Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183034.B #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000158264.b ENSGT00940000156213 ENSGT00940000154347.b.b ENSGT00940000156592 ENSGT00940000157151 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00390000010045 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000182978.B ENSGT00940000164496 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 195 ENSGT00940000157999 ENSGT00410000025651.B ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00940000156115 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00390000010045 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000182978.B ENSGT00940000164496 ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00390000005972 ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 315 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00940000154531 ENSGT00390000002053 ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000183215.c.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 228 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT00950000183215.c.b Amniota ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000006264 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00390000007769 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000153587.b ENSGT00940000157034 ENSGT00940000161085 ENSGT00940000160992 ENSGT00940000160504 ENSGT00940000156761 ENSGT01100000263839 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144 Theria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00980000198642 ENSGT00940000155272 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00940000178388 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 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ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1184 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 Common shrew MODERN SPECIES 1309 RLF (ENSSARG00000000173) #22 TMCO2 (ENSSARG00000000180) #23 Hedgehog MODERN SPECIES 1869 RLF (ENSEEUG00000001288) #22 TMCO2 (ENSEEUG00000001319) #23 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111729 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 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27 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Pig MODERN SPECIES 14 ENSSSCG00000036451 ENSSSCG00000032082 ENSSSCG00000003666 ENSSSCG00000029705 PABPC4 (ENSSSCG00000003660) HEYL (ENSSSCG00000038956) NT5C1A (ENSSSCG00000003662) HPCAL4 (ENSSSCG00000023460) ENSSSCG00000003664 ENSSSCG00000037514 TRIT1 (ENSSSCG00000003667) ENSSSCG00000039761 MFSD2A (ENSSSCG00000003669) CAP1 (ENSSSCG00000003672) PPT1 (ENSSSCG00000036673) RLF (ENSSSCG00000003670) #22 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ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155824.C ENSGT00730000111729 ENSGT00940000155272.j ENSGT00940000154788.nb.a ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272.i ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00390000016051.i ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES ENSOARG00020025841 ENSOARG00020025845 ENSOARG00020025851 PABPC4 (ENSOARG00020025866) HEYL (ENSOARG00020025898) NT5C1A (ENSOARG00020025901) HPCAL4 (ENSOARG00020025905) PPIE (ENSOARG00020025915) 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ENSBMUG00000010124 ENSBMUG00000010116 Domestic yak MODERN SPECIES 22 MACF1 (ENSBGRG00000001404) ENSBGRG00000001003 ENSBGRG00000000845 HEYL (ENSBGRG00000000802) NT5C1A (ENSBGRG00000000790) HPCAL4 (ENSBGRG00000000777) PPIE (ENSBGRG00000000726) OXCT2 (ENSBGRG00000000695) ENSBGRG00000000664 ENSBGRG00000000655 TRIT1 (ENSBGRG00000000546) MYCL (ENSBGRG00000000513) MFSD2A (ENSBGRG00000000405) ENSBGRG00000000339 ENSBGRG00000000267 RLF (ENSBGRG00000000236) #22 TMCO2 (ENSBGRG00000000230) #23 ENSBGRG00000018213 ZMPSTE24 (ENSBGRG00000017914) COL9A2 (ENSBGRG00000017451) SMAP2 (ENSBGRG00000017114) ENSBGRG00000017070 ZFP69 (ENSBGRG00000017030) EXO5 (ENSBGRG00000017012) ZNF684 (ENSBGRG00000016941) ENSBGRG00000016909 RIMS3 (ENSBGRG00000016850) NFYC (ENSBGRG00000016660) KCNQ4 (ENSBGRG00000016298) CITED4 (ENSBGRG00000016268) ENSBGRG00000016241 American bison MODERN SPECIES 3342 MACF1 (ENSBBBG00000009386) ENSBBBG00000009391 ENSBBBG00000009395 HEYL (ENSBBBG00000009396) NT5C1A (ENSBBBG00000009398) HPCAL4 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(ENSCDRG00005012184) HEYL (ENSCDRG00005012353) NT5C1A (ENSCDRG00005012419) HPCAL4 (ENSCDRG00005012456) PPIE (ENSCDRG00005012507) ENSCDRG00005012658 ENSCDRG00005012813 TRIT1 (ENSCDRG00005012882) MYCL (ENSCDRG00005013289) MFSD2A (ENSCDRG00005013329) CAP1 (ENSCDRG00005013432) PPT1 (ENSCDRG00005013620) RLF (ENSCDRG00005013887) #22 TMCO2 (ENSCDRG00005013941) #23 ZMPSTE24 (ENSCDRG00005013984) ENSCDRG00005014109 SMAP2 (ENSCDRG00005014239) ZFP69B (ENSCDRG00005014292) ZFP69 (ENSCDRG00005014364) ZNF684 (ENSCDRG00005014415) RIMS3 (ENSCDRG00005014464) NFYC (ENSCDRG00005014542) KCNQ4 (ENSCDRG00005014732) CITED4 (ENSCDRG00005014841) CTPS1 (ENSCDRG00005014862) SLFNL1 (ENSCDRG00005014975) SCMH1 (ENSCDRG00005015060) FOXO6 (ENSCDRG00005015434) Alpaca MODERN SPECIES 434 TRIT1 (ENSVPAG00000003008) ENSVPAG00000003009 CAP1 (ENSVPAG00000003013) PPT1 (ENSVPAG00000003014) RLF (ENSVPAG00000003020) #22 TMCO2 (ENSVPAG00000003021) #23 ZMPSTE24 (ENSVPAG00000003023) ENSVPAG00000003024 SMAP2 (ENSVPAG00000003026) ZFP69B (ENSVPAG00000003027) ZFP69 (ENSVPAG00000003028) ZNF684 (ENSVPAG00000003031) RIMS3 (ENSVPAG00000003033) NFYC (ENSVPAG00000003034) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000178962 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000165766 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 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ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401.f Horse MODERN SPECIES 11 OXCT2 (ENSECAG00000010065) ENSECAG00000038706 PABPC4 (ENSECAG00000009396) HEYL (ENSECAG00000007220) NT5C1A (ENSECAG00000019710) HPCAL4 (ENSECAG00000019203) ENSECAG00000031692 ENSECAG00000008528 TRIT1 (ENSECAG00000010597) ENSECAG00000038999 MYCL (ENSECAG00000008765) MFSD2A (ENSECAG00000013728) ENSECAG00000052677 CAP1 (ENSECAG00000024658) PPT1 (ENSECAG00000017370) RLF (ENSECAG00000012776) #22 TMCO2 (ENSECAG00000037648) #23 ZMPSTE24 (ENSECAG00000007773) COL9A2 (ENSECAG00000010971) SMAP2 (ENSECAG00000024413) ZFP69B (ENSECAG00000023120) ZFP69 (ENSECAG00000022039) EXO5 (ENSECAG00000004928) ENSECAG00000047147 ZNF684 (ENSECAG00000022010) ENSECAG00000048355 RIMS3 (ENSECAG00000021113) NFYC 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ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 NDUFS5 (ENSRFEG00010004262) MACF1 (ENSRFEG00010003811) ENSRFEG00010004273 ENSRFEG00010004310 PABPC4 (ENSRFEG00010004353) HEYL (ENSRFEG00010004468) NT5C1A (ENSRFEG00010004485) HPCAL4 (ENSRFEG00010004498) ENSRFEG00010004530 ENSRFEG00010004561 TRIT1 (ENSRFEG00010004607) MYCL (ENSRFEG00010004654) MFSD2A (ENSRFEG00010004694) ENSRFEG00010004740 PPT1 (ENSRFEG00010004763) RLF (ENSRFEG00010004791) #22 ENSRFEG00010004804 TMCO2 (ENSRFEG00010004812) #23 ZMPSTE24 (ENSRFEG00010004824) COL9A2 (ENSRFEG00010004846) SMAP2 (ENSRFEG00010004874) ZFP69B (ENSRFEG00010004898) ZFP69 (ENSRFEG00010004907) EXO5 (ENSRFEG00010004913) ZNF684 (ENSRFEG00010004917) RIMS3 (ENSRFEG00010005135) NFYC 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ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c.s ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B Vervet Monkey MODERN SPECIES 12 MACF1 (ENSCSAG00000001128) ENSCSAG00000001129 ENSCSAG00000001130 PPIE (ENSCSAG00000001131) HPCAL4 (ENSCSAG00000001132) NT5C1A (ENSCSAG00000001133) HEYL (ENSCSAG00000001134) PABPC4 (ENSCSAG00000001135) ENSCSAG00000001136 TRIT1 (ENSCSAG00000001137) MYCL (ENSCSAG00000001138) MFSD2A (ENSCSAG00000001139) CAP1 (ENSCSAG00000001140) PPT1 (ENSCSAG00000001141) ENSCSAG00000001142 RLF (ENSCSAG00000001143) #22 TMCO2 (ENSCSAG00000001144) #23 ZMPSTE24 (ENSCSAG00000001145) COL9A2 (ENSCSAG00000001146) SMAP2 (ENSCSAG00000001147) ZFP69B (ENSCSAG00000001148) 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00860000135787 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00910000147126 ENSGT00940000161166 ENSGT00390000004380.m.a.a.b ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272.