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Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	26	ENSHGLG00000032040 #7	GNB1 (ENSHGLG00000015579) #8	NADK (ENSHGLG00000015679) #9	SLC35E2B (ENSHGLG00000015776) #10	ENSHGLG00000039448 #11	FNDC10 (ENSHGLG00000032397) #12	ENSHGLG00000033897 #13	SSU72 (ENSHGLG00000018633) #14	TMEM240 (ENSHGLG00000017381) #15	ATAD3A (ENSHGLG00000017393) #16	VWA1 (ENSHGLG00000017400) #17	TMEM88B (ENSHGLG00000047158) #18	ANKRD65 (ENSHGLG00000017529) #19	MRPL20 (ENSHGLG00000032931) #20	ENSHGLG00000017546 #21	AURKAIP1 (ENSHGLG00000015312) #22	MXRA8 (ENSHGLG00000015323) #23	DVL1 (ENSHGLG00000015329) #24	TAS1R3 (ENSHGLG00000015340) #25	CPTP (ENSHGLG00000015345) #26	INTS11 (ENSHGLG00000017561) #27	PUSL1 (ENSHGLG00000017570) #28	ENSHGLG00000018490 #29	UBE2J2 (ENSHGLG00000046110) #30	C1QTNF12 (ENSHGLG00000003615) #31	B3GALT6 (ENSHGLG00000041571) #32	SDF4 (ENSHGLG00000003849) #33	TNFRSF4 (ENSHGLG00000003947) #34	TNFRSF18 (ENSHGLG00000004048) #35	ENSHGLG00000004156 #36	C1orf159 (ENSHGLG00000004242) #37
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00730000111432 #7	ENSGT01000000214413.b.a.b.b.b #8	ENSGT00390000013792 #9	ENSGT00940000159351 #10	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00940000158097	ENSGT00550000076432 #12	ENSGT00390000010165.i.b.a.b #14	ENSGT00400000023987 #15	ENSGT00730000111059 #16	ENSGT00940000160734 #17	ENSGT00730000111599 #18	ENSGT00390000015823 #20	ENSGT00940000159239 #21	ENSGT00390000012802 #22	ENSGT00390000001509 #23	ENSGT00950000182903.b.a #24	ENSGT00940000160679 #25	ENSGT00940000161763 #26	ENSGT00940000157644 #27	ENSGT00950000183160.C #28	ENSGT00940000156199.b	ENSGT00940000162685 #29	ENSGT00940000156173 #30	ENSGT00940000160300 #31	ENSGT00940000162229 #32	ENSGT01010000222360.B #33	ENSGT00730000111452 #34	ENSGT00730000111424 #35	ENSGT00940000160919 #36
Guinea pig	MODERN SPECIES	184	CFAP74 (ENSCPOG00000020269)	TMEM52 (ENSCPOG00000036151) #7	GNB1 (ENSCPOG00000005544) #8	NADK (ENSCPOG00000035655) #9	SLC35E2B (ENSCPOG00000035097) #10	ENSCPOG00000009457	MMP23B (ENSCPOG00000024407)	MIB2 (ENSCPOG00000025415)	ENSCPOG00000030624 #12	SSU72 (ENSCPOG00000002238) #14	TMEM240 (ENSCPOG00000035205) #15	ATAD3A (ENSCPOG00000025060) #16	VWA1 (ENSCPOG00000021637) #17	MRPL20 (ENSCPOG00000023001) #20	CCNL2 (ENSCPOG00000008005) #21	AURKAIP1 (ENSCPOG00000027539) #22	MXRA8 (ENSCPOG00000023813) #23	DVL1 (ENSCPOG00000006849) #24	TAS1R3 (ENSCPOG00000006842) #25	CPTP (ENSCPOG00000037003) #26	INTS11 (ENSCPOG00000005152) #27	PUSL1 (ENSCPOG00000005149) #28	ACAP3 (ENSCPOG00000009895)	ENSCPOG00000011689 #29	UBE2J2 (ENSCPOG00000008025) #30	C1QTNF12 (ENSCPOG00000020208) #31	B3GALT6 (ENSCPOG00000026270) #32	SDF4 (ENSCPOG00000011687) #33	TNFRSF4 (ENSCPOG00000032915) #34	TNFRSF18 (ENSCPOG00000024995) #35	TTLL10 (ENSCPOG00000026364) #36
