Glires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154873.g.b #8 ENSGT00940000154873.g.a #9 ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853 #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00910000148243 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00410000025615 #22 ENSGT00390000006233.c.b #23 ENSGT00940000157351 #24 ENSGT00940000159603 #25 ENSGT00940000161850 #26 ENSGT00940000157969 #27 ENSGT00940000156783 #28 ENSGT00390000000190 #29 ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154873.g.a #9 ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853 #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00910000148243 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00950000184814 ENSGT00410000025615 #22 ENSGT00390000006233.c.b #23 ENSGT00940000157351 #24 ENSGT00940000159603 #25 ENSGT00940000161850 #26 ENSGT00940000157969 #27 ENSGT00940000156783 #28 ENSGT00390000000190 #29 ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853 #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00910000148243 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00390000018868.B.a ENSGT00950000184814 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ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853 #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00910000148243 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00390000018868.B.a ENSGT00950000184814 ENSGT00410000025615 #22 ENSGT00390000006233.c.b #23 ENSGT00940000157351 #24 ENSGT00940000159603 #25 ENSGT00940000161850 #26 ENSGT00940000157969 #27 ENSGT00940000156783 #28 ENSGT00390000000190 #29 ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154873.g.a #9 ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853 #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00910000148243 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00950000184814 ENSGT00410000025615 #22 ENSGT00390000006233.c.b #23 ENSGT00940000157351 #24 ENSGT00940000159603 #25 ENSGT00940000161850 #26 ENSGT00940000157969 #27 ENSGT00940000156783 #28 ENSGT00390000000190 #29 ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Murinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154873.g.b #8 ENSGT00940000154873.g.a #9 ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853 #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00950000184814 ENSGT00410000025615 #22 ENSGT00390000006233.c.b #23 ENSGT00940000157351 #24 ENSGT00940000159603 #25 ENSGT00940000161850 #26 ENSGT00940000157969 #27 ENSGT00940000156783 #28 ENSGT00390000000190 #29 ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Mus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154873.g.b #8 ENSGT00940000154873.g.a #9 ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853 #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00950000184814 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ENSGT00940000156783 #28 ENSGT00390000000190 #29 ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 Rfng (MGP_CAROLIEiJ_G0017544) #7 Cbr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017543) #8 Dcxr (MGP_CAROLIEiJ_G0017542) #9 Rac3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017541) #10 Lrrc45 (MGP_CAROLIEiJ_G0017540) #11 Cenpx (MGP_CAROLIEiJ_G0017539) #12 Aspscr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017538) #13 Notum (MGP_CAROLIEiJ_G0017537) #14 MGP_CAROLIEiJ_G0017536 #15 Pycr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017535) #16 Mafg (MGP_CAROLIEiJ_G0017534) #17 Sirt7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017533) #18 