Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154461.`c	ENSGT00940000154294.k.a	ENSGT01030000234669.A	ENSGT01090000260018.D.d.b #9	ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.a ##21	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000178333	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00950000186148	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT01030000236091
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	4		ENSGT00940000154461.yb.a	ENSGT00940000154294.k.b	ENSGT00940000154461.`c	ENSGT00940000154294.k.a	ENSGT01030000234669.A	ENSGT01090000260018.D.d.b #9	ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b #21	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000154461.`c	ENSGT00940000154294.k.a	ENSGT01030000234669.A	ENSGT01090000260018.D.d.b #9	ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.f ##21	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000183007.a.b.g.b.c ##7	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.b.j.b ##7	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.b.j.a ##7	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.a #7	ENSGT01090000260018.D.d.b #9	ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a ##21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.e ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.f ##21	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Mus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.e ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.f ##21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.e ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.f ##21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00900000143680 #33	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a.g ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.b #20	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.e ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a.f ##21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00900000143680 #33	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.b.b.j.a ##7	ENSGT00950000183007.a.b.g.a.a #7	ENSGT01090000260018.D.d.b #9	ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.b #20	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b.b #21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00900000143680 #33	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
spretus	MODERN SPECIES	2	Ifi47 (MGP_SPRETEiJ_G0017105) #7	MGP_SPRETEiJ_G0017106 #8	Or2v2 (MGP_SPRETEiJ_G0017107) #9	Or2t26 (MGP_SPRETEiJ_G0017108) #10	Or2o1 (MGP_SPRETEiJ_G0017109) #11	Btnl9 (MGP_SPRETEiJ_G0017110) #12	Zfp62 (MGP_SPRETEiJ_G0017111) #13	Mgat1 (MGP_SPRETEiJ_G0017112) #14	Or2y1e (MGP_SPRETEiJ_G0017113) #15	Or2y1d (MGP_SPRETEiJ_G0017114) #16	MGP_SPRETEiJ_G0017115 #17	Or2y15 (MGP_SPRETEiJ_G0017116) #18	MGP_SPRETEiJ_G0017117 #19	MGP_SPRETEiJ_G0017118 #20	MGP_SPRETEiJ_G0017119 #21	Flt4 (MGP_SPRETEiJ_G0017120) #22	Scgb3a1 (MGP_SPRETEiJ_G0017121) #23	Cnot6 (MGP_SPRETEiJ_G0017122) #24	Gfpt2 (MGP_SPRETEiJ_G0017123) #25	Mapk9 (MGP_SPRETEiJ_G0017124) #26	Rasgef1c (MGP_SPRETEiJ_G0017125) #27	Rnf130 (MGP_SPRETEiJ_G0017126) #28	Tbc1d9b (MGP_SPRETEiJ_G0017127) #29	Mrnip (MGP_SPRETEiJ_G0017128) #30	Sqstm1 (MGP_SPRETEiJ_G0017129) #31	Mgat4b (MGP_SPRETEiJ_G0017130) #32	Ltc4s (MGP_SPRETEiJ_G0017131) #33	Maml1 (MGP_SPRETEiJ_G0017132) #34	Canx (MGP_SPRETEiJ_G0017133) #35	MGP_SPRETEiJ_G0017134 #36	MGP_SPRETEiJ_G0017135 #37
