Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159266 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159266 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000154645.A ENSGT00950000182995.e.a.a.a ENSGT00390000007900 ENSGT00390000004263.b ENSGT00940000155646 ENSGT00940000160213 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000004263.b ENSGT00940000155646 ENSGT00940000160213 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.B.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 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ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000177852 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00960000192062 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 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(ENSLLTG00000006170) KCNS3 (ENSLLTG00000006167) Indian cobra MODERN SPECIES ROCK2 (ENSNNAG00000012714) E2F6 (ENSNNAG00000004227) ENSNNAG00000004249 GREB1 (ENSNNAG00000004275) LPIN1 (ENSNNAG00000004384) TRIB2 (ENSNNAG00000004479) LRATD1 (ENSNNAG00000004490) NBAS (ENSNNAG00000004531) DDX1 (ENSNNAG00000004957) MYCN (ENSNNAG00000005197) CYRIA (ENSNNAG00000005209) ENSNNAG00000005240 ENSNNAG00000005266 VSNL1 (ENSNNAG00000005283) SMC6 (ENSNNAG00000005310) ENSNNAG00000005468 #22 MSGN1 (ENSNNAG00000005477) KCNS3 (ENSNNAG00000005487) WDR35 (ENSNNAG00000005515) RDH14 (ENSNNAG00000005638) NT5C1B (ENSNNAG00000005647) OSR1 (ENSNNAG00000005665) ENSNNAG00000005690 TTC32 (ENSNNAG00000005721) LAPTM4A (ENSNNAG00000005741) ENSNNAG00000005759 ENSNNAG00000005775 PUM2 (ENSNNAG00000005799) ENSNNAG00000005965 RHOB (ENSNNAG00000006172) HS1BP3 (ENSNNAG00000006192) Lizard MODERN SPECIES ENSACAG00000038536 LRATD1 (ENSACAG00000000402) ENSACAG00000036783 ENSACAG00000038844 ENSACAG00000042544 ENSACAG00000036037 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ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d Pink-footed goose MODERN SPECIES 171 CYRIA (ENSABRG00000014109) ENSABRG00000014137 VSNL1 (ENSABRG00000014146) SMC6 (ENSABRG00000014152) GEN1 (ENSABRG00000014167) #22 MSGN1 (ENSABRG00000014179) ENSABRG00000014184 KCNS3 (ENSABRG00000014206) RDH14 (ENSABRG00000014216) NT5C1B (ENSABRG00000014218) Duck MODERN SPECIES 21 UFL1 (ENSAPLG00000005301) FHL5 (ENSAPLG00000005672) GPR63 (ENSAPLG00000001077) NDUFAF4 (ENSAPLG00000005892) KLHL32 (ENSAPLG00000005979) MMS22L (ENSAPLG00000006108) TRIB2 (ENSAPLG00000013170) LRATD1 (ENSAPLG00000011566) NBAS (ENSAPLG00000012361) DDX1 (ENSAPLG00000011093) MYCN (ENSAPLG00000009825) CYRIA (ENSAPLG00000009498) ENSAPLG00000025611 VSNL1 (ENSAPLG00000010558) SMC6 (ENSAPLG00000008910) GEN1 (ENSAPLG00000008596) #22 MSGN1 (ENSAPLG00000001852) ENSAPLG00000008127 KCNS3 (ENSAPLG00000001833) RDH14 (ENSAPLG00000008116) NT5C1B (ENSAPLG00000008001) OSR1 (ENSAPLG00000007971) ENSAPLG00000007727 TTC32 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PUM2 (ENSTGUG00000013149) Medium ground finch MODERN SPECIES 21 SLC66A3 (ENSGFOG00000007534) ENSGFOG00000007525 ROCK2 (ENSGFOG00000007498) ENSGFOG00000007490 ENSGFOG00000007488 GREB1 (ENSGFOG00000007462) LPIN1 (ENSGFOG00000005160) TRIB2 (ENSGFOG00000010590) LRATD1 (ENSGFOG00000010589) NBAS (ENSGFOG00000010569) DDX1 (ENSGFOG00000010553) MYCN (ENSGFOG00000010546) CYRIA (ENSGFOG00000010538) VSNL1 (ENSGFOG00000010531) SMC6 (ENSGFOG00000010514) GEN1 (ENSGFOG00000010501) #22 KCNS3 (ENSGFOG00000010498) RDH14 (ENSGFOG00000010495) NT5C1B (ENSGFOG00000010490) OSR1 (ENSGFOG00000010486) ENSGFOG00000010484 WDR35 (ENSGFOG00000010480) MATN3 (ENSGFOG00000010458) LAPTM4A (ENSGFOG00000010443) ENSGFOG00000010430 SDC1 (ENSGFOG00000010416) ENSGFOG00000010411 PUM2 (ENSGFOG00000010379) ENSGFOG00000010354 RHOB (ENSGFOG00000010348) HS1BP3 (ENSGFOG00000010343) Flycatcher MODERN SPECIES 21 SLC66A3 (ENSFALG00000024817) ROCK2 (ENSFALG00000006707) ENSFALG00000027375 ENSFALG00000026316 GREB1 (ENSFALG00000006718) 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ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000180923 ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00940000164003 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Golden eagle MODERN SPECIES 6 ROCK2 (ENSACCG00020011682) E2F6 (ENSACCG00020011591) GREB1 (ENSACCG00020011499) LPIN1 (ENSACCG00020011416) TRIB2 (ENSACCG00020011397) ENSACCG00020011382 ENSACCG00020011374 LRATD1 (ENSACCG00020011362) NBAS (ENSACCG00020011318) DDX1 (ENSACCG00020011276) MYCN (ENSACCG00020011258) CYRIA (ENSACCG00020011233) ENSACCG00020011205 VSNL1 (ENSACCG00020011201) SMC6 (ENSACCG00020011179) GEN1 (ENSACCG00020011155) #22 MSGN1 (ENSACCG00020011146) KCNS3 (ENSACCG00020011140) RDH14 (ENSACCG00020011134) NT5C1B (ENSACCG00020011126) OSR1 (ENSACCG00020011118) ENSACCG00020011110 WDR35 (ENSACCG00020011082) MATN3 (ENSACCG00020011023) LAPTM4A (ENSACCG00020011001) ENSACCG00020010982 SDC1 (ENSACCG00020010958) ENSACCG00020010949 PUM2 (ENSACCG00020010910) ENSACCG00020010869 ENSACCG00020010855 Kakapo MODERN SPECIES 23 C2orf50 (ENSSHBG00005007249) SLC66A3 (ENSSHBG00005007268) ENSSHBG00005007299 ENSSHBG00005007333 E2F6 (ENSSHBG00005007355) GREB1 (ENSSHBG00005007448) LPIN1 (ENSSHBG00005007857) TRIB2 (ENSSHBG00005007893) LRATD1 (ENSSHBG00005007911) NBAS (ENSSHBG00005008111) DDX1 (ENSSHBG00005009418) MYCN (ENSSHBG00005009434) CYRIA (ENSSHBG00005009457) VSNL1 (ENSSHBG00005009485) SMC6 (ENSSHBG00005009502) ENSSHBG00005009523 #22 MSGN1 (ENSSHBG00005009540) KCNS3 (ENSSHBG00005009545) RDH14 (ENSSHBG00005009558) NT5C1B (ENSSHBG00005009567) OSR1 (ENSSHBG00005009574) TTC32 (ENSSHBG00005009581) WDR35 (ENSSHBG00005009592) LAPTM4A (ENSSHBG00005009614) ENSSHBG00005009640 SDC1 (ENSSHBG00005009652) PUM2 (ENSSHBG00005009670) ENSSHBG00005009714 RHOB (ENSSHBG00005009806) HS1BP3 (ENSSHBG00005009814) GDF7 (ENSSHBG00005009832) African ostrich MODERN SPECIES 803 ENSSCUG00000012515 VSNL1 (ENSSCUG00000012512) SMC6 (ENSSCUG00000012506) GEN1 (ENSSCUG00000012504) #22 KCNS3 (ENSSCUG00000012503) RDH14 (ENSSCUG00000012496) NT5C1B (ENSSCUG00000012495) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 38 ENSCPRG00005006542 ROCK2 (ENSCPRG00005006216) ENSCPRG00005006100 GREB1 (ENSCPRG00005006077) LPIN1 (ENSCPRG00005005996) TRIB2 (ENSCPRG00005005953) ENSCPRG00005005922 NBAS (ENSCPRG00005005782) DDX1 (ENSCPRG00005005666) MYCN (ENSCPRG00005005639) CYRIA (ENSCPRG00005005582) ENSCPRG00005005559 VSNL1 (ENSCPRG00005005557) ENSCPRG00005005504 ENSCPRG00005005424 GEN1 (ENSCPRG00005005337) #22 MSGN1 (ENSCPRG00005005322) KCNS3 (ENSCPRG00005005307) RDH14 (ENSCPRG00005005281) NT5C1B (ENSCPRG00005005265) ENSCPRG00005005234 OSR1 (ENSCPRG00005005214) TTC32 (ENSCPRG00005005187) WDR35 (ENSCPRG00005005160) MATN3 (ENSCPRG00005005148) LAPTM4A (ENSCPRG00005005092) SDC1 (ENSCPRG00005005072) PUM2 (ENSCPRG00005005047) ENSCPRG00005004993 ENSCPRG00005004985 RHOB (ENSCPRG00005004980) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.jb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000177852 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219.a ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 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ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000153446.b.s ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00940000164003 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b painted turtle MODERN SPECIES 2390 KCNF1 (ENSCPBG00000014030) C2orf50 (ENSCPBG00000014027) SLC66A3 (ENSCPBG00000014025) ROCK2 (ENSCPBG00000014009) E2F6 (ENSCPBG00000014007) GREB1 (ENSCPBG00000014004) LPIN1 (ENSCPBG00000014000) TRIB2 (ENSCPBG00000013994) LRATD1 (ENSCPBG00000013990) NBAS (ENSCPBG00000013977) DDX1 (ENSCPBG00000013330) ENSCPBG00000013321 CYRIA (ENSCPBG00000013312) VSNL1 (ENSCPBG00000013304) SMC6 (ENSCPBG00000013302) GEN1 (ENSCPBG00000013299) #22 MSGN1 (ENSCPBG00000013298) ENSCPBG00000013295 KCNS3 (ENSCPBG00000013292) RDH14 (ENSCPBG00000013290) NT5C1B (ENSCPBG00000013288) ENSCPBG00000013282 OSR1 (ENSCPBG00000013280) Three-toed box turtle MODERN SPECIES 15 C2orf50 (ENSTMTG00000002318) ROCK2 (ENSTMTG00000002325) E2F6 (ENSTMTG00000002335) GREB1 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ENSPSIG00000001835 RHOB (ENSPSIG00000011554) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d Theria ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 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ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154459.B ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 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(ENSRFEG00010006120) #22 MSGN1 (ENSRFEG00010006094) KCNS3 (ENSRFEG00010006076) RDH14 (ENSRFEG00010006059) NT5C1B (ENSRFEG00010006003) OSR1 (ENSRFEG00010005966) TTC32 (ENSRFEG00010005945) WDR35 (ENSRFEG00010005857) MATN3 (ENSRFEG00010005757) LAPTM4A (ENSRFEG00010005720) SDC1 (ENSRFEG00010005688) ENSRFEG00010005671 PUM2 (ENSRFEG00010005562) RHOB (ENSRFEG00010005478) HS1BP3 (ENSRFEG00010005461) GDF7 (ENSRFEG00010005440) Megabat MODERN SPECIES 3356 RAD51AP2 (ENSPVAG00000015657) VSNL1 (ENSPVAG00000015658) SMC6 (ENSPVAG00000015659) GEN1 (ENSPVAG00000015665) #22 MSGN1 (ENSPVAG00000015666) KCNS3 (ENSPVAG00000015667) Equus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT01090000263232 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT01090000263317.a ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Horse MODERN SPECIES 6 LPIN1 (ENSECAG00000011239) TRIB2 (ENSECAG00000010405) ENSECAG00000050817 ENSECAG00000038530 ENSECAG00000007860 LRATD1 (ENSECAG00000027835) NBAS (ENSECAG00000016641) DDX1 (ENSECAG00000016396) ENSECAG00000037590 MYCN (ENSECAG00000002896) ENSECAG00000018361 CYRIA (ENSECAG00000014952) RAD51AP2 (ENSECAG00000014706) VSNL1 (ENSECAG00000013682) SMC6 (ENSECAG00000022265) GEN1 (ENSECAG00000020295) #22 MSGN1 (ENSECAG00000002724) KCNS3 (ENSECAG00000019779) RDH14 (ENSECAG00000045905) NT5C1B (ENSECAG00000014033) OSR1 (ENSECAG00000013593) TTC32 (ENSECAG00000013048) WDR35 (ENSECAG00000018258) MATN3 (ENSECAG00000017085) SDC1 (ENSECAG00000014709) ENSECAG00000045674 PUM2 (ENSECAG00000021930) ENSECAG00000021922 ENSECAG00000032315 RHOB (ENSECAG00000051165) HS1BP3 (ENSECAG00000021502) Donkey MODERN SPECIES 26 ROCK2 (ENSEASG00005005236) E2F6 (ENSEASG00005008212) GREB1 (ENSEASG00005008223) NTSR2 (ENSEASG00005008238) LPIN1 (ENSEASG00005008245) TRIB2 (ENSEASG00005008257) ENSEASG00005008260 LRATD1 (ENSEASG00005026394) NBAS (ENSEASG00005008385) DDX1 (ENSEASG00005009335) MYCN (ENSEASG00005037158) CYRIA (ENSEASG00005009344) RAD51AP2 (ENSEASG00005009350) VSNL1 (ENSEASG00005026430) SMC6 (ENSEASG00005009355) GEN1 (ENSEASG00005023619) #22 MSGN1 (ENSEASG00005009364) KCNS3 (ENSEASG00005009368) RDH14 (ENSEASG00005029880) NT5C1B (ENSEASG00005009376) OSR1 (ENSEASG00005009388) TTC32 (ENSEASG00005026368) WDR35 (ENSEASG00005009400) MATN3 (ENSEASG00005009408) LAPTM4A (ENSEASG00005009414) SDC1 (ENSEASG00005009418) PUM2 (ENSEASG00005009429) ENSEASG00005009442 ENSEASG00005027331 RHOB (ENSEASG00005009448) HS1BP3 (ENSEASG00005009454) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000185177 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000185985 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 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ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234517.D ENSGT00990000203553.c.b.o.b ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181.e ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Bos ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00990000203553.c.b.o.b ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181.e ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234517.D ENSGT00990000203553.c.b.o.b ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181.e ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Domestic yak MODERN SPECIES 28 ENSBGRG00000024544 ROCK2 (ENSBGRG00000024309) E2F6 (ENSBGRG00000024251) GREB1 (ENSBGRG00000023941) NTSR2 (ENSBGRG00000023894) LPIN1 (ENSBGRG00000023367) TRIB2 (ENSBGRG00000023292) LRATD1 (ENSBGRG00000023277) NBAS (ENSBGRG00000022914) DDX1 (ENSBGRG00000022559) ENSBGRG00000022487 CYRIA (ENSBGRG00000022323) RAD51AP2 (ENSBGRG00000022307) VSNL1 (ENSBGRG00000022276) SMC6 (ENSBGRG00000022073) GEN1 (ENSBGRG00000022034) #22 MSGN1 (ENSBGRG00000022021) KCNS3 (ENSBGRG00000022008) ENSBGRG00000021977 NT5C1B (ENSBGRG00000021877) OSR1 (ENSBGRG00000021840) ENSBGRG00000021825 TTC32 (ENSBGRG00000021780) WDR35 (ENSBGRG00000020967) MATN3 (ENSBGRG00000020733) SDC1 (ENSBGRG00000020622) PUM2 (ENSBGRG00000020491) ENSBGRG00000020441 ENSBGRG00000020423 RHOB (ENSBGRG00000020410) HS1BP3 (ENSBGRG00000020332) Wild yak MODERN SPECIES 370 LRATD1 (ENSBMUG00000015351) NBAS (ENSBMUG00000015322) DDX1 (ENSBMUG00000015142) ENSBMUG00000015004 CYRIA (ENSBMUG00000014990) RAD51AP2 (ENSBMUG00000014970) VSNL1 (ENSBMUG00000014955) SMC6 (ENSBMUG00000014908) GEN1 (ENSBMUG00000014871) #22 MSGN1 (ENSBMUG00000014840) KCNS3 (ENSBMUG00000014825) RDH14 (ENSBMUG00000014812) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00990000203553.c.b.o.b ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181.e ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 2 E2F6 (ENSBIXG00005022718) ENSBIXG00005003893 ENSBIXG00005022741 GREB1 (ENSBIXG00005023461) NTSR2 (ENSBIXG00005004030) LPIN1 (ENSBIXG00005023863) TRIB2 (ENSBIXG00005024058) LRATD1 (ENSBIXG00005024161) NBAS (ENSBIXG00005007735) DDX1 (ENSBIXG00005024527) MYCN (ENSBIXG00005024578) CYRIA (ENSBIXG00005024640) RAD51AP2 (ENSBIXG00005024673) VSNL1 (ENSBIXG00005024708) SMC6 (ENSBIXG00005004235) GEN1 (ENSBIXG00005024882) #22 MSGN1 (ENSBIXG00005024894) KCNS3 (ENSBIXG00005024916) RDH14 (ENSBIXG00005024953) NT5C1B (ENSBIXG00005025000) ENSBIXG00005025042 TTC32 (ENSBIXG00005025110) WDR35 (ENSBIXG00005025304) MATN3 (ENSBIXG00005006070) ENSBIXG00005025414 LAPTM4A (ENSBIXG00005025436) SDC1 (ENSBIXG00005004335) PUM2 (ENSBIXG00005004375) ENSBIXG00005025762 RHOB (ENSBIXG00005004398) HS1BP3 (ENSBIXG00005025838) Cow MODERN SPECIES 2 NLRP6 (ENSBTAG00000001076) COX8B (ENSBTAG00000002046) PSMD13 (ENSBTAG00000002045) SIRT3 (ENSBTAG00000002044) RIC8A (ENSBTAG00000002042) BET1L (ENSBTAG00000001744) ODF3 (ENSBTAG00000001730) SCGB1C1 (ENSBTAG00000022142) NBAS (ENSBTAG00000014081) DDX1 (ENSBTAG00000009906) MYCN (ENSBTAG00000023372) CYRIA (ENSBTAG00000012779) RAD51AP2 (ENSBTAG00000037812) VSNL1 (ENSBTAG00000017158) SMC6 (ENSBTAG00000018256) GEN1 (ENSBTAG00000020059) #22 MSGN1 (ENSBTAG00000039113) RDH14 (ENSBTAG00000023928) NT5C1B (ENSBTAG00000005270) OSR1 (ENSBTAG00000008113) TTC32 (ENSBTAG00000015587) WDR35 (ENSBTAG00000051164) MATN3 (ENSBTAG00000020893) ENSBTAG00000052052 LAPTM4A (ENSBTAG00000020894) SDC1 (ENSBTAG00000011154) PUM2 (ENSBTAG00000011155) ENSBTAG00000049117 HS1BP3 (ENSBTAG00000015490) GDF7 (ENSBTAG00000038224) LDAH (ENSBTAG00000031014) American bison MODERN SPECIES 3068 RAD51AP2 (ENSBBBG00000005308) VSNL1 (ENSBBBG00000005304) SMC6 (ENSBBBG00000019549) GEN1 (ENSBBBG00000005250) #22 MSGN1 (ENSBBBG00000005230) KCNS3 (ENSBBBG00000019452) ENSBBBG00000019450 NT5C1B (ENSBBBG00000009192) OSR1 (ENSBBBG00000019430) TTC32 (ENSBBBG00000006785) WDR35 (ENSBBBG00000007319) MATN3 (ENSBBBG00000019335) LAPTM4A (ENSBBBG00000007183) SDC1 (ENSBBBG00000009171) PUM2 (ENSBBBG00000019297) ENSBBBG00000019228 RHOB (ENSBBBG00000019223) HS1BP3 (ENSBBBG00000019208) LDAH (ENSBBBG00000019145) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Goat MODERN SPECIES 2 ROCK2 (ENSCHIG00000013173) E2F6 (ENSCHIG00000016333) GREB1 (ENSCHIG00000017667) NTSR2 (ENSCHIG00000011816) LPIN1 (ENSCHIG00000018539) TRIB2 (ENSCHIG00000015740) ENSCHIG00000021912 LRATD1 (ENSCHIG00000008065) ENSCHIG00000013770 NBAS (ENSCHIG00000014758) DDX1 (ENSCHIG00000011046) MYCN (ENSCHIG00000017882) CYRIA (ENSCHIG00000018672) VSNL1 (ENSCHIG00000006913) SMC6 (ENSCHIG00000010144) GEN1 (ENSCHIG00000013888) #22 MSGN1 (ENSCHIG00000010365) KCNS3 (ENSCHIG00000012986) ENSCHIG00000027201 NT5C1B (ENSCHIG00000026605) OSR1 (ENSCHIG00000020202) TTC32 (ENSCHIG00000025091) WDR35 (ENSCHIG00000006588) MATN3 (ENSCHIG00000018061) LAPTM4A (ENSCHIG00000022265) SDC1 (ENSCHIG00000018782) ENSCHIG00000025915 PUM2 (ENSCHIG00000022180) ENSCHIG00000018368 RHOB (ENSCHIG00000012713) HS1BP3 (ENSCHIG00000026302) Siberian musk deer MODERN SPECIES 239 LRATD1 (ENSMMSG00000001828) NBAS (ENSMMSG00000001890) DDX1 (ENSMMSG00000002128) ENSMMSG00000002254 MYCN (ENSMMSG00000002269) CYRIA (ENSMMSG00000002297) ENSMMSG00000002335 VSNL1 (ENSMMSG00000002354) SMC6 (ENSMMSG00000002375) GEN1 (ENSMMSG00000002401) #22 MSGN1 (ENSMMSG00000002419) KCNS3 (ENSMMSG00000002436) RDH14 (ENSMMSG00000002449) NT5C1B (ENSMMSG00000002465) OSR1 (ENSMMSG00000002491) TTC32 (ENSMMSG00000002503) WDR35 (ENSMMSG00000002532) ENSMMSG00000002584 MATN3 (ENSMMSG00000002615) LAPTM4A (ENSMMSG00000002657) ENSMMSG00000002671 SDC1 (ENSMMSG00000002684) PUM2 (ENSMMSG00000002715) ENSMMSG00000002810 RHOB (ENSMMSG00000002823) Yarkand deer MODERN SPECIES 2 ENSCHYG00000009170 ROCK2 (ENSCHYG00000008822) ENSCHYG00000008703 GREB1 (ENSCHYG00000008543) NTSR2 (ENSCHYG00000008520) LPIN1 (ENSCHYG00000008194) TRIB2 (ENSCHYG00000008145) LRATD1 (ENSCHYG00000008068) NBAS (ENSCHYG00000007960) DDX1 (ENSCHYG00000007524) ENSCHYG00000007479 CYRIA (ENSCHYG00000007408) RAD51AP2 (ENSCHYG00000007371) VSNL1 (ENSCHYG00000007343) SMC6 (ENSCHYG00000007159) GEN1 (ENSCHYG00000007066) #22 MSGN1 (ENSCHYG00000007045) KCNS3 (ENSCHYG00000007031) RDH14 (ENSCHYG00000007014) NT5C1B (ENSCHYG00000006961) ENSCHYG00000006946 OSR1 (ENSCHYG00000006938) TTC32 (ENSCHYG00000006877) WDR35 (ENSCHYG00000006261) MATN3 (ENSCHYG00000006044) LAPTM4A (ENSCHYG00000005989) SDC1 (ENSCHYG00000005966) PUM2 (ENSCHYG00000005651) ENSCHYG00000005597 RHOB (ENSCHYG00000005587) HS1BP3 (ENSCHYG00000005568) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT01090000263460 Arabian camel MODERN SPECIES 6 E2F6 (ENSCDRG00005003569) GREB1 (ENSCDRG00005003633) NTSR2 (ENSCDRG00005003795) LPIN1 (ENSCDRG00005003875) TRIB2 (ENSCDRG00005004180) ENSCDRG00005004212 LRATD1 (ENSCDRG00005004252) NBAS (ENSCDRG00005004285) DDX1 (ENSCDRG00005004527) ENSCDRG00005004697 ENSCDRG00005004717 CYRIA (ENSCDRG00005004743) RAD51AP2 (ENSCDRG00005004783) VSNL1 (ENSCDRG00005004814) SMC6 (ENSCDRG00005004835) GEN1 (ENSCDRG00005004909) #22 MSGN1 (ENSCDRG00005004972) KCNS3 (ENSCDRG00005004986) RDH14 (ENSCDRG00005004999) NT5C1B (ENSCDRG00005005015) OSR1 (ENSCDRG00005005052) TTC32 (ENSCDRG00005005072) ENSCDRG00005005097 MATN3 (ENSCDRG00005005117) LAPTM4A (ENSCDRG00005005142) ENSCDRG00005005168 SDC1 (ENSCDRG00005005384) ENSCDRG00005005424 PUM2 (ENSCDRG00005005454) RHOB (ENSCDRG00005005629) HS1BP3 (ENSCDRG00005005637) Alpaca MODERN SPECIES 2892 RAD51AP2 (ENSVPAG00000010297) SMC6 (ENSVPAG00000010300) GEN1 (ENSVPAG00000010307) #22 Suina ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Pig MODERN SPECIES 11 E2F6 (ENSSSCG00000026161) GREB1 (ENSSSCG00000025483) NTSR2 (ENSSSCG00000008625) LPIN1 (ENSSSCG00000008624) TRIB2 (ENSSSCG00000039080) ENSSSCG00000042932 LRATD1 (ENSSSCG00000008664) NBAS (ENSSSCG00000008621) DDX1 (ENSSSCG00000008619) MYCN (ENSSSCG00000008618) ENSSSCG00000033084 CYRIA (ENSSSCG00000008617) RAD51AP2 (ENSSSCG00000038058) VSNL1 (ENSSSCG00000008615) SMC6 (ENSSSCG00000008614) GEN1 (ENSSSCG00000008613) #22 MSGN1 (ENSSSCG00000026538) ENSSSCG00000040752 KCNS3 (ENSSSCG00000031905) RDH14 (ENSSSCG00000008608) NT5C1B (ENSSSCG00000008607) ENSSSCG00000054495 OSR1 (ENSSSCG00000060496) ENSSSCG00000058710 TTC32 (ENSSSCG00000053616) WDR35 (ENSSSCG00000008604) MATN3 (ENSSSCG00000008603) LAPTM4A (ENSSSCG00000008602) SDC1 (ENSSSCG00000008601) PUM2 (ENSSSCG00000008600) ENSSSCG00000054581 Chacoan peccary MODERN SPECIES 776 E2F6 (ENSCWAG00000013986) GREB1 (ENSCWAG00000014037) NTSR2 (ENSCWAG00000014475) LPIN1 (ENSCWAG00000014537) TRIB2 (ENSCWAG00000015191) LRATD1 (ENSCWAG00000015236) NBAS (ENSCWAG00000015265) DDX1 (ENSCWAG00000015647) MYCN (ENSCWAG00000015961) CYRIA (ENSCWAG00000016027) RAD51AP2 (ENSCWAG00000016094) VSNL1 (ENSCWAG00000016143) SMC6 (ENSCWAG00000016171) GEN1 (ENSCWAG00000016234) #22 MSGN1 (ENSCWAG00000016325) KCNS3 (ENSCWAG00000016339) RDH14 (ENSCWAG00000016353) NT5C1B (ENSCWAG00000016386) OSR1 (ENSCWAG00000016456) TTC32 (ENSCWAG00000016481) WDR35 (ENSCWAG00000016523) MATN3 (ENSCWAG00000016742) LAPTM4A (ENSCWAG00000016902) SDC1 (ENSCWAG00000016920) PUM2 (ENSCWAG00000003696) ENSCWAG00000003897 RHOB (ENSCWAG00000004001) HS1BP3 (ENSCWAG00000004014) GDF7 (ENSCWAG00000004046) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1441 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 Common shrew MODERN SPECIES 4284 SMC6 (ENSSARG00000014427) GEN1 (ENSSARG00000014442) #22 Hedgehog MODERN SPECIES 7199 GEN1 (ENSEEUG00000004845) #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C 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#22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Glires ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d 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ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 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ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 229 E2f6 (ENSCGRG00001013963) Greb1 (ENSCGRG00001018970) Ntsr2 (ENSCGRG00001012327) Lpin1 (ENSCGRG00001000692) Trib2 (ENSCGRG00001024816) ENSCGRG00001013482 ENSCGRG00001013069 ENSCGRG00001002169 Nbas (ENSCGRG00001001919) Ddx1 (ENSCGRG00001013025) Mycn (ENSCGRG00001018130) Cyria (ENSCGRG00001014064) ENSCGRG00001012128 Vsnl1 (ENSCGRG00001017035) Smc6 (ENSCGRG00001024287) ENSCGRG00001019699 #22 Msgn1 (ENSCGRG00001003369) Kcns3 (ENSCGRG00001004289) ENSCGRG00001006912 Rdh14 (ENSCGRG00001024177) Nt5c1b (ENSCGRG00001016775) Osr1 (ENSCGRG00001009653) Ttc32 (ENSCGRG00001007763) Wdr35 (ENSCGRG00001004220) Matn3 (ENSCGRG00001025049) Laptm4a (ENSCGRG00001021474) SDC1 (ENSCGRG00001018173) Pum2 (ENSCGRG00001025023) Slc7a15 (ENSCGRG00001018113) Rhob (ENSCGRG00001001843) Hs1bp3 (ENSCGRG00001015945) Golden Hamster MODERN SPECIES 367 ENSMAUG00000007689 #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 14 E2f6 (ENSPEMG00000020192) Greb1 (ENSPEMG00000020144) Ntsr2 (ENSPEMG00000007290) Lpin1 (ENSPEMG00000005628) Trib2 (ENSPEMG00000027972) ENSPEMG00000030202 Lratd1 (ENSPEMG00000027364) Nbas (ENSPEMG00000000126) Ddx1 (ENSPEMG00000016389) ENSPEMG00000027724 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ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Mus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.bb.a ENSGT00390000015159.a.b 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ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Steppe mouse MODERN SPECIES 66 Vsnl1 (ENSMSIG00000003607) Smc6 (ENSMSIG00000003533) Gen1 (ENSMSIG00000003465) #22 Msgn1 (ENSMSIG00000003441) Kcns3 (ENSMSIG00000003427) spretus MODERN SPECIES 3 MGP_SPRETEiJ_G0018473 Rock2 (MGP_SPRETEiJ_G0018472) E2f6 (MGP_SPRETEiJ_G0018471) Greb1 (MGP_SPRETEiJ_G0018470) Ntsr2 (MGP_SPRETEiJ_G0018469) Lpin1 (MGP_SPRETEiJ_G0018468) Trib2 (MGP_SPRETEiJ_G0018467) Lratd1 (MGP_SPRETEiJ_G0018466) Nbas (MGP_SPRETEiJ_G0018465) Ddx1 (MGP_SPRETEiJ_G0018464) Mycn (MGP_SPRETEiJ_G0018463) Cyria (MGP_SPRETEiJ_G0018462) Rad51ap2 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8 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 176 ENSCLAG00000013272 VSNL1 (ENSCLAG00000011222) SMC6 (ENSCLAG00000012919) GEN1 (ENSCLAG00000008865) #22 MSGN1 (ENSCLAG00000015119) KCNS3 (ENSCLAG00000013937) RDH14 (ENSCLAG00000009341) NT5C1B (ENSCLAG00000008659) OSR1 (ENSCLAG00000009423) TTC32 (ENSCLAG00000009839) WDR35 (ENSCLAG00000007929) MATN3 (ENSCLAG00000006019) LAPTM4A (ENSCLAG00000006983) SDC1 (ENSCLAG00000007345) PUM2 (ENSCLAG00000006048) ENSCLAG00000005814 RHOB (ENSCLAG00000017801) HS1BP3 (ENSCLAG00000008832) LDAH (ENSCLAG00000011308) Degu MODERN SPECIES 60 ENSODEG00000009441 ENSODEG00000009977 SGCB (ENSODEG00000009784) ENSODEG00000009044 ENSODEG00000009096 CWH43 (ENSODEG00000009451) OCIAD2 (ENSODEG00000010340) ENSODEG00000010537 OCIAD1 (ENSODEG00000009198) FRYL (ENSODEG00000009331) ENSODEG00000008772 SLC10A4 (ENSODEG00000010331) ENSODEG00000008159 VSNL1 (ENSODEG00000008555) SMC6 (ENSODEG00000008987) GEN1 (ENSODEG00000010156) #22 MSGN1 (ENSODEG00000009615) ENSODEG00000019755 KCNS3 (ENSODEG00000009066) RDH14 (ENSODEG00000008458) NT5C1B (ENSODEG00000008929) OSR1 (ENSODEG00000008728) TTC32 (ENSODEG00000009280) WDR35 (ENSODEG00000012693) MATN3 (ENSODEG00000008451) LAPTM4A (ENSODEG00000008579) SDC1 (ENSODEG00000010758) ENSODEG00000008774 PUM2 (ENSODEG00000007823) ENSODEG00000010362 RHOB (ENSODEG00000019841) Guinea pig MODERN SPECIES 18 VSNL1 (ENSCPOG00000030283) SMC6 (ENSCPOG00000014752) GEN1 (ENSCPOG00000033894) #22 MSGN1 (ENSCPOG00000003061) KCNS3 (ENSCPOG00000009232) RDH14 (ENSCPOG00000022651) NT5C1B (ENSCPOG00000012761) OSR1 (ENSCPOG00000002025) TTC32 (ENSCPOG00000033658) WDR35 (ENSCPOG00000007053) MATN3 (ENSCPOG00000004739) LAPTM4A (ENSCPOG00000009690) SDC1 (ENSCPOG00000008875) ENSCPOG00000007075 PUM2 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(ENSHGLG00000004613) ENSHGLG00000038178 HEATR5A (ENSHGLG00000002799) ENSHGLG00000038655 DTD2 (ENSHGLG00000046094) GPR33 (ENSHGLG00000019958) ENSHGLG00000001878 NUBPL (ENSHGLG00000043820) ENSHGLG00000003444 ENSHGLG00000043700 ENSHGLG00000003356 ENSHGLG00000050973 ENSHGLG00000048569 #22 ENSHGLG00000036198 ENSHGLG00000050257 ENSHGLG00000001333 ENSHGLG00000001019 ENSHGLG00000045174 ENSHGLG00000000723 ENSHGLG00000001684 ENSHGLG00000001381 ENSHGLG00000032861 ENSHGLG00000002049 ENSHGLG00000046910 EAPP (ENSHGLG00000035378) SNX6 (ENSHGLG00000002236) CFL2 (ENSHGLG00000001467) ENSHGLG00000047884 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 30 ENSHGLG00000036392 ENSHGLG00000050705 ENSHGLG00000035577 ENSHGLG00000012435 ENSHGLG00000040813 ENSHGLG00000002743 ENSHGLG00000001556 FBXO25 (ENSHGLG00000001395) ENSHGLG00000012555 ENSHGLG00000044269 ENSHGLG00000032967 ENSHGLG00000037485 ENSHGLG00000042446 ENSHGLG00000016211 ENSHGLG00000016450 GEN1 (ENSHGLG00000015449) #22 ENSHGLG00000017189 ENSHGLG00000046477 ENSHGLG00000045872 ENSHGLG00000008037 ENSHGLG00000007715 ENSHGLG00000006288 ENSHGLG00000007387 ENSHGLG00000011910 ENSHGLG00000043882 ENSHGLG00000044427 NKAPL (ENSHGLG00000035910) ENSHGLG00000043206 ENSHGLG00000005144 ENSHGLG00000039085 ENSHGLG00000005106 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734.q ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.cb ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734.q ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.cb ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a.u.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Alpin marmot MODERN SPECIES 6 SLC66A3 (ENSMMMG00000022562) ROCK2 (ENSMMMG00000022550) E2F6 (ENSMMMG00000022544) GREB1 (ENSMMMG00000022514) LPIN1 (ENSMMMG00000022468) TRIB2 (ENSMMMG00000022461) LRATD1 (ENSMMMG00000022451) NBAS (ENSMMMG00000022403) DDX1 (ENSMMMG00000022392) ENSMMMG00000022387 ENSMMMG00000022385 CYRIA (ENSMMMG00000022371) RAD51AP2 (ENSMMMG00000022347) VSNL1 (ENSMMMG00000022330) SMC6 (ENSMMMG00000022309) GEN1 (ENSMMMG00000022304) #22 MSGN1 (ENSMMMG00000022303) KCNS3 (ENSMMMG00000022292) RDH14 (ENSMMMG00000022280) ENSMMMG00000022251 OSR1 (ENSMMMG00000022239) TTC32 (ENSMMMG00000022212) WDR35 (ENSMMMG00000022195) MATN3 (ENSMMMG00000022186) LAPTM4A (ENSMMMG00000022160) SDC1 (ENSMMMG00000022131) ENSMMMG00000022129 PUM2 (ENSMMMG00000022116) ENSMMMG00000022089 RHOB (ENSMMMG00000022086) HS1BP3 (ENSMMMG00000022083) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734.q ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a.k ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432.cb ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a.u.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES ENSUPAG00010011160 E2F6 (ENSUPAG00010011151) GREB1 (ENSUPAG00010011107) NTSR2 (ENSUPAG00010011106) LPIN1 (ENSUPAG00010009943) TRIB2 (ENSUPAG00010009911) LRATD1 (ENSUPAG00010009896) NBAS (ENSUPAG00010009750) DDX1 (ENSUPAG00010009711) ENSUPAG00010009708 MYCN (ENSUPAG00010009702) CYRIA (ENSUPAG00010009668) RAD51AP2 (ENSUPAG00010009663) VSNL1 (ENSUPAG00010009655) SMC6 (ENSUPAG00010009564) GEN1 (ENSUPAG00010009557) #22 MSGN1 (ENSUPAG00010009556) RDH14 (ENSUPAG00010009546) ENSUPAG00010009474 OSR1 (ENSUPAG00010009451) TTC32 (ENSUPAG00010009436) WDR35 (ENSUPAG00010009354) MATN3 (ENSUPAG00010009339) LAPTM4A (ENSUPAG00010009333) SDC1 (ENSUPAG00010009310) ENSUPAG00010009303 ENSUPAG00010009301 PUM2 (ENSUPAG00010009123) ENSUPAG00010009092 RHOB (ENSUPAG00010009084) HS1BP3 (ENSUPAG00010009063) Squirrel MODERN SPECIES 93 NBAS (ENSSTOG00000008943) DDX1 (ENSSTOG00000003977) MYCN (ENSSTOG00000012252) CYRIA (ENSSTOG00000022187) ENSSTOG00000025212 VSNL1 (ENSSTOG00000010438) SMC6 (ENSSTOG00000013946) GEN1 (ENSSTOG00000013963) #22 MSGN1 (ENSSTOG00000013981) KCNS3 (ENSSTOG00000012420) RDH14 (ENSSTOG00000021114) NT5C1B (ENSSTOG00000014834) OSR1 (ENSSTOG00000015454) TTC32 (ENSSTOG00000007140) WDR35 (ENSSTOG00000007151) MATN3 (ENSSTOG00000019530) ENSSTOG00000007214 SDC1 (ENSSTOG00000028519) ENSSTOG00000033291 PUM2 (ENSSTOG00000006262) ENSSTOG00000023326 ENSSTOG00000014644 HS1BP3 (ENSSTOG00000004973) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 NTSR2 (ENSSVLG00005017070) LPIN1 (ENSSVLG00005016318) TRIB2 (ENSSVLG00005016251) ENSSVLG00005016163 LRATD1 (ENSSVLG00005025440) NBAS (ENSSVLG00005025400) ENSSVLG00005025381 DDX1 (ENSSVLG00005025306) ENSSVLG00005025265 ENSSVLG00005025253 CYRIA (ENSSVLG00005025229) ENSSVLG00005025209 RAD51AP2 (ENSSVLG00005025196) VSNL1 (ENSSVLG00005025182) SMC6 (ENSSVLG00005025164) GEN1 (ENSSVLG00005025123) #22 MSGN1 (ENSSVLG00005025107) KCNS3 (ENSSVLG00005025089) ENSSVLG00005025079 RDH14 (ENSSVLG00005025062) NT5C1B (ENSSVLG00005025002) OSR1 (ENSSVLG00005024914) TTC32 (ENSSVLG00005024889) WDR35 (ENSSVLG00005024826) MATN3 (ENSSVLG00005024711) LAPTM4A (ENSSVLG00005024670) SDC1 (ENSSVLG00005024647) ENSSVLG00005024506 ENSSVLG00005024370 RHOB (ENSSVLG00005024328) HS1BP3 (ENSSVLG00005024304) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Rabbit MODERN