Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160640 #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 717 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 356 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00940000165347 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 127 ENSGT00940000154259 ENSGT00940000156061 ENSGT00940000158226 ENSGT01050000244941.A ENSGT00940000154810 ENSGT00940000163785.a.b ENSGT00390000006684 ENSGT00390000007535 ENSGT00530000064170.e ENSGT00940000153173.a ENSGT00940000157772 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00940000165347 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 Amniota ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156243 ENSGT00950000185213 ENSGT00390000007252.c ENSGT00390000008250 ENSGT00950000182920.b.a.b.a.b ENSGT00940000158215 ENSGT00390000009819.a.a ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430 #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00940000165347 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 ENSGT00940000153173.a ENSGT00530000064170.e ENSGT00390000007535 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000007252.c ENSGT00390000008250 ENSGT00950000182920.b.a.b.a.b ENSGT00940000158215 ENSGT00390000009819.a.a ENSGT00730000110920.b.a.b 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ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00940000165347 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT01000000214430.b ##18 ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 ENSGT00940000153173.a ENSGT00530000064170.e Eutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.a.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #17 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000165099 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00940000165347 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT01000000214430.b ##18 ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #17 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00940000165347 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT01000000214430.b ##18 ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000009819.a.a ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##18 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #17 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00940000165347 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT01000000214430.b ##18 ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.a ENSGT00390000009819.a.a ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 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ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158215 ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.a ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #17 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00860000136187 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT01000000214430.b ##18 ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a #17 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.o ##18 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00860000136187 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT01050000244898.a.a.a.b ENSGT01000000214430.b ##18 ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665 ENSGT00940000157772 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a #17 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.o ##18 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000163078 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00860000136187 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT00940000157721 #34 ENSGT00940000162061 #35 ENSGT01000000214434.F #36 ENSGT00900000143271 ENSGT00940000159251 #37 Murinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000009819.a.a ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.a #17 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.b ##18 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.b #16 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00860000136187 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT00940000157721 #34 ENSGT00940000162061 #35 ENSGT01000000214434.F #36 ENSGT00900000143271 ENSGT00940000159251 #37 Mus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.a ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.a.a #12 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.a.b #17 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000168083 #20 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00860000136187 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT00940000157721 #34 ENSGT00940000162061 #35 ENSGT01000000214434.F #36 ENSGT00940000159251 #37 ENSGT00940000155417.a.b Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00730000110920.b.a.b ENSGT01030000234532.B.e.a ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.a.a #12 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.a.b.a.a ##18 ENSGT00860000135766 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000168083 #20 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00860000136187 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT00940000157721 #34 ENSGT00940000162061 #35 ENSGT01000000214434.F #36 ENSGT00940000159251 #37 ENSGT00940000155417.a.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155903 ENSGT00390000004438 ENSGT00530000062962.b.b ENSGT01000000214430.a.b ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.a.a #12 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b #11 ENSGT00940000154359.e ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.a.b.a.a ##18 ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.p.a.b.a #14 ENSGT01030000234531.A.b.b.b.e.a.a.a.a.a.b.b ENSGT00860000135766 ENSGT01000000214430.a.a.b #18 ENSGT00950000182991.B #19 ENSGT00940000168083 #20 ENSGT00940000162423 #21 ENSGT00940000160640 #22 ENSGT00940000164376.c #23 ENSGT00940000156823.e #24 ENSGT00390000017601 #25 ENSGT00390000013920 #27 ENSGT00390000017010 #28 ENSGT00860000136187 ENSGT00550000074944 #29 ENSGT00390000007109 #30 ENSGT00940000161278 #31 ENSGT00940000158840 #32 ENSGT00390000010786 #33 ENSGT00940000157721 #34 ENSGT00940000162061 #35 ENSGT01000000214434.F #36 ENSGT00940000159251 #37 Mouse MODERN SPECIES 13 Gm13275 (ENSMUSG00000099518) #7 Gm13279 (ENSMUSG00000099420) #8 Gm13285 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