Amniota ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Mammalia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Theria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b #22 Common shrew MODERN SPECIES 1359 SRRM1 (ENSSARG00000013718) #22 Hedgehog MODERN SPECIES 2997 SRRM1 (ENSEEUG00000013830) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.a Suina ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 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(ENSSSCG00000003549) MAN1C1 (ENSSSCG00000023235) SELENON (ENSSSCG00000003554) MTFR1L (ENSSSCG00000003553) AUNIP (ENSSSCG00000003552) PAQR7 (ENSSSCG00000003551) STMN1 (ENSSSCG00000026257) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.a Camelidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.a ENSGT00390000005233.a Arabian camel MODERN SPECIES 4 GALE (ENSCDRG00005003344) HMGCL (ENSCDRG00005003396) FUCA1 (ENSCDRG00005003479) CNR2 (ENSCDRG00005003510) ENSCDRG00005003543 PNRC2 (ENSCDRG00005003571) SRSF10 (ENSCDRG00005003602) MYOM3 (ENSCDRG00005003689) IL22RA1 (ENSCDRG00005003864) ENSCDRG00005003900 GRHL3 (ENSCDRG00005003967) STPG1 (ENSCDRG00005004130) NIPAL3 (ENSCDRG00005004204) RCAN3 (ENSCDRG00005004258) 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ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.a Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b.c ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.a Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b.c ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.a Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00910000148416 ENSGT00940000165247 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000003738.a.a.b.d ENSGT00390000004116 ENSGT00940000164805 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 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ENSPCTG00005006738 RSRP1 (ENSPCTG00005006694) TMEM50A (ENSPCTG00005006647) ENSPCTG00005005488 MACO1 (ENSPCTG00005005347) LDLRAP1 (ENSPCTG00005005304) MAN1C1 (ENSPCTG00005005276) SELENON (ENSPCTG00005005120) MTFR1L (ENSPCTG00005005037) AUNIP (ENSPCTG00005005872) PAQR7 (ENSPCTG00005005864) EXTL1 (ENSPCTG00005005827) Blue whale MODERN SPECIES ENSBMSG00010005030 CNR2 (ENSBMSG00010005035) ENSBMSG00010005073 ENSBMSG00010005090 MYOM3 (ENSBMSG00010005148) IL22RA1 (ENSBMSG00010005209) IFNLR1 (ENSBMSG00010005237) GRHL3 (ENSBMSG00010005270) STPG1 (ENSBMSG00010005319) NIPAL3 (ENSBMSG00010005347) RCAN3 (ENSBMSG00010005360) ENSBMSG00010005385 ENSBMSG00010005393 ENSBMSG00010005404 ENSBMSG00010005412 SRRM1 (ENSBMSG00010005436) #22 CLIC4 (ENSBMSG00010005464) RUNX3 (ENSBMSG00010005477) ENSBMSG00010005490 ENSBMSG00010005498 RSRP1 (ENSBMSG00010005505) TMEM50A (ENSBMSG00010005519) ENSBMSG00010005597 MACO1 (ENSBMSG00010005847) LDLRAP1 (ENSBMSG00010005875) MAN1C1 (ENSBMSG00010005899) SELENON (ENSBMSG00010005935) ENSBMSG00010005965 AUNIP (ENSBMSG00010005981) PAQR7 (ENSBMSG00010006003) ENSBMSG00010006015 Pecora ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188436 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.b Yarkand deer MODERN SPECIES 31 PITHD1 (ENSCHYG00000008305) ENSCHYG00000008375 ENSCHYG00000008499 FUCA1 (ENSCHYG00000008690) CNR2 (ENSCHYG00000008760) ENSCHYG00000008776 PNRC2 (ENSCHYG00000008795) SRSF10 (ENSCHYG00000008859) MYOM3 (ENSCHYG00000009326) IL22RA1 (ENSCHYG00000009617) IFNLR1 (ENSCHYG00000009691) GRHL3 (ENSCHYG00000009786) STPG1 (ENSCHYG00000010086) NIPAL3 (ENSCHYG00000010238) RCAN3 (ENSCHYG00000010444) SRRM1 (ENSCHYG00000000242) #22 ENSCHYG00000000334 ENSCHYG00000000352 RUNX3 (ENSCHYG00000000382) SYF2 (ENSCHYG00000000406) RSRP1 (ENSCHYG00000000419) TMEM50A (ENSCHYG00000000448) ENSCHYG00000000474 MACO1 (ENSCHYG00000000511) LDLRAP1 (ENSCHYG00000000571) MAN1C1 (ENSCHYG00000000620) ENSCHYG00000000668 ENSCHYG00000000679 ENSCHYG00000000694 MTFR1L (ENSCHYG00000000710) ENSCHYG00000000762 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188436 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.b Siberian musk deer MODERN SPECIES 354 ENSMMSG00000008212 FUCA1 (ENSMMSG00000008170) CNR2 (ENSMMSG00000008162) ENSMMSG00000008145 PNRC2 (ENSMMSG00000008137) SRSF10 (ENSMMSG00000008099) ENSMMSG00000008044 MYOM3 (ENSMMSG00000007928) IL22RA1 (ENSMMSG00000007877) IFNLR1 (ENSMMSG00000007799) GRHL3 (ENSMMSG00000007665) STPG1 (ENSMMSG00000007597) NIPAL3 (ENSMMSG00000007511) RCAN3 (ENSMMSG00000007436) NCMAP (ENSMMSG00000007423) SRRM1 (ENSMMSG00000007331) #22 ENSMMSG00000007285 RUNX3 (ENSMMSG00000007223) SYF2 (ENSMMSG00000007178) RSRP1 (ENSMMSG00000007148) ENSMMSG00000007119 TMEM50A (ENSMMSG00000007075) ENSMMSG00000006479 MACO1 (ENSMMSG00000006393) LDLRAP1 (ENSMMSG00000006364) MAN1C1 (ENSMMSG00000006256) SELENON (ENSMMSG00000006176) MTFR1L (ENSMMSG00000006135) AUNIP (ENSMMSG00000006121) PAQR7 (ENSMMSG00000006113) STMN1 (ENSMMSG00000006084) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00960000188537 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188436 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 Bovinae DUPLICATION Bovinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.e #22 ENSGT00960000188537 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188436 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.e #22 ENSGT00960000188537 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188436 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.e #22 ENSGT00960000188537 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188436 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 24 PIANP (ENSBGRG00000000449) ZNF384 (ENSBGRG00000000467) ENSBGRG00000000548 ACRBP (ENSBGRG00000000596) LPAR5 (ENSBGRG00000000647) CHD4 (ENSBGRG00000000684) NOP2 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ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.e #22 ENSGT00960000188537 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188436 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 GALE (ENSBIXG00005030410) HMGCL (ENSBIXG00005030396) FUCA1 (ENSBIXG00005030361) CNR2 (ENSBIXG00005030340) ENSBIXG00005030328 ENSBIXG00005030316 SRSF10 (ENSBIXG00005030280) MYOM3 (ENSBIXG00005030177) IL22RA1 (ENSBIXG00005030112) IFNLR1 (ENSBIXG00005030096) GRHL3 (ENSBIXG00005030077) STPG1 (ENSBIXG00005030049) NIPAL3 (ENSBIXG00005030014) ENSBIXG00005030007 RCAN3 (ENSBIXG00005029979) SRRM1 (ENSBIXG00005029914) #22 CLIC4 (ENSBIXG00005029891) RUNX3 (ENSBIXG00005029882) ENSBIXG00005029871 SYF2 (ENSBIXG00005029859) RSRP1 (ENSBIXG00005029845) TMEM50A (ENSBIXG00005029829) ENSBIXG00005029791 MACO1 (ENSBIXG00005029757) LDLRAP1 (ENSBIXG00005029721) MAN1C1 (ENSBIXG00005029692) ENSBIXG00005029678 SELENON (ENSBIXG00005029596) MTFR1L (ENSBIXG00005029521) AUNIP (ENSBIXG00005029499) PAQR7 (ENSBIXG00005029478) Cow MODERN SPECIES 11 LYPLA2 (ENSBTAG00000011625) GALE (ENSBTAG00000005002) HMGCL (ENSBTAG00000021832) FUCA1 (ENSBTAG00000030434) CNR2 (ENSBTAG00000019371) PNRC2 (ENSBTAG00000030435) SRSF10 (ENSBTAG00000008072) MYOM3 (ENSBTAG00000014885) IL22RA1 (ENSBTAG00000001100) IFNLR1 (ENSBTAG00000001101) GRHL3 (ENSBTAG00000019791) STPG1 (ENSBTAG00000010278) NIPAL3 (ENSBTAG00000013048) RCAN3 (ENSBTAG00000017452) NCMAP (ENSBTAG00000012604) SRRM1 (ENSBTAG00000013772) #22 ENSBTAG00000054129 CLIC4 (ENSBTAG00000009470) RUNX3 (ENSBTAG00000050474) SYF2 (ENSBTAG00000001651) RSRP1 (ENSBTAG00000015222) TMEM50A (ENSBTAG00000001296) ENSBTAG00000001297 MACO1 (ENSBTAG00000002988) LDLRAP1 (ENSBTAG00000001050) MAN1C1 (ENSBTAG00000003069) ENSBTAG00000052666 SELENON (ENSBTAG00000021778) MTFR1L (ENSBTAG00000021781) AUNIP (ENSBTAG00000021786) PAQR7 (ENSBTAG00000021787) American bison MODERN SPECIES 3363 GALE (ENSBBBG00000014832) HMGCL (ENSBBBG00000014808) FUCA1 (ENSBBBG00000006950) CNR2 (ENSBBBG00000003584) ENSBBBG00000014759 PNRC2 (ENSBBBG00000003581) SRSF10 (ENSBBBG00000014740) MYOM3 (ENSBBBG00000014693) IL22RA1 (ENSBBBG00000014626) IFNLR1 (ENSBBBG00000007937) GRHL3 (ENSBBBG00000002862) STPG1 (ENSBBBG00000014563) NIPAL3 (ENSBBBG00000007602) RCAN3 (ENSBBBG00000014529) NCMAP (ENSBBBG00000014506) SRRM1 (ENSBBBG00000014498) #22 ENSBBBG00000008150 CLIC4 (ENSBBBG00000003335) ENSBBBG00000007127 SYF2 (ENSBBBG00000003323) RSRP1 (ENSBBBG00000006948) TMEM50A (ENSBBBG00000014406) ENSBBBG00000001411 MACO1 (ENSBBBG00000003299) LDLRAP1 (ENSBBBG00000014379) MAN1C1 (ENSBBBG00000001416) ENSBBBG00000014327 SELENON (ENSBBBG00000009117) MTFR1L (ENSBBBG00000014312) AUNIP (ENSBBBG00000003252) PAQR7 (ENSBBBG00000014305) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.f #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.f #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00390000007224.b ENSGT00940000156013 ENSGT00550000074783.e.a ENSGT00770000120675 ENSGT00940000158923 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000162550 ENSGT00940000159077 ENSGT00390000001157.A.a ENSGT00730000111539 ENSGT00940000162756 ENSGT00940000162109.B.e ENSGT00940000162109.B.f ENSGT00940000161951 ENSGT00940000162109.A ENSGT00730000111080.b.f #22 ENSGT00860000134229 ENSGT00950000183472 ENSGT00940000165160 ENSGT00950000186363.b ENSGT00950000186330 ENSGT00950000186363.a ENSGT01050000245033.c.b.a.a.d ENSGT01050000245033.c.b.a.b ENSGT00960000187414 ENSGT00530000064274 ENSGT00390000015202 ENSGT00730000111463 ENSGT00940000156294 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000155551 Domestic yak MODERN SPECIES RWDD2B (ENSBGRG00000000076) USP16 (ENSBGRG00000000077) ENSBGRG00000000078 MAP3K7CL (ENSBGRG00000000079) BACH1 (ENSBGRG00000000080) GRIK1 (ENSBGRG00000000082) CLDN17 (ENSBGRG00000000083) CLDN8 (ENSBGRG00000000084) KRTAP24-1 (ENSBGRG00000000085) ENSBGRG00000000086 ENSBGRG00000000088 ENSBGRG00000000089 ENSBGRG00000000090 KAP13.1 (ENSBGRG00000000091) KRTAP15-1 (ENSBGRG00000000092) ENSBGRG00000000093 #22 ENSBGRG00000000094 KRTAP19-3 (ENSBGRG00000000096) KRTAP19-5 (ENSBGRG00000000097) ENSBGRG00000000099 ENSBGRG00000000100 ENSBGRG00000000101 ENSBGRG00000000103 ENSBGRG00000000105 ENSBGRG00000000106 ENSBGRG00000000107 ENSBGRG00000000108 KRTAP8-1 (ENSBGRG00000000109) KRTAP7-1 (ENSBGRG00000000110) KAP11.1 (ENSBGRG00000000111) TIAM1 (ENSBGRG00000000112) Wild yak MODERN SPECIES 1107 CLDN17 (ENSBMUG00000006881) CLDN8 (ENSBMUG00000006867) KRTAP24-1 (ENSBMUG00000006858) KRTAP27-1 (ENSBMUG00000006852) ENSBMUG00000006847 ENSBMUG00000006836 ENSBMUG00000006830 KRTAP13-3 (ENSBMUG00000006819) KRTAP15-1 (ENSBMUG00000006813) ENSBMUG00000006810 #22 ENSBMUG00000006803 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156197.d ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000165247 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00960000188537 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.i.