Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000158377.a.c	ENSGT00940000158827.bb #7	ENSGT00390000016292.c.a #8	ENSGT00980000200496.b #10	ENSGT00940000158922.d #9	ENSGT00940000164651.b #12	ENSGT00950000183046.a.b.l.h ##13	ENSGT00940000157900.m ##14	ENSGT00940000154268.l.b ##15	ENSGT00940000154376.a.a #16	ENSGT00950000182883.a.a.a	ENSGT00730000110974.a.i #17	ENSGT00940000162556.G.d.h #19	ENSGT00390000010440.g.b.a.a ##22	ENSGT00390000010440.g.b.a.b #21	ENSGT00390000010440.g.a #22	ENSGT00940000157423.a.a #23	ENSGT00940000166349 #24	ENSGT00940000158253 #26	ENSGT00390000014069.b #27	ENSGT00940000160773.f.a #28	ENSGT00400000022305.g.b ##29	ENSGT00940000160773.f.b ##28	ENSGT00400000022305.g.a #29	ENSGT00940000154991.a.b #30	ENSGT00940000154991.a.a #31	ENSGT00940000158693.A.f #33	ENSGT00390000001488 #34	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.c.b.b.b ##37	ENSGT00940000154394.b.a.a.b.a.b.c.b.a ##37	ENSGT00980000199397.a.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	162														ENSGT00730000110974.a.j ##17	ENSGT00390000010440.g.b.a.b #21	ENSGT00390000010440.g.a #22	ENSGT00940000157423.a.a.p #23	ENSGT00940000166349.i.a #24	ENSGT00940000158253.yc.a #26	ENSGT00390000014069.b.e #27	ENSGT00940000160773.f.a #28	ENSGT00400000022305.g.b ##29	ENSGT00940000154991.a.a.f ##31	ENSGT00940000158693.A.f #33
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	243													ENSGT00730000110974.a.i.a #17	ENSGT00940000162556.G.d.h.b.a #19	ENSGT00390000010440.g.b.a.b #21	ENSGT00390000010440.g.a #22	ENSGT00940000157423.a.a.p #23	ENSGT00940000166349.i.a #24	ENSGT00940000158253.yc.a #26	ENSGT00390000014069.b.e #27	ENSGT00940000160773.f.a #28
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	strada (ENSOKIG00005032199) #7	rnf113a (ENSOKIG00005033056) #8	RUNDC3A (ENSOKIG00005033098) #9	ENSOKIG00005033537 #10	ENSOKIG00005033543 #11	ENSOKIG00005033550 #12	FAM117A (ENSOKIG00005033565) #13	slc35b1 (ENSOKIG00005033631) #14	ENSOKIG00005033755 #15	spop (ENSOKIG00005033765) #16	NGFR (ENSOKIG00005033821) #17	ENSOKIG00005033847 #18	ENSOKIG00005033854 #19	ENSOKIG00005033869 #20	MIEN1 (ENSOKIG00005033874) #21	selenow2a (ENSOKIG00005033900) #22	slc4a1a (ENSOKIG00005033939) #23	ubtf (ENSOKIG00005034233) #24	ENSOKIG00005034716 #25	atxn7l3a (ENSOKIG00005034724) #26	tmub2 (ENSOKIG00005034749) #27	asb16 (ENSOKIG00005034758) #28	ENSOKIG00005034763 #29	ENSOKIG00005034772 #30	ASIC2 (ENSOKIG00005034821) #31	ENSOKIG00005035054 #32	ENSOKIG00005035078 #33	RRN3 (ENSOKIG00005035508) #34	ENSOKIG00005035692 #35	ENSOKIG00005035709 #36	ENSOKIG00005035739 #37
Chinook salmon	DUPLICATION
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	85													NGFR (ENSOTSG00005037616) ##17	ENSOTSG00005037619 ##20	MIEN1 (ENSOTSG00005037621) ##22	selenow2a (ENSOTSG00005037623) #22	slc4a1a (ENSOTSG00005037627) ##23	ubtf (ENSOTSG00005037680) ##24	atxn7l3a (ENSOTSG00005037752) #26	tmub2 (ENSOTSG00005037753) ##27	asb16 (ENSOTSG00005037754) ##28	ENSOTSG00005037755 ##29	ENSOTSG00005037756 ##31
Rainbow trout	DUPLICATION
