Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 515 ENSGT00970000197355 ENSGT00940000158295 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00440000033232 #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 265 ENSGT00970000197355 ENSGT00940000158295 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00440000033232 #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00970000197355 ENSGT00940000158295 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00440000033232 #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161047 ENSGT00940000160052 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000160211 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00950000182966.A.j ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00440000033232 #22 ENSGT00390000006658.b ENSGT00950000183131.b.b ENSGT00940000157764 ENSGT00490000043404 ENSGT00940000160053 ENSGT00940000158494 Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160052 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000160211 ENSGT00740000117161 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00950000182966.A.j ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000006658.b ENSGT00950000183131.b.b ENSGT00940000157764 ENSGT00490000043404 ENSGT00940000160053 ENSGT00940000158494 ENSGT00390000010767 ENSGT00940000161900 ENSGT00940000156938 ENSGT00390000014299 ENSGT00940000160275 ENSGT00940000158087 ENSGT00390000012498 ENSGT00940000157543 ENSGT00550000074994 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861 #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00530000063557.a #34 ENSGT00940000157446 #35 ENSGT00990000203541.a.b #36 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00490000044176.b.b ENSGT00940000160975.g ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00490000044176.b.b ENSGT00940000160975.g ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000153272.a.b.o.b.b ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00530000063557.a #34 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT00390000017443.q ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 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ENSGGOG00000036793 LMCD1 (ENSGGOG00000013915) #28 SSUH2 (ENSGGOG00000025443) #29 CAV3 (ENSGGOG00000000136) #30 OXTR (ENSGGOG00000011995) #31 ENSGGOG00000037974 RAD18 (ENSGGOG00000008391) #32 Orangutan MODERN SPECIES 16 SHQ1 (ENSPPYG00000013717) ENSPPYG00000038319 GXYLT2 (ENSPPYG00000013716) PPP4R2 (ENSPPYG00000013715) PDZRN3 (ENSPPYG00000013713) CNTN3 (ENSPPYG00000013710) CHL1 (ENSPPYG00000013709) #14 ENSPPYG00000013708 CNTN6 (ENSPPYG00000013706) #15 ENSPPYG00000033051 CNTN4 (ENSPPYG00000013704) #16 IL5RA (ENSPPYG00000013703) #17 TRNT1 (ENSPPYG00000013702) #18 CRBN (ENSPPYG00000013701) #19 LRRN1 (ENSPPYG00000013700) #21 SETMAR (ENSPPYG00000038930) #22 SUMF1 (ENSPPYG00000013698) #20 ITPR1 (ENSPPYG00000013697) #23 BHLHE40 (ENSPPYG00000013696) #24 ENSPPYG00000037656 ARL8B (ENSPPYG00000013694) #25 EDEM1 (ENSPPYG00000013692) #26 GRM7 (ENSPPYG00000013691) #27 LMCD1 (ENSPPYG00000029530) #28 SSUH2 (ENSPPYG00000034055) #29 ENSPPYG00000032602 #30 OXTR (ENSPPYG00000013689) #31 RAD18 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ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 620 LRRN1 (ENSRROG00000014167) #21 ENSRROG00000026881 SETMAR (ENSRROG00000042514) #22 SUMF1 (ENSRROG00000041073) #20 ITPR1 (ENSRROG00000044641) #23 BHLHE40 (ENSRROG00000039619) #24 ARL8B (ENSRROG00000010772) #25 EDEM1 (ENSRROG00000044401) #26 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 334 TRNT1 (ENSRBIG00000042632) #18 CRBN (ENSRBIG00000033574) #19 LRRN1 (ENSRBIG00000019182) #21 ENSRBIG00000030277 SETMAR (ENSRBIG00000031230) #22 SUMF1 (ENSRBIG00000032133) #20 ITPR1 (ENSRBIG00000035266) #23 BHLHE40 (ENSRBIG00000029593) #24 ARL8B (ENSRBIG00000040961) #25 EDEM1 (ENSRBIG00000027489) #26 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000004169.b ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 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ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a #34 Macaca DUPLICATION Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.e #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.e #22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES BTBD8 (ENSMFAG00000003189) EPHX4 (ENSMFAG00000035355) BRDT (ENSMFAG00000044939) ENSMFAG00000047645 TGFBR3 (ENSMFAG00000002239) ENSMFAG00000000474 ENSMFAG00000003649 ENSMFAG00000048501 ENSMFAG00000060879 ENSMFAG00000062421 ZNF644 (ENSMFAG00000033902) ENSMFAG00000047958 ENSMFAG00000064076 ENSMFAG00000062129 BARHL2 (ENSMFAG00000051984) ENSMFAG00000062941 #22 ENSMFAG00000057050 ZNF326 (ENSMFAG00000044308) LRRC8D (ENSMFAG00000062678) ENSMFAG00000051015 LRRC8C (ENSMFAG00000031732) LRRC8B (ENSMFAG00000026599) 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MYO9A (ENSMFAG00000023157) ENSMFAG00000040220 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162026 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c.f #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a #34 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00910000146944 ENSGT00940000162026 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00440000033232.c.f #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT01030000236289.b ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 PROK2 (ENSMFAG00000003820) RYBP (ENSMFAG00000049247) ENSMFAG00000048279 SHQ1 (ENSMFAG00000039148) GXYLT2 (ENSMFAG00000044294) PPP4R2 (ENSMFAG00000042258) PDZRN3 (ENSMFAG00000000986) CNTN3 (ENSMFAG00000045446) CHL1 (ENSMFAG00000040804) #14 CNTN6 (ENSMFAG00000001088) #15 CNTN4 (ENSMFAG00000031919) #16 IL5RA (ENSMFAG00000006030) #17 TRNT1 (ENSMFAG00000045113) #18 CRBN (ENSMFAG00000031028) #19 LRRN1 (ENSMFAG00000020302) #21 ENSMFAG00000029288 #22 SUMF1 (ENSMFAG00000040853) #20 ITPR1 (ENSMFAG00000044748) #23 BHLHE40 (ENSMFAG00000040134) #24 ARL8B (ENSMFAG00000035233) #25 EDEM1 (ENSMFAG00000038359) #26 ENSMFAG00000061059 ENSMFAG00000048887 ENSMFAG00000063438 ENSMFAG00000047622 ENSMFAG00000029998 GRM7 (ENSMFAG00000027785) #27 LMCD1 (ENSMFAG00000033976) #28 SSUH2 (ENSMFAG00000035455) #29 CAV3 (ENSMFAG00000037376) #30 OXTR (ENSMFAG00000037530) #31 Rhesus MODERN SPECIES 11 PPP4R2 (ENSMMUG00000016959) ENSMMUG00000064384 PDZRN3 (ENSMMUG00000012661) ENSMMUG00000051810 CNTN3 (ENSMMUG00000021241) CHL1 (ENSMMUG00000001349) #14 CNTN6 (ENSMMUG00000008549) #15 ENSMMUG00000051943 ENSMMUG00000009425 ENSMMUG00000056158 CNTN4 (ENSMMUG00000001847) #16 IL5RA (ENSMMUG00000001849) #17 TRNT1 (ENSMMUG00000017983) #18 CRBN (ENSMMUG00000017986) #19 LRRN1 (ENSMMUG00000049373) #21 SETMAR (ENSMMUG00000017828) #22 SUMF1 (ENSMMUG00000004734) #20 ITPR1 (ENSMMUG00000012574) #23 BHLHE40 (ENSMMUG00000056699) #24 ARL8B (ENSMMUG00000008810) #25 EDEM1 (ENSMMUG00000065088) #26 ENSMMUG00000065004 ENSMMUG00000057502 ENSMMUG00000031947 GRM7 (ENSMMUG00000011231) #27 ENSMMUG00000062010 LMCD1 (ENSMMUG00000001814) #28 SSUH2 (ENSMMUG00000009699) #29 CAV3 (ENSMMUG00000053020) #30 OXTR (ENSMMUG00000009703) #31 ENSMMUG00000060249 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 CNTN4 (ENSMNEG00000044169) #16 IL5RA (ENSMNEG00000043242) #17 TRNT1 (ENSMNEG00000037805) #18 CRBN (ENSMNEG00000044270) #19 LRRN1 (ENSMNEG00000021728) #21 ENSMNEG00000013018 SETMAR (ENSMNEG00000045183) #22 SUMF1 (ENSMNEG00000003566) #20 ITPR1 (ENSMNEG00000034253) #23 BHLHE40 (ENSMNEG00000038264) #24 ARL8B (ENSMNEG00000029717) #25 EDEM1 (ENSMNEG00000034041) #26 ENSMNEG00000021998 GRM7 (ENSMNEG00000031784) #27 LMCD1 (ENSMNEG00000039664) #28 SSUH2 (ENSMNEG00000032764) #29 CAV3 (ENSMNEG00000045110) #30 OXTR (ENSMNEG00000037475) #31 ENSMNEG00000027815 RAD18 (ENSMNEG00000013464) #32 SRGAP3 (ENSMNEG00000028942) #33 ENSMNEG00000032308 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000004169.b ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00530000063557.a #34 ENSGT00940000157446 #35 Olive baboon MODERN SPECIES 11 GXYLT2 (ENSPANG00000023883) PPP4R2 (ENSPANG00000004247) PDZRN3 (ENSPANG00000011423) CNTN3 (ENSPANG00000011424) ENSPANG00000049590 CHL1 (ENSPANG00000007743) #14 ENSPANG00000050596 CNTN6 (ENSPANG00000010252) #15 ENSPANG00000041415 #16 ENSPANG00000011250 #16 IL5RA (ENSPANG00000011489) #17 TRNT1 (ENSPANG00000025944) #18 CRBN (ENSPANG00000007745) #19 LRRN1 (ENSPANG00000007804) #21 ENSPANG00000043434 SETMAR (ENSPANG00000005127) #22 SUMF1 (ENSPANG00000023714) #20 ITPR1 (ENSPANG00000016086) #23 ENSPANG00000045181 #24 ENSPANG00000039685 #24 ARL8B (ENSPANG00000009815) #25 EDEM1 (ENSPANG00000016993) #26 GRM7 (ENSPANG00000005212) #27 LMCD1 (ENSPANG00000001206) #28 SSUH2 (ENSPANG00000009185) #29 CAV3 (ENSPANG00000046040) #30 OXTR (ENSPANG00000005977) #31 RAD18 (ENSPANG00000008855) #32 SRGAP3 (ENSPANG00000008856) #33 THUMPD3 (ENSPANG00000016253) #34 SETD5 (ENSPANG00000005213) #35 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004169.b ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861.c #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00530000063557.a #34 ENSGT00940000157446 #35 Drill MODERN SPECIES 1460 SETMAR (ENSMLEG00000040951) #22 SUMF1 (ENSMLEG00000001562) #20 ITPR1 (ENSMLEG00000027444) #23 BHLHE40 (ENSMLEG00000031386) #24 ARL8B (ENSMLEG00000038749) #25 EDEM1 (ENSMLEG00000031560) #26 Sooty mangabey MODERN SPECIES 650 ENSCATG00000036252 RYBP (ENSCATG00000034872) SHQ1 (ENSCATG00000041238) GXYLT2 (ENSCATG00000041906) PPP4R2 (ENSCATG00000043982) PDZRN3 (ENSCATG00000011356) CNTN3 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ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861 #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00530000063557.a #34 ENSGT00940000157446 #35 ENSGT00990000203541.a.b #36 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00490000044176 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 #14 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861 #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00530000063557.a #34 ENSGT00940000157446 #35 