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2049																Flt4 (ENSMSIG00000014828) #22	Scgb3a1 (ENSMSIG00000014808) #23
Mouse	MODERN SPECIES	2	Or2y1g (ENSMUSG00000059864) ##21	Or2y1f (ENSMUSG00000101750) ##21	Or2y1b (ENSMUSG00000100923) ##21	Or2y1e (ENSMUSG00000101874) #15	Or2y17 (ENSMUSG00000045421) ##21	Or2y1d (ENSMUSG00000107573) #16	Or2y16 (ENSMUSG00000047702) #17	Or2y15 (ENSMUSG00000063386) #18	Or2y1c (ENSMUSG00000108167) ##21	Or2y1 (ENSMUSG00000059729) ##21	Or2y14 (ENSMUSG00000044170) #21	Or2y13 (ENSMUSG00000107417) ##21	Or2y12 (ENSMUSG00000063827) ##21	Or2y11 (ENSMUSG00000095187) ##21	Or2y10 (ENSMUSG00000107645) ##21	Flt4 (ENSMUSG00000020357) #22	Scgb3a1 (ENSMUSG00000064057) #23	Cnot6 (ENSMUSG00000020362) #24	Gfpt2 (ENSMUSG00000020363) #25	Mapk9 (ENSMUSG00000020366) #26	Rasgef1c (ENSMUSG00000020374) #27	Rnf130 (ENSMUSG00000020376) #28	Tbc1d9b (ENSMUSG00000036644) #29	Mrnip (ENSMUSG00000020381) #30	Sqstm1 (ENSMUSG00000015837) #31	Mgat4b (ENSMUSG00000036620) #32	Ltc4s (ENSMUSG00000020377) #33	Maml1 (ENSMUSG00000050567) #34	Canx (ENSMUSG00000020368) #35	Cby3 (ENSMUSG00000050087) #36	Hnrnph1 (ENSMUSG00000007850) #37
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	MGP_CAROLIEiJ_G0016260 ##7	Ifi47 (MGP_CAROLIEiJ_G0016261) #7	Or2v1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016262) ##10	Or2t26 (MGP_CAROLIEiJ_G0016263) #10	Or2o1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016264) #11	Btnl9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016265) #12	Zfp62 (MGP_CAROLIEiJ_G0016266) #13	Mgat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016267) #14	Or2y1e (MGP_CAROLIEiJ_G0016268) #15	Or2y1d (MGP_CAROLIEiJ_G0016269) #16	Or2y16 (MGP_CAROLIEiJ_G0016270) #17	Or2y15 (MGP_CAROLIEiJ_G0016271) #18	MGP_CAROLIEiJ_G0016272 #20	MGP_CAROLIEiJ_G0016273 #21	MGP_CAROLIEiJ_G0016274 #21	Flt4 (MGP_CAROLIEiJ_G0016275) #22	Scgb3a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016276) #23	Cnot6 (MGP_CAROLIEiJ_G0016277) #24	Gfpt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0016278) #25	Mapk9 (MGP_CAROLIEiJ_G0016279) #26	Rasgef1c (MGP_CAROLIEiJ_G0016280) #27	Rnf130 (MGP_CAROLIEiJ_G0016281) #28	Tbc1d9b (MGP_CAROLIEiJ_G0016282) #29	Mrnip (MGP_CAROLIEiJ_G0016283) #30	Sqstm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016284) #31	Mgat4b (MGP_CAROLIEiJ_G0016285) #32	Ltc4s (MGP_CAROLIEiJ_G0016286) #33	Maml1 (MGP_CAROLIEiJ_G0016287) #34	Canx (MGP_CAROLIEiJ_G0016288) #35	MGP_CAROLIEiJ_G0016289	MGP_CAROLIEiJ_G0016290 #36
