Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000067342 #9	ENSGT00940000157775 #10	ENSGT00940000160908 #11	ENSGT00990000203786 #12	ENSGT00940000165364.a.a #13	ENSGT00940000165134.a.b #14	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #15	ENSGT00390000008714.b #16	ENSGT00940000160115.a.a #17	ENSGT00940000157292.fc.b #18	ENSGT00940000159960.d #19	ENSGT00940000162624 #20	ENSGT00940000177554	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.b #25	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.f #26	ENSGT01100000263479.H.c.a.b ##26	ENSGT01100000263479.G ##26	ENSGT00950000183199.a.b	ENSGT00940000177028	ENSGT00940000163576	ENSGT00940000161202	ENSGT01050000244848.B.b	ENSGT01050000244848.B.a.b.e	ENSGT01050000244848.B.a.b.f	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a.h	ENSGT00940000160262
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000011918 #8	ENSGT00530000067342 #9	ENSGT00940000157775 #10	ENSGT00940000160908 #11	ENSGT00990000203786 #12	ENSGT00940000165364.a.a #13	ENSGT00940000165134.a.b #14	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #15	ENSGT00390000008714.b #16	ENSGT00940000160115.a.a #17	ENSGT00940000157292.fc.b #18	ENSGT00940000159960.d #19	ENSGT00940000162624 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.b #25	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.f #26	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a ##26	ENSGT01100000263479.H.c.a.b ##26	ENSGT01100000263479.G ##26	ENSGT00950000183199.a.b	ENSGT00940000177028	ENSGT00940000163576	ENSGT00940000161202	ENSGT01050000244848.B.b	ENSGT01050000244848.B.a.b.e	ENSGT01050000244848.B.a.b.f	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a.h
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000011918 #8	ENSGT00530000067342 #9	ENSGT00940000157775 #10	ENSGT00940000160908 #11	ENSGT00990000203786 #12	ENSGT00940000165364.a.a #13	ENSGT00940000165134.a.b #14	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #15	ENSGT00390000008714.b #16	ENSGT00940000160115.a.a #17	ENSGT00940000157292.fc.b #18	ENSGT00940000159960.d #19	ENSGT00940000162624 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.b #25	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.f #26	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a ##26	ENSGT01100000263479.H.c.a.b ##26	ENSGT01100000263479.G ##26	ENSGT00950000183199.a.b	ENSGT00940000177028	ENSGT00940000163576	ENSGT00940000161202	ENSGT01050000244848.B.b	ENSGT01050000244848.B.a.b.e	ENSGT01050000244848.B.a.b.f	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a.h
Pike perch	MODERN SPECIES	15	ENSSLUG00000024106 #7	ino80e (ENSSLUG00000024114) #8	ENSSLUG00000024121 #9	vars1 (ENSSLUG00000024188) #10	abhd16a (ENSSLUG00000024689) #11	ENSSLUG00000024732 #12	ENSSLUG00000024738 #13	ENSSLUG00000024859 #14	rabac1 (ENSSLUG00000025342) #15	dedd1 (ENSSLUG00000025343) #16	POU2F2 (ENSSLUG00000025348) #17	ERF (ENSSLUG00000025350) #18	ENSSLUG00000025358 #19	ENSSLUG00000025374 #20	gsk3ab (ENSSLUG00000025383) #21	znf574 (ENSSLUG00000025393) #22	GRIK5 (ENSSLUG00000025400) #23	ENSSLUG00000025407 #24	ENSSLUG00000025414 #25	ENSSLUG00000025420 #26
