Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	7						ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397 #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	30											ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	38							ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00390000009505
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Theria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
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Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Glires	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	121	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Rabbit	MODERN SPECIES	455									ENSOCUG00000013666 #15	NUDT19 (ENSOCUG00000032610) #16	RGS9BP (ENSOCUG00000001135) #17	ANKRD27 (ENSOCUG00000013225) #18	PDCD5 (ENSOCUG00000013220) #19	DPY19L3 (ENSOCUG00000013196) #20	ZNF507 (ENSOCUG00000014069) #21	TSHZ3 (ENSOCUG00000015902) #22	ENSOCUG00000024019 #23	ZNF536 (ENSOCUG00000022631) #24	URI1 (ENSOCUG00000015063) #25	ENSOCUG00000009143 #26	C19orf12 (ENSOCUG00000002865) #27	POP4 (ENSOCUG00000015974) #28	VSTM2B (ENSOCUG00000023884) #29	ENSOCUG00000029273 #30
Pika	MODERN SPECIES	663																TSHZ3 (ENSOPRG00000010680) #22
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160297	ENSGT00390000012508	ENSGT00930000151055	ENSGT00940000162407	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.nb #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b	ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.a	ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.b	ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b	ENSGT00940000161974	ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a	ENSGT00940000155795
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160297	ENSGT00390000012508	ENSGT00930000151055	ENSGT00940000162407	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.nb #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b	ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.b	ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b	ENSGT00940000161974	ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a	ENSGT00940000155795	ENSGT01100000263475.d.a.h
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160297	ENSGT00390000012508	ENSGT00930000151055	ENSGT00940000162407	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.nb #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b	ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.b	ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b	ENSGT00940000161974	ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a	ENSGT00940000155795	ENSGT01100000263475.d.a.h
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	175	ATP4A (ENSCLAG00000013870)	HAUS5 (ENSCLAG00000011624)	RBM42 (ENSCLAG00000012865)	ETV2 (ENSCLAG00000011446)	RHPN2 (ENSCLAG00000011890)	FAAP24 (ENSCLAG00000013484)	ENSCLAG00000012488	SLC7A9 (ENSCLAG00000012671)	TDRD12 (ENSCLAG00000012138)	NUDT19 (ENSCLAG00000015394) #16	RGS9BP (ENSCLAG00000017932) #17	ENSCLAG00000013353 #18	ENSCLAG00000014452 #19	DPY19L3 (ENSCLAG00000013128) #20	ZNF507 (ENSCLAG00000012690) #21	TSHZ3 (ENSCLAG00000012902) #22	ZNF536 (ENSCLAG00000014818) #24	URI1 (ENSCLAG00000014617) #25	CCNE1 (ENSCLAG00000016202) #26	C19orf12 (ENSCLAG00000015360) #27	PLEKHF1 (ENSCLAG00000012584)	POP4 (ENSCLAG00000013162) #28	VSTM2B (ENSCLAG00000016538) #29	UQCRFS1 (ENSCLAG00000011437) #30	FCRL5 (ENSCLAG00000011767)	FCRL3 (ENSCLAG00000012604)	FCRL1 (ENSCLAG00000014567)	CD5L (ENSCLAG00000015227)	ENSCLAG00000015395	KIRREL1 (ENSCLAG00000013814)	CD1D (ENSCLAG00000013027)
Degu	MODERN SPECIES	124	ENSODEG00000014537	ENSODEG00000020158	RHPN2 (ENSODEG00000014557)	FAAP24 (ENSODEG00000013890)	CEP89 (ENSODEG00000014225)	ENSODEG00000015062	ENSODEG00000014355	TDRD12 (ENSODEG00000014443)	NUDT19 (ENSODEG00000014770) #16	RGS9BP (ENSODEG00000020326) #17	ANKRD27 (ENSODEG00000013621) #18	ENSODEG00000013248 #19	DPY19L3 (ENSODEG00000013833) #20	ENSODEG00000013993 #21	ENSODEG00000014205	TSHZ3 (ENSODEG00000013840) #22	ZNF536 (ENSODEG00000013676) #24	URI1 (ENSODEG00000013616) #25	CCNE1 (ENSODEG00000014690) #26	ENSODEG00000020140	C19orf12 (ENSODEG00000013188) #27	ENSODEG00000020216	ENSODEG00000020166	POP4 (ENSODEG00000013025) #28	VSTM2B (ENSODEG00000014510) #29	ENSODEG00000013453	UQCRFS1 (ENSODEG00000014654) #30	ENSODEG00000014952	ENSODEG00000020181	ENSODEG00000014146	CD5L (ENSODEG00000012955)
Guinea pig	MODERN SPECIES	56	RBM42 (ENSCPOG00000012365)	ENSCPOG00000013209	RHPN2 (ENSCPOG00000011968)	FAAP24 (ENSCPOG00000011965)	CEP89 (ENSCPOG00000001470)	ENSCPOG00000011225	ENSCPOG00000030866	ENSCPOG00000034999	TDRD12 (ENSCPOG00000002876)	NUDT19 (ENSCPOG00000038218) #16	RGS9BP (ENSCPOG00000000730) #17	ANKRD27 (ENSCPOG00000000160) #18	PDCD5 (ENSCPOG00000040356) #19	DPY19L3 (ENSCPOG00000012483) #20	ENSCPOG00000012473 #21	TSHZ3 (ENSCPOG00000003591) #22	ZNF536 (ENSCPOG00000008744) #24	URI1 (ENSCPOG00000004105) #25	CCNE1 (ENSCPOG00000004836) #26	C19orf12 (ENSCPOG00000021635) #27	PLEKHF1 (ENSCPOG00000036685)	POP4 (ENSCPOG00000002992) #28	VSTM2B (ENSCPOG00000022127) #29	UQCRFS1 (ENSCPOG00000038582) #30	ENSCPOG00000020010	ENSCPOG00000005105	FCRL1 (ENSCPOG00000031919)	CD5L (ENSCPOG00000002911)	ENSCPOG00000001646	KIRREL1 (ENSCPOG00000004317)	ENSCPOG00000036278
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	20	RBM42 (ENSHGLG00000008418)	ENSHGLG00000006342	ENSHGLG00000005491	FAAP24 (ENSHGLG00000047787)	CEP89 (ENSHGLG00000015749)	TDRD12 (ENSHGLG00000015608)	ENSHGLG00000049663	ENSHGLG00000032764	ENSHGLG00000033957	RGS9BP (ENSHGLG00000043502) #17	ENSHGLG00000000739 #18	PDCD5 (ENSHGLG00000015879) #19	DPY19L3 (ENSHGLG00000008160) #20	ZNF507 (ENSHGLG00000014642) #21	ENSHGLG00000048014	TSHZ3 (ENSHGLG00000015820) #22	ZNF536 (ENSHGLG00000013749) #24	URI1 (ENSHGLG00000009294) #25	CCNE1 (ENSHGLG00000005512) #26	C19orf12 (ENSHGLG00000013665) #27	PLEKHF1 (ENSHGLG00000015663)	POP4 (ENSHGLG00000043121) #28	VSTM2B (ENSHGLG00000010328) #29	ENSHGLG00000034008	UQCRFS1 (ENSHGLG00000046640) #30	ENSHGLG00000049204	ENSHGLG00000005888	FCRL1 (ENSHGLG00000005552)	CD5L (ENSHGLG00000006555)	ENSHGLG00000008016	ENSHGLG00000016598
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.s #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.s #30
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.s #30
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	86	ENSUPAG00010010556	SLC7A10 (ENSUPAG00010010545)	LRP3 (ENSUPAG00010010534)	ENSUPAG00010010532	ENSUPAG00010010526	GPATCH1 (ENSUPAG00010010496)	RHPN2 (ENSUPAG00010010489)	ENSUPAG00010010487	CEP89 (ENSUPAG00010010410)	SLC7A9 (ENSUPAG00010010354)	TDRD12 (ENSUPAG00010010237)	RGS9BP (ENSUPAG00010010233) #17	ANKRD27 (ENSUPAG00010010181) #18	PDCD5 (ENSUPAG00010010174) #19	ZNF507 (ENSUPAG00010010113) #21	TSHZ3 (ENSUPAG00010010104) #22	ZNF536 (ENSUPAG00010010061) #24	URI1 (ENSUPAG00010010020) #25	CCNE1 (ENSUPAG00010010001) #26	C19orf12 (ENSUPAG00010009992) #27	PLEKHF1 (ENSUPAG00010009986)	POP4 (ENSUPAG00010009976) #28	VSTM2B (ENSUPAG00010009950) #29	UQCRFS1 (ENSUPAG00010009946) #30
Squirrel	MODERN SPECIES	170	CEBPG (ENSSTOG00000007596)	ENSSTOG00000027963	SLC7A10 (ENSSTOG00000009450)	LRP3 (ENSSTOG00000009443)	GPATCH1 (ENSSTOG00000003720)	RHPN2 (ENSSTOG00000002103)	CEP89 (ENSSTOG00000019373)	SLC7A9 (ENSSTOG00000013674)	TDRD12 (ENSSTOG00000013638)	ENSSTOG00000031724 #16	RGS9BP (ENSSTOG00000027616) #17	ANKRD27 (ENSSTOG00000013613) #18	PDCD5 (ENSSTOG00000025794) #19	DPY19L3 (ENSSTOG00000025908) #20	ZNF507 (ENSSTOG00000022278) #21	TSHZ3 (ENSSTOG00000024242) #22	ZNF536 (ENSSTOG00000013259) #24	URI1 (ENSSTOG00000009658) #25	CCNE1 (ENSSTOG00000009648) #26	C19orf12 (ENSSTOG00000020602) #27	PLEKHF1 (ENSSTOG00000023108)	POP4 (ENSSTOG00000011016) #28	VSTM2B (ENSSTOG00000020445) #29	ENSSTOG00000011909 #30
Alpin marmot	MODERN SPECIES	45	SLC7A10 (ENSMMMG00000006705)	LRP3 (ENSMMMG00000006727)	ENSMMMG00000006739	GPATCH1 (ENSMMMG00000006748)	RHPN2 (ENSMMMG00000006785)	FAAP24 (ENSMMMG00000006814)	CEP89 (ENSMMMG00000006832)	SLC7A9 (ENSMMMG00000007036)	TDRD12 (ENSMMMG00000007074)	NUDT19 (ENSMMMG00000007175) #16	RGS9BP (ENSMMMG00000007176) #17	ANKRD27 (ENSMMMG00000007203) #18	PDCD5 (ENSMMMG00000007305) #19	DPY19L3 (ENSMMMG00000007308) #20	ZNF507 (ENSMMMG00000007322) #21	TSHZ3 (ENSMMMG00000007335) #22	ZNF536 (ENSMMMG00000007356) #24	URI1 (ENSMMMG00000007374) #25	CCNE1 (ENSMMMG00000007385) #26	C19orf12 (ENSMMMG00000007391) #27	PLEKHF1 (ENSMMMG00000007421)	POP4 (ENSMMMG00000007446) #28	VSTM2B (ENSMMMG00000007454) #29
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	8	SLC7A10 (ENSSVLG00005022473)	LRP3 (ENSSVLG00005022405)	WDR88 (ENSSVLG00005022304)	GPATCH1 (ENSSVLG00005022166)	RHPN2 (ENSSVLG00005022031)	ENSSVLG00005021973	CEP89 (ENSSVLG00005021928)	SLC7A9 (ENSSVLG00005021851)	TDRD12 (ENSSVLG00005021333)	NUDT19 (ENSSVLG00005021230) #16	RGS9BP (ENSSVLG00005021208) #17	ANKRD27 (ENSSVLG00005021121) #18	ENSSVLG00005020933 #19	DPY19L3 (ENSSVLG00005020851) #20	ZNF507 (ENSSVLG00005020811) #21	TSHZ3 (ENSSVLG00005020787) #22	ZNF536 (ENSSVLG00005020746) #24	URI1 (ENSSVLG00005020418) #25	CCNE1 (ENSSVLG00005020303) #26	ENSSVLG00005020245 #27	PLEKHF1 (ENSSVLG00005020227)	POP4 (ENSSVLG00005020169) #28	VSTM2B (ENSSVLG00005020091) #29	ENSSVLG00005020050 #30	ENSSVLG00005020000	ENSSVLG00005019946	ENSSVLG00005019913	ENSSVLG00005019872	SHCBP1 (ENSSVLG00005019832)	ENSSVLG00005019566	VPS35 (ENSSVLG00005019175)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	411	Cebpg (ENSDORG00000027852)	Cebpa (ENSDORG00000027904)	Slc7a10 (ENSDORG00000002321)	Lrp3 (ENSDORG00000002320)	Gpatch1 (ENSDORG00000012546)	Rhpn2 (ENSDORG00000010758)	Cep89 (ENSDORG00000013896)	Slc7a9 (ENSDORG00000026148)	Tdrd12 (ENSDORG00000012134)	ENSDORG00000026153 #16	Rgs9bp (ENSDORG00000015832) #17	Ankrd27 (ENSDORG00000001832) #18	Pdcd5 (ENSDORG00000023317) #19	Dpy19l3 (ENSDORG00000009853) #20	ENSDORG00000013877 #21	ENSDORG00000026232 #22	Zfp536 (ENSDORG00000015237) #24	Uri1 (ENSDORG00000012581) #25	Ccne1 (ENSDORG00000007955) #26	Uqcrfs1 (ENSDORG00000004134) #30
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000014208	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT01030000234576.D.a.b.b.b.g.b	ENSGT00940000163087
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00960000190924	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000014208	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT01030000234576.D.a.b.b.b.g.b	ENSGT00940000163087
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00960000190924	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000014208	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT01030000234576.D.a.b.b.b.g.b	ENSGT00940000163087
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES		Lrp3 (ENSPEMG00000000320)	ENSPEMG00000024856	Gpatch1 (ENSPEMG00000000636)	Rhpn2 (ENSPEMG00000020482)	Faap24 (ENSPEMG00000021083)	Cep89 (ENSPEMG00000020557)	Slc7a9 (ENSPEMG00000020346)	Tdrd12 (ENSPEMG00000009233)	ENSPEMG00000022578	Nudt19 (ENSPEMG00000020519) #16	Rgs9bp (ENSPEMG00000001852) #17	Ankrd27 (ENSPEMG00000020526) #18	Pdcd5 (ENSPEMG00000005766) #19	Dpy19l3 (ENSPEMG00000020636) #20	Zfp507 (ENSPEMG00000023579) #21	Tshz3 (ENSPEMG00000024219) #22	Zfp536 (ENSPEMG00000014198) #24	Uri1 (ENSPEMG00000021114) #25	Ccne1 (ENSPEMG00000020299) #26	1600014C10Rik (ENSPEMG00000030733) #27	ENSPEMG00000014034 #28	ENSPEMG00000026755	ENSPEMG00000019774	ENSPEMG00000026788	Vstm2b (ENSPEMG00000021557) #29	ENSPEMG00000024496	Zfp619 (ENSPEMG00000021007)	ENSPEMG00000024631	ENSPEMG00000027743	Plekhg2 (ENSPEMG00000017217)	Zfp36 (ENSPEMG00000007506)
Prairie vole	MODERN SPECIES	115	Slc7a10 (ENSMOCG00000020699)	Lrp3 (ENSMOCG00000007412)	Gpatch1 (ENSMOCG00000000174)	Rhpn2 (ENSMOCG00000015268)	Faap24 (ENSMOCG00000017357)	Cep89 (ENSMOCG00000000261)	Slc7a9 (ENSMOCG00000001789)	Tdrd12 (ENSMOCG00000002366)	Nudt19 (ENSMOCG00000017828) #16	Rgs9bp (ENSMOCG00000002309) #17	Ankrd27 (ENSMOCG00000013668) #18	ENSMOCG00000016930 #19	Dpy19l3 (ENSMOCG00000009571) #20	Zfp507 (ENSMOCG00000017422) #21	ENSMOCG00000015706	Tshz3 (ENSMOCG00000012794) #22	Zfp536 (ENSMOCG00000011684) #24	Uri1 (ENSMOCG00000018448) #25	Ccne1 (ENSMOCG00000008837) #26	1600014C10Rik (ENSMOCG00000007337) #27	Plekhf1 (ENSMOCG00000017276)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	282	Slc7a10 (ENSCGRG00001006085)	Lrp3 (ENSCGRG00001000089)	Gpatch1 (ENSCGRG00001016736)	Rhpn2 (ENSCGRG00001013772)	Faap24 (ENSCGRG00001012863)	ENSCGRG00001000081	Slc7a9 (ENSCGRG00001005745)	Tdrd12 (ENSCGRG00001021407)	Nudt19 (ENSCGRG00001017272) #16	Rgs9bp (ENSCGRG00001006642) #17	Ankrd27 (ENSCGRG00001018594) #18	ENSCGRG00001016049 #19	ENSCGRG00001014250	Dpy19l3 (ENSCGRG00001022217) #20	Zfp507 (ENSCGRG00001020787) #21	Tshz3 (ENSCGRG00001015566) #22	Zfp536 (ENSCGRG00001014547) #24	Uri1 (ENSCGRG00001019892) #25	Ccne1 (ENSCGRG00001015867) #26	1600014C10Rik (ENSCGRG00001014004) #27	Plekhf1 (ENSCGRG00001014179)	ENSCGRG00001012663	ENSCGRG00001013673
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000014208.y.b
Mus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000014208.y.b	ENSGT01030000234576.D.a.b.b.b.g.b	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000014208.z	ENSGT00390000014208.y.a	ENSGT00940000153165.a.a.c.b.a.b.a	ENSGT00940000155965.t	ENSGT00940000163075	ENSGT01080000257333.A.a.b.a.b.b.a.a.d.a
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728.e	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000014208.y.b	ENSGT01030000234576.D.a.b.b.b.g.b	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000014208.z	ENSGT00390000014208.y.a	ENSGT00940000154469.a.a.b.b.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153165.a.a.c.b.a.b.a	ENSGT00940000155965.t
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728.e	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000014208.y.b.a	ENSGT01030000234576.D.a.b.b.b.g.b	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000014208.z	ENSGT00390000014208.y.a.a.a	ENSGT00940000154469.a.a.b.b.b	ENSGT00950000183069.b.b.a.a.e.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000153165.a.a.c.b.a.b.a	ENSGT00940000155965.t
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728.e	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT01030000234576.D.a.b.b.b.g.b	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00940000154469.a.a.b.b.b
spretus	MODERN SPECIES	16	Cebpg (MGP_SPRETEiJ_G0030677)	Cebpa (MGP_SPRETEiJ_G0030678)	Slc7a10 (MGP_SPRETEiJ_G0030679)	Lrp3 (MGP_SPRETEiJ_G0030680)	Gpatch1 (MGP_SPRETEiJ_G0030681)	Rhpn2 (MGP_SPRETEiJ_G0030682)	Faap24 (MGP_SPRETEiJ_G0030683)	Cep89 (MGP_SPRETEiJ_G0030684)	Slc7a9 (MGP_SPRETEiJ_G0030685)	Tdrd12 (MGP_SPRETEiJ_G0030686)	Rgs9bp (MGP_SPRETEiJ_G0030688) #17	Ankrd27 (MGP_SPRETEiJ_G0030689) #18	Pdcd5 (MGP_SPRETEiJ_G0030690) #19	Dpy19l3 (MGP_SPRETEiJ_G0030691) #20	Zfp507 (MGP_SPRETEiJ_G0030692) #21	Tshz3 (MGP_SPRETEiJ_G0030693) #22	Zfp536 (MGP_SPRETEiJ_G0030694) #24	Uri1 (MGP_SPRETEiJ_G0030695) #25	Ccne1 (MGP_SPRETEiJ_G0030696) #26	1600014C10Rik (MGP_SPRETEiJ_G0030697) #27	Plekhf1 (MGP_SPRETEiJ_G0030698)	Pop4 (MGP_SPRETEiJ_G0030699) #28	MGP_SPRETEiJ_G0030700	Zfp619 (MGP_SPRETEiJ_G0030701)	Vstm2b (MGP_SPRETEiJ_G0030702) #29	AI987944 (MGP_SPRETEiJ_G0030703)	AW146154 (MGP_SPRETEiJ_G0030704)	MGP_SPRETEiJ_G0030705	MGP_SPRETEiJ_G0030706	Zfp788 (MGP_SPRETEiJ_G0030707)	MGP_SPRETEiJ_G0030708
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3056										ENSMSIG00000018080 #16	Rgs9bp (ENSMSIG00000018095) #17	Ankrd27 (ENSMSIG00000018102) #18	Pdcd5 (ENSMSIG00000018284) #19	Dpy19l3 (ENSMSIG00000018318) #20	Zfp507 (ENSMSIG00000018409) #21	Tshz3 (ENSMSIG00000018467) #22
Mouse	MODERN SPECIES	16	Slc7a10 (ENSMUSG00000030495)	Lrp3 (ENSMUSG00000001802)	Wdr88 (ENSMUSG00000118454)	Gpatch1 (ENSMUSG00000063808)	Rhpn2 (ENSMUSG00000030494)	Faap24 (ENSMUSG00000030493)	Cep89 (ENSMUSG00000023072)	Slc7a9 (ENSMUSG00000030492)	Tdrd12 (ENSMUSG00000030491)	Nudt19 (ENSMUSG00000034875) #16	Rgs9bp (ENSMUSG00000056043) #17	Ankrd27 (ENSMUSG00000034867) #18	Pdcd5 (ENSMUSG00000030417) #19	Dpy19l3 (ENSMUSG00000043671) #20	Zfp507 (ENSMUSG00000044452) #21	Tshz3 (ENSMUSG00000021217) #22	Zfp536 (ENSMUSG00000043456) #24	Uri1 (ENSMUSG00000030421) #25	Ccne1 (ENSMUSG00000002068) #26	1600014C10Rik (ENSMUSG00000054676) #27	Plekhf1 (ENSMUSG00000074170)	Pop4 (ENSMUSG00000030423) #28	Gm5591 (ENSMUSG00000060565)	Gm5114 (ENSMUSG00000053742)	Zfp619 (ENSMUSG00000068959)	Vstm2b (ENSMUSG00000039257) #29	4930433I11Rik (ENSMUSG00000091692)	Gm4884 (ENSMUSG00000048312)	Gm5592 (ENSMUSG00000072259)	AI987944 (ENSMUSG00000056383)	Vmn2r57 (ENSMUSG00000066537)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	16	Cebpa (MGP_CAROLIEiJ_G0029579)	Slc7a10 (MGP_CAROLIEiJ_G0029580)	Lrp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029581)	Gpatch1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029582)	Rhpn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029583)	Faap24 (MGP_CAROLIEiJ_G0029584)	Cep89 (MGP_CAROLIEiJ_G0029585)	Slc7a9 (MGP_CAROLIEiJ_G0029586)	Tdrd12 (MGP_CAROLIEiJ_G0029587)	Nudt19 (MGP_CAROLIEiJ_G0029588) #16	Rgs9bp (MGP_CAROLIEiJ_G0029589) #17	Ankrd27 (MGP_CAROLIEiJ_G0029590) #18	MGP_CAROLIEiJ_G0029591 #19	Dpy19l3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029592) #20	Zfp507 (MGP_CAROLIEiJ_G0029593) #21	Tshz3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029594) #22	Zfp536 (MGP_CAROLIEiJ_G0029595) #24	Uri1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029596) #25	Ccne1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029597) #26	MGP_CAROLIEiJ_G0029598 #27	Plekhf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029599)	Pop4 (MGP_CAROLIEiJ_G0029600) #28	Zfp619 (MGP_CAROLIEiJ_G0029602)	Vstm2b (MGP_CAROLIEiJ_G0029603) #29	AI987944 (MGP_CAROLIEiJ_G0029604)	MGP_CAROLIEiJ_G0029605	MGP_CAROLIEiJ_G0029606	Zfp788 (MGP_CAROLIEiJ_G0029608)	MGP_CAROLIEiJ_G0029610	MGP_CAROLIEiJ_G0029609	MGP_CAROLIEiJ_G0029611
Shrew mouse	MODERN SPECIES		Cebpa (MGP_PahariEiJ_G0012813)	Slc7a10 (MGP_PahariEiJ_G0012814)	Lrp3 (MGP_PahariEiJ_G0012815)	Gpatch1 (MGP_PahariEiJ_G0012816)	Rhpn2 (MGP_PahariEiJ_G0012817)	Faap24 (MGP_PahariEiJ_G0012818)	Cep89 (MGP_PahariEiJ_G0012819)	Slc7a9 (MGP_PahariEiJ_G0012820)	Tdrd12 (MGP_PahariEiJ_G0012821)	Nudt19 (MGP_PahariEiJ_G0012822) #16	Rgs9bp (MGP_PahariEiJ_G0012823) #17	Ankrd27 (MGP_PahariEiJ_G0012824) #18	MGP_PahariEiJ_G0012825 #19	Dpy19l3 (MGP_PahariEiJ_G0012826) #20	Zfp507 (MGP_PahariEiJ_G0012827) #21	Tshz3 (MGP_PahariEiJ_G0012828) #22	Zfp536 (MGP_PahariEiJ_G0012829) #24	Uri1 (MGP_PahariEiJ_G0012830) #25	Ccne1 (MGP_PahariEiJ_G0012831) #26	1600014C10Rik (MGP_PahariEiJ_G0012832) #27	Plekhf1 (MGP_PahariEiJ_G0012833)	MGP_PahariEiJ_G0012834	Vstm2b (MGP_PahariEiJ_G0012835) #29	MGP_PahariEiJ_G0012836	AI987944 (MGP_PahariEiJ_G0012838)	2610021A01Rik (MGP_PahariEiJ_G0012839)	MGP_PahariEiJ_G0012840	Zfp788 (MGP_PahariEiJ_G0012841)	MGP_PahariEiJ_G0012842	Siglecf (MGP_PahariEiJ_G0012843)	Siglecg (MGP_PahariEiJ_G0012844)
Rat	MODERN SPECIES		Wdr88 (ENSRNOG00000037393)	Gpatch1 (ENSRNOG00000011584)	Snrpg (ENSRNOG00000032232)	Rhpn2 (ENSRNOG00000011885)	Faap24 (ENSRNOG00000022393)	Cep89 (ENSRNOG00000012140)	Slc7a9 (ENSRNOG00000012344)	Tdrd12 (ENSRNOG00000012719)	AC136661.1 (ENSRNOG00000037380)	Nudt19 (ENSRNOG00000059386) #16	Rgs9bp (ENSRNOG00000012877) #17	Ankrd27 (ENSRNOG00000052814) #18	Pdcd5 (ENSRNOG00000068327) #19	Dpy19l3 (ENSRNOG00000021573) #20	Zfp507 (ENSRNOG00000013565) #21	Tshz3 (ENSRNOG00000013938) #22	RGD1562402 (ENSRNOG00000031859)	Zfp536 (ENSRNOG00000014163) #24	Uri1 (ENSRNOG00000014463) #25	Ccne1 (ENSRNOG00000014786) #26	LOC690000 (ENSRNOG00000014966) #27	Plekhf1 (ENSRNOG00000027724)	Pop4 (ENSRNOG00000027646) #28	Marf1-ps1 (ENSRNOG00000051237)	LOC690114 (ENSRNOG00000027370)	LOC365238 (ENSRNOG00000015168)	LOC108348090 (ENSRNOG00000067296)	Zfp939 (ENSRNOG00000064970)	Zfp619 (ENSRNOG00000066986)	LOC102548320 (ENSRNOG00000069276)	Cdc42se2 (ENSRNOG00000037364)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	458														Dpy19l3 (ENSNGAG00000010668) #20	Zfp507 (ENSNGAG00000010990) #21	Tshz3 (ENSNGAG00000011318) #22
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	73	Cebpg (ENSJJAG00000009499)	ENSJJAG00000014105	Slc7a10 (ENSJJAG00000006090)	Lrp3 (ENSJJAG00000017356)	Gpatch1 (ENSJJAG00000023765)	Rhpn2 (ENSJJAG00000001747)	ENSJJAG00000012680	Cep89 (ENSJJAG00000024207)	Slc7a9 (ENSJJAG00000014613)	ENSJJAG00000018149	Rgs9bp (ENSJJAG00000012886) #17	Ankrd27 (ENSJJAG00000016506) #18	ENSJJAG00000016867 #19	Dpy19l3 (ENSJJAG00000011397) #20	ENSJJAG00000014559 #21	ENSJJAG00000018135 #22	Zfp536 (ENSJJAG00000005397) #24	Uri1 (ENSJJAG00000017190) #25	Ccne1 (ENSJJAG00000013552) #26	1600014C10Rik (ENSJJAG00000015651) #27	Plekhf1 (ENSJJAG00000011982)	Pop4 (ENSJJAG00000013376) #28	Vstm2b (ENSJJAG00000022517) #29	Rnf6 (ENSJJAG00000023994)	Cdk8 (ENSJJAG00000009532)	Wasf3 (ENSJJAG00000018294)	Gpr12 (ENSJJAG00000012507)	Usp12 (ENSJJAG00000019341)	Rasl11a (ENSJJAG00000020910)	Gtf3a (ENSJJAG00000011501)	Mtif3 (ENSJJAG00000013006)
Primates	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Bushbaby	MODERN SPECIES	250	LRP3 (ENSOGAG00000034429)	WDR88 (ENSOGAG00000004017)	GPATCH1 (ENSOGAG00000004016)	RHPN2 (ENSOGAG00000001578)	FAAP24 (ENSOGAG00000001576)	CEP89 (ENSOGAG00000001573)	SLC7A9 (ENSOGAG00000012118)	TDRD12 (ENSOGAG00000001571)	NUDT19 (ENSOGAG00000026276) #16	RGS9BP (ENSOGAG00000032941) #17	ANKRD27 (ENSOGAG00000015112) #18	PDCD5 (ENSOGAG00000025274) #19	ENSOGAG00000033236	DPY19L3 (ENSOGAG00000002677) #20	ZNF507 (ENSOGAG00000002674) #21	TSHZ3 (ENSOGAG00000032636) #22	ZNF536 (ENSOGAG00000003997) #24	URI1 (ENSOGAG00000015310) #25	ENSOGAG00000025344	CCNE1 (ENSOGAG00000006217) #26	C19orf12 (ENSOGAG00000012719) #27	PLEKHF1 (ENSOGAG00000033399)	POP4 (ENSOGAG00000011168) #28	VSTM2B (ENSOGAG00000029203) #29	UQCRFS1 (ENSOGAG00000026492) #30
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	158	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	363	CEBPG (ENSPCOG00000025828)	SLC7A10 (ENSPCOG00000008563)	LRP3 (ENSPCOG00000021536)	WDR88 (ENSPCOG00000025378)	GPATCH1 (ENSPCOG00000009674)	RHPN2 (ENSPCOG00000016163)	FAAP24 (ENSPCOG00000020206)	CEP89 (ENSPCOG00000009646)	ENSPCOG00000011220	SLC7A9 (ENSPCOG00000026968)	TDRD12 (ENSPCOG00000023600)	ANKRD27 (ENSPCOG00000013416) #18	ENSPCOG00000017218 #19	DPY19L3 (ENSPCOG00000016162) #20	ZNF507 (ENSPCOG00000017580) #21	TSHZ3 (ENSPCOG00000023437) #22	ZNF536 (ENSPCOG00000017326) #24	URI1 (ENSPCOG00000019426) #25	CCNE1 (ENSPCOG00000000361) #26	C19orf12 (ENSPCOG00000002733) #27	POP4 (ENSPCOG00000018055) #28	VSTM2B (ENSPCOG00000015905) #29	UQCRFS1 (ENSPCOG00000015205) #30
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	775	WDR88 (ENSPSMG00000014901)	GPATCH1 (ENSPSMG00000014950)	RHPN2 (ENSPSMG00000014984)	FAAP24 (ENSPSMG00000014997)	CEP89 (ENSPSMG00000015002)	SLC7A9 (ENSPSMG00000015023)	TDRD12 (ENSPSMG00000015114)	NUDT19 (ENSPSMG00000015148) #16	ENSPSMG00000015151	RGS9BP (ENSPSMG00000015153) #17	ANKRD27 (ENSPSMG00000015253) #18	ENSPSMG00000015281	PDCD5 (ENSPSMG00000015313) #19	DPY19L3 (ENSPSMG00000015366) #20	ZNF507 (ENSPSMG00000015392) #21	TSHZ3 (ENSPSMG00000015407) #22	ENSPSMG00000015427	ZNF536 (ENSPSMG00000015452) #24	URI1 (ENSPSMG00000015493) #25	CCNE1 (ENSPSMG00000015575) #26
Mouse lemur	MODERN SPECIES	14	LRP3 (ENSMICG00000032993)	WDR88 (ENSMICG00000017262)	GPATCH1 (ENSMICG00000004829)	ENSMICG00000028269	RHPN2 (ENSMICG00000003663)	FAAP24 (ENSMICG00000044088)	CEP89 (ENSMICG00000003646)	SLC7A9 (ENSMICG00000046921)	TDRD12 (ENSMICG00000003623)	NUDT19 (ENSMICG00000037570) #16	ENSMICG00000000420 #18	ENSMICG00000041547 #18	PDCD5 (ENSMICG00000000417) #19	DPY19L3 (ENSMICG00000012369) #20	ZNF507 (ENSMICG00000012333) #21	TSHZ3 (ENSMICG00000027677) #22	ZNF536 (ENSMICG00000035640) #24	URI1 (ENSMICG00000006756) #25	ENSMICG00000036638	CCNE1 (ENSMICG00000006777) #26	C19orf12 (ENSMICG00000046460) #27	PLEKHF1 (ENSMICG00000015447)	POP4 (ENSMICG00000035730) #28	VSTM2B (ENSMICG00000044409) #29	UQCRFS1 (ENSMICG00000027906) #30
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.b.d.a	ENSGT00950000182755.b.a.a.b.a.b.a.a	ENSGT00550000075064	ENSGT00950000183110.a	ENSGT01050000244941.B.c	ENSGT00940000162643	ENSGT00390000008152.B.a
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000154940.qb	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000161942.a.a.a.a.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.b.a.a
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000159345.o	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT01100000263507.E.b.b.c.a
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000159345.o	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT01100000263507.E.b.b.c.a	ENSGT00940000153236.b.b.b.b.b
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b.u.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000155097.w.a	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000159345.o	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.b.b	ENSGT00940000163381.a.e.b
Gorilla	MODERN SPECIES	10	WDR88 (ENSGGOG00000009952)	GPATCH1 (ENSGGOG00000010862)	ENSGGOG00000013137	ENSGGOG00000042319	CEP89 (ENSGGOG00000014134)	SLC7A9 (ENSGGOG00000011960)	TDRD12 (ENSGGOG00000011938)	NUDT19 (ENSGGOG00000007785) #16	RGS9BP (ENSGGOG00000043355) #17	ANKRD27 (ENSGGOG00000008596) #18	ENSGGOG00000006169 #19	DPY19L3 (ENSGGOG00000009160) #20	ZNF507 (ENSGGOG00000010501) #21	ENSGGOG00000043441	ENSGGOG00000041898	TSHZ3 (ENSGGOG00000003676) #22	ZNF536 (ENSGGOG00000013640) #24	ENSGGOG00000025255	URI1 (ENSGGOG00000005886) #25	ENSGGOG00000037265	CCNE1 (ENSGGOG00000008452) #26	C19orf12 (ENSGGOG00000014142) #27	PLEKHF1 (ENSGGOG00000001698)	VSTM2B (ENSGGOG00000009691) #29	UQCRFS1 (ENSGGOG00000012978) #30	ENSGGOG00000025826	ZNF254 (ENSGGOG00000041266)	ZNF726 (ENSGGOG00000038878)	ZNF681 (ENSGGOG00000036199)	ENSGGOG00000036879	ENSGGOG00000040519
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b.u.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000155097.w.a	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000159345.o	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.b.b	ENSGT00940000163381.a.e.b
Pan	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b.u.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000155097.w.a	ENSGT00390000002362.m #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000159345.o	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.b.b	ENSGT00940000163381.a.e.b
Chimpanzee	MODERN SPECIES	10	LRP3 (ENSPTRG00000010806)	WDR88 (ENSPTRG00000010804)	GPATCH1 (ENSPTRG00000010803)	RHPN2 (ENSPTRG00000010801)	FAAP24 (ENSPTRG00000010798)	CEP89 (ENSPTRG00000010797)	SLC7A9 (ENSPTRG00000010796)	TDRD12 (ENSPTRG00000010795)	NUDT19 (ENSPTRG00000034496) #16	RGS9BP (ENSPTRG00000047454) #17	ANKRD27 (ENSPTRG00000010792) #18	PDCD5 (ENSPTRG00000010791) #19	DPY19L3 (ENSPTRG00000010790) #20	ZNF507 (ENSPTRG00000010789) #21	ENSPTRG00000048388	TSHZ3 (ENSPTRG00000010788) #22	ZNF536 (ENSPTRG00000010786) #24	ENSPTRG00000052821	ENSPTRG00000050716	URI1 (ENSPTRG00000010784) #25	CCNE1 (ENSPTRG00000010782) #26	C19H19orf12 (ENSPTRG00000010781) #27	PLEKHF1 (ENSPTRG00000010780)	POP4 (ENSPTRG00000010779) #28	VSTM2B (ENSPTRG00000010778) #29	UQCRFS1 (ENSPTRG00000010777) #30	ENSPTRG00000049554	ZNF254 (ENSPTRG00000019222)	ENSPTRG00000046645	ZNF681 (ENSPTRG00000043365)	ENSPTRG00000048149
Bonobo	MODERN SPECIES	10	SLC7A10 (ENSPPAG00000029338)	LRP3 (ENSPPAG00000036881)	WDR88 (ENSPPAG00000033383)	GPATCH1 (ENSPPAG00000020990)	RHPN2 (ENSPPAG00000039976)	FAAP24 (ENSPPAG00000031426)	CEP89 (ENSPPAG00000030028)	SLC7A9 (ENSPPAG00000040321)	TDRD12 (ENSPPAG00000042284)	ENSPPAG00000034507 #16	RGS9BP (ENSPPAG00000013767) #17	ANKRD27 (ENSPPAG00000035637) #18	ENSPPAG00000042320 #19	DPY19L3 (ENSPPAG00000028384) #20	ZNF507 (ENSPPAG00000042851) #21	TSHZ3 (ENSPPAG00000036336) #22	ZNF536 (ENSPPAG00000034794) #24	ENSPPAG00000037943	ENSPPAG00000032180 #25	CCNE1 (ENSPPAG00000039579) #26	C19orf12 (ENSPPAG00000029958) #27	ENSPPAG00000030231	POP4 (ENSPPAG00000040372) #28	VSTM2B (ENSPPAG00000031848) #29	UQCRFS1 (ENSPPAG00000029945) #30	ENSPPAG00000042511	ENSPPAG00000030126	ZNF726 (ENSPPAG00000038380)	ZNF681 (ENSPPAG00000029602)	ENSPPAG00000025873	ENSPPAG00000043194
Human	MODERN SPECIES	10	SLC7A10 (ENSG00000130876)	LRP3 (ENSG00000130881)	WDR88 (ENSG00000166359)	GPATCH1 (ENSG00000076650)	RHPN2 (ENSG00000131941)	FAAP24 (ENSG00000131944)	CEP89 (ENSG00000121289)	SLC7A9 (ENSG00000021488)	TDRD12 (ENSG00000173809)	NUDT19 (ENSG00000213965) #16	RGS9BP (ENSG00000186326) #17	ANKRD27 (ENSG00000105186) #18	PDCD5 (ENSG00000105185) #19	DPY19L3 (ENSG00000178904) #20	ZNF507 (ENSG00000168813) #21	TSHZ3 (ENSG00000121297) #22	ZNF536 (ENSG00000198597) #24	URI1 (ENSG00000105176) #25	CCNE1 (ENSG00000105173) #26	C19orf12 (ENSG00000131943) #27	PLEKHF1 (ENSG00000166289)	POP4 (ENSG00000105171) #28	VSTM2B (ENSG00000187135) #29	UQCRFS1 (ENSG00000169021) #30	ZNF254 (ENSG00000213096)	ZNF726 (ENSG00000213967)	RPSA2 (ENSG00000288920)	ZNF681 (ENSG00000196172)	ZNF675 (ENSG00000197372)	ZNF91 (ENSG00000167232)	ENSG00000283201
Gibbon	MODERN SPECIES		LRP3 (ENSNLEG00000007676)	ENSNLEG00000035651	GPATCH1 (ENSNLEG00000007659)	ENSNLEG00000030362	ENSNLEG00000007654	ENSNLEG00000033704	CEP89 (ENSNLEG00000007643)	SLC7A9 (ENSNLEG00000007638)	ENSNLEG00000007635	NUDT19 (ENSNLEG00000007633) #16	RGS9BP (ENSNLEG00000033989) #17	ANKRD27 (ENSNLEG00000007615) #18	ENSNLEG00000033870 #19	DPY19L3 (ENSNLEG00000007610) #20	ENSNLEG00000007609	TSHZ3 (ENSNLEG00000007608) #22	ZNF536 (ENSNLEG00000007605) #24	ENSNLEG00000007600 #25	ENSNLEG00000032007	CCNE1 (ENSNLEG00000007599) #26	ENSNLEG00000033714 #27	PLEKHF1 (ENSNLEG00000034434)	ENSNLEG00000028526	VSTM2B (ENSNLEG00000007593) #29	UQCRFS1 (ENSNLEG00000007588) #30	ENSNLEG00000030634	ZNF254 (ENSNLEG00000034962)	ZNF726 (ENSNLEG00000028061)	ZNF681 (ENSNLEG00000026595)	ENSNLEG00000030674	ENSNLEG00000034498
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000154940.qb	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000161942.a.a.a.a.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.b.a.a
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000161942.a.a.a.a.b.e.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000163381.a	ENSGT00940000165698.B.a.a
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156469.h	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161942.a.a.a.a.b.e.a	ENSGT00940000163381.a
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156469.h	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.d	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362.i.a #25	ENSGT00390000002362.j #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.h #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000154915.j	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00910000146855.h	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	218	CEBPG (ENSMNEG00000026159)	SLC7A10 (ENSMNEG00000037424)	LRP3 (ENSMNEG00000024475)	WDR88 (ENSMNEG00000029027)	GPATCH1 (ENSMNEG00000045084)	RHPN2 (ENSMNEG00000032814)	FAAP24 (ENSMNEG00000016780)	CEP89 (ENSMNEG00000034589)	TDRD12 (ENSMNEG00000043067)	NUDT19 (ENSMNEG00000044868) #16	RGS9BP (ENSMNEG00000014719) #17	ANKRD27 (ENSMNEG00000042970) #18	PDCD5 (ENSMNEG00000033071) #19	DPY19L3 (ENSMNEG00000006138) #20	ZNF507 (ENSMNEG00000028743) #21	TSHZ3 (ENSMNEG00000033088) #22	ZNF536 (ENSMNEG00000036995) #24	ENSMNEG00000008907	ENSMNEG00000039852 #25
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156469.g.b	ENSGT00940000162291.d	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT01100000263493.a.a.a.b.b.b.b.a.b.b.b.b	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362.i.a #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.h #30	ENSGT00940000154453.b.a.a.a.b	ENSGT00940000154915.j	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.b	ENSGT00910000146855.h	ENSGT00940000154251.A.b.b.a.b.b	ENSGT00940000153236.b.a.a.b.b.a.b	ENSGT00940000153236.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	10	ENSMFAG00000063532	GPATCH1 (ENSMFAG00000034418)	RHPN2 (ENSMFAG00000043323)	FAAP24 (ENSMFAG00000054473)	CEP89 (ENSMFAG00000001684)	SLC7A9 (ENSMFAG00000002286)	TDRD12 (ENSMFAG00000044756)	ENSMFAG00000059021	NUDT19 (ENSMFAG00000042477) #16	ANKRD27 (ENSMFAG00000030329) #18	ENSMFAG00000051717	PDCD5 (ENSMFAG00000044379) #19	DPY19L3 (ENSMFAG00000043628) #20	ZNF507 (ENSMFAG00000031054) #21	ENSMFAG00000064547	TSHZ3 (ENSMFAG00000033604) #22	ENSMFAG00000058928	ZNF536 (ENSMFAG00000042864) #24	URI1 (ENSMFAG00000044813) #25	CCNE1 (ENSMFAG00000041278) #26	C19orf12 (ENSMFAG00000037046) #27	ENSMFAG00000056289	POP4 (ENSMFAG00000029606) #28	VSTM2B (ENSMFAG00000048636) #29	ENSMFAG00000060436 #30	ENSMFAG00000056393	ENSMFAG00000053270	ENSMFAG00000039986	ENSMFAG00000039830	ZNF254 (ENSMFAG00000003947)	ENSMFAG00000065576
Rhesus	MODERN SPECIES	10	LRP3 (ENSMMUG00000022872)	ENSMMUG00000064983	GPATCH1 (ENSMMUG00000011790)	RHPN2 (ENSMMUG00000028798)	FAAP24 (ENSMMUG00000017939)	CEP89 (ENSMMUG00000018351)	SLC7A9 (ENSMMUG00000028800)	TDRD12 (ENSMMUG00000015608)	RGS9BP (ENSMMUG00000046695) #17	ENSMMUG00000062732	ANKRD27 (ENSMMUG00000008041) #18	PDCD5 (ENSMMUG00000052666) #19	DPY19L3 (ENSMMUG00000010842) #20	ZNF507 (ENSMMUG00000010840) #21	ENSMMUG00000060263	TSHZ3 (ENSMMUG00000014028) #22	ZNF536 (ENSMMUG00000063586) #24	ENSMMUG00000058273	URI1 (ENSMMUG00000018441) #25	CCNE1 (ENSMMUG00000020668) #26	C19H19orf12 (ENSMMUG00000021690) #27	PLEKHF1 (ENSMMUG00000011373)	POP4 (ENSMMUG00000017424) #28	VSTM2B (ENSMMUG00000007392) #29	ENSMMUG00000008417 #30	ENSMMUG00000012013	ENSMMUG00000040891	ENSMMUG00000053639	ZNF254 (ENSMMUG00000052284)	ENSMMUG00000065175	ENSMMUG00000061458
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156469.h	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Olive baboon	MODERN SPECIES	12	SLC7A10 (ENSPANG00000005447)	LRP3 (ENSPANG00000018901)	WDR88 (ENSPANG00000010853)	GPATCH1 (ENSPANG00000012374)	RHPN2 (ENSPANG00000017034)	FAAP24 (ENSPANG00000024282)	CEP89 (ENSPANG00000003158)	SLC7A9 (ENSPANG00000001204)	TDRD12 (ENSPANG00000001203)	NUDT19 (ENSPANG00000011363) #16	RGS9BP (ENSPANG00000004020) #17	ANKRD27 (ENSPANG00000030136) #18	PDCD5 (ENSPANG00000013640) #19	DPY19L3 (ENSPANG00000010375) #20	ZNF507 (ENSPANG00000010840) #21	TSHZ3 (ENSPANG00000001076) #22	ZNF536 (ENSPANG00000016643) #24	URI1 (ENSPANG00000010974) #25	CCNE1 (ENSPANG00000017035) #26	ENSPANG00000007899 #27	PLEKHF1 (ENSPANG00000013107)	POP4 (ENSPANG00000008546) #28	VSTM2B (ENSPANG00000013391) #29	UQCRFS1 (ENSPANG00000024986) #30	ENSPANG00000048435	ENSPANG00000017544	ENSPANG00000026433	ENSPANG00000044512	ENSPANG00000034815	ZNF681 (ENSPANG00000037775)	ENSPANG00000018392
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156469.h	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	535	SLC7A10 (ENSCATG00000030571)	LRP3 (ENSCATG00000033824)	WDR88 (ENSCATG00000037627)	GPATCH1 (ENSCATG00000043637)	RHPN2 (ENSCATG00000028263)	FAAP24 (ENSCATG00000037414)	CEP89 (ENSCATG00000032749)	SLC7A9 (ENSCATG00000032830)	TDRD12 (ENSCATG00000038627)	NUDT19 (ENSCATG00000034824) #16	RGS9BP (ENSCATG00000000718) #17	ANKRD27 (ENSCATG00000039085) #18	PDCD5 (ENSCATG00000032551) #19	DPY19L3 (ENSCATG00000040765) #20	ZNF507 (ENSCATG00000032058) #21	TSHZ3 (ENSCATG00000027617) #22	ZNF536 (ENSCATG00000038060) #24	ENSCATG00000044280	URI1 (ENSCATG00000041548) #25	CCNE1 (ENSCATG00000036730) #26	C19orf12 (ENSCATG00000043372) #27	PLEKHF1 (ENSCATG00000017587)	POP4 (ENSCATG00000036022) #28	VSTM2B (ENSCATG00000041422) #29	UQCRFS1 (ENSCATG00000037427) #30
Drill	MODERN SPECIES	1167	ENSMLEG00000035146	SLC7A10 (ENSMLEG00000037857)	LRP3 (ENSMLEG00000042731)	WDR88 (ENSMLEG00000040613)	GPATCH1 (ENSMLEG00000043840)	RHPN2 (ENSMLEG00000031393)	FAAP24 (ENSMLEG00000034497)	CEP89 (ENSMLEG00000042877)	SLC7A9 (ENSMLEG00000034139)	TDRD12 (ENSMLEG00000042036)	ANKRD27 (ENSMLEG00000035681) #18	PDCD5 (ENSMLEG00000034452) #19	DPY19L3 (ENSMLEG00000041227) #20	ZNF507 (ENSMLEG00000043374) #21	ENSMLEG00000034458	TSHZ3 (ENSMLEG00000001629) #22	ZNF536 (ENSMLEG00000040359) #24	ENSMLEG00000042025	URI1 (ENSMLEG00000042881) #25	CCNE1 (ENSMLEG00000039590) #26	C19orf12 (ENSMLEG00000037130) #27	PLEKHF1 (ENSMLEG00000019239)	POP4 (ENSMLEG00000043454) #28	VSTM2B (ENSMLEG00000037367) #29	UQCRFS1 (ENSMLEG00000037838) #30
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	25	LRP3 (ENSCSAG00000004689)	WDR88 (ENSCSAG00000004701)	GPATCH1 (ENSCSAG00000004743)	RHPN2 (ENSCSAG00000004761)	FAAP24 (ENSCSAG00000004765)	CEP89 (ENSCSAG00000004771)	SLC7A9 (ENSCSAG00000004775)	TDRD12 (ENSCSAG00000004794)	NUDT19 (ENSCSAG00000004800) #16	RGS9BP (ENSCSAG00000018513) #17	ANKRD27 (ENSCSAG00000004811) #18	PDCD5 (ENSCSAG00000004815) #19	DPY19L3 (ENSCSAG00000004818) #20	ZNF507 (ENSCSAG00000004822) #21	ENSCSAG00000004823	TSHZ3 (ENSCSAG00000018510) #22	ZNF536 (ENSCSAG00000004832) #24	URI1 (ENSCSAG00000004838) #25	CCNE1 (ENSCSAG00000004850) #26	C19orf12 (ENSCSAG00000004862) #27	PLEKHF1 (ENSCSAG00000018508)	POP4 (ENSCSAG00000004868) #28	VSTM2B (ENSCSAG00000004872) #29	UQCRFS1 (ENSCSAG00000004876) #30	ENSCSAG00000004890	ENSCSAG00000004895	ENSCSAG00000004898	ZNF726 (ENSCSAG00000004902)	ZNF681 (ENSCSAG00000004903)	ENSCSAG00000004906	ENSCSAG00000018506
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	461														ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362.g #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.i #30
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	455														DPY19L3 (ENSRBIG00000030615) #20	ZNF507 (ENSRBIG00000034646) #21	TSHZ3 (ENSRBIG00000026412) #22	ZNF536 (ENSRBIG00000039506) #24	ENSRBIG00000039664	ENSRBIG00000024225 #25	CCNE1 (ENSRBIG00000032298) #26	C19orf12 (ENSRBIG00000039475) #27	PLEKHF1 (ENSRBIG00000015740)	POP4 (ENSRBIG00000044769) #28	VSTM2B (ENSRBIG00000043416) #29	ENSRBIG00000036646 #30	ENSRBIG00000011549 #30	ENSRBIG00000034078	ENSRBIG00000001068
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	3020														DPY19L3 (ENSRROG00000030373) #20	ZNF507 (ENSRROG00000033058) #21	TSHZ3 (ENSRROG00000030098) #22	ZNF536 (ENSRROG00000029672) #24	ENSRROG00000033869 #25	ENSRROG00000004401	CCNE1 (ENSRROG00000032241) #26	C19orf12 (ENSRROG00000036081) #27	PLEKHF1 (ENSRROG00000024857)	POP4 (ENSRROG00000028903) #28	VSTM2B (ENSRROG00000039045) #29	ENSRROG00000045520 #30
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000155097.kb	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.hb #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067.c #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.n #30	ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.b.d.a	ENSGT00950000182755.b.a.a.b.a.b.a.a.g.a	ENSGT00550000075064	ENSGT00950000183110.a	ENSGT01050000244941.B.c	ENSGT00940000162643
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.hb #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067.c #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.n #30	ENSGT00940000154251.A.a.b	ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.b.d.a	ENSGT00950000182755.b.a.a.b.a.b.a.a.g.a	ENSGT00550000075064	ENSGT00950000183110.a	ENSGT01050000244941.B.c	ENSGT00940000162643
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.hb #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067.c #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.n #30
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	134	CEBPG (ENSSBOG00000019291)	SLC7A10 (ENSSBOG00000027542)	LRP3 (ENSSBOG00000035415)	WDR88 (ENSSBOG00000025893)	GPATCH1 (ENSSBOG00000034650)	ENSSBOG00000015947	RHPN2 (ENSSBOG00000019588)	ENSSBOG00000032597	CEP89 (ENSSBOG00000020185)	SLC7A9 (ENSSBOG00000026844)	TDRD12 (ENSSBOG00000034916)	ANKRD27 (ENSSBOG00000003371) #18	ENSSBOG00000031965 #19	DPY19L3 (ENSSBOG00000016884) #20	ZNF507 (ENSSBOG00000029395) #21	TSHZ3 (ENSSBOG00000026781) #22	ZNF536 (ENSSBOG00000030032) #24	URI1 (ENSSBOG00000026899) #25	CCNE1 (ENSSBOG00000028300) #26	ENSSBOG00000025647 #27	PLEKHF1 (ENSSBOG00000020039)	POP4 (ENSSBOG00000032445) #28	VSTM2B (ENSSBOG00000000764) #29	UQCRFS1 (ENSSBOG00000031980) #30
Capuchin	MODERN SPECIES	261	ZNHIT6 (ENSCCAG00000035034)	COL24A1 (ENSCCAG00000026567)	ODF2L (ENSCCAG00000036639)	CLCA2 (ENSCCAG00000022983)	CLCA1 (ENSCCAG00000032498)	CLCA4 (ENSCCAG00000027130)	ENSCCAG00000035676	SH3GLB1 (ENSCCAG00000029842)	ENSCCAG00000000976	ENSCCAG00000031456 ##15	SELENOF (ENSCCAG00000033446)	HS2ST1 (ENSCCAG00000026104)	ENSCCAG00000035343	ZNF507 (ENSCCAG00000032775) #21	ENSCCAG00000029568	TSHZ3 (ENSCCAG00000028090) #22	ZNF536 (ENSCCAG00000030471) #24	URI1 (ENSCCAG00000019670) #25	CCNE1 (ENSCCAG00000020086) #26	ENSCCAG00000024988 #27	PLEKHF1 (ENSCCAG00000019193)	ENSCCAG00000020285 #28	VSTM2B (ENSCCAG00000028420) #29	UQCRFS1 (ENSCCAG00000026746) #30
Marmoset	MODERN SPECIES	14	SLC7A10 (ENSCJAG00000000642)	LRP3 (ENSCJAG00000000662)	WDR88 (ENSCJAG00000000669)	GPATCH1 (ENSCJAG00000000684)	RHPN2 (ENSCJAG00000000708)	FAAP24 (ENSCJAG00000048468)	CEP89 (ENSCJAG00000000731)	SLC7A9 (ENSCJAG00000000755)	TDRD12 (ENSCJAG00000000763)	NUDT19 (ENSCJAG00000018441) #16	RGS9BP (ENSCJAG00000075946) #17	ANKRD27 (ENSCJAG00000018416) #18	ENSCJAG00000018410 #19	DPY19L3 (ENSCJAG00000018385) #20	ZNF507 (ENSCJAG00000018378) #21	TSHZ3 (ENSCJAG00000018374) #22	ZNF536 (ENSCJAG00000018365) #24	URI1 (ENSCJAG00000001823) #25	CCNE1 (ENSCJAG00000001857) #26	C19orf12 (ENSCJAG00000086068) #27	PLEKHF1 (ENSCJAG00000001871)	POP4 (ENSCJAG00000046750) #28	VSTM2B (ENSCJAG00000001884) #29	ENSCJAG00000001887 #30	ENSCJAG00000085320	ENSCJAG00000011613	ENSCJAG00000072387	ENSCJAG00000072073	ZNF254 (ENSCJAG00000015228)	ENSCJAG00000082182	ZNF681 (ENSCJAG00000011995)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1081	SLC7A10 (ENSANAG00000021682)	LRP3 (ENSANAG00000027962)	WDR88 (ENSANAG00000032336)	GPATCH1 (ENSANAG00000027002)	RHPN2 (ENSANAG00000035594)	ENSANAG00000025099	CEP89 (ENSANAG00000020648)	SLC7A9 (ENSANAG00000023617)	TDRD12 (ENSANAG00000023166)	NUDT19 (ENSANAG00000035514) #16	RGS9BP (ENSANAG00000034601) #17	ANKRD27 (ENSANAG00000035787) #18	ENSANAG00000030236 #19	DPY19L3 (ENSANAG00000019965) #20	ZNF507 (ENSANAG00000022070) #21	TSHZ3 (ENSANAG00000003355) #22	ZNF536 (ENSANAG00000022858) #24	ENSANAG00000022926	URI1 (ENSANAG00000030437) #25	ENSANAG00000020114 #26	ENSANAG00000020400 #27	PLEKHF1 (ENSANAG00000031611)	POP4 (ENSANAG00000020295) #28	VSTM2B (ENSANAG00000011934) #29	ENSANAG00000026070 #30	ENSANAG00000024673	ENSANAG00000021197	ENSANAG00000019793	ENSANAG00000029579
Tarsier	MODERN SPECIES	1025																TSHZ3 (ENSTSYG00000005762) #22
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00990000204193
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.b.a #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	11417																TSHZ3 (ENSEEUG00000004335) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00990000204193
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	104	RHPN2 (ENSCWAG00000001061)	FAAP24 (ENSCWAG00000001092)	CEP89 (ENSCWAG00000001114)	SLC7A9 (ENSCWAG00000001135)	TDRD12 (ENSCWAG00000001230)	ENSCWAG00000001479	ENSCWAG00000001495	ENSCWAG00000001506	NUDT19 (ENSCWAG00000001513) #16	RGS9BP (ENSCWAG00000001525) #17	ANKRD27 (ENSCWAG00000001538) #18	ENSCWAG00000001578 #19	DPY19L3 (ENSCWAG00000001605) #20	ENSCWAG00000001629	ZNF507 (ENSCWAG00000001636) #21	TSHZ3 (ENSCWAG00000001647) #22	ENSCWAG00000001653	ZNF536 (ENSCWAG00000001663) #24	URI1 (ENSCWAG00000001670) #25	CCNE1 (ENSCWAG00000001690) #26	C19orf12 (ENSCWAG00000001799) #27	PLEKHF1 (ENSCWAG00000001825)	POP4 (ENSCWAG00000001837) #28	VSTM2B (ENSCWAG00000001853) #29	UQCRFS1 (ENSCWAG00000001869) #30	SHCBP1 (ENSCWAG00000001888)	VPS35 (ENSCWAG00000001902)	ORC6 (ENSCWAG00000001931)	MYLK3 (ENSCWAG00000001954)	ENSCWAG00000001992	ENSCWAG00000002014
Pig	MODERN SPECIES	14	SLC7A10 (ENSSSCG00000002864)	LRP3 (ENSSSCG00000002863)	WDR88 (ENSSSCG00000002862)	GPATCH1 (ENSSSCG00000002865)	RHPN2 (ENSSSCG00000022312)	FAAP24 (ENSSSCG00000040905)	CEP89 (ENSSSCG00000025152)	SLC7A9 (ENSSSCG00000022948)	TDRD12 (ENSSSCG00000002857)	NUDT19 (ENSSSCG00000036294) #16	RGS9BP (ENSSSCG00000051830) #17	ANKRD27 (ENSSSCG00000002859) #18	PDCD5 (ENSSSCG00000002860) #19	DPY19L3 (ENSSSCG00000022521) #20	ZNF507 (ENSSSCG00000025139) #21	TSHZ3 (ENSSSCG00000025214) #22	ZNF536 (ENSSSCG00000029234) #24	URI1 (ENSSSCG00000025912) #25	ENSSSCG00000002855 #26	C19orf12 (ENSSSCG00000032153) #27	PLEKHF1 (ENSSSCG00000002852)	POP4 (ENSSSCG00000002854) #28	VSTM2B (ENSSSCG00000023921) #29	UQCRFS1 (ENSSSCG00000027085) #30	ENSSSCG00000038906	ENSSSCG00000002850	SHCBP1 (ENSSSCG00000002849)	VPS35 (ENSSSCG00000026239)	ORC6 (ENSSSCG00000024443)	MYLK3 (ENSSSCG00000036874)	C16orf87 (ENSSSCG00000022333)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00990000204193
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b	ENSGT00940000156041
Arabian camel	MODERN SPECIES	35	LRP3 (ENSCDRG00005018325)	ENSCDRG00005018548	GPATCH1 (ENSCDRG00005018715)	RHPN2 (ENSCDRG00005019052)	FAAP24 (ENSCDRG00005019258)	CEP89 (ENSCDRG00005019493)	SLC7A9 (ENSCDRG00005019910)	TDRD12 (ENSCDRG00005020226)	NUDT19 (ENSCDRG00005020362) #16	RGS9BP (ENSCDRG00005020448) #17	ANKRD27 (ENSCDRG00005020575) #18	ENSCDRG00005020847 #19	DPY19L3 (ENSCDRG00005021111) #20	ZNF507 (ENSCDRG00005021348) #21	ENSCDRG00005021461	TSHZ3 (ENSCDRG00005021492) #22	ZNF536 (ENSCDRG00005021564) #24	URI1 (ENSCDRG00005021639) #25	CCNE1 (ENSCDRG00005021725) #26	C19orf12 (ENSCDRG00005021821) #27	PLEKHF1 (ENSCDRG00005021848)	POP4 (ENSCDRG00005021850) #28	UQCRFS1 (ENSCDRG00005021891) #30	ENSCDRG00005021909	SHCBP1 (ENSCDRG00005021912)	VPS35 (ENSCDRG00005021932)	ORC6 (ENSCDRG00005021936)	MYLK3 (ENSCDRG00005021954)	ENSCDRG00005022000	GPT2 (ENSCDRG00005022050)	DNAJA2 (ENSCDRG00005022140)
Alpaca	MODERN SPECIES	118																ENSVPAG00000007970 #22
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00990000204193
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00940000154509.y.b.a.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00940000154509.y.b.a.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00940000157868.c	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00940000157868.c	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Goat	MODERN SPECIES	9	CEBPA (ENSCHIG00000011587)	SLC7A10 (ENSCHIG00000023717)	LRP3 (ENSCHIG00000012481)	GPATCH1 (ENSCHIG00000019626)	ENSCHIG00000023853	RHPN2 (ENSCHIG00000010158)	FAAP24 (ENSCHIG00000021119)	CEP89 (ENSCHIG00000014142)	NUDT19 (ENSCHIG00000021537) #16	RGS9BP (ENSCHIG00000007331) #17	ANKRD27 (ENSCHIG00000017376) #18	PDCD5 (ENSCHIG00000006484) #19	DPY19L3 (ENSCHIG00000021524) #20	ZNF507 (ENSCHIG00000026183) #21	ENSCHIG00000020296	TSHZ3 (ENSCHIG00000015004) #22	ZNF536 (ENSCHIG00000015719) #24	URI1 (ENSCHIG00000011466) #25	CCNE1 (ENSCHIG00000024742) #26	C19orf12 (ENSCHIG00000023412) #27	PLEKHF1 (ENSCHIG00000005768)	POP4 (ENSCHIG00000016743) #28	HYDIN (ENSCHIG00000026411)	ENSCHIG00000013255	CMTR2 (ENSCHIG00000008526)	CALB2 (ENSCHIG00000019148)	TLE7 (ENSCHIG00000016108)	ENSCHIG00000016867	ZNF19 (ENSCHIG00000015453)	CHST4 (ENSCHIG00000007788)	TAT (ENSCHIG00000018390)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	5	GPATCH1 (ENSOARG00020011298)	RHPN2 (ENSOARG00020011137)	FAAP24 (ENSOARG00020011075)	CEP89 (ENSOARG00020010986)	SLC7A9 (ENSOARG00020010886)	TDRD12 (ENSOARG00020010036)	NUDT19 (ENSOARG00020018292) #16	ENSOARG00020018245	RGS9BP (ENSOARG00020018201) #17	TLCD3A (ENSOARG00020018181)	ANKRD27 (ENSOARG00020017656) #18	PDCD5 (ENSOARG00020017391) #19	DPY19L3 (ENSOARG00020017008) #20	ZNF507 (ENSOARG00020016947) #21	ENSOARG00020016916	TSHZ3 (ENSOARG00020016853) #22	ZNF536 (ENSOARG00020016711) #24	URI1 (ENSOARG00020016490) #25	CCNE1 (ENSOARG00020016006) #26	C19orf12 (ENSOARG00020015895) #27	PLEKHF1 (ENSOARG00020015872)	POP4 (ENSOARG00020015812) #28	ENSOARG00020015294	CMTR2 (ENSOARG00020015255)	CALB2 (ENSOARG00020015182)	TLE7 (ENSOARG00020015063)	ZNF23 (ENSOARG00020015007)	ZNF19 (ENSOARG00020014924)	CHST4 (ENSOARG00020014903)	TAT (ENSOARG00020014764)	ENSOARG00020014620
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00940000154509.y.b.a.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00940000157868.c	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00940000154509.y.b.a.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00940000157868.c	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007074	ENSGT00940000154509.y.b.a.a.b	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00950000186085	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00940000157868.c	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Cow	MODERN SPECIES	9	WDR88 (ENSBTAG00000031810)	GPATCH1 (ENSBTAG00000000721)	ENSBTAG00000049582	RHPN2 (ENSBTAG00000003089)	FAAP24 (ENSBTAG00000010403)	CEP89 (ENSBTAG00000004864)	SLC7A9 (ENSBTAG00000013338)	TDRD12 (ENSBTAG00000019266)	ENSBTAG00000049809	NUDT19 (ENSBTAG00000023614) #16	RGS9BP (ENSBTAG00000039441) #17	ANKRD27 (ENSBTAG00000009305) #18	PDCD5 (ENSBTAG00000009304) #19	DPY19L3 (ENSBTAG00000015165) #20	ZNF507 (ENSBTAG00000014123) #21	TSHZ3 (ENSBTAG00000002687) #22	ZNF536 (ENSBTAG00000007262) #24	URI1 (ENSBTAG00000007559) #25	CCNE1 (ENSBTAG00000004735) #26	C18H19orf12 (ENSBTAG00000020434) #27	PLEKHF1 (ENSBTAG00000008625)	POP4 (ENSBTAG00000002223) #28	ENSBTAG00000051512	CMTR2 (ENSBTAG00000047367)	CALB2 (ENSBTAG00000001075)	ZNF23 (ENSBTAG00000050281)	ZNF19 (ENSBTAG00000032018)	CHST4 (ENSBTAG00000016968)	TAT (ENSBTAG00000002214)	MARVELD3 (ENSBTAG00000007544)	PHLPP2 (ENSBTAG00000007545)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	9	WDR88 (ENSBIXG00005028616)	GPATCH1 (ENSBIXG00005028563)	RHPN2 (ENSBIXG00005004919)	ENSBIXG00005028497	FAAP24 (ENSBIXG00005002469)	CEP89 (ENSBIXG00005028440)	SLC7A9 (ENSBIXG00005004880)	TDRD12 (ENSBIXG00005028317)	ENSBIXG00005028232	RGS9BP (ENSBIXG00005028222) #17	ANKRD27 (ENSBIXG00005028194) #18	ENSBIXG00005004831	DPY19L3 (ENSBIXG00005028026) #20	ZNF507 (ENSBIXG00005027929) #21	ENSBIXG00005027900	TSHZ3 (ENSBIXG00005027810) #22	ZNF536 (ENSBIXG00005004770) #24	URI1 (ENSBIXG00005027711) #25	CCNE1 (ENSBIXG00005027655) #26	C19orf12 (ENSBIXG00005027595) #27	PLEKHF1 (ENSBIXG00005027531)	POP4 (ENSBIXG00005027514) #28	ENSBIXG00005027467	ENSBIXG00005004688	CMTR2 (ENSBIXG00005027123)	CALB2 (ENSBIXG00005027092)	TLE7 (ENSBIXG00005027053)	ZNF23 (ENSBIXG00005004631)	ZNF19 (ENSBIXG00005026993)	CHST4 (ENSBIXG00005026947)	TAT (ENSBIXG00005026937)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00940000154509.y.b.a.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00610000086095	ENSGT00940000161773	ENSGT00950000183108.b.a.a	ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162377	ENSGT00940000163278	ENSGT00940000162746	ENSGT00940000156704	ENSGT00950000183102.A.b.b
Domestic yak	MODERN SPECIES	12	WDR88 (ENSBGRG00000012742)	GPATCH1 (ENSBGRG00000012937)	RHPN2 (ENSBGRG00000013257)	ENSBGRG00000013384	FAAP24 (ENSBGRG00000013456)	CEP89 (ENSBGRG00000013711)	SLC7A9 (ENSBGRG00000014100)	TDRD12 (ENSBGRG00000014365)	NUDT19 (ENSBGRG00000015404) #16	ENSBGRG00000015627	RGS9BP (ENSBGRG00000015694) #17	ANKRD27 (ENSBGRG00000015781) #18	PDCD5 (ENSBGRG00000016600) #19	DPY19L3 (ENSBGRG00000016779) #20	ZNF507 (ENSBGRG00000017072) #21	ENSBGRG00000017301 #22	ENSBGRG00000017388	ZNF536 (ENSBGRG00000017429) #24	URI1 (ENSBGRG00000017617) #25	CCNE1 (ENSBGRG00000017848) #26	C19orf12 (ENSBGRG00000018064) #27	PLEKHF1 (ENSBGRG00000018110)	POP4 (ENSBGRG00000018144) #28	ENSBGRG00000018230	CMTR2 (ENSBGRG00000018577)	CALB2 (ENSBGRG00000018597)	TLE7 (ENSBGRG00000018847)	ZNF23 (ENSBGRG00000018887)	ZNF19 (ENSBGRG00000018945)	ENSBGRG00000019020	CHST4 (ENSBGRG00000019045)
Wild yak	MODERN SPECIES	1955																TSHZ3 (ENSBMUG00000008971) #22	ZNF536 (ENSBMUG00000008978) #24
American bison	MODERN SPECIES	3211																TSHZ3 (ENSBBBG00000004412) #22	ZNF536 (ENSBBBG00000017947) #24	URI1 (ENSBBBG00000017939) #25	CCNE1 (ENSBBBG00000017896) #26	C19orf12 (ENSBBBG00000017853) #27	PLEKHF1 (ENSBBBG00000008008)	POP4 (ENSBBBG00000017837) #28	ENSBBBG00000017818	CMTR2 (ENSBBBG00000004380)	CALB2 (ENSBBBG00000017758)	TLE7 (ENSBBBG00000017714)	ZNF23 (ENSBBBG00000017702)	ZNF19 (ENSBBBG00000017689)	CHST4 (ENSBBBG00000017670)	TAT (ENSBBBG00000017662)	ENSBBBG00000017644
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	125	GPATCH1 (ENSMMSG00000000877)	RHPN2 (ENSMMSG00000000908)	ENSMMSG00000000960	FAAP24 (ENSMMSG00000000974)	CEP89 (ENSMMSG00000001009)	SLC7A9 (ENSMMSG00000001076)	TDRD12 (ENSMMSG00000001219)	NUDT19 (ENSMMSG00000001655) #16	RGS9BP (ENSMMSG00000001664) #17	ANKRD27 (ENSMMSG00000001694) #18	PDCD5 (ENSMMSG00000001787) #19	DPY19L3 (ENSMMSG00000001821) #20	ZNF507 (ENSMMSG00000001851) #21	ENSMMSG00000001861	ENSMMSG00000001891	TSHZ3 (ENSMMSG00000001900) #22	ZNF536 (ENSMMSG00000001908) #24	URI1 (ENSMMSG00000001916) #25	CCNE1 (ENSMMSG00000001931) #26	C19orf12 (ENSMMSG00000001952) #27	POP4 (ENSMMSG00000001970) #28	HYDIN (ENSMMSG00000002047)	ENSMMSG00000002328	CMTR2 (ENSMMSG00000002352)	CALB2 (ENSMMSG00000002376)	TLE7 (ENSMMSG00000002450)	ZNF23 (ENSMMSG00000002487)	ZNF19 (ENSMMSG00000002502)	CHST4 (ENSMMSG00000002516)	TAT (ENSMMSG00000002530)	ENSMMSG00000002572
Yarkand deer	MODERN SPECIES	27	SLC7A10 (ENSCHYG00000007871)	LRP3 (ENSCHYG00000007799)	ENSCHYG00000007774	GPATCH1 (ENSCHYG00000007727)	RHPN2 (ENSCHYG00000007660)	FAAP24 (ENSCHYG00000007619)	CEP89 (ENSCHYG00000007507)	SLC7A9 (ENSCHYG00000007447)	TDRD12 (ENSCHYG00000007254)	NUDT19 (ENSCHYG00000007216) #16	RGS9BP (ENSCHYG00000007182) #17	ANKRD27 (ENSCHYG00000006798) #18	PDCD5 (ENSCHYG00000006657) #19	DPY19L3 (ENSCHYG00000006514) #20	ZNF507 (ENSCHYG00000006472) #21	TSHZ3 (ENSCHYG00000006419) #22	ZNF536 (ENSCHYG00000006308) #24	ENSCHYG00000006259	URI1 (ENSCHYG00000006211) #25	CCNE1 (ENSCHYG00000006119) #26	C19orf12 (ENSCHYG00000006082) #27	PLEKHF1 (ENSCHYG00000006065)	ENSCHYG00000006027 #28	ENSCHYG00000006005	ENSCHYG00000005945	CMTR2 (ENSCHYG00000005918)	CALB2 (ENSCHYG00000005859)	TLE7 (ENSCHYG00000005818)	ZNF23 (ENSCHYG00000024101)	ZNF19 (ENSCHYG00000024051)	TAT (ENSCHYG00000024008)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.sb.b #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00760000120431	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.sb.b #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.sb.b #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370.i	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.sb.b #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370.i	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.tb #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370.i	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Beluga whale	MODERN SPECIES	14	ENSDLEG00000000950	GPATCH1 (ENSDLEG00000000964)	RHPN2 (ENSDLEG00000000997)	FAAP24 (ENSDLEG00000001028)	CEP89 (ENSDLEG00000001045)	ENSDLEG00000001076	SLC7A9 (ENSDLEG00000001083)	ENSDLEG00000001110	TDRD12 (ENSDLEG00000001176)	NUDT19 (ENSDLEG00000001447) #16	RGS9BP (ENSDLEG00000001457) #17	ANKRD27 (ENSDLEG00000001495) #18	ENSDLEG00000001621 #19	DPY19L3 (ENSDLEG00000001647) #20	ZNF507 (ENSDLEG00000001695) #21	TSHZ3 (ENSDLEG00000001711) #22	ZNF536 (ENSDLEG00000001724) #24	URI1 (ENSDLEG00000001739) #25	CCNE1 (ENSDLEG00000001752) #26	CUNH19orf12 (ENSDLEG00000001761) #27	POP4 (ENSDLEG00000001765) #28	VSTM2B (ENSDLEG00000001777) #29	UQCRFS1 (ENSDLEG00000001783) #30
Narwhal	MODERN SPECIES	296	WDR88 (ENSMMNG00015002263)	GPATCH1 (ENSMMNG00015002182)	RHPN2 (ENSMMNG00015002110)	FAAP24 (ENSMMNG00015002077)	ENSMMNG00015002056	CEP89 (ENSMMNG00015001947)	ENSMMNG00015001894	SLC7A9 (ENSMMNG00015001863)	TDRD12 (ENSMMNG00015001768)	NUDT19 (ENSMMNG00015001712) #16	RGS9BP (ENSMMNG00015001697) #17	ANKRD27 (ENSMMNG00015001650) #18	PDCD5 (ENSMMNG00015001602) #19	DPY19L3 (ENSMMNG00015001544) #20	ZNF507 (ENSMMNG00015001504) #21	TSHZ3 (ENSMMNG00015001458) #22	ZNF536 (ENSMMNG00015001436) #24	URI1 (ENSMMNG00015001385) #25	CCNE1 (ENSMMNG00015001304) #26	C19orf12 (ENSMMNG00015001260) #27	PLEKHF1 (ENSMMNG00015001239)	POP4 (ENSMMNG00015001208) #28	VSTM2B (ENSMMNG00015001182) #29	UQCRFS1 (ENSMMNG00015001165) #30	SHCBP1 (ENSMMNG00015001117)	VPS35 (ENSMMNG00015001063)	ENSMMNG00015001005	MYLK3 (ENSMMNG00015000932)	C16orf87 (ENSMMNG00015000869)	GPT2 (ENSMMNG00015000815)	DNAJA2 (ENSMMNG00015000782)
Vaquita	MODERN SPECIES	10	LRP3 (ENSPSNG00000019712)	WDR88 (ENSPSNG00000019754)	GPATCH1 (ENSPSNG00000019894)	RHPN2 (ENSPSNG00000019928)	FAAP24 (ENSPSNG00000019954)	CEP89 (ENSPSNG00000019994)	ENSPSNG00000020046	SLC7A9 (ENSPSNG00000020070)	TDRD12 (ENSPSNG00000020182)	NUDT19 (ENSPSNG00000020373) #16	RGS9BP (ENSPSNG00000020384) #17	ANKRD27 (ENSPSNG00000020465) #18	ENSPSNG00000020582 #19	DPY19L3 (ENSPSNG00000020640) #20	ZNF507 (ENSPSNG00000020685) #21	TSHZ3 (ENSPSNG00000020733) #22	ZNF536 (ENSPSNG00000020763) #24	URI1 (ENSPSNG00000020804) #25	CCNE1 (ENSPSNG00000020886) #26	C19orf12 (ENSPSNG00000020941) #27	PLEKHF1 (ENSPSNG00000020975)	POP4 (ENSPSNG00000020993) #28	VSTM2B (ENSPSNG00000021024) #29	UQCRFS1 (ENSPSNG00000021044) #30	SHCBP1 (ENSPSNG00000021057)	VPS35 (ENSPSNG00000021085)	ENSPSNG00000021135	MYLK3 (ENSPSNG00000021168)	C16orf87 (ENSPSNG00000021234)	GPT2 (ENSPSNG00000021261)	DNAJA2 (ENSPSNG00000021284)
Dolphin	MODERN SPECIES	4510																TSHZ3 (ENSTTRG00000007910) #22
Sperm whale	MODERN SPECIES	8	WDR88 (ENSPCTG00005014581)	GPATCH1 (ENSPCTG00005014911)	RHPN2 (ENSPCTG00005014981)	ENSPCTG00005015197	FAAP24 (ENSPCTG00005015251)	CEP89 (ENSPCTG00005015339)	SLC7A9 (ENSPCTG00005015420)	TDRD12 (ENSPCTG00005015644)	NUDT19 (ENSPCTG00005016540) #16	RGS9BP (ENSPCTG00005016564) #17	ANKRD27 (ENSPCTG00005016618) #18	PDCD5 (ENSPCTG00005016856) #19	DPY19L3 (ENSPCTG00005017005) #20	ZNF507 (ENSPCTG00005017138) #21	ENSPCTG00005017174	TSHZ3 (ENSPCTG00005017204) #22	ZNF536 (ENSPCTG00005017245) #24	URI1 (ENSPCTG00005017313) #25	ENSPCTG00005017597	CCNE1 (ENSPCTG00005017668) #26	C17H19orf12 (ENSPCTG00005017766) #27	PLEKHF1 (ENSPCTG00005017836)	POP4 (ENSPCTG00005017854) #28	VSTM2B (ENSPCTG00005017910) #29	ENSPCTG00005017977 #30	ENSPCTG00005018104	ENSPCTG00005018116	SHCBP1 (ENSPCTG00005018139)	MYLK3 (ENSPCTG00005018229)	ORC6 (ENSPCTG00005018581)	C16orf87 (ENSPCTG00005018678)
Blue whale	MODERN SPECIES	10	LRP3 (ENSBMSG00010017500)	WDR88 (ENSBMSG00010017527)	GPATCH1 (ENSBMSG00010017658)	RHPN2 (ENSBMSG00010017698)	FAAP24 (ENSBMSG00010017784)	CEP89 (ENSBMSG00010017830)	SLC7A9 (ENSBMSG00010017871)	ENSBMSG00010017925	NUDT19 (ENSBMSG00010017985) #16	RGS9BP (ENSBMSG00010017993) #17	ANKRD27 (ENSBMSG00010018041) #18	ENSBMSG00010018205 #19	DPY19L3 (ENSBMSG00010018255) #20	ZNF507 (ENSBMSG00010018417) #21	ENSBMSG00010018457	TSHZ3 (ENSBMSG00010018482) #22	ZNF536 (ENSBMSG00010018499) #24	URI1 (ENSBMSG00010018529) #25	CCNE1 (ENSBMSG00010018593) #26	ENSBMSG00010018694 #27	PLEKHF1 (ENSBMSG00010018715)	POP4 (ENSBMSG00010018728) #28	VSTM2B (ENSBMSG00010018756) #29	UQCRFS1 (ENSBMSG00010018781) #30	SHCBP1 (ENSBMSG00010018800)	ENSBMSG00010018825	VPS35 (ENSBMSG00010018847)	ORC6 (ENSBMSG00010018899)	MYLK3 (ENSBMSG00010018990)	C16orf87 (ENSBMSG00010019068)	GPT2 (ENSBMSG00010019103)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.i #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.d #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.i #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.d #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	198			ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000010067.h #28	ENSGT00390000009077.j.a.b #27
American black bear	MODERN SPECIES	340																TSHZ3 (ENSUAMG00000019097) #22
Polar bear	MODERN SPECIES	155				SLC7A10 (ENSUMAG00000014779)	WDR88 (ENSUMAG00000014767)	GPATCH1 (ENSUMAG00000014645)	RHPN2 (ENSUMAG00000014602)	FAAP24 (ENSUMAG00000014600)	CEP89 (ENSUMAG00000014588)	SLC7A9 (ENSUMAG00000014340)	TDRD12 (ENSUMAG00000014314)	ANKRD27 (ENSUMAG00000013702) #18	PDCD5 (ENSUMAG00000013611) #19	DPY19L3 (ENSUMAG00000013572) #20	ZNF507 (ENSUMAG00000013564) #21	TSHZ3 (ENSUMAG00000013540) #22	ZNF536 (ENSUMAG00000013502) #24	URI1 (ENSUMAG00000013495) #25	ENSUMAG00000013491	CCNE1 (ENSUMAG00000013484) #26	ENSUMAG00000013482 #28	ENSUMAG00000013478 #27	ENSUMAG00000013469 #27
Giant Panda	MODERN SPECIES	3	SLC7A10 (ENSAMEG00000008261)	LRP3 (ENSAMEG00000024584)	WDR88 (ENSAMEG00000008257)	GPATCH1 (ENSAMEG00000015575)	RHPN2 (ENSAMEG00000015528)	FAAP24 (ENSAMEG00000015524)	CEP89 (ENSAMEG00000015514)	SLC7A9 (ENSAMEG00000015459)	ENSAMEG00000009847	NUDT19 (ENSAMEG00000009842) #16	RGS9BP (ENSAMEG00000028432) #17	ANKRD27 (ENSAMEG00000009784) #18	PDCD5 (ENSAMEG00000009766) #19	DPY19L3 (ENSAMEG00000009748) #20	ZNF507 (ENSAMEG00000009742) #21	TSHZ3 (ENSAMEG00000009733) #22	ZNF536 (ENSAMEG00000009725) #24	URI1 (ENSAMEG00000009637) #25	ENSAMEG00000007309	CCNE1 (ENSAMEG00000009668) #26	ENSAMEG00000030806 #27	PLEKHF1 (ENSAMEG00000019032)	ENSAMEG00000003172 #28	ENSAMEG00000027559	VSTM2B (ENSAMEG00000027962) #29	ENSAMEG00000018330 #30	ENSAMEG00000018332	ENSAMEG00000018344	ORC6 (ENSAMEG00000018347)	MYLK3 (ENSAMEG00000000866)	C16orf87 (ENSAMEG00000000887)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.i #27	ENSGT00940000160728
Ferret	MODERN SPECIES	272	SLC7A10 (ENSMPUG00000007598)	LRP3 (ENSMPUG00000007608)	WDR88 (ENSMPUG00000007632)	GPATCH1 (ENSMPUG00000007658)	RHPN2 (ENSMPUG00000007671)	FAAP24 (ENSMPUG00000007678)	CEP89 (ENSMPUG00000007682)	SLC7A9 (ENSMPUG00000007696)	TDRD12 (ENSMPUG00000007791)	NUDT19 (ENSMPUG00000007814) #16	RGS9BP (ENSMPUG00000018943) #17	ANKRD27 (ENSMPUG00000007821) #18	PDCD5 (ENSMPUG00000007931) #19	DPY19L3 (ENSMPUG00000007958) #20	ZNF507 (ENSMPUG00000007979) #21	TSHZ3 (ENSMPUG00000007986) #22	ZNF536 (ENSMPUG00000007989) #24	ENSMPUG00000007994	URI1 (ENSMPUG00000008002) #25	ENSMPUG00000008009	CCNE1 (ENSMPUG00000008012) #26	ENSMPUG00000008025 #27	PLEKHF1 (ENSMPUG00000018950)	ENSMPUG00000008033	ENSMPUG00000008041 #28	ENSMPUG00000008050	ENSMPUG00000008056 #27	ENSMPUG00000008063 #28	ENSMPUG00000008129 #27	ENSMPUG00000008141 #28	VSTM2B (ENSMPUG00000008146) #29
American mink	MODERN SPECIES	95	SLC7A10 (ENSNVIG00000019536)	LRP3 (ENSNVIG00000019559)	WDR88 (ENSNVIG00000019568)	GPATCH1 (ENSNVIG00000019604)	RHPN2 (ENSNVIG00000019645)	FAAP24 (ENSNVIG00000019668)	CEP89 (ENSNVIG00000019683)	SLC7A9 (ENSNVIG00000019724)	ENSNVIG00000019776	NUDT19 (ENSNVIG00000019811) #16	RGS9BP (ENSNVIG00000019820) #17	ANKRD27 (ENSNVIG00000019825) #18	PDCD5 (ENSNVIG00000019867) #19	D19L3 (ENSNVIG00000019918) #20	ZNF507 (ENSNVIG00000019975) #21	TSHZ3 (ENSNVIG00000019995) #22	ZNF536 (ENSNVIG00000020006) #24	URI1 (ENSNVIG00000020030) #25	CCNE1 (ENSNVIG00000020059) #26	ENSNVIG00000020090 #27	PLEKHF1 (ENSNVIG00000020098)	ENSNVIG00000020103 #28	ENSNVIG00000020109 #27
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00940000169413	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00950000186085	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30
Dingo	MODERN SPECIES	125	LRP3 (ENSCAFG00020019720)	GPATCH1 (ENSCAFG00020019731)	RHPN2 (ENSCAFG00020019742)	ENSCAFG00020019744	ENSCAFG00020019747	CEP89 (ENSCAFG00020019752)	SLC7A9 (ENSCAFG00020019778)	TDRD12 (ENSCAFG00020019790)	NUDT19 (ENSCAFG00020019828) #16	RGS9BP (ENSCAFG00020019830) #17	ANKRD27 (ENSCAFG00020019831) #18	ENSCAFG00020019841 #19	DPY19L3 (ENSCAFG00020019865) #20	ZNF507 (ENSCAFG00020019878) #21	ENSCAFG00020019907	TSHZ3 (ENSCAFG00020019912) #22	ENSCAFG00020019927 #24	URI1 (ENSCAFG00020019949) #25	ENSCAFG00020019950	CCNE1 (ENSCAFG00020019952) #26	C19orf12 (ENSCAFG00020019957) #27	PLEKHF1 (ENSCAFG00020019960)	ENSCAFG00020019964 #28	VSTM2B (ENSCAFG00020019965) #29	UQCRFS1 (ENSCAFG00020019969) #30	ENSCAFG00020019987
Dog	MODERN SPECIES		LRP3 (ENSCAFG00845000195)	WDR88 (ENSCAFG00845000209)	GPATCH1 (ENSCAFG00845000257)	RHPN2 (ENSCAFG00845000287)	FAAP24 (ENSCAFG00845000331)	CEP89 (ENSCAFG00845000371)	SLC7A9 (ENSCAFG00845000428)	TDRD12 (ENSCAFG00845000471)	NUDT19 (ENSCAFG00845000516) #16	ENSCAFG00845000530	RGS9BP (ENSCAFG00845000547) #17	ANKRD27 (ENSCAFG00845000589) #18	ENSCAFG00845000680 #19	DPY19L3 (ENSCAFG00845000789) #20	ZNF507 (ENSCAFG00845000880) #21	TSHZ3 (ENSCAFG00845000908) #22	ZNF536 (ENSCAFG00845000976) #24	URI1 (ENSCAFG00845001063) #25	CCNE1 (ENSCAFG00845001129) #26	C19orf12 (ENSCAFG00845001166) #27	PLEKHF1 (ENSCAFG00845001176)	POP4 (ENSCAFG00845001208) #28	ENSCAFG00845001253 #29	UQCRFS1 (ENSCAFG00845001274) #30
Red fox	MODERN SPECIES	80	CEBPA (ENSVVUG00000016555)	SLC7A10 (ENSVVUG00000016564)	ENSVVUG00000016565	WDR88 (ENSVVUG00000016568)	GPATCH1 (ENSVVUG00000016572)	RHPN2 (ENSVVUG00000016587)	FAAP24 (ENSVVUG00000016604)	CEP89 (ENSVVUG00000016607)	SLC7A9 (ENSVVUG00000016626)	TDRD12 (ENSVVUG00000016637)	ENSVVUG00000016685 #17	ANKRD27 (ENSVVUG00000016689) #18	ENSVVUG00000016712 #19	DPY19L3 (ENSVVUG00000016714) #20	ZNF507 (ENSVVUG00000016742) #21	TSHZ3 (ENSVVUG00000016783) #22	ZNF536 (ENSVVUG00000016804) #24	URI1 (ENSVVUG00000016834) #25	CCNE1 (ENSVVUG00000016850) #26	CUNH19orf12 (ENSVVUG00000016868) #27	PLEKHF1 (ENSVVUG00000016871)	ENSVVUG00000016876 #28	ENSVVUG00000016882
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Donkey	MODERN SPECIES	18	GPATCH1 (ENSEASG00005021162)	RHPN2 (ENSEASG00005021118)	FAAP24 (ENSEASG00005025311)	CEP89 (ENSEASG00005021099)	ENSEASG00005021086	SLC7A9 (ENSEASG00005021090)	TDRD12 (ENSEASG00005021053)	NUDT19 (ENSEASG00005033299) #16	RGS9BP (ENSEASG00005021029) #17	ANKRD27 (ENSEASG00005021017) #18	PDCD5 (ENSEASG00005026088) #19	ENSEASG00005033053	DPY19L3 (ENSEASG00005021008) #20	ENSEASG00005034115 #20	ZNF507 (ENSEASG00005020999) #21	TSHZ3 (ENSEASG00005020984) #22	ZNF536 (ENSEASG00005020978) #24	URI1 (ENSEASG00005020967) #25	CCNE1 (ENSEASG00005020958) #26	C19orf12 (ENSEASG00005033066) #27	PLEKHF1 (ENSEASG00005026468)	POP4 (ENSEASG00005024499) #28	VSTM2B (ENSEASG00005020939) #29	ENSEASG00005020935 #30	ENSEASG00005029138	ENSEASG00005024864	ENSEASG00005029556	ENSEASG00005025675
Horse	MODERN SPECIES	1	LRP3 (ENSECAG00000010409)	WDR88 (ENSECAG00000008371)	GPATCH1 (ENSECAG00000022743)	RHPN2 (ENSECAG00000010312)	FAAP24 (ENSECAG00000008757)	CEP89 (ENSECAG00000020513)	ENSECAG00000049232	SLC7A9 (ENSECAG00000009914)	TDRD12 (ENSECAG00000037516)	NUDT19 (ENSECAG00000045404) #16	ANKRD27 (ENSECAG00000019736) #18	PDCD5 (ENSECAG00000019406) #19	ENSECAG00000037924	DPY19L3 (ENSECAG00000000212) #20	ZNF507 (ENSECAG00000017052) #21	TSHZ3 (ENSECAG00000016274) #22	ENSECAG00000015459	ZNF536 (ENSECAG00000013732) #24	URI1 (ENSECAG00000007717) #25	CCNE1 (ENSECAG00000021289) #26	C10H19orf12 (ENSECAG00000021258) #27	PLEKHF1 (ENSECAG00000039032)	POP4 (ENSECAG00000020206) #28	VSTM2B (ENSECAG00000026831) #29	UQCRFS1 (ENSECAG00000004824) #30
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	21														ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Megabat	MODERN SPECIES	243																TSHZ3 (ENSPVAG00000003220) #22
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000159115	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000003058.b.a.b	ENSGT00390000007852	ENSGT00940000158841	ENSGT00390000015057	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT00940000158102	ENSGT00390000014546	ENSGT00950000182832.D.a	ENSGT00940000159615	ENSGT00940000160442	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Microbat	MODERN SPECIES	1522																TSHZ3 (ENSMLUG00000029075) #22
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	6	TUBB3 (ENSRFEG00010011101)	MC1R (ENSRFEG00010011233)	TCF25 (ENSRFEG00010011256)	SPIRE2 (ENSRFEG00010011334)	FANCA (ENSRFEG00010011772)	ZNF276 (ENSRFEG00010011958)	VPS9D1 (ENSRFEG00010011985)	SPATA2L (ENSRFEG00010012009)	CDK10 (ENSRFEG00010012042)	ENSRFEG00010012104	CHMP1A (ENSRFEG00010012202)	DPEP1 (ENSRFEG00010012303)	ENSRFEG00010012352	DPY19L3 (ENSRFEG00010012453) #20	ZNF507 (ENSRFEG00010012577) #21	TSHZ3 (ENSRFEG00010012616) #22	ZNF536 (ENSRFEG00010012717) #24	URI1 (ENSRFEG00010012794) #25	CCNE1 (ENSRFEG00010012966) #26	C19orf12 (ENSRFEG00010013119) #27	PLEKHF1 (ENSRFEG00010013255)	POP4 (ENSRFEG00010013270) #28	VSTM2B (ENSRFEG00010013347) #29	UQCRFS1 (ENSRFEG00010013392) #30	SHCBP1 (ENSRFEG00010013445)	VPS35 (ENSRFEG00010013687)	ORC6 (ENSRFEG00010013754)	MYLK3 (ENSRFEG00010013868)	C16orf87 (ENSRFEG00010013924)	GPT2 (ENSRFEG00010014039)	DNAJA2 (ENSRFEG00010014129)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	24			ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000160676	ENSGT00940000162646	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00940000154688.b
Elephant	MODERN SPECIES	393	CEBPA (ENSLAFG00000030435)	LRP3 (ENSLAFG00000027575)	WDR88 (ENSLAFG00000013599)	GPATCH1 (ENSLAFG00000013589)	RHPN2 (ENSLAFG00000013586)	FAAP24 (ENSLAFG00000006401)	CEP89 (ENSLAFG00000006394)	SLC7A9 (ENSLAFG00000008707)	TDRD12 (ENSLAFG00000008698)	NUDT19 (ENSLAFG00000032048) #16	RGS9BP (ENSLAFG00000008696) #17	ANKRD27 (ENSLAFG00000013926) #18	PDCD5 (ENSLAFG00000013922) #19	DPY19L3 (ENSLAFG00000011171) #20	ZNF507 (ENSLAFG00000018078) #21	TSHZ3 (ENSLAFG00000000905) #22	ZNF536 (ENSLAFG00000017731) #24	URI1 (ENSLAFG00000014350) #25	CCNE1 (ENSLAFG00000011876) #26	C19orf12 (ENSLAFG00000021383) #27	PLEKHF1 (ENSLAFG00000030466)	POP4 (ENSLAFG00000000084) #28	VSTM2B (ENSLAFG00000011112) #29	UQCRFS1 (ENSLAFG00000002797) #30	ENSLAFG00000029634	SHCBP1 (ENSLAFG00000030123)	VPS35 (ENSLAFG00000001705)	ORC6 (ENSLAFG00000001707)	MYLK3 (ENSLAFG00000001709)	C16orf87 (ENSLAFG00000009006)	GPT2 (ENSLAFG00000016529)
Hyrax	MODERN SPECIES	1692																ENSPCAG00000011413 #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	275			ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22
Armadillo	MODERN SPECIES	3335	WDR88 (ENSDNOG00000019863)	ENSDNOG00000042043	GPATCH1 (ENSDNOG00000005291)	RHPN2 (ENSDNOG00000014140)	ENSDNOG00000014134	CEP89 (ENSDNOG00000045063)	SLC7A9 (ENSDNOG00000044029)	TDRD12 (ENSDNOG00000017244)	NUDT19 (ENSDNOG00000044256) #16	RGS9BP (ENSDNOG00000004034) #17	ANKRD27 (ENSDNOG00000004014) #18	PDCD5 (ENSDNOG00000004010) #19	ENSDNOG00000033818	DPY19L3 (ENSDNOG00000009405) #20	ZNF507 (ENSDNOG00000009394) #21	TSHZ3 (ENSDNOG00000013222) #22
Sloth	MODERN SPECIES	1892																ENSCHOG00000002113 #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.n #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000039982	RHPN2 (ENSMODG00000012240)	FAAP24 (ENSMODG00000012243)	CEP89 (ENSMODG00000012246)	ENSMODG00000050814	SLC7A9 (ENSMODG00000012256)	TDRD12 (ENSMODG00000012286)	ENSMODG00000012288 #16	ENSMODG00000038175	RGS9BP (ENSMODG00000023490) #17	ANKRD27 (ENSMODG00000012322) #18	ENSMODG00000012326 #19	DPY19L3 (ENSMODG00000012361) #20	ENSMODG00000028628	ZNF507 (ENSMODG00000012367) #21	TSHZ3 (ENSMODG00000012390) #22	ZNF536 (ENSMODG00000012653) #24	URI1 (ENSMODG00000012675) #25	ENSMODG00000012680 #26	C19orf12 (ENSMODG00000012696) #27	PLEKHF1 (ENSMODG00000023488)	POP4 (ENSMODG00000029406) #28	ENSMODG00000037821 #29	ENSMODG00000012703 #29	ENSMODG00000038837	UQCRFS1 (ENSMODG00000012709) #30	ENSMODG00000023487	SHCBP1 (ENSMODG00000012749)	ENSMODG00000042100	VPS35 (ENSMODG00000012784)	ORC6 (ENSMODG00000012795)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.n #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085.n #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021.e #18	ENSGT00390000011085.n #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Common wonbat	MODERN SPECIES	1024	ENSVURG00010011001	ENSVURG00010011018	ENSVURG00010011034	ENSVURG00010011054	ENSVURG00010011149	ENSVURG00010011153	ENSVURG00010011177	ENSVURG00010011228 #16	ENSVURG00010011234 #17	ENSVURG00010011246 #18	ENSVURG00010011291 #19	ENSVURG00010011334 #20	ENSVURG00010011340 #21	ENSVURG00010011374	ENSVURG00010011385	TSHZ3 (ENSVURG00010011394) #22	ZNF536 (ENSVURG00010011415) #24	URI1 (ENSVURG00010011452) #25	CCNE1 (ENSVURG00010011492) #26	C19orf12 (ENSVURG00010012490) #27	PLEKHF1 (ENSVURG00010012501)	POP4 (ENSVURG00010012509) #28	VSTM2B (ENSVURG00010012523) #29	UQCRFS1 (ENSVURG00010012533) #30	SHCBP1 (ENSVURG00010012550)	ENSVURG00010012592	VPS35 (ENSVURG00010012859)	ORC6 (ENSVURG00010012881)	C16orf87 (ENSVURG00010012890)	ENSVURG00010012900	GPT2 (ENSVURG00010012907)
koala	MODERN SPECIES	19	LRP3 (ENSPCIG00000009598)	ENSPCIG00000021005	GPATCH1 (ENSPCIG00000021003)	RHPN2 (ENSPCIG00000020997)	FAAP24 (ENSPCIG00000021002)	ENSPCIG00000021000	SLC7A9 (ENSPCIG00000020995)	TDRD12 (ENSPCIG00000020993)	ENSPCIG00000020992 #16	RGS9BP (ENSPCIG00000020990) #17	ANKRD27 (ENSPCIG00000020984) #18	ENSPCIG00000020982 #19	DPY19L3 (ENSPCIG00000000890) #20	ZNF507 (ENSPCIG00000001104) #21	ENSPCIG00000011864	TSHZ3 (ENSPCIG00000014075) #22	ENSPCIG00000035300	ZNF536 (ENSPCIG00000017559) #24	URI1 (ENSPCIG00000017561) #25	ENSPCIG00000017562	ENSPCIG00000017564 #26	C19orf12 (ENSPCIG00000034142) #27	PLEKHF1 (ENSPCIG00000024734)	POP4 (ENSPCIG00000024738) #28	VSTM2B (ENSPCIG00000024740) #29	UQCRFS1 (ENSPCIG00000024743) #30	SHCBP1 (ENSPCIG00000015536)	ENSPCIG00000018612	VPS35 (ENSPCIG00000018597)	ORC6 (ENSPCIG00000018588)	MYLK3 (ENSPCIG00000018586)
Wallaby	MODERN SPECIES	2961																TSHZ3 (ENSMEUG00000008737) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	LRP3 (ENSSHAG00000015576)	ENSSHAG00000023131	GPATCH1 (ENSSHAG00000016016)	ENSSHAG00000021461	RHPN2 (ENSSHAG00000016222)	FAAP24 (ENSSHAG00000016372)	CEP89 (ENSSHAG00000026537)	ENSSHAG00000026384	SLC7A9 (ENSSHAG00000000814)	TDRD12 (ENSSHAG00000022785)	ANKRD27 (ENSSHAG00000005784) #18	RGS9BP (ENSSHAG00000005364) #17	PDCD5 (ENSSHAG00000029718) #19	DPY19L3 (ENSSHAG00000009113) #20	ZNF507 (ENSSHAG00000010139) #21	TSHZ3 (ENSSHAG00000006124) #22	ZNF536 (ENSSHAG00000013353) #24	URI1 (ENSSHAG00000015726) #25	C19orf12 (ENSSHAG00000028773) #27	ENSSHAG00000016239 #26	ENSSHAG00000022898	POP4 (ENSSHAG00000028432) #28	ENSSHAG00000024076 #29	ENSSHAG00000017804 #30	ENSSHAG00000024152	ENSSHAG00000018876	ENSSHAG00000002563	ENSSHAG00000003156	ORC6 (ENSSHAG00000004207)	MYLK3 (ENSSHAG00000004502)	C16orf87 (ENSSHAG00000029891)
Platypus	MODERN SPECIES	2	LRP3 (ENSOANG00000012736)	ENSOANG00000050528	GPATCH1 (ENSOANG00000012732)	RHPN2 (ENSOANG00000012731)	FAAP24 (ENSOANG00000038390)	ENSOANG00000012729	CEP89 (ENSOANG00000012728)	SLC7A9 (ENSOANG00000012726)	TDRD12 (ENSOANG00000029442)	ENSOANG00000012725 #16	ENSOANG00000049435	ANKRD27 (ENSOANG00000012724) #18	PDCD5 (ENSOANG00000040196) #19	ENSOANG00000037295	ZNF507 (ENSOANG00000002786) #21	TSHZ3 (ENSOANG00000002785) #22	ZNF536 (ENSOANG00000002991) #24	ENSOANG00000002990 #25	CCNE1 (ENSOANG00000014148) #26	ENSOANG00000000737	C19orf12 (ENSOANG00000044469) #27	PLEKHF1 (ENSOANG00000002290)	POP4 (ENSOANG00000020512) #28	ENSOANG00000051058 #29	UQCRFS1 (ENSOANG00000002291) #30	SHCBP1 (ENSOANG00000005202)	VPS35 (ENSOANG00000002249)	ENSOANG00000003660	C16orf87 (ENSOANG00000002163)	GPT2 (ENSOANG00000038755)	ENSOANG00000040349
