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Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37	ENSGT00940000155850	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a
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Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
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Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000171387	ENSGT00390000004755.tb.a.a	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.a ##26	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.b ##26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000171387	ENSGT00390000004755.tb.a.a	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.a ##26	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.b ##26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35
Dolphin	MODERN SPECIES	804											LNPK (ENSTTRG00000013765) #15	EVX2 (ENSTTRG00000013768) #16	HOXD13 (ENSTTRG00000013771) #17	HOXD12 (ENSTTRG00000013772) #18	HOXD9 (ENSTTRG00000013773) #21	HOXD8 (ENSTTRG00000013777) #22	HOXD4 (ENSTTRG00000013778) #23	HOXD3 (ENSTTRG00000013779) #24
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000171387	ENSGT00390000004755.tb.a.a	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000008142.t	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.a ##26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Vaquita	MODERN SPECIES	18	ENSPSNG00000006580 #9	ENSPSNG00000006539	CHRNA1 (ENSPSNG00000006481) #11	CHN1 (ENSPSNG00000006315) #12	ATF2 (ENSPSNG00000006111) #13	ATP5MC3 (ENSPSNG00000006024) #14	ENSPSNG00000005869	ENSPSNG00000005846	LNPK (ENSPSNG00000005786) #15	EVX2 (ENSPSNG00000005734) #16	HOXD13 (ENSPSNG00000005715) #17	HOXD12 (ENSPSNG00000005695) #18	HOXD11 (ENSPSNG00000005666) #19	HOXD10 (ENSPSNG00000005654) #20	HOXD9 (ENSPSNG00000005639) #21	HOXD8 (ENSPSNG00000005602) #22	HOXD4 (ENSPSNG00000005556) #23	HOXD3 (ENSPSNG00000005539) #24	HOXD1 (ENSPSNG00000005524)	MTX2 (ENSPSNG00000005488) #25	ENSPSNG00000005439 ##26	NFE2L2 (ENSPSNG00000005384) #27	AGPS (ENSPSNG00000005315) #28	ENSPSNG00000005284 ##30	ENSPSNG00000007902 #30	PDE11A (ENSPSNG00000007618) #31	ENSPSNG00000007564	RBM45 (ENSPSNG00000007527) #32	OSBPL6 (ENSPSNG00000007225) #33	PRKRA (ENSPSNG00000007030) #35	PJVK (ENSPSNG00000006966) #36
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000171387	ENSGT00390000004755.tb.a.a	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000008142.t	ENSGT00950000182834.A.a.a.t	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.b ##26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Beluga whale	MODERN SPECIES	84	WIPF1 (ENSDLEG00000008289)	ENSDLEG00000008360	CHRNA1 (ENSDLEG00000008433) #11	CHN1 (ENSDLEG00000008654) #12	ATF2 (ENSDLEG00000008726) #13	ATP5G3 (ENSDLEG00000008800) #14	ENSDLEG00000008837	ENSDLEG00000008854	LNPK (ENSDLEG00000008885) #15	EVX2 (ENSDLEG00000008943) #16	HOXD13 (ENSDLEG00000009014) #17	HOXD12 (ENSDLEG00000009038) #18	ENSDLEG00000009052 #19	HOXD10 (ENSDLEG00000009076) #20	HOXD9 (ENSDLEG00000009091) #21	HOXD8 (ENSDLEG00000009104) #22	HOXD4 (ENSDLEG00000009166) #23	HOXD3 (ENSDLEG00000009171) #24	HOXD1 (ENSDLEG00000009181)	MTX2 (ENSDLEG00000009199) #25	ENSDLEG00000009227 ##26	NFE2L2 (ENSDLEG00000009266) #27	AGPS (ENSDLEG00000009335) #28	ENSDLEG00000009463 ##30	ENSDLEG00000009469 #30	ENSDLEG00000009481 #31	ENSDLEG00000009493	RBM45 (ENSDLEG00000009507) #32	OSBPL6 (ENSDLEG00000009570) #33	PRKRA (ENSDLEG00000009768) #35	PJVK (ENSDLEG00000009801) #36
