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CRELD2 (ENSMLEG00000035519) ALG12 (ENSMLEG00000033563) ZBED4 (ENSMLEG00000015352) BRD1 (ENSMLEG00000041580) Macaca ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263.u ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT00910000147363 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00910000148551 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 159 MAPK8IP2 (ENSMNEG00000040573) CHKB (ENSMNEG00000022712) CPT1B (ENSMNEG00000038572) SYCE3 (ENSMNEG00000040516) ODF3B 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ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263.u ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00910000148551 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Rhesus MODERN SPECIES 1 ENSMMUG00000055403 ARSA (ENSMMUG00000016274) MAPK8IP2 (ENSMMUG00000064486) CHKB (ENSMMUG00000057498) CPT1B (ENSMMUG00000003121) SYCE3 (ENSMMUG00000058930) ODF3B (ENSMMUG00000039452) ENSMMUG00000001764 NCAPH2 (ENSMMUG00000001763) MIOX (ENSMMUG00000009088) ADM2 (ENSMMUG00000062822) SBF1 (ENSMMUG00000009082) PPP6R2 (ENSMMUG00000009075) DENND6B (ENSMMUG00000008327) #20 PLXNB2 (ENSMMUG00000008331) #21 MAPK11 (ENSMMUG00000014107) #22 MAPK12 (ENSMMUG00000014106) #23 HDAC10 (ENSMMUG00000014101) #24 TUBGCP6 (ENSMMUG00000014100) #25 SELENOO (ENSMMUG00000014098) #26 TRABD (ENSMMUG00000014087) #27 PANX2 (ENSMMUG00000011023) #28 MOV10L1 (ENSMMUG00000009120) #29 MLC1 (ENSMMUG00000009119) #30 TTLL8 (ENSMMUG00000009115) #31 IL17REL (ENSMMUG00000053863) PIM3 (ENSMMUG00000058033) CRELD2 (ENSMMUG00000011278) ALG12 (ENSMMUG00000011273) ZBED4 (ENSMMUG00000018833) BRD1 (ENSMMUG00000000553) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 1 ENSMFAG00000049162 CHKB (ENSMFAG00000043916) CPT1B (ENSMFAG00000023471) SYCE3 (ENSMFAG00000036358) ENSMFAG00000002276 TYMP (ENSMFAG00000045728) SCO2 (ENSMFAG00000055882) ENSMFAG00000063947 NCAPH2 (ENSMFAG00000033329) LMF2 (ENSMFAG00000031482) MIOX (ENSMFAG00000033234) ADM2 (ENSMFAG00000055878) PPP6R2 (ENSMFAG00000002797) DENND6B (ENSMFAG00000033956) #20 PLXNB2 (ENSMFAG00000035984) #21 MAPK11 (ENSMFAG00000002644) #22 MAPK12 (ENSMFAG00000034798) #23 HDAC10 (ENSMFAG00000033885) #24 SELENOO (ENSMFAG00000000242) #26 TRABD (ENSMFAG00000038729) #27 ENSMFAG00000065187 #28 MOV10L1 (ENSMFAG00000035651) #29 MLC1 (ENSMFAG00000024753) #30 ENSMFAG00000064283 TTLL8 (ENSMFAG00000031806) #31 IL17REL (ENSMFAG00000034453) CRELD2 (ENSMFAG00000042023) ALG12 (ENSMFAG00000040634) ZBED4 (ENSMFAG00000029961) BRD1 (ENSMFAG00000030538) ENSMFAG00000050874 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00940000160461 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263.u ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT00910000147363 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 895 ENSRBIG00000037751 