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077.jb #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077.jb.a #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077.jb.a #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847.b	ENSGT00420000029847.a	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077.jb.a #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847.a	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.jb.a #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156469	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847.a	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000009077.jb.a #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	120	ENSPTXG00000008214	ENSPTXG00000008216	ENSPTXG00000008220	ENSPTXG00000008223	ENSPTXG00000008224	ENSPTXG00000008225	ENSPTXG00000008226	ENSPTXG00000008227	ENSPTXG00000008230	ENSPTXG00000008238 #16	ENSPTXG00000008239 #17	ENSPTXG00000008241 #18	ENSPTXG00000008242 #19	ENSPTXG00000008243 #20	ENSPTXG00000008279 #21	ENSPTXG00000008280 #22
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	119	ENSPTXG00000018218	ENSPTXG00000018220	ENSPTXG00000018221	ENSPTXG00000018225	ENSPTXG00000018226	ENSPTXG00000018227	ENSPTXG00000018228	ENSPTXG00000018229	ENSPTXG00000018230	ENSPTXG00000018231 #16	ENSPTXG00000018232 #17	ENSPTXG00000018233 #18	ENSPTXG00000007825 #19	ENSPTXG00000007826 #20	ENSPTXG00000007827 #21	ENSPTXG00000007828 #22
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	79	EXOSC6 (ENSNSUG00000012895)	SLC7A10 (ENSNSUG00000012892)	LRP3 (ENSNSUG00000012762)	GPATCH1 (ENSNSUG00000012761)	RHPN2 (ENSNSUG00000012760)	FAAP24 (ENSNSUG00000012759)	ENSNSUG00000012758	SLC7A9 (ENSNSUG00000012757)	TDRD12 (ENSNSUG00000012756)	NUDT19 (ENSNSUG00000012755) #16	RGS9BP (ENSNSUG00000012754) #17	ANKRD27 (ENSNSUG00000012753) #18	PDCD5 (ENSNSUG00000012752) #19	DPY19L3 (ENSNSUG00000012720) #20	ZNF507 (ENSNSUG00000012719) #21	TSHZ3 (ENSNSUG00000012718) #22	ZNF536 (ENSNSUG00000012717) #24	URI1 (ENSNSUG00000012716) #25	CCNE1 (ENSNSUG00000012715) #26	ENSNSUG00000012714 #27	PLEKHF1 (ENSNSUG00000012713)	POP4 (ENSNSUG00000012712) #28	VSTM2B (ENSNSUG00000012711) #29	UQCRFS1 (ENSNSUG00000012710) #30	SHCBP1 (ENSNSUG00000012709)	ENSNSUG00000012694	VPS35 (ENSNSUG00000012693)	ORC6 (ENSNSUG00000012692)	MYLK3 (ENSNSUG00000012691)	C16orf87 (ENSNSUG00000012690)	GPT2 (ENSNSUG00000012561)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	6914																TSHZ3 (ENSLLTG00000016658) #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	12	SLC7A10 (ENSNNAG00000016186)	LRP3 (ENSNNAG00000016228)	GPATCH1 (ENSNNAG00000016248)	FAAP24 (ENSNNAG00000016259)	RHPN2 (ENSNNAG00000016305)	CEP89 (ENSNNAG00000016646)	ENSNNAG00000016664	SLC7A9 (ENSNNAG00000016683)	TDRD12 (ENSNNAG00000016697)	NUDT19 (ENSNNAG00000016812) #16	RGS9BP (ENSNNAG00000016817) #17	ANKRD27 (ENSNNAG00000016829) #18	PDCD5 (ENSNNAG00000010137) #19	DPY19L3 (ENSNNAG00000010209) #20	ZNF507 (ENSNNAG00000011046) #21	TSHZ3 (ENSNNAG00000011079) #22	ZNF536 (ENSNNAG00000011087) #24	URI1 (ENSNNAG00000011117) #25	CCNE1 (ENSNNAG00000011156) #26	ENSNNAG00000011184	C19orf12 (ENSNNAG00000011209) #27	PLEKHF1 (ENSNNAG00000011243)	POP4 (ENSNNAG00000011255) #28	VSTM2B (ENSNNAG00000011284) #29	UQCRFS1 (ENSNNAG00000011334) #30	SHCBP1 (ENSNNAG00000011347)	ENSNNAG00000011400	VPS35 (ENSNNAG00000011604)	ORC6 (ENSNNAG00000011683)	MYLK3 (ENSNNAG00000011712)	GPT2 (ENSNNAG00000011858)
Lizard	MODERN SPECIES	913																TSHZ3 (ENSACAG00000037758) #22	ENSACAG00000043032	ZNF536 (ENSACAG00000012257) #24	ENSACAG00000038297	ENSACAG00000042574	URI1 (ENSACAG00000012186) #25	CCNE1 (ENSACAG00000014781) #26	ENSACAG00000029452	ENSACAG00000039719 #27
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077.jb.a #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Common wall lizard	MODERN SPECIES	16	RHPN2 (ENSPMRG00000020259)	FAAP24 (ENSPMRG00000020254)	ENSPMRG00000020249	CEP89 (ENSPMRG00000020236)	ENSPMRG00000020207	ENSPMRG00000020010	TDRD12 (ENSPMRG00000019898)	NUDT19 (ENSPMRG00000019876) #16	RGS9BP (ENSPMRG00000019872) #17	ANKRD27 (ENSPMRG00000019851) #18	PDCD5 (ENSPMRG00000019845) #19	ENSPMRG00000019807	DPY19L3 (ENSPMRG00000019792) #20	ZNF507 (ENSPMRG00000019776) #21	ENSPMRG00000019771	TSHZ3 (ENSPMRG00000019765) #22	ZNF536 (ENSPMRG00000019756) #24	URI1 (ENSPMRG00000019743) #25	CCNE1 (ENSPMRG00000019724) #26	ENSPMRG00000019707	ENSPMRG00000019704 #27	ENSPMRG00000019700 #27	ENSPMRG00000019691 #27	PLEKHF1 (ENSPMRG00000019684)	POP4 (ENSPMRG00000019675) #28	VSTM2B (ENSPMRG00000019668) #29	ENSPMRG00000019664	UQCRFS1 (ENSPMRG00000019661) #30	SHCBP1 (ENSPMRG00000019652)	ENSPMRG00000019644	VPS35 (ENSPMRG00000019631)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	86	ENSSMRG00000017112	ENSSMRG00000017115	ENSSMRG00000017118	FAAP24 (ENSSMRG00000017123)	CEP89 (ENSSMRG00000017126)	ENSSMRG00000017132	SLC7A9 (ENSSMRG00000017135)	TDRD12 (ENSSMRG00000017139)	NUDT19 (ENSSMRG00000017151) #16	RGS9BP (ENSSMRG00000017152) #17	ANKRD27 (ENSSMRG00000017154) #18	PDCD5 (ENSSMRG00000017156) #19	ENSSMRG00000017159	DPY19L3 (ENSSMRG00000017164) #20	ZNF507 (ENSSMRG00000017166) #21	TSHZ3 (ENSSMRG00000017169) #22	ZNF536 (ENSSMRG00000017174) #24	URI1 (ENSSMRG00000017182) #25	CCNE1 (ENSSMRG00000017186) #26	ENSSMRG00000017191	C19orf12 (ENSSMRG00000017192) #27	PLEKHF1 (ENSSMRG00000017205)	POP4 (ENSSMRG00000017206) #28	VSTM2B (ENSSMRG00000017209) #29	UQCRFS1 (ENSSMRG00000017211) #30	SHCBP1 (ENSSMRG00000017212)
tuatara	MODERN SPECIES	1861																TSHZ3 (ENSSPUG00000018669) #22
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Aves	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
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Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160021	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
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Kakapo	DUPLICATION
Kakapo	MODERN SPECIES	19	ENSSHBG00005011571	GPATCH1 (ENSSHBG00005011591)	ENSSHBG00005011625	ENSSHBG00005011638	ENSSHBG00005011660	CEP89 (ENSSHBG00005011674)	SLC7A9 (ENSSHBG00005011804)	TDRD12 (ENSSHBG00005014145)	NUDT19 (ENSSHBG00005014202) #16	ANKRD27 (ENSSHBG00005014210) #18	RGS9BP (ENSSHBG00005014236) #17	PDCD5 (ENSSHBG00005014245) #19	ENSSHBG00005014261	DPY19L3 (ENSSHBG00005014311) #20	ENSSHBG00005014347 #21	ENSSHBG00005000156 #22	ENSSHBG00005001350	ENSSHBG00005001409 #24	ENSSHBG00005001466 #25	ENSSHBG00005001492 #26	ENSSHBG00005001524	ENSSHBG00005001540 #27	ENSSHBG00005001553 #27	ENSSHBG00005001570	LONP2 (ENSSHBG00005001588)	ENSSHBG00005001629	ENSSHBG00005001653	ENSSHBG00005001669	ENSSHBG00005001748	CNEP1R1 (ENSSHBG00005001851)	ENSSHBG00005001903
Kakapo	MODERN SPECIES	4	ENSSHBG00005000289	ENSSHBG00005000285	ENSSHBG00005000283	ENSSHBG00005000280	ENSSHBG00005000277	ENSSHBG00005000275	ENSSHBG00005000273	ENSSHBG00005000272	ENSSHBG00005000267	ENSSHBG00005000261	ENSSHBG00005000249	ENSSHBG00005000247	ENSSHBG00005000240	ENSSHBG00005000237	ENSSHBG00005000234 #21	ENSSHBG00005000231 #22	ENSSHBG00005000228	ENSSHBG00005000223 #24	ENSSHBG00005000217 #25	ENSSHBG00005000196 #26	ENSSHBG00005000184 #27	ENSSHBG00005000175	ENSSHBG00005000164	ENSSHBG00005000141	ENSSHBG00005000122	ENSSHBG00005000095	ENSSHBG00005000089	ENSSHBG00005000087	ENSSHBG00005000083	ENSSHBG00005000080	ENSSHBG00005000077
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000162291.f	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	80														DPY19L3 (ENSABRG00000000675) #20	ZNF507 (ENSABRG00000000934) #21	TSHZ3 (ENSABRG00000001051) #22	ZNF536 (ENSABRG00000001124) #24	URI1 (ENSABRG00000001220) #25	CCNE1 (ENSABRG00000001263) #26	ENSABRG00000001301	PLEKHF1 (ENSABRG00000001339)	POP4 (ENSABRG00000001351) #28	VSTM2B (ENSABRG00000001368) #29	UQCRFS1 (ENSABRG00000001387) #30	SHCBP1 (ENSABRG00000001406)	ENSABRG00000001429	VPS35 (ENSABRG00000001695)	ORC6 (ENSABRG00000001721)	MYLK3 (ENSABRG00000001750)	C16orf87 (ENSABRG00000001820)	GPT2 (ENSABRG00000001845)
Duck	MODERN SPECIES	3										TDRD12 (ENSAPLG00000011417)	NUDT19 (ENSAPLG00000011800) #16	ANKRD27 (ENSAPLG00000011807) #18	PDCD5 (ENSAPLG00000026487) #19	DPY19L3 (ENSAPLG00000012920) #20	ZNF507 (ENSAPLG00000013158) #21	TSHZ3 (ENSAPLG00000011634) #22	ZNF536 (ENSAPLG00000013219) #24	URI1 (ENSAPLG00000017568) #25	CCNE1 (ENSAPLG00000013739) #26	ENSAPLG00000013924	C19orf12 (ENSAPLG00000019442) #27	PLEKHF1 (ENSAPLG00000011645)	POP4 (ENSAPLG00000014051) #28	UQCRFS1 (ENSAPLG00000002275) #30	SHCBP1 (ENSAPLG00000008932)	ENSAPLG00000020084	VPS35 (ENSAPLG00000009261)	ENSAPLG00000020114	MYLK3 (ENSAPLG00000009568)	C16orf87 (ENSAPLG00000009799)	GPT2 (ENSAPLG00000009804)
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Turkey	MODERN SPECIES	4	ENSMGAG00000005213	ENSMGAG00000005229	C16orf87 (ENSMGAG00000005255)	ORC6 (ENSMGAG00000005268)	MYLK3 (ENSMGAG00000005260)	ENSMGAG00000018317	ENSMGAG00000005307	ENSMGAG00000005283	ENSMGAG00000015592 #30	ENSMGAG00000005337 #28	ENSMGAG00000015596	ENSMGAG00000018069 #27	ENSMGAG00000005421 #25	ENSMGAG00000022714 #24	ENSMGAG00000005440 #24	ENSMGAG00000015601 #22	ENSMGAG00000005461 #21	DPY19L3 (ENSMGAG00000005481) #20	ENSMGAG00000005527	ENSMGAG00000005555 #18	ENSMGAG00000005543 #19	ENSMGAG00000017074	ENSMGAG00000005608 #16	ENSMGAG00000005650	ENSMGAG00000005691	ENSMGAG00000005724	ENSMGAG00000005729	ENSMGAG00000019428	ENSMGAG00000005775	ENSMGAG00000005857	SLC7A10 (ENSMGAG00000005866)
Chicken	MODERN SPECIES	2	WDR88 (ENSGALG00010024895)	GPATCH1 (ENSGALG00010025949)	RHPN2 (ENSGALG00010024878)	FAAP24 (ENSGALG00010024868)	CEP89 (ENSGALG00010024852)	SLC7A9 (ENSGALG00010024831)	ENSGALG00010024827	ENSGALG00010025926	NUDT19 (ENSGALG00010024820) #16	RGS9BP (ENSGALG00010025919) #17	ANKRD27 (ENSGALG00010024806) #18	PDCD5 (ENSGALG00010024786) #19	ENSGALG00010024684	DPY19L3 (ENSGALG00010024657) #20	ZNF507 (ENSGALG00010024638) #21	TSHZ3 (ENSGALG00010024626) #22	ZNF536 (ENSGALG00010024544) #24	URI1 (ENSGALG00010024536) #25	CCNE1 (ENSGALG00010024008) #26	ENSGALG00010025899	C19orf12 (ENSGALG00010023993) #27	ENSGALG00010023981 #27	ENSGALG00010023972 #27	PLEKHF1 (ENSGALG00010023954)	POP4 (ENSGALG00010023896) #28	VSTM2B (ENSGALG00010023881) #29	UQCRFS1 (ENSGALG00010023871) #30	SHCBP1 (ENSGALG00010023854)	ENSGALG00010023832	VPS35 (ENSGALG00010023783)	ORC6 (ENSGALG00010023733)
Japanese quail	MODERN SPECIES	2	SLC7A10 (ENSCJPG00005014449)	LRP3 (ENSCJPG00005014448)	GPATCH1 (ENSCJPG00005014447)	RHPN2 (ENSCJPG00005014446)	FAAP24 (ENSCJPG00005014445)	CEP89 (ENSCJPG00005014444)	SLC7A9 (ENSCJPG00005014443)	TDRD12 (ENSCJPG00005014440)	NUDT19 (ENSCJPG00005014439) #16	RGS9BP (ENSCJPG00005014438) #17	ANKRD27 (ENSCJPG00005014437) #18	PDCD5 (ENSCJPG00005014436) #19	ENSCJPG00005014435	DPY19L3 (ENSCJPG00005014415) #20	ZNF507 (ENSCJPG00005014414) #21	TSHZ3 (ENSCJPG00005014409) #22	ZNF536 (ENSCJPG00005014399) #24	URI1 (ENSCJPG00005014395) #25	CCNE1 (ENSCJPG00005014393) #26	ENSCJPG00005014392	ENSCJPG00005014391 #27	ENSCJPG00005014390	ENSCJPG00005014389 #27	PLEKHF1 (ENSCJPG00005014388)	POP4 (ENSCJPG00005014386) #28	VSTM2B (ENSCJPG00005014385) #29	UQCRFS1 (ENSCJPG00005014384) #30	SHCBP1 (ENSCJPG00005014383)	VPS35 (ENSCJPG00005014382)	ORC6 (ENSCJPG00005014381)	MYLK3 (ENSCJPG00005014380)
African ostrich	MODERN SPECIES	737	SLC7A10 (ENSSCUG00000012058)	LRP3 (ENSSCUG00000012050)	GPATCH1 (ENSSCUG00000012047)	RHPN2 (ENSSCUG00000012043)	FAAP24 (ENSSCUG00000012036)	ENSSCUG00000012035	CEP89 (ENSSCUG00000012031)	SLC7A9 (ENSSCUG00000011997)	TDRD12 (ENSSCUG00000011970)	ENSSCUG00000011968 #16	RGS9BP (ENSSCUG00000011966) #17	ANKRD27 (ENSSCUG00000011958) #18	PDCD5 (ENSSCUG00000011956) #19	DPY19L3 (ENSSCUG00000011954) #20	ZNF507 (ENSSCUG00000011953) #21	TSHZ3 (ENSSCUG00000011945) #22	ZNF536 (ENSSCUG00000011942) #24	URI1 (ENSSCUG00000011931) #25	CCNE1 (ENSSCUG00000011925) #26	ENSSCUG00000011921	PLEKHF1 (ENSSCUG00000011920)	POP4 (ENSSCUG00000011917) #28	UQCRFS1 (ENSSCUG00000011911) #30	SHCBP1 (ENSSCUG00000011909)	ENSSCUG00000011904	VPS35 (ENSSCUG00000011901)	ORC6 (ENSSCUG00000011895)	MYLK3 (ENSSCUG00000011892)	GPT2 (ENSSCUG00000011886)	C16orf87 (ENSSCUG00000011880)	ENSSCUG00000011876
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	35	FAAP24 (ENSCPRG00005004323)	ENSCPRG00005004318	ENSCPRG00005004315	ENSCPRG00005004311	CEP89 (ENSCPRG00005004305)	SLC7A9 (ENSCPRG00005004298)	ENSCPRG00005004295	TDRD12 (ENSCPRG00005004257)	NUDT19 (ENSCPRG00005004246) #16	RGS9BP (ENSCPRG00005004245) #17	ANKRD27 (ENSCPRG00005004220) #18	PDCD5 (ENSCPRG00005004211) #19	ENSCPRG00005004190	DPY19L3 (ENSCPRG00005004159) #20	ZNF507 (ENSCPRG00005004153) #21	TSHZ3 (ENSCPRG00005004136) #22	ZNF536 (ENSCPRG00005004130) #24	URI1 (ENSCPRG00005004124) #25	CCNE1 (ENSCPRG00005004111) #26	ENSCPRG00005004104	C19orf12 (ENSCPRG00005004100) #27	PLEKHF1 (ENSCPRG00005004098)	POP4 (ENSCPRG00005004092) #28	UQCRFS1 (ENSCPRG00005004086) #30	ENSCPRG00005004073	SHCBP1 (ENSCPRG00005004067)	ENSCPRG00005004055	VPS35 (ENSCPRG00005004039)	ORC6 (ENSCPRG00005004032)	MYLK3 (ENSCPRG00005004027)	C16orf87 (ENSCPRG00005004023)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00420000029847	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021.a #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
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Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	60	WDR88 (ENSTMTG00000022808)	GPATCH1 (ENSTMTG00000022805)	RHPN2 (ENSTMTG00000022802)	FAAP24 (ENSTMTG00000022798)	ENSTMTG00000022797	CEP89 (ENSTMTG00000022794)	SLC7A9 (ENSTMTG00000022791)	TDRD12 (ENSTMTG00000022781)	NUDT19 (ENSTMTG00000022778) #16	RGS9BP (ENSTMTG00000022775) #17	ANKRD27 (ENSTMTG00000022771) #18	ENSTMTG00000022770	ENSTMTG00000022765	DPY19L3 (ENSTMTG00000022759) #20	ZNF507 (ENSTMTG00000022756) #21	TSHZ3 (ENSTMTG00000022753) #22	ZNF536 (ENSTMTG00000022747) #24	URI1 (ENSTMTG00000022743) #25	CCNE1 (ENSTMTG00000022737) #26	ENSTMTG00000022732	PLEKHF1 (ENSTMTG00000022727)	POP4 (ENSTMTG00000022723) #28	VSTM2B (ENSTMTG00000022720) #29	UQCRFS1 (ENSTMTG00000022718) #30	SHCBP1 (ENSTMTG00000022715)	ENSTMTG00000022710	VPS35 (ENSTMTG00000022702)	ORC6 (ENSTMTG00000022700)	MYLK3 (ENSTMTG00000022699)	C16orf87 (ENSTMTG00000022698)	GPT2 (ENSTMTG00000022695)
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Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2465																TSHZ3 (ENSCABG00000003309) #22	ZNF536 (ENSCABG00000003304) #24	URI1 (ENSCABG00000003239) #25	CCNE1 (ENSCABG00000003232) #26	C19orf12 (ENSCABG00000003227) #27	PLEKHF1 (ENSCABG00000003224)	POP4 (ENSCABG00000003221) #28
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	3	WDR88 (ENSGEVG00005009737)	GPATCH1 (ENSGEVG00005009654)	RHPN2 (ENSGEVG00005009604)	FAAP24 (ENSGEVG00005009583)	ENSGEVG00005009542	CEP89 (ENSGEVG00005009487)	SLC7A9 (ENSGEVG00005017897)	TDRD12 (ENSGEVG00005017875)	NUDT19 (ENSGEVG00005017853) #16	RGS9BP (ENSGEVG00005017844) #17	ANKRD27 (ENSGEVG00005017798) #18	PDCD5 (ENSGEVG00005017773) #19	ENSGEVG00005017634	DPY19L3 (ENSGEVG00005017231) #20	ZNF507 (ENSGEVG00005017111) #21	TSHZ3 (ENSGEVG00005017085) #22	ZNF536 (ENSGEVG00005017060) #24	URI1 (ENSGEVG00005017029) #25	CCNE1 (ENSGEVG00005016999) #26	ENSGEVG00005016978	C19orf12 (ENSGEVG00005016962) #27	PLEKHF1 (ENSGEVG00005016945)	POP4 (ENSGEVG00005016919) #28	VSTM2B (ENSGEVG00005016775) #29	UQCRFS1 (ENSGEVG00005016745) #30	SHCBP1 (ENSGEVG00005016588)	ENSGEVG00005016209	VPS35 (ENSGEVG00005016109)	ORC6 (ENSGEVG00005016083)	MYLK3 (ENSGEVG00005016013)	C16orf87 (ENSGEVG00005015988)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	940				ENSPSIG00000013465	TDRD12 (ENSPSIG00000012970)	ENSPSIG00000001895	NUDT19 (ENSPSIG00000012955) #16	RGS9BP (ENSPSIG00000001892) #17	ANKRD27 (ENSPSIG00000012421) #18	PDCD5 (ENSPSIG00000012235) #19	ENSPSIG00000008489	DPY19L3 (ENSPSIG00000007940) #20	ZNF507 (ENSPSIG00000007531) #21	ENSPSIG00000001889	ENSPSIG00000001887	TSHZ3 (ENSPSIG00000007188) #22	ZNF536 (ENSPSIG00000007065) #24	URI1 (ENSPSIG00000016948) #25	CCNE1 (ENSPSIG00000016456) #26	ENSPSIG00000016381	C19orf12 (ENSPSIG00000016276) #27	PLEKHF1 (ENSPSIG00000016268)	POP4 (ENSPSIG00000015690) #28	ENSPSIG00000015651 #29	UQCRFS1 (ENSPSIG00000015453) #30	ENSPSIG00000001884	SHCBP1 (ENSPSIG00000014494)	ENSPSIG00000014407	VPS35 (ENSPSIG00000014218)	ORC6 (ENSPSIG00000014037)	MYLK3 (ENSPSIG00000013680)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162291	ENSGT00390000007074	ENSGT00940000153837.a.b	ENSGT00390000009456	ENSGT00390000018876	ENSGT00730000111020.a	ENSGT00940000156370	ENSGT00940000166448	ENSGT00420000029858 #16	ENSGT00940000153725.a.b.a #17	ENSGT00940000157021 #18	ENSGT00390000011085 #19	ENSGT00940000164020	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00390000009077 #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00390000001014 #30	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00940000158892.a.a	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
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Osteoglossiformes	DUPLICATION
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	11	tpgs2 (ENSOTSG00005013527)	aqp7 (ENSOTSG00005013528)	ENSOTSG00005013529	CACNA2D2 (ENSOTSG00005013534)	ACY1 (ENSOTSG00005013881)	ENSOTSG00005013981	HYAL2 (ENSOTSG00005013982)	tusc2b (ENSOTSG00005013983)	rassf1 (ENSOTSG00005013984)	cyb561d2 (ENSOTSG00005013985)	RAD54L2 (ENSOTSG00005013990)	bap1 (ENSOTSG00005015287)	BSN (ENSOTSG00005016011)	DPY19L3 (ENSOTSG00005016014) #20	ZNF507 (ENSOTSG00005016026) #21	tshz3b (ENSOTSG00005016027) #22	ENSOTSG00005016030	cfap20dc (ENSOTSG00005016033)	ENSOTSG00005016035	FAM107A (ENSOTSG00005016038)	CAMK1 (ENSOTSG00005016039)	ENSOTSG00005016040	pbrm1l (ENSOTSG00005016071)	stau1 (ENSOTSG00005018838)	ENSOTSG00005018899	KCNB1 (ENSOTSG00005018902)	ptgis (ENSOTSG00005018912)	SRGAP3 (ENSOTSG00005000111)	OXTR (ENSOTSG00005000151)	cav3 (ENSOTSG00005000154)	cav4a (ENSOTSG00005000157)
Huchen	MODERN SPECIES	798																tshz3b (ENSHHUG00000040706) #22	ZNF536 (ENSHHUG00000040709) #24	ccne1 (ENSHHUG00000040711) #26	ENSHHUG00000040721	si:ch211-260e23.9 (ENSHHUG00000040725)	si:ch211-260e23.8 (ENSHHUG00000040730) #27	PLEKHF1 (ENSHHUG00000040737)	pop4 (ENSHHUG00000040739) #28
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Coho salmon	MODERN SPECIES	28	dhcr7 (ENSOKIG00005010778)	MMP15 (ENSOKIG00005010694)	ENSOKIG00005010669	ENSOKIG00005010658	slc7a6os (ENSOKIG00005010649)	slc7a6 (ENSOKIG00005010484)	ENSOKIG00005010452	adgrg1 (ENSOKIG00005010417)	ccdc102a (ENSOKIG00005010395)	ENSOKIG00005010387	DOK4 (ENSOKIG00005010376)	ENSOKIG00005010186	ENSOKIG00005010057	DPY19L3 (ENSOKIG00005009944) #20	ZNF507 (ENSOKIG00005009924) #21	tshz3b (ENSOKIG00005009919) #22	ZNF536 (ENSOKIG00005009888) #24	ccne1 (ENSOKIG00005009836) #26	zgc:162297 (ENSOKIG00005009815)	si:ch211-260e23.9 (ENSOKIG00005009803)	C19orf12 (ENSOKIG00005009793) #27	PLEKHF1 (ENSOKIG00005009784)	ENSOKIG00005009770	vstm2b (ENSOKIG00005009763) #29	ENSOKIG00005009760	uqcrfs1 (ENSOKIG00005009747) #30	SHCBP1 (ENSOKIG00005009685)	hrh3 (ENSOKIG00005009667)	vps35 (ENSOKIG00005033964)	orc6 (ENSOKIG00005033956)	mylk3 (ENSOKIG00005033937)
Huchen	MODERN SPECIES	1200																tshz3b (ENSHHUG00000029153) #22	ZNF536 (ENSHHUG00000029142) #24
Northern pike	MODERN SPECIES	1	ENSELUG00000020444	ENSELUG00000020428	slc7a6os (ENSELUG00000020417)	slc7a6 (ENSELUG00000020394)	ENSELUG00000033053	ENSELUG00000020358	adgrg1 (ENSELUG00000020340)	ccdc102a (ENSELUG00000020229)	DOK4 (ENSELUG00000020178)	ENSELUG00000020137	ENSELUG00000020120	ENSELUG00000020056	DPY19L3 (ENSELUG00000020011) #20	ZNF507 (ENSELUG00000019939) #21	ENSELUG00000019926	tshz3b (ENSELUG00000000876) #22	ZNF536 (ENSELUG00000001298) #24	ccne1 (ENSELUG00000019883) #26	ENSELUG00000019841	zgc:162297 (ENSELUG00000019863)	PLEKHF1 (ENSELUG00000019817)	pop4 (ENSELUG00000019812) #28	vstm2b (ENSELUG00000019803) #29	uqcrfs1 (ENSELUG00000000872) #30	ENSELUG00000029390	ENSELUG00000019780	ENSELUG00000028904	shcbp1 (ENSELUG00000019767)	hrh3 (ENSELUG00000019746)	vps35 (ENSELUG00000019709)	orc6 (ENSELUG00000019665)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	195												ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000006020	ENSGT00940000171971	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000166567
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	141												ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000006020	ENSGT00940000171971	ENSGT00390000009077.c #27
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	17	ENSMMDG00005003096	ctsba (ENSMMDG00005003129)	ENSMMDG00005003467	ppm1g (ENSMMDG00005003481)	mis12 (ENSMMDG00005003530)	dld (ENSMMDG00005003543)	fam120b (ENSMMDG00005003919)	rufy2 (ENSMMDG00005003944)	HNRNPH3 (ENSMMDG00005004137)	pbld (ENSMMDG00005004148)	ENSMMDG00005004182	ENSMMDG00005004552	DPY19L3 (ENSMMDG00005004622) #20	ZNF507 (ENSMMDG00005004625) #21	ENSMMDG00005004628	tshz3b (ENSMMDG00005004632) #22	ZNF536 (ENSMMDG00005004636) #24	ccne1 (ENSMMDG00005004645) #26	zgc:162297 (ENSMMDG00005004662)	si:ch211-260e23.9 (ENSMMDG00005004670)	si:ch211-260e23.8 (ENSMMDG00005004673) #27	ppfia1 (ENSMMDG00005004993)	mrpl21 (ENSMMDG00005016187)	CTTN (ENSMMDG00005016194)	SHANK2 (ENSMMDG00005016237)	ENSMMDG00005016241	ENSMMDG00005016247	ENSMMDG00005016252	guca1g (ENSMMDG00005016263)	ENSMMDG00005016336	ENSMMDG00005016339
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00830000128380	ENSGT00940000159106	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000006020	ENSGT00940000171971	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00390000011846	ENSGT00390000017828	ENSGT00390000009505	ENSGT00390000007315
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	333	ENSHCOG00000020879	ENSHCOG00000020872	ENSHCOG00000020856	ENSHCOG00000020848	ENSHCOG00000020846	MMP15 (ENSHCOG00000020836)	dhcr7 (ENSHCOG00000020776)	ENSHCOG00000020741	ENSHCOG00000020576	ENSHCOG00000000445	ENSHCOG00000015923	ENSHCOG00000015877	ENSHCOG00000015862	DPY19L3 (ENSHCOG00000015786) #20	ZNF507 (ENSHCOG00000015757) #21	tshz3b (ENSHCOG00000015700) #22	zgc:162297 (ENSHCOG00000015650)	ccne1 (ENSHCOG00000015635) #26	ccne1 (ENSHCOG00000000652) #26	ZNF536 (ENSHCOG00000015584) #24	ENSHCOG00000015564	zgc:101715 (ENSHCOG00000015557) #27	AP2A2 (ENSHCOG00000015546)	ENSHCOG00000015497	ENSHCOG00000015484	ENSHCOG00000015476	ENSHCOG00000015463	ENSHCOG00000015459	ENSHCOG00000015441	ENSHCOG00000015425	ENSHCOG00000015414
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00390000017392	ENSGT00390000008092.b.a.b
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00390000017392	ENSGT00390000008092.b.a.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00830000128380	ENSGT00940000159106	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000160021	ENSGT00940000154688.a.b.a	ENSGT00940000156041.c	ENSGT00390000013367	ENSGT00950000183118.B	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24
Fugu	MODERN SPECIES	4	ENSTRUG00000027988	ENSTRUG00000032706	phospho2 (ENSTRUG00000029775)	SYAP1 (ENSTRUG00000004112)	ENSTRUG00000004048	slc7a6 (ENSTRUG00000003083)	slc7a6os (ENSTRUG00000002754)	ENSTRUG00000001929	MMP15 (ENSTRUG00000001957)	dhcr7 (ENSTRUG00000029034)	dhcr7 (ENSTRUG00000003928)	ENSTRUG00000019480	ENSTRUG00000004267	DPY19L3 (ENSTRUG00000004503) #20	ZNF507 (ENSTRUG00000020906) #21	tshz3b (ENSTRUG00000026259) #22	ENSTRUG00000028720	ZNF536 (ENSTRUG00000005430) #24	ENSTRUG00000030395	ENSTRUG00000027995	ccne1 (ENSTRUG00000001857) #26	ccne1 (ENSTRUG00000029958) #26	ENSTRUG00000031242	ENSTRUG00000033258	ENSTRUG00000030455	BNC1 (ENSTRUG00000027711)	gjd6 (ENSTRUG00000030318)	lmnl3 (ENSTRUG00000003766)	EFL1 (ENSTRUG00000032326)	mex3b (ENSTRUG00000033185)	ENSTRUG00000031258
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	znf207b (ENSTNIG00000003722)	rhbdl3 (ENSTNIG00000003721)	vegfc (ENSTNIG00000003882)	CDH8 (ENSTNIG00000010135)	phospho2 (ENSTNIG00000010134)	SYAP1 (ENSTNIG00000010133)	ENSTNIG00000010132	slc7a6 (ENSTNIG00000010131)	slc7a6os (ENSTNIG00000010130)	ENSTNIG00000010129	MMP15 (ENSTNIG00000010128)	dhcr7 (ENSTNIG00000010127)	ENSTNIG00000014203	DPY19L3 (ENSTNIG00000004332) #20	ZNF507 (ENSTNIG00000003653) #21	tshz3b (ENSTNIG00000004737) #22	ENSTNIG00000001818	ptrh2 (ENSTNIG00000000826)	ENSTNIG00000000142	ENSTNIG00000001820	ENSTNIG00000001821	ENSTNIG00000006099	ENSTNIG00000019469	CXXC1 (ENSTNIG00000001822)	ENSTNIG00000001824	psmb6 (ENSTNIG00000001826)	ENSTNIG00000002199	ppp1cbl (ENSTNIG00000002200)	smyd1a (ENSTNIG00000002123)	ENSTNIG00000002201	nadk2 (ENSTNIG00000002202)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00830000128380	ENSGT00940000159106	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	540																tshz3b (ENSLBEG00000002676) #22	ENSLBEG00000002699
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00830000128380	ENSGT00940000159106	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000000227	ENSGT00830000128380	ENSGT00940000159106	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT01090000260003.a.a	ENSGT00940000157182.g.b	ENSGT00390000002105	ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.b.f	ENSGT00940000163716.c.a.a.b	ENSGT00940000161051.a.a.b.b.b.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	69	ENSGT00940000162226	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	18	USP8 (ENSCLMG00005003315)	USP50 (ENSCLMG00005003291)	mapk6 (ENSCLMG00005003286)	leo1 (ENSCLMG00005003282)	tmod2 (ENSCLMG00005003275)	lysmd2 (ENSCLMG00005003274)	scg3 (ENSCLMG00005003194)	zgc:101040 (ENSCLMG00005003191)	MMP15 (ENSCLMG00005003189)	dhcr7 (ENSCLMG00005003186)	ENSCLMG00005003040	ENSCLMG00005003005	DPY19L3 (ENSCLMG00005002985) #20	ZNF507 (ENSCLMG00005002971) #21	ENSCLMG00005002957	tshz3b (ENSCLMG00005002954) #22	ZNF536 (ENSCLMG00005002943) #24	ccne1 (ENSCLMG00005003338) #26	zgc:162297 (ENSCLMG00005003336)	si:ch211-260e23.9 (ENSCLMG00005003334)	si:ch211-260e23.8 (ENSCLMG00005003333) #27	AP2A2 (ENSCLMG00005003326)	TPH1 (ENSCLMG00005002366)	cd81a (ENSCLMG00005002354)	PKP3 (ENSCLMG00005002335)	zgc:153993 (ENSCLMG00005002333)	ano1a (ENSCLMG00005001161)	ENSCLMG00005001158	ENSCLMG00005001157	ENSCLMG00005001156	ENSCLMG00005001154
Stickleback	MODERN SPECIES	1	ADAMTS18 (ENSGACG00000014347)	CDH8 (ENSGACG00000014322)	phospho2 (ENSGACG00000014319)	SYAP1 (ENSGACG00000014311)	adgrg1 (ENSGACG00000014306)	adgrg1 (ENSGACG00000014301)	slc7a6 (ENSGACG00000014291)	slc7a6os (ENSGACG00000014285)	ENSGACG00000014281	MMP15 (ENSGACG00000014272)	dhcr7 (ENSGACG00000014264)	ENSGACG00000014257	ENSGACG00000014247	DPY19L3 (ENSGACG00000014242) #20	ZNF507 (ENSGACG00000014238) #21	tshz3b (ENSGACG00000014236) #22	ZNF536 (ENSGACG00000014234) #24	ENSGACG00000014232	celf1 (ENSGACG00000014226)	mtfmt (ENSGACG00000014220)	gpt2 (ENSGACG00000014217)	zgc:92818 (ENSGACG00000014211)	vps35 (ENSGACG00000014193)	fgf19 (ENSGACG00000014191)	fgf4 (ENSGACG00000014187)	fgf3 (ENSGACG00000014186)	lto1 (ENSGACG00000014182)	ENSGACG00000014179	ccnd1 (ENSGACG00000014165)	vstm2b (ENSGACG00000014160) #29	uqcrfs1 (ENSGACG00000014155) #30
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00950000183075.a.b	ENSGT00390000000227	ENSGT00830000128380	ENSGT00940000159106	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	17	DOK4 (ENSCGOG00000005839)	nadsyn1 (ENSCGOG00000005901)	tpcn2 (ENSCGOG00000007472)	pop4 (ENSCGOG00000007796) #28	PLEKHF1 (ENSCGOG00000007797)	ENSCGOG00000007799	PCSK6 (ENSCGOG00000007803)	slc7a6os (ENSCGOG00000007887)	ENSCGOG00000007889	MMP15 (ENSCGOG00000007894)	dhcr7 (ENSCGOG00000008167)	ENSCGOG00000008367	ENSCGOG00000009143	DPY19L3 (ENSCGOG00000009147) #20	ZNF507 (ENSCGOG00000009480) #21	tshz3b (ENSCGOG00000009484) #22	ZNF536 (ENSCGOG00000009485) #24	ENSCGOG00000009489	ccne1 (ENSCGOG00000009524) #26	zgc:162297 (ENSCGOG00000009570)	si:ch211-260e23.9 (ENSCGOG00000009576)	si:ch211-260e23.8 (ENSCGOG00000009582) #27	ENSCGOG00000009601	zgc:153993 (ENSCGOG00000010337)	ALDH6A1 (ENSCGOG00000010340)	ano1a (ENSCGOG00000010353)	ENSCGOG00000010792	ENSCGOG00000010793	ENSCGOG00000010797	ENSCGOG00000010799	mtch2 (ENSCGOG00000010807)
Pike perch	MODERN SPECIES	85	phospho2 (ENSSLUG00000024479)	SYAP1 (ENSSLUG00000024480)	adgrg1 (ENSSLUG00000024483)	slc7a6 (ENSSLUG00000024485)	slc7a6os (ENSSLUG00000024486)	ENSSLUG00000024489	ENSSLUG00000024491	ENSSLUG00000024495	MMP15 (ENSSLUG00000024501)	dhcr7 (ENSSLUG00000024526)	ENSSLUG00000024537	ENSSLUG00000024545	DPY19L3 (ENSSLUG00000024550) #20	ENSSLUG00000024560	ZNF507 (ENSSLUG00000024567) #21	ENSSLUG00000024570 #22	ENSSLUG00000024575	ccne1 (ENSSLUG00000024577) #26	zgc:162297 (ENSSLUG00000024582)	si:ch211-260e23.9 (ENSSLUG00000024584)	si:ch211-260e23.8 (ENSSLUG00000024587) #27	ENSSLUG00000024608
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00830000128380	ENSGT00940000159106	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000009505	ENSGT00940000159061	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104
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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000178341	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT01060000248556.A.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00390000017392	ENSGT00390000008092.b.a.b
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Zig-zag eel	MODERN SPECIES	17	ITFG1 (ENSMAMG00000008812)	PHKB (ENSMAMG00000008891)	ENSMAMG00000009011	ENSMAMG00000009065	ENSMAMG00000026563	ENSMAMG00000009117	adgrg1 (ENSMAMG00000009142)	ENSMAMG00000009158	slc7a6os (ENSMAMG00000009179)	ENSMAMG00000009195	ENSMAMG00000009202	ENSMAMG00000009235	ENSMAMG00000009276	ZNF507 (ENSMAMG00000009452) #21	ENSMAMG00000009591	tshz3b (ENSMAMG00000009602) #22	ZNF536 (ENSMAMG00000009628) #24	ccne1 (ENSMAMG00000009661) #26	zgc:162297 (ENSMAMG00000009669)	si:ch211-260e23.9 (ENSMAMG00000026775)	si:ch211-260e23.8 (ENSMAMG00000009714) #27	ENSMAMG00000009727	cd81a (ENSMAMG00000009786)	ENSMAMG00000009828	ENSMAMG00000009851	ENSMAMG00000009901	ENSMAMG00000009915	ENSMAMG00000009950	ENSMAMG00000009963	ENSMAMG00000009988	ENSMAMG00000010024
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000178341	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000009505	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104	ENSGT00940000177138	ENSGT00940000163235.A.a.a.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000178341	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000009505	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104	ENSGT00940000177138	ENSGT00940000163235.A.a.a.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000178341	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000009505	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104	ENSGT00940000163235.A.a.a.b	ENSGT00940000156076.a.a.a.b.a.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	1	ENSSDUG00000010877	phospho2 (ENSSDUG00000010880)	SYAP1 (ENSSDUG00000010890)	adgrg1 (ENSSDUG00000010924)	slc7a6 (ENSSDUG00000010948)	slc7a6os (ENSSDUG00000010979)	ENSSDUG00000010994	ENSSDUG00000011009	ENSSDUG00000011025	MMP15 (ENSSDUG00000011040)	dhcr7 (ENSSDUG00000011087)	ENSSDUG00000011119	ENSSDUG00000011156	DPY19L3 (ENSSDUG00000011182) #20	ZNF507 (ENSSDUG00000011201) #21	tshz3b (ENSSDUG00000011211) #22	ZNF536 (ENSSDUG00000011232) #24	ccne1 (ENSSDUG00000011245) #26	zgc:162297 (ENSSDUG00000011291)	si:ch211-260e23.9 (ENSSDUG00000011313)	si:ch211-260e23.8 (ENSSDUG00000011326) #27	ENSSDUG00000011340	cd81a (ENSSDUG00000011438)	ENSSDUG00000011457	zgc:92818 (ENSSDUG00000011479)	vps35 (ENSSDUG00000011495)	mtfmt (ENSSDUG00000011538)	celf1 (ENSSDUG00000011558)	tollip (ENSSDUG00000011594)	ENSSDUG00000011620	ENSSDUG00000011678
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3186	CDH8 (ENSSLDG00000013857)	ENSSLDG00000013837	phospho2 (ENSSLDG00000013826)	SYAP1 (ENSSLDG00000013806)	adgrg1 (ENSSLDG00000013780)	slc7a6 (ENSSLDG00000013752)	slc7a6os (ENSSLDG00000013733)	ENSSLDG00000013726	ENSSLDG00000013711	MMP15 (ENSSLDG00000013644)	dhcr7 (ENSSLDG00000013605)	ENSSLDG00000013578	ENSSLDG00000013497	DPY19L3 (ENSSLDG00000013438) #20	ZNF507 (ENSSLDG00000013410) #21	tshz3b (ENSSLDG00000013394) #22	ENSSLDG00000013377	ZNF536 (ENSSLDG00000013363) #24	ccne1 (ENSSLDG00000013341) #26	zgc:162297 (ENSSLDG00000013325)	si:ch211-260e23.9 (ENSSLDG00000013300)	si:ch211-260e23.8 (ENSSLDG00000013284) #27	AP2A2 (ENSSLDG00000013210)	cd81a (ENSSLDG00000013173)	ENSSLDG00000013054	zgc:92818 (ENSSLDG00000012998)	vps35 (ENSSLDG00000012944)	mtfmt (ENSSLDG00000012920)	celf1 (ENSSLDG00000012863)	tollip (ENSSLDG00000012829)	ENSSLDG00000012797
Barramundi perch	MODERN SPECIES	100																tshz3b (ENSLCAG00010009740) #22	ZNF536 (ENSLCAG00010009738) #24	ccne1 (ENSLCAG00010009733) #26	zgc:162297 (ENSLCAG00010009732)	si:ch211-260e23.9 (ENSLCAG00010009729)	si:ch211-260e23.8 (ENSLCAG00010009726) #27	AP2A2 (ENSLCAG00010009648)	TMC3 (ENSLCAG00010009593)	STARD5 (ENSLCAG00010009570)	IL16 (ENSLCAG00010009559)	TLNRD1 (ENSLCAG00010009550)	mesd (ENSLCAG00010009546)	CEMIP (ENSLCAG00010009422)	abhd17c (ENSLCAG00010009392)	ENSLCAG00010009385	arnt2 (ENSLCAG00010009086)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000178341	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d.b	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00390000009505	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000017828	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000013104	ENSGT00940000163235.A.a.a.b	ENSGT00940000177923
Tongue sole	MODERN SPECIES	15	pcdh17 (ENSCSEG00000000621)	ENSCSEG00000000615	lims1 (ENSCSEG00000000607)	ENSCSEG00000000599	tgfbrap1 (ENSCSEG00000000575)	cul4a (ENSCSEG00000000560)	ENSCSEG00000000511	grtp1a (ENSCSEG00000000499)	MMP15 (ENSCSEG00000000492)	dhcr7 (ENSCSEG00000000484)	ctrb.3 (ENSCSEG00000000477)	ENSCSEG00000000461	ENSCSEG00000000409	DPY19L3 (ENSCSEG00000000368) #20	ZNF507 (ENSCSEG00000000352) #21	tshz3b (ENSCSEG00000000344) #22	ZNF536 (ENSCSEG00000000339) #24	ccne1 (ENSCSEG00000000327) #26	ENSCSEG00000000324	si:ch211-260e23.8 (ENSCSEG00000000323) #27	efcab2 (ENSCSEG00000000319)	ENSCSEG00000000310	ABCB10 (ENSCSEG00000000304)	urb2 (ENSCSEG00000000299)	galnt2 (ENSCSEG00000000272)	smyd2a (ENSCSEG00000000269)	ENSCSEG00000000268	ENSCSEG00000000266	ENSCSEG00000000265	rab4a (ENSCSEG00000000263)	phf10 (ENSCSEG00000000260)
Turbot	MODERN SPECIES	17	ENSSMAG00000012583	ENSSMAG00000032423	ENSSMAG00000012615	adgrg1 (ENSSMAG00000012643)	ENSSMAG00000012657	slc7a6os (ENSSMAG00000012683)	ENSSMAG00000012691	ENSSMAG00000012698	ENSSMAG00000012734	ENSSMAG00000012772	dhcr7 (ENSSMAG00000012834)	ENSSMAG00000012901	ENSSMAG00000013108	DPY19L3 (ENSSMAG00000013138) #20	ZNF507 (ENSSMAG00000013249) #21	tshz3b (ENSSMAG00000013259) #22	ZNF536 (ENSSMAG00000013452) #24	ccne1 (ENSSMAG00000013478) #26	zgc:162297 (ENSSMAG00000013509)	ENSSMAG00000013524	si:ch211-260e23.8 (ENSSMAG00000013532) #27	ENSSMAG00000013543	ENSSMAG00000034045	ENSSMAG00000013710	ENSSMAG00000032464	ENSSMAG00000013750	ENSSMAG00000013817	ENSSMAG00000013827	TOLLIP (ENSSMAG00000024223)	ENSSMAG00000013963	ENSSMAG00000014040
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00390000017392	ENSGT00390000008092.b.a.b
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000154170.B	ENSGT00530000063760.a	ENSGT00390000000954	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067 #28
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	78																ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152	ENSGT00940000160143	ENSGT00730000110960.b
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	13																ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000178372.B	ENSGT00940000178372.A	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	13																ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000178372.B	ENSGT00940000178372.A	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	11																ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000178372.C	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152	ENSGT00940000160143
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	850																tshz3b (ENSHBUG00000012621) #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	10																ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000178372.C	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152	ENSGT00940000160143
P. nyererei	MODERN SPECIES	314																tshz3b (ENSPNYG00000020351) #22	ZNF536 (ENSPNYG00000020319) #24	ccne1 (ENSPNYG00000020291) #26	zgc:162297 (ENSPNYG00000020263)	si:ch211-260e23.9 (ENSPNYG00000020257)	si:ch211-260e23.8 (ENSPNYG00000020247) #27	ENSPNYG00000020224	AP2A2 (ENSPNYG00000020149)	tph1b (ENSPNYG00000020110)	cd81a (ENSPNYG00000020075)	PKP3 (ENSPNYG00000020056)	PLEKHF1 (ENSPNYG00000020050)	pop4 (ENSPNYG00000020038) #28	tpcn2 (ENSPNYG00000020013)	nadsyn1 (ENSPNYG00000019946)	DOK4 (ENSPNYG00000019911)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	3																ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000178372.C	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000160728.i	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000159763	ENSGT00390000010152	ENSGT00940000160143
Eastern happy	MODERN SPECIES		ENSACLG00000001912	slc6a5 (ENSACLG00000001866)	prmt3 (ENSACLG00000001816)	htatip2 (ENSACLG00000001778)	dbx1a (ENSACLG00000001754)	NAV2 (ENSACLG00000001504)	ENSACLG00000001415	e2f8 (ENSACLG00000001352)	csrp3 (ENSACLG00000001322)	zdhhc13 (ENSACLG00000001297)	mpped2a (ENSACLG00000001241)	ENSACLG00000001233	ENSACLG00000001162	NR2E3 (ENSACLG00000001100)	slc22a18 (ENSACLG00000001048)	tshz3b (ENSACLG00000000967) #22	ENSACLG00000000947	ENSACLG00000000933	ZNF536 (ENSACLG00000000897) #24	ccne1 (ENSACLG00000000839) #26	zgc:162297 (ENSACLG00000000821)	si:ch211-260e23.9 (ENSACLG00000000804)	C19orf12 (ENSACLG00000000798) #27	C19orf12 (ENSACLG00000000786) #27	ENSACLG00000000757	AP2A2 (ENSACLG00000000668)	tph1b (ENSACLG00000000631)	cd81a (ENSACLG00000000591)	PKP3 (ENSACLG00000000566)	PLEKHF1 (ENSACLG00000000563)	PLEKHF1 (ENSACLG00000000556)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1091	ENSMZEG00005001510	ENSMZEG00005001494	idh3a (ENSMZEG00005001440)	CIB2 (ENSMZEG00005001422)	hsd11b2 (ENSMZEG00005001414)	ENSMZEG00005001407	zdhhc1 (ENSMZEG00005001398)	tppp3 (ENSMZEG00005001390)	trpm1a (ENSMZEG00005001310)	galr1b (ENSMZEG00005001302)	ctrb.3 (ENSMZEG00005000050)	ENSMZEG00005000049	ENSMZEG00005000048	ENSMZEG00005000047	VPS13C (ENSMZEG00005000046)	tshz3b (ENSMZEG00005000045) #22	ENSMZEG00005000044	MMP15 (ENSMZEG00005000042)	ENSMZEG00005000041	dhcr7 (ENSMZEG00005000040)	ENSMZEG00005000039
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	379															ENSNBRG00000001840	tshz3b (ENSNBRG00000001818) #22	ZNF536 (ENSNBRG00000001799) #24	ccne1 (ENSNBRG00000001765) #26	zgc:162297 (ENSNBRG00000001734)	si:ch211-260e23.9 (ENSNBRG00000001727)	si:ch211-260e23.8 (ENSNBRG00000001717) #27	ENSNBRG00000001705	ENSNBRG00000001697	AP2A2 (ENSNBRG00000001674)	TPH1 (ENSNBRG00000001647)	cd81a (ENSNBRG00000001623)	ENSNBRG00000001557	PLEKHF1 (ENSNBRG00000001544)	tpcn2 (ENSNBRG00000001332)	nadsyn1 (ENSNBRG00000001182)	DOK4 (ENSNBRG00000001153)
Nile tilapia	MODERN SPECIES														ENSONIG00000027492	ENSONIG00000035792	ENSONIG00000041401	tshz3b (ENSONIG00000003518) #22	ENSONIG00000034908	ZNF536 (ENSONIG00000003511) #24	ENSONIG00000027462	ccne1 (ENSONIG00000003504) #26	zgc:162297 (ENSONIG00000003502)	si:ch211-260e23.9 (ENSONIG00000028167)	si:ch211-260e23.8 (ENSONIG00000003499) #27	ENSONIG00000003498	ENSONIG00000023928	AP2A2 (ENSONIG00000003489)	tph1b (ENSONIG00000003476)	cd81a (ENSONIG00000003468)	PKP3 (ENSONIG00000003463)	PLEKHF1 (ENSONIG00000042684)	pop4 (ENSONIG00000003458) #28
Midas cichlid	MODERN SPECIES	198																tshz3b (ENSACIG00000009014) #22	ZNF536 (ENSACIG00000008978) #24	ccne1 (ENSACIG00000008891) #26	zgc:162297 (ENSACIG00000008870)	si:ch211-260e23.9 (ENSACIG00000008839)	si:ch211-260e23.8 (ENSACIG00000008828) #27	ENSACIG00000008820	AP2A2 (ENSACIG00000008771)	tph1b (ENSACIG00000008600)	cd81a (ENSACIG00000008503)	PKP3 (ENSACIG00000008437)	PLEKHF1 (ENSACIG00000008418)	PLEKHF1 (ENSACIG00000008413)	pop4 (ENSACIG00000008358) #28	tpcn2 (ENSACIG00000008273)	nadsyn1 (ENSACIG00000008223)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	219													ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	242													ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	111													ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.a.b.a.a.a	ENSGT01030000234589.g.a.e.a.c.a	ENSGT01080000257344.a.b.b.b.b.b.b.a.a.b.b.a	ENSGT01030000234589.g.a.e.a.c.b	ENSGT00950000183149.C.a	ENSGT00940000159082	ENSGT00390000016068	ENSGT00390000015400	ENSGT00940000155645.i.b	ENSGT00940000154146.b.a.m.b
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1389																tshz3b (ENSAOCG00000018622) #22	ZNF536 (ENSAOCG00000018640) #24	ccne1 (ENSAOCG00000018657) #26	zgc:162297 (ENSAOCG00000018683)	si:ch211-260e23.9 (ENSAOCG00000018696)	si:ch211-260e23.8 (ENSAOCG00000018716) #27	ENSAOCG00000018737	ENSAOCG00000018754
Orange clownfish	MODERN SPECIES		SYAP1 (ENSAPEG00000005188)	adgrg1 (ENSAPEG00000005269)	slc7a6 (ENSAPEG00000005294)	slc7a6os (ENSAPEG00000005328)	ENSAPEG00000005351	lsm1 (ENSAPEG00000005382)	ENSAPEG00000005425	MMP15 (ENSAPEG00000005454)	dhcr7 (ENSAPEG00000005512)	ENSAPEG00000005549	ENSAPEG00000005609	ENSAPEG00000005633	ENSAPEG00000005780	DPY19L3 (ENSAPEG00000006024) #20	ZNF507 (ENSAPEG00000006089) #21	tshz3b (ENSAPEG00000006107) #22	ZNF536 (ENSAPEG00000006133) #24	ccne1 (ENSAPEG00000006177) #26	zgc:162297 (ENSAPEG00000006267)	si:ch211-260e23.9 (ENSAPEG00000006291)	si:ch211-260e23.8 (ENSAPEG00000006308) #27	ENSAPEG00000006320	ENSAPEG00000006333	ENSAPEG00000006377	ENSAPEG00000006403	ENSAPEG00000006448	ENSAPEG00000006468	PDPR (ENSAPEG00000006486)	mrps11 (ENSAPEG00000006598)	mrpl46 (ENSAPEG00000006612)	NTRK3 (ENSAPEG00000006663)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	795																tshz3b (ENSAPOG00000008025) #22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	392																tshz3b (ENSSPAG00000002275) #22	ZNF536 (ENSSPAG00000002197) #24	ccne1 (ENSSPAG00000002143) #26	si:ch211-260e23.9 (ENSSPAG00000002130)	zgc:162297 (ENSSPAG00000002099)	si:ch211-260e23.8 (ENSSPAG00000002081) #27
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00390000017392	ENSGT00390000008092.b.a.b
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000166567.d	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567.c	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f.b	ENSGT00940000158300.f.a	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000183172.C
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000166567.d	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567.c	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00940000171971	ENSGT00390000009077.c.e #27	ENSGT00390000009077.c.f #27	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f.b.a	ENSGT00940000158300.f.a	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00950000182838.A.a.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	26	ENSOMEG00000020388	SYAP1 (ENSOMEG00000020402)	ENSOMEG00000020424	adgrg1 (ENSOMEG00000020456)	slc7a6 (ENSOMEG00000020483)	slc7a6os (ENSOMEG00000020497)	ENSOMEG00000020531	ENSOMEG00000020539	MMP15 (ENSOMEG00000020581)	dhcr7 (ENSOMEG00000020649)	ENSOMEG00000020794	ENSOMEG00000021135	ENSOMEG00000021173	DPY19L3 (ENSOMEG00000021380) #20	ZNF507 (ENSOMEG00000021403) #21	tshz3b (ENSOMEG00000021471) #22	ZNF536 (ENSOMEG00000021491) #24	ccne1 (ENSOMEG00000021519) #26	zgc:162297 (ENSOMEG00000021543)	ENSOMEG00000021527	C19orf12 (ENSOMEG00000021552) #27	C19orf12 (ENSOMEG00000021563) #27	tph1b (ENSOMEG00000021592)	ENSOMEG00000021609	cd81a (ENSOMEG00000021636)	PKP3 (ENSOMEG00000021668)	ENSOMEG00000021758	ENSOMEG00000021798	ENSOMEG00000021813	ENSOMEG00000021822	ENSOMEG00000021841
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	17	phospho2 (ENSOJAG00000007456)	ENSOJAG00000007518	adgrg1 (ENSOJAG00000007528)	slc7a6 (ENSOJAG00000007548)	slc7a6os (ENSOJAG00000007638)	ENSOJAG00000007647	ENSOJAG00000007660	ENSOJAG00000007671	ENSOJAG00000007691	MMP15 (ENSOJAG00000007724)	dhcr7 (ENSOJAG00000007829)	ENSOJAG00000007930	DPY19L3 (ENSOJAG00000008939) #20	ENSOJAG00000009106	ZNF507 (ENSOJAG00000009144) #21	tshz3b (ENSOJAG00000009182) #22	ZNF536 (ENSOJAG00000009193) #24	ENSOJAG00000009218	ccne1 (ENSOJAG00000009251) #26	zgc:162297 (ENSOJAG00000009303)	ENSOJAG00000009313	C19orf12 (ENSOJAG00000009329) #27	C19orf12 (ENSOJAG00000009337) #27	tph1b (ENSOJAG00000009345)	cd81a (ENSOJAG00000009393)	PKP3 (ENSOJAG00000009422)	ENSOJAG00000009450	ENSOJAG00000009548	ANO9 (ENSOJAG00000009558)	shcbp1 (ENSOJAG00000009642)	spg21 (ENSOJAG00000009782)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000166567.d	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567.c	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f.a	ENSGT00390000003194.p.a.a.a	ENSGT00390000003194.p.b	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00950000182838.A.a.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	17	slc7a6os (ENSORLG00000015365)	ENSORLG00000023782	ENSORLG00000030283	ENSORLG00000024842	ENSORLG00000026609	mmp15b (ENSORLG00000015418)	dhcr7 (ENSORLG00000015429)	ENSORLG00000015441	ENSORLG00000030153	ENSORLG00000026674	ENSORLG00000028714	DPY19L3 (ENSORLG00000015460) #20	ENSORLG00000027920	ZNF507 (ENSORLG00000015469) #21	ENSORLG00000025580	tshz3b (ENSORLG00000015489) #22	ZNF536 (ENSORLG00000015493) #24	ccne1 (ENSORLG00000015511) #26	zgc:162297 (ENSORLG00000015518)	si:ch211-260e23.9 (ENSORLG00000030424)	si:ch211-260e23.8 (ENSORLG00000015522) #27	tph1b (ENSORLG00000015541)	cd81a (ENSORLG00000015561)	ENSORLG00000030430	PKP3 (ENSORLG00000023370)	ENSORLG00000026559	ENSORLG00000018673	ENSORLG00000024212	ENSORLG00000029031	ENSORLG00000021813	ENSORLG00000025792
Chinese medaka	MODERN SPECIES	22								ENSOSIG00000001574	MMP15 (ENSOSIG00000001788)	dhcr7 (ENSOSIG00000004593)	ENSOSIG00000004603	ENSOSIG00000004807	ENSOSIG00000004820	DPY19L3 (ENSOSIG00000004832) #20	ZNF507 (ENSOSIG00000004992) #21	tshz3b (ENSOSIG00000005002) #22	ZNF536 (ENSOSIG00000005011) #24	ccne1 (ENSOSIG00000005025) #26	zgc:162297 (ENSOSIG00000005032)	ENSOSIG00000005033	si:ch211-260e23.8 (ENSOSIG00000005034) #27	tph1b (ENSOSIG00000005044)	cd81a (ENSOSIG00000005336)	PKP3 (ENSOSIG00000005339)	ENSOSIG00000005341	ENSOSIG00000005344	ENSOSIG00000005345	ENSOSIG00000005347	ENSOSIG00000005348	ENSOSIG00000005350	ENSOSIG00000005354
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00390000017392	ENSGT00390000008092.b.a.b
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	67										ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000007857	ENSGT00390000017392	ENSGT00390000008092.b.a.b
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	48										MMP15 (ENSKMAG00000013964)	dhcr7 (ENSKMAG00000013920)	ENSKMAG00000013846	ENSKMAG00000013775	DPY19L3 (ENSKMAG00000013681) #20	ZNF507 (ENSKMAG00000013647) #21	tshz3b (ENSKMAG00000013627) #22	ZNF536 (ENSKMAG00000013518) #24	ccne1 (ENSKMAG00000013484) #26	zgc:162297 (ENSKMAG00000013465)	si:ch211-260e23.9 (ENSKMAG00000013454)	si:ch211-260e23.8 (ENSKMAG00000013444) #27	AP2A2 (ENSKMAG00000013307)	tph1b (ENSKMAG00000013199)	cd81a (ENSKMAG00000013135)	ENSKMAG00000013110	ANO9 (ENSKMAG00000013068)	ENSKMAG00000013039	shcbp1 (ENSKMAG00000013021)	spg21 (ENSKMAG00000012981)	pdcd7 (ENSKMAG00000012951)	UBAP1L (ENSKMAG00000012933)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1628	ENSNFUG00015014951	ENSNFUG00015014962	mylipa (ENSNFUG00015015095)	gmpr (ENSNFUG00015015124)	ATXN1A (ENSNFUG00015015205)	ENSNFUG00015015215	ENSNFUG00015015219	ENSNFUG00015015227	ENSNFUG00015015253	OLA.15992 (ENSNFUG00015015259)	MRPL53 (ENSNFUG00015015282)	ENSNFUG00015015304	ENSNFUG00015015314	PAG1 (ENSNFUG00015015328)	znf704 (ENSNFUG00015015340)	tshz3b (ENSNFUG00015014080) #22	TPD52 (ENSNFUG00015014092)	ZBTB10 (ENSNFUG00015014120)	HEY1 (ENSNFUG00015014150)	STMN2B (ENSNFUG00015014161)	ENSNFUG00015014176	OLA.23378 (ENSNFUG00015014268)	ENSNFUG00015014700	ENSNFUG00015014706	ENSNFUG00015014720	ripor2 (ENSNFUG00015014773)	GMNN (ENSNFUG00015015322)	C19H6ORF62 (ENSNFUG00015015334)	ACOT13 (ENSNFUG00015015362)	TDP2B (ENSNFUG00015015380)	TMEM64 (ENSNFUG00015015394)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00390000007741.b	ENSGT00390000007662.d.b	ENSGT00940000154285.b.a.a.b	ENSGT00940000158295	ENSGT00390000015672	ENSGT00940000166567	ENSGT00940000154285.b.a.b	ENSGT00940000156939.e	ENSGT00390000000417.a.b	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00950000182838.A.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.e	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000159515.c.b	ENSGT00940000158300.f	ENSGT00940000171378	ENSGT00940000166163	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b.a	ENSGT00390000001790
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Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	78						ENSGT00940000155491.d	ENSGT00940000159422.b	ENSGT00940000155399.a	ENSGT00940000157725.o	ENSGT00940000158086.a.a	ENSGT00940000155524.f	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.`b.a #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT01060000248998	ENSGT01030000235336	ENSGT01030000235123	ENSGT00940000154706.rb.a	ENSGT00940000154688.a.a	ENSGT00940000157725.o	ENSGT00940000158086.a.a	ENSGT00940000155524.f	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000161356 #29	ENSGT00390000001014.`b.a #30	ENSGT00940000161310	ENSGT00940000163206.a	ENSGT00390000007315	ENSGT00390000007370	ENSGT00940000160007	ENSGT00390000009505
Denticle herring	MODERN SPECIES	7	ENSDCDG00000023971	ENSDCDG00000023969	ENSDCDG00000023968	ENSDCDG00000023967	BTBD1 (ENSDCDG00000023710)	TM6SF1 (ENSDCDG00000023621)	HDGFL3 (ENSDCDG00000023607)	BNC1 (ENSDCDG00000023604)	dnaja2a (ENSDCDG00000023601)	rbpms2b (ENSDCDG00000023595)	cpeb1b (ENSDCDG00000023558)	ENSDCDG00000023133	ENSDCDG00000023099	DPY19L3 (ENSDCDG00000022609) #20	ZNF507 (ENSDCDG00000022596) #21	tshz3b (ENSDCDG00000022594) #22	ZNF536 (ENSDCDG00000022591) #24	ccne1 (ENSDCDG00000022577) #26	zgc:162297 (ENSDCDG00000022567)	ENSDCDG00000022562	C19orf12 (ENSDCDG00000022555) #27	C19orf12 (ENSDCDG00000022551) #27	PLEKHF1 (ENSDCDG00000022549)	pop4 (ENSDCDG00000022545) #28	vstm2b (ENSDCDG00000022538) #29	uqcrfs1 (ENSDCDG00000034845) #30	SHCBP1 (ENSDCDG00000034843)	hrh3 (ENSDCDG00000034842)	vps35 (ENSDCDG00000034841)	orc6 (ENSDCDG00000034836)	mylk3 (ENSDCDG00000034834)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	22	WHAMM (ENSCHAG00000022574)	HOMER2 (ENSCHAG00000022545)	RAMAC (ENSCHAG00000022537)	BTBD1 (ENSCHAG00000022510)	TM6SF1 (ENSCHAG00000022465)	HDGFL3 (ENSCHAG00000022405)	BNC1 (ENSCHAG00000022380)	dnaja2a (ENSCHAG00000022281)	oaz2b (ENSCHAG00000022246)	rbpms2b (ENSCHAG00000022237)	cpeb1b (ENSCHAG00000021921)	ENSCHAG00000021126	ENSCHAG00000020948	DPY19L3 (ENSCHAG00000020674) #20	ZNF507 (ENSCHAG00000020656) #21	tshz3b (ENSCHAG00000020650) #22	ZNF536 (ENSCHAG00000020641) #24	ccne1 (ENSCHAG00000020517) #26	zgc:162297 (ENSCHAG00000020510)	si:ch211-260e23.9 (ENSCHAG00000020508)	si:ch211-260e23.8 (ENSCHAG00000020461) #27	PLEKHF1 (ENSCHAG00000020435)	pop4 (ENSCHAG00000020421) #28	vstm2b (ENSCHAG00000020412) #29	uqcrfs1 (ENSCHAG00000020394) #30	SHCBP1 (ENSCHAG00000020178)	gpib (ENSCHAG00000018749)	ENSCHAG00000018685	pigb (ENSCHAG00000018628)	ENSCHAG00000018603	ENSCHAG00000018590
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	202	ENSGT00530000063981.b.d	ENSGT00940000160588	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT00940000155491.d	ENSGT00940000159422.b	ENSGT00940000155399.a	ENSGT00940000157725.o	ENSGT00940000158086.a.a	ENSGT00940000155524.f	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00940000180790	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000001014.`b.a #30	ENSGT00940000161356 #29
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160745.c	ENSGT00940000164715.a	ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b	ENSGT00940000156049.b	ENSGT00940000159628.c	ENSGT00940000155971.d.b.a.c	ENSGT00940000155426	ENSGT00530000063981.b.d	ENSGT00940000160588	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00940000180790	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000159068	ENSGT00940000156718	ENSGT00530000063582.b	ENSGT00390000007623.c	ENSGT01030000235035	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00390000005764.`b	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000158146.a	ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.j	ENSGT00940000157505	ENSGT00940000158440.g.a	ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	19	traf6 (ENSIPUG00000022164)	ENSIPUG00000022153	trpm5 (ENSIPUG00000022100)	cdkn1ca (ENSIPUG00000022095)	kcnq1.1 (ENSIPUG00000021227)	lingo1b (ENSIPUG00000021214)	Sin3a (ENSIPUG00000021061)	crabp1b (ENSIPUG00000021033)	slc25a44b (ENSIPUG00000021014)	RBPMS (ENSIPUG00000020981)	cpeb1 (ENSIPUG00000020960)	mtss1l (ENSIPUG00000020951)	ENSIPUG00000020923	dpy19l3 (ENSIPUG00000020870) #20	ZNF507 (ENSIPUG00000020853) #21	TSHZ3 (ENSIPUG00000020845) #22	znf536 (ENSIPUG00000020834) #24	nr1h3 (ENSIPUG00000019883)	ENSIPUG00000019875	madd (ENSIPUG00000019744)	Bbox1 (ENSIPUG00000019724)	fibin (ENSIPUG00000019720)	muc15 (ENSIPUG00000019713)	dis3l (ENSIPUG00000019669)	tipin (ENSIPUG00000019666)	crybgx (ENSIPUG00000019649)	LCTL (ENSIPUG00000019586)	smad6a (ENSIPUG00000019564)	SMAD3 (ENSIPUG00000019525)	map2k5 (ENSIPUG00000019485)	skor1a (ENSIPUG00000019469)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000155426	ENSGT00530000063981.b.d	ENSGT00940000160588	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT00940000155491.d	ENSGT00940000159422.b	ENSGT00940000155399.a	ENSGT00940000158086.a.a	ENSGT00940000155524.f	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00940000180790	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000159068	ENSGT00940000156718	ENSGT00530000063582.b	ENSGT00390000007623.c	ENSGT01030000235035	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00390000005764.`b	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000158146.a	ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.j	ENSGT00940000157505	ENSGT00940000158440.h	ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000160745.c	ENSGT00940000164715.a	ENSGT01060000248595.b.a.b.a.n.b	ENSGT00940000156049.b	ENSGT00940000159628.c	ENSGT00940000155971.d.b.a.c	ENSGT00940000155426	ENSGT00530000063981.b.d	ENSGT00940000160588	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00940000180790	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000159068	ENSGT00940000156718	ENSGT00530000063582.b	ENSGT00390000007623.c	ENSGT01030000235035	ENSGT00530000063106.B	ENSGT00390000005764.`b	ENSGT00940000157369.b	ENSGT00940000165890	ENSGT00940000158146.a	ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.j	ENSGT00940000157505	ENSGT00940000158440.h	ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	69																tshz3b (ENSPNAG00000003295) #22	ENSPNAG00000014871	ENSPNAG00000004953	ENSPNAG00000014923	CRISPLD2 (ENSPNAG00000014939)	USP10 (ENSPNAG00000014990)	marveld3 (ENSPNAG00000015006)	PHLPP2 (ENSPNAG00000015065)	ap1g1 (ENSPNAG00000015079)	ZNF821 (ENSPNAG00000015093)	ATXN1L (ENSPNAG00000003367)	hsbp1a (ENSPNAG00000015119)	ENSPNAG00000015127	KMT5B (ENSPNAG00000015190)	tp53i11a (ENSPNAG00000015209)	cd82a (ENSPNAG00000015230)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	47	cpt1aa (ENSAMXG00000007601)	mfge8a (ENSAMXG00000007594)	HAPLN3 (ENSAMXG00000007589)	ACAN (ENSAMXG00000007573)	traf6 (ENSAMXG00000007558)	ENSAMXG00000034197	trpm5 (ENSAMXG00000007541)	ENSAMXG00000043541	cdkn1ca (ENSAMXG00000029661)	kcnq1.1 (ENSAMXG00000007521)	lingo1b (ENSAMXG00000032291)	ENSAMXG00000019158	DPY19L3 (ENSAMXG00000006298) #20	ENSAMXG00000033989	ZNF507 (ENSAMXG00000006289) #21	tshz3b (ENSAMXG00000006284) #22	ZNF536 (ENSAMXG00000006281) #24	ENSAMXG00000033278	nr1h3 (ENSAMXG00000006277)	MADD (ENSAMXG00000006269)	bbox1 (ENSAMXG00000006257)	fibinb (ENSAMXG00000025955)	ENSAMXG00000006252	dis3l (ENSAMXG00000006220)	tipin (ENSAMXG00000035999)	lctla (ENSAMXG00000006194)	crybgx (ENSAMXG00000006190)	ENSAMXG00000029211	smad6a (ENSAMXG00000006188)	smad3a (ENSAMXG00000006181)	map2k5 (ENSAMXG00000006170)
Electric eel	MODERN SPECIES	82	ENSEEEG00000020166	PIAS1 (ENSEEEG00000020167)	skor1a (ENSEEEG00000020172)	map2k5 (ENSEEEG00000020174)	smad3a (ENSEEEG00000020177)	smad6a (ENSEEEG00000020182)	ENSEEEG00000020190	lctla (ENSEEEG00000020199)	tipin (ENSEEEG00000020200)	rbpms2b (ENSEEEG00000020201)	cpeb1b (ENSEEEG00000020204)	ENSEEEG00000020205	ENSEEEG00000020206	DPY19L3 (ENSEEEG00000020207) #20	ZNF507 (ENSEEEG00000020208) #21	tshz3b (ENSEEEG00000020209) #22	ZNF536 (ENSEEEG00000020210) #24	nr1h3 (ENSEEEG00000020215)	MADD (ENSEEEG00000020444)	bbox1 (ENSEEEG00000021039)	fibinb (ENSEEEG00000021042)	ENSEEEG00000021043	dis3l (ENSEEEG00000021047)	slc25a44b (ENSEEEG00000021048)	crabp1b (ENSEEEG00000021052)	ENSEEEG00000021083	lingo1b (ENSEEEG00000021262)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063981.b.d	ENSGT00940000160588	ENSGT00940000164990.d	ENSGT00940000154996.a.b.b	ENSGT00940000155491.d	ENSGT00940000159422.b	ENSGT00940000155399.a	ENSGT00940000157725.o	ENSGT00940000158086.a.a	ENSGT00940000155524.f	ENSGT00950000183156.b	ENSGT00940000164020.c	ENSGT00530000063023.A.a #20	ENSGT00940000180790	ENSGT00490000043434 #21	ENSGT00950000183051.b.a #22	ENSGT00940000156397.a.a #24	ENSGT00940000156256 #26	ENSGT00390000006020	ENSGT00530000063829.B	ENSGT00390000009077.c.w.a #27	ENSGT00390000009077.c.w.b #27	ENSGT00940000171971	ENSGT00390000009077.c.x.a #27	ENSGT00980000200433	ENSGT00390000009077.c.x.b #27	ENSGT00940000160728	ENSGT00390000010067 #28	ENSGT00940000166163	ENSGT00390000001014.`b.a #30	ENSGT00940000161356 #29
Cyprininae	DUPLICATION
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Reedfish	MODERN SPECIES	17	ENSECRG00000005824	MMP15 (ENSECRG00000005587)	zpd (ENSECRG00000005577)	slc7a6os (ENSECRG00000005567)	slc7a6 (ENSECRG00000005558)	ENSECRG00000005542	adgrg1 (ENSECRG00000005521)	ccdc102a (ENSECRG00000005500)	DOK4 (ENSECRG00000005489)	vac14 (ENSECRG00000005436)	ENSECRG00000005396	ENSECRG00000005346	DPY19L3 (ENSECRG00000005296) #20	ZNF507 (ENSECRG00000005278) #21	ENSECRG00000005254	tshz3b (ENSECRG00000005243) #22	ZNF536 (ENSECRG00000005227) #24	uri1 (ENSECRG00000005209) #25	ccne1 (ENSECRG00000005172) #26	zgc:162297 (ENSECRG00000005144)	ENSECRG00000005129	si:ch211-260e23.8 (ENSECRG00000005122) #27	PLEKHF1 (ENSECRG00000005111)	pop4 (ENSECRG00000005078) #28	vstm2b (ENSECRG00000005058) #29	uqcrfs1 (ENSECRG00000005033) #30	ENSECRG00000005026	SHCBP1 (ENSECRG00000005000)	hrh3 (ENSECRG00000008988)	vps35 (ENSECRG00000008919)	orc6 (ENSECRG00000008902)
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Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.b.b ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.b.b ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.b.b ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.b.b ##22
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.b.b ##22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000165530.a.a	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00940000155580.b.a.b	ENSGT00940000163529	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00390000014700.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00940000163529	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b	ENSGT00940000155867.a.b.f
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	114	ENSGT00940000158437	ENSGT00940000158203	ENSGT00940000156681	ENSGT01030000234595.B.c.b	ENSGT00940000154983.c.a	ENSGT00390000010221.z	ENSGT00390000011228.b.b	ENSGT01020000230354.A.b	ENSGT00390000015073	ENSGT00940000163804	ENSGT00390000000950.c.b	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b.b	ENSGT00940000155867.a.b.f	ENSGT00440000033504.B.a
Denticle herring	DUPLICATION
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Atlantic herring	MODERN SPECIES	19	cd81b (ENSCHAG00000024344)	pkp3a (ENSCHAG00000024366)	sigirr (ENSCHAG00000024425)	ANO9 (ENSCHAG00000024433)	ANO5 (ENSCHAG00000024481)	SLC17A6 (ENSCHAG00000025027)	fancf (ENSCHAG00000025490)	GAS2 (ENSCHAG00000025493)	svip (ENSCHAG00000025501)	BEND7 (ENSCHAG00000025503)	sephs1 (ENSCHAG00000025516)	trabd (ENSCHAG00000025525)	selenoo1 (ENSCHAG00000025538)	mapk12a (ENSCHAG00000025556)	mtss1la (ENSCHAG00000025586)	ENSCHAG00000025731 ##22	ENSCHAG00000025734 ##24	uri1 (ENSCHAG00000025744) #25	zgc:112052 (ENSCHAG00000025759) #27	uqcrfs1 (ENSCHAG00000025764) #30	rxylt1 (ENSCHAG00000025771)	SRGAP1 (ENSCHAG00000025868)	ENSCHAG00000026823	ENSCHAG00000026827	ENSCHAG00000026829	ENSCHAG00000026832	parp12a (ENSCHAG00000026835)	parp12a (ENSCHAG00000026838)	tbxas1 (ENSCHAG00000026858)	hipk2 (ENSCHAG00000026942)	ENSCHAG00000027048
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Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000014700.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a.g	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000155218.B.k	ENSGT00390000005410	ENSGT00940000166270.d	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000155580.b.a.a
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Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000014700.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a.g	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000155218.B.k	ENSGT00390000005410	ENSGT00940000166270.d	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000155580.b.a.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01050000244879.b.a.b.a	ENSGT00390000014700.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a.g	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000155218.B.k	ENSGT00390000005410	ENSGT00940000166270.d	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00940000155580.b.a.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES		ric8b (ENSPNAG00000019187)	ENSPNAG00000019232	tmem263 (ENSPNAG00000019249)	si:ch73-62b13.1 (ENSPNAG00000019260)	ENSPNAG00000019268	mterf2 (ENSPNAG00000019282)	zgc:153031 (ENSPNAG00000003587)	cry1b (ENSPNAG00000019322)	ABTB3 (ENSPNAG00000019382)	mlc1 (ENSPNAG00000019402)	panx2 (ENSPNAG00000019428)	trabd (ENSPNAG00000019439)	selenoo1 (ENSPNAG00000019449)	mapk12a (ENSPNAG00000019493)	mtss1la (ENSPNAG00000006515)	ENSPNAG00000019608 ##22	uri1 (ENSPNAG00000019618) #25	pdf (ENSPNAG00000019626)	ENSPNAG00000019633	si:dkey-238o13.4 (ENSPNAG00000019653)	vps9d1 (ENSPNAG00000019676)	CDH13 (ENSPNAG00000019772)	mlycd (ENSPNAG00000005878)	ENSPNAG00000019810	hsbp1b (ENSPNAG00000019836)	ENSPNAG00000019844	kcng4a (ENSPNAG00000019849)	ENSPNAG00000019865	wfdc1 (ENSPNAG00000003611)	utp4 (ENSPNAG00000019890)	mical3a (ENSPNAG00000019970)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	9	rfx4 (ENSAMXG00000020148)	ric8b (ENSAMXG00000020135)	ENSAMXG00000020124	tmem263 (ENSAMXG00000037305)	si:ch73-62b13.1 (ENSAMXG00000042749)	mterf2 (ENSAMXG00000024936)	zgc:153031 (ENSAMXG00000041628)	cry1b (ENSAMXG00000020084)	ABTB3 (ENSAMXG00000020049)	mlc1 (ENSAMXG00000006798)	panx2 (ENSAMXG00000020031)	trabd (ENSAMXG00000039336)	selenoo1 (ENSAMXG00000020012)	mapk12a (ENSAMXG00000019974)	mtss1la (ENSAMXG00000019955)	ENSAMXG00000043502 ##22	uri1 (ENSAMXG00000031880) #25	pdf (ENSAMXG00000019932)	ENSAMXG00000035773	si:dkey-238o13.4 (ENSAMXG00000034754)	vps9d1 (ENSAMXG00000029363)	ENSAMXG00000039399	CDH13 (ENSAMXG00000019851)	mlycd (ENSAMXG00000040324)	ENSAMXG00000019814	hsbp1b (ENSAMXG00000019795)	ENSAMXG00000019779	kcng4a (ENSAMXG00000019763)	ENSAMXG00000019744	wfdc1 (ENSAMXG00000043594)	utp4 (ENSAMXG00000019690)
Electric eel	MODERN SPECIES	482								ENSEEEG00000012039	mlc1 (ENSEEEG00000012044)	panx2 (ENSEEEG00000012050)	trabd (ENSEEEG00000012054)	selenoo1 (ENSEEEG00000012060)	mapk12a (ENSEEEG00000012094)	ENSEEEG00000012581	ENSEEEG00000012582	ENSEEEG00000012585 ##22	uri1 (ENSEEEG00000012587) #25	pdf (ENSEEEG00000012588)	ENSEEEG00000012589	si:dkey-238o13.4 (ENSEEEG00000012590)	vps9d1 (ENSEEEG00000012592)	ENSEEEG00000012594
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01050000244879.b.a.b.a	ENSGT00390000014700.a	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000018698	ENSGT00530000063956.b.a	ENSGT01030000235114	ENSGT00390000015057	ENSGT00940000153533.b	ENSGT00390000014299	ENSGT00940000164450.b	ENSGT00940000156938.f	ENSGT00390000002381.b	ENSGT00940000166270.d	ENSGT00390000005410	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000018220	ENSGT00940000157517.i.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	484							ENSGT00530000063817.b.a.b	ENSGT00940000165780.a	ENSGT00940000155455.h.a	ENSGT00940000156419.a.b	ENSGT00940000153972.C.a	ENSGT00390000009067.d	ENSGT00390000005508.a.a.b	ENSGT00940000156189.a.a.a	ENSGT00950000183156.a.a.e	ENSGT00950000183051.b.b.c ##22	ENSGT00390000002362.r #25	ENSGT00530000063956.b.a.a	ENSGT01030000235114.a	ENSGT00390000015057.h	ENSGT00940000153533.b.a	ENSGT00390000014299.h	ENSGT00940000164450.b.b	ENSGT00940000156938.f.b	ENSGT00390000002381.b.a	ENSGT00390000006293.n.b.a	ENSGT00940000166270.c	ENSGT00390000005410.d	ENSGT00940000155218.B.n
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.h	ENSGT00390000014700.a.b	ENSGT00940000165765	ENSGT00390000013899.a.a.n	ENSGT00390000013899.a.a.m.a	ENSGT00940000164185.b	ENSGT00530000063817.b.a.b	ENSGT00940000165780.a	ENSGT00940000155455.h.a	ENSGT00940000156419.a.b	ENSGT00940000153972.C.a	ENSGT00390000009067.d	ENSGT00390000005508.a.a.b	ENSGT00940000156189.a.a.a	ENSGT00950000183156.a.a.e	ENSGT00950000183051.b.b.c ##22	ENSGT00390000002362.r #25	ENSGT00530000063956.b.a.a	ENSGT01030000235114.a	ENSGT00390000015057.h	ENSGT00940000153533.b.a	ENSGT00390000014299.h	ENSGT00940000164450.b.b	ENSGT00940000156938.f.b	ENSGT00390000002381.b.a	ENSGT00390000006293.n.b.a	ENSGT00940000166270.c	ENSGT00390000005410.d	ENSGT00940000155218.B.n
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	54	POLR3B (ENSSGRG00000041833)	rfx4 (ENSSGRG00000041857)	ric8b (ENSSGRG00000041860)	ENSSGRG00000041879	ENSSGRG00000041899	tmem263 (ENSSGRG00000041900)	si:ch73-62b13.1 (ENSSGRG00000041901)	cry1b (ENSSGRG00000041906)	ABTB3 (ENSSGRG00000042000)	mlc1 (ENSSGRG00000042010)	panx2 (ENSSGRG00000042011)	trabd (ENSSGRG00000042015)	selenoo1 (ENSSGRG00000042064)	mapk12a (ENSSGRG00000042071)	mtss1la (ENSSGRG00000042074)	ENSSGRG00000042356 ##22	uri1 (ENSSGRG00000042359) #25	ENSSGRG00000042360	si:dkey-238o13.4 (ENSSGRG00000042361)	vps9d1 (ENSSGRG00000042362)	utp4 (ENSSGRG00000042365)	wfdc1 (ENSSGRG00000042452)	kcng4a (ENSSGRG00000042454)	ENSSGRG00000042456	hsbp1b (ENSSGRG00000042460)	ENSSGRG00000042462	mlycd (ENSSGRG00000042463)	CDH13 (ENSSGRG00000042494)
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Goldfish	MODERN SPECIES	2537													selenoo1 (ENSCARG00000068276)	mapk12a (ENSCARG00000068305)	mtss1la (ENSCARG00000068363)	ENSCARG00000068484 ##22	uri1 (ENSCARG00000068496) #25	ENSCARG00000068523	ENSCARG00000068533	si:dkey-238o13.4 (ENSCARG00000068550)	vps9d1 (ENSCARG00000068589)	wfdc1 (ENSCARG00000068656)	ENSCARG00000068672
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	25				ENSGT00390000013899.a.a.m.b	ENSGT00940000164185.a	ENSGT00530000063817.b.a.a	ENSGT00940000165780.b	ENSGT00940000155455.h.b	ENSGT00940000156419.a.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C.b	ENSGT00390000009067.e	ENSGT00390000005508.a.a.a	ENSGT00940000156189.a.a.b	ENSGT00950000183156.a.a.f	ENSGT00950000183051.b.b.d ##22	ENSGT00390000002362.q #25	ENSGT00390000018698.e	ENSGT00530000063956.b.a.b	ENSGT01030000235114.b	ENSGT00390000015057.g	ENSGT00940000153533.b.b	ENSGT00390000014299.g	ENSGT00940000164450.b.a	ENSGT00940000156938.f.a	ENSGT00390000002381.b.b	ENSGT00390000006293.n.b.b	ENSGT00940000166270.d	ENSGT00390000005410.c	ENSGT00940000155218.B.m	ENSGT00940000155273.e.a
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	486	POLR3B (ENSSGRG00000032885)	rfx4 (ENSSGRG00000033203)	ric8b (ENSSGRG00000033210)	ENSSGRG00000033225	si:ch73-62b13.1 (ENSSGRG00000033227)	mterf2 (ENSSGRG00000033230)	zgc:153031 (ENSSGRG00000033234)	cry1b (ENSSGRG00000033236)	ABTB3 (ENSSGRG00000033238)	mlc1 (ENSSGRG00000033314)	panx2 (ENSSGRG00000033315)	trabd (ENSSGRG00000033317)	selenoo1 (ENSSGRG00000033319)	mapk12a (ENSSGRG00000033322)	mtss1la (ENSSGRG00000033744)	ENSSGRG00000033909 ##22	uri1 (ENSSGRG00000033910) #25	pdf (ENSSGRG00000033911)	ENSSGRG00000033912	si:dkey-238o13.4 (ENSSGRG00000033913)	vps9d1 (ENSSGRG00000033916)	utp4 (ENSSGRG00000033963)	wfdc1 (ENSSGRG00000034080)	ENSSGRG00000034083	kcng4a (ENSSGRG00000034085)	ENSSGRG00000034087	hsbp1b (ENSSGRG00000034089)	ENSSGRG00000034106	mlycd (ENSSGRG00000034515)	CDH13 (ENSSGRG00000034529)
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Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000013899.a.a	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000165530.a.a	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b	ENSGT00940000155867.a.a	ENSGT00940000164603
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Salmoninae	DUPLICATION
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Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.e	ENSGT00950000183132.A	ENSGT00940000164832.e.b	ENSGT00390000013899.a.a.o	ENSGT00940000164185.d	ENSGT00530000063817.b.a.e	ENSGT00940000165780.g	ENSGT00940000155455.h.d	ENSGT00940000156419.a.h	ENSGT00390000015442.f	ENSGT00940000153972.C.d	ENSGT00390000005508.a.a.e	ENSGT00940000156189.a.a.d	ENSGT00950000183156.a.a.d	ENSGT00940000164020.d.a	ENSGT00950000183051.b.b.e ##22	ENSGT00940000156397.b.d ##24	ENSGT00390000002362.s #25	ENSGT00390000001014.`b.a.h #30	ENSGT00390000003526.l	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f	ENSGT00940000154649.B.n	ENSGT00940000157903.e	ENSGT00940000157742.b.d	ENSGT00530000063472.b.a.f	ENSGT00940000155580.b.a.a.g	ENSGT00940000158225.i.b.f	ENSGT00940000155867.a.a.e	ENSGT00440000033504.B.a.d	ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156144.a.a.l
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000014700.a.f	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.e	ENSGT00950000183132.A.k	ENSGT00940000164832.e.b	ENSGT00390000013899.a.a.o	ENSGT00940000164185.d	ENSGT00530000063817.b.a.e	ENSGT00940000155455.h.d	ENSGT00940000156419.a.h	ENSGT00390000015442.f	ENSGT00940000153972.C.d	ENSGT00390000005508.a.a.e	ENSGT00940000156189.a.a.d	ENSGT00950000183156.a.a.d	ENSGT00940000164020.d.a	ENSGT00950000183051.b.b.e ##22	ENSGT00940000156397.b.d ##24	ENSGT00390000002362.s #25	ENSGT00390000001014.`b.a.h #30	ENSGT00390000003526.l	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f	ENSGT00940000154649.B.n	ENSGT00940000157903.e	ENSGT00940000157742.b.d	ENSGT00530000063472.b.a.f	ENSGT00940000155580.b.a.a.g	ENSGT00940000158225.i.b.f	ENSGT00940000155867.a.a.e	ENSGT00440000033504.B.a.d	ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156144.a.a.l
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	1	ENSSSAG00000071189	rfx4 (ENSSSAG00000071211)	ENSSSAG00000071265	ENSSSAG00000065899	tmem263 (ENSSSAG00000100537)	si:ch73-62b13.1 (ENSSSAG00000092172)	mterf2 (ENSSSAG00000100696)	cry1b (ENSSSAG00000071693)	btbd11 (ENSSSAG00000071875)	mlc1 (ENSSSAG00000071981)	panx2 (ENSSSAG00000086268)	selenoo1 (ENSSSAG00000003932)	mapk12a (ENSSSAG00000003974)	mtss1la (ENSSSAG00000004185)	ENSSSAG00000004764	ENSSSAG00000004842 ##22	ENSSSAG00000121469 ##24	uri1 (ENSSSAG00000004857) #25	ENSSSAG00000004878 #30	rxylt1 (ENSSSAG00000004890)	ENSSSAG00000004979	ENSSSAG00000106367	parp12a (ENSSSAG00000005381)	tbxas1 (ENSSSAG00000005440)	hipk2 (ENSSSAG00000005908)	ENSSSAG00000094798	ENSSSAG00000006893	ENSSSAG00000006937	ENSSSAG00000007828	ENSSSAG00000007836	ENSSSAG00000089624
River trout	MODERN SPECIES	37	rfx4 (ENSSTUG00000008214)	POLR3B (ENSSTUG00000008246)	ENSSTUG00000008594	ENSSTUG00000008629	tmem263 (ENSSTUG00000008637)	si:ch73-62b13.1 (ENSSTUG00000008649)	mterf2 (ENSSTUG00000008656)	cry1b (ENSSTUG00000008668)	ABTB3 (ENSSTUG00000008770)	mlc1 (ENSSTUG00000009122)	panx2 (ENSSTUG00000009191)	selenoo1 (ENSSTUG00000009203)	mapk12a (ENSSTUG00000009296)	mtss1la (ENSSTUG00000011314)	ENSSTUG00000011599	ENSSTUG00000011663 ##22	ENSSTUG00000011670 ##24	uri1 (ENSSTUG00000011686) #25	uqcrfs1 (ENSSTUG00000011706) #30	rxylt1 (ENSSTUG00000011719)	SRGAP1 (ENSSTUG00000012057)	parp12a (ENSSTUG00000016632)	tbxas1 (ENSSTUG00000016725)	hipk2 (ENSSTUG00000017457)	ENSSTUG00000018194	mical3a (ENSSTUG00000018472)	TSPAN9 (ENSSTUG00000021093)	ENSSTUG00000021104	PRMT8 (ENSSTUG00000021133)	CRACR2A (ENSSTUG00000021673)	TMTC2 (ENSSTUG00000021776)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000014700.a.f	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.e	ENSGT00950000183132.A	ENSGT00940000164832.e.b.f	ENSGT00390000013899.a.a.o	ENSGT00940000164185.d	ENSGT00530000063817.b.a.e	ENSGT00940000165780.g	ENSGT00940000155455.h.d	ENSGT00940000156419.a.h	ENSGT00940000153972.C.d	ENSGT00390000005508.a.a.e	ENSGT00940000156189.a.a.d	ENSGT00950000183156.a.a.d	ENSGT00940000164020.d.a	ENSGT00950000183051.b.b.e ##22	ENSGT00940000156397.b.d ##24	ENSGT00390000002362.s #25	ENSGT00390000001014.`b.a.h #30	ENSGT00390000003526.l	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f	ENSGT00940000154649.B.n	ENSGT00940000157903.e	ENSGT00940000157742.b.d	ENSGT00530000063472.b.a.f	ENSGT00940000155580.b.a.a.g	ENSGT00940000158225.i.b.f	ENSGT00940000155867.a.a.e	ENSGT00440000033504.B.a.d	ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156144.a.a.l
