Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	106					ENSGT00940000154527.b	ENSGT00550000074921	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238 #18	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000153541.A	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000153920.b
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238 #18	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00390000012850	ENSGT00390000008296.b.a.b	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.D	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238 #18	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00390000012850	ENSGT00390000008296.b.a.b	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.D	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000156378.a.b	ENSGT00940000156378.a.a	ENSGT00390000014429.a	ENSGT00390000011228.b.a	ENSGT00950000183004.a.a.b	ENSGT00390000005497	ENSGT00510000047967	ENSGT00940000155048	ENSGT00390000005214
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	59															ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000156378.a.b	ENSGT00950000183004.a.a.b	ENSGT00390000005497	ENSGT00510000047967	ENSGT00940000155048	ENSGT00390000005214	ENSGT00940000160100	ENSGT00590000083094.a.a	ENSGT00940000153456.b.b
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00990000210069 #9	ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT01030000235189	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00390000013390	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00950000182846.a.a.a.b	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156878.i.a	ENSGT00940000157205
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT01030000235189	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00950000182846.a.a.a.b	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156878.i.a.a	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00550000074784.a.b	ENSGT00940000158156.b.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000157262.m.a	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00950000182846.a.a.a.b	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156878.i.a.a	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.b.b
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	2				ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000166000	ENSGT00390000014944.a	ENSGT00390000002689	ENSGT00940000161168	ENSGT00390000010463.a.a.a.a	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d	ENSGT00940000168601	ENSGT00940000156629
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000156388	ENSGT00990000210162 #7	ENSGT00940000166256.i.a #8	ENSGT00940000166256.j ##8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860.d ##19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000166000	ENSGT00390000014944.a	ENSGT00390000002689.c	ENSGT00940000161168	ENSGT00390000010463.a.a.a.a
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000011897.d #13	ENSGT00940000159941.a #15	ENSGT00940000157444.c #16	ENSGT00940000160986.b #17	ENSGT00940000157238.a.b #18	ENSGT00390000011897.c.a ##13	ENSGT00950000182952.C.g.b.c ##11	ENSGT00390000010053.b ##12	ENSGT00940000159941.b ##15	ENSGT00940000157444.d ##16	ENSGT00940000160986.a ##17	ENSGT00940000157238.a.a ##18	ENSGT00390000004860.c #19	ENSGT00620000089227.a #20	ENSGT00940000156494.a #21	ENSGT00940000157928.i #22	ENSGT00940000155306.a.j #23	ENSGT00940000157869.e.b.b #24	ENSGT00940000155146.x #25	ENSGT00390000017669.e	ENSGT00530000065109.b	ENSGT00510000048121.o	ENSGT00940000166000.d	ENSGT00390000014944.a.e	ENSGT00390000002689.c.b	ENSGT00940000161168.k	ENSGT00390000010463.a.a.a.a.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	144	ENSGT00990000210162.b #7	ENSGT00940000166256.i.a.a.b #8	ENSGT00940000166256.j.b ##8	ENSGT00940000166455.a #10	ENSGT00950000182952.C.g.b.d #11	ENSGT00390000010053.a #12	ENSGT00390000011897.d #13	ENSGT00940000159941.a #15	ENSGT00940000157444.c #16	ENSGT00940000160986.b #17	ENSGT00940000157238.a.b #18	ENSGT00390000011897.c.b ##13	ENSGT00390000004860.c #19	ENSGT00620000089227.a #20	ENSGT00940000156494.a #21	ENSGT00940000157928.i #22	ENSGT00940000155306.a.j #23	ENSGT00940000157869.e.b.b #24	ENSGT00940000155146.x #25	ENSGT00390000017669.e	ENSGT00530000065109.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	162	ENSSGRG00000039154 #7	shisa10.2 (ENSSGRG00000039155) #8	ENSSGRG00000039157 #9	atrip (ENSSGRG00000039158) #10	si:dkey-42i9.4 (ENSSGRG00000039160) #11	ippk (ENSSGRG00000039163) #12	cenpp (ENSSGRG00000039175) #13	ECM2 (ENSSGRG00000039176) #14	ENSSGRG00000039181 #15	aspn (ENSSGRG00000039183) #16	OMD (ENSSGRG00000039185) #17	ogna (ENSSGRG00000039188) #18	ENSSGRG00000039190 #19	ENSSGRG00000039195 #20	NISCH (ENSSGRG00000039214) #21	stab1 (ENSSGRG00000039810) #22	ccdc71 (ENSSGRG00000039815) #23	kctd6a (ENSSGRG00000039817) #24	pdhb (ENSSGRG00000039822) #25
Common carp reference	MODERN SPECIES	43	bap1 (ENSCCRG00000032782)	shisa10.2 (ENSCCRG00000011552) ##8	ENSCCRG00000076084	ENSCCRG00000000796 ##8	ENSCCRG00000054014 ##8	shisa10.1 (ENSCCRG00000078382) ##8	si:dkey-42i9.4 (ENSCCRG00000000851) #11	atrip (ENSCCRG00000023867) #10	ippk (ENSCCRG00000011379) #12	ECM2 (ENSCCRG00000013138) #15	aspn (ENSCCRG00000013156) #16	ogna (ENSCCRG00000075622) #18	cenpp (ENSCCRG00000020051) ##13	ENSCCRG00000054453 #20	ENSCCRG00000070244 #21	stab1 (ENSCCRG00000005249) #22	ccdc71 (ENSCCRG00000069065) #23	kctd6a (ENSCCRG00000037762) #24	pdhb (ENSCCRG00000077318) #25	pxk (ENSCCRG00000043544)	ENSCCRG00000067718	rbck1 (ENSCCRG00000039034)	bloc1s1 (ENSCCRG00000039135)	rdh5 (ENSCCRG00000039147)	tbc1d20 (ENSCCRG00000081324)	gls2b (ENSCCRG00000072582)	ENSCCRG00000056630	ENSCCRG00000000351	ENSCCRG00000074870	ENSCCRG00000000381	ENSCCRG00000071233
Goldfish	MODERN SPECIES	41	ENSCARG00000019423	RAD54L2 (ENSCARG00000018782)	bap1 (ENSCARG00000018642)	shisa10.2 (ENSCARG00000018623) ##8	shisa10.2 (ENSCARG00000018591) ##8	shisa10.1 (ENSCARG00000018582) ##8	atrip (ENSCARG00000018562) #10	si:dkey-42i9.4 (ENSCARG00000018546) #11	ippk (ENSCARG00000018521) ##12	aspn (ENSCARG00000018504) #16	OMD (ENSCARG00000018501) #17	ogna (ENSCARG00000018484) #18	cenpp (ENSCARG00000068906) ##13	ENSCARG00000068902 #20	ENSCARG00000068897 #21	stab1 (ENSCARG00000068815) #22	ccdc71 (ENSCARG00000068792) #23	kctd6a (ENSCARG00000068781) #24	pdhb (ENSCARG00000068554) #25	pxk (ENSCARG00000068210)	HTD2 (ENSCARG00000068161)	rpp14 (ENSCARG00000068153)	rbck1 (ENSCARG00000068121)	tbc1d20 (ENSCARG00000068100)	bloc1s1 (ENSCARG00000068089)	rdh5 (ENSCARG00000068081)	gls2b (ENSCARG00000067963)	ENSCARG00000067935	ENSCARG00000067922	ENSCARG00000067918	ENSCARG00000067914
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	642													ENSGT00390000004860.d ##19	ENSGT00620000089227.b ##20	ENSGT00940000156494.b ##21	ENSGT00940000157928.j ##22	ENSGT00940000155306.a.i ##23	ENSGT00940000157869.e.b.a ##24	ENSGT00940000155146.w ##25	ENSGT00390000017669.f	ENSGT00530000065109.a	ENSGT00510000048121.p	ENSGT00940000166000.c	ENSGT00390000014944.a.f	ENSGT00390000002689.c.a	ENSGT00940000161168.l	ENSGT00390000010463.a.a.a.a.b
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	274	ENSGT00940000155763.a.b.a	ENSGT00940000156388.b	ENSGT00990000210162.a ##7	ENSGT00940000166256.j.a ##8	ENSGT00940000166455.b ##10	ENSGT00950000182952.C.g.b.c ##11	ENSGT00390000010053.b ##12	ENSGT00390000011897.c.a ##13	ENSGT00940000159941.b ##15	ENSGT00940000157444.d ##16	ENSGT00940000160986.a ##17	ENSGT00940000157238.a.a ##18	ENSGT00390000004860.d ##19	ENSGT00620000089227.b ##20	ENSGT00940000156494.b ##21	ENSGT00940000157928.j ##22	ENSGT00940000155306.a.i ##23	ENSGT00940000157869.e.b.a ##24	ENSGT00940000155146.w ##25	ENSGT00390000017669.f	ENSGT00530000065109.a	ENSGT00510000048121.p	ENSGT00940000166000.c	ENSGT00390000014944.a.f	ENSGT00390000002689.c.a	ENSGT00940000161168.l	ENSGT00390000010463.a.a.a.a.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	5	ENSCCRG00000032777 ##8	shisa10.2 (ENSCCRG00000032769) ##8	ENSCCRG00000057577 ##8	shisa10.1 (ENSCCRG00000082207) ##8	atrip (ENSCCRG00000055206) ##10	si:dkey-42i9.4 (ENSCCRG00000060846) ##11	ippk (ENSCCRG00000000860) ##12	ENSCCRG00000054138 ##13	ECM2 (ENSCCRG00000011404) ##15	aspn (ENSCCRG00000011413) ##16	ENSCCRG00000011416 ##17	ogna (ENSCCRG00000061408) ##18	nol8 (ENSCCRG00000020107) ##19	ENSCCRG00000020111 ##20	ENSCCRG00000058269 ##21	stab1 (ENSCCRG00000043561) ##22	ccdc71 (ENSCCRG00000082420) ##23	kctd6a (ENSCCRG00000043551) ##24	pdhb (ENSCCRG00000069793) ##25	pxk (ENSCCRG00000037768)	rbck1 (ENSCCRG00000053848)	HTD2 (ENSCCRG00000066855)	rpp14 (ENSCCRG00000039166)	tbc1d20 (ENSCCRG00000039117)	ENSCCRG00000063085	ENSCCRG00000068692	gls2b (ENSCCRG00000039157)	ENSCCRG00000065017	ENSCCRG00000039164	ENSCCRG00000061960	ENSCCRG00000046831
Goldfish	MODERN SPECIES	14	arl4ca (ENSCARG00000022131)	sh3bp4a (ENSCARG00000022133)	s100b (ENSCARG00000022164)	ENSCARG00000022291	adarb1a (ENSCARG00000026350)	mmadhca (ENSCARG00000026773)	rnd3a (ENSCARG00000026780)	ENSCARG00000026790	R3HDM1 (ENSCARG00000026895)	ENSCARG00000029144	s100b (ENSCARG00000031921)	sh3bp4a (ENSCARG00000031932)	nol8 (ENSCARG00000031942) ##19	ENSCARG00000031967 ##20	NISCH (ENSCARG00000032054) ##21	stab1 (ENSCARG00000033393) ##22	ccdc71 (ENSCARG00000033962) ##23	ENSCARG00000033973	ENSCARG00000034000	ENSCARG00000034002	ENSCARG00000034007	ENSCARG00000034021	ENSCARG00000034053	rpp21 (ENSCARG00000034060)	rrp36 (ENSCARG00000034073)	ENSCARG00000034087	ENSCARG00000034095	ENSCARG00000034103	mfng (ENSCARG00000034159)	atp6ap2 (ENSCARG00000051655)	ENSCARG00000053192
Zebrafish	MODERN SPECIES	14	bap1 (ENSDARG00000063051)	ENSDARG00000071541 #7	ENSDARG00000095854	shisa10.2 (ENSDARG00000071543) #8	shisa10.1 (ENSDARG00000013681) ##8	atrip (ENSDARG00000063076) #10	si:dkey-42i9.4 (ENSDARG00000008049) #11	ippk (ENSDARG00000003446) #12	ENSDARG00000071549	aspn (ENSDARG00000002192) #16	OMD (ENSDARG00000093600) #17	ogna (ENSDARG00000044132) #18	cenpp (ENSDARG00000044135) #13	nol8 (ENSDARG00000044143) ##19	NISCH (ENSDARG00000043077) #21	stab1 (ENSDARG00000076484) #22	ccdc71 (ENSDARG00000071570) #23	kctd6a (ENSDARG00000043095) #24	pdhb (ENSDARG00000021346) #25	pxk (ENSDARG00000063195)	rpp14 (ENSDARG00000011152)	rbck1 (ENSDARG00000031954)	tbc1d20 (ENSDARG00000032298)	bloc1s1 (ENSDARG00000014171)	rdh5 (ENSDARG00000008306)	gls2b (ENSDARG00000002917)	si:dkey-102c8.3 (ENSDARG00000113572)	ENSDARG00000058537	si:ch211-222k6.3 (ENSDARG00000071578)	ENSDARG00000087046	zgc:174564 (ENSDARG00000071581)
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000164112.a	ENSGT00940000161980	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000166000	ENSGT00390000014944.a	ENSGT00390000002689	ENSGT00940000161168	ENSGT00390000010463.a.a.a.a	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d	ENSGT00940000156629	ENSGT00390000003114.e.a.b
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000164112.a	ENSGT00940000161980	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000166000	ENSGT00390000014944.a	ENSGT00390000002689	ENSGT00940000161168	ENSGT00390000010463.a.a.a.a	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.c.a	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.a	ENSGT00940000168601	ENSGT00940000156629
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000161980	ENSGT00390000004199	ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT01030000235189	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00940000166000	ENSGT00390000014944.a	ENSGT00390000002689	ENSGT00940000161168	ENSGT00390000010463.a.a.a.a	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.a.b	ENSGT01030000234528.B.b.a.a.a.d.a.a
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	103	zgc:77375 (ENSPNAG00000008127)	rab43 (ENSPNAG00000000692)	nuf2 (ENSPNAG00000000683)	shisa10.1 (ENSPNAG00000000671) #8	atrip (ENSPNAG00000008094) #10	si:dkey-42i9.4 (ENSPNAG00000008076) #11	ippk (ENSPNAG00000008073) #12	cenpp (ENSPNAG00000000629) #13	ECM2 (ENSPNAG00000008055) #15	aspn (ENSPNAG00000008046) #16	OMD (ENSPNAG00000006585) #17	ogna (ENSPNAG00000029996) #18	nol8 (ENSPNAG00000029992) #19	ENSPNAG00000004690 #20	NISCH (ENSPNAG00000029982) #21	stab1 (ENSPNAG00000005656) #22	ccdc71 (ENSPNAG00000029934) #23	kctd6a (ENSPNAG00000029932) #24	pdhb (ENSPNAG00000029924) #25	pxk (ENSPNAG00000029914)	HTD2 (ENSPNAG00000029891)	rpp14 (ENSPNAG00000029880)	rbck1 (ENSPNAG00000029872)	tbc1d20 (ENSPNAG00000029862)	bloc1s1 (ENSPNAG00000029856)	rdh5 (ENSPNAG00000029847)	gls2b (ENSPNAG00000029837)	ENSPNAG00000029818	CELA1 (ENSPNAG00000029808)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	1212														ENSAMXG00000005064 #20	NISCH (ENSAMXG00000005024) #21	stab1 (ENSAMXG00000004966) #22	ccdc71 (ENSAMXG00000025979) #23	kctd6a (ENSAMXG00000033161) #24	pdhb (ENSAMXG00000004949) #25	pxk (ENSAMXG00000004944)	HTD2 (ENSAMXG00000025978)	rpp14 (ENSAMXG00000042078)	ENSAMXG00000037599	rbck1 (ENSAMXG00000004941)	tbc1d20 (ENSAMXG00000041540)	bloc1s1 (ENSAMXG00000039913)	rdh5 (ENSAMXG00000038946)	gls2b (ENSAMXG00000004802)	ENSAMXG00000040394	ENSAMXG00000035756	CELA1 (ENSAMXG00000014110)
Electric eel	MODERN SPECIES	237	isy1 (ENSEEEG00000008173)	zgc:77375 (ENSEEEG00000008170)	rab43 (ENSEEEG00000008168)	nuf2 (ENSEEEG00000008163)	shisa10.1 (ENSEEEG00000008159) #8	atrip (ENSEEEG00000008151) #10	ippk (ENSEEEG00000008100) #12	ECM2 (ENSEEEG00000008077) #15	aspn (ENSEEEG00000008075) #16	ogna (ENSEEEG00000008072) #18	cenpp (ENSEEEG00000008070) #13	ENSEEEG00000008069 #19	ENSEEEG00000008068 #19	ENSEEEG00000008064 #20	NISCH (ENSEEEG00000008053) #21	stab1 (ENSEEEG00000007865) #22	ccdc71 (ENSEEEG00000007849) #23	kctd6a (ENSEEEG00000007848) #24	pdhb (ENSEEEG00000007841) #25	pxk (ENSEEEG00000007812)	HTD2 (ENSEEEG00000007808)	rpp14 (ENSEEEG00000007807)	rbck1 (ENSEEEG00000007806)	tbc1d20 (ENSEEEG00000007805)	bloc1s1 (ENSEEEG00000007803)	rdh5 (ENSEEEG00000007744)	gls2b (ENSEEEG00000007742)	CELA1 (ENSEEEG00000007734)	asic1b (ENSEEEG00000007733)	ENSEEEG00000007728	smarcd1 (ENSEEEG00000007720)
Channel catfish	MODERN SPECIES	13	RAB43 (ENSIPUG00000011323)	nuf2 (ENSIPUG00000011256)	shisa5 (ENSIPUG00000011229) #8	atrip (ENSIPUG00000011138) #10	si:dkey-42i9.4 (ENSIPUG00000011123) #11	ippk (ENSIPUG00000011110) #12	ecm2 (ENSIPUG00000011082) #15	aspn (ENSIPUG00000011058) #16	OMD (ENSIPUG00000011045) #17	ogn (ENSIPUG00000011040) #18	cenpp (ENSIPUG00000010997) #13	nol8 (ENSIPUG00000010933) #19	ENSIPUG00000010918 #20	ENSIPUG00000010913	nisch (ENSIPUG00000010896) #21	stab1 (ENSIPUG00000010453) #22	ccdc71 (ENSIPUG00000010381) #23	KCTD6 (ENSIPUG00000010343) ##24	pdhb (ENSIPUG00000010279) #25	PXK (ENSIPUG00000010143)	HTD2 (ENSIPUG00000010099)	rpp14 (ENSIPUG00000010066)	rbck1 (ENSIPUG00000010047)	tbc1d20 (ENSIPUG00000010009)	bloc1s1 (ENSIPUG00000009969)	rdh5 (ENSIPUG00000009950)	ENSIPUG00000009923	gls2b (ENSIPUG00000009764)	tmprss12 (ENSIPUG00000009741)	ENSIPUG00000009731	ENSIPUG00000009724
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	87	ENSGT01070000253775.a.d.a.a.a.b	ENSGT00510000047522	ENSGT00950000183004.a.b.b	ENSGT01030000234563.a.a.c.a	ENSGT00950000183004.a.b.a.a	ENSGT00950000182952.C.h ##11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00950000182846.a.a.a.b	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156878.i.a.a	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.b.b
Denticle herring	MODERN SPECIES	3	ppp4r2b (ENSDCDG00000034728)	pdzrn3b (ENSDCDG00000034720)	ENSDCDG00000034577	ENSDCDG00000034312	ENSDCDG00000034027	cntn4 (ENSDCDG00000032350)	rbm19 (ENSDCDG00000032266)	epha2a (ENSDCDG00000032258)	FUT9 (ENSDCDG00000032252)	ENSDCDG00000032248	ENSDCDG00000032245	sumf1 (ENSDCDG00000032222)	ENSDCDG00000032216	ENSDCDG00000032215	FUT9 (ENSDCDG00000032214)	stab1 (ENSDCDG00000031873) #22	ccdc71 (ENSDCDG00000031819) #23	kctd6a (ENSDCDG00000031818) #24	pdhb (ENSDCDG00000031739) #25	pxk (ENSDCDG00000031718)	HTD2 (ENSDCDG00000031702)	rpp14 (ENSDCDG00000031694)	ABHD6 (ENSDCDG00000031686)	DNASE1L3 (ENSDCDG00000031683)	ENSDCDG00000031682	FLNB (ENSDCDG00000030320)	slmapa (ENSDCDG00000027335)	dennd6aa (ENSDCDG00000024966)	arf4a (ENSDCDG00000024794)	pde12 (ENSDCDG00000024791)	ENSDCDG00000024788
Atlantic herring	MODERN SPECIES	21	alas1 (ENSCHAG00000020253)	POC1A (ENSCHAG00000020449)	ENSCHAG00000020545	alas1 (ENSCHAG00000020568)	ENSCHAG00000020974 #8	atrip (ENSCHAG00000020986) #10	ENSCHAG00000020995 ##11	ippk (ENSCHAG00000021008) #12	cenpp (ENSCHAG00000021024) #13	ENSCHAG00000021044 #15	aspn (ENSCHAG00000021056) #16	ogna (ENSCHAG00000021204) #18	nol8 (ENSCHAG00000021212) #19	ENSCHAG00000021222 #20	NISCH (ENSCHAG00000021242) #21	stab1 (ENSCHAG00000021441) #22	ccdc71 (ENSCHAG00000021581) #23	pdhb (ENSCHAG00000021595) #25	pxk (ENSCHAG00000021859)	HTD2 (ENSCHAG00000021936)	rpp14 (ENSCHAG00000021950)	ABHD6 (ENSCHAG00000021962)	DNASE1L3 (ENSCHAG00000021978)	ENSCHAG00000022004	slmapa (ENSCHAG00000023774)	dennd6aa (ENSCHAG00000024303)	arf4a (ENSCHAG00000024609)	pde12 (ENSCHAG00000024667)	atp6ap1la (ENSCHAG00000024678)	rps23 (ENSCHAG00000024683)	ENSCHAG00000024698
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157262.m.a	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00940000166256 #8	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT01030000235189	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00950000182846.a.a.a.b	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156878.i.a.b	ENSGT00940000157205
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000157262.m.a	ENSGT00940000157494	ENSGT00990000210069 #9	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000182952.C.g.b #11	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00980000199506	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00950000182846.a.a.a.b	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156878.i.a.b	ENSGT00940000157205	ENSGT00950000183124.A
Northern pike	MODERN SPECIES	1	alas1 (ENSELUG00000015461)	shisa10.1 (ENSELUG00000030351) #8	atrip (ENSELUG00000000567) #10	BTG1 (ENSELUG00000032970) #11	ippk (ENSELUG00000015362) #12	ECM2 (ENSELUG00000000561) #15	aspn (ENSELUG00000000558) #16	ogna (ENSELUG00000015301) #18	cenpp (ENSELUG00000015340) #13	ENSELUG00000027100 #19	ENSELUG00000015288 #19	ENSELUG00000025870	ENSELUG00000015264 #20	ENSELUG00000015253 #21	ENSELUG00000027716	stab1 (ENSELUG00000015199) #22	ccdc71 (ENSELUG00000015098) #23	kctd6a (ENSELUG00000015083) #24	pdhb (ENSELUG00000015056) #25	pxk (ENSELUG00000014988)	HTD2 (ENSELUG00000014892)	rpp14 (ENSELUG00000014879)	ABHD6 (ENSELUG00000014851)	DNASE1L3 (ENSELUG00000014818)	ENSELUG00000014790	FLNB (ENSELUG00000014760)	slmapa (ENSELUG00000014623)	dennd6aa (ENSELUG00000014475)	arf4 (ENSELUG00000032802)	pde12 (ENSELUG00000014391)	il10 (ENSELUG00000014348)
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	1141																ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a.p.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146.y #25
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000159711.g.f	ENSGT00390000008429.e.a.e	ENSGT01030000234648.a.a.c.a.g.b	ENSGT00950000183146.b.b.d	ENSGT00390000003282.B.f.a.b	ENSGT00940000160690.i	ENSGT00940000156027.b.l.a	ENSGT00940000166500.j.a	ENSGT00390000007084.m.a	ENSGT00940000157262.m.a.a	ENSGT00940000156030.j.i.b	ENSGT00940000166256.f #8	ENSGT00390000010053.c #12	ENSGT00940000159941.c #15	ENSGT00940000157238.a.c #18	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a.p.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146.y #25	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000157660.k.b	ENSGT00950000183124.A.g	ENSGT00390000004207	ENSGT00940000157562.q.a.a.a
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	124						ENSGT00390000003282.B.f.a.b	ENSGT00940000160690.i	ENSGT00940000156027.b.l.a	ENSGT00940000166500.j.a	ENSGT00940000157262.m.a.a	ENSGT00940000156030.j.i.b	ENSGT00940000166256.f #8	ENSGT00390000010053.c #12	ENSGT00940000159941.c #15	ENSGT00940000157238.a.c #18	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a.p.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146.y #25	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000157660.k.b	ENSGT00950000183124.A.g	ENSGT00390000004207	ENSGT00940000157562.q.a.a.a	ENSGT00940000161921.e.a.a	ENSGT00940000154543.d	ENSGT00940000161664	ENSGT00910000144253	ENSGT00940000158148.f.b	ENSGT00940000160218.j	ENSGT00940000157312
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	3	ENSSSAG00000009275	ENSSSAG00000044841	ENSSSAG00000116964	ENSSSAG00000066901	ENSSSAG00000102488	ENSSSAG00000109185	ENSSSAG00000067640	ENSSSAG00000047688	ENSSSAG00000066907	ENSSSAG00000083746	ENSSSAG00000067808	ENSSSAG00000119612 #8	IPPK (ENSSSAG00000067803) #12	ECM2 (ENSSSAG00000067872) #15	OGN (ENSSSAG00000102125) #18	stab1 (ENSSSAG00000067902) #22	ENSSSAG00000103257	ccdc71 (ENSSSAG00000067912) #23	ENSSSAG00000114357	kctd6a (ENSSSAG00000067913) #24	pdhb (ENSSSAG00000067916) #25	ENSSSAG00000103150	ENSSSAG00000067931	ENSSSAG00000111615	ENSSSAG00000094320	ENSSSAG00000060326	phactr3b (ENSSSAG00000086139)	ENSSSAG00000068209	ENSSSAG00000098714	ENSSSAG00000084297	cstf1 (ENSSSAG00000068210)
River trout	MODERN SPECIES	5		vgll4b (ENSSTUG00000008139)	ENSSTUG00000008145	HRH1 (ENSSTUG00000008152)	slc6a1b (ENSSTUG00000008160)	atp2b2 (ENSSTUG00000008268)	ENSSTUG00000008507	rpl29 (ENSSTUG00000008512)	alas1 (ENSSTUG00000008532)	shisa10.1 (ENSSTUG00000008584) #8	ippk (ENSSTUG00000008593) #12	ENSSTUG00000008622	ECM2 (ENSSTUG00000001289) #15	ENSSTUG00000001318	ogna (ENSSTUG00000001324) #18	stab1 (ENSSTUG00000001356) #22	ccdc71 (ENSSTUG00000001515) #23	kctd6a (ENSSTUG00000001518) #24	ENSSTUG00000001528	pdhb (ENSSTUG00000001535) #25	ENSSTUG00000001556	slmapa (ENSSTUG00000001585)	ENSSTUG00000002177	il10 (ENSSTUG00000002182)	acot8 (ENSSTUG00000002194)	ENSSTUG00000002210	phactr3b (ENSSTUG00000002219)	PPP1R3D (ENSSTUG00000002222)	ENSSTUG00000002235	ENSSTUG00000002241	ENSSTUG00000002247
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000008429.e.a.e	ENSGT00950000183146.b.b.d	ENSGT00940000158813.a.a.b	ENSGT00940000157802.v.a	ENSGT00390000003282.B.f.a.b	ENSGT00940000160690.i	ENSGT00940000156027.b.l.a	ENSGT00940000166500.j.a	ENSGT00390000007084.m.a	ENSGT00940000157262.m.a.a	ENSGT00940000156030.j.i.b	ENSGT00940000166256.f #8	ENSGT00390000010053.c #12	ENSGT00940000159941.c #15	ENSGT00940000157238.a.c #18	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a.p.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146.y #25	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000157660.k.b	ENSGT00950000183124.A.g	ENSGT00390000004207	ENSGT00940000157562.q.a.a.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	170							ENSGT00940000160690.i	ENSGT00940000156027.b.l.a	ENSGT00940000166500.j.a	ENSGT00940000157262.m.a.a	ENSGT00940000156030.j.i.b	ENSGT00940000166256.f #8	ENSGT00390000010053.c #12	ENSGT00940000159941.c #15	ENSGT00940000157238.a.c #18	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a.p.a #23	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146.y #25	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00950000183124.A.g	ENSGT00390000004207	ENSGT00940000157562.q.a.a.a
