Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1594 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 1263 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 258 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113 #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Amniota ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000164164 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000161826.B ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 Theria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000164879 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Glires ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Squirrel MODERN SPECIES 114 TPD52L2 (ENSSTOG00000003991) #7 ABHD16B (ENSSTOG00000019710) #8 ZBTB46 (ENSSTOG00000012003) #9 SLC2A4RG (ENSSTOG00000024188) #10 ENSSTOG00000023660 #11 ZGPAT (ENSSTOG00000011986) #12 ARFRP1 (ENSSTOG00000011978) #13 RTEL1 (ENSSTOG00000011948) #14 STMN3 (ENSSTOG00000006830) #15 GMEB2 (ENSSTOG00000023031) #16 HELZ2 (ENSSTOG00000023572) #17 FNDC11 (ENSSTOG00000007853) #18 SRMS (ENSSTOG00000007835) #19 PTK6 (ENSSTOG00000007821) #20 PPDPF (ENSSTOG00000007808) #21 EEF1A2 (ENSSTOG00000028862) #22 KCNQ2 (ENSSTOG00000020023) #23 CHRNA4 (ENSSTOG00000028017) #24 COL20A1 (ENSSTOG00000014595) #25 ARFGAP1 (ENSSTOG00000022151) #26 BIRC7 (ENSSTOG00000034074) #27 YTHDF1 (ENSSTOG00000023001) #28 ENSSTOG00000030778 #29 SLC17A9 (ENSSTOG00000008798) #30 GID8 (ENSSTOG00000025077) #31 DIDO1 (ENSSTOG00000012318) #32 TCFL5 (ENSSTOG00000026350) #33 ENSSTOG00000021578 #34 ENSSTOG00000020474 #35 MRGBP (ENSSTOG00000012953) #36 NTSR1 (ENSSTOG00000026120) #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 580 DNAJC5 (ENSUPAG00010003587) TPD52L2 (ENSUPAG00010003615) #7 ABHD16B (ENSUPAG00010003740) #8 ZBTB46 (ENSUPAG00010003742) #9 SLC2A4RG (ENSUPAG00010003756) #10 ZGPAT (ENSUPAG00010003773) #12 ENSUPAG00010003811 #13 RTEL1 (ENSUPAG00010003834) #14 STMN3 (ENSUPAG00010004560) #15 GMEB2 (ENSUPAG00010004569) #16 HELZ2 (ENSUPAG00010004576) #17 FNDC11 (ENSUPAG00010004587) #18 SRMS (ENSUPAG00010004602) #19 PTK6 (ENSUPAG00010004618) #20 PPDPF (ENSUPAG00010004632) #21 EEF1A2 (ENSUPAG00010004639) #22 KCNQ2 (ENSUPAG00010004658) #23 CHRNA4 (ENSUPAG00010004850) #24 COL20A1 (ENSUPAG00010004864) #25 ARFGAP1 (ENSUPAG00010005043) #26 BIRC7 (ENSUPAG00010005297) #27 Alpin marmot MODERN SPECIES ZBTB46 (ENSMMMG00000001077) #9 SLC2A4RG (ENSMMMG00000001105) #10 ENSMMMG00000001114 #11 ZGPAT (ENSMMMG00000001152) #12 ENSMMMG00000001208 ARFRP1 (ENSMMMG00000001220) #13 RTEL1 (ENSMMMG00000001278) #14 STMN3 (ENSMMMG00000001758) #15 GMEB2 (ENSMMMG00000001787) #16 ENSMMMG00000001804 HELZ2 (ENSMMMG00000001816) #17 FNDC11 (ENSMMMG00000001907) #18 SRMS (ENSMMMG00000001913) #19 PTK6 (ENSMMMG00000001940) #20 PPDPF (ENSMMMG00000001957) #21 EEF1A2 (ENSMMMG00000001969) #22 KCNQ2 (ENSMMMG00000002019) #23 CHRNA4 (ENSMMMG00000002798) #24 COL20A1 (ENSMMMG00000002849) #25 ARFGAP1 (ENSMMMG00000003181) #26 BIRC7 (ENSMMMG00000003407) #27 YTHDF1 (ENSMMMG00000003425) #28 SLC17A9 (ENSMMMG00000003461) #30 GID8 (ENSMMMG00000003488) #31 DIDO1 (ENSMMMG00000003510) #32 TCFL5 (ENSMMMG00000003663) #33 ENSMMMG00000003673 #34 OGFR (ENSMMMG00000003753) #35 MRGBP (ENSMMMG00000003862) #36 NTSR1 (ENSMMMG00000003907) #37 SLCO4A1 (ENSMMMG00000003911) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 ZBTB46 (ENSSVLG00005011934) #9 SLC2A4RG (ENSSVLG00005011807) #10 ENSSVLG00005011763 #11 ENSSVLG00005011709 ZGPAT (ENSSVLG00005011600) #12 ARFRP1 (ENSSVLG00005011495) #13 RTEL1 (ENSSVLG00005011431) #14 STMN3 (ENSSVLG00005011307) #15 GMEB2 (ENSSVLG00005011239) #16 ENSSVLG00005011188 HELZ2 (ENSSVLG00005011029) #17 FNDC11 (ENSSVLG00005010998) #18 SRMS (ENSSVLG00005010852) #19 PTK6 (ENSSVLG00005010733) #20 PPDPF (ENSSVLG00005010700) #21 EEF1A2 (ENSSVLG00005004916) #22 KCNQ2 (ENSSVLG00005004604) #23 ENSSVLG00005004478 CHRNA4 (ENSSVLG00005004453) #24 ENSSVLG00005004184 ARFGAP1 (ENSSVLG00005003989) #26 BIRC7 (ENSSVLG00005003913) #27 YTHDF1 (ENSSVLG00005003892) #28 BHLHE23 (ENSSVLG00005003872) #29 SLC17A9 (ENSSVLG00005003839) #30 GID8 (ENSSVLG00005003819) #31 ENSSVLG00005003753 #32 TCFL5 (ENSSVLG00005003713) #33 COL9A3 (ENSSVLG00005003650) ENSSVLG00005003605 #35 MRGBP (ENSSVLG00005003577) #36 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 6 PRPF6 (ENSHGLG00000009222) SAMD10 (ENSHGLG00000007557) ZNF512B (ENSHGLG00000014817) ENSHGLG00000041408 ENSHGLG00000033173 DNAJC5 (ENSHGLG00000047794) TPD52L2 (ENSHGLG00000018043) #7 ZBTB46 (ENSHGLG00000019123) #9 ENSHGLG00000014870 #12 ARFRP1 (ENSHGLG00000012078) #13 TNFRSF6B (ENSHGLG00000049558) STMN3 (ENSHGLG00000043617) #15 GMEB2 (ENSHGLG00000042754) #16 ENSHGLG00000042444 PPDPF (ENSHGLG00000014857) #21 EEF1A2 (ENSHGLG00000014996) #22 ENSHGLG00000016521 #23 ARFGAP1 (ENSHGLG00000008445) #26 ENSHGLG00000041458 YTHDF1 (ENSHGLG00000006585) #28 BHLHE23 (ENSHGLG00000020693) #29 GID8 (ENSHGLG00000013122) #31 ENSHGLG00000014809 #32 TCFL5 (ENSHGLG00000011606) #33 ENSHGLG00000005944 #34 ENSHGLG00000046607 #35 MRGBP (ENSHGLG00000042672) #36 NTSR1 (ENSHGLG00000037154) #37 ENSHGLG00000006232 ENSHGLG00000040253 ENSHGLG00000044047 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Guinea pig MODERN SPECIES 119 DNAJC5 (ENSCPOG00000038285) ENSCPOG00000014398 #7 ABHD16B (ENSCPOG00000014395) #8 ZBTB46 (ENSCPOG00000002803) #9 SLC2A4RG (ENSCPOG00000035815) #10 ENSCPOG00000019294 #11 ZGPAT (ENSCPOG00000014427) #12 ARFRP1 (ENSCPOG00000038193) #13 RTEL1 (ENSCPOG00000014414) #14 STMN3 (ENSCPOG00000023626) #15 GMEB2 (ENSCPOG00000025567) #16 HELZ2 (ENSCPOG00000006905) #17 FNDC11 (ENSCPOG00000010652) #18 SRMS (ENSCPOG00000006895) #19 PTK6 (ENSCPOG00000006885) #20 EEF1A2 (ENSCPOG00000022072) #22 KCNQ2 (ENSCPOG00000006949) #23 CHRNA4 (ENSCPOG00000010559) #24 ENSCPOG00000021624 ARFGAP1 (ENSCPOG00000025055) #26 NKAIN4 (ENSCPOG00000005586) BIRC7 (ENSCPOG00000020366) #27 YTHDF1 (ENSCPOG00000010202) #28 SLC17A9 (ENSCPOG00000001082) #30 GID8 (ENSCPOG00000007888) #31 DIDO1 (ENSCPOG00000004884) #32 TCFL5 (ENSCPOG00000020307) #33 ENSCPOG00000002720 #34 OGFR (ENSCPOG00000003143) #35 MRGBP (ENSCPOG00000020272) #36 NTSR1 (ENSCPOG00000033878) #37 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Degu MODERN SPECIES 235 ABHD16B (ENSODEG00000019323) #8 ZBTB46 (ENSODEG00000006493) #9 SLC2A4RG (ENSODEG00000006508) #10 LIME1 (ENSODEG00000006535) #11 ZGPAT (ENSODEG00000006562) #12 ENSODEG00000006608 ARFRP1 (ENSODEG00000006629) #13 RTEL1 (ENSODEG00000006769) #14 STMN3 (ENSODEG00000007140) #15 ENSODEG00000007154 #16 HELZ2 (ENSODEG00000007200) #17 ENSODEG00000007298 #18 SRMS (ENSODEG00000007310) #19 PTK6 (ENSODEG00000007334) #20 PPDPF (ENSODEG00000003923) #21 EEF1A2 (ENSODEG00000003948) #22 KCNQ2 (ENSODEG00000004014) #23 CHRNA4 (ENSODEG00000004088) #24 ENSODEG00000004143 ARFGAP1 (ENSODEG00000004250) #26 NKAIN4 (ENSODEG00000004313) BIRC7 (ENSODEG00000004350) #27 ENSODEG00000004380 #28 SLC17A9 (ENSODEG00000004413) #30 ENSODEG00000004429 #31 DIDO1 (ENSODEG00000004463) #32 TCFL5 (ENSODEG00000004537) #33 ENSODEG00000004560 ENSODEG00000004588 #34 OGFR (ENSODEG00000004656) #35 MRGBP (ENSODEG00000004674) #36 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 235 TPD52L2 (ENSCLAG00000008302) #7 ABHD16B (ENSCLAG00000009029) #8 ZBTB46 (ENSCLAG00000009288) #9 SLC2A4RG (ENSCLAG00000009004) #10 LIME1 (ENSCLAG00000003864) #11 ZGPAT (ENSCLAG00000004087) #12 ARFRP1 (ENSCLAG00000004200) #13 RTEL1 (ENSCLAG00000005519) #14 STMN3 (ENSCLAG00000004737) #15 GMEB2 (ENSCLAG00000005998) #16 HELZ2 (ENSCLAG00000006292) #17 FNDC11 (ENSCLAG00000005206) #18 SRMS (ENSCLAG00000005546) #19 PTK6 (ENSCLAG00000005884) #20 PPDPF (ENSCLAG00000005999) #21 EEF1A2 (ENSCLAG00000006710) #22 KCNQ2 (ENSCLAG00000004205) #23 CHRNA4 (ENSCLAG00000002115) #24 ENSCLAG00000002569 ARFGAP1 (ENSCLAG00000003171) #26 NKAIN4 (ENSCLAG00000003530) BIRC7 (ENSCLAG00000003588) #27 YTHDF1 (ENSCLAG00000005989) #28 SLC17A9 (ENSCLAG00000006378) #30 GID8 (ENSCLAG00000006562) #31 DIDO1 (ENSCLAG00000006615) #32 ENSCLAG00000007594 #33 ENSCLAG00000007710 #34 OGFR (ENSCLAG00000008130) #35 ENSCLAG00000002627 #36 NTSR1 (ENSCLAG00000002645) #37 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Kangaroo rat MODERN SPECIES 448 ENSDORG00000026240 ENSDORG00000002847 Dnajc5 (ENSDORG00000026811) Tpd52l2 (ENSDORG00000003704) #7 Abhd16b (ENSDORG00000026158) #8 Zbtb46 (ENSDORG00000001367) #9 Lime1 (ENSDORG00000001366) #11 Zgpat (ENSDORG00000001360) #12 Arfrp1 (ENSDORG00000013488) #13 Rtel1 (ENSDORG00000013483) #14 Stmn3 (ENSDORG00000006916) #15 Gmeb2 (ENSDORG00000005599) #16 Helz2 (ENSDORG00000005596) #17 Fndc11 (ENSDORG00000005594) #18 Ptk6 (ENSDORG00000004529) #20 Eef1a2 (ENSDORG00000004854) #22 Kcnq2 (ENSDORG00000011128) #23 Chrna4 (ENSDORG00000023973) #24 ENSDORG00000015431 Arfgap1 (ENSDORG00000010660) #26 Nkain4 (ENSDORG00000001799) Birc7 (ENSDORG00000025467) #27 Ythdf1 (ENSDORG00000002879) #28 Gid8 (ENSDORG00000003411) #31 ENSDORG00000011113 #32 Tcfl5 (ENSDORG00000004511) #33 Col9a3 (ENSDORG00000004509) #34 ENSDORG00000030204 #35 ENSDORG00000027453 #36 Ntsr1 (ENSDORG00000025445) #37 Slco4a1 (ENSDORG00000001161) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 171 Abhd16b (ENSJJAG00000013588) #8 Zbtb46 (ENSJJAG00000019512) #9 Lime1 (ENSJJAG00000018995) #11 ENSJJAG00000018714 #12 Arfrp1 (ENSJJAG00000013827) #13 Rtel1 (ENSJJAG00000005487) #14 ENSJJAG00000023281 Stmn3 (ENSJJAG00000023139) #15 ENSJJAG00000013900 Gmeb2 (ENSJJAG00000022801) #16 Helz2 (ENSJJAG00000021775) #17 Fndc11 (ENSJJAG00000021148) #18 Srms (ENSJJAG00000020649) #19 Ptk6 (ENSJJAG00000020457) #20 Ppdpf (ENSJJAG00000020293) #21 Eef1a2 (ENSJJAG00000020185) #22 Kcnq2 (ENSJJAG00000019808) #23 Chrna4 (ENSJJAG00000018512) #24 ENSJJAG00000016700 Arfgap1 (ENSJJAG00000015383) #26 Nkain4 (ENSJJAG00000014525) Birc7 (ENSJJAG00000014210) #27 Ythdf1 (ENSJJAG00000013589) #28 Bhlhe23 (ENSJJAG00000013438) #29 ENSJJAG00000001169 Slc17a9 (ENSJJAG00000000563) #30 Gid8 (ENSJJAG00000000120) #31 Dido1 (ENSJJAG00000022740) #32 ENSJJAG00000022001 #33 Col9a3 (ENSJJAG00000020792) #34 Ogfr (ENSJJAG00000020054) #35 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1229 Dnajc5 (ENSNGAG00000018052) Tpd52l2 (ENSNGAG00000017127) #7 Zbtb46 (ENSNGAG00000015931) #9 Lime1 (ENSNGAG00000015127) #11 ENSNGAG00000014626 #12 Arfrp1 (ENSNGAG00000014373) #13 ENSNGAG00000014149 Rtel1 (ENSNGAG00000003665) #14 Stmn3 (ENSNGAG00000015941) #15 Gmeb2 (ENSNGAG00000015465) #16 Helz2 (ENSNGAG00000013840) #17 Fndc11 (ENSNGAG00000012749) #18 Srms (ENSNGAG00000012152) #19 Ptk6 (ENSNGAG00000010563) #20 Ppdpf (ENSNGAG00000009696) #21 Eef1a2 (ENSNGAG00000009003) #22 Kcnq2 (ENSNGAG00000020074) #23 Chrna4 (ENSNGAG00000016193) #24 Col20a1 (ENSNGAG00000011814) #25 Arfgap1 (ENSNGAG00000005117) #26 Nkain4 (ENSNGAG00000002013) Birc7 (ENSNGAG00000000904) #27 Ythdf1 (ENSNGAG00000000334) #28 Bhlhe23 (ENSNGAG00000000159) #29 Slc17a9 (ENSNGAG00000020412) #30 Gid8 (ENSNGAG00000020229) #31 Dido1 (ENSNGAG00000018812) #32 Tcfl5 (ENSNGAG00000006700) #33 Col9a3 (ENSNGAG00000001500) #34 Ogfr (ENSNGAG00000000640) #35 Mrgbp (ENSNGAG00000021492) #36 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407.n #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Golden Hamster MODERN SPECIES 664 Dnajc5 (ENSMAUG00000009421) Tpd52l2 (ENSMAUG00000016251) #7 Abhd16b (ENSMAUG00000009336) #8 Zbtb46 (ENSMAUG00000003658) #9 Lime1 (ENSMAUG00000018778) #11 Zgpat (ENSMAUG00000017248) #12 ENSMAUG00000006741 #13 Rtel1 (ENSMAUG00000021859) #14 Stmn3 (ENSMAUG00000021053) #15 Gmeb2 (ENSMAUG00000001339) #16 Helz2 (ENSMAUG00000000857) #17 Fndc11 (ENSMAUG00000005228) #18 Srms (ENSMAUG00000017526) #19 Ptk6 (ENSMAUG00000021245) #20 Ppdpf (ENSMAUG00000018881) #21 Eef1a2 (ENSMAUG00000007024) #22 Kcnq2 (ENSMAUG00000016622) #23 Chrna4 (ENSMAUG00000001465) #24 ENSMAUG00000021616 Arfgap1 (ENSMAUG00000015799) #26 Nkain4 (ENSMAUG00000011539) Birc7 (ENSMAUG00000019324) #27 Ythdf1 (ENSMAUG00000017660) #28 Bhlhe23 (ENSMAUG00000009252) #29 Slc17a9 (ENSMAUG00000019462) #30 Dido1 (ENSMAUG00000016487) #32 Tcfl5 (ENSMAUG00000015318) #33 Col9a3 (ENSMAUG00000012721) #34 Ogfr (ENSMAUG00000018534) #35 Mrgbp (ENSMAUG00000017237) #36 Ntsr1 (ENSMAUG00000017871) #37 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 363 Abhd16b (ENSCGRG00001014533) #8 ENSCGRG00001000056 ENSCGRG00001023546 Zbtb46 (ENSCGRG00001023433) #9 Lime1 (ENSCGRG00001016932) #11 Zgpat (ENSCGRG00001011442) #12 ENSCGRG00001001706 #13 Rtel1 (ENSCGRG00001015046) #14 Stmn3 (ENSCGRG00001003004) #15 Gmeb2 (ENSCGRG00001018755) #16 Helz2 (ENSCGRG00001016744) #17 Fndc11 (ENSCGRG00001014780) #18 Srms (ENSCGRG00001017493) #19 Ptk6 (ENSCGRG00001016711) #20 Ppdpf (ENSCGRG00001014557) #21 Eef1a2 (ENSCGRG00001013389) #22 Kcnq2 (ENSCGRG00001001207) #23 Chrna4 (ENSCGRG00001016463) #24 ENSCGRG00001008086 Arfgap1 (ENSCGRG00001000341) #26 Nkain4 (ENSCGRG00001017529) Birc7 (ENSCGRG00001017256) #27 Ythdf1 (ENSCGRG00001016568) #28 Bhlhe23 (ENSCGRG00001006715) #29 Slc17a9 (ENSCGRG00001016886) #30 Gid8 (ENSCGRG00001015095) #31 Dido1 (ENSCGRG00001011636) #32 Tcfl5 (ENSCGRG00001005121) #33 Col9a3 (ENSCGRG00001019417) #34 Ogfr (ENSCGRG00001018620) #35 Mrgbp (ENSCGRG00001017599) #36 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Prairie vole MODERN SPECIES 357 Dnajc5 (ENSMOCG00000007483) Tpd52l2 (ENSMOCG00000014048) #7 Abhd16b (ENSMOCG00000009364) #8 Zbtb46 (ENSMOCG00000019212) #9 Lime1 (ENSMOCG00000020930) #11 Zgpat (ENSMOCG00000001324) #12 ENSMOCG00000003005 #13 Rtel1 (ENSMOCG00000006621) #14 Stmn3 (ENSMOCG00000002791) #15 Gmeb2 (ENSMOCG00000020432) #16 Helz2 (ENSMOCG00000016283) #17 Fndc11 (ENSMOCG00000019957) #18 Srms (ENSMOCG00000005339) #19 Ptk6 (ENSMOCG00000017863) #20 Ppdpf (ENSMOCG00000012754) #21 Eef1a2 (ENSMOCG00000015062) #22 Kcnq2 (ENSMOCG00000011486) #23 ENSMOCG00000019495 #24 ENSMOCG00000004769 #24 ENSMOCG00000022336 Arfgap1 (ENSMOCG00000000921) #26 Nkain4 (ENSMOCG00000021378) Birc7 (ENSMOCG00000007072) #27 Ythdf1 (ENSMOCG00000013573) #28 Bhlhe23 (ENSMOCG00000010535) #29 Slc17a9 (ENSMOCG00000021060) #30 Gid8 (ENSMOCG00000022789) #31 Dido1 (ENSMOCG00000016348) #32 Tcfl5 (ENSMOCG00000013113) #33 Col9a3 (ENSMOCG00000008409) #34 Ogfr (ENSMOCG00000014592) #35 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Dnajc5 (ENSPEMG00000029629) Tpd52l2 (ENSPEMG00000011842) #7 Abhd16b (ENSPEMG00000016010) #8 Zbtb46 (ENSPEMG00000015286) #9 Lime1 (ENSPEMG00000013925) #11 Zgpat (ENSPEMG00000015676) #12 Arfrp1 (ENSPEMG00000027815) #13 Rtel1 (ENSPEMG00000011774) #14 Stmn3 (ENSPEMG00000009067) #15 Gmeb2 (ENSPEMG00000029904) #16 Helz2 (ENSPEMG00000016538) #17 Fndc11 (ENSPEMG00000019134) #18 Srms (ENSPEMG00000011231) #19 Ptk6 (ENSPEMG00000013137) #20 Ppdpf (ENSPEMG00000030332) #21 Eef1a2 (ENSPEMG00000007292) #22 Kcnq2 (ENSPEMG00000000964) #23 Chrna4 (ENSPEMG00000003527) #24 ENSPEMG00000003874 Arfgap1 (ENSPEMG00000020266) #26 Nkain4 (ENSPEMG00000020232) Birc7 (ENSPEMG00000020215) #27 Ythdf1 (ENSPEMG00000020199) #28 Bhlhe23 (ENSPEMG00000013766) #29 Slc17a9 (ENSPEMG00000020148) #30 Gid8 (ENSPEMG00000020136) #31 Dido1 (ENSPEMG00000020026) #32 Tcfl5 (ENSPEMG00000019973) #33 Col9a3 (ENSPEMG00000019951) #34 Ogfr (ENSPEMG00000019927) #35 Mrgbp (ENSPEMG00000030337) #36 Murinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Mus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Shrew mouse MODERN SPECIES 16 Dnajc5 (MGP_PahariEiJ_G0026259) Tpd52l2 (MGP_PahariEiJ_G0026258) #7 Abhd16b (MGP_PahariEiJ_G0026257) #8 Zbtb46 (MGP_PahariEiJ_G0026256) #9 Lime1 (MGP_PahariEiJ_G0026255) #11 Zgpat (MGP_PahariEiJ_G0026254) #12 Arfrp1 (MGP_PahariEiJ_G0026253) #13 Rtel1 (MGP_PahariEiJ_G0026252) #14 Stmn3 (MGP_PahariEiJ_G0026251) #15 Gmeb2 (MGP_PahariEiJ_G0026250) #16 Helz2 (MGP_PahariEiJ_G0026249) #17 Fndc11 (MGP_PahariEiJ_G0026248) #18 Srms (MGP_PahariEiJ_G0026247) #19 Ptk6 (MGP_PahariEiJ_G0026246) #20 Ppdpf (MGP_PahariEiJ_G0026245) #21 Eef1a2 (MGP_PahariEiJ_G0026244) #22 Kcnq2 (MGP_PahariEiJ_G0026243) #23 Chrna4 (MGP_PahariEiJ_G0026242) #24 Col20a1 (MGP_PahariEiJ_G0026241) #25 Arfgap1 (MGP_PahariEiJ_G0026240) #26 Nkain4 (MGP_PahariEiJ_G0026239) Birc7 (MGP_PahariEiJ_G0026238) #27 Ythdf1 (MGP_PahariEiJ_G0026237) #28 Bhlhe23 (MGP_PahariEiJ_G0026236) #29 Slc17a9 (MGP_PahariEiJ_G0026235) #30 Gid8 (MGP_PahariEiJ_G0026234) #31 Dido1 (MGP_PahariEiJ_G0026233) #32 Tcfl5 (MGP_PahariEiJ_G0026232) #33 Col9a3 (MGP_PahariEiJ_G0026231) #34 Ogfr (MGP_PahariEiJ_G0026230) #35 Mrgbp (MGP_PahariEiJ_G0026229) #36 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 spretus MODERN SPECIES 11 Dnajc5 (MGP_SPRETEiJ_G0025738) Tpd52l2 (MGP_SPRETEiJ_G0025737) #7 Abhd16b (MGP_SPRETEiJ_G0025736) #8 Zbtb46 (MGP_SPRETEiJ_G0025735) #9 Lime1 (MGP_SPRETEiJ_G0025733) #11 Zgpat (MGP_SPRETEiJ_G0025732) #12 Arfrp1 (MGP_SPRETEiJ_G0025731) #13 Rtel1 (MGP_SPRETEiJ_G0025730) #14 Stmn3 (MGP_SPRETEiJ_G0025729) #15 Gmeb2 (MGP_SPRETEiJ_G0025728) #16 Helz2 (MGP_SPRETEiJ_G0025727) #17 Fndc11 (MGP_SPRETEiJ_G0025726) #18 Srms (MGP_SPRETEiJ_G0025725) #19 Ptk6 (MGP_SPRETEiJ_G0025724) #20 Ppdpf (MGP_SPRETEiJ_G0025723) #21 Eef1a2 (MGP_SPRETEiJ_G0025722) #22 Kcnq2 (MGP_SPRETEiJ_G0025721) #23 Chrna4 (MGP_SPRETEiJ_G0025720) #24 Col20a1 (MGP_SPRETEiJ_G0025719) #25 Arfgap1 (MGP_SPRETEiJ_G0025718) #26 Nkain4 (MGP_SPRETEiJ_G0025717) Birc7 (MGP_SPRETEiJ_G0025716) #27 Ythdf1 (MGP_SPRETEiJ_G0025715) #28 Bhlhe23 (MGP_SPRETEiJ_G0025714) #29 Slc17a9 (MGP_SPRETEiJ_G0025713) #30 Gid8 (MGP_SPRETEiJ_G0025712) #31 Dido1 (MGP_SPRETEiJ_G0025711) #32 Tcfl5 (MGP_SPRETEiJ_G0025710) #33 Col9a3 (MGP_SPRETEiJ_G0025709) #34 Ogfr (MGP_SPRETEiJ_G0025708) #35 Mrgbp (MGP_SPRETEiJ_G0025707) #36 Steppe mouse MODERN SPECIES 2762 Dnajc5 (ENSMSIG00000012533) Tpd52l2 (ENSMSIG00000012553) #7 Abhd16b (ENSMSIG00000012732) #8 Zbtb46 (ENSMSIG00000012738) #9 Lime1 (ENSMSIG00000012757) #11 Zgpat (ENSMSIG00000012783) #12 Arfrp1 (ENSMSIG00000012801) #13 Rtel1 (ENSMSIG00000012832) #14 Stmn3 (ENSMSIG00000013246) #15 Gmeb2 (ENSMSIG00000013265) #16 Helz2 (ENSMSIG00000013287) #17 Fndc11 (ENSMSIG00000013398) #18 Srms (ENSMSIG00000013408) #19 Ptk6 (ENSMSIG00000013435) #20 Ppdpf (ENSMSIG00000013448) #21 Eef1a2 (ENSMSIG00000013475) #22 Kcnq2 (ENSMSIG00000013491) #23 Chrna4 (ENSMSIG00000014109) #24 Col20a1 (ENSMSIG00000014136) #25 Arfgap1 (ENSMSIG00000014444) #26 Nkain4 (ENSMSIG00000014670) Birc7 (ENSMSIG00000014718) #27 Ythdf1 (ENSMSIG00000014745) #28 ENSMSIG00000014799 Bhlhe23 (ENSMSIG00000014821) #29 Mouse MODERN SPECIES 11 Dnajc5 (ENSMUSG00000000826) Tpd52l2 (ENSMUSG00000000827) #7 Abhd16b (ENSMUSG00000055882) #8 Zbtb46 (ENSMUSG00000027583) #9 Lime1 (ENSMUSG00000090077) #11 Zgpat (ENSMUSG00000027582) #12 Arfrp1 (ENSMUSG00000038671) #13 Rtel1 (ENSMUSG00000038685) #14 Stmn3 (ENSMUSG00000027581) #15 Gmeb2 (ENSMUSG00000038705) #16 Helz2 (ENSMUSG00000027580) #17 Fndc11 (ENSMUSG00000047841) #18 Srms (ENSMUSG00000027579) #19 Ptk6 (ENSMUSG00000038751) #20 Ppdpf (ENSMUSG00000016344) #21 Eef1a2 (ENSMUSG00000016349) #22 Kcnq2 (ENSMUSG00000016346) #23 Chrna4 (ENSMUSG00000027577) #24 Col20a1 (ENSMUSG00000016356) #25 Arfgap1 (ENSMUSG00000027575) #26 Nkain4 (ENSMUSG00000027574) Birc7 (ENSMUSG00000038840) #27 Ythdf1 (ENSMUSG00000038848) #28 Bhlhe23 (ENSMUSG00000045493) #29 Slc17a9 (ENSMUSG00000023393) #30 Gid8 (ENSMUSG00000027573) #31 Dido1 (ENSMUSG00000038914) #32 Tcfl5 (ENSMUSG00000038932) #33 Col9a3 (ENSMUSG00000027570) #34 Ogfr (ENSMUSG00000049401) #35 Mrgbp (ENSMUSG00000027569) #36 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 11 Uckl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024812) Dnajc5 (MGP_CAROLIEiJ_G0024811) Tpd52l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024810) #7 Abhd16b (MGP_CAROLIEiJ_G0024809) #8 Zbtb46 (MGP_CAROLIEiJ_G0024808) #9 Lime1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024807) #11 Zgpat (MGP_CAROLIEiJ_G0024806) #12 Arfrp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024805) #13 Rtel1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024804) #14 Stmn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024803) #15 Gmeb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024802) #16 Helz2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024801) #17 Srms (MGP_CAROLIEiJ_G0024800) #19 Ptk6 (MGP_CAROLIEiJ_G0024799) #20 Ppdpf (MGP_CAROLIEiJ_G0024798) #21 MGP_CAROLIEiJ_G0024797 #22 Kcnq2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024796) #23 MGP_CAROLIEiJ_G0024795 MGP_CAROLIEiJ_G0024794 #25 Arfgap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024793) #26 Nkain4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024792) Birc7 (MGP_CAROLIEiJ_G0024791) #27 Ythdf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024790) #28 Bhlhe23 (MGP_CAROLIEiJ_G0024789) #29 Slc17a9 (MGP_CAROLIEiJ_G0024788) #30 Gid8 (MGP_CAROLIEiJ_G0024787) #31 MGP_CAROLIEiJ_G0024786 #32 Tcfl5 (MGP_CAROLIEiJ_G0024785) #33 Col9a3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024784) #34 Ogfr (MGP_CAROLIEiJ_G0024783) #35 Mrgbp (MGP_CAROLIEiJ_G0024782) #36 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 473 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000159329 #24 Pika MODERN SPECIES 4073 ENSOPRG00000005964 #22 ENSOPRG00000005943 CHRNA4 (ENSOPRG00000005933) #24 Primates ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Tarsier MODERN SPECIES 1615 ZGPAT (ENSTSYG00000000795) #12 ARFRP1 (ENSTSYG00000033120) #13 TNFRSF6B (ENSTSYG00000034993) RTEL1 (ENSTSYG00000036434) #14 STMN3 (ENSTSYG00000036799) #15 GMEB2 (ENSTSYG00000031015) #16 HELZ2 (ENSTSYG00000027453) #17 FNDC11 (ENSTSYG00000000635) #18 SRMS (ENSTSYG00000030556) #19 PTK6 (ENSTSYG00000031564) #20 PPDPF (ENSTSYG00000033172) #21 EEF1A2 (ENSTSYG00000029463) #22 KCNQ2 (ENSTSYG00000028027) #23 CHRNA4 (ENSTSYG00000037562) #24 COL20A1 (ENSTSYG00000029460) #25 ARFGAP1 (ENSTSYG00000005848) #26 NKAIN4 (ENSTSYG00000030936) BIRC7 (ENSTSYG00000012709) #27 YTHDF1 (ENSTSYG00000033436) #28 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Gibbon MODERN SPECIES 3 TPD52L2 (ENSNLEG00000010175) #7 ABHD16B (ENSNLEG00000019168) #8 ENSNLEG00000010171 #9 SLC2A4RG (ENSNLEG00000010167) #10 ENSNLEG00000010165 ZGPAT (ENSNLEG00000010146) #12 ARFRP1 (ENSNLEG00000010131) #13 TNFRSF6B (ENSNLEG00000030355) RTEL1 (ENSNLEG00000010105) #14 STMN3 (ENSNLEG00000010103) #15 GMEB2 (ENSNLEG00000010094) #16 ENSNLEG00000010083 #17 SRMS (ENSNLEG00000010077) #19 PTK6 (ENSNLEG00000034758) #20 PPDPF (ENSNLEG00000010068) #21 EEF1A2 (ENSNLEG00000010060) #22 ENSNLEG00000010053 CHRNA4 (ENSNLEG00000026877) #24 COL20A1 (ENSNLEG00000010011) #25 ARFGAP1 (ENSNLEG00000009990) #26 ENSNLEG00000009987 BIRC7 (ENSNLEG00000009978) #27 ENSNLEG00000028421 #28 ENSNLEG00000031234 ENSNLEG00000009969 #30 GID8 (ENSNLEG00000009967) #31 DIDO1 (ENSNLEG00000009953) #32 ENSNLEG00000032503 #33 ENSNLEG00000009920 #34 ENSNLEG00000009914 #35 ENSNLEG00000009904 #36 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Orangutan MODERN SPECIES 11 DNAJC5 (ENSPPYG00000011252) TPD52L2 (ENSPPYG00000011251) #7 ABHD16B (ENSPPYG00000011250) #8 ZBTB46 (ENSPPYG00000011247) #9 SLC2A4RG (ENSPPYG00000036922) #10 LIME1 (ENSPPYG00000038431) ZGPAT (ENSPPYG00000011246) #12 ARFRP1 (ENSPPYG00000011245) #13 TNFRSF6B (ENSPPYG00000030992) STMN3 (ENSPPYG00000011243) #15 GMEB2 (ENSPPYG00000011242) #16 ENSPPYG00000011240 #18 SRMS (ENSPPYG00000011239) #19 PTK6 (ENSPPYG00000011238) #20 ENSPPYG00000011237 #21 EEF1A2 (ENSPPYG00000011236) #22 KCNQ2 (ENSPPYG00000011234) #23 CHRNA4 (ENSPPYG00000011231) #24 COL20A1 (ENSPPYG00000011230) #25 ARFGAP1 (ENSPPYG00000011229) #26 NKAIN4 (ENSPPYG00000011228) BIRC7 (ENSPPYG00000011227) #27 YTHDF1 (ENSPPYG00000011226) #28 BHLHE23 (ENSPPYG00000033782) #29 SLC17A9 (ENSPPYG00000011222) #30 GID8 (ENSPPYG00000011221) #31 DIDO1 (ENSPPYG00000011220) #32 TCFL5 (ENSPPYG00000011219) #33 COL9A3 (ENSPPYG00000037415) ENSPPYG00000011218 #35 ENSPPYG00000011217 #36 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Gorilla MODERN SPECIES 11 ABHD16B (ENSGGOG00000000569) #8 ZBTB46 (ENSGGOG00000004815) #9 SLC2A4RG (ENSGGOG00000004812) #10 ENSGGOG00000004804 #11 ZGPAT (ENSGGOG00000004801) #12 ARFRP1 (ENSGGOG00000004799) #13 TNFRSF6B (ENSGGOG00000037565) RTEL1 (ENSGGOG00000004784) #14 STMN3 (ENSGGOG00000004779) #15 GMEB2 (ENSGGOG00000008653) #16 HELZ2 (ENSGGOG00000008640) #17 FNDC11 (ENSGGOG00000008639) #18 SRMS (ENSGGOG00000011330) #19 PTK6 (ENSGGOG00000011325) #20 ENSGGOG00000036746 #21 EEF1A2 (ENSGGOG00000011319) #22 ENSGGOG00000037300 KCNQ2 (ENSGGOG00000008388) #23 CHRNA4 (ENSGGOG00000008378) #24 COL20A1 (ENSGGOG00000008361) #25 ARFGAP1 (ENSGGOG00000008353) #26 ENSGGOG00000008346 BIRC7 (ENSGGOG00000008343) #27 YTHDF1 (ENSGGOG00000008340) #28 BHLHE23 (ENSGGOG00000040834) #29 SLC17A9 (ENSGGOG00000001599) #30 GID8 (ENSGGOG00000036471) #31 DIDO1 (ENSGGOG00000001594) #32 ENSGGOG00000027339 TCFL5 (ENSGGOG00000017041) #33 COL9A3 (ENSGGOG00000017028) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Human MODERN SPECIES 12 SLC2A4RG (ENSG00000125520) #10 ENSG00000273047 LIME1 (ENSG00000203896) #11 ENSG00000273154 ZGPAT (ENSG00000197114) #12 ARFRP1 (ENSG00000101246) #13 TNFRSF6B (ENSG00000243509) RTEL1 (ENSG00000258366) #14 STMN3 (ENSG00000197457) #15 GMEB2 (ENSG00000101216) #16 HELZ2 (ENSG00000130589) #17 FNDC11 (ENSG00000125531) #18 SRMS (ENSG00000125508) #19 PTK6 (ENSG00000101213) #20 PPDPF (ENSG00000125534) #21 EEF1A2 (ENSG00000101210) #22 KCNQ2 (ENSG00000075043) #23 CHRNA4 (ENSG00000101204) #24 COL20A1 (ENSG00000101203) #25 ARFGAP1 (ENSG00000101199) #26 NKAIN4 (ENSG00000101198) BIRC7 (ENSG00000101197) #27 YTHDF1 (ENSG00000149658) #28 BHLHE23 (ENSG00000125533) #29 SLC17A9 (ENSG00000101194) #30 GID8 (ENSG00000101193) #31 DIDO1 (ENSG00000101191) #32 TCFL5 (ENSG00000101190) #33 COL9A3 (ENSG00000092758) OGFR (ENSG00000060491) #35 MRGBP (ENSG00000101189) #36 Pan ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Bonobo MODERN SPECIES 11 ABHD16B (ENSPPAG00000022012) #8 ZBTB46 (ENSPPAG00000040509) #9 ENSPPAG00000038340 #10 LIME1 (ENSPPAG00000037722) #11 ZGPAT (ENSPPAG00000027831) #12 ARFRP1 (ENSPPAG00000023993) #13 TNFRSF6B (ENSPPAG00000039916) RTEL1 (ENSPPAG00000037897) #14 ENSPPAG00000036639 #15 GMEB2 (ENSPPAG00000024286) #16 HELZ2 (ENSPPAG00000037593) #17 FNDC11 (ENSPPAG00000005287) #18 SRMS (ENSPPAG00000032626) #19 PTK6 (ENSPPAG00000028129) #20 PPDPF (ENSPPAG00000038524) #21 EEF1A2 (ENSPPAG00000027504) #22 KCNQ2 (ENSPPAG00000033331) #23 CHRNA4 (ENSPPAG00000037528) #24 COL20A1 (ENSPPAG00000024254) #25 ARFGAP1 (ENSPPAG00000032118) #26 NKAIN4 (ENSPPAG00000029205) BIRC7 (ENSPPAG00000027746) #27 YTHDF1 (ENSPPAG00000023277) #28 SLC17A9 (ENSPPAG00000015837) #30 GID8 (ENSPPAG00000041274) #31 DIDO1 (ENSPPAG00000035601) #32 ENSPPAG00000034363 ENSPPAG00000033377 #33 COL9A3 (ENSPPAG00000031491) OGFR (ENSPPAG00000026028) #35 ENSPPAG00000011919 #36 Chimpanzee MODERN SPECIES 11 ABHD16B (ENSPTRG00000041060) #8 ZBTB46 (ENSPTRG00000013754) #9 SLC2A4RG (ENSPTRG00000013751) #10 LIME1 (ENSPTRG00000039458) #11 ZGPAT (ENSPTRG00000013750) #12 ARFRP1 (ENSPTRG00000013747) #13 ENSPTRG00000050999 RTEL1 (ENSPTRG00000013746) #14 STMN3 (ENSPTRG00000030476) #15 GMEB2 (ENSPTRG00000013744) #16 FNDC11 (ENSPTRG00000013742) #18 HELZ2 (ENSPTRG00000013743) #17 SRMS (ENSPTRG00000013741) #19 PTK6 (ENSPTRG00000048800) #20 PPDPF (ENSPTRG00000013739) #21 EEF1A2 (ENSPTRG00000013737) #22 KCNQ2 (ENSPTRG00000013736) #23 CHRNA4 (ENSPTRG00000013735) #24 COL20A1 (ENSPTRG00000013734) #25 ARFGAP1 (ENSPTRG00000013733) #26 NKAIN4 (ENSPTRG00000013732) BIRC7 (ENSPTRG00000013731) #27 YTHDF1 (ENSPTRG00000013730) #28 BHLHE23 (ENSPTRG00000013728) #29 SLC17A9 (ENSPTRG00000013727) #30 GID8 (ENSPTRG00000013726) #31 DIDO1 (ENSPTRG00000013725) #32 ENSPTRG00000049832 TCFL5 (ENSPTRG00000023366) #33 COL9A3 (ENSPTRG00000013721) #34 OGFR (ENSPTRG00000013720) #35 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Vervet Monkey MODERN SPECIES 11 ABHD16B (ENSCSAG00000018733) #8 ENSCSAG00000018734 ZBTB46 (ENSCSAG00000016647) #9 SLC2A4RG (ENSCSAG00000016643) #10 LIME1 (ENSCSAG00000016639) #11 ZGPAT (ENSCSAG00000016628) #12 ARFRP1 (ENSCSAG00000016609) #13 RTEL1 (ENSCSAG00000016550) #14 STMN3 (ENSCSAG00000016432) #15 GMEB2 (ENSCSAG00000016428) #16 HELZ2 (ENSCSAG00000016417) #17 FNDC11 (ENSCSAG00000018735) #18 SRMS (ENSCSAG00000016405) #19 PTK6 (ENSCSAG00000016395) #20 PPDPF (ENSCSAG00000016387) #21 EEF1A2 (ENSCSAG00000016381) #22 KCNQ2 (ENSCSAG00000016373) #23 ENSCSAG00000016363 COL20A1 (ENSCSAG00000016347) #25 ARFGAP1 (ENSCSAG00000016305) #26 NKAIN4 (ENSCSAG00000016293) BIRC7 (ENSCSAG00000016275) #27 YTHDF1 (ENSCSAG00000016266) #28 BHLHE23 (ENSCSAG00000018736) #29 SLC17A9 (ENSCSAG00000016249) #30 GID8 (ENSCSAG00000016219) #31 DIDO1 (ENSCSAG00000016212) #32 ENSCSAG00000016203 #33 ENSCSAG00000018737 ENSCSAG00000016170 #34 OGFR (ENSCSAG00000016119) #35 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00910000147201 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Macaca ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00910000147201 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 462 ABHD16B (ENSMNEG00000001491) #8 ZBTB46 (ENSMNEG00000031674) #9 SLC2A4RG (ENSMNEG00000037179) #10 LIME1 (ENSMNEG00000029323) #11 ZGPAT (ENSMNEG00000019568) #12 ARFRP1 (ENSMNEG00000036325) #13 TNFRSF6B (ENSMNEG00000030049) RTEL1 (ENSMNEG00000038842) #14 STMN3 (ENSMNEG00000036685) #15 GMEB2 (ENSMNEG00000045521) #16 HELZ2 (ENSMNEG00000044829) #17 FNDC11 (ENSMNEG00000008593) #18 SRMS (ENSMNEG00000022895) #19 PTK6 (ENSMNEG00000028388) #20 PPDPF (ENSMNEG00000032310) #21 EEF1A2 (ENSMNEG00000044939) #22 KCNQ2 (ENSMNEG00000033017) #23 CHRNA4 (ENSMNEG00000002400) #24 ENSMNEG00000039409 ARFGAP1 (ENSMNEG00000014434) #26 NKAIN4 (ENSMNEG00000000351) BIRC7 (ENSMNEG00000040250) #27 YTHDF1 (ENSMNEG00000030851) #28 ENSMNEG00000025670 BHLHE23 (ENSMNEG00000001627) #29 SLC17A9 (ENSMNEG00000028689) #30 GID8 (ENSMNEG00000037263) #31 DIDO1 (ENSMNEG00000035888) #32 TCFL5 (ENSMNEG00000041869) #33 ENSMNEG00000037036 #34 OGFR (ENSMNEG00000014861) #35 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 1 DNAJC5 (ENSMFAG00000001665) ZBTB46 (ENSMFAG00000042680) #9 ENSMFAG00000039964 #10 ZGPAT (ENSMFAG00000001467) #12 LIME1 (ENSMFAG00000038089) #11 ARFRP1 (ENSMFAG00000001321) #13 TNFRSF6B (ENSMFAG00000034289) ENSMFAG00000063698 RTEL1 (ENSMFAG00000043680) #14 STMN3 (ENSMFAG00000044092) #15 GMEB2 (ENSMFAG00000053299) #16 ENSMFAG00000060663 SRMS (ENSMFAG00000039048) #19 PTK6 (ENSMFAG00000042934) #20 ENSMFAG00000039551 #21 EEF1A2 (ENSMFAG00000041810) #22 KCNQ2 (ENSMFAG00000042590) #23 CHRNA4 (ENSMFAG00000000312) #24 COL20A1 (ENSMFAG00000001425) #25 ARFGAP1 (ENSMFAG00000045918) #26 NKAIN4 (ENSMFAG00000003175) ENSMFAG00000045233 #27 ENSMFAG00000050102 YTHDF1 (ENSMFAG00000042868) #28 ENSMFAG00000060017 SLC17A9 (ENSMFAG00000044450) #30 GID8 (ENSMFAG00000064422) #31 DIDO1 (ENSMFAG00000000130) #32 ENSMFAG00000002692 #33 ENSMFAG00000002720 #34 OGFR (ENSMFAG00000037888) #35 Rhesus MODERN SPECIES 1 ZBTB46 (ENSMMUG00000020712) #9 SLC2A4RG (ENSMMUG00000020711) #10 LIME1 (ENSMMUG00000050212) #11 ZGPAT (ENSMMUG00000000171) #12 ARFRP1 (ENSMMUG00000000169) #13 TNFRSF6B (ENSMMUG00000045470) ENSMMUG00000050030 RTEL1 (ENSMMUG00000000167) #14 STMN3 (ENSMMUG00000058868) #15 GMEB2 (ENSMMUG00000039256) #16 HELZ2 (ENSMMUG00000006070) #17 FNDC11 (ENSMMUG00000006069) #18 SRMS (ENSMMUG00000050161) #19 PTK6 (ENSMMUG00000006065) #20 PPDPF (ENSMMUG00000048418) #21 EEF1A2 (ENSMMUG00000022526) #22 KCNQ2 (ENSMMUG00000015918) ENSMMUG00000015916 #24 COL20A1 (ENSMMUG00000015912) #25 ARFGAP1 (ENSMMUG00000015911) #26 NKAIN4 (ENSMMUG00000009231) BIRC7 (ENSMMUG00000009229) #27 YTHDF1 (ENSMMUG00000009227) #28 BHLHE23 (ENSMMUG00000037896) #29 SLC17A9 (ENSMMUG00000005713) #30 GID8 (ENSMMUG00000050053) #31 DIDO1 (ENSMMUG00000019310) #32 TCFL5 (ENSMMUG00000008229) #33 ENSMMUG00000016859 #34 OGFR (ENSMMUG00000016856) #35 MRGBP (ENSMMUG00000046848) #36 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00910000147201 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Olive baboon MODERN SPECIES 7 TPD52L2 (ENSPANG00000020636) #7 DNAJC5 (ENSPANG00000049504) UCKL1 (ENSPANG00000011184) ZNF512B (ENSPANG00000020637) SAMD10 (ENSPANG00000005907) PRPF6 (ENSPANG00000024135) C20orf204 (ENSPANG00000032029) SOX18 (ENSPANG00000024134) TCEA2 (ENSPANG00000024133) ENSPANG00000024132 ENSPANG00000020638 OPRL1 (ENSPANG00000048514) NPBWR2 (ENSPANG00000046186) MYT1 (ENSPANG00000005908) PCMTD2 (ENSPANG00000020639) EEF1A2 (ENSPANG00000026187) #22 KCNQ2 (ENSPANG00000024128) #23 CHRNA4 (ENSPANG00000011181) #24 COL20A1 (ENSPANG00000001217) #25 ARFGAP1 (ENSPANG00000033349) #26 NKAIN4 (ENSPANG00000011180) BIRC7 (ENSPANG00000021470) #27 YTHDF1 (ENSPANG00000021472) #28 BHLHE23 (ENSPANG00000042385) #29 SLC17A9 (ENSPANG00000011749) #30 GID8 (ENSPANG00000011748) #31 DIDO1 (ENSPANG00000026186) #32 TCFL5 (ENSPANG00000021056) #33 ENSPANG00000024126 #34 OGFR (ENSPANG00000048448) #35 MRGBP (ENSPANG00000043588) #36 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00910000147201 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 Drill MODERN SPECIES 1087 ABHD16B (ENSMLEG00000037173) #8 ZBTB46 (ENSMLEG00000000237) #9 SLC2A4RG (ENSMLEG00000036498) #10 LIME1 (ENSMLEG00000038721) #11 ZGPAT (ENSMLEG00000035416) #12 ARFRP1 (ENSMLEG00000034228) #13 TNFRSF6B (ENSMLEG00000038268) RTEL1 (ENSMLEG00000036100) #14 STMN3 (ENSMLEG00000036350) #15 GMEB2 (ENSMLEG00000039586) #16 HELZ2 (ENSMLEG00000034372) #17 FNDC11 (ENSMLEG00000027553) #18 SRMS (ENSMLEG00000042766) #19 PTK6 (ENSMLEG00000029204) #20 PPDPF (ENSMLEG00000015350) #21 EEF1A2 (ENSMLEG00000021843) #22 KCNQ2 (ENSMLEG00000038645) #23 CHRNA4 (ENSMLEG00000035637) #24 COL20A1 (ENSMLEG00000028700) #25 ARFGAP1 (ENSMLEG00000044087) #26 NKAIN4 (ENSMLEG00000029404) BIRC7 (ENSMLEG00000008457) #27 YTHDF1 (ENSMLEG00000009252) #28 ENSMLEG00000004545 SLC17A9 (ENSMLEG00000036356) #30 GID8 (ENSMLEG00000042442) #31 DIDO1 (ENSMLEG00000034306) #32 ENSMLEG00000007821 #33 COL9A3 (ENSMLEG00000041767) OGFR (ENSMLEG00000040857) #35 ENSMLEG00000040901 #36 Sooty mangabey MODERN SPECIES 187 ABHD16B (ENSCATG00000022619) #8 ZBTB46 (ENSCATG00000025860) #9 SLC2A4RG (ENSCATG00000033165) #10 LIME1 (ENSCATG00000027340) #11 ZGPAT (ENSCATG00000034076) #12 ARFRP1 (ENSCATG00000039104) #13 TNFRSF6B (ENSCATG00000012537) RTEL1 (ENSCATG00000013982) #14 STMN3 (ENSCATG00000036117) #15 GMEB2 (ENSCATG00000021997) #16 HELZ2 (ENSCATG00000014259) #17 FNDC11 (ENSCATG00000019090) #18 SRMS (ENSCATG00000037362) #19 PTK6 (ENSCATG00000039122) #20 ENSCATG00000035784 #21 EEF1A2 (ENSCATG00000036349) #22 KCNQ2 (ENSCATG00000018473) #23 CHRNA4 (ENSCATG00000044554) #24 COL20A1 (ENSCATG00000034558) #25 ARFGAP1 (ENSCATG00000035183) #26 NKAIN4 (ENSCATG00000020669) BIRC7 (ENSCATG00000015429) #27 YTHDF1 (ENSCATG00000033272) #28 ENSCATG00000021474 BHLHE23 (ENSCATG00000022765) #29 SLC17A9 (ENSCATG00000040220) #30 GID8 (ENSCATG00000038096) #31 DIDO1 (ENSCATG00000032733) #32 TCFL5 (ENSCATG00000016160) #33 COL9A3 (ENSCATG00000030703) OGFR (ENSCATG00000034931) #35 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b.d.a #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 671 ABHD16B (ENSRBIG00000028689) #8 ZBTB46 (ENSRBIG00000042499) #9 SLC2A4RG (ENSRBIG00000033868) #10 LIME1 (ENSRBIG00000034401) #11 ZGPAT (ENSRBIG00000034134) #12 ARFRP1 (ENSRBIG00000044065) #13 TNFRSF6B (ENSRBIG00000040501) RTEL1 (ENSRBIG00000038522) #14 STMN3 (ENSRBIG00000044464) #15 GMEB2 (ENSRBIG00000034424) #16 HELZ2 (ENSRBIG00000044653) #17 FNDC11 (ENSRBIG00000019675) #18 SRMS (ENSRBIG00000036167) #19 PTK6 (ENSRBIG00000030008) #20 PPDPF (ENSRBIG00000030806) #21 EEF1A2 (ENSRBIG00000011386) #22 KCNQ2 (ENSRBIG00000033123) #23 CHRNA4 (ENSRBIG00000040880) #24 COL20A1 (ENSRBIG00000035309) #25 ARFGAP1 (ENSRBIG00000019841) #26 NKAIN4 (ENSRBIG00000044975) BIRC7 (ENSRBIG00000044970) #27 YTHDF1 (ENSRBIG00000044959) #28 BHLHE23 (ENSRBIG00000026436) #29 SLC17A9 (ENSRBIG00000044949) #30 GID8 (ENSRBIG00000044944) #31 DIDO1 (ENSRBIG00000028408) #32 TCFL5 (ENSRBIG00000033479) #33 ENSRBIG00000034671 #34 OGFR (ENSRBIG00000030910) #35 MRGBP (ENSRBIG00000035316) #36 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1209 TPD52L2 (ENSRROG00000045465) #7 ZBTB46 (ENSRROG00000031639) #9 SLC2A4RG (ENSRROG00000028292) #10 LIME1 (ENSRROG00000015370) #11 ZGPAT (ENSRROG00000039084) #12 ARFRP1 (ENSRROG00000010121) #13 TNFRSF6B (ENSRROG00000009615) RTEL1 (ENSRROG00000038795) #14 STMN3 (ENSRROG00000031460) #15 GMEB2 (ENSRROG00000031210) #16 HELZ2 (ENSRROG00000009088) #17 FNDC11 (ENSRROG00000013293) #18 SRMS (ENSRROG00000019037) #19 PTK6 (ENSRROG00000005676) #20 PPDPF (ENSRROG00000029100) #21 EEF1A2 (ENSRROG00000012377) #22 KCNQ2 (ENSRROG00000030287) #23 CHRNA4 (ENSRROG00000026578) #24 COL20A1 (ENSRROG00000037231) #25 ARFGAP1 (ENSRROG00000029373) #26 NKAIN4 (ENSRROG00000035031) BIRC7 (ENSRROG00000039594) #27 YTHDF1 (ENSRROG00000033014) #28 BHLHE23 (ENSRROG00000038786) #29 SLC17A9 (ENSRROG00000041713) #30 GID8 (ENSRROG00000037608) #31 DIDO1 (ENSRROG00000044763) #32 ENSRROG00000004971 ENSRROG00000042285 #33 ENSRROG00000029777 #34 OGFR (ENSRROG00000012775) #35 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000178207 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515.e #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Mas night monkey MODERN SPECIES 628 ENSANAG00000036015 #7 ABHD16B (ENSANAG00000021229) #8 ZBTB46 (ENSANAG00000028560) #9 SLC2A4RG (ENSANAG00000037537) #10 LIME1 (ENSANAG00000027128) #11 ZGPAT (ENSANAG00000035708) #12 ARFRP1 (ENSANAG00000036343) #13 TNFRSF6B (ENSANAG00000026265) RTEL1 (ENSANAG00000019600) #14 STMN3 (ENSANAG00000033038) #15 GMEB2 (ENSANAG00000024904) #16 HELZ2 (ENSANAG00000019546) #17 SRMS (ENSANAG00000026924) #19 PTK6 (ENSANAG00000024550) #20 PPDPF (ENSANAG00000035520) #21 EEF1A2 (ENSANAG00000035272) #22 KCNQ2 (ENSANAG00000036022) #23 CHRNA4 (ENSANAG00000009699) #24 COL20A1 (ENSANAG00000023543) #25 ENSANAG00000036435 #26 ENSANAG00000033769 BIRC7 (ENSANAG00000036822) #27 ENSANAG00000034786 #28 SLC17A9 (ENSANAG00000037919) #30 GID8 (ENSANAG00000038136) #31 DIDO1 (ENSANAG00000036369) #32 ENSANAG00000033851 #33 COL9A3 (ENSANAG00000029986) OGFR (ENSANAG00000023834) #35 ENSANAG00000020630 #36 NTSR1 (ENSANAG00000028125) #37 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000178207 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515.e #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Marmoset MODERN SPECIES 17 ABHD16B (ENSCJAG00000010499) #8 ENSCJAG00000020377 ZBTB46 (ENSCJAG00000010439) #9 SLC2A4RG (ENSCJAG00000036855) #10 LIME1 (ENSCJAG00000038018) #11 ZGPAT (ENSCJAG00000010398) #12 ARFRP1 (ENSCJAG00000010382) #13 RTEL1 (ENSCJAG00000010336) #14 STMN3 (ENSCJAG00000010324) #15 GMEB2 (ENSCJAG00000075313) #16 ENSCJAG00000081424 FNDC11 (ENSCJAG00000010272) #18 SRMS (ENSCJAG00000010253) #19 PTK6 (ENSCJAG00000010243) #20 ENSCJAG00000076938 #21 EEF1A2 (ENSCJAG00000010227) #22 KCNQ2 (ENSCJAG00000010184) #23 CHRNA4 (ENSCJAG00000010168) #24 COL20A1 (ENSCJAG00000010103) #25 ARFGAP1 (ENSCJAG00000010078) #26 ENSCJAG00000009955 #27 YTHDF1 (ENSCJAG00000010056) #28 SLC17A9 (ENSCJAG00000082534) #30 GID8 (ENSCJAG00000010007) #31 DIDO1 (ENSCJAG00000003827) #32 TCFL5 (ENSCJAG00000009980) #33 COL9A3 (ENSCJAG00000009909) OGFR (ENSCJAG00000043786) #35 MRGBP (ENSCJAG00000041703) #36 NTSR1 (ENSCJAG00000041245) #37 SLCO4A1 (ENSCJAG00000009785) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572.j #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515.e #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 93 DNAJC5 (ENSSBOG00000027668) ENSSBOG00000018959 #7 ABHD16B (ENSSBOG00000033830) #8 ZBTB46 (ENSSBOG00000019387) #9 SLC2A4RG (ENSSBOG00000027522) #10 LIME1 (ENSSBOG00000028724) #11 ZGPAT (ENSSBOG00000028752) #12 ARFRP1 (ENSSBOG00000021962) #13 RTEL1 (ENSSBOG00000016779) #14 TNFRSF6B (ENSSBOG00000035198) STMN3 (ENSSBOG00000036133) #15 GMEB2 (ENSSBOG00000024225) #16 HELZ2 (ENSSBOG00000033345) #17 SRMS (ENSSBOG00000030339) #19 PTK6 (ENSSBOG00000025332) #20 EEF1A2 (ENSSBOG00000021512) #22 KCNQ2 (ENSSBOG00000019522) #23 CHRNA4 (ENSSBOG00000029663) #24 COL20A1 (ENSSBOG00000028118) #25 ARFGAP1 (ENSSBOG00000030523) #26 NKAIN4 (ENSSBOG00000022021) BIRC7 (ENSSBOG00000030127) #27 YTHDF1 (ENSSBOG00000027278) #28 SLC17A9 (ENSSBOG00000029063) #30 GID8 (ENSSBOG00000020603) #31 DIDO1 (ENSSBOG00000028181) #32 ENSSBOG00000026416 #33 ENSSBOG00000032867 #34 OGFR (ENSSBOG00000027155) #35 ENSSBOG00000023786 #36 NTSR1 (ENSSBOG00000001221) #37 Capuchin MODERN SPECIES 553 UCKL1 (ENSCCAG00000024309) DNAJC5 (ENSCCAG00000031771) ENSCCAG00000022832 #7 ZBTB46 (ENSCCAG00000022107) #9 SLC2A4RG (ENSCCAG00000032965) #10 LIME1 (ENSCCAG00000029228) #11 ZGPAT (ENSCCAG00000035441) #12 ARFRP1 (ENSCCAG00000022484) #13 TNFRSF6B (ENSCCAG00000023856) RTEL1 (ENSCCAG00000028154) #14 STMN3 (ENSCCAG00000014315) #15 GMEB2 (ENSCCAG00000034831) #16 HELZ2 (ENSCCAG00000027744) #17 SRMS (ENSCCAG00000038086) #19 PTK6 (ENSCCAG00000035452) #20 EEF1A2 (ENSCCAG00000023615) #22 KCNQ2 (ENSCCAG00000027787) #23 CHRNA4 (ENSCCAG00000026573) #24 COL20A1 (ENSCCAG00000012160) #25 ARFGAP1 (ENSCCAG00000027205) #26 NKAIN4 (ENSCCAG00000029526) BIRC7 (ENSCCAG00000037815) #27 YTHDF1 (ENSCCAG00000024650) #28 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 ENSGT00390000014718 Bushbaby MODERN SPECIES 138 DNAJC5 (ENSOGAG00000013691) TPD52L2 (ENSOGAG00000013689) #7 ABHD16B (ENSOGAG00000030985) #8 ZBTB46 (ENSOGAG00000000852) #9 SLC2A4RG (ENSOGAG00000029486) #10 LIME1 (ENSOGAG00000028914) #11 ZGPAT (ENSOGAG00000034509) #12 ARFRP1 (ENSOGAG00000026673) #13 RTEL1 (ENSOGAG00000028487) #14 STMN3 (ENSOGAG00000034051) #15 GMEB2 (ENSOGAG00000008826) #16 HELZ2 (ENSOGAG00000031068) #17 FNDC11 (ENSOGAG00000027142) #18 SRMS (ENSOGAG00000008816) #19 PPDPF (ENSOGAG00000008810) #21 EEF1A2 (ENSOGAG00000004630) #22 KCNQ2 (ENSOGAG00000009901) #23 CHRNA4 (ENSOGAG00000003054) #24 ARFGAP1 (ENSOGAG00000031121) #26 BIRC7 (ENSOGAG00000027612) #27 YTHDF1 (ENSOGAG00000000480) #28 ENSOGAG00000031010 #29 SLC17A9 (ENSOGAG00000013837) #30 GID8 (ENSOGAG00000013834) #31 DIDO1 (ENSOGAG00000013822) #32 TCFL5 (ENSOGAG00000013819) #33 ENSOGAG00000011190 #34 OGFR (ENSOGAG00000011186) #35 MRGBP (ENSOGAG00000011183) #36 NTSR1 (ENSOGAG00000027155) #37 SLCO4A1 (ENSOGAG00000005124) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 ENSGT00390000014718 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 ENSGT00390000014718 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 594 DNAJC5 (ENSPCOG00000011626) TPD52L2 (ENSPCOG00000019769) #7 ZBTB46 (ENSPCOG00000016933) #9 SLC2A4RG (ENSPCOG00000020613) #10 LIME1 (ENSPCOG00000022044) #11 ZGPAT (ENSPCOG00000012369) #12 ARFRP1 (ENSPCOG00000024163) #13 TNFRSF6B (ENSPCOG00000022312) RTEL1 (ENSPCOG00000013374) #14 STMN3 (ENSPCOG00000023075) #15 GMEB2 (ENSPCOG00000007006) #16 HELZ2 (ENSPCOG00000017149) #17 FNDC11 (ENSPCOG00000017414) #18 SRMS (ENSPCOG00000024367) #19 PPDPF (ENSPCOG00000019647) #21 EEF1A2 (ENSPCOG00000018056) #22 KCNQ2 (ENSPCOG00000013133) #23 CHRNA4 (ENSPCOG00000017991) #24 ARFGAP1 (ENSPCOG00000027176) #26 BIRC7 (ENSPCOG00000015457) #27 YTHDF1 (ENSPCOG00000025969) #28 SLC17A9 (ENSPCOG00000014828) #30 GID8 (ENSPCOG00000019546) #31 DIDO1 (ENSPCOG00000023499) #32 TCFL5 (ENSPCOG00000017126) #33 ENSPCOG00000024112 #34 OGFR (ENSPCOG00000020031) #35 MRGBP (ENSPCOG00000023597) #36 NTSR1 (ENSPCOG00000015702) #37 SLCO4A1 (ENSPCOG00000021209) GATA5 (ENSPCOG00000007837) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 471 LIME1 (ENSPSMG00000001305) #11 ZGPAT (ENSPSMG00000001268) #12 ARFRP1 (ENSPSMG00000001220) #13 TNFRSF6B (ENSPSMG00000001164) RTEL1 (ENSPSMG00000001140) #14 STMN3 (ENSPSMG00000001099) #15 GMEB2 (ENSPSMG00000001060) #16 ENSPSMG00000001031 FNDC11 (ENSPSMG00000001011) #18 SRMS (ENSPSMG00000001001) #19 PPDPF (ENSPSMG00000000993) #21 EEF1A2 (ENSPSMG00000000985) #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 9 DNAJC5 (ENSMICG00000044473) TPD52L2 (ENSMICG00000015620) #7 ZBTB46 (ENSMICG00000012871) #9 SLC2A4RG (ENSMICG00000027188) #10 LIME1 (ENSMICG00000008850) #11 ZGPAT (ENSMICG00000033269) #12 ARFRP1 (ENSMICG00000008840) #13 TNFRSF6B (ENSMICG00000031323) RTEL1 (ENSMICG00000008812) #14 STMN3 (ENSMICG00000029780) #15 GMEB2 (ENSMICG00000043724) #16 HELZ2 (ENSMICG00000027046) #17 FNDC11 (ENSMICG00000002023) #18 SRMS (ENSMICG00000044206) #19 PPDPF (ENSMICG00000005959) #21 EEF1A2 (ENSMICG00000015319) #22 KCNQ2 (ENSMICG00000031055) #23 CHRNA4 (ENSMICG00000035086) #24 ARFGAP1 (ENSMICG00000013625) #26 BIRC7 (ENSMICG00000008469) #27 YTHDF1 (ENSMICG00000032266) #28 SLC17A9 (ENSMICG00000045180) #30 GID8 (ENSMICG00000046912) #31 DIDO1 (ENSMICG00000006217) #32 TCFL5 (ENSMICG00000030702) #33 ENSMICG00000043180 #34 OGFR (ENSMICG00000045669) #35 MRGBP (ENSMICG00000048156) #36 NTSR1 (ENSMICG00000026504) #37 SLCO4A1 (ENSMICG00000001139) GATA5 (ENSMICG00000037048) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000178207 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00940000163687 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Suina ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.a.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Pig MODERN SPECIES 8 DNAJC5 (ENSSSCG00000031602) TPD52L2 (ENSSSCG00000036712) #7 ABHD16B (ENSSSCG00000035915) #8 ZBTB46 (ENSSSCG00000040388) #9 SLC2A4RG (ENSSSCG00000037562) #10 LIME1 (ENSSSCG00000061743) #11 ARFRP1 (ENSSSCG00000035304) #13 ZGPAT (ENSSSCG00000036595) #12 RTEL1 (ENSSSCG00000039160) #14 STMN3 (ENSSSCG00000038405) #15 GMEB2 (ENSSSCG00000040107) #16 FNDC11 (ENSSSCG00000038651) #18 SRMS (ENSSSCG00000036706) #19 PTK6 (ENSSSCG00000031474) #20 ENSSSCG00000040118 #21 EEF1A2 (ENSSSCG00000040401) #22 KCNQ2 (ENSSSCG00000031746) #23 CHRNA4 (ENSSSCG00000039677) #24 ENSSSCG00000037260 ARFGAP1 (ENSSSCG00000032235) #26 NKAIN4 (ENSSSCG00000036544) ENSSSCG00000036109 #27 YTHDF1 (ENSSSCG00000040086) #28 BHLHE23 (ENSSSCG00000054477) #29 SLC17A9 (ENSSSCG00000040931) #30 GID8 (ENSSSCG00000034173) #31 ENSSSCG00000033946 #32 TCFL5 (ENSSSCG00000038631) #33 COL9A3 (ENSSSCG00000040554) ENSSSCG00000056699 #35 MRGBP (ENSSSCG00000053677) #36 Chacoan peccary MODERN SPECIES 3 TPD52L2 (ENSCWAG00000011717) #7 ABHD16B (ENSCWAG00000011672) #8 ZBTB46 (ENSCWAG00000011628) #9 SLC2A4RG (ENSCWAG00000011608) #10 ENSCWAG00000011475 #11 ZGPAT (ENSCWAG00000011414) #12 ARFRP1 (ENSCWAG00000011302) #13 TNFRSF6B (ENSCWAG00000011262) RTEL1 (ENSCWAG00000011153) #14 STMN3 (ENSCWAG00000011083) #15 GMEB2 (ENSCWAG00000011043) #16 FNDC11 (ENSCWAG00000011024) #18 SRMS (ENSCWAG00000010934) #19 PTK6 (ENSCWAG00000010848) #20 ENSCWAG00000010800 #21 EEF1A2 (ENSCWAG00000010753) #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Arabian camel MODERN SPECIES 10 UCKL1 (ENSCDRG00005011540) DNAJC5 (ENSCDRG00005011494) TPD52L2 (ENSCDRG00005010759) #7 ZBTB46 (ENSCDRG00005010623) #9 ENSCDRG00005010553 #10 LIME1 (ENSCDRG00005010477) #11 ZGPAT (ENSCDRG00005010433) #12 ARFRP1 (ENSCDRG00005010277) #13 RTEL1 (ENSCDRG00005010018) #14 STMN3 (ENSCDRG00005009921) #15 GMEB2 (ENSCDRG00005009783) #16 FNDC11 (ENSCDRG00005009753) #18 SRMS (ENSCDRG00005009590) #19 ENSCDRG00005009530 #20 ENSCDRG00005009451 #21 EEF1A2 (ENSCDRG00005009396) #22 KCNQ2 (ENSCDRG00005009242) #23 CHRNA4 (ENSCDRG00005009073) #24 COL20A1 (ENSCDRG00005007791) #25 ARFGAP1 (ENSCDRG00005007544) #26 ENSCDRG00005007451 YTHDF1 (ENSCDRG00005007257) #28 BHLHE23 (ENSCDRG00005007231) #29 SLC17A9 (ENSCDRG00005007165) #30 GID8 (ENSCDRG00005007119) #31 ENSCDRG00005007053 #32 TCFL5 (ENSCDRG00005006962) #33 ENSCDRG00005006839 #34 OGFR (ENSCDRG00005006813) #35 MRGBP (ENSCDRG00005006775) #36 NTSR1 (ENSCDRG00005006734) #37 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Blue whale MODERN SPECIES 6 TPD52L2 (ENSBMSG00010010027) #7 ABHD16B (ENSBMSG00010010115) #8 ZBTB46 (ENSBMSG00010010124) #9 SLC2A4RG (ENSBMSG00010010132) #10 LIME1 (ENSBMSG00010010146) #11 ZGPAT (ENSBMSG00010010160) #12 ENSBMSG00010010180 #13 TNFRSF6B (ENSBMSG00010010199) RTEL1 (ENSBMSG00010010226) #14 STMN3 (ENSBMSG00010010250) #15 GMEB2 (ENSBMSG00010010265) #16 ENSBMSG00010010275 FNDC11 (ENSBMSG00010010281) #18 PTK6 (ENSBMSG00010010315) #20 PPDPF (ENSBMSG00010010333) #21 EEF1A2 (ENSBMSG00010010345) #22 KCNQ2 (ENSBMSG00010010397) #23 CHRNA4 (ENSBMSG00010010697) #24 ENSBMSG00010010754 ARFGAP1 (ENSBMSG00010010909) #26 NKAIN4 (ENSBMSG00010011008) BIRC7 (ENSBMSG00010011034) #27 YTHDF1 (ENSBMSG00010011055) #28 BHLHE23 (ENSBMSG00010011080) #29 SLC17A9 (ENSBMSG00010011094) #30 GID8 (ENSBMSG00010011118) #31 ENSBMSG00010011147 #32 ENSBMSG00010011180 TCFL5 (ENSBMSG00010011196) #33 ENSBMSG00010011229 #34 OGFR (ENSBMSG00010011267) #35 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Sperm whale MODERN SPECIES 464 ENSPCTG00005018182 ENSPCTG00005018246 #21 EEF1A2 (ENSPCTG00005018303) #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407.j #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Dolphin MODERN SPECIES 3121 EEF1A2 (ENSTTRG00000001835) #22 KCNQ2 (ENSTTRG00000001831) #23 ENSTTRG00000001828 CHRNA4 (ENSTTRG00000001827) #24 COL20A1 (ENSTTRG00000001818) #25 ARFGAP1 (ENSTTRG00000001815) #26 NKAIN4 (ENSTTRG00000001813) BIRC7 (ENSTTRG00000001809) #27 YTHDF1 (ENSTTRG00000001804) #28 SLC17A9 (ENSTTRG00000001799) #30 GID8 (ENSTTRG00000001797) #31 DIDO1 (ENSTTRG00000001786) #32 TCFL5 (ENSTTRG00000001783) #33 ENSTTRG00000001775 #34 OGFR (ENSTTRG00000001768) #35 MRGBP (ENSTTRG00000001765) #36 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407.j #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Vaquita MODERN SPECIES 6 ENSPSNG00000018326 UCKL1 (ENSPSNG00000018385) DNAJC5 (ENSPSNG00000018545) TPD52L2 (ENSPSNG00000018664) #7 ZBTB46 (ENSPSNG00000018908) #9 SLC2A4RG (ENSPSNG00000018950) #10 ZGPAT (ENSPSNG00000019030) #12 ARFRP1 (ENSPSNG00000019111) #13 TNFRSF6B (ENSPSNG00000019151) RTEL1 (ENSPSNG00000019209) #14 STMN3 (ENSPSNG00000019332) #15 GMEB2 (ENSPSNG00000019400) #16 ENSPSNG00000019447 #17 FNDC11 (ENSPSNG00000019486) #18 ENSPSNG00000019504 #21 EEF1A2 (ENSPSNG00000019559) #22 KCNQ2 (ENSPSNG00000019705) #23 CHRNA4 (ENSPSNG00000020351) #24 ENSPSNG00000020436 ARFGAP1 (ENSPSNG00000020779) #26 NKAIN4 (ENSPSNG00000020851) BIRC7 (ENSPSNG00000020957) #27 YTHDF1 (ENSPSNG00000021004) #28 BHLHE23 (ENSPSNG00000021049) #29 SLC17A9 (ENSPSNG00000021073) #30 GID8 (ENSPSNG00000021145) #31 DIDO1 (ENSPSNG00000021175) #32 TCFL5 (ENSPSNG00000021221) #33 COL9A3 (ENSPSNG00000021251) OGFR (ENSPSNG00000021362) #35 MRGBP (ENSPSNG00000021374) #36 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155597 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407.j #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000178207 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00390000009113.a.a.k.a.b.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Beluga whale MODERN SPECIES 36 UCKL1 (ENSDLEG00000005729) DNAJC5 (ENSDLEG00000006220) TPD52L2 (ENSDLEG00000006229) #7 ABHD16B (ENSDLEG00000006240) #8 ZBTB46 (ENSDLEG00000006243) #9 SLC2A4RG (ENSDLEG00000006246) #10 ZGPAT (ENSDLEG00000006248) #12 ARFRP1 (ENSDLEG00000006274) #13 TNFRSF6B (ENSDLEG00000006327) RTEL1 (ENSDLEG00000006299) #14 STMN3 (ENSDLEG00000006329) #15 GMEB2 (ENSDLEG00000006334) #16 ENSDLEG00000006341 FNDC11 (ENSDLEG00000006348) #18 PPDPF (ENSDLEG00000006352) #21 EEF1A2 (ENSDLEG00000006359) #22 KCNQ2 (ENSDLEG00000006373) #23 CHRNA4 (ENSDLEG00000006419) #24 ARFGAP1 (ENSDLEG00000006487) #26 ENSDLEG00000006501 NKAIN4 (ENSDLEG00000006505) BIRC7 (ENSDLEG00000006511) #27 YTHDF1 (ENSDLEG00000006539) #28 BHLHE23 (ENSDLEG00000006552) #29 SLC17A9 (ENSDLEG00000006561) #30 GID8 (ENSDLEG00000006569) #31 DIDO1 (ENSDLEG00000006572) #32 TCFL5 (ENSDLEG00000006581) #33 ENSDLEG00000006589 #34 OGFR (ENSDLEG00000006610) #35 MRGBP (ENSDLEG00000006615) #36 Narwhal MODERN SPECIES 299 UCKL1 (ENSMMNG00015000505) DNAJC5 (ENSMMNG00015000566) TPD52L2 (ENSMMNG00015000666) #7 ZBTB46 (ENSMMNG00015000842) #9 SLC2A4RG (ENSMMNG00015000872) #10 ENSMMNG00015000902 #11 ZGPAT (ENSMMNG00015000934) #12 ENSMMNG00015001006 #13 TNFRSF6B (ENSMMNG00015001055) RTEL1 (ENSMMNG00015001129) #14 STMN3 (ENSMMNG00015001283) #15 GMEB2 (ENSMMNG00015001319) #16 ENSMMNG00015001359 FNDC11 (ENSMMNG00015001382) #18 ENSMMNG00015001417 #21 EEF1A2 (ENSMMNG00015001463) #22 KCNQ2 (ENSMMNG00015001643) #23 CHRNA4 (ENSMMNG00015001872) #24 ENSMMNG00015002114 ARFGAP1 (ENSMMNG00015002472) #26 NKAIN4 (ENSMMNG00015002566) BIRC7 (ENSMMNG00015002630) #27 YTHDF1 (ENSMMNG00015002665) #28 BHLHE23 (ENSMMNG00015002701) #29 SLC17A9 (ENSMMNG00015002717) #30 GID8 (ENSMMNG00015002735) #31 DIDO1 (ENSMMNG00015002766) #32 TCFL5 (ENSMMNG00015002807) #33 ENSMMNG00015002855 #34 OGFR (ENSMMNG00015002906) #35 MRGBP (ENSMMNG00015002936) #36 Pecora ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Yarkand deer MODERN SPECIES 15 DNAJC5 (ENSCHYG00000020210) TPD52L2 (ENSCHYG00000020472) #7 ABHD16B (ENSCHYG00000021761) #8 ZBTB46 (ENSCHYG00000021787) #9 SLC2A4RG (ENSCHYG00000021881) #10 ZGPAT (ENSCHYG00000021994) #12 ARFRP1 (ENSCHYG00000022042) #13 TNFRSF6B (ENSCHYG00000022144) RTEL1 (ENSCHYG00000022197) #14 STMN3 (ENSCHYG00000022430) #15 GMEB2 (ENSCHYG00000022512) #16 FNDC11 (ENSCHYG00000022671) #18 SRMS (ENSCHYG00000022689) #19 PTK6 (ENSCHYG00000022722) #20 PPDPF (ENSCHYG00000022802) #21 EEF1A2 (ENSCHYG00000022823) #22 KCNQ2 (ENSCHYG00000022884) #23 CHRNA4 (ENSCHYG00000023185) #24 COL20A1 (ENSCHYG00000023249) #25 ARFGAP1 (ENSCHYG00000023418) #26 BIRC7 (ENSCHYG00000024242) #27 YTHDF1 (ENSCHYG00000024279) #28 BHLHE23 (ENSCHYG00000024339) #29 SLC17A9 (ENSCHYG00000024379) #30 GID8 (ENSCHYG00000024609) #31 DIDO1 (ENSCHYG00000024645) #32 TCFL5 (ENSCHYG00000024725) #33 ENSCHYG00000024763 #34 OGFR (ENSCHYG00000024794) #35 MRGBP (ENSCHYG00000024816) #36 NTSR1 (ENSCHYG00000024836) #37 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635.nb ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1193 TPD52L2 (ENSMMSG00000022902) #7 ABHD16B (ENSMMSG00000022863) #8 ZBTB46 (ENSMMSG00000022854) #9 SLC2A4RG (ENSMMSG00000022847) #10 LIME1 (ENSMMSG00000022834) #11 ZGPAT (ENSMMSG00000022821) #12 ENSMMSG00000022813 #13 TNFRSF6B (ENSMMSG00000022803) RTEL1 (ENSMMSG00000022788) #14 STMN3 (ENSMMSG00000022766) #15 GMEB2 (ENSMMSG00000022745) #16 FNDC11 (ENSMMSG00000022733) #18 SRMS (ENSMMSG00000022723) #19 PTK6 (ENSMMSG00000022709) #20 PPDPF (ENSMMSG00000022705) #21 EEF1A2 (ENSMMSG00000022690) #22 KCNQ2 (ENSMMSG00000022085) #23 CHRNA4 (ENSMMSG00000021992) #24 ENSMMSG00000021796 ARFGAP1 (ENSMMSG00000021515) #26 BIRC7 (ENSMMSG00000021444) #27 YTHDF1 (ENSMMSG00000021404) #28 BHLHE23 (ENSMMSG00000021377) #29 SLC17A9 (ENSMMSG00000021281) #30 GID8 (ENSMMSG00000021243) #31 DIDO1 (ENSMMSG00000021079) #32 ENSMMSG00000021045 TCFL5 (ENSMMSG00000021020) #33 ENSMMSG00000020900 #34 OGFR (ENSMMSG00000020874) #35 MRGBP (ENSMMSG00000020847) #36 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635.nb ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635.nb ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Goat MODERN SPECIES 4 ENSCHIG00000026568 TPD52L2 (ENSCHIG00000021142) #7 ABHD16B (ENSCHIG00000002136) #8 ZBTB46 (ENSCHIG00000027256) #9 SLC2A4RG (ENSCHIG00000013029) #10 ZGPAT (ENSCHIG00000026209) #12 ARFRP1 (ENSCHIG00000010007) #13 TNFRSF6B (ENSCHIG00000023828) RTEL1 (ENSCHIG00000014098) #14 STMN3 (ENSCHIG00000025919) #15 GMEB2 (ENSCHIG00000010276) #16 FNDC11 (ENSCHIG00000010688) #18 SRMS (ENSCHIG00000014015) #19 PTK6 (ENSCHIG00000025310) #20 ENSCHIG00000016840 #21 EEF1A2 (ENSCHIG00000016589) #22 KCNQ2 (ENSCHIG00000011199) #23 CHRNA4 (ENSCHIG00000023125) #24 ENSCHIG00000013050 ARFGAP1 (ENSCHIG00000027204) #26 BIRC7 (ENSCHIG00000021634) #27 YTHDF1 (ENSCHIG00000026494) #28 BHLHE23 (ENSCHIG00000012514) #29 SLC17A9 (ENSCHIG00000021766) #30 GID8 (ENSCHIG00000023483) #31 DIDO1 (ENSCHIG00000010423) #32 TCFL5 (ENSCHIG00000019060) #33 ENSCHIG00000022644 #34 OGFR (ENSCHIG00000020689) #35 ENSCHIG00000014569 #36 NTSR1 (ENSCHIG00000026075) #37 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 4 DNAJC5 (ENSOARG00020010877) TPD52L2 (ENSOARG00020010989) #7 ABHD16B (ENSOARG00020011710) #8 ZBTB46 (ENSOARG00020011728) #9 LIME1 (ENSOARG00020011907) #11 ZGPAT (ENSOARG00020012012) #12 ARFRP1 (ENSOARG00020012087) #13 TNFRSF6B (ENSOARG00020003178) RTEL1 (ENSOARG00020003210) #14 STMN3 (ENSOARG00020003323) #15 GMEB2 (ENSOARG00020003375) #16 FNDC11 (ENSOARG00020003472) #18 SRMS (ENSOARG00020003498) #19 PTK6 (ENSOARG00020003662) #20 ENSOARG00020003728 #21 EEF1A2 (ENSOARG00020003758) #22 KCNQ2 (ENSOARG00020003802) #23 CHRNA4 (ENSOARG00020004285) #24 ARFGAP1 (ENSOARG00020004787) #26 BIRC7 (ENSOARG00020005025) #27 YTHDF1 (ENSOARG00020005076) #28 BHLHE23 (ENSOARG00020005128) #29 SLC17A9 (ENSOARG00020005151) #30 GID8 (ENSOARG00020005239) #31 TCFL5 (ENSOARG00020005326) #33 COL9A3 (ENSOARG00020005388) OGFR (ENSOARG00020005520) #35 MRGBP (ENSOARG00020005556) #36 NTSR1 (ENSOARG00020005581) #37 GATA5 (ENSOARG00020005701) RBBP8NL (ENSOARG00020005734) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635.nb ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 American bison MODERN SPECIES 2997 DNAJC5 (ENSBBBG00000018485) TPD52L2 (ENSBBBG00000018473) #7 ABHD16B (ENSBBBG00000004494) #8 ZBTB46 (ENSBBBG00000018391) #9 ENSBBBG00000018362 #11 ZGPAT (ENSBBBG00000018356) #12 ARFRP1 (ENSBBBG00000018329) #13 TNFRSF6B (ENSBBBG00000018268) RTEL1 (ENSBBBG00000018256) #14 STMN3 (ENSBBBG00000018165) #15 GMEB2 (ENSBBBG00000018153) #16 FNDC11 (ENSBBBG00000018128) #18 SRMS (ENSBBBG00000018118) #19 ENSBBBG00000018103 #20 ENSBBBG00000004448 #21 EEF1A2 (ENSBBBG00000018089) #22 KCNQ2 (ENSBBBG00000018060) #23 ENSBBBG00000017850 CHRNA4 (ENSBBBG00000017847) #24 ENSBBBG00000017808 ARFGAP1 (ENSBBBG00000017718) #26 BIRC7 (ENSBBBG00000017559) #27 YTHDF1 (ENSBBBG00000017540) #28 SLC17A9 (ENSBBBG00000017525) #30 GID8 (ENSBBBG00000004333) #31 ENSBBBG00000017486 #32 ENSBBBG00000008003 #33 COL9A3 (ENSBBBG00000017417) OGFR (ENSBBBG00000017322) #35 ENSBBBG00000017309 #36 NTSR1 (ENSBBBG00000017290) #37 Bos ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635.nb ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635.nb ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00960000188905 Domestic yak MODERN SPECIES 3 ENSBGRG00000014398 #7 ABHD16B (ENSBGRG00000015257) #8 ZBTB46 (ENSBGRG00000015279) #9 SLC2A4RG (ENSBGRG00000015318) #10 ENSBGRG00000015342 #11 ZGPAT (ENSBGRG00000015402) #12 ARFRP1 (ENSBGRG00000015487) #13 ENSBGRG00000015689 RTEL1 (ENSBGRG00000015752) #14 ENSBGRG00000016032 #15 GMEB2 (ENSBGRG00000016222) #16 FNDC11 (ENSBGRG00000016384) #18 SRMS (ENSBGRG00000016410) #19 PTK6 (ENSBGRG00000016608) #20 ENSBGRG00000016703 #21 EEF1A2 (ENSBGRG00000016759) #22 KCNQ2 (ENSBGRG00000016904) #23 ENSBGRG00000018038 CHRNA4 (ENSBGRG00000018085) #24 ARFGAP1 (ENSBGRG00000018203) #26 ENSBGRG00000018634 BIRC7 (ENSBGRG00000019380) #27 ENSBGRG00000019416 #28 BHLHE23 (ENSBGRG00000019503) #29 SLC17A9 (ENSBGRG00000019565) #30 GID8 (ENSBGRG00000020140) #31 DIDO1 (ENSBGRG00000020262) #32 TCFL5 (ENSBGRG00000020529) #33 COL9A3 (ENSBGRG00000020604) OGFR (ENSBGRG00000020644) #35 MRGBP (ENSBGRG00000020678) #36 Wild yak MODERN SPECIES 3021 ABHD16B (ENSBMUG00000017494) #8 ZBTB46 (ENSBMUG00000017485) #9 SLC2A4RG (ENSBMUG00000017472) #10 ENSBMUG00000017454 #11 ZGPAT (ENSBMUG00000017440) #12 ARFRP1 (ENSBMUG00000017421) #13 RTEL1 (ENSBMUG00000017379) #14 STMN3 (ENSBMUG00000017284) #15 GMEB2 (ENSBMUG00000017259) #16 FNDC11 (ENSBMUG00000017208) #18 SRMS (ENSBMUG00000017186) #19 PTK6 (ENSBMUG00000017145) #20 ENSBMUG00000017129 #21 EEF1A2 (ENSBMUG00000017118) #22 KCNQ2 (ENSBMUG00000017092) #23 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635.nb ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.k.b.d #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00390000004044.kb ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00970000197151 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 4 UCKL1 (ENSBIXG00005002987) TPD52L2 (ENSBIXG00005018594) #7 ABHD16B (ENSBIXG00005018625) #8 ZBTB46 (ENSBIXG00005003020) #9 SLC2A4RG (ENSBIXG00005018672) #10 ZGPAT (ENSBIXG00005018723) #12 ARFRP1 (ENSBIXG00005018785) #13 ENSBIXG00005018798 RTEL1 (ENSBIXG00005018917) #14 STMN3 (ENSBIXG00005007568) #15 GMEB2 (ENSBIXG00005018966) #16 FNDC11 (ENSBIXG00005018984) #18 SRMS (ENSBIXG00005019096) #19 PTK6 (ENSBIXG00005003117) #20 ENSBIXG00005003125 #21 EEF1A2 (ENSBIXG00005019170) #22 KCNQ2 (ENSBIXG00005019244) #23 ENSBIXG00005003134 CHRNA4 (ENSBIXG00005019296) #24 ENSBIXG00005005672 ARFGAP1 (ENSBIXG00005020213) #26 ENSBIXG00005006458 BIRC7 (ENSBIXG00005003370) #27 YTHDF1 (ENSBIXG00005003409) #28 BHLHE23 (ENSBIXG00005020315) #29 SLC17A9 (ENSBIXG00005005595) #30 GID8 (ENSBIXG00005003440) #31 DIDO1 (ENSBIXG00005020462) #32 TCFL5 (ENSBIXG00005003466) #33 COL9A3 (ENSBIXG00005020674) OGFR (ENSBIXG00005006823) #35 Cow MODERN SPECIES 4 TPD52L2 (ENSBTAG00000021232) #7 ABHD16B (ENSBTAG00000031906) #8 ZBTB46 (ENSBTAG00000016667) #9 SLC2A4RG (ENSBTAG00000016664) #10 LIME1 (ENSBTAG00000007501) #11 ZGPAT (ENSBTAG00000007498) #12 ARFRP1 (ENSBTAG00000007497) #13 TNFRSF6B (ENSBTAG00000027407) RTEL1 (ENSBTAG00000021096) #14 STMN3 (ENSBTAG00000038974) #15 GMEB2 (ENSBTAG00000014769) #16 FNDC11 (ENSBTAG00000027405) #18 SRMS (ENSBTAG00000001985) #19 PTK6 (ENSBTAG00000044091) #20 PPDPF (ENSBTAG00000031800) #21 EEF1A2 (ENSBTAG00000021685) #22 KCNQ2 (ENSBTAG00000003030) #23 ENSBTAG00000031764 CHRNA4 (ENSBTAG00000017198) #24 COL20A1 (ENSBTAG00000004582) ARFGAP1 (ENSBTAG00000004916) #26 ENSBTAG00000051598 BIRC7 (ENSBTAG00000004911) #27 YTHDF1 (ENSBTAG00000010383) #28 BHLHE23 (ENSBTAG00000010873) #29 SLC17A9 (ENSBTAG00000001829) #30 GID8 (ENSBTAG00000001827) #31 DIDO1 (ENSBTAG00000006002) #32 TCFL5 (ENSBTAG00000046520) #33 COL9A3 (ENSBTAG00000015581) #34 OGFR (ENSBTAG00000031718) #35 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Felidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Cat MODERN SPECIES 2 TPD52L2 (ENSFCAG00000001177) #7 ABHD16B (ENSFCAG00000050581) #8 ZBTB46 (ENSFCAG00000001175) #9 SLC2A4RG (ENSFCAG00000027250) #10 ENSFCAG00000044471 #11 ENSFCAG00000001173 #12 ARFRP1 (ENSFCAG00000044777) #13 TNFRSF6B (ENSFCAG00000022732) STMN3 (ENSFCAG00000031508) #15 GMEB2 (ENSFCAG00000031273) #16 HELZ2 (ENSFCAG00000008926) #17 FNDC11 (ENSFCAG00000006167) #18 SRMS (ENSFCAG00000008678) #19 PTK6 (ENSFCAG00000033150) #20 ENSFCAG00000024386 #21 EEF1A2 (ENSFCAG00000028726) #22 KCNQ2 (ENSFCAG00000008923) #23 CHRNA4 (ENSFCAG00000030656) #24 COL20A1 (ENSFCAG00000008920) ARFGAP1 (ENSFCAG00000008919) #26 BIRC7 (ENSFCAG00000008918) #27 YTHDF1 (ENSFCAG00000008917) #28 BHLHE23 (ENSFCAG00000048281) #29 SLC17A9 (ENSFCAG00000025163) #30 GID8 (ENSFCAG00000045255) #31 DIDO1 (ENSFCAG00000015588) #32 TCFL5 (ENSFCAG00000024469) #33 COL9A3 (ENSFCAG00000001332) ENSFCAG00000043168 #35 MRGBP (ENSFCAG00000028818) #36 NTSR1 (ENSFCAG00000000383) #37 Panthera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Tiger MODERN SPECIES 253 TCEA2 (ENSPTIG00000007119) C20orf204 (ENSPTIG00000010349) PRPF6 (ENSPTIG00000011184) SAMD10 (ENSPTIG00000013488) ZNF512B (ENSPTIG00000014076) DNAJC5 (ENSPTIG00000017196) TPD52L2 (ENSPTIG00000017852) #7 ZBTB46 (ENSPTIG00000018929) #9 ZGPAT (ENSPTIG00000020325) #12 ARFRP1 (ENSPTIG00000021097) #13 STMN3 (ENSPTIG00000015482) #15 GMEB2 (ENSPTIG00000016000) #16 ENSPTIG00000018372 #17 PTK6 (ENSPTIG00000018694) #20 ENSPTIG00000019343 #21 EEF1A2 (ENSPTIG00000019573) #22 CHRNA4 (ENSPTIG00000006707) #24 ARFGAP1 (ENSPTIG00000015171) #26 ENSPTIG00000015596 BIRC7 (ENSPTIG00000016083) #27 YTHDF1 (ENSPTIG00000017355) #28 SLC17A9 (ENSPTIG00000018794) #30 GID8 (ENSPTIG00000019701) #31 ENSPTIG00000020540 #32 ENSPTIG00000006278 #33 NTSR1 (ENSPTIG00000009080) #37 ENSPTIG00000009938 CABLES2 (ENSPTIG00000011195) ENSPTIG00000012625 ADRM1 (ENSPTIG00000012974) OSBPL2 (ENSPTIG00000015979) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 leopard MODERN SPECIES 105 TPD52L2 (ENSPPRG00000001555) #7 ENSPPRG00000023040 #8 ENSPPRG00000023425 #8 ZBTB46 (ENSPPRG00000023561) #9 SLC2A4RG (ENSPPRG00000023998) #10 ZGPAT (ENSPPRG00000024151) #12 ARFRP1 (ENSPPRG00000024309) #13 TNFRSF6B (ENSPPRG00000024773) STMN3 (ENSPPRG00000014885) #15 GMEB2 (ENSPPRG00000014369) #16 ENSPPRG00000012697 HELZ2 (ENSPPRG00000012585) #17 SRMS (ENSPPRG00000009301) #19 PTK6 (ENSPPRG00000009136) #20 ENSPPRG00000008829 #21 EEF1A2 (ENSPPRG00000008644) #22 KCNQ2 (ENSPPRG00000007632) #23 CHRNA4 (ENSPPRG00000004145) #24 ENSPPRG00000003520 ARFGAP1 (ENSPPRG00000022748) #26 ENSPPRG00000023805 BIRC7 (ENSPPRG00000024060) #27 YTHDF1 (ENSPPRG00000020805) #28 SLC17A9 (ENSPPRG00000019375) #30 GID8 (ENSPPRG00000015995) #31 ENSPPRG00000015125 #32 ENSPPRG00000010546 #33 COL9A3 (ENSPPRG00000010419) ENSPPRG00000009399 #35 MRGBP (ENSPPRG00000008348) #36 NTSR1 (ENSPPRG00000007852) #37 lion MODERN SPECIES 3 ZBTB46 (ENSPLOG00000020142) #9 SLC2A4RG (ENSPLOG00000020109) #10 LIME1 (ENSPLOG00000020054) #11 ZGPAT (ENSPLOG00000020018) #12 ARFRP1 (ENSPLOG00000019876) #13 TNFRSF6B (ENSPLOG00000019829) RTEL1 (ENSPLOG00000018546) #14 STMN3 (ENSPLOG00000018304) #15 GMEB2 (ENSPLOG00000018224) #16 HELZ2 (ENSPLOG00000018197) #17 FNDC11 (ENSPLOG00000018176) #18 SRMS (ENSPLOG00000018151) #19 PTK6 (ENSPLOG00000018089) #20 ENSPLOG00000018035 #21 EEF1A2 (ENSPLOG00000017979) #22 KCNQ2 (ENSPLOG00000017884) #23 CHRNA4 (ENSPLOG00000017836) #24 ENSPLOG00000017179 ARFGAP1 (ENSPLOG00000016829) #26 BIRC7 (ENSPLOG00000016713) #27 YTHDF1 (ENSPLOG00000016671) #28 BHLHE23 (ENSPLOG00000016645) #29 SLC17A9 (ENSPLOG00000016527) #30 GID8 (ENSPLOG00000016492) #31 DIDO1 (ENSPLOG00000016452) #32 TCFL5 (ENSPLOG00000016420) #33 COL9A3 (ENSPLOG00000016182) OGFR (ENSPLOG00000016077) #35 MRGBP (ENSPLOG00000016026) #36 NTSR1 (ENSPLOG00000015983) #37 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Canidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406.c #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Red fox MODERN SPECIES 108 UCKL1 (ENSVVUG00000014989) DNAJC5 (ENSVVUG00000014992) TPD52L2 (ENSVVUG00000014997) #7 ZBTB46 (ENSVVUG00000015002) #9 SLC2A4RG (ENSVVUG00000015007) #10 ENSVVUG00000015009 #11 ZGPAT (ENSVVUG00000015014) #12 ARFRP1 (ENSVVUG00000015040) #13 RTEL1 (ENSVVUG00000015049) #14 TNFRSF6B (ENSVVUG00000015153) ENSVVUG00000015155 ##15 GMEB2 (ENSVVUG00000015156) #16 HELZ2 (ENSVVUG00000015158) #17 ENSVVUG00000015166 #19 FNDC11 (ENSVVUG00000015177) #18 EEF1A2 (ENSVVUG00000015184) #22 KCNQ2 (ENSVVUG00000015194) #23 CHRNA4 (ENSVVUG00000015205) #24 ENSVVUG00000015209 ARFGAP1 (ENSVVUG00000015255) #26 NKAIN4 (ENSVVUG00000015272) ENSVVUG00000015273 #27 YTHDF1 (ENSVVUG00000015275) #28 ENSVVUG00000015283 #29 SLC17A9 (ENSVVUG00000015289) #30 GID8 (ENSVVUG00000015314) #31 DIDO1 (ENSVVUG00000015321) #32 TCFL5 (ENSVVUG00000015386) #33 ENSVVUG00000015387 #34 ENSVVUG00000015395 #35 MRGBP (ENSVVUG00000015402) #36 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f.c #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406.c #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Dingo MODERN SPECIES 343 UCKL1 (ENSCAFG00020001998) DNAJC5 (ENSCAFG00020001991) TPD52L2 (ENSCAFG00020001989) #7 ABHD16B (ENSCAFG00020001985) #8 ZBTB46 (ENSCAFG00020001979) #9 ENSCAFG00020001968 #10 ENSCAFG00020001962 #11 ZGPAT (ENSCAFG00020001956) #12 ARFRP1 (ENSCAFG00020001953) #13 TNFRSF6B (ENSCAFG00020001946) RTEL1 (ENSCAFG00020001919) #14 STMN3 (ENSCAFG00020001907) #15 GMEB2 (ENSCAFG00020001902) #16 FNDC11 (ENSCAFG00020001885) #18 SRMS (ENSCAFG00020001858) #19 EEF1A2 (ENSCAFG00020001844) #22 KCNQ2 (ENSCAFG00020001486) #23 CHRNA4 (ENSCAFG00020001385) #24 ENSCAFG00020001328 ARFGAP1 (ENSCAFG00020001313) #26 ENSCAFG00020001259 BIRC7 (ENSCAFG00020001235) #27 ENSCAFG00020001219 YTHDF1 (ENSCAFG00020001214) #28 BHLHE23 (ENSCAFG00020001194) #29 SLC17A9 (ENSCAFG00020001162) #30 GID8 (ENSCAFG00020001150) #31 ENSCAFG00020001136 #32 ENSCAFG00020001124 #32 TCFL5 (ENSCAFG00020001087) #33 ENSCAFG00020001056 #34 Dog MODERN SPECIES 16 ENSCAFG00845018710 #11 ENSCAFG00845018556 #9 ZGPAT (ENSCAFG00845018472) #12 ARFRP1 (ENSCAFG00845018384) #13 TNFRSF6B (ENSCAFG00845018187) ENSCAFG00845017564 #14 ENSCAFG00845017453 #15 ENSCAFG00845017271 #18 ENSCAFG00845017209 #19 ENSCAFG00845022791 #15 GMEB2 (ENSCAFG00845022265) #16 ENSCAFG00845022080 #17 FNDC11 (ENSCAFG00845022015) #18 ENSCAFG00845021922 #19 ENSCAFG00845021666 #21 EEF1A2 (ENSCAFG00845021542) #22 KCNQ2 (ENSCAFG00845021011) #23 CHRNA4 (ENSCAFG00845020832) #24 ENSCAFG00845020115 ARFGAP1 (ENSCAFG00845019425) #26 NKAIN4 (ENSCAFG00845019207) ENSCAFG00845019116 #27 ENSCAFG00845018982 #28 YTHDF1 (ENSCAFG00845018849) #28 BHLHE23 (ENSCAFG00845018744) #29 SLC17A9 (ENSCAFG00845018620) #30 GID8 (ENSCAFG00845018539) #31 DIDO1 (ENSCAFG00845018415) #32 TCFL5 (ENSCAFG00845018226) #33 COL9A3 (ENSCAFG00845018010) #34 ENSCAFG00845017856 #35 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 ENSGT01080000257410.C Ferret MODERN SPECIES 236 ABHD16B (ENSMPUG00000020179) #8 ZBTB46 (ENSMPUG00000008570) #9 SLC2A4RG (ENSMPUG00000008537) #10 LIME1 (ENSMPUG00000008523) #11 ARFRP1 (ENSMPUG00000008452) #13 ENSMPUG00000020178 RTEL1 (ENSMPUG00000008435) #14 STMN3 (ENSMPUG00000008430) #15 ENSMPUG00000008389 GMEB2 (ENSMPUG00000008374) #16 HELZ2 (ENSMPUG00000008361) #17 FNDC11 (ENSMPUG00000020177) #18 SRMS (ENSMPUG00000008349) #19 PTK6 (ENSMPUG00000008313) #20 PPDPF (ENSMPUG00000008301) #21 EEF1A2 (ENSMPUG00000008289) #22 KCNQ2 (ENSMPUG00000008202) #23 CHRNA4 (ENSMPUG00000008195) #24 ENSMPUG00000008149 ARFGAP1 (ENSMPUG00000008138) #26 BIRC7 (ENSMPUG00000008120) #27 YTHDF1 (ENSMPUG00000008111) #28 ENSMPUG00000008107 SLC17A9 (ENSMPUG00000008097) #30 GID8 (ENSMPUG00000008060) #31 DIDO1 (ENSMPUG00000008006) #32 ENSMPUG00000008000 #33 COL9A3 (ENSMPUG00000007936) ENSMPUG00000007934 #35 MRGBP (ENSMPUG00000007912) #36 ENSMPUG00000007908 American mink MODERN SPECIES 82 TPD52L2 (ENSNVIG00000018929) #7 ABHD16B (ENSNVIG00000019083) #8 ZBTB46 (ENSNVIG00000019084) #9 SLC2A4RG (ENSNVIG00000019104) #10 ENSNVIG00000019119 #11 ZGPAT (ENSNVIG00000019139) #12 ARFRP1 (ENSNVIG00000019161) #13 ENSNVIG00000019199 RTEL1 (ENSNVIG00000019209) #14 STMN3 (ENSNVIG00000019308) #15 GMEB2 (ENSNVIG00000019333) #16 HELZ2 (ENSNVIG00000019384) #17 FNDC11 (ENSNVIG00000019458) #18 SRMS (ENSNVIG00000019464) #19 PPDPF (ENSNVIG00000019474) #21 EEF1A2 (ENSNVIG00000019476) #22 KCNQ2 (ENSNVIG00000019509) #23 CHRNA4 (ENSNVIG00000019659) #24 ARFGAP1 (ENSNVIG00000019685) #26 BIRC7 (ENSNVIG00000019781) #27 YTHDF1 (ENSNVIG00000019799) #28 SLC17A9 (ENSNVIG00000019834) #30 GID8 (ENSNVIG00000019869) #31 ENSNVIG00000019894 #32 ENSNVIG00000019943 #33 COL9A3 (ENSNVIG00000019962) MRGBP (ENSNVIG00000020047) #36 NTSR1 (ENSNVIG00000020055) #37 SLCO4A1 (ENSNVIG00000020066) ENSNVIG00000020092 GATA5 (ENSNVIG00000020102) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694.e #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Giant Panda MODERN SPECIES 4 DNAJC5 (ENSAMEG00000001818) ENSAMEG00000026757 #7 ZBTB46 (ENSAMEG00000001783) #9 SLC2A4RG (ENSAMEG00000001776) #10 ENSAMEG00000001764 #11 ZGPAT (ENSAMEG00000024713) #12 ARFRP1 (ENSAMEG00000001741) #13 TNFRSF6B (ENSAMEG00000031252) RTEL1 (ENSAMEG00000001689) #14 STMN3 (ENSAMEG00000001672) #15 GMEB2 (ENSAMEG00000001647) #16 HELZ2 (ENSAMEG00000001622) #17 FNDC11 (ENSAMEG00000026205) #18 SRMS (ENSAMEG00000001582) #19 ENSAMEG00000024443 #21 EEF1A2 (ENSAMEG00000026845) #22 KCNQ2 (ENSAMEG00000001530) #23 CHRNA4 (ENSAMEG00000001515) #24 ENSAMEG00000017307 #26 ENSAMEG00000026916 #26 NKAIN4 (ENSAMEG00000017310) BIRC7 (ENSAMEG00000017319) #27 YTHDF1 (ENSAMEG00000017323) #28 SLC17A9 (ENSAMEG00000017329) #30 GID8 (ENSAMEG00000017333) #31 DIDO1 (ENSAMEG00000017335) #32 ENSAMEG00000017341 #33 COL9A3 (ENSAMEG00000017342) ENSAMEG00000029718 #35 ENSAMEG00000025015 #36 SLCO4A1 (ENSAMEG00000023949) Ursus ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694.f #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a.q.b.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 ENSGT00390000014718 Polar bear MODERN SPECIES 148 ZNF512B (ENSUMAG00000021994) UCKL1 (ENSUMAG00000021995) DNAJC5 (ENSUMAG00000022001) TPD52L2 (ENSUMAG00000022003) #7 ZBTB46 (ENSUMAG00000022007) #9 ENSUMAG00000022011 #10 LIME1 (ENSUMAG00000022016) #11 ZGPAT (ENSUMAG00000022033) #12 ARFRP1 (ENSUMAG00000022036) #13 RTEL1 (ENSUMAG00000022059) #14 STMN3 (ENSUMAG00000022173) #15 ENSUMAG00000022180 #16 ENSUMAG00000022201 #18 SRMS (ENSUMAG00000022204) #19 PPDPF (ENSUMAG00000022207) #21 EEF1A2 (ENSUMAG00000022209) #22 ENSUMAG00000022217 #23 ENSUMAG00000022242 ARFGAP1 (ENSUMAG00000022278) #26 BIRC7 (ENSUMAG00000022285) #27 YTHDF1 (ENSUMAG00000022290) #28 ENSUMAG00000022294 SLC17A9 (ENSUMAG00000022304) #30 GID8 (ENSUMAG00000022317) #31 DIDO1 (ENSUMAG00000022326) #32 ENSUMAG00000022355 #33 ENSUMAG00000022356 #34 ENSUMAG00000022360 #36 NTSR1 (ENSUMAG00000022365) #37 ENSUMAG00000022371 ENSUMAG00000022375 American black bear MODERN SPECIES 959 ENSUAMG00000025224 #17 ENSUAMG00000025222 #17 FNDC11 (ENSUAMG00000025220) #18 SRMS (ENSUAMG00000025219) #19 PTK6 (ENSUAMG00000025217) #20 ENSUAMG00000025214 #21 EEF1A2 (ENSUAMG00000025211) #22 KCNQ2 (ENSUAMG00000024996) #23 CHRNA4 (ENSUAMG00000024994) #24 ENSUAMG00000024993 COL20A1 (ENSUAMG00000024976) #25 ARFGAP1 (ENSUAMG00000024971) #26 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Equus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Horse MODERN SPECIES 14 ABHD16B (ENSECAG00000019623) #8 ZBTB46 (ENSECAG00000021082) #9 SLC2A4RG (ENSECAG00000020369) #10 LIME1 (ENSECAG00000019698) #11 ZGPAT (ENSECAG00000019674) #12 ARFRP1 (ENSECAG00000019636) #13 TNFRSF6B (ENSECAG00000032390) RTEL1 (ENSECAG00000021707) #14 STMN3 (ENSECAG00000021320) #15 GMEB2 (ENSECAG00000019377) #16 HELZ2 (ENSECAG00000013636) #17 FNDC11 (ENSECAG00000004861) #18 SRMS (ENSECAG00000053306) #19 PTK6 (ENSECAG00000009935) #20 ENSECAG00000009413 #21 EEF1A2 (ENSECAG00000025109) #22 KCNQ2 (ENSECAG00000020526) #23 CHRNA4 (ENSECAG00000016151) #24 COL20A1 (ENSECAG00000033282) #25 ARFGAP1 (ENSECAG00000038435) #26 NKAIN4 (ENSECAG00000039065) BIRC7 (ENSECAG00000020286) #27 YTHDF1 (ENSECAG00000019475) #28 BHLHE23 (ENSECAG00000031478) #29 SLC17A9 (ENSECAG00000012252) #30 GID8 (ENSECAG00000011992) #31 DIDO1 (ENSECAG00000007150) #32 ENSECAG00000004464 #33 ENSECAG00000056017 #33 COL9A3 (ENSECAG00000023357) #34 OGFR (ENSECAG00000021836) #35 Donkey MODERN SPECIES 6 ENSEASG00005023152 #7 ABHD16B (ENSEASG00005023154) #8 ZBTB46 (ENSEASG00005023155) #9 SLC2A4RG (ENSEASG00005023157) #10 LIME1 (ENSEASG00005023158) #11 ENSEASG00005030827 #12 ARFRP1 (ENSEASG00005023160) #13 TNFRSF6B (ENSEASG00005029941) RTEL1 (ENSEASG00005023163) #14 STMN3 (ENSEASG00005023166) #15 GMEB2 (ENSEASG00005023167) #16 FNDC11 (ENSEASG00005028136) #18 SRMS (ENSEASG00005023170) #19 PTK6 (ENSEASG00005023171) #20 ENSEASG00005023172 #21 EEF1A2 (ENSEASG00005037380) #22 KCNQ2 (ENSEASG00005023175) #23 CHRNA4 (ENSEASG00005023176) #24 ENSEASG00005023177 ARFGAP1 (ENSEASG00005023181) #26 NKAIN4 (ENSEASG00005023184) BIRC7 (ENSEASG00005023185) #27 YTHDF1 (ENSEASG00005023186) #28 SLC17A9 (ENSEASG00005023189) #30 GID8 (ENSEASG00005023190) #31 ENSEASG00005023191 #32 ENSEASG00005023192 #33 ENSEASG00005036171 #33 ENSEASG00005034582 #34 OGFR (ENSEASG00005023195) #35 MRGBP (ENSEASG00005026220) #36 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000028339 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Megabat MODERN SPECIES 3685 EEF1A2 (ENSPVAG00000015698) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Microbat MODERN SPECIES 1488 TPD52L2 (ENSMLUG00000000525) #7 ABHD16B (ENSMLUG00000000523) #8 ZBTB46 (ENSMLUG00000005283) #9 SLC2A4RG (ENSMLUG00000025716) #10 LIME1 (ENSMLUG00000005272) #11 ZGPAT (ENSMLUG00000005264) #12 ARFRP1 (ENSMLUG00000005259) #13 TNFRSF6B (ENSMLUG00000022374) RTEL1 (ENSMLUG00000005233) #14 STMN3 (ENSMLUG00000029218) #15 GMEB2 (ENSMLUG00000014606) #16 HELZ2 (ENSMLUG00000014588) #17 FNDC11 (ENSMLUG00000014586) #18 SRMS (ENSMLUG00000014577) #19 PTK6 (ENSMLUG00000014570) #20 EEF1A2 (ENSMLUG00000016760) #22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 15 ENSRFEG00010011821 #7 ABHD16B (ENSRFEG00010012247) #8 ZBTB46 (ENSRFEG00010012264) #9 ENSRFEG00010012466 #11 ENSRFEG00010012620 #12 ARFRP1 (ENSRFEG00010012720) #13 TNFRSF6B (ENSRFEG00010012819) RTEL1 (ENSRFEG00010012863) #14 STMN3 (ENSRFEG00010012988) #15 GMEB2 (ENSRFEG00010013014) #16 HELZ2 (ENSRFEG00010013192) #17 FNDC11 (ENSRFEG00010013271) #18 SRMS (ENSRFEG00010013295) #19 PTK6 (ENSRFEG00010013418) #20 PPDPF (ENSRFEG00010013473) #21 EEF1A2 (ENSRFEG00010013568) #22 KCNQ2 (ENSRFEG00010013657) #23 CHRNA4 (ENSRFEG00010014002) #24 ENSRFEG00010014109 ARFGAP1 (ENSRFEG00010015968) #26 NKAIN4 (ENSRFEG00010016435) BIRC7 (ENSRFEG00010016554) #27 YTHDF1 (ENSRFEG00010016741) #28 BHLHE23 (ENSRFEG00010016835) #29 SLC17A9 (ENSRFEG00010016863) #30 GID8 (ENSRFEG00010017068) #31 ENSRFEG00010017096 #32 TCFL5 (ENSRFEG00010017418) #33 ENSRFEG00010017452 #34 OGFR (ENSRFEG00010017492) #35 MRGBP (ENSRFEG00010017510) #36 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C #22 Common shrew MODERN SPECIES 160 EEF1A2 (ENSSARG00000003047) #22 Hedgehog MODERN SPECIES 514 ENSEEUG00000004686 #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 215 ENSGT00940000155572 #7 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00390000012450 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 Armadillo MODERN SPECIES 1537 DNAJC5 (ENSDNOG00000032589) ENSDNOG00000046069 ENSDNOG00000014930 #7 ABHD16B (ENSDNOG00000041507) #8 ENSDNOG00000032707 ZBTB46 (ENSDNOG00000045164) #9 SLC2A4RG (ENSDNOG00000045627) #10 ENSDNOG00000036205 #11 ZGPAT (ENSDNOG00000025874) #12 ENSDNOG00000001531 #13 RTEL1 (ENSDNOG00000046492) #14 STMN3 (ENSDNOG00000049349) #15 GMEB2 (ENSDNOG00000041843) #16 HELZ2 (ENSDNOG00000017809) #17 PPDPF (ENSDNOG00000048593) #21 EEF1A2 (ENSDNOG00000013873) #22 ENSDNOG00000047869 #23 CHRNA4 (ENSDNOG00000043797) #24 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000162803 #8 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.a.a #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT01100000263518.A.a.a.a #37 Hyrax MODERN SPECIES 6575 ENSPCAG00000013190 #22 Elephant MODERN SPECIES 52 DNAJC5 (ENSLAFG00000027502) TPD52L2 (ENSLAFG00000027960) #7 ABHD16B (ENSLAFG00000004457) #8 ZBTB46 (ENSLAFG00000012490) #9 SLC2A4RG (ENSLAFG00000012489) #10 ENSLAFG00000010687 #12 ARFRP1 (ENSLAFG00000010685) #13 TNFRSF6B (ENSLAFG00000032756) RTEL1 (ENSLAFG00000021665) #14 STMN3 (ENSLAFG00000025727) #15 GMEB2 (ENSLAFG00000012335) #16 ENSLAFG00000006397 #17 FNDC11 (ENSLAFG00000006392) #18 PTK6 (ENSLAFG00000016890) #20 PPDPF (ENSLAFG00000026496) #21 EEF1A2 (ENSLAFG00000004005) #22 KCNQ2 (ENSLAFG00000027679) #23 CHRNA4 (ENSLAFG00000005402) #24 ENSLAFG00000027493 ARFGAP1 (ENSLAFG00000015786) #26 NKAIN4 (ENSLAFG00000013477) BIRC7 (ENSLAFG00000031254) #27 YTHDF1 (ENSLAFG00000008884) #28 ENSLAFG00000002108 #30 GID8 (ENSLAFG00000014167) #31 DIDO1 (ENSLAFG00000005671) #32 TCFL5 (ENSLAFG00000014903) #33 ENSLAFG00000010016 #34 ENSLAFG00000022322 #35 MRGBP (ENSLAFG00000018296) #36 NTSR1 (ENSLAFG00000008862) #37 Tenrec MODERN SPECIES 455 EEF1A2 (ENSETEG00000005037) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000164879 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b.f ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Opossum MODERN SPECIES ZBTB46 (ENSMODG00000017020) #9 SLC2A4RG (ENSMODG00000027705) #10 ENSMODG00000047016 ZGPAT (ENSMODG00000017016) #12 ARFRP1 (ENSMODG00000017011) #13 TNFRSF6B (ENSMODG00000051538) RTEL1 (ENSMODG00000017003) #14 STMN3 (ENSMODG00000016978) #15 GMEB2 (ENSMODG00000016974) #16 ENSMODG00000016966 #17 ENSMODG00000016904 FNDC11 (ENSMODG00000036893) #18 SRMS (ENSMODG00000016887) #19 PTK6 (ENSMODG00000016881) #20 ENSMODG00000016871 ##21 EEF1A2 (ENSMODG00000016868) #22 KCNQ2 (ENSMODG00000016863) #23 CHRNA4 (ENSMODG00000016860) #24 ENSMODG00000016855 ENSMODG00000046551 ARFGAP1 (ENSMODG00000016848) #26 ENSMODG00000016845 ENSMODG00000016844 #27 YTHDF1 (ENSMODG00000016842) #28 BHLHE23 (ENSMODG00000023267) #29 SLC17A9 (ENSMODG00000016838) #30 GID8 (ENSMODG00000016835) #31 DIDO1 (ENSMODG00000016832) #32 TCFL5 (ENSMODG00000016827) #33 ENSMODG00000016823 #34 ENSMODG00000043896 #35 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000164879 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b.e.