Bilateria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Chordata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES	258															ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.c
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	250														ENSGT00940000157519	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.c	ENSGT00390000002373	ENSGT00940000159620	ENSGT00390000014681	ENSGT00390000011615.A	ENSGT00510000047537	ENSGT00390000011093	ENSGT00390000011309	ENSGT00950000182935.B.a
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00950000183183.b.a	ENSGT00950000183183.b.b	ENSGT00940000155537	ENSGT00940000157972	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000168310	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a	ENSGT00390000005730.b	ENSGT00390000017103	ENSGT00530000063870.a.a
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	165					ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT01080000257338.A.b	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a	ENSGT00390000005730.b	ENSGT00390000017103	ENSGT00530000063870.a.a
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	74				ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT01080000257338.A.b	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000168310	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a	ENSGT00390000017103	ENSGT00530000063870.a.a	ENSGT01050000244997	ENSGT00390000006933	ENSGT00390000001390.a.a
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760 #15	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00940000157016	ENSGT00940000158772
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	221																ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d
Theria	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760 #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000154768.A.a	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Primates	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.h	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27
Mouse lemur	MODERN SPECIES	7	COPS3 (ENSMICG00000000153) #7	GSG1L2 (ENSMICG00000030247) #8	GLP2R (ENSMICG00000005359) #9	RCVRN (ENSMICG00000005372) #10	GAS7 (ENSMICG00000005373) #11	MYH13 (ENSMICG00000005392) #12	MYH8 (ENSMICG00000010957) #13	MYH4 (ENSMICG00000010990) #14	MYH1 (ENSMICG00000010047) #15	ENSMICG00000011020 #16	MYH3 (ENSMICG00000011079) #17	SCO1 (ENSMICG00000011117) #18	ADPRM (ENSMICG00000011123) #19	TMEM220 (ENSMICG00000011126) #20	ENSMICG00000033940 #21	DNAH9 (ENSMICG00000016166) #22	ZNF18 (ENSMICG00000016196) #23	MAP2K4 (ENSMICG00000016202) #24	MYOCD (ENSMICG00000002408) #25	ARHGAP44 (ENSMICG00000002417) #26	ELAC2 (ENSMICG00000002428) #27	ENSMICG00000033884 #28	ENSMICG00000004447 #29	ENSMICG00000014044 #30	ENSMICG00000045291 #31	C17orf49 (ENSMICG00000014069) #32	BCL6B (ENSMICG00000041989) #33	SLC16A13 (ENSMICG00000005926) #34	SLC16A11 (ENSMICG00000005931) #35	CLEC10A (ENSMICG00000037927) #36	ASGR2 (ENSMICG00000012091) #37
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	26	RCVRN (ENSPSMG00000013943) #10	GAS7 (ENSPSMG00000014345) #11	MYH13 (ENSPSMG00000014990) #12	ENSPSMG00000015018	MYH8 (ENSPSMG00000015291) #13	MYH4 (ENSPSMG00000015717) #14	MYH1 (ENSPSMG00000016091) #15	ENSPSMG00000016585 #16	MYH3 (ENSPSMG00000016772) #17	SCO1 (ENSPSMG00000016810) #18	ADPRM (ENSPSMG00000016817) #19	TMEM220 (ENSPSMG00000016831) #20	TMEM238L (ENSPSMG00000016835)	PIRT (ENSPSMG00000016839)	SHISA6 (ENSPSMG00000016868) #21	DNAH9 (ENSPSMG00000017013) #22	ZNF18 (ENSPSMG00000017063) #23	MAP2K4 (ENSPSMG00000017125) #24	ENSPSMG00000017148	MYOCD (ENSPSMG00000017184) #25	ARHGAP44 (ENSPSMG00000017269) #26	ENSPSMG00000017297	ELAC2 (ENSPSMG00000017517) #27
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	585	GSG1L2 (ENSPCOG00000015974) #8	GLP2R (ENSPCOG00000013292) #9	RCVRN (ENSPCOG00000028004) #10	GAS7 (ENSPCOG00000016802) #11	MYH13 (ENSPCOG00000013573) #12	MYH8 (ENSPCOG00000024313) #13	MYH4 (ENSPCOG00000025577) #14	MYH1 (ENSPCOG00000016041) #15	MYH2 (ENSPCOG00000027207)	MYH3 (ENSPCOG00000013238) #17	SCO1 (ENSPCOG00000024419) #18	ADPRM (ENSPCOG00000013851) #19	TMEM220 (ENSPCOG00000018290) #20	ENSPCOG00000019470	SHISA6 (ENSPCOG00000006715) #21	DNAH9 (ENSPCOG00000000073) #22	ZNF18 (ENSPCOG00000024281) #23	MAP2K4 (ENSPCOG00000028542) #24	MYOCD (ENSPCOG00000028319) #25	ARHGAP44 (ENSPCOG00000007455) #26	ELAC2 (ENSPCOG00000014581) #27
Bushbaby	MODERN SPECIES	161	RCVRN (ENSOGAG00000000986) #10	GAS7 (ENSOGAG00000000987) #11	MYH13 (ENSOGAG00000011817) #12	MYH8 (ENSOGAG00000011832) #13	ENSOGAG00000033973	ENSOGAG00000011849 #14	ENSOGAG00000031579	MYH1 (ENSOGAG00000003214) #15	ENSOGAG00000006372 #16	MYH3 (ENSOGAG00000003218) #17	SCO1 (ENSOGAG00000003233) #18	ADPRM (ENSOGAG00000027581) #19	TMEM220 (ENSOGAG00000012666) #20	PIRT (ENSOGAG00000011124)	ENSOGAG00000029630 #21	DNAH9 (ENSOGAG00000012147) #22	ZNF18 (ENSOGAG00000027830) #23	MAP2K4 (ENSOGAG00000016618) #24	MYOCD (ENSOGAG00000004448) #25	ARHGAP44 (ENSOGAG00000012622) #26	ELAC2 (ENSOGAG00000012628) #27	HS3ST3A1 (ENSOGAG00000027942)	ENSOGAG00000007457	HS3ST3B1 (ENSOGAG00000031063)	ENSOGAG00000028503	PMP22 (ENSOGAG00000029602)	TEKT3 (ENSOGAG00000013212)	CDRT4 (ENSOGAG00000013216)	ENSOGAG00000012225	ENSOGAG00000013222	ENSOGAG00000027945
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00910000146967	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b	ENSGT00940000158003
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00910000144152.b.a	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.n #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00910000146967	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00910000144152.b.a	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00910000146967	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00390000012691.c.b.n	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.c.a
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00910000144152.b.a.d	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.c.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00390000011755.A.d	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.c.a	ENSGT00940000158003.k
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Pan	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00390000012691.c.b.n	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00940000154602.b.b	ENSGT00940000160681.A.a
Chimpanzee	MODERN SPECIES	8	RCVRN (ENSPTRG00000008762) #10	GAS7 (ENSPTRG00000008763) #11	MYH13 (ENSPTRG00000008766) #12	MYH8 (ENSPTRG00000008768) #13	MYH4 (ENSPTRG00000008769) #14	MYH1 (ENSPTRG00000008771) #15	MYH2 (ENSPTRG00000008770)	MYH3 (ENSPTRG00000008773) #17	SCO1 (ENSPTRG00000008774) #18	ADPRM (ENSPTRG00000008775) #19	ENSPTRG00000047059	TMEM220 (ENSPTRG00000008776) #20	TMEM238L (ENSPTRG00000049923)	PIRT (ENSPTRG00000050087)	SHISA6 (ENSPTRG00000008778) #21	DNAH9 (ENSPTRG00000008779) #22	ZNF18 (ENSPTRG00000008782) #23	ENSPTRG00000052783	MAP2K4 (ENSPTRG00000008783) #24	MYOCD (ENSPTRG00000008786) #25	ARHGAP44 (ENSPTRG00000008787) #26	ELAC2 (ENSPTRG00000008788) #27	HS3ST3A1 (ENSPTRG00000045588)	ENSPTRG00000051197	COX10 (ENSPTRG00000008790)	HS3ST3B1 (ENSPTRG00000008792)	ENSPTRG00000042899	PMP22 (ENSPTRG00000008793)	TEKT3 (ENSPTRG00000008794)	CDRT4 (ENSPTRG00000043069)	ENSPTRG00000052359
Bonobo	MODERN SPECIES	8	GLP2R (ENSPPAG00000038138) #9	RCVRN (ENSPPAG00000031303) #10	GAS7 (ENSPPAG00000043818) #11	MYH13 (ENSPPAG00000038668) #12	MYH8 (ENSPPAG00000038750) #13	MYH4 (ENSPPAG00000026746) #14	MYH1 (ENSPPAG00000037484) #15	MYH2 (ENSPPAG00000040402)	MYH3 (ENSPPAG00000028829) #17	SCO1 (ENSPPAG00000036248) #18	ADPRM (ENSPPAG00000043053) #19	ENSPPAG00000041377	TMEM220 (ENSPPAG00000037278) #20	TMEM238L (ENSPPAG00000010109)	SHISA6 (ENSPPAG00000003959) #21	DNAH9 (ENSPPAG00000039626) #22	ZNF18 (ENSPPAG00000030735) #23	ENSPPAG00000038925	MAP2K4 (ENSPPAG00000028045) #24	MYOCD (ENSPPAG00000040890) #25	ARHGAP44 (ENSPPAG00000043251) #26	ELAC2 (ENSPPAG00000011633) #27	COX10 (ENSPPAG00000023390)	CDRT15L2 (ENSPPAG00000043104)	ENSPPAG00000044002	ENSPPAG00000023898	PMP22 (ENSPPAG00000030228)	TEKT3 (ENSPPAG00000034997)	ENSPPAG00000026142	ENSPPAG00000037550	ENSPPAG00000037052
Human	MODERN SPECIES	8	GLP2R (ENSG00000065325) #9	RCVRN (ENSG00000109047) #10	GAS7 (ENSG00000007237) #11	MYH13 (ENSG00000006788) #12	MYH8 (ENSG00000133020) #13	MYH4 (ENSG00000264424) #14	MYH1 (ENSG00000109061) #15	MYH2 (ENSG00000125414)	MYH3 (ENSG00000109063) #17	SCO1 (ENSG00000133028) #18	ADPRM (ENSG00000170222) #19	TMEM220 (ENSG00000187824) #20	TMEM238L (ENSG00000263429)	PIRT (ENSG00000233670)	SHISA6 (ENSG00000188803) #21	DNAH9 (ENSG00000007174) #22	ZNF18 (ENSG00000154957) #23	MAP2K4 (ENSG00000065559) #24	MYOCD (ENSG00000141052) #25	ARHGAP44 (ENSG00000006740) #26	ELAC2 (ENSG00000006744) #27	HS3ST3A1 (ENSG00000153976)	COX10 (ENSG00000006695)	CDRT15 (ENSG00000223510)	HS3ST3B1 (ENSG00000125430)	PMP22 (ENSG00000109099)	TEKT3 (ENSG00000125409)	CDRT4 (ENSG00000239704)	TVP23C-CDRT4 (ENSG00000259024)	TVP23C (ENSG00000175106)	FBXW10B (ENSG00000241322)
Gorilla	MODERN SPECIES	8	RCVRN (ENSGGOG00000008541) #10	GAS7 (ENSGGOG00000012941) #11	MYH13 (ENSGGOG00000013609) #12	MYH8 (ENSGGOG00000036439) #13	MYH4 (ENSGGOG00000038293) #14	MYH1 (ENSGGOG00000036891) #15	MYH2 (ENSGGOG00000043331)	MYH3 (ENSGGOG00000000572) #17	SCO1 (ENSGGOG00000009044) #18	ADPRM (ENSGGOG00000009051) #19	TMEM220 (ENSGGOG00000009058) #20	ENSGGOG00000038484	TMEM238L (ENSGGOG00000038556)	PIRT (ENSGGOG00000041295)	SHISA6 (ENSGGOG00000024528) #21	DNAH9 (ENSGGOG00000000004) #22	ZNF18 (ENSGGOG00000005431) #23	ENSGGOG00000011958 #24	ENSGGOG00000036656	MYOCD (ENSGGOG00000008879) #25	ARHGAP44 (ENSGGOG00000015831) #26	ELAC2 (ENSGGOG00000015850) #27	HS3ST3A1 (ENSGGOG00000022262)	COX10 (ENSGGOG00000012308)	CDRT15 (ENSGGOG00000022716)	HS3ST3B1 (ENSGGOG00000024121)	ENSGGOG00000028326	ENSGGOG00000003149	TEKT3 (ENSGGOG00000003151)	ENSGGOG00000042760	ENSGGOG00000027943
Orangutan	MODERN SPECIES	8	RCVRN (ENSPPYG00000007976) #10	GAS7 (ENSPPYG00000007977) #11	ENSPPYG00000025939	MYH13 (ENSPPYG00000007979) #12	MYH8 (ENSPPYG00000007980) #13	MYH4 (ENSPPYG00000034822) #14	MYH1 (ENSPPYG00000039516) #15	MYH2 (ENSPPYG00000040935)	MYH3 (ENSPPYG00000034160) #17	SCO1 (ENSPPYG00000033150) #18	ADPRM (ENSPPYG00000007985) #19	TMEM220 (ENSPPYG00000007986) #20	TMEM238L (ENSPPYG00000007988)	PIRT (ENSPPYG00000007989)	SHISA6 (ENSPPYG00000007990) #21	DNAH9 (ENSPPYG00000007991) #22	ZNF18 (ENSPPYG00000007992) #23	MAP2K4 (ENSPPYG00000007993) #24	ENSPPYG00000036779	MYOCD (ENSPPYG00000007995) #25	ARHGAP44 (ENSPPYG00000007996) #26	ELAC2 (ENSPPYG00000007997) #27	HS3ST3A1 (ENSPPYG00000038520)	ENSPPYG00000036077	ENSPPYG00000037077	ENSPPYG00000007999	COX10 (ENSPPYG00000008000)	HS3ST3B1 (ENSPPYG00000037587)	PMP22 (ENSPPYG00000008002)	TEKT3 (ENSPPYG00000008003)	CDRT4 (ENSPPYG00000008004)
Gibbon	MODERN SPECIES	9	GLP2R (ENSNLEG00000010098) #9	RCVRN (ENSNLEG00000010110) #10	GAS7 (ENSNLEG00000010113) #11	MYH13 (ENSNLEG00000010134) #12	MYH8 (ENSNLEG00000010147) #13	MYH4 (ENSNLEG00000010185) #14	MYH1 (ENSNLEG00000010202) #15	MYH2 (ENSNLEG00000010222)	MYH3 (ENSNLEG00000010256) #17	SCO1 (ENSNLEG00000010281) #18	ADPRM (ENSNLEG00000010291) #19	ENSNLEG00000032520	TMEM220 (ENSNLEG00000010293) #20	PIRT (ENSNLEG00000018264)	SHISA6 (ENSNLEG00000010297) #21	DNAH9 (ENSNLEG00000029421) #22	ZNF18 (ENSNLEG00000014526) #23	ENSNLEG00000030467	MAP2K4 (ENSNLEG00000014536) #24	MYOCD (ENSNLEG00000014576) #25	ARHGAP44 (ENSNLEG00000014592) #26	ENSNLEG00000031910	ELAC2 (ENSNLEG00000014599) #27	HS3ST3A1 (ENSNLEG00000014631)	COX10 (ENSNLEG00000014632)	HS3ST3B1 (ENSNLEG00000014635)	TOR4A (ENSNLEG00000014651)	ENSNLEG00000014639	ZNF286A (ENSNLEG00000014652)	ENSNLEG00000014655	ENSNLEG00000014657
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Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00910000144152.b.a.f	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b.f #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.a.b	ENSGT00940000158003
Olive baboon	MODERN SPECIES	8	GSG1L2 (ENSPANG00000023752) #8	GLP2R (ENSPANG00000023753) #9	RCVRN (ENSPANG00000023754) #10	GAS7 (ENSPANG00000023755) #11	ENSPANG00000048737	MYH13 (ENSPANG00000023756) #12	MYH2 (ENSPANG00000032994)	MYH3 (ENSPANG00000023762) #17	ENSPANG00000040933 #18	ADPRM (ENSPANG00000023764) #19	TMEM220 (ENSPANG00000023765) #20	ENSPANG00000033280	TMEM238L (ENSPANG00000039539)	PIRT (ENSPANG00000005922)	SHISA6 (ENSPANG00000023766) #21	DNAH9 (ENSPANG00000023767) #22	ENSPANG00000044799	ZNF18 (ENSPANG00000023768) #23	ENSPANG00000039050	MAP2K4 (ENSPANG00000023748) #24	ENSPANG00000038058	MYOCD (ENSPANG00000023749) #25	ENSPANG00000048558	ARHGAP44 (ENSPANG00000023750) #26	ELAC2 (ENSPANG00000023751) #27	ENSPANG00000038262	ENSPANG00000037762	HS3ST3A1 (ENSPANG00000023721)	ENSPANG00000043047	COX10 (ENSPANG00000023746)	ENSPANG00000040822
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00910000144152.b.a.f	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b.f #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.a.b	ENSGT00940000158003
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	111	GSG1L2 (ENSCATG00000004344) #8	GLP2R (ENSCATG00000034777) #9	GAS7 (ENSCATG00000029427) #11	ENSCATG00000038661	MYH13 (ENSCATG00000029782) #12	MYH8 (ENSCATG00000030039) #13	MYH4 (ENSCATG00000037773) #14	MYH1 (ENSCATG00000030732) #15	MYH2 (ENSCATG00000044718)	MYH3 (ENSCATG00000040006) #17	SCO1 (ENSCATG00000035747) #18	ADPRM (ENSCATG00000040520) #19	TMEM220 (ENSCATG00000007613) #20	PIRT (ENSCATG00000019904)	SHISA6 (ENSCATG00000034750) #21	DNAH9 (ENSCATG00000040209) #22	ZNF18 (ENSCATG00000043364) #23	ENSCATG00000036590	MAP2K4 (ENSCATG00000041493) #24	MYOCD (ENSCATG00000031443) #25	ARHGAP44 (ENSCATG00000033222) #26	ELAC2 (ENSCATG00000030564) #27	HS3ST3A1 (ENSCATG00000038365)	ENSCATG00000019638	COX10 (ENSCATG00000040261)	HS3ST3B1 (ENSCATG00000044623)	PMP22 (ENSCATG00000014988)	TEKT3 (ENSCATG00000039897)	CDRT4 (ENSCATG00000038935)	ENSCATG00000019223	ENSCATG00000043890
Drill	MODERN SPECIES	1466															ENSMLEG00000033078 #21	DNAH9 (ENSMLEG00000030701) #22	ZNF18 (ENSMLEG00000032627) #23	ENSMLEG00000033814	MAP2K4 (ENSMLEG00000040741) #24	MYOCD (ENSMLEG00000003454) #25	ARHGAP44 (ENSMLEG00000042719) #26	ELAC2 (ENSMLEG00000036307) #27
