Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157506 ENSGT00910000146500 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00910000146917 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a ENSGT01050000244815.B.a.a ENSGT00410000025802.g.b Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157506 ENSGT00910000146500 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00910000146917 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a ENSGT00960000186859 ENSGT00410000025802.g.b Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT00910000146500 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a ENSGT00960000186859 ENSGT00410000025802.g.b Pecora ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.b ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.a.a ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a Percora_a ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.b ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.a.a ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a Bovidae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a ENSGT01030000235238.f ENSGT00410000025802.g.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.a.a ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a Goat MODERN SPECIES 94 ENSCHIG00000015283 #18 TKTL1 (ENSCHIG00000006118) #19 ENSCHIG00000020606 #20 FLNA (ENSCHIG00000011282) #21 EMD (ENSCHIG00000022498) #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 205 IDH3G (ENSOARG00020024407) SSR4 (ENSOARG00020024383) PDZD4 (ENSOARG00020024315) L1CAM (ENSOARG00020023921) AVPR2 (ENSOARG00020023848) ARHGAP4 (ENSOARG00020023326) NAA10 (ENSOARG00020023246) RENBP (ENSOARG00020023053) HCFC1 (ENSOARG00020022415) TMEM187 (ENSOARG00020022375) IRAK1 (ENSOARG00020022349) MECP2 (ENSOARG00020022209) OPN1LW (ENSOARG00020022140) #18 TKTL1 (ENSOARG00020021994) #19 FLNA (ENSOARG00020021631) #21 EMD (ENSOARG00020021549) #22 RPL10 (ENSOARG00020021458) DNASE1L1 (ENSOARG00020021378) TAFAZZIN (ENSOARG00020020574) ATP6AP1 (ENSOARG00020020475) GDI1 (ENSOARG00020020178) FAM50A (ENSOARG00020020129) PLXNA3 (ENSOARG00020019933) UBL4A (ENSOARG00020019884) SLC10A3 (ENSOARG00020019833) G6PD (ENSOARG00020019292) IKBKG (ENSOARG00020018901) ENSOARG00020018798 ENSOARG00020018745 ENSOARG00020018703 ENSOARG00020018678 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT00530000063808.a ENSGT00410000025802.g.b ENSGT00960000186859 Bos ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000160502 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00940000162843 #20 ENSGT00940000162426 #19 ENSGT00940000153588.b #21 ENSGT00390000002034 #22 ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a ENSGT00390000018621 ENSGT00940000156650 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00390000004735.A ENSGT01050000244850.A.a ENSGT00410000025802.g.a ENSGT00730000111022 ENSGT00950000182808.b.b ENSGT00950000183004.a.a.a.b ENSGT00530000063435.a ENSGT01100000263481.n.a.b.b.a.a.b.b ENSGT00530000063808.a ENSGT00410000025802.g.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b 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ENSGT01030000234549.a.a.a.b #18 ENSGT00530000063687.b.b.b ENSGT00910000146917 ENSGT00940000160502 ENSGT00390000011272 ENSGT00940000161383 ENSGT00390000013740 ENSGT00550000074803 ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00940000157506 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00390000008992 Chacoan peccary DUPLICATION Chacoan peccary MODERN SPECIES 34 ENSCWAG00000000527 #22 ENSCWAG00000000485 #22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 34 ENSCWAG00000000485 #22 ENSCWAG00000000527 #22 Pig MODERN SPECIES 300 ENSSSCG00000012827 IKBKG (ENSSSCG00000012825) G6PD (ENSSSCG00000025108) FAM3A (ENSSSCG00000028934) SLC10A3 (ENSSSCG00000025766) ENSSSCG00000057536 ENSSSCG00000032959 PLXNA3 (ENSSSCG00000023483) FAM50A (ENSSSCG00000025303) GDI1 (ENSSSCG00000030421) ATP6AP1 (ENSSSCG00000037310) TAFAZZIN (ENSSSCG00000039655) DNASE1L1 (ENSSSCG00000037032) RPL10 (ENSSSCG00000035997) FLNA (ENSSSCG00000033299) #21 EMD (ENSSSCG00000037777) #22 TKTL1 (ENSSSCG00000029443) #19 TEX28 (ENSSSCG00000029513) #20 ENSSSCG00000029523 #18 MECP2 (ENSSSCG00000034742) ENSSSCG00000059337 IRAK1 (ENSSSCG00000012795) ENSSSCG00000050581 HCFC1 (ENSSSCG00000012793) RENBP (ENSSSCG00000012792) NAA10 (ENSSSCG00000012791) ARHGAP4 (ENSSSCG00000012790) AVPR2 (ENSSSCG00000012789) L1CAM (ENSSSCG00000012787) PDZD4 (ENSSSCG00000012785) SSR4 (ENSSSCG00000012784)