Euteleostomi DUPLICATION Euteleostomi DUPLICATION Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 ENSGT00390000016167 #37 Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c #22 Caniformia_b DUPLICATION Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 ENSGT00390000016167 #37 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 ENSGT00390000016167 #37 American mink MODERN SPECIES 1 DCC (ENSNVIG00000002859) #7 MEX3C (ENSNVIG00000002828) #8 SMAD4 (ENSNVIG00000002745) #9 RNZ1 (ENSNVIG00000002709) #10 ME2 (ENSNVIG00000002617) #11 MSTRO (ENSNVIG00000002520) #12 MAPK4 (ENSNVIG00000002506) #13 SKA1 (ENSNVIG00000002493) #14 CXXC1 (ENSNVIG00000002380) #15 MBD1 (ENSNVIG00000001896) #16 ENSNVIG00000001883 #17 CFAP53 (ENSNVIG00000001864) #18 MYO5B (ENSNVIG00000001798) #19 ACAA2 (ENSNVIG00000001712) #20 LIPG (ENSNVIG00000001676) #21 RPL17 (ENSNVIG00000001575) #22 CR032 (ENSNVIG00000001568) #23 DYM (ENSNVIG00000001500) #24 SMAD7 (ENSNVIG00000001490) #25 CTIF (ENSNVIG00000001442) #26 ZBTB7C (ENSNVIG00000001419) #27 SMAD2 (ENSNVIG00000001323) #28 SKOR2 (ENSNVIG00000001287) #29 IER3IP1 (ENSNVIG00000001270) #30 HDHD2 (ENSNVIG00000001251) #31 KATNAL2 (ENSNVIG00000001211) #32 PIAS2 (ENSNVIG00000001141) #33 B7Z1K9 (ENSNVIG00000001042) #34 LOXHD1 (ENSNVIG00000000795) #35 RNF165 (ENSNVIG00000000779) #36 CR025 (ENSNVIG00000000751) #37 Ferret MODERN SPECIES 195 MYO5B (ENSMPUG00000000748) #19 ACAA2 (ENSMPUG00000000749) #20 LIPG (ENSMPUG00000000750) #21 ENSMPUG00000000801 #22 ENSMPUG00000000819 ##22 DYM (ENSMPUG00000000838) #24 SMAD7 (ENSMPUG00000000842) #25 CTIF (ENSMPUG00000000844) #26 ZBTB7C (ENSMPUG00000000848) #27 SMAD2 (ENSMPUG00000000850) #28 ENSMPUG00000000851 #29 HDHD2 (ENSMPUG00000000855) #31 KATNAL2 (ENSMPUG00000000857) #32 PIAS2 (ENSMPUG00000000861) #33 ST8SIA5 (ENSMPUG00000000867) #34 LOXHD1 (ENSMPUG00000000881) #35 RNF165 (ENSMPUG00000000899) #36 C18orf25 (ENSMPUG00000000916) #37 HAUS1 (ENSMPUG00000000919) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 ENSGT00390000016167 #37 Giant Panda MODERN SPECIES 5 MBD2 (ENSAMEG00000017208) ##16 DCC (ENSAMEG00000017215) #7 ENSAMEG00000002879 MEX3C (ENSAMEG00000002897) #8 SMAD4 (ENSAMEG00000002899) #9 ELAC1 (ENSAMEG00000002931) #10 ME2 (ENSAMEG00000002933) #11 MRO (ENSAMEG00000002971) #12 MAPK4 (ENSAMEG00000026715) #13 SKA1 (ENSAMEG00000000280) #14 CXXC1 (ENSAMEG00000000259) #15 MBD1 (ENSAMEG00000000238) #16 MYO5B (ENSAMEG00000009253) #19 ACAA2 (ENSAMEG00000009411) #20 LIPG (ENSAMEG00000009434) #21 RPL17 (ENSAMEG00000009498) #22 ENSAMEG00000027976 #23 DYM (ENSAMEG00000006724) #24 SMAD7 (ENSAMEG00000031009) #25 CTIF (ENSAMEG00000029852) #26 ZBTB7C (ENSAMEG00000012857) #27 SMAD2 (ENSAMEG00000012816) #28 ENSAMEG00000012815 #29 IER3IP1 (ENSAMEG00000023574) #30 HDHD2 (ENSAMEG00000012799) #31 KATNAL2 (ENSAMEG00000012794) #32 PIAS2 (ENSAMEG00000012748) #33 LOXHD1 (ENSAMEG00000012676) #35 RNF165 (ENSAMEG00000012667) #36 C18orf25 (ENSAMEG00000012662) #37 ENSAMEG00000025621 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.b ##22 Ferret MODERN SPECIES 337 FASTKD5 (ENSMPUG00000019143) UBOX5 (ENSMPUG00000008899) AVP (ENSMPUG00000008942) ENSMPUG00000008974 ENSMPUG00000009014 MRPS26 (ENSMPUG00000009018) PTPRA (ENSMPUG00000009021) VPS16 (ENSMPUG00000009037) PCED1A (ENSMPUG00000009061) TMEM239 (ENSMPUG00000009071) CPXM1 (ENSMPUG00000009076) EBF4 (ENSMPUG00000009093) ENSMPUG00000009107 NOP56 (ENSMPUG00000009118) TMC2 (ENSMPUG00000009125) ENSMPUG00000019147 ##22 SNRPB (ENSMPUG00000009283) TGM6 (ENSMPUG00000009294) TGM3 (ENSMPUG00000009511) STK35 (ENSMPUG00000009523) ENSMPUG00000009532 PDYN (ENSMPUG00000009541) ENSMPUG00000009561 ENSMPUG00000009575 ENSMPUG00000009580 ENSMPUG00000009591 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.b ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.b ##22 American black bear MODERN SPECIES 8959 ENSUAMG00000002457 ##22 C18orf32 (ENSUAMG00000002472) #23 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c #22 Dingo MODERN SPECIES 307 ENSCAFG00020002641 ENSCAFG00020002615 ENSCAFG00020002584 CBX7 (ENSCAFG00020002567) PDGFB (ENSCAFG00020002561) ENSCAFG00020002524 SYNGR1 (ENSCAFG00020002516) TAB1 (ENSCAFG00020002497) MGAT3 (ENSCAFG00020002492) ENSCAFG00020002487 MIEF1 (ENSCAFG00020002464) ATF4 (ENSCAFG00020002461) RPS19BP1 (ENSCAFG00020002454) CACNA1I (ENSCAFG00020002384) ENTHD1 (ENSCAFG00020002369) ENSCAFG00020002362 #22 GRAP2 (ENSCAFG00020002345) FAM83F (ENSCAFG00020002339) ENSCAFG00020002329 TNRC6B (ENSCAFG00020002189) ADSL (ENSCAFG00020002150) SGSM3 (ENSCAFG00020002141) MRTFA (ENSCAFG00020002129) MCHR1 (ENSCAFG00020002114) SLC25A17 (ENSCAFG00020002111) ENSCAFG00020002103 XPNPEP3 (ENSCAFG00020002086) RBX1 (ENSCAFG00020002079) ENSCAFG00020002075 ENSCAFG00020002042 L3MBTL2 (ENSCAFG00020002034) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ##22 Dingo MODERN SPECIES 80 NCK1 (ENSCAFG00020007999) ENSCAFG00020008010 IL20RB (ENSCAFG00020008018) ENSCAFG00020008023 SOX14 (ENSCAFG00020008039) CLDN18 (ENSCAFG00020008047) A4GNT (ENSCAFG00020008054) ENSCAFG00020008057 DBR1 (ENSCAFG00020008060) ARMC8 (ENSCAFG00020008068) ENSCAFG00020008081 MRAS (ENSCAFG00020008087) ENSCAFG00020008091 ESYT3 (ENSCAFG00020008113) CEP70 (ENSCAFG00020008176) ENSCAFG00020008186 ##22 FAIM (ENSCAFG00020008189) PIK3CB (ENSCAFG00020008199) ENSCAFG00020008227 ENSCAFG00020008230 ENSCAFG00020008234 ENSCAFG00020008235 ENSCAFG00020008237 COPB2 (ENSCAFG00020008249) RBP2 (ENSCAFG00020008262) RBP1 (ENSCAFG00020008276) NMNAT3 (ENSCAFG00020008280) CLSTN2 (ENSCAFG00020008307) TRIM42 (ENSCAFG00020008472) ENSCAFG00020008476 ENSCAFG00020008487 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 ENSGT00390000016167 #37 ENSGT00390000006029 Polar bear MODERN SPECIES 96 MBD2 (ENSUMAG00000003257) ##16 DCC (ENSUMAG00000003174) #7 ENSUMAG00000003148 MEX3C (ENSUMAG00000003137) #8 SMAD4 (ENSUMAG00000003120) #9 ELAC1 (ENSUMAG00000003132) #10 ME2 (ENSUMAG00000003096) #11 MRO (ENSUMAG00000003055) #12 MAPK4 (ENSUMAG00000003042) #13 SKA1 (ENSUMAG00000003034) #14 CXXC1 (ENSUMAG00000003014) #15 MBD1 (ENSUMAG00000002947) #16 MYO5B (ENSUMAG00000002812) #19 ACAA2 (ENSUMAG00000002792) #20 LIPG (ENSUMAG00000002779) #21 ENSUMAG00000002766 ##22 C18orf32 (ENSUMAG00000002755) #23 DYM (ENSUMAG00000002750) #24 ENSUMAG00000002746 #25 CTIF (ENSUMAG00000002735) #26 ZBTB7C (ENSUMAG00000002721) #27 SMAD2 (ENSUMAG00000002720) #28 IER3IP1 (ENSUMAG00000002717) #30 HDHD2 (ENSUMAG00000002716) #31 KATNAL2 (ENSUMAG00000002674) #32 PIAS2 (ENSUMAG00000002661) #33 ST8SIA5 (ENSUMAG00000002618) #34 LOXHD1 (ENSUMAG00000002413) #35 RNF165 (ENSUMAG00000002386) #36 C18orf25 (ENSUMAG00000002382) #37 HAUS1 (ENSUMAG00000002378) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ##22 Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 171 ARL4A (ENSMPUG00000019302) ETV1 (ENSMPUG00000014043) DGKB (ENSMPUG00000014037) AGMO (ENSMPUG00000014034) MEOX2 (ENSMPUG00000014031) CRPPA (ENSMPUG00000014028) SOSTDC1 (ENSMPUG00000014023) ENSMPUG00000014014 ANKMY2 (ENSMPUG00000014010) BZW2 (ENSMPUG00000014004) TSPAN13 (ENSMPUG00000013982) AGR2 (ENSMPUG00000013980) ENSMPUG00000013972 ENSMPUG00000013969 AHR (ENSMPUG00000013964) ENSMPUG00000019299 ##22 SNX13 (ENSMPUG00000013958) PRPS1L1 (ENSMPUG00000019297) ENSMPUG00000013956 HDAC9 (ENSMPUG00000013952) POLR1F (ENSMPUG00000013948) TMEM196 (ENSMPUG00000013945) MACC1 (ENSMPUG00000013939) ITGB8 (ENSMPUG00000013932) ABCB5 (ENSMPUG00000013926) SP8 (ENSMPUG00000013919) ENSMPUG00000013913 SP4 (ENSMPUG00000013911) DNAH11 (ENSMPUG00000013607) CDCA7L (ENSMPUG00000013603) RAPGEF5 (ENSMPUG00000013597) Ferret MODERN SPECIES 219 DNAJC28 (ENSMPUG00000019222) GART (ENSMPUG00000001284) SON (ENSMPUG00000001290) DONSON (ENSMPUG00000001294) CRYZL1 (ENSMPUG00000001310) ITSN1 (ENSMPUG00000001311) ENSMPUG00000001317 ATP5PO (ENSMPUG00000001319) MRPS6 (ENSMPUG00000001330) KCNE2 (ENSMPUG00000019225) C21orf140 (ENSMPUG00000019231) KCNE1 (ENSMPUG00000001333) RCAN1 (ENSMPUG00000001337) CLIC6 (ENSMPUG00000001338) RUNX1 (ENSMPUG00000001340) ENSMPUG00000001343 ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00390000018741.m #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 ENSGT00390000016167 #37 Cat MODERN SPECIES 243 POLI (ENSFCAG00000039381) MBD2 (ENSFCAG00000022047) ##16 DCC (ENSFCAG00000012953) #7 ENSFCAG00000022420 MEX3C (ENSFCAG00000027546) #8 SMAD4 (ENSFCAG00000005257) #9 ELAC1 (ENSFCAG00000039876) #10 ME2 (ENSFCAG00000005659) #11 MRO (ENSFCAG00000030720) #12 MAPK4 (ENSFCAG00000012154) #13 SKA1 (ENSFCAG00000023341) #14 CXXC1 (ENSFCAG00000006135) #15 MBD1 (ENSFCAG00000015730) #16 MYO5B (ENSFCAG00000009880) #19 LIPG (ENSFCAG00000012354) #21 RPL17 (ENSFCAG00000011342) #22 ENSFCAG00000022684 #23 DYM (ENSFCAG00000012954) #24 SMAD7 (ENSFCAG00000042475) #25 CTIF (ENSFCAG00000000664) #26 ZBTB7C (ENSFCAG00000030658) #27 SMAD2 (ENSFCAG00000013266) #28 SKOR2 (ENSFCAG00000045761) #29 IER3IP1 (ENSFCAG00000032516) #30 HDHD2 (ENSFCAG00000002788) #31 KATNAL2 (ENSFCAG00000018778) #32 PIAS2 (ENSFCAG00000002787) #33 ST8SIA5 (ENSFCAG00000002786) #34 LOXHD1 (ENSFCAG00000002785) #35 RNF165 (ENSFCAG00000002784) #36 CD3H18orf25 (ENSFCAG00000030676) #37 Panthera ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157230 ENSGT00940000155655.B ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000153988.A ENSGT00960000190219 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d.e ENSGT00390000012204 ENSGT01050000246169 ENSGT00910000144227.s.b ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 Tiger MODERN SPECIES 117 BAZ2B (ENSPTIG00000007795) WDSUB1 (ENSPTIG00000008515) TANC1 (ENSPTIG00000008763) DAPL1 (ENSPTIG00000008896) PKP4 (ENSPTIG00000009059) CCDC148 (ENSPTIG00000009504) ACVR1 (ENSPTIG00000009840) ACVR1C (ENSPTIG00000010133) CYTIP (ENSPTIG00000010346) ERMN (ENSPTIG00000010446) GALNT5 (ENSPTIG00000010695) GPD2 (ENSPTIG00000010856) NR4A2 (ENSPTIG00000011197) KCNJ3 (ENSPTIG00000011787) GALNT13 (ENSPTIG00000011908) ENSPTIG00000010205 #22 RPRM (ENSPTIG00000012190) ARL6IP6 (ENSPTIG00000012359) PRPF40A (ENSPTIG00000012673) FMNL2 (ENSPTIG00000013843) STAM2 (ENSPTIG00000014432) CACNB4 (ENSPTIG00000014914) ARL5A (ENSPTIG00000016763) NEB (ENSPTIG00000017078) RIF1 (ENSPTIG00000020652) ENSPTIG00000005642 ENSPTIG00000005894 TNFAIP6 (ENSPTIG00000006051) NMI (ENSPTIG00000006462) RBM43 (ENSPTIG00000006727) RND3 (ENSPTIG00000007120) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157230 ENSGT00940000155655.B ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000153988.A ENSGT00960000190219 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d.e ENSGT00390000012204 ENSGT01050000246169 ENSGT00910000144227.s.b ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 leopard MODERN SPECIES 1 BAZ2B (ENSPPRG00000000317) WDSUB1 (ENSPPRG00000001249) TANC1 (ENSPPRG00000002613) DAPL1 (ENSPPRG00000003172) PKP4 (ENSPPRG00000004622) ENSPPRG00000006959 CCDC148 (ENSPPRG00000008222) ACVR1 (ENSPPRG00000008596) ACVR1C (ENSPPRG00000010432) CYTIP (ENSPPRG00000011342) ERMN (ENSPPRG00000011665) GALNT5 (ENSPPRG00000011930) GPD2 (ENSPPRG00000014854) NR4A2 (ENSPPRG00000024776) KCNJ3 (ENSPPRG00000024706) ENSPPRG00000015500 #22 GALNT13 (ENSPPRG00000023357) ENSPPRG00000000163 RPRM (ENSPPRG00000015575) ARL6IP6 (ENSPPRG00000000863) PRPF40A (ENSPPRG00000001035) ENSPPRG00000015709 FMNL2 (ENSPPRG00000002927) ENSPPRG00000003451 STAM2 (ENSPPRG00000003557) CACNB4 (ENSPPRG00000006549) ARL5A (ENSPPRG00000008024) NEB (ENSPPRG00000002959) RIF1 (ENSPPRG00000003618) ENSPPRG00000003817 ENSPPRG00000016498 lion MODERN SPECIES 8 WDSUB1 (ENSPLOG00000019560) TANC1 (ENSPLOG00000019620) DAPL1 (ENSPLOG00000019656) PKP4 (ENSPLOG00000019696) CCDC148 (ENSPLOG00000019795) ENSPLOG00000019977 ACVR1 (ENSPLOG00000020011) ACVR1C (ENSPLOG00000020053) CYTIP (ENSPLOG00000020216) ERMN (ENSPLOG00000020235) GALNT5 (ENSPLOG00000020263) GPD2 (ENSPLOG00000020340) NR4A2 (ENSPLOG00000020391) ENSPLOG00000020488 GALNT13 (ENSPLOG00000020521) ENSPLOG00000020601 #22 RPRM (ENSPLOG00000020616) ARL6IP6 (ENSPLOG00000020626) PRPF40A (ENSPLOG00000020664) FMNL2 (ENSPLOG00000020750) STAM2 (ENSPLOG00000020809) CACNB4 (ENSPLOG00000020979) ARL5A (ENSPLOG00000021319) NEB (ENSPLOG00000021581) RIF1 (ENSPLOG00000022230) ENSPLOG00000022451 ENSPLOG00000022454 TNFAIP6 (ENSPLOG00000022459) NMI (ENSPLOG00000022481) RBM43 (ENSPLOG00000022483) RND3 (ENSPLOG00000022487) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157737 ENSGT00940000159819 ENSGT01030000234534.B.a.b ENSGT01030000234518.B.b ENSGT00940000158999 ENSGT00390000014309.cb ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000165655.b ENSGT00940000153289.b.s.a ENSGT00940000159506 ENSGT00940000158389 ENSGT00940000159348 ENSGT00940000155164 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000158943 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000174015.b ENSGT00940000161911 ENSGT00980000199886 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359.b.b ENSGT00940000153941.a.a ENSGT01050000244942.a ENSGT00940000159159 ENSGT00940000156178.A ENSGT00390000018488 ENSGT00910000144335 ENSGT00390000000993 ENSGT00940000153636.a American bison MODERN SPECIES 3102 CIB2 (ENSBBBG00000010616) SH2D7 (ENSBBBG00000001862) TBC1D2B (ENSBBBG00000010632) ADAMTS7 (ENSBBBG00000010780) OTUD7A (ENSBBBG00000010808) ENSBBBG00000010811 CHRNA7 (ENSBBBG00000010844) ENSBBBG00000001903 ENSBBBG00000010864 PCSK6 (ENSBBBG00000010952) TM2D3 (ENSBBBG00000001955) TARS3 (ENSBBBG00000001971) TJP1 (ENSBBBG00000011074) ENTREP2 (ENSBBBG00000011093) APBA2 (ENSBBBG00000011142) ENSBBBG00000011152 #22 ENSBBBG00000011154 ENSBBBG00000011156 ENSBBBG00000007589 TRPM1 (ENSBBBG00000011174) MTMR10 (ENSBBBG00000011191) FAN1 (ENSBBBG00000002035) ENSBBBG00000011224 MCEE (ENSBBBG00000011229) TMC3 (ENSBBBG00000011275) STARD5 (ENSBBBG00000011284) IL16 (ENSBBBG00000011313) CFAP161 (ENSBBBG00000011320) MESD (ENSBBBG00000011332) CEMIP (ENSBBBG00000002077) ABHD17C (ENSBBBG00000002018) Bos ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000159819 ENSGT01030000234534.B.a.b ENSGT01030000234518.B.b ENSGT00940000158999 ENSGT00390000014309.cb ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000165655.b ENSGT00940000153289.b.s.a ENSGT00940000159506 ENSGT00940000168934.b ENSGT00940000158389 ENSGT00940000159348 ENSGT00940000155164 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000158943 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000174015.b ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359.b.b ENSGT00940000153941.a.a ENSGT01050000244942.a ENSGT00940000159159 ENSGT00940000156178.A ENSGT00390000018488 ENSGT00910000144335 ENSGT00390000000993 ENSGT00940000153636.a ENSGT00940000159424.n.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157737 ENSGT00940000159819 ENSGT01030000234518.B.b ENSGT00940000158999 ENSGT00390000014309.cb ENSGT00940000154617.B ENSGT00940000165655.b ENSGT00940000153289.b.s.a ENSGT00940000159506 ENSGT00940000168934.b ENSGT00940000158389 ENSGT00940000159348 ENSGT00940000155164 ENSGT00530000063335.A ENSGT00940000158943 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00940000174015.b ENSGT00940000161911 ENSGT00940000155024 ENSGT00940000156900 ENSGT00390000018637 ENSGT00390000011359.b.b ENSGT00940000153941.a.a ENSGT01050000244942.a ENSGT00940000159159 ENSGT00940000156178.A ENSGT00390000018488 ENSGT00910000144335 ENSGT00390000000993 ENSGT00940000153636.a ENSGT00940000159424.n.b Cow MODERN SPECIES 13 ENSBTAG00000049380 OTUD7A (ENSBTAG00000006868) ENSBTAG00000048580 ENSBTAG00000053412 CHRNA7 (ENSBTAG00000015775) ENSBTAG00000003957 SNRPA1 (ENSBTAG00000013593) PCSK6 (ENSBTAG00000006675) ENSBTAG00000053962 TM2D3 (ENSBTAG00000007649) TARS3 (ENSBTAG00000007651) ENSBTAG00000049368 TJP1 (ENSBTAG00000015398) ENTREP2 (ENSBTAG00000003435) APBA2 (ENSBTAG00000020413) ENSBTAG00000025764 #22 ENSBTAG00000051487 KLF13 (ENSBTAG00000051090) ENSBTAG00000052208 TRPM1 (ENSBTAG00000001639) MTMR10 (ENSBTAG00000014422) FAN1 (ENSBTAG00000009855) MPHOSPH10 (ENSBTAG00000009854) MCEE (ENSBTAG00000035247) TMC3 (ENSBTAG00000012166) STARD5 (ENSBTAG00000010964) IL16 (ENSBTAG00000010963) ENSBTAG00000049620 CFAP161 (ENSBTAG00000011861) MESD (ENSBTAG00000001565) CEMIP (ENSBTAG00000007431) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a #22 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.a #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.a #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3288 ENSRROG00000031232 SLITRK1 (ENSRROG00000016609) ENSRROG00000026467 #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.a #22 Olive baboon MODERN SPECIES 1 UNC80 (ENSPANG00000024759) MAP2 (ENSPANG00000019944) ENSPANG00000051073 ENSPANG00000039642 PTH2R (ENSPANG00000002436) PIKFYVE (ENSPANG00000010442) C2orf80 (ENSPANG00000033159) IDH1 (ENSPANG00000005239) CRYGB (ENSPANG00000049951) CRYGC (ENSPANG00000051332) CRYGD (ENSPANG00000039491) ENSPANG00000040505 ENSPANG00000041891 PLEKHM3 (ENSPANG00000020994) ENSPANG00000049745 ENSPANG00000050051 #22 FZD5 (ENSPANG00000004676) CCNYL1 (ENSPANG00000011206) ENSPANG00000050559 ENSPANG00000047863 METTL21A (ENSPANG00000024440) CREB1 (ENSPANG00000009083) KLF7 (ENSPANG00000005240) CPO (ENSPANG00000005004) FASTKD2 (ENSPANG00000012835) ENSPANG00000043039 MDH1B (ENSPANG00000022792) DYTN (ENSPANG00000011028) FAM237A (ENSPANG00000032174) ADAM23 (ENSPANG00000025872) ENSPANG00000032033 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Gorilla MODERN SPECIES 6 ARIH1 (ENSGGOG00000004230) ENSGGOG00000027721 TMEM202 (ENSGGOG00000012279) ENSGGOG00000022001 HEXA (ENSGGOG00000002909) CELF6 (ENSGGOG00000015463) PARP6 (ENSGGOG00000015451) PKM (ENSGGOG00000005062) GRAMD2A (ENSGGOG00000005059) SENP8 (ENSGGOG00000040484) ENSGGOG00000024376 MYO9A (ENSGGOG00000014766) ENSGGOG00000043004 ENSGGOG00000038708 NR2E3 (ENSGGOG00000004383) ENSGGOG00000028267 #22 THSD4 (ENSGGOG00000001447) ENSGGOG00000022815 THAP10 (ENSGGOG00000013943) LRRC49 (ENSGGOG00000013950) LARP6 (ENSGGOG00000024151) UACA (ENSGGOG00000013910) TLE3 (ENSGGOG00000009717) RPLP1 (ENSGGOG00000003980) ENSGGOG00000023164 KIF23 (ENSGGOG00000003971) PAQR5 (ENSGGOG00000003967) GLCE (ENSGGOG00000016777) NOX5 (ENSGGOG00000010059) SPESP1 (ENSGGOG00000013653) CIAPIN1 (ENSGGOG00000039236) Orangutan MODERN SPECIES 1 AKR1C4 (ENSPPYG00000002053) AKR1C8 (ENSPPYG00000002054) AKR1C3 (ENSPPYG00000002052) ENSPPYG00000035168 AKR1C1 (ENSPPYG00000037741) AKR1E2 (ENSPPYG00000002049) KLF6 (ENSPPYG00000002048) PITRM1 (ENSPPYG00000002047) PFKP (ENSPPYG00000002046) ADARB2 (ENSPPYG00000002042) WDR37 (ENSPPYG00000002040) IDI1 (ENSPPYG00000002039) IDI2 (ENSPPYG00000030278) GTPBP4 (ENSPPYG00000002037) LARP4B (ENSPPYG00000002035) ENSPPYG00000032911 #22 DIP2C (ENSPPYG00000002033) ZMYND11 (ENSPPYG00000002032) ENSPPYG00000041245 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.a #22 Olive baboon MODERN SPECIES 13 BEND4 (ENSPANG00000016087) SLC30A9 (ENSPANG00000024558) ENSPANG00000017113 DCAF4L1 (ENSPANG00000013516) TMEM33 (ENSPANG00000031907) PHOX2B (ENSPANG00000022050) LIMCH1 (ENSPANG00000025221) ENSPANG00000044183 UCHL1 (ENSPANG00000016830) APBB2 (ENSPANG00000012562) NSUN7 (ENSPANG00000001045) ENSPANG00000048835 ENSPANG00000014103 ENSPANG00000040494 RBM47 (ENSPANG00000005980) ENSPANG00000044258 #22 CHRNA9 (ENSPANG00000040189) ENSPANG00000033774 RHOH (ENSPANG00000017744) N4BP2 (ENSPANG00000005533) PDS5A (ENSPANG00000001639) UBE2K (ENSPANG00000014212) SMIM14 (ENSPANG00000006965) UGDH (ENSPANG00000016219) LIAS (ENSPANG00000001640) RPL9 (ENSPANG00000017541) KLB (ENSPANG00000018421) RFC1 (ENSPANG00000016220) WDR19 (ENSPANG00000003767) KLHL5 (ENSPANG00000003768) TMEM156 (ENSPANG00000050889) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 9 CBLN1 (ENSPANG00000009450) C16orf78 (ENSPANG00000022694) ENSPANG00000038448 ZNF423 (ENSPANG00000022231) CNEP1R1 (ENSPANG00000016962) HEATR3 (ENSPANG00000024573) TENT4B (ENSPANG00000006934) ADCY7 (ENSPANG00000011498) BRD7 (ENSPANG00000024571) NKD1 (ENSPANG00000009782) SNX20 (ENSPANG00000000812) NOD2 (ENSPANG00000019150) CYLD (ENSPANG00000019153) SALL1 (ENSPANG00000024176) TOX3 (ENSPANG00000016176) ENSPANG00000034612 #22 CHD9NB (ENSPANG00000047104) CHD9 (ENSPANG00000019307) RBL2 (ENSPANG00000021504) AKTIP (ENSPANG00000018701) RPGRIP1L (ENSPANG00000015743) FTO (ENSPANG00000016386) ENSPANG00000017095 IRX3 (ENSPANG00000041905) IRX5 (ENSPANG00000007155) IRX6 (ENSPANG00000024570) MMP2 (ENSPANG00000006408) LPCAT2 (ENSPANG00000006269) SLC6A2 (ENSPANG00000018478) ENSPANG00000030695 ENSPANG00000008680 Olive baboon MODERN SPECIES 4 ENSPANG00000025201 ENSPANG00000034870 DMAC1 (ENSPANG00000025209) PTPRD (ENSPANG00000025208) ENSPANG00000046642 ENSPANG00000039593 ENSPANG00000048068 ENSPANG00000050311 ENSPANG00000017355 ENSPANG00000040619 TYRP1 (ENSPANG00000025207) LURAP1L (ENSPANG00000025206) MPDZ (ENSPANG00000025205) NFIB (ENSPANG00000025203) ZDHHC21 (ENSPANG00000042206) ENSPANG00000031770 #22 CER1 (ENSPANG00000025225) FREM1 (ENSPANG00000025228) ENSPANG00000038536 ENSPANG00000047398 SNAPC3 (ENSPANG00000025229) PSIP1 (ENSPANG00000025230) ENSPANG00000041882 CCDC171 (ENSPANG00000025236) ENSPANG00000025235 BNC2 (ENSPANG00000025234) ENSPANG00000045248 ENSPANG00000049593 CNTLN (ENSPANG00000025233) ENSPANG00000046683 SH3GL2 (ENSPANG00000025232) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Rhesus MODERN SPECIES 11 RBSN (ENSMMUG00000005158) TRH (ENSMMUG00000046670) TMCC1 (ENSMMUG00000016793) PLXND1 (ENSMMUG00000012737) H1-8 (ENSMMUG00000012736) RHO (ENSMMUG00000055315) IFT122 (ENSMMUG00000012727) ENSMMUG00000062379 MBD4 (ENSMMUG00000012723) EFCAB12 (ENSMMUG00000012721) ENSMMUG00000063541 H1-10 (ENSMMUG00000043091) HMCES (ENSMMUG00000013167) COPG1 (ENSMMUG00000013163) CNBP (ENSMMUG00000058753) ENSMMUG00000047632 #22 ISY1 (ENSMMUG00000011580) GP9 (ENSMMUG00000019799) ENSMMUG00000062320 EFCC1 (ENSMMUG00000047061) CFAP92 (ENSMMUG00000006343) ACAD9 (ENSMMUG00000006338) RAB7A (ENSMMUG00000001798) ENSMMUG00000020716 RPN1 (ENSMMUG00000018321) GATA2 (ENSMMUG00000021371) EEFSEC (ENSMMUG00000018663) RUVBL1 (ENSMMUG00000018662) SEC61A1 (ENSMMUG00000018661) KBTBD12 (ENSMMUG00000046638) MGLL (ENSMMUG00000000168) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a.b.b #22 Orangutan MODERN SPECIES 19 PLAGL1 (ENSPPYG00000017067) SF3B5 (ENSPPYG00000017068) STX11 (ENSPPYG00000017069) UTRN (ENSPPYG00000017070) EPM2A (ENSPPYG00000017071) FBXO30 (ENSPPYG00000017073) SHPRH (ENSPPYG00000017074) GRM1 (ENSPPYG00000017075) RAB32 (ENSPPYG00000035306) ADGB (ENSPPYG00000017077) STXBP5 (ENSPPYG00000017079) SAMD5 (ENSPPYG00000017080) ENSPPYG00000013601 SASH1 (ENSPPYG00000017082) UST (ENSPPYG00000017083) ENSPPYG00000037910 #22 TAB2 (ENSPPYG00000017085) ZC3H12D (ENSPPYG00000017087) PPIL4 (ENSPPYG00000029525) GINM1 (ENSPPYG00000017088) KATNA1 (ENSPPYG00000017090) LATS1 (ENSPPYG00000017091) NUP43 (ENSPPYG00000017092) PCMT1 (ENSPPYG00000032523) LRP11 (ENSPPYG00000017096) RAET1E (ENSPPYG00000017097) ENSPPYG00000017098 ENSPPYG00000017099 ULBP1 (ENSPPYG00000017100) ENSPPYG00000017101 ULBP3 (ENSPPYG00000017268) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a #22 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 958 COQ8A (ENSANAG00000027573) CDC42BPA (ENSANAG00000030280) ENSANAG00000028192 RHOU (ENSANAG00000023279) ENSANAG00000020122 RAB4A (ENSANAG00000032124) CCSAP (ENSANAG00000002364) ACTA1 (ENSANAG00000033052) NUP133 (ENSANAG00000031425) ABCB10 (ENSANAG00000028541) TAF5L (ENSANAG00000030674) URB2 (ENSANAG00000033963) GALNT2 (ENSANAG00000023609) PGBD5 (ENSANAG00000037429) ENSANAG00000024312 ENSANAG00000028566 #22 COG2 (ENSANAG00000023360) AGT (ENSANAG00000021401) CAPN9 (ENSANAG00000021609) C1orf198 (ENSANAG00000025811) TTC13 (ENSANAG00000023881) ARV1 (ENSANAG00000035550) FAM89A (ENSANAG00000036791) ENSANAG00000004938 ENSANAG00000003766 TRIM67 (ENSANAG00000022764) C1orf131 (ENSANAG00000025828) GNPAT (ENSANAG00000026069) EXOC8 (ENSANAG00000011856) SPRTN (ENSANAG00000034569) EGLN1 (ENSANAG00000029262) Mas night monkey MODERN SPECIES 974 ENSANAG00000034640 ADRA1A (ENSANAG00000022712) ENSANAG00000032951 STMN4 (ENSANAG00000021238) TRIM35 (ENSANAG00000034109) PTK2B (ENSANAG00000034147) CHRNA2 (ENSANAG00000023714) EPHX2 (ENSANAG00000006028) CLU (ENSANAG00000032018) SCARA3 (ENSANAG00000032323) ENSANAG00000027853 ESCO2 (ENSANAG00000021740) PBK (ENSANAG00000031844) SCARA5 (ENSANAG00000022183) NUGGC (ENSANAG00000022394) ENSANAG00000026004 #22 ELP3 (ENSANAG00000037178) PNOC (ENSANAG00000005124) ZNF395 (ENSANAG00000035574) FBXO16 (ENSANAG00000010190) ENSANAG00000035511 FZD3 (ENSANAG00000034098) ENSANAG00000018007 EXTL3 (ENSANAG00000034591) ENSANAG00000031622 INTS9 (ENSANAG00000031763) HMBOX1 (ENSANAG00000023362) KIF13B (ENSANAG00000030480) MSRA (ENSANAG00000017040) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.a #22 Capuchin MODERN SPECIES 369 NOL4 (ENSCCAG00000026226) ASXL3 (ENSCCAG00000010303) ENSCCAG00000031634 #22 CCDC178 (ENSCCAG00000025447) KLHL14 (ENSCCAG00000010338) SNRPC (ENSCCAG00000022751) GAREM1 (ENSCCAG00000008741) MEP1B (ENSCCAG00000019914) RNF138 (ENSCCAG00000022918) RNF125 (ENSCCAG00000019470) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Catarrhini DUPLICATION Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 854 CAMLG (ENSRROG00000019981) SEC24A (ENSRROG00000045670) SAR1B (ENSRROG00000028843) JADE2 (ENSRROG00000032987) ENSRROG00000012329 UBE2B (ENSRROG00000041544) CDKL3 (ENSRROG00000036347) PPP2CA (ENSRROG00000036242) ENSRROG00000044330 TCF7 (ENSRROG00000042564) VDAC1 (ENSRROG00000025787) C5orf15 (ENSRROG00000039514) FSTL4 (ENSRROG00000042283) ENSRROG00000030119 HSPA4 (ENSRROG00000038754) ENSRROG00000022780 #22 ENSRROG00000034804 ENSRROG00000032317 AFF4 (ENSRROG00000033812) LEAP2 (ENSRROG00000042130) UQCRQ (ENSRROG00000035832) GDF9 (ENSRROG00000034493) SHROOM1 (ENSRROG00000029747) SOWAHA (ENSRROG00000021650) SEPTIN8 (ENSRROG00000032709) CCNI2 (ENSRROG00000037110) KIF3A (ENSRROG00000031372) IL4 (ENSRROG00000042664) IL13 (ENSRROG00000038522) RAD50 (ENSRROG00000038469) IL5 (ENSRROG00000025726) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2467 ENSRROG00000038130 ENSRROG00000031684 PRKAB2 (ENSRROG00000019359) FMO5 (ENSRROG00000019672) CHD1L (ENSRROG00000041354) ENSRROG00000014400 BCL9 (ENSRROG00000035902) ACP6 (ENSRROG00000044098) GJA5 (ENSRROG00000026560) GJA8 (ENSRROG00000032017) ENSRROG00000036323 ENSRROG00000027930 #22 ENSRROG00000037449 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT01020000230346.E.s.b.b ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000264016 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.a ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000264016 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.a ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 Olive baboon MODERN SPECIES 10 ENSPANG00000045144 ENSPANG00000037100 DCC (ENSPANG00000006451) #7 MEX3C (ENSPANG00000006226) #8 SMAD4 (ENSPANG00000024703) #9 ELAC1 (ENSPANG00000026392) #10 ME2 (ENSPANG00000016868) #11 MRO (ENSPANG00000011894) #12 MAPK4 (ENSPANG00000009483) #13 SKA1 (ENSPANG00000030336) #14 CXXC1 (ENSPANG00000009435) #15 MBD1 (ENSPANG00000010867) #16 MYO5B (ENSPANG00000022089) #19 ACAA2 (ENSPANG00000002878) #20 LIPG (ENSPANG00000024235) #21 ENSPANG00000031295 #22 C18orf32 (ENSPANG00000040941) #23 ENSPANG00000037588 #24 ENSPANG00000046129 SMAD7 (ENSPANG00000025519) #25 CTIF (ENSPANG00000017087) #26 ZBTB7C (ENSPANG00000016942) #27 SMAD2 (ENSPANG00000025520) #28 SKOR2 (ENSPANG00000017535) #29 IER3IP1 (ENSPANG00000041314) #30 HDHD2 (ENSPANG00000010312) #31 ELOA2 (ENSPANG00000049945) KATNAL2 (ENSPANG00000017088) #32 PIAS2 (ENSPANG00000016213) #33 ST8SIA5 (ENSPANG00000024947) #34 LOXHD1 (ENSPANG00000025288) #35 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D.k #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT00390000002428.a.g.b.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b.gb #19 ENSGT01030000234626.D.k #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT00390000002428.a.g.b.a.b Gorilla MODERN SPECIES 9 DCC (ENSGGOG00000007343) #7 ENSGGOG00000025730 ENSGGOG00000014875 #8 ENSGGOG00000036220 SMAD4 (ENSGGOG00000013662) #9 ELAC1 (ENSGGOG00000002624) #10 ME2 (ENSGGOG00000010823) #11 MRO (ENSGGOG00000027618) #12 MAPK4 (ENSGGOG00000010469) #13 SKA1 (ENSGGOG00000016643) #14 CXXC1 (ENSGGOG00000016976) #15 MBD1 (ENSGGOG00000016966) #16 MYO5B (ENSGGOG00000008585) #19 ACAA2 (ENSGGOG00000012552) #20 LIPG (ENSGGOG00000000595) #21 RPL17 (ENSGGOG00000026697) #22 ENSGGOG00000027474 #23 DYM (ENSGGOG00000028457) #24 ENSGGOG00000010554 #25 CTIF (ENSGGOG00000015204) #26 ENSGGOG00000037898 ENSGGOG00000022625 ZBTB7C (ENSGGOG00000008438) #27 SMAD2 (ENSGGOG00000004706) #28 ENSGGOG00000037285 SKOR2 (ENSGGOG00000006679) #29 ENSGGOG00000022397 IER3IP1 (ENSGGOG00000027939) #30 HDHD2 (ENSGGOG00000016414) #31 ENSGGOG00000010534 ENSGGOG00000044154 Gibbon MODERN SPECIES 19 DCC (ENSNLEG00000011879) #7 ENSNLEG00000029756 #8 SMAD4 (ENSNLEG00000011859) #9 ELAC1 (ENSNLEG00000011855) #10 ME2 (ENSNLEG00000011833) #11 ENSNLEG00000011826 #12 MAPK4 (ENSNLEG00000011809) #13 SKA1 (ENSNLEG00000011804) #14 CXXC1 (ENSNLEG00000011746) #15 ENSNLEG00000011661 #16 CFAP53 (ENSNLEG00000011645) #18 MYO5B (ENSNLEG00000011609) #19 ACAA2 (ENSNLEG00000011576) #20 LIPG (ENSNLEG00000011556) #21 ENSNLEG00000034341 ENSNLEG00000029836 #22 C18orf32 (ENSNLEG00000011553) #23 ENSNLEG00000011539 #24 ENSNLEG00000032202 #24 SMAD7 (ENSNLEG00000034951) #25 CTIF (ENSNLEG00000011503) #26 ENSNLEG00000030200 ENSNLEG00000011500 ZBTB7C (ENSNLEG00000011492) #27 SMAD2 (ENSNLEG00000011463) #28 ENSNLEG00000011462 ENSNLEG00000029516 ENSNLEG00000029297 #29 IER3IP1 (ENSNLEG00000011450) #30 ENSNLEG00000029962 HDHD2 (ENSNLEG00000036069) #31 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D.k #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT00390000002428.a.g.b.a.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D.k #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT00390000002428.a.g.b.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 Bonobo MODERN SPECIES 9 DCC (ENSPPAG00000036460) #7 ENSPPAG00000038467 #8 SMAD4 (ENSPPAG00000027913) #9 ELAC1 (ENSPPAG00000036817) #10 ME2 (ENSPPAG00000036244) #11 MRO (ENSPPAG00000039840) #12 MAPK4 (ENSPPAG00000009556) #13 SKA1 (ENSPPAG00000035202) #14 CXXC1 (ENSPPAG00000028863) #15 MBD1 (ENSPPAG00000038886) #16 CFAP53 (ENSPPAG00000035491) #18 MYO5B (ENSPPAG00000042788) #19 ACAA2 (ENSPPAG00000039219) #20 LIPG (ENSPPAG00000034597) #21 ENSPPAG00000032490 ENSPPAG00000028848 #22 C18orf32 (ENSPPAG00000027512) #23 DYM (ENSPPAG00000033907) #24 ENSPPAG00000031318 #25 CTIF (ENSPPAG00000023554) #26 ENSPPAG00000041550 ENSPPAG00000033132 ZBTB7C (ENSPPAG00000039903) #27 SMAD2 (ENSPPAG00000035419) #28 ENSPPAG00000032994 ENSPPAG00000030667 IER3IP1 (ENSPPAG00000029166) #30 HDHD2 (ENSPPAG00000028597) #31 ENSPPAG00000028060 ENSPPAG00000027606 KATNAL2 (ENSPPAG00000019290) #32 Gorilla MODERN SPECIES 16 ENSGGOG00000038907 RPL35A (ENSGGOG00000027749) IQCG (ENSGGOG00000037546) ENSGGOG00000026294 #22 LRCH3 (ENSGGOG00000012799) FYTTD1 (ENSGGOG00000011665) RUBCN (ENSGGOG00000011498) ENSGGOG00000043225 ENSGGOG00000037406 BDH1 (ENSGGOG00000011171) DLG1 (ENSGGOG00000001688) MELTF (ENSGGOG00000014002) PIGZ (ENSGGOG00000006672) SENP5 (ENSGGOG00000007248) PAK2 (ENSGGOG00000007239) PIGX (ENSGGOG00000006859) CEP19 (ENSGGOG00000025058) NRROS (ENSGGOG00000008057) FBXO45 (ENSGGOG00000014199) Orangutan MODERN SPECIES 9 DCC (ENSPPYG00000009166) #7 MEX3C (ENSPPYG00000038962) #8 SMAD4 (ENSPPYG00000009165) #9 ELAC1 (ENSPPYG00000029936) #10 ME2 (ENSPPYG00000009163) #11 MRO (ENSPPYG00000030050) #12 ENSPPYG00000041514 MAPK4 (ENSPPYG00000009161) #13 SKA1 (ENSPPYG00000009159) #14 CXXC1 (ENSPPYG00000031882) #15 MBD1 (ENSPPYG00000009158) #16 CFAP53 (ENSPPYG00000009157) #18 MYO5B (ENSPPYG00000009155) #19 ACAA2 (ENSPPYG00000009154) #20 LIPG (ENSPPYG00000009153) #21 ENSPPYG00000009151 #22 C18orf32 (ENSPPYG00000033389) #23 DYM (ENSPPYG00000009149) #24 SMAD7 (ENSPPYG00000009148) #25 CTIF (ENSPPYG00000009147) #26 ZBTB7C (ENSPPYG00000009145) #27 SMAD2 (ENSPPYG00000009144) #28 ENSPPYG00000037397 ENSPPYG00000030833 SKOR2 (ENSPPYG00000009142) #29 IER3IP1 (ENSPPYG00000009140) #30 HDHD2 (ENSPPYG00000009139) #31 ENSPPYG00000009137 KATNAL2 (ENSPPYG00000009138) #32 PIAS2 (ENSPPYG00000009136) #33 ST8SIA5 (ENSPPYG00000009135) #34 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156251 ENSGT00940000155350 ENSGT00940000156536 ENSGT00940000163174 ENSGT00730000110920.a ENSGT00940000160180.n ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b.a #22 ENSGT00940000160984 ENSGT00940000162288 ENSGT00390000009554 ENSGT00910000147490 ENSGT00440000033232.d ENSGT00530000063516.a.a.c.b.y.a ENSGT00940000158413 ENSGT00390000012877 ENSGT01030000234582.f.a.b ENSGT01030000234582.e.b ENSGT00530000063947.C ENSGT00940000156163.e ENSGT00940000159690 ENSGT00940000161093 ENSGT00390000008610.a.b.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1148 NDUFC2 (ENSRBIG00000009625) THRSP (ENSRBIG00000024986) KCTD14 (ENSRBIG00000042721) INTS4 (ENSRBIG00000042236) AAMDC (ENSRBIG00000044663) RSF1 (ENSRBIG00000043374) ENSRBIG00000035450 AQP11 (ENSRBIG00000013902) PAK1 (ENSRBIG00000034335) ENSRBIG00000036379 GDPD4 (ENSRBIG00000037924) MYO7A (ENSRBIG00000036813) CAPN5 (ENSRBIG00000041321) B3GNT6 (ENSRBIG00000039681) ENSRBIG00000036893 ENSRBIG00000018440 #22 ACER3 (ENSRBIG00000037201) TSKU (ENSRBIG00000019981) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1304 MYO7A (ENSRROG00000032426) CAPN5 (ENSRROG00000040628) B3GNT6 (ENSRROG00000033910) ACER3 (ENSRROG00000034805) ENSRROG00000040805 ENSRROG00000012645 #22 TSKU (ENSRROG00000032131) LRRC32 (ENSRROG00000028668) EMSY (ENSRROG00000039855) ENSRROG00000020533 GVQW3 (ENSRROG00000043820) THAP12 (ENSRROG00000026238) WNT11 (ENSRROG00000031068) UVRAG (ENSRROG00000038883) DGAT2 (ENSRROG00000029306) MOGAT2 (ENSRROG00000018289) ENSRROG00000033527 SERPINH1 (ENSRROG00000034821) GDPD5 (ENSRROG00000032119) KLHL35 (ENSRROG00000042922) RPS3 (ENSRROG00000009870) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 583 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D.m #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b.b #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3093 MYO5B (ENSRROG00000036865) #19 ACAA2 (ENSRROG00000034218) #20 LIPG (ENSRROG00000032692) #21 ENSRROG00000029369 #22 ENSRROG00000041859 #23 DYM (ENSRROG00000011631) #24 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000154430.e.a ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654.c #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b #22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Mas night monkey MODERN SPECIES 426 MAPK4 (ENSANAG00000030817) #13 ENSANAG00000027371 #14 CXXC1 (ENSANAG00000026512) #15 MBD1 (ENSANAG00000036253) #16 CFAP53 (ENSANAG00000038121) #18 MYO5B (ENSANAG00000027712) #19 ACAA2 (ENSANAG00000033683) #20 LIPG (ENSANAG00000020805) #21 ENSANAG00000038237 #22 ENSANAG00000032933 DYM (ENSANAG00000029190) #24 SMAD7 (ENSANAG00000028079) #25 CTIF (ENSANAG00000024925) #26 ZBTB7C (ENSANAG00000033116) #27 SMAD2 (ENSANAG00000031458) #28 ENSANAG00000030706 SKOR2 (ENSANAG00000030804) #29 IER3IP1 (ENSANAG00000023921) #30 ENSANAG00000023759 HDHD2 (ENSANAG00000036024) #31 KATNAL2 (ENSANAG00000030359) #32 ENSANAG00000027601 PIAS2 (ENSANAG00000036127) #33 ST8SIA5 (ENSANAG00000020554) #34 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000154430.e.a ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654.c #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b #22 ENSGT00390000018741.ab #23 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741.