Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000009268 #9	ENSGT00940000160341 #8	ENSGT00400000022853	ENSGT00940000160310 #10	ENSGT00940000153986.b.b #11	ENSGT00390000010740 #12	ENSGT00940000160539 #13	ENSGT00950000182985.b.b #14	ENSGT00940000157074 #15	ENSGT00940000161844 #16	ENSGT00510000048574 #17	ENSGT00390000017869 #18	ENSGT00390000002731 #20	ENSGT00390000013444.a.b.b #19	ENSGT00940000154911 #21	ENSGT00940000161450 #22	ENSGT00940000159375 #23	ENSGT00390000006979.a #24	ENSGT00390000006255.b.b #25	ENSGT00390000014903 #26	ENSGT00940000154196.a #27	ENSGT00940000155031 #28	ENSGT00410000025985 #29	ENSGT00600000084617 #30	ENSGT00940000157482.d #31	ENSGT00940000158566 #32	ENSGT00940000154853.d #33	ENSGT00940000154853.c.d.b ##33	ENSGT00940000162878	ENSGT00940000154853.c.c ##33
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000009268 #9	ENSGT00940000160341 #8	ENSGT00400000022853	ENSGT00940000160310 #10	ENSGT00940000153986.b.b #11	ENSGT00390000010740 #12	ENSGT00940000160539 #13	ENSGT00950000182985.b.b #14	ENSGT00940000157074 #15	ENSGT00940000161844 #16	ENSGT00510000048574 #17	ENSGT00390000017869 #18	ENSGT00390000002731 #20	ENSGT00390000013444.a.b.b #19	ENSGT00940000154911 #21	ENSGT00940000161450 #22	ENSGT00940000159375 #23	ENSGT00390000006979.a #24	ENSGT00390000006255.b.b #25	ENSGT00390000014903 #26	ENSGT00940000154196.a #27	ENSGT00940000155031 #28	ENSGT00410000025985 #29	ENSGT00600000084617 #30	ENSGT00940000157482.d #31	ENSGT00940000158566 #32	ENSGT00940000154853.d #33	ENSGT00940000154853.c.d.b.b ##33	ENSGT00940000154853.c.c.a ##33	ENSGT00940000162878	ENSGT00940000154853.c.d.b.a.a ##33
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000009268 #9	ENSGT00940000160341 #8	ENSGT00400000022853	ENSGT00940000160310 #10	ENSGT00940000153986.b.b #11	ENSGT00390000010740 #12	ENSGT00940000160539 #13	ENSGT00950000182985.b.b #14	ENSGT00940000157074 #15	ENSGT00940000161844 #16	ENSGT00510000048574 #17	ENSGT00390000017869 #18	ENSGT00390000002731 #20	ENSGT00390000013444.a.b.b #19	ENSGT00940000154911 #21	ENSGT00940000161450 #22	ENSGT00940000159375 #23	ENSGT00390000006979.a #24	ENSGT00390000006255.b.b #25	ENSGT00390000014903 #26	ENSGT00940000154196.a #27	ENSGT00940000155031 #28	ENSGT00410000025985 #29	ENSGT00600000084617 #30	ENSGT00940000157482.d #31	ENSGT00940000158566 #32	ENSGT00940000154853.d #33	ENSGT00940000154853.c.d.b.a.b ##33
Squirrel	MODERN SPECIES	199	PRDX5 (ENSSTOG00000002393) #7	ESRRA (ENSSTOG00000019877) #8	TRMT112 (ENSSTOG00000019857) #9	KCNK4 (ENSSTOG00000008461) #10	GPR137 (ENSSTOG00000024794) #11	BAD (ENSSTOG00000008441) #12	PLCB3 (ENSSTOG00000008397) #13	PPP1R14B (ENSSTOG00000021959) #14	FKBP2 (ENSSTOG00000028785) #15	VEGFB (ENSSTOG00000014290) #16	DNAJC4 (ENSSTOG00000026335) #17	NUDT22 (ENSSTOG00000021715) #18	FERMT3 (ENSSTOG00000014271) #19	TRPT1 (ENSSTOG00000014285) #20	STIP1 (ENSSTOG00000014262) #21	MACROD1 (ENSSTOG00000034108) #22	FLRT1 (ENSSTOG00000019831) #23	OTUB1 (ENSSTOG00000026099) #24	COX8A (ENSSTOG00000011372) #25	NAA40 (ENSSTOG00000011363) #26	RCOR2 (ENSSTOG00000011347) #27	MARK2 (ENSSTOG00000020436) #28	SPINDOC (ENSSTOG00000008900) #29	ZFTA (ENSSTOG00000027225) #30	ENSSTOG00000000199 #31	ATL3 (ENSSTOG00000000194) #32	PLAAT3 (ENSSTOG00000022553) #33
