Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000177852 Sauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000177852 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00960000192062 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 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(ENSPTXG00000014562) LAPTM4A (ENSPTXG00000014563) SDC1 (ENSPTXG00000014564) PUM2 (ENSPTXG00000014565) ENSPTXG00000014566 RHOB (ENSPTXG00000014567) HS1BP3 (ENSPTXG00000014568) GDF7 (ENSPTXG00000014569) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5826 GEN1 (ENSLLTG00000006176) ##22 MSGN1 (ENSLLTG00000006170) KCNS3 (ENSLLTG00000006167) Indian cobra MODERN SPECIES ROCK2 (ENSNNAG00000012714) E2F6 (ENSNNAG00000004227) ENSNNAG00000004249 GREB1 (ENSNNAG00000004275) LPIN1 (ENSNNAG00000004384) TRIB2 (ENSNNAG00000004479) LRATD1 (ENSNNAG00000004490) NBAS (ENSNNAG00000004531) DDX1 (ENSNNAG00000004957) MYCN (ENSNNAG00000005197) CYRIA (ENSNNAG00000005209) ENSNNAG00000005240 ENSNNAG00000005266 VSNL1 (ENSNNAG00000005283) SMC6 (ENSNNAG00000005310) ENSNNAG00000005468 #22 MSGN1 (ENSNNAG00000005477) KCNS3 (ENSNNAG00000005487) WDR35 (ENSNNAG00000005515) RDH14 (ENSNNAG00000005638) NT5C1B (ENSNNAG00000005647) OSR1 (ENSNNAG00000005665) ENSNNAG00000005690 TTC32 (ENSNNAG00000005721) LAPTM4A (ENSNNAG00000005741) ENSNNAG00000005759 ENSNNAG00000005775 PUM2 (ENSNNAG00000005799) ENSNNAG00000005965 RHOB (ENSNNAG00000006172) HS1BP3 (ENSNNAG00000006192) Lizard MODERN SPECIES ENSACAG00000038536 LRATD1 (ENSACAG00000000402) ENSACAG00000036783 ENSACAG00000038844 ENSACAG00000042544 ENSACAG00000036037 ENSACAG00000040466 NBAS (ENSACAG00000010861) DDX1 (ENSACAG00000011036) MYCN (ENSACAG00000011351) CYRIA (ENSACAG00000000956) ENSACAG00000042126 VSNL1 (ENSACAG00000001746) ENSACAG00000040359 SMC6 (ENSACAG00000001613) GEN1 (ENSACAG00000001607) #22 MSGN1 (ENSACAG00000001604) KCNS3 (ENSACAG00000001600) ENSACAG00000034780 ENSACAG00000010816 ENSACAG00000043172 ENSACAG00000038525 ENSACAG00000004579 ENSACAG00000038429 ENSACAG00000035373 ENSACAG00000034865 KLHL29 (ENSACAG00000011365) ATAD2B (ENSACAG00000011448) UBXN2A (ENSACAG00000011587) MFSD2B (ENSACAG00000029258) WDCP (ENSACAG00000011645) Laterata ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160213 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D 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(ENSSMRG00000022755) GEN1 (ENSSMRG00000022756) #22 MSGN1 (ENSSMRG00000022757) KCNS3 (ENSSMRG00000022758) WDR35 (ENSSMRG00000022759) RDH14 (ENSSMRG00000022761) NT5C1B (ENSSMRG00000022762) Common wall lizard MODERN SPECIES 11 ESF1 (ENSPMRG00000002058) NDUFAF5 (ENSPMRG00000002068) SEL1L2 (ENSPMRG00000002085) ENSPMRG00000002121 FLRT3 (ENSPMRG00000002123) KIF16B (ENSPMRG00000002144) SNRPB2 (ENSPMRG00000002233) OTOR (ENSPMRG00000002241) PCSK2 (ENSPMRG00000002244) BFSP1 (ENSPMRG00000002249) ENSPMRG00000002256 ENSPMRG00000002259 ENSPMRG00000002261 VSNL1 (ENSPMRG00000002266) SMC6 (ENSPMRG00000002270) GEN1 (ENSPMRG00000002288) #22 KCNS3 (ENSPMRG00000002300) WDR35 (ENSPMRG00000002308) RDH14 (ENSPMRG00000002345) NT5C1B (ENSPMRG00000002348) OSR1 (ENSPMRG00000002362) ENSPMRG00000002372 TTC32 (ENSPMRG00000002380) LAPTM4A (ENSPMRG00000002388) MATN3 (ENSPMRG00000002396) SDC1 (ENSPMRG00000002406) PUM2 (ENSPMRG00000010266) ENSPMRG00000010287 RHOB (ENSPMRG00000010292) HS1BP3 (ENSPMRG00000010298) GDF7 (ENSPMRG00000010304) tuatara MODERN SPECIES 709 VSNL1 (ENSSPUG00000002309) SMC6 (ENSSPUG00000002341) ENSSPUG00000002388 #22 KCNS3 (ENSSPUG00000002407) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000177852 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d Aves ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000180923 ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000180923 ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000180923 ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d Anatidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000180923 ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d Pink-footed goose MODERN SPECIES 171 CYRIA (ENSABRG00000014109) ENSABRG00000014137 VSNL1 (ENSABRG00000014146) SMC6 (ENSABRG00000014152) GEN1 (ENSABRG00000014167) #22 MSGN1 (ENSABRG00000014179) ENSABRG00000014184 KCNS3 (ENSABRG00000014206) RDH14 (ENSABRG00000014216) NT5C1B (ENSABRG00000014218) Duck MODERN SPECIES 21 UFL1 (ENSAPLG00000005301) FHL5 (ENSAPLG00000005672) GPR63 (ENSAPLG00000001077) NDUFAF4 (ENSAPLG00000005892) KLHL32 (ENSAPLG00000005979) MMS22L (ENSAPLG00000006108) TRIB2 (ENSAPLG00000013170) LRATD1 (ENSAPLG00000011566) NBAS (ENSAPLG00000012361) DDX1 (ENSAPLG00000011093) MYCN (ENSAPLG00000009825) CYRIA (ENSAPLG00000009498) ENSAPLG00000025611 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Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734.ab ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00940000164003 Chicken MODERN SPECIES 22 SLC66A3 (ENSGALG00010002673) ROCK2 (ENSGALG00010002706) E2F6 (ENSGALG00010002730) GREB1 (ENSGALG00010002758) LPIN1 (ENSGALG00010002832) TRIB2 (ENSGALG00010002848) FAM84A (ENSGALG00010002918) NBAS (ENSGALG00010002952) DDX1 (ENSGALG00010003057) ENSGALG00010003639 MYCN 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ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000180923 ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00940000164003 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Golden eagle MODERN SPECIES 6 ROCK2 (ENSACCG00020011682) E2F6 (ENSACCG00020011591) GREB1 (ENSACCG00020011499) LPIN1 (ENSACCG00020011416) TRIB2 (ENSACCG00020011397) ENSACCG00020011382 ENSACCG00020011374 LRATD1 (ENSACCG00020011362) NBAS (ENSACCG00020011318) DDX1 (ENSACCG00020011276) MYCN (ENSACCG00020011258) CYRIA (ENSACCG00020011233) ENSACCG00020011205 VSNL1 (ENSACCG00020011201) SMC6 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Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219.a ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.jb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000177852 ENSGT00940000162520.d ENSGT00940000164003 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219.a ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.jb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000153446.b.s ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00940000164003 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b painted turtle MODERN SPECIES 2390 KCNF1 (ENSCPBG00000014030) C2orf50 (ENSCPBG00000014027) SLC66A3 (ENSCPBG00000014025) ROCK2 (ENSCPBG00000014009) E2F6 (ENSCPBG00000014007) GREB1 (ENSCPBG00000014004) LPIN1 (ENSCPBG00000014000) TRIB2 (ENSCPBG00000013994) LRATD1 (ENSCPBG00000013990) NBAS (ENSCPBG00000013977) DDX1 (ENSCPBG00000013330) ENSCPBG00000013321 CYRIA (ENSCPBG00000013312) VSNL1 (ENSCPBG00000013304) SMC6 (ENSCPBG00000013302) GEN1 (ENSCPBG00000013299) #22 MSGN1 (ENSCPBG00000013298) ENSCPBG00000013295 KCNS3 (ENSCPBG00000013292) RDH14 (ENSCPBG00000013290) NT5C1B (ENSCPBG00000013288) ENSCPBG00000013282 OSR1 (ENSCPBG00000013280) Three-toed box turtle MODERN SPECIES 15 C2orf50 (ENSTMTG00000002318) ROCK2 (ENSTMTG00000002325) E2F6 (ENSTMTG00000002335) GREB1 (ENSTMTG00000002344) ENSTMTG00000002372 LPIN1 (ENSTMTG00000002382) TRIB2 (ENSTMTG00000002404) LRATD1 (ENSTMTG00000002408) NBAS (ENSTMTG00000002506) DDX1 (ENSTMTG00000003436) ENSTMTG00000003512 CYRIA (ENSTMTG00000003533) RAD51AP2 (ENSTMTG00000003579) VSNL1 (ENSTMTG00000003601) SMC6 (ENSTMTG00000003697) GEN1 (ENSTMTG00000004477) #22 MSGN1 (ENSTMTG00000004516) KCNS3 (ENSTMTG00000004528) RDH14 (ENSTMTG00000004538) NT5C1B (ENSTMTG00000004549) ENSTMTG00000005639 OSR1 (ENSTMTG00000005645) ENSTMTG00000005663 TTC32 (ENSTMTG00000005737) WDR35 (ENSTMTG00000005747) ENSTMTG00000005813 SDC1 (ENSTMTG00000005833) PUM2 (ENSTMTG00000005851) ENSTMTG00000005951 ENSTMTG00000006051 RHOB (ENSTMTG00000006061) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D 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(ENSPSIG00000011751) ENSPSIG00000011721 TTC32 (ENSPSIG00000011713) WDR35 (ENSPSIG00000011703) LAPTM4A (ENSPSIG00000011641) SDC1 (ENSPSIG00000011638) PUM2 (ENSPSIG00000011626) ENSPSIG00000011571 ENSPSIG00000001835 RHOB (ENSPSIG00000011554) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d Theria ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000153916.B 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ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Microbat MODERN SPECIES 1102 TRIB2 (ENSMLUG00000003079) ENSMLUG00000025107 LRATD1 (ENSMLUG00000010312) NBAS (ENSMLUG00000002994) DDX1 (ENSMLUG00000003027) ENSMLUG00000006738 ENSMLUG00000026821 CYRIA (ENSMLUG00000001745) VSNL1 (ENSMLUG00000023070) SMC6 (ENSMLUG00000014744) GEN1 (ENSMLUG00000007576) #22 MSGN1 (ENSMLUG00000007599) KCNS3 (ENSMLUG00000005107) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 4 SLC66A3 (ENSRFEG00010008070) ROCK2 (ENSRFEG00010007837) E2F6 (ENSRFEG00010007627) GREB1 (ENSRFEG00010007141) LPIN1 (ENSRFEG00010006930) TRIB2 (ENSRFEG00010006836) ENSRFEG00010006807 LRATD1 (ENSRFEG00010006783) 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ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT01090000263317.a ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Horse MODERN SPECIES 6 LPIN1 (ENSECAG00000011239) TRIB2 (ENSECAG00000010405) ENSECAG00000050817 ENSECAG00000038530 ENSECAG00000007860 LRATD1 (ENSECAG00000027835) NBAS (ENSECAG00000016641) DDX1 (ENSECAG00000016396) ENSECAG00000037590 MYCN (ENSECAG00000002896) ENSECAG00000018361 CYRIA (ENSECAG00000014952) RAD51AP2 (ENSECAG00000014706) VSNL1 (ENSECAG00000013682) SMC6 (ENSECAG00000022265) GEN1 (ENSECAG00000020295) #22 MSGN1 (ENSECAG00000002724) KCNS3 (ENSECAG00000019779) RDH14 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(ENSEASG00005009414) SDC1 (ENSEASG00005009418) PUM2 (ENSEASG00005009429) ENSEASG00005009442 ENSEASG00005027331 RHOB (ENSEASG00005009448) HS1BP3 (ENSEASG00005009454) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b.f ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Ursus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b.f ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Polar bear MODERN SPECIES 223 NBAS (ENSUMAG00000023486) DDX1 (ENSUMAG00000023450) ENSUMAG00000023445 ENSUMAG00000023442 ENSUMAG00000023440 CYRIA (ENSUMAG00000023433) RAD51AP2 (ENSUMAG00000023423) VSNL1 (ENSUMAG00000023419) SMC6 (ENSUMAG00000023406) GEN1 (ENSUMAG00000023394) #22 MSGN1 (ENSUMAG00000023391) KCNS3 (ENSUMAG00000023389) RDH14 (ENSUMAG00000023381) NT5C1B (ENSUMAG00000023377) OSR1 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(ENSMPUG00000013624) ENSMPUG00000013627 RAD51AP2 (ENSMPUG00000013634) VSNL1 (ENSMPUG00000013641) SMC6 (ENSMPUG00000013644) GEN1 (ENSMPUG00000013651) #22 MSGN1 (ENSMPUG00000019484) KCNS3 (ENSMPUG00000019486) RDH14 (ENSMPUG00000013659) NT5C1B (ENSMPUG00000013662) OSR1 (ENSMPUG00000013697) TTC32 (ENSMPUG00000013701) WDR35 (ENSMPUG00000013708) MATN3 (ENSMPUG00000013713) LAPTM4A (ENSMPUG00000013714) SDC1 (ENSMPUG00000013732) PUM2 (ENSMPUG00000013734) ENSMPUG00000013736 RHOB (ENSMPUG00000019487) HS1BP3 (ENSMPUG00000013739) GDF7 (ENSMPUG00000013742) Canidae ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000154502.u.b ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00980000202730 