`b.a #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000154430.e.a ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654.c #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b #22 ENSGT00390000018741.ab #23 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741.`b.a #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 58 ENSSBOG00000025727 MEX3C (ENSSBOG00000024094) #8 SMAD4 (ENSSBOG00000029676) #9 ELAC1 (ENSSBOG00000019881) #10 ME2 (ENSSBOG00000021989) #11 ENSSBOG00000032219 MRO (ENSSBOG00000029231) #12 MAPK4 (ENSSBOG00000034699) #13 ENSSBOG00000029260 #14 CXXC1 (ENSSBOG00000020380) #15 MBD1 (ENSSBOG00000027169) #16 MYO5B (ENSSBOG00000024887) #19 ACAA2 (ENSSBOG00000029056) #20 ENSSBOG00000034832 LIPG (ENSSBOG00000017170) #21 ENSSBOG00000026485 #22 C18orf32 (ENSSBOG00000027273) #23 DYM (ENSSBOG00000031374) #24 SMAD7 (ENSSBOG00000028839) #25 CTIF (ENSSBOG00000028468) #26 ZBTB7C (ENSSBOG00000027938) #27 SMAD2 (ENSSBOG00000036148) #28 ENSSBOG00000019181 ENSSBOG00000019888 #29 IER3IP1 (ENSSBOG00000028824) #30 HDHD2 (ENSSBOG00000023121) #31 KATNAL2 (ENSSBOG00000024912) #32 ENSSBOG00000029772 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Marmoset MODERN SPECIES 17 RNF135 (ENSCJAG00000014210) TEFM (ENSCJAG00000014201) ATAD5 (ENSCJAG00000014179) ENSCJAG00000078212 CRLF3 (ENSCJAG00000039568) ENSCJAG00000085031 SUZ12 (ENSCJAG00000014133) UTP6 (ENSCJAG00000014115) COPRS (ENSCJAG00000014110) ENSCJAG00000014106 RAB11FIP4 (ENSCJAG00000014099) NF1 (ENSCJAG00000013924) EVI2A (ENSCJAG00000014096) EVI2B (ENSCJAG00000066576) OMG (ENSCJAG00000057468) ENSCJAG00000076568 #22 ENSCJAG00000083741 ENSCJAG00000087132 ENSCJAG00000077182 GOSR1 (ENSCJAG00000013915) CPD (ENSCJAG00000013845) TMIGD1 (ENSCJAG00000013832) ENSCJAG00000080215 BLMH (ENSCJAG00000038993) SLC6A4 (ENSCJAG00000013726) ENSCJAG00000021934 NSRP1 (ENSCJAG00000013710) EFCAB5 (ENSCJAG00000013688) SSH2 (ENSCJAG00000013673) CORO6 (ENSCJAG00000013646) ANKRD13B (ENSCJAG00000013623) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 62 TPRG1 (ENSSBOG00000036102) TP63 (ENSSBOG00000033306) P3H2 (ENSSBOG00000035056) CLDN1 (ENSSBOG00000020833) CLDN16 (ENSSBOG00000029384) TMEM207 (ENSSBOG00000036118) IL1RAP (ENSSBOG00000032825) GMNC (ENSSBOG00000035297) ENSSBOG00000035925 OSTN (ENSSBOG00000032414) ENSSBOG00000032518 CCDC50 (ENSSBOG00000033037) ENSSBOG00000035617 ENSSBOG00000033371 FGF12 (ENSSBOG00000033018) ENSSBOG00000022053 #22 MB21D2 (ENSSBOG00000021427) ENSSBOG00000024248 PLAAT1 (ENSSBOG00000030423) ATP13A5 (ENSSBOG00000030531) ATP13A4 (ENSSBOG00000032487) OPA1 (ENSSBOG00000021973) HES1 (ENSSBOG00000028215) ENSSBOG00000033814 CPN2 (ENSSBOG00000014283) LRRC15 (ENSSBOG00000031469) ATP13A3 (ENSSBOG00000005544) TMEM44 (ENSSBOG00000020794) LSG1 (ENSSBOG00000034938) FAM43A (ENSSBOG00000018424) XXYLT1 (ENSSBOG00000034641) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 ENSCSAG00000012294 MSTN (ENSCSAG00000012272) C2orf88 (ENSCSAG00000018660) HIBCH (ENSCSAG00000012264) INPP1 (ENSCSAG00000012254) MFSD6 (ENSCSAG00000012252) NEMP2 (ENSCSAG00000012242) NAB1 (ENSCSAG00000012226) GLS (ENSCSAG00000012201) STAT1 (ENSCSAG00000012191) STAT4 (ENSCSAG00000012146) MYO1B (ENSCSAG00000012057) NABP1 (ENSCSAG00000012038) CAVIN2 (ENSCSAG00000012033) TMEFF2 (ENSCSAG00000012029) ENSCSAG00000012018 #22 SLC39A10 (ENSCSAG00000012006) DNAH7 (ENSCSAG00000011927) STK17B (ENSCSAG00000011683) HECW2 (ENSCSAG00000011673) CCDC150 (ENSCSAG00000011637) GTF3C3 (ENSCSAG00000011582) C2orf66 (ENSCSAG00000011573) PGAP1 (ENSCSAG00000011561) ANKRD44 (ENSCSAG00000011536) ENSCSAG00000011517 SF3B1 (ENSCSAG00000011505) COQ10B (ENSCSAG00000011483) HSPD1 (ENSCSAG00000011463) ENSCSAG00000011427 MOB4 (ENSCSAG00000011421) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 6 LY6L (ENSNLEG00000031924) ENSNLEG00000001383 GML (ENSNLEG00000001366) LY6D (ENSNLEG00000001345) LYNX1 (ENSNLEG00000028053) ENSNLEG00000036207 SLURP2 (ENSNLEG00000001320) LYPD2 (ENSNLEG00000001310) SLURP1 (ENSNLEG00000001300) THEM6 (ENSNLEG00000001298) ENSNLEG00000029363 PSCA (ENSNLEG00000001284) JRK (ENSNLEG00000001280) ADGRB1 (ENSNLEG00000001670) ENSNLEG00000001660 ENSNLEG00000034800 #22 MROH5 (ENSNLEG00000001633) PTP4A3 (ENSNLEG00000001610) SLC45A4 (ENSNLEG00000001582) ENSNLEG00000001579 DENND3 (ENSNLEG00000001560) ENSNLEG00000033490 PTK2 (ENSNLEG00000001510) AGO2 (ENSNLEG00000001461) ENSNLEG00000030588 ENSNLEG00000029889 ENSNLEG00000018803 TRAPPC9 (ENSNLEG00000001396) KCNK9 (ENSNLEG00000001377) COL22A1 (ENSNLEG00000032227) FAM135B (ENSNLEG00000010778) Gibbon MODERN SPECIES 20 ENSNLEG00000028386 PCNX2 (ENSNLEG00000002367) MAP3K21 (ENSNLEG00000002463) ENSNLEG00000029888 SLC35F3 (ENSNLEG00000031022) ENSNLEG00000030108 COA6 (ENSNLEG00000002501) TARBP1 (ENSNLEG00000002518) ENSNLEG00000002590 TOMM20 (ENSNLEG00000029038) RBM34 (ENSNLEG00000002610) ENSNLEG00000032959 ARID4B (ENSNLEG00000002665) GGPS1 (ENSNLEG00000002808) TBCE (ENSNLEG00000002823) ENSNLEG00000032061 #22 B3GALNT2 (ENSNLEG00000002950) ENSNLEG00000002971 ENSNLEG00000035816 LYST (ENSNLEG00000002982) NID1 (ENSNLEG00000003070) ENSNLEG00000036269 GPR137B (ENSNLEG00000003165) ERO1B (ENSNLEG00000003192) EDARADD (ENSNLEG00000003225) ENSNLEG00000032843 ENSNLEG00000018839 LGALS8 (ENSNLEG00000003250) HEATR1 (ENSNLEG00000003345) ACTN2 (ENSNLEG00000003539) MTR (ENSNLEG00000003551) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Orangutan MODERN SPECIES 1 CYP2C19 (ENSPPYG00000002504) ENSPPYG00000036087 HELLS (ENSPPYG00000002502) TBC1D12 (ENSPPYG00000002501) NOC3L (ENSPPYG00000002500) PLCE1 (ENSPPYG00000002499) ENSPPYG00000002498 SLC35G1 (ENSPPYG00000002497) LGI1 (ENSPPYG00000002496) FRA10AC1 (ENSPPYG00000002495) PDE6C (ENSPPYG00000002494) RBP4 (ENSPPYG00000002493) FFAR4 (ENSPPYG00000002492) CEP55 (ENSPPYG00000002491) MYOF (ENSPPYG00000002490) ENSPPYG00000034054 #22 CYP26A1 (ENSPPYG00000002489) CYP26C1 (ENSPPYG00000002488) EXOC6 (ENSPPYG00000002487) HHEX (ENSPPYG00000002486) ENSPPYG00000033680 KIF11 (ENSPPYG00000002484) IDE (ENSPPYG00000002483) MARCHF5 (ENSPPYG00000034208) CPEB3 (ENSPPYG00000002481) BTAF1 (ENSPPYG00000002480) FGFBP3 (ENSPPYG00000002479) TNKS2 (ENSPPYG00000036430) PPP1R3C (ENSPPYG00000002478) HECTD2 (ENSPPYG00000002477) ENSPPYG00000002476 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Gorilla MODERN SPECIES CRYZ (ENSGGOG00000034854) TYW3 (ENSGGOG00000013676) LHX8 (ENSGGOG00000026204) SLC44A5 (ENSGGOG00000007029) ENSGGOG00000038599 ACADM (ENSGGOG00000024342) ENSGGOG00000024667 RABGGTB (ENSGGOG00000004675) MSH4 (ENSGGOG00000044071) ASB17 (ENSGGOG00000003221) ST6GALNAC3 (ENSGGOG00000001465) TPI1 (ENSGGOG00000023036) ST6GALNAC5 (ENSGGOG00000005452) ENSGGOG00000036290 PIGK (ENSGGOG00000009240) ENSGGOG00000027673 #22 AK5 (ENSGGOG00000014497) ZZZ3 (ENSGGOG00000009242) USP33 (ENSGGOG00000007543) MIGA1 (ENSGGOG00000017058) NEXN (ENSGGOG00000034812) ENSGGOG00000027554 DNAJB4 (ENSGGOG00000004719) GIPC2 (ENSGGOG00000004987) PTGFR (ENSGGOG00000014499) IFI44L (ENSGGOG00000013652) ENSGGOG00000039692 IFI44 (ENSGGOG00000013663) ADGRL4 (ENSGGOG00000026803) ENSGGOG00000025574 ENSGGOG00000028020 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182835.c.d ENSGT00390000008296.b.a.b.c.b ENSGT00390000012715.b ENSGT00390000012850 ENSGT00390000003710.c.a.b.a.a ENSGT00390000001709 ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000162557 ENSGT00520000060726.b ENSGT00940000160284 ENSGT00940000166259 ENSGT00940000164260 ENSGT00390000000410 ENSGT00390000005052.e ENSGT00940000160737 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.f #22 ENSGT00940000164123 ENSGT00940000158279 ENSGT00940000156347 ENSGT00440000034270 ENSGT00390000011734 ENSGT00940000158130 ENSGT00940000157687 ENSGT00940000157026 ENSGT00940000158533 ENSGT00940000160086 ENSGT00940000158454 ENSGT00390000011619 ENSGT00940000158574 ENSGT01030000234570.d.b.a.b.b.b ENSGT00940000163134 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 PFKFB4 (ENSPTRG00000014889) SHISA5 (ENSPTRG00000014888) TREX1 (ENSPTRG00000033737) ATRIP (ENSPTRG00000014887) TMA7 (ENSPTRG00000041769) CCDC51 (ENSPTRG00000014885) PLXNB1 (ENSPTRG00000014884) FBXW12 (ENSPTRG00000014883) SPINK8 (ENSPTRG00000042337) NME6 (ENSPTRG00000014882) ENSPTRG00000044573 ZNF589 (ENSPTRG00000014881) CAMP (ENSPTRG00000014880) ENSPTRG00000050808 CDC25A (ENSPTRG00000014879) ENSPTRG00000049574 #22 MAP4 (ENSPTRG00000014878) DHX30 (ENSPTRG00000014877) ENSPTRG00000048090 SMARCC1 (ENSPTRG00000014875) CSPG5 (ENSPTRG00000014874) ELP6 (ENSPTRG00000014873) SCAP (ENSPTRG00000014872) PTPN23 (ENSPTRG00000014869) KLHL18 (ENSPTRG00000014868) KIF9 (ENSPTRG00000014867) SETD2 (ENSPTRG00000014866) NBEAL2 (ENSPTRG00000014864) CCDC12 (ENSPTRG00000014862) PTH1R (ENSPTRG00000014861) MYL3 (ENSPTRG00000014860) Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 16 PFKFB4 (ENSPPAG00000040004) SHISA5 (ENSPPAG00000022466) TREX1 (ENSPPAG00000022909) ATRIP (ENSPPAG00000037275) TMA7 (ENSPPAG00000011519) CCDC51 (ENSPPAG00000013899) PLXNB1 (ENSPPAG00000038541) ENSPPAG00000026655 SPINK8 (ENSPPAG00000005562) NME6 (ENSPPAG00000036553) ENSPPAG00000027577 ENSPPAG00000027730 CAMP (ENSPPAG00000042262) ENSPPAG00000017036 CDC25A (ENSPPAG00000034700) ENSPPAG00000033774 #22 MAP4 (ENSPPAG00000042257) DHX30 (ENSPPAG00000034330) SMARCC1 (ENSPPAG00000031011) CSPG5 (ENSPPAG00000041716) ELP6 (ENSPPAG00000039928) SCAP (ENSPPAG00000011239) PTPN23 (ENSPPAG00000042499) KLHL18 (ENSPPAG00000026841) KIF9 (ENSPPAG00000040979) SETD2 (ENSPPAG00000027015) NBEAL2 (ENSPPAG00000043702) CCDC12 (ENSPPAG00000028782) PTH1R (ENSPPAG00000036562) MYL3 (ENSPPAG00000038266) ENSPPAG00000042735 Bonobo MODERN SPECIES 6 HIGD2B (ENSPPAG00000012835) ARIH1 (ENSPPAG00000029632) TMEM202 (ENSPPAG00000032339) ENSPPAG00000035199 HEXA (ENSPPAG00000037219) CELF6 (ENSPPAG00000042321) PARP6 (ENSPPAG00000042901) PKM (ENSPPAG00000041061) GRAMD2A (ENSPPAG00000034526) SENP8 (ENSPPAG00000003990) ENSPPAG00000041256 MYO9A (ENSPPAG00000036622) ENSPPAG00000013619 ENSPPAG00000021142 NR2E3 (ENSPPAG00000042596) ENSPPAG00000034547 #22 ENSPPAG00000039433 THSD4 (ENSPPAG00000038184) ENSPPAG00000031013 ENSPPAG00000042838 THAP10 (ENSPPAG00000009534) LRRC49 (ENSPPAG00000042602) LARP6 (ENSPPAG00000031247) UACA (ENSPPAG00000027889) TLE3 (ENSPPAG00000027158) ENSPPAG00000039263 ENSPPAG00000041698 KIF23 (ENSPPAG00000038174) PAQR5 (ENSPPAG00000043450) GLCE (ENSPPAG00000034026) NOX5 (ENSPPAG00000038195) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1295 DSC2 (ENSDNOG00000010723) DSC3 (ENSDNOG00000010690) ENSDNOG00000038066 ENSDNOG00000047471 ENSDNOG00000045070 #22 CDH2 (ENSDNOG00000008250) CHST9 (ENSDNOG00000013571) AQP4 (ENSDNOG00000046121) Armadillo MODERN SPECIES 2423 ENSDNOG00000014764 ENSDNOG00000019528 ENSDNOG00000039696 #22 ENSDNOG00000044714 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Carnivora DUPLICATION Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155555 ENSGT00390000008212 ENSGT00940000158888 ENSGT00940000154239.a ENSGT00950000182772.A.a.b ENSGT00940000154862 ENSGT00950000185142 ENSGT00390000006113.t ENSGT00390000016478.i.a ENSGT00940000154259.l.q.a.a ENSGT00940000164852 ENSGT01030000234613.b.a.a ENSGT01030000234613.b.a.b ENSGT00610000087423 ENSGT01030000234517.H.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000160538 ENSGT00940000155654 ENSGT00390000018116 ENSGT00940000157283 ENSGT00390000015784 ENSGT00390000002751 ENSGT00940000159582 ENSGT00390000007686.b.d ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.b.g.b ENSGT00520000057711 ENSGT00940000156103 ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a ENSGT00950000183173.O ENSGT00950000186089 Tiger MODERN SPECIES 490 RD3L (ENSPTIG00000019597) ATP5MJ (ENSPTIG00000019687) PPP1R13B (ENSPTIG00000019969) ZFYVE21 (ENSPTIG00000020854) XRCC3 (ENSPTIG00000021183) KLC1 (ENSPTIG00000021796) ENSPTIG00000012187 TRMT61A (ENSPTIG00000012664) CKB (ENSPTIG00000012834) MARK3 (ENSPTIG00000013919) ENSPTIG00000005685 EIF5 (ENSPTIG00000017471) TNFAIP2 (ENSPTIG00000017712) EXOC3L4 (ENSPTIG00000017928) LBHD2 (ENSPTIG00000018933) ENSPTIG00000020371 ##22 TRAF3 (ENSPTIG00000020503) RCOR1 (ENSPTIG00000004161) ENSPTIG00000005734 ENSPTIG00000005992 CINP (ENSPTIG00000006788) ENSPTIG00000007428 MOK (ENSPTIG00000008365) ENSPTIG00000009917 HSP90AA1 (ENSPTIG00000010091) ENSPTIG00000010382 ENSPTIG00000012841 PPP2R5C (ENSPTIG00000013615) DIO3 (ENSPTIG00000014966) ENSPTIG00000006032 ENSPTIG00000015283 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155555 ENSGT00390000008212 ENSGT00940000158888 ENSGT00940000154239.a ENSGT00950000182772.A.a.b ENSGT00940000154862 ENSGT00950000185142 ENSGT00390000006113.t ENSGT00390000016478.i.a ENSGT00940000154259.l.q.a.a ENSGT00940000164852 ENSGT01030000234613.b.a.a ENSGT01030000234613.b.a.b ENSGT00610000087423 ENSGT01030000234517.H.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.a ##22 ENSGT00390000007463 ENSGT00940000160538 ENSGT00940000155654 ENSGT00390000018116 ENSGT00940000157283 ENSGT00390000015784 ENSGT00390000002751 ENSGT00940000159582 ENSGT00390000007686.b.d ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.b.g.b ENSGT01030000235064 ENSGT00520000057711 ENSGT00940000156103 ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a leopard MODERN SPECIES 38 ENSPPRG00000020034 TNFAIP2 (ENSPPRG00000010623) EXOC3L4 (ENSPPRG00000011715) LBHD2 (ENSPPRG00000011985) CDC42BPB (ENSPPRG00000014066) ENSPPRG00000020487 ##22 TRAF3 (ENSPPRG00000025084) RCOR1 (ENSPPRG00000025057) ANKRD9 (ENSPPRG00000020673) TECPR2 (ENSPPRG00000024891) CINP (ENSPPRG00000024721) ZNF839 (ENSPPRG00000024466) MOK (ENSPPRG00000023887) WDR20 (ENSPPRG00000022986) HSP90AA1 (ENSPPRG00000000416) ENSPPRG00000000469 PPP2R5C (ENSPPRG00000009435) ENSPPRG00000009967 ENSPPRG00000010168 DLK1 (ENSPPRG00000016279) BEGAIN (ENSPPRG00000021199) lion MODERN SPECIES 6 KLC1 (ENSPLOG00000006195) COA8 (ENSPLOG00000006136) BAG5 (ENSPLOG00000006121) TRMT61A (ENSPLOG00000006104) CKB (ENSPLOG00000006084) MARK3 (ENSPLOG00000005746) ENSPLOG00000005629 ENSPLOG00000005614 EIF5 (ENSPLOG00000005586) ENSPLOG00000005488 ENSPLOG00000005470 TNFAIP2 (ENSPLOG00000005453) EXOC3L4 (ENSPLOG00000005398) LBHD2 (ENSPLOG00000005383) CDC42BPB (ENSPLOG00000005343) ENSPLOG00000010859 ##22 AMN (ENSPLOG00000010781) TRAF3 (ENSPLOG00000010717) RCOR1 (ENSPLOG00000010640) ANKRD9 (ENSPLOG00000010606) TECPR2 (ENSPLOG00000010430) CINP (ENSPLOG00000010365) ENSPLOG00000010344 MOK (ENSPLOG00000010303) WDR20 (ENSPLOG00000010212) HSP90AA1 (ENSPLOG00000010136) ENSPLOG00000010110 DYNC1H1 (ENSPLOG00000009726) PPP2R5C (ENSPLOG00000009399) ENSPLOG00000009327 RTL1 (ENSPLOG00000008680) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000160226 ENSGT00940000159837 ENSGT00390000017249 ENSGT00940000157667 ENSGT00940000158481 ENSGT00940000169558 ENSGT00940000159662 ENSGT00940000156620 ENSGT00940000161101 ENSGT00940000162841 ENSGT00910000148817 ENSGT00390000016821 ENSGT00940000157226 ENSGT00940000154860 ENSGT00390000006196 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT00390000010991 Polar bear MODERN SPECIES 229 CHST1 (ENSUMAG00000015445) SYT13 (ENSUMAG00000015449) PRDM11 (ENSUMAG00000015467) TP53I11 (ENSUMAG00000015491) TSPAN18 (ENSUMAG00000015509) CD82 (ENSUMAG00000015516) ENSUMAG00000015524 ENSUMAG00000015538 EXT2 (ENSUMAG00000015542) ACCS (ENSUMAG00000015553) ENSUMAG00000015568 ENSUMAG00000015598 ALKBH3 (ENSUMAG00000015602) HSD17B12 (ENSUMAG00000015611) TTC17 (ENSUMAG00000015633) ENSUMAG00000015652 ##22 API5 (ENSUMAG00000015677) ENSUMAG00000015788 LRRC4C (ENSUMAG00000015809) American black bear MODERN SPECIES 5537 TTC17 (ENSUAMG00000019199) ENSUAMG00000019201 ##22 API5 (ENSUAMG00000019202) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 Ferret MODERN SPECIES 596 ENSMPUG00000010954 ENSMPUG00000010918 OR2AE1 (ENSMPUG00000019896) TRIM4 (ENSMPUG00000010906) ENSMPUG00000019894 ##22 AZGP1 (ENSMPUG00000010904) ZKSCAN1 (ENSMPUG00000010898) ZSCAN21 (ENSMPUG00000010896) ENSMPUG00000010891 COPS6 (ENSMPUG00000010887) MCM7 (ENSMPUG00000010881) AP4M1 (ENSMPUG00000010875) TAF6 (ENSMPUG00000010870) CNPY4 (ENSMPUG00000010847) MBLAC1 (ENSMPUG00000019892) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b ##22 Panthera_a DUPLICATION Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155356 ENSGT00940000158083 ENSGT00940000157665 ENSGT00940000156361.B ENSGT00390000014494 ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00940000158947.e ENSGT00390000016950 ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000154158.l.c.a ENSGT00940000163318 ENSGT00390000003368 ENSGT00940000158152 ENSGT00940000157504 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b.a ##22 ENSGT00390000007725.A.b ENSGT00390000012496.a ENSGT00390000019377.b ENSGT00940000162602 ENSGT00940000160364 ENSGT01050000244827.B ENSGT00940000154840.b ENSGT00510000049596 ENSGT00940000155177.b ENSGT01030000234540.E ENSGT00940000158367 ENSGT00940000161722 ENSGT00940000164746 ENSGT00940000154334.k ENSGT00940000157300 leopard MODERN SPECIES 31 HIPK1 (ENSPPRG00000003595) OLFML3 (ENSPPRG00000017719) SYT6 (ENSPPRG00000014396) TRIM33 (ENSPPRG00000012753) BCAS2 (ENSPPRG00000012152) DENND2C (ENSPPRG00000011320) AMPD1 (ENSPPRG00000008277) ENSPPRG00000007102 CSDE1 (ENSPPRG00000006747) SIKE1 (ENSPPRG00000001473) ENSPPRG00000001280 ENSPPRG00000000888 SYCP1 (ENSPPRG00000023786) TSHB (ENSPPRG00000012835) TSPAN2 (ENSPPRG00000012267) ENSPPRG00000016776 ##22 NGF (ENSPPRG00000016689) VANGL1 (ENSPPRG00000010871) CASQ2 (ENSPPRG00000009697) NHLH2 (ENSPPRG00000016591) SLC22A15 (ENSPPRG00000008983) MAB21L3 (ENSPPRG00000008518) ATP1A1 (ENSPPRG00000008177) IGSF3 (ENSPPRG00000004364) CD2 (ENSPPRG00000003530) PTGFRN (ENSPPRG00000003305) CD101 (ENSPPRG00000003135) ENSPPRG00000002352 TRIM45 (ENSPPRG00000001987) VTCN1 (ENSPPRG00000001120) MAN1A2 (ENSPPRG00000000605) lion MODERN SPECIES 8 OLFML3 (ENSPLOG00000017170) SYT6 (ENSPLOG00000017004) TRIM33 (ENSPLOG00000016841) ENSPLOG00000016808 BCAS2 (ENSPLOG00000016764) DENND2C (ENSPLOG00000016707) AMPD1 (ENSPLOG00000016449) NRAS (ENSPLOG00000016315) CSDE1 (ENSPLOG00000015680) SIKE1 (ENSPLOG00000015473) ENSPLOG00000015461 ENSPLOG00000015234 SYCP1 (ENSPLOG00000014657) TSHB (ENSPLOG00000014568) TSPAN2 (ENSPLOG00000014519) ENSPLOG00000014415 ##22 NGF (ENSPLOG00000014389) VANGL1 (ENSPLOG00000014377) CASQ2 (ENSPLOG00000014262) NHLH2 (ENSPLOG00000014240) SLC22A15 (ENSPLOG00000014089) MAB21L3 (ENSPLOG00000014017) ATP1A1 (ENSPLOG00000013723) ENSPLOG00000013611 IGSF3 (ENSPLOG00000013549) CD2 (ENSPLOG00000013510) PTGFRN (ENSPLOG00000013463) CD101 (ENSPLOG00000013429) ENSPLOG00000013203 TRIM45 (ENSPLOG00000013060) VTCN1 (ENSPLOG00000012889) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.b.b ##22 leopard MODERN SPECIES 85 B3GAT1 (ENSPPRG00000001615) GLB1L2 (ENSPPRG00000002084) GLB1L3 (ENSPPRG00000002676) ENSPPRG00000003803 ENSPPRG00000021840 ##22 ACAD8 (ENSPPRG00000004280) ENSPPRG00000005182 VPS26B (ENSPPRG00000005365) NCAPD3 (ENSPPRG00000006156) JAM3 (ENSPPRG00000007242) IGSF9B (ENSPPRG00000008033) SPATA19 (ENSPPRG00000009378) OPCML (ENSPPRG00000010433) NTM (ENSPPRG00000011551) SNX19 (ENSPPRG00000012752) ADAMTS15 (ENSPPRG00000012990) ADAMTS8 (ENSPPRG00000016281) ZBTB44 (ENSPPRG00000024110) ST14 (ENSPPRG00000023767) APLP2 (ENSPPRG00000001219) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 7154 BATF3 (ENSTSYG00000034285) ENSTSYG00000026620 #10 ATF3 (ENSTSYG00000035219) ENSTSYG00000036299 ##22 NENF (ENSTSYG00000001880) TMEM206 (ENSTSYG00000013792) ENSTSYG00000013786 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.c ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.c ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.c ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 42 CYB5R2 (ENSSBOG00000022515) PPFIBP2 (ENSSBOG00000035770) OLFML1 (ENSSBOG00000023633) SYT9 (ENSSBOG00000032140) NLRP14 (ENSSBOG00000024873) ZNF214 (ENSSBOG00000030822) ZNF215 (ENSSBOG00000026706) OR6A2 (ENSSBOG00000019114) MRPL17 (ENSSBOG00000031626) DCHS1 (ENSSBOG00000023128) TPP1 (ENSSBOG00000021190) TAF10 (ENSSBOG00000033223) ILK (ENSSBOG00000027321) RRP8 (ENSSBOG00000035280) ENSSBOG00000032184 ENSSBOG00000031634 ##22 ENSSBOG00000019793 ARFIP2 (ENSSBOG00000029575) TRIM3 (ENSSBOG00000013612) APBB1 (ENSSBOG00000020344) SMPD1 (ENSSBOG00000026297) LATS2 (ENSSBOG00000019616) SAP18 (ENSSBOG00000031979) ENSSBOG00000029627 SKA3 (ENSSBOG00000010390) ZDHHC20 (ENSSBOG00000026798) ENSSBOG00000021865 MICU2 (ENSSBOG00000019033) FGF9 (ENSSBOG00000003885) SGCG (ENSSBOG00000029754) SACS (ENSSBOG00000035759) Mas night monkey MODERN SPECIES 344 ENSANAG00000032131 ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.d ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.d ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.d ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 112 HOXA1 (ENSSBOG00000022017) HOXA2 (ENSSBOG00000024057) HOXA3 (ENSSBOG00000031444) ENSSBOG00000026625 HOXA5 (ENSSBOG00000027127) HOXA6 (ENSSBOG00000026859) HOXA7 (ENSSBOG00000023282) HOXA9 (ENSSBOG00000033572) HOXA10 (ENSSBOG00000033844) HOXA11 (ENSSBOG00000020434) HOXA13 (ENSSBOG00000024071) EVX1 (ENSSBOG00000017478) HIBADH (ENSSBOG00000032980) TAX1BP1 (ENSSBOG00000021153) JAZF1 (ENSSBOG00000031260) ENSSBOG00000018196 ##22 CREB5 (ENSSBOG00000019829) TRIL (ENSSBOG00000017304) CPVL (ENSSBOG00000021419) CHN2 (ENSSBOG00000023305) WIPF3 (ENSSBOG00000022641) SCRN1 (ENSSBOG00000034510) FKBP14 (ENSSBOG00000032897) PLEKHA8 (ENSSBOG00000020795) MTURN (ENSSBOG00000033828) ENSSBOG00000029979 NOD1 (ENSSBOG00000032727) GGCT (ENSSBOG00000029340) GARS1 (ENSSBOG00000022287) CRHR2 (ENSSBOG00000015505) INMT (ENSSBOG00000032759) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162767 ENSGT00390000005185 ENSGT00940000163110 ENSGT00390000008296.b.a.a.g ENSGT00390000017970 ENSGT00940000154499.h ENSGT00940000154930 ENSGT00390000003343 ENSGT00900000143826 ENSGT00940000153617.D ENSGT00940000155804 ENSGT00530000063790.b ENSGT00940000155586.B ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00530000063926.a ENSGT00940000156990 ENSGT00950000182917.a.a.b.a ENSGT00390000005708 ENSGT01100000266431 ENSGT00940000154706 ENSGT00390000007924 ENSGT00410000028916 ENSGT00390000005844.a.b ENSGT00440000034932 ENSGT00940000160529 ENSGT00940000156243 ENSGT00390000007252.c ENSGT01020000230346.E.s.a ENSGT00950000183031.B.e.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000011483 ENSGT00940000162767 ENSGT00390000005185 ENSGT00940000163110 ENSGT00390000008296.b.a.a.g ENSGT00390000017970 ENSGT00940000154930 ENSGT00390000003343 ENSGT00900000141074.f.b ENSGT00940000153617.D ENSGT00940000155804 ENSGT00530000063790.b ENSGT00940000155586.B ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00530000063926.a ENSGT00940000156990 ENSGT00950000182917.a.a.b.a ENSGT00390000005708 ENSGT01100000266431 ENSGT00940000154706 ENSGT00390000007924 ENSGT00410000028916 ENSGT00390000005844.a.b ENSGT00440000034932 ENSGT00940000160529 ENSGT00940000156243 ENSGT00390000007252.c ENSGT01020000230346.E.s.a ENSGT00950000183031.B.e.b Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005185 ENSGT00940000163110 ENSGT00390000008296.b.a.a.g ENSGT00390000017970 ENSGT00940000154930 ENSGT00390000002127.sb ENSGT00390000009328.c.a ENSGT00390000003343 ENSGT00900000141074.f.b ENSGT00940000153617.D ENSGT00940000155804 ENSGT00530000063790.b ENSGT00940000155586.B ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00530000063926.a ENSGT00940000156990 ENSGT00950000182917.a.a.b.a ENSGT00390000005708 ENSGT00940000154706 ENSGT00390000007924 ENSGT00410000028916 ENSGT00390000005844.a.b ENSGT00440000034932 ENSGT00940000160529 ENSGT00940000156243 ENSGT00390000007252.c ENSGT00950000183031.B.e.b ENSGT00390000008250 ENSGT00950000182920.b.a.b.a.b.i Crab-eating macaque MODERN SPECIES 6 ENSMFAG00000014550 ENSMFAG00000014434 DMAC1 (ENSMFAG00000044806) ENSMFAG00000044606 PTPRD (ENSMFAG00000031323) ENSMFAG00000049031 ENSMFAG00000049672 ENSMFAG00000028377 ENSMFAG00000062292 TYRP1 (ENSMFAG00000046179) LURAP1L (ENSMFAG00000040734) ENSMFAG00000057135 MPDZ (ENSMFAG00000032679) NFIB (ENSMFAG00000037052) ZDHHC21 (ENSMFAG00000038466) ENSMFAG00000030041 ##22 CER1 (ENSMFAG00000037928) FREM1 (ENSMFAG00000002956) ENSMFAG00000059525 TTC39B (ENSMFAG00000002246) SNAPC3 (ENSMFAG00000039519) PSIP1 (ENSMFAG00000045606) CCDC171 (ENSMFAG00000007272) ENSMFAG00000036515 BNC2 (ENSMFAG00000036895) CNTLN (ENSMFAG00000038531) SH3GL2 (ENSMFAG00000043791) ADAMTSL1 (ENSMFAG00000042640) SAXO1 (ENSMFAG00000000158) RRAGA (ENSMFAG00000030433) HAUS6 (ENSMFAG00000000635) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 152 UHRF2 (ENSMNEG00000034080) GLDC (ENSMNEG00000032546) ENSMNEG00000033793 ENSMNEG00000031093 KDM4C (ENSMNEG00000029324) DMAC1 (ENSMNEG00000044495) ENSMNEG00000030132 PTPRD (ENSMNEG00000036506) ENSMNEG00000036773 TYRP1 (ENSMNEG00000035543) LURAP1L (ENSMNEG00000029041) ENSMNEG00000035930 MPDZ (ENSMNEG00000040228) ENSMNEG00000035388 NFIB (ENSMNEG00000039065) ENSMNEG00000005084 ##22 ZDHHC21 (ENSMNEG00000033895) CER1 (ENSMNEG00000034249) FREM1 (ENSMNEG00000034773) TTC39B (ENSMNEG00000029192) SNAPC3 (ENSMNEG00000002686) ENSMNEG00000014509 PSIP1 (ENSMNEG00000030633) CCDC171 (ENSMNEG00000042615) ENSMNEG00000043142 BNC2 (ENSMNEG00000040884) CNTLN (ENSMNEG00000040917) SH3GL2 (ENSMNEG00000032599) ENSMNEG00000042732 ADAMTSL1 (ENSMNEG00000039848) ENSMNEG00000044073 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162767 ENSGT00390000005185 ENSGT00940000163110 ENSGT00390000008296.b.a.a.g ENSGT00390000017970 ENSGT00940000154499.h ENSGT00940000154930 ENSGT00390000003343 ENSGT00900000143826 ENSGT00940000153617.D ENSGT00940000155804 ENSGT00530000063790.b ENSGT00940000155586.B ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00530000063926.a ENSGT00940000156990 ENSGT00950000182917.a.a.b.a ENSGT00390000005708 ENSGT00940000154706 ENSGT00390000007924 ENSGT00410000028916 ENSGT00390000005844.a.b ENSGT00440000034932 ENSGT00940000160529 ENSGT00940000156243 ENSGT00390000007252.c ENSGT01020000230346.E.s.a ENSGT00950000183031.B.e.b ENSGT00390000008250 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162767 ENSGT00390000005185 ENSGT00940000163110 ENSGT00390000008296.b.a.a.g ENSGT00390000017970 ENSGT00940000154499.h ENSGT00940000154930 ENSGT00390000003343 ENSGT00900000143826 ENSGT00940000153617.D ENSGT00940000155804 ENSGT00530000063790.b ENSGT00940000155586.B ENSGT00950000182916.a.b.a.b ENSGT00940000158006 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00530000063926.a ENSGT00940000156990 ENSGT00950000182917.a.a.b.a ENSGT00390000005708 ENSGT01100000266120 ENSGT00940000154706 ENSGT00390000007924 ENSGT00410000028916 ENSGT00390000005844.a.b ENSGT00440000034932 ENSGT00940000160529 ENSGT00940000156243 ENSGT00390000007252.c ENSGT01020000230346.E.s.a ENSGT00950000183031.B.e.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 629 TPD52L3 (ENSCATG00000040180) UHRF2 (ENSCATG00000044392) GLDC (ENSCATG00000040028) ENSCATG00000041153 KDM4C (ENSCATG00000044738) DMAC1 (ENSCATG00000024312) PTPRD (ENSCATG00000011010) ENSCATG00000039554 ENSCATG00000040285 TYRP1 (ENSCATG00000044923) LURAP1L (ENSCATG00000042208) ENSCATG00000042089 MPDZ (ENSCATG00000030031) NFIB (ENSCATG00000035506) ENSCATG00000042024 ENSCATG00000019515 ##22 ZDHHC21 (ENSCATG00000041835) CER1 (ENSCATG00000012176) FREM1 (ENSCATG00000034977) TTC39B (ENSCATG00000032662) SNAPC3 (ENSCATG00000042572) ENSCATG00000018868 PSIP1 (ENSCATG00000037840) CCDC171 (ENSCATG00000039627) ENSCATG00000019771 BNC2 (ENSCATG00000039175) CNTLN (ENSCATG00000004826) SH3GL2 (ENSCATG00000004445) ADAMTSL1 (ENSCATG00000042482) ENSCATG00000030026 SAXO1 (ENSCATG00000034966) Drill MODERN SPECIES 1051 NFIB (ENSMLEG00000034055) ZDHHC21 (ENSMLEG00000035467) ENSMLEG00000027784 ##22 CER1 (ENSMLEG00000041007) FREM1 (ENSMLEG00000039451) TTC39B (ENSMLEG00000041037) SNAPC3 (ENSMLEG00000030316) ENSMLEG00000027945 PSIP1 (ENSMLEG00000001440) CCDC171 (ENSMLEG00000037661) ENSMLEG00000029849 BNC2 (ENSMLEG00000010467) Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.e ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 132 OTOA (ENSRBIG00000035609) IGSF6 (ENSRBIG00000035504) METTL9 (ENSRBIG00000042190) CDR2 (ENSRBIG00000027617) POLR3E (ENSRBIG00000039412) ENSRBIG00000004271 ##22 EEF2K (ENSRBIG00000013277) SDR42E2 (ENSRBIG00000043406) VWA3A (ENSRBIG00000028400) ENSRBIG00000028655 PDZD9 (ENSRBIG00000036884) UQCRC2 (ENSRBIG00000001831) ENSRBIG00000006416 ENSRBIG00000041300 CRYM (ENSRBIG00000036381) ANKS4B (ENSRBIG00000030278) ZP2 (ENSRBIG00000034237) LDAF1 (ENSRBIG00000022654) DNAH3 (ENSRBIG00000027886) LYRM1 (ENSRBIG00000028963) ENSRBIG00000020376 Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 407 ENSGT00940000159769.b ENSGT00940000155279.C ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.f.a ##22 ENSGT00390000001376.ab.a ENSGT00940000154949.b ENSGT00940000162642 ENSGT00940000162335 ENSGT00940000162895 ENSGT00940000154888.i.a.b ENSGT00940000159753 ENSGT00940000154589.b ENSGT00390000002219.f ENSGT00940000154340.A Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2724 ANK2 (ENSRROG00000031624) ENSRROG00000004108 ##22 ENSRROG00000043060 LARP7 (ENSRROG00000033414) ENSRROG00000028090 ENSRROG00000042878 NEUROG2 (ENSRROG00000022032) ENSRROG00000038734 ALPK1 (ENSRROG00000033717) TIFA (ENSRROG00000026480) ENSRROG00000045683 FAM241A (ENSRROG00000043155) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 128 ARSJ (ENSRBIG00000038987) ENSRBIG00000019645 ENSRBIG00000027821 ENSRBIG00000024640 ##22 ANK2 (ENSRBIG00000043201) ENSRBIG00000030546 GPN3 (ENSRBIG00000028648) FAM216A (ENSRBIG00000011638) ENSRBIG00000009640 RAD9B (ENSRBIG00000035632) PPTC7 (ENSRBIG00000035647) TCTN1 (ENSRBIG00000038598) HVCN1 (ENSRBIG00000031708) PPP1CC (ENSRBIG00000030893) CCDC63 (ENSRBIG00000015288) MYL2 (ENSRBIG00000033329) CUX2 (ENSRBIG00000037165) PHETA1 (ENSRBIG00000042583) SH2B3 (ENSRBIG00000039617) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b.f.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1132 ENSRBIG00000031565 UBE2E1 (ENSRBIG00000034290) NKIRAS1 (ENSRBIG00000027456) ENSRBIG00000033415 NR1D2 (ENSRBIG00000032612) THRB (ENSRBIG00000012599) ENSRBIG00000038731 ENSRBIG00000023439 ##22 RARB (ENSRBIG00000029659) TOP2B (ENSRBIG00000023441) NGLY1 (ENSRBIG00000008998) OXSM (ENSRBIG00000033144) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2005 TLR4 (ENSDNOG00000032753) ENSDNOG00000015223 TRIM32 (ENSDNOG00000030704) ENSDNOG00000048672 PAPPA (ENSDNOG00000019437) ENSDNOG00000041206 ##22 ENSDNOG00000033204 ENSDNOG00000013511 TNC (ENSDNOG00000017690) TNLG3A (ENSDNOG00000032295) TNLG1B (ENSDNOG00000033887) ENSDNOG00000048398 TMEM268 (ENSDNOG00000000867) ENSDNOG00000008083 WHRN (ENSDNOG00000041182) AKNA (ENSDNOG00000008149) ENSDNOG00000017842 ENSDNOG00000030782 ENSDNOG00000038534 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Tiger MODERN SPECIES 578 C14orf119 (ENSPTIG00000000313) CIROP (ENSPTIG00000013858) CEBPE (ENSPTIG00000015005) SLC7A8 (ENSPTIG00000015656) RNF212B (ENSPTIG00000018534) HOMEZ (ENSPTIG00000019338) BCL2L2 (ENSPTIG00000000034) PABPN1 (ENSPTIG00000001063) SLC22A17 (ENSPTIG00000005634) EFS (ENSPTIG00000009251) IL25 (ENSPTIG00000011136) CMTM5 (ENSPTIG00000012480) MYH6 (ENSPTIG00000015600) MYH7 (ENSPTIG00000004948) ENSPTIG00000009823 ENSPTIG00000000944 ##22 NGDN (ENSPTIG00000012462) ZFHX2 (ENSPTIG00000013814) THTPA (ENSPTIG00000014962) AP1G2 (ENSPTIG00000015262) DHRS2 (ENSPTIG00000019316) ENSPTIG00000005495 CARMIL3 (ENSPTIG00000010464) CPNE6 (ENSPTIG00000019986) NRL (ENSPTIG00000021828) PCK2 (ENSPTIG00000021982) DCAF11 (ENSPTIG00000000534) PSME1 (ENSPTIG00000010395) EMC9 (ENSPTIG00000013073) ENSPTIG00000014037 RNF31 (ENSPTIG00000017714) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 ENSGT00390000016167 #37 ENSGT00390000006029 Arabian camel MODERN SPECIES 23 DCC (ENSCDRG00005021692) #7 MEX3C (ENSCDRG00005008924) #8 SMAD4 (ENSCDRG00005009019) #9 ELAC1 (ENSCDRG00005009129) #10 ME2 (ENSCDRG00005009190) #11 MRO (ENSCDRG00005009438) #12 MAPK4 (ENSCDRG00005009618) #13 SKA1 (ENSCDRG00005009696) #14 CXXC1 (ENSCDRG00005009892) #15 MBD1 (ENSCDRG00005010072) #16 CFAP53 (ENSCDRG00005010332) #18 MYO5B (ENSCDRG00005010461) #19 ACAA2 (ENSCDRG00005010799) #20 ENSCDRG00005010930 LIPG (ENSCDRG00005010970) #21 RPL17 (ENSCDRG00005011453) ##22 C18orf32 (ENSCDRG00005011639) #23 DYM (ENSCDRG00005011719) #24 ENSCDRG00005012031 ENSCDRG00005012050 #25 CTIF (ENSCDRG00005012119) #26 ZBTB7C (ENSCDRG00005012395) #27 SMAD2 (ENSCDRG00005012465) #28 IER3IP1 (ENSCDRG00005012846) #30 HDHD2 (ENSCDRG00005012918) #31 KATNAL2 (ENSCDRG00005012992) #32 ENSCDRG00005013155 PIAS2 (ENSCDRG00005013189) #33 LOXHD1 (ENSCDRG00005013391) #35 ENSCDRG00005014972 #36 ENSCDRG00005015011 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b.gb #19 ENSGT01030000234626.D.k #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT00390000002428.a.g.b.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b.gb #19 ENSGT01030000234626.D.k #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT00390000002428.a.g.b.