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 GALE (ENSOARG00020013234) HMGCL (ENSOARG00020013128) FUCA1 (ENSOARG00020012979) CNR2 (ENSOARG00020012960) ENSOARG00020012913 ENSOARG00020012860 SRSF10 (ENSOARG00020012698) MYOM3 (ENSOARG00020012256) IL22RA1 (ENSOARG00020012141) IFNLR1 (ENSOARG00020011823) GRHL3 (ENSOARG00020011379) STPG1 (ENSOARG00020011141) NIPAL3 (ENSOARG00020010878) RCAN3 (ENSOARG00020010543) NCMAP (ENSOARG00020010447) SRRM1 (ENSOARG00020010009) #22 ENSOARG00020009955 CLIC4 (ENSOARG00020009910) RUNX3 (ENSOARG00020009815) SYF2 (ENSOARG00020009730) RSRP1 (ENSOARG00020009704) TMEM50A (ENSOARG00020009675) ENSOARG00020009279 MACO1 (ENSOARG00020009165) LDLRAP1 (ENSOARG00020009117) MAN1C1 (ENSOARG00020008879) SELENON (ENSOARG00020008602) MTFR1L (ENSOARG00020008503) AUNIP (ENSOARG00020008461) PAQR7 (ENSOARG00020008442) STMN1 (ENSOARG00020008402) Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 11 ENSCHIG00000027165 GALE (ENSCHIG00000014259) HMGCL (ENSCHIG00000026977) FUCA1 (ENSCHIG00000005760) CNR2 (ENSCHIG00000001088) SRSF10 (ENSCHIG00000018516) ENSCHIG00000023999 MYOM3 (ENSCHIG00000008403) IL22RA1 (ENSCHIG00000025784) IFNLR1 (ENSCHIG00000023981) GRHL3 (ENSCHIG00000018972) STPG1 (ENSCHIG00000014996) NIPAL3 (ENSCHIG00000021129) RCAN3 (ENSCHIG00000021890) NCMAP (ENSCHIG00000019328) SRRM1 (ENSCHIG00000014656) #22 ENSCHIG00000007783 CLIC4 (ENSCHIG00000011710) RUNX3 (ENSCHIG00000024379) SYF2 (ENSCHIG00000020874) RSRP1 (ENSCHIG00000015600) TMEM50A (ENSCHIG00000025877) ENSCHIG00000026132 MACO1 (ENSCHIG00000026786) LDLRAP1 (ENSCHIG00000003548) MAN1C1 (ENSCHIG00000017004) SELENON (ENSCHIG00000021642) MTFR1L (ENSCHIG00000021935) AUNIP (ENSCHIG00000014935) ENSCHIG00000023552 PAFAH2 (ENSCHIG00000020000) Goat MODERN SPECIES 8 NPY2R (ENSCHIG00000010029) MAP9 (ENSCHIG00000010944) TLL1 (ENSCHIG00000024381) CPE (ENSCHIG00000025090) MSMO1 (ENSCHIG00000012999) KLHL2 (ENSCHIG00000009018) ENSCHIG00000021994 ENSCHIG00000021159 #22 TMEM192 (ENSCHIG00000025377) ENSCHIG00000019259 ENSCHIG00000010226 RBM46 (ENSCHIG00000000502) LRAT (ENSCHIG00000017020) ENSCHIG00000025097 FGG (ENSCHIG00000014747) ENSCHIG00000018253 ENSCHIG00000006146 FGB (ENSCHIG00000014958) PLRG1 (ENSCHIG00000014074) SFRP2 (ENSCHIG00000022955) RNF175 (ENSCHIG00000021987) TLR2 (ENSCHIG00000025899) TMEM131L (ENSCHIG00000020096) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00390000017845.h ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.h ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.h ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 HMGCL (ENSRFEG00010001760) FUCA1 (ENSRFEG00010001794) CNR2 (ENSRFEG00010001808) ENSRFEG00010001822 PNRC2 (ENSRFEG00010001834) SRSF10 (ENSRFEG00010001865) ENSRFEG00010001898 MYOM3 (ENSRFEG00010001916) IL22RA1 (ENSRFEG00010001972) IFNLR1 (ENSRFEG00010001999) GRHL3 (ENSRFEG00010002078) STPG1 (ENSRFEG00010002240) NIPAL3 (ENSRFEG00010002269) RCAN3 (ENSRFEG00010002325) NCMAP (ENSRFEG00010002384) SRRM1 (ENSRFEG00010002423) #22 CLIC4 (ENSRFEG00010002473) RUNX3 (ENSRFEG00010002500) SYF2 (ENSRFEG00010002536) RSRP1 (ENSRFEG00010002559) TMEM50A (ENSRFEG00010002579) ENSRFEG00010002597 MACO1 (ENSRFEG00010002636) LDLRAP1 (ENSRFEG00010002681) MAN1C1 (ENSRFEG00010002833) SELENON (ENSRFEG00010003076) MTFR1L (ENSRFEG00010003144) AUNIP (ENSRFEG00010003162) PAQR7 (ENSRFEG00010003176) STMN1 (ENSRFEG00010003199) PAFAH2 (ENSRFEG00010003219) Microbat MODERN SPECIES 1474 ENSMLUG00000012056 STPG1 (ENSMLUG00000012072) NIPAL3 (ENSMLUG00000012077) RCAN3 (ENSMLUG00000012084) NCMAP (ENSMLUG00000006243) SRRM1 (ENSMLUG00000006246) #22 CLIC4 (ENSMLUG00000001165) RUNX3 (ENSMLUG00000003395) Megabat MODERN SPECIES 1606 GRHL3 (ENSPVAG00000005827) STPG1 (ENSPVAG00000005828) NIPAL3 (ENSPVAG00000005829) RCAN3 (ENSPVAG00000005833) NCMAP (ENSPVAG00000005835) SRRM1 (ENSPVAG00000005836) #22 CLIC4 (ENSPVAG00000005838) RUNX3 (ENSPVAG00000005839) SYF2 (ENSPVAG00000005841) RSRP1 (ENSPVAG00000005842) Equus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Horse MODERN SPECIES 11 GALE (ENSECAG00000025140) HMGCL (ENSECAG00000025131) FUCA1 (ENSECAG00000024652) CNR2 (ENSECAG00000005682) PNRC2 (ENSECAG00000024629) SRSF10 (ENSECAG00000023709) ENSECAG00000050629 MYOM3 (ENSECAG00000021387) IL22RA1 (ENSECAG00000016232) IFNLR1 (ENSECAG00000013289) GRHL3 (ENSECAG00000009866) STPG1 (ENSECAG00000006581) NIPAL3 (ENSECAG00000022826) RCAN3 (ENSECAG00000020134) NCMAP (ENSECAG00000042902) SRRM1 (ENSECAG00000026981) #22 CLIC4 (ENSECAG00000016168) RUNX3 (ENSECAG00000014360) ENSECAG00000012023 ENSECAG00000010440 RSRP1 (ENSECAG00000007744) TMEM50A (ENSECAG00000022212) ENSECAG00000013140 MACO1 (ENSECAG00000002018) LDLRAP1 (ENSECAG00000019441) MAN1C1 (ENSECAG00000014244) SELENON (ENSECAG00000011412) MTFR1L (ENSECAG00000008719) ENSECAG00000051034 ENSECAG00000050748 AUNIP (ENSECAG00000007562) Donkey MODERN SPECIES 25 GALE (ENSEASG00005004377) HMGCL (ENSEASG00005004364) FUCA1 (ENSEASG00005004361) CNR2 (ENSEASG00005027682) ENSEASG00005004353 PNRC2 (ENSEASG00005028450) SRSF10 (ENSEASG00005031579) MYOM3 (ENSEASG00005004342) IL22RA1 (ENSEASG00005004336) IFNLR1 (ENSEASG00005004332) GRHL3 (ENSEASG00005004315) STPG1 (ENSEASG00005004298) NIPAL3 (ENSEASG00005004287) RCAN3 (ENSEASG00005004277) ENSEASG00005031143 SRRM1 (ENSEASG00005004270) #22 CLIC4 (ENSEASG00005004261) RUNX3 (ENSEASG00005034237) ENSEASG00005032869 ENSEASG00005004224 RSRP1 (ENSEASG00005004216) TMEM50A (ENSEASG00005038339) ENSEASG00005004204 MACO1 (ENSEASG00005004196) ENSEASG00005004192 LDLRAP1 (ENSEASG00005004188) MAN1C1 (ENSEASG00005004181) SELENON (ENSEASG00005004172) MTFR1L (ENSEASG00005004168) AUNIP (ENSEASG00005004165) PAQR7 (ENSEASG00005037634) Carnivora DUPLICATION Carnivora DUPLICATION Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.i.a #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00730000111366 ENSGT00390000012182 ENSGT00940000161825 ENSGT00940000158388 ENSGT00940000156803 ENSGT00970000197053 ENSGT00950000182974.a.a.a.a ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000165902.a.a ENSGT00940000160971 ENSGT00940000162721 ENSGT00940000164798 ENSGT00730000111080.b.i.a #22 ENSGT00940000162359 ENSGT00390000002886.b.b ENSGT00390000004226 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000002517.a.b.b.d ENSGT00940000156974 ENSGT00940000159516 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 ENSGT01070000253816.a.b Panthera ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000161825 ENSGT00390000012182 ENSGT00940000156803 ENSGT00970000197053 ENSGT00950000182974.a.a.a.a ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000165902.a.a ENSGT00940000160971 ENSGT00940000162721 ENSGT00940000164798 ENSGT00730000111080.b.i.a #22 ENSGT00940000162359 ENSGT00390000002886.b.b ENSGT00390000004226 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000002517.a.b.b.d ENSGT00940000156974 ENSGT00940000159516 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 ENSGT01070000253816.a.b Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000161825 ENSGT00390000012182 ENSGT00940000156803 ENSGT00970000197053 ENSGT00950000182974.a.a.a.a ENSGT00950000183189.a.b.b ENSGT00910000146020 ENSGT00940000165847 ENSGT00940000161248 ENSGT00940000165902.a.a ENSGT00940000160971 ENSGT00940000162721 ENSGT00940000164798 ENSGT00730000111080.b.i.a #22 ENSGT00940000162359 ENSGT00390000002886.b.b ENSGT00390000004226 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000002517.a.b.b.d ENSGT00940000156974 ENSGT00940000159516 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000162864.b ENSGT00940000160788 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000163390 ENSGT00940000153425.a.a.b.b ENSGT00940000158723 ENSGT01070000253816.a.b lion MODERN SPECIES 88 GABRE (ENSPLOG00000005892) GABRA3 (ENSPLOG00000005934) ENSPLOG00000005970 GABRQ (ENSPLOG00000005996) IDS (ENSPLOG00000006056) ENSPLOG00000006094 AFF2 (ENSPLOG00000006146) FMR1 (ENSPLOG00000006246) ENSPLOG00000006302 ENSPLOG00000006349 SLITRK2 (ENSPLOG00000006369) 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ENSGT00730000111080.b.i.b.c #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Dog MODERN SPECIES 11 PITHD1 (ENSCAFG00845014919) LYPLA2 (ENSCAFG00845014869) GALE (ENSCAFG00845014844) HMGCL (ENSCAFG00845014812) FUCA1 (ENSCAFG00845014722) CNR2 (ENSCAFG00845014681) ENSCAFG00845014636 SRSF10 (ENSCAFG00845014602) MYOM3 (ENSCAFG00845014559) IL22RA1 (ENSCAFG00845014526) IFNLR1 (ENSCAFG00845014506) GRHL3 (ENSCAFG00845014434) STPG1 (ENSCAFG00845014384) NIPAL3 (ENSCAFG00845014315) RCAN3 (ENSCAFG00845014238) SRRM1 (ENSCAFG00845014121) #22 CLIC4 (ENSCAFG00845014085) RUNX3 (ENSCAFG00845014056) ENSCAFG00845014028 ENSCAFG00845014016 RSRP1 (ENSCAFG00845013985) TMEM50A (ENSCAFG00845013963) RHCE (ENSCAFG00845013884) MACO1 (ENSCAFG00845013803) LDLRAP1 (ENSCAFG00845013761) MAN1C1 (ENSCAFG00845013691) SELENON (ENSCAFG00845013639) MTFR1L (ENSCAFG00845013602) AUNIP (ENSCAFG00845013577) PAQR7 (ENSCAFG00845013560) STMN1 (ENSCAFG00845013518) Dingo MODERN SPECIES 41 LYPLA2 (ENSCAFG00020020050) GALE (ENSCAFG00020020426) HMGCL (ENSCAFG00020020448) FUCA1 (ENSCAFG00020020481) CNR2 (ENSCAFG00020020792) ENSCAFG00020020794 SRSF10 (ENSCAFG00020020795) MYOM3 (ENSCAFG00020020819) IL22RA1 (ENSCAFG00020020838) IFNLR1 (ENSCAFG00020020851) GRHL3 (ENSCAFG00020020873) STPG1 (ENSCAFG00020020900) NIPAL3 (ENSCAFG00020020911) RCAN3 (ENSCAFG00020020917) NCMAP (ENSCAFG00020020923) ENSCAFG00020020948 #22 CLIC4 (ENSCAFG00020021078) RUNX3 (ENSCAFG00020021086) ENSCAFG00020021091 ENSCAFG00020021094 RSRP1 (ENSCAFG00020021098) TMEM50A (ENSCAFG00020021099) ENSCAFG00020021106 MACO1 (ENSCAFG00020021111) LDLRAP1 (ENSCAFG00020021133) MAN1C1 (ENSCAFG00020021157) SELENON (ENSCAFG00020021164) MTFR1L (ENSCAFG00020021179) AUNIP (ENSCAFG00020021184) PAQR7 (ENSCAFG00020021189) STMN1 (ENSCAFG00020021191) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.i.b.d #22 Dingo MODERN SPECIES 67 ENSCAFG00020000003 #22 Red fox MODERN SPECIES 92 LYPLA2 (ENSVVUG00000026893) GALE (ENSVVUG00000026896) HMGCL (ENSVVUG00000026898) FUCA1 (ENSVVUG00000026900) CNR2 (ENSVVUG00000026902) PNRC2 (ENSVVUG00000026903) SRSF10 (ENSVVUG00000026904) MYOM3 (ENSVVUG00000026907) IL22RA1 (ENSVVUG00000026914) IFNLR1 (ENSVVUG00000026916) GRHL3 (ENSVVUG00000026921) STPG1 (ENSVVUG00000026938) NIPAL3 (ENSVVUG00000026941) RCAN3 (ENSVVUG00000026946) NCMAP (ENSVVUG00000026947) SRRM1 (ENSVVUG00000026966) #22 CLIC4 (ENSVVUG00000027166) ENSVVUG00000027170 SYF2 (ENSVVUG00000027175) ENSVVUG00000027181 RSRP1 (ENSVVUG00000027183) TMEM50A (ENSVVUG00000027187) ENSVVUG00000027188 ENSVVUG00000027192 ENSVVUG00000027236 MON1B (ENSVVUG00000027241) ADAMTS18 (ENSVVUG00000027276) NUDT7 (ENSVVUG00000027350) VAT1L (ENSVVUG00000027352) CLEC3A (ENSVVUG00000027354) ENSVVUG00000027356 Felidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01100000263986 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.i.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Panthera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00490000043398 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01100000263986 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.i.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.g.a ENSGT00390000017845.g.b ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Tiger MODERN SPECIES 187 ENSPTIG00000021824 LYPLA2 (ENSPTIG00000021650) GALE (ENSPTIG00000020604) HMGCL (ENSPTIG00000019236) FUCA1 (ENSPTIG00000018718) ENSPTIG00000017652 SRSF10 (ENSPTIG00000014137) MYOM3 (ENSPTIG00000011472) IL22RA1 (ENSPTIG00000010118) IFNLR1 (ENSPTIG00000001878) GRHL3 (ENSPTIG00000018353) STPG1 (ENSPTIG00000016802) NIPAL3 (ENSPTIG00000014687) RCAN3 (ENSPTIG00000012025) NCMAP (ENSPTIG00000011435) ENSPTIG00000008778 #22 CLIC4 (ENSPTIG00000008083) ENSPTIG00000007036 ENSPTIG00000005711 TMEM50A (ENSPTIG00000004884) ENSPTIG00000015194 MACO1 (ENSPTIG00000011078) LDLRAP1 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ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01100000263986 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT01100000267028 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00910000147438 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT01100000267028 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00910000147438 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 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ENSGT00950000182844.a.b.c ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00910000147438 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a ENSGT00940000161960 ENSGT00940000156072 Chimpanzee MODERN SPECIES HMGCL (ENSPTRG00000000339) FUCA1 (ENSPTRG00000000340) CNR2 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(ENSGGOG00000012216) ENSGGOG00000039842 ENSGGOG00000024581 ENSGGOG00000043956 MACO1 (ENSGGOG00000007844) LDLRAP1 (ENSGGOG00000007769) MAN1C1 (ENSGGOG00000011458) SELENON (ENSGGOG00000011465) MTFR1L (ENSGGOG00000011477) AUNIP (ENSGGOG00000022255) Orangutan MODERN SPECIES PITHD1 (ENSPPYG00000001734) LYPLA2 (ENSPPYG00000001733) GALE (ENSPPYG00000001731) FUCA1 (ENSPPYG00000001730) CNR2 (ENSPPYG00000001729) PNRC2 (ENSPPYG00000040540) SRSF10 (ENSPPYG00000001726) MYOM3 (ENSPPYG00000001724) IL22RA1 (ENSPPYG00000001723) IFNLR1 (ENSPPYG00000001722) GRHL3 (ENSPPYG00000001721) STPG1 (ENSPPYG00000001720) NIPAL3 (ENSPPYG00000001719) RCAN3 (ENSPPYG00000001718) NCMAP (ENSPPYG00000001717) SRRM1 (ENSPPYG00000001716) #22 CLIC4 (ENSPPYG00000001715) RUNX3 (ENSPPYG00000001714) SYF2 (ENSPPYG00000001713) RSRP1 (ENSPPYG00000001712) TMEM50A (ENSPPYG00000001711) ENSPPYG00000001710 MACO1 (ENSPPYG00000001709) LDLRAP1 (ENSPPYG00000001708) MAN1C1 (ENSPPYG00000001707) SELENON (ENSPPYG00000001706) MTFR1L 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#22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00910000147109 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00910000147438 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT01100000267028 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00910000147109 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 217 CNR2 (ENSMNEG00000005492) ENSMNEG00000038158 ENSMNEG00000038324 SRSF10 (ENSMNEG00000041500) ENSMNEG00000028650 MYOM3 (ENSMNEG00000030668) IL22RA1 (ENSMNEG00000035805) IFNLR1 (ENSMNEG00000034482) ENSMNEG00000003315 ENSMNEG00000004352 GRHL3 (ENSMNEG00000028885) STPG1 (ENSMNEG00000028123) NIPAL3 (ENSMNEG00000043454) RCAN3 (ENSMNEG00000045388) NCMAP (ENSMNEG00000020288) SRRM1 (ENSMNEG00000039415) #22 CLIC4 (ENSMNEG00000032964) RUNX3 (ENSMNEG00000038114) SYF2 (ENSMNEG00000030180) RSRP1 (ENSMNEG00000031088) TMEM50A (ENSMNEG00000028657) ENSMNEG00000039154 MACO1 (ENSMNEG00000031369) LDLRAP1 (ENSMNEG00000027678) MAN1C1 (ENSMNEG00000042958) SELENON (ENSMNEG00000042835) MTFR1L (ENSMNEG00000033505) AUNIP (ENSMNEG00000029426) STMN1 (ENSMNEG00000044643) ENSMNEG00000027940 PAFAH2 (ENSMNEG00000023207) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT01100000263493.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000161621.A.a.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Rhesus MODERN SPECIES CNR2 (ENSMMUG00000004217) PNRC2 (ENSMMUG00000013783) SRSF10 (ENSMMUG00000038562) MYOM3 (ENSMMUG00000023052) IL22RA1 (ENSMMUG00000063454) IFNLR1 (ENSMMUG00000023057) GRHL3 (ENSMMUG00000004463) ENSMMUG00000063754 STPG1 (ENSMMUG00000054255) NIPAL3 (ENSMMUG00000004466) ENSMMUG00000054190 RCAN3 (ENSMMUG00000022927) ENSMMUG00000053036 ENSMMUG00000058954 NCMAP (ENSMMUG00000057675) SRRM1 (ENSMMUG00000006645) #22 CLIC4 (ENSMMUG00000002416) RUNX3 (ENSMMUG00000002420) ENSMMUG00000057953 SYF2 (ENSMMUG00000002968) RSRP1 (ENSMMUG00000002970) TMEM50A (ENSMMUG00000032217) RHCE (ENSMMUG00000011156) MACO1 (ENSMMUG00000018014) LDLRAP1 (ENSMMUG00000051142) ENSMMUG00000063601 ENSMMUG00000050620 ENSMMUG00000057092 MAN1C1 (ENSMMUG00000004788) MTFR1L (ENSMMUG00000007854) AUNIP (ENSMMUG00000007856) Crab-eating macaque MODERN SPECIES GALE (ENSMFAG00000001926) HMGCL (ENSMFAG00000001549) FUCA1 (ENSMFAG00000001050) CNR2 (ENSMFAG00000009512) PNRC2 (ENSMFAG00000041681) SRSF10 (ENSMFAG00000046011) MYOM3 (ENSMFAG00000035620) IL22RA1 (ENSMFAG00000000068) IFNLR1 (ENSMFAG00000050914) GRHL3 (ENSMFAG00000042460) ENSMFAG00000059335 STPG1 (ENSMFAG00000038760) NIPAL3 (ENSMFAG00000002140) RCAN3 (ENSMFAG00000032259) NCMAP (ENSMFAG00000060484) SRRM1 (ENSMFAG00000025726) #22 CLIC4 (ENSMFAG00000038789) RUNX3 (ENSMFAG00000031725) ENSMFAG00000052857 ENSMFAG00000062275 SYF2 (ENSMFAG00000041831) RSRP1 (ENSMFAG00000003728) TMEM50A (ENSMFAG00000033857) ENSMFAG00000042317 MACO1 (ENSMFAG00000035460) LDLRAP1 (ENSMFAG00000065124) ENSMFAG00000051195 MAN1C1 (ENSMFAG00000034191) SELENON (ENSMFAG00000036435) MTFR1L (ENSMFAG00000037554) AUNIP (ENSMFAG00000041647) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00910000147109 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00910000147438 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT01100000267028 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Olive baboon MODERN SPECIES CNR2 (ENSPANG00000025470) ENSPANG00000011013 ENSPANG00000014462 ENSPANG00000021680 ENSPANG00000037605 MYOM3 (ENSPANG00000003129) IL22RA1 (ENSPANG00000021938) IFNLR1 (ENSPANG00000014431) ENSPANG00000045239 GRHL3 (ENSPANG00000024748) STPG1 (ENSPANG00000023479) NIPAL3 (ENSPANG00000005051) ENSPANG00000043555 RCAN3 (ENSPANG00000005865) NCMAP (ENSPANG00000033614) SRRM1 (ENSPANG00000010194) #22 CLIC4 (ENSPANG00000023168) ENSPANG00000040050 