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ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150.b #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150.b #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 371 ENSMMMG00000009926 #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 135 ENSMMMG00000005054 ENSMMMG00000005087 ENSMMMG00000005099 ARSA (ENSMMMG00000005119) ENSMMMG00000005134 CHKB (ENSMMMG00000005141) CPT1B (ENSMMMG00000005156) SYCE3 (ENSMMMG00000005185) ENSMMMG00000005199 TYMP (ENSMMMG00000005203) NCAPH2 (ENSMMMG00000005406) MIOX (ENSMMMG00000005543) PPP6R2 (ENSMMMG00000006816) ENSMMMG00000006865 #20 PLXNB2 (ENSMMMG00000006871) #21 ENSMMMG00000006969 #22 ENSMMMG00000006982 #23 ENSMMMG00000006990 #23 HDAC10 (ENSMMMG00000006995) #24 SELENOO (ENSMMMG00000007224) #26 TRABD (ENSMMMG00000007360) #27 ENSMMMG00000007392 #28 MOV10L1 (ENSMMMG00000007395) #29 MLC1 (ENSMMMG00000007449) #30 TTLL8 (ENSMMMG00000007470) #31 CRELD2 (ENSMMMG00000007552) ALG12 (ENSMMMG00000007565) ZBED4 (ENSMMMG00000007585) BRD1 (ENSMMMG00000007594) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150.b #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Squirrel MODERN SPECIES 229 MAPK8IP2 (ENSSTOG00000025549) CHKB (ENSSTOG00000028511) CPT1B (ENSSTOG00000014192) SYCE3 (ENSSTOG00000024024) ODF3B (ENSSTOG00000028471) TYMP (ENSSTOG00000000281) SCO2 (ENSSTOG00000026780) NCAPH2 (ENSSTOG00000022417) LMF2 (ENSSTOG00000028688) MIOX (ENSSTOG00000020836) ADM2 (ENSSTOG00000029571) SBF1 (ENSSTOG00000014827) PPP6R2 (ENSSTOG00000014815) DENND6B (ENSSTOG00000015282) #20 PLXNB2 (ENSSTOG00000024431) #21 MAPK11 (ENSSTOG00000015274) #22 MAPK12 (ENSSTOG00000015261) #23 HDAC10 (ENSSTOG00000015253) #24 TUBGCP6 (ENSSTOG00000025992) #25 SELENOO (ENSSTOG00000021258) #26 TRABD (ENSSTOG00000015169) #27 PANX2 (ENSSTOG00000022957) #28 MOV10L1 (ENSSTOG00000003747) #29 MLC1 (ENSSTOG00000003710) #30 TTLL8 (ENSSTOG00000007069) #31 PIM3 (ENSSTOG00000028287) CRELD2 (ENSSTOG00000008552) ENSSTOG00000008531 ZBED4 (ENSSTOG00000023379) BRD1 (ENSSTOG00000009122) ENSSTOG00000028720 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 581 MAPK8IP2 (ENSUPAG00010006363) CHKB (ENSUPAG00010006349) CPT1B (ENSUPAG00010006338) SYCE3 (ENSUPAG00010006330) ENSUPAG00010006327 ODF3B (ENSUPAG00010006319) TYMP (ENSUPAG00010006263) SCO2 (ENSUPAG00010006259) NCAPH2 (ENSUPAG00010006221) LMF2 (ENSUPAG00010006213) MIOX (ENSUPAG00010006204) ADM2 (ENSUPAG00010006199) PPP6R2 (ENSUPAG00010006007) DENND6B (ENSUPAG00010005962) #20 PLXNB2 (ENSUPAG00010005922) #21 MAPK11 (ENSUPAG00010005908) #22 MAPK12 (ENSUPAG00010005892) #23 TUBGCP6 (ENSUPAG00010005693) #25 SELENOO (ENSUPAG00010005528) #26 TRABD (ENSUPAG00010005513) #27 PANX2 (ENSUPAG00010005495) #28 MOV10L1 (ENSUPAG00010005423) #29 MLC1 (ENSUPAG00010005397) #30 TTLL8 (ENSUPAG00010005382) #31 PIM3 (ENSUPAG00010005377) CRELD2 (ENSUPAG00010005362) ALG12 (ENSUPAG00010005352) BRD1 (ENSUPAG00010005315) ENSUPAG00010005303 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 CHKB (ENSSVLG00005003656) CPT1B (ENSSVLG00005003625) SYCE3 (ENSSVLG00005003600) ODF3B (ENSSVLG00005003492) TYMP (ENSSVLG00005003437) SCO2 (ENSSVLG00005011562) NCAPH2 (ENSSVLG00005011493) MIOX (ENSSVLG00005011076) ENSSVLG00005011054 ADM2 (ENSSVLG00005011019) PPP6R2 (ENSSVLG00005010231) ENSSVLG00005010106 #20 ENSSVLG00005010067 #20 ENSSVLG00005009955 #21 ENSSVLG00005009917 MAPK11 (ENSSVLG00005009538) #22 MAPK12 (ENSSVLG00005009443) #23 HDAC10 (ENSSVLG00005008461) #24 TUBGCP6 (ENSSVLG00005008386) #25 SELENOO (ENSSVLG00005008372) #26 TRABD (ENSSVLG00005008334) #27 PANX2 (ENSSVLG00005008282) #28 ENSSVLG00005008247 #29 ENSSVLG00005008197 #29 MLC1 (ENSSVLG00005008063) #30 TTLL8 (ENSSVLG00005007883) #31 PIM3 (ENSSVLG00005007815) CRELD2 (ENSSVLG00005007771) ALG12 (ENSSVLG00005007721) ZBED4 (ENSSVLG00005007699) BRD1 (ENSSVLG00005007645) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 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ENSHGLG00000010839 #25 SELENOO (ENSHGLG00000018969) #26 TRABD (ENSHGLG00000015283) #27 PANX2 (ENSHGLG00000015536) #28 MOV10L1 (ENSHGLG00000015410) #29 MLC1 (ENSHGLG00000015098) #30 ENSHGLG00000040028 #31 PIM3 (ENSHGLG00000015113) CRELD2 (ENSHGLG00000047614) ALG12 (ENSHGLG00000015414) ZBED4 (ENSHGLG00000020932) ENSHGLG00000017778 ENSHGLG00000012238 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b.d ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000160682.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b.d ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000160682.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 120 MAPK8IP2 (ENSCLAG00000017165) CHKB (ENSCLAG00000016876) CPT1B (ENSCLAG00000017252) SYCE3 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ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a 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#26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 Chinese 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ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 Pika MODERN SPECIES 4213 DENND6B (ENSOPRG00000003663) #20 PLXNB2 (ENSOPRG00000003602) #21 MAPK11 (ENSOPRG00000003561) #22 MAPK12 (ENSOPRG00000003528) #23 Rabbit MODERN SPECIES 638 ARSA (ENSOCUG00000008355) ENSOCUG00000035631 ENSOCUG00000002401 CHKB (ENSOCUG00000027181) CPT1B (ENSOCUG00000025449) SYCE3 (ENSOCUG00000023142) ENSOCUG00000017268 PPP6R2 (ENSOCUG00000013599) DENND6B (ENSOCUG00000003448) #20 ENSOCUG00000031838 #22 MAPK12 (ENSOCUG00000007543) #23 HDAC10 (ENSOCUG00000025188) #24 ENSOCUG00000025522 #25 MOV10L1 (ENSOCUG00000013580) #29 ENSOCUG00000033971 MLC1 (ENSOCUG00000021240) #30 TTLL8 (ENSOCUG00000006913) #31 