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Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00410000028701 #10	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00940000167080	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00390000001795	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a
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Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000165398	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00950000185487	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	67		ENSGT00940000165398	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b.a	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00950000185487	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00390000008783.cb.b.a	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00910000148394.a	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00950000185069
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b.a	ENSGT00950000182922.a.a.a.b.b.b.b.c	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00950000185487	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00390000008783.cb.b.a	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00910000148394.a	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00950000185069
Dog	MODERN SPECIES	11	ENSCAFG00845009208 #9	NEBL (ENSCAFG00845008851) #11	ENSCAFG00845008769	ENSCAFG00845008752	SKIDA1 (ENSCAFG00845008698) #12	ENSCAFG00845008676	MLLT10 (ENSCAFG00845008310) #13	DNAJC1 (ENSCAFG00845008124) #14	COMMD3 (ENSCAFG00845008000) #17	SPAG6 (ENSCAFG00845007631) #18	ENSCAFG00845007460	PIP4K2A (ENSCAFG00845007359) #19	ARMC3 (ENSCAFG00845006941) #20	MSRB2 (ENSCAFG00845006829) #21	ENSCAFG00845006794	PTF1A (ENSCAFG00845006739) #22	C10orf67 (ENSCAFG00845006678) #24	OTUD1 (ENSCAFG00845006646)	ENSCAFG00845006450	KIAA1217 (ENSCAFG00845005972)	ARHGAP21 (ENSCAFG00845005616)	PRTFDC1 (ENSCAFG00845005485)	ENKUR (ENSCAFG00845005449)	THNSL1 (ENSCAFG00845005436)	GPR158 (ENSCAFG00845004137)	MYO3A (ENSCAFG00845003959)	GAD2 (ENSCAFG00845003895)	APBB1IP (ENSCAFG00845003856)	ENSCAFG00845003815	ENSCAFG00845003805	PDSS1 (ENSCAFG00845003791)
Dingo	MODERN SPECIES	235	ENSCAFG00020026205	ENSCAFG00020026203	SKIDA1 (ENSCAFG00020026202) #12	ENSCAFG00020026201	ENSCAFG00020026200 #13	ENSCAFG00020026198 #13	DNAJC1 (ENSCAFG00020026196) #14	COMMD3 (ENSCAFG00020026192) #16	BMI1 (ENSCAFG00020026178) #17	SPAG6 (ENSCAFG00020026153) #18	ENSCAFG00020026151	ENSCAFG00020026148	PIP4K2A (ENSCAFG00020026145) #19	ARMC3 (ENSCAFG00020026124) #20	MSRB2 (ENSCAFG00020026119) #21	ENSCAFG00020026118 #22	OTUD1 (ENSCAFG00020026117)	ENSCAFG00020026114	KIAA1217 (ENSCAFG00020025965)	ARHGAP21 (ENSCAFG00020025764)	PRTFDC1 (ENSCAFG00020025727)	ENKUR (ENSCAFG00020025719)	THNSL1 (ENSCAFG00020025717)	GPR158 (ENSCAFG00020025709)	ENSCAFG00020025703	MYO3A (ENSCAFG00020025694)	GAD2 (ENSCAFG00020025688)	ENSCAFG00020025686	APBB1IP (ENSCAFG00020025685)	ENSCAFG00020025684	ENSCAFG00020025681