ENSGT00990000203541.a.b #36 Marmoset MODERN SPECIES 6 ENSCJAG00000077178 ENSCJAG00000082047 CHL1 (ENSCJAG00000015257) #14 ENSCJAG00000084962 CNTN6 (ENSCJAG00000015346) #15 ENSCJAG00000023368 CNTN4 (ENSCJAG00000015394) #16 ENSCJAG00000086653 IL5RA (ENSCJAG00000015437) #17 ENSCJAG00000074141 TRNT1 (ENSCJAG00000015466) #18 ENSCJAG00000015479 #19 ENSCJAG00000058149 ENSCJAG00000070490 ENSCJAG00000071888 SETMAR (ENSCJAG00000015508) #22 SUMF1 (ENSCJAG00000015516) #20 ITPR1 (ENSCJAG00000015544) #23 BHLHE40 (ENSCJAG00000062049) #24 ARL8B (ENSCJAG00000046554) #25 EDEM1 (ENSCJAG00000015856) #26 ENSCJAG00000082150 ENSCJAG00000084935 GRM7 (ENSCJAG00000015891) #27 ENSCJAG00000065767 ENSCJAG00000078658 LMCD1 (ENSCJAG00000015896) #28 ENSCJAG00000069303 ENSCJAG00000076915 ENSCJAG00000079210 ENSCJAG00000081179 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000160606 #15 ENSGT00940000155198.C #16 ENSGT00940000160890 #17 ENSGT00390000009678 #18 ENSGT00390000016404 #19 ENSGT00940000157154.d #21 ENSGT00440000033232.c #22 ENSGT00390000008983.a #20 ENSGT00940000155071.E #23 ENSGT00940000158384 #24 ENSGT00940000154861 #25 ENSGT00940000157717 #26 ENSGT01030000234648.a.a.d #27 ENSGT00940000158813 #28 ENSGT00440000038003 #29 ENSGT00950000183006.B.f.b.b #30 ENSGT01050000244882.a.a.b #31 ENSGT00390000011230 #32 ENSGT00950000182824.a.b.a #33 ENSGT00530000063557.a #34 ENSGT00940000157446 #35 ENSGT00990000203541.a.b #36 Capuchin MODERN SPECIES 474 SETMAR (ENSCCAG00000022390) #22 SUMF1 (ENSCCAG00000038030) #20 ITPR1 (ENSCCAG00000027187) #23 BHLHE40 (ENSCCAG00000023409) #24 ARL8B (ENSCCAG00000028492) #25 EDEM1 (ENSCCAG00000036158) #26 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 62 ENSSBOG00000012697 CNTN6 (ENSSBOG00000005957) #15 ENSSBOG00000025385 CNTN4 (ENSSBOG00000025686) #16 IL5RA (ENSSBOG00000020431) #17 TRNT1 (ENSSBOG00000021208) #18 CRBN (ENSSBOG00000024658) #19 LRRN1 (ENSSBOG00000018919) #21 SETMAR (ENSSBOG00000023556) #22 SUMF1 (ENSSBOG00000031100) #20 ITPR1 (ENSSBOG00000021312) #23 BHLHE40 (ENSSBOG00000026538) #24 ARL8B (ENSSBOG00000032344) #25 EDEM1 (ENSSBOG00000023180) #26 GRM7 (ENSSBOG00000000625) #27 LMCD1 (ENSSBOG00000022801) #28 SSUH2 (ENSSBOG00000025696) #29 CAV3 (ENSSBOG00000032317) #30 OXTR (ENSSBOG00000031766) #31 ENSSBOG00000008434 #32 SRGAP3 (ENSSBOG00000028415) #33 THUMPD3 (ENSSBOG00000023567) #34 SETD5 (ENSSBOG00000034634) #35 LHFPL4 (ENSSBOG00000004674) #36 Mas night monkey MODERN SPECIES 698 CNTN6 (ENSANAG00000025831) #15 ENSANAG00000031628 ENSANAG00000024239 CNTN4 (ENSANAG00000030047) #16 IL5RA (ENSANAG00000030712) #17 TRNT1 (ENSANAG00000024802) #18 CRBN (ENSANAG00000028742) #19 LRRN1 (ENSANAG00000019765) #21 SETMAR (ENSANAG00000031332) #22 ENSANAG00000031521 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 339 ATAD2B (ENSPSMG00000006746) ENSPSMG00000006754 #22 KLHL29 (ENSPSMG00000006774) ENSPSMG00000006781 TDRD15 (ENSPSMG00000006790) APOB (ENSPSMG00000006849) LDAH (ENSPSMG00000006874) ENSPSMG00000006877 GDF7 (ENSPSMG00000006880) HS1BP3 (ENSPSMG00000006908) ENSPSMG00000006929 PUM2 (ENSPSMG00000007064) SDC1 (ENSPSMG00000007157) LAPTM4A (ENSPSMG00000007179) MATN3 (ENSPSMG00000007217) WDR35 (ENSPSMG00000007386) TTC32 (ENSPSMG00000007425) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.a #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.a #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.a #22 Sperm whale MODERN SPECIES RUBCN (ENSPCTG00005003992) ENSPCTG00005003902 TNK2 (ENSPCTG00005003838) TFRC (ENSPCTG00005003787) ZDHHC19 (ENSPCTG00005003766) SLC51A (ENSPCTG00005003756) PCYT1A (ENSPCTG00005003743) TCTEX1D2 (ENSPCTG00005003728) TM4SF19 (ENSPCTG00005003712) UBXN7 (ENSPCTG00005003692) ENSPCTG00005003671 SMCO1 (ENSPCTG00005003655) WDR53 (ENSPCTG00005003642) FBXO45 (ENSPCTG00005003622) NRROS (ENSPCTG00005003615) ENSPCTG00005003608 #22 CEP19 (ENSPCTG00005003603) ENSPCTG00005003593 PIGX (ENSPCTG00005003544) PAK2 (ENSPCTG00005003515) SENP5 (ENSPCTG00005003492) NCBP2 (ENSPCTG00005003452) NCBP2AS2 (ENSPCTG00005003436) ENSPCTG00005003427 MELTF (ENSPCTG00005003409) DLG1 (ENSPCTG00005000931) ENSPCTG00005000550 APOD (ENSPCTG00005000541) ENSPCTG00005000517 ACAP2 (ENSPCTG00005000448) ENSPCTG00005000422 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.a #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.a #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.a #22 Narwhal MODERN SPECIES 296 MT3 (ENSMMNG00015008674) ENSMMNG00015008683 ENSMMNG00015008701 ENSMMNG00015008888 SLC6A2 (ENSMMNG00015009267) LPCAT2 (ENSMMNG00015009321) MMP2 (ENSMMNG00015009342) IRX6 (ENSMMNG00015009363) IRX5 (ENSMMNG00015009375) IRX3 (ENSMMNG00015009381) FTO (ENSMMNG00015009401) RPGRIP1L (ENSMMNG00015009433) AKTIP (ENSMMNG00015009460) RBL2 (ENSMMNG00015009484) CHD9 (ENSMMNG00015009549) ENSMMNG00015009586 #22 CHD9NB (ENSMMNG00015009592) TOX3 (ENSMMNG00015009598) SALL1 (ENSMMNG00015009605) CYLD (ENSMMNG00015009618) NOD2 (ENSMMNG00015009637) SNX20 (ENSMMNG00015009652) NKD1 (ENSMMNG00015009664) BRD7 (ENSMMNG00015009678) ADCY7 (ENSMMNG00015009697) TENT4B (ENSMMNG00015009736) HEATR3 (ENSMMNG00015009780) CNEP1R1 (ENSMMNG00015009819) ZNF423 (ENSMMNG00015009834) C16orf78 (ENSMMNG00015009847) CBLN1 (ENSMMNG00015009855) Beluga whale MODERN SPECIES 16 MTRR (ENSDLEG00000000694) SEMA5A (ENSDLEG00000000752) ATPSCKMT (ENSDLEG00000000926) CCT5 (ENSDLEG00000000940) CMBL (ENSDLEG00000000961) MARCH6 (ENSDLEG00000000992) ROPN1L (ENSDLEG00000001073) ANKRD33B (ENSDLEG00000001095) DAP (ENSDLEG00000001108) ENSDLEG00000001124 CTNND2 (ENSDLEG00000001157) ENSDLEG00000001313 ENSDLEG00000001324 ENSDLEG00000001339 DNAH5 (ENSDLEG00000001370) ENSDLEG00000001564 #22 TRIO (ENSDLEG00000001825) FAM105A (ENSDLEG00000002824) OTULIN (ENSDLEG00000002839) ANKH (ENSDLEG00000002865) ENSDLEG00000002893 ENSDLEG00000002904 FBXL7 (ENSDLEG00000002908) MARCHF11 (ENSDLEG00000002915) ENSDLEG00000002924 ZNF622 (ENSDLEG00000002935) RETREG1 (ENSDLEG00000002953) MYO10 (ENSDLEG00000002973) ENSDLEG00000003030 ENSDLEG00000003035 ENSDLEG00000003046 Pecora ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000015682 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000161772 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000159160 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ENSGT00950000183202.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00940000158925 ENSGT00990000203619.B ENSGT00940000159319 ENSGT01100000263484.C.a ENSGT00940000153676.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b ENSGT00940000158209 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000155814 ENSGT00940000162731 ENSGT00530000063715.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158961 ENSGT00390000015682 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000161772 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000159160 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00710000106860 ENSGT00940000160585 ENSGT00940000159528 ENSGT00390000011864.f ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000010170.a.b ENSGT00390000003338 ENSGT00440000033232.c.a.a #22 ENSGT00390000012063 ENSGT00950000183115.b.a ENSGT00950000183202.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00940000158925 ENSGT00990000203619.B ENSGT00940000159319 ENSGT01100000263484.C.a ENSGT00940000153676.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b ENSGT00940000158209 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000155814 ENSGT00940000162731 ENSGT00530000063715.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000015682 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000161772 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000159160 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00710000106860 ENSGT00940000160585 ENSGT00940000159528 ENSGT00390000011864.f ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000010170.a.b ENSGT00390000003338 ENSGT00440000033232.c.a.a #22 ENSGT00390000012063 ENSGT00950000183115.b.a ENSGT00940000153244.B.z.c.b ENSGT00950000183202.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00940000158925 ENSGT00990000203619.B ENSGT00940000159853 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000161502 ENSGT00940000158762 ENSGT00390000013839 ENSGT00940000156537 ENSGT00390000017515.o.b ENSGT00400000022086.b.b Bos ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000015682 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000161772 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000159160 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00710000106860 ENSGT00940000160585 ENSGT00940000159528 ENSGT00390000011864.f ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000010170.a.b ENSGT00390000003338 ENSGT00440000033232.c.a.a #22 ENSGT00390000012063 ENSGT00950000183115.b.a ENSGT00940000153244.B.z.c.b ENSGT00950000183202.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00940000158925 ENSGT00990000203619.B ENSGT00940000159853 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000161502 ENSGT00940000158762 ENSGT00390000013839 ENSGT00940000156537 ENSGT00390000017515.o.b ENSGT00400000022086.b.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000016051.j ENSGT00940000158961 ENSGT00390000015682 ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000161772 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000159160 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT00710000106860 ENSGT00940000160585 ENSGT00940000159528 ENSGT00390000011864.f ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000010170.a.b ENSGT00390000003338 ENSGT00440000033232.c.a.a #22 ENSGT00390000012063 ENSGT00950000183123.g.a.a.a ENSGT00950000183115.b.a ENSGT00940000153244.B.z.c.b ENSGT00950000183202.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00940000158925 ENSGT00990000203619.B ENSGT01010000228998 ENSGT00940000159319 ENSGT01100000263484.C.a ENSGT00940000153676.