Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000182974.a.a.a.a ENSGT00390000007953 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864 ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b ENSGT00510000047104 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162864.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT01020000231229 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b ENSGT00510000047104 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162864.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT01020000231229 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.a ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162864.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT01020000231229 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.a ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162864.a ENSGT00950000183087.A.b.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT01020000231229 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.a ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b Pecora ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162864.a.d.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00390000004226.b.a #14 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226.a ##14 ENSGT00390000004226.b.b ##14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.a ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b ENSGT00510000047104 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162864.a.d.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00390000004226.b.a #14 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226.a ##14 ENSGT00390000004226.b.b ##14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.a ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902.p ##34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b ENSGT00510000047104 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000161248 ENSGT01030000234964.A.a.b ##13 ENSGT00390000004226.b.b ##14 ENSGT00390000004226.a ##14 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00390000004226.b.a #14 ENSGT01030000234964.A.a.a #13 ENSGT00940000162864.a.c ENSGT00950000183087.A.b.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.a ENSGT00940000158723 #29 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SPECIES 30 ENSCHIG00000020888 #7 ENSCHIG00000024386 #8 IGSF1 (ENSCHIG00000008777) #9 ENSCHIG00000000062 #10 SLITRK4 (ENSCHIG00000019228) #11 ENSCHIG00000018613 #12 ENSCHIG00000000195 #13 ENSCHIG00000000231 #14 LDOC1 (ENSCHIG00000019266) #15 ENSCHIG00000000337 #16 SOX3 (ENSCHIG00000000368) #17 ENSCHIG00000000404 #18 ATP11C (ENSCHIG00000009648) #19 MCF2 (ENSCHIG00000009737) #20 F9 (ENSCHIG00000013903) #21 FGF13 (ENSCHIG00000016286) #22 ENSCHIG00000018935 #23 ZIC3 (ENSCHIG00000021756) #24 ENSCHIG00000007648 #25 ENSCHIG00000009593 #26 ENSCHIG00000000060 #27 ENSCHIG00000000095 #28 ARHGEF6 (ENSCHIG00000000132) #29 CD40LG (ENSCHIG00000000168) #30 ENSCHIG00000018808 #31 ENSCHIG00000000243 #32 BRS3 (ENSCHIG00000000280) #33 HTATSF1 (ENSCHIG00000000312) #34 ENSCHIG00000000348 #35 ENSCHIG00000000379 #36 MOSPD1 (ENSCHIG00000000414) #37 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000007953 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 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ENSGT00390000010165.i.b.a.b ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.a ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902.p ##34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT01100000263480.a.a.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000153460.c.b.j ENSGT00510000047104.pb.b Bos_b ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000162864.a.c ENSGT00950000183087.A.b.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00910000144363.g.b.a.a.a ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226.a.a.b ##14 ENSGT00390000004226.a.a.a.a ##14 ENSGT00390000004226.a.b.a ##14 ENSGT00940000160625.k.b ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00390000010165.i.b.a.b ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000158723 #29 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(ENSBTAG00000009523) MMGT1 (ENSBTAG00000025297) INTS6L (ENSBTAG00000008993) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162313 #22 Domestic yak MODERN SPECIES 69 ENSBGRG00000012699 #13 SLITRK4 (ENSBGRG00000012800) #11 ENSBGRG00000012828 #13 ENSBGRG00000012864 #14 ENSBGRG00000012915 LDOC1 (ENSBGRG00000012930) #15 