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#17 ENSGT00940000154420.C.i #18 ENSGT01090000261964 ENSGT00950000183014.f.b.a.a #19 ENSGT00940000153456.a #20 ENSGT00940000162472 ENSGT00950000183140.a.a.m.a.b #21 ENSGT00940000161068 #22 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000153837.a.a #23 ENSGT00940000162943 ENSGT00940000163493.h #25 ENSGT00940000163360 #27 ENSGT00940000153378.a.a #28 ENSGT00940000154560.b #29 ENSGT00940000154560.a ##29 ENSGT00940000153378.b.b ##28 Pig MODERN SPECIES 12 NRBP2 (ENSSSCG00000038025) PUF60 (ENSSSCG00000038800) #8 SCRIB (ENSSSCG00000039466) #9 IQANK1 (ENSSSCG00000034987) FAM83H (ENSSSCG00000036964) #10 MAPK15 (ENSSSCG00000035933) #11 ENSSSCG00000037038 #12 ZNF623 (ENSSSCG00000039679) #14 GFUS (ENSSSCG00000031698) #16 PYCR3 (ENSSSCG00000032763) #17 TIGD5 (ENSSSCG00000040119) #18 EEF1D (ENSSSCG00000006954) #19 NAPRT (ENSSSCG00000055397) #20 MROH6 (ENSSSCG00000006948) GSDMD (ENSSSCG00000006955) #21 ZC3H3 (ENSSSCG00000006956) #22 MAFA (ENSSSCG00000034820) RHPN1 (ENSSSCG00000006957) #23 TOP1MT (ENSSSCG00000006958) 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ENSGT00940000159966.B ENSGT00730000111514 ENSGT00730000111571.`b.a Bovinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155594 #8 ENSGT00940000154025.a #9 ENSGT00390000010763 ENSGT00940000159342 #10 ENSGT00940000159758 #11 ENSGT00940000154427.B #12 ENSGT00940000163183 #14 ENSGT00940000163493.g.a ##25 ENSGT00390000004681 #16 ENSGT00950000183044.a.b #17 ENSGT00940000154420.C.i #18 ENSGT00950000183014.f.b.a.a #19 ENSGT00940000153456.a #20 ENSGT00940000162472 ENSGT00950000183140.a.a.m.a.b #21 ENSGT00940000161068 #22 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000153837.a.a #23 ENSGT00940000162943 ENSGT00940000163493.h #25 ENSGT00940000163360 #27 ENSGT00940000163493.g.b ##25 ENSGT00940000153378.a.a #28 ENSGT00940000154560.b #29 ENSGT00940000154560.a ##29 ENSGT00940000153378.b.b ##28 ENSGT00940000161506 #31 ENSGT00940000159966.A ENSGT00940000159966.B ENSGT00730000111514 ENSGT00730000111571.`b.a Bos ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155594 #8 ENSGT00940000154025.a #9 ENSGT00390000010763 ENSGT00940000159342 #10 ENSGT00940000159758 #11 ENSGT00940000154427.B #12 ENSGT00940000163183 #14 ENSGT00940000163493.g.a ##25 ENSGT00390000004681 #16 ENSGT00950000183044.a.b #17 ENSGT00940000154420.C.i #18 ENSGT00950000183014.f.b.a.a #19 ENSGT00940000153456.a #20 ENSGT00940000162472 ENSGT00950000183140.a.a.m.a.b #21 ENSGT00940000161068 #22 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000153837.a.a #23 ENSGT00940000162943 ENSGT00940000163493.h #25 ENSGT00940000163360 #27 ENSGT00940000163493.g.b ##25 ENSGT00940000153378.a.a #28 ENSGT00940000154560.b #29 ENSGT00940000154560.a ##29 ENSGT00940000153378.b.b ##28 ENSGT00940000161506 #31 ENSGT00940000159966.A ENSGT00940000159966.B ENSGT00730000111514 ENSGT00730000111571.`b.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155594 #8 ENSGT00940000154025.a #9 ENSGT00390000010763 ENSGT00940000159342 #10 ENSGT00940000159758 #11 ENSGT00940000154427.B #12 ENSGT00940000163183 #14 ENSGT00940000163493.g.a ##25 ENSGT00390000004681 #16 ENSGT00950000183044.a.b #17 ENSGT00940000154420.C.i #18 ENSGT00950000183014.f.b.a.a #19 ENSGT00940000153456.a #20 ENSGT00940000162472 ENSGT00950000183140.a.a.m.a.b #21 ENSGT00940000161068 #22 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000153837.a.a #23 ENSGT00940000162943 ENSGT00940000163493.h #25 ENSGT00940000163360 #27 ENSGT00940000163493.g.b ##25 ENSGT00940000153378.a.a #28 ENSGT00940000154560.b #29 ENSGT00940000154560.a ##29 ENSGT00940000153378.b.b ##28 ENSGT00940000161506.x #31 