Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00550000074851	ENSGT00940000159619.a	ENSGT00860000135828	ENSGT00940000163072	ENSGT00940000161771	ENSGT00940000162953	ENSGT00940000155941.A	ENSGT00390000018718	ENSGT00940000156442	ENSGT00940000161593	ENSGT00940000158154	ENSGT00940000156389.a	ENSGT00390000004757	ENSGT00510000046981	ENSGT00940000156929 #21	ENSGT00940000159409 #22	ENSGT00940000159265 #23	ENSGT00950000183090.C	ENSGT00390000001143 #25	ENSGT00390000003197.i.a #26	ENSGT00940000159865 #27	ENSGT00950000182988.a.a	ENSGT00390000017679	ENSGT00390000016356	ENSGT00940000157975	ENSGT01030000234629.D	ENSGT00390000011073	ENSGT00390000010564	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00940000160019	ENSGT00940000157384
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	13											ENSGT00940000158154	ENSGT00940000156389.a	ENSGT00390000004757.t	ENSGT00510000046981	ENSGT00940000156929 #21	ENSGT00940000159409 #22	ENSGT00940000159265 #23	ENSGT00950000183090.C	ENSGT00390000001143 #25	ENSGT00390000003197.i.a #26	ENSGT00940000159865 #27	ENSGT00960000189442.c #28	ENSGT00950000182988.a.a	ENSGT00390000017679	ENSGT00390000016356	ENSGT00940000157975	ENSGT01030000234629.D	ENSGT00390000011073	ENSGT00390000010564	ENSGT00390000001455.eb.b	ENSGT01030000234590.A.a.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	242												ENSGT00940000156389.a	ENSGT00390000004757.t	ENSGT00510000046981	ENSGT00940000156929 #21	ENSGT00940000159409 #22	ENSGT00940000159265 #23	ENSGT00950000183090.C	ENSGT00390000001143 #25	ENSGT00390000003197.i.a #26	ENSGT00940000159865 #27	ENSGT00960000189442.c #28
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	667															BDH1 (ENSUPAG00010020970) #21	DLG1 (ENSUPAG00010020986) #22	MELTF (ENSUPAG00010021096) #23	PIGZ (ENSUPAG00010021104) #24	NCBP2AS2 (ENSUPAG00010021106) #25	NCBP2 (ENSUPAG00010021111) #26	SENP5 (ENSUPAG00010021118) #27	ENSUPAG00010021127 #28
Squirrel	MODERN SPECIES	433												ENSSTOG00000008963	ENSSTOG00000034442	APOD (ENSSTOG00000023498)	BDH1 (ENSSTOG00000012637) #21	DLG1 (ENSSTOG00000005385) #22	MELTF (ENSSTOG00000001590) #23	ENSSTOG00000021188	NCBP2AS2 (ENSSTOG00000031536) #25	NCBP2 (ENSSTOG00000001584) #26	SENP5 (ENSSTOG00000022693) #27
Alpin marmot	MODERN SPECIES	19	ENSMMMG00000012704	ITGB5 (ENSMMMG00000012679)	ENSMMMG00000012665	SLC12A8 (ENSMMMG00000012328)	ZNF148 (ENSMMMG00000012274)	ENSMMMG00000012255	SNX4 (ENSMMMG00000012229)	GNG5B (ENSMMMG00000012223)	ENSMMMG00000012176	ENSMMMG00000012158	XXYLT1 (ENSMMMG00000012143)	ACAP2 (ENSMMMG00000011132)	ENSMMMG00000011097	APOD (ENSMMMG00000011088)	BDH1 (ENSMMMG00000011058) #21	DLG1 (ENSMMMG00000010315) #22	MELTF (ENSMMMG00000010259) #23	ENSMMMG00000010247	NCBP2AS2 (ENSMMMG00000010243) #25	NCBP2 (ENSMMMG00000010231) #26	SENP5 (ENSMMMG00000010197) #27	ENSMMMG00000010189 #28	PAK2 (ENSMMMG00000010171)	PIGX (ENSMMMG00000010154)	CEP19 (ENSMMMG00000010134)	NRROS (ENSMMMG00000010121)	FBXO45 (ENSMMMG00000010104)	WDR53 (ENSMMMG00000010095)	SMCO1 (ENSMMMG00000010085)	ENSMMMG00000010072	UBXN7 (ENSMMMG00000010021)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	1	OPA1 (ENSSVLG00005005536)	HES1 (ENSSVLG00005005416)	CPN2 (ENSSVLG00005005406)	LRRC15 (ENSSVLG00005005394)	GP5 (ENSSVLG00005005382)	ENSSVLG00005005145	TMEM44 (ENSSVLG00005005023)	LSG1 (ENSSVLG00005004993)	FAM43A (ENSSVLG00005004980)	IER3IP1 (ENSSVLG00005004893)	ENSSVLG00005004850	ACAP2 (ENSSVLG00005004803)	ENSSVLG00005018587	APOD (ENSSVLG00005018519)	BDH1 (ENSSVLG00005018433) #21	DLG1 (ENSSVLG00005015999) #22	MELTF (ENSSVLG00005015198) #23	ENSSVLG00005015158	NCBP2AS2 (ENSSVLG00005015143) #25	ENSSVLG00005014948 #26	SENP5 (ENSSVLG00005014884) #27	ENSSVLG00005014834	ENSSVLG00005014801	ENSSVLG00005014757	ENSSVLG00005014660	ENSSVLG00005014612	ENSSVLG00005014580	PAK2 (ENSSVLG00005014525)	ENSSVLG00005014408	PIGX (ENSSVLG00005014301)	CEP19 (ENSSVLG00005014259)