Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000159791	ENSGT00940000163129 #8	ENSGT00940000156079 #9	ENSGT00940000157280.j #10	ENSGT00940000156658 #11	ENSGT00940000154725 #12	ENSGT00950000182872.f.a.b #13	ENSGT00940000158587 #14	ENSGT00940000159104 #16	ENSGT00940000159300 #15	ENSGT00940000156215.f #17	ENSGT00390000011144 #18	ENSGT00940000158506 #19	ENSGT00940000159760 #20	ENSGT00530000064699 #21	ENSGT00940000159042 #22	ENSGT00390000002143.a #23	ENSGT00940000158742 #24	ENSGT00940000158547 #27	ENSGT00390000015159.b #29	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b #31	ENSGT00940000155285.b.b #32	ENSGT00940000159198 #33	ENSGT00950000182986.a.b.b #34	ENSGT00390000013961 #35	ENSGT00390000011137 #36	ENSGT00390000011759 #37	ENSGT00940000162935	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a	ENSGT00390000005809	ENSGT00940000156272
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159791	ENSGT00940000163129 #8	ENSGT00940000156079 #9	ENSGT00940000157280.j #10	ENSGT00940000156658 #11	ENSGT00940000154725 #12	ENSGT00950000182872.f.a.b #13	ENSGT00940000158587 #14	ENSGT00940000159300 #15	ENSGT00940000159104 #16	ENSGT00940000156215.f #17	ENSGT00390000011144 #18	ENSGT00940000158506 #19	ENSGT00940000159760 #20	ENSGT00530000064699 #21	ENSGT00940000159042 #22	ENSGT00390000002143.a #23	ENSGT00940000158742 #24	ENSGT00940000158547 #27	ENSGT00390000015159.b #29	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b #31	ENSGT00940000155285.b.b #32	ENSGT00940000159198 #33	ENSGT00950000182986.a.b.b #34	ENSGT00390000013961 #35	ENSGT00390000011137 #36	ENSGT00390000011759 #37	ENSGT00940000162935	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a	ENSGT00390000005809	ENSGT00940000156272
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159791	ENSGT00940000163129 #8	ENSGT00940000156079 #9	ENSGT00940000157280.j #10	ENSGT00940000156658 #11	ENSGT00940000154725 #12	ENSGT00950000182872.f.a.b #13	ENSGT00940000158587 #14	ENSGT00940000159300 #15	ENSGT00940000159104 #16	ENSGT00940000156215.f #17	ENSGT00390000011144 #18	ENSGT00940000158506 #19	ENSGT00940000159760 #20	ENSGT00530000064699 #21	ENSGT00940000159042 #22	ENSGT00390000002143.a #23	ENSGT00940000158742 #24	ENSGT00940000158547 #27	ENSGT00390000015159.b #29	ENSGT00950000183140.a.a.m.a.a.b #31	ENSGT00940000155285.b.b #32	ENSGT00940000159198 #33	ENSGT00950000182986.a.b.b #34	ENSGT00390000013961 #35	ENSGT00390000011137 #36	ENSGT00390000011759 #37	ENSGT00940000162935	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a	ENSGT00390000005809	ENSGT00940000156272
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	12		ENSUPAG00010006452 #8	FAM135B (ENSUPAG00010006547) #9	KHDRBS3 (ENSUPAG00010006597) #10	ZFAT (ENSUPAG00010006618) #11	ST3GAL1 (ENSUPAG00010006639) #12	NDRG1 (ENSUPAG00010006645) #13	CCN4 (ENSUPAG00010006658) #14	TG (ENSUPAG00010006678) #15	SLA (ENSUPAG00010006757) #16	PHF20L1 (ENSUPAG00010006793) #17	TMEM71 (ENSUPAG00010006832) #18	DNAAF11 (ENSUPAG00010006850) #19	KCNQ3 (ENSUPAG00010006871) #20	HHLA1 (ENSUPAG00010006905) #21	OC90 (ENSUPAG00010006953) #22	EFR3A (ENSUPAG00010007015) #23	ADCY8 (ENSUPAG00010007199) #24	ENSUPAG00010007296 #25	ENSUPAG00010007308 #26	ASAP1 (ENSUPAG00010007317) #27	