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	620	PRDX5 (ENSUPAG00010007537) #7	TRMT112 (ENSUPAG00010007547) #9	ESRRA (ENSUPAG00010007583) #8	CATSPERZ (ENSUPAG00010007594)	GPR137 (ENSUPAG00010007604) #11	BAD (ENSUPAG00010007644) #12	PLCB3 (ENSUPAG00010007660) #13	PPP1R14B (ENSUPAG00010007704) #14	FKBP2 (ENSUPAG00010007718) #15	VEGFB (ENSUPAG00010007726) #16	DNAJC4 (ENSUPAG00010007738) #17	NUDT22 (ENSUPAG00010007753) #18	TRPT1 (ENSUPAG00010007757) #20	FERMT3 (ENSUPAG00010007770) #19	STIP1 (ENSUPAG00010007782) #21	MACROD1 (ENSUPAG00010007872) #22	FLRT1 (ENSUPAG00010007939) #23	OTUB1 (ENSUPAG00010007945) #24	COX8A (ENSUPAG00010008008) #25	NAA40 (ENSUPAG00010008016) #26	RCOR2 (ENSUPAG00010008026) #27	MARK2 (ENSUPAG00010008066) #28	SPINDOC (ENSUPAG00010008697) #29	ZFTA (ENSUPAG00010008715) #30	RTN3 (ENSUPAG00010008723) #31	ATL3 (ENSUPAG00010008777) #32	PLAAT3 (ENSUPAG00010010461) #33	ENSUPAG00010010469 ##33
Alpin marmot	MODERN SPECIES	3	ESRRA (ENSMMMG00000007925) #8	CATSPERZ (ENSMMMG00000007922)	KCNK4 (ENSMMMG00000007912) #10	GPR137 (ENSMMMG00000007790) #11	BAD (ENSMMMG00000007784) #12	PLCB3 (ENSMMMG00000007736) #13	PPP1R14B (ENSMMMG00000007711) #14	FKBP2 (ENSMMMG00000007672) #15	VEGFB (ENSMMMG00000007651) #16	DNAJC4 (ENSMMMG00000007635) #17	NUDT22 (ENSMMMG00000007628) #18	TRPT1 (ENSMMMG00000007609) #20	FERMT3 (ENSMMMG00000007580) #19	STIP1 (ENSMMMG00000007560) #21	FLRT1 (ENSMMMG00000007522) #23	MACROD1 (ENSMMMG00000007514) #22	OTUB1 (ENSMMMG00000007484) #24	COX8A (ENSMMMG00000007506) #25	NAA40 (ENSMMMG00000007472) #26	RCOR2 (ENSMMMG00000007445) #27	MARK2 (ENSMMMG00000006813) #28	SPINDOC (ENSMMMG00000006798) #29	ENSMMMG00000006783 #31	ATL3 (ENSMMMG00000006763) #32	PLAAT3 (ENSMMMG00000006751) #33	ENSMMMG00000006716 ##33	ENSMMMG00000006666 ##33	ENSMMMG00000006663	ENSMMMG00000006652 ##33	ENSMMMG00000006645	ENSMMMG00000006639 ##33
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	2	CCDC88B (ENSSVLG00005016552)	PRDX5 (ENSSVLG00005017011) #7	ENSSVLG00005017157 #9	ESRRA (ENSSVLG00005017266) #8	KCNK4 (ENSSVLG00005017540) #10	GPR137 (ENSSVLG00005017667) #11	BAD (ENSSVLG00005018004) #12	PLCB3 (ENSSVLG00005018092) #13	PPP1R14B (ENSSVLG00005018431) #14	FKBP2 (ENSSVLG00005018547) #15	DNAJC4 (ENSSVLG00005018674) #17	NUDT22 (ENSSVLG00005018795) #18	TRPT1 (ENSSVLG00005018880) #20	FERMT3 (ENSSVLG00005019185) #19	STIP1 (ENSSVLG00005019327) #21	MACROD1 (ENSSVLG00005019517) #22	FLRT1 (ENSSVLG00005019639) #23	OTUB1 (ENSSVLG00005019708) #24	COX8A (ENSSVLG00005019802) #25	ENSSVLG00005019870 #26	ENSSVLG00005020084 #9	RCOR2 (ENSSVLG00005020151) #27	MARK2 (ENSSVLG00005020452) #28	ENSSVLG00005021665 #29	ZFTA (ENSSVLG00005021728) #30	RTN3 (ENSSVLG00005021816) #31	ATL3 (ENSSVLG00005022126) #32	PLAAT3 (ENSSVLG00005022200) #33	ENSSVLG00005022253	ENSSVLG00005022359 ##33	ENSSVLG00005022391