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00900000141054	ENSGT00730000111432 #7	ENSGT01000000214413.b.a.b.b.b #8	ENSGT00390000013792 #9	ENSGT00940000159351 #10	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00940000158097	ENSGT00390000010165.i.b.a.b #14	ENSGT00400000023987 #15	ENSGT00730000111059 #16	ENSGT00940000160734 #17	ENSGT00730000111599 #18	ENSGT00390000015823 #20	ENSGT00940000159239 #21	ENSGT00390000012802 #22	ENSGT00390000001509 #23	ENSGT00950000182903.b.a #24	ENSGT00940000160679 #25	ENSGT00940000161763 #26	ENSGT00940000157644 #27	ENSGT00950000183160.C #28	ENSGT00940000156199.b	ENSGT00940000156173 #30	ENSGT00940000160300 #31	ENSGT00940000162229 #32	ENSGT01010000222360.B #33	ENSGT00730000111452 #34	ENSGT00730000111424 #35	ENSGT00940000160919 #36	ENSGT00390000009794 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	193	CFAP74 (ENSCLAG00000006157)	TMEM52 (ENSCLAG00000004850) #7	GNB1 (ENSCLAG00000007026) #8	NADK (ENSCLAG00000006095) #9	SLC35E2B (ENSCLAG00000006943) #10	ENSCLAG00000009196	MMP23B (ENSCLAG00000006747)	MIB2 (ENSCLAG00000014976)	SSU72 (ENSCLAG00000013921) #14	TMEM240 (ENSCLAG00000004451) #15	ATAD3A (ENSCLAG00000005088) #16	VWA1 (ENSCLAG00000007707) #17	TMEM88B (ENSCLAG00000009079) #18	ENSCLAG00000009757 #20	CCNL2 (ENSCLAG00000011337) #21	AURKAIP1 (ENSCLAG00000015774) #22	MXRA8 (ENSCLAG00000005340) #23	DVL1 (ENSCLAG00000006123) #24	TAS1R3 (ENSCLAG00000011780) #25	CPTP (ENSCLAG00000009572) #26	INTS11 (ENSCLAG00000004586) #27	PUSL1 (ENSCLAG00000005232) #28	ACAP3 (ENSCLAG00000007949)	UBE2J2 (ENSCLAG00000006776) #30	C1QTNF12 (ENSCLAG00000008319) #31	B3GALT6 (ENSCLAG00000010125) #32	SDF4 (ENSCLAG00000012579) #33	TNFRSF4 (ENSCLAG00000010791) #34	TNFRSF18 (ENSCLAG00000012574) #35	ENSCLAG00000008793 #36	C1orf159 (ENSCLAG00000007074) #37
Degu	MODERN SPECIES	154	ENSODEG00000009565 #8	NADK (ENSODEG00000009926) #9	SLC35E2B (ENSODEG00000008487) #10	ENSODEG00000010865	MMP23B (ENSODEG00000008758)	ENSODEG00000009109	ENSODEG00000008784	ENSODEG00000019880	ENSODEG00000011387 #14	TMEM240 (ENSODEG00000010456) #15	ATAD3A (ENSODEG00000009657) #16	VWA1 (ENSODEG00000008967) #17	TMEM88B (ENSODEG00000009276) #18	MRPL20 (ENSODEG00000010734) #20	ENSODEG00000008816 #21	AURKAIP1 (ENSODEG00000008719) #22	MXRA8 (ENSODEG00000011254) #23	DVL1 (ENSODEG00000009749) #24	TAS1R3 (ENSODEG00000008890) #25	CPTP (ENSODEG00000008044) #26	INTS11 (ENSODEG00000009761) #27	PUSL1 (ENSODEG00000008247) #28	ACAP3 (ENSODEG00000008249)	UBE2J2 (ENSODEG00000007876) #30	C1QTNF12 (ENSODEG00000008805) #31	B3GALT6 (ENSODEG00000008567) #32	SDF4 (ENSODEG00000010985) #33	TNFRSF4 (ENSODEG00000008108) #34	TNFRSF18 (ENSODEG00000007932) #35	TTLL10 (ENSODEG00000010677) #36	C1orf159 (ENSODEG00000008028) #37