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 TPD52L2 (ENSSHAG00000024940) #7 ABHD16B (ENSSHAG00000021217) #8 ZBTB46 (ENSSHAG00000017616) #9 SLC2A4RG (ENSSHAG00000022555) #10 ZGPAT (ENSSHAG00000017828) #12 TNFRSF6B (ENSSHAG00000031393) ARFRP1 (ENSSHAG00000024589) #13 RTEL1 (ENSSHAG00000017874) #14 GMEB2 (ENSSHAG00000023960) #16 ENSSHAG00000018163 #17 ENSSHAG00000028470 FNDC11 (ENSSHAG00000018231) #18 SRMS (ENSSHAG00000018268) #19 PTK6 (ENSSHAG00000018321) #20 ENSSHAG00000018338 ##21 EEF1A2 (ENSSHAG00000018414) #22 KCNQ2 (ENSSHAG00000000392) #23 CHRNA4 (ENSSHAG00000005283) #24 ENSSHAG00000008158 ARFGAP1 (ENSSHAG00000008569) #26 NKAIN4 (ENSSHAG00000009407) ENSSHAG00000010237 #27 YTHDF1 (ENSSHAG00000010430) #28 BHLHE23 (ENSSHAG00000008128) #29 SLC17A9 (ENSSHAG00000008884) #30 DIDO1 (ENSSHAG00000009621) #32 TCFL5 (ENSSHAG00000009928) #33 ENSSHAG00000025084 #34 ENSSHAG00000010685 #35 NTSR1 (ENSSHAG00000025949) #37 SLCO4A1 (ENSSHAG00000007017) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000164879 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b.e.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Wallaby MODERN SPECIES 1058 EEF1A2 (ENSMEUG00000005018) #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158060 #9 ENSGT00940000162832 #10 ENSGT00510000050080 #11 ENSGT00390000000732 #12 ENSGT00940000156407 #13 ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b #14 ENSGT01030000234597.a.b.b.f #15 ENSGT00410000025596.a.a #16 ENSGT00940000160694 #17 ENSGT00940000164879 ENSGT00390000006008 #18 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b.e.b.b.a ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532.b #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Common wonbat MODERN SPECIES 35 ZBTB46 (ENSVURG00010014016) #9 SLC2A4RG (ENSVURG00010014020) #10 ENSVURG00010014025 #11 ZGPAT (ENSVURG00010014029) #12 ARFRP1 (ENSVURG00010014035) #13 TNFRSF6B (ENSVURG00010014053) RTEL1 (ENSVURG00010014066) #14 STMN3 (ENSVURG00010014123) #15 GMEB2 (ENSVURG00010014132) #16 HELZ2 (ENSVURG00010014199) #17 ENSVURG00010014893 FNDC11 (ENSVURG00010014907) #18 SRMS (ENSVURG00010014915) #19 PTK6 (ENSVURG00010014923) #20 ENSVURG00010014930 ##21 EEF1A2 (ENSVURG00010014938) #22 KCNQ2 (ENSVURG00010015014) #23 CHRNA4 (ENSVURG00010016329) #24 ENSVURG00010016978 ENSVURG00010017017 #26 ENSVURG00010017663 ENSVURG00010017671 #27 YTHDF1 (ENSVURG00010017681) #28 BHLHE23 (ENSVURG00010017694) #29 SLC17A9 (ENSVURG00010017698) #30 GID8 (ENSVURG00010017708) #31 ENSVURG00010017716 #32 ENSVURG00010017730 #33 ENSVURG00010017735 #35 MRGBP (ENSVURG00010017741) #36 NTSR1 (ENSVURG00010017743) #37 koala MODERN SPECIES 11 ZBTB46 (ENSPCIG00000017919) #9 SLC2A4RG (ENSPCIG00000017920) #10 ENSPCIG00000017921 #11 ZGPAT (ENSPCIG00000017922) #12 ARFRP1 (ENSPCIG00000017923) #13 TNFRSF6B (ENSPCIG00000017924) RTEL1 (ENSPCIG00000017939) #14 STMN3 (ENSPCIG00000017964) #15 GMEB2 (ENSPCIG00000017965) #16 HELZ2 (ENSPCIG00000017966) #17 ENSPCIG00000017969 FNDC11 (ENSPCIG00000017970) #18 SRMS (ENSPCIG00000017972) #19 PTK6 (ENSPCIG00000017976) #20 ENSPCIG00000032699 ##21 EEF1A2 (ENSPCIG00000017980) #22 KCNQ2 (ENSPCIG00000017983) #23 CHRNA4 (ENSPCIG00000017131) #24 ENSPCIG00000017140 ENSPCIG00000034787 ARFGAP1 (ENSPCIG00000017160) #26 ENSPCIG00000017165 ENSPCIG00000017168 #27 YTHDF1 (ENSPCIG00000017170) #28 BHLHE23 (ENSPCIG00000017180) #29 SLC17A9 (ENSPCIG00000017181) #30 GID8 (ENSPCIG00000017182) #31 ENSPCIG00000017185 #32 ENSPCIG00000036461 #32 ENSPCIG00000017186 #33 ENSPCIG00000037454 #33 Platypus MODERN SPECIES 19 PRPF6 (ENSOANG00000004920) ENSOANG00000004919 ENSOANG00000042451 ENSOANG00000047371 ENSOANG00000004918 RGS19 (ENSOANG00000050487) ENSOANG00000046150 OPRL1 (ENSOANG00000050101) NPBWR2 (ENSOANG00000004915) MYT1 (ENSOANG00000004914) PCMTD2 (ENSOANG00000004913) ENSOANG00000037370 SRMS (ENSOANG00000004911) #19 PTK6 (ENSOANG00000004910) #20 ENSOANG00000004909 ##21 EEF1A2 (ENSOANG00000038015) #22 KCNQ2 (ENSOANG00000003731) #23 CHRNA4 (ENSOANG00000003725) #24 ENSOANG00000003728 ENSOANG00000003727 ARFGAP1 (ENSOANG00000045856) #26 ENSOANG00000003724 ENSOANG00000031992 #27 YTHDF1 (ENSOANG00000003723) #28 SLC17A9 (ENSOANG00000004970) #30 GID8 (ENSOANG00000004972) #31 ENSOANG00000004973 #32 TCFL5 (ENSOANG00000004974) #33 ENSOANG00000051322 #34 ENSOANG00000004976 #35 MRGBP (ENSOANG00000050356) #36 Sauria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000164164 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000180601 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 tuatara MODERN SPECIES 805 OPRL1 (ENSSPUG00000000599) NPBWR2 (ENSSPUG00000000644) MYT1 (ENSSPUG00000000654) PCMTD2 (ENSSPUG00000000681) ENSSPUG00000000708 SRMS (ENSSPUG00000000737) #19 PTK6 (ENSSPUG00000000750) #20 ENSSPUG00000000776 ##21 EEF1A2 (ENSSPUG00000000783) #22 KCNQ2 (ENSSPUG00000000830) #23 CHRNA4 (ENSSPUG00000000850) #24 EFL1 (ENSSPUG00000000941) SAXO2 (ENSSPUG00000000969) ADAMTSL3 (ENSSPUG00000001001) ENSSPUG00000001056 SH3GL3 (ENSSPUG00000001116) BNC1 (ENSSPUG00000001128) HDGFL3 (ENSSPUG00000001149) ENSSPUG00000001162 TM6SF1 (ENSSPUG00000001175) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Laterata ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Common wall lizard MODERN SPECIES 14 PRPF6 (ENSPMRG00000004268) ENSPMRG00000004262 ENSPMRG00000004257 ENSPMRG00000004254 TCEA2 (ENSPMRG00000004237) RGS19 (ENSPMRG00000004212) ENSPMRG00000004201 OPRL1 (ENSPMRG00000004194) NPBWR2 (ENSPMRG00000004187) MYT1 (ENSPMRG00000004106) PCMTD2 (ENSPMRG00000004087) ENSPMRG00000004043 SRMS (ENSPMRG00000004031) #19 PTK6 (ENSPMRG00000004016) #20 ENSPMRG00000004009 ##21 EEF1A2 (ENSPMRG00000003996) #22 KCNQ2 (ENSPMRG00000003976) #23 CHRNA4 (ENSPMRG00000003969) #24 ENSPMRG00000003893 ENSPMRG00000003882 ARFGAP1 (ENSPMRG00000003874) #26 ENSPMRG00000003868 BIRC7 (ENSPMRG00000003861) #27 YTHDF1 (ENSPMRG00000003853) #28 ENSPMRG00000003847 ENSPMRG00000004755 BHLHE23 (ENSPMRG00000004753) #29 SLC17A9 (ENSPMRG00000004747) #30 GID8 (ENSPMRG00000004738) #31 DIDO1 (ENSPMRG00000004709) #32 TCFL5 (ENSPMRG00000004692) #33 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 49 MYT1 (ENSSMRG00000013968) PCMTD2 (ENSSMRG00000013967) ENSSMRG00000013965 SRMS (ENSSMRG00000013964) #19 PTK6 (ENSSMRG00000013958) #20 ENSSMRG00000013957 ##21 EEF1A2 (ENSSMRG00000013956) #22 KCNQ2 (ENSSMRG00000012710) #23 CHRNA4 (ENSSMRG00000012709) #24 ENSSMRG00000012696 ENSSMRG00000012695 ENSSMRG00000012694 NKAIN4 (ENSSMRG00000012686) BIRC7 (ENSSMRG00000012684) #27 YTHDF1 (ENSSMRG00000012683) #28 BHLHE23 (ENSSMRG00000012675) #29 ENSSMRG00000012673 SLC17A9 (ENSSMRG00000012672) #30 GID8 (ENSSMRG00000012671) #31 DIDO1 (ENSSMRG00000012669) #32 ENSSMRG00000012668 #33 ENSSMRG00000012667 #33 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Lizard MODERN SPECIES 3 PRPF6 (ENSACAG00000006464) ENSACAG00000006457 sox18 (ENSACAG00000035255) ENSACAG00000006351 RGS19 (ENSACAG00000006332) ENSACAG00000040691 OPRL1 (ENSACAG00000043781) NPBWR2 (ENSACAG00000006302) ENSACAG00000043016 MYT1 (ENSACAG00000006249) PCMTD2 (ENSACAG00000035696) ENSACAG00000006172 SRMS (ENSACAG00000024839) #19 PTK6 (ENSACAG00000006031) #20 ENSACAG00000006027 ##21 EEF1A2 (ENSACAG00000006007) #22 ENSACAG00000035831 KCNQ2 (ENSACAG00000005872) #23 ENSACAG00000038200 CHRNA4 (ENSACAG00000005817) #24 ENSACAG00000005710 ENSACAG00000005686 ARFGAP1 (ENSACAG00000042571) #26 ENSACAG00000040279 NKAIN4 (ENSACAG00000026860) BIRC7 (ENSACAG00000043634) #27 YTHDF1 (ENSACAG00000005560) #28 ENSACAG00000044252 ENSACAG00000042736 SLC17A9 (ENSACAG00000005516) #30 GID8 (ENSACAG00000005506) #31 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974.k ENSGT00940000159974.l ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Indian cobra MODERN SPECIES 2 ENSNNAG00000002511 ENSNNAG00000002520 ENSNNAG00000002529 ENSNNAG00000002537 ENSNNAG00000002547 OPRL1 (ENSNNAG00000002555) ENSNNAG00000002565 MYT1 (ENSNNAG00000002575) PCMTD2 (ENSNNAG00000002597) ENSNNAG00000002642 ENSNNAG00000002899 ENSNNAG00000002923 SRMS (ENSNNAG00000002930) #19 PTK6 (ENSNNAG00000002945) #20 ENSNNAG00000002955 ##21 EEF1A2 (ENSNNAG00000002963) #22 KCNQ2 (ENSNNAG00000002988) #23 CHRNA4 (ENSNNAG00000003075) #24 ENSNNAG00000003092 ENSNNAG00000003135 ARFGAP1 (ENSNNAG00000003264) #26 BIRC7 (ENSNNAG00000003288) #27 YTHDF1 (ENSNNAG00000003299) #28 BHLHE23 (ENSNNAG00000003313) #29 SLC17A9 (ENSNNAG00000000826) #30 GID8 (ENSNNAG00000000846) #31 DIDO1 (ENSNNAG00000000882) #32 TCFL5 (ENSNNAG00000000936) #33 OGFR (ENSNNAG00000000952) #35 NTSR1 (ENSNNAG00000000967) #37 SLCO4A1 (ENSNNAG00000000979) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974.k ENSGT00940000159974.l ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 9945 EEF1A2 (ENSLLTG00000015220) #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974.k ENSGT00940000159974.l ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 421 SRMS (ENSNSUG00000008161) #19 PTK6 (ENSNSUG00000008158) #20 ENSNSUG00000008157 ##21 EEF1A2 (ENSNSUG00000008155) #22 KCNQ2 (ENSNSUG00000008140) #23 Eastern brown snake MODERN SPECIES 8 ENSPTXG00000013136 ENSPTXG00000013137 ENSPTXG00000013139 ENSPTXG00000013140 RGS19 (ENSPTXG00000013142) OPRL1 (ENSPTXG00000013144) ENSPTXG00000013153 NPBWR2 (ENSPTXG00000013154) ENSPTXG00000013155 MYT1 (ENSPTXG00000013156) PCMTD2 (ENSPTXG00000013158) ENSPTXG00000013163 SRMS (ENSPTXG00000013172) #19 PTK6 (ENSPTXG00000013175) #20 ENSPTXG00000013180 ##21 EEF1A2 (ENSPTXG00000013181) #22 KCNQ2 (ENSPTXG00000013185) #23 ENSPTXG00000013188 CHRNA4 (ENSPTXG00000013189) #24 ENSPTXG00000013190 ENSPTXG00000013191 ARFGAP1 (ENSPTXG00000013192) #26 ENSPTXG00000013193 BIRC7 (ENSPTXG00000013194) #27 YTHDF1 (ENSPTXG00000013195) #28 BHLHE23 (ENSPTXG00000013197) #29 SLC17A9 (ENSPTXG00000013198) #30 GID8 (ENSPTXG00000013206) #31 DIDO1 (ENSPTXG00000013207) #32 TCFL5 (ENSPTXG00000013209) #33 OGFR (ENSPTXG00000013210) #35 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 59 ZNF512B (ENSCPRG00005006071) SAMD10 (ENSCPRG00005006062) PRPF6 (ENSCPRG00005006052) SOX18 (ENSCPRG00005006047) TCEA2 (ENSCPRG00005006035) RGS19 (ENSCPRG00005006030) LKAAEAR1 (ENSCPRG00005006028) OPRL1 (ENSCPRG00005006014) NPBWR2 (ENSCPRG00005006011) MYT1 (ENSCPRG00005005983) PCMTD2 (ENSCPRG00005005973) ENSCPRG00005005964 SRMS (ENSCPRG00005005952) #19 PTK6 (ENSCPRG00005005947) #20 ENSCPRG00005005916 ##21 EEF1A2 (ENSCPRG00005005907) #22 KCNQ2 (ENSCPRG00005005896) #23 CHRNA4 (ENSCPRG00005005873) #24 ENSCPRG00005005854 ENSCPRG00005005795 ENSCPRG00005005780 ENSCPRG00005005771 YTHDF1 (ENSCPRG00005005766) #28 SLC17A9 (ENSCPRG00005005743) #30 GID8 (ENSCPRG00005005740) #31 DIDO1 (ENSCPRG00005005723) #32 TCFL5 (ENSCPRG00005005722) #33 ENSCPRG00005005699 #36 NTSR1 (ENSCPRG00005005694) #37 ENSCPRG00005005684 SLCO4A1 (ENSCPRG00005005674) Aves ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 African ostrich MODERN SPECIES 150 TPD52L2 (ENSSCUG00000002860) #7 UCKL1 (ENSSCUG00000002855) ZNF512B (ENSSCUG00000002848) PRPF6 (ENSSCUG00000002847) ENSSCUG00000002845 SOX18 (ENSSCUG00000002844) TCEA2 (ENSSCUG00000002842) OPRL1 (ENSSCUG00000002839) NPBWR2 (ENSSCUG00000002838) MYT1 (ENSSCUG00000002835) ENSSCUG00000002834 SRMS (ENSSCUG00000002831) #19 EEF1A2 (ENSSCUG00000002827) #22 KCNQ2 (ENSSCUG00000002825) #23 CHRNA4 (ENSSCUG00000002822) #24 ENSSCUG00000002818 ENSSCUG00000002816 ENSSCUG00000002814 ENSSCUG00000002812 BIRC7 (ENSSCUG00000002807) #27 YTHDF1 (ENSSCUG00000002804) #28 SLC17A9 (ENSSCUG00000002797) #30 GID8 (ENSSCUG00000002796) #31 ENSSCUG00000002794 #32 ENSSCUG00000002793 #32 TCFL5 (ENSSCUG00000002792) #33 OGFR (ENSSCUG00000002790) #35 ENSSCUG00000002789 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155597 ENSGT00960000187367 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Great tit MODERN SPECIES 12 ENSPMJG00000007152 UCKL1 (ENSPMJG00000007157) ZNF512B (ENSPMJG00000007165) SAMD10 (ENSPMJG00000007166) PRPF6 (ENSPMJG00000007168) ENSPMJG00000007169 SOX18 (ENSPMJG00000007194) TCEA2 (ENSPMJG00000007198) RGS19 (ENSPMJG00000007203) OPRL1 (ENSPMJG00000007207) NPBWR2 (ENSPMJG00000007212) MYT1 (ENSPMJG00000007233) ENSPMJG00000007240 SRMS (ENSPMJG00000007243) #19 ENSPMJG00000007245 ##21 EEF1A2 (ENSPMJG00000007257) #22 KCNQ2 (ENSPMJG00000007262) #23 CHRNA4 (ENSPMJG00000007280) #24 ENSPMJG00000007283 ENSPMJG00000007294 ARFGAP1 (ENSPMJG00000007302) #26 NKAIN4 (ENSPMJG00000007318) BIRC7 (ENSPMJG00000007326) #27 YTHDF1 (ENSPMJG00000007329) #28 BHLHE23 (ENSPMJG00000007353) #29 SLC17A9 (ENSPMJG00000007357) #30 GID8 (ENSPMJG00000007358) #31 DIDO1 (ENSPMJG00000007359) #32 TCFL5 (ENSPMJG00000007361) #33 OGFR (ENSPMJG00000007365) #35 MRGBP (ENSPMJG00000007370) #36 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Flycatcher MODERN SPECIES 12 ZNF512B (ENSFALG00000005991) SAMD10 (ENSFALG00000024236) ENSFALG00000010326 ENSFALG00000027805 SOX18 (ENSFALG00000010339) ENSFALG00000024638 TCEA2 (ENSFALG00000010343) RGS19 (ENSFALG00000010348) OPRL1 (ENSFALG00000010352) NPBWR2 (ENSFALG00000014956) MYT1 (ENSFALG00000010354) ENSFALG00000010359 ENSFALG00000010362 SRMS (ENSFALG00000010370) #19 ENSFALG00000028509 ##21 EEF1A2 (ENSFALG00000010382) #22 KCNQ2 (ENSFALG00000010396) #23 CHRNA4 (ENSFALG00000010418) #24 ENSFALG00000010438 ENSFALG00000010451 ARFGAP1 (ENSFALG00000026353) #26 NKAIN4 (ENSFALG00000010455) BIRC7 (ENSFALG00000010458) #27 YTHDF1 (ENSFALG00000010463) #28 BHLHE23 (ENSFALG00000010468) #29 SLC17A9 (ENSFALG00000010473) #30 GID8 (ENSFALG00000010483) #31 DIDO1 (ENSFALG00000010488) #32 TCFL5 (ENSFALG00000024225) #33 ENSFALG00000010500 #34 OGFR (ENSFALG00000025576) #35 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Medium ground finch MODERN SPECIES 40 UCKL1 (ENSGFOG00000000466) ZNF512B (ENSGFOG00000000399) SAMD10 (ENSGFOG00000000386) PRPF6 (ENSGFOG00000000357) ENSGFOG00000000341 SOX18 (ENSGFOG00000000332) TCEA2 (ENSGFOG00000000324) RGS19 (ENSGFOG00000011257) OPRL1 (ENSGFOG00000011255) NPBWR2 (ENSGFOG00000011252) MYT1 (ENSGFOG00000011242) PCMTD2 (ENSGFOG00000011236) ENSGFOG00000011225 SRMS (ENSGFOG00000011218) #19 ENSGFOG00000011211 ##21 EEF1A2 (ENSGFOG00000011206) #22 KCNQ2 (ENSGFOG00000010012) #23 CHRNA4 (ENSGFOG00000009966) #24 ENSGFOG00000009897 ENSGFOG00000009879 ARFGAP1 (ENSGFOG00000009862) #26 NKAIN4 (ENSGFOG00000009843) BIRC7 (ENSGFOG00000009835) #27 YTHDF1 (ENSGFOG00000009828) #28 SLC17A9 (ENSGFOG00000009808) #30 GID8 (ENSGFOG00000009803) #31 DIDO1 (ENSGFOG00000009796) #32 TCFL5 (ENSGFOG00000009771) #33 ENSGFOG00000009753 #34 OGFR (ENSGFOG00000009747) #35 MRGBP (ENSGFOG00000009739) #36 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 ENSGT00390000018730.A #35 Common canary MODERN SPECIES 21 UCKL1 (ENSSCAG00000014498) ZNF512B (ENSSCAG00000014507) SAMD10 (ENSSCAG00000014512) PRPF6 (ENSSCAG00000014517) ENSSCAG00000014527 ENSSCAG00000014539 TCEA2 (ENSSCAG00000014543) RGS19 (ENSSCAG00000014553) OPRL1 (ENSSCAG00000014557) NPBWR2 (ENSSCAG00000014560) MYT1 (ENSSCAG00000014565) PCMTD2 (ENSSCAG00000014584) ENSSCAG00000014590 SRMS (ENSSCAG00000014600) #19 ENSSCAG00000014605 ##21 EEF1A2 (ENSSCAG00000014611) #22 KCNQ2 (ENSSCAG00000014634) #23 CHRNA4 (ENSSCAG00000014702) #24 ENSSCAG00000014712 ENSSCAG00000014739 ARFGAP1 (ENSSCAG00000014752) #26 NKAIN4 (ENSSCAG00000014769) BIRC7 (ENSSCAG00000014776) #27 YTHDF1 (ENSSCAG00000014786) #28 BHLHE23 (ENSSCAG00000014796) #29 SLC17A9 (ENSSCAG00000014804) #30 GID8 (ENSSCAG00000014826) #31 DIDO1 (ENSSCAG00000014834) #32 TCFL5 (ENSSCAG00000014842) #33 OGFR (ENSSCAG00000014846) #35 MRGBP (ENSSCAG00000014854) #36 Zebra finch MODERN SPECIES 13 ENSTGUG00000020393 ZNF512B (ENSTGUG00000007184) SAMD10 (ENSTGUG00000020790) PRPF6 (ENSTGUG00000007221) ENSTGUG00000022947 SOX18 (ENSTGUG00000007265) TCEA2 (ENSTGUG00000007270) RGS19 (ENSTGUG00000027981) OPRL1 (ENSTGUG00000026051) NPBWR2 (ENSTGUG00000007312) ENSTGUG00000023865 MYT1 (ENSTGUG00000007315) ENSTGUG00000007380 SRMS (ENSTGUG00000007405) #19 ENSTGUG00000007418 ##21 EEF1A2 (ENSTGUG00000007419) #22 ENSTGUG00000021626 KCNQ2 (ENSTGUG00000007434) #23 CHRNA4 (ENSTGUG00000007453) #24 ENSTGUG00000007458 ENSTGUG00000007511 ARFGAP1 (ENSTGUG00000007518) #26 NKAIN4 (ENSTGUG00000007547) BIRC7 (ENSTGUG00000007560) #27 YTHDF1 (ENSTGUG00000007565) #28 BHLHE23 (ENSTGUG00000007576) #29 SLC17A9 (ENSTGUG00000007577) #30 GID8 (ENSTGUG00000027933) #31 DIDO1 (ENSTGUG00000007595) #32 TCFL5 (ENSTGUG00000022221) #33 COL9A3 (ENSTGUG00000007624) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Kakapo MODERN SPECIES 5 PRPF6 (ENSSHBG00005012448) ENSSHBG00005012426 SOX18 (ENSSHBG00005012412) TCEA2 (ENSSHBG00005012396) RGS19 (ENSSHBG00005012387) OPRL1 (ENSSHBG00005012373) NPBWR2 (ENSSHBG00005012364) MYT1 (ENSSHBG00005012341) ENSSHBG00005012318 PCMTD2 (ENSSHBG00005012304) ENSSHBG00005012288 ENSSHBG00005012265 ENSSHBG00005012225 SRMS (ENSSHBG00005012187) #19 ENSSHBG00005012166 ##21 EEF1A2 (ENSSHBG00005012141) #22 KCNQ2 (ENSSHBG00005012054) #23 CHRNA4 (ENSSHBG00005012009) #24 ENSSHBG00005011166 ENSSHBG00005010860 ARFGAP1 (ENSSHBG00005010826) #26 ENSSHBG00005010765 BIRC7 (ENSSHBG00005010714) #27 YTHDF1 (ENSSHBG00005010688) #28 BHLHE23 (ENSSHBG00005010567) #29 SLC17A9 (ENSSHBG00005010502) #30 GID8 (ENSSHBG00005000701) #31 DIDO1 (ENSSHBG00005017886) #32 ENSSHBG00005017876 #33 ENSSHBG00005017865 #33 OGFR (ENSSHBG00005017855) #35 Golden eagle MODERN SPECIES 19 ZNF512B (ENSACCG00020001208) SAMD10 (ENSACCG00020001232) PRPF6 (ENSACCG00020001251) ENSACCG00020001276 ENSACCG00020001285 SOX18 (ENSACCG00020001300) TCEA2 (ENSACCG00020001314) RGS19 (ENSACCG00020001333) OPRL1 (ENSACCG00020001346) NPBWR2 (ENSACCG00020001357) MYT1 (ENSACCG00020001386) PCMTD2 (ENSACCG00020001449) ENSACCG00020001479 SRMS (ENSACCG00020001497) #19 ENSACCG00020001516 ##21 EEF1A2 (ENSACCG00020001531) #22 KCNQ2 (ENSACCG00020001545) #23 CHRNA4 (ENSACCG00020001562) #24 COL20A1 (ENSACCG00020001583) #25 ENSACCG00020001634 ARFGAP1 (ENSACCG00020001667) #26 NKAIN4 (ENSACCG00020001746) ENSACCG00020001773 YTHDF1 (ENSACCG00020001782) #28 BHLHE23 (ENSACCG00020001799) #29 SLC17A9 (ENSACCG00020001822) #30 GID8 (ENSACCG00020001847) #31 DIDO1 (ENSACCG00020001862) #32 TCFL5 (ENSACCG00020001900) #33 OGFR (ENSACCG00020001936) #35 MRGBP (ENSACCG00020001964) #36 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155597 ENSGT00960000187367 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 Japanese quail MODERN SPECIES 12 UCKL1 (ENSCJPG00005004001) ZNF512B (ENSCJPG00005003739) SAMD10 (ENSCJPG00005003738) PRPF6 (ENSCJPG00005003735) ENSCJPG00005003720 SOX18 (ENSCJPG00005003719) TCEA2 (ENSCJPG00005003707) RGS19 (ENSCJPG00005003701) OPRL1 (ENSCJPG00005003692) NPBWR2 (ENSCJPG00005003691) MYT1 (ENSCJPG00005003679) PCMTD2 (ENSCJPG00005003675) ENSCJPG00005003227 SRMS (ENSCJPG00005003222) #19 ENSCJPG00005003220 ##21 EEF1A2 (ENSCJPG00005003152) #22 ENSCJPG00005003150 KCNQ2 (ENSCJPG00005003135) #23 CHRNA4 (ENSCJPG00005003134) #24 COL20A1 (ENSCJPG00005003131) #25 ENSCJPG00005003130 ARFGAP1 (ENSCJPG00005003128) #26 NKAIN4 (ENSCJPG00005003127) BIRC7 (ENSCJPG00005003125) #27 YTHDF1 (ENSCJPG00005003123) #28 BHLHB4 (ENSCJPG00005003114) #29 SLC17A9 (ENSCJPG00005003112) #30 GID8 (ENSCJPG00005003111) #31 DIDO1 (ENSCJPG00005003105) #32 TCFL5 (ENSCJPG00005003103) #33 ENSCJPG00005003099 #34 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00960000187367 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000163687 Turkey MODERN SPECIES 14 ENSMGAG00000005862 #35 DIDO1 (ENSMGAG00000006090) #32 ENSMGAG00000006105 #31 ENSMGAG00000006123 #30 ENSMGAG00000018427 #30 ENSMGAG00000006134 #29 YTHDF1 (ENSMGAG00000006139) #28 ENSMGAG00000006181 ENSMGAG00000006164 #27 ARFGAP1 (ENSMGAG00000021728) #26 ENSMGAG00000006200 #26 ENSMGAG00000006260 ENSMGAG00000006241 ENSMGAG00000006295 #24 ENSMGAG00000006326 #23 ENSMGAG00000006400 #22 ENSMGAG00000006490 ENSMGAG00000006462 #19 ENSMGAG00000006439 ##21 PCMTD2 (ENSMGAG00000022774) ENSMGAG00000017792 ENSMGAG00000006569 ENSMGAG00000017542 ENSMGAG00000015542 ENSMGAG00000006627 ENSMGAG00000006663 ENSMGAG00000019718 ENSMGAG00000015543 ENSMGAG00000006634 ENSMGAG00000006712 ENSMGAG00000006724 Chicken MODERN SPECIES 12 ZNF512B (ENSGALG00010022578) ENSGALG00010024784 SAMD10 (ENSGALG00010022560) PRPF6 (ENSGALG00010022553) ENSGALG00010024999 ENSGALG00010022527 SOX18 (ENSGALG00010022524) TCEA2 (ENSGALG00010023328) RGS19 (ENSGALG00010023287) OPRL1 (ENSGALG00010023269) NPBWR2 (ENSGALG00010023256) MYT1 (ENSGALG00010023242) ENSGALG00010023230 PTK6 (ENSGALG00010023198) #19 PPDPF (ENSGALG00010023193) ##21 EEF1A2 (ENSGALG00010023180) #22 KCNQ2 (ENSGALG00010023174) #23 CHRNA4 (ENSGALG00010023162) #24 COL20A1 (ENSGALG00010023125) #25 DEPTOR (ENSGALG00010023069) ARFGAP1 (ENSGALG00010023048) #26 NKAIN4 (ENSGALG00010024194) BIRC7 (ENSGALG00010024168) #27 YTHDF1 (ENSGALG00010024141) #28 BHLHE23 (ENSGALG00010024982) #29 SLC17A9 (ENSGALG00010021754) #30 GID8 (ENSGALG00010024129) #31 DIDO1 (ENSGALG00010024124) #32 TCFL5 (ENSGALG00010022356) #33 COL9A3 (ENSGALG00010022320) OGFR (ENSGALG00010022308) #35 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155597 ENSGT00960000187367 ENSGT01020000230412.B.b.a ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Duck MODERN SPECIES 12 DPM1 (ENSAPLG00000007501) KCNG1 (ENSAPLG00000007454) NFATC2 (ENSAPLG00000007259) ATP9A (ENSAPLG00000006598) ENSAPLG00000028344 PRPF6 (ENSAPLG00000015219) TCEA2 (ENSAPLG00000010208) RGS19 (ENSAPLG00000006136) OPRL1 (ENSAPLG00000026067) NPBWR2 (ENSAPLG00000011667) MYT1 (ENSAPLG00000007386) PCMTD2 (ENSAPLG00000007753) ENSAPLG00000007917 SRMS (ENSAPLG00000008178) #19 ENSAPLG00000020848 EEF1A2 (ENSAPLG00000008691) #22 KCNQ2 (ENSAPLG00000008262) #23 CHRNA4 (ENSAPLG00000007776) #24 BIRC7 (ENSAPLG00000006107) #27 ENSAPLG00000007141 ENSAPLG00000006994 ARFGAP1 (ENSAPLG00000006416) #26 NKAIN4 (ENSAPLG00000006143) YTHDF1 (ENSAPLG00000005985) #28 SLC17A9 (ENSAPLG00000005312) #30 GID8 (ENSAPLG00000005405) #31 ENSAPLG00000028484 #32 ENSAPLG00000003283 #33 ENSAPLG00000016892 #33 ENSAPLG00000003290 #34 OGFR (ENSAPLG00000028652) #35 Pink-footed goose MODERN SPECIES 10 UCKL1 (ENSABRG00000006666) ZNF512B (ENSABRG00000006609) SAMD10 (ENSABRG00000006601) PRPF6 (ENSABRG00000006592) ENSABRG00000006575 SOX18 (ENSABRG00000006568) TCEA2 (ENSABRG00000006563) RGS19 (ENSABRG00000006556) OPRL1 (ENSABRG00000006548) NPBWR2 (ENSABRG00000006540) MYT1 (ENSABRG00000006421) PCMTD2 (ENSABRG00000006404) ENSABRG00000006385 SRMS (ENSABRG00000006372) #19 ENSABRG00000006359 ##21 EEF1A2 (ENSABRG00000006342) #22 KCNQ2 (ENSABRG00000006307) #23 CHRNA4 (ENSABRG00000006273) #24 COL20A1 (ENSABRG00000006131) #25 ENSABRG00000006106 ARFGAP1 (ENSABRG00000006095) #26 NKAIN4 (ENSABRG00000006089) BIRC7 (ENSABRG00000006077) #27 YTHDF1 (ENSABRG00000006064) #28 ENSABRG00000006061 ENSABRG00000006034 BHLHE23 (ENSABRG00000006028) #29 SLC17A9 (ENSABRG00000005983) #30 GID8 (ENSABRG00000005950) #31 DIDO1 (ENSABRG00000005803) #32 TCFL5 (ENSABRG00000005756) #33 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000163709 #25 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 Chinese turtle MODERN SPECIES 1798 PRPF6 (ENSPSIG00000007717) SOX18 (ENSPSIG00000009637) TCEA2 (ENSPSIG00000009776) RGS19 (ENSPSIG00000010046) LKAAEAR1 (ENSPSIG00000010229) OPRL1 (ENSPSIG00000010249) ENSPSIG00000000774 NPBWR2 (ENSPSIG00000000787) MYT1 (ENSPSIG00000010265) PCMTD2 (ENSPSIG00000010774) ENSPSIG00000010957 ENSPSIG00000011000 SRMS (ENSPSIG00000011019) #19 PTK6 (ENSPSIG00000011122) #20 ENSPSIG00000011465 ##21 EEF1A2 (ENSPSIG00000011654) #22 KCNQ2 (ENSPSIG00000011876) #23 CHRNA4 (ENSPSIG00000012045) #24 ENSPSIG00000012392 ENSPSIG00000012399 #25 ENSPSIG00000012497 ENSPSIG00000012555 ARFGAP1 (ENSPSIG00000012829) #26 NKAIN4 (ENSPSIG00000012841) BIRC7 (ENSPSIG00000012902) #27 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218.u #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218.u #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000164405.f ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 60 SAMD10 (ENSTMTG00000001056) ENSTMTG00000001064 PRPF6 (ENSTMTG00000001076) SOX18 (ENSTMTG00000001101) TCEA2 (ENSTMTG00000001108) RGS19 (ENSTMTG00000001128) LKAAEAR1 (ENSTMTG00000001139) OPRL1 (ENSTMTG00000001150) NPBWR2 (ENSTMTG00000001158) MYT1 (ENSTMTG00000001169) PCMTD2 (ENSTMTG00000001197) ENSTMTG00000001234 SRMS (ENSTMTG00000001362) #19 PTK6 (ENSTMTG00000001373) #20 ENSTMTG00000001392 ##21 EEF1A2 (ENSTMTG00000001400) #22 KCNQ2 (ENSTMTG00000001413) #23 CHRNA4 (ENSTMTG00000001423) #24 ENSTMTG00000001442 ENSTMTG00000001502 ARFGAP1 (ENSTMTG00000001592) #26 ENSTMTG00000001608 BIRC7 (ENSTMTG00000001619) #27 YTHDF1 (ENSTMTG00000001634) #28 BHLHE23 (ENSTMTG00000001651) #29 ENSTMTG00000001654 SLC17A9 (ENSTMTG00000001662) #30 GID8 (ENSTMTG00000001679) #31 DIDO1 (ENSTMTG00000001693) #32 TCFL5 (ENSTMTG00000001714) #33 OGFR (ENSTMTG00000001726) #35 painted turtle MODERN SPECIES 2365 MYT1 (ENSCPBG00000027220) PCMTD2 (ENSCPBG00000027219) ENSCPBG00000027217 SRMS (ENSCPBG00000027211) #19 PTK6 (ENSCPBG00000027206) #20 ENSCPBG00000027204 ##21 EEF1A2 (ENSCPBG00000027203) #22 KCNQ2 (ENSCPBG00000027200) #23 CHRNA4 (ENSCPBG00000027193) #24 ENSCPBG00000027192 ENSCPBG00000027191 ARFGAP1 (ENSCPBG00000027189) #26 ENSCPBG00000027188 BIRC7 (ENSCPBG00000027185) #27 YTHDF1 (ENSCPBG00000027183) #28 BHLHE23 (ENSCPBG00000027173) #29 ENSCPBG00000027172 SLC17A9 (ENSCPBG00000027170) #30 GID8 (ENSCPBG00000027168) #31 DIDO1 (ENSCPBG00000027166) #32 TCFL5 (ENSCPBG00000027164) #33 ENSCPBG00000027162 #34 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000166123 ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218.u #20 ENSGT00390000009113.b ##21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406 #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00390000007823 #36 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 5 SAMD10 (ENSGEVG00005005054) PRPF6 (ENSGEVG00005005088) SOX18 (ENSGEVG00005005139) TCEA2 (ENSGEVG00005005154) RGS19 (ENSGEVG00005005183) LKAAEAR1 (ENSGEVG00005005201) OPRL1 (ENSGEVG00005005218) NPBWR2 (ENSGEVG00005005239) MYT1 (ENSGEVG00005005285) PCMTD2 (ENSGEVG00005005405) ENSGEVG00005005458 SRMS (ENSGEVG00005005595) #19 ENSGEVG00005005620 #20 ENSGEVG00005005649 #20 ENSGEVG00005005682 ##21 EEF1A2 (ENSGEVG00005005714) #22 KCNQ2 (ENSGEVG00005005845) #23 CHRNA4 (ENSGEVG00005006100) #24 ENSGEVG00005006138 ENSGEVG00005006261 ARFGAP1 (ENSGEVG00005006291) #26 ENSGEVG00005006342 BIRC7 (ENSGEVG00005006406) #27 YTHDF1 (ENSGEVG00005006447) #28 BHLHE23 (ENSGEVG00005006472) #29 SLC17A9 (ENSGEVG00005006485) #30 GID8 (ENSGEVG00005006543) #31 DIDO1 (ENSGEVG00005006576) #32 TCFL5 (ENSGEVG00005006612) #33 OGFR (ENSGEVG00005006667) #35 MRGBP (ENSGEVG00005006691) #36 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2561 ZNF512B (ENSCABG00000000832) SAMD10 (ENSCABG00000000842) PRPF6 (ENSCABG00000000848) SOX18 (ENSCABG00000000851) TCEA2 (ENSCABG00000000852) RGS19 (ENSCABG00000000856) LKAAEAR1 (ENSCABG00000000858) OPRL1 (ENSCABG00000000859) NPBWR2 (ENSCABG00000000861) MYT1 (ENSCABG00000000863) PCMTD2 (ENSCABG00000000883) ENSCABG00000000885 SRMS (ENSCABG00000000899) #19 PTK6 (ENSCABG00000000966) #20 ENSCABG00000000978 ##21 EEF1A2 (ENSCABG00000000982) #22 KCNQ2 (ENSCABG00000000995) #23 CHRNA4 (ENSCABG00000001062) #24 COL20A1 (ENSCABG00000001068) #25 ENSCABG00000001081 ARFGAP1 (ENSCABG00000001178) #26 ENSCABG00000001183 ENSCABG00000001187 YTHDF1 (ENSCABG00000001188) #28 BHLHE23 (ENSCABG00000001192) #29 SLC17A9 (ENSCABG00000001196) #30 GID8 (ENSCABG00000001197) #31 DIDO1 (ENSCABG00000001201) #32 TCFL5 (ENSCABG00000001205) #33 Anura ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159165 ENSGT00390000008161.a.a ENSGT00550000075016 ENSGT00950000182844.a.a ENSGT00940000162709 ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391 ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127 ENSGT00940000156364 ENSGT00950000183032.A.b.b.b ENSGT00940000161518 #19 ENSGT00940000161218 #20 ENSGT00390000009113 #21 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000160093 #23 ENSGT00940000159329 #24 ENSGT00940000153769.G ENSGT00940000164411 ENSGT00890000139515 #26 ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000160406.a #27 ENSGT00940000156911 #28 ENSGT00940000162992 #29 ENSGT00940000158186 #30 ENSGT00390000015162 #31 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 110 ENSLLEG00000026058 #22 Frog MODERN SPECIES 1 ENSXETG00000043999 myt1 (ENSXETG00000011499) ENSXETG00000048889 ENSXETG00000047434 ENSXETG00000031730 ENSXETG00000032059 pcmtd2 (ENSXETG00000048911) ENSXETG00000033189 ENSXETG00000037128 ENSXETG00000039818 #19 ENSXETG00000044110 ENSXETG00000046154 ptk6 (ENSXETG00000031017) #20 ppdpf (ENSXETG00000041601) #21 ENSXETG00000041568 eef1a2 (ENSXETG00000019567) #22 kcnq2 (ENSXETG00000032009) #23 ENSXETG00000049296 chrna4 (ENSXETG00000044956) #24 ENSXETG00000043980 deptorl (ENSXETG00000042520) arfgap1 (ENSXETG00000047116) #26 nkain4 (ENSXETG00000044261) birc7 (ENSXETG00000013316) #27 ythdf1 (ENSXETG00000027086) #28 BHLHE23 (ENSXETG00000048927) #29 slc17a9 (ENSXETG00000041666) #30 gid8 (ENSXETG00000043089) #31 umad1 (ENSXETG00000006106) #32 ENSXETG00000043119 tcfl5 (ENSXETG00000034754) #33 Coelacanth MODERN SPECIES 388 ppdpfb (ENSLACG00000002835) #21 EEF1A2 (ENSLACG00000004296) #22 KCNQ2 (ENSLACG00000005644) #23 CHRNA4 (ENSLACG00000010383) #24 ENSLACG00000011040 ENSLACG00000012267 ARFGAP1 (ENSLACG00000012603) #26 NKAIN4 (ENSLACG00000013142) ENSLACG00000013969 YTHDF1 (ENSLACG00000014195) #28 BHLHE23 (ENSLACG00000016169) #29 SLC17A9 (ENSLACG00000016533) #30 GID8 (ENSLACG00000016647) #31 DIDO1 (ENSLACG00000016718) #32 TCFL5 (ENSLACG00000016963) #33 COL9A3 (ENSLACG00000017042) ENSLACG00000017289 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000154681.b ENSGT00390000013867 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000160318 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00940000156477 ENSGT00940000164502 ENSGT00940000156478 ENSGT00940000161109 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A #35 ENSGT00940000160902 Reedfish MODERN SPECIES 1 mapre1a (ENSECRG00000011238) snai1b (ENSECRG00000011271) samhd1 (ENSECRG00000011287) gss (ENSECRG00000011336) gss (ENSECRG00000011403) myh7ba (ENSECRG00000012925) trpc4apa (ENSECRG00000022886) edem2 (ENSECRG00000022889) ndrg3b (ENSECRG00000022894) PHF20 (ENSECRG00000022905) ENSECRG00000022910 arhgap46a (ENSECRG00000022915) hm13 (ENSECRG00000022921) id1 (ENSECRG00000022925) mrgbp (ENSECRG00000022926) #36 ENSECRG00000022930 #22 sulf2b (ENSECRG00000022932) NCOA3 (ENSECRG00000022933) zgc:113278 (ENSECRG00000022934) prkcbp1l (ENSECRG00000022936) DIDO1 (ENSECRG00000022937) #32 samd10a (ENSECRG00000022940) ENSECRG00000022943 ZNF512B (ENSECRG00000022944) uckl1a (ENSECRG00000022947) ENSECRG00000022950 trim101 (ENSECRG00000022951) dnajc5aa (ENSECRG00000022953) gid8a (ENSECRG00000022955) #31 gfi1ab (ENSECRG00000022957) gfi1ab (ENSECRG00000022963) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b ENSGT00390000013867 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000160318 ENSGT00940000163461.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00950000182872.f.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00940000156477 ENSGT00940000164502 ENSGT00940000156478 ENSGT00940000161109 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00940000154897 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000018730.A.e #35 ENSGT00940000160902 ENSGT00940000158073 ENSGT00390000011620.a.a.b ENSGT00940000156010 ENSGT00940000159695 ENSGT00940000159853 ENSGT00940000157379 Spotted gar MODERN SPECIES 656 ENSLOCG00000018361 snai1b (ENSLOCG00000004443) ENSLOCG00000004427 samhd1 (ENSLOCG00000004382) gss (ENSLOCG00000004359) myh7ba (ENSLOCG00000004315) trpc4apa (ENSLOCG00000004284) edem2 (ENSLOCG00000004263) ndrg3b (ENSLOCG00000004216) sla2b (ENSLOCG00000004198) phf20b (ENSLOCG00000004172) arhgap46a (ENSLOCG00000004130) hm13 (ENSLOCG00000004095) id1 (ENSLOCG00000004086) mrgbp (ENSLOCG00000004057) #36 eef1a2 (ENSLOCG00000004048) #22 sulf2b (ENSLOCG00000004015) NCOA3 (ENSLOCG00000003989) zgc:113278 (ENSLOCG00000003967) prkcbp1l (ENSLOCG00000003951) DIDO1 (ENSLOCG00000003920) #32 TCFL5 (ENSLOCG00000003908) #33 COL9A3 (ENSLOCG00000003885) ogfr (ENSLOCG00000003876) #35 kcnk15 (ENSLOCG00000003854) cdh4 (ENSLOCG00000003805) TAF4 (ENSLOCG00000003773) lsm14b (ENSLOCG00000003746) PSMA7 (ENSLOCG00000003735) SS18L1 (ENSLOCG00000003723) MTG2 (ENSLOCG00000003710) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000158073 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00390000018730.A.f #35 ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00390000018730.A.e #35 ENSGT00940000161930 #34 ENSGT00390000002821 #33 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00940000154897 ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000156478 ENSGT00940000161109 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000166926 ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000156477.d ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000160331 ENSGT00940000159233 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000163461.b ENSGT00390000013764 ENSGT00390000013867 ENSGT00940000154681.b ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000156917.a Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000160902.d ENSGT00390000018730.A.e #35 ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00940000154897.t ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b.f ENSGT00940000156478.c ENSGT00390000007823.`b #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.b ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a ENSGT00940000160331.a ENSGT00940000159233 ENSGT00390000018330.d ENSGT00390000013764 ENSGT00390000013867.cc.a ENSGT00940000154681.b.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000156917.a ENSGT00730000111114.h ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00940000158901.c Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 ENSSFOG00015020644 MTG2 (ENSSFOG00015020678) ENSSFOG00015029293 SS18L1 (ENSSFOG00015020708) CDH4 (ENSSFOG00015020743) ENSSFOG00015028748 ENSSFOG00015028637 ogfr (ENSSFOG00015020870) #35 ENSSFOG00015020918 #32 ZMYND8 (ENSSFOG00015020943) zgc:113278 (ENSSFOG00015020996) NCOA3 (ENSSFOG00015021018) hm13 (ENSSFOG00015021041) ID1 (ENSSFOG00015021071) MRGBP (ENSSFOG00015021074) #36 eef1a2 (ENSSFOG00015021087) #22 sulf2b (ENSSFOG00015021111) ENSSFOG00015021186 phf20b (ENSSFOG00015021216) ndrg3b (ENSSFOG00015021286) sla2b (ENSSFOG00015021385) edem2 (ENSSFOG00015021400) TRPC4AP (ENSSFOG00015021419) ENSSFOG00015024359 gss (ENSSFOG00015021468) ENSSFOG00015028099 samhd1 (ENSSFOG00015021505) ENSSFOG00015021578 TP53INP2 (ENSSFOG00015021584) GGT7 (ENSSFOG00015021596) zgc:114123 (ENSSFOG00015021618) P. kingsleyae MODERN SPECIES 325 ENSPKIG00000021419 ENSPKIG00000021442 ogfr (ENSPKIG00000021464) #35 ENSPKIG00000021536 #32 ZMYND8 (ENSPKIG00000021608) zgc:113278 (ENSPKIG00000021655) NCOA3 (ENSPKIG00000021692) hm13 (ENSPKIG00000021760) ENSPKIG00000021809 ENSPKIG00000021819 ID1 (ENSPKIG00000021831) MRGBP (ENSPKIG00000021844) #36 eef1a2 (ENSPKIG00000021856) #22 sulf2b (ENSPKIG00000021952) ENSPKIG00000022204 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C #22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 370 ENSGT00940000154897.q ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00940000156478 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000155532 #32 ENSGT00390000018730.A.f #35 ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000165254.c.b ENSGT00950000182846.a.a.a.a.b ENSGT00940000174958 ENSGT00940000154897.q ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b.c ENSGT00950000182846.a.a.a.a.a.a.h ENSGT00940000156478 ENSGT00940000161109.p.a ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a ENSGT00940000159233 ENSGT00940000158422.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000157025 ENSGT00940000167901 ENSGT00940000158152.a.b ENSGT00940000164224.b ENSGT00940000157504.c.a Atlantic herring MODERN SPECIES 20 si:dkey-70p6.1 (ENSCHAG00000019324) uckl1a (ENSCHAG00000019345) samd10a (ENSCHAG00000019743) EMILIN3 (ENSCHAG00000019781) si:ch211-229n2.6 (ENSCHAG00000019816) dedd (ENSCHAG00000019829) atp2b3a (ENSCHAG00000019863) dnase1l1l (ENSCHAG00000020727) prkcbp1l (ENSCHAG00000020874) zgc:113278 (ENSCHAG00000023938) NCOA3 (ENSCHAG00000024119) ENSCHAG00000024140 hm13 (ENSCHAG00000024166) ID1 (ENSCHAG00000024392) mrgbp (ENSCHAG00000024401) #36 eef1a2 (ENSCHAG00000024407) #22 sulf2b (ENSCHAG00000024478) ENSCHAG00000024718 ENSCHAG00000024730 phf20b (ENSCHAG00000024739) ndrg3b (ENSCHAG00000024779) sla2b (ENSCHAG00000024939) edem2 (ENSCHAG00000024949) ENSCHAG00000024987 ENSCHAG00000025079 ENSCHAG00000025279 p4htma (ENSCHAG00000025995) ENSCHAG00000026002 ap4b1 (ENSCHAG00000026009) phpt1 (ENSCHAG00000026025) ENSCHAG00000026028 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000165371.b ENSGT00940000164786.b ENSGT00940000155617.A ENSGT00950000183053.C.b ENSGT00940000159879 ENSGT00940000154543.c ENSGT00940000161921.e.b ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000157562.q.b ENSGT00390000018558 ENSGT00940000165527 ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160988 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000165371.b ENSGT00940000164786.b ENSGT00940000155617.A ENSGT00950000183053.C.b ENSGT00940000159879 ENSGT00940000154543.c ENSGT00940000161921.e.b ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000157562.q.b ENSGT00390000018558 ENSGT00940000165527 ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160988 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a ENSGT00940000160331 ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT00390000016168.b.w ENSGT01070000253766.B.f.a.c ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391.f ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127.b.a.b ENSGT00940000156364.a.a ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000165371.b ENSGT00940000164786.b ENSGT00940000155617.A ENSGT00950000183053.C.b ENSGT00940000159879 ENSGT00940000154543.c ENSGT00940000161921.e.b ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000157562.q.b ENSGT00390000018558 ENSGT00940000165527 ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160988 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a ENSGT00940000160331 ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT00390000016168.b.w ENSGT01070000253766.B.f.a.c ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391.f ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127.b.b ENSGT00940000163127.b.a.b ENSGT00940000156364.a.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000164786.b ENSGT00940000155617.A ENSGT00950000183053.C.b ENSGT00940000159879 ENSGT00940000154543.c ENSGT00940000161921.e.b ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000157562.q.b ENSGT00390000018558 ENSGT00940000165527 ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160988 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a ENSGT00940000160331 ENSGT00400000022086.b.a.a ENSGT00390000016168.b.w ENSGT01070000253766.B.f.a.c ENSGT00940000159974 ENSGT00940000160391.f ENSGT00390000009883 ENSGT00940000160661 ENSGT00940000163127.b.a.b ENSGT00940000156364.a.a ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 71 ENSPNAG00000008038 mrgbp (ENSPNAG00000000616) #36 eef1a2 (ENSPNAG00000008054) #22 sulf2b (ENSPNAG00000000672) ENSPNAG00000000690 phf20b (ENSPNAG00000000712) ndrg3b (ENSPNAG00000008187) sla2b (ENSPNAG00000005624) NTSR1 (ENSPNAG00000000779) #37 SLCO4A1 (ENSPNAG00000000803) ENSPNAG00000008245 ENSPNAG00000000824 adrm1 (ENSPNAG00000008259) lama5 (ENSPNAG00000001002) mapre1b (ENSPNAG00000006676) prkcbp1l (ENSPNAG00000008472) slc16a7 (ENSPNAG00000001042) ENSPNAG00000008488 Mexicana tetra MODERN SPECIES 1374 PIGT (ENSAMXG00000002708) wfdc2 (ENSAMXG00000002743) snx21 (ENSAMXG00000002767) ENSAMXG00000002821 ENSAMXG00000002800 mrgbp (ENSAMXG00000042859) #36 eef1a2 (ENSAMXG00000002854) #22 Electric eel MODERN SPECIES 481 ENSEEEG00000012036 ENSEEEG00000012034 ENSEEEG00000012033 mrgbp (ENSEEEG00000012031) #36 eef1a2 (ENSEEEG00000011380) #22 sulf2b (ENSEEEG00000011304) ENSEEEG00000011303 phf20b (ENSEEEG00000011302) ENSEEEG00000011301 ndrg3b (ENSEEEG00000011173) sla2b (ENSEEEG00000011167) CABLES2 (ENSEEEG00000011166) ENSEEEG00000011164 Channel catfish MODERN SPECIES 6 ENSIPUG00000007259 ENSIPUG00000008245 ENSIPUG00000008304 ENSIPUG00000008376 ttll9 (ENSIPUG00000008388) ENSIPUG00000008408 ppp1r3da (ENSIPUG00000008424) ENSIPUG00000008435 phactr3a (ENSIPUG00000008476) PIGT (ENSIPUG00000008511) wfdc2 (ENSIPUG00000008599) snx21 (ENSIPUG00000008604) haus8 (ENSIPUG00000008618) sac3d1 (ENSIPUG00000008661) mrgbp (ENSIPUG00000008672) #36 eef1a2 (ENSIPUG00000008686) #22 sulf2 (ENSIPUG00000008718) ENSIPUG00000008895 ENSIPUG00000008909 PHF20 (ENSIPUG00000008926) ndrg3b (ENSIPUG00000009021) sla2 (ENSIPUG00000009087) cables2 (ENSIPUG00000009122) ccm2l (ENSIPUG00000009133) xkr7b (ENSIPUG00000009149) ENSIPUG00000009165 tcea2 (ENSIPUG00000010069) rgs19 (ENSIPUG00000010127) ENSIPUG00000010183 oprl1 (ENSIPUG00000010202) NPBWR2 (ENSIPUG00000010220) Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155617.A ENSGT00950000183053.C.b ENSGT00940000159879 ENSGT00940000154543.c ENSGT00940000161921.e.b ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000157562.q.b ENSGT00390000018558.e ENSGT00940000157562.r ENSGT00390000018558.f ENSGT00940000165527 ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160988 ENSGT00390000007823 #36 ENSGT00950000183029.C.a #22 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000164502.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a ENSGT00390000015408 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000156172.a ENSGT00940000168127.a.b ENSGT00940000157989.a.b ENSGT00940000164164 ENSGT00940000155606.b ENSGT00950000182837.b.a.b ENSGT00940000155687.e.a ENSGT00940000177752 ENSGT00940000166246.B Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C.a.a #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C.a.a #22 Common carp reference MODERN SPECIES 11 ENSCCRG00000064527 chl1a (ENSCCRG00000040485) ENSCCRG00000069440 ENSCCRG00000016033 edn3b (ENSCCRG00000055342) ttll9 (ENSCCRG00000016006) ENSCCRG00000077625 ppp1r3da (ENSCCRG00000066232) ENSCCRG00000056662 phactr3a (ENSCCRG00000055593) ENSCCRG00000022888 wfdc2 (ENSCCRG00000032210) snx21 (ENSCCRG00000054403) ENSCCRG00000052178 mrgbp (ENSCCRG00000056495) #36 eef1a2 (ENSCCRG00000047001) #22 ENSCCRG00000078705 sulf2b (ENSCCRG00000056328) ENSCCRG00000025573 phf20b (ENSCCRG00000011090) ndrg3b (ENSCCRG00000008783) exosc10 (ENSCCRG00000008771) gss (ENSCCRG00000008583) ENSCCRG00000008571 ENSCCRG00000069159 nkain4 (ENSCCRG00000003812) ddx23 (ENSCCRG00000028599) cacnb3a (ENSCCRG00000028155) ENSCCRG00000077737 ADCY6 (ENSCCRG00000000942) ENSCCRG00000001330 Golden-line barbel MODERN SPECIES 2888 eef1a2 (ENSSGRG00000003775) #22 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 322 ENSCARG00000026434 ENSCARG00000026317 edn3b (ENSCARG00000026296) ENSCARG00000026288 ENSCARG00000026279 phactr3a (ENSCARG00000026259) PIGT (ENSCARG00000025683) wfdc2 (ENSCARG00000025648) snx21 (ENSCARG00000025635) ENSCARG00000025620 mrgbp (ENSCARG00000025607) #36 eef1a2 (ENSCARG00000025549) #22 Goldfish MODERN SPECIES 507 PIGT (ENSCARG00000063678) wfdc2 (ENSCARG00000063652) snx21 (ENSCARG00000063644) ENSCARG00000063637 mrgbp (ENSCARG00000063623) #36 eef1a2 (ENSCARG00000063572) #22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 288 ENSGT00950000183029.C.a.b #22 ENSGT00940000159151.c ENSGT00940000164502.a.a.b ENSGT00940000156477.c.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a.g ENSGT00940000160331.k.b ENSGT00390000015408 ENSGT00390000013764 ENSGT00940000156172.a.b ENSGT00940000168127.a.b.b ENSGT00940000157989.a.b.d ENSGT00970000193593 ENSGT00940000156172.a.a ENSGT00940000168127.a.b.a ENSGT00940000157989.a.b.c ENSGT00940000164164 Goldfish MODERN SPECIES 15 PDZRN3 (ENSCARG00000012864) ENSCARG00000012853 ENSCARG00000012842 ENSCARG00000012306 edn3b (ENSCARG00000012250) ttll9 (ENSCARG00000012185) ENSCARG00000012165 ppp1r3da (ENSCARG00000012161) ENSCARG00000012140 phactr3a (ENSCARG00000012085) ENSCARG00000012036 wfdc2 (ENSCARG00000012027) snx21 (ENSCARG00000012020) ENSCARG00000012014 mrgbp (ENSCARG00000012006) #36 eef1a2 (ENSCARG00000011962) #22 sulf2b (ENSCARG00000010117) ENSCARG00000010018 phf20b (ENSCARG00000009997) ndrg3b (ENSCARG00000007825) sla2b (ENSCARG00000007758) exosc10 (ENSCARG00000007517) ENSCARG00000007482 ENSCARG00000007478 nkain4 (ENSCARG00000007459) ENSCARG00000007447 ENSCARG00000007439 ddx23 (ENSCARG00000007100) cacnb3a (ENSCARG00000006759) ADCY6 (ENSCARG00000005059) ENSCARG00000004808 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000160080.e ENSGT00940000164786.b.c ENSGT00940000155617.A.i.b ENSGT00950000183053.C.b.d ENSGT00940000159879.b ENSGT00940000154543.c.a.a ENSGT00940000161921.e.b.b ENSGT00530000063859.b.b ENSGT00940000157562.q.b.a ENSGT00390000018558.f.a ENSGT00940000165527.b.b ENSGT00530000063759.b.d ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160988.o.b ENSGT00950000183029.C.a.b #22 ENSGT00940000159151.c ENSGT00940000164502.a.a.b ENSGT00940000156477.c.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a.g ENSGT00940000160331.k.b ENSGT00390000015408.c ENSGT00970000193593 ENSGT00940000157989.a.b.c ENSGT00940000164164 ENSGT00940000155606.b.c.b ENSGT00950000182837.b.a.b.b ENSGT00940000155687.e.a.a ENSGT00940000177752 ENSGT00940000166246.B ENSGT00530000063435.a.a.a.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 49 chl1a (ENSCCRG00000032159) ENSCCRG00000052459 ENSCCRG00000036237 edn3b (ENSCCRG00000067248) ttll9 (ENSCCRG00000036170) ENSCCRG00000016001 ppp1r3da (ENSCCRG00000065533) ENSCCRG00000071496 phactr3a (ENSCCRG00000067302) ENSCCRG00000032222 ENSCCRG00000059804 wfdc2 (ENSCCRG00000022864) ENSCCRG00000036135 snx21 (ENSCCRG00000031928) mrgbp (ENSCCRG00000066467) #36 eef1a2 (ENSCCRG00000055243) #22 ENSCCRG00000081769 ENSCCRG00000056537 sulf2b (ENSCCRG00000015827) ENSCCRG00000032027 phf20b (ENSCCRG00000024982) ndrg3b (ENSCCRG00000024941) exosc10 (ENSCCRG00000079955) ENSCCRG00000060474 ENSCCRG00000061555 nkain4 (ENSCCRG00000076966) ENSCCRG00000028423 ddx23 (ENSCCRG00000059988) cacnb3a (ENSCCRG00000065887) ADCY6 (ENSCCRG00000070240) ENSCCRG00000071265 Golden-line barbel MODERN SPECIES 425 ppp4r2a (ENSSGRG00000036989) PDZRN3 (ENSSGRG00000036906) chl1a (ENSSGRG00000036715) ENSSGRG00000036634 ENSSGRG00000036364 edn3b (ENSSGRG00000036363) ttll9 (ENSSGRG00000036362) ppp1r3da (ENSSGRG00000036361) ENSSGRG00000036358 PIGT (ENSSGRG00000036300) wfdc2 (ENSSGRG00000036297) snx21 (ENSSGRG00000036295) ENSSGRG00000036294 ENSSGRG00000036293 mrgbp (ENSSGRG00000036287) #36 eef1a2 (ENSSGRG00000035533) #22 sulf2b (ENSSGRG00000035324) Zebrafish MODERN SPECIES 15 fbxo44.7 (ENSDARG00000057884) ENSDARG00000090572 fbxo6.3 (ENSDARG00000037645) fbxo44.5 (ENSDARG00000012035) fbxo6.2 (ENSDARG00000057899) fbxo44.3 (ENSDARG00000071044) ENSDARG00000115843 fbxo44.1 (ENSDARG00000022623) ENSDARG00000088762 fkbp1ab (ENSDARG00000033567) sdcbp2 (ENSDARG00000012513) ENSDARG00000075539 ENSDARG00000096904 NTSR1 (ENSDARG00000077577) #37 mrgbp (ENSDARG00000028894) #36 eef1a2 (ENSDARG00000006838) #22 sulf2b (ENSDARG00000013838) ENSDARG00000078145 phf20b (ENSDARG00000038737) ndrg3b (ENSDARG00000010052) sla2b (ENSDARG00000020788) exosc10 (ENSDARG00000037708) gss (ENSDARG00000037706) ENSDARG00000093794 ENSDARG00000077762 ENSDARG00000106991 ENSDARG00000100627 nkain4 (ENSDARG00000062699) birc7 (ENSDARG00000058082) #27 ddx23 (ENSDARG00000021945) cacnb3a (ENSDARG00000001881) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C.b #22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C.b #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C.b #22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 5230 ENSSGRG00000004422 #22 Elephant shark MODERN SPECIES 2069 ENSCMIG00000008897 MRGBP (ENSCMIG00000008892) #36 eef1a2 (ENSCMIG00000008785) #22 ENSCMIG00000008751 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.C #22 Hagfish MODERN SPECIES 946 ENSEBUG00000010668 ENSEBUG00000007203 ENSEBUG00000012044 slc2a13b (ENSEBUG00000003317) ENSEBUG00000005752 pmpcb (ENSEBUG00000001846) ENSEBUG00000013232 ENSEBUG00000015530 ENSEBUG00000008771 TBC1D22B (ENSEBUG00000011637) ENSEBUG00000001422 cpne5a (ENSEBUG00000010662) arpc4 (ENSEBUG00000008348) tbl1xr1a (ENSEBUG00000003035) ENSEBUG00000013733 ENSEBUG00000009901 #22 ENSEBUG00000002112 ENSEBUG00000006348 ENSEBUG00000000396 cdc16 (ENSEBUG00000001267) ENSEBUG00000013566 ENSEBUG00000016974 ENSEBUG00000009898 ENSEBUG00000001894 ENSEBUG00000013136 ENSEBUG00000012942 manf (ENSEBUG00000009803) ENSEBUG00000002172 tada3l (ENSEBUG00000016666) ENSEBUG00000002652 ENSEBUG00000007382 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1429 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Anura ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000159209.e ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Frog MODERN SPECIES 5 mei4 (ENSXETG00000033955) htr1b (ENSXETG00000011743) impg1 (ENSXETG00000003611) myo6 (ENSXETG00000003610) senp6 (ENSXETG00000003609) filip1 (ENSXETG00000003608) tmem30a (ENSXETG00000003607) cox7a2 (ENSXETG00000025853) col12a1 (ENSXETG00000003603) cd109 (ENSXETG00000031004) ENSXETG00000039477 ENSXETG00000037232 ENSXETG00000034784 ENSXETG00000047948 slc17a5 (ENSXETG00000002117) eef1a1 (ENSXETG00000001182) ##22 cgas (ENSXETG00000038502) kcnq5 (ENSXETG00000031377) ENSXETG00000044711 rims1 (ENSXETG00000002308) ENSXETG00000037571 asrgl1 (ENSXETG00000002310) ENSXETG00000048917 ENSXETG00000043266 ogfrl1 (ENSXETG00000041769) ##35 ENSXETG00000046639 b3gat2 (ENSXETG00000017898) smap1 (ENSXETG00000017900) ENSXETG00000044146 ENSXETG00000042727 sdhaf4 (ENSXETG00000017922) Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 6 ENSLLEG00000015772 FRMD5 (ENSLLEG00000015430) GOLM2 (ENSLLEG00000015177) ENSLLEG00000014978 ENSLLEG00000014877 EIF3J (ENSLLEG00000014811) SPG11 (ENSLLEG00000014282) ENSLLEG00000014235 CIAO2A (ENSLLEG00000014207) ENSLLEG00000014181 ENSLLEG00000014045 ENSLLEG00000013899 UACA (ENSLLEG00000013505) KIF23 (ENSLLEG00000012720) PAQR5 (ENSLLEG00000012596) ENSLLEG00000012518 ##22 GLCE (ENSLLEG00000012450) NOX5 (ENSLLEG00000012326) ENSLLEG00000012168 CORO2B (ENSLLEG00000011668) ENSLLEG00000011591 ITGA11 (ENSLLEG00000011407) FEM1B (ENSLLEG00000011357) CLN6 (ENSLLEG00000011246) CALML4 (ENSLLEG00000011194) PIAS1 (ENSLLEG00000010874) ENSLLEG00000010729 SKOR1 (ENSLLEG00000010653) MAP2K5 (ENSLLEG00000010224) C15orf61 (ENSLLEG00000010164) IQCH (ENSLLEG00000009988) Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 ENSLLEG00000030582 ENSLLEG00000030576 ENSLLEG00000030570 MYO6 (ENSLLEG00000030400) SENP6 (ENSLLEG00000030308) ENSLLEG00000030288 FILIP1 (ENSLLEG00000030282) ENSLLEG00000030271 TMEM30A (ENSLLEG00000030247) COX7A2 (ENSLLEG00000030235) ENSLLEG00000030228 COL12A1 (ENSLLEG00000030137) ENSLLEG00000030086 ENSLLEG00000030081 SLC17A5 (ENSLLEG00000029906) ENSLLEG00000029821 ##22 ENSLLEG00000029701 ENSLLEG00000029628 ENSLLEG00000029599 ENSLLEG00000029567 ENSLLEG00000029583 RIMS1 (ENSLLEG00000028333) ENSLLEG00000028129 ENSLLEG00000028120 ASRGL1 (ENSLLEG00000028063) ENSLLEG00000028041 OGFRL1 (ENSLLEG00000027739) ##35 ENSLLEG00000027693 ENSLLEG00000027679 B3GAT2 (ENSLLEG00000027636) SMAP1 (ENSLLEG00000027586) Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000004556 ENSLLEG00000004545 ENSLLEG00000026908 CCNB1IP1 (ENSLLEG00000026832) TTC5 (ENSLLEG00000026773) ENSLLEG00000026756 ENSLLEG00000026711 ENSLLEG00000026633 LPCAT4 (ENSLLEG00000026436) ENSLLEG00000026401 ENSLLEG00000026392 ENSLLEG00000026369 SLC12A6 (ENSLLEG00000026017) ENSLLEG00000025964 EMC4 (ENSLLEG00000025882) ENSLLEG00000025853 ##22 PIP4P1 (ENSLLEG00000025733) OSGEP (ENSLLEG00000025594) ENSLLEG00000025501 ENSLLEG00000025474 ENSLLEG00000025314 ENSLLEG00000025260 ENSLLEG00000025222 ENSLLEG00000025178 ENSLLEG00000025130 ENSLLEG00000025102 ENSLLEG00000025056 ENSLLEG00000025012 ENSLLEG00000024886 ENSLLEG00000024752 ENSLLEG00000024730 Amniota DUPLICATION Amniota DUPLICATION Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Sauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000170566 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000162809 Indian cobra MODERN SPECIES HMGN3 (ENSNNAG00000010069) PHIP (ENSNNAG00000010311) IRAK1BP1 (ENSNNAG00000013617) MEI4 (ENSNNAG00000013636) HTR1B (ENSNNAG00000013668) IMPG1 (ENSNNAG00000013694) MYO6 (ENSNNAG00000013883) SENP6 (ENSNNAG00000014172) FILIP1 (ENSNNAG00000014322) TMEM30A (ENSNNAG00000014377) COX7A2 (ENSNNAG00000014396) COL12A1 (ENSNNAG00000014417) ENSNNAG00000014537 CD109 (ENSNNAG00000014548) SLC17A5 (ENSNNAG00000014667) ENSNNAG00000014749 ##22 ENSNNAG00000014788 KCNQ5 (ENSNNAG00000014971) ENSNNAG00000015075 RIMS1 (ENSNNAG00000015102) ASRGL1 (ENSNNAG00000015345) ENSNNAG00000015376 OGFRL1 (ENSNNAG00000015393) ##35 B3GAT2 (ENSNNAG00000015408) SMAP1 (ENSNNAG00000015423) SDHAF4 (ENSNNAG00000015456) FAM135A (ENSNNAG00000015469) ENSNNAG00000015531 ENSNNAG00000015539 LMBRD1 (ENSNNAG00000015553) ADGRB3 (ENSNNAG00000015584) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000170566 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00980000198621.d Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 489 SLC17A5 (ENSLLTG00000002769) ENSLLTG00000000011 ##22 ENSLLTG00000000034 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000170566 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00980000198621.d Eastern brown snake MODERN SPECIES 4 LCA5 (ENSPTXG00000002898) PHIP (ENSPTXG00000002914) IRAK1BP1 (ENSPTXG00000005436) MEI4 (ENSPTXG00000005437) HTR1B (ENSPTXG00000005445) IMPG1 (ENSPTXG00000005446) MYO6 (ENSPTXG00000005448) SENP6 (ENSPTXG00000005463) FILIP1 (ENSPTXG00000005465) TMEM30A (ENSPTXG00000005466) COX7A2 (ENSPTXG00000005469) COL12A1 (ENSPTXG00000005498) CD109 (ENSPTXG00000008492) ENSPTXG00000008765 SLC17A5 (ENSPTXG00000008769) ENSPTXG00000008773 ##22 ENSPTXG00000008775 KCNQ5 (ENSPTXG00000008779) ENSPTXG00000008784 ENSPTXG00000008787 ASRGL1 (ENSPTXG00000008790) ENSPTXG00000008793 OGFRL1 (ENSPTXG00000008795) ##35 B3GAT2 (ENSPTXG00000008796) SMAP1 (ENSPTXG00000008798) SDHAF4 (ENSPTXG00000008814) FAM135A (ENSPTXG00000008816) ENSPTXG00000008817 LMBRD1 (ENSPTXG00000008818) ADGRB3 (ENSPTXG00000008820) ENSPTXG00000008821 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 11 HMGN3 (ENSNSUG00000005051) PHIP (ENSNSUG00000005055) IRAK1BP1 (ENSNSUG00000005064) MEI4 (ENSNSUG00000005066) HTR1B (ENSNSUG00000005068) IMPG1 (ENSNSUG00000005071) MYO6 (ENSNSUG00000005074) SENP6 (ENSNSUG00000005359) ENSNSUG00000005361 FILIP1 (ENSNSUG00000005362) TMEM30A (ENSNSUG00000005365) COX7A2 (ENSNSUG00000005370) COL12A1 (ENSNSUG00000005375) CD109 (ENSNSUG00000005383) SLC17A5 (ENSNSUG00000005418) ENSNSUG00000005422 ##22 ENSNSUG00000005425 KCNQ5 (ENSNSUG00000005447) RIMS1 (ENSNSUG00000005454) ASRGL1 (ENSNSUG00000006138) ENSNSUG00000006141 OGFRL1 (ENSNSUG00000006144) ##35 B3GAT2 (ENSNSUG00000006168) SMAP1 (ENSNSUG00000006170) SDHAF4 (ENSNSUG00000006269) FAM135A (ENSNSUG00000006270) ENSNSUG00000006284 LMBRD1 (ENSNSUG00000006286) ADGRB3 (ENSNSUG00000006396) ENSNSUG00000006397 PHF3 (ENSNSUG00000006401) Lizard MODERN SPECIES 955 SLC17A5 (ENSACAG00000004600) ENSACAG00000004556 ##22 ENSACAG00000004481 CGAS (ENSACAG00000004451) ENSACAG00000004387 KCNQ5 (ENSACAG00000004273) ENSACAG00000043645 ENSACAG00000035705 ENSACAG00000040909 ENSACAG00000041221 ENSACAG00000040745 RIMS1 (ENSACAG00000004122) ENSACAG00000042923 Laterata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 Common wall lizard MODERN SPECIES 11 PHIP (ENSPMRG00000004065) IRAK1BP1 (ENSPMRG00000004058) ENSPMRG00000007843 HTR1B (ENSPMRG00000007840) IMPG1 (ENSPMRG00000007835) MYO6 (ENSPMRG00000007794) ENSPMRG00000007771 FILIP1 (ENSPMRG00000007757) TMEM30A (ENSPMRG00000007751) COX7A2 (ENSPMRG00000007746) COL12A1 (ENSPMRG00000006545) ENSPMRG00000006320 ENSPMRG00000006317 CD109 (ENSPMRG00000006306) SLC17A5 (ENSPMRG00000006281) ENSPMRG00000006270 ##22 MTO1 (ENSPMRG00000006262) CGAS (ENSPMRG00000006256) ENSPMRG00000006243 ENSPMRG00000006236 KCNQ5 (ENSPMRG00000006226) ENSPMRG00000006211 ENSPMRG00000006190 ASRGL1 (ENSPMRG00000006179) ENSPMRG00000006174 OGFRL1 (ENSPMRG00000006166) ##35 B3GAT2 (ENSPMRG00000006152) SMAP1 (ENSPMRG00000006140) FAM135A (ENSPMRG00000006129) ENSPMRG00000006122 LMBRD1 (ENSPMRG00000006101) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 9 IRAK1BP1 (ENSSMRG00000017382) MEI4 (ENSSMRG00000017372) HTR1B (ENSSMRG00000017367) IMPG1 (ENSSMRG00000017353) MYO6 (ENSSMRG00000015441) SENP6 (ENSSMRG00000015440) ENSSMRG00000015439 FILIP1 (ENSSMRG00000015438) TMEM30A (ENSSMRG00000015437) ENSSMRG00000015436 COL12A1 (ENSSMRG00000015435) ENSSMRG00000015434 ENSSMRG00000015433 CD109 (ENSSMRG00000015429) SLC17A5 (ENSSMRG00000015428) ENSSMRG00000015426 ##22 MTO1 (ENSSMRG00000015425) CGAS (ENSSMRG00000015424) ENSSMRG00000015418 ENSSMRG00000015417 KCNQ5 (ENSSMRG00000015191) ENSSMRG00000015189 RIMS1 (ENSSMRG00000015188) ASRGL1 (ENSSMRG00000015187) OGFRL1 (ENSSMRG00000015185) ##35 B3GAT2 (ENSSMRG00000015184) ENSSMRG00000015182 SMAP1 (ENSSMRG00000015181) FAM135A (ENSSMRG00000015177) ENSSMRG00000015174 LMBRD1 (ENSSMRG00000015170) tuatara MODERN SPECIES 142 IMPG1 (ENSSPUG00000018332) MYO6 (ENSSPUG00000018313) SENP6 (ENSSPUG00000018294) FILIP1 (ENSSPUG00000018282) TMEM30A (ENSSPUG00000018271) COX7A2 (ENSSPUG00000018264) COL12A1 (ENSSPUG00000018230) ENSSPUG00000018213 ENSSPUG00000018206 ENSSPUG00000018193 SLC17A5 (ENSSPUG00000018171) ENSSPUG00000018156 ##22 MTO1 (ENSSPUG00000018137) CGAS (ENSSPUG00000018128) ENSSPUG00000018097 KCNQ5 (ENSSPUG00000018069) ENSSPUG00000018045 RIMS1 (ENSSPUG00000016340) ENSSPUG00000015794 ENSSPUG00000015773 B3GAT2 (ENSSPUG00000015749) SMAP1 (ENSSPUG00000015732) SDHAF4 (ENSSPUG00000015724) FAM135A (ENSSPUG00000015700) COL9A1 (ENSSPUG00000015669) LMBRD1 (ENSSPUG00000015646) ADGRB3 (ENSSPUG00000015616) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00950000186266 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Chinese turtle MODERN SPECIES 1586 CD109 (ENSPSIG00000004001) SLC17A5 (ENSPSIG00000004207) ENSPSIG00000004417 ##22 ENSPSIG00000001665 MTO1 (ENSPSIG00000004469) CGAS (ENSPSIG00000004911) Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00950000186266 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C.d ENSGT00940000154923.C.c ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Emydidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C.d ENSGT00940000154923.C.c ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.s ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 15 PHIP (ENSTMTG00000013279) IRAK1BP1 (ENSTMTG00000014997) ENSTMTG00000015007 MEI4 (ENSTMTG00000015024) HTR1B (ENSTMTG00000015036) IMPG1 (ENSTMTG00000015053) MYO6 (ENSTMTG00000015125) SENP6 (ENSTMTG00000015245) FILIP1 (ENSTMTG00000015336) TMEM30A (ENSTMTG00000015350) COX7A2 (ENSTMTG00000015362) ENSTMTG00000015398 ENSTMTG00000015858 CD109 (ENSTMTG00000016013) SLC17A5 (ENSTMTG00000017932) ENSTMTG00000017955 ##22 MTO1 (ENSTMTG00000017967) CGAS (ENSTMTG00000018012) ENSTMTG00000018296 KCNQ5 (ENSTMTG00000018423) RIMS1 (ENSTMTG00000018948) ASRGL1 (ENSTMTG00000021888) OGFRL1 (ENSTMTG00000021898) ##35 B3GAT2 (ENSTMTG00000021901) SMAP1 (ENSTMTG00000021908) SDHAF4 (ENSTMTG00000021914) FAM135A (ENSTMTG00000021916) ENSTMTG00000021921 LMBRD1 (ENSTMTG00000021925) ADGRB3 (ENSTMTG00000021930) ENSTMTG00000021938 painted turtle MODERN SPECIES 750 ENSCPBG00000005222 ##22 MTO1 (ENSCPBG00000005210) CGAS (ENSCPBG00000005204) ENSCPBG00000005180 ENSCPBG00000005177 NPBWR1 (ENSCPBG00000005165) OPRK1 (ENSCPBG00000005160) ATP6V1H (ENSCPBG00000005131) RGS20 (ENSCPBG00000005120) TCEA1 (ENSCPBG00000005109) LYPLA1 (ENSCPBG00000005093) MRPL15 (ENSCPBG00000005085) ENSCPBG00000005077 SOX17 (ENSCPBG00000005074) ENSCPBG00000005069 ENSCPBG00000005038 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00950000186266 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C.d ENSGT00940000154923.C.c ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 17 HMGN3 (ENSGEVG00005007224) PHIP (ENSGEVG00005007162) ENSGEVG00005007140 IRAK1BP1 (ENSGEVG00005007115) MEI4 (ENSGEVG00005007086) HTR1B (ENSGEVG00005007063) IMPG1 (ENSGEVG00005006999) MYO6 (ENSGEVG00005006967) SENP6 (ENSGEVG00005006858) TMEM30A (ENSGEVG00005006797) COX7A2 (ENSGEVG00005006776) ENSGEVG00005006750 ENSGEVG00005006602 CD109 (ENSGEVG00005005778) SLC17A5 (ENSGEVG00005005504) ENSGEVG00005005454 ##22 MTO1 (ENSGEVG00005005432) CGAS (ENSGEVG00005005412) ENSGEVG00005005394 KCNQ5 (ENSGEVG00005005299) ENSGEVG00005005252 ENSGEVG00005005237 RIMS1 (ENSGEVG00005003278) ASRGL1 (ENSGEVG00005002495) OGFRL1 (ENSGEVG00005002484) ##35 B3GAT2 (ENSGEVG00005002476) SMAP1 (ENSGEVG00005002459) SDHAF4 (ENSGEVG00005002442) FAM135A (ENSGEVG00005002357) ENSGEVG00005002331 LMBRD1 (ENSGEVG00005002295) Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2457 CD109 (ENSCABG00000020202) SLC17A5 (ENSCABG00000020020) ENSCABG00000020000 ##22 MTO1 (ENSCABG00000019997) CGAS (ENSCABG00000019995) ENSCABG00000019992 KCNQ5 (ENSCABG00000019986) Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2546 ENSCABG00000013336 ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Platypus MODERN SPECIES LRATD1 (ENSOANG00000007163) TRIB2 (ENSOANG00000001757) LPIN1 (ENSOANG00000002670) GREB1 (ENSOANG00000002667) ENSOANG00000002666 ROCK2 (ENSOANG00000002665) SLC66A3 (ENSOANG00000002664) C2orf50 (ENSOANG00000001088) PDIA6 (ENSOANG00000014500) ATP6V1C2 (ENSOANG00000014499) NOL10 (ENSOANG00000014497) ODC1 (ENSOANG00000002322) HPCAL1 (ENSOANG00000050538) RRM2 (ENSOANG00000005507) SLC17A5 (ENSOANG00000012352) ENSOANG00000043962 ##22 MTO1 (ENSOANG00000003443) ENSOANG00000013441 ENSOANG00000006467 KCNQ5 (ENSOANG00000003444) RIMS1 (ENSOANG00000001502) ENSOANG00000004715 ##35 B3GAT2 (ENSOANG00000039356) SMAP1 (ENSOANG00000046085) SDHAF4 (ENSOANG00000014939) FAM135A (ENSOANG00000014938) COL9A1 (ENSOANG00000014937) LMBRD1 (ENSOANG00000014934) ENSOANG00000001622 ENSOANG00000036307 PHF3 (ENSOANG00000009452) Theria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244828.c.b.b.b.c.a.a.a.a.a.b.a ENSGT01090000260024.A.a.a.b.b.a ENSGT01050000244828.c.b.b.b.c.a.a.a.a.a.a ENSGT01050000244828.c.b.b.b.c.a.a.a.b ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653.a ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 1 MEI4 (ENSMODG00000018477) HTR1B (ENSMODG00000023470) ENSMODG00000018487 MYO6 (ENSMODG00000018489) SENP6 (ENSMODG00000018495) FILIP1 (ENSMODG00000018497) TMEM30A (ENSMODG00000018502) ENSMODG00000018503 COL12A1 (ENSMODG00000018507) ENSMODG00000018512 ENSMODG00000039889 ENSMODG00000043386 ENSMODG00000045941 CD109 (ENSMODG00000018520) SLC17A5 (ENSMODG00000018522) ENSMODG00000018533 ##22 MTO1 (ENSMODG00000018543) ENSMODG00000048836 CGAS (ENSMODG00000018545) ENSMODG00000018546 KCNQ5 (ENSMODG00000018548) ENSMODG00000040024 RIMS1 (ENSMODG00000018557) OGFRL1 (ENSMODG00000018560) ##35 B3GAT2 (ENSMODG00000018561) ENSMODG00000039035 SMAP1 (ENSMODG00000018563) SDHAF4 (ENSMODG00000018571) ENSMODG00000042039 ENSMODG00000018567 ENSMODG00000045475 Opossum MODERN SPECIES 1 CORO6 (ENSMODG00000009661) SSH2 (ENSMODG00000009679) ENSMODG00000009859 NSRP1 (ENSMODG00000009868) SLC6A4 (ENSMODG00000009884) BLMH (ENSMODG00000009909) TMIGD1 (ENSMODG00000009919) ENSMODG00000023173 ENSMODG00000048479 ENSMODG00000038151 CPD (ENSMODG00000009938) GOSR1 (ENSMODG00000041802) ENSMODG00000049395 TRARG1 (ENSMODG00000009959) ENSMODG00000038383 ENSMODG00000010574 ##22 ABR (ENSMODG00000010001) TIMM22 (ENSMODG00000010014) ENSMODG00000048571 MRM3 (ENSMODG00000010029) GLOD4 (ENSMODG00000010038) ENSMODG00000023171 GEMIN4 (ENSMODG00000023170) TLCD3A (ENSMODG00000010047) VPS53 (ENSMODG00000010127) RPH3AL (ENSMODG00000010146) DOC2B (ENSMODG00000038227) YWHAE (ENSMODG00000010174) CRK (ENSMODG00000010187) ENSMODG00000048933 MYO1C (ENSMODG00000010315) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01050000244828.c.b.b.b.c.a.a.a.a.a.b.a ENSGT01090000260024.A.a.a.b.b.a ENSGT01050000244828.c.b.b.b.c.a.a.a.a.a.a ENSGT01050000244828.c.b.b.b.c.a.a.a.b ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653.a ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 ENSSHAG00000002475 ENSSHAG00000025459 ENSSHAG00000026589 ENSSHAG00000009668 HTR1B (ENSSHAG00000029598) ENSSHAG00000023915 ENSSHAG00000013502 MYO6 (ENSSHAG00000012447) SENP6 (ENSSHAG00000011473) FILIP1 (ENSSHAG00000008624) TMEM30A (ENSSHAG00000024471) COX7A2 (ENSSHAG00000024282) COL12A1 (ENSSHAG00000005741) CD109 (ENSSHAG00000008788) SLC17A5 (ENSSHAG00000029856) ENSSHAG00000004864 ##22 ENSSHAG00000023883 MTO1 (ENSSHAG00000003944) ENSSHAG00000002951 ENSSHAG00000001847 KCNQ5 (ENSSHAG00000014723) RIMS1 (ENSSHAG00000008965) OGFRL1 (ENSSHAG00000016382) ##35 B3GAT2 (ENSSHAG00000021663) SMAP1 (ENSSHAG00000014724) SDHAF4 (ENSSHAG00000032284) FAM135A (ENSSHAG00000013798) COL9A1 (ENSSHAG00000012247) COL19A1 (ENSSHAG00000011749) LMBRD1 (ENSSHAG00000025420) ADGRB3 (ENSSHAG00000011284) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653.a ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653.a ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Common wonbat MODERN SPECIES 613 MEI4 (ENSVURG00010014083) HTR1B (ENSVURG00010014076) MYO6 (ENSVURG00010013250) SENP6 (ENSVURG00010013161) FILIP1 (ENSVURG00010013135) TMEM30A (ENSVURG00010013123) COX7A2 (ENSVURG00010013119) COL12A1 (ENSVURG00010013090) ENSVURG00010013078 CD109 (ENSVURG00010013045) SLC17A5 (ENSVURG00010013010) ENSVURG00010012999 ##22 MTO1 (ENSVURG00010012994) ENSVURG00010012990 ENSVURG00010012984 KCNQ5 (ENSVURG00010011836) ENSVURG00010011776 ENSVURG00010011765 ENSVURG00010011753 OGFRL1 (ENSVURG00010011736) ##35 B3GAT2 (ENSVURG00010011724) ENSVURG00010011717 SMAP1 (ENSVURG00010011708) ENSVURG00010011697 FAM135A (ENSVURG00010011637) COL9A1 (ENSVURG00010011537) LMBRD1 (ENSVURG00010011489) koala MODERN SPECIES 81 ENSPCIG00000035496 HTR1B (ENSPCIG00000013791) ENSPCIG00000013794 ENSPCIG00000011572 ENSPCIG00000020512 MYO6 (ENSPCIG00000010630) SENP6 (ENSPCIG00000025762) FILIP1 (ENSPCIG00000019648) TMEM30A (ENSPCIG00000019650) ENSPCIG00000007869 COL12A1 (ENSPCIG00000019655) ENSPCIG00000024782 ENSPCIG00000032522 CD109 (ENSPCIG00000018000) SLC17A5 (ENSPCIG00000017999) ENSPCIG00000017986 ##22 ENSPCIG00000017982 ENSPCIG00000017981 KCNQ5 (ENSPCIG00000017321) RIMS1 (ENSPCIG00000008784) OGFRL1 (ENSPCIG00000006430) ##35 B3GAT2 (ENSPCIG00000006427) ENSPCIG00000020679 ENSPCIG00000030986 FAM135A (ENSPCIG00000020680) COL9A1 (ENSPCIG00000034658) ENSPCIG00000030710 LMBRD1 (ENSPCIG00000023984) ENSPCIG00000023985 Wallaby MODERN SPECIES 6182 ENSMEUG00000011024 ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Elephant MODERN SPECIES 1 PTCHD4 (ENSLAFG00000016766) ENSLAFG00000031546 MMUT (ENSLAFG00000003857) CENPQ (ENSLAFG00000003858) GLYATL3 (ENSLAFG00000003861) ENSLAFG00000002791 RHAG (ENSLAFG00000004728) ENSLAFG00000031706 CRISP2 (ENSLAFG00000005361) ENSLAFG00000000995 PGK2 (ENSLAFG00000008546) DEFB113 (ENSLAFG00000020991) ENSLAFG00000016703 TFAP2D (ENSLAFG00000006172) TFAP2B (ENSLAFG00000027209) ENSLAFG00000030680 ##22 ENSLAFG00000032031 ENSLAFG00000012699 ENSLAFG00000031836 IL17A (ENSLAFG00000001544) IL17F (ENSLAFG00000002150) MCM3 (ENSLAFG00000010584) PAQR8 (ENSLAFG00000009293) EFHC1 (ENSLAFG00000005509) TRAM2 (ENSLAFG00000005516) TMEM14A (ENSLAFG00000001644) ENSLAFG00000026604 ENSLAFG00000027205 ENSLAFG00000031720 ENSLAFG00000031171 GSTA4 (ENSLAFG00000005012) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000162741.j ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Horse MODERN SPECIES 25 CDK6 (ENSECAG00000016512) FAM133B (ENSECAG00000026810) ENSECAG00000052012 RBM48 (ENSECAG00000011070) PEX1 (ENSECAG00000021379) GATAD1 (ENSECAG00000021181) ENSECAG00000053246 ANKIB1 (ENSECAG00000010373) KRIT1 (ENSECAG00000016850) LRRD1 (ENSECAG00000014527) CYP51A1 (ENSECAG00000006455) AKAP9 (ENSECAG00000020181) MTERF1 (ENSECAG00000018128) ENSECAG00000048913 FZD1 (ENSECAG00000001326) ENSECAG00000034800 ##22 CDK14 (ENSECAG00000006765) PTTG1IP2 (ENSECAG00000047053) CLDN12 (ENSECAG00000005767) ENSECAG00000038977 GTPBP10 (ENSECAG00000017416) CFAP69 (ENSECAG00000009023) STEAP2 (ENSECAG00000007108) ENSECAG00000023308 ENSECAG00000044914 TEX47 (ENSECAG00000005692) ZNF804B (ENSECAG00000023047) ENSECAG00000053902 STEAP4 (ENSECAG00000018828) SRI (ENSECAG00000016278) ADAM22 (ENSECAG00000019027) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Microbat MODERN SPECIES 1056 ENSMLUG00000000815 ZC3H10 (ENSMLUG00000006564) ESYT1 (ENSMLUG00000006568) MYL6B (ENSMLUG00000006591) MYL6 (ENSMLUG00000006614) SMARCC2 (ENSMLUG00000006625) ENSMLUG00000022653 RNF41 (ENSMLUG00000006057) NABP2 (ENSMLUG00000006646) SLC39A5 (ENSMLUG00000006654) ANKRD52 (ENSMLUG00000006674) COQ10A (ENSMLUG00000006706) CS (ENSMLUG00000006712) CNPY2 (ENSMLUG00000006725) PAN2 (ENSMLUG00000006737) ENSMLUG00000029293 ##22 IL23A (ENSMLUG00000006778) STAT2 (ENSMLUG00000006785) APOF (ENSMLUG00000006814) TIMELESS (ENSMLUG00000006822) MIP (ENSMLUG00000006844) ENSMLUG00000008153 SPRYD4 (ENSMLUG00000006850) GLS2 (ENSMLUG00000006854) ENSMLUG00000024707 RBMS2 (ENSMLUG00000000530) ENSMLUG00000026475 ENSMLUG00000000546 ATP5F1B (ENSMLUG00000016195) PTGES3 (ENSMLUG00000015927) ENSMLUG00000001169 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 TRAPPC11 (ENSRFEG00010016462) STOX2 (ENSRFEG00010016438) ENPP6 (ENSRFEG00010016393) IRF2 (ENSRFEG00010016324) CASP3 (ENSRFEG00010016238) PRIMPOL (ENSRFEG00010016194) CENPU (ENSRFEG00010016006) ACSL1 (ENSRFEG00010015807) HELT (ENSRFEG00010015716) SLC25A4 (ENSRFEG00010015491) CFAP97 (ENSRFEG00010015438) LRP2BP (ENSRFEG00010015317) UFSP2 (ENSRFEG00010015247) SNX25 (ENSRFEG00010014703) C4orf47 (ENSRFEG00010014615) ENSRFEG00010014599 ##22 ENSRFEG00010014396 PDLIM3 (ENSRFEG00010014254) SORBS2 (ENSRFEG00010013758) TLR3 (ENSRFEG00010013620) FAM149A (ENSRFEG00010013292) CYP4V2 (ENSRFEG00010013125) KLKB1 (ENSRFEG00010013058) ENSRFEG00010012953 MTNR1A (ENSRFEG00010012919) FAT1 (ENSRFEG00010012780) ENSRFEG00010012714 ENSRFEG00010012629 TRIML1 (ENSRFEG00010012322) FRG1 (ENSRFEG00010012259) ASAH1 (ENSRFEG00010011951) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 23 ENSRFEG00010004833 REST (ENSRFEG00010004854) NOA1 (ENSRFEG00010004863) POLR2B (ENSRFEG00010004893) IGFBP7 (ENSRFEG00010004923) ENSRFEG00010004930 ENSRFEG00010010303 ENSRFEG00010010359 ADGRL3 (ENSRFEG00010010560) ENSRFEG00010011269 TECRL (ENSRFEG00010011319) ENSRFEG00010011678 ENSRFEG00010011689 EPHA5 (ENSRFEG00010011768) ENSRFEG00010013182 ENSRFEG00010013198 ##22 CENPC (ENSRFEG00010013218) STAP1 (ENSRFEG00010013275) UBA6 (ENSRFEG00010013313) GNRHR (ENSRFEG00010013422) ENSRFEG00010013481 TMPRSS11D (ENSRFEG00010013679) TMPRSS11A (ENSRFEG00010013841) ENSRFEG00010014010 TMPRSS11F (ENSRFEG00010014158) ENSRFEG00010014313 ENSRFEG00010014472 TMPRSS11B (ENSRFEG00010014505) TMPRSS11E (ENSRFEG00010014675) YTHDC1 (ENSRFEG00010014858) ENSRFEG00010015000 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 ATP8A2 (ENSRFEG00010003553) ENSRFEG00010003604 SHISA2 (ENSRFEG00010003626) RNF6 (ENSRFEG00010003644) CDK8 (ENSRFEG00010003679) WASF3 (ENSRFEG00010003718) ENSRFEG00010003754 GPR12 (ENSRFEG00010003761) USP12 (ENSRFEG00010003775) ENSRFEG00010003789 RASL11A (ENSRFEG00010003821) GTF3A (ENSRFEG00010003845) MTIF3 (ENSRFEG00010003873) LNX2 (ENSRFEG00010003884) ENSRFEG00010003922 ENSRFEG00010003942 ##22 GSX1 (ENSRFEG00010003946) PDX1 (ENSRFEG00010003956) CDX2 (ENSRFEG00010003965) ENSRFEG00010003975 FLT3 (ENSRFEG00010004003) PAN3 (ENSRFEG00010004077) FLT1 (ENSRFEG00010004193) ENSRFEG00010004318 SLC46A3 (ENSRFEG00010004332) MTUS2 (ENSRFEG00010004361) ENSRFEG00010004420 SLC7A1 (ENSRFEG00010000293) UBL3 (ENSRFEG00010000414) KATNAL1 (ENSRFEG00010000476) HMGB1 (ENSRFEG00010000531) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES IL13RA1 (ENSRFEG00010009938) ENSRFEG00010009911 LONRF3 (ENSRFEG00010009814) ENSRFEG00010009757 PGRMC1 (ENSRFEG00010009713) ENSRFEG00010009697 ENSRFEG00010009627 ENSRFEG00010009581 STEEP1 (ENSRFEG00010009475) ENSRFEG00010009340 ENSRFEG00010009302 NKRF (ENSRFEG00010009167) SOWAHD (ENSRFEG00010009100) ENSRFEG00010009058 ENSRFEG00010008994 ENSRFEG00010008919 ##22 ENSRFEG00010008896 ENSRFEG00010008865 ENSRFEG00010008720 NKAP (ENSRFEG00010008685) ZBTB33 (ENSRFEG00010008643) ENSRFEG00010002755 TMEM255A (ENSRFEG00010002695) ATP1B4 (ENSRFEG00010002584) ENSRFEG00010002563 LAMP2 (ENSRFEG00010002495) CUL4B (ENSRFEG00010002422) MCTS1 (ENSRFEG00010002366) C1GALT1C1 (ENSRFEG00010002347) ENSRFEG00010002340 ENSRFEG00010002315 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 11 ZMYND12 (ENSAMEG00000000560) RIMKLA (ENSAMEG00000030543) ENSAMEG00000025996 FOXJ3 (ENSAMEG00000000591) GUCA2A (ENSAMEG00000000614) GUCA2B (ENSAMEG00000026602) HIVEP3 (ENSAMEG00000029105) EDN2 (ENSAMEG00000000522) FOXO6 (ENSAMEG00000028105) SLFNL1 (ENSAMEG00000011863) SCMH1 (ENSAMEG00000011860) CTPS1 (ENSAMEG00000011866) KCNQ4 (ENSAMEG00000011888) NFYC (ENSAMEG00000011899) RIMS3 (ENSAMEG00000011913) ENSAMEG00000026970 ##22 ZNF684 (ENSAMEG00000028572) ENSAMEG00000024599 ZFP69 (ENSAMEG00000031429) SMAP2 (ENSAMEG00000004571) COL9A2 (ENSAMEG00000004524) ZMPSTE24 (ENSAMEG00000004501) TMCO2 (ENSAMEG00000004499) RLF (ENSAMEG00000004478) PPT1 (ENSAMEG00000004444) ENSAMEG00000004417 MFSD2A (ENSAMEG00000004371) MYCL (ENSAMEG00000023600) TRIT1 (ENSAMEG00000004342) ENSAMEG00000011490 PPIE (ENSAMEG00000007346) Ursus ANCESTRAL SPECIES 450 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Polar bear MODERN SPECIES 287 ENSUMAG00000025528 ENSUMAG00000025529 ENSUMAG00000025530 ENSUMAG00000025531 SH2D4A (ENSUMAG00000025533) CSGALNACT1 (ENSUMAG00000025534) ENSUMAG00000025535 INTS10 (ENSUMAG00000025536) HGSNAT (ENSUMAG00000025549) POMK (ENSUMAG00000025550) FNTA (ENSUMAG00000025551) HOOK3 (ENSUMAG00000025553) RNF170 (ENSUMAG00000025554) THAP1 (ENSUMAG00000025555) ENSUMAG00000025556 ENSUMAG00000025557 ##22 CHRNA6 (ENSUMAG00000025558) SMIM19 (ENSUMAG00000025559) SLC20A2 (ENSUMAG00000025561) VDAC3 (ENSUMAG00000025562) DKK4 (ENSUMAG00000025563) POLB (ENSUMAG00000025564) IKBKB (ENSUMAG00000025565) PLAT (ENSUMAG00000025567) AP3M2 (ENSUMAG00000025568) KAT6A (ENSUMAG00000025569) ANK1 (ENSUMAG00000025571) ENSUMAG00000025572 NKX6-3 (ENSUMAG00000025573) GPAT4 (ENSUMAG00000025574) GINS4 (ENSUMAG00000025575) Canidae ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00400000024746.h ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00400000024746.g ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.g.a ##22 Dingo MODERN SPECIES 125 CCDC170 (ENSCAFG00020014704) ESR1 (ENSCAFG00020014707) ENSCAFG00020014804 ENSCAFG00020014881 MYCT1 (ENSCAFG00020014923) VIP (ENSCAFG00020014925) FBXO5 (ENSCAFG00020014935) MTRF1L (ENSCAFG00020014937) RGS17 (ENSCAFG00020014939) ENSCAFG00020014955 ENSCAFG00020014963 ENSCAFG00020014964 OPRM1 (ENSCAFG00020014975) IPCEF1 (ENSCAFG00020014995) CNKSR3 (ENSCAFG00020015015) ENSCAFG00020015021 ##22 ENSCAFG00020015039 SCAF8 (ENSCAFG00020015048) TIAM2 (ENSCAFG00020015145) TFB1M (ENSCAFG00020015224) CLDN20 (ENSCAFG00020015226) NOX3 (ENSCAFG00020015230) ENSCAFG00020015257 ARID1B (ENSCAFG00020015368) TMEM242 (ENSCAFG00020015763) ZDHHC14 (ENSCAFG00020015770) ENSCAFG00020015774 SNX9 (ENSCAFG00020015786) SYNJ2 (ENSCAFG00020015809) SERAC1 (ENSCAFG00020016376) TULP4 (ENSCAFG00020017632) Dog MODERN SPECIES ARID1B (ENSCAFG00845000636) NOX3 (ENSCAFG00845000506) CLDN20 (ENSCAFG00845000485) TFB1M (ENSCAFG00845000478) TIAM2 (ENSCAFG00845000411) SCAF8 (ENSCAFG00845000294) ENSCAFG00845000268 CNKSR3 (ENSCAFG00845000205) OPRM1 (ENSCAFG00845000160) RGS17 (ENSCAFG00845000141) MTRF1L (ENSCAFG00845000120) FBXO5 (ENSCAFG00845000104) ENSCAFG00845000096 VIP (ENSCAFG00845000085) MYCT1 (ENSCAFG00845000077) ENSCAFG00845000071 ##22 SYNE1 (ENSCAFG00845000043) ESR1 (ENSCAFG00845000028) CCDC170 (ENSCAFG00845000020) ARMT1 (ENSCAFG00845000014) RMND1 (ENSCAFG00845000007) ZBTB2 (ENSCAFG00845021289) AKAP12 (ENSCAFG00845021174) MTHFD1L (ENSCAFG00845020116) PLEKHG1 (ENSCAFG00845019814) IYD (ENSCAFG00845019736) PPP1R14C (ENSCAFG00845019656) ENSCAFG00845019584 ENSCAFG00845019534 ENSCAFG00845019515 ENSCAFG00845019312 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.g.b ##22 Dog MODERN SPECIES 27 LRRC31 (ENSCAFG00845021142) LRRIQ4 (ENSCAFG00845021060) LRRC34 (ENSCAFG00845020875) MYNN (ENSCAFG00845020762) ACTRT3 (ENSCAFG00845020716) MECOM (ENSCAFG00845020246) ENSCAFG00845020054 GOLIM4 (ENSCAFG00845019749) ENSCAFG00845019579 ENSCAFG00845019540 SERPINI1 (ENSCAFG00845019443) PDCD10 (ENSCAFG00845019304) WDR49 (ENSCAFG00845018893) SERPINI2 (ENSCAFG00845018745) ZBBX (ENSCAFG00845018508) ENSCAFG00845018442 ##22 BCHE (ENSCAFG00845018401) SLITRK3 (ENSCAFG00845018138) ENSCAFG00845017677 ENSCAFG00845017441 ENSCAFG00845017418 ENSCAFG00845028812 ENSCAFG00845028775 NMD3 (ENSCAFG00845028473) B3GALNT1 (ENSCAFG00845028315) PPM1L (ENSCAFG00845028216) ARL14 (ENSCAFG00845028171) KPNA4 (ENSCAFG00845027853) TRIM59 (ENSCAFG00845027742) SMC4 (ENSCAFG00845027487) IFT80 (ENSCAFG00845027305) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00400000024746.h ENSGT00950000183029.B.c.a.h ##22 ENSGT00400000024746.g ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 17 CLU (ENSCAFG00845010565) ENSCAFG00845010841 EPHX2 (ENSCAFG00845011024) CHRNA2 (ENSCAFG00845011451) PTK2B (ENSCAFG00845011700) TRIM35 (ENSCAFG00845012423) ENSCAFG00845012522 STMN4 (ENSCAFG00845012672) ##15 ADRA1A (ENSCAFG00845012931) DPYSL2 (ENSCAFG00845013099) ENSCAFG00845013305 PNMA2 (ENSCAFG00845013366) PPP2R2A (ENSCAFG00845013440) PPP2R2A (ENSCAFG00845013645) EBF2 (ENSCAFG00845013887) ENSCAFG00845013986 ##22 ENSCAFG00845014017 CDCA2 (ENSCAFG00845014066) KCTD9 (ENSCAFG00845014154) GNRH1 (ENSCAFG00845014221) DOCK5 (ENSCAFG00845014289) NEFL (ENSCAFG00845014438) NEFM (ENSCAFG00845014497) ADAM7 (ENSCAFG00845014694) ADAMDEC1 (ENSCAFG00845014873) ADAM28 (ENSCAFG00845015078) STC1 (ENSCAFG00845015608) NKX2-6 (ENSCAFG00845015839) NKX3-1 (ENSCAFG00845015954) SLC25A37 (ENSCAFG00845016130) ENTPD4 (ENSCAFG00845016515) Dog MODERN SPECIES 26 C33H3orf38 (ENSCAFG00845030412) ENSCAFG00845030425 ENSCAFG00845030437 ##22 ENSCAFG00845030457 EPHA3 (ENSCAFG00845030500) PROS1 (ENSCAFG00845030582) ARL13B (ENSCAFG00845030616) STX19 (ENSCAFG00845030641) NSUN3 (ENSCAFG00845030646) ENSCAFG00845014808 ENSCAFG00845014851 ENSCAFG00845014877 ENSCAFG00845015035 ENSCAFG00845015075 ARL6 (ENSCAFG00845015298) CRYBG3 (ENSCAFG00845015402) RIOX2 (ENSCAFG00845015574) OR5AC27 (ENSCAFG00845015721) Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 6 PDIA5 (ENSVVUG00000000124) SEMA5B (ENSVVUG00000022570) SLC49A4 (ENSVVUG00000022550) HSPBAP1 (ENSVVUG00000022538) PARP14 (ENSVVUG00000022533) PARP15 (ENSVVUG00000022532) DTX3L (ENSVVUG00000022529) PARP9 (ENSVVUG00000022523) KPNA1 (ENSVVUG00000022509) FAM162A (ENSVVUG00000022501) MIX23 (ENSVVUG00000022499) CSTA (ENSVVUG00000022498) CASR (ENSVVUG00000022486) CD86 (ENSVVUG00000022471) ILDR1 (ENSVVUG00000022466) ENSVVUG00000022463 ##22 SLC15A2 (ENSVVUG00000022457) ENSVVUG00000022454 EAF2 (ENSVVUG00000022448) IQCB1 (ENSVVUG00000022443) GOLGB1 (ENSVVUG00000022437) HCLS1 (ENSVVUG00000022434) ENSVVUG00000022430 FBXO40 (ENSVVUG00000022425) POLQ (ENSVVUG00000022390) STXBP5L (ENSVVUG00000022321) GTF2E1 (ENSVVUG00000022305) RABL3 (ENSVVUG00000022300) ENSVVUG00000022298 HGD (ENSVVUG00000022291) NDUFB4 (ENSVVUG00000022287) Red fox MODERN SPECIES 26 TAAR5 (ENSVVUG00000018995) ENSVVUG00000019002 VNN1 (ENSVVUG00000019008) ENSVVUG00000019017 SLC18B1 (ENSVVUG00000019018) RPS12 (ENSVVUG00000019024) ENSVVUG00000019039 EYA4 (ENSVVUG00000019046) TCF21 (ENSVVUG00000019073) TBPL1 (ENSVVUG00000019078) SLC2A12 (ENSVVUG00000000065) SGK1 (ENSVVUG00000000114) ENSVVUG00000000216 ##22 ALDH8A1 (ENSVVUG00000000258) HBS1L (ENSVVUG00000000295) MYB (ENSVVUG00000000361) AHI1 (ENSVVUG00000000451) ENSVVUG00000000569 PDE7B (ENSVVUG00000000584) MTFR2 (ENSVVUG00000000593) ENSVVUG00000000603 ENSVVUG00000000623 MAP7 (ENSVVUG00000000652) MAP3K5 (ENSVVUG00000000760) ENSVVUG00000002154 PEX7 (ENSVVUG00000002175) SLC35D3 (ENSVVUG00000002202) IL20RA (ENSVVUG00000002217) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Vaquita MODERN SPECIES 11 CCDC88C (ENSPSNG00000021352) GPR68 (ENSPSNG00000021318) ENSPSNG00000021300 RPS6KA5 (ENSPSNG00000021269) TTC7B (ENSPSNG00000021228) CALM1 (ENSPSNG00000021158) NRDE2 (ENSPSNG00000021107) PSMC1 (ENSPSNG00000021061) KCNK13 (ENSPSNG00000021041) TDP1 (ENSPSNG00000021010) EFCAB11 (ENSPSNG00000020958) ENSPSNG00000020928 FOXN3 (ENSPSNG00000020889) ENSPSNG00000020868 ENSPSNG00000020663 ENSPSNG00000020565 ##22 EML5 (ENSPSNG00000020093) ZC3H14 (ENSPSNG00000019695) PTPN21 (ENSPSNG00000019560) SPATA7 (ENSPSNG00000019491) KCNK10 (ENSPSNG00000019315) GPR65 (ENSPSNG00000019259) GALC (ENSPSNG00000018967) FLRT2 (ENSPSNG00000018890) SEL1L (ENSPSNG00000018743) ENSPSNG00000018578 STON2 (ENSPSNG00000018543) GTF2A1 (ENSPSNG00000018479) TSHR (ENSPSNG00000018230) ENSPSNG00000018188 CEP128 (ENSPSNG00000018150) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Narwhal MODERN SPECIES 297 MSL2 (ENSMMNG00015004058) PCCB (ENSMMNG00015003918) STAG1 (ENSMMNG00015003707) SLC35G2 (ENSMMNG00015003633) NCK1 (ENSMMNG00015003611) IL20RB (ENSMMNG00015003588) SOX14 (ENSMMNG00015003564) ENSMMNG00015003551 CLDN18 (ENSMMNG00015003443) DZIP1L (ENSMMNG00015003319) A4GNT (ENSMMNG00015003300) DBR1 (ENSMMNG00015003277) ARMC8 (ENSMMNG00015002849) NME9 (ENSMMNG00015002708) MRAS (ENSMMNG00015002691) ENSMMNG00015002641 ##22 ESYT3 (ENSMMNG00015002550) CEP70 (ENSMMNG00015002438) FAIM (ENSMMNG00015002383) PIK3CB (ENSMMNG00015002338) FOXL2 (ENSMMNG00015002300) ENSMMNG00015002276 ENSMMNG00015002267 ENSMMNG00015002255 MRPS22 (ENSMMNG00015002233) COPB2 (ENSMMNG00015002153) RBP2 (ENSMMNG00015002106) RBP1 (ENSMMNG00015002084) NMNAT3 (ENSMMNG00015002017) ENSMMNG00015001951 CLSTN2 (ENSMMNG00015001908) Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 19 CCDC178 (ENSCHYG00000014402) KLHL14 (ENSCHYG00000014241) GAREM1 (ENSCHYG00000014077) MEP1B (ENSCHYG00000026672) ENSCHYG00000026650 RNF125 (ENSCHYG00000026634) TRAPPC8 (ENSCHYG00000026442) B4GALT6 (ENSCHYG00000026327) TTR (ENSCHYG00000026307) DSG3 (ENSCHYG00000026242) DSG4 (ENSCHYG00000026207) DSG1 (ENSCHYG00000026189) ENSCHYG00000026180 DSC2 (ENSCHYG00000026115) DSC3 (ENSCHYG00000026008) ENSCHYG00000025965 ##22 ENSCHYG00000025978 ENSCHYG00000025944 CDH2 (ENSCHYG00000025907) CHST9 (ENSCHYG00000025890) AQP4 (ENSCHYG00000025868) KCTD1 (ENSCHYG00000025850) TAF4B (ENSCHYG00000025823) PSMA8 (ENSCHYG00000025804) SS18 (ENSCHYG00000025725) ZNF521 (ENSCHYG00000025646) ENSCHYG00000025622 HRH4 (ENSCHYG00000025602) IMPACT (ENSCHYG00000025487) OSBPL1A (ENSCHYG00000025361) ENSCHYG00000025325 Yarkand deer MODERN SPECIES 9 ENSCHYG00000024161 GSAP (ENSCHYG00000024234) CCDC146 (ENSCHYG00000024657) FGL2 (ENSCHYG00000024744) FAM185A (ENSCHYG00000024761) ENSCHYG00000024825 FBXL13 (ENSCHYG00000024841) ENSCHYG00000024862 ENSCHYG00000024895 NAPEPLD (ENSCHYG00000025014) ENSCHYG00000025058 DNAJC2 (ENSCHYG00000025102) PSMC2 (ENSCHYG00000025139) SLC26A5 (ENSCHYG00000025193) RELN (ENSCHYG00000025795) ENSCHYG00000026098 ##22 ENSCHYG00000026090 ORC5 (ENSCHYG00000026125) LHFPL3 (ENSCHYG00000026230) KMT2E (ENSCHYG00000026291) SRPK2 (ENSCHYG00000026416) ENSCHYG00000026538 PUS7 (ENSCHYG00000026552) RINT1 (ENSCHYG00000026580) EFCAB10 (ENSCHYG00000026608) ATXN7L1 (ENSCHYG00000026654) CDHR3 (ENSCHYG00000026710) ENSCHYG00000026725 NAMPT (ENSCHYG00000026740) PIK3CG (ENSCHYG00000026778) PRKAR2B (ENSCHYG00000004654) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 22 ENSOARG00020000797 YTHDC1 (ENSOARG00020000649) TMPRSS11E (ENSOARG00020000561) TMPRSS11F (ENSOARG00020000512) ENSOARG00020000477 TMPRSS11A (ENSOARG00020000446) TMPRSS11D (ENSOARG00020000420) ENSOARG00020000395 GNRHR (ENSOARG00020000382) STAP1 (ENSOARG00020000371) ENSOARG00020000288 EPHA5 (ENSOARG00020000230) ENSOARG00020024401 ENSOARG00020024397 TECRL (ENSOARG00020024373) ENSOARG00020024357 ##22 ADGRL3 (ENSOARG00020020864) ENSOARG00020020669 IGFBP7 (ENSOARG00020020541) ENSOARG00020020518 POLR2B (ENSOARG00020020250) NOA1 (ENSOARG00020020172) REST (ENSOARG00020020071) ENSOARG00020020007 HOPX (ENSOARG00020019962) ENSOARG00020019924 THEGL (ENSOARG00020019845) SRP72 (ENSOARG00020019666) ENSOARG00020019566 AASDH (ENSOARG00020019446) CEP135 (ENSOARG00020018779) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161576 ENSGT00940000163521 ENSGT00940000159644 ENSGT00940000163102 ENSGT00940000162298 ENSGT00940000163016 ENSGT00940000163314.b ENSGT00940000163105 ENSGT00940000162869 ENSGT01090000260044.