Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193 #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193 #22 Amniota DUPLICATION Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.b #22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.b #22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.b #22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.b #22 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.b #22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000179483 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000164784 #13 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000153181 #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00940000153246.b ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294 ENSGT00960000189395 #23 ENSGT00940000155193.b #22 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 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Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159729 #8 ENSGT00390000014476.a #9 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000164784 #13 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000153181 #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000155193.b #22 ENSGT00960000189395 #23 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000178229 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529.a #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000014476.a #9 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000164784 #13 ENSGT00390000007746.c #15 ENSGT00390000007746.d ##15 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ENSGT00940000155193.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 16648 ENSEEUG00000009169 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Pig MODERN SPECIES CEP152 (ENSSSCG00000004657) ENSSSCG00000004656 SHC4 (ENSSSCG00000056133) SECISBP2L (ENSSSCG00000004653) COPS2 (ENSSSCG00000004652) GALK2 (ENSSSCG00000004651) FGF7 (ENSSSCG00000056997) FAM227B (ENSSSCG00000004648) DTWD1 (ENSSSCG00000004647) ATP8B4 (ENSSSCG00000004646) SLC27A2 (ENSSSCG00000004643) HDC (ENSSSCG00000004644) GABPB1 (ENSSSCG00000004645) USP8 (ENSSSCG00000004639) USP50 (ENSSSCG00000004638) ENSSSCG00000034352 ##22 TRPM7 (ENSSSCG00000004636) SPPL2A (ENSSSCG00000004635) AP4E1 (ENSSSCG00000004634) TNFAIP8L3 (ENSSSCG00000031794) ENSSSCG00000054479 CYP19A1 (ENSSSCG00000053670) ENSSSCG00000030168 GLDN (ENSSSCG00000004632) ENSSSCG00000039810 DMXL2 (ENSSSCG00000032517) SCG3 (ENSSSCG00000004630) LYSMD2 (ENSSSCG00000004629) TMOD2 (ENSSSCG00000004628) TMOD3 (ENSSSCG00000004626) LEO1 (ENSSSCG00000004625) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Blue whale MODERN SPECIES 8 RNF19A (ENSBMSG00010018105) ANKRD46 (ENSBMSG00010018073) ENSBMSG00010018067 SNX31 (ENSBMSG00010018001) PABPC1 (ENSBMSG00010017940) YWHAZ (ENSBMSG00010017904) ENSBMSG00010017889 ENSBMSG00010017870 GRHL2 (ENSBMSG00010017745) NCALD (ENSBMSG00010017668) RRM2B (ENSBMSG00010017492) ENSBMSG00010017415 ODF1 (ENSBMSG00010017393) KLF10 (ENSBMSG00010017375) ENSBMSG00010017346 ENSBMSG00010017322 ##22 ATP6V1C1 (ENSBMSG00010017243) BAALC (ENSBMSG00010017221) FZD6 (ENSBMSG00010017195) CTHRC1 (ENSBMSG00010017171) ENSBMSG00010017160 ENSBMSG00010017145 SLC25A32 (ENSBMSG00010017123) DCAF13 (ENSBMSG00010017074) ENSBMSG00010017040 RIMS2 (ENSBMSG00010014935) DPYS (ENSBMSG00010014661) LRP12 (ENSBMSG00010014600) ZFPM2 (ENSBMSG00010014545) OXR1 (ENSBMSG00010013992) ABRA (ENSBMSG00010013771) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 15 ZBTB18 (ENSPCTG00005000940) C1orf100 (ENSPCTG00005000925) ADSS (ENSPCTG00005000901) CATSPERE (ENSPCTG00005000795) ENSPCTG00005000757 DESI2 (ENSPCTG00005000724) ENSPCTG00005000694 HNRNPU (ENSPCTG00005000493) ENSPCTG00005000456 EFCAB2 (ENSPCTG00005000430) KIF26B (ENSPCTG00005000340) SMYD3 (ENSPCTG00005021502) ENSPCTG00005021473 TFB2M (ENSPCTG00005021445) CNST (ENSPCTG00005021399) ENSPCTG00005021352 ##22 CACNA1E (ENSPCTG00005019592) ENSPCTG00005019506 ENSPCTG00005019467 STX6 (ENSPCTG00005019442) KIAA1614 (ENSPCTG00005019349) XPR1 (ENSPCTG00005019252) ACBD6 (ENSPCTG00005019211) LHX4 (ENSPCTG00005019157) QSOX1 (ENSPCTG00005019117) CEP350 (ENSPCTG00005018577) TOR1AIP1 (ENSPCTG00005018479) TOR1AIP2 (ENSPCTG00005018436) FAM163A (ENSPCTG00005018398) ENSPCTG00005018344 TDRD5 (ENSPCTG00005017997) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 9 ENSDLEG00000002593 PABPC1 (ENSDLEG00000002559) ENSDLEG00000002547 YWHAZ (ENSDLEG00000002530) ZNF706 (ENSDLEG00000002515) ENSDLEG00000002509 ENSDLEG00000002486 NCALD (ENSDLEG00000002477) ENSDLEG00000002467 ENSDLEG00000002455 UBR5 (ENSDLEG00000000868) ODF1 (ENSDLEG00000000527) KLF10 (ENSDLEG00000000497) AZIN1 (ENSDLEG00000000468) ENSDLEG00000000455 ENSDLEG00000000448 ##22 ATP6V1C1 (ENSDLEG00000000414) BAALC (ENSDLEG00000000404) FZD6 (ENSDLEG00000000391) CTHRC1 (ENSDLEG00000000371) ENSDLEG00000000359 ENSDLEG00000000349 SLC25A32 (ENSDLEG00000000328) DCAF13 (ENSDLEG00000000311) ENSDLEG00000000297 ENSDLEG00000000242 ENSDLEG00000000209 RIMS2 (ENSDLEG00000000186) DCSTAMP (ENSDLEG00000000167) ENSDLEG00000000154 DPYS (ENSDLEG00000000131) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01050000244841.A.b.b.a ENSGT00390000011239 ENSGT00940000158160 ENSGT00940000156858 ENSGT00940000155306.b ENSGT00940000153456.b.a ENSGT00510000047537.u.a ENSGT01030000234637.a.b.b.r ENSGT00940000161245 ENSGT00940000164338 ENSGT00940000158612 ENSGT00940000154487.B ENSGT00390000017006 ENSGT00530000063554.a ENSGT00940000156866.db.b ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00940000154795 ENSGT00940000157862 ENSGT00990000203541.a.a.a.b ENSGT00390000009380 ENSGT01100000264218 ENSGT00580000081623 ENSGT01070000253775.a.d.a.b.a ENSGT01020000230346.B ENSGT00940000155441.i ENSGT00940000156608 ENSGT00390000017990 ENSGT00940000159546 ENSGT00940000160224 ENSGT00940000156400 ENSGT00390000016680 Bos ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004586.m.b ENSGT00390000011239 ENSGT00940000158160 ENSGT00940000156858 ENSGT00940000155306.b ENSGT00940000153456.b.a ENSGT00510000047537.u.a ENSGT01030000234637.a.b.b.r ENSGT00940000161245 ENSGT00940000164338 ENSGT00940000158612 ENSGT00940000154487.B ENSGT00390000017006 ENSGT00530000063554.a ENSGT00940000156866.db.b ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00940000154795 ENSGT00940000157862 ENSGT00990000203541.a.a.a.b ENSGT00390000009380 ENSGT01100000264218 ENSGT00580000081623 ENSGT01070000253775.a.d.a.b.a ENSGT01020000230346.B ENSGT00940000155441.i ENSGT00940000156608 ENSGT00390000017990 ENSGT00940000159546 ENSGT00940000160224 ENSGT00940000156400 ENSGT00390000016680 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01050000244841.A.b.b.a ENSGT00390000004586.m.b ENSGT00390000011239 ENSGT00940000158160 ENSGT00940000156858 ENSGT00940000155306.b ENSGT00940000153456.b.a ENSGT01030000234637.a.b.b.r ENSGT00940000161245 ENSGT00940000164338 ENSGT00940000158612 ENSGT00940000154487.B ENSGT00390000017006 ENSGT00530000063554.a ENSGT00940000156866.db.b ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00940000154795 ENSGT00940000157862 ENSGT00990000203541.a.a.a.b ENSGT00390000009380 ENSGT01100000264218 ENSGT00580000081623 ENSGT01070000253775.a.d.a.b.a ENSGT01020000230346.B ENSGT00940000155441.i ENSGT00940000156608 ENSGT00390000017990 ENSGT00940000159546 ENSGT00940000156400 ENSGT00940000160224 ENSGT00390000016680 Cow MODERN SPECIES 23 GPR22 (ENSBTAG00000046917) COG5 (ENSBTAG00000005526) HBP1 (ENSBTAG00000005524) PRKAR2B (ENSBTAG00000014958) PIK3CG (ENSBTAG00000020848) CCDC71L (ENSBTAG00000053836) NAMPT (ENSBTAG00000015509) SYPL1 (ENSBTAG00000019794) CDHR3 (ENSBTAG00000021365) ATXN7L1 (ENSBTAG00000049733) ATXN7L1 (ENSBTAG00000002037) EFCAB10 (ENSBTAG00000053355) RINT1 (ENSBTAG00000008302) PUS7 (ENSBTAG00000007743) ENSBTAG00000053913 ENSBTAG00000047286 ##22 SRPK2 (ENSBTAG00000002175) KMT2E (ENSBTAG00000009207) ENSBTAG00000048818 LHFPL3 (ENSBTAG00000000189) ORC5 (ENSBTAG00000040058) ENSBTAG00000052629 RELN (ENSBTAG00000003658) SLC26A5 (ENSBTAG00000009296) PSMC2 (ENSBTAG00000046712) DNAJC2 (ENSBTAG00000003784) PMPCB (ENSBTAG00000006876) NAPEPLD (ENSBTAG00000014171) ARMC10 (ENSBTAG00000014161) LRRC17 (ENSBTAG00000024379) FBXL13 (ENSBTAG00000016324) American bison MODERN SPECIES 3084 DUS4L (ENSBBBG00000008503) GPR22 (ENSBBBG00000003782) COG5 (ENSBBBG00000015295) HBP1 (ENSBBBG00000001394) PRKAR2B (ENSBBBG00000001377) PIK3CG (ENSBBBG00000001333) NAMPT (ENSBBBG00000001300) ENSBBBG00000001295 ENSBBBG00000001287 CDHR3 (ENSBBBG00000000793) ATXN7L1 (ENSBBBG00000003812) ENSBBBG00000003823 RINT1 (ENSBBBG00000015372) PUS7 (ENSBBBG00000015402) ENSBBBG00000015405 ENSBBBG00000002732 ##22 SRPK2 (ENSBBBG00000015466) KMT2E (ENSBBBG00000015519) ENSBBBG00000015531 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Goat MODERN SPECIES 4 BFSP1 (ENSCHIG00000025675) PCSK2 (ENSCHIG00000021637) ENSCHIG00000012932 RAB18 (ENSCHIG00000008749) MKX (ENSCHIG00000021913) ENSCHIG00000025949 ODAD2 (ENSCHIG00000005917) ENSCHIG00000024362 ENSCHIG00000018589 WAC (ENSCHIG00000022497) BAMBI (ENSCHIG00000015150) ENSCHIG00000022034 MAP3K8 (ENSCHIG00000017886) MTPAP (ENSCHIG00000025725) JCAD (ENSCHIG00000013597) ENSCHIG00000023018 ##22 SVIL (ENSCHIG00000016403) ZNF438 (ENSCHIG00000013980) ZEB1 (ENSCHIG00000016385) ARHGAP12 (ENSCHIG00000024718) KIF5B (ENSCHIG00000019020) EPC1 (ENSCHIG00000005911) NSUN6 (ENSCHIG00000012618) CACNB2 (ENSCHIG00000001734) SLC39A12 (ENSCHIG00000024612) MRC1 (ENSCHIG00000023775) TMEM236 (ENSCHIG00000002738) STAM (ENSCHIG00000004568) HACD1 (ENSCHIG00000026086) ST8SIA6 (ENSCHIG00000026819) VIM (ENSCHIG00000020459) Siberian musk deer MODERN SPECIES 142 THAP1 (ENSMMSG00000007344) RNF170 (ENSMMSG00000007370) HOOK3 (ENSMMSG00000000108) ENSMMSG00000000137 ENSMMSG00000000151 POMK (ENSMMSG00000000192) HGSNAT (ENSMMSG00000000219) INTS10 (ENSMMSG00000000344) CSGALNACT1 (ENSMMSG00000000434) SH2D4A (ENSMMSG00000000491) PSD3 (ENSMMSG00000000549) ENSMMSG00000000666 ENSMMSG00000000675 ENSMMSG00000000687 LRRC3B (ENSMMSG00000000699) ENSMMSG00000000713 ##22 OXSM (ENSMMSG00000000726) ENSMMSG00000000761 TOP2B (ENSMMSG00000000938) RARB (ENSMMSG00000001288) THRB (ENSMMSG00000001321) NR1D2 (ENSMMSG00000001375) ENSMMSG00000001390 ENSMMSG00000001401 NKIRAS1 (ENSMMSG00000001410) UBE2E1 (ENSMMSG00000001430) UBE2E2 (ENSMMSG00000001470) ENSMMSG00000001509 ZNF385D (ENSMMSG00000001519) ENSMMSG00000001533 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00390000014818 Panthera ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00390000014818 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00390000014818 lion MODERN SPECIES 15 CMTM4 (ENSPLOG00000011730) CMTM3 (ENSPLOG00000011656) CMTM2 (ENSPLOG00000011590) ENSPLOG00000011501 CKLF (ENSPLOG00000011254) TK2 (ENSPLOG00000016167) ENSPLOG00000016105 ENSPLOG00000016090 BEAN1 (ENSPLOG00000016041) CDH5 (ENSPLOG00000015993) CDH11 (ENSPLOG00000015823) ENSPLOG00000015793 CDH8 (ENSPLOG00000015522) ENSPLOG00000015462 ENSPLOG00000015447 ENSPLOG00000015429 ##22 ENSPLOG00000015410 ENSPLOG00000015374 GOT2 (ENSPLOG00000015162) SLC38A7 (ENSPLOG00000014987) CNOT1 (ENSPLOG00000014526) SETD6 (ENSPLOG00000014319) NDRG4 (ENSPLOG00000013343) GINS3 (ENSPLOG00000013168) ENSPLOG00000013054 CCDC113 (ENSPLOG00000012766) CSNK2A2 (ENSPLOG00000012711) CFAP20 (ENSPLOG00000012677) MMP15 (ENSPLOG00000012566) USB1 (ENSPLOG00000012465) ZNF319 (ENSPLOG00000012434) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000014476 #9 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000161613 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00940000153181.z.b #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00950000182858.A.a.a.n ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607.h #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 218 CFAP77 (ENSMPUG00000012533) #9 BARHL1 (ENSMPUG00000012529) #10 DDX31 (ENSMPUG00000012522) #11 GTF3C4 (ENSMPUG00000012519) #12 AK8 (ENSMPUG00000012500) SPACA9 (ENSMPUG00000012496) #15 TSC1 (ENSMPUG00000012491) #14 GFI1B (ENSMPUG00000012489) #16 GTF3C5 (ENSMPUG00000012459) #18 CEL (ENSMPUG00000012440) #17 RALGDS (ENSMPUG00000012429) #19 GBGT1 (ENSMPUG00000012426) #20 ENSMPUG00000012419 ##20 SURF6 (ENSMPUG00000012416) #21 MED22 (ENSMPUG00000012409) ENSMPUG00000012398 ##22 SURF1 (ENSMPUG00000012374) #24 SURF4 (ENSMPUG00000012354) #26 STKLD1 (ENSMPUG00000012330) #27 REXO4 (ENSMPUG00000012315) #28 ADAMTS13 (ENSMPUG00000012303) #29 ENSMPUG00000012288 #30 SLC2A6 (ENSMPUG00000012247) #31 MYMK (ENSMPUG00000012230) #32 ADAMTSL2 (ENSMPUG00000012219) #34 FAM163B (ENSMPUG00000012213) #33 DBH (ENSMPUG00000012206) #35 SARDH (ENSMPUG00000012201) #36 VAV2 (ENSMPUG00000012192) #37 BRD3 (ENSMPUG00000012188) WDR5 (ENSMPUG00000012184) Ferret MODERN SPECIES 250 DZIP1L (ENSMPUG00000009244) CLDN18 (ENSMPUG00000009256) SOX14 (ENSMPUG00000018663) ENSMPUG00000009262 ENSMPUG00000009268 IL20RB (ENSMPUG00000009312) NCK1 (ENSMPUG00000009318) SLC35G2 (ENSMPUG00000018667) STAG1 (ENSMPUG00000009337) PCCB (ENSMPUG00000009355) MSL2 (ENSMPUG00000009366) ENSMPUG00000009371 EPHB1 (ENSMPUG00000009374) KY (ENSMPUG00000009381) CEP63 (ENSMPUG00000009393) ENSMPUG00000009401 ##22 AMOTL2 (ENSMPUG00000009452) RYK (ENSMPUG00000009460) SLCO2A1 (ENSMPUG00000009474) RAB6B (ENSMPUG00000009632) SRPRB (ENSMPUG00000009687) TF (ENSMPUG00000009697) ENSMPUG00000009710 TOPBP1 (ENSMPUG00000009754) ENSMPUG00000009769 ENSMPUG00000009773 BFSP2 (ENSMPUG00000009779) TMEM108 (ENSMPUG00000009813) NPHP3 (ENSMPUG00000009818) UBA5 (ENSMPUG00000009837) ACAD11 (ENSMPUG00000009846) Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 521 SMARCA1 (ENSMPUG00000017423) OCRL (ENSMPUG00000017424) ENSMPUG00000017425 XPNPEP2 (ENSMPUG00000017426) SASH3 (ENSMPUG00000017427) ZDHHC9 (ENSMPUG00000017428) ENSMPUG00000017429 ##22 ENSMPUG00000018986 ENSMPUG00000017436 ENSMPUG00000017438 BCORL1 (ENSMPUG00000017439) ELF4 (ENSMPUG00000017440) ENSMPUG00000017441 AIFM1 (ENSMPUG00000017442) ENSMPUG00000017443 ZNF280C (ENSMPUG00000017444) Ferret MODERN SPECIES 222 ENSMPUG00000003699 ##22 ENSMPUG00000003691 KYNU (ENSMPUG00000003685) ARHGAP15 (ENSMPUG00000003680) ENSMPUG00000003644 ENSMPUG00000003641 ENSMPUG00000003639 GTDC1 (ENSMPUG00000003633) ZEB2 (ENSMPUG00000003620) ACVR2A (ENSMPUG00000003611) ORC4 (ENSMPUG00000003591) MBD5 (ENSMPUG00000003584) EPC2 (ENSMPUG00000003574) KIF5C (ENSMPUG00000003561) LYPD6B (ENSMPUG00000003554) ENSMPUG00000018430 Ferret MODERN SPECIES 332 ENSMPUG00000012594 ##22 TLE4 (ENSMPUG00000012590) ENSMPUG00000012588 PSAT1 (ENSMPUG00000012566) CEP78 (ENSMPUG00000012559) GNAQ (ENSMPUG00000012554) GNA14 (ENSMPUG00000012547) VPS13A (ENSMPUG00000012524) FOXB2 (ENSMPUG00000012521) PRUNE2 (ENSMPUG00000012517) GCNT1 (ENSMPUG00000018578) RFK (ENSMPUG00000012511) PCSK5 (ENSMPUG00000012343) ENSMPUG00000018576 OSTF1 (ENSMPUG00000012340) NMRK1 (ENSMPUG00000012337) Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Rat MODERN SPECIES 17 ENSRNOG00000066702 Odf1 (ENSRNOG00000006578) Klf10 (ENSRNOG00000006118) Azin1 (ENSRNOG00000005333) Atp6v1c1 (ENSRNOG00000004846) Baalc (ENSRNOG00000004697) Fzd6 (ENSRNOG00000004660) Cthrc1 (ENSRNOG00000004578) Slc25a32 (ENSRNOG00000004403) Dcaf13 (ENSRNOG00000004301) Rims2 (ENSRNOG00000004201) Dcstamp (ENSRNOG00000004704) Dpys (ENSRNOG00000004298) Lrp12 (ENSRNOG00000004152) LOC682793 (ENSRNOG00000029377) ENSRNOG00000067069 ##22 Zfpm2 (ENSRNOG00000004109) Oxr1 (ENSRNOG00000056487) Rpl31-ps4 (ENSRNOG00000057824) Abra (ENSRNOG00000007999) LOC103692897 (ENSRNOG00000070941) ENSRNOG00000068130 Angpt1 (ENSRNOG00000005854) Rspo2 (ENSRNOG00000037687) Eif3e (ENSRNOG00000027690) Emc2 (ENSRNOG00000005123) Tmem74 (ENSRNOG00000065300) Trhr (ENSRNOG00000005048) Nudcd1 (ENSRNOG00000024929) Eny2 (ENSRNOG00000004681) Pkhd1l1 (ENSRNOG00000004398) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 ENSCGRG00001008325 ENSCGRG00001018310 Kcnt2 (ENSCGRG00001017430) ENSCGRG00001003032 B3galt2 (ENSCGRG00001001870) Cdc73 (ENSCGRG00001023831) ENSCGRG00001024711 Ro60 (ENSCGRG00001016925) Uchl5 (ENSCGRG00001016538) Rgs2 (ENSCGRG00001015999) Rgs13 (ENSCGRG00001011756) Rgs1 (ENSCGRG00001011664) ENSCGRG00001004114 Rgs21 (ENSCGRG00001010657) Rgs18 (ENSCGRG00001010249) ENSCGRG00001020617 ##22 Brinp3 (ENSCGRG00001019247) ENSCGRG00001017155 ENSCGRG00001016441 Pla2g4a (ENSCGRG00001021132) Ptgs2 (ENSCGRG00001016942) Pdc (ENSCGRG00001018609) Odr4 (ENSCGRG00001012334) Tpr (ENSCGRG00001022166) Prg4 (ENSCGRG00001017987) Hmcn1 (ENSCGRG00001015387) Ivns1abp (ENSCGRG00001010161) Swt1 (ENSCGRG00001022955) Trmt1l (ENSCGRG00001019297) Rnf2 (ENSCGRG00001018674) Niban1 (ENSCGRG00001024143) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 6 Chrna2 (ENSRNOG00000017424) Ptk2b (ENSRNOG00000027839) Trim35 (ENSRNOG00000009449) Stmn4 (ENSRNOG00000053334) Adra1a (ENSRNOG00000009522) Dpysl2 (ENSRNOG00000009625) Pnma2 (ENSRNOG00000009815) Bnip3l (ENSRNOG00000009820) Ppp2r2a (ENSRNOG00000011158) Ebf2 (ENSRNOG00000011548) Cdca2 (ENSRNOG00000025302) Gnrh1 (ENSRNOG00000066847) Kctd9 (ENSRNOG00000012951) Gnrh1 (ENSRNOG00000013433) Dock5 (ENSRNOG00000024703) LOC120097172 (ENSRNOG00000031532) ##22 Nefl (ENSRNOG00000013658) Nefm (ENSRNOG00000013916) Adam7 (ENSRNOG00000014054) Adamdec1 (ENSRNOG00000030724) Adam28 (ENSRNOG00000014518) ENSRNOG00000063586 AABR07018269.1 (ENSRNOG00000031720) ENSRNOG00000063939 ENSRNOG00000067366 Stc1 (ENSRNOG00000015075) Nkx2-6 (ENSRNOG00000021910) Nkx3-1 (ENSRNOG00000015477) Slc25a37 (ENSRNOG00000015495) Synb (ENSRNOG00000021823) Entpd4 (ENSRNOG00000016321) Rat MODERN SPECIES 8 Sfrp4 (ENSRNOG00000054957) Gpr141 (ENSRNOG00000066332) Elmo1 (ENSRNOG00000059705) ENSRNOG00000065006 Aoah (ENSRNOG00000054964) Or2p2 (ENSRNOG00000066002) RGD1564243 (ENSRNOG00000060002) Or2w1c (ENSRNOG00000065839) Or2w1 (ENSRNOG00000066799) Or2ad1 (ENSRNOG00000066484) Trim27 (ENSRNOG00000055917) Gpx5 (ENSRNOG00000057180) Gpx6 (ENSRNOG00000060749) ENSRNOG00000065671 ENSRNOG00000064537 AABR07027819.1 (ENSRNOG00000031902) ##22 Zscan12 (ENSRNOG00000052959) Zkscan3 (ENSRNOG00000055000) Zscan26 (ENSRNOG00000053518) Nkapl (ENSRNOG00000056708) Zkscan4 (ENSRNOG00000051823) ENSRNOG00000065338 Zkscan8 (ENSRNOG00000053635) Or2w2 (ENSRNOG00000062898) LOC102557552 (ENSRNOG00000059328) Or2b2 (ENSRNOG00000062525) ENSRNOG00000070346 H2ac4 (ENSRNOG00000070010) Hist1h2ail1 (ENSRNOG00000064755) Hist1h2bo (ENSRNOG00000068034) Hist1h4m (ENSRNOG00000066473) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 13 ENSMOCG00000021818 Alkbh8 (ENSMOCG00000019349) Cwf19l2 (ENSMOCG00000010389) Endod1 (ENSMOCG00000016035) Sesn3 (ENSMOCG00000013595) Fam76b (ENSMOCG00000001551) Cep57 (ENSMOCG00000005014) Mtmr2 (ENSMOCG00000009930) Maml2 (ENSMOCG00000021568) ENSMOCG00000019222 Ccdc82 (ENSMOCG00000019062) Jrkl (ENSMOCG00000004889) ENSMOCG00000022546 ENSMOCG00000021331 Cntn5 (ENSMOCG00000021354) ENSMOCG00000008541 ##22 Arhgap42 (ENSMOCG00000004053) Pgr (ENSMOCG00000016670) Trpc6 (ENSMOCG00000021166) ENSMOCG00000006458 ENSMOCG00000014609 Cep126 (ENSMOCG00000013353) Cfap300 (ENSMOCG00000013197) Yap1 (ENSMOCG00000007486) Birc3 (ENSMOCG00000013964) Birc2 (ENSMOCG00000010117) Tmem123 (ENSMOCG00000021990) Mmp7 (ENSMOCG00000021222) Mmp20 (ENSMOCG00000019578) Mmp27 (ENSMOCG00000018511) Mmp8 (ENSMOCG00000009399) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.e.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 341 ENSMNEG00000028209 PCYOX1 (ENSMNEG00000041144) TIA1 (ENSMNEG00000030316) C2orf42 (ENSMNEG00000034312) PCBP1 (ENSMNEG00000002934) ENSMNEG00000042836 ASPRV1 (ENSMNEG00000026946) MXD1 (ENSMNEG00000034573) ENSMNEG00000032828 GMCL1 (ENSMNEG00000034099) ANXA4 (ENSMNEG00000025186) AAK1 (ENSMNEG00000032158) NFU1 (ENSMNEG00000041549) GFPT1 (ENSMNEG00000043237) ANTXR1 (ENSMNEG00000042903) ENSMNEG00000025946 ##22 GKN1 (ENSMNEG00000043462) GKN2 (ENSMNEG00000031833) ENSMNEG00000032842 BMP10 (ENSMNEG00000042295) ARHGAP25 (ENSMNEG00000037188) ENSMNEG00000007960 PROKR1 (ENSMNEG00000037205) APLF (ENSMNEG00000028788) FBXO48 (ENSMNEG00000026784) PLEK (ENSMNEG00000029803) CNRIP1 (ENSMNEG00000028096) PPP3R1 (ENSMNEG00000043603) ENSMNEG00000031066 DNAAF10 (ENSMNEG00000027774) C1D (ENSMNEG00000040612) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00940000153181.z #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00850000133605 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 Primates ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000161613 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00940000153181.z #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000161613 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00940000153181.z #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 Tarsier MODERN SPECIES 2984 ENSTSYG00000029336 ##22 MTTP (ENSTSYG00000010751) TRMT10A (ENSTSYG00000010739) CUNH4orf17 (ENSTSYG00000010663) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000161613 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00940000153181.z #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.b.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.b.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.b.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.b.b Pan ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000018830 ENSGT00940000156997 ENSGT00390000016167.g ENSGT00390000006029 ENSGT00550000074846.i ENSGT00440000033919.b ENSGT00940000158788 ENSGT00390000007354 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a ENSGT00390000018729.a.b ENSGT00940000158784 ENSGT00940000159026 ENSGT00940000161402 ENSGT00940000156943 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.b.b ENSGT00940000158673 ENSGT00390000011152 ENSGT00390000018344 ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000157051 ENSGT00390000000916 ENSGT00940000156387 ENSGT00950000183094.b.b ENSGT00390000015789.d.b.a ENSGT00390000013383 ENSGT00390000000984.s.a.a ENSGT00940000154732 ENSGT00390000014303 ENSGT00940000163395 Chimpanzee MODERN SPECIES 9 LOXHD1 (ENSPTRG00000009995) RNF165 (ENSPTRG00000009994) C18orf25 (ENSPTRG00000009993) HAUS1 (ENSPTRG00000009992) ATP5F1A (ENSPTRG00000009991) ENSPTRG00000051812 PSTPIP2 (ENSPTRG00000009990) EPG5 (ENSPTRG00000009989) SIGLEC15 (ENSPTRG00000024035) SLC14A1 (ENSPTRG00000009988) SLC14A2 (ENSPTRG00000009987) SETBP1 (ENSPTRG00000009986) SYT4 (ENSPTRG00000009985) RIT2 (ENSPTRG00000009984) PIK3C3 (ENSPTRG00000009983) ENSPTRG00000029310 ##22 ENSPTRG00000021516 CELF4 (ENSPTRG00000009982) KIAA1328 (ENSPTRG00000009981) TPGS2 (ENSPTRG00000009980) FHOD3 (ENSPTRG00000009979) MOCOS (ENSPTRG00000009978) ELP2 (ENSPTRG00000009977) SLC39A6 (ENSPTRG00000009975) ENSPTRG00000040263 RPRD1A (ENSPTRG00000009974) C18H18orf21 (ENSPTRG00000009973) ENSPTRG00000050731 GALNT1 (ENSPTRG00000009972) INO80C (ENSPTRG00000009971) ZNF396 (ENSPTRG00000009970) Gibbon MODERN SPECIES 10 ROR2 (ENSNLEG00000000461) NFIL3 (ENSNLEG00000018673) ENSNLEG00000031499 SYK (ENSNLEG00000000438) DIRAS2 (ENSNLEG00000034645) GADD45G (ENSNLEG00000000452) ENSNLEG00000000449 ENSNLEG00000033615 SEMA4D (ENSNLEG00000000397) SECISBP2 (ENSNLEG00000008739) CKS2 (ENSNLEG00000032243) SHC3 (ENSNLEG00000029655) S1PR3 (ENSNLEG00000008685) ENSNLEG00000029747 ENSNLEG00000035039 ENSNLEG00000030504 ##22 ENSNLEG00000004281 NXNL2 (ENSNLEG00000005444) SPIN1 (ENSNLEG00000035232) ENSNLEG00000027358 CDK20 (ENSNLEG00000005434) ENSNLEG00000035327 CTSL (ENSNLEG00000005327) DAPK1 (ENSNLEG00000005244) ENSNLEG00000036213 TUT7 (ENSNLEG00000005138) ISCA1 (ENSNLEG00000031606) ENSNLEG00000005127 GOLM1 (ENSNLEG00000003785) NAA35 (ENSNLEG00000003793) ENSNLEG00000033935 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.g.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 113 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.g.a Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.g.