Narwhal	MODERN SPECIES	302	ENSMMNG00015008159	ENSMMNG00015008133	CHRNA1 (ENSMMNG00015008057) #11	CHN1 (ENSMMNG00015007913) #12	ATF2 (ENSMMNG00015007777) #13	ATP5MC3 (ENSMMNG00015007729) #14	ENSMMNG00015007699	ENSMMNG00015007684	LNPK (ENSMMNG00015007647) #15	EVX2 (ENSMMNG00015007622) #16	HOXD13 (ENSMMNG00015007609) #17	HOXD12 (ENSMMNG00015007598) #18	ENSMMNG00015007589 #19	HOXD10 (ENSMMNG00015007571) #20	HOXD9 (ENSMMNG00015007556) #21	HOXD8 (ENSMMNG00015007526) #22	HOXD4 (ENSMMNG00015007477) #23	HOXD3 (ENSMMNG00015007460) #24	HOXD1 (ENSMMNG00015007440)	MTX2 (ENSMMNG00015007394) #25	ENSMMNG00015007339 ##26	NFE2L2 (ENSMMNG00015007306) #27	AGPS (ENSMMNG00015007255) #28	ENSMMNG00015007232 ##30	ENSMMNG00015007201 #30	ENSMMNG00015014296	PDE11A (ENSMMNG00015014260) #31	ENSMMNG00015014238	RBM45 (ENSMMNG00015014220) #32	OSBPL6 (ENSMMNG00015014111) #33	PRKRA (ENSMMNG00015014019) #35
Sperm whale	MODERN SPECIES	11	SCRN3 (ENSPCTG00005005779) #8	GPR155 (ENSPCTG00005005831) #9	WIPF1 (ENSPCTG00005005895)	ENSPCTG00005005929	CHRNA1 (ENSPCTG00005005965) #11	CHN1 (ENSPCTG00005006263) #12	ATF2 (ENSPCTG00005007004) #13	ATP5MC3 (ENSPCTG00005007202) #14	LNPK (ENSPCTG00005007293) #15	EVX2 (ENSPCTG00005007330) #16	HOXD13 (ENSPCTG00005007354) #17	HOXD12 (ENSPCTG00005007367) #18	ENSPCTG00005007381 #19	HOXD10 (ENSPCTG00005007393) #20	HOXD9 (ENSPCTG00005007399) #21	HOXD8 (ENSPCTG00005007418) #22	HOXD4 (ENSPCTG00005007493) #23	HOXD3 (ENSPCTG00005007508) #24	HOXD1 (ENSPCTG00005007516)	MTX2 (ENSPCTG00005007528) #25	ENSPCTG00005003466 ##26	NFE2L2 (ENSPCTG00005003486) #27	AGPS (ENSPCTG00005003530) #28	ENSPCTG00005003590 #30	ENSPCTG00005003599 #30	PDE11A (ENSPCTG00005003616) #31	ENSPCTG00005003686	RBM45 (ENSPCTG00005003694) #32	OSBPL6 (ENSPCTG00005003757) #33	PJVK (ENSPCTG00005003934) #36	PRKRA (ENSPCTG00005003951) #35
Blue whale	MODERN SPECIES	18	SCRN3 (ENSBMSG00010005522) #8	GPR155 (ENSBMSG00010005540) #9	ENSBMSG00010005563	ENSBMSG00010005581	CHRNA1 (ENSBMSG00010005615) #11	CHN1 (ENSBMSG00010005726) #12	ATF2 (ENSBMSG00010005883) #13	ATP5MC3 (ENSBMSG00010005937) #14	LNPK (ENSBMSG00010005955) #15	EVX2 (ENSBMSG00010005974) #16	HOXD13 (ENSBMSG00010005980) #17	HOXD12 (ENSBMSG00010005987) #18	HOXD11 (ENSBMSG00010005993) #19	HOXD10 (ENSBMSG00010006002) #20	HOXD9 (ENSBMSG00010006014) #21	HOXD8 (ENSBMSG00010006022) #22	HOXD4 (ENSBMSG00010006036) #23	HOXD3 (ENSBMSG00010006046) #24	HOXD1 (ENSBMSG00010006055)	MTX2 (ENSBMSG00010006100) #25	ENSBMSG00010006149 ##26	NFE2L2 (ENSBMSG00010006157) #27	AGPS (ENSBMSG00010006175) #28	ENSBMSG00010006193 ##30	ENSBMSG00010006199 #30	PDE11A (ENSBMSG00010006216) #31	ENSBMSG00010006255	ENSBMSG00010006266	RBM45 (ENSBMSG00010006279) #32	OSBPL6 (ENSBMSG00010006347) #33	PRKRA (ENSBMSG00010006442) #35
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00940000153299.c.a.b.u.a	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.a #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT01100000263474.a.b.b.f.g.a.b	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35
Bos	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00940000153299.c.a.b.u.a	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.a #26	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT01100000263474.a.b.b.f.g.a.b	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00940000153299.c.a.b.u.a	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.a #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35
Wild yak	MODERN SPECIES	2654										LNPK (ENSBMUG00000015713) #15	ENSBMUG00000015669	ENSBMUG00000015650	HOXD13 (ENSBMUG00000015639) #17	HOXD12 (ENSBMUG00000015618) #18	HOXD10 (ENSBMUG00000015601) #20	ENSBMUG00000015587 #22	HOXD3 (ENSBMUG00000015572) #24	ENSBMUG00000015556