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000165398	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00950000185487	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00950000185487	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a.h	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350	ENSGT00940000157002	ENSGT00550000074836.k
Giant Panda	MODERN SPECIES	6	CACNB2 (ENSAMEG00000012933)	NSUN6 (ENSAMEG00000012963)	ARL5B (ENSAMEG00000012973) #7	MALRD1 (ENSAMEG00000027613) #8	PLXDC2 (ENSAMEG00000006060) #9	NEBL (ENSAMEG00000006071) #11	SKIDA1 (ENSAMEG00000006113) #12	MLLT10 (ENSAMEG00000006118) #13	DNAJC1 (ENSAMEG00000006177) #14	BMI1 (ENSAMEG00000006200) #17	SPAG6 (ENSAMEG00000006244) #18	ENSAMEG00000026700	PIP4K2A (ENSAMEG00000006281) #19	ARMC3 (ENSAMEG00000006332) #20	MSRB2 (ENSAMEG00000025364) #21	PTF1A (ENSAMEG00000023671) #22	KIAA1217 (ENSAMEG00000006395)	ARHGAP21 (ENSAMEG00000006453)	PRTFDC1 (ENSAMEG00000006532)	ENKUR (ENSAMEG00000001288)	ENSAMEG00000030174	GPR158 (ENSAMEG00000017705)	MYO3A (ENSAMEG00000004928)	GAD2 (ENSAMEG00000004944)	APBB1IP (ENSAMEG00000001945)	ENSAMEG00000028669	PDSS1 (ENSAMEG00000001932)	ENSAMEG00000001906	ENSAMEG00000001878	MASTL (ENSAMEG00000001855)	ENSAMEG00000001795
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000167080	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00940000156098	ENSGT00390000001795	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a
Equus	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000153661.a.a	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A
Donkey	MODERN SPECIES	21	CACNB2 (ENSEASG00005019932)	NSUN6 (ENSEASG00005019939)	ARL5B (ENSEASG00005030385) #7	MALRD1 (ENSEASG00005019949) #8	PLXDC2 (ENSEASG00005019962) #9	NEBL (ENSEASG00005019970) #11	SKIDA1 (ENSEASG00005019976) #12	MLLT10 (ENSEASG00005031964) #13	DNAJC1 (ENSEASG00005006990) #14	ENSEASG00005006975 #16	BMI1 (ENSEASG00005006972) #17	SPAG6 (ENSEASG00005006971) #18	PIP4K2A (ENSEASG00005006966) #19	ARMC3 (ENSEASG00005006950) #20	MSRB2 (ENSEASG00005033779) #21	PTF1A (ENSEASG00005006936) #22	ENSEASG00005038460 #24	KIAA1217 (ENSEASG00005006898)	ARHGAP21 (ENSEASG00005006877)	PRTFDC1 (ENSEASG00005006868)	ENKUR (ENSEASG00005006865)	THNSL1 (ENSEASG00005006864)	ENSEASG00005006862	ENSEASG00005006859	ENSEASG00005006846	ENSEASG00005006844	GAD2 (ENSEASG00005006835)	APBB1IP (ENSEASG00005006831)	ENSEASG00005006824	PDSS1 (ENSEASG00005006820)	ENSEASG00005006816
Horse	MODERN SPECIES	21	ARL5B (ENSECAG00000009195) #7	MALRD1 (ENSECAG00000007484) #8	PLXDC2 (ENSECAG00000017520) #9	NEBL (ENSECAG00000038375) #11	SKIDA1 (ENSECAG00000004192) #12	ENSECAG00000050062	ENSECAG00000054209	MLLT10 (ENSECAG00000012723) #13	DNAJC1 (ENSECAG00000007629) #14	COMMD3 (ENSECAG00000021328) #16	BMI1 (ENSECAG00000019529) #17	SPAG6 (ENSECAG00000012645) #18	PIP4K2A (ENSECAG00000007707) #19	ARMC3 (ENSECAG00000013576) #20	MSRB2 (ENSECAG00000013072) #21	PTF1A (ENSECAG00000038284) #22	C29H10orf67 (ENSECAG00000012482) #24	OTUD1 (ENSECAG00000040284)	ENSECAG00000047964	KIAA1217 (ENSECAG00000000015)	ARHGAP21 (ENSECAG00000011309)	PRTFDC1 (ENSECAG00000009797)	ENKUR (ENSECAG00000008266)	THNSL1 (ENSECAG00000009339)	GPR158 (ENSECAG00000006062)	ENSECAG00000028007	ENSECAG00000019687	MYO3A (ENSECAG00000012060)	GAD2 (ENSECAG00000000006)	APBB1IP (ENSECAG00000022742)	ENSECAG00000032560