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000014700.a.f	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.e	ENSGT00950000183132.A	ENSGT00940000164832.e.b.f	ENSGT00390000013899.a.a.o	ENSGT00940000164185.d	ENSGT00530000063817.b.a.e	ENSGT00940000165780.g	ENSGT00940000155455.h.d	ENSGT00940000156419.a.h	ENSGT00940000153972.C.d	ENSGT00390000005508.a.a.e	ENSGT00940000156189.a.a.d	ENSGT00950000183156.a.a.d	ENSGT00940000164020.d.a	ENSGT00950000183051.b.b.e ##22	ENSGT00940000156397.b.d ##24	ENSGT00390000002362.s #25	ENSGT00390000001014.`b.a.h #30	ENSGT00390000003526.l	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f	ENSGT00940000154649.B.n	ENSGT00940000157903.e	ENSGT00940000157742.b.d	ENSGT00530000063472.b.a.f	ENSGT00940000155580.b.a.a.g	ENSGT00940000158225.i.b.f	ENSGT00940000155867.a.a.e	ENSGT00440000033504.B.a.d	ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156144.a.a.l
Coho salmon	MODERN SPECIES	14	ric8b (ENSOKIG00005006140)	rfx4 (ENSOKIG00005006189)	ENSOKIG00005006322	ENSOKIG00005006671	tmem263 (ENSOKIG00005006694)	si:ch73-62b13.1 (ENSOKIG00005006699)	mterf2 (ENSOKIG00005006702)	zgc:153031 (ENSOKIG00005006707)	cry1b (ENSOKIG00005006749)	ABTB3 (ENSOKIG00005007030)	panx2 (ENSOKIG00005007333)	selenoo1 (ENSOKIG00005007322)	mapk12a (ENSOKIG00005007366)	mtss1la (ENSOKIG00005007702)	ENSOKIG00005007998	ENSOKIG00005008087 ##22	ENSOKIG00005008092	ENSOKIG00005008097 ##24	uri1 (ENSOKIG00005008110) #25	ENSOKIG00005008120	UQCRFS1 (ENSOKIG00005008126) #30	rxylt1 (ENSOKIG00005008139)	SRGAP1 (ENSOKIG00005008355)	parp12a (ENSOKIG00005012261)	tbxas1 (ENSOKIG00005012320)	hipk2 (ENSOKIG00005013298)	ENSOKIG00005013936	ENSOKIG00005013947	mical3a (ENSOKIG00005014137)	TSPAN9 (ENSOKIG00005015316)	PRMT8 (ENSOKIG00005015388)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	10	ric8b (ENSOTSG00005040062)	rfx4 (ENSOTSG00005040075)	ENSOTSG00005040083	ENSOTSG00005040088	tmem263 (ENSOTSG00005040090)	si:ch73-62b13.1 (ENSOTSG00005040093)	mterf2 (ENSOTSG00005040095)	zgc:153031 (ENSOTSG00005040098)	cry1b (ENSOTSG00005040102)	ABTB3 (ENSOTSG00005040135)	panx2 (ENSOTSG00005040172)	selenoo1 (ENSOTSG00005040174)	mapk12a (ENSOTSG00005040175)	mtss1la (ENSOTSG00005040176)	ENSOTSG00005040236	ENSOTSG00005040238 ##22	ENSOTSG00005040240 ##24	uri1 (ENSOTSG00005040241) #25	ENSOTSG00005040243	uqcrfs1 (ENSOTSG00005040244) #30	ENSOTSG00005040246	SRGAP1 (ENSOTSG00005040267)	parp12a (ENSOTSG00005044338)	tbxas1 (ENSOTSG00005044349)	hipk2 (ENSOTSG00005044416)	ENSOTSG00005044446	mical3a (ENSOTSG00005033017)	TSPAN9 (ENSOTSG00005033396)	PRMT8 (ENSOTSG00005033402)	CRACR2A (ENSOTSG00005034954)	ENSOTSG00005034957
Rainbow trout	MODERN SPECIES	11	POLR3B (ENSOMYG00000007132)	ENSOMYG00000007239	tmem263 (ENSOMYG00000076435)	si:ch73-62b13.1 (ENSOMYG00000007265)	ENSOMYG00000007280	mterf2 (ENSOMYG00000007298)	zgc:153031 (ENSOMYG00000007309)	cry1b (ENSOMYG00000007326)	ENSOMYG00000008112	ENSOMYG00000008627	panx2 (ENSOMYG00000008700)	selenoo1 (ENSOMYG00000008723)	mapk12a (ENSOMYG00000009070)	mtss1la (ENSOMYG00000009663)	ENSOMYG00000009746	ENSOMYG00000009782 ##22	ENSOMYG00000009812 ##24	uri1 (ENSOMYG00000009826) #25	rxylt1 (ENSOMYG00000009856)	ENSOMYG00000010832	parp12a (ENSOMYG00000016113)	tbxas1 (ENSOMYG00000016166)	hipk2 (ENSOMYG00000017352)	ENSOMYG00000017865	ENSOMYG00000064981	ENSOMYG00000018004	ENSOMYG00000076032	ENSOMYG00000018652	ENSOMYG00000057229	ENSOMYG00000018690	ENSOMYG00000018760
Huchen	MODERN SPECIES	730	cnot6b (ENSHHUG00000011811)	ENSHHUG00000011857	tmem263 (ENSHHUG00000011884)	si:ch73-62b13.1 (ENSHHUG00000011895)	mterf2 (ENSHHUG00000011901)	zgc:153031 (ENSHHUG00000011904)	cry1b (ENSHHUG00000011918)	ENSHHUG00000012192	ENSHHUG00000012195	mlc1 (ENSHHUG00000012205)	panx2 (ENSHHUG00000012234)	selenoo1 (ENSHHUG00000012241)	mapk12a (ENSHHUG00000012247)	mtss1la (ENSHHUG00000012357)	ENSHHUG00000012420	ENSHHUG00000012424 ##22	ENSHHUG00000012428 ##24	uri1 (ENSHHUG00000012437) #25
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	302	ENSGT00390000014700.a.e	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.f	ENSGT00390000013899.a.a.p	ENSGT00940000164185.c	ENSGT00530000063817.b.a.f	ENSGT00940000165780.h	ENSGT00940000155455.h.c	ENSGT00940000156419.a.g	ENSGT00390000015442.e	ENSGT00940000153972.C.c	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a.f	ENSGT00940000156189.a.a.c	ENSGT00950000183156.a.a.c	ENSGT00940000164020.d.b	ENSGT00950000183051.b.b.f ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b.c ##24	ENSGT00390000002362.t #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526.k	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000154649.B.m	ENSGT00940000157903.f	ENSGT00940000157742.b.c	ENSGT00530000063472.b.a.e	ENSGT00940000155580.b.a.a.h	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b.e
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000014700.a.e	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.f	ENSGT00390000013899.a.a.p	ENSGT00940000164185.c	ENSGT00530000063817.b.a.f	ENSGT00940000165780.h	ENSGT00940000155455.h.c	ENSGT00940000156419.a.g	ENSGT00390000015442.e	ENSGT00940000153972.C.c	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a.f	ENSGT00940000156189.a.a.c	ENSGT00950000183156.a.a.c	ENSGT00940000164020.d.b	ENSGT00950000183051.b.b.f ##22	ENSGT00940000156397.b.c ##24	ENSGT00390000002362.t #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526.k	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000154649.B.m	ENSGT00940000157903.f	ENSGT00940000157742.b.c	ENSGT00530000063472.b.a.e	ENSGT00940000155580.b.a.a.h	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b.e	ENSGT00940000155867.a.a.f	ENSGT00440000033504.B.a.c
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.f	ENSGT00950000183132.A.l	ENSGT00390000013899.a.a.p	ENSGT00940000164185.c	ENSGT00530000063817.b.a.f	ENSGT00940000165780.h	ENSGT00940000155455.h.c	ENSGT00940000156419.a.g	ENSGT00390000015442.e	ENSGT00940000153972.C.c	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a.f	ENSGT00940000156189.a.a.c	ENSGT00950000183156.a.a.c	ENSGT00940000164020.d.b	ENSGT00950000183051.b.b.f ##22	ENSGT00940000156397.b.c ##24	ENSGT00390000002362.t #25	ENSGT00390000003526.k	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000154649.B.m	ENSGT00940000157903.f	ENSGT00940000157742.b.c	ENSGT00530000063472.b.a.e	ENSGT00940000155580.b.a.a.h	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b.e	ENSGT00940000155867.a.a.f	ENSGT00440000033504.B.a.c	ENSGT00940000156144.a.a.k
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	7	si:ch73-62b13.1 (ENSSSAG00000077590)	ENSSSAG00000077627	zgc:153031 (ENSSSAG00000105044)	ENSSSAG00000106490	cry1b (ENSSSAG00000092438)	ENSSSAG00000077053	mlc1 (ENSSSAG00000077007)	panx2 (ENSSSAG00000076995)	trabd (ENSSSAG00000076990)	selenoo1 (ENSSSAG00000109786)	ENSSSAG00000105146	mapk12a (ENSSSAG00000076668)	mtss1la (ENSSSAG00000076530)	ENSSSAG00000076501	ENSSSAG00000076471	ENSSSAG00000111360 ##22	ENSSSAG00000076442 ##24	uri1 (ENSSSAG00000076436) #25	rxylt1 (ENSSSAG00000076433)	ENSSSAG00000076090	PRP12 (ENSSSAG00000076045)	thas (ENSSSAG00000075921)	ENSSSAG00000050659	hipk2 (ENSSSAG00000075873)	ENSSSAG00000096708	ENSSSAG00000075858	mical3a (ENSSSAG00000075434)	ttc38 (ENSSSAG00000075231)	tspan33b (ENSSSAG00000075222)	ENSSSAG00000075214	ENSSSAG00000119251
River trout	MODERN SPECIES	8	rfx4 (ENSSTUG00000050288)	ENSSTUG00000050326	tmem263 (ENSSTUG00000050329)	si:ch73-62b13.1 (ENSSTUG00000050332)	mterf2 (ENSSTUG00000050335)	zgc:153031 (ENSSTUG00000050344)	cry1b (ENSSTUG00000050351)	ABTB3 (ENSSTUG00000050371)	mlc1 (ENSSTUG00000050413)	panx2 (ENSSTUG00000050425)	trabd (ENSSTUG00000050432)	mapk12a (ENSSTUG00000002270)	mtss1la (ENSSTUG00000002460)	ENSSTUG00000002765	ENSSTUG00000002772	ENSSTUG00000002789 ##22	ENSSTUG00000002808 ##24	uri1 (ENSSTUG00000002826) #25	rxylt1 (ENSSTUG00000002852)	SRGAP1 (ENSSTUG00000002927)	parp12a (ENSSTUG00000003949)	tbxas1 (ENSSTUG00000003996)	hipk2 (ENSSTUG00000004433)	ENSSTUG00000004600	mical3a (ENSSTUG00000004719)	ttc38 (ENSSTUG00000005633)	tspan33b (ENSSTUG00000006133)	TSPAN9 (ENSSTUG00000006152)	PRMT8 (ENSSTUG00000006176)	CRACR2A (ENSSTUG00000006381)	TMTC2 (ENSSTUG00000006433)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000014700.a.e	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.f	ENSGT00390000013899.a.a.p	ENSGT00940000164185.c	ENSGT00530000063817.b.a.f	ENSGT00940000165780.h	ENSGT00940000155455.h.c	ENSGT00940000156419.a.g	ENSGT00390000015442.e	ENSGT00940000153972.C.c	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a.f	ENSGT00940000156189.a.a.c	ENSGT00950000183156.a.a.c	ENSGT00940000164020.d.b	ENSGT00950000183051.b.b.f ##22	ENSGT00940000156397.b.c ##24	ENSGT00390000002362.t #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526.k	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000154649.B.m	ENSGT00940000157903.f	ENSGT00940000157742.b.c	ENSGT00530000063472.b.a.e	ENSGT00940000155580.b.a.a.h	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b.e	ENSGT00940000155867.a.a.f	ENSGT00440000033504.B.a.c
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000014700.a.e	ENSGT01050000244879.b.a.b.a.f	ENSGT00390000013899.a.a.p	ENSGT00940000164185.c	ENSGT00530000063817.b.a.f	ENSGT00940000165780.h	ENSGT00940000155455.h.c	ENSGT00940000156419.a.g	ENSGT00390000015442.e	ENSGT00940000153972.C.c	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a.f	ENSGT00940000156189.a.a.c	ENSGT00950000183156.a.a.c	ENSGT00940000164020.d.b	ENSGT00950000183051.b.b.f ##22	ENSGT00940000156397.b.c ##24	ENSGT00390000002362.t #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000003526.k	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.e	ENSGT00940000154649.B.m	ENSGT00940000157903.f	ENSGT00940000157742.b.c	ENSGT00530000063472.b.a.e	ENSGT00940000155580.b.a.a.h	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000158225.i.b.e	ENSGT00940000155867.a.a.f	ENSGT00440000033504.B.a.c	ENSGT00940000156144.a.a.k
Coho salmon	MODERN SPECIES	24	ENSOKIG00005013406	tmem263 (ENSOKIG00005013442)	si:ch73-62b13.1 (ENSOKIG00005028353)	ENSOKIG00005028358	zgc:153031 (ENSOKIG00005028380)	cry1b (ENSOKIG00005028413)	ABTB3 (ENSOKIG00005028845)	mlc1 (ENSOKIG00005029086)	panx2 (ENSOKIG00005029279)	trabd (ENSOKIG00005029309)	selenoo1 (ENSOKIG00005029323)	mapk12a (ENSOKIG00005029405)	mtss1la (ENSOKIG00005029729)	ENSOKIG00005030369	ENSOKIG00005030404	ENSOKIG00005030431 ##22	ENSOKIG00005030445 ##24	uri1 (ENSOKIG00005030518) #25	zgc:112052 (ENSOKIG00005030538) #27	rxylt1 (ENSOKIG00005030568)	SRGAP1 (ENSOKIG00005030869)	parp12a (ENSOKIG00005034284)	tbxas1 (ENSOKIG00005034310)	hipk2 (ENSOKIG00005034403)	ENSOKIG00005035524	ENSOKIG00005035531	mical3a (ENSOKIG00005035663)	ttc38 (ENSOKIG00005036292)	TSPAN9 (ENSOKIG00005036408)	PRMT8 (ENSOKIG00005036565)	CRACR2A (ENSOKIG00005037978)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	30	ENSOTSG00005014396	ENSOTSG00005014397	ENSOTSG00005014407	RHCG (ENSOTSG00005014510)	POLG (ENSOTSG00005014524)	FBXO31 (ENSOTSG00005015694)	banp (ENSOTSG00005016631)	kras (ENSOTSG00005016635)	RASSF8 (ENSOTSG00005016636)	bhlhe41 (ENSOTSG00005016637)	sspn (ENSOTSG00005016638)	ENSOTSG00005016639	mapk12a (ENSOTSG00005016640)	mtss1la (ENSOTSG00005016641)	ENSOTSG00005017133	ENSOTSG00005017136 ##22	ENSOTSG00005017138 ##24	uri1 (ENSOTSG00005017140) #25	zgc:112052 (ENSOTSG00005017143) #27	rxylt1 (ENSOTSG00005017146)	SRGAP1 (ENSOTSG00005017172)	parp12a (ENSOTSG00005029997)	tbxas1 (ENSOTSG00005029999)	hipk2 (ENSOTSG00005030001)	ENSOTSG00005030761	mical3a (ENSOTSG00005030762)	ttc38 (ENSOTSG00005030784)	TSPAN9 (ENSOTSG00005030785)	PRMT8 (ENSOTSG00005030788)	CRACR2A (ENSOTSG00005032636)	TMTC2 (ENSOTSG00005032641)
Rainbow trout	MODERN SPECIES		tmem263 (ENSOMYG00000066473)	si:ch73-62b13.1 (ENSOMYG00000000055)	mterf2 (ENSOMYG00000000097)	zgc:153031 (ENSOMYG00000068207)	cry1b (ENSOMYG00000000195)	ENSOMYG00000068578	ENSOMYG00000000529	mlc1 (ENSOMYG00000000622)	panx2 (ENSOMYG00000000652)	trabd (ENSOMYG00000000670)	ENSOMYG00000065487	mapk12a (ENSOMYG00000000785)	mtss1la (ENSOMYG00000000985)	ENSOMYG00000052823	ENSOMYG00000059148	ENSOMYG00000001088 ##22	ENSOMYG00000001092 ##24	uri1 (ENSOMYG00000001101) #25	zgc:112052 (ENSOMYG00000001114) #27	rxylt1 (ENSOMYG00000001132)	ENSOMYG00000001992	parp12a (ENSOMYG00000002356)	ENSOMYG00000059363	tbxas1 (ENSOMYG00000002386)	hipk2 (ENSOMYG00000002409)	ENSOMYG00000070053	ENSOMYG00000002447	ENSOMYG00000073497	ENSOMYG00000077380	mical3a (ENSOMYG00000003073)	ttc38 (ENSOMYG00000003959)
Huchen	MODERN SPECIES	326	ENSHHUG00000048920	ENSHHUG00000048931	tmem263 (ENSHHUG00000048940)	si:ch73-62b13.1 (ENSHHUG00000048944)	zgc:153031 (ENSHHUG00000048946)	cry1b (ENSHHUG00000048951)	ABTB3 (ENSHHUG00000049012)	mlc1 (ENSHHUG00000049051)	panx2 (ENSHHUG00000049059)	trabd (ENSHHUG00000049062)	selenoo1 (ENSHHUG00000049068)	mapk12a (ENSHHUG00000049116)	mtss1la (ENSHHUG00000049263)	ENSHHUG00000049296	ENSHHUG00000049300	ENSHHUG00000049302 ##22
Northern pike	MODERN SPECIES	18	ENSELUG00000027032	ENSELUG00000031741	tmem263 (ENSELUG00000033928)	si:ch73-62b13.1 (ENSELUG00000020366)	mterf2 (ENSELUG00000020338)	zgc:153031 (ENSELUG00000020328)	cry1b (ENSELUG00000020312)	ABTB3 (ENSELUG00000020253)	mlc1 (ENSELUG00000020166)	panx2 (ENSELUG00000020124)	trabd (ENSELUG00000020091)	selenoo1 (ENSELUG00000020066)	mapk12a (ENSELUG00000020003)	mtss1la (ENSELUG00000019952)	ENSELUG00000019804	ENSELUG00000019722 ##22	ENSELUG00000024725	ENSELUG00000019711 ##24	ENSELUG00000019703	uri1 (ENSELUG00000019669) #25	zgc:112052 (ENSELUG00000019631) #27	rxylt1 (ENSELUG00000019619)	SRGAP1 (ENSELUG00000019581)	parp12a (ENSELUG00000019421)	tbxas1 (ENSELUG00000019402)	ENSELUG00000029601	hipk2 (ENSELUG00000019334)	ENSELUG00000019290	mical3a (ENSELUG00000001046)	ttc38 (ENSELUG00000019080)	tspan33b (ENSELUG00000019015)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000165530.a.a	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b	ENSGT00940000155867.a.a
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000165530.a.a	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000170767	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000165530.a.a	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000170767	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	438	cnot2 (ENSHCOG00000008229)	WASHC4 (ENSHCOG00000008193)	ENSHCOG00000008123	etfbkmt (ENSHCOG00000008050)	mterf2 (ENSHCOG00000008023)	si:ch73-62b13.1 (ENSHCOG00000008015)	cry1b (ENSHCOG00000008002)	ABTB3 (ENSHCOG00000000265)	mlc1 (ENSHCOG00000007949)	panx2 (ENSHCOG00000007874)	trabd (ENSHCOG00000007825)	selenoo1 (ENSHCOG00000007819)	mapk12a (ENSHCOG00000007813)	mtss1la (ENSHCOG00000007791)	ENSHCOG00000007774	ENSHCOG00000007733 ##22	ENSHCOG00000007731 ##24	uri1 (ENSHCOG00000007724) #25	zgc:112052 (ENSHCOG00000007719) #27	UQCRFS1 (ENSHCOG00000007699) #30	rxylt1 (ENSHCOG00000007686)	SRGAP1 (ENSHCOG00000007646)	parp12a (ENSHCOG00000007607)	tbxas1 (ENSHCOG00000007593)	hipk2 (ENSHCOG00000007564)	ENSHCOG00000007517	mical3a (ENSHCOG00000007465)	ttc38 (ENSHCOG00000007213)	tspan33b (ENSHCOG00000007199)	TSPAN9 (ENSHCOG00000007162)	PRMT8 (ENSHCOG00000007139)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000165530.a.a	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B.i	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000170767	ENSGT00940000154649.B.i	ENSGT00940000157903.n	ENSGT00940000157903.m	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	45	ENSKMAG00000000222	etfbkmt (ENSKMAG00000000165)	si:ch73-62b13.1 (ENSKMAG00000022124)	mterf2 (ENSKMAG00000022121)	zgc:153031 (ENSKMAG00000022120)	cry1 (ENSKMAG00000022117)	ENSKMAG00000022114	ABTB3 (ENSKMAG00000022111)	mlc1 (ENSKMAG00000022107)	panx2 (ENSKMAG00000022105)	trabd (ENSKMAG00000022102)	selenoo1 (ENSKMAG00000022100)	mapk12a (ENSKMAG00000022096)	mtss1la (ENSKMAG00000022088)	ENSKMAG00000022083	ENSKMAG00000022079 ##22	ENSKMAG00000022078 ##24	uri1 (ENSKMAG00000022075) #25	ENSKMAG00000022072	zgc:112052 (ENSKMAG00000022067) #27	rxylt1 (ENSKMAG00000022064)	SRGAP1 (ENSKMAG00000022058)	ENSKMAG00000022051	parp12a (ENSKMAG00000022046)	tbxas1 (ENSKMAG00000022038)	tbxas1 (ENSKMAG00000022024)	tbxas1 (ENSKMAG00000022005)	tbxas1 (ENSKMAG00000021990)	tbxas1 (ENSKMAG00000021981)	hipk2 (ENSKMAG00000021967)	ENSKMAG00000021959
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1622	si:ch73-62b13.1 (ENSNFUG00015024567)	mterf2 (ENSNFUG00015024572)	zgc:153031 (ENSNFUG00015024575)	cry1b (ENSNFUG00015024582)	ENSNFUG00015024603	ABTB3 (ENSNFUG00015024623)	ENSNFUG00015024707	MLC1 (ENSNFUG00015024712)	panx2 (ENSNFUG00015024715)	PANX2 (ENSNFUG00015024719)	SELO (ENSNFUG00015024726)	mapk12a (ENSNFUG00015024752)	mtss1la (ENSNFUG00015024845)	ENSNFUG00015024881	ENSNFUG00015024887	ENSNFUG00015004754 ##22	ENSNFUG00015004763	URI1 (ENSNFUG00015004771) #25	zgc:112052 (ENSNFUG00015004778) #27	UQCRFS1 (ENSNFUG00015004785) #30	TMEM5 (ENSNFUG00015004810)	SRGAP1 (ENSNFUG00015005019)	ENSNFUG00015005453	parp12a (ENSNFUG00015005459)	tbxas1 (ENSNFUG00015005471)	hipk2 (ENSNFUG00015005662)	ENSNFUG00015006642	mical3a (ENSNFUG00015006680)	ttc38 (ENSNFUG00015006726)	tspan33b (ENSNFUG00015006776)	TSPAN9B (ENSNFUG00015006782)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B.i	ENSGT00940000170767	ENSGT00940000154649.B.j	ENSGT00940000157041.a	ENSGT00490000043404	ENSGT00940000157764.e.b	ENSGT00950000183131.b.b	ENSGT00940000163228
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B.i	ENSGT00940000154649.B.j	ENSGT00940000157041.a	ENSGT00490000043404	ENSGT00940000157764.e.b	ENSGT00950000183131.b.b	ENSGT00940000163228	ENSGT00950000182991.A.a.c.b
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Guppy	MODERN SPECIES	458	WASHC4 (ENSPREG00000020862)	SLC41A2 (ENSPREG00000020938)	etfbkmt (ENSPREG00000020975)	si:ch73-62b13.1 (ENSPREG00000020983)	mterf2 (ENSPREG00000020992)	zgc:153031 (ENSPREG00000021000)	cry1b (ENSPREG00000021016)	ENSPREG00000021050	mlc1 (ENSPREG00000021074)	panx2 (ENSPREG00000021098)	trabd (ENSPREG00000021111)	selenoo1 (ENSPREG00000021131)	mapk12a (ENSPREG00000021153)	mtss1la (ENSPREG00000021182)	ENSPREG00000021225	ENSPREG00000021274 ##22	ENSPREG00000021278 ##24	uri1 (ENSPREG00000021288) #25	zgc:112052 (ENSPREG00000021304) #27	UQCRFS1 (ENSPREG00000000543) #30	rxylt1 (ENSPREG00000000546)	SRGAP1 (ENSPREG00000000552)	ENSPREG00000000655	parp12a (ENSPREG00000000666)	parp12a (ENSPREG00000000674)	pskh1 (ENSPREG00000000680)	mbtps1 (ENSPREG00000000686)	SLC38A8 (ENSPREG00000000755)	necab2 (ENSPREG00000000791)	hydin (ENSPREG00000000849)	pnp6 (ENSPREG00000000955)
Platyfish	MODERN SPECIES	11	SLC41A2 (ENSXMAG00000019285)	etfbkmt (ENSXMAG00000013003)	si:ch73-62b13.1 (ENSXMAG00000019286)	ENSXMAG00000021834	mterf2 (ENSXMAG00000019427)	zgc:153031 (ENSXMAG00000019287)	cry1b (ENSXMAG00000001744)	ABTB3 (ENSXMAG00000019218)	mlc1 (ENSXMAG00000019211)	panx2 (ENSXMAG00000019204)	trabd (ENSXMAG00000022221)	selenoo1 (ENSXMAG00000019190)	mapk12a (ENSXMAG00000019178)	mtss1la (ENSXMAG00000019158)	ENSXMAG00000019157	ENSXMAG00000019156 ##22	ENSXMAG00000021732	ENSXMAG00000019154 ##24	uri1 (ENSXMAG00000019147) #25	zgc:112052 (ENSXMAG00000023744) #27	UQCRFS1 (ENSXMAG00000026719) #30	rxylt1 (ENSXMAG00000019131)	SRGAP1 (ENSXMAG00000019097)	ENSXMAG00000023788	parp12a (ENSXMAG00000021188)	parp12a (ENSXMAG00000002950)	pskh1 (ENSXMAG00000002947)	mbtps1 (ENSXMAG00000002907)	SLC38A8 (ENSXMAG00000013007)	necab2 (ENSXMAG00000013000)	ENSXMAG00000023669
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Mummichog	MODERN SPECIES	266								ENSFHEG00000012484	mlc1 (ENSFHEG00000012445)	panx2 (ENSFHEG00000000751)	trabd (ENSFHEG00000012231)	selenoo1 (ENSFHEG00000012226)	mapk12a (ENSFHEG00000000892)	mtss1la (ENSFHEG00000012159)	ENSFHEG00000012055	ENSFHEG00000012040 ##22	ENSFHEG00000012037 ##24	uri1 (ENSFHEG00000012026) #25	UQCRFS1 (ENSFHEG00000012014) #30	zgc:112052 (ENSFHEG00000012009) #27	rxylt1 (ENSFHEG00000011998)	SRGAP1 (ENSFHEG00000011991)	ENSFHEG00000011866	parp12a (ENSFHEG00000011844)	parp12a (ENSFHEG00000011833)	pskh1 (ENSFHEG00000011822)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	166			ETFBKMT (ENSCVAG00000015661)	si:ch73-62b13.1 (ENSCVAG00000015671)	mterf2 (ENSCVAG00000015675)	zgc:153031 (ENSCVAG00000015697)	cry1b (ENSCVAG00000015731)	ABTB3 (ENSCVAG00000015829)	mlc1 (ENSCVAG00000015839)	panx2 (ENSCVAG00000015867)	trabd (ENSCVAG00000015905)	selenoo1 (ENSCVAG00000015917)	mapk12a (ENSCVAG00000015947)	mtss1la (ENSCVAG00000016015)	ENSCVAG00000016114	ENSCVAG00000000412 ##22	ENSCVAG00000016129	uri1 (ENSCVAG00000016155) #25	zgc:112052 (ENSCVAG00000016175) #27	UQCRFS1 (ENSCVAG00000016182) #30	rxylt1 (ENSCVAG00000016188)	SRGAP1 (ENSCVAG00000016374)	parp12a (ENSCVAG00000016385)	ENSCVAG00000016394	parp12a (ENSCVAG00000016405)	pskh1 (ENSCVAG00000016413)	mbtps1 (ENSCVAG00000016591)	SLC38A8 (ENSCVAG00000016623)	necab2 (ENSCVAG00000016634)	ENSCVAG00000016654	ENSCVAG00000016664
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000170767	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000170767	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Chinese medaka	MODERN SPECIES	302													mtss1la (ENSOSIG00000006213)	ENSOSIG00000006212	ENSOSIG00000006211	ENSOSIG00000006210 ##22	ENSOSIG00000006209 ##24	zgc:112052 (ENSOSIG00000006207) #27	uri1 (ENSOSIG00000006206) #25	UQCRFS1 (ENSOSIG00000006205) #30	rxylt1 (ENSOSIG00000006204)	SRGAP1 (ENSOSIG00000003821)	ENSOSIG00000010117	parp12a (ENSOSIG00000010115)	hipk2 (ENSOSIG00000009950)	ENSOSIG00000009947	ttc38 (ENSOSIG00000009649)	tspan33b (ENSOSIG00000009630)	TSPAN9 (ENSOSIG00000009622)	ENSOSIG00000009618
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	20	ENSORLG00000016413	etfbkmt (ENSORLG00000016400)	ENSORLG00000026318	si:ch73-62b13.1 (ENSORLG00000029018)	mterf2 (ENSORLG00000016392)	zgc:153031 (ENSORLG00000016391)	cry1b (ENSORLG00000016382)	ABTB3 (ENSORLG00000016367)	mlc1 (ENSORLG00000016340)	panx2 (ENSORLG00000016329)	trabd (ENSORLG00000027004)	selenoo1 (ENSORLG00000016310)	mapk12a (ENSORLG00000016296)	mtss1la (ENSORLG00000016237)	ENSORLG00000016202	ENSORLG00000016193 ##22	ENSORLG00000030615	ENSORLG00000026079 ##24	uri1 (ENSORLG00000029320) #25	zgc:112052 (ENSORLG00000016190) #27	ENSORLG00000016185 #30	rxylt1 (ENSORLG00000016182)	SRGAP1 (ENSORLG00000016175)	parp12a (ENSORLG00000016148)	tbxas1 (ENSORLG00000016143)	hipk2 (ENSORLG00000016085)	ENSORLG00000016080	mical3a (ENSORLG00000016075)	ttc38 (ENSORLG00000016054)	tspan33b (ENSORLG00000016043)	ENSORLG00000016029
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000170767	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	15	ENSOMEG00000023171	etfbkmt (ENSOMEG00000023159)	si:ch73-62b13.1 (ENSOMEG00000023153)	mterf2 (ENSOMEG00000023148)	zgc:153031 (ENSOMEG00000023137)	cry1b (ENSOMEG00000023131)	ABTB3 (ENSOMEG00000023106)	mlc1 (ENSOMEG00000023064)	panx2 (ENSOMEG00000023037)	trabd (ENSOMEG00000023028)	selenoo1 (ENSOMEG00000023016)	mapk12a (ENSOMEG00000023005)	mtss1la (ENSOMEG00000022970)	ENSOMEG00000022921	ENSOMEG00000022907	ENSOMEG00000022882 ##22	ENSOMEG00000022873 ##24	uri1 (ENSOMEG00000022862) #25	rxylt1 (ENSOMEG00000022836)	UQCRFS1 (ENSOMEG00000022814) #30	SRGAP1 (ENSOMEG00000022797)	ENSOMEG00000022746	parp12a (ENSOMEG00000022731)	tbxas1 (ENSOMEG00000022710)	hipk2 (ENSOMEG00000022676)	ENSOMEG00000022660	ENSOMEG00000022654	ENSOMEG00000022615	ENSOMEG00000022588	ENSOMEG00000022574	ENSOMEG00000022553
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	20	bscl2 (ENSOJAG00000001067)	ENSOJAG00000001073	cnot2 (ENSOJAG00000001088)	ENSOJAG00000001143	etfbkmt (ENSOJAG00000001197)	si:ch73-62b13.1 (ENSOJAG00000001200)	mterf2 (ENSOJAG00000001208)	zgc:153031 (ENSOJAG00000001210)	cry1b (ENSOJAG00000001274)	ABTB3 (ENSOJAG00000001505)	mlc1 (ENSOJAG00000001891)	panx2 (ENSOJAG00000001950)	trabd (ENSOJAG00000001969)	mtss1la (ENSOJAG00000002645)	ENSOJAG00000002848	ENSOJAG00000002928 ##22	ENSOJAG00000002940 ##24	uri1 (ENSOJAG00000002949) #25	zgc:112052 (ENSOJAG00000002957) #27	UQCRFS1 (ENSOJAG00000002965) #30	rxylt1 (ENSOJAG00000002970)	SRGAP1 (ENSOJAG00000003281)	ENSOJAG00000006110	parp12a (ENSOJAG00000006130)	tbxas1 (ENSOJAG00000006173)	hipk2 (ENSOJAG00000006728)	mical3a (ENSOJAG00000009133)	ttc38 (ENSOJAG00000009690)	tspan33b (ENSOJAG00000009957)	TSPAN9 (ENSOJAG00000009972)	PRMT8 (ENSOJAG00000010088)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3431												selenoo1 (ENSAOCG00000015655)	mapk12a (ENSAOCG00000015725)	mtss1la (ENSAOCG00000015837)	ENSAOCG00000015991	ENSAOCG00000016007 ##22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	18	WASHC4 (ENSAPEG00000011406)	ENSAPEG00000011538	etfbkmt (ENSAPEG00000011574)	si:ch73-62b13.1 (ENSAPEG00000011582)	mterf2 (ENSAPEG00000011588)	zgc:153031 (ENSAPEG00000011610)	cry1b (ENSAPEG00000011632)	ABTB3 (ENSAPEG00000011664)	mlc1 (ENSAPEG00000011738)	panx2 (ENSAPEG00000011893)	trabd (ENSAPEG00000011944)	selenoo1 (ENSAPEG00000012010)	mapk12a (ENSAPEG00000012033)	mtss1la (ENSAPEG00000012097)	ENSAPEG00000012193	ENSAPEG00000012210 ##22	ENSAPEG00000012220 ##24	ENSAPEG00000012233 ##24	uri1 (ENSAPEG00000012262) #25	zgc:112052 (ENSAPEG00000012273) #27	si:dkey-30c15.2 (ENSAPEG00000012284)	ENSAPEG00000012307	terb1 (ENSAPEG00000012369)	pdp2 (ENSAPEG00000012462)	cdh1 (ENSAPEG00000012499)	ENSAPEG00000012742	frmd4a (ENSAPEG00000012813)	ENSAPEG00000012902	impdh1a (ENSAPEG00000012919)	ENSAPEG00000012958	ENSAPEG00000012982
Spiny chromis	MODERN SPECIES	65	CHRNA6 (ENSAPOG00000006644)	chrnb3b (ENSAPOG00000006628)	ENSAPOG00000006590	etfbkmt (ENSAPOG00000006572)	si:ch73-62b13.1 (ENSAPOG00000006564)	mterf2 (ENSAPOG00000006555)	zgc:153031 (ENSAPOG00000006545)	cry1b (ENSAPOG00000006529)	ABTB3 (ENSAPOG00000006508)	mlc1 (ENSAPOG00000006425)	panx2 (ENSAPOG00000006400)	selenoo1 (ENSAPOG00000006323)	mapk12a (ENSAPOG00000006302)	mtss1la (ENSAPOG00000006241)	ENSAPOG00000006142	ENSAPOG00000006112 ##22	ENSAPOG00000006104 ##24	uri1 (ENSAPOG00000006084) #25	zgc:112052 (ENSAPOG00000000159) #27
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	941					ENSSPAG00000011076	cry1b (ENSSPAG00000011036)	ABTB3 (ENSSPAG00000011004)	mlc1 (ENSSPAG00000010917)	panx2 (ENSSPAG00000010874)	trabd (ENSSPAG00000010809)	selenoo1 (ENSSPAG00000010677)	mapk12a (ENSSPAG00000010605)	mtss1la (ENSSPAG00000010570)	ENSSPAG00000010545	ENSSPAG00000010508	ENSSPAG00000010498 ##22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903.k	ENSGT00940000157903.l	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903.k	ENSGT00940000157903.l.b	ENSGT00940000157903.l.a.a	ENSGT00940000157903.l.a.b	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	ENSONIG00000041230	etfbkmt (ENSONIG00000010461)	ENSONIG00000036080	si:ch73-62b13.1 (ENSONIG00000010457)	mterf2 (ENSONIG00000021286)	zgc:153031 (ENSONIG00000027181)	cry1b (ENSONIG00000010451)	ABTB3 (ENSONIG00000010442)	mlc1 (ENSONIG00000010440)	panx2 (ENSONIG00000010439)	trabd (ENSONIG00000010438)	selenoo1 (ENSONIG00000010436)	mapk12a (ENSONIG00000033062)	mtss1la (ENSONIG00000010426)	ENSONIG00000010425	ENSONIG00000028458 ##22	ENSONIG00000038382 ##24	uri1 (ENSONIG00000010420) #25	zgc:112052 (ENSONIG00000040508) #27	UQCRFS1 (ENSONIG00000034357) #30	ENSONIG00000029822	rxylt1 (ENSONIG00000010415)	SRGAP1 (ENSONIG00000010412)	ENSONIG00000010411	parp12a (ENSONIG00000010409)	tbxas1 (ENSONIG00000017783)	ENSONIG00000028907	hipk2 (ENSONIG00000010383)	ENSONIG00000022697	mical3a (ENSONIG00000010376)	ttc38 (ENSONIG00000010371)
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903.k	ENSGT00940000157903.l.b	ENSGT00940000157903.l.a.a	ENSGT00940000157903.l.a.b	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903.k	ENSGT00940000157903.l.a.a	ENSGT00940000157903.l.a.b	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903.k	ENSGT00940000157903.l.a.a	ENSGT00940000157903.l.a.b	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000177757	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903.k	ENSGT00940000157903.l.a.a	ENSGT00940000157903.l.a.b	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	WASHC4 (ENSACLG00000004055)	SLC41A2 (ENSACLG00000004160)	etfbkmt (ENSACLG00000004215)	si:ch73-62b13.1 (ENSACLG00000004373)	mterf2 (ENSACLG00000004378)	zgc:153031 (ENSACLG00000004382)	cry1b (ENSACLG00000004387)	ABTB3 (ENSACLG00000004410)	mlc1 (ENSACLG00000004485)	panx2 (ENSACLG00000004510)	trabd (ENSACLG00000004524)	selenoo1 (ENSACLG00000004545)	mapk12a (ENSACLG00000004563)	mtss1la (ENSACLG00000004911)	ENSACLG00000004953	ENSACLG00000004984 ##22	ENSACLG00000004992	ENSACLG00000004994 ##24	uri1 (ENSACLG00000005007) #25	zgc:112052 (ENSACLG00000005022) #27	UQCRFS1 (ENSACLG00000005027) #30	rxylt1 (ENSACLG00000005033)	SRGAP1 (ENSACLG00000005406)	ENSACLG00000005480	parp12a (ENSACLG00000005503)	tbxas1 (ENSACLG00000005510)	ENSACLG00000005544	tbxas1 (ENSACLG00000005556)	tbxas1 (ENSACLG00000005928)	hipk2 (ENSACLG00000005950)	ENSACLG00000006656
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	WASHC4 (ENSMZEG00005017251)	SLC41A2 (ENSMZEG00005017242)	etfbkmt (ENSMZEG00005017239)	si:ch73-62b13.1 (ENSMZEG00005017237)	mterf2 (ENSMZEG00005017233)	zgc:153031 (ENSMZEG00005017228)	cry1b (ENSMZEG00005017214)	ABTB3 (ENSMZEG00005017206)	mlc1 (ENSMZEG00005017199)	panx2 (ENSMZEG00005017188)	trabd (ENSMZEG00005017184)	selenoo1 (ENSMZEG00005017179)	mapk12a (ENSMZEG00005017170)	mtss1la (ENSMZEG00005017147)	ENSMZEG00005017128	ENSMZEG00005017123 ##22	ENSMZEG00005017120 ##24	uri1 (ENSMZEG00005017110) #25	zgc:112052 (ENSMZEG00005017108) #27	UQCRFS1 (ENSMZEG00005017102) #30	rxylt1 (ENSMZEG00005017092)	SRGAP1 (ENSMZEG00005017061)	parp12a (ENSMZEG00005017042)	tbxas1 (ENSMZEG00005017016)	tbxas1 (ENSMZEG00005016997)	hipk2 (ENSMZEG00005016988)	ENSMZEG00005016968	mical3a (ENSMZEG00005016926)	ttc38 (ENSMZEG00005016913)	tspan33b (ENSMZEG00005016908)	ENSMZEG00005016902
P. nyererei	MODERN SPECIES	355	WASHC4 (ENSPNYG00000021505)	ENSPNYG00000021488	etfbkmt (ENSPNYG00000021482)	si:ch73-62b13.1 (ENSPNYG00000021476)	mterf2 (ENSPNYG00000021469)	zgc:153031 (ENSPNYG00000021451)	cry1b (ENSPNYG00000021423)	ABTB3 (ENSPNYG00000021392)	mlc1 (ENSPNYG00000021335)	panx2 (ENSPNYG00000021291)	trabd (ENSPNYG00000021275)	selenoo1 (ENSPNYG00000021264)	mapk12a (ENSPNYG00000021237)	mtss1la (ENSPNYG00000021196)	ENSPNYG00000021182	ENSPNYG00000021177 ##22	ENSPNYG00000021164 ##24	uri1 (ENSPNYG00000021154) #25	zgc:112052 (ENSPNYG00000021138) #27	UQCRFS1 (ENSPNYG00000021127) #30	rxylt1 (ENSPNYG00000021114)	SRGAP1 (ENSPNYG00000021071)	ENSPNYG00000021048	parp12a (ENSPNYG00000021033)	tbxas1 (ENSPNYG00000021010)	ENSPNYG00000020990	tbxas1 (ENSPNYG00000020968)	hipk2 (ENSPNYG00000020939)	ENSPNYG00000020890	mical3a (ENSPNYG00000020847)	ttc38 (ENSPNYG00000020825)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	386			etfbkmt (ENSHBUG00000018381)	si:ch73-62b13.1 (ENSHBUG00000018376)	mterf2 (ENSHBUG00000018363)	zgc:153031 (ENSHBUG00000018355)	cry1b (ENSHBUG00000018344)	ABTB3 (ENSHBUG00000018331)	mlc1 (ENSHBUG00000018306)	panx2 (ENSHBUG00000018258)	trabd (ENSHBUG00000018244)	selenoo1 (ENSHBUG00000018236)	mapk12a (ENSHBUG00000018224)	mtss1la (ENSHBUG00000018162)	ENSHBUG00000018051	ENSHBUG00000000533 ##22	ENSHBUG00000018036	ENSHBUG00000018029 ##24	uri1 (ENSHBUG00000018001) #25	zgc:112052 (ENSHBUG00000017994) #27	UQCRFS1 (ENSHBUG00000017986) #30	rxylt1 (ENSHBUG00000017965)	SRGAP1 (ENSHBUG00000017905)	ENSHBUG00000017793	parp12a (ENSHBUG00000017751)	tbxas1 (ENSHBUG00000017733)	tbxas1 (ENSHBUG00000017683)	hipk2 (ENSHBUG00000017618)	ENSHBUG00000017547	mical3a (ENSHBUG00000017499)	ttc38 (ENSHBUG00000017413)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	330	ENSNBRG00000014621	ETFBKMT (ENSNBRG00000014653)	si:ch73-62b13.1 (ENSNBRG00000014665)	ENSNBRG00000014679	mterf2 (ENSNBRG00000014689)	cry1b (ENSNBRG00000014696)	ABTB3 (ENSNBRG00000014720)	mlc1 (ENSNBRG00000014754)	panx2 (ENSNBRG00000014822)	trabd (ENSNBRG00000014878)	selenoo1 (ENSNBRG00000014901)	mapk12a (ENSNBRG00000014913)	ENSNBRG00000014942	mtss1la (ENSNBRG00000014960)	ENSNBRG00000015040	ENSNBRG00000015118 ##22	ENSNBRG00000015131 ##24	uri1 (ENSNBRG00000015170) #25	zgc:112052 (ENSNBRG00000015214) #27	UQCRFS1 (ENSNBRG00000015230) #30	rxylt1 (ENSNBRG00000015243)	ENSNBRG00000015255	ENSNBRG00000015284	ENSNBRG00000015307	tbxas1 (ENSNBRG00000015334)	tbxas1 (ENSNBRG00000015366)	tbxas1 (ENSNBRG00000015389)	ENSNBRG00000015407	ENSNBRG00000015420	hipk2 (ENSNBRG00000015444)	ENSNBRG00000015504
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1078	etfbkmt (ENSACIG00000008581)	si:ch73-62b13.1 (ENSACIG00000008590)	ENSACIG00000008601	ENSACIG00000008609	mterf2 (ENSACIG00000008621)	zgc:153031 (ENSACIG00000008624)	cry1b (ENSACIG00000008657)	ABTB3 (ENSACIG00000008802)	mlc1 (ENSACIG00000008881)	panx2 (ENSACIG00000008966)	trabd (ENSACIG00000009012)	selenoo1 (ENSACIG00000009081)	mapk12a (ENSACIG00000009206)	mtss1la (ENSACIG00000009243)	ENSACIG00000009275	ENSACIG00000009377 ##22	ENSACIG00000009404 ##24	uri1 (ENSACIG00000009427) #25	zgc:112052 (ENSACIG00000009489) #27	UQCRFS1 (ENSACIG00000009501) #30	rxylt1 (ENSACIG00000009511)	SRGAP1 (ENSACIG00000009551)	ENSACIG00000009611	parp12a (ENSACIG00000009637)	tbxas1 (ENSACIG00000009665)	tbxas1 (ENSACIG00000009700)	hipk2 (ENSACIG00000009726)	ENSACIG00000009781	mical3a (ENSACIG00000009842)	ttc38 (ENSACIG00000009918)	tspan33b (ENSACIG00000010038)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00940000163529	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000165530.a.a	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000163793.B	ENSGT00940000154954.nb.a	ENSGT00940000156932.b	ENSGT01010000222360.A	ENSGT00390000011159	ENSGT00940000153731.a.b.c
Fugu	MODERN SPECIES	21	fnbp4 (ENSTRUG00000027143)	bscl2 (ENSTRUG00000032633)	ENSTRUG00000029477	si:ch73-62b13.1 (ENSTRUG00000003331)	mterf2 (ENSTRUG00000003435)	zgc:153031 (ENSTRUG00000003460)	ABTB3 (ENSTRUG00000003690)	mlc1 (ENSTRUG00000004497)	panx2 (ENSTRUG00000004850)	trabd (ENSTRUG00000029898)	selenoo1 (ENSTRUG00000004974)	mapk12a (ENSTRUG00000005120)	mtss1la (ENSTRUG00000005593)	ENSTRUG00000005873	ENSTRUG00000031085	ENSTRUG00000006028 ##22	ENSTRUG00000030712 ##24	uri1 (ENSTRUG00000006106) #25	zgc:112052 (ENSTRUG00000027135) #27	UQCRFS1 (ENSTRUG00000006531) #30	rxylt1 (ENSTRUG00000006536)	SRGAP1 (ENSTRUG00000006667)	ENSTRUG00000030496	parp12a (ENSTRUG00000007328)	tbxas1 (ENSTRUG00000007495)	ch25hl1.2 (ENSTRUG00000025105)	tspan3a (ENSTRUG00000008013)	pstpip1a (ENSTRUG00000008138)	rcn2 (ENSTRUG00000008403)	scaper (ENSTRUG00000008486)	isl2a (ENSTRUG00000008697)
Tetraodon	MODERN SPECIES	4	WASHC4 (ENSTNIG00000008355)	ENSTNIG00000008356	etfbkmt (ENSTNIG00000008357)	si:ch73-62b13.1 (ENSTNIG00000008358)	mterf2 (ENSTNIG00000008359)	zgc:153031 (ENSTNIG00000008360)	ENSTNIG00000008361	ABTB3 (ENSTNIG00000008362)	mlc1 (ENSTNIG00000008363)	panx2 (ENSTNIG00000008364)	trabd (ENSTNIG00000008365)	selenoo1 (ENSTNIG00000008366)	mapk12a (ENSTNIG00000008367)	mtss1la (ENSTNIG00000008368)	ENSTNIG00000008369	ENSTNIG00000008370 ##22	uri1 (ENSTNIG00000008371) #25	zgc:112052 (ENSTNIG00000008372) #27	UQCRFS1 (ENSTNIG00000008373) #30	rxylt1 (ENSTNIG00000008374)	SRGAP1 (ENSTNIG00000008375)	ENSTNIG00000008376	parp12a (ENSTNIG00000008377)	tbxas1 (ENSTNIG00000008378)	tspan3a (ENSTNIG00000008379)	pstpip1a (ENSTNIG00000008380)	rcn2 (ENSTNIG00000001567)	scaper (ENSTNIG00000008381)	isl2a (ENSTNIG00000008382)	etfa (ENSTNIG00000008383)	tmem266 (ENSTNIG00000008384)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	135	ENSLBEG00000009548	bcl2l13 (ENSLBEG00000009493)	atp6v1e1a (ENSLBEG00000009442)	ENSLBEG00000009403	ENSLBEG00000009372	ADA2 (ENSLBEG00000009344)	ribc2 (ENSLBEG00000009269)	tbxas1 (ENSLBEG00000009210)	parp12a (ENSLBEG00000009125)	parp12a (ENSLBEG00000009082)	ENSLBEG00000008606	ENSLBEG00000008115	mapk12a (ENSLBEG00000007957)	mtss1la (ENSLBEG00000007802)	ENSLBEG00000007663	ENSLBEG00000007611 ##22	ENSLBEG00000007572 ##24	uri1 (ENSLBEG00000007492) #25	zgc:112052 (ENSLBEG00000007461) #27	UQCRFS1 (ENSLBEG00000007383) #30	rxylt1 (ENSLBEG00000007360)	SRGAP1 (ENSLBEG00000007186)	ENSLBEG00000007133	ENSLBEG00000007106	selenoo1 (ENSLBEG00000007067)	trabd (ENSLBEG00000006975)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	21	WASHC4 (ENSCLMG00005003734)	ENSCLMG00005003747	etfbkmt (ENSCLMG00005003755)	si:ch73-62b13.1 (ENSCLMG00005003756)	mterf2 (ENSCLMG00005003757)	zgc:153031 (ENSCLMG00005003758)	cry1b (ENSCLMG00005003776)	ABTB3 (ENSCLMG00005005431)	mlc1 (ENSCLMG00005005436)	panx2 (ENSCLMG00005005441)	trabd (ENSCLMG00005005443)	selenoo1 (ENSCLMG00005005445)	mapk12a (ENSCLMG00005005454)	mtss1la (ENSCLMG00005005570)	ENSCLMG00005005732	ENSCLMG00005005737 ##22	ENSCLMG00005005739 ##24	uri1 (ENSCLMG00005005742) #25	zgc:112052 (ENSCLMG00005005746) #27	UQCRFS1 (ENSCLMG00005005749) #30	rxylt1 (ENSCLMG00005005758)	SRGAP1 (ENSCLMG00005005837)	ENSCLMG00005013031	parp12a (ENSCLMG00005013032)	tbxas1 (ENSCLMG00005013033)	ENSCLMG00005013044	hipk2 (ENSCLMG00005013052)	ENSCLMG00005014537	mical3a (ENSCLMG00005014581)	ttc38 (ENSCLMG00005017159)	tspan33b (ENSCLMG00005017529)
Stickleback	MODERN SPECIES	14	cnot2 (ENSGACG00000013517)	WASHC4 (ENSGACG00000013499)	ENSGACG00000013493	etfbkmt (ENSGACG00000013489)	si:ch73-62b13.1 (ENSGACG00000013487)	zgc:153031 (ENSGACG00000013483)	cry1b (ENSGACG00000013480)	ABTB3 (ENSGACG00000013473)	mlc1 (ENSGACG00000013465)	panx2 (ENSGACG00000013460)	trabd (ENSGACG00000013447)	selenoo1 (ENSGACG00000013433)	mapk12a (ENSGACG00000013390)	mtss1la (ENSGACG00000013388)	ENSGACG00000013379	ENSGACG00000013377 ##22	uri1 (ENSGACG00000013365) #25	zgc:112052 (ENSGACG00000013358) #27	UQCRFS1 (ENSGACG00000013352) #30	rxylt1 (ENSGACG00000013345)	SRGAP1 (ENSGACG00000013333)	ENSGACG00000013331	parp12a (ENSGACG00000013321)	tbxas1 (ENSGACG00000013260)	fam174b (ENSGACG00000013258)	chd2 (ENSGACG00000013246)	rgma (ENSGACG00000013241)	lysmd4 (ENSGACG00000013238)	nr2f2 (ENSGACG00000013235)	ENSGACG00000013219	mef2aa (ENSGACG00000013182)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00770000121709.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	20	etfbkmt (ENSCGOG00000003102)	si:ch73-62b13.1 (ENSCGOG00000003101)	ENSCGOG00000003099	mterf2 (ENSCGOG00000003097)	zgc:153031 (ENSCGOG00000003094)	cry1b (ENSCGOG00000002706)	ABTB3 (ENSCGOG00000020187)	mlc1 (ENSCGOG00000020104)	panx2 (ENSCGOG00000020100)	trabd (ENSCGOG00000020096)	selenoo1 (ENSCGOG00000020063)	mapk12a (ENSCGOG00000019661)	mtss1la (ENSCGOG00000019097)	ENSCGOG00000019072	ENSCGOG00000019070	ENSCGOG00000019068 ##22	ENSCGOG00000019066 ##24	uri1 (ENSCGOG00000019063) #25	zgc:112052 (ENSCGOG00000019061) #27	UQCRFS1 (ENSCGOG00000019060) #30	rxylt1 (ENSCGOG00000019059)	SRGAP1 (ENSCGOG00000016750)	ENSCGOG00000016686	parp12a (ENSCGOG00000016667)	tbxas1 (ENSCGOG00000016334)	hipk2 (ENSCGOG00000015591)	ENSCGOG00000015560	mical3a (ENSCGOG00000014853)	ttc38 (ENSCGOG00000014786)	ENSCGOG00000014782	tspan33b (ENSCGOG00000014771)
Pike perch	MODERN SPECIES	6	cnot2 (ENSSLUG00000001886)	WASHC4 (ENSSLUG00000002299)	ENSSLUG00000002696	etfbkmt (ENSSLUG00000002839)	si:ch73-62b13.1 (ENSSLUG00000002842)	mterf2 (ENSSLUG00000002844)	zgc:153031 (ENSSLUG00000002845)	cry1b (ENSSLUG00000002894)	ABTB3 (ENSSLUG00000003575)	mlc1 (ENSSLUG00000004015)	panx2 (ENSSLUG00000004020)	trabd (ENSSLUG00000004032)	selenoo1 (ENSSLUG00000004044)	mapk12a (ENSSLUG00000004072)	mtss1la (ENSSLUG00000004217)	ENSSLUG00000004347 ##22	ENSSLUG00000004354	uri1 (ENSSLUG00000004364) #25	zgc:112052 (ENSSLUG00000004395) #27	ENSSLUG00000004404 #30	rxylt1 (ENSSLUG00000004411)	SRGAP1 (ENSSLUG00000004684)	ccdc113 (ENSSLUG00000011252)	parp12a (ENSSLUG00000011254)	tbxas1 (ENSSLUG00000011315)	hipk2 (ENSSLUG00000012630)	ENSSLUG00000013367	mical3a (ENSSLUG00000013446)	ttc38 (ENSSLUG00000015351)	tspan33b (ENSSLUG00000015389)	TSPAN9 (ENSSLUG00000015414)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	22	WASHC4 (ENSSAUG00010002683)	ENSSAUG00010002536	etfbkmt (ENSSAUG00010002516)	si:ch73-62b13.1 (ENSSAUG00010002509)	mterf2 (ENSSAUG00010002505)	zgc:153031 (ENSSAUG00010002503)	cry1b (ENSSAUG00010001264)	ABTB3 (ENSSAUG00010000873)	mlc1 (ENSSAUG00010000839)	panx2 (ENSSAUG00010000830)	trabd (ENSSAUG00010000816)	selenoo1 (ENSSAUG00010000804)	mapk12a (ENSSAUG00010000736)	mtss1la (ENSSAUG00010000505)	ENSSAUG00010000446	ENSSAUG00010000429 ##22	ENSSAUG00010000415 ##24	uri1 (ENSSAUG00010000405) #25	ENSSAUG00010000395	ENSSAUG00010000389	ENSSAUG00010012046	ENSSAUG00010012044	ENSSAUG00010012043	ENSSAUG00010012039	ENSSAUG00010012038	ENSSAUG00010012036	ENSSAUG00010012033	ENSSAUG00010012032	ENSSAUG00010012031	ENSSAUG00010012029	ENSSAUG00010012028
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
European seabass	MODERN SPECIES	19	ENSDLAG00005022303	ENSDLAG00005022248	etfbkmt (ENSDLAG00005027482)	si:ch73-62b13.1 (ENSDLAG00005022239)	mterf2 (ENSDLAG00005033985)	zgc:153031 (ENSDLAG00005022234)	zgc:153031 (ENSDLAG00005030360)	cry1b (ENSDLAG00005022057)	ENSDLAG00005021765	mlc1 (ENSDLAG00005026632)	panx2 (ENSDLAG00005021717)	selenoo1 (ENSDLAG00005021639)	mapk12a (ENSDLAG00005021528)	mtss1la (ENSDLAG00005021408)	ENSDLAG00005021314	ENSDLAG00005021310 ##22	ENSDLAG00005031072	ENSDLAG00005021293 ##24	uri1 (ENSDLAG00005021285) #25	zgc:112052 (ENSDLAG00005026692) #27	ENSDLAG00005021271 #30	rxylt1 (ENSDLAG00005021263)	ENSDLAG00005021017	ENSDLAG00005020989	parp12a (ENSDLAG00005020986)	tbxas1 (ENSDLAG00005020842)	hipk2 (ENSDLAG00005019815)	ENSDLAG00005019711	mical3a (ENSDLAG00005018834)	ttc38 (ENSDLAG00005018776)	tspan33b (ENSDLAG00005026773)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	492	WASHC4 (ENSLCRG00005015674)	ENSLCRG00005015661	etfbkmt (ENSLCRG00005015659)	si:ch73-62b13.1 (ENSLCRG00005015658)	mterf2 (ENSLCRG00005015657)	zgc:153031 (ENSLCRG00005015656)	cry1b (ENSLCRG00005015281)	ABTB3 (ENSLCRG00005015109)	mlc1 (ENSLCRG00005015105)	panx2 (ENSLCRG00005015102)	trabd (ENSLCRG00005015099)	selenoo1 (ENSLCRG00005015081)	mapk12a (ENSLCRG00005014991)	mtss1la (ENSLCRG00005014946)	ENSLCRG00005014944	ENSLCRG00005014942 ##22	ENSLCRG00005014941 ##24	uri1 (ENSLCRG00005014938) #25	zgc:112052 (ENSLCRG00005014936) #27	UQCRFS1 (ENSLCRG00005014935) #30	rxylt1 (ENSLCRG00005014932)	SRGAP1 (ENSLCRG00005013381)	ENSLCRG00005013346	parp12a (ENSLCRG00005013342)	tbxas1 (ENSLCRG00005013282)	hipk2 (ENSLCRG00005011981)	ENSLCRG00005011954	mical3a (ENSLCRG00005020195)	ttc38 (ENSLCRG00005019933)	tspan33b (ENSLCRG00005019902)	TSPAN9 (ENSLCRG00005019891)
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Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	20	ENSMAMG00000002499	ENSMAMG00000002458	etfbkmt (ENSMAMG00000002442)	si:ch73-62b13.1 (ENSMAMG00000002429)	mterf2 (ENSMAMG00000002420)	zgc:153031 (ENSMAMG00000002403)	cry1b (ENSMAMG00000002323)	ENSMAMG00000002297	mlc1 (ENSMAMG00000002215)	panx2 (ENSMAMG00000002172)	trabd (ENSMAMG00000002162)	selenoo1 (ENSMAMG00000002133)	mapk12a (ENSMAMG00000002080)	mtss1la (ENSMAMG00000001995)	ENSMAMG00000001982	ENSMAMG00000001971 ##22	ENSMAMG00000026253 ##24	uri1 (ENSMAMG00000001930) #25	zgc:112052 (ENSMAMG00000001918) #27	ENSMAMG00000001906 #30	rxylt1 (ENSMAMG00000001897)	ENSMAMG00000001821	ENSMAMG00000001797	parp12a (ENSMAMG00000001755)	tbxas1 (ENSMAMG00000001669)	hipk2 (ENSMAMG00000001570)	ENSMAMG00000001533	mical3a (ENSMAMG00000001453)	ttc38 (ENSMAMG00000001422)	tspan33b (ENSMAMG00000001409)	ENSMAMG00000001372
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	19	ENSATEG00000018550	ENSATEG00000018518	etfbkmt (ENSATEG00000018503)	si:ch73-62b13.1 (ENSATEG00000018494)	mterf2 (ENSATEG00000018492)	zgc:153031 (ENSATEG00000018425)	cry1b (ENSATEG00000018409)	ENSATEG00000018396	mlc1 (ENSATEG00000018322)	panx2 (ENSATEG00000018299)	trabd (ENSATEG00000018262)	selenoo1 (ENSATEG00000018247)	mapk12a (ENSATEG00000018208)	mtss1la (ENSATEG00000018176)	ENSATEG00000030181	ENSATEG00000018154 ##22	ENSATEG00000018139 ##24	uri1 (ENSATEG00000018125) #25	zgc:112052 (ENSATEG00000018112) #27	ENSATEG00000018103 #30	rxylt1 (ENSATEG00000018096)	ENSATEG00000018036	ENSATEG00000018023	parp12a (ENSATEG00000017986)	tbxas1 (ENSATEG00000017935)	hipk2 (ENSATEG00000017882)	ENSATEG00000017857	mical3a (ENSATEG00000017606)	ttc38 (ENSATEG00000017553)	tspan33b (ENSATEG00000017524)	ENSATEG00000017474
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	17	ENSBSLG00000010739	etfbkmt (ENSBSLG00000011196)	si:ch73-62b13.1 (ENSBSLG00000011613)	mterf2 (ENSBSLG00000011654)	zgc:153031 (ENSBSLG00000011707)	cry1b (ENSBSLG00000011854)	ABTB3 (ENSBSLG00000013333)	ENSBSLG00000013839	mlc1 (ENSBSLG00000013847)	panx2 (ENSBSLG00000013857)	trabd (ENSBSLG00000013867)	selenoo1 (ENSBSLG00000013882)	mapk12a (ENSBSLG00000013965)	mtss1la (ENSBSLG00000015248)	ENSBSLG00000016706	ENSBSLG00000017059 ##22	ENSBSLG00000017081 ##24	uri1 (ENSBSLG00000017104) #25	zgc:112052 (ENSBSLG00000017136) #27	ENSBSLG00000017154	rxylt1 (ENSBSLG00000017166)	SRGAP1 (ENSBSLG00000017254)	ENSBSLG00000018430	parp12a (ENSBSLG00000018452)	tbxas1 (ENSBSLG00000018507)	hipk2 (ENSBSLG00000018661)	ENSBSLG00000019352	mical3a (ENSBSLG00000019372)	ttc38 (ENSBSLG00000020054)	tspan33b (ENSBSLG00000020409)	TSPAN9 (ENSBSLG00000020416)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00940000178549	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526.n	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526.n	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2945	WASHC4 (ENSSLDG00000010814)	ENSSLDG00000010755	etfbkmt (ENSSLDG00000010743)	si:ch73-62b13.1 (ENSSLDG00000010732)	mterf2 (ENSSLDG00000010722)	zgc:153031 (ENSSLDG00000010677)	cry1b (ENSSLDG00000010617)	ABTB3 (ENSSLDG00000010519)	mlc1 (ENSSLDG00000010455)	panx2 (ENSSLDG00000010427)	trabd (ENSSLDG00000010402)	selenoo1 (ENSSLDG00000010376)	mapk12a (ENSSLDG00000010324)	mtss1la (ENSSLDG00000010218)	ENSSLDG00000010170	ENSSLDG00000010155 ##22	ENSSLDG00000010139 ##24	uri1 (ENSSLDG00000010119) #25	zgc:112052 (ENSSLDG00000010101) #27	UQCRFS1 (ENSSLDG00000010090) #30	rxylt1 (ENSSLDG00000010075)	SRGAP1 (ENSSLDG00000009963)	parp12a (ENSSLDG00000009897)	tbxas1 (ENSSLDG00000009881)	hipk2 (ENSSLDG00000009830)	ENSSLDG00000009781	mical3a (ENSSLDG00000009684)	ttc38 (ENSSLDG00000009637)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	82	WASHC4 (ENSSDUG00000020208)	ENSSDUG00000020315	etfbkmt (ENSSDUG00000020335)	si:ch73-62b13.1 (ENSSDUG00000020343)	mterf2 (ENSSDUG00000020350)	zgc:153031 (ENSSDUG00000020355)	cry1b (ENSSDUG00000020364)	ABTB3 (ENSSDUG00000020388)	mlc1 (ENSSDUG00000020410)	panx2 (ENSSDUG00000020478)	trabd (ENSSDUG00000020489)	selenoo1 (ENSSDUG00000020498)	mapk12a (ENSSDUG00000020510)	mtss1la (ENSSDUG00000020575)	ENSSDUG00000020633	ENSSDUG00000020692 ##22	ENSSDUG00000020697 ##24	uri1 (ENSSDUG00000020706) #25	zgc:112052 (ENSSDUG00000000077) #27	UQCRFS1 (ENSSDUG00000000124) #30	rxylt1 (ENSSDUG00000000144)	ENSSDUG00000000154	SRGAP1 (ENSSDUG00000000168)	ENSSDUG00000000289	parp12a (ENSSDUG00000000297)	tbxas1 (ENSSDUG00000000314)	hipk2 (ENSSDUG00000000364)	ENSSDUG00000000431	mical3a (ENSSDUG00000000490)	ttc38 (ENSSDUG00000000724)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	97	ENSLCAG00010019301	etfbkmt (ENSLCAG00010019304)	si:ch73-62b13.1 (ENSLCAG00010019306)	ENSLCAG00010019307	mterf2 (ENSLCAG00010019308)	zgc:153031 (ENSLCAG00010019310)	cry1b (ENSLCAG00010019316)	ENSLCAG00010019370	mlc1 (ENSLCAG00010019546)	panx2 (ENSLCAG00010019554)	trabd (ENSLCAG00010019559)	selenoo1 (ENSLCAG00010019568)	mapk12a (ENSLCAG00010019572)	mtss1la (ENSLCAG00010019595)	ENSLCAG00010019639	ENSLCAG00010019645 ##22	ENSLCAG00010019646 ##24	uri1 (ENSLCAG00010019650) #25	zgc:112052 (ENSLCAG00010019656) #27	UQCRFS1 (ENSLCAG00010019659) #30	rxylt1 (ENSLCAG00010019660)	SRGAP1 (ENSLCAG00010019799)	ENSLCAG00010020849	parp12a (ENSLCAG00010020853)	tbxas1 (ENSLCAG00010020857)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000002524	ENSGT00950000183042.a.b.b	ENSGT00940000163501	ENSGT00940000164185	ENSGT00530000063817.b.a	ENSGT00940000165780	ENSGT00940000155455.h	ENSGT00940000156419.a	ENSGT00390000015442	ENSGT00940000153972.C	ENSGT00390000009067	ENSGT00390000005508.a.a	ENSGT00940000156189.a.a	ENSGT00950000183156.a.a	ENSGT00940000164020.d	ENSGT00950000183051.b.b ##22	ENSGT00940000156397.b ##24	ENSGT00390000002362 #25	ENSGT00390000009077.d #27	ENSGT00390000001014.`b.b #30	ENSGT00390000003526	ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154521.B	ENSGT00940000154649.B	ENSGT00940000157903	ENSGT00940000157742.b	ENSGT00530000063472.b.a	ENSGT00940000155580.b.a.a	ENSGT00390000002669	ENSGT00940000166236	ENSGT00940000158225.i.b
Turbot	MODERN SPECIES	1	cnot2 (ENSSMAG00000009857)	ENSSMAG00000009936	ENSSMAG00000010038	etfbkmt (ENSSMAG00000010063)	si:ch73-62b13.1 (ENSSMAG00000010072)	mterf2 (ENSSMAG00000010100)	zgc:153031 (ENSSMAG00000010104)	cry1b (ENSSMAG00000010112)	ENSSMAG00000010133	mlc1 (ENSSMAG00000010178)	PANX (ENSSMAG00000010213)	trabd (ENSSMAG00000010224)	selenoo1 (ENSSMAG00000010268)	mapk12a (ENSSMAG00000010338)	mtss1la (ENSSMAG00000010358)	ENSSMAG00000010554 ##22	ENSSMAG00000010572 ##24	uri1 (ENSSMAG00000010594) #25	zgc:112052 (ENSSMAG00000010602) #27	ENSSMAG00000010608 #30	rxylt1 (ENSSMAG00000010617)	ENSSMAG00000010623	ENSSMAG00000010688	parp12a (ENSSMAG00000010702)	tbxas1 (ENSSMAG00000010721)	hipk2 (ENSSMAG00000010740)	ENSSMAG00000010804	mical3a (ENSSMAG00000010863)	ttc38 (ENSSMAG00000011103)	tspan33b (ENSSMAG00000011134)	ENSSMAG00000011149
Tongue sole	MODERN SPECIES	16	CYP19A1 (ENSCSEG00000010049)	ENSCSEG00000010037	CLPX (ENSCSEG00000010016)	ENSCSEG00000009997	mterf2 (ENSCSEG00000009994)	zgc:153031 (ENSCSEG00000009990)	cry1b (ENSCSEG00000009961)	ABTB3 (ENSCSEG00000009658)	mlc1 (ENSCSEG00000009581)	panx2 (ENSCSEG00000009566)	trabd (ENSCSEG00000009543)	selenoo1 (ENSCSEG00000009527)	mapk12a (ENSCSEG00000009503)	mtss1la (ENSCSEG00000009429)	ENSCSEG00000009386	ENSCSEG00000009372 ##22	ENSCSEG00000009361 ##24	uri1 (ENSCSEG00000009324) #25	UQCRFS1 (ENSCSEG00000009313) #30	zgc:112052 (ENSCSEG00000009305) #27	rxylt1 (ENSCSEG00000009296)	SRGAP1 (ENSCSEG00000009265)	ENSCSEG00000009245	parp12a (ENSCSEG00000009223)	tbxas1 (ENSCSEG00000009189)	ENSCSEG00000009180	hipk2 (ENSCSEG00000009141)	ENSCSEG00000009086	mical3a (ENSCSEG00000009042)	ENSCSEG00000009030	ENSCSEG00000009012
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	20	ENSMMDG00005008341	amn1 (ENSMMDG00005008441)	etfbkmt (ENSMMDG00005008443)	si:ch73-62b13.1 (ENSMMDG00005008445)	mterf2 (ENSMMDG00005008447)	zgc:153031 (ENSMMDG00005008450)	cry1b (ENSMMDG00005008473)	ABTB3 (ENSMMDG00005008573)	mlc1 (ENSMMDG00005008576)	panx2 (ENSMMDG00005008578)	trabd (ENSMMDG00005008580)	selenoo1 (ENSMMDG00005008583)	mapk12a (ENSMMDG00005008585)	mtss1la (ENSMMDG00005008660)	ENSMMDG00005008724	ENSMMDG00005008730 ##22	ENSMMDG00005008733 ##24	uri1 (ENSMMDG00005008735) #25	zgc:112052 (ENSMMDG00005008737) #27	UQCRFS1 (ENSMMDG00005008739) #30	rxylt1 (ENSMMDG00005008740)	SRGAP1 (ENSMMDG00005008755)	ENSMMDG00005009620	parp12a (ENSMMDG00005009621)	tbxas1 (ENSMMDG00005009627)	tbxas1 (ENSMMDG00005009697)	tbxas1 (ENSMMDG00005010331)	hipk2 (ENSMMDG00005013545)	ENSMMDG00005013558	mical3a (ENSMMDG00005013624)	ttc38 (ENSMMDG00005014189)
Gnathostomata	DUPLICATION
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	225														ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	54										ENSGT00940000156500	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00950000183211.a.b
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	91	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000171800	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Sauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00730000110960.a.b	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Common wall lizard	MODERN SPECIES	15	ENSPMRG00000005523	CBLN2 (ENSPMRG00000005526)	NETO1 (ENSPMRG00000005537)	ENSPMRG00000005545	ENSPMRG00000005546	FBXO15 (ENSPMRG00000005551)	TIMM21 (ENSPMRG00000005564)	DIPK1C (ENSPMRG00000005580)	C18orf63 (ENSPMRG00000005600)	ENSPMRG00000005617	CNDP1 (ENSPMRG00000005629)	ENSPMRG00000005664	ENSPMRG00000005671	ENSPMRG00000005678	PTGR3 (ENSPMRG00000005687)	TSHZ1 (ENSPMRG00000005693) ##22	ZNF516 (ENSPMRG00000005707)	ZNF236 (ENSPMRG00000005734)	MBP (ENSPMRG00000005857)	GALR1 (ENSPMRG00000005872)	SALL3 (ENSPMRG00000005880)	ATP9B (ENSPMRG00000005890)	NFATC1 (ENSPMRG00000005931)	CTDP1 (ENSPMRG00000005953)	KCNG2 (ENSPMRG00000005962)	SLC66A2 (ENSPMRG00000005972)	ENSPMRG00000005989	ENSPMRG00000005992	ENSPMRG00000005999	ENSPMRG00000006006	RBFA (ENSPMRG00000006021)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	4	RTTN (ENSSMRG00000004003)	SOCS6 (ENSSMRG00000004025)	ENSSMRG00000004035	CBLN2 (ENSSMRG00000004042)	NETO1 (ENSSMRG00000004045)	FBXO15 (ENSSMRG00000004054)	TIMM21 (ENSSMRG00000004064)	CYB5A (ENSSMRG00000004067)	C18orf63 (ENSSMRG00000004070)	DIPK1C (ENSSMRG00000004073)	CNDP2 (ENSSMRG00000004084)	ENSSMRG00000004092	CNDP1 (ENSSMRG00000004094)	ZNF407 (ENSSMRG00000004168)	PTGR3 (ENSSMRG00000004173)	TSHZ1 (ENSSMRG00000004177) ##22	ZNF516 (ENSSMRG00000004193)	ZNF236 (ENSSMRG00000004202)	MBP (ENSSMRG00000004291)	ENSSMRG00000004319	ENSSMRG00000004391	SALL3 (ENSSMRG00000004402)	ATP9B (ENSSMRG00000004423)	NFATC1 (ENSSMRG00000004483)	CTDP1 (ENSSMRG00000004596)	KCNG2 (ENSSMRG00000004647)	SLC66A2 (ENSSMRG00000004648)	HSBP1L1 (ENSSMRG00000004652)	ENSSMRG00000004653	ENSSMRG00000004656	ENSSMRG00000004660
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535.l	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446.c	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071.n	ENSGT00940000157616.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.e	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535.l	ENSGT00640000091535.k	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446.c	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071.n	ENSGT00940000157616.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.e	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00990000214277	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535.k	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446.c	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071.n	ENSGT00940000157616.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.e	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	30							FBXO15 (ENSNSUG00000013515)	TIMM21 (ENSNSUG00000013516)	CYB5A (ENSNSUG00000013517)	C18orf63 (ENSNSUG00000013518)	DIPK1C (ENSNSUG00000013519)	CNDP2 (ENSNSUG00000013521)	CNDP1 (ENSNSUG00000013523)	ZNF407 (ENSNSUG00000013524)	PTGR3 (ENSNSUG00000013569)	TSHZ1 (ENSNSUG00000013570) ##22	ZNF516 (ENSNSUG00000013572)	ZNF236 (ENSNSUG00000013573)	MBP (ENSNSUG00000013576)	GALR1 (ENSNSUG00000013582)	SALL3 (ENSNSUG00000013583)	ATP9B (ENSNSUG00000013594)	NFATC1 (ENSNSUG00000016698)	CTDP1 (ENSNSUG00000016700)	KCNG2 (ENSNSUG00000016702)	SLC66A2 (ENSNSUG00000016703)	ENSNSUG00000016704	ENSNSUG00000016707	RBFA (ENSNSUG00000016709)	ENSNSUG00000016710	ADNP2 (ENSNSUG00000016712)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	11	RTTN (ENSPTXG00000017288)	ENSPTXG00000017292	ENSPTXG00000017293	CBLN2 (ENSPTXG00000017294)	NETO1 (ENSPTXG00000017295)	ENSPTXG00000017296	FBXO15 (ENSPTXG00000017297)	TIMM21 (ENSPTXG00000017298)	CYB5A (ENSPTXG00000017299)	ENSPTXG00000000041	DIPK1C (ENSPTXG00000000057)	CNDP2 (ENSPTXG00000000070)	CNDP1 (ENSPTXG00000000103)	ZNF407 (ENSPTXG00000000154)	PTGR3 (ENSPTXG00000000213)	TSHZ1 (ENSPTXG00000000230) ##22	ZNF516 (ENSPTXG00000000238)	ZNF236 (ENSPTXG00000000343)	MBP (ENSPTXG00000000515)	GALR1 (ENSPTXG00000000530)	SALL3 (ENSPTXG00000000547)	ATP9B (ENSPTXG00000000615)	NFATC1 (ENSPTXG00000000626)	CTDP1 (ENSPTXG00000000637)	KCNG2 (ENSPTXG00000000642)	SLC66A2 (ENSPTXG00000000645)	ENSPTXG00000000647	ENSPTXG00000000651	ENSPTXG00000000656	RBFA (ENSPTXG00000000663)	ENSPTXG00000000669
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	9227																TSHZ1 (ENSLLTG00000015979) ##22
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	ENSNNAG00000012228	ENSNNAG00000012198	ENSNNAG00000012142	SOCS6 (ENSNNAG00000012131)	ENSNNAG00000012098	CBLN2 (ENSNNAG00000012087)	NETO1 (ENSNNAG00000012046)	FBXO15 (ENSNNAG00000011984)	TIMM21 (ENSNNAG00000011964)	CYB5A (ENSNNAG00000011918)	DIPK1C (ENSNNAG00000011900)	CNDP2 (ENSNNAG00000010123)	CNDP1 (ENSNNAG00000009992)	ENSNNAG00000009958	PTGR3 (ENSNNAG00000009930)	TSHZ1 (ENSNNAG00000009919) ##22	ZNF516 (ENSNNAG00000009905)	ZNF236 (ENSNNAG00000009158)	MBP (ENSNNAG00000009059)	GALR1 (ENSNNAG00000008972)	SALL3 (ENSNNAG00000008844)	ATP9B (ENSNNAG00000006407)	NFATC1 (ENSNNAG00000006157)	CTDP1 (ENSNNAG00000005809)	KCNG2 (ENSNNAG00000015316)	SLC66A2 (ENSNNAG00000015286)	ENSNNAG00000015259	ENSNNAG00000015235	ENSNNAG00000015222	RBFA (ENSNNAG00000015208)	ENSNNAG00000015188
Lizard	MODERN SPECIES	3	ENSACAG00000042376	CBLN2 (ENSACAG00000003828)	NETO1 (ENSACAG00000003789)	ENSACAG00000042139	FBXO15 (ENSACAG00000003780)	TIMM21 (ENSACAG00000003778)	CYB5A (ENSACAG00000034676)	C18orf63 (ENSACAG00000003727)	DIPK1C (ENSACAG00000003723)	CNDP2 (ENSACAG00000003653)	CNDP1 (ENSACAG00000003637)	ENSACAG00000044218	ENSACAG00000023951	ENSACAG00000042708	PTGR3 (ENSACAG00000005316)	TSHZ1 (ENSACAG00000042445) ##22	ENSACAG00000038594	ZNF516 (ENSACAG00000005332)	ZNF236 (ENSACAG00000005340)	MBP (ENSACAG00000005477)	GALR1 (ENSACAG00000005481)	ENSACAG00000040253	SALL3 (ENSACAG00000000478)	ATP9B (ENSACAG00000000552)	NFATC1 (ENSACAG00000000941)	CTDP1 (ENSACAG00000001148)	KCNG2 (ENSACAG00000001221)	SLC66A2 (ENSACAG00000035946)	HSBP1L1 (ENSACAG00000036968)	ENSACAG00000001310	ENSACAG00000029150
tuatara	MODERN SPECIES	1321			FBXO15 (ENSSPUG00000000288)	TIMM21 (ENSSPUG00000000392)	ENSSPUG00000000445	ENSSPUG00000000449	CYB5A (ENSSPUG00000000463)	DIPK1C (ENSSPUG00000000469)	CNDP2 (ENSSPUG00000000484)	CNDP1 (ENSSPUG00000000504)	ENSSPUG00000000546	ENSSPUG00000000570	ENSSPUG00000000620	ENSSPUG00000000651	PTGR3 (ENSSPUG00000000667)	TSHZ1 (ENSSPUG00000000680) ##22	ZNF516 (ENSSPUG00000000695)	ZNF236 (ENSSPUG00000000709)	ENSSPUG00000000813	ENSSPUG00000000823	GALR1 (ENSSPUG00000000828)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Aves	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	14	DOK6 (ENSABRG00000018757)	CD226 (ENSABRG00000018763)	RTTN (ENSABRG00000018775)	SOCS6 (ENSABRG00000018805)	CBLN2 (ENSABRG00000018823)	NETO1 (ENSABRG00000018829)	FBXO15 (ENSABRG00000018889)	TIMM21 (ENSABRG00000018894)	CYB5A (ENSABRG00000018905)	C18orf63 (ENSABRG00000018918)	DIPK1C (ENSABRG00000018929)	CNDP2 (ENSABRG00000018931)	CNDP1 (ENSABRG00000018941)	ZNF407 (ENSABRG00000018959)	PTGR3 (ENSABRG00000018972)	TSHZ1 (ENSABRG00000018981) ##22	ZNF516 (ENSABRG00000018997)	ZNF236 (ENSABRG00000019008)	MBP (ENSABRG00000019050)	ENSABRG00000019054	TDP2 (ENSABRG00000019066)	ACOT13 (ENSABRG00000019070)	C6orf62 (ENSABRG00000019077)	GMNN (ENSABRG00000019086)	RIPOR2 (ENSABRG00000019098)	CARMIL1 (ENSABRG00000019131)	SCGN (ENSABRG00000019181)	PARD6G (ENSABRG00000019191)	BLOC1S4 (ENSABRG00000019197)	GLIPR2 (ENSABRG00000019201)	ENSABRG00000019204
Duck	MODERN SPECIES	10	ENSAPLG00000030695	ENSAPLG00000008843	ENSAPLG00000021502	ENSAPLG00000030542	CBLN2 (ENSAPLG00000009670)	NETO1 (ENSAPLG00000009839)	FBXO15 (ENSAPLG00000012462)	CYB5A (ENSAPLG00000025505)	ENSAPLG00000028433	DIPK1C (ENSAPLG00000009958)	CNDP2 (ENSAPLG00000009010)	CNDP1 (ENSAPLG00000008937)	ZNF407 (ENSAPLG00000015102)	ENSAPLG00000020727	PTGR3 (ENSAPLG00000000703)	TSHZ1 (ENSAPLG00000015100) ##22	ZNF516 (ENSAPLG00000015083)	ZNF236 (ENSAPLG00000014682)	MBP (ENSAPLG00000014659)	GALR1 (ENSAPLG00000011047)	TDP2 (ENSAPLG00000030813)	ACOT13 (ENSAPLG00000024331)	C6orf62 (ENSAPLG00000013019)	GMNN (ENSAPLG00000013031)	RIPOR2 (ENSAPLG00000013099)	CARMIL1 (ENSAPLG00000016185)	ENSAPLG00000030691	ENSAPLG00000030440	PARD6G (ENSAPLG00000002037)	BLOC1S4 (ENSAPLG00000011052)	GLIPR2 (ENSAPLG00000011053)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993.a	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787.u.a	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
Japanese quail	MODERN SPECIES	11	DOK6 (ENSCJPG00005007476)	CD226 (ENSCJPG00005007459)	RTTN (ENSCJPG00005007458)	SOCS6 (ENSCJPG00005007455)	CBLN2 (ENSCJPG00005007436)	NETO1 (ENSCJPG00005007427)	TIMM21 (ENSCJPG00005007370)	FBXO15 (ENSCJPG00005007363)	CYB5A (ENSCJPG00005007362)	C18orf63 (ENSCJPG00005007359)	DIPK1C (ENSCJPG00005007321)	CNDP2 (ENSCJPG00005007320)	CNDP1 (ENSCJPG00005007319)	ZNF407 (ENSCJPG00005007318)	PTGR3 (ENSCJPG00005007262)	TSHZ1 (ENSCJPG00005007261) ##22	ZNF516 (ENSCJPG00005007179)	ZNF236 (ENSCJPG00005007161)	MBP (ENSCJPG00005007160)	GALR1 (ENSCJPG00005007144)	TDP2 (ENSCJPG00005007142)	ACOT13 (ENSCJPG00005007119)	C6orf62 (ENSCJPG00005007118)	ENSCJPG00005007117	RIPOR2 (ENSCJPG00005007113)	CARMIL1 (ENSCJPG00005007109)	SCGN (ENSCJPG00005007081)	PARD6G (ENSCJPG00005007080)	BLOC1S4 (ENSCJPG00005007079)	GLIPR2 (ENSCJPG00005007076)	ENSCJPG00005007073
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993.a	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787.u.a	ENSGT00390000014772.g	ENSGT00940000159286.b	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
Chicken	MODERN SPECIES	11	RTTN (ENSGALG00010001159)	SOCS6 (ENSGALG00010001225)	CBLN2 (ENSGALG00010001268)	ENSGALG00010001259	NETO1 (ENSGALG00010001254)	ENSGALG00010001239	FBXO15 (ENSGALG00010002346)	TIMM21 (ENSGALG00010001157)	CYB5A (ENSGALG00010001155)	C18orf63 (ENSGALG00010001148)	FAM69C (ENSGALG00010001146)	CNDP2 (ENSGALG00010001233)	CNDP1 (ENSGALG00010001231)	ZNF407 (ENSGALG00010001229)	PTGR3 (ENSGALG00010001154)	TSHZ1 (ENSGALG00010001153) ##22	ZNF516 (ENSGALG00010007867)	ZNF236 (ENSGALG00010007795)	MBP (ENSGALG00010007781)	GALR1 (ENSGALG00010007717)	TDP2 (ENSGALG00010008035)	ACOT13 (ENSGALG00010008033)	C2H6ORF62 (ENSGALG00010008027)	GMNN (ENSGALG00010008017)	FAM65B (ENSGALG00010007994)	CARMIL1 (ENSGALG00010007973)	SCGN (ENSGALG00010007953)	ENSGALG00010009189	PARD6G (ENSGALG00010007945)	BLOC1S4 (ENSGALG00010007943)	GLIPR2 (ENSGALG00010007940)
Turkey	MODERN SPECIES	22	ENSMGAG00000021838	ENSMGAG00000017743	ENSMGAG00000007842	ENSMGAG00000019200	ENSMGAG00000007965	ENSMGAG00000007931	TDP2 (ENSMGAG00000008014)	ENSMGAG00000008012	C6orf62 (ENSMGAG00000007993)	ENSMGAG00000008020	ENSMGAG00000018380	ENSMGAG00000008029	ENSMGAG00000008045	ENSMGAG00000018360	ENSMGAG00000008109	ENSMGAG00000008114 ##22	ENSMGAG00000021513	ENSMGAG00000021412	ENSMGAG00000007222	ENSMGAG00000007244	ENSMGAG00000021014	ENSMGAG00000016816	ENSMGAG00000007303	ENSMGAG00000019127	ENSMGAG00000007371	ENSMGAG00000007353	ENSMGAG00000007394	ENSMGAG00000022048	ENSMGAG00000019521	ENSMGAG00000007419	ENSMGAG00000007538
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Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a.d	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
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Kakapo	MODERN SPECIES		EPB41L3 (ENSSHBG00005010140)	TMEM200C (ENSSHBG00005010241)	ARHGAP28 (ENSSHBG00005010310)	LAMA1 (ENSSHBG00005000448)	LRRC30 (ENSSHBG00005000506)	ENSSHBG00005000569	FBXO15 (ENSSHBG00005000593)	TIMM21 (ENSSHBG00005000597)	CYB5A (ENSSHBG00005002134)	C18orf63 (ENSSHBG00005002153)	DIPK1C (ENSSHBG00005002169)	CNDP2 (ENSSHBG00005002177)	CNDP1 (ENSSHBG00005002189)	ENSSHBG00005002206	PTGR3 (ENSSHBG00005002221)	TSHZ1 (ENSSHBG00005002225) ##22	ZNF516 (ENSSHBG00005002233)	ZNF236 (ENSSHBG00005002251)	MBP (ENSSHBG00005002306)	GALR1 (ENSSHBG00005002321)	TDP2 (ENSSHBG00005002339)	ACOT13 (ENSSHBG00005002348)	C6orf62 (ENSSHBG00005002355)	GMNN (ENSSHBG00005002373)	ENSSHBG00005002398	ENSSHBG00005002417	CARMIL1 (ENSSHBG00005002905)	SCGN (ENSSHBG00005004158)	PARD6G (ENSSHBG00005004167)	BLOC1S4 (ENSSHBG00005004172)	GLIPR2 (ENSSHBG00005004179)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158760	ENSGT00960000190252	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158760	ENSGT00960000190252	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a.h	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158760	ENSGT00960000190252	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00390000014242	ENSGT00390000013934	ENSGT00390000008115	ENSGT00940000153270.a	ENSGT00940000153717.a.a	ENSGT00940000155112.B	ENSGT00950000183108.a.h	ENSGT00950000183211.a.b	ENSGT00390000006790.b	ENSGT00390000020276.rb	ENSGT00530000067915
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Zebra finch	MODERN SPECIES	12	DOK6 (ENSTGUG00000009250)	ENSTGUG00000028827	RTTN (ENSTGUG00000009221)	SOCS6 (ENSTGUG00000020323)	CBLN2 (ENSTGUG00000009205)	NETO1 (ENSTGUG00000009188)	FBXO15 (ENSTGUG00000009178)	TIMM21 (ENSTGUG00000023415)	CYB5A (ENSTGUG00000009166)	C18orf63 (ENSTGUG00000024091)	DIPK1C (ENSTGUG00000009165)	CNDP2 (ENSTGUG00000009147)	CNDP1 (ENSTGUG00000009132)	ZNF407 (ENSTGUG00000009124)	PTGR3 (ENSTGUG00000024919)	TSHZ1 (ENSTGUG00000009111) ##22	ZNF516 (ENSTGUG00000009106)	ZNF236 (ENSTGUG00000009074)	MBP (ENSTGUG00000009051)	GALR1 (ENSTGUG00000024217)	TDP2 (ENSTGUG00000009035)	ENSTGUG00000020283	C6orf62 (ENSTGUG00000029400)	GMNN (ENSTGUG00000009018)	RIPOR2 (ENSTGUG00000008974)	CARMIL1 (ENSTGUG00000008921)	SCGN (ENSTGUG00000008902)	PARD6G (ENSTGUG00000008898)	BLOC1S4 (ENSTGUG00000019279)	GLIPR2 (ENSTGUG00000027359)	IFI6 (ENSTGUG00000021692)
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Flycatcher	MODERN SPECIES	11	ENSFALG00000004570	DOK6 (ENSFALG00000004574)	RTTN (ENSFALG00000004592)	SOCS6 (ENSFALG00000014598)	CBLN2 (ENSFALG00000004624)	NETO1 (ENSFALG00000004630)	FBXO15 (ENSFALG00000023381)	TIMM21 (ENSFALG00000028573)	CYB5A (ENSFALG00000026908)	C18orf63 (ENSFALG00000004643)	DIPK1C (ENSFALG00000026013)	CNDP2 (ENSFALG00000004651)	CNDP1 (ENSFALG00000004655)	ZNF407 (ENSFALG00000004663)	PTGR3 (ENSFALG00000022974)	TSHZ1 (ENSFALG00000004672) ##22	ZNF516 (ENSFALG00000004674)	ZNF236 (ENSFALG00000004682)	MBP (ENSFALG00000004700)	TDP2 (ENSFALG00000004710)	GALR1 (ENSFALG00000026015)	C6orf62 (ENSFALG00000004718)	GMNN (ENSFALG00000028466)	RIPOR2 (ENSFALG00000004725)	CARMIL1 (ENSFALG00000004729)	SCGN (ENSFALG00000004743)	ENSFALG00000004746	ENSFALG00000028839	ENSFALG00000004757	ENSFALG00000025474	ALG2 (ENSFALG00000028145)
Great tit	MODERN SPECIES	11	DOK6 (ENSPMJG00000014338)	ENSPMJG00000014337	RTTN (ENSPMJG00000014336)	SOCS6 (ENSPMJG00000014334)	CBLN2 (ENSPMJG00000014331)	NETO1 (ENSPMJG00000014329)	FBXO15 (ENSPMJG00000014326)	TIMM21 (ENSPMJG00000014325)	CYB5A (ENSPMJG00000014324)	C18orf63 (ENSPMJG00000014323)	DIPK1C (ENSPMJG00000014322)	CNDP2 (ENSPMJG00000014321)	CNDP1 (ENSPMJG00000014320)	ZNF407 (ENSPMJG00000014319)	PTGR3 (ENSPMJG00000014316)	TSHZ1 (ENSPMJG00000014315) ##22	ZNF516 (ENSPMJG00000014303)	ZNF236 (ENSPMJG00000014287)	MBP (ENSPMJG00000014269)	GALR1 (ENSPMJG00000014259)	TDP2 (ENSPMJG00000014256)	ACOT13 (ENSPMJG00000014254)	C6orf62 (ENSPMJG00000014252)	GMNN (ENSPMJG00000014251)	RIPOR2 (ENSPMJG00000014241)	CARMIL1 (ENSPMJG00000014196)	SCGN (ENSPMJG00000014177)	PARD6G (ENSPMJG00000014174)	ENSPMJG00000014172	GLIPR2 (ENSPMJG00000014169)	ENSPMJG00000014167
African ostrich	MODERN SPECIES	444				ENSSCUG00000006727	CBLN2 (ENSSCUG00000006725)	NETO1 (ENSSCUG00000006723)	FBXO15 (ENSSCUG00000006715)	TIMM21 (ENSSCUG00000006712)	CYB5A (ENSSCUG00000006710)	C18orf63 (ENSSCUG00000006707)	DIPK1C (ENSSCUG00000006706)	CNDP2 (ENSSCUG00000006701)	CNDP1 (ENSSCUG00000006700)	ZNF407 (ENSSCUG00000006697)	PTGR3 (ENSSCUG00000006693)	TSHZ1 (ENSSCUG00000006692) ##22	ZNF516 (ENSSCUG00000006686)	ZNF236 (ENSSCUG00000010711)	MBP (ENSSCUG00000010705)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES		SOCS6 (ENSCPRG00005005997)	ENSCPRG00005005883	CBLN2 (ENSCPRG00005005790)	NETO1 (ENSCPRG00005005685)	ENSCPRG00005005612	FBXO15 (ENSCPRG00005005597)	TIMM21 (ENSCPRG00005005595)	ENSCPRG00005004956	CYB5A (ENSCPRG00005004883)	C18orf63 (ENSCPRG00005004874)	DIPK1C (ENSCPRG00005004872)	CNDP2 (ENSCPRG00005004864)	CNDP1 (ENSCPRG00005004822)	ZNF407 (ENSCPRG00005004813)	PTGR3 (ENSCPRG00005004797)	TSHZ1 (ENSCPRG00005004790) ##22	ZNF516 (ENSCPRG00005004768)	ZNF236 (ENSCPRG00005004724)	MBP (ENSCPRG00005004693)	GALR1 (ENSCPRG00005004675)	SALL3 (ENSCPRG00005004655)	ATP9B (ENSCPRG00005004634)	NFATC1 (ENSCPRG00005004588)	CTDP1 (ENSCPRG00005004546)	KCNG2 (ENSCPRG00005004501)	SLC66A2 (ENSCPRG00005004499)	ENSCPRG00005004444	ENSCPRG00005004438	ENSCPRG00005004436	ENSCPRG00005004430	RBFA (ENSCPRG00005004420)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839.a	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00990000205958	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b	ENSGT00940000162740.e
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535.g	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.nb	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839.a	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00960000192768	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071.k	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00990000205958	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b
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painted turtle	MODERN SPECIES	2417	SOCS6 (ENSCPBG00000028427)	ENSCPBG00000028428	CBLN2 (ENSCPBG00000028433)	NETO1 (ENSCPBG00000028434)	FBXO15 (ENSCPBG00000028436)	TIMM21 (ENSCPBG00000028437)	ENSCPBG00000002553	CYB5A (ENSCPBG00000002585)	C18orf63 (ENSCPBG00000002599)	DIPK1C (ENSCPBG00000002616)	CNDP2 (ENSCPBG00000002620)	CNDP1 (ENSCPBG00000002643)	ENSCPBG00000002680	ZNF407 (ENSCPBG00000003382)	PTGR3 (ENSCPBG00000003407)	TSHZ1 (ENSCPBG00000003416) ##22	ZNF516 (ENSCPBG00000003442)	ZNF236 (ENSCPBG00000003495)	MBP (ENSCPBG00000003570)	GALR1 (ENSCPBG00000003627)	SALL3 (ENSCPBG00000003657)	ATP9B (ENSCPBG00000003736)	NFATC1 (ENSCPBG00000003948)	CTDP1 (ENSCPBG00000004073)	KCNG2 (ENSCPBG00000006404)	SLC66A2 (ENSCPBG00000006405)	ENSCPBG00000006409	ENSCPBG00000006412	ENSCPBG00000006418	ENSCPBG00000006428	ENSCPBG00000006432
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	24	RTTN (ENSTMTG00000008297)	SOCS6 (ENSTMTG00000008281)	CBLN2 (ENSTMTG00000008252)	NETO1 (ENSTMTG00000008219)	FBXO15 (ENSTMTG00000008121)	TIMM21 (ENSTMTG00000008093)	ENSTMTG00000008008	CYB5A (ENSTMTG00000007989)	C18orf63 (ENSTMTG00000007952)	DIPK1C (ENSTMTG00000007933)	CNDP2 (ENSTMTG00000007881)	CNDP1 (ENSTMTG00000007816)	ENSTMTG00000007793	ZNF407 (ENSTMTG00000007768)	PTGR3 (ENSTMTG00000007763)	TSHZ1 (ENSTMTG00000007752) ##22	ZNF516 (ENSTMTG00000007742)	ZNF236 (ENSTMTG00000007282)	MBP (ENSTMTG00000007225)	GALR1 (ENSTMTG00000007182)	ENSTMTG00000007169	SALL3 (ENSTMTG00000007130)	ATP9B (ENSTMTG00000002000)	NFATC1 (ENSTMTG00000001575)	CTDP1 (ENSTMTG00000001557)	KCNG2 (ENSTMTG00000001551)	SLC66A2 (ENSTMTG00000001538)	ENSTMTG00000001529	ENSTMTG00000001507	RBFA (ENSTMTG00000001492)	ENSTMTG00000001483
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535.g	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.nb	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484.c	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839.a	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00960000192768	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071.k	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00990000205958	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740.f.a	ENSGT00940000162740.f.b
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	11	CBLN2 (ENSGEVG00005012554)	NETO1 (ENSGEVG00005012417)	FBXO15 (ENSGEVG00005011997)	TIMM21 (ENSGEVG00005011942)	ENSGEVG00005011903	ENSGEVG00005011868	ENSGEVG00005011727	ENSGEVG00005011682	ENSGEVG00005011584	DIPK1C (ENSGEVG00005011536)	CNDP2 (ENSGEVG00005011450)	CNDP1 (ENSGEVG00005011192)	ENSGEVG00005010963	ZNF407 (ENSGEVG00005010897)	PTGR3 (ENSGEVG00005010867)	TSHZ1 (ENSGEVG00005010849) ##22	ZNF516 (ENSGEVG00005010828)	ZNF236 (ENSGEVG00005010706)	MBP (ENSGEVG00005010577)	GALR1 (ENSGEVG00005010471)	ENSGEVG00005010422	SALL3 (ENSGEVG00005010347)	ATP9B (ENSGEVG00005010218)	NFATC1 (ENSGEVG00005009488)	CTDP1 (ENSGEVG00005009311)	KCNG2 (ENSGEVG00005009267)	SLC66A2 (ENSGEVG00005009207)	ENSGEVG00005009153	ENSGEVG00005009134	ENSGEVG00005009108	ENSGEVG00005009061
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	262															PTGR3 (ENSCABG00000022594)	TSHZ1 (ENSCABG00000022593) ##22
Chinese turtle	MODERN SPECIES	960	RTTN (ENSPSIG00000003193)	ENSPSIG00000003179	CBLN2 (ENSPSIG00000003176)	NETO1 (ENSPSIG00000003161)	ENSPSIG00000000399	FBXO15 (ENSPSIG00000003070)	TIMM21 (ENSPSIG00000003061)	ENSPSIG00000003041	C18orf63 (ENSPSIG00000003033)	DIPK1C (ENSPSIG00000003023)	CNDP2 (ENSPSIG00000002975)	CNDP1 (ENSPSIG00000002925)	ENSPSIG00000002898	ZNF407 (ENSPSIG00000002896)	PTGR3 (ENSPSIG00000002882)	TSHZ1 (ENSPSIG00000002872) ##22	ENSPSIG00000002867
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Platypus	MODERN SPECIES	85											DIPK1C (ENSOANG00000040718)	CNDP1 (ENSOANG00000013446)	ENSOANG00000013445	CNDP2 (ENSOANG00000013448)	ENSOANG00000045662	TSHZ1 (ENSOANG00000040889) ##22	ENSOANG00000049310	ZNF236 (ENSOANG00000005983)	MBP (ENSOANG00000039093)	GALR1 (ENSOANG00000047844)	SALL3 (ENSOANG00000010135)	ATP9B (ENSOANG00000010134)	NFATC1 (ENSOANG00000030248)	KCNG2 (ENSOANG00000040534)	SLC66A2 (ENSOANG00000042001)	ENSOANG00000040140	TXNL4A (ENSOANG00000012931)	ENSOANG00000050699	ENSOANG00000044635	ADNP2 (ENSOANG00000037498)	ENSOANG00000038891
Theria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Opossum	MODERN SPECIES	2	ENSMODG00000036897	ENSMODG00000024691	ENSMODG00000048297	ENSMODG00000012418	NETO1 (ENSMODG00000012411)	FBXO15 (ENSMODG00000012399)	TIMM21 (ENSMODG00000037747)	CYB5A (ENSMODG00000012386)	C18orf63 (ENSMODG00000012384)	DIPK1C (ENSMODG00000012378)	CNDP2 (ENSMODG00000012371)	CNDP1 (ENSMODG00000012366)	ZNF407 (ENSMODG00000012332)	ENSMODG00000000365	PTGR3 (ENSMODG00000012320)	TSHZ1 (ENSMODG00000012317) ##22	ENSMODG00000046201	ZNF516 (ENSMODG00000012315)	ENSMODG00000045385	ZNF236 (ENSMODG00000012304)	MBP (ENSMODG00000012291)	ENSMODG00000027479	GALR1 (ENSMODG00000012282)	SALL3 (ENSMODG00000012231)	ATP9B (ENSMODG00000012216)	NFATC1 (ENSMODG00000012018)	CTDP1 (ENSMODG00000011995)	ENSMODG00000039089	KCNG2 (ENSMODG00000011988)	SLC66A2 (ENSMODG00000011978)	ENSMODG00000046105
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00950000182967.a.c.b	ENSGT00940000159054.j	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.i	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
koala	MODERN SPECIES	3					FBXO15 (ENSPCIG00000006410)	TIMM21 (ENSPCIG00000006413)	ENSPCIG00000006416	C18orf63 (ENSPCIG00000006419)	DIPK1C (ENSPCIG00000009872)	CNDP2 (ENSPCIG00000022137)	CNDP1 (ENSPCIG00000022140)	ENSPCIG00000036127	ENSPCIG00000022145	ENSPCIG00000022152	PTGR3 (ENSPCIG00000024213)	TSHZ1 (ENSPCIG00000032577) ##22	ACTBL2 (ENSPCIG00000036711)	GPBP1 (ENSPCIG00000024724)	MIER3 (ENSPCIG00000013512)	SETD9 (ENSPCIG00000013507)	MAP3K1 (ENSPCIG00000013501)	ENSPCIG00000013500	ENSPCIG00000010377	IL6ST (ENSPCIG00000024769)	ENSPCIG00000024763	DDX4 (ENSPCIG00000024758)	SLC38A9 (ENSPCIG00000024744)	PLPP1 (ENSPCIG00000024736)	MTREX (ENSPCIG00000024730)	DHX29 (ENSPCIG00000024988)	CCNO (ENSPCIG00000037284)
