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Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000017343 #7	ENSGT01000000214413.b.a.b.a #8	ENSGT00940000159164 #9	ENSGT00390000017213.A #10	ENSGT00390000001745 #11	ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #12	ENSGT01030000234816 #13	ENSGT00390000005023.a #14	ENSGT00940000159873 #15	ENSGT00510000049460 #16	ENSGT00940000156904 #17	ENSGT00940000159033 #18	ENSGT00390000000826 #19	ENSGT00950000183136.b.b #20	ENSGT00940000155088 #21	ENSGT00940000161554 #22	ENSGT00510000046803.b.b #23	ENSGT00940000153298.n #24	ENSGT00940000153566.a #25	ENSGT00390000018821 #26	ENSGT00940000161390 #27	ENSGT00940000160453 #28	ENSGT00510000049297 #29	ENSGT00940000162178 #30	ENSGT00940000160952 #31	ENSGT00940000159540 #32	ENSGT00940000161250 #33	ENSGT00940000155083.b #34	ENSGT00940000155810 #35	ENSGT00940000155840.C #36	ENSGT00390000007725.A.a #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000017343 #7	ENSGT01000000214413.b.a.b.a #8	ENSGT00940000159164 #9	ENSGT00390000017213.A #10	ENSGT00390000001745 #11	ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #12	ENSGT01030000234816 #13	ENSGT00390000005023.a #14	ENSGT00940000159873 #15	ENSGT00510000049460 #16	ENSGT00940000156904 #17	ENSGT00940000159033 #18	ENSGT00390000000826 #19	ENSGT00950000183136.b.b #20	ENSGT00940000155088 #21	ENSGT00940000161554 #22	ENSGT00510000046803.b.b #23	ENSGT00940000153298.n #24	ENSGT00940000153566.a #25	ENSGT00390000018821 #26	ENSGT00940000161390 #27	ENSGT00940000160453 #28	ENSGT00510000049297 #29	ENSGT00940000162178 #30	ENSGT00940000160952 #31	ENSGT00940000159540 #32	ENSGT00940000161250 #33	ENSGT00940000155083.b #34	ENSGT00940000155810 #35	ENSGT00940000155840.C #36	ENSGT00390000007725.A.a #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	120	CDCA3 (ENSCLAG00000013619) #7	GNB3 (ENSCLAG00000014669) #8	P3H3 (ENSCLAG00000012569) #9	GPR162 (ENSCLAG00000015020) #10	CD4 (ENSCLAG00000016197) #11	LAG3 (ENSCLAG00000014680) #12	PTMS (ENSCLAG00000016337) #13	MLF2 (ENSCLAG00000013739) #14	COPS7A (ENSCLAG00000014244) #15	PIANP (ENSCLAG00000016394) #16	ZNF384 (ENSCLAG00000015550) #17	ING4 (ENSCLAG00000014519) #18	ENSCLAG00000014500 #19	LPAR5 (ENSCLAG00000014166) #20	CHD4 (ENSCLAG00000012244) #21	NOP2 (ENSCLAG00000014440) #22	IFFO1 (ENSCLAG00000014944) #23	GAPDH (ENSCLAG00000013783) #24	NCAPD2 (ENSCLAG00000013118) #25	MRPL51 (ENSCLAG00000011881) #26	VAMP1 (ENSCLAG00000012860) #27	TAPBPL (ENSCLAG00000016184) #28	CD27 (ENSCLAG00000016154) #29	LTBR (ENSCLAG00000013106) #30	SCNN1A (ENSCLAG00000015244) #31	TNFRSF1A (ENSCLAG00000016084) #32	PLEKHG6 (ENSCLAG00000015229) #33	CD9 (ENSCLAG00000013477) #34	VWF (ENSCLAG00000014671) #35	ANO2 (ENSCLAG00000015450) #36	NTF3 (ENSCLAG00000016065) #37
Guinea pig	MODERN SPECIES	107	USP5 (ENSCPOG00000012336)	CDCA3 (ENSCPOG00000012334) #7	GNB3 (ENSCPOG00000025068) #8	P3H3 (ENSCPOG00000012330) #9	GPR162 (ENSCPOG00000038691) #10	ENSCPOG00000012324 #11	LAG3 (ENSCPOG00000012321) #12	PTMS (ENSCPOG00000021676) #13	MLF2 (ENSCPOG00000035372) #14	COPS7A (ENSCPOG00000000315) #15	PIANP (ENSCPOG00000000349) #16	ZNF384 (ENSCPOG00000012313) #17	ING4 (ENSCPOG00000012311) #18	ACRBP (ENSCPOG00000012300) #19	CHD4 (ENSCPOG00000008504) #21	NOP2 (ENSCPOG00000020690) #22	IFFO1 (ENSCPOG00000001041) #23	Gapdh (ENSCPOG00000026350) #24	NCAPD2 (ENSCPOG00000008480) #25	MRPL51 (ENSCPOG00000008478) #26	VAMP1 (ENSCPOG00000008473) #27	TAPBPL (ENSCPOG00000008460) #28	CD27 (ENSCPOG00000008449) #29	LTBR (ENSCPOG00000035613) #30	SCNN1A (ENSCPOG00000006185) #31	TNFRSF1A (ENSCPOG00000031352) #32	PLEKHG6 (ENSCPOG00000000576) #33	TEX52 (ENSCPOG00000008276)	FOXM1 (ENSCPOG00000015373)	RHNO1 (ENSCPOG00000035546)	TULP3 (ENSCPOG00000004928)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	24	P3H3 (ENSHGLG00000004948) #9	GPR162 (ENSHGLG00000004580) #10	CD4 (ENSHGLG00000004194) #11	LAG3 (ENSHGLG00000004095) #12	PTMS (ENSHGLG00000038669) #13	MLF2 (ENSHGLG00000003883) #14	COPS7A (ENSHGLG00000032684) #15	PIANP (ENSHGLG00000003689) #16	ZNF384 (ENSHGLG00000003572) #17	ENSHGLG00000039857	Ing4 (ENSHGLG00000003447) #18	ACRBP (ENSHGLG00000003358) #19	ENSHGLG00000047116	LPAR5 (ENSHGLG00000033434) #20	CHD4 (ENSHGLG00000003093) #21	NOP2 (ENSHGLG00000042932) #22	IFFO1 (ENSHGLG00000002934) #23	GAPDH (ENSHGLG00000002856) #24	ENSHGLG00000036344	NCAPD2 (ENSHGLG00000001934) #25	MRPL51 (ENSHGLG00000050005) #26	ENSHGLG00000001867 #27	TAPBPL (ENSHGLG00000001831) #28	CD27 (ENSHGLG00000046681) #29	LTBR (ENSHGLG00000032405) #30	SCNN1A (ENSHGLG00000001735) #31	TNFRSF1A (ENSHGLG00000001689) #32	PLEKHG6 (ENSHGLG00000001657) #33	CD9 (ENSHGLG00000001625) #34	VWF (ENSHGLG00000001451) #35	ENSHGLG00000032394