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Guinea pig	MODERN SPECIES	86	CALR3 (ENSCPOG00000009145) #7	ENSCPOG00000021179 #8	CHERP (ENSCPOG00000019949) #9	SLC35E1 (ENSCPOG00000008975) #10	MED26 (ENSCPOG00000032983) #11	SMIM7 (ENSCPOG00000039863) #12	TMEM38A (ENSCPOG00000026018) #13	NWD1 (ENSCPOG00000024668) #14	SIN3B (ENSCPOG00000025963) #15	F2RL3 (ENSCPOG00000040487) #16	HAUS8 (ENSCPOG00000023189) #17	MYO9B (ENSCPOG00000022307) #18	USE1 (ENSCPOG00000024594) #19	ENSCPOG00000007032 #20	NR2F6 (ENSCPOG00000025861) #21	BABAM1 (ENSCPOG00000006927) #22	ANKLE1 (ENSCPOG00000006932) #23	ABHD8 (ENSCPOG00000006938) #24	MRPL34 (ENSCPOG00000038177) #25	DDA1 (ENSCPOG00000006944) #26	ANO8 (ENSCPOG00000006946) #27	GTPBP3 (ENSCPOG00000027093) #28	ENSCPOG00000006951 #29	CCDC194 (ENSCPOG00000036327) #30	MVB12A (ENSCPOG00000004492) #31	ENSCPOG00000004500 #32	SLC27A1 (ENSCPOG00000009747) #33	PGLS (ENSCPOG00000039654) #34	NIBAN3 (ENSCPOG00000013004) #35	COLGALT1 (ENSCPOG00000011059) #36	UNC13A (ENSCPOG00000026908) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00390000002505 #8	ENSGT00730000111147 #9	ENSGT00940000159007 #10	ENSGT00390000000259 #11	ENSGT00390000014626 #12	ENSGT00390000018845.f #13	ENSGT00940000161635 #14	ENSGT00940000159560 #15	ENSGT01050000244840.A.b.a #16	ENSGT00390000010974 #17	ENSGT00940000156845 #18	ENSGT00390000014361 #19	ENSGT00940000162475 #20	ENSGT00940000160748 #21	ENSGT00530000063974.a	ENSGT00390000016934 #22	ENSGT00510000049316 #23	ENSGT00390000007336 #24	ENSGT00390000012240 #25	ENSGT00390000007029.j #26	ENSGT00940000157019 #27	ENSGT00390000016851 #28	ENSGT00390000006166 #29	ENSGT00850000133633 #30	ENSGT00390000013782	ENSGT00940000160542 #31	ENSGT00390000001907 #32	ENSGT00940000161246	ENSGT00940000159323 #33	ENSGT00550000075110 #34	ENSGT00940000154149.b.b #35
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	231	ENSCLAG00000004795	EPS15L1 (ENSCLAG00000003824)	CALR3 (ENSCLAG00000003434) #7	ENSCLAG00000005950 #8	CHERP (ENSCLAG00000005484) #9	SLC35E1 (ENSCLAG00000005367) #10	MED26 (ENSCLAG00000005164) #11	TMEM38A (ENSCLAG00000004970) #13	NWD1 (ENSCLAG00000007464) #14	SIN3B (ENSCLAG00000006937) #15	F2RL3 (ENSCLAG00000006791) #16	MYO9B (ENSCLAG00000006247) #18	USE1 (ENSCLAG00000006857) #19	ENSCLAG00000006628 #20	USHBP1 (ENSCLAG00000006311)	BABAM1 (ENSCLAG00000006202) #22	ABHD8 (ENSCLAG00000008511) #24	MRPL34 (ENSCLAG00000008278) #25	DDA1 (ENSCLAG00000008060) #26	ANO8 (ENSCLAG00000008087) #27	PLVAP (ENSCLAG00000008012) #29	MVB12A (ENSCLAG00000007762) #31	ENSCLAG00000007691 #32	NXNL1 (ENSCLAG00000007147)	SLC27A1 (ENSCLAG00000007064) #33	PGLS (ENSCLAG00000006976) #34	NIBAN3 (ENSCLAG00000006889) #35	COLGALT1 (ENSCLAG00000006799) #36	ENSCLAG00000005460	ENSCLAG00000005168	ENSCLAG00000005014
Degu	MODERN SPECIES	345	ENSODEG00000001503 #7	CHERP (ENSODEG00000001528) #9	SLC35E1 (ENSODEG00000001560) #10	MED26 (ENSODEG00000001579) #11	SMIM7 (ENSODEG00000001606) #12	TMEM38A (ENSODEG00000001632) #13	NWD1 (ENSODEG00000001676) #14	SIN3B (ENSODEG00000001769) #15	F2RL3 (ENSODEG00000001898) #16	ENSODEG00000001912 #17	MYO9B (ENSODEG00000002010) #18	USE1 (ENSODEG00000002167) #19	ENSODEG00000002226 #20	NR2F6 (ENSODEG00000002243) #21	USHBP1 (ENSODEG00000001357)	BABAM1 (ENSODEG00000001401) #22	ANKLE1 (ENSODEG00000001442) #23	ABHD8 (ENSODEG00000001471) #24	MRPL34 (ENSODEG00000001492) #25	ENSODEG00000001501 #26	ANO8 (ENSODEG00000001546) #27	ENSODEG00000001637 #28	CCDC194 (ENSODEG00000001653) #30	ENSODEG00000001667	MVB12A (ENSODEG00000001694) #31	TMEM221 (ENSODEG00000001734) #32	NXNL1 (ENSODEG00000001748)	SLC27A1 (ENSODEG00000001784) #33	PGLS (ENSODEG00000001872) #34	NIBAN3 (ENSODEG00000001914) #35	COLGALT1 (ENSODEG00000001952) #36