Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157775 #9	ENSGT00940000160908 #10	ENSGT00990000203786 #11	ENSGT00940000165364.a.a #12	ENSGT00940000165134.a.b #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #14	ENSGT00390000008714.b #15	ENSGT00940000179553	ENSGT00940000160115.a.a #16	ENSGT00940000157292.fc.b #17	ENSGT00940000159960.d #18	ENSGT00940000162624 #19	ENSGT00940000177554 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.b ##30	ENSGT00940000177666	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.b.a.b #25	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.b.b ##30	ENSGT01100000263479.G #30	ENSGT00950000183199.a.b #31	ENSGT00940000177028 #32	ENSGT00940000163576 #33	ENSGT00940000161202 #34	ENSGT01050000244848.B.b #35	ENSGT01050000244848.B.a.b.e #36	ENSGT01050000244848.B.a.b.f #37	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157775 #9	ENSGT00940000160908 #10	ENSGT00990000203786 #11	ENSGT00940000165364.a.a #12	ENSGT00940000165134.a.b #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #14	ENSGT00390000008714.b #15	ENSGT00940000179553	ENSGT00940000160115.a.a #16	ENSGT00940000157292.fc.b #17	ENSGT00940000159960.d #18	ENSGT00940000162624 #19	ENSGT00940000177554 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.b ##30	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.a #28	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.b.a.a ##30	ENSGT01100000263479.G #30	ENSGT00950000183199.a.b #31	ENSGT00940000177028 #32	ENSGT00940000163576 #33	ENSGT00940000161202 #34	ENSGT01050000244848.B.b #35	ENSGT01050000244848.B.a.b.e #36	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.c.b #37	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.c.a ##37	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.d ##37
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000067342 #8	ENSGT00940000157775 #9	ENSGT00940000160908 #10	ENSGT00990000203786 #11	ENSGT00940000165364.a.a #12	ENSGT00940000165134.a.b #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #14	ENSGT00390000008714.b #15	ENSGT00940000160115.a.a #16	ENSGT00940000157292.fc.b #17	ENSGT00940000159960.d #18	ENSGT00940000162624 #19	ENSGT00940000177554 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01100000263479.H.c.b ##30	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.a #28	ENSGT01100000263479.H.c.a.b ##30	ENSGT00950000183199.a.b #31	ENSGT00940000177028 #32	ENSGT00940000163576 #33	ENSGT00940000161202 #34	ENSGT01050000244848.B.b #35	ENSGT01050000244848.B.a.b.e #36	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.c.b #37	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.c.a ##37	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.d ##37	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a	ENSGT00940000160262
Platyfish	MODERN SPECIES	17	ino80e (ENSXMAG00000010963) #7	ENSXMAG00000010961 #8	vars1 (ENSXMAG00000010927) #9	abhd16a (ENSXMAG00000028465) #10	ENSXMAG00000010892 #11	ENSXMAG00000022421 #12	ENSXMAG00000010837 #13	rabac1 (ENSXMAG00000010832) #14	dedd1 (ENSXMAG00000010827) #15	ENSXMAG00000010823 #16	ERF (ENSXMAG00000010816) #17	ENSXMAG00000028190 #18	ZNF526 (ENSXMAG00000010814) #19	ENSXMAG00000021247 #20	gsk3ab (ENSXMAG00000010809) #21	znf574 (ENSXMAG00000010807) #22	GRIK5 (ENSXMAG00000010792) #23	ENSXMAG00000027785 #24	ENSXMAG00000025791 #25	ENSXMAG00000029163 #26	ENSXMAG00000026547 #27	ENSXMAG00000010791 #28	ENSXMAG00000027323 #29	ENSXMAG00000010786 #30	pafah1b3 (ENSXMAG00000010774) #31	ENSXMAG00000028662 #32	tlr21 (ENSXMAG00000010772) #33	cnfn (ENSXMAG00000010770) #34	cxcr3.2 (ENSXMAG00000006858) #35	cxcr3.3 (ENSXMAG00000006856) #36	ENSXMAG00000029646 #37