Domestic yak	MODERN SPECIES	11	GPR155 (ENSBGRG00000014360) #9	ENSBGRG00000014674	ENSBGRG00000014699	CHRNA1 (ENSBGRG00000014839) #11	CHN1 (ENSBGRG00000015101) #12	ATF2 (ENSBGRG00000015648) #13	ATP5MC3 (ENSBGRG00000016024) #14	ENSBGRG00000016132	LNPK (ENSBGRG00000016182) #15	EVX2 (ENSBGRG00000016780) #16	HOXD13 (ENSBGRG00000016836) #17	HOXD12 (ENSBGRG00000016890) #18	HOXD11 (ENSBGRG00000016923) #19	HOXD10 (ENSBGRG00000016979) #20	HOXD9 (ENSBGRG00000017014) #21	HOXD8 (ENSBGRG00000017045) #22	ENSBGRG00000017167 #23	HOXD3 (ENSBGRG00000017255) #24	HOXD1 (ENSBGRG00000017303)	MTX2 (ENSBGRG00000017363) #25	ENSBGRG00000000202 #26	NFE2L2 (ENSBGRG00000000213) #27	AGPS (ENSBGRG00000000237) #28	ENSBGRG00000000256 ##30	ENSBGRG00000000264	ENSBGRG00000000270 #30	PDE11A (ENSBGRG00000000288) #31	ENSBGRG00000000317	ENSBGRG00000000319	ENSBGRG00000000328	RBM45 (ENSBGRG00000000341) #32
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT01030000234916.g.b	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT01100000263474.a.b.b.f.g.a.b	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33
Cow	MODERN SPECIES	11	WIPF1 (ENSBTAG00000001585)	CHRNA1 (ENSBTAG00000018253) #11	CHN1 (ENSBTAG00000008028) #12	ATF2 (ENSBTAG00000002295) #13	ATP5MC3 (ENSBTAG00000002944) #14	ENSBTAG00000031711	LNPK (ENSBTAG00000018061) #15	ENSBTAG00000050237	ENSBTAG00000002009	EVX2 (ENSBTAG00000049537) #16	HOXD13 (ENSBTAG00000004313) #17	HOXD12 (ENSBTAG00000004314) #18	HOXD11 (ENSBTAG00000033330) #19	HOXD10 (ENSBTAG00000016030) #20	HOXD9 (ENSBTAG00000016033) #21	HOXD8 (ENSBTAG00000049845) #22	HOXD4 (ENSBTAG00000039581) #23	HOXD3 (ENSBTAG00000004835) #24	HOXD1 (ENSBTAG00000015840)	MTX2 (ENSBTAG00000006693) #25	HNRNPA3 (ENSBTAG00000021580) #26	NFE2L2 (ENSBTAG00000019255) #27	AGPS (ENSBTAG00000009897) #28	TTC30B (ENSBTAG00000027696) ##30	TTC30A (ENSBTAG00000027694) #30	ENSBTAG00000049860	PDE11A (ENSBTAG00000016396) #31	CYCT (ENSBTAG00000039522)	RBM45 (ENSBTAG00000006168) #32	OSBPL6 (ENSBTAG00000014405) #33	PRKRA (ENSBTAG00000001096) #35
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	11	ENSBIXG00005002196	CHRNA1 (ENSBIXG00005028981) #11	CHN1 (ENSBIXG00005001962) #12	ATF2 (ENSBIXG00005001719) #13	ATP5MC3 (ENSBIXG00005029222) #14	ENSBIXG00005029239	LNPK (ENSBIXG00005005282) #15	ENSBIXG00005029245	ENSBIXG00005029246	EVX2 (ENSBIXG00005005288) #16	HOXD13 (ENSBIXG00005001519) #17	HOXD12 (ENSBIXG00005001517) #18	HOXD11 (ENSBIXG00005001515) #19	HOXD10 (ENSBIXG00005005289) #20	HOXD9 (ENSBIXG00005030437) #21	HOXD8 (ENSBIXG00005030431) #22	HOXD3 (ENSBIXG00005030419) #24	HOXD1 (ENSBIXG00005030413)	MTX2 (ENSBIXG00005030400) #25	ENSBIXG00005030356	ENSBIXG00005030352	HNRNPA3 (ENSBIXG00005030333) #26	NFE2L2 (ENSBIXG00005030317) #27	AGPS (ENSBIXG00005030278) #28	ENSBIXG00005030257 ##30	ENSBIXG00005030245	ENSBIXG00005030242 #30	PDE11A (ENSBIXG00005030175) #31	ENSBIXG00005030117	RBM45 (ENSBIXG00005030103) #32	OSBPL6 (ENSBIXG00005029906) #33
American bison	MODERN SPECIES	3320	SCRN3 (ENSBBBG00000017011) #8	GPR155 (ENSBBBG00000017134) #9	WIPF1 (ENSBBBG00000017196) #10	CHRNA1 (ENSBBBG00000017301) #11	CHN1 (ENSBBBG00000004302) #12	ATF2 (ENSBBBG00000017564) #13	ATP5MC3 (ENSBBBG00000017586) #14	ENSBBBG00000017593	LNPK (ENSBBBG00000017627) #15	ENSBBBG00000017634	ENSBBBG00000017638	HOXD13 (ENSBBBG00000017641) #17	HOXD12 (ENSBBBG00000017645) #18	HOXD10 (ENSBBBG00000006962) #20	HOXD9 (ENSBBBG00000017650) #21	HOXD8 (ENSBBBG00000017657) #22	HOXD4 (ENSBBBG00000017669) #23	HOXD3 (ENSBBBG00000017682) #24	HOXD1 (ENSBBBG00000017690)	ENSBBBG00000004376	ENSBBBG00000017700	MTX2 (ENSBBBG00000017733) #25	ENSBBBG00000007269 #26	NFE2L2 (ENSBBBG00000017780) #27	AGPS (ENSBBBG00000017817) #28	ENSBBBG00000007701 ##30	ENSBBBG00000017832 #30	ENSBBBG00000017839	PDE11A (ENSBBBG00000017894) #31	ENSBBBG00000017912	RBM45 (ENSBBBG00000004406) #32
