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Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	17	FLNC (ENSSVLG00005006076) #7	CCDC136 (ENSSVLG00005006165) #8	OPN1SW (ENSSVLG00005006222) #9	ENSSVLG00005006280 #10	GARIN1B (ENSSVLG00005006383) #11	GARIN1A (ENSSVLG00005006434) #12	HILPDA (ENSSVLG00005006462) #13	ENSSVLG00005006479 #14	IMPDH1 (ENSSVLG00005006574) #15	PRRT4 (ENSSVLG00005006756) #16	RBM28 (ENSSVLG00005006856) #17	LEP (ENSSVLG00005006935) #18	SND1 (ENSSVLG00005006972) #19	LRRC4 (ENSSVLG00005007018) #20	ENSSVLG00005007031 #21	PAX4 (ENSSVLG00005007068) #22	FSCN3 (ENSSVLG00005007223) #23	ARF5 (ENSSVLG00005007263) #24	GCC1 (ENSSVLG00005007286) #25	ZNF800 (ENSSVLG00005007309) #26	GRM8 (ENSSVLG00005007347) #27	TEAD2 (ENSSVLG00005007471) #28	POT1 (ENSSVLG00005007551) #29	GPR37 (ENSSVLG00005007725) #30	ENSSVLG00005007773 #31	TMEM229A (ENSSVLG00005007852) #32	SPAM1 (ENSSVLG00005007942) #33	HYAL4 (ENSSVLG00005008218) #34	ENSSVLG00005008265 #35	WASL (ENSSVLG00005008370) #36	LMOD2 (ENSSVLG00005008381) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00390000013208	ENSGT00940000153588.a.b #7	ENSGT00940000159122 #8	ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b #9	ENSGT01010000222360.E.c #10	ENSGT00940000161477 #11	ENSGT00940000162027 #12	ENSGT00390000014201 #13	ENSGT00940000154156.d #15	ENSGT00730000111591 #16	ENSGT00550000074976 #17	ENSGT00390000011772 #18	ENSGT00940000159260 #20	ENSGT00510000047270 #19	ENSGT00940000153314.a.a	ENSGT00940000161709 #22	ENSGT00950000183157.b #23	ENSGT00940000156878 #24	ENSGT00940000153772.A #25	ENSGT00390000008140 #26	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b #27	ENSGT00390000018285 #29	ENSGT01100000263518.B.b.b #30	ENSGT00390000010899.a.b.b.b #32	ENSGT01020000230364.a.a.b.a #33	ENSGT01020000230364.a.a.b.b #34	ENSGT01020000230364.a.b #35	ENSGT00730000110895.b.a #36	ENSGT00940000156567 #37	ENSGT00940000157073	ENSGT00390000008099
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00390000013208	ENSGT00940000153588.a.b #7	ENSGT00940000159122 #8	ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b #9	ENSGT01010000222360.E.c #10	ENSGT00940000161477 #11	ENSGT00940000162027 #12	ENSGT00390000014201 #13	ENSGT00940000154156.d #15	ENSGT00730000111591 #16	ENSGT00550000074976 #17	ENSGT00390000011772 #18	ENSGT00940000159260 #20	ENSGT00510000047270 #19	ENSGT00940000153314.a.a	ENSGT00940000161709 #22	ENSGT00950000183157.b #23	ENSGT00940000156878 #24	ENSGT00940000153772.A #25	ENSGT00390000008140 #26	ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b #27
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	501	ATP6V1F (ENSUPAG00010002394)	FLNC (ENSUPAG00010002251) #7	CCDC136 (ENSUPAG00010002072) #8	OPN1SW (ENSUPAG00010002051) #9	CALU (ENSUPAG00010002015) #10	GARIN1B (ENSUPAG00010001974) #11	GARIN1A (ENSUPAG00010001961) #12	HILPDA (ENSUPAG00010001958) #13	IMPDH1 (ENSUPAG00010001856) #15	PRRT4 (ENSUPAG00010001841) #16	RBM28 (ENSUPAG00010001783) #17	LEP (ENSUPAG00010001772) #18	LRRC4 (ENSUPAG00010001766) #20	SND1 (ENSUPAG00010001727) #19	ENSUPAG00010001679	PAX4 (ENSUPAG00010001638) #22	FSCN3 (ENSUPAG00010001614) #23	ARF5 (ENSUPAG00010001595) #24	GCC1 (ENSUPAG00010001589) #25	ENSUPAG00010001572
Squirrel	MODERN SPECIES	79	ATP6V1FNB (ENSSTOG00000024361)	ATP6V1F (ENSSTOG00000014368)	FLNC (ENSSTOG00000014349) #7	ENSSTOG00000014335 #8	OPN1SW (ENSSTOG00000026017) #9	CALU (ENSSTOG00000022028) #10	GARIN1B (ENSSTOG00000026261) #11	GARIN1A (ENSSTOG00000008506) #12	HILPDA (ENSSTOG00000029766) #13	IMPDH1 (ENSSTOG00000002177) #15	PRRT4 (ENSSTOG00000023582) #16	RBM28 (ENSSTOG00000002169) #17	LEP (ENSSTOG00000027970) #18	LRRC4 (ENSSTOG00000021081) #20	SND1 (ENSSTOG00000002140) #19	PAX4 (ENSSTOG00000002127) #22	FSCN3 (ENSSTOG00000002115) #23	ARF5 (ENSSTOG00000002104) #24	GCC1 (ENSSTOG00000002099) #25	ZNF800 (ENSSTOG00000023294) #26	GRM8 (ENSSTOG00000006490) #27	AGTR2 (ENSSTOG00000012524)	ENSSTOG00000007147	ENSSTOG00000029519	KLHL13 (ENSSTOG00000012035)	WDR44 (ENSSTOG00000007251)	DOCK11 (ENSSTOG00000007295)	IL13RA1 (ENSSTOG00000024422)	ENSSTOG00000022238	LONRF3 (ENSSTOG00000015024)	PGRMC1 (ENSSTOG00000024047)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	22	FLNC (ENSMMMG00000016242) #7	CCDC136 (ENSMMMG00000015944) #8	OPN1SW (ENSMMMG00000015924) #9	CALU (ENSMMMG00000015910) #10	GARIN1B (ENSMMMG00000015890) #11	GARIN1A (ENSMMMG00000015879) #12	HILPDA (ENSMMMG00000015877) #13	IMPDH1 (ENSMMMG00000015789) #15	PRRT4 (ENSMMMG00000015777) #16	RBM28 (ENSMMMG00000015736) #17	LEP (ENSMMMG00000015724) #18	ENSMMMG00000015714	LRRC4 (ENSMMMG00000015704) #20	SND1 (ENSMMMG00000015627) #19	ENSMMMG00000015616	PAX4 (ENSMMMG00000015595) #22	FSCN3 (ENSMMMG00000015585) #23	ARF5 (ENSMMMG00000015574) #24	GCC1 (ENSMMMG00000015571) #25	ZNF800 (ENSMMMG00000015549) #26	GRM8 (ENSMMMG00000015527) #27	POT1 (ENSMMMG00000015400) #29	GPR37 (ENSMMMG00000015396) #30	SPAM1 (ENSMMMG00000015253) #33	HYAL4 (ENSMMMG00000015235) #34	ENSMMMG00000015187 #35	WASL (ENSMMMG00000015176) #36	LMOD2 (ENSMMMG00000015170) #37	ASB15 (ENSMMMG00000015148)	NDUFA5 (ENSMMMG00000015124)	IQUB (ENSMMMG00000015110)