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00910000144152.b.a.f	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b.f #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.n #24	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00910000146967	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	520	GLP2R (ENSMNEG00000044338) #9	RCVRN (ENSMNEG00000012368) #10	GAS7 (ENSMNEG00000037609) #11	ENSMNEG00000026140	MYH13 (ENSMNEG00000042325) #12	MYH8 (ENSMNEG00000037358) #13	MYH4 (ENSMNEG00000003221) #14	MYH1 (ENSMNEG00000027807) #15	MYH3 (ENSMNEG00000032720) #17	SCO1 (ENSMNEG00000045274) #18	ADPRM (ENSMNEG00000032238) #19	ENSMNEG00000030890	TMEM220 (ENSMNEG00000039835) #20	PIRT (ENSMNEG00000000453)	ENSMNEG00000038338 #21	DNAH9 (ENSMNEG00000037143) #22	ZNF18 (ENSMNEG00000039996) #23	ENSMNEG00000038445	MAP2K4 (ENSMNEG00000035566) #24	MYOCD (ENSMNEG00000045528) #25	ARHGAP44 (ENSMNEG00000040440) #26	ENSMNEG00000022827	ELAC2 (ENSMNEG00000044872) #27	ENSMNEG00000002933	HS3ST3A1 (ENSMNEG00000031437)	ENSMNEG00000035562	COX10 (ENSMNEG00000016671)	HS3ST3B1 (ENSMNEG00000044535)	ENSMNEG00000031070	PMP22 (ENSMNEG00000035231)	TEKT3 (ENSMNEG00000043257)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157016	ENSGT00940000158772	ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b.f #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00390000003156.a.a.y.a	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT01050000244986.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.b	ENSGT00940000158003
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	7	USP43 (ENSMFAG00000038797)	DHRS7C (ENSMFAG00000044197)	GSG1L2 (ENSMFAG00000038596) #8	GLP2R (ENSMFAG00000038487) #9	GAS7 (ENSMFAG00000003917) #11	MYH13 (ENSMFAG00000001638) #12	ENSMFAG00000048316	MYH3 (ENSMFAG00000065517) #17	MYH4 (ENSMFAG00000043626) #14	SCO1 (ENSMFAG00000002459) #18	ADPRM (ENSMFAG00000042103) #19	TMEM220 (ENSMFAG00000041492) #20	ENSMFAG00000002151	PIRT (ENSMFAG00000030222)	SHISA6 (ENSMFAG00000031872) #21	DNAH9 (ENSMFAG00000002607) #22	ZNF18 (ENSMFAG00000035864) #23	MAP2K4 (ENSMFAG00000046326) #24	MYOCD (ENSMFAG00000036055) #25	ARHGAP44 (ENSMFAG00000033484) #26	ELAC2 (ENSMFAG00000041840) #27	HS3ST3A1 (ENSMFAG00000062338)	ENSMFAG00000041774	COX10 (ENSMFAG00000042405)	HS3ST3B1 (ENSMFAG00000059170)	ENSMFAG00000062146	ENSMFAG00000051087	ENSMFAG00000058054	PMP22 (ENSMFAG00000045679)	TEKT3 (ENSMFAG00000041688)	CDRT4 (ENSMFAG00000041656)
Rhesus	MODERN SPECIES	7	CFAP52 (ENSMMUG00000009399)	USP43 (ENSMMUG00000014039)	DHRS7C (ENSMMUG00000011968)	GSG1L2 (ENSMMUG00000018089) #8	ENSMMUG00000058374	GLP2R (ENSMMUG00000018090) #9	GAS7 (ENSMMUG00000018092) #11	MYH13 (ENSMMUG00000009759) #12	MYH1 (ENSMMUG00000064405) #17	MYH4 (ENSMMUG00000009771) #14	SCO1 (ENSMMUG00000013833) #18	ADPRM (ENSMMUG00000057593) #19	TMEM220 (ENSMMUG00000004872) #20	PIRT (ENSMMUG00000063621)	SHISA6 (ENSMMUG00000018538) #21	DNAH9 (ENSMMUG00000018539) #22	ENSMMUG00000061694	ZNF18 (ENSMMUG00000018541) #23	MAP2K4 (ENSMMUG00000019842) #24	MYOCD (ENSMMUG00000013281) #25	ARHGAP44 (ENSMMUG00000022515) #26	ELAC2 (ENSMMUG00000014450) #27	ENSMMUG00000061778	HS3ST3A1 (ENSMMUG00000008050)	COX10 (ENSMMUG00000016157)	HS3ST3B1 (ENSMMUG00000053284)	ENSMMUG00000062542	PMP22 (ENSMMUG00000002206)	TEKT3 (ENSMMUG00000002208)	TVP23B (ENSMMUG00000019203)	ENSMMUG00000019200
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	7	GSG1L2 (ENSCSAG00000010240) #8	GLP2R (ENSCSAG00000010211) #9	RCVRN (ENSCSAG00000010137) #10	GAS7 (ENSCSAG00000010125) #11	MYH13 (ENSCSAG00000010104) #12	MYH8 (ENSCSAG00000010037) #13	MYH4 (ENSCSAG00000009749) #14	ENSCSAG00000009463 #16	MYH1 (ENSCSAG00000009440) #15	MYH3 (ENSCSAG00000009356) #17	ENSCSAG00000009229 #18	ADPRM (ENSCSAG00000009222) #19	TMEM220 (ENSCSAG00000009215) #20	PIRT (ENSCSAG00000000562)	ENSCSAG00000009202 #21	DNAH9 (ENSCSAG00000009179) #22	ZNF18 (ENSCSAG00000009126) #23	MAP2K4 (ENSCSAG00000009119) #24	MYOCD (ENSCSAG00000009104) #25	ARHGAP44 (ENSCSAG00000009083) #26	ELAC2 (ENSCSAG00000009057) #27	HS3ST3A1 (ENSCSAG00000009036)	COX10 (ENSCSAG00000009028)	HS3ST3B1 (ENSCSAG00000009017)	PMP22 (ENSCSAG00000009006)	TEKT3 (ENSCSAG00000008985)	CDRT4 (ENSCSAG00000008955)	ENSCSAG00000008950	ENSCSAG00000008937	TRIM16 (ENSCSAG00000008919)	ENSCSAG00000008914
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	698															ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154531.y.b.a	ENSGT00940000154744.m.b #24
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1749																DNAH9 (ENSRBIG00000041572) #22	ZNF18 (ENSRBIG00000043829) #23	MAP2K4 (ENSRBIG00000038886) #24	ENSRBIG00000034450
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1918															SHISA6 (ENSRROG00000034048) #21	DNAH9 (ENSRROG00000033890) #22	ZNF18 (ENSRROG00000006588) #23	ENSRROG00000005419	MAP2K4 (ENSRROG00000032430) #24
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00910000146967	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.f	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.a #24	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00910000146967	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.f.a	ENSGT00940000158003
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744.m.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00910000146967	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.g.b.f.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Capuchin	MODERN SPECIES	72	GSG1L2 (ENSCCAG00000027841) #8	GLP2R (ENSCCAG00000024598) #9	RCVRN (ENSCCAG00000021647) #10	GAS7 (ENSCCAG00000021586) #11	MYH13 (ENSCCAG00000033777) #12	MYH8 (ENSCCAG00000036147) #13	MYH4 (ENSCCAG00000025502) #14	MYH1 (ENSCCAG00000036170) #15	ENSCCAG00000034599 #16	MYH3 (ENSCCAG00000035030) #17	SCO1 (ENSCCAG00000037538) #18	ADPRM (ENSCCAG00000024516) #19	TMEM220 (ENSCCAG00000024154) #20	PIRT (ENSCCAG00000003674)	SHISA6 (ENSCCAG00000016037) #21	DNAH9 (ENSCCAG00000036609) #22	ZNF18 (ENSCCAG00000023156) #23	ENSCCAG00000032022 #24	MYOCD (ENSCCAG00000035642) #25	ARHGAP44 (ENSCCAG00000032659) #26	ELAC2 (ENSCCAG00000036307) #27	HS3ST3A1 (ENSCCAG00000036615)	COX10 (ENSCCAG00000031117)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	74	DHRS7C (ENSSBOG00000033507)	GSG1L2 (ENSSBOG00000016185) #8	GLP2R (ENSSBOG00000025968) #9	RCVRN (ENSSBOG00000027586) #10	GAS7 (ENSSBOG00000034822) #11	MYH13 (ENSSBOG00000034701) #12	MYH8 (ENSSBOG00000032438) #13	MYH4 (ENSSBOG00000033056) #14	ENSSBOG00000002930 #16	MYH3 (ENSSBOG00000027139) #17	SCO1 (ENSSBOG00000028850) #18	ADPRM (ENSSBOG00000034873) #19	TMEM220 (ENSSBOG00000033939) #20	PIRT (ENSSBOG00000016552)	SHISA6 (ENSSBOG00000032746) #21	DNAH9 (ENSSBOG00000026972) #22	ZNF18 (ENSSBOG00000027370) #23	MAP2K4 (ENSSBOG00000033870) #24	MYOCD (ENSSBOG00000034713) #25	ARHGAP44 (ENSSBOG00000030480) #26	ENSSBOG00000022731	ELAC2 (ENSSBOG00000016993) #27	ENSSBOG00000015503	COX10 (ENSSBOG00000021094)	HS3ST3B1 (ENSSBOG00000025504)	ENSSBOG00000031810	PMP22 (ENSSBOG00000035196)	TEKT3 (ENSSBOG00000024926)	CDRT4 (ENSSBOG00000034761)	ENSSBOG00000020103	ENSSBOG00000031742
Marmoset	MODERN SPECIES	17	GSG1L2 (ENSCJAG00000012714) #8	GLP2R (ENSCJAG00000012719) #9	RCVRN (ENSCJAG00000012758) #10	GAS7 (ENSCJAG00000012759) #11	MYH13 (ENSCJAG00000041650) #12	MYH8 (ENSCJAG00000046689) #13	MYH4 (ENSCJAG00000007663) #14	MYH3 (ENSCJAG00000012860) #17	SCO1 (ENSCJAG00000013168) #18	ADPRM (ENSCJAG00000013179) #19	TMEM220 (ENSCJAG00000013186) #20	TMEM238L (ENSCJAG00000047512)	PIRT (ENSCJAG00000047584)	SHISA6 (ENSCJAG00000004887) #21	ENSCJAG00000087313	DNAH9 (ENSCJAG00000004802) #22	ENSCJAG00000080756	ZNF18 (ENSCJAG00000045900) #23	ENSCJAG00000004752 #24	ENSCJAG00000072512	MYOCD (ENSCJAG00000004683) #25	ENSCJAG00000074806	ARHGAP44 (ENSCJAG00000004605) #26	ENSCJAG00000074628	ELAC2 (ENSCJAG00000004542) #27	ENSCJAG00000074121	ENSCJAG00000058033	HS3ST3A1 (ENSCJAG00000044142)	COX10 (ENSCJAG00000041859)	HS3ST3B1 (ENSCJAG00000043789)	ENSCJAG00000083024
Mas night monkey	MODERN SPECIES	326						MYH8 (ENSANAG00000035498) #13	MYH4 (ENSANAG00000025798) #14	MYH1 (ENSANAG00000036551) #15	ENSANAG00000032437 #16	MYH3 (ENSANAG00000028944) #17	SCO1 (ENSANAG00000035692) #18	ADPRM (ENSANAG00000027720) #19	TMEM220 (ENSANAG00000036133) #20	ENSANAG00000037536	ENSANAG00000020724 #21	DNAH9 (ENSANAG00000033880) #22	ENSANAG00000020005	ZNF18 (ENSANAG00000025684) #23	MAP2K4 (ENSANAG00000036533) #24	MYOCD (ENSANAG00000037357) #25	ARHGAP44 (ENSANAG00000028017) #26	ELAC2 (ENSANAG00000036642) #27	ENSANAG00000035552	HS3ST3A1 (ENSANAG00000026271)	COX10 (ENSANAG00000028998)	HS3ST3B1 (ENSANAG00000021778)	ENSANAG00000027382	ENSANAG00000035880	ENSANAG00000001461	PMP22 (ENSANAG00000020946)
Tarsier	MODERN SPECIES	4764															ENSTSYG00000004133 #21	ENSTSYG00000031705 #22	ENSTSYG00000033498
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Tree shrew	MODERN SPECIES	4809															ENSTBEG00000003561 #21	ENSTBEG00000004000 #22	ZNF18 (ENSTBEG00000007103) #23
Glires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00900000143303	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00900000143303	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161686	ENSGT00940000162333
Golden Hamster	MODERN SPECIES	627	Dhrs7c (ENSMAUG00000017063)	Glp2r (ENSMAUG00000012802) #9	Rcvrn (ENSMAUG00000011067) #10	Gas7 (ENSMAUG00000012030) #11	ENSMAUG00000016592	Myh13 (ENSMAUG00000018965) #12	Myh8 (ENSMAUG00000013528) #13	ENSMAUG00000018441 #15	Myh2 (ENSMAUG00000010375) #16	Myh3 (ENSMAUG00000003383) #17	Adprm (ENSMAUG00000019830) #19	Tmem220 (ENSMAUG00000019535) #20	Pirt (ENSMAUG00000002524)	Shisa6 (ENSMAUG00000020628) #21	ENSMAUG00000009671	ENSMAUG00000019609 #22	ENSMAUG00000019961	ENSMAUG00000020282	Zkscan6 (ENSMAUG00000019459) #23	ENSMAUG00000021520 #24	Myocd (ENSMAUG00000020107) #25	Arhgap44 (ENSMAUG00000011297) #26	Elac2 (ENSMAUG00000019006) #27	Hs3st3a1 (ENSMAUG00000013371)	Cox10 (ENSMAUG00000002188)	Hs3st3b1 (ENSMAUG00000005757)	Tekt3 (ENSMAUG00000020704)	Tvp23b (ENSMAUG00000008345)	Fbxw10 (ENSMAUG00000021165)	Zfp286 (ENSMAUG00000020040)	ENSMAUG00000020454
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	Glp2r (ENSCGRG00001020825) #9	Gas7 (ENSCGRG00001016112) #11	ENSCGRG00001014067	Myh13 (ENSCGRG00001020908) #12	Myh8 (ENSCGRG00001009701) #13	Myh4 (ENSCGRG00001023257)	Myh1 (ENSCGRG00001002581) #15	Myh2 (ENSCGRG00001024368) #16	Myh3 (ENSCGRG00001022993) #17	Sco1 (ENSCGRG00001023676) #18	Adprm (ENSCGRG00001005939) #19	Tmem220 (ENSCGRG00001004087) #20	Tmem238l (ENSCGRG00001007926)	Pirt (ENSCGRG00001008602)	Shisa6 (ENSCGRG00001021561) #21	Dnah9 (ENSCGRG00001022291) #22	Zkscan6 (ENSCGRG00001019508) #23	Map2k4 (ENSCGRG00001024521) #24	Myocd (ENSCGRG00001007362) #25	Arhgap44 (ENSCGRG00001012236) #26	Elac2 (ENSCGRG00001023086) #27	Hs3st3a1 (ENSCGRG00001023549)	Cox10 (ENSCGRG00001021854)	Hs3st3b1 (ENSCGRG00001014480)	Pmp22 (ENSCGRG00001005581)	Tekt3 (ENSCGRG00001020083)	Tvp23b (ENSCGRG00001018486)	Fbxw10 (ENSCGRG00001012375)	Zfp286 (ENSCGRG00001001071)	Zfp287 (ENSCGRG00001021885)	Mmgt2 (ENSCGRG00001009799)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00900000143303	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Rcvrn (ENSMOCG00000012719) #10	Gas7 (ENSMOCG00000012190) #11	Myh13 (ENSMOCG00000014800) #12	Myh8 (ENSMOCG00000014401) #13	Myh4 (ENSMOCG00000014962)	Myh1 (ENSMOCG00000022347) #15	Myh2 (ENSMOCG00000009070) #16	Myh3 (ENSMOCG00000018298) #17	Sco1 (ENSMOCG00000015318) #18	Adprm (ENSMOCG00000010100) #19	Tmem220 (ENSMOCG00000017675) #20	Tmem238l (ENSMOCG00000002185)	Pirt (ENSMOCG00000012546)	Shisa6 (ENSMOCG00000015046) #21	ENSMOCG00000020682	ENSMOCG00000018974 #22	ENSMOCG00000003923	ENSMOCG00000015342	Zkscan6 (ENSMOCG00000013138) #23	Map2k4 (ENSMOCG00000018180) #24	Myocd (ENSMOCG00000021190) #25	Arhgap44 (ENSMOCG00000017453) #26	Elac2 (ENSMOCG00000014060) #27	Hs3st3a1 (ENSMOCG00000013823)	Cox10 (ENSMOCG00000022704)	Hs3st3b1 (ENSMOCG00000010807)	ENSMOCG00000002690	ENSMOCG00000013666	Pmp22 (ENSMOCG00000015274)	Tekt3 (ENSMOCG00000016338)	Cdrt4 (ENSMOCG00000016212)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Glp2r (ENSPEMG00000016104) #9	Rcvrn (ENSPEMG00000015761) #10	Gas7 (ENSPEMG00000016042) #11	Myh13 (ENSPEMG00000001511) #12	Myh8 (ENSPEMG00000007340) #13	Myh4 (ENSPEMG00000009765)	Myh1 (ENSPEMG00000017322) #15	Myh2 (ENSPEMG00000008780) #16	Myh3 (ENSPEMG00000018890) #17	Sco1 (ENSPEMG00000002137) #18	Adprm (ENSPEMG00000017650) #19	Tmem220 (ENSPEMG00000028162) #20	Tmem238l (ENSPEMG00000028445)	Pirt (ENSPEMG00000017970)	Shisa6 (ENSPEMG00000017910) #21	Dnah9 (ENSPEMG00000006454) #22	Zkscan6 (ENSPEMG00000016217) #23	Map2k4 (ENSPEMG00000019256) #24	Myocd (ENSPEMG00000010989) #25	ENSPEMG00000027263	ENSPEMG00000030708	Arhgap44 (ENSPEMG00000010507) #26	Elac2 (ENSPEMG00000001670) #27	Hs3st3a1 (ENSPEMG00000008141)	ENSPEMG00000029808	Cox10 (ENSPEMG00000018180)	Hs3st3b1 (ENSPEMG00000026126)	Pmp22 (ENSPEMG00000025245)	Tekt3 (ENSPEMG00000018525)	Cdrt4 (ENSPEMG00000008175)	Tvp23b (ENSPEMG00000008729)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154076.B.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00900000143303	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
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Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00900000143303	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00860000135727	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00900000143303	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249.i	ENSGT00860000135727	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3131											Adprm (ENSMSIG00000019735) #19	Tmem220 (ENSMSIG00000019703) #20	ENSMSIG00000019688	Pirt (ENSMSIG00000019684)	Shisa6 (ENSMSIG00000019658) #21	Dnah9 (ENSMSIG00000019468) #22	Zkscan6 (ENSMSIG00000019408) #23	ENSMSIG00000019375 #24