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	MGP_PahariEiJ_G0017396 #9	Or2t26 (MGP_PahariEiJ_G0017397) #10	Or2o1 (MGP_PahariEiJ_G0017398) #11	MGP_PahariEiJ_G0017399 #12	Zfp62 (MGP_PahariEiJ_G0017400) #13	Mgat1 (MGP_PahariEiJ_G0017401) #14	MGP_PahariEiJ_G0017402 #20	Or2y1e (MGP_PahariEiJ_G0017403) #15	MGP_PahariEiJ_G0017404 ##7	MGP_PahariEiJ_G0017405 ##7	Or2y1d (MGP_PahariEiJ_G0017406) #16	Or2y16 (MGP_PahariEiJ_G0017407) #17	Or2y15 (MGP_PahariEiJ_G0017408) #18	MGP_PahariEiJ_G0017409 #21	MGP_PahariEiJ_G0017410 #21	Flt4 (MGP_PahariEiJ_G0017411) #22	Scgb3a1 (MGP_PahariEiJ_G0017412) #23	Cnot6 (MGP_PahariEiJ_G0017413) #24	Gfpt2 (MGP_PahariEiJ_G0017414) #25	Mapk9 (MGP_PahariEiJ_G0017415) #26	Rasgef1c (MGP_PahariEiJ_G0017416) #27	Rnf130 (MGP_PahariEiJ_G0017417) #28	Tbc1d9b (MGP_PahariEiJ_G0017418) #29	Mrnip (MGP_PahariEiJ_G0017419) #30	Sqstm1 (MGP_PahariEiJ_G0017420) #31	Mgat4b (MGP_PahariEiJ_G0017421) #32	MGP_PahariEiJ_G0017422	Maml1 (MGP_PahariEiJ_G0017423) #34	Canx (MGP_PahariEiJ_G0017424) #35	Cby3 (MGP_PahariEiJ_G0017425) #36	Hnrnph1 (MGP_PahariEiJ_G0017426) #37
Rat	MODERN SPECIES	1	Mgat1 (ENSRNOG00000068826) #14	Or2y1g (ENSRNOG00000065390) ##21	Or2y1h (ENSRNOG00000070227) ##21	Or2y1e (ENSRNOG00000064091) #15	ENSRNOG00000066319	Or2y1d (ENSRNOG00000063155) #16	Or2y16 (ENSRNOG00000062670) #17	Or2y15 (ENSRNOG00000069386) #18	Or2y1c (ENSRNOG00000068424) ##21	Or2y1i (ENSRNOG00000065244) ##21	Or2y14 (ENSRNOG00000068465) #21	Or2y13 (ENSRNOG00000066975) ##21	Or2y12 (ENSRNOG00000070927) ##21	Or2y11 (ENSRNOG00000065754) ##21	LOC102555091 (ENSRNOG00000068579)	Flt4 (ENSRNOG00000002511) #22	Scgb3a1 (ENSRNOG00000002718) #23	Cnot6 (ENSRNOG00000054891) #24	Gfpt2 (ENSRNOG00000002810) #25	Mapk9 (ENSRNOG00000002823) #26	Rasgef1c (ENSRNOG00000003005) #27	Rnf130 (ENSRNOG00000046330) #28	Tbc1d9b (ENSRNOG00000003050) #29	Mrnip (ENSRNOG00000003068) #30	Sqstm1 (ENSRNOG00000003147) #31	Mgat4b (ENSRNOG00000003235) #32	Ltc4s (ENSRNOG00000003244) #33	Maml1 (ENSRNOG00000003268) #34	Canx (ENSRNOG00000003343) #35	Cby3 (ENSRNOG00000066223) #36	Hnrnph1 (ENSRNOG00000003399) #37
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a ##21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a ##21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	ENSPEMG00000028956 ##21	ENSPEMG00000031159 ##21	ENSPEMG00000029606 ##21	Or2y1e (ENSPEMG00000024557) #15	Or2y17 (ENSPEMG00000030604) ##21	Or2y1d (ENSPEMG00000030040) #16	Or2y16 (ENSPEMG00000027297) #17	ENSPEMG00000027022 ##21	Or2y15 (ENSPEMG00000024495) #18	ENSPEMG00000029327 ##21	ENSPEMG00000029838 #21	ENSPEMG00000026297 ##21	ENSPEMG00000028647 ##21	ENSPEMG00000024369 ##21	ENSPEMG00000026395 ##21	Flt4 (ENSPEMG00000013317) #22	Scgb3a1 (ENSPEMG00000001932) #23	Cnot6 (ENSPEMG00000000627) #24	Gfpt2 (ENSPEMG00000001870) #25	Mapk9 (ENSPEMG00000016205) #26	Rasgef1c (ENSPEMG00000018905) #27	Rnf130 (ENSPEMG00000016730) #28	Tbc1d9b (ENSPEMG00000013746) #29	Mrnip (ENSPEMG00000018478) #30	Sqstm1 (ENSPEMG00000019274) #31	Mgat4b (ENSPEMG00000014635) #32	Ltc4s (ENSPEMG00000027708) #33	Maml1 (ENSPEMG00000019224) #34	Canx (ENSPEMG00000005531) #35	ENSPEMG00000017877 #36	Hnrnph1 (ENSPEMG00000018866) #37