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000161098 ENSGT00940000163329 ENSGT00940000160807 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000158537 ENSGT00940000163512 ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.b ENSGT01090000260044.A.b.a.a.b.f.a ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.b ENSGT01090000260044.A.b.a.a.b.e.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.a.d ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.a.b ENSGT01100000263548.a.b.a.m ENSGT01100000263548.b.a.b American bison MODERN SPECIES 3293 ENSBBBG00000014289 ENSBBBG00000014293 ZSCAN9 (ENSBBBG00000014296) ZKSCAN4 (ENSBBBG00000014307) NKAPL (ENSBBBG00000014310) ZSCAN26 (ENSBBBG00000006989) ENSBBBG00000009116 ENSBBBG00000014323 ZSCAN31 (ENSBBBG00000014337) ZSCAN12 (ENSBBBG00000003270) ZSCAN23 (ENSBBBG00000003280) ENSBBBG00000003283 GPX6 (ENSBBBG00000014377) GPX5 (ENSBBBG00000003293) SCAND3 (ENSBBBG00000003300) ENSBBBG00000003317 ##22 TRIM27 (ENSBBBG00000003320) ZNF311 (ENSBBBG00000003327) ENSBBBG00000014440 ENSBBBG00000014447 ENSBBBG00000003341 ENSBBBG00000014486 ENSBBBG00000003361 ENSBBBG00000003368 CLRN2 (ENSBBBG00000014495) QDPR (ENSBBBG00000003397) LDB2 (ENSBBBG00000014565) TAPT1 (ENSBBBG00000014576) PROM1 (ENSBBBG00000003515) FGFBP1 (ENSBBBG00000014610) ENSBBBG00000003529 Bos ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182890.D.c.a.b ENSGT00940000163165 ENSGT00940000161576 ENSGT00940000163521 ENSGT00940000159644 ENSGT00940000163102 ENSGT00940000162298 ENSGT00940000163016 ENSGT00940000163314.b ENSGT00940000163105 ENSGT00940000162869 ENSGT01090000260044.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000161098 ENSGT00940000163329.d ENSGT00940000160807 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000158537 ENSGT00940000163512 ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.b.k.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.b.k.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.b ENSGT01090000260044.A.b.a.a.b.e.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.a.d ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.a.b ENSGT01100000263548.a.b.a.m ENSGT01100000263548.a.b.a.n.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182890.D.c.a.b ENSGT00940000163165 ENSGT00940000161576 ENSGT00940000163521 ENSGT00940000159644 ENSGT00940000163102 ENSGT00940000162298 ENSGT00940000163016 ENSGT00940000163314.b ENSGT00940000163105 ENSGT00940000162869 ENSGT01090000260044.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000161098 ENSGT00940000163329.d ENSGT00940000160807 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000158537 ENSGT00940000163512 ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.b.k.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.b.k.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.b ENSGT01090000260044.A.b.a.a.b.e.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.a.d ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.a.a ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.a.c ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.a.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 15 ZSCAN16 (ENSBIXG00005001404) ZKSCAN8 (ENSBIXG00005012810) ENSBIXG00005012821 ENSBIXG00005012837 ZSCAN9 (ENSBIXG00005012870) ZKSCAN4 (ENSBIXG00005012892) NKAPL (ENSBIXG00005012907) ZSCAN26 (ENSBIXG00005001449) PGBD1 (ENSBIXG00005001458) ZSCAN31 (ENSBIXG00005012968) ZSCAN12 (ENSBIXG00005012992) ENSBIXG00005013020 GPX6 (ENSBIXG00005001492) ENSBIXG00005013084 SCAND3 (ENSBIXG00005013103) ENSBIXG00005013125 ##22 TRIM27 (ENSBIXG00005006336) ZNF311 (ENSBIXG00005013206) ENSBIXG00005013212 ENSBIXG00005013220 OR2W1 (ENSBIXG00005013248) ENSBIXG00005013275 ENSBIXG00005001534 ENSBIXG00005005964 ENSBIXG00005013293 ENSBIXG00005013301 ENSBIXG00005013309 ENSBIXG00005013317 ENSBIXG00005013326 OR2B3 (ENSBIXG00005006724) ENSBIXG00005013350 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163165 ENSGT00940000161576 ENSGT00940000163521 ENSGT00940000159644 ENSGT00940000163102 ENSGT00940000162298 ENSGT00940000163016 ENSGT00940000163314.b ENSGT00940000163105 ENSGT00940000162869 ENSGT01090000260044.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000161098 ENSGT00940000163329.d ENSGT00940000160807 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000158537 ENSGT00940000163512 ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.b.k.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.b ENSGT01090000260044.A.b.a.a.b.e.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.a.d ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.a.b ENSGT01100000263548.a.b.a.m ENSGT01100000263548.b.a.b ENSGT01100000263548.b.a.a.b.d Wild yak DUPLICATION Wild yak MODERN SPECIES 1727 ENSBMUG00000002178 SCAND3 (ENSBMUG00000002192) ENSBMUG00000002212 ##22 TRIM27 (ENSBMUG00000002233) ZNF311 (ENSBMUG00000002263) ENSBMUG00000002273 Wild yak MODERN SPECIES 1744 ENSBMUG00000011820 ENSBMUG00000011809 ENSBMUG00000011799 DEFB114 (ENSBMUG00000011780) ENSBMUG00000011766 CRISP1 (ENSBMUG00000011748) PGK2 (ENSBMUG00000011730) ENSBMUG00000011705 ##22 CRISP3 (ENSBMUG00000011688) CRISP2 (ENSBMUG00000011665) RHAG (ENSBMUG00000011636) ENSBMUG00000011554 GLYATL3 (ENSBMUG00000011547) CENPQ (ENSBMUG00000011535) MMUT (ENSBMUG00000011518) ENSBMUG00000011498 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 23 FBXL13 (ENSBGRG00000011795) LRRC17 (ENSBGRG00000013432) FAM185A (ENSBGRG00000013552) CCDC146 (ENSBGRG00000013877) FGL2 (ENSBGRG00000014055) GSAP (ENSBGRG00000014126) PTPN12 (ENSBGRG00000014871) ENSBGRG00000015273 RSBN1L (ENSBGRG00000015320) ENSBGRG00000015493 TMEM60 (ENSBGRG00000015510) PHTF2 (ENSBGRG00000015566) MAGI2 (ENSBGRG00000016288) ENSBGRG00000019329 ENSBGRG00000019359 ENSBGRG00000019379 ##22 ENSBGRG00000019428 GNAI1 (ENSBGRG00000019449) ENSBGRG00000019597 GNAT3 (ENSBGRG00000019625) CD36 (ENSBGRG00000019844) SEMA3C (ENSBGRG00000020231) ENSBGRG00000020345 ENSBGRG00000020372 HGF (ENSBGRG00000020419) CACNA2D1 (ENSBGRG00000020514) PCLO (ENSBGRG00000021472) SEMA3E (ENSBGRG00000021923) SEMA3A (ENSBGRG00000022242) ENSBGRG00000022512 SEMA3D (ENSBGRG00000022561) Domestic yak MODERN SPECIES 16 ENSBGRG00000015513 ENSBGRG00000015560 ENSBGRG00000015570 ZSCAN9 (ENSBGRG00000015587) ZKSCAN4 (ENSBGRG00000015685) NKAPL (ENSBGRG00000015747) ZSCAN26 (ENSBGRG00000015764) PGBD1 (ENSBGRG00000015853) ZSCAN31 (ENSBGRG00000015898) ZSCAN12 (ENSBGRG00000015969) ENSBGRG00000016064 GPX6 (ENSBGRG00000016142) ENSBGRG00000016229 SCAND3 (ENSBGRG00000016359) ENSBGRG00000016442 ENSBGRG00000016497 ##22 TRIM27 (ENSBGRG00000016574) ZNF311 (ENSBGRG00000016879) OR2W1 (ENSBGRG00000017068) ENSBGRG00000017090 ENSBGRG00000017123 ENSBGRG00000017211 ENSBGRG00000017250 ENSBGRG00000017299 ENSBGRG00000017315 ENSBGRG00000017344 ENSBGRG00000017383 OR2B3 (ENSBGRG00000017536) ENSBGRG00000017620 ENSBGRG00000017637 ENSBGRG00000017766 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Degu MODERN SPECIES 187 STARD10 (ENSODEG00000006015) ATG16L2 (ENSODEG00000007030) ENSODEG00000008989 FCHSD2 (ENSODEG00000006875) ENSODEG00000019749 P2RY2 (ENSODEG00000007272) P2RY6 (ENSODEG00000019427) ARHGEF17 (ENSODEG00000006220) RELT (ENSODEG00000007100) FAM168A (ENSODEG00000008605) ENSODEG00000006010 ENSODEG00000005922 PLEKHB1 (ENSODEG00000006517) RAB6A (ENSODEG00000005942) MRPL48 (ENSODEG00000005929) ENSODEG00000007008 ##22 PAAF1 (ENSODEG00000006842) DNAJB13 (ENSODEG00000009167) UCP2 (ENSODEG00000006654) UCP3 (ENSODEG00000006219) ENSODEG00000006930 PPME1 (ENSODEG00000005995) ENSODEG00000006708 NAALAD2 (ENSODEG00000007241) ENSODEG00000006850 ENSODEG00000006792 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 2970 App (ENSMSIG00000000483) ENSMSIG00000000442 ##22 Gabpa (ENSMSIG00000000354) Atp5j (ENSMSIG00000000322) ENSMSIG00000000201 Mrpl39 (ENSMSIG00000000121) ENSMSIG00000031536 ENSMSIG00000031533 ENSMSIG00000031531 ENSMSIG00000031530 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000185463 ENSGT00940000156502 ENSGT00490000043421 ENSGT00940000158324 ENSGT00940000157135.i ENSGT00940000155525.n ENSGT00390000013555 ENSGT00940000156593 ENSGT00390000018516 ENSGT00940000157150 ENSGT00940000157509 ENSGT00390000012435 ENSGT00510000048466 ENSGT00940000158830 ENSGT00940000161931 ENSGT00950000183029.B.c.a.q.a ##22 ENSGT00940000155369.A ENSGT00390000010799.u.b.a.b.a.a ENSGT00390000007395 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000154514.d.a.b ENSGT00390000005033 ENSGT00940000158712 ENSGT00940000158586 ENSGT00390000012377 ENSGT00940000155658.bb.b ENSGT00730000111477 Sooty mangabey MODERN SPECIES 294 LRR1 (ENSCATG00000042462) ENSCATG00000031196 ENSCATG00000032413 ##22 MDGA2 (ENSCATG00000034636) Drill MODERN SPECIES 1021 ENSMLEG00000029369 ##22 MDGA2 (ENSMLEG00000037408) ENSMLEG00000014402 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.q.b ##22 Degu MODERN SPECIES 127 ENSODEG00000008269 NUBPL (ENSODEG00000008332) ENSODEG00000003785 ENSODEG00000003834 HEATR5A (ENSODEG00000003991) ENSODEG00000019035 HECTD1 (ENSODEG00000004383) ENSODEG00000004725 STRN3 (ENSODEG00000004497) COCH (ENSODEG00000004531) SCFD1 (ENSODEG00000004638) G2E3 (ENSODEG00000004806) ENSODEG00000004710 PRKD1 (ENSODEG00000004844) ENSODEG00000005027 ENSODEG00000019116 ##22 FOXG1 (ENSODEG00000005094) ENSODEG00000005132 ENSODEG00000005143 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Bushbaby MODERN SPECIES 262 EIF2AK3 (ENSOGAG00000008231) TEX37 (ENSOGAG00000024721) ENSOGAG00000029215 ENSOGAG00000024873 THNSL2 (ENSOGAG00000016194) FABP1 (ENSOGAG00000033714) SMYD1 (ENSOGAG00000016185) KRCC1 (ENSOGAG00000016183) ENSOGAG00000014484 ENSOGAG00000007240 CD8A (ENSOGAG00000007233) RMND5A (ENSOGAG00000007229) ENSOGAG00000033216 ENSOGAG00000027674 RNF103 (ENSOGAG00000034488) ENSOGAG00000030818 ##22 KDM3A (ENSOGAG00000011445) REEP1 (ENSOGAG00000004049) MRPL35 (ENSOGAG00000004048) ENSOGAG00000004046 PTCD3 (ENSOGAG00000004040) POLR1A (ENSOGAG00000004031) ST3GAL5 (ENSOGAG00000016459) ATOH8 (ENSOGAG00000025987) SFTPB (ENSOGAG00000012294) USP39 (ENSOGAG00000012291) C2orf68 (ENSOGAG00000033817) TMEM150A (ENSOGAG00000012288) RNF181 (ENSOGAG00000012284) VAMP5 (ENSOGAG00000012283) VAMP8 (ENSOGAG00000012281) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 577 ENSPSMG00000007971 ##22 NDUFAF4 (ENSPSMG00000007981) ENSPSMG00000008003 GLS (ENSPSMG00000008153) STAT1 (ENSPSMG00000008381) STAT4 (ENSPSMG00000008480) ENSPSMG00000008499 MYO1B (ENSPSMG00000008903) NABP1 (ENSPSMG00000009215) CAVIN2 (ENSPSMG00000009231) Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 28 HMGN3 (ENSMICG00000012580) PHIP (ENSMICG00000000134) IRAK1BP1 (ENSMICG00000044942) MEI4 (ENSMICG00000038415) HTR1B (ENSMICG00000012414) ENSMICG00000029528 IMPG1 (ENSMICG00000012422) MYO6 (ENSMICG00000012391) SENP6 (ENSMICG00000005250) FILIP1 (ENSMICG00000031943) TMEM30A (ENSMICG00000015757) COX7A2 (ENSMICG00000015747) COL12A1 (ENSMICG00000015681) CD109 (ENSMICG00000009612) SLC17A5 (ENSMICG00000016403) ENSMICG00000037627 ##22 MTO1 (ENSMICG00000032161) CGAS (ENSMICG00000046397) DDX43 (ENSMICG00000017145) OOEP (ENSMICG00000035829) KHDC3L (ENSMICG00000045560) DPPA5 (ENSMICG00000047987) ENSMICG00000012236 ENSMICG00000046937 CYP39A1 (ENSMICG00000017753) SLC25A27 (ENSMICG00000044777) OR2I1P (ENSMICG00000032426) UBD (ENSMICG00000035072) ENSMICG00000043719 ENSMICG00000046611 KCNQ5 (ENSMICG00000006444) Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ENSMICG00000045193 NUDT11 (ENSMICG00000014540) ENSMICG00000027765 ENSMICG00000038751 SHROOM4 (ENSMICG00000013797) DGKK (ENSMICG00000010584) ENSMICG00000044465 AKAP4 (ENSMICG00000027376) ENSMICG00000036849 CLCN5 (ENSMICG00000002433) ENSMICG00000029745 ENSMICG00000043583 ENSMICG00000037833 USP27X (ENSMICG00000041837) ENSMICG00000034023 ENSMICG00000037290 ##22 ENSMICG00000044560 ENSMICG00000029015 PPP1R3F (ENSMICG00000006403) FOXP3 (ENSMICG00000006391) CCDC22 (ENSMICG00000006380) CACNA1F (ENSMICG00000006356) SYP (ENSMICG00000006351) PRICKLE3 (ENSMICG00000006347) PLP2 (ENSMICG00000006344) MAGIX (ENSMICG00000029530) GPKOW (ENSMICG00000045083) ENSMICG00000034048 WDR45 (ENSMICG00000030259) CCDC120 (ENSMICG00000001966) TFE3 (ENSMICG00000009708) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000153190.A ENSGT00550000075010 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142.j ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b ENSGT00390000002579 ENSGT01010000222313.A.b.a.d ENSGT00390000000954 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT01050000244924.a.b ENSGT00500000044896 ENSGT00940000155315.m ENSGT00940000158610 ENSGT00940000156181.B ENSGT00940000157718 ENSGT00940000157704 ENSGT00390000012596 ENSGT00950000182827.C ENSGT00940000157395 ENSGT00390000006932 ENSGT00390000003182 ENSGT00940000158998 ENSGT00940000156750 ENSGT00940000167990.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000153190.A ENSGT00550000075010 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142.j ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b ENSGT00390000002579 ENSGT01010000222313.A.b.a.d ENSGT00390000000954 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT01050000244924.a.b ENSGT00500000044896 ENSGT00940000155315.m ENSGT00940000158610 ENSGT00940000156181.B ENSGT00940000157718 ENSGT00940000157704 ENSGT00390000012596 ENSGT00950000182827.C ENSGT00940000157395 ENSGT00390000006932 ENSGT00390000003182 ENSGT00940000158998 ENSGT00940000156750 ENSGT00940000167990.a Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153190.A ENSGT00550000075010 ENSGT00950000183047.c.b ENSGT00940000154130.a.a.b ENSGT00510000048142.j ENSGT00510000047658 ENSGT00940000155624.b ENSGT00950000183110.b.b ENSGT00950000182955.a.a.a ENSGT00390000012668 ENSGT00940000160336 ENSGT00940000154539.b ENSGT00390000002579 ENSGT01010000222313.A.b.a.d ENSGT00390000000954 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT01050000244924.a.b ENSGT00500000044896 ENSGT00940000155315.m ENSGT00940000158610 ENSGT00940000156181.B ENSGT00940000157718 ENSGT00940000157704 ENSGT00390000012596 ENSGT00940000157395 ENSGT00390000006932 ENSGT00390000003182 ENSGT00940000158998 ENSGT00940000156750 ENSGT00940000167990.a ENSGT00530000063404.b Bonobo MODERN SPECIES CCDC18 (ENSPPAG00000029331) DR1 (ENSPPAG00000027265) FNBP1L (ENSPPAG00000029809) BCAR3 (ENSPPAG00000029140) DNTTIP2 (ENSPPAG00000044098) GCLM (ENSPPAG00000042369) ABCA4 (ENSPPAG00000035606) ARHGAP29 (ENSPPAG00000020199) ABCD3 (ENSPPAG00000039827) F3 (ENSPPAG00000033102) SLC44A3 (ENSPPAG00000038864) CNN3 (ENSPPAG00000027625) ALG14 (ENSPPAG00000040936) TLCD4 (ENSPPAG00000041461) RWDD3 (ENSPPAG00000027405) ENSPPAG00000034735 ##22 PTBP2 (ENSPPAG00000039951) DPYD (ENSPPAG00000041846) ENSPPAG00000009141 SNX7 (ENSPPAG00000031045) PLPPR5 (ENSPPAG00000035265) PLPPR4 (ENSPPAG00000026148) PALMD (ENSPPAG00000041250) FRRS1 (ENSPPAG00000038944) AGL (ENSPPAG00000036452) ENSPPAG00000040427 SASS6 (ENSPPAG00000031357) TRMT13 (ENSPPAG00000043736) LRRC39 (ENSPPAG00000027298) DBT (ENSPPAG00000028899) ENSPPAG00000015612 Gorilla MODERN SPECIES CCDC18 (ENSGGOG00000016744) DR1 (ENSGGOG00000028511) FNBP1L (ENSGGOG00000015943) BCAR3 (ENSGGOG00000001635) DNTTIP2 (ENSGGOG00000000575) GCLM (ENSGGOG00000016426) ABCA4 (ENSGGOG00000008804) ARHGAP29 (ENSGGOG00000002269) ABCD3 (ENSGGOG00000009815) F3 (ENSGGOG00000014683) SLC44A3 (ENSGGOG00000013852) CNN3 (ENSGGOG00000013870) ALG14 (ENSGGOG00000004834) TLCD4 (ENSGGOG00000023436) RWDD3 (ENSGGOG00000024263) ENSGGOG00000042721 ##22 PTBP2 (ENSGGOG00000000659) ENSGGOG00000041430 ENSGGOG00000024435 ENSGGOG00000037574 ENSGGOG00000040450 SNX7 (ENSGGOG00000023577) PLPPR5 (ENSGGOG00000007608) PLPPR4 (ENSGGOG00000013487) PALMD (ENSGGOG00000017060) ENSGGOG00000003877 AGL (ENSGGOG00000028016) ENSGGOG00000000908 SASS6 (ENSGGOG00000000909) TRMT13 (ENSGGOG00000005616) LRRC39 (ENSGGOG00000016355) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 967 TMOD3 (ENSRROG00000043024) LEO1 (ENSRROG00000036360) ENSRROG00000043470 ENSRROG00000045081 ENSRROG00000041670 ENSRROG00000045330 GNB5 (ENSRROG00000039416) MYO5C (ENSRROG00000044412) ENSRROG00000026589 ENSRROG00000040778 MYO5A (ENSRROG00000041419) ENSRROG00000032116 ENSRROG00000018019 ARPP19 (ENSRROG00000043622) ATOSA (ENSRROG00000031888) ENSRROG00000045385 ##22 ONECUT1 (ENSRROG00000033018) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097.y.a ENSGT00940000162601.m ENSGT00940000154353.B.k.a ENSGT00940000154353.A.o ENSGT00940000154353.A.p ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Mas night monkey MODERN SPECIES 929 PRR32 (ENSANAG00000030781) ENSANAG00000005705 ENSANAG00000038380 ##22 ENSANAG00000034558 ENSANAG00000022590 SMARCA1 (ENSANAG00000023098) OCRL (ENSANAG00000025371) ENSANAG00000023052 XPNPEP2 (ENSANAG00000028579) SASH3 (ENSANAG00000033327) ZDHHC9 (ENSANAG00000029351) ENSANAG00000018118 ENSANAG00000027545 BCORL1 (ENSANAG00000028157) ELF4 (ENSANAG00000032502) AIFM1 (ENSANAG00000033241) RAB33A (ENSANAG00000027971) ZNF280C (ENSANAG00000026195) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097.y.a ENSGT00940000162601.m ENSGT00940000154353.B.k.a ENSGT00940000154353.A.o ENSGT00940000154353.A.p ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Marmoset MODERN SPECIES 11 SPATA9 (ENSCJAG00000010268) GLRX (ENSCJAG00000047220) RHOBTB3 (ENSCJAG00000010252) ELL2 (ENSCJAG00000010200) ENSCJAG00000085801 PCSK1 (ENSCJAG00000010166) ENSCJAG00000085535 CAST (ENSCJAG00000009882) ERAP1 (ENSCJAG00000009832) ENSCJAG00000075310 ERAP2 (ENSCJAG00000009751) LNPEP (ENSCJAG00000009724) ENSCJAG00000085734 RIOK2 (ENSCJAG00000040045) RGMB (ENSCJAG00000009679) ENSCJAG00000074073 ##22 CHD1 (ENSCJAG00000009559) ENSCJAG00000084274 ENSCJAG00000073433 FAM174A (ENSCJAG00000058504) ENSCJAG00000085444 ST8SIA4 (ENSCJAG00000009539) ENSCJAG00000062358 SLCO4C1 (ENSCJAG00000009487) SLCO6A1 (ENSCJAG00000009478) PAM (ENSCJAG00000009287) ENSCJAG00000086630 GIN1 (ENSCJAG00000009265) PPIP5K2 (ENSCJAG00000009127) ENSCJAG00000079708 ENSCJAG00000086987 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097.y.a ENSGT00940000162601.m ENSGT00940000154353.B.k.a ENSGT00940000154353.A.o ENSGT00940000154353.A.p ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Capuchin MODERN SPECIES 370 SYT9 (ENSCCAG00000032564) NLRP14 (ENSCCAG00000033938) ZNF214 (ENSCCAG00000004613) ZNF215 (ENSCCAG00000022492) ENSCCAG00000008025 ENSCCAG00000031715 ##22 ENSCCAG00000003450 OR6A2 (ENSCCAG00000032315) MRPL17 (ENSCCAG00000025049) DCHS1 (ENSCCAG00000029695) TPP1 (ENSCCAG00000036940) TAF10 (ENSCCAG00000034043) ILK (ENSCCAG00000031007) RRP8 (ENSCCAG00000035197) DNHD1 (ENSCCAG00000021762) TIMM10B (ENSCCAG00000020901) ARFIP2 (ENSCCAG00000022412) TRIM3 (ENSCCAG00000022507) HPX (ENSCCAG00000037567) APBB1 (ENSCCAG00000036812) SMPD1 (ENSCCAG00000015662) Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 44 TENT5B (ENSSBOG00000023376) KDF1 (ENSSBOG00000022048) NUDC (ENSSBOG00000035376) NR0B2 (ENSSBOG00000026068) GPATCH3 (ENSSBOG00000019680) GPN2 (ENSSBOG00000031587) ENSSBOG00000021731 SFN (ENSSBOG00000010021) ZDHHC18 (ENSSBOG00000027289) PIGV (ENSSBOG00000031404) ARID1A (ENSSBOG00000021791) THSD7A (ENSSBOG00000022829) ENSSBOG00000027959 PHF14 (ENSSBOG00000033689) ENSSBOG00000019517 ENSSBOG00000015022 ##22 NXPH1 (ENSSBOG00000033774) ICA1 (ENSSBOG00000031664) GLCCI1 (ENSSBOG00000032440) UMAD1 (ENSSBOG00000029436) RPA3 (ENSSBOG00000019538) ENSSBOG00000027188 MIOS (ENSSBOG00000017338) COL28A1 (ENSSBOG00000035682) ENSSBOG00000032452 C1GALT1 (ENSSBOG00000026512) ENSSBOG00000019705 ASNS (ENSSBOG00000031816) TAC1 (ENSSBOG00000031415) SDHAF3 (ENSSBOG00000031188) DLX5 (ENSSBOG00000032115) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 59 ENSSBOG00000030920 UQCRC1 (ENSSBOG00000029522) TMEM89 (ENSSBOG00000029968) SLC26A6 (ENSSBOG00000024978) CELSR3 (ENSSBOG00000024791) NCKIPSD (ENSSBOG00000026578) IP6K2 (ENSSBOG00000034935) ENSSBOG00000034471 FILIP1 (ENSSBOG00000027287) TMEM30A (ENSSBOG00000029847) ENSSBOG00000022493 COL12A1 (ENSSBOG00000029360) ENSSBOG00000032468 CD109 (ENSSBOG00000020327) SLC17A5 (ENSSBOG00000036204) ENSSBOG00000033014 ##22 MTO1 (ENSSBOG00000009456) CGAS (ENSSBOG00000035793) DDX43 (ENSSBOG00000024961) OOEP (ENSSBOG00000020645) KHDC3L (ENSSBOG00000026496) DPPA5 (ENSSBOG00000028113) ENSSBOG00000032311 KCNQ5 (ENSSBOG00000021037) RIMS1 (ENSSBOG00000031761) OGFRL1 (ENSSBOG00000035704) ##35 ENSSBOG00000019180 B3GAT2 (ENSSBOG00000035945) SMAP1 (ENSSBOG00000035623) SDHAF4 (ENSSBOG00000033365) FAM135A (ENSSBOG00000035417) Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6692 ENSTSYG00000036684 ##22 GDAP1 (ENSTSYG00000032474) JPH1 (ENSTSYG00000011287) LY96 (ENSTSYG00000000506) TMEM70 (ENSTSYG00000008347) ELOC (ENSTSYG00000035894) UBE2W (ENSTSYG00000026065) Tarsier MODERN SPECIES 4911 ZNF236 (ENSTSYG00000005130) ENSTSYG00000031175 ##22 ENSTSYG00000028801 MBP (ENSTSYG00000005132) GALR1 (ENSTSYG00000004590) ENSTSYG00000030167 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Glires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000162741.j ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Rabbit MODERN SPECIES 464 ENSOCUG00000016676 ENSOCUG00000031590 MTM1 (ENSOCUG00000016688) MTMR1 (ENSOCUG00000016698) CD99L2 (ENSOCUG00000016710) ENSOCUG00000005986 GPR50 (ENSOCUG00000005566) ENSOCUG00000000669 VMA21 (ENSOCUG00000015201) ENSOCUG00000035408 ##22 ENSOCUG00000029659 CNGA2 (ENSOCUG00000009436) ENSOCUG00000016680 ENSOCUG00000029792 GABRE (ENSOCUG00000009667) GABRA3 (ENSOCUG00000008480) ENSOCUG00000036442 GABRQ (ENSOCUG00000007888) ENSOCUG00000024582 CETN2 (ENSOCUG00000007897) NSDHL (ENSOCUG00000007899) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B Kangaroo rat MODERN SPECIES 525 ENSDORG00000028829 Cd109 (ENSDORG00000014659) Slc17a5 (ENSDORG00000009247) Eef1a1 (ENSDORG00000009629) ##22 Mto1 (ENSDORG00000015529) Cgas (ENSDORG00000013413) Ddx43 (ENSDORG00000030010) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 76 ENSJJAG00000008502 Filip1 (ENSJJAG00000014437) Tmem30a (ENSJJAG00000015851) Cox7a2 (ENSJJAG00000019442) ENSJJAG00000002895 Col12a1 (ENSJJAG00000021947) ENSJJAG00000004765 ENSJJAG00000013875 ENSJJAG00000008007 #12 Cd109 (ENSJJAG00000018810) ENSJJAG00000009738 ENSJJAG00000020395 ENSJJAG00000019028 ENSJJAG00000023397 Slc17a5 (ENSJJAG00000012671) Eef1a1 (ENSJJAG00000021540) ##22 Mto1 (ENSJJAG00000006640) ENSJJAG00000022559 ENSJJAG00000011048 ENSJJAG00000013895 ENSJJAG00000001533 Ddx43 (ENSJJAG00000014184) ENSJJAG00000009351 ENSJJAG00000008740 Dppa5a (ENSJJAG00000013320) ENSJJAG00000015392 Cilk1 (ENSJJAG00000012304) Fbxo9 (ENSJJAG00000007174) ENSJJAG00000010724 ENSJJAG00000010959 ENSJJAG00000022091 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B ENSGT00860000135208 ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 Murinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B ENSGT00860000135208 ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 Mus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00860000135208 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B.j ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00860000135208.b.a.a ENSGT00860000135208.a ENSGT00860000135208.b.a.b ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B.j ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00860000135208.b.a.a ENSGT00860000135208.a ENSGT00860000135208.b.a.b ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b Mouse MODERN SPECIES 18 Lca5 (ENSMUSG00000032258) Hmgn3 (ENSMUSG00000066456) Phip (ENSMUSG00000032253) Irak1bp1 (ENSMUSG00000032251) Mei4 (ENSMUSG00000043289) Htr1b (ENSMUSG00000049511) Impg1 (ENSMUSG00000032343) Myo6 (ENSMUSG00000033577) Senp6 (ENSMUSG00000034252) Filip1 (ENSMUSG00000034898) Tmem30a (ENSMUSG00000032328) Cox7a2 (ENSMUSG00000032330) Col12a1 (ENSMUSG00000032332) Cd109 (ENSMUSG00000046186) Slc17a5 (ENSMUSG00000049624) Eef1a1 (ENSMUSG00000037742) ##22 Mto1 (ENSMUSG00000032342) Cgas (ENSMUSG00000032344) Ddx43 (ENSMUSG00000070291) Ooep (ENSMUSG00000032346) Dppa5a (ENSMUSG00000060461) Gsta2 (ENSMUSG00000057933) Omt2b (ENSMUSG00000038750) Omt2a (ENSMUSG00000066463) Gsta5 (ENSMUSG00000074179) Gm3776 (ENSMUSG00000111709) Gsta1 (ENSMUSG00000074183) Gsta4 (ENSMUSG00000032348) Cilk1 (ENSMUSG00000009828) Fbxo9 (ENSMUSG00000001366) Gcm1 (ENSMUSG00000023333) Shrew mouse MODERN SPECIES 1 Lca5 (MGP_PahariEiJ_G0015352) Hmgn3 (MGP_PahariEiJ_G0015351) Phip (MGP_PahariEiJ_G0015350) Irak1bp1 (MGP_PahariEiJ_G0015349) Mei4 (MGP_PahariEiJ_G0015348) Htr1b (MGP_PahariEiJ_G0015347) Impg1 (MGP_PahariEiJ_G0015346) Myo6 (MGP_PahariEiJ_G0015345) Senp6 (MGP_PahariEiJ_G0015344) Filip1 (MGP_PahariEiJ_G0015343) Tmem30a (MGP_PahariEiJ_G0015342) Cox7a2 (MGP_PahariEiJ_G0015341) Col12a1 (MGP_PahariEiJ_G0015340) Cd109 (MGP_PahariEiJ_G0015339) Slc17a5 (MGP_PahariEiJ_G0015338) Eef1a1 (MGP_PahariEiJ_G0015337) ##22 Mto1 (MGP_PahariEiJ_G0015336) MGP_PahariEiJ_G0015335 Cgas (MGP_PahariEiJ_G0015334) Ddx43 (MGP_PahariEiJ_G0015333) Ooep (MGP_PahariEiJ_G0015332) MGP_PahariEiJ_G0015331 MGP_PahariEiJ_G0015330 MGP_PahariEiJ_G0015329 MGP_PahariEiJ_G0015328 Gsta4 (MGP_PahariEiJ_G0015326) Cilk1 (MGP_PahariEiJ_G0015325) Fbxo9 (MGP_PahariEiJ_G0015324) Gcm1 (MGP_PahariEiJ_G0015323) Elovl5 (MGP_PahariEiJ_G0015322) MGP_PahariEiJ_G0015321 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 18 Mei4 (ENSRNOG00000023794) Htr1b (ENSRNOG00000013042) Impg1 (ENSRNOG00000012479) Myo6 (ENSRNOG00000011852) Senp6 (ENSRNOG00000024336) Filip1 (ENSRNOG00000011521) Tmem30a (ENSRNOG00000010895) ENSRNOG00000010657 Cox7a2 (ENSRNOG00000042903) LOC103690438 (ENSRNOG00000062056) Col12a1 (ENSRNOG00000058470) LOC100363141 (ENSRNOG00000063215) LOC100363141 (ENSRNOG00000056662) ENSRNOG00000031132 Cd109 (ENSRNOG00000025332) Eef1a1 (ENSRNOG00000009439) ##22 ENSRNOG00000070285 Mto1 (ENSRNOG00000037659) Cgas (ENSRNOG00000046191) Ddx43 (ENSRNOG00000050868) AABR07070824.1 (ENSRNOG00000050216) Ooep (ENSRNOG00000025957) RGD1559995 (ENSRNOG00000000199) Gsta2 (ENSRNOG00000029861) AABR07070816.3 (ENSRNOG00000056051) Gsta5 (ENSRNOG00000000201) Gsta4 (ENSRNOG00000030449) Rpl12-ps1 (ENSRNOG00000061579) Cilk1 (ENSRNOG00000008691) Fbxo9 (ENSRNOG00000008214) Gcm1 (ENSRNOG00000007932) Rat MODERN SPECIES 46 Ctag2 (ENSRNOG00000012560) AABR07042226.1 (ENSRNOG00000058521) LOC120099343 (ENSRNOG00000066658) Slitrk2 (ENSRNOG00000011562) LOC689396 (ENSRNOG00000032418) ENSRNOG00000067514 AABR07042293.1 (ENSRNOG00000037381) LOC100912196 (ENSRNOG00000062315) Fam9c (ENSRNOG00000069253) ENSRNOG00000069396 AABR07042418.1 (ENSRNOG00000051726) Fmr1 (ENSRNOG00000057464) Fmr1nb (ENSRNOG00000053397) LOC689600 (ENSRNOG00000067249) Aff2 (ENSRNOG00000052572) LOC100360413 (ENSRNOG00000051885) ##22 LOC689600 (ENSRNOG00000064273) Ids (ENSRNOG00000001465) Eola2 (ENSRNOG00000063254) LOC120099181 (ENSRNOG00000050915) Tmem185a (ENSRNOG00000011047) Hmgb3 (ENSRNOG00000011096) Rpsa-ps4 (ENSRNOG00000022882) Gpr50 (ENSRNOG00000011335) Vma21 (ENSRNOG00000048606) RGD1561481 (ENSRNOG00000064535) RGD1308750 (ENSRNOG00000048356) Pasd1 (ENSRNOG00000061428) Prrg3 (ENSRNOG00000066176) ENSRNOG00000069761 Tuba1c (ENSRNOG00000015544) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B ENSGT00860000135208 ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000154353.B ENSGT00860000135208 ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00940000154025.b Golden Hamster MODERN SPECIES 658 Irak1bp1 (ENSMAUG00000012484) Mei4 (ENSMAUG00000016599) Htr1b (ENSMAUG00000006620) ENSMAUG00000000782 Impg1 (ENSMAUG00000001564) Myo6 (ENSMAUG00000005286) Senp6 (ENSMAUG00000012039) Filip1 (ENSMAUG00000017069) Tmem30a (ENSMAUG00000019655) Cox7a2 (ENSMAUG00000008392) Col12a1 (ENSMAUG00000013245) ENSMAUG00000008464 ENSMAUG00000009878 Cd109 (ENSMAUG00000019038) Slc17a5 (ENSMAUG00000017608) Eef1a1 (ENSMAUG00000022005) ##22 Mto1 (ENSMAUG00000021565) ENSMAUG00000007390 Ddx43 (ENSMAUG00000001441) Dppa5a (ENSMAUG00000021918) ENSMAUG00000015526 Gsta4 (ENSMAUG00000009682) Cilk1 (ENSMAUG00000001197) Fbxo9 (ENSMAUG00000019094) Gcm1 (ENSMAUG00000011356) Elovl5 (ENSMAUG00000001277) Gclc (ENSMAUG00000014564) Klhl31 (ENSMAUG00000020848) Lrrc1 (ENSMAUG00000008978) Mlip (ENSMAUG00000011161) Tinag (ENSMAUG00000018690) Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 ENSCGRG00001015559 Gorab (ENSCGRG00001011913) Prrx1 (ENSCGRG00001015124) Fmo3 (ENSCGRG00001023190) Fmo6 (ENSCGRG00001024925) Fmo2 (ENSCGRG00001002790) Fmo1 (ENSCGRG00001016169) Fmo4 (ENSCGRG00001009519) Prrc2c (ENSCGRG00001018074) Myocos (ENSCGRG00001024195) Myoc (ENSCGRG00001024390) ENSCGRG00001021945 Mettl13 (ENSCGRG00001014417) Dnm3 (ENSCGRG00001006319) ENSCGRG00001016808 ENSCGRG00001019129 ##22 Pigc (ENSCGRG00001004968) ENSCGRG00001012607 Suco (ENSCGRG00001018892) Fasl (ENSCGRG00001018720) Tnfsf18 (ENSCGRG00001013049) Tnfsf4 (ENSCGRG00001013801) ENSCGRG00001000609 Ankrd45 (ENSCGRG00001016754) Klhl20 (ENSCGRG00001023082) Cenpl (ENSCGRG00001017145) Dars2 (ENSCGRG00001021217) Zbtb37 (ENSCGRG00001010444) Serpinc1 (ENSCGRG00001013087) Rc3h1 (ENSCGRG00001020812) ENSCGRG00001012330 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 284 Irak1bp1 (ENSCGRG00001021968) Mei4 (ENSCGRG00001016059) Htr1b (ENSCGRG00001012010) ENSCGRG00001011114 ENSCGRG00001004664 Impg1 (ENSCGRG00001012701) Myo6 (ENSCGRG00001024878) Senp6 (ENSCGRG00001014659) ENSCGRG00001001212 Filip1 (ENSCGRG00001013402) Tmem30a (ENSCGRG00001015376) ENSCGRG00001017831 Col12a1 (ENSCGRG00001000858) Cd109 (ENSCGRG00001017958) Slc17a5 (ENSCGRG00001023838) EEF1A1 (ENSCGRG00001000419) ##22 Mto1 (ENSCGRG00001022063) ENSCGRG00001011641 Cgas (ENSCGRG00001023109) Ddx43 (ENSCGRG00001001145) ENSCGRG00001011570 ENSCGRG00001012853 ENSCGRG00001015955 ENSCGRG00001004595 ENSCGRG00001024170 ENSCGRG00001003804 Gsta4 (ENSCGRG00001017948) Cilk1 (ENSCGRG00001019252) Fbxo9 (ENSCGRG00001024064) Gcm1 (ENSCGRG00001024591) ELOVL5 (ENSCGRG00001012477) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000154353.B ENSGT00860000135208 ENSGT00940000154526.h.i.a ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Phip (ENSPEMG00000026362) Irak1bp1 (ENSPEMG00000022100) Mei4 (ENSPEMG00000030383) Htr1b (ENSPEMG00000027052) Impg1 (ENSPEMG00000020924) Myo6 (ENSPEMG00000021427) Senp6 (ENSPEMG00000022303) Filip1 (ENSPEMG00000021321) Tmem30a (ENSPEMG00000020940) ENSPEMG00000022304 Col12a1 (ENSPEMG00000023006) ENSPEMG00000025784 ENSPEMG00000019322 Cd109 (ENSPEMG00000023373) Slc17a5 (ENSPEMG00000022441) Eef1a1 (ENSPEMG00000024174) ##22 Mto1 (ENSPEMG00000024015) Cgas (ENSPEMG00000022880) Ddx43 (ENSPEMG00000023986) ENSPEMG00000029820 Dppa5a (ENSPEMG00000029152) ENSPEMG00000028681 ENSPEMG00000023102 ENSPEMG00000030561 ENSPEMG00000025925 ENSPEMG00000023344 ENSPEMG00000019489 ENSPEMG00000019623 Minar1 (ENSPEMG00000019747) Tmed3 (ENSPEMG00000019885) Ankrd34c (ENSPEMG00000020141) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 143 ENSMOCG00000013098 ENSMOCG00000000112 ENSMOCG00000016226 ##22 Chil5 (ENSMOCG00000016005) Pifo (ENSMOCG00000007744) Ovgp1 (ENSMOCG00000007897) Wdr77 (ENSMOCG00000000531) ENSMOCG00000018208 I830077J02Rik (ENSMOCG00000001066) Adora3 (ENSMOCG00000009194) Rap1a (ENSMOCG00000002767) Inka2 (ENSMOCG00000012240) Ddx20 (ENSMOCG00000012954) Kcnd3 (ENSMOCG00000019614) Cttnbp2nl (ENSMOCG00000014559) Wnt2b (ENSMOCG00000013588) St7l (ENSMOCG00000020030) Capza1 (ENSMOCG00000007375) Prairie vole MODERN SPECIES 13 ENSMOCG00000002829 Phip (ENSMOCG00000002398) Irak1bp1 (ENSMOCG00000013631) Mei4 (ENSMOCG00000010881) ENSMOCG00000013276 Htr1b (ENSMOCG00000007114) Impg1 (ENSMOCG00000006169) Myo6 (ENSMOCG00000005996) Senp6 (ENSMOCG00000002123) Filip1 (ENSMOCG00000001866) Tmem30a (ENSMOCG00000018992) ENSMOCG00000010157 Col12a1 (ENSMOCG00000003044) Cd109 (ENSMOCG00000004552) Slc17a5 (ENSMOCG00000019625) Eef1a1 (ENSMOCG00000009629) ##22 Mto1 (ENSMOCG00000018371) ENSMOCG00000012903 Cgas (ENSMOCG00000007340) Ddx43 (ENSMOCG00000012956) Dppa5a (ENSMOCG00000020488) ENSMOCG00000021748 ENSMOCG00000022015 ENSMOCG00000011965 ENSMOCG00000002100 ENSMOCG00000005851 Gsta4 (ENSMOCG00000013784) ENSMOCG00000012974 Cilk1 (ENSMOCG00000019502) Fbxo9 (ENSMOCG00000014301) Gcm1 (ENSMOCG00000018733) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1746 Rnf167 (ENSNGAG00000017627) Slc25a11 (ENSNGAG00000017111) Chrne (ENSNGAG00000021566) Mink1 (ENSNGAG00000018553) Pld2 (ENSNGAG00000011882) Gm40193 (ENSNGAG00000007167) Psmb6 (ENSNGAG00000003013) Gltpd2 (ENSNGAG00000001622) Vmo1 (ENSNGAG00000020313) Tm4sf5 (ENSNGAG00000019374) Zmynd15 (ENSNGAG00000008316) ENSNGAG00000001487 Med11 (ENSNGAG00000023193) Arrb2 (ENSNGAG00000022180) Pelp1 (ENSNGAG00000011496) ENSNGAG00000000876 ##22 Alox12e (ENSNGAG00000022388) ENSNGAG00000021978 Alox12 (ENSNGAG00000021693) Rnasek (ENSNGAG00000021419) 0610010K14Rik (ENSNGAG00000019863) Bcl6b (ENSNGAG00000017106) Slc16a11 (ENSNGAG00000024329) Slc16a13 (ENSNGAG00000024247) ENSNGAG00000024124 Asgr2 (ENSNGAG00000023552) Asgr1 (ENSNGAG00000022038) Dlg4 (ENSNGAG00000014371) Acadvl (ENSNGAG00000009001) Dvl2 (ENSNGAG00000021399) Phf23 (ENSNGAG00000019840) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1313 Slc17a5 (ENSNGAG00000000784) Eef1a1 (ENSNGAG00000021594) ##22 Mto1 (ENSNGAG00000015680) Cgas (ENSNGAG00000022480) Ddx43 (ENSNGAG00000015102) ENSNGAG00000021266 ENSNGAG00000016206 ENSNGAG00000011229 ENSNGAG00000002214 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000266454 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 16 ENSSVLG00005007097 ENSSVLG00005007111 ENSSVLG00005007127 IMPG1 (ENSSVLG00005007176) ENSSVLG00005007304 MYO6 (ENSSVLG00005007369) ENSSVLG00005007494 ENSSVLG00005007543 FILIP1 (ENSSVLG00005007573) TMEM30A (ENSSVLG00005007677) ENSSVLG00005007826 COL12A1 (ENSSVLG00005007966) ENSSVLG00005008331 CD109 (ENSSVLG00005008389) SLC17A5 (ENSSVLG00005008448) ENSSVLG00005008471 ##22 ENSSVLG00005008560 CGAS (ENSSVLG00005008686) DDX43 (ENSSVLG00005008735) ENSSVLG00005008820 ENSSVLG00005008843 DPPA5 (ENSSVLG00005008877) ENSSVLG00005008906 KCNQ5 (ENSSVLG00005009032) ENSSVLG00005009444 ENSSVLG00005009453 RIMS1 (ENSSVLG00005009840) OGFRL1 (ENSSVLG00005012614) ##35 B3GAT2 (ENSSVLG00005012729) SMAP1 (ENSSVLG00005012850) SDHAF4 (ENSSVLG00005013015) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 20 ENSMMMG00000003553 CD109 (ENSMMMG00000003475) SLC17A5 (ENSMMMG00000003439) ENSMMMG00000003421 ENSMMMG00000003132 ##22 MTO1 (ENSMMMG00000003047) CGAS (ENSMMMG00000003022) ENSMMMG00000002997 ENSMMMG00000002973 ENSMMMG00000002966 ENSMMMG00000002946 ENSMMMG00000002931 DPPA5 (ENSMMMG00000002922) ENSMMMG00000002902 KCNQ5 (ENSMMMG00000002823) ENSMMMG00000002799 ENSMMMG00000002781 OGFRL1 (ENSMMMG00000002689) ##35 B3GAT2 (ENSMMMG00000002676) SMAP1 (ENSMMMG00000002610) Alpin marmot MODERN SPECIES 2 CALHM6 (ENSMMMG00000015349) DSE (ENSMMMG00000015341) TSPYL4 (ENSMMMG00000015326) ENSMMMG00000015321 ENSMMMG00000015316 FRK (ENSMMMG00000015306) HS3ST5 (ENSMMMG00000015290) HDAC2 (ENSMMMG00000015264) ENSMMMG00000015261 LAMA4 (ENSMMMG00000015194) FAM229B (ENSMMMG00000015179) TUBE1 (ENSMMMG00000015165) CCN6 (ENSMMMG00000015161) FYN (ENSMMMG00000014912) TRAF3IP2 (ENSMMMG00000014896) ENSMMMG00000014893 ##22 REV3L (ENSMMMG00000014848) ENSMMMG00000014825 ENSMMMG00000014818 ENSMMMG00000014808 ENSMMMG00000014803 ENSMMMG00000014777 ENSMMMG00000014760 SLC16A10 (ENSMMMG00000014746) RPF2 (ENSMMMG00000014732) ENSMMMG00000014718 CDK19 (ENSMMMG00000014687) SLC22A16 (ENSMMMG00000014660) DDO (ENSMMMG00000014615) METTL24 (ENSMMMG00000014600) CDC40 (ENSMMMG00000014580) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Squirrel MODERN SPECIES 458 CD109 (ENSSTOG00000030419) ENSSTOG00000026847 ENSSTOG00000029449 MTO1 (ENSSTOG00000007666) ENSSTOG00000007687 ##22 ENSSTOG00000033587 ENSSTOG00000032538 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 ENSHGLG00000003841 ENSHGLG00000011562 ECT2 (ENSHGLG00000011074) NCEH1 (ENSHGLG00000010683) TNFSF10 (ENSHGLG00000044629) GHSR (ENSHGLG00000014950) FNDC3B (ENSHGLG00000014877) TMEM212 (ENSHGLG00000014698) PLD1 (ENSHGLG00000014314) TNIK (ENSHGLG00000013310) SLC2A2 (ENSHGLG00000049404) ENSHGLG00000012647 RPL22L1 (ENSHGLG00000045881) ENSHGLG00000046725 SLC7A14 (ENSHGLG00000012232) ENSHGLG00000049917 ##22 ENSHGLG00000037289 CLDN11 (ENSHGLG00000043741) ENSHGLG00000032237 SKIL (ENSHGLG00000011598) PRKCI (ENSHGLG00000011160) PHC3 (ENSHGLG00000014756) ENSHGLG00000038474 GPR160 (ENSHGLG00000040630) ENSHGLG00000047648 ENSHGLG00000014414 SAMD7 (ENSHGLG00000014079) LRRIQ4 (ENSHGLG00000043637) LRRC34 (ENSHGLG00000013840) MYNN (ENSHGLG00000012975) ACTRT3 (ENSHGLG00000012802) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES 39 MEIG1 (ENSCPOG00000033793) DCLRE1C (ENSCPOG00000002724) SUV39H2 (ENSCPOG00000008492) MSANTD7 (ENSCPOG00000031225) HSPA14 (ENSCPOG00000008489) CDNF (ENSCPOG00000038576) ENSCPOG00000032147 FRMD4A (ENSCPOG00000001529) PRPF18 (ENSCPOG00000021069) ENSCPOG00000002714 SEPHS1 (ENSCPOG00000005549) BAMBI (ENSCPOG00000034429) ENSCPOG00000000268 ENSCPOG00000010457 ##22 MAP3K8 (ENSCPOG00000006641) MTPAP (ENSCPOG00000004018) JCAD (ENSCPOG00000005872) SVIL (ENSCPOG00000013047) ZNF438 (ENSCPOG00000000531) ZEB1 (ENSCPOG00000007682) ARHGAP12 (ENSCPOG00000005846) KIF5B (ENSCPOG00000008278) EPC1 (ENSCPOG00000002494) DHTKD1 (ENSCPOG00000008248) SEC61A2 (ENSCPOG00000000126) NUDT5 (ENSCPOG00000000127) CDC123 (ENSCPOG00000000128) CAMK1D (ENSCPOG00000003027) OPTN (ENSCPOG00000007560) Guinea pig MODERN SPECIES 54 MRPS35 (ENSCPOG00000010714) ENSCPOG00000003094 KLHL42 (ENSCPOG00000003096) PTHLH (ENSCPOG00000014964) ENSCPOG00000039058 CCDC91 (ENSCPOG00000009109) FAR2 (ENSCPOG00000007356) ERGIC2 (ENSCPOG00000015668) TMTC1 (ENSCPOG00000014889) IPO8 (ENSCPOG00000010365) CAPRIN2 (ENSCPOG00000006625) SINHCAF (ENSCPOG00000031402) DENND5B (ENSCPOG00000005517) ENSCPOG00000008943 AMN1 (ENSCPOG00000032967) ENSCPOG00000038662 ##22 ENSCPOG00000027414 ENSCPOG00000032610 BICD1 (ENSCPOG00000001551) FGD4 (ENSCPOG00000015271) DNM1L (ENSCPOG00000015273) YARS2 (ENSCPOG00000015276) PKP2 (ENSCPOG00000012340) SYT10 (ENSCPOG00000006918) ENSCPOG00000040138 CPNE8 (ENSCPOG00000008877) KIF21A (ENSCPOG00000010726) ABCD2 (ENSCPOG00000010205) SLC2A13 (ENSCPOG00000010774) LRRK2 (ENSCPOG00000007935) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 115 ENSODEG00000005234 ENSODEG00000005598 ENSODEG00000004546 ENSODEG00000004740 ENSODEG00000006568 ENSODEG00000006845 FNBP1L (ENSODEG00000006211) ENSODEG00000019152 ENSODEG00000019219 DR1 (ENSODEG00000006106) ENSODEG00000019300 CCDC18 (ENSODEG00000005096) ENSODEG00000004565 TMED5 (ENSODEG00000005461) MTF2 (ENSODEG00000005685) ENSODEG00000019282 ##22 DIPK1A (ENSODEG00000006544) ENSODEG00000005413 ENSODEG00000006057 ENSODEG00000006410 ENSODEG00000004664 ENSODEG00000004891 GLMN (ENSODEG00000005188) C1orf146 (ENSODEG00000005893) ENSODEG00000019394 BTBD8 (ENSODEG00000006488) ENSODEG00000007844 ENSODEG00000005277 EPHX4 (ENSODEG00000005661) BRDT (ENSODEG00000006335) ENSODEG00000005197 Degu MODERN SPECIES 48 ENSODEG00000011736 CCDC80 (ENSODEG00000016068) SLC35A5 (ENSODEG00000011033) ENSODEG00000011061 BTLA (ENSODEG00000010916) CD200 (ENSODEG00000012395) ENSODEG00000012231 SLC9C1 (ENSODEG00000011809) GCSAM (ENSODEG00000010735) C3orf52 (ENSODEG00000012645) ENSODEG00000011041 TMPRSS7 (ENSODEG00000013342) TAGLN3 (ENSODEG00000011777) ABHD10 (ENSODEG00000012002) PHLDB2 (ENSODEG00000010850) ENSODEG00000019911 ##22 PLCXD2 (ENSODEG00000012093) CD96 (ENSODEG00000011641) NECTIN3 (ENSODEG00000011126) ENSODEG00000011279 ENSODEG00000020046 ENSODEG00000011370 ENSODEG00000012051 ENSODEG00000012309 ENSODEG00000012512 ENSODEG00000011541 SEL1L (ENSODEG00000012682) STON2 (ENSODEG00000012136) ENSODEG00000013306 ENSODEG00000013483 ENSODEG00000019902 Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Theria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000162741.j ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Horse MODERN SPECIES 10 NECTIN3 (ENSECAG00000006637) ZBED2 (ENSECAG00000001371) CD96 (ENSECAG00000036315) ENSECAG00000057895 ENSECAG00000036214 PHLDB2 (ENSECAG00000016613) ABHD10 (ENSECAG00000013617) TAGLN3 (ENSECAG00000009793) TMPRSS7 (ENSECAG00000003906) C19H3orf52 (ENSECAG00000022902) GCSAM (ENSECAG00000042563) SLC9C1 (ENSECAG00000020986) ENSECAG00000028148 CD200 (ENSECAG00000017925) ENSECAG00000039007 ENSECAG00000005234 ##22 BTLA (ENSECAG00000016436) ATG3 (ENSECAG00000011954) SLC35A5 (ENSECAG00000005098) CCDC80 (ENSECAG00000019861) ENSECAG00000017717 ENSECAG00000015753 GTPBP8 (ENSECAG00000012554) NEPRO (ENSECAG00000009354) BOC (ENSECAG00000022602) CFAP44 (ENSECAG00000020163) SPICE1 (ENSECAG00000014542) USF3 (ENSECAG00000024549) SIDT1 (ENSECAG00000024677) NAA50 (ENSECAG00000023208) ATP6V1A (ENSECAG00000021773) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 16 RHOBTB1 (ENSAMEG00000003559) ENSAMEG00000026047 TMEM26 (ENSAMEG00000003591) ENSAMEG00000027322 CABCOCO1 (ENSAMEG00000003617) ARID5B (ENSAMEG00000003626) RTKN2 (ENSAMEG00000003646) ZNF365 (ENSAMEG00000025122) ADO (ENSAMEG00000031507) EGR2 (ENSAMEG00000026807) NRBF2 (ENSAMEG00000009590) JMJD1C (ENSAMEG00000009563) REEP3 (ENSAMEG00000009500) CTNNA3 (ENSAMEG00000024140) ENSAMEG00000024224 ENSAMEG00000030196 ##22 LRRTM3 (ENSAMEG00000017141) DNAJC12 (ENSAMEG00000018124) SIRT1 (ENSAMEG00000018117) HERC4 (ENSAMEG00000018102) ENSAMEG00000018099 MYPN (ENSAMEG00000018087) ATOH7 (ENSAMEG00000019067) PBLD (ENSAMEG00000018075) HNRNPH3 (ENSAMEG00000018064) RUFY2 (ENSAMEG00000018039) DNA2 (ENSAMEG00000018028) SLC25A16 (ENSAMEG00000018012) TET1 (ENSAMEG00000018009) CCAR1 (ENSAMEG00000018003) STOX1 (ENSAMEG00000018002) Giant Panda MODERN SPECIES 2288 ENSAMEG00000005525 GYG2 (ENSAMEG00000005507) ARSD (ENSAMEG00000005477) ARSH (ENSAMEG00000005400) ARSF (ENSAMEG00000005388) MXRA5 (ENSAMEG00000005372) PRKX (ENSAMEG00000005348) ENSAMEG00000027159 ENSAMEG00000001506 STS (ENSAMEG00000001445) PNPLA4 (ENSAMEG00000012515) ENSAMEG00000006830 ENSAMEG00000030203 ENSAMEG00000030660 ENSAMEG00000014903 ENSAMEG00000010492 ##22 ENSAMEG00000015133 ENSAMEG00000009277 SHROOM2 (ENSAMEG00000004939) WWC3 (ENSAMEG00000010338) CLCN4 (ENSAMEG00000010265) ENSAMEG00000010220 HCCS (ENSAMEG00000010198) ENSAMEG00000010177 AMELX (ENSAMEG00000010171) MSL3 (ENSAMEG00000010145) FRMPD4 (ENSAMEG00000010130) ENSAMEG00000019784 PRPS2 (ENSAMEG00000010106) TLR7 (ENSAMEG00000019777) TLR8 (ENSAMEG00000019770) Canidae ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00400000024746.h ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00400000024746.g ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Red fox MODERN SPECIES NEDD4 (ENSVVUG00000000843) ENSVVUG00000000785 PRTG (ENSVVUG00000000755) PYGO1 (ENSVVUG00000000736) DNAAF4 (ENSVVUG00000000666) ENSVVUG00000000655 CCPG1 (ENSVVUG00000000630) PIGB (ENSVVUG00000000616) RAB27A (ENSVVUG00000000413) RSL24D1 (ENSVVUG00000000235) UNC13C (ENSVVUG00000000196) WDR72 (ENSVVUG00000000068) ENSVVUG00000000027 ONECUT1 (ENSVVUG00000000018) FAM214A (ENSVVUG00000000015) ENSVVUG00000000014 ##22 ENSVVUG00000000013 ENSVVUG00000000012 MYO5A (ENSVVUG00000000011) MYO5C (ENSVVUG00000000010) GNB5 (ENSVVUG00000000009) ENSVVUG00000000008 MAPK6 (ENSVVUG00000000007) LEO1 (ENSVVUG00000000006) TMOD3 (ENSVVUG00000000005) TMOD2 (ENSVVUG00000000004) LYSMD2 (ENSVVUG00000000003) SCG3 (ENSVVUG00000000002) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00400000024746.h ENSGT00950000183029.B.c.a.h ##22 ENSGT00400000024746.g ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Dog MODERN SPECIES 4 ENPP2 (ENSCAFG00845005953) CCN3 (ENSCAFG00845005703) MAL2 (ENSCAFG00845005680) COLEC10 (ENSCAFG00845005655) ENSCAFG00845005645 TNFRSF11B (ENSCAFG00845005623) SAMD12 (ENSCAFG00845014607) EXT1 (ENSCAFG00845014539) MED30 (ENSCAFG00845014503) SLC30A8 (ENSCAFG00845014466) ENSCAFG00845014379 RAD21 (ENSCAFG00845014331) UTP23 (ENSCAFG00845014281) EIF3H (ENSCAFG00845014234) ENSCAFG00845014190 ENSCAFG00845014182 ##22 ENSCAFG00845014166 TRPS1 (ENSCAFG00845014104) ENSCAFG00845014042 CSMD3 (ENSCAFG00845013880) ENSCAFG00845013806 ENSCAFG00845013779 ENSCAFG00845013759 KCNV1 (ENSCAFG00845013731) ENSCAFG00845013714 SYBU (ENSCAFG00845013598) EBAG9 (ENSCAFG00845013428) PKHD1L1 (ENSCAFG00845011869) ENY2 (ENSCAFG00845011444) NUDCD1 (ENSCAFG00845011288) TRHR (ENSCAFG00845011196) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 108 GTF2H3 (ENSCAFG00020015219) TCTN2 (ENSCAFG00020015210) ATP6V0A2 (ENSCAFG00020014431) DNAH10 (ENSCAFG00020014337) CCDC92 (ENSCAFG00020014329) ZNF664 (ENSCAFG00020014328) RFLNA (ENSCAFG00020014323) NCOR2 (ENSCAFG00020012716) SCARB1 (ENSCAFG00020012613) ENSCAFG00020012609 ENSCAFG00020012596 DHX37 (ENSCAFG00020012586) BRI3BP (ENSCAFG00020012585) AACS (ENSCAFG00020011711) TMEM132B (ENSCAFG00020011680) ENSCAFG00020011671 ##22 TMEM132C (ENSCAFG00020011665) SLC15A4 (ENSCAFG00020011657) GLT1D1 (ENSCAFG00020011654) TMEM132D (ENSCAFG00020011640) FZD10 (ENSCAFG00020011630) PIWIL1 (ENSCAFG00020011618) RIMBP2 (ENSCAFG00020011427) STX2 (ENSCAFG00020011375) RAN (ENSCAFG00020011346) ADGRD1 (ENSCAFG00020011306) ENSCAFG00020011296 SFSWAP (ENSCAFG00020011254) MMP17 (ENSCAFG00020011243) ULK1 (ENSCAFG00020010753) PUS1 (ENSCAFG00020010737) Dingo MODERN SPECIES 308 CFI (ENSCAFG00020015559) PLA2G12A (ENSCAFG00020015557) CASP6 (ENSCAFG00020015552) MCUB (ENSCAFG00020015544) SEC24B (ENSCAFG00020010198) ENSCAFG00020010068 ENSCAFG00020010062 ENSCAFG00020010061 ENSCAFG00020010057 LEF1 (ENSCAFG00020010052) HADH (ENSCAFG00020010045) CYP2U1 (ENSCAFG00020010041) SGMS2 (ENSCAFG00020010038) ENSCAFG00020010027 DKK2 (ENSCAFG00020010010) ENSCAFG00020010008 ##22 ENSCAFG00020010004 GIMD1 (ENSCAFG00020009998) AIMP1 (ENSCAFG00020009990) ENSCAFG00020009987 ENSCAFG00020009967 NPNT (ENSCAFG00020009929) GSTCD (ENSCAFG00020009920) INTS12 (ENSCAFG00020009912) ARHGEF38 (ENSCAFG00020009907) Felidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000163409 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT01040000241919 ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.ab ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Cat MODERN SPECIES 236 MEI4 (ENSFCAG00000036772) HTR1B (ENSFCAG00000007703) ENSFCAG00000047290 ENSFCAG00000047606 IMPG1 (ENSFCAG00000014900) MYO6 (ENSFCAG00000030371) ENSFCAG00000029338 SENP6 (ENSFCAG00000025782) FILIP1 (ENSFCAG00000009789) TMEM30A (ENSFCAG00000022485) COX7A2 (ENSFCAG00000009787) ENSFCAG00000049642 COL12A1 (ENSFCAG00000027408) CD109 (ENSFCAG00000012653) SLC17A5 (ENSFCAG00000012651) EEF1A1 (ENSFCAG00000030977) ##22 MTO1 (ENSFCAG00000029600) CGAS (ENSFCAG00000021963) DDX43 (ENSFCAG00000031631) OOEP (ENSFCAG00000006772) ENSFCAG00000006770 DPPA5 (ENSFCAG00000006769) KCNQ5 (ENSFCAG00000024484) RIMS1 (ENSFCAG00000032381) OGFRL1 (ENSFCAG00000037623) ##35 B3GAT2 (ENSFCAG00000024951) SMAP1 (ENSFCAG00000007247) SDHAF4 (ENSFCAG00000026799) FAM135A (ENSFCAG00000023949) COL9A1 (ENSFCAG00000010489) ENSFCAG00000036453 Panthera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000163409 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT01040000241919 ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.ab ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Tiger DUPLICATION Tiger MODERN SPECIES 319 HMGN3 (ENSPTIG00000020090) PHIP (ENSPTIG00000016313) IRAK1BP1 (ENSPTIG00000008985) MEI4 (ENSPTIG00000008324) HTR1B (ENSPTIG00000001714) IMPG1 (ENSPTIG00000020524) MYO6 (ENSPTIG00000019124) ENSPTIG00000000742 SENP6 (ENSPTIG00000011844) FILIP1 (ENSPTIG00000009205) TMEM30A (ENSPTIG00000006144) COX7A2 (ENSPTIG00000002276) COL12A1 (ENSPTIG00000021337) CD109 (ENSPTIG00000012445) SLC17A5 (ENSPTIG00000012062) ENSPTIG00000007871 ##22 MTO1 (ENSPTIG00000001836) CGAS (ENSPTIG00000020140) ENSPTIG00000017842 OOEP (ENSPTIG00000017366) KHDC3L (ENSPTIG00000017035) DPPA5 (ENSPTIG00000016742) KCNQ5 (ENSPTIG00000011417) ENSPTIG00000019209 ENSPTIG00000018823 OGFRL1 (ENSPTIG00000018139) ##35 ENSPTIG00000017257 SMAP1 (ENSPTIG00000014278) SDHAF4 (ENSPTIG00000013609) FAM135A (ENSPTIG00000019739) COL9A1 (ENSPTIG00000012131) Tiger MODERN SPECIES 399 CDH18 (ENSPTIG00000010486) ENSPTIG00000008162 ENSPTIG00000010201 MYO10 (ENSPTIG00000009835) RETREG1 (ENSPTIG00000009754) ZNF622 (ENSPTIG00000009603) MARCHF11 (ENSPTIG00000009585) FBXL7 (ENSPTIG00000009515) ENSPTIG00000008154 ##22 ANKH (ENSPTIG00000009437) OTULIN (ENSPTIG00000009407) OTULINL (ENSPTIG00000009360) ENSPTIG00000009309 ENSPTIG00000009248 ENSPTIG00000009184 DNAH5 (ENSPTIG00000007989) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000163409 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT01040000241919 ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.ab ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000168566 lion MODERN SPECIES 5 PHIP (ENSPLOG00000020760) IRAK1BP1 (ENSPLOG00000020709) MEI4 (ENSPLOG00000020653) HTR1B (ENSPLOG00000020635) IMPG1 (ENSPLOG00000020513) MYO6 (ENSPLOG00000020376) SENP6 (ENSPLOG00000020085) FILIP1 (ENSPLOG00000019975) TMEM30A (ENSPLOG00000019900) COX7A2 (ENSPLOG00000019826) ENSPLOG00000019787 COL12A1 (ENSPLOG00000017531) ENSPLOG00000017162 CD109 (ENSPLOG00000016428) SLC17A5 (ENSPLOG00000016238) EEF1A1 (ENSPLOG00000016117) ##22 MTO1 (ENSPLOG00000016071) CGAS (ENSPLOG00000015938) DDX43 (ENSPLOG00000015808) OOEP (ENSPLOG00000015739) KHDC3L (ENSPLOG00000015667) DPPA5 (ENSPLOG00000015621) ENSPLOG00000015585 ENSPLOG00000015538 KCNQ5 (ENSPLOG00000014429) RIMS1 (ENSPLOG00000011108) OGFRL1 (ENSPLOG00000010118) ##35 B3GAT2 (ENSPLOG00000010057) SMAP1 (ENSPLOG00000010021) SDHAF4 (ENSPLOG00000009984) FAM135A (ENSPLOG00000009519) leopard MODERN SPECIES 70 CD109 (ENSPPRG00000009631) SLC17A5 (ENSPPRG00000009855) EEF1A1 (ENSPPRG00000011684) ##22 MTO1 (ENSPPRG00000013725) CGAS (ENSPPRG00000014097) DDX43 (ENSPPRG00000014528) OOEP (ENSPPRG00000014686) KHDC3L (ENSPPRG00000018331) DPPA5 (ENSPPRG00000018919) KCNQ5 (ENSPPRG00000002204) RIMS1 (ENSPPRG00000013353) OGFRL1 (ENSPPRG00000016406) ##35 ENSPPRG00000017717 B3GAT2 (ENSPPRG00000019185) ENSPPRG00000020301 SMAP1 (ENSPPRG00000000953) SDHAF4 (ENSPPRG00000001002) FAM135A (ENSPPRG00000001943) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 62 IMPG1 (ENSCWAG00000013692) MYO6 (ENSCWAG00000014070) SENP6 (ENSCWAG00000016440) FILIP1 (ENSCWAG00000016622) TMEM30A (ENSCWAG00000016730) ENSCWAG00000016813 COL12A1 (ENSCWAG00000016907) ENSCWAG00000007789 CD109 (ENSCWAG00000007850) SLC17A5 (ENSCWAG00000008098) EEF1A1 (ENSCWAG00000008166) ##22 MTO1 (ENSCWAG00000008241) CGAS (ENSCWAG00000008377) ENSCWAG00000008430 ENSCWAG00000008448 ENSCWAG00000008588 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E Arabian camel MODERN SPECIES 41 ANKS3 (ENSCDRG00005009160) ENSCDRG00005009372 ZNF500 (ENSCDRG00005009441) SEPTIN12 (ENSCDRG00005009523) SMIM22 (ENSCDRG00005010221) ROGDI (ENSCDRG00005010278) GLYR1 (ENSCDRG00005010438) UBN1 (ENSCDRG00005010928) ENSCDRG00005011009 ENSCDRG00005011040 PPL (ENSCDRG00005011061) ENSCDRG00005011136 SLC17A5 (ENSCDRG00005011165) ENSCDRG00005011228 ENSCDRG00005011264 EEF1A1 (ENSCDRG00005011320) ##22 MTO1 (ENSCDRG00005011418) CGAS (ENSCDRG00005011491) ENSCDRG00005011544 ENSCDRG00005011580 ENSCDRG00005011645 ENSCDRG00005011676 ENSCDRG00005011729 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 1 IRAK1BP1 (ENSPCTG00005000488) ENSPCTG00005022496 MEI4 (ENSPCTG00005022494) IMPG1 (ENSPCTG00005022490) MYO6 (ENSPCTG00005022482) SENP6 (ENSPCTG00005022459) FILIP1 (ENSPCTG00005022453) TMEM30A (ENSPCTG00005022447) ENSPCTG00005022444 COL12A1 (ENSPCTG00005022379) ENSPCTG00005022347 ENSPCTG00005022345 CD109 (ENSPCTG00005022320) SLC17A5 (ENSPCTG00005022302) EEF1A1 (ENSPCTG00005022294) ##22 MTO1 (ENSPCTG00005022283) CGAS (ENSPCTG00005022275) DDX43 (ENSPCTG00005022263) OOEP (ENSPCTG00005022255) ENSPCTG00005022250 ENSPCTG00005022244 ENSPCTG00005022241 ENSPCTG00005022238 ENSPCTG00005022226 RIMS1 (ENSPCTG00005021073) OGFRL1 (ENSPCTG00005020816) ##35 ENSPCTG00005020798 B3GAT2 (ENSPCTG00005020761) SMAP1 (ENSPCTG00005020718) SDHAF4 (ENSPCTG00005020701) Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 28 IRAK1BP1 (ENSCHIG00000018136) MEI4 (ENSCHIG00000016616) ENSCHIG00000009645 HTR1B (ENSCHIG00000008916) ENSCHIG00000020561 IMPG1 (ENSCHIG00000008626) MYO6 (ENSCHIG00000018457) SENP6 (ENSCHIG00000009406) FILIP1 (ENSCHIG00000019437) TMEM30A (ENSCHIG00000023159) ENSCHIG00000016010 COL12A1 (ENSCHIG00000019062) ENSCHIG00000019183 CD109 (ENSCHIG00000022242) SLC17A5 (ENSCHIG00000002917) ENSCHIG00000010087 ##22 MTO1 (ENSCHIG00000014134) CGAS (ENSCHIG00000018397) Goat MODERN SPECIES 27 ENSCHIG00000026756 AGP (ENSCHIG00000010077) AKNA (ENSCHIG00000026296) WHRN (ENSCHIG00000024837) ATP6V1G1 (ENSCHIG00000015713) TMEM268 (ENSCHIG00000026416) TNFSF15 (ENSCHIG00000024052) TNFSF8 (ENSCHIG00000020113) TNC (ENSCHIG00000020744) ENSCHIG00000024042 PAPPA (ENSCHIG00000016958) ENSCHIG00000021499 ASTN2 (ENSCHIG00000000737) TRIM32 (ENSCHIG00000009811) ENSCHIG00000010833 ENSCHIG00000016022 ##22 TLR4 (ENSCHIG00000018498) BRINP1 (ENSCHIG00000010799) CDK5RAP2 (ENSCHIG00000013746) ENSCHIG00000004959 MEGF9 (ENSCHIG00000027246) FBXW2 (ENSCHIG00000020458) PSMD5 (ENSCHIG00000021228) ENSCHIG00000017934 PHF19 (ENSCHIG00000021247) TRAF1 (ENSCHIG00000019383) C5 (ENSCHIG00000011041) CNTRL (ENSCHIG00000017058) ENSCHIG00000023328 RAB14 (ENSCHIG00000026983) GSN (ENSCHIG00000021305) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000012588 ENSGT00940000154915.mb.a.b ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT01100000263506.a.f.a.a.a.b ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 American bison MODERN SPECIES 3214 ENSBBBG00000002350 ENSBBBG00000012383 CD109 (ENSBBBG00000012375) SLC17A5 (ENSBBBG00000001929) EEF1A1 (ENSBBBG00000012291) ##22 MTO1 (ENSBBBG00000001942) CGAS (ENSBBBG00000012248) ENSBBBG00000012231 OOEP (ENSBBBG00000012206) KHDC3L (ENSBBBG00000012203) KCNQ5 (ENSBBBG00000012198) RIMS1 (ENSBBBG00000002261) ENSBBBG00000011954 ENSBBBG00000011943 ##35 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 1 PHIP (ENSBGRG00000004460) IRAK1BP1 (ENSBGRG00000004671) MEI4 (ENSBGRG00000004738) HTR1B (ENSBGRG00000004799) ENSBGRG00000004810 IMPG1 (ENSBGRG00000004826) MYO6 (ENSBGRG00000004931) SENP6 (ENSBGRG00000005342) FILIP1 (ENSBGRG00000005876) TMEM30A (ENSBGRG00000005958) ENSBGRG00000006074 COL12A1 (ENSBGRG00000006189) ENSBGRG00000007839 CD109 (ENSBGRG00000007902) SLC17A5 (ENSBGRG00000008882) EEF1A1 (ENSBGRG00000009070) ##22 MTO1 (ENSBGRG00000009205) CGAS (ENSBGRG00000009337) ENSBGRG00000009400 ENSBGRG00000009579 ENSBGRG00000009633 KCNQ5 (ENSBGRG00000009774) ENSBGRG00000012920 RIMS1 (ENSBGRG00000013217) ENSBGRG00000021168 OGFRL1 (ENSBGRG00000021196) ##35 B3GAT2 (ENSBGRG00000021318) SMAP1 (ENSBGRG00000021416) ENSBGRG00000021647 SDHAF4 (ENSBGRG00000021672) FAM135A (ENSBGRG00000021710) Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 28 HTR1B (ENSBIXG00005005419) ENSBIXG00005014540 ENSBIXG00005014555 IMPG1 (ENSBIXG00005014572) ENSBIXG00005006341 MYO6 (ENSBIXG00005014655) ENSBIXG00005014745 ENSBIXG00005002089 FILIP1 (ENSBIXG00005014816) ENSBIXG00005007540 TMEM30A (ENSBIXG00005014933) COL12A1 (ENSBIXG00005015265) ENSBIXG00005015368 CD109 (ENSBIXG00005002279) SLC17A5 (ENSBIXG00005015518) EEF1A1 (ENSBIXG00005015547) ##22 MTO1 (ENSBIXG00005015597) CGAS (ENSBIXG00005015608) ENSBIXG00005015639 ENSBIXG00005015655 OOEP (ENSBIXG00005015674) ENSBIXG00005015694 KCNQ5 (ENSBIXG00005016452) RIMS1 (ENSBIXG00005021046) ENSBIXG00005021520 OGFRL1 (ENSBIXG00005021578) ##35 B3GAT2 (ENSBIXG00005021604) ENSBIXG00005021619 SMAP1 (ENSBIXG00005003657) ENSBIXG00005021756 SDHAF4 (ENSBIXG00005007360) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Glires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000162741.j ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00970000198265 ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Rabbit MODERN SPECIES 3 MEI4 (ENSOCUG00000031651) ENSOCUG00000036891 ENSOCUG00000022881 HTR1B (ENSOCUG00000009271) ENSOCUG00000024129 IMPG1 (ENSOCUG00000001484) MYO6 (ENSOCUG00000024606) SENP6 (ENSOCUG00000010714) FILIP1 (ENSOCUG00000012854) TMEM30A (ENSOCUG00000030135) ENSOCUG00000035102 COL12A1 (ENSOCUG00000015320) ENSOCUG00000029583 CD109 (ENSOCUG00000006444) SLC17A5 (ENSOCUG00000000030) RABEFLA2 (ENSOCUG00000008481) ##22 MTO1 (ENSOCUG00000008468) ENSOCUG00000030719 ENSOCUG00000006338 ENSOCUG00000025904 ENSOCUG00000014488 DPPA5 (ENSOCUG00000006790) ENSOCUG00000023798 ENSOCUG00000021694 ENSOCUG00000001871 ENSOCUG00000031374 ENSOCUG00000039052 KCNQ5 (ENSOCUG00000016906) RIMS1 (ENSOCUG00000017945) ENSOCUG00000030808 OGFRL1 (ENSOCUG00000006556) ##35 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Degu MODERN SPECIES 70 ENSODEG00000010558 LSM11 (ENSODEG00000009738) THG1L (ENSODEG00000009719) SOX30 (ENSODEG00000009453) ADAM19 (ENSODEG00000009808) NIPAL4 (ENSODEG00000009499) ENSODEG00000009352 FNDC9 (ENSODEG00000019664) CYFIP2 (ENSODEG00000009223) ITK (ENSODEG00000012007) GARIN3 (ENSODEG00000014426) ENSODEG00000020034 HAVCR2 (ENSODEG00000011256) ENSODEG00000013454 SGCD (ENSODEG00000011784) ENSODEG00000010239 ##22 ENSODEG00000009212 GEMIN5 (ENSODEG00000009311) ENSODEG00000009965 FAXDC2 (ENSODEG00000009137) LARP1 (ENSODEG00000010824) HAND1 (ENSODEG00000009445) SAP30L (ENSODEG00000008855) GALNT10 (ENSODEG00000008896) MFAP3 (ENSODEG00000009031) ENSODEG00000009084 GRIA1 (ENSODEG00000009490) NMUR2 (ENSODEG00000009849) GLRA1 (ENSODEG00000009543) ENSODEG00000008869 ENSODEG00000019553 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 5 BLTP1 (ENSMICG00000007069) ADAD1 (ENSMICG00000015912) IL2 (ENSMICG00000036776) ENSMICG00000027821 IL21 (ENSMICG00000005315) ENSMICG00000038024 ENSMICG00000048112 NUDT6 (ENSMICG00000045450) ENSMICG00000028770 SPATA5 (ENSMICG00000010729) SPRY1 (ENSMICG00000043333) ENSMICG00000038297 ANKRD50 (ENSMICG00000014015) FAT4 (ENSMICG00000012108) ENSMICG00000028938 ENSMICG00000004360 ##22 INTU (ENSMICG00000014722) SLC25A31 (ENSMICG00000035863) HSPA4L (ENSMICG00000016951) PLK4 (ENSMICG00000016517) MFSD8 (ENSMICG00000011520) ABHD18 (ENSMICG00000011534) ENSMICG00000036111 PGRMC2 (ENSMICG00000011485) JADE1 (ENSMICG00000044275) SCLT1 (ENSMICG00000017457) C4orf33 (ENSMICG00000042663) ENSMICG00000047477 PCDH10 (ENSMICG00000008070) PABPC4L (ENSMICG00000029683) PCDH18 (ENSMICG00000027527) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Tarsier MODERN SPECIES 1213 EEF1A1 (ENSTSYG00000029690) ##22 MTO1 (ENSTSYG00000009988) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 69 NFIB (ENSSBOG00000032376) ZDHHC21 (ENSSBOG00000031063) CER1 (ENSSBOG00000015623) FREM1 (ENSSBOG00000027449) HPF1 (ENSSBOG00000025298) TTC39B (ENSSBOG00000035178) ENSSBOG00000033785 ENSSBOG00000035820 PSIP1 (ENSSBOG00000033737) ENSSBOG00000031033 CCDC171 (ENSSBOG00000026669) ENSSBOG00000028687 BNC2 (ENSSBOG00000023250) CNTLN (ENSSBOG00000034763) SH3GL2 (ENSSBOG00000032645) ENSSBOG00000034943 ##22 ADAMTSL1 (ENSSBOG00000023299) SAXO1 (ENSSBOG00000026964) ENSSBOG00000008170 ENSSBOG00000031312 HAUS6 (ENSSBOG00000026878) PLIN2 (ENSSBOG00000030779) DENND4C (ENSSBOG00000033170) ENSSBOG00000018471 ACER2 (ENSSBOG00000032724) SLC24A2 (ENSSBOG00000027426) MLLT3 (ENSSBOG00000029045) FOCAD (ENSSBOG00000024709) HACD4 (ENSSBOG00000004033) ENSSBOG00000012028 IFNA14 (ENSSBOG00000033464) Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 42 ZP4 (ENSCCAG00000037192) ENSCCAG00000037955 ##22 RYR2 (ENSCCAG00000036758) MTR (ENSCCAG00000024450) ACTN2 (ENSCCAG00000030240) HEATR1 (ENSCCAG00000037071) ENSCCAG00000037843 LGALS8 (ENSCCAG00000025413) EDARADD (ENSCCAG00000015021) ENSCCAG00000028687 ERO1B (ENSCCAG00000033977) GPR137B (ENSCCAG00000037952) NID1 (ENSCCAG00000024420) LYST (ENSCCAG00000019601) GNG4 (ENSCCAG00000028828) ENSCCAG00000013133 ENSCCAG00000000751 Capuchin MODERN SPECIES 157 IGSF11 (ENSCCAG00000017671) ENSCCAG00000033409 ##22 ENSCCAG00000030753 ENSCCAG00000028283 LSAMP (ENSCCAG00000027378) ENSCCAG00000024601 ENSCCAG00000035352 ENSCCAG00000014619 ZBTB20 (ENSCCAG00000025581) TIGIT (ENSCCAG00000029822) ENSCCAG00000034360 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 16 MEI4 (ENSCJAG00000034767) ENSCJAG00000085763 HTR1B (ENSCJAG00000022374) ENSCJAG00000069680 IMPG1 (ENSCJAG00000010664) MYO6 (ENSCJAG00000010541) ENSCJAG00000060163 SENP6 (ENSCJAG00000010386) FILIP1 (ENSCJAG00000010350) TMEM30A (ENSCJAG00000010325) COL12A1 (ENSCJAG00000010171) ENSCJAG00000079018 CD109 (ENSCJAG00000010082) SLC17A5 (ENSCJAG00000004888) ENSCJAG00000044132 EEF1A1 (ENSCJAG00000083200) ##22 ENSCJAG00000063026 MTO1 (ENSCJAG00000010003) CGAS (ENSCJAG00000009988) DDX43 (ENSCJAG00000009966) KHDC3L (ENSCJAG00000009947) ENSCJAG00000009945 ENSCJAG00000062698 ENSCJAG00000055378 KCNQ5 (ENSCJAG00000009916) ENSCJAG00000086119 RIMS1 (ENSCJAG00000009737) OGFRL1 (ENSCJAG00000003635) ##35 ENSCJAG00000066859 ENSCJAG00000059733 ENSCJAG00000077933 Marmoset MODERN SPECIES 16 TRMT11 (ENSCJAG00000003686) CENPW (ENSCJAG00000038479) ENSCJAG00000042779 RSPO3 (ENSCJAG00000053376) RNF146 (ENSCJAG00000056389) ENSCJAG00000084697 ECHDC1 (ENSCJAG00000003649) ENSCJAG00000022493 KIAA0408 (ENSCJAG00000003616) SOGA3 (ENSCJAG00000048256) C6orf58 (ENSCJAG00000003611) ENSCJAG00000070420 THEMIS (ENSCJAG00000003598) ENSCJAG00000083208 PTPRK (ENSCJAG00000003496) ENSCJAG00000079418 ##22 LAMA2 (ENSCJAG00000003343) ARHGAP18 (ENSCJAG00000003308) TMEM244 (ENSCJAG00000080719) L3MBTL3 (ENSCJAG00000003235) SAMD3 (ENSCJAG00000003214) ENSCJAG00000070985 TMEM200A (ENSCJAG00000003205) ENSCJAG00000082123 ENSCJAG00000077177 SMLR1 (ENSCJAG00000044876) EPB41L2 (ENSCJAG00000003171) ENSCJAG00000063083 ENSCJAG00000078780 ENSCJAG00000083716 AKAP7 (ENSCJAG00000003157) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 226 ENSGT00510000049371.b ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00510000049371.b ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 241 ENSGT00510000049371.b ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Rhesus MODERN SPECIES 2 KICS2 (ENSMMUG00000001955) SRGAP1 (ENSMMUG00000001952) RXYLT1 (ENSMMUG00000011561) AVPR1A (ENSMMUG00000000549) ENSMMUG00000049277 PPM1H (ENSMMUG00000011952) MON2 (ENSMMUG00000000956) ENSMMUG00000049365 USP15 (ENSMMUG00000000955) ENSMMUG00000061646 ENSMMUG00000057830 TAFA2 (ENSMMUG00000011579) ENSMMUG00000049330 SLC16A7 (ENSMMUG00000014778) ENSMMUG00000050355 ENSMMUG00000001210 ##22 ENSMMUG00000055477 LRIG3 (ENSMMUG00000004233) ENSMMUG00000055026 ATP23 (ENSMMUG00000060302) GEMIN7 (ENSMMUG00000057217) CTDSP2 (ENSMMUG00000050282) AVIL (ENSMMUG00000005319) TSFM (ENSMMUG00000005893) METTL1 (ENSMMUG00000022148) CYP27B1 (ENSMMUG00000022144) MARCHF9 (ENSMMUG00000046540) CDK4 (ENSMMUG00000023694) TSPAN31 (ENSMMUG00000023691) AGAP2 (ENSMMUG00000023690) OS9 (ENSMMUG00000020710) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00940000158053 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000161501 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161026 ENSGT00940000154872.C ENSGT00490000044045 ENSGT00940000157394 ENSGT00940000158092 ENSGT00510000049371.b ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00940000154295.y.b.a.a.a ENSGT00940000156328.b ENSGT01100000264926 ENSGT00940000162104 ENSGT00390000000706 ENSGT00940000161393 ENSGT00390000014376 ENSGT00940000157781 ENSGT00940000161703 ENSGT00940000155950.g.b ENSGT00550000075011.d ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.a.a.a.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00940000158053 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000161501 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161026 ENSGT00940000154872.C ENSGT00490000044045 ENSGT00940000157394 ENSGT00940000158092 ENSGT00510000049371.b ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00940000154295.y.b.a.a.a ENSGT00940000156328.b ENSGT01100000264926 ENSGT00940000162104 ENSGT00390000000706 ENSGT00940000161393 ENSGT00390000014376 ENSGT00940000157781 ENSGT00940000161703 ENSGT00940000155950.g.b ENSGT00550000075011.d ENSGT00720000108792.A ENSGT00520000055647.a ENSGT00940000162844 ENSGT00940000156782.c Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 143 ENSCATG00000036740 CD109 (ENSCATG00000041228) SLC17A5 (ENSCATG00000040170) ENSCATG00000035249 EEF1A1 (ENSCATG00000039727) ##22 MTO1 (ENSCATG00000030762) CGAS (ENSCATG00000007134) DDX43 (ENSCATG00000031875) OOEP (ENSCATG00000040076) KHDC3L (ENSCATG00000033310) DPPA5 (ENSCATG00000032143) ENSCATG00000029105 KHDC1 (ENSCATG00000033213) KHDC1L (ENSCATG00000030639) ENSCATG00000008489 ENSCATG00000009252 ENSCATG00000003513 KCNQ5 (ENSCATG00000024600) ENSCATG00000023513 RIMS1 (ENSCATG00000015586) Sooty mangabey MODERN SPECIES 348 TRPC3 (ENSCATG00000044900) BBS7 (ENSCATG00000025713) CCNA2 (ENSCATG00000029547) EXOSC9 (ENSCATG00000044273) ENSCATG00000040714 ENSCATG00000038631 ANXA5 (ENSCATG00000038376) ENSCATG00000031240 QRFPR (ENSCATG00000041017) TNIP3 (ENSCATG00000043498) NDNF (ENSCATG00000031227) PRDM5 (ENSCATG00000042510) ENSCATG00000009459 ENSCATG00000040684 ENSCATG00000039250 ENSCATG00000044697 ##22 PDE5A (ENSCATG00000030892) FABP2 (ENSCATG00000029827) ENSCATG00000029489 USP53 (ENSCATG00000039375) MYOZ2 (ENSCATG00000032371) SYNPO2 (ENSCATG00000024146) SEC24D (ENSCATG00000038872) METTL14 (ENSCATG00000040790) PRSS12 (ENSCATG00000042902) NDST3 (ENSCATG00000041328) TRAM1L1 (ENSCATG00000012900) ENSCATG00000041278 NDST4 (ENSCATG00000032269) UGT8 (ENSCATG00000042119) ENSCATG00000009333 Sooty mangabey MODERN SPECIES 133 ADCY1 (ENSCATG00000004075) CCDC201 (ENSCATG00000035989) IGFBP1 (ENSCATG00000036690) IGFBP3 (ENSCATG00000016937) ENSCATG00000029868 ENSCATG00000015798 ##22 ENSCATG00000035658 TNS3 (ENSCATG00000038242) ENSCATG00000035586 PKD1L1 (ENSCATG00000030467) HUS1 (ENSCATG00000034791) SUN3 (ENSCATG00000036420) C7orf57 (ENSCATG00000028895) UPP1 (ENSCATG00000040025) ABCA13 (ENSCATG00000034377) CDC14C (ENSCATG00000032252) ENSCATG00000044759 VWC2 (ENSCATG00000009270) ZPBP (ENSCATG00000036172) SPATA48 (ENSCATG00000036782) IKZF1 (ENSCATG00000041205) Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 13 UFSP2 (ENSPANG00000009592) C4orf47 (ENSPANG00000000980) CCDC110 (ENSPANG00000031109) PDLIM3 (ENSPANG00000018685) ENSPANG00000044926 ENSPANG00000014464 TLR3 (ENSPANG00000010439) FAM149A (ENSPANG00000005747) CYP4V2 (ENSPANG00000011830) KLKB1 (ENSPANG00000010070) F11 (ENSPANG00000007483) MTNR1A (ENSPANG00000007824) FAT1 (ENSPANG00000011080) ENSPANG00000042231 ENSPANG00000040860 ENSPANG00000044130 ##22 ENSPANG00000040667 ZFP42 (ENSPANG00000037838) ENSPANG00000040677 TRIML2 (ENSPANG00000008921) TRIML1 (ENSPANG00000007482) ENSPANG00000039611 ENSPANG00000051039 ENSPANG00000045116 FRG1 (ENSPANG00000031530) Olive baboon MODERN SPECIES 18 LYN (ENSPANG00000024756) TGS1 (ENSPANG00000018910) TMEM68 (ENSPANG00000009706) XKR4 (ENSPANG00000034384) RP1 (ENSPANG00000005975) ENSPANG00000030917 SOX17 (ENSPANG00000044610) ENSPANG00000049863 ENSPANG00000015007 ENSPANG00000009673 TCEA1 (ENSPANG00000018453) RGS20 (ENSPANG00000017181) ATP6V1H (ENSPANG00000015126) ENSPANG00000032914 OPRK1 (ENSPANG00000009674) ENSPANG00000041605 ##22 RB1CC1 (ENSPANG00000020227) ENSPANG00000045412 ALKAL1 (ENSPANG00000015221) ENSPANG00000040573 ST18 (ENSPANG00000009233) ENSPANG00000042832 ENSPANG00000044009 PCMTD1 (ENSPANG00000013158) ENSPANG00000046588 PXDNL (ENSPANG00000015687) SNTG1 (ENSPANG00000017058) PPDPFL (ENSPANG00000017056) ##21 SNAI2 (ENSPANG00000017540) CLXN (ENSPANG00000007207) ENSPANG00000044905 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 126 ENSGT00950000183125.b.a.a ENSGT01030000234539.b.b.a ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.e.b.b.b ENSGT00900000140979.a.b ENSGT00950000183162.a.b ENSGT00940000158053 ENSGT00390000016168.a ENSGT00940000161501 ENSGT01030000234607.A.a.b.a ENSGT00940000161026 ENSGT00940000154872.C ENSGT00490000044045 ENSGT00940000157394 ENSGT00940000158092 ENSGT00510000049371.b ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 644 NACAD (ENSRBIG00000032699) TBRG4 (ENSRBIG00000039611) RAMP3 (ENSRBIG00000033656) ADCY1 (ENSRBIG00000041309) CCDC201 (ENSRBIG00000044157) IGFBP1 (ENSRBIG00000030168) IGFBP3 (ENSRBIG00000000060) ENSRBIG00000044201 ENSRBIG00000040906 ##22 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 881 CCDC66 (ENSRROG00000041251) TASOR (ENSRROG00000008200) ARHGEF3 (ENSRROG00000036679) IL17RD (ENSRROG00000023719) HESX1 (ENSRROG00000032315) ENSRROG00000039038 APPL1 (ENSRROG00000033584) ASB14 (ENSRROG00000034785) DNAH12 (ENSRROG00000033333) ENSRROG00000003372 ##22 ENSRROG00000034900 PDE12 (ENSRROG00000031279) ARF4 (ENSRROG00000034971) DENND6A (ENSRROG00000039060) SLMAP (ENSRROG00000041937) ENSRROG00000026669 FLNB (ENSRROG00000041820) DNASE1L3 (ENSRROG00000044465) ABHD6 (ENSRROG00000037362) RPP14 (ENSRROG00000045678) HTD2 (ENSRROG00000030647) PXK (ENSRROG00000044268) PDHB (ENSRROG00000004890) KCTD6 (ENSRROG00000035541) ACOX2 (ENSRROG00000042193) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 585 HOXB5 (ENSRROG00000030674) HOXB6 (ENSRROG00000028093) HOXB7 (ENSRROG00000035066) HOXB8 (ENSRROG00000045349) HOXB9 (ENSRROG00000044654) PRAC1 (ENSRROG00000039006) PRAC2 (ENSRROG00000033208) HOXB13 (ENSRROG00000042147) TTLL6 (ENSRROG00000044208) CALCOCO2 (ENSRROG00000042598) ATP5MC1 (ENSRROG00000031127) UBE2Z (ENSRROG00000038314) SNF8 (ENSRROG00000041052) GIP (ENSRROG00000029793) IGF2BP1 (ENSRROG00000039581) ENSRROG00000030406 ##22 B4GALNT2 (ENSRROG00000001500) GNGT2 (ENSRROG00000021991) ABI3 (ENSRROG00000038650) PHOSPHO1 (ENSRROG00000036306) ZNF652 (ENSRROG00000045147) ENSRROG00000038767 ENSRROG00000003131 NGFR (ENSRROG00000032770) NXPH3 (ENSRROG00000035416) SPOP (ENSRROG00000044140) SLC35B1 (ENSRROG00000034434) FAM117A (ENSRROG00000031075) ENSRROG00000035494 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Gibbon MODERN SPECIES 22 ENSNLEG00000031876 ITGA1 (ENSNLEG00000010767) PELO (ENSNLEG00000035970) ISL1 (ENSNLEG00000010739) ENSNLEG00000032250 PARP8 (ENSNLEG00000010603) ENSNLEG00000028831 ENSNLEG00000029095 ENSNLEG00000033534 ENSNLEG00000036214 MRPS30 (ENSNLEG00000010605) FGF10 (ENSNLEG00000031462) NNT (ENSNLEG00000010475) ENSNLEG00000034074 PAIP1 (ENSNLEG00000010443) ENSNLEG00000032653 ##22 C5orf34 (ENSNLEG00000010432) TMEM267 (ENSNLEG00000010427) CCL28 (ENSNLEG00000010425) HMGCS1 (ENSNLEG00000028375) NIM1K (ENSNLEG00000010407) ENSNLEG00000029926 ZNF131 (ENSNLEG00000010402) ENSNLEG00000031898 ENSNLEG00000031088 TRAM1L1 (ENSNLEG00000018250) NDST3 (ENSNLEG00000008847) PRSS12 (ENSNLEG00000008859) METTL14 (ENSNLEG00000008883) SEC24D (ENSNLEG00000008903) SYNPO2 (ENSNLEG00000008969) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.g ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Orangutan MODERN SPECIES 19 OSTM1 (ENSPPYG00000016892) NR2E1 (ENSPPYG00000016893) SNX3 (ENSPPYG00000016894) AFG1L (ENSPPYG00000016895) ENSPPYG00000016896 ENSPPYG00000016897 ARMC2 (ENSPPYG00000016899) SESN1 (ENSPPYG00000016900) CEP57L1 (ENSPPYG00000016901) CD164 (ENSPPYG00000016906) ENSPPYG00000016907 SMPD2 (ENSPPYG00000016908) MICAL1 (ENSPPYG00000016909) ZBTB24 (ENSPPYG00000016910) AK9 (ENSPPYG00000016913) ENSPPYG00000016914 ##22 FIG4 (ENSPPYG00000016916) GPR6 (ENSPPYG00000016917) WASF1 (ENSPPYG00000016918) CDC40 (ENSPPYG00000016919) METTL24 (ENSPPYG00000016920) DDO (ENSPPYG00000016921) SLC22A16 (ENSPPYG00000016922) CDK19 (ENSPPYG00000016923) ENSPPYG00000033503 ENSPPYG00000011700 ENSPPYG00000016924 GTF3C6 (ENSPPYG00000033013) RPF2 (ENSPPYG00000030068) SLC16A10 (ENSPPYG00000016926) MFSD4B (ENSPPYG00000037175) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182802.C ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.g ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00390000002661.b.kb.a ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000018130.a.a.a.h ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Gorilla MODERN SPECIES 8 ITGA2 (ENSGGOG00000001285) ITGA1 (ENSGGOG00000022320) PELO (ENSGGOG00000012635) ISL1 (ENSGGOG00000009588) ENSGGOG00000005819 PARP8 (ENSGGOG00000001459) ENSGGOG00000042396 HCN1 (ENSGGOG00000001533) MRPS30 (ENSGGOG00000016095) FGF10 (ENSGGOG00000004647) NNT (ENSGGOG00000005469) ENSGGOG00000043343 ENSGGOG00000042572 ENSGGOG00000022753 C5orf34 (ENSGGOG00000003565) ENSGGOG00000025803 ##22 TMEM267 (ENSGGOG00000004881) CCL28 (ENSGGOG00000012830) HMGCS1 (ENSGGOG00000001140) NIM1K (ENSGGOG00000001138) ENSGGOG00000023143 ZNF131 (ENSGGOG00000002252) ANXA2R (ENSGGOG00000040072) ENSGGOG00000038169 CCDC152 (ENSGGOG00000012746) GHR (ENSGGOG00000012636) FBXO4 (ENSGGOG00000005501) RIMOC1 (ENSGGOG00000009157) OXCT1 (ENSGGOG00000025087) PLCXD3 (ENSGGOG00000042825) C6 (ENSGGOG00000008230) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182802.C ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.g ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00390000002661.b.kb.a ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000018130.a.a.a.h ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Human MODERN SPECIES 18 LCA5 (ENSG00000135338) HMGN3 (ENSG00000118418) PHIP (ENSG00000146247) IRAK1BP1 (ENSG00000146243) MEI4 (ENSG00000269964) HTR1B (ENSG00000135312) IMPG1 (ENSG00000112706) MYO6 (ENSG00000196586) SENP6 (ENSG00000112701) FILIP1 (ENSG00000118407) TMEM30A (ENSG00000112697) COX7A2 (ENSG00000112695) COL12A1 (ENSG00000111799) CD109 (ENSG00000156535) SLC17A5 (ENSG00000119899) EEF1A1 (ENSG00000156508) ##22 MTO1 (ENSG00000135297) CGAS (ENSG00000164430) DDX43 (ENSG00000080007) OOEP (ENSG00000203907) KHDC3L (ENSG00000203908) DPPA5 (ENSG00000203909) KHDC1 (ENSG00000135314) KHDC1L (ENSG00000256980) KCNQ5 (ENSG00000185760) RIMS1 (ENSG00000079841) OGFRL1 (ENSG00000119900) ##35 B3GAT2 (ENSG00000112309) SMAP1 (ENSG00000112305) SDHAF4 (ENSG00000154079) FAM135A (ENSG00000082269) Pan ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.g ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000163686.b.a.