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	7	ino80e (ENSCGOG00000004917) #8	ENSCGOG00000004924 #9	vars1 (ENSCGOG00000004968) #10	abhd16a (ENSCGOG00000006827) #11	ENSCGOG00000006919 #12	ENSCGOG00000006922 #13	ENSCGOG00000006937 #14	ENSCGOG00000007631	rabac1 (ENSCGOG00000007632) #15	dedd1 (ENSCGOG00000007634) #16	POU2F2 (ENSCGOG00000007638) #17	ENSCGOG00000007650 ##18	ENSCGOG00000007663 #19	ENSCGOG00000007734 #20	gsk3ab (ENSCGOG00000007758) #21	znf574 (ENSCGOG00000008739) #22	grik5 (ENSCGOG00000008765) #23	ENSCGOG00000009619 #24	ENSCGOG00000009622 #24	ENSCGOG00000009627 #26	ENSCGOG00000009658 #26	ENSCGOG00000009665 ##26	ENSCGOG00000009669 ##26	pafah1b3 (ENSCGOG00000009682)	ENSCGOG00000009701	tlr21 (ENSCGOG00000009705)	cnfn (ENSCGOG00000009707)	cxcr3.2 (ENSCGOG00000009727)	cxcr3.3 (ENSCGOG00000009732)	CXCR3 (ENSCGOG00000009741)	trim35-28 (ENSCGOG00000009747)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000011918 #8	ENSGT00530000067342 #9	ENSGT00940000157775 #10	ENSGT00940000160908 #11	ENSGT00990000203786 #12	ENSGT00940000165364.a.a #13	ENSGT00940000165134.a.b #14	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #15	ENSGT00390000008714.b #16	ENSGT00940000160115.a.a #17	ENSGT00940000157292.fc.b #18	ENSGT00940000159960.d #19	ENSGT00940000162624 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01100000263479.H.c.b #25	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.f #26	ENSGT01100000263479.H.c.a.b ##26	ENSGT01100000263479.G ##26	ENSGT00950000183199.a.b	ENSGT00940000163576	ENSGT00940000161202	ENSGT01050000244848.B.b	ENSGT01050000244848.B.a.b.e	ENSGT01050000244848.B.a.b.f	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a.h	ENSGT00940000160262	ENSGT00940000162179.e.a.b	ENSGT00940000164807.G.a.a.b
Stickleback	MODERN SPECIES	19	ino80e (ENSGACG00000009624) #8	ENSGACG00000009618 #9	vars1 (ENSGACG00000009601) #10	abhd16a (ENSGACG00000009564) #11	ENSGACG00000009560 #13	ENSGACG00000009524 #14	ENSGACG00000009520	rabac1 (ENSGACG00000009485) #15	dedd1 (ENSGACG00000009481) #16	ENSGACG00000009471 #17	ERF (ENSGACG00000009467) #18	ENSGACG00000009452 #19	ENSGACG00000009451	ZNF526 (ENSGACG00000009449) #20	gsk3ab (ENSGACG00000009447) #21	znf574 (ENSGACG00000009439) #22	GRIK5 (ENSGACG00000009427) #23	ENSGACG00000009425	ENSGACG00000009423	ENSGACG00000009412 ##26	ENSGACG00000009407	pafah1b3 (ENSGACG00000009368)	tlr21 (ENSGACG00000009364)	cnfn (ENSGACG00000009361)	rundc3b (ENSGACG00000009330)	abcb4 (ENSGACG00000009299)	crot (ENSGACG00000009281)	crot (ENSGACG00000009260)	rpp38 (ENSGACG00000009258)	nmt2 (ENSGACG00000009238)	FAM171A1 (ENSGACG00000009230)
Lumpfish	MODERN SPECIES	7	ino80e (ENSCLMG00005006649) #8	ENSCLMG00005006652 #9	vars1 (ENSCLMG00005006666) #10	abhd16a (ENSCLMG00005007856) #11	ENSCLMG00005009232 #12	ENSCLMG00005009233 #13	ENSCLMG00005009247 #14	ENSCLMG00005013870	rabac1 (ENSCLMG00005013871) #15	dedd1 (ENSCLMG00005013872) #16	POU2F2 (ENSCLMG00005013873) #17	ENSCLMG00005013881 #18	ENSCLMG00005013884 #19	ZNF526 (ENSCLMG00005013913) #20	gsk3ab (ENSCLMG00005013919) #21	znf574 (ENSCLMG00005014158) #22	GRIK5 (ENSCLMG00005014159) #23	ENSCLMG00005014160 #25	ENSCLMG00005014161 #26	ENSCLMG00005014164	ENSCLMG00005014167 #26	ENSCLMG00005014169 ##26	ENSCLMG00005014171 ##26	pafah1b3 (ENSCLMG00005014175)	tlr21 (ENSCLMG00005014176)	cnfn (ENSCLMG00005014177)	cxcr3.2 (ENSCLMG00005014178)	cxcr3.3 (ENSCLMG00005014180)	CXCR3 (ENSCLMG00005014181)	trim35-28 (ENSCLMG00005014182)	ENSCLMG00005014188
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000067342 #9	ENSGT00940000157775 #10	ENSGT00940000160908 #11	ENSGT00990000203786 #12	ENSGT00940000165364.a.a #13	ENSGT00940000165134.a.b #14	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #15	ENSGT00390000008714.b #16	ENSGT00940000160115.a.a #17	ENSGT00940000157292.fc.b #18	ENSGT00940000159960.d #19	ENSGT00940000162624 #20	ENSGT00940000177554	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00990000213343	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a ##26	ENSGT01100000263479.G ##26	ENSGT00950000183199.a.b	ENSGT00940000177028	ENSGT00940000163576	ENSGT00940000161202	ENSGT01050000244848.B.b	ENSGT01050000244848.B.a.b.e	ENSGT01050000244848.B.a.b.f	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a.h	ENSGT00940000160262	ENSGT00940000162179.e.a.b
