Theria	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000008250	ENSGT00950000182920.b.a.b.a.b	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.a	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00940000165347	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a	ENSGT00530000064170.e
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.a.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000165099 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b ##36	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000009819.a.a	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Primates	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.a.j	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00940000165347	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158215	ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.a.j	ENSGT00730000110920.b.a.b	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00910000146874	ENSGT01030000234532.B.e.a	ENSGT00940000155903	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a #10	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772	ENSGT00940000153173.a
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a #8	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #9	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000004438	ENSGT00530000062962.b.b	ENSGT01000000214430.a.b ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.b #10	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.d.b #7	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.d.a #8	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #9	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.b #10	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.d.b #7	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.d.a #8	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #9	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.b #10	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.c ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.d.a.c.b #8	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #9	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.b #10	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000163078	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Pan	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.d.a.d.a ##36	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.a.d.a.c.b #8	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.a #9	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.a.b #10	ENSGT00940000154359.e #11	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.b #12	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a.b #13	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a #14	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b #15	ENSGT01000000214430.a.a.a.a.a.b.b.b.a.a.a #16	ENSGT01000000214430.a.a.b #17	ENSGT00950000182991.B.yb.a #18	ENSGT00940000165099 #19	ENSGT00940000162423 #20	ENSGT00940000153593.c.b.d.a #21	ENSGT00940000160640 #22	ENSGT00940000156823.e #26	ENSGT00390000017601 #27	ENSGT00390000013920 #28	ENSGT00390000017010 #29	ENSGT00550000074944 #30	ENSGT00390000007109 #31	ENSGT00940000161278 #32	ENSGT00940000158840 #33	ENSGT00390000010786 #34	ENSGT01050000244898.a.a.a.b #35	ENSGT01000000214430.b #36	ENSGT00390000005644 #37	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.a.a.b	ENSGT00940000156665	ENSGT00940000157772
Chimpanzee	MODERN SPECIES	22	IFNA21 (ENSPTRG00000048249) #7	IFNA17 (ENSPTRG00000045595) #8	IFNA14 (ENSPTRG00000044822) #9	IFNA5 (ENSPTRG00000048038) #10	KLHL9 (ENSPTRG00000022846) #11	IFNA6 (ENSPTRG00000041238) #12	ENSPTRG00000050673 #13	IFNA2 (ENSPTRG00000020820) #14	IFNA8 (ENSPTRG00000045477) #15	ENSPTRG00000043432 #16	IFNE (ENSPTRG00000020823) #17	MTAP (ENSPTRG00000020825) #18	CDKN2A (ENSPTRG00000020827) #19	CDKN2B (ENSPTRG00000049465) #20	ENSPTRG00000043190 #21	DMRTA1 (ENSPTRG00000050201) #22	MTRNR2L14 (ENSPTRG00000042327) #23	ENSPTRG00000051343 #24	ENSPTRG00000047423 #25	ELAVL2 (ENSPTRG00000020830) #26	IZUMO3 (ENSPTRG00000029308) #27	TUSC1 (ENSPTRG00000029307) #28	CAAP1 (ENSPTRG00000020831) #29	PLAA (ENSPTRG00000020832) #30	IFT74 (ENSPTRG00000020833) #31	LRRC19 (ENSPTRG00000020834) #32	TEK (ENSPTRG00000020835) #33	EQTN (ENSPTRG00000020836) #34	MOB3B (ENSPTRG00000020837) #35	IFNK (ENSPTRG00000020838) #36	C9orf72 (ENSPTRG00000020839) #37