Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012498	ENSGT00940000157543 #7	ENSGT00550000074994.i #8	ENSGT00940000157410 #9	ENSGT00940000156519 #10	ENSGT00390000009535 #11	ENSGT00390000010285.d #12	ENSGT00700000104539.b.a #13	ENSGT00390000007838 #14	ENSGT00390000015933 #15	ENSGT00390000006738.a #17	ENSGT00390000002407.d.w #18	ENSGT00940000158140 #19	ENSGT00940000161035 #20	ENSGT00390000011730 #21	ENSGT00940000162619 #22	ENSGT00940000162251 #23	ENSGT00390000003910 #24	ENSGT00390000001368 #25	ENSGT00940000154158.k.a #26	ENSGT00520000055637.A.b #27	ENSGT00940000158707.a.b #28	ENSGT00390000003374 #29	ENSGT00940000155581.C #30	ENSGT00940000162066 #31	ENSGT00390000011116 #32	ENSGT00530000063823.b.a #33	ENSGT00730000111190.i #35	ENSGT00940000161887 #36	ENSGT00390000002290 #37	ENSGT00390000015359
Goat	MODERN SPECIES	9	KLHL36 (ENSCHIG00000011329) #7	ENSCHIG00000025916 #8	CRISPLD2 (ENSCHIG00000024115) #9	ZDHHC7 (ENSCHIG00000009288) #10	KIAA0513 (ENSCHIG00000006583) #11	CIBAR2 (ENSCHIG00000015967) #12	GSE1 (ENSCHIG00000025163) #13	GINS2 (ENSCHIG00000016347) #14	C16orf74 (ENSCHIG00000021117) #15	ENSCHIG00000011295 #16	EMC8 (ENSCHIG00000020765) #17	ENSCHIG00000012976 #18	IRF8 (ENSCHIG00000027216) #19	FOXF1 (ENSCHIG00000018868) #20	MTHFSD (ENSCHIG00000010977) #21	FOXC2 (ENSCHIG00000024950) #22	FOXL1 (ENSCHIG00000003058) #23	ENSCHIG00000022152 #24	FBXO31 (ENSCHIG00000012761) #25	ENSCHIG00000026673 #26	ZCCHC14 (ENSCHIG00000016741) #27	JPH3 (ENSCHIG00000019663) #28	KLHDC4 (ENSCHIG00000009862) #29	SLC7A5 (ENSCHIG00000019849) #30	CA5A (ENSCHIG00000006073) #31	BANP (ENSCHIG00000014438) #32	ZFPM1 (ENSCHIG00000010239) #33	ENSCHIG00000019746 #34	ENSCHIG00000026768 #35	IL17C (ENSCHIG00000023815) #36	CYBA (ENSCHIG00000014395) #37
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	5	KLHL36 (ENSOARG00020007848) #7	USP10 (ENSOARG00020007922) #8	ENSOARG00020008204	CRISPLD2 (ENSOARG00020008254) #9	ZDHHC7 (ENSOARG00020008568) #10	KIAA0513 (ENSOARG00020008594) #11	CIBAR2 (ENSOARG00020008666) #12	GSE1 (ENSOARG00020008756) #13	GINS2 (ENSOARG00020009486) #14	C16orf74 (ENSOARG00020009512) #15	EMC8 (ENSOARG00020009578) #17	COX4I1 (ENSOARG00020009649) #18	IRF8 (ENSOARG00020009703) #19	FOXF1 (ENSOARG00020009818) #20	ENSOARG00020009849 #21	FOXC2 (ENSOARG00020010027) #22	FOXL1 (ENSOARG00020010056) #23	ENSOARG00020010085 #24	MAP1LC3B (ENSOARG00020010316) #26	ZCCHC14 (ENSOARG00020010371) #27	JPH3 (ENSOARG00020010721) #28	KLHDC4 (ENSOARG00020010847) #29	SLC7A5 (ENSOARG00020011537) #30	CA5A (ENSOARG00020011718) #31	BANP (ENSOARG00020011813) #32	ZFPM1 (ENSOARG00020012306) #33	ZC3H18 (ENSOARG00020012411) #35	IL17C (ENSOARG00020012956) #36	CYBA (ENSOARG00020013046) #37	MVD (ENSOARG00020013121)	SNAI3 (ENSOARG00020013184)