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000154502.u.b ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00980000202468 ENSGT00980000202730 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 223 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leopard MODERN SPECIES C2orf50 (ENSPPRG00000018217) SLC66A3 (ENSPPRG00000018314) ROCK2 (ENSPPRG00000018610) E2F6 (ENSPPRG00000018702) GREB1 (ENSPPRG00000019270) LPIN1 (ENSPPRG00000019764) TRIB2 (ENSPPRG00000019893) LRATD1 (ENSPPRG00000020023) NBAS (ENSPPRG00000020146) DDX1 (ENSPPRG00000020556) MYCN (ENSPPRG00000020616) CYRIA (ENSPPRG00000020692) RAD51AP2 (ENSPPRG00000020727) VSNL1 (ENSPPRG00000020771) SMC6 (ENSPPRG00000020812) GEN1 (ENSPPRG00000020921) #22 MSGN1 (ENSPPRG00000020043) ENSPPRG00000020962 KCNS3 (ENSPPRG00000020060) RDH14 (ENSPPRG00000020986) NT5C1B (ENSPPRG00000021030) OSR1 (ENSPPRG00000021067) TTC32 (ENSPPRG00000021136) WDR35 (ENSPPRG00000021186) MATN3 (ENSPPRG00000021301) LAPTM4A (ENSPPRG00000021333) SDC1 (ENSPPRG00000021362) ENSPPRG00000021380 PUM2 (ENSPPRG00000021443) ENSPPRG00000021503 ENSPPRG00000020084 Tiger MODERN SPECIES 149 TRIB2 (ENSPTIG00000017323) NBAS (ENSPTIG00000018904) DDX1 (ENSPTIG00000008267) ENSPTIG00000018921 CYRIA (ENSPTIG00000019497) RAD51AP2 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ENSGT00390000013092 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 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ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Bos ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00990000203553.c.b.o.b ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181.e ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234517.D ENSGT00990000203553.c.b.o.b ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181.e ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Domestic yak MODERN SPECIES 28 ENSBGRG00000024544 ROCK2 (ENSBGRG00000024309) E2F6 (ENSBGRG00000024251) GREB1 (ENSBGRG00000023941) NTSR2 (ENSBGRG00000023894) LPIN1 (ENSBGRG00000023367) TRIB2 (ENSBGRG00000023292) LRATD1 (ENSBGRG00000023277) NBAS (ENSBGRG00000022914) DDX1 (ENSBGRG00000022559) ENSBGRG00000022487 CYRIA (ENSBGRG00000022323) RAD51AP2 (ENSBGRG00000022307) VSNL1 (ENSBGRG00000022276) SMC6 (ENSBGRG00000022073) GEN1 (ENSBGRG00000022034) #22 MSGN1 (ENSBGRG00000022021) KCNS3 (ENSBGRG00000022008) ENSBGRG00000021977 NT5C1B (ENSBGRG00000021877) OSR1 (ENSBGRG00000021840) ENSBGRG00000021825 TTC32 (ENSBGRG00000021780) WDR35 (ENSBGRG00000020967) MATN3 (ENSBGRG00000020733) SDC1 (ENSBGRG00000020622) PUM2 (ENSBGRG00000020491) ENSBGRG00000020441 ENSBGRG00000020423 RHOB (ENSBGRG00000020410) HS1BP3 (ENSBGRG00000020332) Wild yak MODERN SPECIES 370 LRATD1 (ENSBMUG00000015351) NBAS (ENSBMUG00000015322) DDX1 (ENSBMUG00000015142) ENSBMUG00000015004 CYRIA (ENSBMUG00000014990) RAD51AP2 (ENSBMUG00000014970) VSNL1 (ENSBMUG00000014955) SMC6 (ENSBMUG00000014908) GEN1 (ENSBMUG00000014871) #22 MSGN1 (ENSBMUG00000014840) KCNS3 (ENSBMUG00000014825) RDH14 (ENSBMUG00000014812) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00990000203553.c.b.o.b ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181.e ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 2 E2F6 (ENSBIXG00005022718) ENSBIXG00005003893 ENSBIXG00005022741 GREB1 (ENSBIXG00005023461) NTSR2 (ENSBIXG00005004030) LPIN1 (ENSBIXG00005023863) TRIB2 (ENSBIXG00005024058) LRATD1 (ENSBIXG00005024161) NBAS (ENSBIXG00005007735) DDX1 (ENSBIXG00005024527) MYCN (ENSBIXG00005024578) CYRIA (ENSBIXG00005024640) RAD51AP2 (ENSBIXG00005024673) VSNL1 (ENSBIXG00005024708) SMC6 (ENSBIXG00005004235) GEN1 (ENSBIXG00005024882) #22 MSGN1 (ENSBIXG00005024894) KCNS3 (ENSBIXG00005024916) RDH14 (ENSBIXG00005024953) NT5C1B (ENSBIXG00005025000) ENSBIXG00005025042 TTC32 (ENSBIXG00005025110) WDR35 (ENSBIXG00005025304) MATN3 (ENSBIXG00005006070) ENSBIXG00005025414 LAPTM4A (ENSBIXG00005025436) SDC1 (ENSBIXG00005004335) PUM2 (ENSBIXG00005004375) ENSBIXG00005025762 RHOB (ENSBIXG00005004398) HS1BP3 (ENSBIXG00005025838) Cow MODERN SPECIES 2 NLRP6 (ENSBTAG00000001076) COX8B (ENSBTAG00000002046) PSMD13 (ENSBTAG00000002045) SIRT3 (ENSBTAG00000002044) RIC8A (ENSBTAG00000002042) BET1L (ENSBTAG00000001744) ODF3 (ENSBTAG00000001730) SCGB1C1 (ENSBTAG00000022142) NBAS (ENSBTAG00000014081) DDX1 (ENSBTAG00000009906) MYCN (ENSBTAG00000023372) CYRIA (ENSBTAG00000012779) RAD51AP2 (ENSBTAG00000037812) VSNL1 (ENSBTAG00000017158) SMC6 (ENSBTAG00000018256) GEN1 (ENSBTAG00000020059) #22 MSGN1 (ENSBTAG00000039113) RDH14 (ENSBTAG00000023928) NT5C1B (ENSBTAG00000005270) OSR1 (ENSBTAG00000008113) TTC32 (ENSBTAG00000015587) WDR35 (ENSBTAG00000051164) MATN3 (ENSBTAG00000020893) ENSBTAG00000052052 LAPTM4A (ENSBTAG00000020894) SDC1 (ENSBTAG00000011154) PUM2 (ENSBTAG00000011155) ENSBTAG00000049117 HS1BP3 (ENSBTAG00000015490) GDF7 (ENSBTAG00000038224) LDAH (ENSBTAG00000031014) American bison MODERN SPECIES 3068 RAD51AP2 (ENSBBBG00000005308) VSNL1 (ENSBBBG00000005304) SMC6 (ENSBBBG00000019549) GEN1 (ENSBBBG00000005250) #22 MSGN1 (ENSBBBG00000005230) KCNS3 (ENSBBBG00000019452) ENSBBBG00000019450 NT5C1B (ENSBBBG00000009192) OSR1 (ENSBBBG00000019430) TTC32 (ENSBBBG00000006785) WDR35 (ENSBBBG00000007319) MATN3 (ENSBBBG00000019335) LAPTM4A (ENSBBBG00000007183) SDC1 (ENSBBBG00000009171) PUM2 (ENSBBBG00000019297) ENSBBBG00000019228 RHOB (ENSBBBG00000019223) HS1BP3 (ENSBBBG00000019208) LDAH (ENSBBBG00000019145) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Goat MODERN SPECIES 2 ROCK2 (ENSCHIG00000013173) E2F6 (ENSCHIG00000016333) GREB1 (ENSCHIG00000017667) NTSR2 (ENSCHIG00000011816) LPIN1 (ENSCHIG00000018539) TRIB2 (ENSCHIG00000015740) ENSCHIG00000021912 LRATD1 (ENSCHIG00000008065) ENSCHIG00000013770 NBAS (ENSCHIG00000014758) DDX1 (ENSCHIG00000011046) MYCN (ENSCHIG00000017882) CYRIA (ENSCHIG00000018672) VSNL1 (ENSCHIG00000006913) SMC6 (ENSCHIG00000010144) GEN1 (ENSCHIG00000013888) #22 MSGN1 (ENSCHIG00000010365) KCNS3 (ENSCHIG00000012986) ENSCHIG00000027201 NT5C1B (ENSCHIG00000026605) OSR1 (ENSCHIG00000020202) TTC32 (ENSCHIG00000025091) WDR35 (ENSCHIG00000006588) MATN3 (ENSCHIG00000018061) LAPTM4A (ENSCHIG00000022265) SDC1 (ENSCHIG00000018782) ENSCHIG00000025915 PUM2 (ENSCHIG00000022180) ENSCHIG00000018368 RHOB (ENSCHIG00000012713) HS1BP3 (ENSCHIG00000026302) Siberian musk deer MODERN SPECIES 239 LRATD1 (ENSMMSG00000001828) NBAS (ENSMMSG00000001890) DDX1 (ENSMMSG00000002128) ENSMMSG00000002254 MYCN (ENSMMSG00000002269) CYRIA (ENSMMSG00000002297) ENSMMSG00000002335 VSNL1 (ENSMMSG00000002354) SMC6 (ENSMMSG00000002375) GEN1 (ENSMMSG00000002401) #22 MSGN1 (ENSMMSG00000002419) KCNS3 (ENSMMSG00000002436) RDH14 (ENSMMSG00000002449) NT5C1B (ENSMMSG00000002465) OSR1 (ENSMMSG00000002491) TTC32 (ENSMMSG00000002503) WDR35 (ENSMMSG00000002532) ENSMMSG00000002584 MATN3 (ENSMMSG00000002615) LAPTM4A (ENSMMSG00000002657) ENSMMSG00000002671 SDC1 (ENSMMSG00000002684) PUM2 (ENSMMSG00000002715) ENSMMSG00000002810 RHOB (ENSMMSG00000002823) Yarkand deer MODERN SPECIES 2 ENSCHYG00000009170 ROCK2 (ENSCHYG00000008822) ENSCHYG00000008703 GREB1 (ENSCHYG00000008543) NTSR2 (ENSCHYG00000008520) LPIN1 (ENSCHYG00000008194) TRIB2 (ENSCHYG00000008145) LRATD1 (ENSCHYG00000008068) NBAS (ENSCHYG00000007960) DDX1 (ENSCHYG00000007524) ENSCHYG00000007479 CYRIA (ENSCHYG00000007408) RAD51AP2 (ENSCHYG00000007371) VSNL1 (ENSCHYG00000007343) SMC6 (ENSCHYG00000007159) GEN1 (ENSCHYG00000007066) #22 MSGN1 (ENSCHYG00000007045) KCNS3 (ENSCHYG00000007031) RDH14 (ENSCHYG00000007014) NT5C1B (ENSCHYG00000006961) ENSCHYG00000006946 OSR1 (ENSCHYG00000006938) TTC32 (ENSCHYG00000006877) WDR35 (ENSCHYG00000006261) MATN3 (ENSCHYG00000006044) LAPTM4A (ENSCHYG00000005989) SDC1 (ENSCHYG00000005966) PUM2 (ENSCHYG00000005651) ENSCHYG00000005597 RHOB (ENSCHYG00000005587) HS1BP3 (ENSCHYG00000005568) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT01090000263460 Arabian camel MODERN SPECIES 6 E2F6 (ENSCDRG00005003569) GREB1 (ENSCDRG00005003633) NTSR2 (ENSCDRG00005003795) LPIN1 (ENSCDRG00005003875) TRIB2 (ENSCDRG00005004180) ENSCDRG00005004212 LRATD1 (ENSCDRG00005004252) NBAS (ENSCDRG00005004285) DDX1 (ENSCDRG00005004527) ENSCDRG00005004697 ENSCDRG00005004717 CYRIA (ENSCDRG00005004743) RAD51AP2 (ENSCDRG00005004783) VSNL1 (ENSCDRG00005004814) SMC6 (ENSCDRG00005004835) GEN1 (ENSCDRG00005004909) #22 MSGN1 (ENSCDRG00005004972) KCNS3 (ENSCDRG00005004986) RDH14 (ENSCDRG00005004999) NT5C1B (ENSCDRG00005005015) OSR1 (ENSCDRG00005005052) TTC32 (ENSCDRG00005005072) ENSCDRG00005005097 MATN3 (ENSCDRG00005005117) LAPTM4A (ENSCDRG00005005142) ENSCDRG00005005168 SDC1 (ENSCDRG00005005384) ENSCDRG00005005424 PUM2 (ENSCDRG00005005454) RHOB (ENSCDRG00005005629) HS1BP3 (ENSCDRG00005005637) Alpaca MODERN SPECIES 2892 RAD51AP2 (ENSVPAG00000010297) SMC6 (ENSVPAG00000010300) GEN1 (ENSVPAG00000010307) #22 Suina ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Pig MODERN SPECIES 11 E2F6 (ENSSSCG00000026161) GREB1 (ENSSSCG00000025483) NTSR2 (ENSSSCG00000008625) LPIN1 (ENSSSCG00000008624) TRIB2 (ENSSSCG00000039080) ENSSSCG00000042932 LRATD1 (ENSSSCG00000008664) NBAS (ENSSSCG00000008621) DDX1 (ENSSSCG00000008619) MYCN (ENSSSCG00000008618) ENSSSCG00000033084 CYRIA (ENSSSCG00000008617) RAD51AP2 (ENSSSCG00000038058) VSNL1 (ENSSSCG00000008615) SMC6 (ENSSSCG00000008614) GEN1 (ENSSSCG00000008613) #22 MSGN1 (ENSSSCG00000026538) ENSSSCG00000040752 KCNS3 (ENSSSCG00000031905) RDH14 (ENSSSCG00000008608) NT5C1B (ENSSSCG00000008607) ENSSSCG00000054495 OSR1 (ENSSSCG00000060496) ENSSSCG00000058710 TTC32 (ENSSSCG00000053616) WDR35 (ENSSSCG00000008604) MATN3 (ENSSSCG00000008603) LAPTM4A (ENSSSCG00000008602) SDC1 (ENSSSCG00000008601) PUM2 (ENSSSCG00000008600) ENSSSCG00000054581 Chacoan peccary MODERN SPECIES 776 E2F6 (ENSCWAG00000013986) GREB1 (ENSCWAG00000014037) NTSR2 (ENSCWAG00000014475) LPIN1 (ENSCWAG00000014537) TRIB2 (ENSCWAG00000015191) LRATD1 (ENSCWAG00000015236) NBAS (ENSCWAG00000015265) DDX1 (ENSCWAG00000015647) MYCN (ENSCWAG00000015961) CYRIA (ENSCWAG00000016027) RAD51AP2 (ENSCWAG00000016094) VSNL1 (ENSCWAG00000016143) SMC6 (ENSCWAG00000016171) GEN1 (ENSCWAG00000016234) #22 MSGN1 (ENSCWAG00000016325) KCNS3 (ENSCWAG00000016339) RDH14 (ENSCWAG00000016353) NT5C1B (ENSCWAG00000016386) OSR1 (ENSCWAG00000016456) TTC32 (ENSCWAG00000016481) WDR35 (ENSCWAG00000016523) MATN3 (ENSCWAG00000016742) LAPTM4A (ENSCWAG00000016902) SDC1 (ENSCWAG00000016920) PUM2 (ENSCWAG00000003696) ENSCWAG00000003897 RHOB (ENSCWAG00000004001) HS1BP3 (ENSCWAG00000004014) GDF7 (ENSCWAG00000004046) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1441 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 Common shrew MODERN SPECIES 4284 SMC6 (ENSSARG00000014427) GEN1 (ENSSARG00000014442) #22 Hedgehog MODERN SPECIES 7199 GEN1 (ENSEEUG00000004845) #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Glires ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 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ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 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ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 229 E2f6 (ENSCGRG00001013963) Greb1 (ENSCGRG00001018970) Ntsr2 (ENSCGRG00001012327) Lpin1 (ENSCGRG00001000692) Trib2 (ENSCGRG00001024816) ENSCGRG00001013482 ENSCGRG00001013069 