Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	10		ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000161329	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000161329	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000163656	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Theria	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Primates	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000183424
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000183424
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000183424
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00910000147230 #19	ENSGT00940000153340.B.k.b #21	ENSGT00910000147240	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	205	ENSGT00390000017067	ENSGT00530000064185.a	ENSGT00530000064185.b	ENSGT00940000155936.b	ENSGT00990000205444	ENSGT00950000183021.b	ENSGT00500000044959	ENSGT00390000016702	ENSGT00940000156549.a.a	ENSGT00940000157133.i	ENSGT00390000002143.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00910000147230 #19	ENSGT00940000153340.B.k.b #21	ENSGT00910000147240	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2854													ENSRROG00000029300 #19	ENSRROG00000001955 #20	ENSRROG00000032801 #21	SDC1 (ENSRROG00000033514) #22	LAPTM4A (ENSRROG00000045642) #23	MATN3 (ENSRROG00000033484) #24	ENSRROG00000038720 #25
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1130	PFN4 (ENSRBIG00000007265)	FAM228B (ENSRBIG00000037047)	FAM228A (ENSRBIG00000036877)	ITSN2 (ENSRBIG00000033688)	ENSRBIG00000025719	NCOA1 (ENSRBIG00000035295)	PTRHD1 (ENSRBIG00000032190)	CENPO (ENSRBIG00000040211)	ADCY3 (ENSRBIG00000034802)	ENSRBIG00000041935	EFR3B (ENSRBIG00000029715)	PUM2 (ENSRBIG00000044880) #20	ENSRBIG00000044692 #19	ENSRBIG00000025027 #21	ENSRBIG00000036594	SDC1 (ENSRBIG00000034487) #22	LAPTM4A (ENSRBIG00000014447) #23	MATN3 (ENSRBIG00000040709) #24
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	5	SF3B6 (ENSCSAG00000008390)	FKBP1B (ENSCSAG00000008381)	WDCP (ENSCSAG00000008372)	MFSD2B (ENSCSAG00000008345)	UBXN2A (ENSCSAG00000008300)	ATAD2B (ENSCSAG00000008290)	KLHL29 (ENSCSAG00000008250)	ENSCSAG00000008205	TDRD15 (ENSCSAG00000000380)	APOB (ENSCSAG00000008169)	LDAH (ENSCSAG00000008123)	GDF7 (ENSCSAG00000008108)	HS1BP3 (ENSCSAG00000008096)	RHOB (ENSCSAG00000000379)	PUM2 (ENSCSAG00000008087) #20	SDC1 (ENSCSAG00000008077) #22	LAPTM4A (ENSCSAG00000008071) #23	MATN3 (ENSCSAG00000008064) #24	WDR35 (ENSCSAG00000008051) #25	TTC32 (ENSCSAG00000008028)	OSR1 (ENSCSAG00000008012)	NT5C1B (ENSCSAG00000007999)	RDH14 (ENSCSAG00000007969)	KCNS3 (ENSCSAG00000000378)	MSGN1 (ENSCSAG00000000377)	GEN1 (ENSCSAG00000007952)	SMC6 (ENSCSAG00000007925)	VSNL1 (ENSCSAG00000007914)	RAD51AP2 (ENSCSAG00000007907)	CYRIA (ENSCSAG00000007902)	MYCN (ENSCSAG00000007889)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT01100000264019	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT01100000264019	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT01100000264019	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	542	WDCP (ENSCATG00000030463)	MFSD2B (ENSCATG00000040488)	UBXN2A (ENSCATG00000007176)	ATAD2B (ENSCATG00000035587)	ENSCATG00000036009	KLHL29 (ENSCATG00000037112)	TDRD15 (ENSCATG00000014633)	APOB (ENSCATG00000025709)	LDAH (ENSCATG00000025214)	GDF7 (ENSCATG00000015865)	HS1BP3 (ENSCATG00000038867)	ENSCATG00000037321	RHOB (ENSCATG00000021066)	PUM2 (ENSCATG00000043826) #20	ENSCATG00000041330	SDC1 (ENSCATG00000044796) #22	LAPTM4A (ENSCATG00000036860) #23	MATN3 (ENSCATG00000038685) #24	WDR35 (ENSCATG00000043847) #25	TTC32 (ENSCATG00000043877)	ENSCATG00000035517	ENSCATG00000035076	OSR1 (ENSCATG00000041386)	NT5C1B (ENSCATG00000030226)	RDH14 (ENSCATG00000040055)	KCNS3 (ENSCATG00000019098)	MSGN1 (ENSCATG00000020832)	GEN1 (ENSCATG00000002261)	SMC6 (ENSCATG00000007538)	VSNL1 (ENSCATG00000043748)	RAD51AP2 (ENSCATG00000035523)
Drill	MODERN SPECIES	273									APOB (ENSMLEG00000034887)	LDAH (ENSMLEG00000032951)	GDF7 (ENSMLEG00000030590)	HS1BP3 (ENSMLEG00000036114)	RHOB (ENSMLEG00000014328)	PUM2 (ENSMLEG00000039243) #20	ENSMLEG00000041181	SDC1 (ENSMLEG00000030457) #22	LAPTM4A (ENSMLEG00000011616) #23	MATN3 (ENSMLEG00000028366) #24	WDR35 (ENSMLEG00000042194) #25	TTC32 (ENSMLEG00000034466)	ENSMLEG00000035262	OSR1 (ENSMLEG00000036388)	NT5C1B (ENSMLEG00000032260)	KCNS3 (ENSMLEG00000024480)	MSGN1 (ENSMLEG00000016060)	GEN1 (ENSMLEG00000037009)	SMC6 (ENSMLEG00000038093)	VSNL1 (ENSMLEG00000009493)	RAD51AP2 (ENSMLEG00000032822)	ENSMLEG00000032548	CYRIA (ENSMLEG00000021733)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092.c	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT01100000264019	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	561	FKBP1B (ENSMNEG00000044742)	WDCP (ENSMNEG00000043270)	MFSD2B (ENSMNEG00000042041)	UBXN2A (ENSMNEG00000039344)	ATAD2B (ENSMNEG00000040701)	KLHL29 (ENSMNEG00000040600)	TDRD15 (ENSMNEG00000018389)	APOB (ENSMNEG00000041817)	LDAH (ENSMNEG00000037298)	GDF7 (ENSMNEG00000036625)	HS1BP3 (ENSMNEG00000042432)	ENSMNEG00000035256	RHOB (ENSMNEG00000004093)	PUM2 (ENSMNEG00000039659) #20	ENSMNEG00000031627	SDC1 (ENSMNEG00000037009) #22	LAPTM4A (ENSMNEG00000030721) #23	MATN3 (ENSMNEG00000040055) #24	WDR35 (ENSMNEG00000043506) #25	TTC32 (ENSMNEG00000032654)	ENSMNEG00000000256	ENSMNEG00000040736	OSR1 (ENSMNEG00000024040)	NT5C1B (ENSMNEG00000031824)	RDH14 (ENSMNEG00000042523)	KCNS3 (ENSMNEG00000010748)	MSGN1 (ENSMNEG00000009838)	GEN1 (ENSMNEG00000041505)	SMC6 (ENSMNEG00000037394)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092.c	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT01100000264019	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432	ENSGT00940000153294.m.a.d.e
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	4	UBXN2A (ENSMFAG00000038617)	ATAD2B (ENSMFAG00000045919)	KLHL29 (ENSMFAG00000002617)	ENSMFAG00000064985	ENSMFAG00000051328	ENSMFAG00000060195	APOB (ENSMFAG00000037483)	ENSMFAG00000042760	LDAH (ENSMFAG00000036499)	ENSMFAG00000052727	GDF7 (ENSMFAG00000049809)	HS1BP3 (ENSMFAG00000005189)	RHOB (ENSMFAG00000030406)	PUM2 (ENSMFAG00000000492) #20	ENSMFAG00000043647	ENSMFAG00000064406 #22	LAPTM4A (ENSMFAG00000036772) #23	ENSMFAG00000049571	MATN3 (ENSMFAG00000043379) #24	WDR35 (ENSMFAG00000034406) #25	TTC32 (ENSMFAG00000040343)	OSR1 (ENSMFAG00000039189)	ENSMFAG00000059615	ENSMFAG00000065687	ENSMFAG00000051219	ENSMFAG00000064231	NT5C1B (ENSMFAG00000002988)	KCNS3 (ENSMFAG00000007411)	MSGN1 (ENSMFAG00000007491)	GEN1 (ENSMFAG00000002080)	SMC6 (ENSMFAG00000033284)
Rhesus	MODERN SPECIES	4	WDCP (ENSMMUG00000012340)	MFSD2B (ENSMMUG00000012337)	UBXN2A (ENSMMUG00000006487)	ATAD2B (ENSMMUG00000020952)	ENSMMUG00000055073	KLHL29 (ENSMMUG00000016030)	TDRD15 (ENSMMUG00000048513)	APOB (ENSMMUG00000007692)	ENSMMUG00000056842	LDAH (ENSMMUG00000003355)	ENSMMUG00000055950	GDF7 (ENSMMUG00000050446)	HS1BP3 (ENSMMUG00000022996)	PUM2 (ENSMMUG00000023181) #20	ENSMMUG00000052718	SDC1 (ENSMMUG00000030922) #22	LAPTM4A (ENSMMUG00000001582) #23	MATN3 (ENSMMUG00000001579) #24	WDR35 (ENSMMUG00000001575) #25	TTC32 (ENSMMUG00000001570)	ENSMMUG00000056023	OSR1 (ENSMMUG00000037622)	NT5C1B (ENSMMUG00000014083)	KCNS3 (ENSMMUG00000017198)	MSGN1 (ENSMMUG00000008141)	GEN1 (ENSMMUG00000012058)	SMC6 (ENSMMUG00000012056)	VSNL1 (ENSMMUG00000040529)	RAD51AP2 (ENSMMUG00000058011)	CYRIA (ENSMMUG00000020385)	MYCN (ENSMMUG00000052363)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00550000076422	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00550000076422	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00910000147230 #19	ENSGT00940000164653	ENSGT00910000147240	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Gorilla	MODERN SPECIES	14	MFSD2B (ENSGGOG00000007752)	ENSGGOG00000036282	UBXN2A (ENSGGOG00000002445)	ATAD2B (ENSGGOG00000006027)	KLHL29 (ENSGGOG00000013889)	ENSGGOG00000024059	TDRD15 (ENSGGOG00000026710)	APOB (ENSGGOG00000005179)	LDAH (ENSGGOG00000000226)	GDF7 (ENSGGOG00000000225)	RHOB (ENSGGOG00000042542)	PUM2 (ENSGGOG00000011374) #20	ENSGGOG00000037272 #19	ENSGGOG00000040988	ENSGGOG00000027238	SDC1 (ENSGGOG00000041852) #22	LAPTM4A (ENSGGOG00000027710) #23	MATN3 (ENSGGOG00000009798) #24	WDR35 (ENSGGOG00000009782) #25	TTC32 (ENSGGOG00000009777)	ENSGGOG00000037043	OSR1 (ENSGGOG00000016877)	NT5C1B (ENSGGOG00000014980)	KCNS3 (ENSGGOG00000000972)	MSGN1 (ENSGGOG00000012168)	GEN1 (ENSGGOG00000012157)	SMC6 (ENSGGOG00000003864)	VSNL1 (ENSGGOG00000008280)	RAD51AP2 (ENSGGOG00000004887)	ENSGGOG00000038621	FAM49A (ENSGGOG00000001230)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00550000076422	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00910000147230 #19	ENSGT00940000164653	ENSGT00910000147240	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Human	MODERN SPECIES	11	FAM228B (ENSG00000219626)	SF3B6 (ENSG00000115128)	FKBP1B (ENSG00000119782)	WDCP (ENSG00000163026)	MFSD2B (ENSG00000205639)	UBXN2A (ENSG00000173960)	ATAD2B (ENSG00000119778)	KLHL29 (ENSG00000119771)	TDRD15 (ENSG00000218819)	APOB (ENSG00000084674)	LDAH (ENSG00000118961)	GDF7 (ENSG00000143869)	HS1BP3 (ENSG00000118960)	RHOB (ENSG00000143878)	PUM2 (ENSG00000055917) #20	SDC1 (ENSG00000115884) #22	LAPTM4A (ENSG00000068697) #23	MATN3 (ENSG00000132031) #24	WDR35 (ENSG00000118965) #25	TTC32 (ENSG00000183891)	OSR1 (ENSG00000143867)	NT5C1B (ENSG00000185013)	NT5C1B-RDH14 (ENSG00000250741)	RDH14 (ENSG00000240857)	KCNS3 (ENSG00000170745)	MSGN1 (ENSG00000151379)	GEN1 (ENSG00000178295)	SMC6 (ENSG00000163029)	VSNL1 (ENSG00000163032)	RAD51AP2 (ENSG00000214842)	CYRIA (ENSG00000197872)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00550000076422	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00390000002743.h	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00910000147230 #19	ENSGT00940000164653	ENSGT00910000147240	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00910000147213	ENSGT00940000154445.f.b.b	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Chimpanzee	MODERN SPECIES	14	UBXN2A (ENSPTRG00000011705)	ATAD2B (ENSPTRG00000011702)	KLHL29 (ENSPTRG00000011701)	ENSPTRG00000048960	TDRD15 (ENSPTRG00000024174)	APOB (ENSPTRG00000011699)	LDAH (ENSPTRG00000011698)	GDF7 (ENSPTRG00000011697)	HS1BP3 (ENSPTRG00000011696)	ENSPTRG00000016906	ENSPTRG00000052538	RHOB (ENSPTRG00000046722)	PUM2 (ENSPTRG00000011692) #20	ENSPTRG00000050463	ENSPTRG00000043608	SDC1 (ENSPTRG00000044887) #22	LAPTM4A (ENSPTRG00000011690) #23	MATN3 (ENSPTRG00000011689) #24	WDR35 (ENSPTRG00000011686) #25	TTC32 (ENSPTRG00000011685)	ENSPTRG00000045822	ENSPTRG00000039202	OSR1 (ENSPTRG00000011683)	NT5C1B (ENSPTRG00000011681)	KCNS3 (ENSPTRG00000011680)	MSGN1 (ENSPTRG00000011679)	GEN1 (ENSPTRG00000011678)	SMC6 (ENSPTRG00000011677)	VSNL1 (ENSPTRG00000011675)	RAD51AP2 (ENSPTRG00000034119)	ENSPTRG00000052339
Bonobo	MODERN SPECIES	14	ATAD2B (ENSPPAG00000033306)	KLHL29 (ENSPPAG00000030367)	ENSPPAG00000025710	TDRD15 (ENSPPAG00000032970)	APOB (ENSPPAG00000011975)	LDAH (ENSPPAG00000016359)	ENSPPAG00000041145	HS1BP3 (ENSPPAG00000043977)	ENSPPAG00000008002	ENSPPAG00000029523	RHOB (ENSPPAG00000023187)	ENSPPAG00000039825 #19	PUM2 (ENSPPAG00000023095) #20	ENSPPAG00000039090	ENSPPAG00000037572	SDC1 (ENSPPAG00000037638) #22	LAPTM4A (ENSPPAG00000037069) #23	MATN3 (ENSPPAG00000035472) #24	WDR35 (ENSPPAG00000037901) #25	TTC32 (ENSPPAG00000035271)	ENSPPAG00000034662	OSR1 (ENSPPAG00000032777)	NT5C1B (ENSPPAG00000030956)	ENSPPAG00000033270	KCNS3 (ENSPPAG00000000574)	MSGN1 (ENSPPAG00000033217)	GEN1 (ENSPPAG00000028355)	SMC6 (ENSPPAG00000015508)	VSNL1 (ENSPPAG00000032929)	RAD51AP2 (ENSPPAG00000041865)	ENSPPAG00000027462
Orangutan	MODERN SPECIES	14	SF3B6 (ENSPPYG00000036931)	FKBP1B (ENSPPYG00000012604)	WDCP (ENSPPYG00000012605)	MFSD2B (ENSPPYG00000012606)	UBXN2A (ENSPPYG00000012607)	ATAD2B (ENSPPYG00000012609)	KLHL29 (ENSPPYG00000012610)	ENSPPYG00000012611	TDRD15 (ENSPPYG00000031614)	APOB (ENSPPYG00000012612)	LDAH (ENSPPYG00000037972)	GDF7 (ENSPPYG00000035678)	HS1BP3 (ENSPPYG00000012615)	RHOB (ENSPPYG00000012616)	PUM2 (ENSPPYG00000012617) #20	SDC1 (ENSPPYG00000032047) #22	LAPTM4A (ENSPPYG00000012620) #23	MATN3 (ENSPPYG00000012621) #24	WDR35 (ENSPPYG00000012622) #25	ENSPPYG00000036668	ENSPPYG00000012623	ENSPPYG00000012624	ENSPPYG00000012626	KCNS3 (ENSPPYG00000012627)	MSGN1 (ENSPPYG00000012628)	GEN1 (ENSPPYG00000012629)	SMC6 (ENSPPYG00000012630)	VSNL1 (ENSPPYG00000012631)	RAD51AP2 (ENSPPYG00000012632)	CYRIA (ENSPPYG00000012634)	ENSPPYG00000038333
Gibbon	MODERN SPECIES	9	MFSD2B (ENSNLEG00000000769)	UBXN2A (ENSNLEG00000000751)	ENSNLEG00000033640	ATAD2B (ENSNLEG00000000713)	KLHL29 (ENSNLEG00000000686)	ENSNLEG00000028338	APOB (ENSNLEG00000000598)	LDAH (ENSNLEG00000032022)	GDF7 (ENSNLEG00000002638)	HS1BP3 (ENSNLEG00000002614)	ENSNLEG00000030630	RHOB (ENSNLEG00000030179)	PUM2 (ENSNLEG00000002509) #20	ENSNLEG00000002506 #21	ENSNLEG00000029549	SDC1 (ENSNLEG00000031569) #22	LAPTM4A (ENSNLEG00000002305) #23	MATN3 (ENSNLEG00000002247) #24	WDR35 (ENSNLEG00000002032) #25	TTC32 (ENSNLEG00000030350)	ENSNLEG00000028344	OSR1 (ENSNLEG00000002004)	ENSNLEG00000033627	NT5C1B (ENSNLEG00000001850)	RDH14 (ENSNLEG00000028221)	KCNS3 (ENSNLEG00000001834)	MSGN1 (ENSNLEG00000018810)	GEN1 (ENSNLEG00000029593)	SMC6 (ENSNLEG00000001569)	VSNL1 (ENSNLEG00000001537)	RAD51AP2 (ENSNLEG00000001524)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905.n.a	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Mas night monkey	MODERN SPECIES	950	WDCP (ENSANAG00000025318)	MFSD2B (ENSANAG00000035631)	UBXN2A (ENSANAG00000031177)	ATAD2B (ENSANAG00000024449)	KLHL29 (ENSANAG00000035261)	ENSANAG00000008532	TDRD15 (ENSANAG00000026523)	APOB (ENSANAG00000032282)	ENSANAG00000031943	LDAH (ENSANAG00000022004)	GDF7 (ENSANAG00000035417)	HS1BP3 (ENSANAG00000028913)	RHOB (ENSANAG00000018114)	PUM2 (ENSANAG00000021807) #20	ENSANAG00000019275	SDC1 (ENSANAG00000032410) #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905.n.a	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Marmoset	MODERN SPECIES	5	MFSD2B (ENSCJAG00000007691)	UBXN2A (ENSCJAG00000007665)	ATAD2B (ENSCJAG00000007628)	KLHL29 (ENSCJAG00000007588)	ENSCJAG00000062913	TDRD15 (ENSCJAG00000007582)	ENSCJAG00000043360	APOB (ENSCJAG00000007533)	LDAH (ENSCJAG00000007531)	GDF7 (ENSCJAG00000007529)	HS1BP3 (ENSCJAG00000007517)	ENSCJAG00000022935	RHOB (ENSCJAG00000077207)	ENSCJAG00000086921	PUM2 (ENSCJAG00000007450) #20	SDC1 (ENSCJAG00000039283) #22	ENSCJAG00000071467 #23	MATN3 (ENSCJAG00000007406) #24	WDR35 (ENSCJAG00000007386) #25	TTC32 (ENSCJAG00000065690)	OSR1 (ENSCJAG00000007379)	ENSCJAG00000083040	ENSCJAG00000022933	NT5C1B (ENSCJAG00000007361)	KCNS3 (ENSCJAG00000007354)	MSGN1 (ENSCJAG00000032633)	GEN1 (ENSCJAG00000007327)	SMC6 (ENSCJAG00000007282)	VSNL1 (ENSCJAG00000002578)	RAD51AP2 (ENSCJAG00000007262)	CYRIA (ENSCJAG00000043048)
