Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000003175.a.a #8	ENSGT00390000000628 #9	ENSGT00940000157409 #10	ENSGT00940000157412.b #11	ENSGT00530000064017.a #12	ENSGT00940000157186 #13	ENSGT00390000015375 #14	ENSGT00390000004495 #15	ENSGT00940000154078.a.a #16	ENSGT00950000183002.C #17	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #18	ENSGT00530000063555.B #19	ENSGT00940000158698 #20	ENSGT00940000161756 #21	ENSGT00940000159672 #22	ENSGT00940000158515 #23	ENSGT00390000014031 #24	ENSGT00390000005029 #25	ENSGT00940000159518 #26	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a #27	ENSGT00940000157798 #28	ENSGT00390000002554 #29	ENSGT00390000001546 #30	ENSGT00390000005639.a.b #31	ENSGT00950000183137.a #32	ENSGT00730000111092.b #33	ENSGT01050000244965.a #34	ENSGT00940000161801 #35	ENSGT00940000156925 #36
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	WNT8B (ENSSVLG00005010847) #7	SEC31B (ENSSVLG00005010799) #8	ENSSVLG00005005940 #9	HIF1AN (ENSSVLG00005005917) #10	PAX2 (ENSSVLG00005005719) #11	SLF2 (ENSSVLG00005005553) #12	SEMA4G (ENSSVLG00005005503) #13	MRPL43 (ENSSVLG00005005460) #14	TWNK (ENSSVLG00005005412) #15	LZTS2 (ENSSVLG00005005380) #16	PDZD7 (ENSSVLG00005005347) #17	SFXN3 (ENSSVLG00005005315) #18	KAZALD1 (ENSSVLG00005005289) #19	TLX1 (ENSSVLG00005005266) #20	LBX1 (ENSSVLG00005005245) #21	BTRC (ENSSVLG00005005205) #22	POLL (ENSSVLG00005005135) #23	DPCD (ENSSVLG00005005104) #24	FBXW4 (ENSSVLG00005005056) #25	FGF8 (ENSSVLG00005005038) #26	OGA (ENSSVLG00005004824) #27	KCNIP2 (ENSSVLG00005004570) #28	ARMH3 (ENSSVLG00005004399) #29	HPS6 (ENSSVLG00005004366) #30	LDB1 (ENSSVLG00005004323) #31	PPRC1 (ENSSVLG00005004252) #32	NOLC1 (ENSSVLG00005004225) #33	ELOVL3 (ENSSVLG00005004199) #34	PITX3 (ENSSVLG00005004181) #35	GBF1 (ENSSVLG00005004145) #36	NFKB2 (ENSSVLG00005004099) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000003175.a.a #8	ENSGT00390000000628 #9	ENSGT00940000157409 #10	ENSGT00940000157412.b #11	ENSGT00530000064017.a #12	ENSGT00940000157186 #13	ENSGT00390000015375 #14	ENSGT00390000004495 #15	ENSGT00940000154078.a.a #16	ENSGT00950000183002.C #17	ENSGT00990000203892	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #18	ENSGT00530000063555.B #19	ENSGT00940000158698 #20	ENSGT00940000161756 #21	ENSGT00940000159672 #22	ENSGT00940000158515 #23	ENSGT00390000014031 #24	ENSGT00390000005029 #25	ENSGT00940000159518 #26	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a #27	ENSGT00940000157798 #28	ENSGT00390000002554 #29	ENSGT00390000001546 #30	ENSGT00390000005639.a.b #31	ENSGT00950000183137.a #32	ENSGT00730000111092.b #33	ENSGT01050000244965.a #34	ENSGT00940000161801 #35	ENSGT00940000156925 #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00940000160584 #7	ENSGT00390000003175.a.a #8	ENSGT00390000000628 #9	ENSGT00940000157409.e #10	ENSGT00940000157412.b #11	ENSGT00530000064017.a #12	ENSGT00940000157186 #13	ENSGT00390000015375 #14	ENSGT00390000004495 #15	ENSGT00940000154078.a.a #16	ENSGT00950000183002.C #17	ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a #18	ENSGT00530000063555.B #19	ENSGT00940000158698 #20	ENSGT00940000161756 #21	ENSGT00940000159672 #22	ENSGT00940000158515 #23	ENSGT00390000014031 #24	ENSGT00390000005029 #25	ENSGT00940000159518 #26	ENSGT00940000158796	ENSGT00390000007726.a.a #27	ENSGT00940000157798 #28	ENSGT00390000002554 #29	ENSGT00390000001546 #30	ENSGT00390000005639.a.b #31	ENSGT00950000183137.a #32	ENSGT00730000111092.b #33	ENSGT01050000244965.a #34	ENSGT00940000161801 #35	ENSGT00940000156925 #36