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 Human MODERN SPECIES 9 MBD2 (ENSG00000134046) ##16 DCC (ENSG00000187323) #7 MEX3C (ENSG00000176624) #8 SMAD4 (ENSG00000141646) #9 ELAC1 (ENSG00000141642) #10 ME2 (ENSG00000082212) #11 MRO (ENSG00000134042) #12 MAPK4 (ENSG00000141639) #13 SKA1 (ENSG00000154839) #14 CXXC1 (ENSG00000154832) #15 MBD1 (ENSG00000141644) #16 CFAP53 (ENSG00000172361) #18 MYO5B (ENSG00000167306) #19 ACAA2 (ENSG00000167315) #20 LIPG (ENSG00000101670) #21 RPL17 (ENSG00000265681) ##22 RPL17-C18orf32 (ENSG00000215472) C18orf32 (ENSG00000177576) #23 DYM (ENSG00000141627) #24 SMAD7 (ENSG00000101665) #25 CTIF (ENSG00000134030) #26 ZBTB7C (ENSG00000184828) #27 SMAD2 (ENSG00000175387) #28 SKOR2 (ENSG00000215474) #29 IER3IP1 (ENSG00000134049) #30 HDHD2 (ENSG00000167220) #31 ELOA2 (ENSG00000206181) KATNAL2 (ENSG00000167216) #32 PIAS2 (ENSG00000078043) #33 ST8SIA5 (ENSG00000101638) #34 LOXHD1 (ENSG00000167210) #35 Pan ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b.gb #19 ENSGT01030000234626.D.k #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00390000013264.c.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000265012 ENSGT00910000147179 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00910000148711 ENSGT00390000016823.q ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a Chimpanzee MODERN SPECIES 9 DCC (ENSPTRG00000010031) #7 MEX3C (ENSPTRG00000010029) #8 SMAD4 (ENSPTRG00000010028) #9 ELAC1 (ENSPTRG00000010027) #10 ME2 (ENSPTRG00000010026) #11 MRO (ENSPTRG00000010025) #12 MAPK4 (ENSPTRG00000010024) #13 SKA1 (ENSPTRG00000010023) #14 CXXC1 (ENSPTRG00000010022) #15 MBD1 (ENSPTRG00000010021) #16 CFAP53 (ENSPTRG00000010020) MYO5B (ENSPTRG00000010019) #19 ACAA2 (ENSPTRG00000010016) #20 LIPG (ENSPTRG00000010015) #21 ENSPTRG00000043609 RPL17 (ENSPTRG00000010012) ##22 C18H18orf32 (ENSPTRG00000033700) #23 DYM (ENSPTRG00000010011) #24 SMAD7 (ENSPTRG00000010010) #25 CTIF (ENSPTRG00000010009) #26 ENSPTRG00000045008 ENSPTRG00000050449 ZBTB7C (ENSPTRG00000010006) #27 SMAD2 (ENSPTRG00000043695) #28 ENSPTRG00000051707 ENSPTRG00000049336 ENSPTRG00000051288 SKOR2 (ENSPTRG00000033850) #29 IER3IP1 (ENSPTRG00000010002) #30 HDHD2 (ENSPTRG00000010001) #31 ELOA2 (ENSPTRG00000029302) Gorilla MODERN SPECIES 3 TPH2 (ENSGGOG00000012963) TBC1D15 (ENSGGOG00000013907) RAB21 (ENSGGOG00000015218) TMEM19 (ENSGGOG00000026275) THAP2 (ENSGGOG00000036967) ZFC3H1 (ENSGGOG00000025994) ENSGGOG00000002897 TSPAN8 (ENSGGOG00000016774) ENSGGOG00000022233 PTPRR (ENSGGOG00000014234) PTPRB (ENSGGOG00000006298) KCNMB4 (ENSGGOG00000012735) ENSGGOG00000023163 CNOT2 (ENSGGOG00000027402) MYRFL (ENSGGOG00000014863) RPL17 (ENSGGOG00000040412) ##22 ENSGGOG00000044075 ##22 RAB3IP (ENSGGOG00000008395) BEST3 (ENSGGOG00000009266) LRRC10 (ENSGGOG00000026155) CCT2 (ENSGGOG00000006241) FRS2 (ENSGGOG00000005279) ENSGGOG00000023917 YEATS4 (ENSGGOG00000027391) LYZ (ENSGGOG00000011117) CPSF6 (ENSGGOG00000008211) CPM (ENSGGOG00000001238) MDM2 (ENSGGOG00000012907) ENSGGOG00000041194 ENSGGOG00000028239 SLC35E3 (ENSGGOG00000012605) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT01020000230346.E.s.b.b ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.a #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000264016 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.a ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.b.a.b ENSGT01020000230346.E.s.b.b ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000264016 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.a ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 Drill MODERN SPECIES 1607 MEX3C (ENSMLEG00000040189) #8 SMAD4 (ENSMLEG00000027611) #9 ELAC1 (ENSMLEG00000042560) #10 ME2 (ENSMLEG00000041492) #11 MRO (ENSMLEG00000038700) #12 MAPK4 (ENSMLEG00000031017) #13 ENSMLEG00000039079 ENSMLEG00000026616 SKA1 (ENSMLEG00000030498) #14 CXXC1 (ENSMLEG00000032181) #15 MBD1 (ENSMLEG00000043121) #16 CFAP53 (ENSMLEG00000010151) #18 MYO5B (ENSMLEG00000030497) #19 ACAA2 (ENSMLEG00000035935) #20 LIPG (ENSMLEG00000028146) #21 RPL17 (ENSMLEG00000041470) ##22 C18orf32 (ENSMLEG00000042407) #23 DYM (ENSMLEG00000036447) #24 ENSMLEG00000038861 #25 CTIF (ENSMLEG00000041132) #26 ENSMLEG00000037738 ENSMLEG00000038973 ZBTB7C (ENSMLEG00000034896) #27 SMAD2 (ENSMLEG00000037596) #28 ENSMLEG00000040989 #29 Macaca ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT01020000230346.E.s.b.b ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000264016 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.a ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00940000155478.r ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.a.b.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 9 ME2 (ENSMFAG00000004061) #11 MRO (ENSMFAG00000050667) #12 ENSMFAG00000036294 #13 ENSMFAG00000011076 SKA1 (ENSMFAG00000000025) #14 ENSMFAG00000056437 CXXC1 (ENSMFAG00000040503) #15 MBD1 (ENSMFAG00000026335) #16 CFAP53 (ENSMFAG00000038983) #18 MYO5B (ENSMFAG00000007943) #19 ACAA2 (ENSMFAG00000040240) #20 ENSMFAG00000052720 LIPG (ENSMFAG00000038227) #21 ENSMFAG00000036042 ENSMFAG00000057888 RPL17 (ENSMFAG00000042744) ##22 C18orf32 (ENSMFAG00000030546) #23 DYM (ENSMFAG00000031987) #24 ENSMFAG00000065559 ENSMFAG00000064429 SMAD7 (ENSMFAG00000042998) #25 ENSMFAG00000061902 CTIF (ENSMFAG00000037903) #26 ENSMFAG00000052298 ENSMFAG00000058784 ZBTB7C (ENSMFAG00000031667) #27 SMAD2 (ENSMFAG00000045652) #28 ENSMFAG00000063952 #29 IER3IP1 (ENSMFAG00000060309) #30 HDHD2 (ENSMFAG00000012951) #31 KATNAL2 (ENSMFAG00000029779) #32 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654.c #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b #22 ENSGT00390000018741.ab #23 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741.`b.a #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654.c #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b #22 ENSGT00390000018741.ab #23 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741.`b.a #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Capuchin MODERN SPECIES 60 ENSCCAG00000015175 MEX3C (ENSCCAG00000034228) #8 SMAD4 (ENSCCAG00000033380) #9 ELAC1 (ENSCCAG00000035586) #10 ME2 (ENSCCAG00000033776) #11 MRO (ENSCCAG00000035093) #12 MAPK4 (ENSCCAG00000030009) #13 SKA1 (ENSCCAG00000011220) #14 CXXC1 (ENSCCAG00000013415) #15 MBD1 (ENSCCAG00000034600) #16 CFAP53 (ENSCCAG00000037510) #18 MYO5B (ENSCCAG00000027793) #19 ACAA2 (ENSCCAG00000026857) #20 ENSCCAG00000001466 LIPG (ENSCCAG00000023643) #21 RPL17 (ENSCCAG00000024026) ##22 ENSCCAG00000023815 #23 DYM (ENSCCAG00000032314) #24 ENSCCAG00000037376 SMAD7 (ENSCCAG00000033513) #25 CTIF (ENSCCAG00000022758) #26 ZBTB7C (ENSCCAG00000034868) #27 SMAD2 (ENSCCAG00000036243) #28 ENSCCAG00000037809 SKOR2 (ENSCCAG00000021025) #29 IER3IP1 (ENSCCAG00000036067) #30 HDHD2 (ENSCCAG00000022419) #31 KATNAL2 (ENSCCAG00000027056) #32 ENSCCAG00000033839 PIAS2 (ENSCCAG00000022843) #33 ST8SIA5 (ENSCCAG00000023326) #34 Tarsier MODERN SPECIES 1877 RPL17 (ENSTSYG00000007402) ##22 CUNH18orf32 (ENSTSYG00000033078) #23 DYM (ENSTSYG00000001929) #24 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #36 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 329 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1817 ENSDNOG00000043279 MEX3C (ENSDNOG00000006544) #8 SMAD4 (ENSDNOG00000005063) #9 ME2 (ENSDNOG00000012199) #11 MRO (ENSDNOG00000033380) #12 MAPK4 (ENSDNOG00000017046) #13 SKA1 (ENSDNOG00000046917) #14 ENSDNOG00000046915 CXXC1 (ENSDNOG00000032991) #15 MBD1 (ENSDNOG00000015998) #16 CFAP53 (ENSDNOG00000040321) #18 ENSDNOG00000043862 ENSDNOG00000030882 #19 ACAA2 (ENSDNOG00000011968) #20 LIPG (ENSDNOG00000011829) #21 RPL17 (ENSDNOG00000037762) ##22 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Armadillo MODERN SPECIES 592 ENSDNOG00000038327 ENSDNOG00000041746 ENSDNOG00000036860 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 10460 ENSTBEG00000016998 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Sema5a (ENSCGRG00001006570) ENSCGRG00001005665 ENSCGRG00001017092 Atpsckmt (ENSCGRG00001004624) Cct5 (ENSCGRG00001003625) Cmbl (ENSCGRG00001002936) Marchf6 (ENSCGRG00001001973) Ropn1l (ENSCGRG00001000818) Ankrd33b (ENSCGRG00001016919) Dap (ENSCGRG00001007075) ENSCGRG00001009079 Ctnnd2 (ENSCGRG00001012344) ENSCGRG00001009256 ENSCGRG00001008572 Dnah5 (ENSCGRG00001002726) ENSCGRG00001007408 ##22 Trio (ENSCGRG00001018514) Otulinl (ENSCGRG00001013918) Otulin (ENSCGRG00001009097) Ank (ENSCGRG00001007186) Fbxl7 (ENSCGRG00001002330) Marchf11 (ENSCGRG00001000995) Zfp622 (ENSCGRG00001024661) Retreg1 (ENSCGRG00001003409) Myo10 (ENSCGRG00001006922) Basp1 (ENSCGRG00001010849) Cdh18 (ENSCGRG00001012079) Cdh12 (ENSCGRG00001015709) Cdh10 (ENSCGRG00001001483) Cdh9 (ENSCGRG00001007635) ENSCGRG00001006251 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 Ppm1b (ENSCGRG00001000688) ENSCGRG00001016261 Abcg8 (ENSCGRG00001003896) Abcg5 (ENSCGRG00001022728) Dync2li1 (ENSCGRG00001023127) Plekhh2 (ENSCGRG00001007378) ENSCGRG00001017012 Thada (ENSCGRG00001019927) Zfp36l2 (ENSCGRG00001023281) Haao (ENSCGRG00001018533) Mta3 (ENSCGRG00001014465) Kcng3 (ENSCGRG00001022671) ENSCGRG00001013778 Eml4 (ENSCGRG00001000928) Pkdcc (ENSCGRG00001022104) ENSCGRG00001016352 ##22 ENSCGRG00001018825 ENSCGRG00001016334 Slc8a1 (ENSCGRG00001013311) Thumpd2 (ENSCGRG00001009939) Tmem178 (ENSCGRG00001017231) Map4k3 (ENSCGRG00001021583) Cdkl4 (ENSCGRG00001011508) Dsel (ENSCGRG00001009262) ENSCGRG00001001905 ENSCGRG00001024022 Cdh19 (ENSCGRG00001022811) Cdh7 (ENSCGRG00001022390) Serpinb8 (ENSCGRG00001020741) Serpinb10 (ENSCGRG00001018662) Serpinb2 (ENSCGRG00001014826) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 922 Fgf1 (ENSNGAG00000023588) ENSNGAG00000011614 Spry4 (ENSNGAG00000023023) Ndfip1 (ENSNGAG00000023008) ENSNGAG00000022512 Rnf14 (ENSNGAG00000011674) Pcdh12 (ENSNGAG00000010710) Dele1 (ENSNGAG00000018387) Pcdh1 (ENSNGAG00000015865) ENSNGAG00000014600 ##22 Arap3 (ENSNGAG00000023362) Fchsd1 (ENSNGAG00000019709) ENSNGAG00000018010 Hdac3 (ENSNGAG00000012179) ENSNGAG00000004201 Pcdhgc3 (ENSNGAG00000022970) Pcdhga11 (ENSNGAG00000011680) Pcdhgc4 (ENSNGAG00000007247) Pcdhga7 (ENSNGAG00000001146) Pcdhga5 (ENSNGAG00000022746) Pcdhgb2 (ENSNGAG00000022502) Pcdhga4 (ENSNGAG00000009895) Pcdhga3 (ENSNGAG00000022037) Pcdhga2 (ENSNGAG00000008996) Pcdhga1 (ENSNGAG00000010014) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 117 NR1D2 (ENSOGAG00000010721) RPL15 (ENSOGAG00000013056) NKIRAS1 (ENSOGAG00000007528) UBE2E1 (ENSOGAG00000007527) ENSOGAG00000029099 UBE2E2 (ENSOGAG00000008828) ENSOGAG00000025686 ENSOGAG00000031261 ZNF385D (ENSOGAG00000015958) ENSOGAG00000029509 SGO1 (ENSOGAG00000016786) KAT2B (ENSOGAG00000016781) PP2D1 (ENSOGAG00000007917) RAB5A (ENSOGAG00000003948) EFHB (ENSOGAG00000003944) ENSOGAG00000027211 ##22 KCNH8 (ENSOGAG00000000804) SATB1 (ENSOGAG00000015441) ENSOGAG00000025343 ENSOGAG00000030351 TBC1D5 (ENSOGAG00000016352) PLCL2 (ENSOGAG00000030914) ENSOGAG00000006983 RFTN1 (ENSOGAG00000014420) OXNAD1 (ENSOGAG00000014419) DPH3 (ENSOGAG00000034296) GALNT15 (ENSOGAG00000014413) ANKRD28 (ENSOGAG00000013981) BTD (ENSOGAG00000013977) HACL1 (ENSOGAG00000013969) COLQ (ENSOGAG00000013967) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 846 ZNF326 (ENSPCOG00000023736) BARHL2 (ENSPCOG00000021096) ZNF644 (ENSPCOG00000021784) ENSPCOG00000026252 CDC7 (ENSPCOG00000022992) TGFBR3 (ENSPCOG00000020128) BRDT (ENSPCOG00000009857) EPHX4 (ENSPCOG00000015391) ENSPCOG00000025445 ENSPCOG00000020190 BTBD8 (ENSPCOG00000012403) C1orf146 (ENSPCOG00000014518) GLMN (ENSPCOG00000026708) RPAP2 (ENSPCOG00000021860) GFI1 (ENSPCOG00000020540) ENSPCOG00000023529 ##22 EVI5 (ENSPCOG00000013584) ENSPCOG00000012924 DIPK1A (ENSPCOG00000022059) MTF2 (ENSPCOG00000021106) TMED5 (ENSPCOG00000024672) CCDC18 (ENSPCOG00000021464) DR1 (ENSPCOG00000025924) FNBP1L (ENSPCOG00000027233) BCAR3 (ENSPCOG00000022810) DNTTIP2 (ENSPCOG00000027395) GCLM (ENSPCOG00000000314) ABCA4 (ENSPCOG00000027304) ARHGAP29 (ENSPCOG00000013337) ABCD3 (ENSPCOG00000028862) F3 (ENSPCOG00000024393) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 50 MAGI1 (ENSPCOG00000016669) ADAMTS9 (ENSPCOG00000020855) PRICKLE2 (ENSPCOG00000014318) PSMD6 (ENSPCOG00000017855) ATXN7 (ENSPCOG00000021138) ENSPCOG00000022000 C3orf49 (ENSPCOG00000016558) ENSPCOG00000023618 SNTN (ENSPCOG00000016354) SYNPR (ENSPCOG00000022257) CADPS (ENSPCOG00000027683) FEZF2 (ENSPCOG00000020418) C3orf14 (ENSPCOG00000020405) ENSPCOG00000027667 PTPRG (ENSPCOG00000011073) ENSPCOG00000015146 ##22 ENSPCOG00000026096 CFAP20DC (ENSPCOG00000026642) FAM3D (ENSPCOG00000016154) FAM107A (ENSPCOG00000016417) ACOX2 (ENSPCOG00000027383) KCTD6 (ENSPCOG00000016167) PDHB (ENSPCOG00000018714) PXK (ENSPCOG00000023402) RPP14 (ENSPCOG00000027150) ABHD6 (ENSPCOG00000023970) DNASE1L3 (ENSPCOG00000014644) FLNB (ENSPCOG00000028790) SLMAP (ENSPCOG00000002153) DENND6A (ENSPCOG00000016384) ARF4 (ENSPCOG00000001896) Mouse lemur MODERN SPECIES 30 PPM1G (ENSMICG00000015895) NRBP1 (ENSMICG00000015904) KRTCAP3 (ENSMICG00000015922) IFT172 (ENSMICG00000033177) FNDC4 (ENSMICG00000047524) GCKR (ENSMICG00000015947) C2orf16 (ENSMICG00000037560) ZNF512 (ENSMICG00000014941) ENSMICG00000001920 GPN1 (ENSMICG00000042626) SUPT7L (ENSMICG00000014961) SLC4A1AP (ENSMICG00000014967) MRPL33 (ENSMICG00000043272) ENSMICG00000043937 RBKS (ENSMICG00000015009) ENSMICG00000028615 ##22 BABAM2 (ENSMICG00000015024) FOSL2 (ENSMICG00000028779) PLB1 (ENSMICG00000001426) PPP1CB (ENSMICG00000001446) SPDYA (ENSMICG00000047853) TRMT61B (ENSMICG00000014265) WDR43 (ENSMICG00000014276) TOGARAM2 (ENSMICG00000001254) PCARE (ENSMICG00000001260) CLIP4 (ENSMICG00000000629) ALK (ENSMICG00000000637) YPEL5 (ENSMICG00000038178) LBH (ENSMICG00000000643) ENSMICG00000047228 LCLAT1 (ENSMICG00000000644) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 476 ENSTSYG00000027387 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 485 ENSTSYG00000027231 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6047 PLS1 (ENSTSYG00000013901) ATR (ENSTSYG00000002718) ENSTSYG00000014485 XRN1 (ENSTSYG00000002705) ENSTSYG00000033995 ##22 GK5 (ENSTSYG00000001954) TFDP2 (ENSTSYG00000009267) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 19 ENSPTRG00000047957 CEP162 (ENSPTRG00000018388) MRAP2 (ENSPTRG00000018387) CYB5R4 (ENSPTRG00000018385) RIPPLY2 (ENSPTRG00000029533) SNAP91 (ENSPTRG00000051078) PRSS35 (ENSPTRG00000018382) ME1 (ENSPTRG00000018381) ##11 RWDD2A (ENSPTRG00000049322) PGM3 (ENSPTRG00000018379) DOP1A (ENSPTRG00000018378) UBE3D (ENSPTRG00000018377) TPBG (ENSPTRG00000018376) IBTK (ENSPTRG00000018375) TENT5A (ENSPTRG00000047338) ENSPTRG00000046353 ##22 BCKDHB (ENSPTRG00000018372) ENSPTRG00000048236 ENSPTRG00000050076 ENSPTRG00000044375 TTK (ENSPTRG00000018371) ENSPTRG00000050523 ELOVL4 (ENSPTRG00000043548) SH3BGRL2 (ENSPTRG00000050701) LCA5 (ENSPTRG00000018367) ENSPTRG00000046338 HMGN3 (ENSPTRG00000018366) ENSPTRG00000044309 PHIP (ENSPTRG00000018365) IRAK1BP1 (ENSPTRG00000018363) MEI4 (ENSPTRG00000044078) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 173 ENSGT00940000163220.b.h ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Macaca DUPLICATION Macaca ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000163220.b.h ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a.g ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a.g ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 P2RY10 (ENSMFAG00000065797) ENSMFAG00000058091 GPR174 (ENSMFAG00000048513) ITM2A (ENSMFAG00000037997) ENSMFAG00000050209 TBX22 (ENSMFAG00000000575) ENSMFAG00000058505 TENT5D (ENSMFAG00000059694) BRWD3 (ENSMFAG00000043437) ENSMFAG00000046303 ENSMFAG00000065005 HMGN5 (ENSMFAG00000043155) ENSMFAG00000064363 SH3BGRL (ENSMFAG00000031027) ENSMFAG00000057440 ENSMFAG00000003130 ##22 ENSMFAG00000064912 ENSMFAG00000052377 ENSMFAG00000057041 ENSMFAG00000035175 ENSMFAG00000053410 POU3F4 (ENSMFAG00000027128) ENSMFAG00000048140 CYLC1 (ENSMFAG00000044830) RPS6KA6 (ENSMFAG00000045848) HDX (ENSMFAG00000003281) ENSMFAG00000056508 ENSMFAG00000048579 ENSMFAG00000063039 APOOL (ENSMFAG00000042547) SATL1 (ENSMFAG00000042054) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 85 ENSMNEG00000034394 LPAR4 (ENSMNEG00000026886) ENSMNEG00000039449 P2RY10 (ENSMNEG00000001678) ENSMNEG00000004426 GPR174 (ENSMNEG00000015097) ITM2A (ENSMNEG00000028333) TBX22 (ENSMNEG00000002289) BRWD3 (ENSMNEG00000028960) ENSMNEG00000003904 ENSMNEG00000038133 HMGN5 (ENSMNEG00000029641) ENSMNEG00000036403 SH3BGRL (ENSMNEG00000032748) ENSMNEG00000039695 ENSMNEG00000040680 ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a.h ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 202 FAM83G (ENSMNEG00000041522) SLC5A10 (ENSMNEG00000042590) GRAP (ENSMNEG00000043944) ENSMNEG00000029305 ##22 EPN2 (ENSMNEG00000030616) ENSMNEG00000043551 MAPK7 (ENSMNEG00000041108) MFAP4 (ENSMNEG00000041809) RNF112 (ENSMNEG00000000099) SLC47A1 (ENSMNEG00000031913) ALDH3A2 (ENSMNEG00000029746) SLC47A2 (ENSMNEG00000040271) ALDH3A1 (ENSMNEG00000028466) ULK2 (ENSMNEG00000030857) AKAP10 (ENSMNEG00000026972) ENSMNEG00000032387 ENSMNEG00000043995 ENSMNEG00000029084 SPECC1 (ENSMNEG00000030780) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000163220.b.h ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 313 ENSGT00940000163220.b.h ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Drill MODERN SPECIES 1284 ENSMLEG00000037772 ENSMLEG00000037289 PRICKLE1 (ENSMLEG00000040875) PPHLN1 (ENSMLEG00000019889) ZCRB1 (ENSMLEG00000042951) ENSMLEG00000030453 YAF2 (ENSMLEG00000035641) GXYLT1 (ENSMLEG00000040017) PDZRN4 (ENSMLEG00000001274) ENSMLEG00000030728 ENSMLEG00000037850 ##22 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 210 BRWD3 (ENSCATG00000038615) ENSCATG00000029713 ENSCATG00000029855 HMGN5 (ENSCATG00000018617) ENSCATG00000038731 SH3BGRL (ENSCATG00000031766) ENSCATG00000013910 ENSCATG00000036649 ENSCATG00000039091 ##22 POU3F4 (ENSCATG00000019383) CYLC1 (ENSCATG00000036867) RPS6KA6 (ENSCATG00000016428) HDX (ENSCATG00000038854) Sooty mangabey MODERN SPECIES 617 HNF1B (ENSCATG00000045086) DDX52 (ENSCATG00000041437) SYNRG (ENSCATG00000031190) DUSP14 (ENSCATG00000043837) TADA2A (ENSCATG00000030086) C17orf78 (ENSCATG00000037239) ENSCATG00000021273 ##22 ACACA (ENSCATG00000036167) AATF (ENSCATG00000043611) LHX1 (ENSCATG00000035824) ENSCATG00000044337 MRM1 (ENSCATG00000041516) DHRS11 (ENSCATG00000001680) GGNBP2 (ENSCATG00000030797) PIGW (ENSCATG00000007447) MYO19 (ENSCATG00000042003) ZNHIT3 (ENSCATG00000035385) CA4 (ENSCATG00000034309) ENSCATG00000040911 ENSCATG00000030236 CHCT1 (ENSCATG00000041845) APPBP2 (ENSCATG00000030340) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 23 ENSCCAG00000030474 FAM136A (ENSCCAG00000023520) TGFA (ENSCCAG00000032276) ENSCCAG00000018529 ADD2 (ENSCCAG00000021255) FIGLA (ENSCCAG00000021451) CLEC4F (ENSCCAG00000026145) CD207 (ENSCCAG00000029648) VAX2 (ENSCCAG00000036372) ATP6V1B1 (ENSCCAG00000028478) ANKRD53 (ENSCCAG00000022187) TEX261 (ENSCCAG00000026931) NAGK (ENSCCAG00000033331) MCEE (ENSCCAG00000022477) ENSCCAG00000037954 ENSCCAG00000032514 ##22 PAIP2B (ENSCCAG00000000020) ZNF638 (ENSCCAG00000028170) DYSF (ENSCCAG00000021995) CYP26B1 (ENSCCAG00000032938) EXOC6B (ENSCCAG00000030488) SPR (ENSCCAG00000028340) EMX1 (ENSCCAG00000035193) SFXN5 (ENSCCAG00000036686) RAB11FIP5 (ENSCCAG00000025378) NOTO (ENSCCAG00000029209) SMYD5 (ENSCCAG00000032948) PRADC1 (ENSCCAG00000028676) ENSCCAG00000027148 FBXO41 (ENSCCAG00000033266) EGR4 (ENSCCAG00000037704) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 886 CDCP1 (ENSANAG00000034819) CLEC3B (ENSANAG00000027596) EXOSC7 (ENSANAG00000028607) ZDHHC3 (ENSANAG00000021495) TMEM42 (ENSANAG00000034383) ENSANAG00000036102 KIF15 (ENSANAG00000037629) ENSANAG00000028996 ZNF501 (ENSANAG00000018943) ZNF502 (ENSANAG00000021135) ENSANAG00000034886 ZNF35 (ENSANAG00000019550) ZNF197 (ENSANAG00000029713) ZNF660 (ENSANAG00000017064) ZKSCAN7 (ENSANAG00000025395) ENSANAG00000019389 ##22 ZNF445 (ENSANAG00000031872) ENSANAG00000022841 TCAIM (ENSANAG00000030490) TOPAZ1 (ENSANAG00000034745) ABHD5 (ENSANAG00000028422) ANO10 (ENSANAG00000020139) SNRK (ENSANAG00000035742) POMGNT2 (ENSANAG00000018903) GASK1A (ENSANAG00000020539) ENSANAG00000033547 ENSANAG00000022066 RNF168 (ENSANAG00000031722) Mas night monkey MODERN SPECIES 1027 PI15 (ENSANAG00000023987) CRISPLD1 (ENSANAG00000035675) HNF4G (ENSANAG00000024888) ENSANAG00000022591 ZFHX4 (ENSANAG00000034150) PEX2 (ENSANAG00000031161) ENSANAG00000025403 PKIA (ENSANAG00000035679) ZC2HC1A (ENSANAG00000026492) IL7 (ENSANAG00000018679) ENSANAG00000028133 STMN2 (ENSANAG00000019695) HEY1 (ENSANAG00000006781) TPD52 (ENSANAG00000020626) ENSANAG00000023108 ENSANAG00000008692 ##22 ZNF704 (ENSANAG00000020327) PAG1 (ENSANAG00000035690) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000006096.a.a ENSGT00940000155863.q ENSGT00820000127150 ENSGT00940000155444 ENSGT00390000018717.b.a.b ENSGT00940000153724.A ENSGT00940000159013 ENSGT00390000013693 ENSGT00940000153859.a ENSGT00940000156336 ENSGT00950000185829 ENSGT00940000158856 ENSGT00940000157498 ENSGT00950000185047.a.a ENSGT00940000157300 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000154334.k ENSGT00940000169805 ENSGT00940000161722 ENSGT00940000158367 ENSGT01030000234540.E ENSGT00940000155177.b ENSGT00510000049596 ENSGT00940000154840.b ENSGT00390000013931.a.a.a.a.b ENSGT01050000244827.B ENSGT00940000160364 ENSGT00940000162602 ENSGT00390000019377.b ENSGT00390000012496.a ENSGT00390000007725.A.b Dingo MODERN SPECIES 223 ENSCAFG00020020479 ZNF697 (ENSCAFG00020020535) ENSCAFG00020020537 HAO2 (ENSCAFG00020020545) WARS2 (ENSCAFG00020020570) TBX15 (ENSCAFG00020020577) ENSCAFG00020020597 WDR3 (ENSCAFG00020020610) ENSCAFG00020020626 GDAP2 (ENSCAFG00020020644) ENSCAFG00020020651 TENT5C (ENSCAFG00020020652) MAN1A2 (ENSCAFG00020020664) ENSCAFG00020020761 VTCN1 (ENSCAFG00020020764) ENSCAFG00020020767 ##22 TRIM45 (ENSCAFG00020020769) ENSCAFG00020020772 CD101 (ENSCAFG00020020782) PTGFRN (ENSCAFG00020020784) ENSCAFG00020020788 CD2 (ENSCAFG00020020793) IGSF3 (ENSCAFG00020020808) ENSCAFG00020020844 ATP1A1 (ENSCAFG00020020858) MAB21L3 (ENSCAFG00020020870) SLC22A15 (ENSCAFG00020020878) NHLH2 (ENSCAFG00020020915) CASQ2 (ENSCAFG00020020924) VANGL1 (ENSCAFG00020020963) NGF (ENSCAFG00020020970) Dog MODERN SPECIES 8 HMGCS2 (ENSCAFG00845006979) ENSCAFG00845006590 ENSCAFG00845006411 ZNF697 (ENSCAFG00845006387) HSD3B2 (ENSCAFG00845006351) HAO2 (ENSCAFG00845006278) WARS2 (ENSCAFG00845006189) TBX15 (ENSCAFG00845006079) SPAG17 (ENSCAFG00845005984) WDR3 (ENSCAFG00845005942) GDAP2 (ENSCAFG00845005877) TENT5C (ENSCAFG00845005783) MAN1A2 (ENSCAFG00845029509) ENSCAFG00845029463 VTCN1 (ENSCAFG00845029358) ENSCAFG00845029291 ##22 TRIM45 (ENSCAFG00845029248) ENSCAFG00845029143 CD101 (ENSCAFG00845029071) PTGFRN (ENSCAFG00845029002) CD2 (ENSCAFG00845028984) IGSF3 (ENSCAFG00845028936) ENSCAFG00845028795 ATP1A1 (ENSCAFG00845028456) ENSCAFG00845028320 MAB21L3 (ENSCAFG00845028265) SLC22A15 (ENSCAFG00845028198) ENSCAFG00845028114 CASQ2 (ENSCAFG00845028062) VANGL1 (ENSCAFG00845027910) NGF (ENSCAFG00845027859) Red fox MODERN SPECIES 28 TERB2 (ENSVVUG00000011641) TRIM69 (ENSVVUG00000011621) ENSVVUG00000011616 B2M (ENSVVUG00000011612) PATL2 (ENSVVUG00000011576) SPG11 (ENSVVUG00000010933) EIF3J (ENSVVUG00000010868) ENSVVUG00000010861 CTDSPL2 (ENSVVUG00000010847) ENSVVUG00000010843 CASC4 (ENSVVUG00000010830) ENSVVUG00000010823 ENSVVUG00000010815 ENSVVUG00000010802 FRMD5 (ENSVVUG00000010774) ENSVVUG00000010768 ##22 WDR76 (ENSVVUG00000010752) MFAP1 (ENSVVUG00000010651) ENSVVUG00000010633 SERF2 (ENSVVUG00000010617) SERINC4 (ENSVVUG00000010565) ELL3 (ENSVVUG00000010538) PDIA3 (ENSVVUG00000010527) CATSPER2 (ENSVVUG00000010512) STRC (ENSVVUG00000010410) ENSVVUG00000009966 ENSVVUG00000009944 PPIP5K1 (ENSVVUG00000009875) MAP1A (ENSVVUG00000009860) TP53BP1 (ENSVVUG00000009785) TUBGCP4 (ENSVVUG00000009758) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES ENSRFEG00010001013 ENSRFEG00010001022 NBDY (ENSRFEG00010001038) ENSRFEG00010001051 UBQLN2 (ENSRFEG00010001060) KLF8 (ENSRFEG00010001110) RRAGB (ENSRFEG00010001176) ENSRFEG00010001225 MAGEH1 (ENSRFEG00010001238) USP51 (ENSRFEG00010001250) ALAS2 (ENSRFEG00010001268) APEX2 (ENSRFEG00010001302) PFKFB1 (ENSRFEG00010001373) MAGED2 (ENSRFEG00010001490) ITIH6 (ENSRFEG00010001541) ENSRFEG00010001587 ##22 GNL3L (ENSRFEG00010001603) FGD1 (ENSRFEG00010001665) TSR2 (ENSRFEG00010001704) ENSRFEG00010001718 WNK3 (ENSRFEG00010001743) ENSRFEG00010001852 ENSRFEG00010001859 FAM120C (ENSRFEG00010001877) ENSRFEG00010001924 PHF8 (ENSRFEG00010001984) HUWE1 (ENSRFEG00010002183) HSD17B10 (ENSRFEG00010002239) RIBC1 (ENSRFEG00010002277) SMC1A (ENSRFEG00010002323) IQSEC2 (ENSRFEG00010002435) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 123 ACAA2 (ENSCWAG00000018572) #20 ENSCWAG00000018602 LIPG (ENSCWAG00000018628) #21 ENSCWAG00000018703 ##22 C18orf32 (ENSCWAG00000007861) #23 DYM (ENSCWAG00000007926) #24 ENSCWAG00000008076 ENSCWAG00000008125 SMAD7 (ENSCWAG00000008146) #25 CTIF (ENSCWAG00000008248) #26 ZBTB7C (ENSCWAG00000008442) #27 ENSCWAG00000008490 #28 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Blue whale MODERN SPECIES 15 AGTR1 (ENSBMSG00010000298) ZIC1 (ENSBMSG00010000272) ZIC4 (ENSBMSG00010000237) PLSCR5 (ENSBMSG00010000196) ENSBMSG00010000106 ENSBMSG00010000055 ENSBMSG00010000039 ENSBMSG00010003203 PLSCR4 (ENSBMSG00010003190) PLOD2 (ENSBMSG00010003166) ENSBMSG00010003145 ENSBMSG00010003139 ENSBMSG00010003130 DIPK2A (ENSBMSG00010003121) SLC9A9 (ENSBMSG00010003106) ENSBMSG00010003096 ##22 CHST2 (ENSBMSG00010003091) U2SURP (ENSBMSG00010003077) PAQR9 (ENSBMSG00010003062) PCOLCE2 (ENSBMSG00010003043) TRPC1 (ENSBMSG00010003018) PLS1 (ENSBMSG00010002998) ATR (ENSBMSG00010002907) XRN1 (ENSBMSG00010002838) GK5 (ENSBMSG00010002815) TFDP2 (ENSBMSG00010002750) ENSBMSG00010002724 ENSBMSG00010002711 GRK7 (ENSBMSG00010002693) RNF7 (ENSBMSG00010002685) RASA2 (ENSBMSG00010002664) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 25 AP3M2 (ENSCHYG00000026452) PLAT (ENSCHYG00000026485) IKBKB (ENSCHYG00000026569) ENSCHYG00000026675 ENSCHYG00000026702 DKK4 (ENSCHYG00000026756) ENSCHYG00000026765 SLC20A2 (ENSCHYG00000026772) SMIM19 (ENSCHYG00000026780) CHRNB3 (ENSCHYG00000026790) CHRNA6 (ENSCHYG00000026797) ENSCHYG00000026818 HOOK3 (ENSCHYG00000026837) FNTA (ENSCHYG00000026872) ENSCHYG00000026881 ENSCHYG00000026883 ##22 HGSNAT (ENSCHYG00000026891) INTS10 (ENSCHYG00000026898) CSGALNACT1 (ENSCHYG00000026922) SH2D4A (ENSCHYG00000026929) PSD3 (ENSCHYG00000026947) ENSCHYG00000027005 ENSCHYG00000027006 LRRC3B (ENSCHYG00000027009) OXSM (ENSCHYG00000008677) NGLY1 (ENSCHYG00000008725) TOP2B (ENSCHYG00000009238) RARB (ENSCHYG00000011336) THRB (ENSCHYG00000011439) NR1D2 (ENSCHYG00000011566) ENSCHYG00000011588 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000000687 ENSGT00940000156433.B ENSGT00390000001511 ENSGT00940000167380 ENSGT00940000156267 ENSGT00940000166205.a ENSGT00940000166205.b ENSGT00940000158305 ENSGT00940000159336 ENSGT00550000074855 ENSGT00390000005270 ENSGT00940000155328 ENSGT00940000154910.b.b ENSGT00390000006367.d ENSGT00390000018603 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00390000007975.a ENSGT00940000157523 ENSGT00950000182839.A.d ENSGT00950000182956.b.b.a.a.c.a.l ENSGT00950000183194.a.b ENSGT00940000162628 ENSGT00940000158780 ENSGT00390000000221.A ENSGT00940000157223 ENSGT00940000155456 ENSGT00940000162521 ENSGT00940000154675 ENSGT00390000005097 ENSGT00530000063722.b ENSGT00530000063822.a.b Goat MODERN SPECIES 6 ENSCHIG00000021622 ENSCHIG00000017738 ENSCHIG00000016702 CRSP-2 (ENSCHIG00000026890) CRSP-1 (ENSCHIG00000016334) ENSCHIG00000021176 CYP2R1 (ENSCHIG00000015003) PDE3B (ENSCHIG00000009677) PSMA1 (ENSCHIG00000019700) COPB1 (ENSCHIG00000016260) ENSCHIG00000012272 RRAS2 (ENSCHIG00000021550) SPON1 (ENSCHIG00000024597) FAR1 (ENSCHIG00000018043) PTH (ENSCHIG00000007602) ENSCHIG00000012359 ##22 BTBD10 (ENSCHIG00000026399) BMAL1 (ENSCHIG00000008573) RASSF10 (ENSCHIG00000006553) ENSCHIG00000013740 TEAD1 (ENSCHIG00000015300) PARVA (ENSCHIG00000024855) ENSCHIG00000011918 MICAL2 (ENSCHIG00000024501) DKK3 (ENSCHIG00000011378) USP47 (ENSCHIG00000009969) GALNT18 (ENSCHIG00000012207) ZBED5 (ENSCHIG00000011923) EIF4G2 (ENSCHIG00000017894) CTR9 (ENSCHIG00000011919) ENSCHIG00000024170 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 ZNF300 (ENSOARG00020014457) GPX3 (ENSOARG00020014488) TNIP1 (ENSOARG00020014574) ANXA6 (ENSOARG00020014885) CCDC69 (ENSOARG00020015595) SLC36A2 (ENSOARG00020015753) SLC36A1 (ENSOARG00020016094) FAT2 (ENSOARG00020016340) SPARC (ENSOARG00020017166) ATOX1 (ENSOARG00020017245) ENSOARG00020017316 GLRA1 (ENSOARG00020017407) ENSOARG00020017487 NMUR2 (ENSOARG00020017502) ENSOARG00020017549 ENSOARG00020017570 ##22 GRIA1 (ENSOARG00020017612) FAM114A2 (ENSOARG00020018007) MFAP3 (ENSOARG00020018373) GALNT10 (ENSOARG00020018437) SAP30L (ENSOARG00020019252) HAND1 (ENSOARG00020019349) LARP1 (ENSOARG00020019445) ENSOARG00020019710 CNOT8 (ENSOARG00020019840) GEMIN5 (ENSOARG00020020038) MRPL22 (ENSOARG00020020694) SGCD (ENSOARG00020020956) ENSOARG00020021010 ENSOARG00020021113 HAVCR2 (ENSOARG00020021141) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 6 ENSOARG00020007716 ENSOARG00020007733 ENSOARG00020007755 ENSOARG00020007780 ##22 ENSOARG00020007797 CALCB (ENSOARG00020007826) ENSOARG00020007898 CYP2R1 (ENSOARG00020008229) PDE3B (ENSOARG00020008382) PSMA1 (ENSOARG00020009114) COPB1 (ENSOARG00020009319) RRAS2 (ENSOARG00020009434) SPON1 (ENSOARG00020009467) FAR1 (ENSOARG00020009547) PTH (ENSOARG00020009626) ENSOARG00020009652 ##22 BTBD10 (ENSOARG00020009686) arntl (ENSOARG00020009923) RASSF10 (ENSOARG00020010999) TEAD1 (ENSOARG00020011068) PARVA (ENSOARG00020011875) MICAL2 (ENSOARG00020011978) DKK3 (ENSOARG00020012153) USP47 (ENSOARG00020012457) GALNT18 (ENSOARG00020013870) ZBED5 (ENSOARG00020014031) EIF4G2 (ENSOARG00020014062) CTR9 (ENSOARG00020014257) IRAG1 (ENSOARG00020014539) ENSOARG00020016111 RNF141 (ENSOARG00020016151) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1620 GPM6B (ENSDNOG00000045860) ENSDNOG00000042584 ENSDNOG00000034139 ENSDNOG00000017066 RAB9A (ENSDNOG00000025749) ENSDNOG00000042375 TCEANC (ENSDNOG00000017064) EGFL6 (ENSDNOG00000016651) ENSDNOG00000010358 TLR8 (ENSDNOG00000036980) TLR7 (ENSDNOG00000034029) PRPS2 (ENSDNOG00000039288) FRMPD4 (ENSDNOG00000040542) ENSDNOG00000032796 ##22 MSL3 (ENSDNOG00000041161) ENSDNOG00000036223 AMELX (ENSDNOG00000031324) ARHGAP6 (ENSDNOG00000003142) HCCS (ENSDNOG00000003002) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 758 Klhl4 (ENSMAUG00000014371) ENSMAUG00000016494 ##22 Dach2 (ENSMAUG00000010782) Chm (ENSMAUG00000017065) ENSMAUG00000016526 Pof1b (ENSMAUG00000012853) Zfp711 (ENSMAUG00000012277) 2010106E10Rik (ENSMAUG00000012995) Satl1 (ENSMAUG00000016111) Apool (ENSMAUG00000014048) 4933403O08Rik (ENSMAUG00000009376) ENSMAUG00000016626 Tex16 (ENSMAUG00000006556) ENSMAUG00000018096 Hdx (ENSMAUG00000000922) Rps6ka6 (ENSMAUG00000001357) ENSMAUG00000007023 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 103 GPR151 (ENSSBOG00000018415) TCERG1 (ENSSBOG00000023707) POU4F3 (ENSSBOG00000030801) RBM27 (ENSSBOG00000034172) LARS1 (ENSSBOG00000026661) ENSSBOG00000027145 ENSSBOG00000035124 TGFBI (ENSSBOG00000033447) SMAD5 (ENSSBOG00000025913) SMIM32 (ENSSBOG00000017136) TRPC7 (ENSSBOG00000008290) SPOCK1 (ENSSBOG00000020569) ENSSBOG00000034420 KLHL3 (ENSSBOG00000020692) ENSSBOG00000034299 ENSSBOG00000019777 ##22 ENSSBOG00000027108 MYOT (ENSSBOG00000020860) PKD2L2 (ENSSBOG00000019985) FAM13B (ENSSBOG00000027231) WNT8A (ENSSBOG00000020138) NME5 (ENSSBOG00000028611) BRD8 (ENSSBOG00000030855) KIF20A (ENSSBOG00000022753) CDC23 (ENSSBOG00000001815) GFRA3 (ENSSBOG00000018545) CDC25C (ENSSBOG00000013303) FAM53C (ENSSBOG00000035207) KDM3B (ENSSBOG00000024332) REEP2 (ENSSBOG00000034757) EGR1 (ENSSBOG00000033520) Capuchin MODERN SPECIES 26 ENSCCAG00000030830 TMEM60 (ENSCCAG00000019468) PHTF2 (ENSCCAG00000021004) MAGI2 (ENSCCAG00000020634) GNAI1 (ENSCCAG00000031786) GNAT3 (ENSCCAG00000029068) CD36 (ENSCCAG00000032826) SEMA3C (ENSCCAG00000023014) HGF (ENSCCAG00000035279) CACNA2D1 (ENSCCAG00000031261) ENSCCAG00000035531 PCLO (ENSCCAG00000035496) ENSCCAG00000036742 SEMA3E (ENSCCAG00000028569) SEMA3A (ENSCCAG00000032683) ENSCCAG00000020468 ##22 ENSCCAG00000004235 SEMA3D (ENSCCAG00000031171) ENSCCAG00000032551 GRM3 (ENSCCAG00000037641) ELAPOR2 (ENSCCAG00000029424) DMTF1 (ENSCCAG00000030321) TMEM243 (ENSCCAG00000024863) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01100000263563.c.b ENSGT00390000015965 ENSGT00390000008128.c.a.b.a ENSGT00390000000214.a.b ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.b ENSGT00940000157221 ENSGT01030000234945 ENSGT00910000147204 ENSGT00910000147191 ENSGT00860000135660 ENSGT00940000164947 ENSGT00390000014092.k.a ENSGT00940000160197 ENSGT00940000153404.b ENSGT00940000170408 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000153648.b ENSGT00390000013778 ENSGT00940000159709 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000157949 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00910000147773 ENSGT00900000143434 ENSGT00940000157456 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000162884 ENSGT00940000162201 ENSGT00390000010054.b ENSGT00390000017929 ENSGT00940000155358 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01100000263563.c.b ENSGT00390000015965 ENSGT00390000008128.c.a.b.a ENSGT00390000000214.a.b ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.b ENSGT00940000157221 ENSGT01030000234945 ENSGT00910000147204 ENSGT00910000147191 ENSGT00860000135660 ENSGT00940000164947 ENSGT00390000014092.k.a ENSGT00940000160197 ENSGT00940000153404.b ENSGT00940000170408 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000153648.b ENSGT00390000013778 ENSGT00940000159709 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000157949 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00910000147773 ENSGT00900000143434 ENSGT00940000157456 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000162884 ENSGT00940000162201 ENSGT00390000010054.b ENSGT00390000017929 ENSGT00940000155358 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000164947 ENSGT00390000014092.k.a ENSGT00940000160197 ENSGT00940000153404.b ENSGT00940000170408 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000153648.b ENSGT00390000013778 ENSGT00940000159709 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000157949 ENSGT00390000009693.m.b ENSGT00910000147773 ENSGT00900000143434 ENSGT00940000157456 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000162884 ENSGT00390000010054.b ENSGT00390000017929 ENSGT00940000155358 ENSGT00590000083165 Sooty mangabey MODERN SPECIES 639 ENSCATG00000032648 ENSCATG00000005168 ARAP2 (ENSCATG00000039514) DTHD1 (ENSCATG00000034075) ENSCATG00000040284 ##22 NWD2 (ENSCATG00000017135) C4orf19 (ENSCATG00000032745) RELL1 (ENSCATG00000043220) PGM2 (ENSCATG00000031967) PTTG2 (ENSCATG00000040651) ENSCATG00000037748 TBC1D1 (ENSCATG00000008268) ENSCATG00000006552 KLF3 (ENSCATG00000013375) TLR10 (ENSCATG00000020190) TLR1 (ENSCATG00000018736) FAM114A1 (ENSCATG00000045008) TMEM156 (ENSCATG00000034175) KLHL5 (ENSCATG00000031256) WDR19 (ENSCATG00000038619) Macaca ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000014814.a.b.a.b.b ENSGT00390000005197.a ENSGT01100000263563.c.b ENSGT00390000015965 ENSGT00390000008128.c.a.b.a ENSGT00390000000214.a.b ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.b ENSGT01030000234945 ENSGT00940000157221 ENSGT00910000147204 ENSGT00910000147191 ENSGT00940000164947 ENSGT00390000014092.k.a ENSGT00940000160197 ENSGT00940000153404.b ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000153648.b ENSGT00390000013778 ENSGT00940000159709 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000157949 ENSGT00940000157456.a ENSGT00940000163662 ENSGT00940000162884 ENSGT00940000162201 ENSGT00390000010054.b ENSGT00390000017929 ENSGT00940000155358 ENSGT00590000083165 ENSGT00730000111066 ENSGT00940000157489 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 141 RBPJ (ENSMNEG00000037915) CCKAR (ENSMNEG00000038424) TBC1D19 (ENSMNEG00000031445) ENSMNEG00000032694 STIM2 (ENSMNEG00000032563) ENSMNEG00000029234 ENSMNEG00000038617 ENSMNEG00000034187 PCDH7 (ENSMNEG00000044686) ENSMNEG00000008266 ENSMNEG00000010411 ENSMNEG00000034911 ENSMNEG00000019076 ARAP2 (ENSMNEG00000033019) DTHD1 (ENSMNEG00000045184) ENSMNEG00000043393 ##22 NWD2 (ENSMNEG00000038103) C4orf19 (ENSMNEG00000032287) RELL1 (ENSMNEG00000030854) PGM2 (ENSMNEG00000014173) PTTG2 (ENSMNEG00000042141) TBC1D1 (ENSMNEG00000039653) TLR10 (ENSMNEG00000015099) TLR1 (ENSMNEG00000004407) FAM114A1 (ENSMNEG00000044049) TMEM156 (ENSMNEG00000027960) KLHL5 (ENSMNEG00000044719) WDR19 (ENSMNEG00000043290) RFC1 (ENSMNEG00000032597) KLB (ENSMNEG00000039728) ENSMNEG00000005467 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b.o #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT01020000230346.E.s.b.b ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT01100000264016 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.a ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000002428.a.g.b.a.a.