RUNX3 (ENSPANG00000008140) ENSPANG00000044753 SYF2 (ENSPANG00000008139) RSRP1 (ENSPANG00000008896) TMEM50A (ENSPANG00000005864) ENSPANG00000010026 MACO1 (ENSPANG00000000594) LDLRAP1 (ENSPANG00000012319) MAN1C1 (ENSPANG00000009808) ENSPANG00000020847 ENSPANG00000038573 MTFR1L (ENSPANG00000005970) AUNIP (ENSPANG00000008189) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00910000147109 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00910000147438 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Sooty mangabey MODERN SPECIES 227 FUCA1 (ENSCATG00000030013) CNR2 (ENSCATG00000006881) ENSCATG00000033706 ENSCATG00000017417 SRSF10 (ENSCATG00000031598) ENSCATG00000017493 MYOM3 (ENSCATG00000035070) IL22RA1 (ENSCATG00000029904) IFNLR1 (ENSCATG00000026704) ENSCATG00000006798 GRHL3 (ENSCATG00000030059) STPG1 (ENSCATG00000030007) NIPAL3 (ENSCATG00000019829) RCAN3 (ENSCATG00000033944) NCMAP (ENSCATG00000017154) SRRM1 (ENSCATG00000031303) #22 CLIC4 (ENSCATG00000033748) RUNX3 (ENSCATG00000016885) SYF2 (ENSCATG00000026917) RSRP1 (ENSCATG00000033666) TMEM50A (ENSCATG00000016342) ENSCATG00000021309 MACO1 (ENSCATG00000033846) LDLRAP1 (ENSCATG00000029730) MAN1C1 (ENSCATG00000031483) SELENON (ENSCATG00000015472) MTFR1L (ENSCATG00000020697) AUNIP (ENSCATG00000019786) PAQR7 (ENSCATG00000005096) ENSCATG00000006529 STMN1 (ENSCATG00000016402) Drill MODERN SPECIES 691 HMGCL (ENSMLEG00000034060) FUCA1 (ENSMLEG00000029638) CNR2 (ENSMLEG00000005287) ENSMLEG00000029313 ENSMLEG00000032459 ENSMLEG00000016013 MYOM3 (ENSMLEG00000041098) IL22RA1 (ENSMLEG00000038286) IFNLR1 (ENSMLEG00000043990) ENSMLEG00000027677 GRHL3 (ENSMLEG00000005584) STPG1 (ENSMLEG00000040500) NIPAL3 (ENSMLEG00000043209) RCAN3 (ENSMLEG00000033022) NCMAP (ENSMLEG00000033937) SRRM1 (ENSMLEG00000038030) #22 CLIC4 (ENSMLEG00000043578) RUNX3 (ENSMLEG00000040351) SYF2 (ENSMLEG00000030248) RSRP1 (ENSMLEG00000044189) TMEM50A (ENSMLEG00000043168) ENSMLEG00000034223 MACO1 (ENSMLEG00000040422) LDLRAP1 (ENSMLEG00000032888) Vervet Monkey MODERN SPECIES 12 LYPLA2 (ENSCSAG00000000932) GALE (ENSCSAG00000000933) HMGCL (ENSCSAG00000000934) CNR2 (ENSCSAG00000000643) PNRC2 (ENSCSAG00000000644) SRSF10 (ENSCSAG00000000935) MYOM3 (ENSCSAG00000000936) IL22RA1 (ENSCSAG00000000937) IFNLR1 (ENSCSAG00000000938) GRHL3 (ENSCSAG00000000939) STPG1 (ENSCSAG00000000940) NIPAL3 (ENSCSAG00000000941) ENSCSAG00000000942 RCAN3 (ENSCSAG00000000943) NCMAP (ENSCSAG00000000944) SRRM1 (ENSCSAG00000000945) #22 CLIC4 (ENSCSAG00000000946) RUNX3 (ENSCSAG00000000947) ENSCSAG00000000645 SYF2 (ENSCSAG00000000948) RSRP1 (ENSCSAG00000000949) TMEM50A (ENSCSAG00000000950) ENSCSAG00000000951 MACO1 (ENSCSAG00000000952) LDLRAP1 (ENSCSAG00000000953) MAN1C1 (ENSCSAG00000000954) ENSCSAG00000000955 ENSCSAG00000000956 MTFR1L (ENSCSAG00000000958) AUNIP (ENSCSAG00000000959) PAQR7 (ENSCSAG00000000646) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00940000155720.j ENSGT00940000165247 ENSGT00910000147109 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00910000147438 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b 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(ENSRROG00000016432) ENSRROG00000041015 ENSRROG00000028419 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 820 FUCA1 (ENSRBIG00000023857) CNR2 (ENSRBIG00000029638) ENSRBIG00000040730 ENSRBIG00000041810 ENSRBIG00000042394 ENSRBIG00000028456 MYOM3 (ENSRBIG00000030907) IL22RA1 (ENSRBIG00000038309) IFNLR1 (ENSRBIG00000039009) ENSRBIG00000037538 GRHL3 (ENSRBIG00000010295) STPG1 (ENSRBIG00000040438) NIPAL3 (ENSRBIG00000044771) RCAN3 (ENSRBIG00000029315) NCMAP (ENSRBIG00000038049) SRRM1 (ENSRBIG00000035461) #22 CLIC4 (ENSRBIG00000039218) RUNX3 (ENSRBIG00000041200) SYF2 (ENSRBIG00000042970) RSRP1 (ENSRBIG00000030694) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01050000246666 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT01100000267028 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.a 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Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01050000246666 ENSGT00910000147109 ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT01100000267028 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.k #22 ENSGT00940000155017.y.b ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390.a ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a ENSGT00940000161960 Capuchin MODERN SPECIES 87 GALE (ENSCCAG00000016761) HMGCL (ENSCCAG00000023261) FUCA1 (ENSCCAG00000031239) ENSCCAG00000037107 SRSF10 (ENSCCAG00000022497) ENSCCAG00000037165 MYOM3 (ENSCCAG00000032018) IL22RA1 (ENSCCAG00000030616) ENSCCAG00000034363 GRHL3 (ENSCCAG00000035318) STPG1 (ENSCCAG00000021150) NIPAL3 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Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00940000162721 ENSGT00890000139472.a.b ENSGT00390000013647 ENSGT00940000162359 ENSGT00390000002886.b.b ENSGT00390000004226 ENSGT00940000158878 ENSGT00940000156974 ENSGT00940000159516 ENSGT00390000009320 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000155476.h ENSGT00940000160788 ENSGT00940000153500.a.a.k.a.b ENSGT00940000162539 ENSGT00730000111080.b.l #22 ENSGT00940000153425.b ENSGT01000000214719.a ENSGT00940000158723 ENSGT01070000253816.a.b ENSGT00530000063353.b ENSGT00390000009902 ENSGT01100000263512.b.b.b ENSGT00940000162744 ENSGT00950000182941.b.a ENSGT00940000154833.s.a 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ENSMLEG00000031538 GPR101 (ENSMLEG00000026912) ENSMLEG00000032221 #22 ENSMLEG00000028215 ENSMLEG00000021095 ENSMLEG00000020799 ARHGEF6 (ENSMLEG00000026561) CD40LG (ENSMLEG00000042928) VGLL1 (ENSMLEG00000040123) HTATSF1 (ENSMLEG00000035511) BRS3 (ENSMLEG00000034212) ADGRG4 (ENSMLEG00000029336) MAP7D3 (ENSMLEG00000028761) ENSMLEG00000006125 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 771 ENSRROG00000041543 #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000032077 ENSNLEG00000001381 LDOC1 (ENSNLEG00000002160) ENSNLEG00000034744 SOX3 (ENSNLEG00000018830) ENSNLEG00000027108 CXorf66 (ENSNLEG00000003353) ATP11C (ENSNLEG00000003317) MCF2 (ENSNLEG00000003068) F9 (ENSNLEG00000003035) ENSNLEG00000032994 ENSNLEG00000003011 ENSNLEG00000003005 ENSNLEG00000032935 GPR101 (ENSNLEG00000018828) ENSNLEG00000031294 #22 RBMX (ENSNLEG00000002964) ENSNLEG00000035535 ARHGEF6 (ENSNLEG00000002838) CD40LG (ENSNLEG00000002818) VGLL1 (ENSNLEG00000002785) HTATSF1 (ENSNLEG00000002746) BRS3 (ENSNLEG00000002740) ADGRG4 (ENSNLEG00000002681) ENSNLEG00000035956 MAP7D3 (ENSNLEG00000002667) ENSNLEG00000002560 SLC9A6 (ENSNLEG00000002336) MMGT1 (ENSNLEG00000002320) ENSNLEG00000002303 SAGE1 (ENSNLEG00000002235) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.l #22 Marmoset MODERN SPECIES 5 ENSCJAG00000047273 ENSCJAG00000074175 ENSCJAG00000047176 ENSCJAG00000048625 CHAC2 (ENSCJAG00000061560) ASB3 (ENSCJAG00000010478) ERLEC1 (ENSCJAG00000010521) PSME4 (ENSCJAG00000010300) ENSCJAG00000087191 TSPYL6 (ENSCJAG00000063293) ENSCJAG00000010291 C2orf73 (ENSCJAG00000063846) SPTBN1 (ENSCJAG00000010149) EML6 (ENSCJAG00000010107) RTN4 (ENSCJAG00000010079) ENSCJAG00000056364 #22 ENSCJAG00000073881 ENSCJAG00000083544 CLHC1 (ENSCJAG00000010057) ENSCJAG00000010052 MTIF2 (ENSCJAG00000010030) ENSCJAG00000022366 CCDC88A (ENSCJAG00000009891) CFAP36 (ENSCJAG00000009868) PPP4R3B (ENSCJAG00000009837) PNPT1 (ENSCJAG00000009740) EFEMP1 (ENSCJAG00000009690) CCDC85A (ENSCJAG00000009663) ENSCJAG00000058631 ENSCJAG00000079387 VRK2 (ENSCJAG00000009299) Tarsier MODERN SPECIES 5134 LYPLA2 (ENSTSYG00000028185) GALE (ENSTSYG00000005706) HMGCL (ENSTSYG00000000974) FUCA1 (ENSTSYG00000002869) ENSTSYG00000034899 SRSF10 (ENSTSYG00000009439) MYOM3 (ENSTSYG00000012229) IL22RA1 (ENSTSYG00000012304) ENSTSYG00000035519 IFNLR1 (ENSTSYG00000012308) GRHL3 (ENSTSYG00000006693) STPG1 (ENSTSYG00000006713) NIPAL3 (ENSTSYG00000012503) RCAN3 (ENSTSYG00000007638) NCMAP (ENSTSYG00000011530) SRRM1 (ENSTSYG00000006782) #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01100000263986 ENSGT00530000063881.a.b.i ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01100000263986 ENSGT00530000063881.a.b.i ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Mouse lemur MODERN SPECIES 11 GALE (ENSMICG00000005846) HMGCL (ENSMICG00000005852) FUCA1 (ENSMICG00000007213) ENSMICG00000033155 ENSMICG00000033993 ENSMICG00000029165 ENSMICG00000047638 MYOM3 (ENSMICG00000000527) IL22RA1 (ENSMICG00000043393) IFNLR1 (ENSMICG00000035775) GRHL3 (ENSMICG00000000542) STPG1 (ENSMICG00000000545) NIPAL3 (ENSMICG00000034277) RCAN3 (ENSMICG00000038019) ENSMICG00000006550 SRRM1 (ENSMICG00000006553) #22 CLIC4 (ENSMICG00000038442) RUNX3 (ENSMICG00000035257) SYF2 (ENSMICG00000016191) RSRP1 (ENSMICG00000016214) TMEM50A (ENSMICG00000016225) ENSMICG00000016235 MACO1 (ENSMICG00000016248) LDLRAP1 (ENSMICG00000047758) MAN1C1 (ENSMICG00000012135) ENSMICG00000012147 ENSMICG00000035407 MTFR1L (ENSMICG00000012175) ENSMICG00000001965 AUNIP (ENSMICG00000028919) STMN1 (ENSMICG00000010225) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01100000263986 ENSGT00530000063881.a.b.i ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 278 GALE (ENSPSMG00000013302) HMGCL (ENSPSMG00000013254) FUCA1 (ENSPSMG00000013214) CNR2 (ENSPSMG00000013198) ENSPSMG00000013194 ENSPSMG00000013190 SRSF10 (ENSPSMG00000013179) MYOM3 (ENSPSMG00000013152) IL22RA1 (ENSPSMG00000013103) ENSPSMG00000013097 GRHL3 (ENSPSMG00000013080) STPG1 (ENSPSMG00000013046) NIPAL3 (ENSPSMG00000013021) RCAN3 (ENSPSMG00000012990) NCMAP (ENSPSMG00000012955) SRRM1 (ENSPSMG00000012843) #22 CLIC4 (ENSPSMG00000012750) RUNX3 (ENSPSMG00000012742) SYF2 (ENSPSMG00000012731) RSRP1 (ENSPSMG00000012723) TMEM50A (ENSPSMG00000012713) ENSPSMG00000012560 MACO1 (ENSPSMG00000012398) LDLRAP1 (ENSPSMG00000012341) MAN1C1 (ENSPSMG00000012288) SELENON (ENSPSMG00000012249) MTFR1L (ENSPSMG00000012241) AUNIP (ENSPSMG00000012224) PAQR7 (ENSPSMG00000012218) STMN1 (ENSPSMG00000012209) PAFAH2 (ENSPSMG00000012192) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 481 PITHD1 (ENSPCOG00000013971) ENSPCOG00000025740 GALE (ENSPCOG00000013051) HMGCL (ENSPCOG00000016623) FUCA1 (ENSPCOG00000015161) ENSPCOG00000018607 SRSF10 (ENSPCOG00000022379) MYOM3 (ENSPCOG00000021576) IL22RA1 (ENSPCOG00000012770) ENSPCOG00000020307 GRHL3 (ENSPCOG00000023099) STPG1 (ENSPCOG00000024230) NIPAL3 (ENSPCOG00000019697) ENSPCOG00000016756 NCMAP (ENSPCOG00000015619) SRRM1 (ENSPCOG00000021311) #22 CLIC4 (ENSPCOG00000016950) RUNX3 (ENSPCOG00000023993) Bushbaby MODERN SPECIES 271 LYPLA2 (ENSOGAG00000032260) GALE (ENSOGAG00000009375) HMGCL (ENSOGAG00000009381) FUCA1 (ENSOGAG00000009383) CNR2 (ENSOGAG00000011818) PNRC2 (ENSOGAG00000024747) SRSF10 (ENSOGAG00000015374) MYOM3 (ENSOGAG00000010702) IL22RA1 (ENSOGAG00000024442) ENSOGAG00000010712 GRHL3 (ENSOGAG00000011027) STPG1 (ENSOGAG00000011033) NIPAL3 (ENSOGAG00000011036) RCAN3 (ENSOGAG00000015460) NCMAP (ENSOGAG00000008361) SRRM1 (ENSOGAG00000010210) #22 ENSOGAG00000030641 ENSOGAG00000025062 CLIC4 (ENSOGAG00000014620) RUNX3 (ENSOGAG00000025633) SYF2 (ENSOGAG00000009962) RSRP1 (ENSOGAG00000011942) TMEM50A (ENSOGAG00000028512) ENSOGAG00000011983 MACO1 (ENSOGAG00000033230) LDLRAP1 (ENSOGAG00000002101) MAN1C1 (ENSOGAG00000002102) ENSOGAG00000024972 MTFR1L (ENSOGAG00000002104) AUNIP (ENSOGAG00000034108) PAQR7 (ENSOGAG00000024814) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Tree shrew MODERN SPECIES 7692 NCMAP (ENSTBEG00000000111) SRRM1 (ENSTBEG00000000100) #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017.w.a ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017.w.a.a ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.v ENSGT00390000005233.a Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017.w.a.a ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a.v ENSGT00390000005233.a Squirrel MODERN SPECIES 74 LYPLA2 (ENSSTOG00000011918) GALE (ENSSTOG00000011927) HMGCL (ENSSTOG00000011933) FUCA1 (ENSSTOG00000011938) CNR2 (ENSSTOG00000011946) PNRC2 (ENSSTOG00000000953) SRSF10 (ENSSTOG00000000956) MYOM3 (ENSSTOG00000000934) IL22RA1 (ENSSTOG00000001510) IFNLR1 (ENSSTOG00000022523) GRHL3 (ENSSTOG00000023529) STPG1 (ENSSTOG00000020596) NIPAL3 (ENSSTOG00000002868) RCAN3 (ENSSTOG00000002884) NCMAP (ENSSTOG00000014647) SRRM1 (ENSSTOG00000014640) #22 ENSSTOG00000002184 RUNX3 (ENSSTOG00000022471) SYF2 (ENSSTOG00000023984) TMEM50A (ENSSTOG00000022246) ENSSTOG00000013643 MACO1 (ENSSTOG00000013650) LDLRAP1 (ENSSTOG00000019764) ENSSTOG00000034000 SELENON (ENSSTOG00000032252) MTFR1L (ENSSTOG00000023300) AUNIP (ENSSTOG00000003781) PAQR7 (ENSSTOG00000003791) ENSSTOG00000021708 PAFAH2 (ENSSTOG00000002899) EXTL1 (ENSSTOG00000022136) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 92 SRRM1 (ENSUPAG00010021790) #22 ENSUPAG00010021786 RUNX3 (ENSUPAG00010021783) SYF2 (ENSUPAG00010021777) RSRP1 (ENSUPAG00010021775) TMEM50A (ENSUPAG00010021773) ENSUPAG00010021772 MACO1 (ENSUPAG00010021769) MAN1C1 (ENSUPAG00010021756) SELENON (ENSUPAG00010021750) MTFR1L (ENSUPAG00010021746) AUNIP (ENSUPAG00010021743) PAQR7 (ENSUPAG00010021741) ENSUPAG00010021739 PAFAH2 (ENSUPAG00010021733) EXTL1 (ENSUPAG00010021721) Alpin marmot MODERN SPECIES 15 GALE (ENSMMMG00000018757) HMGCL (ENSMMMG00000018659) FUCA1 (ENSMMMG00000018637) CNR2 (ENSMMMG00000018629) ENSMMMG00000018624 PNRC2 (ENSMMMG00000018622) SRSF10 (ENSMMMG00000018592) MYOM3 (ENSMMMG00000018557) IL22RA1 (ENSMMMG00000018545) IFNLR1 (ENSMMMG00000018513) GRHL3 (ENSMMMG00000018480) STPG1 (ENSMMMG00000018472) NIPAL3 (ENSMMMG00000018457) RCAN3 (ENSMMMG00000018455) NCMAP (ENSMMMG00000018395) SRRM1 (ENSMMMG00000018360) #22 CLIC4 (ENSMMMG00000018318) ENSMMMG00000018312 ENSMMMG00000018294 SYF2 (ENSMMMG00000018261) RSRP1 (ENSMMMG00000018254) TMEM50A (ENSMMMG00000018240) ENSMMMG00000015263 MACO1 (ENSMMMG00000015231) LDLRAP1 (ENSMMMG00000015218) MAN1C1 (ENSMMMG00000014472) ENSMMMG00000014449 ENSMMMG00000014442 MTFR1L (ENSMMMG00000014427) AUNIP (ENSMMMG00000014413) PAQR7 (ENSMMMG00000014408) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES HMGCL (ENSSVLG00005000529) FUCA1 (ENSSVLG00005000561) CNR2 (ENSSVLG00005000589) ENSSVLG00005000604 PNRC2 (ENSSVLG00005000620) SRSF10 (ENSSVLG00005000670) ENSSVLG00005000730 MYOM3 (ENSSVLG00005000787) IL22RA1 (ENSSVLG00005000877) IFNLR1 (ENSSVLG00005000894) GRHL3 (ENSSVLG00005000932) STPG1 (ENSSVLG00005001000) NIPAL3 (ENSSVLG00005001037) RCAN3 (ENSSVLG00005001080) NCMAP (ENSSVLG00005001114) SRRM1 (ENSSVLG00005001180) #22 ENSSVLG00005001230 RUNX3 (ENSSVLG00005001263) SYF2 (ENSSVLG00005001292) RSRP1 (ENSSVLG00005001313) TMEM50A (ENSSVLG00005001335) ENSSVLG00005001369 MACO1 (ENSSVLG00005001436) LDLRAP1 (ENSSVLG00005001468) MAN1C1 (ENSSVLG00005001513) ENSSVLG00005001587 MTFR1L (ENSSVLG00005001597) AUNIP (ENSSVLG00005001627) PAQR7 (ENSSVLG00005001646) STMN1 (ENSSVLG00005001664) PAFAH2 (ENSSVLG00005001686) Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha DUPLICATION Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450.lc ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 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(ENSODEG00000014361) FUCA1 (ENSODEG00000013698) CNR2 (ENSODEG00000014788) ENSODEG00000020207 MYOM3 (ENSODEG00000014259) IL22RA1 (ENSODEG00000015339) IFNLR1 (ENSODEG00000014258) GRHL3 (ENSODEG00000014148) STPG1 (ENSODEG00000014432) NIPAL3 (ENSODEG00000015480) RCAN3 (ENSODEG00000014403) NCMAP (ENSODEG00000014196) ENSODEG00000013381 #22 ENSODEG00000014994 CLIC4 (ENSODEG00000015014) RUNX3 (ENSODEG00000013557) ENSODEG00000020175 ENSODEG00000014338 RSRP1 (ENSODEG00000014609) ENSODEG00000014039 ENSODEG00000013632 MACO1 (ENSODEG00000014747) LDLRAP1 (ENSODEG00000013216) MAN1C1 (ENSODEG00000013579) SELENON (ENSODEG00000014831) MTFR1L (ENSODEG00000013501) AUNIP (ENSODEG00000013714) PAQR7 (ENSODEG00000020104) Degu MODERN SPECIES 93 KANSL3 (ENSODEG00000009383) ENSODEG00000006964 FER1L5 (ENSODEG00000007379) LMAN2L (ENSODEG00000007336) CNNM4 (ENSODEG00000008343) ENSODEG00000007080 ANKRD23 (ENSODEG00000007390) ANKRD39 (ENSODEG00000008651) SEMA4C (ENSODEG00000007356) ENSODEG00000007357 ACTR1B (ENSODEG00000006779) ZAP70 (ENSODEG00000008410) ENSODEG00000008642 ENSODEG00000007216 ENSODEG00000006553 ENSODEG00000007221 #22 ENSODEG00000006920 ENSODEG00000007778 CNGA3 (ENSODEG00000008323) INPP4A (ENSODEG00000007690) COA5 (ENSODEG00000007739) UNC50 (ENSODEG00000008280) ENSODEG00000006992 ENSODEG00000007837 TSGA10 (ENSODEG00000008545) LIPT1 (ENSODEG00000019699) ENSODEG00000010546 LYG2 (ENSODEG00000010732) LYG1 (ENSODEG00000009277) ENSODEG00000019509 ENSODEG00000008190 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 159 LYPLA2 (ENSCLAG00000010904) GALE (ENSCLAG00000011611) HMGCL (ENSCLAG00000013961) FUCA1 (ENSCLAG00000013057) CNR2 (ENSCLAG00000014048) ENSCLAG00000014105 ENSCLAG00000015555 MYOM3 (ENSCLAG00000014590) IL22RA1 (ENSCLAG00000014220) IFNLR1 (ENSCLAG00000011350) GRHL3 (ENSCLAG00000011858) STPG1 (ENSCLAG00000010905) NIPAL3 (ENSCLAG00000008287) RCAN3 (ENSCLAG00000008751) NCMAP (ENSCLAG00000009955) SRRM1 (ENSCLAG00000014592) #22 CLIC4 (ENSCLAG00000007919) RUNX3 (ENSCLAG00000010119) SYF2 (ENSCLAG00000008474) ENSCLAG00000008988 ENSCLAG00000009626 ENSCLAG00000010154 MACO1 (ENSCLAG00000010148) LDLRAP1 (ENSCLAG00000013635) MAN1C1 (ENSCLAG00000013310) SELENON (ENSCLAG00000009093) MTFR1L (ENSCLAG00000012749) AUNIP (ENSCLAG00000014153) PAQR7 (ENSCLAG00000017977) STMN1 (ENSCLAG00000014558) PAFAH2 (ENSCLAG00000010400) Guinea pig MODERN SPECIES 25 LYPLA2 (ENSCPOG00000033750) GALE (ENSCPOG00000031845) HMGCL (ENSCPOG00000008645) FUCA1 (ENSCPOG00000003535) CNR2 (ENSCPOG00000003537) PNRC2 (ENSCPOG00000037509) SRSF10 (ENSCPOG00000034102) MYOM3 (ENSCPOG00000008018) IL22RA1 (ENSCPOG00000024764) IFNLR1 (ENSCPOG00000034175) GRHL3 (ENSCPOG00000008841) STPG1 (ENSCPOG00000008857) NIPAL3 (ENSCPOG00000032188) RCAN3 (ENSCPOG00000003363) NCMAP (ENSCPOG00000037048) SRRM1 (ENSCPOG00000015594) #22 CLIC4 (ENSCPOG00000038478) RUNX3 (ENSCPOG00000038589) SYF2 (ENSCPOG00000005326) RSRP1 (ENSCPOG00000014651) TMEM50A (ENSCPOG00000033045) ENSCPOG00000020328 MACO1 (ENSCPOG00000012618) LDLRAP1 (ENSCPOG00000038658) MAN1C1 (ENSCPOG00000012627) SELENON (ENSCPOG00000030792) MTFR1L (ENSCPOG00000030432) AUNIP (ENSCPOG00000026702) PAQR7 (ENSCPOG00000038910) STMN1 (ENSCPOG00000035267) PAFAH2 (ENSCPOG00000003472) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 FUCA1 (ENSHGLG00000011473) CNR2 (ENSHGLG00000042644) PNRC2 (ENSHGLG00000044854) SRSF10 (ENSHGLG00000046721) ENSHGLG00000033166 MYOM3 (ENSHGLG00000012080) IL22RA1 (ENSHGLG00000013047) IFNLR1 (ENSHGLG00000048210) ENSHGLG00000032213 GRHL3 (ENSHGLG00000012928) STPG1 (ENSHGLG00000009919) NIPAL3 (ENSHGLG00000047881) RCAN3 (ENSHGLG00000010305) ENSHGLG00000045032 ENSHGLG00000037226 