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00390000002661.b.kb.a ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000018130.a.a.a.h ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000154185.l.a.b.b Bonobo MODERN SPECIES 19 ENSPPAG00000031854 PHIP (ENSPPAG00000028075) IRAK1BP1 (ENSPPAG00000034306) MEI4 (ENSPPAG00000018545) HTR1B (ENSPPAG00000014828) IMPG1 (ENSPPAG00000029771) MYO6 (ENSPPAG00000038487) SENP6 (ENSPPAG00000030083) FILIP1 (ENSPPAG00000032598) TMEM30A (ENSPPAG00000028442) ENSPPAG00000005585 COL12A1 (ENSPPAG00000044050) ENSPPAG00000043602 CD109 (ENSPPAG00000029267) SLC17A5 (ENSPPAG00000026527) EEF1A1 (ENSPPAG00000038736) ##22 MTO1 (ENSPPAG00000028710) CGAS (ENSPPAG00000028648) DDX43 (ENSPPAG00000034199) OOEP (ENSPPAG00000037341) KHDC3L (ENSPPAG00000043830) DPPA5 (ENSPPAG00000035257) ENSPPAG00000039320 ENSPPAG00000043529 KHDC1L (ENSPPAG00000025424) ENSPPAG00000041906 ENSPPAG00000038149 KCNQ5 (ENSPPAG00000040956) ENSPPAG00000034250 RIMS1 (ENSPPAG00000040646) OGFRL1 (ENSPPAG00000043342) ##35 Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 19 ENSPTRG00000044309 PHIP (ENSPTRG00000018365) IRAK1BP1 (ENSPTRG00000018363) MEI4 (ENSPTRG00000044078) HTR1B (ENSPTRG00000018361) IMPG1 (ENSPTRG00000018360) MYO6 (ENSPTRG00000023525) SENP6 (ENSPTRG00000018357) FILIP1 (ENSPTRG00000018356) TMEM30A (ENSPTRG00000018355) COX7A2 (ENSPTRG00000050864) COL12A1 (ENSPTRG00000018351) ENSPTRG00000052684 CD109 (ENSPTRG00000018349) SLC17A5 (ENSPTRG00000018348) EEF1A1 (ENSPTRG00000018347) ##22 MTO1 (ENSPTRG00000048593) CGAS (ENSPTRG00000018345) DDX43 (ENSPTRG00000018344) OOEP (ENSPTRG00000029545) KHDC3L (ENSPTRG00000029546) DPPA5 (ENSPTRG00000029547) ENSPTRG00000049430 ENSPTRG00000051619 KHDC1L (ENSPTRG00000052071) ENSPTRG00000018341 ENSPTRG00000048515 KCNQ5 (ENSPTRG00000018339) ENSPTRG00000046439 RIMS1 (ENSPTRG00000051415) OGFRL1 (ENSPTRG00000018335) ##35 Chimpanzee MODERN SPECIES 18 FST (ENSPTRG00000016863) ENSPTRG00000048083 MOCS2 (ENSPTRG00000016862) ITGA2 (ENSPTRG00000016860) ITGA1 (ENSPTRG00000016859) PELO (ENSPTRG00000034409) ISL1 (ENSPTRG00000016858) PARP8 (ENSPTRG00000016857) EMB (ENSPTRG00000016856) HCN1 (ENSPTRG00000016855) MRPS30 (ENSPTRG00000016854) FGF10 (ENSPTRG00000051664) NNT (ENSPTRG00000016851) PAIP1 (ENSPTRG00000016850) C5H5orf34 (ENSPTRG00000016849) ENSPTRG00000051235 ##22 TMEM267 (ENSPTRG00000016848) CCL28 (ENSPTRG00000046280) HMGCS1 (ENSPTRG00000016845) NIM1K (ENSPTRG00000016843) ZNF131 (ENSPTRG00000016842) ANXA2R (ENSPTRG00000016838) ENSPTRG00000051988 ENSPTRG00000050063 CCDC152 (ENSPTRG00000045287) GHR (ENSPTRG00000016836) FBXO4 (ENSPTRG00000016833) RIMOC1 (ENSPTRG00000051599) OXCT1 (ENSPTRG00000016829) PLCXD3 (ENSPTRG00000016827) C6 (ENSPTRG00000016826) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000165345 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 Tenrec MODERN SPECIES 16697 EEF1A1 (ENSETEG00000004236) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 480 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 3472 CD109 (ENSDNOG00000004709) SLC17A5 (ENSDNOG00000033059) EEF1A1 (ENSDNOG00000012756) ##22 MTO1 (ENSDNOG00000015838) ENSDNOG00000017589 OOEP (ENSDNOG00000015242) ENSDNOG00000048618 ENSDNOG00000011544 ENSDNOG00000033459 ENSDNOG00000038894 ENSDNOG00000031308 ENSDNOG00000045168 Armadillo MODERN SPECIES 2255 ENSDNOG00000040258 MAST4 (ENSDNOG00000040156) CD180 (ENSDNOG00000049049) PIK3R1 (ENSDNOG00000018528) ENSDNOG00000049412 ##22 SLC30A5 (ENSDNOG00000039614) ENSDNOG00000048503 ENSDNOG00000039108 ENSDNOG00000033430 ENSDNOG00000017969 ENSDNOG00000014292 CDK7 (ENSDNOG00000039894) CCDC125 (ENSDNOG00000008582) ENSDNOG00000030866 ENSDNOG00000024524 RAD17 (ENSDNOG00000004852) MARVELD2 (ENSDNOG00000007758) OCLN (ENSDNOG00000035828) ENSDNOG00000048390 ENSDNOG00000007283 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Pika MODERN SPECIES 1308 ENSOPRG00000016691 ENSOPRG00000016685 ##22 ENSOPRG00000016673 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 Rgcc (ENSDORG00000015195) Naa16 (ENSDORG00000012584) Mtrf1 (ENSDORG00000016429) Kbtbd7 (ENSDORG00000023750) Wbp4 (ENSDORG00000007755) Elf1 (ENSDORG00000026436) Sugt1 (ENSDORG00000013064) Cnmd (ENSDORG00000013065) Pcdh8 (ENSDORG00000009041) Olfm4 (ENSDORG00000012987) ENSDORG00000013874 Pcdh17 (ENSDORG00000025566) Diaph3 (ENSDORG00000000055) Tdrd3 (ENSDORG00000008714) ENSDORG00000001884 ENSDORG00000027613 ##22 Pcdh9 (ENSDORG00000000735) Klhl1 (ENSDORG00000014310) Mzt1 (ENSDORG00000007292) Dis3 (ENSDORG00000007295) Pibf1 (ENSDORG00000007297) Klf5 (ENSDORG00000005117) Klf12 (ENSDORG00000015820) Tbc1d4 (ENSDORG00000001614) ENSDORG00000011048 ENSDORG00000004556 Lmo7 (ENSDORG00000006551) Kctd12 (ENSDORG00000002106) Acod1 (ENSDORG00000028538) Cln5 (ENSDORG00000003960) Fbxl3 (ENSDORG00000024903) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES ENSPEMG00000030124 Trim68 (ENSPEMG00000013813) Or51d1 (ENSPEMG00000017390) Or51e1 (ENSPEMG00000027238) ENSPEMG00000028534 ENSPEMG00000025812 Or51e2 (ENSPEMG00000027687) Or51f23b (ENSPEMG00000028323) ENSPEMG00000028442 ENSPEMG00000026186 ENSPEMG00000026858 ENSPEMG00000026259 ENSPEMG00000026050 Or51f2 (ENSPEMG00000004523) Or52r1 (ENSPEMG00000014338) ENSPEMG00000006625 ##22 Or51a8 (ENSPEMG00000006128) Or51s1 (ENSPEMG00000003632) Or51h5 (ENSPEMG00000030077) ENSPEMG00000031244 Or51t4 (ENSPEMG00000011810) Or51a6 (ENSPEMG00000005348) Or51a7 (ENSPEMG00000011514) Or51g2 (ENSPEMG00000004791) Or51g1 (ENSPEMG00000003670) ENSPEMG00000030041 Or51a5 (ENSPEMG00000023640) ENSPEMG00000002075 Or51p1 (ENSPEMG00000008824) Or52e2 (ENSPEMG00000030140) ENSPEMG00000029858 Prairie vole MODERN SPECIES 118 ENSMOCG00000019015 ENSMOCG00000014760 ENSMOCG00000021059 ENSMOCG00000001010 Or6n2 (ENSMOCG00000002377) Or6k6 (ENSMOCG00000002933) Or6k4 (ENSMOCG00000003407) ENSMOCG00000001731 Or6k2 (ENSMOCG00000002872) Spta1 (ENSMOCG00000004568) Or10z1 (ENSMOCG00000005345) Or6y1 (ENSMOCG00000006081) Fmn2 (ENSMOCG00000012317) Grem2 (ENSMOCG00000001782) Rgs7 (ENSMOCG00000000104) ENSMOCG00000013748 ##22 Fh1 (ENSMOCG00000018295) Kmo (ENSMOCG00000000068) Opn3 (ENSMOCG00000004321) Wdr64 (ENSMOCG00000019695) ENSMOCG00000004338 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Rat MODERN SPECIES 4 Ier5 (ENSRNOG00000059406) Mr1 (ENSRNOG00000003522) Stx6 (ENSRNOG00000003402) RGD1304622 (ENSRNOG00000000040) Xpr1 (ENSRNOG00000000042) Acbd6 (ENSRNOG00000003550) ENSRNOG00000069939 Lhx4 (ENSRNOG00000003595) Qsox1 (ENSRNOG00000003649) Cep350 (ENSRNOG00000003882) Ifitm2-ps2 (ENSRNOG00000042995) Tor1aip1 (ENSRNOG00000003946) Tor1aip2 (ENSRNOG00000048267) Tor1aip2 (ENSRNOG00000024849) Fam163a (ENSRNOG00000024825) AABR07021465.2 (ENSRNOG00000058710) ##22 Tdrd5 (ENSRNOG00000004018) Nphs2 (ENSRNOG00000004030) Axdnd1 (ENSRNOG00000051405) Soat1 (ENSRNOG00000004111) Abl2 (ENSRNOG00000004305) Tor3a (ENSRNOG00000004307) Fam20b (ENSRNOG00000004337) Ralgps2 (ENSRNOG00000004736) Angptl1 (ENSRNOG00000004712) Tex35 (ENSRNOG00000038921) Clec20a (ENSRNOG00000065155) Rasal2 (ENSRNOG00000004917) Cryzl2 (ENSRNOG00000005177) Sec16b (ENSRNOG00000005229) Brinp2 (ENSRNOG00000005592) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 83 ENSJJAG00000017967 Colec10 (ENSJJAG00000018490) Tnfrsf11b (ENSJJAG00000019893) Samd12 (ENSJJAG00000007485) ENSJJAG00000009708 ENSJJAG00000019753 Med30 (ENSJJAG00000022063) Slc30a8 (ENSJJAG00000022484) ENSJJAG00000001121 ENSJJAG00000004609 Rad21 (ENSJJAG00000009491) ENSJJAG00000009880 ENSJJAG00000012545 Eif3h (ENSJJAG00000016399) Trps1 (ENSJJAG00000021617) ENSJJAG00000009239 ##22 Csmd3 (ENSJJAG00000020031) ENSJJAG00000014375 ENSJJAG00000016761 Kcnv1 (ENSJJAG00000017352) Sybu (ENSJJAG00000017887) Ebag9 (ENSJJAG00000000164) Pkhd1l1 (ENSJJAG00000013395) ENSJJAG00000016511 Nudcd1 (ENSJJAG00000017022) ENSJJAG00000020798 Trhr (ENSJJAG00000020928) Emc2 (ENSJJAG00000022097) Eif3e (ENSJJAG00000005084) Rspo2 (ENSJJAG00000007430) ENSJJAG00000010049 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Degu MODERN SPECIES 112 PRKCQ (ENSODEG00000004870) PFKFB3 (ENSODEG00000004561) ENSODEG00000004393 IL2RA (ENSODEG00000004354) IL15RA (ENSODEG00000004284) FBH1 (ENSODEG00000004201) ANKRD16 (ENSODEG00000004164) ENSODEG00000019017 ENSODEG00000004116 TASOR2 (ENSODEG00000004077) ASB13 (ENSODEG00000004057) CALML3 (ENSODEG00000019023) NET1 (ENSODEG00000003988) ENSODEG00000018981 ENSODEG00000018979 ENSODEG00000003905 ##22 ENSODEG00000003781 TRIM71 (ENSODEG00000005007) CCR4 (ENSODEG00000019140) GLB1 (ENSODEG00000004977) ENSODEG00000004950 CRTAP (ENSODEG00000004936) SUSD5 (ENSODEG00000004909) ENSODEG00000004897 ENSODEG00000004881 UBP1 (ENSODEG00000004843) CLASP2 (ENSODEG00000004563) ENSODEG00000004442 ENSODEG00000004411 ARPP21 (ENSODEG00000004233) ENSODEG00000004084 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 ENSHGLG00000035543 ENSHGLG00000016039 ENSHGLG00000021219 ENSHGLG00000033624 ENSHGLG00000014868 ENSHGLG00000014826 ENSHGLG00000045516 ENSHGLG00000014767 ADAMTS19 (ENSHGLG00000015411) MINAR2 (ENSHGLG00000015376) ENSHGLG00000011633 ENSHGLG00000044750 ENSHGLG00000004498 ENSHGLG00000039649 ENSHGLG00000045312 ENSHGLG00000040996 ##22 ENSHGLG00000016330 ENSHGLG00000007766 ENSHGLG00000007116 ENSHGLG00000006773 ENSHGLG00000045403 DCTN4 (ENSHGLG00000050283) RBM22 (ENSHGLG00000008488) MYOZ3 (ENSHGLG00000007506) SYNPO (ENSHGLG00000039282) NDST1 (ENSHGLG00000004281) RPS14 (ENSHGLG00000004211) CD74 (ENSHGLG00000003902) TCOF1 (ENSHGLG00000007903) ARSI (ENSHGLG00000007275) CAMK2A (ENSHGLG00000006526) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 4 ENSSVLG00005008672 ENSSVLG00005008638 ENSSVLG00005008627 ENSSVLG00005008604 ENSSVLG00005008588 ENSSVLG00005008531 ENSSVLG00005008505 ENSSVLG00005008478 ENSSVLG00005008454 ENSSVLG00005008425 ENSSVLG00005008387 ENSSVLG00005008350 ENSSVLG00005008320 ENSSVLG00005008296 CTSV (ENSSVLG00005008235) ENSSVLG00005008172 ##22 ENSSVLG00005008143 ENSSVLG00005008130 ZNF782 (ENSSVLG00005008114) ENSSVLG00005008085 ZNF510 (ENSSVLG00005008057) ENSSVLG00005008017 ENSSVLG00005007732 HABP4 (ENSSVLG00005007550) ZNF367 (ENSSVLG00005007498) SLC35D2 (ENSSVLG00005007372) HSD17B3 (ENSSVLG00005007249) ERCC6L2 (ENSSVLG00005007060) PTCH1 (ENSSVLG00005006529) ENSSVLG00005006388 FANCC (ENSSVLG00005006217) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 35 IRF5 (ENSMMMG00000014159) TNPO3 (ENSMMMG00000014093) SMO (ENSMMMG00000014036) AHCYL2 (ENSMMMG00000013818) ENSMMMG00000013797 ##22 STRIP2 (ENSMMMG00000013720) SMKR1 (ENSMMMG00000013716) ENSMMMG00000013703 NRF1 (ENSMMMG00000013648) UBE2H (ENSMMMG00000013629) ZC3HC1 (ENSMMMG00000013589) KLHDC10 (ENSMMMG00000013575) TMEM209 (ENSMMMG00000013452) SSMEM1 (ENSMMMG00000013444) CPA2 (ENSMMMG00000013424) CPA4 (ENSMMMG00000013409) CPA5 (ENSMMMG00000013373) CPA1 (ENSMMMG00000013359) CEP41 (ENSMMMG00000013323) ENSMMMG00000013281 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 55 ENSUPAG00010010047 ##22 THOC1 (ENSUPAG00010010122) USP14 (ENSUPAG00010010139) ROCK1 (ENSUPAG00010010170) ENSUPAG00010010207 ENSUPAG00010010213 GREB1L (ENSUPAG00010010218) ESCO1 (ENSUPAG00010010268) SNRPD1 (ENSUPAG00010010314) ABHD3 (ENSUPAG00010010326) MIB1 (ENSUPAG00010010366) GATA6 (ENSUPAG00010010394) RBBP8 (ENSUPAG00010010428) CABLES1 (ENSUPAG00010011986) TMEM241 (ENSUPAG00010012092) RIOK3 (ENSUPAG00010012142) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6637 ENSTSYG00000031558 ENSTSYG00000026137 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4593 NCOA7 (ENSTSYG00000002629) ENSTSYG00000029885 ##22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.a ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 707 ENSRROG00000031096 COL6A6 (ENSRROG00000036997) PIK3R4 (ENSRROG00000038622) ENSRROG00000037301 ATP2C1 (ENSRROG00000008160) ASTE1 (ENSRROG00000040859) NEK11 (ENSRROG00000029026) NUDT16 (ENSRROG00000039298) MRPL3 (ENSRROG00000040393) CPNE4 (ENSRROG00000044667) ENSRROG00000030718 ENSRROG00000028484 ##22 ACP3 (ENSRROG00000043704) ENSRROG00000044739 DNAJC13 (ENSRROG00000037091) ACKR4 (ENSRROG00000028324) ACAD11 (ENSRROG00000043705) UBA5 (ENSRROG00000012368) NPHP3 (ENSRROG00000033549) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 33 BRINP3 (ENSCCAG00000035131) PLA2G4A (ENSCCAG00000024660) PTGS2 (ENSCCAG00000029041) PDC (ENSCCAG00000009891) ENSCCAG00000034521 ODR4 (ENSCCAG00000030481) TPR (ENSCCAG00000034100) PRG4 (ENSCCAG00000021259) HMCN1 (ENSCCAG00000036959) IVNS1ABP (ENSCCAG00000022697) SWT1 (ENSCCAG00000033926) TRMT1L (ENSCCAG00000018699) RNF2 (ENSCCAG00000031916) NIBAN1 (ENSCCAG00000020877) ENSCCAG00000024878 ##22 ENSCCAG00000028553 EDEM3 (ENSCCAG00000036036) C1orf21 (ENSCCAG00000027988) TSEN15 (ENSCCAG00000020940) COLGALT2 (ENSCCAG00000030264) RGL1 (ENSCCAG00000031911) ARPC5 (ENSCCAG00000029332) NCF2 (ENSCCAG00000021228) SMG7 (ENSCCAG00000028596) NMNAT2 (ENSCCAG00000028494) LAMC2 (ENSCCAG00000035541) SNRPD2 (ENSCCAG00000018327) LAMC1 (ENSCCAG00000029953) SHCBP1L (ENSCCAG00000037717) DHX9 (ENSCCAG00000022597) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.b ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.c.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 659 ENSRROG00000030221 ##22 DGKB (ENSRROG00000043927) AGMO (ENSRROG00000034789) MEOX2 (ENSRROG00000035547) ENSRROG00000032977 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 4 ENSNLEG00000035957 ABCA8 (ENSNLEG00000002147) ENSNLEG00000002133 ENSNLEG00000027412 PRKAR1A (ENSNLEG00000030484) WIPI1 (ENSNLEG00000001887) ARSG (ENSNLEG00000001874) SLC16A6 (ENSNLEG00000001827) AMZ2 (ENSNLEG00000001823) ENSNLEG00000030152 ENSNLEG00000035323 KPNA2 (ENSNLEG00000001749) ENSNLEG00000031250 BPTF (ENSNLEG00000001556) ENSNLEG00000028155 ENSNLEG00000033552 ##22 NOL11 (ENSNLEG00000001436) ENSNLEG00000034662 PITPNC1 (ENSNLEG00000001375) PSMD12 (ENSNLEG00000001265) HELZ (ENSNLEG00000000218) CACNG1 (ENSNLEG00000000253) CACNG4 (ENSNLEG00000028359) CACNG5 (ENSNLEG00000000262) ENSNLEG00000029268 PRKCA (ENSNLEG00000000267) APOH (ENSNLEG00000000285) ENSNLEG00000033033 ENSNLEG00000029626 ALMS1 (ENSNLEG00000000294) TPRKB (ENSNLEG00000000300) Gibbon MODERN SPECIES 24 ENSNLEG00000032673 NFKB1 (ENSNLEG00000013325) MANBA (ENSNLEG00000026731) ENSNLEG00000032680 ENSNLEG00000035663 ENSNLEG00000026930 SLC9B1 (ENSNLEG00000026701) SLC9B2 (ENSNLEG00000026685) BDH2 (ENSNLEG00000026601) CENPE (ENSNLEG00000026953) TACR3 (ENSNLEG00000013312) CXXC4 (ENSNLEG00000013306) ENSNLEG00000028470 TET2 (ENSNLEG00000013289) PPA2 (ENSNLEG00000013175) ENSNLEG00000018619 ##22 ENSNLEG00000013162 ENSNLEG00000034939 INTS12 (ENSNLEG00000013144) GSTCD (ENSNLEG00000013117) NPNT (ENSNLEG00000013090) TBCK (ENSNLEG00000013047) AIMP1 (ENSNLEG00000033706) GIMD1 (ENSNLEG00000013029) DKK2 (ENSNLEG00000030139) ENSNLEG00000031216 PAPSS1 (ENSNLEG00000034537) SGMS2 (ENSNLEG00000012986) ENSNLEG00000012977 ENSNLEG00000012951 LEF1 (ENSNLEG00000012942) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Orangutan MODERN SPECIES 14 SOWAHC (ENSPPYG00000012145) SEPTIN10 (ENSPPYG00000012144) SH3RF3 (ENSPPYG00000012143) EDAR (ENSPPYG00000012141) CCDC138 (ENSPPYG00000012140) ENSPPYG00000039134 ENSPPYG00000012137 SULT1C4 (ENSPPYG00000036778) SULT1C2 (ENSPPYG00000012134) ENSPPYG00000012132 SLC5A7 (ENSPPYG00000012131) ENSPPYG00000033176 ENSPPYG00000012709 ENSPPYG00000032394 ST6GAL2 (ENSPPYG00000034681) ENSPPYG00000034771 ##22 UXS1 (ENSPPYG00000012127) ENSPPYG00000041492 NCK2 (ENSPPYG00000012125) FHL2 (ENSPPYG00000012124) C2orf49 (ENSPPYG00000030127) TGFBRAP1 (ENSPPYG00000012122) GPR45 (ENSPPYG00000012120) MRPS9 (ENSPPYG00000012119) POU3F3 (ENSPPYG00000012118) ENSPPYG00000039806 TMEM182 (ENSPPYG00000032935) ENSPPYG00000034423 MFSD9 (ENSPPYG00000038484) SLC9A2 (ENSPPYG00000012115) SLC9A4 (ENSPPYG00000012114) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000153476.b.m.b ENSGT00940000162744 ENSGT01100000263512.b.b.b ENSGT00390000009902 ENSGT00530000063353.b ENSGT01070000253816.a.b ENSGT00940000158723 ENSGT01000000214719 ENSGT00940000165003 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000165733 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000153500.a.a.k.a.b.c ENSGT00940000160788 ENSGT00940000162313 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 ENSGT00910000148205 ENSGT00940000159516 ENSGT00940000156974 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000004226 ENSGT00940000153147.m.a.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00390000002886.b.b ENSGT00940000162359 ENSGT00730000111796 ENSGT00910000146818 ENSGT00940000164981 ENSGT00940000164535.b ENSGT00940000164535.a ENSGT00940000165112 ENSGT00940000163956.c Bonobo MODERN SPECIES 369 ENSPPAG00000025451 ADGRG4 (ENSPPAG00000040242) BRS3 (ENSPPAG00000031235) HTATSF1 (ENSPPAG00000024268) VGLL1 (ENSPPAG00000035917) CD40LG (ENSPPAG00000042603) ARHGEF6 (ENSPPAG00000028700) ENSPPAG00000034899 ENSPPAG00000022910 RBMX (ENSPPAG00000028409) ENSPPAG00000036722 GPR101 (ENSPPAG00000016837) ENSPPAG00000037272 ZIC3 (ENSPPAG00000030013) FGF13 (ENSPPAG00000035766) ENSPPAG00000028602 ##22 ENSPPAG00000037956 F9 (ENSPPAG00000039904) MCF2 (ENSPPAG00000034608) ATP11C (ENSPPAG00000043527) CXorf66 (ENSPPAG00000038036) ENSPPAG00000037228 ENSPPAG00000023819 ENSPPAG00000025131 ENSPPAG00000026521 ENSPPAG00000030721 ENSPPAG00000026388 MAGEC2 (ENSPPAG00000026474) ENSPPAG00000036672 SPANXN3 (ENSPPAG00000038428) SLITRK4 (ENSPPAG00000013354) Chimpanzee MODERN SPECIES 972 MAP7D3 (ENSPTRG00000043576) ENSPTRG00000050522 ADGRG4 (ENSPTRG00000049070) BRS3 (ENSPTRG00000022314) HTATSF1 (ENSPTRG00000044591) VGLL1 (ENSPTRG00000022317) CD40LG (ENSPTRG00000022318) ARHGEF6 (ENSPTRG00000022320) ENSPTRG00000046522 ENSPTRG00000043068 RBMX (ENSPTRG00000052587) ENSPTRG00000049892 GPR101 (ENSPTRG00000022324) ZIC3 (ENSPTRG00000043849) FGF13 (ENSPTRG00000022328) ENSPTRG00000016737 ##22 ENSPTRG00000044472 F9 (ENSPTRG00000022330) MCF2 (ENSPTRG00000046461) ATP11C (ENSPTRG00000022333) CXHXorf66 (ENSPTRG00000028189) ENSPTRG00000048376 ENSPTRG00000047030 SOX3 (ENSPTRG00000044005) ENSPTRG00000022336 ENSPTRG00000052331 ENSPTRG00000022341 MAGEC2 (ENSPTRG00000028182) ENSPTRG00000022342 SPANXN3 (ENSPTRG00000049779) SLITRK4 (ENSPTRG00000028181) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 305 OPRK1 (ENSMNEG00000042852) ENSMNEG00000022043 ##22 ENSMNEG00000043554 NPBWR1 (ENSMNEG00000005589) RB1CC1 (ENSMNEG00000031596) ALKAL1 (ENSMNEG00000019421) ST18 (ENSMNEG00000028872) PCMTD1 (ENSMNEG00000035425) Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT00910000147017 ENSGT00940000159198 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.b.b.b ENSGT00950000182986.a.b.b ENSGT00390000013961.b.a ENSGT00390000011137 ENSGT00390000011759 ENSGT00940000162935 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d.c.a ##22 ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.a ENSGT00390000005809 ENSGT00940000156272 ENSGT00940000158932 ENSGT00390000017802 ENSGT00940000159069 ENSGT00390000009543.c ENSGT00940000159797 ENSGT00940000157647 ENSGT00910000146912 ENSGT00390000004915.a ENSGT00390000014398 ENSGT00940000154156.d.n.b.b.a.b ENSGT00550000074694.a ENSGT00950000182893.a.a.a.a Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 810 ENSRBIG00000030667 ENSRBIG00000029327 TRIB1 (ENSRBIG00000036938) ENSRBIG00000003510 WASHC5 (ENSRBIG00000036256) SQLE (ENSRBIG00000041064) ENSRBIG00000038308 ENSRBIG00000037789 ENSRBIG00000043584 ##22 MTSS1 (ENSRBIG00000016678) ENSRBIG00000039658 TATDN1 (ENSRBIG00000032007) RNF139 (ENSRBIG00000026240) TMEM65 (ENSRBIG00000028669) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1112 ENSRROG00000037521 WASHC5 (ENSRROG00000040310) SQLE (ENSRROG00000032217) ZNF572 (ENSRROG00000027983) ENSRROG00000040095 ##22 MTSS1 (ENSRROG00000038111) NDUFB9 (ENSRROG00000034158) TATDN1 (ENSRROG00000033274) RNF139 (ENSRROG00000042987) TMEM65 (ENSRROG00000011918) FER1L6 (ENSRROG00000041223) FAM91A1 (ENSRROG00000038666) ANXA13 (ENSRROG00000035807) KLHL38 (ENSRROG00000030661) ENSRROG00000002525 FBXO32 (ENSRROG00000040723) NTAQ1 (ENSRROG00000031115) ATAD2 (ENSRROG00000028722) ZHX1 (ENSRROG00000016421) C8orf76 (ENSRROG00000037676) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d.c.b ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2187 KLHL42 (ENSRROG00000042449) MANSC4 (ENSRROG00000042312) MRPS35 (ENSRROG00000042830) REP15 (ENSRROG00000026365) PPFIBP1 (ENSRROG00000042748) SMCO2 (ENSRROG00000041030) BMAL2 (ENSRROG00000029713) STK38L (ENSRROG00000029873) ENSRROG00000036736 C12orf71 (ENSRROG00000033944) MED21 (ENSRROG00000036888) TM7SF3 (ENSRROG00000029894) ENSRROG00000026425 FGFR1OP2 (ENSRROG00000031733) INTS13 (ENSRROG00000043367) ENSRROG00000037938 ##22 ITPR2 (ENSRROG00000035439) ENSRROG00000036680 SSPN (ENSRROG00000023865) BHLHE41 (ENSRROG00000037508) RASSF8 (ENSRROG00000039653) ENSRROG00000027147 LMNTD1 (ENSRROG00000029522) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d.d ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1722 ENSRBIG00000044376 ENSRBIG00000029459 ENSRBIG00000042957 ##22 LRIG3 (ENSRBIG00000040687) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2863 ENSRROG00000042299 ##22 EFNA5 (ENSRROG00000034056) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3121 XXYLT1 (ENSRROG00000042496) ENSRROG00000044458 ##22 ACAP2 (ENSRROG00000029070) ENSRROG00000028569 ENSRROG00000044741 APOD (ENSRROG00000045143) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 463 PHIP (ENSANAG00000037755) IRAK1BP1 (ENSANAG00000028639) MEI4 (ENSANAG00000022641) HTR1B (ENSANAG00000019789) ENSANAG00000022555 IMPG1 (ENSANAG00000027456) MYO6 (ENSANAG00000035523) ENSANAG00000021045 SENP6 (ENSANAG00000021321) FILIP1 (ENSANAG00000034974) TMEM30A (ENSANAG00000027476) COX7A2 (ENSANAG00000034774) COL12A1 (ENSANAG00000023522) CD109 (ENSANAG00000037433) SLC17A5 (ENSANAG00000037674) ENSANAG00000028383 ##22 ENSANAG00000025531 MTO1 (ENSANAG00000019857) ENSANAG00000033004 ENSANAG00000025803 CGAS (ENSANAG00000021094) DDX43 (ENSANAG00000028687) ENSANAG00000023979 ENSANAG00000028882 ENSANAG00000028070 ENSANAG00000030394 ENSANAG00000038227 ENSANAG00000035030 KCNQ5 (ENSANAG00000035320) ENSANAG00000033903 ENSANAG00000020012 Mas night monkey MODERN SPECIES 375 ENSANAG00000025420 ZNF644 (ENSANAG00000026564) ENSANAG00000031530 HFM1 (ENSANAG00000029513) CDC7 (ENSANAG00000020421) ENSANAG00000020685 ##22 TGFBR3 (ENSANAG00000007882) ENSANAG00000015152 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.d ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 143 CABIN1 (ENSSBOG00000000269) ENSSBOG00000029633 ENSSBOG00000033128 ENSSBOG00000032483 ENSSBOG00000029107 MIF (ENSSBOG00000026804) DERL3 (ENSSBOG00000021266) SMARCB1 (ENSSBOG00000031674) ENSSBOG00000023496 MMP11 (ENSSBOG00000025170) ENSSBOG00000029791 ENSSBOG00000022155 VPREB3 (ENSSBOG00000002479) ZNF70 (ENSSBOG00000008001) IGLL1 (ENSSBOG00000027368) ENSSBOG00000031399 ##22 PIWIL3 (ENSSBOG00000005485) SGSM1 (ENSSBOG00000035640) LHFPL7 (ENSSBOG00000021010) ENSSBOG00000033963 KIAA1671 (ENSSBOG00000028799) CRYBB3 (ENSSBOG00000033467) CRYBB2 (ENSSBOG00000031297) GRK3 (ENSSBOG00000035399) MYO18B (ENSSBOG00000028164) SEZ6L (ENSSBOG00000020637) ASPHD2 (ENSSBOG00000021288) HPS4 (ENSSBOG00000031671) SRRD (ENSSBOG00000024759) TFIP11 (ENSSBOG00000035111) TPST2 (ENSSBOG00000014342) Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 2 ENSCJAG00000084055 ENSCJAG00000085825 FAM181B (ENSCJAG00000014709) PRCP (ENSCJAG00000014662) DDIAS (ENSCJAG00000014654) ENSCJAG00000086217 RAB30 (ENSCJAG00000041773) ENSCJAG00000083519 PCF11 (ENSCJAG00000014595) ANKRD42 (ENSCJAG00000014555) ENSCJAG00000014547 ENSCJAG00000087263 ENSCJAG00000074858 ENSCJAG00000036997 ENSCJAG00000082882 ENSCJAG00000085884 ##22 ENSCJAG00000070224 DLG2 (ENSCJAG00000014492) TMEM126B (ENSCJAG00000014472) ENSCJAG00000014466 ENSCJAG00000043995 CCDC89 (ENSCJAG00000014446) SYTL2 (ENSCJAG00000014359) CCDC83 (ENSCJAG00000014339) ENSCJAG00000086029 PICALM (ENSCJAG00000014262) EED (ENSCJAG00000014209) HIKESHI (ENSCJAG00000041472) CCDC81 (ENSCJAG00000012092) ME3 (ENSCJAG00000000649) ENSCJAG00000079494 Marmoset MODERN SPECIES 15 NPNT (ENSCJAG00000015795) ENSCJAG00000081165 TBCK (ENSCJAG00000015822) AIMP1 (ENSCJAG00000015885) GIMD1 (ENSCJAG00000015900) ENSCJAG00000079824 DKK2 (ENSCJAG00000057432) ENSCJAG00000065541 ENSCJAG00000070747 PAPSS1 (ENSCJAG00000015905) ENSCJAG00000079677 SGMS2 (ENSCJAG00000015928) ENSCJAG00000052711 HADH (ENSCJAG00000015938) CYP2U1 (ENSCJAG00000019545) ENSCJAG00000082049 ##22 LEF1 (ENSCJAG00000015947) ENSCJAG00000086893 ENSCJAG00000070564 ENSCJAG00000053141 ENSCJAG00000080504 ETNPPL (ENSCJAG00000016009) ENSCJAG00000066361 COL25A1 (ENSCJAG00000016026) SEC24B (ENSCJAG00000016082) MCUB (ENSCJAG00000016158) CASP6 (ENSCJAG00000016170) PLA2G12A (ENSCJAG00000085363) CFI (ENSCJAG00000004249) GAR1 (ENSCJAG00000082261) RRH (ENSCJAG00000004028) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 24 ENSMICG00000047247 ENSMICG00000027233 ENSMICG00000008770 ##22 NSUN3 (ENSMICG00000011886) ARL13B (ENSMICG00000011874) STX19 (ENSMICG00000030627) PROS1 (ENSMICG00000011858) EPHA3 (ENSMICG00000005266) ENSMICG00000029440 C3orf38 (ENSMICG00000017722) ZNF654 (ENSMICG00000031713) CGGBP1 (ENSMICG00000047167) HTR1F (ENSMICG00000043065) POU1F1 (ENSMICG00000009690) ENSMICG00000037728 VGLL3 (ENSMICG00000043885) CADM2 (ENSMICG00000014503) GBE1 (ENSMICG00000006182) Mouse lemur MODERN SPECIES 27 ENSMICG00000029704 ARHGEF17 (ENSMICG00000016715) RELT (ENSMICG00000016731) FAM168A (ENSMICG00000043205) ENSMICG00000031782 PLEKHB1 (ENSMICG00000003147) RAB6A (ENSMICG00000031565) ENSMICG00000012645 PAAF1 (ENSMICG00000012657) DNAJB13 (ENSMICG00000012675) UCP2 (ENSMICG00000012689) ENSMICG00000037420 UCP3 (ENSMICG00000012710) C2CD3 (ENSMICG00000012725) ENSMICG00000006164 ENSMICG00000031367 ##22 PPME1 (ENSMICG00000002244) P4HA3 (ENSMICG00000002249) ENSMICG00000002256 LIPT2 (ENSMICG00000045741) POLD3 (ENSMICG00000011102) CHRDL2 (ENSMICG00000011134) RNF169 (ENSMICG00000046917) XRRA1 (ENSMICG00000027081) ENSMICG00000011153 NEU3 (ENSMICG00000046723) ENSMICG00000029787 ENSMICG00000035272 ENSMICG00000032041 ENSMICG00000038601 SLCO2B1 (ENSMICG00000011163) Mouse lemur MODERN SPECIES 20 CENPE (ENSMICG00000005101) TACR3 (ENSMICG00000046253) ENSMICG00000042331 CXXC4 (ENSMICG00000045183) TET2 (ENSMICG00000035595) ENSMICG00000013570 ENSMICG00000047313 ENSMICG00000010754 INTS12 (ENSMICG00000010760) GSTCD (ENSMICG00000030887) NPNT (ENSMICG00000010776) TBCK (ENSMICG00000010786) AIMP1 (ENSMICG00000010202) GIMD1 (ENSMICG00000045116) DKK2 (ENSMICG00000027157) ENSMICG00000017692 ##22 PAPSS1 (ENSMICG00000016262) SGMS2 (ENSMICG00000008740) CYP2U1 (ENSMICG00000012817) HADH (ENSMICG00000012822) LEF1 (ENSMICG00000012833) ENSMICG00000041882 OSTC (ENSMICG00000002182) ENSMICG00000002187 ENSMICG00000037629 COL25A1 (ENSMICG00000002737) ENSMICG00000036525 SEC24B (ENSMICG00000010277) ENSMICG00000037926 CASP6 (ENSMICG00000010297) PLA2G12A (ENSMICG00000010304) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1432 ENSPSMG00000008294 ENSPSMG00000008287 KL (ENSPSMG00000008269) ENSPSMG00000008261 ##22 STARD13 (ENSPSMG00000008200) ENSPSMG00000008113 RFC3 (ENSPSMG00000008106) MAB21L1 (ENSPSMG00000008081) Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1425 ERICH6 (ENSPSMG00000006902) SELENOT (ENSPSMG00000006924) EIF2A (ENSPSMG00000007003) ENSPSMG00000007172 TSC22D2 (ENSPSMG00000007186) PFN2 (ENSPSMG00000007227) RNF13 (ENSPSMG00000007264) ANKUB1 (ENSPSMG00000007279) COMMD2 (ENSPSMG00000007296) WWTR1 (ENSPSMG00000007316) TM4SF4 (ENSPSMG00000007321) TM4SF1 (ENSPSMG00000007359) TM4SF18 (ENSPSMG00000007374) ENSPSMG00000007379 ##22 ENSPSMG00000007390 CP (ENSPSMG00000007442) HPS3 (ENSPSMG00000007483) HLTF (ENSPSMG00000007621) GYG1 (ENSPSMG00000007740) CPA3 (ENSPSMG00000007756) CPB1 (ENSPSMG00000007764) AGTR1 (ENSPSMG00000007773) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 28 VWA5B2 (ENSPSMG00000021312) ABCF3 (ENSPSMG00000021387) AP2M1 (ENSPSMG00000021479) DVL3 (ENSPSMG00000021524) EIF2B5 (ENSPSMG00000021580) HTR3E (ENSPSMG00000021608) ENSPSMG00000021631 ABCC5 (ENSPSMG00000021810) ENSPSMG00000021860 PARL (ENSPSMG00000021936) MAP6D1 (ENSPSMG00000021982) YEATS2 (ENSPSMG00000022030) KLHL24 (ENSPSMG00000022048) KLHL6 (ENSPSMG00000022051) B3GNT5 (ENSPSMG00000022061) ENSPSMG00000022066 ##22 ENSPSMG00000022070 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 14 TSPAN17 (ENSBMSG00010006188) UNC5A (ENSBMSG00010006221) HK3 (ENSBMSG00010006330) UIMC1 (ENSBMSG00010006385) ZNF346 (ENSBMSG00010006524) FGFR4 (ENSBMSG00010006695) NSD1 (ENSBMSG00010006893) RAB24 (ENSBMSG00010007248) PRELID1 (ENSBMSG00010007262) MXD3 (ENSBMSG00010007272) LMAN2 (ENSBMSG00010007289) ENSBMSG00010007323 RGS14 (ENSBMSG00010007336) SLC34A1 (ENSBMSG00010007355) PFN3 (ENSBMSG00010007411) ENSBMSG00010007424 ##22 GRK6 (ENSBMSG00010007450) PRR7 (ENSBMSG00010007528) DBN1 (ENSBMSG00010007549) PDLIM7 (ENSBMSG00010007612) DOK3 (ENSBMSG00010007658) DDX41 (ENSBMSG00010007678) FAM193B (ENSBMSG00010007692) ENSBMSG00010007704 TMED9 (ENSBMSG00010007725) B4GALT7 (ENSBMSG00010007738) N4BP3 (ENSBMSG00010007752) RMND5B (ENSBMSG00010007766) NHP2 (ENSBMSG00010007780) HNRNPAB (ENSBMSG00010007805) PHYKPL (ENSBMSG00010007834) Blue whale MODERN SPECIES 40 ENSBMSG00010021279 CD99L2 (ENSBMSG00010021205) MTMR1 (ENSBMSG00010021156) MTM1 (ENSBMSG00010021136) MAMLD1 (ENSBMSG00010021125) ENSBMSG00010021094 ENSBMSG00010021092 ENSBMSG00010021087 ENSBMSG00010021082 ENSBMSG00010021076 ENSBMSG00010021070 ENSBMSG00010021048 ENSBMSG00010021038 IDS (ENSBMSG00010021024) ENSBMSG00010021009 ENSBMSG00010021002 ##22 AFF2 (ENSBMSG00010020952) ENSBMSG00010020927 FMR1 (ENSBMSG00010020867) SLITRK2 (ENSBMSG00010020817) ENSBMSG00010020811 RAB9B (ENSBMSG00010020794) PLP1 (ENSBMSG00010020777) TMEM31 (ENSBMSG00010020764) ENSBMSG00010020745 MORF4L2 (ENSBMSG00010020731) ENSBMSG00010020726 TCEAL1 (ENSBMSG00010020720) ENSBMSG00010020716 ENSBMSG00010020713 ENSBMSG00010020705 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 111 GMNC (ENSDLEG00000013848) ENSDLEG00000013856 IL1RAP (ENSDLEG00000013874) TMEM207 (ENSDLEG00000013928) CLDN16 (ENSDLEG00000013947) CLDN1 (ENSDLEG00000013985) P3H2 (ENSDLEG00000014000) TP63 (ENSDLEG00000014028) LPP (ENSDLEG00000014060) ENSDLEG00000014118 BCL6 (ENSDLEG00000014141) RTP2 (ENSDLEG00000014176) SST (ENSDLEG00000014194) ENSDLEG00000014201 MASP1 (ENSDLEG00000014231) ENSDLEG00000014263 ##22 RTP1 (ENSDLEG00000014277) ST6GAL1 (ENSDLEG00000014287) ADIPOQ (ENSDLEG00000014304) RFC4 (ENSDLEG00000014316) EIF4A2 (ENSDLEG00000014344) ENSDLEG00000014421 ENSDLEG00000014425 FETUB (ENSDLEG00000014447) AHSG (ENSDLEG00000014474) DNAJB11 (ENSDLEG00000014485) TBCCD1 (ENSDLEG00000014504) CRYGS (ENSDLEG00000014518) DGKG (ENSDLEG00000014537) ETV5 (ENSDLEG00000014590) TRA2B (ENSDLEG00000008151) Narwhal MODERN SPECIES 298 CAMK4 (ENSMMNG00015000415) WDR36 (ENSMMNG00015000364) TSLP (ENSMMNG00015000325) SLC25A46 (ENSMMNG00015000274) ENSMMNG00015000240 ENSMMNG00015000211 ENSMMNG00015000169 MAN2A1 (ENSMMNG00015000086) ENSMMNG00015008330 PJA2 (ENSMMNG00015008316) FER (ENSMMNG00015008249) ENSMMNG00015008217 FBXL17 (ENSMMNG00015008187) EFNA5 (ENSMMNG00015008142) ENSMMNG00015008119 ENSMMNG00015008107 ##22 ENSMMNG00015008096 ENSMMNG00015008079 ENSMMNG00015008059 ENSMMNG00015008042 NUDT12 (ENSMMNG00015008002) ENSMMNG00015007981 PPIP5K2 (ENSMMNG00015007856) GIN1 (ENSMMNG00015007787) ENSMMNG00015007750 SLCO6A1 (ENSMMNG00015007635) SLCO4C1 (ENSMMNG00015007574) ENSMMNG00015007471 ST8SIA4 (ENSMMNG00015007448) FAM174A (ENSMMNG00015007430) ENSMMNG00015007415 Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 20 MEI4 (ENSCHYG00000026200) ENSCHYG00000026188 HTR1B (ENSCHYG00000026182) ENSCHYG00000026165 IMPG1 (ENSCHYG00000026013) ENSCHYG00000025974 MYO6 (ENSCHYG00000025820) SENP6 (ENSCHYG00000025652) FILIP1 (ENSCHYG00000025519) TMEM30A (ENSCHYG00000025455) ENSCHYG00000025429 COL12A1 (ENSCHYG00000024520) ENSCHYG00000024388 CD109 (ENSCHYG00000023895) SLC17A5 (ENSCHYG00000023670) ENSCHYG00000023575 ##22 MTO1 (ENSCHYG00000023513) CGAS (ENSCHYG00000023472) KCNQ5 (ENSCHYG00000021333) ENSCHYG00000021170 KHDC3L (ENSCHYG00000021116) OOEP (ENSCHYG00000021050) ENSCHYG00000020960 RIMS1 (ENSCHYG00000019435) ENSCHYG00000019200 ##35 ENSCHYG00000019157 B3GAT2 (ENSCHYG00000019057) ENSCHYG00000018878 ENSCHYG00000018786 FAM135A (ENSCHYG00000017966) COL9A1 (ENSCHYG00000016409) Yarkand deer MODERN SPECIES 32 SNX24 (ENSCHYG00000005056) SNX2 (ENSCHYG00000005112) SNCAIP (ENSCHYG00000005329) ENSCHYG00000005670 LOX (ENSCHYG00000005705) SRFBP1 (ENSCHYG00000005772) FTMT (ENSCHYG00000005816) PRR16 (ENSCHYG00000000399) FAM170A (ENSCHYG00000000416) HSD17B4 (ENSCHYG00000000468) TNFAIP8 (ENSCHYG00000000581) DMXL1 (ENSCHYG00000000630) DTWD2 (ENSCHYG00000000678) ENSCHYG00000000719 ENSCHYG00000000735 ENSCHYG00000000743 ##22 SEMA6A (ENSCHYG00000000796) COMMD10 (ENSCHYG00000001036) ENSCHYG00000001130 ARL10 (ENSCHYG00000001158) NOP16 (ENSCHYG00000001193) ENSCHYG00000001204 CLTB (ENSCHYG00000001215) FAF2 (ENSCHYG00000001227) RNF44 (ENSCHYG00000001257) CDHR2 (ENSCHYG00000001290) GPRIN1 (ENSCHYG00000001429) ENSCHYG00000001450 EIF4E1B (ENSCHYG00000001478) TSPAN17 (ENSCHYG00000001564) UNC5A (ENSCHYG00000001608) Yarkand deer MODERN SPECIES 12 ENSCHYG00000017021 MSH4 (ENSCHYG00000016798) ASB17 (ENSCHYG00000016708) ST6GALNAC3 (ENSCHYG00000016624) ST6GALNAC5 (ENSCHYG00000016572) PIGK (ENSCHYG00000016153) AK5 (ENSCHYG00000015698) ZZZ3 (ENSCHYG00000015450) USP33 (ENSCHYG00000014568) MIGA1 (ENSCHYG00000013877) NEXN (ENSCHYG00000013554) FUBP1 (ENSCHYG00000025894) DNAJB4 (ENSCHYG00000025859) ENSCHYG00000025842 GIPC2 (ENSCHYG00000025813) ENSCHYG00000025806 ##22 ENSCHYG00000025800 PTGFR (ENSCHYG00000025794) ENSCHYG00000025782 IFI44 (ENSCHYG00000025770) ENSCHYG00000025754 ADGRL4 (ENSCHYG00000025660) ENSCHYG00000025603 ENSCHYG00000025564 ENSCHYG00000025554 ADGRL2 (ENSCHYG00000025187) ENSCHYG00000025138 ENSCHYG00000025127 TTLL7 (ENSCHYG00000024854) ENSCHYG00000024821 PRKACB (ENSCHYG00000022683) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 54 PHIP (ENSMMSG00000003088) IRAK1BP1 (ENSMMSG00000003065) MEI4 (ENSMMSG00000003047) HTR1B (ENSMMSG00000003037) ENSMMSG00000003024 IMPG1 (ENSMMSG00000002976) MYO6 (ENSMMSG00000002820) SENP6 (ENSMMSG00000002705) FILIP1 (ENSMMSG00000002667) TMEM30A (ENSMMSG00000002637) ENSMMSG00000002619 COL12A1 (ENSMMSG00000001435) ENSMMSG00000001281 CD109 (ENSMMSG00000001208) SLC17A5 (ENSMMSG00000001151) ENSMMSG00000001122 ##22 MTO1 (ENSMMSG00000001090) ENSMMSG00000001075 CGAS (ENSMMSG00000001055) Siberian musk deer MODERN SPECIES 139 ENSMMSG00000000331 ENSMMSG00000000406 ENSMMSG00000000472 ABCC5 (ENSMMSG00000000523) PARL (ENSMMSG00000000606) MAP6D1 (ENSMMSG00000000647) YEATS2 (ENSMMSG00000000661) KLHL24 (ENSMMSG00000000711) KLHL6 (ENSMMSG00000000728) B3GNT5 (ENSMMSG00000000777) ENSMMSG00000000791 MCCC1 (ENSMMSG00000000836) DCUN1D1 (ENSMMSG00000000928) ATP11B (ENSMMSG00000000997) SOX2 (ENSMMSG00000001102) ENSMMSG00000001107 ##22 ENSMMSG00000001124 ENSMMSG00000001203 CCDC39 (ENSMMSG00000001595) TTC14 (ENSMMSG00000001675) PEX5L (ENSMMSG00000001803) USP13 (ENSMMSG00000003298) NDUFB5 (ENSMMSG00000003341) MRPL47 (ENSMMSG00000003361) ACTL6A (ENSMMSG00000003389) GNB4 (ENSMMSG00000003419) MFN1 (ENSMMSG00000003440) ZNF639 (ENSMMSG00000003462) KCNMB3 (ENSMMSG00000003476) PIK3CA (ENSMMSG00000003505) ZMAT3 (ENSMMSG00000003531) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1175 KMT5A (ENSMMSG00000008337) SBNO1 (ENSMMSG00000007991) CDK2AP1 (ENSMMSG00000007909) MTRFR (ENSMMSG00000007833) MPHOSPH9 (ENSMMSG00000007673) PITPNM2 (ENSMMSG00000007490) ARL6IP4 (ENSMMSG00000007417) OGFOD2 (ENSMMSG00000007329) ABCB9 (ENSMMSG00000006821) VPS37B (ENSMMSG00000006776) HIP1R (ENSMMSG00000006691) CCDC62 (ENSMMSG00000006617) DENR (ENSMMSG00000006542) HCAR1 (ENSMMSG00000006525) ENSMMSG00000006509 ENSMMSG00000006493 ##22 KNTC1 (ENSMMSG00000006101) ENSMMSG00000005999 ZCCHC8 (ENSMMSG00000005963) CLIP1 (ENSMMSG00000005827) VPS33A (ENSMMSG00000005731) ENSMMSG00000005714 DIABLO (ENSMMSG00000005671) B3GNT4 (ENSMMSG00000005642) LRRC43 (ENSMMSG00000005488) ENSMMSG00000005422 MLXIP (ENSMMSG00000005364) BCL7A (ENSMMSG00000005301) CFAP251 (ENSMMSG00000004952) PSMD9 (ENSMMSG00000004804) HPD (ENSMMSG00000004689) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 8 EP400 (ENSOARG00020023106) ENSOARG00020023061 DDX51 (ENSOARG00020022927) NOC4L (ENSOARG00020022819) GALNT9 (ENSOARG00020022708) ENSOARG00020022546 P2RX2 (ENSOARG00020022417) POLE (ENSOARG00020021578) ENSOARG00020021521 PXMP2 (ENSOARG00020021495) PGAM5 (ENSOARG00020021459) GOLGA3 (ENSOARG00020021327) CHFR (ENSOARG00020021173) MBD3L1 (ENSOARG00020021070) ZNF268 (ENSOARG00020021006) ENSOARG00020020963 ##22 ZNF10 (ENSOARG00020020843) ZNF891 (ENSOARG00020020793) ZNF140 (ENSOARG00020020720) ENSOARG00020020685 ZNF84 (ENSOARG00020020649) ZNF26 (ENSOARG00020020558) ZNF605 (ENSOARG00020020540) GUCY1A1 (ENSOARG00020020444) GUCY1B1 (ENSOARG00020019632) ASIC5 (ENSOARG00020019521) TDO2 (ENSOARG00020019442) CTSO (ENSOARG00020019071) PDGFC (ENSOARG00020019005) GLRB (ENSOARG00020018896) GRIA2 (ENSOARG00020017749) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 1 TRPC4 (ENSOARG00020004737) POSTN (ENSOARG00020004992) EXOSC8 (ENSOARG00020005546) ALG5 (ENSOARG00020005611) ENSOARG00020005685 RFXAP (ENSOARG00020005709) SERTM1 (ENSOARG00020005720) CCNA1 (ENSOARG00020005736) SPART (ENSOARG00020005778) DCLK1 (ENSOARG00020005882) NBEA (ENSOARG00020006253) MAB21L1 (ENSOARG00020006363) RFC3 (ENSOARG00020006444) ENSOARG00020006606 FRY (ENSOARG00020006776) ENSOARG00020007798 ##22 RXFP2 (ENSOARG00020007829) ENSOARG00020008205 B3GLCT (ENSOARG00020008264) HSPH1 (ENSOARG00020008491) ENSOARG00020008926 TEX26 (ENSOARG00020009149) MEDAG (ENSOARG00020009224) ALOX5AP (ENSOARG00020009284) HMGB1 (ENSOARG00020009396) KATNAL1 (ENSOARG00020009464) UBL3 (ENSOARG00020009591) SLC7A1 (ENSOARG00020009646) ENSOARG00020009812 SLC46A3 (ENSOARG00020009919) ENSOARG00020010005 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Cow MODERN SPECIES 9 ZNRF1 (ENSBTAG00000034689) LDHD (ENSBTAG00000006779) ZFP1 (ENSBTAG00000000868) CTRB2 (ENSBTAG00000008500) ENSBTAG00000011995 ENSBTAG00000039914 BCAR1 (ENSBTAG00000012002) CFDP1 (ENSBTAG00000015427) CFDP2 (ENSBTAG00000009805) BCNT2 (ENSBTAG00000030600) TMEM170A (ENSBTAG00000015428) CHST6 (ENSBTAG00000040000) TMEM231 (ENSBTAG00000015432) GABARAPL2 (ENSBTAG00000006550) ADAT1 (ENSBTAG00000015669) ENSBTAG00000034185 ##22 KARS1 (ENSBTAG00000015677) TERF2IP (ENSBTAG00000015686) CNTNAP4 (ENSBTAG00000026004) ENSBTAG00000012131 MON1B (ENSBTAG00000052957) ADAMTS18 (ENSBTAG00000001010) NUDT7 (ENSBTAG00000007184) VAT1L (ENSBTAG00000018146) CLEC3A (ENSBTAG00000046772) WWOX (ENSBTAG00000015894) ENSBTAG00000050959 MAF (ENSBTAG00000044192) DYNLRB2 (ENSBTAG00000017752) CDYL2 (ENSBTAG00000017112) CMC2 (ENSBTAG00000017009) Hybrid Bos Indicus DUPLICATION Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 28 RWDD2A (ENSBIXG00005013182) PGM3 (ENSBIXG00005007443) DOP1A (ENSBIXG00005006119) UBE3D (ENSBIXG00005013466) TPBG (ENSBIXG00005013543) ENSBIXG00005013564 IBTK (ENSBIXG00005006921) ENSBIXG00005013858 ENSBIXG00005013870 TENT5A (ENSBIXG00005013992) BCKDHB (ENSBIXG00005014060) TTK (ENSBIXG00005014151) ELOVL4 (ENSBIXG00005001850) SH3BGRL2 (ENSBIXG00005014226) LCA5 (ENSBIXG00005014266) ENSBIXG00005014277 ##22 HMGN3 (ENSBIXG00005014355) PHIP (ENSBIXG00005014424) IRAK1BP1 (ENSBIXG00005001929) ENSBIXG00005014458 ENSBIXG00005001941 ENSBIXG00005014467 MEI4 (ENSBIXG00005014504) HTR1B (ENSBIXG00005005419) ENSBIXG00005014540 ENSBIXG00005014555 IMPG1 (ENSBIXG00005014572) ENSBIXG00005006341 MYO6 (ENSBIXG00005014655) ENSBIXG00005014745 ENSBIXG00005002089 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 107 ENSBIXG00005025370 ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Donkey MODERN SPECIES 29 THG1L (ENSEASG00005000757) SOX30 (ENSEASG00005000761) ENSEASG00005000769 NIPAL4 (ENSEASG00005024733) ENSEASG00005000782 FNDC9 (ENSEASG00005031824) ITK (ENSEASG00005000833) GARIN3 (ENSEASG00005000928) MED7 (ENSEASG00005000944) HAVCR2 (ENSEASG00005000959) ENSEASG00005034411 TIMD4 (ENSEASG00005000989) SGCD (ENSEASG00005000999) ENSEASG00005001006 ENSEASG00005033329 ENSEASG00005001081 ##22 MRPL22 (ENSEASG00005036401) GEMIN5 (ENSEASG00005001026) ENSEASG00005030181 CNOT8 (ENSEASG00005001043) FAXDC2 (ENSEASG00005001054) ENSEASG00005001061 LARP1 (ENSEASG00005001070) HAND1 (ENSEASG00005001085) SAP30L (ENSEASG00005037967) GALNT10 (ENSEASG00005001101) MFAP3 (ENSEASG00005001108) FAM114A2 (ENSEASG00005001111) GRIA1 (ENSEASG00005001130) NMUR2 (ENSEASG00005001147) GLRA1 (ENSEASG00005001178) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 ENSRFEG00010011219 KCNK10 (ENSRFEG00010011135) ENSRFEG00010011077 SPATA7 (ENSRFEG00010010944) PTPN21 (ENSRFEG00010010878) ZC3H14 (ENSRFEG00010010356) EML5 (ENSRFEG00010010199) TTC8 (ENSRFEG00010009898) FOXN3 (ENSRFEG00010009812) EFCAB11 (ENSRFEG00010009733) TDP1 (ENSRFEG00010009605) ENSRFEG00010009545 NRDE2 (ENSRFEG00010009498) ENSRFEG00010009378 TTC7B (ENSRFEG00010009283) ENSRFEG00010009197 ##22 RPS6KA5 (ENSRFEG00010009141) DGLUCY (ENSRFEG00010008974) GPR68 (ENSRFEG00010008925) CCDC88C (ENSRFEG00010008851) PPP4R3A (ENSRFEG00010008400) CATSPERB (ENSRFEG00010008158) TC2N (ENSRFEG00010008069) FBLN5 (ENSRFEG00010007980) TRIP11 (ENSRFEG00010007740) ATXN3 (ENSRFEG00010007362) ENSRFEG00010007278 CPSF2 (ENSRFEG00010007223) ENSRFEG00010007181 SLC24A4 (ENSRFEG00010007052) RIN3 (ENSRFEG00010006941) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 14 IGSF9 (ENSRFEG00010019302) TAGLN2 (ENSRFEG00010019400) CFAP45 (ENSRFEG00010019459) VSIG8 (ENSRFEG00010019604) DUSP23 (ENSRFEG00010020089) FCER1A (ENSRFEG00010020109) ACKR1 (ENSRFEG00010020121) CADM3 (ENSRFEG00010020150) SPTA1 (ENSRFEG00010020243) CD1E (ENSRFEG00010020314) CD1B (ENSRFEG00010020359) CD1C (ENSRFEG00010020380) ENSRFEG00010020419 ENSRFEG00010020442 KIRREL1 (ENSRFEG00010020495) ENSRFEG00010020597 ##22 CD5L (ENSRFEG00010020610) CARMIL1 (ENSRFEG00010020699) RIPOR2 (ENSRFEG00010020962) ARMH2 (ENSRFEG00010021092) GMNN (ENSRFEG00010021109) ENSRFEG00010010667 C6orf62 (ENSRFEG00010010726) ACOT13 (ENSRFEG00010010779) TDP2 (ENSRFEG00010010899) ENSRFEG00010010920 ALDH5A1 (ENSRFEG00010011122) GPLD1 (ENSRFEG00010011303) MRS2 (ENSRFEG00010011462) SLC44A3 (ENSRFEG00010011508) ENSRFEG00010011744 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Caniformia DUPLICATION Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.a ##22 Red fox MODERN SPECIES 69 DDX60 (ENSVVUG00000023953) ANXA10 (ENSVVUG00000023918) SPOCK3 (ENSVVUG00000023913) TLL1 (ENSVVUG00000022513) ENSVVUG00000022421 ##22 CPE (ENSVVUG00000022392) MSMO1 (ENSVVUG00000022387) KLHL2 (ENSVVUG00000022372) TMEM192 (ENSVVUG00000022358) ENSVVUG00000022349 ENSVVUG00000022341 APELA (ENSVVUG00000022338) MARCHF1 (ENSVVUG00000022324) TMA16 (ENSVVUG00000022320) NPY5R (ENSVVUG00000022317) NPY1R (ENSVVUG00000022316) NAF1 (ENSVVUG00000022303) FSTL5 (ENSVVUG00000021188) RAPGEF2 (ENSVVUG00000021085) C4orf45 (ENSVVUG00000021076) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.a ##22 American mink MODERN SPECIES ZFYVE26 (ENSNVIG00000009397) RDH12 (ENSNVIG00000009372) RDH11 (ENSNVIG00000009324) ENSNVIG00000009301 ENSNVIG00000009284 PIGH (ENSNVIG00000009267) PLEKHH1 (ENSNVIG00000009248) T229B (ENSNVIG00000009236) PLEK2 (ENSNVIG00000009204) EIF2S1 (ENSNVIG00000009188) VATD (ENSNVIG00000009146) PALS1 (ENSNVIG00000009115) GARIN2 (ENSNVIG00000009099) GPHN (ENSNVIG00000008909) CCDC196 (ENSNVIG00000008863) ENSNVIG00000008837 ##22 FUT8 (ENSNVIG00000008751) ENSNVIG00000008731 ENSNVIG00000008707 FNTB (ENSNVIG00000008634) RAB15 (ENSNVIG00000008586) GPX2 (ENSNVIG00000008565) G3V1X3 (ENSNVIG00000008535) SPTB (ENSNVIG00000008317) PLEKHG3 (ENSNVIG00000008179) PPP1R36 (ENSNVIG00000008128) HSPA2 (ENSNVIG00000008107) ENSNVIG00000008085 ZBT25 (ENSNVIG00000008056) AKAP5 (ENSNVIG00000008039) MTHFD1 (ENSNVIG00000007998) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.b ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.b ##22 Giant Panda MODERN SPECIES IMPG2 (ENSAMEG00000003809) ENSAMEG00000003833 ENSAMEG00000003855 TFG (ENSAMEG00000003873) ADGRG7 (ENSAMEG00000003893) ENSAMEG00000030906 TMEM45A (ENSAMEG00000003920) LNP1 (ENSAMEG00000003936) TOMM70 (ENSAMEG00000003947) ENSAMEG00000003980 TBC1D23 (ENSAMEG00000004002) ENSAMEG00000004060 FILIP1L (ENSAMEG00000004107) CMSS1 (ENSAMEG00000004092) COL8A1 (ENSAMEG00000029402) ENSAMEG00000030957 ##22 DCBLD2 (ENSAMEG00000015456) ST3GAL6 (ENSAMEG00000015477) CPOX (ENSAMEG00000015511) GPR15 (ENSAMEG00000018960) CLDND1 (ENSAMEG00000023838) ENSAMEG00000018988 ENSAMEG00000004892 ENSAMEG00000027080 ENSAMEG00000029422 ENSAMEG00000025313 ENSAMEG00000025618 ENSAMEG00000030375 ENSAMEG00000029849 GABRR3 (ENSAMEG00000024214) RIOX2 (ENSAMEG00000013693) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.w.b ##22 Red fox MODERN SPECIES 102 ENSVVUG00000011439 INTU (ENSVVUG00000011410) SLC25A31 (ENSVVUG00000011392) HSPA4L (ENSVVUG00000011386) PLK4 (ENSVVUG00000011372) MFSD8 (ENSVVUG00000011348) ABHD18 (ENSVVUG00000011339) LARP1B (ENSVVUG00000011307) PGRMC2 (ENSVVUG00000011296) ENSVVUG00000011292 ENSVVUG00000011289 JADE1 (ENSVVUG00000011265) SCLT1 (ENSVVUG00000011235) CUNH4orf33 (ENSVVUG00000011220) ENSVVUG00000011202 ##22 ENSVVUG00000011156 PCDH10 (ENSVVUG00000011090) ENSVVUG00000011060 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.x ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.x ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000012588 ENSGT00940000176100 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.x ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT01050000245142.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Giant Panda MODERN SPECIES 18 PDC (ENSAMEG00000015527) PTGS2 (ENSAMEG00000015532) ENSAMEG00000015549 ENSAMEG00000015595 ENSAMEG00000014756 ENSAMEG00000014754 TDRD5 (ENSAMEG00000014736) NPHS2 (ENSAMEG00000014701) AXDND1 (ENSAMEG00000014673) SOAT1 (ENSAMEG00000014663) ABL2 (ENSAMEG00000014636) FAM20B (ENSAMEG00000014618) ANGPTL1 (ENSAMEG00000014608) RALGPS2 (ENSAMEG00000014542) TEX35 (ENSAMEG00000014530) ENSAMEG00000024488 ##22 RASAL2 (ENSAMEG00000014504) ENSAMEG00000014497 ENSAMEG00000014441 BRINP2 (ENSAMEG00000014421) ASTN1 (ENSAMEG00000017137) PAPPA2 (ENSAMEG00000017116) ENSAMEG00000026617 ENSAMEG00000030418 COP1 (ENSAMEG00000017098) TNR (ENSAMEG00000017071) KIAA0040 (ENSAMEG00000000190) TNN (ENSAMEG00000000177) MRPS14 (ENSAMEG00000026271) ENSAMEG00000000170 RABGAP1L (ENSAMEG00000000167) Ursus ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00940000176100 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.x ##22 ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT01050000245142.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00390000002581 Polar bear MODERN SPECIES 117 PHIP (ENSUMAG00000015736) IRAK1BP1 (ENSUMAG00000015580) ENSUMAG00000015578 MEI4 (ENSUMAG00000015560) HTR1B (ENSUMAG00000015515) ENSUMAG00000015486 IMPG1 (ENSUMAG00000015416) MYO6 (ENSUMAG00000013807) SENP6 (ENSUMAG00000013661) FILIP1 (ENSUMAG00000013648) TMEM30A (ENSUMAG00000013645) COX7A2 (ENSUMAG00000013642) COL12A1 (ENSUMAG00000012583) CD109 (ENSUMAG00000012341) SLC17A5 (ENSUMAG00000012317) ENSUMAG00000012312 ##22 MTO1 (ENSUMAG00000012307) ENSUMAG00000012301 ENSUMAG00000012291 OOEP (ENSUMAG00000012283) KHDC3L (ENSUMAG00000012278) DPPA5 (ENSUMAG00000012276) ENSUMAG00000012267 ENSUMAG00000012265 ENSUMAG00000012262 RIMS1 (ENSUMAG00000011970) ENSUMAG00000011923 ENSUMAG00000011919 OGFRL1 (ENSUMAG00000011900) ##35 SMAP1 (ENSUMAG00000011886) SDHAF4 (ENSUMAG00000011880) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00390000011494 ENSGT00390000012644 ENSGT00990000203541.a.a.b ENSGT00940000155264 ENSGT01100000263544.c.a.b.a ENSGT00940000155325 ENSGT00940000159584 ENSGT00940000155056 ENSGT00940000160828 ENSGT00390000001176 ENSGT00940000162211 ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.x ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 229 ENSMPUG00000003816 ##22 RPS6KA3 (ENSMPUG00000003384) EIF1AX (ENSMPUG00000003337) MAP7D2 (ENSMPUG00000003325) BCLAF3 (ENSMPUG00000003312) SH3KBP1 (ENSMPUG00000003301) ENSMPUG00000003295 ENSMPUG00000003281 PDHA1 (ENSMPUG00000003269) ADGRG2 (ENSMPUG00000003173) PHKA2 (ENSMPUG00000002957) PPEF1 (ENSMPUG00000002945) RS1 (ENSMPUG00000002912) CDKL5 (ENSMPUG00000002901) ENSMPUG00000002898 ENSMPUG00000002872 Ferret MODERN SPECIES 318 LHFPL5 (ENSMPUG00000003811) SRPK1 (ENSMPUG00000003819) SLC26A8 (ENSMPUG00000003835) MAPK14 (ENSMPUG00000003927) MAPK13 (ENSMPUG00000004068) BRPF3 (ENSMPUG00000004075) PNPLA1 (ENSMPUG00000004082) ENSMPUG00000004090 ENSMPUG00000004094 ETV7 (ENSMPUG00000004099) ENSMPUG00000004109 COL12A1 (ENSMPUG00000004121) ENSMPUG00000004149 CD109 (ENSMPUG00000004172) SLC17A5 (ENSMPUG00000004258) ENSMPUG00000004271 ##22 MTO1 (ENSMPUG00000004323) CGAS (ENSMPUG00000004335) ENSMPUG00000004342 OOEP (ENSMPUG00000004352) ENSMPUG00000004363 ENSMPUG00000004366 KCNQ5 (ENSMPUG00000004368) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.x ##22 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 7 RIMS1 (ENSVVUG00000009659) ENSVVUG00000009586 ENSVVUG00000009573 OGFRL1 (ENSVVUG00000009555) ##35 B3GAT2 (ENSVVUG00000009508) ENSVVUG00000009464 SMAP1 (ENSVVUG00000009458) SDHAF4 (ENSVVUG00000009454) FAM135A (ENSVVUG00000009408) ENSVVUG00000009380 COL19A1 (ENSVVUG00000009362) LMBRD1 (ENSVVUG00000009340) ENSVVUG00000009318 ##22 ADGRB3 (ENSVVUG00000008980) ENSVVUG00000008948 ENSVVUG00000008930 ENSVVUG00000008929 ENSVVUG00000008913 ENSVVUG00000008911 ENSVVUG00000008901 ENSVVUG00000008894 ENSVVUG00000008891 ENSVVUG00000008860 PHF3 (ENSVVUG00000008751) PTP4A1 (ENSVVUG00000008724) LGSN (ENSVVUG00000008700) KHDRBS2 (ENSVVUG00000008652) ENSVVUG00000008637 Red fox MODERN SPECIES 1 LYSMD4 (ENSVVUG00000014281) MEF2A (ENSVVUG00000014258) ENSVVUG00000014251 LRRC28 (ENSVVUG00000014237) TTC23 (ENSVVUG00000014215) ENSVVUG00000014213 ENSVVUG00000014200 IGF1R (ENSVVUG00000014162) ENSVVUG00000014135 ENSVVUG00000014134 ENSVVUG00000014117 ARRDC4 (ENSVVUG00000014081) NR2F2 (ENSVVUG00000014034) ENSVVUG00000014025 MCTP2 (ENSVVUG00000013991) ENSVVUG00000013986 ##22 RGMA (ENSVVUG00000013983) ENSVVUG00000013557 ENSVVUG00000013191 ENSVVUG00000013171 ST8SIA2 (ENSVVUG00000013140) SLCO3A1 (ENSVVUG00000013095) SV2B (ENSVVUG00000013022) AKAP13 (ENSVVUG00000012249) KLHL25 (ENSVVUG00000012193) AGBL1 (ENSVVUG00000012159) ENSVVUG00000012112 NTRK3 (ENSVVUG00000012090) ENSVVUG00000012059 ENSVVUG00000012061 MRPL46 (ENSVVUG00000012054) Red fox MODERN SPECIES 4 ENSVVUG00000000189 ENSVVUG00000000336 DEPDC1B (ENSVVUG00000000387) ELOVL7 (ENSVVUG00000000433) ERCC8 (ENSVVUG00000000470) NDUFAF2 (ENSVVUG00000000524) SMIM15 (ENSVVUG00000000544) ZSWIM6 (ENSVVUG00000000580) KIF2A (ENSVVUG00000001139) DIMT1 (ENSVVUG00000005394) ENSVVUG00000005410 IPO11 (ENSVVUG00000005421) ENSVVUG00000005431 ENSVVUG00000005447 ENSVVUG00000005489 ENSVVUG00000005508 ##22 HTR1A (ENSVVUG00000005510) RNF180 (ENSVVUG00000005524) ENSVVUG00000005534 RGS7BP (ENSVVUG00000005540) SHISAL2B (ENSVVUG00000005545) ENSVVUG00000005556 CWC27 (ENSVVUG00000005562) ENSVVUG00000005585 ENSVVUG00000005607 CENPK (ENSVVUG00000005639) PPWD1 (ENSVVUG00000005688) TRIM23 (ENSVVUG00000005693) TRAPPC13 (ENSVVUG00000005701) SGTB (ENSVVUG00000005714) NLN (ENSVVUG00000005732) Red fox MODERN SPECIES 221 SEMA3A (ENSVVUG00000018987) SEMA3D (ENSVVUG00000018959) ENSVVUG00000018932 ##22 SEPTIN14 (ENSVVUG00000018916) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a.x ##22 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 22 TADA2B (ENSCAFG00845008475) GRPEL1 (ENSCAFG00845008512) SORCS2 (ENSCAFG00845008589) AFAP1 (ENSCAFG00845008918) ABLIM2 (ENSCAFG00845009215) SH3TC1 (ENSCAFG00845009957) HTRA3 (ENSCAFG00845010076) ACOX3 (ENSCAFG00845010178) ENSCAFG00845010480 TRMT44 (ENSCAFG00845010510) CPZ (ENSCAFG00845010568) HMX1 (ENSCAFG00845010633) ENSCAFG00845010654 LRPAP1 (ENSCAFG00845010689) HGFAC (ENSCAFG00845010777) ENSCAFG00845010871 ##22 HGFAC (ENSCAFG00845010920) HGFAC (ENSCAFG00845011005) HTT (ENSCAFG00845011109) HTT (ENSCAFG00845011174) GRK4 (ENSCAFG00845011404) ENSCAFG00845011720 NOP14 (ENSCAFG00845011751) MFSD10 (ENSCAFG00845011850) ADD1 (ENSCAFG00845012015) SH3BP2 (ENSCAFG00845012142) TNIP2 (ENSCAFG00845012210) FAM193A (ENSCAFG00845012303) RNF4 (ENSCAFG00845012388) CFAP99 (ENSCAFG00845012463) ZFYVE28 (ENSCAFG00845012527) Dog MODERN SPECIES 11 ENSCAFG00845001295 ENSCAFG00845001305 ENSCAFG00845001333 ##22 ENSCAFG00845001346 FZD8 (ENSCAFG00845001355) GJD4 (ENSCAFG00845001376) CCNY (ENSCAFG00845001450) ENSCAFG00845001523 ENSCAFG00845001537 CREM (ENSCAFG00845001664) CUL2 (ENSCAFG00845002080) PARD3 (ENSCAFG00845002370) ENSCAFG00845002703 NRP1 (ENSCAFG00845002787) ITGB1 (ENSCAFG00845002947) ENSCAFG00845003110 CCDC7 (ENSCAFG00845003160) ENSCAFG00845003242 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 337 SLAIN1 (ENSCAFG00020025049) EDNRB (ENSCAFG00020025041) POU4F1 (ENSCAFG00020025036) OBI1 (ENSCAFG00020025031) ENSCAFG00020025025 RBM26 (ENSCAFG00020024152) NDFIP2 (ENSCAFG00020024076) SPRY2 (ENSCAFG00020024071) ENSCAFG00020024068 ENSCAFG00020024063 ENSCAFG00020024059 SLITRK1 (ENSCAFG00020024056) ENSCAFG00020024054 ENSCAFG00020024049 SLITRK6 (ENSCAFG00020024048) ENSCAFG00020024045 ##22 ENSCAFG00020024043 ENSCAFG00020024040 ENSCAFG00020024038 SLITRK5 (ENSCAFG00020024036) ENSCAFG00020024030 ENSCAFG00020024028 GPC5 (ENSCAFG00020024017) ENSCAFG00020024011 ENSCAFG00020024009 ENSCAFG00020024006 ENSCAFG00020024005 GPR180 (ENSCAFG00020024004) SOX21 (ENSCAFG00020024003) ABCC4 (ENSCAFG00020023951) CLDN10 (ENSCAFG00020023943) Dingo MODERN SPECIES 313 ENSCAFG00020011686 CCDC152 (ENSCAFG00020011688) GHR (ENSCAFG00020011695) FBXO4 (ENSCAFG00020011700) RIMOC1 (ENSCAFG00020011704) ENSCAFG00020011707 ##22 OXCT1 (ENSCAFG00020011721) PLCXD3 (ENSCAFG00020011744) ENSCAFG00020011746 C6 (ENSCAFG00020011760) MROH2B (ENSCAFG00020012118) C7 (ENSCAFG00020012179) CARD6 (ENSCAFG00020012185) ENSCAFG00020012191 ENSCAFG00020012194 PRKAA1 (ENSCAFG00020012199) TTC33 (ENSCAFG00020012202) PTGER4 (ENSCAFG00020012207) ENSCAFG00020012213 DAB2 (ENSCAFG00020012220) C9 (ENSCAFG00020012230) Dingo MODERN SPECIES 210 ENSCAFG00020000686 ENSCAFG00020000706 ENSCAFG00020000736 ENSCAFG00020000747 ##22 FZD8 (ENSCAFG00020000760) CCNY (ENSCAFG00020000769) CREM (ENSCAFG00020000830) ENSCAFG00020001003 ENSCAFG00020001058 CUL2 (ENSCAFG00020001102) PARD3 (ENSCAFG00020002064) ENSCAFG00020009944 ENSCAFG00020009948 ENSCAFG00020009959 NRP1 (ENSCAFG00020010015) ITGB1 (ENSCAFG00020010708) ENSCAFG00020010712 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 leopard DUPLICATION leopard MODERN SPECIES 25 C4orf48 (ENSPPRG00000004524) ENSPPRG00000004633 HAUS3 (ENSPPRG00000007568) MXD4 (ENSPPRG00000009897) ENSPPRG00000012352 CFAP99 (ENSPPRG00000013633) RNF4 (ENSPPRG00000020972) ENSPPRG00000022001 FAM193A (ENSPPRG00000023349) TNIP2 (ENSPPRG00000022784) SH3BP2 (ENSPPRG00000000297) ENSPPRG00000000360 ADD1 (ENSPPRG00000009526) MFSD10 (ENSPPRG00000010726) NOP14 (ENSPPRG00000012848) ENSPPRG00000001525 ##22 GRK4 (ENSPPRG00000004398) HTT (ENSPPRG00000008717) MSANTD1 (ENSPPRG00000010491) RGS12 (ENSPPRG00000014281) HGFAC (ENSPPRG00000020547) DOK7 (ENSPPRG00000021690) LRPAP1 (ENSPPRG00000022560) ADRA2C (ENSPPRG00000023307) HMX1 (ENSPPRG00000023236) CPZ (ENSPPRG00000000157) TRMT44 (ENSPPRG00000001613) ACOX3 (ENSPPRG00000003521) HTRA3 (ENSPPRG00000005071) SH3TC1 (ENSPPRG00000005952) ABLIM2 (ENSPPRG00000019420) leopard MODERN SPECIES 91 ANKRD61 (ENSPPRG00000007144) ENSPPRG00000006879 PMS2 (ENSPPRG00000005984) ENSPPRG00000004186 ENSPPRG00000003334 ENSPPRG00000001866 LMTK2 (ENSPPRG00000001646) BHLHA15 (ENSPPRG00000022063) TECPR1 (ENSPPRG00000000441) BRI3 (ENSPPRG00000022966) BAIAP2L1 (ENSPPRG00000023080) ENSPPRG00000023746 NPTX2 (ENSPPRG00000024054) TMEM130 (ENSPPRG00000024166) TRRAP (ENSPPRG00000024644) ENSPPRG00000003908 ##22 SMURF1 (ENSPPRG00000013759) KPNA7 (ENSPPRG00000011372) ENSPPRG00000010473 ARPC1A (ENSPPRG00000008068) ARPC1B (ENSPPRG00000007519) PDAP1 (ENSPPRG00000007263) BUD31 (ENSPPRG00000004354) PTCD1 (ENSPPRG00000003478) CPSF4 (ENSPPRG00000003134) ENSPPRG00000001557 ZNF789 (ENSPPRG00000001332) ZNF394 (ENSPPRG00000000948) ZKSCAN5 (ENSPPRG00000000685) FAM200A (ENSPPRG00000020418) ZNF655 (ENSPPRG00000023556) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 Elephant MODERN SPECIES 164 PPARGC1A (ENSLAFG00000012981) ENSLAFG00000030988 GBA3 (ENSLAFG00000029577) ADGRA3 (ENSLAFG00000003897) KCNIP4 (ENSLAFG00000005792) PACRGL (ENSLAFG00000005786) SLIT2 (ENSLAFG00000017738) ENSLAFG00000009691 NCAPG (ENSLAFG00000009686) FAM184B (ENSLAFG00000015420) MED28 (ENSLAFG00000016936) LAP3 (ENSLAFG00000016929) CLRN2 (ENSLAFG00000016844) QDPR (ENSLAFG00000004518) LDB2 (ENSLAFG00000000552) ENSLAFG00000028231 ##22 TAPT1 (ENSLAFG00000003952) PROM1 (ENSLAFG00000004007) ENSLAFG00000000871 ENSLAFG00000013298 BST1 (ENSLAFG00000006613) FBXL5 (ENSLAFG00000022751) ENSLAFG00000025555 CC2D2A (ENSLAFG00000004935) C1QTNF7 (ENSLAFG00000023327) ENSLAFG00000007142 ENSLAFG00000007535 NKX3-2 (ENSLAFG00000031404) RAB28 (ENSLAFG00000002485) HS3ST1 (ENSLAFG00000017334) CLNK (ENSLAFG00000010915) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000162741.j ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 5060 ENSEEUG00000000342 ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 Suina ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E Pig MODERN SPECIES PHIP (ENSSSCG00000004473) ENSSSCG00000049571 IRAK1BP1 (ENSSSCG00000004472) MEI4 (ENSSSCG00000034152) HTR1B (ENSSSCG00000004475) IMPG1 (ENSSSCG00000004477) MYO6 (ENSSSCG00000004478) SENP6 (ENSSSCG00000020702) FILIP1 (ENSSSCG00000004479) TMEM30A (ENSSSCG00000033155) COX7A2 (ENSSSCG00000004480) COL12A1 (ENSSSCG00000004484) ENSSSCG00000053516 CD109 (ENSSSCG00000004485) SLC17A5 (ENSSSCG00000004486) ENSSSCG00000004489 ##22 MTO1 (ENSSSCG00000004487) CGAS (ENSSSCG00000021383) ENSSSCG00000033160 ENSSSCG00000059924 ENSSSCG00000055610 ENSSSCG00000052345 ENSSSCG00000005790 ENSSSCG00000008882 SETBP1 (ENSSSCG00000004490) ENSSSCG00000045948 ENSSSCG00000004491 SLC14A1 (ENSSSCG00000004492) SIGLEC15 (ENSSSCG00000004493) EPG5 (ENSSSCG00000021072) PSTPIP2 (ENSSSCG00000060601) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Alpaca MODERN SPECIES 5089 ENSVPAG00000007637 ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 Cetacea DUPLICATION Cetacea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097.h.b.a ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097.h.b.a ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.f Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00950000182909.b.b.b.e ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097.h.b.a ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.f Narwhal MODERN SPECIES 301 PHIP (ENSMMNG00015021816) IRAK1BP1 (ENSMMNG00015021809) ENSMMNG00015021804 MEI4 (ENSMMNG00015021797) HTR1B (ENSMMNG00015021791) IMPG1 (ENSMMNG00015021769) MYO6 (ENSMMNG00015021711) SENP6 (ENSMMNG00015021664) FILIP1 (ENSMMNG00015021639) TMEM30A (ENSMMNG00015021614) ENSMMNG00015021598 COL12A1 (ENSMMNG00015020073) ENSMMNG00015019164 CD109 (ENSMMNG00015019089) SLC17A5 (ENSMMNG00015019025) ENSMMNG00015018976 ##22 MTO1 (ENSMMNG00015018939) CGAS (ENSMMNG00015018886) ENSMMNG00015018822 ENSMMNG00015018801 KHDC3L (ENSMMNG00015018781) DPPA5 (ENSMMNG00015018758) ENSMMNG00015018724 KCNQ5 (ENSMMNG00015018265) RIMS1 (ENSMMNG00015017217) ENSMMNG00015016922 ##35 B3GAT2 (ENSMMNG00015016819) SMAP1 (ENSMMNG00015016741) SDHAF4 (ENSMMNG00015016696) FAM135A (ENSMMNG00015016471) COL9A1 (ENSMMNG00015015953) Beluga whale MODERN SPECIES 1 HMGN3 (ENSDLEG00000001251) PHIP (ENSDLEG00000001386) IRAK1BP1 (ENSDLEG00000002494) ENSDLEG00000002506 HTR1B (ENSDLEG00000002516) IMPG1 (ENSDLEG00000002533) MYO6 (ENSDLEG00000002587) SENP6 (ENSDLEG00000002695) FILIP1 (ENSDLEG00000003138) TMEM30A (ENSDLEG00000003156) ENSDLEG00000003178 COL12A1 (ENSDLEG00000003318) ENSDLEG00000003964 CD109 (ENSDLEG00000003996) SLC17A5 (ENSDLEG00000004174) EEF1A1 (ENSDLEG00000004186) ##22 MTO1 (ENSDLEG00000004196) MB21D1 (ENSDLEG00000004204) ENSDLEG00000004208 ENSDLEG00000004215 KHDC3L (ENSDLEG00000004220) KCNQ5 (ENSDLEG00000004241) RIMS1 (ENSDLEG00000004683) OGFRL1 (ENSDLEG00000007388) ##35 B3GAT2 (ENSDLEG00000007430) SMAP1 (ENSDLEG00000007452) SDHAF4 (ENSDLEG00000007493) FAM135A (ENSDLEG00000007500) ENSDLEG00000007515 ENSDLEG00000007531 LMBRD1 (ENSDLEG00000007539) Vaquita MODERN SPECIES 3 LCA5 (ENSPSNG00000009858) HMGN3 (ENSPSNG00000009951) PHIP (ENSPSNG00000009757) IRAK1BP1 (ENSPSNG00000009861) MEI4 (ENSPSNG00000009926) HTR1B (ENSPSNG00000010001) IMPG1 (ENSPSNG00000010066) MYO6 (ENSPSNG00000010535) SENP6 (ENSPSNG00000010770) FILIP1 (ENSPSNG00000010913) TMEM30A (ENSPSNG00000011113) ENSPSNG00000011260 COL12A1 (ENSPSNG00000011498) CD109 (ENSPSNG00000012621) SLC17A5 (ENSPSNG00000017062) ENSPSNG00000017147 ##22 MTO1 (ENSPSNG00000017236) CGAS (ENSPSNG00000017365) ENSPSNG00000017421 ENSPSNG00000017460 ENSPSNG00000017518 DPPA5 (ENSPSNG00000017626) ENSPSNG00000017669 KCNQ5 (ENSPSNG00000017810) RIMS1 (ENSPSNG00000019041) OGFRL1 (ENSPSNG00000020599) ##35 B3GAT2 (ENSPSNG00000020653) SMAP1 (ENSPSNG00000020734) SDHAF4 (ENSPSNG00000020825) COL9A1 (ENSPSNG00000021000) COL19A1 (ENSPSNG00000021388) Dolphin MODERN SPECIES 4544 ENSTTRG00000000114 ##22 Blue whale MODERN SPECIES 3 ENSBMSG00010014910 MEI4 (ENSBMSG00010014940) HTR1B (ENSBMSG00010014962) IMPG1 (ENSBMSG00010015013) MYO6 (ENSBMSG00010015279) SENP6 (ENSBMSG00010015609) FILIP1 (ENSBMSG00010015706) TMEM30A (ENSBMSG00010015805) ENSBMSG00010015938 COL12A1 (ENSBMSG00010016088) ENSBMSG00010016468 ENSBMSG00010016479 ENSBMSG00010016500 CD109 (ENSBMSG00010016534) SLC17A5 (ENSBMSG00010016640) ENSBMSG00010016674 ##22 MTO1 (ENSBMSG00010016724) CGAS (ENSBMSG00010016770) ENSBMSG00010016861 DDX43 (ENSBMSG00010016877) ENSBMSG00010016952 ENSBMSG00010016975 ENSBMSG00010017000 KCNQ5 (ENSBMSG00010017092) ENSBMSG00010018164 RIMS1 (ENSBMSG00010018680) OGFRL1 (ENSBMSG00010022166) ##35 B3GAT2 (ENSBMSG00010022170) SMAP1 (ENSBMSG00010022174) SDHAF4 (ENSBMSG00010022179) FAM135A (ENSBMSG00010022183) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.b ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159928 ENSGT00940000167010 ENSGT00940000161886 ENSGT00390000018810 ENSGT00940000154091.a.a ENSGT00940000162741.j.u.s ENSGT00940000157724 ENSGT00940000161247 ENSGT00910000148205 ENSGT00940000156244 ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.b ##22 ENSGT00510000047669 ENSGT00940000156303 ENSGT00940000157646 ENSGT00390000016326 ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000158944 ENSGT00940000158207 ENSGT00390000001442 ENSGT00940000158907 ENSGT00390000004624.a.a ENSGT00940000153432.B.e ENSGT00500000044987 ENSGT00950000184497 ENSGT00390000003050 Narwhal MODERN SPECIES 298 CDC20B (ENSMMNG00015000730) GZMA (ENSMMNG00015000678) ENSMMNG00015000656 GZMK (ENSMMNG00015000622) ESM1 (ENSMMNG00015000601) ENSMMNG00015000591 ENSMMNG00015000584 SNX18 (ENSMMNG00015000568) ENSMMNG00015000543 HSPB3 (ENSMMNG00015000523) ENSMMNG00015000518 ARL15 (ENSMMNG00015000469) NDUFS4 (ENSMMNG00015000413) ENSMMNG00015000397 FST (ENSMMNG00015000375) ENSMMNG00015000358 ##22 MOCS2 (ENSMMNG00015000318) ITGA2 (ENSMMNG00015000243) PELO (ENSMMNG00015000194) ITGA1 (ENSMMNG00015000087) ISL1 (ENSMMNG00015004677) PARP8 (ENSMMNG00015004592) ENSMMNG00015004553 EMB (ENSMMNG00015004544) ENSMMNG00015004536 HCN1 (ENSMMNG00015004515) MRPS30 (ENSMMNG00015004506) FGF10 (ENSMMNG00015004491) ENSMMNG00015004472 NNT (ENSMMNG00015004443) ENSMMNG00015004420 Beluga whale MODERN SPECIES 71 ENSDLEG00000009445 DHX29 (ENSDLEG00000009482) CCNO (ENSDLEG00000009538) MCIDAS (ENSDLEG00000009551) GPX8 (ENSDLEG00000009596) GZMA (ENSDLEG00000009603) ENSDLEG00000009627 GZMK (ENSDLEG00000009688) ESM1 (ENSDLEG00000009703) ENSDLEG00000009723 SNX18 (ENSDLEG00000009741) HSPB3 (ENSDLEG00000009775) ARL15 (ENSDLEG00000009798) NDUFS4 (ENSDLEG00000009844) FST (ENSDLEG00000009866) ENSDLEG00000009877 ##22 MOCS2 (ENSDLEG00000009900) ITGA2 (ENSDLEG00000009923) ITGA1 (ENSDLEG00000009983) PELO (ENSDLEG00000010122) ISL1 (ENSDLEG00000010141) PARP8 (ENSDLEG00000010187) ENSDLEG00000010254 EMB (ENSDLEG00000010268) HCN1 (ENSDLEG00000010295) MRPS30 (ENSDLEG00000010321) ENSDLEG00000010344 FGF10 (ENSDLEG00000010363) NNT (ENSDLEG00000010392) PAIP1 (ENSDLEG00000010481) ENSDLEG00000010795 Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 13 SLC45A4 (ENSCHYG00000016290) ENSCHYG00000016037 ENSCHYG00000015154 ADGRB1 (ENSCHYG00000014800) ENSCHYG00000014280 ARC (ENSCHYG00000014210) JRK (ENSCHYG00000014190) ENSCHYG00000014131 THEM6 (ENSCHYG00000014103) SLURP1 (ENSCHYG00000014068) LYPD2 (ENSCHYG00000014023) ENSCHYG00000013973 LY6D (ENSCHYG00000013937) ENSCHYG00000013884 ENSCHYG00000013816 ENSCHYG00000013844 ##22 ENSCHYG00000013741 LY6L (ENSCHYG00000013694) ENSCHYG00000013594 ENSCHYG00000013545 GLI4 (ENSCHYG00000018122) ZNF696 (ENSCHYG00000018088) RHPN1 (ENSCHYG00000018008) MAFA (ENSCHYG00000017958) ZC3H3 (ENSCHYG00000017811) GSDMD (ENSCHYG00000017506) MROH6 (ENSCHYG00000017175) NAPRT (ENSCHYG00000016943) ENSCHYG00000016622 TIGD5 (ENSCHYG00000016566) PYCR3 (ENSCHYG00000016325) Yarkand deer MODERN SPECIES 28 FNIP2 (ENSCHYG00000000712) PPID (ENSCHYG00000000648) ETFDH (ENSCHYG00000000582) C4orf46 (ENSCHYG00000000542) RXFP1 (ENSCHYG00000000431) TMEM144 (ENSCHYG00000000356) ENSCHYG00000000340 GASK1B (ENSCHYG00000000322) GRIA2 (ENSCHYG00000000264) ENSCHYG00000000231 GLRB (ENSCHYG00000000214) PDGFC (ENSCHYG00000000194) CTSO (ENSCHYG00000000172) TDO2 (ENSCHYG00000000148) ASIC5 (ENSCHYG00000000140) ENSCHYG00000000116 ##22 GUCY1B1 (ENSCHYG00000000070) GUCY1A1 (ENSCHYG00000004864) ZNF605 (ENSCHYG00000004849) ZNF26 (ENSCHYG00000004840) ZNF84 (ENSCHYG00000004792) ZNF140 (ENSCHYG00000004771) ZNF891 (ENSCHYG00000004755) ZNF10 (ENSCHYG00000004727) ZNF268 (ENSCHYG00000004709) MBD3L1 (ENSCHYG00000004699) ANHX (ENSCHYG00000004676) CHFR (ENSCHYG00000004636) GOLGA3 (ENSCHYG00000004532) ANKLE2 (ENSCHYG00000004508) ENSCHYG00000004494 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000018570.a.h ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 13 ENSCHIG00000015528 PAX9 (ENSCHIG00000017353) SLC25A21 (ENSCHIG00000017403) MIPOL1 (ENSCHIG00000011846) FOXA1 (ENSCHIG00000023519) ENSCHIG00000013240 SSTR1 (ENSCHIG00000006157) CLEC14A (ENSCHIG00000008637) SEC23A (ENSCHIG00000026578) GEMIN2 (ENSCHIG00000009881) TRAPPC6B (ENSCHIG00000009203) PNN (ENSCHIG00000016458) ENSCHIG00000010530 FBXO33 (ENSCHIG00000018083) ENSCHIG00000018649 ENSCHIG00000016309 ##22 LRFN5 (ENSCHIG00000008107) ENSCHIG00000025383 ENSCHIG00000007447 ENSCHIG00000014697 ENSCHIG00000016320 ENSCHIG00000017232 ENSCHIG00000012257 C14orf28 (ENSCHIG00000008954) KLHL28 (ENSCHIG00000023507) TOGARAM1 (ENSCHIG00000015767) PRPF39 (ENSCHIG00000010118) FKBP3 (ENSCHIG00000018893) FANCM (ENSCHIG00000015176) MIS18BP1 (ENSCHIG00000023697) TGM5 (ENSCHIG00000015160) Goat MODERN SPECIES 27 KIF13B (ENSCHIG00000011751) HMBOX1 (ENSCHIG00000003424) ENSCHIG00000023976 INTS9 (ENSCHIG00000012847) EXTL3 (ENSCHIG00000027229) FZD3 (ENSCHIG00000023532) ENSCHIG00000013264 ZNF395 (ENSCHIG00000013915) PNOC (ENSCHIG00000027029) ENSCHIG00000011279 ENSCHIG00000011858 ELP3 (ENSCHIG00000025755) NUGGC (ENSCHIG00000016874) SCARA5 (ENSCHIG00000002743) ENSCHIG00000003841 ENSCHIG00000008066 ##22 ENSCHIG00000021742 ESCO2 (ENSCHIG00000012950) CCDC25 (ENSCHIG00000005126) SCARA3 (ENSCHIG00000025164) ENSCHIG00000010216 TMEM215 (ENSCHIG00000008408) NDUFB6 (ENSCHIG00000027260) TOPORS (ENSCHIG00000012805) RIGI (ENSCHIG00000025883) ACO1 (ENSCHIG00000007667) ENSCHIG00000020484 ENSCHIG00000024316 ENSCHIG00000006618 LINGO2 (ENSCHIG00000013346) C9orf72 (ENSCHIG00000014755) Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 ENSOARG00020015399 ENSOARG00020015411 LGSN (ENSOARG00020015419) OCA2 (ENSOARG00020015487) HERC2 (ENSOARG00020015875) NIPA1 (ENSOARG00020020224) NIPA2 (ENSOARG00020020302) CYFIP1 (ENSOARG00020020376) ENSOARG00020020815 TUBGCP5 (ENSOARG00020020859) ENSOARG00020021205 IMP4 (ENSOARG00020021252) ENSOARG00020021317 FAM168B (ENSOARG00020021435) PLEKHB2 (ENSOARG00020021480) ENSOARG00020021651 ##22 HS6ST1 (ENSOARG00020021735) UGGT1 (ENSOARG00020021792) SAP130 (ENSOARG00020022426) ENSOARG00020022687 AMMECR1L (ENSOARG00020006543) POLR2D (ENSOARG00020006571) ENSOARG00020006654 WDR33 (ENSOARG00020006732) SFT2D3 (ENSOARG00020007219) LIMS2 (ENSOARG00020007250) GPR17 (ENSOARG00020007349) MYO7B (ENSOARG00020007427) IWS1 (ENSOARG00020008014) ENSOARG00020008263 ENSOARG00020008323 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 8 TRIM2 (ENSOARG00020019393) ENSOARG00020019717 FHDC1 (ENSOARG00020019747) ARFIP1 (ENSOARG00020019865) TIGD4 (ENSOARG00020020159) TMEM154 (ENSOARG00020020174) FBXW7 (ENSOARG00020020349) GATB (ENSOARG00020020844) FHIP1A (ENSOARG00020021013) PRSS48 (ENSOARG00020021133) ENSOARG00020021320 LRBA (ENSOARG00020021581) MAB21L2 (ENSOARG00020022453) DCLK2 (ENSOARG00020022528) IQCM (ENSOARG00020023274) ENSOARG00020023315 ##22 NR3C2 (ENSOARG00020023338) ARHGAP10 (ENSOARG00020023485) PRMT9 (ENSOARG00020023961) TMEM184C (ENSOARG00020023997) EDNRA (ENSOARG00020024024) TTC29 (ENSOARG00020024092) POU4F2 (ENSOARG00020024207) ZNF827 (ENSOARG00020024616) C4orf51 (ENSOARG00020024840) MMAA (ENSOARG00020024857) SMAD1 (ENSOARG00020024894) OTUD4 (ENSOARG00020024925) ABCE1 (ENSOARG00020024985) ANAPC10 (ENSOARG00020025021) HHIP (ENSOARG00020025042) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 SH3BGRL2 (ENSOARG00020014825) HMGN3 (ENSOARG00020014671) PHIP (ENSOARG00020014287) IRAK1BP1 (ENSOARG00020014232) HTR1B (ENSOARG00020014195) ENSOARG00020014128 IMPG1 (ENSOARG00020013908) MYO6 (ENSOARG00020013312) SENP6 (ENSOARG00020012532) FILIP1 (ENSOARG00020012409) TMEM30A (ENSOARG00020012208) ENSOARG00020012134 COL12A1 (ENSOARG00020010010) CD109 (ENSOARG00020020955) SLC17A5 (ENSOARG00020020626) ENSOARG00020020554 ##22 MTO1 (ENSOARG00020020228) ENSOARG00020020006 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154915.mb.a.b ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724.i ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT01100000263506.a.f.a.a.a.b ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000012588 ENSGT00940000154915.mb.a.b ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724.i ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00550000074975 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT01100000263480.a.b.b.a.b.b.b.b.a.b.a.a.b ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT01100000263506.a.f.a.a.a.b Wild yak MODERN SPECIES 1403 CD109 (ENSBMUG00000019913) SLC17A5 (ENSBMUG00000019836) ENSBMUG00000019814 ##22 MTO1 (ENSBMUG00000019769) CGAS (ENSBMUG00000019747) DDX43 (ENSBMUG00000019720) OOEP (ENSBMUG00000019676) KHDC3L (ENSBMUG00000019638) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00390000005254.i.a.a.a.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724.i ENSGT00950000183010.a.a.a.a.d ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT01100000263506.a.f.a.a.a.b ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 16 TMEM200C (ENSBIXG00005005828) ENSBIXG00005012473 EPB41L3 (ENSBIXG00005012607) ZBTB14 (ENSBIXG00005012690) AKAIN1 (ENSBIXG00005012720) DLGAP1 (ENSBIXG00005013290) TGIF1 (ENSBIXG00005006727) MYL12B (ENSBIXG00005007006) MYL12A (ENSBIXG00005013437) MYOM1 (ENSBIXG00005013491) LPIN2 (ENSBIXG00005013528) EMILIN2 (ENSBIXG00005013554) SMCHD1 (ENSBIXG00005013581) NDC80 (ENSBIXG00005007711) METTL4 (ENSBIXG00005013634) ENSBIXG00005013699 ##22 ADCYAP1 (ENSBIXG00005013724) YES1 (ENSBIXG00005013763) ENOSF1 (ENSBIXG00005014007) TYMS (ENSBIXG00005001829) CLUL1 (ENSBIXG00005014105) CETN1 (ENSBIXG00005001842) ENSBIXG00005014136 COLEC12 (ENSBIXG00005014170) THOC1 (ENSBIXG00005014244) ENSBIXG00005014256 USP14 (ENSBIXG00005014390) ENSBIXG00005014411 ROCK1 (ENSBIXG00005014500) ENSBIXG00005005636 GREB1L (ENSBIXG00005014753) Cow MODERN SPECIES 28 MEI4 (ENSBTAG00000054151) HTR1B (ENSBTAG00000037429) ENSBTAG00000016391 IMPG1 (ENSBTAG00000021175) MYO6 (ENSBTAG00000016751) SENP6 (ENSBTAG00000005869) ENSBTAG00000032382 FILIP1 (ENSBTAG00000000053) TMEM30A (ENSBTAG00000005100) COX7A2 (ENSBTAG00000005096) COL12A1 (ENSBTAG00000020056) ENSBTAG00000053911 ENSBTAG00000054709 CD109 (ENSBTAG00000013222) SLC17A5 (ENSBTAG00000044053) EEF1A1 (ENSBTAG00000014534) ##22 MTO1 (ENSBTAG00000016839) CGAS (ENSBTAG00000000892) ENSBTAG00000021814 OOEP (ENSBTAG00000019600) KHDC3L (ENSBTAG00000034925) KCNQ5 (ENSBTAG00000007791) RIMS1 (ENSBTAG00000020238) ENSBTAG00000048046 OGFRL1 (ENSBTAG00000016374) ##35 ENSBTAG00000053784 B3GAT2 (ENSBTAG00000020817) SMAP1 (ENSBTAG00000038190) SDHAF4 (ENSBTAG00000027049) FAM135A (ENSBTAG00000002171) ENSBTAG00000045999 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Tiger MODERN SPECIES 303 NELFA (ENSPTIG00000017223) C4orf48 (ENSPTIG00000016138) POLN (ENSPTIG00000011746) HAUS3 (ENSPTIG00000011163) ENSPTIG00000010627 ENSPTIG00000009881 CFAP99 (ENSPTIG00000008222) RNF4 (ENSPTIG00000019861) FAM193A (ENSPTIG00000015747) TNIP2 (ENSPTIG00000015248) SH3BP2 (ENSPTIG00000011454) ENSPTIG00000011214 ADD1 (ENSPTIG00000014981) MFSD10 (ENSPTIG00000012030) NOP14 (ENSPTIG00000007085) ENSPTIG00000011764 ##22 GRK4 (ENSPTIG00000007372) HTT (ENSPTIG00000016947) RGS12 (ENSPTIG00000013667) HGFAC (ENSPTIG00000011703) ENSPTIG00000009272 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000168678 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 15 PPP1R10 (ENSAMEG00000013293) ABCF1 (ENSAMEG00000013325) PRR3 (ENSAMEG00000028054) GNL1 (ENSAMEG00000013421) ENSAMEG00000013405 ENSAMEG00000013448 ENSAMEG00000030310 ENSAMEG00000005967 ENSAMEG00000005976 ENSAMEG00000019338 ENSAMEG00000005656 ENSAMEG00000007436 ENSAMEG00000007495 ENSAMEG00000027994 FOXF2 (ENSAMEG00000029771) ENSAMEG00000025252 ##22 ENSAMEG00000025085 ENSAMEG00000010931 GMDS (ENSAMEG00000010935) MYLK4 (ENSAMEG00000010940) ENSAMEG00000025653 WRNIP1 (ENSAMEG00000027067) SERPINB1 (ENSAMEG00000003580) SERPINB9 (ENSAMEG00000003574) ENSAMEG00000003548 NQO2 (ENSAMEG00000014373) RIPK1 (ENSAMEG00000014389) BPHL (ENSAMEG00000014392) ENSAMEG00000014416 ENSAMEG00000023499 ENSAMEG00000030040 Canidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601.s ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000015821 ENSGT00530000063186.b.a ENSGT00940000155450 ENSGT00390000001319.qb ENSGT00940000160556 ENSGT01090000260040.a.a.b.ec ENSGT00940000168023 ENSGT00530000063608.A ENSGT00940000155909 ENSGT00940000156004 ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156782.c ENSGT00940000162844 ENSGT00520000055647.a ENSGT00720000108792.A ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.i.a.a ##22 ENSGT00940000165252 ENSGT00940000157781 ENSGT00390000014376 ENSGT00940000161393 Dingo MODERN SPECIES 103 EGFR (ENSCAFG00020023672) ENSCAFG00020024170 VSTM2A (ENSCAFG00020024172) ENSCAFG00020024176 ENSCAFG00020024178 ENSCAFG00020024181 ENSCAFG00020024183 COBL (ENSCAFG00020024189) GRB10 (ENSCAFG00020024197) DDC (ENSCAFG00020024202) FIGNL1 (ENSCAFG00020024213) IKZF1 (ENSCAFG00020024220) ENSCAFG00020024249 ZPBP (ENSCAFG00020024251) VWC2 (ENSCAFG00020024255) ENSCAFG00020024258 ##22 ENSCAFG00020024270 ENSCAFG00020024306 C7orf57 (ENSCAFG00020024308) SUN3 (ENSCAFG00020024309) Dog MODERN SPECIES 9 EGFR (ENSCAFG00845011396) SEC61G (ENSCAFG00845011317) VSTM2A (ENSCAFG00845011213) ENSCAFG00845011171 ENSCAFG00845011149 ENSCAFG00845011125 ENSCAFG00845011114 COBL (ENSCAFG00845010944) GRB10 (ENSCAFG00845010745) DDC (ENSCAFG00845010355) FIGNL1 (ENSCAFG00845010219) IKZF1 (ENSCAFG00845009878) SPATA48 (ENSCAFG00845009618) ZPBP (ENSCAFG00845009557) VWC2 (ENSCAFG00845009504) ENSCAFG00845009465 ##22 ENSCAFG00845009225 ENSCAFG00845009014 C7orf57 (ENSCAFG00845008897) SUN3 (ENSCAFG00845008844) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.i.a.b ##22 Dingo MODERN SPECIES 125 ENSCAFG00020019987 ##22 UQCRFS1 (ENSCAFG00020019969) VSTM2B (ENSCAFG00020019965) ENSCAFG00020019964 PLEKHF1 (ENSCAFG00020019960) C19orf12 (ENSCAFG00020019957) CCNE1 (ENSCAFG00020019952) ENSCAFG00020019950 URI1 (ENSCAFG00020019949) ENSCAFG00020019927 TSHZ3 (ENSCAFG00020019912) ENSCAFG00020019907 ZNF507 (ENSCAFG00020019878) DPY19L3 (ENSCAFG00020019865) ENSCAFG00020019841 ANKRD27 (ENSCAFG00020019831) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183044.a.a.a.c ENSGT00390000010056 ENSGT00530000063402.b ENSGT01100000263504.a.b.a.a ENSGT00530000063651.a ENSGT00390000000411.g.b ENSGT01030000238203 ENSGT00390000003188 ENSGT00940000156058 ENSGT00390000008003 ENSGT00940000156764.a ENSGT00940000157923 ENSGT00940000156810 ENSGT00390000018900 ENSGT00940000178689 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.i.b ##22 ENSGT00390000004799 ENSGT00390000005861 ENSGT00950000183142.a.b.a.b ENSGT00940000156766 ENSGT00940000156992 ENSGT00940000160590 ENSGT00940000156546 ENSGT00390000016158 ENSGT00730000111005 ENSGT00940000162691 ENSGT00390000015553.a.a.b ENSGT00390000017364 ENSGT00940000155092.b ENSGT00940000157060 ENSGT00730000111198 Dog MODERN SPECIES 35 SDE2 (ENSCAFG00845008939) ENSCAFG00845008917 ACBD3 (ENSCAFG00845008884) ENSCAFG00845008860 MIXL1 (ENSCAFG00845008836) LIN9 (ENSCAFG00845008477) PARP1 (ENSCAFG00845008325) STUM (ENSCAFG00845008283) ITPKB (ENSCAFG00845008212) PSEN2 (ENSCAFG00845008023) COQ8A (ENSCAFG00845007817) ENSCAFG00845007754 CDC42BPA (ENSCAFG00845007016) AHCTF1 (ENSCAFG00845006427) ENSCAFG00845006225 ENSCAFG00845006160 ##22 SCCPDH (ENSCAFG00845006130) CNST (ENSCAFG00845005933) TFB2M (ENSCAFG00845005847) SMYD3 (ENSCAFG00845005785) KIF26B (ENSCAFG00845005694) ENSCAFG00845005646 HNRNPU (ENSCAFG00845005509) ENSCAFG00845005435 DESI2 (ENSCAFG00845005415) CATSPERE (ENSCAFG00845005306) ADSS2 (ENSCAFG00845005250) C7H1orf100 (ENSCAFG00845005216) ZBTB18 (ENSCAFG00845004904) AKT3 (ENSCAFG00845004858) SDCCAG8 (ENSCAFG00845004779) Dingo MODERN SPECIES 271 ENSCAFG00020003228 ACBD3 (ENSCAFG00020003210) ENSCAFG00020003202 ENSCAFG00020003200 LIN9 (ENSCAFG00020003192) PARP1 (ENSCAFG00020001660) STUM (ENSCAFG00020001421) ITPKB (ENSCAFG00020001406) PSEN2 (ENSCAFG00020001399) COQ8A (ENSCAFG00020001368) CDC42BPA (ENSCAFG00020001364) ENSCAFG00020001351 ENSCAFG00020001339 AHCTF1 (ENSCAFG00020001201) ENSCAFG00020001167 ENSCAFG00020001153 ##22 SCCPDH (ENSCAFG00020001113) CNST (ENSCAFG00020001096) TFB2M (ENSCAFG00020001084) ENSCAFG00020001053 KIF26B (ENSCAFG00020000955) ENSCAFG00020000931 HNRNPU (ENSCAFG00020000918) COX20 (ENSCAFG00020000902) DESI2 (ENSCAFG00020000895) ENSCAFG00020000834 ADSS2 (ENSCAFG00020000812) C1orf100 (ENSCAFG00020000808) ZBTB18 (ENSCAFG00020000800) AKT3 (ENSCAFG00020000778) SDCCAG8 (ENSCAFG00020000770) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00960000189784 ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.d.b ENSGT00390000001319.pb ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.j ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229.b ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601.s ENSGT00940000154353.B.