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.a ##22 ENSGT00390000014818.g.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 127 VSNL1 (ENSMNEG00000032595) RAD51AP2 (ENSMNEG00000034585) ENSMNEG00000033454 CYRIA (ENSMNEG00000035773) MYCN (ENSMNEG00000034331) ENSMNEG00000005879 ENSMNEG00000005027 ##22 ENSMNEG00000020096 DDX1 (ENSMNEG00000029189) NBAS (ENSMNEG00000045342) ENSMNEG00000039198 LRATD1 (ENSMNEG00000027054) ENSMNEG00000013637 TRIB2 (ENSMNEG00000033803) LPIN1 (ENSMNEG00000029714) NTSR2 (ENSMNEG00000030048) GREB1 (ENSMNEG00000031259) E2F6 (ENSMNEG00000032994) ROCK2 (ENSMNEG00000044195) SLC66A3 (ENSMNEG00000044841) C2orf50 (ENSMNEG00000037338) KCNF1 (ENSMNEG00000039841) Vervet Monkey MODERN SPECIES 13 MIOS (ENSCSAG00000013106) RPA3 (ENSCSAG00000013124) UMAD1 (ENSCSAG00000013129) GLCCI1 (ENSCSAG00000013152) ICA1 (ENSCSAG00000013228) NXPH1 (ENSCSAG00000019119) NDUFA4 (ENSCSAG00000013267) ENSCSAG00000019118 PHF14 (ENSCSAG00000013274) THSD7A (ENSCSAG00000013288) TMEM106B (ENSCSAG00000013296) VWDE (ENSCSAG00000013340) ENSCSAG00000019117 SCIN (ENSCSAG00000013357) ENSCSAG00000019116 ENSCSAG00000019115 ##22 ETV1 (ENSCSAG00000013365) DGKB (ENSCSAG00000013378) ENSCSAG00000013389 AGMO (ENSCSAG00000013403) MEOX2 (ENSCSAG00000013409) CRPPA (ENSCSAG00000013420) SOSTDC1 (ENSCSAG00000013427) LRRC72 (ENSCSAG00000013450) ANKMY2 (ENSCSAG00000013466) BZW2 (ENSCSAG00000013474) TSPAN13 (ENSCSAG00000013482) AGR2 (ENSCSAG00000013491) AGR3 (ENSCSAG00000013496) AHR (ENSCSAG00000013508) SNX13 (ENSCSAG00000013523) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863 ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000141068.n ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863.b ENSGT00910000146863.a ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000141068.n ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863.b ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000141068.n ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863.b ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000141068.n ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00700000104550.a ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863.b ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000141068.n ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Pan ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00700000104550.a ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863.b ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000141068.n ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Chimpanzee MODERN SPECIES 11 ADIG (ENSPTRG00000013489) RALGAPB (ENSPTRG00000013488) ENSPTRG00000049520 LBP (ENSPTRG00000013486) BPI (ENSPTRG00000013485) ENSPTRG00000052398 KIAA1755 (ENSPTRG00000013484) TGM2 (ENSPTRG00000013483) RPRD1B (ENSPTRG00000013481) TTI1 (ENSPTRG00000013480) VSTM2L (ENSPTRG00000013479) CTNNBL1 (ENSPTRG00000023688) ENSPTRG00000052734 NNAT (ENSPTRG00000013476) BLCAP (ENSPTRG00000045177) ENSPTRG00000047886 ##22 SRC (ENSPTRG00000013474) MANBAL (ENSPTRG00000013473) GHRH (ENSPTRG00000013472) RPN2 (ENSPTRG00000013471) MROH8 (ENSPTRG00000013470) ENSPTRG00000051334 RBL1 (ENSPTRG00000013469) SAMHD1 (ENSPTRG00000013468) TLDC2 (ENSPTRG00000050816) SOGA1 (ENSPTRG00000013465) DSN1 (ENSPTRG00000013464) NDRG3 (ENSPTRG00000013462) SLA2 (ENSPTRG00000013461) RAB5IF (ENSPTRG00000013460) TGIF2 (ENSPTRG00000013459) Bonobo MODERN SPECIES 11 RALGAPB (ENSPPAG00000034748) ENSPPAG00000038154 LBP (ENSPPAG00000035862) BPI (ENSPPAG00000032802) 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(ENSNLEG00000006291) NNAT (ENSNLEG00000006284) ENSNLEG00000027440 BLCAP (ENSNLEG00000027527) ENSNLEG00000030063 ##22 SRC (ENSNLEG00000006271) MANBAL (ENSNLEG00000006269) GHRH (ENSNLEG00000006260) RPN2 (ENSNLEG00000006231) MROH8 (ENSNLEG00000006215) RBL1 (ENSNLEG00000006188) ENSNLEG00000028626 SAMHD1 (ENSNLEG00000006161) TLDC2 (ENSNLEG00000006160) SOGA1 (ENSNLEG00000006153) DSN1 (ENSNLEG00000028237) NDRG3 (ENSNLEG00000006130) SLA2 (ENSNLEG00000006126) ENSNLEG00000035359 TGIF2 (ENSNLEG00000006119) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00700000104550.a ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863 ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b.q ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00700000104550.a ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863 ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b.q ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00700000104550.a ENSGT00910000147305 ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863 ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00900000143635 ENSGT00390000007412 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b.q ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000018723 ENSGT00700000104550.a ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863 ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00390000007412 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b.q ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000018723 ENSGT00700000104550.a ENSGT01100000263545.a.a.b ENSGT01100000263545.a.a.a ENSGT00910000146863 ENSGT00940000161174 ENSGT01050000244866.B ENSGT00910000147755 ENSGT00950000183094.b.a ENSGT00390000009748 ENSGT00940000159381 ENSGT00390000006931.q ENSGT00390000007412 ENSGT00900000143635 ENSGT00390000014105 ENSGT00940000155193.a.a.f.a.b ##22 ENSGT00940000158250 ENSGT00390000003422.k.b ENSGT00950000183154.b.b ENSGT00390000002635 ENSGT00940000160596 ENSGT00950000183202.a.a ENSGT00390000013867 ENSGT00940000161648 ENSGT00950000182982.B ENSGT00390000011347 ENSGT00950000182872.f.a.a.b.q ENSGT00940000160331 ENSGT00390000004786 ENSGT00940000159849 ENSGT00940000155458 Drill MODERN SPECIES 487 ADIG (ENSMLEG00000043534) RALGAPB (ENSMLEG00000035286) LBP (ENSMLEG00000012330) BPI (ENSMLEG00000043727) ENSMLEG00000040568 KIAA1755 (ENSMLEG00000042940) TGM2 (ENSMLEG00000040323) RPRD1B (ENSMLEG00000043647) ENSMLEG00000034913 TTI1 (ENSMLEG00000035560) VSTM2L (ENSMLEG00000007863) CTNNBL1 (ENSMLEG00000038291) NNAT (ENSMLEG00000033602) ENSMLEG00000031022 BLCAP (ENSMLEG00000019435) ENSMLEG00000012582 ##22 SRC (ENSMLEG00000041832) MANBAL (ENSMLEG00000038134) GHRH (ENSMLEG00000035510) RPN2 (ENSMLEG00000039902) MROH8 (ENSMLEG00000041675) RBL1 (ENSMLEG00000028585) SAMHD1 (ENSMLEG00000036893) TLDC2 (ENSMLEG00000044199) SOGA1 (ENSMLEG00000038456) DSN1 (ENSMLEG00000017128) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000014818.i.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000014818.i.a Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group DUPLICATION Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000155193.a.a.f.b.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000155193.a.a.f.b.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.a Pan ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183027.b ENSGT00950000183054.a.a.a ENSGT00950000182924.A.b.a.b ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158131 ENSGT00940000157200.e.b ENSGT00940000160665 ENSGT00390000012959.b.s.b ENSGT00940000159343.b ENSGT01040000241132 ENSGT00940000157168 ENSGT00940000156545 ENSGT00940000159954 ENSGT00940000155150.a ENSGT00940000155279.C ENSGT00940000155193.a.a.f.b.a.a ##22 ENSGT00390000014818.i.a.a ENSGT00940000154949.b ENSGT00940000162642 ENSGT00940000162895 ENSGT00940000154888.i.a.b ENSGT00940000154888.j ENSGT00940000159753 ENSGT00950000182970.A.b.d.b ENSGT00940000154589.b ENSGT00390000002219 ENSGT00940000154340.A ENSGT00940000154185.k.a ENSGT00940000162789 ENSGT00940000156946 ENSGT01050000244965.b Chimpanzee MODERN SPECIES 17 MYOZ2 (ENSPTRG00000016395) SYNPO2 (ENSPTRG00000016394) SEC24D (ENSPTRG00000052560) METTL14 (ENSPTRG00000016391) PRSS12 (ENSPTRG00000016390) ENSPTRG00000049703 NDST3 (ENSPTRG00000016389) ENSPTRG00000019067 ENSPTRG00000042667 ENSPTRG00000048658 NDST4 (ENSPTRG00000016386) UGT8 (ENSPTRG00000016385) ARSJ (ENSPTRG00000016384) CAMK2D (ENSPTRG00000016383) ANK2 (ENSPTRG00000016382) ENSPTRG00000051913 ##22 ENSPTRG00000044802 LARP7 (ENSPTRG00000016380) ZGRF1 (ENSPTRG00000016379) NEUROG2 (ENSPTRG00000047838) ENSPTRG00000049935 ALPK1 (ENSPTRG00000016375) ENSPTRG00000048787 TIFA (ENSPTRG00000052432) AP1AR (ENSPTRG00000052840) FAM241A (ENSPTRG00000016372) ENSPTRG00000052737 PITX2 (ENSPTRG00000016371) ENPEP (ENSPTRG00000016370) ELOVL6 (ENSPTRG00000016368) EGF (ENSPTRG00000016367) Bonobo MODERN SPECIES 17 SYNPO2 (ENSPPAG00000035039) SEC24D (ENSPPAG00000028599) METTL14 (ENSPPAG00000029930) PRSS12 (ENSPPAG00000035391) ENSPPAG00000031601 NDST3 (ENSPPAG00000031007) ENSPPAG00000032949 ENSPPAG00000028200 ENSPPAG00000019617 NDST4 (ENSPPAG00000039280) UGT8 (ENSPPAG00000009777) ARSJ (ENSPPAG00000040500) CAMK2D (ENSPPAG00000030941) ANK2 (ENSPPAG00000037570) ENSPPAG00000016126 ENSPPAG00000037938 ##22 LARP7 (ENSPPAG00000038420) ZGRF1 (ENSPPAG00000002164) ENSPPAG00000042238 ENSPPAG00000005536 ALPK1 (ENSPPAG00000020703) ENSPPAG00000033509 ENSPPAG00000002777 AP1AR (ENSPPAG00000029027) ENSPPAG00000006440 ENSPPAG00000023243 ENSPPAG00000040833 ENPEP (ENSPPAG00000031975) ELOVL6 (ENSPPAG00000033763) EGF (ENSPPAG00000001225) LRIT3 (ENSPPAG00000043621) Gorilla MODERN SPECIES 17 USP53 (ENSGGOG00000006480) MYOZ2 (ENSGGOG00000010448) SYNPO2 (ENSGGOG00000012942) SEC24D (ENSGGOG00000002496) METTL14 (ENSGGOG00000016449) CEP170 (ENSGGOG00000016268) PRSS12 (ENSGGOG00000002810) NDST3 (ENSGGOG00000034831) ENSGGOG00000008099 TRAM1L1 (ENSGGOG00000000128) NDST4 (ENSGGOG00000000466) UGT8 (ENSGGOG00000026542) ARSJ (ENSGGOG00000012700) CAMK2D (ENSGGOG00000022729) ANK2 (ENSGGOG00000028608) ENSGGOG00000026585 ##22 ENSGGOG00000022391 ENSGGOG00000006438 ENSGGOG00000023567 ZGRF1 (ENSGGOG00000022552) NEUROG2 (ENSGGOG00000038276) ENSGGOG00000025016 ENSGGOG00000041153 ALPK1 (ENSGGOG00000006662) RTEL1 (ENSGGOG00000042405) TIFA (ENSGGOG00000041642) AP1AR (ENSGGOG00000009698) FAM241A (ENSGGOG00000023800) ENSGGOG00000043708 PITX2 (ENSGGOG00000008770) ENPEP (ENSGGOG00000007393) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b.a.b ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 PLA1A (ENSPTRG00000015258) POPDC2 (ENSPTRG00000015259) COX17 (ENSPTRG00000048880) CFAP91 (ENSPTRG00000015262) NR1I2 (ENSPTRG00000015263) GSK3B (ENSPTRG00000015264) GPR156 (ENSPTRG00000015267) LRRC58 (ENSPTRG00000015268) FSTL1 (ENSPTRG00000015269) NDUFB4 (ENSPTRG00000015270) HGD (ENSPTRG00000015271) RABL3 (ENSPTRG00000015272) GTF2E1 (ENSPTRG00000015273) STXBP5L (ENSPTRG00000015274) POLQ (ENSPTRG00000015276) ENSPTRG00000044655 ##22 ARGFX (ENSPTRG00000015277) FBXO40 (ENSPTRG00000015278) HCLS1 (ENSPTRG00000015279) GOLGB1 (ENSPTRG00000015280) IQCB1 (ENSPTRG00000015281) EAF2 (ENSPTRG00000015282) SLC15A2 (ENSPTRG00000015284) ILDR1 (ENSPTRG00000015285) CD86 (ENSPTRG00000015288) CASR (ENSPTRG00000015289) CSTA (ENSPTRG00000015290) MIX23 (ENSPTRG00000043778) FAM162A (ENSPTRG00000015292) WDR5B (ENSPTRG00000030152) KPNA1 (ENSPTRG00000015293) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b.b ##22 Bonobo MODERN SPECIES 1 RUFY2 (ENSPPAG00000029488) HNRNPH3 (ENSPPAG00000033764) PBLD (ENSPPAG00000043142) MYPN (ENSPPAG00000026801) ENSPPAG00000027229 HERC4 (ENSPPAG00000036256) SIRT1 (ENSPPAG00000026426) ENSPPAG00000042412 DNAJC12 (ENSPPAG00000000220) ENSPPAG00000024995 LRRTM3 (ENSPPAG00000038363) CTNNA3 (ENSPPAG00000036801) ENSPPAG00000038968 ENSPPAG00000030704 ENSPPAG00000030313 ENSPPAG00000030172 ##22 REEP3 (ENSPPAG00000014795) ENSPPAG00000029932 ENSPPAG00000040277 JMJD1C (ENSPPAG00000043117) ENSPPAG00000028338 EGR2 (ENSPPAG00000036067) ENSPPAG00000026642 ZNF365 (ENSPPAG00000034684) RTKN2 (ENSPPAG00000032579) ARID5B (ENSPPAG00000038387) ENSPPAG00000043572 TMEM26 (ENSPPAG00000042231) RHOBTB1 (ENSPPAG00000043669) CDK1 (ENSPPAG00000040220) ENSPPAG00000040138 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000003601.b ENSGT00940000156043 ENSGT00940000156021 