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01000000214413.b.a.b.b.b #8	ENSGT00390000013792 #9	ENSGT00940000159351 #10	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00940000158097	ENSGT00550000076432 #12	ENSGT00390000010165.i.b.a.b #14	ENSGT00400000023987 #15	ENSGT00730000111059 #16	ENSGT00940000160734 #17	ENSGT00730000111599 #18	ENSGT00940000163707 #19	ENSGT00390000015823 #20	ENSGT00940000159239 #21	ENSGT00390000012802 #22	ENSGT00390000001509 #23	ENSGT00950000182903.b.a #24	ENSGT00940000160679 #25	ENSGT00940000161763 #26	ENSGT00940000157644 #27	ENSGT00950000183160.C #28	ENSGT00940000156199.b	ENSGT00940000162685 #29	ENSGT00940000156173 #30	ENSGT00940000160300 #31	ENSGT00940000162229 #32	ENSGT01010000222360.B #33	ENSGT00730000111452 #34	ENSGT00730000111424 #35	ENSGT00940000160919 #36
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01000000214413.b.a.b.b.b #8	ENSGT00390000013792.e #9	ENSGT00940000159351 #10	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00940000158097	ENSGT00550000076432 #12	ENSGT00390000010165.i.b.a.b #14	ENSGT00400000023987 #15	ENSGT00730000111059 #16	ENSGT00940000160734 #17	ENSGT00730000111599 #18	ENSGT00940000163707 #19	ENSGT00390000015823 #20	ENSGT00940000159239 #21	ENSGT00390000012802 #22	ENSGT00390000001509 #23	ENSGT00950000182903.b.a #24	ENSGT00940000160679 #25	ENSGT00940000161763 #26	ENSGT00940000157644 #27	ENSGT00950000183160.C #28	ENSGT00940000156199.b	ENSGT00940000162685 #29	ENSGT00940000156173 #30	ENSGT00940000160300 #31	ENSGT00940000162229 #32	ENSGT01010000222360.B #33	ENSGT00730000111452 #34	ENSGT00730000111424 #35	ENSGT00940000160919 #36
Alpin marmot	MODERN SPECIES	73	ENSMMMG00000019112	TMEM52 (ENSMMMG00000019122) #7	CALML6 (ENSMMMG00000019136)	GNB1 (ENSMMMG00000019141) #8	NADK (ENSMMMG00000019153) #9	SLC35E2B (ENSMMMG00000019163) #10	ENSMMMG00000019177	MIB2 (ENSMMMG00000019966)	ENSMMMG00000020051 #14	ENSMMMG00000020057	ATAD3A (ENSMMMG00000020062) #16	VWA1 (ENSMMMG00000020087) #17	ENSMMMG00000020093 #19	ENSMMMG00000020095	CCNL2 (ENSMMMG00000020112) #21	AURKAIP1 (ENSMMMG00000020118) #22	DVL1 (ENSMMMG00000020124) #24	TAS1R3 (ENSMMMG00000020135) #25	CPTP (ENSMMMG00000020146) #26	INTS11 (ENSMMMG00000020151) #27	PUSL1 (ENSMMMG00000020168) #28	ACAP3 (ENSMMMG00000020193)	ENSMMMG00000020944 #29	UBE2J2 (ENSMMMG00000020952) #30	C1QTNF12 (ENSMMMG00000020956) #31	SDF4 (ENSMMMG00000020968) #33	ENSMMMG00000020974 #34	TNFRSF18 (ENSMMMG00000020980) #35	ENSMMMG00000020987 #36	C1orf159 (ENSMMMG00000020997) #37	RNF223 (ENSMMMG00000021024)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT01000000214413.b.a.b.b.b #8	ENSGT00390000013792.e #9	ENSGT00940000159351 #10	ENSGT00940000158459	ENSGT00940000161187	ENSGT00940000158097	ENSGT00550000076432 #12	ENSGT00390000010165.i.b.a.b #14	ENSGT00400000023987 #15	ENSGT00730000111059 #16	ENSGT00940000160734 #17	ENSGT00730000111599 #18	ENSGT00940000163707 #19	ENSGT00390000015823 #20	ENSGT00940000159239 #21	ENSGT00390000012802 #22	ENSGT00390000001509 #23	ENSGT00950000182903.b.a #24	ENSGT00940000160679 #25	ENSGT00940000161763 #26	ENSGT00940000157644 #27	ENSGT00950000183160.C #28	ENSGT00940000156199.b	ENSGT00940000156173 #30	ENSGT00940000160300 #31	ENSGT00940000162229 #32	ENSGT01010000222360.B #33	ENSGT00730000111452 #34	ENSGT00730000111424 #35	ENSGT00940000160919 #36	ENSGT00390000009794 #37