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b ENSGT00940000158209 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.b.a Wild yak MODERN SPECIES 2207 SUCLA2 (ENSBMUG00000015386) NUDT15 (ENSBMUG00000015290) ENSBMUG00000015279 #22 MED4 (ENSBMUG00000015266) Domestic yak MODERN SPECIES 6 ENSBGRG00000023179 SLC25A30 (ENSBGRG00000023058) COG3 (ENSBGRG00000022627) CBY2 (ENSBGRG00000022527) SIAH3 (ENSBGRG00000022492) ZC3H13 (ENSBGRG00000022439) ENSBGRG00000022330 LCP1 (ENSBGRG00000022064) LRRC63 (ENSBGRG00000021956) RUBCNL (ENSBGRG00000021526) LRCH1 (ENSBGRG00000020993) ESD (ENSBGRG00000020909) HTR2A (ENSBGRG00000020868) SUCLA2 (ENSBGRG00000020790) NUDT15 (ENSBGRG00000020753) ENSBGRG00000020744 #22 MED4 (ENSBGRG00000020636) ENSBGRG00000020600 ITM2B (ENSBGRG00000020531) ENSBGRG00000020504 LPAR6 (ENSBGRG00000020489) RB1 (ENSBGRG00000020100) RCBTB2 (ENSBGRG00000019788) ENSBGRG00000019770 ENSBGRG00000019739 ENSBGRG00000019677 FNDC3A (ENSBGRG00000019368) MLNR (ENSBGRG00000019319) CDADC1 (ENSBGRG00000019174) CAB39L (ENSBGRG00000019026) SETDB2 (ENSBGRG00000018734) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000015682 ENSGT00940000153655.A.a ENSGT00940000153137.a.b.b.a ENSGT00940000161772 ENSGT00730000111163 ENSGT00940000159160 ENSGT00950000183097.a.a.b ENSGT01100000263828.a.b ENSGT00710000106860 ENSGT00940000160585 ENSGT00940000159528 ENSGT00390000011864.f ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000010170.a.b ENSGT00390000003338 ENSGT00440000033232.c.a.a #22 ENSGT00390000012063 ENSGT00950000183123.g.a.a.a ENSGT00950000183115.b.a ENSGT00940000153244.B.z.c.b ENSGT00950000183202.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.a ENSGT00940000158925 ENSGT00990000203619.B ENSGT00940000159853 ENSGT00940000157379 ENSGT00940000161502 ENSGT00940000158762 ENSGT00390000013839 ENSGT00940000156537 ENSGT00390000017515.o.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 3 ENSBIXG00005007690 COG3 (ENSBIXG00005022513) ENSBIXG00005022372 CBY2 (ENSBIXG00005022348) SIAH3 (ENSBIXG00005003804) ZC3H13 (ENSBIXG00005022307) CPB2 (ENSBIXG00005022273) LCP1 (ENSBIXG00005022212) ENSBIXG00005022169 LRRC63 (ENSBIXG00005022158) RUBCNL (ENSBIXG00005006830) LRCH1 (ENSBIXG00005021912) ESD (ENSBIXG00005003676) HTR2A (ENSBIXG00005021735) SUCLA2 (ENSBIXG00005021655) ENSBIXG00005021596 #22 MED4 (ENSBIXG00005000006) ENSBIXG00005021562 ITM2B (ENSBIXG00005021532) RB1 (ENSBIXG00005021439) ENSBIXG00005021411 LPAR6 (ENSBIXG00005021400) RCBTB2 (ENSBIXG00005021378) ENSBIXG00005003584 ENSBIXG00005021203 FNDC3A (ENSBIXG00005021155) MLNR (ENSBIXG00005005745) CDADC1 (ENSBIXG00005020968) CAB39L (ENSBIXG00005020883) SETDB2 (ENSBIXG00005020628) PHF11 (ENSBIXG00005020432) Cow MODERN SPECIES 3 COG3 (ENSBTAG00000017907) CBY2 (ENSBTAG00000018580) SIAH3 (ENSBTAG00000051729) ZC3H13 (ENSBTAG00000007067) ENSBTAG00000048402 CPB2 (ENSBTAG00000007073) LCP1 (ENSBTAG00000007079) ENSBTAG00000053178 LRRC63 (ENSBTAG00000015994) RUBCNL (ENSBTAG00000013371) LRCH1 (ENSBTAG00000002959) ESD (ENSBTAG00000003415) HTR2A (ENSBTAG00000013498) SUCLA2 (ENSBTAG00000006759) NUDT15 (ENSBTAG00000019501) ENSBTAG00000050479 #22 MED4 (ENSBTAG00000019502) ENSBTAG00000024964 ITM2B (ENSBTAG00000003109) ENSBTAG00000003560 RB1 (ENSBTAG00000006640) LPAR6 (ENSBTAG00000006645) RCBTB2 (ENSBTAG00000006647) CYSLTR2 (ENSBTAG00000017508) ENSBTAG00000048524 FNDC3A (ENSBTAG00000020681) MLNR (ENSBTAG00000010475) CDADC1 (ENSBTAG00000002271) CAB39L (ENSBTAG00000034222) ENSBTAG00000049254 SETDB2 (ENSBTAG00000007329) Yarkand deer MODERN SPECIES 23 SLC25A30 (ENSCHYG00000022376) COG3 (ENSCHYG00000022568) CBY2 (ENSCHYG00000022728) SIAH3 (ENSCHYG00000022790) ZC3H13 (ENSCHYG00000022834) CPB2 (ENSCHYG00000023124) LCP1 (ENSCHYG00000023302) LRRC63 (ENSCHYG00000023437) RUBCNL (ENSCHYG00000023615) LRCH1 (ENSCHYG00000023877) ESD (ENSCHYG00000024416) HTR2A (ENSCHYG00000024474) ENSCHYG00000024533 ENSCHYG00000024543 NUDT15 (ENSCHYG00000024631) ENSCHYG00000024649 #22 ENSCHYG00000024654 ITM2B (ENSCHYG00000024688) RB1 (ENSCHYG00000024752) LPAR6 (ENSCHYG00000024973) RCBTB2 (ENSCHYG00000024991) ENSCHYG00000025118 ENSCHYG00000025124 ENSCHYG00000012913 FNDC3A (ENSCHYG00000012972) MLNR (ENSCHYG00000013419) CDADC1 (ENSCHYG00000013468) CAB39L (ENSCHYG00000013652) SETDB2 (ENSCHYG00000013870) ENSCHYG00000014219 RCBTB1 (ENSCHYG00000014739) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.b #22 Blue whale MODERN SPECIES 9 GTF2F2 (ENSBMSG00010016687) ENSBMSG00010016609 SLC25A30 (ENSBMSG00010016571) COG3 (ENSBMSG00010016549) CBY2 (ENSBMSG00010016528) SIAH3 (ENSBMSG00010016505) ENSBMSG00010016462 CPB2 (ENSBMSG00010016357) LCP1 (ENSBMSG00010016266) LRRC63 (ENSBMSG00010016199) RUBCNL (ENSBMSG00010016070) LRCH1 (ENSBMSG00010015742) ESD (ENSBMSG00010015643) HTR2A (ENSBMSG00010015606) SUCLA2 (ENSBMSG00010015547) ENSBMSG00010015507 #22 MED4 (ENSBMSG00010015472) ITM2B (ENSBMSG00010015413) LPAR6 (ENSBMSG00010015391) RB1 (ENSBMSG00010015354) RCBTB2 (ENSBMSG00010015126) CYSLTR2 (ENSBMSG00010015059) FNDC3A (ENSBMSG00010014911) MLNR (ENSBMSG00010014851) CDADC1 (ENSBMSG00010014838) ENSBMSG00010014815 CAB39L (ENSBMSG00010014720) SETDB2 (ENSBMSG00010014652) PHF11 (ENSBMSG00010014604) RCBTB1 (ENSBMSG00010014563) ARL11 (ENSBMSG00010014541) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.b #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.b #22 Monodontidae DUPLICATION Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.b.a #22 Beluga whale MODERN SPECIES 22 GPR158 (ENSDLEG00000005672) ENSDLEG00000005693 MYO3A (ENSDLEG00000005721) GAD2 (ENSDLEG00000005786) GJD4 (ENSDLEG00000005805) FZD8 (ENSDLEG00000005816) OPTN (ENSDLEG00000005824) MCM10 (ENSDLEG00000005866) UCMA (ENSDLEG00000005897) PHYH (ENSDLEG00000005901) SEPHS1 (ENSDLEG00000005914) BEND7 (ENSDLEG00000005927) ENSDLEG00000005931 PRPF18 (ENSDLEG00000005937) FRMD4A (ENSDLEG00000005956) ENSDLEG00000005992 #22 ENSDLEG00000003552 CDNF (ENSDLEG00000003562) HSPA14 (ENSDLEG00000003571) SUV39H2 (ENSDLEG00000003598) DCLRE1C (ENSDLEG00000003612) MEIG1 (ENSDLEG00000003622) ACBD7 (ENSDLEG00000003626) RPP38 (ENSDLEG00000003631) NMT2 (ENSDLEG00000003636) FAM171A1 (ENSDLEG00000003643) ITGA8 (ENSDLEG00000003684) MINDY3 (ENSDLEG00000003845) ENSDLEG00000003856 PTER (ENSDLEG00000003863) C1QL3 (ENSDLEG00000003873) Narwhal MODERN SPECIES 306 PTPRZ1 (ENSMMNG00015008685) ENSMMNG00015008511 ENSMMNG00015008492 WNT16 (ENSMMNG00015008481) CPED1 (ENSMMNG00015008430) ING3 (ENSMMNG00015008385) TSPAN12 (ENSMMNG00015008372) ENSMMNG00015008364 KCND2 (ENSMMNG00015008351) ENSMMNG00015008326 LSM8 (ENSMMNG00015008300) CTTNBP2 (ENSMMNG00015008242) CFTR (ENSMMNG00015008191) ASZ1 (ENSMMNG00015008132) WNT2 (ENSMMNG00015008114) ENSMMNG00015008101 #22 ST7 (ENSMMNG00015007638) CAPZA2 (ENSMMNG00015007277) MET (ENSMMNG00015007208) CAV1 (ENSMMNG00015007169) ##30 CAV2 (ENSMMNG00015007157) ##30 TES (ENSMMNG00015007124) TFEC (ENSMMNG00015007059) ENSMMNG00015007012 MDFIC (ENSMMNG00015006992) FOXP2 (ENSMMNG00015006660) PPP1R3A (ENSMMNG00015006522) SMIM30 (ENSMMNG00015006497) GPR85 (ENSMMNG00015006484) BMT2 (ENSMMNG00015006454) TMEM168 (ENSMMNG00015006436) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.a.b.b #22 Beluga whale MODERN SPECIES 60 DRG1 (ENSDLEG00000016744) EIF4ENIF1 (ENSDLEG00000015887) SFI1 (ENSDLEG00000015083) PISD (ENSDLEG00000015005) PRR14L (ENSDLEG00000018429) YWHAH (ENSDLEG00000017312) SLC5A1 (ENSDLEG00000017264) ENSDLEG00000017246 ENSDLEG00000017228 ENSDLEG00000017220 ENSDLEG00000017212 ENSDLEG00000017207 ENSDLEG00000017200 ENSDLEG00000017193 ENSDLEG00000017159 ENSDLEG00000017148 #22 ZNF280B (ENSDLEG00000017133) ENSDLEG00000017122 ENSDLEG00000017115 PRAME (ENSDLEG00000017035) ENSDLEG00000017016 ENSDLEG00000016997 ENSDLEG00000016993 ENSDLEG00000016814 ENSDLEG00000016763 GNAZ (ENSDLEG00000016759) RSPH14 (ENSDLEG00000016746) RAB36 (ENSDLEG00000016692) ENSDLEG00000016679 BCR (ENSDLEG00000016644) SPECC1L (ENSDLEG00000016568) Vaquita MODERN SPECIES 9 ENSPSNG00000013707 ENSPSNG00000013603 ENSPSNG00000013532 COG3 (ENSPSNG00000013423) CBY2 (ENSPSNG00000013325) SIAH3 (ENSPSNG00000013279) ZC3H13 (ENSPSNG00000013177) CPB2 (ENSPSNG00000012884) LCP1 (ENSPSNG00000012692) LRRC63 (ENSPSNG00000012567) RUBCNL (ENSPSNG00000012216) LRCH1 (ENSPSNG00000011958) ESD (ENSPSNG00000011858) HTR2A (ENSPSNG00000011806) SUCLA2 (ENSPSNG00000011705) ENSPSNG00000011663 #22 ENSPSNG00000011620 MED4 (ENSPSNG00000011552) ITM2B (ENSPSNG00000011455) LPAR6 (ENSPSNG00000011434) RB1 (ENSPSNG00000011372) RCBTB2 (ENSPSNG00000011199) ENSPSNG00000011140 ENSPSNG00000011098 FNDC3A (ENSPSNG00000010915) MLNR (ENSPSNG00000010798) CDADC1 (ENSPSNG00000010730) ENSPSNG00000022529 CAB39L (ENSPSNG00000022525) SETDB2 (ENSPSNG00000022516) PHF11 (ENSPSNG00000022507) Pecora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000162331 ENSGT00940000160211 ENSGT00740000117161 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00910000146794 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00940000162132 ENSGT00440000033232.c.a.b #22 ENSGT00940000154848 ENSGT00940000157175 ENSGT00390000010938 ENSGT00390000010337.B.a.a ENSGT00400000025006 ENSGT00940000153533.b ENSGT00950000182863.A.a.a ENSGT00940000157319 ENSGT00390000018698 ENSGT00390000015893 ENSGT00950000182971.A.d ENSGT00390000010961 ENSGT00940000158316 ENSGT00940000155584.ob.a ENSGT00940000155213 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000162331 ENSGT00940000160211 ENSGT00740000117161 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00910000146794 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00940000162132 ENSGT00440000033232.c.a.b #22 ENSGT00940000154848 ENSGT00940000157175 ENSGT00390000010938 ENSGT00390000010337.B.a.a ENSGT00400000025006 ENSGT00940000153533.b ENSGT00950000182863.A.a.a ENSGT00940000157319 ENSGT00390000018698 ENSGT00390000015893 ENSGT00950000182971.A.d ENSGT00390000010961 ENSGT00940000158316 ENSGT00940000155584.ob.a ENSGT00940000155213 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000162331 ENSGT00940000160211 ENSGT00740000117161 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00910000146794 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00940000162132 ENSGT00440000033232.c.a.b #22 ENSGT00940000154848 ENSGT00940000157175 ENSGT00390000010938 ENSGT00390000010337.B.a.a ENSGT00400000025006 ENSGT00940000153533.b ENSGT00950000182863.A.a.a ENSGT00940000157319 ENSGT00390000018698 ENSGT00390000015893 ENSGT00950000182971.A.d ENSGT00390000010961 ENSGT00940000158316 ENSGT00940000155584.ob.a ENSGT00940000155213 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000162331 ENSGT00940000160211 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00910000146794 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00940000154276.jb.a.a.a.b ENSGT00940000162132 ENSGT00440000033232.c.a.b #22 ENSGT00940000154848 ENSGT00940000157175 ENSGT00940000168263 ENSGT00390000010938 ENSGT00390000010337.B.a.a ENSGT00400000025006 ENSGT00940000153533.b ENSGT00950000182863.A.a.a ENSGT00940000157319 ENSGT00390000018698 ENSGT00390000015893 ENSGT00950000182971.A.d ENSGT00390000010961 ENSGT00940000158316 ENSGT00940000155584.ob.a Bos ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000162331 ENSGT00940000160211 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00910000146794 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00940000154276.jb.a.a.a.b ENSGT00940000162132 ENSGT00440000033232.c.a.b #22 ENSGT00940000154848 ENSGT00940000157175 ENSGT00940000168263 ENSGT00390000010938 ENSGT00390000010337.B.a.a ENSGT00650000093476 ENSGT00400000025006 ENSGT00940000153533.b ENSGT00950000182863.A.a.a ENSGT00940000157319 ENSGT00390000018698 ENSGT00390000015893 ENSGT00950000182971.A.d ENSGT00390000010961 ENSGT00940000158316 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157672 ENSGT00940000162331 ENSGT00940000160211 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00910000146794 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00940000154276.jb.a.a.a.b ENSGT00940000162132 ENSGT00440000033232.c.a.b #22 ENSGT00940000154848 ENSGT00940000157175 ENSGT00940000168263 ENSGT00390000010938 ENSGT00390000010337.B.a.a ENSGT00650000093476 ENSGT00940000153533.b ENSGT00950000182863.A.a.a ENSGT00940000157319 ENSGT00390000018698 ENSGT00390000015893 ENSGT00950000182971.A.d ENSGT00390000010961 ENSGT00940000158316 ENSGT00940000155584.ob.a Cow MODERN SPECIES 9 PSMB10 (ENSBTAG00000018040) LCAT (ENSBTAG00000018043) SLC12A4 (ENSBTAG00000018045) DPEP3 (ENSBTAG00000002824) DPEP2 (ENSBTAG00000039426) DDX28 (ENSBTAG00000004290) DUS2 (ENSBTAG00000014644) NFATC3 (ENSBTAG00000004368) PLA2G15 (ENSBTAG00000007512) SLC7A6 (ENSBTAG00000012112) SLC7A6OS (ENSBTAG00000009636) PRMT7 (ENSBTAG00000009638) SMPD3 (ENSBTAG00000009639) ENSBTAG00000054799 ZFP90 (ENSBTAG00000007488) ENSBTAG00000053442 #22 CDH3 (ENSBTAG00000033248) CDH1 (ENSBTAG00000015991) TANGO6 (ENSBTAG00000013941) HAS3 (ENSBTAG00000050602) CHTF8 (ENSBTAG00000001698) UTP4 (ENSBTAG00000006347) SNTB2 (ENSBTAG00000001654) VPS4A (ENSBTAG00000001659) PDF (ENSBTAG00000001663) COG8 (ENSBTAG00000001665) NIP7 (ENSBTAG00000001666) TMED6 (ENSBTAG00000007616) TERF2 (ENSBTAG00000007617) CYB5B (ENSBTAG00000002412) ENSBTAG00000052086 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 9 SLC12A4 (ENSBIXG00005023907) DPEP3 (ENSBIXG00005004111) DPEP2 (ENSBIXG00005024041) DDX28 (ENSBIXG00005024055) DUS2 (ENSBIXG00005024133) NFATC3 (ENSBIXG00005024219) ESRP2 (ENSBIXG00005024266) PLA2G15 (ENSBIXG00005024301) SLC7A6 (ENSBIXG00005024342) ENSBIXG00005024371 SLC7A6OS (ENSBIXG00005024395) PRMT7 (ENSBIXG00005024445) SMPD3 (ENSBIXG00005004186) ENSBIXG00005024518 ZFP90 (ENSBIXG00005024617) ENSBIXG00005024635 #22 CDH3 (ENSBIXG00005024711) CDH1 (ENSBIXG00005024771) ENSBIXG00005024816 TANGO6 (ENSBIXG00005024874) HAS3 (ENSBIXG00005024907) DERPC (ENSBIXG00005006294) ENSBIXG00005025030 UTP4 (ENSBIXG00005025084) SNTB2 (ENSBIXG00005007190) VPS4A (ENSBIXG00005025143) PDF (ENSBIXG00005004283) COG8 (ENSBIXG00005004285) TMED6 (ENSBIXG00005025205) TERF2 (ENSBIXG00005004297) NIP7 (ENSBIXG00005025373) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160052 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000162331 ENSGT00940000160211 ENSGT00940000161738 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000157499 ENSGT00940000158295 ENSGT00390000015672 ENSGT00940000156879 ENSGT00400000022168.b ENSGT00940000154276.jb.a.a.a.b ENSGT00940000162132 ENSGT00440000033232.c.a.b #22 ENSGT00940000154848 ENSGT00940000157175 ENSGT00390000010938 ENSGT00390000010337.B.a.a ENSGT00400000025006 ENSGT00940000153533.b ENSGT00950000182863.A.a.a ENSGT00940000157319 ENSGT00390000018698 ENSGT00390000015893 ENSGT00950000182971.A.d ENSGT00390000010961 ENSGT00940000158316 ENSGT00940000155584.pb ENSGT00940000155213 Domestic yak MODERN SPECIES 12 PSKH1 (ENSBGRG00000023536) PSMB10 (ENSBGRG00000023431) SLC12A4 (ENSBGRG00000021263) DPEP3 (ENSBGRG00000020239) DPEP2 (ENSBGRG00000019915) DDX28 (ENSBGRG00000019797) DUS2 (ENSBGRG00000019213) NFATC3 (ENSBGRG00000018263) PLA2G15 (ENSBGRG00000016967) SLC7A6 (ENSBGRG00000016720) SLC7A6OS (ENSBGRG00000016496) PRMT7 (ENSBGRG00000015737) SMPD3 (ENSBGRG00000015288) ENSBGRG00000015049 ZFP90 (ENSBGRG00000014757) ENSBGRG00000014604 #22 CDH3 (ENSBGRG00000014173) CDH1 (ENSBGRG00000012778) TANGO6 (ENSBGRG00000012027) HAS3 (ENSBGRG00000011661) DERPC (ENSBGRG00000011103) UTP4 (ENSBGRG00000010130) SNTB2 (ENSBGRG00000009610) PDF (ENSBGRG00000009433) VPS4A (ENSBGRG00000008997) COG8 (ENSBGRG00000008628) TMED6 (ENSBGRG00000008404) NIP7 (ENSBGRG00000008017) TERF2 (ENSBGRG00000007192) CYB5B (ENSBGRG00000006717) NFAT5 (ENSBGRG00000006014) Yarkand deer MODERN SPECIES 27 LCAT (ENSCHYG00000012936) SLC12A4 (ENSCHYG00000013256) DPEP3 (ENSCHYG00000016357) DPEP2 (ENSCHYG00000016637) DDX28 (ENSCHYG00000016790) DUS2 (ENSCHYG00000016831) NFATC3 (ENSCHYG00000017012) ESRP2 (ENSCHYG00000017451) PLA2G15 (ENSCHYG00000017583) SLC7A6 (ENSCHYG00000017732) SLC7A6OS (ENSCHYG00000017862) PRMT7 (ENSCHYG00000017921) ENSCHYG00000018133 SMPD3 (ENSCHYG00000018154) ZFP90 (ENSCHYG00000018229) ENSCHYG00000018411 #22 CDH3 (ENSCHYG00000018461) CDH1 (ENSCHYG00000019041) TANGO6 (ENSCHYG00000019265) DERPC (ENSCHYG00000019546) HAS3 (ENSCHYG00000019692) UTP4 (ENSCHYG00000019789) ENSCHYG00000019942 PDF (ENSCHYG00000020295) COG8 (ENSCHYG00000020343) NIP7 (ENSCHYG00000020453) TMED6 (ENSCHYG00000020585) TERF2 (ENSCHYG00000020670) CYB5B (ENSCHYG00000020835) NFAT5 (ENSCHYG00000020920) NQO1 (ENSCHYG00000021068) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b #22 Bovidae DUPLICATION Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.a #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.a #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.a #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.a #22 Cow MODERN SPECIES 63 ENSBTAG00000052572 #22 Bovidae DUPLICATION Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.a #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.a #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.a #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.a #22 Wild yak MODERN SPECIES 2272 ENSBMUG00000025414 ASTE1 (ENSBMUG00000025421) ATP2C1 (ENSBMUG00000025505) ENSBMUG00000025570 #22 ENSBMUG00000025574 PSMG1 (ENSBMUG00000025581) BRWD1 (ENSBMUG00000025609) ENSBMUG00000025622 GET1 (ENSBMUG00000025636) LCA5L (ENSBMUG00000025646) SH3BGR (ENSBMUG00000025661) Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.a #22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 24 TMEM121B (ENSBIXG00005024700) IL17RA (ENSBIXG00005024680) CACNA1C (ENSBIXG00005024628) ENSBIXG00005024535 DCP1B (ENSBIXG00005024521) CACNA2D4 (ENSBIXG00005024482) LRTM2 (ENSBIXG00005024352) ENSBIXG00005024319 ADIPOR2 (ENSBIXG00005024199) ENSBIXG00005024187 WNT5B (ENSBIXG00005007578) FBXL14 (ENSBIXG00005024113) ERC1 (ENSBIXG00005024018) RAD52 (ENSBIXG00005004045) WNK1 (ENSBIXG00005023577) ENSBIXG00005023356 #22 ENSBIXG00005023336 B4GALNT3 (ENSBIXG00005023310) CCDC77 (ENSBIXG00005023238) KDM5A (ENSBIXG00005007075) ENSBIXG00005023047 SLC6A12 (ENSBIXG00005022979) IQSEC3 (ENSBIXG00005022803) ENSBIXG00005003892 ENSBIXG00005022719 RHNO1 (ENSBIXG00005022687) DDX11 (ENSBIXG00005022661) FKBP4 (ENSBIXG00005003856) ITFG2 (ENSBIXG00005022573) NRIP2 (ENSBIXG00005022536) TEX52 (ENSBIXG00005022514) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.a #22 Goat MODERN SPECIES 28 PDSS2 (ENSCHIG00000015163) BEND3 (ENSCHIG00000010728) MTRES1 (ENSCHIG00000005527) CD24 (ENSCHIG00000015151) ENSCHIG00000017313 RTN4IP1 (ENSCHIG00000011362) CRYBG1 (ENSCHIG00000020732) ATG5 (ENSCHIG00000019684) PRDM1 (ENSCHIG00000023368) PREP (ENSCHIG00000019257) POPDC3 (ENSCHIG00000016800) BVES (ENSCHIG00000008491) LIN28B (ENSCHIG00000011133) ENSCHIG00000015439 HACE1 (ENSCHIG00000025754) ENSCHIG00000025858 #22 ENSCHIG00000009503 ENSCHIG00000018302 ENSCHIG00000015656 GRIK2 (ENSCHIG00000021980) ASCC3 (ENSCHIG00000023605) SIM1 (ENSCHIG00000010900) ENSCHIG00000009763 MCHR2 (ENSCHIG00000014417) PRDM13 (ENSCHIG00000006628) ENSCHIG00000020922 ENSCHIG00000016858 ENSCHIG00000013830 USP45 (ENSCHIG00000013909) PNISR (ENSCHIG00000017747) COQ3 (ENSCHIG00000011202) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c.b.b.b #22 Cow MODERN SPECIES ENSBTAG00000045771 ENSBTAG00000050235 TMPRSS2 (ENSBTAG00000009132) MX1 (ENSBTAG00000030913) MX2 (ENSBTAG00000008471) FAM3B (ENSBTAG00000030921) BACE2 (ENSBTAG00000000394) ENSBTAG00000054486 DSCAM (ENSBTAG00000004754) PCP4 (ENSBTAG00000051421) IGSF5 (ENSBTAG00000002029) B3GALT5 (ENSBTAG00000023407) SH3BGR (ENSBTAG00000007068) LCA5L (ENSBTAG00000030993) GET1 (ENSBTAG00000013629) ENSBTAG00000023106 #22 HMGN1 (ENSBTAG00000018768) BRWD1 (ENSBTAG00000013602) PSMG1 (ENSBTAG00000013600) ENSBTAG00000050167 ATP2C1 (ENSBTAG00000011626) ASTE1 (ENSBTAG00000007462) NEK11 (ENSBTAG00000009258) NUDT16 (ENSBTAG00000018749) MRPL3 (ENSBTAG00000030942) ENSBTAG00000053358 CPNE4 (ENSBTAG00000010448) ENSBTAG00000054550 ENSBTAG00000054913 ENSBTAG00000049430 ENSBTAG00000054801 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00960000187239 ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000155207.a.b ENSGT00940000155686 ENSGT00940000163266 