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Rainbow trout	MODERN SPECIES	4	ENSOMYG00000005959 ##9	ENSOMYG00000006091 #10	ENSOMYG00000006102 ##11	ENSOMYG00000006123 ##12	FAM117A (ENSOMYG00000006145) ##13	slc35b1 (ENSOMYG00000006195) ##14	ndua4 (ENSOMYG00000007771) ##15	spop (ENSOMYG00000006388) ##16	ENSOMYG00000057878	NXPH3 (ENSOMYG00000006479)	ENSOMYG00000077469	NGFR (ENSOMYG00000006619) #17	ENSOMYG00000070398	ENSOMYG00000006655 #19	ENSOMYG00000051649 ##22	selenow2a (ENSOMYG00000006692) #22	slc4a1a (ENSOMYG00000006966) ##23	ubtf (ENSOMYG00000007387) ##24	atxn7l3a (ENSOMYG00000007563) ##26	tmub2 (ENSOMYG00000007616) ##27	asb16 (ENSOMYG00000007634) #28	ENSOMYG00000007658 ##29	ENSOMYG00000065520 #30	ENSOMYG00000007815 #31	ENSOMYG00000008272 #34	ENSOMYG00000008416 #35	ENSOMYG00000017359	ENSOMYG00000065234 ##37	ENSOMYG00000077206 ##37	asf1ba (ENSOMYG00000008551)	prkacaa (ENSOMYG00000009245)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	219																ENSGT00390000010440.g.a #22	ENSGT00940000157423.a.a.m #23	ENSGT00940000166349.g.a #24	ENSGT00940000158253.ad.a #26	ENSGT00390000014069.b.g #27	ENSGT00940000160773.e.a ##28	ENSGT00400000022305.g.b ##29	ENSGT00940000154991.a.b #30	ENSGT00400000022305.h ##29	ENSGT00940000154991.a.a.g #31	ENSGT00940000158693.A.f #33	ENSGT00390000001488.p #34
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	22	gfap (ENSSSAG00000045892)	ENSSSAG00000001385	ddx42 (ENSSSAG00000001177)	ENSSSAG00000001102 ##7	rnf113a (ENSSSAG00000040392) #8	ENSSSAG00000114487 #9	ENSSSAG00000001029 #10	ENSSSAG00000001023 ##11	FAM117A (ENSSSAG00000001000) #13	s35b1 (ENSSSAG00000000988) ##14	spop (ENSSSAG00000000960) #16	NXPH3 (ENSSSAG00000100957)	NGFR (ENSSSAG00000099650) ##17	ENSSSAG00000121971	ENSSSAG00000102819 ##20	selenow2a (ENSSSAG00000091831) #22	slc4a1a (ENSSSAG00000001877) #23	ubtf (ENSSSAG00000047681) #24	atxn7l3a (ENSSSAG00000010897) #26	tmub2 (ENSSSAG00000092439) #27	asb16 (ENSSSAG00000003381) ##28	ENSSSAG00000001752 ##29	ENSSSAG00000001986 #31	ENSSSAG00000001964 #33	ENSSSAG00000115856	ENSSSAG00000001933 #34	ENSSSAG00000108890	ENSSSAG00000119563 #35	ENSSSAG00000109863 ##37	ENSSSAG00000106784 ##37	prkacaa (ENSSSAG00000091909)
River trout	MODERN SPECIES	25	limd2 (ENSSTUG00000010876)	ddx42 (ENSSTUG00000010932)	strada (ENSSTUG00000010993) #7	rnf113a (ENSSTUG00000011287) ##8	RUNDC3A (ENSSTUG00000011397) #9	ENSSTUG00000011469 #10	ENSSTUG00000011472 ##11	ENSSTUG00000011481	FAM117A (ENSSTUG00000011495) #13	slc35b1 (ENSSTUG00000011509) ##14	NDUFA4 (ENSSTUG00000011529) ##15	NXPH3 (ENSSTUG00000011547)	NGFR (ENSSTUG00000011551) #17	ENSSTUG00000011574 #20	MIEN1 (ENSSTUG00000011587) ##22	selenow2a (ENSSTUG00000011618) #22	slc4a1a (ENSSTUG00000011652) #23	ENSSTUG00000011836	ubtf (ENSSTUG00000011856) #24	ENSSTUG00000012160 ##32	atxn7l3a (ENSSTUG00000012169) #26	tmub2 (ENSSTUG00000012226) #27	asb16 (ENSSTUG00000012239) ##28	ENSSTUG00000012247 ##29	ENSSTUG00000012253 #30	ENSSTUG00000012259	asic2 (ENSSTUG00000012265) #31	trpm4a (ENSSTUG00000012285) #33	RRN3 (ENSSTUG00000036705) #34	ENSSTUG00000037293 #36	ENSSTUG00000037298 ##37