spretus	MODERN SPECIES	2	Dhrs7c (MGP_SPRETEiJ_G0017367)	Gsg1l2 (MGP_SPRETEiJ_G0017366) #8	Rcvrn (MGP_SPRETEiJ_G0017365) #10	Glp2r (MGP_SPRETEiJ_G0017364) #9	Gas7 (MGP_SPRETEiJ_G0017363) #11	Myh13 (MGP_SPRETEiJ_G0017362) #12	MGP_SPRETEiJ_G0017361 #13	MGP_SPRETEiJ_G0017360 #15	Myh2 (MGP_SPRETEiJ_G0017359) #16	Myh3 (MGP_SPRETEiJ_G0017358) #17	Sco1 (MGP_SPRETEiJ_G0017357) #18	Adprm (MGP_SPRETEiJ_G0017356) #19	Tmem220 (MGP_SPRETEiJ_G0017355) #20	Pirt (MGP_SPRETEiJ_G0017354)	Shisa6 (MGP_SPRETEiJ_G0017353) #21	Dnah9 (MGP_SPRETEiJ_G0017352) #22	Zkscan6 (MGP_SPRETEiJ_G0017351) #23	Map2k4 (MGP_SPRETEiJ_G0017350) #24	Myocd (MGP_SPRETEiJ_G0017349) #25	MGP_SPRETEiJ_G0017348	Arhgap44 (MGP_SPRETEiJ_G0017347) #26	Elac2 (MGP_SPRETEiJ_G0017346) #27	MGP_SPRETEiJ_G0017345	MGP_SPRETEiJ_G0017344	Cox10 (MGP_SPRETEiJ_G0017343)	MGP_SPRETEiJ_G0017342	Pmp22 (MGP_SPRETEiJ_G0017341)	Tekt3 (MGP_SPRETEiJ_G0017340)	Cdrt4 (MGP_SPRETEiJ_G0017339)	Tvp23b (MGP_SPRETEiJ_G0017338)	Fbxw10 (MGP_SPRETEiJ_G0017337)
Mouse	MODERN SPECIES	2	Rcvrn (ENSMUSG00000020907) #10	Glp2r (ENSMUSG00000049928) #9	Gas7 (ENSMUSG00000033066) #11	Myh13 (ENSMUSG00000060180) #12	Myh8 (ENSMUSG00000055775) #13	Myh4 (ENSMUSG00000057003)	Myh1 (ENSMUSG00000056328) #15	Myh2 (ENSMUSG00000033196) #16	Myh3 (ENSMUSG00000020908) #17	Sco1 (ENSMUSG00000069844) #18	Adprm (ENSMUSG00000020910) #19	Tmem220 (ENSMUSG00000050270) #20	Tmem238l (ENSMUSG00000085683)	Pirt (ENSMUSG00000048070)	Shisa6 (ENSMUSG00000053930) #21	Dnah9 (ENSMUSG00000056752) #22	Zkscan6 (ENSMUSG00000018347) #23	Map2k4 (ENSMUSG00000033352) #24	Myocd (ENSMUSG00000020542) #25	Arhgap44 (ENSMUSG00000033389) #26	Elac2 (ENSMUSG00000020549) #27	Hs3st3a1 (ENSMUSG00000047759)	Cox10 (ENSMUSG00000042148)	Hs3st3b1 (ENSMUSG00000070407)	Pmp22 (ENSMUSG00000018217)	Tekt3 (ENSMUSG00000042189)	Cdrt4 (ENSMUSG00000042200)	Tvp23b (ENSMUSG00000014177)	Fbxw10 (ENSMUSG00000090173)	Trim16 (ENSMUSG00000047821)	Zfp286 (ENSMUSG00000047342)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Gsg1l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016530) #8	Rcvrn (MGP_CAROLIEiJ_G0016529) #10	Glp2r (MGP_CAROLIEiJ_G0016528) #9	Gas7 (MGP_CAROLIEiJ_G0016527) #11	Myh13 (MGP_CAROLIEiJ_G0016526) #12	Myh8 (MGP_CAROLIEiJ_G0016525) #13	Myh4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016524)	MGP_CAROLIEiJ_G0016523 #15	Myh2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016522) #16	Myh3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016521) #17	Sco1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016520) #18	Adprm (MGP_CAROLIEiJ_G0016519) #19	Tmem220 (MGP_CAROLIEiJ_G0016518) #20	Pirt (MGP_CAROLIEiJ_G0016517)	Shisa6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016516) #21	Dnah9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016515) #22	Zkscan6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016514) #23	Map2k4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016513) #24	Myocd (MGP_CAROLIEiJ_G0016512) #25	MGP_CAROLIEiJ_G0016511	Arhgap44 (MGP_CAROLIEiJ_G0016510) #26	Elac2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016509) #27	Hs3st3a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016508)	MGP_CAROLIEiJ_G0016507	Cox10 (MGP_CAROLIEiJ_G0016506)	Hs3st3b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016505)	Pmp22 (MGP_CAROLIEiJ_G0016504)	Tekt3 (MGP_CAROLIEiJ_G0016503)	Cdrt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016502)	Tvp23b (MGP_CAROLIEiJ_G0016501)	Fbxw10 (MGP_CAROLIEiJ_G0016500)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	Rcvrn (MGP_PahariEiJ_G0017659) #10	Glp2r (MGP_PahariEiJ_G0017658) #9	Gas7 (MGP_PahariEiJ_G0017657) #11	Myh13 (MGP_PahariEiJ_G0017656) #12	Myh8 (MGP_PahariEiJ_G0017655) #13	MGP_PahariEiJ_G0017654	MGP_PahariEiJ_G0017653	Myh2 (MGP_PahariEiJ_G0017652) #16	Myh3 (MGP_PahariEiJ_G0017651) #17	Sco1 (MGP_PahariEiJ_G0017650) #18	Adprm (MGP_PahariEiJ_G0017649) #19	Tmem220 (MGP_PahariEiJ_G0017648) #20	Pirt (MGP_PahariEiJ_G0017647)	Shisa6 (MGP_PahariEiJ_G0017646) #21	MGP_PahariEiJ_G0017645	Dnah9 (MGP_PahariEiJ_G0017644) #22	Zkscan6 (MGP_PahariEiJ_G0017643) #23	Map2k4 (MGP_PahariEiJ_G0017642) #24	Myocd (MGP_PahariEiJ_G0017641) #25	MGP_PahariEiJ_G0017640	Arhgap44 (MGP_PahariEiJ_G0017639) #26	Elac2 (MGP_PahariEiJ_G0017638) #27	Hs3st3a1 (MGP_PahariEiJ_G0017637)	MGP_PahariEiJ_G0017636	Cox10 (MGP_PahariEiJ_G0017635)	Hs3st3b1 (MGP_PahariEiJ_G0017634)	Pmp22 (MGP_PahariEiJ_G0017633)	Tekt3 (MGP_PahariEiJ_G0017632)	Cdrt4 (MGP_PahariEiJ_G0017631)	Tvp23b (MGP_PahariEiJ_G0017630)	Fbxw10 (MGP_PahariEiJ_G0017629)
Rat	MODERN SPECIES	1	Dhrs7c (ENSRNOG00000026548)	Gsg1l2 (ENSRNOG00000062399) #8	Glp2r (ENSRNOG00000003683) #9	Rcvrn (ENSRNOG00000003633) #10	Gas7 (ENSRNOG00000049361) #11	Myh13 (ENSRNOG00000067378) #12	Myh8 (ENSRNOG00000068010) #13	Myh4 (ENSRNOG00000049695) #15	Myh2 (ENSRNOG00000065740) #16	Myh3 (ENSRNOG00000046276) #17	Sco1 (ENSRNOG00000028699) #18	Adprm (ENSRNOG00000003397) #19	Tmem220 (ENSRNOG00000003367) #20	Pirt (ENSRNOG00000063443)	Shisa6 (ENSRNOG00000029012) #21	Dnah9 (ENSRNOG00000004171) #22	Zfp18 (ENSRNOG00000003981) #23	Map2k4 (ENSRNOG00000003834) #24	Myocd (ENSRNOG00000003669) #25	Arhgap44 (ENSRNOG00000003603) #26	Elac2 (ENSRNOG00000003424) #27	Hs3st3a1 (ENSRNOG00000024591)	ENSRNOG00000070061	Cox10 (ENSRNOG00000024972)	Hs3st3b1 (ENSRNOG00000003384)	LOC100360645 (ENSRNOG00000065739)	Pmp22 (ENSRNOG00000003338)	Tekt3 (ENSRNOG00000027212)	Cdrt4 (ENSRNOG00000003294)	Tvp23b (ENSRNOG00000050649)	Fbxw10 (ENSRNOG00000003287)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1746	Glp2r (ENSNGAG00000020783) #9	Rcvrn (ENSNGAG00000020142) #10	Gas7 (ENSNGAG00000017363) #11	Myh13 (ENSNGAG00000009353) #12	Myh8 (ENSNGAG00000019201) #13	Myh4 (ENSNGAG00000023083)	Myh1 (ENSNGAG00000017446) #15	Myh2 (ENSNGAG00000023748) #16	Myh3 (ENSNGAG00000011905) #17	Sco1 (ENSNGAG00000014886) #18	Adprm (ENSNGAG00000023161) #19	Tmem220 (ENSNGAG00000022611) #20	Pirt (ENSNGAG00000022174)	ENSNGAG00000021315	Shisa6 (ENSNGAG00000020366) #21	Dnah9 (ENSNGAG00000023024) #22	Zkscan6 (ENSNGAG00000011319) #23	Map2k4 (ENSNGAG00000022565) #24	Myocd (ENSNGAG00000019776) #25	Arhgap44 (ENSNGAG00000019747) #26	Elac2 (ENSNGAG00000021585) #27	Hs3st3a1 (ENSNGAG00000018722)	Cox10 (ENSNGAG00000021899)	Hs3st3b1 (ENSNGAG00000019437)	ENSNGAG00000017657	Pmp22 (ENSNGAG00000017079)	Tekt3 (ENSNGAG00000012597)	Tvp23b (ENSNGAG00000022069)	Trim16 (ENSNGAG00000020238)	Zfp286 (ENSNGAG00000019787)	Rfxap (ENSNGAG00000011758)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	97	Glp2r (ENSJJAG00000003578) #9	Rcvrn (ENSJJAG00000000217) #10	Gas7 (ENSJJAG00000024084) #11	Myh13 (ENSJJAG00000012026) #12	Myh8 (ENSJJAG00000010170) #13	Myh4 (ENSJJAG00000016358)	Myh1 (ENSJJAG00000010639) #15	Myh2 (ENSJJAG00000023650) #16	Myh3 (ENSJJAG00000004023) #17	ENSJJAG00000004930	Sco1 (ENSJJAG00000021633) #18	Adprm (ENSJJAG00000020026) #19	Tmem220 (ENSJJAG00000019130) #20	Pirt (ENSJJAG00000003084)	ENSJJAG00000002994	Dnah9 (ENSJJAG00000017519) #22	Zkscan6 (ENSJJAG00000022707) #23	ENSJJAG00000022362 #24	Myocd (ENSJJAG00000013377) #25	Arhgap44 (ENSJJAG00000010913) #26	Hs3st3a1 (ENSJJAG00000017567)	Cox10 (ENSJJAG00000016340)	Hs3st3b1 (ENSJJAG00000008018)	Pmp22 (ENSJJAG00000013357)	Tekt3 (ENSJJAG00000018052)	ENSJJAG00000014305	Tvp23c (ENSJJAG00000002989)	Trim16 (ENSJJAG00000014208)	Zfp286 (ENSJJAG00000009917)	Trpv2 (ENSJJAG00000015315)	Pigl (ENSJJAG00000006574)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	338	Gsg1l2 (ENSDORG00000010412) #8	Glp2r (ENSDORG00000000952) #9	Rcvrn (ENSDORG00000004836) #10	Gas7 (ENSDORG00000004839) #11	Myh13 (ENSDORG00000006705) #12	Myh8 (ENSDORG00000028497) #13	Myh4 (ENSDORG00000025597)	Myh1 (ENSDORG00000025480) #15	Myh2 (ENSDORG00000008329) #16	Myh3 (ENSDORG00000013544) #17	Sco1 (ENSDORG00000013547) #18	Adprm (ENSDORG00000013548) #19	Tmem220 (ENSDORG00000025698) #20	Pirt (ENSDORG00000029225)	Shisa6 (ENSDORG00000016678) #21	Dnah9 (ENSDORG00000012356) #22	Zkscan6 (ENSDORG00000012359) #23	ENSDORG00000026283 #24	Myocd (ENSDORG00000028541) #25	Arhgap44 (ENSDORG00000005589) #26	Elac2 (ENSDORG00000005592) #27	Hs3st3a1 (ENSDORG00000029570)	Cox10 (ENSDORG00000000616)	Hs3st3b1 (ENSDORG00000028834)	Pmp22 (ENSDORG00000023290)	Tekt3 (ENSDORG00000023463)	ENSDORG00000027368	Pik3r5 (ENSDORG00000005013)	ENSDORG00000026762	Pik3r6 (ENSDORG00000004824)	Ccdc42 (ENSDORG00000002745)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.l.a.a	ENSGT00940000161116	ENSGT00390000004428.a.l.a.b	ENSGT00940000158003
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a.i #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00950000182895.a.a.a.b.f	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.l.a.a.b	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a.i #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00950000182895.a.a.a.b.f	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a.l.a.a.b	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	77	RCVRN (ENSUPAG00010017070) #10	ENSUPAG00010017073 #11	MYH13 (ENSUPAG00010017113) #12	ENSUPAG00010017227	MYH8 (ENSUPAG00010017234) #13	ENSUPAG00010017274	MYH1 (ENSUPAG00010017334) #15	ENSUPAG00010017464 #16	MYH3 (ENSUPAG00010017537) #17	SCO1 (ENSUPAG00010017558) #18	ADPRM (ENSUPAG00010017566) #19	TMEM220 (ENSUPAG00010017577) #20	TMEM238L (ENSUPAG00010017586)	PIRT (ENSUPAG00010017589)	SHISA6 (ENSUPAG00010017596) #21	DNAH9 (ENSUPAG00010017605) #22	ZNF18 (ENSUPAG00010017682) #23	ENSUPAG00010017710	MAP2K4 (ENSUPAG00010017714) #24	MYOCD (ENSUPAG00010017746) #25	ARHGAP44 (ENSUPAG00010017782) #26	ELAC2 (ENSUPAG00010017878) #27	HS3ST3A1 (ENSUPAG00010017967)
Squirrel	MODERN SPECIES	195	GLP2R (ENSSTOG00000010730) #9	RCVRN (ENSSTOG00000010737) #10	GAS7 (ENSSTOG00000022185) #11	MYH13 (ENSSTOG00000008550) #12	MYH8 (ENSSTOG00000008604) #13	ENSSTOG00000008755	MYH1 (ENSSTOG00000008642) #15	ENSSTOG00000008696 #16	MYH3 (ENSSTOG00000008901) #17	SCO1 (ENSSTOG00000008952) #18	ADPRM (ENSSTOG00000008969) #19	TMEM220 (ENSSTOG00000032743) #20	TMEM238L (ENSSTOG00000032395)	PIRT (ENSSTOG00000006779)	SHISA6 (ENSSTOG00000024068) #21	DNAH9 (ENSSTOG00000012619) #22	ZNF18 (ENSSTOG00000012652) #23	MAP2K4 (ENSSTOG00000022796) #24	MYOCD (ENSSTOG00000011741) #25	ARHGAP44 (ENSSTOG00000006643) #26	ELAC2 (ENSSTOG00000006680) #27
Alpin marmot	MODERN SPECIES	92	GLP2R (ENSMMMG00000020629) #9	RCVRN (ENSMMMG00000020644) #10	ENSMMMG00000020649 #11	MYH13 (ENSMMMG00000020714) #12	MYH8 (ENSMMMG00000020759) #13	ENSMMMG00000020796	MYH1 (ENSMMMG00000020859) #15	ENSMMMG00000020953 #16	MYH3 (ENSMMMG00000021036) #17	SCO1 (ENSMMMG00000021099) #18	ADPRM (ENSMMMG00000021104) #19	TMEM220 (ENSMMMG00000021107) #20	TMEM238L (ENSMMMG00000021132)	PIRT (ENSMMMG00000021135)	SHISA6 (ENSMMMG00000021148) #21	DNAH9 (ENSMMMG00000021155) #22	ZNF18 (ENSMMMG00000021202) #23	ENSMMMG00000021228	MAP2K4 (ENSMMMG00000021233) #24	MYOCD (ENSMMMG00000021238) #25	ARHGAP44 (ENSMMMG00000021291) #26	ENSMMMG00000021322	ELAC2 (ENSMMMG00000021323) #27
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	GLP2R (ENSSVLG00005008969) #9	RCVRN (ENSSVLG00005008926) #10	ENSSVLG00005008619 #11	MYH13 (ENSSVLG00005008310) #12	MYH8 (ENSSVLG00005008068) #13	MYH4 (ENSSVLG00005007863) #14	MYH1 (ENSSVLG00005007619) #15	MYH2 (ENSSVLG00005007391)	MYH3 (ENSSVLG00005007189) #17	ENSSVLG00005007156 #18	ADPRM (ENSSVLG00005007117) #19	TMEM220 (ENSSVLG00005007037) #20	TMEM238L (ENSSVLG00005006982)	PIRT (ENSSVLG00005006964)	SHISA6 (ENSSVLG00005006884) #21	DNAH9 (ENSSVLG00005006097) #22	ZNF18 (ENSSVLG00005005943) #23	MAP2K4 (ENSSVLG00005005865) #24	MYOCD (ENSSVLG00005005703) #25	ARHGAP44 (ENSSVLG00005005563) #26	ELAC2 (ENSSVLG00005005375) #27	ENSSVLG00005005311	ENSSVLG00005005264	HS3ST3A1 (ENSSVLG00005013062)	COX10 (ENSSVLG00005013011)	HS3ST3B1 (ENSSVLG00005012962)	PMP22 (ENSSVLG00005012881)	TEKT3 (ENSSVLG00005012787)	CDRT4 (ENSSVLG00005012748)	ENSSVLG00005012691	ENSSVLG00005012395
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	174	GSG1L2 (ENSCLAG00000008616) #8	GLP2R (ENSCLAG00000015440) #9	RCVRN (ENSCLAG00000015516) #10	GAS7 (ENSCLAG00000010871) #11	MYH13 (ENSCLAG00000007994) #12	MYH8 (ENSCLAG00000013990) #13	ENSCLAG00000010433	MYH1 (ENSCLAG00000016190) #15	ENSCLAG00000013582 #16	MYH3 (ENSCLAG00000012142) #17	SCO1 (ENSCLAG00000010568) #18	ADPRM (ENSCLAG00000009725) #19	TMEM220 (ENSCLAG00000016360) #20	PIRT (ENSCLAG00000013878)	SHISA6 (ENSCLAG00000013067) #21	DNAH9 (ENSCLAG00000009851) #22	ZNF18 (ENSCLAG00000008591) #23	MAP2K4 (ENSCLAG00000011081) #24	MYOCD (ENSCLAG00000009669) #25	ARHGAP44 (ENSCLAG00000010698) #26	ELAC2 (ENSCLAG00000007156) #27	COX10 (ENSCLAG00000008203)	HS3ST3B1 (ENSCLAG00000007932)	PMP22 (ENSCLAG00000007576)	TEKT3 (ENSCLAG00000006894)	CDRT4 (ENSCLAG00000010546)	ENSCLAG00000009007	ENSCLAG00000008891	TRIM16 (ENSCLAG00000007369)	ZNF286A (ENSCLAG00000006594)	ZNF624 (ENSCLAG00000006504)
Degu	MODERN SPECIES	260	DHRS7C (ENSODEG00000001301)	GSG1L2 (ENSODEG00000001321) #8	GLP2R (ENSODEG00000001354) #9	RCVRN (ENSODEG00000001411) #10	GAS7 (ENSODEG00000001461) #11	ENSODEG00000000885	MYH8 (ENSODEG00000000933) #13	ENSODEG00000001080	MYH1 (ENSODEG00000001315) #15	ENSODEG00000000598 #16	MYH3 (ENSODEG00000000673) #17	ENSODEG00000000689 #19	TMEM220 (ENSODEG00000001002) #20	PIRT (ENSODEG00000018651)	SHISA6 (ENSODEG00000001077) #21	DNAH9 (ENSODEG00000001351) #22	ZNF18 (ENSODEG00000001293) #23	MAP2K4 (ENSODEG00000001399) #24
Guinea pig	MODERN SPECIES	61	ENSCPOG00000031719	MYH8 (ENSCPOG00000039186) #13	MYH13 (ENSCPOG00000036992) #12	GAS7 (ENSCPOG00000002804) #11	RCVRN (ENSCPOG00000031816) #10	GLP2R (ENSCPOG00000002800) #9	DHRS7C (ENSCPOG00000034427)	USP43 (ENSCPOG00000034382)	ENSCPOG00000030269	ENSCPOG00000035012	ENSCPOG00000025157 #18	ENSCPOG00000030247 #19	TMEM220 (ENSCPOG00000030155) #20	PIRT (ENSCPOG00000034574)	ENSCPOG00000009604 #21	DNAH9 (ENSCPOG00000012770) #22	ZNF18 (ENSCPOG00000035229) #23	MAP2K4 (ENSCPOG00000014465) #24	MYOCD (ENSCPOG00000002421) #25	ARHGAP44 (ENSCPOG00000019595) #26	ELAC2 (ENSCPOG00000009098) #27	HS3ST3A1 (ENSCPOG00000024693)	COX10 (ENSCPOG00000014288)	HS3ST3B1 (ENSCPOG00000038753)	PMP22 (ENSCPOG00000039155)	TEKT3 (ENSCPOG00000000859)	ENSCPOG00000005330	TRIM16 (ENSCPOG00000005323)	ZNF286A (ENSCPOG00000012429)	ZNF287 (ENSCPOG00000030457)	LRRC75A (ENSCPOG00000027570)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	30	ENSHGLG00000042221	ENSHGLG00000037364	ENSHGLG00000047362	ENSHGLG00000041761	ENSHGLG00000049950	ENSHGLG00000034797	ENSHGLG00000009664	ENSHGLG00000036392	ENSHGLG00000050705	ENSHGLG00000035577	ENSHGLG00000012435	ENSHGLG00000040813	ENSHGLG00000002743	ENSHGLG00000001556	FBXO25 (ENSHGLG00000001395)	ENSHGLG00000012555 #22	ENSHGLG00000044269 #23	ENSHGLG00000032967 #24	ENSHGLG00000037485	ENSHGLG00000042446	ENSHGLG00000016211	ENSHGLG00000016450	GEN1 (ENSHGLG00000015449)	ENSHGLG00000017189	ENSHGLG00000046477	ENSHGLG00000045872	ENSHGLG00000008037	ENSHGLG00000007715	ENSHGLG00000006288	ENSHGLG00000007387	ENSHGLG00000011910
