Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Primates	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.lb	ENSGT00390000010116.mb	ENSGT00940000162151	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.lb	ENSGT00390000010116.mb	ENSGT00940000162151	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.lb	ENSGT00390000010116.mb	ENSGT00940000162151	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Capuchin	MODERN SPECIES	110	GPR155 (ENSCCAG00000032455) #7	WIPF1 (ENSCCAG00000012994) #8	CHRNA1 (ENSCCAG00000032209) #9	CHN1 (ENSCCAG00000027038) #10	ENSCCAG00000034541 #11	ATF2 (ENSCCAG00000035902) #12	ENSCCAG00000020514 #13	ENSCCAG00000015947 #14	LNPK (ENSCCAG00000022702) #15	EVX2 (ENSCCAG00000032502) #16	HOXD13 (ENSCCAG00000032945) #17	HOXD12 (ENSCCAG00000026325) #18	HOXD11 (ENSCCAG00000034968) #19	HOXD10 (ENSCCAG00000020764) #20	HOXD9 (ENSCCAG00000021007) #21	HOXD8 (ENSCCAG00000001172) #22	ENSCCAG00000035403 #23
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	46	ENSSBOG00000020259	CIR1 (ENSSBOG00000028527)	SCRN3 (ENSSBOG00000033089)	GPR155 (ENSSBOG00000034957) #7	WIPF1 (ENSSBOG00000032169) #8	CHRNA1 (ENSSBOG00000035763) #9	CHN1 (ENSSBOG00000016307) #10	ATF2 (ENSSBOG00000025461) #12	ATP5MC3 (ENSSBOG00000022688) #13	LNPK (ENSSBOG00000023054) #15	EVX2 (ENSSBOG00000034364) #16	HOXD13 (ENSSBOG00000032579) #17	HOXD12 (ENSSBOG00000025723) #18	HOXD10 (ENSSBOG00000020553) #20	HOXD9 (ENSSBOG00000031095) #21	ENSSBOG00000029405 #22	HOXD4 (ENSSBOG00000031535) #23	HOXD3 (ENSSBOG00000031894)	HOXD1 (ENSSBOG00000030906)	MTX2 (ENSSBOG00000025795)	HNRNPA3 (ENSSBOG00000034307)	NFE2L2 (ENSSBOG00000022740)	AGPS (ENSSBOG00000026720)	ENSSBOG00000019156	ENSSBOG00000018055	PDE11A (ENSSBOG00000026746)	RBM45 (ENSSBOG00000005469)	OSBPL6 (ENSSBOG00000020436)	ENSSBOG00000035006 ##14	PRKRA (ENSSBOG00000012105)	PJVK (ENSSBOG00000022982)
Marmoset	MODERN SPECIES	18	WIPF1 (ENSCJAG00000048519) #8	CHRNA1 (ENSCJAG00000008007) #9	CHN1 (ENSCJAG00000008041) #10	ATF2 (ENSCJAG00000008085) #12	ATP5MC3 (ENSCJAG00000008207) #13	ENSCJAG00000080703	ENSCJAG00000084464	ENSCJAG00000022954	LNPK (ENSCJAG00000008226) #15	EVX2 (ENSCJAG00000077487) #16	HOXD13 (ENSCJAG00000040882) #17	HOXD12 (ENSCJAG00000079626) #18	HOXD11 (ENSCJAG00000048503) #19	HOXD10 (ENSCJAG00000008269) #20	HOXD9 (ENSCJAG00000046789) #21	HOXD8 (ENSCJAG00000008284) #22	HOXD4 (ENSCJAG00000008286) #23	HOXD3 (ENSCJAG00000063715)	HOXD1 (ENSCJAG00000008290)	MTX2 (ENSCJAG00000039174)	ENSCJAG00000072603	ENSCJAG00000006928	NFE2L2 (ENSCJAG00000008340)	ENSCJAG00000059559	ENSCJAG00000021732	AGPS (ENSCJAG00000021508)	ENSCJAG00000081808	ENSCJAG00000081742	PDE11A (ENSCJAG00000014554)	ENSCJAG00000021516	ENSCJAG00000072241
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1333				ENSANAG00000011341	ENSANAG00000037338 #12	ENSANAG00000033889 #13	ENSANAG00000023367	ENSANAG00000021797	LNPK (ENSANAG00000019161) #15	EVX2 (ENSANAG00000031929) #16	HOXD13 (ENSANAG00000029500) #17	HOXD12 (ENSANAG00000008919) #18	HOXD11 (ENSANAG00000029678) #19	HOXD10 (ENSANAG00000025381) #20	HOXD9 (ENSANAG00000024699) #21	HOXD8 (ENSANAG00000026980) #22	HOXD4 (ENSANAG00000028028) #23	HOXD3 (ENSANAG00000026428)	HOXD1 (ENSANAG00000019775)	ENSANAG00000031061	MTX2 (ENSANAG00000022501)	HNRNPA3 (ENSANAG00000002931)	NFE2L2 (ENSANAG00000023669)	AGPS (ENSANAG00000019626)	ENSANAG00000003240	ENSANAG00000025414
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00940000167313	ENSGT00390000008029.v	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a
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Pan	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00940000167313	ENSGT00390000008029.v	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059
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Chimpanzee	MODERN SPECIES	15	CIR1 (ENSPTRG00000012652)	SCRN3 (ENSPTRG00000012653)	GPR155 (ENSPTRG00000012655) #7	WIPF1 (ENSPTRG00000012656)	CHRNA1 (ENSPTRG00000012658) #9	CHN1 (ENSPTRG00000012659) #10	ATF2 (ENSPTRG00000012660) #12	ATP5MC3 (ENSPTRG00000047314) #13	LNPK (ENSPTRG00000012662) #15	EVX2 (ENSPTRG00000012663) #16	HOXD13 (ENSPTRG00000012664) #17	HOXD12 (ENSPTRG00000012665) #18	HOXD11 (ENSPTRG00000012666) #19	HOXD10 (ENSPTRG00000012667) #20	HOXD9 (ENSPTRG00000043464) #21	HOXD8 (ENSPTRG00000012669) #22	HOXD4 (ENSPTRG00000051862) #23	HOXD3 (ENSPTRG00000012672)	ENSPTRG00000051348	HOXD1 (ENSPTRG00000052716)	ENSPTRG00000023851	MTX2 (ENSPTRG00000012674)	ENSPTRG00000042815	HNRNPA3 (ENSPTRG00000012676)	NFE2L2 (ENSPTRG00000012677)	AGPS (ENSPTRG00000012680)	TTC30B (ENSPTRG00000048299)	TTC30A (ENSPTRG00000044238)	PDE11A (ENSPTRG00000012684)	ENSPTRG00000046153	ENSPTRG00000051577