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000067342 #8	ENSGT00940000157775 #9	ENSGT00940000160908 #10	ENSGT00990000203786 #11	ENSGT00940000165364.a.a #12	ENSGT00940000165134.a.b #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #14	ENSGT00390000008714.b #15	ENSGT00940000160115.a.a #16	ENSGT00940000157292.fc.b #17	ENSGT00940000159960.d #18	ENSGT00940000162624 #19	ENSGT00940000177554 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01100000263479.H.c.b ##30	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.a.b #28	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.b.a.a ##30	ENSGT01100000263479.G #30	ENSGT00950000183199.a.b #31	ENSGT00940000177028 #32	ENSGT00940000163576 #33	ENSGT00940000161202 #34	ENSGT01050000244848.B.b #35	ENSGT01050000244848.B.a.b.e #36	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.c.b #37	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.c.a ##37	ENSGT01050000244848.B.a.b.f.d ##37	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000157775 #9	ENSGT00940000160908 #10	ENSGT00990000203786 #11	ENSGT00940000165364.a.a.g #12	ENSGT00940000165364.a.a.h #12	ENSGT00940000165134.a.b #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #14	ENSGT00390000008714.b #15	ENSGT00940000160115.a.a #16	ENSGT00940000157292.fc.b #17	ENSGT00940000159960.d #18	ENSGT00940000162624 #19	ENSGT00940000177554 #20	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01100000263479.H.c.b ##30	ENSGT01100000263479.E ##30	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.b.b ##30
Sailfin molly	MODERN SPECIES	1261												ENSPLAG00000001789 #18	ENSPLAG00000001754 #19	ENSPLAG00000001746 #20	gsk3ab (ENSPLAG00000001739) #21	znf574 (ENSPLAG00000001720) #22	GRIK5 (ENSPLAG00000001700) #23
Amazon molly	MODERN SPECIES	286	ENSPFOG00000015682 #8	vars1 (ENSPFOG00000015690) #9	abhd16a (ENSPFOG00000015783) #10	ENSPFOG00000015828 #11	ENSPFOG00000015850 #12	ENSPFOG00000015870 #12	ENSPFOG00000015883 #13	ENSPFOG00000016054	rabac1 (ENSPFOG00000016055) #14	dedd1 (ENSPFOG00000016064) #15	ENSPFOG00000016074	ERF (ENSPFOG00000023850) #17	ENSPFOG00000016231 #18	ENSPFOG00000016258 #19	gsk3ab (ENSPFOG00000016170) #21	znf574 (ENSPFOG00000016263) #22	GRIK5 (ENSPFOG00000016273) #23	ENSPFOG00000023784 #25	ENSPFOG00000016358 ##30	ENSPFOG00000024838 #28	ENSPFOG00000016400 ##30
Guppy	MODERN SPECIES	446	ino80e (ENSPREG00000013188) #7	ENSPREG00000013220 #8	vars1 (ENSPREG00000013264) #9	abhd16a (ENSPREG00000013335) #10	ENSPREG00000013451 #11	ENSPREG00000013495 #12	ENSPREG00000013522 #13	ENSPREG00000013567	rabac1 (ENSPREG00000013578) #14	dedd1 (ENSPREG00000013603) #15	ENSPREG00000013636	ERF (ENSPREG00000013694) #17	ENSPREG00000013757 #18	ENSPREG00000013836 #19	gsk3ab (ENSPREG00000013855) #21	znf574 (ENSPREG00000013888) #22	GRIK5 (ENSPREG00000013939) #23	ENSPREG00000013968 ##30	ENSPREG00000013999 #28	ENSPREG00000014021 #25	ENSPREG00000014031 ##30	ENSPREG00000014059 #28	ENSPREG00000014093 ##30	ENSPREG00000014138 #30	pafah1b3 (ENSPREG00000014160) #31	cxcr3.3 (ENSPREG00000014182) #36	tlr21 (ENSPREG00000014195) #33	cnfn (ENSPREG00000014213) #34	cxcr3.2 (ENSPREG00000014218) #35	ENSPREG00000014225 #37	CXCR3 (ENSPREG00000014237) ##37
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000067342 #8	ENSGT00940000157775 #9	ENSGT00940000160908 #10	ENSGT00990000203786 #11	ENSGT00940000165364.a.a #12	ENSGT00940000165134.a.b #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #14	ENSGT00390000008714.b #15	ENSGT00940000179553	ENSGT00940000160115.a.a #16	ENSGT00940000157292.fc.b #17	ENSGT00940000159960.d #18	ENSGT00940000162624 #19	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.b ##30	ENSGT00940000177666	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.g.a ##30