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.o	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Rabbit	MODERN SPECIES	10	DHRS7C (ENSOCUG00000008066)	GLP2R (ENSOCUG00000015492) #9	RCVRN (ENSOCUG00000015504) #10	GAS7 (ENSOCUG00000011000) #11	MYH13 (ENSOCUG00000010207) #12	MYH8 (ENSOCUG00000010229) #13	MYH4 (ENSOCUG00000029652) #14	MYH1 (ENSOCUG00000026636) #15	ENSOCUG00000004509 #16	SCO1 (ENSOCUG00000015719) #18	ADPRM (ENSOCUG00000004522) #19	TMEM220 (ENSOCUG00000012021) #20	TMEM238L (ENSOCUG00000031994)	PIRT (ENSOCUG00000021652)	SHISA6 (ENSOCUG00000010908) #21	ENSOCUG00000038544 #22	ENSOCUG00000035723	ENSOCUG00000016957	ZNF18 (ENSOCUG00000010095) #23	MAP2K4 (ENSOCUG00000010096) #24	MYOCD (ENSOCUG00000009225) #25	ENSOCUG00000022824	ARHGAP44 (ENSOCUG00000003519) #26	ENSOCUG00000036558	ENSOCUG00000035435	HS3ST3A1 (ENSOCUG00000013333)	ENSOCUG00000033083	COX10 (ENSOCUG00000012422)	HS3ST3B1 (ENSOCUG00000012432)	ENSOCUG00000004843	ENSOCUG00000026099
Pika	MODERN SPECIES	3111																DNAH9 (ENSOPRG00000011205) #22	ENSOPRG00000011305 #23
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	1175																ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23
Hedgehog	MODERN SPECIES	9003																ENSEEUG00000011202 #22	ENSEEUG00000011943 #23
Common shrew	MODERN SPECIES	7122																ENSSARG00000002797 #22	ENSSARG00000003073 #23
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Suina	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	870						MYH4 (ENSCWAG00000018366) #14	ENSCWAG00000018540 #15	MYH2 (ENSCWAG00000018596)	MYH3 (ENSCWAG00000018866) #17	SCO1 (ENSCWAG00000019003) #18	ADPRM (ENSCWAG00000019053) #19	TMEM220 (ENSCWAG00000019094) #20	TMEM238L (ENSCWAG00000019246)	PIRT (ENSCWAG00000007831)	SHISA6 (ENSCWAG00000007863) #21	DNAH9 (ENSCWAG00000008177) #22	ZNF18 (ENSCWAG00000009585) #23	MAP2K4 (ENSCWAG00000009647) #24	MYOCD (ENSCWAG00000009825) #25	ARHGAP44 (ENSCWAG00000009968) #26	ENSCWAG00000010739	HS3ST3A1 (ENSCWAG00000010783)	COX10 (ENSCWAG00000010817)	HS3ST3B1 (ENSCWAG00000010862)	PMP22 (ENSCWAG00000010890)	TEKT3 (ENSCWAG00000010941)	CDRT4 (ENSCWAG00000011018)	ENSCWAG00000011047	ENSCWAG00000011223	TRIM16 (ENSCWAG00000011711)	ZNF286A (ENSCWAG00000011827)
Pig	MODERN SPECIES	3	GSG1L2 (ENSSSCG00000043177) #8	GLP2R (ENSSSCG00000017998) #9	RCVRN (ENSSSCG00000037991) #10	GAS7 (ENSSSCG00000039056) #11	MYH13 (ENSSSCG00000024416) #12	MYH8 (ENSSSCG00000018005) #13	MYH4 (ENSSSCG00000062096) #14	MYH1 (ENSSSCG00000054680) #15	ENSSSCG00000029441 #16	MYH3 (ENSSSCG00000018007) #17	SCO1 (ENSSSCG00000018008) #18	ADPRM (ENSSSCG00000018009) #19	TMEM220 (ENSSSCG00000036454) #20	TMEM238L (ENSSSCG00000055105)	PIRT (ENSSSCG00000037179)	DNAH9 (ENSSSCG00000018015) #22	ZNF18 (ENSSSCG00000018014) #23	MAP2K4 (ENSSSCG00000018016) #24	ENSSSCG00000050771	MYOCD (ENSSSCG00000031988) #25	ARHGAP44 (ENSSSCG00000018019) #26	ELAC2 (ENSSSCG00000028465) #27	HS3ST3A1 (ENSSSCG00000038622)	COX10 (ENSSSCG00000018023)	HS3ST3B1 (ENSSSCG00000039318)	PMP22 (ENSSSCG00000037832)	TEKT3 (ENSSSCG00000018028)	ENSSSCG00000053835	ENSSSCG00000018027	ENSSSCG00000018026	TRIM16 (ENSSSCG00000034049)
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Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00390000002993.l	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00390000002993.l	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT01090000261932	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT01090000261932	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Narwhal	MODERN SPECIES	316	GSG1L2 (ENSMMNG00015019605) #8	GLP2R (ENSMMNG00015019557) #9	RCVRN (ENSMMNG00015019541) #10	GAS7 (ENSMMNG00015019413) #11	ENSMMNG00015019321	MYH1 (ENSMMNG00015019081) #15	ENSMMNG00015018839 #16	MYH8 (ENSMMNG00015018612) #13	SCO1 (ENSMMNG00015018511) #18	ADPRM (ENSMMNG00015018486) #19	TMEM220 (ENSMMNG00015018430) #20	TMEM238L (ENSMMNG00015018410)	PIRT (ENSMMNG00015018399)	ENSMMNG00015018375	SHISA6 (ENSMMNG00015018303) #21	DNAH9 (ENSMMNG00015017659) #22	ZNF18 (ENSMMNG00015017511) #23	MAP2K4 (ENSMMNG00015017463) #24	MYOCD (ENSMMNG00015017409) #25	ARHGAP44 (ENSMMNG00015017335) #26	ELAC2 (ENSMMNG00015017203) #27	HS3ST3A1 (ENSMMNG00015017172)	COX10 (ENSMMNG00015017147)	HS3ST3B1 (ENSMMNG00015017121)	PMP22 (ENSMMNG00015017012)	TEKT3 (ENSMMNG00015016963)	ENSMMNG00015016944	ENSMMNG00015016935	ENSMMNG00015016908	ENSMMNG00015016731	TRIM16 (ENSMMNG00015016632)
Beluga whale	MODERN SPECIES	43	CFAP52 (ENSDLEG00000013436)	USP43 (ENSDLEG00000013473)	DHRS7C (ENSDLEG00000013489)	GLP2R (ENSDLEG00000013523) #9	RCVRN (ENSDLEG00000013627) #10	GAS7 (ENSDLEG00000013644) #11	ENSDLEG00000013681	MYH8 (ENSDLEG00000014054) #13	ENSDLEG00000019617 #16	MYH3 (ENSDLEG00000020116) #17	SCO1 (ENSDLEG00000020271) #18	ADPRM (ENSDLEG00000020280) #19	TMEM220 (ENSDLEG00000020285) #20	PIRT (ENSDLEG00000020288)	ENSDLEG00000020296 #21	DNAH9 (ENSDLEG00000020313) #22	ZNF18 (ENSDLEG00000020406) #23	MAP2K4 (ENSDLEG00000020409) #24	MYOCD (ENSDLEG00000020418) #25	ARHGAP44 (ENSDLEG00000020443) #26	ELAC2 (ENSDLEG00000020470) #27	HS3ST3A1 (ENSDLEG00000020571)	COX10 (ENSDLEG00000020577)	HS3ST3B1 (ENSDLEG00000020584)	PMP22 (ENSDLEG00000020590)	TEKT3 (ENSDLEG00000020594)	ENSDLEG00000020603	ENSDLEG00000020607	ENSDLEG00000020613	ENSDLEG00000020619	ENSDLEG00000020644
Vaquita	MODERN SPECIES	12	GSG1L2 (ENSPSNG00000021200) #8	GLP2R (ENSPSNG00000021127) #9	RCVRN (ENSPSNG00000021090) #10	GAS7 (ENSPSNG00000020695) #11	ENSPSNG00000020564	MYH8 (ENSPSNG00000020314) #13	MYH1 (ENSPSNG00000020113) #15	ENSPSNG00000019986 #16	MYH3 (ENSPSNG00000019764) #17	SCO1 (ENSPSNG00000019698) #18	TMEM220 (ENSPSNG00000019605) #20	TMEM238L (ENSPSNG00000019578)	PIRT (ENSPSNG00000019566)	ADPRM (ENSPSNG00000019501) #19	SHISA6 (ENSPSNG00000019359) #21	DNAH9 (ENSPSNG00000018169) #22	ZNF18 (ENSPSNG00000018007) #23	MAP2K4 (ENSPSNG00000017861) #24	MYOCD (ENSPSNG00000017776) #25	ARHGAP44 (ENSPSNG00000017674) #26	ELAC2 (ENSPSNG00000016912) #27	HS3ST3A1 (ENSPSNG00000016845)	COX10 (ENSPSNG00000016801)	HS3ST3B1 (ENSPSNG00000016759)	PMP22 (ENSPSNG00000016675)	TEKT3 (ENSPSNG00000016575)	ENSPSNG00000016482	ENSPSNG00000016455	ENSPSNG00000016367	ENSPSNG00000015779	TRIM16 (ENSPSNG00000015610)
Dolphin	MODERN SPECIES	1885															SHISA6 (ENSTTRG00000012300) #21	DNAH9 (ENSTTRG00000012304) #22	FGG (ENSTTRG00000012314)	ENSTTRG00000012316	ZNF18 (ENSTTRG00000012317) #23	MAP2K4 (ENSTTRG00000012318) #24
Sperm whale	MODERN SPECIES	5	USP43 (ENSPCTG00005009236)	DHRS7C (ENSPCTG00005009111)	GLP2R (ENSPCTG00005008955) #9	RCVRN (ENSPCTG00005008907) #10	GAS7 (ENSPCTG00005008826) #11	MYH8 (ENSPCTG00005014742) #13	ENSPCTG00005014653 #14	MYH2 (ENSPCTG00005013995)	MYH3 (ENSPCTG00005013409) #17	SCO1 (ENSPCTG00005013222) #18	ADPRM (ENSPCTG00005013144) #19	TMEM220 (ENSPCTG00005012983) #20	TMEM238L (ENSPCTG00005012955)	PIRT (ENSPCTG00005012941)	SHISA6 (ENSPCTG00005012750) #21	DNAH9 (ENSPCTG00005011282) #22	ZNF18 (ENSPCTG00005011190) #23	MAP2K4 (ENSPCTG00005011113) #24	ENSPCTG00005011087	MYOCD (ENSPCTG00005010992) #25	ARHGAP44 (ENSPCTG00005010271) #26	ELAC2 (ENSPCTG00005009453) #27	ENSPCTG00005009407	HS3ST3A1 (ENSPCTG00005009365)	ENSPCTG00005009326	ENSPCTG00005009285	COX10 (ENSPCTG00005009199)	ENSPCTG00005009167	ENSPCTG00005009151	PMP22 (ENSPCTG00005009039)	TEKT3 (ENSPCTG00005008919)
Blue whale	MODERN SPECIES	12	DHRS7C (ENSBMSG00010018940)	GSG1L2 (ENSBMSG00010018987) #8	GLP2R (ENSBMSG00010019016) #9	GAS7 (ENSBMSG00010019092) #11	ENSBMSG00010019245 #13	ENSBMSG00010019280 #13	MYH4 (ENSBMSG00010019407) #14	MYH2 (ENSBMSG00010019781)	MYH3 (ENSBMSG00010019884) #17	SCO1 (ENSBMSG00010019929) #18	ADPRM (ENSBMSG00010019946) #19	TMEM220 (ENSBMSG00010019961) #20	TMEM238L (ENSBMSG00010019990)	PIRT (ENSBMSG00010019995)	SHISA6 (ENSBMSG00010020014) #21	DNAH9 (ENSBMSG00010020152) #22	ZNF18 (ENSBMSG00010020470) #23	MAP2K4 (ENSBMSG00010020492) #24	ENSBMSG00010020534	MYOCD (ENSBMSG00010020560) #25	ARHGAP44 (ENSBMSG00010020685) #26	ELAC2 (ENSBMSG00010021128) #27	HS3ST3A1 (ENSBMSG00010021237)	COX10 (ENSBMSG00010021293)	HS3ST3B1 (ENSBMSG00010021298)	PMP22 (ENSBMSG00010021312)	TEKT3 (ENSBMSG00010021323)	ENSBMSG00010021328	ENSBMSG00010021335	ENSBMSG00010021351	TRIM16 (ENSBMSG00010014250)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386.a #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Bos	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386.a #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386.a #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	10	GLP2R (ENSBIXG00005018689) #9	RCVRN (ENSBIXG00005018666) #10	GAS7 (ENSBIXG00005018605) #11	ENSBIXG00005018201	ENSBIXG00005017975	MYH8 (ENSBIXG00005006761) #13	ENSBIXG00005017917 #14	MYH4 (ENSBIXG00005017830) #14	MYH2 (ENSBIXG00005017682)	MYH3 (ENSBIXG00005017608) #17	SCO1 (ENSBIXG00005017450) #18	ADPRM (ENSBIXG00005005512) #19	TMEM220 (ENSBIXG00005017416) #20	PIRT (ENSBIXG00005017293)	SHISA6 (ENSBIXG00005017260) #21	DNAH9 (ENSBIXG00005017124) #22	ZNF18 (ENSBIXG00005016573) #23	MAP2K4 (ENSBIXG00005016544) #24	MYOCD (ENSBIXG00005016453) #25	ARHGAP44 (ENSBIXG00005016279) #26	ELAC2 (ENSBIXG00005016125) #27	HS3ST3A1 (ENSBIXG00005007323)	COX10 (ENSBIXG00005015977)	HS3ST3B1 (ENSBIXG00005015969)	PMP22 (ENSBIXG00005015949)	TEKT3 (ENSBIXG00005015919)	ENSBIXG00005015882	ENSBIXG00005002479	TRIM16 (ENSBIXG00005015751)	ZNF286A (ENSBIXG00005015666)	ZNF624 (ENSBIXG00005006747)
Cow	MODERN SPECIES	10	RCVRN (ENSBTAG00000025088) #10	GAS7 (ENSBTAG00000019107) #11	MYH13 (ENSBTAG00000025337)	ENSBTAG00000053276	MYH8 (ENSBTAG00000009702) #13	MYH4 (ENSBTAG00000037794) #14	MYH1 (ENSBTAG00000018204) #14	MYH2 (ENSBTAG00000007090)	MYH3 (ENSBTAG00000011803) #17	SCO1 (ENSBTAG00000021780) #18	ADPRM (ENSBTAG00000046919) #19	TMEM220 (ENSBTAG00000003958) #20	PIRT (ENSBTAG00000046290)	ENSBTAG00000049618 #21	ENSBTAG00000048344 #21	DNAH9 (ENSBTAG00000022509) #22	ZNF18 (ENSBTAG00000004675) #23	MAP2K4 (ENSBTAG00000012103) #24	MYOCD (ENSBTAG00000035706) #25	ARHGAP44 (ENSBTAG00000021938) #26	ELAC2 (ENSBTAG00000021939) #27	HS3ST3A1 (ENSBTAG00000031107)	COX10 (ENSBTAG00000015294)	HS3ST3B1 (ENSBTAG00000007866)	PMP22 (ENSBTAG00000019070)	TEKT3 (ENSBTAG00000003802)	CDRT4 (ENSBTAG00000031084)	TVP23B (ENSBTAG00000048965)	ENSBTAG00000048771	TRIM16 (ENSBTAG00000002605)	ZNF286A (ENSBTAG00000000943)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386.a #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Domestic yak	MODERN SPECIES	10	GLP2R (ENSBGRG00000026607) #9	RCVRN (ENSBGRG00000026601) #10	GAS7 (ENSBGRG00000026582) #11	ENSBGRG00000026546	MYH8 (ENSBGRG00000026532) #13	MYH4 (ENSBGRG00000021917) #14	MYH1 (ENSBGRG00000021031) #15	MYH2 (ENSBGRG00000020872)	MYH3 (ENSBGRG00000020599) #17	SCO1 (ENSBGRG00000020553) #18	ADPRM (ENSBGRG00000020506) #19	ENSBGRG00000020364 #20	TMEM238L (ENSBGRG00000020319)	PIRT (ENSBGRG00000020285)	SHISA6 (ENSBGRG00000019975) #21	DNAH9 (ENSBGRG00000018182) #22	ZNF18 (ENSBGRG00000018061) #23	MAP2K4 (ENSBGRG00000017964) #24	MYOCD (ENSBGRG00000017767) #25	ENSBGRG00000017742	ARHGAP44 (ENSBGRG00000016986) #26	ELAC2 (ENSBGRG00000015986) #27	HS3ST3A1 (ENSBGRG00000015892)	ENSBGRG00000015794	COX10 (ENSBGRG00000015594)	HS3ST3B1 (ENSBGRG00000015539)	PMP22 (ENSBGRG00000015436)	TEKT3 (ENSBGRG00000015371)	CDRT4 (ENSBGRG00000015356)	ENSBGRG00000015206	ENSBGRG00000014605
Wild yak	MODERN SPECIES	68															SHISA6 (ENSBMUG00000012356) #21	DNAH9 (ENSBMUG00000012510) #22	ZNF18 (ENSBMUG00000012531) #23	MAP2K4 (ENSBMUG00000012571) #24	MYOCD (ENSBMUG00000012633) #25	ARHGAP44 (ENSBMUG00000012702) #26	ELAC2 (ENSBMUG00000013205) #27	ENSBMUG00000013674	COX10 (ENSBMUG00000013699)	HS3ST3B1 (ENSBMUG00000013716)
American bison	MODERN SPECIES	3101	GLP2R (ENSBBBG00000002641) #9	RCVRN (ENSBBBG00000007891) #10	GAS7 (ENSBBBG00000013261) #11	ENSBBBG00000013356	MYH8 (ENSBBBG00000013396) #13	MYH4 (ENSBBBG00000013425) #14	MYH1 (ENSBBBG00000001541) #15	MYH2 (ENSBBBG00000013564)	MYH3 (ENSBBBG00000013604) #17	SCO1 (ENSBBBG00000013626) #18	ADPRM (ENSBBBG00000007028) #19	TMEM220 (ENSBBBG00000013641) #20	TMEM238L (ENSBBBG00000013644)	PIRT (ENSBBBG00000013646)	SHISA6 (ENSBBBG00000002859) #21	DNAH9 (ENSBBBG00000013830) #22	ZNF18 (ENSBBBG00000002902) #23	ENSBBBG00000013870 #24	MYOCD (ENSBBBG00000003017) #25	ARHGAP44 (ENSBBBG00000003094) #26	ELAC2 (ENSBBBG00000014088) #27	ENSBBBG00000014101	COX10 (ENSBBBG00000003165)	PMP22 (ENSBBBG00000014119)	TEKT3 (ENSBBBG00000014130)	CDRT4 (ENSBBBG00000014134)	ENSBBBG00000014152	ENSBBBG00000014187	TRIM16 (ENSBBBG00000014208)	ENSBBBG00000014235	ENSBBBG00000014240
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b.c #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00900000143516	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
Rambouillet Sheep	DUPLICATION
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	2	RCVRN (ENSOARG00020020017) #10	GAS7 (ENSOARG00020019487) #11	ENSOARG00020019172	MYH8 (ENSOARG00020019059) #13	ENSOARG00020018777 #14	MYH4 (ENSOARG00020018635) #14	MYH2 (ENSOARG00020018538)	MYH3 (ENSOARG00020018424) #17	ENSOARG00020018333 #18	ADPRM (ENSOARG00020018295) #19	TMEM220 (ENSOARG00020018002) #20	RPL17 (ENSOARG00020017979)	TMEM238L (ENSOARG00020017955)	PIRT (ENSOARG00020017925)	SHISA6 (ENSOARG00020017631) #21	ENSOARG00020017588 #22	ENSOARG00020017530 #22	ENSOARG00020017515	ENSOARG00020017390	ENSOARG00020017295	MAP2K4 (ENSOARG00020017018) #24	MYOCD (ENSOARG00020016541) #25	ENSOARG00020016503	ENSOARG00020016494	ENSOARG00020016484	ENSOARG00020016469	ARHGAP44 (ENSOARG00020014732) #26	ELAC2 (ENSOARG00020013513) #27	ENSOARG00020013437	HS3ST3A1 (ENSOARG00020013420)	ENSOARG00020013396