`c.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c.s ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 217 ENSMNEG00000043485 PABPC4 (ENSMNEG00000043054) ENSMNEG00000043139 HEYL (ENSMNEG00000009070) NT5C1A (ENSMNEG00000031973) ENSMNEG00000002154 HPCAL4 (ENSMNEG00000028502) ENSMNEG00000033191 PPIE (ENSMNEG00000031362) ENSMNEG00000034094 TRIT1 (ENSMNEG00000023137) MYCL 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ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.a.b.c.a.b.b.a.a.d ENSGT00940000159332 ENSGT01030000238095.b ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00440000034918.q.a.a.a.d.l.a.a ENSGT01090000260213.a.a.a.b.a.a.a ENSGT00910000144179.b.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES HEYL (ENSMFAG00000045585) NT5C1A (ENSMFAG00000056414) HPCAL4 (ENSMFAG00000033968) PPIE (ENSMFAG00000002082) ENSMFAG00000031586 ENSMFAG00000041908 ENSMFAG00000058462 TRIT1 (ENSMFAG00000001316) ENSMFAG00000052885 MYCL (ENSMFAG00000029625) ENSMFAG00000063746 ENSMFAG00000058771 MFSD2A (ENSMFAG00000003330) CAP1 (ENSMFAG00000036663) PPT1 (ENSMFAG00000029038) RLF (ENSMFAG00000001299) #22 TMCO2 (ENSMFAG00000038683) #23 ENSMFAG00000053876 ZMPSTE24 (ENSMFAG00000044167) COL9A2 (ENSMFAG00000028569) SMAP2 (ENSMFAG00000044100) ZFP69 (ENSMFAG00000038294) EXO5 (ENSMFAG00000008984) ZNF684 (ENSMFAG00000000321) ENSMFAG00000050468 ENSMFAG00000054328 RIMS3 (ENSMFAG00000036770) ENSMFAG00000058580 NFYC (ENSMFAG00000033858) KCNQ4 (ENSMFAG00000034264) ENSMFAG00000028126 Rhesus MODERN SPECIES HEYL (ENSMMUG00000050019) NT5C1A (ENSMMUG00000056128) HPCAL4 (ENSMMUG00000044273) PPIE (ENSMMUG00000018869) ENSMMUG00000058881 ENSMMUG00000063318 TRIT1 (ENSMMUG00000016220) ENSMMUG00000051893 ENSMMUG00000054563 MYCL (ENSMMUG00000016223) ENSMMUG00000060377 ENSMMUG00000053512 MFSD2A (ENSMMUG00000011264) CAP1 (ENSMMUG00000009188) PPT1 (ENSMMUG00000009189) RLF (ENSMMUG00000032180) #22 TMCO2 (ENSMMUG00000052510) #23 ZMPSTE24 (ENSMMUG00000005992) COL9A2 (ENSMMUG00000018664) SMAP2 (ENSMMUG00000013839) ENSMMUG00000057845 ZFP69B (ENSMMUG00000005836) EXO5 (ENSMMUG00000020398) ZNF684 (ENSMMUG00000009234) ENSMMUG00000050602 ENSMMUG00000056255 ENSMMUG00000059358 RIMS3 (ENSMMUG00000039139) NFYC (ENSMMUG00000014970) KCNQ4 (ENSMMUG00000019536) CITED4 (ENSMMUG00000043675) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155272.`c.b ENSGT00730000111729 ENSGT00940000155272.ac ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000004380.m.a.a.b ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272.`c.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c.s ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B Olive baboon MODERN SPECIES AKIRIN1 (ENSPANG00000004583) ENSPANG00000019099 MACF1 (ENSPANG00000019093) ENSPANG00000006813 PABPC4 (ENSPANG00000009484) HEYL (ENSPANG00000006227) NT5C1A (ENSPANG00000025518) HPCAL4 (ENSPANG00000006453) PPIE (ENSPANG00000000575) ENSPANG00000010056 TRIT1 (ENSPANG00000018125) MYCL (ENSPANG00000042839) MFSD2A (ENSPANG00000011715) CAP1 (ENSPANG00000006452) PPT1 (ENSPANG00000017273) RLF (ENSPANG00000018124) #22 TMCO2 (ENSPANG00000006394) #23 ZMPSTE24 (ENSPANG00000007506) COL9A2 (ENSPANG00000007011) ZFP69B (ENSPANG00000018450) ZFP69 (ENSPANG00000048994) EXO5 (ENSPANG00000032341) ZNF684 (ENSPANG00000018123) RIMS3 (ENSPANG00000010023) NFYC (ENSPANG00000026473) KCNQ4 (ENSPANG00000006225) CITED4 (ENSPANG00000008319) CTPS1 (ENSPANG00000006392) SLFNL1 (ENSPANG00000005801) SCMH1 (ENSPANG00000025516) FOXO6 (ENSPANG00000000435) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00730000111729 ENSGT00940000155272.ac ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00910000147126 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000004380.m.a.a.b ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272.`c.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c.s ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00440000034918.q.a.a.a.d.l.a.a ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B Drill MODERN SPECIES 672 ENSMLEG00000040128 MACF1 (ENSMLEG00000044445) ENSMLEG00000006499 PABPC4 (ENSMLEG00000040716) HEYL (ENSMLEG00000032705) ENSMLEG00000032704 NT5C1A (ENSMLEG00000038970) ENSMLEG00000040607 PPIE (ENSMLEG00000040735) ENSMLEG00000044426 TRIT1 (ENSMLEG00000035296) MYCL (ENSMLEG00000017162) MFSD2A (ENSMLEG00000040826) CAP1 (ENSMLEG00000044449) ENSMLEG00000043746 RLF (ENSMLEG00000040465) #22 TMCO2 (ENSMLEG00000034301) #23 ZMPSTE24 (ENSMLEG00000037696) COL9A2 (ENSMLEG00000035440) SMAP2 (ENSMLEG00000032355) ZFP69B (ENSMLEG00000014259) ZFP69 (ENSMLEG00000042959) EXO5 (ENSMLEG00000001570) ZNF684 (ENSMLEG00000035552) ENSMLEG00000041734 RIMS3 (ENSMLEG00000042796) NFYC (ENSMLEG00000038570) KCNQ4 (ENSMLEG00000032111) CTPS1 (ENSMLEG00000036132) Sooty mangabey MODERN SPECIES 227 PABPC4 (ENSCATG00000042164) ENSCATG00000002769 ENSCATG00000005536 HEYL (ENSCATG00000037907) ENSCATG00000036036 NT5C1A (ENSCATG00000038875) HPCAL4 (ENSCATG00000032488) ENSCATG00000032456 PPIE (ENSCATG00000034495) ENSCATG00000037613 TRIT1 (ENSCATG00000034344) MYCL (ENSCATG00000033384) MFSD2A (ENSCATG00000032272) ENSCATG00000035987 PPT1 (ENSCATG00000035844) RLF (ENSCATG00000032206) #22 TMCO2 (ENSCATG00000044427) #23 ZMPSTE24 (ENSCATG00000043666) COL9A2 (ENSCATG00000032540) SMAP2 (ENSCATG00000039372) ZFP69B (ENSCATG00000032477) ZFP69 (ENSCATG00000030938) EXO5 (ENSCATG00000003100) ZNF684 (ENSCATG00000032130) RIMS3 (ENSCATG00000017445) NFYC (ENSCATG00000032882) KCNQ4 (ENSCATG00000038249) ENSCATG00000030649 CTPS1 (ENSCATG00000033018) SLFNL1 (ENSCATG00000037639) SCMH1 (ENSCATG00000036607) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00910000147126 ENSGT00940000161166 ENSGT00390000004380.m.a.a.b ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272.ac ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272.`c.a ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00550000076451.a.a.b ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c.s ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689.c ENSGT00940000159209 ENSGT00440000034918.q.a.a.a.d.l.a.a ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2906 ENSRROG00000035560 ENSRROG00000036630 PABPC4 (ENSRROG00000033355) HEYL (ENSRROG00000035732) NT5C1A (ENSRROG00000029433) ENSRROG00000044816 HPCAL4 (ENSRROG00000039612) PPIE (ENSRROG00000044935) ENSRROG00000036368 TRIT1 (ENSRROG00000042670) MYCL (ENSRROG00000039181) ENSRROG00000042951 MFSD2A (ENSRROG00000045774) CAP1 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#22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155824.C ENSGT00980000198642 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155824.C ENSGT00980000198642 ENSGT00940000164770 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155824.C ENSGT00980000198642 ENSGT00940000164770 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000155272 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b 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NT5C1A (ENSSTOG00000010430) HPCAL4 (ENSSTOG00000033957) PPIE (ENSSTOG00000010445) ENSSTOG00000031537 TRIT1 (ENSSTOG00000006446) ENSSTOG00000034207 MYCL (ENSSTOG00000005037) MFSD2A (ENSSTOG00000005042) CAP1 (ENSSTOG00000022338) PPT1 (ENSSTOG00000005065) ENSSTOG00000033898 #22 ENSSTOG00000022071 #22 TMCO2 (ENSSTOG00000004814) #23 ZMPSTE24 (ENSSTOG00000020016) COL9A2 (ENSSTOG00000005862) SMAP2 (ENSSTOG00000005913) ZFP69B (ENSSTOG00000009229) ZFP69 (ENSSTOG00000031462) EXO5 (ENSSTOG00000007049) RIMS3 (ENSSTOG00000001897) NFYC (ENSSTOG00000001900) KCNQ4 (ENSSTOG00000001907) ENSSTOG00000031714 CTPS1 (ENSSTOG00000014218) SLFNL1 (ENSSTOG00000027731) SCMH1 (ENSSTOG00000013099) Squirrel MODERN SPECIES 74 MACF1 (ENSSTOG00000028672) ENSSTOG00000029371 PABPC4 (ENSSTOG00000010416) HEYL (ENSSTOG00000010427) NT5C1A (ENSSTOG00000010430) HPCAL4 (ENSSTOG00000033957) PPIE (ENSSTOG00000010445) ENSSTOG00000031537 TRIT1 (ENSSTOG00000006446) ENSSTOG00000034207 MYCL (ENSSTOG00000005037) MFSD2A (ENSSTOG00000005042) CAP1 (ENSSTOG00000022338) PPT1 (ENSSTOG00000005065) ENSSTOG00000033898 #22 ENSSTOG00000022071 #22 TMCO2 (ENSSTOG00000004814) #23 ZMPSTE24 (ENSSTOG00000020016) COL9A2 (ENSSTOG00000005862) SMAP2 (ENSSTOG00000005913) ZFP69B (ENSSTOG00000009229) ZFP69 (ENSSTOG00000031462) EXO5 (ENSSTOG00000007049) RIMS3 (ENSSTOG00000001897) NFYC (ENSSTOG00000001900) KCNQ4 (ENSSTOG00000001907) ENSSTOG00000031714 CTPS1 (ENSSTOG00000014218) SLFNL1 (ENSSTOG00000027731) SCMH1 (ENSSTOG00000013099) FOXO6 (ENSSTOG00000026753) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155824.C ENSGT00980000198642 ENSGT00940000164770 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A Kangaroo rat MODERN SPECIES 352 Ndufs5 (ENSDORG00000014651) ENSDORG00000024495 ENSDORG00000023553 ENSDORG00000016166 Pabpc4 (ENSDORG00000011581) Heyl (ENSDORG00000024912) Nt5c1a (ENSDORG00000028589) Hpcal4 (ENSDORG00000005161) Ppie (ENSDORG00000005175) ENSDORG00000025089 Trit1 (ENSDORG00000012449) Mycl (ENSDORG00000026501) Mfsd2a (ENSDORG00000012839) ENSDORG00000003053 Ppt1 (ENSDORG00000027642) Rlf (ENSDORG00000010416) #22 Tmco2 (ENSDORG00000024253) #23 Zmpste24 (ENSDORG00000014026) Col9a2 (ENSDORG00000014027) Smap2 (ENSDORG00000016161) Zfp69 (ENSDORG00000024989) Exo5 (ENSDORG00000003571) Rims3 (ENSDORG00000014652) Nfyc (ENSDORG00000009863) Kcnq4 (ENSDORG00000009865) Cited4 (ENSDORG00000024161) Ctps (ENSDORG00000007319) Slfnl1 (ENSDORG00000004953) Scmh1 (ENSDORG00000004955) Foxo6 (ENSDORG00000024053) Edn2 (ENSDORG00000006073) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155824.C ENSGT00980000198642 ENSGT00940000164770 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 117 Khdrbs1 (ENSJJAG00000016809) ENSJJAG00000022891 ENSJJAG00000023812 Adgrb2 (ENSJJAG00000017327) ENSJJAG00000019371 Pef1 (ENSJJAG00000018921) Hcrtr1 (ENSJJAG00000024301) Tinagl1 (ENSJJAG00000019903) ENSJJAG00000023596 ENSJJAG00000000300 Mycl (ENSJJAG00000011159) Mfsd2a (ENSJJAG00000015941) Cap1 (ENSJJAG00000021395) Ppt1 (ENSJJAG00000016991) ENSJJAG00000021094 Rlf (ENSJJAG00000013083) #22 Tmco2 (ENSJJAG00000006506) #23 Zmpste24 (ENSJJAG00000023367) Col9a2 (ENSJJAG00000000950) Smap2 (ENSJJAG00000024140) ENSJJAG00000022543 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155824.C ENSGT00980000198642 ENSGT00940000164770 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 879 Mycl (ENSNGAG00000017487) ENSNGAG00000017860 Mfsd2a (ENSNGAG00000003501) ENSNGAG00000015371 ENSNGAG00000017004 ENSNGAG00000017552 #22 ENSNGAG00000020587 #22 Zmpste24 (ENSNGAG00000000244) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 879 Mycl (ENSNGAG00000017487) ENSNGAG00000017860 Mfsd2a (ENSNGAG00000003501) ENSNGAG00000015371 ENSNGAG00000017004 ENSNGAG00000017552 #22 ENSNGAG00000020587 #22 Zmpste24 (ENSNGAG00000000244) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 321 ENSNGAG00000001253 #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000164770.a ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000164770.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A Murinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A Mus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00390000000102.a ENSGT00390000000102.b ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00860000135841 ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788.s ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00860000135841 ENSGT00910000144179.b.b.g ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154788.s ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00390000000102.a ENSGT00390000000102.b.b.a ENSGT00390000000102.b.b.b ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00860000135841 ENSGT00910000144179.b.b.g ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 Mouse MODERN SPECIES 13 Heyl (ENSMUSG00000032744) Nt5c1a (ENSMUSG00000054958) Hpcal4 (ENSMUSG00000046093) Ppie (ENSMUSG00000028651) Oxct2b (ENSMUSG00000076438) Bmp8b (ENSMUSG00000002384) Trit1 (ENSMUSG00000028653) Mycl (ENSMUSG00000028654) Mfsd2a (ENSMUSG00000028655) Cap1 (ENSMUSG00000028656) Ppt1 (ENSMUSG00000028657) 9530002B09Rik (ENSMUSG00000023263) Gm12887 (ENSMUSG00000078575) Gm12886 (ENSMUSG00000078576) Gm12888 (ENSMUSG00000073764) Rlf (ENSMUSG00000049878) #22 Tmco2 (ENSMUSG00000078577) #23 Zmpste24 (ENSMUSG00000043207) Col9a2 (ENSMUSG00000028626) Smap2 (ENSMUSG00000032870) Zfp69 (ENSMUSG00000064141) Exo5 (ENSMUSG00000028629) Rims3 (ENSMUSG00000032890) Nfyc (ENSMUSG00000032897) Kcnq4 (ENSMUSG00000028631) Cited4 (ENSMUSG00000070803) Ctps (ENSMUSG00000028633) Slfnl1 (ENSMUSG00000047518) Scmh1 (ENSMUSG00000000085) Foxo6 (ENSMUSG00000052135) Edn2 (ENSMUSG00000028635) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154788.s ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000164770.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00390000000102.a ENSGT00390000000102.b.b.a ENSGT00390000000102.b.a ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00860000135841 ENSGT00910000144179.b.b.g ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 spretus MODERN SPECIES 13 Pabpc4 (MGP_SPRETEiJ_G0027415) Heyl (MGP_SPRETEiJ_G0027414) Nt5c1a (MGP_SPRETEiJ_G0027413) Hpcal4 (MGP_SPRETEiJ_G0027412) Ppie (MGP_SPRETEiJ_G0027411) MGP_SPRETEiJ_G0027410 Bmp8b (MGP_SPRETEiJ_G0027409) Trit1 (MGP_SPRETEiJ_G0027408) MGP_SPRETEiJ_G0027407 Mfsd2a (MGP_SPRETEiJ_G0027406) Cap1 (MGP_SPRETEiJ_G0027405) Ppt1 (MGP_SPRETEiJ_G0027404) MGP_SPRETEiJ_G0027403 MGP_SPRETEiJ_G0027402 MGP_SPRETEiJ_G0027401 Rlf (MGP_SPRETEiJ_G0027400) #22 Tmco2 (MGP_SPRETEiJ_G0027399) #23 Zmpste24 (MGP_SPRETEiJ_G0027398) Col9a2 (MGP_SPRETEiJ_G0027397) Smap2 (MGP_SPRETEiJ_G0027396) Zfp69 (MGP_SPRETEiJ_G0027395) Exo5 (MGP_SPRETEiJ_G0027394) Rims3 (MGP_SPRETEiJ_G0027393) Nfyc (MGP_SPRETEiJ_G0027392) Kcnq4 (MGP_SPRETEiJ_G0027391) Cited4 (MGP_SPRETEiJ_G0027390) MGP_SPRETEiJ_G0027389 Ctps (MGP_SPRETEiJ_G0027388) Slfnl1 (MGP_SPRETEiJ_G0027387) Scmh1 (MGP_SPRETEiJ_G0027386) Foxo6 (MGP_SPRETEiJ_G0027385) Steppe mouse MODERN SPECIES 3192 Gm12886 (ENSMSIG00000009722) ENSMSIG00000009736 Rlf (ENSMSIG00000009747) #22 Tmco2 (ENSMSIG00000009780) #23 Zmpste24 (ENSMSIG00000009797) Col9a2 (ENSMSIG00000010004) Smap2 (ENSMSIG00000010052) Zfp69 (ENSMSIG00000010091) Exo5 (ENSMSIG00000010139) Rims3 (ENSMSIG00000010151) Nfyc (ENSMSIG00000010169) Kcnq4 (ENSMSIG00000010258) Cited4 (ENSMSIG00000010267) ENSMSIG00000010277 Ctps (ENSMSIG00000010291) Slfnl1 (ENSMSIG00000010327) Scmh1 (ENSMSIG00000010338) Foxo6 (ENSMSIG00000010418) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 13 Ndufs5 (MGP_CAROLIEiJ_G0026438) Macf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026437) MGP_CAROLIEiJ_G0026436 Pabpc4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026435) Heyl (MGP_CAROLIEiJ_G0026434) Nt5c1a (MGP_CAROLIEiJ_G0026433) Hpcal4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026432) Ppie (MGP_CAROLIEiJ_G0026431) MGP_CAROLIEiJ_G0026430 Bmp8b (MGP_CAROLIEiJ_G0026429) Trit1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026428) Mycl (MGP_CAROLIEiJ_G0026427) Mfsd2a (MGP_CAROLIEiJ_G0026426) Cap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026425) Ppt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026424) Rlf (MGP_CAROLIEiJ_G0026423) #22 Tmco2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026422) #23 Zmpste24 (MGP_CAROLIEiJ_G0026421) Col9a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026420) Smap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026419) Zfp69 (MGP_CAROLIEiJ_G0026418) Exo5 (MGP_CAROLIEiJ_G0026417) Rims3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026416) Nfyc (MGP_CAROLIEiJ_G0026415) Kcnq4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026414) Cited4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026413) MGP_CAROLIEiJ_G0026412 Ctps (MGP_CAROLIEiJ_G0026411) Slfnl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026410) Scmh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026409) Foxo6 (MGP_CAROLIEiJ_G0026408) Shrew mouse MODERN SPECIES 19 Macf1 (MGP_PahariEiJ_G0028767) Bmp8a (MGP_PahariEiJ_G0028766) Pabpc4 (MGP_PahariEiJ_G0028765) Heyl (MGP_PahariEiJ_G0028764) Nt5c1a (MGP_PahariEiJ_G0028763) Hpcal4 (MGP_PahariEiJ_G0028762) Ppie (MGP_PahariEiJ_G0028761) MGP_PahariEiJ_G0028760 MGP_PahariEiJ_G0028759 Trit1 (MGP_PahariEiJ_G0028758) Mycl (MGP_PahariEiJ_G0028757) Mfsd2a (MGP_PahariEiJ_G0028756) Cap1 (MGP_PahariEiJ_G0028755) Ppt1 (MGP_PahariEiJ_G0028754) MGP_PahariEiJ_G0028753 Rlf (MGP_PahariEiJ_G0028752) #22 Tmco2 (MGP_PahariEiJ_G0028751) #23 Zmpste24 (MGP_PahariEiJ_G0028750) Col9a2 (MGP_PahariEiJ_G0028749) Smap2 (MGP_PahariEiJ_G0028748) MGP_PahariEiJ_G0028747 Exo5 (MGP_PahariEiJ_G0028746) Rims3 (MGP_PahariEiJ_G0028745) Nfyc (MGP_PahariEiJ_G0028744) Kcnq4 (MGP_PahariEiJ_G0028743) Cited4 (MGP_PahariEiJ_G0028742) MGP_PahariEiJ_G0028741 Ctps (MGP_PahariEiJ_G0028740) Slfnl1 (MGP_PahariEiJ_G0028739) Scmh1 (MGP_PahariEiJ_G0028738) Foxo6 (MGP_PahariEiJ_G0028737) Rat MODERN SPECIES 15 Bmp8a (ENSRNOG00000030155) Oxct2a (ENSRNOG00000070053) Pabpc4 (ENSRNOG00000015642) Heyl (ENSRNOG00000015318) Nt5c1a (ENSRNOG00000068555) Hpcal4 (ENSRNOG00000050983) Ppie (ENSRNOG00000014762) Bmp8b (ENSRNOG00000033209) Trit1 (ENSRNOG00000014274) Mycl (ENSRNOG00000014259) Mfsd2a (ENSRNOG00000014008) Cap1 (ENSRNOG00000013492) Ppt1 (ENSRNOG00000012616) Twf1-ps1 (ENSRNOG00000012595) AC124205.2 (ENSRNOG00000059975) Rlf (ENSRNOG00000027921) #22 Tmco2 (ENSRNOG00000012340) #23 Zmpste24 (ENSRNOG00000012054) Col9a2 (ENSRNOG00000011502) LOC680700 (ENSRNOG00000011484) Smap2 (ENSRNOG00000011421) Zfp69 (ENSRNOG00000028662) Exo5 (ENSRNOG00000037432) Rims3 (ENSRNOG00000011171) Nfyc (ENSRNOG00000010735) Kcnq4 (ENSRNOG00000060435) Cited4 (ENSRNOG00000046607) ENSRNOG00000065971 Ctps1 (ENSRNOG00000009963) Slfnl1 (ENSRNOG00000032183) Foxo6 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ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 ENSPEMG00000026409 ENSPEMG00000022339 ENSPEMG00000023569 Heyl (ENSPEMG00000028938) Nt5c1a (ENSPEMG00000021341) Hpcal4 (ENSPEMG00000031286) Ppie (ENSPEMG00000013681) ENSPEMG00000024171 Trit1 (ENSPEMG00000022418) Mycl (ENSPEMG00000029362) Mfsd2a (ENSPEMG00000022479) Cap1 (ENSPEMG00000021949) Ppt1 (ENSPEMG00000008449) ENSPEMG00000030310 ENSPEMG00000009772 Rlf (ENSPEMG00000027824) #22 Tmco2 (ENSPEMG00000018032) #23 Zmpste24 (ENSPEMG00000017887) Col9a2 (ENSPEMG00000018729) Smap2 (ENSPEMG00000022978) Zfp69 (ENSPEMG00000004280) Exo5 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Slfnl1 (ENSMOCG00000019476) Scmh1 (ENSMOCG00000001256) Foxo6 (ENSMOCG00000007735) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158787 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000164770.b ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 ENSGT00940000161401 ENSGT00950000183053.A Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 ENSCGRG00001024169 Pabpc4 (ENSCGRG00001018166) Heyl (ENSCGRG00001014507) Nt5c1a (ENSCGRG00001015879) Hpcal4 (ENSCGRG00001017506) Ppie (ENSCGRG00001018491) Bmp8b (ENSCGRG00001024934) 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(ENSOCUG00000016294) SLFNL1 (ENSOCUG00000004701) SCMH1 (ENSOCUG00000004703) Pika MODERN SPECIES 1095 CAP1 (ENSOPRG00000007264) PPT1 (ENSOPRG00000007275) RLF (ENSOPRG00000007289) #22 Tree shrew MODERN SPECIES 700 RLF (ENSTBEG00000013653) #22 ZMPSTE24 (ENSTBEG00000013932) ENSTBEG00000014141 ENSTBEG00000015005 ZFP69 (ENSTBEG00000015175) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Sloth MODERN SPECIES 1592 RLF (ENSCHOG00000013006) #22 Armadillo MODERN SPECIES 767 ENSDNOG00000041309 ENSDNOG00000040636 ENSDNOG00000002404 ENSDNOG00000018444 HEYL (ENSDNOG00000010392) NT5C1A (ENSDNOG00000014666) ENSDNOG00000034942 ENSDNOG00000044541 TRIT1 (ENSDNOG00000001994) MYCL (ENSDNOG00000001996) MFSD2A (ENSDNOG00000014078) ENSDNOG00000016869 PPT1 (ENSDNOG00000005527) RLF (ENSDNOG00000035279) #22 TMCO2 (ENSDNOG00000045954) #23 ZMPSTE24 (ENSDNOG00000038575) COL9A2 (ENSDNOG00000043096) SMAP2 (ENSDNOG00000007914) ZFP69B (ENSDNOG00000017460) ZFP69 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ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00940000158790 ENSGT00390000009130.a.b ENSGT00940000155272 ENSGT00390000015214 ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000163434 ENSGT00940000162278 ENSGT00390000015205 ENSGT00940000163099 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00530000063624.C ENSGT00910000144179.b.b ENSGT00410000025651.B ENSGT00940000157999 Elephant MODERN SPECIES 332 ENSLAFG00000030249 ENSLAFG00000010722 ENSLAFG00000017624 ENSLAFG00000028312 PABPC4 (ENSLAFG00000000151) HEYL (ENSLAFG00000027563) NT5C1A (ENSLAFG00000027551) HPCAL4 (ENSLAFG00000012324) ENSLAFG00000008493 ENSLAFG00000031581 TRIT1 (ENSLAFG00000016876) ENSLAFG00000001935 MFSD2A (ENSLAFG00000003074) CAP1 (ENSLAFG00000005592) PPT1 (ENSLAFG00000022663) RLF (ENSLAFG00000015722) #22 TMCO2 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ENSGT00980000198702 ENSGT00940000161782 ENSGT00940000160103 ENSGT00940000162194 ENSGT00940000154383 ENSGT00940000155718 Opossum MODERN SPECIES 3 RHBDL2 (ENSMODG00000047333) ENSMODG00000017703 ENSMODG00000048410 MACF1 (ENSMODG00000017689) ENSMODG00000017664 PPIE (ENSMODG00000017659) PABPC4 (ENSMODG00000017657) ENSMODG00000017653 ENSMODG00000017652 ENSMODG00000017650 TRIT1 (ENSMODG00000041050) ENSMODG00000017647 MFSD2A (ENSMODG00000017646) CAP1 (ENSMODG00000017643) PPT1 (ENSMODG00000017638) RLF (ENSMODG00000017631) #22 ENSMODG00000017626 #23 ZMPSTE24 (ENSMODG00000017624) COL9A2 (ENSMODG00000017617) SMAP2 (ENSMODG00000017597) RIMS3 (ENSMODG00000017587) NFYC (ENSMODG00000017585) KCNQ4 (ENSMODG00000017582) TINAGL1 (ENSMODG00000028729) PEF1 (ENSMODG00000017573) ENSMODG00000040929 ENSMODG00000017556 PTP4A2 (ENSMODG00000017554) ENSMODG00000017551 ENSMODG00000017545 KPNA6 (ENSMODG00000017528) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 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ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000160023 ENSGT00940000155722 ENSGT00980000198702 ENSGT00940000161782 ENSGT00940000160103 ENSGT00940000162194 ENSGT00940000154383 ENSGT00940000155718 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002919 ENSGT00940000155824.C ENSGT00940000155272 ENSGT00940000158790 ENSGT00940000154788 ENSGT00940000161351 ENSGT00390000017767.b.b ENSGT00940000161166 ENSGT00390000015159.a.a ENSGT00390000015214.w ENSGT00390000015214.x ENSGT00940000158613 ENSGT00390000005318.b.b.b ENSGT00390000017955.c ENSGT00940000156790 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000001528 #23 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000161290 ENSGT00940000158387 ENSGT00940000159332 ENSGT00940000155689 ENSGT00940000159209 ENSGT00940000160023 ENSGT00940000155722.k ENSGT00980000198702 ENSGT00940000161782 ENSGT00940000160103 ENSGT00940000162194 ENSGT00940000154383 ENSGT00940000155718 koala MODERN SPECIES 14 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Episquamata ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002748 ENSGT00940000161100 ENSGT00390000016319 ENSGT00940000161496 ENSGT01030000234637.a.b.e ENSGT01050000244971.C.c.a.b ENSGT01020000230389.b.a.b.d.b.b.a.b.a.a ENSGT01050000244971.C.c.a.a.a ENSGT01050000244971.C.c.a.a.b.b ENSGT00510000047481 ENSGT00510000048354 ENSGT00550000074792.b ENSGT00940000160345 ENSGT00940000164072 ENSGT00390000001041 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000006264 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 Laterata ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000161100.g ENSGT00390000016319 ENSGT00940000161496 ENSGT01030000234637.a.b.e ENSGT01050000244971.C.c.a.b ENSGT01050000244971.C.c.a.a.b.a.b ENSGT01020000230389.b.a.b.d.b.b.a.b.a.b ENSGT01050000244971.C.c.a.a.a ENSGT01050000244971.C.c.a.a.b.b ENSGT00510000047481 ENSGT00510000048354 ENSGT00550000074792.b ENSGT00940000160345 ENSGT00940000164072 ENSGT00390000001041 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Common wall lizard DUPLICATION Common wall lizard MODERN SPECIES 16 ENSPMRG00000015094 ENSPMRG00000015100 ENSPMRG00000015103 ENSPMRG00000015110 DBR1 (ENSPMRG00000015117) IL20RB (ENSPMRG00000015122) ENSPMRG00000015125 DYRK1B (ENSPMRG00000015133) ENSPMRG00000015138 ENSPMRG00000015141 ENSPMRG00000015143 #22 CTU1 (ENSPMRG00000015146) ENSPMRG00000015147 ENSPMRG00000015150 ENSPMRG00000015152 ENSPMRG00000015156 #22 ENSPMRG00000015161 ZMPSTE24 (ENSPMRG00000015166) KDM1A 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ENSGT00940000156115 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 ENSGT00940000164552 ENSGT00390000015364.b ENSGT00940000157291 ENSGT00940000156762 ENSGT00530000063402.a.a.b