Coho salmon	MODERN SPECIES		SYN2 (ENSOKIG00005000511)	TIMP4 (ENSOKIG00005000693)	HRH1 (ENSOKIG00005000701)	SLC6A1 (ENSOKIG00005000721)	ENSOKIG00005000824	ENSOKIG00005000924	ENSOKIG00005000930	ENSOKIG00005000931	DUSP7 (ENSOKIG00005000938)	alas1 (ENSOKIG00005000942)	ENSOKIG00005000951	ENSOKIG00005000953 #8	ippk (ENSOKIG00005000957) #12	ECM2 (ENSOKIG00005000970) #15	OGN (ENSOKIG00005000984) #18	stab1 (ENSOKIG00005001022) #22	ccdc71 (ENSOKIG00005001069) #23	kctd6a (ENSOKIG00005001073) #24	pdhb (ENSOKIG00005001100) #25	ENSOKIG00005001155	ENSOKIG00005001161	SLMAP (ENSOKIG00005001181)	ENSOKIG00005001222	ENSOKIG00005001225	ENSOKIG00005001227	acot8 (ENSOKIG00005001233)	ENSOKIG00005001243	ENSOKIG00005001248	VGLL4 (ENSOKIG00005001258)	ENSOKIG00005001273	IP6K1 (ENSOKIG00005001293)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	66		gypc (ENSOTSG00005031364)	ndufa10 (ENSOTSG00005031366)	ENSOTSG00005031555	ENSOTSG00005031565	ENSOTSG00005031703	ENSOTSG00005031704	agpat3 (ENSOTSG00005031707)	PDXK (ENSOTSG00005031708)	gpc6b (ENSOTSG00005031709)	gpc6b (ENSOTSG00005031710)	dct (ENSOTSG00005031712)	sox21b (ENSOTSG00005031714)	cldn10b (ENSOTSG00005031716)	ENSOTSG00005031721	stab1 (ENSOTSG00005031725) #22	ccdc71 (ENSOTSG00005031727) #23	kctd6a (ENSOTSG00005031730) #24	pdhb (ENSOTSG00005031734) #25	ENSOTSG00005031736	clic3 (ENSOTSG00005031739)	fut7 (ENSOTSG00005031752)	pou5f3 (ENSOTSG00005031753)	ENSOTSG00005031755	slc31a2 (ENSOTSG00005031790)	niban2a (ENSOTSG00005031795)	stxbp1a (ENSOTSG00005031912)	ENSOTSG00005036358	WHRN (ENSOTSG00005036360)	MAN1B1 (ENSOTSG00005036365)	ENSOTSG00005036414
Rainbow trout	MODERN SPECIES	8	ENSOMYG00000058752	ENSOMYG00000036157	ENSOMYG00000053981	ENSOMYG00000066681	ENSOMYG00000032887	ENSOMYG00000032921	ENSOMYG00000005322	ENSOMYG00000074040 #8	ENSOMYG00000058335	IPPK (ENSOMYG00000005523) #12	ENSOMYG00000064014	ENSOMYG00000069132	ECM2 (ENSOMYG00000005548) #15	OGN (ENSOMYG00000005564) #18	ENSOMYG00000048480	stab1 (ENSOMYG00000005799) #22	ENSOMYG00000070695	ccdc71 (ENSOMYG00000006044) #23	kctd6a (ENSOMYG00000050807) #24	pdhb (ENSOMYG00000006083) #25	ENSOMYG00000006110	ENSOMYG00000006266	ENSOMYG00000076915	il10b (ENSOMYG00000071035)	ENSOMYG00000006375	ENSOMYG00000006350	ENSOMYG00000006901	ENSOMYG00000007232	ENSOMYG00000007246	ENSOMYG00000007313	ENSOMYG00000007339
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	3818													ENSHHUG00000048404	ENSHHUG00000048418	ENSHHUG00000048423 #22	ENSHHUG00000048425 #22	ccdc71 (ENSHHUG00000048427) #23
Huchen	MODERN SPECIES	3770																ENSHHUG00000041258 #22	ENSHHUG00000041274
Huchen	MODERN SPECIES	3818														ENSHHUG00000048404	ENSHHUG00000048418	ENSHHUG00000048423 #22	ENSHHUG00000048425 #22	ccdc71 (ENSHHUG00000048427) #23
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	192	ENSGT00940000166842	ENSGT00940000163873.c.b	ENSGT00940000160613	ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a	ENSGT00950000182986.a.a	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT01030000235189	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a
Cod	MODERN SPECIES	4	ENSGMOG00000010983	ENSGMOG00000000422	ENSGMOG00000005597	ENSGMOG00000000340	ENSGMOG00000032729	ENSGMOG00000032074	ENSGMOG00000029109	ENSGMOG00000024503	ippk (ENSGMOG00000002771) #12	ENSGMOG00000002913 #13	ENSGMOG00000002834	aspn (ENSGMOG00000002875) #16	ogna (ENSGMOG00000023891) #18	nol8 (ENSGMOG00000025541) #19	ENSGMOG00000003352 #21	stab1 (ENSGMOG00000006376) #22	ENSGMOG00000023699	pdhb (ENSGMOG00000000301) #25	pxk (ENSGMOG00000010634)	HTD2 (ENSGMOG00000010633)	rpp14 (ENSGMOG00000010625)	ABHD6 (ENSGMOG00000010616)	ENSGMOG00000022887	ENSGMOG00000024774	ENSGMOG00000001444	kdm5ba (ENSGMOG00000001476)	rabif (ENSGMOG00000027448)	adipor1a (ENSGMOG00000001524)	inavab (ENSGMOG00000036578)	ENSGMOG00000014555	ENSGMOG00000014522
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	99							ENSGT00390000010053 #12	ENSGT01030000235189	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000166842	ENSGT00940000163873.c.b	ENSGT00940000160613	ENSGT00950000182991.A.a.c.a.a	ENSGT00950000182986.a.a	ENSGT00940000166455 #10
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	19	HTD2 (ENSMMDG00005010249)	ENSMMDG00005010247	st3gal8 (ENSMMDG00005010238)	REM1 (ENSMMDG00005010198)	pnp4a (ENSMMDG00005010023)	trib3 (ENSMMDG00005010013)	atrip (ENSMMDG00005010009) #10	ippk (ENSMMDG00005010000) #12	ECM2 (ENSMMDG00005009990) #15	aspn (ENSMMDG00005009986) #16	ogna (ENSMMDG00005009973) #18	cenpp (ENSMMDG00005009969) #13	nol8 (ENSMMDG00005009963) #19	ENSMMDG00005009957 #20	NISCH (ENSMMDG00005009741) #21	stab1 (ENSMMDG00005009718) #22	ccdc71 (ENSMMDG00005009713) #23	ENSMMDG00005009711 ##24	pdhb (ENSMMDG00005009707) #25	ENSMMDG00005009704	pxk (ENSMMDG00005009702)	arfrp1 (ENSMMDG00005009701)	ENSMMDG00005009700	ENSMMDG00005009698	ENSMMDG00005009514	ENSMMDG00005009511	chia.1 (ENSMMDG00005009506)	cntn2 (ENSMMDG00005009424)	ALOX15B (ENSMMDG00005009407)	STMN3 (ENSMMDG00005009336)	ENSMMDG00005009306
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183117.a.b.b	ENSGT00970000193560	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00550000074784.b.f	ENSGT00940000174941	ENSGT00550000074784.a.b	ENSGT00940000156550.a
Tiger tail seahorse	DUPLICATION
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	513	zgc:153675 (ENSHCOG00000013030)	dram2b (ENSHCOG00000013044)	zgc:162255 (ENSHCOG00000013056)	nfs1 (ENSHCOG00000013066)	sec13 (ENSHCOG00000013079)	ENSHCOG00000013136	GRIP2 (ENSHCOG00000013177)	slc6a6b (ENSHCOG00000013446)	LSM3 (ENSHCOG00000013481)	ENSHCOG00000013488	RIMS4 (ENSHCOG00000013503)	cpne1 (ENSHCOG00000013520)	hgh1 (ENSHCOG00000013569)	ENSHCOG00000013581 #20	ENSHCOG00000013592 #21	ENSHCOG00000013632 #22	ENSHCOG00000013657 #22	ENSHCOG00000013661	ENSHCOG00000013667 ##24	pdhb (ENSHCOG00000013673) #25	pxk (ENSHCOG00000013686)	HTD2 (ENSHCOG00000013692)	rpp14 (ENSHCOG00000013696)	ABHD6 (ENSHCOG00000013707)	lmcd1 (ENSHCOG00000013716)	gmppb (ENSHCOG00000013742)	pde12 (ENSHCOG00000013749)	ENSHCOG00000013758	ENSHCOG00000013775	rps23 (ENSHCOG00000013785)	ASB14 (ENSHCOG00000013855)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	513	dram2b (ENSHCOG00000013044)	zgc:162255 (ENSHCOG00000013056)	nfs1 (ENSHCOG00000013066)	sec13 (ENSHCOG00000013079)	ENSHCOG00000013136	GRIP2 (ENSHCOG00000013177)	slc6a6b (ENSHCOG00000013446)	LSM3 (ENSHCOG00000013481)	ENSHCOG00000013488	RIMS4 (ENSHCOG00000013503)	cpne1 (ENSHCOG00000013520)	hgh1 (ENSHCOG00000013569)	ENSHCOG00000013581 #20	ENSHCOG00000013592 #21	ENSHCOG00000013632 #22	ENSHCOG00000013657 #22	ENSHCOG00000013661	ENSHCOG00000013667 ##24	pdhb (ENSHCOG00000013673) #25	pxk (ENSHCOG00000013686)	HTD2 (ENSHCOG00000013692)	rpp14 (ENSHCOG00000013696)	ABHD6 (ENSHCOG00000013707)	lmcd1 (ENSHCOG00000013716)	gmppb (ENSHCOG00000013742)	pde12 (ENSHCOG00000013749)	ENSHCOG00000013758	ENSHCOG00000013775	rps23 (ENSHCOG00000013785)	ASB14 (ENSHCOG00000013855)	IP6K1 (ENSHCOG00000013870)
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00550000074784.b.f	ENSGT00940000174941
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00980000199506	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00980000199506	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT01100000265553	ENSGT00550000074784.b.f
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157928 #22
Fugu	DUPLICATION
Fugu	MODERN SPECIES	10	ECM2 (ENSTRUG00000009473) #15	ippk (ENSTRUG00000032171) #12	rbbp5 (ENSTRUG00000010017)	zgc:153675 (ENSTRUG00000024130)	hgh1 (ENSTRUG00000010126)	hgh1 (ENSTRUG00000028625)	ENSTRUG00000010262 #21	ENSTRUG00000010351 #22	phtf1 (ENSTRUG00000010817)	PFKFB2 (ENSTRUG00000011040)	ENSTRUG00000031722 #19	ENSTRUG00000023973	ogna (ENSTRUG00000021546) #18	ippk (ENSTRUG00000032010) #12	ENSTRUG00000027780 #21	ENSTRUG00000030180 #22	PFKFB2 (ENSTRUG00000031546)	yod1 (ENSTRUG00000011325)	ENSTRUG00000019802	sh2d5 (ENSTRUG00000021223)	hp1bp3 (ENSTRUG00000011361)	EIF4G3 (ENSTRUG00000011593)	ece1 (ENSTRUG00000012021)	alpl (ENSTRUG00000004463)	ENSTRUG00000019541	ENSTRUG00000025583	ENSTRUG00000005202	LACTBL1 (ENSTRUG00000023247)	ephb2b (ENSTRUG00000005498)	ENSTRUG00000006571	dhrs3b (ENSTRUG00000006594)
Fugu	MODERN SPECIES	10	ENSTRUG00000029982	ENSTRUG00000032040	atp2b4 (ENSTRUG00000008382)	GPR37L1 (ENSTRUG00000030371)	nol8 (ENSTRUG00000009278) #19	cenpp (ENSTRUG00000028788) #13	ogna (ENSTRUG00000032826) #18	aspn (ENSTRUG00000023083) #16	ECM2 (ENSTRUG00000009473) #15	ippk (ENSTRUG00000032171) #12	rbbp5 (ENSTRUG00000010017)	zgc:153675 (ENSTRUG00000024130)	hgh1 (ENSTRUG00000010126)	hgh1 (ENSTRUG00000028625)	ENSTRUG00000010262 #21	ENSTRUG00000010351 #22	phtf1 (ENSTRUG00000010817)	PFKFB2 (ENSTRUG00000011040)	ENSTRUG00000031722 #19	ENSTRUG00000023973	ogna (ENSTRUG00000021546) #18	ippk (ENSTRUG00000032010) #12	ENSTRUG00000027780 #21	ENSTRUG00000030180 #22	PFKFB2 (ENSTRUG00000031546)	yod1 (ENSTRUG00000011325)	ENSTRUG00000019802	sh2d5 (ENSTRUG00000021223)	hp1bp3 (ENSTRUG00000011361)	EIF4G3 (ENSTRUG00000011593)	ece1 (ENSTRUG00000012021)
Tetraodon	DUPLICATION
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	ENSTNIG00000005919	polr1h (ENSTNIG00000005917)	mgat1b (ENSTNIG00000000449)	vars2 (ENSTNIG00000005916)	ENSTNIG00000005915	ENSTNIG00000005914	or91a1 (ENSTNIG00000001548)	USP48 (ENSTNIG00000005896)	ENSTNIG00000005895	sbf1 (ENSTNIG00000005889)	ENSTNIG00000005888	rcn3 (ENSTNIG00000005886)	rbbp5 (ENSTNIG00000005884)	hgh1 (ENSTNIG00000005883)	ENSTNIG00000005882 #21	ENSTNIG00000001565 #22	ENSTNIG00000005881	ENSTNIG00000005880	ENSTNIG00000005879	ENSTNIG00000003332	ENSTNIG00000005872	cyp4t8 (ENSTNIG00000005871)	ENSTNIG00000005867	ENSTNIG00000003962	ENSTNIG00000005865	plod1a (ENSTNIG00000005864)	ENSTNIG00000005863	ENSTNIG00000005841	hm13 (ENSTNIG00000005840)	nkain4 (ENSTNIG00000005839)	kirrel1b (ENSTNIG00000005830)
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	zgc:158659 (ENSTNIG00000003819)	eif4e2rs1 (ENSTNIG00000003820)	eif3s10 (ENSTNIG00000003822)	nol6 (ENSTNIG00000003826)	aqp3a (ENSTNIG00000003827)	ENSTNIG00000000859	fgf8b (ENSTNIG00000003830)	ENSTNIG00000003831	ENSTNIG00000001250	AMIGO3 (ENSTNIG00000003837)	ENSTNIG00000003838	tfap2c (ENSTNIG00000003840)	ENSTNIG00000003841	det1 (ENSTNIG00000003849)	SKI (ENSTNIG00000001491)	ENSTNIG00000003856 #22	PFKFB2 (ENSTNIG00000003857)	myh7l (ENSTNIG00000003860)	ENSTNIG00000003859	ENSTNIG00000000081	ENSTNIG00000003863	BACH2 (ENSTNIG00000003864)	mbnl1 (ENSTNIG00000003878)	ENSTNIG00000003883	ENSTNIG00000003884	gripap1 (ENSTNIG00000003886)	ENSTNIG00000003895	ABLIM2 (ENSTNIG00000003898)	ENSTNIG00000001060	zbtb49 (ENSTNIG00000003905)	ENSTNIG00000003906
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00980000199506	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT01100000265553
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	34	cept1b (ENSLBEG00000026035)	ENSLBEG00000026062	atp2b4 (ENSLBEG00000026096)	GPR37L1 (ENSLBEG00000026160)	nol8 (ENSLBEG00000026169) #19	ENSLBEG00000026199	ogna (ENSLBEG00000026214) #18	aspn (ENSLBEG00000026234) #16	ECM2 (ENSLBEG00000026256) #15	ippk (ENSLBEG00000026272) #12	rbbp5 (ENSLBEG00000026292)	zgc:153675 (ENSLBEG00000026318)	hgh1 (ENSLBEG00000026331)	ENSLBEG00000026346 #20	ENSLBEG00000026358 #21	stab1 (ENSLBEG00000026430) #22	ENSLBEG00000026603	ccdc71 (ENSLBEG00000026609) #23	ENSLBEG00000026619 ##24	pdhb (ENSLBEG00000026640) #25	pxk (ENSLBEG00000026676)	HTD2 (ENSLBEG00000026703)	rpp14 (ENSLBEG00000026713)	ABHD6 (ENSLBEG00000026720)	lmcd1 (ENSLBEG00000026729)	ENSLBEG00000026735	ENSLBEG00000026741	gmppb (ENSLBEG00000026747)	pde12 (ENSLBEG00000026775)	ENSLBEG00000026795	rps23 (ENSLBEG00000026807)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT01100000265553	ENSGT00550000074784.b.f
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00550000074784.b.f	ENSGT00940000174941	ENSGT00940000156550.a
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183117.a.b.b	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a
Pike perch	MODERN SPECIES	134	ENSSLUG00000021084	atp2b4 (ENSSLUG00000021035)	GPR37L1 (ENSSLUG00000021002)	nol8 (ENSSLUG00000020993) #19	ogna (ENSSLUG00000020986) #18	aspn (ENSSLUG00000020980) #16	ECM2 (ENSSLUG00000020969) #15	ENSSLUG00000020960 #13	ippk (ENSSLUG00000020942) #12	rbbp5 (ENSSLUG00000020059)	zgc:153675 (ENSSLUG00000019987)	hgh1 (ENSSLUG00000019983)	ENSSLUG00000019979 #20	NISCH (ENSSLUG00000019632) #21	ENSSLUG00000019587	stab1 (ENSSLUG00000019582) #22	ccdc71 (ENSSLUG00000019578) #23	ENSSLUG00000019571 ##24	pdhb (ENSSLUG00000019321) #25	ENSSLUG00000019241	pxk (ENSSLUG00000019174)	HTD2 (ENSSLUG00000019158)	rpp14 (ENSSLUG00000019151)	ABHD6 (ENSSLUG00000019134)	lmcd1 (ENSSLUG00000019127)	ENSSLUG00000019124	cyc1 (ENSSLUG00000019118)	romo1 (ENSSLUG00000019116)	ergic3 (ENSSLUG00000019109)	mych (ENSSLUG00000019107)	ENSSLUG00000019104
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	19	cenpp (ENSCGOG00000007522) #13	ogna (ENSCGOG00000007523) #18	ENSCGOG00000007530	aspn (ENSCGOG00000007538) #16	ECM2 (ENSCGOG00000007708) #15	ippk (ENSCGOG00000007714) #12	rbbp5 (ENSCGOG00000007724)	zgc:153675 (ENSCGOG00000007741)	hgh1 (ENSCGOG00000007742)	ENSCGOG00000007754 #21	ENSCGOG00000007770 #20	hgh1 (ENSCGOG00000007772)	zgc:153675 (ENSCGOG00000007792)	rbbp5 (ENSCGOG00000007817)	ippk (ENSCGOG00000008891) #12	stab1 (ENSCGOG00000008940) #22	ENSCGOG00000009010	ccdc71 (ENSCGOG00000009015) #23	ENSCGOG00000009019 ##24	pdhb (ENSCGOG00000009034) #25	pxk (ENSCGOG00000009768)	ENSCGOG00000010556	HTD2 (ENSCGOG00000010557)	rpp14 (ENSCGOG00000010559)	ABHD6 (ENSCGOG00000010560)	lmcd1 (ENSCGOG00000010564)	ENSCGOG00000010567	ENSCGOG00000010575	gmppb (ENSCGOG00000010579)	ENSCGOG00000010651	ASB14 (ENSCGOG00000010654)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00550000074784.b.f	ENSGT00940000156550.a	ENSGT00940000157802	ENSGT00390000012411
Stickleback	DUPLICATION
Stickleback	MODERN SPECIES	17	dram2b (ENSGACG00000004138)	cept1b (ENSGACG00000004106)	ENSGACG00000004105	atp2b4 (ENSGACG00000004097)	GPR37L1 (ENSGACG00000004094)	nol8 (ENSGACG00000004077) #19	ogna (ENSGACG00000004073) #18	aspn (ENSGACG00000004064) #16	ECM2 (ENSGACG00000004058) #15	ippk (ENSGACG00000004054) #12	rbbp5 (ENSGACG00000004043)	zgc:153675 (ENSGACG00000004042)	hgh1 (ENSGACG00000004030)	NISCH (ENSGACG00000004013) #21	ENSGACG00000003998 #22	stab1 (ENSGACG00000003984) #22	ENSGACG00000003980 ##24	pdhb (ENSGACG00000003959) #25	pxk (ENSGACG00000003953)	HTD2 (ENSGACG00000003952)	rpp14 (ENSGACG00000003941)	ABHD6 (ENSGACG00000003935)	lmcd1 (ENSGACG00000003930)	gmppb (ENSGACG00000003924)	pde12 (ENSGACG00000003914)	ENSGACG00000003910	rps23 (ENSGACG00000003895)	ASB14 (ENSGACG00000003890)	IP6K1 (ENSGACG00000003887)	ENSGACG00000003884	ENSGACG00000003880
Stickleback	MODERN SPECIES	17	zgc:162255 (ENSGACG00000004147)	dram2b (ENSGACG00000004138)	cept1b (ENSGACG00000004106)	ENSGACG00000004105	atp2b4 (ENSGACG00000004097)	GPR37L1 (ENSGACG00000004094)	nol8 (ENSGACG00000004077) #19	ogna (ENSGACG00000004073) #18	aspn (ENSGACG00000004064) #16	ECM2 (ENSGACG00000004058) #15	ippk (ENSGACG00000004054) #12	rbbp5 (ENSGACG00000004043)	zgc:153675 (ENSGACG00000004042)	hgh1 (ENSGACG00000004030)	NISCH (ENSGACG00000004013) #21	ENSGACG00000003998 #22	stab1 (ENSGACG00000003984) #22	ENSGACG00000003980 ##24	pdhb (ENSGACG00000003959) #25	pxk (ENSGACG00000003953)	HTD2 (ENSGACG00000003952)	rpp14 (ENSGACG00000003941)	ABHD6 (ENSGACG00000003935)	lmcd1 (ENSGACG00000003930)	gmppb (ENSGACG00000003924)	pde12 (ENSGACG00000003914)	ENSGACG00000003910	rps23 (ENSGACG00000003895)	ASB14 (ENSGACG00000003890)	IP6K1 (ENSGACG00000003887)	ENSGACG00000003884
Lumpfish	MODERN SPECIES	20	GPR37L1 (ENSCLMG00005019720)	nol8 (ENSCLMG00005019717) #19	ENSCLMG00005019714 #19	ogna (ENSCLMG00005019711) #18	aspn (ENSCLMG00005019708) #16	ECM2 (ENSCLMG00005019705) #15	ENSCLMG00005019704 #13	ippk (ENSCLMG00005019703) #12	rbbp5 (ENSCLMG00005019256)	zgc:153675 (ENSCLMG00005019245)	hgh1 (ENSCLMG00005019243)	ENSCLMG00005019242	ENSCLMG00005019241 #20	NISCH (ENSCLMG00005018868) #21	ENSCLMG00005018866	stab1 (ENSCLMG00005018864) #22	ccdc71 (ENSCLMG00005018862) #23	ENSCLMG00005018861 ##24	pdhb (ENSCLMG00005018759) #25	pxk (ENSCLMG00005018758)	HTD2 (ENSCLMG00005018757)	rpp14 (ENSCLMG00005018756)	ABHD6 (ENSCLMG00005018755)	ENSCLMG00005018754	st3gal8 (ENSCLMG00005018753)	ENSCLMG00005018752	REM1 (ENSCLMG00005018742)	pnp4a (ENSCLMG00005018741)	trib3 (ENSCLMG00005018739)	ENSCLMG00005018737 #10	ENSCLMG00005018735
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00940000174941	ENSGT00550000074784.b.f
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	20	atp2b4 (ENSSAUG00010022933)	GPR37L1 (ENSSAUG00010022919)	nol8 (ENSSAUG00010022915) #19	ogna (ENSSAUG00010022912) #18	aspn (ENSSAUG00010022909) #16	ECM2 (ENSSAUG00010022905) #15	cenpp (ENSSAUG00010022904) #13	ippk (ENSSAUG00010022901) #12	rbbp5 (ENSSAUG00010022897)	zgc:153675 (ENSSAUG00010022896)	hgh1 (ENSSAUG00010022894)	ENSSAUG00010022893 #20	NISCH (ENSSAUG00010022846) #21	ENSSAUG00010022844	ENSSAUG00010022842	stab1 (ENSSAUG00010022838) #22	ccdc71 (ENSSAUG00010022833) #23	ENSSAUG00010022831 ##24	pdhb (ENSSAUG00010022818) #25	pxk (ENSSAUG00010022788)	rpp14 (ENSSAUG00010022779)	ABHD6a (ENSSAUG00010022778)	ENSSAUG00010022776	lmcd1 (ENSSAUG00010022773)	ENSSAUG00010022769	ENSSAUG00010022766	ENSSAUG00010022765	ENSSAUG00010022762	ENSSAUG00010022761	ENSSAUG00010022758	ENSSAUG00010022756
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183117.a.b.b	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT01100000265553	ENSGT00550000074784.b.f
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	478	ENSLCRG00005020448	atp2b4 (ENSLCRG00005020232)	GPR37L1 (ENSLCRG00005020136)	nol8 (ENSLCRG00005020124) #19	ogna (ENSLCRG00005020119) #18	aspn (ENSLCRG00005020111) #16	ECM2 (ENSLCRG00005020096) #15	ENSLCRG00005020086 #13	ippk (ENSLCRG00005020073) #12	rbbp5 (ENSLCRG00005019876)	zgc:153675 (ENSLCRG00005019818)	hgh1 (ENSLCRG00005019797)	ENSLCRG00005019775 #20	NISCH (ENSLCRG00005019701) #21	ENSLCRG00005019660	stab1 (ENSLCRG00005019537) #22	ccdc71 (ENSLCRG00005019518) #23	ENSLCRG00005019505 ##24	pdhb (ENSLCRG00005019282) #25	FLNB (ENSLCRG00005009064)	ENSLCRG00005007704	dennd6aa (ENSLCRG00005007493)	ENSLCRG00005007462	ENSLCRG00005007419	per3 (ENSLCRG00005006596)	mxra8a (ENSLCRG00005006508)	mxra8a (ENSLCRG00005006458)	psma5 (ENSLCRG00005006394)	sort1a (ENSLCRG00005006247)	mdm4 (ENSLCRG00005006154)	myog (ENSLCRG00005006143)
European seabass	MODERN SPECIES	10	ENSDLAG00005024038	ENSDLAG00005024105	ENSDLAG00005024120	cenpp (ENSDLAG00005024216) #13	ENSDLAG00005029874	nol8 (ENSDLAG00005024210) #19	ogna (ENSDLAG00005024223) #18	aspn (ENSDLAG00005024230) #16	ECM2 (ENSDLAG00005024238) #15	ENSDLAG00005033333	ENSDLAG00005024267	ENSDLAG00005029524	ENSDLAG00005031686	ENSDLAG00005024409 #20	ENSDLAG00005024433 #21	stab1 (ENSDLAG00005024701) #22	ccdc71 (ENSDLAG00005029820) #23	ENSDLAG00005030580 ##24	pdhb (ENSDLAG00005029424) #25	pxk (ENSDLAG00005000522)	ENSDLAG00005029059	ABHD6 (ENSDLAG00005034760)	ENSDLAG00005000572	ENSDLAG00005003334	ENSDLAG00005010096	ENSDLAG00005027002	ENSDLAG00005000584	ENSDLAG00005002526	pde12 (ENSDLAG00005031952)	ENSDLAG00005002725	ENSDLAG00005026454
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00980000199506	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183117.a.b.b	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00550000074784.b.f	ENSGT00940000174941
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183117.a.b.b	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00550000074784.b.f	ENSGT00940000174941
Climbing perch	MODERN SPECIES	18	ENSATEG00000001916	ENSATEG00000001964	ENSATEG00000001984	ENSATEG00000028458	ENSATEG00000028719 #19	cenpp (ENSATEG00000026253) #13	ogna (ENSATEG00000002159) #18	aspn (ENSATEG00000002163) #16	ECM2 (ENSATEG00000002173) #15	ippk (ENSATEG00000002187) #12	ENSATEG00000002200	ENSATEG00000002218	ENSATEG00000002220	ENSATEG00000002258 #20	ENSATEG00000002269 #21	stab1 (ENSATEG00000002289) #22	ENSATEG00000002765	ccdc71 (ENSATEG00000002777) #23	ENSATEG00000002795 ##24	pdhb (ENSATEG00000028867) #25	pxk (ENSATEG00000002819)	HTD2 (ENSATEG00000002892)	rpp14 (ENSATEG00000002903)	ABHD6 (ENSATEG00000002971)	ENSATEG00000002980	ENSATEG00000002996	ENSATEG00000028059	ENSATEG00000003055	pde12 (ENSATEG00000003072)	ENSATEG00000003135	ENSATEG00000003166
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	16	cept1b (ENSBSLG00000002047)	ENSBSLG00000002061	atp2b4 (ENSBSLG00000002077)	ENSBSLG00000003158	GPR37L1 (ENSBSLG00000003160)	cenpp (ENSBSLG00000003162) #13	ogna (ENSBSLG00000003163) #18	aspn (ENSBSLG00000003165) #16	ECM2 (ENSBSLG00000003168) #15	ippk (ENSBSLG00000003175) #12	rbbp5 (ENSBSLG00000003182)	zgc:153675 (ENSBSLG00000003191)	hgh1 (ENSBSLG00000003194)	ENSBSLG00000003195 #20	NISCH (ENSBSLG00000003196) #21	stab1 (ENSBSLG00000003206) #22	ENSBSLG00000003211	ccdc71 (ENSBSLG00000003213) #23	ENSBSLG00000003215 ##24	pdhb (ENSBSLG00000003219) #25	pxk (ENSBSLG00000003227)	HTD2 (ENSBSLG00000003234)	rpp14 (ENSBSLG00000003236)	ABHD6 (ENSBSLG00000003241)	LMCD1 (ENSBSLG00000003244)	ENSBSLG00000003246	gmppb (ENSBSLG00000003249)	pde12 (ENSBSLG00000003251)	ENSBSLG00000003252	rps23 (ENSBSLG00000003254)	ENSBSLG00000003255
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	19	ENSMAMG00000001024	ENSMAMG00000020611	ENSMAMG00000001002	ENSMAMG00000000989 #19	ogna (ENSMAMG00000000975) #18	aspn (ENSMAMG00000000967) #16	ECM2 (ENSMAMG00000000941) #15	ENSMAMG00000027284 #13	ippk (ENSMAMG00000000924) #12	ENSMAMG00000000860	ENSMAMG00000000847	ENSMAMG00000025698	ENSMAMG00000000786 #20	ENSMAMG00000000729 #21	ENSMAMG00000000716	stab1 (ENSMAMG00000000457) #22	ccdc71 (ENSMAMG00000000422) #23	ENSMAMG00000000391 ##24	pdhb (ENSMAMG00000014572) #25	pxk (ENSMAMG00000027084)	HTD2 (ENSMAMG00000014512)	rpp14 (ENSMAMG00000014525)	ABHD6 (ENSMAMG00000014482)	ENSMAMG00000014459	ENSMAMG00000014452	ENSMAMG00000014446	ENSMAMG00000014437	pde12 (ENSMAMG00000014415)	ENSMAMG00000014396	ENSMAMG00000014378	ENSMAMG00000014350
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00980000199506	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00940000174941
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00950000183117.a.b.b	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	96					ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00940000156038.a.b.b.i.a.b	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b.e	ENSGT00940000177081	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b.f	ENSGT00940000177776	ENSGT00940000158909
Greater amberjack	MODERN SPECIES	25	ENSSDUG00000019195	C1QB (ENSSDUG00000019207)	ENSSDUG00000019215	ENSSDUG00000019234	nol8 (ENSSDUG00000019240) #19	cenpp (ENSSDUG00000019265) #13	ogna (ENSSDUG00000019290) #18	aspn (ENSSDUG00000019299) #16	ECM2 (ENSSDUG00000019355) #15	ippk (ENSSDUG00000019384) #12	rbbp5 (ENSSDUG00000019410)	zgc:153675 (ENSSDUG00000019452)	hgh1 (ENSSDUG00000019464)	ENSSDUG00000019483 #20	NISCH (ENSSDUG00000019494) #21	stab1 (ENSSDUG00000019551) #22	ENSSDUG00000019823	ccdc71 (ENSSDUG00000019838) #23	ENSSDUG00000019841 ##24	pdhb (ENSSDUG00000019855) #25	ENSSDUG00000019913	pxk (ENSSDUG00000020192)	HTD2 (ENSSDUG00000020210)	rpp14 (ENSSDUG00000020222)	ABHD6 (ENSSDUG00000020240)	lmcd1 (ENSSDUG00000020261)	ENSSDUG00000020271	ENSSDUG00000020283	ENSSDUG00000020292	ENSSDUG00000020302	ENSSDUG00000020431