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT01020000230616 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b 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ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT01020000230616 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 Suina ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160461 ENSGT00950000182939.a.b.a 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ENSSSCG00000049725 DENND6B (ENSSSCG00000034272) #20 PLXNB2 (ENSSSCG00000035733) #21 MAPK11 (ENSSSCG00000033171) #22 MAPK12 (ENSSSCG00000032693) #23 HDAC10 (ENSSSCG00000000971) #24 TUBGCP6 (ENSSSCG00000000972) #25 SELENOO (ENSSSCG00000000973) #26 TRABD (ENSSSCG00000000974) #27 PANX2 (ENSSSCG00000000975) #28 ENSSSCG00000044259 #29 ENSSSCG00000044685 #29 MLC1 (ENSSSCG00000000978) #30 TTLL8 (ENSSSCG00000000982) #31 ENSSSCG00000000983 PIM3 (ENSSSCG00000032936) CRELD2 (ENSSSCG00000000981) ALG12 (ENSSSCG00000000980) BRD1 (ENSSSCG00000032820) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT01020000230616 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000162430 ENSGT00940000153561.b.b ENSGT00940000157610 ENSGT00940000160461 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000157236 ENSGT00940000165505 ENSGT00940000160682.b Arabian camel DUPLICATION Arabian camel MODERN SPECIES 3 ACR (ENSCDRG00005004144) SHANK3 (ENSCDRG00005003969) ARSA (ENSCDRG00005003888) MAPK8IP2 (ENSCDRG00005003825) CHKB (ENSCDRG00005003793) CPT1B (ENSCDRG00005003652) SYCE3 (ENSCDRG00005003616) ENSCDRG00005003409 SCO2 (ENSCDRG00005003380) NCAPH2 (ENSCDRG00005003318) MIOX (ENSCDRG00005016670) ADM2 (ENSCDRG00005016649) ENSCDRG00005016138 PPP6R2 (ENSCDRG00005015957) PLXNB2 (ENSCDRG00005015429) #21 ENSCDRG00005015393 #22 ENSCDRG00005015364 #22 MAPK12 (ENSCDRG00005015256) #23 HDAC10 (ENSCDRG00005015046) #24 ENSCDRG00005014960 #25 SELENOO (ENSCDRG00005014912) #26 ENSCDRG00005014874 TRABD (ENSCDRG00005014834) #27 PANX2 (ENSCDRG00005014787) #28 ENSCDRG00005014752 #29 ENSCDRG00005014707 #29 MLC1 (ENSCDRG00005014647) #30 TTLL8 (ENSCDRG00005014285) #31 PIM3 (ENSCDRG00005014206) CRELD2 (ENSCDRG00005014022) ALG12 (ENSCDRG00005013968) Arabian camel MODERN SPECIES 3 SHANK3 (ENSCDRG00005003969) ARSA (ENSCDRG00005003888) MAPK8IP2 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Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160461 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000157610 ENSGT00940000160461 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 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ENSGT00940000157236 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160790 #22 American black bear MODERN SPECIES 1658 MAPK11 (ENSUAMG00000013511) #22 Giant Panda MODERN SPECIES 6 ARSA (ENSAMEG00000003106) MAPK8IP2 (ENSAMEG00000003087) CPT1B (ENSAMEG00000002999) SYCE3 (ENSAMEG00000027140) ENSAMEG00000002888 