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00940000167080	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00940000156098	ENSGT00390000001795	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00950000182837.a.b.a	ENSGT00940000155370	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00390000001795	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	30	NEBL (ENSRFEG00010007581) #11	ENSRFEG00010007971	SKIDA1 (ENSRFEG00010008117) #12	MLLT10 (ENSRFEG00010008217) #13	DNAJC1 (ENSRFEG00010008428) #14	COMMD3 (ENSRFEG00010008507) #16	BMI1 (ENSRFEG00010008566) #17	ENSRFEG00010008641 #18	ENSRFEG00010009031 #18	ENSRFEG00010009094	ENSRFEG00010009143 #19	ENSRFEG00010009171 #19	ARMC3 (ENSRFEG00010009262) #20	ENSRFEG00010009810	ENSRFEG00010009887 #21	PTF1A (ENSRFEG00010009952) #22	OTUD1 (ENSRFEG00010010260)	KIAA1217 (ENSRFEG00010010439)	ENSRFEG00010011032	ENSRFEG00010011089	ARHGAP21 (ENSRFEG00010011157)	PRTFDC1 (ENSRFEG00010011247)	ENKUR (ENSRFEG00010011340)	THNSL1 (ENSRFEG00010011393)	ENSRFEG00010011414	GPR158 (ENSRFEG00010011440)	MYO3A (ENSRFEG00010011683)	GAD2 (ENSRFEG00010012347)	APBB1IP (ENSRFEG00010012424)	ENSRFEG00010012518	PDSS1 (ENSRFEG00010012655)
Microbat	MODERN SPECIES	1069					NEBL (ENSMLUG00000011932) #11	ENSMLUG00000004554	SKIDA1 (ENSMLUG00000005720) #12	MLLT10 (ENSMLUG00000014901) #13	ENSMLUG00000028742	DNAJC1 (ENSMLUG00000014913) #14	COMMD3 (ENSMLUG00000010985) #16	BMI1 (ENSMLUG00000001692) #17	PIP4K2A (ENSMLUG00000016205) #19	ARMC3 (ENSMLUG00000001594) #20	MSRB2 (ENSMLUG00000010112) #21	PTF1A (ENSMLUG00000010122) #22	ENSMLUG00000010146 #24	ENSMLUG00000024060
Megabat	MODERN SPECIES	1270															MSRB2 (ENSPVAG00000013737) #21	PTF1A (ENSPVAG00000013738) #22	ENSPVAG00000013740	ENSPVAG00000013741 #24
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00410000028701 #10	ENSGT00940000172425	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00940000167080	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00910000148022	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a
Suina	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000009751	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00940000153498.B.a	ENSGT00940000154811.A	ENSGT00940000156350	ENSGT00940000157002	ENSGT00550000074836
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	48				PLXDC2 (ENSCWAG00000007075) #9	NEBL (ENSCWAG00000006911) #11	ENSCWAG00000006866	SKIDA1 (ENSCWAG00000006839) #12	MLLT10 (ENSCWAG00000006625) #13	DNAJC1 (ENSCWAG00000006583) #14	COMMD3 (ENSCWAG00000006540) #16	BMI1 (ENSCWAG00000006472) #17	SPAG6 (ENSCWAG00000006200) #18	PIP4K2A (ENSCWAG00000006142) #19	ARMC3 (ENSCWAG00000005912) #20	MSRB2 (ENSCWAG00000005884) #21	PTF1A (ENSCWAG00000005861) #22	OTUD1 (ENSCWAG00000005832)	KIAA1217 (ENSCWAG00000004897)	ARHGAP21 (ENSCWAG00000003379)	ENSCWAG00000003369	PRTFDC1 (ENSCWAG00000003354)	ENKUR (ENSCWAG00000003334)	THNSL1 (ENSCWAG00000003329)	GPR158 (ENSCWAG00000003292)	ENSCWAG00000003264	GAD2 (ENSCWAG00000003224)	APBB1IP (ENSCWAG00000003183)	PDSS1 (ENSCWAG00000003156)	ABI1 (ENSCWAG00000002988)	ACBD5 (ENSCWAG00000002902)	MASTL (ENSCWAG00000002823)