Common wonbat	MODERN SPECIES	599	ENSVURG00010019664	ENSVURG00010019674	ENSVURG00010019684	CBLN2 (ENSVURG00010019691)	NETO1 (ENSVURG00010019720)	ENSVURG00010019736	FBXO15 (ENSVURG00010019742)	TIMM21 (ENSVURG00010019746)	ENSVURG00010019754	C18orf63 (ENSVURG00010019760)	DIPK1C (ENSVURG00010019772)	CNDP2 (ENSVURG00010019786)	CNDP1 (ENSVURG00010019817)	ENSVURG00010020045	PTGR3 (ENSVURG00010020053)	TSHZ1 (ENSVURG00010020060) ##22	ZNF516 (ENSVURG00010020066)	ZNF236 (ENSVURG00010020072)	MBP (ENSVURG00010020099)	GALR1 (ENSVURG00010020125)	SALL3 (ENSVURG00010020136)	ATP9B (ENSVURG00010020173)	NFATC1 (ENSVURG00010020234)	CTDP1 (ENSVURG00010020249)	KCNG2 (ENSVURG00010020329)	SLC66A2 (ENSVURG00010020339)	HSBP1L1 (ENSVURG00010020347)	ENSVURG00010020355	ENSVURG00010020368	ENSVURG00010020404	ENSVURG00010020411
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		ENSSHAG00000022678	RTTN (ENSSHAG00000012406)	SOCS6 (ENSSHAG00000024549)	CBLN2 (ENSSHAG00000025530)	NETO1 (ENSSHAG00000001697)	ENSSHAG00000022932	FBXO15 (ENSSHAG00000029170)	TIMM21 (ENSSHAG00000028322)	CYB5A (ENSSHAG00000006748)	C18orf63 (ENSSHAG00000007427)	DIPK1C (ENSSHAG00000008858)	CNDP2 (ENSSHAG00000009489)	CNDP1 (ENSSHAG00000009859)	ZNF407 (ENSSHAG00000010961)	PTGR3 (ENSSHAG00000014471)	TSHZ1 (ENSSHAG00000014804) ##22	ENSSHAG00000030697	ZNF516 (ENSSHAG00000009007)	ZNF236 (ENSSHAG00000013079)	MBP (ENSSHAG00000027590)	GALR1 (ENSSHAG00000028513)	SALL3 (ENSSHAG00000015872)	ATP9B (ENSSHAG00000000789)	NFATC1 (ENSSHAG00000009139)	CTDP1 (ENSSHAG00000012579)	KCNG2 (ENSSHAG00000028558)	SLC66A2 (ENSSHAG00000026775)	ENSSHAG00000023188	ENSSHAG00000003555	ENSSHAG00000000881	ENSSHAG00000024236
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.b.a	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740
Primates	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00910000147830	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00910000147830	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362
Pan	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362
Chimpanzee	MODERN SPECIES	9	SOCS6 (ENSPTRG00000010105)	ENSPTRG00000051922	CBLN2 (ENSPTRG00000010107)	NETO1 (ENSPTRG00000010108)	FBXO15 (ENSPTRG00000010109)	TIMM21 (ENSPTRG00000010110)	CYB5A (ENSPTRG00000010111)	ENSPTRG00000044095	C18H18orf63 (ENSPTRG00000029279)	ENSPTRG00000042747	DIPK1C (ENSPTRG00000010113)	CNDP2 (ENSPTRG00000010114)	CNDP1 (ENSPTRG00000010115)	ZNF407 (ENSPTRG00000010117)	PTGR3 (ENSPTRG00000048547)	TSHZ1 (ENSPTRG00000010120) ##22	SMIM21 (ENSPTRG00000042672)	ZNF516 (ENSPTRG00000010121)	ZNF236 (ENSPTRG00000010123)	ENSPTRG00000043129	MBP (ENSPTRG00000010124)	GALR1 (ENSPTRG00000010125)	SALL3 (ENSPTRG00000010126)	ATP9B (ENSPTRG00000010127)	NFATC1 (ENSPTRG00000010129)	CTDP1 (ENSPTRG00000010133)	KCNG2 (ENSPTRG00000010134)	SLC66A2 (ENSPTRG00000010135)	HSBP1L1 (ENSPTRG00000038894)	TXNL4A (ENSPTRG00000052385)	RBFA (ENSPTRG00000010137)
Bonobo	MODERN SPECIES	9	SOCS6 (ENSPPAG00000032920)	ENSPPAG00000041821	NETO1 (ENSPPAG00000025619)	FBXO15 (ENSPPAG00000008805)	TIMM21 (ENSPPAG00000013034)	CYB5A (ENSPPAG00000027983)	ENSPPAG00000031780	C18orf63 (ENSPPAG00000034652)	ENSPPAG00000032835	DIPK1C (ENSPPAG00000041469)	CNDP2 (ENSPPAG00000038993)	CNDP1 (ENSPPAG00000033478)	ENSPPAG00000039074	ENSPPAG00000039880	PTGR3 (ENSPPAG00000027237)	TSHZ1 (ENSPPAG00000029386) ##22	ZNF516 (ENSPPAG00000032527)	ZNF236 (ENSPPAG00000038362)	ENSPPAG00000027666	MBP (ENSPPAG00000029936)	GALR1 (ENSPPAG00000028798)	ENSPPAG00000029586	ATP9B (ENSPPAG00000034175)	NFATC1 (ENSPPAG00000030766)	CTDP1 (ENSPPAG00000042068)	SLC66A2 (ENSPPAG00000031573)	ENSPPAG00000033010	TXNL4A (ENSPPAG00000034563)	RBFA (ENSPPAG00000027669)	ADNP2 (ENSPPAG00000028735)	PARD6G (ENSPPAG00000028051)
Human	MODERN SPECIES	9	DOK6 (ENSG00000206052)	CD226 (ENSG00000150637)	RTTN (ENSG00000176225)	SOCS6 (ENSG00000170677)	CBLN2 (ENSG00000141668)	NETO1 (ENSG00000166342)	FBXO15 (ENSG00000141665)	TIMM21 (ENSG00000075336)	CYB5A (ENSG00000166347)	C18orf63 (ENSG00000206043)	DIPK1C (ENSG00000187773)	CNDP2 (ENSG00000133313)	CNDP1 (ENSG00000150656)	ZNF407 (ENSG00000215421)	PTGR3 (ENSG00000180011)	TSHZ1 (ENSG00000179981) ##22	SMIM21 (ENSG00000206026)	ZNF516 (ENSG00000101493)	ZNF236 (ENSG00000130856)	MBP (ENSG00000197971)	GALR1 (ENSG00000166573)	SALL3 (ENSG00000256463)	ATP9B (ENSG00000166377)	NFATC1 (ENSG00000131196)	CTDP1 (ENSG00000060069)	KCNG2 (ENSG00000178342)	SLC66A2 (ENSG00000122490)	HSBP1L1 (ENSG00000226742)	TXNL4A (ENSG00000141759)	RBFA (ENSG00000101546)	ADNP2 (ENSG00000101544)
Gorilla	MODERN SPECIES	9	CD226 (ENSGGOG00000006047)	RTTN (ENSGGOG00000013129)	SOCS6 (ENSGGOG00000023191)	CBLN2 (ENSGGOG00000009354)	ENSGGOG00000025925	FBXO15 (ENSGGOG00000013486)	TIMM21 (ENSGGOG00000015941)	ENSGGOG00000007968	C18orf63 (ENSGGOG00000014525)	DIPK1C (ENSGGOG00000016066)	CNDP2 (ENSGGOG00000016794)	CNDP1 (ENSGGOG00000016801)	ENSGGOG00000040979	ZNF407 (ENSGGOG00000025018)	PTGR3 (ENSGGOG00000007319)	TSHZ1 (ENSGGOG00000005289) ##22	SMIM21 (ENSGGOG00000001499)	ZNF516 (ENSGGOG00000003996)	ZNF236 (ENSGGOG00000008826)	ENSGGOG00000036615	MBP (ENSGGOG00000009590)	GALR1 (ENSGGOG00000001342)	SALL3 (ENSGGOG00000008127)	ATP9B (ENSGGOG00000008135)	NFATC1 (ENSGGOG00000006879)	CTDP1 (ENSGGOG00000011089)	ENSGGOG00000005274	SLC66A2 (ENSGGOG00000005278)	HSBP1L1 (ENSGGOG00000025369)	TXNL4A (ENSGGOG00000005285)	RBFA (ENSGGOG00000003131)
Orangutan	MODERN SPECIES	9	DOK6 (ENSPPYG00000009231)	CD226 (ENSPPYG00000009232)	RTTN (ENSPPYG00000009233)	SOCS6 (ENSPPYG00000009234)	CBLN2 (ENSPPYG00000032181)	NETO1 (ENSPPYG00000009237)	FBXO15 (ENSPPYG00000009238)	TIMM21 (ENSPPYG00000009239)	CYB5A (ENSPPYG00000009240)	C18orf63 (ENSPPYG00000009241)	DIPK1C (ENSPPYG00000009242)	CNDP2 (ENSPPYG00000009243)	CNDP1 (ENSPPYG00000009244)	ZNF407 (ENSPPYG00000009246)	PTGR3 (ENSPPYG00000009247)	TSHZ1 (ENSPPYG00000009248) ##22	ENSPPYG00000037442	ZNF516 (ENSPPYG00000009249)	ZNF236 (ENSPPYG00000009250)	MBP (ENSPPYG00000009251)	GALR1 (ENSPPYG00000009252)	SALL3 (ENSPPYG00000009253)	ATP9B (ENSPPYG00000009254)	NFATC1 (ENSPPYG00000009255)	CTDP1 (ENSPPYG00000009259)	KCNG2 (ENSPPYG00000009261)	SLC66A2 (ENSPPYG00000009262)	ENSPPYG00000037420	TXNL4A (ENSPPYG00000009263)	RBFA (ENSPPYG00000009264)	ADNP2 (ENSPPYG00000009265)
Gibbon	MODERN SPECIES	19	RTTN (ENSNLEG00000009131)	SOCS6 (ENSNLEG00000018458)	ENSNLEG00000035138	ENSNLEG00000033807	CBLN2 (ENSNLEG00000009198)	NETO1 (ENSNLEG00000009204)	FBXO15 (ENSNLEG00000009214)	TIMM21 (ENSNLEG00000029495)	ENSNLEG00000029763	CYB5A (ENSNLEG00000009232)	C18orf63 (ENSNLEG00000009238)	DIPK1C (ENSNLEG00000009259)	CNDP2 (ENSNLEG00000009264)	CNDP1 (ENSNLEG00000009273)	ENSNLEG00000009303	TSHZ1 (ENSNLEG00000018459) ##22	ENSNLEG00000009315	ENSNLEG00000035372	ZNF516 (ENSNLEG00000009317)	ENSNLEG00000031632	ZNF236 (ENSNLEG00000009319)	MBP (ENSNLEG00000009336)	GALR1 (ENSNLEG00000009350)	SALL3 (ENSNLEG00000008217)	ATP9B (ENSNLEG00000008230)	NFATC1 (ENSNLEG00000008307)	CTDP1 (ENSNLEG00000008353)	SLC66A2 (ENSNLEG00000008361)	HSBP1L1 (ENSNLEG00000008376)	TXNL4A (ENSNLEG00000036299)	RBFA (ENSNLEG00000008385)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00910000147830	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.n	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770.m.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00910000147830	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.n	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770.m.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166968	ENSGT00910000147830	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.n	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770.m.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000166968	ENSGT00910000147830	ENSGT00940000160839	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159286.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171	ENSGT00390000015641
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	154				NETO1 (ENSMNEG00000028773)	FBXO15 (ENSMNEG00000044788)	TIMM21 (ENSMNEG00000038734)	ENSMNEG00000038498	ENSMNEG00000033556	C18orf63 (ENSMNEG00000032579)	DIPK1C (ENSMNEG00000032975)	CNDP2 (ENSMNEG00000034380)	CNDP1 (ENSMNEG00000041332)	ENSMNEG00000018895	ZNF407 (ENSMNEG00000032620)	PTGR3 (ENSMNEG00000032613)	TSHZ1 (ENSMNEG00000031078) ##22	SMIM21 (ENSMNEG00000034505)	ENSMNEG00000038263	ZNF516 (ENSMNEG00000003940)	ENSMNEG00000008498	ENSMNEG00000029102	ZNF236 (ENSMNEG00000038296)	MBP (ENSMNEG00000008562)	ENSMNEG00000037566	SALL3 (ENSMNEG00000029916)	ATP9B (ENSMNEG00000028672)	ENSMNEG00000039709	NFATC1 (ENSMNEG00000014830)	CTDP1 (ENSMNEG00000029480)	KCNG2 (ENSMNEG00000035665)	SLC66A2 (ENSMNEG00000035707)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.n	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.a.b.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171	ENSGT00960000192723	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a
Rhesus	MODERN SPECIES	9	DOK6 (ENSMMUG00000018275)	CD226 (ENSMMUG00000052693)	RTTN (ENSMMUG00000010169)	SOCS6 (ENSMMUG00000058184)	CBLN2 (ENSMMUG00000010417)	NETO1 (ENSMMUG00000020595)	FBXO15 (ENSMMUG00000023298)	TIMM21 (ENSMMUG00000023299)	CYB5A (ENSMMUG00000013607)	C18H18orf63 (ENSMMUG00000020905)	DIPK1C (ENSMMUG00000015702)	ENSMMUG00000058864	CNDP1 (ENSMMUG00000008942)	ZNF407 (ENSMMUG00000008945)	PTGR3 (ENSMMUG00000014915)	TSHZ1 (ENSMMUG00000014916) ##22	ZNF516 (ENSMMUG00000017408)	ENSMMUG00000053081	ZNF236 (ENSMMUG00000011329)	MBP (ENSMMUG00000011333)	GALR1 (ENSMMUG00000053003)	ENSMMUG00000051418	SALL3 (ENSMMUG00000000286)	ATP9B (ENSMMUG00000021792)	NFATC1 (ENSMMUG00000022596)	ENSMMUG00000054935	ENSMMUG00000064830	ENSMMUG00000057000	ENSMMUG00000055855	CTDP1 (ENSMMUG00000009151)	KCNG2 (ENSMMUG00000032486)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	9	SOCS6 (ENSMFAG00000036046)	CBLN2 (ENSMFAG00000033106)	NETO1 (ENSMFAG00000032084)	ENSMFAG00000052138	FBXO15 (ENSMFAG00000031818)	TIMM21 (ENSMFAG00000031508)	CYB5A (ENSMFAG00000030228)	C18orf63 (ENSMFAG00000029634)	ENSMFAG00000024091	CNDP2 (ENSMFAG00000045912)	ENSMFAG00000055856	CNDP1 (ENSMFAG00000036771)	ENSMFAG00000057469	ZNF407 (ENSMFAG00000031607)	PTGR3 (ENSMFAG00000063377)	TSHZ1 (ENSMFAG00000037350) ##22	ENSMFAG00000001214	ENSMFAG00000063070	ENSMFAG00000055361	ZNF236 (ENSMFAG00000044643)	ENSMFAG00000057120	ENSMFAG00000059268	ENSMFAG00000056251	ENSMFAG00000041988	GALR1 (ENSMFAG00000063435)	ENSMFAG00000062135	ENSMFAG00000062575	ATP9B (ENSMFAG00000035856)	ENSMFAG00000063885	NFATC1 (ENSMFAG00000021920)	ENSMFAG00000052939
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770.m.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117
Olive baboon	MODERN SPECIES	10	CD226 (ENSPANG00000001764)	RTTN (ENSPANG00000005969)	SOCS6 (ENSPANG00000000352)	ENSPANG00000043001	CBLN2 (ENSPANG00000039023)	ENSPANG00000040840	ENSPANG00000000411	FBXO15 (ENSPANG00000039967)	TIMM21 (ENSPANG00000037593)	CYB5A (ENSPANG00000023961)	C18orf63 (ENSPANG00000004693)	DIPK1C (ENSPANG00000026365)	CNDP1 (ENSPANG00000012761)	ZNF407 (ENSPANG00000023161)	PTGR3 (ENSPANG00000017718)	TSHZ1 (ENSPANG00000000181) ##22	ZNF516 (ENSPANG00000005050)	ENSPANG00000047986	ZNF236 (ENSPANG00000005965)	MBP (ENSPANG00000023229)	SALL3 (ENSPANG00000006485)	ATP9B (ENSPANG00000015208)	NFATC1 (ENSPANG00000014019)	ENSPANG00000042424	CTDP1 (ENSPANG00000012831)	KCNG2 (ENSPANG00000000968)	SLC66A2 (ENSPANG00000002943)	HSBP1L1 (ENSPANG00000011076)	ENSPANG00000037793	RBFA (ENSPANG00000009263)	ADNP2 (ENSPANG00000011713)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	142			ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770.m.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00910000147812	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	248			CBLN2 (ENSCATG00000036161)	NETO1 (ENSCATG00000034226)	FBXO15 (ENSCATG00000025306)	TIMM21 (ENSCATG00000035709)	ENSCATG00000033895	ENSCATG00000037734	C18orf63 (ENSCATG00000008394)	DIPK1C (ENSCATG00000031119)	CNDP2 (ENSCATG00000030983)	CNDP1 (ENSCATG00000034582)	ENSCATG00000020154	ZNF407 (ENSCATG00000000049)	PTGR3 (ENSCATG00000032406)	TSHZ1 (ENSCATG00000038888) ##22	ENSCATG00000042018	ZNF516 (ENSCATG00000035185)	ENSCATG00000017534	ZNF236 (ENSCATG00000033072)	ENSCATG00000016933	MBP (ENSCATG00000030245)	GALR1 (ENSCATG00000036322)	SALL3 (ENSCATG00000029727)	ATP9B (ENSCATG00000032665)	NFATC1 (ENSCATG00000029374)	ENSCATG00000042560	CTDP1 (ENSCATG00000032475)	KCNG2 (ENSCATG00000045098)	SLC66A2 (ENSCATG00000030232)	HSBP1L1 (ENSCATG00000013374)
Drill	MODERN SPECIES	545					CBLN2 (ENSMLEG00000029817)	NETO1 (ENSMLEG00000034707)	FBXO15 (ENSMLEG00000039973)	TIMM21 (ENSMLEG00000036871)	ENSMLEG00000033374	ENSMLEG00000038513	C18orf63 (ENSMLEG00000032146)	DIPK1C (ENSMLEG00000038350)	CNDP2 (ENSMLEG00000013354)	CNDP1 (ENSMLEG00000000707)	ZNF407 (ENSMLEG00000037097)	TSHZ1 (ENSMLEG00000018472) ##22	ENSMLEG00000034511	ZNF516 (ENSMLEG00000027373)	ENSMLEG00000026133	ENSMLEG00000040506	ZNF236 (ENSMLEG00000034779)	MBP (ENSMLEG00000041746)	ENSMLEG00000033952	ENSMLEG00000032518	ATP9B (ENSMLEG00000020365)	ENSMLEG00000014274	NFATC1 (ENSMLEG00000037077)	CTDP1 (ENSMLEG00000035236)	SLC66A2 (ENSMLEG00000033972)	HSBP1L1 (ENSMLEG00000031421)	TXNL4A (ENSMLEG00000010598)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	9	CD226 (ENSCSAG00000018218)	RTTN (ENSCSAG00000018219)	SOCS6 (ENSCSAG00000019505)	CBLN2 (ENSCSAG00000018220)	NETO1 (ENSCSAG00000018221)	ENSCSAG00000018222	FBXO15 (ENSCSAG00000018223)	TIMM21 (ENSCSAG00000018224)	CYB5A (ENSCSAG00000018225)	C18orf63 (ENSCSAG00000018226)	DIPK1C (ENSCSAG00000018228)	CNDP2 (ENSCSAG00000018229)	CNDP1 (ENSCSAG00000018230)	ZNF407 (ENSCSAG00000018231)	PTGR3 (ENSCSAG00000018232)	TSHZ1 (ENSCSAG00000019504) ##22	ENSCSAG00000018233	SMIM21 (ENSCSAG00000018234)	ENSCSAG00000018235	ZNF516 (ENSCSAG00000018237)	ENSCSAG00000018238	ENSCSAG00000018239	ZNF236 (ENSCSAG00000018240)	MBP (ENSCSAG00000018242)	ENSCSAG00000018243	SALL3 (ENSCSAG00000018244)	ATP9B (ENSCSAG00000018245)	NFATC1 (ENSCSAG00000018247)	CTDP1 (ENSCSAG00000018248)	KCNG2 (ENSCSAG00000018249)	SLC66A2 (ENSCSAG00000018252)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	251						ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00910000146991	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a.a	ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a.j.a.b	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000157071.c	ENSGT00940000157616	ENSGT00910000147171
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	3118					FBXO15 (ENSRROG00000031542)	TIMM21 (ENSRROG00000045064)	CYB5A (ENSRROG00000030982)	ENSRROG00000044278	C18orf63 (ENSRROG00000033253)	ENSRROG00000030908	DIPK1C (ENSRROG00000040593)	CNDP2 (ENSRROG00000027039)	CNDP1 (ENSRROG00000033891)	ZNF407 (ENSRROG00000041453)	PTGR3 (ENSRROG00000032513)	TSHZ1 (ENSRROG00000014497) ##22	ENSRROG00000043270
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2868						FBXO15 (ENSRBIG00000038134)	TIMM21 (ENSRBIG00000042483)	CYB5A (ENSRBIG00000034037)	ENSRBIG00000044446	C18orf63 (ENSRBIG00000037011)	DIPK1C (ENSRBIG00000043465)	CNDP2 (ENSRBIG00000032288)	CNDP1 (ENSRBIG00000036078)	ZNF407 (ENSRBIG00000032368)	PTGR3 (ENSRBIG00000016720)	TSHZ1 (ENSRBIG00000037419) ##22	ENSRBIG00000042967	ZNF516 (ENSRBIG00000018664)	ENSRBIG00000042920	ENSRBIG00000029341	ENSRBIG00000006940	ZNF236 (ENSRBIG00000041864)	ENSRBIG00000031198	MBP (ENSRBIG00000037108)	GALR1 (ENSRBIG00000027621)	SALL3 (ENSRBIG00000036190)	ATP9B (ENSRBIG00000037695)	NFATC1 (ENSRBIG00000037652)	ENSRBIG00000036509	CTDP1 (ENSRBIG00000034015)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Marmoset	MODERN SPECIES	4	ENSCJAG00000071876	ENSCJAG00000054330	CBLN2 (ENSCJAG00000084858)	NETO1 (ENSCJAG00000003126)	ENSCJAG00000073296	FBXO15 (ENSCJAG00000003151)	TIMM21 (ENSCJAG00000043210)	ENSCJAG00000065780	CYB5A (ENSCJAG00000003163)	C18orf63 (ENSCJAG00000003172)	DIPK1C (ENSCJAG00000003178)	CNDP2 (ENSCJAG00000085960)	CNDP1 (ENSCJAG00000003184)	ZNF407 (ENSCJAG00000003204)	PTGR3 (ENSCJAG00000003219)	TSHZ1 (ENSCJAG00000046603) ##22	ENSCJAG00000076287	ZNF516 (ENSCJAG00000022733)	ENSCJAG00000082701	ENSCJAG00000084473	ZNF236 (ENSCJAG00000008039)	MBP (ENSCJAG00000047439)	ENSCJAG00000080817	ENSCJAG00000062549	ENSCJAG00000063009	SALL3 (ENSCJAG00000007332)	ATP9B (ENSCJAG00000007347)	NFATC1 (ENSCJAG00000023446)	CTDP1 (ENSCJAG00000010153)	KCNG2 (ENSCJAG00000053684)	SLC66A2 (ENSCJAG00000082565)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000166220	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Capuchin	MODERN SPECIES	49	CD226 (ENSCCAG00000023410)	ENSCCAG00000025716	RTTN (ENSCCAG00000033623)	SOCS6 (ENSCCAG00000011029)	CBLN2 (ENSCCAG00000037222)	NETO1 (ENSCCAG00000034235)	FBXO15 (ENSCCAG00000025771)	ENSCCAG00000021881	CYB5A (ENSCCAG00000029960)	C18orf63 (ENSCCAG00000023366)	DIPK1C (ENSCCAG00000022135)	CNDP2 (ENSCCAG00000031433)	CNDP1 (ENSCCAG00000029722)	ZNF407 (ENSCCAG00000023084)	ZADH2 (ENSCCAG00000026690)	TSHZ1 (ENSCCAG00000020568) ##22	ENSCCAG00000024868	ZNF516 (ENSCCAG00000027802)	ZNF236 (ENSCCAG00000026594)	ENSCCAG00000022455	MBP (ENSCCAG00000026758)	ENSCCAG00000021014
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	58	ENSSBOG00000010853	ENSSBOG00000024747	CBLN2 (ENSSBOG00000019328)	NETO1 (ENSSBOG00000035887)	ENSSBOG00000033127	ENSSBOG00000026756	FBXO15 (ENSSBOG00000035966)	TIMM21 (ENSSBOG00000034325)	CYB5A (ENSSBOG00000006601)	C18orf63 (ENSSBOG00000027206)	DIPK1C (ENSSBOG00000024590)	CNDP2 (ENSSBOG00000027831)	CNDP1 (ENSSBOG00000020895)	ZNF407 (ENSSBOG00000025007)	PTGR3 (ENSSBOG00000035548)	TSHZ1 (ENSSBOG00000017309) ##22	ENSSBOG00000005717	ZNF516 (ENSSBOG00000027376)	ENSSBOG00000025494	ZNF236 (ENSSBOG00000029994)	MBP (ENSSBOG00000030678)	ENSSBOG00000025895	SALL3 (ENSSBOG00000023380)	ATP9B (ENSSBOG00000034933)	CTDP1 (ENSSBOG00000025960)	KCNG2 (ENSSBOG00000022849)	SLC66A2 (ENSSBOG00000027796)	HSBP1L1 (ENSSBOG00000022763)	TXNL4A (ENSSBOG00000009093)	RBFA (ENSSBOG00000024646)	ADNP2 (ENSSBOG00000035405)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	712	CD226 (ENSANAG00000021699)	ENSANAG00000028436	RTTN (ENSANAG00000030012)	SOCS6 (ENSANAG00000013654)	CBLN2 (ENSANAG00000032460)	NETO1 (ENSANAG00000024199)	FBXO15 (ENSANAG00000023790)	TIMM21 (ENSANAG00000026364)	CYB5A (ENSANAG00000020201)	C18orf63 (ENSANAG00000028286)	DIPK1C (ENSANAG00000028265)	CNDP2 (ENSANAG00000035349)	CNDP1 (ENSANAG00000031126)	ZNF407 (ENSANAG00000026344)	PTGR3 (ENSANAG00000035661)	TSHZ1 (ENSANAG00000016880) ##22	ENSANAG00000035939	ZNF516 (ENSANAG00000024430)	ENSANAG00000038453	ZNF236 (ENSANAG00000022552)	MBP (ENSANAG00000027357)	GALR1 (ENSANAG00000030151)	SALL3 (ENSANAG00000032412)	ENSANAG00000020890
Tarsier	MODERN SPECIES	7211								FBXO15 (ENSTSYG00000012653)	TIMM21 (ENSTSYG00000006823)	CYB5A (ENSTSYG00000002241)	CUNH18orf63 (ENSTSYG00000008810)	FAM69C (ENSTSYG00000029938)	CNDP2 (ENSTSYG00000010229)	CNDP1 (ENSTSYG00000009723)	ZNF407 (ENSTSYG00000036525)	TSHZ1 (ENSTSYG00000028132) ##22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	80	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	175	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.a	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	739			CBLN2 (ENSPSMG00000019694)	NETO1 (ENSPSMG00000019668)	FBXO15 (ENSPSMG00000019651)	TIMM21 (ENSPSMG00000019644)	ENSPSMG00000019619	C18orf63 (ENSPSMG00000019568)	DIPK1C (ENSPSMG00000019555)	CNDP2 (ENSPSMG00000019521)	CNDP1 (ENSPSMG00000019431)	ENSPSMG00000019378	ENSPSMG00000019373	ZNF407 (ENSPSMG00000019365)	PTGR3 (ENSPSMG00000019354)	TSHZ1 (ENSPSMG00000019351) ##22	ZNF516 (ENSPSMG00000019344)	ZNF236 (ENSPSMG00000019328)	ENSPSMG00000019282	MBP (ENSPSMG00000019199)	GALR1 (ENSPSMG00000019143)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	420											DIPK1C (ENSPCOG00000019758)	CNDP2 (ENSPCOG00000010165)	CNDP1 (ENSPCOG00000013291)	ZNF407 (ENSPCOG00000014861)	PTGR3 (ENSPCOG00000017533)	TSHZ1 (ENSPCOG00000010742) ##22	ZNF516 (ENSPCOG00000013722)	ZNF236 (ENSPCOG00000003371)	ENSPCOG00000026660	MBP (ENSPCOG00000022672)	GALR1 (ENSPCOG00000015232)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	10	ENSMICG00000027742	CD226 (ENSMICG00000029965)	RTTN (ENSMICG00000014111)	SOCS6 (ENSMICG00000017585)	CBLN2 (ENSMICG00000030925)	NETO1 (ENSMICG00000007872)	FBXO15 (ENSMICG00000035240)	TIMM21 (ENSMICG00000027988)	CYB5A (ENSMICG00000003395)	C18orf63 (ENSMICG00000041724)	CNDP2 (ENSMICG00000012839)	DIPK1C (ENSMICG00000027176)	CNDP1 (ENSMICG00000015694)	ZNF407 (ENSMICG00000034092)	PTGR3 (ENSMICG00000047342)	TSHZ1 (ENSMICG00000013601) ##22	ZNF516 (ENSMICG00000000044)	ZNF236 (ENSMICG00000004031)	ENSMICG00000026747	MBP (ENSMICG00000004041)	PARD6G (ENSMICG00000011267)	ADNP2 (ENSMICG00000036153)	RBFA (ENSMICG00000011956)	ENSMICG00000032888	ENSMICG00000031799	HSBP1L1 (ENSMICG00000028958)	SLC66A2 (ENSMICG00000012807)	KCNG2 (ENSMICG00000036173)	CTDP1 (ENSMICG00000038031)	NFATC1 (ENSMICG00000030578)	ATP9B (ENSMICG00000017396)
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Glires	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
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Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.t	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00900000143828	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000008041.B	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.t	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00900000143828	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Golden Hamster	MODERN SPECIES	619	Greb1l (ENSMAUG00000013565)	Dok6 (ENSMAUG00000001321)	Cd226 (ENSMAUG00000002713)	Rttn (ENSMAUG00000022019)	ENSMAUG00000022132	Cbln2 (ENSMAUG00000011105)	Neto1 (ENSMAUG00000021232)	ENSMAUG00000021871	Timm21 (ENSMAUG00000020549)	ENSMAUG00000009196	Dipk1c (ENSMAUG00000019914)	Cndp2 (ENSMAUG00000021830)	Cndp1 (ENSMAUG00000022223)	Zfp407 (ENSMAUG00000006171)	ENSMAUG00000010942	Tshz1 (ENSMAUG00000022081) ##22	Zfp516 (ENSMAUG00000008561)	ENSMAUG00000002017	ENSMAUG00000015835	ENSMAUG00000000901	Galr1 (ENSMAUG00000009153)	Sall3 (ENSMAUG00000011828)	ENSMAUG00000015980	Nfatc1 (ENSMAUG00000013597)	Ctdp1 (ENSMAUG00000015399)	Slc66a2 (ENSMAUG00000019704)	Hsbp1l1 (ENSMAUG00000007227)	Txnl4a (ENSMAUG00000021849)	Rbfa (ENSMAUG00000010060)	Adnp2 (ENSMAUG00000012119)	Pard6g (ENSMAUG00000009540)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	92	Socs6 (ENSCGRG00001006036)	ENSCGRG00001002314	Cbln2 (ENSCGRG00001018380)	ENSCGRG00001018048	Neto1 (ENSCGRG00001009379)	ENSCGRG00001024329	Fbxo15 (ENSCGRG00001000344)	Timm21 (ENSCGRG00001023966)	Cyb5a (ENSCGRG00001020903)	ENSCGRG00001014845	Dipk1c (ENSCGRG00001011086)	Cndp2 (ENSCGRG00001022839)	Cndp1 (ENSCGRG00001017779)	Zfp407 (ENSCGRG00001024334)	Zadh2 (ENSCGRG00001023041)	Tshz1 (ENSCGRG00001020488) ##22	ENSCGRG00001014546	Zfp516 (ENSCGRG00001014360)	Zfp236 (ENSCGRG00001012398)	Mbp (ENSCGRG00001015943)	Galr1 (ENSCGRG00001023113)	Sall3 (ENSCGRG00001018203)	Atp9b (ENSCGRG00001016871)	Nfatc1 (ENSCGRG00001007565)	ENSCGRG00001000659	Ctdp1 (ENSCGRG00001020255)	Kcng2 (ENSCGRG00001009283)	Slc66a2 (ENSCGRG00001024278)	Hsbp1l1 (ENSCGRG00001020550)	ENSCGRG00001014779	Rbfa (ENSCGRG00001022798)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.t	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00900000143828	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362
Prairie vole	MODERN SPECIES	5				ENSMOCG00000002373	Cbln2 (ENSMOCG00000018040)	Neto1 (ENSMOCG00000021043)	ENSMOCG00000021362	Fbxo15 (ENSMOCG00000017161)	Timm21 (ENSMOCG00000008519)	Cyb5a (ENSMOCG00000023024)	Dipk1c (ENSMOCG00000022218)	Cndp2 (ENSMOCG00000008291)	Cndp1 (ENSMOCG00000017520)	Zfp407 (ENSMOCG00000015024)	Zadh2 (ENSMOCG00000009189)	Tshz1 (ENSMOCG00000001476) ##22	ENSMOCG00000016186	Zfp516 (ENSMOCG00000021872)	Zfp236 (ENSMOCG00000022870)	Mbp (ENSMOCG00000013318)	Galr1 (ENSMOCG00000018111)	Sall3 (ENSMOCG00000013205)	Atp9b (ENSMOCG00000015627)	Nfatc1 (ENSMOCG00000017415)	Ctdp1 (ENSMOCG00000017315)	Kcng2 (ENSMOCG00000011974)	Slc66a2 (ENSMOCG00000005974)	Hsbp1l1 (ENSMOCG00000000864)	Txnl4a (ENSMOCG00000012922)	Rbfa (ENSMOCG00000018963)	ENSMOCG00000019582
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	10	ENSPEMG00000004621	ENSPEMG00000028176	Cbln2 (ENSPEMG00000024653)	Neto1 (ENSPEMG00000021247)	ENSPEMG00000026675	ENSPEMG00000030444	Fbxo15 (ENSPEMG00000003160)	Timm21 (ENSPEMG00000024475)	Cyb5a (ENSPEMG00000020270)	Gm17266 (ENSPEMG00000031219)	Dipk1c (ENSPEMG00000019790)	Cndp2 (ENSPEMG00000020038)	Cndp1 (ENSPEMG00000017304)	Zfp407 (ENSPEMG00000019754)	Zadh2 (ENSPEMG00000028418)	Tshz1 (ENSPEMG00000022838) ##22	Zfp516 (ENSPEMG00000024000)	ENSPEMG00000024427	Zfp236 (ENSPEMG00000026320)	Mbp (ENSPEMG00000021451)	Galr1 (ENSPEMG00000022914)	Sall3 (ENSPEMG00000022799)	ENSPEMG00000005583	Atp9b (ENSPEMG00000023034)	Nfatc1 (ENSPEMG00000022364)	Ctdp1 (ENSPEMG00000022491)	Kcng2 (ENSPEMG00000026971)	Slc66a2 (ENSPEMG00000021424)	Hsbp1l1 (ENSPEMG00000028002)	Txnl4a (ENSPEMG00000021776)	Rbfa (ENSPEMG00000021588)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Mus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00940000164242.b	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500.c	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00940000164242.b	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500.c	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00940000164242.b	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00390000003122.c.a.b	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500.c	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00940000164242.b	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Steppe mouse	MODERN SPECIES	265														Zfp407 (ENSMSIG00000020827)	Zadh2 (ENSMSIG00000020815)	Tshz1 (ENSMSIG00000020808) ##22
spretus	MODERN SPECIES	9	Dok6 (MGP_SPRETEiJ_G0023377)	Cd226 (MGP_SPRETEiJ_G0023376)	Rttn (MGP_SPRETEiJ_G0023375)	MGP_SPRETEiJ_G0023374	MGP_SPRETEiJ_G0023373	Cbln2 (MGP_SPRETEiJ_G0023372)	Neto1 (MGP_SPRETEiJ_G0023371)	Timm21 (MGP_SPRETEiJ_G0023370)	Fbxo15 (MGP_SPRETEiJ_G0023369)	Cyb5a (MGP_SPRETEiJ_G0023368)	MGP_SPRETEiJ_G0023367	Cndp2 (MGP_SPRETEiJ_G0023366)	Cndp1 (MGP_SPRETEiJ_G0023365)	Zfp407 (MGP_SPRETEiJ_G0023364)	Zadh2 (MGP_SPRETEiJ_G0023363)	Tshz1 (MGP_SPRETEiJ_G0023362) ##22	Zfp516 (MGP_SPRETEiJ_G0023361)	Zfp236 (MGP_SPRETEiJ_G0023360)	Mbp (MGP_SPRETEiJ_G0023359)	Galr1 (MGP_SPRETEiJ_G0023358)	Sall3 (MGP_SPRETEiJ_G0023357)	Atp9b (MGP_SPRETEiJ_G0023356)	Nfatc1 (MGP_SPRETEiJ_G0023355)	Ctdp1 (MGP_SPRETEiJ_G0023354)	Kcng2 (MGP_SPRETEiJ_G0023353)	Slc66a2 (MGP_SPRETEiJ_G0023352)	Hsbp1l1 (MGP_SPRETEiJ_G0023351)	Txnl4a (MGP_SPRETEiJ_G0023350)	Naa12 (MGP_SPRETEiJ_G0023349)	Rbfa (MGP_SPRETEiJ_G0023348)	Adnp2 (MGP_SPRETEiJ_G0023347)
Mouse	MODERN SPECIES	9	Cd226 (ENSMUSG00000034028)	Rttn (ENSMUSG00000023066)	Socs6 (ENSMUSG00000056153)	Bhmt1b (ENSMUSG00000069324)	Cbln2 (ENSMUSG00000024647)	Neto1 (ENSMUSG00000050321)	Timm21 (ENSMUSG00000024645)	Fbxo15 (ENSMUSG00000034391)	Cyb5a (ENSMUSG00000024646)	Gm17266 (ENSMUSG00000117781)	Dipk1c (ENSMUSG00000047992)	Cndp2 (ENSMUSG00000024644)	Cndp1 (ENSMUSG00000056162)	Zfp407 (ENSMUSG00000048410)	Zadh2 (ENSMUSG00000049090)	Tshz1 (ENSMUSG00000046982) ##22	Zfp516 (ENSMUSG00000058881)	Zfp236 (ENSMUSG00000041258)	Mbp (ENSMUSG00000041607)	Galr1 (ENSMUSG00000024553)	Sall3 (ENSMUSG00000024565)	Atp9b (ENSMUSG00000024566)	Nfatc1 (ENSMUSG00000033016)	Ctdp1 (ENSMUSG00000033323)	Kcng2 (ENSMUSG00000059852)	Slc66a2 (ENSMUSG00000034006)	Hsbp1l1 (ENSMUSG00000078963)	Txnl4a (ENSMUSG00000057130)	Naa12 (ENSMUSG00000024571)	Rbfa (ENSMUSG00000024570)	Adnp2 (ENSMUSG00000053950)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	9	Tmx3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022462)	Dok6 (MGP_CAROLIEiJ_G0022461)	Cd226 (MGP_CAROLIEiJ_G0022460)	Rttn (MGP_CAROLIEiJ_G0022459)	MGP_CAROLIEiJ_G0022458	Cbln2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022457)	Neto1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022456)	MGP_CAROLIEiJ_G0022455	Timm21 (MGP_CAROLIEiJ_G0022454)	Cyb5a (MGP_CAROLIEiJ_G0022453)	MGP_CAROLIEiJ_G0022452	Cndp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022451)	Cndp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022450)	Zfp407 (MGP_CAROLIEiJ_G0022449)	Zadh2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022448)	Tshz1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022447) ##22	Zfp516 (MGP_CAROLIEiJ_G0022446)	Zfp236 (MGP_CAROLIEiJ_G0022445)	Mbp (MGP_CAROLIEiJ_G0022444)	Galr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022443)	Sall3 (MGP_CAROLIEiJ_G0022442)	Atp9b (MGP_CAROLIEiJ_G0022441)	Nfatc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022440)	Ctdp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022439)	Kcng2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022438)	Slc66a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022437)	Hsbp1l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0022436)	Txnl4a (MGP_CAROLIEiJ_G0022435)	Naa12 (MGP_CAROLIEiJ_G0022434)	Rbfa (MGP_CAROLIEiJ_G0022433)	Adnp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022432)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	6	Tmx3 (MGP_PahariEiJ_G0019190)	Dok6 (MGP_PahariEiJ_G0019189)	Cd226 (MGP_PahariEiJ_G0019188)	Rttn (MGP_PahariEiJ_G0019187)	Socs6 (MGP_PahariEiJ_G0019186)	Cbln2 (MGP_PahariEiJ_G0019185)	Neto1 (MGP_PahariEiJ_G0019184)	Timm21 (MGP_PahariEiJ_G0019183)	MGP_PahariEiJ_G0019182	Cyb5a (MGP_PahariEiJ_G0019181)	MGP_PahariEiJ_G0019180	Cndp2 (MGP_PahariEiJ_G0019179)	Cndp1 (MGP_PahariEiJ_G0019178)	Zfp407 (MGP_PahariEiJ_G0019177)	Zadh2 (MGP_PahariEiJ_G0019176)	Tshz1 (MGP_PahariEiJ_G0019175) ##22	Zfp516 (MGP_PahariEiJ_G0019174)	Zfp236 (MGP_PahariEiJ_G0019173)	Mbp (MGP_PahariEiJ_G0019172)	Galr1 (MGP_PahariEiJ_G0019171)	Sall3 (MGP_PahariEiJ_G0019170)	Atp9b (MGP_PahariEiJ_G0019169)	Nfatc1 (MGP_PahariEiJ_G0019168)	Ctdp1 (MGP_PahariEiJ_G0019167)	Kcng2 (MGP_PahariEiJ_G0019166)	Slc66a2 (MGP_PahariEiJ_G0019165)	Hsbp1l1 (MGP_PahariEiJ_G0019164)	Txnl4a (MGP_PahariEiJ_G0019163)	Naa12 (MGP_PahariEiJ_G0019162)	Rbfa (MGP_PahariEiJ_G0019161)	Adnp2 (MGP_PahariEiJ_G0019160)
Rat	MODERN SPECIES	9	ENSRNOG00000064792	RGD1560813 (ENSRNOG00000013622)	RGD1559726 (ENSRNOG00000034073)	Cbln2 (ENSRNOG00000013654)	Neto1 (ENSRNOG00000014006)	ENSRNOG00000067088	Fbxo15 (ENSRNOG00000038225)	Timm21 (ENSRNOG00000015142)	Cyb5a (ENSRNOG00000070068)	LOC100359752 (ENSRNOG00000038241)	Dipk1c (ENSRNOG00000015448)	Cndp2 (ENSRNOG00000015591)	Cndp1 (ENSRNOG00000027739)	Zfp407 (ENSRNOG00000043357)	Ptgr3 (ENSRNOG00000016239)	Tshz1 (ENSRNOG00000016246) ##22	Zfp516 (ENSRNOG00000016258)	Zfp236 (ENSRNOG00000016303)	Mbp (ENSRNOG00000016516)	Galr1 (ENSRNOG00000016654)	Sall3 (ENSRNOG00000026116)	Atp9b (ENSRNOG00000032039)	Nfatc1 (ENSRNOG00000017146)	Ctdp1 (ENSRNOG00000061474)	Kcng2 (ENSRNOG00000053640)	Slc66a2 (ENSRNOG00000059215)	Hsbp1l1 (ENSRNOG00000059055)	RGD1560212 (ENSRNOG00000057774)	Rbfa (ENSRNOG00000055647)	Adnp2 (ENSRNOG00000053370)	Pard6g (ENSRNOG00000055157)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1543						Cbln2 (ENSNGAG00000021579)	Neto1 (ENSNGAG00000014840)	Fbxo15 (ENSNGAG00000018318)	Timm21 (ENSNGAG00000022926)	Cyb5a (ENSNGAG00000001698)	Dipk1c (ENSNGAG00000014549)	Cndp2 (ENSNGAG00000022339)	Cndp1 (ENSNGAG00000010812)	Zfp407 (ENSNGAG00000012229)	ENSNGAG00000022733	Tshz1 (ENSNGAG00000021600) ##22	Zfp516 (ENSNGAG00000012539)	Zfp236 (ENSNGAG00000011056)	ENSNGAG00000024328	ENSNGAG00000023281	ENSNGAG00000005493	Galr1 (ENSNGAG00000023931)	Sall3 (ENSNGAG00000023772)	Atp9b (ENSNGAG00000021053)	Nfatc1 (ENSNGAG00000023514)	Ctdp1 (ENSNGAG00000003968)	Kcng2 (ENSNGAG00000024057)	Slc66a2 (ENSNGAG00000022082)	ENSNGAG00000011961	ENSNGAG00000014501	Mfsd14b (ENSNGAG00000020135)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	55	Serpinb8 (ENSJJAG00000024051)	Cdh7 (ENSJJAG00000019518)	ENSJJAG00000018700	Dsel (ENSJJAG00000013330)	ENSJJAG00000011145	Dok6 (ENSJJAG00000017009)	ENSJJAG00000023825	ENSJJAG00000016953	Socs6 (ENSJJAG00000017873)	Cbln2 (ENSJJAG00000021520)	Neto1 (ENSJJAG00000024284)	Cyb5a (ENSJJAG00000020003)	Cndp2 (ENSJJAG00000013882)	Cndp1 (ENSJJAG00000022953)	Zadh2 (ENSJJAG00000013604)	ENSJJAG00000017663 ##22	Zfp516 (ENSJJAG00000016237)	Ndc80 (ENSJJAG00000020131)	Adcyap1 (ENSJJAG00000024315)	Yes1 (ENSJJAG00000006110)	ENSJJAG00000019240	Tyms (ENSJJAG00000020713)	Cetn1 (ENSJJAG00000010533)	Colec12 (ENSJJAG00000014240)	ENSJJAG00000014893	Usp14 (ENSJJAG00000001720)	Rock1 (ENSJJAG00000012599)	Greb1l (ENSJJAG00000019827)	ENSJJAG00000024289	Snrpd1 (ENSJJAG00000017698)	Abhd3 (ENSJJAG00000010354)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	410										Cyb5a (ENSDORG00000004719)	Cndp2 (ENSDORG00000009686)	Cndp1 (ENSDORG00000009688)	ENSDORG00000027679	ENSDORG00000030046	Zadh2 (ENSDORG00000008344)	ENSDORG00000000351 ##22	Zfp236 (ENSDORG00000010273)	ENSDORG00000025113	Galr1 (ENSDORG00000028616)	Sall3 (ENSDORG00000002702)	Atp9b (ENSDORG00000002559)	Nfatc1 (ENSDORG00000028944)	Ctdp1 (ENSDORG00000013560)	Slc66a2 (ENSDORG00000011994)	ENSDORG00000024699	Adnp2 (ENSDORG00000023278)	Pard6g (ENSDORG00000014780)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.h	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.h	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.h	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Degu	MODERN SPECIES	161			ENSODEG00000002681	FBXO15 (ENSODEG00000002700)	TIMM21 (ENSODEG00000002726)	ENSODEG00000002747	ENSODEG00000018841	ENSODEG00000002757	DIPK1C (ENSODEG00000002789)	CNDP2 (ENSODEG00000002825)	CNDP1 (ENSODEG00000002852)	ENSODEG00000002905	ENSODEG00000018901	ENSODEG00000002919	PTGR3 (ENSODEG00000002932)	ENSODEG00000002943 ##22	ENSODEG00000002953	ZNF516 (ENSODEG00000002971)	ZNF236 (ENSODEG00000003041)	MBP (ENSODEG00000002651)	GALR1 (ENSODEG00000002674)	SALL3 (ENSODEG00000002692)	ATP9B (ENSODEG00000002792)	NFATC1 (ENSODEG00000002866)	ENSODEG00000002960	CTDP1 (ENSODEG00000003029)	KCNG2 (ENSODEG00000003142)	ENSODEG00000003181	HSBP1L1 (ENSODEG00000003188)	ENSODEG00000018937	TXNL4A (ENSODEG00000003214)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	109	RTTN (ENSCLAG00000008660)	SOCS6 (ENSCLAG00000012662)	ENSCLAG00000013595	ENSCLAG00000007863	CBLN2 (ENSCLAG00000007487)	NETO1 (ENSCLAG00000009727)	FBXO15 (ENSCLAG00000010080)	TIMM21 (ENSCLAG00000010578)	CYB5A (ENSCLAG00000009123)	C18orf63 (ENSCLAG00000008797)	DIPK1C (ENSCLAG00000014214)	CNDP2 (ENSCLAG00000013139)	CNDP1 (ENSCLAG00000008101)	ENSCLAG00000011969	PTGR3 (ENSCLAG00000016929)	TSHZ1 (ENSCLAG00000018002) ##22	ZNF516 (ENSCLAG00000015957)	ZNF236 (ENSCLAG00000007793)	MBP (ENSCLAG00000014151)	GALR1 (ENSCLAG00000013020)	SALL3 (ENSCLAG00000007727)	ATP9B (ENSCLAG00000010218)	NFATC1 (ENSCLAG00000009557)	ENSCLAG00000013642 #19	CTDP1 (ENSCLAG00000011662)	KCNG2 (ENSCLAG00000007825)	SLC66A2 (ENSCLAG00000008800)	ENSCLAG00000014203	ENSCLAG00000015664	RBFA (ENSCLAG00000012122)	ENSCLAG00000010655
Guinea pig	MODERN SPECIES	57	TMX3 (ENSCPOG00000010485)	DOK6 (ENSCPOG00000003225)	CD226 (ENSCPOG00000039994)	RTTN (ENSCPOG00000002661)	SOCS6 (ENSCPOG00000039204)	CBLN2 (ENSCPOG00000002004)	NETO1 (ENSCPOG00000009520)	FBXO15 (ENSCPOG00000006644)	TIMM21 (ENSCPOG00000011226)	CYB5A (ENSCPOG00000012111)	ENSCPOG00000002230	CNDP2 (ENSCPOG00000004578)	CNDP1 (ENSCPOG00000038292)	ENSCPOG00000026737	PTGR3 (ENSCPOG00000024070)	TSHZ1 (ENSCPOG00000009072) ##22
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	9	ENSHGLG00000004807	CYB5A (ENSHGLG00000036219)	C18orf63 (ENSHGLG00000041217)	ENSHGLG00000032625	DIPK1C (ENSHGLG00000032925)	ENSHGLG00000035284	ENSHGLG00000036803	CNDP2 (ENSHGLG00000000420)	CNDP1 (ENSHGLG00000000854)	ENSHGLG00000029663	ENSHGLG00000000471	ENSHGLG00000002361	ENSHGLG00000048880	ENSHGLG00000002000	ENSHGLG00000046614	TSHZ1 (ENSHGLG00000001424) ##22	ENSHGLG00000041384	ENSHGLG00000045035	ENSHGLG00000034199	ENSHGLG00000041344	ENSHGLG00000000648	ENSHGLG00000039076	ENSHGLG00000045815	ENSHGLG00000037792	GALR1 (ENSHGLG00000001233)	ENSHGLG00000019787	SALL3 (ENSHGLG00000000824)	ENSHGLG00000035915	ENSHGLG00000032471	ENSHGLG00000041573	ENSHGLG00000040449
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a.j
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a.j
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	147	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a.j
Squirrel	MODERN SPECIES	216									FBXO15 (ENSSTOG00000014142)	TIMM21 (ENSSTOG00000023611)	ENSSTOG00000022436	DIPK1C (ENSSTOG00000024256)	CNDP2 (ENSSTOG00000002221)	ZNF407 (ENSSTOG00000029099)	PTGR3 (ENSSTOG00000024479)	TSHZ1 (ENSSTOG00000019384) ##22	ZNF516 (ENSSTOG00000026569)	ZNF236 (ENSSTOG00000006987)	MBP (ENSSTOG00000007051)	GALR1 (ENSSTOG00000007064)	SALL3 (ENSSTOG00000004145)	ATP9B (ENSSTOG00000006826)	NFATC1 (ENSSTOG00000008168)	CTDP1 (ENSSTOG00000011752)	KCNG2 (ENSSTOG00000027489)	SLC66A2 (ENSSTOG00000024050)	HSBP1L1 (ENSSTOG00000029821)	TXNL4A (ENSSTOG00000022277)	ENSSTOG00000021487	RBFA (ENSSTOG00000010308)	ADNP2 (ENSSTOG00000025747)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	61	DOK6 (ENSUPAG00010015325)	ENSUPAG00010015339	RTTN (ENSUPAG00010015348)	SOCS6 (ENSUPAG00010015376)	CBLN2 (ENSUPAG00010015415)	NETO1 (ENSUPAG00010015441)	FBXO15 (ENSUPAG00010015463)	TIMM21 (ENSUPAG00010015488)	CYB5A (ENSUPAG00010015513)	C18orf63 (ENSUPAG00010015537)	DIPK1C (ENSUPAG00010015556)	CNDP2 (ENSUPAG00010015570)	CNDP1 (ENSUPAG00010015588)	ZNF407 (ENSUPAG00010015601)	PTGR3 (ENSUPAG00010015615)	TSHZ1 (ENSUPAG00010015631) ##22	ZNF516 (ENSUPAG00010015641)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	62	DOK6 (ENSMMMG00000018509)	ENSMMMG00000018526	RTTN (ENSMMMG00000018533)	SOCS6 (ENSMMMG00000018573)	CBLN2 (ENSMMMG00000018641)	NETO1 (ENSMMMG00000018657)	FBXO15 (ENSMMMG00000018675)	TIMM21 (ENSMMMG00000018686)	CYB5A (ENSMMMG00000018693)	C18orf63 (ENSMMMG00000018708)	DIPK1C (ENSMMMG00000018726)	CNDP2 (ENSMMMG00000018737)	CNDP1 (ENSMMMG00000018749)	ZNF407 (ENSMMMG00000018778)	PTGR3 (ENSMMMG00000018782)	TSHZ1 (ENSMMMG00000018783) ##22	ZNF516 (ENSMMMG00000018790)	ZNF236 (ENSMMMG00000018847)	MBP (ENSMMMG00000018899)	GALR1 (ENSMMMG00000018971)	SALL3 (ENSMMMG00000018978)	ATP9B (ENSMMMG00000018994)	NFATC1 (ENSMMMG00000019049)	ENSMMMG00000019069	CTDP1 (ENSMMMG00000019077)	KCNG2 (ENSMMMG00000019094)	SLC66A2 (ENSMMMG00000019097)	HSBP1L1 (ENSMMMG00000019110)	TXNL4A (ENSMMMG00000019114)	ENSMMMG00000019121	RBFA (ENSMMMG00000019128)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	4	DOK6 (ENSSVLG00005008178)	CD226 (ENSSVLG00005008245)	RTTN (ENSSVLG00005008360)	SOCS6 (ENSSVLG00005008849)	CBLN2 (ENSSVLG00005008889)	NETO1 (ENSSVLG00005008955)	FBXO15 (ENSSVLG00005009033)	TIMM21 (ENSSVLG00005009130)	CYB5A (ENSSVLG00005009233)	C18orf63 (ENSSVLG00005009351)	DIPK1C (ENSSVLG00005009432)	CNDP2 (ENSSVLG00005009505)	CNDP1 (ENSSVLG00005009579)	ZNF407 (ENSSVLG00005009770)	PTGR3 (ENSSVLG00005009844)	TSHZ1 (ENSSVLG00005009882) ##22	ZNF516 (ENSSVLG00005009908)	ZNF236 (ENSSVLG00005009991)	MBP (ENSSVLG00005010263)	GALR1 (ENSSVLG00005010721)	SALL3 (ENSSVLG00005010810)	ATP9B (ENSSVLG00005010928)	ENSSVLG00005011078	NFATC1 (ENSSVLG00005011217)	ENSSVLG00005012377	CTDP1 (ENSSVLG00005012457)	KCNG2 (ENSSVLG00005012552)	SLC66A2 (ENSSVLG00005012630)	HSBP1L1 (ENSSVLG00005012711)	TXNL4A (ENSSVLG00005012763)	ENSSVLG00005012855
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000172154	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a
Suina	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164	ENSGT00530000063335.A
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	788	RTTN (ENSCWAG00000014922)	SOCS6 (ENSCWAG00000015739)	ENSCWAG00000015753 ##15	CBLN2 (ENSCWAG00000015802)	NETO1 (ENSCWAG00000015868)	FBXO15 (ENSCWAG00000015960)	TIMM21 (ENSCWAG00000016025)	CYB5A (ENSCWAG00000016075)	C18orf63 (ENSCWAG00000016150)	ENSCWAG00000016237	CNDP2 (ENSCWAG00000016273)	CNDP1 (ENSCWAG00000016346)	ENSCWAG00000016614	ENSCWAG00000016648	PTGR3 (ENSCWAG00000016684)	TSHZ1 (ENSCWAG00000016715) ##22	ZNF516 (ENSCWAG00000016750)	ZNF236 (ENSCWAG00000016772)	MBP (ENSCWAG00000016987)	GALR1 (ENSCWAG00000018025)	SALL3 (ENSCWAG00000018066)	ATP9B (ENSCWAG00000018143)	ENSCWAG00000018247	NFATC1 (ENSCWAG00000018287)	CTDP1 (ENSCWAG00000019223)	ENSCWAG00000019305	PCSK6 (ENSCWAG00000019381)	TM2D3 (ENSCWAG00000019709)	TARS3 (ENSCWAG00000019788)	TJP1 (ENSCWAG00000019855)	ENTREP2 (ENSCWAG00000020038)
Pig	MODERN SPECIES		DOK6 (ENSSSCG00000028977)	CD226 (ENSSSCG00000038398)	RTTN (ENSSSCG00000032574)	SOCS6 (ENSSSCG00000032214)	CBLN2 (ENSSSCG00000020859)	NETO1 (ENSSSCG00000027654)	FBXO15 (ENSSSCG00000004873)	TIMM21 (ENSSSCG00000032494)	CYB5A (ENSSSCG00000004875)	C18orf63 (ENSSSCG00000004874)	DIPK1C (ENSSSCG00000039486)	CNDP2 (ENSSSCG00000004870)	CNDP1 (ENSSSCG00000004869)	ENSSSCG00000053589	PTGR3 (ENSSSCG00000032488)	TSHZ1 (ENSSSCG00000004861) ##22	ENSSSCG00000060932	ENSSSCG00000057943	ZNF516 (ENSSSCG00000004859)	ZNF236 (ENSSSCG00000023533)	MBP (ENSSSCG00000038767)	GALR1 (ENSSSCG00000036984)	ENSSSCG00000054407	SALL3 (ENSSSCG00000004858)	ENSSSCG00000040521	ATP9B (ENSSSCG00000004857)	NFATC1 (ENSSSCG00000004856)	ENSSSCG00000040252	CTDP1 (ENSSSCG00000005787)	SNRPA1 (ENSSSCG00000005786)	PCSK6 (ENSSSCG00000005785)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.a.a
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162740
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00910000145708	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162740
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.lb.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00890000139472.f.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.a.a.b	ENSGT00940000162740
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.lb.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00390000005811.e.a	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00890000139472.f.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.a.a.a.a
Beluga whale	MODERN SPECIES	25	CCDC102B (ENSDLEG00000003496)	DOK6 (ENSDLEG00000003478)	CD226 (ENSDLEG00000003465)	RTTN (ENSDLEG00000003428)	CBLN2 (ENSDLEG00000003416)	NETO1 (ENSDLEG00000009495)	FBXO15 (ENSDLEG00000009385)	TIMM21 (ENSDLEG00000009352)	ENSDLEG00000009317	C18orf63 (ENSDLEG00000009238)	FAM69C (ENSDLEG00000009206)	CNDP2 (ENSDLEG00000009101)	CNDP1 (ENSDLEG00000009037)	ZNF407 (ENSDLEG00000008995)	ZADH2 (ENSDLEG00000008976)	TSHZ1 (ENSDLEG00000008959) ##22	ENSDLEG00000008928	ZNF516 (ENSDLEG00000008884)	ZNF236 (ENSDLEG00000007883)	ENSDLEG00000007867	MBP (ENSDLEG00000007855)	GALR1 (ENSDLEG00000007850)	ENSDLEG00000007848	SALL3 (ENSDLEG00000007843)	ATP9B (ENSDLEG00000005315)	NFATC1 (ENSDLEG00000004971)	ENSDLEG00000004966	CTDP1 (ENSDLEG00000004958)	KCNG2 (ENSDLEG00000004952)	PQLC1 (ENSDLEG00000004948)	ENSDLEG00000004942
Narwhal	MODERN SPECIES	295	DOK6 (ENSMMNG00015004699)	CD226 (ENSMMNG00015004693)	RTTN (ENSMMNG00015004679)	SOCS6 (ENSMMNG00015004670)	CBLN2 (ENSMMNG00015004661)	NETO1 (ENSMMNG00015004652)	FBXO15 (ENSMMNG00015004632)	TIMM21 (ENSMMNG00015004621)	ENSMMNG00015004609	C18orf63 (ENSMMNG00015004599)	DIPK1C (ENSMMNG00015004591)	CNDP2 (ENSMMNG00015004580)	CNDP1 (ENSMMNG00015004558)	ZNF407 (ENSMMNG00015004543)	PTGR3 (ENSMMNG00015004535)	TSHZ1 (ENSMMNG00015004527) ##22	ENSMMNG00015004517	ZNF516 (ENSMMNG00015004508)	ENSMMNG00015004498	ZNF236 (ENSMMNG00015004434)	MBP (ENSMMNG00015004355)	GALR1 (ENSMMNG00015004319)	SALL3 (ENSMMNG00015004296)	ATP9B (ENSMMNG00015004205)	NFATC1 (ENSMMNG00015004144)	CTDP1 (ENSMMNG00015004114)	KCNG2 (ENSMMNG00015004101)	SLC66A2 (ENSMMNG00015004076)	HSBP1L1 (ENSMMNG00015004051)	ENSMMNG00015004029	ENSMMNG00015003996
Vaquita	MODERN SPECIES	5	CD226 (ENSPSNG00000017461)	ENSPSNG00000017429	RTTN (ENSPSNG00000016449)	SOCS6 (ENSPSNG00000016372)	CBLN2 (ENSPSNG00000016259)	NETO1 (ENSPSNG00000016051)	FBXO15 (ENSPSNG00000016021)	TIMM21 (ENSPSNG00000015973)	ENSPSNG00000015834	C18orf63 (ENSPSNG00000015663)	DIPK1C (ENSPSNG00000015542)	CNDP2 (ENSPSNG00000015447)	CNDP1 (ENSPSNG00000015211)	ZNF407 (ENSPSNG00000015129)	PTGR3 (ENSPSNG00000015074)	TSHZ1 (ENSPSNG00000015019) ##22	ZNF516 (ENSPSNG00000014900)	ZNF236 (ENSPSNG00000014391)	MBP (ENSPSNG00000013612)	GALR1 (ENSPSNG00000013471)	ENSPSNG00000013413	SALL3 (ENSPSNG00000013174)	ATP9B (ENSPSNG00000012909)	NFATC1 (ENSPSNG00000012745)	ENSPSNG00000012721	CTDP1 (ENSPSNG00000012690)	KCNG2 (ENSPSNG00000012622)	ENSPSNG00000012516	ENSPSNG00000012460	TXNL4A (ENSPSNG00000012378)	ENSPSNG00000012284
Dolphin	MODERN SPECIES	4492																TSHZ1 (ENSTTRG00000017219) ##22
Sperm whale	MODERN SPECIES	10	ENSPCTG00005010685	ENSPCTG00005010702	SOCS6 (ENSPCTG00005010719)	CBLN2 (ENSPCTG00005010740)	NETO1 (ENSPCTG00005010835)	ENSPCTG00005011000	FBXO15 (ENSPCTG00005011070)	TIMM21 (ENSPCTG00005011204)	CYB5A (ENSPCTG00005011274)	C19H18orf63 (ENSPCTG00005011353)	ENSPCTG00005011486	CNDP2 (ENSPCTG00005011552)	CNDP1 (ENSPCTG00005011859)	ZNF407 (ENSPCTG00005012106)	PTGR3 (ENSPCTG00005012131)	TSHZ1 (ENSPCTG00005012158) ##22	ZNF516 (ENSPCTG00005012183)	ZNF236 (ENSPCTG00005012375)	MBP (ENSPCTG00005013054)	GALR1 (ENSPCTG00005013906)	SALL3 (ENSPCTG00005013970)	ATP9B (ENSPCTG00005014193)	ENSPCTG00005014376	CTDP1 (ENSPCTG00005014437)	KCNG2 (ENSPCTG00005015311)	PQLC1 (ENSPCTG00005015359)	HSBP1L1 (ENSPCTG00005015498)	TXNL4A (ENSPCTG00005015555)	RBFA (ENSPCTG00005015634)	ADNP2 (ENSPCTG00005015654)	PARD6G (ENSPCTG00005015672)
Blue whale	MODERN SPECIES	5	ENSBMSG00010013043	ENSBMSG00010013048	SOCS6 (ENSBMSG00010013057)	CBLN2 (ENSBMSG00010013061)	NETO1 (ENSBMSG00010013073)	ENSBMSG00010013087	FBXO15 (ENSBMSG00010013097)	TIMM21 (ENSBMSG00010013111)	CYB5A (ENSBMSG00010013121)	C18orf63 (ENSBMSG00010013137)	DIPK1C (ENSBMSG00010013145)	CNDP2 (ENSBMSG00010013159)	CNDP1 (ENSBMSG00010013181)	ZNF407 (ENSBMSG00010013216)	PTGR3 (ENSBMSG00010009206)	TSHZ1 (ENSBMSG00010009213) ##22	ENSBMSG00010009286	ENSBMSG00010009291	ENSBMSG00010009296	MBP (ENSBMSG00010009319)	GALR1 (ENSBMSG00010009407)	ENSBMSG00010009414	SALL3 (ENSBMSG00010009423)	ATP9B (ENSBMSG00010009457)	NFATC1 (ENSBMSG00010009496)	ENSBMSG00010009531	CTDP1 (ENSBMSG00010009542)	KCNG2 (ENSBMSG00010009563)	SLC66A2 (ENSBMSG00010009573)	TXNL4A (ENSBMSG00010009583)	RBFA (ENSBMSG00010009594)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b	ENSGT00940000162740
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b	ENSGT00940000162740
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b	ENSGT00940000162740
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.l	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	15	DOK6 (ENSOARG00020020719)	ENSOARG00020020639	RTTN (ENSOARG00020017785)	SOCS6 (ENSOARG00020017675)	ENSOARG00020017645	CBLN2 (ENSOARG00020017536)	NETO1 (ENSOARG00020017333)	ENSOARG00020017244	FBXO15 (ENSOARG00020017103)	TIMM21 (ENSOARG00020017050)	CYB5A (ENSOARG00020016854)	C18orf63 (ENSOARG00020016748)	CNDP2 (ENSOARG00020016430)	CNDP1 (ENSOARG00020016251)	PTGR3 (ENSOARG00020016189)	TSHZ1 (ENSOARG00020016102) ##22	ENSOARG00020015995	ZNF236 (ENSOARG00020015393)	GALR1 (ENSOARG00020015092)	ATP9B (ENSOARG00020014579)	NFATC1 (ENSOARG00020012783)	CTDP1 (ENSOARG00020012196)	KCNG2 (ENSOARG00020012110)	SLC66A2 (ENSOARG00020011960)	HSBP1L1 (ENSOARG00020011927)	TXNL4A (ENSOARG00020011771)	ENSOARG00020011706	ENSOARG00020011645	ADNP2 (ENSOARG00020011588)	PARD6G (ENSOARG00020011549)	ENSOARG00020011414
Goat	MODERN SPECIES	16	ENSCHIG00000024754	ENSCHIG00000021728	CBLN2 (ENSCHIG00000018855)	NETO1 (ENSCHIG00000013781)	ENSCHIG00000009717	ENSCHIG00000009949	FBXO15 (ENSCHIG00000000420)	TIMM21 (ENSCHIG00000000355)	CYB5A (ENSCHIG00000000287)	C18orf63 (ENSCHIG00000000176)	DIPK1C (ENSCHIG00000000144)	CNDP2 (ENSCHIG00000000112)	CNDP1 (ENSCHIG00000010519)	ZNF407 (ENSCHIG00000000452)	PTGR3 (ENSCHIG00000019084)	TSHZ1 (ENSCHIG00000016422) ##22	ZNF516 (ENSCHIG00000014196)	ENSCHIG00000010813	ZNF236 (ENSCHIG00000000391)	ENSCHIG00000000358	GALR1 (ENSCHIG00000000288)	ENSCHIG00000000252	SALL3 (ENSCHIG00000000145)	ATP9B (ENSCHIG00000018159)	NFATC1 (ENSCHIG00000020951)	CTDP1 (ENSCHIG00000016412)	KCNG2 (ENSCHIG00000011977)	SLC66A2 (ENSCHIG00000001513)	ENSCHIG00000021857	TXNL4A (ENSCHIG00000019218)	ENSCHIG00000016104
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT01100000263528.D.c.b.b.b.a.b.b	ENSGT01100000263522.A.d.b.c.a	ENSGT01100000263522.A.d.b.d.b	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b	ENSGT00940000162740
Bos	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT01100000263481.n.a.b.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641.h	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT01100000263481.n.a.b.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160839	ENSGT01100000263481.n.a.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641.h	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117
Wild yak	MODERN SPECIES	1630								FBXO15 (ENSBMUG00000020110)	TIMM21 (ENSBMUG00000020076)	CYB5A (ENSBMUG00000020045)	C18orf63 (ENSBMUG00000020026)	CNDP2 (ENSBMUG00000019993)	CNDP1 (ENSBMUG00000019940)	ENSBMUG00000019917	PTGR3 (ENSBMUG00000019912)	TSHZ1 (ENSBMUG00000019900) ##22
Domestic yak	MODERN SPECIES	13	SOCS6 (ENSBGRG00000021607)	ENSBGRG00000021635	CBLN2 (ENSBGRG00000021651)	NETO1 (ENSBGRG00000021741)	FBXO15 (ENSBGRG00000021796)	TIMM21 (ENSBGRG00000021856)	CYB5A (ENSBGRG00000021982)	ENSBGRG00000022137	C18orf63 (ENSBGRG00000022180)	DIPK1C (ENSBGRG00000022222)	CNDP2 (ENSBGRG00000022281)	CNDP1 (ENSBGRG00000022393)	ZNF407 (ENSBGRG00000022510)	ENSBGRG00000022594	PTGR3 (ENSBGRG00000022621)	TSHZ1 (ENSBGRG00000022648) ##22	ENSBGRG00000022689	ZNF516 (ENSBGRG00000022703)	ENSBGRG00000022789	ZNF236 (ENSBGRG00000022821)	ENSBGRG00000023225	GALR1 (ENSBGRG00000023482)	SALL3 (ENSBGRG00000023520)	ATP9B (ENSBGRG00000023552)	NFATC1 (ENSBGRG00000023817)	ENSBGRG00000024239	CTDP1 (ENSBGRG00000024256)	KCNG2 (ENSBGRG00000024339)	ENSBGRG00000024398	HSBP1L1 (ENSBGRG00000024554)	TXNL4A (ENSBGRG00000024576)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT01100000263481.n.a.b.a.b.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641.h	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.b
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	16	RTTN (ENSBIXG00005005751)	SOCS6 (ENSBIXG00005021863)	CBLN2 (ENSBIXG00005021894)	ENSBIXG00005021916	NETO1 (ENSBIXG00005021949)	FBXO15 (ENSBIXG00005021977)	TIMM21 (ENSBIXG00005021999)	CYB5A (ENSBIXG00005022055)	C18orf63 (ENSBIXG00005006829)	ENSBIXG00005022143	CNDP2 (ENSBIXG00005003778)	CNDP1 (ENSBIXG00005022283)	ENSBIXG00005022300	ZNF407 (ENSBIXG00005003807)	PTGR3 (ENSBIXG00005022385)	TSHZ1 (ENSBIXG00005022438) ##22	ENSBIXG00005022543	ZNF516 (ENSBIXG00005022566)	ENSBIXG00005003864	ENSBIXG00005022637	ZNF236 (ENSBIXG00005022796)	MBP (ENSBIXG00005022953)	GALR1 (ENSBIXG00005023001)	ENSBIXG00005023023	SALL3 (ENSBIXG00005023059)	ATP9B (ENSBIXG00005006472)	NFATC1 (ENSBIXG00005023346)	ENSBIXG00005023369	CTDP1 (ENSBIXG00005023401)	KCNG2 (ENSBIXG00005004008)	ENSBIXG00005023522
Cow	MODERN SPECIES	16	CD226 (ENSBTAG00000009266)	RTTN (ENSBTAG00000013221)	SOCS6 (ENSBTAG00000017412)	CBLN2 (ENSBTAG00000005985)	NETO1 (ENSBTAG00000012889)	FBXO15 (ENSBTAG00000009686)	TIMM21 (ENSBTAG00000009687)	CYB5A (ENSBTAG00000012012)	C24H18orf63 (ENSBTAG00000022466)	DIPK1C (ENSBTAG00000000106)	CNDP2 (ENSBTAG00000009841)	CNDP1 (ENSBTAG00000021428)	ENSBTAG00000022887	ENSBTAG00000054164	PTGR3 (ENSBTAG00000001724)	TSHZ1 (ENSBTAG00000000422) ##22	ZNF516 (ENSBTAG00000004650)	ENSBTAG00000053937	ZNF236 (ENSBTAG00000017517)	MBP (ENSBTAG00000022890)	GALR1 (ENSBTAG00000021003)	SALL3 (ENSBTAG00000050200)	ATP9B (ENSBTAG00000001224)	NFATC1 (ENSBTAG00000000656)	CTDP1 (ENSBTAG00000053484)	KCNG2 (ENSBTAG00000013665)	SLC66A2 (ENSBTAG00000054103)	ENSBTAG00000050688	TXNL4A (ENSBTAG00000013587)	ENSBTAG00000036298	RBFA (ENSBTAG00000036297)
American bison	MODERN SPECIES	3267	ENSBBBG00000001073	ENSBBBG00000001082	NETO1 (ENSBBBG00000001086)	FBXO15 (ENSBBBG00000001118)	TIMM21 (ENSBBBG00000001146)	CYB5A (ENSBBBG00000001172)	C18orf63 (ENSBBBG00000001219)	ENSBBBG00000001238	CNDP2 (ENSBBBG00000014907)	CNDP1 (ENSBBBG00000003660)	ENSBBBG00000014828	ENSBBBG00000003649	ENSBBBG00000014816	PTGR3 (ENSBBBG00000014811)	ENSBBBG00000002833	TSHZ1 (ENSBBBG00000014803) ##22	ZNF516 (ENSBBBG00000014795)	ZNF236 (ENSBBBG00000007133)	MBP (ENSBBBG00000014716)	GALR1 (ENSBBBG00000014588)	SALL3 (ENSBBBG00000003511)	ATP9B (ENSBBBG00000009131)	ENSBBBG00000014441	CTDP1 (ENSBBBG00000003330)	SLC66A2 (ENSBBBG00000003309)	HSBP1L1 (ENSBBBG00000014388)	TXNL4A (ENSBBBG00000014383)	ENSBBBG00000014378	ADNP2 (ENSBBBG00000014358)	PARD6G (ENSBBBG00000003274)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	373												CNDP2 (ENSMMSG00000008992)	CNDP1 (ENSMMSG00000008827)	ZNF407 (ENSMMSG00000008784)	PTGR3 (ENSMMSG00000008758)	TSHZ1 (ENSMMSG00000008746) ##22	ZNF516 (ENSMMSG00000008709)	ENSMMSG00000008670	ZNF236 (ENSMMSG00000008516)	MBP (ENSMMSG00000008128)	GALR1 (ENSMMSG00000008077)	SALL3 (ENSMMSG00000007960)	ATP9B (ENSMMSG00000007533)	NFATC1 (ENSMMSG00000007403)	CTDP1 (ENSMMSG00000007350)	KCNG2 (ENSMMSG00000007319)	SLC66A2 (ENSMMSG00000007214)	HSBP1L1 (ENSMMSG00000007184)	ENSMMSG00000007113	ENSMMSG00000007067	RBFA (ENSMMSG00000007047)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	19	ENSCHYG00000024044	DOK6 (ENSCHYG00000024096)	CD226 (ENSCHYG00000024147)	RTTN (ENSCHYG00000024194)	SOCS6 (ENSCHYG00000024272)	CBLN2 (ENSCHYG00000024286)	NETO1 (ENSCHYG00000024335)	FBXO15 (ENSCHYG00000024414)	TIMM21 (ENSCHYG00000024465)	ENSCHYG00000024552	C18orf63 (ENSCHYG00000024641)	ENSCHYG00000024713	CNDP2 (ENSCHYG00000024751)	ZNF407 (ENSCHYG00000024817)	PTGR3 (ENSCHYG00000024859)	TSHZ1 (ENSCHYG00000024880) ##22	ZNF516 (ENSCHYG00000024900)	ZNF236 (ENSCHYG00000024966)	ENSCHYG00000025218	MBP (ENSCHYG00000025251)	GALR1 (ENSCHYG00000025374)	ENSCHYG00000025397	SALL3 (ENSCHYG00000025411)	ATP9B (ENSCHYG00000025490)	NFATC1 (ENSCHYG00000025717)	ENSCHYG00000025845	CTDP1 (ENSCHYG00000025858)	KCNG2 (ENSCHYG00000025901)	SLC66A2 (ENSCHYG00000025926)	HSBP1L1 (ENSCHYG00000025985)	TXNL4A (ENSCHYG00000026004)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Arabian camel	MODERN SPECIES	23	RTTN (ENSCDRG00005012707)	CBLN2 (ENSCDRG00005012557)	NETO1 (ENSCDRG00005012441)	FBXO15 (ENSCDRG00005012350)	TIMM21 (ENSCDRG00005012305)	ENSCDRG00005012281	ENSCDRG00005012150	C18orf63 (ENSCDRG00005012117)	ENSCDRG00005012083	CNDP2 (ENSCDRG00005011922)	CNDP1 (ENSCDRG00005011713)	ENSCDRG00005011697	ENSCDRG00005011659	ENSCDRG00005011596	PTGR3 (ENSCDRG00005011586)	TSHZ1 (ENSCDRG00005011569) ##22	ZNF516 (ENSCDRG00005011507)	ZNF236 (ENSCDRG00005011227)	MBP (ENSCDRG00005010386)	GALR1 (ENSCDRG00005010287)	SALL3 (ENSCDRG00005010105)	ATP9B (ENSCDRG00005009917)	NFATC1 (ENSCDRG00005009800)	CTDP1 (ENSCDRG00005009526)	KCNG2 (ENSCDRG00005009403)	SLC66A2 (ENSCDRG00005009135)	HSBP1L1 (ENSCDRG00005009081)	ENSCDRG00005008969	ENSCDRG00005008919	RBFA (ENSCDRG00005019809)	ADNP2 (ENSCDRG00005019800)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000179600	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000179600	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.z	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.z	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.b	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	156	ENSGT00940000163731	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535.m	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.z	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.b	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071.i	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT01000000215617	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
American black bear	MODERN SPECIES	347														ZNF407 (ENSUAMG00000019221)	PTGR3 (ENSUAMG00000019222)	TSHZ1 (ENSUAMG00000019223) ##22
Polar bear	MODERN SPECIES	128	CD226 (ENSUMAG00000004424)	ENSUMAG00000004435	ENSUMAG00000004474	ENSUMAG00000004554	ENSUMAG00000004564	NETO1 (ENSUMAG00000004574)	FBXO15 (ENSUMAG00000004592)	TIMM21 (ENSUMAG00000004599)	ENSUMAG00000004601	C18orf63 (ENSUMAG00000004610)	CNDP2 (ENSUMAG00000004617)	CNDP1 (ENSUMAG00000004630)	ENSUMAG00000004695	ENSUMAG00000004701	ENSUMAG00000004713	TSHZ1 (ENSUMAG00000004721) ##22	ENSUMAG00000004744	ENSUMAG00000004755	MBP (ENSUMAG00000004758)	GALR1 (ENSUMAG00000004765)	ENSUMAG00000004770	ATP9B (ENSUMAG00000004776)	NFATC1 (ENSUMAG00000004785)	CTDP1 (ENSUMAG00000004809)	SLC66A2 (ENSUMAG00000004842)	ENSUMAG00000004867	TXNL4A (ENSUMAG00000004877)	ENSUMAG00000004887	RBFA (ENSUMAG00000004891)	ADNP2 (ENSUMAG00000004903)
Giant Panda	MODERN SPECIES	5	CD226 (ENSAMEG00000018388)	RTTN (ENSAMEG00000018391)	SOCS6 (ENSAMEG00000019075)	ENSAMEG00000029000	ENSAMEG00000024530	NETO1 (ENSAMEG00000013561)	FBXO15 (ENSAMEG00000013571)	TIMM21 (ENSAMEG00000013601)	ENSAMEG00000029496	C18orf63 (ENSAMEG00000013625)	DIPK1C (ENSAMEG00000028067)	CNDP2 (ENSAMEG00000004519)	CNDP1 (ENSAMEG00000004582)	ZNF407 (ENSAMEG00000004614)	PTGR3 (ENSAMEG00000018987)	TSHZ1 (ENSAMEG00000018999) ##22	ZNF516 (ENSAMEG00000028859)	ZNF236 (ENSAMEG00000010549)	MBP (ENSAMEG00000010530)	GALR1 (ENSAMEG00000003075)	SALL3 (ENSAMEG00000010206)	ATP9B (ENSAMEG00000010214)	NFATC1 (ENSAMEG00000010314)	CTDP1 (ENSAMEG00000010355)	KCNG2 (ENSAMEG00000010374)	SLC66A2 (ENSAMEG00000010378)	HSBP1L1 (ENSAMEG00000031443)	TXNL4A (ENSAMEG00000010386)	ENSAMEG00000010397	ADNP2 (ENSAMEG00000010404)	ENSAMEG00000010412
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000179600	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.z	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787.kb	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.f	ENSGT00390000015641	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Ferret	MODERN SPECIES	177	SOCS6 (ENSMPUG00000016614)	ENSMPUG00000016616	CBLN2 (ENSMPUG00000016617)	NETO1 (ENSMPUG00000016619)	ENSMPUG00000016620	ENSMPUG00000016621	FBXO15 (ENSMPUG00000016622)	TIMM21 (ENSMPUG00000016626)	CYB5A (ENSMPUG00000016630)	C18orf63 (ENSMPUG00000016631)	ENSMPUG00000016632	DIPK1C (ENSMPUG00000016633)	CNDP2 (ENSMPUG00000016634)	CNDP1 (ENSMPUG00000016635)	ENSMPUG00000016636	TSHZ1 (ENSMPUG00000019613) ##22	ENSMPUG00000016637	ZNF516 (ENSMPUG00000016638)	ENSMPUG00000019614	ZNF236 (ENSMPUG00000016639)	ENSMPUG00000016640	MBP (ENSMPUG00000016641)	GALR1 (ENSMPUG00000016642)	ENSMPUG00000016643	ENSMPUG00000016645	SALL3 (ENSMPUG00000016646)	ATP9B (ENSMPUG00000016647)	ENSMPUG00000016649	NFATC1 (ENSMPUG00000016650)	CTDP1 (ENSMPUG00000016652)	SLC66A2 (ENSMPUG00000016659)
American mink	MODERN SPECIES	5	CD226 (ENSNVIG00000011995)	RTTN (ENSNVIG00000011935)	ENSNVIG00000011898	SOCS6 (ENSNVIG00000011891)	CBLN2 (ENSNVIG00000011856)	NETO1 (ENSNVIG00000011793)	FBXO15 (ENSNVIG00000011734)	TIMM21 (ENSNVIG00000011701)	CYB5A (ENSNVIG00000011661)	C18orf63 (ENSNVIG00000011632)	ENSNVIG00000011625	CNDP2 (ENSNVIG00000011561)	CNDP1 (ENSNVIG00000011531)	ENSNVIG00000011503	PTGR3 (ENSNVIG00000011498)	TSHZ1 (ENSNVIG00000011486) ##22	ENSNVIG00000011477	ENSNVIG00000011446	ZNF236 (ENSNVIG00000011386)	MBP (ENSNVIG00000011283)	SALL3 (ENSNVIG00000011252)	ATP9B (ENSNVIG00000011196)	ENSNVIG00000011185	ENSNVIG00000011164	CTDP1 (ENSNVIG00000011033)	SLC66A2 (ENSNVIG00000010991)	HSBP1L1 (ENSNVIG00000010980)	ENSNVIG00000010974	ENSNVIG00000010964	ADNP2 (ENSNVIG00000010960)	PARD6G (ENSNVIG00000010951)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	58	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000179600	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.ab	ENSGT00940000156770.`b.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b.d
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000179600	ENSGT00940000154847	ENSGT00390000011962.d	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00490000043329.a.a.a.ob.b.a	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770.`b.a	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01090000260046.e.b.b.a.b.a.a.b.b.b.b.b.a.a.b.a.b.b	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Dog	MODERN SPECIES		SOCS6 (ENSCAFG00845001189)	ENSCAFG00845001115	CBLN2 (ENSCAFG00845001098)	NETO1 (ENSCAFG00845001049)	MAPRE1 (ENSCAFG00845001028)	FBXO15 (ENSCAFG00845000996)	TIMM21 (ENSCAFG00845000972)	ENSCAFG00845000961	CYB5A (ENSCAFG00845000926)	C18orf63 (ENSCAFG00845000859)	DIPK1C (ENSCAFG00845000817)	CNDP2 (ENSCAFG00845000777)	CNDP1 (ENSCAFG00845000751)	ZNF407 (ENSCAFG00845000698)	ZADH2 (ENSCAFG00845000664)	TSHZ1 (ENSCAFG00845000638) ##22	ZNF516 (ENSCAFG00845000590)	ENSCAFG00845000551	ENSCAFG00845000527	ZNF236 (ENSCAFG00845000448)	MBP (ENSCAFG00845000353)	GALR1 (ENSCAFG00845000275)	SALL3 (ENSCAFG00845000191)	ATP9B (ENSCAFG00845000134)	NFATC1 (ENSCAFG00845000073)	CTDP1 (ENSCAFG00845000045)	ENSCAFG00845000033	HSBP1L1 (ENSCAFG00845000030)	TXNL4A (ENSCAFG00845000026)	RBFA (ENSCAFG00845000024)	ADNP2 (ENSCAFG00845000021)
Dingo	MODERN SPECIES	125	ENSCAFG00020015683	ENSCAFG00020015675	CBLN2 (ENSCAFG00020015667)	NETO1 (ENSCAFG00020015664)	ENSCAFG00020015660	ENSCAFG00020015659	FBXO15 (ENSCAFG00020015651)	TIMM21 (ENSCAFG00020015649)	ENSCAFG00020015638	C18orf63 (ENSCAFG00020015633)	DIPK1C (ENSCAFG00020015629)	CNDP2 (ENSCAFG00020015390)	CNDP1 (ENSCAFG00020015339)	ENSCAFG00020015313	PTGR3 (ENSCAFG00020015292)	TSHZ1 (ENSCAFG00020015291) ##22	ENSCAFG00020015281	ZNF516 (ENSCAFG00020015256)	ENSCAFG00020015238	ENSCAFG00020015228	ZNF236 (ENSCAFG00020015152)	ENSCAFG00020015125	GALR1 (ENSCAFG00020015114)	SALL3 (ENSCAFG00020015092)	ATP9B (ENSCAFG00020014769)	NFATC1 (ENSCAFG00020014734)	CTDP1 (ENSCAFG00020014667)	ENSCAFG00020014644	HSBP1L1 (ENSCAFG00020014641)	TXNL4A (ENSCAFG00020014637)	RBFA (ENSCAFG00020014628)
Red fox	MODERN SPECIES	25	CCDC102B (ENSVVUG00000018460)	ENSVVUG00000018470	DOK6 (ENSVVUG00000018481)	RTTN (ENSVVUG00000018491)	CBLN2 (ENSVVUG00000018554)	NETO1 (ENSVVUG00000018563)	FBXO15 (ENSVVUG00000018608)	TIMM21 (ENSVVUG00000018616)	ENSVVUG00000018623	C18orf63 (ENSVVUG00000018634)	DIPK1C (ENSVVUG00000018646)	CNDP2 (ENSVVUG00000018647)	CNDP1 (ENSVVUG00000018653)	ZNF407 (ENSVVUG00000018662)	PTGR3 (ENSVVUG00000018671)	TSHZ1 (ENSVVUG00000018675) ##22	ZNF516 (ENSVVUG00000018686)	ZNF236 (ENSVVUG00000018724)	MBP (ENSVVUG00000018785)	GALR1 (ENSVVUG00000018795)	SALL3 (ENSVVUG00000018838)	ATP9B (ENSVVUG00000018860)	NFATC1 (ENSVVUG00000018908)	ENSVVUG00000018926	CTDP1 (ENSVVUG00000018937)	SLC66A2 (ENSVVUG00000018948)	ENSVVUG00000018958	TXNL4A (ENSVVUG00000018972)	ENSVVUG00000018977	ADNP2 (ENSVVUG00000018983)	ENSVVUG00000018985
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
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leopard	MODERN SPECIES	95				CBLN2 (ENSPPRG00000012031)	NETO1 (ENSPPRG00000012326)	FBXO15 (ENSPPRG00000012358)	ENSPPRG00000012387	CYB5A (ENSPPRG00000012505)	C18orf63 (ENSPPRG00000012554)	DIPK1C (ENSPPRG00000012575)	CNDP2 (ENSPPRG00000012633)	CNDP1 (ENSPPRG00000012701)	ZNF407 (ENSPPRG00000012723)	ENSPPRG00000012742	PTGR3 (ENSPPRG00000012748)	TSHZ1 (ENSPPRG00000011295) ##22	ZNF516 (ENSPPRG00000012759)	ENSPPRG00000012771	ZNF236 (ENSPPRG00000012906)	MBP (ENSPPRG00000013404)	GALR1 (ENSPPRG00000013426)	ATP9B (ENSPPRG00000013726)	NFATC1 (ENSPPRG00000013969)	CTDP1 (ENSPPRG00000014019)	KCNG2 (ENSPPRG00000014050)	SLC66A2 (ENSPPRG00000014124)	HSBP1L1 (ENSPPRG00000014154)	TXNL4A (ENSPPRG00000014185)	ENSPPRG00000014302	RBFA (ENSPPRG00000014340)	PARD6G (ENSPPRG00000014374)
Cat	MODERN SPECIES	243	DOK6 (ENSFCAG00000004167)	CD226 (ENSFCAG00000023562)	RTTN (ENSFCAG00000009192)	SOCS6 (ENSFCAG00000009195)	CBLN2 (ENSFCAG00000040188)	NETO1 (ENSFCAG00000015031)	FBXO15 (ENSFCAG00000010279)	TIMM21 (ENSFCAG00000027980)	CYB5A (ENSFCAG00000029619)	CD3H18orf63 (ENSFCAG00000011958)	DIPK1C (ENSFCAG00000008272)	CNDP2 (ENSFCAG00000008274)	CNDP1 (ENSFCAG00000008275)	ZNF407 (ENSFCAG00000031567)	PTGR3 (ENSFCAG00000008278)	TSHZ1 (ENSFCAG00000036924) ##22	ZNF516 (ENSFCAG00000031855)	ZNF236 (ENSFCAG00000001780)	MBP (ENSFCAG00000034257)	ENSFCAG00000053046	GALR1 (ENSFCAG00000008682)	SALL3 (ENSFCAG00000028839)	ATP9B (ENSFCAG00000008455)	NFATC1 (ENSFCAG00000000884)	CTDP1 (ENSFCAG00000000566)	KCNG2 (ENSFCAG00000040828)	SLC66A2 (ENSFCAG00000000567)	HSBP1L1 (ENSFCAG00000022901)	TXNL4A (ENSFCAG00000000568)	ENSFCAG00000027544	RBFA (ENSFCAG00000046543)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446.j	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Equus	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847.i	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446.j	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a
Donkey	MODERN SPECIES	3	PIP4P2 (ENSEASG00005014038)	OTUD6B (ENSEASG00005014036)	SLC26A7 (ENSEASG00005014030)	RUNX1T1 (ENSEASG00005016311)	TRIQK (ENSEASG00005025608)	ENSEASG00005031386	ENSEASG00005016300	RBM12B (ENSEASG00005016297)	TMEM67 (ENSEASG00005016269)	PDP1 (ENSEASG00005031219)	CDH17 (ENSEASG00005016247)	ENSEASG00005016242	ENSEASG00005036048	ENSEASG00005023898	PTGR3 (ENSEASG00005032876)	TSHZ1 (ENSEASG00005002107) ##22	ZNF516 (ENSEASG00005002101)	ZNF236 (ENSEASG00005002084)	MBP (ENSEASG00005002078)	GALR1 (ENSEASG00005002075)	SALL3 (ENSEASG00005002071)	ATP9B (ENSEASG00005002054)	NFATC1 (ENSEASG00005001978)	CTDP1 (ENSEASG00005001965)	KCNG2 (ENSEASG00005001957)	SLC66A2 (ENSEASG00005001951)	HSBP1L1 (ENSEASG00005001945)	TXNL4A (ENSEASG00005026566)	ENSEASG00005001925	RBFA (ENSEASG00005037791)	ENSEASG00005038230
Horse	MODERN SPECIES	29	DOK6 (ENSECAG00000003159)	CD226 (ENSECAG00000007623)	RTTN (ENSECAG00000009711)	SOCS6 (ENSECAG00000051862)	CBLN2 (ENSECAG00000033234)	NETO1 (ENSECAG00000014149)	FBXO15 (ENSECAG00000016377)	TIMM21 (ENSECAG00000016833)	CYB5A (ENSECAG00000017581)	C8H18orf63 (ENSECAG00000017611)	DIPK1C (ENSECAG00000018225)	CNDP2 (ENSECAG00000043835)	CNDP1 (ENSECAG00000022986)	ZNF407 (ENSECAG00000001496)	PTGR3 (ENSECAG00000002635)	TSHZ1 (ENSECAG00000002955) ##22	ZNF516 (ENSECAG00000003761)	ZNF236 (ENSECAG00000005459)	ENSECAG00000050762	MBP (ENSECAG00000010961)	GALR1 (ENSECAG00000014845)	SALL3 (ENSECAG00000015414)	NFATC1 (ENSECAG00000019813)	ENSECAG00000045161	CTDP1 (ENSECAG00000021835)	KCNG2 (ENSECAG00000034020)	SLC66A2 (ENSECAG00000042673)	TXNL4A (ENSECAG00000055188)	TXNL4A (ENSECAG00000006468)	ENSECAG00000007419	RBFA (ENSECAG00000008292)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000172154	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446.j	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Megabat	MODERN SPECIES	2594																ENSPVAG00000007673 ##22
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446.j	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00550000076117	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	10	DOK6 (ENSRFEG00010017854)	CD226 (ENSRFEG00010017901)	RTTN (ENSRFEG00010017950)	SOCS6 (ENSRFEG00010018100)	CBLN2 (ENSRFEG00010018116)	NETO1 (ENSRFEG00010018182)	FBXO15 (ENSRFEG00010018221)	TIMM21 (ENSRFEG00010018249)	CYB5A (ENSRFEG00010018285)	C18orf63 (ENSRFEG00010018438)	DIPK1C (ENSRFEG00010018462)	CNDP2 (ENSRFEG00010018518)	CNDP1 (ENSRFEG00010018609)	ENSRFEG00010018943	PTGR3 (ENSRFEG00010019004)	TSHZ1 (ENSRFEG00010019021) ##22	ZNF516 (ENSRFEG00010019046)	ZNF236 (ENSRFEG00010019074)	ENSRFEG00010019164	MBP (ENSRFEG00010019222)	GALR1 (ENSRFEG00010019399)	ENSRFEG00010019419	ATP9B (ENSRFEG00010019457)	NFATC1 (ENSRFEG00010019522)	CTDP1 (ENSRFEG00010019640)	KCNG2 (ENSRFEG00010019655)	ENSRFEG00010019698	HSBP1L1 (ENSRFEG00010019755)	TXNL4A (ENSRFEG00010019794)	RBFA (ENSRFEG00010019882)	ADNP2 (ENSRFEG00010019937)
Microbat	MODERN SPECIES	1019	SOCS6 (ENSMLUG00000006873)	ENSMLUG00000015784	ENSMLUG00000022614	ENSMLUG00000022821	CBLN2 (ENSMLUG00000004727)	NETO1 (ENSMLUG00000010614)	FBXO15 (ENSMLUG00000011427)	TIMM21 (ENSMLUG00000011440)	CYB5A (ENSMLUG00000011462)	C18orf63 (ENSMLUG00000028665)	DIPK1C (ENSMLUG00000029517)	CNDP2 (ENSMLUG00000002721)	CNDP1 (ENSMLUG00000002726)	ZNF407 (ENSMLUG00000001226)	PTGR3 (ENSMLUG00000000306)	TSHZ1 (ENSMLUG00000000305) ##22	ZNF516 (ENSMLUG00000003250)	ZNF236 (ENSMLUG00000011089)	MBP (ENSMLUG00000011157)	GALR1 (ENSMLUG00000011174)	ENSMLUG00000028402
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.a.a ##22
Hedgehog	MODERN SPECIES	7301																ENSEEUG00000001038 ##22
Common shrew	MODERN SPECIES	5723																ENSSARG00000008947 ##22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.a.a ##22
Armadillo	MODERN SPECIES	947																TSHZ1 (ENSDNOG00000033317) ##22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00390000010779.a.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158760	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00940000166650	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00390000010779.a.a.o.a	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362	ENSGT00530000063631.a	ENSGT00950000183211.a.b
Elephant	MODERN SPECIES	375	ENSLAFG00000013311	RTTN (ENSLAFG00000013313)	SOCS6 (ENSLAFG00000009337)	ENSLAFG00000030809	NETO1 (ENSLAFG00000009759)	FBXO15 (ENSLAFG00000018628)	TIMM21 (ENSLAFG00000018631)	CYB5A (ENSLAFG00000010020)	ENSLAFG00000004544	CNDP2 (ENSLAFG00000028844)	CNDP1 (ENSLAFG00000010969)	ENSLAFG00000009611	ENSLAFG00000026800	ENSLAFG00000025849	PTGR3 (ENSLAFG00000015694)	TSHZ1 (ENSLAFG00000027654) ##22	ENSLAFG00000005840	ENSLAFG00000031333	ENSLAFG00000007752	ENSLAFG00000032306	ENSLAFG00000007757	GALR1 (ENSLAFG00000027134)	SALL3 (ENSLAFG00000013521)	ATP9B (ENSLAFG00000012641)	NFATC1 (ENSLAFG00000008297)	CTDP1 (ENSLAFG00000018621)	KCNG2 (ENSLAFG00000032162)	SLC66A2 (ENSLAFG00000015804)	ENSLAFG00000003190	ENSLAFG00000031567	RBFA (ENSLAFG00000015100)
Hyrax	MODERN SPECIES	9029																TSHZ1 (ENSPCAG00000013873) ##22
Tenrec	MODERN SPECIES	10653																TSHZ1 (ENSETEG00000004530) ##22
Anura	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00500000044993	ENSGT00640000091535	ENSGT00940000154847	ENSGT00940000159988	ENSGT00940000156700	ENSGT00390000017498	ENSGT00390000011552	ENSGT00940000156770	ENSGT00390000007627	ENSGT00390000006452.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182905.b.l	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT01010000229190	ENSGT00390000010779.b	ENSGT00940000162740	ENSGT00390000011362
Frog	MODERN SPECIES	6	ENSXETG00000015643	rttn (ENSXETG00000039976)	socs6 (ENSXETG00000048969)	ENSXETG00000035754	cbln2 (ENSXETG00000016861)	neto1 (ENSXETG00000016864)	fbxo15 (ENSXETG00000023558)	timm21 (ENSXETG00000023559)	cyb5a (ENSXETG00000042691)	cndp2 (ENSXETG00000023561)	dipk1c (ENSXETG00000023563)	cndp1 (ENSXETG00000023564)	darmin (ENSXETG00000026681)	znf407 (ENSXETG00000040326)	zadh2 (ENSXETG00000037014)	tshz1 (ENSXETG00000039942) ##22	ENSXETG00000042220	znf516 (ENSXETG00000039699)	znf236 (ENSXETG00000010789)	mbp (ENSXETG00000010788)	galr1 (ENSXETG00000014693)	ENSXETG00000024894	ENSXETG00000014690	sall3 (ENSXETG00000000845)	atp9b (ENSXETG00000000852)	nfatc1 (ENSXETG00000000853)	ctdp1 (ENSXETG00000000856)	kcng2 (ENSXETG00000042247)	ENSXETG00000041599	slc66a2.1 (ENSXETG00000025946)	ENSXETG00000041392
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	8	FBXO15 (ENSLLEG00000005352)	ENSLLEG00000005428	TIMM21 (ENSLLEG00000005437)	CYB5A (ENSLLEG00000005484)	C18orf63 (ENSLLEG00000005546)	ENSLLEG00000005729	ENSLLEG00000005738	DIPK1C (ENSLLEG00000005753)	CNDP2 (ENSLLEG00000005785)	ENSLLEG00000005927	CNDP1 (ENSLLEG00000005941)	ENSLLEG00000006007	ZNF407 (ENSLLEG00000006125)	ENSLLEG00000006182	PTGR3 (ENSLLEG00000006201)	TSHZ1 (ENSLLEG00000006227) ##22	ENSLLEG00000006283	ZNF516 (ENSLLEG00000006310)	ENSLLEG00000006430	ENSLLEG00000006445	ENSLLEG00000006459	ENSLLEG00000006494	ENSLLEG00000006734	ENSLLEG00000006788	ENSLLEG00000006833	ENSLLEG00000006897	MBP (ENSLLEG00000006932)	GALR1 (ENSLLEG00000007089)	ENSLLEG00000007097	ENSLLEG00000007128	ENSLLEG00000007182
Coelacanth	MODERN SPECIES	998															PTGR3 (ENSLACG00000014029)	TSHZ1 (ENSLACG00000012913) ##22	ENSLACG00000011429	ZNF516 (ENSLACG00000000728)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	155								ENSGT00390000004886	ENSGT00510000051337	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000160858	ENSGT00390000002381.a	ENSGT00940000177109	ENSGT00940000165060	ENSGT00390000003044	ENSGT00390000006585
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	215							ENSGT00390000004886	ENSGT00940000158302.e	ENSGT00510000051337	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	515													ENSGT00550000075134	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	253												ENSGT00940000157640.a	ENSGT00550000075134	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000160839.r	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00940000159356.a.a.h	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00940000159194.d	ENSGT00390000002661.b.vb	ENSGT00530000063880.b.e
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	15	trps1 (ENSSFOG00015009142)	ENSSFOG00015009120	CSMD3 (ENSSFOG00015008801)	gatad1 (ENSSFOG00015008239)	ANKIB1 (ENSSFOG00015008273)	krit1 (ENSSFOG00015008334)	cyp51 (ENSSFOG00015008396)	ENSSFOG00015008521	ENSSFOG00015031317	MTERF1 (ENSSFOG00015008650)	FZD1 (ENSSFOG00015008660)	cdk14 (ENSSFOG00015008700)	dus3l (ENSSFOG00015008797)	ENSSFOG00015008859	cndp2 (ENSSFOG00015008900)	tshz1 (ENSSFOG00015008951) ##22	ZNF516 (ENSSFOG00015008969)	ZNF236 (ENSSFOG00015008994)	ENSSFOG00015030865	ENSSFOG00015032768	ENSSFOG00015009133	SALL3 (ENSSFOG00015009159)	atp9b (ENSSFOG00015009257)	nfatc1 (ENSSFOG00015009385)	ENSSFOG00015009428	slc52a2 (ENSSFOG00015009452)	ENSSFOG00015009493	ENSSFOG00015009500	ENSSFOG00015009518	pleca (ENSSFOG00015009542)	RSPO2 (ENSSFOG00015033306)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	237									MTERF1 (ENSPKIG00000017849)	FZD1 (ENSPKIG00000017862)	cdk14 (ENSPKIG00000017912)	ENSPKIG00000017998	dus3l (ENSPKIG00000018035)	ENSPKIG00000018091	cndp2 (ENSPKIG00000018114)	tshz1 (ENSPKIG00000018129) ##22	ENSPKIG00000018138	ZNF236 (ENSPKIG00000018168)	ENSPKIG00000018219	ENSPKIG00000018241	SALL3 (ENSPKIG00000018271)	atp9b (ENSPKIG00000018339)	ENSPKIG00000018366	SOX9 (ENSPKIG00000018387)	ENSPKIG00000018413
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	19														ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.b	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00390000002661.b.ub.a
