Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003224.B ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b #7 ENSGT00940000159122 #8 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b #9 ENSGT01010000222360.E.c #10 ENSGT00940000161477 #11 ENSGT00940000162027 #12 ENSGT00390000014201 #13 ENSGT00940000154156.d #14 ENSGT00730000111591 #15 ENSGT00550000074976 #16 ENSGT00390000011772 #17 ENSGT00940000159260 #19 ENSGT00510000047270 #20 ENSGT00940000161709 #22 ENSGT00950000183157.b #23 ENSGT00940000156878 #24 ENSGT00940000153772.A #25 ENSGT00390000008140 #26 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b #27 ENSGT00390000018285 #28 ENSGT01100000263518.B.b.b #29 ENSGT00390000010899.a.b.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a #30 ENSGT01020000230364.a.a.b.b #31 ENSGT01020000230364.a.b #32 ENSGT00730000110895.b.a #33 ENSGT00940000156567 #34 ENSGT00940000157073 #35 ENSGT00390000008099 #36 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000153588.a.b #7 ENSGT00940000159122 #8 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b #9 ENSGT01010000222360.E.c #10 ENSGT00940000161477 #11 ENSGT00940000162027 #12 ENSGT00390000014201 #13 ENSGT00940000154156.d #14 ENSGT00730000111591 #15 ENSGT00550000074976 #16 ENSGT00390000011772 #17 ENSGT00940000159260 #19 ENSGT00510000047270 #20 ENSGT00940000153314.a.a #21 ENSGT00940000161709 #22 ENSGT00950000183157.b #23 ENSGT00940000156878 #24 ENSGT00940000153772.A #25 ENSGT00390000008140 #26 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b #27 ENSGT00390000018285 #28 ENSGT01100000263518.B.b.b #29 ENSGT00390000010899.a.b.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a #30 ENSGT01020000230364.a.a.b.b #31 ENSGT01020000230364.a.b #32 ENSGT00730000110895.b.a #33 ENSGT00940000156567 #34 ENSGT00940000157073 #35 ENSGT00390000008099 #36 Alpin marmot MODERN SPECIES 22 FLNC (ENSMMMG00000016242) #7 CCDC136 (ENSMMMG00000015944) #8 OPN1SW (ENSMMMG00000015924) #9 CALU (ENSMMMG00000015910) #10 GARIN1B (ENSMMMG00000015890) #11 GARIN1A (ENSMMMG00000015879) #12 HILPDA (ENSMMMG00000015877) #13 IMPDH1 (ENSMMMG00000015789) #14 PRRT4 (ENSMMMG00000015777) #15 RBM28 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#19 ENSGT00510000047270 #20 ENSGT00940000153314.a.a #21 ENSGT00940000161709 #22 ENSGT00950000183157.b #23 ENSGT00940000156878 #24 ENSGT00940000153772.A #25 ENSGT00390000008140 #26 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b #27 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 501 ATP6V1F (ENSUPAG00010002394) FLNC (ENSUPAG00010002251) #7 CCDC136 (ENSUPAG00010002072) #8 OPN1SW (ENSUPAG00010002051) #9 CALU (ENSUPAG00010002015) #10 GARIN1B (ENSUPAG00010001974) #11 GARIN1A (ENSUPAG00010001961) #12 HILPDA (ENSUPAG00010001958) #13 IMPDH1 (ENSUPAG00010001856) #14 PRRT4 (ENSUPAG00010001841) #15 RBM28 (ENSUPAG00010001783) #16 LEP (ENSUPAG00010001772) #17 LRRC4 (ENSUPAG00010001766) #19 SND1 (ENSUPAG00010001727) #20 ENSUPAG00010001679 #21 PAX4 (ENSUPAG00010001638) #22 FSCN3 (ENSUPAG00010001614) #23 ARF5 (ENSUPAG00010001595) #24 GCC1 (ENSUPAG00010001589) #25 ENSUPAG00010001572 Squirrel MODERN SPECIES 79 ATP6V1FNB (ENSSTOG00000024361) ATP6V1F (ENSSTOG00000014368) FLNC (ENSSTOG00000014349) #7 ENSSTOG00000014335 #8 OPN1SW 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