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Amniota	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156243	ENSGT00950000185213	ENSGT00390000007252.c	ENSGT00390000008250	ENSGT00950000182920.b.a.b.a.b	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.a	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430 #11	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00940000165347	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a	ENSGT00530000064170.e	ENSGT00390000007535
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000007252.c	ENSGT00390000008250	ENSGT00950000182920.b.a.b.a.b	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.a	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a #11	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00940000165347	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a	ENSGT00530000064170.e
Theria	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000008250	ENSGT00950000182920.b.a.b.a.b	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.a	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a #11	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00940000165347	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a	ENSGT00530000064170.e
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #11	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000165099	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b ##11	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #11	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000009819.a.a	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #11	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Primates	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.a.j	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #11	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.a.j	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #11	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00910000146874	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a #11	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a #15	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a #15	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a #15	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00940000161278	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000158840	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a.c ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.h #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a.d ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.g #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00940000161278	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000158840	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.h #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a.d ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.g #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00910000147619 #23	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000013920	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000164672.b	ENSGT00940000161278	ENSGT00940000158840	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #12	ENSGT00940000154359.e #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.h #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a.d ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b ##11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.g #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00910000147619 #23	ENSGT00940000156823.e #24	ENSGT00390000017601 #25	ENSGT00390000017010	ENSGT00550000074944	ENSGT00940000161278	ENSGT00390000007109	ENSGT00940000158840	ENSGT00390000010786	ENSGT01050000244898.a.a.a.b	ENSGT01000000214430.b ##11	ENSGT00390000005644	ENSGT00940000156665	ENSGT00950000183134.c.b.p	ENSGT00390000009366.c.a.b
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	265					ENSMNEG00000043566 #11	IFNA14 (ENSMNEG00000041515) #12	KLHL9 (ENSMNEG00000031087) #13	IFNA6 (ENSMNEG00000004784) #14	ENSMNEG00000035314 #15	ENSMNEG00000038078 #16	IFNE (ENSMNEG00000038701) #17	MTAP (ENSMNEG00000043027) #18	CDKN2A (ENSMNEG00000044907) #19	CDKN2B (ENSMNEG00000041291) #20	ENSMNEG00000028735 #21	DMRTA1 (ENSMNEG00000029016) #22	ENSMNEG00000028981 #23	ELAVL2 (ENSMNEG00000032526) #24	IZUMO3 (ENSMNEG00000037442) #25