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Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012721.a #7	ENSGT00950000183055.b.b #8	ENSGT00940000160557 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000156385 #11	ENSGT00390000009781	ENSGT00940000153168.C.a.a #13	ENSGT00940000156071 #14	ENSGT00910000146907	ENSGT00950000182810.A.b #16	ENSGT00940000158849 #17	ENSGT00940000160067 #18	ENSGT00940000160864 #19	ENSGT00390000012163 #20	ENSGT00510000046929.b #21	ENSGT00940000160880 #22	ENSGT00940000157770 #23	ENSGT01030000234518.A.a.b #24	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b #25	ENSGT00940000158185 #29	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a #30	ENSGT00940000153713.B.d #31	ENSGT00530000064228 #32	ENSGT00420000029848.B #33	ENSGT00390000011484 #34	ENSGT00510000048608 #35	ENSGT00520000060726.a #36	ENSGT00940000162856 #37	ENSGT00530000064225	ENSGT00900000141664	ENSGT00740000116871
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Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00390000012721.a #7	ENSGT00950000183055.b.b #8	ENSGT00940000160557 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000156385 #11	ENSGT00940000153168.C.a.a #13	ENSGT00940000156071 #14	ENSGT00910000146907	ENSGT00950000182810.A.b #16	ENSGT00940000158849 #17	ENSGT00940000160067 #18	ENSGT00940000160864 #19	ENSGT00390000012163 #20	ENSGT00510000046929.b #21	ENSGT00940000160880 #22	ENSGT00940000157770 #23	ENSGT01030000234518.A.a.b #24	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b #25	ENSGT00940000158185 #29	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a #30	ENSGT00940000153713.B.d #31	ENSGT00530000064228 #32	ENSGT00420000029848.B #33	ENSGT00390000011484 #34	ENSGT00510000048608 #35	ENSGT00520000060726.a #36	ENSGT00940000162856 #37	ENSGT00530000064225	ENSGT00900000141664	ENSGT00740000116871
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154507	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00390000012721.a #7	ENSGT00950000183055.b.b #8	ENSGT00940000160557 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000156385 #11	ENSGT00940000153168.C.a.a #13	ENSGT00940000156071 #14	ENSGT00950000182810.A.b #16	ENSGT00940000158849 #17	ENSGT00940000160067 #18	ENSGT00940000160864 #19	ENSGT00390000012163 #20	ENSGT00510000046929.b #21	ENSGT00940000160880 #22	ENSGT00940000157770 #23	ENSGT01030000234518.A.a.b #24	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b #25	ENSGT00940000158185 #29	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a #30	ENSGT00940000153713.B.d #31	ENSGT00530000064228 #32	ENSGT00420000029848.B #33	ENSGT00390000011484 #34	ENSGT00510000048608 #35	ENSGT00520000060726.a #36	ENSGT00940000162856 #37	ENSGT00530000064225	ENSGT00900000141664	ENSGT00740000116871
Pecora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154507	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00390000012721.a #7	ENSGT00950000183055.b.b #8	ENSGT00940000160557 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000156385 #11	ENSGT00940000153168.C.a.a #13	ENSGT00940000156071 #14	ENSGT00950000182810.A.b #16	ENSGT00940000158849 #17	ENSGT00940000160067 #18	ENSGT00940000160864 #19	ENSGT00390000012163 #20	ENSGT00510000046929.b #21	ENSGT00940000160880 #22	ENSGT00940000157770 #23	ENSGT01030000234518.A.a.b #24	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b #25	ENSGT00940000158185 #29	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a #30	ENSGT00940000153713.B.d #31	ENSGT00530000064228 #32	ENSGT00420000029848.B #33	ENSGT00390000011484 #34	ENSGT00510000048608 #35	ENSGT00520000060726.a #36	ENSGT00940000162856 #37	ENSGT00530000064225	ENSGT00900000141664	ENSGT00740000116871