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Orangutan	MODERN SPECIES	15	ENSPPYG00000012946	GPR155 (ENSPPYG00000012947) #7	WIPF1 (ENSPPYG00000012948) #8	CHRNA1 (ENSPPYG00000012949) #9	CHN1 (ENSPPYG00000012950) #10	ATF2 (ENSPPYG00000012951) #12	ENSPPYG00000041465	ATP5MC3 (ENSPPYG00000037033) #13	LNPK (ENSPPYG00000032630) #15	EVX2 (ENSPPYG00000012955) #16	HOXD13 (ENSPPYG00000012956) #17	HOXD12 (ENSPPYG00000012957) #18	HOXD11 (ENSPPYG00000031598) #19	HOXD10 (ENSPPYG00000012958) #20	HOXD9 (ENSPPYG00000012959) #21	HOXD8 (ENSPPYG00000037201) #22	HOXD4 (ENSPPYG00000034536) #23	HOXD3 (ENSPPYG00000012963)	HOXD1 (ENSPPYG00000012964)	ENSPPYG00000037565	MTX2 (ENSPPYG00000012966)	HNRNPA3 (ENSPPYG00000012967)	NFE2L2 (ENSPPYG00000012968)	AGPS (ENSPPYG00000012969)	TTC30B (ENSPPYG00000034101)	TTC30A (ENSPPYG00000038583)	PDE11A (ENSPPYG00000012972)	RBM45 (ENSPPYG00000012974)	OSBPL6 (ENSPPYG00000012975)	ENSPPYG00000012976	PJVK (ENSPPYG00000012977)
Gibbon	MODERN SPECIES	14	SCRN3 (ENSNLEG00000005880)	GPR155 (ENSNLEG00000005896) #7	ENSNLEG00000033625	WIPF1 (ENSNLEG00000005907) #8	CHRNA1 (ENSNLEG00000005914) #9	CHN1 (ENSNLEG00000005923) #10	ENSNLEG00000028605	ATF2 (ENSNLEG00000005938) #12	ATP5MC3 (ENSNLEG00000005971) #13	LNPK (ENSNLEG00000005977) #15	EVX2 (ENSNLEG00000005999) #16	HOXD13 (ENSNLEG00000029303) #17	HOXD12 (ENSNLEG00000006006) #18	HOXD10 (ENSNLEG00000006010) #20	HOXD9 (ENSNLEG00000006011) #21	ENSNLEG00000006003 #22	HOXD4 (ENSNLEG00000006014) #23	HOXD3 (ENSNLEG00000006018)	ENSNLEG00000027160	HOXD1 (ENSNLEG00000006019)	MTX2 (ENSNLEG00000006020)	ENSNLEG00000035565	ENSNLEG00000029348	HNRNPA3 (ENSNLEG00000028401)	NFE2L2 (ENSNLEG00000006029)	AGPS (ENSNLEG00000006030)	TTC30B (ENSNLEG00000033307)	TTC30A (ENSNLEG00000030979)	PDE11A (ENSNLEG00000006056)	ENSNLEG00000030325	RBM45 (ENSNLEG00000006080)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.i.b	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.i.b	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000165163	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.i.b	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.a.b.b	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000165163	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00390000018390.jc.n	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.i.b	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000168702	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	585	WIPF1 (ENSMNEG00000045560) #8	CHRNA1 (ENSMNEG00000043912) #9	ENSMNEG00000009103	CHN1 (ENSMNEG00000033120) #10	ATF2 (ENSMNEG00000037988) #12	ATP5MC3 (ENSMNEG00000029106) #13	ENSMNEG00000035184	LNPK (ENSMNEG00000028702) #15	ENSMNEG00000024050	EVX2 (ENSMNEG00000028323) #16	HOXD13 (ENSMNEG00000027142) #17	HOXD12 (ENSMNEG00000002891) #18	HOXD11 (ENSMNEG00000029127) #19	HOXD10 (ENSMNEG00000033923) #20	HOXD9 (ENSMNEG00000044938) #21	HOXD8 (ENSMNEG00000028133) #22	HOXD4 (ENSMNEG00000030845) #23	HOXD3 (ENSMNEG00000040202)	ENSMNEG00000018849	HOXD1 (ENSMNEG00000010514)	MTX2 (ENSMNEG00000032881)	ENSMNEG00000026533	ENSMNEG00000034936	NFE2L2 (ENSMNEG00000028208)	AGPS (ENSMNEG00000043672)	TTC30B (ENSMNEG00000011632)	TTC30A (ENSMNEG00000000192)	PDE11A (ENSMNEG00000037080)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00940000166143.A.a.b.b.b.b.a.b.b	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.j	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000170471.B.a.a.a	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000168702	ENSGT00680000100059
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	3	ENSMFAG00000039499	ENSMFAG00000060672	WIPF1 (ENSMFAG00000034165) #8	CHRNA1 (ENSMFAG00000042992) #9	CHN1 (ENSMFAG00000002404) #10	ATF2 (ENSMFAG00000002278) #12	ATP5MC3 (ENSMFAG00000056189) #13	ENSMFAG00000002936	LNPK (ENSMFAG00000002105) #15	ENSMFAG00000053875	HOXD13 (ENSMFAG00000033237) #17	HOXD12 (ENSMFAG00000051547) #18	ENSMFAG00000043724 #19	HOXD10 (ENSMFAG00000031117) #20	HOXD9 (ENSMFAG00000000099) #21	HOXD8 (ENSMFAG00000065214) #22	HOXD4 (ENSMFAG00000052240) #23	HOXD3 (ENSMFAG00000034065)	ENSMFAG00000047422	HOXD1 (ENSMFAG00000046035)	MTX2 (ENSMFAG00000026822)	ENSMFAG00000065500	ENSMFAG00000058081	HNRNPA3 (ENSMFAG00000000823)	NFE2L2 (ENSMFAG00000041108)	AGPS (ENSMFAG00000038904)	TTC30B (ENSMFAG00000057741)	TTC30A (ENSMFAG00000053112)	PDE11A (ENSMFAG00000042268)	ENSMFAG00000034055	RBM45 (ENSMFAG00000042524)
Rhesus	MODERN SPECIES	3	SCRN3 (ENSMMUG00000023009)	GPR155 (ENSMMUG00000021012) #7	ENSMMUG00000053004	WIPF1 (ENSMMUG00000009593) #8	CHRNA1 (ENSMMUG00000021796) #9	CHN1 (ENSMMUG00000021797) #10	ATF2 (ENSMMUG00000003947) #12	ATP5MC3 (ENSMMUG00000003954) #13	LNPK (ENSMMUG00000023498) #15	EVX2 (ENSMMUG00000061506) #16	HOXD13 (ENSMMUG00000055831) #17	HOXD12 (ENSMMUG00000023501) #18	HOXD11 (ENSMMUG00000047915) #19	HOXD10 (ENSMMUG00000046368) #20	HOXD9 (ENSMMUG00000032599) #21	HOXD8 (ENSMMUG00000023504) #22	HOXD4 (ENSMMUG00000060947) #23	HOXD3 (ENSMMUG00000051761)	ENSMMUG00000052177	HOXD1 (ENSMMUG00000065344)	MTX2 (ENSMMUG00000010185)	ENSMMUG00000031367	ENSMMUG00000054983	ENSMMUG00000062299	HNRNPA3 (ENSMMUG00000001858)	NFE2L2 (ENSMMUG00000001861)	ENSMMUG00000065205	AGPS (ENSMMUG00000008502)	TTC30B (ENSMMUG00000043597)	TTC30A (ENSMMUG00000041827)	PDE11A (ENSMMUG00000002011)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.i.b	ENSGT00950000182827.A.j	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.a.b.b	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059