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT01010000228762	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.fc.a ##30	ENSGT00390000010116.fc.b #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	11	ENSOARG00020001367	CHRNA1 (ENSOARG00020001273) #11	ENSOARG00020001229	ENSOARG00020001216	CHN1 (ENSOARG00020000831) #12	ATF2 (ENSOARG00020000583) #13	ATP5MC3 (ENSOARG00020000538) #14	LNPK (ENSOARG00020000416) #15	ENSOARG00020000394	EVX2 (ENSOARG00020000381) #16	HOXD13 (ENSOARG00020000373) #17	HOXD12 (ENSOARG00020000357) #18	hoxd11 (ENSOARG00020000346) #19	HOXD10 (ENSOARG00020000330) #20	HOXD9 (ENSOARG00020000321) #21	HOXD8 (ENSOARG00020000297) #22	HOXD4 (ENSOARG00020000275) #23	HOXD3 (ENSOARG00020000257) #24	HOXD1 (ENSOARG00020000237)	MTX2 (ENSOARG00020000188) #25	HNRNPA3 (ENSOARG00020000123) #26	NFE2L2 (ENSOARG00020022726) #27	AGPS (ENSOARG00020022410) #28	ENSOARG00020022373 ##30	ENSOARG00020022364 #30	PDE11A (ENSOARG00020022115) #31	ENSOARG00020022078	RBM45 (ENSOARG00020022028) #32	OSBPL6 (ENSOARG00020020986) #33	PRKRA (ENSOARG00020020855) #35	PJVK (ENSOARG00020020753) #36
Goat	MODERN SPECIES	11	ENSCHIG00000009043	CHRNA1 (ENSCHIG00000018272) #11	CHN1 (ENSCHIG00000017514) #12	ENSCHIG00000012635	ATF2 (ENSCHIG00000011446) #13	ENSCHIG00000018041 #14	LNPK (ENSCHIG00000012313) #15	ENSCHIG00000025787	ENSCHIG00000004992	EVX2 (ENSCHIG00000026644) #16	HOXD13 (ENSCHIG00000009994) #17	HOXD12 (ENSCHIG00000014734) #18	HOXD11 (ENSCHIG00000026087) #19	HOXD10 (ENSCHIG00000011771) #20	HOXD9 (ENSCHIG00000023245) #21	HOXD8 (ENSCHIG00000013371) #22	HOXD4 (ENSCHIG00000019702) #23	HOXD3 (ENSCHIG00000011624) #24	HOXD1 (ENSCHIG00000017515)	MTX2 (ENSCHIG00000008892) #25	ENSCHIG00000015430 #26	NFE2L2 (ENSCHIG00000026055) #27	AGPS (ENSCHIG00000015256) #28	ENSCHIG00000011750 ##30	ENSCHIG00000011716 #30	PDE11A (ENSCHIG00000016852) #31	ENSCHIG00000026156	RBM45 (ENSCHIG00000010687) #32	ENSCHIG00000017164	OSBPL6 (ENSCHIG00000008898) #33	PRKRA (ENSCHIG00000015333) #35
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	342					ENSMMSG00000008116	ENSMMSG00000008102 ##12	ATF2 (ENSMMSG00000007713) #13	ENSMMSG00000007642 #14	LNPK (ENSMMSG00000007582) #15	EVX2 (ENSMMSG00000007555) #16	HOXD13 (ENSMMSG00000007541) #17	HOXD12 (ENSMMSG00000007530) #18	HOXD11 (ENSMMSG00000007513) #19	HOXD10 (ENSMMSG00000007495) #20	HOXD9 (ENSMMSG00000007480) #21	HOXD8 (ENSMMSG00000007407) #22	HOXD4 (ENSMMSG00000007365) #23	HOXD3 (ENSMMSG00000007343) #24	HOXD1 (ENSMMSG00000007322)	MTX2 (ENSMMSG00000007226) #25	ENSMMSG00000007068 ##26	NFE2L2 (ENSMMSG00000006992) #27	ENSMMSG00000006963	AGPS (ENSMMSG00000006894) #28	ENSMMSG00000006854 ##30	ENSMMSG00000006819 #30	PDE11A (ENSMMSG00000006654) #31	ENSMMSG00000006624	RBM45 (ENSMMSG00000006596) #32	OSBPL6 (ENSMMSG00000006219) #33
Yarkand deer	MODERN SPECIES	26	GPR155 (ENSCHYG00000018083) #9	ENSCHYG00000017877	CHRNA1 (ENSCHYG00000017619) #11	ENSCHYG00000017575	CHN1 (ENSCHYG00000017015) #12	ATF2 (ENSCHYG00000016575) #13	ATP5MC3 (ENSCHYG00000016464) #14	ENSCHYG00000016417	ENSCHYG00000016391	LNPK (ENSCHYG00000016125) #15	HOXD13 (ENSCHYG00000015985) #17	HOXD12 (ENSCHYG00000015954) #18	ENSCHYG00000015846	HOXD10 (ENSCHYG00000015831) #20	HOXD9 (ENSCHYG00000015808) #21	HOXD8 (ENSCHYG00000015741) #22	HOXD4 (ENSCHYG00000015683) #23	HOXD3 (ENSCHYG00000015650) #24	HOXD1 (ENSCHYG00000015562)	MTX2 (ENSCHYG00000015392) #25	ENSCHYG00000015305	ENSCHYG00000015038 #26	NFE2L2 (ENSCHYG00000024719) #27	AGPS (ENSCHYG00000024578) #28	ENSCHYG00000024559 ##30	ENSCHYG00000024550 #30	PDE11A (ENSCHYG00000024466) #31	ENSCHYG00000024445	ENSCHYG00000024431	RBM45 (ENSCHYG00000024364) #32	OSBPL6 (ENSCHYG00000023926) #33
Suina	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a.e #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00390000010491.kb.a	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37	ENSGT00940000155850