ENSUPAG00010008499 #28	CYRIB (ENSUPAG00010008508) #29	ENSUPAG00010008543 #30	GSDMC (ENSUPAG00010008550) #31	MYC (ENSUPAG00010008617) #32	LRATD2 (ENSUPAG00010008630) #33	TRIB1 (ENSUPAG00010008649) #34	NSMCE2 (ENSUPAG00010008658) #35	WASHC5 (ENSUPAG00010008692) #36	SQLE (ENSUPAG00010008785) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	70	KCNK9 (ENSSTOG00000027592)	ENSSTOG00000019372 #8	FAM135B (ENSSTOG00000013996) #9	KHDRBS3 (ENSSTOG00000008710) #10	ZFAT (ENSSTOG00000006903) #11	ST3GAL1 (ENSSTOG00000024282) #12	NDRG1 (ENSSTOG00000027200) #13	CCN4 (ENSSTOG00000024729) #14	ENSSTOG00000012423 #15	SLA (ENSSTOG00000012453) #16	PHF20L1 (ENSSTOG00000012416) #17	TMEM71 (ENSSTOG00000022474) #18	DNAAF11 (ENSSTOG00000011647) #19	KCNQ3 (ENSSTOG00000011130) #20	HHLA1 (ENSSTOG00000011122) #21	OC90 (ENSSTOG00000011108) #22	EFR3A (ENSSTOG00000002906) #23	ADCY8 (ENSSTOG00000002439) #24	ASAP1 (ENSSTOG00000013952) #27	CYRIB (ENSSTOG00000013940) #29	GSDMC (ENSSTOG00000007048) #31	MYC (ENSSTOG00000004944) #32	LRATD2 (ENSSTOG00000025274) #33	TRIB1 (ENSSTOG00000023120) #34	NSMCE2 (ENSSTOG00000025816) #35	WASHC5 (ENSSTOG00000008463) #36	SQLE (ENSSTOG00000008446) #37	ZNF572 (ENSSTOG00000013236)	MTSS1 (ENSSTOG00000004442)	NDUFB9 (ENSSTOG00000021955)	TATDN1 (ENSSTOG00000010833)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	18	ENSMMMG00000004920 #8	FAM135B (ENSMMMG00000004861) #9	ENSMMMG00000004798	KHDRBS3 (ENSMMMG00000004785) #10	ZFAT (ENSMMMG00000004348) #11	ST3GAL1 (ENSMMMG00000004307) #12	NDRG1 (ENSMMMG00000004288) #13	CCN4 (ENSMMMG00000004263) #14	SLA (ENSMMMG00000004139) #16	TG (ENSMMMG00000004004) #15	PHF20L1 (ENSMMMG00000003892) #17	TMEM71 (ENSMMMG00000003878) #18	DNAAF11 (ENSMMMG00000003839) #19	KCNQ3 (ENSMMMG00000003818) #20	HHLA1 (ENSMMMG00000003755) #21	OC90 (ENSMMMG00000003713) #22	EFR3A (ENSMMMG00000003617) #23	ENSMMMG00000003580 #25	ADCY8 (ENSMMMG00000003467) #24	ASAP1 (ENSMMMG00000002349) #27	CYRIB (ENSMMMG00000002280) #29	MYC (ENSMMMG00000002155) #32	LRATD2 (ENSMMMG00000002132) #33	TRIB1 (ENSMMMG00000002104) #34	NSMCE2 (ENSMMMG00000002063) #35	WASHC5 (ENSMMMG00000001964) #36	SQLE (ENSMMMG00000001908) #37	ZNF572 (ENSMMMG00000001899)	ENSMMMG00000001896	MTSS1 (ENSMMMG00000001832)	NDUFB9 (ENSMMMG00000001820)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		KCNK9 (ENSSVLG00005019190)	ENSSVLG00005018670 #8	FAM135B (ENSSVLG00005018467) #9	ENSSVLG00005018282 #10	ZFAT (ENSSVLG00005017882) #11	ST3GAL1 (ENSSVLG00005017801) #12	NDRG1 (ENSSVLG00005017455) #13	CCN4 (ENSSVLG00005017264) #14	SLA (ENSSVLG00005016977) #16	TG (ENSSVLG00005016366) #15	PHF20L1 (ENSSVLG00005016179) #17	TMEM71 (ENSSVLG00005015990) #18	DNAAF11 (ENSSVLG00005015634) #19	KCNQ3 (ENSSVLG00005015209) #20	HHLA1 (ENSSVLG00005015025) #21	OC90 (ENSSVLG00005014895) #22	EFR3A (ENSSVLG00005014594) #23	ADCY8 (ENSSVLG00005014238) #24	ENSSVLG00005014144	ASAP1 (ENSSVLG00005013846) #27	CYRIB (ENSSVLG00005013445) #29	GSDMC (ENSSVLG00005013325) #31	MYC (ENSSVLG00005013254) #32	ENSSVLG00005013168	ENSSVLG00005013107	LRATD2 (ENSSVLG00005013066) #33	TRIB1 (ENSSVLG00005013017) #34	NSMCE2 (ENSSVLG00005012930) #35	WASHC5 (ENSSVLG00005012826) #36	SQLE (ENSSVLG00005012626) #37	ZNF572 (ENSSVLG00005012561)