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00950000182926.b.d.c.a.g.a	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00900000143745	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905.n.a	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Capuchin	MODERN SPECIES	1	SF3B6 (ENSCCAG00000036653)	FKBP1B (ENSCCAG00000003872)	WDCP (ENSCCAG00000035342)	MFSD2B (ENSCCAG00000026318)	UBXN2A (ENSCCAG00000025921)	ENSCCAG00000021209	ENSCCAG00000025817	ATAD2B (ENSCCAG00000031116)	KLHL29 (ENSCCAG00000036850)	APOB (ENSCCAG00000021140)	LDAH (ENSCCAG00000033829)	GDF7 (ENSCCAG00000035529)	HS1BP3 (ENSCCAG00000028038)	RHOB (ENSCCAG00000018485)	PUM2 (ENSCCAG00000037035) #20	SDC1 (ENSCCAG00000031573) #22	ENSCCAG00000019764	LAPTM4A (ENSCCAG00000029231) #23	MATN3 (ENSCCAG00000033118) #24	WDR35 (ENSCCAG00000030486) #25	TTC32 (ENSCCAG00000025284)	OSR1 (ENSCCAG00000029161)	NT5C1B (ENSCCAG00000020565)	RDH14 (ENSCCAG00000027491)	KCNS3 (ENSCCAG00000020195)	MSGN1 (ENSCCAG00000020077)	GEN1 (ENSCCAG00000031121)	SMC6 (ENSCCAG00000027451)	VSNL1 (ENSCCAG00000027421)	RAD51AP2 (ENSCCAG00000024012)	ENSCCAG00000027131
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	113	SF3B6 (ENSSBOG00000002914)	FKBP1B (ENSSBOG00000020385)	ENSSBOG00000029165	MFSD2B (ENSSBOG00000022320)	UBXN2A (ENSSBOG00000023884)	ENSSBOG00000031186	ATAD2B (ENSSBOG00000032583)	KLHL29 (ENSSBOG00000021000)	APOB (ENSSBOG00000008834)	LDAH (ENSSBOG00000031409)	GDF7 (ENSSBOG00000022327)	HS1BP3 (ENSSBOG00000023433)	ENSSBOG00000032320	RHOB (ENSSBOG00000013056)	PUM2 (ENSSBOG00000022007) #20	ENSSBOG00000029288 #22	LAPTM4A (ENSSBOG00000031549) #23	MATN3 (ENSSBOG00000027840) #24	WDR35 (ENSSBOG00000030509) #25	TTC32 (ENSSBOG00000024543)	OSR1 (ENSSBOG00000023175)	ENSSBOG00000023931	NT5C1B (ENSSBOG00000030055)	RDH14 (ENSSBOG00000028443)	KCNS3 (ENSSBOG00000010067)	MSGN1 (ENSSBOG00000010657)	GEN1 (ENSSBOG00000031046)	SMC6 (ENSSBOG00000020240)	VSNL1 (ENSSBOG00000029668)	RAD51AP2 (ENSSBOG00000028552)	CYRIA (ENSSBOG00000025029)
Tarsier	MODERN SPECIES	4807															PUM2 (ENSTSYG00000014463) #20	SDC1 (ENSTSYG00000026443) #22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000183424
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000183424
Mouse lemur	MODERN SPECIES	30	FKBP1B (ENSMICG00000028839)	WDCP (ENSMICG00000001526)	MFSD2B (ENSMICG00000027625)	ENSMICG00000001508	ENSMICG00000043253	ENSMICG00000030239	ATAD2B (ENSMICG00000003489)	KLHL29 (ENSMICG00000032037)	TDRD15 (ENSMICG00000026358)	APOB (ENSMICG00000011331)	LDAH (ENSMICG00000011319)	GDF7 (ENSMICG00000044629)	HS1BP3 (ENSMICG00000027064)	RHOB (ENSMICG00000029771)	PUM2 (ENSMICG00000011647) #20	SDC1 (ENSMICG00000041634) #22	LAPTM4A (ENSMICG00000031395) #23	MATN3 (ENSMICG00000032185) #24	WDR35 (ENSMICG00000037969) #25	ENSMICG00000041804	OSR1 (ENSMICG00000004493)	NT5C1B (ENSMICG00000010847)	RDH14 (ENSMICG00000033814)	ENSMICG00000029479	GEN1 (ENSMICG00000026479)	SMC6 (ENSMICG00000010802)	VSNL1 (ENSMICG00000036354)	RAD51AP2 (ENSMICG00000038023)	CYRIA (ENSMICG00000013924)	MYCN (ENSMICG00000013903)	DDX1 (ENSMICG00000001023)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000183424
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	559									TDRD15 (ENSPCOG00000017764)	APOB (ENSPCOG00000021611)	LDAH (ENSPCOG00000014577)	GDF7 (ENSPCOG00000020938)	HS1BP3 (ENSPCOG00000016428)	RHOB (ENSPCOG00000004927)	PUM2 (ENSPCOG00000019636) #20	SDC1 (ENSPCOG00000024117) #22	LAPTM4A (ENSPCOG00000019008) #23	MATN3 (ENSPCOG00000020678) #24	TTC32 (ENSPCOG00000028173)	ENSPCOG00000015877	OSR1 (ENSPCOG00000024991)	NT5C1B (ENSPCOG00000000264)	RDH14 (ENSPCOG00000023642)	KCNS3 (ENSPCOG00000009392)	GEN1 (ENSPCOG00000022405)	SMC6 (ENSPCOG00000028541)	VSNL1 (ENSPCOG00000003780)	RAD51AP2 (ENSPCOG00000019163)	CYRIA (ENSPCOG00000021268)	MYCN (ENSPCOG00000013382)	DDX1 (ENSPCOG00000028185)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	339				ATAD2B (ENSPSMG00000006746)	ENSPSMG00000006754	KLHL29 (ENSPSMG00000006774)	ENSPSMG00000006781	TDRD15 (ENSPSMG00000006790)	APOB (ENSPSMG00000006849)	LDAH (ENSPSMG00000006874)	ENSPSMG00000006877	GDF7 (ENSPSMG00000006880)	HS1BP3 (ENSPSMG00000006908)	ENSPSMG00000006929	PUM2 (ENSPSMG00000007064) #20	SDC1 (ENSPSMG00000007157) #22	LAPTM4A (ENSPSMG00000007179) #23	MATN3 (ENSPSMG00000007217) #24	WDR35 (ENSPSMG00000007386) #25	TTC32 (ENSPSMG00000007425)	OSR1 (ENSPSMG00000007427)	NT5C1B (ENSPSMG00000007455)	RDH14 (ENSPSMG00000007468)	KCNS3 (ENSPSMG00000007502)	MSGN1 (ENSPSMG00000007507)	GEN1 (ENSPSMG00000007525)	SMC6 (ENSPSMG00000007622)	VSNL1 (ENSPSMG00000007643)	RAD51AP2 (ENSPSMG00000007652)	ENSPSMG00000007660	CYRIA (ENSPSMG00000007716)
Bushbaby	MODERN SPECIES	137	TP53I3 (ENSOGAG00000004470)	SF3B6 (ENSOGAG00000004468)	FKBP1B (ENSOGAG00000029092)	WDCP (ENSOGAG00000002596)	MFSD2B (ENSOGAG00000002595)	UBXN2A (ENSOGAG00000000025)	ATAD2B (ENSOGAG00000004574)	KLHL29 (ENSOGAG00000004572)	TDRD15 (ENSOGAG00000026095)	APOB (ENSOGAG00000015084)	LDAH (ENSOGAG00000000194)	GDF7 (ENSOGAG00000025229)	HS1BP3 (ENSOGAG00000000192)	RHOB (ENSOGAG00000034489)	PUM2 (ENSOGAG00000002187) #20	SDC1 (ENSOGAG00000010183) #22	LAPTM4A (ENSOGAG00000003002) #23	ENSOGAG00000029374	MATN3 (ENSOGAG00000002995) #24	WDR35 (ENSOGAG00000002991) #25	TTC32 (ENSOGAG00000002990)	OSR1 (ENSOGAG00000003047)	NT5C1B (ENSOGAG00000001728)	RDH14 (ENSOGAG00000027061)	KCNS3 (ENSOGAG00000007336)	MSGN1 (ENSOGAG00000012569)	GEN1 (ENSOGAG00000004816)	SMC6 (ENSOGAG00000004809)	VSNL1 (ENSOGAG00000030574)	ENSOGAG00000031508	CYRIA (ENSOGAG00000009218)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Glires	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000017067	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	Wdcp (ENSCGRG00001019012)	Mfsd2b (ENSCGRG00001024664)	Ubxn2a (ENSCGRG00001007449)	Atad2b (ENSCGRG00001016996)	ENSCGRG00001012412	Klhl29 (ENSCGRG00001018377)	ENSCGRG00001024957	ENSCGRG00001024983	Apob (ENSCGRG00001009990)	Gdf7 (ENSCGRG00001002115)	ENSCGRG00001012418	Hs1bp3 (ENSCGRG00001015945)	Rhob (ENSCGRG00001001843)	Slc7a15 (ENSCGRG00001018113)	Pum2 (ENSCGRG00001025023) #20	SDC1 (ENSCGRG00001018173) #22	Laptm4a (ENSCGRG00001021474) #23	Matn3 (ENSCGRG00001025049) #24	Wdr35 (ENSCGRG00001004220) #25	Ttc32 (ENSCGRG00001007763)	Osr1 (ENSCGRG00001009653)	Nt5c1b (ENSCGRG00001016775)	Rdh14 (ENSCGRG00001024177)	ENSCGRG00001006912	Kcns3 (ENSCGRG00001004289)	Msgn1 (ENSCGRG00001003369)	ENSCGRG00001019699	Smc6 (ENSCGRG00001024287)	Vsnl1 (ENSCGRG00001017035)	ENSCGRG00001012128	Cyria (ENSCGRG00001014064)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	705	Fam228a (ENSMAUG00000019010)	Fam228b (ENSMAUG00000017259)	ENSMAUG00000004078	ENSMAUG00000000586	Fkbp1b (ENSMAUG00000016519)	Wdcp (ENSMAUG00000013564)	Ubxn2a (ENSMAUG00000013894)	ENSMAUG00000016676	Klhl29 (ENSMAUG00000015607)	Apob (ENSMAUG00000010835)	Gdf7 (ENSMAUG00000011905)	Hs1bp3 (ENSMAUG00000010929)	Rhob (ENSMAUG00000016245)	Slc7a15 (ENSMAUG00000008328)	Pum2 (ENSMAUG00000000311) #20	Sdc1 (ENSMAUG00000007825) #22	Laptm4a (ENSMAUG00000002092) #23	Matn3 (ENSMAUG00000000731) #24	Wdr35 (ENSMAUG00000017485) #25	Ttc32 (ENSMAUG00000018447)	Osr1 (ENSMAUG00000008188)	Nt5c1b (ENSMAUG00000018395)	Rdh14 (ENSMAUG00000016192)	Kcns3 (ENSMAUG00000017875)	Msgn1 (ENSMAUG00000016000)	Smc6 (ENSMAUG00000016007)	Vsnl1 (ENSMAUG00000014300)	Rad51ap2 (ENSMAUG00000015167)	ENSMAUG00000000527	Cyria (ENSMAUG00000000089)	Mycn (ENSMAUG00000017079)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Prairie vole	MODERN SPECIES	353	Wdcp (ENSMOCG00000013612)	Mfsd2b (ENSMOCG00000012318)	Ubxn2a (ENSMOCG00000020669)	Atad2b (ENSMOCG00000000408)	Klhl29 (ENSMOCG00000007430)	ENSMOCG00000012724	ENSMOCG00000013271	ENSMOCG00000002216	Apob (ENSMOCG00000021753)	Gdf7 (ENSMOCG00000010905)	ENSMOCG00000021323	Hs1bp3 (ENSMOCG00000022226)	Rhob (ENSMOCG00000007966)	Slc7a15 (ENSMOCG00000003687)	Pum2 (ENSMOCG00000013663) #20	Sdc1 (ENSMOCG00000019532) #22	ENSMOCG00000012688	Laptm4a (ENSMOCG00000013181) #23	Matn3 (ENSMOCG00000013872) #24	Wdr35 (ENSMOCG00000001393) #25	Ttc32 (ENSMOCG00000021911)	ENSMOCG00000007598	Osr1 (ENSMOCG00000012793)	ENSMOCG00000013225	Nt5c1b (ENSMOCG00000020580)	Rdh14 (ENSMOCG00000005865)	Kcns3 (ENSMOCG00000007505)	Tacstd2 (ENSMOCG00000008197)	Il23r (ENSMOCG00000010821)	Il12rb2 (ENSMOCG00000022701)	Serbp1 (ENSMOCG00000015573)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	14	Fkbp1b (ENSPEMG00000028047)	Wdcp (ENSPEMG00000011326)	Mfsd2b (ENSPEMG00000014144)	ENSPEMG00000017582	Atad2b (ENSPEMG00000010515)	ENSPEMG00000025296	Klhl29 (ENSPEMG00000012938)	ENSPEMG00000029395	Apob (ENSPEMG00000018913)	ENSPEMG00000019039	Hs1bp3 (ENSPEMG00000001400)	Rhob (ENSPEMG00000013485)	Slc7a15 (ENSPEMG00000009942)	Pum2 (ENSPEMG00000008357) #20	ENSPEMG00000024635	Sdc1 (ENSPEMG00000010998) #22	Laptm4a (ENSPEMG00000015789) #23	Matn3 (ENSPEMG00000017106) #24	Wdr35 (ENSPEMG00000004790) #25	Ttc32 (ENSPEMG00000027871)	Osr1 (ENSPEMG00000008344)	Nt5c1b (ENSPEMG00000013187)	Rdh14 (ENSPEMG00000018416)	ENSPEMG00000000184	ENSPEMG00000025389	Kcns3 (ENSPEMG00000011462)	ENSPEMG00000007987	Msgn1 (ENSPEMG00000007522)	Gen1 (ENSPEMG00000001855)	ENSPEMG00000024461	Vsnl1 (ENSPEMG00000028838)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Mus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Mouse	MODERN SPECIES	3	Pfn4 (ENSMUSG00000020639)	Sf3b6 (ENSMUSG00000037361)	Fkbp1b (ENSMUSG00000020635)	Wdcp (ENSMUSG00000051721)	Mfsd2b (ENSMUSG00000037336)	Ubxn2a (ENSMUSG00000020634)	Atad2b (ENSMUSG00000052812)	Klhl29 (ENSMUSG00000020627)	Apob (ENSMUSG00000020609)	Ldah (ENSMUSG00000037669)	Gdf7 (ENSMUSG00000037660)	Hs1bp3 (ENSMUSG00000020605)	Rhob (ENSMUSG00000054364)	Slc7a15 (ENSMUSG00000020600)	Pum2 (ENSMUSG00000020594) #20	Sdc1 (ENSMUSG00000020592) #22	Laptm4a (ENSMUSG00000020585) #23	Matn3 (ENSMUSG00000020583) #24	Wdr35 (ENSMUSG00000066643) #25	Ttc32 (ENSMUSG00000066637)	Osr1 (ENSMUSG00000048387)	Nt5c1b (ENSMUSG00000020622)	Rdh14 (ENSMUSG00000020621)	Kcns3 (ENSMUSG00000043673)	Msgn1 (ENSMUSG00000047002)	Gen1 (ENSMUSG00000051235)	Smc6 (ENSMUSG00000020608)	Vsnl1 (ENSMUSG00000054459)	Rad51ap2 (ENSMUSG00000086022)	Cyria (ENSMUSG00000020589)	Mycn (ENSMUSG00000037169)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.bb.a
Steppe mouse	MODERN SPECIES	68															Pum2 (ENSMSIG00000004171) #20	Sdc1 (ENSMSIG00000004134) #22	ENSMSIG00000004066 #23	Matn3 (ENSMSIG00000004029) #24	Wdr35 (ENSMSIG00000003728) #25	Ttc32 (ENSMSIG00000003695)	ENSMSIG00000003661
spretus	MODERN SPECIES	3	Pfn4 (MGP_SPRETEiJ_G0018433)	Sf3b6 (MGP_SPRETEiJ_G0018434)	Fkbp1b (MGP_SPRETEiJ_G0018435)	Wdcp (MGP_SPRETEiJ_G0018436)	Mfsd2b (MGP_SPRETEiJ_G0018437)	Ubxn2a (MGP_SPRETEiJ_G0018438)	Atad2b (MGP_SPRETEiJ_G0018439)	Klhl29 (MGP_SPRETEiJ_G0018440)	Apob (MGP_SPRETEiJ_G0018441)	Ldah (MGP_SPRETEiJ_G0018442)	Gdf7 (MGP_SPRETEiJ_G0018443)	Hs1bp3 (MGP_SPRETEiJ_G0018444)	Rhob (MGP_SPRETEiJ_G0018445)	Slc7a15 (MGP_SPRETEiJ_G0018446)	Pum2 (MGP_SPRETEiJ_G0018447) #20	Sdc1 (MGP_SPRETEiJ_G0018448) #22	MGP_SPRETEiJ_G0018449 #23	Matn3 (MGP_SPRETEiJ_G0018450) #24	Wdr35 (MGP_SPRETEiJ_G0018451) #25	Ttc32 (MGP_SPRETEiJ_G0018452)	Osr1 (MGP_SPRETEiJ_G0018453)	Nt5c1b (MGP_SPRETEiJ_G0018454)	Rdh14 (MGP_SPRETEiJ_G0018455)	Kcns3 (MGP_SPRETEiJ_G0018456)	Msgn1 (MGP_SPRETEiJ_G0018457)	Gen1 (MGP_SPRETEiJ_G0018458)	Smc6 (MGP_SPRETEiJ_G0018459)	Vsnl1 (MGP_SPRETEiJ_G0018460)	Rad51ap2 (MGP_SPRETEiJ_G0018461)	Cyria (MGP_SPRETEiJ_G0018462)	Mycn (MGP_SPRETEiJ_G0018463)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	3	Pfn4 (MGP_CAROLIEiJ_G0017589)	Sf3b6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017590)	Fkbp1b (MGP_CAROLIEiJ_G0017591)	Wdcp (MGP_CAROLIEiJ_G0017592)	Mfsd2b (MGP_CAROLIEiJ_G0017593)	MGP_CAROLIEiJ_G0017594	MGP_CAROLIEiJ_G0017595	Klhl29 (MGP_CAROLIEiJ_G0017596)	Apob (MGP_CAROLIEiJ_G0017597)	Ldah (MGP_CAROLIEiJ_G0017598)	Gdf7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017599)	Hs1bp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017600)	Rhob (MGP_CAROLIEiJ_G0017601)	Slc7a15 (MGP_CAROLIEiJ_G0017602)	Pum2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017603) #20	Sdc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017604) #22	MGP_CAROLIEiJ_G0017605 #23	Matn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017606) #24	Wdr35 (MGP_CAROLIEiJ_G0017607) #25	Ttc32 (MGP_CAROLIEiJ_G0017608)	Osr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017609)	Nt5c1b (MGP_CAROLIEiJ_G0017610)	Rdh14 (MGP_CAROLIEiJ_G0017611)	Kcns3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017612)	Vmn1r200 (MGP_CAROLIEiJ_G0017613)	MGP_CAROLIEiJ_G0017614	Msgn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017615)	Gen1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017616)	Smc6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017617)	Vsnl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017618)	Rad51ap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017619)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	20	Pfn4 (MGP_PahariEiJ_G0029347)	Sf3b6 (MGP_PahariEiJ_G0029348)	Fkbp1b (MGP_PahariEiJ_G0029349)	Wdcp (MGP_PahariEiJ_G0029350)	Mfsd2b (MGP_PahariEiJ_G0029351)	Ubxn2a (MGP_PahariEiJ_G0029352)	Atad2b (MGP_PahariEiJ_G0029353)	Klhl29 (MGP_PahariEiJ_G0029354)	Apob (MGP_PahariEiJ_G0029355)	Ldah (MGP_PahariEiJ_G0029356)	Gdf7 (MGP_PahariEiJ_G0029357)	Hs1bp3 (MGP_PahariEiJ_G0029358)	Rhob (MGP_PahariEiJ_G0029359)	Slc7a15 (MGP_PahariEiJ_G0029360)	Pum2 (MGP_PahariEiJ_G0029361) #20	Sdc1 (MGP_PahariEiJ_G0029362) #22	MGP_PahariEiJ_G0029363 #23	Matn3 (MGP_PahariEiJ_G0029364) #24	Wdr35 (MGP_PahariEiJ_G0029365) #25	Ttc32 (MGP_PahariEiJ_G0029366)	Osr1 (MGP_PahariEiJ_G0029367)	Nt5c1b (MGP_PahariEiJ_G0029368)	Rdh14 (MGP_PahariEiJ_G0029369)	Kcns3 (MGP_PahariEiJ_G0029370)	Msgn1 (MGP_PahariEiJ_G0029371)	Gen1 (MGP_PahariEiJ_G0029372)	Smc6 (MGP_PahariEiJ_G0029373)	Vsnl1 (MGP_PahariEiJ_G0029374)	Rad51ap2 (MGP_PahariEiJ_G0029375)	Cyria (MGP_PahariEiJ_G0029376)	Mycn (MGP_PahariEiJ_G0029377)