Olive baboon	MODERN SPECIES	1	SCRN3 (ENSPANG00000001316)	GPR155 (ENSPANG00000006559) #7	WIPF1 (ENSPANG00000019541) #8	CHRNA1 (ENSPANG00000007790) #9	CHN1 (ENSPANG00000008236) #10	ENSPANG00000005473	ATF2 (ENSPANG00000004806) #12	ATP5MC3 (ENSPANG00000031591) #13	LNPK (ENSPANG00000011787) #15	ENSPANG00000039545 #16	ENSPANG00000044695 #17	ENSPANG00000044332 #18	HOXD11 (ENSPANG00000049530) #19	HOXD10 (ENSPANG00000050198) #20	HOXD9 (ENSPANG00000001061) #21	HOXD8 (ENSPANG00000049199) #22	HOXD4 (ENSPANG00000000542) #23	HOXD3 (ENSPANG00000000543)	HOXD1 (ENSPANG00000009593)	MTX2 (ENSPANG00000013333)	ENSPANG00000045287	ENSPANG00000018337	NFE2L2 (ENSPANG00000039361)	AGPS (ENSPANG00000004764)	TTC30B (ENSPANG00000046724)	TTC30A (ENSPANG00000041839)	PDE11A (ENSPANG00000025222)	ENSPANG00000029672	RBM45 (ENSPANG00000016088)	ENSPANG00000046096	OSBPL6 (ENSPANG00000016378)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.i.b	ENSGT00950000182827.A.j	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00950000182922.a.a.a.b.a.a.b.b	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00910000147400	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00910000147200	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.jb	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	570	CHRNA1 (ENSCATG00000030584) #9	CHN1 (ENSCATG00000036640) #10	ENSCATG00000035911	ATF2 (ENSCATG00000005694) #12	ATP5MC3 (ENSCATG00000035329) #13	ENSCATG00000037951	ENSCATG00000041432	LNPK (ENSCATG00000039052) #15	ENSCATG00000005782	EVX2 (ENSCATG00000038250) #16	HOXD13 (ENSCATG00000031889) #17	HOXD12 (ENSCATG00000032043) #18	HOXD10 (ENSCATG00000032256) #20	HOXD11 (ENSCATG00000031157) #19	HOXD9 (ENSCATG00000037190) #21	HOXD8 (ENSCATG00000032148) #22	HOXD4 (ENSCATG00000041719) #23	HOXD3 (ENSCATG00000029355)	ENSCATG00000032250	HOXD1 (ENSCATG00000032397)	MTX2 (ENSCATG00000039959)	ENSCATG00000022731	HNRNPA3 (ENSCATG00000032162)	ENSCATG00000001855	NFE2L2 (ENSCATG00000036834)	AGPS (ENSCATG00000038387)	TTC30B (ENSCATG00000004635)	TTC30A (ENSCATG00000000123)	PDE11A (ENSCATG00000042325)	ENSCATG00000008317	ENSCATG00000039319
Drill	MODERN SPECIES	1072	ENSMLEG00000029654	WIPF1 (ENSMLEG00000001484) #8	CHRNA1 (ENSMLEG00000043089) #9	ENSMLEG00000000615	CHN1 (ENSMLEG00000032406) #10	ATF2 (ENSMLEG00000035167) #12	ATP5MC3 (ENSMLEG00000043816) #13	ENSMLEG00000001270	LNPK (ENSMLEG00000033659) #15	EVX2 (ENSMLEG00000035528) #16	HOXD13 (ENSMLEG00000031532) #17	HOXD12 (ENSMLEG00000032533) #18	ENSMLEG00000030792 #19	HOXD10 (ENSMLEG00000044067) #20	HOXD9 (ENSMLEG00000025695) #21	ENSMLEG00000042507 #22	HOXD4 (ENSMLEG00000024188) #23	HOXD3 (ENSMLEG00000037278)	HOXD1 (ENSMLEG00000035890)	MTX2 (ENSMLEG00000002029)	NFE2L2 (ENSMLEG00000042705)	AGPS (ENSMLEG00000033858)	TTC30B (ENSMLEG00000027894)	TTC30A (ENSMLEG00000027775)	ENSMLEG00000039892	ENSMLEG00000035955	PDE11A (ENSMLEG00000044286)	RBM45 (ENSMLEG00000042404)	OSBPL6 (ENSMLEG00000021439)	PRKRA (ENSMLEG00000019578)	PJVK (ENSMLEG00000027972)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	1	SP9 (ENSCSAG00000014648)	CIR1 (ENSCSAG00000014627)	SCRN3 (ENSCSAG00000014584)	GPR155 (ENSCSAG00000014572) #7	WIPF1 (ENSCSAG00000014556) #8	CHRNA1 (ENSCSAG00000014545) #9	CHN1 (ENSCSAG00000014539) #10	ATF2 (ENSCSAG00000014523) #12	LNPK (ENSCSAG00000014506) #15	EVX2 (ENSCSAG00000014486) #16	HOXD13 (ENSCSAG00000014475) #17	HOXD12 (ENSCSAG00000014464) #18	HOXD11 (ENSCSAG00000014457) #19	HOXD10 (ENSCSAG00000014448) #20	HOXD9 (ENSCSAG00000014441) #21	HOXD8 (ENSCSAG00000014437) #22	HOXD4 (ENSCSAG00000014429) #23	HOXD3 (ENSCSAG00000014422)	HOXD1 (ENSCSAG00000014419)	MTX2 (ENSCSAG00000014412)	ENSCSAG00000014399	NFE2L2 (ENSCSAG00000014353)	AGPS (ENSCSAG00000014345)	TTC30A (ENSCSAG00000018651)	PDE11A (ENSCSAG00000014313)	ENSCSAG00000014240	RBM45 (ENSCSAG00000014231)	OSBPL6 (ENSCSAG00000014221)	PJVK (ENSCSAG00000014212)	FKBP7 (ENSCSAG00000014194)	PLEKHA3 (ENSCSAG00000014182)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	148						ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00950000182827.A.i.b	ENSGT00390000001859.c #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000154301.`b.a	ENSGT00960000186717.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.kb	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010991.f.b	ENSGT00910000148248	ENSGT00940000168702