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 155 DCC (ENSMNEG00000044541) #7 MEX3C (ENSMNEG00000037450) #8 SMAD4 (ENSMNEG00000030827) #9 ELAC1 (ENSMNEG00000034310) #10 ME2 (ENSMNEG00000034912) #11 MRO (ENSMNEG00000033026) #12 ENSMNEG00000000269 MAPK4 (ENSMNEG00000038618) #13 SKA1 (ENSMNEG00000029687) #14 CXXC1 (ENSMNEG00000028715) #15 MBD1 (ENSMNEG00000038822) #16 CFAP53 (ENSMNEG00000015915) #18 MYO5B (ENSMNEG00000033529) #19 ACAA2 (ENSMNEG00000037789) #20 LIPG (ENSMNEG00000043610) #21 ENSMNEG00000035945 ##22 C18orf32 (ENSMNEG00000037414) #23 DYM (ENSMNEG00000030545) #24 SMAD7 (ENSMNEG00000039694) #25 CTIF (ENSMNEG00000039395) #26 ENSMNEG00000045230 ENSMNEG00000034460 ZBTB7C (ENSMNEG00000031886) #27 SMAD2 (ENSMNEG00000037330) #28 ENSMNEG00000038031 #29 IER3IP1 (ENSMNEG00000030543) #30 ENSMNEG00000038574 #31 KATNAL2 (ENSMNEG00000029817) #32 ENSMNEG00000040070 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 583 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D.m #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b.b.b #22 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 923 MYO5B (ENSRBIG00000038069) #19 ENSRBIG00000039813 #20 LIPG (ENSRBIG00000030348) #21 ENSRBIG00000041788 ##22 C18orf32 (ENSRBIG00000031626) #23 DYM (ENSRBIG00000033553) #24 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1676 PACC1 (ENSRROG00000033809) PPP2R5A (ENSRROG00000025443) DTL (ENSRROG00000029896) INTS7 (ENSRROG00000039254) LPGAT1 (ENSRROG00000036627) ENSRROG00000023261 ##22 NEK2 (ENSRROG00000030544) SLC30A1 (ENSRROG00000045714) RD3 (ENSRROG00000041409) ENSRROG00000033555 ENSRROG00000000056 TRAF5 (ENSRROG00000035255) RCOR3 (ENSRROG00000040449) KCNH1 (ENSRROG00000012202) ENSRROG00000043551 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Goat MODERN SPECIES 22 PTCH2 (ENSCHIG00000017723) EIF2B3 (ENSCHIG00000015663) HECTD3 (ENSCHIG00000025462) UROD (ENSCHIG00000026792) ZSWIM5 (ENSCHIG00000026563) ENSCHIG00000023611 HPDL (ENSCHIG00000010279) MUTYH (ENSCHIG00000011167) TOE1 (ENSCHIG00000026678) TESK2 (ENSCHIG00000024948) ENSCHIG00000006507 ENSCHIG00000009639 ENSCHIG00000023686 MMACHC (ENSCHIG00000026675) ENSCHIG00000009892 ENSCHIG00000016357 ##22 ENSCHIG00000006672 TMSB4X (ENSCHIG00000012574) AKR1A1 (ENSCHIG00000005900) NASP (ENSCHIG00000014381) ENSCHIG00000016081 ENSCHIG00000022480 ENSCHIG00000003469 TMEM69 (ENSCHIG00000022471) IPP (ENSCHIG00000023256) MAST2 (ENSCHIG00000022319) PIK3R3 (ENSCHIG00000015779) P3R3URF (ENSCHIG00000014270) TSPAN1 (ENSCHIG00000018316) POMGNT1 (ENSCHIG00000014882) LURAP1 (ENSCHIG00000013931) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 1116 ENSBMUG00000012415 ##22 ENSBMUG00000012331 CMTM8 (ENSBMUG00000012300) CMTM7 (ENSBMUG00000012264) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000006705 ENSGT00940000160383 ENSGT00940000155759 ENSGT00490000043417 ENSGT00390000001170 ENSGT00940000153470.a.a.a.a ENSGT00390000011085.sb.a.a.a ENSGT00940000164579.f ENSGT00530000063607.b ENSGT00390000002215 ENSGT01100000263518.A.a.b ENSGT00390000007776.d ENSGT00390000005949 ENSGT00940000155065.mb ENSGT00940000154657.D ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00680000100037 ENSGT01010000229817 ENSGT00390000011294 ENSGT00580000081600.c.b ENSGT00940000160811 ENSGT00950000183074.C ENSGT00940000156913.b ENSGT00390000008042.A.b ENSGT00390000015352 ENSGT00940000154846.b.x ENSGT00940000159158 ENSGT00940000154817.b.b.b ENSGT00390000011515 ENSGT00940000153568.B ENSGT00940000157629.e.b Narwhal MODERN SPECIES 302 RAB3GAP1 (ENSMMNG00015006395) CCNT2 (ENSMMNG00015006480) ACMSD (ENSMMNG00015006514) TMEM163 (ENSMMNG00015006547) MGAT5 (ENSMMNG00015006577) ENSMMNG00015006617 ENSMMNG00015006627 ENSMMNG00015006640 NCKAP5 (ENSMMNG00015006713) ENSMMNG00015006851 LYPD1 (ENSMMNG00015006865) GPR39 (ENSMMNG00015006884) SLC35F5 (ENSMMNG00015006913) ACTR3 (ENSMMNG00015006959) DPP10 (ENSMMNG00015007053) ENSMMNG00015007279 ##22 DDX18 (ENSMMNG00015007294) ENSMMNG00015007310 CCDC93 (ENSMMNG00015007324) INSIG2 (ENSMMNG00015007370) EN1 (ENSMMNG00015007385) MARCO (ENSMMNG00015007408) C1QL2 (ENSMMNG00015007435) STEAP3 (ENSMMNG00015007462) C2orf76 (ENSMMNG00015007492) DBI (ENSMMNG00015007543) TFCP2L1 (ENSMMNG00015007621) CLASP1 (ENSMMNG00015007757) NIFK (ENSMMNG00015007818) TSN (ENSMMNG00015007849) TIPRL (ENSMMNG00015007877) Beluga whale DUPLICATION Beluga whale MODERN SPECIES 18 U2SURP (ENSDLEG00000003020) PAQR9 (ENSDLEG00000003008) PCOLCE2 (ENSDLEG00000002981) TRPC1 (ENSDLEG00000002901) PLS1 (ENSDLEG00000002877) ENSDLEG00000002868 ATR (ENSDLEG00000002842) XRN1 (ENSDLEG00000002314) GK5 (ENSDLEG00000002054) ENSDLEG00000002016 TFDP2 (ENSDLEG00000001700) ENSDLEG00000001620 ATP1B3 (ENSDLEG00000001587) GRK7 (ENSDLEG00000001565) RNF7 (ENSDLEG00000001551) ENSDLEG00000001540 ##22 RASA2 (ENSDLEG00000001473) ZBTB38 (ENSDLEG00000001456) PXYLP1 (ENSDLEG00000001445) SPSB4 (ENSDLEG00000001437) SLC25A36 (ENSDLEG00000001393) TRIM42 (ENSDLEG00000001364) CLSTN2 (ENSDLEG00000001185) ENSDLEG00000001151 NMNAT3 (ENSDLEG00000001136) RBP1 (ENSDLEG00000001122) RBP2 (ENSDLEG00000001101) COPB2 (ENSDLEG00000001067) MRPS22 (ENSDLEG00000001044) ENSDLEG00000001031 ENSDLEG00000001020 Beluga whale MODERN SPECIES 5 ENSDLEG00000016891 ENSDLEG00000016879 ENSDLEG00000016860 ENSDLEG00000016849 ENSDLEG00000016835 NCKAP5 (ENSDLEG00000016766) ENSDLEG00000016753 ENSDLEG00000016742 GPR39 (ENSDLEG00000016739) ENSDLEG00000016727 SLC35F5 (ENSDLEG00000016710) ACTR3 (ENSDLEG00000016689) DPP10 (ENSDLEG00000016504) ENSDLEG00000016473 ##22 DDX18 (ENSDLEG00000016447) CCDC93 (ENSDLEG00000016397) INSIG2 (ENSDLEG00000016370) EN1 (ENSDLEG00000016364) MARCO (ENSDLEG00000016344) C1QL2 (ENSDLEG00000016331) STEAP3 (ENSDLEG00000016318) C2orf76 (ENSDLEG00000016309) DBI (ENSDLEG00000016300) ENSDLEG00000016288 TFCP2L1 (ENSDLEG00000016257) CLASP1 (ENSDLEG00000015964) NIFK (ENSDLEG00000015915) TSN (ENSDLEG00000015902) ENSDLEG00000015893 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000015984 ENSGT00940000158117 ENSGT00940000159194 ENSGT00390000002661.b ENSGT00390000011922.f ENSGT01020000230401.a.a.a.i.b.g ENSGT00530000063880.b ENSGT01100000263484.B.b.b ENSGT00390000007776 ENSGT00390000011748.j.b ENSGT00940000157594 ENSGT00390000004040 ENSGT00520000055634.a ENSGT00940000155935.h ENSGT00940000159740 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155549.b ENSGT00950000183087.B ENSGT00940000157893 ENSGT00910000144211.n.b.c ENSGT00730000111042 ENSGT00940000153117.A ENSGT00940000154655.a ENSGT00940000160706 ENSGT00390000010887.a ENSGT00940000155321 ENSGT00910000148652 ENSGT00390000008161.a.b ENSGT00940000155167.b.b ENSGT00940000159374 ENSGT00940000159514 Dingo MODERN SPECIES 88 ANGPT1 (ENSCAFG00020003297) RSPO2 (ENSCAFG00020003341) EIF3E (ENSCAFG00020003350) ENSCAFG00020003360 ENSCAFG00020003374 TMEM74 (ENSCAFG00020003393) TRHR (ENSCAFG00020003402) NUDCD1 (ENSCAFG00020003417) ENY2 (ENSCAFG00020003420) PKHD1L1 (ENSCAFG00020003456) EBAG9 (ENSCAFG00020003724) SYBU (ENSCAFG00020003730) ENSCAFG00020003744 KCNV1 (ENSCAFG00020003748) ENSCAFG00020003768 ENSCAFG00020003786 ##22 CSMD3 (ENSCAFG00020003854) ENSCAFG00020004032 ENSCAFG00020004048 ENSCAFG00020004080 TRPS1 (ENSCAFG00020004107) ENSCAFG00020004144 EIF3H (ENSCAFG00020004169) UTP23 (ENSCAFG00020004174) RAD21 (ENSCAFG00020004189) SLC30A8 (ENSCAFG00020004204) MED30 (ENSCAFG00020004225) EXT1 (ENSCAFG00020004235) ENSCAFG00020004283 SAMD12 (ENSCAFG00020004321) TNFRSF11B (ENSCAFG00020004337) Dog MODERN SPECIES 4 RSPO2 (ENSCAFG00845010981) EIF3E (ENSCAFG00845011027) EMC2 (ENSCAFG00845011107) ENSCAFG00845011139 TMEM74 (ENSCAFG00845011167) TRHR (ENSCAFG00845011196) NUDCD1 (ENSCAFG00845011288) ENY2 (ENSCAFG00845011444) PKHD1L1 (ENSCAFG00845011869) EBAG9 (ENSCAFG00845013428) SYBU (ENSCAFG00845013598) ENSCAFG00845013714 KCNV1 (ENSCAFG00845013731) ENSCAFG00845013759 ENSCAFG00845013779 ENSCAFG00845013806 ##22 CSMD3 (ENSCAFG00845013880) ENSCAFG00845014042 TRPS1 (ENSCAFG00845014104) ENSCAFG00845014166 ENSCAFG00845014182 ENSCAFG00845014190 EIF3H (ENSCAFG00845014234) UTP23 (ENSCAFG00845014281) RAD21 (ENSCAFG00845014331) ENSCAFG00845014379 SLC30A8 (ENSCAFG00845014466) MED30 (ENSCAFG00845014503) EXT1 (ENSCAFG00845014539) SAMD12 (ENSCAFG00845014607) TNFRSF11B (ENSCAFG00845005623) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.a.b ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES LAS1L (ENSRFEG00010000497) ENSRFEG00010000464 ZC3H12B (ENSRFEG00010000441) ZC4H2 (ENSRFEG00010000420) ENSRFEG00010000382 ENSRFEG00010000366 MTMR8 (ENSRFEG00010000342) AMER1 (ENSRFEG00010000332) ENSRFEG00010000325 ARHGEF9 (ENSRFEG00010000258) ENSRFEG00010000214 SPIN4 (ENSRFEG00010000198) ENSRFEG00010000193 FGF16 (ENSRFEG00010000182) ATRX (ENSRFEG00010000118) ENSRFEG00010000095 ##22 ENSRFEG00010005487 MAGT1 (ENSRFEG00010005458) ENSRFEG00010005435 ATP7A (ENSRFEG00010005348) ENSRFEG00010005309 ENSRFEG00010005300 ENSRFEG00010005289 TAF9B (ENSRFEG00010005277) ENSRFEG00010005274 ENSRFEG00010005262 ENSRFEG00010005245 CYSLTR1 (ENSRFEG00010005241) ENSRFEG00010005233 RTL3 (ENSRFEG00010005225) LPAR4 (ENSRFEG00010005218) Microbat MODERN SPECIES 1365 KIF2B (ENSMLUG00000025002) ENSMLUG00000029253 ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 3 TBC1D15 (ENSGGOG00000013907) RAB21 (ENSGGOG00000015218) TMEM19 (ENSGGOG00000026275) THAP2 (ENSGGOG00000036967) ZFC3H1 (ENSGGOG00000025994) ENSGGOG00000002897 TSPAN8 (ENSGGOG00000016774) ENSGGOG00000022233 PTPRR (ENSGGOG00000014234) PTPRB (ENSGGOG00000006298) KCNMB4 (ENSGGOG00000012735) ENSGGOG00000023163 CNOT2 (ENSGGOG00000027402) MYRFL (ENSGGOG00000014863) RPL17 (ENSGGOG00000040412) ##22 ENSGGOG00000044075 ##22 RAB3IP (ENSGGOG00000008395) BEST3 (ENSGGOG00000009266) LRRC10 (ENSGGOG00000026155) CCT2 (ENSGGOG00000006241) FRS2 (ENSGGOG00000005279) ENSGGOG00000023917 YEATS4 (ENSGGOG00000027391) LYZ (ENSGGOG00000011117) CPSF6 (ENSGGOG00000008211) CPM (ENSGGOG00000001238) MDM2 (ENSGGOG00000012907) ENSGGOG00000041194 ENSGGOG00000028239 SLC35E3 (ENSGGOG00000012605) NUP107 (ENSGGOG00000012583) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 190 MEX3C (ENSCATG00000031557) #8 SMAD4 (ENSCATG00000041132) #9 ELAC1 (ENSCATG00000036385) #10 ME2 (ENSCATG00000034688) #11 MRO (ENSCATG00000041212) #12 MAPK4 (ENSCATG00000016401) #13 ENSCATG00000017689 ENSCATG00000033940 SKA1 (ENSCATG00000039979) #14 CXXC1 (ENSCATG00000035708) #15 MBD1 (ENSCATG00000029959) #16 CFAP53 (ENSCATG00000026928) #18 MYO5B (ENSCATG00000038137) #19 ACAA2 (ENSCATG00000031450) #20 LIPG (ENSCATG00000033603) #21 ENSCATG00000043658 ##22 ENSCATG00000037257 #23 ENSCATG00000018328 DYM (ENSCATG00000031272) #24 ENSCATG00000037245 SMAD7 (ENSCATG00000037681) #25 CTIF (ENSCATG00000038134) #26 ENSCATG00000045052 ENSCATG00000005038 ZBTB7C (ENSCATG00000044413) #27 SMAD2 (ENSCATG00000003842) #28 SKOR2 (ENSCATG00000035815) #29 IER3IP1 (ENSCATG00000035811) #30 HDHD2 (ENSCATG00000035277) #31 KATNAL2 (ENSCATG00000037094) #32 ELOA2 (ENSCATG00000032113) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Marmoset MODERN SPECIES 4 SMAD4 (ENSCJAG00000001910) #9 ELAC1 (ENSCJAG00000001925) #10 MRO (ENSCJAG00000041277) #12 ME2 (ENSCJAG00000001929) #11 MAPK4 (ENSCJAG00000001974) #13 ENSCJAG00000086150 SKA1 (ENSCJAG00000084830) #14 ENSCJAG00000005044 #15 MBD1 (ENSCJAG00000004959) #16 CFAP53 (ENSCJAG00000004928) #18 MYO5B (ENSCJAG00000004857) #19 ACAA2 (ENSCJAG00000004820) #20 ENSCJAG00000073947 ENSCJAG00000078071 LIPG (ENSCJAG00000004803) #21 ENSCJAG00000004779 ##22 ENSCJAG00000076436 #23 DYM (ENSCJAG00000004754) #24 ENSCJAG00000060917 ENSCJAG00000067581 SMAD7 (ENSCJAG00000039611) #25 CTIF (ENSCJAG00000004729) #26 ZBTB7C (ENSCJAG00000004704) #27 ENSCJAG00000081448 SMAD2 (ENSCJAG00000004630) #28 ENSCJAG00000071063 SKOR2 (ENSCJAG00000048253) #29 IER3IP1 (ENSCJAG00000072341) #30 HDHD2 (ENSCJAG00000004578) #31 ENSCJAG00000060346 KATNAL2 (ENSCJAG00000008107) #32 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000018741.m #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000153201.j.n ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 Tiger MODERN SPECIES 143 DCC (ENSPTIG00000013104) #7 ENSPTIG00000021315 MEX3C (ENSPTIG00000004865) #8 SMAD4 (ENSPTIG00000005616) #9 ELAC1 (ENSPTIG00000006619) #10 ME2 (ENSPTIG00000007762) #11 MRO (ENSPTIG00000013632) #12 ENSPTIG00000015504 #13 SKA1 (ENSPTIG00000015731) #14 CXXC1 (ENSPTIG00000017258) #15 MBD1 (ENSPTIG00000021231) #16 CFAP53 (ENSPTIG00000018895) #18 MYO5B (ENSPTIG00000019987) #19 ACAA2 (ENSPTIG00000021827) #20 LIPG (ENSPTIG00000000449) #21 ENSPTIG00000007691 ##22 C18orf32 (ENSPTIG00000009698) #23 DYM (ENSPTIG00000011072) #24 ENSPTIG00000012715 ENSPTIG00000013182 #25 CTIF (ENSPTIG00000013761) #26 ENSPTIG00000014786 SMAD2 (ENSPTIG00000015931) #28 ENSPTIG00000019038 #29 IER3IP1 (ENSPTIG00000019219) #30 HDHD2 (ENSPTIG00000019534) #31 KATNAL2 (ENSPTIG00000019828) #32 PIAS2 (ENSPTIG00000020076) #33 ST8SIA5 (ENSPTIG00000021493) #34 LOXHD1 (ENSPTIG00000003929) #35 ENSPTIG00000018660 #36 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01050000244995 #18 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00390000018741.m #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000153201.j.n ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000156997 #36 leopard MODERN SPECIES 43 ENSPPRG00000015809 ENSPPRG00000013111 MEX3C (ENSPPRG00000012151) #8 SMAD4 (ENSPPRG00000010397) #9 ELAC1 (ENSPPRG00000009439) #10 ME2 (ENSPPRG00000008913) #11 MRO (ENSPPRG00000004466) #12 MAPK4 (ENSPPRG00000003118) #13 SKA1 (ENSPPRG00000002324) #14 CXXC1 (ENSPPRG00000001170) #15 MBD1 (ENSPPRG00000021387) #16 CFAP53 (ENSPPRG00000012971) #18 MYO5B (ENSPPRG00000012444) #19 ACAA2 (ENSPPRG00000009885) #20 LIPG (ENSPPRG00000009382) #21 ENSPPRG00000006166 ##22 ENSPPRG00000004942 #23 DYM (ENSPPRG00000004872) #24 ENSPPRG00000003458 SMAD7 (ENSPPRG00000002686) #25 CTIF (ENSPPRG00000002265) #26 ZBTB7C (ENSPPRG00000001432) #27 SMAD2 (ENSPPRG00000000616) #28 ENSPPRG00000000048 #29 IER3IP1 (ENSPPRG00000022716) #30 HDHD2 (ENSPPRG00000022964) #31 KATNAL2 (ENSPPRG00000023079) #32 PIAS2 (ENSPPRG00000023399) #33 ST8SIA5 (ENSPPRG00000018954) #34 LOXHD1 (ENSPPRG00000016773) #35 RNF165 (ENSPPRG00000006559) #36 lion MODERN SPECIES 12 ENSPLOG00000012308 ENSPLOG00000012345 MEX3C (ENSPLOG00000012379) #8 SMAD4 (ENSPLOG00000012428) #9 ELAC1 (ENSPLOG00000012525) #10 ME2 (ENSPLOG00000012643) #11 MRO (ENSPLOG00000012819) #12 ENSPLOG00000012947 #13 SKA1 (ENSPLOG00000013016) #14 CXXC1 (ENSPLOG00000013121) #15 MBD1 (ENSPLOG00000013232) #16 CFAP53 (ENSPLOG00000013386) #18 MYO5B (ENSPLOG00000013501) #19 ACAA2 (ENSPLOG00000013846) #20 LIPG (ENSPLOG00000014024) #21 ENSPLOG00000014279 ##22 ENSPLOG00000014438 #23 DYM (ENSPLOG00000014488) #24 ENSPLOG00000014599 SMAD7 (ENSPLOG00000014649) #25 CTIF (ENSPLOG00000014765) #26 ZBTB7C (ENSPLOG00000014833) #27 SMAD2 (ENSPLOG00000014910) #28 SKOR2 (ENSPLOG00000015171) #29 IER3IP1 (ENSPLOG00000015259) #30 HDHD2 (ENSPLOG00000015310) #31 KATNAL2 (ENSPLOG00000015369) #32 PIAS2 (ENSPLOG00000015647) #33 ST8SIA5 (ENSPLOG00000015755) #34 LOXHD1 (ENSPLOG00000016139) #35 RNF165 (ENSPLOG00000017833) #36 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.a.b ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1276 Rpl17 (ENSAMEG00000031030) ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #36 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000161642 #12 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00390000011654 #14 ENSGT00730000111044 #15 ENSGT00950000183005.a.a #16 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #33 ENSGT01030000234535.C #34 ENSGT00390000018830 #35 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #36 Elephant MODERN SPECIES 375 DCC (ENSLAFG00000001980) #7 MEX3C (ENSLAFG00000027818) #8 SMAD4 (ENSLAFG00000012595) #9 ELAC1 (ENSLAFG00000001538) #10 ME2 (ENSLAFG00000001536) #11 MRO (ENSLAFG00000013029) #12 MAPK4 (ENSLAFG00000013022) #13 ENSLAFG00000026060 SKA1 (ENSLAFG00000005238) #14 CXXC1 (ENSLAFG00000030706) #15 MBD1 (ENSLAFG00000031328) #16 ENSLAFG00000015611 MYO5B (ENSLAFG00000015591) #19 ACAA2 (ENSLAFG00000022796) #20 LIPG (ENSLAFG00000003595) #21 RPL17 (ENSLAFG00000005569) ##22 C18orf32 (ENSLAFG00000021351) #23 DYM (ENSLAFG00000017747) #24 SMAD7 (ENSLAFG00000008013) #25 CTIF (ENSLAFG00000016335) #26 ZBTB7C (ENSLAFG00000003436) #27 SMAD2 (ENSLAFG00000000143) #28 SKOR2 (ENSLAFG00000020778) #29 HDHD2 (ENSLAFG00000004419) #31 KATNAL2 (ENSLAFG00000004417) #32 PIAS2 (ENSLAFG00000018135) #33 ST8SIA5 (ENSLAFG00000010716) #34 LOXHD1 (ENSLAFG00000008500) #35 ENSLAFG00000030824 ENSLAFG00000008497 #36 C18orf25 (ENSLAFG00000013703) #37 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Tenrec MODERN SPECIES 18818 ENSETEG00000017056 ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3937 NDST3 (ENSDNOG00000005700) PRSS12 (ENSDNOG00000019225) METTL14 (ENSDNOG00000002149) SEC24D (ENSDNOG00000008271) SYNPO2 (ENSDNOG00000041225) MYOZ2 (ENSDNOG00000048160) USP53 (ENSDNOG00000003596) FABP2 (ENSDNOG00000036022) PDE5A (ENSDNOG00000010114) ENSDNOG00000031112 ENSDNOG00000039792 MAD2L1 (ENSDNOG00000013456) ENSDNOG00000045818 ##22 PRDM5 (ENSDNOG00000002009) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES LRRC53 (ENSPTRG00000000862) ERICH3 (ENSPTRG00000000863) CRYZ (ENSPTRG00000000865) TYW3 (ENSPTRG00000000867) LHX8 (ENSPTRG00000000868) SLC44A5 (ENSPTRG00000000869) ACADM (ENSPTRG00000000871) ENSPTRG00000040641 RABGGTB (ENSPTRG00000032439) MSH4 (ENSPTRG00000000873) ASB17 (ENSPTRG00000000874) ST6GALNAC3 (ENSPTRG00000000875) ENSPTRG00000041210 ST6GALNAC5 (ENSPTRG00000000877) PIGK (ENSPTRG00000000878) ENSPTRG00000050410 ##22 AK5 (ENSPTRG00000000880) ZZZ3 (ENSPTRG00000000881) USP33 (ENSPTRG00000000882) MIGA1 (ENSPTRG00000000884) ENSPTRG00000045301 NEXN (ENSPTRG00000000886) FUBP1 (ENSPTRG00000000888) DNAJB4 (ENSPTRG00000000889) GIPC2 (ENSPTRG00000051570) PTGFR (ENSPTRG00000000891) IFI44L (ENSPTRG00000000892) IFI44 (ENSPTRG00000000893) ENSPTRG00000052741 ADGRL4 (ENSPTRG00000000894) ENSPTRG00000039978 Gibbon MODERN SPECIES 18 RFX6 (ENSNLEG00000013258) VGLL2 (ENSNLEG00000013293) ROS1 (ENSNLEG00000013311) DCBLD1 (ENSNLEG00000013410) GOPC (ENSNLEG00000013426) NUS1 (ENSNLEG00000029327) SLC35F1 (ENSNLEG00000013471) ENSNLEG00000028147 CEP85L (ENSNLEG00000013486) PLN (ENSNLEG00000029331) ASF1A (ENSNLEG00000013535) ENSNLEG00000013543 ENSNLEG00000036236 FAM184A (ENSNLEG00000013554) MAN1A1 (ENSNLEG00000013642) ENSNLEG00000029620 ##22 TBC1D32 (ENSNLEG00000013663) ENSNLEG00000029174 HSF2 (ENSNLEG00000013721) SERINC1 (ENSNLEG00000013791) PKIB (ENSNLEG00000013817) ENSNLEG00000013832 SMPDL3A (ENSNLEG00000013840) ENSNLEG00000019149 ENSNLEG00000013862 CLVS2 (ENSNLEG00000013863) TRDN (ENSNLEG00000013875) NKAIN2 (ENSNLEG00000035566) RNF217 (ENSNLEG00000013922) TPD52L1 (ENSNLEG00000013932) HDDC2 (ENSNLEG00000013960) Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a ##22 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000163264.A.a ENSGT00940000161868 ENSGT00940000161976 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.b ENSGT00950000182943.jb ENSGT00390000013353 ENSGT00530000063691.a ENSGT00940000162631 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00390000007919 ENSGT00950000183132.B ENSGT00940000161907 ENSGT01030000234543.E ENSGT00940000157396 ENSGT00940000161918 ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000156844.b ENSGT00940000155669 ENSGT00390000005163.ib.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000154173.B ENSGT00940000155039.f ENSGT00390000011729 ENSGT00390000003178 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00910000145352 ENSGT00940000161868 ENSGT00940000161976 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.b ENSGT00950000182943.jb ENSGT00390000013353 ENSGT00530000063691.a ENSGT00940000162631 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00390000007919 ENSGT00950000183132.B ENSGT00940000161907 ENSGT01030000234543.E ENSGT00940000157396 ENSGT00940000161918 ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000156844.b ENSGT00940000155669 ENSGT00390000005163.ib.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000154173.B ENSGT00940000155039.f ENSGT00390000011729 ENSGT00390000003178 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00910000145352 ENSGT00940000161868 ENSGT00940000161976 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.b ENSGT00950000182943.jb ENSGT00390000013353 ENSGT00530000063691.a ENSGT00940000162631 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00390000007919 ENSGT00950000183132.B ENSGT00940000161907 ENSGT00940000157396 ENSGT00940000161918 ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000156844.b ENSGT00940000155669 ENSGT00390000005163.ib.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000155039.f ENSGT00390000003178 ENSGT00940000161693 ENSGT00940000157865 ENSGT00390000007551 Sooty mangabey MODERN SPECIES 166 PAX8 (ENSCATG00000036605) ENSCATG00000036465 PSD4 (ENSCATG00000043819) IL1RN (ENSCATG00000040482) IL1F10 (ENSCATG00000014084) IL36RN (ENSCATG00000023446) IL36B (ENSCATG00000040042) IL36A (ENSCATG00000023144) IL36G (ENSCATG00000025800) IL37 (ENSCATG00000035192) IL1B (ENSCATG00000032875) IL1A (ENSCATG00000040848) CKAP2L (ENSCATG00000035303) NT5DC4 (ENSCATG00000036107) SLC20A1 (ENSCATG00000034278) ENSCATG00000021927 ##22 CHCHD5 (ENSCATG00000041625) POLR1B (ENSCATG00000037382) TTL (ENSCATG00000037532) ZC3H6 (ENSCATG00000036595) ZC3H8 (ENSCATG00000031295) FBLN7 (ENSCATG00000028759) TMEM87B (ENSCATG00000030327) MERTK (ENSCATG00000035216) ENSCATG00000030840 ANAPC1 (ENSCATG00000028722) BCL2L11 (ENSCATG00000043052) ACOXL (ENSCATG00000043108) ENSCATG00000032241 ENSCATG00000004527 BUB1 (ENSCATG00000000312) Drill MODERN SPECIES 1558 ENSMLEG00000034379 PSD4 (ENSMLEG00000042825) IL1RN (ENSMLEG00000019913) IL1F10 (ENSMLEG00000038141) IL36RN (ENSMLEG00000037763) IL36B (ENSMLEG00000011517) IL36A (ENSMLEG00000032993) IL36G (ENSMLEG00000037926) IL37 (ENSMLEG00000037668) IL1B (ENSMLEG00000036556) IL1A (ENSMLEG00000031807) CKAP2L (ENSMLEG00000028608) NT5DC4 (ENSMLEG00000029599) SLC20A1 (ENSMLEG00000033623) ENSMLEG00000032222 ##22 CHCHD5 (ENSMLEG00000032703) POLR1B (ENSMLEG00000030588) TTL (ENSMLEG00000037718) Macaca ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000163264.A.a ENSGT00940000161868 ENSGT00940000161976 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.b ENSGT00950000182943.jb ENSGT00390000013353 ENSGT00530000063691.a ENSGT00940000162631 ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00390000007919 ENSGT00950000183132.B ENSGT00940000161907 ENSGT01030000234543.E ENSGT00940000157396 ENSGT00940000161918 ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000156844.b ENSGT00940000155669 ENSGT00390000016757 ENSGT00940000155039.f ENSGT00390000003178 ENSGT00940000161693 ENSGT00940000157865 ENSGT00390000007551 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161868 ENSGT00940000161976 ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.b.b ENSGT00950000182943.kb.b.a.b.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.a ENSGT00950000182943.kb.b.b.a.a.b ENSGT00950000182943.kb.b.b.b ENSGT00950000182943.jb ENSGT00390000013353 ENSGT00530000063691.a ENSGT00940000162631 ENSGT01100000263493.a.a.a.b.b.b.b.a.b.b.a.b.b.b ENSGT00390000014879.c.a ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.a ##22 ENSGT00390000007919 ENSGT00980000203183 ENSGT00950000183132.B ENSGT01030000234543.E ENSGT00940000157396 ENSGT00940000161918 ENSGT00830000128368.a ENSGT00940000156844.b ENSGT00940000155669 ENSGT00390000016757 ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00390000003178 ENSGT00940000161693 ENSGT00940000157865 ENSGT00390000007701 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 4 PSD4 (ENSMFAG00000040672) IL1RN (ENSMFAG00000031381) IL1F10 (ENSMFAG00000050256) IL36RN (ENSMFAG00000056041) IL36B (ENSMFAG00000031320) IL36A (ENSMFAG00000031039) IL36G (ENSMFAG00000042196) IL37 (ENSMFAG00000044707) IL1B (ENSMFAG00000043064) IL1A (ENSMFAG00000004069) CKAP2L (ENSMFAG00000028477) ENSMFAG00000056323 NT5DC4 (ENSMFAG00000024760) ENSMFAG00000065424 SLC20A1 (ENSMFAG00000006822) ENSMFAG00000036286 ##22 CHCHD5 (ENSMFAG00000044931) ENSMFAG00000051892 POLR1B (ENSMFAG00000032912) ENSMFAG00000056985 ZC3H6 (ENSMFAG00000036963) ZC3H8 (ENSMFAG00000031522) FBLN7 (ENSMFAG00000015043) TMEM87B (ENSMFAG00000000849) ENSMFAG00000054120 ENSMFAG00000059585 MERTK (ENSMFAG00000032328) ENSMFAG00000008223 ANAPC1 (ENSMFAG00000037630) ENSMFAG00000062246 ENSMFAG00000056725 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.a.b ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 148 CREB3L2 (ENSCATG00000034474) DGKI (ENSCATG00000032594) PTN (ENSCATG00000000939) CHRM2 (ENSCATG00000023535) ENSCATG00000041456 MTPN (ENSCATG00000031920) FAM180A (ENSCATG00000026812) SLC13A4 (ENSCATG00000042011) STMP1 (ENSCATG00000012047) NUP205 (ENSCATG00000030033) CNOT4 (ENSCATG00000022607) STRA8 (ENSCATG00000032354) WDR91 (ENSCATG00000038018) CYREN (ENSCATG00000034772) ENSCATG00000026597 ENSCATG00000022237 ##22 AGBL3 (ENSCATG00000042873) CALD1 (ENSCATG00000037074) ENSCATG00000029471 BPGM (ENSCATG00000030674) ENSCATG00000014043 ENSCATG00000031856 ENSCATG00000040571 ENSCATG00000033377 ENSCATG00000028631 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00510000048844 ENSGT00530000063169.a.a ENSGT00390000011412 ENSGT00730000111645 ENSGT00910000144274 ENSGT00390000013159 ENSGT00940000157887 ENSGT00900000140979.a.a.ab ENSGT00950000182878.b.b.`b.b.b ENSGT00530000063652.a.a ENSGT00390000012139 ENSGT00940000156306 ENSGT00390000008787.a ENSGT00940000158926 ENSGT00940000158625 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00390000001670 ENSGT00940000153339.a.a.a.a ENSGT00390000003422.l ENSGT00940000153169.A.b.b.a.a.b ENSGT00940000156660 ENSGT00390000013285.b ENSGT00390000013285.a ENSGT00940000156721 ENSGT00940000160597 ENSGT00940000153745.b ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 ENSGT00390000017004.a.a ENSGT00390000008128.d ENSGT00950000183088.a.b.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 348 C4orf17 (ENSCATG00000007938) ENSCATG00000031003 MTTP (ENSCATG00000034810) C4orf54 (ENSCATG00000045211) DAPP1 (ENSCATG00000039739) LAMTOR3 (ENSCATG00000037771) DNAJB14 (ENSCATG00000040344) ENSCATG00000034717 ENSCATG00000037554 DDIT4L (ENSCATG00000044014) EMCN (ENSCATG00000036310) PPP3CA (ENSCATG00000012154) BANK1 (ENSCATG00000030015) SLC39A8 (ENSCATG00000039737) NFKB1 (ENSCATG00000044952) ENSCATG00000011413 ##22 MANBA (ENSCATG00000039280) ENSCATG00000036123 ENSCATG00000029256 ENSCATG00000037960 CISD2 (ENSCATG00000040750) SLC9B1 (ENSCATG00000022744) SLC9B2 (ENSCATG00000035468) BDH2 (ENSCATG00000012596) CENPE (ENSCATG00000038459) TACR3 (ENSCATG00000036705) CXXC4 (ENSCATG00000036439) TET2 (ENSCATG00000044104) PPA2 (ENSCATG00000016898) ENSCATG00000028897 ARHGEF38 (ENSCATG00000043411) Drill MODERN SPECIES 1086 SLC39A8 (ENSMLEG00000022871) NFKB1 (ENSMLEG00000030561) ENSMLEG00000042292 ##22 MANBA (ENSMLEG00000036247) ENSMLEG00000030905 ENSMLEG00000038269 ENSMLEG00000036393 CISD2 (ENSMLEG00000039455) SLC9B1 (ENSMLEG00000030173) SLC9B2 (ENSMLEG00000040747) BDH2 (ENSMLEG00000039239) CENPE (ENSMLEG00000028666) TACR3 (ENSMLEG00000044107) EAPP (ENSMLEG00000042797) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 126 ADH7 (ENSMNEG00000033055) C4orf17 (ENSMNEG00000035254) TRMT10A (ENSMNEG00000044321) MTTP (ENSMNEG00000033442) C4orf54 (ENSMNEG00000036400) DAPP1 (ENSMNEG00000045303) LAMTOR3 (ENSMNEG00000033312) DNAJB14 (ENSMNEG00000035915) ENSMNEG00000036937 DDIT4L (ENSMNEG00000040634) EMCN (ENSMNEG00000033602) PPP3CA (ENSMNEG00000036863) BANK1 (ENSMNEG00000045046) SLC39A8 (ENSMNEG00000025853) NFKB1 (ENSMNEG00000029847) ENSMNEG00000032895 ##22 ENSMNEG00000027952 MANBA (ENSMNEG00000040770) ENSMNEG00000029341 CISD2 (ENSMNEG00000041045) ENSMNEG00000027081 SLC9B1 (ENSMNEG00000037351) SLC9B2 (ENSMNEG00000044785) BDH2 (ENSMNEG00000029165) CENPE (ENSMNEG00000040148) ENSMNEG00000018206 TACR3 (ENSMNEG00000033579) CXXC4 (ENSMNEG00000038974) ENSMNEG00000016504 TET2 (ENSMNEG00000032282) PPA2 (ENSMNEG00000043169) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1608 PPP2R5A (ENSRBIG00000038466) DTL (ENSRBIG00000039793) INTS7 (ENSRBIG00000029039) LPGAT1 (ENSRBIG00000014571) ENSRBIG00000029644 ##22 NEK2 (ENSRBIG00000028940) SLC30A1 (ENSRBIG00000037622) RD3 (ENSRBIG00000005095) ENSRBIG00000032375 TRAF5 (ENSRBIG00000028676) RCOR3 (ENSRBIG00000010046) ENSRBIG00000044233 ENSRBIG00000023591 KCNH1 (ENSRBIG00000039615) ENSRBIG00000035378 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1145 SRBD1 (ENSRROG00000041599) PRKCE (ENSRROG00000029195) EPAS1 (ENSRROG00000040968) TMEM247 (ENSRROG00000028710) ATP6V1E2 (ENSRROG00000014680) RHOQ (ENSRROG00000042208) PIGF (ENSRROG00000043302) CRIPT (ENSRROG00000039659) SOCS5 (ENSRROG00000011752) MCFD2 (ENSRROG00000032954) TTC7A (ENSRROG00000029928) ENSRROG00000043038 STPG4 (ENSRROG00000032949) ENSRROG00000033589 ENSRROG00000012737 ##22 EPCAM (ENSRROG00000005977) MSH2 (ENSRROG00000002126) KCNK12 (ENSRROG00000044464) ENSRROG00000034141 MSH6 (ENSRROG00000034827) FBXO11 (ENSRROG00000044862) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.b ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000162138 ENSGT01050000244891.C.c.a.g ENSGT00910000147190 ENSGT00940000160146.C ENSGT00440000038181.fb ENSGT00900000141094 ENSGT00440000033499 ENSGT00390000005823 ENSGT00390000016906 ENSGT00390000011127 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.b ##22 ENSGT00950000183762 ENSGT00390000000847 ENSGT00390000011700 ENSGT00530000063813.a ENSGT00530000063813.b ENSGT00550000074911 ENSGT00390000005023.b ENSGT00730000111251 ENSGT00940000154287.b ENSGT00940000163939 ENSGT00390000018660.e ENSGT01100000263515.a.b.a.a ENSGT00940000159135 ENSGT00940000162647 ENSGT00940000155368 Drill MODERN SPECIES 203 IL12A (ENSMLEG00000032877) SCHIP1 (ENSMLEG00000030705) ENSMLEG00000024030 ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 99 ARL14 (ENSCATG00000017494) KPNA4 (ENSCATG00000041511) TRIM59 (ENSCATG00000032073) ENSCATG00000042170 SMC4 (ENSCATG00000023485) IFT80 (ENSCATG00000009307) C3orf80 (ENSCATG00000016242) IL12A (ENSCATG00000041528) ENSCATG00000016311 ##22 ENSCATG00000021185 IQCJ (ENSCATG00000036638) MFSD1 (ENSCATG00000032129) RARRES1 (ENSCATG00000041879) LXN (ENSCATG00000044907) GFM1 (ENSCATG00000037622) MLF1 (ENSCATG00000041224) RSRC1 (ENSCATG00000036643) SHOX2 (ENSCATG00000036242) ENSCATG00000011015 PTX3 (ENSCATG00000039761) VEPH1 (ENSCATG00000029319) CCNL1 (ENSCATG00000035386) LEKR1 (ENSCATG00000045022) TIPARP (ENSCATG00000030375) Vervet Monkey MODERN SPECIES 6 SLITRK3 (ENSCSAG00000018889) SI (ENSCSAG00000012376) OTOL1 (ENSCSAG00000012350) SPTSSB (ENSCSAG00000012341) NMD3 (ENSCSAG00000012333) B3GALNT1 (ENSCSAG00000018890) PPM1L (ENSCSAG00000012321) ARL14 (ENSCSAG00000018891) KPNA4 (ENSCSAG00000012304) TRIM59 (ENSCSAG00000018892) SMC4 (ENSCSAG00000012248) IFT80 (ENSCSAG00000012233) C3orf80 (ENSCSAG00000018894) IL12A (ENSCSAG00000012218) SCHIP1 (ENSCSAG00000012193) ENSCSAG00000018896 ##22 MFSD1 (ENSCSAG00000012186) RARRES1 (ENSCSAG00000012175) GFM1 (ENSCSAG00000012162) LXN (ENSCSAG00000012154) MLF1 (ENSCSAG00000012151) RSRC1 (ENSCSAG00000012145) SHOX2 (ENSCSAG00000012131) ENSCSAG00000012112 VEPH1 (ENSCSAG00000012098) PTX3 (ENSCSAG00000012090) CCNL1 (ENSCSAG00000012077) LEKR1 (ENSCSAG00000012071) ENSCSAG00000012064 TIPARP (ENSCSAG00000012060) ENSCSAG00000012048 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2764 ENSRROG00000035633 ENSRROG00000015887 ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 202 ENSSBOG00000010278 ##22 ATOH8 (ENSSBOG00000026608) ST3GAL5 (ENSSBOG00000029221) POLR1A (ENSSBOG00000030262) PTCD3 (ENSSBOG00000026455) IMMT (ENSSBOG00000021696) MRPL35 (ENSSBOG00000022291) REEP1 (ENSSBOG00000026659) KDM3A (ENSSBOG00000022833) ENSSBOG00000033860 ENSSBOG00000029158 RNF103 (ENSSBOG00000000040) RMND5A (ENSSBOG00000030029) CD8A (ENSSBOG00000011322) ENSSBOG00000029324 ENSSBOG00000028889 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Pika MODERN SPECIES 9476 ENSOPRG00000007577 ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 4 SPOCK3 (ENSDLEG00000020953) ANXA10 (ENSDLEG00000020963) DDX60 (ENSDLEG00000021066) PALLD (ENSDLEG00000021387) ENSDLEG00000021512 CBR4 (ENSDLEG00000021515) SH3RF1 (ENSDLEG00000021519) NEK1 (ENSDLEG00000021537) ENSDLEG00000021559 ##22 CLCN3 (ENSDLEG00000021568) HPF1 (ENSDLEG00000021583) MFAP3L (ENSDLEG00000021588) ENSDLEG00000021594 ENSDLEG00000021595 ENSDLEG00000021598 GALNTL6 (ENSDLEG00000021601) GALNT7 (ENSDLEG00000021605) HMGB2 (ENSDLEG00000021614) SAP30 (ENSDLEG00000021615) SCRG1 (ENSDLEG00000021619) HAND2 (ENSDLEG00000021620) FBXO8 (ENSDLEG00000021623) CEP44 (ENSDLEG00000021626) ENSDLEG00000021633 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Goat MODERN SPECIES 3 ARL11 (ENSCHIG00000004176) EBPL (ENSCHIG00000014488) KPNA3 (ENSCHIG00000020446) SPRYD7 (ENSCHIG00000015127) TRIM13 (ENSCHIG00000010839) KCNRG (ENSCHIG00000009570) RNASEH2B (ENSCHIG00000018220) ENSCHIG00000014579 ENSCHIG00000009486 FAM124A (ENSCHIG00000017545) SERPINE3 (ENSCHIG00000014421) ENSCHIG00000021224 INTS6 (ENSCHIG00000017223) WDFY2 (ENSCHIG00000022622) DHRS12 (ENSCHIG00000011286) ENSCHIG00000019809 ##22 CCDC70 (ENSCHIG00000019882) ATP7B (ENSCHIG00000024048) ALG11 (ENSCHIG00000024968) NEK5 (ENSCHIG00000017084) NEK3 (ENSCHIG00000021662) CKAP2 (ENSCHIG00000022915) VPS36 (ENSCHIG00000007557) THSD1 (ENSCHIG00000016392) ENSCHIG00000015922 SLC25A15 (ENSCHIG00000023922) MRPS31 (ENSCHIG00000012457) FOXO1 (ENSCHIG00000018191) COG6 (ENSCHIG00000006953) ENSCHIG00000015682 NHLRC3 (ENSCHIG00000022530) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183041.C ENSGT00950000182772.B.a.a ENSGT00940000155679 ENSGT00950000184259 ENSGT00550000074949 ENSGT00390000010283 ENSGT00940000161069.h ENSGT00390000012355.A.a ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00940000163574 ENSGT00950000182767.a.b.b ENSGT01030000234623.a.b.a ENSGT00940000155227 ENSGT00950000182919.B.b ENSGT00940000159696 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000156640 ENSGT00940000156354 ENSGT00510000046704.b.a ENSGT00390000003122.c.a ENSGT00390000003122.c.b ENSGT00940000158176 ENSGT00940000158270 ENSGT00390000009443.j ENSGT00990000203589.b.b ENSGT00940000157310 ENSGT00940000157603 ENSGT00390000009710 ENSGT00940000159952 ENSGT00390000017026 ENSGT00940000157817 leopard MODERN SPECIES 40 CKMT2 (ENSPPRG00000023587) RASGRF2 (ENSPPRG00000024375) ENSPPRG00000019187 MSH3 (ENSPPRG00000018081) ENSPPRG00000015793 ENSPPRG00000014559 ANKRD34B (ENSPPRG00000019199) FAM151B (ENSPPRG00000013219) ZFYVE16 (ENSPPRG00000012892) SPZ1 (ENSPPRG00000019097) SERINC5 (ENSPPRG00000012240) THBS4 (ENSPPRG00000011385) ENSPPRG00000010693 MTX3 (ENSPPRG00000010541) CMYA5 (ENSPPRG00000010137) ENSPPRG00000018657 ##22 TENT2 (ENSPPRG00000008396) HOMER1 (ENSPPRG00000006866) JMY (ENSPPRG00000004743) BHMT (ENSPPRG00000004028) BHMT2 (ENSPPRG00000003496) DMGDH (ENSPPRG00000002973) ARSB (ENSPPRG00000002867) ENSPPRG00000000967 LHFPL2 (ENSPPRG00000000681) SCAMP1 (ENSPPRG00000000330) ENSPPRG00000020501 AP3B1 (ENSPPRG00000019993) TBCA (ENSPPRG00000018237) OTP (ENSPPRG00000015334) WDR41 (ENSPPRG00000015058) lion MODERN SPECIES ACOT12 (ENSPLOG00000000044) ZCCHC9 (ENSPLOG00000000050) CKMT2 (ENSPLOG00000000058) RASGRF2 (ENSPLOG00000000068) MSH3 (ENSPLOG00000000131) ENSPLOG00000000207 ANKRD34B (ENSPLOG00000000219) FAM151B (ENSPLOG00000000229) ZFYVE16 (ENSPLOG00000000241) ENSPLOG00000000257 SPZ1 (ENSPLOG00000000337) SERINC5 (ENSPLOG00000000355) THBS4 (ENSPLOG00000000412) MTX3 (ENSPLOG00000000460) CMYA5 (ENSPLOG00000000485) ENSPLOG00000000504 ##22 TENT2 (ENSPLOG00000000530) HOMER1 (ENSPLOG00000000572) JMY (ENSPLOG00000000614) BHMT (ENSPLOG00000000665) BHMT2 (ENSPLOG00000000718) DMGDH (ENSPLOG00000000773) ARSB (ENSPLOG00000000803) ENSPLOG00000000818 LHFPL2 (ENSPLOG00000000832) SCAMP1 (ENSPLOG00000000849) AP3B1 (ENSPLOG00000000902) TBCA (ENSPLOG00000001046) OTP (ENSPLOG00000001071) WDR41 (ENSPLOG00000001110) PDE8B (ENSPLOG00000001335) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000012340 ENSGT00390000017317 ENSGT00940000161894 ENSGT00940000165363 ENSGT00390000016067 ENSGT00940000153491.b.b.a ENSGT00390000002453 ENSGT00940000160337 ENSGT00390000008688 ENSGT00940000156919 ENSGT00510000048311 ENSGT00390000001735 ENSGT00940000157855 ENSGT00940000154049.a ENSGT00940000160691.m ENSGT00950000183010.a.a.a.b.b ##22 ENSGT00940000157430 ENSGT00940000159328 ENSGT00950000182928.A.a.a ENSGT00940000159604 ENSGT00390000008202 ENSGT00950000182902.b.b.a ENSGT00520000059663 ENSGT00940000155796 ENSGT00440000038328 ENSGT00940000159685 ENSGT00940000155768.B ENSGT00950000185134.b ENSGT00390000011000 ENSGT00940000156995 ENSGT00940000155713 Dingo MODERN SPECIES 327 GLOD4 (ENSCAFG00020010966) MRM3 (ENSCAFG00020010972) NXN (ENSCAFG00020010982) ENSCAFG00020010994 TIMM22 (ENSCAFG00020011001) ABR (ENSCAFG00020011015) BHLHA9 (ENSCAFG00020011059) GOSR1 (ENSCAFG00020011061) CPD (ENSCAFG00020011093) TMIGD1 (ENSCAFG00020011282) BLMH (ENSCAFG00020011283) SLC6A4 (ENSCAFG00020011289) NSRP1 (ENSCAFG00020011309) ENSCAFG00020011323 ENSCAFG00020011339 ENSCAFG00020011340 ##22 SSH2 (ENSCAFG00020011357) CORO6 (ENSCAFG00020011415) ANKRD13B (ENSCAFG00020011466) GIT1 (ENSCAFG00020011475) TP53I13 (ENSCAFG00020011480) ABHD15 (ENSCAFG00020011490) ENSCAFG00020011495 TAOK1 (ENSCAFG00020011508) NUFIP2 (ENSCAFG00020011598) CRYBA1 (ENSCAFG00020011603) MYO18A (ENSCAFG00020011619) ENSCAFG00020011660 PIPOX (ENSCAFG00020011664) SEZ6 (ENSCAFG00020011667) PHF12 (ENSCAFG00020011690) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 6 NPY2R (ENSCAFG00845010147) RBM46 (ENSCAFG00845010074) LRAT (ENSCAFG00845010027) ENSCAFG00845009958 FGG (ENSCAFG00845009858) ENSCAFG00845009752 FGB (ENSCAFG00845009700) PLRG1 (ENSCAFG00845009646) ENSCAFG00845009626 DCHS2 (ENSCAFG00845009547) SFRP2 (ENSCAFG00845009450) RNF175 (ENSCAFG00845009415) TLR2 (ENSCAFG00845009391) TMEM131L (ENSCAFG00845009147) ENSCAFG00845009098 ENSCAFG00845009081 ##22 TRIM2 (ENSCAFG00845008493) FHDC1 (ENSCAFG00845008193) ENSCAFG00845008099 ARFIP1 (ENSCAFG00845007940) TIGD4 (ENSCAFG00845007856) TMEM154 (ENSCAFG00845007673) ENSCAFG00845007288 FBXW7 (ENSCAFG00845007020) ENSCAFG00845006957 GATB (ENSCAFG00845006707) ATP5J2 (ENSCAFG00845006554) FAM160A1 (ENSCAFG00845006461) ENSCAFG00845006404 PRSS48 (ENSCAFG00845006205) SH3D19 (ENSCAFG00845005957) Dog MODERN SPECIES 37 ENSCAFG00845013664 GLOD4 (ENSCAFG00845013647) MRM3 (ENSCAFG00845013626) ENSCAFG00845013589 TIMM22 (ENSCAFG00845013556) ABR (ENSCAFG00845013244) ENSCAFG00845013053 GOSR1 (ENSCAFG00845012980) CPD (ENSCAFG00845012753) TMIGD1 (ENSCAFG00845012606) BLMH (ENSCAFG00845012487) SLC6A4 (ENSCAFG00845012358) NSRP1 (ENSCAFG00845012253) ENSCAFG00845012188 EFCAB5 (ENSCAFG00845012075) ENSCAFG00845012020 ##22 SSH2 (ENSCAFG00845011817) CORO6 (ENSCAFG00845011653) ANKRD13B (ENSCAFG00845011563) GIT1 (ENSCAFG00845011450) TP53I13 (ENSCAFG00845011354) ENSCAFG00845011314 ABHD15 (ENSCAFG00845011269) TAOK1 (ENSCAFG00845011111) CRYBA1 (ENSCAFG00845011001) NUFIP2 (ENSCAFG00845010911) MYO18A (ENSCAFG00845010063) ENSCAFG00845009786 PIPOX (ENSCAFG00845009717) SEZ6 (ENSCAFG00845009454) PHF12 (ENSCAFG00845009308) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.b #22 koala MODERN SPECIES 66 ENSPCIG00000023159 #22 SGCG (ENSPCIG00000013780) SACS (ENSPCIG00000035553) TNFRSF19 (ENSPCIG00000033639) MIPEP (ENSPCIG00000016191) ENSPCIG00000016190 SPATA13 (ENSPCIG00000016188) AMER2 (ENSPCIG00000025961) ENSPCIG00000025960 MTMR6 (ENSPCIG00000025959) NUP58 (ENSPCIG00000025958) SHISA2 (ENSPCIG00000025956) ATP8A2 (ENSPCIG00000036982) RNF6 (ENSPCIG00000026870) CDK8 (ENSPCIG00000017352) WASF3 (ENSPCIG00000037264) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Testudinoidea DUPLICATION Testudinoidea DUPLICATION Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A ENSGT00940000157218.C ENSGT00950000183010.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00950000185703 ENSGT01030000234623.a.a.b ENSGT01030000235111 ENSGT00940000155104 ENSGT00510000047363 ENSGT00940000155058 ENSGT00940000159949 ENSGT00940000158079 ENSGT00940000160209 ENSGT00940000153446.a.b ENSGT00940000159638 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213.l ENSGT00940000158264.b Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A ENSGT00940000157218.C ENSGT00950000183010.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00950000185703 ENSGT01030000234623.a.a.b ENSGT01030000235111 ENSGT00940000155104 ENSGT00510000047363 ENSGT00940000155058 ENSGT00940000158102.f ENSGT00940000159949 ENSGT00940000158079 ENSGT00940000160209 ENSGT00940000153446.a.b ENSGT00940000159638 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1232 ENSCABG00000017621 ##22 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 12 PTAFR (ENSGEVG00005012860) EYA3 (ENSGEVG00005012687) XKR8 (ENSGEVG00005012650) SMPDL3B (ENSGEVG00005012630) RPA2 (ENSGEVG00005012601) THEMIS2 (ENSGEVG00005012576) PPP1R8 (ENSGEVG00005012540) STX12 (ENSGEVG00005012511) CITED4 (ENSGEVG00005012494) CTPS1 (ENSGEVG00005012454) SLFNL1 (ENSGEVG00005012193) SCMH1 (ENSGEVG00005012060) FOXO6 (ENSGEVG00005011996) EDN2 (ENSGEVG00005011954) HIVEP3 (ENSGEVG00005011926) ENSGEVG00005011841 ##22 ENSGEVG00005011799 SERINC2 (ENSGEVG00005011239) ENSGEVG00005011122 FABP3 (ENSGEVG00005011101) ZCCHC17 (ENSGEVG00005011062) SNRNP40 (ENSGEVG00005011017) ENSGEVG00005010885 NKAIN1 (ENSGEVG00005010814) PUM1 (ENSGEVG00005010741) ENSGEVG00005010702 SDC3 (ENSGEVG00005010583) LAPTM5 (ENSGEVG00005010532) MATN1 (ENSGEVG00005010444) ENSGEVG00005010431 ENSGEVG00005010403 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A ENSGT00940000157218.C ENSGT00950000183010.a.a.a.a.a.a ##22 ENSGT00950000185703 ENSGT01030000234623.a.a.b ENSGT01030000235111 ENSGT00940000155104 ENSGT00510000047363 ENSGT00940000155058 ENSGT00940000159949 ENSGT00940000158079 ENSGT00940000160209 ENSGT00940000153446.a.b ENSGT00940000159638 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213.l ENSGT00940000158264.b Three-toed box turtle MODERN SPECIES 111 PTAFR (ENSTMTG00000003931) EYA3 (ENSTMTG00000003943) XKR8 (ENSTMTG00000004014) SMPDL3B (ENSTMTG00000004022) RPA2 (ENSTMTG00000004049) THEMIS2 (ENSTMTG00000004070) PPP1R8 (ENSTMTG00000004082) STX12 (ENSTMTG00000004113) CITED4 (ENSTMTG00000004137) CTPS1 (ENSTMTG00000004156) SLFNL1 (ENSTMTG00000004197) SCMH1 (ENSTMTG00000004250) FOXO6 (ENSTMTG00000004359) EDN2 (ENSTMTG00000004374) HIVEP3 (ENSTMTG00000004389) ENSTMTG00000004422 ##22 SERINC2 (ENSTMTG00000004444) ENSTMTG00000004467 ENSTMTG00000004482 FABP3 (ENSTMTG00000004503) ZCCHC17 (ENSTMTG00000004522) SNRNP40 (ENSTMTG00000004552) NKAIN1 (ENSTMTG00000004582) PUM1 (ENSTMTG00000004615) SDC3 (ENSTMTG00000004720) LAPTM5 (ENSTMTG00000004850) MATN1 (ENSTMTG00000004875) PTPRU (ENSTMTG00000005283) MECR (ENSTMTG00000009571) ENSTMTG00000009603 ENSTMTG00000009632 painted turtle MODERN SPECIES 713 STX12 (ENSCPBG00000015655) CITED4 (ENSCPBG00000015653) CTPS1 (ENSCPBG00000015650) SLFNL1 (ENSCPBG00000015648) SCMH1 (ENSCPBG00000015645) FOXO6 (ENSCPBG00000015641) EDN2 (ENSCPBG00000015635) HIVEP3 (ENSCPBG00000015630) ENSCPBG00000015623 ##22 ENSCPBG00000015621 SERINC2 (ENSCPBG00000015618) ENSCPBG00000015615 DPM1 (ENSCPBG00000015612) ADNP (ENSCPBG00000015610) BCAS4 (ENSCPBG00000015609) PARD6B (ENSCPBG00000015608) RIPOR3 (ENSCPBG00000015606) PTPN1 (ENSCPBG00000015605) CEBPB (ENSCPBG00000015601) ENSCPBG00000015600 UBE2V1 (ENSCPBG00000015599) RNF114 (ENSCPBG00000015597) SPATA2 (ENSCPBG00000015596) ENSCPBG00000015595 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.a.b ##22 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.a.b ##22 painted turtle MODERN SPECIES 716 SLC27A4 (ENSCPBG00000025193) COQ4 (ENSCPBG00000025188) TRUB2 (ENSCPBG00000025186) ENSCPBG00000025183 ENSCPBG00000025180 ENSCPBG00000025176 DNM1 (ENSCPBG00000024671) CIZ1 (ENSCPBG00000024640) BBLN (ENSCPBG00000024631) PTGES2 (ENSCPBG00000024615) ODF2 (ENSCPBG00000024574) GLE1 (ENSCPBG00000024524) SPTAN1 (ENSCPBG00000023766) DYNC2I2 (ENSCPBG00000023373) SET (ENSCPBG00000023372) ENSCPBG00000023369 ##22 ENSCPBG00000023366 ZDHHC12 (ENSCPBG00000023365) ZER1 (ENSCPBG00000023362) TBC1D13 (ENSCPBG00000023355) ENDOG (ENSCPBG00000023353) SPOUT1 (ENSCPBG00000023348) KYAT1 (ENSCPBG00000023339) LRRC8A (ENSCPBG00000023338) PHYHD1 (ENSCPBG00000023333) DOLK (ENSCPBG00000023330) NUP188 (ENSCPBG00000022859) SH3GLB2 (ENSCPBG00000022792) MIGA2 (ENSCPBG00000022784) DOLPP1 (ENSCPBG00000022775) CRAT (ENSCPBG00000022764) Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.b ##22 Testudinidae DUPLICATION Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.b.a ##22 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2570 PEPD (ENSCABG00000006160) CHST8 (ENSCABG00000006155) KCTD15 (ENSCABG00000006153) LSM14A (ENSCABG00000006149) SS18L2 (ENSCABG00000006148) GARRE1 (ENSCABG00000006147) GPI (ENSCABG00000006145) ENSCABG00000006144 ##22 WTIP (ENSCABG00000006141) UBA2 (ENSCABG00000006112) PDCD2L (ENSCABG00000006108) ENSCABG00000006107 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 3 WDR88 (ENSGEVG00005009737) LRP3 (ENSGEVG00005009838) SLC7A10 (ENSGEVG00005009940) ENSGEVG00005010278 CEBPA (ENSGEVG00005010303) CEBPG (ENSGEVG00005010316) PEPD (ENSGEVG00005010344) CHST8 (ENSGEVG00005010392) KCTD15 (ENSGEVG00005010441) ENSGEVG00005010559 LSM14A (ENSGEVG00005010715) SS18L2 (ENSGEVG00005010754) GARRE1 (ENSGEVG00005010777) GPI (ENSGEVG00005010824) WTIP (ENSGEVG00005010949) ENSGEVG00005011206 ##22 UBA2 (ENSGEVG00005011268) ENSGEVG00005011513 PDCD2L (ENSGEVG00005012279) ENSGEVG00005012420 ENSGEVG00005013150 ENSGEVG00005013731 CIAO2B (ENSGEVG00005013796) RRAD (ENSGEVG00005013828) ENSGEVG00005013944 PDP2 (ENSGEVG00005014085) CA7 (ENSGEVG00005014133) NAE1 (ENSGEVG00005014412) TERB1 (ENSGEVG00005014450) DYNC1LI2 (ENSGEVG00005014562) CMTM4 (ENSGEVG00005014598) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.b.b ##22 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1958 ENSCABG00000016585 ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.a ##22 Caniformia_b DUPLICATION Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.a.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.a.a ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.a.a ##22 Polar bear MODERN SPECIES 223 ENSUMAG00000012094 ZNF2 (ENSUMAG00000012091) ZNF514 (ENSUMAG00000012083) MRPS5 (ENSUMAG00000012079) MAL (ENSUMAG00000012078) MALL (ENSUMAG00000012074) NPHP1 (ENSUMAG00000011858) ENSUMAG00000011807 BUB1 (ENSUMAG00000011620) ACOXL (ENSUMAG00000011570) ENSUMAG00000011540 ANAPC1 (ENSUMAG00000009055) MERTK (ENSUMAG00000008754) TMEM87B (ENSUMAG00000008712) FBLN7 (ENSUMAG00000008676) ENSUMAG00000008673 ##22 ZC3H8 (ENSUMAG00000008665) ZC3H6 (ENSUMAG00000008663) ENSUMAG00000008662 POLR1B (ENSUMAG00000008619) CHCHD5 (ENSUMAG00000008612) SLC20A1 (ENSUMAG00000008606) CKAP2L (ENSUMAG00000008573) IL1A (ENSUMAG00000008557) IL1B (ENSUMAG00000008551) IL36G (ENSUMAG00000008523) ENSUMAG00000008514 ENSUMAG00000008502 IL1F10 (ENSUMAG00000008488) IL1RN (ENSUMAG00000008485) PSD4 (ENSUMAG00000008469) Giant Panda MODERN SPECIES 15 GALNT7 (ENSAMEG00000014267) GALNTL6 (ENSAMEG00000024177) AADAT (ENSAMEG00000000909) MFAP3L (ENSAMEG00000000904) HPF1 (ENSAMEG00000013232) CLCN3 (ENSAMEG00000013246) NEK1 (ENSAMEG00000013287) ENSAMEG00000013347 SH3RF1 (ENSAMEG00000013355) CBR4 (ENSAMEG00000013400) PALLD (ENSAMEG00000013412) DDX60 (ENSAMEG00000013429) ANXA10 (ENSAMEG00000013452) ENSAMEG00000026069 SPOCK3 (ENSAMEG00000005030) ENSAMEG00000005035 ##22 TLL1 (ENSAMEG00000005039) CPE (ENSAMEG00000005123) MSMO1 (ENSAMEG00000005596) KLHL2 (ENSAMEG00000005550) TMEM192 (ENSAMEG00000005536) TRIM75 (ENSAMEG00000019737) TRIM60 (ENSAMEG00000005532) ENSAMEG00000025716 ENSAMEG00000031128 ENSAMEG00000027946 ENSAMEG00000025226 ENSAMEG00000030591 SMIM31 (ENSAMEG00000031344) MARCHF1 (ENSAMEG00000001142) TMA16 (ENSAMEG00000001147) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.a.a ##22 American mink MODERN SPECIES 227 ENSNVIG00000018505 ENSNVIG00000018499 ENSNVIG00000018492 ##22 COBL (ENSNVIG00000018385) GRB10 (ENSNVIG00000018327) DDC (ENSNVIG00000018036) FIGNL1 (ENSNVIG00000018013) IKZF1 (ENSNVIG00000017814) SPATA48 (ENSNVIG00000017792) ZPBP (ENSNVIG00000017769) VWC2 (ENSNVIG00000017764) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.a.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.a.b ##22 American mink MODERN SPECIES 157 ENSNVIG00000009724 NEXN (ENSNVIG00000009791) MIGA1 (ENSNVIG00000009835) USP33 (ENSNVIG00000009922) ZZZ3 (ENSNVIG00000010036) AK5 (ENSNVIG00000010119) PIGK (ENSNVIG00000010172) ST6GALNAC5 (ENSNVIG00000010229) ST6GALNAC3 (ENSNVIG00000010253) ASB17 (ENSNVIG00000010286) MSH4 (ENSNVIG00000010302) RABGGTB (ENSNVIG00000010334) ACADM (ENSNVIG00000010380) SLC44A5 (ENSNVIG00000010403) LHX8 (ENSNVIG00000010449) ENSNVIG00000010470 ##22 TYW3 (ENSNVIG00000010472) ENSNVIG00000010500 ENSNVIG00000010591 TNNI3K (ENSNVIG00000010632) ENSNVIG00000010656 FPGT (ENSNVIG00000010670) ENSNVIG00000010690 LRRIQ3 (ENSNVIG00000010715) NEGR1 (ENSNVIG00000010796) ENSNVIG00000010809 ZRANB2 (ENSNVIG00000010818) PTGER3 (ENSNVIG00000010874) CTH (ENSNVIG00000010934) AN13C (ENSNVIG00000011000) SRSF11 (ENSNVIG00000011028) Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.a ##22 Dog MODERN SPECIES 25 MEPE (ENSCAFG00845015931) IBSP (ENSCAFG00845015862) ENSCAFG00845015806 DMP1 (ENSCAFG00845015764) DSPP (ENSCAFG00845015696) SPARCL1 (ENSCAFG00845015583) NUDT9 (ENSCAFG00845015495) HSD17B13 (ENSCAFG00845015328) ENSCAFG00845015190 KLHL8 (ENSCAFG00845015090) AFF1 (ENSCAFG00845014804) C4orf36 (ENSCAFG00845024944) SLC10A6 (ENSCAFG00845024905) PTPN13 (ENSCAFG00845024290) ENSCAFG00845024181 ENSCAFG00845024149 ##22 MAPK10 (ENSCAFG00845023201) ENSCAFG00845022736 ARHGAP24 (ENSCAFG00845022578) WDFY3 (ENSCAFG00845022217) CDS1 (ENSCAFG00845022114) ENSCAFG00845022070 NKX6-1 (ENSCAFG00845022031) ENSCAFG00845022001 GPAT3 (ENSCAFG00845021887) ABRAXAS1 (ENSCAFG00845021759) MRPS18C (ENSCAFG00845021626) ENSCAFG00845021572 ENSCAFG00845021505 HPSE (ENSCAFG00845021381) COQ2 (ENSCAFG00845021322) Red fox MODERN SPECIES 189 DPYSL5 (ENSVVUG00000016028) CENPA (ENSVVUG00000016014) SLC35F6 (ENSVVUG00000016012) KCNK3 (ENSVVUG00000016010) ENSVVUG00000016007 CIB4 (ENSVVUG00000016001) DRC1 (ENSVVUG00000015954) SELENOI (ENSVVUG00000015951) ADGRF3 (ENSVVUG00000015946) HADHB (ENSVVUG00000015924) ##20 HADHA (ENSVVUG00000015907) GAREM2 (ENSVVUG00000015897) RAB10 (ENSVVUG00000015895) ENSVVUG00000015893 KIF3C (ENSVVUG00000015885) ENSVVUG00000015876 ##22 ASXL2 (ENSVVUG00000015856) DTNB (ENSVVUG00000015770) DNMT3A (ENSVVUG00000015409) POMC (ENSVVUG00000015392) EFR3B (ENSVVUG00000015262) DNAJC27 (ENSVVUG00000015241) CENPO (ENSVVUG00000015237) ADCY3 (ENSVVUG00000014909) NCOA1 (ENSVVUG00000013134) ITSN2 (ENSVVUG00000011007) FAM228B (ENSVVUG00000010899) PFN4 (ENSVVUG00000010887) TP53I3 (ENSVVUG00000010879) SF3B6 (ENSVVUG00000010874) FKBP1B (ENSVVUG00000010837) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.a ##22 American mink MODERN SPECIES 67 ENSNVIG00000006133 PCDH20 (ENSNVIG00000006121) TDRD3 (ENSNVIG00000006075) ENSNVIG00000006064 DIAPH3 (ENSNVIG00000005614) ENSNVIG00000005568 ##22 ENSNVIG00000005565 PCDH17 (ENSNVIG00000005550) ENSNVIG00000005531 ENSNVIG00000005503 OLFM4 (ENSNVIG00000005486) PCDH8 (ENSNVIG00000005480) ENSNVIG00000005476 NINJ2 (ENSNVIG00000005469) B4GALNT3 (ENSNVIG00000005448) CCDC77 (ENSNVIG00000005398) ENSNVIG00000005388 KDM5A (ENSNVIG00000005351) SLC6A13 (ENSNVIG00000005305) SLC6A12 (ENSNVIG00000005204) IQSEC3 (ENSNVIG00000005165) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.b ##22 Dingo MODERN SPECIES 342 PKD2 (ENSCAFG00020008069) SPP1 (ENSCAFG00020008078) MEPE (ENSCAFG00020008084) IBSP (ENSCAFG00020008106) DMP1 (ENSCAFG00020008108) DSPP (ENSCAFG00020008112) SPARCL1 (ENSCAFG00020008125) NUDT9 (ENSCAFG00020008135) HSD17B11 (ENSCAFG00020008138) HSD17B13 (ENSCAFG00020008141) ENSCAFG00020008146 KLHL8 (ENSCAFG00020008159) AFF1 (ENSCAFG00020008224) SLC10A6 (ENSCAFG00020008242) PTPN13 (ENSCAFG00020008350) ENSCAFG00020009916 ##22 MAPK10 (ENSCAFG00020009946) ARHGAP24 (ENSCAFG00020010087) WDFY3 (ENSCAFG00020010121) CDS1 (ENSCAFG00020010454) NKX6-1 (ENSCAFG00020010474) ENSCAFG00020010476 GPAT3 (ENSCAFG00020010481) ABRAXAS1 (ENSCAFG00020010484) MRPS18C (ENSCAFG00020010491) HELQ (ENSCAFG00020010495) HPSE (ENSCAFG00020010498) COQ2 (ENSCAFG00020010543) ENSCAFG00020010561 ENSCAFG00020010564 PLAC8 (ENSCAFG00020010575) Dog MODERN SPECIES 1 NPTXR (ENSCAFG00845022551) CBX6 (ENSCAFG00845022457) APOBEC3Z1 (ENSCAFG00845022387) APOBEC3Z1 (ENSCAFG00845022347) APOBEC3Z3 (ENSCAFG00845022251) CBX7 (ENSCAFG00845022140) PDGFB (ENSCAFG00845022039) RPL3 (ENSCAFG00845021864) SYNGR1 (ENSCAFG00845021779) ENSCAFG00845021674 TAB1 (ENSCAFG00845021610) MIEF1 (ENSCAFG00845021530) ATF4 (ENSCAFG00845021497) CACNA1I (ENSCAFG00845021242) ENTHD1 (ENSCAFG00845021136) ENSCAFG00845021105 ##22 GRAP2 (ENSCAFG00845021051) FAM83F (ENSCAFG00845021004) ENSCAFG00845020976 TNRC6B (ENSCAFG00845020617) ADSL (ENSCAFG00845020328) SGSM3 (ENSCAFG00845020097) MRTFA (ENSCAFG00845019751) MCHR1 (ENSCAFG00845019660) MDH2 (ENSCAFG00845019601) SLC25A17 (ENSCAFG00845019500) ST13 (ENSCAFG00845019349) XPNPEP3 (ENSCAFG00845019212) RBX1 (ENSCAFG00845019033) EP300 (ENSCAFG00845018383) L3MBTL2 (ENSCAFG00845017974) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a.b.b ##22 American mink MODERN SPECIES 500 ENSNVIG00000019346 ENSNVIG00000019267 TCF19 (ENSNVIG00000019233) CCHCR1 (ENSNVIG00000019148) PSORS1C2 (ENSNVIG00000019140) CDSN (ENSNVIG00000019068) C6orf15 (ENSNVIG00000019058) ENSNVIG00000019053 ENSNVIG00000019038 SFTA2 (ENSNVIG00000019030) VARS2 (ENSNVIG00000018942) GTF2H4 (ENSNVIG00000018877) DDR1 (ENSNVIG00000018545) ENSNVIG00000018506 ##22 ENSNVIG00000018500 IEX1 (ENSNVIG00000018493) FLOT1 (ENSNVIG00000018486) ENSNVIG00000018474 ENSNVIG00000018466 NRM (ENSNVIG00000018461) PPP1R18 (ENSNVIG00000018453) DHX16 (ENSNVIG00000018424) C6orf136 (ENSNVIG00000018408) ATAT1 (ENSNVIG00000018307) MRPS18B (ENSNVIG00000018287) PPP1R10 (ENSNVIG00000018250) ABCF1 (ENSNVIG00000018155) PRR3 (ENSNVIG00000018139) GNL1 (ENSNVIG00000018092) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.a ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 812 HECTD4 (ENSCWAG00000016429) TRAFD1 (ENSCWAG00000016318) NAA25 (ENSCWAG00000016168) ERP29 (ENSCWAG00000016131) TMEM116 (ENSCWAG00000015816) MAPKAPK5 (ENSCWAG00000015704) ALDH2 (ENSCWAG00000015605) BICDL1 (ENSCWAG00000015495) RAB35 (ENSCWAG00000015436) GCN1 (ENSCWAG00000014778) ENSCWAG00000014622 ENSCWAG00000014442 SIRT4 (ENSCWAG00000014375) PLA2G1B (ENSCWAG00000014263) MSI1 (ENSCWAG00000014121) ENSCWAG00000014090 ##22 COX6A1 (ENSCWAG00000014059) ENSCWAG00000014027 GATC (ENSCWAG00000013975) SRSF9 (ENSCWAG00000013938) ENSCWAG00000013914 DYNLL1 (ENSCWAG00000013874) COQ5 (ENSCWAG00000013808) RNF10 (ENSCWAG00000013724) POP5 (ENSCWAG00000013649) CABP1 (ENSCWAG00000013481) MLEC (ENSCWAG00000013410) UNC119B (ENSCWAG00000013356) ACADS (ENSCWAG00000013312) SPPL3 (ENSCWAG00000013187) HNF1A (ENSCWAG00000012950) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 452 ENSDNOG00000019439 SERPINI2 (ENSDNOG00000008864) WDR49 (ENSDNOG00000008877) PDCD10 (ENSDNOG00000042230) SERPINI1 (ENSDNOG00000015382) ENSDNOG00000043604 ENSDNOG00000033323 GOLIM4 (ENSDNOG00000038929) ENSDNOG00000048881 ENSDNOG00000044922 ENSDNOG00000032078 MECOM (ENSDNOG00000007746) ENSDNOG00000017489 ENSDNOG00000043319 ##22 ACTRT3 (ENSDNOG00000045149) MYNN (ENSDNOG00000004681) LRRC34 (ENSDNOG00000017242) LRRIQ4 (ENSDNOG00000015942) LRRC31 (ENSDNOG00000015945) SAMD7 (ENSDNOG00000006359) SEC62 (ENSDNOG00000014081) PHC3 (ENSDNOG00000042270) PRKCI (ENSDNOG00000008880) ENSDNOG00000008923 CLDN11 (ENSDNOG00000041782) SLC7A14 (ENSDNOG00000040425) ENSDNOG00000032636 ENSDNOG00000048637 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3246 ENSMSIG00000015835 Actbl2 (ENSMSIG00000015838) ENSMSIG00000015869 ENSMSIG00000015878 Plk2 (ENSMSIG00000015883) Gapt (ENSMSIG00000015941) Rab3c (ENSMSIG00000015958) ENSMSIG00000016016 Pde4d (ENSMSIG00000016032) ENSMSIG00000016180 ##22 Depdc1b (ENSMSIG00000016211) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 3 CRTAC1 (ENSCJAG00000016821) ENSCJAG00000087255 SFRP5 (ENSCJAG00000016808) ZFYVE27 (ENSCJAG00000016783) MARVELD1 (ENSCJAG00000016782) AVPI1 (ENSCJAG00000062664) PI4K2A (ENSCJAG00000016755) MORN4 (ENSCJAG00000016744) HOGA1 (ENSCJAG00000047404) ANKRD2 (ENSCJAG00000016726) UBTD1 (ENSCJAG00000016722) MMS19 (ENSCJAG00000016651) ZDHHC16 (ENSCJAG00000016605) EXOSC1 (ENSCJAG00000016586) PGAM1 (ENSCJAG00000069022) ENSCJAG00000079967 ##22 ENSCJAG00000022968 RRP12 (ENSCJAG00000016549) ENSCJAG00000058491 ENSCJAG00000042089 ARHGAP19 (ENSCJAG00000016514) SLIT1 (ENSCJAG00000036372) LCOR (ENSCJAG00000022966) PIK3AP1 (ENSCJAG00000016474) ENSCJAG00000071491 TM9SF3 (ENSCJAG00000016413) TLL2 (ENSCJAG00000016371) OPALIN (ENSCJAG00000047907) DNTT (ENSCJAG00000016325) BLNK (ENSCJAG00000016270) ZNF518A (ENSCJAG00000016267) Marmoset MODERN SPECIES 2 INSC (ENSCJAG00000009705) CALCB (ENSCJAG00000072821) ENSCJAG00000009757 ENSCJAG00000075982 CYP2R1 (ENSCJAG00000009776) PDE3B (ENSCJAG00000009800) ENSCJAG00000086676 ENSCJAG00000082675 PSMA1 (ENSCJAG00000009850) COPB1 (ENSCJAG00000038149) ENSCJAG00000046068 ##20 ENSCJAG00000040842 SPON1 (ENSCJAG00000010055) FAR1 (ENSCJAG00000010077) ENSCJAG00000070220 ENSCJAG00000076330 ##22 PTH (ENSCJAG00000010117) BTBD10 (ENSCJAG00000010121) BMAL1 (ENSCJAG00000010162) RASSF10 (ENSCJAG00000085759) ENSCJAG00000072498 TEAD1 (ENSCJAG00000010263) ENSCJAG00000052611 PARVA (ENSCJAG00000010314) ENSCJAG00000010368 DKK3 (ENSCJAG00000010506) USP47 (ENSCJAG00000010537) ENSCJAG00000072959 GALNT18 (ENSCJAG00000010607) ENSCJAG00000039717 ENSCJAG00000021962 Marmoset DUPLICATION Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 11 MTRR (ENSCJAG00000008934) SEMA5A (ENSCJAG00000008962) TAS2R1 (ENSCJAG00000077757) ATPSCKMT (ENSCJAG00000070705) ENSCJAG00000008977 ENSCJAG00000045979 MARCHF6 (ENSCJAG00000009091) ENSCJAG00000083278 ANKRD33B (ENSCJAG00000009224) ENSCJAG00000046611 ENSCJAG00000085149 CTNND2 (ENSCJAG00000009238) ENSCJAG00000004019 ENSCJAG00000080282 ENSCJAG00000074642 ENSCJAG00000071150 ##22 ENSCJAG00000076372 DNAH5 (ENSCJAG00000009326) ENSCJAG00000072293 TRIO (ENSCJAG00000010904) OTULINL (ENSCJAG00000010893) OTULIN (ENSCJAG00000010884) ANKH (ENSCJAG00000010839) FBXL7 (ENSCJAG00000010823) MARCHF11 (ENSCJAG00000047285) RETREG1 (ENSCJAG00000042515) MYO10 (ENSCJAG00000011831) ENSCJAG00000053651 BASP1 (ENSCJAG00000046235) ENSCJAG00000082447 ENSCJAG00000085722 Marmoset MODERN SPECIES 17 NOL11 (ENSCJAG00000008775) ENSCJAG00000012603 BPTF (ENSCJAG00000031506) C17orf58 (ENSCJAG00000041812) ENSCJAG00000075828 ENSCJAG00000073466 ENSCJAG00000081146 ENSCJAG00000065370 ENSCJAG00000083853 ENSCJAG00000045924 ENSCJAG00000084707 SMURF2 (ENSCJAG00000019260) CEP95 (ENSCJAG00000019293) DDX5 (ENSCJAG00000019310) POLG2 (ENSCJAG00000019350) ENSCJAG00000065145 ##22 MILR1 (ENSCJAG00000019250) ENSCJAG00000040527 PECAM1 (ENSCJAG00000019367) TEX2 (ENSCJAG00000019377) ERN1 (ENSCJAG00000019415) ICAM2 (ENSCJAG00000019438) PRR29 (ENSCJAG00000019442) SCN4A (ENSCJAG00000019443) CD79B (ENSCJAG00000019471) ENSCJAG00000043217 GH1 (ENSCJAG00000075159) ENSCJAG00000060314 SMARCD2 (ENSCJAG00000019528) PSMC5 (ENSCJAG00000019558) FTSJ3 (ENSCJAG00000019631) Marmoset MODERN SPECIES 15 ENSCJAG00000080058 ENSCJAG00000079130 C4orf33 (ENSCJAG00000068844) SCLT1 (ENSCJAG00000003278) ENSCJAG00000060761 JADE1 (ENSCJAG00000003295) ENSCJAG00000077978 PGRMC2 (ENSCJAG00000003328) ENSCJAG00000069652 ENSCJAG00000085399 LARP1B (ENSCJAG00000003338) ABHD18 (ENSCJAG00000003356) MFSD8 (ENSCJAG00000003382) ENSCJAG00000085986 PLK4 (ENSCJAG00000003403) ENSCJAG00000087156 ##22 ENSCJAG00000070187 ENSCJAG00000074409 HSPA4L (ENSCJAG00000003450) INTU (ENSCJAG00000003524) ENSCJAG00000065011 FAT4 (ENSCJAG00000003565) ENSCJAG00000043387 ANKRD50 (ENSCJAG00000003581) SPRY1 (ENSCJAG00000021817) SPATA5 (ENSCJAG00000004346) ENSCJAG00000070589 ENSCJAG00000081404 NUDT6 (ENSCJAG00000002741) ENSCJAG00000002744 BBS12 (ENSCJAG00000002751) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 15 CCDC192 (ENSPANG00000029832) SLC12A2 (ENSPANG00000007040) FBN2 (ENSPANG00000008220) SLC27A6 (ENSPANG00000004065) ISOC1 (ENSPANG00000011667) ADAMTS19 (ENSPANG00000020423) MINAR2 (ENSPANG00000032769) ENSPANG00000038214 CHSY3 (ENSPANG00000040658) ENSPANG00000014180 HINT1 (ENSPANG00000012466) LYRM7 (ENSPANG00000012368) CDC42SE2 (ENSPANG00000006469) RAPGEF6 (ENSPANG00000023266) FNIP1 (ENSPANG00000002759) ENSPANG00000045567 ##22 ACSL6 (ENSPANG00000014592) IL3 (ENSPANG00000011666) CSF2 (ENSPANG00000010837) P4HA2 (ENSPANG00000003024) PDLIM4 (ENSPANG00000011299) SLC22A4 (ENSPANG00000024866) SLC22A5 (ENSPANG00000010659) IRF1 (ENSPANG00000014875) IL5 (ENSPANG00000018674) RAD50 (ENSPANG00000003668) IL13 (ENSPANG00000005704) IL4 (ENSPANG00000004677) KIF3A (ENSPANG00000003996) CCNI2 (ENSPANG00000009548) SEPTIN8 (ENSPANG00000010836) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 565 BANK1 (ENSRBIG00000031251) SLC39A8 (ENSRBIG00000034345) ENSRBIG00000040857 NFKB1 (ENSRBIG00000030114) ENSRBIG00000032069 ##22 ENSRBIG00000034238 ENSRBIG00000026970 MANBA (ENSRBIG00000032492) UBE2D3 (ENSRBIG00000030683) CISD2 (ENSRBIG00000034388) SLC9B1 (ENSRBIG00000042031) SLC9B2 (ENSRBIG00000042416) BDH2 (ENSRBIG00000018405) CENPE (ENSRBIG00000035147) ENSRBIG00000038418 ENSRBIG00000038680 TACR3 (ENSRBIG00000037541) CXXC4 (ENSRBIG00000013827) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b ##22 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000000583 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00940000155337 ENSGT00940000154186.a ENSGT00940000157081 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000154958 ENSGT00390000017004.a.a.q.a ENSGT00940000154556 ENSGT00910000147398 ENSGT00940000156841 ENSGT00950000183164.E.c.b.b ENSGT00940000156327 ENSGT00390000017839.o.a ENSGT00390000009597 ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a.a ##22 ENSGT00390000015405 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000018052 ENSGT00940000156530.c ENSGT00390000004284 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000012248 ENSGT00390000010591 ENSGT00940000154544.a ENSGT00950000183015.A ENSGT00940000156279 ENSGT00930000150969.A.c.a ENSGT00930000150969.A.c.b.a ENSGT00940000156522 ENSGT00940000158488 Dingo MODERN SPECIES 307 PELI1 (ENSCAFG00020026939) LGALSL (ENSCAFG00020026947) AFTPH (ENSCAFG00020026953) SLC1A4 (ENSCAFG00020026962) CEP68 (ENSCAFG00020026969) RAB1A (ENSCAFG00020026971) ENSCAFG00020026973 ACTR2 (ENSCAFG00020026978) ENSCAFG00020026981 SPRED2 (ENSCAFG00020026983) ENSCAFG00020026985 ENSCAFG00020026987 MEIS1 (ENSCAFG00020026989) ENSCAFG00020026992 ETAA1 (ENSCAFG00020026994) ENSCAFG00020026995 ##22 C1D (ENSCAFG00020026997) DNAAF10 (ENSCAFG00020026999) PNO1 (ENSCAFG00020027002) PPP3R1 (ENSCAFG00020027004) CNRIP1 (ENSCAFG00020000090) PLEK (ENSCAFG00020000109) FBXO48 (ENSCAFG00020000114) APLF (ENSCAFG00020000129) PROKR1 (ENSCAFG00020000143) ARHGAP25 (ENSCAFG00020000168) BMP10 (ENSCAFG00020000180) GKN2 (ENSCAFG00020000261) GKN1 (ENSCAFG00020000316) ANTXR1 (ENSCAFG00020000433) GFPT1 (ENSCAFG00020000705) Dog MODERN SPECIES 1 PELI1 (ENSCAFG00845020350) LGALSL (ENSCAFG00845020462) ENSCAFG00845020543 AFTPH (ENSCAFG00845020600) SLC1A4 (ENSCAFG00845020925) CEP68 (ENSCAFG00845021026) RAB1A (ENSCAFG00845021139) ENSCAFG00845021343 ENSCAFG00845021409 ACTR2 (ENSCAFG00845021843) SPRED2 (ENSCAFG00845022023) ENSCAFG00845022112 MEIS1 (ENSCAFG00845022164) ENSCAFG00845022346 ETAA1 (ENSCAFG00845022577) ENSCAFG00845022735 ##22 WDR92 (ENSCAFG00845022766) WDR92 (ENSCAFG00845022818) PNO1 (ENSCAFG00845022894) PPP3R1 (ENSCAFG00845022977) CNRIP1 (ENSCAFG00845023282) PLEK (ENSCAFG00845023363) FBXO48 (ENSCAFG00845023484) APLF (ENSCAFG00845023524) PROKR1 (ENSCAFG00845023574) ARHGAP25 (ENSCAFG00845023650) BMP10 (ENSCAFG00845023837) GKN2 (ENSCAFG00845023893) GKN1 (ENSCAFG00845024000) ANTXR1 (ENSCAFG00845024244) GFPT1 (ENSCAFG00845024744) Red fox MODERN SPECIES 11 ATG10 (ENSVVUG00000023291) SSBP2 (ENSVVUG00000023314) ACOT12 (ENSVVUG00000023325) ZCCHC9 (ENSVVUG00000023331) SEPT11 (ENSVVUG00000023346) ENSVVUG00000023386 SHROOM3 (ENSVVUG00000023389) CCDC158 (ENSVVUG00000023403) STBD1 (ENSVVUG00000023432) ENSVVUG00000023434 SCARB2 (ENSVVUG00000023440) NUP54 (ENSVVUG00000023444) ENSVVUG00000023448 ART3 (ENSVVUG00000023461) CXCL10 (ENSVVUG00000023469) ENSVVUG00000023471 ##22 CXCL9 (ENSVVUG00000023474) ENSVVUG00000023531 NAAA (ENSVVUG00000024151) PPEF2 (ENSVVUG00000024157) USO1 (ENSVVUG00000024163) G3BP2 (ENSVVUG00000024171) CDKL2 (ENSVVUG00000024175) ENSVVUG00000024181 ENSVVUG00000024183 ENSVVUG00000024186 THAP6 (ENSVVUG00000024190) RCHY1 (ENSVVUG00000024193) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a.b ##22 Dog MODERN SPECIES 15 ENSCAFG00845022866 IL20RB (ENSCAFG00845022899) ENSCAFG00845022964 SOX14 (ENSCAFG00845023200) CLDN18 (ENSCAFG00845023238) ENSCAFG00845023325 A4GNT (ENSCAFG00845023425) ENSCAFG00845023449 DBR1 (ENSCAFG00845023502) ARMC8 (ENSCAFG00845023706) NME9 (ENSCAFG00845024321) MRAS (ENSCAFG00845024583) ESYT3 (ENSCAFG00845024743) CEP70 (ENSCAFG00845025346) ENSCAFG00845025659 ENSCAFG00845025691 ##22 FAIM (ENSCAFG00845025733) PIK3CB (ENSCAFG00845025921) PRR23A (ENSCAFG00845026853) ENSCAFG00845026883 ENSCAFG00845026940 ENSCAFG00845026965 MRPS22 (ENSCAFG00845027000) COPB2 (ENSCAFG00845027083) RBP2 (ENSCAFG00845027313) ENSCAFG00845027390 NMNAT3 (ENSCAFG00845027464) CLSTN2 (ENSCAFG00845027590) TRIM42 (ENSCAFG00845027689) SLC25A36 (ENSCAFG00845027764) SPSB4 (ENSCAFG00845027830) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 lion MODERN SPECIES 28 RBM24 (ENSPLOG00000017655) STMND1 (ENSPLOG00000017593) ATXN1 (ENSPLOG00000017539) GMPR (ENSPLOG00000017506) MYLIP (ENSPLOG00000017463) DTNBP1 (ENSPLOG00000017074) JARID2 (ENSPLOG00000016914) CD83 (ENSPLOG00000016791) RNF182 (ENSPLOG00000016761) MCUR1 (ENSPLOG00000016675) RANBP9 (ENSPLOG00000016382) NOL7 (ENSPLOG00000016262) SIRT5 (ENSPLOG00000016186) GFOD1 (ENSPLOG00000016140) TBC1D7 (ENSPLOG00000016036) ENSPLOG00000015988 ##22 PHACTR1 (ENSPLOG00000015813) EDN1 (ENSPLOG00000015758) ENSPLOG00000015715 ENSPLOG00000015652 ADTRP (ENSPLOG00000015607) TMEM170B (ENSPLOG00000015571) NEDD9 (ENSPLOG00000015418) SMIM13 (ENSPLOG00000015335) ELOVL2 (ENSPLOG00000015241) SYCP2L (ENSPLOG00000014969) GCM2 (ENSPLOG00000014873) MAK (ENSPLOG00000014775) TMEM14C (ENSPLOG00000014694) PAK1IP1 (ENSPLOG00000014566) ENSPLOG00000014487 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES ENSRFEG00010000025 ENSRFEG00010000026 PHKA1 (ENSRFEG00010000027) HDAC8 (ENSRFEG00010000028) ENSRFEG00010000029 ENSRFEG00010000030 PIN4 (ENSRFEG00010000031) ERCC6L (ENSRFEG00010000032) NHSL2 (ENSRFEG00010000033) RTL5 (ENSRFEG00010000034) ENSRFEG00010000035 ENSRFEG00010000036 CXCR3 (ENSRFEG00010000037) ENSRFEG00010000039 ENSRFEG00010000041 ENSRFEG00010000042 ##22 ENSRFEG00010000043 ITGB1BP2 (ENSRFEG00010000045) ENSRFEG00010000046 ZMYM3 (ENSRFEG00010000047) GJB1 (ENSRFEG00010000048) NLGN3 (ENSRFEG00010000049) MED12 (ENSRFEG00010000050) IL2RG (ENSRFEG00010000051) CXorf65 (ENSRFEG00010000052) FOXO4 (ENSRFEG00010000053) SNX12 (ENSRFEG00010000054) ENSRFEG00010000055 SLC7A3 (ENSRFEG00010000056) ENSRFEG00010000057 DLG3 (ENSRFEG00010000060) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.a ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 30 CDYL (ENSCHYG00000001347) RPP40 (ENSCHYG00000001289) PPP1R3G (ENSCHYG00000001273) ENSCHYG00000001244 FARS2 (ENSCHYG00000001148) NRN1 (ENSCHYG00000001106) F13A1 (ENSCHYG00000001064) LY86 (ENSCHYG00000001035) RREB1 (ENSCHYG00000000989) SSR1 (ENSCHYG00000000835) ENSCHYG00000000763 RIOK1 (ENSCHYG00000000714) DSP (ENSCHYG00000000616) SNRNP48 (ENSCHYG00000000577) ENSCHYG00000000567 ENSCHYG00000000559 ##22 BMP6 (ENSCHYG00000000551) TXNDC5 (ENSCHYG00000000515) ENSCHYG00000000494 EEF1E1 (ENSCHYG00000000476) SLC35B3 (ENSCHYG00000000422) ENSCHYG00000000381 TFAP2A (ENSCHYG00000000326) ENSCHYG00000000298 GCNT2 (ENSCHYG00000000267) PAK1IP1 (ENSCHYG00000000228) TMEM14C (ENSCHYG00000024918) MAK (ENSCHYG00000024598) GCM2 (ENSCHYG00000024560) SYCP2L (ENSCHYG00000024440) ELOVL2 (ENSCHYG00000024380) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 8 LEF1 (ENSCHYG00000025171) ENSCHYG00000025081 ENSCHYG00000025066 OSTC (ENSCHYG00000025020) ETNPPL (ENSCHYG00000024949) COL25A1 (ENSCHYG00000023049) SEC24B (ENSCHYG00000021070) MCUB (ENSCHYG00000020811) CASP6 (ENSCHYG00000020581) ENSCHYG00000020524 CFI (ENSCHYG00000018892) GAR1 (ENSCHYG00000018741) RRH (ENSCHYG00000018607) LRIT3 (ENSCHYG00000018518) ENSCHYG00000018402 ENSCHYG00000018367 ##22 ELOVL6 (ENSCHYG00000018333) ENPEP (ENSCHYG00000017750) PITX2 (ENSCHYG00000017532) ENSCHYG00000017419 ENSCHYG00000017401 FAM241A (ENSCHYG00000017369) AP1AR (ENSCHYG00000017199) TIFA (ENSCHYG00000017159) ALPK1 (ENSCHYG00000016924) NEUROG2 (ENSCHYG00000016884) ZGRF1 (ENSCHYG00000016563) LARP7 (ENSCHYG00000016420) ENSCHYG00000013660 CAMK2D (ENSCHYG00000021900) ENSCHYG00000021709 Yarkand deer MODERN SPECIES 11 SHANK2 (ENSCHYG00000000934) ENSCHYG00000001247 DHCR7 (ENSCHYG00000001261) NADSYN1 (ENSCHYG00000001306) ENSCHYG00000001517 MRGPRG (ENSCHYG00000001526) OSBPL5 (ENSCHYG00000001576) ENSCHYG00000001703 ENSCHYG00000001719 CARS1 (ENSCHYG00000001793) NAP1L4 (ENSCHYG00000001968) PHLDA2 (ENSCHYG00000002027) SLC22A18 (ENSCHYG00000002046) CDKN1C (ENSCHYG00000002075) KCNQ1 (ENSCHYG00000002120) ENSCHYG00000002194 ##22 TRPM5 (ENSCHYG00000002214) CD81 (ENSCHYG00000002329) ENSCHYG00000002365 TH (ENSCHYG00000002406) INS (ENSCHYG00000002508) ENSCHYG00000002520 ENSCHYG00000002574 ENSCHYG00000002638 PRR33 (ENSCHYG00000002988) TNNI2 (ENSCHYG00000002997) CTSD (ENSCHYG00000003030) ENSCHYG00000003170 ENSCHYG00000003183 BRSK2 (ENSCHYG00000003251) TOLLIP (ENSCHYG00000003447) Yarkand deer MODERN SPECIES 28 NHERF1 (ENSCHYG00000003364) RAB37 (ENSCHYG00000003432) ENSCHYG00000003568 ENSCHYG00000003597 CD300H (ENSCHYG00000003629) ENSCHYG00000003668 CD300LB (ENSCHYG00000003694) ENSCHYG00000003713 GPRC5C (ENSCHYG00000003760) GPR142 (ENSCHYG00000003802) BTBD17 (ENSCHYG00000003812) KIF19 (ENSCHYG00000003830) DNAI2 (ENSCHYG00000003874) TTYH2 (ENSCHYG00000003903) ENSCHYG00000003937 ENSCHYG00000003954 ##22 SDK2 (ENSCHYG00000003979) ENSCHYG00000004038 ENSCHYG00000004048 ENSCHYG00000004052 C17orf80 (ENSCHYG00000004074) FAM104A (ENSCHYG00000004095) COG1 (ENSCHYG00000004119) SLC39A11 (ENSCHYG00000004170) SSTR2 (ENSCHYG00000004231) SOX9 (ENSCHYG00000004243) KCNJ2 (ENSCHYG00000004266) KCNJ16 (ENSCHYG00000004281) MAP2K6 (ENSCHYG00000004301) ABCA5 (ENSCHYG00000004346) ABCA10 (ENSCHYG00000004384) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Blue whale MODERN SPECIES 12 ENSBMSG00010021723 MILR1 (ENSBMSG00010021717) POLG2 (ENSBMSG00010021711) ENSBMSG00010021683 CEP95 (ENSBMSG00010021632) SMURF2 (ENSBMSG00010021607) KPNA2 (ENSBMSG00010021590) C17orf58 (ENSBMSG00010021579) BPTF (ENSBMSG00010021472) NOL11 (ENSBMSG00010021388) PITPNC1 (ENSBMSG00010021350) PSMD12 (ENSBMSG00010021318) METRNL (ENSBMSG00010021306) ENSBMSG00010021295 ZNF750 (ENSBMSG00010021286) ENSBMSG00010021275 ##22 TBCD (ENSBMSG00010021261) FN3K (ENSBMSG00010021229) FN3KRP (ENSBMSG00010021209) RAB40B (ENSBMSG00010021192) WDR45B (ENSBMSG00010021164) FOXK2 (ENSBMSG00010021138) ENSBMSG00010021101 ENSBMSG00010021126 CYBC1 (ENSBMSG00010021067) HEXD (ENSBMSG00010021031) OGFOD3 (ENSBMSG00010021003) UTS2R (ENSBMSG00010020982) ENSBMSG00010020970 ENSBMSG00010020958 ENSBMSG00010020943 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 American mink MODERN SPECIES 168 PCNP (ENSNVIG00000017722) TRMT10C (ENSNVIG00000017717) ENSNVIG00000017704 SENP7 (ENSNVIG00000017530) IMPG2 (ENSNVIG00000017469) ENSNVIG00000017433 TFG (ENSNVIG00000017297) ADGRG7 (ENSNVIG00000017236) ENSNVIG00000017226 TMEM45A (ENSNVIG00000017210) LNP1 (ENSNVIG00000017190) TOMM70 (ENSNVIG00000017175) ENSNVIG00000017150 TBC1D23 (ENSNVIG00000017076) ENSNVIG00000017014 ENSNVIG00000017005 ##22 FILIP1L (ENSNVIG00000016962) CC026 (ENSNVIG00000016879) COL8A1 (ENSNVIG00000016844) ENSNVIG00000016833 DCBLD2 (ENSNVIG00000016789) ST3GAL6 (ENSNVIG00000016667) CPOX (ENSNVIG00000016650) GPR15 (ENSNVIG00000016647) CLDND1 (ENSNVIG00000016585) ENSNVIG00000016574 OR5K3 (ENSNVIG00000016563) OR5K4 (ENSNVIG00000016556) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.d.b ##22 lion MODERN SPECIES 5 PTP4A1 (ENSPLOG00000007765) ENSPLOG00000007739 LGSN (ENSPLOG00000007674) ENSPLOG00000007641 KHDRBS2 (ENSPLOG00000007607) ENSPLOG00000007594 ENSPLOG00000007575 PRIM2 (ENSPLOG00000007536) RAB23 (ENSPLOG00000007511) BAG2 (ENSPLOG00000007479) ZNF451 (ENSPLOG00000007397) KIAA1586 (ENSPLOG00000007341) BEND6 (ENSPLOG00000007281) DST (ENSPLOG00000006730) COL21A1 (ENSPLOG00000006412) ENSPLOG00000006363 ##22 BMP5 (ENSPLOG00000006334) HMGCLL1 (ENSPLOG00000006191) GFRAL (ENSPLOG00000006100) HCRTR2 (ENSPLOG00000006068) FAM83B (ENSPLOG00000004226) TINAG (ENSPLOG00000004202) MLIP (ENSPLOG00000004128) LRRC1 (ENSPLOG00000004053) KLHL31 (ENSPLOG00000004028) GCLC (ENSPLOG00000003932) ELOVL5 (ENSPLOG00000003839) GCM1 (ENSPLOG00000003807) FBXO9 (ENSPLOG00000003770) CILK1 (ENSPLOG00000003736) GSTA4 (ENSPLOG00000003698) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.e ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.e ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.c.b.e ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 216 BCL10 (ENSCWAG00000016929) C1orf52 (ENSCWAG00000016957) SYDE2 (ENSCWAG00000016990) DNAI3 (ENSCWAG00000017052) PCDH20 (ENSCWAG00000017337) TDRD3 (ENSCWAG00000017371) ENSCWAG00000017495 DIAPH3 (ENSCWAG00000017632) ENSCWAG00000019391 ENSCWAG00000019419 PCDH17 (ENSCWAG00000019432) ENSCWAG00000019461 ENSCWAG00000019477 ENSCWAG00000019495 OLFM4 (ENSCWAG00000019527) ENSCWAG00000019571 ##22 PCDH8 (ENSCWAG00000000054) CNMD (ENSCWAG00000000097) SUGT1 (ENSCWAG00000000140) ELF1 (ENSCWAG00000000184) WBP4 (ENSCWAG00000000246) KBTBD6 (ENSCWAG00000000273) KBTBD7 (ENSCWAG00000000301) MTRF1 (ENSCWAG00000000321) NAA16 (ENSCWAG00000000371) RGCC (ENSCWAG00000000406) VWA8 (ENSCWAG00000000455) DGKH (ENSCWAG00000000630) AKAP11 (ENSCWAG00000000801) TNFSF11 (ENSCWAG00000000851) FAM216B (ENSCWAG00000000885) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 7152 ENSEEUG00000004875 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Blue whale MODERN SPECIES CHIA (ENSBMSG00010008641) ENSBMSG00010008572 DENND2D (ENSBMSG00010008496) CEPT1 (ENSBMSG00010008459) DRAM2 (ENSBMSG00010008440) LRIF1 (ENSBMSG00010008429) CD53 (ENSBMSG00010008411) KCNA3 (ENSBMSG00010008395) KCNA2 (ENSBMSG00010008384) KCNA10 (ENSBMSG00010008377) ENSBMSG00010008319 PROK1 (ENSBMSG00010008280) LAMTOR5 (ENSBMSG00010008260) SLC16A4 (ENSBMSG00010008140) RBM15 (ENSBMSG00010008103) ENSBMSG00010008095 ##22 KCNC4 (ENSBMSG00010008085) SLC6A17 (ENSBMSG00010008070) UBL4B (ENSBMSG00010008061) ALX3 (ENSBMSG00010008054) STRIP1 (ENSBMSG00010008007) AHCYL1 (ENSBMSG00010007982) CSF1 (ENSBMSG00010007970) ENSBMSG00010007961 EPS8L3 (ENSBMSG00010007907) GSTM3 (ENSBMSG00010007878) ENSBMSG00010007860 AMPD2 (ENSBMSG00010007797) GNAT2 (ENSBMSG00010007771) GNAI3 (ENSBMSG00010007747) GPR61 (ENSBMSG00010007737) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Vaquita MODERN SPECIES 11 SYNE3 (ENSPSNG00000003075) GLRX5 (ENSPSNG00000003132) ENSPSNG00000003164 TCL1B (ENSPSNG00000003192) TCL1A (ENSPSNG00000003201) ENSPSNG00000003224 ENSPSNG00000003262 BDKRB2 (ENSPSNG00000003286) BDKRB1 (ENSPSNG00000003305) ATG2B (ENSPSNG00000003367) GSKIP (ENSPSNG00000003452) AK7 (ENSPSNG00000003480) PAPOLA (ENSPSNG00000003512) VRK1 (ENSPSNG00000003557) BCL11B (ENSPSNG00000003608) ENSPSNG00000003647 ##22 SETD3 (ENSPSNG00000003667) CCNK (ENSPSNG00000003703) CCDC85C (ENSPSNG00000003734) ENSPSNG00000003763 CYP46A1 (ENSPSNG00000003814) EML1 (ENSPSNG00000003897) ENSPSNG00000003981 DEGS2 (ENSPSNG00000003999) YY1 (ENSPSNG00000004013) SLC25A29 (ENSPSNG00000004036) ENSPSNG00000004064 WARS1 (ENSPSNG00000004092) WDR25 (ENSPSNG00000004116) BEGAIN (ENSPSNG00000004165) DLK1 (ENSPSNG00000004221) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000162601 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000163229 ENSGT01050000244827.E ENSGT00390000011297 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ENSGT00940000160370 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000158351.v.b.b ENSGT00910000148442 ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 ENSGT00940000155724.i ENSGT00940000156078 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000013856 ENSGT00940000154915.mb.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00560000077266.a ENSGT00940000159157 ENSGT01050000244838.D ENSGT00950000182984.a ENSGT00940000156533.b Cow MODERN SPECIES 28 KCNQ5 (ENSBTAG00000007791) KHDC3L (ENSBTAG00000034925) OOEP (ENSBTAG00000019600) ENSBTAG00000021814 CGAS (ENSBTAG00000000892) MTO1 (ENSBTAG00000016839) EEF1A1 (ENSBTAG00000014534) SLC17A5 (ENSBTAG00000044053) CD109 (ENSBTAG00000013222) ENSBTAG00000054709 ENSBTAG00000053911 COL12A1 (ENSBTAG00000020056) COX7A2 (ENSBTAG00000005096) TMEM30A (ENSBTAG00000005100) FILIP1 (ENSBTAG00000000053) ENSBTAG00000032382 ##22 SENP6 (ENSBTAG00000005869) MYO6 (ENSBTAG00000016751) IMPG1 (ENSBTAG00000021175) ENSBTAG00000016391 HTR1B (ENSBTAG00000037429) MEI4 (ENSBTAG00000054151) ENSBTAG00000034662 IRAK1BP1 (ENSBTAG00000020825) PHIP (ENSBTAG00000024688) ENSBTAG00000052031 ENSBTAG00000048976 LCA5 (ENSBTAG00000043950) SH3BGRL2 (ENSBTAG00000055014) ELOVL4 (ENSBTAG00000015498) TTK (ENSBTAG00000005456) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Wild yak MODERN SPECIES 1465 ENSBMUG00000007928 COL12A1 (ENSBMUG00000008307) COX7A2 (ENSBMUG00000008381) TMEM30A (ENSBMUG00000008406) FILIP1 (ENSBMUG00000008437) ENSBMUG00000008446 ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Dog MODERN SPECIES 144 ENSCAFG00845027763 ADGRG4 (ENSCAFG00845029120) BRS3 (ENSCAFG00845029186) HTATSF1 (ENSCAFG00845029208) VGLL1 (ENSCAFG00845029257) ENSCAFG00845029269 CD40LG (ENSCAFG00845029290) ARHGEF6 (ENSCAFG00845029339) RBMX (ENSCAFG00845029404) GPR101 (ENSCAFG00845029453) ENSCAFG00845029466 ZIC3 (ENSCAFG00845029495) ATP5ME (ENSCAFG00845029517) ENSCAFG00845029526 FGF13 (ENSCAFG00845029595) ENSCAFG00845029688 ##22 F9 (ENSCAFG00845029706) MCF2 (ENSCAFG00845029804) ATP11C (ENSCAFG00845030103) ENSCAFG00845030392 SOX3 (ENSCAFG00845030422) ENSCAFG00845030462 ENSCAFG00845019387 SLITRK4 (ENSCAFG00845019492) ENSCAFG00845019585 ENSCAFG00845019607 ENSCAFG00845019668 SLITRK2 (ENSCAFG00845019739) ENSCAFG00845020221 ENSCAFG00845020271 ENSCAFG00845020302 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Ferret MODERN SPECIES 545 ENSMPUG00000018683 ##22 ARHGEF9 (ENSMPUG00000009906) AMER1 (ENSMPUG00000018682) ASB12 (ENSMPUG00000009895) Felidae DUPLICATION Felidae DUPLICATION Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d.a.a ##22 Cat MODERN SPECIES 247 ENSFCAG00000041147 PRM3 (ENSFCAG00000041604) TNP2 (ENSFCAG00000003606) SOCS1 (ENSFCAG00000041934) CLEC16A (ENSFCAG00000011670) DEXI (ENSFCAG00000044833) CIITA (ENSFCAG00000028848) TVP23A (ENSFCAG00000009893) NUBP1 (ENSFCAG00000009892) TEKT5 (ENSFCAG00000009891) EMP2 (ENSFCAG00000030923) ATF7IP2 (ENSFCAG00000038926) GRIN2A (ENSFCAG00000014299) ENSFCAG00000051933 ENSFCAG00000043677 ENSFCAG00000031442 ##22 HAPSTR1 (ENSFCAG00000044352) USP7 (ENSFCAG00000004089) LITAFD (ENSFCAG00000046455) CARHSP1 (ENSFCAG00000036654) PMM2 (ENSFCAG00000004086) TMEM186 (ENSFCAG00000003287) ABAT (ENSFCAG00000031419) METTL22 (ENSFCAG00000001434) TMEM114 (ENSFCAG00000042899) RBFOX1 (ENSFCAG00000025322) ENSFCAG00000024232 ENSFCAG00000024781 ENSFCAG00000004574 CE3H16orf89 (ENSFCAG00000022864) NAGPA (ENSFCAG00000004573) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d.a.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d.a.b ##22 Tiger MODERN SPECIES 313 ADAM23 (ENSPTIG00000011931) CMKLR2 (ENSPTIG00000008203) ENSPTIG00000011994 NDUFS1 (ENSPTIG00000012021) INO80D (ENSPTIG00000012089) NRP2 (ENSPTIG00000012139) PARD3B (ENSPTIG00000012297) ENSPTIG00000008211 ICOS (ENSPTIG00000012385) CTLA4 (ENSPTIG00000012408) CD28 (ENSPTIG00000012428) ENSPTIG00000012473 ABI2 (ENSPTIG00000012734) CYP20A1 (ENSPTIG00000012850) NBEAL1 (ENSPTIG00000012887) ENSPTIG00000008218 ##22 CARF (ENSPTIG00000012946) WDR12 (ENSPTIG00000013035) ICA1L (ENSPTIG00000013050) ENSPTIG00000008227 BMPR2 (ENSPTIG00000013082) NOP58 (ENSPTIG00000013131) SUMO1 (ENSPTIG00000013157) ENSPTIG00000008234 KIAA2012 (ENSPTIG00000013192) CDK15 (ENSPTIG00000013223) ALS2 (ENSPTIG00000013259) MPP4 (ENSPTIG00000013368) TMEM237 (ENSPTIG00000013692) ENSPTIG00000013739 STRADB (ENSPTIG00000013805) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d.a.b ##22 leopard MODERN SPECIES 196 ENSPPRG00000014526 ##22 CARF (ENSPPRG00000014454) WDR12 (ENSPPRG00000014037) ICA1L (ENSPPRG00000014024) FAM117B (ENSPPRG00000013956) BMPR2 (ENSPPRG00000013936) NOP58 (ENSPPRG00000013837) SUMO1 (ENSPPRG00000013405) ENSPPRG00000012375 KIAA2012 (ENSPPRG00000013282) FZD7 (ENSPPRG00000012355) CDK15 (ENSPPRG00000013166) ALS2 (ENSPPRG00000012887) MPP4 (ENSPPRG00000012822) TMEM237 (ENSPPRG00000012249) Cat MODERN SPECIES 239 ZDBF2 (ENSFCAG00000041779) CMKLR2 (ENSFCAG00000028762) EEF1B2 (ENSFCAG00000010239) NDUFS1 (ENSFCAG00000023344) INO80D (ENSFCAG00000022035) NRP2 (ENSFCAG00000000423) PARD3B (ENSFCAG00000025870) ICOS (ENSFCAG00000038001) CTLA4 (ENSFCAG00000014272) CD28 (ENSFCAG00000014271) ENSFCAG00000034107 RAPH1 (ENSFCAG00000019050) ABI2 (ENSFCAG00000012982) CYP20A1 (ENSFCAG00000022927) ENSFCAG00000048141 ENSFCAG00000027770 ##22 NBEAL1 (ENSFCAG00000025997) CARF (ENSFCAG00000046458) WDR12 (ENSFCAG00000026676) ICA1L (ENSFCAG00000008514) FAM117B (ENSFCAG00000046269) BMPR2 (ENSFCAG00000014094) NOP58 (ENSFCAG00000014093) ENSFCAG00000031005 KIAA2012 (ENSFCAG00000027667) FZD7 (ENSFCAG00000012609) CDK15 (ENSFCAG00000000530) ALS2 (ENSFCAG00000004007) MPP4 (ENSFCAG00000004006) TMEM237 (ENSFCAG00000004003) C2CD6 (ENSFCAG00000009008) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d.b ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d.b ##22 leopard MODERN SPECIES 62 GBP3 (ENSPPRG00000024538) KYAT3 (ENSPPRG00000024297) GTF2B (ENSPPRG00000024228) PKN2 (ENSPPRG00000023367) LMO4 (ENSPPRG00000022948) ENSPPRG00000022731 ENSPPRG00000000985 HS2ST1 (ENSPPRG00000001594) SELENOF (ENSPPRG00000003036) SH3GLB1 (ENSPPRG00000005342) ENSPPRG00000008796 CLCA4 (ENSPPRG00000010047) CLCA1 (ENSPPRG00000010379) CLCA2 (ENSPPRG00000016194) ODF2L (ENSPPRG00000024565) ENSPPRG00000024439 ##22 COL24A1 (ENSPPRG00000024037) ZNHIT6 (ENSPPRG00000023340) CCN1 (ENSPPRG00000023322) ENSPPRG00000021077 DDAH1 (ENSPPRG00000000442) BCL10 (ENSPPRG00000000878) C1orf52 (ENSPPRG00000001522) SYDE2 (ENSPPRG00000002218) DNAI3 (ENSPPRG00000004873) MCOLN3 (ENSPPRG00000006193) MCOLN2 (ENSPPRG00000006914) LPAR3 (ENSPPRG00000006969) SSX2IP (ENSPPRG00000008492) ENSPPRG00000008708 CTBS (ENSPPRG00000008795) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3326 Mtx2 (ENSMSIG00000006053) Hoxd1 (ENSMSIG00000006137) Hoxd3 (ENSMSIG00000006158) ENSMSIG00000006186 Hoxd8 (ENSMSIG00000006283) Hoxd9 (ENSMSIG00000006304) Hoxd10 (ENSMSIG00000006313) Hoxd11 (ENSMSIG00000006326) Hoxd12 (ENSMSIG00000006333) Hoxd13 (ENSMSIG00000006348) Evx2 (ENSMSIG00000006361) Lnpk (ENSMSIG00000006386) ENSMSIG00000006495 Atp5g3 (ENSMSIG00000006512) Atf2 (ENSMSIG00000006546) ENSMSIG00000006659 ##22 Chn1 (ENSMSIG00000006692) Chrna1 (ENSMSIG00000006852) Wipf1 (ENSMSIG00000006899) Gpr155 (ENSMSIG00000006975) Scrn3 (ENSMSIG00000007111) Cir1 (ENSMSIG00000007130) Sp9 (ENSMSIG00000007182) Ola1 (ENSMSIG00000007200) ENSMSIG00000007302 ENSMSIG00000007310 Sp3 (ENSMSIG00000007322) ENSMSIG00000007399 Cdca7 (ENSMSIG00000007687) Map3k20 (ENSMSIG00000007713) Rapgef4 (ENSMSIG00000007773) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 MTR (ENSHGLG00000018165) ENSHGLG00000009800 ENSHGLG00000009879 ENSHGLG00000034223 ENSHGLG00000016129 HEATR1 (ENSHGLG00000016543) LGALS8 (ENSHGLG00000016074) EDARADD (ENSHGLG00000043766) ERO1B (ENSHGLG00000018091) GPR137B (ENSHGLG00000015957) NID1 (ENSHGLG00000017135) LYST (ENSHGLG00000015493) GNG4 (ENSHGLG00000037464) ENSHGLG00000039942 ENSHGLG00000016198 ENSHGLG00000006905 ##22 ENSHGLG00000019008 GGPS1 (ENSHGLG00000020898) ARID4B (ENSHGLG00000012546) RBM34 (ENSHGLG00000016495) ENSHGLG00000016770 ENSHGLG00000037951 ENSHGLG00000009866 TARBP1 (ENSHGLG00000011592) ENSHGLG00000012375 SLC35F3 (ENSHGLG00000049707) ENSHGLG00000034501 KCNK1 (ENSHGLG00000015891) ENSHGLG00000011707 MAP3K21 (ENSHGLG00000018159) PCNX2 (ENSHGLG00000013796) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 767 CRYL1 (ENSPSMG00000012898) GJB6 (ENSPSMG00000012910) ENSPSMG00000012916 GJB2 (ENSPSMG00000012922) GJA3 (ENSPSMG00000012927) ENSPSMG00000012935 GUCA2A (ENSPSMG00000012938) GUCA2B (ENSPSMG00000012946) ENSPSMG00000012960 ##22 HIVEP3 (ENSPSMG00000012971) EDN2 (ENSPSMG00000012980) FOXO6 (ENSPSMG00000012982) SCMH1 (ENSPSMG00000013066) ENSPSMG00000013181 SLFNL1 (ENSPSMG00000013189) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156338 ENSGT00940000160747 ENSGT00390000017418 ENSGT00390000001376.bb.a.a ENSGT00390000016565 ENSGT00940000155361 ENSGT00390000015719.c ENSGT00390000004191 ENSGT00950000183172.B ENSGT01090000260040.b.b.b.a ENSGT00940000156585 ENSGT00390000013174 ENSGT00940000155194 ENSGT00940000159314 ENSGT00390000004871.b.m.b ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 ENSGT00390000007879 ENSGT00940000153295.a.m.a ENSGT00940000163172 ENSGT00940000157740 ENSGT00860000134004 ENSGT00520000055567.b ENSGT00940000157260 ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00940000161879 ENSGT00940000159599 ENSGT01070000253847 ENSGT00390000004173 ENSGT00530000067301 ENSGT00950000183056.A.a ENSGT00940000158412 Bonobo MODERN SPECIES SLC9A1 (ENSPPAG00000043811) TENT5B (ENSPPAG00000035934) ENSPPAG00000041792 KDF1 (ENSPPAG00000030084) NUDC (ENSPPAG00000000217) NR0B2 (ENSPPAG00000039413) GPATCH3 (ENSPPAG00000032902) GPN2 (ENSPPAG00000039790) SFN (ENSPPAG00000013397) ZDHHC18 (ENSPPAG00000031507) PIGV (ENSPPAG00000033338) ARID1A (ENSPPAG00000035294) RPS6KA1 (ENSPPAG00000041102) ENSPPAG00000028434 ENSPPAG00000032129 ENSPPAG00000042179 ##22 DHDDS (ENSPPAG00000031128) LIN28A (ENSPPAG00000037906) ZNF683 (ENSPPAG00000038727) CRYBG2 (ENSPPAG00000021426) CD52 (ENSPPAG00000037302) ENSPPAG00000011359 UBXN11 (ENSPPAG00000031858) CEP85 (ENSPPAG00000035844) CATSPER4 (ENSPPAG00000001651) CNKSR1 (ENSPPAG00000042812) ZNF593OS (ENSPPAG00000038226) ZNF593 (ENSPPAG00000030063) C1orf232 (ENSPPAG00000031691) PDIK1L (ENSPPAG00000019009) TRIM63 (ENSPPAG00000042727) Chimpanzee MODERN SPECIES TENT5B (ENSPTRG00000000397) TRNP1 (ENSPTRG00000046384) ENSPTRG00000044717 KDF1 (ENSPTRG00000000396) NUDC (ENSPTRG00000000395) NR0B2 (ENSPTRG00000000394) GPATCH3 (ENSPTRG00000023419) GPN2 (ENSPTRG00000000392) SFN (ENSPTRG00000030723) ZDHHC18 (ENSPTRG00000051743) PIGV (ENSPTRG00000047988) ARID1A (ENSPTRG00000000388) RPS6KA1 (ENSPTRG00000000387) ENSPTRG00000048717 HMGN2 (ENSPTRG00000000386) ENSPTRG00000045505 ##22 DHDDS (ENSPTRG00000000385) LIN28A (ENSPTRG00000000384) ZNF683 (ENSPTRG00000000383) CRYBG2 (ENSPTRG00000000382) CD52 (ENSPTRG00000000381) UBXN11 (ENSPTRG00000000380) SH3BGRL3 (ENSPTRG00000047319) CEP85 (ENSPTRG00000000378) CATSPER4 (ENSPTRG00000000377) CNKSR1 (ENSPTRG00000048000) ENSPTRG00000050455 ZNF593 (ENSPTRG00000000375) C1H1orf232 (ENSPTRG00000050100) FAM110D (ENSPTRG00000022777) PDIK1L (ENSPTRG00000000374) Orangutan MODERN SPECIES ENSPPYG00000033121 TENT5B (ENSPPYG00000038825) TRNP1 (ENSPPYG00000036663) KDF1 (ENSPPYG00000001672) NUDC (ENSPPYG00000001673) NR0B2 (ENSPPYG00000001674) GPATCH3 (ENSPPYG00000001675) GPN2 (ENSPPYG00000001676) SFN (ENSPPYG00000001677) ZDHHC18 (ENSPPYG00000001678) PIGV (ENSPPYG00000001679) ARID1A (ENSPPYG00000001680) RPS6KA1 (ENSPPYG00000001681) HMGN2 (ENSPPYG00000001682) DHDDS (ENSPPYG00000001683) ENSPPYG00000014748 ##22 LIN28A (ENSPPYG00000001684) ZNF683 (ENSPPYG00000001685) CRYBG2 (ENSPPYG00000001686) CD52 (ENSPPYG00000001687) UBXN11 (ENSPPYG00000001688) SH3BGRL3 (ENSPPYG00000001689) CEP85 (ENSPPYG00000001690) ENSPPYG00000008742 CATSPER4 (ENSPPYG00000001691) CNKSR1 (ENSPPYG00000001692) ZNF593OS (ENSPPYG00000031753) ZNF593 (ENSPPYG00000001693) C1orf232 (ENSPPYG00000031495) FAM110D (ENSPPYG00000001694) PDIK1L (ENSPPYG00000035248) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 4 ENSPANG00000024833 STXBP1 (ENSPANG00000024829) NIBAN2 (ENSPANG00000024828) LRSAM1 (ENSPANG00000024820) ENSPANG00000024821 ZNF79 (ENSPANG00000024822) SLC2A8 (ENSPANG00000024823) GARNL3 (ENSPANG00000024824) ANGPTL2 (ENSPANG00000024826) ENSPANG00000024827 ZBTB34 (ENSPANG00000024819) RALGPS1 (ENSPANG00000024825) ZBTB43 (ENSPANG00000000295) LMX1B (ENSPANG00000024818) MVB12B (ENSPANG00000049397) ENSPANG00000050841 ##22 PBX3 (ENSPANG00000024812) ENSPANG00000051227 MAPKAP1 (ENSPANG00000024814) GAPVD1 (ENSPANG00000024816) HSPA5 (ENSPANG00000024811) ENSPANG00000024810 PPP6C (ENSPANG00000024802) SCAI (ENSPANG00000011266) GOLGA1 (ENSPANG00000017415) ARPC5L (ENSPANG00000044193) RPL35 (ENSPANG00000032631) WDR38 (ENSPANG00000007029) OLFML2A (ENSPANG00000025860) NR6A1 (ENSPANG00000025861) NR5A1 (ENSPANG00000025862) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ##22 Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 10256 ENSETEG00000000897 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 11957 ENSETEG00000019420 ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 33 ENSOTSG00005025444 ENSOTSG00005025441 nup155 (ENSOTSG00005025431) ENSOTSG00005025366 SLC1A3 (ENSOTSG00005025217) RANBP3L (ENSOTSG00005025207) skp2 (ENSOTSG00005025201) ENSOTSG00005024755 myo5b (ENSOTSG00005003595) #19 ENSOTSG00005003363 capslb (ENSOTSG00005003361) lmbrd2b (ENSOTSG00005001331) ppp1r3b (ENSOTSG00005001175) eri1 (ENSOTSG00005000916) ENSOTSG00005000796 ENSOTSG00005047487 ##22 nkx6.1 (ENSOTSG00005047486) gpat3 (ENSOTSG00005047195) abraxas1 (ENSOTSG00005047192) ENSOTSG00005047191 ENSOTSG00005047189 btc (ENSOTSG00005047188) slc45a2 (ENSOTSG00005047187) rxfp3 (ENSOTSG00005047185) rai14 (ENSOTSG00005047183) fgf10a (ENSOTSG00005047181) nnt (ENSOTSG00005046844) ENSOTSG00005046843 ENSOTSG00005046842 PDE6B (ENSOTSG00005046786) rbp4l (ENSOTSG00005046782) Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 4 ENSSSAG00000063799 ENSSSAG00000068186 SLC1A3 (ENSSSAG00000068621) RANBP3L (ENSSSAG00000068697) NADK2 (ENSSSAG00000068701) SKP2 (ENSSSAG00000068716) ENSSSAG00000068795 myo5b (ENSSSAG00000069046) #19 ENSSSAG00000105075 ENSSSAG00000009350 lmbrd2b (ENSSSAG00000070502) ENSSSAG00000092956 ppp1r3b (ENSSSAG00000071303) thex1 (ENSSSAG00000094462) ENSSSAG00000071317 ENSSSAG00000071322 ##22 nkx6.1 (ENSSSAG00000120093) gpat3 (ENSSSAG00000071359) ccd98 (ENSSSAG00000072520) ENSSSAG00000072522 HELQ (ENSSSAG00000072527) hpse (ENSSSAG00000072530) btc (ENSSSAG00000072537) ENSSSAG00000110559 slc45a2 (ENSSSAG00000072541) rxfp3 (ENSSSAG00000072545) rai14 (ENSSSAG00000072556) fgf10a (ENSSSAG00000072596) nnt (ENSSSAG00000072639) ENSSSAG00000090561 fyb (ENSSSAG00000074513) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1456 MFHAS1 (ENSSPAG00000008233) rpl17 (ENSSPAG00000008247) ##22 nkx6.1 (ENSSPAG00000008326) gpat3 (ENSSPAG00000008367) abraxas1 (ENSSPAG00000008673) mrps18c (ENSSPAG00000008687) HELQ (ENSSPAG00000008705) ppp3ccb (ENSSPAG00000008755) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Midas cichlid MODERN SPECIES 573 ENSACIG00000020015 ENSACIG00000020036 MFHAS1 (ENSACIG00000020042) rpl17 (ENSACIG00000020062) ##22 nkx6.1 (ENSACIG00000020153) gpat3 (ENSACIG00000020168) abraxas1 (ENSACIG00000020189) HELQ (ENSACIG00000020216) mrps18c (ENSACIG00000020253) hpse (ENSACIG00000020277) ppp3ccb (ENSACIG00000020334) dmtn (ENSACIG00000020357) pbdc1 (ENSACIG00000020377) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Electric eel MODERN SPECIES 34 spon2a (ENSEEEG00000014958) KDM3B (ENSEEEG00000014784) reep2 (ENSEEEG00000014767) egr1 (ENSEEEG00000014764) smim19 (ENSEEEG00000014762) si:ch211-175m2.5 (ENSEEEG00000014760) TMEM132C (ENSEEEG00000014738) ENSEEEG00000014736 smpd4 (ENSEEEG00000014671) med15 (ENSEEEG00000014633) crkl (ENSEEEG00000014627) ENSEEEG00000014615 pgam2 (ENSEEEG00000014613) neflb (ENSEEEG00000014611) nefma (ENSEEEG00000014609) rpl17 (ENSEEEG00000014601) ##22 nkx6.1 (ENSEEEG00000014599) gpat3 (ENSEEEG00000014590) abraxas1 (ENSEEEG00000014584) mrps18c (ENSEEEG00000014582) HELQ (ENSEEEG00000014526) hpse (ENSEEEG00000014517) MYL5 (ENSEEEG00000014516) btc (ENSEEEG00000014515) amacr (ENSEEEG00000014511) slc45a2 (ENSEEEG00000014510) rxfp3 (ENSEEEG00000014508) ENSEEEG00000014507 rai14 (ENSEEEG00000014500) fgf10a (ENSEEEG00000014495) nnt (ENSEEEG00000013559) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.a.a ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 4498 rpl17 (ENSSGRG00000003457) ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT01100000266768 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.b ##22 ENSGT00940000170114 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000159487 ENSGT00950000183005.a.b ##16 ENSGT00940000158867 #7 ENSGT00940000160973 #8 ENSGT00940000157435 #9 ENSGT00730000111224 #10 ENSGT00950000183134.c.b #11 ENSGT00940000159850 #13 ENSGT00940000166139 ENSGT00940000164634 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234626.D #20 ENSGT00940000159394 #21 ENSGT00950000183010.a.b ##22 ENSGT00940000170114 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 34 POLI (ENSSMRG00000016509) MBD2 (ENSSMRG00000016511) ##16 DCC (ENSSMRG00000016526) #7 ENSSMRG00000016529 MEX3C (ENSSMRG00000016531) #8 SMAD4 (ENSSMRG00000016533) #9 ELAC1 (ENSSMRG00000016541) #10 ME2 (ENSSMRG00000016542) #11 MAPK4 (ENSSMRG00000016550) #13 ENSSMRG00000016552 ENSSMRG00000016555 ENSSMRG00000016557 MYO5B (ENSSMRG00000016569) #19 ACAA2 (ENSSMRG00000016578) #20 LIPG (ENSSMRG00000016580) #21 RPL17 (ENSSMRG00000016581) ##22 C18orf32 (ENSSMRG00000016584) #23 DYM (ENSSMRG00000016587) #24 SMAD7 (ENSSMRG00000016590) #25 CTIF (ENSSMRG00000016591) #26 ENSSMRG00000016592 ZBTB7C (ENSSMRG00000016594) #27 SMAD2 (ENSSMRG00000016595) #28 SKOR2 (ENSSMRG00000000124) #29 IER3IP1 (ENSSMRG00000000137) #30 HDHD2 (ENSSMRG00000000191) #31 KATNAL2 (ENSSMRG00000000219) #32 PIAS2 (ENSSMRG00000000256) #33 ENSSMRG00000000298 ST8SIA5 (ENSSMRG00000000377) #34 LOXHD1 (ENSSMRG00000000443) #35 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Golden eagle MODERN SPECIES 91 MBD2 (ENSACCG00020009819) ##16 DCC (ENSACCG00020009773) #7 ENSACCG00020009660 MEX3C (ENSACCG00020009646) #8 SMAD4 (ENSACCG00020009624) #9 ELAC1 (ENSACCG00020009599) #10 ENSACCG00020009582 ME2 (ENSACCG00020009563) #11 MAPK4 (ENSACCG00020009547) #13 ENSACCG00020009534 ENSACCG00020009516 ENSACCG00020009495 MYO5B (ENSACCG00020016656) #19 ACAA2 (ENSACCG00020016573) #20 LIPG (ENSACCG00020016557) #21 RPL17 (ENSACCG00020016537) ##22 C18orf32 (ENSACCG00020016535) #23 DYM (ENSACCG00020016531) #24 SMAD7 (ENSACCG00020016530) #25 CTIF (ENSACCG00020016528) #26 ZBTB7C (ENSACCG00020016526) #27 SMAD2 (ENSACCG00020016518) #28 SKOR2 (ENSACCG00020016513) #29 IER3IP1 (ENSACCG00020016510) #30 HDHD2 (ENSACCG00020016506) #31 KATNAL2 (ENSACCG00020016503) #32 PIAS2 (ENSACCG00020016500) #33 ENSACCG00020016495 ST8SIA5 (ENSACCG00020016492) #34 LOXHD1 (ENSACCG00020016482) #35 RNF165 (ENSACCG00020016454) #36 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 362 Dcc (ENSDORG00000001861) #7 Mex3c (ENSDORG00000025473) #8 Smad4 (ENSDORG00000009089) #9 Elac1 (ENSDORG00000025215) #10 ENSDORG00000024602 Me2 (ENSDORG00000010848) #11 Mro (ENSDORG00000004230) #12 ENSDORG00000028529 #13 ENSDORG00000013704 Cxxc1 (ENSDORG00000000890) #15 Mbd1 (ENSDORG00000013917) #16 ENSDORG00000013915 #18 Myo5b (ENSDORG00000013047) #19 Acaa2 (ENSDORG00000012365) #20 Lipg (ENSDORG00000015147) #21 ENSDORG00000026216 ##22 BC031181 (ENSDORG00000000327) #23 Dym (ENSDORG00000029874) #24 Smad7 (ENSDORG00000001837) #25 Ctif (ENSDORG00000003221) #26 Zbtb7c (ENSDORG00000002188) #27 Smad2 (ENSDORG00000013015) #28 Skor2 (ENSDORG00000012420) #29 ENSDORG00000027748 #30 Hdhd2 (ENSDORG00000012417) #31 Katnal2 (ENSDORG00000005500) #32 Coelacanth MODERN SPECIES 2149 RPL17 (ENSLACG00000008835) ##22 ENSLACG00000009142 #23 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00390000018741 #23 ENSGT00390000008772 #24 ENSGT00940000159872 #25 ENSGT00940000153432.A.b #26 ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 #27 ENSGT00940000153499.a #28 ENSGT00940000160474 #29 ENSGT00510000047648 #30 ENSGT00940000155805 #31 ENSGT00940000157302 #32 ENSGT00390000012082 ENSGT00390000016188 ENSGT00940000158864 ENSGT00940000160904 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00940000158907 ENSGT00390000004624.a.a ENSGT00940000153432.B ##26 ENSGT00940000175038 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00390000005102 ENSGT00940000156471.a ENSGT00510000047107.B ENSGT00390000015494 ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.B ENSGT00940000159475.c ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000156901.B ENSGT00510000048748 ENSGT00510000048556 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157438.c ENSGT00670000098179.d.b ENSGT00670000098179.d.a ENSGT00390000005102 ENSGT00940000156471.a ENSGT00510000047107.B ENSGT00390000015494 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00390000009453.gb ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.B ENSGT00940000159475.c ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234518.B.a.a ENSGT00960000187050 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907 ENSGT00390000004624.a.