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	9														ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.b	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00390000002661.b.ub.a	ENSGT00530000063880.b.e	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	260															ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i	ENSGT00940000159356.a.b	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00390000002661.b.ub.a	ENSGT00530000063880.b.e	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	172															ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i	ENSGT00940000159356.a.b	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00390000002661.b.ub.a	ENSGT00530000063880.b.e	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	16	mturn (ENSIPUG00000003620)	znrf2 (ENSIPUG00000003600)	ggcta (ENSIPUG00000003587)	snrpd1 (ENSIPUG00000003576)	clptm1l (ENSIPUG00000003529)	rplp1 (ENSIPUG00000003514)	ptk2 (ENSIPUG00000003268)	ENSIPUG00000003235	ggcta (ENSIPUG00000003221)	ENSIPUG00000003213	slc45a4 (ENSIPUG00000003180)	lrrc3b (ENSIPUG00000003166)	klhl7 (ENSIPUG00000003141)	ENSIPUG00000003090	cndp2 (ENSIPUG00000003077)	tshz1 (ENSIPUG00000003059) ##22	znf516 (ENSIPUG00000003046)	ENSIPUG00000003031	GALR1 (ENSIPUG00000003021)	sall3b (ENSIPUG00000003006)	atp9b (ENSIPUG00000002960)	nfatc1 (ENSIPUG00000002936)	rft2 (ENSIPUG00000002914)	SLC52A1 (ENSIPUG00000002893)	ENSIPUG00000002886	fbxl6 (ENSIPUG00000002871)	pleca (ENSIPUG00000002350)	eif3eb (ENSIPUG00000002187)	TMEM74 (ENSIPUG00000002171)	trhrb (ENSIPUG00000002162)	nudcd1 (ENSIPUG00000002139)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00500000045044	ENSGT00940000159017.a.b	ENSGT00500000044921.a	ENSGT00510000047245	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00550000074698.b	ENSGT00940000155113.a.a.b	ENSGT00940000164832.e.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155602	ENSGT00940000157780	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00940000166193	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i	ENSGT00940000159356.a.b	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00390000002661.b.ub.a	ENSGT00530000063880.b.e	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a
Electric eel	MODERN SPECIES	421										DENND3 (ENSEEEG00000012230)	klhl7 (ENSEEEG00000012222)	lrrc3b (ENSEEEG00000012217)	SLC45A4 (ENSEEEG00000012048)	ENSEEEG00000012015	cndp2 (ENSEEEG00000011976)	tshz1 (ENSEEEG00000011966) ##22
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00500000045044	ENSGT00940000159017.a.b	ENSGT00500000044921.a	ENSGT00510000047245	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00550000074698.b	ENSGT00940000155113.a.a.b	ENSGT00940000164832.e.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155602	ENSGT00940000157780	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00940000166193	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i	ENSGT00940000159356.a.b	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000154843.F.d	ENSGT00400000022514	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00390000002661.b.ub.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	68	znrf2a (ENSPNAG00000017867)	ggcta (ENSPNAG00000017854)	snrpd1 (ENSPNAG00000017824)	clptm1l (ENSPNAG00000017807)	ENSPNAG00000017758	rplp1 (ENSPNAG00000017741)	PTK2 (ENSPNAG00000017725)	ENSPNAG00000017618	DENND3 (ENSPNAG00000017591)	klhl7 (ENSPNAG00000017551)	lrrc3b (ENSPNAG00000017517)	SLC45A4 (ENSPNAG00000017495)	GPR20 (ENSPNAG00000017441)	ENSPNAG00000017423	cndp2 (ENSPNAG00000017310)	tshz1 (ENSPNAG00000017293) ##22	znf516 (ENSPNAG00000017286)	ENSPNAG00000017263	GALR1 (ENSPNAG00000017178)	sall3b (ENSPNAG00000017141)	atp9b (ENSPNAG00000017126)	nfatc1 (ENSPNAG00000017021)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	130																tshz1 (ENSAMXG00000011155) ##22	znf516 (ENSAMXG00000011137)	ENSAMXG00000034042	GALR1 (ENSAMXG00000011120)	sall3b (ENSAMXG00000035442)	atp9b (ENSAMXG00000011082)	nfatc1 (ENSAMXG00000011048)	ENSAMXG00000011035	slc52a2 (ENSAMXG00000032834)	ENSAMXG00000029713	fbxl6 (ENSAMXG00000002376)	ENSAMXG00000032584	pleca (ENSAMXG00000020763)	eif3eb (ENSAMXG00000010999)	TMEM74 (ENSAMXG00000024994)	trhrb (ENSAMXG00000035218)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000157167	ENSGT00940000154957.B	ENSGT00950000183188.B	ENSGT00390000004280	ENSGT00530000063609.b.x	ENSGT00530000063480.b	ENSGT00940000157121	ENSGT00390000008096.C.b	ENSGT00940000156869	ENSGT00940000154337.b	ENSGT00940000154995	ENSGT00390000006540	ENSGT00530000063631.a.k	ENSGT00390000010779.a.b.a	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i	ENSGT00940000159356.a.b.b	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b	ENSGT00390000002661.b.ub.a	ENSGT00530000063880.b.e	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a	ENSGT00390000007776
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	115	ENSGT00390000004280.a	ENSGT00530000063609.b.x.q.a	ENSGT00530000063480.b.p	ENSGT00940000157121.g	ENSGT00390000008096.C.b.a	ENSGT00940000156869.i	ENSGT00390000008096.C.a.b	ENSGT00940000168259	ENSGT00940000154337.b.f	ENSGT00940000154995.fb	ENSGT00390000006540.f	ENSGT00510000047030.d.q.b	ENSGT00530000063631.a.k.b	ENSGT00390000010779.a.b.a.f	ENSGT00940000156500.e	ENSGT00950000183051.a.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408.a	ENSGT00390000014772.k.e	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i.a	ENSGT00940000159356.a.b.b.b	ENSGT00940000157071.s	ENSGT00940000157616.j.a.b	ENSGT00390000003774.a.a.c.f	ENSGT00390000003774.b.a	ENSGT00400000024940.b	ENSGT00400000022514.d.a	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b.a	ENSGT00390000002661.b.ub.a	ENSGT00530000063880.b.e.a.b	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a.a
Goldfish	MODERN SPECIES	10	GPNMB (ENSCARG00000020368)	oxnad1 (ENSCARG00000020398)	ENSCARG00000020405	dazl (ENSCARG00000020409)	tbc1d5 (ENSCARG00000020443)	satb1a (ENSCARG00000020567)	KCNH8 (ENSCARG00000020573)	rab5aa (ENSCARG00000020626)	kat2b (ENSCARG00000020707)	ngly1 (ENSCARG00000022617)	ENSCARG00000022623	nutf2l (ENSCARG00000022627)	adnp2b (ENSCARG00000022636)	txnl4a (ENSCARG00000022641)	cndp2 (ENSCARG00000022692)	tshz1 (ENSCARG00000023087) ##22	znf516 (ENSCARG00000023096)	ENSCARG00000023108	ENSCARG00000018113	sall3b (ENSCARG00000018144)	atp9b (ENSCARG00000018289)	slc52a2 (ENSCARG00000024178)	ENSCARG00000024190	fbxl6 (ENSCARG00000024196)	pleca (ENSCARG00000024250)	EIF3E (ENSCARG00000024940)	TMEM74 (ENSCARG00000024980)	trhrb (ENSCARG00000024988)	nudcd1 (ENSCARG00000024995)	pkhd1l1.2 (ENSCARG00000025086)	gdf6b (ENSCARG00000025878)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00390000004280.a	ENSGT00530000063609.b.x.q.a	ENSGT00530000063480.b.p	ENSGT00940000157121.g	ENSGT00390000008096.C.b.a	ENSGT00940000156869.i	ENSGT00390000008096.C.a.b	ENSGT00940000168259	ENSGT00940000154337.b.f	ENSGT00940000154995.fb	ENSGT00390000006540.f	ENSGT00510000047030.d.q.b	ENSGT00530000063631.a.k.b	ENSGT00390000010779.a.b.a.f	ENSGT00940000156500.e	ENSGT00950000183051.a.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408.a	ENSGT00390000014772.k.e	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i.a	ENSGT00940000159356.a.b.b.b	ENSGT00940000157071.s	ENSGT00940000157616.j.a.b	ENSGT00390000003774.a.a.c.f	ENSGT00390000003774.b.a	ENSGT00400000024940.b	ENSGT00400000022514.d.a	ENSGT00940000162855.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.b.a	ENSGT00390000002661.a.a	ENSGT00530000063880.b.e.a.b	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	12	igf2bp3 (ENSCCRG00000030227)	GPNMB (ENSCCRG00000023873)	oxnad1 (ENSCCRG00000023876)	RFTN1 (ENSCCRG00000023881)	dazl (ENSCCRG00000023883)	tbc1d5 (ENSCCRG00000023940)	satb1a (ENSCCRG00000024007)	KCNH8 (ENSCCRG00000023886)	ENSCCRG00000077868	kat2b (ENSCCRG00000069798)	ngly1 (ENSCCRG00000021036)	adnp2b (ENSCCRG00000021092)	txnl4a (ENSCCRG00000021097)	cndp2 (ENSCCRG00000020392)	ENSCCRG00000043638	tshz1 (ENSCCRG00000055930) ##22	znf516 (ENSCCRG00000026041)	ENSCCRG00000058472	GALR1 (ENSCCRG00000069851)	sall3b (ENSCCRG00000079531)	atp9b (ENSCCRG00000040711)	ENSCCRG00000061462	nfatc1 (ENSCCRG00000007446)	ENSCCRG00000048113	ENSCCRG00000042066	slc52a2 (ENSCCRG00000042060)	fbxl6 (ENSCCRG00000060495)	eppk1 (ENSCCRG00000069112)	pleca (ENSCCRG00000042048)	ENSCCRG00000007415	ENSCCRG00000065900
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	148	tra2a (ENSSGRG00000050536)	igf2bp3 (ENSSGRG00000050552)	ENSSGRG00000051380	GPNMB (ENSSGRG00000051381)	oxnad1 (ENSSGRG00000051382)	ENSSGRG00000051383	dazl (ENSSGRG00000051384)	tbc1d5 (ENSSGRG00000051406)	satb1a (ENSSGRG00000051505)	KCNH8 (ENSSGRG00000051506)	kat2b (ENSSGRG00000051507)	nutf2l (ENSSGRG00000051532)	adnp2b (ENSSGRG00000051534)	txnl4a (ENSSGRG00000051535)	cndp2 (ENSSGRG00000051541)	tshz1 (ENSSGRG00000051558) ##22	znf516 (ENSSGRG00000051559)	ENSSGRG00000051562	GALR1 (ENSSGRG00000051567)	sall3b (ENSSGRG00000051568)	atp9b (ENSSGRG00000051577)	nfatc1 (ENSSGRG00000052172)	ENSSGRG00000052189	slc52a2 (ENSSGRG00000052190)	ENSSGRG00000052191	fbxl6 (ENSSGRG00000052195)	ENSSGRG00000052197	pleca (ENSSGRG00000052204)	EIF3E (ENSSGRG00000052518)	TMEM74 (ENSSGRG00000052743)	trhrb (ENSSGRG00000052745)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00950000183188.B.i	ENSGT00390000004280.b	ENSGT00530000063609.b.x.q.b	ENSGT00530000063609.b.x.r	ENSGT00530000063480.b.o	ENSGT00940000157121.h	ENSGT00390000008096.C.b.b	ENSGT00940000156869.j	ENSGT00940000154337.b.e.a	ENSGT00940000154995.gb	ENSGT00390000006540.e	ENSGT00510000047030.d.q.a	ENSGT00530000063631.a.k.a	ENSGT00390000010779.a.b.a.e	ENSGT00940000156500.f	ENSGT00950000183051.a.a.a.b ##22	ENSGT00940000161408.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183188.B.i	ENSGT00390000004280.b	ENSGT00530000063609.b.x.q.b	ENSGT00530000063609.b.x.r	ENSGT00530000063480.b.o	ENSGT00940000157121.h	ENSGT00390000008096.C.b.b	ENSGT00940000156869.j	ENSGT00940000154337.b.e.a	ENSGT00940000154995.gb	ENSGT00390000006540.e	ENSGT00510000047030.d.q.a	ENSGT00530000063631.a.k.a	ENSGT00390000010779.a.b.a.e	ENSGT00940000156500.f	ENSGT00950000183051.a.a.a.b ##22	ENSGT00940000161408.b	ENSGT00390000014772.k.f	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.i.b	ENSGT00940000159356.a.b.b.a	ENSGT00940000157071.t	ENSGT00940000157616.j.a.a	ENSGT00390000003774.a.a.c.e	ENSGT00390000003774.b.b	ENSGT00400000024940.a	ENSGT00400000022514.d.b	ENSGT00940000154843.F.d.a	ENSGT00940000162855.a.a.a.b.b	ENSGT00530000063880.b.e.b	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.a.b	ENSGT00390000007776.q
Common carp reference	MODERN SPECIES	31	oxnad1 (ENSCCRG00000032264)	ENSCCRG00000032267	ENSCCRG00000023882	dazl (ENSCCRG00000064421)	tbc1d5 (ENSCCRG00000032372)	satb1a (ENSCCRG00000041031)	KCNH8 (ENSCCRG00000041034)	rab5aa (ENSCCRG00000054440)	kat2b (ENSCCRG00000007857)	ngly1 (ENSCCRG00000020431)	nutf2l (ENSCCRG00000020425)	adnp2b (ENSCCRG00000020419)	txnl4a (ENSCCRG00000020409)	cndp2 (ENSCCRG00000021131)	ENSCCRG00000068758	tshz1 (ENSCCRG00000078395) ##22	ENSCCRG00000067793	znf516 (ENSCCRG00000060631)	ENSCCRG00000076353	GALR1 (ENSCCRG00000058396)	ENSCCRG00000055835	sall3b (ENSCCRG00000040618)	atp9b (ENSCCRG00000079182)	nfatc1 (ENSCCRG00000042043)	ENSCCRG00000076741	ENSCCRG00000048111	eppk1 (ENSCCRG00000067005)	ENSCCRG00000070090	pleca (ENSCCRG00000003243)	TMEM74 (ENSCCRG00000066050)	trhrb (ENSCCRG00000011257)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	173	ccdc126 (ENSSGRG00000048847)	tra2a (ENSSGRG00000048846)	igf2bp3 (ENSSGRG00000048700)	GPNMB (ENSSGRG00000048697)	oxnad1 (ENSSGRG00000048695)	dazl (ENSSGRG00000048694)	tbc1d5 (ENSSGRG00000048006)	satb1a (ENSSGRG00000047993)	KCNH8 (ENSSGRG00000047985)	kat2b (ENSSGRG00000047666)	ngly1 (ENSSGRG00000047655)	nutf2l (ENSSGRG00000047639)	adnp2b (ENSSGRG00000047638)	ENSSGRG00000047633	cndp2 (ENSSGRG00000047548)	tshz1 (ENSSGRG00000047545) ##22	PCDH1 (ENSSGRG00000047544)
Goldfish	MODERN SPECIES	38	igf2bp3 (ENSCARG00000025298)	GPNMB (ENSCARG00000025004)	oxnad1 (ENSCARG00000024962)	ENSCARG00000024956	dazl (ENSCARG00000024917)	tbc1d5 (ENSCARG00000023076)	satb1a (ENSCARG00000023032)	KCNH8 (ENSCARG00000022999)	rab5aa (ENSCARG00000022987)	kat2b (ENSCARG00000022552)	ngly1 (ENSCARG00000022519)	nutf2l (ENSCARG00000022510)	adnp2b (ENSCARG00000022506)	txnl4a (ENSCARG00000022496)	cndp2 (ENSCARG00000022040)	tshz1 (ENSCARG00000022016) ##22	znf516 (ENSCARG00000022006)	ENSCARG00000022000	ext1b (ENSCARG00000021952)	med30 (ENSCARG00000021936)	SLC30A8 (ENSCARG00000021920)	crabp2b (ENSCARG00000021900)	mrps21 (ENSCARG00000021888)	ciarta (ENSCARG00000021868)	rprd2a (ENSCARG00000021836)	celf3a (ENSCARG00000021768)	cers2a (ENSCARG00000021724)	ENSCARG00000021695	chrna11 (ENSCARG00000021663)	snx27a (ENSCARG00000020384)	s100a10a (ENSCARG00000020334)
Zebrafish	MODERN SPECIES	10	igf2bp3 (ENSDARG00000010266)	GPNMB (ENSDARG00000062688)	oxnad1 (ENSDARG00000062664)	RFTN1 (ENSDARG00000070831)	dazl (ENSDARG00000036214)	tbc1d5 (ENSDARG00000036212)	satb1a (ENSDARG00000057649)	KCNH8 (ENSDARG00000062640)	rab5aa (ENSDARG00000018602)	kat2b (ENSDARG00000062634)	ngly1 (ENSDARG00000003205)	nutf2l (ENSDARG00000014499)	adnp2b (ENSDARG00000028431)	txnl4a (ENSDARG00000036190)	cndp2 (ENSDARG00000003931)	tshz1 (ENSDARG00000005026) ##22	znf516 (ENSDARG00000070809)	ENSDARG00000036186	ENSDARG00000111408	GALR1 (ENSDARG00000005522)	sall3b (ENSDARG00000057586)	atp9b (ENSDARG00000062521)	nfatc1 (ENSDARG00000036168)	ENSDARG00000062502	slc52a2 (ENSDARG00000102035)	ENSDARG00000070800	fbxl6 (ENSDARG00000077227)	eppk1 (ENSDARG00000096359)	pleca (ENSDARG00000062590)	eif3eb (ENSDARG00000002549)	trhrb (ENSDARG00000036159)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	385														ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00390000014772.k	ENSGT00390000009042	ENSGT00390000014542	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000018560.a.a.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429
Atlantic herring	MODERN SPECIES	10	slc52a2 (ENSCHAG00000014082)	ENSCHAG00000013905	nfatc1 (ENSCHAG00000013880)	atp9b (ENSCHAG00000008142)	sall3b (ENSCHAG00000007900)	LIX1L (ENSCHAG00000007816)	ENSCHAG00000007801	tnfaip8l2a (ENSCHAG00000007782)	ENSCHAG00000007758	sema6d (ENSCHAG00000007598)	ENSCHAG00000007577	ENSCHAG00000007546	ENSCHAG00000007497	ENSCHAG00000007479	cndp2 (ENSCHAG00000007351)	tshz1 (ENSCHAG00000007345) ##22	znf516 (ENSCHAG00000007326)	ENSCHAG00000007208	prcc (ENSCHAG00000007189)	mrpl24 (ENSCHAG00000007178)	sf3b4 (ENSCHAG00000007167)	naxe (ENSCHAG00000007145)	chd4a (ENSCHAG00000002793)	cdc42l (ENSCHAG00000002415)	eno2 (ENSCHAG00000026360)	tpi1a (ENSCHAG00000026350)	gnb3b (ENSCHAG00000026346)	zgc:174904 (ENSCHAG00000026344)	ENSCHAG00000026339	GRIK5 (ENSCHAG00000026252)	ENSCHAG00000026247
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	241	ENSGT00390000014542	ENSGT00940000157485	ENSGT00390000009042	ENSGT00390000008281	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00940000165143.a.b	ENSGT00530000063721.A	ENSGT00940000161427	ENSGT00930000151026	ENSGT00730000110871.a.a.a.a	ENSGT00730000110871.b	ENSGT00530000063817.a	ENSGT00550000075134	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159283.c.a	ENSGT00950000182919.B.a.h	ENSGT00400000025005	ENSGT00940000157485	ENSGT00390000009042	ENSGT00390000008281	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00940000165143.a.b	ENSGT00530000063721.A	ENSGT00940000161427	ENSGT00930000151026	ENSGT00940000162584.i.b	ENSGT00550000075134	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h	ENSGT00530000064067	ENSGT00390000002390.b.f	ENSGT00940000159463.n.b	ENSGT00940000157343.a.a	ENSGT00390000014542	ENSGT00940000154870.A.b	ENSGT00990000205603	ENSGT00940000161854.b	ENSGT00530000063725.o	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000156361.A.a	ENSGT00940000164158.A.b	ENSGT00390000014273.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1107																ENSGT00950000183051.a.a.a.c ##22	ENSGT00940000161408.d	ENSGT00500000044904.a.b.g.a.a	ENSGT00500000044904.a.b.g.a.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00990000204388.d	ENSGT00940000158522.m.k	ENSGT00940000159283.c.a.c	ENSGT00950000182919.B.a.h.d.a	ENSGT00940000157485.u	ENSGT00390000009042.h.a	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.a	ENSGT00530000063721.A.i	ENSGT00930000151026.u.b	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.fb	ENSGT00530000063817.a	ENSGT00970000193390.c.a.b.b.b.a	ENSGT00940000162584.i.b.b	ENSGT00550000075134.e	ENSGT00940000156500.q	ENSGT00950000183051.a.a.a.c ##22	ENSGT00940000161408.d	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h.d	ENSGT00500000044904.a.b.g.a.a	ENSGT00500000044904.a.b.g.a.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000004097.b.j.b	ENSGT00990000204388.d	ENSGT00940000158522.m.k	ENSGT00940000159283.c.a.c	ENSGT00950000182919.B.a.h.d.a	ENSGT00940000157485.u	ENSGT00390000009042.h.a	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.a	ENSGT00530000063721.A.i	ENSGT00930000151026.u.b	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.fb	ENSGT00530000063817.a	ENSGT00970000193390.c.a.b.b.b.a	ENSGT00550000075134.e	ENSGT00940000156500.q	ENSGT00950000183051.a.a.a.c ##22	ENSGT00940000161408.d
River trout	MODERN SPECIES	27	thbs3b (ENSSTUG00000043786)	mtx1b (ENSSTUG00000043730)	HDGF (ENSSTUG00000043726)	prcc (ENSSTUG00000043712)	rpz2 (ENSSTUG00000043707)	ENSSTUG00000043701	krit1 (ENSSTUG00000043598)	cyp51 (ENSSTUG00000043420)	ENSSTUG00000043346	MTERF1 (ENSSTUG00000043339)	ENSSTUG00000043330	dus3l (ENSSTUG00000042566)	bdh2 (ENSSTUG00000042527)	ENSSTUG00000042520	cndp2 (ENSSTUG00000041778)	tshz1 (ENSSTUG00000041756) ##22	znf516 (ENSSTUG00000041709)	ENSSTUG00000041698	ENSSTUG00000040813	ENSSTUG00000040746	ENSSTUG00000040720	ENSSTUG00000040711	ENSSTUG00000040697	ENSSTUG00000040686	ENSSTUG00000040669	ENSSTUG00000040649	ENSSTUG00000040626	ENSSTUG00000040614	ENSSTUG00000040600	ENSSTUG00000040581	msto1 (ENSSTUG00000040547)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	19	ENSSSAG00000063338	txnip (ENSSSAG00000063333)	ENSSSAG00000062793	ENSSSAG00000062587	ENSSSAG00000062558	PRCC (ENSSSAG00000062526)	ENSSSAG00000099070	krit1 (ENSSSAG00000062253)	cyp51 (ENSSSAG00000059749)	ENSSSAG00000059650	MTERF1 (ENSSSAG00000106222)	ENSSSAG00000109696	dus3l (ENSSSAG00000059369)	ENSSSAG00000111419	cndp2 (ENSSSAG00000058866)	ENSSSAG00000093835 ##22	ENSSSAG00000058840	znf516 (ENSSSAG00000058806)	ENSSSAG00000112227	ENSSSAG00000058781	ENSSSAG00000058764	ENSSSAG00000120108	ENSSSAG00000083075	ENSSSAG00000058744	ENSSSAG00000099708	ENSSSAG00000113654	ENSSSAG00000091504	ENSSSAG00000111467	ENSSSAG00000087962	ENSSSAG00000099820	ENSSSAG00000119224
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00990000204388.d	ENSGT00940000158522.m.k	ENSGT00940000159283.c.a.c	ENSGT00950000182919.B.a.h.d.a	ENSGT00940000157485.u	ENSGT00390000009042.h.a	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.a	ENSGT00530000063721.A.i	ENSGT00930000151026.u.b	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.fb	ENSGT00530000063817.a.q	ENSGT00970000193390.c.a.b.b.b.a	ENSGT00940000162584.i.b.b	ENSGT00550000075134.e	ENSGT00940000156500.q	ENSGT00950000183051.a.a.a.c ##22	ENSGT00940000161408.d	ENSGT01030000234589.g.a.a.b.a	ENSGT00940000153770.h.a.b.a.b.b	ENSGT01030000234589.g.a.a.a	ENSGT01100000263549.j.a.b.a	ENSGT00940000153770.h.a.b.a.a	ENSGT00940000154869.b.d	ENSGT00940000153770.h.a.b.a.b.a	ENSGT01030000234589.g.a.a.b.b	ENSGT01100000263549.j.a.b.b	ENSGT00950000182912.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00990000204388.d	ENSGT00940000158522.m.k	ENSGT00940000159283.c.a.c	ENSGT00950000182919.B.a.h.d.a	ENSGT00940000157485.u	ENSGT00390000009042.h.a	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.a	ENSGT00530000063721.A.i	ENSGT00930000151026.u.b	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.fb	ENSGT00530000063817.a.q	ENSGT00970000193390.c.a.b.b.b.a	ENSGT00940000162584.i.b.b	ENSGT00550000075134.e	ENSGT00940000156500.q	ENSGT00950000183051.a.a.a.c ##22	ENSGT00940000161408.d	ENSGT00940000153770.h.a.a	ENSGT01100000263549.j.a.b.b	ENSGT01030000234589.g.a.a.b.a	ENSGT00950000182912.b.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h.d
Chinook salmon	MODERN SPECIES	4	polr3gla (ENSOTSG00005009673)	txnipa (ENSOTSG00005009674)	thbs3b (ENSOTSG00005009681)	mtx1b (ENSOTSG00005013309)	HDGF (ENSOTSG00005013311)	prcc (ENSOTSG00005013313)	rpz2 (ENSOTSG00005013315)	krit1 (ENSOTSG00005013317)	cyp51 (ENSOTSG00005013330)	ENSOTSG00005013893	MTERF1 (ENSOTSG00005013895)	ENSOTSG00005013897	fzd1 (ENSOTSG00005013899)	dus3l (ENSOTSG00005013909)	cndp2 (ENSOTSG00005014257)	tshz1 (ENSOTSG00005014595) ##22	znf516 (ENSOTSG00005014597)	ENSOTSG00005014598	ENSOTSG00005014600	ENSOTSG00005014601	ENSOTSG00005014602	ENSOTSG00005014603	ENSOTSG00005014605	ENSOTSG00005014607	ENSOTSG00005014609	ENSOTSG00005014610	ENSOTSG00005014614	mef2d (ENSOTSG00005014617)	BCAN (ENSOTSG00005014621)	ENSOTSG00005014625	thap7 (ENSOTSG00005014630)
Coho salmon	MODERN SPECIES	8	thbs3b (ENSOKIG00005018833)	ENSOKIG00005020574	ENSOKIG00005020623	HDGF (ENSOKIG00005020633)	ENSOKIG00005020642	ENSOKIG00005020655	KRIT1 (ENSOKIG00005020670)	cyp51 (ENSOKIG00005020736)	ENSOKIG00005021127	MTERF1 (ENSOKIG00005021131)	ENSOKIG00005021137	FZD1 (ENSOKIG00005021152)	FZD1 (ENSOKIG00005021170)	dus3l (ENSOKIG00005021219)	cndp2 (ENSOKIG00005022011)	tshz1 (ENSOKIG00005022861) ##22	znf516 (ENSOKIG00005022872)	ENSOKIG00005022891	ENSOKIG00005022991	ENSOKIG00005023258	ENSOKIG00005023263	ENSOKIG00005023275	ENSOKIG00005023296	ENSOKIG00005023308	ENSOKIG00005023334	ENSOKIG00005023365	ENSOKIG00005023369	ENSOKIG00005023374	ENSOKIG00005023415	MEF2D (ENSOKIG00005023430)	ENSOKIG00005023477
Rainbow trout	MODERN SPECIES	9	ENSOMYG00000023141	ENSOMYG00000023121	ENSOMYG00000023059	ENSOMYG00000023042	KRIT1 (ENSOMYG00000022964)	cyp51 (ENSOMYG00000022720)	ENSOMYG00000065290	ENSOMYG00000022465	ENSOMYG00000058747	MTERF1 (ENSOMYG00000022305)	ENSOMYG00000022295	FZD1 (ENSOMYG00000022288)	dus3l (ENSOMYG00000022215)	ENSOMYG00000022189	cndp2 (ENSOMYG00000020972)	ENSOMYG00000020835 ##22	ENSOMYG00000054391	ENSOMYG00000060928	znf516 (ENSOMYG00000020814)	ENSOMYG00000020708	ENSOMYG00000020736	ENSOMYG00000052652	ENSOMYG00000052246	ENSOMYG00000074249	ENSOMYG00000049106	ENSOMYG00000020729	ENSOMYG00000049830	ENSOMYG00000069494	ENSOMYG00000020663	ENSOMYG00000052356	ENSOMYG00000060406
Huchen	MODERN SPECIES	728																tshz1 (ENSHHUG00000010264) ##22	znf516 (ENSHHUG00000010248)	ENSHHUG00000010238	ENSHHUG00000010232	ENSHHUG00000010229	ENSHHUG00000010178	ENSHHUG00000009529	ENSHHUG00000009464	ENSHHUG00000009457	ENSHHUG00000009450	TRIM45 (ENSHHUG00000009438)	man1a2 (ENSHHUG00000009411)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	105											ENSGT00940000163581.f.b.k.a	ENSGT00940000162584.i.b.a	ENSGT00550000075134.f	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500.r	ENSGT00950000183051.a.a.a.d ##22	ENSGT00940000161408.c	ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h	ENSGT00530000064067.o	ENSGT00390000002390.b.f.b	ENSGT00940000159463.n.b.a	ENSGT00530000064067.p	ENSGT00390000002390.b.f.a	ENSGT00940000159463.n.b.b	ENSGT00940000157343.a.a.n	ENSGT00390000014542.c	ENSGT00940000154870.A.b.c	ENSGT00940000161854.b.d	ENSGT00730000111394	ENSGT00940000164158.A.b.d
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157485.t	ENSGT00390000009042.g	ENSGT00390000008281	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.b	ENSGT00530000063721.A.j	ENSGT00930000151026.v	ENSGT00940000161019.ub	ENSGT00930000151026.u.a	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.gb	ENSGT00940000163581.f.b.k.a	ENSGT00940000162584.i.b.a	ENSGT00550000075134.f	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500.r	ENSGT00950000183051.a.a.a.d ##22	ENSGT00940000161408.c	ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.a.b.a.b	ENSGT01100000263549.j.b	ENSGT01030000234589.g.a.b	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h.c	ENSGT00530000064067.o	ENSGT00390000002390.b.f.b	ENSGT00940000159463.n.b.a	ENSGT00530000064067.p	ENSGT00390000002390.b.f.a	ENSGT00940000159463.n.b.b	ENSGT00940000157343.a.a.n	ENSGT00390000014542.c.a	ENSGT00940000154870.A.b.c	ENSGT00940000161854.b.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182919.B.a.h.c	ENSGT00400000025005	ENSGT00940000157485.t	ENSGT00390000009042.g	ENSGT00390000008281	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.b	ENSGT00530000063721.A.j	ENSGT00940000161019.ub	ENSGT00930000151026.u.a	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.gb	ENSGT00940000163581.f.b.k.a	ENSGT00550000075134.f	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500.r	ENSGT00950000183051.a.a.a.d ##22	ENSGT00940000161408.c	ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.a.b.a.b	ENSGT01100000263549.j.b	ENSGT01030000234589.g.a.b	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h.c	ENSGT00530000064067.o	ENSGT00390000002390.b.f.b	ENSGT00940000159463.n.b.a	ENSGT00940000157343.a.a.m	ENSGT00390000014542.d	ENSGT00940000154870.A.b.d	ENSGT00940000161854.b.c.a	ENSGT00940000161854.b.c.b	ENSGT00530000063725.o.rb	ENSGT00940000176166
River trout	MODERN SPECIES	29	ENSSTUG00000032919	HDGF (ENSSTUG00000032933)	prcc (ENSSTUG00000032937)	mrpl9 (ENSSTUG00000032961)	si:dkey-266f7.9 (ENSSTUG00000033006)	rpz2 (ENSSTUG00000033013)	krit1 (ENSSTUG00000033020)	ENSSTUG00000033092	cyp51 (ENSSTUG00000033110)	ENSSTUG00000033290	ENSSTUG00000033325	ENSSTUG00000033336	ENSSTUG00000033341	ENSSTUG00000033348	cndp2 (ENSSTUG00000033363)	tshz1 (ENSSTUG00000033470) ##22	znf516 (ENSSTUG00000014422)	ENSSTUG00000014427	ENSSTUG00000014428	ENSSTUG00000014435	msto1 (ENSSTUG00000014437)	ENSSTUG00000014443	mef2d (ENSSTUG00000014448)	ENSSTUG00000014490	mrpl24 (ENSSTUG00000014506)	ENSSTUG00000014512	s100v2 (ENSSTUG00000014591)	prf1.2 (ENSSTUG00000014616)	ENSSTUG00000014627	zgc:64022 (ENSSTUG00000014670)	pex11b (ENSSTUG00000014688)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	5	ENSSSAG00000005628	ENSSSAG00000005617	RM09 (ENSSSAG00000005597)	ENSSSAG00000005589	ENSSSAG00000005580	KRIT1 (ENSSSAG00000005545)	ENSSSAG00000005531	ENSSSAG00000005253	ENSSSAG00000005008	ifi44 (ENSSSAG00000005212)	ENSSSAG00000096573	ENSSSAG00000106126	ENSSSAG00000112203	ENSSSAG00000004981	cndp2 (ENSSSAG00000004830)	ENSSSAG00000004779 ##22	znf516 (ENSSSAG00000004752)	ENSSSAG00000101162	ENSSSAG00000004730	ENSSSAG00000099657	ENSSSAG00000004697	ENSSSAG00000102280	ENSSSAG00000112881	ENSSSAG00000004604	ENSSSAG00000004545	ENSSSAG00000004534	ENSSSAG00000004476	s100v2 (ENSSSAG00000110695)	S10AD (ENSSSAG00000004421)	prf1.2 (ENSSSAG00000109876)	ENSSSAG00000004380
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182919.B.a.h.c	ENSGT00400000025005	ENSGT00940000157485.t	ENSGT00390000009042.h.b	ENSGT00390000008281.e	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.b	ENSGT00530000063721.A.j	ENSGT00930000151026.u.a	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.gb	ENSGT00940000163581.f.b.k.a	ENSGT00940000162584.i.b.a	ENSGT00550000075134.f	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500.r	ENSGT00950000183051.a.a.a.d ##22	ENSGT00940000161408.c	ENSGT00970000193381.a.a.c.b.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h.c.a	ENSGT00530000064067.o	ENSGT00390000002390.b.f.b	ENSGT00940000159463.n.b.a	ENSGT00530000064067.p	ENSGT00390000002390.b.f.a	ENSGT00940000159463.n.b.b	ENSGT00940000157343.a.a.n	ENSGT00940000154870.A.b.c	ENSGT00730000111394.f	ENSGT00940000164158.A.b.d	ENSGT00390000014273.b.l	ENSGT00940000160132.p
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159283.c.a.d	ENSGT00950000182919.B.a.h.c	ENSGT00400000025005	ENSGT00940000157485.t	ENSGT00390000009042.g	ENSGT00390000008281.e	ENSGT00390000010118.c.b	ENSGT00940000165143.a.b.p.b.b	ENSGT00530000063721.A.j	ENSGT00930000151026.u.a	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.gb	ENSGT00940000163581.f.b.k.a	ENSGT00940000162584.i.b.a	ENSGT00940000163253.a.a.b	ENSGT00940000156500.r	ENSGT00950000183051.a.a.a.d ##22	ENSGT00940000161408.c	ENSGT00950000182966.A.a.b.a.h.c.a	ENSGT00530000064067.o	ENSGT00390000002390.b.f.b	ENSGT00940000159463.n.b.a	ENSGT00940000159463.n.b.b.b	ENSGT00530000064067.p	ENSGT00390000002390.b.f.a	ENSGT00940000159463.n.b.b.a	ENSGT00940000157343.a.a.n	ENSGT00940000154870.A.b.c	ENSGT00730000111394.f	ENSGT00940000164158.A.b.d	ENSGT00390000014273.b.l	ENSGT00940000160132.p
Coho salmon	MODERN SPECIES	5	ENSOKIG00005023353	HDGF (ENSOKIG00005023320)	prcc (ENSOKIG00005023266)	mrpl9 (ENSOKIG00005021682)	si:dkey-266f7.9 (ENSOKIG00005021669)	ENSOKIG00005021658	krit1 (ENSOKIG00005021520)	cyp51 (ENSOKIG00005021176)	ENSOKIG00005020995	ENSOKIG00005020815	FZD1 (ENSOKIG00005020807)	ENSOKIG00005020786	ENSOKIG00005020716	ENSOKIG00005020698	cndp2 (ENSOKIG00005018519)	TSHZ1 (ENSOKIG00005018405) ##22	znf516 (ENSOKIG00005018381)	ENSOKIG00005018369	ENSOKIG00005018333	ENSOKIG00005018329	ENSOKIG00005018322	msto1 (ENSOKIG00005018277)	tmem79a (ENSOKIG00005018262)	MEF2D (ENSOKIG00005018167)	ENSOKIG00005018124	ENSOKIG00005018084	s100v2 (ENSOKIG00005018051)	prf1.2 (ENSOKIG00005018035)	ENSOKIG00005018031	zgc:64022 (ENSOKIG00005018006)	pex11b (ENSOKIG00005017997)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	24	mrpl9 (ENSOTSG00005041655)	si:dkey-266f7.9 (ENSOTSG00005041667)	rpz2 (ENSOTSG00005041778)	krit1 (ENSOTSG00005041675)	CYP51A1 (ENSOTSG00005041779)	ENSOTSG00005041800	ENSOTSG00005041814	ENSOTSG00005041815	fzd1 (ENSOTSG00005041816)	ENSOTSG00005041817	ENSOTSG00005041819	bgnb (ENSOTSG00005041823)	B4GALT3 (ENSOTSG00005041856)	atp6ap1lb (ENSOTSG00005041858)	ddx20 (ENSOTSG00005041859)	tshz1 (ENSOTSG00005041902) ##22	znf516 (ENSOTSG00005041903)	ENSOTSG00005041905	ENSOTSG00005041906	ENSOTSG00005041907	ENSOTSG00005041909	msto1 (ENSOTSG00005041924)	ENSOTSG00005041925	ENSOTSG00005041926	mef2d (ENSOTSG00005041929)	BCAN (ENSOTSG00005041932)	mrpl24 (ENSOTSG00005042479)	ENSOTSG00005042480	ENSOTSG00005042481	s100v2 (ENSOTSG00005042483)	prf1.2 (ENSOTSG00005042485)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	24	ENSOMYG00000004618	ENSOMYG00000004640	KRIT1 (ENSOMYG00000004769)	cyp51 (ENSOMYG00000005467)	ENSOMYG00000006219	ENSOMYG00000076980	ENSOMYG00000006395	ENSOMYG00000061973	ENSOMYG00000006430	ENSOMYG00000006446	ENSOMYG00000006600	ENSOMYG00000074405	ENSOMYG00000006859	ENSOMYG00000070233	cndp2 (ENSOMYG00000007904)	ENSOMYG00000008624 ##22	ENSOMYG00000052299	znf516 (ENSOMYG00000008662)	ENSOMYG00000008696	ENSOMYG00000075050	ENSOMYG00000008771	ENSOMYG00000076517	ENSOMYG00000008814	ENSOMYG00000008838	ENSOMYG00000008940	ENSOMYG00000053048	ENSOMYG00000048142	ENSOMYG00000009093	s100v2 (ENSOMYG00000009173)	s100v2 (ENSOMYG00000060442)	prf1.2 (ENSOMYG00000053711)
Huchen	MODERN SPECIES	92														ENSHHUG00000045690	cndp2 (ENSHHUG00000045701)	tshz1 (ENSHHUG00000046058) ##22	znf516 (ENSHHUG00000046060)	ENSHHUG00000046069	ENSHHUG00000046080	ENSHHUG00000046085	msto1 (ENSHHUG00000046094)	tmem79a (ENSHHUG00000046105)	mef2d (ENSHHUG00000046107)	BCAN (ENSHHUG00000046132)	mrpl24 (ENSHHUG00000046140)	ENSHHUG00000046146	s100v2 (ENSHHUG00000046157)	ENSHHUG00000046167	prf1.2 (ENSHHUG00000046169)	ENSHHUG00000046171	zgc:64022 (ENSHHUG00000046184)
Northern pike	MODERN SPECIES	9	mtx1b (ENSELUG00000014089)	ENSELUG00000014129	HDGF (ENSELUG00000014191)	prcc (ENSELUG00000014219)	mrpl9 (ENSELUG00000014367)	si:dkey-266f7.9 (ENSELUG00000014390)	rpz2 (ENSELUG00000014409)	krit1 (ENSELUG00000014458)	cyp51 (ENSELUG00000014507)	ENSELUG00000014810	MTERF1 (ENSELUG00000014952)	fzd1 (ENSELUG00000014962)	dus3l (ENSELUG00000015033)	ENSELUG00000015068	cndp2 (ENSELUG00000015151)	tshz1 (ENSELUG00000015181) ##22	znf516 (ENSELUG00000015215)	ENSELUG00000015230	ENSELUG00000015242	msto1 (ENSELUG00000015313)	tmem79a (ENSELUG00000015337)	mef2d (ENSELUG00000015462)	ENSELUG00000015530	mrpl24 (ENSELUG00000015553)	ENSELUG00000015584	s100v2 (ENSELUG00000028491)	thap7 (ENSELUG00000015639)	ENSELUG00000015673	zgc:64022 (ENSELUG00000015708)	pex11b (ENSELUG00000025708)	rit1 (ENSELUG00000015742)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000160242.b	ENSGT00940000154107.b	ENSGT00940000154995	ENSGT00940000154337.a.b	ENSGT00390000012840	ENSGT00950000183176.b.f	ENSGT01030000234950	ENSGT00390000010285.c	ENSGT00950000182986.a.b.b	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT01030000234531.C	ENSGT00390000012916	ENSGT00390000005801	ENSGT00530000063576.B.a.b	ENSGT00940000153253.a	ENSGT00940000156245.a.b	ENSGT00390000017955.d	ENSGT00390000007486	ENSGT00940000159758	ENSGT01050000244890.a.a.a.g	ENSGT00940000172951	ENSGT00940000159342.a	ENSGT00940000164175.b	ENSGT00940000165758	ENSGT00510000047245
Fugu	MODERN SPECIES	3	smap2 (ENSTRUG00000018144)	ZNF385D (ENSTRUG00000018125)	ENSTRUG00000018124	kat2b (ENSTRUG00000018099)	RAB5A (ENSTRUG00000032332)	otud6b (ENSTRUG00000018086)	runx1t1 (ENSTRUG00000001804)	ENSTRUG00000030954	ENSTRUG00000029066	cibar1 (ENSTRUG00000001486)	TRIB1 (ENSTRUG00000028474)	rplp1 (ENSTRUG00000005235)	clptm1l (ENSTRUG00000005291)	trps1 (ENSTRUG00000021680)	ENSTRUG00000024953	tshz1 (ENSTRUG00000010712) ##22	ENSTRUG00000032760	lrrc14b (ENSTRUG00000010672)	uqcrb (ENSTRUG00000010634)	mterf3 (ENSTRUG00000010597)	PTDSS1 (ENSTRUG00000010448)	nup153 (ENSTRUG00000010163)	rbm24a (ENSTRUG00000010089)	cap2 (ENSTRUG00000009507)	vps28 (ENSTRUG00000009357)	mapk15 (ENSTRUG00000009284)	grina (ENSTRUG00000009217)	ENSTRUG00000029207	fam83hb (ENSTRUG00000009193)	ENSTRUG00000023862	ankib1a (ENSTRUG00000009032)
Tetraodon	MODERN SPECIES	15	rims3 (ENSTNIG00000009201)	smap2 (ENSTNIG00000009200)	ZNF385D (ENSTNIG00000009199)	ENSTNIG00000009198	kat2b (ENSTNIG00000009197)	RAB5A (ENSTNIG00000009196)	otud6b (ENSTNIG00000009195)	runx1t1 (ENSTNIG00000009194)	cibar1 (ENSTNIG00000009193)	TRIB1 (ENSTNIG00000009192)	rplp1 (ENSTNIG00000009191)	clptm1l (ENSTNIG00000009190)	ENSTNIG00000009189	ENSTNIG00000009188	CSMD3 (ENSTNIG00000009187)	tshz1 (ENSTNIG00000001441) ##22	lrrc14b (ENSTNIG00000009186)	uqcrb (ENSTNIG00000009185)	mterf3 (ENSTNIG00000009184)	PTDSS1 (ENSTNIG00000009183)	nup153 (ENSTNIG00000009182)	rbm24a (ENSTNIG00000009181)	cap2 (ENSTNIG00000009180)	cap2 (ENSTNIG00000000065)	vps28 (ENSTNIG00000009179)	mapk15 (ENSTNIG00000009178)	grinaa (ENSTNIG00000000386)	fam83hb (ENSTNIG00000009177)	ENSTNIG00000001242	ankib1a (ENSTNIG00000009176)	snrpd1 (ENSTNIG00000001224)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	71	ENSLBEG00000025617	RPRD1A (ENSLBEG00000025645)	fkbp9 (ENSLBEG00000025665)	crtap (ENSLBEG00000025699)	ENSLBEG00000025722	fbxl2 (ENSLBEG00000025748)	clasp2 (ENSLBEG00000025890)	SLC45A4 (ENSLBEG00000026195)	DENND3 (ENSLBEG00000026220)	PTK2 (ENSLBEG00000026333)	rplp1 (ENSLBEG00000026469)	clptm1l (ENSLBEG00000026499)	trps1 (ENSLBEG00000026549)	ENSLBEG00000026564	CSMD3 (ENSLBEG00000026598)	tshz1 (ENSLBEG00000026670) ##22	znf516 (ENSLBEG00000026679)	ENSLBEG00000026684	ENSLBEG00000026694	SYNGAP1 (ENSLBEG00000026710)	vps72a (ENSLBEG00000026731)	lingo4a (ENSLBEG00000026746)	ctss1 (ENSLBEG00000026758)	ENSLBEG00000026788	SV2A (ENSLBEG00000026804)	sf3b4 (ENSLBEG00000026818)	LIX1L (ENSLBEG00000026830)	pabpc1b (ENSLBEG00000026845)	ENSLBEG00000026866	ENSLBEG00000026899	znf706 (ENSLBEG00000026905)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
European seabass	MODERN SPECIES	22	ENSDLAG00005011330	ENSDLAG00005010708	ENSDLAG00005010700	ENSDLAG00005010689	ENSDLAG00005010627	zgc:63863 (ENSDLAG00005027179)	dgat1a (ENSDLAG00005010300)	cfap20 (ENSDLAG00005010284)	ENSDLAG00005010275	ENSDLAG00005010272	ENSDLAG00005010225	ENSDLAG00005009634	ENSDLAG00005009543	ENSDLAG00005009523	ENSDLAG00005006477	ENSDLAG00005006308 ##22	ENSDLAG00005006301	ENSDLAG00005006292	ENSDLAG00005005485	ENSDLAG00005031604	ENSDLAG00005028344	ENSDLAG00005030709	ENSDLAG00005034178	pabpc1b (ENSDLAG00005003138)	ENSDLAG00005002987	znf706 (ENSDLAG00005026451)	grhl2b (ENSDLAG00005002772)	ncaldb (ENSDLAG00005002723)	ENSDLAG00005002641	ENSDLAG00005002575	psmg2 (ENSDLAG00005002548)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	484	ENSLCRG00005007524	SCRT1 (ENSLCRG00005007526)	KLHL10 (ENSLCRG00005007530)	zgc:63863 (ENSLCRG00005007533)	dgat1a (ENSLCRG00005003023)	cfap20 (ENSLCRG00005004526)	ENSLCRG00005004532	SLC45A4 (ENSLCRG00005004535)	DENND3 (ENSLCRG00005004563)	PTK2 (ENSLCRG00005004656)	clptm1l (ENSLCRG00005005246)	trps1 (ENSLCRG00005005352)	ENSLCRG00005005355	CSMD3 (ENSLCRG00005005650)	ENSLCRG00005006378	tshz1 (ENSLCRG00005006381) ##22	znf516 (ENSLCRG00005006383)	ENSLCRG00005006389	SYNGAP1 (ENSLCRG00005006430)	vps72a (ENSLCRG00005006882)	lingo4a (ENSLCRG00005006894)	ctss1 (ENSLCRG00005006898)	CTSS (ENSLCRG00005006917)	SV2A (ENSLCRG00005006957)	sf3b4 (ENSLCRG00005007593)	LIX1L (ENSLCRG00005007594)	ENSLCRG00005007596	pabpc1b (ENSLCRG00005007670)	ENSLCRG00005007909	ENSLCRG00005007915	grhl2b (ENSLCRG00005007944)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	17	ENSSAUG00010014271	ENSSAUG00010014274	ENSSAUG00010014275	SCRT1 (ENSSAUG00010014276)	zgc:63863 (ENSSAUG00010014277)	dgat1a (ENSSAUG00010014280)	cfap20 (ENSSAUG00010014298)	GPR20 (ENSSAUG00010014299)	SLC45A4 (ENSSAUG00010014300)	DENND3 (ENSSAUG00010014304)	PTK2 (ENSSAUG00010014341)	rplp1 (ENSSAUG00010016580)	clptm1l (ENSSAUG00010016589)	trps1 (ENSSAUG00010016602)	CSMD3 (ENSSAUG00010016627)	tshz1 (ENSSAUG00010016651) ##22	znf516 (ENSSAUG00010016652)	RXFP4 (ENSSAUG00010016653)	SYNGAP1 (ENSSAUG00010016670)	vps72a (ENSSAUG00010017287)	ENSSAUG00010017290	ENSSAUG00010017292	SV2A (ENSSAUG00010001240)	sf3b4 (ENSSAUG00010001398)	LIX1L (ENSSAUG00010001405)	ENSSAUG00010001411	ENSSAUG00010001418	pabpc1b (ENSSAUG00010001450)	ENSSAUG00010001626	znf706 (ENSSAUG00010001636)	grhl2b (ENSSAUG00010001680)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408.f	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000171019	ENSGT00940000161408.f	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a
Lumpfish	MODERN SPECIES	2	cndp2 (ENSCLMG00005002128)	ENSCLMG00005002139	ENSCLMG00005002140	SCRT1 (ENSCLMG00005002141)	zgc:63863 (ENSCLMG00005002142)	dgat1a (ENSCLMG00005002143)	cfap20 (ENSCLMG00005002144)	GPR20 (ENSCLMG00005002145)	SLC45A4 (ENSCLMG00005002146)	PTK2 (ENSCLMG00005002160)	drc1 (ENSCLMG00005002232)	rplp1 (ENSCLMG00005002236)	clptm1l (ENSCLMG00005002245)	ENSCLMG00005002260	CSMD3 (ENSCLMG00005002265)	tshz1 (ENSCLMG00005002275) ##22	SV2A (ENSCLMG00005002276)	sf3b4 (ENSCLMG00005002278)	LIX1L (ENSCLMG00005002280)	ENSCLMG00005002284	pabpc1b (ENSCLMG00005002299)	ENSCLMG00005002337	znf706 (ENSCLMG00005002338)	grhl2b (ENSCLMG00005002343)	ncaldb (ENSCLMG00005002351)	zgc:136493 (ENSCLMG00005002355)	psmg2 (ENSCLMG00005002356)	ptpn2b (ENSCLMG00005002359)	ENSCLMG00005002360	spag1a (ENSCLMG00005002365)	polr2k (ENSCLMG00005002367)
Stickleback	MODERN SPECIES	9	ENSGACG00000004076	SCRT1 (ENSGACG00000004072)	zgc:63863 (ENSGACG00000004066)	dgat1a (ENSGACG00000004051)	cfap20 (ENSGACG00000004039)	ENSGACG00000004037	SLC45A4 (ENSGACG00000004032)	DENND3 (ENSGACG00000004021)	PTK2 (ENSGACG00000004011)	ENSGACG00000004003	rplp1 (ENSGACG00000003995)	clptm1l (ENSGACG00000003981)	trps1 (ENSGACG00000003970)	ENSGACG00000003969	CSMD3 (ENSGACG00000003938)	tshz1 (ENSGACG00000003937) ##22	ENSGACG00000003934	ENSGACG00000003932	ENSGACG00000003931	SYNGAP1 (ENSGACG00000003919)	vps72a (ENSGACG00000003903)	lingo4a (ENSGACG00000003902)	ctss1 (ENSGACG00000003898)	ENSGACG00000003870	SV2A (ENSGACG00000003844)	sf3b4 (ENSGACG00000003819)	LIX1L (ENSGACG00000003809)	ENSGACG00000003808	pabpc1b (ENSGACG00000003771)	ENSGACG00000003700	grhl2b (ENSGACG00000003695)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408.f	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	2	SCRT1 (ENSCGOG00000014105)	KLHL10 (ENSCGOG00000014089)	zgc:63863 (ENSCGOG00000014085)	dgat1a (ENSCGOG00000013924)	cfap20 (ENSCGOG00000013912)	GPR20 (ENSCGOG00000013911)	SLC45A4 (ENSCGOG00000013897)	DENND3 (ENSCGOG00000013831)	PTK2 (ENSCGOG00000011000)	rplp1 (ENSCGOG00000010946)	clptm1l (ENSCGOG00000010577)	ENSCGOG00000010558	trps1 (ENSCGOG00000010550)	ENSCGOG00000010544	CSMD3 (ENSCGOG00000010256)	tshz1 (ENSCGOG00000010240) ##22	RXFP4 (ENSCGOG00000010238)	SYNGAP1 (ENSCGOG00000009649)	vps72a (ENSCGOG00000009632)	lingo4a (ENSCGOG00000009630)	ctss1 (ENSCGOG00000009468)	ENSCGOG00000009104	SV2A (ENSCGOG00000008440)	sf3b4 (ENSCGOG00000008421)	LIX1L (ENSCGOG00000008411)	ENSCGOG00000008408	pabpc1b (ENSCGOG00000006771)	ENSCGOG00000006707	znf706 (ENSCGOG00000006695)	grhl2b (ENSCGOG00000006665)	ncaldb (ENSCGOG00000006636)
Pike perch	MODERN SPECIES	13	ENSSLUG00000000632	SCRT1 (ENSSLUG00000000637)	KLHL10 (ENSSLUG00000000646)	zgc:63863 (ENSSLUG00000000669)	dgat1a (ENSSLUG00000000703)	cfap20 (ENSSLUG00000000762)	ENSSLUG00000000766	SLC45A4 (ENSSLUG00000000775)	DENND3 (ENSSLUG00000000799)	PTK2 (ENSSLUG00000000917)	rplp1 (ENSSLUG00000001213)	clptm1l (ENSSLUG00000001221)	ENSSLUG00000001237	trps1 (ENSSLUG00000001242)	CSMD3 (ENSSLUG00000001279)	tshz1 (ENSSLUG00000001373) ##22	ENSSLUG00000001375	ENSSLUG00000001380	SYNGAP1 (ENSSLUG00000001383)	vps72a (ENSSLUG00000001392)	lingo4a (ENSSLUG00000001395)	ctss1 (ENSSLUG00000001398)	ENSSLUG00000001399	SV2A (ENSSLUG00000001407)	sf3b4 (ENSSLUG00000001425)	LIX1L (ENSSLUG00000001427)	ENSSLUG00000001430	pabpc1b (ENSSLUG00000001464)	ENSSLUG00000001565	znf706 (ENSSLUG00000001578)	grhl2b (ENSSLUG00000001600)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
Climbing perch	MODERN SPECIES	2	ENSATEG00000011645	ENSATEG00000011660	ENSATEG00000026499	zgc:63863 (ENSATEG00000011715)	dgat1a (ENSATEG00000011833)	ENSATEG00000026031	cfap20 (ENSATEG00000030112)	ENSATEG00000011899	ENSATEG00000011943	DENND3 (ENSATEG00000012018)	ENSATEG00000012064	ENSATEG00000012174	clptm1l (ENSATEG00000012184)	ENSATEG00000012244	ENSATEG00000012278	ENSATEG00000012508 ##22	ENSATEG00000012526	ENSATEG00000012551	ENSATEG00000012560	ENSATEG00000028699	ENSATEG00000012771	ENSATEG00000012784	ENSATEG00000012795	ENSATEG00000012844	ENSATEG00000012853	ENSATEG00000027797	pabpc1b (ENSATEG00000012917)	ENSATEG00000012968	znf706 (ENSATEG00000012982)	grhl2b (ENSATEG00000012994)	ncaldb (ENSATEG00000013046)
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Zig-zag eel	MODERN SPECIES	2	slc39a4 (ENSMAMG00000015561)	ENSMAMG00000015541	ENSMAMG00000015514	zgc:63863 (ENSMAMG00000015459)	dgat1a (ENSMAMG00000015394)	cfap20 (ENSMAMG00000015366)	ENSMAMG00000015327	ENSMAMG00000015281	ENSMAMG00000015260	ENSMAMG00000015199	ENSMAMG00000015182	clptm1l (ENSMAMG00000015115)	ENSMAMG00000015100	ENSMAMG00000026702	ENSMAMG00000014951	ENSMAMG00000014926 ##22	ENSMAMG00000025372	ENSMAMG00000014910	ENSMAMG00000014773	ENSMAMG00000014737	ENSMAMG00000014730	ENSMAMG00000014698	ENSMAMG00000014692	ENSMAMG00000014681	ENSMAMG00000027440	pabpc1b (ENSMAMG00000014610)	ENSMAMG00000027637	znf706 (ENSMAMG00000024516)	grhl2b (ENSMAMG00000014479)	ncaldb (ENSMAMG00000014464)	psmg2 (ENSMAMG00000014455)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156500	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Turbot	MODERN SPECIES	14	ENSSMAG00000004943	ENSSMAG00000004982	ENSSMAG00000005002	ENSSMAG00000005041	zgc:63863 (ENSSMAG00000005137)	ENSSMAG00000026994	dgat1a (ENSSMAG00000005178)	cfap20 (ENSSMAG00000031899)	ENSSMAG00000005278	ENSSMAG00000005307	DENND3 (ENSSMAG00000005636)	ENSSMAG00000005698	ENSSMAG00000005950	ENSSMAG00000006061	ENSSMAG00000006107	ENSSMAG00000024835 ##22	ENSSMAG00000006560	ENSSMAG00000006570	ENSSMAG00000006587	ENSSMAG00000006697	ENSSMAG00000006726	ENSSMAG00000006733	ENSSMAG00000006780	ENSSMAG00000006796	ENSSMAG00000006837	ENSSMAG00000006846	ENSSMAG00000037593	pabpc1b (ENSSMAG00000006869)	ywhaz (ENSSMAG00000006925)	znf706 (ENSSMAG00000022468)	grhl2b (ENSSMAG00000006955)
Tongue sole	MODERN SPECIES	9	zgc:85777 (ENSCSEG00000012715)	bet1 (ENSCSEG00000012731)	col1a2 (ENSCSEG00000012737)	ENSCSEG00000012762	ENSCSEG00000012778	ENSCSEG00000012783	ENSCSEG00000012791	ENSCSEG00000012798	ndufv1 (ENSCSEG00000012805)	PTK2 (ENSCSEG00000012851)	rplp1 (ENSCSEG00000012994)	clptm1l (ENSCSEG00000013040)	ENSCSEG00000013063	trps1 (ENSCSEG00000013076)	CSMD3 (ENSCSEG00000013095)	tshz1 (ENSCSEG00000013167) ##22	znf516 (ENSCSEG00000013170)	ENSCSEG00000013177	SYNGAP1 (ENSCSEG00000013184)	ENSCSEG00000013225	FAM135B (ENSCSEG00000013367)	KHDRBS3 (ENSCSEG00000013385)	ST3GAL1 (ENSCSEG00000013408)	ENSCSEG00000013425	ENSCSEG00000013448	cpsf1 (ENSCSEG00000013464)	adck5 (ENSCSEG00000013550)	ctdp1 (ENSCSEG00000013570)	ENSCSEG00000013582	SLC66A2 (ENSCSEG00000013596)	hpcal4 (ENSCSEG00000013607)
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.e.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT00940000153773.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a
Barramundi perch	MODERN SPECIES	225										PTK2 (ENSLCAG00010013097)	rplp1 (ENSLCAG00010012922)	clptm1l (ENSLCAG00010012899)	ENSLCAG00010012889	trps1 (ENSLCAG00010012884)	CSMD3 (ENSLCAG00010012715)	tshz1 (ENSLCAG00010012647) ##22	ENSLCAG00010012643	ENSLCAG00010012640
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.b.e.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Greater amberjack	MODERN SPECIES	48	SCRT1 (ENSSDUG00000013215)	KLHL10 (ENSSDUG00000013192)	ENSSDUG00000013189	zgc:63863 (ENSSDUG00000013176)	dgat1a (ENSSDUG00000013146)	cfap20 (ENSSDUG00000013130)	GPR20 (ENSSDUG00000013098)	SLC45A4 (ENSSDUG00000013026)	DENND3 (ENSSDUG00000012929)	PTK2 (ENSSDUG00000012750)	rplp1 (ENSSDUG00000012713)	clptm1l (ENSSDUG00000012627)	trps1 (ENSSDUG00000012576)	ENSSDUG00000012561	CSMD3 (ENSSDUG00000012391)	tshz1 (ENSSDUG00000012354) ##22	znf516 (ENSSDUG00000012341)	ENSSDUG00000012328	SYNGAP1 (ENSSDUG00000012218)	vps72a (ENSSDUG00000012188)	lingo4a (ENSSDUG00000012181)	ctss1 (ENSSDUG00000012145)	ENSSDUG00000012123	SV2A (ENSSDUG00000012082)	sf3b4 (ENSSDUG00000012064)	LIX1L (ENSSDUG00000012053)	ENSSDUG00000012027	pabpc1b (ENSSDUG00000011965)	ENSSDUG00000011944	znf706 (ENSSDUG00000011931)	grhl2b (ENSSDUG00000011854)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2954		ENSSLDG00000011044	zgc:63863 (ENSSLDG00000011075)	dgat1a (ENSSLDG00000011104)	cfap20 (ENSSLDG00000011143)	ENSSLDG00000011180	SLC45A4 (ENSSLDG00000011250)	DENND3 (ENSSLDG00000011375)	PTK2 (ENSSLDG00000011667)	rplp1 (ENSSLDG00000011985)	clptm1l (ENSSLDG00000012012)	trps1 (ENSSLDG00000012102)	ENSSLDG00000012131	CSMD3 (ENSSLDG00000012173)	ENSSLDG00000012325	tshz1 (ENSSLDG00000012345) ##22
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010	ENSGT00940000162740.k.a	ENSGT00390000018415
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	2	ENSKMAG00000009537	ENSKMAG00000009503	ENSKMAG00000009489	KLHL10 (ENSKMAG00000009467)	zgc:63863 (ENSKMAG00000009431)	dgat1a (ENSKMAG00000009340)	cfap20 (ENSKMAG00000009297)	cfap20 (ENSKMAG00000009263)	SLC45A4 (ENSKMAG00000009242)	DENND3 (ENSKMAG00000009201)	PTK2 (ENSKMAG00000009027)	rplp1 (ENSKMAG00000008998)	clptm1l (ENSKMAG00000008913)	trps1 (ENSKMAG00000008869)	CSMD3 (ENSKMAG00000008620)	tshz1 (ENSKMAG00000008580) ##22	ENSKMAG00000008571	SYNGAP1 (ENSKMAG00000008440)	vps72a (ENSKMAG00000008394)	lingo4a (ENSKMAG00000008371)	ENSKMAG00000008316	ctss1 (ENSKMAG00000008257)	SV2A (ENSKMAG00000008186)	sf3b4 (ENSKMAG00000008154)	LIX1L (ENSKMAG00000008131)	pabpc1b (ENSKMAG00000008049)	ENSKMAG00000008021	znf706 (ENSKMAG00000007997)	grhl2b (ENSKMAG00000007969)	ncaldb (ENSKMAG00000007945)	zgc:136493 (ENSKMAG00000007903)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1628	ATXN1A (ENSNFUG00015015205)	gmpr (ENSNFUG00015015124)	mylipa (ENSNFUG00015015095)	ENSNFUG00015014962	ENSNFUG00015014951	Nfu_g_1_004094 (ENSNFUG00015014942)	dtnbp1b (ENSNFUG00015014904)	JARID2B (ENSNFUG00015014860)	ENSNFUG00015014847	pard6gb (ENSNFUG00015014835)	BLOC1S4 (ENSNFUG00015014786)	BX927253.1 (ENSNFUG00015014780)	rrm2b (ENSNFUG00015013825)	MTDHA (ENSNFUG00015013757)	LAPTM4B (ENSNFUG00015013727)	tshz1 (ENSNFUG00015013716) ##22	ENSNFUG00015013713	ZNF516 (ENSNFUG00015013698)	ENSNFUG00015013682	SYNGAP1 (ENSNFUG00015013549)	SV2A (ENSNFUG00015013426)	SF3B4 (ENSNFUG00015013419)	LIX1L (ENSNFUG00015013407)	pabpc1b (ENSNFUG00015013150)	Nfu_g_1_004152 (ENSNFUG00015013123)	ZNF706 (ENSNFUG00015013116)	grhl2b (ENSNFUG00015013084)	ncaldb (ENSNFUG00015013071)	Nfu_g_1_004162 (ENSNFUG00015013065)	ENSNFUG00015013058	ENSNFUG00015013053
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156500.i	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156500.i	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156500.i	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	277															ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000171019	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
Amazon molly	DUPLICATION
Amazon molly	MODERN SPECIES	536															CSMD3 (ENSPFOG00000002171)	tshz1 (ENSPFOG00000021989) ##22	tshz1 (ENSPFOG00000004940) ##22	ENSPFOG00000021970	ENSPFOG00000004994	ENSPFOG00000020351	SYNGAP1 (ENSPFOG00000005041)	vps72a (ENSPFOG00000005541)	lingo4a (ENSPFOG00000020352)	ctss1 (ENSPFOG00000005583)	ENSPFOG00000021838	SV2A (ENSPFOG00000005638)	sf3b4 (ENSPFOG00000005754)	LIX1L (ENSPFOG00000005818)	ENSPFOG00000005894	pabpc1b (ENSPFOG00000005917)	ENSPFOG00000006021
Amazon molly	MODERN SPECIES	536														CSMD3 (ENSPFOG00000002171)	tshz1 (ENSPFOG00000021989) ##22	tshz1 (ENSPFOG00000004940) ##22	ENSPFOG00000021970	ENSPFOG00000004994	ENSPFOG00000020351	SYNGAP1 (ENSPFOG00000005041)	vps72a (ENSPFOG00000005541)	lingo4a (ENSPFOG00000020352)	ctss1 (ENSPFOG00000005583)	ENSPFOG00000021838	SV2A (ENSPFOG00000005638)	sf3b4 (ENSPFOG00000005754)	LIX1L (ENSPFOG00000005818)	ENSPFOG00000005894	pabpc1b (ENSPFOG00000005917)	ENSPFOG00000006021	znf706 (ENSPFOG00000006058)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	130															CSMD3 (ENSPLAG00000000649)	tshz1 (ENSPLAG00000010333) ##22
Guppy	MODERN SPECIES	441	ENSPREG00000012196	slc39a4 (ENSPREG00000012173)	ENSPREG00000012166	ENSPREG00000012153	zgc:63863 (ENSPREG00000012136)	dgat1a (ENSPREG00000012064)	cfap20 (ENSPREG00000012033)	ENSPREG00000012010	SLC45A4 (ENSPREG00000011989)	DENND3 (ENSPREG00000011896)	PTK2 (ENSPREG00000011683)	rplp1 (ENSPREG00000011579)	clptm1l (ENSPREG00000011507)	trps1 (ENSPREG00000011468)	CSMD3 (ENSPREG00000011344)	tshz1 (ENSPREG00000011305) ##22	znf516 (ENSPREG00000011296)	ENSPREG00000011286	SYNGAP1 (ENSPREG00000011216)	vps72a (ENSPREG00000011189)	lingo4a (ENSPREG00000011184)	ctss1 (ENSPREG00000011168)	SV2A (ENSPREG00000011109)	sf3b4 (ENSPREG00000011076)	lix1l (ENSPREG00000011018)	ENSPREG00000010984	pabpc1b (ENSPREG00000010911)	ENSPREG00000009309	znf706 (ENSPREG00000009035)	grhl2b (ENSPREG00000008946)	ncaldb (ENSPREG00000008920)
Platyfish	MODERN SPECIES	4	cndp2 (ENSXMAG00000015266)	ENSXMAG00000015315	ENSXMAG00000015339	SCRT1 (ENSXMAG00000015353)	zgc:63863 (ENSXMAG00000015355)	dgat1a (ENSXMAG00000015366)	cfap20 (ENSXMAG00000015399)	GPR20 (ENSXMAG00000015403)	SLC45A4 (ENSXMAG00000015412)	DENND3 (ENSXMAG00000015472)	PTK2 (ENSXMAG00000015476)	rplp1 (ENSXMAG00000015532)	clptm1l (ENSXMAG00000015553)	trps1 (ENSXMAG00000015559)	CSMD3 (ENSXMAG00000015566)	tshz1 (ENSXMAG00000023230) ##22	znf516 (ENSXMAG00000028251)	ENSXMAG00000015639	SYNGAP1 (ENSXMAG00000003807)	vps72a (ENSXMAG00000003802)	lingo4a (ENSXMAG00000020336)	ctss1 (ENSXMAG00000003801)	ENSXMAG00000003793	SV2A (ENSXMAG00000003782)	sf3b4 (ENSXMAG00000003772)	LIX1L (ENSXMAG00000003769)	ENSXMAG00000003767	pabpc1b (ENSXMAG00000003753)	znf706 (ENSXMAG00000027213)	grhl2b (ENSXMAG00000003725)	ncaldb (ENSXMAG00000003721)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000156500.i	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Mummichog	MODERN SPECIES	2348	RECQL4 (ENSFHEG00000009855)	slc39a4 (ENSFHEG00000009832)	SCRT1 (ENSFHEG00000009794)	zgc:63863 (ENSFHEG00000009773)	dgat1a (ENSFHEG00000009713)	cfap20 (ENSFHEG00000009610)	GPR20 (ENSFHEG00000009588)	SLC45A4 (ENSFHEG00000009569)	ENSFHEG00000009492	DENND3 (ENSFHEG00000000219)	PTK2 (ENSFHEG00000009427)	rplp1 (ENSFHEG00000008862)	clptm1l (ENSFHEG00000008826)	trps1 (ENSFHEG00000008678)	CSMD3 (ENSFHEG00000008655)	tshz1 (ENSFHEG00000008423) ##22	znf516 (ENSFHEG00000008408)	ENSFHEG00000008394	ENSFHEG00000008377	vps72a (ENSFHEG00000008307)	ENSFHEG00000008289	ctss1 (ENSFHEG00000008270)	ENSFHEG00000008248	SV2A (ENSFHEG00000008239)	sf3b4 (ENSFHEG00000008211)	ENSFHEG00000008168	pabpc1b (ENSFHEG00000008186)	ENSFHEG00000008156	znf706 (ENSFHEG00000008123)	ENSFHEG00000008103	grhl2b (ENSFHEG00000008089)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	328															CSMD3 (ENSCVAG00000006492)	tshz1 (ENSCVAG00000006346) ##22	znf516 (ENSCVAG00000006343)	ENSCVAG00000006336	SYNGAP1 (ENSCVAG00000006316)	vps72a (ENSCVAG00000006086)	lingo4a (ENSCVAG00000006067)	ctss1 (ENSCVAG00000006060)	ENSCVAG00000000173	SV2A (ENSCVAG00000005585)	sf3b4 (ENSCVAG00000005536)	LIX1L (ENSCVAG00000005525)	pabpc1b (ENSCVAG00000005489)	ywhaz (ENSCVAG00000000656)	znf706 (ENSCVAG00000005445)	grhl2b (ENSCVAG00000005426)	ncaldb (ENSCVAG00000005331)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00910000145033	ENSGT00950000182872.f.a.b.p	ENSGT00940000158587.c.b	ENSGT00940000159104.c	ENSGT00450000040303	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00390000000916	ENSGT00940000155783	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000163607	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000162490	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00910000145033	ENSGT00950000182872.f.a.b.p	ENSGT00940000158587.c.b	ENSGT00940000159104.c	ENSGT00450000040303	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00390000000916	ENSGT00940000155783	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000163607	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000162490	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
Indian medaka	MODERN SPECIES	3	ndrg1a (ENSOMEG00000014944)	ccn4a (ENSOMEG00000014866)	sla1a (ENSOMEG00000014832)	abitram (ENSOMEG00000014812)	ctnnal1 (ENSOMEG00000000371)	elp2 (ENSOMEG00000014718)	gabbr2 (ENSOMEG00000014632)	GALNT12 (ENSOMEG00000014573)	poc1bl (ENSOMEG00000014547)	si:dkey-184p18.2 (ENSOMEG00000014504)	rp9 (ENSOMEG00000014485)	elmo1 (ENSOMEG00000014438)	ENSOMEG00000014354	trps1 (ENSOMEG00000014343)	CSMD3 (ENSOMEG00000000942)	tshz1 (ENSOMEG00000014146) ##22	znf516 (ENSOMEG00000014103)	ENSOMEG00000014090	SYNGAP1 (ENSOMEG00000014068)	vps72a (ENSOMEG00000014002)	lingo4a (ENSOMEG00000013969)	ctss1 (ENSOMEG00000013902)	CTSS (ENSOMEG00000013876)	SV2A (ENSOMEG00000013830)	sf3b4 (ENSOMEG00000013694)	LIX1L (ENSOMEG00000013675)	pabpc1b (ENSOMEG00000013627)	ENSOMEG00000013565	znf706 (ENSOMEG00000013549)	grhl2b (ENSOMEG00000013529)	ncaldb (ENSOMEG00000013460)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	2	ccn4a (ENSOJAG00000018038)	sla1a (ENSOJAG00000018042)	abitram (ENSOJAG00000018060)	ctnnal1 (ENSOJAG00000018095)	elp2 (ENSOJAG00000018476)	gabbr2 (ENSOJAG00000019179)	GALNT12 (ENSOJAG00000019283)	poc1bl (ENSOJAG00000019375)	si:dkey-184p18.2 (ENSOJAG00000019477)	rp9 (ENSOJAG00000019487)	elmo1 (ENSOJAG00000019568)	trps1 (ENSOJAG00000019935)	ENSOJAG00000019946	ENSOJAG00000019972	CSMD3 (ENSOJAG00000020226)	tshz1 (ENSOJAG00000021736) ##22	znf516 (ENSOJAG00000021746)	ENSOJAG00000021754	SYNGAP1 (ENSOJAG00000021762)	vps72a (ENSOJAG00000021799)	lingo4a (ENSOJAG00000021809)	ctss1 (ENSOJAG00000021818)	SV2A (ENSOJAG00000021863)	sf3b4 (ENSOJAG00000022079)	LIX1L (ENSOJAG00000022091)	pabpc1b (ENSOJAG00000022120)	ENSOJAG00000022218	znf706 (ENSOJAG00000022227)	grhl2b (ENSOJAG00000022240)	ncaldb (ENSOJAG00000022273)	zgc:136493 (ENSOJAG00000022293)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00910000145033	ENSGT00950000182872.f.a.b.p	ENSGT00940000158587.c.b	ENSGT00940000159104.c	ENSGT00450000040303	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00390000000916	ENSGT00940000155783	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000163607	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000162490	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	2	ccn4a (ENSORLG00000003512)	abitram (ENSORLG00000003464)	ctnnal1 (ENSORLG00000003458)	ENSORLG00000022828	ENSORLG00000025712	elp2 (ENSORLG00000003446)	gabbr2 (ENSORLG00000003422)	GALNT12 (ENSORLG00000003408)	poc1bl (ENSORLG00000003394)	si:dkey-184p18.2 (ENSORLG00000026365)	rp9 (ENSORLG00000003381)	elmo1 (ENSORLG00000003371)	ENSORLG00000023853	trps1 (ENSORLG00000003272)	CSMD3 (ENSORLG00000003251)	ENSORLG00000003228 ##22	znf516 (ENSORLG00000023821)	ENSORLG00000003213	ENSORLG00000003202	vps72a (ENSORLG00000003174)	ENSORLG00000026314	ENSORLG00000003156	ctss1 (ENSORLG00000029787)	ctss (ENSORLG00000003145)	ENSORLG00000003092	sf3b4 (ENSORLG00000003062)	LIX1L (ENSORLG00000003036)	ENSORLG00000022703	pabpc1b (ENSORLG00000003008)	ENSORLG00000027312	znf706 (ENSORLG00000002918)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	46															CSMD3 (ENSOSIG00000019404)	tshz1 (ENSOSIG00000019215) ##22	ENSOSIG00000019213	ENSOSIG00000019209	SYNGAP1 (ENSOSIG00000019202)	vps72a (ENSOSIG00000019189)	lingo4a (ENSOSIG00000019186)	CTSS (ENSOSIG00000019185)	SV2A (ENSOSIG00000019085)	sf3b4 (ENSOSIG00000019059)	LIX1L (ENSOSIG00000019055)	ctss1 (ENSOSIG00000019050)	pabpc1b (ENSOSIG00000017137)	ENSOSIG00000017089	znf706 (ENSOSIG00000017086)	grhl2b (ENSOSIG00000016903)	ncaldb (ENSOSIG00000016888)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c.e	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c.e	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c.e	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	288											PTK2 (ENSHBUG00000023488)	rplp1 (ENSHBUG00000023496)	clptm1l (ENSHBUG00000023587)	trps1 (ENSHBUG00000023601)	CSMD3 (ENSHBUG00000023828)	tshz1 (ENSHBUG00000023837) ##22	znf516 (ENSHBUG00000001908)	ENSHBUG00000001913	ENSHBUG00000001931	vps72a (ENSHBUG00000001951)	lingo4a (ENSHBUG00000001961)	ENSHBUG00000001976	ENSHBUG00000001992	SV2A (ENSHBUG00000002013)	sf3b4 (ENSHBUG00000002028)	LIX1L (ENSHBUG00000000954)	ENSHBUG00000002044	pabpc1b (ENSHBUG00000002075)	ENSHBUG00000002099	znf706 (ENSHBUG00000002106)	grhl2b (ENSHBUG00000002143)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c.e.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160387	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c.e.c.a.a	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260040.b.b.a.c.a	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l	ENSGT00940000163010
Eastern happy	MODERN SPECIES	13	SCRT1 (ENSACLG00000012046)	KLHL10 (ENSACLG00000012065)	KLHL10 (ENSACLG00000012119)	zgc:63863 (ENSACLG00000012165)	dgat1a (ENSACLG00000012220)	cfap20 (ENSACLG00000012271)	ENSACLG00000012293	SLC45A4 (ENSACLG00000012397)	DENND3 (ENSACLG00000012420)	PTK2 (ENSACLG00000012512)	rplp1 (ENSACLG00000012690)	clptm1l (ENSACLG00000012698)	trps1 (ENSACLG00000013131)	ENSACLG00000013155	CSMD3 (ENSACLG00000013677)	tshz1 (ENSACLG00000013882) ##22	znf516 (ENSACLG00000013902)	ENSACLG00000013930	SYNGAP1 (ENSACLG00000013965)	vps72a (ENSACLG00000014023)	ctss1 (ENSACLG00000014073)	lingo4a (ENSACLG00000014091)	ENSACLG00000014098	SV2A (ENSACLG00000014186)	sf3b4 (ENSACLG00000014260)	LIX1L (ENSACLG00000014271)	ENSACLG00000014302	pabpc1b (ENSACLG00000014335)	ENSACLG00000014375	znf706 (ENSACLG00000014423)	grhl2b (ENSACLG00000014447)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1104	ENSMZEG00005026701	ENSMZEG00005026702	KLHL10 (ENSMZEG00005026703)	KLHL10 (ENSMZEG00005026704)	zgc:63863 (ENSMZEG00005026705)	dgat1a (ENSMZEG00005026706)	cfap20 (ENSMZEG00005026708)	ENSMZEG00005026709	SLC45A4 (ENSMZEG00005026711)	DENND3 (ENSMZEG00005026714)	PTK2 (ENSMZEG00005026719)	rplp1 (ENSMZEG00005026720)	clptm1l (ENSMZEG00005026722)	trps1 (ENSMZEG00005026723)	CSMD3 (ENSMZEG00005026724)	tshz1 (ENSMZEG00005026725) ##22	ENSMZEG00005026726	znf516 (ENSMZEG00005026727)	ENSMZEG00005026728	ENSMZEG00005026729	vps72a (ENSMZEG00005026730)	lingo4a (ENSMZEG00005026731)	ENSMZEG00005026732	ENSMZEG00005026735	SV2A (ENSMZEG00005026738)	sf3b4 (ENSMZEG00005026741)	LIX1L (ENSMZEG00005026743)	ENSMZEG00005026746	pabpc1b (ENSMZEG00005026745)	ENSMZEG00005026749	znf706 (ENSMZEG00005002874)
P. nyererei	MODERN SPECIES	323							ENSPNYG00000013308	ENSPNYG00000013293	ENSPNYG00000013275	ENSPNYG00000013260	rplp1 (ENSPNYG00000013249)	clptm1l (ENSPNYG00000013208)	ENSPNYG00000013173	ENSPNYG00000013159	CSMD3 (ENSPNYG00000013030)	tshz1 (ENSPNYG00000012989) ##22	znf516 (ENSPNYG00000012972)	ENSPNYG00000012965	SYNGAP1 (ENSPNYG00000012872)	vps72a (ENSPNYG00000012841)	ENSPNYG00000012824	ENSPNYG00000012786	ENSPNYG00000012762	SV2A (ENSPNYG00000012723)	sf3b4 (ENSPNYG00000012700)	LIX1L (ENSPNYG00000012677)	ENSPNYG00000012653	pabpc1b (ENSPNYG00000012578)	ENSPNYG00000012548	znf706 (ENSPNYG00000012537)	grhl2b (ENSPNYG00000012499)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	302	KLHL10 (ENSNBRG00000014863)	zgc:63863 (ENSNBRG00000014838)	dgat1a (ENSNBRG00000014736)	cfap20 (ENSNBRG00000014678)	GPR20 (ENSNBRG00000014662)	SLC45A4 (ENSNBRG00000014628)	ENSNBRG00000014566	ENSNBRG00000014525	ENSNBRG00000014497	ENSNBRG00000014483	ENSNBRG00000014464	rplp1 (ENSNBRG00000014452)	clptm1l (ENSNBRG00000014408)	trps1 (ENSNBRG00000014352)	CSMD3 (ENSNBRG00000014186)	tshz1 (ENSNBRG00000014165) ##22	znf516 (ENSNBRG00000014157)	ENSNBRG00000014140	SYNGAP1 (ENSNBRG00000014033)	vps72a (ENSNBRG00000014002)	lingo4a (ENSNBRG00000013990)	ENSNBRG00000013953	ENSNBRG00000013925	SV2A (ENSNBRG00000013892)	sf3b4 (ENSNBRG00000013865)	LIX1L (ENSNBRG00000013844)	ENSNBRG00000013830	pabpc1b (ENSNBRG00000013737)	ENSNBRG00000013700	znf706 (ENSNBRG00000013690)	grhl2b (ENSNBRG00000013652)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	13	ENSONIG00000037409	ENSONIG00000042862	ENSONIG00000030309	ENSONIG00000038713	zgc:63863 (ENSONIG00000002857)	dgat1a (ENSONIG00000002849)	cfap20 (ENSONIG00000002845)	GPR20 (ENSONIG00000037263)	SLC45A4 (ENSONIG00000002838)	DENND3 (ENSONIG00000002833)	PTK2 (ENSONIG00000002815)	rplp1 (ENSONIG00000002814)	clptm1l (ENSONIG00000002800)	trps1 (ENSONIG00000038056)	CSMD3 (ENSONIG00000002776)	tshz1 (ENSONIG00000002775) ##22	znf516 (ENSONIG00000030464)	ENSONIG00000020851	SYNGAP1 (ENSONIG00000002773)	ENSONIG00000002770	vps72a (ENSONIG00000002771)	lingo4a (ENSONIG00000020850)	ENSONIG00000002754	SV2A (ENSONIG00000002737)	sf3b4 (ENSONIG00000002730)	LIX1L (ENSONIG00000002728)	ENSONIG00000038825	pabpc1b (ENSONIG00000002717)	ENSONIG00000002711	znf706 (ENSONIG00000040105)	grhl2b (ENSONIG00000002710)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1307									PTK2 (ENSACIG00000018814)	ENSACIG00000018806	clptm1l (ENSACIG00000018782)	trps1 (ENSACIG00000018741)	ENSACIG00000018731	ENSACIG00000018718	CSMD3 (ENSACIG00000018627)	tshz1 (ENSACIG00000018602) ##22	ENSACIG00000018594	SYNGAP1 (ENSACIG00000018557)	vps72a (ENSACIG00000018543)	lingo4a (ENSACIG00000018535)	ENSACIG00000018515	ENSACIG00000018495	SV2A (ENSACIG00000018471)	sf3b4 (ENSACIG00000018455)	LIX1L (ENSACIG00000018419)	ENSACIG00000018405	pabpc1b (ENSACIG00000018366)	ENSACIG00000016755	ENSACIG00000016669	grhl2b (ENSACIG00000016643)	ncaldb (ENSACIG00000016629)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160042	ENSGT00730000112601	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22	ENSGT00940000161408	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l.d
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	99	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c.j	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554.r	ENSGT00390000004554.q	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	186	ENSGT00940000160042	ENSGT00940000154491.c.b.b	ENSGT00940000154664.h.n.c.j	ENSGT00390000014944.b	ENSGT00950000183081.b.i.b	ENSGT00390000004554.r	ENSGT00390000004554.q	ENSGT01040000240444.B.a	ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b	ENSGT00940000155784.C.u.b	ENSGT00940000155113.a.a	ENSGT00550000074698	ENSGT00530000063461.A.b	ENSGT00940000157893	ENSGT00940000155549.a.a.b	ENSGT00950000183051.a.a.a ##22
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1401																tshz1 (ENSAOCG00000014351) ##22	ENSAOCG00000014345	ENSAOCG00000014336
Orange clownfish	MODERN SPECIES	8	ENSAPEG00000005691	SCRT1 (ENSAPEG00000005677)	KLHL10 (ENSAPEG00000005598)	zgc:63863 (ENSAPEG00000005579)	dgat1a (ENSAPEG00000005517)	cfap20 (ENSAPEG00000005503)	cfap20 (ENSAPEG00000005472)	GPR20 (ENSAPEG00000005428)	SLC45A4 (ENSAPEG00000005346)	DENND3 (ENSAPEG00000005252)	PTK2 (ENSAPEG00000005023)	rplp1 (ENSAPEG00000004985)	clptm1l (ENSAPEG00000004913)	trps1 (ENSAPEG00000004813)	CSMD3 (ENSAPEG00000004568)	tshz1 (ENSAPEG00000004494) ##22	ENSAPEG00000004484	ENSAPEG00000004472	ENSAPEG00000004455	ddah2 (ENSAPEG00000004429)	ENSAPEG00000004411	clic1 (ENSAPEG00000004376)	ENSAPEG00000004363	ENSAPEG00000004344	CSNK2B (ENSAPEG00000004320)	prrc2a (ENSAPEG00000004231)	neu1 (ENSAPEG00000004181)	ENSAPEG00000004163	ENSAPEG00000004098	ENSAPEG00000004059	VPS52 (ENSAPEG00000003975)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	3														trps1 (ENSAPOG00000016785)	CSMD3 (ENSAPOG00000017193)	tshz1 (ENSAPOG00000017234) ##22	ENSAPOG00000017243	ENSAPOG00000017254	SYNGAP1 (ENSAPOG00000017311)	vps72a (ENSAPOG00000017347)	lingo4a (ENSAPOG00000017358)	ENSAPOG00000017388	CTSS (ENSAPOG00000017560)	SV2A (ENSAPOG00000017639)	sf3b4 (ENSAPOG00000017647)	LIX1L (ENSAPOG00000000475)	ENSAPOG00000017690	pabpc1b (ENSAPOG00000017776)	ENSAPOG00000017801	znf706 (ENSAPOG00000017809)	grhl2b (ENSAPOG00000017933)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	554															ENSSPAG00000013012	tshz1 (ENSSPAG00000013148) ##22	ENSSPAG00000013157	ENSSPAG00000013165
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	99	MTERF1 (ENSHCOG00000016064)	ENSHCOG00000016056	cyp51 (ENSHCOG00000015902)	krit1 (ENSHCOG00000015896)	rpz2 (ENSHCOG00000000442)	si:dkey-266f7.9 (ENSHCOG00000015848)	PTK2 (ENSHCOG00000015835)	rplp1 (ENSHCOG00000015713)	clptm1l (ENSHCOG00000015698)	trps1 (ENSHCOG00000015687)	ENSHCOG00000015654	ENSHCOG00000015638	ENSHCOG00000015631	ENSHCOG00000015615	ENSHCOG00000015574	tshz1 (ENSHCOG00000015516) ##22	DNAH17 (ENSHCOG00000015509)	ENSHCOG00000015351	ENSHCOG00000015339	ENSHCOG00000015331	maff (ENSHCOG00000000426)	tomm22 (ENSHCOG00000015307)	gspt1 (ENSHCOG00000015286)	ENSHCOG00000015212	rsl1d1 (ENSHCOG00000015208)	ENSHCOG00000015202	ENSHCOG00000015190	SNX29 (ENSHCOG00000015178)	shisa9a (ENSHCOG00000015148)	cpped1 (ENSHCOG00000015134)	ercc4 (ENSHCOG00000015123)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	2	ENSMMDG00005002398	cndp2 (ENSMMDG00005002406)	RECQL4 (ENSMMDG00005002687)	ENSMMDG00005002714	SCRT1 (ENSMMDG00005002733)	zgc:63863 (ENSMMDG00005002744)	dgat1a (ENSMMDG00005002759)	cfap20 (ENSMMDG00005002784)	SLC45A4 (ENSMMDG00005002814)	DENND3 (ENSMMDG00005002895)	PTK2 (ENSMMDG00005003089)	rplp1 (ENSMMDG00005003107)	clptm1l (ENSMMDG00005003160)	trps1 (ENSMMDG00005003403)	CSMD3 (ENSMMDG00005003424)	tshz1 (ENSMMDG00005004041) ##22	znf516 (ENSMMDG00005004049)	ENSMMDG00005004053	SYNGAP1 (ENSMMDG00005004075)	vps72a (ENSMMDG00005004101)	lingo4a (ENSMMDG00005004108)	ctss1 (ENSMMDG00005004164)	ENSMMDG00005005316	SV2A (ENSMMDG00005005325)	sf3b4 (ENSMMDG00005005330)	LIX1L (ENSMMDG00005005334)	ENSMMDG00005005345	pabpc1b (ENSMMDG00005005388)	ENSMMDG00005005557	znf706 (ENSMMDG00005005559)	grhl2b (ENSMMDG00005005562)
Cod	MODERN SPECIES	14	ENSGMOG00000001340	ENSGMOG00000029940	ENSGMOG00000013833	zgc:63863 (ENSGMOG00000009822)	ENSGMOG00000036473	dgat1a (ENSGMOG00000016836)	cfap20 (ENSGMOG00000016832)	ENSGMOG00000029829	ENSGMOG00000034931	ENSGMOG00000016795	ENSGMOG00000022786	ENSGMOG00000031213	ENSGMOG00000003124	ENSGMOG00000007072	ENSGMOG00000002786	ENSGMOG00000029802 ##22	ENSGMOG00000035253	ENSGMOG00000023748	ENSGMOG00000002665	ENSGMOG00000002645	ENSGMOG00000002639	ENSGMOG00000002589	ENSGMOG00000002565	ENSGMOG00000002532	ENSGMOG00000002519	ENSGMOG00000002496	ENSGMOG00000031648	pabpc1b (ENSGMOG00000002448)	ENSGMOG00000002411	znf706 (ENSGMOG00000026726)	grhl2b (ENSGMOG00000002368)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	112					ENSGT00940000166857	ENSGT00940000166686	ENSGT00940000153979.B	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000167743	ENSGT00510000051337	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.k	ENSGT00940000159286.b	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616.j.a	ENSGT00390000003774.a.a.c	ENSGT00390000003774.b	ENSGT00400000024940	ENSGT00390000009358	ENSGT00940000162855.a.b
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00730000110871.b	ENSGT00730000110871.a.a.a.a.kb	ENSGT00530000063817.a	ENSGT00940000162584	ENSGT00940000157640.b	ENSGT00940000164984	ENSGT00940000166686	ENSGT00940000153979.B	ENSGT00390000004886	ENSGT00940000167743	ENSGT00510000051337	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839.q	ENSGT00390000014772.k	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a.g	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022	ENSGT00940000159194.c	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	1	ENSPKIG00000014014	ENSPKIG00000014004	ENSPKIG00000013986	ENSPKIG00000013970	fzd1 (ENSPKIG00000013955)	cdk14 (ENSPKIG00000013865)	ENSPKIG00000013764	sri (ENSPKIG00000013737)	snrnp48 (ENSPKIG00000013703)	zgc:113232 (ENSPKIG00000013669)	ENSPKIG00000013645	cndp1 (ENSPKIG00000013619)	CNDP1 (ENSPKIG00000013590)	ENSPKIG00000013574	PTGR3 (ENSPKIG00000013560)	TSHZ1 (ENSPKIG00000013544) ##22	ENSPKIG00000013529	MBP (ENSPKIG00000013514)	GALR1 (ENSPKIG00000013494)	SALL3 (ENSPKIG00000013427)	NFATC1 (ENSPKIG00000013338)	zgc:91890 (ENSPKIG00000013291)	ENSPKIG00000013258	ENSPKIG00000013237	ENSPKIG00000013112	ENSPKIG00000013061	RSPO2 (ENSPKIG00000013040)	EIF3E (ENSPKIG00000012995)	emc2 (ENSPKIG00000012898)	TMEM74 (ENSPKIG00000012866)	TRHR (ENSPKIG00000012858)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	9	fzd1 (ENSSFOG00015006637)	cdk14 (ENSSFOG00015006666)	ENSSFOG00015006659	ENSSFOG00015025415	sri (ENSSFOG00015006626)	snrnp48 (ENSSFOG00015006610)	ENSSFOG00015025635	ENSSFOG00015012383	ENSSFOG00015005344	ENSSFOG00015030055	ENSSFOG00015006058	ENSSFOG00015029778	cndp1 (ENSSFOG00015012480)	CNDP1 (ENSSFOG00015012386)	PTGR3 (ENSSFOG00015027057)	TSHZ1 (ENSSFOG00015012321) ##22	ZNF516 (ENSSFOG00015031454)	ENSSFOG00015028246	ENSSFOG00015032584	GALR1 (ENSSFOG00015027200)	SALL3 (ENSSFOG00015012223)	NFATC1 (ENSSFOG00015012171)	zgc:91890 (ENSSFOG00015012146)	ENSSFOG00015026639	ENSSFOG00015012103	ENSSFOG00015012019	RSPO2 (ENSSFOG00015011936)	eif3ea (ENSSFOG00015030883)	emc2 (ENSSFOG00015011902)	TMEM74 (ENSSFOG00015031673)	TRHR (ENSSFOG00015009715)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	253											ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.b	ENSGT00390000011748.bb	ENSGT00940000160140.a.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	62														ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.b	ENSGT00390000011748.bb	ENSGT00940000160140.a.b	ENSGT01030000234822
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000011734	ENSGT00440000034270.a.b	ENSGT00940000156347.f	ENSGT00650000094921	ENSGT00390000017671.a.b	ENSGT00940000158741	ENSGT00530000063023.B ##20	ENSGT00940000157045.a	ENSGT00940000158728.l	ENSGT00940000166989	ENSGT00940000153704.A.q	ENSGT00940000155141.w.b	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.a	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f.h	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.b
Denticle herring	MODERN SPECIES	15	CSPG5 (ENSDCDG00000023950)	SMARCC1 (ENSDCDG00000023476)	ENSDCDG00000023459	herpud2 (ENSDCDG00000023458)	tbx20 (ENSDCDG00000023455)	dpy19l1l (ENSDCDG00000023182) ##20	SLC4A7 (ENSDCDG00000022260)	eomesb (ENSDCDG00000022207)	cmc1 (ENSDCDG00000022197)	azi2 (ENSDCDG00000022195)	ENSDCDG00000022189	ENSDCDG00000022184	cndp1 (ENSDCDG00000021615)	ZNF407 (ENSDCDG00000021596)	PTGR3 (ENSDCDG00000021594)	TSHZ1 (ENSDCDG00000021593) ##22	ZNF516 (ENSDCDG00000021591)	ZNF236 (ENSDCDG00000021583)	ENSDCDG00000021576	mbpb (ENSDCDG00000021573)	GALR1 (ENSDCDG00000021571)	SALL3 (ENSDCDG00000021569)	NFATC1 (ENSDCDG00000021567)	zgc:91890 (ENSDCDG00000021564)	ENSDCDG00000021563	ENSDCDG00000021560	ENSDCDG00000014905	RSPO2 (ENSDCDG00000014614)	emc2 (ENSDCDG00000014097)	TMEM74 (ENSDCDG00000014041)	TRHR (ENSDCDG00000014029)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	2	KCNV1 (ENSCHAG00000000643)	gbp (ENSCHAG00000000627)	ENSCHAG00000000525	ENSCHAG00000000437	ENSCHAG00000000399	ENSCHAG00000021902	ENSCHAG00000021896	ENSCHAG00000021839	eomesb (ENSCHAG00000021831)	cmc1 (ENSCHAG00000021828)	azi2 (ENSCHAG00000021820)	ENSCHAG00000021816	cndp1 (ENSCHAG00000021458)	ZNF407 (ENSCHAG00000021418)	PTGR3 (ENSCHAG00000021416)	TSHZ1 (ENSCHAG00000021412) ##22	ZNF516 (ENSCHAG00000021407)	ENSCHAG00000021400	ENSCHAG00000021396	ENSCHAG00000021361	SALL3 (ENSCHAG00000021345)	NFATC1 (ENSCHAG00000021304)	zgc:91890 (ENSCHAG00000021297)	ENSCHAG00000021189	ENSCHAG00000021168	ENSCHAG00000020285	RSPO2 (ENSCHAG00000020203)	EIF3E (ENSCHAG00000020027)	emc2 (ENSCHAG00000019872)	TMEM74 (ENSCHAG00000019848)	TRHR (ENSCHAG00000019838)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	454														ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	123														ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156890.a.a.t	ENSGT00940000160528.a	ENSGT00940000158313.a.a	ENSGT00940000157046.E	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.j	ENSGT01060000248664	ENSGT00730000111138	ENSGT00390000007284	ENSGT00950000182919.A.p.h	ENSGT00940000155184	ENSGT00940000162208.`c.a	ENSGT00940000164385.b
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	107														ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156890.a.a.t	ENSGT00940000160528.a	ENSGT00940000158313.a.a	ENSGT00940000157046.E	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.j	ENSGT01060000248664	ENSGT00730000111138	ENSGT00390000007284	ENSGT00950000182919.A.p.h	ENSGT00940000155184	ENSGT00940000162208.`c.a	ENSGT00940000164385.b
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	193														ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.j	ENSGT01060000248664	ENSGT00730000111138	ENSGT00390000007284	ENSGT00950000182919.A.p.h	ENSGT00940000155184	ENSGT00940000164385.b	ENSGT00390000011769	ENSGT00940000157179	ENSGT01030000234610.a.b	ENSGT00390000009168	ENSGT00940000156772.a	ENSGT00940000166924
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	850													ENSPNAG00000013327	ENSPNAG00000013303	PTGR3 (ENSPNAG00000002695)	TSHZ1 (ENSPNAG00000002688) ##22
