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Zebra finch	MODERN SPECIES	29	SLC23A3 (ENSTGUG00000005708)	NHEJ1 (ENSTGUG00000005688)	IHH (ENSTGUG00000027388) #7	ENSTGUG00000005702 #8	CFAP65 (ENSTGUG00000005692) #9	CRYBA2 (ENSTGUG00000005681) #10	FEV (ENSTGUG00000027918) #11	WNT10A (ENSTGUG00000019647) #13	WNT6 (ENSTGUG00000005662) #14	PRKAG3 (ENSTGUG00000005596) #16	TTLL4 (ENSTGUG00000005577) #17	CYP27A1 (ENSTGUG00000005641) #15	STK36 (ENSTGUG00000020080) #19	RNF25 (ENSTGUG00000005569) #20	BCS1L (ENSTGUG00000005562) #21	ZNF142 (ENSTGUG00000005552) #22	PLCD4 (ENSTGUG00000005509) #23	CNOT9 (ENSTGUG00000005493) #24	USP37 (ENSTGUG00000005444) #25	VIL1 (ENSTGUG00000005367) #26	CTDSP1 (ENSTGUG00000021628) #27	SLC11A1 (ENSTGUG00000005297) #28	PNKD (ENSTGUG00000005290) #30	TMBIM1 (ENSTGUG00000005261) #31	ENSTGUG00000005122 #32	AAMP (ENSTGUG00000005212)	ARPC2 (ENSTGUG00000005170) #34	ENSTGUG00000023091 #33	RUFY4 (ENSTGUG00000005168) #35	TNS1 (ENSTGUG00000005126) #36	IGFBP5 (ENSTGUG00000025564)
Common canary	MODERN SPECIES	8	NHEJ1 (ENSSCAG00000013292)	IHH (ENSSCAG00000013282) #7	ENSSCAG00000013275 #8	CFAP65 (ENSSCAG00000013251) #9	CRYBA2 (ENSSCAG00000013238) #10	ENSSCAG00000013230	ENSSCAG00000013228 #12	WNT10A (ENSSCAG00000013224) #13	WNT6 (ENSSCAG00000013214) #14	CYP27A1 (ENSSCAG00000013191) #15	PRKAG3 (ENSSCAG00000013178) #16	TTLL4 (ENSSCAG00000013100) #17	STK36 (ENSSCAG00000013070) #19	RNF25 (ENSSCAG00000013063) #20	BCS1L (ENSSCAG00000013059) #21	ZNF142 (ENSSCAG00000013052) #22	PLCD4 (ENSSCAG00000013045) #23	CNOT9 (ENSSCAG00000013041) #24	USP37 (ENSSCAG00000013031) #25	VIL1 (ENSSCAG00000013018) #26	CTDSP1 (ENSSCAG00000012952) #27	SLC11A1 (ENSSCAG00000012937) #28	CATIP (ENSSCAG00000012930) #29	PNKD (ENSSCAG00000012879) #30	TMBIM1 (ENSSCAG00000012874) #31	ENSSCAG00000012871 #32	AAMP (ENSSCAG00000012865)	ARPC2 (ENSSCAG00000012860) #34	ENSSCAG00000012859 #33	RUFY4 (ENSSCAG00000012856) #35	ENSSCAG00000012691 #36
Medium ground finch	MODERN SPECIES	1	NHEJ1 (ENSGFOG00000004070)	IHH (ENSGFOG00000004061) #7	ENSGFOG00000004052	CFAP65 (ENSGFOG00000004022) #9	CRYBA2 (ENSGFOG00000004005) #10	FEV (ENSGFOG00000004000) #11	ENSGFOG00000003993 #12	WNT10A (ENSGFOG00000003984) #13	WNT6 (ENSGFOG00000003972) #14	CYP27A1 (ENSGFOG00000002744) #15	PRKAG3 (ENSGFOG00000002635) #16	TTLL4 (ENSGFOG00000002599) #17	ENSGFOG00000002578 #19	RNF25 (ENSGFOG00000002561) #20	BCS1L (ENSGFOG00000002536) #21	ZNF142 (ENSGFOG00000002473) #22	PLCD4 (ENSGFOG00000002408) #23	CNOT9 (ENSGFOG00000002368) #24	USP37 (ENSGFOG00000002319) #25	VIL1 (ENSGFOG00000000774) #26	CTDSP1 (ENSGFOG00000000644) #27	SLC11A1 (ENSGFOG00000000632) #28	CATIP (ENSGFOG00000000620) #29	PNKD (ENSGFOG00000000614) #30	TMBIM1 (ENSGFOG00000000605) #31	ENSGFOG00000000596	AAMP (ENSGFOG00000000584)	ARPC2 (ENSGFOG00000000561) #34	ENSGFOG00000000549 #33	ENSGFOG00000000542 #35	TNS1 (ENSGFOG00000000444) #36