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	88	SCRN3 (ENSCWAG00000015324) #8	GPR155 (ENSCWAG00000015434) #9	WIPF1 (ENSCWAG00000000086) #10	CHRNA1 (ENSCWAG00000000173) #11	CHN1 (ENSCWAG00000000417) #12	ATF2 (ENSCWAG00000000507) #13	ENSCWAG00000000620 #14	LNPK (ENSCWAG00000000637) #15	ENSCWAG00000000677	EVX2 (ENSCWAG00000000686) #16	HOXD13 (ENSCWAG00000000704) #17	HOXD12 (ENSCWAG00000000716) #18	HOXD11 (ENSCWAG00000000728) #19	HOXD10 (ENSCWAG00000000737) #20	HOXD9 (ENSCWAG00000000750) #21	HOXD8 (ENSCWAG00000000766) #22	HOXD4 (ENSCWAG00000000799) #23	HOXD3 (ENSCWAG00000000815) #24	HOXD1 (ENSCWAG00000000831)	MTX2 (ENSCWAG00000000848) #25	HNRNPA3 (ENSCWAG00000000880) #26	NFE2L2 (ENSCWAG00000000916) #27	AGPS (ENSCWAG00000000957) #28	PDE11A (ENSCWAG00000001000) #31	ENSCWAG00000001084	RBM45 (ENSCWAG00000001104) #32	OSBPL6 (ENSCWAG00000001227) #33	PRKRA (ENSCWAG00000001459) #35	PJVK (ENSCWAG00000001480) #36	FKBP7 (ENSCWAG00000001502) #37	PLEKHA3 (ENSCWAG00000001517)
Pig	MODERN SPECIES	6	GPR155 (ENSSSCG00000015965) #9	ENSSSCG00000027348	CHRNA1 (ENSSSCG00000015969) #11	ENSSSCG00000022345 #12	ATF2 (ENSSSCG00000038076) #13	ATP5MC3 (ENSSSCG00000015973) #14	LNPK (ENSSSCG00000015976) #15	ENSSSCG00000039002	ENSSSCG00000053760	EVX2 (ENSSSCG00000023146) #16	HOXD13 (ENSSSCG00000057890) #17	HOXD12 (ENSSSCG00000015980) #18	HOXD11 (ENSSSCG00000034741) #19	HOXD10 (ENSSSCG00000015981) #20	HOXD9 (ENSSSCG00000015982) #21	HOXD8 (ENSSSCG00000040349) #22	HOXD4 (ENSSSCG00000015984) #23	HOXD3 (ENSSSCG00000015985) #24	HOXD1 (ENSSSCG00000015986)	MTX2 (ENSSSCG00000022222) #25	ENSSSCG00000015988 ##26	NFE2L2 (ENSSSCG00000015987) #27	AGPS (ENSSSCG00000023983) #28	PDE11A (ENSSSCG00000038903) #31	ENSSSCG00000047774	RBM45 (ENSSSCG00000015996) #32	OSBPL6 (ENSSSCG00000023133) #33	PRKRA (ENSSSCG00000038254) #35	PJVK (ENSSSCG00000015998) #36	FKBP7 (ENSSSCG00000015999) #37	PLEKHA3 (ENSSSCG00000049025)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
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Panthera	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.vb #30	ENSGT00390000010116.wb #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Tiger	MODERN SPECIES	43	SP3 (ENSPTIG00000014294)	ENSPTIG00000011872	ENSPTIG00000009967	CIR1 (ENSPTIG00000008708) #7	SCRN3 (ENSPTIG00000003437) #8	GPR155 (ENSPTIG00000018965) #9	WIPF1 (ENSPTIG00000016801) #10	CHRNA1 (ENSPTIG00000012090) #11	CHN1 (ENSPTIG00000006887) #12	ATF2 (ENSPTIG00000017517) #13	ATP5MC3 (ENSPTIG00000016881) #14	LNPK (ENSPTIG00000016532) #15	HOXD13 (ENSPTIG00000016212) #17	HOXD10 (ENSPTIG00000015771) #20	ENSPTIG00000006835 #21	ENSPTIG00000015581 #22	HOXD4 (ENSPTIG00000015199) #23	ENSPTIG00000013485	MTX2 (ENSPTIG00000011503) #25	HNRNPA3 (ENSPTIG00000008598) #26	NFE2L2 (ENSPTIG00000007874) #27
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.vb #30	ENSGT00390000010116.wb #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
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Cat	MODERN SPECIES	239	SCRN3 (ENSFCAG00000022042) #8	GPR155 (ENSFCAG00000000439) #9	ENSFCAG00000034843	WIPF1 (ENSFCAG00000014400) #10	CHRNA1 (ENSFCAG00000014103) #11	CHN1 (ENSFCAG00000039893) #12	ATF2 (ENSFCAG00000027595) #13	ATP5MC3 (ENSFCAG00000012719) #14	LNPK (ENSFCAG00000033171) #15	EVX2 (ENSFCAG00000023892) #16	HOXD13 (ENSFCAG00000030694) #17	HOXD12 (ENSFCAG00000044671) #18	HOXD11 (ENSFCAG00000030594) #19	HOXD10 (ENSFCAG00000006264) #20	HOXD9 (ENSFCAG00000035038) #21	HOXD8 (ENSFCAG00000034788) #22	HOXD4 (ENSFCAG00000045772) #23	HOXD3 (ENSFCAG00000022371) #24	HOXD1 (ENSFCAG00000042171)	MTX2 (ENSFCAG00000030099) #25	HNRNPA3 (ENSFCAG00000012146) #26	NFE2L2 (ENSFCAG00000012147) #27	AGPS (ENSFCAG00000022316) #28	ENSFCAG00000048732 #30	ENSFCAG00000049217 #30	PDE11A (ENSFCAG00000022207) #31	RBM45 (ENSFCAG00000018793) #32	OSBPL6 (ENSFCAG00000012535) #33	PRKRA (ENSFCAG00000031042) #35	PJVK (ENSFCAG00000018124) #36	FKBP7 (ENSFCAG00000012540) #37
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a.m.b #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.b ##26	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a.m.b #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.b ##26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