Pig	MODERN SPECIES	1	PLXDC2 (ENSSSCG00000032444) #9	NEBL (ENSSSCG00000011090) #11	SKIDA1 (ENSSSCG00000011087) #12	ENSSSCG00000060456	ENSSSCG00000045711	MLLT10 (ENSSSCG00000011085) #13	DNAJC1 (ENSSSCG00000026001) #14	ENSSSCG00000055138	COMMD3 (ENSSSCG00000011082) #16	BMI1 (ENSSSCG00000011081) #17	SPAG6 (ENSSSCG00000011080) #18	PIP4K2A (ENSSSCG00000011079) #19	ENSSSCG00000045344	ARMC3 (ENSSSCG00000011078) #20	MSRB2 (ENSSSCG00000011077) #21	PTF1A (ENSSSCG00000030662) #22	ENSSSCG00000058253 #24	OTUD1 (ENSSSCG00000011076)	KIAA1217 (ENSSSCG00000011075)	ARHGAP21 (ENSSSCG00000011074)	ENSSSCG00000059535	ENSSSCG00000037690	PRTFDC1 (ENSSSCG00000028135)	ENKUR (ENSSSCG00000032929)	THNSL1 (ENSSSCG00000011071)	GPR158 (ENSSSCG00000038536)	ENSSSCG00000011059	GAD2 (ENSSSCG00000011060)	APBB1IP (ENSSSCG00000030156)	PDSS1 (ENSSSCG00000011061)	ABI1 (ENSSSCG00000024127)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00410000028701 #10	ENSGT00940000172425	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00940000167080	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00910000148022	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000156105	ENSGT00390000005508.b	ENSGT00940000153498.B.a
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	103				ENSGT00940000158809.k #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00940000167080	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144
Arabian camel	MODERN SPECIES	28	SKIDA1 (ENSCDRG00005018822) #12	MLLT10 (ENSCDRG00005018405) #13	DNAJC1 (ENSCDRG00005018321) #14	ENSCDRG00005018291	ENSCDRG00005018255	COMMD3 (ENSCDRG00005018220) #16	BMI1 (ENSCDRG00005018183) #17	SPAG6 (ENSCDRG00005018080) #18	PIP4K2A (ENSCDRG00005018006) #19	ENSCDRG00005017993	ENSCDRG00005017977	ENSCDRG00005017964	ARMC3 (ENSCDRG00005017783) #20	MSRB2 (ENSCDRG00005017746) #21	ENSCDRG00005017724	PTF1A (ENSCDRG00005017662) #22	ENSCDRG00005017628	ENSCDRG00005017606	ENSCDRG00005017587	C10orf67 (ENSCDRG00005017524) #24	ENSCDRG00005017498	ENSCDRG00005017355	ENSCDRG00005017337	ENSCDRG00005017307	ENSCDRG00005017302	ENSCDRG00005017278	ENSCDRG00005017250	ENSCDRG00005017230	ENSCDRG00005017205	ENSCDRG00005017197	ENSCDRG00005017172
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00410000028701 #10	ENSGT00940000172425	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00940000167080	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00910000148022	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT01000000221977	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00950000182802.A.ab.a.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000012138.a.b.t.cb	ENSGT00510000049635	ENSGT00910000148022	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT01000000221977	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00950000182802.A.ab.a.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000012138.a.b.t.cb	ENSGT00510000049635	ENSGT00910000148022	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158809.i #8	ENSGT01000000221977	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00950000182802.A.ab.a.