Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00940000160275	ENSGT00940000158087	ENSGT00390000012498 #7	ENSGT00940000157543 #8	ENSGT00550000074994 #9	ENSGT00940000157410 #10	ENSGT00940000156519 #11	ENSGT00390000009535 #12	ENSGT00390000010285.d #13	ENSGT00700000104539.b.a #14	ENSGT00390000007838 #15	ENSGT00390000015933 #16	ENSGT00390000006738.a #17	ENSGT00390000002407.d #18	ENSGT00940000158140 #21	ENSGT00940000161035 #22	ENSGT00390000011730 #23	ENSGT00940000162251 #24	ENSGT00390000001368 #25	ENSGT00940000154158.k.a.ab #26	ENSGT00520000055637.A.b #27	ENSGT00940000158707.a.b #28	ENSGT00390000003374 #29	ENSGT00940000155581.C	ENSGT00940000162066	ENSGT00390000011116	ENSGT00530000063823.b.a	ENSGT00730000111190	ENSGT00940000161887	ENSGT00390000002290	ENSGT00390000015359
Degu	MODERN SPECIES	256	COTL1 (ENSODEG00000004482) #7	KLHL36 (ENSODEG00000004503) #8	USP10 (ENSODEG00000004533) #9	CRISPLD2 (ENSODEG00000004620) #10	ZDHHC7 (ENSODEG00000004683) #11	KIAA0513 (ENSODEG00000004724) #12	CIBAR2 (ENSODEG00000004799) #13	GSE1 (ENSODEG00000004855) #14	GINS2 (ENSODEG00000004957) #15	C16orf74 (ENSODEG00000004976) #16	EMC8 (ENSODEG00000004987) #17	ENSODEG00000004994 #18	ENSODEG00000005004 #19	ENSODEG00000005014 #20	IRF8 (ENSODEG00000005035) #21	FOXF1 (ENSODEG00000003466) #22	MTHFSD (ENSODEG00000003482) #23	FOXL1 (ENSODEG00000003524) #24	FBXO31 (ENSODEG00000003564) #25	ENSODEG00000003687 #26	ZCCHC14 (ENSODEG00000003749) #27	JPH3 (ENSODEG00000003822) #28	ENSODEG00000003885 #29	ENSODEG00000003363 #30	GAS8 (ENSODEG00000003436) #31	DBNDD1 (ENSODEG00000003664) #32	ENSODEG00000003697 #33	DEF8 (ENSODEG00000003777) #34	TUBB3 (ENSODEG00000003944) #35	TCF25 (ENSODEG00000004123) #36	SPIRE2 (ENSODEG00000003817) #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	248	ATP2C2 (ENSCLAG00000001971)	MEAK7 (ENSCLAG00000002725)	COTL1 (ENSCLAG00000000826) #7	KLHL36 (ENSCLAG00000000925) #8	USP10 (ENSCLAG00000001215) #9	CRISPLD2 (ENSCLAG00000000589) #10	ZDHHC7 (ENSCLAG00000000903) #11	KIAA0513 (ENSCLAG00000000984) #12	CIBAR2 (ENSCLAG00000000847) #13	GSE1 (ENSCLAG00000001184) #14	GINS2 (ENSCLAG00000000938) #15	C16orf74 (ENSCLAG00000001005) #16	EMC8 (ENSCLAG00000001317) #17	COX4I1 (ENSCLAG00000001404) #18	IRF8 (ENSCLAG00000001452) #21	FOXF1 (ENSCLAG00000000554) #22	MTHFSD (ENSCLAG00000000611) #23	FOXL1 (ENSCLAG00000000645) #24	FBXO31 (ENSCLAG00000000716) #25	ENSCLAG00000000783 ##26	ZCCHC14 (ENSCLAG00000001784) #27	JPH3 (ENSCLAG00000001912) #28	KLHDC4 (ENSCLAG00000002117) #29	SLC7A5 (ENSCLAG00000000815)	CA5A (ENSCLAG00000000828)	BANP (ENSCLAG00000000895)	ENSCLAG00000001012	ZC3H18 (ENSCLAG00000000600)	IL17C (ENSCLAG00000000670)	CYBA (ENSCLAG00000000711)	MVD (ENSCLAG00000000836)