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2953	ENSSLDG00000007071 #10	ENSSLDG00000007052	ENSSLDG00000007034	ENSSLDG00000007021 #19	ogna (ENSSLDG00000007003) #18	aspn (ENSSLDG00000006993) #16	ECM2 (ENSSLDG00000006959) #15	ENSSLDG00000006928 #13	ippk (ENSSLDG00000006782) #12	rbbp5 (ENSSLDG00000006699)	zgc:153675 (ENSSLDG00000006684)	hgh1 (ENSSLDG00000006647)	ENSSLDG00000006638 #20	ENSSLDG00000006595 #21	ENSSLDG00000006547	stab1 (ENSSLDG00000006358) #22
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00980000199506	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT00940000158909	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00940000174941	ENSGT00550000074784.a.b	ENSGT01100000265553	ENSGT00550000074784.b.f
Tongue sole	MODERN SPECIES	2	ENSCSEG00000012868	atp2b4 (ENSCSEG00000012825)	GPR37L1 (ENSCSEG00000012810)	ENSCSEG00000012803 #19	ogna (ENSCSEG00000012793) #18	aspn (ENSCSEG00000012773) #16	ECM2 (ENSCSEG00000012763) #15	ENSCSEG00000012751 #13	ippk (ENSCSEG00000012725) #12	rbbp5 (ENSCSEG00000012701)	zgc:153675 (ENSCSEG00000012695)	hgh1 (ENSCSEG00000012684)	ENSCSEG00000012680 #20	ENSCSEG00000012666 #21	ENSCSEG00000012662	stab1 (ENSCSEG00000012611) #22	ENSCSEG00000012601	ENSCSEG00000012598	ENSCSEG00000012590	ENSCSEG00000012584	ENSCSEG00000012578	pcsk1 (ENSCSEG00000012536)	ENSCSEG00000012527	ell2 (ENSCSEG00000012516)	ENSCSEG00000012505	rfesd (ENSCSEG00000012484)	nudt2 (ENSCSEG00000012479)	ube2r2 (ENSCSEG00000012472)	ubap1 (ENSCSEG00000012455)	dcaf12 (ENSCSEG00000012439)	opn1lw1 (ENSCSEG00000011345)
Turbot	MODERN SPECIES	18	ENSSMAG00000004076 #19	ENSSMAG00000004064 #19	ENSSMAG00000003964	ogna (ENSSMAG00000021718) #18	ENSSMAG00000004051	aspn (ENSSMAG00000004041) #16	ENSSMAG00000003984	ENSSMAG00000034510	ippk (ENSSMAG00000003941) #12	ENSSMAG00000003883	ENSSMAG00000029659	ENSSMAG00000003836	ENSSMAG00000003823 #20	ENSSMAG00000003778 #21	ENSSMAG00000003129	stab1 (ENSSMAG00000003561) #22	ccdc71 (ENSSMAG00000003549) #23	ENSSMAG00000003541	ENSSMAG00000036875 ##24	pdhb (ENSSMAG00000003469) #25	pxk (ENSSMAG00000003428)	HTD2 (ENSSMAG00000003406)	rpp14 (ENSSMAG00000003394)	ABHD6 (ENSSMAG00000003378)	ENSSMAG00000024313	ENSSMAG00000003310	pde12 (ENSSMAG00000003258)	ENSSMAG00000036893	ENSSMAG00000003240	ENSSMAG00000003218	ENSSMAG00000003208
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	125											ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00550000074997	ENSGT01100000263545.a.b.d.b	ENSGT00390000007458	ENSGT00940000160093.a	ENSGT00700000104550.a.i	ENSGT00880000138014.b	ENSGT00940000169138	ENSGT00940000155052	ENSGT00730000111020.b.b	ENSGT00940000153725.a.a	ENSGT00930000150941	ENSGT00550000074975	ENSGT00510000047836	ENSGT00390000016206
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	131											ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00550000074997	ENSGT01100000263545.a.b.d.b	ENSGT00390000007458	ENSGT00940000160093.a	ENSGT00700000104550.a.i	ENSGT00880000138014.b	ENSGT00940000155052	ENSGT00940000169138	ENSGT00730000111020.b.b	ENSGT00940000153725.a.a	ENSGT00930000150941	ENSGT00550000074975	ENSGT00510000047836	ENSGT00390000016206
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	144	ENSGT00940000158315	ENSGT00390000015972	ENSGT00940000158853	ENSGT00390000011067.C	ENSGT00440000038003	ENSGT00940000179908	ENSGT00940000165085	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000155514.c	ENSGT00390000005874.j	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00550000074997	ENSGT01100000263545.a.b.d.b	ENSGT00390000007458	ENSGT00940000160093.a	ENSGT00700000104550.a.i
Orange clownfish	DUPLICATION
Orange clownfish	MODERN SPECIES	20	eif6 (ENSAPEG00000022991)	map1lc3a (ENSAPEG00000022980)	ENSAPEG00000022971	ENSAPEG00000022953	ENSAPEG00000022932	ENSAPEG00000022875	smpd4 (ENSAPEG00000022790)	DOCK3 (ENSAPEG00000022687)	DCAF1 (ENSAPEG00000022532)	rbbp5 (ENSAPEG00000022468)	zgc:153675 (ENSAPEG00000022448)	hgh1 (ENSAPEG00000022424)	ENSAPEG00000022416 #20	ENSAPEG00000022397 #21	ENSAPEG00000022368 #22	ENSAPEG00000022339 #22	ccdc71 (ENSAPEG00000022297) #23	ddx27 (ENSAPEG00000022281)	pltp (ENSAPEG00000022254)	khk (ENSAPEG00000022116)	ENSAPEG00000022073	ENSAPEG00000022054	ENSAPEG00000022016	mkrn2 (ENSAPEG00000021987)	MKRN2OS (ENSAPEG00000021959)	tsen2 (ENSAPEG00000021947)	rbm39a (ENSAPEG00000021927)	si:ch211-15p9.2 (ENSAPEG00000021920)	isy1 (ENSAPEG00000021883)	ENSAPEG00000021832	pcif1 (ENSAPEG00000021778)
Orange clownfish	MODERN SPECIES	20	MMP24 (ENSAPEG00000023011)	eif6 (ENSAPEG00000022991)	map1lc3a (ENSAPEG00000022980)	ENSAPEG00000022971	ENSAPEG00000022953	ENSAPEG00000022932	ENSAPEG00000022875	smpd4 (ENSAPEG00000022790)	DOCK3 (ENSAPEG00000022687)	DCAF1 (ENSAPEG00000022532)	rbbp5 (ENSAPEG00000022468)	zgc:153675 (ENSAPEG00000022448)	hgh1 (ENSAPEG00000022424)	ENSAPEG00000022416 #20	ENSAPEG00000022397 #21	ENSAPEG00000022368 #22	ENSAPEG00000022339 #22	ccdc71 (ENSAPEG00000022297) #23	ddx27 (ENSAPEG00000022281)	pltp (ENSAPEG00000022254)	khk (ENSAPEG00000022116)	ENSAPEG00000022073	ENSAPEG00000022054	ENSAPEG00000022016	mkrn2 (ENSAPEG00000021987)	MKRN2OS (ENSAPEG00000021959)	tsen2 (ENSAPEG00000021947)	rbm39a (ENSAPEG00000021927)	si:ch211-15p9.2 (ENSAPEG00000021920)	isy1 (ENSAPEG00000021883)	ENSAPEG00000021832
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3502	zdhhc16b (ENSAOCG00000004581)	mms19 (ENSAOCG00000004558)	ubtd1b (ENSAOCG00000004527)	ENSAOCG00000004508	rbp3 (ENSAOCG00000004470)	RBP3 (ENSAOCG00000004453)	gdf2 (ENSAOCG00000004445)	gdf10b (ENSAOCG00000004435)	DOCK3 (ENSAOCG00000002472)	DCAF1 (ENSAOCG00000004376)	rbbp5 (ENSAOCG00000004359)	zgc:153675 (ENSAOCG00000004312)	hgh1 (ENSAOCG00000004303)	ENSAOCG00000004288 #20	NISCH (ENSAOCG00000004277) #21	stab1 (ENSAOCG00000004227) #22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1594										rbbp5 (ENSSPAG00000008553)	ENSSPAG00000008542	zgc:153675 (ENSSPAG00000008536)	hgh1 (ENSSPAG00000008489)	ENSSPAG00000008479 #20	ENSSPAG00000008449 #21	stab1 (ENSSPAG00000007783) #22	ccdc71 (ENSSPAG00000007707) #23	ddx27 (ENSSPAG00000007670)	pltp (ENSSPAG00000007639)	khk (ENSSPAG00000007582)	KCNQ2 (ENSSPAG00000007055)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937	ENSGT00940000155326.b	ENSGT00490000043388.b.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937	ENSGT00940000155326.b	ENSGT00490000043388.b.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000004933.l	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937	ENSGT00940000155326.b	ENSGT00460000041731.C.c.b.b
Eastern happy	MODERN SPECIES	17	ENSACLG00000004015	atp2b4 (ENSACLG00000004033)	GPR37L1 (ENSACLG00000004258)	nol8 (ENSACLG00000004270) #19	cenpp (ENSACLG00000004454) #13	ogna (ENSACLG00000004495) #18	aspn (ENSACLG00000004516) #16	ECM2 (ENSACLG00000004534) #15	ippk (ENSACLG00000004549) #12	rbbp5 (ENSACLG00000004604)	zgc:153675 (ENSACLG00000004710)	hgh1 (ENSACLG00000004720)	ENSACLG00000004771 #20	ENSACLG00000004780 #21	ENSACLG00000004813 #21	stab1 (ENSACLG00000005183) #22	ENSACLG00000005423	ENSACLG00000005435	ccdc71 (ENSACLG00000005444) #23	ENSACLG00000005447	ENSACLG00000005454 ##24	ENSACLG00000005458	pdhb (ENSACLG00000005893) #25	pxk (ENSACLG00000005918)	rpp14 (ENSACLG00000006157)	ABHD6 (ENSACLG00000006186)	lmcd1 (ENSACLG00000006217)	mcm2 (ENSACLG00000006226)	ENSACLG00000006270	blcap (ENSACLG00000006274)	ripor3 (ENSACLG00000006280)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1108	ENSMZEG00005017181	atp2b4 (ENSMZEG00005017145)	GPR37L1 (ENSMZEG00005017125)	nol8 (ENSMZEG00005017111) #19	ogna (ENSMZEG00005017104) #18	aspn (ENSMZEG00005017093) #16	ECM2 (ENSMZEG00005017079) #15	ENSMZEG00005017074 #13	ippk (ENSMZEG00005017051) #12	rbbp5 (ENSMZEG00005017040)	zgc:153675 (ENSMZEG00005017033)	hgh1 (ENSMZEG00005017028)	ENSMZEG00005017023 #20	ENSMZEG00005017005 #21	ENSMZEG00005016998	stab1 (ENSMZEG00005016959) #22	ccdc71 (ENSMZEG00005016949) #23	ENSMZEG00005016941 ##24	pdhb (ENSMZEG00005016928) #25	pxk (ENSMZEG00005016864)	rpp14 (ENSMZEG00005016843)	ABHD6 (ENSMZEG00005016838)	lmcd1 (ENSMZEG00005016837)	mcm2 (ENSMZEG00005016827)	ENSMZEG00005016818	blcap (ENSMZEG00005016817)	ENSMZEG00005016812	ripor3 (ENSMZEG00005016783)	ENSMZEG00005016756	ENSMZEG00005016753	ENSMZEG00005016748
P. nyererei	MODERN SPECIES	541							aspn (ENSPNYG00000022103) #16	ECM2 (ENSPNYG00000022127) #15	ENSPNYG00000022141	ippk (ENSPNYG00000022148) #12	rbbp5 (ENSPNYG00000022173)	zgc:153675 (ENSPNYG00000022210)	hgh1 (ENSPNYG00000022220)	ENSPNYG00000022235 #20	ENSPNYG00000022245 #21	stab1 (ENSPNYG00000022293) #22	ENSPNYG00000022399	ccdc71 (ENSPNYG00000022406) #23	ENSPNYG00000022412 ##24	pdhb (ENSPNYG00000022423) #25	pxk (ENSPNYG00000022441)	rpp14 (ENSPNYG00000022453)	ABHD6 (ENSPNYG00000022459)	lmcd1 (ENSPNYG00000022464)	mcm2 (ENSPNYG00000022469)	blcap (ENSPNYG00000022481)	ripor3 (ENSPNYG00000022490)	ENSPNYG00000022501	CHD6 (ENSPNYG00000022516)	ENSPNYG00000022566
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	294	cept1b (ENSNBRG00000012541)	ENSNBRG00000012577	atp2b4 (ENSNBRG00000012597)	GPR37L1 (ENSNBRG00000012653)	ENSNBRG00000012679 #19	cenpp (ENSNBRG00000012693) #13	ogna (ENSNBRG00000012722) #18	aspn (ENSNBRG00000012767) #16	ECM2 (ENSNBRG00000012838) #15	ippk (ENSNBRG00000012875) #12	rbbp5 (ENSNBRG00000012966)	zgc:153675 (ENSNBRG00000013008)	hgh1 (ENSNBRG00000013015)	ENSNBRG00000013056 #20	ENSNBRG00000013074 #21	stab1 (ENSNBRG00000013159) #22	ENSNBRG00000013419	ccdc71 (ENSNBRG00000013429) #23	ENSNBRG00000013434 ##24	pdhb (ENSNBRG00000013454) #25	pxk (ENSNBRG00000013498)	HTD2 (ENSNBRG00000013603)	rpp14 (ENSNBRG00000013614)	ABHD6 (ENSNBRG00000013641)	lmcd1 (ENSNBRG00000013672)	mcm2 (ENSNBRG00000013686)	blcap (ENSNBRG00000013740)	ripor3 (ENSNBRG00000013748)	CHD6 (ENSNBRG00000013839)	rspo4 (ENSNBRG00000014063)	PTPRT (ENSNBRG00000014099)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	17	cept1b (ENSONIG00000000512)	ENSONIG00000027479	atp2b4 (ENSONIG00000000496)	GPR37L1 (ENSONIG00000035099)	nol8 (ENSONIG00000000491) #19	cenpp (ENSONIG00000034839) #13	ogna (ENSONIG00000000488) #18	aspn (ENSONIG00000000479) #16	ECM2 (ENSONIG00000000475) #15	ippk (ENSONIG00000000472) #12	rbbp5 (ENSONIG00000000468)	ENSONIG00000037729	zgc:153675 (ENSONIG00000000466)	hgh1 (ENSONIG00000000462)	NISCH (ENSONIG00000000457) #21	stab1 (ENSONIG00000000426) #22	ENSONIG00000031297	ccdc71 (ENSONIG00000038353) #23	ENSONIG00000000422 ##24	pdhb (ENSONIG00000000416) #25	pxk (ENSONIG00000027396)	HTD2 (ENSONIG00000020731)	rpp14 (ENSONIG00000031687)	ABHD6 (ENSONIG00000000411)	lmcd1 (ENSONIG00000000408)	mcm2 (ENSONIG00000000404)	ENSONIG00000032385	blcap (ENSONIG00000035245)	ripor3 (ENSONIG00000000401)	CHD6 (ENSONIG00000000393)	ENSONIG00000000392
Midas cichlid	MODERN SPECIES	945	atp2b4 (ENSACIG00000010861)	GPR37L1 (ENSACIG00000010826)	nol8 (ENSACIG00000010793) #19	ogna (ENSACIG00000010748) #18	aspn (ENSACIG00000010672) #16	ENSACIG00000010623	ENSACIG00000010615	ippk (ENSACIG00000010563) #12	rbbp5 (ENSACIG00000010528)	ENSACIG00000010510	zgc:153675 (ENSACIG00000010502)	hgh1 (ENSACIG00000010475)	ENSACIG00000010468 #20	ENSACIG00000010435 #21	ENSACIG00000010421	stab1 (ENSACIG00000010316) #22	ccdc71 (ENSACIG00000010298) #23	ENSACIG00000010285 ##24	pdhb (ENSACIG00000010107) #25	pxk (ENSACIG00000009910)	HTD2 (ENSACIG00000009881)	rpp14 (ENSACIG00000009835)	ABHD6 (ENSACIG00000009756)	lmcd1 (ENSACIG00000009734)	mcm2 (ENSACIG00000009681)	blcap (ENSACIG00000009676)	ripor3 (ENSACIG00000009616)	ENSACIG00000009577	ENSACIG00000009564
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000177993
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00940000165085	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546.b	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000177993
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00390000002376	ENSGT00510000048041	ENSGT00390000012980.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546.b	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000177993	ENSGT00940000157928 #22
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	19	tomm6 (ENSORLG00000027357)	uqcc2 (ENSORLG00000019925)	tspo (ENSORLG00000019914)	nol8 (ENSORLG00000019906) #19	cenpp (ENSORLG00000019849) #13	ogna (ENSORLG00000019880) #18	aspn (ENSORLG00000019874) #16	ECM2 (ENSORLG00000027442) #15	ippk (ENSORLG00000026125) #12	rbbp5 (ENSORLG00000019813)	zgc:153675 (ENSORLG00000027644)	hgh1 (ENSORLG00000019785)	ENSORLG00000024018 #20	NISCH (ENSORLG00000019759) #21	ENSORLG00000024152	stab1 (ENSORLG00000019688) #22	krr1 (ENSORLG00000019616)	ENSORLG00000019559	ENSORLG00000019551	pdhb (ENSORLG00000019525) #25	pxk (ENSORLG00000019489)	ENSORLG00000019397	ENSORLG00000019133	ENSORLG00000029200	ENSORLG00000019094	ENSORLG00000026645	ENSORLG00000027255	ENSORLG00000019076	atf1 (ENSORLG00000019069)	ENSORLG00000026766	ENSORLG00000019036
Chinese medaka	MODERN SPECIES	77																stab1 (ENSOSIG00000000461) #22	ENSOSIG00000000467
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000169219	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546.b	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000177993	ENSGT00390000017669	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00510000047225.a	ENSGT01090000260040.b.a.b.y.b	ENSGT00390000018775
Indian medaka	MODERN SPECIES	8	ENSOMEG00000003766	atp2b4 (ENSOMEG00000003825)	GPR37L1 (ENSOMEG00000003849)	nol8 (ENSOMEG00000003904) #19	ogna (ENSOMEG00000003922) #18	aspn (ENSOMEG00000003935) #16	ECM2 (ENSOMEG00000003954) #15	ENSOMEG00000003976 #13	ippk (ENSOMEG00000003993) #12	ENSOMEG00000004001	rbbp5 (ENSOMEG00000004058)	zgc:153675 (ENSOMEG00000004080)	hgh1 (ENSOMEG00000004111)	ENSOMEG00000004118 #20	NISCH (ENSOMEG00000004174) #21	stab1 (ENSOMEG00000000873) #22	ENSOMEG00000004272	ENSOMEG00000004279	pxk (ENSOMEG00000004310)	pdhb (ENSOMEG00000004340) #25	ABHD6 (ENSOMEG00000004358)	ENSOMEG00000004378	krr1 (ENSOMEG00000004397)	SLC4A8 (ENSOMEG00000004419)	ENSOMEG00000004429	slc25a34 (ENSOMEG00000004439)	TMEM82 (ENSOMEG00000004450)	fblim1 (ENSOMEG00000004465)	ENSOMEG00000004509	prkar2ab (ENSOMEG00000004543)	slc25a20 (ENSOMEG00000004583)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000165085	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.r	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00940000158813	ENSGT01050000244824.F	ENSGT00730000111323	ENSGT00390000014105	ENSGT00940000153717.a.b	ENSGT00940000158986	ENSGT00940000160937
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	91	ENSGT00390000011067.C	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT00390000006044	ENSGT00940000165085	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.r	ENSGT00940000155306.a #23
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	535												ENSKMAG00000015653	smpd4 (ENSKMAG00000015709)	ENSKMAG00000015843	ENSKMAG00000015851 #21	stab1 (ENSKMAG00000015985) #22	ENSKMAG00000016351	ccdc71 (ENSKMAG00000016469) #23
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	90									ENSGT00940000165085	ENSGT00440000038003	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.r	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	345													ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.r	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	442													hgh1 (ENSCVAG00000022524)	ENSCVAG00000022534 #20	ENSCVAG00000022560 #21	ENSCVAG00000022577 #22	ENSCVAG00000022587	ccdc71 (ENSCVAG00000022592) #23	ENSCVAG00000022594 ##24	pdhb (ENSCVAG00000022620) #25	pxk (ENSCVAG00000022675)	usp30 (ENSCVAG00000022691)	SVOP (ENSCVAG00000022730)	dao.2 (ENSCVAG00000022750)	SSH1 (ENSCVAG00000022767)	coro1ca (ENSCVAG00000022809)	ENSCVAG00000022821	si:ch211-191d15.2 (ENSCVAG00000022834)	ENSCVAG00000022842	cmklr1 (ENSCVAG00000022852)	sart3 (ENSCVAG00000022898)
Mummichog	MODERN SPECIES	667														ENSFHEG00000007705 #20	NISCH (ENSFHEG00000007721) #21	ENSFHEG00000007773 #22	ENSFHEG00000007779	ccdc71 (ENSFHEG00000007783) #23	ENSFHEG00000007801 ##24	pdhb (ENSFHEG00000007810) #25
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01050000244866.D.a.c.m.b.a	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000165085	ENSGT00440000038003	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.b.b.a.b.a	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.r	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000165432.b	ENSGT00940000165432.a	ENSGT00530000066252	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000157660	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000161091	ENSGT00940000161227
Platyfish	MODERN SPECIES	12	ENSXMAG00000026386	osgepl1 (ENSXMAG00000022739)	IP6K1 (ENSXMAG00000012185)	ripor3 (ENSXMAG00000012157)	blcap (ENSXMAG00000019463)	ENSXMAG00000021779	mcm2 (ENSXMAG00000000302)	lmcd1 (ENSXMAG00000000309)	ENSXMAG00000022108	arhgef3 (ENSXMAG00000025917)	zgc:153675 (ENSXMAG00000022860)	hgh1 (ENSXMAG00000000313)	ENSXMAG00000023453 #20	NISCH (ENSXMAG00000000318) #21	ENSXMAG00000029242	stab1 (ENSXMAG00000021784) #22	ccdc71 (ENSXMAG00000020114) #23	ENSXMAG00000026268	ENSXMAG00000025314 ##24	pdhb (ENSXMAG00000008822) #25	pxk (ENSXMAG00000008793)	il17rd (ENSXMAG00000008778)	ENSXMAG00000021174	appl1 (ENSXMAG00000007624)	ENSXMAG00000028917	ENSXMAG00000029601	dennd6aa (ENSXMAG00000007634)	slmapa (ENSXMAG00000007676)	ENSXMAG00000007687	C1QB (ENSXMAG00000028696)	ENSXMAG00000007788
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01050000244866.D.a.c.m.b.a	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000165085	ENSGT00440000038003	ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.c.a.a.b.b.a.b.a.a.a	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.r	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000165432.b	ENSGT00940000165432.a	ENSGT00530000066252	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000157660	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000161091	ENSGT00940000161227
Guppy	MODERN SPECIES	457	ENSPREG00000010175 #19	ENSPREG00000010164	ogna (ENSPREG00000010150) #18	aspn (ENSPREG00000010071) #16	ECM2 (ENSPREG00000010041) #15	ENSPREG00000009864	ENSPREG00000009821	ENSPREG00000009808	ccndbp1 (ENSPREG00000009795)	rbbp5 (ENSPREG00000009754)	zgc:153675 (ENSPREG00000009742)	hgh1 (ENSPREG00000009723)	ENSPREG00000009717 #20	NISCH (ENSPREG00000009687) #21	ENSPREG00000009666	ENSPREG00000009654 #22	ccdc71 (ENSPREG00000009645) #23	ENSPREG00000009642 ##24	pdhb (ENSPREG00000009627) #25	pxk (ENSPREG00000009588)	ZNFX1 (ENSPREG00000009540)	tbc1d20 (ENSPREG00000009507)	rbck1 (ENSPREG00000009475)	NECAB3 (ENSPREG00000009455)	cbfa2t2 (ENSPREG00000009386)	SNTA1 (ENSPREG00000009350)	tox2 (ENSPREG00000009327)	st7l (ENSPREG00000009286)	wnt2ba (ENSPREG00000009263)	CTTNBP2NL (ENSPREG00000009234)	KCND3 (ENSPREG00000009190)
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	148											ENSGT00530000064100	ENSGT00390000013899.a.b	ENSGT00390000016546	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.a.a.b.b.r	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.f ##24	ENSGT00940000155146 #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000165432.b	ENSGT00940000165432.a	ENSGT00530000066252	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000157660	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000161091	ENSGT00940000161227
Amazon molly	MODERN SPECIES	922											rbbp5 (ENSPFOG00000003020)	zgc:153675 (ENSPFOG00000003240)	hgh1 (ENSPFOG00000003252)	ENSPFOG00000003403 #20	NISCH (ENSPFOG00000003415) #21	stab1 (ENSPFOG00000004170) #22	ENSPFOG00000019911	ccdc71 (ENSPFOG00000019912) #23	ENSPFOG00000006294 ##24	pdhb (ENSPFOG00000006377) #25	pxk (ENSPFOG00000006564)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	655											rbbp5 (ENSPLAG00000006137)	zgc:153675 (ENSPLAG00000006108)	hgh1 (ENSPLAG00000006101)	ENSPLAG00000006057 #20	ENSPLAG00000006050 #21	ENSPLAG00000006002 #22	ENSPLAG00000005960	ccdc71 (ENSPLAG00000005943) #23	ENSPLAG00000005937 ##24	pdhb (ENSPLAG00000000119) #25	pxk (ENSPLAG00000005828)	il17rd (ENSPLAG00000005492)	appl1 (ENSPLAG00000005437)
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	388															ENSGT00390000010053.l #12	ENSGT00940000157928.g #22	ENSGT00940000155306.a #23	ENSGT00940000157869.e.a ##24	ENSGT00940000155146.v #25	ENSGT00940000157660.h	ENSGT00940000158156.a	ENSGT00940000154280	ENSGT00530000063735.a.b	ENSGT00940000157802.k.b	ENSGT00950000183146.b.a	ENSGT01030000234648.a.a.c.a.a
P. kingsleyae	DUPLICATION
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	3	ocstamp (ENSPKIG00000006534)	ENSPKIG00000006527	PRPH (ENSPKIG00000006480)	ENSPKIG00000006447	MMP19 (ENSPKIG00000006358)	pym1 (ENSPKIG00000006301)	SPATS2 (ENSPKIG00000006242)	ENSPKIG00000006195	ormdl2 (ENSPKIG00000006163)	ENSPKIG00000006132	nemp1 (ENSPKIG00000006105)	NAB2 (ENSPKIG00000006062)	cd63 (ENSPKIG00000006017)	letmd1 (ENSPKIG00000005986)	IPPK (ENSPKIG00000005960) #12	ENSPKIG00000005937 #22	ENSPKIG00000005913 #22	ENSPKIG00000005896 #23	KCTD6 (ENSPKIG00000005875) ##24	pdhb (ENSPKIG00000005802) #25	slmapa (ENSPKIG00000005625)	ENSPKIG00000005540	DNAH12 (ENSPKIG00000005294)	ENSPKIG00000005171	IP6K1 (ENSPKIG00000005140)	AMIGO3 (ENSPKIG00000005130)	GRM7 (ENSPKIG00000005094)	mmp9 (ENSPKIG00000005040)	ENSPKIG00000005006	fez1 (ENSPKIG00000004972)	esama (ENSPKIG00000004923)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	3	ENSPKIG00000006527	PRPH (ENSPKIG00000006480)	ENSPKIG00000006447	MMP19 (ENSPKIG00000006358)	pym1 (ENSPKIG00000006301)	SPATS2 (ENSPKIG00000006242)	ENSPKIG00000006195	ormdl2 (ENSPKIG00000006163)	ENSPKIG00000006132	nemp1 (ENSPKIG00000006105)	NAB2 (ENSPKIG00000006062)	cd63 (ENSPKIG00000006017)	letmd1 (ENSPKIG00000005986)	IPPK (ENSPKIG00000005960) #12	ENSPKIG00000005937 #22	ENSPKIG00000005913 #22	ENSPKIG00000005896 #23	KCTD6 (ENSPKIG00000005875) ##24	pdhb (ENSPKIG00000005802) #25	slmapa (ENSPKIG00000005625)	ENSPKIG00000005540	DNAH12 (ENSPKIG00000005294)	ENSPKIG00000005171	IP6K1 (ENSPKIG00000005140)	AMIGO3 (ENSPKIG00000005130)	GRM7 (ENSPKIG00000005094)	mmp9 (ENSPKIG00000005040)	ENSPKIG00000005006	fez1 (ENSPKIG00000004972)	esama (ENSPKIG00000004923)	MSANTD2 (ENSPKIG00000004896)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES		WNT7A (ENSSFOG00015031761)	NUP210 (ENSSFOG00015015318)	IQSEC1 (ENSSFOG00015014520)	ENSSFOG00015028833	ENSSFOG00015014402	zgc:77375 (ENSSFOG00015014380)	cnbpa (ENSSFOG00015014361)	raf1a (ENSSFOG00015014237)	syn2a (ENSSFOG00015013839)	TIMP4 (ENSSFOG00015029944)	VGLL4 (ENSSFOG00015028466)	slc6a1a (ENSSFOG00015013739)	DUSP7 (ENSSFOG00015027406)	ALAS1 (ENSSFOG00015013574)	IPPK (ENSSFOG00015013541) #12	stab1 (ENSSFOG00015013421) #22	ENSSFOG00015013402 #23	kctd6b (ENSSFOG00015025544) ##24	slmapa (ENSSFOG00015013304)	ENSSFOG00015013285	ENSSFOG00015013262	ENSSFOG00015013245	IP6K1 (ENSSFOG00015013241)	ENSSFOG00015013232	DNAH12 (ENSSFOG00015013120)	ENSSFOG00015027648	ENSSFOG00015032273	IP6K1 (ENSSFOG00015013045)	AMIGO3 (ENSSFOG00015013033)	GRM7 (ENSSFOG00015012045)	DAG1 (ENSSFOG00015032160)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000157262.m.a	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030.j	ENSGT00990000210069 #9	ENSGT00940000166455 #10	ENSGT00950000183004.a.b.a.a.p	ENSGT00950000182952.C #11	ENSGT00390000010053.k #12	ENSGT00390000011897 #13	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000157238.a #18	ENSGT00390000004860 #19	ENSGT00620000089227 #20	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928.h #22	ENSGT00390000013390	ENSGT00940000157869.e.b #24	ENSGT00940000155146.u #25	ENSGT00390000017669	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225.a	ENSGT00950000182846.a.a.a.b	ENSGT00390000003224.A	ENSGT00940000156286	ENSGT00940000157660.g	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156878.i.a	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000158156.b