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	2	GAS7 (ENSOARG00020019487) #11	ENSOARG00020019172	MYH8 (ENSOARG00020019059) #13	ENSOARG00020018777 #14	MYH4 (ENSOARG00020018635) #14	MYH2 (ENSOARG00020018538)	MYH3 (ENSOARG00020018424) #17	ENSOARG00020018333 #18	ADPRM (ENSOARG00020018295) #19	TMEM220 (ENSOARG00020018002) #20	RPL17 (ENSOARG00020017979)	TMEM238L (ENSOARG00020017955)	PIRT (ENSOARG00020017925)	SHISA6 (ENSOARG00020017631) #21	ENSOARG00020017588 #22	ENSOARG00020017530 #22	ENSOARG00020017515	ENSOARG00020017390	ENSOARG00020017295	MAP2K4 (ENSOARG00020017018) #24	MYOCD (ENSOARG00020016541) #25	ENSOARG00020016503	ENSOARG00020016494	ENSOARG00020016484	ENSOARG00020016469	ARHGAP44 (ENSOARG00020014732) #26	ELAC2 (ENSOARG00020013513) #27	ENSOARG00020013437	HS3ST3A1 (ENSOARG00020013420)	ENSOARG00020013396	PMP22 (ENSOARG00020013247)
Goat	MODERN SPECIES	10	DHRS7C (ENSCHIG00000017124)	GLP2R (ENSCHIG00000026542) #9	RCVRN (ENSCHIG00000026517) #10	GAS7 (ENSCHIG00000009715) #11	ENSCHIG00000011344	MYH8 (ENSCHIG00000008714) #13	ENSCHIG00000009070 #14	MYH4 (ENSCHIG00000026733) #14	MYH2 (ENSCHIG00000026092)	MYH3 (ENSCHIG00000020512) #17	ENSCHIG00000024706 #18	ADPRM (ENSCHIG00000021768) #19	TMEM220 (ENSCHIG00000024425) #20	PIRT (ENSCHIG00000011151)	ENSCHIG00000000507 #21	DNAH9 (ENSCHIG00000021643) #22	ZNF18 (ENSCHIG00000012011) #23	MAP2K4 (ENSCHIG00000025624) #24	MYOCD (ENSCHIG00000021206) #25	ARHGAP44 (ENSCHIG00000020070) #26	ELAC2 (ENSCHIG00000025992) #27	ENSCHIG00000018202	HS3ST3A1 (ENSCHIG00000009870)	ENSCHIG00000022788	COX10 (ENSCHIG00000010093)	HS3ST3B1 (ENSCHIG00000024456)	PMP22 (ENSCHIG00000010084)	TEKT3 (ENSCHIG00000013221)	CDRT4 (ENSCHIG00000015866)	ENSCHIG00000007814	ENSCHIG00000009940
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1210				ENSMMSG00000013067	MYH8 (ENSMMSG00000013169) #13	ENSMMSG00000013287 #14	MYH4 (ENSMMSG00000013826) #14	ENSMMSG00000023783 #16	MYH3 (ENSMMSG00000023796) #17	SCO1 (ENSMMSG00000023819) #18	ADPRM (ENSMMSG00000023831) #19	TMEM220 (ENSMMSG00000023841) #20	TMEM238L (ENSMMSG00000023861)	PIRT (ENSMMSG00000023865)	SHISA6 (ENSMMSG00000023871) #21	DNAH9 (ENSMMSG00000023931) #22	ZNF18 (ENSMMSG00000023991) #23	MAP2K4 (ENSMMSG00000023997) #24	MYOCD (ENSMMSG00000024025) #25	ARHGAP44 (ENSMMSG00000024043) #26	ELAC2 (ENSMMSG00000024066) #27	ENSMMSG00000024099	HS3ST3A1 (ENSMMSG00000024100)	ENSMMSG00000024101	COX10 (ENSMMSG00000024106)	HS3ST3B1 (ENSMMSG00000024110)	PMP22 (ENSMMSG00000024115)	TEKT3 (ENSMMSG00000024120)	CDRT4 (ENSMMSG00000024125)	ENSMMSG00000024130	ENSMMSG00000024138
Yarkand deer	MODERN SPECIES	28	CFAP52 (ENSCHYG00000020963)	USP43 (ENSCHYG00000021348)	DHRS7C (ENSCHYG00000021513)	GSG1L2 (ENSCHYG00000008935) #8	GLP2R (ENSCHYG00000008962) #9	RCVRN (ENSCHYG00000009028) #10	GAS7 (ENSCHYG00000009121) #11	ENSCHYG00000009892	MYH8 (ENSCHYG00000010290) #13	MYH3 (ENSCHYG00000010607) #17	SCO1 (ENSCHYG00000010752) #18	ADPRM (ENSCHYG00000010848) #19	TMEM220 (ENSCHYG00000010897) #20	PIRT (ENSCHYG00000011017)	SHISA6 (ENSCHYG00000011072) #21	DNAH9 (ENSCHYG00000011340) #22	ZNF18 (ENSCHYG00000011603) #23	ENSCHYG00000011671 #24	MYOCD (ENSCHYG00000011969) #25	ARHGAP44 (ENSCHYG00000012227) #26	ELAC2 (ENSCHYG00000012810) #27	HS3ST3A1 (ENSCHYG00000013716)	ENSCHYG00000013746	COX10 (ENSCHYG00000013789)	HS3ST3B1 (ENSCHYG00000013922)	PMP22 (ENSCHYG00000013978)	TEKT3 (ENSCHYG00000014076)	ENSCHYG00000014160	ENSCHYG00000014321	ENSCHYG00000014452	ENSCHYG00000014549
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161336.u	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Arabian camel	DUPLICATION
Arabian camel	MODERN SPECIES	7	RCVRN (ENSCDRG00005017065) #10	GAS7 (ENSCDRG00005017120) #11	ENSCDRG00005017428	MYH8 (ENSCDRG00005017681) #13	MYH4 (ENSCDRG00005018178) #14	ENSCDRG00005021772 #15	ENSCDRG00005021776	MYH2 (ENSCDRG00005021781)	MYH3 (ENSCDRG00005021793) #17	SCO1 (ENSCDRG00005021797) #18	ADPRM (ENSCDRG00005021801) #19	ENSCDRG00005021805 #20	TMEM238L (ENSCDRG00005021809)	PIRT (ENSCDRG00005021811)	ENSCDRG00005021831 #22	ENSCDRG00005021832 #22	ENSCDRG00005008806	ENSCDRG00005008864	ZNF18 (ENSCDRG00005008936) #23	MAP2K4 (ENSCDRG00005009003) #24	MYOCD (ENSCDRG00005009287) #25	ENSCDRG00005009485 #26	ENSCDRG00005009369 #26	ELAC2 (ENSCDRG00005009659) #27	HS3ST3A1 (ENSCDRG00005013366)	ENSCDRG00005013405	COX10 (ENSCDRG00005013442)	HS3ST3B1 (ENSCDRG00005013544)	PMP22 (ENSCDRG00005013586)	TEKT3 (ENSCDRG00005013674)	CDRT4 (ENSCDRG00005013739)
Arabian camel	MODERN SPECIES	7	GLP2R (ENSCDRG00005016987) #9	RCVRN (ENSCDRG00005017065) #10	GAS7 (ENSCDRG00005017120) #11	ENSCDRG00005017428	MYH8 (ENSCDRG00005017681) #13	MYH4 (ENSCDRG00005018178) #14	ENSCDRG00005021772 #15	ENSCDRG00005021776	MYH2 (ENSCDRG00005021781)	MYH3 (ENSCDRG00005021793) #17	SCO1 (ENSCDRG00005021797) #18	ADPRM (ENSCDRG00005021801) #19	ENSCDRG00005021805 #20	TMEM238L (ENSCDRG00005021809)	PIRT (ENSCDRG00005021811)	ENSCDRG00005021831 #22	ENSCDRG00005021832 #22	ENSCDRG00005008806	ENSCDRG00005008864	ZNF18 (ENSCDRG00005008936) #23	MAP2K4 (ENSCDRG00005009003) #24	MYOCD (ENSCDRG00005009287) #25	ENSCDRG00005009485 #26	ENSCDRG00005009369 #26	ELAC2 (ENSCDRG00005009659) #27	HS3ST3A1 (ENSCDRG00005013366)	ENSCDRG00005013405	COX10 (ENSCDRG00005013442)	HS3ST3B1 (ENSCDRG00005013544)	PMP22 (ENSCDRG00005013586)	TEKT3 (ENSCDRG00005013674)
Alpaca	MODERN SPECIES	3051																ENSVPAG00000007128 #22	ENSVPAG00000007132 #23	MAP2K4 (ENSVPAG00000007133) #24	ENSVPAG00000007135 #25
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000168040	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000167712
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Megabat	MODERN SPECIES	2971															SHISA6 (ENSPVAG00000010698) #21	DNAH9 (ENSPVAG00000010699) #22
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	13	GAS7 (ENSRFEG00010005755) #11	ENSRFEG00010005632	MYH13 (ENSRFEG00010005561) #12	MYH8 (ENSRFEG00010005469) #13	ENSRFEG00010018480	MYH1 (ENSRFEG00010018452) #15	ENSRFEG00010018395 #16	MYH3 (ENSRFEG00010018021) #17	SCO1 (ENSRFEG00010017953) #18	ADPRM (ENSRFEG00010017929) #19	TMEM220 (ENSRFEG00010017812) #20	TMEM238L (ENSRFEG00010017800)	PIRT (ENSRFEG00010017784)	ENSRFEG00010017770	SHISA6 (ENSRFEG00010017537) #21	DNAH9 (ENSRFEG00010015443) #22	ZNF18 (ENSRFEG00010015327) #23	MAP2K4 (ENSRFEG00010015194) #24	MYOCD (ENSRFEG00010015068) #25	ARHGAP44 (ENSRFEG00010014837) #26	ELAC2 (ENSRFEG00010013625) #27	HS3ST3A1 (ENSRFEG00010013442)	COX10 (ENSRFEG00010013286)	HS3ST3B1 (ENSRFEG00010013247)	ENSRFEG00010013184	PMP22 (ENSRFEG00010013092)	TEKT3 (ENSRFEG00010013034)	CDRT4 (ENSRFEG00010012975)	ENSRFEG00010012887	ENSRFEG00010012830	TRIM16 (ENSRFEG00010012736)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000166513	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000167712
Horse	MODERN SPECIES	2	PIK3R5 (ENSECAG00000047656)	NTN1 (ENSECAG00000026819)	STX8 (ENSECAG00000017772)	CFAP52 (ENSECAG00000046205)	USP43 (ENSECAG00000018340)	DHRS7C (ENSECAG00000018404)	GLP2R (ENSECAG00000018559) #9	GAS7 (ENSECAG00000019002) #11	MYH2 (ENSECAG00000024667) #16	MYH3 (ENSECAG00000025060) #17	SCO1 (ENSECAG00000025151) #18	ADPRM (ENSECAG00000025154) #19	TMEM220 (ENSECAG00000025155) #20	PIRT (ENSECAG00000003266)	SHISA6 (ENSECAG00000025157) #21	DNAH9 (ENSECAG00000025159) #22	ZNF18 (ENSECAG00000025164) #23	MAP2K4 (ENSECAG00000025163) #24	ENSECAG00000046063	MYOCD (ENSECAG00000025166) #25	ARHGAP44 (ENSECAG00000025167) #26	ELAC2 (ENSECAG00000025168) #27	HS3ST3A1 (ENSECAG00000025171)	COX10 (ENSECAG00000025173)	HS3ST3B1 (ENSECAG00000025174)	PMP22 (ENSECAG00000025178)	TEKT3 (ENSECAG00000025179)	ENSECAG00000025180	ENSECAG00000000870	ENSECAG00000001076	TRIM16 (ENSECAG00000035193)
Donkey	MODERN SPECIES	4	DHRS7C (ENSEASG00005021828)	GLP2R (ENSEASG00005021831) #9	RCVRN (ENSEASG00005021835) #10	GAS7 (ENSEASG00005021840) #11	ENSEASG00005021867	MYH8 (ENSEASG00005021917) #13	MYH4 (ENSEASG00005038268) #14	MYH1 (ENSEASG00005029368) #15	ENSEASG00005003672 #16	MYH3 (ENSEASG00005015262) #17	SCO1 (ENSEASG00005016048) #18	TMEM220 (ENSEASG00005016054) #20	ADPRM (ENSEASG00005016052) #19	TMEM238L (ENSEASG00005029814)	PIRT (ENSEASG00005029115)	DNAH9 (ENSEASG00005016211) #22	ZNF18 (ENSEASG00005016826) #23	MAP2K4 (ENSEASG00005016829) #24	ENSEASG00005037589	MYOCD (ENSEASG00005016841) #25	ARHGAP44 (ENSEASG00005016849) #26	ELAC2 (ENSEASG00005016922) #27	HS3ST3A1 (ENSEASG00005028940)	COX10 (ENSEASG00005017231)	HS3ST3B1 (ENSEASG00005026842)	PMP22 (ENSEASG00005017236)	TEKT3 (ENSEASG00005017238)	ENSEASG00005017241	ENSEASG00005017243	ENSEASG00005017248	TRIM16 (ENSEASG00005017256)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000168040	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000168040	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000168040	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003.u
Tiger	MODERN SPECIES	556															ENSPTIG00000011619 #21	DNAH9 (ENSPTIG00000011998) #22	ZNF18 (ENSPTIG00000017501) #23	MAP2K4 (ENSPTIG00000019454) #24	MYOCD (ENSPTIG00000020572) #25	ENSPTIG00000020794 #26	ENSPTIG00000002903	COX10 (ENSPTIG00000006793)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000168040	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003.u
leopard	MODERN SPECIES	61	GLP2R (ENSPPRG00000012501) #9	RCVRN (ENSPPRG00000012635) #10	GAS7 (ENSPPRG00000018902) #11	MYH13 (ENSPPRG00000001845) #12	MYH8 (ENSPPRG00000003310) #13	MYH4 (ENSPPRG00000004968) #14	MYH1 (ENSPPRG00000007921) #15	ENSPPRG00000011335 #16	MYH3 (ENSPPRG00000013965) #17	SCO1 (ENSPPRG00000014904) #18	ADPRM (ENSPPRG00000016594) #19	TMEM220 (ENSPPRG00000019533) #20	TMEM238L (ENSPPRG00000020753)	PIRT (ENSPPRG00000020774)	SHISA6 (ENSPPRG00000023160) #21	DNAH9 (ENSPPRG00000009480) #22	ZNF18 (ENSPPRG00000010269) #23	MAP2K4 (ENSPPRG00000011498) #24	MYOCD (ENSPPRG00000013106) #25	ARHGAP44 (ENSPPRG00000021634) #26	ELAC2 (ENSPPRG00000023801) #27	HS3ST3A1 (ENSPPRG00000023311)	ENSPPRG00000023281	ENSPPRG00000022978	HS3ST3B1 (ENSPPRG00000022773)	PMP22 (ENSPPRG00000000118)	TEKT3 (ENSPPRG00000000351)	CDRT4 (ENSPPRG00000000494)	ENSPPRG00000001832	ENSPPRG00000006782	TRIM16 (ENSPPRG00000009769)
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Cat	MODERN SPECIES	245	GSG1L2 (ENSFCAG00000027977) #8	GLP2R (ENSFCAG00000001842) #9	RCVRN (ENSFCAG00000022515) #10	GAS7 (ENSFCAG00000001845) #11	MYH13 (ENSFCAG00000009091) #12	MYH4 (ENSFCAG00000010562) #14	MYH1 (ENSFCAG00000010564) #15	ENSFCAG00000034047 #16	MYH3 (ENSFCAG00000003957) #17	SCO1 (ENSFCAG00000003959) #18	ADPRM (ENSFCAG00000003960) #19	TMEM220 (ENSFCAG00000003962) #20	TMEM238L (ENSFCAG00000045600)	PIRT (ENSFCAG00000032895)	SHISA6 (ENSFCAG00000011996) #21	ENSFCAG00000050808 #22	ENSFCAG00000011997	ZNF18 (ENSFCAG00000027934) #23	MAP2K4 (ENSFCAG00000038251) #24	MYOCD (ENSFCAG00000011071) #25	ARHGAP44 (ENSFCAG00000008402) #26	ELAC2 (ENSFCAG00000008407) #27	HS3ST3A1 (ENSFCAG00000046796)	COX10 (ENSFCAG00000010334)	HS3ST3B1 (ENSFCAG00000044418)	ENSFCAG00000048380	PMP22 (ENSFCAG00000037679)	TEKT3 (ENSFCAG00000008994)	ENSFCAG00000037088	ENSFCAG00000053401	TVP23B (ENSFCAG00000028247)
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Canidae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00940000175746.c	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116
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Dog	MODERN SPECIES	33	GSG1L2 (ENSCAFG00845001566) #8	GLP2R (ENSCAFG00845001586) #9	GAS7 (ENSCAFG00845001655) #11	RCVRN (ENSCAFG00845001836) #10	MYH8 (ENSCAFG00845002075) #13	MYH4 (ENSCAFG00845002385)	MYH1 (ENSCAFG00845002508) #15	MYH2 (ENSCAFG00845002613) #16	MYH3 (ENSCAFG00845002766) #17	SCO1 (ENSCAFG00845002812) #18	ADPRM (ENSCAFG00845002842) #19	ENSCAFG00845002881 #20	TMEM238L (ENSCAFG00845002923)	PIRT (ENSCAFG00845002937)	SHISA6 (ENSCAFG00845002978) #21	DNAH9 (ENSCAFG00845003182) #22	ZNF18 (ENSCAFG00845003462) #23	ENSCAFG00845003482	MAP2K4 (ENSCAFG00845003515) #24	ENSCAFG00845003596	MYOCD (ENSCAFG00845003630) #25	ARHGAP44 (ENSCAFG00845003750) #26	ELAC2 (ENSCAFG00845003879) #27	HS3ST3A1 (ENSCAFG00845003985)	ENSCAFG00845004032	COX10 (ENSCAFG00845004049)	ENSCAFG00845004065	HS3ST3B1 (ENSCAFG00845004082)	ENSCAFG00845004106	ENSCAFG00845004122	PMP22 (ENSCAFG00845004152)
Dingo	MODERN SPECIES	373	GLP2R (ENSCAFG00020006619) #9	RCVRN (ENSCAFG00020006608) #10	GAS7 (ENSCAFG00020006602) #11	ENSCAFG00020006590	MYH13 (ENSCAFG00020006005) #12	ENSCAFG00020005978	MYH8 (ENSCAFG00020004818) #13	ENSCAFG00020003702	MYH1 (ENSCAFG00020003220) #15	ENSCAFG00020001841 #16	ENSCAFG00020001535 #17	SCO1 (ENSCAFG00020001530) #18	ADPRM (ENSCAFG00020001525) #19	TMEM220 (ENSCAFG00020001519) #20	PIRT (ENSCAFG00020001513)	DNAH9 (ENSCAFG00020001198) #22	ZNF18 (ENSCAFG00020001141) #23	MAP2K4 (ENSCAFG00020001091) #24	ENSCAFG00020001071	MYOCD (ENSCAFG00020001034) #25	ARHGAP44 (ENSCAFG00020000991) #26	ELAC2 (ENSCAFG00020000574) #27	HS3ST3A1 (ENSCAFG00020000488)	ENSCAFG00020000477	ENSCAFG00020000457	ENSCAFG00020000429	COX10 (ENSCAFG00020000420)	HS3ST3B1 (ENSCAFG00020000393)	ENSCAFG00020000359	ENSCAFG00020000346	PMP22 (ENSCAFG00020000339)
Red fox	MODERN SPECIES	52	RCVRN (ENSVVUG00000028918) #10	GAS7 (ENSVVUG00000028920) #11	MYH13 (ENSVVUG00000029033) #12	ENSVVUG00000029387	ENSVVUG00000029396 #13	ENSVVUG00000029408 #13	ENSVVUG00000029445	MYH1 (ENSVVUG00000029610) #15	ENSVVUG00000029624 #16	MYH3 (ENSVVUG00000029754) #17	SCO1 (ENSVVUG00000029846) #18	ADPRM (ENSVVUG00000029848) #19	PIRT (ENSVVUG00000029849)	ENSVVUG00000029853 #21	ENSVVUG00000029855 #21	DNAH9 (ENSVVUG00000029873) #22	ZNF18 (ENSVVUG00000029880) #23	MAP2K4 (ENSVVUG00000029881) #24	ENSVVUG00000029886	MYOCD (ENSVVUG00000029888) #25	ARHGAP44 (ENSVVUG00000029902) #26	ELAC2 (ENSVVUG00000029905) #27	HS3ST3A1 (ENSVVUG00000029917)	COX10 (ENSVVUG00000029925)	HS3ST3B1 (ENSVVUG00000029929)	PMP22 (ENSVVUG00000029935)	TEKT3 (ENSVVUG00000029938)	ENSVVUG00000029943	ENSVVUG00000029946	ENSVVUG00000029948	CDRT1 (ENSVVUG00000029954)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Ferret	MODERN SPECIES	237	ENSMPUG00000007737	DHRS7C (ENSMPUG00000007730)	ENSMPUG00000007724 #8	GLP2R (ENSMPUG00000007715) #9	RCVRN (ENSMPUG00000007685) #10	ENSMPUG00000007683 #11	MYH13 (ENSMPUG00000007602) #12	MYH8 (ENSMPUG00000005644) #13	ENSMPUG00000003746	MYH1 (ENSMPUG00000003727) #15	SCO1 (ENSMPUG00000003720) #18	ADPRM (ENSMPUG00000003714) #19	TMEM220 (ENSMPUG00000003707) #20	ENSMPUG00000003702	SHISA6 (ENSMPUG00000003696) #21	DNAH9 (ENSMPUG00000003676) #22	ZNF18 (ENSMPUG00000003670) #23	MAP2K4 (ENSMPUG00000003664) #24	MYOCD (ENSMPUG00000003656) #25	ARHGAP44 (ENSMPUG00000003635) #26	ELAC2 (ENSMPUG00000003608) #27	ENSMPUG00000003598	ENSMPUG00000003593	ENSMPUG00000003582	COX10 (ENSMPUG00000003525)	HS3ST3B1 (ENSMPUG00000003515)	ENSMPUG00000003513	ENSMPUG00000003506	PMP22 (ENSMPUG00000003494)	TEKT3 (ENSMPUG00000003370)	ENSMPUG00000003365