American black bear	MODERN SPECIES	3042										EVX2 (ENSUAMG00000025680) #16	HOXD13 (ENSUAMG00000025683) #17	HOXD12 (ENSUAMG00000025684) #18	HOXD11 (ENSUAMG00000025686) #19	HOXD10 (ENSUAMG00000025688) #20	HOXD9 (ENSUAMG00000025690) #21	HOXD8 (ENSUAMG00000025693) #22	HOXD4 (ENSUAMG00000025697) #23	HOXD3 (ENSUAMG00000025698) #24	HOXD1 (ENSUAMG00000025700)
Polar bear	MODERN SPECIES	142	SP3 (ENSUMAG00000015395)	OLA1 (ENSUMAG00000015410)	ENSUMAG00000015413	CIR1 (ENSUMAG00000015415) #7	SCRN3 (ENSUMAG00000015422) #8	GPR155 (ENSUMAG00000015425) #9	ENSUMAG00000015461	ENSUMAG00000015473	CHRNA1 (ENSUMAG00000015480) #11	CHN1 (ENSUMAG00000015511) #12	ATF2 (ENSUMAG00000015564) #13	ATP5MC3 (ENSUMAG00000015579) #14	LNPK (ENSUMAG00000015613) #15	ENSUMAG00000015649 #19	HOXD10 (ENSUMAG00000015650) #20	ENSUMAG00000015653 #22	HOXD4 (ENSUMAG00000015658) #23	MTX2 (ENSUMAG00000015662) #25	ENSUMAG00000015686 ##26	NFE2L2 (ENSUMAG00000015689) #27	AGPS (ENSUMAG00000015781) #28	ENSUMAG00000016390 #30	PDE11A (ENSUMAG00000016414) #31	RBM45 (ENSUMAG00000016503) #32	OSBPL6 (ENSUMAG00000016519) #33	PRKRA (ENSUMAG00000016566) #35	PJVK (ENSUMAG00000016572) #36	FKBP7 (ENSUMAG00000016577) #37	PLEKHA3 (ENSUMAG00000016580)	ENSUMAG00000016583	ENSUMAG00000016602
Giant Panda	MODERN SPECIES	11	SCRN3 (ENSAMEG00000012230) #8	GPR155 (ENSAMEG00000012251) #9	ENSAMEG00000027164	WIPF1 (ENSAMEG00000012269) #10	CHRNA1 (ENSAMEG00000012277) #11	CHN1 (ENSAMEG00000012304) #12	ATF2 (ENSAMEG00000012333) #13	ATP5MC3 (ENSAMEG00000012367) #14	LNPK (ENSAMEG00000001869) #15	EVX2 (ENSAMEG00000001868) #16	HOXD13 (ENSAMEG00000001865) #17	HOXD12 (ENSAMEG00000023609) #18	ENSAMEG00000025193 #19	HOXD10 (ENSAMEG00000001849) #20	HOXD9 (ENSAMEG00000029987) #21	HOXD8 (ENSAMEG00000023565) #22	HOXD4 (ENSAMEG00000025663) #23	HOXD3 (ENSAMEG00000026957) #24	HOXD1 (ENSAMEG00000028345)	MTX2 (ENSAMEG00000001799) #25	ENSAMEG00000019906	HNRNPA3 (ENSAMEG00000011920) #26	NFE2L2 (ENSAMEG00000011937) #27	AGPS (ENSAMEG00000011950) #28	PDE11A (ENSAMEG00000000902) #31	ENSAMEG00000023664	RBM45 (ENSAMEG00000000896) #32	OSBPL6 (ENSAMEG00000000825) #33	PRKRA (ENSAMEG00000000803) #35	PJVK (ENSAMEG00000000801) #36	FKBP7 (ENSAMEG00000027885) #37
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00570000080031	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
American mink	MODERN SPECIES	222									LNPK (ENSNVIG00000007208) #15	EVX2 (ENSNVIG00000007198) #16	HOXD13 (ENSNVIG00000007186) #17	HOXD12 (ENSNVIG00000007175) #18	ENSNVIG00000007170 #19	HOXD10 (ENSNVIG00000007162) #20	HOXD9 (ENSNVIG00000007158) #21	ENSNVIG00000007149 #22	HOXD4 (ENSNVIG00000007138) #23	HOXD3 (ENSNVIG00000007128) #24	HOXD1 (ENSNVIG00000007113)	MTX2 (ENSNVIG00000007075) #25	HNRNPA3 (ENSNVIG00000007022) #26	NFE2L2 (ENSNVIG00000006995) #27	AGPS (ENSNVIG00000006950) #28	ENSNVIG00000006929	PDE11A (ENSNVIG00000006854) #31	ENSNVIG00000006839	RBM45 (ENSNVIG00000006823) #32	OSBPL6 (ENSNVIG00000006388) #33	PRKRA (ENSNVIG00000006320) #35	PJVK (ENSNVIG00000006274) #36	FKBP7 (ENSNVIG00000006271) #37
Ferret	MODERN SPECIES	359	ENSMPUG00000013943 #7	SCRN3 (ENSMPUG00000013961) #8	GPR155 (ENSMPUG00000013963) #9	ENSMPUG00000013967	CHRNA1 (ENSMPUG00000013974) #11	CHN1 (ENSMPUG00000013977) #12	ATF2 (ENSMPUG00000013983) #13	ATP5MC3 (ENSMPUG00000013986) #14	LNPK (ENSMPUG00000014007) #15	EVX2 (ENSMPUG00000014012) #16	HOXD13 (ENSMPUG00000014022) #17	HOXD12 (ENSMPUG00000014025) #18	HOXD11 (ENSMPUG00000014029) #19	HOXD10 (ENSMPUG00000014049) #20	HOXD9 (ENSMPUG00000014053) #21	ENSMPUG00000014060 #22	ENSMPUG00000014067	HOXD4 (ENSMPUG00000014070) #23	HOXD3 (ENSMPUG00000014072) #24	ENSMPUG00000014080	HOXD1 (ENSMPUG00000014084)	ENSMPUG00000014088	MTX2 (ENSMPUG00000014094) #25	ENSMPUG00000014101	ENSMPUG00000014103 ##26	ENSMPUG00000014168 #27	ENSMPUG00000014172	AGPS (ENSMPUG00000014173) #28