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000012138.a.b.t.cb	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01000000221977	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00950000182802.A.ab.a.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000163089.b	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000012138.a.b.t.cb	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000158809.i #8	ENSGT01000000221977	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00950000182802.A.ab.a.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000163089.b	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000012138.a.b.t.cb	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Beluga whale	MODERN SPECIES	22	ENSDLEG00000004998	PLXDC2 (ENSDLEG00000005004) #9	ENSDLEG00000005011	NEBL (ENSDLEG00000005016) #11	NEBL (ENSDLEG00000005042) #11	SKIDA1 (ENSDLEG00000005109) #12	MLLT10 (ENSDLEG00000005121) #13	DNAJC1 (ENSDLEG00000005162) #14	COMMD3 (ENSDLEG00000005177) #16	BMI1 (ENSDLEG00000005183) #17	SPAG6 (ENSDLEG00000005196) #18	PIP4K2A (ENSDLEG00000005239) #19	ARMC3 (ENSDLEG00000005283) #20	MSRB2 (ENSDLEG00000005444) #21	ENSDLEG00000005452	PTF1A (ENSDLEG00000005455) #22	ENSDLEG00000005462	OTUD1 (ENSDLEG00000005465)	KIAA1217 (ENSDLEG00000005487)	ARHGAP21 (ENSDLEG00000005573)	PRTFDC1 (ENSDLEG00000005627)	ENKUR (ENSDLEG00000005646)	THNSL1 (ENSDLEG00000005663)	GPR158 (ENSDLEG00000005672)	ENSDLEG00000005693	MYO3A (ENSDLEG00000005721)	GAD2 (ENSDLEG00000005786)	GJD4 (ENSDLEG00000005805)	FZD8 (ENSDLEG00000005816)	OPTN (ENSDLEG00000005824)	MCM10 (ENSDLEG00000005866)
Narwhal	MODERN SPECIES	308	PLXDC2 (ENSMMNG00015015001) #9	ENSMMNG00015014981	NEBL (ENSMMNG00015014944) #11	ENSMMNG00015014909	SKIDA1 (ENSMMNG00015014859) #12	MLLT10 (ENSMMNG00015014594) #13	ENSMMNG00015014486	DNAJC1 (ENSMMNG00015014465) #14	ENSMMNG00015014450	BMI1 (ENSMMNG00015014440) #17	SPAG6 (ENSMMNG00015014387) #18	PIP4K2A (ENSMMNG00015014340) #19	ARMC3 (ENSMMNG00015014277) #20	MSRB2 (ENSMMNG00015014254) #21	ENSMMNG00015014244	PTF1A (ENSMMNG00015014226) #22	ENSMMNG00015014219	OTUD1 (ENSMMNG00015014213)	KIAA1217 (ENSMMNG00015014142)	ARHGAP21 (ENSMMNG00015014062)	PRTFDC1 (ENSMMNG00015014024)	ENKUR (ENSMMNG00015014000)	THNSL1 (ENSMMNG00015013993)	GPR158 (ENSMMNG00015013963)	MYO3A (ENSMMNG00015013883)	GAD2 (ENSMMNG00015013825)	OPTN (ENSMMNG00015013794)	MCM10 (ENSMMNG00015013720)	UCMA (ENSMMNG00015013649)	PHYH (ENSMMNG00015013619)	SEPHS1 (ENSMMNG00015013598)
Vaquita	MODERN SPECIES	11	PLXDC2 (ENSPSNG00000008936) #9	NEBL (ENSPSNG00000008689) #11	ENSPSNG00000008581	ENSPSNG00000008537	SKIDA1 (ENSPSNG00000008497) #12	ENSPSNG00000008481	MLLT10 (ENSPSNG00000008148) #13	DNAJC1 (ENSPSNG00000008059) #14	COMMD3 (ENSPSNG00000008023) #16	BMI1 (ENSPSNG00000007988) #17	SPAG6 (ENSPSNG00000007749) #18	PIP4K2A (ENSPSNG00000007673) #19	ARMC3 (ENSPSNG00000007614) #20	MSRB2 (ENSPSNG00000007591) #21	ENSPSNG00000007566	PTF1A (ENSPSNG00000007537) #22	ENSPSNG00000007505	OTUD1 (ENSPSNG00000007481)	KIAA1217 (ENSPSNG00000006898)	ARHGAP21 (ENSPSNG00000006645)	PRTFDC1 (ENSPSNG00000006527)	ENKUR (ENSPSNG00000006476)	THNSL1 (ENSPSNG00000006461)	GPR158 (ENSPSNG00000006342)	ENSPSNG00000006275	GAD2 (ENSPSNG00000006192)	FZD8 (ENSPSNG00000006170)	OPTN (ENSPSNG00000006139)	MCM10 (ENSPSNG00000006091)	UCMA (ENSPSNG00000006044)	PHYH (ENSPSNG00000005995)