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000159548 ENSGT01030000238221 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00530000064267 ENSGT00940000158524.h ENSGT00940000160964 ENSGT00940000159847 ENSGT00560000077266.b ENSGT00390000008610.a.b.a.a.b ENSGT00440000033232.c.b.b.b #22 ENSGT00950000182802.A.ab.b.b.b ENSGT00950000183107.a.b.a ENSGT00950000185720 ENSGT00500000044950 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00390000011422 ENSGT00940000155519 ENSGT00940000160450 ENSGT00390000017582 ENSGT01030000234667.a.a.a.b ENSGT00940000160993 ENSGT00940000156177 Goat MODERN SPECIES TMPRSS2 (ENSCHIG00000024477) MX1 (ENSCHIG00000001865) MX2 (ENSCHIG00000014150) FAM3B (ENSCHIG00000017490) ENSCHIG00000016035 BACE2 (ENSCHIG00000019839) ENSCHIG00000015454 ENSCHIG00000025338 DSCAM (ENSCHIG00000010917) PCP4 (ENSCHIG00000026748) ENSCHIG00000010437 B3GALT5 (ENSCHIG00000003423) SH3BGR (ENSCHIG00000018188) LCA5L (ENSCHIG00000013759) GET1 (ENSCHIG00000008859) ENSCHIG00000000879 #22 ENSCHIG00000008037 BRWD1 (ENSCHIG00000013528) ENSCHIG00000022501 PSMG1 (ENSCHIG00000005726) ATP2C1 (ENSCHIG00000015474) ASTE1 (ENSCHIG00000021806) NEK11 (ENSCHIG00000008883) NUDT16 (ENSCHIG00000026305) ENSCHIG00000015651 MRPL3 (ENSCHIG00000024783) ENSCHIG00000018608 ENSCHIG00000005044 ACP3 (ENSCHIG00000016695) DNAJC13 (ENSCHIG00000010645) ACKR4 (ENSCHIG00000008163) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.c #22 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1269 PRSS27 (ENSMLUG00000012469) ENSMLUG00000015289 ENSMLUG00000029957 #22 PDPK1 (ENSMLUG00000004579) AMDHD2 (ENSMLUG00000016094) ENSMLUG00000026715 TBC1D24 (ENSMLUG00000016101) NTN3 (ENSMLUG00000016851) TEDC2 (ENSMLUG00000016843) CCNF (ENSMLUG00000016829) ENSMLUG00000026580 ABCA3 (ENSMLUG00000016811) RNPS1 (ENSMLUG00000016808) ECI1 (ENSMLUG00000016802) DNASE1L2 (ENSMLUG00000016796) E4F1 (ENSMLUG00000016786) PGP (ENSMLUG00000025280) BRICD5 (ENSMLUG00000003946) Microbat MODERN SPECIES 953 ST8SIA5 (ENSMLUG00000008890) LOXHD1 (ENSMLUG00000008832) RNF165 (ENSMLUG00000008813) C18orf25 (ENSMLUG00000008806) HAUS1 (ENSMLUG00000009879) ATP5F1A (ENSMLUG00000009856) PSTPIP2 (ENSMLUG00000009831) EPG5 (ENSMLUG00000009791) SIGLEC15 (ENSMLUG00000004894) SLC14A1 (ENSMLUG00000004885) SLC14A2 (ENSMLUG00000000990) ENSMLUG00000013354 ENSMLUG00000022722 SYT4 (ENSMLUG00000016472) PIK3C3 (ENSMLUG00000014471) ENSMLUG00000028486 #22 CELF4 (ENSMLUG00000001755) KIAA1328 (ENSMLUG00000001746) TPGS2 (ENSMLUG00000001739) FHOD3 (ENSMLUG00000001727) MOCOS (ENSMLUG00000008488) ELP2 (ENSMLUG00000008443) SLC39A6 (ENSMLUG00000001845) RPRD1A (ENSMLUG00000008424) ENSMLUG00000001978 ENSMLUG00000030708 RALGAPB (ENSMLUG00000009515) ADIG (ENSMLUG00000023053) ARHGAP40 (ENSMLUG00000009584) SLC32A1 (ENSMLUG00000009604) ACTR5 (ENSMLUG00000009154) Microbat MODERN SPECIES 939 ENSMLUG00000008966 ELF4 (ENSMLUG00000012862) BCORL1 (ENSMLUG00000008944) ENSMLUG00000028941 ENSMLUG00000001984 ZDHHC9 (ENSMLUG00000001980) SASH3 (ENSMLUG00000001974) XPNPEP2 (ENSMLUG00000001962) APLN (ENSMLUG00000023749) OCRL (ENSMLUG00000015997) SMARCA1 (ENSMLUG00000029614) ENSMLUG00000016470 ENSMLUG00000025391 ENSMLUG00000029909 DCAF12L2 (ENSMLUG00000015935) ENSMLUG00000025675 #22 ENSMLUG00000028867 ENSMLUG00000030179 ENSMLUG00000025681 TENM1 (ENSMLUG00000014882) ENSMLUG00000024778 SH2D1A (ENSMLUG00000014879) STAG2 (ENSMLUG00000009349) XIAP (ENSMLUG00000001731) ENSMLUG00000027315 ENSMLUG00000013656 GRIA3 (ENSMLUG00000007407) C1GALT1C1 (ENSMLUG00000012757) MCTS1 (ENSMLUG00000015101) CUL4B (ENSMLUG00000013231) LAMP2 (ENSMLUG00000012320) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 DHRS7 (ENSRFEG00010003763) PCNX4 (ENSRFEG00010003778) LRRC9 (ENSRFEG00010003818) RTN1 (ENSRFEG00010003928) CCDC175 (ENSRFEG00010003982) JKAMP (ENSRFEG00010004007) L3HYPDH (ENSRFEG00010004031) GPR135 (ENSRFEG00010004043) DAAM1 (ENSRFEG00010004071) ENSRFEG00010004127 DACT1 (ENSRFEG00010004136) KIAA0586 (ENSRFEG00010004194) TIMM9 (ENSRFEG00010004281) TOMM20L (ENSRFEG00010004303) ARID4A (ENSRFEG00010004329) ENSRFEG00010004355 #22 PSMA3 (ENSRFEG00010004363) ENSRFEG00010004387 ACTR10 (ENSRFEG00010004399) ARMH4 (ENSRFEG00010004418) ENSRFEG00010004425 SLC35F4 (ENSRFEG00010004439) CCDC198 (ENSRFEG00010004458) NAA30 (ENSRFEG00010004478) AP5M1 (ENSRFEG00010004511) EXOC5 (ENSRFEG00010004550) OTX2 (ENSRFEG00010000223) ENSRFEG00010000266 TMEM260 (ENSRFEG00010000307) PELI2 (ENSRFEG00010000362) KTN1 (ENSRFEG00010000612) Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.d ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.d ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163113 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MODERN SPECIES 423 ENSMNEG00000043807 ENSMNEG00000030448 SLCO2B1 (ENSMNEG00000042734) TPBGL (ENSMNEG00000021296) ARRB1 (ENSMNEG00000040641) ENSMNEG00000032069 KLHL35 (ENSMNEG00000038478) GDPD5 (ENSMNEG00000040623) SERPINH1 (ENSMNEG00000034292) MAP6 (ENSMNEG00000028588) MOGAT2 (ENSMNEG00000017020) DGAT2 (ENSMNEG00000045455) UVRAG (ENSMNEG00000036116) WNT11 (ENSMNEG00000042384) ENSMNEG00000014529 GVQW3 (ENSMNEG00000035110) ##22 ENSMNEG00000025096 EMSY (ENSMNEG00000041511) LRRC32 (ENSMNEG00000041843) TSKU (ENSMNEG00000013194) ACER3 (ENSMNEG00000030819) B3GNT6 (ENSMNEG00000035934) CAPN5 (ENSMNEG00000037879) MYO7A (ENSMNEG00000030597) GDPD4 (ENSMNEG00000038159) ENSMNEG00000028157 PAK1 (ENSMNEG00000044840) AQP11 (ENSMNEG00000044078) CLNS1A (ENSMNEG00000036050) RSF1 (ENSMNEG00000043815) AAMDC (ENSMNEG00000029653) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163113.b ENSGT00390000013347.b.b ENSGT01080000257336.a.c.a ENSGT00940000163536 ENSGT00950000182887.C.a.b ENSGT00390000008610.a.a ENSGT00940000161093 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163.e ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.d ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 5 ENSMFAG00000035199 OR2AT4 (ENSMFAG00000015937) ENSMFAG00000049841 SLCO2B1 (ENSMFAG00000042845) ARRB1 (ENSMFAG00000042650) ENSMFAG00000000525 KLHL35 (ENSMFAG00000031078) GDPD5 (ENSMFAG00000043053) SERPINH1 (ENSMFAG00000043814) MAP6 (ENSMFAG00000064715) MOGAT2 (ENSMFAG00000032272) DGAT2 (ENSMFAG00000042930) UVRAG (ENSMFAG00000001657) WNT11 (ENSMFAG00000043196) THAP12 (ENSMFAG00000033682) ENSMFAG00000042788 ##22 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ENSRROG00000038845 SLCO2B1 (ENSRROG00000029185) ARRB1 (ENSRROG00000037258) RPS3 (ENSRROG00000009870) KLHL35 (ENSRROG00000042922) GDPD5 (ENSRROG00000032119) SERPINH1 (ENSRROG00000034821) ENSRROG00000033527 MOGAT2 (ENSRROG00000018289) DGAT2 (ENSRROG00000029306) UVRAG (ENSRROG00000038883) WNT11 (ENSRROG00000031068) THAP12 (ENSRROG00000026238) GVQW3 (ENSRROG00000043820) ##22 ENSRROG00000020533 EMSY (ENSRROG00000039855) LRRC32 (ENSRROG00000028668) TSKU (ENSRROG00000032131) ENSRROG00000012645 ENSRROG00000040805 ACER3 (ENSRROG00000034805) B3GNT6 (ENSRROG00000033910) CAPN5 (ENSRROG00000040628) MYO7A (ENSRROG00000032426) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 255 UVRAG (ENSRBIG00000038543) WNT11 (ENSRBIG00000042828) THAP12 (ENSRBIG00000038933) GVQW3 (ENSRBIG00000043158) ##22 ENSRBIG00000012140 EMSY (ENSRBIG00000035210) LRRC32 (ENSRBIG00000043891) WWOX (ENSRBIG00000035298) CLEC3A (ENSRBIG00000042562) VAT1L (ENSRBIG00000010655) NUDT7 (ENSRBIG00000030419) ADAMTS18 (ENSRBIG00000042780) SYCE1L 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ARRB1 (ENSNLEG00000016918) ENSNLEG00000036221 ENSNLEG00000016911 ENSNLEG00000016910 GDPD5 (ENSNLEG00000028251) SERPINH1 (ENSNLEG00000016882) MAP6 (ENSNLEG00000016878) MOGAT2 (ENSNLEG00000028048) DGAT2 (ENSNLEG00000016866) UVRAG (ENSNLEG00000027301) WNT11 (ENSNLEG00000016841) ENSNLEG00000032732 ENSNLEG00000033823 ##22 ENSNLEG00000028651 EMSY (ENSNLEG00000016812) LRRC32 (ENSNLEG00000016810) TSKU (ENSNLEG00000033845) ACER3 (ENSNLEG00000034984) B3GNT6 (ENSNLEG00000016789) OMP (ENSNLEG00000016787) CAPN5 (ENSNLEG00000016775) MYO7A (ENSNLEG00000016747) GDPD4 (ENSNLEG00000016736) ENSNLEG00000030724 PAK1 (ENSNLEG00000016711) AQP11 (ENSNLEG00000016709) CLNS1A (ENSNLEG00000016699) RSF1 (ENSNLEG00000016681) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163113 ENSGT00940000162049.r ENSGT01080000257336.a.c.a ENSGT00940000163536 ENSGT00950000182887.C.a.b ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00940000161093 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163.e ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b 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ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.n Gorilla MODERN SPECIES 2 XRRA1 (ENSGGOG00000014505) SPCS2 (ENSGGOG00000014500) NEU3 (ENSGGOG00000014507) OR2AT4 (ENSGGOG00000023922) SLCO2B1 (ENSGGOG00000007327) ARRB1 (ENSGGOG00000009699) RPS3 (ENSGGOG00000006519) KLHL35 (ENSGGOG00000015839) GDPD5 (ENSGGOG00000015848) SERPINH1 (ENSGGOG00000005397) MAP6 (ENSGGOG00000005400) DGAT2 (ENSGGOG00000002910) UVRAG (ENSGGOG00000002911) WNT11 (ENSGGOG00000015024) THAP12 (ENSGGOG00000006152) GVQW3 (ENSGGOG00000027994) ##22 EMSY (ENSGGOG00000012926) LRRC32 (ENSGGOG00000001727) TSKU (ENSGGOG00000008670) ACER3 (ENSGGOG00000003818) B3GNT6 (ENSGGOG00000000016) CAPN5 (ENSGGOG00000008071) MYO7A (ENSGGOG00000008082) ENSGGOG00000008102 ENSGGOG00000043330 PAK1 (ENSGGOG00000003150) AQP11 (ENSGGOG00000011985) CLNS1A (ENSGGOG00000003091) RSF1 (ENSGGOG00000001833) ENSGGOG00000023151 ENSGGOG00000013088 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163113 ENSGT00940000162049.r ENSGT01080000257336.a.c.a 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ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a.a ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554.o ENSGT00910000147490 ENSGT00390000009554.p ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00390000011698.c.a.c.b ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.n ENSGT00530000064411 Chimpanzee MODERN SPECIES 2 OR2AT4 (ENSPTRG00000004076) ENSPTRG00000047698 SLCO2B1 (ENSPTRG00000004078) TPBGL (ENSPTRG00000052868) ARRB1 (ENSPTRG00000004079) RPS3 (ENSPTRG00000048574) KLHL35 (ENSPTRG00000004081) GDPD5 (ENSPTRG00000046453) SERPINH1 (ENSPTRG00000004083) MAP6 (ENSPTRG00000004085) MOGAT2 (ENSPTRG00000004086) DGAT2 (ENSPTRG00000004087) UVRAG (ENSPTRG00000004088) WNT11 (ENSPTRG00000004090) THAP12 (ENSPTRG00000004091) ENSPTRG00000028470 ##22 ENSPTRG00000049644 EMSY (ENSPTRG00000004093) LRRC32 (ENSPTRG00000004094) TSKU (ENSPTRG00000028468) ACER3 (ENSPTRG00000004096) B3GNT6 (ENSPTRG00000023606) CAPN5 (ENSPTRG00000049993) MYO7A (ENSPTRG00000004098) GDPD4 (ENSPTRG00000004100) ENSPTRG00000048327 PAK1 (ENSPTRG00000004101) AQP11 (ENSPTRG00000004103) CLNS1A (ENSPTRG00000048842) RSF1 (ENSPTRG00000004105) AAMDC (ENSPTRG00000004106) Bonobo MODERN SPECIES 2 ENSPPAG00000043844 RSF1 (ENSPPAG00000020888) CLNS1A (ENSPPAG00000035940) AQP11 (ENSPPAG00000030812) PAK1 (ENSPPAG00000042768) ENSPPAG00000033073 GDPD4 (ENSPPAG00000033740) MYO7A (ENSPPAG00000035116) CAPN5 (ENSPPAG00000034162) B3GNT6 (ENSPPAG00000004892) ACER3 (ENSPPAG00000015516) TSKU (ENSPPAG00000025259) LRRC32 (ENSPPAG00000028327) ENSPPAG00000027471 THAP12 (ENSPPAG00000005479) ENSPPAG00000028053 ##22 ENSPPAG00000038460 ENSPPAG00000030327 WNT11 (ENSPPAG00000010959) UVRAG (ENSPPAG00000027735) DGAT2 (ENSPPAG00000015345) MOGAT2 (ENSPPAG00000012175) ENSPPAG00000040024 ENSPPAG00000041483 GDPD5 (ENSPPAG00000042473) KLHL35 (ENSPPAG00000010945) RPS3 (ENSPPAG00000029211) ARRB1 (ENSPPAG00000040868) SLCO2B1 (ENSPPAG00000031133) ENSPPAG00000015262 OR2AT4 (ENSPPAG00000043903) Human MODERN SPECIES 2 NEU3 (ENSG00000162139) OR2AT4 (ENSG00000171561) SLCO2B1 (ENSG00000137491) TPBGL (ENSG00000261594) ARRB1 (ENSG00000137486) RPS3 (ENSG00000149273) KLHL35 (ENSG00000149243) GDPD5 (ENSG00000158555) SERPINH1 (ENSG00000149257) MAP6 (ENSG00000171533) MOGAT2 (ENSG00000166391) DGAT2 (ENSG00000062282) UVRAG (ENSG00000198382) WNT11 (ENSG00000085741) THAP12 (ENSG00000137492) GVQW3 (ENSG00000179240) ##22 EMSY (ENSG00000158636) LRRC32 (ENSG00000137507) TSKU (ENSG00000182704) ACER3 (ENSG00000078124) B3GNT6 (ENSG00000198488) CAPN5 (ENSG00000149260) OMP (ENSG00000254550) MYO7A (ENSG00000137474) GDPD4 (ENSG00000178795) PAK1 (ENSG00000149269) CLNS1A (ENSG00000074201) AQP11 (ENSG00000178301) RSF1 (ENSG00000048649) AAMDC (ENSG00000087884) INTS4 (ENSG00000149262) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000163113 ENSGT00940000162049.n ENSGT01080000257336.a.c.a ENSGT00940000163536 ENSGT00950000182887.C.a.b ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00940000161093 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163 ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 Bushbaby MODERN SPECIES 116 ENSOGAG00000034601 ENSOGAG00000030028 ENSOGAG00000002927 SLCO2B1 (ENSOGAG00000011545) ARRB1 (ENSOGAG00000011549) RPS3 (ENSOGAG00000005318) KLHL35 (ENSOGAG00000005323) GDPD5 (ENSOGAG00000027265) SERPINH1 (ENSOGAG00000032244) MAP6 (ENSOGAG00000005329) MOGAT2 (ENSOGAG00000000329) DGAT2 (ENSOGAG00000000330) UVRAG (ENSOGAG00000025371) WNT11 (ENSOGAG00000001568) ENSOGAG00000001569 GVQW3 (ENSOGAG00000027877) ##22 EMSY (ENSOGAG00000011434) LRRC32 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ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063 ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1701 ENSPSMG00000007819 GVQW3 (ENSPSMG00000007816) ##22 EMSY (ENSPSMG00000007731) LRRC32 (ENSPSMG00000007385) ENSPSMG00000007377 ENSPSMG00000007371 ENSPSMG00000007370 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01080000257336.a.c.a ENSGT00940000163536 ENSGT00950000182887.C.a.b ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00940000161093 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163 ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00940000169601 ENSGT00530000063516.a.a.d ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00390000009497 ENSGT00940000155350 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ENSGT00390000011958 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 SLCO2B1 (ENSHGLG00000015264) TPBGL (ENSHGLG00000021318) ARRB1 (ENSHGLG00000015558) RPS3 (ENSHGLG00000019339) KLHL35 (ENSHGLG00000004947) GDPD5 (ENSHGLG00000009912) SERPINH1 (ENSHGLG00000007288) MAP6 (ENSHGLG00000005485) ENSHGLG00000043050 MOGAT2 (ENSHGLG00000005337) DGAT2 (ENSHGLG00000003971) ENSHGLG00000039982 UVRAG (ENSHGLG00000003077) WNT11 (ENSHGLG00000010701) THAP12 (ENSHGLG00000043567) GVQW3 (ENSHGLG00000047967) ##22 EMSY (ENSHGLG00000006473) LRRC32 (ENSHGLG00000019111) ENSHGLG00000019386 ENSHGLG00000019448 ENSHGLG00000046732 ENSHGLG00000040669 ENSHGLG00000046387 ENSHGLG00000043666 ENSHGLG00000007972 ENSHGLG00000017959 ACER3 (ENSHGLG00000010087) ENSHGLG00000037392 OMP (ENSHGLG00000046318) CAPN5 (ENSHGLG00000002816) MYO7A (ENSHGLG00000011345) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000163113 ENSGT01080000257336.a.c.a ENSGT00940000163536 ENSGT00950000182887.C.a.b ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00940000161093 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ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251 ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.ab ENSGT00530000064411 ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 Alpin marmot MODERN SPECIES 3 ENSMMMG00000010292 RNF169 (ENSMMMG00000010273) XRRA1 (ENSMMMG00000010212) SPCS2 (ENSMMMG00000010185) NEU3 (ENSMMMG00000010144) SLCO2B1 (ENSMMMG00000010020) ARRB1 (ENSMMMG00000009891) RPS3 (ENSMMMG00000009823) GDPD5 (ENSMMMG00000009761) SERPINH1 (ENSMMMG00000009745) MAP6 (ENSMMMG00000009732) MOGAT2 (ENSMMMG00000009708) DGAT2 (ENSMMMG00000009694) UVRAG (ENSMMMG00000009669) WNT11 (ENSMMMG00000009631) GVQW3 (ENSMMMG00000009582) ##22 EMSY (ENSMMMG00000009455) LRRC32 (ENSMMMG00000009408) ENSMMMG00000009326 TSKU (ENSMMMG00000009316) ACER3 (ENSMMMG00000009260) B3GNT6 (ENSMMMG00000009247) CAPN5 (ENSMMMG00000009202) MYO7A (ENSMMMG00000008595) GDPD4 (ENSMMMG00000008571) ENSMMMG00000008545 PAK1 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B3GNT6 (ENSCHYG00000005731) CAPN5 (ENSCHYG00000005742) MYO7A (ENSCHYG00000005782) ENSCHYG00000005884 ENSCHYG00000006051 ANO3 (ENSCHYG00000006109) MUC15 (ENSCHYG00000006418) SLC5A12 (ENSCHYG00000006464) ENSCHYG00000006539 FIBIN (ENSCHYG00000006554) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00940000161093 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163 ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b.h ENSGT00970000197259 ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.a.a ENSGT01030000234582.e.b.g.a.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00390000005534.b.b.c.a ENSGT00940000156257 ENSGT00390000001698 ENSGT00940000159545 ENSGT00390000007623 ENSGT00530000063582.b ENSGT00730000111271 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00940000161093 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163 ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b.h ENSGT00970000197259 ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.a.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.a.a ENSGT01030000234582.e.b.g.a.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00390000005534.b.b.c.a ENSGT00940000156257 ENSGT00390000001698 ENSGT00940000159545 ENSGT00390000007623 ENSGT00530000063582.b ENSGT00730000111271 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163 ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b.h ENSGT01030000234582.e.b.g.b.b ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000007473.d ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.a.a ENSGT01030000234582.e.b.g.a.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00960000189459.a ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251.f.e.b ENSGT00940000156257 ENSGT00390000001698 ENSGT00940000159545 ENSGT00390000007623 ENSGT00530000063582.b Bos ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156163 ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b.h ENSGT01030000234582.e.b.g.b.b ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000007473.d ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.a.a ENSGT01030000234582.e.b.g.a.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000153434.a.b.a.b ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251.f.e.b ENSGT00940000156257 ENSGT00390000001698 ENSGT00940000159545 ENSGT00390000007623 ENSGT00530000063582.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT01030000234582.e.b.g.b.a.a.b ENSGT01030000234582.e.b.g.a.a ENSGT01030000234582.e.b.g.a.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000153434.a.b.a.b ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251.f.e.b ENSGT00940000156257 ENSGT00390000001698 ENSGT00940000159545 ENSGT00390000007623 ENSGT00530000063582.b ENSGT00730000111271 Domestic yak MODERN SPECIES 4 ACAD8 (ENSBGRG00000014917) ENSBGRG00000015140 GLB1L3 (ENSBGRG00000015614) GLB1L2 (ENSBGRG00000016150) ENSBGRG00000016722 ENSBGRG00000016847 ENSBGRG00000016922 ENSBGRG00000016954 ENSBGRG00000017082 DGAT2 (ENSBGRG00000017136) UVRAG (ENSBGRG00000017246) ENSBGRG00000017482 WNT11 (ENSBGRG00000017533) ENSBGRG00000017662 THAP12 (ENSBGRG00000017688) GVQW3 (ENSBGRG00000017782) ##22 EMSY (ENSBGRG00000017864) LRRC32 (ENSBGRG00000018703) TSKU (ENSBGRG00000018765) ACER3 (ENSBGRG00000018776) ENSBGRG00000018913 B3GNT6 (ENSBGRG00000018932) CAPN5 (ENSBGRG00000018968) MYO7A (ENSBGRG00000019096) ANO3 (ENSBGRG00000019295) MUC15 (ENSBGRG00000019809) SLC5A12 (ENSBGRG00000019870) FIBIN (ENSBGRG00000020121) BBOX1 (ENSBGRG00000020156) CCDC34 (ENSBGRG00000020253) LGR4 (ENSBGRG00000020409) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.a ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT00550000074618.a.b.ab.a.a.a.a ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00390000009948.c.l ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000153434.a.b.a.b ENSGT00940000163174 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156257 ENSGT00390000001698 ENSGT00940000159545 ENSGT00390000007623 ENSGT00530000063582.b ENSGT00730000111271 Cow MODERN SPECIES 6 RPS3 (ENSBTAG00000005620) KLHL35 (ENSBTAG00000015087) GDPD5 (ENSBTAG00000031777) SERPINH1 (ENSBTAG00000001027) MAP6 (ENSBTAG00000001028) MOGAT2 (ENSBTAG00000049519) ENSBTAG00000053794 ENSBTAG00000047111 ENSBTAG00000017443 ENSBTAG00000015091 ENSBTAG00000052936 MOGAT2 (ENSBTAG00000037483) UVRAG (ENSBTAG00000016355) WNT11 (ENSBTAG00000010820) THAP12 (ENSBTAG00000031609) GVQW3 (ENSBTAG00000052297) ##22 EMSY (ENSBTAG00000010826) LRRC32 (ENSBTAG00000001301) ENSBTAG00000051627 TSKU (ENSBTAG00000001537) ACER3 (ENSBTAG00000017218) ENSBTAG00000052260 ENSBTAG00000008557 B3GNT6 (ENSBTAG00000047129) CAPN5 (ENSBTAG00000005034) MYO7A (ENSBTAG00000003955) ANO3 (ENSBTAG00000021855) MUC15 (ENSBTAG00000027126) SLC5A12 (ENSBTAG00000021858) FIBIN (ENSBTAG00000006676) BBOX1 (ENSBTAG00000014847) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.d ##22 Goat MODERN SPECIES 6 RPS3 (ENSCHIG00000012342) KLHL35 (ENSCHIG00000024312) GDPD5 (ENSCHIG00000014683) SERPINH1 (ENSCHIG00000002757) MAP6 (ENSCHIG00000023796) ENSCHIG00000022165 ENSCHIG00000016754 ENSCHIG00000017465 ENSCHIG00000016227 ENSCHIG00000025677 ENSCHIG00000015313 DGAT2 (ENSCHIG00000010320) UVRAG (ENSCHIG00000025967) WNT11 (ENSCHIG00000021782) ENSCHIG00000008621 GVQW3 (ENSCHIG00000021697) ##22 ENSCHIG00000006745 EMSY (ENSCHIG00000016218) LRRC32 (ENSCHIG00000024280) ENSCHIG00000018605 TSKU (ENSCHIG00000002033) ACER3 (ENSCHIG00000012398) 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(ENSAMEG00000002128) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182944.A ENSGT00940000163113 ENSGT01080000257336.a.c.a ENSGT00940000163536 ENSGT00950000182887.C.a.b ENSGT00390000008610.a.b.a.b ENSGT00940000161093 ENSGT00940000159690 ENSGT00940000156163 ENSGT00530000063947.C ENSGT01030000234582.e.b ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT00390000012877 ENSGT00940000158413 ENSGT00530000063516.a.a.c.b ENSGT00440000033232.d ##22 ENSGT00390000009554 ENSGT00940000162288 ENSGT00940000162702 ENSGT00940000160984 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000156536 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156251.h.a ENSGT00950000182988.a.b.a ENSGT00530000063816.c ENSGT00390000010063.c.b ENSGT00530000064411 ENSGT00940000166485.a ENSGT00390000011958 ENSGT00390000010128 American mink MODERN SPECIES 6 NEU3 (ENSNVIG00000022399) OR2AT4 (ENSNVIG00000022405) SLCO2B1 (ENSNVIG00000022418) TPBGL (ENSNVIG00000022489) ARRB1 (ENSNVIG00000022499) RPS3 (ENSNVIG00000022524) KLHL35 (ENSNVIG00000000027) GDPD5 (ENSNVIG00000000058) SERPINH1 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Dingo MODERN SPECIES 245 RPS3 (ENSCAFG00020002102) KLHL35 (ENSCAFG00020002093) GDPD5 (ENSCAFG00020002063) SERPINH1 (ENSCAFG00020002046) ENSCAFG00020002018 MOGAT2 (ENSCAFG00020002004) ENSCAFG00020001974 UVRAG (ENSCAFG00020001967) WNT11 (ENSCAFG00020001959) THAP12 (ENSCAFG00020001916) GVQW3 (ENSCAFG00020001914) ##22 EMSY (ENSCAFG00020001634) LRRC32 (ENSCAFG00020001532) ENSCAFG00020001515 ENSCAFG00020001492 TSKU (ENSCAFG00020001488) ENSCAFG00020001463 ACER3 (ENSCAFG00020001459) B3GNT6 (ENSCAFG00020001446) CAPN5 (ENSCAFG00020001423) MYO7A (ENSCAFG00020001093) GDPD4 (ENSCAFG00020001036) PAK1 (ENSCAFG00020001022) ENSCAFG00020001015 AQP11 (ENSCAFG00020001010) ENSCAFG00020000978 Dog MODERN SPECIES 13 OR2AT2B (ENSCAFG00845012435) ENSCAFG00845012420 SLCO2B1 (ENSCAFG00845012322) ENSCAFG00845012257 ARRB1 (ENSCAFG00845011997) RPS3 (ENSCAFG00845011844) KLHL35 (ENSCAFG00845011797) GDPD5 (ENSCAFG00845011562) SERPINH1 (ENSCAFG00845011365) MAP6 (ENSCAFG00845011305) MOGAT2 (ENSCAFG00845011232) DGAT2 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ENSGT00440000033232 #22 Toxicofera DUPLICATION Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a #22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a #22 Elapidae_a DUPLICATION Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.a #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.a #22 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 102 ENSNSUG00000006417 UBP1 (ENSNSUG00000006421) CRTAP (ENSNSUG00000006671) ENSNSUG00000006673 #22 GLB1 (ENSNSUG00000006674) ENSNSUG00000006676 ENSNSUG00000006683 ENSNSUG00000006684 CCK (ENSNSUG00000006685) TRAK1 (ENSNSUG00000006690) ENSNSUG00000006691 ENSNSUG00000006692 KIAA1143 (ENSNSUG00000006693) TMEM42 (ENSNSUG00000006694) ZDHHC3 (ENSNSUG00000006695) EXOSC7 (ENSNSUG00000006697) ENSNSUG00000006707 CLEC3B (ENSNSUG00000006708) CDCP1 (ENSNSUG00000006710) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 178 SDHAF2 (ENSNSUG00000003417) ENSNSUG00000003423 ENSNSUG00000003432 TMEM216 (ENSNSUG00000003438) TMEM138 (ENSNSUG00000003447) CYB561A3 (ENSNSUG00000003449) TKFC (ENSNSUG00000003453) DDB1 (ENSNSUG00000003464) VWCE (ENSNSUG00000003474) ENSNSUG00000003487 VPS37C (ENSNSUG00000003691) SLC15A3 (ENSNSUG00000003696) TMEM132A (ENSNSUG00000003706) TMEM109 (ENSNSUG00000004040) ENSNSUG00000004041 ENSNSUG00000004042 #22 ZP1 (ENSNSUG00000004043) BAAT (ENSNSUG00000004059) ENSNSUG00000004064 ENSNSUG00000004066 ENSNSUG00000004067 ENSNSUG00000004068 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 30 RNF144B (ENSNSUG00000016748) DEK (ENSNSUG00000016749) KDM1B (ENSNSUG00000016783) TPMT (ENSNSUG00000016913) NHLRC1 (ENSNSUG00000016914) KIF13A (ENSNSUG00000016921) SIRT5 (ENSNSUG00000016969) NOL7 (ENSNSUG00000017035) ENSNSUG00000017036 ENSNSUG00000017037 MCUR1 (ENSNSUG00000017038) RNF182 (ENSNSUG00000017039) ENSNSUG00000017040 ENSNSUG00000017041 JARID2 (ENSNSUG00000017042) ENSNSUG00000017057 #22 DTNBP1 (ENSNSUG00000017060) MYLIP (ENSNSUG00000017063) GMPR (ENSNSUG00000017064) ATXN1 (ENSNSUG00000017067) RBM24 (ENSNSUG00000017071) CAP2 (ENSNSUG00000017075) FAM8A1 (ENSNSUG00000017088) NUP153 (ENSNSUG00000017089) ENSNSUG00000017092 PAK1IP1 (ENSNSUG00000017093) ENSNSUG00000017094 ENSNSUG00000017095 ENSNSUG00000017096 TBC1D7 (ENSNSUG00000017097) PHACTR1 (ENSNSUG00000017098) Eastern brown snake MODERN SPECIES 72 ZNF385A (ENSPTXG00000007241) GPR84 (ENSPTXG00000007240) COPZ1 (ENSPTXG00000007238) NFE2 (ENSPTXG00000007237) ENSPTXG00000007236 CBX5 (ENSPTXG00000007235) ENSPTXG00000007234 #22 SMUG1 (ENSPTXG00000007233) ENSPTXG00000007232 HOXC4 (ENSPTXG00000007231) HOXC5 (ENSPTXG00000007229) HOXC6 (ENSPTXG00000007228) HOXC8 (ENSPTXG00000007227) HOXC9 (ENSPTXG00000007226) HOXC10 (ENSPTXG00000007224) HOXC11 (ENSPTXG00000007223) HOXC12 (ENSPTXG00000007222) HOXC13 (ENSPTXG00000007221) CALCOCO1 (ENSPTXG00000007220) ENSPTXG00000007219 ATF7 (ENSPTXG00000007218) TARBP2 (ENSPTXG00000007217) Elapidae_a DUPLICATION Elapidae_a DUPLICATION Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.a.a #22 Acanthophiinae DUPLICATION Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.a.a.a #22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 8 FOXG1 (ENSNSUG00000005697) NOVA1 (ENSNSUG00000005700) STXBP6 (ENSNSUG00000005702) ENSNSUG00000005703 ACTC1 (ENSNSUG00000005705) AQR (ENSNSUG00000005708) ENSNSUG00000006075 DPH6 (ENSNSUG00000006076) ENSNSUG00000006077 CDIN1 (ENSNSUG00000006080) ENSNSUG00000006081 MEIS2 (ENSNSUG00000006082) SPRED1 (ENSNSUG00000006083) FAM98B (ENSNSUG00000006084) RASGRP1 (ENSNSUG00000006085) ENSNSUG00000006086 #22 ENSNSUG00000006087 SCG5 (ENSNSUG00000006088) GREM1 (ENSNSUG00000006095) FMN1 (ENSNSUG00000006102) RYR3 (ENSNSUG00000006104) AVEN (ENSNSUG00000006311) CHRM5 (ENSNSUG00000006335) EMC7 (ENSNSUG00000006336) KATNBL1 (ENSNSUG00000006337) THBS1 (ENSNSUG00000006349) GPR176 (ENSNSUG00000007560) EIF2AK4 (ENSNSUG00000007572) SRP14 (ENSNSUG00000007638) BMF (ENSNSUG00000007639) BUB1B (ENSNSUG00000007640) Eastern brown snake MODERN SPECIES 49 UBE2Z (ENSPTXG00000013882) ATP5MC1 (ENSPTXG00000013884) ENSPTXG00000013886 ENSPTXG00000013887 ENSPTXG00000013890 HOXB13 (ENSPTXG00000013892) HOXB9 (ENSPTXG00000013894) ENSPTXG00000013896 ENSPTXG00000013897 HOXB6 (ENSPTXG00000013898) HOXB5 (ENSPTXG00000013900) HOXB4 (ENSPTXG00000013902) HOXB3 (ENSPTXG00000013904) HOXB2 (ENSPTXG00000013905) HOXB1 (ENSPTXG00000013906) ENSPTXG00000013907 #22 SKAP1 (ENSPTXG00000013908) SNX11 (ENSPTXG00000013909) ENSPTXG00000013911 NFE2L1 (ENSPTXG00000013912) COPZ2 (ENSPTXG00000013913) CDK5RAP3 (ENSPTXG00000013914) PRR15L (ENSPTXG00000013915) PNPO (ENSPTXG00000013916) ENSPTXG00000013917 SP6 (ENSPTXG00000013918) SCRN2 (ENSPTXG00000013919) ENSPTXG00000013920 MRPL10 (ENSPTXG00000013921) OSBPL7 (ENSPTXG00000013922) TBX21 (ENSPTXG00000013928) Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.a.a.b #22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 1 ENSNSUG00000014350 HABP4 (ENSNSUG00000014351) ZNF367 (ENSNSUG00000014352) SLC35D2 (ENSNSUG00000014353) HSD17B3 (ENSNSUG00000014354) ENSNSUG00000014355 PTCH1 (ENSNSUG00000014356) FANCC (ENSNSUG00000014357) ENSNSUG00000014361 ENSNSUG00000014363 FBP1 (ENSNSUG00000014364) FBP2 (ENSNSUG00000014365) ENSNSUG00000014366 ENSNSUG00000014367 ENSNSUG00000014368 ENSNSUG00000014371 #22 GAS1 (ENSNSUG00000014372) ENSNSUG00000014449 ISCA1 (ENSNSUG00000014450) ENSNSUG00000014451 NAA35 (ENSNSUG00000014452) AGTPBP1 (ENSNSUG00000014453) NTRK2 (ENSNSUG00000014454) ENSNSUG00000014455 SLC28A3 (ENSNSUG00000014456) ENSNSUG00000014457 HNRNPK (ENSNSUG00000014458) C9orf64 (ENSNSUG00000014459) ENSNSUG00000014460 ENSNSUG00000014461 GKAP1 (ENSNSUG00000014462) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.a.b #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.a.b #22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 31 PLXDC2 (ENSPTXG00000004071) ENSPTXG00000004396 NEBL (ENSPTXG00000004397) MLLT10 (ENSPTXG00000004403) DNAJC1 (ENSPTXG00000004405) ENSPTXG00000004406 ENSPTXG00000004407 SPAG6 (ENSPTXG00000004409) PIP4K2A (ENSPTXG00000004415) ARMC3 (ENSPTXG00000005024) PTF1A (ENSPTXG00000005063) OTUD1 (ENSPTXG00000005064) KIAA1217 (ENSPTXG00000005065) ENSPTXG00000005067 #22 ENSPTXG00000005069 ENSPTXG00000005070 CDK6 (ENSPTXG00000005071) HEPACAM2 (ENSPTXG00000005072) VPS50 (ENSPTXG00000005073) CALCR (ENSPTXG00000005074) ENSPTXG00000005075 GNG11 (ENSPTXG00000005076) ENSPTXG00000005077 ENSPTXG00000005078 COL1A2 (ENSPTXG00000005079) CASD1 (ENSPTXG00000005080) SGCE (ENSPTXG00000005081) PPP1R9A (ENSPTXG00000005898) ENSPTXG00000013557 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 3953 ENSLLTG00000002185 #22 Elapidae_a DUPLICATION Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.b.a #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.b.a #22 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 172 FMO1 (ENSNSUG00000019078) FMO2 (ENSNSUG00000019079) FMO3 (ENSNSUG00000019095) ENSNSUG00000019096 PRRX1 (ENSNSUG00000019098) KIFAP3 (ENSNSUG00000019103) SCYL3 (ENSNSUG00000019168) C1orf112 (ENSNSUG00000019169) METTL18 (ENSNSUG00000019170) ENSNSUG00000019171 ENSNSUG00000019172 RXRG (ENSNSUG00000019208) LMX1A (ENSNSUG00000019209) ENSNSUG00000019210 ENSNSUG00000019211 ENSNSUG00000019212 #22 NUF2 (ENSNSUG00000019213) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 76 ENSNSUG00000009453 PLXDC2 (ENSNSUG00000009451) NEBL (ENSNSUG00000009447) ENSNSUG00000009445 ENSNSUG00000009441 ENSNSUG00000009439 ENSNSUG00000009437 DNAJC1 (ENSNSUG00000009436) ENSNSUG00000009435 ENSNSUG00000009434 SPAG6 (ENSNSUG00000009433) PIP4K2A (ENSNSUG00000009432) ARMC3 (ENSNSUG00000009345) ENSNSUG00000009344 OTUD1 (ENSNSUG00000009342) ENSNSUG00000009340 #22 KIAA1217 (ENSNSUG00000009339) ENSNSUG00000009337 ENSNSUG00000009336 CDK6 (ENSNSUG00000009333) HEPACAM2 (ENSNSUG00000009332) VPS50 (ENSNSUG00000009202) CALCR (ENSNSUG00000009201) GNG11 (ENSNSUG00000009200) ENSNSUG00000009199 ENSNSUG00000009198 COL1A2 (ENSNSUG00000008859) CASD1 (ENSNSUG00000008858) SGCE (ENSNSUG00000008644) PPP1R9A (ENSNSUG00000008631) ENSNSUG00000008630 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 200 NMT1 (ENSNSUG00000015850) DCAKD (ENSNSUG00000015834) ENSNSUG00000015833 KIF18B (ENSNSUG00000015831) GFAP (ENSNSUG00000015801) FAM187A (ENSNSUG00000015800) CCDC103 (ENSNSUG00000015799) EFTUD2 (ENSNSUG00000015598) GJC1 (ENSNSUG00000015595) GRN (ENSNSUG00000015594) FAM171A2 (ENSNSUG00000015592) ENSNSUG00000015591 ENSNSUG00000015590 ENSNSUG00000015589 FZD2 (ENSNSUG00000015588) ENSNSUG00000015587 #22 ENSNSUG00000015585 CCDC43 (ENSNSUG00000015584) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.b.b #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.a.b.b.b #22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2766 ENSNSUG00000004138 #22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 2 FBXO4 (ENSPTXG00000008975) RIMOC1 (ENSPTXG00000008974) ENSPTXG00000008973 PLCXD3 (ENSPTXG00000008972) ENSPTXG00000008951 ENSPTXG00000008921 C7 (ENSPTXG00000008920) ENSPTXG00000008918 PRKAA1 (ENSPTXG00000008917) TTC33 (ENSPTXG00000008916) PTGER4 (ENSPTXG00000008915) ENSPTXG00000008914 DAB2 (ENSPTXG00000008913) ENSPTXG00000008912 ENSPTXG00000008911 ENSPTXG00000008910 #22 FYB1 (ENSPTXG00000008908) RICTOR (ENSPTXG00000007824) ENSPTXG00000007808 LIFR (ENSPTXG00000007804) EGFLAM (ENSPTXG00000007796) GDNF (ENSPTXG00000007789) WDR70 (ENSPTXG00000007785) NUP155 (ENSPTXG00000007774) NIPBL (ENSPTXG00000007747) SLC1A3 (ENSPTXG00000007729) NADK2 (ENSPTXG00000007656) SKP2 (ENSPTXG00000007653) LMBRD2 (ENSPTXG00000007650) CAPSL (ENSPTXG00000007648) ENSPTXG00000007647 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 10430 ENSLLTG00000011428 #22 Lizard MODERN SPECIES 808 MSH4 (ENSACAG00000010892) ENSACAG00000011052 ACADM (ENSACAG00000011142) ENSACAG00000011263 SLC44A5 (ENSACAG00000011234) LHX8 (ENSACAG00000011289) ENSACAG00000035279 ENSACAG00000024761 TYW3 (ENSACAG00000011380) ENSACAG00000038741 ENSACAG00000011385 ERICH3 (ENSACAG00000011481) ENSACAG00000011717 TNNI3K (ENSACAG00000011525) FPGT (ENSACAG00000027860) ENSACAG00000045574 #22 ENSACAG00000028996 LRRIQ3 (ENSACAG00000028360) ENSACAG00000035177 ENSACAG00000038896 ENSACAG00000037212 ENSACAG00000036785 ENSACAG00000042436 ENSACAG00000043754 ENSACAG00000040962 NEGR1 (ENSACAG00000004220) ENSACAG00000000517 ENSACAG00000028841 ZRANB2 (ENSACAG00000004293) PTGER3 (ENSACAG00000038385) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.b #22 Lizard MODERN SPECIES 979 ENSACAG00000001819 ENSACAG00000001851 ENSACAG00000036885 ENSACAG00000022682 #22 SRSF6 (ENSACAG00000002061) L3MBTL1 (ENSACAG00000002143) SGK2 (ENSACAG00000002261) IFT52 (ENSACAG00000002461) MYBL2 (ENSACAG00000002463) ENSACAG00000040902 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232 #22 Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.e #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.e #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.e #22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.e #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.e #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.e #22 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 482 ENSLCAG00010008501 ENSLCAG00010008503 polr2c (ENSLCAG00010008515) coq9 (ENSLCAG00010008546) ciapin1 (ENSLCAG00010008551) prmt7 (ENSLCAG00010008560) exoc3l1 (ENSLCAG00010008596) ENSLCAG00010008619 ENSLCAG00010008623 ENSLCAG00010008625 ENSLCAG00010008628 septin15 (ENSLCAG00010008645) ENSLCAG00010008726 smpd3 (ENSLCAG00010008735) ENSLCAG00010008749 #22 ENSLCAG00010008752 ENSLCAG00010008760 znf276 (ENSLCAG00010008767) Barramundi perch MODERN SPECIES 244 ENSLCAG00010027716 #22 LRP1B (ENSLCAG00010027696) BZW1 (ENSLCAG00010027657) MYO1B (ENSLCAG00010027636) mnx2a (ENSLCAG00010027627) ENSLCAG00010027624 ENSLCAG00010027622 ENSLCAG00010027618 ENSLCAG00010027616 WNT6 (ENSLCAG00010027615) wnt10a (ENSLCAG00010027614) cdk5r2b (ENSLCAG00010027613) fev (ENSLCAG00010027612) cryba2b (ENSLCAG00010027610) umps (ENSLCAG00010027608) fn1a (ENSLCAG00010026990) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 574 paxip1 (ENSLCAG00010007808) ENSLCAG00010007823 #22 en2b (ENSLCAG00010007826) cnpy1 (ENSLCAG00010007830) Barramundi perch MODERN SPECIES 233 ENSLCAG00010022531 ENSLCAG00010022534 ENSLCAG00010022538 FMN2 (ENSLCAG00010022542) CHRM3 (ENSLCAG00010022551) RYR2 (ENSLCAG00010022671) mtr (ENSLCAG00010023021) bms1 (ENSLCAG00010023439) adoa (ENSLCAG00010023479) egr2b (ENSLCAG00010023481) NHLRC3 (ENSLCAG00010023483) nrbf2b (ENSLCAG00010023485) reep3b (ENSLCAG00010023488) cyp26a1 (ENSLCAG00010023505) exoc6 (ENSLCAG00010023631) ENSLCAG00010023929 #22 ENSLCAG00010023931 trub1 (ENSLCAG00010023935) LRRC45 (ENSLCAG00010023948) Barramundi perch MODERN SPECIES 932 ENSLCAG00010021109 #22 carhsp1 (ENSLCAG00010021104) Barramundi perch MODERN SPECIES 352 RAPH1 (ENSLCAG00010012093) il17d (ENSLCAG00010012136) ift88 (ENSLCAG00010012219) cryl1 (ENSLCAG00010012549) gjb8 (ENSLCAG00010012560) ENSLCAG00010012563 gja3 (ENSLCAG00010012568) ENSLCAG00010012613 #22 mphosph8 (ENSLCAG00010012635) ENSLCAG00010012689 ENSLCAG00010012712 ENSLCAG00010012716 ENSLCAG00010012720 ENSLCAG00010012725 ENSLCAG00010012747 RDX (ENSLCAG00010012968) ENSLCAG00010013329 ENSLCAG00010013339 ENSLCAG00010013356 ENSLCAG00010013361 Barramundi perch MODERN SPECIES 91 cdh6 (ENSLCAG00010027347) zgc:56556 (ENSLCAG00010027350) ENSLCAG00010027351 rnf2 (ENSLCAG00010027353) ENSLCAG00010027356 AGL (ENSLCAG00010027369) ENSLCAG00010027392 #22 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ENSLCAG00010013659 ENSLCAG00010013655 ENSLCAG00010013652 ENSLCAG00010013647 ENSLCAG00010013644 ENSLCAG00010013641 ENSLCAG00010013635 ENSLCAG00010013633 ENSLCAG00010013630 lgals9l3 (ENSLCAG00010013628) Percomorphaceae DUPLICATION Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.a #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.a #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.a #22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.a #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.a #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.a #22 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 993 ENSLCAG00010019239 #22 ENSLCAG00010019231 Barramundi perch MODERN SPECIES 845 ENSLCAG00010006831 ENSLCAG00010006834 ENSLCAG00010006840 ENSLCAG00010006848 ENSLCAG00010006852 #22 Barramundi perch MODERN SPECIES 105 ITFG1 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(ENSLCAG00010002142) asz1 (ENSLCAG00010002133) Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 860 ENSLCAG00010003154 #22 Barramundi perch MODERN SPECIES 624 ENSLCAG00010013722 ENSLCAG00010013718 #22 ENSLCAG00010013716 ENSLCAG00010013711 cnot9 (ENSLCAG00010013701) ENSLCAG00010013632 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 272 zc3h18 (ENSHCOG00000014856) ENSHCOG00000014817 utp4 (ENSHCOG00000014802) chtf8 (ENSHCOG00000014745) has3 (ENSHCOG00000014730) TANGO6 (ENSHCOG00000014682) cry2 (ENSHCOG00000014642) ENSHCOG00000014620 ENSHCOG00000014606 cstpp1 (ENSHCOG00000014591) ckap5 (ENSHCOG00000014584) DBX1 (ENSHCOG00000014526) dnaaf4 (ENSHCOG00000014495) anpepb.1 (ENSHCOG00000014391) ANPEP (ENSHCOG00000014017) ENSHCOG00000013381 #22 ENSHCOG00000013372 ENSHCOG00000013343 mical2b (ENSHCOG00000013301) parvaa (ENSHCOG00000013212) parvaa (ENSHCOG00000013007) tead1a (ENSHCOG00000012993) RASSF10 (ENSHCOG00000000375) OLFML1 (ENSHCOG00000012962) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.b #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.b #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.b #22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.b #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.b #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033232.f.b #22 Barramundi perch MODERN SPECIES 140 katnal2 (ENSLCAG00010003875) sigmar1 (ENSLCAG00010003870) galt (ENSLCAG00010003863) ENSLCAG00010003859 #22 cntfr (ENSLCAG00010003848) tmem267 (ENSLCAG00010003843) ENSLCAG00010003841 si:busm1-57f23.1 (ENSLCAG00010003836) ENSLCAG00010003831 rassf6 (ENSLCAG00010003826) MUSK (ENSLCAG00010003816) lpar1 (ENSLCAG00010003809) ENSLCAG00010003807 ENSLCAG00010003805 ENSLCAG00010003578 ENSLCAG00010002807 stoml2 (ENSLCAG00010002722) PIGO (ENSLCAG00010002714) PHF24 (ENSLCAG00010002711) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 78 auh (ENSHCOG00000014115) nfil3 (ENSHCOG00000014107) ROR2 (ENSHCOG00000014104) sptlc1 (ENSHCOG00000014091) chsy3 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