SPECIES 11 ENSOCUG00000038693 ENSOCUG00000031382 TRIB2 (ENSOCUG00000003153) ENSOCUG00000039303 LRATD1 (ENSOCUG00000002283) ENSOCUG00000039105 ENSOCUG00000023292 NBAS (ENSOCUG00000015460) DDX1 (ENSOCUG00000007010) ENSOCUG00000037275 CYRIA (ENSOCUG00000007886) RAD51AP2 (ENSOCUG00000027767) VSNL1 (ENSOCUG00000026184) ENSOCUG00000017307 ENSOCUG00000034282 GEN1 (ENSOCUG00000027255) #22 MSGN1 (ENSOCUG00000000309) KCNS3 (ENSOCUG00000007365) RDH14 (ENSOCUG00000025332) NT5C1B (ENSOCUG00000026238) OSR1 (ENSOCUG00000006091) ENSOCUG00000034308 TTC32 (ENSOCUG00000003731) WDR35 (ENSOCUG00000013185) MATN3 (ENSOCUG00000021257) LAPTM4A (ENSOCUG00000026699) SDC1 (ENSOCUG00000025956) ENSOCUG00000032467 PUM2 (ENSOCUG00000017908) ENSOCUG00000025149 RHOB (ENSOCUG00000032265) Primates ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00900000143745 ENSGT00390000013092 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00900000143745 ENSGT00390000013092 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00900000143745 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424.a ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 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KCNS3 (ENSPPYG00000012627) ENSPPYG00000012626 ENSPPYG00000012624 ENSPPYG00000012623 ENSPPYG00000036668 WDR35 (ENSPPYG00000012622) MATN3 (ENSPPYG00000012621) LAPTM4A (ENSPPYG00000012620) SDC1 (ENSPPYG00000032047) PUM2 (ENSPPYG00000012617) RHOB (ENSPPYG00000012616) HS1BP3 (ENSPPYG00000012615) GDF7 (ENSPPYG00000035678) LDAH (ENSPPYG00000037972) Gibbon MODERN SPECIES 9 GREB1 (ENSNLEG00000014178) NTSR2 (ENSNLEG00000014189) LPIN1 (ENSNLEG00000014196) ENSNLEG00000028139 TRIB2 (ENSNLEG00000014260) ENSNLEG00000014270 ENSNLEG00000018294 NBAS (ENSNLEG00000014272) DDX1 (ENSNLEG00000014417) ENSNLEG00000014496 ENSNLEG00000031164 CYRIA (ENSNLEG00000001413) RAD51AP2 (ENSNLEG00000001524) VSNL1 (ENSNLEG00000001537) SMC6 (ENSNLEG00000001569) GEN1 (ENSNLEG00000029593) #22 MSGN1 (ENSNLEG00000018810) KCNS3 (ENSNLEG00000001834) RDH14 (ENSNLEG00000028221) NT5C1B (ENSNLEG00000001850) ENSNLEG00000033627 OSR1 (ENSNLEG00000002004) ENSNLEG00000028344 TTC32 (ENSNLEG00000030350) WDR35 (ENSNLEG00000002032) MATN3 (ENSNLEG00000002247) LAPTM4A (ENSNLEG00000002305) SDC1 (ENSNLEG00000031569) ENSNLEG00000029549 ENSNLEG00000002506 PUM2 (ENSNLEG00000002509) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00910000147240 ENSGT00940000153340.B.k.b ENSGT00910000147230 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00900000143745 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00910000148193 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00910000146982 ENSGT00950000185147 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 542 LPIN1 (ENSCATG00000039834) TRIB2 (ENSCATG00000017155) ENSCATG00000020884 LRATD1 (ENSCATG00000021787) NBAS (ENSCATG00000042904) DDX1 (ENSCATG00000033924) ENSCATG00000014658 ENSCATG00000019609 MYCN (ENSCATG00000041172) ENSCATG00000003592 CYRIA (ENSCATG00000004720) ENSCATG00000043417 RAD51AP2 (ENSCATG00000035523) VSNL1 (ENSCATG00000043748) SMC6 (ENSCATG00000007538) GEN1 (ENSCATG00000002261) #22 MSGN1 (ENSCATG00000020832) KCNS3 (ENSCATG00000019098) RDH14 (ENSCATG00000040055) NT5C1B (ENSCATG00000030226) OSR1 (ENSCATG00000041386) ENSCATG00000035076 ENSCATG00000035517 TTC32 (ENSCATG00000043877) WDR35 (ENSCATG00000043847) MATN3 (ENSCATG00000038685) LAPTM4A (ENSCATG00000036860) SDC1 (ENSCATG00000044796) ENSCATG00000041330 PUM2 (ENSCATG00000043826) RHOB (ENSCATG00000021066) Drill MODERN SPECIES 273 ENSMLEG00000027447 LRATD1 (ENSMLEG00000014430) NBAS (ENSMLEG00000030040) DDX1 (ENSMLEG00000030787) ENSMLEG00000041133 ENSMLEG00000042759 ENSMLEG00000038077 ENSMLEG00000042888 ENSMLEG00000000943 CYRIA (ENSMLEG00000021733) ENSMLEG00000032548 RAD51AP2 (ENSMLEG00000032822) VSNL1 (ENSMLEG00000009493) SMC6 (ENSMLEG00000038093) GEN1 (ENSMLEG00000037009) #22 MSGN1 (ENSMLEG00000016060) KCNS3 (ENSMLEG00000024480) NT5C1B (ENSMLEG00000032260) OSR1 (ENSMLEG00000036388) ENSMLEG00000035262 TTC32 (ENSMLEG00000034466) WDR35 (ENSMLEG00000042194) MATN3 (ENSMLEG00000028366) LAPTM4A (ENSMLEG00000011616) SDC1 (ENSMLEG00000030457) ENSMLEG00000041181 PUM2 (ENSMLEG00000039243) RHOB (ENSMLEG00000014328) HS1BP3 (ENSMLEG00000036114) GDF7 (ENSMLEG00000030590) Olive baboon MODERN SPECIES 5 LPIN1 (ENSPANG00000009989) TRIB2 (ENSPANG00000005636) ENSPANG00000047167 ENSPANG00000050237 ENSPANG00000044900 LRATD1 (ENSPANG00000018765) NBAS (ENSPANG00000018551) DDX1 (ENSPANG00000025185) ENSPANG00000032256 ENSPANG00000029967 CYRIA (ENSPANG00000008636) ENSPANG00000050326 RAD51AP2 (ENSPANG00000022532) ENSPANG00000022533 SMC6 (ENSPANG00000018608) GEN1 (ENSPANG00000008635) #22 MSGN1 (ENSPANG00000004064) KCNS3 (ENSPANG00000010367) RDH14 (ENSPANG00000007663) OSR1 (ENSPANG00000045188) ENSPANG00000033126 TTC32 (ENSPANG00000015095) WDR35 (ENSPANG00000019305) MATN3 (ENSPANG00000019588) LAPTM4A (ENSPANG00000011260) ENSPANG00000033560 PUM2 (ENSPANG00000009393) RHOB (ENSPANG00000016884) HS1BP3 (ENSPANG00000008436) GDF7 (ENSPANG00000015811) LDAH (ENSPANG00000017330) Macaca ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00910000148107 ENSGT00940000161165 ENSGT00770000121715 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00950000183424 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000154445.f.b.b ENSGT00910000147213 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 561 SMC6 (ENSMNEG00000037394) GEN1 (ENSMNEG00000041505) #22 MSGN1 (ENSMNEG00000009838) KCNS3 (ENSMNEG00000010748) RDH14 (ENSMNEG00000042523) NT5C1B (ENSMNEG00000031824) OSR1 (ENSMNEG00000024040) ENSMNEG00000040736 ENSMNEG00000000256 TTC32 (ENSMNEG00000032654) WDR35 (ENSMNEG00000043506) MATN3 (ENSMNEG00000040055) LAPTM4A (ENSMNEG00000030721) SDC1 (ENSMNEG00000037009) ENSMNEG00000031627 PUM2 (ENSMNEG00000039659) RHOB (ENSMNEG00000004093) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000153294.m.a.d.e ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT01100000264019 