ENSGT00940000155626 ENSGT00940000156710 ENSGT00500000044920 ENSGT00390000005261 ENSGT00910000148039 ENSGT00940000157580 ENSGT00940000160654 ENSGT00510000048726 ENSGT00940000162193 ENSGT00940000158640 ENSGT00940000159453 ENSGT00940000161471 ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 ENSGT00440000033811 ENSGT00940000164461 ENSGT00390000003428 ENSGT00390000010172 ENSGT00390000013264.d.f ENSGT00940000159397 ENSGT00940000154630.b ENSGT00390000017143 ENSGT00530000064285 ENSGT00940000155341.h ENSGT00390000001695 ENSGT00950000183132.C ENSGT00930000150941.x.b.b ENSGT00530000063555.A.a.a ENSGT00940000155527 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156043 ENSGT00940000156021 ENSGT00940000155626 ENSGT00940000156710 ENSGT00500000044920 ENSGT00390000005261 ENSGT00910000148039 ENSGT00940000157580 ENSGT00940000160654 ENSGT00940000154433.a.b.l.a ENSGT00510000048726 ENSGT00940000162193 ENSGT00940000158640 ENSGT00940000159453 ENSGT00940000161471 ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 ENSGT00440000033811 ENSGT00940000164461 ENSGT00390000003428 ENSGT00390000010172 ENSGT00390000013264.d.f ENSGT00940000159397 ENSGT00940000154630.b ENSGT00390000017143 ENSGT00530000064285 ENSGT00940000155341.h ENSGT00390000001695 ENSGT00950000183132.C ENSGT00930000150941.x.b.b ENSGT00530000063555.A.a.a ENSGT00940000155527 Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 26 LNX1 (ENSCSAG00000004979) GSX2 (ENSCSAG00000004981) PDGFRA (ENSCSAG00000004987) KIT (ENSCSAG00000004992) ENSCSAG00000004997 KDR (ENSCSAG00000005005) SRD5A3 (ENSCSAG00000005010) TMEM165 (ENSCSAG00000005013) CLOCK (ENSCSAG00000005019) PDCL2 (ENSCSAG00000005023) ENSCSAG00000000424 NMU (ENSCSAG00000005030) EXOC1 (ENSCSAG00000005038) CEP135 (ENSCSAG00000005042) CRACD (ENSCSAG00000005049) ENSCSAG00000005053 ##22 AASDH (ENSCSAG00000005057) ENSCSAG00000000425 PPAT (ENSCSAG00000005060) SRP72 (ENSCSAG00000005079) ARL9 (ENSCSAG00000005100) THEGL (ENSCSAG00000005107) HOPX (ENSCSAG00000005112) ENSCSAG00000005117 REST (ENSCSAG00000005119) POLR2B (ENSCSAG00000005130) ENSCSAG00000000426 IGFBP7 (ENSCSAG00000005138) ENSCSAG00000005140 ADGRL3 (ENSCSAG00000005151) TECRL (ENSCSAG00000005163) Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 25 ENSCSAG00000004976 ENSCSAG00000004974 ENSCSAG00000018502 ZNF43 (ENSCSAG00000004971) ENSCSAG00000004967 ENSCSAG00000004964 ENSCSAG00000004956 ENSCSAG00000004945 ENSCSAG00000018504 ENSCSAG00000004935 ENSCSAG00000004928 ENSCSAG00000004924 ENSCSAG00000004919 ZNF724 (ENSCSAG00000004914) ENSCSAG00000004910 ENSCSAG00000018506 ##22 ENSCSAG00000004906 ZNF681 (ENSCSAG00000004903) ZNF726 (ENSCSAG00000004902) ENSCSAG00000004898 ENSCSAG00000004895 ENSCSAG00000004890 UQCRFS1 (ENSCSAG00000004876) VSTM2B (ENSCSAG00000004872) POP4 (ENSCSAG00000004868) PLEKHF1 (ENSCSAG00000018508) C19orf12 (ENSCSAG00000004862) CCNE1 (ENSCSAG00000004850) URI1 (ENSCSAG00000004838) ZNF536 (ENSCSAG00000004832) TSHZ3 (ENSCSAG00000018510) Vervet Monkey MODERN SPECIES 3 RIC1 (ENSCSAG00000008890) ERMP1 (ENSCSAG00000008897) MLANA (ENSCSAG00000008907) KIAA2026 (ENSCSAG00000008912) RANBP6 (ENSCSAG00000018489) IL33 (ENSCSAG00000008936) TPD52L3 (ENSCSAG00000018487) UHRF2 (ENSCSAG00000008957) GLDC (ENSCSAG00000008978) KDM4C (ENSCSAG00000008997) DMAC1 (ENSCSAG00000009013) PTPRD (ENSCSAG00000009046) TYRP1 (ENSCSAG00000009081) LURAP1L (ENSCSAG00000009100) MPDZ (ENSCSAG00000009137) ENSCSAG00000018485 ##22 NFIB (ENSCSAG00000009158) ZDHHC21 (ENSCSAG00000009169) CER1 (ENSCSAG00000009180) FREM1 (ENSCSAG00000009200) TTC39B (ENSCSAG00000009217) SNAPC3 (ENSCSAG00000009226) PSIP1 (ENSCSAG00000009243) CCDC171 (ENSCSAG00000009259) ENSCSAG00000009275 BNC2 (ENSCSAG00000009282) CNTLN (ENSCSAG00000009297) SH3GL2 (ENSCSAG00000009307) ENSCSAG00000018483 ADAMTSL1 (ENSCSAG00000009320) SAXO1 (ENSCSAG00000009331) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000014818.g.b.a.a.a Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 ENSGT00390000014818.g.b.a.a.a.a Olive baboon MODERN SPECIES 14 ENSPANG00000018988 ENSPANG00000050334 NCAM2 (ENSPANG00000015989) MRPL39 (ENSPANG00000028985) JAM2 (ENSPANG00000016226) ATP5PF (ENSPANG00000016230) GABPA (ENSPANG00000016228) ENSPANG00000043842 APP (ENSPANG00000016227) ENSPANG00000048375 CYYR1 (ENSPANG00000039896) ADAMTS1 (ENSPANG00000022527) ADAMTS5 (ENSPANG00000015990) ENSPANG00000036981 ENSPANG00000041357 ENSPANG00000032086 ##22 ENSPANG00000050192 ENSPANG00000041989 N6AMT1 (ENSPANG00000033103) LTN1 (ENSPANG00000015701) RWDD2B (ENSPANG00000009388) USP16 (ENSPANG00000019586) CCT8 (ENSPANG00000015807) ENSPANG00000044189 MAP3K7CL (ENSPANG00000009924) BACH1 (ENSPANG00000007661) ENSPANG00000050139 ENSPANG00000044412 GRIK1 (ENSPANG00000017329) ENSPANG00000038576 CLDN8 (ENSPANG00000044644) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 362 CHODL (ENSCATG00000009364) TMPRSS15 (ENSCATG00000044263) ENSCATG00000036118 NCAM2 (ENSCATG00000042913) ENSCATG00000032330 MRPL39 (ENSCATG00000034260) JAM2 (ENSCATG00000041401) ENSCATG00000044906 ENSCATG00000033056 GABPA (ENSCATG00000039489) APP (ENSCATG00000042315) CYYR1 (ENSCATG00000032657) ADAMTS1 (ENSCATG00000015336) ADAMTS5 (ENSCATG00000033259) ENSCATG00000036146 ENSCATG00000032659 ##22 N6AMT1 (ENSCATG00000030066) ENSCATG00000020844 LTN1 (ENSCATG00000030163) ENSCATG00000039441 RWDD2B (ENSCATG00000038388) USP16 (ENSCATG00000036294) CCT8 (ENSCATG00000038849) MAP3K7CL (ENSCATG00000037607) BACH1 (ENSCATG00000020971) GRIK1 (ENSCATG00000034150) CLDN8 (ENSCATG00000022654) KRTAP25-1 (ENSCATG00000042142) ENSCATG00000030557 ENSCATG00000033607 KRTAP19-3 (ENSCATG00000038578) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 8 GPC5 (ENSMFAG00000035829) ENSMFAG00000032951 ENSMFAG00000056979 ENSMFAG00000063182 ENSMFAG00000065726 SLITRK5 (ENSMFAG00000040496) ENSMFAG00000054028 SLITRK6 (ENSMFAG00000040915) SLITRK1 (ENSMFAG00000000028) ENSMFAG00000004349 ENSMFAG00000055887 ENSMFAG00000002765 SPRY2 (ENSMFAG00000038994) NDFIP2 (ENSMFAG00000003559) RBM26 (ENSMFAG00000044633) ENSMFAG00000027988 ##22 ENSMFAG00000028725 OBI1 (ENSMFAG00000034310) POU4F1 (ENSMFAG00000064810) EDNRB (ENSMFAG00000001921) SLAIN1 (ENSMFAG00000002894) ENSMFAG00000040919 SCEL (ENSMFAG00000030524) ENSMFAG00000063467 ENSMFAG00000011600 ENSMFAG00000041856 MYCBP2 (ENSMFAG00000031053) FBXL3 (ENSMFAG00000044754) CLN5 (ENSMFAG00000044623) ACOD1 (ENSMFAG00000043445) ENSMFAG00000058044 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 ORMDL2 (ENSMFAG00000061489) ENSMFAG00000048555 ENSMFAG00000045270 CD63 (ENSMFAG00000045733) RDH5 (ENSMFAG00000002032) BLOC1S1 (ENSMFAG00000057152) ITGA7 (ENSMFAG00000022956) METTL7B (ENSMFAG00000041138) OR10P1 (ENSMFAG00000030027) OR2AP1 (ENSMFAG00000056876) OR6C4 (ENSMFAG00000052186) ENSMFAG00000062892 ENSMFAG00000064214 ENSMFAG00000055540 OR6C2 (ENSMFAG00000028782) ENSMFAG00000055470 ##22 OR6C75 (ENSMFAG00000059604) OR6C1 (ENSMFAG00000054015) OR6C74 (ENSMFAG00000054196) OR10A7 (ENSMFAG00000036855) ENSMFAG00000003915 ENSMFAG00000065221 ENSMFAG00000063829 ENSMFAG00000065363 NEUROD4 (ENSMFAG00000030073) TESPA1 (ENSMFAG00000040218) MUCL1 (ENSMFAG00000051719) DCD (ENSMFAG00000040810) LACRT (ENSMFAG00000063533) PPP1R1A (ENSMFAG00000037982) PDE1B (ENSMFAG00000033293) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 345 ENSGT00940000159453 ENSGT00940000161471 ENSGT00940000155193.a.a.f.b ##22 ENSGT00440000033811 ENSGT00910000148425 ENSGT00390000003428 ENSGT00390000010172 ENSGT00390000013264.d.f ENSGT00940000159397 ENSGT00940000154630.b ENSGT00390000017143 ENSGT00530000064285 ENSGT00940000155341.h ENSGT00390000001695 ENSGT00950000183132.C ENSGT00530000063555.A.a.a Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2992 CEP135 (ENSRROG00000041197) CRACD (ENSRROG00000038384) ENSRROG00000041577 ##22 AASDH (ENSRROG00000000101) PPAT (ENSRROG00000044329) PAICS (ENSRROG00000040196) SRP72 (ENSRROG00000035704) ARL9 (ENSRROG00000034399) THEGL (ENSRROG00000039089) HOPX (ENSRROG00000030617) Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 902 MAP3K7 (ENSRBIG00000021335) ENSRBIG00000010998 ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1450 NTN1 (ENSRBIG00000038304) STX8 (ENSRBIG00000007063) CFAP52 (ENSRBIG00000041622) USP43 (ENSRBIG00000043437) DHRS7C (ENSRBIG00000036333) GSG1L2 (ENSRBIG00000036865) GLP2R (ENSRBIG00000035854) RCVRN (ENSRBIG00000040415) GAS7 (ENSRBIG00000041094) MYH13 (ENSRBIG00000031890) MYH8 (ENSRBIG00000033585) MYH4 (ENSRBIG00000028635) CEP135 (ENSRBIG00000041053) ENSRBIG00000037426 CRACD (ENSRBIG00000032624) ENSRBIG00000037343 ##22 AASDH (ENSRBIG00000040658) ENSRBIG00000026826 PPAT (ENSRBIG00000040341) PAICS (ENSRBIG00000020711) ENSRBIG00000042069 ARL9 (ENSRBIG00000037669) THEGL (ENSRBIG00000034929) HOPX (ENSRBIG00000028439) ENSRBIG00000037876 REST (ENSRBIG00000030668) NOA1 (ENSRBIG00000014858) POLR2B (ENSRBIG00000042838) IGFBP7 (ENSRBIG00000034571) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 500 SOS1 (ENSANAG00000031815) ENSANAG00000028385 ENSANAG00000011026 CDKL4 (ENSANAG00000020544) MAP4K3 (ENSANAG00000017560) ENSANAG00000024412 TMEM178A (ENSANAG00000020117) THUMPD2 (ENSANAG00000034298) SLC8A1 (ENSANAG00000030032) ENSANAG00000028309 ENSANAG00000028164 PKDCC (ENSANAG00000026503) EML4 (ENSANAG00000034852) ENSANAG00000034342 ENSANAG00000031751 ENSANAG00000035965 ##22 KCNG3 (ENSANAG00000022486) ENSANAG00000033986 ENSANAG00000021425 MTA3 (ENSANAG00000030281) OXER1 (ENSANAG00000020644) HAAO (ENSANAG00000023855) ENSANAG00000022220 ZFP36L2 (ENSANAG00000025228) THADA (ENSANAG00000038155) PLEKHH2 (ENSANAG00000026720) DYNC2LI1 (ENSANAG00000026294) ABCG5 (ENSANAG00000030896) ABCG8 (ENSANAG00000033135) LRPPRC (ENSANAG00000027440) ENSANAG00000034181 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014476 #9 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000161613 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00940000153181.z #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00940000153294.m.a.c.a.e.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123.xd.b #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 ENSGT00940000159718 #37 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123.xd.b #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 ENSGT00940000159718 #37 ENSGT01030000235088 ENSGT00940000153385.b.a.a Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 61 ARHGEF33 (ENSSBOG00000020892) ENSSBOG00000025463 SOS1 (ENSSBOG00000028658) ENSSBOG00000027102 CDKL4 (ENSSBOG00000022521) MAP4K3 (ENSSBOG00000022834) ENSSBOG00000033269 TMEM178A (ENSSBOG00000028853) THUMPD2 (ENSSBOG00000015419) SLC8A1 (ENSSBOG00000021323) ENSSBOG00000032761 PKDCC (ENSSBOG00000035223) EML4 (ENSSBOG00000033960) COX7A2L (ENSSBOG00000035426) ENSSBOG00000036228 ENSSBOG00000033255 ##22 KCNG3 (ENSSBOG00000032206) MTA3 (ENSSBOG00000030404) HAAO (ENSSBOG00000034142) ENSSBOG00000023471 ENSSBOG00000036256 ZFP36L2 (ENSSBOG00000020271) THADA (ENSSBOG00000034696) ENSSBOG00000018933 PLEKHH2 (ENSSBOG00000021126) DYNC2LI1 (ENSSBOG00000027181) ABCG5 (ENSSBOG00000030125) ABCG8 (ENSSBOG00000015810) ENSSBOG00000029182 LRPPRC (ENSSBOG00000011807) ENSSBOG00000021379 Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 21 CCR4 (ENSCCAG00000019573) TRIM71 (ENSCCAG00000024597) CNOT10 (ENSCCAG00000020746) ENSCCAG00000019874 ENSCCAG00000014618 DYNC1LI1 (ENSCCAG00000025596) ENSCCAG00000031054 CMTM6 (ENSCCAG00000036050) CMTM7 (ENSCCAG00000021122) CMTM8 (ENSCCAG00000034682) GPD1L (ENSCCAG00000026946) OSBPL10 (ENSCCAG00000028004) STT3B (ENSCCAG00000028345) GADL1 (ENSCCAG00000020686) TGFBR2 (ENSCCAG00000022409) ENSCCAG00000033718 ##22 RNF144B (ENSCCAG00000024520) DEK (ENSCCAG00000031656) KDM1B (ENSCCAG00000021864) TPMT (ENSCCAG00000019158) NHLRC1 (ENSCCAG00000005020) KIF13A (ENSCCAG00000020851) ENSCCAG00000003528 NUP153 (ENSCCAG00000024038) FAM8A1 (ENSCCAG00000019876) CAP2 (ENSCCAG00000033725) RBM24 (ENSCCAG00000030791) STMND1 (ENSCCAG00000017508) ATXN1 (ENSCCAG00000018590) GMPR (ENSCCAG00000021522) MYLIP (ENSCCAG00000023590) Capuchin MODERN SPECIES 486 MED22 (ENSCCAG00000032680) ENSCCAG00000035068 ##22 ENSCCAG00000023749 SURF2 (ENSCCAG00000021767) #25 SURF4 (ENSCCAG00000023152) #26 STKLD1 (ENSCCAG00000035466) #27 REXO4 (ENSCCAG00000027049) #28 ADAMTS13 (ENSCCAG00000037675) #29 CACFD1 (ENSCCAG00000030525) #30 SLC2A6 (ENSCCAG00000037488) #31 MYMK (ENSCCAG00000028174) #32 ADAMTSL2 (ENSCCAG00000021833) #34 FAM163B (ENSCCAG00000013948) #33 DBH (ENSCCAG00000024257) #35 SARDH (ENSCCAG00000027795) #36 VAV2 (ENSCCAG00000028423) #37 BRD3OS (ENSCCAG00000008444) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 Bushbaby MODERN SPECIES 202 ENSOGAG00000008569 KCNT1 (ENSOGAG00000008571) CAMSAP1 (ENSOGAG00000026569) UBAC1 (ENSOGAG00000014447) NACC2 (ENSOGAG00000024802) TMEM250 (ENSOGAG00000029423) LHX3 (ENSOGAG00000000723) QSOX2 (ENSOGAG00000000724) ENSOGAG00000031359 GPSM1 (ENSOGAG00000029436) DNLZ (ENSOGAG00000027386) CARD9 (ENSOGAG00000024499) SNAPC4 (ENSOGAG00000015861) ENSOGAG00000015872 PMPCA (ENSOGAG00000015875) ENSOGAG00000007682 ##22 ENSOGAG00000024858 INPP5E (ENSOGAG00000015883) SEC16A (ENSOGAG00000015887) NOTCH1 (ENSOGAG00000015908) EGFL7 (ENSOGAG00000007178) AGPAT2 (ENSOGAG00000025726) DIPK1B (ENSOGAG00000008561) ABO (ENSOGAG00000029319) ##20 SURF6 (ENSOGAG00000027199) #21 MED22 (ENSOGAG00000014026) ENSOGAG00000014027 ENSOGAG00000024295 #26 SURF2 (ENSOGAG00000031360) #25 STKLD1 (ENSOGAG00000014034) #27 REXO4 (ENSOGAG00000014040) #28 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 380 INSL6 (ENSPCOG00000018388) ENSPCOG00000016254 PLGRKT (ENSPCOG00000024244) CD274 (ENSPCOG00000015449) PDCD1LG2 (ENSPCOG00000024540) RIC1 (ENSPCOG00000015027) ERMP1 (ENSPCOG00000018894) ENSPCOG00000004337 ##22 MLANA (ENSPCOG00000022962) ENSPCOG00000019930 KIAA2026 (ENSPCOG00000006427) ENSPCOG00000022511 IL33 (ENSPCOG00000018910) TPD52L3 (ENSPCOG00000021409) UHRF2 (ENSPCOG00000013716) GLDC (ENSPCOG00000026220) KDM4C (ENSPCOG00000018901) DMAC1 (ENSPCOG00000020857) ENSPCOG00000022605 ENSPCOG00000020491 PTPRD (ENSPCOG00000025889) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 430 KIDINS220 (ENSPSMG00000020495) MBOAT2 (ENSPSMG00000020319) ASAP2 (ENSPSMG00000020266) ENSPSMG00000020223 CPSF3 (ENSPSMG00000020174) IAH1 (ENSPSMG00000020104) ADAM17 (ENSPSMG00000020083) YWHAQ (ENSPSMG00000020036) TAF1B (ENSPSMG00000019984) GRHL1 (ENSPSMG00000019897) KLF11 (ENSPSMG00000019846) CYS1 (ENSPSMG00000019836) RRM2 (ENSPSMG00000019823) HPCAL1 (ENSPSMG00000019803) ODC1 (ENSPSMG00000019773) ENSPSMG00000019736 ##22 ENSPSMG00000019726 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 Tree shrew MODERN SPECIES 5126 RFX5 (ENSTBEG00000006419) PI4KB (ENSTBEG00000004970) ENSTBEG00000004134 ENSTBEG00000003942 ENSTBEG00000003344 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 Rabbit MODERN SPECIES 18 FSIP2 (ENSOCUG00000005608) ENSOCUG00000009690 ZC3H15 (ENSOCUG00000011903) ITGAV (ENSOCUG00000017626) FAM171B (ENSOCUG00000001825) ZSWIM2 (ENSOCUG00000011122) CALCRL (ENSOCUG00000013954) TFPI (ENSOCUG00000008253) GULP1 (ENSOCUG00000026935) ENSOCUG00000038005 COL3A1 (ENSOCUG00000014988) COL5A2 (ENSOCUG00000015020) ENSOCUG00000031224 WDR75 (ENSOCUG00000011450) SLC40A1 (ENSOCUG00000004826) ENSOCUG00000022874 ##22 ASDURF (ENSOCUG00000036487) ENSOCUG00000012468 ANKAR (ENSOCUG00000012473) OSGEPL1 (ENSOCUG00000012491) ENSOCUG00000012504 PMS1 (ENSOCUG00000012511) MSTN (ENSOCUG00000012663) C2orf88 (ENSOCUG00000028135) HIBCH (ENSOCUG00000005515) INPP1 (ENSOCUG00000000006) MFSD6 (ENSOCUG00000003405) NEMP2 (ENSOCUG00000003413) NAB1 (ENSOCUG00000008556) ENSOCUG00000025378 GLS (ENSOCUG00000002448) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a.c.b ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 GPSM1 (ENSHGLG00000012552) ENSHGLG00000013032 CARD9 (ENSHGLG00000013369) SNAPC4 (ENSHGLG00000019312) ENSHGLG00000018437 PMPCA (ENSHGLG00000012489) INPP5E (ENSHGLG00000014038) SEC16A (ENSHGLG00000019238) NOTCH1 (ENSHGLG00000011967) EGFL7 (ENSHGLG00000019272) AGPAT2 (ENSHGLG00000018608) ENSHGLG00000012618 ENSHGLG00000050990 ENSHGLG00000032558 #21 ENSHGLG00000013372 ENSHGLG00000013590 ##22 ENSHGLG00000038677 SURF1 (ENSHGLG00000014684) #24 SURF2 (ENSHGLG00000019109) #25 SURF4 (ENSHGLG00000042282) #26 ENSHGLG00000039152 REXO4 (ENSHGLG00000016901) #28 ADAMTS13 (ENSHGLG00000016856) #29 CACFD1 (ENSHGLG00000019453) #30 SLC2A6 (ENSHGLG00000018833) #31 ENSHGLG00000046985 MYMK (ENSHGLG00000019250) #32 ADAMTSL2 (ENSHGLG00000010249) #34 FAM163B (ENSHGLG00000049689) #33 DBH (ENSHGLG00000012166) #35 SARDH (ENSHGLG00000013184) #36 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 DENND1A (ENSHGLG00000014439) LHX2 (ENSHGLG00000014024) NEK6 (ENSHGLG00000013776) PSMB7 (ENSHGLG00000013424) NR5A1 (ENSHGLG00000042870) NR6A1 (ENSHGLG00000012869) OLFML2A (ENSHGLG00000012516) ENSHGLG00000035609 ARPC5L (ENSHGLG00000012246) GOLGA1 (ENSHGLG00000012081) SCAI (ENSHGLG00000011703) PPP6C (ENSHGLG00000037108) RABEPK (ENSHGLG00000010878) HSPA5 (ENSHGLG00000045279) GAPVD1 (ENSHGLG00000012368) ENSHGLG00000012167 ##22 MAPKAP1 (ENSHGLG00000011921) PBX3 (ENSHGLG00000011457) ENSHGLG00000043708 MVB12B (ENSHGLG00000011104) LMX1B (ENSHGLG00000035542) ZBTB43 (ENSHGLG00000044018) ZBTB34 (ENSHGLG00000032761) ANGPTL2 (ENSHGLG00000042186) ENSHGLG00000018019 RALGPS1 (ENSHGLG00000017780) GARNL3 (ENSHGLG00000017737) SLC2A8 (ENSHGLG00000017706) ENSHGLG00000048469 LRSAM1 (ENSHGLG00000017618) NIBAN2 (ENSHGLG00000018010) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 6 ENSSVLG00005022990 ENSSVLG00005023004 OR13D1 (ENSSVLG00005023029) NIPSNAP3A (ENSSVLG00005023053) ABCA1 (ENSSVLG00005023157) SLC44A1 (ENSSVLG00005023410) ENSSVLG00005023457 FSD1L (ENSSVLG00005023494) FKTN (ENSSVLG00005013173) TAL2 (ENSSVLG00005013299) TMEM38B (ENSSVLG00005013327) ENSSVLG00005013378 ZNF462 (ENSSVLG00005013554) ENSSVLG00005013612 KLF4 (ENSSVLG00005013642) ENSSVLG00005013747 ##22 ACTL7B (ENSSVLG00005013848) ACTL7A (ENSSVLG00005013866) ELP1 (ENSSVLG00005013963) ABITRAM (ENSSVLG00005014070) CTNNAL1 (ENSSVLG00005014145) TMEM245 (ENSSVLG00005014297) FRRS1L (ENSSVLG00005014483) EPB41L4B (ENSSVLG00005014589) PTPN3 (ENSSVLG00005015106) PALM2AKAP2 (ENSSVLG00005015453) C9orf152 (ENSSVLG00005015706) ENSSVLG00005015761 ENSSVLG00005015870 SVEP1 (ENSSVLG00005016056) ENSSVLG00005016135 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000153412.A.u ENSGT00390000007539.i.b.b ENSGT00940000155762.ac ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00940000162932 ENSGT00950000183164.E ENSGT00950000183164.B.h ENSGT00940000153412.A.v ENSGT00950000183164.D ENSGT00950000183164.C ENSGT00940000153412.C.c ENSGT00390000001134.b ENSGT00950000182994.A.n.a ENSGT00390000000141 ENSGT00940000159611 ENSGT00520000059318 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a ENSGT00530000067269 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00940000155762.ac ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00940000162932 ENSGT00950000183164.E ENSGT00950000183164.B.h ENSGT00940000153412.A.v ENSGT00950000183164.D ENSGT00950000183164.C.g ENSGT00940000153412.C.c ENSGT00390000001134.b ENSGT00950000182994.A.n.a ENSGT00390000000141 ENSGT00940000159611 ENSGT00520000059318 ENSGT00950000183121.b.b.b.a ENSGT00530000063666.a ENSGT00940000163888.n Squirrel MODERN SPECIES 147 ENSSTOG00000030112 ENSSTOG00000031997 ##22 BEX4 (ENSSTOG00000004130) TCEAL8 (ENSSTOG00000004386) ENSSTOG00000024937 ENSSTOG00000027481 ENSSTOG00000016142 TCEAL7 (ENSSTOG00000005945) ENSSTOG00000008144 ENSSTOG00000029794 DACH2 (ENSSTOG00000006685) CHM (ENSSTOG00000022111) POF1B (ENSSTOG00000011717) ZNF711 (ENSSTOG00000008918) ENSSTOG00000029673 APOOL (ENSSTOG00000005067) ENSSTOG00000023046 Alpin marmot MODERN SPECIES 78 ENSMMMG00000010564 ENSMMMG00000010629 BEX5 (ENSMMMG00000010668) ENSMMMG00000010671 ENSMMMG00000010680 ENSMMMG00000010684 NXF3 (ENSMMMG00000010686) ENSMMMG00000010721 ENSMMMG00000010744 ##22 BEX4 (ENSMMMG00000010757) ENSMMMG00000010766 ENSMMMG00000010770 TCEAL7 (ENSMMMG00000010775) BEX3 (ENSMMMG00000010779) DACH2 (ENSMMMG00000010801) CHM (ENSMMMG00000010964) POF1B (ENSMMMG00000011075) ENSMMMG00000011100 ENSMMMG00000011112 APOOL (ENSMMMG00000011126) ENSMMMG00000011171 HDX (ENSMMMG00000011191) RPS6KA6 (ENSMMMG00000011222) CYLC1 (ENSMMMG00000011257) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 159 Cfap61 (ENSJJAG00000018922) Crnkl1 (ENSJJAG00000016926) Naa20 (ENSJJAG00000016004) ENSJJAG00000015745 Slc24a3 (ENSJJAG00000015385) Dtd1 (ENSJJAG00000014379) Sec23b (ENSJJAG00000018722) Rbbp9 (ENSJJAG00000017816) Polr3f (ENSJJAG00000017513) Dzank1 (ENSJJAG00000016670) ENSJJAG00000015853 Kat14 (ENSJJAG00000015569) Ovol2 (ENSJJAG00000014942) Mgme1 (ENSJJAG00000014663) ENSJJAG00000014561 ENSJJAG00000014376 ##22 Banf2 (ENSJJAG00000014091) Rrbp1 (ENSJJAG00000011577) Dstn (ENSJJAG00000010476) ENSJJAG00000012050 Bfsp1 (ENSJJAG00000009919) Pcsk2 (ENSJJAG00000014747) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 69 ENSJJAG00000011966 ENSJJAG00000023552 ENSJJAG00000024422 ENSJJAG00000005461 ENSJJAG00000011135 Tceal1 (ENSJJAG00000011407) Morf4l2 (ENSJJAG00000019613) Glra4 (ENSJJAG00000018273) Plp1 (ENSJJAG00000010337) ENSJJAG00000016927 Slc25a53 (ENSJJAG00000010669) ENSJJAG00000011420 ENSJJAG00000021348 Fam199x (ENSJJAG00000018721) ENSJJAG00000021979 ENSJJAG00000024026 ##22 Il1rapl2 (ENSJJAG00000011451) ENSJJAG00000005280 Serpina7 (ENSJJAG00000024168) ENSJJAG00000015393 Rnf128 (ENSJJAG00000016014) Tbc1d8b (ENSJJAG00000011087) ENSJJAG00000020964 Cldn2 (ENSJJAG00000011051) Morc4 (ENSJJAG00000023626) Rbm41 (ENSJJAG00000010415) Nup62cl (ENSJJAG00000020606) ENSJJAG00000024096 Frmpd3 (ENSJJAG00000010591) ENSJJAG00000012647 ENSJJAG00000002094 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 206 Fdft1 (ENSJJAG00000018680) Neil2 (ENSJJAG00000018877) ENSJJAG00000019146 ENSJJAG00000019153 Tdh (ENSJJAG00000010374) Mtmr9 (ENSJJAG00000010497) Xkr6 (ENSJJAG00000010556) Pinx1 (ENSJJAG00000010795) Sox7 (ENSJJAG00000010830) 4930578I06Rik (ENSJJAG00000011044) Rp1l1 (ENSJJAG00000011185) Prss55 (ENSJJAG00000011322) ENSJJAG00000011396 Prss52 (ENSJJAG00000011586) Msra (ENSJJAG00000012183) ENSJJAG00000012899 ##22 Kif13b (ENSJJAG00000014137) Hmbox1 (ENSJJAG00000012781) ENSJJAG00000014576 ENSJJAG00000014642 Extl3 (ENSJJAG00000014870) Fzd3 (ENSJJAG00000015167) Fbxo16 (ENSJJAG00000015532) Zfp395 (ENSJJAG00000017401) Elp3 (ENSJJAG00000017778) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 153 Ror2 (ENSJJAG00000020635) Nfil3 (ENSJJAG00000012187) Auh (ENSJJAG00000014980) Syk (ENSJJAG00000004667) Diras2 (ENSJJAG00000012287) ENSJJAG00000000175 Gadd45g (ENSJJAG00000000083) Sema4d (ENSJJAG00000000493) ENSJJAG00000000039 Secisbp2 (ENSJJAG00000020492) Cks2 (ENSJJAG00000019823) Shc3 (ENSJJAG00000019038) S1pr3 (ENSJJAG00000012199) Nxnl2 (ENSJJAG00000018123) Spin1 (ENSJJAG00000017100) ENSJJAG00000016802 ##22 Sbk1 (ENSJJAG00000015865) Xpo6 (ENSJJAG00000019392) Gsg1l (ENSJJAG00000020816) Katnip (ENSJJAG00000018459) Gtf3c1 (ENSJJAG00000015015) Il21r (ENSJJAG00000012663) Il4ra (ENSJJAG00000020039) Nsmce1 (ENSJJAG00000019760) Kdm8 (ENSJJAG00000019538) ENSJJAG00000012215 Zkscan2 (ENSJJAG00000019353) Aqp8 (ENSJJAG00000017882) Lcmt1 (ENSJJAG00000011971) Arhgap17 (ENSJJAG00000020980) ENSJJAG00000019562 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Fam133b (ENSPEMG00000010640) 1700109H08Rik (ENSPEMG00000010299) Rbm48 (ENSPEMG00000008284) Pex1 (ENSPEMG00000014258) ENSPEMG00000026596 Tmbim7 (ENSPEMG00000016377) Ankib1 (ENSPEMG00000016309) Krit1 (ENSPEMG00000010538) Lrrd1 (ENSPEMG00000015593) ENSPEMG00000028372 Cyp51 (ENSPEMG00000011646) ENSPEMG00000030769 ENSPEMG00000017227 ENSPEMG00000013884 ENSPEMG00000002373 ENSPEMG00000028603 ##22 ENSPEMG00000028894 Fzd1 (ENSPEMG00000004940) Cdk14 (ENSPEMG00000009698) Pttg1ip2 (ENSPEMG00000009217) Cldn12 (ENSPEMG00000029946) Gtpbp10 (ENSPEMG00000009263) Gm8773 (ENSPEMG00000025050) Cfap69 (ENSPEMG00000007814) Steap2 (ENSPEMG00000008900) Steap1 (ENSPEMG00000011064) Zfp804b (ENSPEMG00000010520) ENSPEMG00000013287 Slc25a40 (ENSPEMG00000024272) Rundc3b (ENSPEMG00000022540) Abcb1a (ENSPEMG00000022584) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a.f ##22 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 12 RGD1310495 (ENSRNOG00000000589) Naglt1 (ENSRNOG00000000590) RGD1561777 (ENSRNOG00000050425) Mfsd4b2 (ENSRNOG00000042918) ENSRNOG00000068471 Mfsd4b1 (ENSRNOG00000024543) Rev3l (ENSRNOG00000000593) Traf3ip2 (ENSRNOG00000000595) Fyn (ENSRNOG00000000596) Ccn6 (ENSRNOG00000000597) Tube1 (ENSRNOG00000000598) Fam229b (ENSRNOG00000024918) Lama4 (ENSRNOG00000000599) AABR07045341.1 (ENSRNOG00000058648) LOC120098890 (ENSRNOG00000032548) AABR07045321.1 (ENSRNOG00000033652) ##22 Marcks (ENSRNOG00000000579) Hdac2 (ENSRNOG00000000604) Hs3st5 (ENSRNOG00000000605) Frk (ENSRNOG00000000543) Col10a1 (ENSRNOG00000051399) Nt5dc1 (ENSRNOG00000000546) Tspyl4 (ENSRNOG00000000547) ENSRNOG00000063538 ENSRNOG00000069043 ENSRNOG00000067001 ENSRNOG00000065029 ENSRNOG00000068589 Smpdl3a (ENSRNOG00000000815) Fabp7 (ENSRNOG00000000814) Pkib (ENSRNOG00000000811) Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 13 ENSRNOG00000068403 Chn1 (ENSRNOG00000017939) Chrna1 (ENSRNOG00000018286) Rbx1-ps2 (ENSRNOG00000067031) Wipf1 (ENSRNOG00000018406) Gpr155 (ENSRNOG00000018485) Scrn3 (ENSRNOG00000018657) Cir1 (ENSRNOG00000018719) Sp9 (ENSRNOG00000028187) ENSRNOG00000032195 Ola1 (ENSRNOG00000019047) Sp3 (ENSRNOG00000060479) AC120066.1 (ENSRNOG00000001510) LOC120101567 (ENSRNOG00000028492) Eno1-ps1 (ENSRNOG00000028543) AABR07052519.1 (ENSRNOG00000029423) ##22 Cdca7 (ENSRNOG00000001514) Map3k20 (ENSRNOG00000001515) Rapgef4 (ENSRNOG00000001516) Pdk1 (ENSRNOG00000001517) Itga6 (ENSRNOG00000001518) Dlx2 (ENSRNOG00000001519) Dlx1 (ENSRNOG00000001520) Metap1d (ENSRNOG00000061587) Hat1 (ENSRNOG00000001524) ENSRNOG00000065953 Slc25a12 (ENSRNOG00000022922) Dync1i2 (ENSRNOG00000009781) AC107446.1 (ENSRNOG00000023090) Cybrd1 (ENSRNOG00000009620) Dcaf17 (ENSRNOG00000009403) Rat MODERN SPECIES 15 Map7d1 (ENSRNOG00000010237) Trappc3 (ENSRNOG00000010550) Col8a2 (ENSRNOG00000010841) Adprs (ENSRNOG00000010849) Tekt2 (ENSRNOG00000011033) Ago3 (ENSRNOG00000034269) Ago1 (ENSRNOG00000055915) Ago4 (ENSRNOG00000025596) Clspn (ENSRNOG00000011332) RGD1563072 (ENSRNOG00000021609) Psmb2 (ENSRNOG00000011463) Tfap2e (ENSRNOG00000027595) Ncdn (ENSRNOG00000011751) LOC100294508 (ENSRNOG00000012204) Zmym4 (ENSRNOG00000012397) AABR07049918.1 (ENSRNOG00000029310) ##22 ENSRNOG00000062954 Rpl37a-ps1 (ENSRNOG00000066117) Sfpq (ENSRNOG00000058461) Zmym1 (ENSRNOG00000013855) Zmym6 (ENSRNOG00000013865) Tmem35b (ENSRNOG00000028083) Dlgap3 (ENSRNOG00000014302) Smim12 (ENSRNOG00000014352) Gja4 (ENSRNOG00000014357) ENSRNOG00000067866 Gjb3 (ENSRNOG00000014372) Gjb4 (ENSRNOG00000026910) Gjb5 (ENSRNOG00000059897) LOC682102 (ENSRNOG00000048129) Csmd2 (ENSRNOG00000007057) Rat MODERN SPECIES 14 H1f8 (ENSRNOG00000025251) Rho (ENSRNOG00000011144) Ift122 (ENSRNOG00000010952) Mbd4 (ENSRNOG00000010919) Efcab12 (ENSRNOG00000026176) Rpl32 (ENSRNOG00000010746) Cand2 (ENSRNOG00000010473) Tmem40 (ENSRNOG00000010430) Raf1 (ENSRNOG00000010153) Mkrn2 (ENSRNOG00000009176) Mkrn2os (ENSRNOG00000070957) Tsen2 (ENSRNOG00000060175) Pparg (ENSRNOG00000008839) Timp4 (ENSRNOG00000007955) ENSRNOG00000069227 AC128901.1 (ENSRNOG00000028826) ##22 ENSRNOG00000067395 Syn2 (ENSRNOG00000008157) Tamm41 (ENSRNOG00000007874) Vgll4 (ENSRNOG00000007822) Atg7 (ENSRNOG00000007486) ENSRNOG00000069624 LOC120102367 (ENSRNOG00000067090) Hrh1 (ENSRNOG00000007420) Slc6a1 (ENSRNOG00000006527) Slc6a11 (ENSRNOG00000005697) Atp2b2 (ENSRNOG00000030269) Sec13 (ENSRNOG00000010628) Ghrl (ENSRNOG00000010349) Tatdn2 (ENSRNOG00000042482) Irak2 (ENSRNOG00000021817) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000153294.m.a ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000166736 ENSGT00940000157589 #36 ENSGT00940000159718 #37 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 167 ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447.e #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 ENSGT00940000159718 #37 ENSGT00940000153385.b.a.a Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00950000182858.A.a.a ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447.e #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 ENSGT00940000159718 #37 ENSGT00940000153385.b.a.a Elephant MODERN SPECIES 593 RFX3 (ENSLAFG00000021602) ENSLAFG00000031654 ENSLAFG00000029971 ENSLAFG00000026125 SLC1A1 (ENSLAFG00000001120) PLPP6 (ENSLAFG00000001123) SPATA6L (ENSLAFG00000001121) CDC37L1 (ENSLAFG00000001125) AK3 (ENSLAFG00000001126) RCL1 (ENSLAFG00000017495) JAK2 (ENSLAFG00000007471) INSL6 (ENSLAFG00000007479) ABO (ENSLAFG00000010293) ##20 SURF6 (ENSLAFG00000026419) #21 MED22 (ENSLAFG00000002513) ENSLAFG00000006436 ##22 ENSLAFG00000016963 #24 STKLD1 (ENSLAFG00000008238) #27 REXO4 (ENSLAFG00000011274) #28 ADAMTS13 (ENSLAFG00000011278) #29 CACFD1 (ENSLAFG00000005395) #30 SLC2A6 (ENSLAFG00000005401) #31 MYMK (ENSLAFG00000016453) #32 ADAMTSL2 (ENSLAFG00000021754) #34 FAM163B (ENSLAFG00000021737) #33 DBH (ENSLAFG00000002773) #35 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.a ##22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1506 ENSDNOG00000031289 ##22 ENSDNOG00000034593 ENSDNOG00000048467 ENSDNOG00000042003 ENSDNOG00000041707 ENSDNOG00000034952 ENSDNOG00000044654 ENSDNOG00000037974 ENSDNOG00000036665 ENSDNOG00000044295 ENSDNOG00000032953 ENSDNOG00000030823 OR4C3 (ENSDNOG00000038506) OR4S1 (ENSDNOG00000001481) ENSDNOG00000044205 ENSDNOG00000046625 Armadillo MODERN SPECIES 2710 ENSDNOG00000036170 #19 ENSDNOG00000010421 ENSDNOG00000024138 ENSDNOG00000049381 ENSDNOG00000016118 ENSDNOG00000043851 ENSDNOG00000030713 ##22 LGSN (ENSDNOG00000002259) Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160918 #7 ENSGT00940000159729 #8 ENSGT00390000014476.a #9 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000164784 #13 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000153181 #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00940000153246.b ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607 #28 ENSGT00940000158379.a #29 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 ENSGT00940000159718 #37 ENSGT01100000264062 Duck MODERN SPECIES 8 ENSAPLG00000017432 SETX (ENSAPLG00000016276) #7 TTF1 (ENSAPLG00000016383) #8 CFAP77 (ENSAPLG00000016385) #9 DDX31 (ENSAPLG00000016396) #11 GTF3C4 (ENSAPLG00000000962) #12 ENSAPLG00000002249 #13 SPACA9 (ENSAPLG00000002446) #15 TSC1 (ENSAPLG00000002487) #14 GFI1B (ENSAPLG00000003373) #16 GTF3C5 (ENSAPLG00000003782) #18 ENSAPLG00000019453 GBGT1 (ENSAPLG00000004843) #20 ENSAPLG00000004861 SURF6 (ENSAPLG00000005069) #21 ENSAPLG00000005247 ##22 SURF1 (ENSAPLG00000005581) #24 SURF2 (ENSAPLG00000005587) #25 SURF4 (ENSAPLG00000005704) #26 STKLD1 (ENSAPLG00000005819) #27 REXO4 (ENSAPLG00000005865) #28 ENSAPLG00000019736 #29 ENSAPLG00000017995 #29 ENSAPLG00000006553 CACFD1 (ENSAPLG00000006756) #30 SLC2A6 (ENSAPLG00000006885) #31 MYMK (ENSAPLG00000007109) #32 ADAMTSL2 (ENSAPLG00000007114) #34 FAM163B (ENSAPLG00000020379) #33 DBH (ENSAPLG00000007151) #35 SARDH (ENSAPLG00000007295) #36 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 483 ENSDORG00000027559 ##22 Septin14 (ENSDORG00000011677) Nipsnap2 (ENSDORG00000004440) Psph (ENSDORG00000004178) Cct6a (ENSDORG00000013420) Sumf2 (ENSDORG00000001252) Phkg1 (ENSDORG00000001256) ENSDORG00000011939 Gusb (ENSDORG00000011942) Asl (ENSDORG00000011943) Crcp (ENSDORG00000013712) Tpst1 (ENSDORG00000007420) Kctd7 (ENSDORG00000028669) Rabgef1 (ENSDORG00000004205) ENSDORG00000014767 Sbds (ENSDORG00000026218) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 82 Colq (ENSJJAG00000012436) ENSJJAG00000014692 Eaf1 (ENSJJAG00000019409) Mettl6 (ENSJJAG00000018567) ENSJJAG00000014685 Sh3bp5 (ENSJJAG00000014182) Capn7 (ENSJJAG00000019584) ENSJJAG00000016845 Slmap (ENSJJAG00000022979) Dennd6a (ENSJJAG00000014183) Arf4 (ENSJJAG00000012294) Pde12 (ENSJJAG00000006038) ENSJJAG00000015636 Dnah12 (ENSJJAG00000012772) Asb14 (ENSJJAG00000000382) ENSJJAG00000022569 ##22 Appl1 (ENSJJAG00000017551) Hesx1 (ENSJJAG00000014902) Il17rd (ENSJJAG00000019975) Arhgef3 (ENSJJAG00000018063) Tasor (ENSJJAG00000011951) Ube2e2 (ENSJJAG00000005882) ENSJJAG00000010861 ENSJJAG00000020028 Nkiras1 (ENSJJAG00000014668) Rpl15 (ENSJJAG00000014445) Nr1d2 (ENSJJAG00000013005) Thrb (ENSJJAG00000006766) Rarb (ENSJJAG00000000743) Top2b (ENSJJAG00000005440) Ngly1 (ENSJJAG00000000939) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Rat MODERN SPECIES 1 Suz12 (ENSRNOG00000058663) Crlf3 (ENSRNOG00000050657) Atad5 (ENSRNOG00000021903) Tefm (ENSRNOG00000004000) Adap2 (ENSRNOG00000037148) Rhot1 (ENSRNOG00000004093) Rhbdl3 (ENSRNOG00000005515) RGD1310429 (ENSRNOG00000000237) Psmd11 (ENSRNOG00000005538) Cdk5r1 (ENSRNOG00000068243) Myo1d (ENSRNOG00000003276) Tmem98 (ENSRNOG00000021316) Spaca3 (ENSRNOG00000006994) Asic2 (ENSRNOG00000058308) AABR07030122.1 (ENSRNOG00000030217) ENSRNOG00000063667 ##22 ENSRNOG00000068272 Ccl2 (ENSRNOG00000007159) Ccl7 (ENSRNOG00000000239) Ccl11 (ENSRNOG00000007335) Ccl12 (ENSRNOG00000029768) Ccl1 (ENSRNOG00000021851) Tmem132e (ENSRNOG00000007455) Cct6b (ENSRNOG00000007523) AC095947.1 (ENSRNOG00000030291) Zfp830 (ENSRNOG00000007578) Lig3 (ENSRNOG00000021815) Rffl (ENSRNOG00000007596) Fndc8 (ENSRNOG00000008264) Nle1 (ENSRNOG00000008287) Unc45b (ENSRNOG00000009466) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 414 ENSPEMG00000013592 ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 644 Serpinc1 (ENSMAUG00000019496) Rc3h1 (ENSMAUG00000020864) ENSMAUG00000009533 ENSMAUG00000021252 ENSMAUG00000015678 Mrps14 (ENSMAUG00000018062) Tnn (ENSMAUG00000014939) 4930523C07Rik (ENSMAUG00000016508) Tnr (ENSMAUG00000000637) Cop1 (ENSMAUG00000001871) Pappa2 (ENSMAUG00000011215) Astn1 (ENSMAUG00000021977) Brinp2 (ENSMAUG00000016427) ENSMAUG00000011275 Sec16b (ENSMAUG00000001343) ENSMAUG00000019197 ##22 Cryzl2 (ENSMAUG00000012366) Rasal2 (ENSMAUG00000000816) Tex35 (ENSMAUG00000018275) Angptl1 (ENSMAUG00000013871) Ralgps2 (ENSMAUG00000015720) Fam20b (ENSMAUG00000001069) Tor3a (ENSMAUG00000011851) Abl2 (ENSMAUG00000013694) Soat1 (ENSMAUG00000008590) Axdnd1 (ENSMAUG00000020744) Nphs2 (ENSMAUG00000021749) Tdrd5 (ENSMAUG00000022134) Fam163a (ENSMAUG00000018345) ENSMAUG00000011822 Tor1aip1 (ENSMAUG00000018612) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 583 GRIA3 (ENSUPAG00010006487) ENSUPAG00010006478 ##22 THOC2 (ENSUPAG00010006443) ENSUPAG00010006440 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 RANGAP1 (ENSHGLG00000015526) CHADL (ENSHGLG00000018119) L3MBTL2 (ENSHGLG00000018290) EP300 (ENSHGLG00000015586) RBX1 (ENSHGLG00000014822) XPNPEP3 (ENSHGLG00000013429) ENSHGLG00000013411 SLC25A17 (ENSHGLG00000013720) MCHR1 (ENSHGLG00000005319) MRTFA (ENSHGLG00000009723) SGSM3 (ENSHGLG00000018585) ADSL (ENSHGLG00000016466) ENSHGLG00000009306 ENSHGLG00000038998 ENSHGLG00000042810 ENSHGLG00000018482 ##22 ENSHGLG00000049183 ENSHGLG00000017812 GRAP2 (ENSHGLG00000012328) ENSHGLG00000016043 CACNA1I (ENSHGLG00000017516) RPS19BP1 (ENSHGLG00000010403) ATF4 (ENSHGLG00000011252) ENSHGLG00000017939 ENSHGLG00000041878 ENSHGLG00000039337 MGAT3 (ENSHGLG00000012583) TAB1 (ENSHGLG00000015491) SYNGR1 (ENSHGLG00000044391) ENSHGLG00000043353 RPL3 (ENSHGLG00000010440) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 747 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00390000014818 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 14 GABRP (ENSOCUG00000008191) KCNMB1 (ENSOCUG00000000539) KCNIP1 (ENSOCUG00000000540) LCP2 (ENSOCUG00000000534) C5orf58 (ENSOCUG00000030888) FOXI1 (ENSOCUG00000000836) INSYN2B (ENSOCUG00000000834) ENSOCUG00000031547 SPDL1 (ENSOCUG00000005503) SLIT3 (ENSOCUG00000017302) PANK3 (ENSOCUG00000011991) RARS1 (ENSOCUG00000015698) WWC1 (ENSOCUG00000003581) ENSOCUG00000037832 TENM2 (ENSOCUG00000003576) ENSOCUG00000025389 ##22 ENSOCUG00000031379 MAT2B (ENSOCUG00000008074) HMMR (ENSOCUG00000022126) NUDCD2 (ENSOCUG00000005783) ENSOCUG00000002129 GABRG2 (ENSOCUG00000016742) GABRA1 (ENSOCUG00000016109) GABRA6 (ENSOCUG00000014884) ENSOCUG00000031142 ENSOCUG00000032731 GABRB2 (ENSOCUG00000010098) ATP10B (ENSOCUG00000006800) ENSOCUG00000037038 ENSOCUG00000014877 SLU7 (ENSOCUG00000011743) Rabbit MODERN SPECIES GCNT1 (ENSOCUG00000007916) PRUNE2 (ENSOCUG00000008553) FOXB2 (ENSOCUG00000002111) VPS13A (ENSOCUG00000001328) GNA14 (ENSOCUG00000005507) GNAQ (ENSOCUG00000016559) CEP78 (ENSOCUG00000007758) PSAT1 (ENSOCUG00000007765) ENSOCUG00000026996 ENSOCUG00000024344 TLE4 (ENSOCUG00000011891) ENSOCUG00000032761 ENSOCUG00000022657 ENSOCUG00000000531 ENSOCUG00000035151 ENSOCUG00000027027 ##22 ENSOCUG00000032438 ENSOCUG00000023951 ENSOCUG00000034184 ENSOCUG00000027755 ENSOCUG00000039432 RASEF (ENSOCUG00000001548) MFSD14B (ENSOCUG00000005373) ZNF484 (ENSOCUG00000029283) IARS1 (ENSOCUG00000016888) NOL8 (ENSOCUG00000008053) CENPP (ENSOCUG00000007236) OGN (ENSOCUG00000009017) OMD (ENSOCUG00000016193) ASPN (ENSOCUG00000028053) ECM2 (ENSOCUG00000008288) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 760 ENSANAG00000029038 ENSANAG00000028169 ENSANAG00000035571 ENSANAG00000019045 ENSANAG00000033721 USP18 (ENSANAG00000038004) TUBA8 (ENSANAG00000020993) PEX26 (ENSANAG00000033468) ENSANAG00000024037 MICAL3 (ENSANAG00000021919) BID (ENSANAG00000035339) BCL2L13 (ENSANAG00000017578) ENSANAG00000037241 SLC25A18 (ENSANAG00000036909) ENSANAG00000021362 ##22 CECR2 (ENSANAG00000035159) ENSANAG00000038012 ENSANAG00000027660 HDHD5 (ENSANAG00000022048) TMEM121B (ENSANAG00000024835) ENSANAG00000033260 ENSANAG00000031012 ENSANAG00000025732 ENSANAG00000034686 RTN4R (ENSANAG00000032599) CCDC188 (ENSANAG00000028823) ZDHHC8 (ENSANAG00000032330) ENSANAG00000024454 TRMT2A (ENSANAG00000035461) DGCR8 (ENSANAG00000013710) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 3 ADIRF (ENSCJAG00000073286) SNCG (ENSCJAG00000065128) ENSCJAG00000084420 MMRN2 (ENSCJAG00000011588) BMPR1A (ENSCJAG00000011555) LDB3 (ENSCJAG00000011521) ENSCJAG00000047316 ENSCJAG00000071422 ENSCJAG00000085907 ENSCJAG00000068554 CDHR1 (ENSCJAG00000084607) LRIT2 (ENSCJAG00000056097) LRIT1 (ENSCJAG00000015350) RGR (ENSCJAG00000015338) ENSCJAG00000008837 ENSCJAG00000079169 ##22 ENSCJAG00000083223 ENSCJAG00000081025 ENSCJAG00000072533 ENSCJAG00000008101 ANTXRL (ENSCJAG00000044868) RBP3 (ENSCJAG00000013661) GDF2 (ENSCJAG00000013659) GDF10 (ENSCJAG00000013653) PTPN20 (ENSCJAG00000013632) FRMPD2 (ENSCJAG00000013608) MAPK8 (ENSCJAG00000013551) ARHGAP22 (ENSCJAG00000013537) ENSCJAG00000013528 LRRC18 (ENSCJAG00000013525) ENSCJAG00000067460 Marmoset MODERN SPECIES 11 ENSCJAG00000069799 SREK1 (ENSCJAG00000015950) ERBIN (ENSCJAG00000015895) ENSCJAG00000064854 NLN (ENSCJAG00000015865) SGTB (ENSCJAG00000015847) TRAPPC13 (ENSCJAG00000015812) ENSCJAG00000079010 TRIM23 (ENSCJAG00000015796) PPWD1 (ENSCJAG00000015769) CENPK (ENSCJAG00000015759) ADAMTS6 (ENSCJAG00000015704) CWC27 (ENSCJAG00000015673) ENSCJAG00000075503 SREK1IP1 (ENSCJAG00000015668) ENSCJAG00000040821 ##22 SHISAL2B (ENSCJAG00000074167) RGS7BP (ENSCJAG00000074552) ENSCJAG00000068624 RNF180 (ENSCJAG00000015644) ENSCJAG00000086181 ENSCJAG00000075363 IPO11 (ENSCJAG00000015559) ENSCJAG00000045176 ENSCJAG00000084651 ENSCJAG00000085673 DIMT1 (ENSCJAG00000015527) ENSCJAG00000083662 KIF2A (ENSCJAG00000015422) ENSCJAG00000015420 ENSCJAG00000076754 Marmoset MODERN SPECIES 20 PALS2 (ENSCJAG00000007689) GSDME (ENSCJAG00000007718) OSBPL3 (ENSCJAG00000007746) ENSCJAG00000071449 ENSCJAG00000074356 C7orf31 (ENSCJAG00000063137) NPVF (ENSCJAG00000007888) ENSCJAG00000084957 ENSCJAG00000075759 ENSCJAG00000087067 NFE2L3 (ENSCJAG00000007897) HNRNPA2B1 (ENSCJAG00000007908) CBX3 (ENSCJAG00000007952) SNX10 (ENSCJAG00000060087) SKAP2 (ENSCJAG00000007979) ENSCJAG00000072929 ##22 ENSCJAG00000074413 ENSCJAG00000080948 HOXA1 (ENSCJAG00000008024) HOXA2 (ENSCJAG00000008032) HOXA3 (ENSCJAG00000043202) HOXA4 (ENSCJAG00000008058) HOXA5 (ENSCJAG00000047690) HOXA6 (ENSCJAG00000077854) HOXA7 (ENSCJAG00000080800) HOXA9 (ENSCJAG00000038531) HOXA10 (ENSCJAG00000081224) HOXA11 (ENSCJAG00000008187) HOXA13 (ENSCJAG00000008192) EVX1 (ENSCJAG00000008197) ENSCJAG00000081981 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00390000014818.g.b.a.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00390000014818.g.b.a.a Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00390000014818.g.b.a.a.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 178 MMP15 (ENSMNEG00000037386) ENSMNEG00000037709 CFAP20 (ENSMNEG00000036695) CSNK2A2 (ENSMNEG00000027967) CCDC113 (ENSMNEG00000028188) PRSS54 (ENSMNEG00000027374) GINS3 (ENSMNEG00000031079) NDRG4 (ENSMNEG00000042324) SETD6 (ENSMNEG00000043306) CNOT1 (ENSMNEG00000031820) SLC38A7 (ENSMNEG00000044122) ENSMNEG00000026883 ENSMNEG00000038406 ENSMNEG00000037447 ENSMNEG00000044282 ENSMNEG00000037496 ##22 ENSMNEG00000024176 CDH8 (ENSMNEG00000045175) CDH11 (ENSMNEG00000043918) CDH5 (ENSMNEG00000042861) ENSMNEG00000017786 BEAN1 (ENSMNEG00000037073) TK2 (ENSMNEG00000033766) ENSMNEG00000000811 CKLF (ENSMNEG00000041932) CMTM1 (ENSMNEG00000038140) CMTM2 (ENSMNEG00000037612) CMTM3 (ENSMNEG00000028761) CMTM4 (ENSMNEG00000031182) DYNC1LI2 (ENSMNEG00000026978) TERB1 (ENSMNEG00000028756) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 NCAM2 (ENSMFAG00000041136) ENSMFAG00000051017 MRPL39 (ENSMFAG00000032925) JAM2 (ENSMFAG00000042681) ATP5PF (ENSMFAG00000044695) GABPA (ENSMFAG00000041587) ENSMFAG00000059610 APP (ENSMFAG00000002479) ENSMFAG00000055023 ENSMFAG00000052953 ENSMFAG00000020561 ENSMFAG00000003558 ADAMTS1 (ENSMFAG00000039719) ADAMTS5 (ENSMFAG00000000566) ENSMFAG00000051968 ENSMFAG00000044607 ##22 N6AMT1 (ENSMFAG00000032851) LTN1 (ENSMFAG00000043574) RWDD2B (ENSMFAG00000034639) USP16 (ENSMFAG00000044627) CCT8 (ENSMFAG00000035602) MAP3K7CL (ENSMFAG00000035512) BACH1 (ENSMFAG00000041148) ENSMFAG00000061766 GRIK1 (ENSMFAG00000039272) CLDN8 (ENSMFAG00000030251) KRTAP24-1 (ENSMFAG00000050451) ENSMFAG00000062742 ENSMFAG00000051583 ENSMFAG00000050984 ENSMFAG00000061919 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 139 ENSCATG00000000450 ENSCATG00000030902 ENSCATG00000031493 ENSCATG00000041315 QRSL1 (ENSCATG00000041686) RTN4IP1 (ENSCATG00000045221) CRYBG1 (ENSCATG00000030957) ATG5 (ENSCATG00000032926) PRDM1 (ENSCATG00000029610) ENSCATG00000003731 PREP (ENSCATG00000029835) POPDC3 (ENSCATG00000018981) BVES (ENSCATG00000037642) LIN28B (ENSCATG00000037900) HACE1 (ENSCATG00000011353) ENSCATG00000031343 ##22 GRIK2 (ENSCATG00000030553) ENSCATG00000012149 ASCC3 (ENSCATG00000011281) ENSCATG00000045106 SIM1 (ENSCATG00000003305) MCHR2 (ENSCATG00000041382) PRDM13 (ENSCATG00000041563) ENSCATG00000041886 CCNC (ENSCATG00000042868) ENSCATG00000029496 USP45 (ENSCATG00000034256) ENSCATG00000036657 PNISR (ENSCATG00000012848) COQ3 (ENSCATG00000009558) FAXC (ENSCATG00000029392) Olive baboon MODERN SPECIES ENSPANG00000046646 ENSPANG00000004419 ENSPANG00000047597 ENSPANG00000034210 ENSPANG00000042324 RNPC3 (ENSPANG00000012137) COL11A1 (ENSPANG00000012521) OLFM3 (ENSPANG00000011612) ENSPANG00000040459 ENSPANG00000043856 ENSPANG00000048569 S1PR1 (ENSPANG00000014841) DPH5 (ENSPANG00000004610) SLC30A7 (ENSPANG00000004420) EXTL2 (ENSPANG00000015544) ENSPANG00000003750 ##22 ENSPANG00000030624 VCAM1 (ENSPANG00000007779) GPR88 (ENSPANG00000012474) CDC14A (ENSPANG00000014368) RTCA (ENSPANG00000000346) DBT (ENSPANG00000003632) LRRC39 (ENSPANG00000009763) TRMT13 (ENSPANG00000007598) SASS6 (ENSPANG00000017887) MFSD14A (ENSPANG00000020894) AGL (ENSPANG00000011613) FRRS1 (ENSPANG00000013359) PALMD (ENSPANG00000007599) PLPPR4 (ENSPANG00000006691) ENSPANG00000040457 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1740 APCDD1 (ENSRROG00000042421) ENSRROG00000040720 ENSRROG00000045258 ENSRROG00000030485 TXNDC2 (ENSRROG00000029697) RAB31 (ENSRROG00000027824) PPP4R1 (ENSRROG00000028801) RALBP1 (ENSRROG00000029961) TWSG1 (ENSRROG00000045634) ENSRROG00000041587 ANKRD12 (ENSRROG00000029328) ENSRROG00000028802 NDUFV2 (ENSRROG00000040789) MTCL1 (ENSRROG00000045370) RAB12 (ENSRROG00000019249) ENSRROG00000035341 ##22 PTPRM (ENSRROG00000037638) LRRC30 (ENSRROG00000018176) LAMA1 (ENSRROG00000031656) ENSRROG00000036253 ENSRROG00000042304 ARHGAP28 (ENSRROG00000042703) L3MBTL4 (ENSRROG00000042453) TMEM200C (ENSRROG00000020933) EPB41L3 (ENSRROG00000042750) ZBTB14 (ENSRROG00000029019) AKAIN1 (ENSRROG00000036584) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 474 SLC38A9 (ENSRBIG00000028044) ENSRBIG00000033979 DDX4 (ENSRBIG00000028795) ENSRBIG00000015941 IL31RA (ENSRBIG00000015386) ENSRBIG00000036601 ENSRBIG00000039163 ANKRD55 (ENSRBIG00000026624) ENSRBIG00000039375 ENSRBIG00000034921 ENSRBIG00000041568 MAP3K1 (ENSRBIG00000005725) SETD9 (ENSRBIG00000035762) MIER3 (ENSRBIG00000042787) GPBP1 (ENSRBIG00000032152) ENSRBIG00000007002 ##22 ACTBL2 (ENSRBIG00000018264) PLK2 (ENSRBIG00000038612) RAB3C (ENSRBIG00000043383) ENSRBIG00000028058 PDE4D (ENSRBIG00000043913) ENSRBIG00000038967 ENSRBIG00000028893 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Gibbon MODERN SPECIES 13 ADPRH (ENSNLEG00000004967) PLA1A (ENSNLEG00000004973) POPDC2 (ENSNLEG00000005011) ENSNLEG00000005017 CFAP91 (ENSNLEG00000005022) NR1I2 (ENSNLEG00000005060) GSK3B (ENSNLEG00000005074) GPR156 (ENSNLEG00000005093) LRRC58 (ENSNLEG00000033297) FSTL1 (ENSNLEG00000005099) RABL3 (ENSNLEG00000031723) GTF2E1 (ENSNLEG00000005135) ENSNLEG00000030176 ENSNLEG00000005175 STXBP5L (ENSNLEG00000005139) ENSNLEG00000030901 ##22 ENSNLEG00000032376 POLQ (ENSNLEG00000005179) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Orangutan MODERN SPECIES 13 DGCR2 (ENSPPYG00000011571) TSSK2 (ENSPPYG00000011573) ESS2 (ENSPPYG00000011574) GSC2 (ENSPPYG00000011575) SLC25A1 (ENSPPYG00000029785) CLTCL1 (ENSPPYG00000011576) HIRA (ENSPPYG00000011577) MRPL40 (ENSPPYG00000011578) C22H22orf39 (ENSPPYG00000037291) UFD1 (ENSPPYG00000011580) CDC45 (ENSPPYG00000011581) CLDN5 (ENSPPYG00000011582) SEPTIN5 (ENSPPYG00000011583) GP1BB (ENSPPYG00000011584) TBX1 (ENSPPYG00000011585) ENSPPYG00000033606 ##22 RTL10 (ENSPPYG00000032970) GNB1L (ENSPPYG00000011586) TXNRD2 (ENSPPYG00000011587) ENSPPYG00000011588 ARVCF (ENSPPYG00000011589) TANGO2 (ENSPPYG00000011590) DGCR8 (ENSPPYG00000011591) TRMT2A (ENSPPYG00000011592) RANBP1 (ENSPPYG00000011593) ZDHHC8 (ENSPPYG00000011594) ENSPPYG00000040850 ENSPPYG00000011596 RTN4R (ENSPPYG00000011597) ENSPPYG00000025952 ZNF74 (ENSPPYG00000011598) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000009387 ENSGT00940000162536 ENSGT00910000147541 ENSGT00550000074856 ENSGT00950000183166.a.b ENSGT00550000074919 ENSGT00390000010239 ENSGT00390000002511 ENSGT00390000002408.c.a.a ENSGT00390000009662 ENSGT00940000161769 ENSGT00940000159913 ENSGT00530000064244.b ENSGT00940000154816.a.b ENSGT00390000018606 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00940000158832 ENSGT00940000155317.b ENSGT00940000157027 ENSGT00390000012733 ENSGT00390000015977 ENSGT00530000063723.a ENSGT00900000141073.r.a ENSGT00940000158044.a ENSGT00940000153380.D.b ENSGT00550000076205 ENSGT00940000160711 ENSGT00390000017663.x.b.b ENSGT00940000162000.d ENSGT00950000183101.b ENSGT00940000159598 Bonobo MODERN SPECIES 13 TSSK2 (ENSPPAG00000015347) ESS2 (ENSPPAG00000034139) ENSPPAG00000035340 ENSPPAG00000032546 SLC25A1 (ENSPPAG00000003691) CLTCL1 (ENSPPAG00000030517) HIRA (ENSPPAG00000037592) MRPL40 (ENSPPAG00000030349) ENSPPAG00000031774 UFD1 (ENSPPAG00000035639) CDC45 (ENSPPAG00000028685) ENSPPAG00000040414 