American mink	MODERN SPECIES	204	GAS7 (ENSNVIG00000006100) #11	MYH13 (ENSNVIG00000006374) #12	ENSNVIG00000006514 #12	MYH8 (ENSNVIG00000006527) #13	ENSNVIG00000006687	MYH1 (ENSNVIG00000007982) #15	ENSNVIG00000008072 #16	ENSNVIG00000008345	MYH3 (ENSNVIG00000008358) #17	SCO1 (ENSNVIG00000008440) #18	ADPRM (ENSNVIG00000008453) #19	TMEM220 (ENSNVIG00000008470) #20	TMEM238L (ENSNVIG00000008530)	PIRT (ENSNVIG00000008539)	SHISA6 (ENSNVIG00000008547) #21	DNAH9 (ENSNVIG00000008652) #22	ZNF18 (ENSNVIG00000008976) #23	MAP2K4 (ENSNVIG00000008991) #24
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000154399.a.b	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000162568	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000161686
Giant Panda	MODERN SPECIES	8	GSG1L2 (ENSAMEG00000012116) #8	GLP2R (ENSAMEG00000012122) #9	RCVRN (ENSAMEG00000012153) #10	GAS7 (ENSAMEG00000012156) #11	MYH13 (ENSAMEG00000001675) #12	MYH8 (ENSAMEG00000001660) #13	MYH4 (ENSAMEG00000001301) #14	ENSAMEG00000000667 #16	MYH3 (ENSAMEG00000000332) #17	SCO1 (ENSAMEG00000000325) #18	ADPRM (ENSAMEG00000000324) #19	TMEM220 (ENSAMEG00000000321) #20	PIRT (ENSAMEG00000019623)	ENSAMEG00000012509	SHISA6 (ENSAMEG00000000318) #21	ENSAMEG00000000310 #22	ENSAMEG00000030668	ENSAMEG00000014189	ENSAMEG00000030088	ENSAMEG00000026924	GCSAML (ENSAMEG00000026182)	OR2C3 (ENSAMEG00000019044)	ENSAMEG00000019049	ENSAMEG00000018770	OR2B11 (ENSAMEG00000018592)	NLRP3 (ENSAMEG00000016947)	ENSAMEG00000024538	ENSAMEG00000013142	ENSAMEG00000013156 #23	ENSAMEG00000013165 #24	MYOCD (ENSAMEG00000002819) #25
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000154399.a.b	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000162249	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b
Polar bear	MODERN SPECIES	147	GSG1L2 (ENSUMAG00000017841) #8	GLP2R (ENSUMAG00000017848) #9	RCVRN (ENSUMAG00000017879) #10	GAS7 (ENSUMAG00000017908) #11	MYH13 (ENSUMAG00000018054) #12	MYH8 (ENSUMAG00000018459) #13	ENSUMAG00000019500	MYH1 (ENSUMAG00000019956) #15	ENSUMAG00000020575 #16	MYH3 (ENSUMAG00000021056) #17	SCO1 (ENSUMAG00000021078) #18	ADPRM (ENSUMAG00000021079) #19	TMEM220 (ENSUMAG00000021084) #20	PIRT (ENSUMAG00000021089)	ENSUMAG00000021091	DNAH9 (ENSUMAG00000021132) #22	ZNF18 (ENSUMAG00000021290) #23	MAP2K4 (ENSUMAG00000021313) #24	ARHGAP44 (ENSUMAG00000021375) #26	ELAC2 (ENSUMAG00000021393) #27	ENSUMAG00000021429	COX10 (ENSUMAG00000021433)	ENSUMAG00000021434	PMP22 (ENSUMAG00000021438)	TEKT3 (ENSUMAG00000021440)
American black bear	DUPLICATION
American black bear	DUPLICATION
American black bear	MODERN SPECIES	4849															ENSUAMG00000027656 #22	ENSUAMG00000027657 #22
American black bear	MODERN SPECIES	4849																ENSUAMG00000027656 #22	ENSUAMG00000027657 #22
American black bear	MODERN SPECIES	7085															ENSUAMG00000024139	ENSUAMG00000024141 #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00490000044402	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163646	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00490000044402	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000157100	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000154760.c.b #16	ENSGT00490000044402	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27
Elephant	DUPLICATION
Elephant	MODERN SPECIES	414	CFAP52 (ENSLAFG00000014230)	USP43 (ENSLAFG00000014238)	DHRS7C (ENSLAFG00000007624)	GLP2R (ENSLAFG00000010840) #9	RCVRN (ENSLAFG00000010842) #10	GAS7 (ENSLAFG00000016499) #11	MYH13 (ENSLAFG00000015382) #12	MYH8 (ENSLAFG00000015399) #13	MYH1 (ENSLAFG00000015427) #15	MYH3 (ENSLAFG00000010957) #17	SCO1 (ENSLAFG00000005056) #18	ADPRM (ENSLAFG00000008416) #19	TMEM220 (ENSLAFG00000008417) #20	PIRT (ENSLAFG00000026694)	SHISA6 (ENSLAFG00000028201) #21	ENSLAFG00000029180 #22	ENSLAFG00000009016 #22	ENSLAFG00000009028 #23	ENSLAFG00000032539 #23	ENSLAFG00000032409 #23	MAP2K4 (ENSLAFG00000013443) #24	MYOCD (ENSLAFG00000012269) #25	ARHGAP44 (ENSLAFG00000009401) #26	ELAC2 (ENSLAFG00000009404) #27	ENSLAFG00000028133	ENSLAFG00000028514
Elephant	MODERN SPECIES	414	USP43 (ENSLAFG00000014238)	DHRS7C (ENSLAFG00000007624)	GLP2R (ENSLAFG00000010840) #9	RCVRN (ENSLAFG00000010842) #10	GAS7 (ENSLAFG00000016499) #11	MYH13 (ENSLAFG00000015382) #12	MYH8 (ENSLAFG00000015399) #13	MYH1 (ENSLAFG00000015427) #15	MYH3 (ENSLAFG00000010957) #17	SCO1 (ENSLAFG00000005056) #18	ADPRM (ENSLAFG00000008416) #19	TMEM220 (ENSLAFG00000008417) #20	PIRT (ENSLAFG00000026694)	SHISA6 (ENSLAFG00000028201) #21	ENSLAFG00000029180 #22	ENSLAFG00000009016 #22	ENSLAFG00000009028 #23	ENSLAFG00000032539 #23	ENSLAFG00000032409 #23	MAP2K4 (ENSLAFG00000013443) #24	MYOCD (ENSLAFG00000012269) #25	ARHGAP44 (ENSLAFG00000009401) #26	ELAC2 (ENSLAFG00000009404) #27	ENSLAFG00000028133	ENSLAFG00000028514
Hyrax	MODERN SPECIES	7477																DNAH9 (ENSPCAG00000003990) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	8444																DNAH9 (ENSETEG00000000596) #22	ZNF18 (ENSETEG00000000611) #23
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	292								ENSGT00940000154760.c.a #15	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27
Sloth	MODERN SPECIES	8005																DNAH9 (ENSCHOG00000001748) #22	ZNF18 (ENSCHOG00000001767) #23
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.a #15	ENSGT00940000154760.b #15	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854.i #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000154768.A.a	ENSGT00940000161576	ENSGT00950000182696.B.a	ENSGT00950000182894.A.b.b	ENSGT00390000005396	ENSGT00390000004428.a	ENSGT00940000158003	ENSGT00940000161116	ENSGT00940000153104.e.a.a.a.a.b.b
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.a #15	ENSGT00940000154760.b #15	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854.i #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000154768.A.a	ENSGT00940000161576	ENSGT00940000163165.b.a.a	ENSGT00940000163395	ENSGT00940000162441	ENSGT00940000161396	ENSGT00940000154740.a.a.c.b	ENSGT00940000162299	ENSGT00950000182696.B.a
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.a #15	ENSGT00940000154760.b #15	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854.i #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000154768.A.a	ENSGT00940000161576	ENSGT00940000163165.b.a.a
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000159441 #10	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000161785 #13	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760.a #15	ENSGT00940000154760.b #15	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000156854.i #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000161617 #23	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000157296 #26	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000153771.A	ENSGT00940000154768.A.a	ENSGT00940000161576	ENSGT00940000163165.b.a.a
koala	MODERN SPECIES	164	GLP2R (ENSPCIG00000019772) #9	RCVRN (ENSPCIG00000018028) #10	GAS7 (ENSPCIG00000018027) #11	MYH13 (ENSPCIG00000014313) #12	MYH8 (ENSPCIG00000033871) #13	MYH4 (ENSPCIG00000033153) #14	ENSPCIG00000007975 #15	ENSPCIG00000004522 #15	MYH3 (ENSPCIG00000016998) #17	SCO1 (ENSPCIG00000017012) #18	ADPRM (ENSPCIG00000017015) #19	TMEM220 (ENSPCIG00000017016) #20	TMEM238L (ENSPCIG00000031548)	PIRT (ENSPCIG00000017019)	SHISA6 (ENSPCIG00000015676) #21	DNAH9 (ENSPCIG00000015874) #22	ZNF18 (ENSPCIG00000028789) #23	MAP2K4 (ENSPCIG00000028792) #24	MYOCD (ENSPCIG00000009361) #25	ARHGAP44 (ENSPCIG00000009354) #26	ELAC2 (ENSPCIG00000009347) #27	ENSPCIG00000016011	ENSPCIG00000033470	ENSPCIG00000016012	ENSPCIG00000016013	ENSPCIG00000016016	ENSPCIG00000016633	ENSPCIG00000016634
Wallaby	MODERN SPECIES	537																ENSMEUG00000014582 #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	RCVRN (ENSSHAG00000000959) #10	GAS7 (ENSSHAG00000004809) #11	MYH13 (ENSSHAG00000024735) #12	MYH8 (ENSSHAG00000031367) #13	MYH4 (ENSSHAG00000009623) #14	ENSSHAG00000026259 #15	ENSSHAG00000031215 #15	MYH3 (ENSSHAG00000010854) #17	SCO1 (ENSSHAG00000021650) #18	ADPRM (ENSSHAG00000003007) #19	TMEM220 (ENSSHAG00000022277) #20	TMEM238L (ENSSHAG00000021468)	PIRT (ENSSHAG00000021837)	ENSSHAG00000031265	SHISA6 (ENSSHAG00000020763) #21	DNAH9 (ENSSHAG00000000616) #22	ZNF18 (ENSSHAG00000004742) #23	MAP2K4 (ENSSHAG00000000653) #24	MYOCD (ENSSHAG00000002911) #25	ARHGAP44 (ENSSHAG00000001529) #26	ELAC2 (ENSSHAG00000000107) #27	ENSSHAG00000003900	ENSSHAG00000002796	ENSSHAG00000005434	ENSSHAG00000023499	ENSSHAG00000024175	ENSSHAG00000030927	ENSSHAG00000029738	ENSSHAG00000002854	ENSSHAG00000024775	TEKT3 (ENSSHAG00000015511)
Opossum	MODERN SPECIES	1	ENSMODG00000049927 #15	ENSMODG00000049129 #15	ENSMODG00000047488	MYH3 (ENSMODG00000047156) #17	ENSMODG00000000338 #18	ADPRM (ENSMODG00000000343) #19	ENSMODG00000023868 #20	TMEM238L (ENSMODG00000036444)	PIRT (ENSMODG00000041714)	ENSMODG00000050050	ENSMODG00000047313	ENSMODG00000044623	ENSMODG00000000243 #21	ENSMODG00000007206	ENSMODG00000048856 #21	DNAH9 (ENSMODG00000000233) #22	ENSMODG00000023860	ENSMODG00000045095	ZNF18 (ENSMODG00000000157) #23	ENSMODG00000009226	ENSMODG00000047925	PGBD2 (ENSMODG00000009187)	ENSMODG00000009178	ZNF692 (ENSMODG00000009168)	ENSMODG00000023566	SH3BP5L (ENSMODG00000009145)	ENSMODG00000009131	ENSMODG00000046343	ENSMODG00000009094	ENSMODG00000023567	ENSMODG00000051587
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT00940000162543 #12	ENSGT00940000163211 #14	ENSGT00940000154760 #15	ENSGT00940000161336.u.e.a	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	26										ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000170754	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a.f	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b
tuatara	DUPLICATION
tuatara	MODERN SPECIES	1429											FOXK2 (ENSSPUG00000004739)	WDR45B (ENSSPUG00000004780)	FN3KRP (ENSSPUG00000004786)	ELAC2 (ENSSPUG00000004817) #27	ENSSPUG00000004861 #22	ENSSPUG00000004891 #22	ENSSPUG00000004908	ENSSPUG00000004911	ENSSPUG00000004921	SHISA6 (ENSSPUG00000004961) #21	NDEL1 (ENSSPUG00000004988)	MYH10 (ENSSPUG00000005090)	CCDC42 (ENSSPUG00000005482)	ENSSPUG00000005510	MFSD6L (ENSSPUG00000005550)	PIK3R6 (ENSSPUG00000005563)	PIK3R5 (ENSSPUG00000005610)	NTN1 (ENSSPUG00000005623)	STX8 (ENSSPUG00000005632)	ENSSPUG00000005640	ENSSPUG00000005651
tuatara	MODERN SPECIES	1429												FOXK2 (ENSSPUG00000004739)	WDR45B (ENSSPUG00000004780)	FN3KRP (ENSSPUG00000004786)	ELAC2 (ENSSPUG00000004817) #27	ENSSPUG00000004861 #22	ENSSPUG00000004891 #22	ENSSPUG00000004908	ENSSPUG00000004911	ENSSPUG00000004921	SHISA6 (ENSSPUG00000004961) #21	NDEL1 (ENSSPUG00000004988)	MYH10 (ENSSPUG00000005090)	CCDC42 (ENSSPUG00000005482)	ENSSPUG00000005510	MFSD6L (ENSSPUG00000005550)	PIK3R6 (ENSSPUG00000005563)	PIK3R5 (ENSSPUG00000005610)	NTN1 (ENSSPUG00000005623)	STX8 (ENSSPUG00000005632)	ENSSPUG00000005640
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156233	ENSGT00940000162790.a	ENSGT00940000153385.b.a.b	ENSGT00940000161157	ENSGT00940000160381	ENSGT00940000154549.b	ENSGT00530000063777.a.a.b	ENSGT00530000063777.a.a.a	ENSGT00940000159979	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000170754	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a.f	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000175175	ENSGT00550000075140	ENSGT00950000182975.a.b	ENSGT00980000198723	ENSGT00940000160234	ENSGT00940000154549.b	ENSGT00530000063777.a.a.b	ENSGT00530000063777.a.a.a	ENSGT00940000159979	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000170754	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a.f	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160045	ENSGT00940000162025	ENSGT00940000175175	ENSGT00550000075140	ENSGT00950000182975.a.b	ENSGT00980000198723	ENSGT00940000160234	ENSGT00530000063777.a.a.b	ENSGT00530000063777.a.a.a	ENSGT00940000159979	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a.f	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779
Indian cobra	MODERN SPECIES	1	STXBP2 (ENSNNAG00000010318)	ENSNNAG00000010384	ENSNNAG00000010419	ENSNNAG00000010481	ENSNNAG00000010532	ENSNNAG00000010557	ENSNNAG00000010572	AKAP8 (ENSNNAG00000010662)	AKAP8L (ENSNNAG00000010673)	WIZ (ENSNNAG00000010721)	FOXK2 (ENSNNAG00000010859)	WDR45B (ENSNNAG00000010923)	RAB40B (ENSNNAG00000010973)	FN3KRP (ENSNNAG00000010997)	ELAC2 (ENSNNAG00000011075) #27	ENSNNAG00000011391 #22	ENSNNAG00000011427	ENSNNAG00000011452	PIRT (ENSNNAG00000011571)	ENSNNAG00000011582	RNF222 (ENSNNAG00000011593)	NDEL1 (ENSNNAG00000011630)	MYH10 (ENSNNAG00000012330)	CCDC42 (ENSNNAG00000017930)	ENSNNAG00000017933	MFSD6L (ENSNNAG00000017935)	PIK3R6 (ENSNNAG00000017936)	PIK3R5 (ENSNNAG00000017940)	NTN1 (ENSNNAG00000017957)	STX8 (ENSNNAG00000017960)	ENSNNAG00000017968
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162025	ENSGT00940000175175	ENSGT00550000075140	ENSGT00950000182975.a.b	ENSGT00980000198723	ENSGT00940000160234	ENSGT00940000162790.a	ENSGT00530000063777.a.a.b	ENSGT00530000063777.a.a.a	ENSGT00940000159979	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a.f	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.v	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	8394															ELAC2 (ENSLLTG00000017618) #27	ENSLLTG00000017620 #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162025	ENSGT00940000175175	ENSGT00550000075140	ENSGT00950000182975.a.b	ENSGT00980000198723	ENSGT00940000160234	ENSGT00940000162790.a	ENSGT00530000063777.a.a.b	ENSGT00530000063777.a.a.a	ENSGT00940000159979	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a.f	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.v	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b
Mainland tiger snake	DUPLICATION
