Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156185	ENSGT00730000111237 #7	ENSGT00940000159446 #8	ENSGT00390000017260 #9	ENSGT00940000161582 #10	ENSGT00390000011031 #11	ENSGT00940000154962.A #12	ENSGT00390000011206.a #13	ENSGT00510000046985.h.a #14	ENSGT00390000006707 #15	ENSGT00940000160058 #17	ENSGT00940000159299.k #18	ENSGT00440000033552 #20	ENSGT01030000234575.d.c	ENSGT00940000161863 #21	ENSGT00940000161043 #22	ENSGT00940000161413 #23	ENSGT00390000005650 #24	ENSGT00390000010888.b #25	ENSGT00510000047418 #26	ENSGT00390000017284.a.b #27	ENSGT00940000153322.A.r #28	ENSGT00940000156187 #29	ENSGT00800000124060.A.a #30	ENSGT00390000005739.a.a #31	ENSGT00440000033609	ENSGT00940000161476	ENSGT01030000234641.a.a	ENSGT00940000158783	ENSGT00940000154361.B	ENSGT00510000047420
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00730000111237 #7	ENSGT00940000159446 #8	ENSGT00390000017260 #9	ENSGT00940000161582 #10	ENSGT00390000011031 #11	ENSGT00940000154962.A #12	ENSGT00390000011206.a #13	ENSGT00510000046985.h.a #14	ENSGT00390000006707 #15	ENSGT00940000160058 #17	ENSGT00940000159299.k #18	ENSGT00440000033552 #20	ENSGT00390000000696.t	ENSGT01030000234575.d.c	ENSGT00940000161863 #21	ENSGT00940000161043 #22	ENSGT00940000161413 #23	ENSGT00390000005650 #24	ENSGT00390000010888.b #25	ENSGT00510000047418 #26	ENSGT00390000017284.a.b #27	ENSGT00940000153322.A.r #28	ENSGT00940000156187 #29	ENSGT00800000124060.A.a #30	ENSGT00390000005739.a.a #31	ENSGT00440000033609.r	ENSGT00440000033609.q	ENSGT00940000161476	ENSGT01030000234641.a.a	ENSGT00940000158783	ENSGT00940000154361.B
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00730000111237 #7	ENSGT00940000159446 #8	ENSGT00390000017260 #9	ENSGT00940000161582 #10	ENSGT00390000011031 #11	ENSGT00940000154962.A #12	ENSGT00390000011206.a #13	ENSGT00510000046985.h.a #14	ENSGT00390000006707 #15	ENSGT00940000160058 #17	ENSGT00940000159299.k #18	ENSGT00440000033552 #20	ENSGT00390000000696.t	ENSGT01030000234575.d.c	ENSGT00940000161863 #21	ENSGT00940000161043 #22	ENSGT00940000161413 #23	ENSGT00390000005650 #24	ENSGT00390000010888.b #25	ENSGT00510000047418 #26	ENSGT00390000017284.a.b #27	ENSGT00940000153322.A.r #28	ENSGT00940000156187 #29	ENSGT00800000124060.A.a #30	ENSGT00390000005739.a.a #31	ENSGT00440000033609.r	ENSGT00440000033609.q	ENSGT00940000161476	ENSGT01030000234641.a.a	ENSGT00940000158783	ENSGT00940000154361.B
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	311	SNRNP27 (ENSUPAG00010005452) #7	MXD1 (ENSUPAG00010005468) #8	ASPRV1 (ENSUPAG00010005479) #9	PCBP1 (ENSUPAG00010005484) #10	C2orf42 (ENSUPAG00010005488) #11	TIA1 (ENSUPAG00010005529) #12	PCYOX1 (ENSUPAG00010005647) #13	ENSUPAG00010005652 #14	ENSUPAG00010005658 #15	ENSUPAG00010005666 #16	TGFA (ENSUPAG00010005668) #17	ADD2 (ENSUPAG00010005680) #18	ENSUPAG00010005947 #19	FIGLA (ENSUPAG00010005952) #20	CD207 (ENSUPAG00010005970) #21	VAX2 (ENSUPAG00010005982) #22	ATP6V1B1 (ENSUPAG00010005985) #23	ANKRD53 (ENSUPAG00010006011) #24	TEX261 (ENSUPAG00010006019) #25	NAGK (ENSUPAG00010006023) #26	PAIP2B (ENSUPAG00010006035) #27	ZNF638 (ENSUPAG00010006058) #28	DYSF (ENSUPAG00010007440) #29	CYP26B1 (ENSUPAG00010007719) #30	ENSUPAG00010007744 #31