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a.g.b #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a.i #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.tb #30	ENSGT00390000010116.ub #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000147479.a.b.b	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a.g.b #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a.i #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116.tb #30	ENSGT00390000010116.ub #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36
Dingo	MODERN SPECIES	339	WIPF1 (ENSCAFG00020006074) #10	ENSCAFG00020006077 #10	CHRNA1 (ENSCAFG00020006081) #11	ENSCAFG00020006110 #12	ENSCAFG00020006118 #12	ATF2 (ENSCAFG00020006131) #13	ENSCAFG00020006151 #14	ENSCAFG00020006176	LNPK (ENSCAFG00020006192) #15	EVX2 (ENSCAFG00020006206) #16	HOXD13 (ENSCAFG00020006212) #17	HOXD12 (ENSCAFG00020006216) #18	HOXD9 (ENSCAFG00020006227) #21	HOXD11 (ENSCAFG00020006229) #19	HOXD10 (ENSCAFG00020006239) #20	HOXD8 (ENSCAFG00020006244) #22	HOXD4 (ENSCAFG00020006256) #23	HOXD3 (ENSCAFG00020006263) #24	HOXD1 (ENSCAFG00020006270)	MTX2 (ENSCAFG00020006273) #25	ENSCAFG00020006299 ##26	NFE2L2 (ENSCAFG00020006313) #27	AGPS (ENSCAFG00020006351) #28	ENSCAFG00020006961 #30	ENSCAFG00020006963 #30	PDE11A (ENSCAFG00020006966) #31	RBM45 (ENSCAFG00020007013) #32	OSBPL6 (ENSCAFG00020007025) #33	ENSCAFG00020007071 #35	PJVK (ENSCAFG00020007088) #36	FKBP7 (ENSCAFG00020007095) #37
Red fox	MODERN SPECIES	15	SCRN3 (ENSVVUG00000012946) #8	GPR155 (ENSVVUG00000012912) #9	ENSVVUG00000012900	WIPF1 (ENSVVUG00000012885) #10	CHRNA1 (ENSVVUG00000012830) #11	CHN1 (ENSVVUG00000012819) #12	ATF2 (ENSVVUG00000012774) #13	ATP5MC3 (ENSVVUG00000012759) #14	LNPK (ENSVVUG00000012737) #15	EVX2 (ENSVVUG00000012735) #16	HOXD13 (ENSVVUG00000012734) #17	HOXD12 (ENSVVUG00000012731) #18	ENSVVUG00000012726 #19	HOXD10 (ENSVVUG00000012722) #20	ENSVVUG00000012717 #21	HOXD8 (ENSVVUG00000012714) #22	HOXD3 (ENSVVUG00000012700) #24	ENSVVUG00000012694	ENSVVUG00000012682 #25	ENSVVUG00000012651 ##26	NFE2L2 (ENSVVUG00000012641) #27	ENSVVUG00000012637	ENSVVUG00000012634 #30	AGPS (ENSVVUG00000010164) #28	ENSVVUG00000010109 #30	PDE11A (ENSVVUG00000010094) #31	RBM45 (ENSVVUG00000010078) #32	OSBPL6 (ENSVVUG00000010039) #33	PRKRA (ENSVVUG00000010032) #35	PJVK (ENSVVUG00000010029) #36	FKBP7 (ENSVVUG00000010027) #37
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a ##26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00730000111135 #7	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a ##26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	26	CIR1 (ENSRFEG00010000863) #7	SCRN3 (ENSRFEG00010000835) #8	GPR155 (ENSRFEG00010000805) #9	WIPF1 (ENSRFEG00010000762) #10	CHRNA1 (ENSRFEG00010000686) #11	CHN1 (ENSRFEG00010000595) #12	ATF2 (ENSRFEG00010000479) #13	ENSRFEG00010000353 #14	LNPK (ENSRFEG00010000270) #15	EVX2 (ENSRFEG00010000230) #16	HOXD13 (ENSRFEG00010022173) #17	HOXD12 (ENSRFEG00010022172) #18	HOXD11 (ENSRFEG00010022171) #19	HOXD10 (ENSRFEG00010022170) #20	HOXD9 (ENSRFEG00010022169) #21	HOXD8 (ENSRFEG00010022168) #22	HOXD4 (ENSRFEG00010022166) #23	HOXD3 (ENSRFEG00010022165) #24	HOXD1 (ENSRFEG00010022164)	MTX2 (ENSRFEG00010022163) #25	ENSRFEG00010022161 ##26	NFE2L2 (ENSRFEG00010022160) #27	ENSRFEG00010022158 #28	ENSRFEG00010022157 #30	ENSRFEG00010022156 #30	PDE11A (ENSRFEG00010022154) #31	ENSRFEG00010022153	RBM45 (ENSRFEG00010022152) #32	OSBPL6 (ENSRFEG00010022151) #33	PRKRA (ENSRFEG00010022150) #35	DFNB59 (ENSRFEG00010022149) #36