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	24	ENSAMXG00000001518	PIK3CB (ENSAMXG00000001526)	ENSAMXG00000001545	mrpl34 (ENSAMXG00000038851)	myh7l (ENSAMXG00000001635)	gorasp1a (ENSAMXG00000044042)	fitm1l (ENSAMXG00000042111)	rpp40 (ENSAMXG00000001755)	CDY1 (ENSAMXG00000038382)	trnau1apb (ENSAMXG00000001805)	MED26 (ENSAMXG00000042246)	ENSAMXG00000029483	tssk6 (ENSAMXG00000037044)	ENSAMXG00000040828	PTGR3 (ENSAMXG00000001839)	TSHZ1 (ENSAMXG00000032425) ##22	ENSAMXG00000034873	ENSAMXG00000033001	ENSAMXG00000039889	ENSAMXG00000032254	GALR1 (ENSAMXG00000001883)	ENSAMXG00000008502	coq3 (ENSAMXG00000008641)	FAXC (ENSAMXG00000008654)	fbxl4 (ENSAMXG00000008664)	ENSAMXG00000039835	mms22l (ENSAMXG00000008792)	klhl32 (ENSAMXG00000009056)	calhm5.1 (ENSAMXG00000032177)	rwdd1 (ENSAMXG00000035253)	zufsp (ENSAMXG00000009217)
Electric eel	MODERN SPECIES	238			nlgn2b (ENSEEEG00000008382)	ENSEEEG00000008385	ENSEEEG00000008386	GIGYF1 (ENSEEEG00000008389)	ENSEEEG00000008390	ENSEEEG00000008391	tmem88a (ENSEEEG00000008392)	pcolcea (ENSEEEG00000008393)	per1a (ENSEEEG00000008394)	vamp2 (ENSEEEG00000008434)	and3 (ENSEEEG00000008437)	ENSEEEG00000008440	ENSEEEG00000008443	TSHZ1 (ENSEEEG00000008444) ##22	ZNF516 (ENSEEEG00000008447)	ENSEEEG00000008449	ENSEEEG00000008456
Channel catfish	MODERN SPECIES	12	ift80 (ENSIPUG00000005577)	smc4 (ENSIPUG00000005409)	Trim59 (ENSIPUG00000005387)	KPNA4 (ENSIPUG00000005219)	ENSIPUG00000005194	ENSIPUG00000005181	KLHL10 (ENSIPUG00000005168)	PPM1L (ENSIPUG00000005149)	nmd3 (ENSIPUG00000005073)	sptssb (ENSIPUG00000005061)	otol1a (ENSIPUG00000005050)	ENSIPUG00000005005	rabgef1l (ENSIPUG00000004981)	znf407 (ENSIPUG00000004963)	zadh2 (ENSIPUG00000004945)	TSHZ1 (ENSIPUG00000004927) ##22	ZNF236 (ENSIPUG00000004905)	mbp (ENSIPUG00000004886)	ENSIPUG00000004873	GALR1 (ENSIPUG00000004857)	pnisr (ENSIPUG00000004847)	coq3 (ENSIPUG00000004833)	FAXC (ENSIPUG00000004829)	fbxl4 (ENSIPUG00000004812)	ENSIPUG00000004784	mms22l (ENSIPUG00000004760)	fam26e (ENSIPUG00000004741)	ENSIPUG00000004730	ENSIPUG00000004723	ENSIPUG00000004718	ENSIPUG00000004704
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	58										ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00940000155141.w.b	ENSGT00940000165015	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.b
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	52												ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.b
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00390000008751.a.fb	ENSGT00940000157284.cb.a	ENSGT00940000158416.q.a	ENSGT01050000244950.a.a.b	ENSGT00940000166924	ENSGT00940000156772.a	ENSGT00390000009168	ENSGT01030000234610.a.b	ENSGT01030000234610.a.a	ENSGT00390000001827	ENSGT00390000012832	ENSGT00940000160484	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00940000182276	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234871	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	425	sdha (ENSHCOG00000009811)	ccdc127a (ENSHCOG00000009822)	mrpl32 (ENSHCOG00000009839)	psma2a (ENSHCOG00000009873)	ATAD2 (ENSHCOG00000009954)	ZHX1 (ENSHCOG00000009971)	zgc:101716 (ENSHCOG00000009978)	ENSHCOG00000010005	ENSHCOG00000010028	derl1 (ENSHCOG00000010062)	zhx2a (ENSHCOG00000010067)	has2 (ENSHCOG00000010115)	ENSHCOG00000010149	PTGR3 (ENSHCOG00000010152)	ENSHCOG00000010166	TSHZ1 (ENSHCOG00000010177) ##22	ZNF516 (ENSHCOG00000010219)	ZNF236 (ENSHCOG00000010282)	ENSHCOG00000010309	mbpb (ENSHCOG00000010322)	ENSHCOG00000010345	DEPDC1B (ENSHCOG00000010373)	SALL3 (ENSHCOG00000010423)	NFATC1 (ENSHCOG00000010450)	zgc:91890 (ENSHCOG00000010457)	ENSHCOG00000010475	ENSHCOG00000010488	ENSHCOG00000010500	ENSHCOG00000010576	ENSHCOG00000010612	ENSHCOG00000010627
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a	ENSGT00390000013999.d.a.a	ENSGT00940000159194
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.b	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f
Climbing perch	MODERN SPECIES	7	ENSATEG00000024442	ENSATEG00000025846	ENSATEG00000028820	mrpl32 (ENSATEG00000024446)	ENSATEG00000024447	ATAD2 (ENSATEG00000024449)	ZHX1 (ENSATEG00000024460)	ENSATEG00000024472	ENSATEG00000024466	C8orf76 (ENSATEG00000026045)	TBC1D31 (ENSATEG00000024481)	DERL1 (ENSATEG00000024484)	HAS2 (ENSATEG00000028491)	ZNF407 (ENSATEG00000027498)	ZADH2 (ENSATEG00000026716)	TSHZ1 (ENSATEG00000024496) ##22	ZNF516 (ENSATEG00000024498)	ZNF236 (ENSATEG00000024503)	ENSATEG00000024514	mbpb (ENSATEG00000029962)	ENSATEG00000024516	ENSATEG00000024518	SALL3 (ENSATEG00000024524)	ENSATEG00000024530	ENSATEG00000024535	ENSATEG00000026390	ENSATEG00000024559	RSPO2 (ENSATEG00000024596)	eif3ea (ENSATEG00000024601)	emc2 (ENSATEG00000024606)	TMEM74 (ENSATEG00000024611)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	7	psma2a (ENSBSLG00000026492)	ATAD2 (ENSBSLG00000026522)	ZHX1 (ENSBSLG00000026534)	ENSBSLG00000014126	ENSBSLG00000014427	ENSBSLG00000014654	ENSBSLG00000014703	zgc:101716 (ENSBSLG00000014717)	ENSBSLG00000014738	TBC1D31 (ENSBSLG00000014752)	derl1 (ENSBSLG00000014913)	zhx2a (ENSBSLG00000015173)	has2 (ENSBSLG00000015290)	ZNF407 (ENSBSLG00000015316)	PTGR3 (ENSBSLG00000015383)	TSHZ1 (ENSBSLG00000015393) ##22	ENSBSLG00000015414	ZNF236 (ENSBSLG00000015433)	ENSBSLG00000015692	ENSBSLG00000015703	mbpb (ENSBSLG00000016573)	ENSBSLG00000016614	DEPDC1B (ENSBSLG00000016719)	SALL3 (ENSBSLG00000016957)	NFATC1 (ENSBSLG00000016980)	zgc:91890 (ENSBSLG00000017068)	ENSBSLG00000017188	RSPO2 (ENSBSLG00000018091)	eif3ea (ENSBSLG00000018187)	emc2 (ENSBSLG00000018354)	TMEM74 (ENSBSLG00000018420)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	7	ENSMAMG00000000475	ENSMAMG00000000501	ENSMAMG00000000526	ENSMAMG00000026399	mrpl32 (ENSMAMG00000000634)	ENSMAMG00000000647	ATAD2 (ENSMAMG00000000712)	ZHX1 (ENSMAMG00000000778)	C8orf76 (ENSMAMG00000000792)	FAM83A (ENSMAMG00000028236)	TBC1D31 (ENSMAMG00000000834)	DERL1 (ENSMAMG00000000906)	HAS2 (ENSMAMG00000028371)	ZNF407 (ENSMAMG00000027526)	ZADH2 (ENSMAMG00000001030)	TSHZ1 (ENSMAMG00000001047) ##22	ZNF516 (ENSMAMG00000026383)	ZNF236 (ENSMAMG00000001157)	ENSMAMG00000001184	mbpb (ENSMAMG00000001207)	ENSMAMG00000027481	ENSMAMG00000001237	SALL3 (ENSMAMG00000001276)	ENSMAMG00000001326	ENSMAMG00000001388	ENSMAMG00000027680	ENSMAMG00000001487	ENSMAMG00000025300	RSPO2 (ENSMAMG00000001654)	ENSMAMG00000001786	emc2 (ENSMAMG00000001800)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01100000263583	ENSGT00940000166706	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000155008.C	ENSGT00940000166866	ENSGT00390000017590	ENSGT00940000155064
Tongue sole	MODERN SPECIES	4	si:dkey-33i11.9 (ENSCSEG00000011355)	zgc:101716 (ENSCSEG00000011357)	ZHX1 (ENSCSEG00000011363)	ENSCSEG00000011370	psma2a (ENSCSEG00000011383)	mrpl32 (ENSCSEG00000011393)	ccdc127a (ENSCSEG00000011398)	ENSCSEG00000011437	sdha (ENSCSEG00000011447)	TBC1D31 (ENSCSEG00000011462)	derl1 (ENSCSEG00000011481)	zhx2a (ENSCSEG00000011495)	has2 (ENSCSEG00000011505)	ENSCSEG00000011518	PTGR3 (ENSCSEG00000011531)	TSHZ1 (ENSCSEG00000011537) ##22	ZNF516 (ENSCSEG00000011543)	ZNF236 (ENSCSEG00000011586)	ENSCSEG00000011620	mbpb (ENSCSEG00000011627)	TMEM145 (ENSCSEG00000011635)	ENSCSEG00000011642	cd79a (ENSCSEG00000011649)	ENSCSEG00000011656	ENSCSEG00000011664	ENSCSEG00000011682	ENSCSEG00000011688	ENSCSEG00000011696	MEGF8 (ENSCSEG00000011714)	ENSCSEG00000011780	CXCR3 (ENSCSEG00000011788)
Turbot	MODERN SPECIES		ENSSMAG00000029379	fxyd3 (ENSSMAG00000007009)	ENSSMAG00000032484	ENSSMAG00000007060	ENSSMAG00000037042	mrpl32 (ENSSMAG00000027043)	ENSSMAG00000007148	ATAD2 (ENSSMAG00000007172)	ZHX1 (ENSSMAG00000007251)	C8orf76 (ENSSMAG00000007260)	TBC1D31 (ENSSMAG00000007306)	DERL1 (ENSSMAG00000007383)	HAS2 (ENSSMAG00000007441)	ENSSMAG00000007455	ENSSMAG00000007470	TSHZ1 (ENSSMAG00000007487) ##22	PTGR3 (ENSSMAG00000032552)	ENSSMAG00000007495	ENSSMAG00000032527	ENSSMAG00000035057	ENSSMAG00000007561	ENSSMAG00000028315	mbpb (ENSSMAG00000007650)	ENSSMAG00000007656	ENSSMAG00000007665	SALL3 (ENSSMAG00000007674)	ENSSMAG00000007713	zgc:91890 (ENSSMAG00000007719)	ENSSMAG00000033884	ENSSMAG00000007751	ENSSMAG00000007821
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000155824.A	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a
Greater amberjack	MODERN SPECIES	75	ccdc127a (ENSSDUG00000011724)	ENSSDUG00000011711	mrpl32 (ENSSDUG00000011693)	psma2a (ENSSDUG00000011656)	ENSSDUG00000011569	ZHX1 (ENSSDUG00000011542)	ENSSDUG00000011512	zgc:101716 (ENSSDUG00000011504)	FAM83A (ENSSDUG00000011491)	TBC1D31 (ENSSDUG00000011396)	derl1 (ENSSDUG00000011365)	zhx2a (ENSSDUG00000011335)	has2 (ENSSDUG00000011316)	ENSSDUG00000011297	PTGR3 (ENSSDUG00000011282)	TSHZ1 (ENSSDUG00000011260) ##22	ZNF516 (ENSSDUG00000011214)	ZNF236 (ENSSDUG00000011170)	ENSSDUG00000011160	mbpb (ENSSDUG00000011147)	ENSSDUG00000011140	ENSSDUG00000011118	SALL3 (ENSSDUG00000011099)	NFATC1 (ENSSDUG00000011072)	zgc:91890 (ENSSDUG00000011053)	ENSSDUG00000011038	ENSSDUG00000011018	ENSSDUG00000011007	ENSSDUG00000010997	ENSSDUG00000010777	ENSSDUG00000010500
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2851	ccdc127a (ENSSLDG00000013524)	ENSSLDG00000013512	mrpl32 (ENSSLDG00000013498)	psma2a (ENSSLDG00000013476)	ATAD2 (ENSSLDG00000013335)	ZHX1 (ENSSLDG00000013310)	ENSSLDG00000013283	zgc:101716 (ENSSLDG00000013266)	TBC1D31 (ENSSLDG00000013128)	derl1 (ENSSLDG00000013068)	zhx2a (ENSSLDG00000013041)	has2 (ENSSLDG00000013021)	ENSSLDG00000013008	ENSSLDG00000012995	PTGR3 (ENSSLDG00000012982)	TSHZ1 (ENSSLDG00000012961) ##22	ZNF516 (ENSSLDG00000012905)	ZNF236 (ENSSLDG00000012821)	ENSSLDG00000012795	mbpb (ENSSLDG00000012778)	ENSSLDG00000012769	ENSSLDG00000012747	ENSSLDG00000012724	SALL3 (ENSSLDG00000012706)	NFATC1 (ENSSLDG00000012672)	zgc:91890 (ENSSLDG00000012649)	ENSSLDG00000012630	ENSSLDG00000012615	ENSSLDG00000012597	ENSSLDG00000012522	ENSSLDG00000012473
Barramundi perch	MODERN SPECIES	17	ccdc127a (ENSLCAG00010016648)	ENSLCAG00010016641	mrpl32 (ENSLCAG00010016635)	psma2a (ENSLCAG00010016628)	ATAD2 (ENSLCAG00010016506)	ZHX1 (ENSLCAG00010016468)	ENSLCAG00010016464	ENSLCAG00010016462	zgc:101716 (ENSLCAG00010016458)	TBC1D31 (ENSLCAG00010016444)	derl1 (ENSLCAG00010016433)	zhx2a (ENSLCAG00010016430)	has2 (ENSLCAG00010016427)	ENSLCAG00010016423	PTGR3 (ENSLCAG00010016422)	TSHZ1 (ENSLCAG00010016421) ##22	ENSLCAG00010016416	ENSLCAG00010016390	ENSLCAG00010016373	mbpb (ENSLCAG00010016355)	ENSLCAG00010016353	ENSLCAG00010016350	SALL3 (ENSLCAG00010016342)	NFATC1 (ENSLCAG00010016338)	zgc:91890 (ENSLCAG00010016332)	ENSLCAG00010016323	ENSLCAG00010016318	ENSLCAG00010016233	ENSLCAG00010016182	ENSLCAG00010016179	ENSLCAG00010016177
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.b	ENSGT00940000159194
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00920000149572	ENSGT01010000222294.c.b.b.a.a.b.a.a.f.b	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.b	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f.b
Tetraodon	MODERN SPECIES	23	ENSTNIG00000019084	ENSTNIG00000001049	sdha (ENSTNIG00000019083)	ccdc127a (ENSTNIG00000019082)	psma2a (ENSTNIG00000019081)	ATAD2 (ENSTNIG00000019080)	ZHX1 (ENSTNIG00000019079)	C8orf76 (ENSTNIG00000019078)	FAM83A (ENSTNIG00000019077)	TBC1D31 (ENSTNIG00000019076)	derl1 (ENSTNIG00000019075)	zhx2a (ENSTNIG00000019074)	has2 (ENSTNIG00000019073)	ENSTNIG00000019072	PTGR3 (ENSTNIG00000019071)	TSHZ1 (ENSTNIG00000019070) ##22	ENSTNIG00000019069	mbpb (ENSTNIG00000019068)	ENSTNIG00000019067	DEPDC1B (ENSTNIG00000019066)	SALL3 (ENSTNIG00000001257)	zgc:91890 (ENSTNIG00000019065)	PLEC (ENSTNIG00000019064)	ENSTNIG00000000298	ENSTNIG00000001615	eif3ea (ENSTNIG00000015446)	emc2 (ENSTNIG00000015445)	TMEM74 (ENSTNIG00000006886)	TRHR (ENSTNIG00000006885)	eny2 (ENSTNIG00000006884)	gdf6a (ENSTNIG00000006883)
Fugu	MODERN SPECIES	19	ENSTRUG00000021515	ENSTRUG00000022817	ctnnb1 (ENSTRUG00000003520)	ENSTRUG00000021550	ENSTRUG00000028523	ENSTRUG00000023730	TRAK1 (ENSTRUG00000002103)	ccka (ENSTRUG00000033262)	ENSTRUG00000001349	ENSTRUG00000017365	sult2st3 (ENSTRUG00000017363)	tmem147 (ENSTRUG00000020274)	gapdhs (ENSTRUG00000017358)	scx (ENSTRUG00000017355)	PTGR3 (ENSTRUG00000031863)	TSHZ1 (ENSTRUG00000017496) ##22	ENSTRUG00000017489	ZNF236 (ENSTRUG00000017456)	mbpb (ENSTRUG00000026841)	ENSTRUG00000022186	ENSTRUG00000017445	ENSTRUG00000017436	SALL3 (ENSTRUG00000027801)	NFATC1 (ENSTRUG00000022286)	zgc:91890 (ENSTRUG00000019817)	ENSTRUG00000003715	ENSTRUG00000000220	ENSTRUG00000021531	RSPO2 (ENSTRUG00000005463)	eif3ea (ENSTRUG00000005064)	TMEM74 (ENSTRUG00000004659)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.b	ENSGT00940000159194
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	3	sdha (ENSLBEG00000006135)	ccdc127a (ENSLBEG00000006108)	ENSLBEG00000006096	mrpl32 (ENSLBEG00000006081)	psma2a (ENSLBEG00000006026)	ATAD2 (ENSLBEG00000005948)	ZHX1 (ENSLBEG00000005916)	zgc:101716 (ENSLBEG00000005896)	ENSLBEG00000005843	ENSLBEG00000005808	derl1 (ENSLBEG00000005782)	zhx2a (ENSLBEG00000005624)	has2 (ENSLBEG00000005565)	ENSLBEG00000005532	PTGR3 (ENSLBEG00000005501)	TSHZ1 (ENSLBEG00000005456) ##22	ZNF516 (ENSLBEG00000005411)	ZNF236 (ENSLBEG00000005307)	ENSLBEG00000005263	mbpb (ENSLBEG00000005225)	ENSLBEG00000005212	DEPDC1B (ENSLBEG00000005181)	SALL3 (ENSLBEG00000005152)	NFATC1 (ENSLBEG00000005083)	zgc:91890 (ENSLBEG00000005044)	ENSLBEG00000005016	ENSLBEG00000004980	ENSLBEG00000004960	ENSLBEG00000004779	ENSLBEG00000004683	ENSLBEG00000004408
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.b	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT01050000248023	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922
Lumpfish	MODERN SPECIES	17	ENSCLMG00005018958	ENSCLMG00005018956	sdha (ENSCLMG00005018927)	ccdc127a (ENSCLMG00005018925)	ENSCLMG00005018923	mrpl32 (ENSCLMG00005018922)	psma2a (ENSCLMG00005018920)	ATAD2 (ENSCLMG00005018794)	ZHX1 (ENSCLMG00005018793)	ENSCLMG00005018792	C8orf76 (ENSCLMG00005018791)	derl1 (ENSCLMG00005018788)	TBC1D31 (ENSCLMG00005018300)	has2 (ENSCLMG00005018296)	PTGR3 (ENSCLMG00005018295)	TSHZ1 (ENSCLMG00005018294) ##22	ZNF516 (ENSCLMG00005018293)	ZNF236 (ENSCLMG00005018262)	ENSCLMG00005018259	mbpb (ENSCLMG00005018258)	ENSCLMG00005018257	DEPDC1B (ENSCLMG00005018248)	SALL3 (ENSCLMG00005018222)	NFATC1 (ENSCLMG00005018219)	zgc:91890 (ENSCLMG00005018216)	ENSCLMG00005018215	ENSCLMG00005018213	ENSCLMG00005018212	ENSCLMG00005014670	ENSCLMG00005014627	ENSCLMG00005014616
Stickleback	MODERN SPECIES	19	sdha (ENSGACG00000005763)	ccdc127a (ENSGACG00000005756)	mrpl32 (ENSGACG00000005754)	psma2a (ENSGACG00000005705)	ATAD2 (ENSGACG00000005685)	ZHX1 (ENSGACG00000005679)	ENSGACG00000005677	C8orf76 (ENSGACG00000005669)	ENSGACG00000005666	TBC1D31 (ENSGACG00000005646)	derl1 (ENSGACG00000005615)	zhx2a (ENSGACG00000005611)	has2 (ENSGACG00000005603)	ENSGACG00000005600	PTGR3 (ENSGACG00000005597)	TSHZ1 (ENSGACG00000005592) ##22	ZNF516 (ENSGACG00000005587)	ZNF236 (ENSGACG00000005553)	ENSGACG00000005547	mbpb (ENSGACG00000005544)	ENSGACG00000005535	DEPDC1B (ENSGACG00000005507)	SALL3 (ENSGACG00000005503)	NFATC1 (ENSGACG00000005481)	zgc:91890 (ENSGACG00000005476)	ENSGACG00000005471	ENSGACG00000005467	ENSGACG00000005460	ENSGACG00000005431	ENSGACG00000005429	ENSGACG00000005425
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	7	fxyd3 (ENSCGOG00000008241)	sdha (ENSCGOG00000008272)	ccdc127a (ENSCGOG00000009353)	ENSCGOG00000009356	mrpl32 (ENSCGOG00000009365)	psma2a (ENSCGOG00000009400)	ENSCGOG00000010027	ZHX1 (ENSCGOG00000010279)	C8orf76 (ENSCGOG00000010280)	FAM83A (ENSCGOG00000010281)	derl1 (ENSCGOG00000010284)	zhx2a (ENSCGOG00000010286)	has2 (ENSCGOG00000010289)	ZNF407 (ENSCGOG00000010298)	PTGR3 (ENSCGOG00000010363)	TSHZ1 (ENSCGOG00000010369) ##22	ZNF516 (ENSCGOG00000010376)	ZNF236 (ENSCGOG00000010384)	ENSCGOG00000010464	mbpb (ENSCGOG00000010467)	ENSCGOG00000010470	ENSCGOG00000010478	SALL3 (ENSCGOG00000010552)	NFATC1 (ENSCGOG00000010565)	zgc:91890 (ENSCGOG00000010774)	ENSCGOG00000010784	ENSCGOG00000010803	ENSCGOG00000011463	ENSCGOG00000011476	ENSCGOG00000011496	ENSCGOG00000011507
Pike perch	MODERN SPECIES	49	sdha (ENSSLUG00000001847)	ccdc127a (ENSSLUG00000002441)	ENSSLUG00000002447	mrpl32 (ENSSLUG00000002454)	psma2a (ENSSLUG00000002462)	ATAD2 (ENSSLUG00000002496)	ZHX1 (ENSSLUG00000002574)	ENSSLUG00000002581	zgc:101716 (ENSSLUG00000002584)	TBC1D31 (ENSSLUG00000002658)	derl1 (ENSSLUG00000003510)	zhx2a (ENSSLUG00000003522)	has2 (ENSSLUG00000003536)	ZNF407 (ENSSLUG00000003564)	PTGR3 (ENSSLUG00000003664)	TSHZ1 (ENSSLUG00000003672) ##22	ZNF516 (ENSSLUG00000003679)	ZNF236 (ENSSLUG00000003697)	ENSSLUG00000003726	ENSSLUG00000003750	ENSSLUG00000003765	SALL3 (ENSSLUG00000003778)	NFATC1 (ENSSLUG00000003792)	zgc:91890 (ENSSLUG00000003826)	ENSSLUG00000003835	ENSSLUG00000003848	ENSSLUG00000004118	ENSSLUG00000008093	ENSSLUG00000008104	RSPO2 (ENSSLUG00000008119)	eif3ea (ENSSLUG00000008140)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166706	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.b	ENSGT00390000013999.d.a.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166706	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000159045	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.b	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	484	si:dkey-33i11.9 (ENSLCRG00005003542)	sdha (ENSLCRG00005003634)	ccdc127a (ENSLCRG00005004227)	ENSLCRG00005004243	mrpl32 (ENSLCRG00005004249)	psma2b (ENSLCRG00005004262)	ATAD2 (ENSLCRG00005004451)	ZHX1 (ENSLCRG00005004718)	zgc:101716 (ENSLCRG00005004735)	ENSLCRG00005004755	TBC1D31 (ENSLCRG00005004896)	derl1 (ENSLCRG00005005072)	has2 (ENSLCRG00005005085)	ZNF407 (ENSLCRG00005005095)	PTGR3 (ENSLCRG00005005110)	TSHZ1 (ENSLCRG00005005117) ##22	ZNF516 (ENSLCRG00005005125)	ZNF236 (ENSLCRG00005005186)	ENSLCRG00005005295	mbpb (ENSLCRG00005005301)	ENSLCRG00005005302	DEPDC1B (ENSLCRG00005005312)	SALL3 (ENSLCRG00005005357)	NFATC1 (ENSLCRG00005005375)	zgc:91890 (ENSLCRG00005005410)	ENSLCRG00005005420	ENSLCRG00005005456	ENSLCRG00005005822	ENSLCRG00005007474	ENSLCRG00005007529	ENSLCRG00005007549
European seabass	MODERN SPECIES	6	ENSDLAG00005031378	ENSDLAG00005001080	ENSDLAG00005034650	ENSDLAG00005001628	ENSDLAG00005030144	ENSDLAG00005001650	ENSDLAG00005001780	ZHX1 (ENSDLAG00005002050)	C8orf76 (ENSDLAG00005002061)	FAM83A (ENSDLAG00005002086)	TBC1D31 (ENSDLAG00005002126)	DERL1 (ENSDLAG00005002260)	HAS2 (ENSDLAG00005002291)	ZNF407 (ENSDLAG00005002307)	PTGR3 (ENSDLAG00005002338)	TSHZ1 (ENSDLAG00005002351) ##22	ENSDLAG00005002358	ZNF236 (ENSDLAG00005002377)	ENSDLAG00005002464	mbpb (ENSDLAG00005002579)	ENSDLAG00005002612	ENSDLAG00005002679	SALL3 (ENSDLAG00005003049)	ENSDLAG00005003066	zgc:91890 (ENSDLAG00005003171)	ENSDLAG00005003196	ENSDLAG00005003301	ENSDLAG00005003460	ENSDLAG00005005252	ENSDLAG00005028074	RSPO2 (ENSDLAG00005005616)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	8	fxyd3 (ENSSAUG00010015371)	ENSSAUG00010015370	SDHA (ENSSAUG00010014692)	ccdc127a (ENSSAUG00010014684)	ENSSAUG00010014681	mrpl32 (ENSSAUG00010014679)	psma2a (ENSSAUG00010014669)	ATAD2 (ENSSAUG00010014600)	ZHX1 (ENSSAUG00010014591)	zgc:101716 (ENSSAUG00010014589)	derl1 (ENSSAUG00010018207)	TBC1D31 (ENSSAUG00010016780)	has2 (ENSSAUG00010016774)	ZNF407 (ENSSAUG00010016759)	PTGR3 (ENSSAUG00010016752)	TSHZ1 (ENSSAUG00010016751) ##22	ZNF236 (ENSSAUG00010016745)	ENSSAUG00010016741	mbpb (ENSSAUG00010016740)	ENSSAUG00010016739	DEPDC1B (ENSSAUG00010016706)	SALL3 (ENSSAUG00010016703)	NFATC1 (ENSSAUG00010016688)	zgc:91890 (ENSSAUG00010016683)	ENSSAUG00010016681	ENSSAUG00010015994	ENSSAUG00010015979	ENSSAUG00010015977	ENSSAUG00010015975	ENSSAUG00010015968	ENSSAUG00010015962
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000166706	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.b.a
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01100000263583	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234534.B.a.a.b	ENSGT00940000158438.m	ENSGT00390000017503	ENSGT00940000154996.a.a.b	ENSGT00940000166429	ENSGT00940000155176.o.b	ENSGT00950000182940.b.a.b.a.b	ENSGT00870000136537	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00760000119766	ENSGT00940000160311.a.b	ENSGT01090000260061.c.a.d.b.b	ENSGT00390000003465.b.b.a	ENSGT00940000155788.l.d
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT01100000263583	ENSGT00910000144277	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT01030000234534.B.a.a.b
Orange clownfish	MODERN SPECIES	21	fxyd3 (ENSAPEG00000018264)	sdha (ENSAPEG00000018278)	ccdc127a (ENSAPEG00000018336)	ENSAPEG00000018353	mrpl32 (ENSAPEG00000018363)	psma2a (ENSAPEG00000018372)	ATAD2 (ENSAPEG00000018408)	ZHX1 (ENSAPEG00000018556)	zgc:101716 (ENSAPEG00000018673)	TBC1D31 (ENSAPEG00000018694)	derl1 (ENSAPEG00000018795)	zhx2a (ENSAPEG00000018836)	has2 (ENSAPEG00000018869)	ENSAPEG00000018919	PTGR3 (ENSAPEG00000018939)	TSHZ1 (ENSAPEG00000018993) ##22	ENSAPEG00000019004	ZNF236 (ENSAPEG00000019026)	ENSAPEG00000019130	ENSAPEG00000019146	mbpb (ENSAPEG00000019165)	ENSAPEG00000019191	ENSAPEG00000019208	SALL3 (ENSAPEG00000019278)	NFATC1 (ENSAPEG00000019297)	zgc:91890 (ENSAPEG00000019331)	ENSAPEG00000019341	ENSAPEG00000019363	ENSAPEG00000019400	ENSAPEG00000019531	ENSAPEG00000019574
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1552															PTGR3 (ENSAOCG00000022184)	TSHZ1 (ENSAOCG00000002522) ##22
Spiny chromis	MODERN SPECIES	67	fxyd3 (ENSAPOG00000004572)	sdha (ENSAPOG00000004596)	ccdc127a (ENSAPOG00000004614)	ENSAPOG00000004627	mrpl32 (ENSAPOG00000004637)	psma2a (ENSAPOG00000004666)	ENSAPOG00000004705	ZHX1 (ENSAPOG00000004741)	C8orf76 (ENSAPOG00000004771)	TBC1D31 (ENSAPOG00000004809)	derl1 (ENSAPOG00000004846)	zhx2a (ENSAPOG00000004868)	has2 (ENSAPOG00000004929)	ENSAPOG00000004966	PTGR3 (ENSAPOG00000004979)	TSHZ1 (ENSAPOG00000004985) ##22	ZNF516 (ENSAPOG00000005020)	ZNF236 (ENSAPOG00000005097)	ENSAPOG00000005125	mbpb (ENSAPOG00000005138)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	558													has2 (ENSSPAG00000016159)	ENSSPAG00000016199	PTGR3 (ENSSPAG00000016213)	TSHZ1 (ENSSPAG00000016227) ##22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.b.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000179624	ENSGT00940000171417.e	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.b.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000179624	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.b.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000179624	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000171417.f	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.b.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	500							ENSHBUG00000010061	ENSHBUG00000010049	TBC1D31 (ENSHBUG00000010039)	derl1 (ENSHBUG00000010019)	zhx2a (ENSHBUG00000009980)	ENSHBUG00000009971	has2 (ENSHBUG00000000253)	ENSHBUG00000009934	PTGR3 (ENSHBUG00000009910)	TSHZ1 (ENSHBUG00000009890) ##22	ENSHBUG00000009880	ZNF516 (ENSHBUG00000009867)	ZNF236 (ENSHBUG00000009837)	ENSHBUG00000009733	mbpb (ENSHBUG00000009709)	ENSHBUG00000009695	DEPDC1B (ENSHBUG00000009678)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417.e	ENSGT00940000179624	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000171417.f	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.b.a
P. nyererei	MODERN SPECIES	424	ccdc127a (ENSPNYG00000013648)	ENSPNYG00000013660	mrpl32 (ENSPNYG00000013630)	psma2a (ENSPNYG00000013602)	ATAD2 (ENSPNYG00000013510)	ZHX1 (ENSPNYG00000013472)	ENSPNYG00000013441	ENSPNYG00000013426	zgc:101716 (ENSPNYG00000013341)	TBC1D31 (ENSPNYG00000013234)	derl1 (ENSPNYG00000013197)	zhx2a (ENSPNYG00000013128)	has2 (ENSPNYG00000013108)	ENSPNYG00000013080	PTGR3 (ENSPNYG00000013068)	TSHZ1 (ENSPNYG00000013049) ##22	ENSPNYG00000013034	ZNF236 (ENSPNYG00000012877)	ENSPNYG00000012847	mbpb (ENSPNYG00000012837)	ENSPNYG00000012830	DEPDC1B (ENSPNYG00000012802)	SALL3 (ENSPNYG00000012783)	NFATC1 (ENSPNYG00000012750)	zgc:91890 (ENSPNYG00000012741)	ENSPNYG00000012721	ENSPNYG00000012708	ENSPNYG00000012692	ENSPNYG00000012665	ENSPNYG00000012480	ENSPNYG00000012203
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417.e	ENSGT00940000179624	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000171417.f	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00940000157017.b	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.a.b.a.b.a	ENSGT00390000013999.d.a.b.b.b.a.a.b
Eastern happy	MODERN SPECIES	2	ATAD2 (ENSACLG00000021719)	ZHX1 (ENSACLG00000021858)	ENSACLG00000021876	ENSACLG00000021884	C8orf76 (ENSACLG00000021945)	ENSACLG00000021981	ENSACLG00000021992	ENSACLG00000022004	ENSACLG00000022018	TBC1D31 (ENSACLG00000022036)	derl1 (ENSACLG00000022063)	zhx2a (ENSACLG00000022125)	has2 (ENSACLG00000022166)	ENSACLG00000022191	PTGR3 (ENSACLG00000022230)	TSHZ1 (ENSACLG00000022251) ##22	ENSACLG00000022267	ENSACLG00000022287	ENSACLG00000022305	ENSACLG00000022312	ENSACLG00000022316	ENSACLG00000022319	mbpb (ENSACLG00000022337)	ENSACLG00000022353	DEPDC1B (ENSACLG00000022370)	SALL3 (ENSACLG00000022451)	NFATC1 (ENSACLG00000022509)	zgc:91890 (ENSACLG00000022531)	ENSACLG00000022550	ENSACLG00000022563	ENSACLG00000022576
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1093	sdha (ENSMZEG00005006913)	ENSMZEG00005006953	ccdc127a (ENSMZEG00005006958)	mrpl32 (ENSMZEG00005006966)	psma2a (ENSMZEG00005006983)	ATAD2 (ENSMZEG00005007015)	ZHX1 (ENSMZEG00005007125)	ENSMZEG00005007135	C8orf76 (ENSMZEG00005007153)	TBC1D31 (ENSMZEG00005007177)	derl1 (ENSMZEG00005007203)	zhx2a (ENSMZEG00005007229)	has2 (ENSMZEG00005007246)	ENSMZEG00005007263	PTGR3 (ENSMZEG00005007295)	TSHZ1 (ENSMZEG00005007316) ##22	ENSMZEG00005007330	ZNF236 (ENSMZEG00005007366)	ENSMZEG00005007492	mbpb (ENSMZEG00005007521)	ENSMZEG00005007536	DEPDC1B (ENSMZEG00005007566)	SALL3 (ENSMZEG00005007586)	NFATC1 (ENSMZEG00005007616)	zgc:91890 (ENSMZEG00005007658)	ENSMZEG00005007669	ENSMZEG00005007683	ENSMZEG00005007693	ENSMZEG00005007736	ENSMZEG00005007838	ENSMZEG00005007861
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	324	sdha (ENSNBRG00000009676)	ccdc127a (ENSNBRG00000009658)	ENSNBRG00000009666	mrpl32 (ENSNBRG00000009648)	psma2a (ENSNBRG00000009619)	ATAD2 (ENSNBRG00000009567)	ZHX1 (ENSNBRG00000009527)	ENSNBRG00000009496	ENSNBRG00000009468	derl1 (ENSNBRG00000009418)	zhx2a (ENSNBRG00000009329)	has2 (ENSNBRG00000009264)	ENSNBRG00000009231	PTGR3 (ENSNBRG00000009215)	ENSNBRG00000009208	TSHZ1 (ENSNBRG00000009195) ##22	ZNF516 (ENSNBRG00000009162)	ZNF236 (ENSNBRG00000009075)	ENSNBRG00000009052	mbpb (ENSNBRG00000009037)	ENSNBRG00000009024	DEPDC1B (ENSNBRG00000008993)	SALL3 (ENSNBRG00000008974)	NFATC1 (ENSNBRG00000008942)	zgc:91890 (ENSNBRG00000008932)	ENSNBRG00000008902	ENSNBRG00000008890	ENSNBRG00000008867	ENSNBRG00000008848	ENSNBRG00000008648	ENSNBRG00000008583
Nile tilapia	MODERN SPECIES	2	mrpl32 (ENSONIG00000032508)	psma2a (ENSONIG00000007278)	ATAD2 (ENSONIG00000007281)	ZHX1 (ENSONIG00000033055)	ENSONIG00000035134	ENSONIG00000033093	zgc:101716 (ENSONIG00000007285)	ENSONIG00000007286	ENSONIG00000041908	ENSONIG00000029048	TBC1D31 (ENSONIG00000007289)	derl1 (ENSONIG00000007287)	has2 (ENSONIG00000033734)	ZNF407 (ENSONIG00000007293)	PTGR3 (ENSONIG00000007294)	TSHZ1 (ENSONIG00000040112) ##22	ZNF516 (ENSONIG00000007296)	ZNF236 (ENSONIG00000007298)	ENSONIG00000038569	mbpb (ENSONIG00000042836)	ENSONIG00000007300	ENSONIG00000030715	ENSONIG00000042935	DEPDC1B (ENSONIG00000040606)	SALL3 (ENSONIG00000028993)	NFATC1 (ENSONIG00000007307)	zgc:91890 (ENSONIG00000007310)	ENSONIG00000027609	ENSONIG00000029732	ENSONIG00000034396	ENSONIG00000028721
Midas cichlid	MODERN SPECIES	255												ENSACIG00000014260	has2 (ENSACIG00000014250)	ENSACIG00000014233	PTGR3 (ENSACIG00000014225)	TSHZ1 (ENSACIG00000014213) ##22	ZNF516 (ENSACIG00000014197)	ZNF236 (ENSACIG00000014123)	ENSACIG00000014106	mbpb (ENSACIG00000014099)	ENSACIG00000014091	ENSACIG00000014063	SALL3 (ENSACIG00000014041)	NFATC1 (ENSACIG00000013997)	zgc:91890 (ENSACIG00000013981)	ENSACIG00000013965	ENSACIG00000013943	ENSACIG00000013914	ENSACIG00000013848	ENSACIG00000013806	ENSACIG00000013784
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00940000171417	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.b	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922	ENSGT00530000063880.b.f
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.b.e.b
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.b.e.b	ENSGT00390000013999.d.b.e.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1614	MRPL32 (ENSNFUG00015004170)	ENSNFUG00015004167	PSMA2 (ENSNFUG00015004157)	ATAD2 (ENSNFUG00015004103)	ZHX1 (ENSNFUG00015004078)	ENSNFUG00015004074	ENSNFUG00015004035	C16H8ORF76 (ENSNFUG00015004010)	ENSNFUG00015004008	DERL1 (ENSNFUG00015004004)	TBC1D31 (ENSNFUG00015003980)	ENSNFUG00015003965	has2 (ENSNFUG00015003961)	ZNF407 (ENSNFUG00015003955)	ZADH2 (ENSNFUG00015003950)	TSHZ1 (ENSNFUG00015003945) ##22	ENSNFUG00015003943	ENSNFUG00015003939	ZNF236 (ENSNFUG00015003892)	ENSNFUG00015003870	mbpb (ENSNFUG00015003865)	ENSNFUG00015003863	ENSNFUG00015003860	DEPDC1B (ENSNFUG00015003849)	ENSNFUG00015003842	SALL3A (ENSNFUG00015003837)	ENSNFUG00015003831	NFATC1 (ENSNFUG00015003822)	ENSNFUG00015003817	Nfu_g_1_016749 (ENSNFUG00015003814)	ENSNFUG00015003809
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	14	ENSKMAG00000021638	mrpl32 (ENSKMAG00000021643)	psma2a (ENSKMAG00000021648)	ENSKMAG00000021659	ZHX1 (ENSKMAG00000021688)	ENSKMAG00000021696	zgc:101716 (ENSKMAG00000021701)	ENSKMAG00000021716	TBC1D31 (ENSKMAG00000021748)	derl1 (ENSKMAG00000021758)	zhx2a (ENSKMAG00000021766)	has2 (ENSKMAG00000021775)	ENSKMAG00000021779	ENSKMAG00000021785	PTGR3 (ENSKMAG00000021790)	TSHZ1 (ENSKMAG00000021795) ##22	ENSKMAG00000021801	ENSKMAG00000021810	ZNF236 (ENSKMAG00000021817)	ENSKMAG00000021830	mbpb (ENSKMAG00000021833)	GALR1 (ENSKMAG00000021837)	DEPDC1B (ENSKMAG00000021842)
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.b.e.b
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	42								ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772.l	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00940000179522	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b
Mummichog	MODERN SPECIES	2307													has2 (ENSFHEG00000008195)	ENSFHEG00000008213	PTGR3 (ENSFHEG00000008229)	TSHZ1 (ENSFHEG00000008236) ##22	ZNF516 (ENSFHEG00000008254)	ZNF236 (ENSFHEG00000008286)	ENSFHEG00000008304	mbpb (ENSFHEG00000008317)	ENSFHEG00000008330	DEPDC1B (ENSFHEG00000008341)	ENSFHEG00000008352	SALL3 (ENSFHEG00000008424)	NFATC1 (ENSFHEG00000008540)	zgc:91890 (ENSFHEG00000000209)	ENSFHEG00000008614	ENSFHEG00000008635	ENSFHEG00000008650	ENSFHEG00000000786	ENSFHEG00000008769
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	261								zgc:101716 (ENSCVAG00000018416)	TBC1D31 (ENSCVAG00000018405)	ENSCVAG00000018326	derl1 (ENSCVAG00000018315)	zhx2a (ENSCVAG00000018275)	has2 (ENSCVAG00000018260)	ENSCVAG00000018247	PTGR3 (ENSCVAG00000018216)	TSHZ1 (ENSCVAG00000018205) ##22	ZNF516 (ENSCVAG00000018183)	ENSCVAG00000018135	ENSCVAG00000018127	ENSCVAG00000018118	mbpb (ENSCVAG00000018096)	ENSCVAG00000018092
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.b.e.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000171417.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01030000234871	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.b.e.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00390000008818	ENSGT00390000012014.A	ENSGT00390000014996	ENSGT00550000074870	ENSGT00550000074694.a.k	ENSGT00950000182893.a.a.a.a.b	ENSGT00940000172126	ENSGT00390000011435	ENSGT00940000160768	ENSGT00940000153859.b	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787.g	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000166022.d	ENSGT00390000013999.d.b.e.b	ENSGT00390000013999.d.b.e.a.b	ENSGT00940000159194
Sailfin molly	MODERN SPECIES	3728																TSHZ1 (ENSPLAG00000010975) ##22
Amazon molly	MODERN SPECIES	252	mrpl32 (ENSPFOG00000018949)	psma2a (ENSPFOG00000018952)	ATAD2 (ENSPFOG00000018961)	ZHX1 (ENSPFOG00000018986)	ENSPFOG00000018989	zgc:101716 (ENSPFOG00000018992)	ENSPFOG00000018996	TBC1D31 (ENSPFOG00000019012)	derl1 (ENSPFOG00000019049)	zhx2a (ENSPFOG00000019055)	ENSPFOG00000019066	ENSPFOG00000019069	has2 (ENSPFOG00000019071)	ZNF407 (ENSPFOG00000019074)	PTGR3 (ENSPFOG00000019075)	TSHZ1 (ENSPFOG00000019081) ##22	ZNF516 (ENSPFOG00000019083)	ZNF236 (ENSPFOG00000019091)	mbpb (ENSPFOG00000019109)	GALR1 (ENSPFOG00000019111)	DEPDC1B (ENSPFOG00000019117)	SALL3 (ENSPFOG00000019127)	NFATC1 (ENSPFOG00000019133)	zgc:91890 (ENSPFOG00000019141)	PLEC (ENSPFOG00000019175)	ENSPFOG00000019228	ENSPFOG00000023186	ENSPFOG00000024095	RSPO2 (ENSPFOG00000019230)	eif3ea (ENSPFOG00000019233)	emc2 (ENSPFOG00000019243)
Guppy	MODERN SPECIES	446	ZHX1 (ENSPREG00000014000)	ENSPREG00000014018	ENSPREG00000014020	ENSPREG00000014026	ENSPREG00000014032	zgc:101716 (ENSPREG00000014040)	ENSPREG00000014048	TBC1D31 (ENSPREG00000014065)	derl1 (ENSPREG00000014096)	zhx2a (ENSPREG00000014120)	ENSPREG00000014133	ENSPREG00000014139	has2 (ENSPREG00000014148)	ENSPREG00000014191	PTGR3 (ENSPREG00000014202)	TSHZ1 (ENSPREG00000014215) ##22	ENSPREG00000014239	ZNF236 (ENSPREG00000014291)	ENSPREG00000014319	ENSPREG00000014334	mbpb (ENSPREG00000014354)	DEPDC1B (ENSPREG00000014400)	SALL3 (ENSPREG00000014420)	ENSPREG00000014432	ENSPREG00000014451	NFATC1 (ENSPREG00000014467)	zgc:91890 (ENSPREG00000014495)	ENSPREG00000014510	ENSPREG00000014518	ENSPREG00000014532	ENSPREG00000014625
Platyfish	MODERN SPECIES	17	ccdc127a (ENSXMAG00000021467)	ENSXMAG00000008930	mrpl32 (ENSXMAG00000008933)	psma2a (ENSXMAG00000022157)	ATAD2 (ENSXMAG00000008949)	ZHX1 (ENSXMAG00000021203)	ENSXMAG00000027666	zgc:101716 (ENSXMAG00000008971)	ENSXMAG00000025323	TBC1D31 (ENSXMAG00000008980)	derl1 (ENSXMAG00000008991)	zhx2a (ENSXMAG00000008999)	has2 (ENSXMAG00000009011)	ENSXMAG00000027759	PTGR3 (ENSXMAG00000009023)	TSHZ1 (ENSXMAG00000027021) ##22	ZNF516 (ENSXMAG00000009031)	ZNF236 (ENSXMAG00000026111)	ENSXMAG00000029135	ENSXMAG00000026401	mbpb (ENSXMAG00000009053)	ENSXMAG00000009054	DEPDC1B (ENSXMAG00000009067)	SALL3 (ENSXMAG00000023447)	NFATC1 (ENSXMAG00000009087)	zgc:91890 (ENSXMAG00000009105)	ENSXMAG00000029291	ENSXMAG00000026059	ENSXMAG00000027720	ENSXMAG00000029046	ENSXMAG00000009171
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	48										ENSGT01020000230438.A.e.a.f	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787.l	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000155965.b	ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.b	ENSGT00990000203884	ENSGT01050000244883.A.a.a.b	ENSGT00940000164700.A	ENSGT00980000202586	ENSGT00940000181435	ENSGT00940000166443.d.b	ENSGT01020000230438.A.e.b	ENSGT01020000230438.A.e.a.f	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787.l	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000155824.C.fc.l	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	7	ENSORLG00000026463	ENSORLG00000029441	prss1 (ENSORLG00000013582)	ENSORLG00000022147	ENSORLG00000022478	ENSORLG00000028711	ENSORLG00000030637	ENSORLG00000020746	ENSORLG00000006293	derl1 (ENSORLG00000020742)	zhx2a (ENSORLG00000020740)	ENSORLG00000026963	has2 (ENSORLG00000024353)	ENSORLG00000020738	PTGR3 (ENSORLG00000023224)	TSHZ1 (ENSORLG00000020732) ##22	ZNF516 (ENSORLG00000020731)	ENSORLG00000029270	ENSORLG00000030561	mbpb (ENSORLG00000020727)	GALR1 (ENSORLG00000022653)	ENSORLG00000020724	ENSORLG00000025678	ENSORLG00000024127	ENSORLG00000025065	SALL3 (ENSORLG00000020718)	ENSORLG00000020716	zgc:91890 (ENSORLG00000020715)	ENSORLG00000028039	ENSORLG00000029927	ENSORLG00000026390
Chinese medaka	MODERN SPECIES	73	zgc:66448 (ENSOSIG00000021888)	ENSOSIG00000021877	prss1 (ENSOSIG00000021871)	ENSOSIG00000021867	ENSOSIG00000021864	ENSOSIG00000021860	ENSOSIG00000021856	ENSOSIG00000021854	ENSOSIG00000021851	derl1 (ENSOSIG00000021844)	zhx2a (ENSOSIG00000021835)	ENSOSIG00000021827	has2 (ENSOSIG00000021819)	ZNF407 (ENSOSIG00000021807)	PTGR3 (ENSOSIG00000021802)	TSHZ1 (ENSOSIG00000021799) ##22	ZNF516 (ENSOSIG00000021797)	ENSOSIG00000021793	ENSOSIG00000021779	ENSOSIG00000021768	DEPDC1B (ENSOSIG00000021740)
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154446.b.b.b	ENSGT00940000162287.B.b	ENSGT00940000166158.a.b	ENSGT00940000172513	ENSGT00940000179005	ENSGT00940000164700.A	ENSGT00940000162287.C	ENSGT01020000230438.A.e.b	ENSGT00940000168692.e.b	ENSGT01020000230438.A.e.a.f	ENSGT00530000063156.b	ENSGT00950000182893.a.a.a.b.c	ENSGT00390000010337.B.a.b	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787.l	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00950000182976.b.b	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00940000177120	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00390000013999.d.b.c	ENSGT00390000013999.d.b.d
Indian medaka	MODERN SPECIES	467	zgc:66448 (ENSOMEG00000010575)	ENSOMEG00000010605	prss1 (ENSOMEG00000010641)	ENSOMEG00000010664	ENSOMEG00000010689	ENSOMEG00000010701	ENSOMEG00000010715	ENSOMEG00000010733	ENSOMEG00000010749	ENSOMEG00000010760	derl1 (ENSOMEG00000000259)	zhx2a (ENSOMEG00000010852)	has2 (ENSOMEG00000010881)	ENSOMEG00000010905	PTGR3 (ENSOMEG00000010923)	TSHZ1 (ENSOMEG00000010943) ##22	ENSOMEG00000010966	ZNF516 (ENSOMEG00000011053)	ENSOMEG00000011124	ENSOMEG00000011156	ENSOMEG00000011212	mbpb (ENSOMEG00000011271)	GALR1 (ENSOMEG00000011296)	DEPDC1B (ENSOMEG00000011343)	ENSOMEG00000011373	SALL3 (ENSOMEG00000011390)	NFATC1 (ENSOMEG00000011409)	zgc:91890 (ENSOMEG00000011432)	ENSOMEG00000011449	ENSOMEG00000011458	ENSOMEG00000011475
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	7	ENSOJAG00000011951	ENSOJAG00000011939	ENSOJAG00000011932	prss1 (ENSOJAG00000011830)	ENSOJAG00000011816	ENSOJAG00000011784	ENSOJAG00000011770	ENSOJAG00000011718	ENSOJAG00000011684	ENSOJAG00000011680	derl1 (ENSOJAG00000011674)	zhx2a (ENSOJAG00000011599)	has2 (ENSOJAG00000011579)	ZNF407 (ENSOJAG00000011517)	PTGR3 (ENSOJAG00000011175)	TSHZ1 (ENSOJAG00000011125) ##22	ENSOJAG00000011108	ENSOJAG00000011071	mbpb (ENSOJAG00000010933)	ENSOJAG00000010908	ENSOJAG00000010858	SALL3 (ENSOJAG00000010844)	NFATC1 (ENSOJAG00000010838)	zgc:91890 (ENSOJAG00000010827)	ENSOJAG00000010541	ENSOJAG00000010510	ENSOJAG00000010255	hamp2 (ENSOJAG00000010151)	ENSOJAG00000010115	RSPO2 (ENSOJAG00000010054)	ENSOJAG00000010023
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	7	SCX (ENSMMDG00005009170)	gapdhs (ENSMMDG00005009131)	ENSMMDG00005009120	tmem147 (ENSMMDG00005009117)	sult2st3 (ENSMMDG00005009114)	ENSMMDG00005009113	ENSMMDG00005008321	rwdd1 (ENSMMDG00005008279)	calhm5.1 (ENSMMDG00005023417)	calhm6 (ENSMMDG00005023416)	cnot10 (ENSMMDG00005023045)	TCAIM (ENSMMDG00005022916)	CNDP1 (ENSMMDG00005022820)	ZNF407 (ENSMMDG00005022816)	PTGR3 (ENSMMDG00005022815)	TSHZ1 (ENSMMDG00005022813) ##22	ZNF516 (ENSMMDG00005022812)	ZNF236 (ENSMMDG00005022806)	ENSMMDG00005022805	mbpb (ENSMMDG00005022804)	ENSMMDG00005022802	SALL3 (ENSMMDG00005022800)	NFATC1 (ENSMMDG00005022799)	zgc:91890 (ENSMMDG00005022798)	ENSMMDG00005022797	ENSMMDG00005022796	ENSMMDG00005022793	ENSMMDG00005022792	ENSMMDG00005022778	RSPO2 (ENSMMDG00005022762)	eif3ea (ENSMMDG00005022752)
Cod	MODERN SPECIES	2	lyplal1 (ENSGMOG00000014091)	ENSGMOG00000024728	tgfb2 (ENSGMOG00000017371)	RRP15 (ENSGMOG00000017385)	ENSGMOG00000017396	ENSGMOG00000023864	gprc6a (ENSGMOG00000007217)	kpna5 (ENSGMOG00000007147)	zufsp (ENSGMOG00000007079)	ENSGMOG00000007067	rwdd1 (ENSGMOG00000009852)	calhm5.1 (ENSGMOG00000007051)	calhm6 (ENSGMOG00000007041)	ENSGMOG00000006780	PTGR3 (ENSGMOG00000006772)	TSHZ1 (ENSGMOG00000032771) ##22	ZNF516 (ENSGMOG00000025897)	ZNF236 (ENSGMOG00000006668)	ENSGMOG00000027182	GALR1 (ENSGMOG00000018051)	SALL3 (ENSGMOG00000035951)	NFATC1 (ENSGMOG00000006631)	zgc:91890 (ENSGMOG00000006625)	ENSGMOG00000022230	ENSGMOG00000032792	ENSGMOG00000034847	ENSGMOG00000006545	RSPO2 (ENSGMOG00000026535)	emc2 (ENSGMOG00000006521)	TMEM74 (ENSGMOG00000006511)	TRHR (ENSGMOG00000006502)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00390000001745.a	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.d	ENSGT01060000249076	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c	ENSGT00940000159873	ENSGT00940000165779	ENSGT00520000055567.b	ENSGT00620000087993.a.b	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00390000007371.f	ENSGT00940000154868.a.b.b	ENSGT00390000016565.g	ENSGT00390000015719.c.c	ENSGT00940000156446	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a.b ##22	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT01000000219127	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157616.j.b	ENSGT00390000003774.a.a.d	ENSGT00940000166468	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a	ENSGT00940000161549.a.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a	ENSGT00940000159194	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.a
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000159873.j	ENSGT00390000001745.a.b	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.d	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00940000159873.i.a	ENSGT00940000165779	ENSGT00520000055567.b	ENSGT00620000087993.a.b.i	ENSGT00950000182900.B.c	ENSGT00390000007371.f.d	ENSGT00940000154868.a.b.b	ENSGT00390000016565.g.f	ENSGT00390000015719.c.c.c	ENSGT00940000156446.db.a	ENSGT00920000149172.d	ENSGT00950000183051.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000160839.f	ENSGT00940000156787.b	ENSGT00390000014772.l.mc.a	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000159356.a.a.e	ENSGT00940000157616.j.b.c	ENSGT00390000003774.a.a.d.b	ENSGT00940000166468	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.b	ENSGT01000000219127	ENSGT00390000016565.g.e	ENSGT00390000015719.c.c.d	ENSGT00940000156446.db.b	ENSGT00920000149172.c	ENSGT00950000183051.a.a.b.b ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00510000054197.m	ENSGT00390000001745.a.b	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.d	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00940000159873.i.a	ENSGT00940000165779	ENSGT00520000055567.b	ENSGT00620000087993.a.b.i	ENSGT00950000182900.B.c	ENSGT00390000007371.f.d.a.a	ENSGT00940000154868.a.b.b.d	ENSGT00390000016565.g.f	ENSGT00390000015719.c.c.c	ENSGT00940000156446.db.a	ENSGT00920000149172.d	ENSGT00950000183051.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000160839.f	ENSGT00940000156787.b	ENSGT01000000219127	ENSGT00940000171486.A.b	ENSGT00390000014772.l.mc.b	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000159356.a.a.f	ENSGT00940000157616.j.b.d	ENSGT00390000003774.a.a.d.a	ENSGT00940000166468	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.a	ENSGT00940000161549.a.b.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.d	ENSGT00940000159194.h	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00510000054197.m	ENSGT00390000001745.a.b	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.d	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00940000159873.i.b	ENSGT00940000165779.c	ENSGT00520000055567.b	ENSGT00620000087993.a.b.i	ENSGT00950000182900.B.c	ENSGT00390000007371.f.c.b.b	ENSGT00940000154868.a.b.b.d	ENSGT00390000016565.g.f	ENSGT00390000015719.c.c.c	ENSGT00940000156446.db.a	ENSGT00920000149172.d	ENSGT00950000183051.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000160839.f	ENSGT01000000219127	ENSGT00940000156787.b	ENSGT00940000171486.A.b	ENSGT00390000014772.l.mc.b	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000159356.a.a.f	ENSGT00940000157616.j.b.d	ENSGT00390000003774.a.a.d.a	ENSGT00940000166468	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.a	ENSGT00940000161549.a.b.b	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.d	ENSGT00940000159194.h	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.b
River trout	MODERN SPECIES	22	CD4-2b (ENSSTUG00000002855)	cd4-1 (ENSSTUG00000002816)	cldc1 (ENSSTUG00000002795)	cldc1 (ENSSTUG00000002763)	cops7a (ENSSTUG00000002740)	si:ch211-154o6.3 (ENSSTUG00000002704)	ENSSTUG00000002687	CEP85 (ENSSTUG00000002648)	wdtc1 (ENSSTUG00000002419)	tmem222a (ENSSTUG00000002395)	tpbgl (ENSSTUG00000002387)	KDF1 (ENSSTUG00000002381)	nr0b2a (ENSSTUG00000002363)	ZNF407 (ENSSTUG00000002289)	PTGR3 (ENSSTUG00000002224)	TSHZ1 (ENSSTUG00000002217) ##22	ENSSTUG00000002212	ZNF516 (ENSSTUG00000002205)	ENSSTUG00000002197	ZNF236 (ENSSTUG00000002170)	ENSSTUG00000002160	mbpb (ENSSTUG00000002150)	GALR1 (ENSSTUG00000002145)	ENSSTUG00000002144	ENSSTUG00000002142	SALL3 (ENSSTUG00000002135)	NFATC1 (ENSSTUG00000002110)	zgc:91890 (ENSSTUG00000002091)	ENSSTUG00000002072	ENSSTUG00000002065	ENSSTUG00000001596
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	24	ENSSSAG00000040842	cd4-1 (ENSSSAG00000040774)	CLC4E (ENSSSAG00000040735)	ENSSSAG00000040658	ENSSSAG00000040620	ENSSSAG00000040491	ENSSSAG00000040435	ENSSSAG00000039109	ENSSSAG00000040386	tpbgl (ENSSSAG00000039024)	ENSSSAG00000038969	nr0b2a (ENSSSAG00000038883)	ENSSSAG00000109771	ZNF407 (ENSSSAG00000037948)	PTGR3 (ENSSSAG00000036059)	TSHZ1 (ENSSSAG00000035735) ##22	ZNF516 (ENSSSAG00000035325)	ZNF236 (ENSSSAG00000034272)	ENSSSAG00000104955	mbpb (ENSSSAG00000033944)	GALR1 (ENSSSAG00000103605)	ENSSSAG00000094103	SALL3 (ENSSSAG00000033555)	NFATC1 (ENSSSAG00000032982)	zgc:91890 (ENSSSAG00000032826)	ENSSSAG00000076976	ENSSSAG00000092333	ENSSSAG00000036583	ENSSSAG00000012590	RSPO2 (ENSSSAG00000096641)	eif3ea (ENSSSAG00000010484)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.d	ENSGT01060000249076.b	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00940000159873.i.a	ENSGT00940000165779	ENSGT00520000055567.b	ENSGT00620000087993.a.b.i.b	ENSGT00620000087993.a.b.i.a	ENSGT00950000182900.B.c	ENSGT00390000007371.f.d.a.a	ENSGT00940000154868.a.b.b.d	ENSGT00390000016565.g.f	ENSGT00390000015719.c.c.c	ENSGT00940000156446.db.a	ENSGT00920000149172.d	ENSGT00950000183051.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000160839.f	ENSGT01000000219127	ENSGT00940000156787.b	ENSGT00940000171486.A.b	ENSGT00390000014772.l.mc.b	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000159356.a.a.f	ENSGT00940000157616.j.b.d	ENSGT00390000003774.a.a.d.a	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.a	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.d	ENSGT00940000159194.h	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.a.b.a	ENSGT00390000011922.t	ENSGT00530000063880.b.f.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00390000001745.a.b	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.d	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.b.a	ENSGT00940000159873.i.a	ENSGT00940000165779	ENSGT00520000055567.b	ENSGT00620000087993.a.b.i.b	ENSGT00620000087993.a.b.i.a	ENSGT00950000182900.B.c	ENSGT00390000007371.f.d.a.a	ENSGT00940000154868.a.b.b.d	ENSGT00390000016565.g.f	ENSGT00390000015719.c.c.c	ENSGT00940000156446.db.a	ENSGT00920000149172.d	ENSGT00950000183051.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000160839.f	ENSGT00940000156787.b	ENSGT01000000219127	ENSGT00940000171486.A.b	ENSGT00390000014772.l.mc.b	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000159356.a.a.f	ENSGT00940000157616.j.b.d	ENSGT00390000003774.a.a.d.a	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.a	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.d	ENSGT00940000159194.h	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.b	ENSGT00390000011922.t	ENSGT00530000063880.b.f.d
Chinook salmon	MODERN SPECIES	15	ENSOTSG00005009179	tpi1b (ENSOTSG00005009180)	lpcat3 (ENSOTSG00005009183)	CLSTN3 (ENSOTSG00005009190)	pex5 (ENSOTSG00005009505)	cdca3 (ENSOTSG00005009614)	gnb3a (ENSOTSG00005009615)	P3H3 (ENSOTSG00005009616)	usp5 (ENSOTSG00005009633)	ENSOTSG00005011510	cd4-1 (ENSOTSG00005011511)	ENSOTSG00005011513	cldc1 (ENSOTSG00005011514)	ENSOTSG00005011515	PTGR3 (ENSOTSG00005011517)	TSHZ1 (ENSOTSG00005011518) ##22	ZNF516 (ENSOTSG00005011519)	ZNF236 (ENSOTSG00005011520)	ENSOTSG00005011521	ENSOTSG00005011523	mbpb (ENSOTSG00005011522)	GALR1 (ENSOTSG00005011524)	ENSOTSG00005011525	SALL3 (ENSOTSG00005011526)	NFATC1 (ENSOTSG00005011528)	zgc:91890 (ENSOTSG00005011542)	ENSOTSG00005011543	ENSOTSG00005011545	RSPO2 (ENSOTSG00005011580)	eif3ea (ENSOTSG00005011582)	emc2 (ENSOTSG00005011715)
Coho salmon	MODERN SPECIES	4	cldc1 (ENSOKIG00005004106)	cops7a (ENSOKIG00005004092)	si:ch211-154o6.3 (ENSOKIG00005004068)	ENSOKIG00005004046	ENSOKIG00005004038	ENSOKIG00005004034	ENSOKIG00005004016	wdtc1 (ENSOKIG00005003873)	tmem222a (ENSOKIG00005003814)	ENSOKIG00005026204	tpbgl (ENSOKIG00005026203)	KDF1 (ENSOKIG00005026199)	nr0b2a (ENSOKIG00005026188)	ZNF407 (ENSOKIG00005026123)	PTGR3 (ENSOKIG00005026070)	TSHZ1 (ENSOKIG00005026057) ##22	ENSOKIG00005026049	ENSOKIG00005026038	ENSOKIG00005026023	ZNF236 (ENSOKIG00005025952)	ENSOKIG00005025929	mbpb (ENSOKIG00005025916)	GALR1 (ENSOKIG00005025890)	SALL3 (ENSOKIG00005025839)	NFATC1 (ENSOKIG00005025817)	ENSOKIG00005025797	ENSOKIG00005025784	ENSOKIG00005013925	RSPO2 (ENSOKIG00005013309)	eif3ea (ENSOKIG00005013195)	emc2 (ENSOKIG00005012801)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	11	ENSOMYG00000034790	cd4-1 (ENSOMYG00000034801)	ENSOMYG00000034819	cldc1 (ENSOMYG00000034835)	ENSOMYG00000034866	si:ch211-154o6.3 (ENSOMYG00000034899)	ENSOMYG00000034924	ENSOMYG00000034941	wdtc1 (ENSOMYG00000035008)	ENSOMYG00000057152	tpbgl (ENSOMYG00000074373)	ENSOMYG00000035439	nr0b2a (ENSOMYG00000035445)	ZNF407 (ENSOMYG00000035459)	PTGR3 (ENSOMYG00000035472)	TSHZ1 (ENSOMYG00000035486) ##22	ZNF516 (ENSOMYG00000035494)	ZNF236 (ENSOMYG00000035528)	ENSOMYG00000064197	mbpb (ENSOMYG00000068618)	GALR1 (ENSOMYG00000058662)	ENSOMYG00000035556	SALL3 (ENSOMYG00000035569)	ENSOMYG00000060359	NFATC1 (ENSOMYG00000035590)	zgc:91890 (ENSOMYG00000035606)	ENSOMYG00000063996	ENSOMYG00000035618	ENSOMYG00000035625	ENSOMYG00000035633	ENSOMYG00000051575
Huchen	MODERN SPECIES	45	cd4-1 (ENSHHUG00000014428)	cldc1 (ENSHHUG00000014398)	cldc1 (ENSHHUG00000014348)	ENSHHUG00000014334	si:ch211-154o6.3 (ENSHHUG00000014325)	ENSHHUG00000014301	CEP85 (ENSHHUG00000014282)	wdtc1 (ENSHHUG00000014182)	tmem222a (ENSHHUG00000014174)	ENSHHUG00000014166	KDF1 (ENSHHUG00000014161)	nr0b2a (ENSHHUG00000014156)	ENSHHUG00000014153	ENSHHUG00000014148	PTGR3 (ENSHHUG00000014145)	TSHZ1 (ENSHHUG00000014141) ##22	ZNF516 (ENSHHUG00000014117)	ZNF236 (ENSHHUG00000014041)	mbpb (ENSHHUG00000014011)	GALR1 (ENSHHUG00000013988)	SALL3 (ENSHHUG00000013967)	NFATC1 (ENSHHUG00000013952)	zgc:91890 (ENSHHUG00000013928)	ENSHHUG00000013924	ENSHHUG00000013921	ENSHHUG00000013917	ENSHHUG00000013003
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00950000183051.a.a.b.a ##22	ENSGT00940000160839.f	ENSGT00940000156787.b	ENSGT00390000014772.l.mc.a	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000159356.a.a.e	ENSGT00940000157616.j.b.c	ENSGT00390000003774.a.a.d.b	ENSGT00940000166468	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.b	ENSGT01000000219127	ENSGT00390000016565.g.e	ENSGT00390000015719.c.c.d	ENSGT00940000156446.db.b	ENSGT00920000149172.c	ENSGT00950000183051.a.a.b.b ##22	ENSGT00940000160839.e	ENSGT00940000156787.a	ENSGT00940000171486.A	ENSGT00390000014772.l.mc.b	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000159356.a.a.f	ENSGT00940000157616.j.b.d	ENSGT00390000003774.a.a.d.a	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.a	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.d	ENSGT00940000159194.h	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.b	ENSGT00390000011922.t	ENSGT00530000063880.b.f.d	ENSGT01100000263484.B.b.b.a.b.d
Huchen	MODERN SPECIES	2202													ENSHHUG00000032644	ENSHHUG00000032643	PTGR3 (ENSHHUG00000032642)	TSHZ1 (ENSHHUG00000032641) ##22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	90							ENSGT00960000191430	ENSGT00620000087993.a.b.j	ENSGT00950000182900.B.d	ENSGT00390000007371.f.d.a.b	ENSGT00940000154868.a.b.b.c	ENSGT00390000016565.g.e	ENSGT00390000015719.c.c.d	ENSGT00940000156446.db.b	ENSGT00920000149172.c	ENSGT00950000183051.a.a.b.b ##22	ENSGT00940000160839.e	ENSGT00940000156787.a	ENSGT00940000171486.A.a	ENSGT00390000014772.l.mc.a	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000159356.a.a.e	ENSGT00940000157616.j.b.c	ENSGT00390000003774.a.a.d.b	ENSGT00940000159045	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.b	ENSGT00940000161549.a.b.a	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.c	ENSGT00940000159194.g	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.a.b.b	ENSGT00390000011922.s
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00510000054197.n	ENSGT00390000001745.a.a	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.a	ENSGT01060000249076	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.b.b	ENSGT00940000159873.i.a	ENSGT00940000165779.d	ENSGT00620000087993.a.b.j	ENSGT00950000182900.B.d	ENSGT00390000007371.f.d.a.b	ENSGT00940000154868.a.b.b.c	ENSGT00390000016565.g.e	ENSGT00390000015719.c.c.d	ENSGT00940000156446.db.b	ENSGT00920000149172.c	ENSGT00950000183051.a.a.b.b ##22	ENSGT00940000160839.e	ENSGT00940000156787.a	ENSGT00940000171486.A.a	ENSGT00390000014772.l.lc	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000159356.a.a.e	ENSGT00940000157616.j.b.c	ENSGT00390000003774.a.a.d.b	ENSGT00940000159045	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.b	ENSGT00940000161549.a.b.a	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.c	ENSGT00940000159194.g	ENSGT00390000002661.b.ub.b.b	ENSGT00390000011922.s
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	11	usp5 (ENSSSAG00000076540)	ENSSSAG00000076595	cd4-1 (ENSSSAG00000076631)	ENSSSAG00000076652	C209E (ENSSSAG00000076658)	csn7a (ENSSSAG00000076662)	si:ch211-154o6.3 (ENSSSAG00000076670)	ENSSSAG00000076685	wdtc1 (ENSSSAG00000076694)	tmem222a (ENSSSAG00000076801)	tpbgl (ENSSSAG00000117301)	ENSSSAG00000076816	nr0b2 (ENSSSAG00000076817)	ZNF407 (ENSSSAG00000085595)	zadh2 (ENSSSAG00000076818)	TSHZ1 (ENSSSAG00000076821) ##22	ENSSSAG00000093355	ZNF516 (ENSSSAG00000076825)	ZNF236 (ENSSSAG00000076830)	ENSSSAG00000093220	mbpb (ENSSSAG00000076838)	GALR1 (ENSSSAG00000033629)	ENSSSAG00000098916	SALL3 (ENSSSAG00000108951)	NFATC1 (ENSSSAG00000076879)	ct054 (ENSSSAG00000076975)	ENSSSAG00000032530	ENSSSAG00000076982	ENSSSAG00000038733	RSPO2 (ENSSSAG00000046933)	eif3ea (ENSSSAG00000046961)
River trout	MODERN SPECIES	30	usp5 (ENSSTUG00000038671)	CD4-2a (ENSSTUG00000038814)	CD4-1 (ENSSTUG00000038833)	cldc1 (ENSSTUG00000038854)	cops7a (ENSSTUG00000038867)	CEP85 (ENSSTUG00000038883)	wdtc1 (ENSSTUG00000038906)	tmem222a (ENSSTUG00000039221)	tpbgl (ENSSTUG00000039236)	ENSSTUG00000039242	nr0b2a (ENSSTUG00000039248)	ZNF407 (ENSSTUG00000039259)	ENSSTUG00000039271	ENSSTUG00000039276	PTGR3 (ENSSTUG00000039286)	TSHZ1 (ENSSTUG00000039293) ##22	ZNF516 (ENSSTUG00000039297)	ENSSTUG00000039306	ZNF236 (ENSSTUG00000039315)	ENSSTUG00000039434	mbpb (ENSSTUG00000039439)	GALR1 (ENSSTUG00000039447)	SALL3 (ENSSTUG00000039470)	NFATC1 (ENSSTUG00000039482)	zgc:91890 (ENSSTUG00000039570)	ENSSTUG00000039579	ENSSTUG00000039604	ENSSTUG00000039608	ENSSTUG00000039635	RSPO2 (ENSSTUG00000041112)	eif3ea (ENSSTUG00000041164)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00510000054197.n	ENSGT00390000001745.a.a	ENSGT01060000249076.a	ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.a.c.a	ENSGT00940000159873.j	ENSGT00990000211197	ENSGT00960000191430	ENSGT00620000087993.a.b.j	ENSGT00950000182900.B.d	ENSGT00390000007371.f.d.a.b	ENSGT00940000154868.a.b.b.c	ENSGT00390000016565.g.e	ENSGT00390000015719.c.c.d	ENSGT00940000156446.db.b	ENSGT00920000149172.c	ENSGT00950000183051.a.a.b.b ##22	ENSGT00940000160839.e	ENSGT00940000156787.a	ENSGT00940000171486.A.a	ENSGT00390000014772.l.mc.a	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000159356.a.a.e	ENSGT00940000157616.j.b.c	ENSGT00390000003774.a.a.d.b	ENSGT00940000166468
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156115.d.b	ENSGT00940000161527.w.a	ENSGT00390000003312.a	ENSGT00940000165224.a.b.c	ENSGT00940000165134.a.b.f.a.a.b	ENSGT00990000211197	ENSGT00960000191430	ENSGT00620000087993.a.b.j	ENSGT00950000182900.B.d	ENSGT00390000007371.f.d.a.b	ENSGT00940000154868.a.b.b.c	ENSGT00390000016565.g.e	ENSGT00390000015719.c.c.d	ENSGT00940000156446.db.b	ENSGT00920000149172.c	ENSGT00950000183051.a.a.b.b ##22	ENSGT00940000160839.e	ENSGT00940000156787.a	ENSGT00940000171486.A.a	ENSGT00390000014772.l.mc.a	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000159356.a.a.e	ENSGT00940000157616.j.b.c	ENSGT00390000003774.a.a.d.b	ENSGT00940000159045	ENSGT00970000193390.c.b.b.a.l.a.b	ENSGT00940000161549.a.b.a	ENSGT00940000162855.a.a.a.a.c	ENSGT00940000159194.g	ENSGT00390000002661.b.ub.b.a.a.b.b	ENSGT00390000011922.s
Chinook salmon	DUPLICATION
Chinook salmon	DUPLICATION
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	21	cd209 (ENSOMYG00000000828)	ENSOMYG00000000836	ENSOMYG00000000849	ENSOMYG00000000867	ENSOMYG00000058000	ENSOMYG00000000880	wdtc1 (ENSOMYG00000000892)	tmem222a (ENSOMYG00000000900)	tpbgl (ENSOMYG00000072556)	ENSOMYG00000000924	nr0b2a (ENSOMYG00000000941)	ENSOMYG00000064514	ZNF407 (ENSOMYG00000072638)	ENSOMYG00000072387	PTGR3 (ENSOMYG00000000954)	TSHZ1 (ENSOMYG00000000961) ##22	ZNF516 (ENSOMYG00000000977)	ZNF236 (ENSOMYG00000001055)	ENSOMYG00000064884	mbpb (ENSOMYG00000077327)	GALR1 (ENSOMYG00000001126)	SALL3 (ENSOMYG00000001150)	NFATC1 (ENSOMYG00000001264)	zgc:91890 (ENSOMYG00000001305)	ENSOMYG00000068740	ENSOMYG00000001352	ENSOMYG00000001374	ENSOMYG00000002802	RSPO2 (ENSOMYG00000004058)	if36 (ENSOMYG00000004178)	emc2 (ENSOMYG00000004490)
Northern pike	MODERN SPECIES	19	ENSELUG00000019629	cd4-1 (ENSELUG00000019649)	cldc1 (ENSELUG00000019676)	cldc1 (ENSELUG00000032669)	cops7a (ENSELUG00000019718)	si:ch211-154o6.3 (ENSELUG00000019787)	ENSELUG00000019827	CEP85 (ENSELUG00000019854)	wdtc1 (ENSELUG00000019912)	tpbgl (ENSELUG00000019857)	ENSELUG00000019929	RNF213 (ENSELUG00000020033)	nr0b2a (ENSELUG00000020058)	ZNF407 (ENSELUG00000020080)	PTGR3 (ENSELUG00000020096)	TSHZ1 (ENSELUG00000020104) ##22	ENSELUG00000021678	ZNF236 (ENSELUG00000020211)	ENSELUG00000020125	ENSELUG00000020277	mbpb (ENSELUG00000027307)	GALR1 (ENSELUG00000020304)	SALL3 (ENSELUG00000020351)	NFATC1 (ENSELUG00000000894)	zgc:91890 (ENSELUG00000020425)	ENSELUG00000020437	ENSELUG00000030656	ENSELUG00000020466	gdf6a (ENSELUG00000020475)	ENSELUG00000025161	eny2 (ENSELUG00000028439)
Spotted gar	MODERN SPECIES	649	ENSLOCG00000004298	ENSLOCG00000004279	ENSLOCG00000018326	cpvl (ENSLOCG00000004266)	vars1 (ENSLOCG00000004240)	ENSLOCG00000004226	ENSLOCG00000004196	snrnp48 (ENSLOCG00000004187)	ENSLOCG00000004159	ENSLOCG00000004141	cndp2 (ENSLOCG00000004123)	cndp1 (ENSLOCG00000004094)	CNDP1 (ENSLOCG00000004060)	ZNF407 (ENSLOCG00000004046)	PTGR3 (ENSLOCG00000004028)	tshz1 (ENSLOCG00000004005) ##22	ZNF516 (ENSLOCG00000003974)	ZNF236 (ENSLOCG00000003926)	MBP (ENSLOCG00000003900)	GALR1 (ENSLOCG00000003878)	ENSLOCG00000003865	kcnk9 (ENSLOCG00000003851)	ENSLOCG00000003807	ENSLOCG00000018325	ENSLOCG00000003777	FAM135B (ENSLOCG00000003757)	KHDRBS3 (ENSLOCG00000003734)	ZFAT (ENSLOCG00000003701)	ENSLOCG00000003676	ST3GAL1 (ENSLOCG00000003647)	RPRD1A (ENSLOCG00000003632)
Reedfish	MODERN SPECIES	4	ENSECRG00000021150	ENSECRG00000021143	mrpl32 (ENSECRG00000021136)	psma2b (ENSECRG00000021101)	wdyhv1 (ENSECRG00000021075)	ATAD2 (ENSECRG00000021029)	ENSECRG00000021000	ENSECRG00000020987	ENSECRG00000020970	cndp2 (ENSECRG00000020940)	cndp1 (ENSECRG00000020772)	CNDP1 (ENSECRG00000020687)	ENSECRG00000020651	ENSECRG00000020638	PTGR3 (ENSECRG00000020615)	tshz1 (ENSECRG00000020602) ##22	ZNF516 (ENSECRG00000020570)	ZNF236 (ENSECRG00000020468)	MBP (ENSECRG00000020435)	SALL3 (ENSECRG00000020420)	ENSECRG00000020408	atp9b (ENSECRG00000020120)	nfatc1 (ENSECRG00000019663)	ctdp1 (ENSECRG00000019575)	KCNG2 (ENSECRG00000019556)	SLC66A2 (ENSECRG00000019522)	ENSECRG00000019490	ENSECRG00000019468	RBFA (ENSECRG00000019443)	nutf2l (ENSECRG00000019402)	adnp2b (ENSECRG00000019383)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1565		has2 (ENSCMIG00000008024)	TBC1D31 (ENSCMIG00000008048)	DERL1 (ENSCMIG00000008081)	ENSCMIG00000008084	ENSCMIG00000008088	ZHX1 (ENSCMIG00000008092)	ATAD2 (ENSCMIG00000008105)	wdyhv1 (ENSCMIG00000008134)	fbxo32 (ENSCMIG00000008137)	klhl38a (ENSCMIG00000008152)	ANXA13 (ENSCMIG00000008154)	fam91a1 (ENSCMIG00000008175)	ZNF407 (ENSCMIG00000008182)	PTGR3 (ENSCMIG00000008184)	tshz1 (ENSCMIG00000008186) ##22	ENSCMIG00000008188	ZNF516 (ENSCMIG00000008190)	ZNF236 (ENSCMIG00000008200)	ENSCMIG00000008220	ENSCMIG00000008225	ENSCMIG00000008232	SALL3 (ENSCMIG00000008237)	atp9b (ENSCMIG00000008397)	nfatc1 (ENSCMIG00000008886)	ctdp1 (ENSCMIG00000008903)	ENSCMIG00000008927	SLC66A2 (ENSCMIG00000008929)
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	355									ENSGT00940000154900	ENSGT00940000156134	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000160725	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00950000182905.b
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00950000182909.b.b.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00950000182909.b.b.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000156490	ENSGT00980000202953	ENSGT00390000001787
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182909.b.b.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Anura	ANCESTRAL SPECIES	118	ENSGT00950000182909.b.b.a	ENSGT00530000063956.a	ENSGT01100000263524.B.b.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b.k	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	3	ENSLLEG00000029312	PARD6B (ENSLLEG00000029287)	ENSLLEG00000029269	ENSLLEG00000029258	ADNP (ENSLLEG00000029240)	DPM1 (ENSLLEG00000029127)	KCNG1 (ENSLLEG00000029105)	NFATC2 (ENSLLEG00000029049)	ATP9A (ENSLLEG00000028745)	SALL4 (ENSLLEG00000028680)	ZFP64 (ENSLLEG00000028647)	ENSLLEG00000028634	ENSLLEG00000028629	ENSLLEG00000028617	ENSLLEG00000028601	TSHZ2 (ENSLLEG00000028593) ##22	ZNF217 (ENSLLEG00000028506)	ENSLLEG00000027840	CYP24A1 (ENSLLEG00000027731)	PFDN4 (ENSLLEG00000027696)	ENSLLEG00000027648	DOK5 (ENSLLEG00000027460)	ENSLLEG00000027433	ENSLLEG00000027400	CBLN4 (ENSLLEG00000027370)	ENSLLEG00000027281	MC3R (ENSLLEG00000027236)	ENSLLEG00000027224	FAM210B (ENSLLEG00000027183)	AURKA (ENSLLEG00000027137)	CSTF1 (ENSLLEG00000027100)
Frog	MODERN SPECIES	1	spata2 (ENSXETG00000024008)	opn7b (ENSXETG00000031228)	cebpb (ENSXETG00000048564)	ptpn1 (ENSXETG00000012288)	ripor3 (ENSXETG00000012297)	pard6b (ENSXETG00000040385)	bcas4 (ENSXETG00000040230)	adnp (ENSXETG00000045270)	dpm1 (ENSXETG00000012303)	kcng1 (ENSXETG00000045918)	nfatc2 (ENSXETG00000012311)	atp9a (ENSXETG00000012313)	sall4 (ENSXETG00000012326)	ENSXETG00000041304	zfp64 (ENSXETG00000012327)	tshz2 (ENSXETG00000017555) ##22	znf217 (ENSXETG00000017550)	ENSXETG00000042264	bcas1 (ENSXETG00000035009)	cyp24a1 (ENSXETG00000017527)	pfdn4 (ENSXETG00000017525)	dok5 (ENSXETG00000015723)	ENSXETG00000043417	ENSXETG00000041563	cbln4 (ENSXETG00000015716)	mc3r (ENSXETG00000048875)	ENSXETG00000048914	abca9 (ENSXETG00000021974)	kif19 (ENSXETG00000012830)	dnai2 (ENSXETG00000012829)	ttyh2 (ENSXETG00000012828)
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Aves	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182909.b.b.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000182909.b.b.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Common canary	MODERN SPECIES	21	ENSSCAG00000015563	CEBPB (ENSSCAG00000015560)	PTPN1 (ENSSCAG00000015550)	RIPOR3 (ENSSCAG00000015538)	PARD6B (ENSSCAG00000015530)	ENSSCAG00000015525	ADNP (ENSSCAG00000015521)	DPM1 (ENSSCAG00000015518)	MOCS3 (ENSSCAG00000015515)	KCNG1 (ENSSCAG00000015512)	NFATC2 (ENSSCAG00000015508)	ATP9A (ENSSCAG00000015481)	ZFP64 (ENSSCAG00000015462)	SALL4 (ENSSCAG00000015460)	ENSSCAG00000015455	TSHZ2 (ENSSCAG00000015452) ##22	ENSSCAG00000015450	ZNF217 (ENSSCAG00000015449)	ENSSCAG00000015447	CYP24A1 (ENSSCAG00000015444)	DOK5 (ENSSCAG00000015438)	CBLN4 (ENSSCAG00000015435)	MC3R (ENSSCAG00000015430)	FAM210B (ENSSCAG00000015428)	AURKA (ENSSCAG00000015426)	CSTF1 (ENSSCAG00000015423)	CASS4 (ENSSCAG00000015419)	GCNT7 (ENSSCAG00000015417)	RTF2 (ENSSCAG00000015415)	TFAP2C (ENSSCAG00000015400)	BMP7 (ENSSCAG00000015394)
Zebra finch	MODERN SPECIES	13	ENSTGUG00000029053	CEBPB (ENSTGUG00000029712)	ENSTGUG00000008681	ENSTGUG00000025838	ENSTGUG00000026980	ENSTGUG00000008662	ENSTGUG00000008645	ENSTGUG00000029116	ENSTGUG00000024127	ENSTGUG00000020398	ENSTGUG00000018954	ENSTGUG00000028285	ENSTGUG00000008565	ENSTGUG00000024302	ENSTGUG00000028603	TSHZ2 (ENSTGUG00000008551) ##22	ZNF217 (ENSTGUG00000023199)	BCAS1 (ENSTGUG00000019321)	CYP24A1 (ENSTGUG00000008516)	ENSTGUG00000008507	DOK5 (ENSTGUG00000008495)	CBLN4 (ENSTGUG00000022496)	ENSTGUG00000008480	MC3R (ENSTGUG00000008472)	FAM210B (ENSTGUG00000018839)	AURKA (ENSTGUG00000008457)	CSTF1 (ENSTGUG00000008448)	CASS4 (ENSTGUG00000008443)	GCNT7 (ENSTGUG00000008427)	RTF2 (ENSTGUG00000020647)	TFAP2C (ENSTGUG00000008378)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	59	SPATA2 (ENSGFOG00000001747)	RNF114 (ENSGFOG00000001738)	ENSGFOG00000001721	ENSGFOG00000001699	PTPN1 (ENSGFOG00000001654)	RIPOR3 (ENSGFOG00000001624)	PARD6B (ENSGFOG00000001604)	ADNP (ENSGFOG00000001590)	DPM1 (ENSGFOG00000001576)	ENSGFOG00000001569	KCNG1 (ENSGFOG00000001557)	ENSGFOG00000001521	ENSGFOG00000001507	ATP9A (ENSGFOG00000001492)	SALL4 (ENSGFOG00000001487)	TSHZ2 (ENSGFOG00000001481) ##22	ENSGFOG00000001475	ZNF217 (ENSGFOG00000001470)	ENSGFOG00000001462	CYP24A1 (ENSGFOG00000001452)	PFDN4 (ENSGFOG00000001440)	DOK5 (ENSGFOG00000001429)	CBLN4 (ENSGFOG00000001421)	ENSGFOG00000001404	MC3R (ENSGFOG00000001395)	FAM210B (ENSGFOG00000001389)	AURKA (ENSGFOG00000001380)	CSTF1 (ENSGFOG00000001373)	CASS4 (ENSGFOG00000001363)	GCNT7 (ENSGFOG00000001357)	RTF2 (ENSGFOG00000001355)
Flycatcher	MODERN SPECIES	12	ENSFALG00000012987	ENSFALG00000012994	CEBPB (ENSFALG00000014081)	ENSFALG00000027297	PTPN1 (ENSFALG00000026835)	RIPOR3 (ENSFALG00000013024)	PARD6B (ENSFALG00000028746)	ADNP (ENSFALG00000023912)	DPM1 (ENSFALG00000013035)	MOCS3 (ENSFALG00000013036)	KCNG1 (ENSFALG00000013038)	NFATC2 (ENSFALG00000013042)	ATP9A (ENSFALG00000013078)	SALL4 (ENSFALG00000013149)	ZFP64 (ENSFALG00000013162)	TSHZ2 (ENSFALG00000013173) ##22	ZNF217 (ENSFALG00000013177)	ENSFALG00000013180	CYP24A1 (ENSFALG00000013185)	ENSFALG00000013193	ENSFALG00000023955	DOK5 (ENSFALG00000010957)	CBLN4 (ENSFALG00000027511)	ENSFALG00000023014	MC3R (ENSFALG00000015070)	FAM210B (ENSFALG00000010938)	AURKA (ENSFALG00000010927)	CSTF1 (ENSFALG00000026393)	CASS4 (ENSFALG00000010908)	GCNT7 (ENSFALG00000010896)	ENSFALG00000027930
Great tit	MODERN SPECIES	12	ENSPMJG00000009188	CEBPB (ENSPMJG00000009183)	ENSPMJG00000009176	PTPN1 (ENSPMJG00000009171)	RIPOR3 (ENSPMJG00000009168)	PARD6B (ENSPMJG00000009164)	ADNP (ENSPMJG00000009162)	DPM1 (ENSPMJG00000009147)	MOCS3 (ENSPMJG00000009145)	KCNG1 (ENSPMJG00000009144)	NFATC2 (ENSPMJG00000009143)	ATP9A (ENSPMJG00000009140)	SALL4 (ENSPMJG00000009135)	ZFP64 (ENSPMJG00000009131)	ENSPMJG00000009123	TSHZ2 (ENSPMJG00000009122) ##22	ENSPMJG00000009115	ZNF217 (ENSPMJG00000009111)	ENSPMJG00000009107	CYP24A1 (ENSPMJG00000009102)	PFDN4 (ENSPMJG00000009095)	DOK5 (ENSPMJG00000009076)	CBLN4 (ENSPMJG00000009074)	ENSPMJG00000009073	MC3R (ENSPMJG00000009072)	FAM210B (ENSPMJG00000009071)	AURKA (ENSPMJG00000009069)	CSTF1 (ENSPMJG00000009062)	CASS4 (ENSPMJG00000009060)	GCNT7 (ENSPMJG00000009059)	RTF2 (ENSPMJG00000009056)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Kakapo	MODERN SPECIES	5	ENSSHBG00005006977	UBE2V1 (ENSSHBG00005006945)	ENSSHBG00005006905	CEBPB (ENSSHBG00005006889)	PTPN1 (ENSSHBG00005006848)	RIPOR3 (ENSSHBG00005006743)	PARD6B (ENSSHBG00005006723)	ADNP (ENSSHBG00005006679)	DPM1 (ENSSHBG00005006655)	MOCS3 (ENSSHBG00005006649)	KCNG1 (ENSSHBG00005006625)	NFATC2 (ENSSHBG00005006602)	ATP9A (ENSSHBG00005006556)	SALL4 (ENSSHBG00005006532)	ZFP64 (ENSSHBG00005006515)	TSHZ2 (ENSSHBG00005006499) ##22	ENSSHBG00005006486	ZNF217 (ENSSHBG00005006452)	ENSSHBG00005006435	CYP24A1 (ENSSHBG00005006412)	PFDN4 (ENSSHBG00005006394)	DOK5 (ENSSHBG00005006374)	CBLN4 (ENSSHBG00005006358)	MC3R (ENSSHBG00005006348)	FAM210B (ENSSHBG00005006333)	AURKA (ENSSHBG00005006319)	CSTF1 (ENSSHBG00005006299)	CASS4 (ENSSHBG00005005897)	GCNT7 (ENSSHBG00005005831)	RTF2 (ENSSHBG00005005814)	TFAP2C (ENSSHBG00005005793)
Golden eagle	MODERN SPECIES	19	ENSACCG00020009490	CEBPB (ENSACCG00020009480)	PTPN1 (ENSACCG00020009468)	RIPOR3 (ENSACCG00020009436)	PARD6B (ENSACCG00020009406)	BCAS4 (ENSACCG00020009398)	ADNP (ENSACCG00020009379)	DPM1 (ENSACCG00020009351)	MOCS3 (ENSACCG00020009342)	KCNG1 (ENSACCG00020009334)	NFATC2 (ENSACCG00020009326)	ATP9A (ENSACCG00020009297)	SALL4 (ENSACCG00020009275)	ZFP64 (ENSACCG00020009263)	ENSACCG00020009252	TSHZ2 (ENSACCG00020009249) ##22	ZNF217 (ENSACCG00020009238)	BCAS1 (ENSACCG00020009215)	CYP24A1 (ENSACCG00020009197)	PFDN4 (ENSACCG00020009177)	DOK5 (ENSACCG00020009159)	CBLN4 (ENSACCG00020009135)	MC3R (ENSACCG00020009123)	FAM210B (ENSACCG00020009117)	AURKA (ENSACCG00020009105)	CSTF1 (ENSACCG00020009093)	CASS4 (ENSACCG00020009058)	GCNT7 (ENSACCG00020008953)	RTF2 (ENSACCG00020008941)	TFAP2C (ENSACCG00020008922)	BMP7 (ENSACCG00020003902)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.d	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	10	ENSABRG00000021123	ENSABRG00000021125	CEBPB (ENSABRG00000021130)	PTPN1 (ENSABRG00000021148)	RIPOR3 (ENSABRG00000021155)	PARD6B (ENSABRG00000021158)	BCAS4 (ENSABRG00000021167)	ENSABRG00000021174	ENSABRG00000021179	DPM1 (ENSABRG00000021185)	KCNG1 (ENSABRG00000021189)	NFATC2 (ENSABRG00000021208)	ATP9A (ENSABRG00000021425)	SALL4 (ENSABRG00000021954)	ZFP64 (ENSABRG00000021962)	TSHZ2 (ENSABRG00000021972) ##22	ENSABRG00000021974	ZNF217 (ENSABRG00000021976)	BCAS1 (ENSABRG00000021981)	CYP24A1 (ENSABRG00000021985)	PFDN4 (ENSABRG00000021989)	DOK5 (ENSABRG00000021991)	CBLN4 (ENSABRG00000022012)	ENSABRG00000022016	MC3R (ENSABRG00000022024)	ENSABRG00000022026	AURKA (ENSABRG00000022028)	CSTF1 (ENSABRG00000022034)	CASS4 (ENSABRG00000022035)	RTF2 (ENSABRG00000022039)	GCNT7 (ENSABRG00000022042)
Duck	MODERN SPECIES	12	STK35 (ENSAPLG00000010202)	FNDC11 (ENSAPLG00000010384)	HELZ2 (ENSAPLG00000010386)	GMEB2 (ENSAPLG00000010816)	RTEL1 (ENSAPLG00000011075)	ENSAPLG00000014394	ARFRP1 (ENSAPLG00000014398)	ZGPAT (ENSAPLG00000014707)	ENSAPLG00000029497	ENSAPLG00000019397	TPD52L2 (ENSAPLG00000014822)	DNAJC5 (ENSAPLG00000030676)	ENSAPLG00000029064	SALL4 (ENSAPLG00000006498)	ZFP64 (ENSAPLG00000006423)	TSHZ2 (ENSAPLG00000011554) ##22	ENSAPLG00000016541	ZNF217 (ENSAPLG00000006344)	BCAS1 (ENSAPLG00000006033)	CYP24A1 (ENSAPLG00000005136)	PFDN4 (ENSAPLG00000025483)	DOK5 (ENSAPLG00000004868)	CBLN4 (ENSAPLG00000004863)	ENSAPLG00000028977	MC3R (ENSAPLG00000011546)	FAM210B (ENSAPLG00000021271)	AURKA (ENSAPLG00000004677)	CSTF1 (ENSAPLG00000004391)	CASS4 (ENSAPLG00000004370)	GCNT7 (ENSAPLG00000004099)	RTF2 (ENSAPLG00000022166)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00740000115534.a.b.a	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a.z	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT01040000244732	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a.z	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT01040000244732	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Turkey	MODERN SPECIES	14	ENSMGAG00000009085	ENSMGAG00000009195	GCNT7 (ENSMGAG00000009162)	ENSMGAG00000009131	CSTF1 (ENSMGAG00000009186)	ENSMGAG00000018223	ENSMGAG00000009221	ENSMGAG00000009205	ENSMGAG00000015554	ENSMGAG00000019213	ENSMGAG00000020497	ENSMGAG00000009245	ENSMGAG00000009263	ENSMGAG00000009274	BCAS1 (ENSMGAG00000009281)	ENSMGAG00000015562 ##22	ENSMGAG00000018226	ENSMGAG00000019018	ENSMGAG00000009292	ENSMGAG00000018687	ENSMGAG00000009301	ENSMGAG00000009344	NFATC2 (ENSMGAG00000009346)	ENSMGAG00000022874	ENSMGAG00000009354	ENSMGAG00000021003	ENSMGAG00000009359	ENSMGAG00000009385	PARD6B (ENSMGAG00000009390)	ENSMGAG00000021421	ENSMGAG00000009421
Chicken	MODERN SPECIES	12	UBE2V1 (ENSGALG00010014676)	TMEM189 (ENSGALG00010014611)	CEBPB (ENSGALG00010014573)	PTPN1 (ENSGALG00010014474)	RIPOR3 (ENSGALG00010014400)	PARD6B (ENSGALG00010014272)	ADNP (ENSGALG00010014260)	DPM1 (ENSGALG00010014205)	MOCS3 (ENSGALG00010014186)	KCNG1 (ENSGALG00010014148)	NFATC2 (ENSGALG00010014143)	ATP9A (ENSGALG00010015362)	SALL4 (ENSGALG00010015318)	ZFP64 (ENSGALG00010015291)	ENSGALG00010015740	TSHZ2 (ENSGALG00010015734) ##22	ZNF217 (ENSGALG00010015668)	BCAS1 (ENSGALG00010015485)	CYP24A1 (ENSGALG00010015154)	PFDN4 (ENSGALG00010015141)	DOK5 (ENSGALG00010015131)	CBLN3 (ENSGALG00010015112)	MC3R (ENSGALG00010016481)	ENSGALG00010015192	FAM210B (ENSGALG00010013260)	AURKA (ENSGALG00010013249)	CSTF1 (ENSGALG00010013220)	CASS4 (ENSGALG00010016671)	GCNT7 (ENSGALG00010013235)	RTFDC1 (ENSGALG00010013228)	TFAP2C (ENSGALG00010015041)
Japanese quail	MODERN SPECIES	12	ENSCJPG00005007310	ENSCJPG00005007309	CEBPB (ENSCJPG00005007308)	PTPN1 (ENSCJPG00005007304)	RIPOR3 (ENSCJPG00005007303)	PARD6B (ENSCJPG00005007302)	ADNP (ENSCJPG00005007301)	DPM1 (ENSCJPG00005007297)	MOCS3 (ENSCJPG00005007296)	KCNG1 (ENSCJPG00005007295)	NFATC2 (ENSCJPG00005007292)	ATP9A (ENSCJPG00005007291)	SALL4 (ENSCJPG00005007289)	ZFP64 (ENSCJPG00005007284)	ENSCJPG00005007281	TSHZ2 (ENSCJPG00005007280) ##22	ENSCJPG00005007279	ZNF217 (ENSCJPG00005007278)	ENSCJPG00005007275	CYP24A1 (ENSCJPG00005007273)	PFDN4 (ENSCJPG00005007271)	DOK5 (ENSCJPG00005007266)	CBLN4 (ENSCJPG00005007264)	MC3R (ENSCJPG00005007263)	ENSCJPG00005007260	FAM210B (ENSCJPG00005007259)	AURKA (ENSCJPG00005007257)	CSTF1 (ENSCJPG00005007254)	CASS4 (ENSCJPG00005007253)	GCNT7 (ENSCJPG00005007252)	RTF2 (ENSCJPG00005007251)