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000009940	ENSGT00940000159207 #7	ENSGT00940000160059.a.b #8	ENSGT00430000031142 #9	ENSGT00940000160306 #10	ENSGT00940000161562 #11	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #13	ENSGT00940000159281 #14	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #15	ENSGT00950000183019.f.b.b #16	ENSGT00940000157916 #17	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #28	ENSGT00940000154101.a #29	ENSGT00940000158887 #30	ENSGT01050000244890.a.b.a #31	ENSGT00530000065055 #32	ENSGT00940000153648.a	ENSGT00390000016794.b #34	ENSGT01050000244848.A.a #33	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000154044.a.b #35
Golden eagle	MODERN SPECIES	22	ENSACCG00020000407 #8	CFAP65 (ENSACCG00020000455) #9	ENSACCG00020000487	CRYBA2 (ENSACCG00020000511) #10	ENSACCG00020000542	CDK5R2 (ENSACCG00020000556) #12	WNT10A (ENSACCG00020000606) #13	WNT6 (ENSACCG00020000635) #14	CYP27A1 (ENSACCG00020000675) #15	PRKAG3 (ENSACCG00020000717) #16	TTLL4 (ENSACCG00020000754) #17	ENSACCG00020000793 #19	ENSACCG00020000814 #19	RNF25 (ENSACCG00020000835) #20	BCS1L (ENSACCG00020000859) #21	ZNF142 (ENSACCG00020000894) #22	PLCD4 (ENSACCG00020000937) #23	CNOT9 (ENSACCG00020000973) #24	USP37 (ENSACCG00020001017) #25	VIL1 (ENSACCG00020001336) #26	CTDSP1 (ENSACCG00020001726) #27	SLC11A1 (ENSACCG00020001785) #28	CATIP (ENSACCG00020001823) #29	PNKD (ENSACCG00020001881) #30	TMBIM1 (ENSACCG00020001923) #31	ENSACCG00020001941 #32	AAMP (ENSACCG00020001953)	ARPC2 (ENSACCG00020001977) #34	ENSACCG00020001994 #33	ENSACCG00020002007 #35	TNS1 (ENSACCG00020002099) #36
Kakapo	MODERN SPECIES	22	IHH (ENSSHBG00005012576) #7	ENSSHBG00005012563 #8	CFAP65 (ENSSHBG00005012510) #9	CRYBA2 (ENSSHBG00005012469) #10	FEV (ENSSHBG00005012458) #11	CDK5R2 (ENSSHBG00005012446) #12	WNT10A (ENSSHBG00005012434) #13	WNT6 (ENSSHBG00005012420) #14	CYP27A1 (ENSSHBG00005012405) #15	PRKAG3 (ENSSHBG00005012380) #16	TTLL4 (ENSSHBG00005012360) #17	ENSSHBG00005012338 #19	ENSSHBG00005012316 #19	RNF25 (ENSSHBG00005012291) #20	BCS1L (ENSSHBG00005012242) #21	ZNF142 (ENSSHBG00005012200) #22	ENSSHBG00005012179	PLCD4 (ENSSHBG00005012127) #23	CNOT9 (ENSSHBG00005012091) #24	USP37 (ENSSHBG00005012063) #25	VIL1 (ENSSHBG00005012034) #26	CTDSP1 (ENSSHBG00005012010) #27	SLC11A1 (ENSSHBG00005011978) #28	ENSSHBG00005011938 #29	PNKD (ENSSHBG00005011916) #30	TMBIM1 (ENSSHBG00005011879) #31	ENSSHBG00005011860 #32	AAMP (ENSSHBG00005011826)	ARPC2 (ENSSHBG00005000585) #34	ENSSHBG00005000584 #33	ENSSHBG00005000582