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	60	tnnc1a (ENSPKIG00000025038)	rpl29 (ENSPKIG00000025048)	dusp7 (ENSPKIG00000025059)	POC1A (ENSPKIG00000025072)	alas1 (ENSPKIG00000025086)	atrip (ENSPKIG00000025096) #10	si:dkey-42i9.4 (ENSPKIG00000025101) #11	ippk (ENSPKIG00000025106) #12	cenpp (ENSPKIG00000025115) #13	ECM2 (ENSPKIG00000025120) #15	aspn (ENSPKIG00000025130) #16	ogna (ENSPKIG00000025138) #18	nol8 (ENSPKIG00000025150) #19	ENSPKIG00000025168 #20	NISCH (ENSPKIG00000025174) #21	stab1 (ENSPKIG00000025195) #22	UQCC5 (ENSPKIG00000025238)	ccdc71 (ENSPKIG00000025241) #23	ENSPKIG00000025243	kctd6a (ENSPKIG00000025245) #24	pdhb (ENSPKIG00000025249) #25	pxk (ENSPKIG00000025263)	HTD2 (ENSPKIG00000025275)	rpp14 (ENSPKIG00000025282)	ABHD6 (ENSPKIG00000025287)	DNASE1L3 (ENSPKIG00000025293)	ENSPKIG00000025295	FLNB (ENSPKIG00000025306)	slmapa (ENSPKIG00000025332)	dennd6aa (ENSPKIG00000025340)	arf4a (ENSPKIG00000025349)
Spotted gar	MODERN SPECIES	671	rbm5 (ENSLOCG00000010774)	BRK1 (ENSLOCG00000010770)	gpx1b (ENSLOCG00000010762)	ENSLOCG00000010739	emc3 (ENSLOCG00000010724)	fancd2 (ENSLOCG00000010711)	tex264a (ENSLOCG00000010705)	grm2b (ENSLOCG00000010693)	rrp9 (ENSLOCG00000010672)	parp3 (ENSLOCG00000010661)	ENSLOCG00000018247	cav3 (ENSLOCG00000010650)	oxtrb (ENSLOCG00000010646)	rad18 (ENSLOCG00000010629)	NISCH (ENSLOCG00000010609) #21	stab1 (ENSLOCG00000010584) #22	UQCC5 (ENSLOCG00000010575)	PBRM1 (ENSLOCG00000010556)	gnl3 (ENSLOCG00000010542)	glt8d1 (ENSLOCG00000010530)	spcs1 (ENSLOCG00000010522)	nek4 (ENSLOCG00000010516)	CAMK1 (ENSLOCG00000010502)	ccdc3b (ENSLOCG00000010493)	FAM107A (ENSLOCG00000010486)	ENSLOCG00000010476	cfap20dc (ENSLOCG00000010469)	ENSLOCG00000010463	ENSLOCG00000010456	ptprga (ENSLOCG00000010428)	C3orf14 (ENSLOCG00000010418)
Reedfish	MODERN SPECIES	9	ndufaf3 (ENSECRG00000022501)	dalrd3 (ENSECRG00000022492)	CELSR3 (ENSECRG00000022451)	NCKIPSD (ENSECRG00000022425)	wdr6 (ENSECRG00000022415)	ENSECRG00000022363	ENSECRG00000022339	ENSECRG00000022330	p4htma (ENSECRG00000022321)	POC1A (ENSECRG00000022313)	dusp7 (ENSECRG00000022292)	rpl29 (ENSECRG00000022275)	ENSECRG00000022262	NISCH (ENSECRG00000022245) #21	ENSECRG00000022235	stab1 (ENSECRG00000022201) #22	DCP1A (ENSECRG00000022185)	cacna1da (ENSECRG00000021519)	CHDH (ENSECRG00000021278)	IL17RB (ENSECRG00000021243)	actr8 (ENSECRG00000021182)	selenok (ENSECRG00000021164)	parapinopsinb (ENSECRG00000020782)	LRTM1 (ENSECRG00000020699)	CACNA2D3 (ENSECRG00000020601)	wnt5a (ENSECRG00000020392)	ERC2 (ENSECRG00000020326)	ENSECRG00000020299	tlr9 (ENSECRG00000020275)	ENSECRG00000020233	ENSECRG00000020213
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157238 #18	ENSGT00940000160986 #17	ENSGT00940000157444 #16	ENSGT00940000159941 #15	ENSGT01030000235189	ENSGT00390000010053 #12	ENSGT00950000182952.C #11	ENSGT00390000012850	ENSGT00390000008296.b.a.b	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.D	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448
Coelacanth	MODERN SPECIES	230	NOL8 (ENSLACG00000018898) #19	OGN (ENSLACG00000018887) #18	OMD (ENSLACG00000018880) #17	ASPN (ENSLACG00000018869) #16	ECM2 (ENSLACG00000018857) #15	IPPK (ENSLACG00000018837) #12	si:dkey-42i9.4 (ENSLACG00000018830) #11	ATRIP (ENSLACG00000018824)	SHISA5 (ENSLACG00000018821)	ALAS1 (ENSLACG00000018803)	POC1A (ENSLACG00000018788)	DUSP7 (ENSLACG00000018752)	rpl29 (ENSLACG00000018622)	tnnc1a (ENSLACG00000018616)	NISCH (ENSLACG00000018599) #21	ENSLACG00000018550 #22	NT5DC2 (ENSLACG00000018520)	PPM1M (ENSLACG00000018487)	WDR82 (ENSLACG00000018445)	ENSLACG00000018426	tlr9 (ENSLACG00000018420)	EMC3 (ENSLACG00000018410)	BAP1 (ENSLACG00000018395)	GLYCTK (ENSLACG00000018387)	ENSLACG00000018160	DNAH1 (ENSLACG00000018145)	FANCD2 (ENSLACG00000018105)	FANCD2OS (ENSLACG00000018101)	ENSLACG00000018034	ENSLACG00000017984	CDK16 (ENSLACG00000017855)
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	182											ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a
Anura	ANCESTRAL SPECIES	318																ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	11	ENSLLEG00000025476	ENSLLEG00000026032	ENSLLEG00000026049	ENSLLEG00000026063	ENSLLEG00000026088	ENSLLEG00000026099	ENSLLEG00000026156	ENSLLEG00000026721	DUSP12 (ENSLLEG00000026925)	ENSLLEG00000027012	DDR2 (ENSLLEG00000027059)	ENSLLEG00000027477	OLFML2B (ENSLLEG00000027493)	ENSLLEG00000027557	ENSLLEG00000027712	ENSLLEG00000027836 #22	ENSLLEG00000029202	ENSLLEG00000029214	ENSLLEG00000029222	UQCC5 (ENSLLEG00000029230)	PBRM1 (ENSLLEG00000029303)	ENSLLEG00000029797	GNL3 (ENSLLEG00000029804)	GLT8D1 (ENSLLEG00000029833)	SPCS1 (ENSLLEG00000029853)	ENSLLEG00000029862	NEK4 (ENSLLEG00000029878)	ENSLLEG00000029907	HRH1 (ENSLLEG00000029914)	ATG7 (ENSLLEG00000029952)	ENSLLEG00000030142
Frog	MODERN SPECIES	4																STAB1 (ENSXETG00000044486) #22	NT5DC2 (ENSXETG00000047019)	pbrm1 (ENSXETG00000013671)	ENSXETG00000043218	ENSXETG00000049370	glt8d1 (ENSXETG00000042897)	spcs1 (ENSXETG00000013668)	gnl3 (ENSXETG00000013669)	nek4 (ENSXETG00000006888)	ENSXETG00000046560	itih3 (ENSXETG00000006887)	ENSXETG00000042890	mkrn2os (ENSXETG00000041950)	mkrn2 (ENSXETG00000043301)	raf1 (ENSXETG00000020163)	pparg (ENSXETG00000017422)
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	22														ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Aves	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
African ostrich	MODERN SPECIES	352			BAP1 (ENSSCUG00000003900)	DNAH1 (ENSSCUG00000003972)	ENSSCUG00000004062	GLYCTK (ENSSCUG00000004063)	WDR82 (ENSSCUG00000004068)	PPM1M (ENSSCUG00000004071)	TWF2 (ENSSCUG00000004072)	ALAS1 (ENSSCUG00000004073)	POC1A (ENSSCUG00000004074)	DUSP7 (ENSSCUG00000004079)	RPL29 (ENSSCUG00000004083)	TNNC1 (ENSSCUG00000004084)	NISCH (ENSSCUG00000004089) #21	STAB1 (ENSSCUG00000004094) #22	NT5DC2 (ENSSCUG00000004106)	UQCC5 (ENSSCUG00000004113)
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	41											ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	16										ENSGT00940000158328	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.b
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	16										ENSGT00940000158328	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.b
Chicken	MODERN SPECIES	3				ENSGALG00010027990	ENSGALG00010027991	ENSGALG00010027992	ENSGALG00010027997	ENSGALG00010028003	RRP9 (ENSGALG00010028009)	POC1A (ENSGALG00010028011)	DUSP7 (ENSGALG00010028015)	ENSGALG00010028018	RPL29 (ENSGALG00010028019)	TNNC1 (ENSGALG00010028025)	NISCH (ENSGALG00010028031) #21	STAB1 (ENSGALG00010028039) #22	NT5DC2 (ENSGALG00010028043)	SMIM4 (ENSGALG00010028046)	PBRM1 (ENSGALG00010028050)	GNL3 (ENSGALG00010028051)	GLT8D1 (ENSGALG00010028058)	SPCS1 (ENSGALG00010028064)	NEK4 (ENSGALG00010028069)	ITIH3 (ENSGALG00010028079)	MUSTN1 (ENSGALG00010028080)	STIMATE (ENSGALG00010028087)	SFMBT1 (ENSGALG00010028093)	RFT1 (ENSGALG00010028098)	PRKCD (ENSGALG00010028105)	PFKFB4 (ENSGALG00010028114)	HYAL1 (ENSGALG00010028116)
Turkey	MODERN SPECIES	5	ENSMGAG00000017686	ENSMGAG00000018569	ENSMGAG00000016749	ENSMGAG00000001797	ENSMGAG00000021883	ENSMGAG00000002261	ENSMGAG00000001655	ENSMGAG00000001685	ENSMGAG00000016382	ENSMGAG00000001673	POC1A (ENSMGAG00000001628)	ENSMGAG00000001220	RPL29 (ENSMGAG00000019514)	TNNC1 (ENSMGAG00000001184)	NISCH (ENSMGAG00000001150) #21	STAB1 (ENSMGAG00000000964) #22	NT5DC2 (ENSMGAG00000000916)	UQCC5 (ENSMGAG00000000961)	PBRM1 (ENSMGAG00000000883)	GNL3 (ENSMGAG00000000848)	GLT8D1 (ENSMGAG00000000834)	SPCS1 (ENSMGAG00000000828)	NEK4 (ENSMGAG00000001127)	ITIH3 (ENSMGAG00000001118)	MUSTN1 (ENSMGAG00000000956)	STIMATE (ENSMGAG00000000938)	SFMBT1 (ENSMGAG00000000785)	ENSMGAG00000020785
Japanese quail	MODERN SPECIES	3										RRP9 (ENSCJPG00005004106)	POC1A (ENSCJPG00005004107)	DUSP7 (ENSCJPG00005004110)	RPL29 (ENSCJPG00005004112)	TNNC1 (ENSCJPG00005004113)	NISCH (ENSCJPG00005004117) #21	STAB1 (ENSCJPG00005004119) #22	NT5DC2 (ENSCJPG00005004125)	UQCC5 (ENSCJPG00005004130)	PBRM1 (ENSCJPG00005004132)	GNL3 (ENSCJPG00005004137)	GLT8D1 (ENSCJPG00005004143)	SPCS1 (ENSCJPG00005004144)	NEK4 (ENSCJPG00005004145)	ITIH3 (ENSCJPG00005004146)	MUSTN1 (ENSCJPG00005004147)	STIMATE (ENSCJPG00005004148)	SFMBT1 (ENSCJPG00005004150)	PRKCD (ENSCJPG00005004424)	PFKFB4 (ENSCJPG00005004434)	HYAL1 (ENSCJPG00005005740)	HYAL2 (ENSCJPG00005005743)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	68											ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	252										POC1A (ENSABRG00000020094)	ENSABRG00000020088	DUSP7 (ENSABRG00000020087)	ENSABRG00000020076	TNNC1 (ENSABRG00000020073)	NISCH (ENSABRG00000020062) #21	STAB1 (ENSABRG00000019942) #22	NT5DC2 (ENSABRG00000019855)	UQCC5 (ENSABRG00000019847)	PBRM1 (ENSABRG00000018589)	GNL3 (ENSABRG00000018349)	GLT8D1 (ENSABRG00000018312)	SPCS1 (ENSABRG00000018308)	NEK4 (ENSABRG00000018305)	ITIH3 (ENSABRG00000017764)	ITIH4 (ENSABRG00000017653)	MUSTN1 (ENSABRG00000017645)	STIMATE (ENSABRG00000017641)	SFMBT1 (ENSABRG00000017631)
Duck	MODERN SPECIES	4	ENSAPLG00000022689	RNF123 (ENSAPLG00000007425)	AMIGO3 (ENSAPLG00000020461)	ENSAPLG00000002149	ENSAPLG00000024735	ENSAPLG00000024855	EMC3 (ENSAPLG00000001148)	USP4 (ENSAPLG00000014796)	GPX1 (ENSAPLG00000001202)	RHOA (ENSAPLG00000014687)	POC1A (ENSAPLG00000007756)	DUSP7 (ENSAPLG00000008525)	RPL29 (ENSAPLG00000017190)	TNNC1 (ENSAPLG00000008432)	NISCH (ENSAPLG00000007897) #21	STAB1 (ENSAPLG00000006699) #22	NT5DC2 (ENSAPLG00000006247)	UQCC5 (ENSAPLG00000027619)	PBRM1 (ENSAPLG00000005420)	GNL3 (ENSAPLG00000005171)	GLT8D1 (ENSAPLG00000004984)	SPCS1 (ENSAPLG00000004976)	NEK4 (ENSAPLG00000004795)	ENSAPLG00000026057	ENSAPLG00000004256	ITIH4 (ENSAPLG00000004101)	MUSTN1 (ENSAPLG00000024683)	STIMATE (ENSAPLG00000014904)	SFMBT1 (ENSAPLG00000003543)	RFT1 (ENSAPLG00000003368)	PRKCD (ENSAPLG00000002693)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157452.t	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Great tit	MODERN SPECIES	3	SEMA3G (ENSPMJG00000012534)	BAP1 (ENSPMJG00000012533)	ENSPMJG00000012532	DNAH1 (ENSPMJG00000009880)	GLYCTK (ENSPMJG00000009862)	WDR82 (ENSPMJG00000009855)	PPM1M (ENSPMJG00000009845)	TWF2 (ENSPMJG00000009835)	ALAS1 (ENSPMJG00000009834)	ENSPMJG00000009833	POC1A (ENSPMJG00000009832)	DUSP7 (ENSPMJG00000009829)	ENSPMJG00000009755	TNNC1 (ENSPMJG00000009753)	NISCH (ENSPMJG00000009591) #21	STAB1 (ENSPMJG00000009304) #22	NT5DC2 (ENSPMJG00000009068)	UQCC5 (ENSPMJG00000009065)	PBRM1 (ENSPMJG00000005413)	GNL3 (ENSPMJG00000005401)	GLT8D1 (ENSPMJG00000005400)	SPCS1 (ENSPMJG00000005399)	NEK4 (ENSPMJG00000005398)	ITIH3 (ENSPMJG00000005395)	ITIH4 (ENSPMJG00000005390)	MUSTN1 (ENSPMJG00000005389)	STIMATE (ENSPMJG00000005386)	SFMBT1 (ENSPMJG00000005381)	RFT1 (ENSPMJG00000005361)	PRKCD (ENSPMJG00000005342)	PFKFB4 (ENSPMJG00000005341)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157452.t	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Flycatcher	MODERN SPECIES	3	ACY1 (ENSFALG00000008839)	SEMA3G (ENSFALG00000008851)	BAP1 (ENSFALG00000008877)	ENSFALG00000008890	DNAH1 (ENSFALG00000008880)	GLYCTK (ENSFALG00000028948)	WDR82 (ENSFALG00000008902)	PPM1M (ENSFALG00000008914)	TWF2 (ENSFALG00000026344)	ALAS1 (ENSFALG00000008917)	POC1A (ENSFALG00000008922)	DUSP7 (ENSFALG00000008924)	RPL29 (ENSFALG00000027543)	TNNC1 (ENSFALG00000025343)	NISCH (ENSFALG00000008935) #21	STAB1 (ENSFALG00000008941) #22	NT5DC2 (ENSFALG00000008946)	UQCC5 (ENSFALG00000008950)	PBRM1 (ENSFALG00000008954)	GNL3 (ENSFALG00000025760)	GLT8D1 (ENSFALG00000008966)	SPCS1 (ENSFALG00000008968)	NEK4 (ENSFALG00000008969)	ITIH3 (ENSFALG00000008971)	ITIH4 (ENSFALG00000003532)	MUSTN1 (ENSFALG00000028870)	STIMATE (ENSFALG00000026699)	SFMBT1 (ENSFALG00000003499)	RFT1 (ENSFALG00000003488)	PRKCD (ENSFALG00000003460)	ENSFALG00000024102
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157452.t	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Medium ground finch	MODERN SPECIES	42	BAP1 (ENSGFOG00000000306)	ENSGFOG00000000295	ENSGFOG00000012018	ENSGFOG00000012015	ENSGFOG00000012010	GLYCTK (ENSGFOG00000012005)	WDR82 (ENSGFOG00000012000)	PPM1M (ENSGFOG00000011995)	TWF2 (ENSGFOG00000011987)	ALAS1 (ENSGFOG00000011978)	ENSGFOG00000011975	POC1A (ENSGFOG00000011969)	DUSP7 (ENSGFOG00000011960)	TNNC1 (ENSGFOG00000011955)	NISCH (ENSGFOG00000011934) #21	STAB1 (ENSGFOG00000011766) #22	NT5DC2 (ENSGFOG00000011705)	UQCC5 (ENSGFOG00000011693)	PBRM1 (ENSGFOG00000011680)	ENSGFOG00000011672	ENSGFOG00000011663	GLT8D1 (ENSGFOG00000011659)	SPCS1 (ENSGFOG00000011656)	ENSGFOG00000011646	NEK4 (ENSGFOG00000011642)	ITIH3 (ENSGFOG00000011635)	ITIH4 (ENSGFOG00000011541)	MUSTN1 (ENSGFOG00000011525)	STIMATE (ENSGFOG00000011520)	SFMBT1 (ENSGFOG00000011506)	RFT1 (ENSGFOG00000011472)
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157452.t	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d
Zebra finch	MODERN SPECIES	3	ABHD14A (ENSTGUG00000006376)	ACY1 (ENSTGUG00000006344)	SEMA3G (ENSTGUG00000006291)	BAP1 (ENSTGUG00000006264)	DNAH1 (ENSTGUG00000006140)	ENSTGUG00000006261	GLYCTK (ENSTGUG00000006130)	WDR82 (ENSTGUG00000023769)	PPM1M (ENSTGUG00000006115)	TWF2 (ENSTGUG00000006095)	ALAS1 (ENSTGUG00000006069)	ENSTGUG00000006065	POC1A (ENSTGUG00000006036)	DUSP7 (ENSTGUG00000006028)	TNNC1 (ENSTGUG00000006008)	STAB1 (ENSTGUG00000005918) #22	NT5DC2 (ENSTGUG00000005893)	PBRM1 (ENSTGUG00000005797)	GNL3 (ENSTGUG00000005774)	GLT8D1 (ENSTGUG00000005754)	SPCS1 (ENSTGUG00000005751)	NEK4 (ENSTGUG00000005727)	ITIH3 (ENSTGUG00000005650)	ITIH4 (ENSTGUG00000005546)	MUSTN1 (ENSTGUG00000005545)	STIMATE (ENSTGUG00000025639)	SFMBT1 (ENSTGUG00000005471)	ENSTGUG00000022033	ENSTGUG00000004531	ENSTGUG00000019871	NOL8 (ENSTGUG00000005411) #19
Common canary	MODERN SPECIES	15	SELENOK (ENSSCAG00000002405)	ACTR8 (ENSSCAG00000002357)	CHDH (ENSSCAG00000002341)	CACNA1D (ENSSCAG00000002294)	DCP1A (ENSSCAG00000002277)	TKT (ENSSCAG00000002261)	ENSSCAG00000002245	FANCD2 (ENSSCAG00000002229)	EMC3 (ENSSCAG00000002222)	USP4 (ENSSCAG00000002213)	GPX1 (ENSSCAG00000002206)	RHOA (ENSSCAG00000002200)	ENSSCAG00000002191	TNNC1 (ENSSCAG00000002187)	NISCH (ENSSCAG00000002069) #21	STAB1 (ENSSCAG00000002018) #22	NT5DC2 (ENSSCAG00000001889)	UQCC5 (ENSSCAG00000001851)	PBRM1 (ENSSCAG00000001819)	GNL3 (ENSSCAG00000001796)	GLT8D1 (ENSSCAG00000001790)	SPCS1 (ENSSCAG00000001786)	NEK4 (ENSSCAG00000001781)	ITIH3 (ENSSCAG00000001438)	ITIH4 (ENSSCAG00000001291)	MUSTN1 (ENSSCAG00000001280)	STIMATE (ENSSCAG00000001265)	SFMBT1 (ENSSCAG00000001247)	RFT1 (ENSSCAG00000001160)	PRKCD (ENSSCAG00000001124)	PFKFB4 (ENSSCAG00000001085)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d	ENSGT01020000230364.a.a.a.a.b
Golden eagle	MODERN SPECIES	12	ENSACCG00020011275	ENSACCG00020011261	ENSACCG00020011248	GLYCTK (ENSACCG00020011235)	WDR82 (ENSACCG00020011225)	PPM1M (ENSACCG00020011212)	TWF2 (ENSACCG00020011198)	ALAS1 (ENSACCG00020011182)	ENSACCG00020011173	POC1A (ENSACCG00020011157)	DUSP7 (ENSACCG00020011149)	ENSACCG00020011141	ENSACCG00020011135	TNNC1 (ENSACCG00020011128)	NISCH (ENSACCG00020011112) #21	STAB1 (ENSACCG00020011039) #22	NT5DC2 (ENSACCG00020010913)	UQCC5 (ENSACCG00020010895)	PBRM1 (ENSACCG00020010759)	GNL3 (ENSACCG00020014755)	GLT8D1 (ENSACCG00020014737)	SPCS1 (ENSACCG00020014729)	NEK4 (ENSACCG00020014711)	ITIH3 (ENSACCG00020014659)	ITIH4 (ENSACCG00020014580)	STIMATE (ENSACCG00020014533)	SFMBT1 (ENSACCG00020014418)	RFT1 (ENSACCG00020014320)	PRKCD (ENSACCG00020014301)	PFKFB4 (ENSACCG00020014237)	HYAL1 (ENSACCG00020014168)
Kakapo	MODERN SPECIES	3	BAP1 (ENSSHBG00005005410)	ENSSHBG00005020974	ENSSHBG00005020968	ENSSHBG00005020964	ENSSHBG00005020960	GLYCTK (ENSSHBG00005020952)	WDR82 (ENSSHBG00005020939)	PPM1M (ENSSHBG00005020935)	TWF2 (ENSSHBG00005020925)	ALAS1 (ENSSHBG00005020913)	POC1A (ENSSHBG00005020907)	DUSP7 (ENSSHBG00005020900)	RPL29 (ENSSHBG00005020895)	TNNC1 (ENSSHBG00005020887)	NISCH (ENSSHBG00005020879) #21	STAB1 (ENSSHBG00005020858) #22	NT5DC2 (ENSSHBG00005020840)	UQCC5 (ENSSHBG00005020832)	PBRM1 (ENSSHBG00005020759)	GNL3 (ENSSHBG00005020734)	GLT8D1 (ENSSHBG00005020730)	SPCS1 (ENSSHBG00005020727)	NEK4 (ENSSHBG00005020725)	ITIH3 (ENSSHBG00005020712)	ITIH4 (ENSSHBG00005020685)	STIMATE (ENSSHBG00005020677)	SFMBT1 (ENSSHBG00005020664)	RFT1 (ENSSHBG00005020651)	PRKCD (ENSSHBG00005020640)	ENSSHBG00005020630	ENSSHBG00005020620
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	56													ENSCPRG00005013926	TNNC1 (ENSCPRG00005013936)	NISCH (ENSCPRG00005013985) #21	STAB1 (ENSCPRG00005014062) #22	NT5DC2 (ENSCPRG00005014125)	UQCC5 (ENSCPRG00005014237)	PBRM1 (ENSCPRG00005014245)	GNL3 (ENSCPRG00005014268)	GLT8D1 (ENSCPRG00005014283)	SPCS1 (ENSCPRG00005014301)	NEK4 (ENSCPRG00005014307)	ITIH3 (ENSCPRG00005014323)	MUSTN1 (ENSCPRG00005014346)	STIMATE (ENSCPRG00005014348)	SFMBT1 (ENSCPRG00005014352)	RFT1 (ENSCPRG00005014385)	PRKCD (ENSCPRG00005014398)	PFKFB4 (ENSCPRG00005014406)	IFRD2 (ENSCPRG00005014423)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00390000007160.a.a	ENSGT00940000155514	ENSGT00940000154089.a	ENSGT00940000157392	ENSGT00390000014125	ENSGT00410000025882.a	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000154554.a.gb.b	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Chinese turtle	DUPLICATION
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1386		ENSPSIG00000016285	MAPKAPK3 (ENSPSIG00000016102)	CISH (ENSPSIG00000016088)	HEMK1 (ENSPSIG00000016072)	C3orf18 (ENSPSIG00000016012)	PPM1M (ENSPSIG00000015909)	WDR82 (ENSPSIG00000015458)	ENSPSIG00000015451	ALAS1 (ENSPSIG00000015154)	POC1A (ENSPSIG00000014809)	DUSP7 (ENSPSIG00000014747)	RPL29 (ENSPSIG00000014699)	TNNC1 (ENSPSIG00000014627)	NISCH (ENSPSIG00000014534) #21	ENSPSIG00000014476 #22	ENSPSIG00000013000 #22	NT5DC2 (ENSPSIG00000012264)	UQCC5 (ENSPSIG00000012245)	PBRM1 (ENSPSIG00000011502)	GNL3 (ENSPSIG00000011486)	GLT8D1 (ENSPSIG00000011156)	SPCS1 (ENSPSIG00000011137)	NEK4 (ENSPSIG00000011009)	ENSPSIG00000008164	ITIH4 (ENSPSIG00000006896)	ENSPSIG00000017905	MUSTN1 (ENSPSIG00000017881)	STIMATE (ENSPSIG00000017876)	SFMBT1 (ENSPSIG00000017501)	RFT1 (ENSPSIG00000017497)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1386	ENSPSIG00000016285	MAPKAPK3 (ENSPSIG00000016102)	CISH (ENSPSIG00000016088)	HEMK1 (ENSPSIG00000016072)	C3orf18 (ENSPSIG00000016012)	PPM1M (ENSPSIG00000015909)	WDR82 (ENSPSIG00000015458)	ENSPSIG00000015451	ALAS1 (ENSPSIG00000015154)	POC1A (ENSPSIG00000014809)	DUSP7 (ENSPSIG00000014747)	RPL29 (ENSPSIG00000014699)	TNNC1 (ENSPSIG00000014627)	NISCH (ENSPSIG00000014534) #21	ENSPSIG00000014476 #22	ENSPSIG00000013000 #22	NT5DC2 (ENSPSIG00000012264)	UQCC5 (ENSPSIG00000012245)	PBRM1 (ENSPSIG00000011502)	GNL3 (ENSPSIG00000011486)	GLT8D1 (ENSPSIG00000011156)	SPCS1 (ENSPSIG00000011137)	NEK4 (ENSPSIG00000011009)	ENSPSIG00000008164	ITIH4 (ENSPSIG00000006896)	ENSPSIG00000017905	MUSTN1 (ENSPSIG00000017881)	STIMATE (ENSPSIG00000017876)	SFMBT1 (ENSPSIG00000017501)	RFT1 (ENSPSIG00000017497)	ENSPSIG00000000286
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007160.a.a	ENSGT00940000155514	ENSGT00940000154089.a	ENSGT00940000157392	ENSGT00390000014125	ENSGT00410000025882.a	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.g	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000154554.a.gb.b	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007160.a.a	ENSGT00940000155514	ENSGT00940000154089.a	ENSGT00940000157392	ENSGT00390000014125	ENSGT00410000025882.a	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.g.a	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000154554.a.gb.b	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2335	DOCK3 (ENSCABG00000014345)	MAPKAPK3 (ENSCABG00000014229)	CISH (ENSCABG00000014228)	HEMK1 (ENSCABG00000014226)	C3orf18 (ENSCABG00000014225)	WDR82 (ENSCABG00000014222)	PPM1M (ENSCABG00000014221)	TWF2 (ENSCABG00000014219)	ENSCABG00000014217	ALAS1 (ENSCABG00000014214)	POC1A (ENSCABG00000014213)	DUSP7 (ENSCABG00000014211)	RPL29 (ENSCABG00000014209)	TNNC1 (ENSCABG00000014207)	NISCH (ENSCABG00000014206) #21	STAB1 (ENSCABG00000014123) #22	NT5DC2 (ENSCABG00000014110)	UQCC5 (ENSCABG00000014109)	PBRM1 (ENSCABG00000011575)	ENSCABG00000011554	GNL3 (ENSCABG00000011547)	GLT8D1 (ENSCABG00000011546)	ENSCABG00000011543	NEK4 (ENSCABG00000011540)	ENSCABG00000011505	ITIH4 (ENSCABG00000011500)	ENSCABG00000011494	ENSCABG00000011490	MUSTN1 (ENSCABG00000011479)	STIMATE (ENSCABG00000011474)	SFMBT1 (ENSCABG00000011462)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	21	MAPKAPK3 (ENSGEVG00005009651)	CISH (ENSGEVG00005010534)	ENSGEVG00005010553	HEMK1 (ENSGEVG00005010573)	C3orf18 (ENSGEVG00005010617)	WDR82 (ENSGEVG00005010674)	PPM1M (ENSGEVG00005010710)	TWF2 (ENSGEVG00005010731)	ENSGEVG00005010753	ALAS1 (ENSGEVG00005010806)	POC1A (ENSGEVG00005010905)	DUSP7 (ENSGEVG00005011303)	ENSGEVG00005011325	TNNC1 (ENSGEVG00005011344)	NISCH (ENSGEVG00005011405) #21	STAB1 (ENSGEVG00005011544) #22	NT5DC2 (ENSGEVG00005012336)	ENSGEVG00005012368	PBRM1 (ENSGEVG00005012413)	ENSGEVG00005012656	GNL3 (ENSGEVG00005012682)	GLT8D1 (ENSGEVG00005012743)	ENSGEVG00005012769	NEK4 (ENSGEVG00005012801)	ENSGEVG00005012857	ITIH4 (ENSGEVG00005013213)	ENSGEVG00005013352	ENSGEVG00005013429	MUSTN1 (ENSGEVG00005013513)	STIMATE (ENSGEVG00005013536)	SFMBT1 (ENSGEVG00005013605)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000007160.a.a	ENSGT00940000155514	ENSGT00940000154089.a	ENSGT00940000157392	ENSGT00390000014125	ENSGT00410000025882.a	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.g	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.gb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000154554.a.gb.b	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
painted turtle	MODERN SPECIES	2379													ENSCPBG00000016679	TNNC1 (ENSCPBG00000016681)	NISCH (ENSCPBG00000016685) #21	STAB1 (ENSCPBG00000016722) #22	NT5DC2 (ENSCPBG00000016884)	UQCC5 (ENSCPBG00000016889)	PBRM1 (ENSCPBG00000016984)	ENSCPBG00000018328	GNL3 (ENSCPBG00000018330)	GLT8D1 (ENSCPBG00000018340)	ENSCPBG00000018343	NEK4 (ENSCPBG00000018347)	ENSCPBG00000018359	ITIH4 (ENSCPBG00000018372)	ENSCPBG00000018377	MUSTN1 (ENSCPBG00000018383)	STIMATE (ENSCPBG00000018384)	SFMBT1 (ENSCPBG00000018389)	ENSCPBG00000018404