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	87	ENSNSUG00000018058	ENSNSUG00000018059	ENSNSUG00000018060	ENSNSUG00000018061	ENSNSUG00000018062	ENSNSUG00000018063	ENSNSUG00000018064	AKAP8 (ENSNSUG00000018115)	AKAP8L (ENSNSUG00000018117)	WIZ (ENSNSUG00000018118)	FOXK2 (ENSNSUG00000018119)	WDR45B (ENSNSUG00000018120)	RAB40B (ENSNSUG00000018129)	FN3KRP (ENSNSUG00000018130)	ELAC2 (ENSNSUG00000018131) #27	ENSNSUG00000018163 #22	ENSNSUG00000018164 #22	ENSNSUG00000018165	ENSNSUG00000018166	PIRT (ENSNSUG00000018167)	ENSNSUG00000018168	RNF222 (ENSNSUG00000018169)	NDEL1 (ENSNSUG00000018170)	MYH10 (ENSNSUG00000018171)	CCDC42 (ENSNSUG00000019350)	ENSNSUG00000019351	MFSD6L (ENSNSUG00000019352)	PIK3R6 (ENSNSUG00000019353)	PIK3R5 (ENSNSUG00000019354)	NTN1 (ENSNSUG00000019355)	STX8 (ENSNSUG00000019356)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	87	ENSNSUG00000018059	ENSNSUG00000018060	ENSNSUG00000018061	ENSNSUG00000018062	ENSNSUG00000018063	ENSNSUG00000018064	AKAP8 (ENSNSUG00000018115)	AKAP8L (ENSNSUG00000018117)	WIZ (ENSNSUG00000018118)	FOXK2 (ENSNSUG00000018119)	WDR45B (ENSNSUG00000018120)	RAB40B (ENSNSUG00000018129)	FN3KRP (ENSNSUG00000018130)	ELAC2 (ENSNSUG00000018131) #27	ENSNSUG00000018163 #22	ENSNSUG00000018164 #22	ENSNSUG00000018165	ENSNSUG00000018166	PIRT (ENSNSUG00000018167)	ENSNSUG00000018168	RNF222 (ENSNSUG00000018169)	NDEL1 (ENSNSUG00000018170)	MYH10 (ENSNSUG00000018171)	CCDC42 (ENSNSUG00000019350)	ENSNSUG00000019351	MFSD6L (ENSNSUG00000019352)	PIK3R6 (ENSNSUG00000019353)	PIK3R5 (ENSNSUG00000019354)	NTN1 (ENSNSUG00000019355)	STX8 (ENSNSUG00000019356)	ENSNSUG00000019357
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	6	ENSPTXG00000003664	XAB2 (ENSPTXG00000003662)	CAMSAP3 (ENSPTXG00000003657)	NOTCH3 (ENSPTXG00000003651)	ENSPTXG00000003645	ENSPTXG00000003642	ENSPTXG00000009691	AKAP8 (ENSPTXG00000009690)	AKAP8L (ENSPTXG00000009689)	WIZ (ENSPTXG00000009688)	FOXK2 (ENSPTXG00000009687)	WDR45B (ENSPTXG00000009686)	RAB40B (ENSPTXG00000009685)	FN3KRP (ENSPTXG00000009684)	ELAC2 (ENSPTXG00000009480) #27	ENSPTXG00000009478 #22	ENSPTXG00000009477	ENSPTXG00000009476	ENSPTXG00000009475	ENSPTXG00000009474 #21	ENSPTXG00000009473 #21	ENSPTXG00000009471	NDEL1 (ENSPTXG00000009468)	MYH10 (ENSPTXG00000009464)	CCDC42 (ENSPTXG00000009462)	ENSPTXG00000009459	MFSD6L (ENSPTXG00000009458)	PIK3R6 (ENSPTXG00000009457)	PIK3R5 (ENSPTXG00000009438)	NTN1 (ENSPTXG00000009436)	STX8 (ENSPTXG00000009433)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	19			ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d.w.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	12				ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00940000157016
Aves	ANCESTRAL SPECIES	17		ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.t.a.b.a	ENSGT00940000161336.t.a.a	ENSGT00940000161336.t.b.a.b.b.b.a	ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00940000157016
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	17		ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.t.a.b.a	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854.d #21	ENSGT00940000156854.c.a #21	ENSGT00940000156854.c.b #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT01080000257700	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	19		ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854.d #21	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.w.b	ENSGT00940000156854.c.a #21	ENSGT00940000156854.c.b #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT01080000257700	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00940000157016
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Chicken	MODERN SPECIES	9	GLP2R (ENSGALG00010029195) #9	GAS7 (ENSGALG00010029200) #11	ENSGALG00010029530	MYH1B (ENSGALG00010029537)	MYH1C (ENSGALG00010029553)	ENSGALG00010029554	ENSGALG00010029557	ENSGALG00010029558	ENSGALG00010029559	SCO1 (ENSGALG00010029561) #18	ADPRM (ENSGALG00010029563) #19	TMEM220 (ENSGALG00010029569) #20	MAP2K4 (ENSGALG00010029573) #24	MYOCD (ENSGALG00010029743) #25	ELAC2 (ENSGALG00010029756) #27	DNAH9 (ENSGALG00010029758) #22	SHISA6 (ENSGALG00010029760) #21	PIRT (ENSGALG00010029334)	RNF222 (ENSGALG00010029335)	NDEL1 (ENSGALG00010029340)	MYH10 (ENSGALG00010029349)	ENSGALG00010029358	ENSGALG00010029359	PIK3R6 (ENSGALG00010029363)	PIK3R5 (ENSGALG00010029365)	NTN1 (ENSGALG00010029907)	STX8 (ENSGALG00010029921)	ENSGALG00010029927	USP43 (ENSGALG00010029928)	ARHGAP44 (ENSGALG00010029930) #26	ENSGALG00010029931
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	18								ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.w.b	ENSGT00940000156854.c.a #21	ENSGT00940000156854.c.b #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT01080000257700	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00940000157016
Duck	MODERN SPECIES	9				ENSAPLG00000025616	ENSAPLG00000013659	GAS7 (ENSAPLG00000003204) #11	GLP2R (ENSAPLG00000003827) #9	GSG1L2 (ENSAPLG00000004526) #8	DHRS7C (ENSAPLG00000004529)	ENSAPLG00000005481	SCO1 (ENSAPLG00000027233) #18	ADPRM (ENSAPLG00000017438) #19	TMEM220 (ENSAPLG00000025111) #20	MAP2K4 (ENSAPLG00000013074) #24	MYOCD (ENSAPLG00000013526) #25	ENSAPLG00000025354 #22	ENSAPLG00000021474	ENSAPLG00000003696	ENSAPLG00000024109	ENSAPLG00000003691 #21	ENSAPLG00000023977 #21	PIRT (ENSAPLG00000023353)	RNF222 (ENSAPLG00000000734)	ENSAPLG00000018403	MYH10 (ENSAPLG00000015386)	ENSAPLG00000015857	ENSAPLG00000015933	PIK3R6 (ENSAPLG00000015945)	PIK3R5 (ENSAPLG00000016065)	NTN1 (ENSAPLG00000009859)	STX8 (ENSAPLG00000009824)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161336.t.a.b.a	ENSGT00940000161336.t.a.a.a	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.a.b	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854.d #21	ENSGT00940000156854.c.a #21	ENSGT00940000156854.c.b #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT01080000257700	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161336.t.a.b.a	ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.a.b	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854.d #21	ENSGT00940000156854.c.a #21	ENSGT00940000156854.c.b #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063599.A
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161336.t.a.b.a	ENSGT00940000161336.t.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a.b	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.a.b	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.b	ENSGT00940000161575 #17	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854.d #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00440000038745.a	ENSGT01080000257700
Flycatcher	MODERN SPECIES	8	ENSFALG00000011827	ENSFALG00000023745	ENSFALG00000025795	ENSFALG00000000593	ENSFALG00000011326	SCO1 (ENSFALG00000023169) #18	ENSFALG00000027954 #19	ENSFALG00000011236 #19	TMEM220 (ENSFALG00000011228) #20	ENSFALG00000028223 #24	ENSFALG00000023884	ENSFALG00000011169 #25	ENSFALG00000024734	ENSFALG00000028258	ENSFALG00000011155 #27	ENSFALG00000004022 #22	SHISA6 (ENSFALG00000025010) #21	ENSFALG00000014728	ENSFALG00000027279	RNF222 (ENSFALG00000009202)	ENSFALG00000009203	ENSFALG00000026692	ENSFALG00000028758	MYH10 (ENSFALG00000009225)	ENSFALG00000009348	STX8 (ENSFALG00000009353)	NTN1 (ENSFALG00000009362)	PIK3R5 (ENSFALG00000009386)	PIK3R6 (ENSFALG00000009410)	MFSD6L (ENSFALG00000024459)	ENSFALG00000009419
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161336.t.a.b.a	ENSGT00940000161336.t.a.b.b.b	ENSGT00940000161336.t.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a.b	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.a.b	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854.d #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000164189	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00440000038745.a	ENSGT01080000257700	ENSGT00940000157296.i.a #26
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT01030000235289	ENSGT00940000161336.t.a.b.a	ENSGT00940000161336.t.a.b.b.b	ENSGT00940000161336.t.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161336.t.b.b.b.a.b	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000161336.t.b.a.a.b.b	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000156854.d #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00940000153882.a.a	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00940000157296.i.a #26	ENSGT00940000165584.c	ENSGT00940000158003
Zebra finch	MODERN SPECIES	9	ENSTGUG00000021631	ENSTGUG00000026636	ENSTGUG00000013838	ENSTGUG00000016416	ENSTGUG00000028218	ENSTGUG00000026651	ENSTGUG00000025624	ENSTGUG00000022182	ENSTGUG00000019071	SCO1 (ENSTGUG00000005870) #18	ADPRM (ENSTGUG00000005867) #19	TMEM220 (ENSTGUG00000021019) #20	MAP2K4 (ENSTGUG00000005828) #24	MYOCD (ENSTGUG00000005789) #25	ELAC2 (ENSTGUG00000005776) #27	ENSTGUG00000025522 #22	ENSTGUG00000024608	ENSTGUG00000005689	SHISA6 (ENSTGUG00000024759) #21	PIRT (ENSTGUG00000005670)	RNF222 (ENSTGUG00000005667)	NDEL1 (ENSTGUG00000005651)	MYH10 (ENSTGUG00000005201)	ENSTGUG00000005186	STX8 (ENSTGUG00000028237)	NTN1 (ENSTGUG00000005165)	ENSTGUG00000005088	ENSTGUG00000005080	ENSTGUG00000005067	TEKT3 (ENSTGUG00000005044)	PMP22 (ENSTGUG00000021788)
Common canary	MODERN SPECIES	80	ENSSCAG00000010343	ENSSCAG00000010033	ENSSCAG00000009909	ENSSCAG00000009907	ENSSCAG00000009516	ENSSCAG00000009411	ENSSCAG00000009406	ENSSCAG00000009403	ENSSCAG00000009345	SCO1 (ENSSCAG00000009326) #18	ADPRM (ENSSCAG00000009319) #19	TMEM220 (ENSSCAG00000009309) #20	MAP2K4 (ENSSCAG00000009136) #24	MYOCD (ENSSCAG00000009074) #25	ELAC2 (ENSSCAG00000008849) #27	ENSSCAG00000008814 #22	ENSSCAG00000008811	ENSSCAG00000008795	SHISA6 (ENSSCAG00000008791) #21
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Golden eagle	MODERN SPECIES	21	ENSACCG00020004223	ENSACCG00020004334	ENSACCG00020004411	ENSACCG00020004824	ENSACCG00020005156	ENSACCG00020004565	ENSACCG00020005212	ENSACCG00020006433	MYH3 (ENSACCG00020007052) #17	SCO1 (ENSACCG00020007096) #18	ADPRM (ENSACCG00020007112) #19	TMEM220 (ENSACCG00020007118) #20	MAP2K4 (ENSACCG00020007135) #24	MYOCD (ENSACCG00020007157) #25	ELAC2 (ENSACCG00020007191) #27	ENSACCG00020007222 #22	ENSACCG00020007234	ENSACCG00020007242	ENSACCG00020007252	ENSACCG00020007271	ENSACCG00020007293 #21	PIRT (ENSACCG00020007300)	RNF222 (ENSACCG00020007308)	NDEL1 (ENSACCG00020007336)	MYH10 (ENSACCG00020007401)	ENSACCG00020007468	ENSACCG00020007525	MFSD6L (ENSACCG00020007554)	PIK3R6 (ENSACCG00020007565)	PIK3R5 (ENSACCG00020007630)	NTN1 (ENSACCG00020007690)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	67			ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d.x	ENSGT00940000154076.C.d.w.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.w.a	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00940000157016
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153527.c.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000153527.c.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT01030000234669.L.a.b.b.a.b	ENSGT00940000157100	ENSGT01050000244814.a.b #8	ENSGT00940000158127.a #9	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000161336.u.f.c	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00390000009386 #20	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d.w.b	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d.w.a	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00390000002856	ENSGT00390000000111.a	ENSGT00940000155159.C	ENSGT00940000153110.C	ENSGT00440000038745.a	ENSGT00530000063599.A	ENSGT00530000063753.A	ENSGT00530000063753.B	ENSGT00940000153882.a.b.b.b	ENSGT00390000007779	ENSGT00410000025739.c.b	ENSGT00940000157016
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Abingdon island giant tortoise	DUPLICATION
Abingdon island giant tortoise	DUPLICATION
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Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00950000183183.b.a	ENSGT00950000183183.b.b	ENSGT00940000155537	ENSGT00940000157972	ENSGT00940000156268.a.a #11	ENSGT00940000163461.a.a.a.a	ENSGT00940000163461.a.a.a.b	ENSGT00940000161336	ENSGT00390000004323.b #18	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000168279	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00730000111191 #27	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000156854 #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000168310	ENSGT00940000154322.C	ENSGT00940000162720.b.a	ENSGT00940000155709	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000161207	ENSGT00390000005730.a.a	ENSGT00390000005730.b	ENSGT00390000017103	ENSGT00530000063870.a.a	ENSGT00390000006933	ENSGT00390000001390.a.a
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Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000166074.B	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00950000183183.b.a	ENSGT00950000183183.b.b	ENSGT00940000155537	ENSGT00940000157972	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744 #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000177272
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Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00940000166074.B	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000167542	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b	ENSGT00940000164818.c.a	ENSGT00940000153840.a.a.a.a	ENSGT00940000166206
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	90	ENSGT00940000169412	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000167542	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b	ENSGT00940000164818.c.a
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Huchen	MODERN SPECIES	323		ENSHHUG00000045831 #9	ENSHHUG00000045842	PTS (ENSHHUG00000045845)	ENSHHUG00000045854	gas7a (ENSHHUG00000045891) ##11	ENSHHUG00000045904	ENSHHUG00000045957	ENSHHUG00000045964	ENSHHUG00000045972	ENSHHUG00000045979	adprm (ENSHHUG00000045983) #19	map2k4b (ENSHHUG00000046000) #24	MYOCD (ENSHHUG00000046368) #25	ENSHHUG00000046387	dnah9 (ENSHHUG00000046390) #22	SHISA6 (ENSHHUG00000046403) #21	foxk2a (ENSHHUG00000046408)	wdr45b (ENSHHUG00000046415)	MRPL58 (ENSHHUG00000046447)	CDR2L (ENSHHUG00000046453)	ENSHHUG00000046455	sap30bp (ENSHHUG00000046460)	itgb4 (ENSHHUG00000046465)	zgc:194990 (ENSHHUG00000046742)	ENSHHUG00000046754	ENSHHUG00000046760	unk (ENSHHUG00000046821)	UNC13D (ENSHHUG00000046839)	wbp2 (ENSHHUG00000046910)