ENSGT00940000159966.A.d ENSGT00940000161506.w.b #31 ENSGT00940000159966.A.c ENSGT00940000161506.w.a #31 Cow MODERN SPECIES 5 PUF60 (ENSBTAG00000037493) #8 SCRIB (ENSBTAG00000008421) #9 IQANK1 (ENSBTAG00000048486) FAM83H (ENSBTAG00000038682) #10 MAPK15 (ENSBTAG00000019864) #11 CCDC166 (ENSBTAG00000040360) #12 ZNF623 (ENSBTAG00000045791) #14 ENSBTAG00000052472 ##25 GFUS (ENSBTAG00000034691) #16 PYCR3 (ENSBTAG00000016810) #17 TIGD5 (ENSBTAG00000048160) #18 EEF1D (ENSBTAG00000014643) #19 NAPRT (ENSBTAG00000014642) #20 MROH6 (ENSBTAG00000034613) GSDMD (ENSBTAG00000021474) #21 ZC3H3 (ENSBTAG00000021472) #22 MAFA (ENSBTAG00000026344) RHPN1 (ENSBTAG00000002104) #23 TOP1MT (ENSBTAG00000053896) ZNF696 (ENSBTAG00000049014) #25 GLI4 (ENSBTAG00000003606) #27 GPIHBP1 (ENSBTAG00000049125) #28 LY6H (ENSBTAG00000011939) #29 LY6E (ENSBTAG00000017040) ##28 ENSBTAG00000004596 #31 GML (ENSBTAG00000004595) CYP11B1 (ENSBTAG00000054126) #31 ENSBTAG00000054483 ENSBTAG00000037824 #31 LY6K (ENSBTAG00000050161) LY6D (ENSBTAG00000034498) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 5 ENSBIXG00005029835 PUF60 (ENSBIXG00005029853) #8 SCRIB (ENSBIXG00005029884) #9 FAM83H (ENSBIXG00005029924) #10 ENSBIXG00005029936 #11 ENSBIXG00005029950 #12 ZNF623 (ENSBIXG00005029955) #14 ENSBIXG00005029964 ##25 GFUS (ENSBIXG00005029985) #16 PYCR3 (ENSBIXG00005030011) #17 TIGD5 (ENSBIXG00005030024) #18 ENSBIXG00005030062 #19 NAPRT (ENSBIXG00005030133) #20 MROH6 (ENSBIXG00005030160) GSDMD (ENSBIXG00005030192) #21 ZC3H3 (ENSBIXG00005030225) #22 MAFA (ENSBIXG00005030239) RHPN1 (ENSBIXG00005030249) #23 ENSBIXG00005030263 ENSBIXG00005030272 ZNF696 (ENSBIXG00005030285) #25 GLI4 (ENSBIXG00005030297) #27 ENSBIXG00005030310 ##25 ENSBIXG00005030330 #28 LY6H (ENSBIXG00005030344) #29 LY6L (ENSBIXG00005030354) ##29 ENSBIXG00005030371 #31 ENSBIXG00005030376 ENSBIXG00005030390 #31 ENSBIXG00005030432 ENSBIXG00005030442 #31 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155594 #8 ENSGT00940000154025.a #9 ENSGT00390000010763 ENSGT00940000159342 #10 ENSGT00940000159758 #11 ENSGT00940000154427.B #12 ENSGT00940000163183 #14 ENSGT00940000163493.g.a ##25 ENSGT00390000004681 #16 ENSGT00950000183044.a.b #17 ENSGT00940000154420.C.i #18 ENSGT00950000183014.f.b.a.a #19 ENSGT00940000153456.a #20 ENSGT00940000162472 ENSGT00950000183140.a.a.m.a.b #21 ENSGT00940000161068 #22 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000153837.a.a #23 ENSGT00940000163493.h #25 ENSGT00940000163360 #27 ENSGT00940000163493.g.b ##25 ENSGT00910000147678 ENSGT00960000190596 ENSGT00940000154560.b #29 ENSGT00940000154560.a ##29 ENSGT00940000153378.b.b ##28 ENSGT00940000159966.A ENSGT00940000159966.B ENSGT00730000111514 ENSGT00730000111571.`b.a ENSGT00940000162197 Domestic yak MODERN SPECIES 9 PLEC (ENSBGRG00000007959) ENSBGRG00000007510 ENSBGRG00000007392 PUF60 (ENSBGRG00000007018) #8 FAM83H (ENSBGRG00000005952) #10 MAPK15 (ENSBGRG00000005786) #11 ZNF623 (ENSBGRG00000005671) #14 GFUS (ENSBGRG00000005617) #16 ENSBGRG00000005589 #17 TIGD5 (ENSBGRG00000005583) #18 ENSBGRG00000005570 ENSBGRG00000005433 #19 NAPRT (ENSBGRG00000005281) #20 MROH6 (ENSBGRG00000005185) GSDMD (ENSBGRG00000005118) #21 ZC3H3 (ENSBGRG00000005085) #22 MAFA (ENSBGRG00000005073) RHPN1 (ENSBGRG00000005027) #23 ZNF696 (ENSBGRG00000004992) #25 GLI4 (ENSBGRG00000004935) #27 ENSBGRG00000004913 ##25 ENSBGRG00000004901 LY6H (ENSBGRG00000004864) #29 LY6L (ENSBGRG00000004838) ##29 LY6E (ENSBGRG00000004776) ##28 GML (ENSBGRG00000004405) ENSBGRG00000004382 ENSBGRG00000004325 LYNX1 (ENSBGRG00000004297) LYPD2 (ENSBGRG00000004248) ENSBGRG00000004207 Wild yak MODERN SPECIES 168 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