`b ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Dingo MODERN SPECIES 295 ENSCAFG00020019093 RESF1 (ENSCAFG00020019109) BICD1 (ENSCAFG00020019123) FGD4 (ENSCAFG00020019160) DNM1L (ENSCAFG00020019688) YARS2 (ENSCAFG00020019713) PKP2 (ENSCAFG00020019715) SYT10 (ENSCAFG00020019730) ENSCAFG00020019745 ENSCAFG00020019749 ENSCAFG00020019753 CPNE8 (ENSCAFG00020019768) KIF21A (ENSCAFG00020019794) ABCD2 (ENSCAFG00020019872) SLC2A13 (ENSCAFG00020019911) ENSCAFG00020019936 ##22 LRRK2 (ENSCAFG00020019954) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 8 SMCP (ENSCAFG00845026447) LCE7A (ENSCAFG00845026322) ENSCAFG00845026294 ENSCAFG00845026168 ENSCAFG00845026131 ENSCAFG00845026059 C1orf68 (ENSCAFG00845026034) ENSCAFG00845025984 ENSCAFG00845025948 ENSCAFG00845025920 ENSCAFG00845025895 ENSCAFG00845025860 RPTN (ENSCAFG00845025826) ENSCAFG00845025766 TCHHL1 (ENSCAFG00845025618) ENSCAFG00845025590 ##22 ENSCAFG00845025548 ENSCAFG00845025500 S100A10 (ENSCAFG00845025458) THEM4 (ENSCAFG00845025388) ENSCAFG00845025367 THEM5 (ENSCAFG00845025312) ENSCAFG00845025285 RORC (ENSCAFG00845025144) LINGO4 (ENSCAFG00845025100) TDRKH (ENSCAFG00845024938) OAZ3 (ENSCAFG00845024748) ENSCAFG00845024650 ENSCAFG00845024612 RIIAD1 (ENSCAFG00845024568) CELF3 (ENSCAFG00845024380) Dog MODERN SPECIES 3 ENSCAFG00845008350 ENSCAFG00845008278 MYO6 (ENSCAFG00845008090) ENSCAFG00845007913 FILIP1 (ENSCAFG00845007846) TMEM30A (ENSCAFG00845007678) ENSCAFG00845007548 ENSCAFG00845007358 ENSCAFG00845013409 ENSCAFG00845013391 ENSCAFG00845013382 COL12A1 (ENSCAFG00845012985) ENSCAFG00845012785 CD109 (ENSCAFG00845012354) SLC17A5 (ENSCAFG00845012197) EEF1A1 (ENSCAFG00845012150) ##22 MTO1 (ENSCAFG00845012090) CGAS (ENSCAFG00845012039) DDX43 (ENSCAFG00845011968) OOEP (ENSCAFG00845011927) ENSCAFG00845011900 DPPA5 (ENSCAFG00845011867) ENSCAFG00845011834 KCNQ5 (ENSCAFG00845011313) RIMS1 (ENSCAFG00845010428) OGFRL1 (ENSCAFG00845010164) ##35 ENSCAFG00845010137 B3GAT2 (ENSCAFG00845010055) SMAP1 (ENSCAFG00845009742) SDHAF4 (ENSCAFG00845009642) FAM135A (ENSCAFG00845009022) Red fox DUPLICATION Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 48 ENSVVUG00000013854 ENSVVUG00000014109 CYP51A1 (ENSVVUG00000014394) LRRD1 (ENSVVUG00000014702) ENSVVUG00000014704 KRIT1 (ENSVVUG00000014707) ANKIB1 (ENSVVUG00000014994) ENSVVUG00000015333 ENSVVUG00000015336 PEX1 (ENSVVUG00000015340) RBM48 (ENSVVUG00000015356) ENSVVUG00000015357 ENSVVUG00000015360 CDK6 (ENSVVUG00000015364) HEPACAM2 (ENSVVUG00000015380) ENSVVUG00000015383 ##22 ENSVVUG00000015385 VPS50 (ENSVVUG00000015394) CALCR (ENSVVUG00000015480) TFPI2 (ENSVVUG00000015507) GNGT1 (ENSVVUG00000015511) ENSVVUG00000015515 BET1 (ENSVVUG00000015520) COL1A2 (ENSVVUG00000015539) CASD1 (ENSVVUG00000015568) SGCE (ENSVVUG00000015577) ENSVVUG00000015584 ENSVVUG00000015587 PPP1R9A (ENSVVUG00000015603) PON1 (ENSVVUG00000015624) PON3 (ENSVVUG00000015625) Red fox MODERN SPECIES 55 ENSVVUG00000006975 METTL4 (ENSVVUG00000006988) NDC80 (ENSVVUG00000007016) ENSVVUG00000007254 SMCHD1 (ENSVVUG00000007320) EMILIN2 (ENSVVUG00000008678) LPIN2 (ENSVVUG00000008689) MYOM1 (ENSVVUG00000008791) ENSVVUG00000009225 MYL12B (ENSVVUG00000009238) TGIF1 (ENSVVUG00000009272) DLGAP1 (ENSVVUG00000009317) ZBTB14 (ENSVVUG00000010107) EPB41L3 (ENSVVUG00000010125) ENSVVUG00000010208 ##22 L3MBTL4 (ENSVVUG00000010230) ARHGAP28 (ENSVVUG00000010346) ENSVVUG00000010487 LAMA1 (ENSVVUG00000010548) ENSVVUG00000011552 LRRC30 (ENSVVUG00000011556) PTPRM (ENSVVUG00000011599) RAB12 (ENSVVUG00000011748) MTCL1 (ENSVVUG00000011763) NDUFV2 (ENSVVUG00000011795) ANKRD12 (ENSVVUG00000011805) ENSVVUG00000011816 TWSG1 (ENSVVUG00000011819) RALBP1 (ENSVVUG00000011826) ENSVVUG00000011839 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 128 ENSVVUG00000011123 ENSVVUG00000011148 ENSVVUG00000011155 POU3F4 (ENSVVUG00000011203) CYLC1 (ENSVVUG00000011222) RPS6KA6 (ENSVVUG00000011245) ENSVVUG00000011287 HDX (ENSVVUG00000011303) ENSVVUG00000011312 ENSVVUG00000011330 APOOL (ENSVVUG00000011396) ENSVVUG00000011403 ZNF711 (ENSVVUG00000011419) POF1B (ENSVVUG00000011479) CHM (ENSVVUG00000011968) ENSVVUG00000012014 ##22 ENSVVUG00000012017 ENSVVUG00000012023 ENSVVUG00000012028 KLHL4 (ENSVVUG00000012072) CPXCR1 (ENSVVUG00000013152) ENSVVUG00000013157 PABPC5 (ENSVVUG00000013172) ENSVVUG00000013175 Red fox MODERN SPECIES 39 ARPC2 (ENSVVUG00000007377) ENSVVUG00000007390 ENSVVUG00000007393 RUFY4 (ENSVVUG00000007396) TNS1 (ENSVVUG00000007426) TNP1 (ENSVVUG00000007592) IGFBP5 (ENSVVUG00000007604) IGFBP2 (ENSVVUG00000007623) ENSVVUG00000007642 SMARCAL1 (ENSVVUG00000007658) MARCH4 (ENSVVUG00000007709) XRCC5 (ENSVVUG00000007761) TMEM169 (ENSVVUG00000008962) ENSVVUG00000008964 MREG (ENSVVUG00000008966) ENSVVUG00000008967 ##22 FN1 (ENSVVUG00000008974) ATIC (ENSVVUG00000008989) ABCA12 (ENSVVUG00000009005) BARD1 (ENSVVUG00000009080) VWC2L (ENSVVUG00000009113) ENSVVUG00000009126 IKZF2 (ENSVVUG00000009142) ERBB4 (ENSVVUG00000009194) ENSVVUG00000009222 CPS1 (ENSVVUG00000009235) LANCL1 (ENSVVUG00000009273) ENSVVUG00000009278 MYL1 (ENSVVUG00000009295) ACADL (ENSVVUG00000009345) KANSL1L (ENSVVUG00000009477) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Microbat MODERN SPECIES 2592 ENSMLUG00000027525 ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00560000077266.a ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 Donkey MODERN SPECIES 16 LCA5 (ENSEASG00005005428) HMGN3 (ENSEASG00005026064) PHIP (ENSEASG00005017280) IRAK1BP1 (ENSEASG00005018565) MEI4 (ENSEASG00005018566) HTR1B (ENSEASG00005018567) ENSEASG00005018568 IMPG1 (ENSEASG00005018572) MYO6 (ENSEASG00005018621) SENP6 (ENSEASG00005019562) FILIP1 (ENSEASG00005002972) TMEM30A (ENSEASG00005002982) COL12A1 (ENSEASG00005003217) CD109 (ENSEASG00005004082) SLC17A5 (ENSEASG00005004314) ENSEASG00005023174 ##22 ENSEASG00005035561 MTO1 (ENSEASG00005004331) ENSEASG00005004341 ENSEASG00005028339 ENSEASG00005004346 ENSEASG00005025369 Horse DUPLICATION Horse MODERN SPECIES 9 ACVR1 (ENSECAG00000018902) ACVR1C (ENSECAG00000019682) CYTIP (ENSECAG00000017457) ERMN (ENSECAG00000017073) GALNT5 (ENSECAG00000012388) GPD2 (ENSECAG00000018290) NR4A2 (ENSECAG00000014232) ENSECAG00000058726 ENSECAG00000002256 ENSECAG00000046581 KCNJ3 (ENSECAG00000001276) GALNT13 (ENSECAG00000007821) RPRM (ENSECAG00000001246) ARL6IP6 (ENSECAG00000007580) PRPF40A (ENSECAG00000009113) ENSECAG00000001048 ##22 FMNL2 (ENSECAG00000011111) STAM2 (ENSECAG00000021355) CACNB4 (ENSECAG00000056636) ARL5A (ENSECAG00000023672) NEB (ENSECAG00000020638) RIF1 (ENSECAG00000012679) TNFAIP6 (ENSECAG00000012104) NMI (ENSECAG00000006801) RBM43 (ENSECAG00000000566) RND3 (ENSECAG00000021310) MMADHC (ENSECAG00000014503) LYPD6 (ENSECAG00000014321) LYPD6B (ENSECAG00000013932) KIF5C (ENSECAG00000013822) EPC2 (ENSECAG00000010930) Horse MODERN SPECIES 1 ENSECAG00000049697 ENSECAG00000051286 MEI4 (ENSECAG00000007058) ENSECAG00000056953 ENSECAG00000035404 ENSECAG00000059682 IMPG1 (ENSECAG00000019440) MYO6 (ENSECAG00000024053) SENP6 (ENSECAG00000021001) FILIP1 (ENSECAG00000018916) TMEM30A (ENSECAG00000013904) COX7A2 (ENSECAG00000012469) COL12A1 (ENSECAG00000025065) CD109 (ENSECAG00000023066) SLC17A5 (ENSECAG00000015945) EEF1A1 (ENSECAG00000020363) ##22 ENSECAG00000055760 MTO1 (ENSECAG00000019823) ENSECAG00000033497 CGAS (ENSECAG00000019809) DDX43 (ENSECAG00000017971) MZF1 (ENSECAG00000016471) MZF1 (ENSECAG00000055496) ENSECAG00000038105 UBE2M (ENSECAG00000013447) CHMP2A (ENSECAG00000013244) TRIM28 (ENSECAG00000010774) ZBTB45 (ENSECAG00000010390) SLC27A5 (ENSECAG00000046881) ZNF446 (ENSECAG00000016668) ENSECAG00000016453 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000154037.C Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000154037.C Tree shrew MODERN SPECIES 2768 ENSTBEG00000012151 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000154037.C Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 493 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000154037.C Rabbit MODERN SPECIES 6 ENSOCUG00000006591 ENSOCUG00000023227 MAML3 (ENSOCUG00000009376) ENSOCUG00000009370 SETD7 (ENSOCUG00000009367) NAA15 (ENSOCUG00000017331) NDUFC1 (ENSOCUG00000004419) MGARP (ENSOCUG00000006499) ELF2 (ENSOCUG00000003711) NOCT (ENSOCUG00000005465) SLC7A11 (ENSOCUG00000001662) ENSOCUG00000002051 ENSOCUG00000009004 PCDH18 (ENSOCUG00000009057) ENSOCUG00000032687 ENSOCUG00000026992 ##22 ENSOCUG00000030197 ENSOCUG00000035926 ENSOCUG00000036673 ENSOCUG00000038661 PABPC4L (ENSOCUG00000028226) ENSOCUG00000033772 PRSS12 (ENSOCUG00000013625) NDST3 (ENSOCUG00000009952) ENSOCUG00000038669 TRAM1L1 (ENSOCUG00000003846) ENSOCUG00000003691 ENSOCUG00000002295 NDST4 (ENSOCUG00000007796) UGT8 (ENSOCUG00000015037) ENSOCUG00000030939 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000266454 ENSGT00950000183029.B.c.a.r ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000266454 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000266454 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00390000000050 ENSGT00940000160533 ENSGT00940000160447 ENSGT00390000009109 ENSGT00940000162257 ENSGT00940000160953.A ENSGT00940000154838.C ENSGT00940000161282 ENSGT00940000161791 ENSGT00940000161873 ENSGT00940000157290 Guinea pig MODERN SPECIES 4 LCA5 (ENSCPOG00000005542) HMGN3 (ENSCPOG00000012407) PHIP (ENSCPOG00000006709) ENSCPOG00000026381 MEI4 (ENSCPOG00000022878) HTR1B (ENSCPOG00000000103) IMPG1 (ENSCPOG00000007022) MYO6 (ENSCPOG00000007009) SENP6 (ENSCPOG00000033810) FILIP1 (ENSCPOG00000012736) ENSCPOG00000030167 COX7A2 (ENSCPOG00000040353) COL12A1 (ENSCPOG00000014388) CD109 (ENSCPOG00000007568) SLC17A5 (ENSCPOG00000004069) ENSCPOG00000004067 ##22 MTO1 (ENSCPOG00000013100) ENSCPOG00000010595 ENSCPOG00000003991 RUSF1 (ENSCPOG00000011538) SLC5A2 (ENSCPOG00000011533) TGFB1I1 (ENSCPOG00000007914) ARMC5 (ENSCPOG00000010294) COX6A2 (ENSCPOG00000004927) ITGAD (ENSCPOG00000031568) ENSCPOG00000015518 ITGAM (ENSCPOG00000032933) TRIM72 (ENSCPOG00000024725) PYCARD (ENSCPOG00000032734) FUS (ENSCPOG00000038302) PRSS36 (ENSCPOG00000006304) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 CAMKMT (ENSHGLG00000017750) PREPL (ENSHGLG00000017302) SLC3A1 (ENSHGLG00000017221) PPM1B (ENSHGLG00000009834) ENSHGLG00000039009 LRPPRC (ENSHGLG00000006123) ABCG8 (ENSHGLG00000016760) ABCG5 (ENSHGLG00000018455) ENSHGLG00000047117 DYNC2LI1 (ENSHGLG00000010574) ENSHGLG00000012261 PLEKHH2 (ENSHGLG00000007771) THADA (ENSHGLG00000005656) ZFP36L2 (ENSHGLG00000035572) HAAO (ENSHGLG00000042032) ENSHGLG00000033761 ##22 Mta3 (ENSHGLG00000013809) ENSHGLG00000032595 KCNG3 (ENSHGLG00000050660) COX7A2L (ENSHGLG00000050207) ENSHGLG00000009421 ENSHGLG00000007285 ENSHGLG00000039075 ENSHGLG00000046799 ENSHGLG00000038868 ENSHGLG00000044522 ENSHGLG00000015808 ENSHGLG00000015079 ENSHGLG00000042007 ENSHGLG00000046900 ENSHGLG00000019145 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 ENSHGLG00000019916 FILIP1 (ENSHGLG00000001478) ENSHGLG00000044901 ENSHGLG00000000822 ENSHGLG00000001859 COX7A2 (ENSHGLG00000001808) ENSHGLG00000041994 ENSHGLG00000000933 ENSHGLG00000046785 ENSHGLG00000048564 ENSHGLG00000042022 ENSHGLG00000019854 ENSHGLG00000008186 ENSHGLG00000000949 SLC17A5 (ENSHGLG00000000678) ENSHGLG00000001692 ##22 MTO1 (ENSHGLG00000001518) ENSHGLG00000001379 ENSHGLG00000001118 ENSHGLG00000001023 ENSHGLG00000033498 ENSHGLG00000046391 ENSHGLG00000001005 ENSHGLG00000007075 ENSHGLG00000006331 ENSHGLG00000005300 ENSHGLG00000048573 TRBV2 (ENSHGLG00000050552) ENSHGLG00000042756 ENSHGLG00000038713 ENSHGLG00000050826 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 17 STK17A (ENSSVLG00005005990) HECW1 (ENSSVLG00005005468) ENSSVLG00005005320 MRPL32 (ENSSVLG00005005303) PSMA2 (ENSSVLG00005005237) C7orf25 (ENSSVLG00005005209) GLI3 (ENSSVLG00005005178) INHBA (ENSSVLG00005005151) ENSSVLG00005005081 ENSSVLG00005005063 SUGCT (ENSSVLG00005004898) MPLKIP (ENSSVLG00005004837) ENSSVLG00005004818 RALA (ENSSVLG00005004779) YAE1 (ENSSVLG00005004760) ENSSVLG00005023507 ##22 POU6F2 (ENSSVLG00005023305) VPS41 (ENSSVLG00005023041) AMPH (ENSSVLG00005022710) ENSSVLG00005022644 TRGV9 (ENSSVLG00005022616) ENSSVLG00005022603 ENSSVLG00005022581 ENSSVLG00005022564 STARD3NL (ENSSVLG00005022519) ENSSVLG00005022493 EPDR1 (ENSSVLG00005022455) SFRP4 (ENSSVLG00005022432) NME8 (ENSSVLG00005022326) ENSSVLG00005022300 GPR141 (ENSSVLG00005022281) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 131 TLE4 (ENSUPAG00010021868) PSAT1 (ENSUPAG00010021862) CEP78 (ENSUPAG00010021857) ENSUPAG00010021855 GNA14 (ENSUPAG00010021852) VPS13A (ENSUPAG00010021846) FOXB2 (ENSUPAG00010021845) ENSUPAG00010021844 PRUNE2 (ENSUPAG00010021836) GCNT1 (ENSUPAG00010021834) ENSUPAG00010021831 ##22 RFK (ENSUPAG00010021827) ENSUPAG00010021821 Primates ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00940000155258.s.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.g ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00940000155258.s.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Gibbon MODERN SPECIES 18 ENSNLEG00000029986 MBL2 (ENSNLEG00000012005) ENSNLEG00000011914 ZWINT (ENSNLEG00000011900) MEI4 (ENSNLEG00000035107) HTR1B (ENSNLEG00000018381) IMPG1 (ENSNLEG00000005102) MYO6 (ENSNLEG00000005076) SENP6 (ENSNLEG00000004998) FILIP1 (ENSNLEG00000004988) ENSNLEG00000004962 ENSNLEG00000034149 COL12A1 (ENSNLEG00000004898) CD109 (ENSNLEG00000004794) SLC17A5 (ENSNLEG00000004778) ENSNLEG00000035164 ##22 MTO1 (ENSNLEG00000001308) CGAS (ENSNLEG00000001281) DDX43 (ENSNLEG00000001209) OOEP (ENSNLEG00000001204) KHDC3L (ENSNLEG00000001200) DPPA5 (ENSNLEG00000001195) ENSNLEG00000001183 ENSNLEG00000029407 KHDC1L (ENSNLEG00000001179) ENSNLEG00000001177 KCNQ5 (ENSNLEG00000001127) ENSNLEG00000031152 ENSNLEG00000028596 ENSNLEG00000033063 RIMS1 (ENSNLEG00000001000) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Orangutan MODERN SPECIES 19 ENSPPYG00000025883 PHIP (ENSPPYG00000016790) IRAK1BP1 (ENSPPYG00000016789) MEI4 (ENSPPYG00000016788) HTR1B (ENSPPYG00000016787) IMPG1 (ENSPPYG00000016786) MYO6 (ENSPPYG00000016785) SENP6 (ENSPPYG00000016784) FILIP1 (ENSPPYG00000016783) TMEM30A (ENSPPYG00000016782) ENSPPYG00000016781 COL12A1 (ENSPPYG00000016780) ENSPPYG00000032492 CD109 (ENSPPYG00000016779) SLC17A5 (ENSPPYG00000016778) EEF1A1 (ENSPPYG00000016777) ##22 MTO1 (ENSPPYG00000016776) CGAS (ENSPPYG00000016775) DDX43 (ENSPPYG00000016774) OOEP (ENSPPYG00000016773) KHDC3L (ENSPPYG00000016772) DPPA5 (ENSPPYG00000016771) KHDC1 (ENSPPYG00000033174) KHDC1L (ENSPPYG00000016770) KCNQ5 (ENSPPYG00000016769) RIMS1 (ENSPPYG00000016768) OGFRL1 (ENSPPYG00000016765) ##35 B3GAT2 (ENSPPYG00000016764) SMAP1 (ENSPPYG00000016763) SDHAF4 (ENSPPYG00000039186) FAM135A (ENSPPYG00000016760) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00900000141068.m.a.a ENSGT00940000154828.k.a ENSGT00940000157385 ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.b.b.a.b.d.a.b.b ENSGT00730000111450 ENSGT00940000155469 ENSGT00940000160746 ENSGT00390000018047 ENSGT00940000160025 ENSGT00940000158009 ENSGT00940000153375.kb.b ENSGT00910000147847 ENSGT00860000135740 ENSGT00390000012189 ENSGT00390000009802.b ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000009802.a ENSGT00940000154766.a.a ENSGT00910000148085 ENSGT00940000155533.d ENSGT00390000007084.c.a.d.c.a.b.b ENSGT00940000154952.a.b.p ENSGT00910000148267 ENSGT00940000154952.a.b.o ENSGT00940000154574.c ENSGT00500000044852.a ENSGT00390000012138.a.a.j.b ENSGT00390000012731.a.a ENSGT00940000155171.a.b ENSGT00390000000183 ENSGT00550000074988.u.b Chimpanzee MODERN SPECIES 18 GLRX (ENSPTRG00000044246) ELL2 (ENSPTRG00000017090) PCSK1 (ENSPTRG00000017091) LINC02218 (ENSPTRG00000052795) ENSPTRG00000050024 BASP1 (ENSPTRG00000044904) MYO10 (ENSPTRG00000016745) RETREG1 (ENSPTRG00000016744) ZNF622 (ENSPTRG00000016743) MARCHF11 (ENSPTRG00000016742) FBXL7 (ENSPTRG00000016741) ENSPTRG00000052184 ENSPTRG00000043268 ANKH (ENSPTRG00000016739) OTULIN (ENSPTRG00000016738) ENSPTRG00000051935 ##22 ENSPTRG00000045231 OTULINL (ENSPTRG00000045722) ENSPTRG00000043022 TRIO (ENSPTRG00000016735) DNAH5 (ENSPTRG00000016734) ENSPTRG00000044329 CTNND2 (ENSPTRG00000016731) ENSPTRG00000040212 ANKRD33B (ENSPTRG00000016729) ROPN1L (ENSPTRG00000016728) MARCHF6 (ENSPTRG00000016727) CMBL (ENSPTRG00000045109) CCT5 (ENSPTRG00000016725) ATPSCKMT (ENSPTRG00000016724) TAS2R1 (ENSPTRG00000016723) Bonobo MODERN SPECIES 18 ELL2 (ENSPPAG00000018384) PCSK1 (ENSPPAG00000037499) ENSPPAG00000042399 ENSPPAG00000004561 MYO10 (ENSPPAG00000033643) ENSPPAG00000035828 ZNF622 (ENSPPAG00000028322) ENSPPAG00000016393 FBXL7 (ENSPPAG00000020751) ENSPPAG00000016923 ENSPPAG00000040662 ENSPPAG00000015929 ENSPPAG00000021833 ANKH (ENSPPAG00000029143) OTULIN (ENSPPAG00000031497) ENSPPAG00000031191 ##22 ENSPPAG00000033437 OTULINL (ENSPPAG00000012785) ENSPPAG00000041606 TRIO (ENSPPAG00000042679) DNAH5 (ENSPPAG00000038258) ENSPPAG00000025352 ENSPPAG00000036981 ENSPPAG00000033743 ENSPPAG00000033895 ENSPPAG00000042372 ENSPPAG00000014499 ENSPPAG00000037114 ROPN1L (ENSPPAG00000027569) MARCHF6 (ENSPPAG00000036651) CMBL (ENSPPAG00000033069) Gorilla MODERN SPECIES 19 ENSGGOG00000042737 PHIP (ENSGGOG00000001706) IRAK1BP1 (ENSGGOG00000015202) MEI4 (ENSGGOG00000041152) HTR1B (ENSGGOG00000022590) IMPG1 (ENSGGOG00000025852) ENSGGOG00000026526 MYO6 (ENSGGOG00000011400) SENP6 (ENSGGOG00000006460) FILIP1 (ENSGGOG00000017170) TMEM30A (ENSGGOG00000003491) ENSGGOG00000005865 COL12A1 (ENSGGOG00000009324) CD109 (ENSGGOG00000004082) SLC17A5 (ENSGGOG00000002667) ENSGGOG00000025675 ##22 ENSGGOG00000041490 ENSGGOG00000038471 CGAS (ENSGGOG00000010774) DDX43 (ENSGGOG00000016092) OOEP (ENSGGOG00000016832) KHDC3L (ENSGGOG00000007778) DPPA5 (ENSGGOG00000012001) ENSGGOG00000041551 ENSGGOG00000038983 ENSGGOG00000006894 KHDC1L (ENSGGOG00000025471) ENSGGOG00000043309 ENSGGOG00000038734 ENSGGOG00000038380 KCNQ5 (ENSGGOG00000011406) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.j ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00550000074801.h.c.a.a.b ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00500000044955.j.a.b ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00940000155258.s.a ENSGT00390000018730.B ##35 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT00530000063503.a.b.c ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.j.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00550000074801.h.c.a.a.b ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B.o ENSGT00390000002661.b ENSGT00390000011922 ENSGT00530000063880.b ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00500000044955.j.a.b ENSGT00940000155134 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 370 CD109 (ENSRBIG00000043018) SLC17A5 (ENSRBIG00000008059) ENSRBIG00000038510 ENSRBIG00000028957 ##22 MTO1 (ENSRBIG00000021154) CGAS (ENSRBIG00000034179) DDX43 (ENSRBIG00000043253) OOEP (ENSRBIG00000038750) KHDC3L (ENSRBIG00000036722) ENSRBIG00000022568 KHDC1 (ENSRBIG00000042990) ENSRBIG00000017493 KHDC1L (ENSRBIG00000039358) ENSRBIG00000043116 KCNQ5 (ENSRBIG00000044288) ENSRBIG00000036792 RIMS1 (ENSRBIG00000034439) ENSRBIG00000028660 OGFRL1 (ENSRBIG00000037067) ##35 Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1242 ENSRROG00000032858 ENSRROG00000036635 SLC24A2 (ENSRROG00000028465) ENSRROG00000035913 ACER2 (ENSRROG00000029963) ENSRROG00000036521 DENND4C (ENSRROG00000039318) ENSRROG00000034997 PLIN2 (ENSRROG00000039216) HAUS6 (ENSRROG00000032556) RRAGA (ENSRROG00000002426) SAXO1 (ENSRROG00000037277) ENSRROG00000031860 ADAMTSL1 (ENSRROG00000029960) ENSRROG00000035810 ENSRROG00000041199 ##22 ENSRROG00000004463 SH3GL2 (ENSRROG00000043603) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1655 IMPG1 (ENSRROG00000037129) MYO6 (ENSRROG00000043368) SENP6 (ENSRROG00000039865) ENSRROG00000043853 FILIP1 (ENSRROG00000043297) TMEM30A (ENSRROG00000044798) ENSRROG00000001816 COL12A1 (ENSRROG00000035369) ENSRROG00000033815 CD109 (ENSRROG00000043905) SLC17A5 (ENSRROG00000034791) ENSRROG00000030804 ENSRROG00000044652 ##22 MTO1 (ENSRROG00000030150) CGAS (ENSRROG00000041644) ENSRROG00000033023 DDX43 (ENSRROG00000031424) OOEP (ENSRROG00000032756) KHDC3L (ENSRROG00000031155) DPPA5 (ENSRROG00000045657) ENSRROG00000040317 KHDC1 (ENSRROG00000035632) KHDC1L (ENSRROG00000002245) ENSRROG00000042096 KCNQ5 (ENSRROG00000030226) ENSRROG00000025274 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.j ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00550000074801.h.c.a.a.b ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00500000044955.j.a.b ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00940000155258.s.a ENSGT00390000018730.B ##35 Vervet Monkey DUPLICATION Vervet Monkey MODERN SPECIES 14 IL17RB (ENSCSAG00000012976) ACTR8 (ENSCSAG00000012933) CACNA2D3 (ENSCSAG00000012922) LRTM1 (ENSCSAG00000012890) WNT5A (ENSCSAG00000012882) ERC2 (ENSCSAG00000012871) CCDC66 (ENSCSAG00000012850) TASOR (ENSCSAG00000012829) ARHGEF3 (ENSCSAG00000012807) SPATA12 (ENSCSAG00000018794) IL17RD (ENSCSAG00000012794) HESX1 (ENSCSAG00000012779) APPL1 (ENSCSAG00000012768) ASB14 (ENSCSAG00000012753) DNAH12 (ENSCSAG00000012610) ENSCSAG00000018796 ##22 PDE12 (ENSCSAG00000012275) ARF4 (ENSCSAG00000012271) DENND6A (ENSCSAG00000012260) SLMAP (ENSCSAG00000012241) FLNB (ENSCSAG00000012217) DNASE1L3 (ENSCSAG00000012190) ABHD6 (ENSCSAG00000012185) RPP14 (ENSCSAG00000012176) HTD2 (ENSCSAG00000018798) PXK (ENSCSAG00000012166) PDHB (ENSCSAG00000012153) KCTD6 (ENSCSAG00000012148) ACOX2 (ENSCSAG00000012133) FAM107A (ENSCSAG00000012116) FAM3D (ENSCSAG00000012100) Vervet Monkey MODERN SPECIES 8 TMEM30A (ENSCSAG00000014495) COX7A2 (ENSCSAG00000014488) COL12A1 (ENSCSAG00000014357) CD109 (ENSCSAG00000014064) SLC17A5 (ENSCSAG00000014050) ENSCSAG00000019292 ENSCSAG00000014041 ##22 MTO1 (ENSCSAG00000014033) CGAS (ENSCSAG00000014020) DDX43 (ENSCSAG00000013999) OOEP (ENSCSAG00000013926) KHDC3L (ENSCSAG00000013920) DPPA5 (ENSCSAG00000013914) KHDC1 (ENSCSAG00000013912) ENSCSAG00000013909 KCNQ5 (ENSCSAG00000013904) RIMS1 (ENSCSAG00000013893) OGFRL1 (ENSCSAG00000013882) ##35 B3GAT2 (ENSCSAG00000013881) SMAP1 (ENSCSAG00000013875) SDHAF4 (ENSCSAG00000013870) FAM135A (ENSCSAG00000013861) Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.u.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.u.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000011782 ENSGT01070000253766.A.b ENSGT00940000154242.b ENSGT00390000015600.c.a.e ENSGT00940000156694 ENSGT00440000038159.o.b ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185.l.a.a.a ENSGT00940000155121 ENSGT00390000004881.z ENSGT00940000159123 ENSGT00910000147783 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000154351.k.b.a.b.b ENSGT00940000157341 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.u.a ##22 ENSGT00390000001347.vb.a.b.b.b ENSGT00940000161936 ENSGT00390000015871 ENSGT00940000159969.a ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a ENSGT00940000163562 Drill MODERN SPECIES 1145 ENSMLEG00000033690 ##22 ENSMLEG00000043551 RB1CC1 (ENSMLEG00000031840) ALKAL1 (ENSMLEG00000036152) ST18 (ENSMLEG00000038764) PCMTD1 (ENSMLEG00000027519) PXDNL (ENSMLEG00000040611) Sooty mangabey MODERN SPECIES 184 LYN (ENSCATG00000030247) TGS1 (ENSCATG00000035375) TMEM68 (ENSCATG00000040134) XKR4 (ENSCATG00000035909) RP1 (ENSCATG00000036262) ENSCATG00000032680 ENSCATG00000033814 SOX17 (ENSCATG00000032966) MRPL15 (ENSCATG00000029666) LYPLA1 (ENSCATG00000007446) TCEA1 (ENSCATG00000039602) ENSCATG00000029701 RGS20 (ENSCATG00000035536) ATP6V1H (ENSCATG00000036357) OPRK1 (ENSCATG00000037584) ENSCATG00000029226 ##22 ENSCATG00000028185 NPBWR1 (ENSCATG00000017400) RB1CC1 (ENSCATG00000031086) ALKAL1 (ENSCATG00000036184) ST18 (ENSCATG00000032688) PCMTD1 (ENSCATG00000034883) PXDNL (ENSCATG00000012510) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000001231.s.a.a.b ENSGT00390000010872 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00910000147105 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT00940000154573 ENSGT00940000154931 ENSGT00940000154519.g.b ENSGT00940000156563 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.u.b ##22 ENSGT00940000159347 ENSGT00390000004746 ENSGT00940000154150 ENSGT00390000011804 ENSGT00940000157354 ENSGT00940000154295.y.b.b ENSGT00390000009209 ENSGT00390000004735.B ENSGT00550000075030.n ENSGT00940000155562 ENSGT00940000154543.b ENSGT00390000008360 ENSGT00940000154632.q.a.a.b ENSGT00940000155105 ENSGT00910000147523 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000157153.s ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00910000147105 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT00940000154573 ENSGT00940000154931 ENSGT00940000154519.g.b ENSGT00940000156563 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.u.b ##22 ENSGT00940000159347 ENSGT00390000004746 ENSGT00940000154150 ENSGT00390000011804 ENSGT00940000157354 ENSGT00390000009209 ENSGT00390000004735.B ENSGT00550000075030.n ENSGT00940000155562 ENSGT00940000154543.b ENSGT00390000008360 ENSGT00940000154632.q.a.a.b ENSGT00940000155105 ENSGT00940000155106 ENSGT00390000014167 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000157153.s ENSGT00940000159059 ENSGT00390000010872 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00440000033640 ENSGT00910000147105 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT00940000154573 ENSGT00940000154931 ENSGT00940000154519.g.b ENSGT00940000156563 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.u.b ##22 ENSGT00940000159347 ENSGT00390000004746 ENSGT00940000154150 ENSGT00390000011804 ENSGT00940000157354 ENSGT00390000009209 ENSGT00390000004735.B ENSGT00550000075030.n ENSGT00940000155562 ENSGT00940000154543.b ENSGT00390000008360 ENSGT00940000154632.q.a.a.b ENSGT00940000155105 ENSGT00940000155106 ENSGT00390000014167 Sooty mangabey MODERN SPECIES 247 DUSP22 (ENSCATG00000030616) IRF4 (ENSCATG00000015583) EXOC2 (ENSCATG00000037603) HUS1B (ENSCATG00000008071) FOXQ1 (ENSCATG00000017933) FOXF2 (ENSCATG00000005462) ENSCATG00000043623 GMDS (ENSCATG00000039562) ENSCATG00000033597 MYLK4 (ENSCATG00000036658) WRNIP1 (ENSCATG00000041978) SERPINB1 (ENSCATG00000039910) SERPINB6 (ENSCATG00000030479) NQO2 (ENSCATG00000027170) ENSCATG00000021756 ##22 RIPK1 (ENSCATG00000032918) BPHL (ENSCATG00000032656) TUBB2B (ENSCATG00000017036) PSMG4 (ENSCATG00000036332) SLC22A23 (ENSCATG00000022177) PXDC1 (ENSCATG00000034625) FAM50B (ENSCATG00000019736) PRPF4B (ENSCATG00000039868) FAM217A (ENSCATG00000045004) ENSCATG00000038905 ENSCATG00000034182 ECI2 (ENSCATG00000039055) Drill MODERN SPECIES 899 DUSP22 (ENSMLEG00000034563) ENSMLEG00000015544 IRF4 (ENSMLEG00000004768) EXOC2 (ENSMLEG00000033278) ENSMLEG00000019226 ENSMLEG00000027734 ENSMLEG00000044127 ENSMLEG00000041640 MYLK4 (ENSMLEG00000043022) ENSMLEG00000011844 SERPINB1 (ENSMLEG00000031662) SERPINB9 (ENSMLEG00000028963) SERPINB6 (ENSMLEG00000013840) NQO2 (ENSMLEG00000044409) ENSMLEG00000033411 ##22 RIPK1 (ENSMLEG00000025829) BPHL (ENSMLEG00000033802) ENSMLEG00000034009 TUBB2B (ENSMLEG00000037972) PSMG4 (ENSMLEG00000035294) SLC22A23 (ENSMLEG00000029569) PXDC1 (ENSMLEG00000037642) FAM50B (ENSMLEG00000005931) ENSMLEG00000021954 PRPF4B (ENSMLEG00000030421) FAM217A (ENSMLEG00000039857) ENSMLEG00000031291 ENSMLEG00000037689 ECI2 (ENSMLEG00000033204) CDYL (ENSMLEG00000010888) Macaca ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157153 ENSGT00940000159059 ENSGT00390000001231.s.a.a.b ENSGT00390000010872 ENSGT00940000162937.b ENSGT00940000162527 ENSGT00940000162303.b ENSGT00440000033640 ENSGT00940000156211.b ENSGT00390000008538 ENSGT00940000154573 ENSGT00940000154931 ENSGT00940000154519.g.b ENSGT00940000156563 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.u.b ##22 ENSGT00940000159347 ENSGT00390000004746 ENSGT00940000154150 ENSGT00390000011804 ENSGT00940000157354 ENSGT00940000154295.y.b.b ENSGT00390000009209 ENSGT00390000004735.B ENSGT00550000075030.n ENSGT00940000155562 ENSGT00940000154543.b ENSGT00390000008360 ENSGT00940000154632.q.a.a.b ENSGT00940000155105 ENSGT00910000147523 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 136 FOXC1 (ENSMNEG00000006978) GMDS (ENSMNEG00000035111) ENSMNEG00000036375 ENSMNEG00000035768 MYLK4 (ENSMNEG00000033807) WRNIP1 (ENSMNEG00000032509) SERPINB1 (ENSMNEG00000031098) SERPINB9 (ENSMNEG00000018071) SERPINB6 (ENSMNEG00000038077) NQO2 (ENSMNEG00000039080) ENSMNEG00000030982 ##22 RIPK1 (ENSMNEG00000029731) BPHL (ENSMNEG00000034992) ENSMNEG00000030834 TUBB2B (ENSMNEG00000000042) PSMG4 (ENSMNEG00000045254) SLC22A23 (ENSMNEG00000035865) ENSMNEG00000040334 PXDC1 (ENSMNEG00000029513) FAM50B (ENSMNEG00000017045) ENSMNEG00000039272 PRPF4B (ENSMNEG00000036107) FAM217A (ENSMNEG00000035674) ENSMNEG00000020877 ENSMNEG00000034908 ECI2 (ENSMNEG00000000039) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00930000150941.y ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.j ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.v ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00500000044955.j.a.b ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00940000155258.s.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.v ##22 ENSGT00400000024746 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 16 ENSPANG00000047414 ENSPANG00000010457 RIMS1 (ENSPANG00000024245) KCNQ5 (ENSPANG00000019581) ENSPANG00000015806 KHDC1L (ENSPANG00000024450) ENSPANG00000039650 ENSPANG00000048234 ENSPANG00000020317 ENSPANG00000029964 OOEP (ENSPANG00000010455) ENSPANG00000041637 CD109 (ENSPANG00000025498) SLC17A5 (ENSPANG00000040614) ENSPANG00000021501 ENSPANG00000006932 ##22 MTO1 (ENSPANG00000024449) CGAS (ENSPANG00000012327) DDX43 (ENSPANG00000005686) ENSPANG00000045521 COL12A1 (ENSPANG00000018518) ENSPANG00000034091 TMEM30A (ENSPANG00000026151) FILIP1 (ENSPANG00000018645) ENSPANG00000038632 SENP6 (ENSPANG00000036022) MYO6 (ENSPANG00000019225) IMPG1 (ENSPANG00000019906) HTR1B (ENSPANG00000015604) ENSPANG00000051429 MEI4 (ENSPANG00000034147) Olive baboon MODERN SPECIES 792 ENSPANG00000014395 ENSPANG00000032660 MAMLD1 (ENSPANG00000008461) MTM1 (ENSPANG00000009162) MTMR1 (ENSPANG00000021671) CD99L2 (ENSPANG00000005515) ENSPANG00000049067 ENSPANG00000003865 ENSPANG00000044758 ENSPANG00000048433 GPR50 (ENSPANG00000013292) ENSPANG00000032066 PASD1 (ENSPANG00000002295) FATE1 (ENSPANG00000012784) CNGA2 (ENSPANG00000005736) EEF1A1 (ENSPANG00000043127) ##22 ENSPANG00000040251 GABRQ (ENSPANG00000011138) ENSPANG00000048183 ENSPANG00000038708 ENSPANG00000000919 MAGEA4 (ENSPANG00000048327) GABRE (ENSPANG00000040993) MAGEA10 (ENSPANG00000045326) GABRA3 (ENSPANG00000023463) ENSPANG00000042565 CETN2 (ENSPANG00000042432) NSDHL (ENSPANG00000001786) ZNF185 (ENSPANG00000011355) PNMA5 (ENSPANG00000041264) PNMA3 (ENSPANG00000008016) Olive baboon MODERN SPECIES 3 ENSPANG00000050009 ENSPANG00000048667 ENSPANG00000040293 ENSPANG00000039565 ENSPANG00000042910 ENSPANG00000043048 FAM181B (ENSPANG00000020377) ENSPANG00000042520 PRCP (ENSPANG00000000426) DDIAS (ENSPANG00000000427) RAB30 (ENSPANG00000003974) PCF11 (ENSPANG00000006355) ENSPANG00000033818 CCDC90B (ENSPANG00000018014) ANKRD42 (ENSPANG00000009554) ENSPANG00000047282 ##22 ENSPANG00000048439 ENSPANG00000046399 ENSPANG00000042996 DLG2 (ENSPANG00000007863) TMEM126B (ENSPANG00000014631) TMEM126A (ENSPANG00000011636) ENSPANG00000035892 CCDC89 (ENSPANG00000048782) SYTL2 (ENSPANG00000010114) CCDC83 (ENSPANG00000019126) PICALM (ENSPANG00000019177) EED (ENSPANG00000023331) HIKESHI (ENSPANG00000006476) CCDC81 (ENSPANG00000011943) ENSPANG00000038398 Macaca ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00900000143584 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00930000150941.y ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.j ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.v ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00940000155258.s.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f.j ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.v ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000164259 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A.n.a ENSGT00940000154353.A.n.b ENSGT00940000154353.A.m ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 14 HTR1B (ENSMFAG00000042700) IMPG1 (ENSMFAG00000033339) MYO6 (ENSMFAG00000038795) ENSMFAG00000041950 FILIP1 (ENSMFAG00000001452) TMEM30A (ENSMFAG00000036109) COX7A2 (ENSMFAG00000046193) COL12A1 (ENSMFAG00000034460) ENSMFAG00000053928 ENSMFAG00000061165 ENSMFAG00000057734 ENSMFAG00000057392 ENSMFAG00000054519 CD109 (ENSMFAG00000044576) SLC17A5 (ENSMFAG00000044818) ENSMFAG00000045026 ##22 ENSMFAG00000062064 MTO1 (ENSMFAG00000042481) CGAS (ENSMFAG00000046319) DDX43 (ENSMFAG00000043087) OOEP (ENSMFAG00000044288) KHDC3L (ENSMFAG00000041622) DPPA5 (ENSMFAG00000045714) ENSMFAG00000037484 ENSMFAG00000062492 ENSMFAG00000047354 KCNQ5 (ENSMFAG00000036978) ENSMFAG00000061169 ENSMFAG00000059993 RIMS1 (ENSMFAG00000038905) ENSMFAG00000047850 Rhesus DUPLICATION Rhesus MODERN SPECIES 18 TGS1 (ENSMMUG00000005478) TMEM68 (ENSMMUG00000005477) ENSMMUG00000055000 XKR4 (ENSMMUG00000003733) RP1 (ENSMMUG00000014640) ENSMMUG00000000082 SOX17 (ENSMMUG00000063192) ENSMMUG00000051150 MRPL15 (ENSMMUG00000005539) LYPLA1 (ENSMMUG00000013157) TCEA1 (ENSMMUG00000016022) RGS20 (ENSMMUG00000015417) ATP6V1H (ENSMMUG00000004064) ENSMMUG00000063928 OPRK1 (ENSMMUG00000065247) ENSMMUG00000062566 ##22 NPBWR1 (ENSMMUG00000020909) ENSMMUG00000057267 RB1CC1 (ENSMMUG00000009990) ALKAL1 (ENSMMUG00000042459) ST18 (ENSMMUG00000008439) PCMTD1 (ENSMMUG00000003347) PXDNL (ENSMMUG00000002781) ENSMMUG00000060991 SNTG1 (ENSMMUG00000002811) ENSMMUG00000047485 ENSMMUG00000057165 PPDPFL (ENSMMUG00000057040) ##21 SNAI2 (ENSMMUG00000016195) CLXN (ENSMMUG00000053238) ENSMMUG00000059736 Rhesus MODERN SPECIES 14 IRAK1BP1 (ENSMMUG00000060268) ENSMMUG00000061178 MEI4 (ENSMMUG00000005328) ENSMMUG00000057119 HTR1B (ENSMMUG00000015717) IMPG1 (ENSMMUG00000054471) MYO6 (ENSMMUG00000005032) SENP6 (ENSMMUG00000004491) FILIP1 (ENSMMUG00000019275) TMEM30A (ENSMMUG00000019273) COX7A2 (ENSMMUG00000043152) COL12A1 (ENSMMUG00000019261) ENSMMUG00000056770 CD109 (ENSMMUG00000017806) SLC17A5 (ENSMMUG00000008133) EEF1A1 (ENSMMUG00000004852) ##22 MTO1 (ENSMMUG00000019270) CGAS (ENSMMUG00000019606) DDX43 (ENSMMUG00000019599) OOEP (ENSMMUG00000000416) KHDC3L (ENSMMUG00000010084) DPPA5 (ENSMMUG00000065289) KHDC1 (ENSMMUG00000051247) KHDC1L (ENSMMUG00000018573) ENSMMUG00000063219 KCNQ5 (ENSMMUG00000015320) RIMS1 (ENSMMUG00000010345) ENSMMUG00000051886 ENSMMUG00000065155 OGFRL1 (ENSMMUG00000014671) ##35 B3GAT2 (ENSMMUG00000058487) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Cebidae DUPLICATION Cebidae DUPLICATION Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.w.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 18 ENSCJAG00000069790 NDN (ENSCJAG00000003738) MAGEL2 (ENSCJAG00000085421) ENSCJAG00000045017 ENSCJAG00000076248 CHRNA7 (ENSCJAG00000021542) ENSCJAG00000070281 ENSCJAG00000069970 OTUD7A (ENSCJAG00000017621) KLF13 (ENSCJAG00000017617) TRPM1 (ENSCJAG00000017565) MTMR10 (ENSCJAG00000017528) ENSCJAG00000017520 APBA2 (ENSCJAG00000017493) ENTREP2 (ENSCJAG00000082089) ENSCJAG00000076541 ##22 ENSCJAG00000073911 ENSCJAG00000083661 TJP1 (ENSCJAG00000017370) TARS3 (ENSCJAG00000017350) TM2D3 (ENSCJAG00000017340) PCSK6 (ENSCJAG00000017309) ENSCJAG00000017268 SELENOS (ENSCJAG00000017258) CHSY1 (ENSCJAG00000058237) LRRK1 (ENSCJAG00000017202) ALDH1A3 (ENSCJAG00000017159) ENSCJAG00000074763 ASB7 (ENSCJAG00000017150) LINS1 (ENSCJAG00000017135) CERS3 (ENSCJAG00000017114) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.w.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 52 SLC10A1 (ENSSBOG00000026882) SMOC1 (ENSSBOG00000020092) SLC8A3 (ENSSBOG00000028349) ENSSBOG00000027648 ENSSBOG00000034308 COX16 (ENSSBOG00000034593) SYNJ2BP (ENSSBOG00000028807) ENSSBOG00000021356 ADAM20 (ENSSBOG00000025132) TTC9 (ENSSBOG00000035147) MAP3K9 (ENSSBOG00000026870) ENSSBOG00000027808 PCNX1 (ENSSBOG00000021906) ENSSBOG00000034324 SIPA1L1 (ENSSBOG00000025880) ENSSBOG00000027922 ##22 ENSSBOG00000007314 RGS6 (ENSSBOG00000029364) DPF3 (ENSSBOG00000034660) DCAF4 (ENSSBOG00000033529) ZFYVE1 (ENSSBOG00000024876) RBM25 (ENSSBOG00000034153) PSEN1 (ENSSBOG00000023450) PAPLN (ENSSBOG00000025394) NUMB (ENSSBOG00000033352) HEATR4 (ENSSBOG00000018986) RIOX1 (ENSSBOG00000013673) ENSSBOG00000034097 ACOT4 (ENSSBOG00000011298) ENSSBOG00000021771 ENSSBOG00000022744 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.w.b ##22 Marmoset MODERN SPECIES 3 ENSCJAG00000023301 ENSCJAG00000020614 NDUFAB1 (ENSCJAG00000020616) PALB2 (ENSCJAG00000020619) DCTN5 (ENSCJAG00000020623) PLK1 (ENSCJAG00000020626) ERN2 (ENSCJAG00000020632) CHP2 (ENSCJAG00000085909) PRKCB (ENSCJAG00000020643) CACNG3 (ENSCJAG00000044940) RBBP6 (ENSCJAG00000020661) TNRC6A (ENSCJAG00000020677) SLC5A11 (ENSCJAG00000020690) ARHGAP17 (ENSCJAG00000020698) LCMT1 (ENSCJAG00000020729) ENSCJAG00000074972 ##22 AQP8 (ENSCJAG00000020747) ZKSCAN2 (ENSCJAG00000043706) HS3ST4 (ENSCJAG00000020752) C16orf82 (ENSCJAG00000022334) KDM8 (ENSCJAG00000020509) NSMCE1 (ENSCJAG00000020515) IL4R (ENSCJAG00000005921) IL21R (ENSCJAG00000031444) GTF3C1 (ENSCJAG00000005950) KATNIP (ENSCJAG00000005965) GSG1L (ENSCJAG00000044404) XPO6 (ENSCJAG00000006014) SBK1 (ENSCJAG00000055391) ENSCJAG00000042659 LAT (ENSCJAG00000033767) Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.x ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b.x ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 46 ENSSBOG00000032089 TTN (ENSSBOG00000021641) CCDC141 (ENSSBOG00000020873) SESTD1 (ENSSBOG00000028940) ZNF385B (ENSSBOG00000033350) CWC22 (ENSSBOG00000021683) UBE2E3 (ENSSBOG00000032070) ENSSBOG00000019739 ITGA4 (ENSSBOG00000000272) CERKL (ENSSBOG00000021307) NEUROD1 (ENSSBOG00000015587) ITPRID2 (ENSSBOG00000013272) PPP1R1C (ENSSBOG00000032708) ENSSBOG00000030558 PDE1A (ENSSBOG00000034194) ENSSBOG00000035539 ##22 DNAJC10 (ENSSBOG00000020962) FRZB (ENSSBOG00000023256) NCKAP1 (ENSSBOG00000031170) DUSP19 (ENSSBOG00000029076) NUP35 (ENSSBOG00000018676) ENSSBOG00000026419 ZNF804A (ENSSBOG00000025383) TMLHE (ENSSBOG00000033577) SPRY3 (ENSSBOG00000011067) ENSSBOG00000026268 IL9R (ENSSBOG00000029398) ENSSBOG00000023734 ENSSBOG00000031371 ENSSBOG00000022772 Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 173 KCNN2 (ENSCCAG00000030075) TRIM36 (ENSCCAG00000008961) PGGT1B (ENSCCAG00000034709) ENSCCAG00000010826 ##22 CCDC112 (ENSCCAG00000011181) ENSCCAG00000027931 YIPF7 (ENSCCAG00000021592) KCTD8 (ENSCCAG00000034794) GRXCR1 (ENSCCAG00000030769) ATP8A1 (ENSCCAG00000035933) SHISA3 (ENSCCAG00000029044) BEND4 (ENSCCAG00000027819) SLC30A9 (ENSCCAG00000032296) TMEM33 (ENSCCAG00000029094) Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 124 GABRG1 (ENSCCAG00000020663) GABRA2 (ENSCCAG00000024117) ENSCCAG00000018365 ##22 GABRA4 (ENSCCAG00000031211) GABRB1 (ENSCCAG00000031056) ENSCCAG00000021015 COMMD8 (ENSCCAG00000037718) ATP10D (ENSCCAG00000032623) CORIN (ENSCCAG00000036055) NFXL1 (ENSCCAG00000035844) CNGA1 (ENSCCAG00000027342) NIPAL1 (ENSCCAG00000032859) TXK (ENSCCAG00000017733) TEC (ENSCCAG00000034761) ENSCCAG00000021799 SLAIN2 (ENSCCAG00000008869) SLC10A4 (ENSCCAG00000037459) ENSCCAG00000034311 Capuchin MODERN SPECIES 196 FBP2 (ENSCCAG00000022182) FBP1 (ENSCCAG00000005125) AOPEP (ENSCCAG00000029936) FANCC (ENSCCAG00000026638) ENSCCAG00000034109 ENSCCAG00000029017 ##22 PTCH1 (ENSCCAG00000021603) ENSCCAG00000026980 HSD17B3 (ENSCCAG00000032712) SLC35D2 (ENSCCAG00000019726) ZNF367 (ENSCCAG00000011083) ENSCCAG00000025778 HABP4 (ENSCCAG00000029535) ENSCCAG00000026671 ENSCCAG00000004738 ENSCCAG00000030771 PRXL2C (ENSCCAG00000021330) ENSCCAG00000031010 ENSCCAG00000032829 ENSCCAG00000025019 ENSCCAG00000036180 Capuchin MODERN SPECIES 939 ENSCCAG00000016503 ##22 Capuchin MODERN SPECIES 32 ST7L (ENSCCAG00000031301) WNT2B (ENSCCAG00000030621) CTTNBP2NL (ENSCCAG00000027542) ENSCCAG00000026900 KCND3 (ENSCCAG00000036329) DDX20 (ENSCCAG00000026759) INKA2 (ENSCCAG00000035044) RAP1A (ENSCCAG00000034175) FILIP1 (ENSCCAG00000036105) TMEM30A (ENSCCAG00000025332) ENSCCAG00000024466 COL12A1 (ENSCCAG00000029086) ENSCCAG00000013592 CD109 (ENSCCAG00000027471) SLC17A5 (ENSCCAG00000038020) ENSCCAG00000033087 ##22 MTO1 (ENSCCAG00000020119) CGAS (ENSCCAG00000024770) DDX43 (ENSCCAG00000037349) ENSCCAG00000031552 ENSCCAG00000025605 DPPA5 (ENSCCAG00000029007) ENSCCAG00000026548 KHDC1L (ENSCCAG00000029448) KCNQ5 (ENSCCAG00000015294) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 278 TRPC6 (ENSANAG00000032595) ANGPTL5 (ENSANAG00000025830) CEP126 (ENSANAG00000033095) CFAP300 (ENSANAG00000023658) YAP1 (ENSANAG00000029463) ENSANAG00000022618 BIRC3 (ENSANAG00000035989) BIRC2 (ENSANAG00000037030) TMEM123 (ENSANAG00000029026) MMP7 (ENSANAG00000023347) MMP20 (ENSANAG00000021702) MMP27 (ENSANAG00000020509) MMP8 (ENSANAG00000023440) MMP3 (ENSANAG00000029899) MMP1 (ENSANAG00000028859) ENSANAG00000004878 ##22 MMP12 (ENSANAG00000022445) MMP13 (ENSANAG00000020799) DCUN1D5 (ENSANAG00000034204) DYNC2H1 (ENSANAG00000035967) PDGFD (ENSANAG00000023791) CASP4 (ENSANAG00000027784) CASP1 (ENSANAG00000032743) CARD16 (ENSANAG00000028470) CARD18 (ENSANAG00000028356) ENSANAG00000036500 ENSANAG00000023856 ENSANAG00000009840 Mas night monkey MODERN SPECIES 1229 SLITRK2 (ENSANAG00000018916) ENSANAG00000024700 ENSANAG00000034827 FMR1 (ENSANAG00000026715) FMR1NB (ENSANAG00000029333) AFF2 (ENSANAG00000023509) ENSANAG00000009320 ##22 IDS (ENSANAG00000029668) ENSANAG00000022415 ENSANAG00000031481 TMEM185A (ENSANAG00000028488) ENSANAG00000021783 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 129 ZNF462 (ENSOGAG00000001625) RAD23B (ENSOGAG00000014216) ENSOGAG00000024651 ENSOGAG00000025236 KLF4 (ENSOGAG00000029918) ENSOGAG00000024789 ACTL7B (ENSOGAG00000009063) ACTL7A (ENSOGAG00000009064) ELP1 (ENSOGAG00000009065) ABITRAM (ENSOGAG00000024317) CTNNAL1 (ENSOGAG00000009072) TMEM245 (ENSOGAG00000009075) FRRS1L (ENSOGAG00000026708) EPB41L4B (ENSOGAG00000005508) PTPN3 (ENSOGAG00000016018) ENSOGAG00000034039 ##22 ENSOGAG00000025160 PALM2AKAP2 (ENSOGAG00000009157) C9orf152 (ENSOGAG00000009164) ENSOGAG00000009165 SVEP1 (ENSOGAG00000011809) MUSK (ENSOGAG00000012704) ENSOGAG00000015335 OR2K2 (ENSOGAG00000025252) ECPAS (ENSOGAG00000011393) ZNF483 (ENSOGAG00000011399) PTGR1 (ENSOGAG00000011144) DNAJC25 (ENSOGAG00000034263) SHOC1 (ENSOGAG00000011149) UGCG (ENSOGAG00000031517) ENSOGAG00000024324 Bushbaby MODERN SPECIES 150 ENSOGAG00000009152 ##22 MTO1 (ENSOGAG00000006692) CGAS (ENSOGAG00000013665) DDX43 (ENSOGAG00000013660) OOEP (ENSOGAG00000013658) KHDC3L (ENSOGAG00000016691) ENSOGAG00000006102 ENSOGAG00000013952 ENSOGAG00000028161 ENSOGAG00000032765 RIMS1 (ENSOGAG00000002914) OGFRL1 (ENSOGAG00000034907) ##35 B3GAT2 (ENSOGAG00000013406) SMAP1 (ENSOGAG00000013402) ENSOGAG00000030708 SDHAF4 (ENSOGAG00000027850) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Mouse lemur MODERN SPECIES 7 MYH4 (ENSMICG00000010990) MYH1 (ENSMICG00000010047) ENSMICG00000011020 MYH3 (ENSMICG00000011079) SCO1 (ENSMICG00000011117) ADPRM (ENSMICG00000011123) TMEM220 (ENSMICG00000011126) ENSMICG00000033940 DNAH9 (ENSMICG00000016166) ZNF18 (ENSMICG00000016196) MAP2K4 (ENSMICG00000016202) MYOCD (ENSMICG00000002408) ARHGAP44 (ENSMICG00000002417) ELAC2 (ENSMICG00000002428) ENSMICG00000033884 ENSMICG00000004447 ##22 ENSMICG00000014044 ENSMICG00000045291 C17orf49 (ENSMICG00000014069) BCL6B (ENSMICG00000041989) SLC16A13 (ENSMICG00000005926) SLC16A11 (ENSMICG00000005931) CLEC10A (ENSMICG00000037927) ASGR2 (ENSMICG00000012091) ASGR1 (ENSMICG00000004281) DLG4 (ENSMICG00000004288) ACADVL (ENSMICG00000004298) DVL2 (ENSMICG00000004315) ENSMICG00000004320 GABARAP (ENSMICG00000035720) CTDNEP1 (ENSMICG00000032783) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 545 ZPLD1 (ENSPCOG00000007555) ENSPCOG00000004639 ##22 ENSPCOG00000019631 ##22 ENSPCOG00000027710 NFKBIZ (ENSPCOG00000023299) ENSPCOG00000025056 NXPE3 (ENSPCOG00000027837) CEP97 (ENSPCOG00000019850) ENSPCOG00000022342 RPL24 (ENSPCOG00000002493) ZBTB11 (ENSPCOG00000027234) PCNP (ENSPCOG00000027764) ENSPCOG00000023943 SENP7 (ENSPCOG00000019516) ENSPCOG00000015976 IMPG2 (ENSPCOG00000019074) ENSPCOG00000015454 ABI3BP (ENSPCOG00000000174) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 545 ZPLD1 (ENSPCOG00000007555) ENSPCOG00000004639 ##22 ENSPCOG00000019631 ##22 ENSPCOG00000027710 NFKBIZ (ENSPCOG00000023299) ENSPCOG00000025056 NXPE3 (ENSPCOG00000027837) CEP97 (ENSPCOG00000019850) ENSPCOG00000022342 RPL24 (ENSPCOG00000002493) ZBTB11 (ENSPCOG00000027234) PCNP (ENSPCOG00000027764) ENSPCOG00000023943 SENP7 (ENSPCOG00000019516) ENSPCOG00000015976 IMPG2 (ENSPCOG00000019074) ENSPCOG00000015454 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 304 TCEA1 (ENSPSMG00000014580) ENSPSMG00000014480 RGS20 (ENSPSMG00000014458) ATP6V1H (ENSPSMG00000014394) ENSPSMG00000014329 ##22 OPRK1 (ENSPSMG00000014319) NPBWR1 (ENSPSMG00000014303) ENSPSMG00000014298 RB1CC1 (ENSPSMG00000014088) ALKAL1 (ENSPSMG00000013919) ST18 (ENSPSMG00000013895) ENSPSMG00000013850 PCMTD1 (ENSPSMG00000013847) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 397 ENSLAFG00000000662 RIPOR2 (ENSLAFG00000005687) ARMH2 (ENSLAFG00000031504) GMNN (ENSLAFG00000022693) C6orf62 (ENSLAFG00000002569) TDP2 (ENSLAFG00000002567) ENSLAFG00000009860 ALDH5A1 (ENSLAFG00000006580) GPLD1 (ENSLAFG00000011368) MRS2 (ENSLAFG00000011362) ENSLAFG00000008302 DCDC2 (ENSLAFG00000008299) NRSN1 (ENSLAFG00000016732) HDGFL1 (ENSLAFG00000002133) PRL (ENSLAFG00000022270) ENSLAFG00000030577 ##22 SOX4 (ENSLAFG00000018401) CDKAL1 (ENSLAFG00000000235) E2F3 (ENSLAFG00000000232) MBOAT1 (ENSLAFG00000008346) ENSLAFG00000029188 ID4 (ENSLAFG00000014467) RNF144B (ENSLAFG00000013923) DEK (ENSLAFG00000004470) KDM1B (ENSLAFG00000004467) TPMT (ENSLAFG00000011632) KIF13A (ENSLAFG00000008598) NUP153 (ENSLAFG00000015905) FAM8A1 (ENSLAFG00000015900) CAP2 (ENSLAFG00000011419) RBM24 (ENSLAFG00000000116) Elephant MODERN SPECIES 239 ENSLAFG00000032234 PCDH9 (ENSLAFG00000029953) ENSLAFG00000025700 ##22 ENSLAFG00000027452 ENSLAFG00000030868 ENSLAFG00000030478 ENSLAFG00000027466 PCDH20 (ENSLAFG00000031335) TDRD3 (ENSLAFG00000002705) DIAPH3 (ENSLAFG00000008135) PCDH17 (ENSLAFG00000002377) OLFM4 (ENSLAFG00000018242) PCDH8 (ENSLAFG00000012913) CNMD (ENSLAFG00000018396) SUGT1 (ENSLAFG00000009157) ELF1 (ENSLAFG00000032117) WBP4 (ENSLAFG00000005901) KBTBD6 (ENSLAFG00000009917) Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Sauria ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00910000144211.o ENSGT00940000162741 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00400000024746 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 387 ENSGT00940000162741 ENSGT00950000183029.B.d ##22 tuatara DUPLICATION tuatara MODERN SPECIES 1719 ENSSPUG00000003655 ENSSPUG00000003644 ##22 ENSSPUG00000003622 ##22 ENSSPUG00000003612 ENSSPUG00000003591 CAP1 (ENSSPUG00000003576) MFSD2A (ENSSPUG00000003562) MYCL (ENSSPUG00000003545) ENSSPUG00000003530 TRIT1 (ENSSPUG00000003472) ENSSPUG00000003365 HPCAL4 (ENSSPUG00000003336) NT5C1A (ENSSPUG00000003317) HEYL (ENSSPUG00000003299) PABPC4 (ENSSPUG00000003204) PPIE (ENSSPUG00000003147) ENSSPUG00000003125 tuatara MODERN SPECIES 1719 ENSSPUG00000003655 ENSSPUG00000003644 ##22 ENSSPUG00000003622 ##22 ENSSPUG00000003612 ENSSPUG00000003591 CAP1 (ENSSPUG00000003576) MFSD2A (ENSSPUG00000003562) MYCL (ENSSPUG00000003545) ENSSPUG00000003530 TRIT1 (ENSSPUG00000003472) ENSSPUG00000003365 HPCAL4 (ENSSPUG00000003336) NT5C1A (ENSSPUG00000003317) HEYL (ENSSPUG00000003299) PABPC4 (ENSSPUG00000003204) PPIE (ENSSPUG00000003147) ENSSPUG00000003125 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Laterata ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154450 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00440000035378.c ENSGT00940000158484 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000156197 ENSGT00490000043398.g ENSGT00490000043398.h ENSGT00390000002428.a ENSGT00940000166197 ENSGT00910000144211.o ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00940000156790 ENSGT00390000017955.c ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00940000157613 ENSGT00390000013601 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00640000091536 ENSGT00390000001867 ENSGT00390000012738 ENSGT00940000158729 ENSGT00940000158568 ENSGT00940000155256 ENSGT00950000182894.D ENSGT00390000015369 ENSGT00940000154317.a.a Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 117 INPP5B (ENSSMRG00000020810) SF3A3 (ENSSMRG00000020812) FHL3 (ENSSMRG00000020813) UTP11 (ENSSMRG00000020814) ENSSMRG00000000031 RRAGC (ENSSMRG00000000086) MYCBP (ENSSMRG00000000089) RHBDL2 (ENSSMRG00000000112) GALE (ENSSMRG00000000133) LYPLA2 (ENSSMRG00000000196) PITHD1 (ENSSMRG00000000229) C1orf109 (ENSSMRG00000000245) ENSSMRG00000000289 ENSSMRG00000000314 RPL11 (ENSSMRG00000000323) ENSSMRG00000000473 ##22 PPT1 (ENSSMRG00000000489) CAP1 (ENSSMRG00000000506) MFSD2A (ENSSMRG00000000547) KIAA0319L (ENSSMRG00000000634) NCDN (ENSSMRG00000000686) TFAP2E (ENSSMRG00000000694) PSMB2 (ENSSMRG00000000706) C1orf216 (ENSSMRG00000000717) CLSPN (ENSSMRG00000000727) AGO4 (ENSSMRG00000000748) AGO1 (ENSSMRG00000000771) AGO3 (ENSSMRG00000000795) TEKT2 (ENSSMRG00000000826) ADPRS (ENSSMRG00000000851) COL8A2 (ENSSMRG00000000866) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00910000144211.o ENSGT00940000162741 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00400000024746 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Aves ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Kakapo MODERN SPECIES 23 HMGN3 (ENSSHBG00005003735) PHIP (ENSSHBG00005003926) ENSSHBG00005004156 IRAK1BP1 (ENSSHBG00005004166) MEI4 (ENSSHBG00005004176) HTR1B (ENSSHBG00005004192) IMPG1 (ENSSHBG00005004207) MYO6 (ENSSHBG00005004296) SENP6 (ENSSHBG00005004407) FILIP1 (ENSSHBG00005004432) TMEM30A (ENSSHBG00005004441) COX7A2 (ENSSHBG00005004450) COL12A1 (ENSSHBG00005004710) CD109 (ENSSHBG00005007760) SLC17A5 (ENSSHBG00005008721) EEF1A1 (ENSSHBG00005008734) ##22 MTO1 (ENSSHBG00005008741) CGAS (ENSSHBG00005008750) ENSSHBG00005008757 KCNQ5 (ENSSHBG00005008797) RIMS1 (ENSSHBG00005000355) ASRGL1 (ENSSHBG00005000361) OGFRL1 (ENSSHBG00005001742) ##35 B3GAT2 (ENSSHBG00005001768) SMAP1 (ENSSHBG00005001790) SDHAF4 (ENSSHBG00005001815) FAM135A (ENSSHBG00005001902) ENSSHBG00005001967 LMBRD1 (ENSSHBG00005002082) ADGRB3 (ENSSHBG00005002302) ENSSHBG00005002326 Golden eagle MODERN SPECIES 11 LCA5 (ENSACCG00020003963) HMGN3 (ENSACCG00020003976) PHIP (ENSACCG00020004170) IRAK1BP1 (ENSACCG00020004322) MEI4 (ENSACCG00020004333) HTR1B (ENSACCG00020004337) IMPG1 (ENSACCG00020004348) MYO6 (ENSACCG00020004460) SENP6 (ENSACCG00020004547) FILIP1 (ENSACCG00020004575) TMEM30A (ENSACCG00020004591) COX7A2 (ENSACCG00020004599) COL12A1 (ENSACCG00020005240) CD109 (ENSACCG00020006357) SLC17A5 (ENSACCG00020006535) EEF1A1 (ENSACCG00020006558) ##22 MTO1 (ENSACCG00020006568) CGAS (ENSACCG00020006584) ENSACCG00020006599 KCNQ5 (ENSACCG00020006696) ENSACCG00020006756 RIMS1 (ENSACCG00020006798) ENSACCG00020006860 ASRGL1 (ENSACCG00020006889) OGFRL1 (ENSACCG00020006923) ##35 B3GAT2 (ENSACCG00020006936) SMAP1 (ENSACCG00020006957) SDHAF4 (ENSACCG00020006982) FAM135A (ENSACCG00020007002) ENSACCG00020007036 COL19A1 (ENSACCG00020007061) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00950000186266 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00950000186266 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Passeroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00950000186266 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Common canary MODERN SPECIES 1 ADGRB3 (ENSSCAG00000008350) LMBRD1 (ENSSCAG00000008154) ENSSCAG00000008102 ENSSCAG00000008087 FAM135A (ENSSCAG00000008058) SDHAF4 (ENSSCAG00000008052) SMAP1 (ENSSCAG00000008048) B3GAT2 (ENSSCAG00000008013) OGFRL1 (ENSSCAG00000007993) ##35 ASRGL1 (ENSSCAG00000007977) ENSSCAG00000007926 ENSSCAG00000007769 CD109 (ENSSCAG00000007729) SLC17A5 (ENSSCAG00000007700) ENSSCAG00000007696 EEF1A1 (ENSSCAG00000007693) ##22 MTO1 (ENSSCAG00000007689) CGAS (ENSSCAG00000007683) ENSSCAG00000007663 KCNQ5 (ENSSCAG00000007615) COL12A1 (ENSSCAG00000007543) COX7A2 (ENSSCAG00000007533) TMEM30A (ENSSCAG00000007521) FILIP1 (ENSSCAG00000007503) SENP6 (ENSSCAG00000007472) MYO6 (ENSSCAG00000006533) IMPG1 (ENSSCAG00000006384) HTR1B (ENSSCAG00000006372) MEI4 (ENSSCAG00000006359) IRAK1BP1 (ENSSCAG00000006329) PHIP (ENSSCAG00000005084) Zebra finch MODERN SPECIES 23 MEI4 (ENSTGUG00000028003) HTR1B (ENSTGUG00000012613) IMPG1 (ENSTGUG00000012614) MYO6 (ENSTGUG00000012619) SENP6 (ENSTGUG00000012629) FILIP1 (ENSTGUG00000012640) TMEM30A (ENSTGUG00000012644) COX7A2 (ENSTGUG00000012645) ENSTGUG00000019567 COL12A1 (ENSTGUG00000012648) CD109 (ENSTGUG00000012659) SLC17A5 (ENSTGUG00000018160) MTO1 (ENSTGUG00000012680) CGAS (ENSTGUG00000012683) ENSTGUG00000012684 EEF1A1 (ENSTGUG00000012670) ##22 KCNQ5 (ENSTGUG00000012688) RIMS1 (ENSTGUG00000012695) ASRGL1 (ENSTGUG00000012710) OGFRL1 (ENSTGUG00000012712) ##35 B3GAT2 (ENSTGUG00000012716) SMAP1 (ENSTGUG00000012718) FAM135A (ENSTGUG00000012721) COL9A1 (ENSTGUG00000012730) COL19A1 (ENSTGUG00000012740) LMBRD1 (ENSTGUG00000023628) ADGRB3 (ENSTGUG00000012749) ENSTGUG00000012758 ENSTGUG00000028933 PHF3 (ENSTGUG00000012770) PTP4A1 (ENSTGUG00000012777) Medium ground finch MODERN SPECIES 31 LCA5 (ENSGFOG00000012389) HMGN3 (ENSGFOG00000012385) PHIP (ENSGFOG00000010921) IRAK1BP1 (ENSGFOG00000010838) MEI4 (ENSGFOG00000010831) HTR1B (ENSGFOG00000010828) IMPG1 (ENSGFOG00000010812) MYO6 (ENSGFOG00000010768) SENP6 (ENSGFOG00000010740) FILIP1 (ENSGFOG00000010729) TMEM30A (ENSGFOG00000010725) COX7A2 (ENSGFOG00000010721) COL12A1 (ENSGFOG00000010690) CD109 (ENSGFOG00000010625) SLC17A5 (ENSGFOG00000010616) EEF1A1 (ENSGFOG00000010613) ##22 MTO1 (ENSGFOG00000010591) ENSGFOG00000010573 KCNQ5 (ENSGFOG00000010567) RIMS1 (ENSGFOG00000010304) ASRGL1 (ENSGFOG00000010266) OGFRL1 (ENSGFOG00000010245) ##35 Great tit MODERN SPECIES 22 LCA5 (ENSPMJG00000003787) HMGN3 (ENSPMJG00000003813) PHIP (ENSPMJG00000003820) ENSPMJG00000005403 IRAK1BP1 (ENSPMJG00000005408) MEI4 (ENSPMJG00000005471) HTR1B (ENSPMJG00000005477) IMPG1 (ENSPMJG00000005495) MYO6 (ENSPMJG00000005506) SENP6 (ENSPMJG00000008075) FILIP1 (ENSPMJG00000008145) TMEM30A (ENSPMJG00000008155) COL12A1 (ENSPMJG00000008162) CD109 (ENSPMJG00000008447) SLC17A5 (ENSPMJG00000008453) EEF1A1 (ENSPMJG00000008454) ##22 MTO1 (ENSPMJG00000008492) CGAS (ENSPMJG00000008494) ENSPMJG00000008495 KCNQ5 (ENSPMJG00000008536) RIMS1 (ENSPMJG00000008547) ASRGL1 (ENSPMJG00000008570) OGFRL1 (ENSPMJG00000008571) ##35 B3GAT2 (ENSPMJG00000008577) SMAP1 (ENSPMJG00000008578) SDHAF4 (ENSPMJG00000008580) FAM135A (ENSPMJG00000008581) COL9A1 (ENSPMJG00000008590) LMBRD1 (ENSPMJG00000008596) ADGRB3 (ENSPMJG00000008636) ENSPMJG00000008697 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Anatidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Duck MODERN SPECIES 21 LCA5 (ENSAPLG00000003360) HMGN3 (ENSAPLG00000003473) PHIP (ENSAPLG00000003512) IRAK1BP1 (ENSAPLG00000004376) HTR1B (ENSAPLG00000001665) ENSAPLG00000019200 IMPG1 (ENSAPLG00000002413) MYO6 (ENSAPLG00000002456) SENP6 (ENSAPLG00000014331) FILIP1 (ENSAPLG00000014226) TMEM30A (ENSAPLG00000013903) COX7A2 (ENSAPLG00000013886) COL12A1 (ENSAPLG00000012959) CD109 (ENSAPLG00000007918) SLC17A5 (ENSAPLG00000008535) EEF1A1 (ENSAPLG00000009349) ##22 MTO1 (ENSAPLG00000009903) CGAS (ENSAPLG00000010154) ENSAPLG00000010182 KCNQ5 (ENSAPLG00000010359) RIMS1 (ENSAPLG00000010534) ASRGL1 (ENSAPLG00000011850) OGFRL1 (ENSAPLG00000011967) ##35 B3GAT2 (ENSAPLG00000017791) SMAP1 (ENSAPLG00000012058) SDHAF4 (ENSAPLG00000012169) FAM135A (ENSAPLG00000012238) ENSAPLG00000020898 ENSAPLG00000021718 LMBRD1 (ENSAPLG00000016044) ENSAPLG00000017793 Pink-footed goose MODERN SPECIES 70 SENP6 (ENSABRG00000016334) FILIP1 (ENSABRG00000016385) TMEM30A (ENSABRG00000016399) COX7A2 (ENSABRG00000016401) COL12A1 (ENSABRG00000016410) CD109 (ENSABRG00000000431) SLC17A5 (ENSABRG00000000478) EEF1A1 (ENSABRG00000000491) ##22 MTO1 (ENSABRG00000000499) CGAS (ENSABRG00000000515) ENSABRG00000000525 KCNQ5 (ENSABRG00000000616) ENSABRG00000002399 RIMS1 (ENSABRG00000002469) ASRGL1 (ENSABRG00000002689) OGFRL1 (ENSABRG00000002745) ##35 B3GAT2 (ENSABRG00000002763) SMAP1 (ENSABRG00000002790) SDHAF4 (ENSABRG00000002809) FAM135A (ENSABRG00000002827) COL9A1 (ENSABRG00000002887) COL19A1 (ENSABRG00000003083) LMBRD1 (ENSABRG00000003467) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000065281 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b.f ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C.b ENSGT00910000148442 ENSGT00940000154923.C.a ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Japanese quail MODERN SPECIES 21 LCA5 (ENSCJPG00005004400) HMGN3 (ENSCJPG00005004401) PHIP (ENSCJPG00005004402) IRAK1BP1 (ENSCJPG00005005228) MEI4 (ENSCJPG00005005239) HTR1B (ENSCJPG00005005243) IMPG1 (ENSCJPG00005005250) MYO6 (ENSCJPG00005005255) SENP6 (ENSCJPG00005006979) FILIP1 (ENSCJPG00005006990) TMEM30A (ENSCJPG00005006994) COX7A2 (ENSCJPG00005006995) COL12A1 (ENSCJPG00005006996) CD109 (ENSCJPG00005007009) SLC17A5 (ENSCJPG00005007013) EEF1A1 (ENSCJPG00005007015) ##22 MTO1 (ENSCJPG00005007016) CGAS (ENSCJPG00005007017) ENSCJPG00005007018 KCNQ5 (ENSCJPG00005007022) RIMS1 (ENSCJPG00005007064) ASRGL1 (ENSCJPG00005007069) OGFRL1 (ENSCJPG00005007070) ##35 B3GAT2 (ENSCJPG00005007096) SMAP1 (ENSCJPG00005007097) SDHAF4 (ENSCJPG00005007101) FAM135A (ENSCJPG00005007103) COL9A1 (ENSCJPG00005007115) COL19A1 (ENSCJPG00005007116) LMBRD1 (ENSCJPG00005007147) ADGRB3 (ENSCJPG00005007163) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00400000024746 Turkey MODERN SPECIES 11 ENSMGAG00000022226 IRAK1BP1 (ENSMGAG00000013771) MEI4 (ENSMGAG00000013773) ENSMGAG00000022305 ENSMGAG00000020978 ENSMGAG00000013799 ENSMGAG00000013794 ENSMGAG00000020895 ENSMGAG00000013792 ENSMGAG00000022190 ENSMGAG00000020631 ENSMGAG00000013778 ENSMGAG00000013775 ENSMGAG00000020937 ENSMGAG00000011604 ENSMGAG00000013825 ##22 CD109 (ENSMGAG00000013819) SLC17A5 (ENSMGAG00000013809) MTO1 (ENSMGAG00000013830) CGAS (ENSMGAG00000013831) ENSMGAG00000013832 KCNQ5 (ENSMGAG00000013833) RIMS1 (ENSMGAG00000013836) ENSMGAG00000013841 ENSMGAG00000013842 ##35 B3GAT2 (ENSMGAG00000013844) SMAP1 (ENSMGAG00000013845) FAM135A (ENSMGAG00000000924) ENSMGAG00000021659 LMBRD1 (ENSMGAG00000013851) ENSMGAG00000013856 Chicken MODERN SPECIES 22 HMGN2P46 (ENSGALG00010003810) PHIP (ENSGALG00010003819) ENSGALG00010003828 IRAK1BP1 (ENSGALG00010003831) MEI4 (ENSGALG00010003846) HTR1B (ENSGALG00010003863) IMPG1 (ENSGALG00010003935) MYO6 (ENSGALG00010003977) SENP6 (ENSGALG00010004038) FILIP1 (ENSGALG00010004055) TMEM30A (ENSGALG00010004058) COX7A2 (ENSGALG00010004076) COL12A1 (ENSGALG00010004096) CD109 (ENSGALG00010001508) SLC17A5 (ENSGALG00010001518) EEF1A1 (ENSGALG00010001525) ##22 ENSGALG00010001532 MTO1 (ENSGALG00010001542) CGAS (ENSGALG00010001546) ENSGALG00010001550 KCNQ5 (ENSGALG00010002405) RIMS1 (ENSGALG00010002446) ASRGL1 (ENSGALG00010002463) OGFRL1 (ENSGALG00010002471) ##35 B3GAT2 (ENSGALG00010001633) SMAP1 (ENSGALG00010001657) SDHAF4 (ENSGALG00010001677) FAM135A (ENSGALG00010001696) COL9A1 (ENSGALG00010001727) COL19A1 (ENSGALG00010001758) LMBRD1 (ENSGALG00010001776) African ostrich MODERN SPECIES 1078 IMPG1 (ENSSCUG00000015595) MYO6 (ENSSCUG00000015601) SENP6 (ENSSCUG00000015610) FILIP1 (ENSSCUG00000015616) TMEM30A (ENSSCUG00000015623) COX7A2 (ENSSCUG00000015626) COL12A1 (ENSSCUG00000015725) CD109 (ENSSCUG00000015886) SLC17A5 (ENSSCUG00000015903) EEF1A1 (ENSSCUG00000015913) ##22 MTO1 (ENSSCUG00000015917) CGAS (ENSSCUG00000015924) ENSSCUG00000015925 KCNQ5 (ENSSCUG00000015927) RIMS1 (ENSSCUG00000015953) ASRGL1 (ENSSCUG00000015981) OGFRL1 (ENSSCUG00000015985) ##35 SMAP1 (ENSSCUG00000015996) SDHAF4 (ENSSCUG00000016001) FAM135A (ENSSCUG00000016012) COL9A1 (ENSSCUG00000016031) COL19A1 (ENSSCUG00000016055) LMBRD1 (ENSSCUG00000016102) ADGRB3 (ENSSCUG00000016112) Australian saltwater crocodile DUPLICATION Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 38 IRAK1BP1 (ENSCPRG00005014294) ENSCPRG00005014290 MEI4 (ENSCPRG00005014282) HTR1B (ENSCPRG00005014275) IMPG1 (ENSCPRG00005014269) MYO6 (ENSCPRG00005013697) SENP6 (ENSCPRG00005013554) FILIP1 (ENSCPRG00005013542) TMEM30A (ENSCPRG00005013521) COX7A2 (ENSCPRG00005013509) COL12A1 (ENSCPRG00005013365) ENSCPRG00005013310 ENSCPRG00005013303 CD109 (ENSCPRG00005013290) SLC17A5 (ENSCPRG00005013278) EEF1A1 (ENSCPRG00005013272) ##22 MTO1 (ENSCPRG00005013270) CGAS (ENSCPRG00005013267) ENSCPRG00005013243 KCNQ5 (ENSCPRG00005013181) RIMS1 (ENSCPRG00005013117) ASRGL1 (ENSCPRG00005013097) OGFRL1 (ENSCPRG00005013089) ##35 B3GAT2 (ENSCPRG00005013079) SMAP1 (ENSCPRG00005013073) FAM135A (ENSCPRG00005013041) ENSCPRG00005013025 COL19A1 (ENSCPRG00005012933) LMBRD1 (ENSCPRG00005012884) ENSCPRG00005012855 ENSCPRG00005012844 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 57 GRHL3 (ENSCPRG00005016628) ENSCPRG00005016621 MYOM3 (ENSCPRG00005016575) ENSCPRG00005016562 SRSF10 (ENSCPRG00005016560) PNRC2 (ENSCPRG00005016555) CNR2 (ENSCPRG00005016552) FUCA1 (ENSCPRG00005016551) HMGCL (ENSCPRG00005016550) GALE (ENSCPRG00005016501) LYPLA2 (ENSCPRG00005016486) ENSCPRG00005016479 ENSCPRG00005016476 RPL11 (ENSCPRG00005016471) ENSCPRG00005016468 ENSCPRG00005016449 ##22 SLC17A4 (ENSCPRG00005016433) PPT1 (ENSCPRG00005016429) CAP1 (ENSCPRG00005016316) ENSCPRG00005016264 MYCL (ENSCPRG00005016254) TRIT1 (ENSCPRG00005016250) ENSCPRG00005016239 HPCAL4 (ENSCPRG00005016237) NT5C1A (ENSCPRG00005016235) HEYL (ENSCPRG00005016232) PABPC4 (ENSCPRG00005015886) ENSCPRG00005015789 ENSCPRG00005015777 ENSCPRG00005015669 ENSCPRG00005015582 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Theria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000171801 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT00970000198019 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182802.C ENSGT00950000183107.a.a ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00940000172381 ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.f ENSGT00940000154923.C ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.d ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Microbat MODERN SPECIES 996 ENSMLUG00000004916 IMPG1 (ENSMLUG00000015799) MYO6 (ENSMLUG00000015766) SENP6 (ENSMLUG00000013081) FILIP1 (ENSMLUG00000011941) TMEM30A (ENSMLUG00000011923) COL12A1 (ENSMLUG00000011832) CD109 (ENSMLUG00000014532) SLC17A5 (ENSMLUG00000001185) ENSMLUG00000013537 ##22 MTO1 (ENSMLUG00000013527) CGAS (ENSMLUG00000017605) ENSMLUG00000017604 ENSMLUG00000017174 ENSMLUG00000004469 DPPA5 (ENSMLUG00000004463) KCNQ5 (ENSMLUG00000016115) RIMS1 (ENSMLUG00000028614) OGFRL1 (ENSMLUG00000007329) ##35 ENSMLUG00000024923 B3GAT2 (ENSMLUG00000003429) SMAP1 (ENSMLUG00000003422) FAM135A (ENSMLUG00000011290) COL9A1 (ENSMLUG00000011234) COL19A1 (ENSMLUG00000011139) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.d ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 105 Tmsb4x (ENSJJAG00000010628) Tlr8 (ENSJJAG00000003676) Tlr7 (ENSJJAG00000021076) Prps2 (ENSJJAG00000003526) Frmpd4 (ENSJJAG00000017099) ENSJJAG00000000367 Msl3 (ENSJJAG00000007793) ENSJJAG00000004147 ENSJJAG00000003883 ##22 Amelx (ENSJJAG00000012298) ENSJJAG00000010681 Hccs (ENSJJAG00000009600) Mid1 (ENSJJAG00000008283) Clcn4 (ENSJJAG00000007035) ENSJJAG00000024054 ENSJJAG00000022822 ENSJJAG00000005358 ENSJJAG00000022358 Tab3 (ENSJJAG00000019643) ENSJJAG00000015331 Tasl (ENSJJAG00000014753) ENSJJAG00000014702 Nr0b1 (ENSJJAG00000022330) ENSJJAG00000020571 Tree shrew MODERN SPECIES 3394 ENSTBEG00000017170 ##22 Coelacanth DUPLICATION Coelacanth MODERN SPECIES 3695 ENSLACG00000002952 ##22 CGAS (ENSLACG00000001323) Coelacanth MODERN SPECIES 409 OSCP1 (ENSLACG00000011564) PABPC4 (ENSLACG00000011907) ENSLACG00000012215 ENSLACG00000012473 NT5C1A (ENSLACG00000012671) MFSD2A (ENSLACG00000012951) MYCL (ENSLACG00000013771) TRIT1 (ENSLACG00000013861) fam49al (ENSLACG00000014201) hpcal4 (ENSLACG00000014888) CAP1 (ENSLACG00000014998) PPT1 (ENSLACG00000015155) ENSLACG00000015216 eef1a1l1 (ENSLACG00000015342) ENSLACG00000015392 ##22 MACO1 (ENSLACG00000015510) ENSLACG00000015690 TMEM50A (ENSLACG00000015760) MAN1C1 (ENSLACG00000015845) ENSLACG00000016044 ENSLACG00000016086 SLC30A2 (ENSLACG00000016311) TRIM63 (ENSLACG00000016332) PDIK1L (ENSLACG00000016419) FAM110D (ENSLACG00000016477) CATSPER4 (ENSLACG00000016509) CNKSR1 (ENSLACG00000016549) C1orf232 (ENSLACG00000016679) PAFAH2 (ENSLACG00000016712) STMN1 (ENSLACG00000016788) ##15 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000006916.c ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b ENSGT00940000154866.B ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00390000006243 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Reedfish MODERN SPECIES 6 snx5 (ENSECRG00000018397) mgme1 (ENSECRG00000018384) OVOL2 (ENSECRG00000018367) MERTK (ENSECRG00000018329) TMEM87B (ENSECRG00000018241) ENSECRG00000018188 ZC3H6 (ENSECRG00000018147) ttl (ENSECRG00000018112) polr1b (ENSECRG00000018074) nanp (ENSECRG00000018058) ENSECRG00000018045 dtd1 (ENSECRG00000018026) SLC24A3 (ENSECRG00000017986) RIN2 (ENSECRG00000017944) SLC17A5 (ENSECRG00000017914) eef1a1a (ENSECRG00000017895) ##22 CGAS (ENSECRG00000017882) ddx43 (ENSECRG00000017694) KCNQ5 (ENSECRG00000017518) ENSECRG00000017473 ENSECRG00000017435 RIMS1 (ENSECRG00000017153) asrgl1 (ENSECRG00000017024) OGFRL1 (ENSECRG00000016996) ##35 b3gat2 (ENSECRG00000016981) smap1 (ENSECRG00000016957) SDHAF4 (ENSECRG00000016940) ENSECRG00000016915 fam135a (ENSECRG00000016823) ENSECRG00000016791 mtr (ENSECRG00000016740) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163878 ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000007529 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00910000147025 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00390000006916.c ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b ENSGT00940000154866.B ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 ENSGT00390000009155 ENSGT00390000006243 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 Spotted gar DUPLICATION Spotted gar MODERN SPECIES 654 SANBR (ENSLOCG00000016119) pex13 (ENSLOCG00000016122) pus10 (ENSLOCG00000016123) rel (ENSLOCG00000016127) papolg (ENSLOCG00000016130) bcl11aa (ENSLOCG00000016135) fancl (ENSLOCG00000016137) vrk2 (ENSLOCG00000016138) ccdc85a (ENSLOCG00000016142) ENSLOCG00000016143 sec23b (ENSLOCG00000016145) dtd1 (ENSLOCG00000016152) SLC24A3 (ENSLOCG00000016155) RIN2 (ENSLOCG00000016163) slc17a5 (ENSLOCG00000016166) eef1a1b (ENSLOCG00000016168) ##22 CGAS (ENSLOCG00000016169) ddx43 (ENSLOCG00000016170) KCNQ5 (ENSLOCG00000016173) RIMS1 (ENSLOCG00000016181) asrgl1 (ENSLOCG00000016189) eif3s6ip (ENSLOCG00000016195) SMOC2 (ENSLOCG00000016200) dact2 (ENSLOCG00000016207) ENSLOCG00000016209 TARBP1 (ENSLOCG00000016214) slc35f3a (ENSLOCG00000016220) kcnk1a (ENSLOCG00000016222) MAP3K4 (ENSLOCG00000016223) agpat4 (ENSLOCG00000016235) THBS2 (ENSLOCG00000016241) Spotted gar MODERN SPECIES 672 tekt2 (ENSLOCG00000000469) ago1 (ENSLOCG00000000504) ago4 (ENSLOCG00000000584) CLSPN (ENSLOCG00000000631) C1orf216 (ENSLOCG00000000664) psmb2 (ENSLOCG00000000700) tfap2e (ENSLOCG00000000725) NCDN (ENSLOCG00000000757) ENSLOCG00000000785 adprs (ENSLOCG00000000800) cap1 (ENSLOCG00000000820) ppt1 (ENSLOCG00000000848) ENSLOCG00000000882 ENSLOCG00000000907 ##22 ENSLOCG00000000926 rpl11 (ENSLOCG00000000953) ENSLOCG00000000972 eloa (ENSLOCG00000000997) pithd1 (ENSLOCG00000001023) lypla2 (ENSLOCG00000001047) sfpq (ENSLOCG00000001067) rnf19b (ENSLOCG00000001101) ak2 (ENSLOCG00000001124) ENSLOCG00000001148 ndufs5 (ENSLOCG00000001164) MACF1 (ENSLOCG00000001182) bmp8a (ENSLOCG00000001276) HCRTR1 (ENSLOCG00000001293) TINAGL1 (ENSLOCG00000001320) Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 201 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000158179.a ENSGT00390000010672 ENSGT00390000006618 ENSGT00940000162528 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b ENSGT00390000001134.a.b ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00940000157735 ENSGT00940000160127.h ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000154418.a.a.b Characiphysae DUPLICATION Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000162528 ENSGT00950000183009.eb ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b ENSGT00390000001134.a.b ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00940000157735 ENSGT00940000160127.h ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00950000183029.B.i.a.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00940000154418.a.a.b ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000159034 ENSGT00390000001742.a ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00940000158515 ENSGT00390000014031 ENSGT00940000159518.b ENSGT00940000164095.b ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000165158.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000158179.a ENSGT00390000010672 ENSGT00390000006618 ENSGT00940000162528 ENSGT00950000183009.eb ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b ENSGT00390000001134.a.b ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00940000157735 ENSGT00940000160127.h ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00950000183029.B.i.a.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00390000014380.h.b.a.b.b ENSGT00940000160378.kb.b.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000158179.a ENSGT00390000010672 ENSGT00940000162528 ENSGT00950000183009.eb ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b ENSGT00950000182999.b.b ENSGT00390000001134.a.b ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00940000157735 ENSGT00940000160127.h ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00950000183029.B.i.a.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00390000014380.h.b.a.b.b.d ENSGT00940000160378.kb.b.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 440 dlx2b (ENSPNAG00000010022) itga6b (ENSPNAG00000010003) ENSPNAG00000009941 eef1a1b (ENSPNAG00000009890) ##22 ENSPNAG00000009866 RIMS1 (ENSPNAG00000009762) cenpk (ENSPNAG00000009578) lbx1b (ENSPNAG00000009553) ENSPNAG00000009512 ENSPNAG00000009423 Mexicana tetra MODERN SPECIES 3 vps8 (ENSAMXG00000000612) si:dkey-22o12.2 (ENSAMXG00000033741) tmem41ab (ENSAMXG00000000591) igf2bp2b (ENSAMXG00000032347) TRA2B (ENSAMXG00000039469) gpr183b (ENSAMXG00000025031) ubac2 (ENSAMXG00000030024) dachc (ENSAMXG00000040839) mzt1 (ENSAMXG00000033399) bora (ENSAMXG00000000572) DIS3 (ENSAMXG00000000563) metap1d (ENSAMXG00000000558) dlx2b (ENSAMXG00000000552) itga6b (ENSAMXG00000000536) ENSAMXG00000034633 eef1a1b (ENSAMXG00000020651) ##22 ENSAMXG00000000507 RIMS1 (ENSAMXG00000000491) cenpk (ENSAMXG00000042770) lbx1b (ENSAMXG00000000484) ENSAMXG00000000481 ENSAMXG00000035498 get3 (ENSAMXG00000000478) BEST2 (ENSAMXG00000029576) fbxo48 (ENSAMXG00000031002) prokr1a (ENSAMXG00000000449) snrpb2 (ENSAMXG00000037263) rnaseh2a (ENSAMXG00000000436) ENSAMXG00000018995 junba (ENSAMXG00000025030) dand5 (ENSAMXG00000030931) Electric eel MODERN SPECIES 511 ENSEEEG00000005152 ENSEEEG00000005155 ENSEEEG00000005158 ubac2 (ENSEEEG00000005160) gpr183b (ENSEEEG00000005163) dachc (ENSEEEG00000005165) mzt1 (ENSEEEG00000005168) bora (ENSEEEG00000005169) DIS3 (ENSEEEG00000005181) metap1d (ENSEEEG00000005216) dlx2b (ENSEEEG00000005219) itga6b (ENSEEEG00000005240) ENSEEEG00000005483 eef1a1b (ENSEEEG00000005554) ##22 ENSEEEG00000006098 ENSEEEG00000006102 ENSEEEG00000006105 g3bp2b (ENSEEEG00000006111) CDKL2 (ENSEEEG00000006115) Channel catfish MODERN SPECIES 18 c26h3orf70 (ENSIPUG00000022035) vps8 (ENSIPUG00000022040) tmem41a (ENSIPUG00000022085) Igf2bp2 (ENSIPUG00000022106) TRA2B (ENSIPUG00000022183) UBAC2 (ENSIPUG00000022213) gpr183b (ENSIPUG00000022230) DACH1 (ENSIPUG00000022234) mzt1 (ENSIPUG00000022271) bora (ENSIPUG00000022284) dis3 (ENSIPUG00000022296) metap1d (ENSIPUG00000022323) dlx2b (ENSIPUG00000022337) itga6b (ENSIPUG00000022343) ENSIPUG00000022396 eef1a1b (ENSIPUG00000022421) ##22 ENSIPUG00000022429 RIMS1 (ENSIPUG00000022460) cenpk (ENSIPUG00000022610) lbx1b (ENSIPUG00000022616) ENSIPUG00000022620 ENSIPUG00000022629 ina (ENSIPUG00000022635) nt5c2b (ENSIPUG00000022637) CNNM2 (ENSIPUG00000022677) as3mt (ENSIPUG00000022683) ENSIPUG00000022695 wbp1lb (ENSIPUG00000022700) poll (ENSIPUG00000022704) dpcd (ENSIPUG00000022713) fgf8b (ENSIPUG00000022725) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007221.a.b ENSGT00390000000046 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r.c ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.i.a.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b Channel catfish MODERN SPECIES 22 pcbd1 (ENSIPUG00000021570) sgpl1 (ENSIPUG00000021596) ENSIPUG00000021615 Pdlim1 (ENSIPUG00000021620) rel (ENSIPUG00000021629) papolg (ENSIPUG00000021642) ENSIPUG00000021759 bcl11a (ENSIPUG00000021763) FANCL (ENSIPUG00000023295) vrk2 (ENSIPUG00000023328) ccdc85a (ENSIPUG00000023342) soul2 (ENSIPUG00000023353) slc24a3 (ENSIPUG00000023365) rin2 (ENSIPUG00000023376) SLC17A5 (ENSIPUG00000023388) EEF1A1 (ENSIPUG00000023399) ##22 CGAS (ENSIPUG00000023419) ddx43 (ENSIPUG00000023423) kcnq5 (ENSIPUG00000024247) rims1 (ENSIPUG00000024250) asrgl1 (ENSIPUG00000024269) OGFRL1 (ENSIPUG00000024273) ##35 B3GAT2 (ENSIPUG00000024274) smap1 (ENSIPUG00000024326) sdhaf4 (ENSIPUG00000024338) TLX1 (ENSIPUG00000024339) ENSIPUG00000024340 slc2a15a (ENSIPUG00000024343) fgf8a (ENSIPUG00000024347) fbxw4 (ENSIPUG00000024432) wbp1l (ENSIPUG00000024436) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000007221.a.b ENSGT00390000000046 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r.c ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.i.a.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b Electric eel MODERN SPECIES 227 slc38a11 (ENSEEEG00000017618) scn1laa (ENSEEEG00000017673) ENSEEEG00000018223 ttc21b (ENSEEEG00000018226) GALNT3 (ENSEEEG00000018328) CSRNP3 (ENSEEEG00000018616) ENSEEEG00000018618 ENSEEEG00000018620 ENSEEEG00000018621 ccdc85a (ENSEEEG00000018623) soul2 (ENSEEEG00000018624) ENSEEEG00000018625 SLC24A3 (ENSEEEG00000018627) RIN2 (ENSEEEG00000018629) slc17a5 (ENSEEEG00000018633) EEF1A1 (ENSEEEG00000018661) ##22 CGAS (ENSEEEG00000019056) ddx43 (ENSEEEG00000019059) ENSEEEG00000019061 RIMS1 (ENSEEEG00000019063) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007221.a.b ENSGT00390000000046 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r.c ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.i.a.