Rat	MODERN SPECIES	16	Sf3b6 (ENSRNOG00000046172)	Fkbp1b (ENSRNOG00000047143)	Wdcp (ENSRNOG00000049989)	Mfsd2b (ENSRNOG00000023508)	Ubxn2a (ENSRNOG00000068687)	Atad2b (ENSRNOG00000058973)	Klhl29 (ENSRNOG00000005371)	ENSRNOG00000069218	Tdrd15 (ENSRNOG00000060052)	Apob (ENSRNOG00000005542)	Ldah (ENSRNOG00000021475)	Gdf7 (ENSRNOG00000006046)	Hs1bp3 (ENSRNOG00000006062)	Slc7a15 (ENSRNOG00000006119)	Pum2 (ENSRNOG00000006180) #20	Sdc1 (ENSRNOG00000059947) #22	Laptm4a (ENSRNOG00000006865) #23	Matn3 (ENSRNOG00000056141) #24	Wdr35 (ENSRNOG00000028783) #25	Ttc32 (ENSRNOG00000049088)	Osr1 (ENSRNOG00000004210)	Nt5c1b (ENSRNOG00000004296)	Rdh14 (ENSRNOG00000039551)	Kcns3 (ENSRNOG00000004899)	Msgn1 (ENSRNOG00000028518)	Gen1 (ENSRNOG00000004667)	Smc6 (ENSRNOG00000004908)	Vsnl1 (ENSRNOG00000005345)	Rad51ap2 (ENSRNOG00000049271)	AABR07072562.1 (ENSRNOG00000050653)	Cyria (ENSRNOG00000052758)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1858														ENSNGAG00000015046	ENSNGAG00000016665 #20	Sdc1 (ENSNGAG00000010323) #22	Laptm4a (ENSNGAG00000019118) #23	Matn3 (ENSNGAG00000000368) #24	Wdr35 (ENSNGAG00000020320) #25	Ttc32 (ENSNGAG00000011876)	Osr1 (ENSNGAG00000009668)	Nt5c1b (ENSNGAG00000014021)	Rdh14 (ENSNGAG00000001843)	ENSNGAG00000015754	Kcns3 (ENSNGAG00000015414)	Msgn1 (ENSNGAG00000014536)	Smc6 (ENSNGAG00000018825)	Vsnl1 (ENSNGAG00000012638)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	106	Ubxn2a (ENSJJAG00000016225)	ENSJJAG00000017291	ENSJJAG00000018968	ENSJJAG00000022603	ENSJJAG00000014110	Klhl29 (ENSJJAG00000023008)	ENSJJAG00000003145	ENSJJAG00000004727	ENSJJAG00000007009	Ldah (ENSJJAG00000015888)	Gdf7 (ENSJJAG00000016441)	ENSJJAG00000017439	Rhob (ENSJJAG00000013877)	ENSJJAG00000017909	Pum2 (ENSJJAG00000020969) #20	Sdc1 (ENSJJAG00000021653) #22	Laptm4a (ENSJJAG00000000101) #23	Matn3 (ENSJJAG00000000252) #24	Wdr35 (ENSJJAG00000016508) #25	Ttc32 (ENSJJAG00000022107)	ENSJJAG00000014132	Osr1 (ENSJJAG00000022508)	Nt5c1b (ENSJJAG00000021950)	Rdh14 (ENSJJAG00000023561)	Kcns3 (ENSJJAG00000001486)	Msgn1 (ENSJJAG00000006273)	Smc6 (ENSJJAG00000010160)	Vsnl1 (ENSJJAG00000011824)	ENSJJAG00000014268	ENSJJAG00000013620	Cyria (ENSJJAG00000007480)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	339	ENSDORG00000009773	ENSDORG00000009772	Fkbp1b (ENSDORG00000025103)	Wdcp (ENSDORG00000009768)	Mfsd2b (ENSDORG00000015943)	Ubxn2a (ENSDORG00000025740)	ENSDORG00000027743	Klhl29 (ENSDORG00000012917)	Apob (ENSDORG00000028395)	Ldah (ENSDORG00000010281)	Gdf7 (ENSDORG00000010280)	Hs1bp3 (ENSDORG00000005361)	Rhob (ENSDORG00000016173)	ENSDORG00000027569	Pum2 (ENSDORG00000011453) #20	Sdc1 (ENSDORG00000014605) #22	Laptm4a (ENSDORG00000014089) #23	Matn3 (ENSDORG00000014087) #24	Wdr35 (ENSDORG00000014086) #25	Ttc32 (ENSDORG00000029568)	Osr1 (ENSDORG00000000798)	Nt5c1b (ENSDORG00000012516)	Rdh14 (ENSDORG00000019712)	Kcns3 (ENSDORG00000024097)	Msgn1 (ENSDORG00000003509)	Gen1 (ENSDORG00000010754)	Smc6 (ENSDORG00000010753)	Vsnl1 (ENSDORG00000024043)	ENSDORG00000026713	Cyria (ENSDORG00000010274)	Mycn (ENSDORG00000009906)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.cb
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.h.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Guinea pig	MODERN SPECIES	18	FAM228B (ENSCPOG00000030306)	PFN4 (ENSCPOG00000009683)	SF3B6 (ENSCPOG00000008016)	FKBP1B (ENSCPOG00000039379)	WDCP (ENSCPOG00000019263)	MFSD2B (ENSCPOG00000022662)	UBXN2A (ENSCPOG00000038294)	ATAD2B (ENSCPOG00000014176)	KLHL29 (ENSCPOG00000014174)	APOB (ENSCPOG00000004931)	LDAH (ENSCPOG00000012586)	HS1BP3 (ENSCPOG00000000278)	ENSCPOG00000037907	PUM2 (ENSCPOG00000031996) #20	ENSCPOG00000007075	SDC1 (ENSCPOG00000008875) #22	LAPTM4A (ENSCPOG00000009690) #23	MATN3 (ENSCPOG00000004739) #24	WDR35 (ENSCPOG00000007053) #25	TTC32 (ENSCPOG00000033658)	OSR1 (ENSCPOG00000002025)	NT5C1B (ENSCPOG00000012761)	RDH14 (ENSCPOG00000022651)	KCNS3 (ENSCPOG00000009232)	MSGN1 (ENSCPOG00000003061)	GEN1 (ENSCPOG00000033894)	SMC6 (ENSCPOG00000014752)	VSNL1 (ENSCPOG00000030283)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000017067	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	176	FAM228B (ENSCLAG00000004984)	PFN4 (ENSCLAG00000004618)	SF3B6 (ENSCLAG00000014512)	FKBP1B (ENSCLAG00000011181)	WDCP (ENSCLAG00000008275)	MFSD2B (ENSCLAG00000014189)	UBXN2A (ENSCLAG00000014610)	ATAD2B (ENSCLAG00000005215)	KLHL29 (ENSCLAG00000005598)	APOB (ENSCLAG00000008056)	LDAH (ENSCLAG00000011308)	HS1BP3 (ENSCLAG00000008832)	RHOB (ENSCLAG00000017801)	ENSCLAG00000005814	PUM2 (ENSCLAG00000006048) #20	SDC1 (ENSCLAG00000007345) #22	LAPTM4A (ENSCLAG00000006983) #23	MATN3 (ENSCLAG00000006019) #24	WDR35 (ENSCLAG00000007929) #25	TTC32 (ENSCLAG00000009839)	OSR1 (ENSCLAG00000009423)	NT5C1B (ENSCLAG00000008659)	RDH14 (ENSCLAG00000009341)	KCNS3 (ENSCLAG00000013937)	MSGN1 (ENSCLAG00000015119)	GEN1 (ENSCLAG00000008865)	SMC6 (ENSCLAG00000012919)	VSNL1 (ENSCLAG00000011222)	ENSCLAG00000013272
Degu	MODERN SPECIES	60	ENSODEG00000009834	ENSODEG00000008786	KLHL29 (ENSODEG00000009928)	ENSODEG00000007428	ENSODEG00000019450	ENSODEG00000007994	ENSODEG00000019494	APOB (ENSODEG00000008337)	ENSODEG00000008523	GDF7 (ENSODEG00000008847)	HS1BP3 (ENSODEG00000010003)	RHOB (ENSODEG00000019841)	ENSODEG00000010362	PUM2 (ENSODEG00000007823) #20	ENSODEG00000008774	SDC1 (ENSODEG00000010758) #22	LAPTM4A (ENSODEG00000008579) #23	MATN3 (ENSODEG00000008451) #24	WDR35 (ENSODEG00000012693) #25	TTC32 (ENSODEG00000009280)	OSR1 (ENSODEG00000008728)	NT5C1B (ENSODEG00000008929)	RDH14 (ENSODEG00000008458)	KCNS3 (ENSODEG00000009066)	ENSODEG00000019755	MSGN1 (ENSODEG00000009615)	GEN1 (ENSODEG00000010156)	SMC6 (ENSODEG00000008987)	VSNL1 (ENSODEG00000008555)	ENSODEG00000008159	SLC10A4 (ENSODEG00000010331)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.cb
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a.u.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.cb
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.g	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a.u.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.cb
Squirrel	MODERN SPECIES	93	WDCP (ENSSTOG00000032257)	MFSD2B (ENSSTOG00000003123)	UBXN2A (ENSSTOG00000030412)	ATAD2B (ENSSTOG00000021066)	KLHL29 (ENSSTOG00000008403)	ENSSTOG00000033132 #23	TDRD15 (ENSSTOG00000027567)	APOB (ENSSTOG00000027598)	LDAH (ENSSTOG00000026882)	GDF7 (ENSSTOG00000027110)	HS1BP3 (ENSSTOG00000004973)	ENSSTOG00000014644	ENSSTOG00000023326	PUM2 (ENSSTOG00000006262) #20	ENSSTOG00000033291	SDC1 (ENSSTOG00000028519) #22	ENSSTOG00000007214 #23	MATN3 (ENSSTOG00000019530) #24	WDR35 (ENSSTOG00000007151) #25	TTC32 (ENSSTOG00000007140)	OSR1 (ENSSTOG00000015454)	NT5C1B (ENSSTOG00000014834)	RDH14 (ENSSTOG00000021114)	KCNS3 (ENSSTOG00000012420)	MSGN1 (ENSSTOG00000013981)	GEN1 (ENSSTOG00000013963)	SMC6 (ENSSTOG00000013946)	VSNL1 (ENSSTOG00000010438)	ENSSTOG00000025212	CYRIA (ENSSTOG00000022187)	MYCN (ENSSTOG00000012252)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES		UBXN2A (ENSUPAG00010008734)	ATAD2B (ENSUPAG00010008759)	KLHL29 (ENSUPAG00010008812)	ENSUPAG00010008883	TDRD15 (ENSUPAG00010008953)	APOB (ENSUPAG00010008961)	LDAH (ENSUPAG00010009007)	ENSUPAG00010009042	ENSUPAG00010009055	HS1BP3 (ENSUPAG00010009063)	RHOB (ENSUPAG00010009084)	ENSUPAG00010009092	PUM2 (ENSUPAG00010009123) #20	ENSUPAG00010009301	ENSUPAG00010009303	SDC1 (ENSUPAG00010009310) #22	LAPTM4A (ENSUPAG00010009333) #23	MATN3 (ENSUPAG00010009339) #24	WDR35 (ENSUPAG00010009354) #25	TTC32 (ENSUPAG00010009436)	OSR1 (ENSUPAG00010009451)	ENSUPAG00010009474	RDH14 (ENSUPAG00010009546)	MSGN1 (ENSUPAG00010009556)	GEN1 (ENSUPAG00010009557)	SMC6 (ENSUPAG00010009564)	VSNL1 (ENSUPAG00010009655)	RAD51AP2 (ENSUPAG00010009663)	CYRIA (ENSUPAG00010009668)	MYCN (ENSUPAG00010009702)	ENSUPAG00010009708
Alpin marmot	MODERN SPECIES	6	FKBP1B (ENSMMMG00000021830)	WDCP (ENSMMMG00000021855)	MFSD2B (ENSMMMG00000021873)	ENSMMMG00000021893	ATAD2B (ENSMMMG00000021898)	KLHL29 (ENSMMMG00000022005)	TDRD15 (ENSMMMG00000022048)	ENSMMMG00000022049	ENSMMMG00000022059	LDAH (ENSMMMG00000022060)	HS1BP3 (ENSMMMG00000022083)	RHOB (ENSMMMG00000022086)	ENSMMMG00000022089	PUM2 (ENSMMMG00000022116) #20	ENSMMMG00000022129	SDC1 (ENSMMMG00000022131) #22	LAPTM4A (ENSMMMG00000022160) #23	MATN3 (ENSMMMG00000022186) #24	WDR35 (ENSMMMG00000022195) #25	TTC32 (ENSMMMG00000022212)	OSR1 (ENSMMMG00000022239)	ENSMMMG00000022251	RDH14 (ENSMMMG00000022280)	KCNS3 (ENSMMMG00000022292)	MSGN1 (ENSMMMG00000022303)	GEN1 (ENSMMMG00000022304)	SMC6 (ENSMMMG00000022309)	VSNL1 (ENSMMMG00000022330)	RAD51AP2 (ENSMMMG00000022347)	CYRIA (ENSMMMG00000022371)	ENSMMMG00000022385
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	5	ENSSVLG00005023387	FKBP1B (ENSSVLG00005023436)	WDCP (ENSSVLG00005023512)	MFSD2B (ENSSVLG00005023554)	ENSSVLG00005023695	ATAD2B (ENSSVLG00005023756)	KLHL29 (ENSSVLG00005023916)	TDRD15 (ENSSVLG00005023954)	APOB (ENSSVLG00005023994)	LDAH (ENSSVLG00005024216)	GDF7 (ENSSVLG00005024288)	HS1BP3 (ENSSVLG00005024304)	RHOB (ENSSVLG00005024328)	ENSSVLG00005024370	ENSSVLG00005024506 #20	SDC1 (ENSSVLG00005024647) #22	LAPTM4A (ENSSVLG00005024670) #23	MATN3 (ENSSVLG00005024711) #24	WDR35 (ENSSVLG00005024826) #25	TTC32 (ENSSVLG00005024889)	OSR1 (ENSSVLG00005024914)	NT5C1B (ENSSVLG00005025002)	RDH14 (ENSSVLG00005025062)	ENSSVLG00005025079	KCNS3 (ENSSVLG00005025089)	MSGN1 (ENSSVLG00005025107)	GEN1 (ENSSVLG00005025123)	SMC6 (ENSSVLG00005025164)	VSNL1 (ENSSVLG00005025182)	RAD51AP2 (ENSSVLG00005025196)	ENSSVLG00005025209
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a.h.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Rabbit	MODERN SPECIES	11	FKBP1B (ENSOCUG00000037720)	WDCP (ENSOCUG00000012562)	ENSOCUG00000008793	UBXN2A (ENSOCUG00000008783)	ATAD2B (ENSOCUG00000005723)	KLHL29 (ENSOCUG00000017372)	TDRD15 (ENSOCUG00000005346)	APOB (ENSOCUG00000005329)	LDAH (ENSOCUG00000015795)	GDF7 (ENSOCUG00000026956)	HS1BP3 (ENSOCUG00000015781)	RHOB (ENSOCUG00000032265)	ENSOCUG00000025149	PUM2 (ENSOCUG00000017908) #20	ENSOCUG00000032467	SDC1 (ENSOCUG00000025956) #22	LAPTM4A (ENSOCUG00000026699) #23	MATN3 (ENSOCUG00000021257) #24	WDR35 (ENSOCUG00000013185) #25	TTC32 (ENSOCUG00000003731)	ENSOCUG00000034308	OSR1 (ENSOCUG00000006091)	NT5C1B (ENSOCUG00000026238)	RDH14 (ENSOCUG00000025332)	KCNS3 (ENSOCUG00000007365)	MSGN1 (ENSOCUG00000000309)	GEN1 (ENSOCUG00000027255)	ENSOCUG00000034282	ENSOCUG00000017307	VSNL1 (ENSOCUG00000026184)	RAD51AP2 (ENSOCUG00000027767)
Pika	MODERN SPECIES	432															PUM2 (ENSOPRG00000001963) #20	SDC1 (ENSOPRG00000001946) #22
Tree shrew	MODERN SPECIES	637														PUM2 (ENSTBEG00000008729) #20	ENSTBEG00000008106	SDC1 (ENSTBEG00000007662) #22
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000161171 #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	1765																SDC1 (ENSEEUG00000012508) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000017067	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000017067	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Beluga whale	MODERN SPECIES	37	TP53I3 (ENSDLEG00000003236)	SF3B6 (ENSDLEG00000003252)	FKBP1B (ENSDLEG00000003261)	WDCP (ENSDLEG00000003277)	MFSD2B (ENSDLEG00000003286)	UBXN2A (ENSDLEG00000003355)	ENSDLEG00000003368	ENSDLEG00000003376	KLHL29 (ENSDLEG00000003396)	APOB (ENSDLEG00000003485)	LDAH (ENSDLEG00000003656)	GDF7 (ENSDLEG00000003664)	HS1BP3 (ENSDLEG00000003696)	RHOB (ENSDLEG00000003706)	PUM2 (ENSDLEG00000003713) #20	SDC1 (ENSDLEG00000003726) #22	LAPTM4A (ENSDLEG00000003732) #23	MATN3 (ENSDLEG00000003741) #24	WDR35 (ENSDLEG00000003761) #25	TTC32 (ENSDLEG00000003795)	ENSDLEG00000003800	OSR1 (ENSDLEG00000003804)	NT5C1B (ENSDLEG00000003811)	RDH14 (ENSDLEG00000003827)	KCNS3 (ENSDLEG00000003837)	MSGN1 (ENSDLEG00000003842)	GEN1 (ENSDLEG00000003850)	SMC6 (ENSDLEG00000003874)	VSNL1 (ENSDLEG00000003903)	RAD51AP2 (ENSDLEG00000003910)	FAM49A (ENSDLEG00000003918)
Narwhal	MODERN SPECIES	305	PFN4 (ENSMMNG00015008611)	TP53I3 (ENSMMNG00015008625)	SF3B6 (ENSMMNG00015008636)	FKBP1B (ENSMMNG00015008655)	WDCP (ENSMMNG00015008672)	MFSD2B (ENSMMNG00015008694)	UBXN2A (ENSMMNG00015008718)	ATAD2B (ENSMMNG00015008735)	KLHL29 (ENSMMNG00015008756)	APOB (ENSMMNG00015008780)	LDAH (ENSMMNG00015008820)	GDF7 (ENSMMNG00015008839)	HS1BP3 (ENSMMNG00015008848)	RHOB (ENSMMNG00015008862)	PUM2 (ENSMMNG00015008879) #20	SDC1 (ENSMMNG00015005397) #22	LAPTM4A (ENSMMNG00015005414) #23	MATN3 (ENSMMNG00015005436) #24	WDR35 (ENSMMNG00015005480) #25	TTC32 (ENSMMNG00015005504)	OSR1 (ENSMMNG00015005525)	NT5C1B (ENSMMNG00015005540)	RDH14 (ENSMMNG00015005575)	KCNS3 (ENSMMNG00015005585)	MSGN1 (ENSMMNG00015005600)	GEN1 (ENSMMNG00015005619)	SMC6 (ENSMMNG00015005666)	VSNL1 (ENSMMNG00015005727)	RAD51AP2 (ENSMMNG00015005739)	CYRIA (ENSMMNG00015005774)	ENSMMNG00015005789
Vaquita	MODERN SPECIES	4	FAM228B (ENSPSNG00000006789)	TP53I3 (ENSPSNG00000006747)	SF3B6 (ENSPSNG00000006711)	FKBP1B (ENSPSNG00000006673)	WDCP (ENSPSNG00000006641)	MFSD2B (ENSPSNG00000006537)	UBXN2A (ENSPSNG00000006489)	ATAD2B (ENSPSNG00000006447)	KLHL29 (ENSPSNG00000006365)	APOB (ENSPSNG00000006093)	LDAH (ENSPSNG00000005977)	GDF7 (ENSPSNG00000005912)	HS1BP3 (ENSPSNG00000005889)	RHOB (ENSPSNG00000005853)	PUM2 (ENSPSNG00000005720) #20	SDC1 (ENSPSNG00000005664) #22	LAPTM4A (ENSPSNG00000005648) #23	MATN3 (ENSPSNG00000005606) #24	WDR35 (ENSPSNG00000005538) #25	TTC32 (ENSPSNG00000005497)	OSR1 (ENSPSNG00000005478)	NT5C1B (ENSPSNG00000005430)	RDH14 (ENSPSNG00000005407)	KCNS3 (ENSPSNG00000005395)	MSGN1 (ENSPSNG00000005383)	GEN1 (ENSPSNG00000005368)	SMC6 (ENSPSNG00000005297)	VSNL1 (ENSPSNG00000005265)	RAD51AP2 (ENSPSNG00000005244)	CYRIA (ENSPSNG00000005208)	ENSPSNG00000005190
Dolphin	MODERN SPECIES	4592															PUM2 (ENSTTRG00000004887) #20	SDC1 (ENSTTRG00000004870) #22
Sperm whale	MODERN SPECIES	1172																SDC1 (ENSPCTG00005018750) #22