Prairie vole	MODERN SPECIES	15	Trim7 (ENSMOCG00000012310)	Irgm1 (ENSMOCG00000009734) ##7	ENSMOCG00000008024 ##7	ENSMOCG00000016393 ##7	ENSMOCG00000012574 ##7	Or2v1 (ENSMOCG00000003060) ##10	Or2t26 (ENSMOCG00000003090) #10	Btnl9 (ENSMOCG00000022810) #12	Zfp62 (ENSMOCG00000020277) #13	Mgat1 (ENSMOCG00000018641) #14	ENSMOCG00000002296 ##21	ENSMOCG00000001892 ##21	Or2y1e (ENSMOCG00000002007) #15	ENSMOCG00000002339 ##21	ENSMOCG00000002436 ##21	Flt4 (ENSMOCG00000016968) #22	Scgb3a1 (ENSMOCG00000018902) #23	Cnot6 (ENSMOCG00000021662) #24	Gfpt2 (ENSMOCG00000022580) #25	Mapk9 (ENSMOCG00000020546) #26	Rasgef1c (ENSMOCG00000017254) #27	Rnf130 (ENSMOCG00000022727) #28	Tbc1d9b (ENSMOCG00000017854) #29	Mrnip (ENSMOCG00000014732) #30	ENSMOCG00000019043	ENSMOCG00000002756	Mgat4b (ENSMOCG00000010677) #32	ENSMOCG00000021052	Maml1 (ENSMOCG00000001181) #34	Canx (ENSMOCG00000011838) #35	ENSMOCG00000011359 #36
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.a ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.a #16	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.a #17	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.b.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a.e.b.b #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.b ##21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.b #21	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.b.a.a.a.a ##21	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	229	Or2o1 (ENSCGRG00001008440) #11	Btnl9 (ENSCGRG00001004215) #12	Mgat1 (ENSCGRG00001009916) #14	ENSCGRG00001007853 ##21	Or2y1e (ENSCGRG00001007503) #15	Or2y17 (ENSCGRG00001009532) ##21	Or2y1d (ENSCGRG00001007708) #16	Or2y16 (ENSCGRG00001011387) #17	ENSCGRG00001006876 ##21	ENSCGRG00001005846 #18	ENSCGRG00001004527 #18	ENSCGRG00001006709 ##21	ENSCGRG00001005729 #21	ENSCGRG00001015595 ##21	ENSCGRG00001001933 ##21	Flt4 (ENSCGRG00001019633) #22	Scgb3a1 (ENSCGRG00001005289) #23	Cnot6 (ENSCGRG00001011452) #24	Gfpt2 (ENSCGRG00001020958) #25	Mapk9 (ENSCGRG00001007000) #26	Rasgef1c (ENSCGRG00001012629) #27	Rnf130 (ENSCGRG00001021248) #28	Tbc1d9b (ENSCGRG00001020092) #29	Mrnip (ENSCGRG00001004426) #30	Sqstm1 (ENSCGRG00001009697) #31	ENSCGRG00001010734	Mgat4b (ENSCGRG00001006474) #32	ENSCGRG00001013494	Maml1 (ENSCGRG00001016447) #34	Canx (ENSCGRG00001017710) #35	Cby3 (ENSCGRG00001009348) #36
Golden Hamster	MODERN SPECIES	647	Dppa1 (ENSMAUG00000014594)	Timd4 (ENSMAUG00000003000)	ENSMAUG00000011659	ENSMAUG00000008048	ENSMAUG00000001081	Ifi47 (ENSMAUG00000006870) #7	Or2v1 (ENSMAUG00000017002) ##10	Or2t26 (ENSMAUG00000016888) #10	Btnl9 (ENSMAUG00000000678) #12	ENSMAUG00000016879 ##21	Or2y1e (ENSMAUG00000016843) #15	Or2y1d (ENSMAUG00000017011) #16	Or2y16 (ENSMAUG00000016979) #17	ENSMAUG00000016974 ##21	ENSMAUG00000018285 ##21	Flt4 (ENSMAUG00000014271) #22	Scgb3a1 (ENSMAUG00000012240) #23	Cnot6 (ENSMAUG00000019798) #24	Gfpt2 (ENSMAUG00000000755) #25	Mapk9 (ENSMAUG00000017175) #26	Rasgef1c (ENSMAUG00000017005) #27	Rnf130 (ENSMAUG00000015405) #28	Tbc1d9b (ENSMAUG00000014065) #29	Mrnip (ENSMAUG00000016042) #30	Sqstm1 (ENSMAUG00000014382) #31	Mgat4b (ENSMAUG00000000092) #32	ENSMAUG00000004203	Maml1 (ENSMAUG00000011048) #34	Canx (ENSMAUG00000007570) #35	ENSMAUG00000005355 #36	Hnrnph1 (ENSMAUG00000012959) #37