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000015757 ENSGT00940000164013 ENSGT00670000098179.d.b ENSGT00670000098179.d.a ENSGT00390000005102 ENSGT00940000156471.a ENSGT00510000047107.B ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00390000009453.gb ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.B ENSGT00940000159475.c ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234518.B.a.a ENSGT01030000234551.i ENSGT00910000144271.C ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907 Asian bonytongue MODERN SPECIES 21 ENSSFOG00015018872 ENSSFOG00015027919 ENSSFOG00015024946 hspb9l (ENSSFOG00015018907) atp5mea (ENSSFOG00015032769) PDE6B (ENSSFOG00015018946) rbp4l (ENSSFOG00015018987) slc26a1 (ENSSFOG00015033212) zgc:86764 (ENSSFOG00015019069) ENSSFOG00015019096 dusp4 (ENSSFOG00015019120) tnksb (ENSSFOG00015019144) ppp1r3b (ENSSFOG00015031266) eri1 (ENSSFOG00015031603) MFHAS1 (ENSSFOG00015019302) rpl17 (ENSSFOG00015019318) ##22 nkx6.1 (ENSSFOG00015019392) agpat9l (ENSSFOG00015019403) abraxas1 (ENSSFOG00015019434) mrps18c (ENSSFOG00015032365) HELQ (ENSSFOG00015019460) hpse (ENSSFOG00015019513) MYL5 (ENSSFOG00015019520) btc (ENSSFOG00015019539) amacr (ENSSFOG00015019554) slc45a2 (ENSSFOG00015019563) RXFP3 (ENSSFOG00015030645) ENSSFOG00015019596 rai14 (ENSSFOG00015019611) fgf10b (ENSSFOG00015030737) nnt (ENSSFOG00015019697) P. kingsleyae MODERN SPECIES 9 KCNV2 (ENSPKIG00000022294) pum3 (ENSPKIG00000022249) ENSPKIG00000022185 ENSPKIG00000022165 atp5meb (ENSPKIG00000022156) hspb9l (ENSPKIG00000022145) PDE6B (ENSPKIG00000022117) slc26a1 (ENSPKIG00000022094) zgc:86764 (ENSPKIG00000022057) ENSPKIG00000022021 dusp4 (ENSPKIG00000021994) tnksb (ENSPKIG00000021889) ppp1r3b (ENSPKIG00000021852) eri1 (ENSPKIG00000021836) MFHAS1 (ENSPKIG00000021824) rpl17 (ENSPKIG00000021790) ##22 nkx6.1 (ENSPKIG00000021776) gpat3 (ENSPKIG00000021754) abraxas1 (ENSPKIG00000021725) mrps18c (ENSPKIG00000021736) HELQ (ENSPKIG00000021702) hpse (ENSPKIG00000021681) MYL5 (ENSPKIG00000020953) btc (ENSPKIG00000020696) amacr (ENSPKIG00000020682) slc45a2 (ENSPKIG00000020666) rxfp3 (ENSPKIG00000020655) ENSPKIG00000020640 rai14 (ENSPKIG00000020593) fgf10b (ENSPKIG00000020575) nnt (ENSPKIG00000020489) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00940000165184 ENSGT00940000157438.c ENSGT00390000005102 ENSGT00940000156471.a ENSGT00510000047107.B ENSGT00390000015494 ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00390000009453.gb ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.B ENSGT00940000159475.c ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000155855 ENSGT00940000158907.d ENSGT00940000153432.B ##26 ENSGT00500000044987 ENSGT00390000002096 ENSGT00940000165259.a ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234908 ENSGT00510000048500 ENSGT00940000156466 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000156466 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000156466 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 3 sptan1 (ENSMMDG00005024759) ODF2 (ENSMMDG00005024754) SCAI (ENSMMDG00005024753) ppp6c (ENSMMDG00005024752) ENSMMDG00005024751 smarcb1b (ENSMMDG00005024750) derl2 (ENSMMDG00005024749) ENSMMDG00005024748 ENSMMDG00005024747 cfap53 (ENSMMDG00005024746) myo5b (ENSMMDG00005023295) #19 ENSMMDG00005023113 capslb (ENSMMDG00005023108) lmbrd2b (ENSMMDG00005023002) ENSMMDG00005022986 rpl17 (ENSMMDG00005022980) ##22 nkx6.1 (ENSMMDG00005022979) gpat3 (ENSMMDG00005022976) abraxas1 (ENSMMDG00005022974) mrps18c (ENSMMDG00005022973) HELQ (ENSMMDG00005022960) hpse (ENSMMDG00005022951) MYL5 (ENSMMDG00005022949) ppp3ccb (ENSMMDG00005021889) dmtn (ENSMMDG00005021847) pbdc1 (ENSMMDG00005021844) xpo7 (ENSMMDG00005021048) GFRA2 (ENSMMDG00005021022) ENSMMDG00005021018 ENSMMDG00005021017 ATP6V1B2 (ENSMMDG00005020967) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000156466 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 207 hsdl2 (ENSHCOG00000012961) ppp3ccb (ENSHCOG00000013023) ppp1r3b (ENSHCOG00000013035) ppp1r3b (ENSHCOG00000013073) MFHAS1 (ENSHCOG00000013081) rpl17 (ENSHCOG00000013096) ##22 nkx6.1 (ENSHCOG00000013141) abraxas1 (ENSHCOG00000000659) mrps18c (ENSHCOG00000013161) HELQ (ENSHCOG00000013179) ENSHCOG00000000676 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153662.B ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.a ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000015874 ENSGT00940000153662.B ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155147 ENSGT00940000154399 ENSGT01020000232179 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000048500 ENSGT00510000049239.b.a ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155147 ENSGT00940000154399 ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT01020000232179 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000049239.b.a ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.a ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Zig-zag eel MODERN SPECIES 3 ENSMAMG00000026525 hsdl2 (ENSMAMG00000012828) PTBP3 (ENSMAMG00000012797) ugcg (ENSMAMG00000012770) ENSMAMG00000012753 ENSMAMG00000012737 ENSMAMG00000012728 ENSMAMG00000012715 ENSMAMG00000012623 #19 ENSMAMG00000012606 ENSMAMG00000012597 ENSMAMG00000012591 ENSMAMG00000012536 ENSMAMG00000012527 ENSMAMG00000012520 ENSMAMG00000012465 ##22 nkx6.1 (ENSMAMG00000012450) ENSMAMG00000012447 gpat3 (ENSMAMG00000012423) abraxas1 (ENSMAMG00000012397) mrps18c (ENSMAMG00000026215) HELQ (ENSMAMG00000012364) hpse (ENSMAMG00000012352) ENSMAMG00000012337 ENSMAMG00000012284 dmtn (ENSMAMG00000012271) pbdc1 (ENSMAMG00000012250) xpo7 (ENSMAMG00000012156) GFRA2 (ENSMAMG00000012126) ENSMAMG00000012090 ENSMAMG00000012062 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154399 ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.a ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000161682.i ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c Climbing perch MODERN SPECIES 3 ENSATEG00000023224 ENSATEG00000023228 ENSATEG00000027059 ENSATEG00000023245 ENSATEG00000023251 ENSATEG00000023263 ENSATEG00000023290 ENSATEG00000023303 #19 ENSATEG00000023327 ENSATEG00000023331 ENSATEG00000023334 ENSATEG00000023346 ENSATEG00000023366 ENSATEG00000023381 ENSATEG00000023384 ENSATEG00000023387 ##22 nkx6.1 (ENSATEG00000023404) gpat3 (ENSATEG00000023407) abraxas1 (ENSATEG00000026181) mrps18c (ENSATEG00000027902) HELQ (ENSATEG00000023420) ENSATEG00000023434 hpse (ENSATEG00000023437) ENSATEG00000023445 ENSATEG00000023456 dmtn (ENSATEG00000023472) pbdc1 (ENSATEG00000025714) xpo7 (ENSATEG00000023484) GFRA2 (ENSATEG00000000060) ENSATEG00000000167 dusp11 (ENSATEG00000000234) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 3 ENSBSLG00000008822 hsdl2 (ENSBSLG00000008841) PTBP3 (ENSBSLG00000008884) ugcg (ENSBSLG00000009078) ENSBSLG00000009149 ENSBSLG00000009176 ENSBSLG00000009255 ENSBSLG00000010325 myo5b (ENSBSLG00000010335) #19 ENSBSLG00000010687 capslb (ENSBSLG00000010741) ENSBSLG00000010780 lmbrd2b (ENSBSLG00000010833) ppp1r3b (ENSBSLG00000010990) MFHAS1 (ENSBSLG00000010998) rpl17 (ENSBSLG00000011009) ##22 nkx6.1 (ENSBSLG00000011617) abraxas1 (ENSBSLG00000011978) mrps18c (ENSBSLG00000012122) HELQ (ENSBSLG00000012143) ENSBSLG00000012336 ppp3ccb (ENSBSLG00000012409) dmtn (ENSBSLG00000013003) pbdc1 (ENSBSLG00000013015) xpo7 (ENSBSLG00000013212) GFRA2 (ENSBSLG00000013611) ATP6V1B2 (ENSBSLG00000014065) dusp11 (ENSBSLG00000014263) ENSBSLG00000014278 ENSBSLG00000014293 tcf7l1a (ENSBSLG00000014304) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154399 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000048500 ENSGT00510000049239.b.a ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000015874 ENSGT00940000155147 ENSGT00940000154399 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000048500 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b.l #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Turbot MODERN SPECIES 7 ENSSMAG00000008869 ENSSMAG00000008852 ENSSMAG00000008848 ENSSMAG00000008820 ENSSMAG00000008792 ugcg (ENSSMAG00000008731) PTBP3 (ENSSMAG00000008658) hsdl2 (ENSSMAG00000008441) ENSSMAG00000008409 ENSSMAG00000031401 ENSSMAG00000029577 ENSSMAG00000008284 #19 ENSSMAG00000031721 ENSSMAG00000008242 ENSSMAG00000008230 ENSSMAG00000008225 ##22 nkx6.1 (ENSSMAG00000008198) gpat3 (ENSSMAG00000035292) abraxas1 (ENSSMAG00000037441) mrps18c (ENSSMAG00000037445) HELQ (ENSSMAG00000031179) ENSSMAG00000038004 ENSSMAG00000031785 dmtn (ENSSMAG00000024114) pbdc1 (ENSSMAG00000029601) xpo7 (ENSSMAG00000032317) ENSSMAG00000036211 ENSSMAG00000009149 ENSSMAG00000021812 ENSSMAG00000009165 ENSSMAG00000009168 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES ENSCSEG00000005132 ENSCSEG00000005129 trpc5a (ENSCSEG00000005117) cnpy3 (ENSCSEG00000005112) dachb (ENSCSEG00000005103) ENSCSEG00000005073 stk26 (ENSCSEG00000005056) zgc:77880 (ENSCSEG00000005054) ENSCSEG00000005048 pip4p1b (ENSCSEG00000005042) ENSCSEG00000005021 ENSCSEG00000005015 dysf (ENSCSEG00000004989) cyp26b1 (ENSCSEG00000004973) camk2d1 (ENSCSEG00000004948) rpl17 (ENSCSEG00000004760) ##22 ARSJ (ENSCSEG00000004731) mad2l1 (ENSCSEG00000004726) pde5ab (ENSCSEG00000004689) ENSCSEG00000004679 ENSCSEG00000004675 zcchc4 (ENSCSEG00000004671) ABLIM2 (ENSCSEG00000004654) AFAP1 (ENSCSEG00000004634) STIM2 (ENSCSEG00000004617) tbc1d19 (ENSCSEG00000004592) CCKAR (ENSCSEG00000004584) RBPJ (ENSCSEG00000004581) smim20 (ENSCSEG00000004579) ENSCSEG00000004575 ENSCSEG00000004573 Tongue sole MODERN SPECIES 5 wdr36 (ENSCSEG00000020460) slc25a46 (ENSCSEG00000020462) slc31a1 (ENSCSEG00000020464) atp6v1g1 (ENSCSEG00000020466) ENSCSEG00000020470 ugcg (ENSCSEG00000020477) PTBP3 (ENSCSEG00000020483) hsdl2 (ENSCSEG00000020489) capslb (ENSCSEG00000020500) ENSCSEG00000020503 myo5b (ENSCSEG00000020510) #19 ENSCSEG00000020514 #19 ENSCSEG00000020516 lmbrd2b (ENSCSEG00000020521) MFHAS1 (ENSCSEG00000020534) rpl17 (ENSCSEG00000020536) ##22 ENSCSEG00000000698 gpat3 (ENSCSEG00000000703) abraxas1 (ENSCSEG00000000705) mrps18c (ENSCSEG00000000711) HELQ (ENSCSEG00000000724) hpse (ENSCSEG00000000739) MYL5 (ENSCSEG00000000748) ppp3ccb (ENSCSEG00000000754) PLPP1 (ENSCSEG00000000770) CSGALNACT1 (ENSCSEG00000000782) nxnl2 (ENSCSEG00000000798) gng10 (ENSCSEG00000000805) ENSCSEG00000000810 rxfp3 (ENSCSEG00000000813) slc45a2 (ENSCSEG00000000815) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000161682.i ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Barramundi perch MODERN SPECIES 671 ENSLCAG00010017920 ENSLCAG00010017922 ENSLCAG00010017923 ENSLCAG00010017927 ENSLCAG00010017929 lmbrd2b (ENSLCAG00010017947) ppp1r3b (ENSLCAG00010018006) MFHAS1 (ENSLCAG00010018007) rpl17 (ENSLCAG00010018008) ##22 nkx6.1 (ENSLCAG00010018021) Seriola ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000161682.i ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b Greater amberjack MODERN SPECIES 224 ENSSDUG00000015917 lmbrd2b (ENSSDUG00000015850) ppp1r3b (ENSSDUG00000015830) MFHAS1 (ENSSDUG00000015819) rpl17 (ENSSDUG00000015761) ##22 nkx6.1 (ENSSDUG00000015738) gpat3 (ENSSDUG00000015712) abraxas1 (ENSSDUG00000015688) mrps18c (ENSSDUG00000015676) HELQ (ENSSDUG00000015665) hpse (ENSSDUG00000015608) ENSSDUG00000015581 ppp3ccb (ENSSDUG00000015519) dmtn (ENSSDUG00000015467) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2083 rpl17 (ENSSLDG00000014775) ##22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.a ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.b.a.a ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000165151.a ENSGT00390000003828 ENSGT00940000166276 ENSGT00730000111276 ENSGT00940000176908 ENSGT00940000161616.c ENSGT00940000156744.p ENSGT00390000004524 ENSGT00530000064123 ENSGT00940000165981 ENSGT00390000001761 ENSGT00440000039084.a.b ENSGT00940000155214.k.a ENSGT00530000062932 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 ENSGT00940000157038.a.b Fugu MODERN SPECIES 18 bspry (ENSTRUG00000018663) coq4 (ENSTRUG00000026778) ENSTRUG00000018661 fbxw5 (ENSTRUG00000018660) ENSTRUG00000022499 prdm12b (ENSTRUG00000018659) fubp3 (ENSTRUG00000018658) ASS1 (ENSTRUG00000018657) surf4 (ENSTRUG00000018656) surf2 (ENSTRUG00000018655) bbln (ENSTRUG00000028996) ENSTRUG00000018653 dnm1a (ENSTRUG00000018652) golga2 (ENSTRUG00000018651) MFHAS1 (ENSTRUG00000018650) rpl17 (ENSTRUG00000025797) ##22 NKX6-1 (ENSTRUG00000026306) gpat3 (ENSTRUG00000018646) abraxas1 (ENSTRUG00000018645) mrps18c (ENSTRUG00000028095) HELQ (ENSTRUG00000018644) hpse (ENSTRUG00000018643) ppp3ccb (ENSTRUG00000018642) dmtn (ENSTRUG00000018641) pbdc1 (ENSTRUG00000027342) xpo7 (ENSTRUG00000001082) ENSTRUG00000032753 ENSTRUG00000030281 ENSTRUG00000033476 GFRA2 (ENSTRUG00000018638) ATP6V1B2 (ENSTRUG00000018637) Tetraodon MODERN SPECIES 19 zmynd19 (ENSTNIG00000009025) bspry (ENSTNIG00000009024) coq4 (ENSTNIG00000009023) ENSTNIG00000009022 fbxw5 (ENSTNIG00000009021) prdm12b (ENSTNIG00000009020) fubp3 (ENSTNIG00000009019) ASS1 (ENSTNIG00000009018) surf4 (ENSTNIG00000004786) surf2 (ENSTNIG00000009017) bbln (ENSTNIG00000009016) ENSTNIG00000009015 dnm1a (ENSTNIG00000009014) golga2 (ENSTNIG00000009013) MFHAS1 (ENSTNIG00000009012) rpl17 (ENSTNIG00000009011) ##22 nkx6.1 (ENSTNIG00000009010) gpat3 (ENSTNIG00000005676) abraxas1 (ENSTNIG00000005675) mrps18c (ENSTNIG00000005674) HELQ (ENSTNIG00000005673) hpse (ENSTNIG00000005672) ppp3ccb (ENSTNIG00000005671) dmtn (ENSTNIG00000005670) pbdc1 (ENSTNIG00000005669) xpo7 (ENSTNIG00000004671) GFRA2 (ENSTNIG00000013609) ENSTNIG00000000400 ENSTNIG00000013608 ENSTNIG00000013607 dusp11 (ENSTNIG00000013606) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153662.B ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.b.a.a.d ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Ballan wrasse MODERN SPECIES 94 ENSLBEG00000020263 capslb (ENSLBEG00000020249) ENSLBEG00000020087 lmbrd2b (ENSLBEG00000019883) ENSLBEG00000019807 ENSLBEG00000019795 ENSLBEG00000019719 myo5b (ENSLBEG00000019611) #19 ENSLBEG00000019590 capslb (ENSLBEG00000019559) ENSLBEG00000019533 hsdl2 (ENSLBEG00000019478) PTBP3 (ENSLBEG00000019422) ugcg (ENSLBEG00000019387) MFHAS1 (ENSLBEG00000019368) rpl17 (ENSLBEG00000019276) ##22 nkx6.1 (ENSLBEG00000019245) gpat3 (ENSLBEG00000019197) mrps18c (ENSLBEG00000019174) abraxas1 (ENSLBEG00000019087) HELQ (ENSLBEG00000019017) hpse (ENSLBEG00000018994) ppp3ccb (ENSLBEG00000018935) dmtn (ENSLBEG00000018887) pbdc1 (ENSLBEG00000018849) xpo7 (ENSLBEG00000018784) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153662.B ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.b.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000049239.b.a ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.b.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005032024 ENSDLAG00005005667 ENSDLAG00005005593 GFRA2 (ENSDLAG00005027802) pbdc1 (ENSDLAG00005034167) xpo7 (ENSDLAG00005003106) ENSDLAG00005027132 ENSDLAG00005026881 ENSDLAG00005024328 HELQ (ENSDLAG00005024295) mrps18c (ENSDLAG00005024288) abraxas1 (ENSDLAG00005024284) gpat3 (ENSDLAG00005024256) ENSDLAG00005028985 ENSDLAG00005024227 ENSDLAG00005024234 ##22 ENSDLAG00005034189 ENSDLAG00005014478 ENSDLAG00005026354 ENSDLAG00005027118 ENSDLAG00005033707 meis2b (ENSDLAG00005020388) gjd2b (ENSDLAG00005020379) stxbp6l (ENSDLAG00005028205) ENSDLAG00005031790 ddhd1b (ENSDLAG00005020357) ENSDLAG00005027981 cgrrf1 (ENSDLAG00005020351) psmc6 (ENSDLAG00005020310) ptger2b (ENSDLAG00005020304) ENSDLAG00005030521 Large yellow croaker MODERN SPECIES 4 wdr36 (ENSLCRG00005010849) slc31a1 (ENSLCRG00005010843) atp6v1g1 (ENSLCRG00005010840) lmbrd2b (ENSLCRG00005010429) ENSLCRG00005010421 myo5b (ENSLCRG00005010248) #19 ENSLCRG00005010235 capslb (ENSLCRG00005010234) hsdl2 (ENSLCRG00005010231) PTBP3 (ENSLCRG00005009967) ugcg (ENSLCRG00005009826) ENSLCRG00005009819 ENSLCRG00005008449 MFHAS1 (ENSLCRG00005008444) ppp1r3b (ENSLCRG00005008443) rpl17 (ENSLCRG00005008438) ##22 nkx6.1 (ENSLCRG00005008436) ENSLCRG00005008435 abraxas1 (ENSLCRG00005008434) ENSLCRG00005008433 scarb1 (ENSLCRG00005008418) ENSLCRG00005008408 ENSLCRG00005008406 grk5 (ENSLCRG00005007823) ash2l (ENSLCRG00005007401) pnx (ENSLCRG00005007387) aebp1a (ENSLCRG00005007327) ddx56 (ENSLCRG00005006878) DUSP26 (ENSLCRG00005006873) ENSLCRG00005006869 ZMIZ2 (ENSLCRG00005006864) ##33 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.b ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.b.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT00940000165965 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT00940000165965 ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000156732.a.a ENSGT00390000011010.a.a Lumpfish MODERN SPECIES 3 dab2ipb (ENSCLMG00005012038) zgc:63972 (ENSCLMG00005012001) fibcd1b (ENSCLMG00005011669) ENSCLMG00005011667 ENSCLMG00005011666 ENSCLMG00005011665 aif1l (ENSCLMG00005011663) zgc:171695 (ENSCLMG00005011662) capslb (ENSCLMG00005011661) ENSCLMG00005011660 myo5b (ENSCLMG00005010955) #19 ENSCLMG00005010944 ENSCLMG00005010943 lmbrd2b (ENSCLMG00005010878) MFHAS1 (ENSCLMG00005010874) rpl17 (ENSCLMG00005010868) ##22 nkx6.1 (ENSCLMG00005010867) ENSCLMG00005010866 ENSCLMG00005010865 mrps18c (ENSCLMG00005010864) HELQ (ENSCLMG00005010853) hpse (ENSCLMG00005010845) PPP3CB (ENSCLMG00005006624) dmtn (ENSCLMG00005006579) pbdc1 (ENSCLMG00005006578) xpo7 (ENSCLMG00005006304) ENSCLMG00005006283 ENSCLMG00005006281 dusp11 (ENSCLMG00005006277) ENSCLMG00005006275 tcf7l1a (ENSCLMG00005006271) Stickleback MODERN SPECIES 214 ENSGACG00000013484 capslb (ENSGACG00000013479) ENSGACG00000013478 myo5b (ENSGACG00000013454) #19 lmbrd2b (ENSGACG00000013445) ppp1r3b (ENSGACG00000013442) MFHAS1 (ENSGACG00000013440) rpl17 (ENSGACG00000013435) ##22 nkx6.1 (ENSGACG00000013430) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 Channel bull blenny MODERN SPECIES 145 MFHAS1 (ENSCGOG00000015833) rpl17 (ENSCGOG00000015837) ##22 nkx6.1 (ENSCGOG00000015847) nkx6.1 (ENSCGOG00000015851) Pike perch MODERN SPECIES 354 ENSSLUG00000024270 ppp1r3b (ENSSLUG00000024279) MFHAS1 (ENSSLUG00000024280) rpl17 (ENSSLUG00000024287) ##22 ENSSLUG00000024304 nkx6.1 (ENSSLUG00000024305) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153662.B ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.a ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153662.B ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00390000012898 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.a ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 ENSGT00940000157038.a.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00940000153662.B ENSGT00390000015874 ENSGT00940000154399 ENSGT00940000155147 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01090000260978 ENSGT00940000159475.c ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 ENSGT00940000157038.a.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00940000153662.B ENSGT00390000015874 ENSGT00940000154399 ENSGT00940000155147 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01090000260978 ENSGT00940000159475.c ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000156732.a.a Indian medaka MODERN SPECIES 30 ENSOMEG00000005407 ENSOMEG00000005378 ENSOMEG00000005366 wdr36 (ENSOMEG00000005342) slc25a46 (ENSOMEG00000005317) atp6v1g1 (ENSOMEG00000005297) slc31a1 (ENSOMEG00000005286) ENSOMEG00000005253 capslb (ENSOMEG00000005269) ENSOMEG00000005239 myo5b (ENSOMEG00000005222) #19 ENSOMEG00000005130 ppp1r3b (ENSOMEG00000005119) lmbrd2b (ENSOMEG00000005113) MFHAS1 (ENSOMEG00000005094) rpl17 (ENSOMEG00000005081) ##22 nkx6.1 (ENSOMEG00000005058) gpat3 (ENSOMEG00000005047) abraxas1 (ENSOMEG00000005029) mrps18c (ENSOMEG00000005009) HELQ (ENSOMEG00000004983) hpse (ENSOMEG00000004923) ppp3ccb (ENSOMEG00000004900) dmtn (ENSOMEG00000004866) pbdc1 (ENSOMEG00000004797) xpo7 (ENSOMEG00000004832) ENSOMEG00000004783 GFRA2 (ENSOMEG00000004769) ENSOMEG00000000874 ATP6V1B2 (ENSOMEG00000004736) ENSOMEG00000004713 Javanese ricefish MODERN SPECIES 3 hsdl2 (ENSOJAG00000016016) ugcg (ENSOJAG00000016010) MOCS2 (ENSOJAG00000015998) ENSOJAG00000015976 ENSOJAG00000015884 wdr36 (ENSOJAG00000015764) slc25a46 (ENSOJAG00000015735) atp6v1g1 (ENSOJAG00000015700) slc31a1 (ENSOJAG00000015685) capslb (ENSOJAG00000015672) ENSOJAG00000015658 myo5b (ENSOJAG00000015623) #19 ENSOJAG00000015608 ppp1r3b (ENSOJAG00000015591) MFHAS1 (ENSOJAG00000015475) rpl17 (ENSOJAG00000015430) ##22 nkx6.1 (ENSOJAG00000015395) abraxas1 (ENSOJAG00000015086) mrps18c (ENSOJAG00000015075) ENSOJAG00000014738 hpse (ENSOJAG00000014729) ppp3ccb (ENSOJAG00000012553) dmtn (ENSOJAG00000012376) pbdc1 (ENSOJAG00000012370) ENSOJAG00000012326 GFRA2 (ENSOJAG00000012287) dusp11 (ENSOJAG00000012276) ENSOJAG00000012269 tcf7l1a (ENSOJAG00000012257) ENSOJAG00000012239 ENSOJAG00000012228 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT01030000234638.b.b.d ENSGT00940000153662.B ENSGT00390000015874 ENSGT00940000154399 ENSGT00940000155147 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01090000260978 ENSGT00940000159475.c ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00990000208027 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 ENSGT00940000157038.a.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 3 ENSORLG00000028512 ENSORLG00000022307 ENSORLG00000024245 wdr36 (ENSORLG00000019652) slc25a46 (ENSORLG00000019508) atp6v1g1 (ENSORLG00000024931) slc31a1 (ENSORLG00000019615) capslb (ENSORLG00000028878) ENSORLG00000022007 myo5b (ENSORLG00000018326) #19 myo5b (ENSORLG00000028096) #19 ENSORLG00000028036 ppp1r3b (ENSORLG00000020468) lmbrd2b (ENSORLG00000022269) MFHAS1 (ENSORLG00000022182) rpl17 (ENSORLG00000028403) ##22 ENSORLG00000028484 nkx6.1 (ENSORLG00000019018) gpat3 (ENSORLG00000023001) abraxas1 (ENSORLG00000022037) ENSORLG00000027371 HELQ (ENSORLG00000022717) hpse (ENSORLG00000020343) ppp3ccb (ENSORLG00000026198) dmtn (ENSORLG00000030150) pbdc1 (ENSORLG00000019795) xpo7 (ENSORLG00000025259) GFRA2 (ENSORLG00000029388) ENSORLG00000022641 ATP6V1B2 (ENSORLG00000029718) dusp11 (ENSORLG00000023976) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157419 ENSGT00940000159990 ENSGT00940000156261 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157006 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000155826 ENSGT00390000018878 ENSGT01100000263514.B ENSGT00940000161047 ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000183162.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000164699 ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00390000016333 ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00390000004874.a.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000157419 ENSGT00940000159990 ENSGT00940000156261 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157006 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000155826 ENSGT00390000018878 ENSGT01100000263514.B ENSGT00940000161047 ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000183162.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000164699 ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00390000016333 ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00390000004874.a.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 101 VASH2 (ENSKMAG00000015521) NEK6 (ENSKMAG00000015555) DENND1A (ENSKMAG00000015603) tpm2 (ENSKMAG00000015667) tln1 (ENSKMAG00000015737) hmgcs1 (ENSKMAG00000015892) YTHDC2 (ENSKMAG00000015969) dcp2 (ENSKMAG00000016066) ENSKMAG00000016083 psmb10 (ENSKMAG00000016108) ENSKMAG00000016137 PURG (ENSKMAG00000016155) slc38a9 (ENSKMAG00000016172) ENSKMAG00000016214 MFHAS1 (ENSKMAG00000016229) rpl17 (ENSKMAG00000016257) ##22 nkx6.1 (ENSKMAG00000016346) gpat3 (ENSKMAG00000016366) ENSKMAG00000016409 abraxas1 (ENSKMAG00000016436) mrps18c (ENSKMAG00000016467) HELQ (ENSKMAG00000016486) tcf7l1a (ENSKMAG00000016503) ENSKMAG00000016521 dusp11 (ENSKMAG00000016529) ATP6V1B2 (ENSKMAG00000016556) GFRA2 (ENSKMAG00000016668) xpo7 (ENSKMAG00000016721) pbdc1 (ENSKMAG00000016856) dmtn (ENSKMAG00000016868) ppp3ccb (ENSKMAG00000016898) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1611 PURG (ENSNFUG00015001742) SLC38A9 (ENSNFUG00015001806) chd1 (ENSNFUG00015002385) SYK (ENSNFUG00015003624) auh (ENSNFUG00015003670) nfil3 (ENSNFUG00015003675) PAM (ENSNFUG00015003692) ENSNFUG00015003735 Nfu_g_1_010837 (ENSNFUG00015003737) ENSNFUG00015003739 ENSNFUG00015003740 ROR2 (ENSNFUG00015003741) ENSNFUG00015003745 NRG1 (ENSNFUG00015003752) MFHAS1 (ENSNFUG00015003754) rpl17 (ENSNFUG00015003759) ##22 NKX6-3 (ENSNFUG00015003764) ENSNFUG00015003765 ENSNFUG00015003766 gpat3 (ENSNFUG00015003772) ENSNFUG00015003774 abraxas1 (ENSNFUG00015003777) MRPS18C (ENSNFUG00015003779) HELQ (ENSNFUG00015003789) Nfu_g_1_010854 (ENSNFUG00015003828) ENSNFUG00015003835 DUSP11 (ENSNFUG00015003839) ATP6V1B2 (ENSNFUG00015003929) SEZ6L (ENSNFUG00015004382) SLC4A5 (ENSNFUG00015004910) tacr1b (ENSNFUG00015007292) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000157419 ENSGT00940000159990 ENSGT00940000156261 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157006 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000155826 ENSGT00390000018878 ENSGT01100000263514.B ENSGT00940000161047 ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000183162.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000164699 ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00390000016333 ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00390000004874.a.b NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 267 ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000183162.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000164699 ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000155068.a.a Mummichog MODERN SPECIES 623 ENSFHEG00000002075 PURG (ENSFHEG00000002088) slc38a9 (ENSFHEG00000002113) nrg1 (ENSFHEG00000002125) MFHAS1 (ENSFHEG00000000864) rpl17 (ENSFHEG00000002154) ##22 ENSFHEG00000000783 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 731 nrg1 (ENSCVAG00000020439) MFHAS1 (ENSCVAG00000020428) rpl17 (ENSCVAG00000020418) ##22 nkx6.1 (ENSCVAG00000020405) gpat3 (ENSCVAG00000020395) abraxas1 (ENSCVAG00000020355) mrps18c (ENSCVAG00000020169) HELQ (ENSCVAG00000020159) ENSCVAG00000020109 ENSCVAG00000020065 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157419 ENSGT00940000159990 ENSGT00940000156261 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157006 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000155826 ENSGT00390000018878 ENSGT01100000263514.B ENSGT00940000161047 ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000183162.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000164699 ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00390000016333 ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00390000004874.a.b Platyfish MODERN SPECIES 22 DENND1A (ENSXMAG00000007556) tpm2 (ENSXMAG00000007560) tln1 (ENSXMAG00000007568) ENSXMAG00000024099 hmgcs1 (ENSXMAG00000006091) YTHDC2 (ENSXMAG00000007618) dcp2 (ENSXMAG00000007623) ENSXMAG00000007636 psmb10 (ENSXMAG00000007637) ENSXMAG00000007648 PURG (ENSXMAG00000007654) slc38a9 (ENSXMAG00000007655) nrg1 (ENSXMAG00000021305) ENSXMAG00000026289 MFHAS1 (ENSXMAG00000000212) rpl17 (ENSXMAG00000012219) ##22 nkx6.1 (ENSXMAG00000020939) gpat3 (ENSXMAG00000012498) mrps18c (ENSXMAG00000012555) ENSXMAG00000012563 tcf7l1a (ENSXMAG00000012205) ENSXMAG00000028643 dusp11 (ENSXMAG00000023145) ATP6V1B2 (ENSXMAG00000012143) GFRA2 (ENSXMAG00000023717) ENSXMAG00000010553 xpo7 (ENSXMAG00000000433) pbdc1 (ENSXMAG00000025033) dmtn (ENSXMAG00000029718) ppp3ccb (ENSXMAG00000000406) hpse (ENSXMAG00000000390) Poecilia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b ENSGT00940000157419 ENSGT00940000156261 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157006 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000155826 ENSGT00390000018878 ENSGT01100000263514.B ENSGT00940000161047 ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000183162.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000164699 ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00390000016333 ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00390000004874.a.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b ENSGT00940000157419 ENSGT00940000156261 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157006 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00940000155826 ENSGT00390000018878 ENSGT01100000263514.B ENSGT00940000161047 ENSGT00940000155603.A.a.a.a ENSGT00950000183162.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157326 ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00940000157038.a.b ENSGT00940000164699 ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00390000016333 ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00390000004874.a.b Sailfin molly MODERN SPECIES 1980 slc38a9 (ENSPLAG00000023659) nrg1 (ENSPLAG00000023688) MFHAS1 (ENSPLAG00000023691) rpl17 (ENSPLAG00000023701) ##22 nkx6.1 (ENSPLAG00000023746) Amazon molly MODERN SPECIES 593 PSMB7 (ENSPFOG00000024696) DENND1A (ENSPFOG00000005530) tpm2 (ENSPFOG00000005448) tln1 (ENSPFOG00000004419) hmgcs1 (ENSPFOG00000004371) YTHDC2 (ENSPFOG00000003895) dcp2 (ENSPFOG00000003762) selenoh (ENSPFOG00000003754) psmb10 (ENSPFOG00000003600) ENSPFOG00000003395 PURG (ENSPFOG00000020349) slc38a9 (ENSPFOG00000003069) ENSPFOG00000002996 MFHAS1 (ENSPFOG00000002987) rpl17 (ENSPFOG00000002869) ##22 nkx6.1 (ENSPFOG00000002761) ENSPFOG00000022166 gpat3 (ENSPFOG00000002511) abraxas1 (ENSPFOG00000002401) mrps18c (ENSPFOG00000002351) HELQ (ENSPFOG00000002091) TCF7L1 (ENSPFOG00000001893) ENSPFOG00000001784 Guppy MODERN SPECIES 442 psmb7 (ENSPREG00000011799) DENND1A (ENSPREG00000011826) ENSPREG00000011923 tln1 (ENSPREG00000011950) ENSPREG00000012016 hmgcs1 (ENSPREG00000012056) YTHDC2 (ENSPREG00000012096) dcp2 (ENSPREG00000012185) ENSPREG00000012254 psmb10 (ENSPREG00000012274) ENSPREG00000012293 PURG (ENSPREG00000012322) slc38a9 (ENSPREG00000012343) ENSPREG00000012386 MFHAS1 (ENSPREG00000012401) rpl17 (ENSPREG00000012415) ##22 nkx6.1 (ENSPREG00000012467) ENSPREG00000012492 gpat3 (ENSPREG00000012518) abraxas1 (ENSPREG00000012574) mrps18c (ENSPREG00000012593) HELQ (ENSPREG00000012605) ENSPREG00000012639 ENSPREG00000012655 dusp11 (ENSPREG00000012668) ATP6V1B2 (ENSPREG00000012684) GFRA2 (ENSPREG00000012717) xpo7 (ENSPREG00000012766) pbdc1 (ENSPREG00000012829) dmtn (ENSPREG00000012844) ppp3ccb (ENSPREG00000012883) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.a.b ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.a.a.a.b ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.b.b.a ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.b ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000049239.b.a ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.a.a.a.b ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000157038.a.b.v ENSGT00940000164699.r ENSGT00940000164699.q Nile tilapia MODERN SPECIES 19 ppp1r3b (ENSONIG00000012496) ENSONIG00000041861 ENSONIG00000012497 ENSONIG00000021062 ENSONIG00000039262 ENSONIG00000012503 ENSONIG00000039751 ENSONIG00000041068 ENSONIG00000012500 ENSONIG00000038656 ENSONIG00000035780 ENSONIG00000027867 ENSONIG00000030099 ENSONIG00000036777 MFHAS1 (ENSONIG00000012507) rpl17 (ENSONIG00000012509) ##22 nkx6-1 (ENSONIG00000040109) gpat3 (ENSONIG00000012514) HELQ (ENSONIG00000012532) mrps18c (ENSONIG00000012527) hpse (ENSONIG00000012533) ppp3ccb (ENSONIG00000012541) dmtn (ENSONIG00000012554) pbdc1 (ENSONIG00000012558) xpo7 (ENSONIG00000012566) ENSONIG00000019086 ENSONIG00000003620 GFRA2 (ENSONIG00000012573) ATP6V1B2 (ENSONIG00000012574) TCF7L1 (ENSONIG00000012578) ENSONIG00000012584 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002634.a.f.b.a.a.a.a ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00940000156466 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.a.a.a.b ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000157038.a.b.v ENSGT00940000164699.r ENSGT00940000164699.q.b Lyretail cichlid MODERN SPECIES 293 ENSNBRG00000005563 myo5b (ENSNBRG00000005626) #19 ENSNBRG00000005743 ENSNBRG00000005776 ENSNBRG00000005797 ENSNBRG00000005816 ENSNBRG00000005828 lmbrd2b (ENSNBRG00000005856) ppp1r3b (ENSNBRG00000005909) ENSNBRG00000005917 ENSNBRG00000005930 ENSNBRG00000005956 ENSNBRG00000005974 ENSNBRG00000006002 MFHAS1 (ENSNBRG00000006014) rpl17 (ENSNBRG00000006026) ##22 nkx6.1 (ENSNBRG00000006083) gpat3 (ENSNBRG00000006106) abraxas1 (ENSNBRG00000006147) mrps18c (ENSNBRG00000006182) hpse (ENSNBRG00000006197) ppp3ccb (ENSNBRG00000006251) dmtn (ENSNBRG00000006310) pbdc1 (ENSNBRG00000006350) xpo7 (ENSNBRG00000006360) ENSNBRG00000006452 GFRA2 (ENSNBRG00000006485) ENSNBRG00000006571 ATP6V1B2 (ENSNBRG00000006606) TCF7L1 (ENSNBRG00000006638) ENSNBRG00000006647 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000066485 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000049239.b.a ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.a.a.a.b ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.a.a ENSGT00940000163299.B.b.b.h.c.b.s.a.b ENSGT00940000155987.b ENSGT00940000163299.B.b.b.h.c.b.t.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.a.a.a.b ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000157038.a.b.v ENSGT00940000164699.r ENSGT00940000164699.q.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 706 ENSHBUG00000002104 ENSHBUG00000002092 MFHAS1 (ENSHBUG00000002081) rpl17 (ENSHBUG00000002066) ##22 ENSHBUG00000002042 nkx6.1 (ENSHBUG00000002037) gpat3 (ENSHBUG00000002032) abraxas1 (ENSHBUG00000002018) mrps18c (ENSHBUG00000002008) HELQ (ENSHBUG00000001997) hpse (ENSHBUG00000001958) ppp3ccb (ENSHBUG00000001946) dmtn (ENSHBUG00000001936) pbdc1 (ENSHBUG00000001927) xpo7 (ENSHBUG00000001912) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156466 ENSGT00510000049239.b.a ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00940000163299.B.b.b.h.c.b.s.a.b ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.a.a ENSGT00940000162139 ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.a.a.a.b ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000155987.b ENSGT00940000163299.B.b.b.h.c.b.t.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.a.a.a.b.a ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000157038.a.b.v ENSGT00940000164699.r P. nyererei MODERN SPECIES 516 ugcg (ENSPNYG00000011264) ENSPNYG00000011250 ENSPNYG00000011244 capslb (ENSPNYG00000011222) ENSPNYG00000011203 myo5b (ENSPNYG00000011105) #19 ENSPNYG00000011023 ENSPNYG00000010978 ENSPNYG00000010958 ENSPNYG00000010929 lmbrd2b (ENSPNYG00000010898) ppp1r3b (ENSPNYG00000010876) ENSPNYG00000010872 ENSPNYG00000010827 MFHAS1 (ENSPNYG00000010802) rpl17 (ENSPNYG00000010723) ##22 nkx6.1 (ENSPNYG00000010705) gpat3 (ENSPNYG00000010667) abraxas1 (ENSPNYG00000010639) mrps18c (ENSPNYG00000010654) HELQ (ENSPNYG00000010575) hpse (ENSPNYG00000010531) ppp3ccb (ENSPNYG00000010466) dmtn (ENSPNYG00000010425) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT00950000183234 ENSGT00940000162139 ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.b.b.a.a.a.b ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.b ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00500000044904.a.b.e.a.k.a.a.a.a.a ENSGT00940000163299.B.b.b.h.c.b.s.a.b ENSGT00940000163299.B.b.b.h.c.b.t.a ENSGT01000000214408.a.b.a.a.a.c.a.b.e.a.a.b ENSGT00940000155987.b.h.a ENSGT00940000163299.B.b.b.h.c.b.t.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.b.a.a.a.b.a ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000157038.a.b.v Zebra mbuna MODERN SPECIES 1110 ENSMZEG00005023332 myo5b (ENSMZEG00005023325) #19 ENSMZEG00005023319 ENSMZEG00005023317 ENSMZEG00005023316 ENSMZEG00005023315 lmbrd2b (ENSMZEG00005023312) ppp1r3b (ENSMZEG00005023310) ENSMZEG00005023309 ENSMZEG00005023307 ENSMZEG00005023305 ENSMZEG00005023303 ENSMZEG00005023298 ENSMZEG00005023296 MFHAS1 (ENSMZEG00005023295) rpl17 (ENSMZEG00005023287) ##22 nkx6.1 (ENSMZEG00005023285) gpat3 (ENSMZEG00005023281) mrps18c (ENSMZEG00005023278) HELQ (ENSMZEG00005023270) hpse (ENSMZEG00005023262) ppp3ccb (ENSMZEG00005023257) dmtn (ENSMZEG00005023252) pbdc1 (ENSMZEG00005023249) xpo7 (ENSMZEG00005023246) GFRA2 (ENSMZEG00005023241) ENSMZEG00005023235 ATP6V1B2 (ENSMZEG00005023232) kcne4 (ENSMZEG00005023231) fezf1 (ENSMZEG00005023230) CADPS2 (ENSMZEG00005023215) Eastern happy MODERN SPECIES 19 myo5b (ENSACLG00000008924) #19 ENSACLG00000009218 ENSACLG00000009241 ENSACLG00000009261 lmbrd2b (ENSACLG00000009265) ppp1r3b (ENSACLG00000009327) ENSACLG00000009330 ENSACLG00000009333 ENSACLG00000009340 ENSACLG00000009348 ENSACLG00000009552 ENSACLG00000009555 ENSACLG00000009558 ENSACLG00000009571 MFHAS1 (ENSACLG00000009577) rpl17 (ENSACLG00000009583) ##22 nkx6.1 (ENSACLG00000009617) ENSACLG00000009622 gpat3 (ENSACLG00000010444) abraxas1 (ENSACLG00000010501) mrps18c (ENSACLG00000010521) HELQ (ENSACLG00000010558) hpse (ENSACLG00000010619) ppp3ccb (ENSACLG00000010653) dmtn (ENSACLG00000010704) pbdc1 (ENSACLG00000010774) xpo7 (ENSACLG00000010791) GFRA2 (ENSACLG00000010980) ENSACLG00000011135 ENSACLG00000011142 ENSACLG00000011433 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00390000008196 ENSGT00390000014471 ENSGT00530000063749.c.b ENSGT00940000157979 ENSGT00940000159623 ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c ENSGT00940000164699 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00390000008196 ENSGT00390000014471 ENSGT00530000063749.c.b ENSGT00940000157979 ENSGT00940000159623 ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350.i ENSGT00940000157350.j ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000154115.d ENSGT00950000182850.a.b.b.b.