Blue whale	MODERN SPECIES	4	FKBP1B (ENSBMSG00010013149)	WDCP (ENSBMSG00010013158)	MFSD2B (ENSBMSG00010013171)	UBXN2A (ENSBMSG00010013209)	ENSBMSG00010013222	ATAD2B (ENSBMSG00010013251)	KLHL29 (ENSBMSG00010013307)	ENSBMSG00010013332	ENSBMSG00010013370	LDAH (ENSBMSG00010013418)	GDF7 (ENSBMSG00010013453)	HS1BP3 (ENSBMSG00010013470)	RHOB (ENSBMSG00010013496)	PUM2 (ENSBMSG00010013534) #20	ENSBMSG00010013651	SDC1 (ENSBMSG00010013669) #22	LAPTM4A (ENSBMSG00010013698) #23	MATN3 (ENSBMSG00010013735) #24	WDR35 (ENSBMSG00010013819) #25	TTC32 (ENSBMSG00010014051)	OSR1 (ENSBMSG00010014098)	NT5C1B (ENSBMSG00010014150)	RDH14 (ENSBMSG00010014286)	KCNS3 (ENSBMSG00010014305)	MSGN1 (ENSBMSG00010014319)	ENSBMSG00010014350	SMC6 (ENSBMSG00010014555)	ENSBMSG00010014894	VSNL1 (ENSBMSG00010014927)	CYRIA (ENSBMSG00010015112)	MYCN (ENSBMSG00010015182)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00930000152728.b.b	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT01010000230154	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00930000152728.b.b	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT01010000230154	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00930000152728.b.b	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT01010000230154	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00930000152728.b.b	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a.b	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181.e	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
American bison	MODERN SPECIES	3068	FKBP1B (ENSBBBG00000004715)	WDCP (ENSBBBG00000018782)	MFSD2B (ENSBBBG00000004782)	UBXN2A (ENSBBBG00000018929)	ATAD2B (ENSBBBG00000018952)	KLHL29 (ENSBBBG00000019026)	ENSBBBG00000004864	ENSBBBG00000004865	TDRD15 (ENSBBBG00000004866)	APOB (ENSBBBG00000019104)	LDAH (ENSBBBG00000019145)	HS1BP3 (ENSBBBG00000019208)	RHOB (ENSBBBG00000019223)	ENSBBBG00000019228	PUM2 (ENSBBBG00000019297) #20	SDC1 (ENSBBBG00000009171) #22	LAPTM4A (ENSBBBG00000007183) #23	MATN3 (ENSBBBG00000019335) #24	WDR35 (ENSBBBG00000007319) #25	TTC32 (ENSBBBG00000006785)	OSR1 (ENSBBBG00000019430)	NT5C1B (ENSBBBG00000009192)	ENSBBBG00000019450	KCNS3 (ENSBBBG00000019452)	MSGN1 (ENSBBBG00000005230)	GEN1 (ENSBBBG00000005250)	SMC6 (ENSBBBG00000019549)	VSNL1 (ENSBBBG00000005304)	RAD51AP2 (ENSBBBG00000005308)
Bos	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00930000152728.b.b	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a.b	ENSGT01030000234916.g.a	ENSGT00550000074784.a.b	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181.e	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00930000152728.b.b	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a.b	ENSGT00550000074784.a.b	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181.e	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Wild yak	MODERN SPECIES	752	MFSD2B (ENSBMUG00000006096)	UBXN2A (ENSBMUG00000006075)	ATAD2B (ENSBMUG00000006045)	KLHL29 (ENSBMUG00000005980)	ENSBMUG00000005963	ENSBMUG00000005951	ENSBMUG00000005946	ENSBMUG00000005934	TDRD15 (ENSBMUG00000005920)	APOB (ENSBMUG00000005903)	LDAH (ENSBMUG00000005822)	HS1BP3 (ENSBMUG00000005770)	RHOB (ENSBMUG00000005721)	ENSBMUG00000005710	PUM2 (ENSBMUG00000005650) #20	SDC1 (ENSBMUG00000005608) #22	LAPTM4A (ENSBMUG00000005607) #23	MATN3 (ENSBMUG00000005603) #24	WDR35 (ENSBMUG00000005571) #25	ENSBMUG00000005524	OSR1 (ENSBMUG00000005507)	NT5C1B (ENSBMUG00000005486)
Domestic yak	MODERN SPECIES	28	WDCP (ENSBGRG00000019427)	MFSD2B (ENSBGRG00000019458)	UBXN2A (ENSBGRG00000019653)	ATAD2B (ENSBGRG00000019718)	KLHL29 (ENSBGRG00000019818)	ENSBGRG00000019916	TDRD15 (ENSBGRG00000019929)	ENSBGRG00000019965	LDAH (ENSBGRG00000020053)	GDF7 (ENSBGRG00000020284)	HS1BP3 (ENSBGRG00000020332)	RHOB (ENSBGRG00000020410)	ENSBGRG00000020423	ENSBGRG00000020441	PUM2 (ENSBGRG00000020491) #20	SDC1 (ENSBGRG00000020622) #22	MATN3 (ENSBGRG00000020733) #24	WDR35 (ENSBGRG00000020967) #25	TTC32 (ENSBGRG00000021780)	ENSBGRG00000021825	OSR1 (ENSBGRG00000021840)	NT5C1B (ENSBGRG00000021877)	ENSBGRG00000021977	KCNS3 (ENSBGRG00000022008)	MSGN1 (ENSBGRG00000022021)	GEN1 (ENSBGRG00000022034)	SMC6 (ENSBGRG00000022073)	VSNL1 (ENSBGRG00000022276)	RAD51AP2 (ENSBGRG00000022307)	CYRIA (ENSBGRG00000022323)	ENSBGRG00000022487
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a.b	ENSGT01030000234916.g.a.a	ENSGT00550000074784.a.b	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b.b	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181.e	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
Cow	MODERN SPECIES	2	WDCP (ENSBTAG00000016987)	MFSD2B (ENSBTAG00000002034)	UBXN2A (ENSBTAG00000002033)	ATAD2B (ENSBTAG00000017255)	KLHL29 (ENSBTAG00000021969)	ENSBTAG00000004565	ENSBTAG00000054991	ENSBTAG00000030834	TDRD15 (ENSBTAG00000051889)	APOB (ENSBTAG00000008505)	LDAH (ENSBTAG00000031014)	GDF7 (ENSBTAG00000038224)	HS1BP3 (ENSBTAG00000015490)	ENSBTAG00000049117	PUM2 (ENSBTAG00000011155) #20	SDC1 (ENSBTAG00000011154) #22	LAPTM4A (ENSBTAG00000020894) #23	ENSBTAG00000052052	MATN3 (ENSBTAG00000020893) #24	WDR35 (ENSBTAG00000051164) #25	TTC32 (ENSBTAG00000015587)	OSR1 (ENSBTAG00000008113)	NT5C1B (ENSBTAG00000005270)	RDH14 (ENSBTAG00000023928)	MSGN1 (ENSBTAG00000039113)	GEN1 (ENSBTAG00000020059)	SMC6 (ENSBTAG00000018256)	VSNL1 (ENSBTAG00000017158)	RAD51AP2 (ENSBTAG00000037812)	CYRIA (ENSBTAG00000012779)	MYCN (ENSBTAG00000023372)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	2	ATAD2B (ENSBIXG00005026503)	ENSBIXG00005026418	KLHL29 (ENSBIXG00005004508)	ENSBIXG00005026267	ENSBIXG00005026241	ENSBIXG00005005602	ENSBIXG00005026182	TDRD15 (ENSBIXG00005026149)	APOB (ENSBIXG00005006700)	LDAH (ENSBIXG00005026010)	GDF7 (ENSBIXG00005025857)	HS1BP3 (ENSBIXG00005025838)	RHOB (ENSBIXG00005004398)	ENSBIXG00005025762	PUM2 (ENSBIXG00005004375) #20	SDC1 (ENSBIXG00005004335) #22	LAPTM4A (ENSBIXG00005025436) #23	ENSBIXG00005025414	MATN3 (ENSBIXG00005006070) #24	WDR35 (ENSBIXG00005025304) #25	TTC32 (ENSBIXG00005025110)	ENSBIXG00005025042	NT5C1B (ENSBIXG00005025000)	RDH14 (ENSBIXG00005024953)	KCNS3 (ENSBIXG00005024916)	MSGN1 (ENSBIXG00005024894)	GEN1 (ENSBIXG00005024882)	SMC6 (ENSBIXG00005004235)	VSNL1 (ENSBIXG00005024708)	RAD51AP2 (ENSBIXG00005024673)	CYRIA (ENSBIXG00005024640)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00930000152728.b.b	ENSGT00950000183014.f.a.h.u.a.a.a	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT01010000230154	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Goat	MODERN SPECIES	2	MFSD2B (ENSCHIG00000015093)	UBXN2A (ENSCHIG00000008772)	ATAD2B (ENSCHIG00000016699)	KLHL29 (ENSCHIG00000021081)	ENSCHIG00000013040	TDRD15 (ENSCHIG00000024751)	APOB (ENSCHIG00000016651)	LDAH (ENSCHIG00000013047)	ENSCHIG00000024630	GDF7 (ENSCHIG00000011381)	HS1BP3 (ENSCHIG00000026302)	RHOB (ENSCHIG00000012713)	ENSCHIG00000018368	PUM2 (ENSCHIG00000022180) #20	ENSCHIG00000025915	SDC1 (ENSCHIG00000018782) #22	LAPTM4A (ENSCHIG00000022265) #23	MATN3 (ENSCHIG00000018061) #24	WDR35 (ENSCHIG00000006588) #25	TTC32 (ENSCHIG00000025091)	OSR1 (ENSCHIG00000020202)	NT5C1B (ENSCHIG00000026605)	ENSCHIG00000027201	KCNS3 (ENSCHIG00000012986)	MSGN1 (ENSCHIG00000010365)	GEN1 (ENSCHIG00000013888)	SMC6 (ENSCHIG00000010144)	VSNL1 (ENSCHIG00000006913)	CYRIA (ENSCHIG00000018672)	MYCN (ENSCHIG00000017882)	DDX1 (ENSCHIG00000011046)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	MFSD2B (ENSOARG00020019757)	UBXN2A (ENSOARG00020019662)	ENSOARG00020019629	ATAD2B (ENSOARG00020019344)	KLHL29 (ENSOARG00020019264)	ENSOARG00020019210	ENSOARG00020019194	TDRD15 (ENSOARG00020019143)	ENSOARG00020018981	ENSOARG00020018924	LDAH (ENSOARG00020018657)	GDF7 (ENSOARG00020018622)	HS1BP3 (ENSOARG00020018571)	RHOB (ENSOARG00020018495)	PUM2 (ENSOARG00020018298) #20	SDC1 (ENSOARG00020018247) #22	LAPTM4A (ENSOARG00020018198) #23	MATN3 (ENSOARG00020018018) #24	WDR35 (ENSOARG00020017694) #25	TTC32 (ENSOARG00020017652)	OSR1 (ENSOARG00020017609)	NT5C1B (ENSOARG00020017529)	RDH14 (ENSOARG00020017495)	KCNS3 (ENSOARG00020017454)	MSGN1 (ENSOARG00020017429)	SMC6 (ENSOARG00020016887)	VSNL1 (ENSOARG00020016837)	RAD51AP2 (ENSOARG00020016789)	FAM49A (ENSOARG00020016491)	ENSOARG00020016447	DDX1 (ENSOARG00020016090)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	239						ENSMMSG00000003169	TDRD15 (ENSMMSG00000003160)	APOB (ENSMMSG00000003055)	ENSMMSG00000003002	ENSMMSG00000002886	GDF7 (ENSMMSG00000002860)	HS1BP3 (ENSMMSG00000002840)	RHOB (ENSMMSG00000002823)	ENSMMSG00000002810	PUM2 (ENSMMSG00000002715) #20	SDC1 (ENSMMSG00000002684) #22	ENSMMSG00000002671	LAPTM4A (ENSMMSG00000002657) #23	MATN3 (ENSMMSG00000002615) #24	ENSMMSG00000002584	WDR35 (ENSMMSG00000002532) #25	TTC32 (ENSMMSG00000002503)	OSR1 (ENSMMSG00000002491)	NT5C1B (ENSMMSG00000002465)	RDH14 (ENSMMSG00000002449)	KCNS3 (ENSMMSG00000002436)	MSGN1 (ENSMMSG00000002419)	GEN1 (ENSMMSG00000002401)	SMC6 (ENSMMSG00000002375)	VSNL1 (ENSMMSG00000002354)	ENSMMSG00000002335
Yarkand deer	MODERN SPECIES	2	WDCP (ENSCHYG00000016368)	MFSD2B (ENSCHYG00000016413)	ENSCHYG00000016517	ATAD2B (ENSCHYG00000016580)	KLHL29 (ENSCHYG00000017090)	ENSCHYG00000017476	TDRD15 (ENSCHYG00000017505)	APOB (ENSCHYG00000017558)	LDAH (ENSCHYG00000017844)	ENSCHYG00000005540	GDF7 (ENSCHYG00000005551)	HS1BP3 (ENSCHYG00000005568)	RHOB (ENSCHYG00000005587)	ENSCHYG00000005597	PUM2 (ENSCHYG00000005651) #20	SDC1 (ENSCHYG00000005966) #22	LAPTM4A (ENSCHYG00000005989) #23	MATN3 (ENSCHYG00000006044) #24	WDR35 (ENSCHYG00000006261) #25	TTC32 (ENSCHYG00000006877)	OSR1 (ENSCHYG00000006938)	ENSCHYG00000006946	NT5C1B (ENSCHYG00000006961)	RDH14 (ENSCHYG00000007014)	KCNS3 (ENSCHYG00000007031)	MSGN1 (ENSCHYG00000007045)	GEN1 (ENSCHYG00000007066)	SMC6 (ENSCHYG00000007159)	VSNL1 (ENSCHYG00000007343)	RAD51AP2 (ENSCHYG00000007371)	CYRIA (ENSCHYG00000007408)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT01090000263460	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Arabian camel	MODERN SPECIES	6	WDCP (ENSCDRG00005007980)	MFSD2B (ENSCDRG00005007767)	UBXN2A (ENSCDRG00005007692)	ATAD2B (ENSCDRG00005007580)	KLHL29 (ENSCDRG00005007511)	ENSCDRG00005007461	ENSCDRG00005007452	TDRD15 (ENSCDRG00005007436)	APOB (ENSCDRG00005005937)	ENSCDRG00005005813	LDAH (ENSCDRG00005005753)	HS1BP3 (ENSCDRG00005005637)	RHOB (ENSCDRG00005005629)	PUM2 (ENSCDRG00005005454) #20	ENSCDRG00005005424	SDC1 (ENSCDRG00005005384) #22	ENSCDRG00005005168	LAPTM4A (ENSCDRG00005005142) #23	MATN3 (ENSCDRG00005005117) #24	ENSCDRG00005005097 #25	TTC32 (ENSCDRG00005005072)	OSR1 (ENSCDRG00005005052)	NT5C1B (ENSCDRG00005005015)	RDH14 (ENSCDRG00005004999)	KCNS3 (ENSCDRG00005004986)	MSGN1 (ENSCDRG00005004972)	GEN1 (ENSCDRG00005004909)	SMC6 (ENSCDRG00005004835)	VSNL1 (ENSCDRG00005004814)	RAD51AP2 (ENSCDRG00005004783)	CYRIA (ENSCDRG00005004743)
Suina	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Pig	MODERN SPECIES	11	ENSSSCG00000041783	ATAD2B (ENSSSCG00000008591)	ENSSSCG00000055154	KLHL29 (ENSSSCG00000008593)	ENSSSCG00000044002	ENSSSCG00000039066	ENSSSCG00000048838	APOB (ENSSSCG00000008595)	LDAH (ENSSSCG00000025357)	GDF7 (ENSSSCG00000028931)	HS1BP3 (ENSSSCG00000030115)	RHOB (ENSSSCG00000043781)	ENSSSCG00000008599	ENSSSCG00000054581	PUM2 (ENSSSCG00000008600) #20	SDC1 (ENSSSCG00000008601) #22	LAPTM4A (ENSSSCG00000008602) #23	MATN3 (ENSSSCG00000008603) #24	WDR35 (ENSSSCG00000008604) #25	TTC32 (ENSSSCG00000053616)	ENSSSCG00000058710	OSR1 (ENSSSCG00000060496)	ENSSSCG00000054495	NT5C1B (ENSSSCG00000008607)	RDH14 (ENSSSCG00000008608)	KCNS3 (ENSSSCG00000031905)	ENSSSCG00000040752	MSGN1 (ENSSSCG00000026538)	GEN1 (ENSSSCG00000008613)	SMC6 (ENSSSCG00000008614)	VSNL1 (ENSSSCG00000008615)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	776	TP53I3 (ENSCWAG00000004737)	SF3B6 (ENSCWAG00000004714)	FKBP1B (ENSCWAG00000004665)	WDCP (ENSCWAG00000004635)	MFSD2B (ENSCWAG00000004534)	UBXN2A (ENSCWAG00000004513)	ATAD2B (ENSCWAG00000004481)	KLHL29 (ENSCWAG00000004442)	APOB (ENSCWAG00000004185)	LDAH (ENSCWAG00000004087)	GDF7 (ENSCWAG00000004046)	HS1BP3 (ENSCWAG00000004014)	RHOB (ENSCWAG00000004001)	ENSCWAG00000003897	PUM2 (ENSCWAG00000003696) #20	SDC1 (ENSCWAG00000016920) #22	LAPTM4A (ENSCWAG00000016902) #23	MATN3 (ENSCWAG00000016742) #24	WDR35 (ENSCWAG00000016523) #25	TTC32 (ENSCWAG00000016481)	OSR1 (ENSCWAG00000016456)	NT5C1B (ENSCWAG00000016386)	RDH14 (ENSCWAG00000016353)	KCNS3 (ENSCWAG00000016339)	MSGN1 (ENSCWAG00000016325)	GEN1 (ENSCWAG00000016234)	SMC6 (ENSCWAG00000016171)	VSNL1 (ENSCWAG00000016143)	RAD51AP2 (ENSCWAG00000016094)	CYRIA (ENSCWAG00000016027)	MYCN (ENSCWAG00000015961)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	4	SF3B6 (ENSRFEG00010018003)	FKBP1B (ENSRFEG00010018043)	WDCP (ENSRFEG00010018155)	MFSD2B (ENSRFEG00010005251)	UBXN2A (ENSRFEG00010005270)	ATAD2B (ENSRFEG00010005280)	KLHL29 (ENSRFEG00010005296)	ENSRFEG00010005311	APOB (ENSRFEG00010005349)	LDAH (ENSRFEG00010005397)	GDF7 (ENSRFEG00010005440)	HS1BP3 (ENSRFEG00010005461)	RHOB (ENSRFEG00010005478)	PUM2 (ENSRFEG00010005562) #20	ENSRFEG00010005671	SDC1 (ENSRFEG00010005688) #22	LAPTM4A (ENSRFEG00010005720) #23	MATN3 (ENSRFEG00010005757) #24	WDR35 (ENSRFEG00010005857) #25	TTC32 (ENSRFEG00010005945)	OSR1 (ENSRFEG00010005966)	NT5C1B (ENSRFEG00010006003)	RDH14 (ENSRFEG00010006059)	KCNS3 (ENSRFEG00010006076)	MSGN1 (ENSRFEG00010006094)	GEN1 (ENSRFEG00010006120)	SMC6 (ENSRFEG00010006174)	VSNL1 (ENSRFEG00010006243)	RAD51AP2 (ENSRFEG00010006267)	CYRIA (ENSRFEG00010006289)	MYCN (ENSRFEG00010006325)
Microbat	MODERN SPECIES	1031	ENSMLUG00000030749	ENSMLUG00000013466	UBXN2A (ENSMLUG00000015640)	ATAD2B (ENSMLUG00000004476)	KLHL29 (ENSMLUG00000004470)	TDRD15 (ENSMLUG00000007897)	APOB (ENSMLUG00000007812)	ENSMLUG00000029392	LDAH (ENSMLUG00000007792)	ENSMLUG00000027645	HS1BP3 (ENSMLUG00000022201)	ENSMLUG00000005981	RHOB (ENSMLUG00000001627)	ENSMLUG00000023764	PUM2 (ENSMLUG00000007362) #20	SDC1 (ENSMLUG00000007349) #22	LAPTM4A (ENSMLUG00000001596) #23	MATN3 (ENSMLUG00000003456) #24	WDR35 (ENSMLUG00000001419) #25	TTC32 (ENSMLUG00000001415)	OSR1 (ENSMLUG00000011374)	NT5C1B (ENSMLUG00000015910)	RDH14 (ENSMLUG00000024368)