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	722								ENSRROG00000041768 #15	ENSRROG00000044546	EVX2 (ENSRROG00000044705) #16	HOXD13 (ENSRROG00000040419) #17	HOXD12 (ENSRROG00000043268) #18	ENSRROG00000043226 #19	HOXD9 (ENSRROG00000032216) #21	HOXD10 (ENSRROG00000036162) #20	ENSRROG00000024611 #22	HOXD4 (ENSRROG00000026646) #23	HOXD3 (ENSRROG00000044509)	HOXD1 (ENSRROG00000035364)	ENSRROG00000038369	ENSRROG00000042876	ENSRROG00000020854	MTX2 (ENSRROG00000030249)	ENSRROG00000028794	NFE2L2 (ENSRROG00000045317)	AGPS (ENSRROG00000035068)	TTC30A (ENSRROG00000023478)	PDE11A (ENSRROG00000028809)	ENSRROG00000041594	RBM45 (ENSRROG00000031398)	OSBPL6 (ENSRROG00000036096)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	241							ATF2 (ENSRBIG00000041657) #12	ATP5MC3 (ENSRBIG00000040343) #13	ENSRBIG00000038159	LNPK (ENSRBIG00000038235) #15	HOXD13 (ENSRBIG00000033719) #17	ENSRBIG00000035253 #19	HOXD12 (ENSRBIG00000040792) #18	HOXD10 (ENSRBIG00000030470) #20	HOXD9 (ENSRBIG00000035340) #21	HOXD8 (ENSRBIG00000036417) #22	HOXD4 (ENSRBIG00000027637) #23	HOXD3 (ENSRBIG00000044829)	HOXD1 (ENSRBIG00000031297)	ENSRBIG00000032024	ENSRBIG00000042767	MTX2 (ENSRBIG00000043097)	ENSRBIG00000012615	NFE2L2 (ENSRBIG00000042825)	AGPS (ENSRBIG00000039582)	TTC30A (ENSRBIG00000041155)	ENSRBIG00000030274	ENSRBIG00000035583	PDE11A (ENSRBIG00000043623)	RBM45 (ENSRBIG00000033680)	OSBPL6 (ENSRBIG00000040280)
Tarsier	MODERN SPECIES	1909																ENSTSYG00000001418 #22	HOXD4 (ENSTSYG00000032287) #23	HOXD3 (ENSTSYG00000036098)	MTX2 (ENSTSYG00000006401)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000164264	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Mouse lemur	MODERN SPECIES	30	SCRN3 (ENSMICG00000000366)	GPR155 (ENSMICG00000000369) #7	ENSMICG00000031974	CHRNA1 (ENSMICG00000014284) #9	ENSMICG00000038672	CHN1 (ENSMICG00000014292) #10	ATF2 (ENSMICG00000006417) #12	ATP5MC3 (ENSMICG00000006421) #13	LNPK (ENSMICG00000027707) #15	EVX2 (ENSMICG00000035343) #16	HOXD13 (ENSMICG00000002170) #17	HOXD12 (ENSMICG00000002172) #18	HOXD11 (ENSMICG00000048033) #19	HOXD10 (ENSMICG00000028373) #20	HOXD9 (ENSMICG00000031229) #21	HOXD8 (ENSMICG00000004277) #22	HOXD4 (ENSMICG00000043209) #23	HOXD3 (ENSMICG00000004286)	HOXD1 (ENSMICG00000044650)	MTX2 (ENSMICG00000004295)	ENSMICG00000027841	NFE2L2 (ENSMICG00000009559)	AGPS (ENSMICG00000003750)	ENSMICG00000003768	ENSMICG00000046051	ENSMICG00000030225	PDE11A (ENSMICG00000003770)	ENSMICG00000047030	RBM45 (ENSMICG00000003787)	OSBPL6 (ENSMICG00000003793)	PRKRA (ENSMICG00000009883)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	69	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	478	SCRN3 (ENSPCOG00000015456)	GPR155 (ENSPCOG00000014376) #7	ENSPCOG00000018466	ENSPCOG00000015733	CHRNA1 (ENSPCOG00000020642) #9	CHN1 (ENSPCOG00000018830) #10	ATF2 (ENSPCOG00000025416) #12	ATP5MC3 (ENSPCOG00000016374) #13	LNPK (ENSPCOG00000026983) #15	EVX2 (ENSPCOG00000022416) #16	HOXD13 (ENSPCOG00000018735) #17	HOXD12 (ENSPCOG00000022036) #18	HOXD11 (ENSPCOG00000015055) #19	HOXD10 (ENSPCOG00000023637) #20	HOXD9 (ENSPCOG00000026809) #21	HOXD8 (ENSPCOG00000024233) #22	HOXD4 (ENSPCOG00000018337) #23	HOXD3 (ENSPCOG00000017195)	HOXD1 (ENSPCOG00000024445)	MTX2 (ENSPCOG00000025077)	NFE2L2 (ENSPCOG00000007362)	AGPS (ENSPCOG00000018665)	PDE11A (ENSPCOG00000025830)	ENSPCOG00000025842	ENSPCOG00000028806	RBM45 (ENSPCOG00000021526)	ENSPCOG00000005659	OSBPL6 (ENSPCOG00000010731)	PRKRA (ENSPCOG00000018812)	PJVK (ENSPCOG00000022935)	FKBP7 (ENSPCOG00000018941)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	243	SCRN3 (ENSPSMG00000024170)	GPR155 (ENSPSMG00000024199) #7	WIPF1 (ENSPSMG00000024219) #8	CHRNA1 (ENSPSMG00000024264) #9	CHN1 (ENSPSMG00000024301) #10	ATF2 (ENSPSMG00000024416) #12	ATP5MC3 (ENSPSMG00000024446) #13	LNPK (ENSPSMG00000024460) #15	ENSPSMG00000024465	EVX2 (ENSPSMG00000024469) #16	HOXD13 (ENSPSMG00000024474) #17	HOXD12 (ENSPSMG00000024476) #18	HOXD11 (ENSPSMG00000024479) #19	HOXD10 (ENSPSMG00000024482) #20	HOXD9 (ENSPSMG00000024487) #21	HOXD8 (ENSPSMG00000024501) #22	HOXD4 (ENSPSMG00000024504) #23	HOXD3 (ENSPSMG00000024507)	ENSPSMG00000024512	HOXD1 (ENSPSMG00000024516)	NNT (ENSPSMG00000024528)	PAIP1 (ENSPSMG00000024554)	ENSPSMG00000024563
Bushbaby	MODERN SPECIES	163	GPR155 (ENSOGAG00000016571) #7	WIPF1 (ENSOGAG00000016579) #8	CHRNA1 (ENSOGAG00000000890) #9	CHN1 (ENSOGAG00000000894) #10	ATF2 (ENSOGAG00000011373) #12	ATP5MC3 (ENSOGAG00000027578) #13	ENSOGAG00000026184	ENSOGAG00000030354	LNPK (ENSOGAG00000030372) #15	EVX2 (ENSOGAG00000025378) #16	HOXD13 (ENSOGAG00000027055) #17	HOXD12 (ENSOGAG00000015689) #18	HOXD11 (ENSOGAG00000029520) #19	HOXD10 (ENSOGAG00000015694) #20	HOXD9 (ENSOGAG00000015697) #21	HOXD8 (ENSOGAG00000015707) #22	HOXD4 (ENSOGAG00000029168) #23	HOXD3 (ENSOGAG00000015710)	HOXD1 (ENSOGAG00000015712)	MTX2 (ENSOGAG00000016422)	ENSOGAG00000032690	ENSOGAG00000028132	NFE2L2 (ENSOGAG00000034393)	AGPS (ENSOGAG00000013184)	ENSOGAG00000013189	ENSOGAG00000013191	ENSOGAG00000026648	RBM45 (ENSOGAG00000015195)	OSBPL6 (ENSOGAG00000013765)	PRKRA (ENSOGAG00000013971)	PJVK (ENSOGAG00000033780)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Tree shrew	MODERN SPECIES	3966												EVX2 (ENSTBEG00000010517) #16	HOXD12 (ENSTBEG00000010799) #18	HOXD10 (ENSTBEG00000010925) #20	HOXD9 (ENSTBEG00000010979) #21	HOXD8 (ENSTBEG00000011462) #22	ENSTBEG00000011786