Dolphin	MODERN SPECIES	1711																PTF1A (ENSTTRG00000016843) #22	ENSTTRG00000016844	ENSTTRG00000016845 #24
Sperm whale	MODERN SPECIES	2	ENSPCTG00005002247	PLXDC2 (ENSPCTG00005002198) #9	ENSPCTG00005002173	NEBL (ENSPCTG00005002125) #11	ENSPCTG00005002104	SKIDA1 (ENSPCTG00005002080) #12	MLLT10 (ENSPCTG00005001847) #13	ENSPCTG00005001796	DNAJC1 (ENSPCTG00005001781) #14	COMMD3 (ENSPCTG00005001759) #16	BMI1 (ENSPCTG00005001744) #17	SPAG6 (ENSPCTG00005001658) #18	PIP4K2A (ENSPCTG00005001598) #19	ARMC3 (ENSPCTG00005001504) #20	MSRB2 (ENSPCTG00005001481) #21	PTF1A (ENSPCTG00005001474) #22	ENSPCTG00005001466	OTUD1 (ENSPCTG00005001454)	ENSPCTG00005001440	KIAA1217 (ENSPCTG00005001014)	ARHGAP21 (ENSPCTG00005000826)	PRTFDC1 (ENSPCTG00005000745)	ENKUR (ENSPCTG00005000710)	THNSL1 (ENSPCTG00005000693)	ENSPCTG00005000685	GPR158 (ENSPCTG00005000644)	MYO3A (ENSPCTG00005000572)	GAD2 (ENSPCTG00005011554)	FZD8 (ENSPCTG00005011487)	GJD4 (ENSPCTG00005011420)	ENSPCTG00005011354
Blue whale	MODERN SPECIES	11	PLXDC2 (ENSBMSG00010004417) #9	ENSBMSG00010004405 #10	NEBL (ENSBMSG00010004247) #11	ENSBMSG00010004203	ENSBMSG00010004190	SKIDA1 (ENSBMSG00010004180) #12	MLLT10 (ENSBMSG00010004128) #13	ENSBMSG00010004104	DNAJC1 (ENSBMSG00010004096) #14	COMMD3 (ENSBMSG00010004076) #16	BMI1 (ENSBMSG00010004062) #17	SPAG6 (ENSBMSG00010003990) #18	PIP4K2A (ENSBMSG00010003968) #19	ARMC3 (ENSBMSG00010003930) #20	ENSBMSG00010003915 #21	PTF1A (ENSBMSG00010003904) #22	ENSBMSG00010003856	OTUD1 (ENSBMSG00010003848)	ENSBMSG00010003843	KIAA1217 (ENSBMSG00010003391)	ARHGAP21 (ENSBMSG00010003323)	PRTFDC1 (ENSBMSG00010003299)	ENKUR (ENSBMSG00010003285)	THNSL1 (ENSBMSG00010003276)	ENSBMSG00010003269	GPR158 (ENSBMSG00010003248)	MYO3A (ENSBMSG00010003231)	GAD2 (ENSBMSG00010003210)	FZD8 (ENSBMSG00010003200)	OPTN (ENSBMSG00010003169)	MCM10 (ENSBMSG00010003151)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000172425	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000172425	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000161191.A	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000172425	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000172425	ENSGT00940000170401.d	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.b.i.b	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918.g	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Bos	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000172425	ENSGT00940000170401.d	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000009819.a.b.a.a.b.b.i.b	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918.g	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492	ENSGT00390000001775.B.h
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00960000190920	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000172425	ENSGT00940000170401.d	ENSGT00410000028443	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918.g	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT01090000260098.B	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492	ENSGT00390000001775.B.h