ENSAMEG00000002991 SCO2 (ENSAMEG00000019080) NCAPH2 (ENSAMEG00000002961) LMF2 (ENSAMEG00000002923) MIOX (ENSAMEG00000002890) ADM2 (ENSAMEG00000002138) SBF1 (ENSAMEG00000002766) PPP6R2 (ENSAMEG00000002667) DENND6B (ENSAMEG00000002617) #20 PLXNB2 (ENSAMEG00000002506) #21 MAPK11 (ENSAMEG00000002468) #22 MAPK12 (ENSAMEG00000002456) #23 HDAC10 (ENSAMEG00000002414) #24 TUBGCP6 (ENSAMEG00000002382) #25 SELENOO (ENSAMEG00000002359) #26 ENSAMEG00000002346 #27 PANX2 (ENSAMEG00000002335) #28 MOV10L1 (ENSAMEG00000002296) #29 MLC1 (ENSAMEG00000002283) #30 TTLL8 (ENSAMEG00000002263) #31 ENSAMEG00000002259 CRELD2 (ENSAMEG00000002224) ALG12 (ENSAMEG00000002208) ZBED4 (ENSAMEG00000002207) BRD1 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ENSVVUG00000025070 MLC1 (ENSVVUG00000025051) #31 PIM3 (ENSVVUG00000025045) ENSVVUG00000025038 ALG12 (ENSVVUG00000025026) ZBED4 (ENSVVUG00000025020) BRD1 (ENSVVUG00000025015) FAM19A5 (ENSVVUG00000025007) Felidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160461 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00930000152681 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160461 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ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 CPT1B (ENSRFEG00010002459) SYCE3 (ENSRFEG00010002491) KLHDC7B (ENSRFEG00010002505) ENSRFEG00010002538 TYMP (ENSRFEG00010002639) SCO2 (ENSRFEG00010002663) NCAPH2 (ENSRFEG00010002699) LMF2 (ENSRFEG00010002756) MIOX (ENSRFEG00010002783) ADM2 (ENSRFEG00010002808) SBF1 (ENSRFEG00010002872) PPP6R2 (ENSRFEG00010003065) ENSRFEG00010003143 DENND6B (ENSRFEG00010003177) #20 PLXNB2 (ENSRFEG00010003263) #21 MAPK11 (ENSRFEG00010003325) #22 MAPK12 (ENSRFEG00010003363) #23 HDAC10 (ENSRFEG00010003445) #24 TUBGCP6 (ENSRFEG00010003539) #25 SELENOO (ENSRFEG00010003639) #26 TRABD (ENSRFEG00010003666) #27 PANX2 (ENSRFEG00010003700) #28 ENSRFEG00010003721 #29 MLC1 (ENSRFEG00010003746) #30 TTLL8 (ENSRFEG00010006880) #31 ENSRFEG00010007126 PIM3 (ENSRFEG00010007178) CRELD2 (ENSRFEG00010007265) ALG12 (ENSRFEG00010007351) ZBED4 (ENSRFEG00010007396) 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ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 ENSSHAG00000025292 ARSA (ENSSHAG00000005296) MAPK8IP2 (ENSSHAG00000026548) CPT1B (ENSSHAG00000003537) ENSSHAG00000022464 ENSSHAG00000030059 TYMP (ENSSHAG00000001515) NCAPH2 (ENSSHAG00000000189) LMF2 (ENSSHAG00000004843) MIOX (ENSSHAG00000004066) ENSSHAG00000021406 SBF1 (ENSSHAG00000000303) PPP6R2 (ENSSHAG00000011257) DENND6B (ENSSHAG00000010749) #20 PLXNB2 (ENSSHAG00000010107) #21 ENSSHAG00000029547 #22 ENSSHAG00000009776 #22 MAPK12 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(ENSSHAG00000007502) #29 ENSSHAG00000006196 #31 ENSSHAG00000005521 ENSSHAG00000021243 CRELD2 (ENSSHAG00000021476) ALG12 (ENSSHAG00000017040) ZBED4 (ENSSHAG00000029510) BRD1 (ENSSHAG00000016774) TAFA5 (ENSSHAG00000021478) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Wallaby MODERN SPECIES 13972 MAPK11 (ENSMEUG00000001871) #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182939.a.b.a ENSGT01060000248595.b.a.a ENSGT00390000009978 ENSGT00940000163480 ENSGT00940000161995 ENSGT00390000009250 ENSGT00390000004323.a ENSGT00390000014443 ENSGT00530000063702.a ENSGT00390000016211 ENSGT00940000154380.a ENSGT00940000155263 ENSGT00390000009899.b ENSGT00390000005529.b #20 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Common wonbat MODERN SPECIES 657 CPT1B (ENSVURG00010005593) SYCE3 (ENSVURG00010005579) ENSVURG00010005575 ODF3B (ENSVURG00010005554) TYMP (ENSVURG00010005533) SCO2 (ENSVURG00010005520) NCAPH2 (ENSVURG00010005480) LMF2 (ENSVURG00010005448) MIOX (ENSVURG00010005414) ENSVURG00010005406 ENSVURG00010005401 SBF1 (ENSVURG00010002747) PPP6R2 (ENSVURG00010002499) DENND6B (ENSVURG00010002044) #20 PLXNB2 (ENSVURG00010001916) #21 MAPK11 (ENSVURG00010001892) #22 MAPK12 (ENSVURG00010001860) #23 HDAC10 (ENSVURG00010001834) #24 TUBGCP6 (ENSVURG00010001278) #25 SELENOO (ENSVURG00010001210) #26 ENSVURG00010001194 TRABD (ENSVURG00010001133) #27 PANX2 (ENSVURG00010001115) #28 ENSVURG00010001085 MOV10L1 (ENSVURG00010000404) #29 MLC1 (ENSVURG00010000318) #30 TTLL8 (ENSVURG00010024420) #31 ENSVURG00010024408 PIM3 (ENSVURG00010024403) CRELD2 (ENSVURG00010024398) ALG12 (ENSVURG00010024393) koala MODERN SPECIES 13 ARSA (ENSPCIG00000002293) MAPK8IP2 (ENSPCIG00000019525) CHKB (ENSPCIG00000023489) CPT1B (ENSPCIG00000008276) SYCE3 (ENSPCIG00000034717) ENSPCIG00000026447 TYMP (ENSPCIG00000026444) SCO2 (ENSPCIG00000026442) NCAPH2 (ENSPCIG00000026435) LMF2 (ENSPCIG00000026433) MIOX (ENSPCIG00000026432) SBF1 (ENSPCIG00000026429) PPP6R2 (ENSPCIG00000026109) DENND6B (ENSPCIG00000016129) #20 PLXNB2 (ENSPCIG00000016132) #21 MAPK11 (ENSPCIG00000034016) #22 MAPK12 (ENSPCIG00000035075) #23 HDAC10 (ENSPCIG00000016148) #24 TUBGCP6 (ENSPCIG00000016151) #25 SELENOO (ENSPCIG00000016158) #26 ENSPCIG00000033724 TRABD (ENSPCIG00000034313) #27 PANX2 (ENSPCIG00000035129) #28 ENSPCIG00000011125 MOV10L1 (ENSPCIG00000011128) #29 MLC1 (ENSPCIG00000011131) #30 ENSPCIG00000013777 #31 PIM3 (ENSPCIG00000026458) ENSPCIG00000026457 ALG12 (ENSPCIG00000026455) ZBED4 (ENSPCIG00000026453) Platypus MODERN SPECIES 5 NAGA (ENSOANG00000004242) ENSOANG00000004241 SMDT1 (ENSOANG00000002673) NDUFA6 (ENSOANG00000004240) CYP2D6 (ENSOANG00000004239) TCF20 (ENSOANG00000049101) ENSOANG00000001881 RRP7A (ENSOANG00000015007) POLDIP3 (ENSOANG00000041313) MIOX (ENSOANG00000044028) SBF1 (ENSOANG00000050427) PPP6R2 (ENSOANG00000001656) DENND6B (ENSOANG00000003206) #20 PLXNB2 (ENSOANG00000007796) #21 ENSOANG00000036306 MAPK11 (ENSOANG00000049823) #22 MAPK12 (ENSOANG00000040421) #23 ENSOANG00000031603 #24 TUBGCP6 (ENSOANG00000047013) #25 SELENOO (ENSOANG00000032085) #26 TRABD (ENSOANG00000007072) #27 PANX2 (ENSOANG00000011415) #28 ENSOANG00000009622 #29 MLC1 (ENSOANG00000005649) #30 ENSOANG00000009380 #31 PIM3 (ENSOANG00000045790) CRELD2 (ENSOANG00000045035) ALG12 (ENSOANG00000003994) ZBED4 (ENSOANG00000037931) BRD1 (ENSOANG00000003992) ENSOANG00000043282 Sauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B Archosauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 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ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B African ostrich MODERN SPECIES 1021 PLXNB2 (ENSSCUG00000013234) #21 MAPK11 (ENSSCUG00000013226) #22 ENSSCUG00000013222 HDAC10 (ENSSCUG00000013217) #24 TUBGCP6 (ENSSCUG00000013212) #25 SELENOO (ENSSCUG00000013208) #26 TRABD (ENSSCUG00000013203) #27 ENSSCUG00000013198 ENSSCUG00000013196 PANX2 (ENSSCUG00000013194) #28 MOV10L1 (ENSSCUG00000013193) #29 MLC1 (ENSSCUG00000013190) #30 ENSSCUG00000013189 #31 IL17REL (ENSSCUG00000013186) ENSSCUG00000013183 ZNF800 (ENSSCUG00000013182) GRM8 (ENSSCUG00000013180) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 3 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ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Pink-footed goose MODERN SPECIES 32 ENSABRG00000013133 ENSABRG00000013134 IQUB (ENSABRG00000013138) NDUFA5 (ENSABRG00000013142) ASB15 (ENSABRG00000013148) LMOD2 (ENSABRG00000013153) WASL (ENSABRG00000013163) ENSABRG00000013173 SPAM1 (ENSABRG00000013201) ENSABRG00000013204 GPR37 (ENSABRG00000013226) POT1 (ENSABRG00000013243) GRM8 (ENSABRG00000013274) ZNF800 (ENSABRG00000013281) PLXNB2 (ENSABRG00000013365) #21 MAPK11 (ENSABRG00000014292) #22 MAPK12 (ENSABRG00000014303) #23 ENSABRG00000014312 HDAC10 (ENSABRG00000014313) #24 TUBGCP6 (ENSABRG00000014330) #25 SELENOO (ENSABRG00000014346) #26 TRABD (ENSABRG00000014351) #27 ENSABRG00000014357 PANX2 (ENSABRG00000014359) #28 MOV10L1 (ENSABRG00000014362) #29 MLC1 (ENSABRG00000014377) #30 IL17REL (ENSABRG00000014381) PIM3 (ENSABRG00000014401) CRELD2 (ENSABRG00000014407) ALG12 (ENSABRG00000014410) ZBED4 (ENSABRG00000014411) Duck MODERN SPECIES SLC13A1 (ENSAPLG00000013575) ENSAPLG00000014367 IQUB (ENSAPLG00000014571) NDUFA5 (ENSAPLG00000019976) ASB15 (ENSAPLG00000014812) LMOD2 (ENSAPLG00000015178) WASL (ENSAPLG00000015306) ENSAPLG00000015709 SPAM1 (ENSAPLG00000015825) ENSAPLG00000015872 GPR37 (ENSAPLG00000015956) POT1 (ENSAPLG00000016011) GRM8 (ENSAPLG00000013904) ZNF800 (ENSAPLG00000014433) PLXNB2 (ENSAPLG00000004968) #21 MAPK11 (ENSAPLG00000004462) #22 MAPK12 (ENSAPLG00000004157) #23 ENSAPLG00000004018 HDAC10 (ENSAPLG00000003588) #24 TUBGCP6 (ENSAPLG00000003180) #25 SELENOO (ENSAPLG00000003085) #26 TRABD (ENSAPLG00000002798) #27 ENSAPLG00000001582 PANX2 (ENSAPLG00000002700) #28 MOV10L1 (ENSAPLG00000002129) #29 MLC1 (ENSAPLG00000016154) #30 