Squirrel	MODERN SPECIES	337	RER1 (ENSSTOG00000007413)	SKI (ENSSTOG00000022893)	PRKCZ (ENSSTOG00000012801)	GABRD (ENSSTOG00000028473)	CALML6 (ENSSTOG00000026712)	GNB1 (ENSSTOG00000010522) #8	ENSSTOG00000012783 #9	SLC35E2B (ENSSTOG00000020174) #10	ENSSTOG00000024470	MMP23B (ENSSTOG00000020131)	ENSSTOG00000030797	ENSSTOG00000002960 #14	ATAD3A (ENSSTOG00000022939) #16	VWA1 (ENSSTOG00000023469) #17	CCNL2 (ENSSTOG00000001826) #21	AURKAIP1 (ENSSTOG00000034496) #22	MXRA8 (ENSSTOG00000001815) #23	DVL1 (ENSSTOG00000013023) #24	TAS1R3 (ENSSTOG00000013015) #25	CPTP (ENSSTOG00000024154) #26	INTS11 (ENSSTOG00000020019) #27	PUSL1 (ENSSTOG00000001783) #28	ACAP3 (ENSSTOG00000028134)	UBE2J2 (ENSSTOG00000001777) #30	C1QTNF12 (ENSSTOG00000001771) #31	B3GALT6 (ENSSTOG00000029209) #32	SDF4 (ENSSTOG00000027911) #33	AGRN (ENSSTOG00000015318)	KLHL17 (ENSSTOG00000014357)	NOC2L (ENSSTOG00000009911)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	638	GNB1 (ENSUPAG00010018256) #8	NADK (ENSUPAG00010018243) #9	SLC35E2B (ENSUPAG00010018234) #10	ENSUPAG00010017083	MMP23B (ENSUPAG00010017053)	MIB2 (ENSUPAG00010016514)	FNDC10 (ENSUPAG00010016503) #12	ENSUPAG00010016500 #14	TMEM240 (ENSUPAG00010016492) #15	ATAD3A (ENSUPAG00010016454) #16	VWA1 (ENSUPAG00010016443) #17	TMEM88B (ENSUPAG00010016433) #18	ANKRD65 (ENSUPAG00010016428) #19	MRPL20 (ENSUPAG00010016402) #20	CCNL2 (ENSUPAG00010016359) #21	AURKAIP1 (ENSUPAG00010016333) #22	MXRA8 (ENSUPAG00010016318) #23	DVL1 (ENSUPAG00010016306) #24	TAS1R3 (ENSUPAG00010016288) #25	CPTP (ENSUPAG00010016277) #26	INTS11 (ENSUPAG00010016221) #27	PUSL1 (ENSUPAG00010016212) #28	ACAP3 (ENSUPAG00010016178)	UBE2J2 (ENSUPAG00010016131) #30	C1QTNF12 (ENSUPAG00010016122) #31	B3GALT6 (ENSUPAG00010016115) #32	SDF4 (ENSUPAG00010016084) #33	TNFRSF4 (ENSUPAG00010016055) #34	TNFRSF18 (ENSUPAG00010016053) #35	TTLL10 (ENSUPAG00010016013) #36	C1orf159 (ENSUPAG00010015973) #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		GNB1 (ENSSVLG00005000043) #8	NADK (ENSSVLG00005000042) #9	SLC35E2B (ENSSVLG00005000041) #10	ENSSVLG00005000040	MMP23B (ENSSVLG00005000039)	MIB2 (ENSSVLG00005000038)	FNDC10 (ENSSVLG00005000037) #12	ENSSVLG00005000036 #14	TMEM240 (ENSSVLG00005000035) #15	ATAD3C (ENSSVLG00005000034)	VWA1 (ENSSVLG00005000033) #17	TMEM88B (ENSSVLG00005000032) #18	ANKRD65 (ENSSVLG00005000031) #19	MRPL20 (ENSSVLG00005000030) #20	CCNL2 (ENSSVLG00005000029) #21	AURKAIP1 (ENSSVLG00005000028) #22	MXRA8 (ENSSVLG00005000027) #23	DVL1 (ENSSVLG00005000026) #24	TAS1R3 (ENSSVLG00005000025) #25	CPTP (ENSSVLG00005000024) #26	INTS11 (ENSSVLG00005000023) #27	ENSSVLG00005000022 #28	ACAP3 (ENSSVLG00005000021)	UBE2J2 (ENSSVLG00005000020) #30	C1QTNF12 (ENSSVLG00005000019) #31	B3GALT6 (ENSSVLG00005000018) #32	SDF4 (ENSSVLG00005000017) #33	TNFRSF4 (ENSSVLG00005000016) #34	ENSSVLG00005000015 #35	TTLL10 (ENSSVLG00005000014) #36	C1orf159 (ENSSVLG00005000013) #37