SEPTIN5 (ENSPPAG00000042516) ENSPPAG00000032550 GNB1L (ENSPPAG00000041675) ENSPPAG00000035063 ##22 TXNRD2 (ENSPPAG00000042002) COMT (ENSPPAG00000027543) ARVCF (ENSPPAG00000027324) TANGO2 (ENSPPAG00000042205) DGCR8 (ENSPPAG00000039507) TRMT2A (ENSPPAG00000043781) RANBP1 (ENSPPAG00000042966) ZDHHC8 (ENSPPAG00000016192) CCDC188 (ENSPPAG00000036009) ENSPPAG00000006622 RTN4R (ENSPPAG00000005770) ZNF74 (ENSPPAG00000035031) ENSPPAG00000037889 KLHL22 (ENSPPAG00000029088) ENSPPAG00000027009 Chimpanzee MODERN SPECIES 13 ENSPTRG00000045972 ESS2 (ENSPTRG00000014055) GSC2 (ENSPTRG00000050838) ENSPTRG00000045428 SLC25A1 (ENSPTRG00000014057) CLTCL1 (ENSPTRG00000014058) HIRA (ENSPTRG00000014060) MRPL40 (ENSPTRG00000014061) C22H22orf39 (ENSPTRG00000051117) UFD1 (ENSPTRG00000043162) CDC45 (ENSPTRG00000014064) SEPTIN5 (ENSPTRG00000014066) GP1BB (ENSPTRG00000033843) TBX1 (ENSPTRG00000014067) GNB1L (ENSPTRG00000044843) ENSPTRG00000049410 ##22 TXNRD2 (ENSPTRG00000014069) COMT (ENSPTRG00000014070) ARVCF (ENSPTRG00000014071) TANGO2 (ENSPTRG00000014072) DGCR8 (ENSPTRG00000014073) TRMT2A (ENSPTRG00000014074) RANBP1 (ENSPTRG00000043450) ZDHHC8 (ENSPTRG00000014077) CCDC188 (ENSPTRG00000042466) ENSPTRG00000038652 RTN4R (ENSPTRG00000014079) DGCR6L (ENSPTRG00000014080) ENSPTRG00000046891 ZNF74 (ENSPTRG00000014083) SCARF2 (ENSPTRG00000014084) Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 1 ENSGGOG00000010645 RUFY2 (ENSGGOG00000000118) HNRNPH3 (ENSGGOG00000025378) PBLD (ENSGGOG00000009363) ATOH7 (ENSGGOG00000016464) MYPN (ENSGGOG00000005699) HERC4 (ENSGGOG00000008249) SIRT1 (ENSGGOG00000010187) DNAJC12 (ENSGGOG00000015053) ENSGGOG00000025461 CTNNA3 (ENSGGOG00000039427) LRRTM3 (ENSGGOG00000026152) ENSGGOG00000042340 ENSGGOG00000006481 ENSGGOG00000022173 ENSGGOG00000025516 ##22 REEP3 (ENSGGOG00000008217) ENSGGOG00000025033 JMJD1C (ENSGGOG00000015694) ENSGGOG00000040996 ENSGGOG00000013016 EGR2 (ENSGGOG00000005292) ADO (ENSGGOG00000005286) ENSGGOG00000041727 ZNF365 (ENSGGOG00000013216) RTKN2 (ENSGGOG00000016938) ARID5B (ENSGGOG00000004127) ENSGGOG00000011328 TMEM26 (ENSGGOG00000003595) CDK1 (ENSGGOG00000013311) ENSGGOG00000006954 Gorilla MODERN SPECIES 6 FGF7 (ENSGGOG00000005378) ENSGGOG00000022889 FAM227B (ENSGGOG00000042553) GALK2 (ENSGGOG00000002838) COPS2 (ENSGGOG00000002827) SECISBP2L (ENSGGOG00000007289) SHC4 (ENSGGOG00000010408) CEP152 (ENSGGOG00000000404) ENSGGOG00000037122 FBN1 (ENSGGOG00000003292) ENSGGOG00000005658 SLC12A1 (ENSGGOG00000000757) CTXN2 (ENSGGOG00000024403) MYEF2 (ENSGGOG00000014968) SLC24A5 (ENSGGOG00000015163) ENSGGOG00000023680 ##22 SEMA6D (ENSGGOG00000016555) SQOR (ENSGGOG00000006235) BLOC1S6 (ENSGGOG00000013892) SLC30A4 (ENSGGOG00000015394) ENSGGOG00000026815 SPATA5L1 (ENSGGOG00000028274) GATM (ENSGGOG00000010939) SLC28A2 (ENSGGOG00000001151) ENSGGOG00000012356 DUOX1 (ENSGGOG00000012320) ENSGGOG00000011725 DUOXA2 (ENSGGOG00000011720) DUOX2 (ENSGGOG00000011693) ENSGGOG00000026415 TERB2 (ENSGGOG00000024649) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 28 FBXO5 (ENSMICG00000003809) ENSMICG00000032018 VIP (ENSMICG00000035122) MYCT1 (ENSMICG00000036362) ENSMICG00000042037 SYNE1 (ENSMICG00000007620) ESR1 (ENSMICG00000007592) CCDC170 (ENSMICG00000029885) ARMT1 (ENSMICG00000047928) RMND1 (ENSMICG00000010583) ZBTB2 (ENSMICG00000027366) AKAP12 (ENSMICG00000034625) MTHFD1L (ENSMICG00000004610) PLEKHG1 (ENSMICG00000004593) IYD (ENSMICG00000004582) ENSMICG00000026491 ##22 ENSMICG00000045223 PPP1R14C (ENSMICG00000038749) ENSMICG00000042667 LRP11 (ENSMICG00000006322) PCMT1 (ENSMICG00000006318) NUP43 (ENSMICG00000006312) LATS1 (ENSMICG00000006305) KATNA1 (ENSMICG00000006299) GINM1 (ENSMICG00000006295) PPIL4 (ENSMICG00000006287) ZC3H12D (ENSMICG00000044838) TAB2 (ENSMICG00000027001) UST (ENSMICG00000014507) SASH1 (ENSMICG00000014483) SAMD5 (ENSMICG00000038329) Bushbaby MODERN SPECIES 117 PKIB (ENSOGAG00000015729) FABP7 (ENSOGAG00000031110) SMPDL3A (ENSOGAG00000014474) CLVS2 (ENSOGAG00000014477) ENSOGAG00000026714 ENSOGAG00000001252 RNF217 (ENSOGAG00000015414) TPD52L1 (ENSOGAG00000015418) HDDC2 (ENSOGAG00000015421) ENSOGAG00000029689 HEY2 (ENSOGAG00000027812) NCOA7 (ENSOGAG00000008760) HINT3 (ENSOGAG00000033384) TRMT11 (ENSOGAG00000008764) CENPW (ENSOGAG00000031133) ENSOGAG00000029360 ##22 RSPO3 (ENSOGAG00000014550) ENSOGAG00000002224 ECHDC1 (ENSOGAG00000002226) KIAA0408 (ENSOGAG00000034906) SOGA3 (ENSOGAG00000027735) C6orf58 (ENSOGAG00000002231) THEMIS (ENSOGAG00000033785) PTPRK (ENSOGAG00000012585) LAMA2 (ENSOGAG00000000484) ARHGAP18 (ENSOGAG00000000489) L3MBTL3 (ENSOGAG00000001632) SAMD3 (ENSOGAG00000001635) TMEM200A (ENSOGAG00000001637) EPB41L2 (ENSOGAG00000010709) AKAP7 (ENSOGAG00000010862) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 FBXO11 (ENSOARG00020004568) ENSOARG00020004545 ENSOARG00020004540 FOXN2 (ENSOARG00020004450) ENSOARG00020004435 PPP1R21 (ENSOARG00020003660) STON1 (ENSOARG00020003561) GTF2A1L (ENSOARG00020003448) LHCGR (ENSOARG00020003269) ENSOARG00020003239 FSHR (ENSOARG00020003107) ENSOARG00020003060 ENSOARG00020003042 ENSOARG00020003028 NRXN1 (ENSOARG00020001627) ENSOARG00020001440 ##22 CHAC2 (ENSOARG00020001428) ERLEC1 (ENSOARG00020001369) ASB3 (ENSOARG00020001287) PSME4 (ENSOARG00020001134) ENSOARG00020001110 ENSOARG00020001082 C2orf73 (ENSOARG00020001065) SPTBN1 (ENSOARG00020000992) EML6 (ENSOARG00020000918) RTN4 (ENSOARG00020000804) RPS27A (ENSOARG00020000741) MTIF2 (ENSOARG00020000721) ENSOARG00020000668 CCDC88A (ENSOARG00020000430) CFAP36 (ENSOARG00020000353) Yarkand deer MODERN SPECIES 11 FAM89B (ENSCHYG00000004077) ZNRD2 (ENSCHYG00000004064) LTBP3 (ENSCHYG00000003945) SCYL1 (ENSCHYG00000003862) ENSCHYG00000003838 FRMD8 (ENSCHYG00000003743) SLC25A45 (ENSCHYG00000003656) TIGD3 (ENSCHYG00000003639) DPF2 (ENSCHYG00000003588) CDC42EP2 (ENSCHYG00000003563) POLA2 (ENSCHYG00000003526) ENSCHYG00000003507 ENSCHYG00000003498 CAPN1 (ENSCHYG00000003439) ENSCHYG00000003409 ENSCHYG00000003397 ##22 SYVN1 (ENSCHYG00000003375) MRPL49 (ENSCHYG00000003355) ENSCHYG00000003316 ZNHIT2 (ENSCHYG00000003301) TM7SF2 (ENSCHYG00000003242) VPS51 (ENSCHYG00000003179) TMEM262 (ENSCHYG00000003156) ZFPL1 (ENSCHYG00000003140) CDCA5 (ENSCHYG00000003127) NAALADL1 (ENSCHYG00000003035) SAC3D1 (ENSCHYG00000002999) SNX15 (ENSCHYG00000002906) BATF2 (ENSCHYG00000002852) ENSCHYG00000002841 GPHA2 (ENSCHYG00000002826) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 leopard MODERN SPECIES 2 IGFBP7 (ENSPPRG00000002033) POLR2B (ENSPPRG00000001235) NOA1 (ENSPPRG00000023695) ENSPPRG00000023965 ENSPPRG00000024410 HOPX (ENSPPRG00000024713) THEGL (ENSPPRG00000018282) ENSPPRG00000017715 SRP72 (ENSPPRG00000015991) PAICS (ENSPPRG00000014288) PPAT (ENSPPRG00000013619) AASDH (ENSPPRG00000013116) CRACD (ENSPPRG00000010895) CEP135 (ENSPPRG00000009012) EXOC1 (ENSPPRG00000008449) ENSPPRG00000008233 ##22 EXOC1L (ENSPPRG00000007673) NMU (ENSPPRG00000007536) PDCL2 (ENSPPRG00000006963) CLOCK (ENSPPRG00000006916) TMEM165 (ENSPPRG00000005927) SRD5A3 (ENSPPRG00000005520) KDR (ENSPPRG00000005424) KIT (ENSPPRG00000004930) PDGFRA (ENSPPRG00000004078) ENSPPRG00000003939 GSX2 (ENSPPRG00000003871) CHIC2 (ENSPPRG00000003452) LNX1 (ENSPPRG00000003037) FIP1L1 (ENSPPRG00000002221) SCFD2 (ENSPPRG00000000228) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Dog MODERN SPECIES 32 FBXO4 (ENSCAFG00845002116) RIMOC1 (ENSCAFG00845002073) GHR (ENSCAFG00845001941) CCDC152 (ENSCAFG00845001839) SELENOP (ENSCAFG00845001737) ZNF131 (ENSCAFG00845001696) NIM1K (ENSCAFG00845001649) HMGCS1 (ENSCAFG00845001633) CCL28 (ENSCAFG00845001613) TMEM267 (ENSCAFG00845001595) ENSCAFG00845001580 C5orf34 (ENSCAFG00845001554) PAIP1 (ENSCAFG00845001471) NNT (ENSCAFG00845001372) ENSCAFG00845001341 ENSCAFG00845001327 ##22 FGF10 (ENSCAFG00845001301) MRPS30 (ENSCAFG00845001286) HCN1 (ENSCAFG00845001252) EMB (ENSCAFG00845001102) ENSCAFG00845001054 PARP8 (ENSCAFG00845000833) ENSCAFG00845000667 ISL1 (ENSCAFG00845000645) ENSCAFG00845000617 ITGA1 (ENSCAFG00845000521) ENSCAFG00845000486 ITGA2 (ENSCAFG00845000432) ENSCAFG00845000390 ENSCAFG00845000374 FST (ENSCAFG00845000357) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160428 #10 ENSGT00550000075041 #11 ENSGT00390000011873 #12 ENSGT00940000161613 ENSGT00390000007746 #15 ENSGT00390000014148 #14 ENSGT00940000160010 #16 ENSGT00390000004458 #18 ENSGT00940000156231 #17 ENSGT00940000153181.z.b #19 ENSGT00950000182858.A.b.b #20 ENSGT00950000182858.A.a.a.n ##20 ENSGT00390000006980 #21 ENSGT00390000004339 ENSGT00940000155193.a.a ##22 ENSGT00940000155193.a.b ##22 ENSGT00530000064194 #24 ENSGT00390000016800 #25 ENSGT00530000064123 #26 ENSGT00390000018038 #27 ENSGT00940000159607.h #28 ENSGT00940000158379 #29 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #30 ENSGT00940000159976 #31 ENSGT00940000160710 #32 ENSGT00940000159447 #34 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #35 ENSGT00940000157589 #36 ENSGT00940000159718 #37 American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 395 SURF6 (ENSNVIG00000021098) #21 MED22 (ENSNVIG00000021066) ENSNVIG00000021013 ##22 SURF1 (ENSNVIG00000020973) #24 ENSNVIG00000020948 SURF2 (ENSNVIG00000020928) #25 SURF4 (ENSNVIG00000020901) #26 ENSNVIG00000020859 ENSNVIG00000020830 #28 ENSNVIG00000020813 #28 ADAMTS13 (ENSNVIG00000020474) #29 ENSNVIG00000020308 CACFD1 (ENSNVIG00000020227) #30 SLC2A6 (ENSNVIG00000020135) #31 MYMK (ENSNVIG00000020079) #32 ADAMTSL2 (ENSNVIG00000019920) #34 FAM163B (ENSNVIG00000019879) #33 DBH (ENSNVIG00000019787) #35 American mink MODERN SPECIES 21 ENSNVIG00000012952 ZMAT2 (ENSNVIG00000012962) HARS2 (ENSNVIG00000012976) ENSNVIG00000013180 DND1 (ENSNVIG00000013444) WDR55 (ENSNVIG00000013456) IK (ENSNVIG00000013473) NDUFA2 (ENSNVIG00000013487) TMCO6 (ENSNVIG00000013502) CD14 (ENSNVIG00000013525) SLC35A4 (ENSNVIG00000013539) ENSNVIG00000013548 APBB3 (ENSNVIG00000013558) EIF4EBP3 (ENSNVIG00000013703) ANKHD1 (ENSNVIG00000013724) ENSNVIG00000013878 ##22 SLC4A9 (ENSNVIG00000013887) HBEGF (ENSNVIG00000014005) PFDN1 (ENSNVIG00000014058) CYSTM1 (ENSNVIG00000014072) IGIP (ENSNVIG00000014092) NRG2 (ENSNVIG00000014099) PSD2 (ENSNVIG00000014125) CXXC5 (ENSNVIG00000014156) UBE2D2 (ENSNVIG00000014164) STING1 (ENSNVIG00000014206) SMIM33 (ENSNVIG00000014229) ECSCR (ENSNVIG00000014231) DJC18 (ENSNVIG00000014272) SPATA24 (ENSNVIG00000014301) PROB1 (ENSNVIG00000014327) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155193.a.b ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1043 SLC29A4 (ENSVURG00010018431) WIPI2 (ENSVURG00010018474) MMD2 (ENSVURG00010018492) RADIL (ENSVURG00010018523) AP5Z1 (ENSVURG00010018537) FOXK1 (ENSVURG00010018549) ENSVURG00010018557 ENSVURG00010018562 ENSVURG00010018565 ENSVURG00010018571 ENSVURG00010018585 ENSVURG00010018591 ENSVURG00010018605 SDK1 (ENSVURG00010018689) CARD11 (ENSVURG00010019095) ENSVURG00010019108 ##22 GNA12 (ENSVURG00010019115) AMZ1 (ENSVURG00010019119) BRAT1 (ENSVURG00010019131) ENSVURG00010019142 TTYH3 (ENSVURG00010019152) LFNG (ENSVURG00010019169) GRIFIN (ENSVURG00010019182) CHST12 (ENSVURG00010019189) ENSVURG00010019195 EIF3B (ENSVURG00010019207) SNX8 (ENSVURG00010019221) NUDT1 (ENSVURG00010019228) MAD1L1 (ENSVURG00010019250) ELFN1 (ENSVURG00010019279) PSMG3 (ENSVURG00010019283) Coelacanth MODERN SPECIES 234 TMEM250 (ENSLACG00000016820) LHX3 (ENSLACG00000016988) ENSLACG00000017037 QSOX2 (ENSLACG00000017053) GPSM1 (ENSLACG00000017491) ENSLACG00000017649 DNLZ (ENSLACG00000017683) CARD9 (ENSLACG00000017705) SNAPC4 (ENSLACG00000017756) entr1 (ENSLACG00000017826) PMPCA (ENSLACG00000017844) INPP5E (ENSLACG00000017879) SEC16A (ENSLACG00000017905) ENSLACG00000017968 NOTCH1 (ENSLACG00000017995) rpl7a (ENSLACG00000018224) #22 SURF1 (ENSLACG00000018227) #24 ENSLACG00000018249 ENSLACG00000018293 PIERCE1 (ENSLACG00000022112) ENSLACG00000018406 OLFM1 (ENSLACG00000018549) COL5A1 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