Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000012267 ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00390000006806 #7 ENSGT01100000263497.E.a.a #8 ENSGT00390000008063 #9 ENSGT00940000159016 #10 ENSGT00390000002121 #11 ENSGT01030000234638.b.a.a #12 ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.b.d.b ##13 ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.a.b #15 ENSGT00390000016735 #17 ENSGT00390000000053 #18 ENSGT00940000159680 #19 ENSGT00390000005147 #20 ENSGT00940000160257 #21 ENSGT00940000160389 #22 ENSGT00510000047770.c.a #23 ENSGT00940000153116.C.b #24 ENSGT00940000161935 #25 ENSGT00940000160315 #26 ENSGT00390000007170 #27 ENSGT00940000158145 #28 ENSGT00390000008201 #29 ENSGT00390000016298.a #30 ENSGT00940000157552 #31 ENSGT00510000049338 #32 ENSGT00440000034383 #33 ENSGT00940000159313 #34 ENSGT00940000161012 #35 ENSGT00390000005584 #36 ENSGT00940000161046 #37 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000012267 ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00390000006806 #7 ENSGT01100000263497.E.a.a #8 ENSGT00390000008063 #9 ENSGT00940000159016 #10 ENSGT00390000002121 #11 ENSGT01030000234638.b.a.a #12 ENSGT00950000182755.b.a.a.a.b #14 ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.a.b #15 ENSGT00390000016735 #17 ENSGT00390000000053 #18 ENSGT00940000159680 #19 ENSGT00390000005147 #20 ENSGT00940000160257 #21 ENSGT00940000160389 #22 ENSGT00510000047770.c.a #23 ENSGT00940000153116.C.b #24 ENSGT00940000161935 #25 ENSGT00940000160315 #26 ENSGT00390000007170 #27 ENSGT00940000158145 #28 ENSGT00390000008201 #29 ENSGT00390000016298.a #30 ENSGT00940000157552 #31 ENSGT00510000049338 #32 ENSGT00440000034383 #33 ENSGT00940000159313 #34 ENSGT00940000161012 #35 ENSGT00390000005584 #36 ENSGT00940000161046 #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00390000012267 ENSGT00940000156708.a.a ENSGT00390000006806 #7 ENSGT01100000263497.E.a.a #8 ENSGT00390000008063 #9 ENSGT00940000159016 #10 ENSGT00390000002121 #11 ENSGT01030000234638.b.a.a #12 ENSGT00950000182755.b.a.a.a.b #14 ENSGT00950000182755.b.a.a.a.a.a.a.b #15 ENSGT00390000016735 #17 ENSGT00390000000053 #18 ENSGT00940000159680 #19 ENSGT00390000005147 #20 ENSGT00940000160257 #21 ENSGT00940000160389 #22 ENSGT00510000047770.c.a #23 ENSGT00940000153116.C.b #24 ENSGT00940000161935 #25 ENSGT00940000160315 #26 ENSGT00390000007170 #27 ENSGT00940000158145 #28 ENSGT00390000008201 #29 ENSGT00390000016298.a #30 ENSGT00940000157552 #31 ENSGT00510000049338 #32 ENSGT00440000034383 #33 ENSGT00940000159313 #34 ENSGT00940000161012 #35 ENSGT00390000005584 #36 ENSGT00940000161046 #37 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 217 FBXW9 (ENSUPAG00010007705) #7 ENSUPAG00010007702 #8 DHPS (ENSUPAG00010007686) #9 WDR83 (ENSUPAG00010007673) #10 WDR83OS (ENSUPAG00010007669) #11 MAN2B1 (ENSUPAG00010007651) #12 ENSUPAG00010007643 #13 ENSUPAG00010007642 #14 ENSUPAG00010007638 #15 ENSUPAG00010007632 #16 ACP5 (ENSUPAG00010007588) #17 ELOF1 (ENSUPAG00010007576) #18 CNN1 (ENSUPAG00010007563) #19 ECSIT (ENSUPAG00010007553) #20 ZNF653 (ENSUPAG00010007541) #21 ELAVL3 (ENSUPAG00010007525) #22 PRKCSH (ENSUPAG00010007493) #23 ODAD3 (ENSUPAG00010007463) #24 RGL3 (ENSUPAG00010007340) #25 EPOR (ENSUPAG00010007323) #26 SWSAP1 (ENSUPAG00010007321) #27 PLPPR2 (ENSUPAG00010007227) #28 CCDC159 (ENSUPAG00010007207) #29 TMEM205 (ENSUPAG00010007186) #30 RAB3D (ENSUPAG00010007164) #31 TSPAN16 (ENSUPAG00010007148) #32 ANGPTL8 (ENSUPAG00010007137) #33 DOCK6 (ENSUPAG00010003421) #34 KANK2 (ENSUPAG00010003372) #35 SPC24 (ENSUPAG00010003350) #36 LDLR (ENSUPAG00010003299) #37 Squirrel MODERN SPECIES 259 TRIR (ENSSTOG00000006978) TNPO2 (ENSSTOG00000006952) FBXW9 (ENSSTOG00000006921) #7 ENSSTOG00000030269 #8 DHPS (ENSSTOG00000006900) #9 WDR83 (ENSSTOG00000006883) #10 WDR83OS (ENSSTOG00000006874) #11 MAN2B1 (ENSSTOG00000029598) #12 ENSSTOG00000034910 #14 ZNF709 (ENSSTOG00000029196) #15 ACP5 (ENSSTOG00000003699) #17 ELOF1 (ENSSTOG00000003687) #18 CNN1 (ENSSTOG00000003674) #19 ECSIT (ENSSTOG00000003653) #20 ZNF653 (ENSSTOG00000003640) #21 ELAVL3 (ENSSTOG00000021111) #22 PRKCSH (ENSSTOG00000003132) #23 ODAD3 (ENSSTOG00000019506) #24 RGL3 (ENSSTOG00000003004) #25 EPOR (ENSSTOG00000002992) #26 SWSAP1 (ENSSTOG00000002990) #27 PLPPR2 (ENSSTOG00000010119) #28 CCDC159 (ENSSTOG00000005786) #29 TMEM205 (ENSSTOG00000005779) #30 RAB3D (ENSSTOG00000027509) #31 TSPAN16 (ENSSTOG00000002961) #32 ANGPTL8 (ENSSTOG00000026191) #33 DOCK6 (ENSSTOG00000023652) #34 KANK2 (ENSSTOG00000008035) #35 SPC24 (ENSSTOG00000008026) #36 LDLR (ENSSTOG00000007999) #37 Alpin marmot MODERN SPECIES 24 TRIR (ENSMMMG00000020777) TNPO2 (ENSMMMG00000020726) FBXW9 (ENSMMMG00000020717) #7 ENSMMMG00000020713 #8 DHPS (ENSMMMG00000020706) #9 WDR83 (ENSMMMG00000020697) #10 WDR83OS (ENSMMMG00000020687) #11 MAN2B1 (ENSMMMG00000020653) #12 ENSMMMG00000020633 ##13 ENSMMMG00000020539 #15 ACP5 (ENSMMMG00000020512) #17 ELOF1 (ENSMMMG00000020499) #18 CNN1 (ENSMMMG00000020489) #19 ECSIT (ENSMMMG00000020481) #20 ZNF653 (ENSMMMG00000020464) #21 ELAVL3 (ENSMMMG00000020248) #22 PRKCSH (ENSMMMG00000020205) #23 ODAD3 (ENSMMMG00000020179) #24 RGL3 (ENSMMMG00000020154) #25 EPOR (ENSMMMG00000020144) #26 SWSAP1 (ENSMMMG00000020143) #27 PLPPR2 (ENSMMMG00000020126) #28 CCDC159 (ENSMMMG00000020119) #29 TMEM205 (ENSMMMG00000020116) #30 RAB3D (ENSMMMG00000020113) #31 TSPAN16 (ENSMMMG00000020105) #32 ANGPTL8 (ENSMMMG00000020098) #33 DOCK6 (ENSMMMG00000019995) #34 KANK2 (ENSMMMG00000019957) #35 SPC24 (ENSMMMG00000019947) #36 LDLR (ENSMMMG00000019891) #37 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 FBXW9 (ENSSVLG00005025161) #7 ENSSVLG00005025134 #8 DHPS (ENSSVLG00005025110) #9 ENSSVLG00005025092 #10 ENSSVLG00005025070 #11 ENSSVLG00005025050 #12 ENSSVLG00005025025 ##13 ENSSVLG00005025001 ##13 ENSSVLG00005024969 #15 ACP5 (ENSSVLG00005024901) #17 ENSSVLG00005024870 #18 CNN1 (ENSSVLG00005024841) #19 ENSSVLG00005024824 #20 ENSSVLG00005024804 #20 ENSSVLG00005024790 #21 ELAVL3 (ENSSVLG00005024773) #22 PRKCSH (ENSSVLG00005024745) #23 ODAD3 (ENSSVLG00005024648) #24 RGL3 (ENSSVLG00005024512) #25 EPOR (ENSSVLG00005024468) #26 SWSAP1 (ENSSVLG00005024453) #27 PLPPR2 (ENSSVLG00005024405) #28 CCDC159 (ENSSVLG00005024349) #29 TMEM205 (ENSSVLG00005024312) #30 RAB3D (ENSSVLG00005024280) #31 TSPAN16 (ENSSVLG00005024177) #32 ANGPTL8 (ENSSVLG00005024122) #33 DOCK6 (ENSSVLG00005024084) #34 KANK2 (ENSSVLG00005024021) #35 SPC24 (ENSSVLG00005024002) #36 LDLR (ENSSVLG00005023861) #37