Squirrel	MODERN SPECIES	200	WNT8B (ENSSTOG00000022425) #7	SEC31B (ENSSTOG00000009253) #8	NDUFB8 (ENSSTOG00000020727) #9	ENSSTOG00000009302 #10	PAX2 (ENSSTOG00000011575) #11	SLF2 (ENSSTOG00000008951) #12	SEMA4G (ENSSTOG00000008994) #13	MRPL43 (ENSSTOG00000009016) #14	TWNK (ENSSTOG00000009030) #15	LZTS2 (ENSSTOG00000015232) #16	PDZD7 (ENSSTOG00000009046) #17	SFXN3 (ENSSTOG00000026614) #18	KAZALD1 (ENSSTOG00000015240) #19	ENSSTOG00000023842 #20	LBX1 (ENSSTOG00000006491) #21	BTRC (ENSSTOG00000022481) #22	POLL (ENSSTOG00000011485) #23	DPCD (ENSSTOG00000011490) #24	FBXW4 (ENSSTOG00000011495) #25	FGF8 (ENSSTOG00000023351) #26	NPM3 (ENSSTOG00000022621)	ENSSTOG00000032901 #27	KCNIP2 (ENSSTOG00000021030) #28	ARMH3 (ENSSTOG00000015633) #29	HPS6 (ENSSTOG00000024918) #30	LDB1 (ENSSTOG00000002139) #31	ENSSTOG00000034359 #32	ENSSTOG00000002156 #32	NOLC1 (ENSSTOG00000002168) #33	ELOVL3 (ENSSTOG00000015013) #34	PITX3 (ENSSTOG00000015025) #35
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	373	NDUFB8 (ENSUPAG00010010693) #9	ENSUPAG00010010677 #10	PAX2 (ENSUPAG00010010652) #11	SLF2 (ENSUPAG00010010631) #12	SEMA4G (ENSUPAG00010010602) #13	MRPL43 (ENSUPAG00010010598) #14	TWNK (ENSUPAG00010010588) #15	LZTS2 (ENSUPAG00010010572) #16	ENSUPAG00010010561 #17	ENSUPAG00010010444 #17	SFXN3 (ENSUPAG00010010359) #18	KAZALD1 (ENSUPAG00010010340) #19	TLX1 (ENSUPAG00010010336) #20	LBX1 (ENSUPAG00010010328) #21	ENSUPAG00010010321	BTRC (ENSUPAG00010010245) #22	POLL (ENSUPAG00010010241) #23	DPCD (ENSUPAG00010010220) #24	FBXW4 (ENSUPAG00010010202) #25	FGF8 (ENSUPAG00010010083) #26	NPM3 (ENSUPAG00010010073)	OGA (ENSUPAG00010010052) #27	KCNIP2 (ENSUPAG00010009866) #28	ARMH3 (ENSUPAG00010009848) #29	HPS6 (ENSUPAG00010009845) #30	ENSUPAG00010009826 #31	PPRC1 (ENSUPAG00010009814) #32	NOLC1 (ENSUPAG00010009783) #33
Alpin marmot	MODERN SPECIES	39	NDUFB8 (ENSMMMG00000023049) #9	HIF1AN (ENSMMMG00000023051) #10	PAX2 (ENSMMMG00000023055) #11	SLF2 (ENSMMMG00000023066) #12	SEMA4G (ENSMMMG00000023078) #13	MRPL43 (ENSMMMG00000023087) #14	TWNK (ENSMMMG00000023092) #15	ENSMMMG00000023095 #16	ENSMMMG00000023099 #17	ENSMMMG00000023144 #17	ENSMMMG00000023146	SFXN3 (ENSMMMG00000023149) #18	KAZALD1 (ENSMMMG00000023167) #19	ENSMMMG00000023172 #20	LBX1 (ENSMMMG00000023177) #21	BTRC (ENSMMMG00000023182) #22	POLL (ENSMMMG00000023200) #23	DPCD (ENSMMMG00000023210) #24	FBXW4 (ENSMMMG00000023212) #25	FGF8 (ENSMMMG00000023215) #26	NPM3 (ENSMMMG00000023217)	OGA (ENSMMMG00000023220) #27	KCNIP2 (ENSMMMG00000023225) #28	ARMH3 (ENSMMMG00000023233) #29	HPS6 (ENSMMMG00000023243) #30	LDB1 (ENSMMMG00000023248) #31	PPRC1 (ENSMMMG00000023259) #32	NOLC1 (ENSMMMG00000023274) #33	ELOVL3 (ENSMMMG00000023279) #34	PITX3 (ENSMMMG00000023281) #35	GBF1 (ENSMMMG00000023283) #36