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	8	ENSSAUG00010025282 #9	vars1 (ENSSAUG00010025296) #10	abhd16a (ENSSAUG00010025843) #11	ENSSAUG00010025852 #12	ENSSAUG00010025860 #13	ENSSAUG00010025989 #14	ENSSAUG00010027263	rabac1 (ENSSAUG00010027265) #15	dedd1 (ENSSAUG00010027268) #16	ENSSAUG00010014944	ERF (ENSSAUG00010014962) #18	ENSSAUG00010014967 #19	ENSSAUG00010014974 #20	ENSSAUG00010014977	gsk3ab (ENSSAUG00010014980) #21	znf574 (ENSSAUG00010015061) #22	ENSSAUG00010015064	GRIK5 (ENSSAUG00010015085) #23	ENSSAUG00010015129 #24	ENSSAUG00010015131 ##26	ENSSAUG00010015140 ##26	ENSSAUG00010015146 ##26	ENSSAUG00010015152 ##26	ENSSAUG00010015155 ##26	ENSSAUG00010015158 ##26	ENSSAUG00010015162 ##26	ENSSAUG00010015166 ##26	ENSSAUG00010015169 ##26	ENSSAUG00010015174 ##26	pafah1b3 (ENSSAUG00010015175)	tlr21 (ENSSAUG00010015180)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000067342 #9	ENSGT00940000157775 #10	ENSGT00940000160908 #11	ENSGT00990000203786 #12	ENSGT00940000165364.a.a #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00940000165134.a.b #14	ENSGT00390000010549 #15	ENSGT00390000008714.b #16	ENSGT00940000160115.a.a #17	ENSGT00940000157292.fc.b #18	ENSGT00940000159960.d #19	ENSGT00940000177554	ENSGT00940000162624 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00990000213343	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a ##26	ENSGT01100000263479.G ##26	ENSGT00950000183199.a.b	ENSGT00940000177028	ENSGT00940000163576	ENSGT00940000161202	ENSGT01050000244848.B.b	ENSGT01050000244848.B.a.b.e	ENSGT01050000244848.B.a.b.f	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a.h	ENSGT00940000160262	ENSGT00940000162179.e.a.b
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	488	vars1 (ENSLCRG00005017373) #10	abhd16a (ENSLCRG00005017356) #11	ENSLCRG00005017353	ENSLCRG00005017351 #12	ENSLCRG00005017349 #13	ENSLCRG00005017348	ENSLCRG00005009657 #14	rabac1 (ENSLCRG00005009597) #15	dedd1 (ENSLCRG00005009594) #16	ENSLCRG00005009574 #17	ERF (ENSLCRG00005009568) #18	ENSLCRG00005009529 #19	ENSLCRG00005009526	ENSLCRG00005009525 #20	gsk3ab (ENSLCRG00005009414) #21	znf574 (ENSLCRG00005009393) #22	GRIK5 (ENSLCRG00005008415) #23	ENSLCRG00005008365 #26	ENSLCRG00005008353	ENSLCRG00005008350	ENSLCRG00005008347	bsk146 (ENSLCRG00005008345)	ENSLCRG00005008344	ENSLCRG00005008189	dhrs7cb (ENSLCRG00005008185)	ENSLCRG00005008184	hs3st3l (ENSLCRG00005008183)	ENSLCRG00005008182	GLP2R (ENSLCRG00005008181)	PTS (ENSLCRG00005008180)	ENSLCRG00005008178
European seabass	MODERN SPECIES	6	ENSDLAG00005002885	ENSDLAG00005002808	ENSDLAG00005002717 #9	vars1 (ENSDLAG00005001978) #10	ENSDLAG00005001765 #12	ENSDLAG00005001703 #13	ENSDLAG00005001178 #14	rabac1 (ENSDLAG00005001150) #15	dedd1 (ENSDLAG00005001141) #16	ENSDLAG00005001094 #17	ENSDLAG00005001087 #18	ENSDLAG00005035075 #19	ENSDLAG00005001022	ENSDLAG00005001017 #20	gsk3ab (ENSDLAG00005000993) #21	znf574 (ENSDLAG00005000982) #22	ENSDLAG00005000978	ENSDLAG00005000902 #23	ENSDLAG00005034004 #24	ENSDLAG00005000848	ENSDLAG00005000831 ##26	ENSDLAG00005013446 ##26	pafah1b3 (ENSDLAG00005000824)	tlr21 (ENSDLAG00005000820)	cxcr3.2 (ENSDLAG00005027937)	cxcr3.3 (ENSDLAG00005033844)	ENSDLAG00005032808	ENSDLAG00005000756	ENSDLAG00005000794	ENSDLAG00005000744	arhgef1b (ENSDLAG00005000640)