ENSCGRG00001002169 Nbas (ENSCGRG00001001919) Ddx1 (ENSCGRG00001013025) Mycn (ENSCGRG00001018130) Cyria (ENSCGRG00001014064) ENSCGRG00001012128 Vsnl1 (ENSCGRG00001017035) Smc6 (ENSCGRG00001024287) ENSCGRG00001019699 #22 Msgn1 (ENSCGRG00001003369) Kcns3 (ENSCGRG00001004289) ENSCGRG00001006912 Rdh14 (ENSCGRG00001024177) Nt5c1b (ENSCGRG00001016775) Osr1 (ENSCGRG00001009653) Ttc32 (ENSCGRG00001007763) Wdr35 (ENSCGRG00001004220) Matn3 (ENSCGRG00001025049) Laptm4a (ENSCGRG00001021474) SDC1 (ENSCGRG00001018173) Pum2 (ENSCGRG00001025023) Slc7a15 (ENSCGRG00001018113) Rhob (ENSCGRG00001001843) Hs1bp3 (ENSCGRG00001015945) Golden Hamster MODERN SPECIES 367 ENSMAUG00000007689 #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 14 E2f6 (ENSPEMG00000020192) Greb1 (ENSPEMG00000020144) Ntsr2 (ENSPEMG00000007290) Lpin1 (ENSPEMG00000005628) Trib2 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(ENSMOCG00000012235) Vsnl1 (ENSMOCG00000000359) Smc6 (ENSMOCG00000009440) Gen1 (ENSMOCG00000000146) #22 Msgn1 (ENSMOCG00000003059) Murinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Mus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Mus_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153916.B.c ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 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ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Steppe mouse MODERN SPECIES 66 Vsnl1 (ENSMSIG00000003607) Smc6 (ENSMSIG00000003533) Gen1 (ENSMSIG00000003465) #22 Msgn1 (ENSMSIG00000003441) Kcns3 (ENSMSIG00000003427) spretus MODERN SPECIES 3 MGP_SPRETEiJ_G0018473 Rock2 (MGP_SPRETEiJ_G0018472) E2f6 (MGP_SPRETEiJ_G0018471) Greb1 (MGP_SPRETEiJ_G0018470) Ntsr2 (MGP_SPRETEiJ_G0018469) Lpin1 (MGP_SPRETEiJ_G0018468) Trib2 (MGP_SPRETEiJ_G0018467) Lratd1 (MGP_SPRETEiJ_G0018466) Nbas 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ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 176 ENSCLAG00000013272 VSNL1 (ENSCLAG00000011222) SMC6 (ENSCLAG00000012919) GEN1 (ENSCLAG00000008865) #22 MSGN1 (ENSCLAG00000015119) KCNS3 (ENSCLAG00000013937) RDH14 (ENSCLAG00000009341) NT5C1B (ENSCLAG00000008659) OSR1 (ENSCLAG00000009423) TTC32 (ENSCLAG00000009839) WDR35 (ENSCLAG00000007929) MATN3 (ENSCLAG00000006019) LAPTM4A (ENSCLAG00000006983) SDC1 (ENSCLAG00000007345) PUM2 (ENSCLAG00000006048) ENSCLAG00000005814 RHOB (ENSCLAG00000017801) HS1BP3 (ENSCLAG00000008832) LDAH (ENSCLAG00000011308) Degu MODERN SPECIES 60 ENSODEG00000009441 ENSODEG00000009977 SGCB (ENSODEG00000009784) ENSODEG00000009044 ENSODEG00000009096 CWH43 (ENSODEG00000009451) OCIAD2 (ENSODEG00000010340) ENSODEG00000010537 OCIAD1 (ENSODEG00000009198) FRYL (ENSODEG00000009331) ENSODEG00000008772 SLC10A4 (ENSODEG00000010331) ENSODEG00000008159 VSNL1 (ENSODEG00000008555) SMC6 (ENSODEG00000008987) GEN1 (ENSODEG00000010156) #22 MSGN1 (ENSODEG00000009615) ENSODEG00000019755 KCNS3 (ENSODEG00000009066) RDH14 (ENSODEG00000008458) NT5C1B (ENSODEG00000008929) OSR1 (ENSODEG00000008728) TTC32 (ENSODEG00000009280) WDR35 (ENSODEG00000012693) MATN3 (ENSODEG00000008451) LAPTM4A (ENSODEG00000008579) SDC1 (ENSODEG00000010758) ENSODEG00000008774 PUM2 (ENSODEG00000007823) ENSODEG00000010362 RHOB (ENSODEG00000019841) Guinea pig MODERN SPECIES 18 VSNL1 (ENSCPOG00000030283) SMC6 (ENSCPOG00000014752) GEN1 (ENSCPOG00000033894) #22 MSGN1 (ENSCPOG00000003061) KCNS3 (ENSCPOG00000009232) RDH14 (ENSCPOG00000022651) NT5C1B (ENSCPOG00000012761) OSR1 (ENSCPOG00000002025) TTC32 (ENSCPOG00000033658) WDR35 (ENSCPOG00000007053) MATN3 (ENSCPOG00000004739) LAPTM4A (ENSCPOG00000009690) SDC1 (ENSCPOG00000008875) ENSCPOG00000007075 PUM2 (ENSCPOG00000031996) ENSCPOG00000037907 HS1BP3 (ENSCPOG00000000278) LDAH (ENSCPOG00000012586) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 ENSHGLG00000008939 SAMSN1 (ENSHGLG00000015900) HSPA13 (ENSHGLG00000043774) RBM11 (ENSHGLG00000013951) ENSHGLG00000016407 ENSHGLG00000005987 ENSHGLG00000042984 ENSHGLG00000037863 ENSHGLG00000000774 ENSHGLG00000045735 ENSHGLG00000001440 ENSHGLG00000035920 ENSHGLG00000046617 ENSHGLG00000003293 ENSHGLG00000002905 ENSHGLG00000037292 #22 VGLL3 (ENSHGLG00000000912) ENSHGLG00000050433 CHMP2B (ENSHGLG00000000954) POU1F1 (ENSHGLG00000001001) ENSHGLG00000032647 ENSHGLG00000047444 ENSHGLG00000001380 ENSHGLG00000032052 ENSHGLG00000042763 CGGBP1 (ENSHGLG00000034659) ZNF654 (ENSHGLG00000001844) ENSHGLG00000037445 C3orf38 (ENSHGLG00000002435) ENSHGLG00000041404 EPHA3 (ENSHGLG00000003586) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 ENSHGLG00000002072 ENSHGLG00000031903 ENSHGLG00000006911 HECTD1 (ENSHGLG00000004613) ENSHGLG00000038178 HEATR5A (ENSHGLG00000002799) ENSHGLG00000038655 DTD2 (ENSHGLG00000046094) GPR33 (ENSHGLG00000019958) ENSHGLG00000001878 NUBPL (ENSHGLG00000043820) ENSHGLG00000003444 ENSHGLG00000043700 ENSHGLG00000003356 ENSHGLG00000050973 ENSHGLG00000048569 #22 ENSHGLG00000036198 ENSHGLG00000050257 ENSHGLG00000001333 ENSHGLG00000001019 ENSHGLG00000045174 ENSHGLG00000000723 ENSHGLG00000001684 ENSHGLG00000001381 ENSHGLG00000032861 ENSHGLG00000002049 ENSHGLG00000046910 EAPP (ENSHGLG00000035378) SNX6 (ENSHGLG00000002236) CFL2 (ENSHGLG00000001467) ENSHGLG00000047884 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 ENSHGLG00000036392 ENSHGLG00000050705 ENSHGLG00000035577 ENSHGLG00000012435 ENSHGLG00000040813 ENSHGLG00000002743 ENSHGLG00000001556 FBXO25 (ENSHGLG00000001395) ENSHGLG00000012555 ENSHGLG00000044269 ENSHGLG00000032967 ENSHGLG00000037485 ENSHGLG00000042446 ENSHGLG00000016211 ENSHGLG00000016450 GEN1 (ENSHGLG00000015449) #22 ENSHGLG00000017189 ENSHGLG00000046477 ENSHGLG00000045872 ENSHGLG00000008037 ENSHGLG00000007715 ENSHGLG00000006288 ENSHGLG00000007387 ENSHGLG00000011910 ENSHGLG00000043882 ENSHGLG00000044427 NKAPL (ENSHGLG00000035910) ENSHGLG00000043206 ENSHGLG00000005144 ENSHGLG00000039085 ENSHGLG00000005106 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734.q ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.cb ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734.q ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.cb ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a.u.