MGP_CAROLIEiJ_G0017532 #19 Npb (MGP_CAROLIEiJ_G0017531) #20 Anapc11 (MGP_CAROLIEiJ_G0017530) #21 Alyref (MGP_CAROLIEiJ_G0017529) #22 Arhgdia (MGP_CAROLIEiJ_G0017528) #23 P4hb (MGP_CAROLIEiJ_G0017527) #24 Ppp1r27 (MGP_CAROLIEiJ_G0017526) #25 Mcrip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017525) #26 Gcgr (MGP_CAROLIEiJ_G0017524) #27 Slc25a10 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ENSGT00410000025615.g.a.b ##22 spretus MODERN SPECIES 1 Acss3 (MGP_SPRETEiJ_G0016605) Ppfia2 (MGP_SPRETEiJ_G0016604) Ccdc59 (MGP_SPRETEiJ_G0016603) Mettl25 (MGP_SPRETEiJ_G0016602) Tmtc2 (MGP_SPRETEiJ_G0016601) Slc6a15 (MGP_SPRETEiJ_G0016600) MGP_SPRETEiJ_G0016599 Alx1 (MGP_SPRETEiJ_G0016598) Rassf9 (MGP_SPRETEiJ_G0016597) Nts (MGP_SPRETEiJ_G0016596) Mgat4c (MGP_SPRETEiJ_G0016595) 1700017N19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0016594) 4930430F08Rik (MGP_SPRETEiJ_G0016593) Cep290 (MGP_SPRETEiJ_G0016592) Tmtc3 (MGP_SPRETEiJ_G0016591) MGP_SPRETEiJ_G0016590 ##22 Kitl (MGP_SPRETEiJ_G0016589) Csl (MGP_SPRETEiJ_G0016588) MGP_SPRETEiJ_G0016587 Dusp6 (MGP_SPRETEiJ_G0016586) MGP_SPRETEiJ_G0016585 Galnt4 (MGP_SPRETEiJ_G0016584) Poc1b (MGP_SPRETEiJ_G0016583) Atp2b1 (MGP_SPRETEiJ_G0016582) MGP_SPRETEiJ_G0016581 Ccer1 (MGP_SPRETEiJ_G0016580) MGP_SPRETEiJ_G0016579 Epyc (MGP_SPRETEiJ_G0016578) Kera (MGP_SPRETEiJ_G0016577) Lum (MGP_SPRETEiJ_G0016576) Dcn (MGP_SPRETEiJ_G0016575) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 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SPECIES 18 Gsta3 (MGP_PahariEiJ_G0027239) Kcnq5 (MGP_PahariEiJ_G0027240) MGP_PahariEiJ_G0027241 Ppp1r14bl (MGP_PahariEiJ_G0027242) MGP_PahariEiJ_G0027243 B3gat2 (MGP_PahariEiJ_G0027244) Smap1 (MGP_PahariEiJ_G0027245) Sdhaf4 (MGP_PahariEiJ_G0027246) Fam135a (MGP_PahariEiJ_G0027247) Col9a1 (MGP_PahariEiJ_G0027248) Col19a1 (MGP_PahariEiJ_G0027249) Lmbrd1 (MGP_PahariEiJ_G0027250) Adgrb3 (MGP_PahariEiJ_G0027251) Phf3 (MGP_PahariEiJ_G0027252) MGP_PahariEiJ_G0027253 MGP_PahariEiJ_G0027254 #22 MGP_PahariEiJ_G0027255 #22 MGP_PahariEiJ_G0027256 Lgsn (MGP_PahariEiJ_G0027257) Dnaaf6 (MGP_PahariEiJ_G0027258) Khdrbs2 (MGP_PahariEiJ_G0027259) Prim2 (MGP_PahariEiJ_G0027260) Rab23 (MGP_PahariEiJ_G0027261) Bag2 (MGP_PahariEiJ_G0027262) Zfp451 (MGP_PahariEiJ_G0027263) Bend6 (MGP_PahariEiJ_G0027264) MGP_PahariEiJ_G0027265 Ccdc115 (MGP_PahariEiJ_G0027266) Imp4 (MGP_PahariEiJ_G0027267) MGP_PahariEiJ_G0027268 MGP_PahariEiJ_G0027269 Shrew mouse MODERN SPECIES 18 Kcnq5 (MGP_PahariEiJ_G0027240) 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ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154873.g.a #9 ENSGT00940000153500.a.b #10 ENSGT00940000154003.B #11 ENSGT00390000002725 ENSGT00940000156853.d #13 ENSGT00390000015892 #14 ENSGT00950000182933.A.a.a #15 ENSGT00950000183044.a.a.a.d #16 ENSGT00940000160070 #17 ENSGT00910000148243 ENSGT00940000159703 #18 ENSGT00550000075065 #19 ENSGT00940000158204.a #20 ENSGT00550000075186 #21 ENSGT00950000184814 ENSGT00410000025615 #22 ENSGT00390000006233.c.b #23 ENSGT00940000157351 #24 ENSGT00940000159603 #25 ENSGT00940000161850 #26 ENSGT00940000157969 #27 ENSGT00940000156783 #28 ENSGT00390000000190 #29 ENSGT00940000158297 #30 ENSGT00730000111327 #31 ENSGT00390000004169 #32 ENSGT00390000003596 #33 ENSGT00390000013260.B #34 ENSGT00940000160874 #35 ENSGT00390000018731 #36 ENSGT00390000016682 #37 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 RAC3 (ENSSVLG00005016691) #10 LRRC45 (ENSSVLG00005016731) #11 CENPX (ENSSVLG00005016768) 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