ENSBGRG00000013037 SOX3 (ENSBGRG00000013074) #17 ENSBGRG00000013322 #18 ENSBGRG00000013335 ##14 ENSBGRG00000013390 ##14 ENSBGRG00000013454 ATP11C (ENSBGRG00000013594) #19 MCF2 (ENSBGRG00000016309) #20 F9 (ENSBGRG00000017397) #21 FGF13 (ENSBGRG00000017651) #22 ENSBGRG00000017892 ENSBGRG00000017943 ENSBGRG00000017990 ENSBGRG00000018033 ZIC3 (ENSBGRG00000018094) #24 ENSBGRG00000018234 #26 GPR101 (ENSBGRG00000018481) RBMXL1 (ENSBGRG00000018516) ARHGEF6 (ENSBGRG00000018751) #29 CD40LG (ENSBGRG00000019129) #30 ENSBGRG00000019321 #32 HTATSF1 (ENSBGRG00000019364) ##34 BRS3 (ENSBGRG00000019515) #33 ENSBGRG00000019586 #35 ENSBGRG00000020148 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162313 #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162313 #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162313 #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007953 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00940000161248 ENSGT00950000183087.A.b.a.e ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00950000183375 ENSGT00940000164798 ENSGT01020000231229 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00530000064050.j ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902.k #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b ENSGT00510000047104 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00390000014547.d.a.b Beluga whale MODERN SPECIES FMR1 (ENSDLEG00000000712) SLITRK2 (ENSDLEG00000000769) ENSDLEG00000000774 SLITRK4 (ENSDLEG00000000783) #11 LDOC1 (ENSDLEG00000000802) #15 ENSDLEG00000000805 ENSDLEG00000000818 ENSDLEG00000000822 SOX3 (ENSDLEG00000000843) #17 ENSDLEG00000000855 #18 ATP11C (ENSDLEG00000000892) #19 ENSDLEG00000001046 MCF2 (ENSDLEG00000001070) #20 F9 (ENSDLEG00000001177) #21 ENSDLEG00000001192 FGF13 (ENSDLEG00000001212) #22 ENSDLEG00000001240 ZIC3 (ENSDLEG00000001271) #24 GPR101 (ENSDLEG00000001280) GPR101 (ENSDLEG00000001283) RBMX (ENSDLEG00000001291) ARHGEF6 (ENSDLEG00000001336) #29 CD40LG (ENSDLEG00000001439) #30 VGLL1 (ENSDLEG00000001448) #32 HTATSF1 (ENSDLEG00000001466) #34 BRS3 (ENSDLEG00000001472) #33 MAP7D3 (ENSDLEG00000001486) #35 FHL1 (ENSDLEG00000001531) ENSDLEG00000001544 ENSDLEG00000001558 MMGT1 (ENSDLEG00000001581) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000156803 ENSGT00950000182974.a.a.a.a ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b ENSGT00510000047104 Alpaca MODERN SPECIES 311 MCF2 (ENSVPAG00000009718) #20 F9 (ENSVPAG00000009716) #21 ENSVPAG00000009715 #22 Suina ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000162864.a ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00390000010165.i.b.b.a ENSGT00940000164798 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b ENSGT00510000047104 ENSGT00390000016655.a.b ENSGT00390000014547.d.a.b ENSGT00940000160108 Chacoan peccary DUPLICATION Chacoan peccary MODERN SPECIES 15 SLITRK4 (ENSCWAG00000012982) #11 ENSCWAG00000012967 LDOC1 (ENSCWAG00000012948) #15 ENSCWAG00000012915 SOX3 (ENSCWAG00000012837) #17 ENSCWAG00000012813 #18 ENSCWAG00000012778 #14 ENSCWAG00000012723 ENSCWAG00000012705 ATP11C (ENSCWAG00000012057) #19 MCF2 (ENSCWAG00000007508) #20 F9 (ENSCWAG00000007270) #21 FGF13 (ENSCWAG00000007218) #22 ENSCWAG00000007195 Chacoan peccary DUPLICATION Chacoan peccary MODERN SPECIES 147 ENSCWAG00000002952 #22 ENSCWAG00000002959 #22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 147 ENSCWAG00000002959 #22 ENSCWAG00000002952 #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT01020000231229 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b Carnivora ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007953 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 #29 ENSGT01070000253816.a.b #30 ENSGT00530000063353.b #32 ENSGT00390000009902 #34 ENSGT01100000263512.b.b.b #33 ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a #35 ENSGT00940000154833 ENSGT00940000153460.c.b Caniformia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000007953 ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT01090000261020.B ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000160971 #11 ENSGT00940000162721 #15 ENSGT00940000164798 ENSGT00940000162359 #17 ENSGT00390000002886.b.b #18 ENSGT00390000004226 #14 ENSGT00940000158878 #19 ENSGT00940000156974 #20 ENSGT00940000159516 #21 ENSGT00940000162313 #22 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 #24 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 #26 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