Megabat	MODERN SPECIES	2734															PUM2 (ENSPVAG00000002920) #20	SDC1 (ENSPVAG00000002916) #22	LAPTM4A (ENSPVAG00000002909) #23	MATN3 (ENSPVAG00000002905) #24	WDR35 (ENSPVAG00000002899) #25	TTC32 (ENSPVAG00000002897)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000170401	ENSGT01100000265002	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT01090000263317.a	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Donkey	MODERN SPECIES	26	UBXN2A (ENSEASG00005009983)	ATAD2B (ENSEASG00005009516)	KLHL29 (ENSEASG00005009482)	ENSEASG00005009479	ENSEASG00005009477	ENSEASG00005009474	TDRD15 (ENSEASG00005034301)	APOB (ENSEASG00005009466)	LDAH (ENSEASG00005009459)	GDF7 (ENSEASG00005009457)	HS1BP3 (ENSEASG00005009454)	RHOB (ENSEASG00005009448)	ENSEASG00005027331	ENSEASG00005009442	PUM2 (ENSEASG00005009429) #20	SDC1 (ENSEASG00005009418) #22	LAPTM4A (ENSEASG00005009414) #23	MATN3 (ENSEASG00005009408) #24	WDR35 (ENSEASG00005009400) #25	TTC32 (ENSEASG00005026368)	OSR1 (ENSEASG00005009388)	NT5C1B (ENSEASG00005009376)	RDH14 (ENSEASG00005029880)	KCNS3 (ENSEASG00005009368)	MSGN1 (ENSEASG00005009364)	GEN1 (ENSEASG00005023619)	SMC6 (ENSEASG00005009355)	VSNL1 (ENSEASG00005026430)	RAD51AP2 (ENSEASG00005009350)	CYRIA (ENSEASG00005009344)	MYCN (ENSEASG00005037158)
Horse	MODERN SPECIES	6	ENSECAG00000033565	ENSECAG00000038636	ENSECAG00000032306	ENSECAG00000034152	TDRD15 (ENSECAG00000008581)	APOB (ENSECAG00000008600)	LDAH (ENSECAG00000020412)	ENSECAG00000058266	GDF7 (ENSECAG00000021083)	HS1BP3 (ENSECAG00000021502)	RHOB (ENSECAG00000051165)	ENSECAG00000032315	ENSECAG00000021922	PUM2 (ENSECAG00000021930) #20	ENSECAG00000045674	SDC1 (ENSECAG00000014709) #22	MATN3 (ENSECAG00000017085) #24	WDR35 (ENSECAG00000018258) #25	TTC32 (ENSECAG00000013048)	OSR1 (ENSECAG00000013593)	NT5C1B (ENSECAG00000014033)	RDH14 (ENSECAG00000045905)	KCNS3 (ENSECAG00000019779)	MSGN1 (ENSECAG00000002724)	GEN1 (ENSECAG00000020295)	SMC6 (ENSECAG00000022265)	VSNL1 (ENSECAG00000013682)	RAD51AP2 (ENSECAG00000014706)	CYRIA (ENSECAG00000014952)	ENSECAG00000018361	MYCN (ENSECAG00000002896)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.c #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00390000003628.b	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.k.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.l	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.c #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00390000003628.b	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.k.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.l	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.c #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
lion	MODERN SPECIES	3	WDCP (ENSPLOG00000000585)	MFSD2B (ENSPLOG00000000549)	UBXN2A (ENSPLOG00000000531)	ATAD2B (ENSPLOG00000000487)	KLHL29 (ENSPLOG00000000329)	ENSPLOG00000000267	TDRD15 (ENSPLOG00000000249)	APOB (ENSPLOG00000004809)	LDAH (ENSPLOG00000004752)	GDF7 (ENSPLOG00000004729)	HS1BP3 (ENSPLOG00000004714)	RHOB (ENSPLOG00000004676)	ENSPLOG00000004582	PUM2 (ENSPLOG00000004537) #20	ENSPLOG00000004519	SDC1 (ENSPLOG00000004513) #22	ENSPLOG00000004505 #23	MATN3 (ENSPLOG00000004487) #24	WDR35 (ENSPLOG00000004441) #25	TTC32 (ENSPLOG00000004421)	OSR1 (ENSPLOG00000004407)	NT5C1B (ENSPLOG00000004380)	RDH14 (ENSPLOG00000004360)	KCNS3 (ENSPLOG00000004351)	MSGN1 (ENSPLOG00000004343)	GEN1 (ENSPLOG00000004334)	SMC6 (ENSPLOG00000004301)	VSNL1 (ENSPLOG00000004292)	RAD51AP2 (ENSPLOG00000004282)	CYRIA (ENSPLOG00000004262)	ENSPLOG00000004254
leopard	MODERN SPECIES		UBXN2A (ENSPPRG00000022151)	ATAD2B (ENSPPRG00000022083)	KLHL29 (ENSPPRG00000022044)	ENSPPRG00000021990	ENSPPRG00000021960	TDRD15 (ENSPPRG00000020099)	APOB (ENSPPRG00000021875)	LDAH (ENSPPRG00000021658)	GDF7 (ENSPPRG00000021614)	HS1BP3 (ENSPPRG00000021577)	ENSPPRG00000021519	ENSPPRG00000020084	ENSPPRG00000021503	PUM2 (ENSPPRG00000021443) #20	ENSPPRG00000021380	SDC1 (ENSPPRG00000021362) #22	LAPTM4A (ENSPPRG00000021333) #23	MATN3 (ENSPPRG00000021301) #24	WDR35 (ENSPPRG00000021186) #25	TTC32 (ENSPPRG00000021136)	OSR1 (ENSPPRG00000021067)	NT5C1B (ENSPPRG00000021030)	RDH14 (ENSPPRG00000020986)	KCNS3 (ENSPPRG00000020060)	ENSPPRG00000020962	MSGN1 (ENSPPRG00000020043)	GEN1 (ENSPPRG00000020921)	SMC6 (ENSPPRG00000020812)	VSNL1 (ENSPPRG00000020771)	RAD51AP2 (ENSPPRG00000020727)	CYRIA (ENSPPRG00000020692)
Tiger	MODERN SPECIES	149	WDCP (ENSPTIG00000011327)	MFSD2B (ENSPTIG00000008501)	UBXN2A (ENSPTIG00000006975)	ATAD2B (ENSPTIG00000020553)	KLHL29 (ENSPTIG00000019549)	ENSPTIG00000018573	TDRD15 (ENSPTIG00000006858)	ENSPTIG00000017235	APOB (ENSPTIG00000012825)	LDAH (ENSPTIG00000011369)	HS1BP3 (ENSPTIG00000010200)	RHOB (ENSPTIG00000006084)	ENSPTIG00000000251	PUM2 (ENSPTIG00000018982) #20	ENSPTIG00000018625	SDC1 (ENSPTIG00000017404) #22	LAPTM4A (ENSPTIG00000016492) #23	MATN3 (ENSPTIG00000015261) #24	WDR35 (ENSPTIG00000012685) #25	TTC32 (ENSPTIG00000012474)	OSR1 (ENSPTIG00000012004)	NT5C1B (ENSPTIG00000011201)	RDH14 (ENSPTIG00000010724)	KCNS3 (ENSPTIG00000006472)	MSGN1 (ENSPTIG00000006467)	GEN1 (ENSPTIG00000007224)	SMC6 (ENSPTIG00000001154)	VSNL1 (ENSPTIG00000020980)	RAD51AP2 (ENSPTIG00000020726)	CYRIA (ENSPTIG00000019497)	ENSPTIG00000018921
Cat	MODERN SPECIES	2	ENSFCAG00000040740	WDCP (ENSFCAG00000004303)	MFSD2B (ENSFCAG00000004302)	UBXN2A (ENSFCAG00000028218)	ATAD2B (ENSFCAG00000030573)	KLHL29 (ENSFCAG00000003613)	TDRD15 (ENSFCAG00000035443)	APOB (ENSFCAG00000029807)	LDAH (ENSFCAG00000026226)	GDF7 (ENSFCAG00000044521)	HS1BP3 (ENSFCAG00000002398)	ENSFCAG00000048458	ENSFCAG00000028084	PUM2 (ENSFCAG00000027520) #20	ENSFCAG00000039293	SDC1 (ENSFCAG00000005354) #22	ENSFCAG00000043657 #23	MATN3 (ENSFCAG00000033314) #24	WDR35 (ENSFCAG00000005351) #25	TTC32 (ENSFCAG00000037766)	OSR1 (ENSFCAG00000026754)	NT5C1B (ENSFCAG00000010773)	KCNS3 (ENSFCAG00000014253)	MSGN1 (ENSFCAG00000045777)	GEN1 (ENSFCAG00000013581)	SMC6 (ENSFCAG00000013578)	VSNL1 (ENSFCAG00000023416)	RAD51AP2 (ENSFCAG00000028900)	CYRIA (ENSFCAG00000004125)	MYCN (ENSFCAG00000043374)	ENSFCAG00000048673
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00940000153609.b.w.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00980000202730	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00940000153609.b.w.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00980000202730	ENSGT00980000202468	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Dingo	MODERN SPECIES	223	MFSD2B (ENSCAFG00020025582)	ENSCAFG00020025601	ATAD2B (ENSCAFG00020025604)	ENSCAFG00020025616	KLHL29 (ENSCAFG00020025619)	TDRD15 (ENSCAFG00020025627)	APOB (ENSCAFG00020025649)	LDAH (ENSCAFG00020025670)	GDF7 (ENSCAFG00020025671)	HS1BP3 (ENSCAFG00020025673)	RHOB (ENSCAFG00020025677)	ENSCAFG00020025680	ENSCAFG00020025683	PUM2 (ENSCAFG00020025689) #20	ENSCAFG00020025758	SDC1 (ENSCAFG00020025760) #22	LAPTM4A (ENSCAFG00020025761) #23	WDR35 (ENSCAFG00020025847) #25	TTC32 (ENSCAFG00020026024)	OSR1 (ENSCAFG00020026025)	NT5C1B (ENSCAFG00020026028)	RDH14 (ENSCAFG00020026035)	ENSCAFG00020026037	KCNS3 (ENSCAFG00020026039)	MSGN1 (ENSCAFG00020026040)	ENSCAFG00020026044	ENSCAFG00020026045	ENSCAFG00020026046	ENSCAFG00020026047	VSNL1 (ENSCAFG00020026051)	RAD51AP2 (ENSCAFG00020026058)
Dog	MODERN SPECIES	8	FKBP1B (ENSCAFG00845022652)	WDCP (ENSCAFG00845022467)	ENSCAFG00845022118	ENSCAFG00845021952	ENSCAFG00845021908	ATAD2B (ENSCAFG00845021031)	KLHL29 (ENSCAFG00845020825)	TDRD15 (ENSCAFG00845020461)	APOB (ENSCAFG00845020315)	LDAH (ENSCAFG00845020079)	GDF7 (ENSCAFG00845020009)	HS1BP3 (ENSCAFG00845019848)	RHOB (ENSCAFG00845019784)	ENSCAFG00845019715	PUM2 (ENSCAFG00845018880) #20	SDC1 (ENSCAFG00845018675) #22	MATN3 (ENSCAFG00845018598) #23	MATN3 (ENSCAFG00845018475) #24	WDR35 (ENSCAFG00845017734) #25	TTC32 (ENSCAFG00845017602)	OSR1 (ENSCAFG00845017551)	NT5C1B (ENSCAFG00845017369)	NT5C1B (ENSCAFG00845017330)	ENSCAFG00845017291	ENSCAFG00845017269	KCNS3 (ENSCAFG00845017227)	MSGN1 (ENSCAFG00845017161)	GEN1 (ENSCAFG00845017081)	SMC6 (ENSCAFG00845016537)	VSNL1 (ENSCAFG00845016286)	RAD51AP2 (ENSCAFG00845016237)
Red fox	MODERN SPECIES	107		UBXN2A (ENSVVUG00000014898)	ENSVVUG00000014896	ATAD2B (ENSVVUG00000014891)	KLHL29 (ENSVVUG00000014884)	ENSVVUG00000014880	TDRD15 (ENSVVUG00000014860)	APOB (ENSVVUG00000014850)	LDAH (ENSVVUG00000014846)	HS1BP3 (ENSVVUG00000014842)	RHOB (ENSVVUG00000014839)	ENSVVUG00000014838	ENSVVUG00000014837	PUM2 (ENSVVUG00000014829) #20	ENSVVUG00000014826	SDC1 (ENSVVUG00000014823) #22	LAPTM4A (ENSVVUG00000014821) #23	MATN3 (ENSVVUG00000014820) #24	WDR35 (ENSVVUG00000014818) #25	ENSVVUG00000014817	OSR1 (ENSVVUG00000014812)	NT5C1B (ENSVVUG00000014799)	RDH14 (ENSVVUG00000014797)	ENSVVUG00000014794	KCNS3 (ENSVVUG00000014792)	MSGN1 (ENSVVUG00000014790)	GEN1 (ENSVVUG00000014785)	SMC6 (ENSVVUG00000013308)	VSNL1 (ENSVVUG00000013234)	RAD51AP2 (ENSVVUG00000013222)	ENSVVUG00000013219
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00390000005908.y	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
American mink	MODERN SPECIES	7	ATAD2B (ENSNVIG00000012717)	KLHL29 (ENSNVIG00000012776)	ENSNVIG00000012791	ENSNVIG00000012796	TDRD15 (ENSNVIG00000012820)	APOB (ENSNVIG00000012830)	B5MDU6 (ENSNVIG00000012863)	ENSNVIG00000012897	ENSNVIG00000012914	ENSNVIG00000012923	RHOB (ENSNVIG00000012943)	ENSNVIG00000012955	PUM2 (ENSNVIG00000013016) #20	ENSNVIG00000013176 #19	ENSNVIG00000013188	SDC1 (ENSNVIG00000013190) #22	LAPTM4A (ENSNVIG00000013199) #23	MATN3 (ENSNVIG00000013221) #24	WDR35 (ENSNVIG00000013269) #25	TTC32 (ENSNVIG00000013413)	OSR1 (ENSNVIG00000013439)	ENSNVIG00000013455	NT5C1B (ENSNVIG00000013468)	RDH14 (ENSNVIG00000013495)	KCNS3 (ENSNVIG00000013506)	ENSNVIG00000013510	MSGN1 (ENSNVIG00000013513)	GEN1 (ENSNVIG00000013515)	ENSNVIG00000013543	VSNL1 (ENSNVIG00000013664)	RAD51AP2 (ENSNVIG00000013682)
Ferret	MODERN SPECIES	178	SF3B6 (ENSMPUG00000013957)	FKBP1B (ENSMPUG00000013941)	WDCP (ENSMPUG00000013937)	MFSD2B (ENSMPUG00000013875)	UBXN2A (ENSMPUG00000013862)	ATAD2B (ENSMPUG00000013855)	KLHL29 (ENSMPUG00000013755)	TDRD15 (ENSMPUG00000013753)	APOB (ENSMPUG00000013749)	LDAH (ENSMPUG00000013748)	GDF7 (ENSMPUG00000013742)	HS1BP3 (ENSMPUG00000013739)	RHOB (ENSMPUG00000019487)	ENSMPUG00000013736	PUM2 (ENSMPUG00000013734) #20	SDC1 (ENSMPUG00000013732) #22	LAPTM4A (ENSMPUG00000013714) #23	MATN3 (ENSMPUG00000013713) #24	WDR35 (ENSMPUG00000013708) #25	TTC32 (ENSMPUG00000013701)	OSR1 (ENSMPUG00000013697)	NT5C1B (ENSMPUG00000013662)	RDH14 (ENSMPUG00000013659)	KCNS3 (ENSMPUG00000019486)	MSGN1 (ENSMPUG00000019484)	GEN1 (ENSMPUG00000013651)	SMC6 (ENSMPUG00000013644)	VSNL1 (ENSMPUG00000013641)	RAD51AP2 (ENSMPUG00000013634)	ENSMPUG00000013627	CYRIA (ENSMPUG00000013624)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b.d	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.f #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Giant Panda	MODERN SPECIES	14	FKBP1B (ENSAMEG00000029795)	WDCP (ENSAMEG00000002801)	MFSD2B (ENSAMEG00000002807)	UBXN2A (ENSAMEG00000002843)	ATAD2B (ENSAMEG00000002853)	KLHL29 (ENSAMEG00000002886)	TDRD15 (ENSAMEG00000029907)	APOB (ENSAMEG00000013086)	LDAH (ENSAMEG00000029431)	ENSAMEG00000002904	ENSAMEG00000025415	RHOB (ENSAMEG00000019884)	ENSAMEG00000002884	PUM2 (ENSAMEG00000002823) #20	ENSAMEG00000025209	SDC1 (ENSAMEG00000002804) #22	LAPTM4A (ENSAMEG00000002787) #23	MATN3 (ENSAMEG00000002771) #24	WDR35 (ENSAMEG00000002724) #25	TTC32 (ENSAMEG00000002717)	OSR1 (ENSAMEG00000002708)	NT5C1B (ENSAMEG00000002686)	KCNS3 (ENSAMEG00000019878)	MSGN1 (ENSAMEG00000019874)	GEN1 (ENSAMEG00000002666)	SMC6 (ENSAMEG00000002654)	VSNL1 (ENSAMEG00000011624)	RAD51AP2 (ENSAMEG00000002644)	ENSAMEG00000002627	CYRIA (ENSAMEG00000001040)	ENSAMEG00000023555
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00390000005908.y	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b.d	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.f #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00950000185985
Polar bear	MODERN SPECIES	223	TP53I3 (ENSUMAG00000022832)	SF3B6 (ENSUMAG00000022835)	ENSUMAG00000022839	WDCP (ENSUMAG00000022841)	MFSD2B (ENSUMAG00000022848)	UBXN2A (ENSUMAG00000022883)	ATAD2B (ENSUMAG00000022911)	KLHL29 (ENSUMAG00000023015)	TDRD15 (ENSUMAG00000023037)	APOB (ENSUMAG00000023043)	LDAH (ENSUMAG00000023067)	ENSUMAG00000023070	ENSUMAG00000023094	PUM2 (ENSUMAG00000023198) #20	ENSUMAG00000023203	ENSUMAG00000023205 #22	LAPTM4A (ENSUMAG00000023207) #23	MATN3 (ENSUMAG00000023214) #24	WDR35 (ENSUMAG00000023232) #25	TTC32 (ENSUMAG00000023371)	OSR1 (ENSUMAG00000023373)	NT5C1B (ENSUMAG00000023377)	RDH14 (ENSUMAG00000023381)	KCNS3 (ENSUMAG00000023389)	MSGN1 (ENSUMAG00000023391)	GEN1 (ENSUMAG00000023394)	SMC6 (ENSUMAG00000023406)	VSNL1 (ENSUMAG00000023419)	RAD51AP2 (ENSUMAG00000023423)	CYRIA (ENSUMAG00000023433)	ENSUMAG00000023440
American black bear	MODERN SPECIES	149														PUM2 (ENSUAMG00000008120) #20	ENSUAMG00000008099	SDC1 (ENSUAMG00000008096) #22	LAPTM4A (ENSUAMG00000008094) #23	ENSUAMG00000008091 #24	WDR35 (ENSUAMG00000007366) #25	TTC32 (ENSUAMG00000007348)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	1388														ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22
Armadillo	MODERN SPECIES	2649														ENSDNOG00000031941	PUM2 (ENSDNOG00000006733) #20	SDC1 (ENSDNOG00000031824) #22
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000161217	ENSGT00390000005908	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Elephant	MODERN SPECIES	197	TP53I3 (ENSLAFG00000017221)	SF3B6 (ENSLAFG00000029423)	FKBP1B (ENSLAFG00000005196)	WDCP (ENSLAFG00000017499)	MFSD2B (ENSLAFG00000023340)	UBXN2A (ENSLAFG00000017493)	ATAD2B (ENSLAFG00000016605)	KLHL29 (ENSLAFG00000013813)	TDRD15 (ENSLAFG00000026920)	APOB (ENSLAFG00000009232)	GDF7 (ENSLAFG00000021797)	HS1BP3 (ENSLAFG00000013276)	RHOB (ENSLAFG00000000243)	ENSLAFG00000030177	PUM2 (ENSLAFG00000009278) #20	SDC1 (ENSLAFG00000022920) #22	LAPTM4A (ENSLAFG00000013774) #23	MATN3 (ENSLAFG00000014853) #24	WDR35 (ENSLAFG00000014834) #25	TTC32 (ENSLAFG00000014830)	ENSLAFG00000030361	ENSLAFG00000027572	OSR1 (ENSLAFG00000027174)	NT5C1B (ENSLAFG00000007746)	RDH14 (ENSLAFG00000022569)	KCNS3 (ENSLAFG00000021521)	ENSLAFG00000028092	ENSLAFG00000029496	MSGN1 (ENSLAFG00000015319)	GEN1 (ENSLAFG00000023255)	SMC6 (ENSLAFG00000007506)
Hyrax	MODERN SPECIES	1351																SDC1 (ENSPCAG00000016237) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	1678														PUM2 (ENSETEG00000017683) #20	ENSETEG00000017680	SDC1 (ENSETEG00000017678) #22