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00950000185875	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.hb.b	ENSGT00940000154554.a.ib	ENSGT00940000154554.a.hb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.hb.b	ENSGT00940000154554.a.ib	ENSGT00940000154554.a.hb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388.r	ENSGT00940000154791.c.a	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.hb.b.a.b	ENSGT00940000154554.a.hb.b.b	ENSGT00940000154554.a.ib	ENSGT00940000154554.a.hb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363
Indian cobra	MODERN SPECIES	1	BAP1 (ENSNNAG00000002752)	ENSNNAG00000002714	ENSNNAG00000002689	ENSNNAG00000002681	GLYCTK (ENSNNAG00000002673)	WDR82 (ENSNNAG00000002652)	PPM1M (ENSNNAG00000002620)	TWF2 (ENSNNAG00000002601)	ENSNNAG00000002583	ALAS1 (ENSNNAG00000002570)	POC1A (ENSNNAG00000002560)	DUSP7 (ENSNNAG00000002549)	ENSNNAG00000002540	TNNC1 (ENSNNAG00000002527)	NISCH (ENSNNAG00000002074) #21	ENSNNAG00000001979 #22	NT5DC2 (ENSNNAG00000001802)	UQCC5 (ENSNNAG00000001745)	ENSNNAG00000001704	GNL3 (ENSNNAG00000001649)	GLT8D1 (ENSNNAG00000001634)	SPCS1 (ENSNNAG00000001626)	NEK4 (ENSNNAG00000001606)	ENSNNAG00000001510	ENSNNAG00000001336	ENSNNAG00000001124	ENSNNAG00000000907	MUSTN1 (ENSNNAG00000000866)	STIMATE (ENSNNAG00000000850)	SFMBT1 (ENSNNAG00000000823)	RFT1 (ENSNNAG00000000765)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388.r	ENSGT00940000154791.c.a	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.hb.b.a.b.a	ENSGT00940000154554.a.hb.b.b	ENSGT00940000154554.a.ib	ENSGT00940000154554.a.hb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	10652																ENSLLTG00000008882 #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388.r	ENSGT00940000154791.c.a	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00390000007084	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.hb.b.a.b.a	ENSGT00940000154554.a.hb.b.b	ENSGT00940000154554.a.ib	ENSGT00940000154554.a.hb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	198					GLYCTK (ENSNSUG00000011297)	WDR82 (ENSNSUG00000011299)	PPM1M (ENSNSUG00000011335)	TWF2 (ENSNSUG00000011336)	ENSNSUG00000011338	ALAS1 (ENSNSUG00000011340)	POC1A (ENSNSUG00000011343)	DUSP7 (ENSNSUG00000011345)	ENSNSUG00000011354	TNNC1 (ENSNSUG00000011356)	ENSNSUG00000011359 #21	STAB1 (ENSNSUG00000011366) #22	NT5DC2 (ENSNSUG00000011388)	UQCC5 (ENSNSUG00000011393)	PBRM1 (ENSNSUG00000011408)	GLT8D1 (ENSNSUG00000013030)	SPCS1 (ENSNSUG00000013041)	NEK4 (ENSNSUG00000013042)	ENSNSUG00000013048
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	3	ENSPTXG00000008092	ENSPTXG00000008090	ENSPTXG00000008088	GLYCTK (ENSPTXG00000008084)	WDR82 (ENSPTXG00000008079)	PPM1M (ENSPTXG00000008076)	TWF2 (ENSPTXG00000008073)	ENSPTXG00000008056	ALAS1 (ENSPTXG00000008054)	POC1A (ENSPTXG00000008052)	DUSP7 (ENSPTXG00000008051)	ENSPTXG00000008049	TNNC1 (ENSPTXG00000008048)	NISCH (ENSPTXG00000006653) #21	ENSPTXG00000006644	STAB1 (ENSPTXG00000006642) #22	NT5DC2 (ENSPTXG00000006640)	UQCC5 (ENSPTXG00000006638)	PBRM1 (ENSPTXG00000006633)	GLT8D1 (ENSPTXG00000006629)	SPCS1 (ENSPTXG00000006627)	ENSPTXG00000006625	NEK4 (ENSPTXG00000006620)	ENSPTXG00000000665	ENSPTXG00000000124	ENSPTXG00000000085	ITIH4 (ENSPTXG00000000051)	MUSTN1 (ENSPTXG00000000036)	STIMATE (ENSPTXG00000000021)	SFMBT1 (ENSPTXG00000009522)	RFT1 (ENSPTXG00000009513)
Lizard	MODERN SPECIES	1	ABHD14A (ENSACAG00000011932)	ACY1 (ENSACAG00000011945)	GLYCTK (ENSACAG00000006619)	WDR82 (ENSACAG00000006639)	PPM1M (ENSACAG00000006676)	TWF2 (ENSACAG00000006679)	ENSACAG00000006715	ALAS1 (ENSACAG00000006743)	POC1A (ENSACAG00000006781)	DUSP7 (ENSACAG00000006861)	ENSACAG00000044449	RPL29 (ENSACAG00000006888)	ENSACAG00000006891	TNNC1 (ENSACAG00000006898)	NISCH (ENSACAG00000006939) #21	STAB1 (ENSACAG00000006988) #22	NT5DC2 (ENSACAG00000007080)	ENSACAG00000007122	UQCC5 (ENSACAG00000007129)	PBRM1 (ENSACAG00000007132)	GNL3 (ENSACAG00000007357)	GLT8D1 (ENSACAG00000007417)	SPCS1 (ENSACAG00000007470)	NEK4 (ENSACAG00000007481)	ENSACAG00000007499	ENSACAG00000027634	ITIH4 (ENSACAG00000007955)	MUSTN1 (ENSACAG00000036067)	STIMATE (ENSACAG00000008201)	SFMBT1 (ENSACAG00000008228)	ENSACAG00000041557
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000161296	ENSGT00940000155631	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000156388	ENSGT00940000154791	ENSGT00390000011904.p	ENSGT00390000014365	ENSGT00530000063965	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a.ib	ENSGT00940000154554.a.hb.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	8	BAP1 (ENSSMRG00000009153)	DNAH1 (ENSSMRG00000009179)	ENSSMRG00000009500	ENSSMRG00000009501	ENSSMRG00000009502	GLYCTK (ENSSMRG00000009535)	WDR82 (ENSSMRG00000009536)	PPM1M (ENSSMRG00000009543)	TWF2 (ENSSMRG00000009544)	ENSSMRG00000009545	ALAS1 (ENSSMRG00000009547)	POC1A (ENSSMRG00000009567)	DUSP7 (ENSSMRG00000009571)	TNNC1 (ENSSMRG00000009583)	NISCH (ENSSMRG00000009592) #21	STAB1 (ENSSMRG00000009597) #22	NT5DC2 (ENSSMRG00000009923)	UQCC5 (ENSSMRG00000009925)	PBRM1 (ENSSMRG00000009948)	GNL3 (ENSSMRG00000014813)	GLT8D1 (ENSSMRG00000014819)	SPCS1 (ENSSMRG00000014820)	NEK4 (ENSSMRG00000014821)	ENSSMRG00000014823	ENSSMRG00000014824	ENSSMRG00000014827	ITIH4 (ENSSMRG00000014831)	MUSTN1 (ENSSMRG00000014833)	STIMATE (ENSSMRG00000014834)	SFMBT1 (ENSSMRG00000014836)	RFT1 (ENSSMRG00000014837)
Common wall lizard	MODERN SPECIES	10	BAP1 (ENSPMRG00000007327)	DNAH1 (ENSPMRG00000007635)	ENSPMRG00000008451	GLYCTK (ENSPMRG00000008461)	WDR82 (ENSPMRG00000008466)	PPM1M (ENSPMRG00000008481)	TWF2 (ENSPMRG00000008508)	ENSPMRG00000008532	ALAS1 (ENSPMRG00000008541)	POC1A (ENSPMRG00000008555)	DUSP7 (ENSPMRG00000008572)	ENSPMRG00000008575	ENSPMRG00000008588	TNNC1 (ENSPMRG00000008598)	NISCH (ENSPMRG00000008674) #21	STAB1 (ENSPMRG00000008904) #22	ENSPMRG00000008920	ENSPMRG00000008970	UQCC5 (ENSPMRG00000009272)	PBRM1 (ENSPMRG00000009441)	GNL3 (ENSPMRG00000011155)	GLT8D1 (ENSPMRG00000011170)	SPCS1 (ENSPMRG00000011177)	NEK4 (ENSPMRG00000011179)	ITIH3 (ENSPMRG00000011271)	ENSPMRG00000011754	ENSPMRG00000011828	MUSTN1 (ENSPMRG00000012139)	STIMATE (ENSPMRG00000012147)	SFMBT1 (ENSPMRG00000012179)	RFT1 (ENSPMRG00000012268)
tuatara	DUPLICATION
tuatara	MODERN SPECIES	1425												ENSSPUG00000003773	RPL29 (ENSSPUG00000003760)	TNNC1 (ENSSPUG00000003748)	NISCH (ENSSPUG00000003729) #21	ENSSPUG00000003720 #22	ENSSPUG00000003714 #22	ENSSPUG00000003708 #22	ENSSPUG00000003703 #22	ENSSPUG00000003689 #22	ENSSPUG00000003683 #22	NT5DC2 (ENSSPUG00000003656)	ENSSPUG00000003649	PBRM1 (ENSSPUG00000003615)	GNL3 (ENSSPUG00000003582)	GLT8D1 (ENSSPUG00000003573)	SPCS1 (ENSSPUG00000003558)	ENSSPUG00000003548	NEK4 (ENSSPUG00000003533)	ITIH3 (ENSSPUG00000003431)	ITIH4 (ENSSPUG00000003109)
tuatara	DUPLICATION
tuatara	DUPLICATION
tuatara	DUPLICATION
tuatara	DUPLICATION
tuatara	MODERN SPECIES	1425											ENSSPUG00000003773	RPL29 (ENSSPUG00000003760)	TNNC1 (ENSSPUG00000003748)	NISCH (ENSSPUG00000003729) #21	ENSSPUG00000003720 #22	ENSSPUG00000003714 #22	ENSSPUG00000003708 #22	ENSSPUG00000003703 #22	ENSSPUG00000003689 #22	ENSSPUG00000003683 #22	NT5DC2 (ENSSPUG00000003656)	ENSSPUG00000003649	PBRM1 (ENSSPUG00000003615)	GNL3 (ENSSPUG00000003582)	GLT8D1 (ENSSPUG00000003573)	SPCS1 (ENSSPUG00000003558)	ENSSPUG00000003548	NEK4 (ENSSPUG00000003533)	ITIH3 (ENSSPUG00000003431)	ITIH4 (ENSSPUG00000003109)	MUSTN1 (ENSSPUG00000003063)
tuatara	MODERN SPECIES	1425							ENSSPUG00000003773	RPL29 (ENSSPUG00000003760)	TNNC1 (ENSSPUG00000003748)	NISCH (ENSSPUG00000003729) #21	ENSSPUG00000003720 #22	ENSSPUG00000003714 #22	ENSSPUG00000003708 #22	ENSSPUG00000003703 #22	ENSSPUG00000003689 #22	ENSSPUG00000003683 #22	NT5DC2 (ENSSPUG00000003656)	ENSSPUG00000003649	PBRM1 (ENSSPUG00000003615)	GNL3 (ENSSPUG00000003582)	GLT8D1 (ENSSPUG00000003573)	SPCS1 (ENSSPUG00000003558)	ENSSPUG00000003548	NEK4 (ENSSPUG00000003533)	ITIH3 (ENSSPUG00000003431)	ITIH4 (ENSSPUG00000003109)	MUSTN1 (ENSSPUG00000003063)	STIMATE (ENSSPUG00000003060)	SFMBT1 (ENSSPUG00000003049)	RFT1 (ENSSPUG00000003032)	PRKCD (ENSSPUG00000003027)
tuatara	MODERN SPECIES	1425								ENSSPUG00000003773	RPL29 (ENSSPUG00000003760)	TNNC1 (ENSSPUG00000003748)	NISCH (ENSSPUG00000003729) #21	ENSSPUG00000003720 #22	ENSSPUG00000003714 #22	ENSSPUG00000003708 #22	ENSSPUG00000003703 #22	ENSSPUG00000003689 #22	ENSSPUG00000003683 #22	NT5DC2 (ENSSPUG00000003656)	ENSSPUG00000003649	PBRM1 (ENSSPUG00000003615)	GNL3 (ENSSPUG00000003582)	GLT8D1 (ENSSPUG00000003573)	SPCS1 (ENSSPUG00000003558)	ENSSPUG00000003548	NEK4 (ENSSPUG00000003533)	ITIH3 (ENSSPUG00000003431)	ITIH4 (ENSSPUG00000003109)	MUSTN1 (ENSSPUG00000003063)	STIMATE (ENSSPUG00000003060)	SFMBT1 (ENSSPUG00000003049)	RFT1 (ENSSPUG00000003032)
tuatara	MODERN SPECIES	1425										ENSSPUG00000003773	RPL29 (ENSSPUG00000003760)	TNNC1 (ENSSPUG00000003748)	NISCH (ENSSPUG00000003729) #21	ENSSPUG00000003720 #22	ENSSPUG00000003714 #22	ENSSPUG00000003708 #22	ENSSPUG00000003703 #22	ENSSPUG00000003689 #22	ENSSPUG00000003683 #22	NT5DC2 (ENSSPUG00000003656)	ENSSPUG00000003649	PBRM1 (ENSSPUG00000003615)	GNL3 (ENSSPUG00000003582)	GLT8D1 (ENSSPUG00000003573)	SPCS1 (ENSSPUG00000003558)	ENSSPUG00000003548	NEK4 (ENSSPUG00000003533)	ITIH3 (ENSSPUG00000003431)	ITIH4 (ENSSPUG00000003109)	MUSTN1 (ENSSPUG00000003063)	STIMATE (ENSSPUG00000003060)
tuatara	MODERN SPECIES	1425									ENSSPUG00000003773	RPL29 (ENSSPUG00000003760)	TNNC1 (ENSSPUG00000003748)	NISCH (ENSSPUG00000003729) #21	ENSSPUG00000003720 #22	ENSSPUG00000003714 #22	ENSSPUG00000003708 #22	ENSSPUG00000003703 #22	ENSSPUG00000003689 #22	ENSSPUG00000003683 #22	NT5DC2 (ENSSPUG00000003656)	ENSSPUG00000003649	PBRM1 (ENSSPUG00000003615)	GNL3 (ENSSPUG00000003582)	GLT8D1 (ENSSPUG00000003573)	SPCS1 (ENSSPUG00000003558)	ENSSPUG00000003548	NEK4 (ENSSPUG00000003533)	ITIH3 (ENSSPUG00000003431)	ITIH4 (ENSSPUG00000003109)	MUSTN1 (ENSSPUG00000003063)	STIMATE (ENSSPUG00000003060)	SFMBT1 (ENSSPUG00000003049)
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	103														ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00950000182835.c.d
Platypus	MODERN SPECIES	84	AMT (ENSOANG00000001372)	TCTA (ENSOANG00000048917)	RHOA (ENSOANG00000013807)	GPX1 (ENSOANG00000036255)	USP4 (ENSOANG00000013806)	EMC3 (ENSOANG00000013805)	FANCD2 (ENSOANG00000020444)	ENSOANG00000001507	BRK1 (ENSOANG00000043269)	ENSOANG00000046901	IRAK2 (ENSOANG00000028234)	ENSOANG00000036015	TAMM41 (ENSOANG00000001504)	TNNC1 (ENSOANG00000001503)	NISCH (ENSOANG00000001501) #21	STAB1 (ENSOANG00000001499) #22	NT5DC2 (ENSOANG00000001498)	UQCC5 (ENSOANG00000036245)	PBRM1 (ENSOANG00000050313)	GNL3 (ENSOANG00000013437)	GLT8D1 (ENSOANG00000013435)	ENSOANG00000045820	NEK4 (ENSOANG00000013434)	ENSOANG00000029878	ITIH3 (ENSOANG00000029842)	ENSOANG00000002099	MUSTN1 (ENSOANG00000045634)	STIMATE (ENSOANG00000043186)	SFMBT1 (ENSOANG00000030105)	RFT1 (ENSOANG00000022204)	PRKCD (ENSOANG00000004136)
Theria	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000155631	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007084.c.a.a.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000163875	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.a.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039.b	ENSGT00940000161039.a	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
Opossum	MODERN SPECIES	5	ENSMODG00000011728	POC1A (ENSMODG00000011717)	ENSMODG00000011675	ENSMODG00000011665	ENSMODG00000040085	TWF2 (ENSMODG00000011648)	PPM1M (ENSMODG00000011632)	ENSMODG00000011614	GLYCTK (ENSMODG00000011601)	DNAH1 (ENSMODG00000011579)	BAP1 (ENSMODG00000011521)	PHF7 (ENSMODG00000011485)	SEMA3G (ENSMODG00000011476)	TNNC1 (ENSMODG00000044798)	ENSMODG00000011444 #21	STAB1 (ENSMODG00000011416) #22	NT5DC2 (ENSMODG00000011341)	UQCC5 (ENSMODG00000024115)	PBRM1 (ENSMODG00000011318)	GNL3 (ENSMODG00000011257)	GLT8D1 (ENSMODG00000011221)	SPCS1 (ENSMODG00000011199)	NEK4 (ENSMODG00000011196)	ITIH1 (ENSMODG00000048882)	ITIH3 (ENSMODG00000011145)	ENSMODG00000011117	ENSMODG00000046269	ENSMODG00000010837	MUSTN1 (ENSMODG00000047744)	STIMATE (ENSMODG00000050453)	SFMBT1 (ENSMODG00000010779)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007084.c.a.a.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000163875	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.a.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039.b	ENSGT00940000161039.a	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000007084.c.a.a.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000163875	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.a.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039.b	ENSGT00940000161039.a	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000007084.c.a.a.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000163875	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.a.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039.b	ENSGT00940000161039.a	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Common wonbat	MODERN SPECIES	1056	ACY1 (ENSVURG00010017138)	DUSP7 (ENSVURG00010017107)	POC1A (ENSVURG00010017083)	ALAS1 (ENSVURG00010017058)	ENSVURG00010017053	ENSVURG00010016999	TWF2 (ENSVURG00010016977)	PPM1M (ENSVURG00010016961)	ENSVURG00010016950	GLYCTK (ENSVURG00010016940)	DNAH1 (ENSVURG00010016900)	BAP1 (ENSVURG00010016879)	ENSVURG00010016874	ENSVURG00010016868 #21	ENSVURG00010016861 #21	STAB1 (ENSVURG00010015546) #22	NT5DC2 (ENSVURG00010015434)	UQCC5 (ENSVURG00010015429)	PBRM1 (ENSVURG00010015333)	GNL3 (ENSVURG00010015273)	GLT8D1 (ENSVURG00010015258)	ENSVURG00010015252	NEK4 (ENSVURG00010015208)	ENSVURG00010015183	ITIH3 (ENSVURG00010015175)	ENSVURG00010015089	ENSVURG00010014979	MUSTN1 (ENSVURG00010014954)	STIMATE (ENSVURG00010014947)	SFMBT1 (ENSVURG00010014909)	RFT1 (ENSVURG00010014844)
koala	MODERN SPECIES	215	ALAS1 (ENSPCIG00000018165)	TLR9 (ENSPCIG00000018166)	ENSPCIG00000018167	TWF2 (ENSPCIG00000018168)	ENSPCIG00000031420	ENSPCIG00000018170	GLYCTK (ENSPCIG00000018172)	DNAH1 (ENSPCIG00000018182)	BAP1 (ENSPCIG00000018268)	PHF7 (ENSPCIG00000018272)	SEMA3G (ENSPCIG00000018296)	TNNC1 (ENSPCIG00000018298)	ENSPCIG00000033826 #21	ENSPCIG00000018306 #21	ENSPCIG00000018312	STAB1 (ENSPCIG00000018323) #22	NT5DC2 (ENSPCIG00000018358)	UQCC5 (ENSPCIG00000018638)	PBRM1 (ENSPCIG00000018640)	GNL3 (ENSPCIG00000018642)	GLT8D1 (ENSPCIG00000018647)	SPCS1 (ENSPCIG00000018648)	NEK4 (ENSPCIG00000018649)	ENSPCIG00000019538	ITIH3 (ENSPCIG00000018652)	ENSPCIG00000018655	ENSPCIG00000007405	STIMATE (ENSPCIG00000018660)	SFMBT1 (ENSPCIG00000018663)	ENSPCIG00000031111	RFT1 (ENSPCIG00000018674)
Wallaby	MODERN SPECIES	1236																ENSMEUG00000002309 #22	NT5DC2 (ENSMEUG00000002371)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		DUSP7 (ENSSHAG00000021178)	POC1A (ENSSHAG00000001263)	ALAS1 (ENSSHAG00000021735)	ENSSHAG00000004018	ENSSHAG00000029225	TWF2 (ENSSHAG00000002923)	PPM1M (ENSSHAG00000002110)	ENSSHAG00000026928	GLYCTK (ENSSHAG00000000848)	DNAH1 (ENSSHAG00000002401)	BAP1 (ENSSHAG00000009571)	PHF7 (ENSSHAG00000009297)	SEMA3G (ENSSHAG00000031866)	TNNC1 (ENSSHAG00000009252)	NISCH (ENSSHAG00000008768) #21	STAB1 (ENSSHAG00000008227) #22	NT5DC2 (ENSSHAG00000007941)	PBRM1 (ENSSHAG00000006335)	ENSSHAG00000006141	GLT8D1 (ENSSHAG00000006080)	SPCS1 (ENSSHAG00000021565)	NEK4 (ENSSHAG00000005365)	ENSSHAG00000004652	ITIH3 (ENSSHAG00000003721)	ENSSHAG00000002537	ENSSHAG00000004281	STIMATE (ENSSHAG00000023431)	SFMBT1 (ENSSHAG00000004280)	RFT1 (ENSSHAG00000002393)	ENSSHAG00000008499	ENSSHAG00000007233
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	40			ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.d	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00940000155552	ENSGT00940000158818
Sloth	MODERN SPECIES	346																ENSCHOG00000004255 #22
Armadillo	MODERN SPECIES	2145										ENSDNOG00000039264	BAP1 (ENSDNOG00000001818)	PHF7 (ENSDNOG00000018466)	SEMA3G (ENSDNOG00000034301)	TNNC1 (ENSDNOG00000032961)	NISCH (ENSDNOG00000036637) #21	STAB1 (ENSDNOG00000014588) #22	NT5DC2 (ENSDNOG00000047591)	UQCC5 (ENSDNOG00000001032)	PBRM1 (ENSDNOG00000001034)	GNL3 (ENSDNOG00000001037)	GLT8D1 (ENSDNOG00000001038)	ENSDNOG00000012421	NEK4 (ENSDNOG00000005278)	ITIH3 (ENSDNOG00000023803)	ITIH4 (ENSDNOG00000023801)	STIMATE (ENSDNOG00000033582)	SFMBT1 (ENSDNOG00000006278)	RFT1 (ENSDNOG00000012005)	PRKCD (ENSDNOG00000007776)	TKT (ENSDNOG00000033443)	DCP1A (ENSDNOG00000036524)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00940000155552
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327	ENSGT00940000155552
Elephant	MODERN SPECIES	49	RPL29 (ENSLAFG00000005757)	DUSP7 (ENSLAFG00000021627)	POC1A (ENSLAFG00000028434)	ALAS1 (ENSLAFG00000002991)	TLR9 (ENSLAFG00000002993)	TWF2 (ENSLAFG00000021926)	PPM1M (ENSLAFG00000017432)	WDR82 (ENSLAFG00000028309)	GLYCTK (ENSLAFG00000008525)	DNAH1 (ENSLAFG00000023232)	BAP1 (ENSLAFG00000006332)	PHF7 (ENSLAFG00000006339)	SEMA3G (ENSLAFG00000008579)	TNNC1 (ENSLAFG00000017754)	NISCH (ENSLAFG00000017761) #21	STAB1 (ENSLAFG00000013893) #22	NT5DC2 (ENSLAFG00000013916)	PBRM1 (ENSLAFG00000016039)	GNL3 (ENSLAFG00000016056)	GLT8D1 (ENSLAFG00000016064)	SPCS1 (ENSLAFG00000016073)	NEK4 (ENSLAFG00000016078)	ITIH1 (ENSLAFG00000016085)	ITIH3 (ENSLAFG00000018659)	ITIH4 (ENSLAFG00000016106)	MUSTN1 (ENSLAFG00000031986)	STIMATE (ENSLAFG00000020786)	SFMBT1 (ENSLAFG00000004910)	RFT1 (ENSLAFG00000002792)	PRKCD (ENSLAFG00000015864)	TKT (ENSLAFG00000005325)
Hyrax	MODERN SPECIES	1269										DNAH1 (ENSPCAG00000010932)	BAP1 (ENSPCAG00000011581)	PHF7 (ENSPCAG00000011707)	SEMA3G (ENSPCAG00000011784)	TNNC1 (ENSPCAG00000011903)	NISCH (ENSPCAG00000011968) #21	STAB1 (ENSPCAG00000012169) #22	NT5DC2 (ENSPCAG00000012643)
Tenrec	MODERN SPECIES	357																STAB1 (ENSETEG00000009606) #22	ENSETEG00000009616	PBRM1 (ENSETEG00000009619)	UQCC5 (ENSETEG00000009623)
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Primates	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157494	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00390000011390
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157494	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00390000011390
Pan	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182987.c.a.a.db.a	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00390000011390
Chimpanzee	MODERN SPECIES	16	ENSPTRG00000044698	ALAS1 (ENSPTRG00000014991)	TLR9 (ENSPTRG00000014992)	TWF2 (ENSPTRG00000042003)	PPM1M (ENSPTRG00000014993)	WDR82 (ENSPTRG00000044611)	GLYCTK (ENSPTRG00000014995)	DNAH1 (ENSPTRG00000014996)	ENSPTRG00000048221	BAP1 (ENSPTRG00000014997)	PHF7 (ENSPTRG00000014998)	ENSPTRG00000051179	SEMA3G (ENSPTRG00000014999)	TNNC1 (ENSPTRG00000015000)	NISCH (ENSPTRG00000015001) #21	STAB1 (ENSPTRG00000015002) #22	NT5DC2 (ENSPTRG00000015004)	UQCC5 (ENSPTRG00000015006)	PBRM1 (ENSPTRG00000015007)	GNL3 (ENSPTRG00000015009)	GLT8D1 (ENSPTRG00000015010)	SPCS1 (ENSPTRG00000015011)	NEK4 (ENSPTRG00000049205)	ITIH1 (ENSPTRG00000015014)	ITIH3 (ENSPTRG00000015015)	ITIH4 (ENSPTRG00000034152)	MUSTN1 (ENSPTRG00000048402)	STIMATE (ENSPTRG00000015018)	SFMBT1 (ENSPTRG00000015019)	ENSPTRG00000051979	ENSPTRG00000043838
Bonobo	MODERN SPECIES	16	ENSPPAG00000017387	ALAS1 (ENSPPAG00000042129)	TLR9 (ENSPPAG00000018063)	TWF2 (ENSPPAG00000033131)	PPM1M (ENSPPAG00000037368)	WDR82 (ENSPPAG00000032115)	GLYCTK (ENSPPAG00000042988)	DNAH1 (ENSPPAG00000032288)	ENSPPAG00000038782	BAP1 (ENSPPAG00000028588)	PHF7 (ENSPPAG00000036489)	ENSPPAG00000030262	SEMA3G (ENSPPAG00000033280)	TNNC1 (ENSPPAG00000036861)	NISCH (ENSPPAG00000014444) #21	STAB1 (ENSPPAG00000038101) #22	NT5DC2 (ENSPPAG00000035408)	UQCC5 (ENSPPAG00000041969)	PBRM1 (ENSPPAG00000020870)	GNL3 (ENSPPAG00000019253)	GLT8D1 (ENSPPAG00000042721)	ENSPPAG00000034424	NEK4 (ENSPPAG00000029788)	ITIH1 (ENSPPAG00000041546)	ITIH3 (ENSPPAG00000029064)	ITIH4 (ENSPPAG00000040047)	MUSTN1 (ENSPPAG00000031763)	STIMATE (ENSPPAG00000043942)	SFMBT1 (ENSPPAG00000004062)	ENSPPAG00000006378	RFT1 (ENSPPAG00000035449)
Human	MODERN SPECIES	15	DUSP7 (ENSG00000164086)	POC1A (ENSG00000164087)	ALAS1 (ENSG00000023330)	TLR9 (ENSG00000239732)	ENSG00000173366	TWF2 (ENSG00000247596)	PPM1M (ENSG00000164088)	WDR82 (ENSG00000164091)	GLYCTK (ENSG00000168237)	DNAH1 (ENSG00000114841)	BAP1 (ENSG00000163930)	PHF7 (ENSG00000010318)	SEMA3G (ENSG00000010319)	TNNC1 (ENSG00000114854)	NISCH (ENSG00000010322) #21	STAB1 (ENSG00000010327) #22	NT5DC2 (ENSG00000168268)	UQCC5 (ENSG00000168273)	PBRM1 (ENSG00000163939)	GNL3 (ENSG00000163938)	GLT8D1 (ENSG00000016864)	SPCS1 (ENSG00000114902)	NEK4 (ENSG00000114904)	ITIH1 (ENSG00000055957)	ITIH3 (ENSG00000162267)	ITIH4 (ENSG00000055955)	MUSTN1 (ENSG00000272573)	STIMATE-MUSTN1 (ENSG00000248592)	STIMATE (ENSG00000213533)	SFMBT1 (ENSG00000163935)	RFT1 (ENSG00000163933)
Gorilla	MODERN SPECIES	16	POC1A (ENSGGOG00000006652)	ENSGGOG00000040468	ALAS1 (ENSGGOG00000013205)	TLR9 (ENSGGOG00000015810)	TWF2 (ENSGGOG00000041047)	PPM1M (ENSGGOG00000015824)	WDR82 (ENSGGOG00000040779)	GLYCTK (ENSGGOG00000015844)	DNAH1 (ENSGGOG00000015852)	BAP1 (ENSGGOG00000015895)	PHF7 (ENSGGOG00000015905)	ENSGGOG00000043984	SEMA3G (ENSGGOG00000015913)	TNNC1 (ENSGGOG00000015926)	NISCH (ENSGGOG00000015932) #21	STAB1 (ENSGGOG00000015946) #22	NT5DC2 (ENSGGOG00000015984)	UQCC5 (ENSGGOG00000016000)	PBRM1 (ENSGGOG00000016002)	GNL3 (ENSGGOG00000011444)	GLT8D1 (ENSGGOG00000011449)	ENSGGOG00000028027	NEK4 (ENSGGOG00000014660)	ITIH1 (ENSGGOG00000005722)	ITIH3 (ENSGGOG00000005732)	ITIH4 (ENSGGOG00000005746)	MUSTN1 (ENSGGOG00000044150)	STIMATE (ENSGGOG00000005757)	SFMBT1 (ENSGGOG00000005765)	ENSGGOG00000036814	RFT1 (ENSGGOG00000003201)
Orangutan	MODERN SPECIES	16	DUSP7 (ENSPPYG00000040626)	POC1A (ENSPPYG00000013816)	ALAS1 (ENSPPYG00000013815)	TLR9 (ENSPPYG00000039505)	TWF2 (ENSPPYG00000013814)	PPM1M (ENSPPYG00000013813)	WDR82 (ENSPPYG00000013812)	GLYCTK (ENSPPYG00000013811)	ENSPPYG00000030612	DNAH1 (ENSPPYG00000013810)	BAP1 (ENSPPYG00000013809)	PHF7 (ENSPPYG00000013808)	SEMA3G (ENSPPYG00000013807)	TNNC1 (ENSPPYG00000013806)	NISCH (ENSPPYG00000013805) #21	STAB1 (ENSPPYG00000013804) #22	NT5DC2 (ENSPPYG00000013803)	UQCC5 (ENSPPYG00000035114)	PBRM1 (ENSPPYG00000013801)	GNL3 (ENSPPYG00000013800)	GLT8D1 (ENSPPYG00000013799)	SPCS1 (ENSPPYG00000013798)	NEK4 (ENSPPYG00000013797)	ITIH1 (ENSPPYG00000013796)	ITIH3 (ENSPPYG00000013795)	ITIH4 (ENSPPYG00000013794)	ENSPPYG00000013793	SFMBT1 (ENSPPYG00000013792)	RFT1 (ENSPPYG00000013790)	PRKCD (ENSPPYG00000013789)	TKT (ENSPPYG00000025895)
Gibbon	MODERN SPECIES	19	ENSNLEG00000035115	ALAS1 (ENSNLEG00000007088)	TLR9 (ENSNLEG00000007091)	TWF2 (ENSNLEG00000033626)	PPM1M (ENSNLEG00000007097)	WDR82 (ENSNLEG00000007104)	GLYCTK (ENSNLEG00000007106)	ENSNLEG00000029286	DNAH1 (ENSNLEG00000007110)	BAP1 (ENSNLEG00000028041)	PHF7 (ENSNLEG00000007134)	ENSNLEG00000032495	SEMA3G (ENSNLEG00000007140)	TNNC1 (ENSNLEG00000007148)	NISCH (ENSNLEG00000007149) #21	STAB1 (ENSNLEG00000007151) #22	NT5DC2 (ENSNLEG00000007158)	UQCC5 (ENSNLEG00000015974)	PBRM1 (ENSNLEG00000007161)	GNL3 (ENSNLEG00000007173)	GLT8D1 (ENSNLEG00000007181)	ENSNLEG00000033313	NEK4 (ENSNLEG00000007185)	ITIH1 (ENSNLEG00000007188)	ITIH3 (ENSNLEG00000007191)	ITIH4 (ENSNLEG00000007192)	MUSTN1 (ENSNLEG00000032716)	STIMATE (ENSNLEG00000007196)	SFMBT1 (ENSNLEG00000007198)	ENSNLEG00000028713	ENSNLEG00000034706