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Alpin marmot MODERN SPECIES 6 SLC66A3 (ENSMMMG00000022562) ROCK2 (ENSMMMG00000022550) E2F6 (ENSMMMG00000022544) GREB1 (ENSMMMG00000022514) LPIN1 (ENSMMMG00000022468) TRIB2 (ENSMMMG00000022461) LRATD1 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ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a.u.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES ENSUPAG00010011160 E2F6 (ENSUPAG00010011151) GREB1 (ENSUPAG00010011107) NTSR2 (ENSUPAG00010011106) LPIN1 (ENSUPAG00010009943) TRIB2 (ENSUPAG00010009911) LRATD1 (ENSUPAG00010009896) NBAS (ENSUPAG00010009750) DDX1 (ENSUPAG00010009711) ENSUPAG00010009708 MYCN (ENSUPAG00010009702) CYRIA (ENSUPAG00010009668) RAD51AP2 (ENSUPAG00010009663) VSNL1 (ENSUPAG00010009655) SMC6 (ENSUPAG00010009564) GEN1 (ENSUPAG00010009557) #22 MSGN1 (ENSUPAG00010009556) RDH14 (ENSUPAG00010009546) ENSUPAG00010009474 OSR1 (ENSUPAG00010009451) TTC32 (ENSUPAG00010009436) WDR35 (ENSUPAG00010009354) MATN3 (ENSUPAG00010009339) LAPTM4A (ENSUPAG00010009333) SDC1 (ENSUPAG00010009310) ENSUPAG00010009303 ENSUPAG00010009301 PUM2 (ENSUPAG00010009123) ENSUPAG00010009092 RHOB (ENSUPAG00010009084) HS1BP3 (ENSUPAG00010009063) Squirrel MODERN SPECIES 93 NBAS (ENSSTOG00000008943) DDX1 (ENSSTOG00000003977) MYCN (ENSSTOG00000012252) CYRIA (ENSSTOG00000022187) ENSSTOG00000025212 VSNL1 (ENSSTOG00000010438) SMC6 (ENSSTOG00000013946) GEN1 (ENSSTOG00000013963) #22 MSGN1 (ENSSTOG00000013981) KCNS3 (ENSSTOG00000012420) RDH14 (ENSSTOG00000021114) NT5C1B (ENSSTOG00000014834) OSR1 (ENSSTOG00000015454) TTC32 (ENSSTOG00000007140) WDR35 (ENSSTOG00000007151) MATN3 (ENSSTOG00000019530) ENSSTOG00000007214 SDC1 (ENSSTOG00000028519) ENSSTOG00000033291 PUM2 (ENSSTOG00000006262) ENSSTOG00000023326 ENSSTOG00000014644 HS1BP3 (ENSSTOG00000004973) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 NTSR2 (ENSSVLG00005017070) LPIN1 (ENSSVLG00005016318) TRIB2 (ENSSVLG00005016251) ENSSVLG00005016163 LRATD1 (ENSSVLG00005025440) NBAS (ENSSVLG00005025400) ENSSVLG00005025381 DDX1 (ENSSVLG00005025306) ENSSVLG00005025265 ENSSVLG00005025253 CYRIA (ENSSVLG00005025229) ENSSVLG00005025209 RAD51AP2 (ENSSVLG00005025196) VSNL1 (ENSSVLG00005025182) SMC6 (ENSSVLG00005025164) GEN1 (ENSSVLG00005025123) #22 MSGN1 (ENSSVLG00005025107) KCNS3 (ENSSVLG00005025089) ENSSVLG00005025079 RDH14 (ENSSVLG00005025062) NT5C1B (ENSSVLG00005025002) OSR1 (ENSSVLG00005024914) TTC32 (ENSSVLG00005024889) WDR35 (ENSSVLG00005024826) MATN3 (ENSSVLG00005024711) LAPTM4A (ENSSVLG00005024670) SDC1 (ENSSVLG00005024647) ENSSVLG00005024506 ENSSVLG00005024370 RHOB (ENSSVLG00005024328) HS1BP3 (ENSSVLG00005024304) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Rabbit MODERN SPECIES 11 ENSOCUG00000038693 ENSOCUG00000031382 TRIB2 (ENSOCUG00000003153) ENSOCUG00000039303 LRATD1 (ENSOCUG00000002283) ENSOCUG00000039105 ENSOCUG00000023292 NBAS (ENSOCUG00000015460) DDX1 (ENSOCUG00000007010) ENSOCUG00000037275 CYRIA (ENSOCUG00000007886) RAD51AP2 (ENSOCUG00000027767) VSNL1 (ENSOCUG00000026184) ENSOCUG00000017307 ENSOCUG00000034282 GEN1 (ENSOCUG00000027255) #22 MSGN1 (ENSOCUG00000000309) KCNS3 (ENSOCUG00000007365) RDH14 (ENSOCUG00000025332) NT5C1B (ENSOCUG00000026238) OSR1 (ENSOCUG00000006091) ENSOCUG00000034308 TTC32 (ENSOCUG00000003731) WDR35 (ENSOCUG00000013185) MATN3 (ENSOCUG00000021257) LAPTM4A (ENSOCUG00000026699) SDC1 (ENSOCUG00000025956) ENSOCUG00000032467 PUM2 (ENSOCUG00000017908) ENSOCUG00000025149 RHOB (ENSOCUG00000032265) Primates ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00900000143745 ENSGT00390000013092 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 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ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000001347.vb.a.b.b.a.a ENSGT00910000146844.b ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00950000183424.a ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00910000147240 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ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00900000143745 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 542 LPIN1 (ENSCATG00000039834) TRIB2 (ENSCATG00000017155) ENSCATG00000020884 LRATD1 (ENSCATG00000021787) NBAS (ENSCATG00000042904) DDX1 (ENSCATG00000033924) ENSCATG00000014658 ENSCATG00000019609 MYCN (ENSCATG00000041172) ENSCATG00000003592 CYRIA (ENSCATG00000004720) ENSCATG00000043417 RAD51AP2 (ENSCATG00000035523) VSNL1 (ENSCATG00000043748) SMC6 (ENSCATG00000007538) GEN1 (ENSCATG00000002261) #22 MSGN1 (ENSCATG00000020832) KCNS3 (ENSCATG00000019098) RDH14 (ENSCATG00000040055) NT5C1B (ENSCATG00000030226) OSR1 (ENSCATG00000041386) ENSCATG00000035076 ENSCATG00000035517 TTC32 (ENSCATG00000043877) WDR35 (ENSCATG00000043847) MATN3 (ENSCATG00000038685) LAPTM4A (ENSCATG00000036860) SDC1 (ENSCATG00000044796) ENSCATG00000041330 PUM2 (ENSCATG00000043826) RHOB (ENSCATG00000021066) Drill MODERN SPECIES 273 ENSMLEG00000027447 LRATD1 (ENSMLEG00000014430) NBAS (ENSMLEG00000030040) DDX1 (ENSMLEG00000030787) ENSMLEG00000041133 ENSMLEG00000042759 ENSMLEG00000038077 ENSMLEG00000042888 ENSMLEG00000000943 CYRIA (ENSMLEG00000021733) ENSMLEG00000032548 RAD51AP2 (ENSMLEG00000032822) VSNL1 (ENSMLEG00000009493) SMC6 (ENSMLEG00000038093) GEN1 (ENSMLEG00000037009) #22 MSGN1 (ENSMLEG00000016060) KCNS3 (ENSMLEG00000024480) NT5C1B (ENSMLEG00000032260) OSR1 (ENSMLEG00000036388) ENSMLEG00000035262 TTC32 (ENSMLEG00000034466) WDR35 (ENSMLEG00000042194) MATN3 (ENSMLEG00000028366) LAPTM4A (ENSMLEG00000011616) SDC1 (ENSMLEG00000030457) ENSMLEG00000041181 PUM2 (ENSMLEG00000039243) RHOB (ENSMLEG00000014328) HS1BP3 (ENSMLEG00000036114) GDF7 (ENSMLEG00000030590) Olive baboon MODERN SPECIES 5 LPIN1 (ENSPANG00000009989) TRIB2 (ENSPANG00000005636) ENSPANG00000047167 ENSPANG00000050237 ENSPANG00000044900 LRATD1 (ENSPANG00000018765) NBAS (ENSPANG00000018551) DDX1 (ENSPANG00000025185) ENSPANG00000032256 ENSPANG00000029967 CYRIA (ENSPANG00000008636) ENSPANG00000050326 RAD51AP2 (ENSPANG00000022532) ENSPANG00000022533 SMC6 (ENSPANG00000018608) GEN1 (ENSPANG00000008635) #22 MSGN1 (ENSPANG00000004064) KCNS3 (ENSPANG00000010367) RDH14 (ENSPANG00000007663) OSR1 (ENSPANG00000045188) ENSPANG00000033126 TTC32 (ENSPANG00000015095) WDR35 (ENSPANG00000019305) MATN3 (ENSPANG00000019588) LAPTM4A (ENSPANG00000011260) ENSPANG00000033560 PUM2 (ENSPANG00000009393) RHOB (ENSPANG00000016884) HS1BP3 (ENSPANG00000008436) GDF7 (ENSPANG00000015811) LDAH (ENSPANG00000017330) Macaca ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000183424 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 561 SMC6 (ENSMNEG00000037394) GEN1 (ENSMNEG00000041505) #22 MSGN1 (ENSMNEG00000009838) KCNS3 (ENSMNEG00000010748) RDH14 (ENSMNEG00000042523) NT5C1B (ENSMNEG00000031824) OSR1 (ENSMNEG00000024040) ENSMNEG00000040736 ENSMNEG00000000256 TTC32 (ENSMNEG00000032654) WDR35 (ENSMNEG00000043506) MATN3 (ENSMNEG00000040055) LAPTM4A (ENSMNEG00000030721) SDC1 (ENSMNEG00000037009) ENSMNEG00000031627 PUM2 (ENSMNEG00000039659) RHOB (ENSMNEG00000004093) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000153294.m.a.d.e ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092.c ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000009688 Rhesus MODERN SPECIES 4 NTSR2 (ENSMMUG00000020250) LPIN1 (ENSMMUG00000021672) ENSMMUG00000062508 TRIB2 (ENSMMUG00000038615) ENSMMUG00000060624 ENSMMUG00000059746 LRATD1 (ENSMMUG00000004215) NBAS (ENSMMUG00000023434) DDX1 (ENSMMUG00000023437) ENSMMUG00000052644 MYCN (ENSMMUG00000052363) CYRIA (ENSMMUG00000020385) RAD51AP2 (ENSMMUG00000058011) VSNL1 (ENSMMUG00000040529) SMC6 (ENSMMUG00000012056) GEN1 (ENSMMUG00000012058) #22 MSGN1 (ENSMMUG00000008141) KCNS3 (ENSMMUG00000017198) NT5C1B (ENSMMUG00000014083) OSR1 (ENSMMUG00000037622) ENSMMUG00000056023 TTC32 (ENSMMUG00000001570) WDR35 (ENSMMUG00000001575) MATN3 (ENSMMUG00000001579) LAPTM4A (ENSMMUG00000001582) SDC1 (ENSMMUG00000030922) ENSMMUG00000052718 PUM2 (ENSMMUG00000023181) HS1BP3 (ENSMMUG00000022996) GDF7 (ENSMMUG00000050446) ENSMMUG00000055950 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 4 ENSMFAG00000044386 NTSR2 (ENSMFAG00000043071) ENSMFAG00000064291 LPIN1 (ENSMFAG00000035872) TRIB2 (ENSMFAG00000042686) ENSMFAG00000047890 LRATD1 (ENSMFAG00000027588) NBAS (ENSMFAG00000003823) DDX1 (ENSMFAG00000033987) ENSMFAG00000052602 MYCN (ENSMFAG00000032784) CYRIA (ENSMFAG00000030486) RAD51AP2 (ENSMFAG00000002803) VSNL1 (ENSMFAG00000063922) SMC6 (ENSMFAG00000033284) GEN1 (ENSMFAG00000002080) #22 MSGN1 (ENSMFAG00000007491) KCNS3 (ENSMFAG00000007411) NT5C1B (ENSMFAG00000002988) ENSMFAG00000064231 ENSMFAG00000051219 ENSMFAG00000065687 ENSMFAG00000059615 OSR1 (ENSMFAG00000039189) TTC32 (ENSMFAG00000040343) WDR35 (ENSMFAG00000034406) MATN3 (ENSMFAG00000043379) ENSMFAG00000049571 LAPTM4A (ENSMFAG00000036772) ENSMFAG00000064406 ENSMFAG00000043647 Vervet Monkey MODERN SPECIES 5 E2F6 (ENSCSAG00000007487) ENSCSAG00000007494 ENSCSAG00000007503 NTSR2 (ENSCSAG00000007519) LPIN1 (ENSCSAG00000007534) TRIB2 (ENSCSAG00000007539) LRATD1 (ENSCSAG00000000375) ENSCSAG00000000376 NBAS (ENSCSAG00000007763) DDX1 (ENSCSAG00000007883) MYCN (ENSCSAG00000007889) CYRIA (ENSCSAG00000007902) RAD51AP2 (ENSCSAG00000007907) VSNL1 (ENSCSAG00000007914) SMC6 (ENSCSAG00000007925) GEN1 (ENSCSAG00000007952) #22 MSGN1 (ENSCSAG00000000377) KCNS3 (ENSCSAG00000000378) RDH14 (ENSCSAG00000007969) NT5C1B (ENSCSAG00000007999) OSR1 (ENSCSAG00000008012) TTC32 (ENSCSAG00000008028) WDR35 (ENSCSAG00000008051) MATN3 (ENSCSAG00000008064) LAPTM4A (ENSCSAG00000008071) SDC1 (ENSCSAG00000008077) PUM2 (ENSCSAG00000008087) RHOB (ENSCSAG00000000379) HS1BP3 (ENSCSAG00000008096) GDF7 (ENSCSAG00000008108) LDAH (ENSCSAG00000008123) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 327 ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000154958.lb.a ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2966 RAD51AP2 (ENSRROG00000039994) VSNL1 (ENSRROG00000045059) SMC6 (ENSRROG00000021603) GEN1 (ENSRROG00000031604) #22 MSGN1 (ENSRROG00000028305) KCNS3 (ENSRROG00000006598) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 374 LRATD1 (ENSRBIG00000004537) ENSRBIG00000000433 NBAS (ENSRBIG00000040798) ENSRBIG00000039266 DDX1 (ENSRBIG00000041664) MYCN (ENSRBIG00000031158) ENSRBIG00000016916 CYRIA (ENSRBIG00000037805) RAD51AP2 (ENSRBIG00000041339) VSNL1 (ENSRBIG00000043244) SMC6 (ENSRBIG00000032057) GEN1 (ENSRBIG00000034123) #22 MSGN1 (ENSRBIG00000031141) KCNS3 (ENSRBIG00000031172) RDH14 (ENSRBIG00000031223) NT5C1B (ENSRBIG00000035028) DLG5 (ENSRBIG00000030077) ENSRBIG00000035661 ENSRBIG00000041134 KCNMA1 (ENSRBIG00000045005) ENSRBIG00000036747 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a 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SPECIES 1 NTSR2 (ENSCCAG00000036768) LPIN1 (ENSCCAG00000030095) TRIB2 (ENSCCAG00000013010) LRATD1 (ENSCCAG00000019002) ENSCCAG00000024507 NBAS (ENSCCAG00000028087) DDX1 (ENSCCAG00000030085) ENSCCAG00000032936 ENSCCAG00000033245 MYCN (ENSCCAG00000036405) CYRIA (ENSCCAG00000019373) ENSCCAG00000027131 RAD51AP2 (ENSCCAG00000024012) VSNL1 (ENSCCAG00000027421) SMC6 (ENSCCAG00000027451) GEN1 (ENSCCAG00000031121) #22 MSGN1 (ENSCCAG00000020077) KCNS3 (ENSCCAG00000020195) RDH14 (ENSCCAG00000027491) NT5C1B (ENSCCAG00000020565) OSR1 (ENSCCAG00000029161) TTC32 (ENSCCAG00000025284) WDR35 (ENSCCAG00000030486) MATN3 (ENSCCAG00000033118) LAPTM4A (ENSCCAG00000029231) ENSCCAG00000019764 SDC1 (ENSCCAG00000031573) PUM2 (ENSCCAG00000037035) RHOB (ENSCCAG00000018485) HS1BP3 (ENSCCAG00000028038) GDF7 (ENSCCAG00000035529) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 113 NBAS (ENSSBOG00000030791) DDX1 (ENSSBOG00000027577) MYCN (ENSSBOG00000027501) CYRIA (ENSSBOG00000025029) RAD51AP2 (ENSSBOG00000028552) VSNL1 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ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000009688 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 339 E2F6 (ENSPSMG00000008847) GREB1 (ENSPSMG00000008813) NTSR2 (ENSPSMG00000008712) LPIN1 (ENSPSMG00000008652) TRIB2 (ENSPSMG00000008501) LRATD1 (ENSPSMG00000008472) NBAS (ENSPSMG00000008335) DDX1 (ENSPSMG00000007970) ENSPSMG00000007742 ENSPSMG00000007732 CYRIA (ENSPSMG00000007716) ENSPSMG00000007660 RAD51AP2 (ENSPSMG00000007652) VSNL1 (ENSPSMG00000007643) SMC6 (ENSPSMG00000007622) GEN1 (ENSPSMG00000007525) #22 MSGN1 (ENSPSMG00000007507) KCNS3 (ENSPSMG00000007502) RDH14 (ENSPSMG00000007468) NT5C1B (ENSPSMG00000007455) OSR1 (ENSPSMG00000007427) TTC32 (ENSPSMG00000007425) WDR35 (ENSPSMG00000007386) MATN3 (ENSPSMG00000007217) LAPTM4A (ENSPSMG00000007179) SDC1 (ENSPSMG00000007157) PUM2 (ENSPSMG00000007064) ENSPSMG00000006929 HS1BP3 (ENSPSMG00000006908) GDF7 (ENSPSMG00000006880) ENSPSMG00000006877 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 559 LRATD1 (ENSPCOG00000007737) NBAS (ENSPCOG00000021921) DDX1 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GEN1 (ENSMICG00000026479) #22 ENSMICG00000029479 RDH14 (ENSMICG00000033814) NT5C1B (ENSMICG00000010847) OSR1 (ENSMICG00000004493) ENSMICG00000041804 WDR35 (ENSMICG00000037969) MATN3 (ENSMICG00000032185) LAPTM4A (ENSMICG00000031395) SDC1 (ENSMICG00000041634) PUM2 (ENSMICG00000011647) RHOB (ENSMICG00000029771) HS1BP3 (ENSMICG00000027064) GDF7 (ENSMICG00000044629) LDAH (ENSMICG00000011319) APOB (ENSMICG00000011331) Bushbaby MODERN SPECIES 137 ROCK2 (ENSOGAG00000009767) ENSOGAG00000024515 E2F6 (ENSOGAG00000013601) GREB1 (ENSOGAG00000013608) NTSR2 (ENSOGAG00000013618) LPIN1 (ENSOGAG00000013620) TRIB2 (ENSOGAG00000002490) LRATD1 (ENSOGAG00000032892) NBAS (ENSOGAG00000008723) DDX1 (ENSOGAG00000008730) MYCN (ENSOGAG00000010927) CYRIA (ENSOGAG00000009218) ENSOGAG00000031508 VSNL1 (ENSOGAG00000030574) SMC6 (ENSOGAG00000004809) GEN1 (ENSOGAG00000004816) #22 MSGN1 (ENSOGAG00000012569) KCNS3 (ENSOGAG00000007336) RDH14 (ENSOGAG00000027061) NT5C1B (ENSOGAG00000001728) OSR1 (ENSOGAG00000003047) TTC32 (ENSOGAG00000002990) WDR35 (ENSOGAG00000002991) MATN3 (ENSOGAG00000002995) ENSOGAG00000029374 LAPTM4A (ENSOGAG00000003002) SDC1 (ENSOGAG00000010183) PUM2 (ENSOGAG00000002187) RHOB (ENSOGAG00000034489) HS1BP3 (ENSOGAG00000000192) GDF7 (ENSOGAG00000025229) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000169919 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 803 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 Armadillo MODERN SPECIES 784 CYRIA (ENSDNOG00000034711) ENSDNOG00000048026 RAD51AP2 (ENSDNOG00000049595) ENSDNOG00000030945 VSNL1 (ENSDNOG00000043870) ENSDNOG00000035527 ENSDNOG00000005599 GEN1 (ENSDNOG00000036480) #22 MSGN1 (ENSDNOG00000013441) KCNS3 (ENSDNOG00000043353) Sloth MODERN SPECIES 4923 SMC6 (ENSCHOG00000008563) ENSCHOG00000008614 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000169919 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000169919 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Elephant MODERN SPECIES 197 ROCK2 (ENSLAFG00000007153) E2F6 (ENSLAFG00000021573) GREB1 (ENSLAFG00000003341) ENSLAFG00000016802 LPIN1 (ENSLAFG00000008202) TRIB2 (ENSLAFG00000013795) LRATD1 (ENSLAFG00000012514) ENSLAFG00000013044 ENSLAFG00000030074 DDX1 (ENSLAFG00000002213) MYCN (ENSLAFG00000015181) CYRIA (ENSLAFG00000014613) RAD51AP2 (ENSLAFG00000025867) VSNL1 (ENSLAFG00000015994) SMC6 (ENSLAFG00000007506) GEN1 (ENSLAFG00000023255) #22 MSGN1 (ENSLAFG00000015319) ENSLAFG00000029496 ENSLAFG00000028092 KCNS3 (ENSLAFG00000021521) RDH14 (ENSLAFG00000022569) NT5C1B (ENSLAFG00000007746) OSR1 (ENSLAFG00000027174) ENSLAFG00000027572 ENSLAFG00000030361 TTC32 (ENSLAFG00000014830) WDR35 (ENSLAFG00000014834) MATN3 (ENSLAFG00000014853) LAPTM4A (ENSLAFG00000013774) SDC1 (ENSLAFG00000022920) PUM2 (ENSLAFG00000009278) Hyrax MODERN SPECIES 4551 VSNL1 (ENSPCAG00000012647) SMC6 (ENSPCAG00000012676) GEN1 (ENSPCAG00000012835) #22 Tenrec MODERN SPECIES 5362 SMC6 (ENSETEG00000015304) ENSETEG00000015308 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157631 ENSGT00390000013048 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ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157631 ENSGT00390000013048 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000154863 ENSGT00940000157488 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00960000192062 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a.f ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d 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