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688.s	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a.f	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688.s	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092.b	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a.f	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	35							ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688.s	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092.b	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a.f	ENSGT00940000156513	ENSGT00960000192062	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	34							ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688.s	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092.b	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a.f	ENSGT00940000156513	ENSGT00960000192062	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Common wonbat	MODERN SPECIES	694												RHOB (ENSVURG00010023826)	ENSVURG00010023821	PUM2 (ENSVURG00010023817) #20	ENSVURG00010023816	ENSVURG00010023814 #22	LAPTM4A (ENSVURG00010023811) #23	WDR35 (ENSVURG00010023804) #25	TTC32 (ENSVURG00010023802)	ENSVURG00010023800	ENSVURG00010023796	RDH14 (ENSVURG00010023793)	KCNS3 (ENSVURG00010023790)	MSGN1 (ENSVURG00010023787)	GEN1 (ENSVURG00010023780)	ENSVURG00010023775	VSNL1 (ENSVURG00010023772)	CYRIA (ENSVURG00010023771)	MYCN (ENSVURG00010023760)	DDX1 (ENSVURG00010023755)	NBAS (ENSVURG00010023744)
koala	MODERN SPECIES	175							TDRD15 (ENSPCIG00000007414)	APOB (ENSPCIG00000008641)	ENSPCIG00000022174	GDF7 (ENSPCIG00000036380)	ENSPCIG00000022157	RHOB (ENSPCIG00000036417)	ENSPCIG00000022147	PUM2 (ENSPCIG00000022139) #20	ENSPCIG00000022138	ENSPCIG00000035866 #22	LAPTM4A (ENSPCIG00000016629) #23	MATN3 (ENSPCIG00000016627) #24	ENSPCIG00000022097 #25	TTC32 (ENSPCIG00000035406)	OSR1 (ENSPCIG00000011035)	ENSPCIG00000016776	RDH14 (ENSPCIG00000024554)	KCNS3 (ENSPCIG00000029436)	MSGN1 (ENSPCIG00000029437)	ENSPCIG00000029438	ENSPCIG00000029439	VSNL1 (ENSPCIG00000029441)	ENSPCIG00000035261	CYRIA (ENSPCIG00000010035)	ENSPCIG00000001358
Opossum	MODERN SPECIES	579																ENSMODG00000036381 #22
Platypus	MODERN SPECIES	20	ZSWIM2 (ENSOANG00000030404)	CALCRL (ENSOANG00000020803)	ENSOANG00000046127	ENSOANG00000036826	ENSOANG00000041695	APMAP (ENSOANG00000038065)	ENSOANG00000040205	ACSS1 (ENSOANG00000003805)	ENSOANG00000046868	ENTPD6 (ENSOANG00000021164)	PYGB (ENSOANG00000009608)	ABHD12 (ENSOANG00000042191)	GINS1 (ENSOANG00000004118)	ENSOANG00000039988	PUM2 (ENSOANG00000005907) #20	ENSOANG00000001136 #22	LAPTM4A (ENSOANG00000001105) #23	MATN3 (ENSOANG00000037447) #24	WDR35 (ENSOANG00000047974) #25	RHOB (ENSOANG00000008835)	ENSOANG00000004402	ENSOANG00000015095	LDAH (ENSOANG00000020206)	APOB (ENSOANG00000003378)	ENSOANG00000047651	KLHL29 (ENSOANG00000007620)	ATAD2B (ENSOANG00000007622)	UBXN2A (ENSOANG00000042505)	MFSD2B (ENSOANG00000007625)	ENSOANG00000007626	ENSOANG00000048768
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00960000192062	ENSGT00390000015159.a.b
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00960000192062	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660.f	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432	ENSGT00940000155678
Common wall lizard	MODERN SPECIES	11	FKBP1B (ENSPMRG00000010400)	ENSPMRG00000010389	WDCP (ENSPMRG00000010386)	MFSD2B (ENSPMRG00000010373)	UBXN2A (ENSPMRG00000010363)	ATAD2B (ENSPMRG00000010349)	KLHL29 (ENSPMRG00000010337)	TDRD15 (ENSPMRG00000010330)	APOB (ENSPMRG00000010317)	LDAH (ENSPMRG00000010307)	GDF7 (ENSPMRG00000010304)	HS1BP3 (ENSPMRG00000010298)	RHOB (ENSPMRG00000010292)	ENSPMRG00000010287	PUM2 (ENSPMRG00000010266) #20	SDC1 (ENSPMRG00000002406) #22	MATN3 (ENSPMRG00000002396) #24	LAPTM4A (ENSPMRG00000002388) #23	TTC32 (ENSPMRG00000002380)	ENSPMRG00000002372	OSR1 (ENSPMRG00000002362)	NT5C1B (ENSPMRG00000002348)	RDH14 (ENSPMRG00000002345)	WDR35 (ENSPMRG00000002308) #25	KCNS3 (ENSPMRG00000002300)	GEN1 (ENSPMRG00000002288)	SMC6 (ENSPMRG00000002270)	VSNL1 (ENSPMRG00000002266)	ENSPMRG00000002261	ENSPMRG00000002259	ENSPMRG00000002256
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	9	ATAD2B (ENSSMRG00000004856)	KLHL29 (ENSSMRG00000004808)	ENSSMRG00000004685	ENSSMRG00000004607	ENSSMRG00000004598	ENSSMRG00000004589	ENSSMRG00000004548	TDRD15 (ENSSMRG00000004493)	APOB (ENSSMRG00000004486)	LDAH (ENSSMRG00000004454)	GDF7 (ENSSMRG00000004428)	HS1BP3 (ENSSMRG00000004424)	RHOB (ENSSMRG00000004413)	ENSSMRG00000004410	PUM2 (ENSSMRG00000004387) #20	SDC1 (ENSSMRG00000004375) #22	LAPTM4A (ENSSMRG00000004329) #23	TTC32 (ENSSMRG00000004326)	ENSSMRG00000004320	OSR1 (ENSSMRG00000004296)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00960000192062	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000001660.f	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a.c	ENSGT00940000156513	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432	ENSGT00940000155678
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000001660.f	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181.a	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266.e	ENSGT00550000074816.A.a.c	ENSGT00940000156513	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432	ENSGT00940000155678	ENSGT00390000012474
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000001660.f	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181.a	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266.e	ENSGT00550000074816.A.a.c	ENSGT00940000156513	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432	ENSGT00940000155678
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	4							TDRD15 (ENSPTXG00000014579)	APOB (ENSPTXG00000014575)	LDAH (ENSPTXG00000014573)	ENSPTXG00000014571	GDF7 (ENSPTXG00000014569)	HS1BP3 (ENSPTXG00000014568)	RHOB (ENSPTXG00000014567)	ENSPTXG00000014566	PUM2 (ENSPTXG00000014565) #20	SDC1 (ENSPTXG00000014564) #22	LAPTM4A (ENSPTXG00000014563) #23	TTC32 (ENSPTXG00000014562)	ENSPTXG00000014561	OSR1 (ENSPTXG00000014560)	NT5C1B (ENSPTXG00000014559)	RDH14 (ENSPTXG00000014558)	WDR35 (ENSPTXG00000014548) #25	KCNS3 (ENSPTXG00000014540)	MSGN1 (ENSPTXG00000014539)	ENSPTXG00000014537	ENSPTXG00000014536	SMC6 (ENSPTXG00000014533)	VSNL1 (ENSPTXG00000014531)	CYRIA (ENSPTXG00000014529)	MYCN (ENSPTXG00000014526)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	74	ENSNSUG00000000616	WDCP (ENSNSUG00000000620)	ENSNSUG00000000625	UBXN2A (ENSNSUG00000000628)	ATAD2B (ENSNSUG00000000683)	KLHL29 (ENSNSUG00000000726)	TDRD15 (ENSNSUG00000000737)	APOB (ENSNSUG00000000739)	LDAH (ENSNSUG00000000742)	GDF7 (ENSNSUG00000000752)	ENSNSUG00000000756	HS1BP3 (ENSNSUG00000000758)	RHOB (ENSNSUG00000000761)	ENSNSUG00000000764	PUM2 (ENSNSUG00000000851) #20	SDC1 (ENSNSUG00000003733) #22	LAPTM4A (ENSNSUG00000003734) #23	TTC32 (ENSNSUG00000003736)	ENSNSUG00000003742	OSR1 (ENSNSUG00000003748)	NT5C1B (ENSNSUG00000003749)	RDH14 (ENSNSUG00000003758)	WDR35 (ENSNSUG00000003762) #25	KCNS3 (ENSNSUG00000003771)	MSGN1 (ENSNSUG00000003773)	GEN1 (ENSNSUG00000003777)	SMC6 (ENSNSUG00000003811)	VSNL1 (ENSNSUG00000005729)
Indian cobra	MODERN SPECIES		ENSNNAG00000009330	WDCP (ENSNNAG00000009309)	MFSD2B (ENSNNAG00000009283)	UBXN2A (ENSNNAG00000009257)	ATAD2B (ENSNNAG00000007175)	KLHL29 (ENSNNAG00000007070)	TDRD15 (ENSNNAG00000007049)	APOB (ENSNNAG00000006325)	LDAH (ENSNNAG00000006227)	GDF7 (ENSNNAG00000006210)	HS1BP3 (ENSNNAG00000006192)	RHOB (ENSNNAG00000006172)	ENSNNAG00000005965	PUM2 (ENSNNAG00000005799) #20	ENSNNAG00000005775	ENSNNAG00000005759 #22	LAPTM4A (ENSNNAG00000005741) #23	TTC32 (ENSNNAG00000005721)	ENSNNAG00000005690	OSR1 (ENSNNAG00000005665)	NT5C1B (ENSNNAG00000005647)	RDH14 (ENSNNAG00000005638)	WDR35 (ENSNNAG00000005515) #25	KCNS3 (ENSNNAG00000005487)	MSGN1 (ENSNNAG00000005477)	ENSNNAG00000005468	SMC6 (ENSNNAG00000005310)	VSNL1 (ENSNNAG00000005283)	ENSNNAG00000005266	ENSNNAG00000005240	CYRIA (ENSNNAG00000005209)
Lizard	MODERN SPECIES		MYOM2 (ENSACAG00000004962)	ENSACAG00000026290	CSMD1 (ENSACAG00000004617)	ENSACAG00000042265	TDRD15 (ENSACAG00000010836)	APOB (ENSACAG00000010692)	ENSACAG00000043263	LDAH (ENSACAG00000010680)	GDF7 (ENSACAG00000010676)	HS1BP3 (ENSACAG00000010669)	RHOB (ENSACAG00000010665)	ENSACAG00000042007	ENSACAG00000010614	PUM2 (ENSACAG00000010491) #20	ENSACAG00000041550	SDC1 (ENSACAG00000010489) #22	ENSACAG00000044127	LAPTM4A (ENSACAG00000014474) #23	TTC32 (ENSACAG00000014548)	ENSACAG00000014553	ENSACAG00000036133	ENSACAG00000003251	OSR1 (ENSACAG00000007059)	ENSACAG00000044400	NT5C1B (ENSACAG00000007066)	RDH14 (ENSACAG00000044389)	ENSACAG00000007095 #25	ENSACAG00000042353	ENSACAG00000044738	ENSACAG00000041381	ENSACAG00000037198
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Aves	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	453												RHOB (ENSABRG00000018900)	ENSABRG00000018907	ENSABRG00000018921	PUM2 (ENSABRG00000018939) #20	SDC1 (ENSABRG00000018944) #22
Duck	MODERN SPECIES	21	FKBP1B (ENSAPLG00000030383)	ENSAPLG00000013078	WDCP (ENSAPLG00000013065)	MFSD2B (ENSAPLG00000012916)	ENSAPLG00000022593	UBXN2A (ENSAPLG00000012737)	ATAD2B (ENSAPLG00000012458)	KLHL29 (ENSAPLG00000012405)	TDRD15 (ENSAPLG00000017833)	APOB (ENSAPLG00000011670)	LDAH (ENSAPLG00000011591)	HS1BP3 (ENSAPLG00000011418)	RHOB (ENSAPLG00000011404)	ENSAPLG00000011262	PUM2 (ENSAPLG00000010496) #20	SDC1 (ENSAPLG00000010484) #22	ENSAPLG00000019338	LAPTM4A (ENSAPLG00000006688) #23	MATN3 (ENSAPLG00000006850) #24	WDR35 (ENSAPLG00000007231) #25	TTC32 (ENSAPLG00000007719)	ENSAPLG00000007727	OSR1 (ENSAPLG00000007971)	NT5C1B (ENSAPLG00000008001)	RDH14 (ENSAPLG00000008116)	KCNS3 (ENSAPLG00000001833)	ENSAPLG00000008127	MSGN1 (ENSAPLG00000001852)	GEN1 (ENSAPLG00000008596)	SMC6 (ENSAPLG00000008910)	VSNL1 (ENSAPLG00000010558)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000001660.f	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Japanese quail	MODERN SPECIES	21	ENSCJPG00005011704	ENSCJPG00005011703	WDCP (ENSCJPG00005011702)	MFSD2B (ENSCJPG00005011701)	UBXN2A (ENSCJPG00005011700)	ATAD2B (ENSCJPG00005011679)	KLHL29 (ENSCJPG00005011667)	TDRD15 (ENSCJPG00005011633)	APOB (ENSCJPG00005011298)	LDAH (ENSCJPG00005011295)	GDF7 (ENSCJPG00005011294)	HS1BP3 (ENSCJPG00005011293)	RHOB (ENSCJPG00005011290)	ENSCJPG00005011289	PUM2 (ENSCJPG00005011284) #20	SDC1 (ENSCJPG00005011283) #22	LAPTM4A (ENSCJPG00005011281) #23	MATN3 (ENSCJPG00005011280) #24	WDR35 (ENSCJPG00005011144) #25	TTC32 (ENSCJPG00005011143)	ENSCJPG00005011142	OSR1 (ENSCJPG00005011136)	NT5C1B (ENSCJPG00005011122)	RDH14 (ENSCJPG00005011121)	ENSCJPG00005011119	MSGN1 (ENSCJPG00005011118)	GEN1 (ENSCJPG00005011117)	SMC6 (ENSCJPG00005011116)	VSNL1 (ENSCJPG00005011115)	ENSCJPG00005011113	CYRIA (ENSCJPG00005011106)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001660.f	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500
Chicken	MODERN SPECIES	22	FKBP1B (ENSGALG00010008455)	ENSGALG00010009852	WDCP (ENSGALG00010009806)	MFSD2B (ENSGALG00010009780)	UBXN2A (ENSGALG00010009712)	ATAD2B (ENSGALG00010009695)	KLHL29 (ENSGALG00010009650)	TDRD15 (ENSGALG00010007981)	APOB (ENSGALG00010007977)	LDAH (ENSGALG00010007963)	ENSGALG00010007948	HS1BP3 (ENSGALG00010007956)	RHOB (ENSGALG00010008046)	ENSGALG00010008042	PUM2 (ENSGALG00010008032) #20	SDC1 (ENSGALG00010007999) #22	LAPTM4A (ENSGALG00010007992) #23	MATN3 (ENSGALG00010002579) #24	WDR35 (ENSGALG00010002551) #25	TTC32 (ENSGALG00010002520)	ENSGALG00010002513	OSR1 (ENSGALG00010002500)	NT5C1B (ENSGALG00010003681)	RDH14 (ENSGALG00010003665)	KCNS3 (ENSGALG00010003438)	ZPAX (ENSGALG00010003469)	MSGN1 (ENSGALG00010003849)	GEN1 (ENSGALG00010002376)	SMC6 (ENSGALG00010002372)	VSNL1 (ENSGALG00010002364)	ENSGALG00010002344
Turkey	MODERN SPECIES	11	ENSMGAG00000014055	WDCP (ENSMGAG00000014054)	MFSD2B (ENSMGAG00000014052)	UBXN2A (ENSMGAG00000014053)	ATAD2B (ENSMGAG00000014051)	KLHL29 (ENSMGAG00000014049)	TDRD15 (ENSMGAG00000014046)	APOB (ENSMGAG00000014045)	LDAH (ENSMGAG00000014044)	GDF7 (ENSMGAG00000015643)	HS1BP3 (ENSMGAG00000014042)	RHOB (ENSMGAG00000022411)	ENSMGAG00000015625	ENSMGAG00000014041	PUM2 (ENSMGAG00000014040) #20	SDC1 (ENSMGAG00000014039) #22	LAPTM4A (ENSMGAG00000014038) #23	MATN3 (ENSMGAG00000014036) #24	WDR35 (ENSMGAG00000014034) #25	TTC32 (ENSMGAG00000019538)	ENSMGAG00000014037	OSR1 (ENSMGAG00000014033)	NT5C1B (ENSMGAG00000014031)	RDH14 (ENSMGAG00000021183)	KCNS3 (ENSMGAG00000015620)	ENSMGAG00000014030	MSGN1 (ENSMGAG00000016374)	ENSMGAG00000014029	SMC6 (ENSMGAG00000014028)	VSNL1 (ENSMGAG00000014027)	ENSMGAG00000021857
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Great tit	MODERN SPECIES	22	WDCP (ENSPMJG00000012954)	MFSD2B (ENSPMJG00000012953)	UBXN2A (ENSPMJG00000012952)	ATAD2B (ENSPMJG00000012951)	KLHL29 (ENSPMJG00000012950)	TDRD15 (ENSPMJG00000012942)	APOB (ENSPMJG00000012512)	LDAH (ENSPMJG00000012509)	ENSPMJG00000012508	GDF7 (ENSPMJG00000012507)	HS1BP3 (ENSPMJG00000012505)	RHOB (ENSPMJG00000012501)	ENSPMJG00000012500	PUM2 (ENSPMJG00000012498) #20	ENSPMJG00000012497	SDC1 (ENSPMJG00000012496) #22	ENSPMJG00000012495	LAPTM4A (ENSPMJG00000012494) #23	MATN3 (ENSPMJG00000012493) #24	WDR35 (ENSPMJG00000012492) #25	TTC32 (ENSPMJG00000012491)	ENSPMJG00000012490	OSR1 (ENSPMJG00000012488)	NT5C1B (ENSPMJG00000012484)	RDH14 (ENSPMJG00000012483)	KCNS3 (ENSPMJG00000012481)	MSGN1 (ENSPMJG00000012480)	GEN1 (ENSPMJG00000012479)	SMC6 (ENSPMJG00000012478)	VSNL1 (ENSPMJG00000012477)	ENSPMJG00000012476
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Flycatcher	MODERN SPECIES	21	UBXN2A (ENSFALG00000001681)	ENSFALG00000028837	ENSFALG00000001684	KLHL29 (ENSFALG00000001686)	ENSFALG00000026691	TDRD15 (ENSFALG00000025891)	APOB (ENSFALG00000001698)	LDAH (ENSFALG00000001713)	GDF7 (ENSFALG00000014848)	HS1BP3 (ENSFALG00000001718)	RHOB (ENSFALG00000014864)	ENSFALG00000001728	ENSFALG00000001759 #20	ENSFALG00000025154 #20	ENSFALG00000026224	SDC1 (ENSFALG00000001773) #22	ENSFALG00000021365	LAPTM4A (ENSFALG00000001775) #23	MATN3 (ENSFALG00000025667) #24	WDR35 (ENSFALG00000001777) #25	TTC32 (ENSFALG00000001778)	ENSFALG00000001780	OSR1 (ENSFALG00000028520)	NT5C1B (ENSFALG00000001786)	RDH14 (ENSFALG00000014908)	KCNS3 (ENSFALG00000014929)	MSGN1 (ENSFALG00000001820)	GEN1 (ENSFALG00000027943)	SMC6 (ENSFALG00000001824)	VSNL1 (ENSFALG00000027644)	ENSFALG00000001832
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00900000143081	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513