ENSGT00950000183028.a.b ENSGT00390000005813 ENSGT00940000165372 ENSGT00950000183031.A.a.a ENSGT00390000017974 ENSGT01090000260070.C ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000006264 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00390000010045 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Great tit MODERN SPECIES 15 RSPO1 (ENSPMJG00000006854) ENSPMJG00000006855 CDCA8 (ENSPMJG00000006856) ENSPMJG00000006857 YRDC (ENSPMJG00000006858) MTF1 (ENSPMJG00000006861) INPP5B (ENSPMJG00000006867) SF3A3 (ENSPMJG00000006882) FHL3 (ENSPMJG00000006888) UTP11 (ENSPMJG00000006889) ENSPMJG00000006894 RRAGC (ENSPMJG00000006909) MYCBP (ENSPMJG00000006912) GJA9 (ENSPMJG00000006919) ENSPMJG00000006922 RLF (ENSPMJG00000006923) #22 ZMPSTE24 (ENSPMJG00000006926) KDM1A (ENSPMJG00000006928) LUZP1 (ENSPMJG00000007066) HTR1D (ENSPMJG00000007068) HNRNPR (ENSPMJG00000007076) ATP5IF1 (ENSPMJG00000007080) DNAJC8 (ENSPMJG00000007082) PTAFR (ENSPMJG00000007087) EYA3 (ENSPMJG00000007089) XKR8 (ENSPMJG00000007095) RPA2 (ENSPMJG00000007097) SMPDL3B (ENSPMJG00000007106) PPP1R8 (ENSPMJG00000007111) STX12 (ENSPMJG00000007115) CITED4 (ENSPMJG00000007118) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00810000125524 ENSGT00940000158871 ENSGT00390000008551 ENSGT00390000011115 ENSGT00940000164552 ENSGT00390000015364.b ENSGT00940000157291 ENSGT00940000156762 ENSGT00530000063402.a.a.b ENSGT00950000183028.a.b ENSGT00390000005813 ENSGT00940000165372 ENSGT00950000183031.A.a.a ENSGT00390000017974 ENSGT01090000260070.C ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00390000010045 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00390000010045 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00530000063624.C Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00390000010045 ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Zebra finch MODERN SPECIES 16 RSPO1 (ENSTGUG00000001536) ENSTGUG00000019470 ENSTGUG00000022284 C23H1orf109 (ENSTGUG00000001534) CDCA8 (ENSTGUG00000001531) ENSTGUG00000001509 MTF1 (ENSTGUG00000001500) INPP5B (ENSTGUG00000001481) SF3A3 (ENSTGUG00000001466) FHL3 (ENSTGUG00000001464) UTP11 (ENSTGUG00000001453) ENSTGUG00000028583 RRAGC (ENSTGUG00000001449) GJA9 (ENSTGUG00000024329) ENSTGUG00000029717 RLF (ENSTGUG00000001447) #22 ZMPSTE24 (ENSTGUG00000001445) KDM1A (ENSTGUG00000001439) LUZP1 (ENSTGUG00000001438) ENSTGUG00000001436 Common canary MODERN SPECIES 49 ENSSCAG00000015197 CDCA8 (ENSSCAG00000015192) ENSSCAG00000015184 ENSSCAG00000015183 YRDC (ENSSCAG00000015177) MTF1 (ENSSCAG00000015171) INPP5B (ENSSCAG00000015164) ENSSCAG00000015138 FHL3 (ENSSCAG00000015125) UTP11 (ENSSCAG00000015118) ENSSCAG00000015115 RRAGC (ENSSCAG00000015111) MYCBP (ENSSCAG00000015108) GJA9 (ENSSCAG00000015104) NFKBID (ENSSCAG00000015101) RLF (ENSSCAG00000015097) #22 ZMPSTE24 (ENSSCAG00000015080) KDM1A (ENSSCAG00000014914) LUZP1 (ENSSCAG00000014839) HTR1D (ENSSCAG00000014835) HNRNPR (ENSSCAG00000014830) ENSSCAG00000014822 DNAJC8 (ENSSCAG00000014817) PTAFR (ENSSCAG00000014812) EYA3 (ENSSCAG00000014797) XKR8 (ENSSCAG00000014785) ENSSCAG00000014780 SMPDL3B (ENSSCAG00000014770) PPP1R8 (ENSSCAG00000014759) STX12 (ENSSCAG00000014753) CITED4 (ENSSCAG00000014742) Medium ground finch MODERN SPECIES 202 ENSGFOG00000014349 YRDC (ENSGFOG00000014351) MTF1 (ENSGFOG00000014353) INPP5B (ENSGFOG00000014358) SF3A3 (ENSGFOG00000014363) FHL3 (ENSGFOG00000014368) ENSGFOG00000014369 UTP11 (ENSGFOG00000001885) RRAGC (ENSGFOG00000002171) MYCBP (ENSGFOG00000002347) GJA9 (ENSGFOG00000002490) RLF (ENSGFOG00000002519) #22 ZMPSTE24 (ENSGFOG00000002529) KDM1A (ENSGFOG00000002574) LUZP1 (ENSGFOG00000002824) HTR1D (ENSGFOG00000002859) HNRNPR (ENSGFOG00000002883) DNAJC8 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(ENSFALG00000014287) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 Kakapo MODERN SPECIES 6 MACO1 (ENSSHBG00005006097) LDLRAP1 (ENSSHBG00005006122) MAN1C1 (ENSSHBG00005006149) ENSSHBG00005006191 MTFR1L (ENSSHBG00005006204) STMN1 (ENSSHBG00005006218) PAQR7 (ENSSHBG00005006235) ENSSHBG00005006251 SLC30A2 (ENSSHBG00005006276) TRIM63 (ENSSHBG00005006297) PDIK1L (ENSSHBG00005006321) FAM110D (ENSSHBG00005006339) ZNF593 (ENSSHBG00005006370) ENSSHBG00005006381 CNKSR1 (ENSSHBG00005006401) RLF (ENSSHBG00005006421) #22 ZMPSTE24 (ENSSHBG00005006439) ENSSHBG00005006470 RNF19B (ENSSHBG00005006496) AK2 (ENSSHBG00005006521) AZIN2 (ENSSHBG00005006553) NDUFS5 (ENSSHBG00005006581) MACF1 (ENSSHBG00005008256) ENSSHBG00005018704 ENSSHBG00005018713 ENSSHBG00005018719 PABPC4 (ENSSHBG00005018728) HEYL (ENSSHBG00005018739) NT5C1A (ENSSHBG00005018743) HPCAL4 (ENSSHBG00005018749) ENSSHBG00005018756 Golden eagle MODERN SPECIES 7 IRF7 (ENSACCG00020010394) ENSACCG00020010384 ENSACCG00020010361 RASSF7 (ENSACCG00020010335) LRRC56 (ENSACCG00020010309) HRAS (ENSACCG00020010287) ENSACCG00020010265 RNH1 (ENSACCG00020010244) CHKA (ENSACCG00020010220) KMT5B (ENSACCG00020010199) ENSACCG00020010186 LRP5 (ENSACCG00020010174) PPP6R3 (ENSACCG00020010116) GAL (ENSACCG00020010062) CPT1A (ENSACCG00020010046) RLF (ENSACCG00020010025) #22 ZMPSTE24 (ENSACCG00020010004) KDM1A (ENSACCG00020009958) LUZP1 (ENSACCG00020009928) HTR1D (ENSACCG00020009921) HNRNPR (ENSACCG00020009901) ENSACCG00020009880 DNAJC8 (ENSACCG00020009867) PTAFR (ENSACCG00020009857) EYA3 (ENSACCG00020009827) XKR8 (ENSACCG00020009794) ENSACCG00020009781 ENSACCG00020009763 RPA2 (ENSACCG00020009745) ENSACCG00020009729 PPP1R8 (ENSACCG00020009704) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Anatidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Pink-footed goose MODERN SPECIES 107 RLF (ENSABRG00000008728) #22 ZMPSTE24 (ENSABRG00000008737) KDM1A (ENSABRG00000008753) LUZP1 (ENSABRG00000008776) ENSABRG00000008785 HNRNPR (ENSABRG00000008788) ENSABRG00000008801 DNAJC8 (ENSABRG00000008806) PTAFR (ENSABRG00000008835) EYA3 (ENSABRG00000008872) XKR8 (ENSABRG00000008945) SMPDL3B (ENSABRG00000008952) RPA2 (ENSABRG00000008960) THEMIS2 (ENSABRG00000008971) PPP1R8 (ENSABRG00000008978) STX12 (ENSABRG00000008993) Duck MODERN SPECIES 15 RLF (ENSAPLG00000011786) #22 ZMPSTE24 (ENSAPLG00000011563) ENSAPLG00000026503 KDM1A (ENSAPLG00000011113) LUZP1 (ENSAPLG00000019114) ENSAPLG00000025845 DNAJC8 (ENSAPLG00000003576) ENSAPLG00000002014 ENSAPLG00000023614 HNRNPR (ENSAPLG00000003755) ENSAPLG00000029661 PTAFR (ENSAPLG00000001444) EYA3 (ENSAPLG00000002973) XKR8 (ENSAPLG00000029716) SMPDL3B (ENSAPLG00000002828) RPA2 (ENSAPLG00000002616) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159398 ENSGT00940000160932 ENSGT00390000007371 ENSGT00950000182900.B ENSGT00940000156338 ENSGT00940000160747 ENSGT00390000017418 ENSGT00390000016565 ENSGT00940000155361 ENSGT00390000015719.c ENSGT00390000004191 ENSGT00950000183172.B ENSGT01090000260040.b.b.b.a ENSGT00940000156585 ENSGT00940000162934 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Japanese quail MODERN SPECIES 15 ENSCJPG00005016033 ENSCJPG00005016032 TMEM222 (ENSCJPG00005016031) WDTC1 (ENSCJPG00005016030) SLC9A1 (ENSCJPG00005016029) TENT5B (ENSCJPG00005016028) ENSCJPG00005016026 KDF1 (ENSCJPG00005016025) NUDC (ENSCJPG00005016024) NR0B2 (ENSCJPG00005016022) GPATCH3 (ENSCJPG00005016021) GPN2 (ENSCJPG00005016020) SFN (ENSCJPG00005016019) ZDHHC18 (ENSCJPG00005016018) ENSCJPG00005016016 RLF (ENSCJPG00005016014) #22 ZMPSTE24 (ENSCJPG00005016012) KDM1A (ENSCJPG00005015581) LUZP1 (ENSCJPG00005015576) ENSCJPG00005015575 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Chicken MODERN SPECIES 15 MAP3K6 (ENSGALG00010016816) SYTL1 (ENSGALG00010016809) TMEM222 (ENSGALG00010016802) WDTC1 (ENSGALG00010016799) SLC9A1 (ENSGALG00010016793) TENT5B (ENSGALG00010012654) TRNP1 (ENSGALG00010017829) KDF1 (ENSGALG00010013187) NR0B2 (ENSGALG00010013182) NUDC (ENSGALG00010013165) GPATCH3 (ENSGALG00010013093) GPN2 (ENSGALG00010013087) SFN (ENSGALG00010014011) ZDHHC18 (ENSGALG00010014002) ENSGALG00010013989 RLF (ENSGALG00010013981) #22 ZMPSTE24 (ENSGALG00010014225) KDM1A (ENSGALG00010014192) LUZP1 (ENSGALG00010014165) HTR1D (ENSGALG00010014147) HNRNPR (ENSGALG00010014082) ENSGALG00010016500 DNAJC8 (ENSGALG00010016491) PTAFR (ENSGALG00010012873) EYA3 (ENSGALG00010012808) XKR8 (ENSGALG00010012773) SMPDL3B (ENSGALG00010012763) RPA2 (ENSGALG00010012756) ENSGALG00010012743 PPP1R8 (ENSGALG00010012709) STX12 (ENSGALG00010013257) Turkey MODERN SPECIES 17 CITED4 (ENSMGAG00000021892) ENSMGAG00000001063 PPP1R8 (ENSMGAG00000001116) ENSMGAG00000001131 ENSMGAG00000001122 SMPDL3B 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ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000006264 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000006264 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 472 RLF (ENSCABG00000009241) #22 ZMPSTE24 (ENSCABG00000009246) Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 12 RLF (ENSGEVG00005013131) #22 ZMPSTE24 (ENSGEVG00005013094) ENSGEVG00005013076 KDM1A (ENSGEVG00005013035) LUZP1 (ENSGEVG00005012998) HNRNPR (ENSGEVG00005012957) ATP5IF1 (ENSGEVG00005012908) DNAJC8 (ENSGEVG00005012879) PTAFR (ENSGEVG00005012860) EYA3 (ENSGEVG00005012687) XKR8 (ENSGEVG00005012650) SMPDL3B (ENSGEVG00005012630) RPA2 (ENSGEVG00005012601) THEMIS2 (ENSGEVG00005012576) PPP1R8 (ENSGEVG00005012540) STX12 (ENSGEVG00005012511) Emydidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT00940000154484.B.a.b ENSGT00940000153511.a ENSGT00940000165091 ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045 ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a Three-toed box turtle MODERN SPECIES 111 RLF (ENSTMTG00000003747) #22 ZMPSTE24 (ENSTMTG00000003765) KDM1A (ENSTMTG00000003791) LUZP1 (ENSTMTG00000003832) HTR1D (ENSTMTG00000003839) HNRNPR (ENSTMTG00000003851) ENSTMTG00000003872 DNAJC8 (ENSTMTG00000003886) 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znf593 (ENSDCDG00000004595) RLF (ENSDCDG00000004603) #22 zmpste24 (ENSDCDG00000004619) rpl13a (ENSDCDG00000004641) HNRNPR (ENSDCDG00000004660) ENSDCDG00000004681 tmem30b (ENSDCDG00000004687) kdm1a (ENSDCDG00000004700) LUZP1 (ENSDCDG00000004733) pacrg (ENSDCDG00000004742) qkia (ENSDCDG00000004748) ENSDCDG00000004753 ENSDCDG00000004755 ENSDCDG00000004757 ctsl.1 (ENSDCDG00000004764) vgll2b (ENSDCDG00000004772) ythdf2 (ENSDCDG00000004777) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 219 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00940000154531 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d.c ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000157330 ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00940000155115.a.b.e.a ENSGT00940000155115.a.b.f ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314.h.a ENSGT00940000159599 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(ENSIPUG00000012801) Xpo1 (ENSIPUG00000012891) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 179 ENSGT00940000155115.a.b.e.a ENSGT00940000155115.a.b.f ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314.h.a ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000169877 ENSGT00940000158247 ENSGT00940000166228 ENSGT00940000159744 ENSGT00940000154718 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT01030000234592.A.a.a.b.f.b Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 1367 ENSEEEG00000000605 #22 ENSEEEG00000000602 #22 ENSEEEG00000000597 Electric eel MODERN SPECIES 1367 ENSEEEG00000000605 #22 ENSEEEG00000000602 #22 ENSEEEG00000000597 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 184 ENSGT00940000155115.a.b.f ENSGT00940000164286.i.b.a.b ENSGT00940000165326 ENSGT00390000017418 ENSGT00940000159314.h.a ENSGT00940000159599 ENSGT00940000166510 ENSGT00940000157970 ENSGT00940000158233 ENSGT00940000159501 ENSGT00940000169877 ENSGT00940000158247 ENSGT00940000166228 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(ENSCCRG00000013073) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 351 ENSGT00530000063410.a.r.c.b ENSGT00940000153464.B.z.b.g ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000166587.c ENSGT00940000154186.a.q.f ENSGT00950000183034.B.n #22 ENSGT00940000154531.vc.b ENSGT00390000002053.d ENSGT00940000165091.d.c.a ENSGT00390000010799.k ENSGT00390000006218.i ENSGT00530000063557.b.k ENSGT00940000155483.f.nb.a.a ENSGT00940000163420.e ENSGT00390000006619 ENSGT00390000004173 ENSGT00940000164027.c ENSGT00940000155187.A.a ENSGT00940000181185 ENSGT00950000183215.c.b.i ENSGT00950000183092.b.b.d Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 8 grhl1 (ENSCARG00000069455) ENSCARG00000069465 gcfc2 (ENSCARG00000069467) eva1a (ENSCARG00000069488) ENSCARG00000069489 gcfc2 (ENSCARG00000069500) ywhaqb (ENSCARG00000069514) grhl1 (ENSCARG00000069517) KCNK2 (ENSCARG00000069519) ENSCARG00000069523 ctsba (ENSCARG00000069527) ARHGAP5 (ENSCARG00000069542) nubpl (ENSCARG00000050449) ENSCARG00000050585 pomt2 (ENSCARG00000050626) 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ENSCARG00000024116 ENSCARG00000024126 znf593 (ENSCARG00000024136) selenon (ENSCARG00000024155) ENSCARG00000024218 mtfr1l (ENSCARG00000024225) STAC (ENSCARG00000024237) pacrg (ENSCARG00000024273) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000017746.g ENSGT00390000016883.k ENSGT00390000008178.l ENSGT00940000153408.B.t.d.a.b ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000155345.q.c ENSGT00940000157597.e.a.b ENSGT00940000161234.a ENSGT00390000016551.j.b ENSGT00390000016551.j.a ENSGT00530000063410.a.r.c.b ENSGT00940000153464.B.z.b.g ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a.a ENSGT00940000166587.c ENSGT00940000154186.a.q.f ENSGT00950000183034.B.n #22 ENSGT00390000002053.d ENSGT00940000165091.d.c.a ENSGT00390000010799.k ENSGT00390000006218.i ENSGT00530000063557.b.k ENSGT00940000155483.f.nb.a.a ENSGT00940000163420.e ENSGT00390000006619 ENSGT00390000004173 ENSGT00940000164027.c ENSGT00940000155187.A.a ENSGT00950000183215.c.b.i ENSGT00950000183092.b.b.d ENSGT01060000253468 ENSGT00940000154524.b.e Common carp reference MODERN SPECIES 30 slc18a2 (ENSCCRG00000013071) PDZD8 (ENSCCRG00000013188) ENSCCRG00000057670 ENSCCRG00000055884 ENSCCRG00000003451 ENSCCRG00000003438 b3gnt2b (ENSCCRG00000053079) EHBP1 (ENSCCRG00000022494) otx1 (ENSCCRG00000067814) WDPCP (ENSCCRG00000024549) mdh1ab (ENSCCRG00000026888) ugp2b (ENSCCRG00000018829) peli1b (ENSCCRG00000018790) ENSCCRG00000018709 ENSCCRG00000049285 ENSCCRG00000058941 #22 zmpste24 (ENSCCRG00000057683) atp5if1b (ENSCCRG00000049269) rpl13a (ENSCCRG00000031859) commd9 (ENSCCRG00000049251) ENSCCRG00000049249 ENSCCRG00000034639 znf593 (ENSCCRG00000064674) ENSCCRG00000076662 selenon (ENSCCRG00000034330) ENSCCRG00000058106 mtfr1l (ENSCCRG00000070238) ENSCCRG00000063936 ENSCCRG00000070104 ENSCCRG00000067202 ENSCCRG00000073050 Golden-line barbel MODERN SPECIES 53 slc18a2 (ENSSGRG00000008065) PDZD8 (ENSSGRG00000008067) pex13 (ENSSGRG00000008068) SANBR (ENSSGRG00000008070) XPO1 (ENSSGRG00000008167) ENSSGRG00000009075 b3gnt2b (ENSSGRG00000009076) EHBP1 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ENSDARG00000063553 #22 DYNLT1 (ENSDARG00000094627) zmpste24 (ENSDARG00000044090) atp5if1b (ENSDARG00000044092) rpl13a (ENSDARG00000044093) commd9 (ENSDARG00000094258) ENSDARG00000093070 MAP4K3 (ENSDARG00000071357) ENSDARG00000097964 morn2 (ENSDARG00000071360) znf593 (ENSDARG00000044102) selenon (ENSDARG00000033616) ENSDARG00000063511 ENSDARG00000097385 mtfr1l (ENSDARG00000003940) STAC (ENSDARG00000074004) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D ENSGT00940000157330 ENSGT00940000165937 ENSGT00940000163885 ENSGT00530000063353.a.a ENSGT00940000156761 ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT00940000153511.a ENSGT00390000012569.a ENSGT00940000154947.k ENSGT01030000234515.a.b.a.a.e ENSGT00940000154716.gc.b ENSGT00950000183094.a.n ENSGT00390000018360.