Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000154044.a.b
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00940000165272.a	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000165272.a	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225.o #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916.a #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225.o #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B
Chicken	MODERN SPECIES	36	NHEJ1 (ENSGALG00010022224) #7	IHH (ENSGALG00010021505) #8	ENSGALG00010018369 #9	CFAP65 (ENSGALG00010018110) #10	CRYBA2 (ENSGALG00010021198) #11	CDK5R2 (ENSGALG00010021205) #12	FEV (ENSGALG00010021226) #13	WNT10A (ENSGALG00010021151) #14	WNT6 (ENSGALG00010021142) #15	CYP27A1 (ENSGALG00010021541) #16	PRKAG3 (ENSGALG00010021564) #17	TTLL4 (ENSGALG00010021574) #18	STK36 (ENSGALG00010021582) #19	RNF25 (ENSGALG00010021588) #20	BCS1L (ENSGALG00010021612) #21	ZNF142 (ENSGALG00010021626) #22	PLCD4 (ENSGALG00010021634) #23	CNOT9 (ENSGALG00010021663) #24	USP37 (ENSGALG00010021193) #25	VIL1 (ENSGALG00010019011) #26	CTDSP1 (ENSGALG00010018986) #27	TMBIM1 (ENSGALG00010019127) #28	ENSGALG00010022204 #29	SLC11A1 (ENSGALG00010021140) #30	CATIP (ENSGALG00010019164) #31	PNKD (ENSGALG00010019184) #32	ENSGALG00010019194 #33	AAMP (ENSGALG00010019223) #34	ARPC2 (ENSGALG00010019233) #35	CXCR1 (ENSGALG00010019250) #36	ENSGALG00010019254 #37
Turkey	MODERN SPECIES	27	ENSMGAG00000011630	ENSMGAG00000021023	ENSMGAG00000011587	ENSMGAG00000011581	ENSMGAG00000015922 #36	ENSMGAG00000011555 #34	ENSMGAG00000011572 #35	TMBIM1 (ENSMGAG00000011539) #28	PNKD (ENSMGAG00000011524) #32	SLC11A1 (ENSMGAG00000011500) #30	ENSMGAG00000011495 #27	ENSMGAG00000011483 #26	ENSMGAG00000011465 #25	ENSMGAG00000021644 ##24	ENSMGAG00000011461 #24	ENSMGAG00000011447 #22	ENSMGAG00000011452 #23	ENSMGAG00000020353	RNF25 (ENSMGAG00000011433) #20	BCS1L (ENSMGAG00000011442) #21	STK36 (ENSMGAG00000011353) #19	ENSMGAG00000011420 #18	ENSMGAG00000011393 #16	ENSMGAG00000011406 #17	ENSMGAG00000021851 ##18	ENSMGAG00000011382 #15	ENSMGAG00000011371 #14	ENSMGAG00000022755 #13	ENSMGAG00000003525 #11	ENSMGAG00000022553 #9	ENSMGAG00000008962 #10