Zebra finch	MODERN SPECIES	23	FKBP1B (ENSTGUG00000013190)	ENSTGUG00000018392	WDCP (ENSTGUG00000013189)	MFSD2B (ENSTGUG00000013188)	UBXN2A (ENSTGUG00000013185)	ATAD2B (ENSTGUG00000013179)	KLHL29 (ENSTGUG00000013176)	APOB (ENSTGUG00000013166)	LDAH (ENSTGUG00000013165)	GDF7 (ENSTGUG00000020444)	ENSTGUG00000013164	HS1BP3 (ENSTGUG00000013163)	RHOB (ENSTGUG00000019854)	ENSTGUG00000013159	PUM2 (ENSTGUG00000013149) #20	SDC1 (ENSTGUG00000013148) #22	ENSTGUG00000024330	LAPTM4A (ENSTGUG00000013146) #23	MATN3 (ENSTGUG00000013143) #24	WDR35 (ENSTGUG00000013136) #25	TTC32 (ENSTGUG00000013135)	ENSTGUG00000013130	OSR1 (ENSTGUG00000019377)	NT5C1B (ENSTGUG00000013129)	RDH14 (ENSTGUG00000013127)	KCNS3 (ENSTGUG00000013126)	ENSTGUG00000013124	MSGN1 (ENSTGUG00000013122)	VSNL1 (ENSTGUG00000013109)	GEN1 (ENSTGUG00000013117)	SMC6 (ENSTGUG00000013110)
Common canary	MODERN SPECIES	1	WDCP (ENSSCAG00000013913)	MFSD2B (ENSSCAG00000013911)	UBXN2A (ENSSCAG00000013905)	ATAD2B (ENSSCAG00000013891)	KLHL29 (ENSSCAG00000013870)	TDRD15 (ENSSCAG00000013836)	APOB (ENSSCAG00000013554)	LDAH (ENSSCAG00000013455)	ENSSCAG00000013452	GDF7 (ENSSCAG00000013449)	HS1BP3 (ENSSCAG00000013438)	RHOB (ENSSCAG00000013430)	ENSSCAG00000013425	PUM2 (ENSSCAG00000013402) #20	ENSSCAG00000013394	SDC1 (ENSSCAG00000013387) #22	ENSSCAG00000013381	LAPTM4A (ENSSCAG00000013378) #23	MATN3 (ENSSCAG00000013373) #24	WDR35 (ENSSCAG00000013365) #25	TTC32 (ENSSCAG00000013359)	ENSSCAG00000013351	OSR1 (ENSSCAG00000013326)	NT5C1B (ENSSCAG00000013290)	RDH14 (ENSSCAG00000013279)	KCNS3 (ENSSCAG00000013262)	MSGN1 (ENSSCAG00000013255)	GEN1 (ENSSCAG00000013242)	SMC6 (ENSSCAG00000013216)	VSNL1 (ENSSCAG00000013204)	ENSSCAG00000013192
Medium ground finch	MODERN SPECIES	21							TDRD15 (ENSGFOG00000010131)	APOB (ENSGFOG00000010155)	LDAH (ENSGFOG00000010320)	GDF7 (ENSGFOG00000010332)	HS1BP3 (ENSGFOG00000010343)	RHOB (ENSGFOG00000010348)	ENSGFOG00000010354	PUM2 (ENSGFOG00000010379) #20	ENSGFOG00000010411	SDC1 (ENSGFOG00000010416) #22	ENSGFOG00000010430	LAPTM4A (ENSGFOG00000010443) #23	MATN3 (ENSGFOG00000010458) #24	WDR35 (ENSGFOG00000010480) #25	ENSGFOG00000010484	OSR1 (ENSGFOG00000010486)	NT5C1B (ENSGFOG00000010490)	RDH14 (ENSGFOG00000010495)	KCNS3 (ENSGFOG00000010498)	GEN1 (ENSGFOG00000010501)	SMC6 (ENSGFOG00000010514)	VSNL1 (ENSGFOG00000010531)	CYRIA (ENSGFOG00000010538)	MYCN (ENSGFOG00000010546)	DDX1 (ENSGFOG00000010553)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000180923	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
Golden eagle	MODERN SPECIES	6	WDCP (ENSACCG00020010661)	MFSD2B (ENSACCG00020010686)	UBXN2A (ENSACCG00020010703)	ATAD2B (ENSACCG00020010718)	KLHL29 (ENSACCG00020010747)	TDRD15 (ENSACCG00020010769)	APOB (ENSACCG00020010784)	LDAH (ENSACCG00020010799)	GDF7 (ENSACCG00020010813)	HS1BP3 (ENSACCG00020010832)	RHOB (ENSACCG00020010848)	ENSACCG00020010855	ENSACCG00020010869	PUM2 (ENSACCG00020010910) #20	ENSACCG00020010949	SDC1 (ENSACCG00020010958) #22	ENSACCG00020010982	LAPTM4A (ENSACCG00020011001) #23	MATN3 (ENSACCG00020011023) #24	WDR35 (ENSACCG00020011082) #25	ENSACCG00020011110	OSR1 (ENSACCG00020011118)	NT5C1B (ENSACCG00020011126)	RDH14 (ENSACCG00020011134)	KCNS3 (ENSACCG00020011140)	MSGN1 (ENSACCG00020011146)	GEN1 (ENSACCG00020011155)	SMC6 (ENSACCG00020011179)	VSNL1 (ENSACCG00020011201)	ENSACCG00020011205	CYRIA (ENSACCG00020011233)
Kakapo	MODERN SPECIES	23	ENSSHBG00005011092	WDCP (ENSSHBG00005011059)	MFSD2B (ENSSHBG00005010986)	UBXN2A (ENSSHBG00005010922)	ATAD2B (ENSSHBG00005010123)	KLHL29 (ENSSHBG00005009964)	TDRD15 (ENSSHBG00005009933)	APOB (ENSSHBG00005009898)	LDAH (ENSSHBG00005009862)	ENSSHBG00005009844	GDF7 (ENSSHBG00005009832)	HS1BP3 (ENSSHBG00005009814)	RHOB (ENSSHBG00005009806)	ENSSHBG00005009714	PUM2 (ENSSHBG00005009670) #20	SDC1 (ENSSHBG00005009652) #22	ENSSHBG00005009640	LAPTM4A (ENSSHBG00005009614) #23	WDR35 (ENSSHBG00005009592) #25	TTC32 (ENSSHBG00005009581)	OSR1 (ENSSHBG00005009574)	NT5C1B (ENSSHBG00005009567)	RDH14 (ENSSHBG00005009558)	KCNS3 (ENSSHBG00005009545)	MSGN1 (ENSSHBG00005009540)	ENSSHBG00005009523	SMC6 (ENSSHBG00005009502)	VSNL1 (ENSSHBG00005009485)	CYRIA (ENSSHBG00005009457)	MYCN (ENSSHBG00005009434)	DDX1 (ENSSHBG00005009418)
African ostrich	MODERN SPECIES	205												RHOB (ENSSCUG00000002415)	ENSSCUG00000002417	ENSSCUG00000002420	PUM2 (ENSSCUG00000002422) #20	ENSSCUG00000002428 #22	ENSSCUG00000002430	LAPTM4A (ENSSCUG00000002434) #23	MATN3 (ENSSCUG00000002436) #24	WDR35 (ENSSCUG00000002445) #25	ENSSCUG00000002461	OSR1 (ENSSCUG00000002467)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	38	ENSCPRG00005004596	WDCP (ENSCPRG00005004611)	ENSCPRG00005004618	UBXN2A (ENSCPRG00005004621)	ATAD2B (ENSCPRG00005004626)	KLHL29 (ENSCPRG00005004677)	ENSCPRG00005004697	TDRD15 (ENSCPRG00005004718)	APOB (ENSCPRG00005004760)	LDAH (ENSCPRG00005004941)	HS1BP3 (ENSCPRG00005004967)	RHOB (ENSCPRG00005004980)	ENSCPRG00005004985	ENSCPRG00005004993	PUM2 (ENSCPRG00005005047) #20	SDC1 (ENSCPRG00005005072) #22	LAPTM4A (ENSCPRG00005005092) #23	MATN3 (ENSCPRG00005005148) #24	WDR35 (ENSCPRG00005005160) #25	TTC32 (ENSCPRG00005005187)	OSR1 (ENSCPRG00005005214)	ENSCPRG00005005234	NT5C1B (ENSCPRG00005005265)	RDH14 (ENSCPRG00005005281)	KCNS3 (ENSCPRG00005005307)	MSGN1 (ENSCPRG00005005322)	GEN1 (ENSCPRG00005005337)	ENSCPRG00005005424	ENSCPRG00005005504	VSNL1 (ENSCPRG00005005557)	ENSCPRG00005005559
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00940000164003	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000001660.e	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.s #23	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000165918	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b
painted turtle	MODERN SPECIES	2397	WDCP (ENSCPBG00000020036)	MFSD2B (ENSCPBG00000020034)	UBXN2A (ENSCPBG00000020031)	ATAD2B (ENSCPBG00000020023)	KLHL29 (ENSCPBG00000020014)	TDRD15 (ENSCPBG00000020009)	APOB (ENSCPBG00000019999)	LDAH (ENSCPBG00000019987)	GDF7 (ENSCPBG00000019983)	ENSCPBG00000019982	HS1BP3 (ENSCPBG00000019981)	RHOB (ENSCPBG00000019979)	ENSCPBG00000019977	ENSCPBG00000019973	PUM2 (ENSCPBG00000019966) #20	SDC1 (ENSCPBG00000019963) #22	ENSCPBG00000019959 #23	WDR35 (ENSCPBG00000019949) #25	TTC32 (ENSCPBG00000019945)	ENSCPBG00000019943	VPS26A (ENSCPBG00000019942)	SRGN (ENSCPBG00000019940)	KIFBP (ENSCPBG00000019939)	ENSCPBG00000019937	ENSCPBG00000019934	STOX1 (ENSCPBG00000019930)	CCAR1 (ENSCPBG00000019635)	TET1 (ENSCPBG00000019599)	SLC25A16 (ENSCPBG00000019596)	DNA2 (ENSCPBG00000019591)	RUFY2 (ENSCPBG00000019578)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	15	WDCP (ENSTMTG00000006464)	MFSD2B (ENSTMTG00000006392)	UBXN2A (ENSTMTG00000006362)	ATAD2B (ENSTMTG00000006299)	KLHL29 (ENSTMTG00000006263)	TDRD15 (ENSTMTG00000006240)	APOB (ENSTMTG00000006158)	LDAH (ENSTMTG00000006126)	ENSTMTG00000006106	GDF7 (ENSTMTG00000006100)	HS1BP3 (ENSTMTG00000006074)	RHOB (ENSTMTG00000006061)	ENSTMTG00000006051	ENSTMTG00000005951	PUM2 (ENSTMTG00000005851) #20	SDC1 (ENSTMTG00000005833) #22	ENSTMTG00000005813 #23	WDR35 (ENSTMTG00000005747) #25	TTC32 (ENSTMTG00000005737)	ENSTMTG00000005663	OSR1 (ENSTMTG00000005645)	ENSTMTG00000005639	NT5C1B (ENSTMTG00000004549)	RDH14 (ENSTMTG00000004538)	KCNS3 (ENSTMTG00000004528)	MSGN1 (ENSTMTG00000004516)	GEN1 (ENSTMTG00000004477)	SMC6 (ENSTMTG00000003697)	VSNL1 (ENSTMTG00000003601)	RAD51AP2 (ENSTMTG00000003579)	CYRIA (ENSTMTG00000003533)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00950000185286	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000164003	ENSGT00940000162520.d	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00470000042500	ENSGT00390000015159.a.b	ENSGT00940000158432.jb.a	ENSGT00940000155678
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	346												RHOB (ENSCABG00000007182)	ENSCABG00000007183	PUM2 (ENSCABG00000007185) #20	ENSCABG00000007190	SDC1 (ENSCABG00000007194) #22	LAPTM4A (ENSCABG00000007199) #23	WDR35 (ENSCABG00000007203) #25	TTC32 (ENSCABG00000007209)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	17	WDCP (ENSGEVG00005004579)	MFSD2B (ENSGEVG00005004631)	UBXN2A (ENSGEVG00005004707)	ATAD2B (ENSGEVG00005004743)	KLHL29 (ENSGEVG00005004803)	TDRD15 (ENSGEVG00005004857)	APOB (ENSGEVG00005004982)	LDAH (ENSGEVG00005005455)	GDF7 (ENSGEVG00005005483)	ENSGEVG00005005503	HS1BP3 (ENSGEVG00005005524)	RHOB (ENSGEVG00005005543)	ENSGEVG00005005556	ENSGEVG00005005576	PUM2 (ENSGEVG00005005679) #20	ENSGEVG00005005777 #22	LAPTM4A (ENSGEVG00005005801) #23	WDR35 (ENSGEVG00005005855) #25	TTC32 (ENSGEVG00005005918)	OSR1 (ENSGEVG00005005926)	NT5C1B (ENSGEVG00005005960)	RDH14 (ENSGEVG00005005984)	KCNS3 (ENSGEVG00005006009)	MSGN1 (ENSGEVG00005006020)	GEN1 (ENSGEVG00005006047)	SMC6 (ENSGEVG00005006087)	VSNL1 (ENSGEVG00005006120)	RAD51AP2 (ENSGEVG00005006144)	CYRIA (ENSGEVG00005006179)	ENSGEVG00005006200	DDX1 (ENSGEVG00005006272)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2214												RHOB (ENSPSIG00000011554)	ENSPSIG00000001835	ENSPSIG00000011571	PUM2 (ENSPSIG00000011626) #20	SDC1 (ENSPSIG00000011638) #22	LAPTM4A (ENSPSIG00000011641) #23	WDR35 (ENSPSIG00000011703) #25	TTC32 (ENSPSIG00000011713)	ENSPSIG00000011721	OSR1 (ENSPSIG00000011751)	NT5C1B (ENSPSIG00000011766)	RDH14 (ENSPSIG00000001840)	KCNS3 (ENSPSIG00000001843)	ENSPSIG00000011815	MSGN1 (ENSPSIG00000001846)	GEN1 (ENSPSIG00000011938)	SMC6 (ENSPSIG00000012096)	VSNL1 (ENSPSIG00000012117)	ENSPSIG00000001849	ENSPSIG00000012137
Anura	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000153311.a.b.b	ENSGT00390000001660.h	ENSGT00390000001660.g	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a	ENSGT00940000156513	ENSGT00960000192062	ENSGT00390000015159.a.b
Frog	MODERN SPECIES	5	ENSXETG00000026107	klhl29 (ENSXETG00000018212)	ENSXETG00000026762	tdrd15 (ENSXETG00000007137)	ENSXETG00000045691	ENSXETG00000041499	ENSXETG00000042933	ENSXETG00000045547	ENSXETG00000045091	ldah (ENSXETG00000008907)	gdf7 (ENSXETG00000008906)	hs1bp3 (ENSXETG00000008905)	rhob (ENSXETG00000026772)	slc7a15 (ENSXETG00000008904)	pum2 (ENSXETG00000008903) #20	sdc1 (ENSXETG00000049205) #22	laptm4a (ENSXETG00000008012) #23	matn3 (ENSXETG00000008005) #24	wdr35 (ENSXETG00000008003) #25	ENSXETG00000007995	ENSXETG00000046042	ttc32 (ENSXETG00000039846)	osr1 (ENSXETG00000036783)	nt5c1a (ENSXETG00000015581)	rdh14 (ENSXETG00000015578)	kcns3 (ENSXETG00000015573)	zpax (ENSXETG00000015572)	msgn1 (ENSXETG00000015571)	gen1 (ENSXETG00000015570)	ENSXETG00000045739	smc6 (ENSXETG00000044652)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	7	ITSN2 (ENSLLEG00000007560)	ENSLLEG00000007507	PFN4 (ENSLLEG00000007481)	TP53I3 (ENSLLEG00000007436)	SF3B6 (ENSLLEG00000007404)	FKBP1B (ENSLLEG00000007153)	ENSLLEG00000007049	ENSLLEG00000007029	ENSLLEG00000007009	MFSD2B (ENSLLEG00000006927)	UBXN2A (ENSLLEG00000006887)	ATAD2B (ENSLLEG00000006684)	KLHL29 (ENSLLEG00000006543)	ENSLLEG00000006503	ENSLLEG00000006434	ENSLLEG00000006397 #22	ENSLLEG00000006281 #23	MATN3 (ENSLLEG00000006234) #24	WDR35 (ENSLLEG00000005278) #25	TTC32 (ENSLLEG00000005155)	ENSLLEG00000005137	ENSLLEG00000005126	OSR1 (ENSLLEG00000005107)	ENSLLEG00000005093	ENSLLEG00000005070	ENSLLEG00000005052	ENSLLEG00000005033	ENSLLEG00000005024	ENSLLEG00000005010	NT5C1B (ENSLLEG00000004984)	RDH14 (ENSLLEG00000004975)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	135	ENSGT00390000005318.b.b.a	ENSGT00520000055567.a.b	ENSGT00550000074694.b	ENSGT00940000158824	ENSGT00940000161329	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000160181	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00530000063712.a.b	ENSGT00940000159266	ENSGT00550000074816.A.a
Reedfish	MODERN SPECIES	11	wdcp (ENSECRG00000001218)	mfsd2b (ENSECRG00000001235)	UBXN2A (ENSECRG00000001256)	ENSECRG00000001290	ENSECRG00000001328	KLHL29 (ENSECRG00000001368)	ENSECRG00000001410	dusp23b (ENSECRG00000001420)	ldah (ENSECRG00000001438)	GDF7 (ENSECRG00000001462)	HS1BP3 (ENSECRG00000001484)	RHOB (ENSECRG00000001498)	RHOB (ENSECRG00000001509)	ENSECRG00000001518	PUM2 (ENSECRG00000001544) #20	SDC1 (ENSECRG00000001593) #22	laptm4a (ENSECRG00000001613) #23	matn3b (ENSECRG00000001671) #24	wdr35 (ENSECRG00000001740) #25	ttc32 (ENSECRG00000001872)	osr1 (ENSECRG00000001887)	ENSECRG00000001903	nt5c1ba (ENSECRG00000001925)	rdh14b (ENSECRG00000001958)	QPCT (ENSECRG00000002000)	mns1 (ENSECRG00000002013)	ENSECRG00000002024	stxbp2 (ENSECRG00000002035)	ENSECRG00000002045	ENSECRG00000002055	ENSECRG00000002073
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	91					ENSGT00940000161329	ENSGT00940000162581	ENSGT00590000083139	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581 #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00940000155979	ENSGT00940000160181	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000159420	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00390000006845	ENSGT00940000156775	ENSGT00940000164048
Spotted gar	DUPLICATION
Spotted gar	MODERN SPECIES	647	adi1 (ENSLOCG00000017213)	rnaseh1 (ENSLOCG00000017212)	rps7 (ENSLOCG00000017211)	colec11 (ENSLOCG00000017210)	allc (ENSLOCG00000017209)	ENSLOCG00000017208	dusp23b (ENSLOCG00000017207)	tdrd15 (ENSLOCG00000017206)	apobb.1 (ENSLOCG00000017204)	ldah (ENSLOCG00000017202)	GDF7 (ENSLOCG00000017201)	hs1bp3 (ENSLOCG00000017199)	ENSLOCG00000017876	ENSLOCG00000017197	PUM2 (ENSLOCG00000017196) #20	ENSLOCG00000017195 #22	laptm4a (ENSLOCG00000017194) #23	matn3b (ENSLOCG00000017193) #24	wdr35 (ENSLOCG00000017192) #25	ttc32 (ENSLOCG00000017191)	ENSLOCG00000017190	kcns3a (ENSLOCG00000017189)	rdh14b (ENSLOCG00000017188)	nt5c1ba (ENSLOCG00000017187)	osr1 (ENSLOCG00000017186)	osr1 (ENSLOCG00000017185)	ENSLOCG00000017184	ENSLOCG00000017183	utp25 (ENSLOCG00000017182)	SYT14 (ENSLOCG00000017181)	SERTAD4 (ENSLOCG00000017180)
Spotted gar	MODERN SPECIES	672	cnksr1 (ENSLOCG00000005495)	rps6ka1 (ENSLOCG00000005457)	asap3 (ENSLOCG00000005435)	E2F2 (ENSLOCG00000005413)	id3 (ENSLOCG00000005395)	ENSLOCG00000005379	ythdf2 (ENSLOCG00000005362)	vgll2b (ENSLOCG00000005348)	ctsl.1 (ENSLOCG00000005329)	ctsl.1 (ENSLOCG00000005309)	fabp3 (ENSLOCG00000005299)	zcchc17 (ENSLOCG00000005280)	snrnp40 (ENSLOCG00000005258)	nkain1 (ENSLOCG00000005227)	pum1 (ENSLOCG00000005210)	ENSLOCG00000005176 #22	ENSLOCG00000005164	ENSLOCG00000018285	ENSLOCG00000005149 ##23	matn1 (ENSLOCG00000005128)	SESN2 (ENSLOCG00000005106)	ENSLOCG00000005086	ENSLOCG00000018284	ENSLOCG00000005054	ENSLOCG00000005034	ENSLOCG00000005016	ENSLOCG00000004978	ENSLOCG00000004946	zgc:114119 (ENSLOCG00000004930)	ENSLOCG00000004913	ENSLOCG00000004899