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000004660.C.a.b ENSGT00940000157193 ENSGT00950000182852.A.b ENSGT01060000248589.D Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 384 ENSGT00950000183034.B.o #22 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ENSSTUG00000021872 id3 (ENSSTUG00000021889) Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 HTR1E (ENSSSAG00000003618) ENSSSAG00000003598 ##22 ENSSSAG00000114215 ##22 ENSSSAG00000003561 ENSSSAG00000098934 ENSSSAG00000003538 ENSSSAG00000003457 ENSSSAG00000003380 ENSSSAG00000003357 ENSSSAG00000003338 ENSSSAG00000003327 ENSSSAG00000083010 ENSSSAG00000003310 ENSSSAG00000107471 ENSSSAG00000121866 ENSSSAG00000003287 #22 zmpste24 (ENSSSAG00000003219) ATIF1 (ENSSSAG00000003198) rpl13a (ENSSSAG00000003176) ENSSSAG00000002882 ENSSSAG00000087348 ENSSSAG00000084934 ENSSSAG00000002472 ENSSSAG00000002405 pacrg (ENSSSAG00000002352) ENSSSAG00000084583 ctsl.1 (ENSSSAG00000002302) vgll2b (ENSSSAG00000002278) ENSSSAG00000103784 ythdf2 (ENSSSAG00000002258) ENSSSAG00000106971 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00990000212836 ENSGT00390000012242.a.a ENSGT00950000183034.C.a.b.f.b ##22 ENSGT00390000011376.d ENSGT00940000156096.e.a.c ENSGT01060000248564.a.a.a.b.a ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b.f 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ENSGT00940000165091.d.b ENSGT00390000010799.c ENSGT00940000153511.a.nb.b ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a.d ENSGT00940000157193.f ENSGT00950000182852.A.b.f ENSGT01060000248589.D.v ENSGT00940000157330.a ENSGT00940000165937.c.b ENSGT00940000163885.i ENSGT00530000063353.a.a.d ENSGT00940000156761.d ENSGT00940000167209 ENSGT00940000160504.g Chinook salmon MODERN SPECIES 32 ENSOTSG00005022631 CGA (ENSOTSG00005022630) znf292a (ENSOTSG00005022629) ##22 orc3 (ENSOTSG00005022627) akirin2 (ENSOTSG00005022626) CNR1 (ENSOTSG00005022625) PM20D2 (ENSOTSG00005022624) ENSOTSG00005022610 tonsl (ENSOTSG00005022522) ENSOTSG00005022514 STAC (ENSOTSG00005022513) ENSOTSG00005022512 ENSOTSG00005022511 ENSOTSG00005022510 ENSOTSG00005022509 ENSOTSG00005022508 #22 zmpste24 (ENSOTSG00005022505) atp5if1b (ENSOTSG00005022504) ENSOTSG00005022383 ENSOTSG00005022382 kdm1a (ENSOTSG00005022157) LUZP1 (ENSOTSG00005022156) PTAFR (ENSOTSG00005022155) pacrg (ENSOTSG00005022154) qkia (ENSOTSG00005022153) ctsl.1 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ENSOMYG00000022786 ##22 cf166 (ENSOMYG00000022497) ENSOMYG00000022478 ENSOMYG00000022452 ENSOMYG00000022291 ENSOMYG00000076691 ENSOMYG00000022156 ENSOMYG00000022090 ENSOMYG00000022069 ENSOMYG00000077792 ENSOMYG00000022046 ENSOMYG00000022035 ENSOMYG00000022016 ENSOMYG00000066254 ENSOMYG00000022007 #22 zmpste24 (ENSOMYG00000021719) atp5if1b (ENSOMYG00000021643) rpl13a (ENSOMYG00000021624) ENSOMYG00000021119 ENSOMYG00000020999 ENSOMYG00000020992 kdm1a (ENSOMYG00000020905) ENSOMYG00000020833 ENSOMYG00000043295 ENSOMYG00000020810 ENSOMYG00000020768 ENSOMYG00000076285 vgll2b (ENSOMYG00000074139) ythdf2 (ENSOMYG00000031355) ENSOMYG00000031341 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 333 ENSGT00950000183034.C.a.b.e ##22 ENSGT00390000011376.c ENSGT00940000156096.e.a.d ENSGT01060000248564.a.a.a.b.b ENSGT00940000158591.g.b.e ENSGT00510000050935.q.b ENSGT00510000050935.q.a ENSGT00950000183092.b.b.f ENSGT00950000183215.c.b.g ENSGT00940000181185.a ENSGT00950000183215.c.b.h ENSGT00940000181185.b 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ENSGT00940000178412.b ENSGT00940000163885.j ENSGT00530000063353.a.a.c Coho salmon MODERN SPECIES 27 syncripl (ENSOKIG00005002093) ENSOKIG00005002211 CGA (ENSOKIG00005002246) ENSOKIG00005002323 ##22 AKIRIN2 (ENSOKIG00005002446) CNR1 (ENSOKIG00005002462) ENSOKIG00005002525 ENSOKIG00005002734 ENSOKIG00005002746 STAC (ENSOKIG00005002787) mtfr1l (ENSOKIG00005002806) ENSOKIG00005002822 selenon (ENSOKIG00005002840) ENSOKIG00005002849 znf593 (ENSOKIG00005002851) ENSOKIG00005002867 #22 DYNLT1 (ENSOKIG00005002880) zmpste24 (ENSOKIG00005002967) atp5if1b (ENSOKIG00005003260) rpl13a (ENSOKIG00005003267) HNRNPR (ENSOKIG00005003312) ENSOKIG00005003366 tmem30b (ENSOKIG00005003378) kdm1a (ENSOKIG00005003416) LUZP1 (ENSOKIG00005003502) PTAFR (ENSOKIG00005003514) PTAFR (ENSOKIG00005003530) ythdf2 (ENSOKIG00005003548) ENSOKIG00005003559 ctsl.1 (ENSOKIG00005003572) ENSOKIG00005003585 Chinook salmon MODERN SPECIES 2 syncripl (ENSOTSG00005034680) HTR1E (ENSOTSG00005034726) CGA (ENSOTSG00005034727) orc3 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ENSOMYG00000006654 selenon (ENSOMYG00000006708) znf593 (ENSOMYG00000006723) ENSOMYG00000006758 #22 ENSOMYG00000006777 zmpste24 (ENSOMYG00000006955) atp5if1b (ENSOMYG00000007030) rpl13a (ENSOMYG00000007093) ENSOMYG00000007541 ENSOMYG00000007620 tmem30b (ENSOMYG00000007695) kdm1a (ENSOMYG00000007963) ENSOMYG00000008068 ENSOMYG00000008082 ENSOMYG00000008122 ENSOMYG00000074144 ENSOMYG00000008152 ENSOMYG00000053750 ENSOMYG00000008191 Huchen MODERN SPECIES 738 ENSHHUG00000021690 STAC (ENSHHUG00000021695) mtfr1l (ENSHHUG00000021701) ENSHHUG00000021715 selenon (ENSHHUG00000021729) znf593 (ENSHHUG00000021817) RLF (ENSHHUG00000021833) #22 DYNLT1 (ENSHHUG00000021920) atp5if1b (ENSHHUG00000021958) rpl13a (ENSHHUG00000021979) HNRNPR (ENSHHUG00000022120) ENSHHUG00000022194 Northern pike MODERN SPECIES 14 orc3 (ENSELUG00000013930) akirin2 (ENSELUG00000013964) CNR1 (ENSELUG00000029484) PM20D2 (ENSELUG00000014005) ENSELUG00000014055 ENSELUG00000001586 tonsl (ENSELUG00000014221) nkl.4 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clownfish MODERN SPECIES 9 SNX14 (ENSAPEG00000020310) syncripl (ENSAPEG00000020251) cga (ENSAPEG00000019701) znf292a (ENSAPEG00000019624) ##22 orc3 (ENSAPEG00000019356) akirin2 (ENSAPEG00000019315) CNR1 (ENSAPEG00000019293) GABRR1 (ENSAPEG00000019277) tonsl (ENSAPEG00000019090) ENSAPEG00000019073 STAC (ENSAPEG00000018988) mtfr1l (ENSAPEG00000018973) ENSAPEG00000018941 selenon (ENSAPEG00000018900) znf593 (ENSAPEG00000018888) ENSAPEG00000018882 #22 zmpste24 (ENSAPEG00000018830) atp5if1b (ENSAPEG00000018820) rpl13a (ENSAPEG00000018777) ENSAPEG00000018751 PPP2R5C (ENSAPEG00000018686) ENSAPEG00000018666 ENSAPEG00000018657 DIO3 (ENSAPEG00000018645) DLK1 (ENSAPEG00000018555) ENSAPEG00000018512 WDR25 (ENSAPEG00000018501) WARS1 (ENSAPEG00000018449) SLC25A29 (ENSAPEG00000018438) ENSAPEG00000018389 soul3 (ENSAPEG00000018367) Spiny chromis MODERN SPECIES 13 SNX14 (ENSAPOG00000013313) syncripl (ENSAPOG00000013389) cga (ENSAPOG00000013410) znf292a (ENSAPOG00000013515) ##22 orc3 (ENSAPOG00000013547) 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3 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00390000012242 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000173691 ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164539 ENSGT00940000164359.a Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00390000012242 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 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ENSGT00940000164539 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00390000017195 ENSGT00940000164359.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164539 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000165828 Fugu MODERN SPECIES 11 cga (ENSTRUG00000005818) ENSTRUG00000027132 ##22 orc3 (ENSTRUG00000006055) akirin2 (ENSTRUG00000028593) CNR1 (ENSTRUG00000022175) PM20D2 (ENSTRUG00000007025) GABRR1 (ENSTRUG00000007103) tonsl (ENSTRUG00000007494) nkl.4 (ENSTRUG00000007776) ENSTRUG00000025295 STAC (ENSTRUG00000007813) mtfr1l (ENSTRUG00000007966) ENSTRUG00000032981 ENSTRUG00000024941 znf593 (ENSTRUG00000008269) ENSTRUG00000008329 #22 zmpste24 (ENSTRUG00000008346) atp5if1b (ENSTRUG00000025044) rpl13a (ENSTRUG00000027237) ENSTRUG00000008586 ENSTRUG00000008712 dio3 (ENSTRUG00000025841) DLK1 (ENSTRUG00000009231) ENSTRUG00000009344 WDR25 (ENSTRUG00000024192) WARS1 (ENSTRUG00000009413) SLC25A29 (ENSTRUG00000009698) soul3 (ENSTRUG00000031829) ENSTRUG00000009756 dcdc2b (ENSTRUG00000009980) tmem234 (ENSTRUG00000027663) Tetraodon MODERN SPECIES 1 SNX14 (ENSTNIG00000017300) syncripl (ENSTNIG00000017299) znf292a (ENSTNIG00000017298) ##22 orc3 (ENSTNIG00000002054) akirin2 (ENSTNIG00000017297) CNR1 (ENSTNIG00000017296) PM20D2 (ENSTNIG00000017295) GABRR1 (ENSTNIG00000017294) tonsl (ENSTNIG00000017293) ENSTNIG00000001275 STAC (ENSTNIG00000017292) mtfr1l (ENSTNIG00000017291) ENSTNIG00000017290 selenon (ENSTNIG00000017289) znf593 (ENSTNIG00000017288) ENSTNIG00000017287 #22 zmpste24 (ENSTNIG00000017286) rpl13a (ENSTNIG00000017285) ENSTNIG00000017284 DIO3 (ENSTNIG00000017283) DLK1 (ENSTNIG00000017282) ENSTNIG00000017281 ENSTNIG00000017280 WARS1 (ENSTNIG00000017279) SLC25A29 (ENSTNIG00000017278) ENSTNIG00000017277 soul3 (ENSTNIG00000000202) dcdc2b (ENSTNIG00000017276) tmem234 (ENSTNIG00000017275) rcan3 (ENSTNIG00000017274) nipal3 (ENSTNIG00000017273) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00390000017195 ENSGT00940000164359.a Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00390000017195 ENSGT00940000164359.