Squirrel	MODERN SPECIES	91	SNRNP27 (ENSSTOG00000022865) #7	MXD1 (ENSSTOG00000000718) #8	ASPRV1 (ENSSTOG00000000721) #9	PCBP1 (ENSSTOG00000026002) #10	C2orf42 (ENSSTOG00000008296) #11	TIA1 (ENSSTOG00000008309) #12	PCYOX1 (ENSSTOG00000008327) #13	SNRPG (ENSSTOG00000008654) #14	FAM136A (ENSSTOG00000008343) #15	TGFA (ENSSTOG00000029351) #17	ADD2 (ENSSTOG00000000808) #18	FIGLA (ENSSTOG00000007556) #20	ENSSTOG00000024636	ENSSTOG00000007570	CD207 (ENSSTOG00000022452) #21	VAX2 (ENSSTOG00000007595) #22	ATP6V1B1 (ENSSTOG00000007606) #23	TEX261 (ENSSTOG00000022032) #25	NAGK (ENSSTOG00000003976) #26	PAIP2B (ENSSTOG00000003986) #27	ZNF638 (ENSSTOG00000003995) #28	DYSF (ENSSTOG00000015993) #29	CYP26B1 (ENSSTOG00000021898) #30	EXOC6B (ENSSTOG00000025926) #31	ENSSTOG00000015385	ENSSTOG00000030144	ENSSTOG00000031889	EMX1 (ENSSTOG00000027476)	SFXN5 (ENSSTOG00000002337)	RAB11FIP5 (ENSSTOG00000023937)	NOTO (ENSSTOG00000021867)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	6	SNRNP27 (ENSMMMG00000004977) #7	MXD1 (ENSMMMG00000004959) #8	ASPRV1 (ENSMMMG00000004955) #9	PCBP1 (ENSMMMG00000004939) #10	C2orf42 (ENSMMMG00000004891) #11	ENSMMMG00000004787 #12	PCYOX1 (ENSMMMG00000004781) #13	SNRPG (ENSMMMG00000004771) #14	FAM136A (ENSMMMG00000004761) #15	TGFA (ENSMMMG00000004748) #17	ADD2 (ENSMMMG00000004508) #18	FIGLA (ENSMMMG00000004487) #20	ENSMMMG00000004479	CLEC4F (ENSMMMG00000004473)	CD207 (ENSMMMG00000004444) #21	VAX2 (ENSMMMG00000004432) #22	ATP6V1B1 (ENSMMMG00000004412) #23	ANKRD53 (ENSMMMG00000004397) #24	TEX261 (ENSMMMG00000004388) #25	NAGK (ENSMMMG00000004369) #26	PAIP2B (ENSMMMG00000004342) #27	ZNF638 (ENSMMMG00000003356) #28	DYSF (ENSMMMG00000000630) #29	ENSMMMG00000000440	CYP26B1 (ENSMMMG00000000421) #30	ENSMMMG00000000391	EXOC6B (ENSMMMG00000000339) #31	SPR (ENSMMMG00000000283)	SFXN5 (ENSMMMG00000000237)	RAB11FIP5 (ENSMMMG00000000200)	NOTO (ENSMMMG00000000180)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	5	PCBP1 (ENSSVLG00005016164) #10	C2orf42 (ENSSVLG00005016194) #11	TIA1 (ENSSVLG00005016265) #12	ENSSVLG00005016388	PCYOX1 (ENSSVLG00005016408) #13	SNRPG (ENSSVLG00005016445) #14	FAM136A (ENSSVLG00005016524) #15	ENSSVLG00005016562	ENSSVLG00005016607	TGFA (ENSSVLG00005016633) #17	ENSSVLG00005016769 #18	ENSSVLG00005017201 ##18	FIGLA (ENSSVLG00005017245) #20	ENSSVLG00005017330	CD207 (ENSSVLG00005017385) #21	VAX2 (ENSSVLG00005017457) #22	ATP6V1B1 (ENSSVLG00005017522) #23	ANKRD53 (ENSSVLG00005017836) #24	TEX261 (ENSSVLG00005017917) #25	NAGK (ENSSVLG00005017949) #26	PAIP2B (ENSSVLG00005018040) #27	ZNF638 (ENSSVLG00005018146) #28	DYSF (ENSSVLG00005018248) #29	ENSSVLG00005018496 #30	ENSSVLG00005018636 #30	EXOC6B (ENSSVLG00005018863) #31	ENSSVLG00005018987	ENSSVLG00005019053	ENSSVLG00005019111	ENSSVLG00005019184	ENSSVLG00005019237