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1624																Flt4 (ENSNGAG00000013547) #22	Scgb3a1 (ENSNGAG00000011521) #23	Cnot6 (ENSNGAG00000008269) #24	Gfpt2 (ENSNGAG00000014610) #25	Mapk9 (ENSNGAG00000019965) #26	Rasgef1c (ENSNGAG00000020883) #27	Rnf130 (ENSNGAG00000000237) #28	ENSNGAG00000013038	Tbc1d9b (ENSNGAG00000020655) #29	Mrnip (ENSNGAG00000019013) #30	Sqstm1 (ENSNGAG00000000111) #31	Mgat4b (ENSNGAG00000011567) #32	ENSNGAG00000019905	Maml1 (ENSNGAG00000007418) #34	Canx (ENSNGAG00000009718) #35	ENSNGAG00000019073 #36
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	133	ENSJJAG00000009096	Fnip1 (ENSJJAG00000023248)	Rapgef6 (ENSJJAG00000021502)	Cdc42se2 (ENSJJAG00000016990)	ENSJJAG00000021235	Gpx3 (ENSJJAG00000024418)	Tnip1 (ENSJJAG00000010474)	Anxa6 (ENSJJAG00000019090)	ENSJJAG00000000754	Gm2a (ENSJJAG00000017378)	Slc36a3 (ENSJJAG00000012424)	Slc36a2 (ENSJJAG00000022506)	Slc36a1 (ENSJJAG00000015295)	Fat2 (ENSJJAG00000019929)	Sparc (ENSJJAG00000003597)	Flt4 (ENSJJAG00000017737) #22	Scgb3a1 (ENSJJAG00000011541) #23	Cnot6 (ENSJJAG00000012296) #24	Gfpt2 (ENSJJAG00000014420) #25	Mapk9 (ENSJJAG00000012308) #26	Rasgef1c (ENSJJAG00000016338) #27	Rnf130 (ENSJJAG00000014438) #28	ENSJJAG00000013685	Tbc1d9b (ENSJJAG00000013138) #29	Mrnip (ENSJJAG00000010968) #30	ENSJJAG00000012040 #31	Mgat4b (ENSJJAG00000021000) #32	ENSJJAG00000019535	Maml1 (ENSJJAG00000023847) #34	Canx (ENSJJAG00000022784) #35	ENSJJAG00000014052 #36
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	454	ENSDORG00000012988	Sgcd (ENSDORG00000000348)	Mrpl22 (ENSDORG00000010733)	ENSDORG00000010735	ENSDORG00000025352	ENSDORG00000027801	Trim7 (ENSDORG00000010737)	Or2v1 (ENSDORG00000013183) ##10	Btnl9 (ENSDORG00000002028) #12	Or2y1e (ENSDORG00000028730) #15	ENSDORG00000023920 ##21	ENSDORG00000028273 #17	ENSDORG00000023565 #17	ENSDORG00000024307 #15	ENSDORG00000024367 #15	Flt4 (ENSDORG00000012877) #22	Scgb3a1 (ENSDORG00000027422) #23	Cnot6 (ENSDORG00000001708) #24	Gfpt2 (ENSDORG00000003922) #25	Mapk9 (ENSDORG00000003921) #26	Rasgef1c (ENSDORG00000003918) #27	Rnf130 (ENSDORG00000012990) #28	Tbc1d9b (ENSDORG00000014854) #29	Sqstm1 (ENSDORG00000014852) #31	Mgat4b (ENSDORG00000007019) #32	ENSDORG00000025410	Maml1 (ENSDORG00000023567) #34	Canx (ENSDORG00000002108) #35	ENSDORG00000024643 #36	Hnrnph1 (ENSDORG00000005453) #37	Rufy1 (ENSDORG00000005452)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000154461.`c	ENSGT00940000154294.k.a	ENSGT00940000154294.k.b	ENSGT00940000154294.l	ENSGT01030000234669.A	ENSGT01090000260018.D.d.b #9	ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a #18	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000178333	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00950000186148	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT01030000236091
