Amniota ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016237 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00940000154920 ENSGT00390000014290 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00390000008413 ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00940000173219 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000170513 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00390000000444 #33 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00930000153033 ENSGT00940000167019 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00940000154920 ENSGT00390000014290 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00390000008413 ENSGT00390000008041.B 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Beluga whale MODERN SPECIES 11 ENOSF1 (ENSDLEG00000001162) TYMS (ENSDLEG00000001214) CLUL1 (ENSDLEG00000001237) ENSDLEG00000001276 CETN1 (ENSDLEG00000001281) COLEC12 (ENSDLEG00000001294) THOC1 (ENSDLEG00000001319) USP14 (ENSDLEG00000001356) ROCK1 (ENSDLEG00000001559) GREB1L (ENSDLEG00000002648) ENSDLEG00000002664 ESCO1 (ENSDLEG00000002679) ENSDLEG00000002691 ABHD3 (ENSDLEG00000002699) MIB1 (ENSDLEG00000002708) #21 GATA6 (ENSDLEG00000002724) #22 RBBP8 (ENSDLEG00000002736) #23 CABLES1 (ENSDLEG00000002760) #24 ENSDLEG00000002769 ENSDLEG00000002775 #25 RIOK3 (ENSDLEG00000002781) #26 CUNH18orf8 (ENSDLEG00000002795) #27 NPC1 (ENSDLEG00000002888) #28 ANKRD29 (ENSDLEG00000002958) #29 LAMA3 (ENSDLEG00000003188) #30 TTC39C (ENSDLEG00000003460) #31 ENSDLEG00000003488 #33 OSBPL1A (ENSDLEG00000003564) #34 IMPACT (ENSDLEG00000003771) #36 HRH4 (ENSDLEG00000003777) #37 ZNF521 (ENSDLEG00000003793) Vaquita MODERN SPECIES 5 CLUL1 (ENSPSNG00000012188) CETN1 (ENSPSNG00000012140) COLEC12 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ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000014290 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00940000157209.jb ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT00390000008413 ENSGT01030000234517.A ENSGT00940000158528.y.b ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00510000047245 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00390000004856.w.a.a.b.a ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00390000000444 #33 ENSGT00940000155295.p #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000162118 #37 ENSGT00940000159287 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00940000157209.jb ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT00390000008413 ENSGT01030000234517.A ENSGT00940000158528.y.b ENSGT00390000008041.B 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ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00510000047245 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00390000000444.b #33 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000159287 ENSGT00940000156352 ENSGT00940000160354 ENSGT00390000011620.a.a.a Microbat MODERN SPECIES 1137 ENSMLUG00000004090 USP14 (ENSMLUG00000004069) ROCK1 (ENSMLUG00000014044) ENSMLUG00000025553 GREB1L (ENSMLUG00000009091) ESCO1 (ENSMLUG00000009110) SNRPD1 (ENSMLUG00000009124) ABHD3 (ENSMLUG00000009135) MIB1 (ENSMLUG00000004022) #21 ENSMLUG00000013566 #22 RBBP8 (ENSMLUG00000014469) #23 PARD6G (ENSMLUG00000000673) ADNP2 (ENSMLUG00000006751) RBFA (ENSMLUG00000006729) ENSMLUG00000026918 TXNL4A (ENSMLUG00000009188) SLC66A2 (ENSMLUG00000016199) KCNG2 (ENSMLUG00000016184) CTDP1 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(ENSRFEG00010021574) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00940000157209.jb ENSGT00940000173400 ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00390000008413 ENSGT00940000158528.y.b ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00510000047245 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00390000000444 #33 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00940000167019 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000162118 #37 ENSGT00940000159287 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00940000157209.jb ENSGT00940000173400 ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00390000008413 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ENSGT00940000156352 Ferret MODERN SPECIES 170 YES1 (ENSMPUG00000005394) ENOSF1 (ENSMPUG00000005407) TYMS (ENSMPUG00000005419) CLUL1 (ENSMPUG00000005429) COLEC12 (ENSMPUG00000005437) THOC1 (ENSMPUG00000005448) USP14 (ENSMPUG00000005469) ROCK1 (ENSMPUG00000005488) ENSMPUG00000019884 GREB1L (ENSMPUG00000005516) ESCO1 (ENSMPUG00000005547) ENSMPUG00000005567 ABHD3 (ENSMPUG00000005583) ENSMPUG00000005594 MIB1 (ENSMPUG00000005601) #21 GATA6 (ENSMPUG00000005621) #22 RBBP8 (ENSMPUG00000005667) #23 CABLES1 (ENSMPUG00000005680) #24 ENSMPUG00000005746 TMEM241 (ENSMPUG00000005755) #25 RIOK3 (ENSMPUG00000005772) #26 RMC1 (ENSMPUG00000005780) #27 NPC1 (ENSMPUG00000005792) #28 ANKRD29 (ENSMPUG00000005801) #29 LAMA3 (ENSMPUG00000005805) #30 TTC39C (ENSMPUG00000005831) #31 ENSMPUG00000005839 #33 OSBPL1A (ENSMPUG00000005858) #34 IMPACT (ENSMPUG00000006271) #36 HRH4 (ENSMPUG00000006279) #37 ENSMPUG00000006318 American mink MODERN SPECIES 1 ENSNVIG00000016905 CLUL1 (ENSNVIG00000016951) CETN1 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Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018386 ENSGT00390000016237 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00940000154920 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00960000189334 ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638.h #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000163206.b.k ENSGT00940000163206.b.l ENSGT00940000159287 ENSGT00940000156352 Flycatcher MODERN SPECIES 11 SMCHD1 (ENSFALG00000006275) ENSFALG00000006264 METTL4 (ENSFALG00000006257) ADCYAP1 (ENSFALG00000028660) YES1 (ENSFALG00000023811) TYMS (ENSFALG00000006240) CLUL1 (ENSFALG00000006234) COLEC12 (ENSFALG00000006224) THOC1 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ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638.h #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000163206.b.k ENSGT00940000162118 #37 ENSGT00940000163206.b.l ENSGT00940000159287 Medium ground finch MODERN SPECIES 8 NDC80 (ENSGFOG00000003969) METTL4 (ENSGFOG00000004006) ADCYAP1 (ENSGFOG00000004443) YES1 (ENSGFOG00000004474) TYMS (ENSGFOG00000004489) CLUL1 (ENSGFOG00000004502) COLEC12 (ENSGFOG00000004526) THOC1 (ENSGFOG00000004582) USP14 (ENSGFOG00000004818) ROCK1 (ENSGFOG00000004833) ENSGFOG00000004864 GREB1L (ENSGFOG00000004871) ESCO1 (ENSGFOG00000004931) ABHD3 (ENSGFOG00000004954) MIB1 (ENSGFOG00000005438) #21 GATA6 (ENSGFOG00000005470) #22 RBBP8 (ENSGFOG00000005486) #23 CABLES1 (ENSGFOG00000005494) #24 TMEM241 (ENSGFOG00000005506) #25 RIOK3 (ENSGFOG00000005522) #26 RMC1 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ENSGT00940000163206.b.l ENSGT00940000159287 Zebra finch MODERN SPECIES 12 NDC80 (ENSTGUG00000010126) METTL4 (ENSTGUG00000010144) ADCYAP1 (ENSTGUG00000021936) YES1 (ENSTGUG00000010159) TYMS (ENSTGUG00000010173) CLUL1 (ENSTGUG00000010187) COLEC12 (ENSTGUG00000010195) THOC1 (ENSTGUG00000010204) USP14 (ENSTGUG00000010223) ROCK1 (ENSTGUG00000010253) ENSTGUG00000016989 GREB1L (ENSTGUG00000010297) ESCO1 (ENSTGUG00000027328) ABHD3 (ENSTGUG00000010308) MIB1 (ENSTGUG00000010324) #21 GATA6 (ENSTGUG00000010356) #22 RBBP8 (ENSTGUG00000010362) #23 CABLES1 (ENSTGUG00000010373) #24 TMEM241 (ENSTGUG00000010387) #25 RIOK3 (ENSTGUG00000010392) #26 RMC1 (ENSTGUG00000010413) #27 NPC1 (ENSTGUG00000010427) #28 ANKRD29 (ENSTGUG00000010477) #29 ENSTGUG00000028768 #30 ENSTGUG00000010481 #30 TTC39C (ENSTGUG00000010516) #31 OSBPL1A (ENSTGUG00000010525) #34 IMPACT (ENSTGUG00000010551) #36 ENSTGUG00000022147 ENSTGUG00000024544 ENSTGUG00000010562 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000016237 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00940000154920 ENSGT00390000014290 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00390000008413 ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00390000000444 #33 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000159287 ENSGT00940000156352 ENSGT00390000011620.a.a.