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092.c ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000009688 Rhesus MODERN SPECIES 4 NTSR2 (ENSMMUG00000020250) LPIN1 (ENSMMUG00000021672) ENSMMUG00000062508 TRIB2 (ENSMMUG00000038615) ENSMMUG00000060624 ENSMMUG00000059746 LRATD1 (ENSMMUG00000004215) NBAS (ENSMMUG00000023434) DDX1 (ENSMMUG00000023437) ENSMMUG00000052644 MYCN (ENSMMUG00000052363) CYRIA (ENSMMUG00000020385) RAD51AP2 (ENSMMUG00000058011) VSNL1 (ENSMMUG00000040529) SMC6 (ENSMMUG00000012056) GEN1 (ENSMMUG00000012058) #22 MSGN1 (ENSMMUG00000008141) KCNS3 (ENSMMUG00000017198) NT5C1B (ENSMMUG00000014083) OSR1 (ENSMMUG00000037622) ENSMMUG00000056023 TTC32 (ENSMMUG00000001570) WDR35 (ENSMMUG00000001575) MATN3 (ENSMMUG00000001579) LAPTM4A (ENSMMUG00000001582) SDC1 (ENSMMUG00000030922) ENSMMUG00000052718 PUM2 (ENSMMUG00000023181) HS1BP3 (ENSMMUG00000022996) GDF7 (ENSMMUG00000050446) ENSMMUG00000055950 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 4 ENSMFAG00000044386 NTSR2 (ENSMFAG00000043071) ENSMFAG00000064291 LPIN1 (ENSMFAG00000035872) TRIB2 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ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000009688 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00950000183424 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 ENSGT00940000160140.b ENSGT00390000009688 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 339 E2F6 (ENSPSMG00000008847) GREB1 (ENSPSMG00000008813) NTSR2 (ENSPSMG00000008712) LPIN1 (ENSPSMG00000008652) TRIB2 (ENSPSMG00000008501) LRATD1 (ENSPSMG00000008472) NBAS (ENSPSMG00000008335) DDX1 (ENSPSMG00000007970) ENSPSMG00000007742 ENSPSMG00000007732 CYRIA (ENSPSMG00000007716) ENSPSMG00000007660 RAD51AP2 (ENSPSMG00000007652) VSNL1 (ENSPSMG00000007643) SMC6 (ENSPSMG00000007622) GEN1 (ENSPSMG00000007525) #22 MSGN1 (ENSPSMG00000007507) KCNS3 (ENSPSMG00000007502) RDH14 (ENSPSMG00000007468) NT5C1B (ENSPSMG00000007455) OSR1 (ENSPSMG00000007427) TTC32 (ENSPSMG00000007425) WDR35 (ENSPSMG00000007386) MATN3 (ENSPSMG00000007217) LAPTM4A (ENSPSMG00000007179) SDC1 (ENSPSMG00000007157) PUM2 (ENSPSMG00000007064) ENSPSMG00000006929 HS1BP3 (ENSPSMG00000006908) GDF7 (ENSPSMG00000006880) ENSPSMG00000006877 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 559 LRATD1 (ENSPCOG00000007737) NBAS (ENSPCOG00000021921) DDX1 (ENSPCOG00000028185) MYCN (ENSPCOG00000013382) CYRIA (ENSPCOG00000021268) RAD51AP2 (ENSPCOG00000019163) VSNL1 (ENSPCOG00000003780) SMC6 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(ENSOGAG00000010183) PUM2 (ENSOGAG00000002187) RHOB (ENSOGAG00000034489) HS1BP3 (ENSOGAG00000000192) GDF7 (ENSOGAG00000025229) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000169919 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 803 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 Armadillo MODERN SPECIES 784 CYRIA (ENSDNOG00000034711) ENSDNOG00000048026 RAD51AP2 (ENSDNOG00000049595) ENSDNOG00000030945 VSNL1 (ENSDNOG00000043870) ENSDNOG00000035527 ENSDNOG00000005599 GEN1 (ENSDNOG00000036480) #22 MSGN1 (ENSDNOG00000013441) KCNS3 (ENSDNOG00000043353) Sloth MODERN SPECIES 4923 SMC6 (ENSCHOG00000008563) ENSCHOG00000008614 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000169919 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT00940000169919 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00940000165918 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Elephant MODERN SPECIES 197 ROCK2 (ENSLAFG00000007153) E2F6 (ENSLAFG00000021573) GREB1 (ENSLAFG00000003341) ENSLAFG00000016802 LPIN1 (ENSLAFG00000008202) TRIB2 (ENSLAFG00000013795) LRATD1 (ENSLAFG00000012514) ENSLAFG00000013044 ENSLAFG00000030074 DDX1 (ENSLAFG00000002213) MYCN (ENSLAFG00000015181) CYRIA (ENSLAFG00000014613) RAD51AP2 (ENSLAFG00000025867) VSNL1 (ENSLAFG00000015994) SMC6 (ENSLAFG00000007506) GEN1 (ENSLAFG00000023255) #22 MSGN1 (ENSLAFG00000015319) ENSLAFG00000029496 ENSLAFG00000028092 KCNS3 (ENSLAFG00000021521) RDH14 (ENSLAFG00000022569) NT5C1B (ENSLAFG00000007746) OSR1 (ENSLAFG00000027174) ENSLAFG00000027572 ENSLAFG00000030361 TTC32 (ENSLAFG00000014830) WDR35 (ENSLAFG00000014834) MATN3 (ENSLAFG00000014853) LAPTM4A (ENSLAFG00000013774) SDC1 (ENSLAFG00000022920) PUM2 (ENSLAFG00000009278) Hyrax MODERN SPECIES 4551 VSNL1 (ENSPCAG00000012647) SMC6 (ENSPCAG00000012676) GEN1 (ENSPCAG00000012835) #22 Tenrec MODERN SPECIES 5362 SMC6 (ENSETEG00000015304) ENSETEG00000015308 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157631 ENSGT00390000013048 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000154863 ENSGT00940000157488 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a.f ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157631 ENSGT00390000013048 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000154863 ENSGT00940000157488 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00470000042500 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a.f ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157631 ENSGT00390000013048 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000154863 ENSGT00940000157488 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00960000192062 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a.f ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092.b Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000157631 ENSGT00390000013048 ENSGT01050000244898.b.a ENSGT00940000154863 ENSGT00940000157488 ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00960000192062 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a.f ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00900000143081 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520.d ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092.b Common wonbat MODERN SPECIES 694 TET3 (ENSVURG00010023722) BOLA3 (ENSVURG00010023724) ENSVURG00010023725 MTHFD2 (ENSVURG00010023727) SLC4A5 (ENSVURG00010023729) LPIN1 (ENSVURG00010023733) TRIB2 (ENSVURG00010023736) ENSVURG00010023738 LRATD1 (ENSVURG00010023740) NBAS (ENSVURG00010023744) DDX1 (ENSVURG00010023755) MYCN (ENSVURG00010023760) CYRIA (ENSVURG00010023771) VSNL1 (ENSVURG00010023772) ENSVURG00010023775 GEN1 (ENSVURG00010023780) #22 MSGN1 (ENSVURG00010023787) KCNS3 (ENSVURG00010023790) RDH14 (ENSVURG00010023793) ENSVURG00010023796 ENSVURG00010023800 TTC32 (ENSVURG00010023802) WDR35 (ENSVURG00010023804) LAPTM4A (ENSVURG00010023811) ENSVURG00010023814 ENSVURG00010023816 PUM2 (ENSVURG00010023817) ENSVURG00010023821 RHOB (ENSVURG00010023826) koala MODERN SPECIES 175 ENSPCIG00000018101 NBAS (ENSPCIG00000010934) DDX1 (ENSPCIG00000010941) MYCN (ENSPCIG00000036099) ENSPCIG00000001358 CYRIA (ENSPCIG00000010035) ENSPCIG00000035261 VSNL1 (ENSPCIG00000029441) ENSPCIG00000029439 ENSPCIG00000029438 #22 MSGN1 (ENSPCIG00000029437) KCNS3 (ENSPCIG00000029436) RDH14 (ENSPCIG00000024554) ENSPCIG00000016776 OSR1 (ENSPCIG00000011035) TTC32 (ENSPCIG00000035406) ENSPCIG00000022097 MATN3 (ENSPCIG00000016627) LAPTM4A (ENSPCIG00000016629) ENSPCIG00000035866 ENSPCIG00000022138 PUM2 (ENSPCIG00000022139) ENSPCIG00000022147 RHOB (ENSPCIG00000036417) ENSPCIG00000022157 Wallaby MODERN SPECIES 8589 ENSMEUG00000016284 #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 TET3 (ENSSHAG00000028758) ENSSHAG00000007748 MOB1A (ENSSHAG00000021354) ENSSHAG00000008571 ENSSHAG00000008676 ENSSHAG00000001060 TRIB2 (ENSSHAG00000020582) LRATD1 (ENSSHAG00000026203) NBAS (ENSSHAG00000008409) DDX1 (ENSSHAG00000009363) ENSSHAG00000030834 CYRIA (ENSSHAG00000031827) ENSSHAG00000030057 VSNL1 (ENSSHAG00000030993) ENSSHAG00000004113 ENSSHAG00000020514 #22 KCNS3 (ENSSHAG00000001315) RDH14 (ENSSHAG00000009042) ENSSHAG00000008640 WDR35 (ENSSHAG00000007255) MATN3 (ENSSHAG00000006973) LAPTM4A (ENSSHAG00000006571) ENSSHAG00000031833 PUM2 (ENSSHAG00000002778) ENSSHAG00000000746 RHOB (ENSSHAG00000031379) ENSSHAG00000007625 GDF7 (ENSSHAG00000024813) ENSSHAG00000025983 ENSSHAG00000006797 APOB (ENSSHAG00000002807) Anura ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000153916.B ENSGT01030000234517.D ENSGT00940000155734 ENSGT00390000008041.C ENSGT01100000263518.A.a.a.b ENSGT00940000157219 ENSGT00950000182986.a.b.a ENSGT00940000161165 ENSGT00390000012474 ENSGT00940000155678 ENSGT00940000158432 ENSGT00390000015159.a.b ENSGT00960000192062 ENSGT00940000156513 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000162520 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000013092 Frog DUPLICATION Frog MODERN SPECIES 5 ENSXETG00000042956 ENSXETG00000045231 nbas (ENSXETG00000017826) ENSXETG00000034873 ddx1 (ENSXETG00000017825) mycn (ENSXETG00000015485) ENSXETG00000040643 cyria (ENSXETG00000015482) ENSXETG00000048120 ENSXETG00000047794 ENSXETG00000046467 ENSXETG00000039745 vsnl1 (ENSXETG00000031786) smc6 (ENSXETG00000044652) ENSXETG00000045739 #22 gen1 (ENSXETG00000015570) #22 msgn1 (ENSXETG00000015571) zpax (ENSXETG00000015572) kcns3 (ENSXETG00000015573) 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(ENSLACG00000015187) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT00940000163503.B ENSGT00940000155979 ENSGT00940000160181 ENSGT00390000017767.b.a ENSGT00940000158993 ENSGT00390000011905 ENSGT00940000155745 ENSGT00940000157581 ENSGT00940000153446.b ENSGT00940000161171 ENSGT00940000157575 ENSGT00940000177852 ENSGT00940000162520 ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000157913 ENSGT00390000005606 ENSGT00390000017888 ENSGT00390000004915.b ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00940000162690 ENSGT00940000159969.b ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000158351 ENSGT00940000162505 ENSGT00390000015191 ENSGT00390000004585 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT01030000234809 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299 ENSGT00940000158614 ENSGT00510000049722 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000157172 ENSGT00940000178326 ENSGT00390000017888 ENSGT00390000004915.b ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00940000158351 ENSGT00940000162505.a ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000162505.b ENSGT00940000162690 ENSGT00940000159969.b ENSGT00390000015191 ENSGT01100000263595 ENSGT00550000074816.A.a ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT01030000234809 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000158299.a ENSGT00390000013853 ENSGT00940000160284 ENSGT00550000075009 ENSGT00390000017252 ENSGT00950000183212.B ENSGT00940000158687.a.a ENSGT00940000165084 ENSGT00940000165540 ENSGT00390000004923.B ENSGT00390000005345 ENSGT00940000164033 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000016811.h ENSGT00390000002143.b.a.z ENSGT00940000157133.h ENSGT00940000156058 ENSGT01030000234555.a.b.f.a ENSGT00390000003188.c ENSGT00940000162190 ENSGT00530000063651.a.a.a ENSGT00390000017888 ENSGT00390000004915.b ENSGT00950000183056.A.b.a ENSGT00940000158351 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ENSGT00940000159266 #22 ENSGT00530000063712.a.b ENSGT01030000234809 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000155913.d ENSGT00390000007183 ENSGT00940000154531 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 5 agbl5 (ENSDCDG00000029289) GPR31 (ENSDCDG00000029280) ENSDCDG00000029277 ENSDCDG00000029252 plg (ENSDCDG00000029147) plg (ENSDCDG00000029112) slc22a2 (ENSDCDG00000028938) igf2r (ENSDCDG00000028197) ENSDCDG00000028164 brox (ENSDCDG00000028124) ENSDCDG00000028111 aida (ENSDCDG00000028084) ENSDCDG00000028079 taf1a (ENSDCDG00000028073) DUSP10 (ENSDCDG00000028071) ENSDCDG00000028069 #22 ENSDCDG00000028068 #22 msgn1 (ENSDCDG00000028067) si:ch211-51e12.7 (ENSDCDG00000028066) mrps10 (ENSDCDG00000028064) ENSDCDG00000028063 tulp4a (ENSDCDG00000028053) tmem181 (ENSDCDG00000028037) DYNLT1 (ENSDCDG00000028036) SAMD5 (ENSDCDG00000028033) sash1a (ENSDCDG00000028029) ENSDCDG00000028023 ENSDCDG00000028020 stxbp5a (ENSDCDG00000027961) ENSDCDG00000027952 ENSDCDG00000027947 Denticle herring 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