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l.b	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l.b	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l.b	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	650	ALAS1 (ENSCATG00000043824)	TLR9 (ENSCATG00000042563)	TWF2 (ENSCATG00000042476)	PPM1M (ENSCATG00000000663)	WDR82 (ENSCATG00000041029)	GLYCTK (ENSCATG00000035027)	DNAH1 (ENSCATG00000044776)	ENSCATG00000040421	BAP1 (ENSCATG00000036457)	ENSCATG00000034612	PHF7 (ENSCATG00000044277)	ENSCATG00000040703	SEMA3G (ENSCATG00000035629)	TNNC1 (ENSCATG00000038007)	NISCH (ENSCATG00000030768) #21	STAB1 (ENSCATG00000014397) #22	ENSCATG00000031103	UQCC5 (ENSCATG00000042501)	PBRM1 (ENSCATG00000021847)	GNL3 (ENSCATG00000040886)	GLT8D1 (ENSCATG00000037083)	SPCS1 (ENSCATG00000032544)	NEK4 (ENSCATG00000040318)	ITIH1 (ENSCATG00000035267)	ITIH3 (ENSCATG00000042414)	ITIH4 (ENSCATG00000042798)	MUSTN1 (ENSCATG00000044810)	STIMATE (ENSCATG00000043027)	SFMBT1 (ENSCATG00000029065)	ENSCATG00000036152	ENSCATG00000034156
Drill	MODERN SPECIES	937	ALAS1 (ENSMLEG00000032040)	TLR9 (ENSMLEG00000006731)	TWF2 (ENSMLEG00000027690)	PPM1M (ENSMLEG00000036643)	WDR82 (ENSMLEG00000032032)	GLYCTK (ENSMLEG00000028922)	ENSMLEG00000033199	DNAH1 (ENSMLEG00000041529)	ENSMLEG00000043544	BAP1 (ENSMLEG00000041809)	PHF7 (ENSMLEG00000027635)	ENSMLEG00000044065	SEMA3G (ENSMLEG00000040041)	TNNC1 (ENSMLEG00000040569)	NISCH (ENSMLEG00000026853) #21	STAB1 (ENSMLEG00000034516) #22	ENSMLEG00000036641	UQCC5 (ENSMLEG00000034027)	PBRM1 (ENSMLEG00000044440)	GNL3 (ENSMLEG00000027696)	GLT8D1 (ENSMLEG00000034281)	SPCS1 (ENSMLEG00000030517)	NEK4 (ENSMLEG00000028746)	ITIH1 (ENSMLEG00000044139)	ITIH3 (ENSMLEG00000012273)	ITIH4 (ENSMLEG00000038445)	MUSTN1 (ENSMLEG00000030735)	STIMATE (ENSMLEG00000041623)	SFMBT1 (ENSMLEG00000043388)	ENSMLEG00000041403	ENSMLEG00000012505
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000146983	ENSGT00940000166326
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT01100000263539.b.b.b.b.b.a.b.a.a.b.a.b	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	11	ENSMFAG00000049968	POC1A (ENSMFAG00000001970)	ALAS1 (ENSMFAG00000034496)	TLR9 (ENSMFAG00000036170)	TWF2 (ENSMFAG00000030787)	PPM1M (ENSMFAG00000035503)	WDR82 (ENSMFAG00000065212)	GLYCTK (ENSMFAG00000033123)	DNAH1 (ENSMFAG00000038690)	ENSMFAG00000051698	BAP1 (ENSMFAG00000037249)	PHF7 (ENSMFAG00000044611)	SEMA3G (ENSMFAG00000031594)	TNNC1 (ENSMFAG00000034519)	NISCH (ENSMFAG00000029268) #21	STAB1 (ENSMFAG00000045138) #22	NT5DC2 (ENSMFAG00000004068)	UQCC5 (ENSMFAG00000045064)	PBRM1 (ENSMFAG00000035585)	GNL3 (ENSMFAG00000000613)	GLT8D1 (ENSMFAG00000043905)	SPCS1 (ENSMFAG00000040738)	ITIH4 (ENSMFAG00000038477)	NEK4 (ENSMFAG00000003641)	ITIH1 (ENSMFAG00000038345)	ITIH3 (ENSMFAG00000038762)	MUSTN1 (ENSMFAG00000038131)	STIMATE (ENSMFAG00000044286)	SFMBT1 (ENSMFAG00000002793)	ENSMFAG00000061709	RFT1 (ENSMFAG00000034584)
Rhesus	MODERN SPECIES	11	DUSP7 (ENSMMUG00000005300)	POC1A (ENSMMUG00000012485)	ALAS1 (ENSMMUG00000005596)	TLR9 (ENSMMUG00000012263)	TWF2 (ENSMMUG00000047685)	PPM1M (ENSMMUG00000008236)	WDR82 (ENSMMUG00000008234)	GLYCTK (ENSMMUG00000016971)	DNAH1 (ENSMMUG00000016974)	ENSMMUG00000055701	BAP1 (ENSMMUG00000016982)	PHF7 (ENSMMUG00000016984)	SEMA3G (ENSMMUG00000018872)	TNNC1 (ENSMMUG00000005618)	NISCH (ENSMMUG00000005619) #21	STAB1 (ENSMMUG00000017351) #22	NT5DC2 (ENSMMUG00000017360)	UQCC5 (ENSMMUG00000050505)	PBRM1 (ENSMMUG00000017361)	GNL3 (ENSMMUG00000012511)	GLT8D1 (ENSMMUG00000012526)	SPCS1 (ENSMMUG00000017370)	NEK4 (ENSMMUG00000017903)	ITIH1 (ENSMMUG00000014520)	ITIH3 (ENSMMUG00000014522)	ITIH4 (ENSMMUG00000014523)	STIMATE (ENSMMUG00000014526)	SFMBT1 (ENSMMUG00000014527)	RFT1 (ENSMMUG00000016197)	PRKCD (ENSMMUG00000007230)	TKT (ENSMMUG00000014433)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	563	POC1A (ENSMNEG00000042811)	ALAS1 (ENSMNEG00000036890)	TLR9 (ENSMNEG00000045276)	TWF2 (ENSMNEG00000040395)	PPM1M (ENSMNEG00000002813)	WDR82 (ENSMNEG00000033534)	GLYCTK (ENSMNEG00000036181)	DNAH1 (ENSMNEG00000016385)	ENSMNEG00000045285	BAP1 (ENSMNEG00000028324)	PHF7 (ENSMNEG00000036817)	ENSMNEG00000036603	SEMA3G (ENSMNEG00000043048)	TNNC1 (ENSMNEG00000030852)	NISCH (ENSMNEG00000041321) #21	STAB1 (ENSMNEG00000039494) #22	ENSMNEG00000028955	UQCC5 (ENSMNEG00000027514)	PBRM1 (ENSMNEG00000031931)	GNL3 (ENSMNEG00000041979)	GLT8D1 (ENSMNEG00000036858)	SPCS1 (ENSMNEG00000029114)	NEK4 (ENSMNEG00000012873)	ITIH1 (ENSMNEG00000026201)	ITIH3 (ENSMNEG00000041402)	ITIH4 (ENSMNEG00000015665)	MUSTN1 (ENSMNEG00000036314)	STIMATE (ENSMNEG00000040009)	SFMBT1 (ENSMNEG00000037355)	ENSMNEG00000037513	ENSMNEG00000030850
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	14	ACY1 (ENSCSAG00000013897)	ENSCSAG00000013884	DUSP7 (ENSCSAG00000013871)	POC1A (ENSCSAG00000013862)	ALAS1 (ENSCSAG00000013850)	TLR9 (ENSCSAG00000013839)	TWF2 (ENSCSAG00000013812)	PPM1M (ENSCSAG00000013770)	GLYCTK (ENSCSAG00000013762)	DNAH1 (ENSCSAG00000013710)	BAP1 (ENSCSAG00000013472)	PHF7 (ENSCSAG00000013464)	SEMA3G (ENSCSAG00000013447)	TNNC1 (ENSCSAG00000013426)	NISCH (ENSCSAG00000013414) #21	STAB1 (ENSCSAG00000013391) #22	NT5DC2 (ENSCSAG00000013353)	UQCC5 (ENSCSAG00000013345)	PBRM1 (ENSCSAG00000013338)	GNL3 (ENSCSAG00000013315)	GLT8D1 (ENSCSAG00000013304)	SPCS1 (ENSCSAG00000013298)	NEK4 (ENSCSAG00000013286)	ITIH1 (ENSCSAG00000013253)	ITIH3 (ENSCSAG00000013238)	ITIH4 (ENSCSAG00000013190)	ENSCSAG00000013113	ENSCSAG00000013086	SFMBT1 (ENSCSAG00000013081)	RFT1 (ENSCSAG00000013064)	PRKCD (ENSCSAG00000013055)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT01030000234620.a.a.a.a.a.b.l	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940.a.b	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00910000148570
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1201	ALAS1 (ENSRROG00000010480)	TLR9 (ENSRROG00000042143)	TWF2 (ENSRROG00000032567)	PPM1M (ENSRROG00000037382)	WDR82 (ENSRROG00000037223)	GLYCTK (ENSRROG00000036017)	ENSRROG00000045163	DNAH1 (ENSRROG00000042414)	ENSRROG00000040683	BAP1 (ENSRROG00000040428)	PHF7 (ENSRROG00000038518)	ENSRROG00000035257	SEMA3G (ENSRROG00000029611)	TNNC1 (ENSRROG00000030663)	NISCH (ENSRROG00000037098) #21	STAB1 (ENSRROG00000032345) #22	ENSRROG00000043762	UQCC5 (ENSRROG00000045667)	PBRM1 (ENSRROG00000044453)	GNL3 (ENSRROG00000030086)	GLT8D1 (ENSRROG00000036321)	SPCS1 (ENSRROG00000044527)	NEK4 (ENSRROG00000036812)	ITIH1 (ENSRROG00000030548)	ITIH3 (ENSRROG00000044207)	ITIH4 (ENSRROG00000031098)	MUSTN1 (ENSRROG00000032741)	STIMATE (ENSRROG00000044611)	SFMBT1 (ENSRROG00000039894)
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2323	ALAS1 (ENSRBIG00000036219)	TLR9 (ENSRBIG00000038584)	TWF2 (ENSRBIG00000027035)	PPM1M (ENSRBIG00000044032)	WDR82 (ENSRBIG00000027475)	GLYCTK (ENSRBIG00000039788)	ENSRBIG00000027535	DNAH1 (ENSRBIG00000042646)	ENSRBIG00000038290	BAP1 (ENSRBIG00000025339)	PHF7 (ENSRBIG00000033367)	ENSRBIG00000039399	SEMA3G (ENSRBIG00000013558)	TNNC1 (ENSRBIG00000040091)	NISCH (ENSRBIG00000028710) #21	STAB1 (ENSRBIG00000038956) #22	ENSRBIG00000036677	UQCC5 (ENSRBIG00000035350)	PBRM1 (ENSRBIG00000038881)	GNL3 (ENSRBIG00000031778)	GLT8D1 (ENSRBIG00000037307)	SPCS1 (ENSRBIG00000030656)	NEK4 (ENSRBIG00000043954)	ITIH1 (ENSRBIG00000040179)	ITIH3 (ENSRBIG00000026208)	ITIH4 (ENSRBIG00000039092)	MUSTN1 (ENSRBIG00000010385)	STIMATE (ENSRBIG00000029028)	ENSRBIG00000041371	SFMBT1 (ENSRBIG00000035596)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856.a	ENSGT00940000156388.g	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00910000146926	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448.a	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856.a	ENSGT00940000156388.g	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448.a	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965.o.b	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856.a	ENSGT00940000156388.g	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448.a	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Capuchin	MODERN SPECIES		DUSP7 (ENSCCAG00000033164)	POC1A (ENSCCAG00000023380)	ALAS1 (ENSCCAG00000024705)	TLR9 (ENSCCAG00000026080)	TWF2 (ENSCCAG00000036838)	PPM1M (ENSCCAG00000024537)	WDR82 (ENSCCAG00000024417)	GLYCTK (ENSCCAG00000025040)	DNAH1 (ENSCCAG00000036049)	ENSCCAG00000037951	BAP1 (ENSCCAG00000004114)	PHF7 (ENSCCAG00000032970)	SEMA3G (ENSCCAG00000001366)	TNNC1 (ENSCCAG00000035927)	NISCH (ENSCCAG00000018832) #21	STAB1 (ENSCCAG00000031199) #22	ENSCCAG00000028270	SMIM4 (ENSCCAG00000037390)	PBRM1 (ENSCCAG00000023683)	GNL3 (ENSCCAG00000033281)	GLT8D1 (ENSCCAG00000024771)	SPCS1 (ENSCCAG00000033527)	NEK4 (ENSCCAG00000027093)	ITIH1 (ENSCCAG00000035426)	ITIH3 (ENSCCAG00000027144)	ITIH4 (ENSCCAG00000022636)	MUSTN1 (ENSCCAG00000034591)	STIMATE (ENSCCAG00000015813)	SFMBT1 (ENSCCAG00000023354)	RFT1 (ENSCCAG00000038099)	PRKCD (ENSCCAG00000009822)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	127	DUSP7 (ENSSBOG00000020477)	POC1A (ENSSBOG00000027902)	ALAS1 (ENSSBOG00000030763)	TLR9 (ENSSBOG00000030530)	TWF2 (ENSSBOG00000023295)	PPM1M (ENSSBOG00000031764)	WDR82 (ENSSBOG00000014681)	GLYCTK (ENSSBOG00000028319)	DNAH1 (ENSSBOG00000020440)	ENSSBOG00000033108	BAP1 (ENSSBOG00000018762)	PHF7 (ENSSBOG00000016729)	SEMA3G (ENSSBOG00000028783)	TNNC1 (ENSSBOG00000034266)	NISCH (ENSSBOG00000027508) #21	STAB1 (ENSSBOG00000032779) #22	NT5DC2 (ENSSBOG00000027090)	UQCC5 (ENSSBOG00000023757)	PBRM1 (ENSSBOG00000021866)	GNL3 (ENSSBOG00000019990)	GLT8D1 (ENSSBOG00000024181)	SPCS1 (ENSSBOG00000030585)	ENSSBOG00000032590	ITIH1 (ENSSBOG00000014653)	ITIH3 (ENSSBOG00000032406)	ITIH4 (ENSSBOG00000027138)	MUSTN1 (ENSSBOG00000028261)	STIMATE (ENSSBOG00000033443)	SFMBT1 (ENSSBOG00000031463)	RFT1 (ENSSBOG00000035256)	PRKCD (ENSSBOG00000029760)
Marmoset	MODERN SPECIES	6	ENSCJAG00000077523	DUSP7 (ENSCJAG00000038360)	POC1A (ENSCJAG00000005972)	ALAS1 (ENSCJAG00000006000)	TLR9 (ENSCJAG00000006069)	TWF2 (ENSCJAG00000048516)	PPM1M (ENSCJAG00000006090)	WDR82 (ENSCJAG00000047163)	GLYCTK (ENSCJAG00000006155)	DNAH1 (ENSCJAG00000006182)	BAP1 (ENSCJAG00000006322)	PHF7 (ENSCJAG00000006361)	SEMA3G (ENSCJAG00000006415)	TNNC1 (ENSCJAG00000006439)	NISCH (ENSCJAG00000006457) #21	STAB1 (ENSCJAG00000006484) #22	NT5DC2 (ENSCJAG00000006610)	UQCC5 (ENSCJAG00000075056)	PBRM1 (ENSCJAG00000006635)	GNL3 (ENSCJAG00000006864)	GLT8D1 (ENSCJAG00000006883)	SPCS1 (ENSCJAG00000006947)	NEK4 (ENSCJAG00000006955)	ITIH1 (ENSCJAG00000048486)	ITIH3 (ENSCJAG00000006989)	ITIH4 (ENSCJAG00000007045)	MUSTN1 (ENSCJAG00000087173)	STIMATE (ENSCJAG00000031804)	SFMBT1 (ENSCJAG00000007089)	RFT1 (ENSCJAG00000007179)	PRKCD (ENSCJAG00000007197)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	553	POC1A (ENSANAG00000030897)	ALAS1 (ENSANAG00000023806)	TLR9 (ENSANAG00000028901)	TWF2 (ENSANAG00000022502)	PPM1M (ENSANAG00000035341)	WDR82 (ENSANAG00000038110)	GLYCTK (ENSANAG00000031147)	DNAH1 (ENSANAG00000031638)	ENSANAG00000032200	ENSANAG00000025082	PHF7 (ENSANAG00000021364)	ENSANAG00000026339	SEMA3G (ENSANAG00000026752)	TNNC1 (ENSANAG00000022710)	NISCH (ENSANAG00000022782) #21	STAB1 (ENSANAG00000031871) #22	NT5DC2 (ENSANAG00000005150)	UQCC5 (ENSANAG00000007283)	PBRM1 (ENSANAG00000034205)	ENSANAG00000032255	GNL3 (ENSANAG00000033209)	GLT8D1 (ENSANAG00000026279)	SPCS1 (ENSANAG00000031409)	NEK4 (ENSANAG00000021460)	ENSANAG00000030360	ITIH1 (ENSANAG00000036541)	ITIH3 (ENSANAG00000025494)	ITIH4 (ENSANAG00000021480)	MUSTN1 (ENSANAG00000037491)	STIMATE (ENSANAG00000038396)	SFMBT1 (ENSANAG00000036375)
Tarsier	MODERN SPECIES	3733									ENSTSYG00000033645	BAP1 (ENSTSYG00000013738)	ENSTSYG00000028289	PHF7 (ENSTSYG00000013760)	SEMA3G (ENSTSYG00000029536)	TNNC1 (ENSTSYG00000035388)	NISCH (ENSTSYG00000032320) #21	STAB1 (ENSTSYG00000012020) #22	NT5DC2 (ENSTSYG00000029481)	SMIM4 (ENSTSYG00000032069)	PBRM1 (ENSTSYG00000006795)	ENSTSYG00000029785	GNL3 (ENSTSYG00000006851)	GLT8D1 (ENSTSYG00000006853)	SPCS1 (ENSTSYG00000033206)	NEK4 (ENSTSYG00000006316)	ITIH1 (ENSTSYG00000003497)	ITIH3 (ENSTSYG00000003515)	ITIH4 (ENSTSYG00000028944)	MUSTN1 (ENSTSYG00000030888)	STIMATE (ENSTSYG00000032227)	SFMBT1 (ENSTSYG00000012300)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000018566.h	ENSGT00390000011390
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00910000146856	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT01010000226680	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000018566.h	ENSGT00390000011390
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	50	DUSP7 (ENSPCOG00000026200)	POC1A (ENSPCOG00000012625)	ALAS1 (ENSPCOG00000028000)	TLR9 (ENSPCOG00000014709)	TWF2 (ENSPCOG00000017085)	PPM1M (ENSPCOG00000020890)	WDR82 (ENSPCOG00000013388)	GLYCTK (ENSPCOG00000017281)	DNAH1 (ENSPCOG00000025308)	ENSPCOG00000014931	BAP1 (ENSPCOG00000026505)	ENSPCOG00000014149	SEMA3G (ENSPCOG00000015103)	TNNC1 (ENSPCOG00000002063)	NISCH (ENSPCOG00000019182) #21	STAB1 (ENSPCOG00000013257) #22	UQCC5 (ENSPCOG00000019542)	NT5DC2 (ENSPCOG00000013714)	PBRM1 (ENSPCOG00000028346)	ENSPCOG00000021067	GNL3 (ENSPCOG00000026637)	GLT8D1 (ENSPCOG00000024462)	SPCS1 (ENSPCOG00000027934)	NEK4 (ENSPCOG00000026529)	ITIH1 (ENSPCOG00000026867)	ITIH3 (ENSPCOG00000020530)	ITIH4 (ENSPCOG00000028295)	MUSTN1 (ENSPCOG00000027125)	STIMATE (ENSPCOG00000010959)	SFMBT1 (ENSPCOG00000016220)	ENSPCOG00000027141
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	121	ACY1 (ENSPSMG00000006695)	DUSP7 (ENSPSMG00000006439)	POC1A (ENSPSMG00000006396)	ALAS1 (ENSPSMG00000006328)	TLR9 (ENSPSMG00000006301)	TWF2 (ENSPSMG00000006269)	PPM1M (ENSPSMG00000006238)	WDR82 (ENSPSMG00000006205)	GLYCTK (ENSPSMG00000006196)	DNAH1 (ENSPSMG00000006181)	BAP1 (ENSPSMG00000006130)	PHF7 (ENSPSMG00000006086)	SEMA3G (ENSPSMG00000006031)	TNNC1 (ENSPSMG00000006022)	NISCH (ENSPSMG00000005935) #21	STAB1 (ENSPSMG00000005864) #22	ENSPSMG00000005841	ENSPSMG00000005791	PBRM1 (ENSPSMG00000005419)	GNL3 (ENSPSMG00000005179)	GLT8D1 (ENSPSMG00000005150)	SPCS1 (ENSPSMG00000005117)	NEK4 (ENSPSMG00000005109)	ITIH1 (ENSPSMG00000005089)	ITIH3 (ENSPSMG00000005023)	ITIH4 (ENSPSMG00000004821)	MUSTN1 (ENSPSMG00000004716)	STIMATE (ENSPSMG00000004711)	SFMBT1 (ENSPSMG00000004664)	RFT1 (ENSPSMG00000004562)	PRKCD (ENSPSMG00000004497)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	5	ENSMICG00000045877	DUSP7 (ENSMICG00000002706)	POC1A (ENSMICG00000002709)	ALAS1 (ENSMICG00000002714)	TLR9 (ENSMICG00000002716)	TWF2 (ENSMICG00000002719)	ENSMICG00000002725	WDR82 (ENSMICG00000002732)	GLYCTK (ENSMICG00000030257)	DNAH1 (ENSMICG00000002743)	BAP1 (ENSMICG00000002801)	PHF7 (ENSMICG00000002810)	SEMA3G (ENSMICG00000002820)	TNNC1 (ENSMICG00000002829)	NISCH (ENSMICG00000002831) #21	STAB1 (ENSMICG00000002842) #22	NT5DC2 (ENSMICG00000028554)	UQCC5 (ENSMICG00000042921)	PBRM1 (ENSMICG00000002878)	GNL3 (ENSMICG00000016373)	GLT8D1 (ENSMICG00000016385)	SPCS1 (ENSMICG00000045517)	NEK4 (ENSMICG00000016394)	ITIH1 (ENSMICG00000013651)	ITIH3 (ENSMICG00000013675)	ITIH4 (ENSMICG00000012130)	MUSTN1 (ENSMICG00000026959)	STIMATE (ENSMICG00000042243)	SFMBT1 (ENSMICG00000006897)	ENSMICG00000031620	RFT1 (ENSMICG00000010892)
Bushbaby	MODERN SPECIES	147	ACY1 (ENSOGAG00000014615)	ENSOGAG00000013766	ENSOGAG00000032809	POC1A (ENSOGAG00000032245)	ALAS1 (ENSOGAG00000016020)	TLR9 (ENSOGAG00000016022)	PPM1M (ENSOGAG00000016027)	WDR82 (ENSOGAG00000016032)	GLYCTK (ENSOGAG00000016035)	DNAH1 (ENSOGAG00000012038)	ENSOGAG00000012056	PHF7 (ENSOGAG00000012060)	SEMA3G (ENSOGAG00000004073)	TNNC1 (ENSOGAG00000004074)	NISCH (ENSOGAG00000004076) #21	STAB1 (ENSOGAG00000004077) #22	NT5DC2 (ENSOGAG00000004086)	UQCC5 (ENSOGAG00000004088)	PBRM1 (ENSOGAG00000004090)	GNL3 (ENSOGAG00000004101)	GLT8D1 (ENSOGAG00000004105)	SPCS1 (ENSOGAG00000004106)	NEK4 (ENSOGAG00000004108)	ITIH1 (ENSOGAG00000004111)	ITIH3 (ENSOGAG00000004118)	ITIH4 (ENSOGAG00000004121)	STIMATE (ENSOGAG00000033993)	SFMBT1 (ENSOGAG00000004126)	RFT1 (ENSOGAG00000003296)	PRKCD (ENSOGAG00000004030)	TKT (ENSOGAG00000016911)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.d	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Glires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.d	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Rabbit	MODERN SPECIES	20	ENSOCUG00000002074	ENSOCUG00000002075	POC1A (ENSOCUG00000002080)	ALAS1 (ENSOCUG00000008551)	TLR9 (ENSOCUG00000024735)	TWF2 (ENSOCUG00000021993)	PPM1M (ENSOCUG00000008558)	WDR82 (ENSOCUG00000008564)	GLYCTK (ENSOCUG00000007847)	DNAH1 (ENSOCUG00000007895)	BAP1 (ENSOCUG00000007946)	PHF7 (ENSOCUG00000007957)	SEMA3G (ENSOCUG00000007969)	TNNC1 (ENSOCUG00000007983)	NISCH (ENSOCUG00000007987) #21	STAB1 (ENSOCUG00000028026) #22	NT5DC2 (ENSOCUG00000021457)	UQCC5 (ENSOCUG00000027067)	PBRM1 (ENSOCUG00000009829)	GNL3 (ENSOCUG00000009841)	GLT8D1 (ENSOCUG00000009849)	SPCS1 (ENSOCUG00000003296)	NEK4 (ENSOCUG00000009854)	ITIH1 (ENSOCUG00000011067)	ITIH3 (ENSOCUG00000011077)	ITIH4 (ENSOCUG00000011089)	MUSTN1 (ENSOCUG00000037528)	STIMATE (ENSOCUG00000024197)	SFMBT1 (ENSOCUG00000009822)	ENSOCUG00000026649	RFT1 (ENSOCUG00000004546)
Pika	MODERN SPECIES	384	ABHD14A (ENSOPRG00000008792)	ACY1 (ENSOPRG00000008804)	RPL29 (ENSOPRG00000008821)	POC1A (ENSOPRG00000008831)	ALAS1 (ENSOPRG00000008842)	ENSOPRG00000008854	PPM1M (ENSOPRG00000008857)	WDR82 (ENSOPRG00000008864)	GLYCTK (ENSOPRG00000008880)	DNAH1 (ENSOPRG00000008889)	BAP1 (ENSOPRG00000009025)	PHF7 (ENSOPRG00000009048)	SEMA3G (ENSOPRG00000009063)	TNNC1 (ENSOPRG00000009108)	NISCH (ENSOPRG00000009121) #21	STAB1 (ENSOPRG00000009159) #22	NT5DC2 (ENSOPRG00000009277)	UQCC5 (ENSOPRG00000009300)	PBRM1 (ENSOPRG00000009312)	GNL3 (ENSOPRG00000009356)	GLT8D1 (ENSOPRG00000009373)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00910000148052	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00900000143613	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00900000143613	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00900000143613	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000160808	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160808	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	15						ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156914	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537.z	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Prairie vole	MODERN SPECIES	14	Anxa11 (ENSMOCG00000022761)	Plac9 (ENSMOCG00000022874)	Tmem254 (ENSMOCG00000008162)	Duxbl1 (ENSMOCG00000009549)	Eaf1 (ENSMOCG00000016000)	Mettl6 (ENSMOCG00000017391)	Sh3bp5 (ENSMOCG00000019047)	Capn7 (ENSMOCG00000020566)	Dnah1 (ENSMOCG00000007684)	Bap1 (ENSMOCG00000013939)	Phf7 (ENSMOCG00000016623)	Sema3g (ENSMOCG00000005022)	Tnnc1 (ENSMOCG00000002938)	ENSMOCG00000017988 #21	ENSMOCG00000012665 #21	Stab1 (ENSMOCG00000019424) #22	Nt5dc2 (ENSMOCG00000014543)	Uqcc5 (ENSMOCG00000017867)	Pbrm1 (ENSMOCG00000006150)	Gnl3 (ENSMOCG00000018437)	Glt8d1 (ENSMOCG00000009254)	Spcs1 (ENSMOCG00000013875)	ENSMOCG00000016349	Itih1 (ENSMOCG00000004041)	Itih3 (ENSMOCG00000003549)	Itih4 (ENSMOCG00000020896)	Mustn1 (ENSMOCG00000000384)	Stimate (ENSMOCG00000005091)	Sfmbt1 (ENSMOCG00000022372)	Rft1 (ENSMOCG00000014616)	Prkcd (ENSMOCG00000019091)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	22	Tmem254 (ENSPEMG00000008045)	ENSPEMG00000016400	Duxbl1 (ENSPEMG00000024340)	ENSPEMG00000030014	ENSPEMG00000025547	Eaf1 (ENSPEMG00000015934)	Mettl6 (ENSPEMG00000006627)	Sh3bp5 (ENSPEMG00000010547)	Capn7 (ENSPEMG00000015264)	Dnah1 (ENSPEMG00000009939)	Bap1 (ENSPEMG00000004441)	Phf7 (ENSPEMG00000018721)	Sema3g (ENSPEMG00000013600)	Tnnc1 (ENSPEMG00000012039)	Nisch (ENSPEMG00000003312) #21	ENSPEMG00000015779 #22	Nt5dc2 (ENSPEMG00000017661)	Uqcc5 (ENSPEMG00000024923)	Pbrm1 (ENSPEMG00000011659)	Gnl3 (ENSPEMG00000017577)	Glt8d1 (ENSPEMG00000013268)	Spcs1 (ENSPEMG00000007574)	Nek4 (ENSPEMG00000011780)	Itih1 (ENSPEMG00000007666)	Itih3 (ENSPEMG00000011898)	Itih4 (ENSPEMG00000008343)	Mustn1 (ENSPEMG00000028738)	Stimate (ENSPEMG00000009634)	Sfmbt1 (ENSPEMG00000002946)	Rft1 (ENSPEMG00000009645)	Prkcd (ENSPEMG00000017874)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	47						ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	76	Hacl1 (ENSCGRG00001023591)	Btd (ENSCGRG00001020340)	Ankrd28 (ENSCGRG00001009527)	ENSCGRG00001006788	Galnt15 (ENSCGRG00001018867)	ENSCGRG00001019909	Mettl6 (ENSCGRG00001000127)	Sh3bp5 (ENSCGRG00001011458)	Capn7 (ENSCGRG00001019135)	Dnah1 (ENSCGRG00001004021)	Bap1 (ENSCGRG00001000294)	Phf7 (ENSCGRG00001022887)	Sema3g (ENSCGRG00001018192)	Tnnc1 (ENSCGRG00001012338)	Nisch (ENSCGRG00001023268) #21	Stab1 (ENSCGRG00001006175) #22	Nt5dc2 (ENSCGRG00001023862)	Uqcc5 (ENSCGRG00001014406)	Pbrm1 (ENSCGRG00001010538)	Gnl3 (ENSCGRG00001020950)	Glt8d1 (ENSCGRG00001005981)	Spcs1 (ENSCGRG00001010942)	Nek4 (ENSCGRG00001021020)	Itih1 (ENSCGRG00001012316)	Itih3 (ENSCGRG00001023563)	Itih4 (ENSCGRG00001000470)	Mustn1 (ENSCGRG00001011979)	Stimate (ENSCGRG00001017347)	Sfmbt1 (ENSCGRG00001000631)	Rft1 (ENSCGRG00001004189)	Prkcd (ENSCGRG00001023705)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	803	Anxa11 (ENSMAUG00000009705)	Plac9 (ENSMAUG00000001932)	Tmem254 (ENSMAUG00000010787)	ENSMAUG00000015071	ENSMAUG00000009139	ENSMAUG00000007867	Sh3bp5 (ENSMAUG00000010671)	Capn7 (ENSMAUG00000019335)	ENSMAUG00000013275	ENSMAUG00000016506	Bap1 (ENSMAUG00000013459)	Phf7 (ENSMAUG00000014188)	Sema3g (ENSMAUG00000000962)	Tnnc1 (ENSMAUG00000018023)	Nisch (ENSMAUG00000011330) #21	Stab1 (ENSMAUG00000001222) #22	Nt5dc2 (ENSMAUG00000021063)	Uqcc5 (ENSMAUG00000019664)	ENSMAUG00000004373	ENSMAUG00000014706	Gnl3 (ENSMAUG00000020178)	Glt8d1 (ENSMAUG00000020504)	Spcs1 (ENSMAUG00000000391)	ENSMAUG00000011939	Itih3 (ENSMAUG00000016750)	Itih4 (ENSMAUG00000019835)	Mustn1 (ENSMAUG00000004136)	Stimate (ENSMAUG00000021150)	Sfmbt1 (ENSMAUG00000005395)	Rft1 (ENSMAUG00000002114)	Prkcd (ENSMAUG00000021435)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160808	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Mus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160808	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160808	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160808	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Mouse	MODERN SPECIES	5	Galnt15 (ENSMUSG00000021903)	Ankrd28 (ENSMUSG00000014496)	Btd (ENSMUSG00000021900)	Hacl1 (ENSMUSG00000021884)	Colq (ENSMUSG00000057606)	Eaf1 (ENSMUSG00000021890)	Mettl6 (ENSMUSG00000021891)	Sh3bp5 (ENSMUSG00000021892)	Capn7 (ENSMUSG00000021893)	Dnah1 (ENSMUSG00000019027)	Bap1 (ENSMUSG00000021901)	Phf7 (ENSMUSG00000021902)	Sema3g (ENSMUSG00000021904)	Tnnc1 (ENSMUSG00000091898)	Nisch (ENSMUSG00000021910) #21	Stab1 (ENSMUSG00000042286) #22	Nt5dc2 (ENSMUSG00000071547)	Uqcc5 (ENSMUSG00000058351)	Pbrm1 (ENSMUSG00000042323)	Gnl3 (ENSMUSG00000042354)	Glt8d1 (ENSMUSG00000021916)	Spcs1 (ENSMUSG00000021917)	Nek4 (ENSMUSG00000021918)	Itih1 (ENSMUSG00000006529)	Itih3 (ENSMUSG00000006522)	Itih4 (ENSMUSG00000021922)	Mustn1 (ENSMUSG00000042485)	Stimate (ENSMUSG00000006526)	Sfmbt1 (ENSMUSG00000006527)	Rft1 (ENSMUSG00000052395)	Prkcd (ENSMUSG00000021948)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00900000143613	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
