Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000158809	ENSGT00440000033408.a	ENSGT00940000156390	ENSGT00940000153451.a.b	ENSGT00940000157711	ENSGT00940000156678	ENSGT00390000015971	ENSGT00940000156042	ENSGT00900000141099.e.b	ENSGT00940000156508	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00510000049635 #23	ENSGT00940000156098 #25	ENSGT00940000155406 #26	ENSGT00940000153866.A #31	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918 #33	ENSGT00940000155939 #34	ENSGT00940000157951 #35	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350	ENSGT00940000157002	ENSGT00550000074836
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000158809	ENSGT00440000033408.a	ENSGT00940000156390	ENSGT00940000153451.a.b	ENSGT00940000157711	ENSGT00940000156678	ENSGT00390000015971	ENSGT00940000156042	ENSGT00900000141099.e.b	ENSGT00940000156508	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00510000049635 #23	ENSGT00940000156098 #25	ENSGT00940000155406 #26	ENSGT00940000162225 #27	ENSGT00940000153866.A #31	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918 #33	ENSGT00940000155939 #34	ENSGT00940000157951 #35	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350	ENSGT00940000157002
Degu	MODERN SPECIES	186														ARMC3 (ENSODEG00000002341) #20	MSRB2 (ENSODEG00000002295) #21	PTF1A (ENSODEG00000002261) #22	OTUD1 (ENSODEG00000002122) #23	ENSODEG00000003530 #24	KIAA1217 (ENSODEG00000003130) #25	ARHGAP21 (ENSODEG00000003667) #26	PRTFDC1 (ENSODEG00000003390) #27	ENSODEG00000003316 #28	ENSODEG00000003305 #29	ENSODEG00000003243 #30	ENKUR (ENSODEG00000003177) #31	ENSODEG00000004103 #32	GPR158 (ENSODEG00000004004) #33	MYO3A (ENSODEG00000003447) #34	GAD2 (ENSODEG00000002488) #35	ENSODEG00000002425 #36	ENSODEG00000002394 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	136	NSUN6 (ENSCLAG00000008092)	ARL5B (ENSCLAG00000007016)	MALRD1 (ENSCLAG00000005010)	PLXDC2 (ENSCLAG00000006978)	NEBL (ENSCLAG00000008890)	SKIDA1 (ENSCLAG00000006225)	MLLT10 (ENSCLAG00000011519)	DNAJC1 (ENSCLAG00000006988)	COMMD3 (ENSCLAG00000004946)	ENSCLAG00000013918	ENSCLAG00000006642	PIP4K2A (ENSCLAG00000007419)	ARMC3 (ENSCLAG00000006328) #20	MSRB2 (ENSCLAG00000005941) #21	ENSCLAG00000017726	PTF1A (ENSCLAG00000007259) #22	ENSCLAG00000006751	ENSCLAG00000007180	KIAA1217 (ENSCLAG00000015492) #25	ENSCLAG00000005271 #26	ENKUR (ENSCLAG00000008963) #31	THNSL1 (ENSCLAG00000012933)	GPR158 (ENSCLAG00000011756) #33	MYO3A (ENSCLAG00000005793) #34	GAD2 (ENSCLAG00000006714) #35	APBB1IP (ENSCLAG00000007811)	ENSCLAG00000004989	PDSS1 (ENSCLAG00000011631)	ABI1 (ENSCLAG00000010653)	ACBD5 (ENSCLAG00000006783)	MASTL (ENSCLAG00000006587)
Guinea pig	MODERN SPECIES	91			ARL5B (ENSCPOG00000005856)	MALRD1 (ENSCPOG00000033227)	PLXDC2 (ENSCPOG00000007300)	NEBL (ENSCPOG00000013320)	SKIDA1 (ENSCPOG00000014676)	MLLT10 (ENSCPOG00000008764)	DNAJC1 (ENSCPOG00000012322)	COMMD3 (ENSCPOG00000015426)	BMI1 (ENSCPOG00000040651)	ENSCPOG00000036027	PIP4K2A (ENSCPOG00000007557)	ARMC3 (ENSCPOG00000013110) #20	MSRB2 (ENSCPOG00000007526) #21	PTF1A (ENSCPOG00000022828) #22	KIAA1217 (ENSCPOG00000003578) #25	IQSEC1 (ENSCPOG00000024771)	NUP210 (ENSCPOG00000009066)	HDAC11 (ENSCPOG00000006628)	FBLN2 (ENSCPOG00000006125)	WNT7A (ENSCPOG00000039003)