Cow	MODERN SPECIES	4	ENSBTAG00000048971	ENSBTAG00000003937	ENSBTAG00000050131	ENSBTAG00000050686	SKIDA1 (ENSBTAG00000044047) #12	MLLT10 (ENSBTAG00000044074) #13	DNAJC1 (ENSBTAG00000033315) #14	ENSBTAG00000025968	ENSBTAG00000051361	COMMD3 (ENSBTAG00000003589) #16	BMI1 (ENSBTAG00000015584) #17	SPAG6 (ENSBTAG00000033291) #18	PIP4K2A (ENSBTAG00000018033) #19	ARMC3 (ENSBTAG00000020929) #20	MSRB2 (ENSBTAG00000044112) #21	PTF1A (ENSBTAG00000047315) #22	OTUD1 (ENSBTAG00000047752)	KIAA1217 (ENSBTAG00000018395)	ARHGAP21 (ENSBTAG00000021857)	ENKUR (ENSBTAG00000015569)	THNSL1 (ENSBTAG00000009117)	GPR158 (ENSBTAG00000023920)	MYO3A (ENSBTAG00000002123)	GAD2 (ENSBTAG00000008056)	GJD4 (ENSBTAG00000003640)	FZD8 (ENSBTAG00000052989)	OPTN (ENSBTAG00000016401)	MCM10 (ENSBTAG00000016406)	UCMA (ENSBTAG00000054631)	ENSBTAG00000047869	PHYH (ENSBTAG00000007700)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	4	ENSBIXG00005021529	PLXDC2 (ENSBIXG00005021627) #9	ENSBIXG00005021704	ENSBIXG00005021732	NEBL (ENSBIXG00005021861) #11	ENSBIXG00005021898	SKIDA1 (ENSBIXG00005021929) #12	MLLT10 (ENSBIXG00005022071) #13	DNAJC1 (ENSBIXG00005022133) #14	BMI1 (ENSBIXG00005007224) #17	SPAG6 (ENSBIXG00005022314) #18	ENSBIXG00005022342	PIP4K2A (ENSBIXG00005022377) #19	ARMC3 (ENSBIXG00005022496) #20	MSRB2 (ENSBIXG00005022544) #21	PTF1A (ENSBIXG00005022569) #22	ENSBIXG00005022633 #24	OTUD1 (ENSBIXG00005003874)	ENSBIXG00005022670	KIAA1217 (ENSBIXG00005006893)	ARHGAP21 (ENSBIXG00005023435)	ENSBIXG00005007388	ENSBIXG00005006004	ENKUR (ENSBIXG00005023626)	THNSL1 (ENSBIXG00005023665)	GPR158 (ENSBIXG00005023699)	MYO3A (ENSBIXG00005023826)	GAD2 (ENSBIXG00005004092)	FZD8 (ENSBIXG00005005561)	ENSBIXG00005023947	OPTN (ENSBIXG00005024077)
American bison	MODERN SPECIES	3321	ENSBBBG00000014820	NEBL (ENSBBBG00000014814) #11	ENSBBBG00000014782	ENSBBBG00000003590	ENSBBBG00000014776	SKIDA1 (ENSBBBG00000014768) #12	MLLT10 (ENSBBBG00000014752) #13	DNAJC1 (ENSBBBG00000014621) #14	ENSBBBG00000014606	COMMD3 (ENSBBBG00000014594) #16	BMI1 (ENSBBBG00000014582) #17	SPAG6 (ENSBBBG00000007604) #18	PIP4K2A (ENSBBBG00000003407) #19	ARMC3 (ENSBBBG00000003388) #20	MSRB2 (ENSBBBG00000014479) #21	PTF1A (ENSBBBG00000014471) #22	KIAA1217 (ENSBBBG00000014434)	ARHGAP21 (ENSBBBG00000003208)	PRTFDC1 (ENSBBBG00000014140)	ENKUR (ENSBBBG00000014121)	THNSL1 (ENSBBBG00000003174)	GPR158 (ENSBBBG00000008747)	ENSBBBG00000014091	GAD2 (ENSBBBG00000014080)	ENSBBBG00000003133	OPTN (ENSBBBG00000014045)	MCM10 (ENSBBBG00000003086)	UCMA (ENSBBBG00000008745)	ENSBBBG00000013955	ENSBBBG00000003045	SEPHS1 (ENSBBBG00000013939)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000157567 #7	ENSGT00940000165398	ENSGT00940000158809 #8	ENSGT00440000033408.a #9	ENSGT00940000154775.c.b	ENSGT00940000156390 #11	ENSGT00940000153451.a.b #12	ENSGT00940000157711 #13	ENSGT00940000156678 #14	ENSGT00390000015971 #16	ENSGT00940000156042 #17	ENSGT00900000141099 #18	ENSGT00940000156508 #19	ENSGT00940000157476 #20	ENSGT00940000161673 #21	ENSGT00940000161000 #22	ENSGT00390000003836 #24	ENSGT00510000049635	ENSGT00940000156098	ENSGT00940000155406	ENSGT00940000162225	ENSGT00940000153866.A	ENSGT00940000161144	ENSGT00940000155918	ENSGT00940000154431.e.a.a.a.a.a.a	ENSGT00940000155939	ENSGT00940000157951	ENSGT00940000161191.A	ENSGT00530000063808.b	ENSGT00390000007134	ENSGT00390000011492