spretus	MODERN SPECIES	5	Galnt15 (MGP_SPRETEiJ_G0019967)	Ankrd28 (MGP_SPRETEiJ_G0019966)	Btd (MGP_SPRETEiJ_G0019965)	Hacl1 (MGP_SPRETEiJ_G0019964)	Colq (MGP_SPRETEiJ_G0019963)	Eaf1 (MGP_SPRETEiJ_G0019962)	Mettl6 (MGP_SPRETEiJ_G0019961)	Sh3bp5 (MGP_SPRETEiJ_G0019960)	Capn7 (MGP_SPRETEiJ_G0019959)	Dnah1 (MGP_SPRETEiJ_G0019958)	Bap1 (MGP_SPRETEiJ_G0019957)	Phf7 (MGP_SPRETEiJ_G0019956)	Sema3g (MGP_SPRETEiJ_G0019955)	Tnnc1 (MGP_SPRETEiJ_G0019954)	Nisch (MGP_SPRETEiJ_G0019953) #21	Stab1 (MGP_SPRETEiJ_G0019952) #22	Nt5dc2 (MGP_SPRETEiJ_G0019951)	Uqcc5 (MGP_SPRETEiJ_G0019950)	Pbrm1 (MGP_SPRETEiJ_G0019949)	Gnl3 (MGP_SPRETEiJ_G0019948)	Glt8d1 (MGP_SPRETEiJ_G0019947)	Spcs1 (MGP_SPRETEiJ_G0019946)	Nek4 (MGP_SPRETEiJ_G0019945)	Itih1 (MGP_SPRETEiJ_G0019944)	Itih3 (MGP_SPRETEiJ_G0019943)	Itih4 (MGP_SPRETEiJ_G0019942)	Mustn1 (MGP_SPRETEiJ_G0019941)	Stimate (MGP_SPRETEiJ_G0019940)	Sfmbt1 (MGP_SPRETEiJ_G0019939)	Rft1 (MGP_SPRETEiJ_G0019938)	Prkcd (MGP_SPRETEiJ_G0019937)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	275								Sh3bp5 (ENSMSIG00000029705)	Capn7 (ENSMSIG00000029694)	Dnah1 (ENSMSIG00000029672)	Bap1 (ENSMSIG00000029652)	Phf7 (ENSMSIG00000029633)	Sema3g (ENSMSIG00000029629)	Tnnc1 (ENSMSIG00000029621)	Nisch (ENSMSIG00000029583) #21	Stab1 (ENSMSIG00000029419) #22	Nt5dc2 (ENSMSIG00000029409)	ENSMSIG00000029407	Pbrm1 (ENSMSIG00000029168)	Gnl3 (ENSMSIG00000029154)	Glt8d1 (ENSMSIG00000029151)	ENSMSIG00000029143	Nek4 (ENSMSIG00000029101)	Itih1 (ENSMSIG00000029071)	Itih3 (ENSMSIG00000029037)	Itih4 (ENSMSIG00000028937)	Mustn1 (ENSMSIG00000028924)	Stimate (ENSMSIG00000028915)	Sfmbt1 (ENSMSIG00000028879)	Rft1 (ENSMSIG00000028844)	Prkcd (ENSMSIG00000028700)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	5	Galnt15 (MGP_CAROLIEiJ_G0019082)	Ankrd28 (MGP_CAROLIEiJ_G0019081)	Btd (MGP_CAROLIEiJ_G0019080)	Hacl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019079)	Colq (MGP_CAROLIEiJ_G0019078)	Eaf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019077)	Mettl6 (MGP_CAROLIEiJ_G0019076)	Sh3bp5 (MGP_CAROLIEiJ_G0019075)	Capn7 (MGP_CAROLIEiJ_G0019074)	Dnah1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019073)	Bap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019072)	Phf7 (MGP_CAROLIEiJ_G0019071)	Sema3g (MGP_CAROLIEiJ_G0019070)	Tnnc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019069)	Nisch (MGP_CAROLIEiJ_G0019068) #21	Stab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019067) #22	Nt5dc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019066)	MGP_CAROLIEiJ_G0019065	Pbrm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019064)	Gnl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019063)	Glt8d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019062)	Spcs1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019061)	Nek4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019060)	Itih1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019059)	Itih3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019058)	Itih4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019057)	Mustn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019056)	Stimate (MGP_CAROLIEiJ_G0019055)	Sfmbt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019054)	Rft1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019053)	Prkcd (MGP_CAROLIEiJ_G0019052)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	21	Galnt15 (MGP_PahariEiJ_G0030099)	Ankrd28 (MGP_PahariEiJ_G0030098)	Btd (MGP_PahariEiJ_G0030097)	Hacl1 (MGP_PahariEiJ_G0030096)	Colq (MGP_PahariEiJ_G0030095)	Eaf1 (MGP_PahariEiJ_G0030094)	Mettl6 (MGP_PahariEiJ_G0030093)	Sh3bp5 (MGP_PahariEiJ_G0030092)	Capn7 (MGP_PahariEiJ_G0030091)	Dnah1 (MGP_PahariEiJ_G0030090)	Bap1 (MGP_PahariEiJ_G0030089)	Phf7 (MGP_PahariEiJ_G0030088)	Sema3g (MGP_PahariEiJ_G0030087)	Tnnc1 (MGP_PahariEiJ_G0030086)	Nisch (MGP_PahariEiJ_G0030085) #21	Stab1 (MGP_PahariEiJ_G0030084) #22	MGP_PahariEiJ_G0030083	MGP_PahariEiJ_G0030082	Pbrm1 (MGP_PahariEiJ_G0030081)	Gnl3 (MGP_PahariEiJ_G0030080)	Glt8d1 (MGP_PahariEiJ_G0030079)	Spcs1 (MGP_PahariEiJ_G0030078)	Nek4 (MGP_PahariEiJ_G0030077)	Itih1 (MGP_PahariEiJ_G0030076)	Itih3 (MGP_PahariEiJ_G0030075)	Itih4 (MGP_PahariEiJ_G0030074)	Mustn1 (MGP_PahariEiJ_G0030073)	Stimate (MGP_PahariEiJ_G0030072)	Sfmbt1 (MGP_PahariEiJ_G0030071)	Rft1 (MGP_PahariEiJ_G0030070)	Prkcd (MGP_PahariEiJ_G0030069)
Rat	MODERN SPECIES	7	Ankrd28 (ENSRNOG00000019697)	Btd (ENSRNOG00000019656)	Hacl1 (ENSRNOG00000019630)	Colq (ENSRNOG00000019615)	Eaf1 (ENSRNOG00000019559)	Mettl6 (ENSRNOG00000052391)	Capn7 (ENSRNOG00000019273)	RGD1564325 (ENSRNOG00000046517)	Dnah1 (ENSRNOG00000026914)	Bap1 (ENSRNOG00000019097)	Phf7 (ENSRNOG00000018996)	Sema3g (ENSRNOG00000018952)	Tnnc1 (ENSRNOG00000018943)	ENSRNOG00000066386	Nisch (ENSRNOG00000018823) #21	Stab1 (ENSRNOG00000018434) #22	Nt5dc2 (ENSRNOG00000018358)	Uqcc5 (ENSRNOG00000068020)	Pbrm1 (ENSRNOG00000028227)	Gnl3 (ENSRNOG00000028461)	Glt8d1 (ENSRNOG00000018179)	Spcs1 (ENSRNOG00000018075)	Nek4 (ENSRNOG00000017997)	Itih1 (ENSRNOG00000033386)	Itih3 (ENSRNOG00000017689)	Itih4 (ENSRNOG00000017381)	Mustn1 (ENSRNOG00000017369)	Stimate (ENSRNOG00000017051)	Sfmbt1 (ENSRNOG00000016645)	Rft1 (ENSRNOG00000021805)	Prkcd (ENSRNOG00000016346)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1602										Dnah1 (ENSNGAG00000006892)	Bap1 (ENSNGAG00000013307)	Phf7 (ENSNGAG00000017885)	Sema3g (ENSNGAG00000015991)	Tnnc1 (ENSNGAG00000010755)	Nisch (ENSNGAG00000020164) #21	Stab1 (ENSNGAG00000016620) #22	ENSNGAG00000008066	ENSNGAG00000010406	Pbrm1 (ENSNGAG00000020024)	Gnl3 (ENSNGAG00000017202)	Glt8d1 (ENSNGAG00000020563)	Spcs1 (ENSNGAG00000020882)	ENSNGAG00000010678	Itih1 (ENSNGAG00000012435)	Itih3 (ENSNGAG00000013514)	Itih4 (ENSNGAG00000001211)	Mustn1 (ENSNGAG00000014653)	Stimate (ENSNGAG00000015695)	Sfmbt1 (ENSNGAG00000017367)	ENSNGAG00000019039	Prkcd (ENSNGAG00000000420)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	82	Cadps (ENSJJAG00000012695)	Synpr (ENSJJAG00000014840)	Sntn (ENSJJAG00000015141)	Cdhr18 (ENSJJAG00000015546)	Thoc7 (ENSJJAG00000016662)	Atxn7 (ENSJJAG00000018348)	Psmd6 (ENSJJAG00000020880)	ENSJJAG00000017345	Or2t35 (ENSJJAG00000014412)	Dnah1 (ENSJJAG00000011990)	Bap1 (ENSJJAG00000024249)	Phf7 (ENSJJAG00000001008)	Sema3g (ENSJJAG00000004734)	Tnnc1 (ENSJJAG00000009720)	Nisch (ENSJJAG00000013344) #21	Stab1 (ENSJJAG00000000307) #22	Nt5dc2 (ENSJJAG00000001193)	ENSJJAG00000005889	Pbrm1 (ENSJJAG00000019284)	Gnl3 (ENSJJAG00000021993)	Glt8d1 (ENSJJAG00000021166)	Spcs1 (ENSJJAG00000009161)	ENSJJAG00000012316	Itih1 (ENSJJAG00000018511)	Itih3 (ENSJJAG00000001642)	ENSJJAG00000009920	Lrrc3b (ENSJJAG00000010278)	ENSJJAG00000010990	Oxsm (ENSJJAG00000012817)	Ngly1 (ENSJJAG00000000939)	Top2b (ENSJJAG00000005440)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	451								ENSDORG00000023404	Capn7 (ENSDORG00000001849)	Dnah1 (ENSDORG00000001520)	Bap1 (ENSDORG00000001539)	Phf7 (ENSDORG00000001543)	Sema3g (ENSDORG00000003822)	Tnnc1 (ENSDORG00000003825)	Nisch (ENSDORG00000003827) #21	Stab1 (ENSDORG00000003832) #22	Nt5dc2 (ENSDORG00000003838)	ENSDORG00000003840	Pbrm1 (ENSDORG00000003842)	Gnl3 (ENSDORG00000000674)	Glt8d1 (ENSDORG00000000675)	Spcs1 (ENSDORG00000025433)	ENSDORG00000000679	Itih1 (ENSDORG00000009140)	Itih3 (ENSDORG00000009143)	Itih4 (ENSDORG00000009145)	Mustn1 (ENSDORG00000024822)	Stimate (ENSDORG00000009146)	Sfmbt1 (ENSDORG00000009149)	Rft1 (ENSDORG00000008359)	Prkcd (ENSDORG00000014718)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00950000182908.C	ENSGT00910000148052	ENSGT00390000013823.a	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225	ENSGT00390000013823.a.d	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	7	ENSSVLG00005023010	ABHD6 (ENSSVLG00005022978)	ENSSVLG00005022958	HACL1 (ENSSVLG00005022883)	COLQ (ENSSVLG00005022341)	EAF1 (ENSSVLG00005022245)	METTL6 (ENSSVLG00005022187)	SH3BP5 (ENSSVLG00005022124)	CAPN7 (ENSSVLG00005022021)	DNAH1 (ENSSVLG00005021474)	BAP1 (ENSSVLG00005021396)	PHF7 (ENSSVLG00005021215)	SEMA3G (ENSSVLG00005021027)	TNNC1 (ENSSVLG00005020999)	NISCH (ENSSVLG00005020926) #21	STAB1 (ENSSVLG00005020376) #22	NT5DC2 (ENSSVLG00005020258)	UQCC5 (ENSSVLG00005020149)	PBRM1 (ENSSVLG00005019876)	GNL3 (ENSSVLG00005019572)	GLT8D1 (ENSSVLG00005019481)	SPCS1 (ENSSVLG00005019356)	NEK4 (ENSSVLG00005019127)	ITIH1 (ENSSVLG00005018681)	ITIH3 (ENSSVLG00005018269)	ITIH4 (ENSSVLG00005017991)	MUSTN1 (ENSSVLG00005017922)	STIMATE (ENSSVLG00005017898)	SFMBT1 (ENSSVLG00005017860)	RFT1 (ENSSVLG00005017758)	PRKCD (ENSSVLG00005017697)
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00510000048121.a	ENSGT00510000047225	ENSGT00390000013823.a.d	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000047225	ENSGT00390000013823.a.d	ENSGT00940000156802	ENSGT00940000157248	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Squirrel	MODERN SPECIES	73	HTD2 (ENSSTOG00000024837)	ABHD6 (ENSSTOG00000015390)	ENSSTOG00000015008	HACL1 (ENSSTOG00000020242)	COLQ (ENSSTOG00000031231)	EAF1 (ENSSTOG00000014978)	METTL6 (ENSSTOG00000014974)	SH3BP5 (ENSSTOG00000014966)	CAPN7 (ENSSTOG00000014949)	DNAH1 (ENSSTOG00000010134)	BAP1 (ENSSTOG00000010206)	PHF7 (ENSSTOG00000000317)	SEMA3G (ENSSTOG00000000321)	TNNC1 (ENSSTOG00000000324)	ENSSTOG00000000327 #21	STAB1 (ENSSTOG00000000330) #22	NT5DC2 (ENSSTOG00000027067)	UQCC5 (ENSSTOG00000000350)	PBRM1 (ENSSTOG00000000351)	GNL3 (ENSSTOG00000000356)	GLT8D1 (ENSSTOG00000000360)	SPCS1 (ENSSTOG00000000362)	NEK4 (ENSSTOG00000000363)	ITIH1 (ENSSTOG00000000370)	ITIH3 (ENSSTOG00000000373)	ITIH4 (ENSSTOG00000000377)	MUSTN1 (ENSSTOG00000024851)	STIMATE (ENSSTOG00000021640)	ENSSTOG00000031045	SFMBT1 (ENSSTOG00000000384)	RFT1 (ENSSTOG00000004551)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000017724.a.a.d	ENSGT00940000157248	ENSGT00940000156802	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	28	PXK (ENSHGLG00000003319)	HTD2 (ENSHGLG00000047381)	ABHD6 (ENSHGLG00000043839)	ENSHGLG00000006022	ENSHGLG00000042411	COLQ (ENSHGLG00000005340)	ENSHGLG00000003574	ENSHGLG00000002882	CAPN7 (ENSHGLG00000018881)	ENSHGLG00000015068	ENSHGLG00000013658	PHF7 (ENSHGLG00000015052)	SEMA3G (ENSHGLG00000048828)	TNNC1 (ENSHGLG00000034758)	NISCH (ENSHGLG00000004536) #21	STAB1 (ENSHGLG00000003794) #22	NT5DC2 (ENSHGLG00000003527)	UQCC5 (ENSHGLG00000003313)	PBRM1 (ENSHGLG00000014864)	ENSHGLG00000018299	GLT8D1 (ENSHGLG00000031909)	SPCS1 (ENSHGLG00000035120)	NEK4 (ENSHGLG00000019429)	ITIH1 (ENSHGLG00000019403)	ITIH3 (ENSHGLG00000010431)	ITIH4 (ENSHGLG00000007787)	MUSTN1 (ENSHGLG00000031988)	STIMATE (ENSHGLG00000043251)	SFMBT1 (ENSHGLG00000009343)	ENSHGLG00000041965	RFT1 (ENSHGLG00000007981)
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000017724.a.a.d	ENSGT00940000157248	ENSGT00940000156802	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Guinea pig	MODERN SPECIES		HTD2 (ENSCPOG00000036094)	RPP14 (ENSCPOG00000004281)	ABHD6 (ENSCPOG00000037337)	METTL6 (ENSCPOG00000037082)	EAF1 (ENSCPOG00000031143)	COLQ (ENSCPOG00000002476)	HACL1 (ENSCPOG00000024203)	SH3BP5 (ENSCPOG00000015586)	CAPN7 (ENSCPOG00000015583)	DNAH1 (ENSCPOG00000003223)	BAP1 (ENSCPOG00000003241)	PHF7 (ENSCPOG00000003251)	SEMA3G (ENSCPOG00000004316)	TNNC1 (ENSCPOG00000003265)	NISCH (ENSCPOG00000003266) #21	STAB1 (ENSCPOG00000021618) #22	NT5DC2 (ENSCPOG00000007433)	UQCC5 (ENSCPOG00000036380)	PBRM1 (ENSCPOG00000000280)	GNL3 (ENSCPOG00000000282)	GLT8D1 (ENSCPOG00000000283)	SPCS1 (ENSCPOG00000033867)	ENSCPOG00000000284	ITIH1 (ENSCPOG00000000285)	ITIH3 (ENSCPOG00000033334)	ITIH4 (ENSCPOG00000000287)	MUSTN1 (ENSCPOG00000040259)	STIMATE (ENSCPOG00000033900)	SFMBT1 (ENSCPOG00000008585)	RFT1 (ENSCPOG00000010793)	PRKCD (ENSCPOG00000011547)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00530000065109	ENSGT00510000048121	ENSGT00510000047225	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000017724.a.a.d	ENSGT00940000157248	ENSGT00940000156802	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	84	METTL6 (ENSODEG00000008650)	EAF1 (ENSODEG00000008752)	COLQ (ENSODEG00000009333)	HACL1 (ENSODEG00000007866)	ENSODEG00000019451	SH3BP5 (ENSODEG00000013984)	CAPN7 (ENSODEG00000009154)	ENSODEG00000008798	DNAH1 (ENSODEG00000008443)	BAP1 (ENSODEG00000008927)	PHF7 (ENSODEG00000008416)	SEMA3G (ENSODEG00000010653)	ENSODEG00000010480	NISCH (ENSODEG00000007768) #21	ENSODEG00000007867 #22	ENSODEG00000008276 #22	NT5DC2 (ENSODEG00000008156)	UQCC5 (ENSODEG00000007436)	ENSODEG00000019639	ENSODEG00000009139	PBRM1 (ENSODEG00000008265)	GNL3 (ENSODEG00000009492)	ENSODEG00000007760	SPCS1 (ENSODEG00000007651)	ENSODEG00000007472	ITIH1 (ENSODEG00000007678)	ITIH3 (ENSODEG00000011594)	MUSTN1 (ENSODEG00000007782)	STIMATE (ENSODEG00000007556)	SFMBT1 (ENSODEG00000008195)	RFT1 (ENSODEG00000006717)
Degu	MODERN SPECIES	84	ENSODEG00000010685	METTL6 (ENSODEG00000008650)	EAF1 (ENSODEG00000008752)	COLQ (ENSODEG00000009333)	HACL1 (ENSODEG00000007866)	ENSODEG00000019451	SH3BP5 (ENSODEG00000013984)	CAPN7 (ENSODEG00000009154)	ENSODEG00000008798	DNAH1 (ENSODEG00000008443)	BAP1 (ENSODEG00000008927)	PHF7 (ENSODEG00000008416)	SEMA3G (ENSODEG00000010653)	ENSODEG00000010480	NISCH (ENSODEG00000007768) #21	ENSODEG00000007867 #22	ENSODEG00000008276 #22	NT5DC2 (ENSODEG00000008156)	UQCC5 (ENSODEG00000007436)	ENSODEG00000019639	ENSODEG00000009139	PBRM1 (ENSODEG00000008265)	GNL3 (ENSODEG00000009492)	ENSODEG00000007760	SPCS1 (ENSODEG00000007651)	ENSODEG00000007472	ITIH1 (ENSODEG00000007678)	ITIH3 (ENSODEG00000011594)	MUSTN1 (ENSODEG00000007782)	STIMATE (ENSODEG00000007556)	SFMBT1 (ENSODEG00000008195)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	137	PXK (ENSCLAG00000006771)	HTD2 (ENSCLAG00000007172)	ABHD6 (ENSCLAG00000007460)	METTL6 (ENSCLAG00000004710)	EAF1 (ENSCLAG00000004790)	COLQ (ENSCLAG00000004933)	HACL1 (ENSCLAG00000005601)	SH3BP5 (ENSCLAG00000005750)	CAPN7 (ENSCLAG00000006072)	DNAH1 (ENSCLAG00000006841)	BAP1 (ENSCLAG00000004745)	PHF7 (ENSCLAG00000005775)	SEMA3G (ENSCLAG00000005845)	TNNC1 (ENSCLAG00000005939)	NISCH (ENSCLAG00000006947) #21	STAB1 (ENSCLAG00000009139) #22	NT5DC2 (ENSCLAG00000004490)	PBRM1 (ENSCLAG00000006512)	ENSCLAG00000005355	GLT8D1 (ENSCLAG00000005828)	SPCS1 (ENSCLAG00000006130)	NEK4 (ENSCLAG00000006173)	ITIH1 (ENSCLAG00000007267)	ITIH3 (ENSCLAG00000006538)	ITIH4 (ENSCLAG00000004599)	MUSTN1 (ENSCLAG00000005729)	STIMATE (ENSCLAG00000005968)	SFMBT1 (ENSCLAG00000006337)	RFT1 (ENSCLAG00000006553)	PRKCD (ENSCLAG00000004074)	TKT (ENSCLAG00000006447)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157928 #22
Common shrew	MODERN SPECIES	4427																ENSSARG00000000533 #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Suina	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180.a	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	950	ENSCWAG00000013259	DUSP7 (ENSCWAG00000013315)	POC1A (ENSCWAG00000013352)	ALAS1 (ENSCWAG00000013593)	TLR9 (ENSCWAG00000013673)	TWF2 (ENSCWAG00000013706)	PPM1M (ENSCWAG00000013780)	WDR82 (ENSCWAG00000013919)	GLYCTK (ENSCWAG00000013957)	DNAH1 (ENSCWAG00000014073)	BAP1 (ENSCWAG00000014624)	PHF7 (ENSCWAG00000014727)	SEMA3G (ENSCWAG00000014898)	TNNC1 (ENSCWAG00000015048)	NISCH (ENSCWAG00000015107) #21	STAB1 (ENSCWAG00000015199) #22	NT5DC2 (ENSCWAG00000015680)	UQCC5 (ENSCWAG00000015766)	PBRM1 (ENSCWAG00000015843)	GNL3 (ENSCWAG00000016120)	GLT8D1 (ENSCWAG00000016166)	ENSCWAG00000016203	NEK4 (ENSCWAG00000016238)	ENSCWAG00000016255	ENSCWAG00000016303	ITIH3 (ENSCWAG00000016482)	ITIH4 (ENSCWAG00000017064)	MUSTN1 (ENSCWAG00000017405)	STIMATE (ENSCWAG00000017427)	SFMBT1 (ENSCWAG00000017463)	RFT1 (ENSCWAG00000017572)
Pig	MODERN SPECIES	4	RPL29 (ENSSSCG00000027573)	DUSP7 (ENSSSCG00000059013)	POC1A (ENSSSCG00000011426)	ALAS1 (ENSSSCG00000011437)	TLR9 (ENSSSCG00000011436)	TWF2 (ENSSSCG00000011435)	PPM1M (ENSSSCG00000011434)	WDR82 (ENSSSCG00000011433)	GLYCTK (ENSSSCG00000011432)	DNAH1 (ENSSSCG00000028184)	BAP1 (ENSSSCG00000011438)	PHF7 (ENSSSCG00000011439)	SEMA3G (ENSSSCG00000011440)	TNNC1 (ENSSSCG00000011441)	NISCH (ENSSSCG00000011442) #21	STAB1 (ENSSSCG00000011443) #22	NT5DC2 (ENSSSCG00000011444)	UQCC5 (ENSSSCG00000034529)	PBRM1 (ENSSSCG00000035824)	GNL3 (ENSSSCG00000011449)	GLT8D1 (ENSSSCG00000011448)	SPCS1 (ENSSSCG00000011447)	NEK4 (ENSSSCG00000011446)	ITIH1 (ENSSSCG00000011450)	ITIH3 (ENSSSCG00000011451)	ITIH4 (ENSSSCG00000011453)	STIMATE (ENSSSCG00000033422)	ENSSSCG00000041313	SFMBT1 (ENSSSCG00000011454)	RFT1 (ENSSSCG00000034614)	PRKCD (ENSSSCG00000023503)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000007084.c.b.ab	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007084.c.b.ab	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007084.c.b.ab	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007084.c.b.ab	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007084.c.b.ab	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Narwhal	MODERN SPECIES	310	ENSMMNG00015011121	DUSP7 (ENSMMNG00015011160)	POC1A (ENSMMNG00015011223)	ALAS1 (ENSMMNG00015011296)	TLR9 (ENSMMNG00015011326)	TWF2 (ENSMMNG00015011342)	PPM1M (ENSMMNG00015011365)	WDR82 (ENSMMNG00015011378)	GLYCTK (ENSMMNG00015011398)	DNAH1 (ENSMMNG00015011453)	BAP1 (ENSMMNG00015011497)	PHF7 (ENSMMNG00015011541)	SEMA3G (ENSMMNG00015011577)	TNNC1 (ENSMMNG00015011608)	NISCH (ENSMMNG00015011666) #21	STAB1 (ENSMMNG00015011774) #22	NT5DC2 (ENSMMNG00015011911)	ENSMMNG00015011960	PBRM1 (ENSMMNG00015012272)	GNL3 (ENSMMNG00015012829)	GLT8D1 (ENSMMNG00015012876)	SPCS1 (ENSMMNG00015012894)	NEK4 (ENSMMNG00015012938)	ITIH3 (ENSMMNG00015013021)	ITIH4 (ENSMMNG00015013084)	MUSTN1 (ENSMMNG00015013107)	STIMATE (ENSMMNG00015013121)	SFMBT1 (ENSMMNG00015013147)	RFT1 (ENSMMNG00015013181)	PRKCD (ENSMMNG00015013214)	TKT (ENSMMNG00015013239)
Beluga whale	MODERN SPECIES	28	RPL29 (ENSDLEG00000021882)	DUSP7 (ENSDLEG00000021878)	POC1A (ENSDLEG00000021877)	ALAS1 (ENSDLEG00000021873)	TLR9 (ENSDLEG00000021871)	TWF2 (ENSDLEG00000021869)	PPM1M (ENSDLEG00000021868)	WDR82 (ENSDLEG00000021865)	GLYCTK (ENSDLEG00000021864)	DNAH1 (ENSDLEG00000021744)	BAP1 (ENSDLEG00000021603)	PHF7 (ENSDLEG00000021600)	SEMA3G (ENSDLEG00000021589)	TNNC1 (ENSDLEG00000021578)	NISCH (ENSDLEG00000021546) #21	STAB1 (ENSDLEG00000021435) #22	NT5DC2 (ENSDLEG00000021412)	SMIM4 (ENSDLEG00000021406)	PBRM1 (ENSDLEG00000021009)	GNL3 (ENSDLEG00000020855)	GLT8D1 (ENSDLEG00000020844)	SPCS1 (ENSDLEG00000020833)	NEK4 (ENSDLEG00000020823)	ITIH1 (ENSDLEG00000020516)	ITIH3 (ENSDLEG00000019525)	ITIH4 (ENSDLEG00000018632)	MUSTN1 (ENSDLEG00000018544)	STIMATE (ENSDLEG00000018537)	SFMBT1 (ENSDLEG00000018300)	RFT1 (ENSDLEG00000018149)	PRKCD (ENSDLEG00000018106)
Vaquita	MODERN SPECIES	2	DUSP7 (ENSPSNG00000006958)	POC1A (ENSPSNG00000006909)	ALAS1 (ENSPSNG00000006863)	TLR9 (ENSPSNG00000006840)	TWF2 (ENSPSNG00000006800)	PPM1M (ENSPSNG00000006731)	WDR82 (ENSPSNG00000006687)	GLYCTK (ENSPSNG00000006648)	DNAH1 (ENSPSNG00000006331)	BAP1 (ENSPSNG00000006193)	PHF7 (ENSPSNG00000006098)	SEMA3G (ENSPSNG00000006026)	ENSPSNG00000005997	TNNC1 (ENSPSNG00000005969)	ENSPSNG00000005940 #21	STAB1 (ENSPSNG00000005712) #22	NT5DC2 (ENSPSNG00000005583)	ENSPSNG00000005550	PBRM1 (ENSPSNG00000005426)	GNL3 (ENSPSNG00000005305)	GLT8D1 (ENSPSNG00000005275)	SPCS1 (ENSPSNG00000005173)	NEK4 (ENSPSNG00000004970)	ITIH1 (ENSPSNG00000004858)	ITIH3 (ENSPSNG00000004675)	ITIH4 (ENSPSNG00000004326)	MUSTN1 (ENSPSNG00000004156)	STIMATE (ENSPSNG00000022383)	SFMBT1 (ENSPSNG00000022380)	RFT1 (ENSPSNG00000022373)	PRKCD (ENSPSNG00000022362)
Dolphin	MODERN SPECIES	3526														TNNC1 (ENSTTRG00000008475)	NISCH (ENSTTRG00000008512) #21	STAB1 (ENSTTRG00000008537) #22	NT5DC2 (ENSTTRG00000008562)	UQCC5 (ENSTTRG00000008567)	PBRM1 (ENSTTRG00000008569)	ENSTTRG00000008574	GLT8D1 (ENSTTRG00000008575)	SPCS1 (ENSTTRG00000008576)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000007084.c.b.db.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000007084.c.b.db.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000007084.c.b.db.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007084.c.b.db.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.i	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Bos	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007084.c.b.db.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.i	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000007084.c.b.db.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.i	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Domestic yak	MODERN SPECIES	14	ENSBGRG00000026045	POC1A (ENSBGRG00000006902)	ALAS1 (ENSBGRG00000007235)	TLR9 (ENSBGRG00000007329)	TWF2 (ENSBGRG00000007391)	PPM1M (ENSBGRG00000007494)	WDR82 (ENSBGRG00000007697)	GLYCTK (ENSBGRG00000007824)	DNAH1 (ENSBGRG00000008005)	ENSBGRG00000008244	ENSBGRG00000008566	PHF7 (ENSBGRG00000008600)	SEMA3G (ENSBGRG00000008759)	TNNC1 (ENSBGRG00000008957)	NISCH (ENSBGRG00000009033) #21	STAB1 (ENSBGRG00000009361) #22	NT5DC2 (ENSBGRG00000009919)	ENSBGRG00000010230	PBRM1 (ENSBGRG00000010511)	GNL3 (ENSBGRG00000015261)	GLT8D1 (ENSBGRG00000015540)	ENSBGRG00000015636	NEK4 (ENSBGRG00000015784)	ITIH1 (ENSBGRG00000016526)	ITIH3 (ENSBGRG00000016999)	ITIH4 (ENSBGRG00000017598)	MUSTN1 (ENSBGRG00000017887)	STIMATE (ENSBGRG00000017935)	SFMBT1 (ENSBGRG00000018036)	RFT1 (ENSBGRG00000018214)	PRKCD (ENSBGRG00000018341)
Wild yak	MODERN SPECIES	958	RPL29 (ENSBMUG00000008110)	POC1A (ENSBMUG00000008091)	ALAS1 (ENSBMUG00000008007)	TLR9 (ENSBMUG00000007976)	TWF2 (ENSBMUG00000007964)	PPM1M (ENSBMUG00000007940)	WDR82 (ENSBMUG00000007918)	GLYCTK (ENSBMUG00000007904)	ENSBMUG00000007862	DNAH1 (ENSBMUG00000007850)	BAP1 (ENSBMUG00000007813)	PHF7 (ENSBMUG00000007786)	SEMA3G (ENSBMUG00000007755)	TNNC1 (ENSBMUG00000007746)	NISCH (ENSBMUG00000007733) #21	STAB1 (ENSBMUG00000007022) #22	NT5DC2 (ENSBMUG00000006222)	ENSBMUG00000006049	PBRM1 (ENSBMUG00000005462)	GNL3 (ENSBMUG00000004999)	GLT8D1 (ENSBMUG00000004968)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000007084.c.b.db.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.i	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Cow	MODERN SPECIES	14	DUSP7 (ENSBTAG00000021912)	POC1A (ENSBTAG00000001471)	ALAS1 (ENSBTAG00000004118)	TLR9 (ENSBTAG00000018198)	TWF2 (ENSBTAG00000054131)	PPM1M (ENSBTAG00000002962)	WDR82 (ENSBTAG00000002960)	GLYCTK (ENSBTAG00000021695)	ENSBTAG00000054920	DNAH1 (ENSBTAG00000047794)	BAP1 (ENSBTAG00000045817)	PHF7 (ENSBTAG00000047658)	SEMA3G (ENSBTAG00000046924)	TNNC1 (ENSBTAG00000045757)	NISCH (ENSBTAG00000014779) #21	STAB1 (ENSBTAG00000014782) #22	NT5DC2 (ENSBTAG00000014784)	UQCC5 (ENSBTAG00000044079)	PBRM1 (ENSBTAG00000014786)	GNL3 (ENSBTAG00000014549)	GLT8D1 (ENSBTAG00000014550)	SPCS1 (ENSBTAG00000053918)	NEK4 (ENSBTAG00000004749)	ITIH1 (ENSBTAG00000007843)	ITIH3 (ENSBTAG00000007846)	ITIH4 (ENSBTAG00000007850)	MUSTN1 (ENSBTAG00000032531)	TMEM110 (ENSBTAG00000011344)	SFMBT1 (ENSBTAG00000011345)	RFT1 (ENSBTAG00000020973)	PRKCD (ENSBTAG00000008719)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	14	ENSBIXG00005009133	DUSP7 (ENSBIXG00005009102)	POC1A (ENSBIXG00005009078)	ALAS1 (ENSBIXG00005009028)	TLR9 (ENSBIXG00005005362)	TWF2 (ENSBIXG00005008994)	PPM1M (ENSBIXG00005008974)	WDR82 (ENSBIXG00005008957)	GLYCTK (ENSBIXG00005008937)	ENSBIXG00005008882	BAP1 (ENSBIXG00005008843)	PHF7 (ENSBIXG00005000275)	SEMA3G (ENSBIXG00005008748)	TNNC1 (ENSBIXG00005008732)	NISCH (ENSBIXG00005006303) #21	STAB1 (ENSBIXG00005008665) #22	NT5DC2 (ENSBIXG00005000227)	ENSBIXG00005008559	PBRM1 (ENSBIXG00005008527)	GNL3 (ENSBIXG00005008454)	GLT8D1 (ENSBIXG00005008425)	SPCS1 (ENSBIXG00005000183)	NEK4 (ENSBIXG00005008395)	ITIH1 (ENSBIXG00005000170)	ITIH3 (ENSBIXG00005008298)	ITIH4 (ENSBIXG00005008242)	MUSTN1 (ENSBIXG00005008190)	STIMATE (ENSBIXG00005008182)	SFMBT1 (ENSBIXG00005008167)	ENSBIXG00005008148	RFT1 (ENSBIXG00005008137)