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 10 fancl (ENSPNAG00000009246) vrk2 (ENSPNAG00000009224) ccdc85a (ENSPNAG00000009206) soul2 (ENSPNAG00000001305) SLC24A3 (ENSPNAG00000009179) ENSPNAG00000009148 RIN2 (ENSPNAG00000009141) slc17a5 (ENSPNAG00000009132) CGAS (ENSPNAG00000009093) EEF1A1 (ENSPNAG00000008912) ##22 ddx43 (ENSPNAG00000001232) KCNQ5 (ENSPNAG00000008878) RIMS1 (ENSPNAG00000001214) asrgl1 (ENSPNAG00000008660) OGFRL1 (ENSPNAG00000008651) ##35 b3gat2 (ENSPNAG00000001132) smap1 (ENSPNAG00000008623) SDHAF4 (ENSPNAG00000001114) tlx1 (ENSPNAG00000006029) ENSPNAG00000001103 slc2a15a (ENSPNAG00000008571) fgf8a (ENSPNAG00000008557) fbxw4 (ENSPNAG00000001068) wbp1la (ENSPNAG00000001064) cyp17a1 (ENSPNAG00000007027) Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 pcbd1 (ENSAMXG00000030052) sgpl1 (ENSAMXG00000004674) neurog3 (ENSAMXG00000040416) pdlim1 (ENSAMXG00000004659) rel (ENSAMXG00000042935) papolg (ENSAMXG00000004611) ENSAMXG00000029450 bcl11aa (ENSAMXG00000040355) fancl (ENSAMXG00000030243) vrk2 (ENSAMXG00000004559) ccdc85a (ENSAMXG00000038903) soul2 (ENSAMXG00000038941) SLC24A3 (ENSAMXG00000039529) RIN2 (ENSAMXG00000004501) slc17a5 (ENSAMXG00000004496) EEF1A1 (ENSAMXG00000004487) ##22 CGAS (ENSAMXG00000036028) ddx43 (ENSAMXG00000004457) KCNQ5 (ENSAMXG00000004427) RIMS1 (ENSAMXG00000011907) asrgl1 (ENSAMXG00000037416) OGFRL1 (ENSAMXG00000031531) ##35 b3gat2 (ENSAMXG00000039282) smap1 (ENSAMXG00000043334) SDHAF4 (ENSAMXG00000035767) tlx1 (ENSAMXG00000011990) ENSAMXG00000033957 slc2a15a (ENSAMXG00000012007) fgf8 (ENSAMXG00000034070) fbxw4 (ENSAMXG00000033937) wbp1la (ENSAMXG00000033725) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000158179.a ENSGT00390000010672 ENSGT00390000006618 ENSGT00940000162528 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b ENSGT00390000001134.a.b ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00940000157735 ENSGT00940000160127.h ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000154418.a.a.b ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 364 ENSGT00940000158179.a.a ENSGT00390000010672.e ENSGT00390000006618.n.a ENSGT00940000162528.j ENSGT00940000154913.cb.a ENSGT00950000182999.b.b.d ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000001134.a.b.b ENSGT00390000005954.ob ENSGT00390000013790.d ENSGT00530000063106.C.n ENSGT00940000157735.b ENSGT00940000160127.h.a ENSGT00940000155353.a.a.b.a ENSGT00940000164127.b.b ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b.a ENSGT00940000155134.z.a ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b.l.b ENSGT00940000164095.b Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES mtmr7b (ENSCARG00000008427) marchf4l (ENSCARG00000008443) vps8 (ENSCARG00000008535) si:dkey-22o12.2 (ENSCARG00000011301) tmem41ab (ENSCARG00000011306) igf2bp2b (ENSCARG00000011322) gpr183b (ENSCARG00000011381) gpr183b (ENSCARG00000011384) dachc (ENSCARG00000011391) ENSCARG00000011440 mzt1 (ENSCARG00000000109) bora (ENSCARG00000000114) dlx2b (ENSCARG00000000132) itga6b (ENSCARG00000000507) ENSCARG00000001149 eef1a1b (ENSCARG00000001165) ##22 ENSCARG00000001176 ENSCARG00000001201 RIMS1 (ENSCARG00000001479) lbx1b (ENSCARG00000002215) fgf8b (ENSCARG00000002229) wbp1lb (ENSCARG00000002263) CNNM2 (ENSCARG00000002274) nt5c2b (ENSCARG00000002368) inab (ENSCARG00000002533) anos1a (ENSCARG00000002539) ENSCARG00000002552 ENSCARG00000002561 pudp (ENSCARG00000002566) nlgn4xa (ENSCARG00000002582) phox2ba (ENSCARG00000002604) Goldfish MODERN SPECIES 18 marchf4l (ENSCARG00000035027) ENSCARG00000035048 si:dkey-22o12.2 (ENSCARG00000010166) tmem41ab (ENSCARG00000010169) igf2bp2b (ENSCARG00000010180) ubac2 (ENSCARG00000010203) gpr183b (ENSCARG00000010213) dachc (ENSCARG00000010228) mzt1 (ENSCARG00000010269) bora (ENSCARG00000010286) DIS3 (ENSCARG00000010336) metap1d (ENSCARG00000010489) dlx2b (ENSCARG00000010852) itga6b (ENSCARG00000010972) ENSCARG00000013154 eef1a1b (ENSCARG00000013192) ##22 ENSCARG00000013196 ENSCARG00000013212 RIMS1 (ENSCARG00000013343) cenpk (ENSCARG00000014485) lbx1b (ENSCARG00000014488) slc2a15b (ENSCARG00000014504) fgf8b (ENSCARG00000014627) dpcd (ENSCARG00000014642) poll (ENSCARG00000014649) wbp1lb (ENSCARG00000014665) ENSCARG00000014673 as3mt (ENSCARG00000014687) CNNM2 (ENSCARG00000014756) nt5c2b (ENSCARG00000014795) ENSCARG00000015019 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 256 ENSGT00940000158179.a.a ENSGT00390000010672.e ENSGT00390000006618.n.a ENSGT00940000162528.j ENSGT00940000154913.cb.a ENSGT00950000182999.b.b.d ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000001134.a.b.b ENSGT00390000005954.ob ENSGT00390000013790.d ENSGT00530000063106.C.n ENSGT00940000157735.b ENSGT00940000160127.h.a ENSGT00940000155353.a.a.b.a ENSGT00940000164127.b.b ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b.a ENSGT00940000155134.z.a ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b.l.b ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b.b ENSGT00390000014031.c ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.c ENSGT00390000001742.a.h ENSGT00940000159034.jb.a ENSGT00940000163289.b.a.a.b ENSGT00940000154418.a.a.b.e ENSGT00440000033720.a.a.b.b ENSGT00940000161153.k Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 27 marchf4l (ENSCCRG00000002694) vps8 (ENSCCRG00000063200) igf2bp2b (ENSCCRG00000029425) si:dkey-22o12.2 (ENSCCRG00000058112) tmem41ab (ENSCCRG00000067879) ubac2 (ENSCCRG00000019907) gpr183b (ENSCCRG00000063264) dachc (ENSCCRG00000032347) bora (ENSCCRG00000030093) mzt1 (ENSCCRG00000054748) ENSCCRG00000082299 metap1d (ENSCCRG00000067438) dlx2b (ENSCCRG00000015420) itga6b (ENSCCRG00000023620) ENSCCRG00000025690 eef1a1b (ENSCCRG00000068272) ##22 ENSCCRG00000060865 ENSCCRG00000074168 cenpk (ENSCCRG00000079032) lbx1b (ENSCCRG00000012953) slc2a15b (ENSCCRG00000032469) fgf8b (ENSCCRG00000036243) poll (ENSCCRG00000075739) dpcd (ENSCCRG00000036244) wbp1lb (ENSCCRG00000082236) as3mt (ENSCCRG00000068214) ENSCCRG00000047640 ENSCCRG00000068233 nt5c2b (ENSCCRG00000030371) inab (ENSCCRG00000012948) anos1a (ENSCCRG00000012925) Common carp reference MODERN SPECIES 22 marchf4l (ENSCCRG00000022199) vps8 (ENSCCRG00000067159) si:dkey-22o12.2 (ENSCCRG00000076466) tmem41ab (ENSCCRG00000055224) igf2bp2b (ENSCCRG00000032364) ubac2 (ENSCCRG00000032357) gpr183b (ENSCCRG00000032361) dachc (ENSCCRG00000080120) mzt1 (ENSCCRG00000075782) bora (ENSCCRG00000036868) DIS3 (ENSCCRG00000053402) metap1d (ENSCCRG00000054582) dlx2b (ENSCCRG00000062845) itga6b (ENSCCRG00000016674) ENSCCRG00000079997 eef1a1b (ENSCCRG00000032645) ##22 ENSCCRG00000077062 ENSCCRG00000070376 ENSCCRG00000012958 cenpk (ENSCCRG00000077695) lbx1b (ENSCCRG00000000446) fgf8b (ENSCCRG00000073156) dpcd (ENSCCRG00000000422) wbp1lb (ENSCCRG00000002551) ENSCCRG00000064278 ENSCCRG00000002508 nt5c2b (ENSCCRG00000058145) inab (ENSCCRG00000002487) anos1a (ENSCCRG00000033788) ENSCCRG00000066787 pudp (ENSCCRG00000037755) Golden-line barbel MODERN SPECIES 333 dachc (ENSSGRG00000031874) mzt1 (ENSSGRG00000031881) bora (ENSSGRG00000031883) metap1d (ENSSGRG00000031888) ENSSGRG00000031974 dlx2b (ENSSGRG00000031975) itga6b (ENSSGRG00000031995) eef1a1b (ENSSGRG00000032231) ##22 ENSSGRG00000033034 RIMS1 (ENSSGRG00000033037) cenpk (ENSSGRG00000033140) lbx1b (ENSSGRG00000033141) slc2a15b (ENSSGRG00000033142) fgf8b (ENSSGRG00000033143) dpcd (ENSSGRG00000033144) poll (ENSSGRG00000033145) poll (ENSSGRG00000033146) ENSSGRG00000033147 wbp1lb (ENSSGRG00000033149) as3mt (ENSSGRG00000033150) CNNM2 (ENSSGRG00000033152) nt5c2b (ENSSGRG00000033166) inab (ENSSGRG00000034984) Zebrafish MODERN SPECIES marchf4l (ENSDARG00000055839) vps8 (ENSDARG00000060477) C9H3orf70 (ENSDARG00000091513) tmem41ab (ENSDARG00000026771) igf2bp2b (ENSDARG00000099758) ubac2 (ENSDARG00000093065) gpr183b (ENSDARG00000074302) dachc (ENSDARG00000003142) mzt1 (ENSDARG00000096668) bora (ENSDARG00000042688) DIS3 (ENSDARG00000060559) metap1d (ENSDARG00000019715) dlx2b (ENSDARG00000017174) itga6b (ENSDARG00000069946) ENSDARG00000074575 eef1a1b (ENSDARG00000069951) ##22 ENSDARG00000069953 ENSDARG00000078902 cenpk (ENSDARG00000039616) lbx1b (ENSDARG00000018611) slc2a15b (ENSDARG00000053269) fgf8b (ENSDARG00000039615) dpcd (ENSDARG00000060501) poll (ENSDARG00000039613) wbp1lb (ENSDARG00000029751) as3mt (ENSDARG00000027572) CNNM2 (ENSDARG00000078733) nt5c2b (ENSDARG00000058231) inab (ENSDARG00000053248) anos1a (ENSDARG00000012896) ENSDARG00000100996 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 203 ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000154418.a.a.b ENSGT00940000153342.a ENSGT00940000166377.f ENSGT00390000012228 ENSGT00940000166025.a Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 13 ENSDCDG00000002423 CACNA1B (ENSDCDG00000003259) zgc:122979 (ENSDCDG00000030358) thbs4b (ENSDCDG00000030442) ENSDCDG00000032941 ENSDCDG00000032944 ENSDCDG00000032951 ENSDCDG00000032953 ENSDCDG00000032958 bcl11ab (ENSDCDG00000032959) ccdc85al (ENSDCDG00000032961) sec23b (ENSDCDG00000032982) dtd1 (ENSDCDG00000033332) SLC24A3 (ENSDCDG00000033338) RIN2 (ENSDCDG00000033343) eef1a1b (ENSDCDG00000033347) ##22 ENSDCDG00000033350 RIMS1 (ENSDCDG00000033416) cenpk (ENSDCDG00000034131) slc2a15b (ENSDCDG00000034132) fgf8b (ENSDCDG00000034133) dpcd (ENSDCDG00000034135) poll (ENSDCDG00000034136) wbp1lb (ENSDCDG00000034138) as3mt (ENSDCDG00000034141) CNNM2 (ENSDCDG00000034145) nt5c2b (ENSDCDG00000034168) inab (ENSDCDG00000034284) taf5 (ENSDCDG00000034292) atp5md (ENSDCDG00000034297) pdcd11 (ENSDCDG00000034303) Denticle herring MODERN SPECIES 18 SIRT1 (ENSDCDG00000033004) ENSDCDG00000033008 MYPN (ENSDCDG00000033014) atoh7 (ENSDCDG00000033029) PKD2L1 (ENSDCDG00000033032) tial1 (ENSDCDG00000033044) ENSDCDG00000033066 inpp5f (ENSDCDG00000033077) mcmbp (ENSDCDG00000033127) sec23ip (ENSDCDG00000033164) csgalnact2 (ENSDCDG00000033196) ecd (ENSDCDG00000033202) ENSDCDG00000033211 p4ha1b (ENSDCDG00000033225) slc17a5 (ENSDCDG00000033470) EEF1A1 (ENSDCDG00000033494) ##22 CGAS (ENSDCDG00000002934) ddx43 (ENSDCDG00000002965) KCNQ5 (ENSDCDG00000003148) RIMS1 (ENSDCDG00000003449) asrgl1 (ENSDCDG00000004365) OGFRL1 (ENSDCDG00000004374) ##35 ENSDCDG00000004467 ##35 asrgl1 (ENSDCDG00000004521) RIMS1 (ENSDCDG00000004537) ENSDCDG00000004599 ENSDCDG00000004601 ENSDCDG00000004604 tlx1 (ENSDCDG00000004607) lbx1b (ENSDCDG00000004608) slc2a15a (ENSDCDG00000004629) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00390000016883 ENSGT00940000158732.l ENSGT00940000156467.n ENSGT00940000156983.a.a.i ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.b ENSGT00940000170402 ENSGT00940000179750 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683 ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291.g ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT01050000244827.E.e.b ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a.b ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698.l.a ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.d Asian bonytongue MODERN SPECIES 19 EHBP1 (ENSSFOG00015011508) B3GNT2 (ENSSFOG00015024343) ENSSFOG00015011598 SANBR (ENSSFOG00015011799) pex13 (ENSSFOG00015026130) rel (ENSSFOG00015011855) papolg (ENSSFOG00015011874) bcl11aa (ENSSFOG00015026685) fancl (ENSSFOG00015011964) vrk2 (ENSSFOG00015011998) ENSSFOG00015012043 ENSSFOG00015030330 ENSSFOG00015012058 ENSSFOG00015029442 slc17a5 (ENSSFOG00015012119) EEF1A1 (ENSSFOG00015012136) ##22 CGAS (ENSSFOG00015012161) ddx43 (ENSSFOG00015012193) ENSSFOG00015003071 ENSSFOG00015012291 asrgl1 (ENSSFOG00015012313) OGFRL1 (ENSSFOG00015024337) ##35 b3gat2 (ENSSFOG00015028654) SDHAF4 (ENSSFOG00015030247) TLX1 (ENSSFOG00015026057) slc2a15a (ENSSFOG00015012364) fgf8a (ENSSFOG00015012408) fbxw4 (ENSSFOG00015012488) nt5c2a (ENSSFOG00015012548) calhm2.1 (ENSSFOG00015025842) CALHM1 (ENSSFOG00015012690) P. kingsleyae MODERN SPECIES 11 ENSPKIG00000003715 ENSPKIG00000003545 SANBR (ENSPKIG00000003437) pex13 (ENSPKIG00000003409) ENSPKIG00000003400 papolg (ENSPKIG00000003313) bcl11aa (ENSPKIG00000003260) fancl (ENSPKIG00000003202) ENSPKIG00000003162 ccdc85a (ENSPKIG00000003135) soul2 (ENSPKIG00000003106) SLC24A3 (ENSPKIG00000003070) ENSPKIG00000003049 RIN2 (ENSPKIG00000003022) slc17a5 (ENSPKIG00000002993) eef1a1b (ENSPKIG00000002973) ##22 ddx43 (ENSPKIG00000002941) ENSPKIG00000002858 RIMS1 (ENSPKIG00000002723) asrgl1 (ENSPKIG00000002669) OGFRL1 (ENSPKIG00000002645) ##35 b3gat2 (ENSPKIG00000002632) smap1 (ENSPKIG00000002589) tlx1 (ENSPKIG00000002563) ENSPKIG00000002553 slc2a15a (ENSPKIG00000002478) fgf8a (ENSPKIG00000002430) fbxw4 (ENSPKIG00000002375) WBP1L (ENSPKIG00000002346) cnnm2a (ENSPKIG00000002307) nt5c2a (ENSPKIG00000002181) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.b ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.b ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000153408.B.t ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.i.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b Otophysi ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000007221.a.b ENSGT00390000000046 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.i.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001491.b ENSGT00390000007221.a.b ENSGT00390000000046 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.i.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.b.a.a ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.b.a.a ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 68 fancl (ENSSGRG00000030677) vrk2 (ENSSGRG00000030675) ENSSGRG00000030672 ccdc85a (ENSSGRG00000030669) soul2 (ENSSGRG00000030668) SLC24A3 (ENSSGRG00000030529) RIN2 (ENSSGRG00000030524) slc17a5 (ENSSGRG00000030360) eef1a1a (ENSSGRG00000028572) ##22 CGAS (ENSSGRG00000028453) KCNQ5 (ENSSGRG00000028438) RIMS1 (ENSSGRG00000028430) asrgl1 (ENSSGRG00000028425) OGFRL1 (ENSSGRG00000028414) ##35 b3gat2 (ENSSGRG00000028412) smap1 (ENSSGRG00000028411) SDHAF4 (ENSSGRG00000028409) tlx1 (ENSSGRG00000028408) ENSSGRG00000028407 slc2a15a (ENSSGRG00000028377) fgf8a (ENSSGRG00000028374) fbxw4 (ENSSGRG00000028373) wbp1la (ENSSGRG00000028372) cyp17a1 (ENSSGRG00000028369) Goldfish MODERN SPECIES 4 ccsapb (ENSCARG00000011901) acta1b (ENSCARG00000011887) ABCB10 (ENSCARG00000011367) galnt2 (ENSCARG00000010699) pgbd5 (ENSCARG00000010662) cog2 (ENSCARG00000010383) agt (ENSCARG00000010368) ENSCARG00000010345 sf3b5 (ENSCARG00000010337) oprm1 (ENSCARG00000010320) ccdc85a (ENSCARG00000010312) soul2 (ENSCARG00000010302) SLC24A3 (ENSCARG00000010214) RIN2 (ENSCARG00000010192) slc17a5 (ENSCARG00000009751) eef1a1a (ENSCARG00000009726) ##22 CGAS (ENSCARG00000009722) KCNQ5 (ENSCARG00000009712) CALHM1 (ENSCARG00000009708) calhm2.1 (ENSCARG00000009704) ENSCARG00000009697 tial1 (ENSCARG00000009663) ENSCARG00000009660 ENSCARG00000009656 ENSCARG00000009651 csgalnact2 (ENSCARG00000009645) ret (ENSCARG00000009557) ENSCARG00000009538 pcbd1 (ENSCARG00000009520) sgpl1 (ENSCARG00000007537) neurog3 (ENSCARG00000007434) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.i.b.a.b ##22 Goldfish MODERN SPECIES 31 pcbd1 (ENSCARG00000016766) sgpl1 (ENSCARG00000014326) neurog3 (ENSCARG00000014257) pdlim1 (ENSCARG00000014247) rel (ENSCARG00000014236) papolg (ENSCARG00000013523) bcl11aa (ENSCARG00000013441) bag3 (ENSCARG00000013429) tial1 (ENSCARG00000013382) PKD2L1 (ENSCARG00000013302) atoh7 (ENSCARG00000013299) ENSCARG00000013295 SLC24A3 (ENSCARG00000013260) RIN2 (ENSCARG00000013236) slc17a5 (ENSCARG00000013199) eef1a1a (ENSCARG00000013182) ##22 CGAS (ENSCARG00000013172) ddx43 (ENSCARG00000013125) KCNQ5 (ENSCARG00000011671) RIMS1 (ENSCARG00000010768) asrgl1 (ENSCARG00000010677) inaa (ENSCARG00000010665) pcgf6 (ENSCARG00000010656) polr1c (ENSCARG00000010548) ldb1a (ENSCARG00000010138) ENSCARG00000010091 ENSCARG00000010073 nsmce4a (ENSCARG00000010063) ENSCARG00000010000 ly6pge (ENSCARG00000009982) si:dkey-18j18.3 (ENSCARG00000009978) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00390000000046.g ENSGT00940000163077.g ENSGT00940000155525.a ENSGT00940000158732.x ENSGT00940000156467.q ENSGT00940000156983.a.a.r.b ENSGT00390000005537.h ENSGT00940000158042.g ENSGT00940000157361.a.m.a ENSGT00940000160412.b.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a.d ENSGT00940000166291.b ENSGT00950000183029.B.i.b.b ##22 ENSGT01050000244827.E.g.a ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a.d ENSGT00940000155134.y.d ENSGT00950000183045.A.a.a.o ENSGT00390000018730.B.c.a ##35 ENSGT00940000159583.m ENSGT00940000155884.a.f ENSGT00390000009155.a ENSGT00940000158698.i ENSGT00940000164611.b.k.b ENSGT00940000164095.a.b ENSGT00940000159518.a.a ENSGT00390000005029.e ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000007221.a.b.r ENSGT00390000000046.g ENSGT00940000163077.g ENSGT00940000155525.a ENSGT00940000158732.x ENSGT00940000156467.q ENSGT00940000156983.a.a.r.b ENSGT00390000005537.h ENSGT00940000158042.g ENSGT00940000157361.a.m.a ENSGT00940000160412.b.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000154866.B.a.d ENSGT00940000166291.b ENSGT00950000183029.B.i.b.b ##22 ENSGT01050000244827.E.g.a ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a.d ENSGT00940000155134.y.d ENSGT00950000183045.A.a.a.o ENSGT00390000018730.B.c.a ##35 ENSGT00940000159583.m ENSGT00940000155884.a.f ENSGT00390000009155.a ENSGT00940000158698.i ENSGT00940000164611.b.k.b ENSGT00940000164095.a.b ENSGT00940000159518.a.a ENSGT00390000005029.e ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 48 pcbd1 (ENSCCRG00000061538) sgpl1 (ENSCCRG00000015634) pdlim1 (ENSCCRG00000030006) rel (ENSCCRG00000049637) papolg (ENSCCRG00000076360) bcl11aa (ENSCCRG00000064025) fancl (ENSCCRG00000032446) vrk2 (ENSCCRG00000032428) ccdc85a (ENSCCRG00000037099) ENSCCRG00000081103 ENSCCRG00000065246 soul2 (ENSCCRG00000037093) ENSCCRG00000080640 ENSCCRG00000081717 slc17a5 (ENSCCRG00000073356) eef1a1a (ENSCCRG00000072785) ##22 CGAS (ENSCCRG00000076509) ddx43 (ENSCCRG00000076256) KCNQ5 (ENSCCRG00000027387) RIMS1 (ENSCCRG00000002003) asrgl1 (ENSCCRG00000070456) OGFRL1 (ENSCCRG00000067169) ##35 b3gat2 (ENSCCRG00000058439) smap1 (ENSCCRG00000081017) SDHAF4 (ENSCCRG00000064793) tlx1 (ENSCCRG00000073948) ENSCCRG00000069064 slc2a15a (ENSCCRG00000015324) fgf8a (ENSCCRG00000010033) fbxw4 (ENSCCRG00000010031) wbp1la (ENSCCRG00000078206) Zebrafish MODERN SPECIES 4 si:dkey-192p21.6 (ENSDARG00000091212) pcbd1 (ENSDARG00000031981) sgpl1 (ENSDARG00000061375) neurog3 (ENSDARG00000016951) pdlim1 (ENSDARG00000019845) rel (ENSDARG00000055276) papolg (ENSDARG00000012141) bcl11aa (ENSDARG00000061352) fancl (ENSDARG00000007885) vrk2 (ENSDARG00000021547) ccdc85a (ENSDARG00000039497) soul2 (ENSDARG00000039499) SLC24A3 (ENSDARG00000006760) RIN2 (ENSDARG00000074589) slc17a5 (ENSDARG00000055190) eef1a1a (ENSDARG00000039502) ##22 CGAS (ENSDARG00000021572) ddx43 (ENSDARG00000022614) KCNQ5 (ENSDARG00000069954) RIMS1 (ENSDARG00000074680) asrgl1 (ENSDARG00000021681) ogfrl1 (ENSDARG00000061223) ##35 b3gat2 (ENSDARG00000030733) smap1 (ENSDARG00000031302) sdhaf4 (ENSDARG00000039390) tlx1 (ENSDARG00000003965) lbx1a (ENSDARG00000018321) slc2a15a (ENSDARG00000029894) fgf8a (ENSDARG00000003399) fbxw4 (ENSDARG00000033551) wbp1la (ENSDARG00000013245) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000178862 ENSGT00940000157824 ENSGT00940000153408.B ENSGT00940000158659 ENSGT00390000007529 ENSGT00940000158732.k ENSGT00940000156467.o ENSGT00940000156983.a.a.j ENSGT00910000147025 ENSGT00390000006916.c ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT00940000166291.h ENSGT00950000183029.B.i.b ##22 ENSGT01050000244827.E.e.a ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00940000155884.a.a ENSGT00390000006243 ENSGT00940000158698.l.b ENSGT00940000164611 ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 Asian bonytongue MODERN SPECIES 7 XPO1 (ENSSFOG00015001881) USP34 (ENSSFOG00015001953) pus10 (ENSSFOG00015002234) rel (ENSSFOG00015002336) papolg (ENSSFOG00015002383) ENSSFOG00015002513 bcl11aa (ENSSFOG00015031714) ENSSFOG00015002560 ccdc85al (ENSSFOG00015028476) sec23b (ENSSFOG00015002716) dtd1 (ENSSFOG00015002797) ENSSFOG00015002819 ENSSFOG00015002919 RIN2 (ENSSFOG00015002933) ENSSFOG00015002983 eef1a1a (ENSSFOG00015003033) ##22 CGAS (ENSSFOG00015003054) KCNQ5 (ENSSFOG00015031464) RIMS1 (ENSSFOG00015003186) b3gat2 (ENSSFOG00015003295) smap1 (ENSSFOG00015003315) cenpk (ENSSFOG00015003362) tlx1 (ENSSFOG00015030414) lbx1b (ENSSFOG00015003483) slc2a15b (ENSSFOG00015003512) fgf8b (ENSSFOG00015032385) dpcd (ENSSFOG00015003562) poll (ENSSFOG00015003586) wbp1lb (ENSSFOG00015003615) cyp17a1 (ENSSFOG00015003625) borcs7 (ENSSFOG00015003655) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00390000007529 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00910000147025 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.b ENSGT00940000170402 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683 ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611 ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063426.b.a ENSGT00940000164552 ENSGT00390000011115 ENSGT00390000008551 ENSGT00940000163648.b ENSGT00940000158729 ENSGT00390000012738 ENSGT00390000001867 ENSGT00640000091536 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00390000013601 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j ##22 ENSGT01050000244827.E.f ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000159550.g ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00390000003465.b.a ENSGT00940000160023 P. kingsleyae MODERN SPECIES 27 ENSPKIG00000022486 ENSPKIG00000022520 cdca8 (ENSPKIG00000022545) c19h1orf109 (ENSPKIG00000022562) ENSPKIG00000022578 ago4 (ENSPKIG00000022598) CLSPN (ENSPKIG00000022647) ENSPKIG00000022675 psmb2 (ENSPKIG00000022685) tfap2e (ENSPKIG00000022714) NCDN (ENSPKIG00000022739) ENSPKIG00000022762 cap1 (ENSPKIG00000022783) ppt1 (ENSPKIG00000022808) ENSPKIG00000022835 ENSPKIG00000022865 ##22 ENSPKIG00000022886 ENSPKIG00000022899 ENSPKIG00000022911 rpl11 (ENSPKIG00000022926) ENSPKIG00000022938 eloa (ENSPKIG00000022960) pithd1 (ENSPKIG00000022990) lypla2 (ENSPKIG00000023009) sfpq (ENSPKIG00000023035) ZMYM4 (ENSPKIG00000023057) ak2 (ENSPKIG00000023102) rnf19b (ENSPKIG00000023127) ndufs5 (ENSPKIG00000023159) MACF1 (ENSPKIG00000023210) bmp8a (ENSPKIG00000023298) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00910000147025 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.b ENSGT00940000170402 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a ENSGT00940000166683.b ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 248 ENSGT00940000155884.a.c ENSGT00940000159583 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00940000156983.a.b ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.b ENSGT00940000170402 ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.b ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000178131 ENSGT00940000161693 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00390000015299.a.b.b.b.c ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 6 ENTPD6 (ENSGMOG00000002346) ENSGMOG00000034012 ACSS1 (ENSGMOG00000017472) ENSGMOG00000000833 ENSGMOG00000031532 prph2b (ENSGMOG00000002745) pkdcca (ENSGMOG00000002754) EML4 (ENSGMOG00000009981) ENSGMOG00000029774 COX7A2L (ENSGMOG00000010003) KCNG3 (ENSGMOG00000036198) ENSGMOG00000016152 ENSGMOG00000032898 ENSGMOG00000002157 slc17a5 (ENSGMOG00000004216) eef1a1a (ENSGMOG00000004205) ##22 ddx43 (ENSGMOG00000004178) KCNQ5 (ENSGMOG00000011290) ENSGMOG00000004440 ENSGMOG00000036459 ENSGMOG00000004423 ENSGMOG00000034070 gins1 (ENSGMOG00000002295) ENSGMOG00000032535 ENSGMOG00000013109 elovl6b (ENSGMOG00000026947) ENSGMOG00000019319 ENSGMOG00000036720 ENSGMOG00000002675 glud1a (ENSGMOG00000012444) ENSGMOG00000013507 Cod MODERN SPECIES 14 nudcd1 (ENSGMOG00000013561) ENY2 (ENSGMOG00000030563) pkhd1l1.2 (ENSGMOG00000013579) gdf6b (ENSGMOG00000012100) ENSGMOG00000012097 ENSGMOG00000012090 ENSGMOG00000012063 ENSGMOG00000012054 ENSGMOG00000012040 slc9a1b (ENSGMOG00000012033) ENSGMOG00000012026 ENSGMOG00000012018 gja9b (ENSGMOG00000020571) mycbp (ENSGMOG00000037243) ENSGMOG00000012011 ENSGMOG00000012005 ##22 rpl11 (ENSGMOG00000011990) ENSGMOG00000011985 eloa (ENSGMOG00000011976) pithd1 (ENSGMOG00000011971) lypla2 (ENSGMOG00000011966) ENSGMOG00000011957 ENSGMOG00000011950 fabp4a (ENSGMOG00000011938) ENSGMOG00000006959 atxn1a (ENSGMOG00000029028) gmpr (ENSGMOG00000000402) mylipa (ENSGMOG00000001473) ENSGMOG00000026302 ENSGMOG00000004634 dtnbp1b (ENSGMOG00000015437) Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea DUPLICATION Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00990000206076 ENSGT00940000171885 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000171885 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00980000198902 ENSGT00940000156184.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00940000156696.B ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT00940000171885 ENSGT00990000204664 ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000164415 ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00980000198902 ENSGT00940000156184.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00940000156696.B ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT00990000204664.a ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263529.a.a.a.b.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000164415 ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 Nile tilapia MODERN SPECIES 18 slkb (ENSONIG00000008924) stn1 (ENSONIG00000008926) SH3PXD2A (ENSONIG00000008928) neurl1aa (ENSONIG00000008931) ENSONIG00000037720 ENSONIG00000008935 ENSONIG00000008941 ENSONIG00000022976 RPS6KB2 (ENSONIG00000008956) ENSONIG00000008963 ENSONIG00000042570 dtd1 (ENSONIG00000030547) SLC24A3 (ENSONIG00000008969) RIN2 (ENSONIG00000033297) ENSONIG00000008974 EEF1A1 (ENSONIG00000043142) ##22 ENSONIG00000008979 RIMS1 (ENSONIG00000008981) krt97 (ENSONIG00000008991) KRT222 (ENSONIG00000008997) ccr7 (ENSONIG00000030896) ENSONIG00000009004 IGFBP4 (ENSONIG00000009007) ENSONIG00000009010 ENSONIG00000009012 ENSONIG00000030899 ENSONIG00000028417 ENSONIG00000006724 ENSONIG00000032440 ENSONIG00000004179 ENSONIG00000029917 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000156184.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00940000156696.B ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT00990000204664.a ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263529.a.a.a.b.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000164415 ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 355 ENSNBRG00000016334 slkb (ENSNBRG00000016350) SH3PXD2A (ENSNBRG00000016394) neurl1aa (ENSNBRG00000016439) ENSNBRG00000016466 ENSNBRG00000016529 ENSNBRG00000016576 ENSNBRG00000016589 ENSNBRG00000016601 ENSNBRG00000016612 dtd1 (ENSNBRG00000016635) SLC24A3 (ENSNBRG00000016662) RIN2 (ENSNBRG00000016691) ENSNBRG00000016710 ENSNBRG00000016770 ##22 ENSNBRG00000016788 ##22 ENSNBRG00000016819 ENSNBRG00000016853 krt97 (ENSNBRG00000016868) KRT222 (ENSNBRG00000016891) ccr7 (ENSNBRG00000016910) ENSNBRG00000016920 ENSNBRG00000016940 IGFBP4 (ENSNBRG00000016951) ENSNBRG00000016974 MLLT6 (ENSNBRG00000017019) PCGF2 (ENSNBRG00000017053) PIP4K2B (ENSNBRG00000017074) psmb3 (ENSNBRG00000017100) ENSNBRG00000017108 sp6 (ENSNBRG00000017116) Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156184.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00940000156696.B ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT00990000204664.a ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00860000134050 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263529.a.a.a.b.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156184.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00940000156696.B ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT00990000204664.a ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00860000134050 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263529.a.a.a.b.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000156184.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00940000156696.B ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT00990000204664.a ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263529.a.a.a.b.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Eastern happy MODERN SPECIES 18 neurl1aa (ENSACLG00000006223) ENSACLG00000006272 ENSACLG00000006294 ENSACLG00000006413 ENSACLG00000006749 ENSACLG00000007497 ENSACLG00000007591 RPS6KB2 (ENSACLG00000007792) ENSACLG00000007825 ENSACLG00000007831 ENSACLG00000007869 dtd1 (ENSACLG00000007875) SLC24A3 (ENSACLG00000007881) RIN2 (ENSACLG00000007912) ENSACLG00000007923 EEF1A1 (ENSACLG00000007936) ##22 ENSACLG00000007969 ENSACLG00000008010 RIMS1 (ENSACLG00000008035) KRT222 (ENSACLG00000009030) krt97 (ENSACLG00000009073) TNS4 (ENSACLG00000009099) ccr7 (ENSACLG00000009137) SMARCE1 (ENSACLG00000009146) IGFBP4 (ENSACLG00000009214) ENSACLG00000009242 MLLT6 (ENSACLG00000009259) ENSACLG00000009306 ENSACLG00000009310 ENSACLG00000009316 PCGF2 (ENSACLG00000009320) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1109 slkb (ENSMZEG00005013258) stn1 (ENSMZEG00005013232) SH3PXD2A (ENSMZEG00005013142) neurl1aa (ENSMZEG00005013097) ENSMZEG00005013059 ENSMZEG00005013019 ENSMZEG00005013004 RPS6KB2 (ENSMZEG00005012978) ENSMZEG00005012931 ENSMZEG00005012913 dtd1 (ENSMZEG00005012906) SLC24A3 (ENSMZEG00005012883) RIN2 (ENSMZEG00005012875) ENSMZEG00005012864 ENSMZEG00005012852 EEF1A1 (ENSMZEG00005012825) ##22 ENSMZEG00005012772 RIMS1 (ENSMZEG00005012628) krt97 (ENSMZEG00005012578) KRT222 (ENSMZEG00005012564) ENSMZEG00005012559 ccr7 (ENSMZEG00005012551) ENSMZEG00005012542 IGFBP4 (ENSMZEG00005012532) ENSMZEG00005012520 ENSMZEG00005012493 ENSMZEG00005012487 ENSMZEG00005012482 ENSMZEG00005012474 PIP4K2B (ENSMZEG00005012456) psmb3 (ENSMZEG00005012437) P. nyererei MODERN SPECIES 466 ENSPNYG00000005052 ENSPNYG00000005082 ENSPNYG00000005158 RPS6KB2 (ENSPNYG00000005173) ENSPNYG00000005245 SMIM26 (ENSPNYG00000005283) ENSPNYG00000005292 dtd1 (ENSPNYG00000005312) SLC24A3 (ENSPNYG00000005329) RIN2 (ENSPNYG00000005375) ENSPNYG00000005450 EEF1A1 (ENSPNYG00000005593) ##22 ENSPNYG00000005614 RIMS1 (ENSPNYG00000005657) krt97 (ENSPNYG00000005805) KRT222 (ENSPNYG00000005823) TNS4 (ENSPNYG00000005850) ccr7 (ENSPNYG00000005879) SMARCE1 (ENSPNYG00000005893) IGFBP4 (ENSPNYG00000005940) ENSPNYG00000005951 ENSPNYG00000006003 ENSPNYG00000006048 PCGF2 (ENSPNYG00000006066) PIP4K2B (ENSPNYG00000006093) psmb3 (ENSPNYG00000006129) ENSPNYG00000006153 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 297 slkb (ENSHBUG00000001244) stn1 (ENSHBUG00000001245) SH3PXD2A (ENSHBUG00000001248) neurl1aa (ENSHBUG00000001254) ENSHBUG00000001262 ENSHBUG00000001272 ENSHBUG00000001275 RPS6KB2 (ENSHBUG00000001281) ENSHBUG00000001294 SMIM26 (ENSHBUG00000001299) ENSHBUG00000001301 dtd1 (ENSHBUG00000001306) SLC24A3 (ENSHBUG00000001307) RIN2 (ENSHBUG00000001311) ENSHBUG00000001317 EEF1A1 (ENSHBUG00000001322) ##22 ENSHBUG00000001329 RIMS1 (ENSHBUG00000001343) krt97 (ENSHBUG00000001352) KRT222 (ENSHBUG00000001354) ENSHBUG00000001355 ccr7 (ENSHBUG00000001358) ENSHBUG00000001362 IGFBP4 (ENSHBUG00000001367) ENSHBUG00000001369 MLLT6 (ENSHBUG00000001374) ENSHBUG00000001376 ENSHBUG00000001378 ENSHBUG00000001381 PIP4K2B (ENSHBUG00000001386) psmb3 (ENSHBUG00000001388) Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1111 ENSACIG00000005322 ENSACIG00000005361 ENSACIG00000005419 ENSACIG00000005422 RPS6KB2 (ENSACIG00000005433) ENSACIG00000005467 ENSACIG00000005499 dtd1 (ENSACIG00000005511) SLC24A3 (ENSACIG00000005525) RIN2 (ENSACIG00000005564) ENSACIG00000005593 ENSACIG00000005620 ##22 EEF1A1 (ENSACIG00000005630) ##22 ENSACIG00000005649 ENSACIG00000005680 Midas cichlid MODERN SPECIES 230 vip (ENSACIG00000011138) ANAPC1 (ENSACIG00000011160) ENSACIG00000011251 SLC16A12 (ENSACIG00000011260) ENSACIG00000011283 zgc:65997 (ENSACIG00000011311) nphp1 (ENSACIG00000011330) ENSACIG00000011449 malb (ENSACIG00000011521) mrps5 (ENSACIG00000011594) slc8a1b (ENSACIG00000011645) ENSACIG00000011677 MAP4K3 (ENSACIG00000011728) slc17a5 (ENSACIG00000011825) ENSACIG00000011849 EEF1A1 (ENSACIG00000011859) ##22 CGAS (ENSACIG00000011886) ddx43 (ENSACIG00000012170) KCNQ5 (ENSACIG00000012311) cnrip1b (ENSACIG00000012353) ppp3r1a (ENSACIG00000012385) pno1 (ENSACIG00000012543) dnaaf10 (ENSACIG00000012570) c1d (ENSACIG00000012684) ENSACIG00000012728 meis1b (ENSACIG00000012745) SPRED2 (ENSACIG00000012773) actr2a (ENSACIG00000012799) ENSACIG00000012820 lgalslb (ENSACIG00000012830) ENSACIG00000012854 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT00940000171885 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 377 neurl1aa (ENSSPAG00000015740) ENSSPAG00000015731 SH3PXD2A (ENSSPAG00000015676) stn1 (ENSSPAG00000015660) slkb (ENSSPAG00000015642) ENSSPAG00000015635 dtd1 (ENSSPAG00000015616) SLC24A3 (ENSSPAG00000015584) ENSSPAG00000015576 RIN2 (ENSSPAG00000015544) ENSSPAG00000015527 ENSSPAG00000015516 EEF1A1 (ENSSPAG00000015488) ##22 zgc:77739 (ENSSPAG00000015468) ENSSPAG00000015444 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT00940000171885 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT00940000171885 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000180729 ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000163886.A ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2362 ENSAOCG00000015072 RIN2 (ENSAOCG00000015092) ENSAOCG00000015139 EEF1A1 (ENSAOCG00000001055) ##22 angel2 (ENSAOCG00000015192) galnt14 (ENSAOCG00000015249) Orange clownfish MODERN SPECIES 17 ENSAPEG00000011971 ENSAPEG00000011983 ENSAPEG00000012014 ENSAPEG00000012156 ENSAPEG00000012255 neurl1aa (ENSAPEG00000012299) SH3PXD2A (ENSAPEG00000012345) stn1 (ENSAPEG00000012396) slkb (ENSAPEG00000012404) SMIM26 (ENSAPEG00000012413) dtd1 (ENSAPEG00000012431) SLC24A3 (ENSAPEG00000012473) RIN2 (ENSAPEG00000012498) ENSAPEG00000012510 ENSAPEG00000012536 EEF1A1 (ENSAPEG00000012561) ##22 ENSAPEG00000012663 RIMS1 (ENSAPEG00000012711) krt97 (ENSAPEG00000012866) ENSAPEG00000012880 ENSAPEG00000012886 ccr7 (ENSAPEG00000012901) ENSAPEG00000012911 ENSAPEG00000013014 IGFBP4 (ENSAPEG00000013038) ENSAPEG00000013045 ENSAPEG00000013073 ENSAPEG00000013077 PIP4K2B (ENSAPEG00000013098) PCGF2 (ENSAPEG00000013163) psmb3 (ENSAPEG00000013173) Spiny chromis MODERN SPECIES 156 RIN2 (ENSAPOG00000001288) ENSAPOG00000001294 EEF1A1 (ENSAPOG00000001301) ##22 ENSAPOG00000001313 RIMS1 (ENSAPOG00000001369) krt97 (ENSAPOG00000001393) ENSAPOG00000001409 TNS4 (ENSAPOG00000001417) ccr7 (ENSAPOG00000001424) SMARCE1 (ENSAPOG00000001434) IGFBP4 (ENSAPOG00000001441) ENSAPOG00000001448 ENSAPOG00000001457 ENSAPOG00000001460 ENSAPOG00000001464 PCGF2 (ENSAPOG00000001472) PIP4K2B (ENSAPOG00000001480) psmb3 (ENSAPOG00000001487) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000176858 ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000158153.a ENSGT00390000011055 ENSGT00940000166983.d ENSGT00940000154866.B.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 ENSGT00440000039055 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 297 IGKV2D-30 (ENSKMAG00000020435) ENSKMAG00000020421 ENSKMAG00000020409 GRIK5 (ENSKMAG00000020380) ENSKMAG00000020358 RPS6KB2 (ENSKMAG00000020276) ENSKMAG00000020240 ENSKMAG00000020233 RIN2 (ENSKMAG00000020173) EEF1A1 (ENSKMAG00000020147) ##22 Turquoise killifish MODERN SPECIES 112 ENSNFUG00015018479 RPS6KB2 (ENSNFUG00015018480) ENSNFUG00015018483 RIN2 (ENSNFUG00015018490) EEF1A1A (ENSNFUG00015018495) ##22 ENSNFUG00015018531 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007535 ENSGT00530000064170.c ENSGT00950000182991.B ENSGT00940000159801.A ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 ENSGT00390000017004.a.a ENSGT00950000183088.a.b.b ENSGT00390000005218 ENSGT00390000004446 ENSGT00930000150973.B.e.b ENSGT00940000155191.a.b ENSGT00940000166257 ENSGT00940000161510 ENSGT00940000158244 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182810.B.b.a.a ENSGT00390000007535 ENSGT00530000064170.c ENSGT00950000182991.B ENSGT00940000159801.A ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 ENSGT00390000017004.a.a ENSGT00950000183088.a.b.b ENSGT00390000005218 ENSGT00390000004446 ENSGT00930000150973.B.e.b ENSGT00940000161510.u ENSGT00940000155191.a.b ENSGT00940000158244 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182810.B.b.a.a ENSGT00390000007535 ENSGT00530000064170.c ENSGT00950000182991.B ENSGT00940000159801.A ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 ENSGT00390000017004.a.a ENSGT00950000183088.a.b.b ENSGT00390000005218 ENSGT00390000004446 ENSGT00930000150973.B.e.b ENSGT00940000178012 ENSGT00940000155191.a.b ENSGT00940000158244 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160120 ENSGT00950000182810.B.b.a.a ENSGT00390000007535 ENSGT00530000064170.c ENSGT00950000182991.B ENSGT00940000159801.A ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 ENSGT00390000017004.a.a ENSGT00950000183088.a.b.b ENSGT00390000005218 ENSGT00390000004446 ENSGT00930000150973.B.e.b ENSGT00940000155191.a.b ENSGT00940000158244 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a.g ENSGT00940000165589.a.h ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 Sailfin molly MODERN SPECIES 477 ENSPLAG00000005481 ENSPLAG00000005453 ENSPLAG00000005427 tbck (ENSPLAG00000005368) EEF1A1 (ENSPLAG00000005287) ##22 ENSPLAG00000005227 ENSPLAG00000004819 ENSPLAG00000004780 krt97 (ENSPLAG00000004767) KRT222 (ENSPLAG00000004746) TNS4 (ENSPLAG00000004726) ccr7 (ENSPLAG00000004701) SMARCE1 (ENSPLAG00000004694) IGFBP4 (ENSPLAG00000004670) ENSPLAG00000004644 ENSPLAG00000004615 ENSPLAG00000004599 ENSPLAG00000004592 PCGF2 (ENSPLAG00000004584) ENSPLAG00000004577 Amazon molly MODERN SPECIES 456 mtap (ENSPFOG00000011997) ENSPFOG00000012056 CXXC4 (ENSPFOG00000012064) TET2 (ENSPFOG00000021899) ppa2 (ENSPFOG00000012128) ARHGEF38 (ENSPFOG00000012342) CXXC4 (ENSPFOG00000012083) TET2 (ENSPFOG00000012090) ENSPFOG00000023399 ints12 (ENSPFOG00000012447) gstcd (ENSPFOG00000012468) npnta (ENSPFOG00000012587) ENSPFOG00000012681 ENSPFOG00000012877 tbck (ENSPFOG00000013036) EEF1A1 (ENSPFOG00000013175) ##22 ENSPFOG00000013215 RIMS1 (ENSPFOG00000013377) krt97 (ENSPFOG00000013514) ENSPFOG00000023545 TNS4 (ENSPFOG00000013685) ccr7 (ENSPFOG00000013716) SMARCE1 (ENSPFOG00000013726) IGFBP4 (ENSPFOG00000013793) ENSPFOG00000013807 ENSPFOG00000013855 ENSPFOG00000022447 Guppy MODERN SPECIES 439 lgi2b (ENSPREG00000004594) ENSPREG00000004582 mttp (ENSPREG00000004546) tspan5b (ENSPREG00000004513) ACER2 (ENSPREG00000004503) rps6 (ENSPREG00000004484) ENSPREG00000004472 ENSPREG00000004446 SMU1 (ENSPREG00000004424) dnaja1 (ENSPREG00000004402) aptx (ENSPREG00000004375) ENSPREG00000004361 sparcl1 (ENSPREG00000004346) ENSPREG00000004322 tbck (ENSPREG00000004214) EEF1A1 (ENSPREG00000004165) ##22 ENSPREG00000004085 ENSPREG00000004028 ENSPREG00000003965 krt97 (ENSPREG00000003948) KRT222 (ENSPREG00000003924) ENSPREG00000003902 ccr7 (ENSPREG00000003896) SMARCE1 (ENSPREG00000003882) IGFBP4 (ENSPREG00000003872) ENSPREG00000003847 MLLT6 (ENSPREG00000003817) ENSPREG00000003793 ENSPREG00000003771 PCGF2 (ENSPREG00000003765) PIP4K2B (ENSPREG00000003722) Platyfish MODERN SPECIES 19 MXD4 (ENSXMAG00000005473) ENSXMAG00000005463 ndufb6 (ENSXMAG00000005457) ENSXMAG00000025126 mtap (ENSXMAG00000005446) ENSXMAG00000005443 CXXC4 (ENSXMAG00000024047) TET2 (ENSXMAG00000005438) ppa2 (ENSXMAG00000005399) ARHGEF38 (ENSXMAG00000005387) ints12 (ENSXMAG00000029835) gstcd (ENSXMAG00000012151) npnta (ENSXMAG00000012135) ENSXMAG00000012085 tbck (ENSXMAG00000012060) EEF1A1 (ENSXMAG00000012048) ##22 ENSXMAG00000012035 RIMS1 (ENSXMAG00000018211) krt97 (ENSXMAG00000018197) KRT222 (ENSXMAG00000018192) TNS4 (ENSXMAG00000023115) ccr7 (ENSXMAG00000018191) SMARCE1 (ENSXMAG00000018179) IGFBP4 (ENSXMAG00000018176) ENSXMAG00000018173 ENSXMAG00000018158 ENSXMAG00000018157 ENSXMAG00000018154 ENSXMAG00000018149 PIP4K2B (ENSXMAG00000018124) psmb3 (ENSXMAG00000018120) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00950000182810.B.b.a.a ENSGT00390000007535 ENSGT00530000064170.c ENSGT00950000182991.B ENSGT00940000159801.A ENSGT00940000154108.b.a.a ENSGT00940000160003 ENSGT00390000017004.a.a ENSGT00950000183088.a.b.b ENSGT00390000005218 ENSGT00390000004446 ENSGT00930000150973.B.e.b ENSGT00940000155191.a.b ENSGT00940000161510.s ENSGT00940000158244 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000163886.A ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00390000004574 ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 Mummichog MODERN SPECIES 253 ALOX15B (ENSFHEG00000005383) ENSFHEG00000005358 ENSFHEG00000005346 EEF1A1 (ENSFHEG00000005331) ##22 ENSFHEG00000005302 RIMS1 (ENSFHEG00000005189) krt97 (ENSFHEG00000005039) KRT222 (ENSFHEG00000005026) ENSFHEG00000005008 ccr7 (ENSFHEG00000005005) ENSFHEG00000004997 IGFBP4 (ENSFHEG00000004962) ENSFHEG00000004944 MLLT6 (ENSFHEG00000004793) ENSFHEG00000004779 PCGF2 (ENSFHEG00000004771) psmb3 (ENSFHEG00000004761) cwc25 (ENSFHEG00000004754) sp6 (ENSFHEG00000004748) Sheepshead minnow DUPLICATION Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1514 ENSCVAG00000021385 EEF1A1 (ENSCVAG00000002957) ##22 ENSCVAG00000002982 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 689 toporsa (ENSCVAG00000021760) mtap (ENSCVAG00000021753) ENSCVAG00000000836 CXXC4 (ENSCVAG00000021723) TET2 (ENSCVAG00000021717) ppa2 (ENSCVAG00000021704) ARHGEF38 (ENSCVAG00000021675) ints12 (ENSCVAG00000021666) gstcd (ENSCVAG00000021643) npnta (ENSCVAG00000021581) ENSCVAG00000021488 ENSCVAG00000021468 tbck (ENSCVAG00000021423) EEF1A1 (ENSCVAG00000021241) ##22 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000164766 ENSGT00610000086518.a.eb ENSGT00610000086518.a.db.a.b ENSGT00940000155921 ENSGT00940000158394.f ENSGT00390000014082.a.a ENSGT00940000160678.b ENSGT00940000159934 ENSGT00940000159084 ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000166587 Chinese medaka MODERN SPECIES 794 EGR2 (ENSOSIG00000015659) adob (ENSOSIG00000015658) ENSOSIG00000015655 slc30a6 (ENSOSIG00000014727) sult6b1 (ENSOSIG00000014710) ENSOSIG00000014709 MAP4K3 (ENSOSIG00000009685) ENSOSIG00000009628 slc17a5 (ENSOSIG00000009625) eef1a1a (ENSOSIG00000009623) ##22 ENSOSIG00000009621 ddx43 (ENSOSIG00000009443) ENSOSIG00000009435 cnrip1b (ENSOSIG00000009432) ppp3r1a (ENSOSIG00000009392) pno1 (ENSOSIG00000009390) dnaaf10 (ENSOSIG00000009388) c1d (ENSOSIG00000009385) ENSOSIG00000009381 ENSOSIG00000009379 SPRED2 (ENSOSIG00000009377) actr2a (ENSOSIG00000009372) LGALSL (ENSOSIG00000009371) ENSOSIG00000009349 peli1b (ENSOSIG00000009346) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155062.a ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155062.a ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000166594 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT01030000237580 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000166594 ENSGT00940000155337.ab Turbot MODERN SPECIES 6 vip (ENSSMAG00000033181) ENSSMAG00000019782 ENSSMAG00000019747 ENSSMAG00000019790 ENSSMAG00000019724 zgc:65997 (ENSSMAG00000019711) nphp1 (ENSSMAG00000019664) ENSSMAG00000019652 malb (ENSSMAG00000022037) mrps5 (ENSSMAG00000019624) slc8a1b (ENSSMAG00000019611) ENSSMAG00000019604 ENSSMAG00000019378 ENSSMAG00000030081 slc17a5 (ENSSMAG00000019352) EEF1A1 (ENSSMAG00000019345) ##22 CGAS (ENSSMAG00000019315) ddx43 (ENSSMAG00000019288) KCNQ5 (ENSSMAG00000019274) cnrip1b (ENSSMAG00000019273) pno1 (ENSSMAG00000019252) dnaaf10 (ENSSMAG00000019245) C1D (ENSSMAG00000036865) ENSSMAG00000019217 MEIS1 (ENSSMAG00000019196) SPRED2 (ENSSMAG00000019178) actr2b (ENSSMAG00000019164) ENSSMAG00000032537 ctu2 (ENSSMAG00000019141) PIEZO1 (ENSSMAG00000019053) CDT1 (ENSSMAG00000019002) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Seriola ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163551.i.b ENSGT00520000055649.a ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Greater amberjack MODERN SPECIES 20 ENSSDUG00000005305 ENSSDUG00000005296 ENSSDUG00000005281 ENSSDUG00000005271 ENSSDUG00000005227 ENSSDUG00000005183 neurl1aa (ENSSDUG00000005144) SH3PXD2A (ENSSDUG00000005118) stn1 (ENSSDUG00000005081) slkb (ENSSDUG00000005052) SMIM26 (ENSSDUG00000005036) dtd1 (ENSSDUG00000005018) SLC24A3 (ENSSDUG00000004963) RIN2 (ENSSDUG00000004936) ENSSDUG00000004923 EEF1A1 (ENSSDUG00000004897) ##22 ENSSDUG00000004802 RIMS1 (ENSSDUG00000004667) krt97 (ENSSDUG00000004640) KRT222 (ENSSDUG00000004623) TNS4 (ENSSDUG00000004606) ccr7 (ENSSDUG00000004599) SMARCE1 (ENSSDUG00000004575) IGFBP4 (ENSSDUG00000004535) ENSSDUG00000004409 ENSSDUG00000004391 ENSSDUG00000004372 PCGF2 (ENSSDUG00000004355) PIP4K2B (ENSSDUG00000004328) psmb3 (ENSSDUG00000004313) cwc25 (ENSSDUG00000004302) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2917 EEF1A1 (ENSSLDG00000006378) ##22 ENSSLDG00000006336 RIMS1 (ENSSLDG00000006173) krt97 (ENSSLDG00000006134) ENSSLDG00000006101 TNS4 (ENSSLDG00000006086) ccr7 (ENSSLDG00000006071) SMARCE1 (ENSSLDG00000006022) IGFBP4 (ENSSLDG00000005980) ENSSLDG00000005941 ENSSLDG00000005895 ENSSLDG00000005874 PCGF2 (ENSSLDG00000005848) PIP4K2B (ENSSLDG00000005820) psmb3 (ENSSLDG00000005782) cwc25 (ENSSLDG00000005761) Barramundi perch MODERN SPECIES 78 ENSLCAG00010006868 neurl1aa (ENSLCAG00010007329) SH3PXD2A (ENSLCAG00010007345) stn1 (ENSLCAG00010007366) slkb (ENSLCAG00010007641) dtd1 (ENSLCAG00010008660) SLC24A3 (ENSLCAG00010008673) RIN2 (ENSLCAG00010008708) ENSLCAG00010008724 EEF1A1 (ENSLCAG00010008738) ##22 ENSLCAG00010008797 RIMS1 (ENSLCAG00010008990) krt97 (ENSLCAG00010009703) ENSLCAG00010009719 ENSLCAG00010009723 TNS4 (ENSLCAG00010009731) ccr7 (ENSLCAG00010009735) SMARCE1 (ENSLCAG00010009739) IGFBP4 (ENSLCAG00010009741) ENSLCAG00010009745 ENSLCAG00010009750 ENSLCAG00010009753 ENSLCAG00010009755 PCGF2 (ENSLCAG00010009756) PIP4K2B (ENSLCAG00010009836) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00980000201148 ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B.l ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Zig-zag eel MODERN SPECIES ENSMAMG00000003950 ENSMAMG00000004038 ENSMAMG00000004063 ENSMAMG00000004097 ENSMAMG00000004196 ENSMAMG00000004218 ENSMAMG00000004269 neurl1aa (ENSMAMG00000004358) SH3PXD2A (ENSMAMG00000004389) stn1 (ENSMAMG00000004419) SLK (ENSMAMG00000004440) SMIM26 (ENSMAMG00000004480) DTD1 (ENSMAMG00000028550) SLC24A3 (ENSMAMG00000004489) RIN2 (ENSMAMG00000004527) ENSMAMG00000007730 ##22 ENSMAMG00000004581 ENSMAMG00000004685 ENSMAMG00000004898 KRT222 (ENSMAMG00000004914) TNS4 (ENSMAMG00000004954) ENSMAMG00000004972 SMARCE1 (ENSMAMG00000004987) IGFBP4 (ENSMAMG00000024259) ENSMAMG00000005046 ENSMAMG00000005064 ENSMAMG00000005080 ENSMAMG00000005098 ENSMAMG00000027712 ENSMAMG00000027210 ENSMAMG00000005176 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00980000201148 ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B.k ENSGT00940000156696.B.l ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Climbing perch MODERN SPECIES ENSATEG00000002070 ENSATEG00000002017 ENSATEG00000002013 ENSATEG00000001890 ENSATEG00000001759 ENSATEG00000001724 neurl1aa (ENSATEG00000001684) SH3PXD2A (ENSATEG00000001601) stn1 (ENSATEG00000001592) SLK (ENSATEG00000001585) ENSATEG00000001557 DTD1 (ENSATEG00000029992) SLC24A3 (ENSATEG00000001443) RIN2 (ENSATEG00000001431) ENSATEG00000026801 ENSATEG00000001388 ##22 ENSATEG00000001300 ENSATEG00000001090 ENSATEG00000001074 ENSATEG00000001064 TNS4 (ENSATEG00000001057) ENSATEG00000001048 SMARCE1 (ENSATEG00000001011) IGFBP4 (ENSATEG00000029296) ENSATEG00000000975 ENSATEG00000026777 ENSATEG00000029246 ENSATEG00000027169 ENSATEG00000000924 ENSATEG00000000878 ENSATEG00000000850 Siamese fighting fish MODERN SPECIES RPS6KB2 (ENSBSLG00000024359) ENSBSLG00000024920 ENSBSLG00000024928 ENSBSLG00000024935 ENSBSLG00000005070 ENSBSLG00000007057 ENSBSLG00000009265 ENSBSLG00000009275 neurl1aa (ENSBSLG00000009287) SH3PXD2A (ENSBSLG00000009349) stn1 (ENSBSLG00000009367) slkb (ENSBSLG00000009441) dtd1 (ENSBSLG00000011467) SLC24A3 (ENSBSLG00000011681) RIN2 (ENSBSLG00000011909) ENSBSLG00000011966 ##22 ENSBSLG00000012166 RIMS1 (ENSBSLG00000012635) krt97 (ENSBSLG00000013055) ENSBSLG00000013096 TNS4 (ENSBSLG00000013135) ENSBSLG00000013189 SMARCE1 (ENSBSLG00000013234) IGFBP4 (ENSBSLG00000013496) ENSBSLG00000013529 ENSBSLG00000013536 ENSBSLG00000013548 ENSBSLG00000013577 PIP4K2B (ENSBSLG00000013638) cwc25 (ENSBSLG00000014179) psmb3 (ENSBSLG00000014211) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00940000168136 ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00940000168136 ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Ballan wrasse MODERN SPECIES 124 RPS6KB2 (ENSLBEG00000009739) ENSLBEG00000009717 ENSLBEG00000009708 ENSLBEG00000009573 ENSLBEG00000009449 neurl1aa (ENSLBEG00000009389) SH3PXD2A (ENSLBEG00000009293) stn1 (ENSLBEG00000009231) slkb (ENSLBEG00000009202) dtd1 (ENSLBEG00000009154) SLC24A3 (ENSLBEG00000009089) RIN2 (ENSLBEG00000009046) ENSLBEG00000008998 ENSLBEG00000008974 EEF1A1 (ENSLBEG00000008936) ##22 ENSLBEG00000008809 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00940000168136 ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155062.a ENSGT01030000234934.f ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 Channel bull blenny MODERN SPECIES ENSCGOG00000001213 ENSCGOG00000001186 RPS6KB2 (ENSCGOG00000001028) ENSCGOG00000001009 ENSCGOG00000001008 ENSCGOG00000000905 ENSCGOG00000000608 neurl1aa (ENSCGOG00000016424) SH3PXD2A (ENSCGOG00000016358) stn1 (ENSCGOG00000016351) slkb (ENSCGOG00000014887) ENSCGOG00000014863 SLC24A3 (ENSCGOG00000014741) RIN2 (ENSCGOG00000014735) ENSCGOG00000014734 EEF1A1 (ENSCGOG00000013916) ##22 ENSCGOG00000013545 RIMS1 (ENSCGOG00000012729) krt97 (ENSCGOG00000012511) KRT222 (ENSCGOG00000012489) ccr7 (ENSCGOG00000012485) ENSCGOG00000012385 IGFBP4 (ENSCGOG00000012381) ENSCGOG00000012379 MLLT6 (ENSCGOG00000012377) ENSCGOG00000012376 PCGF2 (ENSCGOG00000012372) psmb3 (ENSCGOG00000012333) PIP4K2B (ENSCGOG00000011168) cwc25 (ENSCGOG00000011122) sp6 (ENSCGOG00000011120) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157828 ENSGT00940000157174.c ENSGT00940000173544 ENSGT00950000183061.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00440000033329.a.a.b ENSGT00940000159796.a.a ENSGT00940000166345 ENSGT00940000159681 ENSGT00390000011766 ENSGT00390000001289.a ENSGT00940000160334 ENSGT00940000154336 ENSGT00390000003919 ENSGT00940000156950.b ENSGT01100000263495.A.a.a.n ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Lumpfish MODERN SPECIES spock3 (ENSCLMG00005007452) SLC44A1 (ENSCLMG00005007359) ENSCLMG00005007356 DLC1 (ENSCLMG00005007045) ENSCLMG00005007041 ENSCLMG00005007039 doc2d (ENSCLMG00005007038) serping1 (ENSCLMG00005006957) tmem134 (ENSCLMG00005006953) aip (ENSCLMG00005006952) cdk2ap2 (ENSCLMG00005006949) GPR83 (ENSCLMG00005006948) ankrd49 (ENSCLMG00005006946) GRIA2 (ENSCLMG00005006817) ENSCLMG00005006812 EEF1A1 (ENSCLMG00005006408) ##22 ENSCLMG00005005417 RIMS1 (ENSCLMG00005005411) krt97 (ENSCLMG00005005409) KRT222 (ENSCLMG00005005407) TNS4 (ENSCLMG00005005404) ccr7 (ENSCLMG00005005401) SMARCE1 (ENSCLMG00005005381) IGFBP4 (ENSCLMG00005005378) ENSCLMG00005005377 ENSCLMG00005005376 ENSCLMG00005005372 ENSCLMG00005005371 PCGF2 (ENSCLMG00005005370) PIP4K2B (ENSCLMG00005005265) psmb3 (ENSCLMG00005005260) Stickleback MODERN SPECIES 4 ugt8 (ENSGACG00000018024) spock3 (ENSGACG00000018028) SLC44A1 (ENSGACG00000018031) DLC1 (ENSGACG00000018034) LONRF1 (ENSGACG00000018037) ENSGACG00000018047 doc2d (ENSGACG00000018051) serping1 (ENSGACG00000018054) tmem134 (ENSGACG00000018056) aip (ENSGACG00000018060) cdk2ap2 (ENSGACG00000018065) GPR83 (ENSGACG00000018066) ankrd49 (ENSGACG00000018070) GRIA2 (ENSGACG00000018071) ENSGACG00000018088 eef1a1b (ENSGACG00000018090) ##22 ENSGACG00000018097 RIMS1 (ENSGACG00000018104) krt97 (ENSGACG00000018108) ENSGACG00000018109 KRT222 (ENSGACG00000018110) ENSGACG00000018111 ccr7 (ENSGACG00000018112) SMARCE1 (ENSGACG00000018114) IGFBP4 (ENSGACG00000018120) ENSGACG00000018123 ENSGACG00000018124 ENSGACG00000018126 ENSGACG00000018128 PIP4K2B (ENSGACG00000018135) psmb3 (ENSGACG00000018151) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00940000168136 ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 Gilthead seabream MODERN SPECIES ENSSAUG00010012937 slkb (ENSSAUG00010008906) stn1 (ENSSAUG00010008836) SH3PXD2A (ENSSAUG00010008689) neurl1aa (ENSSAUG00010008681) ENSSAUG00010008526 ENSSAUG00010008286 ENSSAUG00010008268 ENSSAUG00010008266 RPS6KB2 (ENSSAUG00010007075) ENSSAUG00010006872 ENSSAUG00010006857 dtd1 (ENSSAUG00010006855) SLC24A3 (ENSSAUG00010006850) RIN2 (ENSSAUG00010006846) EEF1A1 (ENSSAUG00010006843) ##22 ENSSAUG00010005554 RIMS1 (ENSSAUG00010001933) krt97 (ENSSAUG00010001794) KRT222 (ENSSAUG00010001784) TNS4 (ENSSAUG00010001774) ccr7 (ENSSAUG00010001767) SMARCE1 (ENSSAUG00010001477) IGFBP4 (ENSSAUG00010001470) ENSSAUG00010001464 ENSSAUG00010001460 ENSSAUG00010001451 PCGF2 (ENSSAUG00010001448) PIP4K2B (ENSSAUG00010001269) psmb3 (ENSSAUG00010001256) cwc25 (ENSSAUG00010001252) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01100000263568.b.a.c.b.a.b.h.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00940000163514.C ENSGT00980000198902 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000163886.A ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.a ENSGT00940000165589.b ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 ENSGT00440000039055 European seabass MODERN SPECIES 20 ENSDLAG00005029141 ENSDLAG00005030943 ENSDLAG00005014805 ENSDLAG00005014887 ENSDLAG00005006423 ENSDLAG00005003059 ENSDLAG00005014976 neurl1aa (ENSDLAG00005018019) ENSDLAG00005018046 SLK (ENSDLAG00005018450) ENSDLAG00005030620 DTD1 (ENSDLAG00005033950) SLC24A3 (ENSDLAG00005019787) RIN2 (ENSDLAG00005019840) ENSDLAG00005035020 ENSDLAG00005030833 ##22 ENSDLAG00005019909 ENSDLAG00005020105 ENSDLAG00005030630 ENSDLAG00005020535 ENSDLAG00005020540 ENSDLAG00005034319 ENSDLAG00005027046 ENSDLAG00005031104 ENSDLAG00005028105 ENSDLAG00005010978 ENSDLAG00005027787 ENSDLAG00005011020 ENSDLAG00005011694 ENSDLAG00005011712 ENSDLAG00005028937 Large yellow croaker MODERN SPECIES ENSLCRG00005008997 ENSLCRG00005007789 ENSLCRG00005007768 ENSLCRG00005005434 neurl1aa (ENSLCRG00005005390) SH3PXD2A (ENSLCRG00005005384) stn1 (ENSLCRG00005005380) slkb (ENSLCRG00005002201) ENSLCRG00005002151 ENSLCRG00005002149 SMIM26 (ENSLCRG00005002148) dtd1 (ENSLCRG00005002147) SLC24A3 (ENSLCRG00005002139) RIN2 (ENSLCRG00005002138) ENSLCRG00005002133 EEF1A1 (ENSLCRG00005001962) ##22 ENSLCRG00005001017 RIMS1 (ENSLCRG00005000583) krt97 (ENSLCRG00005000574) KRT222 (ENSLCRG00005000572) ENSLCRG00005000570 ccr7 (ENSLCRG00005000569) ENSLCRG00005000567 IGFBP4 (ENSLCRG00005000562) ENSLCRG00005000558 ENSLCRG00005000552 ENSLCRG00005000550 ENSLCRG00005000548 PCGF2 (ENSLCRG00005000539) PIP4K2B (ENSLCRG00005000406) psmb3 (ENSLCRG00005000367) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 363 ENSHCOG00000015184 ENSHCOG00000015156 ciao2b (ENSHCOG00000015153) lgalslb (ENSHCOG00000015138) ENSHCOG00000015117 peli1b (ENSHCOG00000015073) ugp2b (ENSHCOG00000015044) mdh1aa (ENSHCOG00000015008) WDPCP (ENSHCOG00000000697) otx1 (ENSHCOG00000014924) EHBP1 (ENSHCOG00000014911) b3gnt2b (ENSHCOG00000014754) slc17a5 (ENSHCOG00000014744) eef1a1b (ENSHCOG00000014718) ##22 ddx43 (ENSHCOG00000014704) KCNQ5 (ENSHCOG00000014664) cnrip1b (ENSHCOG00000000405) ENSHCOG00000014627 pno1 (ENSHCOG00000014618) dnaaf10 (ENSHCOG00000014596) c1d (ENSHCOG00000014589) c1d (ENSHCOG00000014568) meis1b (ENSHCOG00000014553) SPRED2 (ENSHCOG00000014521) actr2a (ENSHCOG00000014491) SLC16A12 (ENSHCOG00000014460) pank1a (ENSHCOG00000014434) zgc:65997 (ENSHCOG00000014407) nphp1 (ENSHCOG00000014383) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES atp5pd (ENSMMDG00005006055) ENSMMDG00005006052 caly (ENSMMDG00005006048) ENSMMDG00005006041 ENSMMDG00005006038 ENSMMDG00005005966 ENSMMDG00005004821 neurl1aa (ENSMMDG00005004771) SH3PXD2A (ENSMMDG00005004761) stn1 (ENSMMDG00005004753) slkb (ENSMMDG00005004745) dtd1 (ENSMMDG00005004739) SLC24A3 (ENSMMDG00005004709) RIN2 (ENSMMDG00005004678) ENSMMDG00005004661 ENSMMDG00005004464 ##22 ENSMMDG00005002966 RIMS1 (ENSMMDG00005002730) krt97 (ENSMMDG00005002686) KRT222 (ENSMMDG00005002657) ccr7 (ENSMMDG00005002640) ENSMMDG00005011107 IGFBP4 (ENSMMDG00005011101) ENSMMDG00005011097 ENSMMDG00005011094 ENSMMDG00005011089 ENSMMDG00005011086 PIP4K2B (ENSMMDG00005009013) psmb3 (ENSMMDG00005008971) cwc25 (ENSMMDG00005008969) sp6 (ENSMMDG00005008967) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00390000016757 ENSGT00940000178131 ENSGT00940000161693 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 6 hint1 (ENSMMDG00005013490) lyrm7 (ENSMMDG00005013487) dync2li1 (ENSMMDG00005013482) abcg5 (ENSMMDG00005013426) abcg8 (ENSMMDG00005013419) LRPPRC (ENSMMDG00005008898) znhit2 (ENSMMDG00005008808) ppm1ba (ENSMMDG00005008805) SLC3A1 (ENSMMDG00005008796) prepl (ENSMMDG00005008758) CAMKMT (ENSMMDG00005008750) six3a (ENSMMDG00005008748) six2a (ENSMMDG00005008747) SRBD1 (ENSMMDG00005007351) slc17a5 (ENSMMDG00005006581) EEF1A1 (ENSMMDG00005006490) ##22 CGAS (ENSMMDG00005006487) ddx43 (ENSMMDG00005006480) KCNQ5 (ENSMMDG00005005265) cnrip1b (ENSMMDG00005005245) pno1 (ENSMMDG00005005242) dnaaf10 (ENSMMDG00005005183) c1d (ENSMMDG00005005173) ENSMMDG00005005164 meis1b (ENSMMDG00005005050) SPRED2 (ENSMMDG00005005012) ACTR2 (ENSMMDG00005004705) ENSMMDG00005004671 ENSMMDG00005004660 lgalslb (ENSMMDG00005004651) ENSMMDG00005004598 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00940000162741 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000164807.G.a.a.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Orange clownfish MODERN SPECIES 12 ENSAPEG00000000536 ENSAPEG00000000568 ENSAPEG00000000621 pank1a (ENSAPEG00000000663) zgc:65997 (ENSAPEG00000000758) nphp1 (ENSAPEG00000000781) ENSAPEG00000000837 malb (ENSAPEG00000000848) mrps5 (ENSAPEG00000000853) slc8a1b (ENSAPEG00000000914) ENSAPEG00000000981 ENSAPEG00000000987 ENSAPEG00000000993 slc17a5 (ENSAPEG00000001012) ENSAPEG00000001056 EEF1A1 (ENSAPEG00000001072) ##22 CGAS (ENSAPEG00000001118) ddx43 (ENSAPEG00000001133) KCNQ5 (ENSAPEG00000001262) cnrip1b (ENSAPEG00000001341) ppp3r1a (ENSAPEG00000001356) pno1 (ENSAPEG00000001366) dnaaf10 (ENSAPEG00000001394) c1d (ENSAPEG00000001403) ENSAPEG00000001417 meis1b (ENSAPEG00000001438) SPRED2 (ENSAPEG00000001488) actr2a (ENSAPEG00000001530) ENSAPEG00000001578 ENSAPEG00000001612 lgalslb (ENSAPEG00000001619) Clown anemonefish MODERN SPECIES 3136 EEF1A1 (ENSAOCG00000012886) ##22 ENSAOCG00000012856 Spiny chromis MODERN SPECIES 332 ENSAPOG00000002005 ENSAPOG00000001996 ENSAPOG00000001989 ENSAPOG00000001961 ENSAPOG00000001910 ENSAPOG00000001802 ENSAPOG00000001783 slc17a5 (ENSAPOG00000000033) EEF1A1 (ENSAPOG00000001743) ##22 ddx43 (ENSAPOG00000001712) KCNQ5 (ENSAPOG00000001680) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2049 EEF1A1 (ENSSPAG00000007007) ##22 CGAS (ENSSPAG00000006992) ddx43 (ENSSPAG00000006858) KCNQ5 (ENSSPAG00000006804) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 4 ENSONIG00000041495 SLC16A12 (ENSONIG00000029210) pank1a (ENSONIG00000001137) zgc:65997 (ENSONIG00000001142) nphp1 (ENSONIG00000029772) ENSONIG00000001144 malb (ENSONIG00000034164) mrps5 (ENSONIG00000001150) slc8a1b (ENSONIG00000001153) ENSONIG00000001165 MAP4K3 (ENSONIG00000001166) ENSONIG00000001180 slc17a5 (ENSONIG00000001181) EEF1A1 (ENSONIG00000041189) ##22 ddx43 (ENSONIG00000040886) EEF1A1 (ENSONIG00000035707) ##22 CGAS (ENSONIG00000040980) ddx43 (ENSONIG00000001195) KCNQ5 (ENSONIG00000001209) cnrip1b (ENSONIG00000001213) pno1 (ENSONIG00000001223) dnaaf10 (ENSONIG00000001214) c1d (ENSONIG00000001233) ENSONIG00000036908 meis1b (ENSONIG00000001236) SPRED2 (ENSONIG00000029966) actr2a (ENSONIG00000001245) ENSONIG00000039063 ENSONIG00000030341 lgalslb (ENSONIG00000001248) ENSONIG00000008025 Nile tilapia MODERN SPECIES 4 ANAPC1 (ENSONIG00000001115) ENSONIG00000028050 ENSONIG00000041495 SLC16A12 (ENSONIG00000029210) pank1a (ENSONIG00000001137) zgc:65997 (ENSONIG00000001142) nphp1 (ENSONIG00000029772) ENSONIG00000001144 malb (ENSONIG00000034164) mrps5 (ENSONIG00000001150) slc8a1b (ENSONIG00000001153) ENSONIG00000001165 MAP4K3 (ENSONIG00000001166) ENSONIG00000001180 slc17a5 (ENSONIG00000001181) EEF1A1 (ENSONIG00000041189) ##22 ddx43 (ENSONIG00000040886) EEF1A1 (ENSONIG00000035707) ##22 CGAS (ENSONIG00000040980) ddx43 (ENSONIG00000001195) KCNQ5 (ENSONIG00000001209) cnrip1b (ENSONIG00000001213) pno1 (ENSONIG00000001223) dnaaf10 (ENSONIG00000001214) c1d (ENSONIG00000001233) ENSONIG00000036908 meis1b (ENSONIG00000001236) SPRED2 (ENSONIG00000029966) actr2a (ENSONIG00000001245) ENSONIG00000039063 ENSONIG00000030341 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 798 ENSHBUG00000011799 ENSHBUG00000011780 MAP4K3 (ENSHBUG00000011769) slc17a5 (ENSHBUG00000011726) EEF1A1 (ENSHBUG00000011690) ##22 CGAS (ENSHBUG00000011681) ddx43 (ENSHBUG00000011653) KCNQ5 (ENSHBUG00000011634) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 P. nyererei MODERN SPECIES 349 ANAPC1 (ENSPNYG00000010088) ENSPNYG00000010061 SLC16A12 (ENSPNYG00000010039) ENSPNYG00000010026 pank1a (ENSPNYG00000009983) zgc:65997 (ENSPNYG00000009968) nphp1 (ENSPNYG00000009923) ENSPNYG00000009894 malb (ENSPNYG00000009877) mrps5 (ENSPNYG00000009861) slc8a1b (ENSPNYG00000009830) ENSPNYG00000009804 MAP4K3 (ENSPNYG00000009592) slc17a5 (ENSPNYG00000009447) EEF1A1 (ENSPNYG00000009404) ##22 CGAS (ENSPNYG00000009164) ddx43 (ENSPNYG00000009064) KCNQ5 (ENSPNYG00000009016) cnrip1b (ENSPNYG00000008998) ppp3r1a (ENSPNYG00000008986) pno1 (ENSPNYG00000008942) dnaaf10 (ENSPNYG00000008828) c1d (ENSPNYG00000008789) ENSPNYG00000008771 ENSPNYG00000008745 meis1b (ENSPNYG00000008708) SPRED2 (ENSPNYG00000008682) actr2a (ENSPNYG00000008624) ENSPNYG00000008600 lgalslb (ENSPNYG00000008578) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1095 ENSMZEG00005027366 cfap36 (ENSMZEG00005027365) ppp4r3b (ENSMZEG00005027364) PNPT1 (ENSMZEG00005027363) CCDC88A (ENSMZEG00005027362) ENSMZEG00005027361 ENSMZEG00005027360 ENSMZEG00005027359 SYNPO2L (ENSMZEG00005027358) MYOZ1 (ENSMZEG00005027357) hhat (ENSMZEG00005027356) slc8a1b (ENSMZEG00005027355) ENSMZEG00005027354 MAP4K3 (ENSMZEG00005027353) slc17a5 (ENSMZEG00005027352) EEF1A1 (ENSMZEG00005027351) ##22 CGAS (ENSMZEG00005027350) ddx43 (ENSMZEG00005027349) KCNQ5 (ENSMZEG00005027348) cnrip1b (ENSMZEG00005027347) ppp3r1a (ENSMZEG00005027346) pno1 (ENSMZEG00005027345) dnaaf10 (ENSMZEG00005027344) c1d (ENSMZEG00005027343) ENSMZEG00005027342 meis1b (ENSMZEG00005027341) SPRED2 (ENSMZEG00005027339) actr2a (ENSMZEG00005027338) ENSMZEG00005027337 lgalslb (ENSMZEG00005027336) ENSMZEG00005027335 Eastern happy MODERN SPECIES 4 fbxo5 (ENSACLG00000025555) vip (ENSACLG00000025564) ANAPC1 (ENSACLG00000025580) SLC16A12 (ENSACLG00000025645) pank1a (ENSACLG00000025674) zgc:65997 (ENSACLG00000025686) nphp1 (ENSACLG00000025700) ENSACLG00000025741 malb (ENSACLG00000025748) mrps5 (ENSACLG00000025759) slc8a1b (ENSACLG00000025808) ENSACLG00000025840 MAP4K3 (ENSACLG00000025938) ENSACLG00000026002 slc17a5 (ENSACLG00000026026) EEF1A1 (ENSACLG00000026047) ##22 CGAS (ENSACLG00000026073) ddx43 (ENSACLG00000026081) KCNQ5 (ENSACLG00000026094) cnrip1b (ENSACLG00000026147) ppp3r1a (ENSACLG00000026154) pno1 (ENSACLG00000026167) dnaaf10 (ENSACLG00000026190) c1d (ENSACLG00000026206) ENSACLG00000026219 meis1b (ENSACLG00000026249) SPRED2 (ENSACLG00000026311) actr2a (ENSACLG00000026334) ENSACLG00000026357 lgalslb (ENSACLG00000026386) ENSACLG00000026411 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 295 ENSNBRG00000011985 MTRF1L (ENSNBRG00000011974) fbxo5 (ENSNBRG00000011953) ANAPC1 (ENSNBRG00000011846) SLC16A12 (ENSNBRG00000011828) pank1a (ENSNBRG00000011795) zgc:65997 (ENSNBRG00000011774) nphp1 (ENSNBRG00000011708) ENSNBRG00000011676 malb (ENSNBRG00000011605) mrps5 (ENSNBRG00000011584) slc8a1b (ENSNBRG00000011545) ENSNBRG00000011526 MAP4K3 (ENSNBRG00000011204) slc17a5 (ENSNBRG00000011078) ENSNBRG00000011060 ##22 ENSNBRG00000011042 ddx43 (ENSNBRG00000010942) ENSNBRG00000010894 cnrip1b (ENSNBRG00000010873) ppp3r1a (ENSNBRG00000010865) pno1 (ENSNBRG00000010839) dnaaf10 (ENSNBRG00000010737) c1d (ENSNBRG00000010704) ENSNBRG00000010688 meis1b (ENSNBRG00000010657) SPRED2 (ENSNBRG00000010593) actr2a (ENSNBRG00000010551) ENSNBRG00000010532 lgalslb (ENSNBRG00000010508) ENSNBRG00000010455 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000164807.G.a.a.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063713.a ENSGT00800000124060.A.b ENSGT00940000156410.h ENSGT00940000164766 ENSGT00610000086518.a ENSGT00940000155921 ENSGT00940000158394.f ENSGT00390000014082.a.a ENSGT00940000160678.b ENSGT00940000159934 ENSGT00940000159084 ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000166587 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063713.a ENSGT00800000124060.A.b ENSGT00940000156410.h ENSGT00940000164766 ENSGT00610000086518.a ENSGT00940000155921 ENSGT00940000158394.f ENSGT00390000014082.a.a ENSGT00940000160678.b ENSGT00940000159934 ENSGT00940000159084 ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00940000161907 ENSGT00940000161552 ENSGT00940000156782.c ENSGT00720000108792.A ENSGT00940000162185 ENSGT00940000157051 ENSGT00940000165086.b ENSGT00940000155493 Indian medaka MODERN SPECIES 27 ENSOMEG00000001143 cyp26c1 (ENSOMEG00000001140) ENSOMEG00000001135 slc22a15 (ENSOMEG00000001131) ENSOMEG00000001130 kif11 (ENSOMEG00000001128) EGR2 (ENSOMEG00000001126) adob (ENSOMEG00000001124) ENSOMEG00000023624 slc30a6 (ENSOMEG00000023610) sult6b1 (ENSOMEG00000023568) ENSOMEG00000023563 MAP4K3 (ENSOMEG00000023528) ENSOMEG00000023502 slc17a5 (ENSOMEG00000023471) eef1a1b (ENSOMEG00000023456) ##22 CGAS (ENSOMEG00000023427) ddx43 (ENSOMEG00000023418) KCNQ5 (ENSOMEG00000023390) cnrip1b (ENSOMEG00000023337) ppp3r1a (ENSOMEG00000023323) pno1 (ENSOMEG00000023300) dnaaf10 (ENSOMEG00000023287) ttl (ENSOMEG00000023276) fignl1 (ENSOMEG00000023258) ikzf1 (ENSOMEG00000023255) ENSOMEG00000023245 SPRED2 (ENSOMEG00000023237) actr2a (ENSOMEG00000023221) lgalslb (ENSOMEG00000023198) ENSOMEG00000023188 Javanese ricefish MODERN SPECIES 6 ENSOJAG00000014414 ENSOJAG00000014452 cyp26c1 (ENSOJAG00000014459) ENSOJAG00000014490 slc22a15 (ENSOJAG00000015012) ENSOJAG00000015136 ENSOJAG00000015155 ENSOJAG00000015166 ENSOJAG00000015199 ENSOJAG00000015221 slc30a6 (ENSOJAG00000015258) sult6b1 (ENSOJAG00000015564) ENSOJAG00000015574 MAP4K3 (ENSOJAG00000015852) ENSOJAG00000018267 eef1a1b (ENSOJAG00000018399) ##22 ENSOJAG00000018490 ddx43 (ENSOJAG00000018507) KCNQ5 (ENSOJAG00000018681) cnrip1b (ENSOJAG00000018812) dnaaf10 (ENSOJAG00000018831) pno1 (ENSOJAG00000019001) ttl (ENSOJAG00000019060) fignl1 (ENSOJAG00000019074) ikzf1 (ENSOJAG00000019082) vwc2 (ENSOJAG00000019149) zgc:110045 (ENSOJAG00000019155) si:ch211-117n7.7 (ENSOJAG00000019281) tm9sf3 (ENSOJAG00000019377) prdx3 (ENSOJAG00000019576) sfxn4 (ENSOJAG00000019603) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00800000124060.A.b ENSGT00940000156410.h ENSGT00940000164766 ENSGT00610000086518.a.eb ENSGT00610000086518.a.db.a.b ENSGT00940000155921 ENSGT00940000158394.f ENSGT00390000014082.a.a ENSGT00940000160678.b ENSGT00940000159934 ENSGT00940000159084 ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000155337.ab Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 ENSORLG00000028450 ENSORLG00000028733 ENSORLG00000027958 kif11 (ENSORLG00000002076) ENSORLG00000027769 adob (ENSORLG00000027492) ENSORLG00000002088 ENSORLG00000027098 ENSORLG00000026999 slc30a6 (ENSORLG00000002108) sult6b1 (ENSORLG00000022898) ENSORLG00000002138 MAP4K3 (ENSORLG00000002196) ENSORLG00000026157 slc17a5 (ENSORLG00000002237) eef1a1a (ENSORLG00000002258) ##22 ENSORLG00000021960 ddx43 (ENSORLG00000002267) KCNQ5 (ENSORLG00000002279) cnrip1b (ENSORLG00000025748) ppp3r1a (ENSORLG00000002343) pno1 (ENSORLG00000002371) dnaaf10 (ENSORLG00000030098) c1d (ENSORLG00000021968) ENSORLG00000030003 ENSORLG00000026767 ENSORLG00000023223 meis1b (ENSORLG00000002411) SPRED2 (ENSORLG00000002435) actr2a (ENSORLG00000002451) lgalslb (ENSORLG00000028938) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000164807.G.a.a.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l.q ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000164807.G.a.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291.d ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l.q ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000164807.G.a.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291.d ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00660000097267 ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l.r Sailfin molly MODERN SPECIES 2373 slc17a5 (ENSPLAG00000022865) EEF1A1 (ENSPLAG00000022915) ##22 CGAS (ENSPLAG00000023335) ddx43 (ENSPLAG00000023362) KCNQ5 (ENSPLAG00000023411) Amazon molly MODERN SPECIES 292 ANAPC1 (ENSPFOG00000007648) SLC16A12 (ENSPFOG00000007489) pank1a (ENSPFOG00000007398) zgc:65997 (ENSPFOG00000007367) nphp1 (ENSPFOG00000006938) ENSPFOG00000006916 malb (ENSPFOG00000006896) mrps5 (ENSPFOG00000006753) slc8a1b (ENSPFOG00000006514) ENSPFOG00000023250 ENSPFOG00000006461 MAP4K3 (ENSPFOG00000005304) ENSPFOG00000005124 ENSPFOG00000005109 slc17a5 (ENSPFOG00000004867) EEF1A1 (ENSPFOG00000004725) ##22 CGAS (ENSPFOG00000004678) ddx43 (ENSPFOG00000004241) KCNQ5 (ENSPFOG00000003981) cnrip1b (ENSPFOG00000023191) pno1 (ENSPFOG00000003843) ppp3r1a (ENSPFOG00000003706) ENSPFOG00000021698 c1d (ENSPFOG00000003686) ENSPFOG00000003680 meis1b (ENSPFOG00000003364) Guppy MODERN SPECIES 445 vip (ENSPREG00000002280) ANAPC1 (ENSPREG00000002130) ENSPREG00000002100 SLC16A12 (ENSPREG00000002055) pank1a (ENSPREG00000002008) zgc:65997 (ENSPREG00000001977) nphp1 (ENSPREG00000001951) ENSPREG00000001842 malb (ENSPREG00000001744) mrps5 (ENSPREG00000001722) slc8a1b (ENSPREG00000001659) ENSPREG00000001603 MAP4K3 (ENSPREG00000001518) ENSPREG00000001493 slc17a5 (ENSPREG00000001453) EEF1A1 (ENSPREG00000001416) ##22 CGAS (ENSPREG00000001034) ddx43 (ENSPREG00000000923) KCNQ5 (ENSPREG00000000873) cnrip1b (ENSPREG00000000842) ppp3r1a (ENSPREG00000000832) pno1 (ENSPREG00000000793) dnaaf10 (ENSPREG00000000779) c1d (ENSPREG00000000742) ENSPREG00000000726 meis1b (ENSPREG00000000691) SPRED2 (ENSPREG00000000651) actr2a (ENSPREG00000000566) ENSPREG00000021487 ENSPREG00000021483 lgalslb (ENSPREG00000021476) Platyfish MODERN SPECIES 14 SLC16A12 (ENSXMAG00000017203) ENSXMAG00000021263 ENSXMAG00000026492 pank1a (ENSXMAG00000015452) zgc:65997 (ENSXMAG00000015470) nphp1 (ENSXMAG00000015471) ENSXMAG00000029559 malb (ENSXMAG00000023290) mrps5 (ENSXMAG00000028833) slc8a1b (ENSXMAG00000017251) ENSXMAG00000017249 MAP4K3 (ENSXMAG00000017170) ENSXMAG00000017168 ENSXMAG00000026195 slc17a5 (ENSXMAG00000017162) EEF1A1 (ENSXMAG00000017149) ##22 CGAS (ENSXMAG00000028055) ddx43 (ENSXMAG00000017126) KCNQ5 (ENSXMAG00000024491) cnrip1b (ENSXMAG00000024487) ppp3r1a (ENSXMAG00000022836) pno1 (ENSXMAG00000021459) dnaaf10 (ENSXMAG00000029168) c1d (ENSXMAG00000022273) ENSXMAG00000027599 meis1b (ENSXMAG00000011739) ENSXMAG00000029931 SPRED2 (ENSXMAG00000011804) actr2a (ENSXMAG00000011813) ENSXMAG00000029191 ENSXMAG00000025365 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000164807.G.a.a.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 938 ENSCVAG00000009866 slc17a5 (ENSCVAG00000009898) EEF1A1 (ENSCVAG00000009938) ##22 CGAS (ENSCVAG00000009949) ddx43 (ENSCVAG00000009980) KCNQ5 (ENSCVAG00000010093) cnrip1b (ENSCVAG00000010110) ppp3r1a (ENSCVAG00000010117) pno1 (ENSCVAG00000010136) dnaaf10 (ENSCVAG00000010143) Mummichog MODERN SPECIES 491 slc8a1b (ENSFHEG00000000263) ENSFHEG00000011402 MAP4K3 (ENSFHEG00000011381) ENSFHEG00000011309 slc17a5 (ENSFHEG00000011301) EEF1A1 (ENSFHEG00000011259) ##22 CGAS (ENSFHEG00000011214) ddx43 (ENSFHEG00000011226) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000161503.b ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000165928 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000162528 ENSGT00390000004153.d ENSGT00910000144296 ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00940000177342.a ENSGT00940000157824.i.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 3 vip (ENSKMAG00000016983) ANAPC1 (ENSKMAG00000016819) ENSKMAG00000016777 SLC16A12 (ENSKMAG00000016741) pank1a (ENSKMAG00000016704) zgc:65997 (ENSKMAG00000016685) nphp1 (ENSKMAG00000016651) ENSKMAG00000016627 ENSKMAG00000016619 malb (ENSKMAG00000016605) mrps5 (ENSKMAG00000016581) slc8a1b (ENSKMAG00000016559) MAP4K3 (ENSKMAG00000016374) ENSKMAG00000016287 slc17a5 (ENSKMAG00000016240) EEF1A1 (ENSKMAG00000016211) ##22 CGAS (ENSKMAG00000016190) ddx43 (ENSKMAG00000016167) KCNQ5 (ENSKMAG00000016142) ENSKMAG00000016129 ENSKMAG00000016114 mtx2 (ENSKMAG00000016098) cdh5 (ENSKMAG00000016073) ENSKMAG00000016061 tmem41ab (ENSKMAG00000016045) GPR155 (ENSKMAG00000015977) ENSKMAG00000015949 ciao2b (ENSKMAG00000015929) ENSKMAG00000015858 ENSKMAG00000015830 ENSKMAG00000015815 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1612 NPHP1 (ENSNFUG00015005710) ENSNFUG00015005763 MAL (ENSNFUG00015005764) malb (ENSNFUG00015005768) MRPS5 (ENSNFUG00015005770) ENSNFUG00015005780 ENSNFUG00015005783 ENSNFUG00015005786 slc8a1b (ENSNFUG00015005827) ENSNFUG00015006053 ENSNFUG00015006056 MAP4K3 (ENSNFUG00015006140) ENSNFUG00015006654 ENSNFUG00015006658 slc17a5 (ENSNFUG00015006685) EEF1A1 (ENSNFUG00015006942) ##22 CGAS (ENSNFUG00015006985) ddx43 (ENSNFUG00015007019) KCNQ5 (ENSNFUG00015007192) ENSNFUG00015007494 ENSNFUG00015007501 ENSNFUG00015007505 MTX2 (ENSNFUG00015006652) CDH5 (ENSNFUG00015006665) BEAN1 (ENSNFUG00015006672) TMEM41A (ENSNFUG00015006674) GPR155 (ENSNFUG00015006682) WIPF1 (ENSNFUG00015006700) ciao2b (ENSNFUG00015006705) ENSNFUG00015006716 ENSNFUG00015006729 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000162741 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000162333 ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 Fugu MODERN SPECIES 16 fbxo5 (ENSTRUG00000023972) vip (ENSTRUG00000001139) ANAPC1 (ENSTRUG00000001055) ENSTRUG00000027086 SLC16A12 (ENSTRUG00000027543) pank1a (ENSTRUG00000026863) zgc:65997 (ENSTRUG00000032567) nphp1 (ENSTRUG00000026367) ENSTRUG00000026056 malb (ENSTRUG00000031016) mrps5 (ENSTRUG00000030917) slc8a1b (ENSTRUG00000013345) MAP4K3 (ENSTRUG00000013107) ENSTRUG00000026938 slc17a5 (ENSTRUG00000013027) eef1a1b (ENSTRUG00000012893) ##22 ddx43 (ENSTRUG00000012795) KCNQ5 (ENSTRUG00000012601) cnrip1b (ENSTRUG00000012558) dnaaf10 (ENSTRUG00000012303) pno1 (ENSTRUG00000012470) c1d (ENSTRUG00000012245) ENSTRUG00000022857 meis1b (ENSTRUG00000011993) SPRED2 (ENSTRUG00000011904) actr2a (ENSTRUG00000011717) ENSTRUG00000011707 ENSTRUG00000021877 lgalslb (ENSTRUG00000011696) ENSTRUG00000019803 peli1b (ENSTRUG00000011542) Tetraodon MODERN SPECIES 9 MTRF1L (ENSTNIG00000007451) fbxo5 (ENSTNIG00000007450) vip (ENSTNIG00000007449) ANAPC1 (ENSTNIG00000007448) SLC16A12 (ENSTNIG00000007447) pank1a (ENSTNIG00000007446) zgc:65997 (ENSTNIG00000007445) nphp1 (ENSTNIG00000007444) ENSTNIG00000007443 ENSTNIG00000009889 slc8a1b (ENSTNIG00000009816) ENSTNIG00000009817 MAP4K3 (ENSTNIG00000009818) ENSTNIG00000009819 slc17a5 (ENSTNIG00000009820) eef1a1b (ENSTNIG00000009821) ##22 ddx43 (ENSTNIG00000009822) KCNQ5 (ENSTNIG00000009823) ppp3r1a (ENSTNIG00000009824) pno1 (ENSTNIG00000009825) dnaaf10 (ENSTNIG00000009826) c1d (ENSTNIG00000009827) meis1b (ENSTNIG00000009828) SPRED2 (ENSTNIG00000009829) actr2a (ENSTNIG00000009830) ENSTNIG00000009831 lgalslb (ENSTNIG00000009832) ENSTNIG00000009833 peli1b (ENSTNIG00000009834) ugp2b (ENSTNIG00000009837) peli1b (ENSTNIG00000009836) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 123 ENSLBEG00000007213 ENSLBEG00000007232 SLC16A12 (ENSLBEG00000007272) pank1a (ENSLBEG00000007341) zgc:65997 (ENSLBEG00000007406) nphp1 (ENSLBEG00000007428) ENSLBEG00000007457 malb (ENSLBEG00000007475) mrps5 (ENSLBEG00000007499) slc8a1b (ENSLBEG00000007533) ENSLBEG00000007585 MAP4K3 (ENSLBEG00000007665) slc17a5 (ENSLBEG00000007798) EEF1A1 (ENSLBEG00000007846) ##22 ddx43 (ENSLBEG00000007913) KCNQ5 (ENSLBEG00000008083) cnrip1b (ENSLBEG00000008256) ppp3r1a (ENSLBEG00000008282) pno1 (ENSLBEG00000008305) dnaaf10 (ENSLBEG00000008344) c1d (ENSLBEG00000008351) ENSLBEG00000008369 meis1b (ENSLBEG00000008402) SPRED2 (ENSLBEG00000008460) ACTR2 (ENSLBEG00000008499) ENSLBEG00000008542 ENSLBEG00000008560 lgalslb (ENSLBEG00000008580) ENSLBEG00000008607 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000177700 ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000155337.ab Gilthead seabream MODERN SPECIES 6 ENSSAUG00010017055 ENSSAUG00010017056 ENSSAUG00010017059 ENSSAUG00010017061 ENSSAUG00010017063 ENSSAUG00010017073 ENSSAUG00010017075 ENSSAUG00010017079 ENSSAUG00010017082 mrps5 (ENSSAUG00010017084) slc8a1b (ENSSAUG00010017113) ENSSAUG00010018070 MAP4K3 (ENSSAUG00010018108) ENSSAUG00010018537 slc17a5 (ENSSAUG00010018543) EEF1A1 (ENSSAUG00010018560) ##22 CGAS (ENSSAUG00010018571) ddx43 (ENSSAUG00010018572) KCNQ5 (ENSSAUG00010018578) cnrip1b (ENSSAUG00010019175) dnaaf10 (ENSSAUG00010019181) pno1 (ENSSAUG00010019182) c1d (ENSSAUG00010019188) ENSSAUG00010019192 meis1b (ENSSAUG00010019201) SPRED2 (ENSSAUG00010019238) ACTR2 (ENSSAUG00010019253) ENSSAUG00010019554 ENSSAUG00010019557 ENSSAUG00010019559 ENSSAUG00010001554 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000177700 ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000155337.ab Large yellow croaker MODERN SPECIES 2 ENSLCRG00005008026 HBP1 (ENSLCRG00005007984) pik3cg (ENSLCRG00005007441) ano2b (ENSLCRG00005006639) ntf3 (ENSLCRG00005006625) ENSLCRG00005006624 pfkfb3 (ENSLCRG00005004458) rbm17 (ENSLCRG00005004360) ENSLCRG00005004358 ENSLCRG00005004356 fbxo18 (ENSLCRG00005004352) ENSLCRG00005004339 MAP4K3 (ENSLCRG00005004240) ENSLCRG00005004228 slc17a5 (ENSLCRG00005004152) EEF1A1 (ENSLCRG00005004079) ##22 ENSLCRG00005004073 ddx43 (ENSLCRG00005004026) KCNQ5 (ENSLCRG00005003543) cnrip1b (ENSLCRG00005003531) ppp3r1a (ENSLCRG00005003511) pno1 (ENSLCRG00005003507) dnaaf10 (ENSLCRG00005003504) c1d (ENSLCRG00005003503) ENSLCRG00005003502 meis1b (ENSLCRG00005000371) SPRED2 (ENSLCRG00005000227) ACTR2 (ENSLCRG00005000189) ENSLCRG00005000165 ENSLCRG00005000141 ENSLCRG00005000106 European seabass MODERN SPECIES 1 ENSDLAG00005009216 ENSDLAG00005009223 zgc:65997 (ENSDLAG00005026774) nphp1 (ENSDLAG00005009281) ENSDLAG00005030126 malb (ENSDLAG00005033757) mrps5 (ENSDLAG00005009328) ENSDLAG00005029134 ENSDLAG00005009562 slc8a1b (ENSDLAG00005009574) ENSDLAG00005009595 ENSDLAG00005009669 ENSDLAG00005010555 slc17a5 (ENSDLAG00005010580) ddx43 (ENSDLAG00005010835) EEF1A1 (ENSDLAG00005027413) ##22 CGAS (ENSDLAG00005010821) KCNQ5 (ENSDLAG00005010946) PPP3R1 (ENSDLAG00005033179) PNO1 (ENSDLAG00005011598) C1D (ENSDLAG00005034609) ENSDLAG00005011679 MEIS1 (ENSDLAG00005011711) SPRED2 (ENSDLAG00005034776) ACTR2 (ENSDLAG00005012437) ENSDLAG00005012508 ENSDLAG00005012530 LGALSL (ENSDLAG00005027623) ENSDLAG00005012591 peli1b (ENSDLAG00005012804) ugp2b (ENSDLAG00005012869) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a.h ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.ab ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a.h ENSGT00940000154556.a.b ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 Lumpfish MODERN SPECIES 6 ENSCLMG00005002339 zgc:65997 (ENSCLMG00005002342) ENSCLMG00005002344 SLC16A12 (ENSCLMG00005002346) ENSCLMG00005002348 vip (ENSCLMG00005002389) fbxo5 (ENSCLMG00005002390) MTRF1L (ENSCLMG00005002392) desi2 (ENSCLMG00005002394) MAL (ENSCLMG00005002396) mrps5 (ENSCLMG00005002398) slc8a1b (ENSCLMG00005002404) ENSCLMG00005002444 ENSCLMG00005002478 slc17a5 (ENSCLMG00005008183) ENSCLMG00005008931 ##22 ENSCLMG00005009225 ENSCLMG00005009226 ENSCLMG00005009227 ddx43 (ENSCLMG00005009228) ENSCLMG00005009230 cnrip1b (ENSCLMG00005009450) ENSCLMG00005009451 pno1 (ENSCLMG00005009452) dnaaf10 (ENSCLMG00005009463) c1d (ENSCLMG00005009465) ENSCLMG00005009466 ENSCLMG00005009467 SPRED2 (ENSCLMG00005009468) ACTR2 (ENSCLMG00005009470) ENSCLMG00005009540 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT01030000237580 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a.h ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a Pike perch MODERN SPECIES 30 vip (ENSSLUG00000010901) ANAPC1 (ENSSLUG00000010873) ENSSLUG00000010851 SLC16A12 (ENSSLUG00000010845) pank1a (ENSSLUG00000010829) zgc:65997 (ENSSLUG00000010823) nphp1 (ENSSLUG00000010797) ENSSLUG00000010762 ENSSLUG00000010750 malb (ENSSLUG00000010745) mrps5 (ENSSLUG00000010736) slc8a1b (ENSSLUG00000010691) ENSSLUG00000010676 MAP4K3 (ENSSLUG00000009726) slc17a5 (ENSSLUG00000008576) eef1a1b (ENSSLUG00000008428) ##22 CGAS (ENSSLUG00000008418) ddx43 (ENSSLUG00000008401) KCNQ5 (ENSSLUG00000008175) cnrip1b (ENSSLUG00000008160) sult6b1 (ENSSLUG00000008118) pno1 (ENSSLUG00000008114) dnaaf10 (ENSSLUG00000008055) c1d (ENSSLUG00000008045) ENSSLUG00000008032 meis1b (ENSSLUG00000007585) SPRED2 (ENSSLUG00000007558) ACTR2 (ENSSLUG00000007306) ENSSLUG00000007287 ENSSLUG00000007277 ENSSLUG00000007269 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT01030000237580 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT01030000237580 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Zig-zag eel MODERN SPECIES 6 fbxo5 (ENSMAMG00000022019) ENSMAMG00000022023 ENSMAMG00000022030 ENSMAMG00000022038 ENSMAMG00000022039 ENSMAMG00000022049 zgc:65997 (ENSMAMG00000022058) nphp1 (ENSMAMG00000022063) ENSMAMG00000022068 malb (ENSMAMG00000022072) mrps5 (ENSMAMG00000022074) slc8a1b (ENSMAMG00000022080) ENSMAMG00000022090 ENSMAMG00000022108 slc17a5 (ENSMAMG00000022121) EEF1A1 (ENSMAMG00000004552) ##22 CGAS (ENSMAMG00000022124) ddx43 (ENSMAMG00000022128) KCNQ5 (ENSMAMG00000022134) ENSMAMG00000022136 DNAAF10 (ENSMAMG00000022141) pno1 (ENSMAMG00000022144) C1D (ENSMAMG00000022156) ENSMAMG00000022164 MEIS1 (ENSMAMG00000022171) SPRED2 (ENSMAMG00000025530) actr2b (ENSMAMG00000022188) AFTPH (ENSMAMG00000022192) LGALSL (ENSMAMG00000022198) ENSMAMG00000022200 peli1b (ENSMAMG00000022208) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT01030000237580 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab Climbing perch MODERN SPECIES 6 ENSATEG00000012115 ENSATEG00000025766 ENSATEG00000012155 zgc:65997 (ENSATEG00000012188) nphp1 (ENSATEG00000012206) ENSATEG00000012217 ENSATEG00000026083 malb (ENSATEG00000012241) mrps5 (ENSATEG00000012264) slc8a1b (ENSATEG00000012293) ENSATEG00000028108 ENSATEG00000027204 ENSATEG00000012370 ENSATEG00000012559 slc17a5 (ENSATEG00000012575) EEF1A1 (ENSATEG00000012623) ##22 CGAS (ENSATEG00000012654) ddx43 (ENSATEG00000012664) KCNQ5 (ENSATEG00000012797) ENSATEG00000027106 DNAAF10 (ENSATEG00000012915) pno1 (ENSATEG00000012887) C1D (ENSATEG00000012922) ENSATEG00000012939 MEIS1 (ENSATEG00000012952) SPRED2 (ENSATEG00000013004) ACTR2 (ENSATEG00000013034) ENSATEG00000028886 ENSATEG00000013084 LGALSL (ENSATEG00000027905) ENSATEG00000013162 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 6 vip (ENSBSLG00000026130) ANAPC1 (ENSBSLG00000026182) ENSBSLG00000026357 SLC16A12 (ENSBSLG00000026359) pank1a (ENSBSLG00000026363) nphp1 (ENSBSLG00000026373) zgc:65997 (ENSBSLG00000026382) malb (ENSBSLG00000013171) mrps5 (ENSBSLG00000013218) slc8a1b (ENSBSLG00000013391) ENSBSLG00000014213 MAP4K3 (ENSBSLG00000014437) ENSBSLG00000015485 slc17a5 (ENSBSLG00000015518) ddx43 (ENSBSLG00000015799) EEF1A1 (ENSBSLG00000015871) ##22 ENSBSLG00000015916 ENSBSLG00000016785 cnrip1b (ENSBSLG00000017289) ENSBSLG00000017307 ppp3r1a (ENSBSLG00000017314) pno1 (ENSBSLG00000017358) dnaaf10 (ENSBSLG00000017449) c1d (ENSBSLG00000017549) ENSBSLG00000017560 meis1b (ENSBSLG00000017627) SPRED2 (ENSBSLG00000018342) actr2a (ENSBSLG00000018376) ENSBSLG00000018593 lgalslb (ENSBSLG00000018607) ENSBSLG00000018627 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT01030000237580 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00950000183029.B.j.c.a ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000166594 Tongue sole MODERN SPECIES 3 ENSCSEG00000000663 ENSCSEG00000000657 ENSCSEG00000000644 calm2a (ENSCSEG00000000634) si:ch211-93n23.7 (ENSCSEG00000000630) TTC7A (ENSCSEG00000000610) mcfd2 (ENSCSEG00000000605) ENSCSEG00000000604 ENSCSEG00000000598 ENSCSEG00000000595 c1d (ENSCSEG00000000587) dnaaf10 (ENSCSEG00000000577) pno1 (ENSCSEG00000000565) ppp3r1a (ENSCSEG00000000556) slc17a5 (ENSCSEG00000000550) eef1a1b (ENSCSEG00000000544) ##22 ddx43 (ENSCSEG00000000532) KCNQ5 (ENSCSEG00000000525) cnrip1b (ENSCSEG00000000521) MAP4K3 (ENSCSEG00000000516) ENSCSEG00000000512 slc8a1b (ENSCSEG00000000505) mrps5 (ENSCSEG00000000495) ENSCSEG00000000491 MAL (ENSCSEG00000000488) nphp1 (ENSCSEG00000000462) zgc:65997 (ENSCSEG00000000455) pank1a (ENSCSEG00000000452) SLC16A12 (ENSCSEG00000000451) ENSCSEG00000000444 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155683 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000166594 ENSGT01030000235205 Seriola ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063692.b ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00390000016757 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263491.a.a.c.