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159207 #7	ENSGT00940000160059.a.b #8	ENSGT00430000031142 #9	ENSGT00940000160306 #10	ENSGT00940000161562 #11	ENSGT00940000165272.a	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #13	ENSGT00940000159281 #14	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #15	ENSGT00950000183019.f.b.b #16	ENSGT00940000157916 #17	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #28	ENSGT00940000154101.a #29	ENSGT00940000158887 #30	ENSGT01050000244890.a.b.a #31	ENSGT00530000065055 #32	ENSGT00940000153648.a	ENSGT00390000016794.b #34	ENSGT01050000244848.A.a #33	ENSGT00940000154044.a.b #35	ENSGT00940000155400.B #36
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00950000182953.A	ENSGT00390000009940	ENSGT00940000159207 #7	ENSGT00940000160059.a.b #8	ENSGT00430000031142 #9	ENSGT00940000160306.c #10	ENSGT00940000161562 #11	ENSGT00940000160299 #13	ENSGT00940000159281 #14	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #15	ENSGT00950000183019.f.b.b #16	ENSGT00940000157916 #17	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	25	SLC23A3 (ENSABRG00000022316)	NHEJ1 (ENSABRG00000022315)	IHH (ENSABRG00000022314) #7	ENSABRG00000022313 #8	CFAP65 (ENSABRG00000022312) #9	CRYBA2 (ENSABRG00000022308) #10	FEV (ENSABRG00000022306) #11	WNT10A (ENSABRG00000022303) #13	WNT6 (ENSABRG00000022302) #14	CYP27A1 (ENSABRG00000022301) #15	PRKAG3 (ENSABRG00000022188) #16	TTLL4 (ENSABRG00000022158) #17	STK36 (ENSABRG00000022150) #19	RNF25 (ENSABRG00000022147) #20	BCS1L (ENSABRG00000022145) #21	ZNF142 (ENSABRG00000022143) #22	PLCD4 (ENSABRG00000022142) #23	CNOT9 (ENSABRG00000022140) #24	USP37 (ENSABRG00000022136) #25	VIL1 (ENSABRG00000022126) #26
Duck	MODERN SPECIES	25	ENSAPLG00000022307	ENSAPLG00000026806	ENSAPLG00000026953	ENSAPLG00000022613	ENSAPLG00000017682	ENSAPLG00000022774	ENSAPLG00000017075	SESTD1 (ENSAPLG00000002954)	ZNF385B (ENSAPLG00000003705)	WNT10A (ENSAPLG00000016706) #13	CYP27A1 (ENSAPLG00000004381) #15	PRKAG3 (ENSAPLG00000025550) #16	ENSAPLG00000020988 #19	RNF25 (ENSAPLG00000005028) #20	BCS1L (ENSAPLG00000005237) #21	ZNF142 (ENSAPLG00000026417) #22	PLCD4 (ENSAPLG00000025810) #23	CNOT9 (ENSAPLG00000005817) #24	ARPC2 (ENSAPLG00000004251) #34	TNS1 (ENSAPLG00000025012) #36	ENSAPLG00000009817	ENSAPLG00000017994	ENSAPLG00000009836	SMARCAL1 (ENSAPLG00000009864)	MARCHF4 (ENSAPLG00000020548)	XRCC5 (ENSAPLG00000012767)	TMEM169 (ENSAPLG00000012858)	PECR (ENSAPLG00000012862)	MAP3K2 (ENSAPLG00000012930)	HNMT (ENSAPLG00000022720)	SPOPL (ENSAPLG00000008966)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159207 #7	ENSGT00940000160059.a.b #8	ENSGT00430000031142 #9	ENSGT00940000160306 #10	ENSGT00940000165272.a	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000161562 #11	ENSGT00940000160299 #13	ENSGT00940000159281 #14	