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000155646	ENSGT00390000004263.b	ENSGT00390000007900	ENSGT00950000182995.e.a.a.a	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d	ENSGT00590000083139.c	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.h	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b #23	ENSGT00940000157581.a #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000157581.b #24	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000163503.B	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000160181.j	ENSGT00940000155979.g	ENSGT00940000160181.i	ENSGT00390000017767.b.a	ENSGT00940000158993	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000159420	ENSGT00530000063876.a
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000161171 #22
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000161171 #22
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000161171 #22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00940000154164.c.a.d	ENSGT01030000234517.B.b.l	ENSGT00940000153916.B	ENSGT00940000160213.a.d	ENSGT00390000007900.f	ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc	ENSGT00940000165355.b	ENSGT00940000165355.a	ENSGT00940000160213.b	ENSGT00940000155646.k	ENSGT00940000154645.A.e.a	ENSGT00590000083139.d.b.b	ENSGT00590000083139.d.a	ENSGT00590000083139.d.b.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.x #23	ENSGT00940000157581.b #24	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000002089.a.a.a.a	ENSGT00940000156484.b.e.b.c
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT01030000234517.B.b.l	ENSGT00940000153916.B	ENSGT00940000160213.a.d	ENSGT00390000007900.f	ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc	ENSGT00940000165355.b	ENSGT00940000165355.a	ENSGT00940000160213.b	ENSGT00940000155646.k	ENSGT00940000154645.A.e.a	ENSGT00590000083139.d.b.a	ENSGT00590000083139.d.b.b	ENSGT00590000083139.d.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v	ENSGT00990000207468	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.x #23	ENSGT00940000157581.b #24	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000002089.a.a.a.a	ENSGT00940000156484.b.e.b.c
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT01030000234517.B.b.l	ENSGT00940000153916.B	ENSGT00940000160213.a.d	ENSGT00390000007900.f	ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc	ENSGT00940000165355.b	ENSGT00940000165355.a	ENSGT00940000160213.b	ENSGT00940000155646.k	ENSGT00940000154645.A.e.a	ENSGT00590000083139.d.b.a	ENSGT00590000083139.d.b.b	ENSGT00590000083139.d.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v	ENSGT00990000207468	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.x #23	ENSGT00940000157581.b #24	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000002089.a.a.a.a	ENSGT00940000156484.b.e.b.c
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT01030000234517.B.b.l	ENSGT00940000153916.B	ENSGT00940000160213.a.d	ENSGT00390000007900.f	ENSGT00950000182995.e.a.a.a.bc	ENSGT00940000165355.b	ENSGT00940000165355.a	ENSGT00940000160213.b	ENSGT00940000155646.k	ENSGT00940000154645.A.e.a	ENSGT00590000083139.d.b.a	ENSGT00590000083139.d.b.b	ENSGT00590000083139.d.a	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.v	ENSGT00990000207468	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.x #23	ENSGT00940000157581.b #24	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000002089.a.a.a.a	ENSGT00940000156484.b.e.b.c
Coho salmon	MODERN SPECIES	3	mrap2b (ENSOKIG00005005432)	ENSOKIG00005005439	ENSOKIG00005005448	ENSOKIG00005005517	ENSOKIG00005005566	sobpb (ENSOKIG00005005571)	ROCK2 (ENSOKIG00005005634)	SLC66A3 (ENSOKIG00005005791)	kcnf1a (ENSOKIG00005005806)	pdia6 (ENSOKIG00005005873)	hpcal1 (ENSOKIG00005006350)	apobb.1 (ENSOKIG00005006499)	ENSOKIG00005007827	ENSOKIG00005010529	RHOB (ENSOKIG00005010534)	ENSOKIG00005010537 #22	laptm4a (ENSOKIG00005010543) #23	MATN3 (ENSOKIG00005010560) #24	zpax1 (ENSOKIG00005010609)	kcns3b (ENSOKIG00005010724)	mideasa (ENSOKIG00005010729)	ttbk2b (ENSOKIG00005010741)	churc1 (ENSOKIG00005010750)	ENSOKIG00005010777	CAPN3 (ENSOKIG00005010921)	nrbp1 (ENSOKIG00005012412)	ENSOKIG00005012488	rhag (ENSOKIG00005012532)	rd3 (ENSOKIG00005012927)	slc30a1a (ENSOKIG00005012933)	nek2 (ENSOKIG00005012940)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	603												ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.h	ENSGT00940000162520.g	ENSGT00940000161171 #22
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	624												ENSGT00390000013092	ENSGT00940000163656	ENSGT00940000162520.h	ENSGT00940000162520.g	ENSGT00940000161171 #22
Denticle herring	DUPLICATION
Denticle herring	MODERN SPECIES		ENSDCDG00000000808	ENSDCDG00000000806	ENSDCDG00000000776	zbtb8os (ENSDCDG00000000760)	ENSDCDG00000000758	khdrbs1a (ENSDCDG00000000734)	tmem39b (ENSDCDG00000000729)	ccdc28b (ENSDCDG00000000727)	hs1bp3 (ENSDCDG00000000725)	ENSDCDG00000000724	ENSDCDG00000000722	ENSDCDG00000000720	ENSDCDG00000000717	ENSDCDG00000000714	ENSDCDG00000000713	ENSDCDG00000000710 #22	ENSDCDG00000000707	ENSDCDG00000000701	ENSDCDG00000000700	ENSDCDG00000000697	ENSDCDG00000000693 #22	HPCAL1 (ENSDCDG00000000689)	gnmt (ENSDCDG00000000661)	kcnk5a (ENSDCDG00000000650)	ENSDCDG00000000645	kif6 (ENSDCDG00000000606)	DAAM2 (ENSDCDG00000000458)	mocs1 (ENSDCDG00000000393)	fosl2 (ENSDCDG00000000373)	babam2 (ENSDCDG00000000349)	rbks (ENSDCDG00000000322)
Denticle herring	MODERN SPECIES		khdrbs1a (ENSDCDG00000000734)	tmem39b (ENSDCDG00000000729)	ccdc28b (ENSDCDG00000000727)	hs1bp3 (ENSDCDG00000000725)	ENSDCDG00000000724	ENSDCDG00000000722	ENSDCDG00000000720	ENSDCDG00000000717	ENSDCDG00000000714	ENSDCDG00000000713	ENSDCDG00000000710 #22	ENSDCDG00000000707	ENSDCDG00000000701	ENSDCDG00000000700	ENSDCDG00000000697	ENSDCDG00000000693 #22	HPCAL1 (ENSDCDG00000000689)	gnmt (ENSDCDG00000000661)	kcnk5a (ENSDCDG00000000650)	ENSDCDG00000000645	kif6 (ENSDCDG00000000606)	DAAM2 (ENSDCDG00000000458)	mocs1 (ENSDCDG00000000393)	fosl2 (ENSDCDG00000000373)	babam2 (ENSDCDG00000000349)	rbks (ENSDCDG00000000322)	mrpl33 (ENSDCDG00000000300)	ENSDCDG00000000289	SLC4A1AP (ENSDCDG00000000264)	supt7l (ENSDCDG00000000241)	LRFN2 (ENSDCDG00000000231)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	5											ENSCHAG00000024001	ENSCHAG00000023998	serpinb1l3 (ENSCHAG00000023955)	ENSCHAG00000023939	ERG28 (ENSCHAG00000023929)	ENSCHAG00000023921 #22	RHOB (ENSCHAG00000023918)	ENSCHAG00000023914	gnmt (ENSCHAG00000023902)	kcnk5a (ENSCHAG00000023893)	ENSCHAG00000023884	ENSCHAG00000023873	kif6 (ENSCHAG00000023850)	DAAM2 (ENSCHAG00000022109)	mocs1 (ENSCHAG00000021890)	fosl2 (ENSCHAG00000021875)	babam2 (ENSCHAG00000021811)	rbks (ENSCHAG00000021795)	ENSCHAG00000021781	ENSCHAG00000021772	ENSCHAG00000021751
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	445												ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.h	ENSGT00940000162520.g	ENSGT00940000161171 #22
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000154790.b.a.b	ENSGT00930000151014.q	ENSGT00940000159815	ENSGT00940000155454.w.a	ENSGT00940000155454.w.b	ENSGT00940000154297.A.g.a	ENSGT00940000159057	ENSGT00390000012703.b	ENSGT00940000153117.B	ENSGT00940000156723	ENSGT00940000160884	ENSGT00940000155823.A	ENSGT00390000013092	ENSGT00940000163656	ENSGT00940000162520.g.f	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00950000182995.e.a.a.a	ENSGT00390000007900	ENSGT00390000004263.b	ENSGT00940000155646.m	ENSGT01030000234667.b.f.b	ENSGT00940000164908	ENSGT00940000157666	ENSGT00940000155671.y.a	ENSGT00730000111137	ENSGT00390000002448	ENSGT00390000008195	ENSGT00940000158751	ENSGT00770000120838.B.c	ENSGT00940000156891.a.a	ENSGT00960000187083
Channel catfish	MODERN SPECIES	28	rps6kl1 (ENSIPUG00000007905)	ENSIPUG00000007940	ENSIPUG00000008106	LRRC74A (ENSIPUG00000008118)	angel1 (ENSIPUG00000008142)	VASH1 (ENSIPUG00000008160)	fcf1 (ENSIPUG00000008200)	arel1 (ENSIPUG00000008259)	ENSIPUG00000008341	hs1bp3 (ENSIPUG00000008403)	RHOB (ENSIPUG00000008426)	ENSIPUG00000008447	ENSIPUG00000008462	ENSIPUG00000008477	ENSIPUG00000008489	sdc1 (ENSIPUG00000008506) #22	HPCAL1 (ENSIPUG00000008521)	Odc1 (ENSIPUG00000008600)	odc1 (ENSIPUG00000008659)	nol10 (ENSIPUG00000008691)	ATP6V1C2 (ENSIPUG00000008783)	CCR6 (ENSIPUG00000008828)	pxdn (ENSIPUG00000008838)	MYT1L (ENSIPUG00000008902)	tssc1 (ENSIPUG00000008984)	trappc12 (ENSIPUG00000009023)	adi1 (ENSIPUG00000009069)	psen1 (ENSIPUG00000009094)	papln (ENSIPUG00000009136)	ENSIPUG00000009243	ENSIPUG00000009251
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000154790.b.a.b	ENSGT00930000151014.q	ENSGT00940000159815	ENSGT00940000155454.w.a	ENSGT00940000155454.w.b	ENSGT00940000154297.A.g.a	ENSGT00940000159057	ENSGT00390000012703.b	ENSGT00940000153117.B	ENSGT00940000156723	ENSGT00940000160884	ENSGT00940000155823.A	ENSGT00390000013092	ENSGT00940000163656	ENSGT00940000162520.g.f	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00950000182995.e.a.a.a	ENSGT00390000007900	ENSGT00390000004263.b	ENSGT00940000155646.m	ENSGT01030000234667.b.f.b	ENSGT00940000164908	ENSGT00940000157666	ENSGT00940000155671.y.a	ENSGT00940000155671.z	ENSGT00730000111137	ENSGT00390000002448	ENSGT00390000008195	ENSGT00940000158751	ENSGT00770000120838.B.c	ENSGT00940000156891.a.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00930000151014.q	ENSGT00940000159815	ENSGT00940000155454.w.a	ENSGT00940000155454.w.b	ENSGT00940000154297.A.g.a	ENSGT00940000159057	ENSGT00390000012703.b	ENSGT00940000153117.B	ENSGT00940000156723	ENSGT00940000160884	ENSGT00940000155823.A	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.h	ENSGT00940000162520.g.e	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00950000182995.e.a.a.a	ENSGT00390000007900	ENSGT00390000004263.b	ENSGT00940000155646.m	ENSGT01030000234667.b.f.b	ENSGT00940000164908	ENSGT00940000157666	ENSGT00940000155671.y.a	ENSGT00940000155671.z	ENSGT00730000111137	ENSGT00390000002448	ENSGT00390000008195	ENSGT00940000158751	ENSGT00770000120838.B.c
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	24	camk2n1a (ENSAMXG00000031429)	ENSAMXG00000041346	ncapd2 (ENSAMXG00000014774)	acsm3 (ENSAMXG00000014820)	ENSAMXG00000035132	YEATS2 (ENSAMXG00000014837)	klhl24a (ENSAMXG00000014840)	ENSAMXG00000026276	ENSAMXG00000026277	mterf4 (ENSAMXG00000036876)	ENSAMXG00000014843	ENSAMXG00000043609	hs1bp3 (ENSAMXG00000032736)	RHOB (ENSAMXG00000026330)	ENSAMXG00000040525	SDC1 (ENSAMXG00000030549) #22	HPCAL1 (ENSAMXG00000031023)	odc1 (ENSAMXG00000014026)	nol10 (ENSAMXG00000014006)	ATP6V1C2 (ENSAMXG00000013973)	PDIA6 (ENSAMXG00000013951)	CCR6 (ENSAMXG00000026329)	zgc:113142 (ENSAMXG00000037721)	PXDN (ENSAMXG00000013926)	ENSAMXG00000029091	ENSAMXG00000043399	eipr1 (ENSAMXG00000039015)	trappc12 (ENSAMXG00000013846)	ENSAMXG00000030074	ENSAMXG00000039631	adi1 (ENSAMXG00000035568)
Electric eel	MODERN SPECIES	239		ENSEEEG00000009318	ENSEEEG00000009313	ENSEEEG00000009311	LRRC74A (ENSEEEG00000009308)	ENSEEEG00000009302	VASH1 (ENSEEEG00000009301)	fcf1 (ENSEEEG00000009294)	AREL1 (ENSEEEG00000009288)	ENSEEEG00000009285	hs1bp3 (ENSEEEG00000009284)	ENSEEEG00000009281	ENSEEEG00000009277	ENSEEEG00000009276	ENSEEEG00000009275	ENSEEEG00000009273 #22	HPCAL1 (ENSEEEG00000009263)	odc1 (ENSEEEG00000009262)	nol10 (ENSEEEG00000008867)	ENSEEEG00000008857	PDIA6 (ENSEEEG00000008784)	CCR6 (ENSEEEG00000008778)	ENSEEEG00000008777	PXDN (ENSEEEG00000008770)	ENSEEEG00000008767	ENSEEEG00000008766	eipr1 (ENSEEEG00000008763)	trappc12 (ENSEEEG00000008543)	adi1 (ENSEEEG00000008533)	psen1 (ENSEEEG00000008493)	ENSEEEG00000008486
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000161171 #22
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000161171 #22
Goldfish	MODERN SPECIES	10	crtap (ENSCARG00000044077)	ENSCARG00000044060	fbxl2 (ENSCARG00000043901)	clasp2 (ENSCARG00000033627)	ubp1 (ENSCARG00000031869)	pdcd6ip (ENSCARG00000029920)	ENSCARG00000029843	ENSCARG00000029833	cyhr1 (ENSCARG00000029823)	DCLK3 (ENSCARG00000029807)	fabp3 (ENSCARG00000029792)	zcchc17 (ENSCARG00000029769)	snrnp40 (ENSCARG00000029636)	nkain1 (ENSCARG00000029596)	pum1 (ENSCARG00000029238)	ENSCARG00000029181 #22	ENSCARG00000029176	matn1 (ENSCARG00000029150)	sesn2 (ENSCARG00000029114)	yrk (ENSCARG00000028409)	AHDC1 (ENSCARG00000028377)	wasf2 (ENSCARG00000028362)	CD164L2 (ENSCARG00000028352)	si:ch211-199g17.9 (ENSCARG00000028332)	fam83hb (ENSCARG00000028324)	KIAA0319L (ENSCARG00000027964)	cap1 (ENSCARG00000027483)	ppt1 (ENSCARG00000027147)	ENSCARG00000027076	ENSCARG00000026858	ENSCARG00000026826
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000155646	ENSGT00390000004263.b	ENSGT00390000007900	ENSGT00950000182995.e.a.a.a	ENSGT00940000154645.A	ENSGT00590000083139.d	ENSGT00590000083139.c	ENSGT00390000009688	ENSGT00950000185286	ENSGT00940000160140.b	ENSGT00390000013092	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b	ENSGT00940000162520.h	ENSGT00940000177852	ENSGT00940000157575 #20	ENSGT00940000161171 #22	ENSGT00940000153446.b.`b #23	ENSGT00940000157581.a #24	ENSGT00940000155745 #25	ENSGT00940000155979.g
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	609														ablim1b (ENSPKIG00000003690)	fhip2a (ENSPKIG00000003753)	ENSPKIG00000003815 #22	ENSPKIG00000003828	trub1 (ENSPKIG00000003852)	ATRNL1 (ENSPKIG00000003893)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	6	si:dkey-18j18.3 (ENSSFOG00015031625)	KCNF1 (ENSSFOG00015002954)	pdia6 (ENSSFOG00015002978)	ATP6V1C2 (ENSSFOG00015003022)	nol10 (ENSSFOG00015003083)	odc1 (ENSSFOG00015003183)	hpcal1 (ENSSFOG00015025652)	ENSSFOG00015003230	APOB (ENSSFOG00015003291)	ldah (ENSSFOG00015003305)	GDF7 (ENSSFOG00015026533)	hs1bp3 (ENSSFOG00015028023)	RHOB (ENSSFOG00015003377)	ENSSFOG00015003397	PUM2 (ENSSFOG00015003476) #20	ENSSFOG00015031760 #22	ENSSFOG00015003579	LAPTM4A (ENSSFOG00015003600) #23	matn3b (ENSSFOG00015003648) #24	wdr35 (ENSSFOG00015003709) #25	ENSSFOG00015003816	ENSSFOG00015003956	kcns3a (ENSSFOG00015003986)	rdh14a (ENSSFOG00015026208)	NT5C1B (ENSSFOG00015004011)	osr1 (ENSSFOG00015028228)	ENSSFOG00015032465	utp25 (ENSSFOG00015004048)	SYT14 (ENSSFOG00015004079)	SERTAD4 (ENSSFOG00015004110)	gnmt (ENSSFOG00015004123)