Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000158809	ENSGT00440000033408.a #7	ENSGT00940000156390 #9	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836	ENSGT00510000049635 #24	ENSGT00940000156098 #25	ENSGT00940000155406 #26	ENSGT00940000162225 #28	ENSGT00940000153866.A #29	ENSGT00940000161144.b #30	ENSGT00940000155918 #32	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951 #35	ENSGT00940000156105 #36	ENSGT00390000005508.b #37	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	3	PLXDC2 (ENSSVLG00005014950) #7	ENSSVLG00005014900 #8	NEBL (ENSSVLG00005014393) #9	ENSSVLG00005014360 #10	ENSSVLG00005014330 #11	SKIDA1 (ENSSVLG00005014278) #12	MLLT10 (ENSSVLG00005013802) #13	DNAJC1 (ENSSVLG00005013420) #14	ENSSVLG00005013284 #15	COMMD3 (ENSSVLG00005018569) #16	ENSSVLG00005018484 #17	SPAG6 (ENSSVLG00005018268) #18	PIP4K2A (ENSSVLG00005018202) #19	ARMC3 (ENSSVLG00005017564) #20	MSRB2 (ENSSVLG00005017505) #21	PTF1A (ENSSVLG00005017462) #22	ENSSVLG00005017420 #23	OTUD1 (ENSSVLG00005016919) #24	KIAA1217 (ENSSVLG00005015769) #25	ARHGAP21 (ENSSVLG00005014772) #26	ENSSVLG00005014651 #27	PRTFDC1 (ENSSVLG00005014583) #28	ENKUR (ENSSVLG00005014473) #29	THNSL1 (ENSSVLG00005014444) #30	ENSSVLG00005014402 #31	GPR158 (ENSSVLG00005014159) #32	ENSSVLG00005014103 #33	ENSSVLG00005014026 #34	GAD2 (ENSSVLG00005013824) #35	APBB1IP (ENSSVLG00005013617) #36	ENSSVLG00005013262 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000158809	ENSGT00440000033408.a #7	ENSGT00940000156390 #9	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836	ENSGT00510000049635 #24	ENSGT00940000156098 #25	ENSGT00940000155406 #26	ENSGT00940000162225 #28	ENSGT00940000153866.A #29	ENSGT00940000161144.b #30	ENSGT00940000155918 #32	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951 #35	ENSGT00940000156105 #36	ENSGT00390000005508.b #37	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567	ENSGT00940000158809	ENSGT00440000033408.a #7	ENSGT00940000156390 #9	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00390000006922.m.a	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836	ENSGT00510000049635 #24	ENSGT00940000156098 #25	ENSGT00940000155406 #26	ENSGT00940000162225 #28	ENSGT00940000153866.A #29	ENSGT00940000161144.b #30	ENSGT00940000155918 #32	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951 #35	ENSGT00940000156105 #36	ENSGT00390000005508.b #37	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	240													ARMC3 (ENSUPAG00010020821) #20	MSRB2 (ENSUPAG00010020854) #21	ENSUPAG00010020861	PTF1A (ENSUPAG00010020868) #22	OTUD1 (ENSUPAG00010020876) #24	KIAA1217 (ENSUPAG00010020897) #25	ARHGAP21 (ENSUPAG00010021811) #26	PRTFDC1 (ENSUPAG00010021815) #28	ENKUR (ENSUPAG00010021816) #29	THNSL1 (ENSUPAG00010021817) #30	GPR158 (ENSUPAG00010021820) #32	MYO3A (ENSUPAG00010021823)	GAD2 (ENSUPAG00010021871) #35
Squirrel	MODERN SPECIES	120	NSUN6 (ENSSTOG00000004317)	ARL5B (ENSSTOG00000027859)	MALRD1 (ENSSTOG00000034625)	PLXDC2 (ENSSTOG00000005048) #7	NEBL (ENSSTOG00000020521) #9	SKIDA1 (ENSSTOG00000005865) #12	MLLT10 (ENSSTOG00000016486) #13	DNAJC1 (ENSSTOG00000002303) #14	COMMD3 (ENSSTOG00000001638) #16	BMI1 (ENSSTOG00000001647) #17	SPAG6 (ENSSTOG00000001651) #18	PIP4K2A (ENSSTOG00000001661) #19	ARMC3 (ENSSTOG00000009417) #20	ENSSTOG00000013900 #21	ENSSTOG00000019871	PTF1A (ENSSTOG00000022679) #22	ENSSTOG00000010976	EIF4E (ENSSTOG00000002230)	METAP1 (ENSSTOG00000006210)	ADH5 (ENSSTOG00000006233)	ADH4 (ENSSTOG00000029406)	ENSSTOG00000026896	ENSSTOG00000019811	ADH7 (ENSSTOG00000006815)	C4orf17 (ENSSTOG00000013616)	TRMT10A (ENSSTOG00000005064)	MTTP (ENSSTOG00000006428)	C4orf54 (ENSSTOG00000026836)	DAPP1 (ENSSTOG00000010934)	LAMTOR3 (ENSSTOG00000010944)	DNAJB14 (ENSSTOG00000021338)