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Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	GNPNAT1 (ENSSVLG00005006714) #7	ENSSVLG00005006693 #8	FERMT2 (ENSSVLG00005006620) #9	ENSSVLG00005006589 #10	DDHD1 (ENSSVLG00005006359) #11	ENSSVLG00005006333 #12	ENSSVLG00005006320 #13	CDKN3 (ENSSVLG00005006189) #14	CNIH1 (ENSSVLG00005006051) #15	ENSSVLG00005005962 #16	ENSSVLG00005005906 #17	SAMD4A (ENSSVLG00005005855) #18	ENSSVLG00005005811 #19	ENSSVLG00005004501 #20	WDHD1 (ENSSVLG00005004416) #21	SOCS4 (ENSSVLG00005004401) #22	ENSSVLG00005004383 #23	LGALS3 (ENSSVLG00005004351) #24	ENSSVLG00005004332 #25	DLGAP5 (ENSSVLG00005004281) #26	FBXO34 (ENSSVLG00005004246) #27	ATG14 (ENSSVLG00005004233) #28	KTN1 (ENSSVLG00005003695) #29	PELI2 (ENSSVLG00005003386) #30	TMEM260 (ENSSVLG00005003323) #31	ENSSVLG00005003294 #32	ENSSVLG00005003276 #33	EXOC5 (ENSSVLG00005003254) #34	AP5M1 (ENSSVLG00005003216) #35	NAA30 (ENSSVLG00005003191) #36	CCDC198 (ENSSVLG00005003166) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153986.a	ENSGT00390000007753.b	ENSGT01020000230346.A	ENSGT00940000154859	ENSGT00390000008666 #7	ENSGT00390000013444.a.a #9	ENSGT00940000156065.c #11	ENSGT00940000159502 #12	ENSGT00390000004717 #14	ENSGT00950000182834.A.a.a #15	ENSGT00390000008920.c.a #16	ENSGT00390000004542 #17	ENSGT00940000157933 #18	ENSGT00390000013481.c.a #20	ENSGT00390000002030 #21	ENSGT00940000161456 #22	ENSGT00730000111340 #23	ENSGT00940000157224 #24	ENSGT01010000222666	ENSGT00530000064222.b #27	ENSGT00390000011854 #28	ENSGT00940000159561	ENSGT00940000158237 #29	ENSGT00390000006178.gb	ENSGT00950000183050.b.a #30	ENSGT00390000013544 #31	ENSGT00940000155014 #32	ENSGT01010000230324 #33	ENSGT00390000012837 #34	ENSGT00390000006191 #35	ENSGT00390000005665 #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153986.a	ENSGT00390000007753.b	ENSGT01020000230346.A	ENSGT00940000154859	ENSGT00390000008666 #7	ENSGT00390000013444.a.a #9	ENSGT00940000156065.c #11	ENSGT00940000159502 #12	ENSGT00390000004717 #14	ENSGT00950000182834.A.a.a #15	ENSGT00390000008920.c.a #16	ENSGT00390000004542 #17	ENSGT00940000157933 #18	ENSGT00390000013481.c.a.o #20	ENSGT00390000002030 #21	ENSGT00940000161456 #22	ENSGT00730000111340 #23	ENSGT00940000157224 #24	ENSGT01010000222666	ENSGT00530000064222.b #27	ENSGT00390000011854 #28	ENSGT00940000159561	ENSGT00940000158237 #29	ENSGT00390000006178.gb	ENSGT00950000183050.b.a #30	ENSGT00390000013544 #31	ENSGT00940000155014 #32	ENSGT00390000012837 #34	ENSGT00390000006191.e #35	ENSGT00390000005665 #36	ENSGT00390000001071 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	27	CCDC179 (ENSUPAG00010003796)	ENSUPAG00010003788	LUZP2 (ENSUPAG00010003729)	MUC15 (ENSUPAG00010003693)	ANO3 (ENSUPAG00010003647)	SLC5A12 (ENSUPAG00010003595)	FIBIN (ENSUPAG00010003590)	BMP4 (ENSUPAG00010003585) #12	CDKN3 (ENSUPAG00010003565) #14	CNIH1 (ENSUPAG00010003545) #15	GMFB (ENSUPAG00010003533) #16	CGRRF1 (ENSUPAG00010003511) #17	SAMD4A (ENSUPAG00010003229) #18	GCH1 (ENSUPAG00010003221) #20	WDHD1 (ENSUPAG00010003149) #21	SOCS4 (ENSUPAG00010003145) #22	MAPK1IP1L (ENSUPAG00010003130) #23	LGALS3 (ENSUPAG00010003112) #24	ENSUPAG00010003095	FBXO34 (ENSUPAG00010003083) #27	ATG14 (ENSUPAG00010003072) #28	TBPL2 (ENSUPAG00010003064)	ENSUPAG00010003052	KTN1 (ENSUPAG00010001418) #29	ENSUPAG00010001410	PELI2 (ENSUPAG00010001379) #30	TMEM260 (ENSUPAG00010001276) #31	OTX2 (ENSUPAG00010001231) #32	EXOC5 (ENSUPAG00010001129) #34	AP5M1 (ENSUPAG00010001100) #35	NAA30 (ENSUPAG00010001083) #36
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Alpin marmot	MODERN SPECIES	7	GPR137C (ENSMMMG00000001720)	ERO1A (ENSMMMG00000001747)	PSMC6 (ENSMMMG00000001802)	STYX (ENSMMMG00000001812)	GNPNAT1 (ENSMMMG00000001835) #7	FERMT2 (ENSMMMG00000001867) #9	ENSMMMG00000001924 #11	BMP4 (ENSMMMG00000002321) #12	CDKN3 (ENSMMMG00000002335) #14	CNIH1 (ENSMMMG00000002362) #15	GMFB (ENSMMMG00000002388) #16	CGRRF1 (ENSMMMG00000002415) #17	SAMD4A (ENSMMMG00000002450) #18	GCH1 (ENSMMMG00000002659) #20	WDHD1 (ENSMMMG00000002686) #21	SOCS4 (ENSMMMG00000002820) #22	MAPK1IP1L (ENSMMMG00000002821) #23	LGALS3 (ENSMMMG00000002842) #24	ENSMMMG00000002883	FBXO34 (ENSMMMG00000002895) #27	ATG14 (ENSMMMG00000002906) #28	TBPL2 (ENSMMMG00000002943)	ENSMMMG00000002960	KTN1 (ENSMMMG00000003061) #29	ENSMMMG00000005015	PELI2 (ENSMMMG00000005044) #30	TMEM260 (ENSMMMG00000005095) #31	ENSMMMG00000005191	OTX2 (ENSMMMG00000005205) #32	ENSMMMG00000005219 #33	EXOC5 (ENSMMMG00000005231) #34