Goat	MODERN SPECIES	4	MALRD1 (ENSCHIG00000021485) #8	PLXDC2 (ENSCHIG00000023670) #9	ENSCHIG00000023193	NEBL (ENSCHIG00000023751) #11	SKIDA1 (ENSCHIG00000020595) #12	MLLT10 (ENSCHIG00000010933) #13	DNAJC1 (ENSCHIG00000008531) #14	ENSCHIG00000010411	COMMD3 (ENSCHIG00000017616) #16	BMI1 (ENSCHIG00000016716) #17	SPAG6 (ENSCHIG00000025023) #18	PIP4K2A (ENSCHIG00000022526) #19	ENSCHIG00000007754	ARMC3 (ENSCHIG00000023741) #20	MSRB2 (ENSCHIG00000014549) #21	PTF1A (ENSCHIG00000024165) #22	C10orf67 (ENSCHIG00000014515) #24	OTUD1 (ENSCHIG00000011814)	KIAA1217 (ENSCHIG00000022589)	ARHGAP21 (ENSCHIG00000018776)	PRTFDC1 (ENSCHIG00000019326)	ENKUR (ENSCHIG00000009363)	GPR158 (ENSCHIG00000025773)	ENSCHIG00000013726	ENSCHIG00000011148	MYO3A (ENSCHIG00000015900)	GAD2 (ENSCHIG00000021003)	FZD8 (ENSCHIG00000026810)	OPTN (ENSCHIG00000017855)	MCM10 (ENSCHIG00000021952)	UCMA (ENSCHIG00000025422)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	4	PLXDC2 (ENSOARG00020023004) #9	ENSOARG00020023295	NEBL (ENSOARG00020023328) #11	ENSOARG00020023735	ENSOARG00020023745	SKIDA1 (ENSOARG00020023795) #12	MLLT10 (ENSOARG00020023844) #13	DNAJC1 (ENSOARG00020024307) #14	ENSOARG00020024323	COMMD3 (ENSOARG00020024334) #16	BMI1 (ENSOARG00020024353) #17	SPAG6 (ENSOARG00020024405) #18	PIP4K2A (ENSOARG00020024466) #19	ARMC3 (ENSOARG00020024507) #20	MSRB2 (ENSOARG00020024574) #21	PTF1A (ENSOARG00020024582) #22	ENSOARG00020024601 #24	OTUD1 (ENSOARG00020024691)	KIAA1217 (ENSOARG00020024750)	ARHGAP21 (ENSOARG00020025002)	PRTFDC1 (ENSOARG00020025193)	ENKUR (ENSOARG00020025225)	THNSL1 (ENSOARG00020025238)	GPR158 (ENSOARG00020025256)	ENSOARG00020025314	MYO3A (ENSOARG00020025333)	GAD2 (ENSOARG00020025435)	FZD8 (ENSOARG00020025454)	OPTN (ENSOARG00020003222)	PHYH (ENSOARG00020003287)	SEPHS1 (ENSOARG00020003364)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1194	PLXDC2 (ENSMMSG00000011036) #9	ENSMMSG00000011005	NEBL (ENSMMSG00000010862) #11	ENSMMSG00000010842	ENSMMSG00000010830	SKIDA1 (ENSMMSG00000010753) #12	MLLT10 (ENSMMSG00000010556) #13	DNAJC1 (ENSMMSG00000010489) #14	COMMD3 (ENSMMSG00000010440) #16	BMI1 (ENSMMSG00000010401) #17	SPAG6 (ENSMMSG00000009939) #18	PIP4K2A (ENSMMSG00000009845) #19	ENSMMSG00000009832	ARMC3 (ENSMMSG00000009602) #20	MSRB2 (ENSMMSG00000009568) #21	PTF1A (ENSMMSG00000009546) #22	OTUD1 (ENSMMSG00000009420)	KIAA1217 (ENSMMSG00000009308)	ARHGAP21 (ENSMMSG00000008987)	PRTFDC1 (ENSMMSG00000008847)	ENSMMSG00000008819	ENKUR (ENSMMSG00000008794)	THNSL1 (ENSMMSG00000008782)	GPR158 (ENSMMSG00000008659)	ENSMMSG00000008632	ENSMMSG00000008510	GAD2 (ENSMMSG00000008371)	FZD8 (ENSMMSG00000008339)	OPTN (ENSMMSG00000008278)	MCM10 (ENSMMSG00000008245)	UCMA (ENSMMSG00000008183)
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