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000165828 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00940000175159 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000181185 ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000165828 European seabass MODERN SPECIES 2 CNR1 (ENSDLAG00005032092) PM20D2 (ENSDLAG00005034721) GABRR1 (ENSDLAG00005000470) ENSDLAG00005031600 ENSDLAG00005032399 ENSDLAG00005032849 ENSDLAG00005028699 ENSDLAG00005003436 ENSDLAG00005000512 ENSDLAG00005000539 ENSDLAG00005000545 mtfr1l (ENSDLAG00005028385) ENSDLAG00005034464 ENSDLAG00005029402 selenon (ENSDLAG00005032126) ENSDLAG00005034680 #22 zmpste24 (ENSDLAG00005000613) atp5if1b (ENSDLAG00005032619) rpl13a (ENSDLAG00005000624) rpl13a (ENSDLAG00005032540) ENSDLAG00005027762 ENSDLAG00005031733 ENSDLAG00005000807 DLK1 (ENSDLAG00005000813) ENSDLAG00005027047 ENSDLAG00005028675 WARS1 (ENSDLAG00005000841) ENSDLAG00005030149 ENSDLAG00005028251 ENSDLAG00005032156 iqcc (ENSDLAG00005028138) Large yellow croaker MODERN SPECIES 495 znf292a (ENSLCRG00005012511) ##22 orc3 (ENSLCRG00005011979) akirin2 (ENSLCRG00005011935) CNR1 (ENSLCRG00005011929) PM20D2 (ENSLCRG00005011927) GABRR1 (ENSLCRG00005011886) tonsl (ENSLCRG00005011874) ENSLCRG00005011871 nkl.4 (ENSLCRG00005011866) ENSLCRG00005011862 STAC (ENSLCRG00005011858) mtfr1l (ENSLCRG00005011857) ENSLCRG00005011856 selenon (ENSLCRG00005011842) znf593 (ENSLCRG00005011840) ENSLCRG00005011837 #22 zmpste24 (ENSLCRG00005011835) atp5if1b (ENSLCRG00005011833) rpl13a (ENSLCRG00005011811) ENSLCRG00005011809 ENSLCRG00005011593 ENSLCRG00005011578 ENSLCRG00005011577 DLK1 (ENSLCRG00005011574) ENSLCRG00005011569 WDR25 (ENSLCRG00005011564) WARS1 (ENSLCRG00005011513) SLC25A29 (ENSLCRG00005011503) soul3 (ENSLCRG00005011502) ENSLCRG00005011491 dcdc2b (ENSLCRG00005011488) Gilthead seabream MODERN SPECIES 7 znf292a (ENSSAUG00010003577) ##22 orc3 (ENSSAUG00010003509) akirin2 (ENSSAUG00010003480) CNR1 (ENSSAUG00010003476) PM20D2 (ENSSAUG00010003462) GABRR1 (ENSSAUG00010003331) tonsl (ENSSAUG00010003245) nkl.4 (ENSSAUG00010003231) ENSSAUG00010003227 STAC (ENSSAUG00010003217) ENSSAUG00010003214 mtfr1l (ENSSAUG00010003211) ENSSAUG00010003204 selenon (ENSSAUG00010003190) znf593 (ENSSAUG00010003179) RLF (ENSSAUG00010003171) #22 zmpste24 (ENSSAUG00010003156) atp5if1b (ENSSAUG00010003151) rpl13a (ENSSAUG00010003114) ENSSAUG00010003108 ENSSAUG00010002713 DIO3 (ENSSAUG00010002642) DLK1 (ENSSAUG00010002633) ENSSAUG00010002623 WDR25 (ENSSAUG00010002609) WARS1 (ENSSAUG00010001699) SLC25A29 (ENSSAUG00010001530) soul3 (ENSSAUG00010001503) ENSSAUG00010010287 tmem234 (ENSSAUG00010010268) dcdc2b (ENSSAUG00010010266) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00390000012242 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799.h ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164539 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000165828 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00390000012242 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799.h ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164539 ENSGT00940000164359.a ENSGT00940000165828 Lumpfish MODERN SPECIES 14 cga (ENSCLMG00005021590) ENSCLMG00005021594 ##22 ENSCLMG00005021596 ##22 orc3 (ENSCLMG00005021601) AKIRIN2 (ENSCLMG00005021622) CNR1 (ENSCLMG00005021624) PM20D2 (ENSCLMG00005021626) GABRR1 (ENSCLMG00005021657) tonsl (ENSCLMG00005010170) nkl.4 (ENSCLMG00005010197) STAC (ENSCLMG00005010203) mtfr1l (ENSCLMG00005010214) ENSCLMG00005010218 selenon (ENSCLMG00005010223) znf593 (ENSCLMG00005010229) ENSCLMG00005010232 #22 zmpste24 (ENSCLMG00005010237) atp5if1b (ENSCLMG00005010246) ENSCLMG00005010251 ENSCLMG00005010271 rpl13a (ENSCLMG00005011384) ENSCLMG00005011394 ENSCLMG00005011442 ENSCLMG00005016934 ENSCLMG00005016936 DLK1 (ENSCLMG00005016937) ENSCLMG00005016940 WDR25 (ENSCLMG00005016948) WARS1 (ENSCLMG00005016949) SLC25A29 (ENSCLMG00005016951) ENSCLMG00005016955 Stickleback MODERN SPECIES 15 SNX14 (ENSGACG00000009094) syncripl (ENSGACG00000009124) cga (ENSGACG00000009153) znf292a (ENSGACG00000009170) ##22 akirin2 (ENSGACG00000009179) CNR1 (ENSGACG00000009189) PM20D2 (ENSGACG00000009194) GABRR1 (ENSGACG00000009199) tonsl (ENSGACG00000009209) nkl.4 (ENSGACG00000009229) STAC (ENSGACG00000009232) mtfr1l (ENSGACG00000009245) ENSGACG00000009254 selenon (ENSGACG00000009262) znf593 (ENSGACG00000009279) ENSGACG00000009288 #22 zmpste24 (ENSGACG00000009297) atp5if1b (ENSGACG00000009305) rpl13a (ENSGACG00000009310) ENSGACG00000009379 ENSGACG00000009386 ENSGACG00000009397 ENSGACG00000009402 WDR25 (ENSGACG00000009406) WARS1 (ENSGACG00000009413) SLC25A29 (ENSGACG00000009441) ENSGACG00000009448 soul3 (ENSGACG00000009458) ENSGACG00000009464 ENSGACG00000009466 tmem234 (ENSGACG00000009473) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153511.b.q ENSGT00390000012242 ENSGT00950000183034.C.a.b ##22 ENSGT00390000011376 ENSGT00940000156096.e.a ENSGT01060000248564.a.a.a.b ENSGT00390000003365.b ENSGT00940000158591.g.b ENSGT00940000160188 ENSGT00510000050935 ENSGT00950000183092.b.b ENSGT00950000183215.c.b ENSGT00940000155187.A ENSGT00940000164027 ENSGT00390000004173 ENSGT00950000183034.B #22 ENSGT00390000002053 ENSGT00940000165091.d ENSGT00390000010799.h ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154482.b.b.a.c ENSGT00940000154225.b ENSGT00940000165081.a ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000164539 ENSGT00940000156480 ENSGT00390000017195 ENSGT00940000164359.a Pike perch MODERN SPECIES 110 megf10 (ENSSLUG00000019603) chsy3 (ENSSLUG00000019593) sptlc1 (ENSSLUG00000019559) ENSSLUG00000019549 ROR2 (ENSSLUG00000019517) nfil3 (ENSSLUG00000019507) auh (ENSSLUG00000019504) syk (ENSSLUG00000019466) chd1 (ENSSLUG00000012190) reep5 (ENSSLUG00000011875) STAC (ENSSLUG00000011861) mtfr1l (ENSSLUG00000011854) ENSSLUG00000011849 selenon (ENSSLUG00000011845) znf593 (ENSSLUG00000011841) RLF (ENSSLUG00000011838) #22 zmpste24 (ENSSLUG00000011745) atp5if1b (ENSSLUG00000011722) ENSSLUG00000011714 rpl13a (ENSSLUG00000011699) ENSSLUG00000011627 ENSSLUG00000025334 ENSSLUG00000025315 DLK1 (ENSSLUG00000025312) ENSSLUG00000025306 WDR25 (ENSSLUG00000025302) WARS1 (ENSSLUG00000025300) SLC25A29 (ENSSLUG00000025297) soul3 (ENSSLUG00000025295) ENSSLUG00000025293 iqcc (ENSSLUG00000025288) Channel bull blenny MODERN SPECIES 14 ENSCGOG00000021767 ##22 ENSCGOG00000021765 ##22 ENSCGOG00000021764 orc3 (ENSCGOG00000021416) akirin2 (ENSCGOG00000021732) CNR1 (ENSCGOG00000021407) PM20D2 (ENSCGOG00000021403) GABRR1 (ENSCGOG00000021380) tonsl (ENSCGOG00000021291) nkl.4 (ENSCGOG00000021287) STAC (ENSCGOG00000021284) mtfr1l (ENSCGOG00000021280) ENSCGOG00000021278 selenon (ENSCGOG00000021268) znf593 (ENSCGOG00000021267) ENSCGOG00000021265 #22 zmpste24 (ENSCGOG00000021229) atp5if1b (ENSCGOG00000021222) rpl13a (ENSCGOG00000021189) ENSCGOG00000021179 ENSCGOG00000018083 DLK1 (ENSCGOG00000018022) ENSCGOG00000017998 WDR25 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ENSGT00530000063583.a.a.a ENSGT00940000153724.B ENSGT00940000157766.b.a ENSGT00940000156480 ENSGT00940000164539 ENSGT00940000164359.a.f ENSGT00940000165828 Climbing perch MODERN SPECIES 13 ENSATEG00000030171 ##22 orc3 (ENSATEG00000013212) ENSATEG00000013188 CNR1 (ENSATEG00000013176) ENSATEG00000013140 ENSATEG00000013101 ENSATEG00000013035 ENSATEG00000013023 ENSATEG00000013013 ENSATEG00000012978 mtfr1l (ENSATEG00000012947) ENSATEG00000027605 ENSATEG00000026067 selenon (ENSATEG00000012886) znf593 (ENSATEG00000028135) ENSATEG00000012869 #22 zmpste24 (ENSATEG00000012851) atp5if1b (ENSATEG00000012846) rpl13a (ENSATEG00000012828) ENSATEG00000012808 ENSATEG00000012752 ENSATEG00000012730 DLK1 (ENSATEG00000029944) ENSATEG00000012519 WDR25 (ENSATEG00000012498) WARS1 (ENSATEG00000012465) SLC25A29 (ENSATEG00000025374) ENSATEG00000012432 ENSATEG00000012412 ENSATEG00000012405 ENSATEG00000027551 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 12 ENSBSLG00000026519 ##22 ENSBSLG00000026520 ##22 orc3 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