Glires	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000000673.b	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000164264	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b
Pika	MODERN SPECIES	959													ENSOPRG00000004018 #19	HOXD10 (ENSOPRG00000004038) #20	ENSOPRG00000004049 #21	HOXD8 (ENSOPRG00000004065) #22	ENSOPRG00000004081 #23	HOXD3 (ENSOPRG00000004098)	ENSOPRG00000004116
Rabbit	MODERN SPECIES	18	SCRN3 (ENSOCUG00000011499)	GPR155 (ENSOCUG00000003683) #7	ENSOCUG00000036607	ENSOCUG00000005696	CHRNA1 (ENSOCUG00000024814) #9	CHN1 (ENSOCUG00000008134) #10	ATF2 (ENSOCUG00000012156) #12	ATP5MC3 (ENSOCUG00000012164) #13	LNPK (ENSOCUG00000008962) #15	EVX2 (ENSOCUG00000032776) #16	HOXD13 (ENSOCUG00000029547) #17	HOXD12 (ENSOCUG00000002412) #18	HOXD11 (ENSOCUG00000013942) #19	HOXD10 (ENSOCUG00000008964) #20	HOXD9 (ENSOCUG00000023956) #21	ENSOCUG00000035940 #22	HOXD4 (ENSOCUG00000002413) #23	HOXD3 (ENSOCUG00000014119)	HOXD1 (ENSOCUG00000015582)	MTX2 (ENSOCUG00000008760)	ENSOCUG00000025666	ENSOCUG00000030456	ENSOCUG00000002743	NFE2L2 (ENSOCUG00000001009)	AGPS (ENSOCUG00000011521)	ENSOCUG00000029884	ENSOCUG00000039012	ENSOCUG00000008038	ENSOCUG00000039559	ENSOCUG00000025342	RBM45 (ENSOCUG00000001125)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296.t #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000154808.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000155850
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296.t #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000154808.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000155850
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296.t #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000154808.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964	ENSGT00940000155850
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	110	KLKB1 (ENSCLAG00000016848)	F11 (ENSCLAG00000012318)	MTNR1A (ENSCLAG00000015269)	FAT1 (ENSCLAG00000013169)	ENSCLAG00000015923	ZFP42 (ENSCLAG00000011822)	TRIML2 (ENSCLAG00000011159)	TRIML1 (ENSCLAG00000014494)	LNPK (ENSCLAG00000015033) #15	EVX2 (ENSCLAG00000014389) #16	HOXD13 (ENSCLAG00000013095) #17	HOXD12 (ENSCLAG00000013058) #18	ENSCLAG00000012563 #19	HOXD10 (ENSCLAG00000012482) #20	HOXD9 (ENSCLAG00000012447) #21	ENSCLAG00000011108 #22	HOXD4 (ENSCLAG00000014461) #23	ENSCLAG00000013605	HOXD1 (ENSCLAG00000012505)	MTX2 (ENSCLAG00000011598)	ENSCLAG00000011088	HNRNPA3 (ENSCLAG00000012855)	NFE2L2 (ENSCLAG00000013122)	ENSCLAG00000012626	ENSCLAG00000013627	AGPS (ENSCLAG00000013279)	ENSCLAG00000017938	ENSCLAG00000013714	PDE11A (ENSCLAG00000013013)	RBM45 (ENSCLAG00000015215)	OSBPL6 (ENSCLAG00000011433)
Degu	MODERN SPECIES	106	ENSODEG00000008975 #8	ENSODEG00000019598	CHRNA1 (ENSODEG00000010458) #9	CHN1 (ENSODEG00000008560) #10	ATF2 (ENSODEG00000010947) #12	ENSODEG00000010951 #13	ENSODEG00000010385	LNPK (ENSODEG00000010046) #15	ENSODEG00000008992	EVX2 (ENSODEG00000010771) #16	HOXD13 (ENSODEG00000008793) #17	HOXD12 (ENSODEG00000008376) #18	ENSODEG00000010934 #19	HOXD10 (ENSODEG00000010382) #20	HOXD9 (ENSODEG00000008626) #21	ENSODEG00000010496 #22	HOXD4 (ENSODEG00000010297) #23	HOXD3 (ENSODEG00000009722)	HOXD1 (ENSODEG00000008961)	ENSODEG00000008879	MTX2 (ENSODEG00000008062)	ENSODEG00000009697	ENSODEG00000009265	NFE2L2 (ENSODEG00000010043)	AGPS (ENSODEG00000008272)	ENSODEG00000020058	ENSODEG00000019592	PDE11A (ENSODEG00000010682)	ENSODEG00000019574	RBM45 (ENSODEG00000007959)	ENSODEG00000019659
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Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	22	GPR155 (ENSHGLG00000012529) #7	ENSHGLG00000036822 #8	ENSHGLG00000039411 #8	CHRNA1 (ENSHGLG00000015432) #9	ENSHGLG00000016114 #10	ENSHGLG00000018805 #12	Atp5mc3 (ENSHGLG00000033165) #13	ENSHGLG00000040802	LNPK (ENSHGLG00000004015) #15	EVX2 (ENSHGLG00000004218) #16	HOXD13 (ENSHGLG00000050884) #17	HOXD12 (ENSHGLG00000005403) #18	HOXD11 (ENSHGLG00000034527) #19	HOXD9 (ENSHGLG00000007185) #21	HOXD10 (ENSHGLG00000033462) #20	ENSHGLG00000003577 #22	HOXD4 (ENSHGLG00000037842) #23	HOXD3 (ENSHGLG00000003761)	HOXD1 (ENSHGLG00000004072)	MTX2 (ENSHGLG00000004177)	ENSHGLG00000012734	ENSHGLG00000046644	ENSHGLG00000036655	HNRNPA3 (ENSHGLG00000005451)	NFE2L2 (ENSHGLG00000006475)	AGPS (ENSHGLG00000007541)	ENSHGLG00000036841	TTC30B (ENSHGLG00000042840)	ENSHGLG00000005226	ENSHGLG00000006609	ENSHGLG00000007342