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	147	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000163461.a.a.a.b.d	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000163461.a.a.a.b.d	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT01100000263533.b.b.a.b.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT01100000263520.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000163461.a.a.a.b.d	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00840000130048.a	ENSGT00400000022326.b.a.b.a.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT01100000263520.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000163461.a.a.a.b.d	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000176040	ENSGT00940000164189	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT01100000263520.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000162100	ENSGT00390000013727.d.b	ENSGT00940000155931.b	ENSGT00940000165563.a	ENSGT00390000018525.b	ENSGT00730000111130	ENSGT00940000157709.j	ENSGT00390000003849	ENSGT00940000154004.a.e.a	ENSGT00940000159294	ENSGT00940000158259.a	ENSGT00390000009194	ENSGT00940000156207.a.a.a	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000162179.e.b.a.b	ENSGT00390000014069.a	ENSGT00940000158547.d	ENSGT00940000165754	ENSGT01030000234607.A.a.a.b	ENSGT00940000159566	ENSGT00940000155594.d	ENSGT00940000157026	ENSGT00940000159820	ENSGT01030000234667.a.a.b.f	ENSGT00910000144592	ENSGT01100000263502.B.a.a.c	ENSGT00930000151022.b	ENSGT00940000155106	ENSGT00390000014167
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.b.b	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.b.a	ENSGT00940000162100	ENSGT00390000013727.d.b	ENSGT00940000155931.b	ENSGT00940000165563.a	ENSGT00390000018525.b	ENSGT00730000111130	ENSGT00390000003849	ENSGT00940000154004.a.e.a	ENSGT00940000159294	ENSGT00940000158259.a	ENSGT00390000009194	ENSGT00940000156207.a.a.a	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000162179.e.b.a.b	ENSGT00390000014069.a	ENSGT00940000158547.d	ENSGT00940000165754	ENSGT01030000234607.A.a.a.b	ENSGT00940000159566	ENSGT00940000155594.d	ENSGT00940000157026	ENSGT00940000159820	ENSGT01030000234667.a.a.b.f	ENSGT00910000144592	ENSGT01100000263502.B.a.a.c	ENSGT00930000151022.b	ENSGT00940000155106	ENSGT00390000014167
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Fugu	MODERN SPECIES		ENSTRUG00000014712	ENSTRUG00000026825	RSPH1 (ENSTRUG00000004211)	ENSTRUG00000021236	map2k4b (ENSTRUG00000003494) #24	ENSTRUG00000002497 #25	ENSTRUG00000033082	ENSTRUG00000000099	ENSTRUG00000032081	ENSTRUG00000033135	ENSTRUG00000032694	ENSTRUG00000031522	ENSTRUG00000027049	ENSTRUG00000030937	ENSTRUG00000027865	DNAH9 (ENSTRUG00000029644) #22	ENSTRUG00000029845	SHISA6 (ENSTRUG00000000061) #21	SHISA6 (ENSTRUG00000031724) #21	ENSTRUG00000026795	ENSTRUG00000032461	ENSTRUG00000027478	ENSTRUG00000029029	ENSTRUG00000028518	ENSTRUG00000031421	ENSTRUG00000022328	ENSTRUG00000023385	foxk2a (ENSTRUG00000003203)	wdr45b (ENSTRUG00000003669)	ENSTRUG00000022657	ENSTRUG00000032216
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000153141.B.b	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.b.b.b.a	ENSGT00940000162100	ENSGT00390000013727.d.b	ENSGT00940000155931.b	ENSGT00940000165563.a	ENSGT00390000018525.b	ENSGT00730000111130	ENSGT00390000003849	ENSGT00940000154004.a.e.a	ENSGT00940000159294	ENSGT00940000158259.a	ENSGT00390000009194	ENSGT00940000156207.a.a.a	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT01100000263505.b.b.b.a.b.b	ENSGT00390000014069.a	ENSGT00940000158547.d	ENSGT00940000165754	ENSGT01030000234607.A.a.a.b	ENSGT00940000159566	ENSGT00940000155594.d	ENSGT00940000157026.h	ENSGT00940000159820	ENSGT01030000234667.a.a.b.f	ENSGT00930000151022.b	ENSGT00940000155106	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000157075	ENSGT00940000154634.c.lb.b
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000014100.k.a	ENSGT00940000153141.B.b	ENSGT00940000162100	ENSGT00390000013727.d.b	ENSGT00940000155931.b	ENSGT00940000165563.a	ENSGT00390000018525.b	ENSGT00730000111130	ENSGT00390000003849	ENSGT00940000154004.a.e.a	ENSGT00940000159294	ENSGT00940000158259.a	ENSGT00390000009194	ENSGT00940000156207.a.a.a	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT01100000263505.b.b.b.a.b.b	ENSGT00390000014069.a	ENSGT00940000158547.d	ENSGT00940000165754	ENSGT01030000234607.A.a.a.b	ENSGT00940000159566	ENSGT00940000155594.d	ENSGT00940000157026.h	ENSGT00940000159820	ENSGT01030000234667.a.a.b.f	ENSGT00930000151022.b	ENSGT00940000155106	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000157075	ENSGT00940000154634.c.lb.b
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153141.B.b	ENSGT00940000162100	ENSGT00390000013727.d.b	ENSGT00940000155931.b	ENSGT00940000165563.a	ENSGT00390000018525.b	ENSGT00730000111130	ENSGT00940000157709.j	ENSGT00390000003849	ENSGT00940000154004.a.e.a	ENSGT00940000159294	ENSGT00940000158259.a	ENSGT00390000009194	ENSGT00940000156207.a.a.a	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00390000014069.a	ENSGT00940000165754	ENSGT01030000234607.A.a.a.b	ENSGT00940000159566	ENSGT00940000155594.d	ENSGT00940000157026.g.a	ENSGT00940000157026.h	ENSGT00940000159820	ENSGT01030000234667.a.a.b.f	ENSGT00910000144592	ENSGT00930000151022.b	ENSGT00940000155106	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000157075	ENSGT00940000154634.d.b
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00390000014100.k.a	ENSGT00940000153141.B.b	ENSGT00940000162100	ENSGT00390000013727.d.b	ENSGT00940000155931.b	ENSGT00940000165563.a	ENSGT00390000018525.b	ENSGT00730000111130	ENSGT00390000003849	ENSGT00940000154004.a.e.a	ENSGT00940000159294	ENSGT00940000158259.a	ENSGT00390000009194	ENSGT00940000156207.a.a.a	ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00390000014069.a	ENSGT00940000165754	ENSGT01030000234607.A.a.a.b	ENSGT00940000159566	ENSGT00940000155594.d	ENSGT00940000157026.g.a	ENSGT00940000159820	ENSGT01030000234667.a.a.b.f	ENSGT00910000144592	ENSGT00930000151022.b	ENSGT00940000155106	ENSGT00390000014167	ENSGT00940000157075	ENSGT00940000154634.d.b	ENSGT00530000064112.a
Stickleback	MODERN SPECIES	80	ENSGACG00000001621	ENSGACG00000001617	ENSGACG00000001611	ENSGACG00000001587	ENSGACG00000001583	ENSGACG00000001581	WDR33 (ENSGACG00000001571)	adhfe1 (ENSGACG00000001534)	ENSGACG00000001529	ENSGACG00000001527	ENSGACG00000001526	SLC4A2 (ENSGACG00000001525)	ttc19 (ENSGACG00000001524)	ENSGACG00000001523	ENSGACG00000001521	ENSGACG00000001518 #22	tmub1 (ENSGACG00000001515)	ubtfl (ENSGACG00000001504)	fastk (ENSGACG00000001499)	afg3l2 (ENSGACG00000001496)	ENSGACG00000001484	klhl18 (ENSGACG00000001481)
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000163461.a.a.a.b.d	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT01080000257338.A.b.d.b.a.a.a.a	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000163461.a.a.a.b.d	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00390000006705
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000163461.a.a.a.b.d	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00940000154289.B.e.b	ENSGT00940000160084.h	ENSGT00940000154906.C.d	ENSGT00420000029824	ENSGT00940000153195.B
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Spiny chromis	DUPLICATION
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Spiny chromis	MODERN SPECIES	270						PTS (ENSAPOG00000003686)	ENSAPOG00000003672	ENSAPOG00000003599 ##11	ENSAPOG00000003580	RSPH1 (ENSAPOG00000003483)	adprm (ENSAPOG00000003472) #19	map2k4b (ENSAPOG00000003450) #24	MYOCD (ENSAPOG00000003395) #25	dnah9 (ENSAPOG00000003359) #22	ENSAPOG00000003272	ENSAPOG00000003255 #22
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000169412	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	113															ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.c	ENSGT00940000154076.C.d
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159875	ENSGT00390000000134.b.a	ENSGT00940000155874.a	ENSGT00950000183197.b.a.a	ENSGT00940000165531.b.a	ENSGT00950000182815.a.a.b.h	ENSGT00730000111181	ENSGT00940000155596.q	ENSGT00940000160987	ENSGT00940000159729	ENSGT00390000020276.t.b	ENSGT00940000154394.a	ENSGT00390000020276.t.a	ENSGT00940000154394.b.a.a.a.a.a.b.d	ENSGT00530000064286	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.c	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00390000014148.f	ENSGT00940000156231.o.b	ENSGT00940000159868.b	ENSGT00940000158016.c.b	ENSGT00950000183101.a.b.b.a.a	ENSGT00940000158540	ENSGT01060000248575.C	ENSGT00940000161534	ENSGT00940000153391.c.b.a.j.a	ENSGT00940000157936	ENSGT00940000157194	ENSGT00990000203759	ENSGT00390000016384.m
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Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	156															ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.c	ENSGT00940000154076.C.d
Indian medaka	DUPLICATION
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Indian medaka	DUPLICATION
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Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000169412	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000169412	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000169412	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000162720.b.a.a.a	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00940000162287.B.a.d.a	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000169412	ENSGT00940000165096.b.b	ENSGT00940000156922.b.a	ENSGT00940000164958.a	ENSGT00940000157100.a	ENSGT00940000154768.A.b	ENSGT01050000244814.a.b.a #8	ENSGT00940000158127 #9	ENSGT00390000002752	ENSGT00940000160705.C.b	ENSGT00940000156268.a.b ##11	ENSGT00940000157240	ENSGT00390000014667 #19	ENSGT00940000154744.a.b #24	ENSGT00950000182979.a.b.b.b.a.c #25	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.d	ENSGT00940000156854.s #21	ENSGT00940000155709.i	ENSGT00940000157510	ENSGT00940000162287.B.a.d.b	ENSGT00390000004010.a.b.a.b	ENSGT00390000013648	ENSGT00940000158256.g	ENSGT00950000182849.B.c.b.b	ENSGT00940000158883.b	ENSGT00390000014660	ENSGT00530000063937.a	ENSGT00940000155223.a.b	ENSGT00390000014380.h.b.b.i.b.a.b.i.a.a	ENSGT00940000154615.i.a.a.c.b.a.b.a.a
Amazon molly	DUPLICATION
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Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
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Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	DUPLICATION
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Otophysi	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Zebrafish	MODERN SPECIES	3	ENSDARG00000096669	ENSDARG00000096562	bsk146 (ENSDARG00000099069)	ENSDARG00000090142	ENSDARG00000102081	dhrs7cb (ENSDARG00000071877)	hs3st3l (ENSDARG00000059903)	ENSDARG00000045265 #8	rcvrnb (ENSDARG00000111827)	PTS (ENSDARG00000045269)	ENSDARG00000113674	adprm (ENSDARG00000026090) #19	map2k4b (ENSDARG00000077177) #24	ENSDARG00000076357	ENSDARG00000116210 ##11	dnah9 (ENSDARG00000103383) #22	ENSDARG00000112433	si:ch1073-357b18.4 (ENSDARG00000096602)	mrpl58 (ENSDARG00000078835)	wdr45b (ENSDARG00000021557)	foxk2a (ENSDARG00000030583)	shisa6 (ENSDARG00000115501) #21
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Electric eel	DUPLICATION
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Electric eel	MODERN SPECIES	36	sult2st2 (ENSEEEG00000007261)	ENSEEEG00000007265	bsk146 (ENSEEEG00000007271)	ENSEEEG00000007272	ENSEEEG00000007276	dhrs7cb (ENSEEEG00000007288)	hs3st3l (ENSEEEG00000007291)	ENSEEEG00000007293 #8	ENSEEEG00000007296 #9	PTS (ENSEEEG00000007297)	PTS (ENSEEEG00000007300)	ENSEEEG00000007322 ##11	adprm (ENSEEEG00000007328) #19	map2k4b (ENSEEEG00000007342) #24	dnah9 (ENSEEEG00000007520) #22	ENSEEEG00000007524 #22	ENSEEEG00000007525	ENSEEEG00000007530	ENSEEEG00000007531	ENSEEEG00000007532	ENSEEEG00000007535 #21	ENSEEEG00000007537	foxk2a (ENSEEEG00000007540)	wdr45b (ENSEEEG00000007545)	mrpl58 (ENSEEEG00000007562)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	450																ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000158880	ENSGT00940000155137.a.a	ENSGT00940000155137.b.d
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1106															ENSPNAG00000007646	ENSPNAG00000007652 #22	ENSPNAG00000007659
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES	288															ENSGT00940000154076.A	ENSGT00940000159717 #22	ENSGT00940000154076.C.c.w
Lamprey	MODERN SPECIES	4645																dnah9 (ENSPMAG00000009225) #22
Hagfish	DUPLICATION
Hagfish	MODERN SPECIES	879	ENSEBUG00000013291	ENSEBUG00000009544	ENSEBUG00000000531	TM7SF2 (ENSEBUG00000006875)	ENSEBUG00000016402	ENSEBUG00000013384	ENSEBUG00000009367	ENSEBUG00000016088	ercc4 (ENSEBUG00000009103)	ENSEBUG00000010329 #22	ENSEBUG00000002037 #22	ENSEBUG00000011087 #22	ENSEBUG00000012686	ENSEBUG00000015623 #22	ENSEBUG00000011308	ENSEBUG00000003915 #22	ostc (ENSEBUG00000013303)	bpnt1 (ENSEBUG00000001919)	MRPL49 (ENSEBUG00000003645)	FAU (ENSEBUG00000006275)	ENSEBUG00000004184
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Hagfish	DUPLICATION
Hagfish	DUPLICATION
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Hagfish	MODERN SPECIES	879	ENSEBUG00000009032	ENSEBUG00000004783	ENSEBUG00000009871	ENSEBUG00000005630	ENSEBUG00000013291	ENSEBUG00000009544	ENSEBUG00000000531	TM7SF2 (ENSEBUG00000006875)	ENSEBUG00000016402	ENSEBUG00000013384	ENSEBUG00000009367	ENSEBUG00000016088	ercc4 (ENSEBUG00000009103)	ENSEBUG00000010329 #22	ENSEBUG00000002037 #22	ENSEBUG00000011087 #22	ENSEBUG00000012686	ENSEBUG00000015623 #22	ENSEBUG00000011308	ENSEBUG00000003915 #22	ostc (ENSEBUG00000013303)	bpnt1 (ENSEBUG00000001919)	MRPL49 (ENSEBUG00000003645)	FAU (ENSEBUG00000006275)	ENSEBUG00000004184
Hagfish	MODERN SPECIES	224																ENSEBUG00000008549 #22	ENSEBUG00000002529	ENSEBUG00000010827	ENSEBUG00000004702	ENSEBUG00000009797
Ecdysozoa	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159717 #22
Fruitfly	DUPLICATION
Fruitfly	DUPLICATION
Fruitfly	MODERN SPECIES	27	Mst77Y-7 (FBgn0267492)	CG45766 (FBgn0267413)	CG45765 (FBgn0267412)	CG45764 (FBgn0267411)	Mst77Y-4 (FBgn0267490)	CG46193 (FBgn0267905)	CG46192 (FBgn0267904)	CG46191 (FBgn0267903)	FDY (FBgn0265047)	WDY (FBgn0267449)	Ppr-Y (FBgn0046697)	ARY (FBgn0058064)	kl-2 (FBgn0001313)	kl-3 (FBgn0267432)	PRY (FBgn0267489)	kl-5 (FBgn0267433) #22	Pp1-Y1 (FBgn0261399)
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