African ostrich	MODERN SPECIES	933			PEDS1 (ENSSCUG00000017967)	PTPN1 (ENSSCUG00000017965)	RIPOR3 (ENSSCUG00000017960)	PARD6B (ENSSCUG00000017958)	BCAS4 (ENSSCUG00000017956)	ADNP (ENSSCUG00000017952)	DPM1 (ENSSCUG00000017948)	MOCS3 (ENSSCUG00000017946)	KCNG1 (ENSSCUG00000017944)	NFATC2 (ENSSCUG00000017941)	ATP9A (ENSSCUG00000017937)	SALL4 (ENSSCUG00000017934)	ZFP64 (ENSSCUG00000017932)	TSHZ2 (ENSSCUG00000017928) ##22	ENSSCUG00000017927	ZNF217 (ENSSCUG00000017926)	BCAS1 (ENSSCUG00000017920)	CYP24A1 (ENSSCUG00000017918)	PFDN4 (ENSSCUG00000017917)	DOK5 (ENSSCUG00000017914)	CBLN4 (ENSSCUG00000017913)	MC3R (ENSSCUG00000017911)	ENSSCUG00000017909	AURKA (ENSSCUG00000017904)	CSTF1 (ENSSCUG00000017900)	CASS4 (ENSSCUG00000017896)	GCNT7 (ENSSCUG00000017893)	RTF2 (ENSSCUG00000017891)	TFAP2C (ENSSCUG00000017889)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	59	UBE2V1 (ENSCPRG00005004609)	ENSCPRG00005004612	CEBPB (ENSCPRG00005004615)	PTPN1 (ENSCPRG00005004625)	RIPOR3 (ENSCPRG00005004627)	PARD6B (ENSCPRG00005004641)	BCAS4 (ENSCPRG00005004645)	ADNP (ENSCPRG00005004649)	DPM1 (ENSCPRG00005004652)	MOCS3 (ENSCPRG00005004658)	KCNG1 (ENSCPRG00005004660)	NFATC2 (ENSCPRG00005004673)	ATP9A (ENSCPRG00005004681)	SALL4 (ENSCPRG00005004707)	ZFP64 (ENSCPRG00005004712)	TSHZ2 (ENSCPRG00005004716) ##22	ZNF217 (ENSCPRG00005004720)	ENSCPRG00005004723	BCAS1 (ENSCPRG00005004725)	CYP24A1 (ENSCPRG00005004739)	PFDN4 (ENSCPRG00005004832)	DOK5 (ENSCPRG00005004838)	CBLN4 (ENSCPRG00005004845)	MC3R (ENSCPRG00005004851)	FAM210B (ENSCPRG00005004856)	ENSCPRG00005004861	CSTF1 (ENSCPRG00005004867)	CASS4 (ENSCPRG00005004885)	RTF2 (ENSCPRG00005004938)	GCNT7 (ENSCPRG00005004942)	TFAP2C (ENSCPRG00005004951)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158854.b	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158854.b	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	5	ENSGEVG00005005075	CEBPB (ENSGEVG00005005065)	ENSGEVG00005005041	PTPN1 (ENSGEVG00005005024)	RIPOR3 (ENSGEVG00005004951)	PARD6B (ENSGEVG00005004914)	BCAS4 (ENSGEVG00005004895)	ADNP (ENSGEVG00005004865)	DPM1 (ENSGEVG00005004806)	MOCS3 (ENSGEVG00005004780)	KCNG1 (ENSGEVG00005004753)	NFATC2 (ENSGEVG00005004705)	ATP9A (ENSGEVG00005004625)	SALL4 (ENSGEVG00005004574)	ZFP64 (ENSGEVG00005004540)	TSHZ2 (ENSGEVG00005004514) ##22	ZNF217 (ENSGEVG00005004473)	BCAS1 (ENSGEVG00005004419)	CYP24A1 (ENSGEVG00005004360)	PFDN4 (ENSGEVG00005004335)	DOK5 (ENSGEVG00005004302)	CBLN4 (ENSGEVG00005004285)	MC3R (ENSGEVG00005004271)	FAM210B (ENSGEVG00005004259)	AURKA (ENSGEVG00005004230)	CSTF1 (ENSGEVG00005004205)	CASS4 (ENSGEVG00005011219)	GCNT7 (ENSGEVG00005011187)	RTF2 (ENSGEVG00005011157)	TFAP2C (ENSGEVG00005011067)	BMP7 (ENSGEVG00005010852)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	380																TSHZ2 (ENSCABG00000016115) ##22	ENSCABG00000016116	ZNF217 (ENSCABG00000016117)	BCAS1 (ENSCABG00000016120)	CYP24A1 (ENSCABG00000016121)	PFDN4 (ENSCABG00000016123)	DOK5 (ENSCABG00000016125)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000158854.b	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.g	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	60	UBE2V1 (ENSTMTG00000002048)	ENSTMTG00000002040	CEBPB (ENSTMTG00000002034)	PTPN1 (ENSTMTG00000002024)	RIPOR3 (ENSTMTG00000001968)	PARD6B (ENSTMTG00000001950)	BCAS4 (ENSTMTG00000001939)	ADNP (ENSTMTG00000001931)	DPM1 (ENSTMTG00000001915)	MOCS3 (ENSTMTG00000001910)	KCNG1 (ENSTMTG00000001902)	NFATC2 (ENSTMTG00000001812)	ATP9A (ENSTMTG00000001771)	SALL4 (ENSTMTG00000001765)	ZFP64 (ENSTMTG00000001756)	TSHZ2 (ENSTMTG00000001753) ##22	ENSTMTG00000001749	ZNF217 (ENSTMTG00000001742)	BCAS1 (ENSTMTG00000001728)	CYP24A1 (ENSTMTG00000001709)	PFDN4 (ENSTMTG00000001695)	DOK5 (ENSTMTG00000001687)	CBLN4 (ENSTMTG00000001675)	MC3R (ENSTMTG00000001669)	FAM210B (ENSTMTG00000001658)	AURKA (ENSTMTG00000001645)	CSTF1 (ENSTMTG00000001628)	CASS4 (ENSTMTG00000001493)	GCNT7 (ENSTMTG00000001450)	RTF2 (ENSTMTG00000001439)	TFAP2C (ENSTMTG00000001427)
painted turtle	MODERN SPECIES	804												ENSCPBG00000014991	ATP9A (ENSCPBG00000014994)	SALL4 (ENSCPBG00000014995)	ZFP64 (ENSCPBG00000015001)	TSHZ2 (ENSCPBG00000015002) ##22	ENSCPBG00000015006	ZNF217 (ENSCPBG00000015008)	BCAS1 (ENSCPBG00000015016)	CYP24A1 (ENSCPBG00000015021)	PFDN4 (ENSCPBG00000015024)	DOK5 (ENSCPBG00000015026)	CBLN4 (ENSCPBG00000015031)	MC3R (ENSCPBG00000015038)	FAM210B (ENSCPBG00000015039)	AURKA (ENSCPBG00000015040)	CSTF1 (ENSCPBG00000015042)	CASS4 (ENSCPBG00000015044)	RTF2 (ENSCPBG00000015046)	GCNT7 (ENSCPBG00000015048)	ENSCPBG00000015050
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1549	ENSPSIG00000016812	CEBPB (ENSPSIG00000016606)	PTPN1 (ENSPSIG00000016536)	ENSPSIG00000016269	ENSPSIG00000016266	PARD6B (ENSPSIG00000016185)	BCAS4 (ENSPSIG00000015713)	ADNP (ENSPSIG00000015209)	DPM1 (ENSPSIG00000014853)	MOCS3 (ENSPSIG00000014735)	KCNG1 (ENSPSIG00000014441)	NFATC2 (ENSPSIG00000013745)	ATP9A (ENSPSIG00000009087)	SALL4 (ENSPSIG00000009066)	ZFP64 (ENSPSIG00000008007)	TSHZ2 (ENSPSIG00000007559) ##22	BCAS1 (ENSPSIG00000007149)	PFDN4 (ENSPSIG00000006869)	CYP24A1 (ENSPSIG00000016130)	CBLN4 (ENSPSIG00000016039)	MC3R (ENSPSIG00000000032)	FAM210B (ENSPSIG00000015956)	AURKA (ENSPSIG00000014587)	CSTF1 (ENSPSIG00000012545)	CASS4 (ENSPSIG00000012101)	GCNT7 (ENSPSIG00000011637)	RTF2 (ENSPSIG00000011335)	TFAP2C (ENSPSIG00000010979)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
tuatara	MODERN SPECIES	551																TSHZ2 (ENSSPUG00000003279) ##22	ENSSPUG00000003289	ZNF217 (ENSSPUG00000003292)	CYP24A1 (ENSSPUG00000003312)	PFDN4 (ENSSPUG00000003353)
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Common wall lizard	MODERN SPECIES	14	CEBPB (ENSPMRG00000010548)	ENSPMRG00000010551	PTPN1 (ENSPMRG00000010556)	RIPOR3 (ENSPMRG00000010574)	PARD6B (ENSPMRG00000010641)	ENSPMRG00000010652	ADNP (ENSPMRG00000010668)	DPM1 (ENSPMRG00000010675)	MOCS3 (ENSPMRG00000010677)	KCNG1 (ENSPMRG00000010687)	NFATC2 (ENSPMRG00000010694)	ATP9A (ENSPMRG00000010709)	ENSPMRG00000010724	SALL4 (ENSPMRG00000010728)	ZFP64 (ENSPMRG00000010733)	TSHZ2 (ENSPMRG00000010735) ##22	ENSPMRG00000010740	ZNF217 (ENSPMRG00000010743)	BCAS1 (ENSPMRG00000010750)	CYP24A1 (ENSPMRG00000003513)	PFDN4 (ENSPMRG00000003521)	DOK5 (ENSPMRG00000003538)	CBLN4 (ENSPMRG00000003548)	ENSPMRG00000003556	MC3R (ENSPMRG00000003576)	FAM210B (ENSPMRG00000003581)	AURKA (ENSPMRG00000003589)	CSTF1 (ENSPMRG00000003603)	CASS4 (ENSPMRG00000003614)	RTF2 (ENSPMRG00000003622)	GCNT7 (ENSPMRG00000003624)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	66	PTPN1 (ENSSMRG00000006025)	RIPOR3 (ENSSMRG00000006018)	PARD6B (ENSSMRG00000005931)	BCAS4 (ENSSMRG00000005926)	ADNP (ENSSMRG00000005881)	DPM1 (ENSSMRG00000005880)	MOCS3 (ENSSMRG00000005879)	KCNG1 (ENSSMRG00000005876)	ENSSMRG00000005870	ENSSMRG00000005869	ATP9A (ENSSMRG00000005841)	SALL4 (ENSSMRG00000005816)	ENSSMRG00000005815	ZFP64 (ENSSMRG00000005813)	ENSSMRG00000005803	TSHZ2 (ENSSMRG00000005796) ##22	ENSSMRG00000005794	ZNF217 (ENSSMRG00000005792)	ENSSMRG00000005784	BCAS1 (ENSSMRG00000005775)	CYP24A1 (ENSSMRG00000005759)	PFDN4 (ENSSMRG00000005753)	DOK5 (ENSSMRG00000005745)	CBLN4 (ENSSMRG00000005683)	MC3R (ENSSMRG00000005679)	FAM210B (ENSSMRG00000005663)	AURKA (ENSSMRG00000005659)	CSTF1 (ENSSMRG00000005658)	CASS4 (ENSSMRG00000005656)	GCNT7 (ENSSMRG00000005655)	RTF2 (ENSSMRG00000005651)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b	ENSGT00940000156490
Lizard	MODERN SPECIES	840	PTPN1 (ENSACAG00000003763)	RIPOR3 (ENSACAG00000003824)	PARD6B (ENSACAG00000039885)	BCAS4 (ENSACAG00000003909)	ADNP (ENSACAG00000043744)	ENSACAG00000040831	DPM1 (ENSACAG00000003927)	MOCS3 (ENSACAG00000003931)	KCNG1 (ENSACAG00000037992)	ENSACAG00000045478	NFATC2 (ENSACAG00000013075)	ATP9A (ENSACAG00000012763)	SALL4 (ENSACAG00000012748)	ZFP64 (ENSACAG00000012706)	ENSACAG00000037301	TSHZ2 (ENSACAG00000012691) ##22	ENSACAG00000038485	ENSACAG00000038402	ZNF217 (ENSACAG00000012676)	BCAS1 (ENSACAG00000012671)
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.m	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT01000000217917	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b	ENSGT00940000156490
Indian cobra	MODERN SPECIES	2	UBE2V1 (ENSNNAG00000004529)	ENSNNAG00000004498	CEBPB (ENSNNAG00000004482)	PTPN1 (ENSNNAG00000004419)	RIPOR3 (ENSNNAG00000004260)	PARD6B (ENSNNAG00000004236)	BCAS4 (ENSNNAG00000004214)	DPM1 (ENSNNAG00000004101)	MOCS3 (ENSNNAG00000004079)	KCNG1 (ENSNNAG00000004057)	NFATC2 (ENSNNAG00000003856)	ATP9A (ENSNNAG00000003775)	SALL4 (ENSNNAG00000003718)	ZFP64 (ENSNNAG00000003693)	ENSNNAG00000003680	ENSNNAG00000003674 ##22	ENSNNAG00000003636	ZNF217 (ENSNNAG00000003595)	BCAS1 (ENSNNAG00000003553)	CYP24A1 (ENSNNAG00000003507)	PFDN4 (ENSNNAG00000003493)	ENSNNAG00000003485	DOK5 (ENSNNAG00000003461)	ENSNNAG00000003454	CBLN4 (ENSNNAG00000003447)	FAM210B (ENSNNAG00000003442)	AURKA (ENSNNAG00000003364)	CSTF1 (ENSNNAG00000003349)	CASS4 (ENSNNAG00000003317)	GCNT7 (ENSNNAG00000003300)	RTF2 (ENSNNAG00000003286)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.m	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT01000000217917	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b	ENSGT00940000156490
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00960000190095	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.m	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT01000000217917	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT01030000237186	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	10	ENSNSUG00000014329	CEBPB (ENSNSUG00000014328)	PTPN1 (ENSNSUG00000014327)	RIPOR3 (ENSNSUG00000014326)	PARD6B (ENSNSUG00000014325)	ENSNSUG00000014324	ADNP (ENSNSUG00000014323)	DPM1 (ENSNSUG00000014321)	MOCS3 (ENSNSUG00000014320)	KCNG1 (ENSNSUG00000014319)	NFATC2 (ENSNSUG00000014316)	ATP9A (ENSNSUG00000014315)	SALL4 (ENSNSUG00000014314)	ZFP64 (ENSNSUG00000014312)	ENSNSUG00000014311	TSHZ2 (ENSNSUG00000014310) ##22	ZNF217 (ENSNSUG00000014309)	ENSNSUG00000014308	CYP24A1 (ENSNSUG00000014307)	PFDN4 (ENSNSUG00000014306)	DOK5 (ENSNSUG00000014305)	ENSNSUG00000014304	CBLN4 (ENSNSUG00000014303)	MC3R (ENSNSUG00000014302)	FAM210B (ENSNSUG00000014301)	AURKA (ENSNSUG00000014300)	ENSNSUG00000014299	CSTF1 (ENSNSUG00000014298)	CASS4 (ENSNSUG00000014285)	GCNT7 (ENSNSUG00000014280)	RTF2 (ENSNSUG00000014279)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	8	ENSPTXG00000002303	CEBPB (ENSPTXG00000002302)	PTPN1 (ENSPTXG00000002301)	RIPOR3 (ENSPTXG00000002299)	PARD6B (ENSPTXG00000002298)	ENSPTXG00000002297	ADNP (ENSPTXG00000002296)	DPM1 (ENSPTXG00000002295)	MOCS3 (ENSPTXG00000002293)	KCNG1 (ENSPTXG00000002291)	NFATC2 (ENSPTXG00000002280)	ATP9A (ENSPTXG00000002278)	SALL4 (ENSPTXG00000002277)	ZFP64 (ENSPTXG00000002276)	ENSPTXG00000002275	TSHZ2 (ENSPTXG00000002274) ##22	ZNF217 (ENSPTXG00000002271)	ENSPTXG00000002270	CYP24A1 (ENSPTXG00000002267)	PFDN4 (ENSPTXG00000002266)	DOK5 (ENSPTXG00000002263)	ENSPTXG00000002261	CBLN4 (ENSPTXG00000002260)	MC3R (ENSPTXG00000002257)	FAM210B (ENSPTXG00000002254)	AURKA (ENSPTXG00000002251)	CSTF1 (ENSPTXG00000002250)	CASS4 (ENSPTXG00000002231)	GCNT7 (ENSPTXG00000002228)	RTF2 (ENSPTXG00000002227)	TFAP2C (ENSPTXG00000002226)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	6807																TSHZ2 (ENSLLTG00000017683) ##22
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Platypus	MODERN SPECIES	19	SNAI1 (ENSOANG00000008681)	ENSOANG00000046821	ENSOANG00000008680	CEBPB (ENSOANG00000046874)	PTPN1 (ENSOANG00000008679)	RIPOR3 (ENSOANG00000008677)	PARD6B (ENSOANG00000008676)	ENSOANG00000038610	ENSOANG00000036298	MOCS3 (ENSOANG00000044020)	KCNG1 (ENSOANG00000008672)	NFATC2 (ENSOANG00000008671)	ATP9A (ENSOANG00000008668)	SALL4 (ENSOANG00000008667)	ZFP64 (ENSOANG00000036388)	TSHZ2 (ENSOANG00000003138) ##22	ENSOANG00000043358	ZNF217 (ENSOANG00000003139)	ENSOANG00000009238	ENSOANG00000003140	ENSOANG00000019907	DOK5 (ENSOANG00000009239)	CBLN4 (ENSOANG00000045264)	MC3R (ENSOANG00000009244)	FAM210B (ENSOANG00000041846)	AURKA (ENSOANG00000011911)	CSTF1 (ENSOANG00000037738)	ENSOANG00000009246	RTF2 (ENSOANG00000009249)	ENSOANG00000009251	ENSOANG00000009252
Theria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402
Opossum	MODERN SPECIES		PEDS1 (ENSMODG00000016312)	CEBPB (ENSMODG00000016314)	PTPN1 (ENSMODG00000016335)	RIPOR3 (ENSMODG00000016345)	ENSMODG00000016347	BCAS4 (ENSMODG00000025761)	ADNP (ENSMODG00000016350)	DPM1 (ENSMODG00000016356)	MOCS3 (ENSMODG00000023246)	KCNG1 (ENSMODG00000016358)	NFATC2 (ENSMODG00000016363)	ATP9A (ENSMODG00000016381)	SALL4 (ENSMODG00000016387)	ZFP64 (ENSMODG00000016390)	ENSMODG00000048126	TSHZ2 (ENSMODG00000016391) ##22	ENSMODG00000046132	ZNF217 (ENSMODG00000016392)	ENSMODG00000025790	CYP24A1 (ENSMODG00000016400)	PFDN4 (ENSMODG00000016401)	DOK5 (ENSMODG00000016405)	ENSMODG00000047728	ENSMODG00000028344	ENSMODG00000040608	ENSMODG00000025116	ENSMODG00000039226	ENSMODG00000038379 ##23	CBLN4 (ENSMODG00000016410)	ENSMODG00000027399	MC3R (ENSMODG00000016430)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
koala	MODERN SPECIES	15	SPATA2 (ENSPCIG00000023284)	RNF114 (ENSPCIG00000023283)	SNAI1 (ENSPCIG00000023282)	PEDS1 (ENSPCIG00000008453)	PTPN1 (ENSPCIG00000008446)	RIPOR3 (ENSPCIG00000008439)	PARD6B (ENSPCIG00000034199)	ENSPCIG00000011065	ADNP (ENSPCIG00000011069)	DPM1 (ENSPCIG00000011076)	KCNG1 (ENSPCIG00000009066)	NFATC2 (ENSPCIG00000022852)	ATP9A (ENSPCIG00000022842)	SALL4 (ENSPCIG00000022838)	ZFP64 (ENSPCIG00000022836)	TSHZ2 (ENSPCIG00000011626) ##22	ENSPCIG00000011628	ZNF217 (ENSPCIG00000011630)	BCAS1 (ENSPCIG00000007829)	CYP24A1 (ENSPCIG00000007851)	PFDN4 (ENSPCIG00000007853)	DOK5 (ENSPCIG00000007855)	ENSPCIG00000007864	CBLN4 (ENSPCIG00000027330)	MC3R (ENSPCIG00000035814)
Common wonbat	MODERN SPECIES	35	SNAI1 (ENSVURG00010018899)	UBE2V1 (ENSVURG00010018896)	ENSVURG00010018891	PTPN1 (ENSVURG00010018881)	RIPOR3 (ENSVURG00010018843)	PARD6B (ENSVURG00010018835)	BCAS4 (ENSVURG00010018830)	ADNP (ENSVURG00010018827)	DPM1 (ENSVURG00010018817)	MOCS3 (ENSVURG00010018816)	KCNG1 (ENSVURG00010018813)	NFATC2 (ENSVURG00010018804)	ATP9A (ENSVURG00010018777)	SALL4 (ENSVURG00010018759)	ZFP64 (ENSVURG00010018745)	TSHZ2 (ENSVURG00010018738) ##22	ENSVURG00010018729	ZNF217 (ENSVURG00010018725)	ENSVURG00010018716	CYP24A1 (ENSVURG00010018690)	PFDN4 (ENSVURG00010018680)	DOK5 (ENSVURG00010018666)	ENSVURG00010018660	CBLN4 (ENSVURG00010018658)	MC3R (ENSVURG00010018648)	FAM210B (ENSVURG00010018643)	AURKA (ENSVURG00010018636)	CSTF1 (ENSVURG00010018632)	CASS4 (ENSVURG00010018629)	ENSVURG00010018623	RTF2 (ENSVURG00010018611)
Wallaby	MODERN SPECIES	8850																TSHZ2 (ENSMEUG00000004751) ##22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	UBE2V1 (ENSSHAG00000030275)	ENSSHAG00000022934	CEBPB (ENSSHAG00000029404)	PTPN1 (ENSSHAG00000031375)	RIPOR3 (ENSSHAG00000025378)	PARD6B (ENSSHAG00000018814)	BCAS4 (ENSSHAG00000018778)	ADNP (ENSSHAG00000026614)	DPM1 (ENSSHAG00000029685)	MOCS3 (ENSSHAG00000018733)	KCNG1 (ENSSHAG00000018683)	NFATC2 (ENSSHAG00000018222)	ATP9A (ENSSHAG00000025449)	SALL4 (ENSSHAG00000018013)	ZFP64 (ENSSHAG00000021784)	TSHZ2 (ENSSHAG00000015362) ##22	ENSSHAG00000031732	ZNF217 (ENSSHAG00000030424)	BCAS1 (ENSSHAG00000012411)	CYP24A1 (ENSSHAG00000011826)	PFDN4 (ENSSHAG00000024204)	DOK5 (ENSSHAG00000008979)	ENSSHAG00000015205	CBLN4 (ENSSHAG00000021656)	ENSSHAG00000028803	MC3R (ENSSHAG00000030709)	FAM210B (ENSSHAG00000030459)	AURKA (ENSSHAG00000021349)	CSTF1 (ENSSHAG00000013103)	CASS4 (ENSSHAG00000012669)	RTF2 (ENSSHAG00000012236)
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	1146																ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167
Armadillo	MODERN SPECIES	1961																TSHZ2 (ENSDNOG00000034743) ##22	ENSDNOG00000048290	ZNF217 (ENSDNOG00000003396)	BCAS1 (ENSDNOG00000047867)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Tenrec	MODERN SPECIES	7307																TSHZ2 (ENSETEG00000011541) ##22
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	87	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Elephant	MODERN SPECIES	551	UBE2V1 (ENSLAFG00000027359)	PEDS1 (ENSLAFG00000007392)	ENSLAFG00000026180	PTPN1 (ENSLAFG00000009137)	RIPOR3 (ENSLAFG00000009142)	PARD6B (ENSLAFG00000004136)	BCAS4 (ENSLAFG00000004138)	ADNP (ENSLAFG00000004139)	MOCS3 (ENSLAFG00000004140)	KCNG1 (ENSLAFG00000011027)	ENSLAFG00000013693	NFATC2 (ENSLAFG00000015276)	ATP9A (ENSLAFG00000004303)	SALL4 (ENSLAFG00000004309)	ZFP64 (ENSLAFG00000022960)	TSHZ2 (ENSLAFG00000002942) ##22	ZNF217 (ENSLAFG00000017592)	BCAS1 (ENSLAFG00000002312)	CYP24A1 (ENSLAFG00000017059)	PFDN4 (ENSLAFG00000017064)	DOK5 (ENSLAFG00000030432)	ENSLAFG00000031183	CBLN4 (ENSLAFG00000004861)	MC3R (ENSLAFG00000005954)	FAM210B (ENSLAFG00000008388)	AURKA (ENSLAFG00000008392)	CSTF1 (ENSLAFG00000008393)	CASS4 (ENSLAFG00000008394)	RTF2 (ENSLAFG00000008399)	GCNT7 (ENSLAFG00000031589)	ENSLAFG00000020518
Hyrax	MODERN SPECIES	9054																TSHZ2 (ENSPCAG00000000181) ##22
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000183051.a.b ##22
Hedgehog	MODERN SPECIES	7439																TSHZ2 (ENSEEUG00000000596) ##22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900.cb	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900.cb.a	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696.ab	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900.cb.a	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Dog	MODERN SPECIES	16	CEBPB (ENSCAFG00845026193)	PTPN1 (ENSCAFG00845026218)	RIPOR3 (ENSCAFG00845026334)	PARD6B (ENSCAFG00845026631)	ENSCAFG00845026672	ADNP (ENSCAFG00845026717)	ENSCAFG00845026743	DPM1 (ENSCAFG00845026765)	MOCS3 (ENSCAFG00845026807)	ENSCAFG00845026830	KCNG1 (ENSCAFG00845026863)	NFATC2 (ENSCAFG00845026966)	ATP9A (ENSCAFG00845027235)	SALL4 (ENSCAFG00845027669)	ZFP64 (ENSCAFG00845027811)	TSHZ2 (ENSCAFG00845027975) ##22	ENSCAFG00845028117	ZNF217 (ENSCAFG00845028152)	BCAS1 (ENSCAFG00845028476)	CYP24A1 (ENSCAFG00845028958)	ENSCAFG00845029028	DOK5 (ENSCAFG00845029068)	CBLN4 (ENSCAFG00845029097)	MC3R (ENSCAFG00845029148)	FAM210B (ENSCAFG00845029164)	ENSCAFG00845029207	CSTF1 (ENSCAFG00845029253)	CASS4 (ENSCAFG00845029281)	RTF2 (ENSCAFG00845029371)	GCNT7 (ENSCAFG00845029505)	ENSCAFG00845029529
Dingo	MODERN SPECIES	343	PEDS1 (ENSCAFG00020017489)	CEBPB (ENSCAFG00020017492)	PTPN1 (ENSCAFG00020017498)	RIPOR3 (ENSCAFG00020017501)	PARD6B (ENSCAFG00020017523)	BCAS4 (ENSCAFG00020017528)	ADNP (ENSCAFG00020017529)	DPM1 (ENSCAFG00020017532)	MOCS3 (ENSCAFG00020017535)	KCNG1 (ENSCAFG00020017537)	NFATC2 (ENSCAFG00020017548)	ATP9A (ENSCAFG00020017722)	SALL4 (ENSCAFG00020021870)	ZFP64 (ENSCAFG00020021877)	ENSCAFG00020021880	TSHZ2 (ENSCAFG00020021890) ##22	ENSCAFG00020021892	ZNF217 (ENSCAFG00020021894)	BCAS1 (ENSCAFG00020021900)	CYP24A1 (ENSCAFG00020021905)	ENSCAFG00020021915	DOK5 (ENSCAFG00020021917)	CBLN4 (ENSCAFG00020021919)	MC3R (ENSCAFG00020021920)	FAM210B (ENSCAFG00020021921)	ENSCAFG00020021922	CSTF1 (ENSCAFG00020021923)	CASS4 (ENSCAFG00020021924)	RTF2 (ENSCAFG00020021926)	GCNT7 (ENSCAFG00020021927)	ENSCAFG00020021929
Red fox	MODERN SPECIES	104	SNAI1 (ENSVVUG00000022410)	ENSVVUG00000022417	TMEM189 (ENSVVUG00000022420)	PTPN1 (ENSVVUG00000022432)	RIPOR3 (ENSVVUG00000022436)	PARD6B (ENSVVUG00000022445)	BCAS4 (ENSVVUG00000022450)	ADNP (ENSVVUG00000022456)	DPM1 (ENSVVUG00000022458)	MOCS3 (ENSVVUG00000022461)	KCNG1 (ENSVVUG00000022465)	NFATC2 (ENSVVUG00000022491)	ATP9A (ENSVVUG00000022659)	ENSVVUG00000022697	ZFP64 (ENSVVUG00000022699)	TSHZ2 (ENSVVUG00000022715) ##22	ENSVVUG00000022718	ZNF217 (ENSVVUG00000022722)	BCAS1 (ENSVVUG00000022730)	CYP24A1 (ENSVVUG00000022737)	PFDN4 (ENSVVUG00000022740)	DOK5 (ENSVVUG00000022743)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000162354	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900.cb	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.a	ENSGT00940000156230.b	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900.cb	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.a	ENSGT00940000156230.b	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696
Polar bear	MODERN SPECIES	211	RNF114 (ENSUMAG00000024459)	SNAI1 (ENSUMAG00000024458)	UBE2V1 (ENSUMAG00000024454)	PEDS1 (ENSUMAG00000024453)	PTPN1 (ENSUMAG00000024451)	RIPOR3 (ENSUMAG00000024450)	ENSUMAG00000024449	BCAS4 (ENSUMAG00000024448)	ADNP (ENSUMAG00000024447)	DPM1 (ENSUMAG00000024446)	MOCS3 (ENSUMAG00000024445)	ENSUMAG00000024442	ATP9A (ENSUMAG00000024314)	SALL4 (ENSUMAG00000024274)	ZFP64 (ENSUMAG00000024271)	TSHZ2 (ENSUMAG00000024266) ##22	ENSUMAG00000024265	ZNF217 (ENSUMAG00000024263)	BCAS1 (ENSUMAG00000024242)	CYP24A1 (ENSUMAG00000024233)	PFDN4 (ENSUMAG00000024230)
American black bear	MODERN SPECIES	580																TSHZ2 (ENSUAMG00000026694) ##22
Giant Panda	MODERN SPECIES	4	SNAI1 (ENSAMEG00000013478)	UBE2V1 (ENSAMEG00000030870)	PEDS1 (ENSAMEG00000013457)	PTPN1 (ENSAMEG00000013425)	RIPOR3 (ENSAMEG00000013385)	PARD6B (ENSAMEG00000023756)	BCAS4 (ENSAMEG00000023607)	ADNP (ENSAMEG00000013360)	DPM1 (ENSAMEG00000013335)	MOCS3 (ENSAMEG00000019820)	KCNG1 (ENSAMEG00000013332)	NFATC2 (ENSAMEG00000013329)	ATP9A (ENSAMEG00000013268)	SALL4 (ENSAMEG00000013250)	ZFP64 (ENSAMEG00000013237)	TSHZ2 (ENSAMEG00000013234) ##22	ENSAMEG00000019927	ZNF217 (ENSAMEG00000013231)	BCAS1 (ENSAMEG00000013223)	CYP24A1 (ENSAMEG00000013169)	PFDN4 (ENSAMEG00000013164)	DOK5 (ENSAMEG00000013163)	ENSAMEG00000019489	CBLN4 (ENSAMEG00000027847)	MC3R (ENSAMEG00000019471)	FAM210B (ENSAMEG00000029051)	AURKA (ENSAMEG00000007168)	CASS4 (ENSAMEG00000007113)	GCNT7 (ENSAMEG00000007103)	RTF2 (ENSAMEG00000007072)	ENSAMEG00000007066
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	58																ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900.cb	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
American mink	MODERN SPECIES	82																TSHZ2 (ENSNVIG00000022622) ##22	B1H0U8 (ENSNVIG00000022617)	ZNF217 (ENSNVIG00000022614)	BCAS1 (ENSNVIG00000022589)	CYP24A1 (ENSNVIG00000022568)	PFD4 (ENSNVIG00000022561)	DOK5 (ENSNVIG00000022551)	ENSNVIG00000022545	CBLN4 (ENSNVIG00000022537)	MC3R (ENSNVIG00000022532)	FAM210B (ENSNVIG00000022528)	AURKA (ENSNVIG00000022500)	CSTF1 (ENSNVIG00000022484)	CASS4 (ENSNVIG00000022461)	GCNT7 (ENSNVIG00000022451)	RTF2 (ENSNVIG00000022403)
Ferret	MODERN SPECIES	236																TSHZ2 (ENSMPUG00000020171) ##22	ZNF217 (ENSMPUG00000006142)	BCAS1 (ENSMPUG00000006155)	CYP24A1 (ENSMPUG00000006168)	PFDN4 (ENSMPUG00000006173)	DOK5 (ENSMPUG00000006202)	CBLN4 (ENSMPUG00000006215)	MC3R (ENSMPUG00000020172)	ENSMPUG00000020173	FAM210B (ENSMPUG00000006225)	AURKA (ENSMPUG00000006233)	CSTF1 (ENSMPUG00000006243)	CASS4 (ENSMPUG00000006337)	RTF2 (ENSMPUG00000006344)	GCNT7 (ENSMPUG00000006358)	ENSMPUG00000006379
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000154276.kb	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696.cb	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000154276.kb	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696.cb	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000154276.kb	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696.cb	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057	ENSGT00950000182848.c.b.a.b
leopard	MODERN SPECIES	32	PTPN1 (ENSPPRG00000000695)	RIPOR3 (ENSPPRG00000002233)	PARD6B (ENSPPRG00000002536)	BCAS4 (ENSPPRG00000003058)	ADNP (ENSPPRG00000003461)	DPM1 (ENSPPRG00000003732)	MOCS3 (ENSPPRG00000016957)	KCNG1 (ENSPPRG00000004104)	NFATC2 (ENSPPRG00000005267)	ENSPPRG00000017056	ATP9A (ENSPPRG00000008193)	SALL4 (ENSPPRG00000008677)	ENSPPRG00000009749	ENSPPRG00000010090	ZFP64 (ENSPPRG00000012539)	TSHZ2 (ENSPPRG00000013365) ##22	ZNF217 (ENSPPRG00000014025)	BCAS1 (ENSPPRG00000015142)	CYP24A1 (ENSPPRG00000024597)	ENSPPRG00000024512	DOK5 (ENSPPRG00000024034)	CBLN4 (ENSPPRG00000023868)	MC3R (ENSPPRG00000017600)	FAM210B (ENSPPRG00000023782)	AURKA (ENSPPRG00000000440)	CSTF1 (ENSPPRG00000000733)	CASS4 (ENSPPRG00000001534)	GCNT7 (ENSPPRG00000001763)	RTF2 (ENSPPRG00000005166)	ENSPPRG00000006287	TFAP2C (ENSPPRG00000006375)
lion	MODERN SPECIES	3	CEBPB (ENSPLOG00000002998)	PTPN1 (ENSPLOG00000003015)	RIPOR3 (ENSPLOG00000003036)	PARD6B (ENSPLOG00000003051)	ENSPLOG00000003071	ADNP (ENSPLOG00000003098)	DPM1 (ENSPLOG00000003116)	MOCS3 (ENSPLOG00000003140)	KCNG1 (ENSPLOG00000003153)	NFATC2 (ENSPLOG00000003200)	ATP9A (ENSPLOG00000003344)	SALL4 (ENSPLOG00000003409)	ENSPLOG00000003422	ENSPLOG00000003430	ZFP64 (ENSPLOG00000003449)	TSHZ2 (ENSPLOG00000003471) ##22	ZNF217 (ENSPLOG00000003494)	BCAS1 (ENSPLOG00000003532)	ENSPLOG00000003567	DOK5 (ENSPLOG00000003578)	CBLN4 (ENSPLOG00000003605)	MC3R (ENSPLOG00000003615)	FAM210B (ENSPLOG00000003624)	AURKA (ENSPLOG00000003634)	CSTF1 (ENSPLOG00000003647)	CASS4 (ENSPLOG00000003663)	RTF2 (ENSPLOG00000003723)	GCNT7 (ENSPLOG00000003785)	ENSPLOG00000003801	TFAP2C (ENSPLOG00000003814)	BMP7 (ENSPLOG00000003845)
Tiger	MODERN SPECIES	253											ENSPTIG00000020900	ENSPTIG00000001966	ATP9A (ENSPTIG00000010238)	ENSPTIG00000009370	ZFP64 (ENSPTIG00000008689)	TSHZ2 (ENSPTIG00000007834) ##22	ZNF217 (ENSPTIG00000005463)	BCAS1 (ENSPTIG00000020298)	CYP24A1 (ENSPTIG00000018918)	ENSPTIG00000018209	DOK5 (ENSPTIG00000017461)	CBLN4 (ENSPTIG00000017065)	MC3R (ENSPTIG00000001341)	FAM210B (ENSPTIG00000015174)	AURKA (ENSPTIG00000012737)	CSTF1 (ENSPTIG00000012174)	CASS4 (ENSPTIG00000009122)	GCNT7 (ENSPTIG00000007809)	RTF2 (ENSPTIG00000003720)	ENSPTIG00000021739	TFAP2C (ENSPTIG00000021497)
Cat	MODERN SPECIES	2	PEDS1 (ENSFCAG00000026629)	CEBPB (ENSFCAG00000041071)	PTPN1 (ENSFCAG00000003944)	RIPOR3 (ENSFCAG00000003947)	PARD6B (ENSFCAG00000042038)	BCAS4 (ENSFCAG00000009980)	ADNP (ENSFCAG00000025702)	DPM1 (ENSFCAG00000042178)	MOCS3 (ENSFCAG00000009792)	KCNG1 (ENSFCAG00000009793)	NFATC2 (ENSFCAG00000000947)	ATP9A (ENSFCAG00000022069)	ENSFCAG00000032676	SALL4 (ENSFCAG00000002822)	ZFP64 (ENSFCAG00000011815)	TSHZ2 (ENSFCAG00000014616) ##22	ZNF217 (ENSFCAG00000029845)	BCAS1 (ENSFCAG00000002451)	CYP24A1 (ENSFCAG00000002452)	PFDN4 (ENSFCAG00000013355)	DOK5 (ENSFCAG00000007809)	CBLN4 (ENSFCAG00000042415)	MC3R (ENSFCAG00000007053)	FAM210B (ENSFCAG00000044679)	AURKA (ENSFCAG00000024493)	CSTF1 (ENSFCAG00000025673)	CASS4 (ENSFCAG00000005548)	GCNT7 (ENSFCAG00000005550)	RTF2 (ENSFCAG00000037890)	TFAP2C (ENSFCAG00000005551)	ENSFCAG00000053180
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Equus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Horse	MODERN SPECIES	14	UBE2V1 (ENSECAG00000011858)	CEBPB (ENSECAG00000027770)	PTPN1 (ENSECAG00000019772)	RIPOR3 (ENSECAG00000004962)	PARD6B (ENSECAG00000009294)	BCAS4 (ENSECAG00000038338)	ADNP (ENSECAG00000009307)	MOCS3 (ENSECAG00000004476)	DPM1 (ENSECAG00000011277)	KCNG1 (ENSECAG00000017924)	NFATC2 (ENSECAG00000018997)	ATP9A (ENSECAG00000020949)	SALL4 (ENSECAG00000018533)	ENSECAG00000052741	ZFP64 (ENSECAG00000021570)	TSHZ2 (ENSECAG00000010856) ##22	ENSECAG00000040326	ZNF217 (ENSECAG00000011966)	BCAS1 (ENSECAG00000013155)	CYP24A1 (ENSECAG00000016322)	ENSECAG00000053968	PFDN4 (ENSECAG00000035072)	DOK5 (ENSECAG00000023012)	CBLN4 (ENSECAG00000036307)	MC3R (ENSECAG00000004637)	AURKA (ENSECAG00000023961)	FAM210B (ENSECAG00000023915)	CSTF1 (ENSECAG00000008949)	CASS4 (ENSECAG00000009479)	RTF2 (ENSECAG00000009943)	GCNT7 (ENSECAG00000016323)
Donkey	MODERN SPECIES	6	PEDS1 (ENSEASG00005023319)	ENSEASG00005024380	PTPN1 (ENSEASG00005023312)	RIPOR3 (ENSEASG00005023308)	PARD6B (ENSEASG00005031803)	ENSEASG00005038449	ADNP (ENSEASG00005023304)	DPM1 (ENSEASG00005023302)	MOCS3 (ENSEASG00005023301)	KCNG1 (ENSEASG00005023299)	NFATC2 (ENSEASG00005023295)	ATP9A (ENSEASG00005023291)	SALL4 (ENSEASG00005023290)	ENSEASG00005031550	ZFP64 (ENSEASG00005023288)	TSHZ2 (ENSEASG00005023286) ##22	ENSEASG00005023285	ENSEASG00005023284	ZNF217 (ENSEASG00005023283)	BCAS1 (ENSEASG00005023282)	CYP24A1 (ENSEASG00005023280)	PFDN4 (ENSEASG00005023279)	DOK5 (ENSEASG00005023278)	CBLN4 (ENSEASG00005023277)	MC3R (ENSEASG00005023275)	FAM210B (ENSEASG00005023274)	AURKA (ENSEASG00005023273)	CSTF1 (ENSEASG00005023272)	CASS4 (ENSEASG00005023271)	RTF2 (ENSEASG00005028295)	ENSEASG00005037027
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Megabat	MODERN SPECIES	2655																TSHZ2 (ENSPVAG00000001894) ##22
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Microbat	MODERN SPECIES	1195															ZFP64 (ENSMLUG00000001227)	TSHZ2 (ENSMLUG00000013960) ##22	ENSMLUG00000003669	ENSMLUG00000026676	BCAS1 (ENSMLUG00000008531)	CYP24A1 (ENSMLUG00000008552)	PFDN4 (ENSMLUG00000008582)	ENSMLUG00000029039
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	15	ENSRFEG00010013971	PEDS1 (ENSRFEG00010013707)	PTPN1 (ENSRFEG00010013609)	RIPOR3 (ENSRFEG00010013491)	PARD6B (ENSRFEG00010013439)	BCAS4 (ENSRFEG00010013389)	ADNP (ENSRFEG00010013316)	DPM1 (ENSRFEG00010013174)	MOCS3 (ENSRFEG00010013157)	KCNG1 (ENSRFEG00010013123)	NFATC2 (ENSRFEG00010012829)	ENSRFEG00010012770	ATP9A (ENSRFEG00010012611)	SALL4 (ENSRFEG00010012441)	ZFP64 (ENSRFEG00010012242)	TSHZ2 (ENSRFEG00010012218) ##22	ENSRFEG00010012201	ZNF217 (ENSRFEG00010012136)	BCAS1 (ENSRFEG00010011942)	CYP24A1 (ENSRFEG00010011474)	PFDN4 (ENSRFEG00010011415)	ENSRFEG00010011339	DOK5 (ENSRFEG00010011259)	CBLN4 (ENSRFEG00010011203)	MC3R (ENSRFEG00010021575)	FAM210B (ENSRFEG00010021572)	AURKA (ENSRFEG00010021556)	CSTF1 (ENSRFEG00010021540)	CASS4 (ENSRFEG00010021526)	GCNT7 (ENSRFEG00010021518)	RTF2 (ENSRFEG00010021502)
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Suina	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	801	CEBPB (ENSCWAG00000005488)	PTPN1 (ENSCWAG00000005450)	RIPOR3 (ENSCWAG00000005298)	PARD6B (ENSCWAG00000005258)	BCAS4 (ENSCWAG00000005219)	ADNP (ENSCWAG00000005189)	DPM1 (ENSCWAG00000005161)	MOCS3 (ENSCWAG00000005146)	KCNG1 (ENSCWAG00000005124)	NFATC2 (ENSCWAG00000004900)	ATP9A (ENSCWAG00000004811)	SALL4 (ENSCWAG00000004750)	ENSCWAG00000004698	ENSCWAG00000004683	ZFP64 (ENSCWAG00000004512)	TSHZ2 (ENSCWAG00000004473) ##22	ENSCWAG00000004441	ZNF217 (ENSCWAG00000004422)	BCAS1 (ENSCWAG00000004272)	CYP24A1 (ENSCWAG00000004053)	ENSCWAG00000004002	DOK5 (ENSCWAG00000003971)	ENSCWAG00000003959	CBLN4 (ENSCWAG00000003931)	ENSCWAG00000003907	MC3R (ENSCWAG00000003893)	FAM210B (ENSCWAG00000003878)	AURKA (ENSCWAG00000003823)	CSTF1 (ENSCWAG00000003789)	CASS4 (ENSCWAG00000003694)	GCNT7 (ENSCWAG00000013939)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Arabian camel	MODERN SPECIES	10	CEBPB (ENSCDRG00005014799)	PTPN1 (ENSCDRG00005014827)	RIPOR3 (ENSCDRG00005014953)	PARD6B (ENSCDRG00005015447)	BCAS4 (ENSCDRG00005015482)	ADNP (ENSCDRG00005015515)	DPM1 (ENSCDRG00005015547)	MOCS3 (ENSCDRG00005015622)	ENSCDRG00005015632	KCNG1 (ENSCDRG00005015648)	NFATC2 (ENSCDRG00005015695)	ATP9A (ENSCDRG00005015920)	SALL4 (ENSCDRG00005016240)	ZFP64 (ENSCDRG00005016359)	ENSCDRG00005016576	TSHZ2 (ENSCDRG00005016617) ##22	ENSCDRG00005016633	ZNF217 (ENSCDRG00005016648)	BCAS1 (ENSCDRG00005016699)	CYP24A1 (ENSCDRG00005016933)	PFDN4 (ENSCDRG00005017062)	DOK5 (ENSCDRG00005017101)	CBLN4 (ENSCDRG00005017147)	MC3R (ENSCDRG00005017174)	FAM210B (ENSCDRG00005017188)	AURKA (ENSCDRG00005017220)	CSTF1 (ENSCDRG00005017255)	CASS4 (ENSCDRG00005017279)	RTF2 (ENSCDRG00005017316)	GCNT7 (ENSCDRG00005017452)	ENSCDRG00005017508
Alpaca	MODERN SPECIES	2328																TSHZ2 (ENSVPAG00000009638) ##22	ZNF217 (ENSVPAG00000009639)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	4	SNAI1 (ENSOARG00020010897)	UBE2V1 (ENSOARG00020010955)	ENSOARG00020011139	CEBPB (ENSOARG00020011295)	PTPN1 (ENSOARG00020011319)	PARD6B (ENSOARG00020011957)	BCAS4 (ENSOARG00020011987)	ADNP (ENSOARG00020012056)	DPM1 (ENSOARG00020012189)	MOCS3 (ENSOARG00020012279)	KCNG1 (ENSOARG00020012313)	NFATC2 (ENSOARG00020012410)	ATP9A (ENSOARG00020013019)	SALL4 (ENSOARG00020013545)	ZFP64 (ENSOARG00020013675)	TSHZ2 (ENSOARG00020013957) ##22	ENSOARG00020013991	CYP24A1 (ENSOARG00020014269)	ENSOARG00020014624	DOK5 (ENSOARG00020014697)	CBLN4 (ENSOARG00020014929)
Goat	MODERN SPECIES	4	ENSCHIG00000026963	ENSCHIG00000025237	CEBPB (ENSCHIG00000026165)	PTPN1 (ENSCHIG00000018438)	RIPOR3 (ENSCHIG00000021955)	PARD6B (ENSCHIG00000024844)	BCAS4 (ENSCHIG00000019980)	ADNP (ENSCHIG00000026866)	DPM1 (ENSCHIG00000024448)	MOCS3 (ENSCHIG00000002985)	KCNG1 (ENSCHIG00000023574)	NFATC2 (ENSCHIG00000013486)	ATP9A (ENSCHIG00000017687)	SALL4 (ENSCHIG00000026270)	ZFP64 (ENSCHIG00000013734)	TSHZ2 (ENSCHIG00000012906) ##22	ENSCHIG00000002437	ZNF217 (ENSCHIG00000015816)	BCAS1 (ENSCHIG00000014229)	CYP24A1 (ENSCHIG00000009239)	ENSCHIG00000019520	DOK5 (ENSCHIG00000019478)	CBLN4 (ENSCHIG00000016613)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000162354	ENSGT00960000190565	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Bos	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000162354	ENSGT00960000190565	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Wild yak	MODERN SPECIES	1542														ENSBMUG00000001094	ENSBMUG00000001085	TSHZ2 (ENSBMUG00000001075) ##22
Domestic yak	MODERN SPECIES	3	ENSBGRG00000003892	PEDS1 (ENSBGRG00000003997)	CEBPB (ENSBGRG00000004091)	PTPN1 (ENSBGRG00000004126)	RIPOR3 (ENSBGRG00000004295)	ENSBGRG00000004869	ADNP (ENSBGRG00000005009)	MOCS3 (ENSBGRG00000005144)	KCNG1 (ENSBGRG00000005160)	NFATC2 (ENSBGRG00000005184)	ATP9A (ENSBGRG00000005270)	ENSBGRG00000005594	ZFP64 (ENSBGRG00000005650)	ENSBGRG00000005794	ENSBGRG00000005846	TSHZ2 (ENSBGRG00000005855) ##22	ENSBGRG00000005903	ZNF217 (ENSBGRG00000005942)	ENSBGRG00000006035	ENSBGRG00000006080	CYP24A1 (ENSBGRG00000006412)	ENSBGRG00000006608	DOK5 (ENSBGRG00000006644)	CBLN4 (ENSBGRG00000006755)	ENSBGRG00000006815	ENSBGRG00000006879	OTOR (ENSBGRG00000006895)	ENSBGRG00000006934	ENSBGRG00000007002	KIF16B (ENSBGRG00000007083)	ENSBGRG00000008214
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000162354	ENSGT00960000190565	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	4	PEDS1 (ENSBIXG00005020099)	CEBPB (ENSBIXG00005003302)	PTPN1 (ENSBIXG00005020158)	RIPOR3 (ENSBIXG00005003360)	ENSBIXG00005003390	ENSBIXG00005020294	ADNP (ENSBIXG00005020336)	ENSBIXG00005020382	KCNG1 (ENSBIXG00005003446)	NFATC2 (ENSBIXG00005020482)	ATP9A (ENSBIXG00005020806)	SALL4 (ENSBIXG00005020915)	ENSBIXG00005020944	ZFP64 (ENSBIXG00005021039)	ENSBIXG00005021084	TSHZ2 (ENSBIXG00005021102) ##22	ZNF217 (ENSBIXG00005021153)	BCAS1 (ENSBIXG00005021258)	CYP24A1 (ENSBIXG00005021353)	ENSBIXG00005021386	PFDN4 (ENSBIXG00005003613)	DOK5 (ENSBIXG00005021479)	CBLN4 (ENSBIXG00005005543)
Cow	MODERN SPECIES	4	ENSBTAG00000049867	CEBPB (ENSBTAG00000051972)	PTPN1 (ENSBTAG00000006616)	RIPOR3 (ENSBTAG00000012297)	PARD6B (ENSBTAG00000021601)	BCAS4 (ENSBTAG00000038929)	ADNP (ENSBTAG00000000340)	DPM1 (ENSBTAG00000007721)	MOCS3 (ENSBTAG00000049509)	KCNG1 (ENSBTAG00000003398)	NFATC2 (ENSBTAG00000018270)	ATP9A (ENSBTAG00000007962)	SALL4 (ENSBTAG00000003101)	ENSBTAG00000053699	ZFP64 (ENSBTAG00000001512)	TSHZ2 (ENSBTAG00000007917) ##22	ZNF217 (ENSBTAG00000030556)	BCAS1 (ENSBTAG00000000835)	CYP24A1 (ENSBTAG00000002765)	PFDN4 (ENSBTAG00000008812)	DOK5 (ENSBTAG00000047975)	CBLN4 (ENSBTAG00000017524)
American bison	DUPLICATION
American bison	MODERN SPECIES	220																ENSBBBG00000008221 ##22
American bison	MODERN SPECIES	3066	ENSBBBG00000024513	MSRA (ENSBBBG00000024509)	ENSBBBG00000024420	HMBOX1 (ENSBBBG00000024381)	INTS9 (ENSBBBG00000024337)	EXTL3 (ENSBBBG00000006297)	FZD3 (ENSBBBG00000024196)	ENSBBBG00000007807	ZNF395 (ENSBBBG00000006273)	PNOC (ENSBBBG00000024099)	ENSBBBG00000024093	ENSBBBG00000006262	ELP3 (ENSBBBG00000006255)	NUGGC (ENSBBBG00000023948)	ZFP64 (ENSBBBG00000023903)	ENSBBBG00000008855 ##22	BCAS1 (ENSBBBG00000023792)	CYP24A1 (ENSBBBG00000023751)	ENSBBBG00000023699	DOK5 (ENSBBBG00000023680)	ENSBBBG00000023664
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	156	CEBPB (ENSMMSG00000000488)	ENSMMSG00000000476	PTPN1 (ENSMMSG00000000433)	RIPOR3 (ENSMMSG00000000362)	PARD6B (ENSMMSG00000000327)	BCAS4 (ENSMMSG00000000296)	ADNP (ENSMMSG00000000269)	DPM1 (ENSMMSG00000000236)	ENSMMSG00000000184	KCNG1 (ENSMMSG00000015644)	NFATC2 (ENSMMSG00000015490)	ATP9A (ENSMMSG00000015245)	SALL4 (ENSMMSG00000015115)	ZFP64 (ENSMMSG00000014981)	ENSMMSG00000014970	TSHZ2 (ENSMMSG00000014943) ##22	ENSMMSG00000014933	ZNF217 (ENSMMSG00000014894)	ENSMMSG00000014879	BCAS1 (ENSMMSG00000014841)	CYP24A1 (ENSMMSG00000014774)	ENSMMSG00000014760	DOK5 (ENSMMSG00000014714)	CBLN4 (ENSMMSG00000014691)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	15	ENSCHYG00000009981	PTPN1 (ENSCHYG00000010096)	RIPOR3 (ENSCHYG00000010277)	PARD6B (ENSCHYG00000010449)	BCAS4 (ENSCHYG00000010495)	ENSCHYG00000010533	ADNP (ENSCHYG00000010570)	DPM1 (ENSCHYG00000010621)	MOCS3 (ENSCHYG00000010694)	KCNG1 (ENSCHYG00000010717)	NFATC2 (ENSCHYG00000010759)	ATP9A (ENSCHYG00000011270)	SALL4 (ENSCHYG00000012194)	ENSCHYG00000012287	ZFP64 (ENSCHYG00000012335)	TSHZ2 (ENSCHYG00000012687) ##22	ZNF217 (ENSCHYG00000012731)	BCAS1 (ENSCHYG00000012786)	CYP24A1 (ENSCHYG00000013105)	PFDN4 (ENSCHYG00000013295)	DOK5 (ENSCHYG00000013393)	CBLN4 (ENSCHYG00000013539)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a.g	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847.l	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a.g	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847.l	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a.g	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847.l	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a.g	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000153664.A.a.m.b.b	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Beluga whale	MODERN SPECIES	36	PEDS1 (ENSDLEG00000002253)	CEBPB (ENSDLEG00000002250)	PTPN1 (ENSDLEG00000002239)	RIPOR3 (ENSDLEG00000002219)	PARD6B (ENSDLEG00000002207)	ENSDLEG00000002201	BCAS4 (ENSDLEG00000002183)	ADNP (ENSDLEG00000002171)	DPM1 (ENSDLEG00000002158)	MOCS3 (ENSDLEG00000002146)	KCNG1 (ENSDLEG00000002141)	NFATC2 (ENSDLEG00000002111)	ATP9A (ENSDLEG00000002017)	SALL4 (ENSDLEG00000001990)	ZFP64 (ENSDLEG00000001976)	TSHZ2 (ENSDLEG00000001964) ##22	ENSDLEG00000001949	ZNF217 (ENSDLEG00000001937)	ENSDLEG00000001927	BCAS1 (ENSDLEG00000001828)	CYP24A1 (ENSDLEG00000001776)	PFDN4 (ENSDLEG00000001762)	DOK5 (ENSDLEG00000001742)	CBLN4 (ENSDLEG00000001722)	MC3R (ENSDLEG00000001714)	FAM210B (ENSDLEG00000001702)	AURKA (ENSDLEG00000001687)	CSTF1 (ENSDLEG00000001658)	CASS4 (ENSDLEG00000001641)	GCNT7 (ENSDLEG00000001619)	RTFDC1 (ENSDLEG00000001595)
Narwhal	MODERN SPECIES	299	CEBPB (ENSMMNG00015001228)	PTPN1 (ENSMMNG00015001207)	RIPOR3 (ENSMMNG00015001135)	ENSMMNG00015001097	ENSMMNG00015001084	BCAS4 (ENSMMNG00015001066)	ADNP (ENSMMNG00015001049)	DPM1 (ENSMMNG00015001027)	MOCS3 (ENSMMNG00015001013)	KCNG1 (ENSMMNG00015000992)	ENSMMNG00015000978	NFATC2 (ENSMMNG00015000875)	ATP9A (ENSMMNG00015000677)	ENSMMNG00015000612	ZFP64 (ENSMMNG00015000539)	TSHZ2 (ENSMMNG00015000487) ##22	ENSMMNG00015000468	ZNF217 (ENSMMNG00015000437)	ENSMMNG00015000402	BCAS1 (ENSMMNG00015000370)	CYP24A1 (ENSMMNG00015000319)	PFDN4 (ENSMMNG00015000280)	DOK5 (ENSMMNG00015000246)	ENSMMNG00015000209	CBLN4 (ENSMMNG00015000195)	MC3R (ENSMMNG00015000177)	FAM210B (ENSMMNG00015000159)	AURKA (ENSMMNG00015000130)	CSTF1 (ENSMMNG00015000105)	CASS4 (ENSMMNG00015000069)	GCNT7 (ENSMMNG00015000042)
Vaquita	MODERN SPECIES	6	ENSPSNG00000021242	PEDS1 (ENSPSNG00000021182)	CEBPB (ENSPSNG00000021163)	PTPN1 (ENSPSNG00000021125)	RIPOR3 (ENSPSNG00000020934)	ENSPSNG00000020880	BCAS4 (ENSPSNG00000020852)	ADNP (ENSPSNG00000020812)	DPM1 (ENSPSNG00000020744)	ENSPSNG00000020711	KCNG1 (ENSPSNG00000020680)	NFATC2 (ENSPSNG00000020496)	ATP9A (ENSPSNG00000020387)	SALL4 (ENSPSNG00000020296)	ZFP64 (ENSPSNG00000020170)	TSHZ2 (ENSPSNG00000020114) ##22	ENSPSNG00000020106	ZNF217 (ENSPSNG00000020078)	ENSPSNG00000020059	BCAS1 (ENSPSNG00000019991)	CYP24A1 (ENSPSNG00000019798)	PFDN4 (ENSPSNG00000019742)	DOK5 (ENSPSNG00000019697)	CBLN4 (ENSPSNG00000019654)	MC3R (ENSPSNG00000019606)	FAM210B (ENSPSNG00000019586)	AURKA (ENSPSNG00000019542)	CSTF1 (ENSPSNG00000019520)	CASS4 (ENSPSNG00000019490)	GCNT7 (ENSPSNG00000019434)	RTF2 (ENSPSNG00000019378)
Dolphin	MODERN SPECIES	2252																TSHZ2 (ENSTTRG00000005801) ##22
Sperm whale	MODERN SPECIES	5	SLC9A8 (ENSPCTG00005005474)	B4GALT5 (ENSPCTG00005005401)	TMEM189 (ENSPCTG00005005331)	PTPN1 (ENSPCTG00005005281)	RIPOR3 (ENSPCTG00005005154)	PARD6B (ENSPCTG00005005115)	BCAS4 (ENSPCTG00005005092)	ADNP (ENSPCTG00005005045)	DPM1 (ENSPCTG00005005006)	MOCS3 (ENSPCTG00005004988)	KCNG1 (ENSPCTG00005004977)	NFATC2 (ENSPCTG00005004813)	ATP9A (ENSPCTG00005004382)	ENSPCTG00005004261	ZFP64 (ENSPCTG00005021080)	TSHZ2 (ENSPCTG00005021047) ##22	ENSPCTG00005021022	ZNF217 (ENSPCTG00005021008)	ENSPCTG00005020985	ENSPCTG00005020977	BCAS1 (ENSPCTG00005020687)	CYP24A1 (ENSPCTG00005020488)	PFDN4 (ENSPCTG00005020437)	DOK5 (ENSPCTG00005020398)	ENSPCTG00005020331	ENSPCTG00005020310	CBLN4 (ENSPCTG00005020287)	MC3R (ENSPCTG00005020261)	FAM210B (ENSPCTG00005020243)	AURKA (ENSPCTG00005020213)	CSTF1 (ENSPCTG00005020190)
Blue whale	MODERN SPECIES	6	PTPN1 (ENSBMSG00010018637)	RIPOR3 (ENSBMSG00010018504)	ENSBMSG00010018471	ENSBMSG00010018443	ADNP (ENSBMSG00010018402)	DPM1 (ENSBMSG00010018385)	ENSBMSG00010018371	KCNG1 (ENSBMSG00010018351)	NFATC2 (ENSBMSG00010018152)	ATP9A (ENSBMSG00010018064)	SALL4 (ENSBMSG00010017978)	ENSBMSG00010017945	ZFP64 (ENSBMSG00010017865)	PNMA5 (ENSBMSG00010017834)	ENSBMSG00010017820	TSHZ2 (ENSBMSG00010017799) ##22	ENSBMSG00010017767	ZNF217 (ENSBMSG00010017748)	ENSBMSG00010017734	BCAS1 (ENSBMSG00010017677)	CYP24A1 (ENSBMSG00010017495)	ENSBMSG00010017440	ENSBMSG00010017414	DOK5 (ENSBMSG00010017385)	CBLN4 (ENSBMSG00010017348)	MC3R (ENSBMSG00010017331)	FAM210B (ENSBMSG00010017312)	AURKA (ENSBMSG00010017273)	CSTF1 (ENSBMSG00010017244)	CASS4 (ENSBMSG00010017207)	GCNT7 (ENSBMSG00010017169)
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
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Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00910000147046	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
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Pan	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00910000147046	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00910000148217	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00900000143204.a	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057.b
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Bonobo	MODERN SPECIES	11	ENSPPAG00000029645	PARD6B (ENSPPAG00000038274)	ENSPPAG00000031066	ADNP (ENSPPAG00000035684)	ENSPPAG00000035180	ENSPPAG00000038880	DPM1 (ENSPPAG00000042946)	MOCS3 (ENSPPAG00000008891)	KCNG1 (ENSPPAG00000032019)	NFATC2 (ENSPPAG00000040722)	ENSPPAG00000042667	ATP9A (ENSPPAG00000030836)	SALL4 (ENSPPAG00000038064)	ZFP64 (ENSPPAG00000028816)	ENSPPAG00000040778	TSHZ2 (ENSPPAG00000031686) ##22	ENSPPAG00000032773	ZNF217 (ENSPPAG00000033439)	BCAS1 (ENSPPAG00000036066)	CYP24A1 (ENSPPAG00000038708)	PFDN4 (ENSPPAG00000041414)	DOK5 (ENSPPAG00000041888)	ENSPPAG00000026181	ENSPPAG00000029138	CBLN4 (ENSPPAG00000029475)	ENSPPAG00000030559	AURKA (ENSPPAG00000031434)	CSTF1 (ENSPPAG00000037866)	CASS4 (ENSPPAG00000000925)	RTF2 (ENSPPAG00000026702)	ENSPPAG00000031674
Human	MODERN SPECIES	12	PEDS1-UBE2V1 (ENSG00000124208)	PEDS1 (ENSG00000240849)	CEBPB (ENSG00000172216)	PTPN1 (ENSG00000196396)	RIPOR3 (ENSG00000042062)	PARD6B (ENSG00000124171)	BCAS4 (ENSG00000124243)	ADNP (ENSG00000101126)	DPM1 (ENSG00000000419)	MOCS3 (ENSG00000124217)	KCNG1 (ENSG00000026559)	NFATC2 (ENSG00000101096)	ATP9A (ENSG00000054793)	SALL4 (ENSG00000101115)	ZFP64 (ENSG00000020256)	TSHZ2 (ENSG00000182463) ##22	ZNF217 (ENSG00000171940)	BCAS1 (ENSG00000064787)	CYP24A1 (ENSG00000019186)	PFDN4 (ENSG00000101132)	DOK5 (ENSG00000101134)	CBLN4 (ENSG00000054803)	MC3R (ENSG00000124089)	FAM210B (ENSG00000124098)	AURKA (ENSG00000087586)	CSTF1 (ENSG00000101138)	CASS4 (ENSG00000087589)	RTF2 (ENSG00000022277)	GCNT7 (ENSG00000124091)	FAM209A (ENSG00000124103)	FAM209B (ENSG00000213714)
Gorilla	MODERN SPECIES	11	RIPOR3 (ENSGGOG00000007043)	PARD6B (ENSGGOG00000010338)	ENSGGOG00000025933	ADNP (ENSGGOG00000003120)	ENSGGOG00000040026	ENSGGOG00000038274	DPM1 (ENSGGOG00000008993)	MOCS3 (ENSGGOG00000008999)	KCNG1 (ENSGGOG00000000844)	NFATC2 (ENSGGOG00000024518)	ENSGGOG00000040795	ATP9A (ENSGGOG00000016586)	SALL4 (ENSGGOG00000001832)	ZFP64 (ENSGGOG00000012030)	ENSGGOG00000026918	TSHZ2 (ENSGGOG00000005282) ##22	ENSGGOG00000043241	ZNF217 (ENSGGOG00000022817)	BCAS1 (ENSGGOG00000001286)	CYP24A1 (ENSGGOG00000009673)	PFDN4 (ENSGGOG00000027337)	DOK5 (ENSGGOG00000002089)	ENSGGOG00000042206	ENSGGOG00000038418	CBLN4 (ENSGGOG00000010488)	MC3R (ENSGGOG00000028519)	FAM210B (ENSGGOG00000043075)	AURKA (ENSGGOG00000007197)	CSTF1 (ENSGGOG00000007205)	CASS4 (ENSGGOG00000004217)	RTF2 (ENSGGOG00000004223)
Orangutan	MODERN SPECIES	11	CEBPB (ENSPPYG00000011124)	PTPN1 (ENSPPYG00000011126)	RIPOR3 (ENSPPYG00000011127)	PARD6B (ENSPPYG00000038640)	ENSPPYG00000037475	ENSPPYG00000030749	ADNP (ENSPPYG00000011130)	DPM1 (ENSPPYG00000011131)	MOCS3 (ENSPPYG00000011132)	KCNG1 (ENSPPYG00000011133)	NFATC2 (ENSPPYG00000011135)	ENSPPYG00000011136	SALL4 (ENSPPYG00000011138)	ENSPPYG00000019918	ZFP64 (ENSPPYG00000011139)	TSHZ2 (ENSPPYG00000011269) ##22	ENSPPYG00000037756	ZNF217 (ENSPPYG00000011140)	BCAS1 (ENSPPYG00000011142)	CYP24A1 (ENSPPYG00000011143)	ENSPPYG00000025840	DOK5 (ENSPPYG00000011144)	CBLN4 (ENSPPYG00000011145)	MC3R (ENSPPYG00000011146)	FAM210B (ENSPPYG00000011147)	AURKA (ENSPPYG00000011148)	CSTF1 (ENSPPYG00000011149)	CASS4 (ENSPPYG00000011150)	RTF2 (ENSPPYG00000011151)	ENSPPYG00000011152	ENSPPYG00000033583
Gibbon	MODERN SPECIES	3	RIPOR3 (ENSNLEG00000006989)	PARD6B (ENSNLEG00000006993)	ENSNLEG00000019226	ENSNLEG00000006994	ADNP (ENSNLEG00000006995)	DPM1 (ENSNLEG00000006998)	MOCS3 (ENSNLEG00000019227)	KCNG1 (ENSNLEG00000007001)	ENSNLEG00000019228	NFATC2 (ENSNLEG00000007002)	ENSNLEG00000034112	ATP9A (ENSNLEG00000007005)	SALL4 (ENSNLEG00000007013)	ENSNLEG00000034384	ZFP64 (ENSNLEG00000007015)	TSHZ2 (ENSNLEG00000007016) ##22	ENSNLEG00000028918	ZNF217 (ENSNLEG00000007017)	ENSNLEG00000013615	ENSNLEG00000007019	CYP24A1 (ENSNLEG00000007020)	PFDN4 (ENSNLEG00000007023)	DOK5 (ENSNLEG00000007024)	CBLN4 (ENSNLEG00000007027)	MC3R (ENSNLEG00000019230)	ENSNLEG00000007028	AURKA (ENSNLEG00000007029)	CSTF1 (ENSNLEG00000007034)	CASS4 (ENSNLEG00000007036)	ENSNLEG00000028915	RTF2 (ENSNLEG00000007037)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00910000147046	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00910000147046	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00910000147046	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.b.e	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057.d
Drill	MODERN SPECIES	711									ENSMLEG00000034180	NFATC2 (ENSMLEG00000034598)	ENSMLEG00000000428	ATP9A (ENSMLEG00000031475)	SALL4 (ENSMLEG00000030467)	ZFP64 (ENSMLEG00000036238)	ENSMLEG00000036978	TSHZ2 (ENSMLEG00000033081) ##22	ENSMLEG00000025465	ZNF217 (ENSMLEG00000028314)	BCAS1 (ENSMLEG00000028154)	CYP24A1 (ENSMLEG00000038601)	PFDN4 (ENSMLEG00000042229)	DOK5 (ENSMLEG00000035038)	CBLN4 (ENSMLEG00000018831)	FAM210B (ENSMLEG00000036070)	AURKA (ENSMLEG00000003588)	CSTF1 (ENSMLEG00000016128)	CASS4 (ENSMLEG00000037604)	RTF2 (ENSMLEG00000036789)	GCNT7 (ENSMLEG00000031478)	ENSMLEG00000025747	ENSMLEG00000013626
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	648	ENSCATG00000039168	RIPOR3 (ENSCATG00000037442)	PARD6B (ENSCATG00000006757)	BCAS4 (ENSCATG00000041470)	ENSCATG00000000447	ADNP (ENSCATG00000044453)	DPM1 (ENSCATG00000043688)	MOCS3 (ENSCATG00000015208)	KCNG1 (ENSCATG00000040592)	ENSCATG00000020597	NFATC2 (ENSCATG00000042896)	ATP9A (ENSCATG00000044505)	SALL4 (ENSCATG00000030757)	ENSCATG00000041010	ZFP64 (ENSCATG00000042266)	TSHZ2 (ENSCATG00000039930) ##22	ENSCATG00000022997	ZNF217 (ENSCATG00000032669)	ENSCATG00000015802	BCAS1 (ENSCATG00000031760)	CYP24A1 (ENSCATG00000043442)	PFDN4 (ENSCATG00000042568)	DOK5 (ENSCATG00000029158)	CBLN4 (ENSCATG00000036053)	FAM210B (ENSCATG00000039274)	ENSCATG00000033256	CSTF1 (ENSCATG00000031885)	CASS4 (ENSCATG00000033801)	GCNT7 (ENSCATG00000013240)	RTF2 (ENSCATG00000039310)	ENSCATG00000021152
Olive baboon	MODERN SPECIES	7	ENSPANG00000040021	PEDS1 (ENSPANG00000011164)	CEBPB (ENSPANG00000007537)	PTPN1 (ENSPANG00000011165)	RIPOR3 (ENSPANG00000020916)	PARD6B (ENSPANG00000007538)	BCAS4 (ENSPANG00000003915)	ADNP (ENSPANG00000021104)	DPM1 (ENSPANG00000034110)	MOCS3 (ENSPANG00000000373)	KCNG1 (ENSPANG00000014248)	NFATC2 (ENSPANG00000021791)	ATP9A (ENSPANG00000023209)	SALL4 (ENSPANG00000021792)	ZFP64 (ENSPANG00000021108)	TSHZ2 (ENSPANG00000049614) ##22	ENSPANG00000004337	ZNF217 (ENSPANG00000020786)	ENSPANG00000038001	ENSPANG00000037067	BCAS1 (ENSPANG00000020784)	CYP24A1 (ENSPANG00000020783)	PFDN4 (ENSPANG00000021793)	DOK5 (ENSPANG00000021794)	ENSPANG00000046400	CBLN4 (ENSPANG00000049128)	MC3R (ENSPANG00000043329)	FAM210B (ENSPANG00000040473)	AURKA (ENSPANG00000021795)	CSTF1 (ENSPANG00000020917)	CASS4 (ENSPANG00000020918)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00910000147046	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	462	CEBPB (ENSMNEG00000008052)	PTPN1 (ENSMNEG00000037262)	RIPOR3 (ENSMNEG00000034821)	ENSMNEG00000010103	PARD6B (ENSMNEG00000035151)	ENSMNEG00000028660	ADNP (ENSMNEG00000042761)	DPM1 (ENSMNEG00000034717)	MOCS3 (ENSMNEG00000011056)	KCNG1 (ENSMNEG00000029109)	NFATC2 (ENSMNEG00000034579)	ATP9A (ENSMNEG00000023182)	SALL4 (ENSMNEG00000035995)	ENSMNEG00000034407	ZFP64 (ENSMNEG00000040581)	TSHZ2 (ENSMNEG00000040060) ##22	ENSMNEG00000028135	ZNF217 (ENSMNEG00000029796)	BCAS1 (ENSMNEG00000039962)	CYP24A1 (ENSMNEG00000039138)	PFDN4 (ENSMNEG00000028087)	DOK5 (ENSMNEG00000005921)	CBLN4 (ENSMNEG00000028083)	FAM210B (ENSMNEG00000031940)	AURKA (ENSMNEG00000020907)	CSTF1 (ENSMNEG00000028759)	CASS4 (ENSMNEG00000041494)	GCNT7 (ENSMNEG00000042982)	RTF2 (ENSMNEG00000002223)	ENSMNEG00000031630	ENSMNEG00000041000
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00940000154319.u.a.d	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.b.b.a.a.a.a.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134.e	ENSGT00940000154900.e	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	1	RIPOR3 (ENSMFAG00000034413)	PARD6B (ENSMFAG00000007135)	ENSMFAG00000015516	ENSMFAG00000059434	ENSMFAG00000064118	ADNP (ENSMFAG00000042512)	DPM1 (ENSMFAG00000036839)	MOCS3 (ENSMFAG00000060225)	NFATC2 (ENSMFAG00000044962)	ATP9A (ENSMFAG00000001634)	ENSMFAG00000054797	SALL4 (ENSMFAG00000027169)	ZFP64 (ENSMFAG00000034598)	ENSMFAG00000060520	ENSMFAG00000063669	TSHZ2 (ENSMFAG00000044946) ##22	ZNF217 (ENSMFAG00000041447)	ENSMFAG00000025867	BCAS1 (ENSMFAG00000033646)	CYP24A1 (ENSMFAG00000046397)	PFDN4 (ENSMFAG00000002174)	DOK5 (ENSMFAG00000032194)	ENSMFAG00000062425	CBLN4 (ENSMFAG00000058053)	MC3R (ENSMFAG00000062266)	ENSMFAG00000047548	FAM210B (ENSMFAG00000056763)	AURKA (ENSMFAG00000001851)	CSTF1 (ENSMFAG00000003531)	CASS4 (ENSMFAG00000045759)	RTF2 (ENSMFAG00000002272)
Rhesus	MODERN SPECIES	1	CEBPB (ENSMMUG00000045219)	PTPN1 (ENSMMUG00000007878)	RIPOR3 (ENSMMUG00000007883)	PARD6B (ENSMMUG00000064108)	BCAS4 (ENSMMUG00000012127)	ADNP (ENSMMUG00000002761)	DPM1 (ENSMMUG00000002759)	MOCS3 (ENSMMUG00000002758)	KCNG1 (ENSMMUG00000000683)	NFATC2 (ENSMMUG00000012657)	ATP9A (ENSMMUG00000000918)	ENSMMUG00000062664	ENSMMUG00000064070	SALL4 (ENSMMUG00000003870)	ZFP64 (ENSMMUG00000018846)	TSHZ2 (ENSMMUG00000013035) ##22	ZNF217 (ENSMMUG00000018358)	ENSMMUG00000043345	BCAS1 (ENSMMUG00000020082)	CYP24A1 (ENSMMUG00000014860)	PFDN4 (ENSMMUG00000017300)	DOK5 (ENSMMUG00000007090)	ENSMMUG00000053508	ENSMMUG00000056122	CBLN4 (ENSMMUG00000006005)	MC3R (ENSMMUG00000051905)	FAM210B (ENSMMUG00000061353)	AURKA (ENSMMUG00000000070)	CSTF1 (ENSMMUG00000000072)	CASS4 (ENSMMUG00000000073)	RTF2 (ENSMMUG00000000074)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	11	SNAI1 (ENSCSAG00000015065)	PEDS1 (ENSCSAG00000015097)	CEBPB (ENSCSAG00000018746)	PTPN1 (ENSCSAG00000015111)	RIPOR3 (ENSCSAG00000015167)	PARD6B (ENSCSAG00000015184)	BCAS4 (ENSCSAG00000015199)	ADNP (ENSCSAG00000015205)	DPM1 (ENSCSAG00000015216)	MOCS3 (ENSCSAG00000018745)	KCNG1 (ENSCSAG00000015218)	NFATC2 (ENSCSAG00000015242)	ATP9A (ENSCSAG00000015260)	SALL4 (ENSCSAG00000015269)	ZFP64 (ENSCSAG00000015277)	TSHZ2 (ENSCSAG00000018744) ##22	ENSCSAG00000018743	ZNF217 (ENSCSAG00000015287)	ENSCSAG00000018742	BCAS1 (ENSCSAG00000015313)	CYP24A1 (ENSCSAG00000015320)	PFDN4 (ENSCSAG00000015325)	DOK5 (ENSCSAG00000015329)	CBLN4 (ENSCSAG00000015334)	MC3R (ENSCSAG00000018741)	FAM210B (ENSCSAG00000015346)	AURKA (ENSCSAG00000015393)	CSTF1 (ENSCSAG00000015411)	CASS4 (ENSCSAG00000015418)	GCNT7 (ENSCSAG00000015423)	RTF2 (ENSCSAG00000015426)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	151	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00390000018566.j	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1077				ENSRROG00000019663	PARD6B (ENSRROG00000043087)	BCAS4 (ENSRROG00000044081)	ADNP (ENSRROG00000030887)	DPM1 (ENSRROG00000036379)	MOCS3 (ENSRROG00000006793)	KCNG1 (ENSRROG00000035240)	NFATC2 (ENSRROG00000043137)	ATP9A (ENSRROG00000041159)	SALL4 (ENSRROG00000036585)	ENSRROG00000039377	ZFP64 (ENSRROG00000042819)	TSHZ2 (ENSRROG00000036440) ##22	ENSRROG00000014210	ZNF217 (ENSRROG00000045421)	BCAS1 (ENSRROG00000029559)	CYP24A1 (ENSRROG00000043791)	PFDN4 (ENSRROG00000031138)	DOK5 (ENSRROG00000037243)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	897	ENSRBIG00000044255	PEDS1 (ENSRBIG00000043990)	PTPN1 (ENSRBIG00000011178)	RIPOR3 (ENSRBIG00000044567)	PARD6B (ENSRBIG00000033259)	BCAS4 (ENSRBIG00000040298)	ADNP (ENSRBIG00000027632)	DPM1 (ENSRBIG00000025547)	MOCS3 (ENSRBIG00000044580)	KCNG1 (ENSRBIG00000029539)	NFATC2 (ENSRBIG00000029008)	ATP9A (ENSRBIG00000028855)	SALL4 (ENSRBIG00000039876)	ZFP64 (ENSRBIG00000019844)	ENSRBIG00000044557	TSHZ2 (ENSRBIG00000023205) ##22	ENSRBIG00000030503	ZNF217 (ENSRBIG00000044401)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041.c.a	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153404.a.m.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884.a	ENSGT00940000154319.u.a	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00940000160161	ENSGT00390000006865	ENSGT00940000153313.C.b	ENSGT00390000006696.vb	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041.c.a	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884.a	ENSGT00940000154319.u.a	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00940000160161	ENSGT00390000006865	ENSGT00940000153313.C.b	ENSGT00390000006696.vb	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253
Marmoset	MODERN SPECIES	17	UBE2V1 (ENSCJAG00000039715)	PEDS1 (ENSCJAG00000072528)	CEBPB (ENSCJAG00000038265)	ENSCJAG00000000531	RIPOR3 (ENSCJAG00000000534)	PARD6B (ENSCJAG00000044244)	BCAS4 (ENSCJAG00000000562)	ADNP (ENSCJAG00000000563)	DPM1 (ENSCJAG00000000551)	MOCS3 (ENSCJAG00000023186)	KCNG1 (ENSCJAG00000000570)	NFATC2 (ENSCJAG00000000574)	ATP9A (ENSCJAG00000000586)	ENSCJAG00000000591	ZFP64 (ENSCJAG00000000596)	TSHZ2 (ENSCJAG00000000609) ##22	ENSCJAG00000040137	ENSCJAG00000076838	ZNF217 (ENSCJAG00000000615)	ENSCJAG00000075669	ENSCJAG00000081777	ENSCJAG00000076753	ENSCJAG00000072940	ENSCJAG00000023203	ENSCJAG00000084109	BCAS1 (ENSCJAG00000000622)	CYP24A1 (ENSCJAG00000000625)	ENSCJAG00000020407	NDUFA9 (ENSCJAG00000002625)	AKAP3 (ENSCJAG00000002622)	ENSCJAG00000084558
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041.d	ENSGT00940000158041.c.a	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884.a	ENSGT00940000154319.u.a	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00940000160161	ENSGT00390000006865	ENSGT00940000153313.C.b	ENSGT00390000006696.vb	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253
Capuchin	MODERN SPECIES	224			PTPN1 (ENSCCAG00000023451)	RIPOR3 (ENSCCAG00000031037)	PARD6B (ENSCCAG00000025810)	BCAS4 (ENSCCAG00000022933)	ADNP (ENSCCAG00000034384)	DPM1 (ENSCCAG00000027064)	MOCS3 (ENSCCAG00000032344)	KCNG1 (ENSCCAG00000034975)	NFATC2 (ENSCCAG00000025112)	ENSCCAG00000031561	ATP9A (ENSCCAG00000027234)	ENSCCAG00000029512	ZFP64 (ENSCCAG00000033968)	TSHZ2 (ENSCCAG00000021876) ##22	ENSCCAG00000020419	ENSCCAG00000034411	ENSCCAG00000025469	BCAS1 (ENSCCAG00000033293)	CYP24A1 (ENSCCAG00000034422)	ENSCCAG00000025923	ENSCCAG00000020226
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	93	ENSSBOG00000028538	PEDS1 (ENSSBOG00000000313)	ENSSBOG00000021238	RIPOR3 (ENSSBOG00000020304)	PARD6B (ENSSBOG00000033004)	BCAS4 (ENSSBOG00000031019)	ADNP (ENSSBOG00000031931)	DPM1 (ENSSBOG00000035012)	MOCS3 (ENSSBOG00000016142)	KCNG1 (ENSSBOG00000030989)	NFATC2 (ENSSBOG00000023445)	ENSSBOG00000020755	ATP9A (ENSSBOG00000018293)	SALL4 (ENSSBOG00000030011)	ZFP64 (ENSSBOG00000026654)	TSHZ2 (ENSSBOG00000024081) ##22	ENSSBOG00000018726	ZNF217 (ENSSBOG00000023737)	ENSSBOG00000017716	BCAS1 (ENSSBOG00000027776)	CYP24A1 (ENSSBOG00000033981)	GALNT8 (ENSSBOG00000023511)	NDUFA9 (ENSSBOG00000023634)	ENSSBOG00000027064	ENSSBOG00000032651	DOK5 (ENSSBOG00000034460)	CBLN4 (ENSSBOG00000027027)	MC3R (ENSSBOG00000011355)	FAM210B (ENSSBOG00000024853)	AURKA (ENSSBOG00000007729)	CSTF1 (ENSSBOG00000024921)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1347	PEDS1 (ENSANAG00000027579)	CEBPB (ENSANAG00000026101)	ENSANAG00000030593	RIPOR3 (ENSANAG00000024708)	PARD6B (ENSANAG00000024355)	BCAS4 (ENSANAG00000036456)	ADNP (ENSANAG00000035777)	ENSANAG00000026501	DPM1 (ENSANAG00000030552)	MOCS3 (ENSANAG00000003316)	KCNG1 (ENSANAG00000036536)	NFATC2 (ENSANAG00000034927)	ATP9A (ENSANAG00000032631)	SALL4 (ENSANAG00000023352)	ZFP64 (ENSANAG00000034694)	TSHZ2 (ENSANAG00000038357) ##22	ENSANAG00000005571	ENSANAG00000036769	ENSANAG00000028551	BCAS1 (ENSANAG00000019184)	CYP24A1 (ENSANAG00000028217)	NDUFA9 (ENSANAG00000036928)	AKAP3 (ENSANAG00000029990)	DOK5 (ENSANAG00000016760)	CBLN4 (ENSANAG00000027031)	MC3R (ENSANAG00000006077)	FAM210B (ENSANAG00000035348)	ENSANAG00000038011	CSTF1 (ENSANAG00000033317)	CASS4 (ENSANAG00000030932)	RTF2 (ENSANAG00000028030)
Tarsier	MODERN SPECIES	4408																TSHZ2 (ENSTSYG00000009303) ##22	ENSTSYG00000031097	ZNF217 (ENSTSYG00000006086)	ENSTSYG00000027960	PLEKHN1 (ENSTSYG00000025681)	KLHL17 (ENSTSYG00000032370)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00910000148217	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	686												NFATC2 (ENSPCOG00000019465)	ATP9A (ENSPCOG00000024229)	SALL4 (ENSPCOG00000016321)	ZFP64 (ENSPCOG00000017919)	TSHZ2 (ENSPCOG00000018914) ##22
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	310																TSHZ2 (ENSPSMG00000020678) ##22	ENSPSMG00000020671	ZNF217 (ENSPSMG00000020665)	BCAS1 (ENSPSMG00000020657)	CYP24A1 (ENSPSMG00000020642)	PFDN4 (ENSPSMG00000020609)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	9	ENSMICG00000011166	ENSMICG00000047905	CEBPB (ENSMICG00000035606)	PTPN1 (ENSMICG00000017702)	RIPOR3 (ENSMICG00000017704)	PARD6B (ENSMICG00000032853)	BCAS4 (ENSMICG00000015943)	ADNP (ENSMICG00000027969)	DPM1 (ENSMICG00000003186)	KCNG1 (ENSMICG00000032333)	NFATC2 (ENSMICG00000000025)	ATP9A (ENSMICG00000000026)	SALL4 (ENSMICG00000000027)	ENSMICG00000047411	ZFP64 (ENSMICG00000034213)	TSHZ2 (ENSMICG00000035295) ##22	ENSMICG00000028159	BANF2 (ENSMICG00000032062)	RRBP1 (ENSMICG00000013693)	DSTN (ENSMICG00000035158)	BFSP1 (ENSMICG00000028889)	PCSK2 (ENSMICG00000004252)	OTOR (ENSMICG00000043592)	SNRPB2 (ENSMICG00000015404)	ENSMICG00000015229	DOK5 (ENSMICG00000004144)	PFDN4 (ENSMICG00000004651)	CYP24A1 (ENSMICG00000029179)	ENSMICG00000045708	ZNF217 (ENSMICG00000009450)	BCAS1 (ENSMICG00000004635)
Bushbaby	MODERN SPECIES	138	ENSOGAG00000025894	PEDS1 (ENSOGAG00000009132)	CEBPB (ENSOGAG00000026467)	PTPN1 (ENSOGAG00000005483)	RIPOR3 (ENSOGAG00000005486)	PARD6B (ENSOGAG00000005490)	BCAS4 (ENSOGAG00000005491)	ADNP (ENSOGAG00000005381)	DPM1 (ENSOGAG00000005384)	MOCS3 (ENSOGAG00000030283)	KCNG1 (ENSOGAG00000028070)	NFATC2 (ENSOGAG00000013787)	ATP9A (ENSOGAG00000013793)	SALL4 (ENSOGAG00000013799)	ZFP64 (ENSOGAG00000005192)	TSHZ2 (ENSOGAG00000008544) ##22	ENSOGAG00000033043	ZNF217 (ENSOGAG00000001685)	BCAS1 (ENSOGAG00000000952)	CYP24A1 (ENSOGAG00000016370)	PFDN4 (ENSOGAG00000016375)	DOK5 (ENSOGAG00000005109)	CBLN4 (ENSOGAG00000001413)	MC3R (ENSOGAG00000004439)	FAM210B (ENSOGAG00000004440)	ENSOGAG00000004441	CSTF1 (ENSOGAG00000004442)	CASS4 (ENSOGAG00000034431)	RTF2 (ENSOGAG00000004444)	GCNT7 (ENSOGAG00000004446)	ENSOGAG00000028848
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Tree shrew	MODERN SPECIES	4382																TSHZ2 (ENSTBEG00000015472) ##22	ZNF217 (ENSTBEG00000015797)
Glires	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	158														ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00940000169372	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923
Rabbit	MODERN SPECIES	445													SALL4 (ENSOCUG00000011797)	ENSOCUG00000032290	ENSOCUG00000029581	TSHZ2 (ENSOCUG00000002587) ##22	ENSOCUG00000033970	ZNF217 (ENSOCUG00000011363)	BCAS1 (ENSOCUG00000004927)	ENSOCUG00000033518	CYP24A1 (ENSOCUG00000004935)	ENSOCUG00000004940	ENSOCUG00000025205	DOK5 (ENSOCUG00000009223)	CBLN4 (ENSOCUG00000000072)	MC3R (ENSOCUG00000010002)	ENSOCUG00000017897	AURKA (ENSOCUG00000017898)	ENSOCUG00000035020	CASS4 (ENSOCUG00000017901)	GCNT7 (ENSOCUG00000017904)
Pika	MODERN SPECIES	3897																ENSOPRG00000012800 ##22	ENSOPRG00000012813
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	394	Rnf114 (ENSDORG00000014937)	Snai1 (ENSDORG00000025372)	ENSDORG00000027579	ENSDORG00000004219	Ptpn1 (ENSDORG00000013016)	Ripor3 (ENSDORG00000026878)	Pard6b (ENSDORG00000007031)	Adnp (ENSDORG00000024209)	Dpm1 (ENSDORG00000010186)	Mocs3 (ENSDORG00000029643)	Kcng1 (ENSDORG00000008510)	Nfatc2 (ENSDORG00000028181)	Atp9a (ENSDORG00000008732)	Sall4 (ENSDORG00000012841)	Zfp64 (ENSDORG00000024389)	ENSDORG00000028111 ##22	ENSDORG00000027670	Zfp217 (ENSDORG00000023982)	Bcas1 (ENSDORG00000002327)	Cyp24a1 (ENSDORG00000016127)	ENSDORG00000006644	Dok5 (ENSDORG00000007241)	Cbln4 (ENSDORG00000009501)	ENSDORG00000029002	Mc3r (ENSDORG00000001167)	Fam210b (ENSDORG00000008544)	Aurka (ENSDORG00000008545)	Cstf1 (ENSDORG00000008546)	Cass4 (ENSDORG00000007789)	Gcnt7 (ENSDORG00000007793)	Rtf2 (ENSDORG00000028729)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	107	Slc9a8 (ENSJJAG00000024393)	Rnf114 (ENSJJAG00000021901)	Snai1 (ENSJJAG00000017317)	Ube2v1 (ENSJJAG00000011640)	Peds1 (ENSJJAG00000002964)	Cebpb (ENSJJAG00000023307)	Ptpn1 (ENSJJAG00000023377)	Adnp (ENSJJAG00000022527)	Dpm1 (ENSJJAG00000015047)	Mocs3 (ENSJJAG00000001507)	Kcng1 (ENSJJAG00000012496)	Nfatc2 (ENSJJAG00000022151)	Atp9a (ENSJJAG00000014602)	Sall4 (ENSJJAG00000020688)	Zfp64 (ENSJJAG00000013954)	ENSJJAG00000002372 ##22	ENSJJAG00000002075	Bcas1 (ENSJJAG00000014333)	Dok5 (ENSJJAG00000020159)	ENSJJAG00000017187	Mc3r (ENSJJAG00000002102)	ENSJJAG00000020175	Cstf1 (ENSJJAG00000016089)	Cass4 (ENSJJAG00000024186)	Gcnt7 (ENSJJAG00000020200)	ENSJJAG00000007606	Bmp7 (ENSJJAG00000019966)	ENSJJAG00000018364	ENSJJAG00000016299	ENSJJAG00000022019	Pck1 (ENSJJAG00000011814)
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	910	Ube2v1 (ENSNGAG00000015973)	ENSNGAG00000013302	Cebpb (ENSNGAG00000012015)	Ptpn1 (ENSNGAG00000010216)	Ripor3 (ENSNGAG00000013334)	Pard6b (ENSNGAG00000013685)	ENSNGAG00000011839	ENSNGAG00000001117	Mocs3 (ENSNGAG00000011771)	Kcng1 (ENSNGAG00000022351)	Nfatc2 (ENSNGAG00000010940)	ENSNGAG00000006990	Atp9a (ENSNGAG00000000818)	Sall4 (ENSNGAG00000017833)	Zfp64 (ENSNGAG00000018331)	ENSNGAG00000016474 ##22	Zfp217 (ENSNGAG00000016391)	Bcas1 (ENSNGAG00000015655)	Cyp24a1 (ENSNGAG00000013537)	Pfdn4 (ENSNGAG00000001025)	Dok5 (ENSNGAG00000013135)	Cbln4 (ENSNGAG00000000535)	Mc3r (ENSNGAG00000002843)
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT01090000262946	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B.g.b	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT01090000262946	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B.g.b	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B.g.b	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT01090000262956	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402
spretus	MODERN SPECIES	11	MGP_SPRETEiJ_G0025630	Peds1 (MGP_SPRETEiJ_G0025631)	Cebpb (MGP_SPRETEiJ_G0025632)	Ptpn1 (MGP_SPRETEiJ_G0025633)	Ripor3 (MGP_SPRETEiJ_G0025634)	Pard6b (MGP_SPRETEiJ_G0025635)	Adnp (MGP_SPRETEiJ_G0025636)	MGP_SPRETEiJ_G0025637	MGP_SPRETEiJ_G0025638	Mocs3 (MGP_SPRETEiJ_G0025639)	Kcng1 (MGP_SPRETEiJ_G0025640)	Nfatc2 (MGP_SPRETEiJ_G0025641)	Atp9a (MGP_SPRETEiJ_G0025642)	Sall4 (MGP_SPRETEiJ_G0025643)	Zfp64 (MGP_SPRETEiJ_G0025644)	Tshz2 (MGP_SPRETEiJ_G0025645) ##22	Zfp217 (MGP_SPRETEiJ_G0025646)	Bcas1 (MGP_SPRETEiJ_G0025647)	Cyp24a1 (MGP_SPRETEiJ_G0025648)	Pfdn4 (MGP_SPRETEiJ_G0025649)	MGP_SPRETEiJ_G0025650	Dok5 (MGP_SPRETEiJ_G0025651)	Cbln4 (MGP_SPRETEiJ_G0025652)	Mc3r (MGP_SPRETEiJ_G0025653)	Fam210b (MGP_SPRETEiJ_G0025654)	Aurka (MGP_SPRETEiJ_G0025655)	Cstf1 (MGP_SPRETEiJ_G0025656)	Cass4 (MGP_SPRETEiJ_G0025657)	Rtf2 (MGP_SPRETEiJ_G0025658)	Gcnt7 (MGP_SPRETEiJ_G0025659)	Fam209 (MGP_SPRETEiJ_G0025660)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2716															ENSMSIG00000009904	Tshz2 (ENSMSIG00000009890) ##22	ENSMSIG00000009887	ENSMSIG00000009882	Zfp217 (ENSMSIG00000009853)
Mouse	MODERN SPECIES	11	Ube2v1 (ENSMUSG00000078923)	Gm20431 (ENSMUSG00000089739)	Peds1 (ENSMUSG00000090213)	Cebpb (ENSMUSG00000056501)	Ptpn1 (ENSMUSG00000027540)	Ripor3 (ENSMUSG00000074577)	Pard6b (ENSMUSG00000044641)	Adnp (ENSMUSG00000051149)	Dpm1 (ENSMUSG00000078919)	Mocs3 (ENSMUSG00000074576)	Kcng1 (ENSMUSG00000074575)	Nfatc2 (ENSMUSG00000027544)	Atp9a (ENSMUSG00000027546)	Sall4 (ENSMUSG00000027547)	Zfp64 (ENSMUSG00000027551)	Tshz2 (ENSMUSG00000047907) ##22	Zfp217 (ENSMUSG00000052056)	Bcas1 (ENSMUSG00000013523)	Cyp24a1 (ENSMUSG00000038567)	Pfdn4 (ENSMUSG00000052033)	Dok5 (ENSMUSG00000027560)	Cbln4 (ENSMUSG00000067578)	Mc3r (ENSMUSG00000038537)	Fam210b (ENSMUSG00000027495)	Aurka (ENSMUSG00000027496)	Cstf1 (ENSMUSG00000027498)	Cass4 (ENSMUSG00000074570)	Rtf2 (ENSMUSG00000027502)	Gcnt7 (ENSMUSG00000074569)	Fam209 (ENSMUSG00000027505)	Tfap2c (ENSMUSG00000028640)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	MGP_CAROLIEiJ_G0024710	Peds1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024711)	Cebpb (MGP_CAROLIEiJ_G0024712)	Ptpn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024713)	Ripor3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024714)	Pard6b (MGP_CAROLIEiJ_G0024715)	Adnp (MGP_CAROLIEiJ_G0024716)	MGP_CAROLIEiJ_G0024717	MGP_CAROLIEiJ_G0024718	Mocs3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024719)	Kcng1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024720)	Nfatc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024721)	Atp9a (MGP_CAROLIEiJ_G0024722)	Sall4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024723)	Zfp64 (MGP_CAROLIEiJ_G0024724)	Tshz2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024725) ##22	Zfp217 (MGP_CAROLIEiJ_G0024726)	Bcas1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024727)	Cyp24a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024728)	MGP_CAROLIEiJ_G0024729	MGP_CAROLIEiJ_G0024730	Dok5 (MGP_CAROLIEiJ_G0024731)	Cbln4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024732)	Mc3r (MGP_CAROLIEiJ_G0024733)	Fam210b (MGP_CAROLIEiJ_G0024734)	Aurka (MGP_CAROLIEiJ_G0024735)	Cstf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024736)	Cass4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024737)	Rtf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024738)	Gcnt7 (MGP_CAROLIEiJ_G0024739)	Fam209 (MGP_CAROLIEiJ_G0024740)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Snai1 (MGP_PahariEiJ_G0026151)	MGP_PahariEiJ_G0026152	Peds1 (MGP_PahariEiJ_G0026153)	Cebpb (MGP_PahariEiJ_G0026154)	Ptpn1 (MGP_PahariEiJ_G0026155)	Ripor3 (MGP_PahariEiJ_G0026156)	Pard6b (MGP_PahariEiJ_G0026157)	MGP_PahariEiJ_G0026158	Dpm1 (MGP_PahariEiJ_G0026159)	Mocs3 (MGP_PahariEiJ_G0026160)	Kcng1 (MGP_PahariEiJ_G0026161)	Nfatc2 (MGP_PahariEiJ_G0026162)	Atp9a (MGP_PahariEiJ_G0026163)	Sall4 (MGP_PahariEiJ_G0026164)	Zfp64 (MGP_PahariEiJ_G0026165)	Tshz2 (MGP_PahariEiJ_G0026166) ##22	Zfp217 (MGP_PahariEiJ_G0026167)	Bcas1 (MGP_PahariEiJ_G0026168)	Cyp24a1 (MGP_PahariEiJ_G0026169)	Pfdn4 (MGP_PahariEiJ_G0026170)	MGP_PahariEiJ_G0026171	Dok5 (MGP_PahariEiJ_G0026172)	Cbln4 (MGP_PahariEiJ_G0026173)	Mc3r (MGP_PahariEiJ_G0026174)	Fam210b (MGP_PahariEiJ_G0026175)	Aurka (MGP_PahariEiJ_G0026176)	Cstf1 (MGP_PahariEiJ_G0026177)	Cass4 (MGP_PahariEiJ_G0026178)	Rtf2 (MGP_PahariEiJ_G0026179)	Gcnt7 (MGP_PahariEiJ_G0026180)	Fam209 (MGP_PahariEiJ_G0026181)
Rat	MODERN SPECIES	13	LOC679539 (ENSRNOG00000025580)	Peds1 (ENSRNOG00000060571)	Cebpb (ENSRNOG00000057347)	Ptpn1 (ENSRNOG00000010574)	Ripor3 (ENSRNOG00000010791)	Pard6b (ENSRNOG00000010883)	Adnp (ENSRNOG00000010975)	Dpm1 (ENSRNOG00000010993)	Mocs3 (ENSRNOG00000025067)	Kcng1 (ENSRNOG00000054314)	Nfatc2 (ENSRNOG00000012175)	Atp9a (ENSRNOG00000049484)	Sall4 (ENSRNOG00000050035)	Zfp93 (ENSRNOG00000012762)	ENSRNOG00000067568	Tshz2 (ENSRNOG00000048433) ##22	ENSRNOG00000064332	Zfp217 (ENSRNOG00000021787)	Bcas1 (ENSRNOG00000012906)	ENSRNOG00000063885	ENSRNOG00000064257	Cyp24a1 (ENSRNOG00000013062)	Pfdn4 (ENSRNOG00000050932)	Dok5 (ENSRNOG00000013196)	ENSRNOG00000065655	Cbln4 (ENSRNOG00000004372)	Mc3r (ENSRNOG00000004451)	Fam210b (ENSRNOG00000004466)	Aurka (ENSRNOG00000004479)	Cstf1 (ENSRNOG00000004775)	Cass4 (ENSRNOG00000021560)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Golden Hamster	MODERN SPECIES	664	Rnf114 (ENSMAUG00000019385)	Snai1 (ENSMAUG00000021592)	Ube2v1 (ENSMAUG00000020962)	Peds1 (ENSMAUG00000016961)	Ptpn1 (ENSMAUG00000010010)	Ripor3 (ENSMAUG00000010157)	Pard6b (ENSMAUG00000010497)	Adnp (ENSMAUG00000020819)	Dpm1 (ENSMAUG00000016233)	Mocs3 (ENSMAUG00000007351)	Kcng1 (ENSMAUG00000015676)	Nfatc2 (ENSMAUG00000011773)	Atp9a (ENSMAUG00000004916)	Sall4 (ENSMAUG00000015814)	Zfp64 (ENSMAUG00000015438)	ENSMAUG00000003995 ##22	ENSMAUG00000015308	Cyp24a1 (ENSMAUG00000013246)	Pfdn4 (ENSMAUG00000002277)	ENSMAUG00000001483	Cbln4 (ENSMAUG00000013556)	Mc3r (ENSMAUG00000006998)	Fam210b (ENSMAUG00000020693)	ENSMAUG00000008679	Cstf1 (ENSMAUG00000021501)	Cass4 (ENSMAUG00000016962)	Rtf2 (ENSMAUG00000007866)	Gcnt7 (ENSMAUG00000001661)	Tfap2c (ENSMAUG00000019572)	Bmp7 (ENSMAUG00000015344)	Spo11 (ENSMAUG00000020198)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	195	Ube2v1 (ENSCGRG00001009565)	Peds1 (ENSCGRG00001010523)	Cebpb (ENSCGRG00001001737)	Ptpn1 (ENSCGRG00001012267)	Ripor3 (ENSCGRG00001013099)	Pard6b (ENSCGRG00001014206)	Adnp (ENSCGRG00001004111)	Dpm1 (ENSCGRG00001007175)	Mocs3 (ENSCGRG00001003680)	Kcng1 (ENSCGRG00001009827)	Nfatc2 (ENSCGRG00001012491)	Atp9a (ENSCGRG00001017172)	Sall4 (ENSCGRG00001019569)	Zfp64 (ENSCGRG00001020443)	ENSCGRG00001015533	Tshz2 (ENSCGRG00001000496) ##22	ENSCGRG00001007530	Zfp217 (ENSCGRG00001002600)	Bcas1 (ENSCGRG00001007157)	Cyp24a1 (ENSCGRG00001010160)	Pfdn4 (ENSCGRG00001010542)	Dok5 (ENSCGRG00001011991)	Cbln4 (ENSCGRG00001012538)	Mc3r (ENSCGRG00001015997)	Fam210b (ENSCGRG00001013313)	Aurka (ENSCGRG00001014225)	Cstf1 (ENSCGRG00001021492)	Cass4 (ENSCGRG00001022964)	Rtf2 (ENSCGRG00001024046)	Gcnt7 (ENSCGRG00001024252)	Fam209 (ENSCGRG00001024477)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154681.a	ENSGT00940000158854.ib.b.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Prairie vole	MODERN SPECIES	357	Snai1 (ENSMOCG00000007847)	Ube2v1 (ENSMOCG00000012071)	Peds1 (ENSMOCG00000010275)	Cebpb (ENSMOCG00000010607)	Ptpn1 (ENSMOCG00000001636)	Ripor3 (ENSMOCG00000010739)	Pard6b (ENSMOCG00000003321)	ENSMOCG00000001467	Dpm1 (ENSMOCG00000015289)	Mocs3 (ENSMOCG00000003624)	Kcng1 (ENSMOCG00000009238)	Nfatc2 (ENSMOCG00000000259)	Atp9a (ENSMOCG00000016994)	Sall4 (ENSMOCG00000018245)	Zfp64 (ENSMOCG00000004895)	ENSMOCG00000013704 ##22	Zfp217 (ENSMOCG00000018704)	Bcas1 (ENSMOCG00000004294)	Cyp24a1 (ENSMOCG00000016929)	ENSMOCG00000000248	ENSMOCG00000013934	Dok5 (ENSMOCG00000006196)	Cbln4 (ENSMOCG00000002519)	Mc3r (ENSMOCG00000008736)	Fam210b (ENSMOCG00000012454)	Aurka (ENSMOCG00000005866)	Cstf1 (ENSMOCG00000022740)	Cass4 (ENSMOCG00000002673)	Gcnt7 (ENSMOCG00000002404)	Rtf2 (ENSMOCG00000021800)	Fam209 (ENSMOCG00000021570)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	ENSPEMG00000001442	Peds1 (ENSPEMG00000006010)	Ptpn1 (ENSPEMG00000012811)	Ripor3 (ENSPEMG00000011182)	Pard6b (ENSPEMG00000015881)	Adnp (ENSPEMG00000028284)	Dpm1 (ENSPEMG00000022392)	ENSPEMG00000023371	Kcng1 (ENSPEMG00000021560)	Nfatc2 (ENSPEMG00000022457)	ENSPEMG00000028160	Atp9a (ENSPEMG00000022700)	Sall4 (ENSPEMG00000022706)	Zfp64 (ENSPEMG00000014980)	ENSPEMG00000014233	Tshz2 (ENSPEMG00000029085) ##22	ENSPEMG00000029761	Zfp217 (ENSPEMG00000011097)	Bcas1 (ENSPEMG00000000354)	Cyp24a1 (ENSPEMG00000014776)	Pfdn4 (ENSPEMG00000022289)	Dok5 (ENSPEMG00000022784)	ENSPEMG00000030716	ENSPEMG00000027974	Cbln4 (ENSPEMG00000030725)	Mc3r (ENSPEMG00000012765)	Fam210b (ENSPEMG00000025841)	ENSPEMG00000020059	ENSPEMG00000027444	Cstf1 (ENSPEMG00000019660)	Cass4 (ENSPEMG00000019504)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B.k	ENSGT00940000153481.B.l	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041.e	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B.l	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00390000010923	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000005057
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041.e	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B.l	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	83	ENSUPAG00010000293	ENSUPAG00010000318	CEBPB (ENSUPAG00010000335)	ENSUPAG00010000358	RIPOR3 (ENSUPAG00010000410)	PARD6B (ENSUPAG00010000463)	ENSUPAG00010000474	ADNP (ENSUPAG00010000496)	ENSUPAG00010000511	MOCS3 (ENSUPAG00010000719)	KCNG1 (ENSUPAG00010000726)	NFATC2 (ENSUPAG00010000747)	ATP9A (ENSUPAG00010000794)	SALL4 (ENSUPAG00010000889)	ZFP64 (ENSUPAG00010000898)	TSHZ2 (ENSUPAG00010000932) ##22	ENSUPAG00010000940	ZNF217 (ENSUPAG00010000948)	BCAS1 (ENSUPAG00010000967)	CYP24A1 (ENSUPAG00010001072)	ENSUPAG00010001098	DOK5 (ENSUPAG00010001123)
Squirrel	MODERN SPECIES	114	RNF114 (ENSSTOG00000005727)	SNAI1 (ENSSTOG00000005866)	ENSSTOG00000014322	PEDS1 (ENSSTOG00000016416)	ENSSTOG00000025542	RIPOR3 (ENSSTOG00000023513)	PARD6B (ENSSTOG00000009330)	ADNP (ENSSTOG00000023722)	ENSSTOG00000014659	MOCS3 (ENSSTOG00000026585)	KCNG1 (ENSSTOG00000000015)	NFATC2 (ENSSTOG00000013460)	ATP9A (ENSSTOG00000024149)	SALL4 (ENSSTOG00000025002)	ZFP64 (ENSSTOG00000019989)	TSHZ2 (ENSSTOG00000008373) ##22	ZNF217 (ENSSTOG00000013807)	BCAS1 (ENSSTOG00000028914)	CYP24A1 (ENSSTOG00000001968)	PFDN4 (ENSSTOG00000028253)	DOK5 (ENSSTOG00000028767)