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a.xb #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a.xb.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.gb	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Alpin marmot	MODERN SPECIES	5	ENSMMMG00000023702	GPR155 (ENSMMMG00000023705) #7	ENSMMMG00000023714	WIPF1 (ENSMMMG00000023716) #8	CHRNA1 (ENSMMMG00000023717) #9	CHN1 (ENSMMMG00000023718) #10	ENSMMMG00000023730	ATF2 (ENSMMMG00000023733) #12	ENSMMMG00000023748 #13	LNPK (ENSMMMG00000023755) #15	HOXD13 (ENSMMMG00000023759) #17	HOXD12 (ENSMMMG00000023760) #18	ENSMMMG00000023762 #19	HOXD10 (ENSMMMG00000023763) #20	HOXD9 (ENSMMMG00000023764) #21	ENSMMMG00000023765 #22	HOXD4 (ENSMMMG00000023767) #23	HOXD3 (ENSMMMG00000023768)	MTX2 (ENSMMMG00000023772)	NFE2L2 (ENSMMMG00000023776)	AGPS (ENSMMMG00000023778)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a.xb.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.gb	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Squirrel	MODERN SPECIES	109	OLA1 (ENSSTOG00000015547)	CIR1 (ENSSTOG00000001233)	SCRN3 (ENSSTOG00000001236)	GPR155 (ENSSTOG00000001239) #7	ENSSTOG00000004271 #8	CHRNA1 (ENSSTOG00000004281) #9	CHN1 (ENSSTOG00000004301) #10	ATF2 (ENSSTOG00000014079) #12	ENSSTOG00000013572 #13	LNPK (ENSSTOG00000014498) #15	EVX2 (ENSSTOG00000014512) #16	HOXD13 (ENSSTOG00000004117) #17	HOXD12 (ENSSTOG00000004918) #18	HOXD10 (ENSSTOG00000003935) #20	HOXD9 (ENSSTOG00000026761) #21	ENSSTOG00000023453 #22	HOXD4 (ENSSTOG00000029055) #23	HOXD3 (ENSSTOG00000014680)	HOXD1 (ENSSTOG00000012230)	MTX2 (ENSSTOG00000014688)	ENSSTOG00000030884	HNRNPA3 (ENSSTOG00000025125)	NFE2L2 (ENSSTOG00000000313)	AGPS (ENSSTOG00000012623)	ENSSTOG00000003267	PDE11A (ENSSTOG00000012639)	ENSSTOG00000008853	RBM45 (ENSSTOG00000002708)	OSBPL6 (ENSSTOG00000006092)	PRKRA (ENSSTOG00000006156)	PJVK (ENSSTOG00000028411)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	323				WIPF1 (ENSUPAG00010020649) #8	CHRNA1 (ENSUPAG00010020641) #9	CHN1 (ENSUPAG00010020575) #10	ATF2 (ENSUPAG00010020491) #12	ENSUPAG00010020485 #13	LNPK (ENSUPAG00010020452) #15	EVX2 (ENSUPAG00010020442) #16	HOXD13 (ENSUPAG00010020441) #17	HOXD12 (ENSUPAG00010020440) #18	HOXD11 (ENSUPAG00010020439) #19	HOXD10 (ENSUPAG00010020434) #20	HOXD9 (ENSUPAG00010020431) #21	HOXD8 (ENSUPAG00010020425) #22	HOXD4 (ENSUPAG00010020416) #23	HOXD3 (ENSUPAG00010020410)	HOXD1 (ENSUPAG00010020407)	ENSUPAG00010020400	MTX2 (ENSUPAG00010020394)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	SCRN3 (ENSSVLG00005002703)	GPR155 (ENSSVLG00005002750) #7	WIPF1 (ENSSVLG00005002786) #8	CHRNA1 (ENSSVLG00005002856) #9	CHN1 (ENSSVLG00005003041) #10	ENSSVLG00005003279 #12	ENSSVLG00005003430 #13	ENSSVLG00005003466	LNPK (ENSSVLG00005003500) #15	EVX2 (ENSSVLG00005003539) #16	HOXD13 (ENSSVLG00005003554) #17	HOXD12 (ENSSVLG00005003565) #18	HOXD11 (ENSSVLG00005003581) #19	HOXD10 (ENSSVLG00005003599) #20	HOXD9 (ENSSVLG00005003618) #21	HOXD8 (ENSSVLG00005003645) #22	HOXD4 (ENSSVLG00005003676) #23	HOXD1 (ENSSVLG00005003762)	MTX2 (ENSSVLG00005003812)	ENSSVLG00005003881	ENSSVLG00005003903	AGPS (ENSSVLG00005003959)	ENSSVLG00005003996	ENSSVLG00005004006	ENSSVLG00005004018	PDE11A (ENSSVLG00005004050)	ENSSVLG00005004113	RBM45 (ENSSVLG00005004137)	OSBPL6 (ENSSVLG00005004465)	PRKRA (ENSSVLG00005005027)	PJVK (ENSSVLG00005005095)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	324	ENSDORG00000008681	Sp9 (ENSDORG00000025534)	Cir1 (ENSDORG00000013676)	ENSDORG00000013682	Gpr155 (ENSDORG00000013683) #7	ENSDORG00000027952 #8	Chrna1 (ENSDORG00000001136) #9	Chn1 (ENSDORG00000002182) #10	Atf2 (ENSDORG00000024409) #12	Atp5g3 (ENSDORG00000012973) #13	Lnpk (ENSDORG00000015736) #15	Evx2 (ENSDORG00000009432) #16	Hoxd12 (ENSDORG00000009434) #18	ENSDORG00000029219 #19	Hoxd10 (ENSDORG00000009436) #20	ENSDORG00000027655 #22	Hoxd4 (ENSDORG00000028681) #23	Hoxd3 (ENSDORG00000029389)	Hoxd1 (ENSDORG00000009445)	Mtx2 (ENSDORG00000003848)	Hnrnpa3 (ENSDORG00000011155)	Nfe2l2 (ENSDORG00000030173)	Agps (ENSDORG00000006480)	ENSDORG00000028567	ENSDORG00000028697	ENSDORG00000023150	Cyct (ENSDORG00000004101)	Rbm45 (ENSDORG00000015831)	Osbpl6 (ENSDORG00000001912)	Prkra (ENSDORG00000013338)	Pjvk (ENSDORG00000013339)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000159964
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00940000171387	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000154808.a.a	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	188	Gpr155 (ENSCGRG00001014219) #7	ENSCGRG00001021853	Chrna1 (ENSCGRG00001020291) #9	ENSCGRG00001019803	Chn1 (ENSCGRG00001019152) #10	Atf2 (ENSCGRG00001015584) #12	Atp5g3 (ENSCGRG00001012041) #13	Lnpk (ENSCGRG00001011515) #15	ENSCGRG00001006802	Evx2 (ENSCGRG00001003649) #16	Hoxd13 (ENSCGRG00001001661) #17	Hoxd12 (ENSCGRG00001000877) #18	Hoxd11 (ENSCGRG00001010386) #19	Hoxd10 (ENSCGRG00001008302) #20	Hoxd9 (ENSCGRG00001005991) #21	Hoxd8 (ENSCGRG00001013130) #22	Hoxd4 (ENSCGRG00001012360) #23	Hoxd3 (ENSCGRG00001011863)	Hoxd1 (ENSCGRG00001011572)	ENSCGRG00001014512	Mtx2 (ENSCGRG00001014247)	ENSCGRG00001003235	ENSCGRG00001008592	Nfe2l2 (ENSCGRG00001005715)	Agps (ENSCGRG00001003863)	Ttc30b (ENSCGRG00001002157)	Ttc30a1 (ENSCGRG00001000892)	ENSCGRG00001003072	Pde11a (ENSCGRG00001011422)	Cyct (ENSCGRG00001008096)	Rbm45 (ENSCGRG00001005759)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	618	Scrn3 (ENSMAUG00000020703)	Gpr155 (ENSMAUG00000019481) #7	ENSMAUG00000019796	Chrna1 (ENSMAUG00000017924) #9	Chn1 (ENSMAUG00000018455) #10	