American bison	MODERN SPECIES	3218	ENSBBBG00000001346	DUSP7 (ENSBBBG00000001340)	POC1A (ENSBBBG00000001285)	ALAS1 (ENSBBBG00000003505)	TLR9 (ENSBBBG00000003495)	TWF2 (ENSBBBG00000015345)	PPM1M (ENSBBBG00000015368)	WDR82 (ENSBBBG00000015376)	ENSBBBG00000015393	DNAH1 (ENSBBBG00000015469)	BAP1 (ENSBBBG00000015502)	PHF7 (ENSBBBG00000006844)	SEMA3G (ENSBBBG00000015571)	TNNC1 (ENSBBBG00000003880)	ENSBBBG00000015590 #21	ENSBBBG00000003438 #22	NT5DC2 (ENSBBBG00000015653)	ENSBBBG00000015662	PBRM1 (ENSBBBG00000016381)	GNL3 (ENSBBBG00000016457)	GLT8D1 (ENSBBBG00000016503)	ENSBBBG00000007373	NEK4 (ENSBBBG00000016603)	ITIH1 (ENSBBBG00000016640)	ITIH3 (ENSBBBG00000016663)	ITIH4 (ENSBBBG00000016728)	MUSTN1 (ENSBBBG00000006889)	STIMATE (ENSBBBG00000000714)	SFMBT1 (ENSBBBG00000004149)	RFT1 (ENSBBBG00000008294)	PRKCD (ENSBBBG00000008341)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000007084.c.b.db.b.f	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388.l.a	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT01010000226680	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	10	RPL29 (ENSOARG00020025879)	DUSP7 (ENSOARG00020025876)	POC1A (ENSOARG00020025863)	ALAS1 (ENSOARG00020025852)	TLR9 (ENSOARG00020025847)	TWF2 (ENSOARG00020025844)	PPM1M (ENSOARG00020025837)	WDR82 (ENSOARG00020025831)	GLYCTK (ENSOARG00020025825)	DNAH1 (ENSOARG00020025802)	ENSOARG00020025798	PHF7 (ENSOARG00020025787)	SEMA3G (ENSOARG00020025776)	TNNC1 (ENSOARG00020025771)	NISCH (ENSOARG00020025764) #21	STAB1 (ENSOARG00020025691) #22	NT5DC2 (ENSOARG00020025653)	ENSOARG00020025644	PBRM1 (ENSOARG00020024646)	GLT8D1 (ENSOARG00020024475)	SPCS1 (ENSOARG00020024460)	NEK4 (ENSOARG00020024428)	ITIH1 (ENSOARG00020024377)	ITIH3 (ENSOARG00020024329)	ITIH4 (ENSOARG00020024164)	MUSTN1 (ENSOARG00020024147)	STIMATE (ENSOARG00020024121)	SFMBT1 (ENSOARG00020024040)	RFT1 (ENSOARG00020023951)	PRKCD (ENSOARG00020023853)	TKT (ENSOARG00020023805)
Goat	MODERN SPECIES	14	ACY1 (ENSCHIG00000016266)	DUSP7 (ENSCHIG00000008697)	POC1A (ENSCHIG00000002571)	ALAS1 (ENSCHIG00000003148)	TLR9 (ENSCHIG00000024325)	TWF2 (ENSCHIG00000014531)	PPM1M (ENSCHIG00000012893)	ENSCHIG00000021650	GLYCTK (ENSCHIG00000008125)	DNAH1 (ENSCHIG00000013326)	ENSCHIG00000022028	PHF7 (ENSCHIG00000012799)	SEMA3G (ENSCHIG00000022875)	TNNC1 (ENSCHIG00000019356)	NISCH (ENSCHIG00000017539) #21	ENSCHIG00000023133 #22	NT5DC2 (ENSCHIG00000023928)	UQCC5 (ENSCHIG00000010104)	ENSCHIG00000006551	PBRM1 (ENSCHIG00000018542)	GNL3 (ENSCHIG00000022181)	GLT8D1 (ENSCHIG00000014311)	SPCS1 (ENSCHIG00000000545)	NEK4 (ENSCHIG00000017522)	ITIH1 (ENSCHIG00000022850)	ITIH3 (ENSCHIG00000024683)	ITIH4 (ENSCHIG00000013634)	MUSTN1 (ENSCHIG00000020792)	STIMATE (ENSCHIG00000014968)	ENSCHIG00000023126	SFMBT1 (ENSCHIG00000010563)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1221	RPL29 (ENSMMSG00000022684)	DUSP7 (ENSMMSG00000022695)	POC1A (ENSMMSG00000022706)	ALAS1 (ENSMMSG00000022729)	TLR9 (ENSMMSG00000022746)	TWF2 (ENSMMSG00000022757)	PPM1M (ENSMMSG00000022785)	WDR82 (ENSMMSG00000022802)	GLYCTK (ENSMMSG00000022817)	DNAH1 (ENSMMSG00000007681)	BAP1 (ENSMMSG00000008841)	PHF7 (ENSMMSG00000009006)	SEMA3G (ENSMMSG00000009129)	TNNC1 (ENSMMSG00000009190)	NISCH (ENSMMSG00000009296) #21	ENSMMSG00000009406 #22	NT5DC2 (ENSMMSG00000009650)	UQCC5 (ENSMMSG00000009787)	PBRM1 (ENSMMSG00000009865)	GNL3 (ENSMMSG00000010179)	GLT8D1 (ENSMMSG00000010236)	ENSMMSG00000010260	NEK4 (ENSMMSG00000010301)	ITIH1 (ENSMMSG00000010642)	ITIH3 (ENSMMSG00000010849)	ITIH4 (ENSMMSG00000010921)	MUSTN1 (ENSMMSG00000011044)	STIMATE (ENSMMSG00000011068)	SFMBT1 (ENSMMSG00000011103)	RFT1 (ENSMMSG00000011171)	PRKCD (ENSMMSG00000011239)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Arabian camel	MODERN SPECIES	8	ENSCDRG00005015696	DUSP7 (ENSCDRG00005015741)	POC1A (ENSCDRG00005015778)	ALAS1 (ENSCDRG00005015841)	TLR9 (ENSCDRG00005015908)	TWF2 (ENSCDRG00005015927)	PPM1M (ENSCDRG00005016003)	WDR82 (ENSCDRG00005016057)	GLYCTK (ENSCDRG00005016161)	DNAH1 (ENSCDRG00005016236)	BAP1 (ENSCDRG00005016383)	PHF7 (ENSCDRG00005016459)	SEMA3G (ENSCDRG00005003388)	TNNC1 (ENSCDRG00005003430)	NISCH (ENSCDRG00005003758) #21	STAB1 (ENSCDRG00005008460) #22	NT5DC2 (ENSCDRG00005009184)	UQCC5 (ENSCDRG00005009913)	PBRM1 (ENSCDRG00005010037)	GNL3 (ENSCDRG00005010733)	GLT8D1 (ENSCDRG00005011129)	ENSCDRG00005011205	NEK4 (ENSCDRG00005011296)	ITIH1 (ENSCDRG00005011695)	ITIH3 (ENSCDRG00005011808)	ITIH4 (ENSCDRG00005012615)	MUSTN1 (ENSCDRG00005012695)	STIMATE (ENSCDRG00005012748)	ENSCDRG00005012818	SFMBT1 (ENSCDRG00005012841)	RFT1 (ENSCDRG00005012982)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007084.d	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	49							ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Megabat	MODERN SPECIES	2084									GLYCTK (ENSPVAG00000012548)	DNAH1 (ENSPVAG00000012549)	BAP1 (ENSPVAG00000012553)	PHF7 (ENSPVAG00000012559)	SEMA3G (ENSPVAG00000012561)	TNNC1 (ENSPVAG00000012568)	NISCH (ENSPVAG00000012569) #21	STAB1 (ENSPVAG00000012573) #22	NT5DC2 (ENSPVAG00000012578)	UQCC5 (ENSPVAG00000012579)	PBRM1 (ENSPVAG00000012580)	GNL3 (ENSPVAG00000012586)	GLT8D1 (ENSPVAG00000012587)	SPCS1 (ENSPVAG00000012588)	NEK4 (ENSPVAG00000012590)	ITIH1 (ENSPVAG00000012592)	ITIH3 (ENSPVAG00000012595)	ITIH4 (ENSPVAG00000012601)	STIMATE (ENSPVAG00000012607)	SFMBT1 (ENSPVAG00000012611)
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	47							ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Microbat	MODERN SPECIES	1020									GLYCTK (ENSMLUG00000015258)	DNAH1 (ENSMLUG00000015263)	BAP1 (ENSMLUG00000015314)	PHF7 (ENSMLUG00000015328)	SEMA3G (ENSMLUG00000015339)	TNNC1 (ENSMLUG00000015353)	NISCH (ENSMLUG00000015362) #21	STAB1 (ENSMLUG00000015377) #22	NT5DC2 (ENSMLUG00000015418)	UQCC5 (ENSMLUG00000008766)	PBRM1 (ENSMLUG00000008774)	GNL3 (ENSMLUG00000000728)	GLT8D1 (ENSMLUG00000000737)	SPCS1 (ENSMLUG00000000744)	NEK4 (ENSMLUG00000009093)	ITIH1 (ENSMLUG00000009112)	ENSMLUG00000009139	ENSMLUG00000023681	ENSMLUG00000009872	ITIH4 (ENSMLUG00000009171)	ENSMLUG00000024444	STIMATE (ENSMLUG00000023700)	SFMBT1 (ENSMLUG00000012514)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	8	OXTR (ENSRFEG00010015954)	CAV3 (ENSRFEG00010016003)	SSUH2 (ENSRFEG00010016053)	LMCD1 (ENSRFEG00010016208)	GRM7 (ENSRFEG00010016395)	PPM1M (ENSRFEG00010016849)	WDR82 (ENSRFEG00010016964)	ENSRFEG00010017009	GLYCTK (ENSRFEG00010017030)	DNAH1 (ENSRFEG00010017179)	BAP1 (ENSRFEG00010017990)	PHF7 (ENSRFEG00010018334)	SEMA3G (ENSRFEG00010018373)	TNNC1 (ENSRFEG00010018419)	NISCH (ENSRFEG00010018464) #21	STAB1 (ENSRFEG00010018575) #22	NT5DC2 (ENSRFEG00010020356)	UQCC5 (ENSRFEG00010020406)	PBRM1 (ENSRFEG00010020466)	ENSRFEG00010020600	GLT8D1 (ENSRFEG00010020644)	ENSRFEG00010020673	NEK4 (ENSRFEG00010020693)	ENSRFEG00010020738	ITIH1 (ENSRFEG00010020810)	ITIH4 (ENSRFEG00010021058)	MUSTN1 (ENSRFEG00010021121)	STIMATE (ENSRFEG00010021137)	SFMBT1 (ENSRFEG00010021160)	RFT1 (ENSRFEG00010021195)	PRKCD (ENSRFEG00010021234)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007084.c.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321.m	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Horse	MODERN SPECIES	7	POC1A (ENSECAG00000021302)	ALAS1 (ENSECAG00000014533)	TLR9 (ENSECAG00000014294)	TWF2 (ENSECAG00000014047)	ENSECAG00000051138	PPM1M (ENSECAG00000012070)	WDR82 (ENSECAG00000039147)	GLYCTK (ENSECAG00000012193)	ENSECAG00000058571	DNAH1 (ENSECAG00000000475)	BAP1 (ENSECAG00000020681)	PHF7 (ENSECAG00000019268)	SEMA3G (ENSECAG00000022121)	TNNC1 (ENSECAG00000020452)	NISCH (ENSECAG00000007104) #21	STAB1 (ENSECAG00000009860) #22	NT5DC2 (ENSECAG00000015835)	SMIM4 (ENSECAG00000046384)	PBRM1 (ENSECAG00000000555)	GNL3 (ENSECAG00000014850)	GLT8D1 (ENSECAG00000000410)	ENSECAG00000023559	NEK4 (ENSECAG00000017761)	ITIH1 (ENSECAG00000024792)	ITIH3 (ENSECAG00000003355)	ITIH4 (ENSECAG00000002111)	STIMATE (ENSECAG00000018596)	SFMBT1 (ENSECAG00000006486)	RFT1 (ENSECAG00000023042)	PRKCD (ENSECAG00000023172)	TKT (ENSECAG00000005863)
Donkey	MODERN SPECIES	13	ENSEASG00005032395	DUSP7 (ENSEASG00005012901)	POC1A (ENSEASG00005012903)	ALAS1 (ENSEASG00005012907)	TLR9 (ENSEASG00005024871)	TWF2 (ENSEASG00005012916)	PPM1M (ENSEASG00005012932)	WDR82 (ENSEASG00005012933)	GLYCTK (ENSEASG00005012939)	DNAH1 (ENSEASG00005012971)	BAP1 (ENSEASG00005013039)	PHF7 (ENSEASG00005013042)	SEMA3G (ENSEASG00005013045)	TNNC1 (ENSEASG00005031072)	NISCH (ENSEASG00005013056) #21	STAB1 (ENSEASG00005013117) #22	NT5DC2 (ENSEASG00005013178)	UQCC5 (ENSEASG00005036142)	PBRM1 (ENSEASG00005013418)	GNL3 (ENSEASG00005014636)	GLT8D1 (ENSEASG00005014657)	ENSEASG00005014661	NEK4 (ENSEASG00005014673)	ITIH1 (ENSEASG00005014684)	ITIH3 (ENSEASG00005014721)	ITIH4 (ENSEASG00005014821)	MUSTN1 (ENSEASG00005038234)	STIMATE (ENSEASG00005014874)	SFMBT1 (ENSEASG00005014896)	RFT1 (ENSEASG00005014945)	PRKCD (ENSEASG00005014952)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007084.c.b.x.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007084.c.b.x.a	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000007084.c.b.x.a	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000005914.a.l	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000007084.c.b.x.b	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B.b	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000005914.a.l	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007084.c.b.x.a	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365.i	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B.b	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000005914.a.l	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
American black bear	MODERN SPECIES	3448								ENSUAMG00000006591	ENSUAMG00000006585	ENSUAMG00000006545	BAP1 (ENSUAMG00000006536)	PHF7 (ENSUAMG00000006528)	SEMA3G (ENSUAMG00000006519)	TNNC1 (ENSUAMG00000006516)	NISCH (ENSUAMG00000006467) #21	STAB1 (ENSUAMG00000006175) #22	NT5DC2 (ENSUAMG00000006148)
Polar bear	MODERN SPECIES	255	ACY1 (ENSUMAG00000021533)	ENSUMAG00000021488	DUSP7 (ENSUMAG00000021487)	POC1A (ENSUMAG00000021482)	ALAS1 (ENSUMAG00000021481)	TWF2 (ENSUMAG00000021475)	PPM1M (ENSUMAG00000021462)	WDR82 (ENSUMAG00000021456)	GLYCTK (ENSUMAG00000021446)	DNAH1 (ENSUMAG00000021417)	BAP1 (ENSUMAG00000021397)	PHF7 (ENSUMAG00000021394)	SEMA3G (ENSUMAG00000021371)	TNNC1 (ENSUMAG00000021362)	ENSUMAG00000021358 #21	ENSUMAG00000021338 #22	NT5DC2 (ENSUMAG00000021325)	UQCC5 (ENSUMAG00000021322)	ENSUMAG00000021319	PBRM1 (ENSUMAG00000021058)	GNL3 (ENSUMAG00000021001)	GLT8D1 (ENSUMAG00000020995)	SPCS1 (ENSUMAG00000020992)	NEK4 (ENSUMAG00000020986)	ITIH1 (ENSUMAG00000020959)	ITIH3 (ENSUMAG00000020574)	ITIH4 (ENSUMAG00000020337)	MUSTN1 (ENSUMAG00000020304)	STIMATE (ENSUMAG00000020296)	SFMBT1 (ENSUMAG00000020271)	RFT1 (ENSUMAG00000020253)
Giant Panda	MODERN SPECIES	14	ENSAMEG00000017772	DUSP7 (ENSAMEG00000009156)	POC1A (ENSAMEG00000009136)	ALAS1 (ENSAMEG00000009102)	TLR9 (ENSAMEG00000009061)	TWF2 (ENSAMEG00000023622)	PPM1M (ENSAMEG00000009047)	WDR82 (ENSAMEG00000009017)	GLYCTK (ENSAMEG00000009008)	DNAH1 (ENSAMEG00000008937)	BAP1 (ENSAMEG00000008887)	PHF7 (ENSAMEG00000008872)	SEMA3G (ENSAMEG00000008782)	TNNC1 (ENSAMEG00000008763)	NISCH (ENSAMEG00000008715) #21	STAB1 (ENSAMEG00000008575) #22	NT5DC2 (ENSAMEG00000008538)	UQCC5 (ENSAMEG00000008535)	PBRM1 (ENSAMEG00000008496)	GNL3 (ENSAMEG00000008456)	GLT8D1 (ENSAMEG00000008428)	SPCS1 (ENSAMEG00000008426)	NEK4 (ENSAMEG00000008388)	ITIH1 (ENSAMEG00000008282)	ITIH3 (ENSAMEG00000008201)	ITIH4 (ENSAMEG00000008108)	MUSTN1 (ENSAMEG00000031259)	STIMATE (ENSAMEG00000008091)	SFMBT1 (ENSAMEG00000008043)	RFT1 (ENSAMEG00000008029)	PRKCD (ENSAMEG00000007953)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000007084.c.b.x.a	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791.t	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000005914.a.l	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390
American mink	MODERN SPECIES	47	RPL29 (ENSNVIG00000000529)	DUSP7 (ENSNVIG00000000525)	POC1A (ENSNVIG00000000498)	ALAS1 (ENSNVIG00000000473)	TLR9 (ENSNVIG00000000466)	TWF2 (ENSNVIG00000000427)	ENSNVIG00000000396	WDR82 (ENSNVIG00000000350)	GLYCTK (ENSNVIG00000000339)	DNAH1 (ENSNVIG00000000253)	BAP1 (ENSNVIG00000000174)	PHF7 (ENSNVIG00000000111)	SEMA3G (ENSNVIG00000000048)	TNNC1 (ENSNVIG00000000035)	NISCH (ENSNVIG00000023327) #21	STAB1 (ENSNVIG00000023305) #22	NT5DC2 (ENSNVIG00000023268)	UQCC5 (ENSNVIG00000023263)	ENSNVIG00000023258	PBRM1 (ENSNVIG00000023083)	GNL3 (ENSNVIG00000023058)	GLT8D1 (ENSNVIG00000023053)	SPCS1 (ENSNVIG00000023049)	NEK4 (ENSNVIG00000023045)	ITIH1 (ENSNVIG00000023034)	ITIH3 (ENSNVIG00000023014)	ITIH4 (ENSNVIG00000023001)	MUSTN1 (ENSNVIG00000022991)	STIMATE (ENSNVIG00000022985)	SFMBT1 (ENSNVIG00000022972)	RFT1 (ENSNVIG00000022953)
Ferret	MODERN SPECIES	163									ENSMPUG00000020107	DNAH1 (ENSMPUG00000016689)	PBRM1 (ENSMPUG00000016764)	PHF7 (ENSMPUG00000016766)	SEMA3G (ENSMPUG00000016770)	TNNC1 (ENSMPUG00000016773)	NISCH (ENSMPUG00000016775) #21	STAB1 (ENSMPUG00000016776) #22	GNL3 (ENSMPUG00000016777)	GLT8D1 (ENSMPUG00000016779)	NEK4 (ENSMPUG00000016780)	ITIH1 (ENSMPUG00000016782)	ITIH3 (ENSMPUG00000016784)	ITIH4 (ENSMPUG00000016785)	MUSTN1 (ENSMPUG00000016810)	STIMATE (ENSMPUG00000016811)	SFMBT1 (ENSMPUG00000016812)	RFT1 (ENSMPUG00000016813)	ENSMPUG00000016814	PRKCD (ENSMPUG00000016815)	TKT (ENSMPUG00000016816)	DCP1A (ENSMPUG00000016817)	CACNA1D (ENSMPUG00000016818)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000007084.c.b.y	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180.e.a	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000162180.e.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363.a	ENSGT00390000011390
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000007084.c.b.y	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180.e.a	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000162180.e.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363.a	ENSGT00390000011390
Dog	MODERN SPECIES	12	RPL29 (ENSCAFG00845030865)	POC1A (ENSCAFG00845030794)	ACY1 (ENSCAFG00845030738)	ALAS1 (ENSCAFG00845030692)	TLR9 (ENSCAFG00845030683)	TWF2 (ENSCAFG00845030676)	PPM1M (ENSCAFG00845030656)	WDR82 (ENSCAFG00845030640)	GLYCTK (ENSCAFG00845030623)	DNAH1 (ENSCAFG00845030603)	SEMA3G (ENSCAFG00845030530)	PHF7 (ENSCAFG00845030444)	SEMA3G (ENSCAFG00845030395)	TNNC1 (ENSCAFG00845030373)	NISCH (ENSCAFG00845030329) #21	STAB1 (ENSCAFG00845030285) #22	NT5DC2 (ENSCAFG00845030174)	ENSCAFG00845030133	PBRM1 (ENSCAFG00845030027)	GNL3 (ENSCAFG00845029903)	GLT8D1 (ENSCAFG00845029866)	SPCS1 (ENSCAFG00845029846)	NEK4 (ENSCAFG00845029812)	ENSCAFG00845029717	ITIH3 (ENSCAFG00845029600)	ITIH4 (ENSCAFG00845029390)	MUSTN1 (ENSCAFG00845029288)	ENSCAFG00845029177	STIMATE (ENSCAFG00845029134)	ENSCAFG00845029085	ENSCAFG00845029054
Dingo	MODERN SPECIES	401	DUSP7 (ENSCAFG00020022378)	POC1A (ENSCAFG00020022379)	ALAS1 (ENSCAFG00020022382)	TLR9 (ENSCAFG00020022384)	TWF2 (ENSCAFG00020000089)	PPM1M (ENSCAFG00020000106)	WDR82 (ENSCAFG00020000113)	GLYCTK (ENSCAFG00020000139)	ENSCAFG00020000189	ENSCAFG00020000284	BAP1 (ENSCAFG00020000402)	PHF7 (ENSCAFG00020000421)	SEMA3G (ENSCAFG00020000517)	TNNC1 (ENSCAFG00020000532)	NISCH (ENSCAFG00020000534) #21	STAB1 (ENSCAFG00020000581) #22	NT5DC2 (ENSCAFG00020001342)	UQCC5 (ENSCAFG00020001996)	PBRM1 (ENSCAFG00020002088)	GNL3 (ENSCAFG00020002613)	GLT8D1 (ENSCAFG00020002635)	SPCS1 (ENSCAFG00020002647)	NEK4 (ENSCAFG00020002652)	ENSCAFG00020002663	ENSCAFG00020002670	ITIH3 (ENSCAFG00020002762)	ITIH4 (ENSCAFG00020003756)	MUSTN1 (ENSCAFG00020004446)	ENSCAFG00020004449	STIMATE (ENSCAFG00020004458)	SFMBT1 (ENSCAFG00020004476)
Red fox	MODERN SPECIES	5	DUSP7 (ENSVVUG00000026848)	POC1A (ENSVVUG00000026847)	ALAS1 (ENSVVUG00000026843)	TLR9 (ENSVVUG00000026842)	TWF2 (ENSVVUG00000026837)	PPM1M (ENSVVUG00000026832)	ENSVVUG00000026831	WDR82 (ENSVVUG00000026827)	GLYCTK (ENSVVUG00000026824)	DNAH1 (ENSVVUG00000026510)	BAP1 (ENSVVUG00000026411)	PHF7 (ENSVVUG00000026368)	SEMA3G (ENSVVUG00000026235)	TNNC1 (ENSVVUG00000026216)	NISCH (ENSVVUG00000026172) #21	STAB1 (ENSVVUG00000026125) #22	NT5DC2 (ENSVVUG00000026087)	SMIM4 (ENSVVUG00000026075)	PBRM1 (ENSVVUG00000024714)	GNL3 (ENSVVUG00000024536)	GLT8D1 (ENSVVUG00000024521)	SPCS1 (ENSVVUG00000024515)	NEK4 (ENSVVUG00000024437)	ENSVVUG00000024364	ITIH3 (ENSVVUG00000024210)	ITIH4 (ENSVVUG00000023931)	MUSTN1 (ENSVVUG00000023898)	ENSVVUG00000023897	STIMATE (ENSVVUG00000023887)	ENSVVUG00000023794	RFT1 (ENSVVUG00000023786)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00980000202914	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00980000202914	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157262	ENSGT00940000157494	ENSGT00940000156030	ENSGT00940000162493	ENSGT00530000063868.a	ENSGT00940000161084	ENSGT00530000063965	ENSGT00390000014365	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494 #21	ENSGT00980000202914	ENSGT00940000157928 #22	ENSGT00940000159940	ENSGT00390000013390	ENSGT00390000003017.c.a	ENSGT00940000158320	ENSGT00940000159273	ENSGT00390000018321	ENSGT00940000157448	ENSGT00940000162180	ENSGT00940000154554.a	ENSGT00940000161039	ENSGT00940000153920.a.b	ENSGT00940000153920.b	ENSGT00940000157363	ENSGT00390000011390	ENSGT00940000155327
lion	MODERN SPECIES	2	DUSP7 (ENSPLOG00000000920)	POC1A (ENSPLOG00000000950)	ALAS1 (ENSPLOG00000001000)	TLR9 (ENSPLOG00000001028)	TWF2 (ENSPLOG00000001066)	PPM1M (ENSPLOG00000001125)	WDR82 (ENSPLOG00000001170)	GLYCTK (ENSPLOG00000001205)	DNAH1 (ENSPLOG00000001320)	BAP1 (ENSPLOG00000001461)	PHF7 (ENSPLOG00000001512)	SEMA3G (ENSPLOG00000001552)	TNNC1 (ENSPLOG00000001593)	ENSPLOG00000001629 #21	ENSPLOG00000001667	STAB1 (ENSPLOG00000001763) #22	NT5DC2 (ENSPLOG00000001896)	UQCC5 (ENSPLOG00000001944)	PBRM1 (ENSPLOG00000002479)	GNL3 (ENSPLOG00000003267)	GLT8D1 (ENSPLOG00000003333)	ENSPLOG00000003359	NEK4 (ENSPLOG00000003391)	ITIH1 (ENSPLOG00000003468)	ITIH3 (ENSPLOG00000003625)	ITIH4 (ENSPLOG00000003748)	MUSTN1 (ENSPLOG00000003792)	STIMATE (ENSPLOG00000003851)	SFMBT1 (ENSPLOG00000003888)	RFT1 (ENSPLOG00000003952)	PRKCD (ENSPLOG00000003998)
leopard	MODERN SPECIES	68	ENSPPRG00000003581	DUSP7 (ENSPPRG00000003470)	POC1A (ENSPPRG00000003365)	ALAS1 (ENSPPRG00000003156)	TLR9 (ENSPPRG00000002798)	TWF2 (ENSPPRG00000002589)	PPM1M (ENSPPRG00000002382)	WDR82 (ENSPPRG00000002136)	GLYCTK (ENSPPRG00000002035)	DNAH1 (ENSPPRG00000001599)	BAP1 (ENSPPRG00000000461)	PHF7 (ENSPPRG00000000226)	SEMA3G (ENSPPRG00000000100)	TNNC1 (ENSPPRG00000022823)	ENSPPRG00000022889 #21	STAB1 (ENSPPRG00000020606) #22	NT5DC2 (ENSPPRG00000016431)	UQCC5 (ENSPPRG00000014236)	PBRM1 (ENSPPRG00000013906)	GNL3 (ENSPPRG00000009550)	GLT8D1 (ENSPPRG00000009431)	SPCS1 (ENSPPRG00000009395)	NEK4 (ENSPPRG00000009113)	ITIH1 (ENSPPRG00000008937)	ITIH3 (ENSPPRG00000008377)	ITIH4 (ENSPPRG00000007703)	MUSTN1 (ENSPPRG00000006902)	STIMATE (ENSPPRG00000006758)	SFMBT1 (ENSPPRG00000006750)	RFT1 (ENSPPRG00000006535)	PRKCD (ENSPPRG00000006263)
Cat	MODERN SPECIES	1	DUSP7 (ENSFCAG00000009151)	POC1A (ENSFCAG00000015704)	ALAS1 (ENSFCAG00000015705)	TLR9 (ENSFCAG00000035015)	TWF2 (ENSFCAG00000024069)	PPM1M (ENSFCAG00000015707)	WDR82 (ENSFCAG00000024181)	GLYCTK (ENSFCAG00000015709)	DNAH1 (ENSFCAG00000015710)	BAP1 (ENSFCAG00000015711)	PHF7 (ENSFCAG00000015712)	SEMA3G (ENSFCAG00000015713)	TNNC1 (ENSFCAG00000015714)	NISCH (ENSFCAG00000015715) #21	ENSFCAG00000049121	STAB1 (ENSFCAG00000015716) #22	NT5DC2 (ENSFCAG00000015717)	UQCC5 (ENSFCAG00000007265)	PBRM1 (ENSFCAG00000015718)	GNL3 (ENSFCAG00000015719)	GLT8D1 (ENSFCAG00000015720)	SPCS1 (ENSFCAG00000031232)	NEK4 (ENSFCAG00000015721)	ITIH1 (ENSFCAG00000015722)	ITIH3 (ENSFCAG00000015723)	ITIH4 (ENSFCAG00000015724)	MUSTN1 (ENSFCAG00000025206)	STIMATE (ENSFCAG00000028183)	SFMBT1 (ENSFCAG00000003896)	RFT1 (ENSFCAG00000030958)	PRKCD (ENSFCAG00000003900)
Elephant shark	DUPLICATION
Elephant shark	MODERN SPECIES	1716	ECM2 (ENSCMIG00000008862) #15	ENSCMIG00000008859 #13	ippk (ENSCMIG00000008856) #12	ENSCMIG00000008855 #11	ENSCMIG00000008854	ENSCMIG00000008852	ENSCMIG00000008839	ENSCMIG00000008826 #21	ENSCMIG00000008821	ENSCMIG00000008818 #21	ENSCMIG00000008815 #21	ENSCMIG00000008813 #22	ENSCMIG00000008807 #22	ENSCMIG00000008803	ENSCMIG00000008797	ENSCMIG00000008791 #22	NT5DC2 (ENSCMIG00000008673)	PBRM1 (ENSCMIG00000008643)	ENSCMIG00000008635	glt8d1 (ENSCMIG00000008633)	spcs1 (ENSCMIG00000008628)	ENSCMIG00000008625	itih3a.1 (ENSCMIG00000008370)	surf6 (ENSCMIG00000008273)	ENSCMIG00000008271	KLHDC8B (ENSCMIG00000008268)	DCAF1 (ENSCMIG00000008254)	nprl2 (ENSCMIG00000008238)	cyb561d2 (ENSCMIG00000008231)	ENSCMIG00000008229	ENSCMIG00000008222
Elephant shark	MODERN SPECIES	1716	ENSCMIG00000008883 #19	ogna (ENSCMIG00000008879) #18	omd (ENSCMIG00000008877) #17	aspn (ENSCMIG00000008870) #16	ECM2 (ENSCMIG00000008862) #15	ENSCMIG00000008859 #13	ippk (ENSCMIG00000008856) #12	ENSCMIG00000008855 #11	ENSCMIG00000008854	ENSCMIG00000008852	ENSCMIG00000008839	ENSCMIG00000008826 #21	ENSCMIG00000008821	ENSCMIG00000008818 #21	ENSCMIG00000008815 #21	ENSCMIG00000008813 #22	ENSCMIG00000008807 #22	ENSCMIG00000008803	ENSCMIG00000008797	ENSCMIG00000008791 #22	NT5DC2 (ENSCMIG00000008673)	PBRM1 (ENSCMIG00000008643)	ENSCMIG00000008635	glt8d1 (ENSCMIG00000008633)	spcs1 (ENSCMIG00000008628)	ENSCMIG00000008625	itih3a.1 (ENSCMIG00000008370)	surf6 (ENSCMIG00000008273)	ENSCMIG00000008271	KLHDC8B (ENSCMIG00000008268)	DCAF1 (ENSCMIG00000008254)
Elephant shark	MODERN SPECIES	1716	ogna (ENSCMIG00000008879) #18	omd (ENSCMIG00000008877) #17	aspn (ENSCMIG00000008870) #16	ECM2 (ENSCMIG00000008862) #15	ENSCMIG00000008859 #13	ippk (ENSCMIG00000008856) #12	ENSCMIG00000008855 #11	ENSCMIG00000008854	ENSCMIG00000008852	ENSCMIG00000008839	ENSCMIG00000008826 #21	ENSCMIG00000008821	ENSCMIG00000008818 #21	ENSCMIG00000008815 #21	ENSCMIG00000008813 #22	ENSCMIG00000008807 #22	ENSCMIG00000008803	ENSCMIG00000008797	ENSCMIG00000008791 #22	NT5DC2 (ENSCMIG00000008673)	PBRM1 (ENSCMIG00000008643)	ENSCMIG00000008635	glt8d1 (ENSCMIG00000008633)	spcs1 (ENSCMIG00000008628)	ENSCMIG00000008625	itih3a.1 (ENSCMIG00000008370)	surf6 (ENSCMIG00000008273)	ENSCMIG00000008271	KLHDC8B (ENSCMIG00000008268)	DCAF1 (ENSCMIG00000008254)	nprl2 (ENSCMIG00000008238)