Alpin marmot	MODERN SPECIES		ENSMMMG00000007564	RNF114 (ENSMMMG00000007568)	SNAI1 (ENSMMMG00000007619)	UBE2V1 (ENSMMMG00000007630)	ENSMMMG00000007699	RIPOR3 (ENSMMMG00000007709)	PARD6B (ENSMMMG00000007746)	ADNP (ENSMMMG00000007757)	ENSMMMG00000007768	MOCS3 (ENSMMMG00000007809)	KCNG1 (ENSMMMG00000007813)	ENSMMMG00000007852	ATP9A (ENSMMMG00000007891)	SALL4 (ENSMMMG00000008074)	ZFP64 (ENSMMMG00000008125)	TSHZ2 (ENSMMMG00000008206) ##22	ENSMMMG00000008228	ZNF217 (ENSMMMG00000008233)	BCAS1 (ENSMMMG00000008267)	CYP24A1 (ENSMMMG00000008409)	PFDN4 (ENSMMMG00000008431)	DOK5 (ENSMMMG00000008468)	CBLN4 (ENSMMMG00000008501)	MC3R (ENSMMMG00000008520)	FAM210B (ENSMMMG00000008521)	AURKA (ENSMMMG00000008526)	CSTF1 (ENSMMMG00000008566)	CASS4 (ENSMMMG00000008599)	RTF2 (ENSMMMG00000008617)	GCNT7 (ENSMMMG00000008630)	ENSMMMG00000008638
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	CEBPB (ENSSVLG00005004641)	PTPN1 (ENSSVLG00005000174)	RIPOR3 (ENSSVLG00005000232)	ENSSVLG00005000290	ENSSVLG00005000318	BCAS4 (ENSSVLG00005000345)	ADNP (ENSSVLG00005000370)	DPM1 (ENSSVLG00005000398)	MOCS3 (ENSSVLG00005000434)	KCNG1 (ENSSVLG00005000448)	NFATC2 (ENSSVLG00005000511)	ATP9A (ENSSVLG00005000658)	SALL4 (ENSSVLG00005000729)	ENSSVLG00005000761	ZFP64 (ENSSVLG00005000833)	TSHZ2 (ENSSVLG00005000893) ##22	ENSSVLG00005000915	ENSSVLG00005000930	ZNF217 (ENSSVLG00005000945)	BCAS1 (ENSSVLG00005000986)	CYP24A1 (ENSSVLG00005001045)	PFDN4 (ENSSVLG00005001111)	DOK5 (ENSSVLG00005001133)	CBLN4 (ENSSVLG00005001167)	ENSSVLG00005001173	ENSSVLG00005001189	MC3R (ENSSVLG00005001203)	FAM210B (ENSSVLG00005001217)	ENSSVLG00005001248	CSTF1 (ENSSVLG00005001285)	CASS4 (ENSSVLG00005001328)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00910000146955	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	6	ENSHGLG00000012434	RIPOR3 (ENSHGLG00000012260)	PARD6B (ENSHGLG00000012058)	ENSHGLG00000034848	ADNP (ENSHGLG00000011922)	ENSHGLG00000011694	MOCS3 (ENSHGLG00000020809)	KCNG1 (ENSHGLG00000011040)	NFATC2 (ENSHGLG00000010406)	ENSHGLG00000044936	ATP9A (ENSHGLG00000009412)	SALL4 (ENSHGLG00000009043)	ENSHGLG00000044690	ENSHGLG00000008937	ENSHGLG00000033028	ENSHGLG00000049099 ##22	ENSHGLG00000050175	ENSHGLG00000048236	ENSHGLG00000015145	ENSHGLG00000049516	ENSHGLG00000034941	DOK5 (ENSHGLG00000043654)	ENSHGLG00000014904	ENSHGLG00000042983	ENSHGLG00000014853	ENSHGLG00000014810	ENSHGLG00000015306	ENSHGLG00000003479	ENSHGLG00000038187	FAM210B (ENSHGLG00000037066)	AURKA (ENSHGLG00000018440)
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696.ac.a	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Guinea pig	MODERN SPECIES	96				PTPN1 (ENSCPOG00000033436)	RIPOR3 (ENSCPOG00000010650)	PARD6B (ENSCPOG00000021603)	ADNP (ENSCPOG00000001591)	DPM1 (ENSCPOG00000033471)	MOCS3 (ENSCPOG00000026680)	KCNG1 (ENSCPOG00000015203)	NFATC2 (ENSCPOG00000012743)	ATP9A (ENSCPOG00000012747)	ENSCPOG00000038489	ENSCPOG00000036300	ZFP64 (ENSCPOG00000025271)	TSHZ2 (ENSCPOG00000002986) ##22	ENSCPOG00000038107	ZNF217 (ENSCPOG00000027399)	BCAS1 (ENSCPOG00000009194)	CYP24A1 (ENSCPOG00000010077)	ENSCPOG00000032848	DOK5 (ENSCPOG00000012780)	ENSCPOG00000010289	CBLN4 (ENSCPOG00000011681)	MC3R (ENSCPOG00000024876)	FAM210B (ENSCPOG00000006630)	ENSCPOG00000006633	CSTF1 (ENSCPOG00000004957)	CASS4 (ENSCPOG00000026525)	GCNT7 (ENSCPOG00000035093)	ENSCPOG00000024456
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000162354	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000160847	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00560000078660	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696.ac.a.b	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000156134	ENSGT00940000154900	ENSGT00910000144253	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00940000160402	ENSGT00390000010923	ENSGT00390000005057
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	152	PEDS1 (ENSCLAG00000005635)	ENSCLAG00000006078	PTPN1 (ENSCLAG00000005789)	RIPOR3 (ENSCLAG00000004580)	PARD6B (ENSCLAG00000009267)	BCAS4 (ENSCLAG00000009069)	ENSCLAG00000013494	ADNP (ENSCLAG00000012575)	ENSCLAG00000016153	MOCS3 (ENSCLAG00000017807)	KCNG1 (ENSCLAG00000006678)	NFATC2 (ENSCLAG00000006467)	ATP9A (ENSCLAG00000010633)	SALL4 (ENSCLAG00000010479)	ZFP64 (ENSCLAG00000008329)	TSHZ2 (ENSCLAG00000009630) ##22	ENSCLAG00000017696	ENSCLAG00000006928	BCAS1 (ENSCLAG00000006299)	CYP24A1 (ENSCLAG00000006942)	ENSCLAG00000009443	DOK5 (ENSCLAG00000009152)	CBLN4 (ENSCLAG00000006156)	MC3R (ENSCLAG00000017777)	FAM210B (ENSCLAG00000005865)	AURKA (ENSCLAG00000009511)	CSTF1 (ENSCLAG00000006676)	CASS4 (ENSCLAG00000005692)	GCNT7 (ENSCLAG00000006522)	RTF2 (ENSCLAG00000005946)	ENSCLAG00000005877
Degu	MODERN SPECIES	118	PEDS1 (ENSODEG00000006093)	CEBPB (ENSODEG00000007763)	PTPN1 (ENSODEG00000009073)	RIPOR3 (ENSODEG00000005970)	PARD6B (ENSODEG00000005877)	ADNP (ENSODEG00000007210)	ENSODEG00000006312	MOCS3 (ENSODEG00000019332)	KCNG1 (ENSODEG00000005905)	ENSODEG00000007977	NFATC2 (ENSODEG00000006560)	ATP9A (ENSODEG00000006908)	ENSODEG00000006762	ENSODEG00000006564	ZFP64 (ENSODEG00000005735)	ENSODEG00000019550 ##22	ENSODEG00000019595	ZNF217 (ENSODEG00000006753)	ENSODEG00000006282	CYP24A1 (ENSODEG00000005827)	ENSODEG00000005992	DOK5 (ENSODEG00000009072)	CBLN4 (ENSODEG00000008098)	ENSODEG00000007202	MC3R (ENSODEG00000019495)	FAM210B (ENSODEG00000005961)	ENSODEG00000007572	ENSODEG00000019482	CASS4 (ENSODEG00000006198)	GCNT7 (ENSODEG00000006051)	RTF2 (ENSODEG00000005634)
Coelacanth	MODERN SPECIES	293															ZFP64 (ENSLACG00000004984)	TSHZ2 (ENSLACG00000011012) ##22	ZNF217 (ENSLACG00000012453)	CYP24A1 (ENSLACG00000014028)	PFDN4 (ENSLACG00000014225)	CBLN4 (ENSLACG00000015548)	ENSLACG00000015637	FAM210B (ENSLACG00000016160)	AURKA (ENSLACG00000016221)	ENSLACG00000016233	CSTF1 (ENSLACG00000016278)	CASS4 (ENSLACG00000016450)	RTF2 (ENSLACG00000016541)	GCNT7 (ENSLACG00000016587)	TFAP2C (ENSLACG00000016799)	BMP7 (ENSLACG00000017567)	SPO11 (ENSLACG00000017703)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	62							ENSGT00950000183211.a.a.a	ENSGT00390000006790.a	ENSGT00530000063631.b	ENSGT00940000153481.B	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000003167	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT01030000234510.a.a.a.a.b	ENSGT00940000159430	ENSGT00390000012914	ENSGT00940000163348	ENSGT01030000234550.a.b	ENSGT00940000153269.b.a	ENSGT01100000263484.B.b.a
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000007832	ENSGT00940000154491.d.a	ENSGT00390000003774.a.b	ENSGT00940000162354	ENSGT00740000115534.a.a	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000158250	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000003774.a.b	ENSGT00740000115534.a.a.gb	ENSGT00940000163703.a	ENSGT00940000162137	ENSGT00940000158041	ENSGT00940000158250	ENSGT00390000003422	ENSGT00940000156230.o	ENSGT00950000182905.b	ENSGT00940000160725	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665	ENSGT00940000158083.a	ENSGT00940000160300
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	118										ENSGT00940000158250.a.a	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665	ENSGT00940000158083.a	ENSGT00940000160300
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	10	ENSSFOG00015021260	tcf15 (ENSSFOG00015029916)	SRXN1 (ENSSFOG00015032069)	scrt2 (ENSSFOG00015026741)	slc52a3 (ENSSFOG00015021231)	ENSSFOG00015025091	peds1 (ENSSFOG00015025261)	cebpb (ENSSFOG00015028278)	ptpn1 (ENSSFOG00015021156)	src (ENSSFOG00015021140)	kcng1 (ENSSFOG00015031845)	NFATC2 (ENSSFOG00015021121)	ATP9A (ENSSFOG00015021094)	sall4 (ENSSFOG00015021075)	ZFP64 (ENSSFOG00015021057)	TSHZ2 (ENSSFOG00015027158) ##22	ENSSFOG00015021048	znf217 (ENSSFOG00015021036)	PFDN4 (ENSSFOG00015031815)	ENSSFOG00015021020	cbln4 (ENSSFOG00015021011)	ENSSFOG00015027625	ENSSFOG00015021002	ENSSFOG00015030806	ENSSFOG00015020986	PLEKHG5 (ENSSFOG00015020921)	NOL9 (ENSSFOG00015020896)	ZBTB48 (ENSSFOG00015024225)	klhl21 (ENSSFOG00015020873)	SYT6 (ENSSFOG00015020861)	olfml3a (ENSSFOG00015020855)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	3	mc3r (ENSPKIG00000006652)	ENSPKIG00000006701	tcf15 (ENSPKIG00000006747)	scrt2 (ENSPKIG00000006756)	slc52a3 (ENSPKIG00000006769)	ENSPKIG00000006795	peds1 (ENSPKIG00000006824)	cebpb (ENSPKIG00000006865)	ptpn1 (ENSPKIG00000006880)	src (ENSPKIG00000006914)	kcng1 (ENSPKIG00000006950)	NFATC2 (ENSPKIG00000006979)	ATP9A (ENSPKIG00000007033)	sall4 (ENSPKIG00000007074)	ZFP64 (ENSPKIG00000007097)	TSHZ2 (ENSPKIG00000007117) ##22	ENSPKIG00000007138	znf217 (ENSPKIG00000007163)	PFDN4 (ENSPKIG00000007211)	cbln4 (ENSPKIG00000007259)	cd40 (ENSPKIG00000007291)	irx7 (ENSPKIG00000007317)	ENSPKIG00000007328	PLEKHG5 (ENSPKIG00000007380)	NOL9 (ENSPKIG00000007469)	ZBTB48 (ENSPKIG00000007498)	klhl21 (ENSPKIG00000007526)	SYT6 (ENSPKIG00000007589)	olfml3a (ENSPKIG00000007644)	c1qtnf12 (ENSPKIG00000007658)	sdf4 (ENSPKIG00000007691)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	41				ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT01050000244850.C.b.u.a.a	ENSGT00390000008414.h	ENSGT00940000154285.a.b.a.a.b	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b.k
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	107	ENSGT01050000244850.C.b.u.a.a	ENSGT00390000008414.h	ENSGT00940000154285.a.b.a.a.b	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b.k
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01050000244850.C.b.u.a.a	ENSGT00390000008414.h	ENSGT00940000154285.a.b.a.a.b	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b.k	ENSGT00940000159698	ENSGT00950000182824.a.b.b.c.f	ENSGT00390000008992	ENSGT01050000244882.b.c.b.a.a	ENSGT00950000182989.D.a.a.a
Channel catfish	MODERN SPECIES	6	ENSIPUG00000018855	PLXNA2 (ENSIPUG00000018865)	ENSIPUG00000018916	ENSIPUG00000018925	taf8 (ENSIPUG00000018934)	g0s2 (ENSIPUG00000018970)	camk1g (ENSIPUG00000018978)	ENSIPUG00000019005	ENSIPUG00000019022	src (ENSIPUG00000019030)	kcng1 (ENSIPUG00000019068)	NFATC2 (ENSIPUG00000019074)	atp9a (ENSIPUG00000019101)	sall4 (ENSIPUG00000019170)	zfp64 (ENSIPUG00000019177)	tshz2 (ENSIPUG00000019206) ##22	ENSIPUG00000019212	ZNF217 (ENSIPUG00000019222)	pfdn4 (ENSIPUG00000019264)	CBLN4 (ENSIPUG00000019289)	ENSIPUG00000019305	cd40 (ENSIPUG00000019334)	irx7 (ENSIPUG00000019356)	ENSIPUG00000019362	plekhg5 (ENSIPUG00000019378)	casp9 (ENSIPUG00000019414)	arhgap4a (ENSIPUG00000019443)	SSR4 (ENSIPUG00000019496)	AVPR2 (ENSIPUG00000019575)	idh3g (ENSIPUG00000019597)	fam3a (ENSIPUG00000019634)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	121	ENSGT00390000003023	ENSGT01050000244850.C.b.u.a.a	ENSGT00390000008414.h	ENSGT00940000154285.a.b.a.a.b	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b.k	ENSGT00940000159698	ENSGT00950000182824.a.b.b.c.f
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	116	ENSGT00390000003023	ENSGT01050000244850.C.b.u.a.a	ENSGT00390000008414.h	ENSGT00940000154285.a.b.a.a.b	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b.k	ENSGT00940000159698	ENSGT00950000182824.a.b.b.c.f
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	32	ENSPNAG00000021703	PLXNA2 (ENSPNAG00000021654)	ENSPNAG00000021483	ENSPNAG00000021458	ENSPNAG00000021445	taf8 (ENSPNAG00000021439)	g0s2 (ENSPNAG00000021423)	camk1gb (ENSPNAG00000021401)	mical1 (ENSPNAG00000021344)	src (ENSPNAG00000021238)	kcng1 (ENSPNAG00000021172)	NFATC2 (ENSPNAG00000021151)	ATP9A (ENSPNAG00000021093)	sall4 (ENSPNAG00000020929)	ZFP64 (ENSPNAG00000020922)	TSHZ2 (ENSPNAG00000020910) ##22	ENSPNAG00000020904	znf217 (ENSPNAG00000020890)	PFDN4 (ENSPNAG00000020866)	ENSPNAG00000020842	cbln4 (ENSPNAG00000020840)	ENSPNAG00000020824	irx7 (ENSPNAG00000020808)	ENSPNAG00000020788	PLEKHG5 (ENSPNAG00000020727)	casp9 (ENSPNAG00000020640)	arhgap4a (ENSPNAG00000020564)	SSR4 (ENSPNAG00000003648)	AVPR2 (ENSPNAG00000020379)	idh3g (ENSPNAG00000020360)	fam3a (ENSPNAG00000020330)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	6	ENSAMXG00000042323	ENSAMXG00000001291	ENSAMXG00000042530	taf8 (ENSAMXG00000036100)	ENSAMXG00000039995	camk1gb (ENSAMXG00000001286)	mical1 (ENSAMXG00000001280)	src (ENSAMXG00000001275)	kcng1 (ENSAMXG00000032586)	ENSAMXG00000029192	ENSAMXG00000043658	NFATC2 (ENSAMXG00000029811)	ATP9A (ENSAMXG00000001261)	sall4 (ENSAMXG00000001254)	ZFP64 (ENSAMXG00000034054)	TSHZ2 (ENSAMXG00000001175) ##22	ENSAMXG00000032748	znf217 (ENSAMXG00000001689)	PFDN4 (ENSAMXG00000031280)	ENSAMXG00000009362	ENSAMXG00000039052	cbln4 (ENSAMXG00000005306)	ENSAMXG00000034936	tssk6 (ENSAMXG00000000342)	cd40 (ENSAMXG00000041127)	irx7 (ENSAMXG00000000335)	ENSAMXG00000031946	ENSAMXG00000043356	ENSAMXG00000006216	ENSAMXG00000041537	arhgap4a (ENSAMXG00000037374)
Electric eel	MODERN SPECIES	119	dbpa (ENSEEEG00000023176)	ENSEEEG00000023178	cacng7a (ENSEEEG00000023181)	cacng8a (ENSEEEG00000023182)	cacng6a (ENSEEEG00000023183)	slc2a3a (ENSEEEG00000023184)	ENSEEEG00000023186	si:dkey-211g8.1 (ENSEEEG00000023187)	ENSEEEG00000023189	src (ENSEEEG00000023251)	kcng1 (ENSEEEG00000023722)	NFATC2 (ENSEEEG00000023723)	ATP9A (ENSEEEG00000023732)	sall4 (ENSEEEG00000023752)	ZFP64 (ENSEEEG00000023755)	ENSEEEG00000023756 ##22	ENSEEEG00000023758	znf217 (ENSEEEG00000023759)	PFDN4 (ENSEEEG00000023766)	cbln4 (ENSEEEG00000023775)	cd40 (ENSEEEG00000023776)	irx7 (ENSEEEG00000023777)	ENSEEEG00000023778	PLEKHG5 (ENSEEEG00000023781)	casp9 (ENSEEEG00000023785)	arhgap4a (ENSEEEG00000023786)	SSR4 (ENSEEEG00000023787)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018003.a.k	ENSGT00940000168345	ENSGT01010000222287.A	ENSGT00390000001400	ENSGT00940000160734.d	ENSGT00390000016392	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00990000209982	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b.k	ENSGT00950000182888.a.a.a.g.a	ENSGT00950000182888.a.a.a.g.b.a	ENSGT00950000182888.a.a.a.g.b.b	ENSGT00940000155851.c.a	ENSGT00950000183195.a
Cyprininae	DUPLICATION
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000001400.h	ENSGT00940000168345.b	ENSGT00940000154484.A	ENSGT00390000001400.g.a	ENSGT00940000160734.d.a	ENSGT00390000016392.i	ENSGT00390000005294.a.c.a	ENSGT00940000156872.c.b	ENSGT00940000159117.b	ENSGT00940000158250.d.b.b	ENSGT00940000159686.e	ENSGT00940000156230.p.b	ENSGT00940000159181.j	ENSGT00940000155384.a.b	ENSGT00940000156405.e	ENSGT00950000183051.a.b.c ##22	ENSGT00940000159884.h	ENSGT00990000209982.a	ENSGT00390000006696.jc	ENSGT00940000159728.b	ENSGT00940000165811.c	ENSGT01040000240385.A.b.b.b.a.a.b.b.b.b	ENSGT01090000260030.a.b.a.b.b.a.b.a.a.a.a.b.b.a.a	ENSGT01050000244939.a.a.b.a.b.c.b.a.b	ENSGT00950000182879.b.o.a	ENSGT00940000156988.g	ENSGT00940000159127.i	ENSGT00940000161304.a.a.d	ENSGT00940000156073.c.b.a.a	ENSGT00940000160740.c.a.a
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Golden-line barbel	MODERN SPECIES	813															ZFP64 (ENSSGRG00000042908)	TSHZ2 (ENSSGRG00000042907) ##22	znf217 (ENSSGRG00000042906)	zgc:112994 (ENSSGRG00000042905)	PFDN4 (ENSSGRG00000042904)	ENSSGRG00000042903	cbln4 (ENSSGRG00000042901)	ENSSGRG00000042899	ENSSGRG00000042898	tgm1l4 (ENSSGRG00000042897)	ENSSGRG00000042895	ENSSGRG00000042210	ENSSGRG00000042165	gpx7 (ENSSGRG00000042163)
Goldfish	MODERN SPECIES	15	iyd (ENSCARG00000005077)	SIKE1 (ENSCARG00000005069)	ENSCARG00000005064	HTR6 (ENSCARG00000005058)	TMCO4 (ENSCARG00000004819)	vwa1 (ENSCARG00000004791)	otud3 (ENSCARG00000004779)	g0s2 (ENSCARG00000004775)	camk1gb (ENSCARG00000004753)	mical1 (ENSCARG00000004733)	src (ENSCARG00000004450)	kcng1 (ENSCARG00000004415)	NFATC2 (ENSCARG00000004333)	ATP9A (ENSCARG00000004044)	sall4 (ENSCARG00000003866)	TSHZ2 (ENSCARG00000003859) ##22	znf217 (ENSCARG00000003844)	zgc:112994 (ENSCARG00000010118)	PFDN4 (ENSCARG00000010109)	cbln4 (ENSCARG00000010101)	ENSCARG00000010097	ENSCARG00000010090	ENSCARG00000010082	tgm1l4 (ENSCARG00000010074)	ENSCARG00000010066	ENSCARG00000009998	ENSCARG00000009983	ENSCARG00000009897	ENSCARG00000009873	ENSCARG00000009863	ENSCARG00000009677
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	427	ENSGT00940000168345.a	ENSGT01010000222287.A.c.b	ENSGT00390000001400.h	ENSGT00940000160734.d.b	ENSGT00390000016392.j	ENSGT00390000005294.a.c.a	ENSGT00940000156872.c.a	ENSGT01050000244806.b.a.a.b	ENSGT00940000159117.a	ENSGT00940000158250.d.b.a	ENSGT00940000159686.f	ENSGT00940000156230.p.a	ENSGT00940000159181.i	ENSGT00940000155384.a.a	ENSGT00940000156405.f	ENSGT00950000183051.a.b.d ##22	ENSGT00940000159884.g	ENSGT00990000209982.b	ENSGT00390000006696.kc	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728.a	ENSGT00940000165811.d
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	255				ENSGT00940000160734.d.b	ENSGT00390000016392.j	ENSGT00390000005294.a.d	ENSGT00940000156872.c.a	ENSGT01050000244806.b.a.a.b	ENSGT00940000159117.a	ENSGT00940000158250.d.b.a	ENSGT00940000159686.f	ENSGT00940000156230.p.a	ENSGT00940000159181.i	ENSGT00940000155384.a.a	ENSGT00940000156405.f	ENSGT00950000183051.a.b.d ##22	ENSGT00940000159884.g	ENSGT00990000209982.b	ENSGT00390000006696.kc	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728.a	ENSGT00940000165811.d	ENSGT01050000244939.a.a.b.a.b.c.b.a.a	ENSGT00950000182879.b.p.a	ENSGT00940000156988.h	ENSGT00940000159127.j	ENSGT00940000161304.a.a.c.a	ENSGT00940000156073.c.b.a.b	ENSGT00940000160740.d	ENSGT00940000154327.b.f.b.a	ENSGT00940000160740.c.b
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Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	127	SIKE1 (ENSSGRG00000054064)	ENSSGRG00000054065	ENSSGRG00000054067	ENSSGRG00000054068	vwa1 (ENSSGRG00000054069)	otud3 (ENSSGRG00000054070)	g0s2 (ENSSGRG00000054071)	g0s2 (ENSSGRG00000054073)	camk1gb (ENSSGRG00000054078)	ENSSGRG00000054113	src (ENSSGRG00000054141)	kcng1 (ENSSGRG00000054566)	NFATC2 (ENSSGRG00000054567)	ATP9A (ENSSGRG00000054577)	sall4 (ENSSGRG00000054582)	TSHZ2 (ENSSGRG00000054584) ##22	znf217 (ENSSGRG00000054587)	ENSSGRG00000054589	zgc:112994 (ENSSGRG00000054590)	ENSSGRG00000054592	cbln4 (ENSSGRG00000054596)	tgm1l4 (ENSSGRG00000054598)	cyp2aa12 (ENSSGRG00000054600)	ENSSGRG00000054616	ENSSGRG00000054639	ENSSGRG00000054641	gpx7 (ENSSGRG00000054643)	SHISAL2A (ENSSGRG00000054644)	slc1a7b (ENSSGRG00000054645)	PODN (ENSSGRG00000054648)	scp2b (ENSSGRG00000054649)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	4924																ENSSGRG00000002947 ##22
Zebrafish	MODERN SPECIES	15	SIKE1 (ENSDARG00000102199)	micos10 (ENSDARG00000101619)	HTR6 (ENSDARG00000016095)	TMCO4 (ENSDARG00000078924)	vwa1 (ENSDARG00000075468)	otud3 (ENSDARG00000022648)	g0s2 (ENSDARG00000078859)	camk1gb (ENSDARG00000008788)	mical1 (ENSDARG00000011809)	src (ENSDARG00000008107)	kcng1 (ENSDARG00000099038)	NFATC2 (ENSDARG00000100927)	ATP9A (ENSDARG00000115869)	sall4 (ENSDARG00000044485)	ZFP64 (ENSDARG00000061147)	TSHZ2 (ENSDARG00000079201) ##22	ENSDARG00000113348	znf217 (ENSDARG00000088123)	zgc:112994 (ENSDARG00000026296)	PFDN4 (ENSDARG00000061228)	cbln4 (ENSDARG00000061240)	cd40 (ENSDARG00000054968)	irx7 (ENSDARG00000002601)	PLEKHG5 (ENSDARG00000101752)	tor1l3 (ENSDARG00000026895)	ENSDARG00000090741	tor1l1 (ENSDARG00000055856)	DNAJC16 (ENSDARG00000059699)	agmat (ENSDARG00000059700)	pink1 (ENSDARG00000001929)	cdaa (ENSDARG00000111188)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	147	ENSGT00940000179167	ENSGT00940000160077	ENSGT00390000014621	ENSGT00910000146976	ENSGT00940000157726	ENSGT00940000154875	ENSGT01030000240251	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00650000094986	ENSGT00510000046843.a.b.k	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631
Atlantic herring	MODERN SPECIES	20	impdh2 (ENSCHAG00000015599)	arih2 (ENSCHAG00000015287)	ENSCHAG00000015246	ENSCHAG00000015236	ENSCHAG00000015214	camk1gb (ENSCHAG00000013381)	ENSCHAG00000013332	mical1 (ENSCHAG00000013319)	src (ENSCHAG00000010199)	kcng1 (ENSCHAG00000010105)	NFATC2 (ENSCHAG00000009779)	ATP9A (ENSCHAG00000001647)	sall4 (ENSCHAG00000000516)	ZFP64 (ENSCHAG00000000483)	ENSCHAG00000000460	TSHZ2 (ENSCHAG00000000447) ##22	znf217 (ENSCHAG00000000413)	PFDN4 (ENSCHAG00000000342)	ENSCHAG00000000333	cbln4 (ENSCHAG00000000300)	ENSCHAG00000000280	ENSCHAG00000000260	irx7 (ENSCHAG00000000248)	ENSCHAG00000000236	PLEKHG5 (ENSCHAG00000000168)	ENSCHAG00000027719	ENSCHAG00000027718	CDH4 (ENSCHAG00000027691)	ENSCHAG00000027678	kcnk15 (ENSCHAG00000027677)	ogfr (ENSCHAG00000027676)
Denticle herring	MODERN SPECIES	1									ENSDCDG00000017207	src (ENSDCDG00000017389)	kcng1 (ENSDCDG00000025122)	NFATC2 (ENSDCDG00000025130)	ATP9A (ENSDCDG00000025627)	sall4 (ENSDCDG00000028584)	ZFP64 (ENSDCDG00000028590)	TSHZ2 (ENSDCDG00000028593) ##22	ENSDCDG00000028595	ENSDCDG00000028599	znf217 (ENSDCDG00000028602)	PFDN4 (ENSDCDG00000028624)	ENSDCDG00000028627	cbln4 (ENSDCDG00000028628)	HIPK1 (ENSDCDG00000028633)	ube2j2 (ENSDCDG00000028638)	ACAP3 (ENSDCDG00000028692)	ENSDCDG00000030240	ints11 (ENSDCDG00000030251)	ENSDCDG00000030267	cptp (ENSDCDG00000030270)	ddx19a (ENSDCDG00000030295)	ENSDCDG00000030341
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211.b	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	21	ENSMAMG00000005655	ENSMAMG00000025991	gdi1 (ENSMAMG00000005513)	atp6ap1b (ENSMAMG00000028086)	ENSMAMG00000005479	ENSMAMG00000005454	ENSMAMG00000005422	camk1gb (ENSMAMG00000005401)	mical1 (ENSMAMG00000005343)	src (ENSMAMG00000005314)	kcng1 (ENSMAMG00000005309)	NFATC2 (ENSMAMG00000005297)	ENSMAMG00000026287	ATP9A (ENSMAMG00000005239)	ZFP64 (ENSMAMG00000005205)	TSHZ2 (ENSMAMG00000005195) ##22	znf217 (ENSMAMG00000005177)	PFDN4 (ENSMAMG00000024979)	ENSMAMG00000005122	cbln4 (ENSMAMG00000005104)	ENSMAMG00000026273	cd40 (ENSMAMG00000005091)	irx7 (ENSMAMG00000005073)	ENSMAMG00000005050	PLEKHG5 (ENSMAMG00000005009)	NOL9 (ENSMAMG00000004993)	ZBTB48 (ENSMAMG00000004968)	klhl21 (ENSMAMG00000004956)	ENSMAMG00000004923	olfml3a (ENSMAMG00000004904)	c1qtnf12 (ENSMAMG00000026776)
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	18	SLC26A6 (ENSBSLG00000023528)	mgll (ENSBSLG00000023436)	prkar2aa (ENSBSLG00000023422)	ENSBSLG00000023417	amt (ENSBSLG00000023385)	ifrd2 (ENSBSLG00000023261)	zgc:136971 (ENSBSLG00000023040)	camk1gb (ENSBSLG00000022749)	mical1 (ENSBSLG00000022686)	src (ENSBSLG00000022205)	kcng1 (ENSBSLG00000022186)	NFATC2 (ENSBSLG00000022167)	ATP9A (ENSBSLG00000020928)	sall4 (ENSBSLG00000020903)	ZFP64 (ENSBSLG00000020900)	TSHZ2 (ENSBSLG00000020898) ##22	ENSBSLG00000020897	znf217 (ENSBSLG00000020896)	PFDN4 (ENSBSLG00000020894)	ENSBSLG00000020893	cbln4 (ENSBSLG00000020892)	ENSBSLG00000020891	cd40 (ENSBSLG00000020890)	irx7 (ENSBSLG00000020889)	ENSBSLG00000020888	PLEKHG5 (ENSBSLG00000020872)	NOL9 (ENSBSLG00000020864)	ZBTB48 (ENSBSLG00000020862)	klhl21 (ENSBSLG00000020861)	SYT6 (ENSBSLG00000020859)	olfml3a (ENSBSLG00000020858)
Climbing perch	MODERN SPECIES	20	ENSATEG00000026969	pfkfb1 (ENSATEG00000024541)	ENSATEG00000024536	gdi1 (ENSATEG00000024529)	atp6ap1b (ENSATEG00000024527)	ENSATEG00000027664	ENSATEG00000024515	ENSATEG00000028572	camk1gb (ENSATEG00000024508)	mical1 (ENSATEG00000024506)	src (ENSATEG00000024502)	kcng1 (ENSATEG00000024501)	NFATC2 (ENSATEG00000024497)	ATP9A (ENSATEG00000024485)	ZFP64 (ENSATEG00000025866)	TSHZ2 (ENSATEG00000024474) ##22	znf217 (ENSATEG00000024467)	PFDN4 (ENSATEG00000025311)	ENSATEG00000024462	cbln4 (ENSATEG00000024461)	ENSATEG00000024457	cd40 (ENSATEG00000024455)	irx7 (ENSATEG00000026981)	ENSATEG00000024451	PLEKHG5 (ENSATEG00000024427)	NOL9 (ENSATEG00000024414)	ZBTB48 (ENSATEG00000024413)	klhl21 (ENSATEG00000024410)	ENSATEG00000024407	olfml3a (ENSATEG00000024405)	c1qtnf12 (ENSATEG00000028336)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Turbot	MODERN SPECIES	2	pfkfb1 (ENSSMAG00000018891)	ENSSMAG00000018925	ENSSMAG00000032263	gdi1 (ENSSMAG00000018942)	atp6ap1b (ENSSMAG00000018969)	ENSSMAG00000018976	ENSSMAG00000018991	ENSSMAG00000031399	camk1gb (ENSSMAG00000019034)	mical1 (ENSSMAG00000019064)	src (ENSSMAG00000019082)	kcng1 (ENSSMAG00000019122)	NFATC2 (ENSSMAG00000019135)	ATP9A (ENSSMAG00000019156)	ZFP64 (ENSSMAG00000028911)	TSHZ2 (ENSSMAG00000035694) ##22	ENSSMAG00000019237	znf217 (ENSSMAG00000019241)	PFDN4 (ENSSMAG00000021588)	ENSSMAG00000019257	cbln4 (ENSSMAG00000019266)	ENSSMAG00000019269	ENSSMAG00000019280	irx7 (ENSSMAG00000037384)	ENSSMAG00000025759	PLEKHG5 (ENSSMAG00000019289)	NOL9 (ENSSMAG00000019318)	ZBTB48 (ENSSMAG00000019326)	klhl21 (ENSSMAG00000019333)	ENSSMAG00000019346	olfml3a (ENSSMAG00000029134)
Tongue sole	MODERN SPECIES	1	ENSCSEG00000014939	PFDN4 (ENSCSEG00000014933)	znf217 (ENSCSEG00000014927)	ENSCSEG00000014917	ENSCSEG00000014914	taf8 (ENSCSEG00000014880)	camk1gb (ENSCSEG00000014851)	mical1 (ENSCSEG00000014804)	fanci (ENSCSEG00000014766)	src (ENSCSEG00000014687)	kcng1 (ENSCSEG00000014663)	NFATC2 (ENSCSEG00000014650)	ATP9A (ENSCSEG00000014615)	sall4 (ENSCSEG00000014604)	ZFP64 (ENSCSEG00000014597)	TSHZ2 (ENSCSEG00000009972) ##22	atp6ap1b (ENSCSEG00000009955)	gdi1 (ENSCSEG00000009921)	ENSCSEG00000009885	pfkfb1 (ENSCSEG00000009829)	ENSCSEG00000009816	ENSCSEG00000009804	ugt5e1 (ENSCSEG00000009801)	ccn5 (ENSCSEG00000009789)	ada (ENSCSEG00000009764)	pkig (ENSCSEG00000009758)	ttpal (ENSCSEG00000009750)	hnf4a (ENSCSEG00000009708)	fitm2 (ENSCSEG00000009699)	GDAP1L1 (ENSCSEG00000009689)	ENSCSEG00000009677
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3215	ugt5e1 (ENSSLDG00000004309)	pfkfb1 (ENSSLDG00000004321)	ENSSLDG00000004396	gdi1 (ENSSLDG00000004434)	atp6ap1b (ENSSLDG00000004493)	ENSSLDG00000004508	taf8 (ENSSLDG00000004532)	camk1gb (ENSSLDG00000004585)	mical1 (ENSSLDG00000004628)	src (ENSSLDG00000004737)	kcng1 (ENSSLDG00000004783)	NFATC2 (ENSSLDG00000004810)	ATP9A (ENSSLDG00000004848)	sall4 (ENSSLDG00000004973)	ZFP64 (ENSSLDG00000005009)	TSHZ2 (ENSSLDG00000005026) ##22	ENSSLDG00000005038	znf217 (ENSSLDG00000005047)	PFDN4 (ENSSLDG00000005069)	ENSSLDG00000005090	cbln4 (ENSSLDG00000005110)	ENSSLDG00000005124	cd40 (ENSSLDG00000005154)	ENSSLDG00000005164	irx7 (ENSSLDG00000005190)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	145	pfkfb1 (ENSSDUG00000005109)	ITIH6 (ENSSDUG00000005082)	gdi1 (ENSSDUG00000005044)	atp6ap1b (ENSSDUG00000005025)	ENSSDUG00000005013	taf8 (ENSSDUG00000004986)	ENSSDUG00000004966	camk1gb (ENSSDUG00000004939)	mical1 (ENSSDUG00000004905)	src (ENSSDUG00000004836)	kcng1 (ENSSDUG00000004822)	NFATC2 (ENSSDUG00000004792)	ATP9A (ENSSDUG00000004689)	sall4 (ENSSDUG00000004657)	ZFP64 (ENSSDUG00000004647)	TSHZ2 (ENSSDUG00000004636) ##22	znf217 (ENSSDUG00000004615)	PFDN4 (ENSSDUG00000004607)	ENSSDUG00000004595	cbln4 (ENSSDUG00000004578)	ENSSDUG00000004566	cd40 (ENSSDUG00000004547)	irx7 (ENSSDUG00000004539)	ENSSDUG00000004516	PLEKHG5 (ENSSDUG00000004485)	NOL9 (ENSSDUG00000004472)	ZBTB48 (ENSSDUG00000004449)	klhl21 (ENSSDUG00000004414)	SYT6 (ENSSDUG00000004382)	olfml3a (ENSSDUG00000004367)	c1qtnf12 (ENSSDUG00000004349)
Barramundi perch	MODERN SPECIES									camk1gb (ENSLCAG00010025918)	mical1 (ENSLCAG00010025896)	src (ENSLCAG00010025877)	kcng1 (ENSLCAG00010025869)	NFATC2 (ENSLCAG00010025867)	ATP9A (ENSLCAG00010025738)	sall4 (ENSLCAG00010025650)	ZFP64 (ENSLCAG00010025648)	TSHZ2 (ENSLCAG00010025643) ##22	znf217 (ENSLCAG00010025635)	PFDN4 (ENSLCAG00010025632)	ENSLCAG00010025631	cbln4 (ENSLCAG00010025626)	ENSLCAG00010025623	ENSLCAG00010025620	irx7 (ENSLCAG00010025616)	ENSLCAG00010025610	PLEKHG5 (ENSLCAG00010025600)	ENSLCAG00010025574	ENSLCAG00010025571	klhl21 (ENSLCAG00010025566)	ENSLCAG00010025564	SYT6 (ENSLCAG00010025560)	olfml3a (ENSLCAG00010025555)
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000008414.g	ENSGT00940000161110.a.a	ENSGT00990000203957	ENSGT00940000167346	ENSGT00390000001969.a	ENSGT00940000156496.a.b	ENSGT00940000157871.i	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p.f	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220
Tetraodon	MODERN SPECIES	24	tcf15 (ENSTNIG00000012471)	slc13a3 (ENSTNIG00000012470)	ocstamp (ENSTNIG00000012469)	ENSTNIG00000000179	ENSTNIG00000000108	ENSTNIG00000012468	ENSTNIG00000012467	ENSTNIG00000012466	ENSTNIG00000012465	ENSTNIG00000012464	kcng1 (ENSTNIG00000012463)	NFATC2 (ENSTNIG00000012462)	ATP9A (ENSTNIG00000012461)	sall4 (ENSTNIG00000012460)	ZFP64 (ENSTNIG00000012459)	TSHZ2 (ENSTNIG00000012458) ##22	znf217 (ENSTNIG00000012457)	PFDN4 (ENSTNIG00000012456)	cbln4 (ENSTNIG00000012455)	ENSTNIG00000012454	cd40 (ENSTNIG00000012453)	irx7 (ENSTNIG00000000637)	ENSTNIG00000012452	PLEKHG5 (ENSTNIG00000012451)	NOL9 (ENSTNIG00000012450)	ZBTB48 (ENSTNIG00000012449)	klhl21 (ENSTNIG00000012448)	taf8 (ENSTNIG00000012447)	atp6ap1b (ENSTNIG00000012446)	gdi1 (ENSTNIG00000012445)	ITIH6 (ENSTNIG00000012444)
Fugu	MODERN SPECIES	15	ENSTRUG00000019690	ENSTRUG00000027577	ENSTRUG00000024645	ptpn22 (ENSTRUG00000024011)	RSBN1 (ENSTRUG00000003349)	ENSTRUG00000003426	ENSTRUG00000005090	camk1gb (ENSTRUG00000005125)	mical1 (ENSTRUG00000005444)	src (ENSTRUG00000005980)	kcng1 (ENSTRUG00000006380)	NFATC2 (ENSTRUG00000006498)	ATP9A (ENSTRUG00000006638)	sall4 (ENSTRUG00000007410)	ZFP64 (ENSTRUG00000024947)	TSHZ2 (ENSTRUG00000030699) ##22	ENSTRUG00000021313	znf217 (ENSTRUG00000007681)	pfdn4 (ENSTRUG00000007728)	ENSTRUG00000032390	cbln4 (ENSTRUG00000007768)	cd40 (ENSTRUG00000007898)	irx7 (ENSTRUG00000007926)	ENSTRUG00000024611	PLEKHG5 (ENSTRUG00000007943)	ENSTRUG00000008615	klhl21 (ENSTRUG00000008923)	taf8 (ENSTRUG00000008989)	ENSTRUG00000025088	atp6ap1b (ENSTRUG00000009201)	gdi1 (ENSTRUG00000009351)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	376											kcng1 (ENSLBEG00000019738)	NFATC2 (ENSLBEG00000019767)	ATP9A (ENSLBEG00000019835)	sall4 (ENSLBEG00000019951)	ZFP64 (ENSLBEG00000019968)	TSHZ2 (ENSLBEG00000019988) ##22	ENSLBEG00000020004	znf217 (ENSLBEG00000020036)	PFDN4 (ENSLBEG00000020107)	ENSLBEG00000020123	cbln4 (ENSLBEG00000020144)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166720	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a	ENSGT00940000160300
Lumpfish	MODERN SPECIES	22	ugt5e1 (ENSCLMG00005017018)	pfkfb1 (ENSCLMG00005017017)	ENSCLMG00005016975	gdi1 (ENSCLMG00005016942)	ENSCLMG00005016933	taf8 (ENSCLMG00005016909)	ENSCLMG00005016906	camk1gb (ENSCLMG00005016897)	mical1 (ENSCLMG00005016888)	src (ENSCLMG00005013214)	kcng1 (ENSCLMG00005013169)	NFATC2 (ENSCLMG00005012539)	ATP9A (ENSCLMG00005005783)	sall4 (ENSCLMG00005005729)	ZFP64 (ENSCLMG00005005728)	TSHZ2 (ENSCLMG00005005727) ##22	znf217 (ENSCLMG00005005725)	PFDN4 (ENSCLMG00005005722)	ENSCLMG00005005720	cbln4 (ENSCLMG00005005719)	ENSCLMG00005005712	zgc:113274 (ENSCLMG00005005710)	ENSCLMG00005005709	irx7 (ENSCLMG00005005708)	ENSCLMG00005005707	PLEKHG5 (ENSCLMG00005005577)	NOL9 (ENSCLMG00005005572)	ZBTB48 (ENSCLMG00005005560)	klhl21 (ENSCLMG00005005558)	SYT6 (ENSCLMG00005005366)	olfml3a (ENSCLMG00005005364)
Stickleback	MODERN SPECIES	11	ENSGACG00000011017	ENSGACG00000011023	ENSGACG00000011025	RSBN1 (ENSGACG00000011031)	ENSGACG00000011033	ENSGACG00000011034	tmem269 (ENSGACG00000011044)	ENSGACG00000011047	ENSGACG00000011057	agmat (ENSGACG00000011061)	kcng1 (ENSGACG00000011084)	NFATC2 (ENSGACG00000011086)	ATP9A (ENSGACG00000011089)	sall4 (ENSGACG00000011124)	ZFP64 (ENSGACG00000011128)	TSHZ2 (ENSGACG00000011135) ##22	ENSGACG00000011137	PFDN4 (ENSGACG00000011139)	ENSGACG00000011148	cbln4 (ENSGACG00000011149)	cd40 (ENSGACG00000011155)	irx7 (ENSGACG00000011160)	ENSGACG00000011163	PLEKHG5 (ENSGACG00000011168)	NOL9 (ENSGACG00000011178)	ENSGACG00000011186	ZBTB48 (ENSGACG00000011187)	klhl21 (ENSGACG00000011193)	SYT6 (ENSGACG00000011194)	olfml3a (ENSGACG00000011204)	c1qtnf12 (ENSGACG00000011209)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	21	ENSCGOG00000005171	ugt5e1 (ENSCGOG00000005172)	ITIH6 (ENSCGOG00000005179)	gdi1 (ENSCGOG00000005304)	atp6ap1b (ENSCGOG00000006785)	ENSCGOG00000006789	taf8 (ENSCGOG00000006800)	g0s2 (ENSCGOG00000006819)	camk1gb (ENSCGOG00000006879)	mical1 (ENSCGOG00000009054)	src (ENSCGOG00000009258)	kcng1 (ENSCGOG00000015658)	ATP9A (ENSCGOG00000015667)	sall4 (ENSCGOG00000015758)	ZFP64 (ENSCGOG00000015763)	TSHZ2 (ENSCGOG00000015765) ##22	ENSCGOG00000015783	znf217 (ENSCGOG00000015786)	PFDN4 (ENSCGOG00000015792)	ENSCGOG00000015800	cbln4 (ENSCGOG00000015803)	ENSCGOG00000015807	cd40 (ENSCGOG00000015813)	irx7 (ENSCGOG00000015819)	ENSCGOG00000015820	PLEKHG5 (ENSCGOG00000015827)	NOL9 (ENSCGOG00000015902)	ZBTB48 (ENSCGOG00000015905)	klhl21 (ENSCGOG00000015907)	SYT6 (ENSCGOG00000015910)	olfml3a (ENSCGOG00000015911)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
European seabass	MODERN SPECIES	14	ENSDLAG00005031943	ENSDLAG00005011956	pfkfb1 (ENSDLAG00005011978)	ENSDLAG00005031028	ENSDLAG00005012195	gdi1 (ENSDLAG00005012204)	atp6ap1b (ENSDLAG00005012331)	ENSDLAG00005012363	ENSDLAG00005012387	camk1gb (ENSDLAG00005012415)	mical1 (ENSDLAG00005012472)	src (ENSDLAG00005012554)	NFATC2 (ENSDLAG00005013321)	sall4 (ENSDLAG00005014620)	ZFP64 (ENSDLAG00005014627)	TSHZ2 (ENSDLAG00005014656) ##22	ENSDLAG00005014666	znf217 (ENSDLAG00005014672)	PFDN4 (ENSDLAG00005014688)	ENSDLAG00005014709	cbln4 (ENSDLAG00005033519)	ENSDLAG00005014744	cd40 (ENSDLAG00005027038)	irx7 (ENSDLAG00005014784)	ENSDLAG00005014795	PLEKHG5 (ENSDLAG00005014831)	NOL9 (ENSDLAG00005015048)	ZBTB48 (ENSDLAG00005015076)	klhl21 (ENSDLAG00005034360)	ENSDLAG00005027484	olfml3a (ENSDLAG00005030589)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	487	gdi1 (ENSLCRG00005020808)	atp6ap1b (ENSLCRG00005020801)	ENSLCRG00005020800	ENSLCRG00005020799	ENSLCRG00005020798	taf8 (ENSLCRG00005020793)	ENSLCRG00005020792	camk1gb (ENSLCRG00005020620)	mical1 (ENSLCRG00005020615)	src (ENSLCRG00005020425)	kcng1 (ENSLCRG00005020422)	NFATC2 (ENSLCRG00005020412)	ATP9A (ENSLCRG00005018115)	sall4 (ENSLCRG00005018092)	ZFP64 (ENSLCRG00005018090)	TSHZ2 (ENSLCRG00005018088) ##22	znf217 (ENSLCRG00005018086)	PFDN4 (ENSLCRG00005018084)	ENSLCRG00005018083	cbln4 (ENSLCRG00005018082)	cd40 (ENSLCRG00005018080)	irx7 (ENSLCRG00005018079)	ENSLCRG00005018078	PLEKHG5 (ENSLCRG00005018076)	NOL9 (ENSLCRG00005018074)	ZBTB48 (ENSLCRG00005018073)	klhl21 (ENSLCRG00005018072)	SYT6 (ENSLCRG00005018070)	olfml3a (ENSLCRG00005018069)	ENSLCRG00005018068	c1qtnf12 (ENSLCRG00005018066)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	21	pfkfb1 (ENSSAUG00010006509)	ENSSAUG00010006494	gdi1 (ENSSAUG00010006147)	atp6ap1b (ENSSAUG00010006126)	ENSSAUG00010006121	taf8 (ENSSAUG00010006103)	ENSSAUG00010006098	camk1gb (ENSSAUG00010006073)	mical1 (ENSSAUG00010006046)	src (ENSSAUG00010003910)	kcng1 (ENSSAUG00010003873)	NFATC2 (ENSSAUG00010003763)	ATP9A (ENSSAUG00010003575)	sall4 (ENSSAUG00010003557)	ZFP64 (ENSSAUG00010003549)	TSHZ2 (ENSSAUG00010003542) ##22	znf217 (ENSSAUG00010003531)	ENSSAUG00010003529	cbln4 (ENSSAUG00010003527)	ENSSAUG00010003521	cd40 (ENSSAUG00010003513)	irx7 (ENSSAUG00010003506)	ENSSAUG00010003503	PFDN4 (ENSSAUG00010003498)	PLEKHG5 (ENSSAUG00010003486)	NOL9 (ENSSAUG00010003479)	ZBTB48 (ENSSAUG00010003477)	klhl21 (ENSSAUG00010003474)	SYT6 (ENSSAUG00010003473)	olfml3a (ENSSAUG00010003470)	c1qtnf12 (ENSSAUG00010003468)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211.b	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211.b	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211.b	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	46	pfkfb1 (ENSKMAG00000001858)	ENSKMAG00000001903	gdi1 (ENSKMAG00000001977)	atp6ap1b (ENSKMAG00000002033)	ENSKMAG00000002051	taf8 (ENSKMAG00000002062)	camk1gb (ENSKMAG00000002128)	mical1 (ENSKMAG00000002146)	src (ENSKMAG00000002189)	kcng1 (ENSKMAG00000002272)	ENSKMAG00000002283	NFATC2 (ENSKMAG00000002325)	ATP9A (ENSKMAG00000002365)	sall4 (ENSKMAG00000002501)	ZFP64 (ENSKMAG00000002536)	TSHZ2 (ENSKMAG00000002553) ##22	ENSKMAG00000002573	znf217 (ENSKMAG00000002585)	PFDN4 (ENSKMAG00000002594)	ENSKMAG00000002618	cbln4 (ENSKMAG00000002633)	ENSKMAG00000002657	ENSKMAG00000002691	cd40 (ENSKMAG00000002709)	ENSKMAG00000002722	ENSKMAG00000002738	PLEKHG5 (ENSKMAG00000002792)	NOL9 (ENSKMAG00000002937)	ZBTB48 (ENSKMAG00000002963)	klhl21 (ENSKMAG00000002980)	SYT6 (ENSKMAG00000002989)
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Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211.b	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a
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Mummichog	MODERN SPECIES	240	pfkfb1 (ENSFHEG00000013421)	ENSFHEG00000013470	gdi1 (ENSFHEG00000013514)	atp6ap1b (ENSFHEG00000000312)	ENSFHEG00000013524	taf8 (ENSFHEG00000013529)	ENSFHEG00000013545	camk1gb (ENSFHEG00000013936)	mical1 (ENSFHEG00000013952)	src (ENSFHEG00000014030)	kcng1 (ENSFHEG00000014049)	NFATC2 (ENSFHEG00000014080)	ATP9A (ENSFHEG00000014171)	sall4 (ENSFHEG00000014187)	ZFP64 (ENSFHEG00000014197)	TSHZ2 (ENSFHEG00000014202) ##22	znf217 (ENSFHEG00000014218)	PFDN4 (ENSFHEG00000014232)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	193										kcng1 (ENSCVAG00000010676)	NFATC2 (ENSCVAG00000010700)	ATP9A (ENSCVAG00000010769)	sall4 (ENSCVAG00000010815)	ENSCVAG00000010846	ZFP64 (ENSCVAG00000010908)	TSHZ2 (ENSCVAG00000010918) ##22	znf217 (ENSCVAG00000010939)	PFDN4 (ENSCVAG00000010960)	ENSCVAG00000010983	cbln4 (ENSCVAG00000010993)	ENSCVAG00000011018	cd40 (ENSCVAG00000011030)	irx7 (ENSCVAG00000011055)	ENSCVAG00000011063	PLEKHG5 (ENSCVAG00000011097)	NOL9 (ENSCVAG00000011105)	ZBTB48 (ENSCVAG00000011111)	klhl21 (ENSCVAG00000011125)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211.b	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000177211.b	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	319																ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00650000094602	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000167176	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631
Amazon molly	MODERN SPECIES	518																TSHZ2 (ENSPFOG00000020779) ##22	znf217 (ENSPFOG00000006420)	ENSPFOG00000022622	PFDN4 (ENSPFOG00000006443)	ENSPFOG00000006488	cbln4 (ENSPFOG00000006504)	ENSPFOG00000006563	cd40 (ENSPFOG00000006609)	irx7 (ENSPFOG00000006638)	ENSPFOG00000006650	PLEKHG5 (ENSPFOG00000006720)	PLEKHG5 (ENSPFOG00000023599)	NOL9 (ENSPFOG00000007135)	ZBTB48 (ENSPFOG00000007280)	klhl21 (ENSPFOG00000007400)	NOL9 (ENSPFOG00000007423)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	3751																TSHZ2 (ENSPLAG00000012397) ##22
Guppy	MODERN SPECIES	459	pfkfb1 (ENSPREG00000020762)	ENSPREG00000020806	gdi1 (ENSPREG00000020826)	atp6ap1b (ENSPREG00000020851)	ENSPREG00000020868	taf8 (ENSPREG00000020878)	camk1gb (ENSPREG00000020903)	ENSPREG00000020924	ENSPREG00000020936	src (ENSPREG00000020990)	kcng1 (ENSPREG00000021031)	NFATC2 (ENSPREG00000021045)	ATP9A (ENSPREG00000021080)	sall4 (ENSPREG00000021140)	ZFP64 (ENSPREG00000021151)	TSHZ2 (ENSPREG00000021160) ##22	ENSPREG00000021162	znf217 (ENSPREG00000021169)	PFDN4 (ENSPREG00000021178)	ENSPREG00000021191	cbln4 (ENSPREG00000021202)	ENSPREG00000021207	cd40 (ENSPREG00000021221)	irx7 (ENSPREG00000021227)	ENSPREG00000021235	PLEKHG5 (ENSPREG00000021258)	NOL9 (ENSPREG00000021305)	ZBTB48 (ENSPREG00000021324)	klhl21 (ENSPREG00000021333)	SYT6 (ENSPREG00000021360)	olfml3a (ENSPREG00000021414)
Platyfish	MODERN SPECIES		pfkfb1 (ENSXMAG00000001286)	ENSXMAG00000001322	ENSXMAG00000027027	gdi1 (ENSXMAG00000001355)	atp6ap1b (ENSXMAG00000001388)	ENSXMAG00000001389	taf8 (ENSXMAG00000001391)	camk1gb (ENSXMAG00000001406)	mical1 (ENSXMAG00000001437)	src (ENSXMAG00000001476)	kcng1 (ENSXMAG00000024902)	NFATC2 (ENSXMAG00000003976)	ATP9A (ENSXMAG00000024976)	sall4 (ENSXMAG00000012692)	ZFP64 (ENSXMAG00000012686)	TSHZ2 (ENSXMAG00000012685) ##22	znf217 (ENSXMAG00000012683)	PFDN4 (ENSXMAG00000012679)	ENSXMAG00000012677	cbln4 (ENSXMAG00000012671)	ENSXMAG00000026579	cd40 (ENSXMAG00000026380)	irx7 (ENSXMAG00000012663)	ENSXMAG00000012658	PLEKHG5 (ENSXMAG00000012638)	NOL9 (ENSXMAG00000012629)	ZBTB48 (ENSXMAG00000012617)	klhl21 (ENSXMAG00000012605)	SYT6 (ENSXMAG00000012599)	olfml3a (ENSXMAG00000012596)	c1qtnf12 (ENSXMAG00000012587)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000166720	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000017567	ENSGT01100000265579	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a	ENSGT00940000160300
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000166720	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000017567	ENSGT01100000265579	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a	ENSGT00940000160300
Indian medaka	MODERN SPECIES	23	ENSOMEG00000016460	ugt5e1 (ENSOMEG00000016471)	pfkfb1 (ENSOMEG00000016573)	ENSOMEG00000016640	gdi1 (ENSOMEG00000016690)	atp6ap1b (ENSOMEG00000016723)	taf8 (ENSOMEG00000016765)	camk1gb (ENSOMEG00000016801)	ENSOMEG00000016818	mical1 (ENSOMEG00000016860)	src (ENSOMEG00000016964)	kcng1 (ENSOMEG00000016998)	ATP9A (ENSOMEG00000017259)	sall4 (ENSOMEG00000017344)	ZFP64 (ENSOMEG00000017361)	TSHZ2 (ENSOMEG00000017379) ##22	znf217 (ENSOMEG00000017400)	PFDN4 (ENSOMEG00000017423)	ENSOMEG00000017439	cbln4 (ENSOMEG00000017455)	ENSOMEG00000017485	cd40 (ENSOMEG00000000715)	ENSOMEG00000017510	ENSOMEG00000017531	PLEKHG5 (ENSOMEG00000017670)	NOL9 (ENSOMEG00000017724)	ZBTB48 (ENSOMEG00000017762)	klhl21 (ENSOMEG00000017784)	SYT6 (ENSOMEG00000017823)	olfml3a (ENSOMEG00000017854)	c1qtnf12 (ENSOMEG00000017868)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	21	ugt5e1 (ENSOJAG00000010426)	pfkfb1 (ENSOJAG00000010381)	ITIH6 (ENSOJAG00000010317)	gdi1 (ENSOJAG00000010196)	atp6ap1b (ENSOJAG00000010172)	taf8 (ENSOJAG00000010080)	ENSOJAG00000010058	camk1gb (ENSOJAG00000010022)	mical1 (ENSOJAG00000009763)	src (ENSOJAG00000009352)	kcng1 (ENSOJAG00000009295)	NFATC2 (ENSOJAG00000009270)	ATP9A (ENSOJAG00000006294)	sall4 (ENSOJAG00000005879)	ZFP64 (ENSOJAG00000005860)	TSHZ2 (ENSOJAG00000005846) ##22	znf217 (ENSOJAG00000005795)	ENSOJAG00000005686	PFDN4 (ENSOJAG00000013943)	ENSOJAG00000013918	cbln4 (ENSOJAG00000013882)	ENSOJAG00000013774	ENSOJAG00000013761	cd40 (ENSOJAG00000013751)	irx7 (ENSOJAG00000013747)	ENSOJAG00000013728	PLEKHG5 (ENSOJAG00000013507)	NOL9 (ENSOJAG00000013476)	ZBTB48 (ENSOJAG00000013464)	klhl21 (ENSOJAG00000013437)	SYT6 (ENSOJAG00000013430)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155094.b.x.b.c.c	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000017567	ENSGT01100000265579	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a	ENSGT01010000222360.B
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	21	ENSORLG00000030512	pfkfb1 (ENSORLG00000016293)	ENSORLG00000016280	gdi1 (ENSORLG00000016266)	atp6ap1b (ENSORLG00000016253)	taf8 (ENSORLG00000016241)	ENSORLG00000030018	camk1gb (ENSORLG00000016226)	mical1 (ENSORLG00000016209)	src (ENSORLG00000016183)	kcng1 (ENSORLG00000016178)	NFATC2 (ENSORLG00000016173)	ATP9A (ENSORLG00000016166)	sall4 (ENSORLG00000016130)	ZFP64 (ENSORLG00000016115)	TSHZ2 (ENSORLG00000016111) ##22	znf217 (ENSORLG00000029823)	PFDN4 (ENSORLG00000026937)	ENSORLG00000019186	cbln4 (ENSORLG00000028922)	ENSORLG00000021988	ENSORLG00000023336	cd40 (ENSORLG00000026270)	irx7 (ENSORLG00000030275)	ENSORLG00000027296	PLEKHG5 (ENSORLG00000019281)	NOL9 (ENSORLG00000025184)	ZBTB48 (ENSORLG00000019331)	klhl21 (ENSORLG00000019357)	ENSORLG00000029457	SYT6 (ENSORLG00000016069)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	103												NFATC2 (ENSOSIG00000022366)	ATP9A (ENSOSIG00000020935)	sall4 (ENSOSIG00000020739)	ZFP64 (ENSOSIG00000020735)	TSHZ2 (ENSOSIG00000020732) ##22	znf217 (ENSOSIG00000020729)	PFDN4 (ENSOSIG00000020727)	ENSOSIG00000020725	ENSOSIG00000020716	cd40 (ENSOSIG00000020709)	irx7 (ENSOSIG00000020707)	ENSOSIG00000020705	PLEKHG5 (ENSOSIG00000020701)	NOL9 (ENSOSIG00000020695)	ZBTB48 (ENSOSIG00000020694)	klhl21 (ENSOSIG00000020693)	SYT6 (ENSOSIG00000020692)	c1qtnf12 (ENSOSIG00000020691)	sdf4 (ENSOSIG00000020690)	HIPK1 (ENSOSIG00000020675)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00940000159483.a.a	ENSGT00940000163250.A.b	ENSGT00950000183202.a.b	ENSGT00650000094986	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00650000094986	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a.e	ENSGT00940000158083.a	ENSGT00940000160300
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00650000094986	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a.e	ENSGT00940000158083.a	ENSGT00940000160300
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	650								mical1 (ENSAOCG00000023520)	src (ENSAOCG00000023573)	kcng1 (ENSAOCG00000023592)	ENSAOCG00000023594	NFATC2 (ENSAOCG00000023603)	ATP9A (ENSAOCG00000023659)	sall4 (ENSAOCG00000023678)	ZFP64 (ENSAOCG00000001717)	TSHZ2 (ENSAOCG00000023687) ##22	znf217 (ENSAOCG00000023700)	PFDN4 (ENSAOCG00000023708)	ENSAOCG00000023718	cbln4 (ENSAOCG00000023720)	ENSAOCG00000023736	cd40 (ENSAOCG00000023742)	irx7 (ENSAOCG00000023752)	ENSAOCG00000023763
Orange clownfish	MODERN SPECIES	22	ENSAPEG00000001524	gdi1 (ENSAPEG00000001467)	atp6ap1b (ENSAPEG00000001455)	ENSAPEG00000001437	taf8 (ENSAPEG00000001414)	ENSAPEG00000001390	camk1gb (ENSAPEG00000001368)	mical1 (ENSAPEG00000001353)	src (ENSAPEG00000001308)	kcng1 (ENSAPEG00000001280)	ENSAPEG00000000932	NFATC2 (ENSAPEG00000000866)	ATP9A (ENSAPEG00000000780)	sall4 (ENSAPEG00000000751)	ZFP64 (ENSAPEG00000000733)	TSHZ2 (ENSAPEG00000000720) ##22	znf217 (ENSAPEG00000000682)	PFDN4 (ENSAPEG00000000664)	ENSAPEG00000000631	cbln4 (ENSAPEG00000000619)	cd40 (ENSAPEG00000000612)	irx7 (ENSAPEG00000000593)	ENSAPEG00000000583	PLEKHG5 (ENSAPEG00000000430)	NOL9 (ENSAPEG00000000416)	ZBTB48 (ENSAPEG00000000398)	klhl21 (ENSAPEG00000000370)	SYT6 (ENSAPEG00000000337)	olfml3a (ENSAPEG00000000297)	c1qtnf12 (ENSAPEG00000024793)	sdf4 (ENSAPEG00000024789)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	70	pfkfb1 (ENSAPOG00000002122)	ENSAPOG00000002148	gdi1 (ENSAPOG00000002187)	atp6ap1b (ENSAPOG00000002216)	ENSAPOG00000002224	taf8 (ENSAPOG00000002254)	ENSAPOG00000002262	camk1gb (ENSAPOG00000000049)	mical1 (ENSAPOG00000002328)	src (ENSAPOG00000002357)	kcng1 (ENSAPOG00000000053)	NFATC2 (ENSAPOG00000002387)	ATP9A (ENSAPOG00000001055)	sall4 (ENSAPOG00000002465)	ZFP64 (ENSAPOG00000002481)	TSHZ2 (ENSAPOG00000002486) ##22	znf217 (ENSAPOG00000002505)	PFDN4 (ENSAPOG00000002536)	ENSAPOG00000002554	cbln4 (ENSAPOG00000002566)	cd40 (ENSAPOG00000002598)	irx7 (ENSAPOG00000002617)	ENSAPOG00000002654	PLEKHG5 (ENSAPOG00000002727)	NOL9 (ENSAPOG00000002752)	ZBTB48 (ENSAPOG00000002861)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	248	pfkfb1 (ENSSPAG00000002529)	ENSSPAG00000002495	gdi1 (ENSSPAG00000002427)	atp6ap1b (ENSSPAG00000002410)	ENSSPAG00000002377	taf8 (ENSSPAG00000002347)	ENSSPAG00000002328	camk1gb (ENSSPAG00000002316)	mical1 (ENSSPAG00000002190)	src (ENSSPAG00000002146)	kcng1 (ENSSPAG00000002128)	NFATC2 (ENSSPAG00000002068)	ATP9A (ENSSPAG00000002005)	sall4 (ENSSPAG00000001978)	ZFP64 (ENSSPAG00000001969)	TSHZ2 (ENSSPAG00000001957) ##22	znf217 (ENSSPAG00000001923)	ENSSPAG00000001913	PFDN4 (ENSSPAG00000001904)	ENSSPAG00000001887
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000175220	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000166720	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00940000181618	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	295	pfkfb1 (ENSHBUG00000007858)	ENSHBUG00000007833	gdi1 (ENSHBUG00000007791)	atp6ap1b (ENSHBUG00000007744)	ENSHBUG00000007718	taf8 (ENSHBUG00000007708)	camk1gb (ENSHBUG00000007662)	mical1 (ENSHBUG00000007631)	src (ENSHBUG00000007505)	kcng1 (ENSHBUG00000007408)	NFATC2 (ENSHBUG00000007399)	ATP9A (ENSHBUG00000007373)	sall4 (ENSHBUG00000007327)	ZFP64 (ENSHBUG00000007318)	ENSHBUG00000007308	TSHZ2 (ENSHBUG00000007293) ##22	ENSHBUG00000000178	znf217 (ENSHBUG00000007278)	PFDN4 (ENSHBUG00000007272)	ENSHBUG00000007255	cbln4 (ENSHBUG00000007249)	ENSHBUG00000007238	cd40 (ENSHBUG00000007231)	irx7 (ENSHBUG00000007224)	ENSHBUG00000007205	PLEKHG5 (ENSHBUG00000007175)	NOL9 (ENSHBUG00000007134)	ZBTB48 (ENSHBUG00000007124)	klhl21 (ENSHBUG00000007101)	SYT6 (ENSHBUG00000007073)	olfml3a (ENSHBUG00000007044)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00940000181618	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
P. nyererei	MODERN SPECIES	401	pfkfb1 (ENSPNYG00000022027)	ENSPNYG00000022015	gdi1 (ENSPNYG00000021999)	atp6ap1b (ENSPNYG00000021977)	ENSPNYG00000021961	taf8 (ENSPNYG00000021944)	camk1gb (ENSPNYG00000021911)	mical1 (ENSPNYG00000021876)	src (ENSPNYG00000021857)	kcng1 (ENSPNYG00000021848)	NFATC2 (ENSPNYG00000021813)	ATP9A (ENSPNYG00000021768)	sall4 (ENSPNYG00000021738)	ZFP64 (ENSPNYG00000021724)	ENSPNYG00000021710	TSHZ2 (ENSPNYG00000021698) ##22	znf217 (ENSPNYG00000021685)	PFDN4 (ENSPNYG00000021672)	ENSPNYG00000021658	cbln4 (ENSPNYG00000021616)	cd40 (ENSPNYG00000021599)	irx7 (ENSPNYG00000021587)	ENSPNYG00000021567	PLEKHG5 (ENSPNYG00000021532)	ENSPNYG00000021506	ENSPNYG00000021501	klhl21 (ENSPNYG00000021481)	SYT6 (ENSPNYG00000021462)	olfml3a (ENSPNYG00000021454)	c1qtnf12 (ENSPNYG00000021436)	sdf4 (ENSPNYG00000021421)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000166720	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1103	ENSMZEG00005023481	pfkfb1 (ENSMZEG00005023474)	ENSMZEG00005023470	gdi1 (ENSMZEG00005023464)	atp6ap1b (ENSMZEG00005023459)	ENSMZEG00005023457	taf8 (ENSMZEG00005023455)	camk1gb (ENSMZEG00005023450)	mical1 (ENSMZEG00005023441)	src (ENSMZEG00005023436)	kcng1 (ENSMZEG00005023435)	NFATC2 (ENSMZEG00005023433)	ATP9A (ENSMZEG00005023425)	sall4 (ENSMZEG00005023418)	ZFP64 (ENSMZEG00005023417)	TSHZ2 (ENSMZEG00005023416) ##22	znf217 (ENSMZEG00005023413)	PFDN4 (ENSMZEG00005023411)	ENSMZEG00005023408	cbln4 (ENSMZEG00005023406)	ENSMZEG00005023402	cd40 (ENSMZEG00005023400)	irx7 (ENSMZEG00005023398)	ENSMZEG00005023397	PLEKHG5 (ENSMZEG00005023390)	NOL9 (ENSMZEG00005023387)	ZBTB48 (ENSMZEG00005023385)	klhl21 (ENSMZEG00005023382)	SYT6 (ENSMZEG00005023378)	olfml3a (ENSMZEG00005023377)	c1qtnf12 (ENSMZEG00005023375)
Eastern happy	MODERN SPECIES	12	ENSACLG00000017106	pfkfb1 (ENSACLG00000017127)	ENSACLG00000017226	gdi1 (ENSACLG00000017266)	atp6ap1b (ENSACLG00000017339)	ENSACLG00000017367	taf8 (ENSACLG00000017386)	camk1gb (ENSACLG00000017438)	mical1 (ENSACLG00000017491)	src (ENSACLG00000017545)	kcng1 (ENSACLG00000017661)	NFATC2 (ENSACLG00000017675)	ATP9A (ENSACLG00000017726)	sall4 (ENSACLG00000017851)	ZFP64 (ENSACLG00000017880)	TSHZ2 (ENSACLG00000017920) ##22	ENSACLG00000017936	znf217 (ENSACLG00000017951)	PFDN4 (ENSACLG00000017978)	ENSACLG00000017992	ENSACLG00000018006	cbln4 (ENSACLG00000018020)	ENSACLG00000018040	cd40 (ENSACLG00000018083)	irx7 (ENSACLG00000018106)	ENSACLG00000018114	PLEKHG5 (ENSACLG00000018187)	ZBTB48 (ENSACLG00000018276)	klhl21 (ENSACLG00000018306)	klhl21 (ENSACLG00000018342)	SYT6 (ENSACLG00000018361)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	321	ENSNBRG00000000978	ENSNBRG00000000994	ENSNBRG00000001043	gdi1 (ENSNBRG00000001136)	atp6ap1b (ENSNBRG00000001197)	ENSNBRG00000001470	taf8 (ENSNBRG00000001511)	camk1gb (ENSNBRG00000001579)	mical1 (ENSNBRG00000001605)	src (ENSNBRG00000001659)	kcng1 (ENSNBRG00000001698)	NFATC2 (ENSNBRG00000001713)	ATP9A (ENSNBRG00000001749)	sall4 (ENSNBRG00000001829)	ZFP64 (ENSNBRG00000001872)	TSHZ2 (ENSNBRG00000001911) ##22	ENSNBRG00000001922	znf217 (ENSNBRG00000001938)	ENSNBRG00000001987	ENSNBRG00000002007	cbln4 (ENSNBRG00000002026)	cd40 (ENSNBRG00000002037)	irx7 (ENSNBRG00000002047)	ENSNBRG00000002062	ENSNBRG00000002086	ENSNBRG00000002099	ENSNBRG00000002162	ENSNBRG00000002198	klhl21 (ENSNBRG00000002210)	SYT6 (ENSNBRG00000002233)	olfml3a (ENSNBRG00000002258)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	12	ITIH6 (ENSONIG00000016533)	gdi1 (ENSONIG00000029560)	atp6ap1b (ENSONIG00000016537)	ENSONIG00000039074	taf8 (ENSONIG00000016541)	ENSONIG00000035840	camk1gb (ENSONIG00000016542)	mical1 (ENSONIG00000016543)	src (ENSONIG00000016547)	kcng1 (ENSONIG00000016551)	ENSONIG00000035363	NFATC2 (ENSONIG00000016552)	ATP9A (ENSONIG00000016554)	sall4 (ENSONIG00000016557)	ZFP64 (ENSONIG00000021135)	TSHZ2 (ENSONIG00000016558) ##22	ENSONIG00000029636	znf217 (ENSONIG00000016559)	PFDN4 (ENSONIG00000016560)	ENSONIG00000033286	cbln4 (ENSONIG00000035155)	ENSONIG00000038971	ENSONIG00000041489	irx7 (ENSONIG00000016567)	ENSONIG00000016568	PLEKHG5 (ENSONIG00000016570)	NOL9 (ENSONIG00000016574)	ZBTB48 (ENSONIG00000016577)	klhl21 (ENSONIG00000016580)	SYT6 (ENSONIG00000016581)	ENSONIG00000027833
Midas cichlid	MODERN SPECIES	531	ugt5e1 (ENSACIG00000018106)	pfkfb1 (ENSACIG00000018077)	ENSACIG00000018054	gdi1 (ENSACIG00000018010)	atp6ap1b (ENSACIG00000017819)	ENSACIG00000017791	taf8 (ENSACIG00000017717)	camk1gb (ENSACIG00000017627)	mical1 (ENSACIG00000017586)	src (ENSACIG00000017397)	kcng1 (ENSACIG00000017380)	NFATC2 (ENSACIG00000017365)	ATP9A (ENSACIG00000017323)	sall4 (ENSACIG00000017298)	ZFP64 (ENSACIG00000017268)	TSHZ2 (ENSACIG00000017256) ##22	znf217 (ENSACIG00000017229)	PFDN4 (ENSACIG00000017208)	ENSACIG00000017195	cbln4 (ENSACIG00000017186)	cd40 (ENSACIG00000017163)	irx7 (ENSACIG00000017152)	ENSACIG00000017131	PLEKHG5 (ENSACIG00000017066)	NOL9 (ENSACIG00000017043)	ZBTB48 (ENSACIG00000016989)	klhl21 (ENSACIG00000016975)	SYT6 (ENSACIG00000016956)	olfml3a (ENSACIG00000016938)	c1qtnf12 (ENSACIG00000016909)	sdf4 (ENSACIG00000016880)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	28	COQ10A (ENSHCOG00000008977)	pmelb (ENSHCOG00000008954)	tuba1c (ENSHCOG00000008907) ##15	TUBA1A (ENSHCOG00000008897) ##15	tamalin (ENSHCOG00000008893)	dgkaa (ENSHCOG00000008875)	rnf41 (ENSHCOG00000008814)	ankrd52a (ENSHCOG00000008791)	src (ENSHCOG00000008735)	kcng1 (ENSHCOG00000008708)	NFATC2 (ENSHCOG00000008692)	ATP9A (ENSHCOG00000008564)	sall4 (ENSHCOG00000008519)	ENSHCOG00000008502	ZFP64 (ENSHCOG00000008398)	TSHZ2 (ENSHCOG00000008381) ##22	ENSHCOG00000008378	znf217 (ENSHCOG00000000278)	PFDN4 (ENSHCOG00000008371)	ENSHCOG00000008363	cbln4 (ENSHCOG00000008346)	cd40 (ENSHCOG00000008241)	irx7 (ENSHCOG00000008237)	ENSHCOG00000008219	PLEKHG5 (ENSHCOG00000008192)	nsmce4a (ENSHCOG00000008094)	NOL9 (ENSHCOG00000008081)	ZBTB48 (ENSHCOG00000008069)	klhl21 (ENSHCOG00000008036)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	21	pfkfb1 (ENSMMDG00005013009)	ENSMMDG00005012860	gdi1 (ENSMMDG00005012589)	atp6ap1b (ENSMMDG00005012586)	ENSMMDG00005012581	taf8 (ENSMMDG00005012574)	G0S2 (ENSMMDG00005012570)	camk1gb (ENSMMDG00005012566)	mical1 (ENSMMDG00005012550)	src (ENSMMDG00005008751)	kcng1 (ENSMMDG00005008715)	NFATC2 (ENSMMDG00005008712)	ATP9A (ENSMMDG00005005535)	sall4 (ENSMMDG00005005499)	ZFP64 (ENSMMDG00005005497)	TSHZ2 (ENSMMDG00005005494) ##22	znf217 (ENSMMDG00005005491)	PFDN4 (ENSMMDG00005005490)	ENSMMDG00005005487	cbln4 (ENSMMDG00005005484)	cd40 (ENSMMDG00005005483)	irx7 (ENSMMDG00005005482)	ENSMMDG00005005481	PLEKHG5 (ENSMMDG00005005396)	NOL9 (ENSMMDG00005005351)	ZBTB48 (ENSMMDG00005005344)	klhl21 (ENSMMDG00005005338)	SYT6 (ENSMMDG00005005327)	olfml3a (ENSMMDG00005005319)	c1qtnf12 (ENSMMDG00005005315)	sdf4 (ENSMMDG00005005309)
Cod	MODERN SPECIES		pfkfb1 (ENSGMOG00000003739)	ENSGMOG00000003642	gdi1 (ENSGMOG00000003624)	atp6ap1b (ENSGMOG00000003605)	ENSGMOG00000003588	ENSGMOG00000025851	camk1gb (ENSGMOG00000003562)	mical1 (ENSGMOG00000003524)	mical1 (ENSGMOG00000019183)	src (ENSGMOG00000013049)	kcng1 (ENSGMOG00000008391)	NFATC2 (ENSGMOG00000034240)	ATP9A (ENSGMOG00000003768)	sall4 (ENSGMOG00000027231)	ZFP64 (ENSGMOG00000034637)	TSHZ2 (ENSGMOG00000003891) ##22	znf217 (ENSGMOG00000003895)	PFDN4 (ENSGMOG00000004004)	ENSGMOG00000010545	cbln4 (ENSGMOG00000004017)	ENSGMOG00000034735	cd40 (ENSGMOG00000004030)	irx7 (ENSGMOG00000034204)	ENSGMOG00000030169	PLEKHG5 (ENSGMOG00000006496)	NOL9 (ENSGMOG00000006534)	ZBTB48 (ENSGMOG00000006563)	klhl21 (ENSGMOG00000006592)	ENSGMOG00000006597	olfml3a (ENSGMOG00000006608)	c1qtnf12 (ENSGMOG00000006612)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182835.c.c.g.b	ENSGT00940000162980	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.f	ENSGT00940000156650.i	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567	ENSGT00390000005294.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117	ENSGT00940000158250.d.b	ENSGT00940000159686	ENSGT00940000156230.p	ENSGT00940000159181	ENSGT00940000155384.a	ENSGT00940000156405	ENSGT00950000183051.a.b ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884	ENSGT00390000006696	ENSGT00950000182932.C.b	ENSGT00940000159728	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581	ENSGT00940000165935	ENSGT00950000183003.a.b	ENSGT00510000046843.a.b	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981	ENSGT00940000158631	ENSGT00940000157665.a	ENSGT00940000158083.a.e
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	113	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.f	ENSGT00940000156650.i.e	ENSGT00390000017567.q	ENSGT00940000175220	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567.r	ENSGT00390000005294.a.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117.d	ENSGT00940000158250.d.b.d	ENSGT00940000159686.d	ENSGT00940000156230.p.j	ENSGT00940000159181.m	ENSGT00940000155384.a.f	ENSGT00940000156405.a	ENSGT00950000183051.a.b.e ##22	ENSGT00940000159884.j	ENSGT00390000006696.nc	ENSGT00950000182932.C.b.a	ENSGT00940000159728.d	ENSGT00940000166581.d	ENSGT00940000165935.f	ENSGT00950000183003.a.b.f	ENSGT00510000046843.a.b.i	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981.i	ENSGT00940000158631.f	ENSGT00940000157665.a.g	ENSGT00940000158083.a.e	ENSGT00940000160300.o.b	ENSGT01010000222360.B.d
Huchen	MODERN SPECIES	242													olfml2a (ENSHHUG00000044469)	sall4 (ENSHHUG00000044463)	ZFP64 (ENSHHUG00000044457)	TSHZ2 (ENSHHUG00000044455) ##22	znf217 (ENSHHUG00000044443)	PFDN4 (ENSHHUG00000044425)	ENSHHUG00000044422	cbln4 (ENSHHUG00000044420)	ENSHHUG00000044415	irx7 (ENSHHUG00000044411)	ENSHHUG00000044408	ENSHHUG00000044400	PLEKHG5 (ENSHHUG00000044339)	NOL9 (ENSHHUG00000044331)	ZBTB48 (ENSHHUG00000044325)	klhl21 (ENSHHUG00000044324)	irf3 (ENSHHUG00000044317)	PRR12 (ENSHHUG00000044308)	ENSHHUG00000044307
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.h	ENSGT00940000162980.l	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.e	ENSGT00940000156650.i.f	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567.r	ENSGT00390000005294.a.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117.d	ENSGT00940000158250.d.b.d	ENSGT00940000159686.d	ENSGT00940000156230.p.j	ENSGT00940000159181.m	ENSGT00940000155384.a.f	ENSGT00940000156405.a	ENSGT00950000183051.a.b.e ##22	ENSGT00940000159884.j	ENSGT00390000006696.nc	ENSGT00950000182932.C.b.a	ENSGT00940000159728.d	ENSGT00940000166581.d	ENSGT00940000165935.f	ENSGT00950000183003.a.b.f	ENSGT00510000046843.a.b.i	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981.i	ENSGT00940000158631.f	ENSGT00940000157665.a.g	ENSGT00940000158083.a.e	ENSGT00940000160300.o.b	ENSGT01010000222360.B.d
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.h	ENSGT00940000162980.l	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.e	ENSGT00940000156650.i.f	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567.r	ENSGT00390000005294.a.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117.d	ENSGT00940000158250.d.b.d	ENSGT00940000159686.d	ENSGT00940000156230.p.j	ENSGT00940000159181.m	ENSGT00940000155384.a.f	ENSGT00940000156405.a	ENSGT00950000183051.a.b.e ##22	ENSGT00940000159884.j	ENSGT00390000006696.nc	ENSGT00950000182932.C.b.a	ENSGT00940000159728.d	ENSGT00940000166581.d	ENSGT00940000165935.f	ENSGT00950000183003.a.b.f	ENSGT00510000046843.a.b.i	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981.i	ENSGT00940000158631.f	ENSGT00940000157665.a.g	ENSGT00940000158083.a.e	ENSGT00940000160300.o.b	ENSGT01010000222360.B.d
River trout	MODERN SPECIES	23	pfkfb1 (ENSSTUG00000005007)	ENSSTUG00000008453	gdi1 (ENSSTUG00000008478)	atp6ap1b (ENSSTUG00000008751)	ENSSTUG00000008772	taf8 (ENSSTUG00000008798)	ENSSTUG00000008847	camk1gb (ENSSTUG00000008855)	mical1 (ENSSTUG00000008888)	src (ENSSTUG00000008952)	kcng1 (ENSSTUG00000009027)	ENSSTUG00000009039	ATP9A (ENSSTUG00000009205)	sall4 (ENSSTUG00000014691)	ZFP64 (ENSSTUG00000014700)	TSHZ2 (ENSSTUG00000014704) ##22	ENSSTUG00000014706	ENSSTUG00000014709	znf217 (ENSSTUG00000014716)	PFDN4 (ENSSTUG00000014725)	ENSSTUG00000014735	cbln4 (ENSSTUG00000014746)	cd40 (ENSSTUG00000014758)	irx7 (ENSSTUG00000014788)	ENSSTUG00000014789	PLEKHG5 (ENSSTUG00000014798)	NOL9 (ENSSTUG00000014896)	ZBTB48 (ENSSTUG00000014964)	klhl21 (ENSSTUG00000014982)	SYT6 (ENSSTUG00000015010)	olfml3a (ENSSTUG00000015020)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	ENSSSAG00000041592	pfkfb1 (ENSSSAG00000041075)	atp6ap1b (ENSSSAG00000104939)	ENSSSAG00000084056	G0S2 (ENSSSAG00000042105)	camk1gb (ENSSSAG00000042130)	mical1 (ENSSSAG00000042473)	src (ENSSSAG00000042654)	ENSSSAG00000093022	kcng1 (ENSSSAG00000099980)	ENSSSAG00000092409	NFATC2 (ENSSSAG00000048230)	ATP9A (ENSSSAG00000041025)	sall4 (ENSSSAG00000064827)	ZFP64 (ENSSSAG00000106168)	TSHZ2 (ENSSSAG00000064833) ##22	znf217 (ENSSSAG00000064838)	pfd4 (ENSSSAG00000064846)	ENSSSAG00000064860	cbln4 (ENSSSAG00000112241)	cd40 (ENSSSAG00000064880)	irx7 (ENSSSAG00000064883)	ENSSSAG00000064888	ENSSSAG00000108523	PLEKHG5 (ENSSSAG00000064902)	nol9 (ENSSSAG00000064949)	zbtb48 (ENSSSAG00000064982)	klhl21 (ENSSSAG00000064990)	ENSSSAG00000065007	olfml3a (ENSSSAG00000121822)	c1qtnf12 (ENSSSAG00000110692)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.h	ENSGT00940000162980.l	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.e	ENSGT00940000156650.i.f	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567.r	ENSGT00390000005294.a.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117.d	ENSGT00940000158250.d.b.d	ENSGT00940000159686.d	ENSGT00940000156230.p.j	ENSGT00940000159181.m	ENSGT00940000155384.a.f	ENSGT00940000156405.a	ENSGT00950000183051.a.b.e ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884.j	ENSGT00390000006696.nc	ENSGT00950000182932.C.b.a	ENSGT00940000159728.d	ENSGT00940000166581.d	ENSGT00940000165935.f	ENSGT00950000183003.a.b.f	ENSGT00510000046843.a.b.i	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981.i	ENSGT00940000158631.f	ENSGT00940000157665.a.g	ENSGT00940000158083.a.e	ENSGT00940000160300.o.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	7	ENSOMYG00000005772	gdi1 (ENSOMYG00000006577)	atp6ap1b (ENSOMYG00000007072)	ENSOMYG00000007224	ENSOMYG00000007322	ENSOMYG00000007372	camk1gb (ENSOMYG00000007392)	ENSOMYG00000068761	mical1 (ENSOMYG00000007425)	src (ENSOMYG00000008029)	kcng1 (ENSOMYG00000008367)	NFATC2 (ENSOMYG00000010118)	ENSOMYG00000071285	sall4 (ENSOMYG00000009155)	ZFP64 (ENSOMYG00000010180)	TSHZ2 (ENSOMYG00000010218) ##22	ENSOMYG00000062094	ENSOMYG00000010227	znf217 (ENSOMYG00000010248)	pfd4 (ENSOMYG00000010275)	ENSOMYG00000010285	cbln4 (ENSOMYG00000066304)	cd40 (ENSOMYG00000010299)	irx7 (ENSOMYG00000010312)	ENSOMYG00000010329	PLEKHG5 (ENSOMYG00000010469)	NOL9 (ENSOMYG00000010855)	ZBTB48 (ENSOMYG00000010865)	klhl21 (ENSOMYG00000010880)	ENSOMYG00000010892	olfml3a (ENSOMYG00000010913)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.h	ENSGT00940000162980.l	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.e	ENSGT00940000156650.i.f	ENSGT00390000001017	ENSGT00390000017567.r	ENSGT00390000005294.a.a	ENSGT00940000156872.c	ENSGT00940000159117.d	ENSGT00940000158250.d.b.d	ENSGT00940000159686.d	ENSGT00940000156230.p.j	ENSGT00940000159181.m	ENSGT00940000155384.a.f	ENSGT00940000156405.a	ENSGT00950000183051.a.b.e ##22	ENSGT00940000159884.j	ENSGT00390000006696.nc	ENSGT00950000182932.C.b.a	ENSGT00940000159728.d	ENSGT00940000166581.d	ENSGT00940000165935.f	ENSGT00950000183003.a.b.f	ENSGT00510000046843.a.b.i	ENSGT00940000153668.A	ENSGT00940000158981.i	ENSGT00940000158631.f	ENSGT00940000157665.a.g	ENSGT00940000158083.a.e	ENSGT00940000160300.o.b	ENSGT01010000222360.B.d
Chinook salmon	MODERN SPECIES	14	pfkfb1 (ENSOTSG00005042896)	ENSOTSG00005042950	gdi1 (ENSOTSG00005042953)	atp6ap1b (ENSOTSG00005043166)	ENSOTSG00005043167	taf8 (ENSOTSG00005043168)	ENSOTSG00005043169	camk1gb (ENSOTSG00005043170)	mical1 (ENSOTSG00005043171)	src (ENSOTSG00005043172)	kcng1 (ENSOTSG00005043637)	NFATC2 (ENSOTSG00005043638)	ATP9A (ENSOTSG00005043641)	sall4 (ENSOTSG00005043811)	ZFP64 (ENSOTSG00005043812)	TSHZ2 (ENSOTSG00005043813) ##22	ENSOTSG00005043814	znf217 (ENSOTSG00005043815)	PFDN4 (ENSOTSG00005043816)	ENSOTSG00005043817	cbln4 (ENSOTSG00005043818)	cd40 (ENSOTSG00005002574)	irx7 (ENSOTSG00005002583)	ENSOTSG00005002588	PLEKHG5 (ENSOTSG00005002596)	NOL9 (ENSOTSG00005002610)	ZBTB48 (ENSOTSG00005002614)	klhl21 (ENSOTSG00005002620)	SYT6 (ENSOTSG00005002665)	olfml3a (ENSOTSG00005002666)	c1qtnf12 (ENSOTSG00005002667)
Coho salmon	MODERN SPECIES	16	pfkfb1 (ENSOKIG00005014506)	ENSOKIG00005018763	gdi1 (ENSOKIG00005018822)	atp6ap1b (ENSOKIG00005019630)	ENSOKIG00005019716	taf8 (ENSOKIG00005019742)	ENSOKIG00005019835	camk1gb (ENSOKIG00005019841)	mical1 (ENSOKIG00005019870)	src (ENSOKIG00005019926)	kcng1 (ENSOKIG00005019988)	NFATC2 (ENSOKIG00005019999)	ATP9A (ENSOKIG00005020122)	sall4 (ENSOKIG00005020664)	ZFP64 (ENSOKIG00005020668)	TSHZ2 (ENSOKIG00005020673) ##22	ENSOKIG00005020678	znf217 (ENSOKIG00005020685)	PFDN4 (ENSOKIG00005020692)	ENSOKIG00005020701	cbln4 (ENSOKIG00005020727)	cd40 (ENSOKIG00005020753)	irx7 (ENSOKIG00005006110)	ENSOKIG00005006121	PLEKHG5 (ENSOKIG00005006220)	NOL9 (ENSOKIG00005006621)	ZBTB48 (ENSOKIG00005006657)	klhl21 (ENSOKIG00005006672)	SYT6 (ENSOKIG00005006701)	olfml3a (ENSOKIG00005006713)	c1qtnf12 (ENSOKIG00005006720)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	10									ENSGT00940000159117.c	ENSGT00940000158250.d.b.c	ENSGT00940000159686.c	ENSGT00940000156230.p.i	ENSGT00940000159181.n	ENSGT00940000155384.a.e	ENSGT00940000156405.b	ENSGT00950000183051.a.b.f ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884.i	ENSGT00390000006696.oc	ENSGT00950000182932.C.b.b	ENSGT00940000159728.c	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581.c	ENSGT00940000165935.e	ENSGT00950000183003.a.b.e.a.a	ENSGT00950000183003.a.b.e.b	ENSGT00510000046843.a.b.j	ENSGT00940000158981.j	ENSGT00940000158631.e	ENSGT00940000157665.a.h	ENSGT00940000158083.a.f
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160207.b.f	ENSGT00940000155094.b.a	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.g	ENSGT00940000162980.k	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.f	ENSGT00940000156650.i.e	ENSGT00390000017567.q	ENSGT00390000005294.a.b	ENSGT00940000159117.c	ENSGT00940000158250.d.b.c	ENSGT00940000159686.c	ENSGT00940000156230.p.i	ENSGT00940000159181.n	ENSGT00940000155384.a.e	ENSGT00940000156405.b	ENSGT00950000183051.a.b.f ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884.i	ENSGT00390000006696.oc	ENSGT00950000182932.C.b.b	ENSGT00940000159728.c	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581.c	ENSGT00940000165935.e	ENSGT00950000183003.a.b.e.a.a	ENSGT00950000183003.a.b.e.b	ENSGT00510000046843.a.b.j	ENSGT00940000158981.j	ENSGT00940000158631.e	ENSGT00940000157665.a.h	ENSGT00940000158083.a.f
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000155094.b.a	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.g	ENSGT00940000162980.k	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.f	ENSGT00940000156650.i.e	ENSGT00390000017567.q	ENSGT00940000175220	ENSGT00390000005294.a.b	ENSGT00940000159117.c	ENSGT00940000158250.d.b.c	ENSGT00940000159686.c	ENSGT00940000156230.p.i	ENSGT00940000159181.n	ENSGT00940000155384.a.e	ENSGT00940000156405.b	ENSGT00950000183051.a.b.f ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884.i	ENSGT00390000006696.oc	ENSGT00950000182932.C.b.b	ENSGT00940000159728.c	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581.c	ENSGT00940000165935.e	ENSGT00950000183003.a.b.e.a.a	ENSGT00510000046843.a.b.j	ENSGT00940000158981.j	ENSGT00940000158631.e	ENSGT00940000157665.a.h	ENSGT00940000160300.o.a	ENSGT01010000222360.B.c
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River trout	MODERN SPECIES	20	ENSSTUG00000027082	pfkfb1 (ENSSTUG00000027155)	ENSSTUG00000030094	gdi1 (ENSSTUG00000030174)	atp6ap1b (ENSSTUG00000030523)	taf8 (ENSSTUG00000030550)	ENSSTUG00000030612	mical1 (ENSSTUG00000030631)	src (ENSSTUG00000030688)	kcng1 (ENSSTUG00000030801)	ENSSTUG00000030809	NFATC2 (ENSSTUG00000030819)	ATP9A (ENSSTUG00000030869)	sall4 (ENSSTUG00000031841)	ZFP64 (ENSSTUG00000031851)	TSHZ2 (ENSSTUG00000031863) ##22	ENSSTUG00000031865	znf217 (ENSSTUG00000031869)	PFDN4 (ENSSTUG00000031885)	ENSSTUG00000031896	cbln4 (ENSSTUG00000031914)	ENSSTUG00000031952	cd40 (ENSSTUG00000031966)	irx7 (ENSSTUG00000032005)	ENSSTUG00000032012	PLEKHG5 (ENSSTUG00000032043)	ZBTB48 (ENSSTUG00000032078)	klhl21 (ENSSTUG00000032097)	SYT6 (ENSSTUG00000032141)	c1qtnf12 (ENSSTUG00000032165)	sdf4 (ENSSTUG00000032231)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000183113.a.b.e	ENSGT00940000160207.b.f	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.g	ENSGT00940000162980.k	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.f.b	ENSGT00940000156650.i.e	ENSGT00390000017567.q	ENSGT00390000005294.a.b	ENSGT00940000159117.c	ENSGT00940000158250.d.b.c	ENSGT00940000159686.c	ENSGT00940000156230.p.i	ENSGT00940000159181.n	ENSGT00940000155384.a.e	ENSGT00940000156405.b	ENSGT00950000183051.a.b.f ##22	ENSGT00940000159884.i	ENSGT00390000006696.oc	ENSGT00950000182932.C.b.b	ENSGT00940000159728.c	ENSGT00940000166581.c	ENSGT00940000165935.e	ENSGT00950000183003.a.b.e.b	ENSGT00510000046843.a.b.j	ENSGT00940000158981.j	ENSGT00940000158631.e	ENSGT00940000157665.a.h	ENSGT00940000158083.a.f	ENSGT00940000160300.o.a	ENSGT01010000222360.B.c	ENSGT00940000155356.c.a.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183113.a.b.e	ENSGT00940000160207.b.f	ENSGT00950000182835.c.c.g.b.g	ENSGT00940000162980.k	ENSGT00950000182994.B.a.a.a.f.b	ENSGT00940000156650.i.e	ENSGT00390000017567.q	ENSGT00390000005294.a.b	ENSGT00940000159117.c	ENSGT00940000158250.d.b.c	ENSGT00940000159686.c	ENSGT00940000156230.p.i	ENSGT00940000159181.n	ENSGT00940000155384.a.e	ENSGT00940000156405.b	ENSGT00950000183051.a.b.f ##22	ENSGT00940000177198	ENSGT00940000159884.i	ENSGT00390000006696.oc	ENSGT00950000182932.C.b.b	ENSGT00940000159728.c	ENSGT00940000165811	ENSGT00940000166581.c	ENSGT00940000165935.e	ENSGT00950000183003.a.b.e.b	ENSGT00510000046843.a.b.j	ENSGT00940000158981.j	ENSGT00940000158631.e	ENSGT00940000157665.a.h	ENSGT00940000158083.a.f	ENSGT00940000160300.o.a
Coho salmon	MODERN SPECIES	8	ccn5 (ENSOKIG00005040624)	pfkfb1 (ENSOKIG00005038187)	ENSOKIG00005038005	gdi1 (ENSOKIG00005037902)	atp6ap1b (ENSOKIG00005037834)	TAF8 (ENSOKIG00005037731)	ENSOKIG00005037695	mical1 (ENSOKIG00005037459)	src (ENSOKIG00005037346)	kcng1 (ENSOKIG00005037323)	NFATC2 (ENSOKIG00005037284)	ENSOKIG00005037272	ATP9A (ENSOKIG00005033933)	sall4 (ENSOKIG00005033740)	ZFP64 (ENSOKIG00005033734)	TSHZ2 (ENSOKIG00005033723) ##22	ENSOKIG00005033709	znf217 (ENSOKIG00005033695)	PFDN4 (ENSOKIG00005033678)	cbln4 (ENSOKIG00005033629)	cd40 (ENSOKIG00005033607)	irx7 (ENSOKIG00005033597)	ENSOKIG00005033578	ENSOKIG00005033561	PLEKHG5 (ENSOKIG00005033443)	ZBTB48 (ENSOKIG00005033417)	klhl21 (ENSOKIG00005033406)	SYT6 (ENSOKIG00005033403)	c1qtnf12 (ENSOKIG00005033351)	sdf4 (ENSOKIG00005033319)	HIPK1 (ENSOKIG00005033247)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	7	ada (ENSOTSG00005027934)	ccn5 (ENSOTSG00005027933)	pfkfb1 (ENSOTSG00005024375)	ENSOTSG00005023923	gdi1 (ENSOTSG00005023907)	atp6ap1b (ENSOTSG00005023905)	taf8 (ENSOTSG00005023900)	ENSOTSG00005023899	mical1 (ENSOTSG00005023898)	src (ENSOTSG00005023611)	kcng1 (ENSOTSG00005023609)	NFATC2 (ENSOTSG00005023607)	ATP9A (ENSOTSG00005020737)	sall4 (ENSOTSG00005020732)	ZFP64 (ENSOTSG00005020731)	TSHZ2 (ENSOTSG00005020730) ##22	ENSOTSG00005020729	znf217 (ENSOTSG00005020728)	PFDN4 (ENSOTSG00005020727)	ENSOTSG00005020726	cbln4 (ENSOTSG00005020725)	ENSOTSG00005020723	irx7 (ENSOTSG00005020722)	cd40 (ENSOTSG00005020721)	ENSOTSG00005020720	ENSOTSG00005020719	PLEKHG5 (ENSOTSG00005020718)	ZBTB48 (ENSOTSG00005020717)	klhl21 (ENSOTSG00005020716)	SYT6 (ENSOTSG00005020715)	olfml3a (ENSOTSG00005020714)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	30	pkig (ENSOMYG00000021213)	ada (ENSOMYG00000020364)	ccn5 (ENSOMYG00000020258)	pfkfb1 (ENSOMYG00000018079)	ENSOMYG00000018012	gdi1 (ENSOMYG00000017941)	atp6ap1b (ENSOMYG00000017869)	ENSOMYG00000017811	ENSOMYG00000017804	mical1 (ENSOMYG00000017697)	src (ENSOMYG00000017587)	kcng1 (ENSOMYG00000017564)	NFATC2 (ENSOMYG00000017528)	ATP9A (ENSOMYG00000009947)	ZFP64 (ENSOMYG00000008203)	TSHZ2 (ENSOMYG00000008175) ##22	znf217 (ENSOMYG00000008129)	PFDN4 (ENSOMYG00000062261)	ENSOMYG00000008045	cbln4 (ENSOMYG00000007996)	ENSOMYG00000007968	cd40 (ENSOMYG00000007878)	irx7 (ENSOMYG00000007853)	ENSOMYG00000007833	PLEKHG5 (ENSOMYG00000007779)	ZBTB48 (ENSOMYG00000007547)	klhl21 (ENSOMYG00000007497)	ENSOMYG00000007445	c1qtnf12 (ENSOMYG00000007363)	sdf4 (ENSOMYG00000007225)	ENSOMYG00000006963
Huchen	MODERN SPECIES	38																TSHZ2 (ENSHHUG00000023814) ##22	znf217 (ENSHHUG00000023803)	PFDN4 (ENSHHUG00000023788)	ENSHHUG00000023777	cbln4 (ENSHHUG00000023688)	ENSHHUG00000023658	cd40 (ENSHHUG00000023640)	irx7 (ENSHHUG00000023636)	ENSHHUG00000023630	ENSHHUG00000023622	PLEKHG5 (ENSHHUG00000023548)	ENSHHUG00000023535	ENSHHUG00000023532	chrm2a (ENSHHUG00000023531)	ENSHHUG00000023529	ptn (ENSHHUG00000023511)
Northern pike	MODERN SPECIES	11	pfkfb1 (ENSELUG00000006386)	ITIH6 (ENSELUG00000006309)	gdi1 (ENSELUG00000006250)	atp6ap1b (ENSELUG00000006198)	ENSELUG00000006182	taf8 (ENSELUG00000006170)	ENSELUG00000006139	camk1gb (ENSELUG00000006115)	mical1 (ENSELUG00000006057)	src (ENSELUG00000000185)	kcng1 (ENSELUG00000005868)	NFATC2 (ENSELUG00000005843)	ATP9A (ENSELUG00000005760)	sall4 (ENSELUG00000005696)	ZFP64 (ENSELUG00000005665)	TSHZ2 (ENSELUG00000005624) ##22	ENSELUG00000005606	znf217 (ENSELUG00000005599)	pfdn4 (ENSELUG00000029441)	ENSELUG00000005540	cbln4 (ENSELUG00000005527)	ENSELUG00000005847	ENSELUG00000005512	cd40 (ENSELUG00000005484)	irx7 (ENSELUG00000005436)	ENSELUG00000005417	ENSELUG00000005382	NOL9 (ENSELUG00000005350)	ENSELUG00000005317	klhl21 (ENSELUG00000005286)	SYT6 (ENSELUG00000005251)
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Reedfish	MODERN SPECIES	1	ENSECRG00000010605	ENSECRG00000010619	ENSECRG00000010641	ENSECRG00000010688	sod1 (ENSECRG00000010691)	pard6b (ENSECRG00000010695)	adnpa (ENSECRG00000010704)	dpm1 (ENSECRG00000010712)	snrpb (ENSECRG00000010721)	cse1l (ENSECRG00000010735)	ENSECRG00000010747	NFATC2 (ENSECRG00000010756)	ATP9A (ENSECRG00000010860)	sall4 (ENSECRG00000011225)	ZFP64 (ENSECRG00000011229)	TSHZ2 (ENSECRG00000011236) ##22	ENSECRG00000011240	znf217 (ENSECRG00000011268)	BCAS1 (ENSECRG00000011313)	cyp24a1 (ENSECRG00000011371)	PFDN4 (ENSECRG00000011384)	DOK5 (ENSECRG00000011406)	cbln4 (ENSECRG00000011420)	ENSECRG00000011432	mc3r (ENSECRG00000011450)	slc2a10 (ENSECRG00000011462)	tp53rk (ENSECRG00000011470)	slc13a3 (ENSECRG00000011484)	ENSECRG00000011500	ENSECRG00000011510	ENSECRG00000011521
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