Atf2 (ENSMAUG00000018366) #12	Atp5g3 (ENSMAUG00000017685) #13	ENSMAUG00000020495	Lnpk (ENSMAUG00000018821) #15	Evx2 (ENSMAUG00000020383) #16	Hoxd13 (ENSMAUG00000017185) #17	Hoxd12 (ENSMAUG00000018416) #18	ENSMAUG00000020249 #19	Hoxd10 (ENSMAUG00000016731) #20	Hoxd9 (ENSMAUG00000018538) #21	Hoxd8 (ENSMAUG00000018092) #22	Hoxd4 (ENSMAUG00000018545) #23	Hoxd3 (ENSMAUG00000018318)	Hoxd1 (ENSMAUG00000018401)	Mtx2 (ENSMAUG00000017870)	ENSMAUG00000017462	Nfe2l2 (ENSMAUG00000017700)	Agps (ENSMAUG00000017317)	Pde11a (ENSMAUG00000021257)	Cyct (ENSMAUG00000016722)	Rbm45 (ENSMAUG00000016948)	Osbpl6 (ENSMAUG00000018609)	Prkra (ENSMAUG00000019631)	Pjvk (ENSMAUG00000018018)	Fkbp7 (ENSMAUG00000016606)	Plekha3 (ENSMAUG00000019341)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b
Prairie vole	MODERN SPECIES	12	Cir1 (ENSMOCG00000017545)	Scrn3 (ENSMOCG00000018966)	Gpr155 (ENSMOCG00000003950) #7	ENSMOCG00000014660	Chrna1 (ENSMOCG00000020367) #9	Chn1 (ENSMOCG00000005574) #10	Atf2 (ENSMOCG00000015301) #12	ENSMOCG00000012786 #13	Lnpk (ENSMOCG00000022345) #15	Evx2 (ENSMOCG00000010466) #16	Hoxd13 (ENSMOCG00000014618) #17	Hoxd12 (ENSMOCG00000018953) #18	Hoxd11 (ENSMOCG00000019226) #19	Hoxd10 (ENSMOCG00000006052) #20	Hoxd9 (ENSMOCG00000005870) #21	Hoxd8 (ENSMOCG00000022746) #22	Hoxd3 (ENSMOCG00000022552)	Hoxd4 (ENSMOCG00000013646) #23	Hoxd1 (ENSMOCG00000014086)	Mtx2 (ENSMOCG00000017110)	ENSMOCG00000019409	Nfe2l2 (ENSMOCG00000020760)	Agps (ENSMOCG00000017476)	Ttc30b (ENSMOCG00000001580)	ENSMOCG00000001098	Ttc30a2 (ENSMOCG00000002802)	Pde11a (ENSMOCG00000005959)	Cyct (ENSMOCG00000021506)	Rbm45 (ENSMOCG00000017295)	Osbpl6 (ENSMOCG00000017155)	Prkra (ENSMOCG00000004548)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Scrn3 (ENSPEMG00000022424)	Gpr155 (ENSPEMG00000022602) #7	Wipf1 (ENSPEMG00000013848) #8	Chrna1 (ENSPEMG00000012571) #9	Chn1 (ENSPEMG00000022535) #10	Atf2 (ENSPEMG00000021625) #12	Atp5g3 (ENSPEMG00000023766) #13	ENSPEMG00000008662	Lnpk (ENSPEMG00000017827) #15	Evx2 (ENSPEMG00000022145) #16	Hoxd13 (ENSPEMG00000022412) #17	Hoxd12 (ENSPEMG00000019240) #18	ENSPEMG00000018816 #19	Hoxd10 (ENSPEMG00000030445) #20	Hoxd9 (ENSPEMG00000006162) #21	ENSPEMG00000028623 #22	ENSPEMG00000029322	Hoxd4 (ENSPEMG00000024627) #23	Hoxd3 (ENSPEMG00000028862)	Hoxd1 (ENSPEMG00000021389)	Mtx2 (ENSPEMG00000022093)	Hnrnpa3 (ENSPEMG00000021885)	Nfe2l2 (ENSPEMG00000023181)	Agps (ENSPEMG00000010561)	ENSPEMG00000023662	Ttc30b (ENSPEMG00000001902)	Ttc30a1 (ENSPEMG00000025624)	Pde11a (ENSPEMG00000021597)	Cyct (ENSPEMG00000028091)	Rbm45 (ENSPEMG00000002470)	Osbpl6 (ENSPEMG00000010580)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p.a.a	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p.a.a	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p.a.a	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00390000010116.y.a.b	ENSGT00390000010116.y.a.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618
Mouse	MODERN SPECIES	11	Cir1 (ENSMUSG00000041777)	Scrn3 (ENSMUSG00000008226)	Gpr155 (ENSMUSG00000041762) #7	Wipf1 (ENSMUSG00000075284) #8	Chrna1 (ENSMUSG00000027107) #9	Chn1 (ENSMUSG00000056486) #10	Atf2 (ENSMUSG00000027104) #12	Atp5g3 (ENSMUSG00000018770) #13	Lnpk (ENSMUSG00000009207) #15	Evx2 (ENSMUSG00000001815) #16	Hoxd13 (ENSMUSG00000001819) #17	Hoxd12 (ENSMUSG00000001823) #18	Hoxd11 (ENSMUSG00000042499) #19	Hoxd10 (ENSMUSG00000050368) #20	Hoxd9 (ENSMUSG00000043342) #21	Hoxd8 (ENSMUSG00000027102) #22	Hoxd3 (ENSMUSG00000079277)	Hoxd4 (ENSMUSG00000101174) #23	Hoxd1 (ENSMUSG00000042448)	Mtx2 (ENSMUSG00000027099)	Hnrnpa3 (ENSMUSG00000059005)	Nfe2l2 (ENSMUSG00000015839)	Agps (ENSMUSG00000042410)	Ttc30b (ENSMUSG00000075273)	Ttc30a2 (ENSMUSG00000075272)	Ttc30a1 (ENSMUSG00000075271)	Pde11a (ENSMUSG00000075270)	Cyct (ENSMUSG00000056436)	Rbm45 (ENSMUSG00000042369)	Osbpl6 (ENSMUSG00000042359)	Prkra (ENSMUSG00000002731)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00730000111135	ENSGT00390000013474.a	ENSGT00390000004153 #7	ENSGT00910000144296 #8	ENSGT00940000156851 #9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #10	ENSGT00940000156582 #12	ENSGT00940000154298.a.a #13	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000153147.m.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.p.a.b	ENSGT00950000182892.a.a.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00390000010116.y.b	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000156791	ENSGT00940000157618	ENSGT00950000183140.a.b