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154507	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00390000012721.a #7	ENSGT00950000183055.b.b #8	ENSGT00940000160557 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000156385 #11	ENSGT00940000153168.C.a.a #13	ENSGT00940000156071 #14	ENSGT00950000182810.A.b #16	ENSGT00940000158849 #17	ENSGT00940000160067 #18	ENSGT00940000160864 #19	ENSGT00390000012163 #20	ENSGT00510000046929.b #21	ENSGT00940000160880 #22	ENSGT00940000157770 #23	ENSGT01030000234518.A.a.b #24	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b #25	ENSGT00940000158185 #29	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a #30	ENSGT00940000153713.B.d #31	ENSGT00530000064228 #32	ENSGT00420000029848.B #33	ENSGT00390000011484 #34	ENSGT00510000048608 #35	ENSGT00520000060726.a #36	ENSGT00940000162856 #37	ENSGT00530000064225	ENSGT00900000141664	ENSGT00740000116871
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012721.a #7	ENSGT00950000183055.b.b #8	ENSGT00940000160557 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000156385 #11	ENSGT00980000201221 #12	ENSGT00390000015889.o.a	ENSGT00940000153168.C.a.a #13	ENSGT00940000156071 #14	ENSGT00950000182810.A.b #16	ENSGT00940000158849 #17	ENSGT00940000160067 #18	ENSGT00940000160864 #19	ENSGT00390000012163 #20	ENSGT00510000046929.b #21	ENSGT00940000160880 #22	ENSGT00940000157770 #23	ENSGT01030000234518.A.a.b #24	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b #25	ENSGT00940000158185 #29	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a #30	ENSGT00940000153713.B.d #31	ENSGT00530000064228 #32	ENSGT00420000029848.B #33	ENSGT00390000011484 #34	ENSGT00510000048608 #35	ENSGT00520000060726.a #36	ENSGT00940000162856 #37	ENSGT00530000064225	ENSGT00900000141664	ENSGT00740000116871
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000014316.c.b	ENSGT00390000012721.a #7	ENSGT00950000183055.b.b #8	ENSGT00940000160557 #9	ENSGT00940000157254 #10	ENSGT00940000156385 #11	ENSGT00390000015889.o.a	ENSGT00940000153168.C.a.a #13	ENSGT00940000156071 #14	ENSGT00950000182810.A.b #16	ENSGT00940000158849 #17	ENSGT00940000160067 #18	ENSGT00940000160864 #19	ENSGT00390000012163 #20	ENSGT00510000046929.b #21	ENSGT00940000160880 #22	ENSGT00940000157770 #23	ENSGT01030000234518.A.a.b #24	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.b #25	ENSGT00940000158185 #29	ENSGT01030000234527.A.a.b.b.a #30	ENSGT00940000153713.B.d #31	ENSGT00530000064228 #32	ENSGT00420000029848.B #33	ENSGT00390000011484 #34	ENSGT00510000048608 #35	ENSGT00520000060726.a #36	ENSGT00940000162856 #37	ENSGT00530000064225	ENSGT00980000199376.a	ENSGT00940000165308.c.b
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	21	NDFIP1 (ENSOARG00020019295) #7	SPRY4 (ENSOARG00020019332) #8	ENSOARG00020019371 #9	ARHGAP26 (ENSOARG00020019500) #10	NR3C1 (ENSOARG00020019996) #11	ENSOARG00020020171 #12	YIPF5 (ENSOARG00020020202) #13	KCTD16 (ENSOARG00020020241) #14	ENSOARG00020020289 #15	PRELID2 (ENSOARG00020020309) #16	GRXCR2 (ENSOARG00020020373) #17	SH3RF2 (ENSOARG00020020399) #18	PLAC8L1 (ENSOARG00020020461) #19	ENSOARG00020020500 #20	RBM27 (ENSOARG00020020611) #21	POU4F3 (ENSOARG00020021135) #22	ENSOARG00020021186 #23	GPR151 (ENSOARG00020021621) #24	PPP2R2B (ENSOARG00020021670) #25	ENSOARG00020022156 #26	ENSOARG00020022171 #27	ENSOARG00020022188 #28	STK32A (ENSOARG00020022217) #29	DPYSL3 (ENSOARG00020022318) #30	JAKMIP2 (ENSOARG00020022485) #31	SPINK1 (ENSOARG00020022853) #32	SCGB3A2 (ENSOARG00020022888) #33	C5orf46 (ENSOARG00020022918) #34	SPINK5 (ENSOARG00020022999) #35	ENSOARG00020023080 #36	SPINK14 (ENSOARG00020023206) #37