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000154294.k.a	ENSGT01030000234669.A	ENSGT01090000260018.D.d.b #9	ENSGT01090000260018.D.d.a ##10	ENSGT01090000260018.A.a.b #10	ENSGT01090000259995.b.a.a.b #11	ENSGT00940000160338 #12	ENSGT00940000162750 #13	ENSGT00530000063632.B #14	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a.c.a.b.b #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a.c.a.b.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a.c.a.a #15	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.a #18	ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a.d #15	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000178333	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00950000186148	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT01030000236091
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	90														ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a.d.b.a #15	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00950000186148	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	162														ENSGT01100000263486.a.b.a.a.a.a.a.b.a.b.a.a.b.f.b.a.a.d.b.a #15	ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	533														ENSUPAG00010013751 #15	ENSUPAG00010013659	FLT4 (ENSUPAG00010013592) #22	SCGB3A1 (ENSUPAG00010013577) #23	CNOT6 (ENSUPAG00010013547) #24	ENSUPAG00010013530	GFPT2 (ENSUPAG00010013498) #25	MAPK9 (ENSUPAG00010013292) #26	RASGEF1C (ENSUPAG00010013202) #27	RNF130 (ENSUPAG00010013174) #28	TBC1D9B (ENSUPAG00010013038) #29	MRNIP (ENSUPAG00010013026) #30	SQSTM1 (ENSUPAG00010012981) #31	MGAT4B (ENSUPAG00010012951) #32	LTC4S (ENSUPAG00010012940)	MAML1 (ENSUPAG00010012921) #34	CANX (ENSUPAG00010012868) #35
Squirrel	MODERN SPECIES	339													ENSSTOG00000034786	ENSSTOG00000023199 #15	ENSSTOG00000024162 ##21	FLT4 (ENSSTOG00000009900) #22	SCGB3A1 (ENSSTOG00000029379) #23	CNOT6 (ENSSTOG00000002803) #24	ENSSTOG00000026322	GFPT2 (ENSSTOG00000002766) #25	MAPK9 (ENSSTOG00000002755) #26	RASGEF1C (ENSSTOG00000002744) #27	RNF130 (ENSSTOG00000013681) #28	TBC1D9B (ENSSTOG00000013665) #29	ENSSTOG00000013660 #30	SQSTM1 (ENSSTOG00000013654) #31	MGAT4B (ENSSTOG00000015692) #32	LTC4S (ENSSTOG00000028546)	MAML1 (ENSSTOG00000013644) #34	CANX (ENSSTOG00000013636) #35	CBY3 (ENSSTOG00000013625) #36
Alpin marmot	MODERN SPECIES	119											ENSMMMG00000009788 #15	ENSMMMG00000009796 #15	ENSMMMG00000009800 #15	ENSMMMG00000009807 #15	ENSMMMG00000009813	FLT4 (ENSMMMG00000009846) #22	SCGB3A1 (ENSMMMG00000009881) #23	CNOT6 (ENSMMMG00000009896) #24	ENSMMMG00000009920	ENSMMMG00000009922	GFPT2 (ENSMMMG00000009950) #25	MAPK9 (ENSMMMG00000009979) #26	RASGEF1C (ENSMMMG00000010333) #27	RNF130 (ENSMMMG00000010453) #28	TBC1D9B (ENSMMMG00000010464) #29	ENSMMMG00000010472	ENSMMMG00000010477 #30	ENSMMMG00000010488	SQSTM1 (ENSMMMG00000010495) #31	MGAT4B (ENSMMMG00000010531) #32	LTC4S (ENSMMMG00000010544)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	30															ENSGT00940000163029	ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000006124 #30	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153137.a.b.a #36	ENSGT00940000153503.a.a #37