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	1332												ENSCVAG00000015143 #17	ENSCVAG00000015136 #18	ENSCVAG00000015110 #19	gsk3ab (ENSCVAG00000015103) #21	znf574 (ENSCVAG00000015092) #22
Mummichog	MODERN SPECIES	2274	ENSFHEG00000010686 #8	vars1 (ENSFHEG00000010672) #9	abhd16a (ENSFHEG00000010472) #10	ENSFHEG00000010355 #11	ENSFHEG00000010332 #12	ENSFHEG00000010295 #13	ENSFHEG00000010158	rabac1 (ENSFHEG00000010151) #14	dedd1 (ENSFHEG00000010142) #15	ENSFHEG00000010128	ENSFHEG00000010115 #16	ENSFHEG00000010107 #17	ENSFHEG00000000225 #18	ZNF574 (ENSFHEG00000010085)	gsk3ab (ENSFHEG00000010034) #21	znf574 (ENSFHEG00000010018) #22	GRIK5 (ENSFHEG00000009991) #23	ENSFHEG00000009929 ##30
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000067342 #8	ENSGT00940000157775 #9	ENSGT00940000160908 #10	ENSGT00990000203786 #11	ENSGT00940000165364.a.a #12	ENSGT00940000165134.a.b #13	ENSGT00940000177056.a	ENSGT00390000010549 #14	ENSGT00390000008714.b #15	ENSGT00940000160115.a.a #16	ENSGT00970000196884.b	ENSGT00940000157292.fc.b #17	ENSGT00940000159960.d #18	ENSGT00940000162624 #19	ENSGT00520000055635.c.b.b #21	ENSGT00940000166708 #22	ENSGT00940000158852.e.a #23	ENSGT01030000234778 #24	ENSGT01100000263479.H.c.a.a.e.a.h.b.b ##30	ENSGT01100000263479.G #30	ENSGT00950000183199.a.b #31	ENSGT00940000177028 #32	ENSGT00940000163576 #33	ENSGT00940000161202 #34	ENSGT01050000244848.B.b #35	ENSGT01050000244848.B.a.b.e #36	ENSGT01050000244848.B.a.b.f #37	ENSGT01030000234583.a.a.c.a.a	ENSGT00940000160262	ENSGT01100000263491.a.b.a.a.a.a.b.r	ENSGT00940000157292.gc ##17
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	33	ino80e (ENSKMAG00000009417) #7	ENSKMAG00000009432 #8	vars1 (ENSKMAG00000009455) #9	abhd16a (ENSKMAG00000009561) #10	ENSKMAG00000009638 #11	ENSKMAG00000009679 #12	ENSKMAG00000009734 #13	rabac1 (ENSKMAG00000009847) #14	dedd1 (ENSKMAG00000009886) #15	ENSKMAG00000009941	ERF (ENSKMAG00000010028) #17	ENSKMAG00000010054 #18	ENSKMAG00000010116	ENSKMAG00000010133 #19	gsk3ab (ENSKMAG00000010150) #21	znf574 (ENSKMAG00000010186) #22	GRIK5 (ENSKMAG00000010219) #23	ENSKMAG00000010263 #24	ENSKMAG00000010305 ##30	ENSKMAG00000010394 ##30	ENSKMAG00000010465 #30	pafah1b3 (ENSKMAG00000010509) #31	ENSKMAG00000010537 #32	tlr21 (ENSKMAG00000010548) #33	cnfn (ENSKMAG00000010566) #34	cxcr3.2 (ENSKMAG00000010579) #35	ENSKMAG00000010590 #36	CXCR3 (ENSKMAG00000010605) #37	CXCR3 (ENSKMAG00000010623) #37	trim35-28 (ENSKMAG00000010647)	MEGF8 (ENSKMAG00000010690)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1614	ENSNFUG00015002310	INO80E (ENSNFUG00015002314) #7	ENSNFUG00015002318	VARS (ENSNFUG00015002349) #9	ENSNFUG00015002588 #11	PVRL2 (ENSNFUG00015002595) #12	ENSNFUG00015002612 #13	ENSNFUG00015002683	RABAC1 (ENSNFUG00015002686) #14	DEDD2 (ENSNFUG00015002697) #15	POU2F2 (ENSNFUG00015002703) #16	ENSNFUG00015002709	ENSNFUG00015002724 #18	ZNF526 (ENSNFUG00015002749) #19	GSK3AB (ENSNFUG00015002760) #21	znf574 (ENSNFUG00015002814) #22	GRIK5 (ENSNFUG00015002902) #23	ENSNFUG00015003097 #24	ENSNFUG00015003103 ##30	ENSNFUG00015003110	ENSNFUG00015003117 ##30	ENSNFUG00015003130 #25	ENSNFUG00015003140	ENSNFUG00015003147 #30	PAFAH1B3 (ENSNFUG00015003157) #31	tlr21 (ENSNFUG00015003168) #33	cnfn (ENSNFUG00015003173) #34	CXCR3.2 (ENSNFUG00015003180) #35	Nfu_g_1_001121 (ENSNFUG00015003185) #36	CXCR3 (ENSNFUG00015003187) #37	TRIM35-28 (ENSNFUG00015003193)