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #15	ENSGT00950000183019.f.b.b #16	ENSGT00940000157916 #17	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225.o #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #28	ENSGT00940000154101.a #29	ENSGT00940000158887 #30	ENSGT01050000244890.a.b.a #31	ENSGT00530000065055 #32	ENSGT00940000153648.a	ENSGT00390000016794.b #34	ENSGT01050000244848.A.a #33	ENSGT00940000154044.a.b #35	ENSGT00940000155400.B #36
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000009940	ENSGT00940000159207 #7	ENSGT00940000160059.a.b #8	ENSGT00430000031142 #9	ENSGT00940000160306 #10	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000161562 #11	ENSGT00940000160299 #13	ENSGT00940000159281 #14	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #15	ENSGT00950000183019.f.b.b #16	ENSGT00940000157916.a #17	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225.o #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #28	ENSGT00940000154101.a #29	ENSGT00940000158887 #30	ENSGT01050000244890.a.b.a #31	ENSGT00530000065055 #32	ENSGT00940000153648.a	ENSGT00390000016794.b #34	ENSGT01050000244848.A.a #33	ENSGT00940000154044.a.b #35	ENSGT00940000155400.B #36
Turkey	MODERN SPECIES	27	ENSMGAG00000011630	ENSMGAG00000021023	ENSMGAG00000011587 #36	ENSMGAG00000011581 #35	ENSMGAG00000015922 #33	ENSMGAG00000011555	ENSMGAG00000011572 #34	TMBIM1 (ENSMGAG00000011539) #31	PNKD (ENSMGAG00000011524) #30	SLC11A1 (ENSMGAG00000011500) #28	ENSMGAG00000011495 #27	ENSMGAG00000011483 #26	ENSMGAG00000011465 #25	ENSMGAG00000021644 #24	ENSMGAG00000011461 #24	ENSMGAG00000011447 #22	ENSMGAG00000011452 #23	ENSMGAG00000020353	RNF25 (ENSMGAG00000011433) #20	BCS1L (ENSMGAG00000011442) #21	STK36 (ENSMGAG00000011353) #19	ENSMGAG00000011420 #17	ENSMGAG00000011393 #15	ENSMGAG00000011406 #16	ENSMGAG00000021851 #17	ENSMGAG00000011382 #14	ENSMGAG00000011371 #13	ENSMGAG00000022755 #11	ENSMGAG00000003525 #10	ENSMGAG00000022553 #8	ENSMGAG00000008962 #9
Chicken	MODERN SPECIES	36	NHEJ1 (ENSGALG00010022224)	IHH (ENSGALG00010021505) #7	ENSGALG00010018369 #8	CFAP65 (ENSGALG00010018110) #9	CRYBA2 (ENSGALG00010021198) #10	CDK5R2 (ENSGALG00010021205) #12	FEV (ENSGALG00010021226) #11	WNT10A (ENSGALG00010021151) #13	WNT6 (ENSGALG00010021142) #14	CYP27A1 (ENSGALG00010021541) #15	PRKAG3 (ENSGALG00010021564) #16	TTLL4 (ENSGALG00010021574) #17	STK36 (ENSGALG00010021582) #19	RNF25 (ENSGALG00010021588) #20	BCS1L (ENSGALG00010021612) #21	ZNF142 (ENSGALG00010021626) #22	PLCD4 (ENSGALG00010021634) #23	CNOT9 (ENSGALG00010021663) #24	USP37 (ENSGALG00010021193) #25	VIL1 (ENSGALG00010019011) #26	CTDSP1 (ENSGALG00010018986) #27	TMBIM1 (ENSGALG00010019127) #31	ENSGALG00010022204 #28	SLC11A1 (ENSGALG00010021140) #28	CATIP (ENSGALG00010019164) #29	PNKD (ENSGALG00010019184) #30	ENSGALG00010019194 #32	AAMP (ENSGALG00010019223)	ARPC2 (ENSGALG00010019233) #34	CXCR1 (ENSGALG00010019250) #33	ENSGALG00010019254