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	74																ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153503.a.a #37	ENSGT00940000158334	ENSGT00940000156647
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	19																ENSGT00940000159358 #22	ENSGT00420000029848.A #23	ENSGT00940000158978 #24	ENSGT00940000156413 #25	ENSGT00940000158327 #26	ENSGT00940000161005 #27	ENSGT00940000157465 #28	ENSGT00940000158554 #29	ENSGT00390000002781 #31	ENSGT00940000156526.a #32	ENSGT00940000160738	ENSGT00950000183201.b.b.b.a #34	ENSGT00950000182915.a.a.a #35	ENSGT00940000153503.a.a #37	ENSGT00940000158334	ENSGT00940000156647
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	115																FLT4 (ENSCLAG00000012174) #22	SCGB3A1 (ENSCLAG00000017376) #23	CNOT6 (ENSCLAG00000010489) #24	GFPT2 (ENSCLAG00000011097) #25	MAPK9 (ENSCLAG00000011477) #26	RASGEF1C (ENSCLAG00000010592) #27	RNF130 (ENSCLAG00000012509) #28	TBC1D9B (ENSCLAG00000010716) #29	SQSTM1 (ENSCLAG00000014864) #31	MGAT4B (ENSCLAG00000013986) #32	MAML1 (ENSCLAG00000012443) #34	CANX (ENSCLAG00000012635) #35	HNRNPH1 (ENSCLAG00000013617) #37	RUFY1 (ENSCLAG00000012650)	ADAMTS2 (ENSCLAG00000012213)	ZNF354C (ENSCLAG00000012651)
Degu	MODERN SPECIES	70																FLT4 (ENSODEG00000006420) #22	SCGB3A1 (ENSODEG00000006628) #23	CNOT6 (ENSODEG00000007041) #24	ENSODEG00000006939	GFPT2 (ENSODEG00000007246) #25	ENSODEG00000006074 #26	RNF130 (ENSODEG00000006815) #28	TBC1D9B (ENSODEG00000007268) #29	SQSTM1 (ENSODEG00000007536) #31	MGAT4B (ENSODEG00000006661) #32	LTC4S (ENSODEG00000006956)	MAML1 (ENSODEG00000007120) #34	CANX (ENSODEG00000007247) #35	ENSODEG00000007058 #37	RUFY1 (ENSODEG00000006045)	ADAMTS2 (ENSODEG00000010343)
Guinea pig	MODERN SPECIES	232															ENSCPOG00000021043	FLT4 (ENSCPOG00000008026) #22	SCGB3A1 (ENSCPOG00000036615) #23	ENSCPOG00000022262	CNOT6 (ENSCPOG00000035657) #24	GFPT2 (ENSCPOG00000013949) #25	MAPK9 (ENSCPOG00000013948) #26
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	23	ENSHGLG00000018064	DMXL1 (ENSHGLG00000015447)	ENSHGLG00000013163	ENSHGLG00000008817	HSD17B4 (ENSHGLG00000006574)	FAM170A (ENSHGLG00000013651)	ENSHGLG00000049468	ENSHGLG00000001749	ENSHGLG00000032307	ENSHGLG00000039428	ENSHGLG00000041133	ENSHGLG00000041991	ENSHGLG00000049749	ENSHGLG00000033873	ENSHGLG00000019068	ENSHGLG00000017837 #22	ENSHGLG00000015320 #23	CNOT6 (ENSHGLG00000017756) #24	GFPT2 (ENSHGLG00000018020) #25	MAPK9 (ENSHGLG00000018063) #26	ENSHGLG00000039343	RASGEF1C (ENSHGLG00000018254) #27	ENSHGLG00000016658	RNF130 (ENSHGLG00000019044) #28	TBC1D9B (ENSHGLG00000014248) #29	ENSHGLG00000034162 #30	SQSTM1 (ENSHGLG00000012249) #31	ENSHGLG00000010792 #32	LTC4S (ENSHGLG00000008079)	MAML1 (ENSHGLG00000007422) #34	ENSHGLG00000014507 #35