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000016237 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00940000154920 ENSGT00390000014290 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00390000008413 ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00390000000444 #33 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000159287 ENSGT00940000156352 ENSGT00390000011620.a.a.a Laterata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00940000154920 ENSGT00390000014290 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT00390000008413 ENSGT01030000234517.A ENSGT00960000189334 ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00390000000444 #33 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000159287 ENSGT00940000156352 ENSGT00390000011620.a.a.a Common wall lizard MODERN SPECIES 15 NDC80 (ENSPMRG00000005868) METTL4 (ENSPMRG00000005852) ADCYAP1 (ENSPMRG00000005832) YES1 (ENSPMRG00000005808) ENOSF1 (ENSPMRG00000005780) TYMS (ENSPMRG00000005762) CLUL1 (ENSPMRG00000005750) THOC1 (ENSPMRG00000005726) USP14 (ENSPMRG00000005636) ENSPMRG00000005620 ROCK1 (ENSPMRG00000005592) GREB1L (ENSPMRG00000005424) ESCO1 (ENSPMRG00000005365) ABHD3 (ENSPMRG00000005341) MIB1 (ENSPMRG00000005318) #21 GATA6 (ENSPMRG00000005306) #22 RBBP8 (ENSPMRG00000005295) #23 CABLES1 (ENSPMRG00000005285) #24 TMEM241 (ENSPMRG00000005271) #25 RIOK3 (ENSPMRG00000005262) #26 RMC1 (ENSPMRG00000005247) #27 NPC1 (ENSPMRG00000006953) #28 ANKRD29 (ENSPMRG00000006924) #29 LAMA3 (ENSPMRG00000006100) #30 TTC39C (ENSPMRG00000005770) #31 ENSPMRG00000005743 #33 OSBPL1A (ENSPMRG00000005702) #34 IMPACT (ENSPMRG00000005677) #36 ZNF521 (ENSPMRG00000005662) SS18 (ENSPMRG00000005630) ENSPMRG00000005615 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 4 METTL4 (ENSSMRG00000016614) ADCYAP1 (ENSSMRG00000016604) YES1 (ENSSMRG00000016600) ENOSF1 (ENSSMRG00000016599) TYMS (ENSSMRG00000016598) CLUL1 (ENSSMRG00000016597) COLEC12 (ENSSMRG00000016596) THOC1 (ENSSMRG00000016593) USP14 (ENSSMRG00000016589) ENSSMRG00000016588 ROCK1 (ENSSMRG00000012388) GREB1L (ENSSMRG00000012352) ESCO1 (ENSSMRG00000012331) ABHD3 (ENSSMRG00000012330) MIB1 (ENSSMRG00000012328) #21 GATA6 (ENSSMRG00000012313) #22 RBBP8 (ENSSMRG00000012281) #23 CABLES1 (ENSSMRG00000012280) #24 TMEM241 (ENSSMRG00000012279) #25 RIOK3 (ENSSMRG00000012259) #26 RMC1 (ENSSMRG00000012256) #27 NPC1 (ENSSMRG00000012250) #28 ANKRD29 (ENSSMRG00000012247) #29 ENSSMRG00000012246 #30 ENSSMRG00000012150 #30 TTC39C (ENSSMRG00000012148) #31 ENSSMRG00000012144 #33 OSBPL1A (ENSSMRG00000012088) #34 IMPACT (ENSSMRG00000012086) #36 ZNF521 (ENSSMRG00000011955) SS18 (ENSSMRG00000011862) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000016237 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00940000154920 ENSGT00390000014290 ENSGT00390000014786 ENSGT00530000063668.A ENSGT00950000183074.A ENSGT00390000016232 ENSGT00390000009615 ENSGT01030000234517.A ENSGT00390000008413 ENSGT00390000008041.B ENSGT00940000157762 ENSGT00950000182902.a.c ENSGT00940000156781 #21 ENSGT00940000160814 #22 ENSGT00530000063835.b #23 ENSGT00400000022086.a #24 ENSGT00510000048348 #25 ENSGT00940000157008 #26 ENSGT00390000009127 #27 ENSGT00940000156182 #28 ENSGT00940000153902.a #29 ENSGT00940000155638 #30 ENSGT00950000182917.b #31 ENSGT00390000000444 #33 ENSGT00940000155295 #34 ENSGT00390000017571 #36 ENSGT00940000159287 ENSGT00940000156352 ENSGT00390000011620.a.a.a Lizard MODERN SPECIES 3 ADCYAP1 (ENSACAG00000008729) YES1 (ENSACAG00000008639) ENOSF1 (ENSACAG00000008487) TYMS (ENSACAG00000008456) CLUL1 (ENSACAG00000008429) COLEC12 (ENSACAG00000008396) THOC1 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(ENSSPUG00000015476) #30