Japanese quail	MODERN SPECIES	25	IHH (ENSCJPG00005013116) #8	ENSCJPG00005013115 #9	CFAP65 (ENSCJPG00005013114) #10	CRYBA2 (ENSCJPG00005013112) #11	ENSCJPG00005013111	CDK5R2 (ENSCJPG00005013110) #12	WNT10A (ENSCJPG00005013109) #14	WNT6 (ENSCJPG00005013108) #15	CYP27A1 (ENSCJPG00005013107) #16	PRKAG3 (ENSCJPG00005013106) #17	TTLL4 (ENSCJPG00005013105) #18	STK36 (ENSCJPG00005013104) #19	RNF25 (ENSCJPG00005013103) #20	BCS1L (ENSCJPG00005013102) #21	ENSCJPG00005013101	ZNF142 (ENSCJPG00005013100) #22	PLCD4 (ENSCJPG00005013099) #23	CNOT9 (ENSCJPG00005013098) #24	USP37 (ENSCJPG00005013097) #25	VIL1 (ENSCJPG00005013096) #26	CTDSP1 (ENSCJPG00005013092) #27	SLC11A1 (ENSCJPG00005013091) #30	CATIP (ENSCJPG00005013090) #31	PNKD (ENSCJPG00005013089) #32	TMBIM1 (ENSCJPG00005013088) #28	AAMP (ENSCJPG00005013087) #34	ARPC2 (ENSCJPG00005013086) #35	ENSCJPG00005013085 #36	ENSCJPG00005013084 #37	RUFY4 (ENSCJPG00005013083)	TNS1 (ENSCJPG00005013082)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00950000182953.A	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306.c #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	25	SLC23A3 (ENSABRG00000022316)	NHEJ1 (ENSABRG00000022315) #7	IHH (ENSABRG00000022314) #8	ENSABRG00000022313 #9	CFAP65 (ENSABRG00000022312) #10	CRYBA2 (ENSABRG00000022308) #11	FEV (ENSABRG00000022306) #13	WNT10A (ENSABRG00000022303) #14	WNT6 (ENSABRG00000022302) #15	CYP27A1 (ENSABRG00000022301) #16	PRKAG3 (ENSABRG00000022188) #17	TTLL4 (ENSABRG00000022158) #18	STK36 (ENSABRG00000022150) #19	RNF25 (ENSABRG00000022147) #20	BCS1L (ENSABRG00000022145) #21	ZNF142 (ENSABRG00000022143) #22	PLCD4 (ENSABRG00000022142) #23	CNOT9 (ENSABRG00000022140) #24	USP37 (ENSABRG00000022136) #25	VIL1 (ENSABRG00000022126) #26
Duck	MODERN SPECIES	25	ENSAPLG00000022307	ENSAPLG00000026806	ENSAPLG00000026953	ENSAPLG00000022613	ENSAPLG00000017682	ENSAPLG00000022774	ENSAPLG00000017075	SESTD1 (ENSAPLG00000002954)	ZNF385B (ENSAPLG00000003705)	WNT10A (ENSAPLG00000016706) #14	CYP27A1 (ENSAPLG00000004381) #16	PRKAG3 (ENSAPLG00000025550) #17	ENSAPLG00000020988 #19	RNF25 (ENSAPLG00000005028) #20	BCS1L (ENSAPLG00000005237) #21	ZNF142 (ENSAPLG00000026417) #22	PLCD4 (ENSAPLG00000025810) #23	CNOT9 (ENSAPLG00000005817) #24	ARPC2 (ENSAPLG00000004251) #35	TNS1 (ENSAPLG00000025012)	ENSAPLG00000009817	ENSAPLG00000017994	ENSAPLG00000009836	SMARCAL1 (ENSAPLG00000009864)	MARCHF4 (ENSAPLG00000020548)	XRCC5 (ENSAPLG00000012767)	TMEM169 (ENSAPLG00000012858)	PECR (ENSAPLG00000012862)	MAP3K2 (ENSAPLG00000012930)	HNMT (ENSAPLG00000022720)	SPOPL (ENSAPLG00000008966)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000154044.a.b
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B