Microbat	MODERN SPECIES	942	CIR1 (ENSMLUG00000013807) #7	SCRN3 (ENSMLUG00000013823) #8	GPR155 (ENSMLUG00000013828) #9	WIPF1 (ENSMLUG00000022385) #10	CHRNA1 (ENSMLUG00000015698) #11	CHN1 (ENSMLUG00000015709) #12	ATF2 (ENSMLUG00000015718) #13	ENSMLUG00000012822 #14	LNPK (ENSMLUG00000006972) #15	ENSMLUG00000022478	EVX2 (ENSMLUG00000006989) #16	HOXD13 (ENSMLUG00000006997) #17	HOXD12 (ENSMLUG00000007009) #18	HOXD11 (ENSMLUG00000007030) #19	HOXD10 (ENSMLUG00000007048) #20	HOXD8 (ENSMLUG00000028864) #22	HOXD4 (ENSMLUG00000012508) #23	HOXD3 (ENSMLUG00000012510) #24	ENSMLUG00000029447	MTX2 (ENSMLUG00000015966) #25	ENSMLUG00000003906 ##26	NFE2L2 (ENSMLUG00000003909) #27	ENSMLUG00000025480	AGPS (ENSMLUG00000005113) #28	ENSMLUG00000005126 #30	ENSMLUG00000005133 #30	ENSMLUG00000028755	PDE11A (ENSMLUG00000005135) #31	RBM45 (ENSMLUG00000005782) #32	OSBPL6 (ENSMLUG00000005787) #33	ENSMLUG00000022423
Megabat	MODERN SPECIES	1085										LNPK (ENSPVAG00000017411) #15	EVX2 (ENSPVAG00000017414) #16	HOXD13 (ENSPVAG00000017415) #17	HOXD12 (ENSPVAG00000017416) #18	HOXD11 (ENSPVAG00000017417) #19	HOXD10 (ENSPVAG00000017418) #20	HOXD8 (ENSPVAG00000017420) #22	HOXD3 (ENSPVAG00000017421) #24	HOXD1 (ENSPVAG00000017425)	MTX2 (ENSPVAG00000017426) #25
Equus	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000013474.a #8	ENSGT00390000004153 #9	ENSGT00910000144296 #10	ENSGT00940000156851 #11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000156582 #13	ENSGT00940000154298.a.a #14	ENSGT00390000001859 #15	ENSGT00390000005569.x.a.a.b	ENSGT00940000161025 #16	ENSGT00940000161457 #17	ENSGT00940000159938 #18	ENSGT00940000161308 #19	ENSGT00940000158266 #20	ENSGT00940000161503 #21	ENSGT00940000161653 #22	ENSGT00940000157270 #23	ENSGT00940000160027 #24	ENSGT00940000161892	ENSGT00950000182919.C #25	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b #26	ENSGT00950000182892.a.a.b #27	ENSGT00940000156112 #28	ENSGT00390000010116 #30	ENSGT00940000162151 #31	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00680000100059 #32	ENSGT00940000156791 #33	ENSGT00940000157618 #35	ENSGT00950000183140.a.b #36	ENSGT00940000159964 #37
Donkey	MODERN SPECIES	24	SCRN3 (ENSEASG00005022597) #8	GPR155 (ENSEASG00005022591) #9	WIPF1 (ENSEASG00005022583) #10	CHRNA1 (ENSEASG00005022581) #11	CHN1 (ENSEASG00005022579) #12	ATF2 (ENSEASG00005022575) #13	ATP5MC3 (ENSEASG00005022573) #14	LNPK (ENSEASG00005022567) #15	ENSEASG00005022564	EVX2 (ENSEASG00005022562) #16	HOXD13 (ENSEASG00005029242) #17	HOXD12 (ENSEASG00005022555) #18	HOXD11 (ENSEASG00005030904) #19	HOXD10 (ENSEASG00005022552) #20	HOXD9 (ENSEASG00005023994) #21	HOXD8 (ENSEASG00005033905) #22	HOXD4 (ENSEASG00005024806) #23	HOXD3 (ENSEASG00005022544) #24	HOXD1 (ENSEASG00005030887)	MTX2 (ENSEASG00005022537) #25	HNRNPA3 (ENSEASG00005022530) #26	NFE2L2 (ENSEASG00005028739) #27	ENSEASG00005026944 #30	AGPS (ENSEASG00005022514) #28	ENSEASG00005028303 #30	PDE11A (ENSEASG00005022489) #31	ENSEASG00005026887	RBM45 (ENSEASG00005022475) #32	OSBPL6 (ENSEASG00005022455) #33	PRKRA (ENSEASG00005022436) #35	PJVK (ENSEASG00005022430) #36
Horse	MODERN SPECIES	9	CIR1 (ENSECAG00000006773) #7	SCRN3 (ENSECAG00000018530) #8	GPR155 (ENSECAG00000008471) #9	WIPF1 (ENSECAG00000015984)	CHRNA1 (ENSECAG00000019649) #11	CHN1 (ENSECAG00000008277) #12	ATF2 (ENSECAG00000018723) #13	ATP5MC3 (ENSECAG00000008514) #14	LNPK (ENSECAG00000008534) #15	ENSECAG00000043913	EVX2 (ENSECAG00000019796) #16	HOXD13 (ENSECAG00000020388) #17	HOXD11 (ENSECAG00000003045) #19	HOXD10 (ENSECAG00000020599) #20	HOXD9 (ENSECAG00000021845) #21	HOXD8 (ENSECAG00000021980) #22	HOXD4 (ENSECAG00000038429) #23	HOXD3 (ENSECAG00000022129) #24	HOXD1 (ENSECAG00000035437)	MTX2 (ENSECAG00000022464) #25	HNRNPA3 (ENSECAG00000059976) #26	NFE2L2 (ENSECAG00000005675) #27	AGPS (ENSECAG00000008695) #28	ENSECAG00000051775	ENSECAG00000000927 #30	PDE11A (ENSECAG00000004445) #31	ENSECAG00000057854	CYCT (ENSECAG00000016170)	RBM45 (ENSECAG00000017129) #32	OSBPL6 (ENSECAG00000020078) #33	PRKRA (ENSECAG00000024263) #35