ENSHGLG00000017105 #22 ENSHGLG00000050374 RUNX3 (ENSHGLG00000043838) ENSHGLG00000045581 SYF2 (ENSHGLG00000044606) TMEM50A (ENSHGLG00000017064) ENSHGLG00000010472 MACO1 (ENSHGLG00000010882) LDLRAP1 (ENSHGLG00000012177) MAN1C1 (ENSHGLG00000043962) SELENON (ENSHGLG00000010947) MTFR1L (ENSHGLG00000017097) AUNIP (ENSHGLG00000035083) PAQR7 (ENSHGLG00000012421) ENSHGLG00000012564 ENSHGLG00000014002 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.m.b #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 ENSHGLG00000011602 ENSHGLG00000043091 ENSHGLG00000012034 ENSHGLG00000012179 ENSHGLG00000012324 SUCNR1 (ENSHGLG00000012430) ENSHGLG00000045627 ENSHGLG00000032291 MBNL1 (ENSHGLG00000012911) P2RY1 (ENSHGLG00000012962) ENSHGLG00000013739 RAP2B (ENSHGLG00000032240) ARHGEF26 (ENSHGLG00000017391) DHX36 (ENSHGLG00000017407) GPR149 (ENSHGLG00000013607) ENSHGLG00000042929 #22 ENSHGLG00000049890 ENSHGLG00000039740 ENSHGLG00000041038 MME (ENSHGLG00000013970) ENSHGLG00000035877 PLCH1 (ENSHGLG00000017434) ENSHGLG00000019192 SLC33A1 (ENSHGLG00000042989) ENSHGLG00000019482 ENSHGLG00000019405 ENSHGLG00000039018 KCNAB1 (ENSHGLG00000019332) SSR3 (ENSHGLG00000037144) ENSHGLG00000020605 ENSHGLG00000010960 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 162 ENSGT00730000111080.b.n #22 ENSGT00910000148394 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 20 ZNF565 (ENSHGLG00000011257) ENSHGLG00000011608 ENSHGLG00000017642 ENSHGLG00000014291 ENSHGLG00000048732 ENSHGLG00000044190 ZNF260 (ENSHGLG00000018250) ZNF566 (ENSHGLG00000043971) ENSHGLG00000017623 ENSHGLG00000015653 ENSHGLG00000014373 ENSHGLG00000050918 ENSHGLG00000048522 ZNF570 (ENSHGLG00000035445) ZNF569 (ENSHGLG00000015479) ENSHGLG00000021151 #22 ENSHGLG00000036251 ZNF527 (ENSHGLG00000014344) ZNF383 (ENSHGLG00000035360) ENSHGLG00000014546 ENSHGLG00000014646 ENSHGLG00000046953 ENSHGLG00000014176 ENSHGLG00000035688 ENSHGLG00000042254 ENSHGLG00000039259 ENSHGLG00000050653 ENSHGLG00000050735 ENSHGLG00000049196 ENSHGLG00000044662 ENSHGLG00000014474 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.n #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.n #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 175 SLC26A7 (ENSODEG00000005374) RUNX1T1 (ENSODEG00000005303) TRIQK (ENSODEG00000005257) CIBAR1 (ENSODEG00000005214) RBM12B (ENSODEG00000019204) TMEM67 (ENSODEG00000005116) PDP1 (ENSODEG00000005061) CDH17 (ENSODEG00000004993) ENSODEG00000004970 GEM (ENSODEG00000004933) ENSODEG00000018916 ENSODEG00000018878 ENSODEG00000002650 ENSODEG00000018816 VIRMA (ENSODEG00000002449) ENSODEG00000002361 #22 ESRP1 (ENSODEG00000002165) DPY19L4 (ENSODEG00000003026) ENSODEG00000018890 INTS8 (ENSODEG00000002766) ENSODEG00000002694 TP53INP1 (ENSODEG00000002683) ENSODEG00000002658 ENSODEG00000002493 NDUFAF6 (ENSODEG00000002477) ENSODEG00000002462 CFAP418 (ENSODEG00000002430) GDF6 (ENSODEG00000002393) MTERF3 (ENSODEG00000002232) PTDSS1 (ENSODEG00000004210) SDC2 (ENSODEG00000004200) Degu MODERN SPECIES 63 RRAGD (ENSODEG00000007559) UBE2J1 (ENSODEG00000009168) GABRR2 (ENSODEG00000007212) ENSODEG00000019483 GABRR1 (ENSODEG00000008074) PM20D2 (ENSODEG00000008228) SRSF12 (ENSODEG00000009174) ENSODEG00000007177 ENSODEG00000019379 RNGTT (ENSODEG00000007302) ENSODEG00000019444 ENSODEG00000007826 CNR1 (ENSODEG00000008433) ENSODEG00000019610 SPACA1 (ENSODEG00000009288) ENSODEG00000019473 #22 ENSODEG00000019522 AKIRIN2 (ENSODEG00000008203) ORC3 (ENSODEG00000008073) RARS2 (ENSODEG00000007822) SLC35A1 (ENSODEG00000009238) CFAP206 (ENSODEG00000007616) ENSODEG00000008775 ENSODEG00000009562 C6orf163 (ENSODEG00000010057) SMIM8 (ENSODEG00000007885) ZNF292 (ENSODEG00000007524) ENSODEG00000011652 Cga (ENSODEG00000009510) HTR1E (ENSODEG00000019516) ENSODEG00000019529 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT01080000259389 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Kangaroo rat MODERN SPECIES 325 Lypla2 (ENSDORG00000011120) Gale (ENSDORG00000011121) Hmgcl (ENSDORG00000011123) Fuca1 (ENSDORG00000000643) Cnr2 (ENSDORG00000025264) Pnrc2 (ENSDORG00000009138) Srsf10 (ENSDORG00000024574) Myom3 (ENSDORG00000013358) Il22ra1 (ENSDORG00000029927) Ifnlr1 (ENSDORG00000029083) Grhl3 (ENSDORG00000001381) Stpg1 (ENSDORG00000012246) Nipal3 (ENSDORG00000015286) Rcan3 (ENSDORG00000007662) ENSDORG00000002716 ENSDORG00000028601 #22 Clic4 (ENSDORG00000008730) Runx3 (ENSDORG00000024774) Syf2 (ENSDORG00000001274) Rsrp1 (ENSDORG00000025796) Tmem50a (ENSDORG00000013839) Rhd (ENSDORG00000013842) Maco1 (ENSDORG00000000638) Ldlrap1 (ENSDORG00000000640) Man1c1 (ENSDORG00000013005) Selenon (ENSDORG00000004349) Mtfr1l (ENSDORG00000010828) Aunip (ENSDORG00000010829) Paqr7 (ENSDORG00000004272) ENSDORG00000001797 Pafah2 (ENSDORG00000003820) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c 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ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 2 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ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017.t ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Gale (ENSCGRG00001004708) Hmgcl (ENSCGRG00001008106) Fuca1 (ENSCGRG00001023492) Cnr2 (ENSCGRG00001001683) ENSCGRG00001014818 Pnrc2 (ENSCGRG00001012333) Srsf10 (ENSCGRG00001017946) Myom3 (ENSCGRG00001025061) Il22ra1 (ENSCGRG00001016910) Ifnlr1 (ENSCGRG00001021656) Grhl3 (ENSCGRG00001012724) Stpg1 (ENSCGRG00001019578) Nipal3 (ENSCGRG00001009567) Rcan3 (ENSCGRG00001021122) Ncmap (ENSCGRG00001023666) ENSCGRG00001014174 #22 Clic4 (ENSCGRG00001015756) Runx3 (ENSCGRG00001017975) Syf2 (ENSCGRG00001020733) Rsrp1 (ENSCGRG00001024049) ENSCGRG00001024623 Rhd 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Fggy (ENSCGRG00001024005) Golden Hamster MODERN SPECIES 709 Lypla2 (ENSMAUG00000015204) Gale (ENSMAUG00000016163) Cnr2 (ENSMAUG00000009347) ENSMAUG00000020799 Srsf10 (ENSMAUG00000019452) Myom3 (ENSMAUG00000011597) Il22ra1 (ENSMAUG00000022084) Ifnlr1 (ENSMAUG00000009183) Grhl3 (ENSMAUG00000000979) Stpg1 (ENSMAUG00000012732) Nipal3 (ENSMAUG00000021437) Rcan3 (ENSMAUG00000002939) Ncmap (ENSMAUG00000014750) Srrm1 (ENSMAUG00000015705) #22 Clic4 (ENSMAUG00000016358) Runx3 (ENSMAUG00000010386) Syf2 (ENSMAUG00000018974) Rsrp1 (ENSMAUG00000021410) Tmem50a (ENSMAUG00000018026) Rhd (ENSMAUG00000010533) Maco1 (ENSMAUG00000014109) Ldlrap1 (ENSMAUG00000018853) Man1c1 (ENSMAUG00000018414) Mtfr1l (ENSMAUG00000006161) Aunip (ENSMAUG00000015763) Paqr7 (ENSMAUG00000009753) Stmn1 (ENSMAUG00000011932) Pafah2 (ENSMAUG00000009805) Extl1 (ENSMAUG00000012590) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 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ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 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ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Mus_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00990000204354 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a spretus MODERN SPECIES 13 Lypla2 (MGP_SPRETEiJ_G0027631) Gale (MGP_SPRETEiJ_G0027630) Hmgcl (MGP_SPRETEiJ_G0027629) Fuca1 (MGP_SPRETEiJ_G0027628) Cnr2 (MGP_SPRETEiJ_G0027627) Pnrc2 (MGP_SPRETEiJ_G0027626) MGP_SPRETEiJ_G0027625 Myom3 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Myom3 (ENSJJAG00000001690) Il22ra1 (ENSJJAG00000017430) Ifnlr1 (ENSJJAG00000011888) ENSJJAG00000016170 Stpg1 (ENSJJAG00000007414) Nipal3 (ENSJJAG00000015416) Rcan3 (ENSJJAG00000011623) Srrm1 (ENSJJAG00000018643) #22 Clic4 (ENSJJAG00000023938) Runx3 (ENSJJAG00000003722) Syf2 (ENSJJAG00000013301) Rsrp1 (ENSJJAG00000001101) Maco1 (ENSJJAG00000002912) Ldlrap1 (ENSJJAG00000009407) Man1c1 (ENSJJAG00000011381) Selenon (ENSJJAG00000007206) Mtfr1l (ENSJJAG00000005254) Paqr7 (ENSJJAG00000004766) Stmn1 (ENSJJAG00000023623) Pafah2 (ENSJJAG00000008153) Slc30a2 (ENSJJAG00000012135) Trim63 (ENSJJAG00000002973) Pdik1l (ENSJJAG00000008196) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450.b ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.c ENSGT00390000017845.d ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450.b ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.c ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 Sloth MODERN SPECIES 2594 SRRM1 (ENSCHOG00000000027) #22 Armadillo MODERN SPECIES 2239 LYPLA2 (ENSDNOG00000011285) GALE (ENSDNOG00000011299) HMGCL (ENSDNOG00000038631) ENSDNOG00000011323 CNR2 (ENSDNOG00000011342) PNRC2 (ENSDNOG00000023948) ENSDNOG00000044047 MYOM3 (ENSDNOG00000012772) IL22RA1 (ENSDNOG00000045320) ENSDNOG00000038570 GRHL3 (ENSDNOG00000013939) STPG1 (ENSDNOG00000032430) NIPAL3 (ENSDNOG00000014003) RCAN3 (ENSDNOG00000011357) NCMAP (ENSDNOG00000000914) SRRM1 (ENSDNOG00000049141) #22 ENSDNOG00000042215 RUNX3 (ENSDNOG00000043493) SYF2 (ENSDNOG00000047605) ENSDNOG00000035528 TMEM50A (ENSDNOG00000036245) ENSDNOG00000017485 MACO1 (ENSDNOG00000005372) LDLRAP1 (ENSDNOG00000025498) MAN1C1 (ENSDNOG00000046261) SELENON (ENSDNOG00000015062) MTFR1L (ENSDNOG00000015087) AUNIP (ENSDNOG00000044053) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450.b ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.c ENSGT00390000017845.d ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Tenrec MODERN SPECIES 7509 NCMAP (ENSETEG00000006813) SRRM1 (ENSETEG00000006817) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450.b ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845.c ENSGT00390000017845.d ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Elephant MODERN SPECIES 332 LYPLA2 (ENSLAFG00000017315) GALE (ENSLAFG00000017319) HMGCL (ENSLAFG00000017326) FUCA1 (ENSLAFG00000015305) CNR2 (ENSLAFG00000012676) PNRC2 (ENSLAFG00000014701) SRSF10 (ENSLAFG00000026905) MYOM3 (ENSLAFG00000003712) IL22RA1 (ENSLAFG00000003722) IFNLR1 (ENSLAFG00000031890) GRHL3 (ENSLAFG00000001618) STPG1 (ENSLAFG00000001619) NIPAL3 (ENSLAFG00000012374) RCAN3 (ENSLAFG00000017638) NCMAP (ENSLAFG00000014893) SRRM1 (ENSLAFG00000013830) #22 CLIC4 (ENSLAFG00000017470) RUNX3 (ENSLAFG00000008382) ENSLAFG00000023150 ENSLAFG00000030814 RSRP1 (ENSLAFG00000022865) TMEM50A (ENSLAFG00000014756) ENSLAFG00000014759 MACO1 (ENSLAFG00000001213) LDLRAP1 (ENSLAFG00000001214) MAN1C1 (ENSLAFG00000004643) SELENON (ENSLAFG00000021561) MTFR1L (ENSLAFG00000002306) AUNIP (ENSLAFG00000022386) PAQR7 (ENSLAFG00000000368) ENSLAFG00000006089 Hyrax MODERN SPECIES 6303 ENSPCAG00000015132 SRRM1 (ENSPCAG00000015138) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156197 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027.a.b ENSGT00940000164027.a.a ENSGT00940000164027.b ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000003280 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c.j 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ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027.a.b ENSGT00940000164027.a.a ENSGT00940000164027.b ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b.f ENSGT00950000183215.c.b.e Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c.j ENSGT00440000035378.c.i ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027.a.b ENSGT00940000164027.a.a ENSGT00940000164027.b ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b.e ENSGT00390000003280 Common wonbat MODERN SPECIES 1084 HMGCL (ENSVURG00010023158) ENSVURG00010023154 ENSVURG00010023134 CNR2 (ENSVURG00010023132) PNRC2 (ENSVURG00010023129) SRSF10 (ENSVURG00010023125) MYOM3 (ENSVURG00010023115) IL22RA1 (ENSVURG00010023112) ENSVURG00010023111 ENSVURG00010023110 GRHL3 (ENSVURG00010023106) STPG1 (ENSVURG00010023104) NIPAL3 (ENSVURG00010023099) RCAN3 (ENSVURG00010023097) NCMAP (ENSVURG00010023095) SRRM1 (ENSVURG00010023088) #22 CLIC4 (ENSVURG00010023080) ENSVURG00010023073 RUNX3 (ENSVURG00010023071) koala MODERN SPECIES 14 HMGCL (ENSPCIG00000014290) ENSPCIG00000014280 ENSPCIG00000014285 CNR2 (ENSPCIG00000014279) PNRC2 (ENSPCIG00000014271) SRSF10 (ENSPCIG00000014270) MYOM3 (ENSPCIG00000014267) IL22RA1 (ENSPCIG00000014266) ENSPCIG00000014263 ENSPCIG00000014262 GRHL3 (ENSPCIG00000014261) STPG1 (ENSPCIG00000032916) NIPAL3 (ENSPCIG00000035044) RCAN3 (ENSPCIG00000014253) ENSPCIG00000014248 SRRM1 (ENSPCIG00000009214) #22 CLIC4 (ENSPCIG00000014243) RUNX3 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MODERN SPECIES 3 ENSMODG00000012842 PITHD1 (ENSMODG00000012852) LYPLA2 (ENSMODG00000012872) HMGCL (ENSMODG00000012891) FUCA1 (ENSMODG00000013008) CNR2 (ENSMODG00000023904) SRSF10 (ENSMODG00000013020) MYOM3 (ENSMODG00000013043) ENSMODG00000013049 ENSMODG00000013053 GRHL3 (ENSMODG00000013064) STPG1 (ENSMODG00000013076) NIPAL3 (ENSMODG00000013086) RCAN3 (ENSMODG00000013089) NCMAP (ENSMODG00000051523) SRRM1 (ENSMODG00000013861) #22 CLIC4 (ENSMODG00000013939) ENSMODG00000046366 ENSMODG00000013951 RSRP1 (ENSMODG00000013955) TMEM50A (ENSMODG00000038632) ENSMODG00000013982 MACO1 (ENSMODG00000013985) LDLRAP1 (ENSMODG00000013990) ENSMODG00000049139 MAN1C1 (ENSMODG00000013999) ENSMODG00000025591 ENSMODG00000014009 ENSMODG00000037388 MTFR1L (ENSMODG00000014017) ENSMODG00000014020 Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 7 HMGCL (ENSOANG00000045129) FUCA1 (ENSOANG00000036041) CNR2 (ENSOANG00000006844) ENSOANG00000046602 PNRC2 (ENSOANG00000044006) SRSF10 (ENSOANG00000004308) ENSOANG00000049301 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ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 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SLC30A2 (ENSNSUG00000013824) TRIM63 (ENSNSUG00000013825) Eastern brown snake MODERN SPECIES 19 HMGCL (ENSPTXG00000001730) FUCA1 (ENSPTXG00000001724) CNR2 (ENSPTXG00000001721) PNRC2 (ENSPTXG00000001718) SRSF10 (ENSPTXG00000001715) ENSPTXG00000001714 ENSPTXG00000001712 ENSPTXG00000001710 MYOM3 (ENSPTXG00000001531) ENSPTXG00000001501 GRHL3 (ENSPTXG00000001494) STPG1 (ENSPTXG00000001488) NIPAL3 (ENSPTXG00000005620) RCAN3 (ENSPTXG00000005619) NCMAP (ENSPTXG00000005618) SRRM1 (ENSPTXG00000005617) #22 CLIC4 (ENSPTXG00000005616) RUNX3 (ENSPTXG00000005594) SYF2 (ENSPTXG00000005593) ENSPTXG00000005592 TMEM50A (ENSPTXG00000005591) ENSPTXG00000005590 MACO1 (ENSPTXG00000005589) LDLRAP1 (ENSPTXG00000005587) MAN1C1 (ENSPTXG00000005585) ENSPTXG00000005584 ENSPTXG00000005583 MTFR1L (ENSPTXG00000005582) PAQR7 (ENSPTXG00000005581) STMN1 (ENSPTXG00000005580) PAFAH2 (ENSPTXG00000005577) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5975 NCMAP (ENSLLTG00000005242) SRRM1 (ENSLLTG00000005216) #22 CLIC4 (ENSLLTG00000005194) Indian cobra MODERN SPECIES 11 CNR2 (ENSNNAG00000006837) PNRC2 (ENSNNAG00000006845) SRSF10 (ENSNNAG00000006857) ENSNNAG00000006871 ENSNNAG00000006880 ENSNNAG00000006903 MYOM3 (ENSNNAG00000006942) IL22RA1 (ENSNNAG00000007030) ENSNNAG00000007050 GRHL3 (ENSNNAG00000007074) STPG1 (ENSNNAG00000007104) ENSNNAG00000007158 NIPAL3 (ENSNNAG00000007183) RCAN3 (ENSNNAG00000007243) NCMAP (ENSNNAG00000007263) ENSNNAG00000007281 #22 ENSNNAG00000007299 CLIC4 (ENSNNAG00000007318) RUNX3 (ENSNNAG00000007339) SYF2 (ENSNNAG00000007366) TMEM50A (ENSNNAG00000007409) ENSNNAG00000007432 MACO1 (ENSNNAG00000007460) LDLRAP1 (ENSNNAG00000007488) MAN1C1 (ENSNNAG00000007503) ENSNNAG00000007566 ENSNNAG00000007629 MTFR1L (ENSNNAG00000007649) PAQR7 (ENSNNAG00000007699) STMN1 (ENSNNAG00000007722) PAFAH2 (ENSNNAG00000007761) Lizard MODERN SPECIES 1076 ENSACAG00000001138 FGR (ENSACAG00000000905) AHDC1 (ENSACAG00000017829) WASF2 (ENSACAG00000017831) MAP3K6 (ENSACAG00000017835) SYTL1 (ENSACAG00000017840) ENSACAG00000017843 ENSACAG00000017844 RCAN3 (ENSACAG00000017846) SRRM1 (ENSACAG00000017848) #22 CLIC4 (ENSACAG00000017852) RUNX3 (ENSACAG00000017855) tuatara MODERN SPECIES 334 PNRC2 (ENSSPUG00000016233) SRSF10 (ENSSPUG00000016224) ENSSPUG00000016216 ENSSPUG00000016203 MYOM3 (ENSSPUG00000016083) ENSSPUG00000016057 IFNLR1 (ENSSPUG00000016046) GRHL3 (ENSSPUG00000016022) STPG1 (ENSSPUG00000015972) NIPAL3 (ENSSPUG00000015957) RCAN3 (ENSSPUG00000015937) NCMAP (ENSSPUG00000015925) SRRM1 (ENSSPUG00000015890) #22 CLIC4 (ENSSPUG00000015765) RUNX3 (ENSSPUG00000015722) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000160519 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l 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MODERN SPECIES 57 LYPLA2 (ENSCPRG00005016486) GALE (ENSCPRG00005016501) HMGCL (ENSCPRG00005016550) FUCA1 (ENSCPRG00005016551) CNR2 (ENSCPRG00005016552) PNRC2 (ENSCPRG00005016555) SRSF10 (ENSCPRG00005016560) ENSCPRG00005016562 MYOM3 (ENSCPRG00005016575) ENSCPRG00005016621 GRHL3 (ENSCPRG00005016628) STPG1 (ENSCPRG00005016652) NIPAL3 (ENSCPRG00005016660) RCAN3 (ENSCPRG00005016665) NCMAP (ENSCPRG00005016669) SRRM1 (ENSCPRG00005016672) #22 ENSCPRG00005016682 CLIC4 (ENSCPRG00005016689) ENSCPRG00005016698 RUNX3 (ENSCPRG00005016703) ENSCPRG00005016707 SYF2 (ENSCPRG00005016709) RSRP1 (ENSCPRG00005016713) TMEM50A (ENSCPRG00005016717) ENSCPRG00005016721 MACO1 (ENSCPRG00005016725) LDLRAP1 (ENSCPRG00005016731) MAN1C1 (ENSCPRG00005016746) ENSCPRG00005016779 MTFR1L (ENSCPRG00005016787) PAQR7 (ENSCPRG00005016793) Aves ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000160519 ENSGT00940000164147 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ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00960000189517 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000160519 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00990000212016 ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00960000189517 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Golden eagle MODERN SPECIES 7 HMGCL (ENSACCG00020008306) FUCA1 (ENSACCG00020008316) CNR2 (ENSACCG00020008327) ENSACCG00020008337 PNRC2 (ENSACCG00020008343) SRSF10 (ENSACCG00020008355) ENSACCG00020008361 ENSACCG00020008373 MYOM3 (ENSACCG00020008469) ENSACCG00020008552 ENSACCG00020008567 GRHL3 (ENSACCG00020008719) NIPAL3 (ENSACCG00020008846) RCAN3 (ENSACCG00020008867) NCMAP (ENSACCG00020008894) SRRM1 (ENSACCG00020008955) #22 CLIC4 (ENSACCG00020008992) RUNX3 (ENSACCG00020009015) ENSACCG00020009025 SYF2 (ENSACCG00020009036) RSRP1 (ENSACCG00020009050) TMEM50A (ENSACCG00020009075) ENSACCG00020009090 MACO1 (ENSACCG00020009110) LDLRAP1 (ENSACCG00020009133) MAN1C1 (ENSACCG00020009149) ENSACCG00020009173 MTFR1L (ENSACCG00020009202) ENSACCG00020009212 PAQR7 (ENSACCG00020009220) STMN1 (ENSACCG00020009230) Kakapo MODERN SPECIES 6 TAF12 (ENSSHBG00005017463) ENSSHBG00005017467 TRNAU1AP 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(ENSSCAG00000007058) PAFAH2 (ENSSCAG00000007063) ENSSCAG00000007069 Flycatcher MODERN SPECIES 15 LYPLA2 (ENSFALG00000028382) GALE (ENSFALG00000000514) HMGCL (ENSFALG00000000512) FUCA1 (ENSFALG00000000508) CNR2 (ENSFALG00000014254) SRSF10 (ENSFALG00000000505) PNRC2 (ENSFALG00000024462) ENSFALG00000000503 MYOM3 (ENSFALG00000000500) IL22RA1 (ENSFALG00000000499) ENSFALG00000000497 GRHL3 (ENSFALG00000000490) NIPAL3 (ENSFALG00000000487) RCAN3 (ENSFALG00000000481) ENSFALG00000027539 ENSFALG00000027500 #22 CLIC4 (ENSFALG00000000472) RUNX3 (ENSFALG00000000470) SYF2 (ENSFALG00000024367) ENSFALG00000000465 TMEM50A (ENSFALG00000000455) ENSFALG00000000454 MACO1 (ENSFALG00000000444) ENSFALG00000000419 ENSFALG00000025362 MAN1C1 (ENSFALG00000000434) ENSFALG00000000425 MTFR1L (ENSFALG00000025744) PAQR7 (ENSFALG00000000421) PAFAH2 (ENSFALG00000000417) ENSFALG00000000414 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.t #22 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b.s #22 ENSGT00730000111080.b.t #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a ENSGT00390000005233.a ENSGT00940000161960 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111080.b.t #22 Common canary MODERN SPECIES 65 LYPLA2 (ENSSCAG00000006857) GALE (ENSSCAG00000006860) HMGCL (ENSSCAG00000006869) FUCA1 (ENSSCAG00000006878) CNR2 (ENSSCAG00000006884) PNRC2 (ENSSCAG00000006887) SRSF10 (ENSSCAG00000006889) ENSSCAG00000006894 IL22RA1 (ENSSCAG00000006905) ENSSCAG00000006911 GRHL3 (ENSSCAG00000006915) NIPAL3 (ENSSCAG00000006921) RCAN3 (ENSSCAG00000006926) NCMAP (ENSSCAG00000006928) ENSSCAG00000006931 #22 ENSSCAG00000006941 #22 CLIC4 (ENSSCAG00000006957) RUNX3 (ENSSCAG00000006962) SYF2 (ENSSCAG00000006965) RSRP1 (ENSSCAG00000006970) ENSSCAG00000006971 ENSSCAG00000006975 MACO1 (ENSSCAG00000006983) LDLRAP1 (ENSSCAG00000007039) MAN1C1 (ENSSCAG00000007042) ENSSCAG00000007047 MTFR1L (ENSSCAG00000007053) STMN1 (ENSSCAG00000007058) PAFAH2 (ENSSCAG00000007063) ENSSCAG00000007069 SLC30A2 (ENSSCAG00000007078) Medium ground finch MODERN SPECIES 139 LYPLA2 (ENSGFOG00000008108) GALE (ENSGFOG00000008100) HMGCL (ENSGFOG00000008076) FUCA1 (ENSGFOG00000008062) CNR2 (ENSGFOG00000008053) ENSGFOG00000008050 PNRC2 (ENSGFOG00000008047) SRSF10 (ENSGFOG00000008029) ENSGFOG00000008022 MYOM3 (ENSGFOG00000007854) ENSGFOG00000007826 GRHL3 (ENSGFOG00000007814) NIPAL3 (ENSGFOG00000007801) RCAN3 (ENSGFOG00000007794) NCMAP (ENSGFOG00000007786) SRRM1 (ENSGFOG00000007771) #22 CLIC4 (ENSGFOG00000007758) RUNX3 (ENSGFOG00000007751) ENSGFOG00000007742 SYF2 (ENSGFOG00000007737) TMEM50A (ENSGFOG00000007733) ENSGFOG00000007723 MACO1 (ENSGFOG00000007710) LDLRAP1 (ENSGFOG00000007702) MAN1C1 (ENSGFOG00000007691) SELENON (ENSGFOG00000007663) MTFR1L (ENSGFOG00000007652) PAQR7 (ENSGFOG00000007647) STMN1 (ENSGFOG00000007634) PAFAH2 (ENSGFOG00000007625) EXTL1 (ENSGFOG00000007438) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b Anatidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00960000188019 ENSGT00950000183215.c.b Duck MODERN SPECIES 15 TRIT1 (ENSAPLG00000011421) MYCL (ENSAPLG00000016475) ENSAPLG00000026452 PPT1 (ENSAPLG00000012514) PNRC2 (ENSAPLG00000000996) SRSF10 (ENSAPLG00000005446) ENSAPLG00000005402 MYOM3 (ENSAPLG00000003784) IL22RA1 (ENSAPLG00000003661) ENSAPLG00000003557 GRHL3 (ENSAPLG00000003161) STPG1 (ENSAPLG00000003159) NIPAL3 (ENSAPLG00000002628) RCAN3 (ENSAPLG00000002545) NCMAP (ENSAPLG00000002541) SRRM1 (ENSAPLG00000002066) #22 CLIC4 (ENSAPLG00000019742) RUNX3 (ENSAPLG00000016439) SYF2 (ENSAPLG00000016435) RSRP1 (ENSAPLG00000023561) TMEM50A (ENSAPLG00000016434) ENSAPLG00000016375 MACO1 (ENSAPLG00000016308) LDLRAP1 (ENSAPLG00000016262) MAN1C1 (ENSAPLG00000016115) ENSAPLG00000025313 MTFR1L (ENSAPLG00000016018) Pink-footed goose MODERN SPECIES 73 GALE (ENSABRG00000012490) HMGCL (ENSABRG00000012489) FUCA1 (ENSABRG00000012475) ENSABRG00000012456 PNRC2 (ENSABRG00000012454) SRSF10 (ENSABRG00000012445) ENSABRG00000012434 MYOM3 (ENSABRG00000012402) IL22RA1 (ENSABRG00000012385) ENSABRG00000012376 GRHL3 (ENSABRG00000012359) STPG1 (ENSABRG00000012299) NIPAL3 (ENSABRG00000012225) RCAN3 (ENSABRG00000012217) NCMAP (ENSABRG00000012194) SRRM1 (ENSABRG00000012156) #22 CLIC4 (ENSABRG00000012147) RUNX3 (ENSABRG00000012142) SYF2 (ENSABRG00000012134) RSRP1 (ENSABRG00000012129) TMEM50A (ENSABRG00000012117) ENSABRG00000012095 MACO1 (ENSABRG00000012082) LDLRAP1 (ENSABRG00000012068) ENSABRG00000012066 MAN1C1 (ENSABRG00000012053) ENSABRG00000012040 ENSABRG00000012037 MTFR1L (ENSABRG00000012032) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000163960 ENSGT00940000156072 ENSGT00940000156529 ENSGT00940000158412.e ENSGT00950000183056.A.a ENSGT00530000067301 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000163960 ENSGT00940000156072 ENSGT00940000156529 ENSGT00940000158412.e ENSGT00950000183056.A.a ENSGT00530000067301 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00940000158264.b ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000155019.a.a ENSGT00940000156139.ab ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000164873 ENSGT00390000002144 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00940000156761 Chicken MODERN SPECIES 15 ENSGALG00010013463 SLC30A2 (ENSGALG00010016436) TRIM63 (ENSGALG00010016425) PDIK1L (ENSGALG00010016394) FAM110D (ENSGALG00010016383) C1orf232 (ENSGALG00010016353) PTPRU (ENSGALG00010016338) MECR (ENSGALG00010016312) SRSF4 (ENSGALG00010016299) L3MBTL4 (ENSGALG00010016257) TMEM200B (ENSGALG00010016221) EPB41 (ENSGALG00010016111) ENSGALG00010015979 TRNAU1AP (ENSGALG00010015959) ENSGALG00010015937 SRRM1 (ENSGALG00010015914) #22 CLIC4 (ENSGALG00010015874) 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LDLRAP1 (ENSCJPG00005016298) MAN1C1 (ENSCJPG00005016273) ENSCJPG00005016272 MTFR1L (ENSCJPG00005016271) ENSCJPG00005016270 TAF12 (ENSCJPG00005016269) ENSCJPG00005016267 GMEB1 (ENSCJPG00005016263) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978 ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00960000189517 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Chinese turtle MODERN SPECIES 1632 PITHD1 (ENSPSIG00000007175) LYPLA2 (ENSPSIG00000007169) GALE (ENSPSIG00000006332) 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ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00960000189517 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158000 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00510000048978.g ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00960000189517 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1418 ENSCABG00000002007 GALE (ENSCABG00000001983) HMGCL (ENSCABG00000001979) FUCA1 (ENSCABG00000001978) CNR2 (ENSCABG00000001976) PNRC2 (ENSCABG00000001975) SRSF10 (ENSCABG00000001973) ENSCABG00000001971 MYOM3 (ENSCABG00000001932) IFNLR1 (ENSCABG00000001927) GRHL3 (ENSCABG00000001913) STPG1 (ENSCABG00000001909) NIPAL3 (ENSCABG00000001906) RCAN3 (ENSCABG00000001902) NCMAP (ENSCABG00000001900) ENSCABG00000001897 #22 ENSCABG00000001896 #22 CLIC4 (ENSCABG00000001892) RUNX3 (ENSCABG00000001883) ENSCABG00000001878 SYF2 (ENSCABG00000001874) RSRP1 (ENSCABG00000001871) TMEM50A (ENSCABG00000001867) ENSCABG00000001863 MACO1 (ENSCABG00000001746) LDLRAP1 (ENSCABG00000001742) MAN1C1 (ENSCABG00000001741) MON1A (ENSCABG00000001739) ENSCABG00000001731 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1418 GALE (ENSCABG00000001983) HMGCL (ENSCABG00000001979) FUCA1 (ENSCABG00000001978) CNR2 (ENSCABG00000001976) PNRC2 (ENSCABG00000001975) SRSF10 (ENSCABG00000001973) ENSCABG00000001971 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(ENSGEVG00005021192) RUNX3 (ENSGEVG00005021193) SYF2 (ENSGEVG00005021196) RSRP1 (ENSGEVG00005021197) TMEM50A (ENSGEVG00005021200) ENSGEVG00005021204 MACO1 (ENSGEVG00005021206) LDLRAP1 (ENSGEVG00005021210) MAN1C1 (ENSGEVG00005021213) ENSGEVG00005021214 MTFR1L (ENSGEVG00005021216) ENSGEVG00005021217 PAQR7 (ENSGEVG00005021219) STMN1 (ENSGEVG00005021220) PAFAH2 (ENSGEVG00005021222) Emydidae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000158484 ENSGT00440000035378.c ENSGT01060000248564.a.b ENSGT01030000235992 ENSGT00530000063881.a.b ENSGT00940000154450 ENSGT00940000164147 ENSGT00940000158669 ENSGT00940000161366 ENSGT00510000048978.g ENSGT00940000157970 ENSGT00390000011598 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00390000004116 ENSGT00730000111080.b #22 ENSGT00940000155017 ENSGT00940000156598.l ENSGT00390000017845 ENSGT00730000111390 ENSGT00940000157715 ENSGT00950000182844.a.b ENSGT00390000016613.c ENSGT00940000157118.c.a ENSGT00940000159312 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000005972 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00960000189517 ENSGT00940000161438 ENSGT01030000234597.a.a painted turtle MODERN SPECIES 757 LYPLA2 (ENSCPBG00000000554) GALE (ENSCPBG00000000537) HMGCL (ENSCPBG00000000518) FUCA1 (ENSCPBG00000000504) CNR2 (ENSCPBG00000000494) PNRC2 (ENSCPBG00000000483) SRSF10 (ENSCPBG00000000469) ENSCPBG00000000419 MYOM3 (ENSCPBG00000000170) IFNLR1 (ENSCPBG00000000138) GRHL3 (ENSCPBG00000025098) STPG1 (ENSCPBG00000025093) NIPAL3 (ENSCPBG00000025090) RCAN3 (ENSCPBG00000025089) NCMAP (ENSCPBG00000025086) SRRM1 (ENSCPBG00000025083) #22 CLIC4 (ENSCPBG00000025078) RUNX3 (ENSCPBG00000025074) SYF2 (ENSCPBG00000025073) RSRP1 (ENSCPBG00000025072) TMEM50A (ENSCPBG00000025071) ENSCPBG00000025069 MACO1 (ENSCPBG00000025064) LDLRAP1 (ENSCPBG00000025060) MAN1C1 (ENSCPBG00000025055) MTFR1L (ENSCPBG00000025052) ENSCPBG00000025050 STMN1 (ENSCPBG00000025048) PAFAH2 (ENSCPBG00000025044) ENSCPBG00000025041 SLC30A2 (ENSCPBG00000025040) Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2861 ENSTMTG00000011978 #22 ENSTMTG00000011994 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 2830 ENSTMTG00000010136 #22 ENSTMTG00000010148