Great tit	MODERN SPECIES	27	IHH (ENSPMJG00000019724) #8	ENSPMJG00000019725 #9	CFAP65 (ENSPMJG00000019726) #10	CRYBA2 (ENSPMJG00000019728) #11	FEV (ENSPMJG00000019729) #13	CDK5R2 (ENSPMJG00000019730) #12	WNT10A (ENSPMJG00000019731) #14	WNT6 (ENSPMJG00000019732) #15	CYP27A1 (ENSPMJG00000019733) #16	PRKAG3 (ENSPMJG00000019734) #17	TTLL4 (ENSPMJG00000019735) #18	ENSPMJG00000019736 #19	ENSPMJG00000019737 #19	RNF25 (ENSPMJG00000019738) #20	BCS1L (ENSPMJG00000019739) #21	ZNF142 (ENSPMJG00000019740) #22	PLCD4 (ENSPMJG00000019741) #23	CNOT9 (ENSPMJG00000019742) #24	USP37 (ENSPMJG00000019743) #25	VIL1 (ENSPMJG00000019744) #26	CTDSP1 (ENSPMJG00000019745) #27	SLC11A1 (ENSPMJG00000019746) #30	CATIP (ENSPMJG00000019747) #31	PNKD (ENSPMJG00000019749) #32	TMBIM1 (ENSPMJG00000019750) #28	ENSPMJG00000019751 #33	ENSPMJG00000019752 #36	ARPC2 (ENSPMJG00000019753) #35	RUFY4 (ENSPMJG00000019754)	TNS1 (ENSPMJG00000019755)	ENSPMJG00000019756
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B
Flycatcher	MODERN SPECIES	26	NHEJ1 (ENSFALG00000004177) #7	IHH (ENSFALG00000023942) #8	ENSFALG00000004173	CFAP65 (ENSFALG00000004169) #10	CRYBA2 (ENSFALG00000004167) #11	FEV (ENSFALG00000028150) #13	ENSFALG00000028569 #12	WNT10A (ENSFALG00000004164) #14	WNT6 (ENSFALG00000024670) #15	ENSFALG00000004152 #16	ENSFALG00000004143 #17	TTLL4 (ENSFALG00000004135) #18	STK36 (ENSFALG00000004118) #19	RNF25 (ENSFALG00000004112) #20	BCS1L (ENSFALG00000004106) #21	ZNF142 (ENSFALG00000004099) #22	PLCD4 (ENSFALG00000004084) #23	ENSFALG00000004046 #27	CNOT9 (ENSFALG00000024424) #24	USP37 (ENSFALG00000004072) #25	VIL1 (ENSFALG00000004061) #26	SLC11A1 (ENSFALG00000004041) #30	CATIP (ENSFALG00000004038) #31	PNKD (ENSFALG00000004028) #32	TMBIM1 (ENSFALG00000026407) #28	ENSFALG00000026825 #33	AAMP (ENSFALG00000004015) #34	ARPC2 (ENSFALG00000003999) #35	ENSFALG00000028906 #36	ENSFALG00000003992	TNS1 (ENSFALG00000003985)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00940000165272.a	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00940000154044.a.b	ENSGT00940000155400.B
Zebra finch	MODERN SPECIES	29	SLC23A3 (ENSTGUG00000005708)	NHEJ1 (ENSTGUG00000005688) #7	IHH (ENSTGUG00000027388) #8	ENSTGUG00000005702 #9	CFAP65 (ENSTGUG00000005692) #10	CRYBA2 (ENSTGUG00000005681) #11	FEV (ENSTGUG00000027918) #13	WNT10A (ENSTGUG00000019647) #14	WNT6 (ENSTGUG00000005662) #15	PRKAG3 (ENSTGUG00000005596) #17	TTLL4 (ENSTGUG00000005577) #18	CYP27A1 (ENSTGUG00000005641) #16	STK36 (ENSTGUG00000020080) #19	RNF25 (ENSTGUG00000005569) #20	BCS1L (ENSTGUG00000005562) #21	ZNF142 (ENSTGUG00000005552) #22	PLCD4 (ENSTGUG00000005509) #23	CNOT9 (ENSTGUG00000005493) #24	USP37 (ENSTGUG00000005444) #25	VIL1 (ENSTGUG00000005367) #26	CTDSP1 (ENSTGUG00000021628) #27	SLC11A1 (ENSTGUG00000005297) #30	PNKD (ENSTGUG00000005290) #32	TMBIM1 (ENSTGUG00000005261) #28	ENSTGUG00000005122 #33	AAMP (ENSTGUG00000005212) #34	ARPC2 (ENSTGUG00000005170) #35	ENSTGUG00000023091 #36	RUFY4 (ENSTGUG00000005168)	TNS1 (ENSTGUG00000005126)	IGFBP5 (ENSTGUG00000025564)
Common canary	MODERN SPECIES	8	NHEJ1 (ENSSCAG00000013292) #7	IHH (ENSSCAG00000013282) #8	ENSSCAG00000013275 #9	CFAP65 (ENSSCAG00000013251) #10	CRYBA2 (ENSSCAG00000013238) #11	ENSSCAG00000013230	ENSSCAG00000013228 #12	WNT10A (ENSSCAG00000013224) #14	WNT6 (ENSSCAG00000013214) #15	CYP27A1 (ENSSCAG00000013191) #16	PRKAG3 (ENSSCAG00000013178) #17	TTLL4 (ENSSCAG00000013100) #18	STK36 (ENSSCAG00000013070) #19	RNF25 (ENSSCAG00000013063) #20	BCS1L (ENSSCAG00000013059) #21	ZNF142 (ENSSCAG00000013052) #22	PLCD4 (ENSSCAG00000013045) #23	CNOT9 (ENSSCAG00000013041) #24	USP37 (ENSSCAG00000013031) #25	VIL1 (ENSSCAG00000013018) #26	CTDSP1 (ENSSCAG00000012952) #27	SLC11A1 (ENSSCAG00000012937) #30	CATIP (ENSSCAG00000012930) #31	PNKD (ENSSCAG00000012879) #32	TMBIM1 (ENSSCAG00000012874) #28	ENSSCAG00000012871 #33	AAMP (ENSSCAG00000012865) #34	ARPC2 (ENSSCAG00000012860) #35	ENSSCAG00000012859 #36	RUFY4 (ENSSCAG00000012856)	ENSSCAG00000012691
Medium ground finch	MODERN SPECIES	1	NHEJ1 (ENSGFOG00000004070) #7	IHH (ENSGFOG00000004061) #8	ENSGFOG00000004052	CFAP65 (ENSGFOG00000004022) #10	CRYBA2 (ENSGFOG00000004005) #11	FEV (ENSGFOG00000004000) #13	ENSGFOG00000003993 #12	WNT10A (ENSGFOG00000003984) #14	WNT6 (ENSGFOG00000003972) #15	CYP27A1 (ENSGFOG00000002744) #16	PRKAG3 (ENSGFOG00000002635) #17	TTLL4 (ENSGFOG00000002599) #18	ENSGFOG00000002578 #19	RNF25 (ENSGFOG00000002561) #20	BCS1L (ENSGFOG00000002536) #21	ZNF142 (ENSGFOG00000002473) #22	PLCD4 (ENSGFOG00000002408) #23	CNOT9 (ENSGFOG00000002368) #24	USP37 (ENSGFOG00000002319) #25	VIL1 (ENSGFOG00000000774) #26	CTDSP1 (ENSGFOG00000000644) #27	SLC11A1 (ENSGFOG00000000632) #30	CATIP (ENSGFOG00000000620) #31	PNKD (ENSGFOG00000000614) #32	TMBIM1 (ENSGFOG00000000605) #28	ENSGFOG00000000596	AAMP (ENSGFOG00000000584) #34	ARPC2 (ENSGFOG00000000561) #35	ENSGFOG00000000549 #36	ENSGFOG00000000542	TNS1 (ENSGFOG00000000444)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000009940 #7	ENSGT00940000159207 #8	ENSGT00940000160059.a.b #9	ENSGT00430000031142 #10	ENSGT00940000160306 #11	ENSGT00940000161562 #13	ENSGT00390000008812.a #12	ENSGT00940000160299 #14	ENSGT00940000159281 #15	ENSGT00950000182905.a.a.a.a.b #16	ENSGT00950000183019.f.b.b #17	ENSGT00940000157916 #18	ENSGT00940000158375 #19	ENSGT00390000001557 #20	ENSGT00390000005415 #21	ENSGT00940000163074 #22	ENSGT00940000156180 #23	ENSGT00390000001225 #24	ENSGT00940000158091 #25	ENSGT00940000160544 #26	ENSGT01040000240451.a.a #27	ENSGT00940000160799 #30	ENSGT00940000154101.a #31	ENSGT00940000158887 #32	ENSGT01050000244890.a.b.a #28	ENSGT00530000065055 #33	ENSGT00940000153648.a #34	ENSGT00390000016794.b #35	ENSGT01050000244848.A.a #36	ENSGT00950000186252	ENSGT00940000154044.a.b
Golden eagle	MODERN SPECIES	22	ENSACCG00020000407 #9	CFAP65 (ENSACCG00020000455) #10	ENSACCG00020000487	CRYBA2 (ENSACCG00020000511) #11	ENSACCG00020000542	CDK5R2 (ENSACCG00020000556) #12	WNT10A (ENSACCG00020000606) #14	WNT6 (ENSACCG00020000635) #15	CYP27A1 (ENSACCG00020000675) #16	PRKAG3 (ENSACCG00020000717) #17	TTLL4 (ENSACCG00020000754) #18	ENSACCG00020000793 #19	ENSACCG00020000814 #19	RNF25 (ENSACCG00020000835) #20	BCS1L (ENSACCG00020000859) #21	ZNF142 (ENSACCG00020000894) #22	PLCD4 (ENSACCG00020000937) #23	CNOT9 (ENSACCG00020000973) #24	USP37 (ENSACCG00020001017) #25	VIL1 (ENSACCG00020001336) #26	CTDSP1 (ENSACCG00020001726) #27	SLC11A1 (ENSACCG00020001785) #30	CATIP (ENSACCG00020001823) #31	PNKD (ENSACCG00020001881) #32	TMBIM1 (ENSACCG00020001923) #28	ENSACCG00020001941 #33	AAMP (ENSACCG00020001953) #34	ARPC2 (ENSACCG00020001977) #35	ENSACCG00020001994 #36	ENSACCG00020002007	TNS1 (ENSACCG00020002099)
Kakapo	MODERN SPECIES	22	IHH (ENSSHBG00005012576) #8	ENSSHBG00005012563 #9	CFAP65 (ENSSHBG00005012510) #10	CRYBA2 (ENSSHBG00005012469) #11	FEV (ENSSHBG00005012458) #13	CDK5R2 (ENSSHBG00005012446) #12	WNT10A (ENSSHBG00005012434) #14	WNT6 (ENSSHBG00005012420) #15	CYP27A1 (ENSSHBG00005012405) #16	PRKAG3 (ENSSHBG00005012380) #17	TTLL4 (ENSSHBG00005012360) #18	ENSSHBG00005012338 #19	ENSSHBG00005012316 #19	RNF25 (ENSSHBG00005012291) #20	BCS1L (ENSSHBG00005012242) #21	ZNF142 (ENSSHBG00005012200) #22	ENSSHBG00005012179	PLCD4 (ENSSHBG00005012127) #23	CNOT9 (ENSSHBG00005012091) #24	USP37 (ENSSHBG00005012063) #25	VIL1 (ENSSHBG00005012034) #26	CTDSP1 (ENSSHBG00005012010) #27	SLC11A1 (ENSSHBG00005011978) #30	ENSSHBG00005011938 #31	PNKD (ENSSHBG00005011916) #32	TMBIM1 (ENSSHBG00005011879) #28	ENSSHBG00005011860 #33	AAMP (ENSSHBG00005011826) #34	ARPC2 (ENSSHBG00005000585) #35	ENSSHBG00005000584 #36	ENSSHBG00005000582