Japanese quail	MODERN SPECIES	25	IHH (ENSCJPG00005013116) #7	ENSCJPG00005013115 #8	CFAP65 (ENSCJPG00005013114) #9	CRYBA2 (ENSCJPG00005013112) #10	ENSCJPG00005013111	CDK5R2 (ENSCJPG00005013110) #12	WNT10A (ENSCJPG00005013109) #13	WNT6 (ENSCJPG00005013108) #14	CYP27A1 (ENSCJPG00005013107) #15	PRKAG3 (ENSCJPG00005013106) #16	TTLL4 (ENSCJPG00005013105) #17	STK36 (ENSCJPG00005013104) #19	RNF25 (ENSCJPG00005013103) #20	BCS1L (ENSCJPG00005013102) #21	ENSCJPG00005013101	ZNF142 (ENSCJPG00005013100) #22	PLCD4 (ENSCJPG00005013099) #23	CNOT9 (ENSCJPG00005013098) #24	USP37 (ENSCJPG00005013097) #25	VIL1 (ENSCJPG00005013096) #26	CTDSP1 (ENSCJPG00005013092) #27	SLC11A1 (ENSCJPG00005013091) #28	CATIP (ENSCJPG00005013090) #29	PNKD (ENSCJPG00005013089) #30	TMBIM1 (ENSCJPG00005013088) #31	AAMP (ENSCJPG00005013087)	ARPC2 (ENSCJPG00005013086) #34	ENSCJPG00005013085 #33	ENSCJPG00005013084	RUFY4 (ENSCJPG00005013083) #35	TNS1 (ENSCJPG00005013082) #36
African ostrich	MODERN SPECIES	240								WNT10A (ENSSCUG00000005087) #13	ENSSCUG00000005084 #15	ENSSCUG00000005083 #16	ENSSCUG00000005082	TTLL4 (ENSSCUG00000005080) #17	STK36 (ENSSCUG00000005078) #19	RNF25 (ENSSCUG00000005075) #20	BCS1L (ENSSCUG00000005074) #21	ZNF142 (ENSSCUG00000005073) #22	ENSSCUG00000005071	PLCD4 (ENSSCUG00000005021) #23	CNOT9 (ENSSCUG00000005010) #24	USP37 (ENSSCUG00000005006) #25	VIL1 (ENSSCUG00000004999) #26	CTDSP1 (ENSSCUG00000004996) #27	SLC11A1 (ENSSCUG00000004994) #28	TMBIM1 (ENSSCUG00000004993) #31	AAMP (ENSSCUG00000004992)	ARPC2 (ENSSCUG00000004990) #34	ENSSCUG00000004988 #33	ENSSCUG00000004986 #35	TNS1 (ENSSCUG00000004958) #36	IGFBP5 (ENSSCUG00000004941)	IGFBP2 (ENSSCUG00000004940)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	66	CD302 (ENSCPRG00005018836)	ENSCPRG00005018881	SLC4A3 (ENSCPRG00005018888)	STK11IP (ENSCPRG00005018889)	ENSCPRG00005018890	INHA (ENSCPRG00005018891)	OBSL1 (ENSCPRG00005018892)	TMEM198 (ENSCPRG00005018893)	ENSCPRG00005018894 #9	NHEJ1 (ENSCPRG00005018895)	TTLL4 (ENSCPRG00005018896) #17	STK36 (ENSCPRG00005018897) #19	RNF25 (ENSCPRG00005018898) #20	CYP27A1 (ENSCPRG00005018899) #15	BCS1L (ENSCPRG00005018900) #21	ZNF142 (ENSCPRG00005018905) #22	CNOT9 (ENSCPRG00005018911) #24	USP37 (ENSCPRG00005018913) #25	VIL1 (ENSCPRG00005018914) #26	SLC11A1 (ENSCPRG00005018916) #28	PNKD (ENSCPRG00005018918) #30	TMBIM1 (ENSCPRG00005018919) #31	ENSCPRG00005018920 #32	AAMP (ENSCPRG00005018921)	ARPC2 (ENSCPRG00005018922) ##34	ENSCPRG00005018924 #33	TNS1 (ENSCPRG00005018944) #36	IGFBP5 (ENSCPRG00005018975)	IGFBP2 (ENSCPRG00005018976)	ENSCPRG00005018977	SMARCAL1 (ENSCPRG00005000158)