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a Greater amberjack MODERN SPECIES 72 vip (ENSSDUG00000019423) ANAPC1 (ENSSDUG00000019457) ENSSDUG00000019627 ENSSDUG00000019633 SLC16A12 (ENSSDUG00000019637) pank1a (ENSSDUG00000019651) zgc:65997 (ENSSDUG00000019677) nphp1 (ENSSDUG00000019684) MAL (ENSSDUG00000019705) malb (ENSSDUG00000019726) mrps5 (ENSSDUG00000019792) slc8a1b (ENSSDUG00000019868) ENSSDUG00000019898 MAP4K3 (ENSSDUG00000019925) slc17a5 (ENSSDUG00000020030) EEF1A1 (ENSSDUG00000020050) ##22 ENSSDUG00000020072 CGAS (ENSSDUG00000020107) ddx43 (ENSSDUG00000020120) KCNQ5 (ENSSDUG00000020143) cnrip1b (ENSSDUG00000020172) ppp3r1a (ENSSDUG00000020180) pno1 (ENSSDUG00000020189) dnaaf10 (ENSSDUG00000020203) c1d (ENSSDUG00000020213) ENSSDUG00000020231 meis1b (ENSSDUG00000020244) SPRED2 (ENSSDUG00000020295) ACTR2 (ENSSDUG00000020311) ENSSDUG00000020338 ENSSDUG00000020354 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2948 ENSSLDG00000016538 SLC16A12 (ENSSLDG00000016558) pank1a (ENSSLDG00000016595) zgc:65997 (ENSSLDG00000016643) nphp1 (ENSSLDG00000016665) ENSSLDG00000016695 malb (ENSSLDG00000016707) mrps5 (ENSSLDG00000016726) slc8a1b (ENSSLDG00000016760) ENSSLDG00000016788 MAP4K3 (ENSSLDG00000016855) slc17a5 (ENSSLDG00000017146) EEF1A1 (ENSSLDG00000017189) ##22 ddx43 (ENSSLDG00000017225) KCNQ5 (ENSSLDG00000017263) cnrip1b (ENSSLDG00000017291) ppp3r1a (ENSSLDG00000017313) pno1 (ENSSLDG00000017330) dnaaf10 (ENSSLDG00000017358) c1d (ENSSLDG00000017371) ENSSLDG00000017390 meis1b (ENSSLDG00000017406) SPRED2 (ENSSLDG00000017425) ACTR2 (ENSSLDG00000017448) ENSSLDG00000017479 ENSSLDG00000017491 ENSSLDG00000017510 lgalslb (ENSSLDG00000017531) Barramundi perch MODERN SPECIES 33 slc8a1b (ENSLCAG00010014445) ENSLCAG00010014439 MAP4K3 (ENSLCAG00010014415) ENSLCAG00010014405 slc17a5 (ENSLCAG00010014365) EEF1A1 (ENSLCAG00010014256) ##22 ENSLCAG00010014227 ddx43 (ENSLCAG00010014225) KCNQ5 (ENSLCAG00010014113) cnrip1b (ENSLCAG00010014096) ppp3r1a (ENSLCAG00010014087) pno1 (ENSLCAG00010014077) dnaaf10 (ENSLCAG00010014068) c1d (ENSLCAG00010014064) ENSLCAG00010014062 meis1b (ENSLCAG00010013649) SPRED2 (ENSLCAG00010013603) ACTR2 (ENSLCAG00010013559) ENSLCAG00010013537 ENSLCAG00010013530 ENSLCAG00010013527 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000162741 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C.fc Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000162741 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00940000162741 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000162741 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000177019 ENSGT00940000156169.a.b ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157594 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00940000161029 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157594 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00940000161029 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc European seabass DUPLICATION European seabass MODERN SPECIES 22 eif3eb (ENSDLAG00005011074) TMEM74 (ENSDLAG00005011213) trhrb (ENSDLAG00005011218) nudcd1 (ENSDLAG00005011227) ENY2 (ENSDLAG00005011304) pkhd1l1.2 (ENSDLAG00005011328) ENSDLAG00005011678 CCNE2 (ENSDLAG00005011713) ENSDLAG00005011742 DPY19L4 (ENSDLAG00005011843) ENSDLAG00005012001 ENSDLAG00005013490 ENSDLAG00005013511 ENSDLAG00005014132 ENSDLAG00005014126 ENSDLAG00005029407 ##22 ENSDLAG00005028494 ##22 ENSDLAG00005014694 rpl11 (ENSDLAG00005014702) ENSDLAG00005033309 eloa (ENSDLAG00005014745) pithd1 (ENSDLAG00005014758) lypla2 (ENSDLAG00005014778) ENSDLAG00005032445 ENSDLAG00005029252 ENSDLAG00005014824 ENSDLAG00005029648 ENSDLAG00005007336 ENSDLAG00005026709 ENSDLAG00005005499 ENSDLAG00005014175 European seabass MODERN SPECIES 22 TMEM74 (ENSDLAG00005011213) trhrb (ENSDLAG00005011218) nudcd1 (ENSDLAG00005011227) ENY2 (ENSDLAG00005011304) pkhd1l1.2 (ENSDLAG00005011328) ENSDLAG00005011678 CCNE2 (ENSDLAG00005011713) ENSDLAG00005011742 DPY19L4 (ENSDLAG00005011843) ENSDLAG00005012001 ENSDLAG00005013490 ENSDLAG00005013511 ENSDLAG00005014132 ENSDLAG00005014126 ENSDLAG00005029407 ##22 ENSDLAG00005028494 ##22 ENSDLAG00005014694 rpl11 (ENSDLAG00005014702) ENSDLAG00005033309 eloa (ENSDLAG00005014745) pithd1 (ENSDLAG00005014758) lypla2 (ENSDLAG00005014778) ENSDLAG00005032445 ENSDLAG00005029252 ENSDLAG00005014824 ENSDLAG00005029648 ENSDLAG00005007336 ENSDLAG00005026709 ENSDLAG00005005499 ENSDLAG00005014175 ENSDLAG00005029538 Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 necap1 (ENSLCRG00005023929) ENSLCRG00005023932 ENSLCRG00005023933 ENSLCRG00005023934 ints8 (ENSLCRG00005023935) CCNE2 (ENSLCRG00005023936) DPY19L4 (ENSLCRG00005023937) KDM1B (ENSLCRG00005023948) ENSLCRG00005023950 slc9a1b (ENSLCRG00005023951) ENSLCRG00005023952 ENSLCRG00005023953 gja9b (ENSLCRG00005023954) mycbp (ENSLCRG00005000609) ENSLCRG00005000621 ENSLCRG00005000650 ##22 ENSLCRG00005000734 ENSLCRG00005000746 ENSLCRG00005000967 ENSLCRG00005000988 rpl11 (ENSLCRG00005000999) ENSLCRG00005001012 eloa (ENSLCRG00005001018) pithd1 (ENSLCRG00005001026) lypla2 (ENSLCRG00005001033) sfpq (ENSLCRG00005001039) ENSLCRG00005001054 ENSLCRG00005001074 ENSLCRG00005001089 ENSLCRG00005001092 ENSLCRG00005001097 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000182894.C.i ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00940000161029 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000182894.C.i ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00690000103882 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000164334 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc Stickleback MODERN SPECIES 9 CCNE2 (ENSGACG00000002312) ints8 (ENSGACG00000002293) ENSGACG00000002289 ENSGACG00000002285 DPY19L4 (ENSGACG00000002271) tekt1 (ENSGACG00000002270) KDM1B (ENSGACG00000002257) ENSGACG00000002253 slc9a1b (ENSGACG00000002247) ENSGACG00000002234 srsf10b (ENSGACG00000002231) gja9b (ENSGACG00000002230) ENSGACG00000002224 ENSGACG00000002223 ENSGACG00000002182 ENSGACG00000002175 ##22 ENSGACG00000002143 rpl11 (ENSGACG00000002118) ENSGACG00000002089 eloa (ENSGACG00000002085) pithd1 (ENSGACG00000002074) lypla2 (ENSGACG00000002050) sfpq (ENSGACG00000002034) zmym4.2 (ENSGACG00000002029) ak2 (ENSGACG00000002010) rnf19b (ENSGACG00000002003) ndufs5 (ENSGACG00000002002) MACF1 (ENSGACG00000001993) bmp8a (ENSGACG00000001991) zgc:91910 (ENSGACG00000001990) gsk3aa (ENSGACG00000001987) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00950000182894.C.i ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 ENSGT00390000003465.b.a Pike perch MODERN SPECIES 13 CCNE2 (ENSSLUG00000023456) ints8 (ENSSLUG00000023436) DPY19L4 (ENSSLUG00000023332) tekt1 (ENSSLUG00000023309) KDM1B (ENSSLUG00000023030) CFAP69 (ENSSLUG00000022985) slc9a1b (ENSSLUG00000022498) ENSSLUG00000022440 ENSSLUG00000022436 srsf10b (ENSSLUG00000022432) gja9b (ENSSLUG00000022428) mycbp (ENSSLUG00000022422) ENSSLUG00000022417 ENSSLUG00000022411 ENSSLUG00000022364 ENSSLUG00000022276 ##22 ENSSLUG00000022255 rpl11 (ENSSLUG00000022216) ENSSLUG00000022202 eloa (ENSSLUG00000022193) pithd1 (ENSSLUG00000022186) lypla2 (ENSSLUG00000022173) sfpq (ENSSLUG00000022159) ENSSLUG00000022143 ENSSLUG00000022122 ENSSLUG00000022096 ak2 (ENSSLUG00000022083) rnf19b (ENSSLUG00000022064) ndufs5 (ENSSLUG00000022058) MACF1 (ENSSLUG00000011062) bmp8a (ENSSLUG00000010619) Channel bull blenny DUPLICATION Channel bull blenny MODERN SPECIES 6 ANAPC1 (ENSCGOG00000024256) ENSCGOG00000024395 SLC16A12 (ENSCGOG00000024397) pank1a (ENSCGOG00000008650) zgc:65997 (ENSCGOG00000008737) nphp1 (ENSCGOG00000008740) ENSCGOG00000008747 ENSCGOG00000008748 malb (ENSCGOG00000008750) mrps5 (ENSCGOG00000008752) slc8a1b (ENSCGOG00000008760) ENSCGOG00000008776 MAP4K3 (ENSCGOG00000008956) ENSCGOG00000013110 slc17a5 (ENSCGOG00000013126) EEF1A1 (ENSCGOG00000013428) ##22 CGAS (ENSCGOG00000014721) ddx43 (ENSCGOG00000014781) KCNQ5 (ENSCGOG00000014877) cnrip1b (ENSCGOG00000014921) ppp3r1a (ENSCGOG00000014926) pno1 (ENSCGOG00000014929) dnaaf10 (ENSCGOG00000014955) c1d (ENSCGOG00000014962) meis1b (ENSCGOG00000014989) SPRED2 (ENSCGOG00000017236) ACTR2 (ENSCGOG00000017247) ENSCGOG00000017511 ENSCGOG00000017515 ENSCGOG00000017517 ENSCGOG00000017519 Channel bull blenny MODERN SPECIES 2 gdf6b (ENSCGOG00000005795) ENSCGOG00000005783 CCNE2 (ENSCGOG00000005761) ints8 (ENSCGOG00000004741) DPY19L4 (ENSCGOG00000004660) ENSCGOG00000004652 tekt1 (ENSCGOG00000004650) KDM1B (ENSCGOG00000004226) ENSCGOG00000004187 ENSCGOG00000004081 slc9a1b (ENSCGOG00000018231) ENSCGOG00000018202 gja9b (ENSCGOG00000018200) mycbp (ENSCGOG00000018199) ENSCGOG00000018194 ENSCGOG00000017593 ##22 rpl11 (ENSCGOG00000017530) ENSCGOG00000017522 eloa (ENSCGOG00000017516) pithd1 (ENSCGOG00000017509) lypla2 (ENSCGOG00000017508) sfpq (ENSCGOG00000017504) ENSCGOG00000017499 ENSCGOG00000017497 ENSCGOG00000017496 ENSCGOG00000017490 ENSCGOG00000017485 ak2 (ENSCGOG00000017476) rnf19b (ENSCGOG00000017418) ndufs5 (ENSCGOG00000017417) bmp8a (ENSCGOG00000017154) Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000158105 ENSGT00390000013419 ENSGT00390000003049.b.a ENSGT00940000155062.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198753 ENSGT00860000134050 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00390000004574 ENSGT00940000159730 ENSGT00940000159874 ENSGT00550000074820 ENSGT00440000039055 Tetraodon DUPLICATION Tetraodon MODERN SPECIES 10 ENSTNIG00000017802 vps37c (ENSTNIG00000017801) ENSTNIG00000017800 ENSTNIG00000017799 ndufs8a (ENSTNIG00000001102) RPS6KB2 (ENSTNIG00000017798) ENSTNIG00000003748 neurl1aa (ENSTNIG00000014164) SH3PXD2A (ENSTNIG00000014163) stn1 (ENSTNIG00000014162) slkb (ENSTNIG00000014161) ENSTNIG00000014160 dtd1 (ENSTNIG00000014159) SLC24A3 (ENSTNIG00000014158) RIN2 (ENSTNIG00000014157) EEF1A1 (ENSTNIG00000014156) ##22 ENSTNIG00000014155 RIMS1 (ENSTNIG00000014154) krt97 (ENSTNIG00000014153) ENSTNIG00000014152 ENSTNIG00000014151 SMARCE1 (ENSTNIG00000014150) IGFBP4 (ENSTNIG00000014149) ENSTNIG00000014148 ENSTNIG00000014147 PCGF2 (ENSTNIG00000014146) PIP4K2B (ENSTNIG00000014145) psmb3 (ENSTNIG00000014144) cwc25 (ENSTNIG00000014143) sp6 (ENSTNIG00000014142) scrn2 (ENSTNIG00000014141) Tetraodon MODERN SPECIES 15 ENSTNIG00000002903 ENSTNIG00000019517 pkhd1l1.2 (ENSTNIG00000005470) ENSTNIG00000004138 ENSTNIG00000004139 ENSTNIG00000004235 ints8 (ENSTNIG00000004234) DPY19L4 (ENSTNIG00000004233) KDM1B (ENSTNIG00000019845) ENSTNIG00000005724 slc9a1b (ENSTNIG00000005725) gja9b (ENSTNIG00000005726) mycbp (ENSTNIG00000005727) ENSTNIG00000005728 ENSTNIG00000002619 ENSTNIG00000002618 ##22 ENSTNIG00000002617 rpl11 (ENSTNIG00000002616) ENSTNIG00000003754 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00940000161029 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000161029 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000165604 ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00520000055649.a ENSGT00940000157122.b.b ENSGT00940000155062.a ENSGT00940000176858 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00950000182969.B.c.a.b ENSGT00940000159655 ENSGT00940000160142 ENSGT01030000234667.a.a.a.a.b ENSGT00390000003628.b ENSGT00940000164415 ENSGT00390000003628.a.a ENSGT00940000159647 ENSGT00940000156782.d ENSGT00940000158572 ENSGT00940000165589.b ENSGT00390000004574 ENSGT00940000159730 Turbot MODERN SPECIES 20 ENSSMAG00000009548 ENSSMAG00000009570 ENSSMAG00000009624 ENSSMAG00000009667 ENSSMAG00000009691 ENSSMAG00000009768 neurl1aa (ENSSMAG00000009853) SH3PXD2A (ENSSMAG00000009908) stn1 (ENSSMAG00000010029) SLK (ENSSMAG00000010057) ENSSMAG00000010117 DTD1 (ENSSMAG00000037240) SLC24A3 (ENSSMAG00000010158) RIN2 (ENSSMAG00000010253) ENSSMAG00000010287 ENSSMAG00000010349 ##22 ENSSMAG00000010378 ENSSMAG00000010490 ENSSMAG00000034272 ENSSMAG00000010629 ENSSMAG00000010642 ENSSMAG00000010660 ENSSMAG00000010672 ENSSMAG00000028167 ENSSMAG00000033401 ENSSMAG00000010766 ENSSMAG00000010750 ENSSMAG00000010788 ENSSMAG00000025924 ENSSMAG00000010883 ENSSMAG00000010892 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES 9 pkhd1l1.2 (ENSCSEG00000008607) gdf6b (ENSCSEG00000008556) ENSCSEG00000008546 ints8 (ENSCSEG00000008358) DPY19L4 (ENSCSEG00000008333) KDM1B (ENSCSEG00000008311) ENSCSEG00000008281 slc9a1b (ENSCSEG00000008266) ENSCSEG00000008220 srsf10b (ENSCSEG00000008199) ENSCSEG00000008184 gja9b (ENSCSEG00000008175) mycbp (ENSCSEG00000008166) ENSCSEG00000008033 ENSCSEG00000008011 ENSCSEG00000008004 ##22 ENSCSEG00000007992 ENSCSEG00000007982 ##22 ENSCSEG00000007972 ENSCSEG00000007966 ##22 rpl11 (ENSCSEG00000007952) ENSCSEG00000007938 eloa (ENSCSEG00000007921) pithd1 (ENSCSEG00000007900) lypla2 (ENSCSEG00000007872) sfpq (ENSCSEG00000007852) ENSCSEG00000007833 ENSCSEG00000007824 ENSCSEG00000007809 ENSCSEG00000007792 ak2 (ENSCSEG00000007777) Tongue sole MODERN SPECIES 382 ENSCSEG00000008204 ##22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000161029 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Barramundi perch MODERN SPECIES 26 ENY2 (ENSLCAG00010013753) gdf6b (ENSLCAG00010013715) ENSLCAG00010013710 CCNE2 (ENSLCAG00010013661) ints8 (ENSLCAG00010013572) DPY19L4 (ENSLCAG00010013398) KDM1B (ENSLCAG00010013197) ENSLCAG00010013149 slc9a1b (ENSLCAG00010013118) ENSLCAG00010013105 ENSLCAG00010013103 srsf10b (ENSLCAG00010013099) gja9b (ENSLCAG00010013098) mycbp (ENSLCAG00010013096) ENSLCAG00010013092 ENSLCAG00010012892 ##22 ENSLCAG00010012727 ENSLCAG00010012638 rpl11 (ENSLCAG00010012589) ENSLCAG00010012580 eloa (ENSLCAG00010012574) pithd1 (ENSLCAG00010012570) lypla2 (ENSLCAG00010012509) sfpq (ENSLCAG00010012491) ENSLCAG00010012476 Seriola ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT01100000263531.G.l.c.a.b.b.d ENSGT01100000263531.G.l.c.b.b ENSGT01100000263531.G.l.c.a.b.a.a ENSGT00940000159200 ENSGT00390000009448 ENSGT00940000160991.a ENSGT00940000161735 ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3241 ENSSLDG00000024478 ENSSLDG00000024443 ENSSLDG00000023700 ENSSLDG00000022195 ENSSLDG00000021699 ENSSLDG00000019557 ENSSLDG00000019359 daxx (ENSSLDG00000019350) zbtb22b (ENSSLDG00000019315) kifc1 (ENSSLDG00000019268) ENSSLDG00000019239 ENSSLDG00000019227 ENSSLDG00000019156 ##22 ENSSLDG00000019066 ENSSLDG00000019043 ENSSLDG00000019026 eloa (ENSSLDG00000019007) pithd1 (ENSSLDG00000018984) lypla2 (ENSSLDG00000018948) sfpq (ENSSLDG00000018917) ENSSLDG00000018866 ENSSLDG00000018849 ENSSLDG00000018812 ENSSLDG00000018789 ak2 (ENSSLDG00000018761) rnf19b (ENSSLDG00000018721) ndufs5 (ENSSLDG00000018701) MACF1 (ENSSLDG00000017880) Greater amberjack MODERN SPECIES 32 ENSSDUG00000008065 ENSSDUG00000008084 ENSSDUG00000008099 daxx (ENSSDUG00000008117) zbtb22b (ENSSDUG00000008134) kifc1 (ENSSDUG00000008164) ENSSDUG00000008184 ENSSDUG00000008198 ENSSDUG00000008223 ##22 ENSSDUG00000008239 rpl11 (ENSSDUG00000008255) ENSSDUG00000008289 eloa (ENSSDUG00000008309) pithd1 (ENSSDUG00000008323) lypla2 (ENSSDUG00000008356) sfpq (ENSSDUG00000008402) ENSSDUG00000008424 ENSSDUG00000008516 ENSSDUG00000008527 ENSSDUG00000008536 ENSSDUG00000008564 ak2 (ENSSDUG00000008585) rnf19b (ENSSDUG00000008598) ndufs5 (ENSSDUG00000008625) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000162741 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C.fc Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000162741 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C.fc Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183053.D ENSGT00390000008812.b.a ENSGT00940000158053 ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.a ENSGT00940000175963.C ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.b ENSGT00940000154576 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183053.D ENSGT00390000008812.b.a ENSGT00940000158053 ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.a.a.b ENSGT00940000175963.C.f ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158242 ENSGT00950000183053.D ENSGT00390000008812.b.a ENSGT00940000158053 ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.b.a.a ENSGT00940000175963.C.f ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT01030000234921 ENSGT00940000155824.C.fc Poecilia ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000160424 ENSGT00940000158242 ENSGT00950000183053.D ENSGT00390000008812.b.a ENSGT00940000158053 ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.b.a.b.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000160424 ENSGT00940000158242 ENSGT00950000183053.D ENSGT00390000008812.b.a ENSGT00940000158053 ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.b.a.b.a.b.a.b Sailfin molly MODERN SPECIES 479 ENSPLAG00000003978 KDM1B (ENSPLAG00000000070) ENSPLAG00000004053 slc9a1b (ENSPLAG00000004065) ENSPLAG00000004227 srsf10b (ENSPLAG00000004239) gja9b (ENSPLAG00000004247) mycbp (ENSPLAG00000004259) ENSPLAG00000004301 ENSPLAG00000004316 ENSPLAG00000004325 ##22 rpl11 (ENSPLAG00000004334) ENSPLAG00000004345 eloa (ENSPLAG00000004358) pithd1 (ENSPLAG00000004364) lypla2 (ENSPLAG00000004390) ENSPLAG00000004407 ENSPLAG00000004434 ENSPLAG00000004450 ENSPLAG00000004463 ENSPLAG00000004469 ENSPLAG00000004478 Amazon molly MODERN SPECIES 362 TMEM170B (ENSPFOG00000005459) HIVEP1 (ENSPFOG00000005423) edn1 (ENSPFOG00000005409) si:dkeyp-92c9.2 (ENSPFOG00000020941) myo1g (ENSPFOG00000004936) KDM1B (ENSPFOG00000004666) ENSPFOG00000023348 slc9a1b (ENSPFOG00000004410) ENSPFOG00000004356 srsf10b (ENSPFOG00000004318) gja9b (ENSPFOG00000020940) mycbp (ENSPFOG00000004312) ENSPFOG00000004073 ENSPFOG00000004052 ENSPFOG00000003924 ENSPFOG00000003782 ##22 ENSPFOG00000022594 rpl11 (ENSPFOG00000003710) ENSPFOG00000003601 eloa (ENSPFOG00000003464) pithd1 (ENSPFOG00000003367) lypla2 (ENSPFOG00000003234) sfpq (ENSPFOG00000003127) ENSPFOG00000003113 ENSPFOG00000002868 ENSPFOG00000023866 ENSPFOG00000023917 ENSPFOG00000002799 ENSPFOG00000021980 ENSPFOG00000002778 ak2 (ENSPFOG00000002672) Platyfish MODERN SPECIES 4 TMEM170B (ENSXMAG00000021733) ENSXMAG00000022925 HIVEP1 (ENSXMAG00000024924) edn1 (ENSXMAG00000016147) si:dkeyp-92c9.2 (ENSXMAG00000019599) myo1g (ENSXMAG00000016150) KDM1B (ENSXMAG00000016188) ENSXMAG00000016195 slc9a1b (ENSXMAG00000016199) ENSXMAG00000004722 srsf10b (ENSXMAG00000029337) ENSXMAG00000025360 gja9b (ENSXMAG00000016245) mycbp (ENSXMAG00000027091) ENSXMAG00000016257 ENSXMAG00000016289 ##22 ENSXMAG00000016322 rpl11 (ENSXMAG00000016325) ENSXMAG00000016340 eloa (ENSXMAG00000016354) pithd1 (ENSXMAG00000027176) lypla2 (ENSXMAG00000016371) sfpq (ENSXMAG00000016391) zmym4.1 (ENSXMAG00000016404) ENSXMAG00000027251 ENSXMAG00000029454 ENSXMAG00000017792 ENSXMAG00000027807 ENSXMAG00000028118 ENSXMAG00000027631 ENSXMAG00000029294 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00950000183008.a.a.a.b ENSGT00940000160424 ENSGT00940000158242 ENSGT00950000183053.D ENSGT00390000008812.b.a ENSGT00940000158053 ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1159 ENSCVAG00000019245 srsf10b (ENSCVAG00000019270) gja9b (ENSCVAG00000019284) mycbp (ENSCVAG00000019291) ENSCVAG00000019303 ENSCVAG00000019309 ENSCVAG00000019356 ENSCVAG00000019378 ##22 rpl11 (ENSCVAG00000019408) ENSCVAG00000019441 eloa (ENSCVAG00000019449) pithd1 (ENSCVAG00000019479) lypla2 (ENSCVAG00000019507) sfpq (ENSCVAG00000019538) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000160424 ENSGT00940000158242 ENSGT00950000183053.D ENSGT00390000008812.b.a ENSGT00940000158053 ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.b.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.a.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 302 ENSKMAG00000001040 ndufs5 (ENSKMAG00000001021) rnf19b (ENSKMAG00000000958) ak2 (ENSKMAG00000000914) ENSKMAG00000000886 ENSKMAG00000000854 ENSKMAG00000000821 ENSKMAG00000000749 slc9a1b (ENSKMAG00000000685) ENSKMAG00000000619 gja9b (ENSKMAG00000000608) mycbp (ENSKMAG00000000569) ENSKMAG00000000476 ENSKMAG00000000413 ##22 rpl11 (ENSKMAG00000000381) ENSKMAG00000000373 eloa (ENSKMAG00000000365) pithd1 (ENSKMAG00000000320) lypla2 (ENSKMAG00000000260) sfpq (ENSKMAG00000000238) ENSKMAG00000000228 ENSKMAG00000000151 ENSKMAG00000021435 ENSKMAG00000021423 ENSKMAG00000021419 myo1g (ENSKMAG00000021405) si:dkeyp-92c9.2 (ENSKMAG00000021394) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1628 apoa4a (ENSNFUG00015022908) ENSNFUG00015022876 ENSNFUG00015022868 NEDD9 (ENSNFUG00015022859) TMEM170B (ENSNFUG00015022857) HIVEP1 (ENSNFUG00015022853) edn1 (ENSNFUG00015022846) myo1g (ENSNFUG00015022705) KDM1B (ENSNFUG00015022480) slc9a1b (ENSNFUG00015021673) ENSNFUG00015021640 srsf10b (ENSNFUG00015021637) MYCBP (ENSNFUG00015021633) ENSNFUG00015021631 ENSNFUG00015021627 ENSNFUG00015021615 ##22 ENSNFUG00015021605 RPL11 (ENSNFUG00015021595) ENSNFUG00015021584 TCEB3C (ENSNFUG00015021574) PITHD1 (ENSNFUG00015021569) lypla2 (ENSNFUG00015021525) ENSNFUG00015021516 sfpq (ENSNFUG00015021508) ENSNFUG00015021505 ENSNFUG00015021494 ENSNFUG00015021491 ENSNFUG00015021487 AK2 (ENSNFUG00015021475) ENSNFUG00015021473 RNF19B (ENSNFUG00015021447) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000176110 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000177548 ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc.k.b ENSGT01030000234921 ENSGT00940000155824.C.fc.l Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000176110 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00940000161029 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000162741 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT00940000177548 ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc.k.b ENSGT01030000234921 Indian medaka MODERN SPECIES 3 ENY2 (ENSOMEG00000019029) ENSOMEG00000018999 gdf6b (ENSOMEG00000018981) ENSOMEG00000018929 ints8 (ENSOMEG00000018846) DPY19L4 (ENSOMEG00000000655) KDM1B (ENSOMEG00000018643) ENSOMEG00000018507 slc9a1b (ENSOMEG00000018409) ENSOMEG00000018365 srsf10b (ENSOMEG00000018287) gja9b (ENSOMEG00000018274) mycbp (ENSOMEG00000018261) ENSOMEG00000018251 ENSOMEG00000018226 ENSOMEG00000018209 ##22 ENSOMEG00000018186 ENSOMEG00000018154 eloa (ENSOMEG00000018138) pithd1 (ENSOMEG00000018105) lypla2 (ENSOMEG00000018063) sfpq (ENSOMEG00000018020) ENSOMEG00000000458 ENSOMEG00000017837 ENSOMEG00000017835 ak2 (ENSOMEG00000017810) rnf19b (ENSOMEG00000017763) ndufs5 (ENSOMEG00000017722) ENSOMEG00000017691 ENSOMEG00000017669 ENSOMEG00000017642 Javanese ricefish MODERN SPECIES 2 nudcd1 (ENSOJAG00000017741) ENY2 (ENSOJAG00000017753) gdf6b (ENSOJAG00000018879) ENSOJAG00000018883 ENSOJAG00000018896 DPY19L4 (ENSOJAG00000019045) KDM1B (ENSOJAG00000019457) ENSOJAG00000005835 slc9a1b (ENSOJAG00000005891) ENSOJAG00000006118 srsf10b (ENSOJAG00000006194) ENSOJAG00000006209 gja9b (ENSOJAG00000006229) mycbp (ENSOJAG00000006238) ENSOJAG00000006249 ENSOJAG00000006292 ##22 rpl11 (ENSOJAG00000006550) ENSOJAG00000006619 eloa (ENSOJAG00000006718) pithd1 (ENSOJAG00000006737) lypla2 (ENSOJAG00000006764) sfpq (ENSOJAG00000006800) ENSOJAG00000006950 ENSOJAG00000007433 ENSOJAG00000007448 AK2 (ENSOJAG00000007468) ENSOJAG00000007484 ndufs5 (ENSOJAG00000007571) bmp8a (ENSOJAG00000017919) zgc:91910 (ENSOJAG00000017953) gsk3aa (ENSOJAG00000017982) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000007776 ENSGT00390000011748.ab ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000177548 ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc.k.b ENSGT01030000234921 ENSGT00940000155008.C ENSGT00940000159045 ENSGT00980000198642 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 2 ENY2 (ENSORLG00000030402) ENSORLG00000007925 gdf6b (ENSORLG00000007867) ENSORLG00000027329 ints8 (ENSORLG00000007855) DPY19L4 (ENSORLG00000007771) KDM1B (ENSORLG00000007744) ENSORLG00000007724 slc9a1b (ENSORLG00000007714) ENSORLG00000007702 srsf10b (ENSORLG00000007691) gja9b (ENSORLG00000007682) mycbp (ENSORLG00000027339) ENSORLG00000007671 eef1a (ENSORLG00000007614) ENSORLG00000007585 ##22 ENSORLG00000025116 rpl11 (ENSORLG00000007578) ENSORLG00000007567 eloa (ENSORLG00000007504) pithd1 (ENSORLG00000007480) lypla2 (ENSORLG00000007466) sfpq (ENSORLG00000007459) ENSORLG00000030569 ENSORLG00000026715 ENSORLG00000030398 ENSORLG00000027563 ak2 (ENSORLG00000007388) ENSORLG00000007363 ndufs5 (ENSORLG00000028137) ENSORLG00000025786 Chinese medaka DUPLICATION Chinese medaka MODERN SPECIES 2093 EEF1A1 (ENSOSIG00000012684) ##22 Chinese medaka MODERN SPECIES 136 ENSOSIG00000009462 gdf6b (ENSOSIG00000009463) ENSOSIG00000009465 ints8 (ENSOSIG00000009477) ENSOSIG00000010415 DPY19L4 (ENSOSIG00000010418) KDM1B (ENSOSIG00000010422) ENSOSIG00000011691 slc9a1b (ENSOSIG00000011703) ENSOSIG00000014220 srsf10b (ENSOSIG00000014221) gja9b (ENSOSIG00000014222) mycbp (ENSOSIG00000014223) ENSOSIG00000014226 eef1a1l1 (ENSOSIG00000014228) ENSOSIG00000014229 ##22 rpl11 (ENSOSIG00000014249) ENSOSIG00000014250 eloa (ENSOSIG00000014271) pithd1 (ENSOSIG00000014273) lypla2 (ENSOSIG00000014275) sfpq (ENSOSIG00000014280) ak2 (ENSOSIG00000014286) rnf19b (ENSOSIG00000014303) ndufs5 (ENSOSIG00000014305) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000175963.B ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000157594 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1075 ENSSPAG00000002176 CCNE2 (ENSSPAG00000002161) ints8 (ENSSPAG00000002091) DPY19L4 (ENSSPAG00000002071) KDM1B (ENSSPAG00000002036) ENSSPAG00000001981 slc9a1b (ENSSPAG00000001940) ENSSPAG00000001848 ENSSPAG00000001821 srsf10b (ENSSPAG00000001810) gja9b (ENSSPAG00000001804) mycbp (ENSSPAG00000001785) ENSSPAG00000001769 ENSSPAG00000001742 ##22 ENSSPAG00000001734 ##22 ENSSPAG00000001719 ##22 ENSSPAG00000001710 ENSSPAG00000001694 rpl11 (ENSSPAG00000001672) ENSSPAG00000001632 eloa (ENSSPAG00000001612) pithd1 (ENSSPAG00000001585) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1075 ENSSPAG00000002176 CCNE2 (ENSSPAG00000002161) ints8 (ENSSPAG00000002091) DPY19L4 (ENSSPAG00000002071) KDM1B (ENSSPAG00000002036) ENSSPAG00000001981 slc9a1b (ENSSPAG00000001940) ENSSPAG00000001848 ENSSPAG00000001821 srsf10b (ENSSPAG00000001810) gja9b (ENSSPAG00000001804) mycbp (ENSSPAG00000001785) ENSSPAG00000001769 ENSSPAG00000001742 ##22 ENSSPAG00000001734 ##22 ENSSPAG00000001719 ##22 ENSSPAG00000001710 ENSSPAG00000001694 rpl11 (ENSSPAG00000001672) ENSSPAG00000001632 eloa (ENSSPAG00000001612) pithd1 (ENSSPAG00000001585) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 307 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000154576 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.c ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.d ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000166582.b ENSGT00940000165604 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334.f ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000164334.e ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000157751 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00390000007597 ENSGT00970000193390.c.a.b.u.b.a ENSGT00940000156934.k ENSGT00950000183145.C Clown anemonefish MODERN SPECIES 3562 ENSAOCG00000001598 ENSAOCG00000022002 ENSAOCG00000022025 ##22 ENSAOCG00000022039 ENSAOCG00000022074 rpl11 (ENSAOCG00000002035) ENSAOCG00000022153 eloa (ENSAOCG00000002876) pithd1 (ENSAOCG00000002878) lypla2 (ENSAOCG00000002881) sfpq (ENSAOCG00000002889) ENSAOCG00000002895 Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 8 ak2 (ENSAPEG00000015837) ENSAPEG00000015874 ENSAPEG00000015910 ENSAPEG00000015937 ENSAPEG00000015956 ENSAPEG00000016035 ENSAPEG00000016056 slc9a1b (ENSAPEG00000016089) ENSAPEG00000016144 srsf10b (ENSAPEG00000016149) ENSAPEG00000016160 gja9b (ENSAPEG00000016180) mycbp (ENSAPEG00000016191) ENSAPEG00000016215 ENSAPEG00000016257 ##22 ENSAPEG00000016322 ##22 ENSAPEG00000016361 ENSAPEG00000016381 ##22 rpl11 (ENSAPEG00000016389) ENSAPEG00000016421 eloa (ENSAPEG00000016461) pithd1 (ENSAPEG00000016489) lypla2 (ENSAPEG00000016511) sfpq (ENSAPEG00000016556) ENSAPEG00000016579 KDM1B (ENSAPEG00000016633) DPY19L4 (ENSAPEG00000016693) ints8 (ENSAPEG00000016771) ENSAPEG00000016877 CCNE2 (ENSAPEG00000016889) ENSAPEG00000016972 Orange clownfish MODERN SPECIES 8 rnf19b (ENSAPEG00000015788) ak2 (ENSAPEG00000015837) ENSAPEG00000015874 ENSAPEG00000015910 ENSAPEG00000015937 ENSAPEG00000015956 ENSAPEG00000016035 ENSAPEG00000016056 slc9a1b (ENSAPEG00000016089) ENSAPEG00000016144 srsf10b (ENSAPEG00000016149) ENSAPEG00000016160 gja9b (ENSAPEG00000016180) mycbp (ENSAPEG00000016191) ENSAPEG00000016215 ENSAPEG00000016257 ##22 ENSAPEG00000016322 ##22 ENSAPEG00000016361 ENSAPEG00000016381 ##22 rpl11 (ENSAPEG00000016389) ENSAPEG00000016421 eloa (ENSAPEG00000016461) pithd1 (ENSAPEG00000016489) lypla2 (ENSAPEG00000016511) sfpq (ENSAPEG00000016556) ENSAPEG00000016579 KDM1B (ENSAPEG00000016633) DPY19L4 (ENSAPEG00000016693) ints8 (ENSAPEG00000016771) ENSAPEG00000016877 CCNE2 (ENSAPEG00000016889) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT00940000175963.B ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc Midas cichlid MODERN SPECIES 62 slc9a1b (ENSACIG00000001555) ENSACIG00000001537 ENSACIG00000001374 ENSACIG00000001359 gja9b (ENSACIG00000001350) mycbp (ENSACIG00000001337) ENSACIG00000001248 ENSACIG00000001243 ##22 ENSACIG00000001219 ENSACIG00000001197 ##22 rpl11 (ENSACIG00000001176) ENSACIG00000001158 eloa (ENSACIG00000001104) pithd1 (ENSACIG00000001083) lypla2 (ENSACIG00000001058) sfpq (ENSACIG00000000905) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000175963.B ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc Nile tilapia MODERN SPECIES 13 KDM1B (ENSONIG00000013849) ENSONIG00000013850 ENSONIG00000013852 ENSONIG00000042976 granzyme (ENSONIG00000039096) ENSONIG00000041285 ENSONIG00000041642 ENSONIG00000031931 slc9a1b (ENSONIG00000013864) ENSONIG00000039952 srsf10b (ENSONIG00000013871) gja9b (ENSONIG00000020907) ENSONIG00000029599 mycbp (ENSONIG00000017767) ENSONIG00000017762 ef-1a (ENSONIG00000035055) ##22 ENSONIG00000041662 rpl11 (ENSONIG00000017753) ENSONIG00000017749 eloa (ENSONIG00000017746) pithd1 (ENSONIG00000027265) lypla2 (ENSONIG00000017740) sfpq (ENSONIG00000017737) ENSONIG00000017735 ENSONIG00000017733 ENSONIG00000028823 ENSONIG00000040077 ENSONIG00000010751 jpt2 (ENSONIG00000039679) ENSONIG00000027379 ENSONIG00000017728 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232.e ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc Lyretail cichlid MODERN SPECIES 322 ENY2 (ENSNBRG00000016696) ENSNBRG00000016721 gdf6b (ENSNBRG00000016783) ENSNBRG00000016837 ints8 (ENSNBRG00000016875) DPY19L4 (ENSNBRG00000016945) KDM1B (ENSNBRG00000016992) ENSNBRG00000017031 slc9a1b (ENSNBRG00000017066) ENSNBRG00000017142 srsf10b (ENSNBRG00000017230) ENSNBRG00000017240 mycbp (ENSNBRG00000017265) ENSNBRG00000017300 ENSNBRG00000017346 ENSNBRG00000017369 ##22 rpl11 (ENSNBRG00000017377) ENSNBRG00000017390 eloa (ENSNBRG00000017406) pithd1 (ENSNBRG00000017427) lypla2 (ENSNBRG00000017448) sfpq (ENSNBRG00000017479) ENSNBRG00000017563 ENSNBRG00000017699 ENSNBRG00000017732 ENSNBRG00000017811 ENSNBRG00000017856 ENSNBRG00000017921 ENSNBRG00000017939 ENSNBRG00000017975 ENSNBRG00000017986 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232.e ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 568 ENSHBUG00000017681 ENSHBUG00000017646 ints8 (ENSHBUG00000017603) DPY19L4 (ENSHBUG00000017538) KDM1B (ENSHBUG00000017496) ENSHBUG00000017356 slc9a1b (ENSHBUG00000017310) ENSHBUG00000017272 srsf10b (ENSHBUG00000017264) gja9b (ENSHBUG00000017256) mycbp (ENSHBUG00000017241) ENSHBUG00000017195 ENSHBUG00000017166 ENSHBUG00000017136 ##22 ENSHBUG00000017123 ENSHBUG00000017108 ##22 ENSHBUG00000017046 rpl11 (ENSHBUG00000017027) ENSHBUG00000017010 eloa (ENSHBUG00000016952) pithd1 (ENSHBUG00000016911) lypla2 (ENSHBUG00000000498) sfpq (ENSHBUG00000016818) ENSHBUG00000016795 ENSHBUG00000016767 ENSHBUG00000016744 ENSHBUG00000016693 ENSHBUG00000016641 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232.e ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161029 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232.e ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.a.a ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Eastern happy MODERN SPECIES 13 ENSACLG00000000128 gdf6b (ENSACLG00000000123) ENSACLG00000000101 ints8 (ENSACLG00000000057) DPY19L4 (ENSACLG00000022865) KDM1B (ENSACLG00000022761) ENSACLG00000022708 slc9a1b (ENSACLG00000022672) ENSACLG00000022663 srsf10b (ENSACLG00000022631) ENSACLG00000022624 gja9b (ENSACLG00000022619) mycbp (ENSACLG00000022606) ENSACLG00000022580 ENSACLG00000022560 ENSACLG00000022529 ##22 ENSACLG00000022512 rpl11 (ENSACLG00000022487) ENSACLG00000022450 eloa (ENSACLG00000022428) pithd1 (ENSACLG00000022415) lypla2 (ENSACLG00000022367) sfpq (ENSACLG00000022332) ENSACLG00000022279 ENSACLG00000022139 ENSACLG00000022105 ENSACLG00000022082 ENSACLG00000022061 ENSACLG00000022050 ENSACLG00000021988 ENSACLG00000021953 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1104 pkhd1l1.2 (ENSMZEG00005026155) ENSMZEG00005026153 gdf6b (ENSMZEG00005026152) ENSMZEG00005026151 CCNE2 (ENSMZEG00005026150) ints8 (ENSMZEG00005026144) DPY19L4 (ENSMZEG00005026139) KDM1B (ENSMZEG00005026135) ENSMZEG00005026131 slc9a1b (ENSMZEG00005026126) ENSMZEG00005026124 srsf10b (ENSMZEG00005026122) ENSMZEG00005026120 mycbp (ENSMZEG00005026117) ENSMZEG00005026116 ENSMZEG00005026112 ##22 ENSMZEG00005026110 rpl11 (ENSMZEG00005026109) ENSMZEG00005026107 eloa (ENSMZEG00005026105) pithd1 (ENSMZEG00005026103) lypla2 (ENSMZEG00005026098) sfpq (ENSMZEG00005026091) ENSMZEG00005026063 ENSMZEG00005026057 ENSMZEG00005026056 ENSMZEG00005026055 ENSMZEG00005026054 ENSMZEG00005026053 ENSMZEG00005026051 ENSMZEG00005026050 P. nyererei MODERN SPECIES 388 pkhd1l1.2 (ENSPNYG00000006487) gdf6b (ENSPNYG00000006658) ENSPNYG00000006695 ints8 (ENSPNYG00000006742) DPY19L4 (ENSPNYG00000006850) KDM1B (ENSPNYG00000006929) ENSPNYG00000007008 slc9a1b (ENSPNYG00000007054) ENSPNYG00000007074 srsf10b (ENSPNYG00000007168) ENSPNYG00000007181 mycbp (ENSPNYG00000007219) ENSPNYG00000007251 ENSPNYG00000007263 ENSPNYG00000007288 ##22 ENSPNYG00000007306 ##22 rpl11 (ENSPNYG00000007331) ENSPNYG00000007379 eloa (ENSPNYG00000007427) pithd1 (ENSPNYG00000007437) lypla2 (ENSPNYG00000007464) sfpq (ENSPNYG00000007494) ENSPNYG00000007512 ENSPNYG00000007544 ENSPNYG00000007562 ENSPNYG00000007576 ENSPNYG00000007637 ENSPNYG00000007680 Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii DUPLICATION Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000155884.a.c ENSGT00940000159583 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00940000156983.a.b ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.b ENSGT00940000170402 ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00550000075101.t ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.e.a ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000157656.b ENSGT00940000156481.a.a.b ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b.c ENSGT00950000183027.a.b.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT01100000263502.B.a.a.d.b.c.b ENSGT00940000154877.C ENSGT00950000183175.A.d.a.a ENSGT00390000000854.c.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000159583.h ENSGT00390000018730.B.f ##35 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y.f ENSGT00940000156983.a.b.b ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042.i ENSGT00390000001745.b ENSGT00940000157361.b.e ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.c ENSGT00940000154866.B.a.e ENSGT00390000008673.o.b ENSGT00550000075101.t ENSGT00940000166291.f ENSGT00950000183029.B.j.e.a.a ##22 ENSGT01050000244827.E.u.b ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a.e ENSGT00940000157656.b ENSGT00940000156481.a.a.b.n ENSGT00940000156237.h ENSGT00940000156999.f ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.b ENSGT00390000007683 ENSGT00390000014293.b.l ENSGT00570000079168.b.b.a.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00950000183100.B.p.b ENSGT00390000002970.c Huchen MODERN SPECIES 52 flrt2 (ENSHHUG00000027866) ENSHHUG00000027864 rps7 (ENSHHUG00000027783) rnaseh1 (ENSHHUG00000027776) fancl (ENSHHUG00000027770) vrk2 (ENSHHUG00000027761) ENSHHUG00000027760 CCDC85A (ENSHHUG00000027757) ENSHHUG00000027754 SLC24A3 (ENSHHUG00000027718) RIN2 (ENSHHUG00000027715) sc5d (ENSHHUG00000027704) slc17a5 (ENSHHUG00000027694) EEF1A1 (ENSHHUG00000027280) ##22 CGAS (ENSHHUG00000027276) ddx43 (ENSHHUG00000027253) KCNQ5 (ENSHHUG00000027122) ENSHHUG00000027119 ENSHHUG00000027109 NDST2 (ENSHHUG00000026987) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155884.a.c.a.a ENSGT00940000159583.h ENSGT00390000018730.B.f ##35 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y.f ENSGT00940000156983.a.b.b ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042.i ENSGT00390000001745.b ENSGT00940000157361.b.e ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.c ENSGT00940000154866.B.a.e ENSGT00550000075101.t ENSGT00940000166291.f ENSGT00950000183029.B.j.e.a.a ##22 ENSGT01050000244827.E.u.b ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a.e ENSGT00940000157656.b.k ENSGT00940000156481.a.a.b.n ENSGT00940000156237.h ENSGT00940000156999.f ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.b ENSGT00390000007683.g ENSGT00390000014293.b.l ENSGT00570000079168.b.b.a.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00950000183100.B.p.b ENSGT00390000002970.c ENSGT00390000013448.a.a.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000018730.B.f ##35 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y.f ENSGT00990000213803 ENSGT00940000156983.a.b.b ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042.i ENSGT00390000001745.b ENSGT01060000248799.a ENSGT00940000157361.b.e ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.c ENSGT00940000154866.B.a.e ENSGT00550000075101.t ENSGT00940000166291.f ENSGT00950000183029.B.j.e.a.a ##22 ENSGT01050000244827.E.u.b ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a.e ENSGT00940000157656.b.k ENSGT00940000156481.a.a.b.n ENSGT00940000156237.h ENSGT00940000156999.f ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.b ENSGT00390000007683.g ENSGT00390000014293.b.l ENSGT00570000079168.b.b.a.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00950000183100.B.o ENSGT00390000002970.c ENSGT00390000013448.a.a.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159583.h ENSGT00390000018730.B.f ##35 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y.f ENSGT00990000213803 ENSGT00940000156983.a.b.b ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042.i ENSGT00390000001745.b ENSGT00940000157361.b.e ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.c ENSGT00940000154866.B.a.e ENSGT00550000075101.t ENSGT00940000166291.f ENSGT00950000183029.B.j.e.a.a ##22 ENSGT01050000244827.E.u.b ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a.e ENSGT00940000157656.b.k ENSGT00940000156481.a.a.b.n ENSGT00940000156237.h ENSGT00940000156999.f ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.b ENSGT00390000007683.g ENSGT00390000014293.b.l ENSGT00570000079168.b.b.a.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00950000183100.B.o ENSGT00390000002970.c ENSGT00390000013448.a.a.b Chinook salmon MODERN SPECIES 30 GTPBP2 (ENSOTSG00005020686) polh (ENSOTSG00005020678) ENSOTSG00005020675 ENSOTSG00005020670 tp53bp2a (ENSOTSG00005020664) ENSOTSG00005020662 fancl (ENSOTSG00005020634) vrk2 (ENSOTSG00005020632) ENSOTSG00005020631 CCDC85A (ENSOTSG00005020630) soul2 (ENSOTSG00005020627) SLC24A3 (ENSOTSG00005020614) RIN2 (ENSOTSG00005020613) sc5d (ENSOTSG00005020611) slc17a5 (ENSOTSG00005020609) EEF1A1 (ENSOTSG00005020555) ##22 CGAS (ENSOTSG00005020551) ddx43 (ENSOTSG00005020536) KCNQ5 (ENSOTSG00005020521) ENSOTSG00005020520 ENSOTSG00005015455 NDST2 (ENSOTSG00005015366) boc (ENSOTSG00005015311) USF3 (ENSOTSG00005015308) naa50 (ENSOTSG00005015305) ATP6V1A (ENSOTSG00005015298) GRAMD1C (ENSOTSG00005015291) zdhhc23b (ENSOTSG00005015288) ccdc191 (ENSOTSG00005015286) qtrt2 (ENSOTSG00005015285) drd3 (ENSOTSG00005015283) Coho salmon MODERN SPECIES 24 OGFRL1 (ENSOKIG00005043280) ##35 asrgl1 (ENSOKIG00005043209) RIMS1 (ENSOKIG00005043113) ENSOKIG00005043076 ENSOKIG00005043056 fancl (ENSOKIG00005042991) vrk2 (ENSOKIG00005042955) ENSOKIG00005042920 CCDC85A (ENSOKIG00005042898) soul2 (ENSOKIG00005042870) ENSOKIG00005042573 RIN2 (ENSOKIG00005042538) SC5D (ENSOKIG00005042503) slc17a5 (ENSOKIG00005041774) ENSOKIG00005041733 ENSOKIG00005041630 ##22 ddx43 (ENSOKIG00005041294) KCNQ5 (ENSOKIG00005041109) ENSOKIG00005041079 ENSOKIG00005035696 NDST2 (ENSOKIG00005034756) ENSOKIG00005034732 zswim8 (ENSOKIG00005029771) ENSOKIG00005029468 chchd1 (ENSOKIG00005029456) ENSOKIG00005029399 ENSOKIG00005029390 fbxo28 (ENSOKIG00005029386) ENSOKIG00005029379 degs1 (ENSOKIG00005029375) nvl (ENSOKIG00005029013) Rainbow trout MODERN SPECIES RIMS1 (ENSOMYG00000000326) ENSOMYG00000072056 ENSOMYG00000000108 ENSOMYG00000066135 fancl (ENSOMYG00000019795) vrk2 (ENSOMYG00000019744) ENSOMYG00000051676 ENSOMYG00000019720 CCDC85A (ENSOMYG00000019709) soul2 (ENSOMYG00000019692) ENSOMYG00000019490 ENSOMYG00000066129 ENSOMYG00000019427 ENSOMYG00000019392 slc17a5 (ENSOMYG00000018901) EEF1A1 (ENSOMYG00000018789) ##22 CGAS (ENSOMYG00000018737) ddx43 (ENSOMYG00000018355) KCNQ5 (ENSOMYG00000017151) ENSOMYG00000017072 ENSOMYG00000063991 ENSOMYG00000016246 ENSOMYG00000015243 zswim8 (ENSOMYG00000014877) ENSOMYG00000014770 ENSOMYG00000066141 chchd1 (ENSOMYG00000014742) ENSOMYG00000014713 ENSOMYG00000067063 ENSOMYG00000014707 ENSOMYG00000053148 Salmo ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155884.a.c.a.a ENSGT00940000159583.h ENSGT00390000018730.B.f ##35 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y.f ENSGT00940000156983.a.b.b ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042.i ENSGT00390000001745.b ENSGT00940000157361.b.e ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.c ENSGT00940000154866.B.a.e ENSGT00550000075101.t.a ENSGT00940000166291.f ENSGT00950000183029.B.j.e.a.a ##22 ENSGT01050000244827.E.u.b ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a.e ENSGT00940000157656.b.k ENSGT00940000156481.a.a.b.n ENSGT00940000156237.h ENSGT00940000156999.f ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.b ENSGT00390000007683.g ENSGT00390000014293.b.l ENSGT00570000079168.b.b.a.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00950000183100.B.p.b ENSGT00390000002970.c ENSGT00390000013448.a.a.b River trout MODERN SPECIES 35 smap1 (ENSSTUG00000022622) b3gat2 (ENSSTUG00000022666) asrgl1 (ENSSTUG00000022690) RIMS1 (ENSSTUG00000022818) ENSSTUG00000024134 ENSSTUG00000024149 fancl (ENSSTUG00000024193) vrk2 (ENSSTUG00000024264) ENSSTUG00000024348 CCDC85A (ENSSTUG00000024355) soul2 (ENSSTUG00000024376) ENSSTUG00000024389 RIN2 (ENSSTUG00000024476) sc5d (ENSSTUG00000024491) slc17a5 (ENSSTUG00000024519) EEF1A1 (ENSSTUG00000024867) ##22 CGAS (ENSSTUG00000024932) ddx43 (ENSSTUG00000025144) KCNQ5 (ENSSTUG00000025248) ENSSTUG00000025742 ENSSTUG00000025843 NDST2 (ENSSTUG00000029861) zswim8 (ENSSTUG00000030759) ENSSTUG00000031057 chchd1 (ENSSTUG00000031087) ENSSTUG00000031091 ENSSTUG00000000185 ENSSTUG00000000191 ENSSTUG00000000196 polr1c (ENSSTUG00000000221) fbxo28 (ENSSTUG00000000252) Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 OGFRL1 (ENSSSAG00000096472) ##35 asrgl1 (ENSSSAG00000078184) asrgl1 (ENSSSAG00000117701) RIMS1 (ENSSSAG00000078126) ENSSSAG00000078113 fancl (ENSSSAG00000078102) vrk2 (ENSSSAG00000078094) ENSSSAG00000116804 ENSSSAG00000078088 CCDC85A (ENSSSAG00000078084) soul2 (ENSSSAG00000107878) ENSSSAG00000074203 ENSSSAG00000078032 ENSSSAG00000100327 slc17a5 (ENSSSAG00000077945) EEF1A1 (ENSSSAG00000105944) ##22 CGAS (ENSSSAG00000103922) ddx43 (ENSSSAG00000077780) KCNQ5 (ENSSSAG00000077578) ENSSSAG00000077549 ENSSSAG00000070083 ENSSSAG00000068729 zswim8 (ENSSSAG00000055908) ENSSSAG00000089193 chchd1 (ENSSSAG00000055622) ENSSSAG00000055575 ENSSSAG00000121660 ENSSSAG00000121403 ENSSSAG00000055445 fbxo28 (ENSSSAG00000091948) ENSSSAG00000055417 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000158042.j ENSGT00940000157361.b.f ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.d ENSGT00940000154866.B.a.f ENSGT00940000166291.e ENSGT00950000183029.B.j.e.a.b ##22 ENSGT01050000244827.E.u.a ENSGT00940000155933.b.a.f ENSGT00940000156481.a.a.b.m ENSGT00940000156237.g ENSGT00940000156999.e ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.a ENSGT01000000220538 ENSGT00390000014293.b.k ENSGT00570000079168.b.b.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00950000183100.B.p.a ENSGT00390000002970.d ENSGT00390000013448.a.a.a ENSGT00570000079239.g ENSGT00440000037341.a.z.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000166657.a.b ENSGT00390000016976.f ENSGT00940000156965.f ENSGT00940000154308.D.c.a.b.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000153463.b.a.d ENSGT00940000155884.a.c.a.b ENSGT00940000159583.g ENSGT00390000018730.B.e ##35 ENSGT00940000155134.y.e ENSGT00940000156983.a.b.a.a ENSGT00940000158042.j ENSGT00940000157361.b.f ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.d ENSGT00940000154866.B.a.f ENSGT00940000166291.e ENSGT00950000183029.B.j.e.a.b ##22 ENSGT01050000244827.E.u.a ENSGT00940000155933.b.a.f ENSGT00940000157656.b.l ENSGT00940000156481.a.a.b.m ENSGT00940000156237.g ENSGT00940000156999.e ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.a ENSGT00390000007683.h ENSGT00390000014293.b.k ENSGT00570000079168.b.b.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00950000183100.B.p.a ENSGT00390000002970.d ENSGT00390000013448.a.a.a ENSGT00570000079239.g Salmo ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157885.h ENSGT00940000166657.a.b ENSGT00390000016976.f ENSGT00940000156965.f ENSGT00940000154308.D.c.a.b.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000153463.b.a.d ENSGT00940000155884.a.c.a.b ENSGT00940000159583.g ENSGT00390000018730.B.e ##35 ENSGT00940000155134.y.e ENSGT00940000156983.a.b.a.a ENSGT00940000157361.b.f ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.d ENSGT00940000154866.B.a.f ENSGT00940000166291.e ENSGT00950000183029.B.j.e.a.b ##22 ENSGT01050000244827.E.u.a ENSGT00940000155933.b.a.f ENSGT00940000157656.b.l ENSGT00940000156481.a.a.b.m ENSGT00940000156237.g ENSGT00940000156999.e ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.a ENSGT00390000007683.h ENSGT00390000014293.b.k ENSGT00570000079168.b.b.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00950000183100.B.p.a ENSGT00390000002970.d ENSGT00390000013448.a.a.a ENSGT00570000079239.g River trout MODERN SPECIES 9 ENSSTUG00000034366 ENSSTUG00000046347 tp53bp2a (ENSSTUG00000046187) ENSSTUG00000046168 smap1 (ENSSTUG00000046128) b3gat2 (ENSSTUG00000046114) OGFRL1 (ENSSTUG00000046108) ##35 ENSSTUG00000046073 RIMS1 (ENSSTUG00000045800) ENSSTUG00000045776 ENSSTUG00000045774 ENSSTUG00000045768 ENSSTUG00000045593 RIN2 (ENSSTUG00000045560) slc17a5 (ENSSTUG00000045478) EEF1A1 (ENSSTUG00000045376) ##22 CGAS (ENSSTUG00000045363) KCNQ5 (ENSSTUG00000045011) ENSSTUG00000044973 ENSSTUG00000044964 ENSSTUG00000042164 NDST2 (ENSSTUG00000041118) zswim8 (ENSSTUG00000036819) ENSSTUG00000036641 ENSSTUG00000036620 ENSSTUG00000036566 ENSSTUG00000036562 si:ch211-223p8.8 (ENSSTUG00000036548) polr1c (ENSSTUG00000036428) fbxo28 (ENSSTUG00000036418) ENSSTUG00000036406 Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000075627 pcsk2 (ENSSSAG00000075458) ENSSSAG00000096800 ENSSSAG00000075352 smap1 (ENSSSAG00000075322) b3gat2 (ENSSSAG00000097600) OGFRL1 (ENSSSAG00000084639) ##35 RIMS1 (ENSSSAG00000074376) ENSSSAG00000074341 ENSSSAG00000084752 ENSSSAG00000090043 ENSSSAG00000074338 ENSSSAG00000078046 ENSSSAG00000074190 slc17a5 (ENSSSAG00000074184) EEF1A1 (ENSSSAG00000074154) ##22 CGAS (ENSSSAG00000074138) KCNQ5 (ENSSSAG00000071939) ENSSSAG00000118755 ENSSSAG00000042518 ENSSSAG00000041749 ENSSSAG00000089450 zswim8 (ENSSSAG00000005853) ENSSSAG00000112785 chchd1 (ENSSSAG00000005574) ENSSSAG00000005562 ENSSSAG00000005555 rpac1 (ENSSSAG00000005525) FBXO28 (ENSSSAG00000088314) ENSSSAG00000005550 degs1 (ENSSSAG00000084472) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000165723.b.f ENSGT00940000156675.c.a ENSGT00940000157885.h ENSGT00390000016976.f ENSGT00940000156965.f ENSGT00940000154308.D.c.a.b.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000153463.b.a.d ENSGT00940000159583.g ENSGT00390000018730.B.e ##35 ENSGT00940000155134.y.e ENSGT00940000156983.a.b.a.a ENSGT00940000158042.j ENSGT00940000157361.b.f ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.d ENSGT00940000154866.B.a.f ENSGT00950000183029.B.j.e.a.b ##22 ENSGT01050000244827.E.u.a ENSGT00940000155933.b.a.f ENSGT00940000157656.b.l ENSGT00940000156481.a.a.b.m ENSGT00940000156237.g ENSGT00940000156999.e ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.a ENSGT00390000007683.h ENSGT00390000014293.b.k ENSGT00570000079168.b.b.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00950000183100.B.p.a ENSGT00390000002970.d ENSGT00390000013448.a.a.a ENSGT00570000079239.g Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165723.b.f ENSGT00940000156675.c.a ENSGT00940000157885.h ENSGT00390000016976.f ENSGT00940000156965.f ENSGT00940000154308.D.c.a.b.a.b.a.b.b.b ENSGT00940000153463.b.a.d ENSGT00940000159583.g ENSGT00390000018730.B.e ##35 ENSGT00940000155134.y.e ENSGT00940000156983.a.b.a.a ENSGT00940000158042.j ENSGT00940000157361.b.f ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.d ENSGT00940000154866.B.a.f ENSGT00950000183029.B.j.e.a.b ##22 ENSGT01050000244827.E.u.a ENSGT00940000155933.b.a.f ENSGT00940000157656.b.l ENSGT00940000156481.a.a.b.m ENSGT00940000156237.g ENSGT00940000156999.e ENSGT00940000164412.a.a.b.j.b.a ENSGT01000000220538 ENSGT00390000014293.b.k ENSGT00570000079168.b.b.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00950000183100.B.p.a ENSGT00390000002970.d ENSGT00390000013448.a.a.a ENSGT00570000079239.g Coho salmon MODERN SPECIES 2 ENSOKIG00005032467 pcdh15a (ENSOKIG00005032623) plek (ENSOKIG00005036783) BFSP1 (ENSOKIG00005037024) pcsk2 (ENSOKIG00005037109) ENSOKIG00005037613 TP53BP2 (ENSOKIG00005037634) b3gat2 (ENSOKIG00005037776) OGFRL1 (ENSOKIG00005037810) ##35 RIMS1 (ENSOKIG00005038258) ENSOKIG00005041192 vrk2 (ENSOKIG00005041239) ENSOKIG00005041303 ENSOKIG00005041329 RIN2 (ENSOKIG00005041428) ENSOKIG00005041504 ##22 ENSOKIG00005041753 ENSOKIG00005041760 ENSOKIG00005041803 ENSOKIG00005042119 ENSOKIG00005042304 NDST2 (ENSOKIG00005043875) zswim8 (ENSOKIG00005044477) ENSOKIG00005045313 ENSOKIG00005045338 ENSOKIG00005045346 ENSOKIG00005045377 ENSOKIG00005045384 polr1c (ENSOKIG00005045401) fbxo28 (ENSOKIG00005045448) ENSOKIG00005045454 Chinook salmon MODERN SPECIES LTBP1 (ENSOTSG00005013163) rasgrp3 (ENSOTSG00005013432) degs1 (ENSOTSG00005016628) fbxo28 (ENSOTSG00005016629) polr1c (ENSOTSG00005016630) si:ch211-223p8.8 (ENSOTSG00005016672) ENSOTSG00005016675 ENSOTSG00005016676 ENSOTSG00005016677 zswim8 (ENSOTSG00005016688) NDST2 (ENSOTSG00005019149) ENSOTSG00005021975 ENSOTSG00005023769 ENSOTSG00005023772 RIN2 (ENSOTSG00005023774) EEF1A1 (ENSOTSG00005023778) ##22 ENSOTSG00005023788 KCNQ5 (ENSOTSG00005023790) ENSOTSG00005023849 ENSOTSG00005023852 ENSOTSG00005023853 ENSOTSG00005023854 ENSOTSG00005023856 ENSOTSG00005023858 ENSOTSG00005023861 ##35 b3gat2 (ENSOTSG00005023864) tp53bp2a (ENSOTSG00005023869) ENSOTSG00005000055 pcsk2 (ENSOTSG00005000145) BFSP1 (ENSOTSG00005000150) plek (ENSOTSG00005000169) Rainbow trout MODERN SPECIES 15 pcsk2 (ENSOMYG00000040378) ENSOMYG00000040278 ENSOMYG00000040241 b3gat2 (ENSOMYG00000040179) ENSOMYG00000040160 ##35 ENSOMYG00000050267 ENSOMYG00000063780 RIMS1 (ENSOMYG00000040144) ENSOMYG00000040132 vrk2 (ENSOMYG00000040106) ENSOMYG00000040087 ENSOMYG00000052839 ENSOMYG00000040073 ENSOMYG00000056917 ENSOMYG00000040054 EEF1A1 (ENSOMYG00000039980) ##22 ENSOMYG00000039937 KCNQ5 (ENSOMYG00000039878) ENSOMYG00000039685 ENSOMYG00000038561 ENSOMYG00000074877 zswim8 (ENSOMYG00000035056) ENSOMYG00000034743 chchd1 (ENSOMYG00000034721) ENSOMYG00000034713 ENSOMYG00000034705 ENSOMYG00000048967 ENSOMYG00000034630 fbxo28 (ENSOMYG00000034596) ENSOMYG00000034592 ENSOMYG00000057435 Huchen MODERN SPECIES 27 ENSHHUG00000033780 SLC24A3 (ENSHHUG00000033674) RIN2 (ENSHHUG00000033637) slc17a5 (ENSHHUG00000033629) EEF1A1 (ENSHHUG00000033326) ##22 CGAS (ENSHHUG00000033317) KCNQ5 (ENSHHUG00000033300) ENSHHUG00000030148 NDST2 (ENSHHUG00000029866) zswim8 (ENSHHUG00000029625) ENSHHUG00000029609 ENSHHUG00000029602 ENSHHUG00000029584 ENSHHUG00000029578 si:ch211-223p8.8 (ENSHHUG00000029567) polr1c (ENSHHUG00000029524) fbxo28 (ENSHHUG00000029519) degs1 (ENSHHUG00000029515) nvl (ENSHHUG00000029491) ENSHHUG00000029468 Northern pike MODERN SPECIES 5 smap1 (ENSELUG00000011620) b3gat2 (ENSELUG00000011664) OGFRL1 (ENSELUG00000011690) ##35 asrgl1 (ENSELUG00000000424) RIMS1 (ENSELUG00000011803) ENSELUG00000011850 ENSELUG00000032350 fancl (ENSELUG00000011876) vrk2 (ENSELUG00000011898) CCDC85A (ENSELUG00000011910) ENSELUG00000011921 SLC24A3 (ENSELUG00000011958) RIN2 (ENSELUG00000011985) sc5d (ENSELUG00000012009) slc17a5 (ENSELUG00000012049) eef1a1b (ENSELUG00000012084) ##22 CGAS (ENSELUG00000012095) ddx43 (ENSELUG00000012126) KCNQ5 (ENSELUG00000012235) ENSELUG00000012272 ENSELUG00000012521 ENSELUG00000027301 NDST2 (ENSELUG00000012593) zswim8 (ENSELUG00000012714) ENSELUG00000012778 chchd1 (ENSELUG00000012809) ENSELUG00000012817 ENSELUG00000012891 ENSELUG00000012909 ENSELUG00000026080 si:ch211-223p8.8 (ENSELUG00000012941) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.d ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a.e ENSGT00390000000909 ENSGT00940000156184.a ENSGT00980000198902 ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.e.b ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00940000155884.b ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000154418.a.a.b ENSGT00940000153342.a Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000156696.B.g ENSGT00940000157732.f.a.e.b ENSGT00390000000909.f ENSGT00940000156184.a.i ENSGT00940000153431.b.r.a ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b.f ENSGT01100000263476.B.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.e.b ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z.f.a.b ENSGT00940000155884.b.d ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.b.a ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515.k.a ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000158515.l ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a.f Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000164982.b.b ENSGT00390000000483.a.b.b ENSGT00990000206076.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a.k ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.a.a ENSGT00940000156696.B.g ENSGT00940000157732.f.a.e.b ENSGT00390000000909.f ENSGT00940000156184.a.i ENSGT00940000153431.b.r.a ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b.f ENSGT01100000263476.A.b.a.b.a ENSGT00940000155933.b.b.e.a ENSGT00940000162741.b ENSGT00950000183029.B.j.e.b ##22 ENSGT00940000155933.b.b.e.b ENSGT00940000155134.z.f.a.b ENSGT00940000155884.b.d ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.b.a ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515.k.a ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a.e ENSGT00940000154418.a.a.b.c.b ENSGT00940000153342.a.f Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000164982.b.b ENSGT00940000167072 ENSGT00990000206076.d ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a.k ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.a.a ENSGT00940000156696.B.g ENSGT00940000157732.f.a.e.b ENSGT00390000000909.e ENSGT00940000156184.a.j ENSGT00940000168136 ENSGT00980000198902 ENSGT00940000153431.b.r.a ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b.f ENSGT00940000154866.B.b.e ENSGT01100000263476.A.b.a.a ENSGT00950000183029.B.j.e.b.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b.e.b ENSGT00940000155134.z.f.b ENSGT00940000155884.b.d.a ENSGT00390000006243.l ENSGT00940000164611.b.b ENSGT00940000164095.b.a.b ENSGT00940000159518.b.e ENSGT00390000014031.k ENSGT00940000158515.k.b ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034.s ENSGT00940000163289.b.a.a.f ENSGT00940000154418.a.a.b.c.a ENSGT00940000153342.a.e.a.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 11 ENSSSAG00000088994 ENSSSAG00000104985 ENSSSAG00000084073 ENSSSAG00000113979 ENSSSAG00000075924 neurl1aa (ENSSSAG00000009737) SH3PXD2A (ENSSSAG00000077123) stn1 (ENSSSAG00000009712) SLK (ENSSSAG00000077165) ENSSSAG00000089494 dtd1 (ENSSSAG00000077334) SLC24A3 (ENSSSAG00000077343) RIN2 (ENSSSAG00000077352) ENSSSAG00000006741 ENSSSAG00000077363 ENSSSAG00000077370 ##22 ENSSSAG00000077417 ENSSSAG00000077953 ENSSSAG00000078828 cenpk (ENSSSAG00000000322) lbx1b (ENSSSAG00000106457) ENSSSAG00000000388 fgf8b (ENSSSAG00000097919) dpcd (ENSSSAG00000000437) poll (ENSSSAG00000008385) wbp1lb (ENSSSAG00000111043) as3mt (ENSSSAG00000000508) ENSSSAG00000000557 nt5c2b (ENSSSAG00000078886) inab (ENSSSAG00000079284) pdcd11 (ENSSSAG00000079293) River trout MODERN SPECIES 31 PNPLA6 (ENSSTUG00000043958) ENSSTUG00000043939 ENSSTUG00000043935 ENSSTUG00000043929 ENSSTUG00000042977 ENSSTUG00000039369 neurl1aa (ENSSTUG00000039309) SH3PXD2A (ENSSTUG00000039294) stn1 (ENSSTUG00000039267) SLK (ENSSTUG00000038768) dtd1 (ENSSTUG00000049789) SLC24A3 (ENSSTUG00000049787) ENSSTUG00000049780 ENSSTUG00000049775 ENSSTUG00000049772 ENSSTUG00000049762 ##22 ENSSTUG00000049586 RIMS1 (ENSSTUG00000049254) ENSSTUG00000049196 cenpk (ENSSTUG00000049185) lbx1b (ENSSTUG00000049180) ENSSTUG00000049091 fgf8b (ENSSTUG00000049053) dpcd (ENSSTUG00000049043) poll (ENSSTUG00000049036) wbp1lb (ENSSTUG00000049033) as3mt (ENSSTUG00000048917) CNNM2 (ENSSTUG00000048902) nt5c2b (ENSSTUG00000048853) ENSSTUG00000048836 inab (ENSSTUG00000048835) Salmo ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00550000075117.m.a.a ENSGT00940000155632.p.j ENSGT00940000159130.i.b ENSGT00940000164982.b.a ENSGT00390000000483.a.b.a.b ENSGT00990000206076.c ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a.l ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000156696.B.h.a ENSGT00940000157732.f.a.e.a ENSGT00390000000909.f ENSGT00940000156184.a.i ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b.e ENSGT00940000154866.B.b.f ENSGT01100000263476.A.b.a.b.a ENSGT00950000183029.B.j.e.b.b ##22 ENSGT00940000155933.b.b.e.a ENSGT00940000155134.z.e.a ENSGT00940000155884.b.d.b ENSGT00390000006243.k ENSGT00940000164611.b.a ENSGT00940000164095.b.a.a ENSGT00940000159518.b.f ENSGT00390000014031.l ENSGT00940000158515.k.a ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000159034.t ENSGT00940000163289.b.a.a.e ENSGT00940000154418.a.a.b.c.b ENSGT00940000153342.a.e.a.b ENSGT00940000153342.a.f River trout MODERN SPECIES 5 ENSSTUG00000023888 ENSSTUG00000023930 ENSSTUG00000024615 ENSSTUG00000024658 neurl1aa (ENSSTUG00000025500) SH3PXD2A (ENSSTUG00000025515) stn1 (ENSSTUG00000025633) slkb (ENSSTUG00000025673) ENSSTUG00000026640 ENSSTUG00000026668 dtd1 (ENSSTUG00000026692) SLC24A3 (ENSSTUG00000026705) RIN2 (ENSSTUG00000026715) ENSSTUG00000026730 ENSSTUG00000026742 ENSSTUG00000026751 ##22 ENSSTUG00000026821 RIMS1 (ENSSTUG00000026976) ENSSTUG00000030783 cenpk (ENSSTUG00000030796) lbx1b (ENSSTUG00000030824) ENSSTUG00000030833 fgf8b (ENSSTUG00000030879) dpcd (ENSSTUG00000030884) poll (ENSSTUG00000030901) wbp1lb (ENSSTUG00000030911) CNNM2 (ENSSTUG00000030920) nt5c2b (ENSSTUG00000030969) inab (ENSSTUG00000031227) taf5 (ENSSTUG00000031238) atp5md (ENSSTUG00000031569) Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 ENSSSAG00000117210 ENSSSAG00000026282 ENSSSAG00000009812 neurl1aa (ENSSSAG00000077112) ENSSSAG00000107127 SH3PXD2A (ENSSSAG00000009727) stn1 (ENSSSAG00000088408) SLK (ENSSSAG00000006874) ENSSSAG00000108873 ENSSSAG00000006769 ENSSSAG00000116802 ENSSSAG00000006755 ENSSSAG00000116362 ENSSSAG00000077361 ENSSSAG00000006735 ENSSSAG00000006679 ##22 ENSSSAG00000005004 ENSSSAG00000000250 ENSSSAG00000000305 cenpk (ENSSSAG00000078834) lbx1b (ENSSSAG00000092954) ENSSSAG00000094147 ENSSSAG00000073607 fgf8b (ENSSSAG00000008393) dpcd (ENSSSAG00000008388) poll (ENSSSAG00000000450) wbp1lb (ENSSSAG00000113488) as3mt (ENSSSAG00000008326) ENSSSAG00000008311 inab (ENSSSAG00000104505) nt5c2b (ENSSSAG00000000687) Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus DUPLICATION Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000483.a.b.b ENSGT00390000000483.a.b.a.a.b ENSGT00990000206076.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a.l.a.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.b.a ENSGT00940000156696.B.h.a ENSGT00940000157732.f.a.e.a ENSGT00390000000909.e ENSGT00940000156184.a.j ENSGT00980000198902 ENSGT00940000153431.b.r.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b.h ENSGT00940000154866.B.b.f ENSGT01100000263476.A.b.a.b.a ENSGT01100000263476.A.b.a.b.b.a.a ENSGT00950000183029.B.j.e.b.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b.e.a ENSGT01080000258962 ENSGT00940000155134.z.e ENSGT00940000155884.b.c ENSGT00390000006243.n ENSGT00940000164611.b.c.a ENSGT00940000164095.b.a ENSGT00940000159518.b.h ENSGT00390000014031.j ENSGT00940000158515.k.a ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.b.a ENSGT00390000001742.a.n ENSGT00940000154418.a.a.b.c.b ENSGT00940000153342.a.f ENSGT00940000166377.g Rainbow trout MODERN SPECIES 8 ENSOMYG00000069443 ENSOMYG00000054477 ENSOMYG00000038121 neurl1aa (ENSOMYG00000037720) SH3PXD2A (ENSOMYG00000037704) stn1 (ENSOMYG00000037658) SLK (ENSOMYG00000033386) ENSOMYG00000077173 ENSOMYG00000074597 DTD1 (ENSOMYG00000032719) SLC24A3 (ENSOMYG00000032700) ENSOMYG00000056365 RIN2 (ENSOMYG00000032641) ENSOMYG00000032618 ENSOMYG00000032590 ENSOMYG00000032529 ##22 ENSOMYG00000060658 ENSOMYG00000031469 ENSOMYG00000030981 ENSOMYG00000030782 cenpk (ENSOMYG00000030767) lbx1b (ENSOMYG00000030762) ENSOMYG00000030288 fgf8b (ENSOMYG00000069031) dpcd (ENSOMYG00000030065) poll (ENSOMYG00000030037) wbp1lb (ENSOMYG00000030012) as3mt (ENSOMYG00000029994) ENSOMYG00000049904 nt5c2b (ENSOMYG00000012141) ENSOMYG00000068185 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000000483.a.b.a.a.b ENSGT00990000206076.c.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a.c.a.l.a.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.b.a ENSGT00940000156696.B.h.a ENSGT00940000157732.f.a.e.a ENSGT00390000000909.e ENSGT00940000156184.a.j ENSGT00980000198902 ENSGT00940000153431.b.r.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b.g ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b.h ENSGT00940000154866.B.b.f ENSGT01100000263476.A.b.a.b.a ENSGT01100000263476.A.b.a.b.b.a.a ENSGT00950000183029.B.j.e.b.c.a ##22 ENSGT00940000155933.b.b.e.a ENSGT01080000258962 ENSGT00940000155884.b.c ENSGT00390000006243.n ENSGT00940000164611.b.c.a ENSGT00940000164095.b.a ENSGT00940000159518.b.h ENSGT00390000014031.j ENSGT00940000158515.k.a ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.b.a ENSGT00390000001742.a.n ENSGT00940000159034.r ENSGT00940000163289.b.a.a.e ENSGT00940000154418.a.a.b.c.b ENSGT00940000153342.a.f Chinook salmon MODERN SPECIES 88 RIN2 (ENSOTSG00005037448) ENSOTSG00005037445 ENSOTSG00005037443 EEF1A1 (ENSOTSG00005045683) ##22 ENSOTSG00005045682 ENSOTSG00005045467 RIMS1 (ENSOTSG00005044599) ENSOTSG00005044587 ENSOTSG00005044583 cenpk (ENSOTSG00005044581) lbx1b (ENSOTSG00005044580) slc2a15b (ENSOTSG00005044578) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 727 ENSGT00940000162741.b ENSGT00950000183029.B.j.e.b.c.b ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 846 ENSGT00940000162741.b ENSGT00950000183029.B.j.e.b.c.b ##22 Chinook salmon MODERN SPECIES 120 SLC24A3 (ENSOTSG00005030825) RIN2 (ENSOTSG00005030826) ENSOTSG00005030827 ENSOTSG00005030828 ENSOTSG00005030830 ENSOTSG00005030829 ##22 ENSOTSG00005030832 RIMS1 (ENSOTSG00005030834) Rainbow trout MODERN SPECIES 4 ENSOMYG00000022127 ENSOMYG00000072254 ENSOMYG00000040542 neurl1aa (ENSOMYG00000040306) ENSOMYG00000056017 SH3PXD2A (ENSOMYG00000040294) stn1 (ENSOMYG00000040274) SLK (ENSOMYG00000035986) DTD1 (ENSOMYG00000035372) SLC24A3 (ENSOMYG00000035348) ENSOMYG00000063915 RIN2 (ENSOMYG00000035334) ENSOMYG00000035318 ENSOMYG00000073188 ENSOMYG00000035283 ENSOMYG00000035209 ##22 ENSOMYG00000034676 ENSOMYG00000031395 ENSOMYG00000030949 cenpk (ENSOMYG00000030919) lbx1b (ENSOMYG00000030905) ENSOMYG00000030866 fgf8b (ENSOMYG00000003927) dpcd (ENSOMYG00000030819) poll (ENSOMYG00000030792) wbp1lb (ENSOMYG00000030780) as3mt (ENSOMYG00000030751) ENSOMYG00000030734 nt5c2b (ENSOMYG00000029057) inab (ENSOMYG00000028395) taf5 (ENSOMYG00000028324) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.j.e.b.d ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.j.e.b.d ##22 Coho salmon MODERN SPECIES ENSOKIG00005019709 caly (ENSOKIG00005019730) ENSOKIG00005019741 ENSOKIG00005019785 ENSOKIG00005020516 neurl1aa (ENSOKIG00005024241) SH3PXD2A (ENSOKIG00005024253) ENSOKIG00005024292 stn1 (ENSOKIG00005024324) SLK (ENSOKIG00005024536) ENSOKIG00005030775 ENSOKIG00005030802 RIN2 (ENSOKIG00005030826) ENSOKIG00005030848 ENSOKIG00005030879 ENSOKIG00005030893 ##22 ENSOKIG00005031032 ENSOKIG00005031804 RIMS1 (ENSOKIG00005031962) ENSOKIG00005033433 ENSOKIG00005033446 cenpk (ENSOKIG00005033460) lbx1b (ENSOKIG00005033488) ENSOKIG00005033542 ENSOKIG00005033829 fgf8b (ENSOKIG00005033833) dpcd (ENSOKIG00005033839) poll (ENSOKIG00005033862) wbp1lb (ENSOKIG00005033879) as3mt (ENSOKIG00005033893) CNNM2 (ENSOKIG00005034003) Huchen MODERN SPECIES 484 SLC24A3 (ENSHHUG00000046627) RIN2 (ENSHHUG00000046592) ENSHHUG00000046577 ENSHHUG00000046569 ENSHHUG00000046562 ENSHHUG00000046557 ENSHHUG00000046549 ENSHHUG00000046369 ##22 ENSHHUG00000046303 ENSHHUG00000046299 RIMS1 (ENSHHUG00000046260) ENSHHUG00000046257 cenpk (ENSHHUG00000046254) lbx1b (ENSHHUG00000046240) slc2a15b (ENSHHUG00000046232) fgf8b (ENSHHUG00000046083) dpcd (ENSHHUG00000046070) poll (ENSHHUG00000046062) wbp1lb (ENSHHUG00000046059) as3mt (ENSHHUG00000046047) CNNM2 (ENSHHUG00000046045) nt5c2b (ENSHHUG00000046006) inab (ENSHHUG00000046004) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 505 ENSGT00950000183029.B.j.f ##22 ENSGT00940000174058 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1850 ENSGT00950000183029.B.j.f ##22 ENSGT00940000174058 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B.j.f ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00950000183099.b.a ENSGT00550000075117.m.a.b ENSGT00940000155632.p.i ENSGT00940000159130.i.a ENSGT00940000164982.b.b ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.a.a ENSGT00940000156696.B.g ENSGT00940000157732.f.a.e.b ENSGT00390000000909.f ENSGT00940000156184.a.i.a ENSGT00940000153431.b.r.a ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b.g ENSGT01030000234532.A.a.a.b.k ENSGT00940000154866.B.b.e ENSGT01100000263476.A.b.a.a ENSGT00950000183029.B.j.f ##22 ENSGT00940000155933.b.b.e.b ENSGT00940000155134.z.f.a.b ENSGT00940000155884.b.d ENSGT00390000006243.m ENSGT00940000164611.b.c.b ENSGT00940000164095.b.b ENSGT00940000159518.b.g ENSGT00390000014031.i ENSGT00940000158515.l ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.b.b ENSGT00390000001742.a.m ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a.f ENSGT00940000154418.a.a.b.c.a ENSGT00940000153342.a.e.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000000159.j.c ENSGT00950000183099.b.a ENSGT00550000075117.m.a.b ENSGT00940000155632.p.i ENSGT00940000159130.i.a ENSGT00940000164982.b.b ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.c.a.a ENSGT00940000156696.B.g ENSGT00940000157732.f.a.e.b ENSGT00390000000909.f ENSGT00940000156184.a.i.a ENSGT00940000153431.b.r.a ENSGT01030000234532.A.a.a.b.k ENSGT00940000154866.B.b.e ENSGT01100000263476.A.b.a.b.b.a.b ENSGT00950000183029.B.j.f ##22 ENSGT00940000155933.b.b.e.b ENSGT00940000155134.z.f.a.b ENSGT00940000155884.b.d ENSGT00390000006243.m ENSGT00940000164611.b.c.b ENSGT00940000164095.b.b ENSGT00940000159518.b.g ENSGT00940000158515.l.a ENSGT00390000014031.i ENSGT00940000158515.k.b ENSGT00940000158515.l.b ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b.b.b ENSGT00390000001742.a.m ENSGT00940000159034.q.a ENSGT00940000163289.b.a.a.f Coho salmon MODERN SPECIES 12 ENSOKIG00005044267 ENSOKIG00005044336 ENSOKIG00005044694 ENSOKIG00005019027 ENSOKIG00005019315 neurl1aa (ENSOKIG00005023865) SH3PXD2A (ENSOKIG00005023934) stn1 (ENSOKIG00005024027) slkb (ENSOKIG00005024184) DTD1 (ENSOKIG00005024674) ENSOKIG00005024713 RIN2 (ENSOKIG00005024742) ENSOKIG00005024776 ENSOKIG00005024790 ENSOKIG00005024801 ENSOKIG00005024807 ##22 ENSOKIG00005024829 RIMS1 (ENSOKIG00005024968) ENSOKIG00005025675 ENSOKIG00005025692 lbx1b (ENSOKIG00005025704) ENSOKIG00005025752 fgf8b (ENSOKIG00005026139) dpcd (ENSOKIG00005026181) ENSOKIG00005026202 poll (ENSOKIG00005026221) wbp1lb (ENSOKIG00005026288) as3mt (ENSOKIG00005026319) CNNM2 (ENSOKIG00005026462) nt5c2b (ENSOKIG00005026543) inab (ENSOKIG00005027163) Huchen DUPLICATION Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 408 ENSHHUG00000011924 ENSHHUG00000011912 dtd1 (ENSHHUG00000011896) SLC24A3 (ENSHHUG00000011862) RIN2 (ENSHHUG00000011679) ENSHHUG00000011675 ENSHHUG00000011673 ENSHHUG00000011672 ENSHHUG00000011668 ##22 ENSHHUG00000011664 ENSHHUG00000011658 ENSHHUG00000011643 RIMS1 (ENSHHUG00000010786) SMAP1 (ENSHHUG00000010747) ENSHHUG00000010723 lbx1b (ENSHHUG00000010702) slc2a15b (ENSHHUG00000010687) Huchen MODERN SPECIES 899 ENSHHUG00000008329 ENSHHUG00000008345 ENSHHUG00000008346 arl8a (ENSHHUG00000008354) GPR37L1 (ENSHHUG00000008409) ##37 itpr3 (ENSHHUG00000008419) snx21 (ENSHHUG00000008832) dnase1l1 (ENSHHUG00000008850) hm13 (ENSHHUG00000008934) ID1 (ENSHHUG00000009034) mrgbp (ENSHHUG00000009062) #36 ENSHHUG00000009069 ##22 ENSHHUG00000009077 Huchen MODERN SPECIES 756 ENSHHUG00000009705 ENSHHUG00000009712 ENSHHUG00000009727 cdca8 (ENSHHUG00000009731) c19h1orf109 (ENSHHUG00000009741) ENSHHUG00000009753 ago4 (ENSHHUG00000009771) ENSHHUG00000010816 ENSHHUG00000010842 psmb2 (ENSHHUG00000010843) ENSHHUG00000010846 KIAA0319L (ENSHHUG00000010857) cap1 (ENSHHUG00000010925) ppt1 (ENSHHUG00000011019) ENSHHUG00000011142 ENSHHUG00000011165 ##22 ENSHHUG00000011937 rpl11 (ENSHHUG00000011940) ENSHHUG00000012017 eloa (ENSHHUG00000012020) pithd1 (ENSHHUG00000012031) lypla2 (ENSHHUG00000012039) sfpq (ENSHHUG00000012098) ENSHHUG00000012167 ENSHHUG00000012212 illr4 (ENSHHUG00000012231) illr4 (ENSHHUG00000012252) ENSHHUG00000012261 ak2 (ENSHHUG00000012276) rnf19b (ENSHHUG00000012331) ndufs5 (ENSHHUG00000012378) Otomorpha DUPLICATION Otomorpha DUPLICATION Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 1011 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000175786 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00390000002881 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000175786 ENSGT00940000159638.g ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00390000002881 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554.b ENSGT00460000042249 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 575 ENSGT00940000157613.g ENSGT00390000017955.c.sb ENSGT00940000156790.fb ENSGT00940000166232.d ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211.j ENSGT00940000166197.d ENSGT00390000002428.a.a ENSGT00940000156197.gb ENSGT00940000165758.a ENSGT00940000175699 ENSGT01030000234531.C.e ENSGT00390000012916.bb ENSGT00390000005801.b ENSGT00940000154655.a.i.b.a ENSGT00940000155549.a.a.b.p.a ENSGT00940000157893.h Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000175786.a ENSGT00940000159638.g.a ENSGT00950000183168.B.a.a ENSGT00940000157554.s.a ENSGT00390000018883.c ENSGT00950000182962.b.a.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a.b ENSGT00530000063929.a.b.h.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352.e ENSGT00940000159342.a.c ENSGT00940000157613.g ENSGT00390000017955.c.sb ENSGT00940000156790.fb ENSGT00940000166232.d ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E.h.b ENSGT00910000144211.k ENSGT00940000166197.d ENSGT00390000002428.a.a ENSGT00940000156197.gb ENSGT00940000165758.a ENSGT00940000175699 ENSGT01030000234531.C.e ENSGT00390000012916.bb ENSGT00390000005801.b ENSGT00940000154655.a.i.b.a ENSGT00940000155549.a.a.b.p.a ENSGT00940000157893.h Common carp reference MODERN SPECIES 31 ENSCCRG00000050201 ENSCCRG00000081784 matn1 (ENSCCRG00000079213) sesn2 (ENSCCRG00000031091) yrk (ENSCCRG00000061987) AHDC1 (ENSCCRG00000062000) wasf2 (ENSCCRG00000071212) gpr3 (ENSCCRG00000077745) CD164L2 (ENSCCRG00000042396) si:ch211-199g17.9 (ENSCCRG00000050871) fam83hb (ENSCCRG00000050874) ENSCCRG00000024103 cap1 (ENSCCRG00000024091) ppt1 (ENSCCRG00000024020) ENSCCRG00000024006 ENSCCRG00000041266 ##22 ENSCCRG00000041301 ##22 ENSCCRG00000082450 rpl11 (ENSCCRG00000041254) ENSCCRG00000041241 eloa (ENSCCRG00000068552) lypla2 (ENSCCRG00000058275) ankib1a (ENSCCRG00000043360) ENSCCRG00000081238 lrrc14b (ENSCCRG00000043339) uqcrb (ENSCCRG00000076213) rad21b (ENSCCRG00000075006) CSMD3 (ENSCCRG00000043191) trps1 (ENSCCRG00000047454) eif3hb (ENSCCRG00000039076) ENSCCRG00000030922 Goldfish MODERN SPECIES 38 SDC3 (ENSCARG00000065809) ENSCARG00000065818 ENSCARG00000065824 matn1 (ENSCARG00000065836) sesn2 (ENSCARG00000018320) yrk (ENSCARG00000018346) AHDC1 (ENSCARG00000018410) wasf2 (ENSCARG00000018420) CD164L2 (ENSCARG00000018441) si:ch211-199g17.9 (ENSCARG00000018451) fam83hb (ENSCARG00000018473) KIAA0319L (ENSCARG00000018518) cap1 (ENSCARG00000019433) ppt1 (ENSCARG00000019499) ENSCARG00000019568 ENSCARG00000019582 ##22 ENSCARG00000019630 ##22 rpl11 (ENSCARG00000019634) ENSCARG00000019656 eloa (ENSCARG00000019670) pithd1 (ENSCARG00000019687) lypla2 (ENSCARG00000019704) ankib1a (ENSCARG00000019717) lrrc14b (ENSCARG00000019758) uqcrb (ENSCARG00000019768) ENSCARG00000019781 rad21b (ENSCARG00000019793) CSMD3 (ENSCARG00000019896) ENSCARG00000020271 COL22A1 (ENSCARG00000020324) kcnk9 (ENSCARG00000020351) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000175786 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00390000002881 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158079 ENSGT00940000160209 ENSGT00650000093445 ENSGT00940000175786 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b Characoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158079 ENSGT00940000160209 ENSGT00650000093445 ENSGT00940000175786 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1 ENSPNAG00000026544 matn1 (ENSPNAG00000007138) sesn2 (ENSPNAG00000006738) yrk (ENSPNAG00000004051) AHDC1 (ENSPNAG00000004726) ENSPNAG00000026358 wasf2 (ENSPNAG00000026345) gpr3 (ENSPNAG00000026328) ENSPNAG00000026316 si:ch211-199g17.9 (ENSPNAG00000026286) fam83hb (ENSPNAG00000026242) KIAA0319L (ENSPNAG00000026231) cap1 (ENSPNAG00000006261) ppt1 (ENSPNAG00000026191) ENSPNAG00000004013 ENSPNAG00000026137 ##22 ENSPNAG00000026105 ##22 ENSPNAG00000026075 rpl11 (ENSPNAG00000026061) ENSPNAG00000026024 eloa (ENSPNAG00000025986) pithd1 (ENSPNAG00000025972) lypla2 (ENSPNAG00000025943) ankib1a (ENSPNAG00000025893) gatad1 (ENSPNAG00000025686) ENSPNAG00000025661 lrrc14b (ENSPNAG00000025596) uqcrb (ENSPNAG00000025584) mterf3 (ENSPNAG00000025430) rad21b (ENSPNAG00000025416) CSMD3 (ENSPNAG00000004769) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00530000063426.b.a ENSGT00940000164552 ENSGT00390000011115 ENSGT00390000008551 ENSGT00940000163648.b ENSGT00940000158729 ENSGT00390000012738 ENSGT00980000199207 ENSGT00640000091536 ENSGT00950000182848.c.b.b.a ENSGT00390000013601 ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 ENSGT00390000003465.b.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a Denticle herring MODERN SPECIES 12 psmb2 (ENSDCDG00000025825) tfap2e (ENSDCDG00000025820) NCDN (ENSDCDG00000025814) KIAA0319L (ENSDCDG00000024599) cap1 (ENSDCDG00000024085) ppt1 (ENSDCDG00000024058) ENSDCDG00000024052 ybx1 (ENSDCDG00000024051) ENSDCDG00000024048 ENSDCDG00000024045 ENSDCDG00000024034 ENSDCDG00000024027 ENSDCDG00000024025 ENSDCDG00000024013 ENSDCDG00000024010 ENSDCDG00000023965 ##22 ENSDCDG00000023951 rpl11 (ENSDCDG00000023931) ENSDCDG00000023926 eloa (ENSDCDG00000023921) pithd1 (ENSDCDG00000023864) lypla2 (ENSDCDG00000023868) sfpq (ENSDCDG00000023858) zmym4.2 (ENSDCDG00000023751) ENSDCDG00000023740 ENSDCDG00000023686 ENSDCDG00000023469 ENSDCDG00000023468 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00390000002881 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b ENSGT00940000157893 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159638.g ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00390000002881 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554.b ENSGT00460000042249 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT01060000248564.b.a.a.b.f ENSGT00940000158349.n ENSGT00390000016034.`b.a ENSGT00940000175851 ENSGT00950000182962.b.a.b ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352.e ENSGT00940000159342.a.c ENSGT00390000017352.f ENSGT00940000159342.a.d ENSGT00940000157613.h ENSGT00390000017955.c.rb ENSGT00940000156790.gb ENSGT00940000166232.c ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E.h ENSGT00910000144211.k ENSGT00940000166197.c ENSGT00390000002428.a.b ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.fb ENSGT00940000165758.b ENSGT00390000018554.b ENSGT00460000042249.a.a ENSGT00440000033589.d.b.a ENSGT01030000234531.C.f ENSGT00390000012916.cb ENSGT00390000005801.a ENSGT00940000154655.a.i.b.b ENSGT00940000155549.a.a.b.p.b Goldfish MODERN SPECIES 10 pum1 (ENSCARG00000029238) ENSCARG00000029181 ENSCARG00000029176 matn1 (ENSCARG00000029150) sesn2 (ENSCARG00000029114) yrk (ENSCARG00000028409) AHDC1 (ENSCARG00000028377) wasf2 (ENSCARG00000028362) CD164L2 (ENSCARG00000028352) si:ch211-199g17.9 (ENSCARG00000028332) fam83hb (ENSCARG00000028324) KIAA0319L (ENSCARG00000027964) cap1 (ENSCARG00000027483) ppt1 (ENSCARG00000027147) ENSCARG00000027076 ENSCARG00000026858 ##22 ENSCARG00000026826 rpl11 (ENSCARG00000026802) ENSCARG00000026792 eloa (ENSCARG00000026782) pithd1 (ENSCARG00000026753) lypla2 (ENSCARG00000026592) ENSCARG00000026581 ankib1a (ENSCARG00000026542) ENSCARG00000026513 ENSCARG00000026481 ENSCARG00000026474 lrrc14b (ENSCARG00000026464) uqcrb (ENSCARG00000026439) mterf3 (ENSCARG00000026429) rad21b (ENSCARG00000026371) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000159638.g.a ENSGT00950000183168.B.a.a ENSGT00940000157554.s.a ENSGT00390000018883.c ENSGT00950000182962.b.a.