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spretus	MODERN SPECIES	11	Cir1 (MGP_SPRETEiJ_G0024580)	Scrn3 (MGP_SPRETEiJ_G0024581)	Gpr155 (MGP_SPRETEiJ_G0024582) #7	Wipf1 (MGP_SPRETEiJ_G0024583) #8	Chrna1 (MGP_SPRETEiJ_G0024584) #9	Chn1 (MGP_SPRETEiJ_G0024585) #10	Atf2 (MGP_SPRETEiJ_G0024586) #12	Atp5g3 (MGP_SPRETEiJ_G0024587) #13	Lnpk (MGP_SPRETEiJ_G0024588) #15	Evx2 (MGP_SPRETEiJ_G0024589) #16	Hoxd13 (MGP_SPRETEiJ_G0024590) #17	Hoxd12 (MGP_SPRETEiJ_G0024591) #18	Hoxd11 (MGP_SPRETEiJ_G0024592) #19	Hoxd10 (MGP_SPRETEiJ_G0024593) #20	Hoxd9 (MGP_SPRETEiJ_G0024594) #21	Hoxd8 (MGP_SPRETEiJ_G0024595) #22	Hoxd3 (MGP_SPRETEiJ_G0024596)	Hoxd4 (MGP_SPRETEiJ_G0024597) #23	MGP_SPRETEiJ_G0024598 #23	Hoxd1 (MGP_SPRETEiJ_G0024599)	Mtx2 (MGP_SPRETEiJ_G0024600)	MGP_SPRETEiJ_G0024601	Nfe2l2 (MGP_SPRETEiJ_G0024602)	Agps (MGP_SPRETEiJ_G0024603)	MGP_SPRETEiJ_G0024604	Pde11a (MGP_SPRETEiJ_G0024605)	Cyct (MGP_SPRETEiJ_G0024606)	Rbm45 (MGP_SPRETEiJ_G0024607)	Osbpl6 (MGP_SPRETEiJ_G0024608)	Prkra (MGP_SPRETEiJ_G0024609)	Pjvk (MGP_SPRETEiJ_G0024610)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	Cir1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023657)	Scrn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023658)	Gpr155 (MGP_CAROLIEiJ_G0023659) #7	Wipf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023660) #8	Chrna1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023661) #9	Chn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023662) #10	Atf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023663) #12	Atp5g3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023664) #13	Lnpk (MGP_CAROLIEiJ_G0023665) #15	Evx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023666) #16	Hoxd13 (MGP_CAROLIEiJ_G0023667) #17	Hoxd12 (MGP_CAROLIEiJ_G0023668) #18	Hoxd11 (MGP_CAROLIEiJ_G0023669) #19	Hoxd10 (MGP_CAROLIEiJ_G0023670) #20	Hoxd9 (MGP_CAROLIEiJ_G0023671) #21	Hoxd8 (MGP_CAROLIEiJ_G0023672) #22	Hoxd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023673)	Hoxd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023674) #23	MGP_CAROLIEiJ_G0023675 #23	Hoxd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023676)	Mtx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023677)	MGP_CAROLIEiJ_G0023678	Nfe2l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023679)	Agps (MGP_CAROLIEiJ_G0023680)	MGP_CAROLIEiJ_G0023681	MGP_CAROLIEiJ_G0023682	Pde11a (MGP_CAROLIEiJ_G0023683)	MGP_CAROLIEiJ_G0023684	Cyct (MGP_CAROLIEiJ_G0023685)	Rbm45 (MGP_CAROLIEiJ_G0023686)	Osbpl6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023687)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	MGP_PahariEiJ_G0025109	Scrn3 (MGP_PahariEiJ_G0025110)	Gpr155 (MGP_PahariEiJ_G0025111) #7	Wipf1 (MGP_PahariEiJ_G0025112) #8	Chrna1 (MGP_PahariEiJ_G0025113) #9	MGP_PahariEiJ_G0025114 #10	Atf2 (MGP_PahariEiJ_G0025115) #12	Atp5g3 (MGP_PahariEiJ_G0025116) #13	Lnpk (MGP_PahariEiJ_G0025117) #15	Evx2 (MGP_PahariEiJ_G0025118) #16	Hoxd13 (MGP_PahariEiJ_G0025119) #17	Hoxd12 (MGP_PahariEiJ_G0025120) #18	Hoxd11 (MGP_PahariEiJ_G0025121) #19	Hoxd10 (MGP_PahariEiJ_G0025122) #20	Hoxd9 (MGP_PahariEiJ_G0025123) #21	Hoxd8 (MGP_PahariEiJ_G0025124) #22	Hoxd3 (MGP_PahariEiJ_G0025125)	Hoxd4 (MGP_PahariEiJ_G0025126) #23	MGP_PahariEiJ_G0025127 #23	Hoxd1 (MGP_PahariEiJ_G0025128)	Mtx2 (MGP_PahariEiJ_G0025129)	Hnrnpa3 (MGP_PahariEiJ_G0025130)	Nfe2l2 (MGP_PahariEiJ_G0025131)	MGP_PahariEiJ_G0025132	MGP_PahariEiJ_G0025133	MGP_PahariEiJ_G0025134	Pde11a (MGP_PahariEiJ_G0025135)	Cyct (MGP_PahariEiJ_G0025136)	Rbm45 (MGP_PahariEiJ_G0025137)	Osbpl6 (MGP_PahariEiJ_G0025138)	Prkra (MGP_PahariEiJ_G0025139)
Rat	MODERN SPECIES	13	Gpr155 (ENSRNOG00000018485) #7	Wipf1 (ENSRNOG00000018406) #8	Rbx1-ps2 (ENSRNOG00000067031)	Chrna1 (ENSRNOG00000018286) #9	Chn1 (ENSRNOG00000017939) #10	ENSRNOG00000068403	Atf2 (ENSRNOG00000001597) #12	Atp5mc3 (ENSRNOG00000001596) #13	Lnpk (ENSRNOG00000001593) #15	Evx2 (ENSRNOG00000001589) #16	Hoxd13 (ENSRNOG00000001588) #17	Hoxd12 (ENSRNOG00000001587) #18	Hoxd11 (ENSRNOG00000069591) #19	Hoxd10 (ENSRNOG00000001581) #20	Hoxd9 (ENSRNOG00000001580) #21	Hoxd8 (ENSRNOG00000071108) #22	Hoxd4 (ENSRNOG00000001578) #23	AABR07052559.1 (ENSRNOG00000053144)	Hoxd3 (ENSRNOG00000001577)	Hoxd1 (ENSRNOG00000001572)	Mtx2 (ENSRNOG00000001559)	Hnrnpa3 (ENSRNOG00000052968)	Nfe2l2 (ENSRNOG00000001548)	ENSRNOG00000066660	Agps (ENSRNOG00000001547)	Ttc30b (ENSRNOG00000059460)	Ttc30a1 (ENSRNOG00000052519)	Ttc30a (ENSRNOG00000069321)	Cyct (ENSRNOG00000024457)	Rbm45 (ENSRNOG00000010595)	Osbpl6 (ENSRNOG00000010812)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1735	Cir1 (ENSNGAG00000023091)	Scrn3 (ENSNGAG00000008783)	Gpr155 (ENSNGAG00000019246) #7	ENSNGAG00000022478 #8	Chrna1 (ENSNGAG00000023534) #9	Chn1 (ENSNGAG00000021893) #10	Atf2 (ENSNGAG00000003870) #12	Atp5g3 (ENSNGAG00000004748) #13	Lnpk (ENSNGAG00000023466) #15	Evx2 (ENSNGAG00000023877) #16	Hoxd13 (ENSNGAG00000023727) #17	Hoxd12 (ENSNGAG00000023455) #18	Hoxd11 (ENSNGAG00000023438) #19	Hoxd10 (ENSNGAG00000023868) #20	Hoxd9 (ENSNGAG00000011105) #21	Hoxd8 (ENSNGAG00000011799) #22	Hoxd4 (ENSNGAG00000020270) #23	Hoxd3 (ENSNGAG00000021055)	Hoxd1 (ENSNGAG00000021714)	Mtx2 (ENSNGAG00000020555)	ENSNGAG00000021745	Nfe2l2 (ENSNGAG00000022809)	Agps (ENSNGAG00000020263)	ENSNGAG00000022555	Pde11a (ENSNGAG00000023493)	Cyct (ENSNGAG00000023547)	ENSNGAG00000021016	Rbm45 (ENSNGAG00000023886)	Osbpl6 (ENSNGAG00000014527)	Prkra (ENSNGAG00000021816)	Pjvk (ENSNGAG00000022020)