Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT01030000234527.A.a.b.a.a	ENSGT00390000013415.a.b	ENSGT00950000182864.a.b.a	ENSGT00950000182859.A.a.a.b #8	ENSGT00940000154352.A #10	ENSGT00940000154314 #11	ENSGT00390000008225 #12	ENSGT00940000157734 #13	ENSGT00940000156208 #14	ENSGT00940000161685.A.a	ENSGT00940000161406 #17	ENSGT00900000141143 #18	ENSGT00940000156716 #19	ENSGT00390000005989.b #20	ENSGT00940000162737 #21	ENSGT00940000160930 #22	ENSGT00940000158607 #23	ENSGT01100000263540.B.d #24	ENSGT00940000155874 #26	ENSGT00530000063711.a #27	ENSGT00720000108860 #29	ENSGT00940000162957	ENSGT00940000158918 #30	ENSGT00940000162387	ENSGT00940000160355 #32	ENSGT00950000182882.B #33	ENSGT00530000063672.b #34	ENSGT00390000000531 #35	ENSGT00940000160418 #36	ENSGT00940000160558 #37	ENSGT00940000154115.c.a
Degu	MODERN SPECIES	77	ENSODEG00000007854 #7	EBF2 (ENSODEG00000007640) #8	ENSODEG00000006905 #9	ENSODEG00000007418 #10	KCTD9 (ENSODEG00000008616) #11	GNRH1 (ENSODEG00000007834) #12	DOCK5 (ENSODEG00000007523) #13	NEFL (ENSODEG00000007183) #14	NEFM (ENSODEG00000008392) #15	ENSODEG00000007521 #16	ADAM7 (ENSODEG00000007547) #17	ADAMDEC1 (ENSODEG00000008034) #18	ADAM28 (ENSODEG00000007875) #19	STC1 (ENSODEG00000007382) #20	NKX2-6 (ENSODEG00000007413) #21	NKX3-1 (ENSODEG00000007004) #22	SLC25A37 (ENSODEG00000007363) #23	ENTPD4 (ENSODEG00000009788) #24	ENSODEG00000009404 #25	LOXL2 (ENSODEG00000006938) #26	R3HCC1 (ENSODEG00000007529) #27	ENSODEG00000019474 #28	ENSODEG00000007294 #29	RHOBTB2 (ENSODEG00000007111) #30	ENSODEG00000008725 #31	EGR3 (ENSODEG00000007442) #32	BIN3 (ENSODEG00000006965) #33	CCAR2 (ENSODEG00000008466) #34	C8orf58 (ENSODEG00000006637) #35	PDLIM2 (ENSODEG00000006028) #36	SORBS3 (ENSODEG00000007179) #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	110	BNIP3L (ENSCLAG00000016223)	PPP2R2A (ENSCLAG00000013984)	EBF2 (ENSCLAG00000013500) #8	CDCA2 (ENSCLAG00000011981) #10	KCTD9 (ENSCLAG00000013948) #11	GNRH1 (ENSCLAG00000014234) #12	DOCK5 (ENSCLAG00000015174) #13	NEFL (ENSCLAG00000014935) #14	ENSCLAG00000013799	ADAM7 (ENSCLAG00000013174) #17	ENSCLAG00000015375 #18	ADAM28 (ENSCLAG00000016310) #19	ENSCLAG00000015807	STC1 (ENSCLAG00000014786) #20	NKX2-6 (ENSCLAG00000014720) #21	NKX3-1 (ENSCLAG00000013957) #22	SLC25A37 (ENSCLAG00000014235) #23	ENTPD4 (ENSCLAG00000013899) #24	LOXL2 (ENSCLAG00000016283) #26	R3HCC1 (ENSCLAG00000015556) #27	CHMP7 (ENSCLAG00000015529) #29	ENSCLAG00000013896	RHOBTB2 (ENSCLAG00000014037) #30	PEBP4 (ENSCLAG00000015116)	EGR3 (ENSCLAG00000016373) #32	BIN3 (ENSCLAG00000016398) #33	CCAR2 (ENSCLAG00000014299) #34	C8orf58 (ENSCLAG00000014186) #35	ENSCLAG00000014272 #36	SORBS3 (ENSCLAG00000014309) #37	PPP3CC (ENSCLAG00000015203)