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a.b ENSGT00530000063929.a.b.h.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352.e ENSGT00940000159342.a.c ENSGT00940000157613.g ENSGT00390000017955.c.sb ENSGT00940000156790.fb ENSGT00940000166232.d ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E.h.b ENSGT00910000144211.k ENSGT00940000166197.d ENSGT00390000002428.a.a ENSGT00940000156197.gb ENSGT00940000165758.a ENSGT00940000175699 ENSGT01030000234531.C.e ENSGT00390000012916.bb ENSGT00390000005801.b ENSGT00940000154655.a.i.b.a ENSGT00940000155549.a.a.b.p.a ENSGT00940000157893.h Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 115 si:ch211-199g17.9 (ENSSGRG00000011610) cap1 (ENSSGRG00000010401) ppt1 (ENSSGRG00000009962) ENSSGRG00000009933 ENSSGRG00000007505 ##22 ENSSGRG00000007460 rpl11 (ENSSGRG00000007428) ENSSGRG00000007420 eloa (ENSSGRG00000007416) lypla2 (ENSSGRG00000007295) ENSSGRG00000007287 ENSSGRG00000007277 ENSSGRG00000007271 zgc:86598 (ENSSGRG00000004876) hsf1 (ENSSGRG00000003421) scxa (ENSSGRG00000003388) bop1 (ENSSGRG00000001807) hgh1 (ENSSGRG00000001786) exosc7 (ENSSGRG00000001783) ENSSGRG00000001781 Golden-line barbel MODERN SPECIES 143 ENSSGRG00000018133 ENSSGRG00000018134 matn1 (ENSSGRG00000018135) yrk (ENSSGRG00000018208) AHDC1 (ENSSGRG00000023178) wasf2 (ENSSGRG00000023179) gpr3 (ENSSGRG00000023180) ENSSGRG00000023181 si:ch211-199g17.9 (ENSSGRG00000023183) fam83hb (ENSSGRG00000023184) si:ch211-199g17.9 (ENSSGRG00000023185) fam83hb (ENSSGRG00000023186) KIAA0319L (ENSSGRG00000023196) ppt1 (ENSSGRG00000023705) ENSSGRG00000023764 ENSSGRG00000023785 ##22 ENSSGRG00000024658 rpl11 (ENSSGRG00000024659) ENSSGRG00000024790 ENSSGRG00000024791 eloa (ENSSGRG00000024793) pithd1 (ENSSGRG00000024794) lypla2 (ENSSGRG00000024798) ankib1a (ENSSGRG00000024831) ENSSGRG00000024836 lrrc14b (ENSSGRG00000024837) uqcrb (ENSSGRG00000024838) mterf3 (ENSSGRG00000024844) rad21b (ENSSGRG00000024845) Common carp reference MODERN SPECIES 31 ENSCCRG00000081784 matn1 (ENSCCRG00000079213) sesn2 (ENSCCRG00000031091) yrk (ENSCCRG00000061987) AHDC1 (ENSCCRG00000062000) wasf2 (ENSCCRG00000071212) gpr3 (ENSCCRG00000077745) CD164L2 (ENSCCRG00000042396) si:ch211-199g17.9 (ENSCCRG00000050871) fam83hb (ENSCCRG00000050874) ENSCCRG00000024103 cap1 (ENSCCRG00000024091) ppt1 (ENSCCRG00000024020) ENSCCRG00000024006 ENSCCRG00000041266 ##22 ENSCCRG00000041301 ##22 ENSCCRG00000082450 rpl11 (ENSCCRG00000041254) ENSCCRG00000041241 eloa (ENSCCRG00000068552) lypla2 (ENSCCRG00000058275) ankib1a (ENSCCRG00000043360) ENSCCRG00000081238 lrrc14b (ENSCCRG00000043339) uqcrb (ENSCCRG00000076213) rad21b (ENSCCRG00000075006) CSMD3 (ENSCCRG00000043191) trps1 (ENSCCRG00000047454) eif3hb (ENSCCRG00000039076) ENSCCRG00000030922 krit1 (ENSCCRG00000029048) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00940000157554 ENSGT00390000018883 ENSGT00390000002881 ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b ENSGT00940000157893 Channel catfish MODERN SPECIES 16 matn1 (ENSIPUG00000020337) sesn2 (ENSIPUG00000020323) fgr (ENSIPUG00000020219) ahdc1 (ENSIPUG00000020214) ENSIPUG00000020205 wasf2 (ENSIPUG00000020198) gpr3 (ENSIPUG00000020193) cd164l2 (ENSIPUG00000020166) ENSIPUG00000020141 fam83h (ENSIPUG00000020131) KIAA0319L (ENSIPUG00000020105) CAP1 (ENSIPUG00000020066) ppt1 (ENSIPUG00000020038) ENSIPUG00000019972 ENSIPUG00000019957 ENSIPUG00000019880 ##22 ENSIPUG00000019867 rpl11 (ENSIPUG00000019795) ENSIPUG00000019774 tceb3 (ENSIPUG00000019763) pithd1 (ENSIPUG00000019752) lypla2 (ENSIPUG00000019714) gatad1 (ENSIPUG00000019694) nkd2l (ENSIPUG00000019668) lrrc14b (ENSIPUG00000019665) snrnp25 (ENSIPUG00000019654) ENSIPUG00000019642 ENSIPUG00000019606 shisa9b (ENSIPUG00000019600) Igfals (ENSIPUG00000019594) ENSIPUG00000019549 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160209 ENSGT00650000093445 ENSGT00940000175786 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b ENSGT00940000157893 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160209 ENSGT00650000093445 ENSGT00940000175786 ENSGT00940000159638 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00950000182962.b.a ENSGT01060000248564.b.a.a.a ENSGT00940000177340 ENSGT00390000017352 ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157613 ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000165758 ENSGT00390000018554 ENSGT00440000033589.d.b ENSGT01030000234531.C ENSGT00390000012916 ENSGT00390000005801 ENSGT00940000154655.a.i.b ENSGT00940000155549.a.a.b ENSGT00940000157893 Mexicana tetra MODERN SPECIES 15 ENSAMXG00000037645 ENSAMXG00000037364 matn1 (ENSAMXG00000020612) sesn2 (ENSAMXG00000020616) yrk (ENSAMXG00000020619) AHDC1 (ENSAMXG00000025287) wasf2 (ENSAMXG00000020622) gpr3 (ENSAMXG00000036140) ENSAMXG00000020624 si:ch211-199g17.9 (ENSAMXG00000041603) fam83hb (ENSAMXG00000020626) KIAA0319L (ENSAMXG00000020627) cap1 (ENSAMXG00000020631) ppt1 (ENSAMXG00000036664) ENSAMXG00000020643 ENSAMXG00000029743 ##22 ENSAMXG00000020663 rpl11 (ENSAMXG00000034710) ENSAMXG00000030505 eloa (ENSAMXG00000029662) pithd1 (ENSAMXG00000038633) lypla2 (ENSAMXG00000038933) ankib1a (ENSAMXG00000020685) gatad1 (ENSAMXG00000039156) ENSAMXG00000020692 lrrc14b (ENSAMXG00000020693) uqcrb (ENSAMXG00000029368) mterf3 (ENSAMXG00000020695) rad21b (ENSAMXG00000020698) CSMD3 (ENSAMXG00000020754) trps1 (ENSAMXG00000020943) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1 matn1 (ENSPNAG00000007138) sesn2 (ENSPNAG00000006738) yrk (ENSPNAG00000004051) AHDC1 (ENSPNAG00000004726) ENSPNAG00000026358 wasf2 (ENSPNAG00000026345) gpr3 (ENSPNAG00000026328) ENSPNAG00000026316 si:ch211-199g17.9 (ENSPNAG00000026286) fam83hb (ENSPNAG00000026242) KIAA0319L (ENSPNAG00000026231) cap1 (ENSPNAG00000006261) ppt1 (ENSPNAG00000026191) ENSPNAG00000004013 ENSPNAG00000026137 ##22 ENSPNAG00000026105 ##22 ENSPNAG00000026075 rpl11 (ENSPNAG00000026061) ENSPNAG00000026024 eloa (ENSPNAG00000025986) pithd1 (ENSPNAG00000025972) lypla2 (ENSPNAG00000025943) ankib1a (ENSPNAG00000025893) gatad1 (ENSPNAG00000025686) ENSPNAG00000025661 lrrc14b (ENSPNAG00000025596) uqcrb (ENSPNAG00000025584) mterf3 (ENSPNAG00000025430) rad21b (ENSPNAG00000025416) CSMD3 (ENSPNAG00000004769) trps1 (ENSPNAG00000024647) Electric eel MODERN SPECIES 173 ENSEEEG00000008107 si:ch211-199g17.9 (ENSEEEG00000008110) fam83hb (ENSEEEG00000008111) KIAA0319L (ENSEEEG00000008130) cap1 (ENSEEEG00000008420) ppt1 (ENSEEEG00000008453) ENSEEEG00000008510 ENSEEEG00000008535 ##22 ENSEEEG00000008900 rpl11 (ENSEEEG00000008901) ENSEEEG00000008903 eloa (ENSEEEG00000008905) pithd1 (ENSEEEG00000008906) lypla2 (ENSEEEG00000008908) ENSEEEG00000008925 gatad1 (ENSEEEG00000008928) ENSEEEG00000008930 lrrc14b (ENSEEEG00000008931) uqcrb (ENSEEEG00000008932) mterf3 (ENSEEEG00000008933) rad21b (ENSEEEG00000008937) ENSEEEG00000009224 ENSEEEG00000009225 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000155559.a.b ENSGT00950000183059.b.a.b.r ENSGT00940000155103.a.b.ld ENSGT00940000156983.a.a.q ENSGT00390000006916.c ENSGT00940000153431.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.b ENSGT00940000154866.B.b ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000154418.a.a.b ENSGT00940000153342.a ENSGT00940000166377.f Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT00950000183029.B.j.g.b ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884.a ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 Atlantic herring DUPLICATION Atlantic herring MODERN SPECIES 4 ENSCHAG00000000467 CALHM2 (ENSCHAG00000000402) CALHM2 (ENSCHAG00000027869) CALHM3 (ENSCHAG00000027867) GCNT3 (ENSCHAG00000027866) ENSCHAG00000027864 slc18a2 (ENSCHAG00000027862) phyhipla (ENSCHAG00000027861) BICC1 (ENSCHAG00000027860) BIRC6 (ENSCHAG00000027855) ttc27 (ENSCHAG00000027846) LTBP1 (ENSCHAG00000027822) rasgrp3 (ENSCHAG00000027785) FAM98A (ENSCHAG00000027781) slc17a5 (ENSCHAG00000027772) EEF1A1 (ENSCHAG00000027762) ##22 CGAS (ENSCHAG00000027756) CGAS (ENSCHAG00000027752) ddx43 (ENSCHAG00000027750) KCNQ5 (ENSCHAG00000027745) RIMS1 (ENSCHAG00000027742) asrgl1 (ENSCHAG00000027741) OGFRL1 (ENSCHAG00000027739) ##35 b3gat2 (ENSCHAG00000027738) smap1 (ENSCHAG00000027736) SDHAF4 (ENSCHAG00000027735) tlx1 (ENSCHAG00000027734) ENSCHAG00000027733 slc2a15a (ENSCHAG00000027732) fgf8a (ENSCHAG00000027731) fbxw4 (ENSCHAG00000027727) Atlantic herring MODERN SPECIES 16 ENSCHAG00000006668 ENSCHAG00000006685 ENSCHAG00000006696 ENSCHAG00000006711 ENSCHAG00000006722 ENSCHAG00000006808 ENSCHAG00000006837 ENSCHAG00000006908 ENSCHAG00000006921 bcl11ab (ENSCHAG00000006938) ccdc85al (ENSCHAG00000007005) sec23b (ENSCHAG00000007066) dtd1 (ENSCHAG00000007680) SLC24A3 (ENSCHAG00000007732) RIN2 (ENSCHAG00000008374) EEF1A1 (ENSCHAG00000008431) ##22 ENSCHAG00000008569 RIMS1 (ENSCHAG00000008981) ENSCHAG00000011039 ENSCHAG00000011087 ENSCHAG00000013425 ENSCHAG00000013436 lbx1b (ENSCHAG00000013543) slc2a15b (ENSCHAG00000013573) fgf8b (ENSCHAG00000013783) dpcd (ENSCHAG00000013912) poll (ENSCHAG00000013920) wbp1lb (ENSCHAG00000013931) as3mt (ENSCHAG00000013938) CNNM2 (ENSCHAG00000014012) nt5c2b (ENSCHAG00000002738) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 201 ENSGT00940000158179.a ENSGT00390000010672 ENSGT00390000006618 ENSGT00940000162528 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b ENSGT00390000001134.a.b ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00940000157735 ENSGT00940000160127.h ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164611.b ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000154418.a.a.b Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158179.a ENSGT00390000010672 ENSGT00390000006618 ENSGT00940000162528 ENSGT00950000182999.b.b ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.b ENSGT00390000001134.a.b ENSGT00390000005954 ENSGT00390000013790 ENSGT00530000063106.C ENSGT00940000157735 ENSGT00940000160127.h ENSGT00940000155353.a.a.b ENSGT00940000164127.b ENSGT00950000183029.B.i.a ##22 ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134.z ENSGT00390000006243 ENSGT00940000164095.b ENSGT00940000159518.b ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.b ENSGT00390000001742.a ENSGT00940000159034 ENSGT00940000163289.b.a.a ENSGT00940000154418.a.a.b ENSGT00440000033720.a.a.b ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 255 ENSGT00390000001491.b ENSGT00390000007221.a.b ENSGT00390000000046.h ENSGT00940000163077.h ENSGT00940000155525.b ENSGT00940000158732.w ENSGT00940000156467.p ENSGT00940000156983.a.a.r.a ENSGT00390000005537.g ENSGT00940000158042.h ENSGT00940000157361.a.m.b ENSGT00940000160412.b.a ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.b ENSGT00940000154866.B.a.c ENSGT00940000166291.a ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT01050000244827.E.g.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00390000005537.g ENSGT00940000158042.h ENSGT00940000160560.a.b.a.c.a.a ENSGT00940000157361.a.m.b ENSGT00940000160412.b.a ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a.b ENSGT00940000154866.B.a.c ENSGT00940000166291.a ENSGT00950000183029.B.j.h ##22 ENSGT01050000244827.E.g.b ENSGT00940000155933.b.a.c ENSGT00940000155134.y.c ENSGT00950000183045.A.a.a.p ENSGT00390000018730.B.c.b ##35 ENSGT00940000159583.n ENSGT00940000155884.a.e ENSGT00390000009155.b ENSGT00940000158698.j ENSGT00940000164611.b.k.a ENSGT00940000164095.a.a ENSGT00940000159518.a.b ENSGT00390000005029.f ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a.b ENSGT00940000155588.b.b Common carp reference MODERN SPECIES 18 neurog3 (ENSCCRG00000048057) pdlim1 (ENSCCRG00000048060) rel (ENSCCRG00000048067) papolg (ENSCCRG00000048090) bcl11aa (ENSCCRG00000066550) fancl (ENSCCRG00000035294) vrk2 (ENSCCRG00000035288) ENSCCRG00000076870 ENSCCRG00000067191 soul2 (ENSCCRG00000032825) ccdc85a (ENSCCRG00000032821) ENSCCRG00000080928 ENSCCRG00000072606 ENSCCRG00000054411 slc17a5 (ENSCCRG00000071094) ENSCCRG00000032642 ##22 CGAS (ENSCCRG00000075489) ENSCCRG00000050069 ddx43 (ENSCCRG00000007601) KCNQ5 (ENSCCRG00000012224) RIMS1 (ENSCCRG00000052961) asrgl1 (ENSCCRG00000076614) ENSCCRG00000013245 OGFRL1 (ENSCCRG00000020959) ##35 b3gat2 (ENSCCRG00000037475) smap1 (ENSCCRG00000077009) SDHAF4 (ENSCCRG00000062363) tlx1 (ENSCCRG00000062204) ENSCCRG00000078379 ENSCCRG00000077372 slc2a15a (ENSCCRG00000034481) Golden-line barbel MODERN SPECIES 575 vps8 (ENSSGRG00000026741) ENSSGRG00000026726 si:dkey-22o12.2 (ENSSGRG00000026725) tmem41ab (ENSSGRG00000026723) igf2bp2b (ENSSGRG00000026303) ubac2 (ENSSGRG00000026290) dachc (ENSSGRG00000026289) mzt1 (ENSSGRG00000026287) bora (ENSSGRG00000026286) DIS3 (ENSSGRG00000026213) metap1d (ENSSGRG00000026197) dlx2b (ENSSGRG00000026184) dlx2b (ENSSGRG00000026183) itga6b (ENSSGRG00000025086) ENSSGRG00000025035 EEF1A1 (ENSSGRG00000025034) ##22 ENSSGRG00000024824 RIMS1 (ENSSGRG00000024736) Elephant shark DUPLICATION Elephant shark MODERN SPECIES 1712 ENSCMIG00000006263 psmb2 (ENSCMIG00000006267) tfap2e (ENSCMIG00000006269) ENSCMIG00000006270 ago4 (ENSCMIG00000006337) ago1 (ENSCMIG00000006640) tekt2 (ENSCMIG00000006786) ENSCMIG00000006807 cap1 (ENSCMIG00000006811) ppt1 (ENSCMIG00000006835) ENSCMIG00000006892 ENSCMIG00000006936 ##22 ENSCMIG00000007023 ELOA (ENSCMIG00000007026) gale (ENSCMIG00000007031) lypla2 (ENSCMIG00000007036) pithd1 (ENSCMIG00000007037) hmgcl (ENSCMIG00000007040) bmp8a (ENSCMIG00000007069) MACF1 (ENSCMIG00000007149) ndufs5 (ENSCMIG00000007330) Elephant shark MODERN SPECIES 2411 eef1a1b (ENSCMIG00000006529) ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.B ##22 Lamprey MODERN SPECIES 5961 eef1a1a (ENSPMAG00000010399) ##22 Hagfish DUPLICATION Hagfish MODERN SPECIES 609 ENSEBUG00000004468 ##22 ENSEBUG00000014766 ##22 ENSEBUG00000001408 ENSEBUG00000014759 ENSEBUG00000008770 ENSEBUG00000004920 kcnk15 (ENSEBUG00000007930) Hagfish MODERN SPECIES 609 kcnk15 (ENSEBUG00000007930) ENSEBUG00000004920 ENSEBUG00000008770 ENSEBUG00000014759 ENSEBUG00000001408 ENSEBUG00000014766 ##22 ENSEBUG00000004468 ##22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 1288 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B ##22 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000165345 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000171583 ENSGT00940000155933.b.b ENSGT00940000155134 ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935 ENSGT00940000158276 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 662 PLEKHG1 (ENSPSMG00000020047) MTHFD1L (ENSPSMG00000020197) AKAP12 (ENSPSMG00000020300) ZBTB2 (ENSPSMG00000020305) RMND1 (ENSPSMG00000020327) ARMT1 (ENSPSMG00000020363) CCDC170 (ENSPSMG00000020376) ENSPSMG00000020377 ESR1 (ENSPSMG00000020487) SYNE1 (ENSPSMG00000021005) MYCT1 (ENSPSMG00000021158) VIP (ENSPSMG00000021172) FBXO5 (ENSPSMG00000021196) MTRF1L (ENSPSMG00000021227) RGS17 (ENSPSMG00000021243) ENSPSMG00000021248 ##22 OPRM1 (ENSPSMG00000021308) CNKSR3 (ENSPSMG00000021374) SCAF8 (ENSPSMG00000021483) TIAM2 (ENSPSMG00000021535) TFB1M (ENSPSMG00000021571) CLDN20 (ENSPSMG00000021575) NOX3 (ENSPSMG00000021601) ENSPSMG00000021609 ARID1B (ENSPSMG00000021663) TMEM242 (ENSPSMG00000021698) ZDHHC14 (ENSPSMG00000021714) SNX9 (ENSPSMG00000021776) SYNJ2 (ENSPSMG00000021913) SERAC1 (ENSPSMG00000022291) ENSPSMG00000022575 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 30 CASP8 (ENSMICG00000004468) FLACC1 (ENSMICG00000004479) ENSMICG00000033274 ENSMICG00000013250 STRADB (ENSMICG00000013292) ENSMICG00000032723 C2CD6 (ENSMICG00000034413) TMEM237 (ENSMICG00000013335) MPP4 (ENSMICG00000013369) ALS2 (ENSMICG00000013399) CDK15 (ENSMICG00000008920) FZD7 (ENSMICG00000037803) KIAA2012 (ENSMICG00000008942) SUMO1 (ENSMICG00000008968) ENSMICG00000003539 ENSMICG00000007114 ##22 BMPR2 (ENSMICG00000004432) ENSMICG00000031997 FAM117B (ENSMICG00000042296) SLC16A14 (ENSMICG00000010609) FBXO36 (ENSMICG00000034045) ICA1L (ENSMICG00000002701) ENSMICG00000044580 CARF (ENSMICG00000011943) ENSMICG00000026752 NBEAL1 (ENSMICG00000003736) CYP20A1 (ENSMICG00000010806) ABI2 (ENSMICG00000048062) RAPH1 (ENSMICG00000001085) CD28 (ENSMICG00000044645) CTLA4 (ENSMICG00000032206) Mouse lemur MODERN SPECIES 169 AMELX (ENSMICG00000034215) ENSMICG00000046301 MSL3 (ENSMICG00000014399) FRMPD4 (ENSMICG00000014417) PRPS2 (ENSMICG00000034531) TLR7 (ENSMICG00000030654) TLR8 (ENSMICG00000014450) TMSB4X (ENSMICG00000045381) EGFL6 (ENSMICG00000026836) TCEANC (ENSMICG00000002284) ENSMICG00000041433 ENSMICG00000004690 OFD1 (ENSMICG00000006744) GPM6B (ENSMICG00000015356) GEMIN8 (ENSMICG00000015984) ENSMICG00000043857 ##22 GLRA2 (ENSMICG00000015578) ENSMICG00000046220 FANCB (ENSMICG00000038518) MOSPD2 (ENSMICG00000004964) ASB9 (ENSMICG00000003161) ASB11 (ENSMICG00000003169) PIGA (ENSMICG00000003170) VEGFD (ENSMICG00000003176) PIR (ENSMICG00000003180) BMX (ENSMICG00000003184) ACE2 (ENSMICG00000003198) ENSMICG00000034241 CLTRN (ENSMICG00000003210) ENSMICG00000003502 CA5B (ENSMICG00000047453) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Tarsier MODERN SPECIES 6220 ARHGAP20 (ENSTSYG00000030813) ENSTSYG00000031495 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES ENSCJAG00000074564 GAS1 (ENSCJAG00000062210) ENSCJAG00000084670 ZNF484 (ENSCJAG00000005536) PRXL2C (ENSCJAG00000076685) ENSCJAG00000061833 ENSCJAG00000012598 HABP4 (ENSCJAG00000012589) ENSCJAG00000040778 SLC35D2 (ENSCJAG00000012556) ENSCJAG00000047796 ENSCJAG00000064535 CTSV (ENSCJAG00000046004) ENSCJAG00000067353 ENSCJAG00000076862 ENSCJAG00000075286 ##22 FBP2 (ENSCJAG00000021334) FBP1 (ENSCJAG00000041493) AOPEP (ENSCJAG00000021327) FANCC (ENSCJAG00000021324) PTCH1 (ENSCJAG00000021318) ERCC6L2 (ENSCJAG00000043554) ENSCJAG00000055424 HSD17B3 (ENSCJAG00000008899) ENSCJAG00000080940 ENSCJAG00000055940 ZNF782 (ENSCJAG00000005372) ENSCJAG00000069734 ENSCJAG00000000423 FGD3 (ENSCJAG00000020520) BICD2 (ENSCJAG00000020519) Marmoset MODERN SPECIES 21 ENSCJAG00000086271 ENSCJAG00000059386 KLRF1 (ENSCJAG00000018584) ENSCJAG00000087106 ENSCJAG00000077800 CD69 (ENSCJAG00000018576) ENSCJAG00000067364 ENSCJAG00000011120 ENSCJAG00000076201 ENSCJAG00000016491 ENSCJAG00000062635 ENSCJAG00000078523 ENSCJAG00000044206 RPAP3 (ENSCJAG00000012838) PCED1B (ENSCJAG00000012864) ENSCJAG00000021340 ##22 AMIGO2 (ENSCJAG00000012873) ENSCJAG00000076367 SLC38A4 (ENSCJAG00000012877) SLC38A2 (ENSCJAG00000012956) SLC38A1 (ENSCJAG00000012989) SCAF11 (ENSCJAG00000013077) ARID2 (ENSCJAG00000013099) ENSCJAG00000081349 ANO6 (ENSCJAG00000013160) DBX2 (ENSCJAG00000013213) NELL2 (ENSCJAG00000013215) ENSCJAG00000086234 TMEM117 (ENSCJAG00000013333) TWF1 (ENSCJAG00000013346) IRAK4 (ENSCJAG00000013388) Marmoset MODERN SPECIES PHF5A (ENSCJAG00000004999) POLR3H (ENSCJAG00000005072) ENSCJAG00000075226 ENSCJAG00000010682 SMARCB1 (ENSCJAG00000046335) MMP11 (ENSCJAG00000010798) CHCHD10 (ENSCJAG00000010824) C22orf15 (ENSCJAG00000010833) VPREB3 (ENSCJAG00000010848) ZNF70 (ENSCJAG00000038628) ENSCJAG00000054495 IGLL1 (ENSCJAG00000081711) ENSCJAG00000051690 ENSCJAG00000074689 ENSCJAG00000047647 ENSCJAG00000072768 ##22 ENSCJAG00000065858 ENSCJAG00000045374 SLC7A4 (ENSCJAG00000015953) P2RX6 (ENSCJAG00000015940) THAP7 (ENSCJAG00000015921) LZTR1 (ENSCJAG00000040898) AIFM3 (ENSCJAG00000015869) CRKL (ENSCJAG00000057682) SNAP29 (ENSCJAG00000015857) PI4KA (ENSCJAG00000015845) ENSCJAG00000044663 SERPIND1 (ENSCJAG00000015854) ENSCJAG00000015839 ENSCJAG00000067237 ENSCJAG00000044997 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 3 SPX (ENSPPYG00000037855) GOLT1B (ENSPPYG00000004353) RECQL (ENSPPYG00000004352) ENSPPYG00000041458 PYROXD1 (ENSPPYG00000004351) IAPP (ENSPPYG00000034050) SLCO1A2 (ENSPPYG00000004350) ENSPPYG00000037021 CEP20 (ENSPPYG00000032006) ENSPPYG00000034632 SLCO1B1 (ENSPPYG00000004349) ENSPPYG00000040296 SLCO1B3 (ENSPPYG00000004348) SLCO1C1 (ENSPPYG00000004347) PDE3A (ENSPPYG00000004346) ENSPPYG00000039816 ##22 AEBP2 (ENSPPYG00000004345) PLEKHA5 (ENSPPYG00000004344) ENSPPYG00000004343 ENSPPYG00000035134 ENSPPYG00000035392 CAPZA3 (ENSPPYG00000004342) PLCZ1 (ENSPPYG00000004341) PIK3C2G (ENSPPYG00000040791) RERGL (ENSPPYG00000004340) ENSPPYG00000035996 ENSPPYG00000032276 LMO3 (ENSPPYG00000004338) MGST1 (ENSPPYG00000004337) SLC15A5 (ENSPPYG00000004336) DERA (ENSPPYG00000004335) Orangutan MODERN SPECIES 18 FST (ENSPPYG00000015454) MOCS2 (ENSPPYG00000015453) ITGA2 (ENSPPYG00000015452) PELO (ENSPPYG00000015451) ITGA1 (ENSPPYG00000015450) ISL1 (ENSPPYG00000015449) ENSPPYG00000035805 PARP8 (ENSPPYG00000015448) ENSPPYG00000033521 EMB (ENSPPYG00000015447) HCN1 (ENSPPYG00000015446) MRPS30 (ENSPPYG00000015445) FGF10 (ENSPPYG00000015444) NNT (ENSPPYG00000015443) PAIP1 (ENSPPYG00000015442) ENSPPYG00000038065 ##22 C5orf34 (ENSPPYG00000029849) ENSPPYG00000030021 CCL28 (ENSPPYG00000015440) HMGCS1 (ENSPPYG00000015439) NIM1K (ENSPPYG00000015438) ENSPPYG00000033307 ZNF131 (ENSPPYG00000015437) ENSPPYG00000015434 SELENOP (ENSPPYG00000025924) CCDC152 (ENSPPYG00000015432) GHR (ENSPPYG00000015431) FBXO4 (ENSPPYG00000015430) RIMOC1 (ENSPPYG00000030534) OXCT1 (ENSPPYG00000015428) PLCXD3 (ENSPPYG00000015427) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Gorilla MODERN SPECIES 14 SH3RF3 (ENSGGOG00000034870) EDAR (ENSGGOG00000010851) CCDC138 (ENSGGOG00000034976) ENSGGOG00000011125 ENSGGOG00000022756 ENSGGOG00000039420 ENSGGOG00000012512 ENSGGOG00000040710 GCC2 (ENSGGOG00000022411) SULT1C4 (ENSGGOG00000007837) SULT1C2 (ENSGGOG00000006731) SULT1C3 (ENSGGOG00000008271) SLC5A7 (ENSGGOG00000007818) ENSGGOG00000039918 ST6GAL2 (ENSGGOG00000039277) ENSGGOG00000039828 ##22 ENSGGOG00000023429 UXS1 (ENSGGOG00000034951) ECRG4 (ENSGGOG00000011015) NCK2 (ENSGGOG00000014764) ENSGGOG00000012919 C2orf49 (ENSGGOG00000023363) TGFBRAP1 (ENSGGOG00000008221) GPR45 (ENSGGOG00000012122) MRPS9 (ENSGGOG00000007751) ENSGGOG00000043897 TMEM182 (ENSGGOG00000037042) MFSD9 (ENSGGOG00000037798) SLC9A2 (ENSGGOG00000016491) SLC9A4 (ENSGGOG00000014583) IL18RAP (ENSGGOG00000005842) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00910000146985 ENSGT00940000163450.g.a ENSGT00390000015229 ENSGT00530000064242.a ENSGT00390000018206 ENSGT00940000154852.a ENSGT00390000002810.a ENSGT01050000244814.a.a.a.a ENSGT00910000146988 ENSGT00390000004566 ENSGT00390000008664 ENSGT00510000048783 ENSGT00510000049182 ENSGT00390000009084 ENSGT00940000158074 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000147036 ENSGT00910000148667 ENSGT00390000001471 ENSGT00940000161466 ENSGT00940000161884 ENSGT00940000159304 ENSGT00940000156372 ENSGT00910000146945 ENSGT00940000156201 ENSGT00940000157690 ENSGT00940000158180 ENSGT00940000157561 ENSGT01050000244893.c.a.a ENSGT00940000155217 ENSGT00940000161957 Chimpanzee MODERN SPECIES 7 LAT (ENSPTRG00000034140) SPNS1 (ENSPTRG00000048927) NFATC2IP (ENSPTRG00000007945) CLN3 (ENSPTRG00000007930) SBK1 (ENSPTRG00000046337) ENSPTRG00000048258 XPO6 (ENSPTRG00000007919) GSG1L (ENSPTRG00000007918) ENSPTRG00000046233 KATNIP (ENSPTRG00000007917) GTF3C1 (ENSPTRG00000007915) IL21R (ENSPTRG00000052817) IL4R (ENSPTRG00000007913) NSMCE1 (ENSPTRG00000007912) KDM8 (ENSPTRG00000007910) ENSPTRG00000044737 ##22 ENSPTRG00000048703 ENSPTRG00000047452 ENSPTRG00000046595 HS3ST4 (ENSPTRG00000045995) ZKSCAN2 (ENSPTRG00000007906) AQP8 (ENSPTRG00000007905) LCMT1 (ENSPTRG00000031247) ENSPTRG00000044102 ENSPTRG00000047360 ARHGAP17 (ENSPTRG00000007900) SLC5A11 (ENSPTRG00000007899) TNRC6A (ENSPTRG00000007898) ENSPTRG00000045941 RBBP6 (ENSPTRG00000007897) CACNG3 (ENSPTRG00000007896) Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 17 ENSPPAG00000036190 INTU (ENSPPAG00000033240) SLC25A31 (ENSPPAG00000029688) HSPA4L (ENSPPAG00000029199) ENSPPAG00000006462 PLK4 (ENSPPAG00000029673) MFSD8 (ENSPPAG00000015530) ABHD18 (ENSPPAG00000038392) LARP1B (ENSPPAG00000030439) PGRMC2 (ENSPPAG00000042028) JADE1 (ENSPPAG00000027693) SCLT1 (ENSPPAG00000039830) C4orf33 (ENSPPAG00000036110) PCDH10 (ENSPPAG00000035058) PABPC4L (ENSPPAG00000043745) ENSPPAG00000042996 ##22 ENSPPAG00000036402 ENSPPAG00000032483 PCDH18 (ENSPPAG00000003442) SLC7A11 (ENSPPAG00000039405) ENSPPAG00000027209 ENSPPAG00000003317 NOCT (ENSPPAG00000042856) ELF2 (ENSPPAG00000016962) ENSPPAG00000037896 MGARP (ENSPPAG00000040248) ENSPPAG00000037033 NAA15 (ENSPPAG00000034447) ENSPPAG00000042826 ENSPPAG00000043084 RAB33B (ENSPPAG00000043376) Bonobo MODERN SPECIES 7 ENSPPAG00000030300 SULT1A2 (ENSPPAG00000034744) SGF29 (ENSPPAG00000039380) NUPR1 (ENSPPAG00000033055) ENSPPAG00000033047 ENSPPAG00000029983 XPO6 (ENSPPAG00000033668) ENSPPAG00000035481 ENSPPAG00000039390 KATNIP (ENSPPAG00000036183) GTF3C1 (ENSPPAG00000026435) IL21R (ENSPPAG00000041431) IL4R (ENSPPAG00000041614) NSMCE1 (ENSPPAG00000043297) KDM8 (ENSPPAG00000038815) ENSPPAG00000029755 ##22 ENSPPAG00000033232 ENSPPAG00000004748 ENSPPAG00000002730 HS3ST4 (ENSPPAG00000039544) ZKSCAN2 (ENSPPAG00000037342) AQP8 (ENSPPAG00000036645) LCMT1 (ENSPPAG00000029904) ENSPPAG00000027615 ARHGAP17 (ENSPPAG00000036798) SLC5A11 (ENSPPAG00000028580) TNRC6A (ENSPPAG00000028379) RBBP6 (ENSPPAG00000023595) CACNG3 (ENSPPAG00000037451) PRKCB (ENSPPAG00000034428) CHP2 (ENSPPAG00000041421) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 151 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2425 MRPL39 (ENSRROG00000019655) JAM2 (ENSRROG00000039705) ATP5PF (ENSRROG00000029076) GABPA (ENSRROG00000034285) APP (ENSRROG00000039848) ENSRROG00000029418 ENSRROG00000035525 ADAMTS1 (ENSRROG00000041518) ADAMTS5 (ENSRROG00000045575) ENSRROG00000034848 ENSRROG00000031715 ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Rhesus MODERN SPECIES 14 DAXX (ENSMMUG00000004287) ZBTB22 (ENSMMUG00000003876) TAPBP (ENSMMUG00000003875) RGL2 (ENSMMUG00000003872) PFDN6 (ENSMMUG00000003871) WDR46 (ENSMMUG00000003869) B3GALT4 (ENSMMUG00000064507) VPS52 (ENSMMUG00000003864) ENSMMUG00000003867 RING1 (ENSMMUG00000003863) SLC39A7 (ENSMMUG00000003859) HSD17B8 (ENSMMUG00000003861) RXRB (ENSMMUG00000003858) COL11A2 (ENSMMUG00000003850) ENSMMUG00000019371 ENSMMUG00000041095 ##22 MAMU-DOA (ENSMMUG00000015734) BRD2 (ENSMMUG00000023138) MAMU-DMB (ENSMMUG00000022626) ENSMMUG00000063291 PSMB9 (ENSMMUG00000011304) PSMB8 (ENSMMUG00000011301) MAMU-DOB (ENSMMUG00000011293) ENSMMUG00000054826 MAMU-DRB1 (ENSMMUG00000029799) MAMU-DRA (ENSMMUG00000039082) TSBP1 (ENSMMUG00000018425) ENSMMUG00000029402 NOTCH4 (ENSMMUG00000018461) GPSM3 (ENSMMUG00000018459) PBX2 (ENSMMUG00000018456) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 14 OGDH (ENSPANG00000026232) ZMIZ2 (ENSPANG00000007148) ENSPANG00000029569 ENSPANG00000040992 PURB (ENSPANG00000045024) MYO1G (ENSPANG00000000682) CCM2 (ENSPANG00000000406) NACAD (ENSPANG00000000405) TBRG4 (ENSPANG00000004288) RAMP3 (ENSPANG00000014132) ENSPANG00000040400 ENSPANG00000000194 CCDC201 (ENSPANG00000040872) IGFBP1 (ENSPANG00000043551) IGFBP3 (ENSPANG00000016470) ENSPANG00000037546 ##22 ENSPANG00000008589 TNS3 (ENSPANG00000021643) HUS1 (ENSPANG00000009981) SUN3 (ENSPANG00000000696) C7orf57 (ENSPANG00000008206) UPP1 (ENSPANG00000018933) ABCA13 (ENSPANG00000016095) CDC14C (ENSPANG00000048996) ENSPANG00000050406 VWC2 (ENSPANG00000022524) ZPBP (ENSPANG00000049779) SPATA48 (ENSPANG00000020442) IKZF1 (ENSPANG00000005244) ENSPANG00000029760 DDC (ENSPANG00000020090) Olive baboon MODERN SPECIES 16 DUSP22 (ENSPANG00000018613) IRF4 (ENSPANG00000023389) EXOC2 (ENSPANG00000010769) FOXQ1 (ENSPANG00000037731) FOXF2 (ENSPANG00000044013) FOXC1 (ENSPANG00000011156) GMDS (ENSPANG00000020544) MYLK4 (ENSPANG00000007409) WRNIP1 (ENSPANG00000044052) ENSPANG00000041893 SERPINB1 (ENSPANG00000030460) ENSPANG00000015755 NQO2 (ENSPANG00000033064) ENSPANG00000033442 ##22 ENSPANG00000038780 RIPK1 (ENSPANG00000024400) TUBB2B (ENSPANG00000047634) PSMG4 (ENSPANG00000007366) SLC22A23 (ENSPANG00000023485) ENSPANG00000037486 FAM50B (ENSPANG00000006202) ENSPANG00000039354 PRPF4B (ENSPANG00000008444) FAM217A (ENSPANG00000009605) ENSPANG00000021758 ECI2 (ENSPANG00000025189) CDYL (ENSPANG00000023577) ENSPANG00000045914 RPP40 (ENSPANG00000017865) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.a ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 10 ENSHGLG00000046873 RPAP2 (ENSHGLG00000009983) ENSHGLG00000011940 ENSHGLG00000012510 ENSHGLG00000012851 BTBD8 (ENSHGLG00000008571) ENSHGLG00000046149 ENSHGLG00000033060 ENSHGLG00000010230 BRDT (ENSHGLG00000004317) ENSHGLG00000046123 ENSHGLG00000004997 CDC7 (ENSHGLG00000046565) HFM1 (ENSHGLG00000007780) ZNF644 (ENSHGLG00000008786) ENSHGLG00000041803 ##22 ENSHGLG00000009126 ENSHGLG00000032341 ENSHGLG00000040937 ZNF326 (ENSHGLG00000004782) ENSHGLG00000033474 ENSHGLG00000036797 ENSHGLG00000007352 ENSHGLG00000031997 ENSHGLG00000004912 ENSHGLG00000009330 ENSHGLG00000007998 ENSHGLG00000005453 ENSHGLG00000006893 GBP1 (ENSHGLG00000008509) CCBL2 (ENSHGLG00000004456) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.a ##22 Degu MODERN SPECIES 42 ENSODEG00000020392 ENSODEG00000020300 BEND6 (ENSODEG00000015776) ZNF451 (ENSODEG00000015693) ENSODEG00000015324 ENSODEG00000015963 RAB23 (ENSODEG00000016056) PRIM2 (ENSODEG00000015933) KHDRBS2 (ENSODEG00000015927) ENSODEG00000016695 ENSODEG00000015713 ENSODEG00000016016 LGSN (ENSODEG00000016651) ENSODEG00000016255 ENSODEG00000020332 ENSODEG00000015899 ##22 ENSODEG00000015590 ENSODEG00000016630 ENSODEG00000015661 ENSODEG00000016000 ENSODEG00000015697 ENSODEG00000016046 ENSODEG00000015414 ENSODEG00000015537 ENSODEG00000016200 ZNF366 (ENSODEG00000015681) PTCD2 (ENSODEG00000016417) ENSODEG00000016220 MRPS27 (ENSODEG00000016210) ENSODEG00000015665 ENSODEG00000016114 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.b ##22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 ENSHGLG00000041965 RFT1 (ENSHGLG00000007981) PRKCD (ENSHGLG00000005558) ENSHGLG00000048991 DCP1A (ENSHGLG00000049267) CACNA1D (ENSHGLG00000002771) CHDH (ENSHGLG00000040809) ENSHGLG00000036025 IL17RB (ENSHGLG00000033538) ACTR8 (ENSHGLG00000002016) SELK (ENSHGLG00000039969) CACNA2D3 (ENSHGLG00000010346) LRTM1 (ENSHGLG00000037277) WNT5A (ENSHGLG00000007709) ERC2 (ENSHGLG00000003759) ENSHGLG00000038552 ##22 ENSHGLG00000021148 ENSHGLG00000002622 CCDC66 (ENSHGLG00000002221) TASOR (ENSHGLG00000006020) ARHGEF3 (ENSHGLG00000004164) ENSHGLG00000004559 ENSHGLG00000048468 IL17RD (ENSHGLG00000003939) ENSHGLG00000003745 ENSHGLG00000036669 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.l.b ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 47 ENSJJAG00000013641 ENSJJAG00000011732 Prm3 (ENSJJAG00000011366) Tnp2 (ENSJJAG00000014779) Socs1 (ENSJJAG00000002198) Clec16a (ENSJJAG00000021362) Dexi (ENSJJAG00000001375) Ciita (ENSJJAG00000023224) Tvp23a (ENSJJAG00000020794) ENSJJAG00000021721 Tekt5 (ENSJJAG00000021821) Emp2 (ENSJJAG00000021377) ENSJJAG00000023832 Atf7ip2 (ENSJJAG00000003124) Grin2a (ENSJJAG00000018555) ENSJJAG00000019263 ##22 Hapstr1 (ENSJJAG00000019154) Usp7 (ENSJJAG00000022705) Carhsp1 (ENSJJAG00000024253) Pmm2 (ENSJJAG00000017129) Tmem186 (ENSJJAG00000020738) Abat (ENSJJAG00000022893) Rbfox1 (ENSJJAG00000002575) Eef2kmt (ENSJJAG00000022222) Alg1 (ENSJJAG00000024413) AU021092 (ENSJJAG00000018944) Nagpa (ENSJJAG00000018264) Sec14l5 (ENSJJAG00000011994) Ppl (ENSJJAG00000021909) Ubn1 (ENSJJAG00000018339) Glyr1 (ENSJJAG00000019126) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 161 ENSJJAG00000021560 ENSJJAG00000021910 Amph (ENSJJAG00000022889) Stard3nl (ENSJJAG00000023909) Epdr1 (ENSJJAG00000024132) Sfrp4 (ENSJJAG00000024190) Nme8 (ENSJJAG00000000267) Gpr141 (ENSJJAG00000012473) ENSJJAG00000000615 Elmo1 (ENSJJAG00000003658) 9530077C05Rik (ENSJJAG00000005276) Rala (ENSJJAG00000006484) ENSJJAG00000007969 ENSJJAG00000009580 Sugct (ENSJJAG00000010553) ENSJJAG00000007354 ##22 Inhba (ENSJJAG00000007614) Gli3 (ENSJJAG00000009019) AW209491 (ENSJJAG00000010303) ENSJJAG00000010341 Mrpl32 (ENSJJAG00000010906) Hecw1 (ENSJJAG00000011435) ENSJJAG00000012096 Blvra (ENSJJAG00000012133) Vopp1 (ENSJJAG00000012611) Lancl2 (ENSJJAG00000012831) Egfr (ENSJJAG00000014249) Sec61g (ENSJJAG00000015922) Vstm2a (ENSJJAG00000016705) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 48 ENSJJAG00000015678 Ndst1 (ENSJJAG00000014514) Synpo (ENSJJAG00000022414) Myoz3 (ENSJJAG00000023711) Rbm22 (ENSJJAG00000009565) Dctn4 (ENSJJAG00000021369) Smim3 (ENSJJAG00000011996) Fam170a (ENSJJAG00000003910) ENSJJAG00000016100 ENSJJAG00000006199 ##22 Prr16 (ENSJJAG00000016970) Ankrd33b (ENSJJAG00000016371) Dap (ENSJJAG00000022373) ENSJJAG00000014543 Ctnnd2 (ENSJJAG00000015243) Dnah5 (ENSJJAG00000021504) Trio (ENSJJAG00000019719) Otulinl (ENSJJAG00000019612) Otulin (ENSJJAG00000021711) Ank (ENSJJAG00000010626) Fbxl7 (ENSJJAG00000013915) ENSJJAG00000019583 Zfp622 (ENSJJAG00000000941) Retreg1 (ENSJJAG00000007779) Myo10 (ENSJJAG00000013696) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Prairie vole MODERN SPECIES Atp5mpl (ENSMOCG00000018303) Ppp1r13b (ENSMOCG00000017048) Zfyve21 (ENSMOCG00000013746) Xrcc3 (ENSMOCG00000008144) Klc1 (ENSMOCG00000016748) Coa8 (ENSMOCG00000018572) Bag5 (ENSMOCG00000015176) Trmt61a (ENSMOCG00000014726) Ckb (ENSMOCG00000014242) Mark3 (ENSMOCG00000018347) ENSMOCG00000021790 Tnfaip2 (ENSMOCG00000011420) Exoc3l4 (ENSMOCG00000004296) Lbhd2 (ENSMOCG00000018196) Cdc42bpb (ENSMOCG00000021696) ENSMOCG00000017882 ##22 Amn (ENSMOCG00000001893) Traf3 (ENSMOCG00000017772) Rcor1 (ENSMOCG00000012999) Ankrd9 (ENSMOCG00000002881) Tecpr2 (ENSMOCG00000000369) Cinp (ENSMOCG00000019159) Mok (ENSMOCG00000016493) ENSMOCG00000018133 ENSMOCG00000004179 1700001K19Rik (ENSMOCG00000001086) Dync1h1 (ENSMOCG00000014093) Ppp2r5c (ENSMOCG00000010635) ENSMOCG00000014215 ENSMOCG00000012506 Dlk1 (ENSMOCG00000004545) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.m ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2939 Mybpc1 (ENSMSIG00000018042) Spic (ENSMSIG00000018013) ENSMSIG00000017992 ENSMSIG00000017985 Utp20 (ENSMSIG00000017862) ENSMSIG00000017854 ##22 Slc5a8 (ENSMSIG00000017818) Ano4 (ENSMSIG00000017553) Gas2l3 (ENSMSIG00000017395) Nr1h4 (ENSMSIG00000017294) Slc17a8 (ENSMSIG00000017267) Scyl2 (ENSMSIG00000017210) Actr6 (ENSMSIG00000017172) Uhrf1bp1l (ENSMSIG00000017125) Steppe mouse MODERN SPECIES 3297 Pcsk5 (ENSMSIG00000010676) ENSMSIG00000010858 ##22 ENSMSIG00000010877 Ostf1 (ENSMSIG00000010886) Nmrk1 (ENSMSIG00000010916) Carnmt1 (ENSMSIG00000010955) D030056L22Rik (ENSMSIG00000010978) Trpm6 (ENSMSIG00000011014) Rorb (ENSMSIG00000011287) ENSMSIG00000011376 Anxa1 (ENSMSIG00000011423) Aldh1a1 (ENSMSIG00000011474) ENSMSIG00000011516 Aldh1a7 (ENSMSIG00000011529) Tmc1 (ENSMSIG00000011536) Zfand5 (ENSMSIG00000011574) ENSMSIG00000011580 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012588 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000154353.B ENSGT00940000154353.A ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000013856 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b ENSGT00530000063503.a.b ENSGT00940000156078 ENSGT00940000155724 ENSGT00950000182852.A.a.a ENSGT00390000004660.C.a.a ENSGT00940000154550.a.e.a.a.b.b ENSGT00940000154923.C ENSGT00910000148442 ENSGT00940000158351.v.b ENSGT00940000155926 ENSGT00940000160370 ENSGT00950000183029.B.c.b.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00950000183029.B.c.b.b.b ##22 ENSGT00390000011297 ENSGT01100000263980 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163229 ENSGT00940000162097 ENSGT00940000162601 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00900000143526 ENSGT00940000155134 ENSGT00390000018730.B ##35 ENSGT00940000159583 ENSGT00940000155884 Yarkand deer MODERN SPECIES 19 ST8SIA5 (ENSCHYG00000011028) LOXHD1 (ENSCHYG00000011324) ENSCHYG00000013406 ENSCHYG00000013803 HAUS1 (ENSCHYG00000013860) ATP5F1A (ENSCHYG00000014052) PSTPIP2 (ENSCHYG00000014255) ENSCHYG00000014621 EPG5 (ENSCHYG00000014653) SIGLEC15 (ENSCHYG00000014853) SLC14A1 (ENSCHYG00000014960) SLC14A2 (ENSCHYG00000015148) SETBP1 (ENSCHYG00000015524) ENSCHYG00000015620 ENSCHYG00000015702 ENSCHYG00000015729 ##22 MC2R (ENSCHYG00000015770) MC5R (ENSCHYG00000015807) ENSCHYG00000015835 FAM210A (ENSCHYG00000015902) LDLRAD4 (ENSCHYG00000015972) ENSCHYG00000016072 CEP192 (ENSCHYG00000016202) ENSCHYG00000016387 PTPN2 (ENSCHYG00000016527) ENSCHYG00000016788 CEP76 (ENSCHYG00000016908) SPIRE1 (ENSCHYG00000017091) PRELID3A (ENSCHYG00000018436) AFG3L2 (ENSCHYG00000018603) TUBB6 (ENSCHYG00000019004) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 91 ENSMMSG00000008774 SPIN4 (ENSMMSG00000009205) ENSMMSG00000009224 ENSMMSG00000009237 ENSMMSG00000009263 ENSMMSG00000009355 ENSMMSG00000009369 ENSMMSG00000009402 ENSMMSG00000009436 ENSMMSG00000009464 ENSMMSG00000009490 ##22 ENSMMSG00000009507 DIPK2B (ENSMMSG00000009534) KDM6A (ENSMMSG00000009624) DUSP21 (ENSMMSG00000010320) FUNDC1 (ENSMMSG00000010343) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182890.D.c.a.b ENSGT00940000163165 ENSGT00940000161576 ENSGT00940000163521 ENSGT00940000159644 ENSGT00940000163102 ENSGT00940000162298 ENSGT00940000163016 ENSGT00940000163314.b ENSGT00940000163105 ENSGT00940000162869 ENSGT01090000260044.A.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000161098 ENSGT00940000163329 ENSGT00940000160807 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.c.a ##22 ENSGT00940000158537 ENSGT00940000163512 ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.a ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.b ENSGT01090000260044.A.b.a.a.b.f.a ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.b ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.b ENSGT01090000260044.A.b.a.a.b.e.b ENSGT01050000244815.A.c.a.a.a.m.a.a.d ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.b.d.b.a.a.b Bos ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Bos_b DUPLICATION Bos_b DUPLICATION Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161348 ENSGT00390000015537 ENSGT00940000155770 ENSGT00920000149159 ENSGT00940000159384 ENSGT00390000005323 ENSGT00390000001325 ENSGT00940000158164 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000157708 ENSGT00960000191550 ENSGT00940000155221.l ENSGT00940000154609 ENSGT01050000244942.b.a.a ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.b.b.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000183029.A.n.a ##22 ENSGT00940000156165 ENSGT00390000017130 ENSGT00440000033805.h.a ENSGT00940000157611 ENSGT00950000182926.b.d.c.a.c.a ENSGT00940000153636.b ENSGT00940000157366.f ENSGT00940000160905 ENSGT01100000263511.b.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00550000074816.B ENSGT00940000156117 ENSGT00390000014593 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a ENSGT00530000063335.B.a.b Cow MODERN SPECIES 27 RFK (ENSBTAG00000019345) PCSK5 (ENSBTAG00000008101) ENSBTAG00000053085 OSTF1 (ENSBTAG00000002746) NMRK1 (ENSBTAG00000019687) CARNMT1 (ENSBTAG00000008204) C8H9orf40 (ENSBTAG00000013231) ENSBTAG00000051504 TRPM6 (ENSBTAG00000033076) RORB (ENSBTAG00000021699) ENSBTAG00000053207 ANXA1 (ENSBTAG00000015978) ALDH1A1 (ENSBTAG00000008103) ENSBTAG00000052698 TMC1 (ENSBTAG00000018778) ENSBTAG00000054894 ##22 ZFAND5 (ENSBTAG00000009417) GDA (ENSBTAG00000011545) C8H9orf85 (ENSBTAG00000006831) ABHD17B (ENSBTAG00000006816) ENSBTAG00000054590 CEMIP2 (ENSBTAG00000005090) TRPM3 (ENSBTAG00000050253) TRPM3 (ENSBTAG00000007778) KLF9 (ENSBTAG00000016229) ENSBTAG00000052999 SMC5 (ENSBTAG00000018437) MAMDC2 (ENSBTAG00000017369) CFAP95 (ENSBTAG00000033396) PTAR1 (ENSBTAG00000005826) APBA1 (ENSBTAG00000008877) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 27 GCNT1 (ENSBIXG00005012101) ENSBIXG00005012140 ENSBIXG00005012159 PCSK5 (ENSBIXG00005012986) OSTF1 (ENSBIXG00005013151) NMRK1 (ENSBIXG00005013188) CARNMT1 (ENSBIXG00005013231) TRPM6 (ENSBIXG00005014056) ENSBIXG00005014163 RORB (ENSBIXG00005006505) ENSBIXG00005014214 ENSBIXG00005014241 ALDH1A1 (ENSBIXG00005001914) TMC1 (ENSBIXG00005005407) ENSBIXG00005001926 ENSBIXG00005014453 ##22 ENSBIXG00005014461 ZFAND5 (ENSBIXG00005014532) ENSBIXG00005014554 GDA (ENSBIXG00005014619) ENSBIXG00005014654 ABHD17B (ENSBIXG00005014706) ENSBIXG00005014713 ENSBIXG00005014723 CEMIP2 (ENSBIXG00005002091) TRPM3 (ENSBIXG00005015290) KLF9 (ENSBIXG00005015399) ENSBIXG00005015415 ENSBIXG00005002258 ENSBIXG00005015611 ENSBIXG00005015663 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153783.b.b.c.b.a.a ENSGT01030000234540.B.b.l ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.a ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.b ENSGT00940000161974.c.b ENSGT00940000161974.c.a ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT00940000155795 ENSGT01100000263475.d.a.h.m ENSGT01100000263475.d.a.g.b.b.a.c.a.b ENSGT01100000263475.d.a.g.b.b.a.c.b ENSGT01100000263475.d.a.h.n ENSGT01100000263475.d.a.g.b.b.a.c.a.a ENSGT00950000183029.A.n.b ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT01100000263475.d.a.g.a.b.n.a.c.b ENSGT01100000263475.d.a.g.a.b.n.b ENSGT01100000263475.d.a.g.a.b.n.a.c.a ENSGT01100000263475.d.a.g.a.b.m.b ENSGT01100000263475.d.a.g.a.b.m.a ENSGT01100000263475.d.a.g.a.a ENSGT00940000164107 ENSGT00940000154227.a.b.f ENSGT00940000161377.y.b.c ENSGT00940000161377.y.b.d ENSGT01100000263475.d.a.g.b.b.a.d ENSGT00940000154227.a.a.c.b ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00940000164339 Cow MODERN SPECIES 22 ENSBTAG00000051454 ENSBTAG00000054932 ENSBTAG00000053098 FCRL5 (ENSBTAG00000000964) FCRL4 (ENSBTAG00000054233) FCRL3 (ENSBTAG00000039702) FCRL1 (ENSBTAG00000005891) ENSBTAG00000053777 CD5L (ENSBTAG00000022514) ENSBTAG00000017204 KIRREL1 (ENSBTAG00000005799) ENSBTAG00000038263 ENSBTAG00000024960 CD1D (ENSBTAG00000039993) CD1A (ENSBTAG00000054063) ENSBTAG00000048613 ##22 ENSBTAG00000038502 ENSBTAG00000022893 ENSBTAG00000039189 CD1B (ENSBTAG00000038426) ENSBTAG00000000963 CD1B5 (ENSBTAG00000038366) CD1E (ENSBTAG00000009421) OR10T2 (ENSBTAG00000007297) OR10T1 (ENSBTAG00000037807) OR10K1C (ENSBTAG00000049745) OR10K1B (ENSBTAG00000022556) ENSBTAG00000039366 OR10R2 (ENSBTAG00000017778) ENSBTAG00000026848 OR10K2 (ENSBTAG00000023556) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 22 ETV3 (ENSBIXG00005014992) ENSBIXG00005015017 ENSBIXG00005015071 ENSBIXG00005006553 ENSBIXG00005015118 ENSBIXG00005006557 FCRL5 (ENSBIXG00005015280) FCRL4 (ENSBIXG00005006135) FCRL1 (ENSBIXG00005005503) ENSBIXG00005015502 ENSBIXG00005015539 KIRREL1 (ENSBIXG00005015635) ENSBIXG00005000211 ENSBIXG00005006567 ENSBIXG00005015832 ENSBIXG00005000167 ##22 ENSBIXG00005000162 ENSBIXG00005015895 ENSBIXG00005015923 ENSBIXG00005015937 ENSBIXG00005015952 CD1E (ENSBIXG00005016203) ENSBIXG00005016257 ENSBIXG00005016293 ENSBIXG00005016316 ENSBIXG00005000088 OR10R2 (ENSBIXG00005016344) ENSBIXG00005016360 OR10K2 (ENSBIXG00005016368) ENSBIXG00005016375 ENSBIXG00005016398 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.o ##22 Cow MODERN SPECIES 15 TRAM2 (ENSBTAG00000009112) EFHC1 (ENSBTAG00000017810) PAQR8 (ENSBTAG00000025494) MCM3 (ENSBTAG00000010721) IL17F (ENSBTAG00000016835) IL17A (ENSBTAG00000002150) PKHD1 (ENSBTAG00000011237) ENSBTAG00000053324 TFAP2B (ENSBTAG00000020426) TFAP2D (ENSBTAG00000020425) ENSBTAG00000046711 DEFB110 (ENSBTAG00000051453) DEFB113 (ENSBTAG00000054396) DEFB114 (ENSBTAG00000054219) CRISP1 (ENSBTAG00000008085) ENSBTAG00000053808 ##22 CRISP3 (ENSBTAG00000012918) CRISP2 (ENSBTAG00000002166) RHAG (ENSBTAG00000011300) C23H6orf141 (ENSBTAG00000047591) GLYATL3 (ENSBTAG00000025535) CENPQ (ENSBTAG00000020710) MMUT (ENSBTAG00000014272) ENSBTAG00000054235 ENSBTAG00000038677 OR5M10C (ENSBTAG00000047485) OR9G1 (ENSBTAG00000053275) PTCHD4 (ENSBTAG00000051749) ENSBTAG00000021415 OPN5 (ENSBTAG00000016499) ADGRF4 (ENSBTAG00000002934) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Wild yak MODERN SPECIES 1304 ATG5 (ENSBMUG00000023134) PRDM1 (ENSBMUG00000023100) ENSBMUG00000023085 PREP (ENSBMUG00000023073) POPDC3 (ENSBMUG00000023059) BVES (ENSBMUG00000023051) LIN28B (ENSBMUG00000023040) HACE1 (ENSBMUG00000023019) ENSBMUG00000022972 ##22 ENSBMUG00000022963 American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 3376 RIOK2 (ENSBBBG00000021102) RGMB (ENSBBBG00000021070) CHD1 (ENSBBBG00000021058) ENSBBBG00000020977 ST8SIA4 (ENSBBBG00000007803) SLCO4C1 (ENSBBBG00000020941) ENSBBBG00000020921 PAM (ENSBBBG00000020858) ENSBBBG00000005548 ENSBBBG00000007049 PPIP5K2 (ENSBBBG00000020508) MACIR (ENSBBBG00000020370) ENSBBBG00000020365 NUDT12 (ENSBBBG00000008838) ENSBBBG00000008393 ENSBBBG00000007469 ##22 EFNA5 (ENSBBBG00000005022) American bison MODERN SPECIES 3002 ENSBBBG00000024753 ENSBBBG00000006500 SP110 (ENSBBBG00000007717) ENSBBBG00000000202 ENSBBBG00000000211 SLC16A14 (ENSBBBG00000006455) FBXO36 (ENSBBBG00000000223) TRIP12 (ENSBBBG00000008212) DNER (ENSBBBG00000024265) PID1 (ENSBBBG00000024245) SPHKAP (ENSBBBG00000024223) DAW1 (ENSBBBG00000006290) CCL20 (ENSBBBG00000024155) SCYGR8 (ENSBBBG00000006279) SCYGR6 (ENSBBBG00000024138) ENSBBBG00000024129 ##22 ENSBBBG00000024121 ENSBBBG00000024115 ENSBBBG00000024107 AGFG1 (ENSBBBG00000024080) TM4SF20 (ENSBBBG00000006229) ENSBBBG00000000312 COL4A3 (ENSBBBG00000006184) ENSBBBG00000023643 RHBDD1 (ENSBBBG00000006172) IRS1 (ENSBBBG00000023621) ENSBBBG00000006165 NYAP2 (ENSBBBG00000006164) DOCK10 (ENSBBBG00000008970) CCDC195 (ENSBBBG00000023305) CUL3 (ENSBBBG00000023282) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155385 ENSGT00950000183017.b.a ENSGT00390000018121.b ENSGT00940000157939 ENSGT00940000157584 ENSGT00940000154666 ENSGT00940000156956 ENSGT00940000154586.i ENSGT00940000153678.a.b ENSGT00940000153185.a.b ENSGT00950000182999.b.a.b ENSGT00390000000819.a ENSGT00940000162850 ENSGT00390000012348 ENSGT00390000017064 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00950000182931.B.b ENSGT00390000005534.b.b.c.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000159240 ENSGT00940000159050 ENSGT00910000146885 ENSGT00940000153908.b.a.a ENSGT00440000034107.a ENSGT00940000158372 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT01040000240406.C.a.a.i.a ENSGT01040000240406.C.a.a.i.b ENSGT01040000240406.C.a.b.o.a ENSGT01040000240406.C.a.b.o.b ENSGT01040000240406.C.a.a.j ENSGT01040000240406.C.a.b.p Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 6 SBF2 (ENSOARG00020016669) SWAP70 (ENSOARG00020017034) ENSOARG00020017192 WEE1 (ENSOARG00020017220) ZNF143 (ENSOARG00020017439) IPO7 (ENSOARG00020017859) TMEM41B (ENSOARG00020018081) ENSOARG00020018187 DENND5A (ENSOARG00020018228) SCUBE2 (ENSOARG00020018704) NRIP3 (ENSOARG00020020408) TMEM9B (ENSOARG00020020521) ASCL3 (ENSOARG00020020556) C11orf16 (ENSOARG00020020576) AKIP1 (ENSOARG00020020684) ENSOARG00020020919 ##22 DENND2B (ENSOARG00020020975) RPL27A (ENSOARG00020021579) TRIM66 (ENSOARG00020021713) STK33 (ENSOARG00020021958) LMO1 (ENSOARG00020022083) RIC3 (ENSOARG00020022173) TUB (ENSOARG00020022355) EIF3F (ENSOARG00020022600) ENSOARG00020022663 ENSOARG00020022685 ENSOARG00020022700 ENSOARG00020022709 ENSOARG00020022727 ENSOARG00020022736 OR5P3 (ENSOARG00020022765) Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 18 PDZD8 (ENSCHIG00000014429) SLC18A2 (ENSCHIG00000024050) KCNK18 (ENSCHIG00000013853) VAX1 (ENSCHIG00000001536) SHTN1 (ENSCHIG00000001689) ENO4 (ENSCHIG00000019329) HSPA12A (ENSCHIG00000002992) C10orf82 (ENSCHIG00000021577) PNLIPRP2 (ENSCHIG00000011772) PNLIPRP1 (ENSCHIG00000000787) PNLIP (ENSCHIG00000002440) PNLIPRP3 (ENSCHIG00000016919) CCDC172 (ENSCHIG00000022378) GFRA1 (ENSCHIG00000015186) ATRNL1 (ENSCHIG00000021652) ENSCHIG00000011844 ##22 TRUB1 (ENSCHIG00000020884) ENSCHIG00000005285 FHIP2A (ENSCHIG00000020587) ENSCHIG00000022681 ABLIM1 (ENSCHIG00000013355) AFAP1L2 (ENSCHIG00000006433) VWA2 (ENSCHIG00000002274) TDRD1 (ENSCHIG00000012766) CCDC186 (ENSCHIG00000017133) ADRB1 (ENSCHIG00000007509) NHLRC2 (ENSCHIG00000009352) DCLRE1A (ENSCHIG00000016555) ENSCHIG00000023118 CASP7 (ENSCHIG00000011503) NRAP (ENSCHIG00000020183) Goat MODERN SPECIES 6 SBF2 (ENSCHIG00000019548) SWAP70 (ENSCHIG00000000725) ENSCHIG00000019629 WEE1 (ENSCHIG00000017141) ZNF143 (ENSCHIG00000026822) IPO7 (ENSCHIG00000024527) TMEM41B (ENSCHIG00000016086) ENSCHIG00000021194 DENND5A (ENSCHIG00000013301) SCUBE2 (ENSCHIG00000017481) NRIP3 (ENSCHIG00000020900) TMEM9B (ENSCHIG00000019262) ASCL3 (ENSCHIG00000004050) C11orf16 (ENSCHIG00000027030) AKIP1 (ENSCHIG00000014273) ENSCHIG00000025866 ##22 DENND2B (ENSCHIG00000003569) ENSCHIG00000018150 TRIM66 (ENSCHIG00000013414) STK33 (ENSCHIG00000025791) ENSCHIG00000025442 LMO1 (ENSCHIG00000020736) RIC3 (ENSCHIG00000019881) TUB (ENSCHIG00000024174) ENSCHIG00000020447 ENSCHIG00000011001 ENSCHIG00000002354 ENSCHIG00000004082 ENSCHIG00000024437 ENSCHIG00000011547 ENSCHIG00000015598 Goat MODERN SPECIES 11 HERC2 (ENSCHIG00000016110) NIPA1 (ENSCHIG00000008727) NIPA2 (ENSCHIG00000024961) CYFIP1 (ENSCHIG00000017200) ENSCHIG00000007633 TUBGCP5 (ENSCHIG00000025117) ENSCHIG00000015512 IMP4 (ENSCHIG00000027227) PTPN18 (ENSCHIG00000013671) ENSCHIG00000025882 ENSCHIG00000012973 ENSCHIG00000018690 FAM168B (ENSCHIG00000023919) ENSCHIG00000007457 PLEKHB2 (ENSCHIG00000020463) ENSCHIG00000009789 ##22 ENSCHIG00000016781 ENSCHIG00000025950 HS6ST1 (ENSCHIG00000016130) UGGT1 (ENSCHIG00000017321) SAP130 (ENSCHIG00000019417) ENSCHIG00000011826 AMMECR1L (ENSCHIG00000011778) POLR2D (ENSCHIG00000025995) ENSCHIG00000007698 WDR33 (ENSCHIG00000019104) SFT2D3 (ENSCHIG00000009475) GPR17 (ENSCHIG00000009894) LIMS2 (ENSCHIG00000017089) MYO7B (ENSCHIG00000010823) IWS1 (ENSCHIG00000008783) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Blue whale MODERN SPECIES 7 DHX32 (ENSBMSG00010013653) BCCIP (ENSBMSG00010013666) ENSBMSG00010013691 EDRF1 (ENSBMSG00010013766) TEX36 (ENSBMSG00010013896) CTBP2 (ENSBMSG00010013957) ZRANB1 (ENSBMSG00010014072) ABRAXAS2 (ENSBMSG00010014139) EEF1AKMT2 (ENSBMSG00010014167) FAM53B (ENSBMSG00010014196) LHPP (ENSBMSG00010014228) ENSBMSG00010014254 NKX1-2 (ENSBMSG00010014273) OAT (ENSBMSG00010014300) ENSBMSG00010014326 ENSBMSG00010014351 ##22 CHST15 (ENSBMSG00010014379) CPXM2 (ENSBMSG00010014404) GPR26 (ENSBMSG00010014443) ENSBMSG00010014482 BUB3 (ENSBMSG00010014520) HMX2 (ENSBMSG00010014617) HMX3 (ENSBMSG00010014645) ENSBMSG00010014664 IKZF5 (ENSBMSG00010014703) PSTK (ENSBMSG00010014723) ENSBMSG00010014749 ENSBMSG00010014768 ENSBMSG00010014794 ENSBMSG00010014809 ENSBMSG00010014827 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153270.b.b ENSGT01090000260076.a ENSGT00390000006126 ENSGT00730000111162 ENSGT00940000155387 ENSGT00940000159593 ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156311 ENSGT00940000162172 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162610 ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00940000161858 ENSGT00940000157053 ENSGT00940000159828 ENSGT00550000074917 ENSGT00940000153783.b.b.c.a.b.c ENSGT00860000135739 ENSGT00950000182930.B ENSGT00950000182930.A.b ENSGT00950000182930.C ENSGT00940000155792 ENSGT00470000042284 ENSGT00940000160342 ENSGT00940000156768 ENSGT00940000160680 ENSGT00950000183009 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000153270.b.b ENSGT01090000260076.a ENSGT00390000006126 ENSGT00730000111162 ENSGT00940000155387 ENSGT00940000159593 ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000162172 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162610 ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00940000161858 ENSGT00940000157053 ENSGT00940000159828 ENSGT00550000074917 ENSGT00940000153783.b.b.c.a.b.c ENSGT00860000135739 ENSGT00950000182930.B ENSGT00950000182930.A.b ENSGT00950000182930.C ENSGT00940000155792 ENSGT00470000042284 ENSGT00940000160342 ENSGT00940000156768 ENSGT00940000160680 ENSGT00950000183009 Narwhal MODERN SPECIES 297 CLDN16 (ENSMMNG00015000943) CLDN1 (ENSMMNG00015000969) P3H2 (ENSMMNG00015000991) TP63 (ENSMMNG00015001263) ENSMMNG00015001800 TPRG1 (ENSMMNG00015001838) LPP (ENSMMNG00015001868) ENSMMNG00015001892 ENSMMNG00015001911 BCL6 (ENSMMNG00015001927) ENSMMNG00015001980 RTP2 (ENSMMNG00015001993) SST (ENSMMNG00015002014) ENSMMNG00015002054 MASP1 (ENSMMNG00015002086) ENSMMNG00015002133 ##22 RTP1 (ENSMMNG00015002144) ST6GAL1 (ENSMMNG00015002165) ADIPOQ (ENSMMNG00015002186) RFC4 (ENSMMNG00015002207) ENSMMNG00015002249 ENSMMNG00015002348 KNG1 (ENSMMNG00015002403) FETUB (ENSMMNG00015002470) AHSG (ENSMMNG00015002496) DNAJB11 (ENSMMNG00015002520) TBCCD1 (ENSMMNG00015002562) CRYGS (ENSMMNG00015002601) DGKG (ENSMMNG00015002688) ETV5 (ENSMMNG00015002815) TRA2B (ENSMMNG00015002840) Vaquita MODERN SPECIES 15 GMNC (ENSPSNG00000012883) IL1RAP (ENSPSNG00000012840) TMEM207 (ENSPSNG00000012768) CLDN16 (ENSPSNG00000012645) CLDN1 (ENSPSNG00000012587) P3H2 (ENSPSNG00000012524) TP63 (ENSPSNG00000010992) TPRG1 (ENSPSNG00000010703) LPP (ENSPSNG00000010571) ENSPSNG00000010530 BCL6 (ENSPSNG00000010360) RTP2 (ENSPSNG00000010300) SST (ENSPSNG00000010259) ENSPSNG00000010235 MASP1 (ENSPSNG00000010078) ENSPSNG00000010008 ##22 RTP1 (ENSPSNG00000009958) ST6GAL1 (ENSPSNG00000009897) ADIPOQ (ENSPSNG00000009849) RFC4 (ENSPSNG00000009752) ENSPSNG00000006295 ENSPSNG00000006228 KNG1 (ENSPSNG00000006112) FETUB (ENSPSNG00000005950) AHSG (ENSPSNG00000005839) DNAJB11 (ENSPSNG00000005816) TBCCD1 (ENSPSNG00000005754) CRYGS (ENSPSNG00000005698) DGKG (ENSPSNG00000005388) ETV5 (ENSPSNG00000005224) ENSPSNG00000005195 Sperm whale MODERN SPECIES 7 ENSPCTG00005004506 KCNJ11 (ENSPCTG00005004532) ABCC8 (ENSPCTG00005004712) USH1C (ENSPCTG00005006223) OTOG (ENSPCTG00005006334) MYOD1 (ENSPCTG00005006484) KCNC1 (ENSPCTG00005006503) SERGEF (ENSPCTG00005006546) TPH1 (ENSPCTG00005006667) SAAL1 (ENSPCTG00005006752) ENSPCTG00005006800 ENSPCTG00005006824 ENSPCTG00005006852 HPS5 (ENSPCTG00005006903) GTF2H1 (ENSPCTG00005007039) ENSPCTG00005007257 ##22 LDHA (ENSPCTG00005007271) LDHC (ENSPCTG00005007321) ENSPCTG00005007383 TSG101 (ENSPCTG00005007406) UEVLD (ENSPCTG00005007495) MISFA (ENSPCTG00005007534) SPTY2D1 (ENSPCTG00005007559) TMEM86A (ENSPCTG00005007580) IGSF22 (ENSPCTG00005007611) PTPN5 (ENSPCTG00005007677) ENSPCTG00005007749 ENSPCTG00005007781 ZDHHC13 (ENSPCTG00005007891) CSRP3 (ENSPCTG00005007959) E2F8 (ENSPCTG00005008024) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 American mink MODERN SPECIES 184 ENSNVIG00000020199 ##22 ENSNVIG00000020196 PCDH7 (ENSNVIG00000020186) ENSNVIG00000020181 ENSNVIG00000020167 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 American black bear MODERN SPECIES 6754 ENSUAMG00000018906 ##22 Polar bear MODERN SPECIES 332 PLS3 (ENSUMAG00000021897) IL13RA2 (ENSUMAG00000022905) ENSUMAG00000022910 HTR2C (ENSUMAG00000022914) ENSUMAG00000022919 ENSUMAG00000022925 ENSUMAG00000022928 ##22 ENSUMAG00000022930 LHFPL1 (ENSUMAG00000022934) RTL4 (ENSUMAG00000022935) TRPC5 (ENSUMAG00000022936) TRPC5OS (ENSUMAG00000022941) ENSUMAG00000022944 ENSUMAG00000022947 DCX (ENSUMAG00000022953) CAPN6 (ENSUMAG00000022979) PAK3 (ENSUMAG00000023011) CHRDL1 (ENSUMAG00000023050) ENSUMAG00000023081 ENSUMAG00000023082 TMEM164 (ENSUMAG00000023085) ACSL4 (ENSUMAG00000023090) Canidae DUPLICATION Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.u.a ##22 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 10 ENSVVUG00000012706 SLC9A4 (ENSVVUG00000012698) SLC9A2 (ENSVVUG00000012609) MFSD9 (ENSVVUG00000012601) TMEM182 (ENSVVUG00000012600) YPEL5 (ENSVVUG00000012570) ENSVVUG00000012534 MRPS9 (ENSVVUG00000012519) GPR45 (ENSVVUG00000012504) TGFBRAP1 (ENSVVUG00000012480) CUNH2orf49 (ENSVVUG00000012474) FHL2 (ENSVVUG00000012463) NCK2 (ENSVVUG00000012449) CUNH2orf40 (ENSVVUG00000012431) UXS1 (ENSVVUG00000012428) ENSVVUG00000012417 ##22 ENSVVUG00000012397 ENSVVUG00000012373 SLC5A7 (ENSVVUG00000012346) ENSVVUG00000012341 ENSVVUG00000012335 Red fox MODERN SPECIES 66 LRRC34 (ENSVVUG00000000575) LRRIQ4 (ENSVVUG00000000662) LRRC31 (ENSVVUG00000000681) ENSVVUG00000000692 SAMD7 (ENSVVUG00000000702) SEC62 (ENSVVUG00000000766) PHC3 (ENSVVUG00000000912) ENSVVUG00000001040 PRKCI (ENSVVUG00000001057) SKIL (ENSVVUG00000001083) CLDN11 (ENSVVUG00000001091) SLC7A14 (ENSVVUG00000001102) ENSVVUG00000001121 RPL22L1 (ENSVVUG00000001132) EIF5A2 (ENSVVUG00000001140) ENSVVUG00000001154 ##22 SLC2A2 (ENSVVUG00000001163) ENSVVUG00000001177 TNIK (ENSVVUG00000001221) PLD1 (ENSVVUG00000001416) TMEM212 (ENSVVUG00000001592) FNDC3B (ENSVVUG00000001630) GHSR (ENSVVUG00000001716) TNFSF10 (ENSVVUG00000001732) NCEH1 (ENSVVUG00000001743) ENSVVUG00000001754 ECT2 (ENSVVUG00000001784) SPATA16 (ENSVVUG00000001877) NLGN1 (ENSVVUG00000001921) NAALADL2 (ENSVVUG00000001942) ENSVVUG00000001970 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.u.a ##22 Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 19 CECR2 (ENSCAFG00845030673) ADA2 (ENSCAFG00845030648) ENSCAFG00845030635 ENSCAFG00845030604 ENSCAFG00845030526 ENSCAFG00845030517 ENSCAFG00845030375 RPP25L (ENSCAFG00845030243) DCP1B (ENSCAFG00845030207) ENSCAFG00845030189 LRTM2 (ENSCAFG00845030181) CACNA2D4 (ENSCAFG00845029753) ADIPOR2 (ENSCAFG00845029546) WNT5B (ENSCAFG00845029513) FBXL14 (ENSCAFG00845029493) ENSCAFG00845029436 ##22 ERC1 (ENSCAFG00845029083) RAD52 (ENSCAFG00845028934) WNK1 (ENSCAFG00845028333) NINJ2 (ENSCAFG00845028073) B4GALNT3 (ENSCAFG00845027982) CCDC77 (ENSCAFG00845027776) KDM5A (ENSCAFG00845027343) SLC6A13 (ENSCAFG00845027058) SLC6A12 (ENSCAFG00845026822) ENSCAFG00845026692 ENSCAFG00845026599 DDX11 (ENSCAFG00845025631) ##14 FKBP4 (ENSCAFG00845025321) ITFG2 (ENSCAFG00845025183) NRIP2 (ENSCAFG00845025130) Dog MODERN SPECIES 3 DXO (ENSCAFG00845014369) CYP21A2 (ENSCAFG00845014419) ENSCAFG00845014483 ATF6B (ENSCAFG00845014557) FKBPL (ENSCAFG00845014657) PRRT1 (ENSCAFG00845014684) PPT2 (ENSCAFG00845014727) EGFL8 (ENSCAFG00845014787) AGPAT1 (ENSCAFG00845014837) RNF5 (ENSCAFG00845014858) AGER (ENSCAFG00845014982) PBX2 (ENSCAFG00845016393) GPSM3 (ENSCAFG00845016471) ENSCAFG00845016724 ENSCAFG00845016762 ENSCAFG00845016831 ##22 ENSCAFG00845016861 ENSCAFG00845016990 ENSCAFG00845017104 BTNL2 (ENSCAFG00845017222) ENSCAFG00845017367 DLA-DRA (ENSCAFG00845017467) DLA-DQA1 (ENSCAFG00845017728) HLA-DQB2 (ENSCAFG00845017781) TAP2 (ENSCAFG00845017879) PSMB8 (ENSCAFG00845018353) PSMB9 (ENSCAFG00845018485) DLA-DMB (ENSCAFG00845018536) DLA-DMA (ENSCAFG00845018613) BRD2 (ENSCAFG00845018726) DLA-DOA (ENSCAFG00845018933) Dingo MODERN SPECIES 74 TMEM121B (ENSCAFG00020007600) IL17RA (ENSCAFG00020007606) ENSCAFG00020007616 CACNA1C (ENSCAFG00020007795) ENSCAFG00020012001 ENSCAFG00020012012 DCP1B (ENSCAFG00020012014) CACNA2D4 (ENSCAFG00020012026) ENSCAFG00020012095 LRTM2 (ENSCAFG00020012097) ADIPOR2 (ENSCAFG00020012102) ENSCAFG00020012110 ENSCAFG00020012113 FBXL14 (ENSCAFG00020012120) ERC1 (ENSCAFG00020012182) ENSCAFG00020014213 ##22 RAD52 (ENSCAFG00020014219) WNK1 (ENSCAFG00020014236) NINJ2 (ENSCAFG00020014312) B4GALNT3 (ENSCAFG00020014313) CCDC77 (ENSCAFG00020014349) KDM5A (ENSCAFG00020014354) SLC6A13 (ENSCAFG00020014603) SLC6A12 (ENSCAFG00020014608) IQSEC3 (ENSCAFG00020014638) ENSCAFG00020014652 DDX11 (ENSCAFG00020014710) ##14 FKBP4 (ENSCAFG00020014724) ITFG2 (ENSCAFG00020014725) NRIP2 (ENSCAFG00020014729) TEX52 (ENSCAFG00020014731) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.u.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00440000034367 ENSGT00940000158350 ENSGT00940000165681 ENSGT00940000162271 ENSGT00940000160963 ENSGT01030000234540.B.b.l ENSGT01030000234540.B.b.k ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.b.b ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.b ENSGT00940000161974 ENSGT01050000244808.D.fb.b.b.a ENSGT01050000244808.D.fb.b.a.a.a.a ENSGT00940000160090 ENSGT00940000154784.D.a.b ENSGT00940000153463.b ENSGT00950000183029.A.u.b ##22 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00950000182891.a.a.b.a.a.a.b.a.a.x.a ENSGT00950000183123.g.a.a.b ENSGT00390000000412 ENSGT00940000160505 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 ENSGT00390000018505.b ENSGT00390000002210.d ENSGT00940000159576 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 271 LRRC71 (ENSCAFG00020004984) ARHGEF11 (ENSCAFG00020003900) ENSCAFG00020003830 ENSCAFG00020003825 ETV3 (ENSCAFG00020003819) ENSCAFG00020003814 ENSCAFG00020003785 ENSCAFG00020003778 FCRL2 (ENSCAFG00020003774) ENSCAFG00020003770 CD5L (ENSCAFG00020003767) ENSCAFG00020003750 ENSCAFG00020003741 CAPN2 (ENSCAFG00020003732) TP53BP2 (ENSCAFG00020003710) ENSCAFG00020003697 ##22 FBXO28 (ENSCAFG00020003694) DEGS1 (ENSCAFG00020003693) ENSCAFG00020003689 NVL (ENSCAFG00020003680) CNIH4 (ENSCAFG00020003678) WDR26 (ENSCAFG00020003429) CNIH3 (ENSCAFG00020003397) ENSCAFG00020003365 ENSCAFG00020003361 ENSCAFG00020003357 ENSCAFG00020003333 ENSCAFG00020003326 LBR (ENSCAFG00020003321) ENAH (ENSCAFG00020003296) SRP9 (ENSCAFG00020003285) Dingo MODERN SPECIES 317 LRRC34 (ENSCAFG00020000619) LRRIQ4 (ENSCAFG00020000646) ENSCAFG00020000683 SAMD7 (ENSCAFG00020000689) ENSCAFG00020000715 ENSCAFG00020000719 GPR160 (ENSCAFG00020000726) PHC3 (ENSCAFG00020000759) PRKCI (ENSCAFG00020001182) SKIL (ENSCAFG00020003889) CLDN11 (ENSCAFG00020003902) SLC7A14 (ENSCAFG00020003904) ENSCAFG00020003928 ENSCAFG00020003931 EIF5A2 (ENSCAFG00020003939) ENSCAFG00020003946 ##22 SLC2A2 (ENSCAFG00020003949) ENSCAFG00020003964 ENSCAFG00020003970 ENSCAFG00020004120 PLD1 (ENSCAFG00020004212) TMEM212 (ENSCAFG00020004412) FNDC3B (ENSCAFG00020004443) GHSR (ENSCAFG00020004605) TNFSF10 (ENSCAFG00020004618) ENSCAFG00020004622 ECT2 (ENSCAFG00020004635) SPATA16 (ENSCAFG00020004681) NLGN1 (ENSCAFG00020004713) NAALADL2 (ENSCAFG00020004751) ENSCAFG00020004812 Dog MODERN SPECIES 35 ARHGEF11 (ENSCAFG00845014149) ETV3L (ENSCAFG00845013961) ETV3 (ENSCAFG00845013939) ENSCAFG00845013888 ENSCAFG00845013836 ENSCAFG00845013811 ENSCAFG00845013789 FCRL4 (ENSCAFG00845013675) FCRL2 (ENSCAFG00845013579) FCRL1 (ENSCAFG00845013495) CD5L (ENSCAFG00845013426) ENSCAFG00845013378 ENSCAFG00845013276 CAPN2 (ENSCAFG00845013136) TP53BP2 (ENSCAFG00845013060) ENSCAFG00845012978 ##22 FBXO28 (ENSCAFG00845012940) DEGS1 (ENSCAFG00845012915) ENSCAFG00845012857 NVL (ENSCAFG00845012656) CNIH4 (ENSCAFG00845012452) WDR26 (ENSCAFG00845012382) CNIH3 (ENSCAFG00845012278) ENSCAFG00845012260 ENSCAFG00845012247 DNAH14 (ENSCAFG00845011498) LBR (ENSCAFG00845010980) ENAH (ENSCAFG00845009892) SRP9 (ENSCAFG00845009505) EPHX1 (ENSCAFG00845009397) TMEM63A (ENSCAFG00845009155) Red fox MODERN SPECIES 277 ENSVVUG00000015892 ENSVVUG00000015889 ENSVVUG00000015888 ENSVVUG00000015868 CHIC1 (ENSVVUG00000015860) ENSVVUG00000015823 ENSVVUG00000015801 ENSVVUG00000015792 ##22 ENSVVUG00000015788 ZCCHC13 (ENSVVUG00000015754) ENSVVUG00000015751 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A.v ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182946.c.b.a ENSGT00950000182946.c.b.b ENSGT00950000182946.d.h ENSGT00950000182946.d.g ENSGT00940000161962 ENSGT00940000159981 ENSGT00940000162173 ENSGT00940000162764.B ENSGT00940000160084 ENSGT00910000146855 ENSGT00950000183029.A.v ##22 ENSGT00940000161324 ENSGT00940000154906.C.d ENSGT00940000166627 ENSGT00420000029824 ENSGT00940000153968.a.b.a ENSGT00390000015845 ENSGT00940000155727 ENSGT00390000001136 ENSGT00390000007753.a ENSGT00940000153986.b.a ENSGT00940000156318 ENSGT00940000156359 ENSGT01100000263497.A ENSGT00940000156562 ENSGT00530000063405.a Dog MODERN SPECIES 32 ENSCAFG00845001861 ENSCAFG00845001906 ENSCAFG00845001939 ZNF248 (ENSCAFG00845001984) ENSCAFG00845002018 ZNF25 (ENSCAFG00845002050) ENSCAFG00845002093 ENSCAFG00845002123 ENSCAFG00845002157 ENSCAFG00845002175 ENSCAFG00845002185 ENSCAFG00845002215 ENSCAFG00845002227 ##22 ENSCAFG00845002311 RYR2 (ENSCAFG00845002388) ENSCAFG00845002457 MTR (ENSCAFG00845002493) ACTN2 (ENSCAFG00845002571) HEATR1 (ENSCAFG00845002644) LGALS8 (ENSCAFG00845002813) EDARADD (ENSCAFG00845002915) ERO1B (ENSCAFG00845002967) GPR137B (ENSCAFG00845003012) NID1 (ENSCAFG00845003062) LYST (ENSCAFG00845003136) GNG4 (ENSCAFG00845003188) ENSCAFG00845003209 B3GALNT2 (ENSCAFG00845003224) Dingo MODERN SPECIES 258 IFIT2 (ENSCAFG00020025212) IFIT3 (ENSCAFG00020025215) ENSCAFG00020025219 ENSCAFG00020025230 ZNF248 (ENSCAFG00020025231) ENSCAFG00020025236 ZNF25 (ENSCAFG00020025239) ENSCAFG00020025242 ZNF37A (ENSCAFG00020025243) ENSCAFG00020025248 CHRM3 (ENSCAFG00020025250) ENSCAFG00020025255 ##22 ZP4 (ENSCAFG00020025258) RYR2 (ENSCAFG00020025276) ENSCAFG00020025327 MTR (ENSCAFG00020025329) ACTN2 (ENSCAFG00020025472) HEATR1 (ENSCAFG00020026884) LGALS8 (ENSCAFG00020026961) EDARADD (ENSCAFG00020026963) ERO1B (ENSCAFG00020026965) GPR137B (ENSCAFG00020026977) NID1 (ENSCAFG00020027007) LYST (ENSCAFG00020027099) GNG4 (ENSCAFG00020027119) B3GALNT2 (ENSCAFG00020027121) TBCE (ENSCAFG00020027123) Red fox MODERN SPECIES 22 ENSVVUG00000009220 POLR1D (ENSVVUG00000009216) LNX2 (ENSVVUG00000009209) MTIF3 (ENSVVUG00000009207) GTF3A (ENSVVUG00000009197) RASL11A (ENSVVUG00000009191) RPL21 (ENSVVUG00000009183) USP12 (ENSVVUG00000009179) GPR12 (ENSVVUG00000009138) WASF3 (ENSVVUG00000009124) CDK8 (ENSVVUG00000009115) RNF6 (ENSVVUG00000009109) ENSVVUG00000009104 ENSVVUG00000009036 ATP8A2 (ENSVVUG00000007940) ENSVVUG00000007872 ##22 NUP58 (ENSVVUG00000007842) MTMR6 (ENSVVUG00000007814) SPATA13 (ENSVVUG00000007799) ENSVVUG00000007789 ENSVVUG00000007781 MIPEP (ENSVVUG00000007756) TNFRSF19 (ENSVVUG00000007739) SACS (ENSVVUG00000007720) SGCG (ENSVVUG00000007711) FGF9 (ENSVVUG00000007684) MICU2 (ENSVVUG00000007665) ZDHHC20 (ENSVVUG00000007587) SKA3 (ENSVVUG00000007579) ENSVVUG00000007575 SAP18 (ENSVVUG00000007549) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Opossum MODERN SPECIES 2 EFR3A (ENSMODG00000001307) ENSMODG00000001231 ENSMODG00000029720 KCNQ3 (ENSMODG00000001213) ENSMODG00000001218 ENSMODG00000036744 DNAAF11 (ENSMODG00000001207) ENSMODG00000025627 ENSMODG00000001188 TG (ENSMODG00000001154) SLA (ENSMODG00000001164) ENSMODG00000001114 NDRG1 (ENSMODG00000001109) ST3GAL1 (ENSMODG00000001088) ENSMODG00000042414 ENSMODG00000047814 ##22 ZFAT (ENSMODG00000001068) ENSMODG00000001054 KHDRBS3 (ENSMODG00000000975) ENSMODG00000041754 ENSMODG00000040118 ENSMODG00000048341 ENSMODG00000000893 FAM135B (ENSMODG00000000885) ENSMODG00000000768 KCNK9 (ENSMODG00000000764) ENSMODG00000024423 TRAPPC9 (ENSMODG00000024422) CHRAC1 (ENSMODG00000044477) AGO2 (ENSMODG00000000748) ENSMODG00000000707 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1129 ENSVURG00010009959 ENSVURG00010009954 ENSVURG00010009949 ENSVURG00010009934 ENSVURG00010009930 ##22 PCDH9 (ENSVURG00010009913) ENSVURG00010009891 KLHL1 (ENSVURG00010009870) ENSVURG00010009848 DACH1 (ENSVURG00010009638) MZT1 (ENSVURG00010009610) BORA (ENSVURG00010009555) DIS3 (ENSVURG00010009515) PIBF1 (ENSVURG00010009480) KLF5 (ENSVURG00010009446) KLF12 (ENSVURG00010009434) TBC1D4 (ENSVURG00010009407) ENSVURG00010009398 COMMD6 (ENSVURG00010009392) UCHL3 (ENSVURG00010009372) Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 1429 ENSPTXG00000017400 ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 111 ENSLLEG00000026175 ENSLLEG00000026160 ENSLLEG00000026149 ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 1083 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 861 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 1061 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 936 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 1011 ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Zebrafish MODERN SPECIES 10 crtap (ENSDARG00000018010) ENSDARG00000088277 fbxl2 (ENSDARG00000012135) clasp2 (ENSDARG00000020345) ubp1 (ENSDARG00000018000) pdcd6ip (ENSDARG00000025269) ENSDARG00000061081 cyhr1 (ENSDARG00000061057) DCLK3 (ENSDARG00000078997) fabp3 (ENSDARG00000023290) zcchc17 (ENSDARG00000018936) snrnp40 (ENSDARG00000023160) nkain1 (ENSDARG00000006859) pum1 (ENSDARG00000099256) eef1a1l1 (ENSDARG00000020850) ENSDARG00000109996 ##22 gnrhr1 (ENSDARG00000100593) DGKD (ENSDARG00000113111) ENSDARG00000101785 matn1 (ENSDARG00000030215) sesn2 (ENSDARG00000070012) yrk (ENSDARG00000004378) AHDC1 (ENSDARG00000093453) ENSDARG00000100839 ENSDARG00000035657 wasf2 (ENSDARG00000024209) gpr3 (ENSDARG00000094860) CD164L2 (ENSDARG00000096327) ENSDARG00000092310 si:ch211-199g17.9 (ENSDARG00000076609) fam83hb (ENSDARG00000060830) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 575 ENSGT00940000157613.g ENSGT00390000017955.c.sb ENSGT00940000156790.fb ENSGT00940000166232.d ENSGT00950000183029.B.j.g.a ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211.j ENSGT00940000166197.d ENSGT00390000002428.a.a ENSGT00940000156197.gb ENSGT00940000165758.a ENSGT00940000175699 ENSGT01030000234531.C.e ENSGT00390000012916.bb ENSGT00390000005801.b ENSGT00940000154655.a.i.b.a ENSGT00940000155549.a.a.b.p.a ENSGT00940000157893.h Goldfish MODERN SPECIES 38 ENSCARG00000065818 ENSCARG00000065824 matn1 (ENSCARG00000065836) sesn2 (ENSCARG00000018320) yrk (ENSCARG00000018346) AHDC1 (ENSCARG00000018410) wasf2 (ENSCARG00000018420) CD164L2 (ENSCARG00000018441) si:ch211-199g17.9 (ENSCARG00000018451) fam83hb (ENSCARG00000018473) KIAA0319L (ENSCARG00000018518) cap1 (ENSCARG00000019433) ppt1 (ENSCARG00000019499) ENSCARG00000019568 ENSCARG00000019582 ##22 ENSCARG00000019630 ##22 rpl11 (ENSCARG00000019634) ENSCARG00000019656 eloa (ENSCARG00000019670) pithd1 (ENSCARG00000019687) lypla2 (ENSCARG00000019704) ankib1a (ENSCARG00000019717) lrrc14b (ENSCARG00000019758) uqcrb (ENSCARG00000019768) ENSCARG00000019781 rad21b (ENSCARG00000019793) CSMD3 (ENSCARG00000019896) ENSCARG00000020271 COL22A1 (ENSCARG00000020324) kcnk9 (ENSCARG00000020351) TRAPPC9 (ENSCARG00000020378) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 699 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Huchen MODERN SPECIES 12159 ENSHHUG00000013987 ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 669 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000162741 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00980000198642 ENSGT00940000155272 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000160519.a.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000162741 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000165449 ENSGT00390000007701 ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00390000001878 ENSGT00940000155129.A ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00940000166291 ENSGT00950000183029.B.j.c.b ##22 ENSGT00940000174058 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00940000164334 ENSGT00940000162741 ENSGT01050000244827.E ENSGT00940000163653 ENSGT00940000155933.b.a ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Ballan wrasse MODERN SPECIES 277 ENSLBEG00000002732 ENSLBEG00000002759 ENSLBEG00000002776 ##22 eef1a1l1 (ENSLBEG00000002790) cd81b (ENSLBEG00000002831) ENSLBEG00000002931 ENSLBEG00000002955 rpl11 (ENSLBEG00000002984) ENSLBEG00000003028 eloa (ENSLBEG00000003069) pithd1 (ENSLBEG00000003093) lypla2 (ENSLBEG00000003109) sfpq (ENSLBEG00000003163) ENSLBEG00000003200 ENSLBEG00000003215 ENSLBEG00000003244 ENSLBEG00000003261 ENSLBEG00000003304 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183029.A ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000165604 ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc ENSGT00940000155272 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES 9 ENSCSEG00000008546 ints8 (ENSCSEG00000008358) DPY19L4 (ENSCSEG00000008333) KDM1B (ENSCSEG00000008311) ENSCSEG00000008281 slc9a1b (ENSCSEG00000008266) ENSCSEG00000008220 srsf10b (ENSCSEG00000008199) ENSCSEG00000008184 gja9b (ENSCSEG00000008175) mycbp (ENSCSEG00000008166) ENSCSEG00000008033 ENSCSEG00000008011 ENSCSEG00000008004 ##22 ENSCSEG00000007992 ENSCSEG00000007982 ##22 ENSCSEG00000007972 ENSCSEG00000007966 ##22 rpl11 (ENSCSEG00000007952) ENSCSEG00000007938 eloa (ENSCSEG00000007921) pithd1 (ENSCSEG00000007900) lypla2 (ENSCSEG00000007872) sfpq (ENSCSEG00000007852) ENSCSEG00000007833 ENSCSEG00000007824 ENSCSEG00000007809 ENSCSEG00000007792 ak2 (ENSCSEG00000007777) rnf19b (ENSCSEG00000007762) ndufs5 (ENSCSEG00000007757) Tongue sole MODERN SPECIES 9 ENSCSEG00000007727 ENSCSEG00000007737 ndufs5 (ENSCSEG00000007757) rnf19b (ENSCSEG00000007762) ak2 (ENSCSEG00000007777) ENSCSEG00000007792 ENSCSEG00000007809 ENSCSEG00000007824 ENSCSEG00000007833 sfpq (ENSCSEG00000007852) lypla2 (ENSCSEG00000007872) pithd1 (ENSCSEG00000007900) eloa (ENSCSEG00000007921) ENSCSEG00000007938 rpl11 (ENSCSEG00000007952) ENSCSEG00000007966 ##22 ENSCSEG00000007972 ENSCSEG00000007982 ##22 ENSCSEG00000007992 ENSCSEG00000008004 ##22 ENSCSEG00000008011 ENSCSEG00000008033 mycbp (ENSCSEG00000008166) gja9b (ENSCSEG00000008175) ENSCSEG00000008184 srsf10b (ENSCSEG00000008199) ENSCSEG00000008220 slc9a1b (ENSCSEG00000008266) ENSCSEG00000008281 KDM1B (ENSCSEG00000008311) DPY19L4 (ENSCSEG00000008333) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000162741 ENSGT00690000103882 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000175963.B ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161029 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT00940000175963.B ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000161029 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000175963.B ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161029 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232.e ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 355 ENSNBRG00000016334 slkb (ENSNBRG00000016350) SH3PXD2A (ENSNBRG00000016394) neurl1aa (ENSNBRG00000016439) ENSNBRG00000016466 ENSNBRG00000016529 ENSNBRG00000016576 ENSNBRG00000016589 ENSNBRG00000016601 ENSNBRG00000016612 dtd1 (ENSNBRG00000016635) SLC24A3 (ENSNBRG00000016662) RIN2 (ENSNBRG00000016691) ENSNBRG00000016710 ENSNBRG00000016770 ##22 ENSNBRG00000016788 ##22 ENSNBRG00000016819 ENSNBRG00000016853 krt97 (ENSNBRG00000016868) KRT222 (ENSNBRG00000016891) ccr7 (ENSNBRG00000016910) ENSNBRG00000016920 ENSNBRG00000016940 IGFBP4 (ENSNBRG00000016951) ENSNBRG00000016974 MLLT6 (ENSNBRG00000017019) PCGF2 (ENSNBRG00000017053) PIP4K2B (ENSNBRG00000017074) psmb3 (ENSNBRG00000017100) ENSNBRG00000017108 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232.e ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00400000024746 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a ENSGT01020000230590.b.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 568 pkhd1l1.2 (ENSHBUG00000017910) gdf6b (ENSHBUG00000017694) ENSHBUG00000017681 ENSHBUG00000017646 ints8 (ENSHBUG00000017603) DPY19L4 (ENSHBUG00000017538) KDM1B (ENSHBUG00000017496) ENSHBUG00000017356 slc9a1b (ENSHBUG00000017310) ENSHBUG00000017272 srsf10b (ENSHBUG00000017264) gja9b (ENSHBUG00000017256) mycbp (ENSHBUG00000017241) ENSHBUG00000017195 ENSHBUG00000017166 ENSHBUG00000017136 ##22 ENSHBUG00000017123 ENSHBUG00000017108 ##22 ENSHBUG00000017046 rpl11 (ENSHBUG00000017027) ENSHBUG00000017010 eloa (ENSHBUG00000016952) pithd1 (ENSHBUG00000016911) lypla2 (ENSHBUG00000000498) sfpq (ENSHBUG00000016818) ENSHBUG00000016795 ENSHBUG00000016767 ENSHBUG00000016744 ENSHBUG00000016693 ENSHBUG00000016641 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT01030000235133 ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232.e ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197.kb ENSGT00940000156221 ENSGT00940000166582.a.b ENSGT00940000166582.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.a.b.a.a.b ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.b.b.a.b ENSGT00940000154576 ENSGT00940000158451 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C.fc P. nyererei MODERN SPECIES 388 ENY2 (ENSPNYG00000006447) pkhd1l1.2 (ENSPNYG00000006487) gdf6b (ENSPNYG00000006658) ENSPNYG00000006695 ints8 (ENSPNYG00000006742) DPY19L4 (ENSPNYG00000006850) KDM1B (ENSPNYG00000006929) ENSPNYG00000007008 slc9a1b (ENSPNYG00000007054) ENSPNYG00000007074 srsf10b (ENSPNYG00000007168) ENSPNYG00000007181 mycbp (ENSPNYG00000007219) ENSPNYG00000007251 ENSPNYG00000007263 ENSPNYG00000007288 ##22 ENSPNYG00000007306 ##22 rpl11 (ENSPNYG00000007331) ENSPNYG00000007379 eloa (ENSPNYG00000007427) pithd1 (ENSPNYG00000007437) lypla2 (ENSPNYG00000007464) sfpq (ENSPNYG00000007494) ENSPNYG00000007512 ENSPNYG00000007544 ENSPNYG00000007562 ENSPNYG00000007576 ENSPNYG00000007637 ENSPNYG00000007680 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 62 slc9a1b (ENSACIG00000001555) ENSACIG00000001537 ENSACIG00000001374 ENSACIG00000001359 gja9b (ENSACIG00000001350) mycbp (ENSACIG00000001337) ENSACIG00000001248 ENSACIG00000001243 ##22 ENSACIG00000001219 ENSACIG00000001197 ##22 rpl11 (ENSACIG00000001176) ENSACIG00000001158 eloa (ENSACIG00000001104) pithd1 (ENSACIG00000001083) lypla2 (ENSACIG00000001058) sfpq (ENSACIG00000000905) Midas cichlid MODERN SPECIES 1111 ENSACIG00000005322 ENSACIG00000005361 ENSACIG00000005419 ENSACIG00000005422 RPS6KB2 (ENSACIG00000005433) ENSACIG00000005467 ENSACIG00000005499 dtd1 (ENSACIG00000005511) SLC24A3 (ENSACIG00000005525) RIN2 (ENSACIG00000005564) ENSACIG00000005593 ENSACIG00000005620 ##22 EEF1A1 (ENSACIG00000005630) ##22 ENSACIG00000005649 ENSACIG00000005680 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000156934.k ENSGT00390000007597 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00940000157751 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 307 ENSGT00940000164334 ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00950000183029.A ##22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.d.d ENSGT01030000234575.c.a.a.a.a.a.a.a.c.a ENSGT00940000166582.b ENSGT00940000165604 ENSGT00940000166582.a ENSGT00940000156338.b ENSGT00940000164147.b ENSGT00940000154450.tc ENSGT00940000160519.a.b ENSGT01090000260070.C.b ENSGT00390000017974.ob ENSGT00940000166232 ENSGT00940000164334.f ENSGT00950000183029.B.j.d ##22 ENSGT00940000164334.e ENSGT00950000183029.A ##22 ENSGT00910000144211 ENSGT00940000166197 ENSGT00390000002428.a ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000156221 ENSGT00390000014274 ENSGT00940000157751 ENSGT00530000063023.A.b ENSGT00390000007597 ENSGT00970000193390.c.a.b.u.b.a ENSGT00940000156934.k ENSGT00950000183145.C ENSGT00940000160140.a.a ENSGT00940000157594 Orange clownfish MODERN SPECIES 8 ENSAPEG00000015910 ENSAPEG00000015937 ENSAPEG00000015956 ENSAPEG00000016035 ENSAPEG00000016056 slc9a1b (ENSAPEG00000016089) ENSAPEG00000016144 srsf10b (ENSAPEG00000016149) ENSAPEG00000016160 gja9b (ENSAPEG00000016180) mycbp (ENSAPEG00000016191) ENSAPEG00000016215 ENSAPEG00000016257 ##22 ENSAPEG00000016322 ##22 ENSAPEG00000016361 ENSAPEG00000016381 ##22 rpl11 (ENSAPEG00000016389) ENSAPEG00000016421 eloa (ENSAPEG00000016461) pithd1 (ENSAPEG00000016489) lypla2 (ENSAPEG00000016511) sfpq (ENSAPEG00000016556) ENSAPEG00000016579 KDM1B (ENSAPEG00000016633) DPY19L4 (ENSAPEG00000016693) ints8 (ENSAPEG00000016771) ENSAPEG00000016877 CCNE2 (ENSAPEG00000016889) ENSAPEG00000016972 gdf6b (ENSAPEG00000017000) pkhd1l1.2 (ENSAPEG00000017059) Spiny chromis MODERN SPECIES 2395 ENSAPOG00000004775 eef1a1l1 (ENSAPOG00000004757) ENSAPOG00000004714 ENSAPOG00000004685 ENSAPOG00000004676 ##22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1075 ENSSPAG00000002176 CCNE2 (ENSSPAG00000002161) ints8 (ENSSPAG00000002091) DPY19L4 (ENSSPAG00000002071) KDM1B (ENSSPAG00000002036) ENSSPAG00000001981 slc9a1b (ENSSPAG00000001940) ENSSPAG00000001848 ENSSPAG00000001821 srsf10b (ENSSPAG00000001810) gja9b (ENSSPAG00000001804) mycbp (ENSSPAG00000001785) ENSSPAG00000001769 ENSSPAG00000001742 ##22 ENSSPAG00000001734 ##22 ENSSPAG00000001719 ##22 ENSSPAG00000001710 ENSSPAG00000001694 rpl11 (ENSSPAG00000001672) ENSSPAG00000001632 eloa (ENSSPAG00000001612) pithd1 (ENSSPAG00000001585) Elephant shark MODERN SPECIES 1387 ENSCMIG00000002167 ##22