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153139.B.a ENSGT00940000156168.B ENSGT00940000155068.a.a ENSGT00940000155847.c Spiny chromis MODERN SPECIES 1624 rpl17 (ENSAPOG00000018953) ##22 nkx6.1 (ENSAPOG00000018996) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 250 ENSGT00940000156729 ENSGT01050000244924.a.a.a ENSGT00390000012898 ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00390000008196 ENSGT00390000014471 ENSGT00530000063749.c.b ENSGT00940000157979 ENSGT00940000159623 ENSGT00940000159475.c ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 Orange clownfish MODERN SPECIES 7 atp6v1g1 (ENSAPEG00000024195) ENSAPEG00000024188 hsdl2 (ENSAPEG00000024172) PTBP3 (ENSAPEG00000024155) ugcg (ENSAPEG00000024140) ENSAPEG00000024137 ENSAPEG00000024134 ENSAPEG00000024130 UFC1 (ENSAPEG00000024125) fktn (ENSAPEG00000024117) ENSAPEG00000024109 ENSAPEG00000024073 ENSAPEG00000024060 ppp1r3b (ENSAPEG00000024052) MFHAS1 (ENSAPEG00000024047) rpl17 (ENSAPEG00000024012) ##22 MYL5 (ENSAPEG00000023657) HELQ (ENSAPEG00000023153) mrps18c (ENSAPEG00000023068) ENSAPEG00000023053 abraxas1 (ENSAPEG00000023045) gpat3 (ENSAPEG00000023036) hpse (ENSAPEG00000023005) HELQ (ENSAPEG00000022964) mrps18c (ENSAPEG00000022956) ENSAPEG00000022927 abraxas1 (ENSAPEG00000022912) gpat3 (ENSAPEG00000022834) ENSAPEG00000022795 ENSAPEG00000022783 nkx6.1 (ENSAPEG00000022770) Clown anemonefish MODERN SPECIES 1160 rpl17 (ENSAOCG00000014751) ##22 Cod MODERN SPECIES 17 ENSGMOG00000001667 ENSGMOG00000029289 myo5b (ENSGMOG00000019264) #19 ENSGMOG00000035554 ENSGMOG00000019290 lmbrd2b (ENSGMOG00000012999) ENSGMOG00000025798 ENSGMOG00000012984 nkx6.1 (ENSGMOG00000029517) gpat3 (ENSGMOG00000031783) ENSGMOG00000035135 ENSGMOG00000000023 mrps18c (ENSGMOG00000032590) HELQ (ENSGMOG00000000020) hpse (ENSGMOG00000000018) ENSGMOG00000012980 ##22 ENSGMOG00000000016 dmtn (ENSGMOG00000025083) pbdc1 (ENSGMOG00000019503) xpo7 (ENSGMOG00000019505) ENSGMOG00000008712 dusp11 (ENSGMOG00000028702) ENSGMOG00000034173 tcf7l1a (ENSGMOG00000006333) dbnla (ENSGMOG00000027970) ENSGMOG00000030473 npy8ar (ENSGMOG00000017513) ENSGMOG00000017491 ENSGMOG00000028456 kctd9b (ENSGMOG00000014201) ENSGMOG00000012944 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00390000016532 ENSGT00390000010427.c ENSGT00940000155464.a.a ENSGT00940000161387 ENSGT00390000006320 ENSGT00390000007918 ENSGT00940000165259.a ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b #19 ENSGT01030000234908 ENSGT00940000156466 ENSGT00390000018651.a ENSGT00940000159475.c ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b.q ENSGT00530000063424.b.r ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 778 ENSGT00940000155402.a.b.h #19 ENSGT01030000234908.c ENSGT00940000156466.tb.a.b ENSGT00390000018651.a.e ENSGT00940000159475.c.j ENSGT00530000063205.B.l ENSGT00940000158928.m ENSGT00950000183010.a.a.b.c ##22 ENSGT00940000160897.n ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.g Huchen MODERN SPECIES 204 psmd12 (ENSHHUG00000038346) helz (ENSHHUG00000038362) cacng1a (ENSHHUG00000038467) CACNG4 (ENSHHUG00000038469) CACNG5 (ENSHHUG00000038475) prkcaa (ENSHHUG00000038480) ENSHHUG00000038815 ENSHHUG00000038821 myo5b (ENSHHUG00000038823) #19 ENSHHUG00000039046 capslb (ENSHHUG00000039063) lmbrd2b (ENSHHUG00000039076) ppp1r3b (ENSHHUG00000039179) eri1 (ENSHHUG00000039185) ENSHHUG00000039220 rpl17 (ENSHHUG00000039226) ##22 nkx6.1 (ENSHHUG00000039239) gpat3 (ENSHHUG00000039242) abraxas1 (ENSHHUG00000039370) ENSHHUG00000039390 HELQ (ENSHHUG00000039413) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00730000112225.e ENSGT00390000016532.k ENSGT00390000010427.c.q.b ENSGT00940000155464.a.a.h ENSGT00940000161387.b ENSGT00390000006320.r ENSGT00390000007918.d ENSGT00390000002096.s.b ENSGT00940000155402.a.b.h #19 ENSGT01030000234908.c ENSGT00940000156466.tb.a.b ENSGT00390000018651.a.e ENSGT00940000159475.c.j ENSGT00530000063205.B.l ENSGT00940000158928.m ENSGT00950000183010.a.a.b.c ##22 ENSGT00940000160897.n ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.g ENSGT00530000063424.b.q ENSGT00990000209419 ENSGT00940000157350.h ENSGT00390000004874.a.b.i ENSGT00940000160508.d ENSGT00940000157215.r.b ENSGT00950000182914.a.b.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.b ENSGT00940000157400.f ENSGT00940000158907.c.d ENSGT00390000004624.a.a.a ENSGT00940000166240 ENSGT00530000063460.A.b.k.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00730000112225.e ENSGT00390000016532.k ENSGT00390000010427.c.q.b ENSGT00940000155464.a.a.h ENSGT00940000161387.b ENSGT00390000006320.r ENSGT00390000007918.d ENSGT00390000002096.s.b ENSGT00940000155402.a.b.h #19 ENSGT01030000234908.c ENSGT00940000156466.tb.a.b ENSGT00390000018651.a.e ENSGT00940000159475.c.j ENSGT00530000063205.B.l ENSGT00940000158928.m ENSGT00950000183010.a.a.b.c ##22 ENSGT00940000160897.n ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.g ENSGT00530000063424.b.q ENSGT01000000220771 ENSGT00390000004874.a.b.i ENSGT00940000160508.d ENSGT00940000157215.r.b ENSGT00950000182914.a.b.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.b ENSGT00940000157400.f ENSGT00940000158907.c.d ENSGT00390000004624.a.a.a ENSGT00940000166240 ENSGT00530000063460.A.b.k.b ENSGT00390000005102.dd.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00730000112225.e ENSGT00390000016532.k ENSGT00390000010427.c.q.b ENSGT00940000155464.a.a.h ENSGT00940000161387.b ENSGT00390000006320.r ENSGT00390000007918.d ENSGT00390000002096.s.b ENSGT00940000155402.a.b.h #19 ENSGT01030000234908.c ENSGT00940000156466.tb.a.b ENSGT00390000018651.a.e ENSGT00940000159475.c.j ENSGT00530000063205.B.l ENSGT00940000158928.m ENSGT00950000183010.a.a.b.c ##22 ENSGT00940000160897.n ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.g ENSGT00530000063424.b.q ENSGT01000000220771 ENSGT00390000004874.a.b.i ENSGT00940000160508.d ENSGT00940000157215.r.b ENSGT00950000182914.a.b.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.b ENSGT00940000157400.f ENSGT00940000158907.c.d ENSGT00390000004624.a.a.a ENSGT00940000166240 ENSGT00530000063460.A.b.k.b ENSGT00390000005102.dd.b Coho salmon MODERN SPECIES 26 ENSOKIG00005021324 SLC1A3 (ENSOKIG00005021263) RANBP3L (ENSOKIG00005021233) nadk2 (ENSOKIG00005021162) skp2 (ENSOKIG00005021126) ENSOKIG00005020959 ENSOKIG00005020916 myo5b (ENSOKIG00005020119) #19 ENSOKIG00005019996 CAPSL (ENSOKIG00005019987) lmbrd2b (ENSOKIG00005019089) ppp1r3b (ENSOKIG00005018982) ENSOKIG00005018975 ERI1 (ENSOKIG00005018940) MFHAS1 (ENSOKIG00005018930) RPL17 (ENSOKIG00005018873) ##22 nkx6.1 (ENSOKIG00005018845) ENSOKIG00005018496 abraxas1 (ENSOKIG00005018393) btc (ENSOKIG00005018335) amacr (ENSOKIG00005018313) rxfp3 (ENSOKIG00005018300) rai14 (ENSOKIG00005018267) fgf10a (ENSOKIG00005018256) nnt (ENSOKIG00005015324) ENSOKIG00005015129 ENSOKIG00005015108 atp5mea (ENSOKIG00005015088) PDE6B (ENSOKIG00005014809) rbp4l (ENSOKIG00005014773) ENSOKIG00005014770 Rainbow trout MODERN SPECIES 3 ENSOMYG00000027976 ENSOMYG00000049772 ENSOMYG00000027674 SLC1A3 (ENSOMYG00000061009) RANBP3L (ENSOMYG00000027601) SKP2 (ENSOMYG00000027423) ENSOMYG00000026109 ENSOMYG00000073044 myo5b (ENSOMYG00000009470) #19 ENSOMYG00000004204 ENSOMYG00000004193 lmbrd2b (ENSOMYG00000003753) ppp1r3b (ENSOMYG00000003161) ENSOMYG00000028800 ENSOMYG00000028785 ENSOMYG00000028729 ##22 nkx6.1 (ENSOMYG00000028689) ENSOMYG00000028373 abraxas1 (ENSOMYG00000028158) ENSOMYG00000028141 hpse (ENSOMYG00000028106) btc (ENSOMYG00000049167) ENSOMYG00000028049 rxfp3 (ENSOMYG00000028041) rai14 (ENSOMYG00000028011) fgf10a (ENSOMYG00000073584) nnt (ENSOMYG00000027817) ENSOMYG00000027650 ENSOMYG00000027609 ENSOMYG00000027557 ENSOMYG00000026766 Salmo ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00730000112225.e ENSGT00390000016532.k ENSGT00390000010427.c.q.b ENSGT00940000155464.a.a.h ENSGT00940000161387.b ENSGT00390000006320.r ENSGT00390000007918.d ENSGT00390000002096.s.b ENSGT00940000155402.a.b.h #19 ENSGT01030000234908.c ENSGT00940000156466.tb.a.a.a ENSGT00390000018651.a.e ENSGT00940000159475.c.j ENSGT00530000063205.B.l ENSGT00940000158928.m ENSGT00950000183010.a.a.b.c ##22 ENSGT00940000160897.n ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.g ENSGT00530000063424.b.q ENSGT00990000209419 ENSGT00940000157350.h ENSGT00390000004874.a.b.i ENSGT00940000160508.d ENSGT00940000157215.r.b ENSGT00950000182914.a.b.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.b ENSGT00940000157400.f ENSGT00940000158907.c.d ENSGT00390000004624.a.a.a ENSGT00940000166240 ENSGT00530000063460.A.b.k.b River trout MODERN SPECIES 6 ENSSTUG00000015590 nup155 (ENSSTUG00000015735) SLC1A3 (ENSSTUG00000019871) RANBP3L (ENSSTUG00000020202) nadk2 (ENSSTUG00000020232) skp2 (ENSSTUG00000020264) ENSSTUG00000020351 myo5b (ENSSTUG00000020444) #19 ENSSTUG00000021260 capslb (ENSSTUG00000021281) lmbrd2b (ENSSTUG00000021315) ppp1r3b (ENSSTUG00000022102) ENSSTUG00000022111 eri1 (ENSSTUG00000022117) ENSSTUG00000022127 rpl17 (ENSSTUG00000022135) ##22 nkx6.1 (ENSSTUG00000022167) ENSSTUG00000022181 gpat3 (ENSSTUG00000022205) abraxas1 (ENSSTUG00000022663) ENSSTUG00000022721 HELQ (ENSSTUG00000022736) hpse (ENSSTUG00000022800) ENSSTUG00000022830 btc (ENSSTUG00000022834) amacr (ENSSTUG00000022855) slc45a2 (ENSSTUG00000023049) rxfp3 (ENSSTUG00000023067) rai14 (ENSSTUG00000023082) fgf10a (ENSSTUG00000023127) nnt (ENSSTUG00000023200) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 289 ENSGT00940000165259.a ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b.g #19 ENSGT01030000234908.d ENSGT00940000156466.tb.b ENSGT00390000018651.a.f ENSGT00940000159475.c.i ENSGT00530000063205.B.k ENSGT00940000158928.n ENSGT00950000183010.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000160897.m ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.h ENSGT00530000063424.b.q ENSGT00940000157350.h ENSGT00390000004874.a.b.i ENSGT00530000063424.b.r ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350.g ENSGT00390000004874.a.b.j ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508.c ENSGT00940000157215.r.a ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.a ENSGT00940000161886 Huchen MODERN SPECIES 336 nup155 (ENSHHUG00000040054) ENSHHUG00000039753 SLC1A3 (ENSHHUG00000039718) ENSHHUG00000039713 nadk2 (ENSHHUG00000039657) skp2 (ENSHHUG00000039623) ENSHHUG00000039501 cfap53 (ENSHHUG00000039484) myo5b (ENSHHUG00000037123) #19 ENSHHUG00000037090 ENSHHUG00000037087 lmbrd2b (ENSHHUG00000036973) ppp1r3b (ENSHHUG00000036970) eri1 (ENSHHUG00000036962) MFHAS1 (ENSHHUG00000036958) rpl17 (ENSHHUG00000036924) ##22 nkx6.1 (ENSHHUG00000036919) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00390000010427.c.q.a ENSGT00940000155464.a.a.g ENSGT00940000161387.a ENSGT00390000006320.q ENSGT00390000007918.c ENSGT00390000002096.s.a ENSGT00940000165259.a ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b.g #19 ENSGT01030000234908.d ENSGT00940000156466.tb.b ENSGT00390000018651.a.f ENSGT00940000159475.c.i ENSGT00530000063205.B.k ENSGT00940000158928.n ENSGT00950000183010.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000160897.m ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.h ENSGT00530000063424.b.r ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350.g ENSGT00390000004874.a.b.j ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508.c ENSGT00940000157215.r.a ENSGT00950000182914.a.b.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.a ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400.e ENSGT00940000158907.c.c ENSGT00390000004624.a.a.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000016532.j ENSGT00390000010427.c.q.a ENSGT00940000155464.a.a.g ENSGT00940000161387.a ENSGT00390000006320.q ENSGT00390000007918.c ENSGT00390000002096.s.a ENSGT00940000165259.a ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b.g #19 ENSGT01030000234908.d ENSGT00390000018651.a.f ENSGT00940000159475.c.i ENSGT00530000063205.B.k ENSGT00940000158928.n ENSGT00950000183010.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000160897.m ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.h ENSGT00530000063424.b.r ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350.g ENSGT00390000004874.a.b.j ENSGT00940000160508.c ENSGT00940000157215.r.a ENSGT00950000182914.a.b.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.a ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400.e ENSGT00940000158907.c.c ENSGT00390000004624.a.a.b ENSGT00530000063460.A.b.k.a River trout MODERN SPECIES 15 SLC1A3 (ENSSTUG00000039319) ENSSTUG00000039305 nadk2 (ENSSTUG00000039039) skp2 (ENSSTUG00000039007) ENSSTUG00000038043 ENSSTUG00000037985 cfap53 (ENSSTUG00000037964) myo5b (ENSSTUG00000036648) #19 ENSSTUG00000036607 ENSSTUG00000036602 capslb (ENSSTUG00000036581) lmbrd2b (ENSSTUG00000036178) ppp1r3b (ENSSTUG00000036162) eri1 (ENSSTUG00000036149) MFHAS1 (ENSSTUG00000036145) rpl17 (ENSSTUG00000036118) ##22 nkx6.1 (ENSSTUG00000036099) gpat3 (ENSSTUG00000035876) abraxas1 (ENSSTUG00000035844) mrps18c (ENSSTUG00000035834) HELQ (ENSSTUG00000035510) hpse (ENSSTUG00000035477) btc (ENSSTUG00000035464) amacr (ENSSTUG00000035448) slc45a2 (ENSSTUG00000035439) rxfp3 (ENSSTUG00000035429) GZMK (ENSSTUG00000035421) rai14 (ENSSTUG00000035373) fgf10a (ENSSTUG00000035358) nnt (ENSSTUG00000035331) ENSSTUG00000035294 Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000089647 ENSSSAG00000000423 SLC1A3 (ENSSSAG00000000163) RANBP3L (ENSSSAG00000001289) NADK2 (ENSSSAG00000069298) SKP2 (ENSSSAG00000069118) ENSSSAG00000068165 ENSSSAG00000068114 cfap53 (ENSSSAG00000068107) myo5b (ENSSSAG00000009979) #19 ENSSSAG00000009360 lmbrd2b (ENSSSAG00000007614) ppp1r3b (ENSSSAG00000117668) ENSSSAG00000007591 ENSSSAG00000007587 ENSSSAG00000007561 ##22 nkx6.1 (ENSSSAG00000007552) gpat3 (ENSSSAG00000006983) abraxas1 (ENSSSAG00000007539) mrps18c (ENSSSAG00000006936) HELQ (ENSSSAG00000006930) hpse (ENSSSAG00000006915) btc (ENSSSAG00000006911) amacr (ENSSSAG00000101933) slc45a2 (ENSSSAG00000006897) rxfp3 (ENSSSAG00000006884) ENSSSAG00000006878 rai14 (ENSSSAG00000006855) fgf10a (ENSSSAG00000087289) nnt (ENSSSAG00000006834) ENSSSAG00000006821 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00390000010427.c.q.a ENSGT00940000155464.a.a.g ENSGT00940000161387.a ENSGT00390000006320.q ENSGT00390000007918.c ENSGT00390000002096.s.a ENSGT00940000165259.a ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b.g #19 ENSGT01030000234908.d ENSGT00940000156466.tb.b ENSGT00390000018651.a.f ENSGT00940000159475.c.i ENSGT00530000063205.B.k ENSGT00940000158928.n ENSGT00950000183010.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000160897.m ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.h ENSGT00530000063424.b.r ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350.g ENSGT00390000004874.a.b.j ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508.c ENSGT00940000157215.r.a ENSGT00950000182914.a.b.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.a ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400.e ENSGT00940000158907.c.c ENSGT00390000004624.a.a.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00390000010427.c.q.a ENSGT00940000155464.a.a.g ENSGT00940000161387.a ENSGT00390000006320.q ENSGT00390000007918.c ENSGT00390000002096.s.a ENSGT00940000165259.a ENSGT00970000193642 ENSGT00940000155402.a.b.g #19 ENSGT01030000234908.d ENSGT00940000156466.tb.b ENSGT00390000018651.a.f ENSGT00940000159475.c.i ENSGT00530000063205.B.k ENSGT00940000158928.n ENSGT00950000183010.a.a.b.d ##22 ENSGT00940000160897.m ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.h ENSGT00530000063424.b.r ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350.g ENSGT00390000004874.a.b.j ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508.c ENSGT00940000157215.r.a ENSGT00950000182914.a.b.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.a ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400.e ENSGT00940000158907.c.c ENSGT00390000004624.a.a.b Coho salmon MODERN SPECIES 15 nup155 (ENSOKIG00005020587) ENSOKIG00005020398 SLC1A3 (ENSOKIG00005020166) ENSOKIG00005020130 NADK2 (ENSOKIG00005020080) ENSOKIG00005019937 ENSOKIG00005019847 cfap53 (ENSOKIG00005019831) myo5b (ENSOKIG00005019261) #19 ENSOKIG00005019223 capslb (ENSOKIG00005019214) lmbrd2b (ENSOKIG00005019146) ppp1r3b (ENSOKIG00005019138) eri1 (ENSOKIG00005019126) MFHAS1 (ENSOKIG00005019122) rpl17 (ENSOKIG00005019091) ##22 nkx6.1 (ENSOKIG00005019070) gpat3 (ENSOKIG00005017803) abraxas1 (ENSOKIG00005017677) mrps18c (ENSOKIG00005017640) HELQ (ENSOKIG00005017573) hpse (ENSOKIG00005017529) ENSOKIG00005017508 btc (ENSOKIG00005017498) ENSOKIG00005017494 amacr (ENSOKIG00005017487) slc45a2 (ENSOKIG00005017471) rxfp3 (ENSOKIG00005017461) GZMK (ENSOKIG00005017449) rai14 (ENSOKIG00005017420) fgf10a (ENSOKIG00005017413) Chinook salmon MODERN SPECIES 12 ENSOTSG00005042935 SLC1A3 (ENSOTSG00005042980) RANBP3L (ENSOTSG00005043005) nadk2 (ENSOTSG00005043007) skp2 (ENSOTSG00005043011) ENSOTSG00005043012 ENSOTSG00005043015 cfap53 (ENSOTSG00005043016) myo5b (ENSOTSG00005043022) #19 ENSOTSG00005043311 capslb (ENSOTSG00005043312) lmbrd2b (ENSOTSG00005043316) ppp1r3b (ENSOTSG00005043348) eri1 (ENSOTSG00005043349) MFHAS1 (ENSOTSG00005043350) rpl17 (ENSOTSG00005043351) ##22 nkx6.1 (ENSOTSG00005043355) ENSOTSG00005043356 gpat3 (ENSOTSG00005043359) abraxas1 (ENSOTSG00005043362) mrps18c (ENSOTSG00005043363) HELQ (ENSOTSG00005043364) hpse (ENSOTSG00005043369) MYL5 (ENSOTSG00005043370) btc (ENSOTSG00005001650) amacr (ENSOTSG00005001682) slc45a2 (ENSOTSG00005001683) rxfp3 (ENSOTSG00005001686) GZMK (ENSOTSG00005001687) rai14 (ENSOTSG00005001692) fgf10a (ENSOTSG00005001695) Rainbow trout MODERN SPECIES 26 ENSOMYG00000029237 SKP2 (ENSOMYG00000029285) ENSOMYG00000029426 ENSOMYG00000061263 ENSOMYG00000029474 ENSOMYG00000054485 cfap53 (ENSOMYG00000029500) ENSOMYG00000066204 myo5b (ENSOMYG00000031585) #19 ENSOMYG00000041305 capslb (ENSOMYG00000041310) lmbrd2b (ENSOMYG00000041315) ppp1r3b (ENSOMYG00000067363) ENSOMYG00000041352 ENSOMYG00000041361 rl17 (ENSOMYG00000041369) ##22 nkx6.1 (ENSOMYG00000041392) gpat3 (ENSOMYG00000041467) abraxas1 (ENSOMYG00000042010) mrps18c (ENSOMYG00000042029) HELQ (ENSOMYG00000042051) hpse (ENSOMYG00000042123) ENSOMYG00000042145 btc (ENSOMYG00000042158) amacr (ENSOMYG00000042167) slc45a2 (ENSOMYG00000042183) rxfp3 (ENSOMYG00000042189) ENSOMYG00000042197 rai14 (ENSOMYG00000042219) fgf10a (ENSOMYG00000042238) ENSOMYG00000042245 Northern pike MODERN SPECIES 13 SLC1A3 (ENSELUG00000023711) RANBP3L (ENSELUG00000023720) nadk2 (ENSELUG00000023791) skp2 (ENSELUG00000023797) ENSELUG00000023909 ENSELUG00000034220 ENSELUG00000023982 cfap53 (ENSELUG00000024017) myo5b (ENSELUG00000024138) #19 ENSELUG00000024168 capslb (ENSELUG00000024179) lmbrd2b (ENSELUG00000024278) ppp1r3b (ENSELUG00000024294) eri1 (ENSELUG00000024302) MFHAS1 (ENSELUG00000024348) rpl17 (ENSELUG00000024443) ##22 nkx6.1 (ENSELUG00000024459) ENSELUG00000030749 gpat3 (ENSELUG00000024527) abraxas1 (ENSELUG00000024536) mrps18c (ENSELUG00000026337) HELQ (ENSELUG00000002085) ENSELUG00000031500 slc45a2 (ENSELUG00000002090) rxfp3 (ENSELUG00000002097) rai14 (ENSELUG00000002108) fgf10a (ENSELUG00000002111) nnt (ENSELUG00000000059) ENSELUG00000002118 ENSELUG00000002125 atp5mea (ENSELUG00000029188) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT00670000098179.d.a ENSGT00390000005102.id.b ENSGT00940000156471.a ENSGT00510000047107.B ENSGT01100000263544.c.a.a.b ENSGT00390000009453.gb ENSGT00940000155983.a.b ENSGT00940000168590 ENSGT00940000159066 ENSGT00940000156161.B ENSGT00940000159475.c ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00940000166762 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00390000006044 ENSGT00940000167368 ENSGT00730000111140 ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00950000182926.b.c ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00940000161685.A.a.d ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156662.d ENSGT00940000181939 ENSGT00530000063497.a.a ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00940000166762 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00390000003581 ENSGT00390000006044 ENSGT00940000167368 ENSGT00730000111140 ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00950000182926.b.c ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00940000161685.A.a.d ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156662.d ENSGT00940000181939 ENSGT00530000063497.a.a ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00940000166762 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00390000003581 ENSGT00390000006044 ENSGT00940000167368 ENSGT00730000111140 ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00950000182926.b.c ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00940000161685.A.a.d ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156662.d ENSGT00940000181939 ENSGT00530000063497.a.a ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00940000166762 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00390000003581 ENSGT00390000006044 ENSGT00940000167368 ENSGT00730000111140 ENSGT00820000127055.b ENSGT00940000164254.a.b ENSGT00950000182926.b.c ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00940000161685.A.a.d ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000163023 ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000161886 ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a Mexicana tetra MODERN SPECIES 66 ENSAMXG00000031269 ENSAMXG00000031686 ENSAMXG00000038695 TMEM132C (ENSAMXG00000002738) ENSAMXG00000031497 ENSAMXG00000026016 smpd4 (ENSAMXG00000031407) si:ch211-222n4.2 (ENSAMXG00000031218) med15 (ENSAMXG00000040274) ENSAMXG00000037233 crkl (ENSAMXG00000041556) neflb (ENSAMXG00000001050) ENSAMXG00000001033 pgam2 (ENSAMXG00000030317) nefma (ENSAMXG00000040032) rpl17 (ENSAMXG00000001082) ##22 nkx6.1 (ENSAMXG00000001095) gpat3 (ENSAMXG00000012191) abraxas1 (ENSAMXG00000038713) ENSAMXG00000029786 mrps18c (ENSAMXG00000012238) HELQ (ENSAMXG00000012252) hpse (ENSAMXG00000032004) MYL5 (ENSAMXG00000034506) btc (ENSAMXG00000037033) amacr (ENSAMXG00000029907) slc45a2 (ENSAMXG00000011270) rxfp3 (ENSAMXG00000025441) ENSAMXG00000034072 rai14 (ENSAMXG00000011402) fgf10a (ENSAMXG00000043492) Channel catfish MODERN SPECIES 9 wdr34 (ENSIPUG00000003139) sptan1 (ENSIPUG00000003170) smpd4 (ENSIPUG00000003269) ENSIPUG00000003370 TMEM132C (ENSIPUG00000003376) ENSIPUG00000003418 RIMBP2 (ENSIPUG00000003435) odf2 (ENSIPUG00000003472) cp080 (ENSIPUG00000003491) med15 (ENSIPUG00000003511) crkl (ENSIPUG00000003533) ENSIPUG00000003546 pgam2 (ENSIPUG00000003558) neflb (ENSIPUG00000003563) nefm (ENSIPUG00000003572) rpl17 (ENSIPUG00000003599) ##22 nkx6.1 (ENSIPUG00000003661) agpat9 (ENSIPUG00000003715) fam175a (ENSIPUG00000003772) mrps18c (ENSIPUG00000003783) helq (ENSIPUG00000003800) hpse (ENSIPUG00000003847) myl5 (ENSIPUG00000003872) btc (ENSIPUG00000003972) AMACR (ENSIPUG00000003980) slc45a2 (ENSIPUG00000003993) rxfp3 (ENSIPUG00000004003) gzmk (ENSIPUG00000004016) rai14 (ENSIPUG00000004046) fgf10a (ENSIPUG00000004119) nnt (ENSIPUG00000004138) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b ENSGT00950000183203.c.a ENSGT00940000166762 ENSGT00940000154702.a.b ENSGT00390000006044 ENSGT00940000167368 ENSGT00730000111140 ENSGT00820000127055.b ENSGT00950000182926.b.c ENSGT00940000156208.i.e ENSGT00940000161685.A.a.d ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00530000063424.b ENSGT00940000165965 ENSGT00940000157350 ENSGT00390000004874.a.b ENSGT00940000160508 ENSGT00940000157215 ENSGT00950000182914.a.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b ENSGT00940000163160.a ENSGT00940000157400 ENSGT00940000158907.c ENSGT00390000004624.a.a ENSGT00940000166240 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000159721.h.i.b ENSGT00940000159721.h.j.a ENSGT00940000166328.b ENSGT00390000014845.ab ENSGT00940000156436.w.a ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b.b ENSGT00950000183203.c.a.b ENSGT00940000166762.c ENSGT00940000154702.a.b.a ENSGT00390000006044.l ENSGT00730000111140 ENSGT00820000127055.b.d ENSGT00950000182926.b.c.l ENSGT00940000156208.i.e.b ENSGT00940000161685.A.a.d.a ENSGT00950000183010.a.a.b.e ##22 ENSGT00940000160897.g ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.b ENSGT00530000063424.b.x ENSGT00940000165965.a.a ENSGT00940000157350.o ENSGT00940000165965.b ENSGT00390000004874.a.b.c ENSGT00940000160508.b ENSGT00940000157215.d ENSGT00950000182914.a.b.f ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.d ENSGT00940000163160.a.d.a ENSGT00940000157400.c ENSGT00940000158907.c.a ENSGT00390000004624.a.a.d Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000154143.d.d ENSGT00940000162790.b.c.a ENSGT00940000159718.o.b ENSGT01040000240817.b ENSGT00940000156436.w.a ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b.b ENSGT00950000183203.c.a.b ENSGT00940000166762.c ENSGT00940000154702.a.b.a ENSGT00390000006044.l ENSGT00730000111140.ec ENSGT00820000127055.b.d ENSGT00950000182926.b.c.l ENSGT00940000165501.d ENSGT00940000161685.A.a.d.a ENSGT00950000183010.a.a.b.e ##22 ENSGT00940000160897.g ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.b ENSGT00530000063424.b.x ENSGT00940000165965.a.a ENSGT00940000157350.o ENSGT00940000165965.b ENSGT00390000004874.a.b.c ENSGT00940000160508.b ENSGT00940000157215.d.a ENSGT00940000163160.a.d.a ENSGT00940000157400.c ENSGT00940000158907.c.a ENSGT00390000004624.a.a.d ENSGT00940000166240 ENSGT00530000063460.A.b.f.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 45 brd3a (ENSCCRG00000051597) ENSCCRG00000048535 ENSCCRG00000030916 dnai1.2 (ENSCCRG00000047227) stx2a (ENSCCRG00000048584) ENSCCRG00000023964 ENSCCRG00000023977 ENSCCRG00000062413 smpd4 (ENSCCRG00000030618) med15 (ENSCCRG00000069677) ENSCCRG00000072989 ENSCCRG00000045323 ENSCCRG00000045333 pgam2 (ENSCCRG00000076384) nefma (ENSCCRG00000053665) rpl17 (ENSCCRG00000025631) ##22 nkx6.1 (ENSCCRG00000077610) gpat3 (ENSCCRG00000049286) abraxas1 (ENSCCRG00000022204) mrps18c (ENSCCRG00000049341) HELQ (ENSCCRG00000049351) hpse (ENSCCRG00000018956) btc (ENSCCRG00000070380) amacr (ENSCCRG00000021193) ENSCCRG00000021186 rai14 (ENSCCRG00000020713) fgf10a (ENSCCRG00000020695) nnt (ENSCCRG00000057395) ENSCCRG00000019874 ENSCCRG00000061180 ENSCCRG00000075254 Goldfish MODERN SPECIES 13 GCNT4 (ENSCARG00000012190) lhx5 (ENSCARG00000012184) ENSCARG00000012130 VAV2 (ENSCARG00000010911) ENSCARG00000010865 dnai1.2 (ENSCARG00000010308) stx2a (ENSCARG00000010257) RIMBP2 (ENSCARG00000010157) ENSCARG00000010135 TMEM132C (ENSCARG00000010129) smpd4 (ENSCARG00000008444) crkl (ENSCARG00000008369) pgam2 (ENSCARG00000008359) NEFL (ENSCARG00000008349) nefma (ENSCARG00000008332) rpl17 (ENSCARG00000008315) ##22 nkx6.1 (ENSCARG00000008308) gpat3 (ENSCARG00000007805) abraxas1 (ENSCARG00000007783) mrps18c (ENSCARG00000007773) HELQ (ENSCARG00000007636) hpse (ENSCARG00000007573) ENSCARG00000007546 ENSCARG00000007539 atp5mea (ENSCARG00000007526) PDE6B (ENSCARG00000007078) rbp4l (ENSCARG00000007026) slc26a1 (ENSCARG00000007013) zgc:86764 (ENSCARG00000006976) ENSCARG00000006960 dusp4 (ENSCARG00000006954) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00940000159789.r.b ENSGT00940000154143.d.c ENSGT00940000162790.b.c.b ENSGT00940000159718.o.a ENSGT01040000240817.a ENSGT00940000156436.w.b ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b.a ENSGT00950000183203.c.a.a ENSGT00940000166762.d ENSGT00940000154702.a.b.b ENSGT00390000006044.k ENSGT00820000127055.b.c ENSGT00950000182926.b.c.k ENSGT00940000156208.i.e.a ENSGT00940000161685.A.a.d.b ENSGT00950000183010.a.a.b.f ##22 ENSGT00940000160897.h Goldfish MODERN SPECIES 40 slc45a2 (ENSCARG00000025889) amacr (ENSCARG00000025874) btc (ENSCARG00000025870) hpse (ENSCARG00000025811) mrps18c (ENSCARG00000025796) abraxas1 (ENSCARG00000025778) gpat3 (ENSCARG00000025669) ENSCARG00000025650 ENSCARG00000025638 smpd4 (ENSCARG00000024004) med15 (ENSCARG00000023896) crkl (ENSCARG00000023888) pgam2 (ENSCARG00000023868) NEFL (ENSCARG00000023860) nefma (ENSCARG00000023855) rpl17 (ENSCARG00000023847) ##22 nkx6.1 (ENSCARG00000023839) nipal4 (ENSCARG00000023829) tlcd1 (ENSCARG00000023822) rpl23a (ENSCARG00000023797) ENSCARG00000069899 supt6h (ENSCARG00000069868) sdf2 (ENSCARG00000069856) ENSCARG00000069853 nf2b (ENSCARG00000069851) ENSCARG00000069850 RBFOX3 (ENSCARG00000069848) c1qtnf1 (ENSCARG00000069846) csnk1db (ENSCARG00000069829) slc16a3b (ENSCARG00000069821) ccdc57 (ENSCARG00000069769) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000162790.b.c.b ENSGT00940000159718.o.a ENSGT01040000240817.a ENSGT00940000156436.w.b ENSGT01030000234627.a.b.a.b.b.a ENSGT00950000183203.c.a.a ENSGT00940000166762.d ENSGT00940000154702.a.b.b ENSGT00390000006044.k ENSGT00940000167368 ENSGT00730000111140.dc ENSGT00820000127055.b.c ENSGT00950000182926.b.c.k ENSGT00940000156208.i.e.a ENSGT00940000161685.A.a.d.b ENSGT00950000183010.a.a.b.f ##22 ENSGT00940000160897.h ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a.a ENSGT00530000063424.b.w ENSGT00940000165965.a.b ENSGT00940000157350.p ENSGT00390000004874.a.b.d ENSGT00940000160508.a ENSGT00940000157215.c ENSGT00950000182914.a.b.e ENSGT01030000234534.B.a.a.a.b.d ENSGT00940000157400.d ENSGT00940000158907.c.b ENSGT00390000004624.a.a.c ENSGT00940000173711 ENSGT00530000063460.A.b.f.a.b Common carp reference MODERN SPECIES 38 rxraa (ENSCCRG00000011147) wdr5 (ENSCCRG00000067522) brd3a (ENSCCRG00000049737) ENSCCRG00000029921 stx2a (ENSCCRG00000010609) ENSCCRG00000078045 ENSCCRG00000024984 ENSCCRG00000058288 ENSCCRG00000064563 smpd4 (ENSCCRG00000048346) med15 (ENSCCRG00000081800) crkl (ENSCCRG00000034747) ENSCCRG00000034745 ENSCCRG00000055031 nefma (ENSCCRG00000055322) ENSCCRG00000009887 ##22 ENSCCRG00000069417 nkx6.1 (ENSCCRG00000009898) gpat3 (ENSCCRG00000029084) abraxas1 (ENSCCRG00000074286) mrps18c (ENSCCRG00000056607) HELQ (ENSCCRG00000022228) hpse (ENSCCRG00000049378) btc (ENSCCRG00000072417) amacr (ENSCCRG00000073501) slc45a2 (ENSCCRG00000024947) rai14 (ENSCCRG00000041158) fgf10a (ENSCCRG00000041138) nnt (ENSCCRG00000077664) ENSCCRG00000019866 ENSCCRG00000070694 Zebrafish MODERN SPECIES 13 dnai1.2 (ENSDARG00000038788) VAV2 (ENSDARG00000044718) brd3a (ENSDARG00000006527) wdr5 (ENSDARG00000016903) DNAI1 (ENSDARG00000100081) RIMBP2 (ENSDARG00000104101) ENSDARG00000075837 TMEM132C (ENSDARG00000074863) si:dkey-65l23.2 (ENSDARG00000093234) smpd4 (ENSDARG00000020730) si:ch211-222n4.2 (ENSDARG00000093026) med15 (ENSDARG00000014292) crkl (ENSDARG00000028699) ENSDARG00000058477 MPP4 (ENSDARG00000009386) rpl17 (ENSDARG00000057556) ##22 pgam2 (ENSDARG00000057571) ENSDARG00000057568 nefma (ENSDARG00000021351) nkx6.1 (ENSDARG00000022569) gpat3 (ENSDARG00000016048) abraxas1 (ENSDARG00000043339) mrps18c (ENSDARG00000069624) helq (ENSDARG00000079818) hpse (ENSDARG00000063634) btc (ENSDARG00000098112) amacr (ENSDARG00000057435) slc45a2 (ENSDARG00000002593) rxfp3 (ENSDARG00000057410) ENSDARG00000028780 ENSDARG00000090380 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000160353 ENSGT00940000158101 ENSGT00940000162631 ENSGT00940000166787 ENSGT00940000166216 ENSGT00910000144252.d.b ENSGT00950000182904.a.b.a ENSGT00940000153340.B ENSGT00940000157856 ENSGT00390000014879.c.a.a.a ENSGT00390000011206.a ENSGT00390000006707 ENSGT00940000156185 ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000158928 ENSGT00950000183010.a.a.b ##22 ENSGT00940000160897 ENSGT01030000234574.B.c.b.a.a.a ENSGT00940000156038.a.b.a.a.a.b Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 138 eri1 (ENSDCDG00000011248) MFHAS1 (ENSDCDG00000011276) rpl17 (ENSDCDG00000011297) ##22 nkx6.1 (ENSDCDG00000011328) Denticle herring MODERN SPECIES 13 slc2a11l (ENSDCDG00000001613) slc2a11l (ENSDCDG00000001609) ska1 (ENSDCDG00000001603) smarcad1b (ENSDCDG00000001560) KCNN2 (ENSDCDG00000001548) drg1 (ENSDCDG00000001546) STARD7 (ENSDCDG00000001529) slc20a1b (ENSDCDG00000001523) ENSDCDG00000001520 pcyox1 (ENSDCDG00000001519) pcyox1 (ENSDCDG00000001517) fam136a (ENSDCDG00000001515) gmcl1 (ENSDCDG00000001513) eri1 (ENSDCDG00000001512) MFHAS1 (ENSDCDG00000001510) rpl17 (ENSDCDG00000001503) ##22 nkx6.1 (ENSDCDG00000001501) gpat3 (ENSDCDG00000001496) ENSDCDG00000001489 ENSDCDG00000001470 ENSDCDG00000001459 nfil3-5 (ENSDCDG00000001458) ENSDCDG00000001457 ENSDCDG00000001454 ENSDCDG00000001452 PLPPR2 (ENSDCDG00000001447) myh9a (ENSDCDG00000000630) ENSDCDG00000000275 Atlantic herring MODERN SPECIES 3 hint1 (ENSCHAG00000012294) ENSCHAG00000012287 ttll11 (ENSCHAG00000012269) ENSCHAG00000012223 dab2ipb (ENSCHAG00000011875) zgc:63972 (ENSCHAG00000011860) fibcd1b (ENSCHAG00000011845) ENSCHAG00000011841 aif1l (ENSCHAG00000011793) gfm2 (ENSCHAG00000011498) hexb (ENSCHAG00000011143) fam136a (ENSCHAG00000011118) gmcl1 (ENSCHAG00000010832) eri1 (ENSCHAG00000010804) MFHAS1 (ENSCHAG00000010800) rpl17 (ENSCHAG00000010742) ##22 mef2ca (ENSCHAG00000010634) cetn3 (ENSCHAG00000010592) arrdc3b (ENSCHAG00000010510) nr2f1b (ENSCHAG00000010335) TLR8 (ENSCHAG00000010070) MCTP1 (ENSCHAG00000009821) ENSCHAG00000009797 septin5b (ENSCHAG00000009078) cldn5b (ENSCHAG00000009062) acads (ENSCHAG00000008810) crybb1 (ENSCHAG00000008790) cryba4 (ENSCHAG00000008761) ENSCHAG00000008281 npm2b (ENSCHAG00000008262) SEZ6L (ENSCHAG00000004829) Spotted gar MODERN SPECIES 658 ENSLOCG00000017548 paip1 (ENSLOCG00000012270) ##26 ENSLOCG00000012263 atp5meb (ENSLOCG00000012258) ENSLOCG00000012238 rbp4l (ENSLOCG00000012234) slc26a1 (ENSLOCG00000012231) IDUA (ENSLOCG00000012221) ENSLOCG00000012217 ENSLOCG00000012209 dusp4 (ENSLOCG00000012199) tnksb (ENSLOCG00000012168) ppp1r3b (ENSLOCG00000017547) eri1 (ENSLOCG00000012161) MFHAS1 (ENSLOCG00000012154) rpl17 (ENSLOCG00000012148) ##22 nkx6.1 (ENSLOCG00000012142) GPAT3 (ENSLOCG00000012133) abraxas1 (ENSLOCG00000012124) mrps18c (ENSLOCG00000012115) HELQ (ENSLOCG00000012099) MYL5 (ENSLOCG00000012090) hpse (ENSLOCG00000012076) btc (ENSLOCG00000012070) ENSLOCG00000012063 EREG (ENSLOCG00000012059) EPGN (ENSLOCG00000012056) mthfd2l (ENSLOCG00000012052) ptpn13 (ENSLOCG00000012036) mapk10 (ENSLOCG00000012028) ARHGAP24 (ENSLOCG00000012018) Reedfish MODERN SPECIES 15 MOB3B (ENSECRG00000008569) THAP1 (ENSECRG00000008562) june (ENSECRG00000008557) rnf170 (ENSECRG00000008551) HOOK3 (ENSECRG00000008508) TRABD2A (ENSECRG00000008488) ENSECRG00000008477 hpse (ENSECRG00000008394) HELQ (ENSECRG00000008340) mrps18c (ENSECRG00000008321) ENSECRG00000008308 abraxas1 (ENSECRG00000008293) GPAT3 (ENSECRG00000008282) cycsb (ENSECRG00000008271) nkx6.1 (ENSECRG00000008236) rpl17 (ENSECRG00000008193) ##22 C18orf32 (ENSECRG00000008179) #23 DYM (ENSECRG00000008045) #24 smad7 (ENSECRG00000008025) #25 CTIF (ENSECRG00000008014) #26 ENSECRG00000008006 ZBTB7C (ENSECRG00000007988) #27 SMAD2 (ENSECRG00000007967) #28 skor2 (ENSECRG00000007957) #29 ier3ip1 (ENSECRG00000007948) #30 hdhd2 (ENSECRG00000007937) #31 katnal2 (ENSECRG00000007921) #32 sigmar1 (ENSECRG00000007911) galt (ENSECRG00000007892) ENSECRG00000007879 cntfr (ENSECRG00000007868)