IL17REL (ENSAPLG00000016050) PIM3 (ENSAPLG00000016454) CRELD2 (ENSAPLG00000015891) ALG12 (ENSAPLG00000015810) ZBED4 (ENSAPLG00000001579) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Japanese quail MODERN SPECIES LMOD2 (ENSCJPG00005012111) ASB15 (ENSCJPG00005012110) NDUFA5 (ENSCJPG00005012109) IQUB (ENSCJPG00005012108) ENSCJPG00005012107 SLC13A1 (ENSCJPG00005012104) CADPS2 (ENSCJPG00005009705) FEZF1 (ENSCJPG00005009701) AASS 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#26 TRABD (ENSGALG00010001540) #27 ENSGALG00010001919 PANX2 (ENSGALG00010001210) #28 MOV10L1 (ENSGALG00010001208) #29 MLC1 (ENSGALG00010008055) #30 IL17REL (ENSGALG00010008043) PIM3 (ENSGALG00010008094) CRELD2 (ENSGALG00010009040) ALG12 (ENSGALG00010009003) ZBED4 (ENSGALG00010008938) Turkey MODERN SPECIES ENSMGAG00000008443 IQUB (ENSMGAG00000008434) ENSMGAG00000008411 ASB15 (ENSMGAG00000008383) LMOD2 (ENSMGAG00000008371) WASL (ENSMGAG00000008344) ENSMGAG00000008334 SPAM1 (ENSMGAG00000008329) ENSMGAG00000010101 GPR37 (ENSMGAG00000008322) POT1 (ENSMGAG00000008259) GRM8 (ENSMGAG00000008237) ZNF800 (ENSMGAG00000008232) ENSMGAG00000019941 PLXNB2 (ENSMGAG00000016484) #21 MAPK11 (ENSMGAG00000008092) #22 MAPK12 (ENSMGAG00000008074) #23 ENSMGAG00000008065 HDAC10 (ENSMGAG00000008036) #24 TUBGCP6 (ENSMGAG00000008013) #25 SELENOO (ENSMGAG00000008004) #26 TRABD (ENSMGAG00000007985) #27 ENSMGAG00000022752 PANX2 (ENSMGAG00000007981) #28 MOV10L1 (ENSMGAG00000007902) #29 MLC1 (ENSMGAG00000007862) #30 IL17REL (ENSMGAG00000007847) ENSMGAG00000007839 CRELD2 (ENSMGAG00000007817) ALG12 (ENSMGAG00000007824) ZBED4 (ENSMGAG00000015681) Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 Golden eagle MODERN SPECIES 21 ENSACCG00020012300 ENSACCG00020012259 IQUB (ENSACCG00020012226) NDUFA5 (ENSACCG00020012194) ASB15 (ENSACCG00020012171) LMOD2 (ENSACCG00020012138) WASL (ENSACCG00020012101) ENSACCG00020012045 SPAM1 (ENSACCG00020011959) ENSACCG00020011830 GPR37 (ENSACCG00020011806) POT1 (ENSACCG00020011777) GRM8 (ENSACCG00020011743) 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ENSSHBG00005016666 HDAC10 (ENSSHBG00005016661) #24 TUBGCP6 (ENSSHBG00005016652) #25 SELENOO (ENSSHBG00005016637) #26 TRABD (ENSSHBG00005016625) #27 ENSSHBG00005016612 PANX2 (ENSSHBG00005016599) #28 ENSSHBG00005016588 #29 MLC1 (ENSSHBG00005016578) #30 ENSSHBG00005016569 PIM3 (ENSSHBG00005016564) CRELD2 (ENSSHBG00005016559) ALG12 (ENSSHBG00005016551) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Great tit MODERN SPECIES 10 ENSPMJG00000009956 IQUB (ENSPMJG00000009955) NDUFA5 (ENSPMJG00000009953) ENSPMJG00000009952 LMOD2 (ENSPMJG00000009951) WASL (ENSPMJG00000009949) ENSPMJG00000009948 SPAM1 (ENSPMJG00000009925) ENSPMJG00000009923 GPR37 (ENSPMJG00000009841) POT1 (ENSPMJG00000009830) GRM8 (ENSPMJG00000009799) ZNF800 (ENSPMJG00000009751) ENSPMJG00000009706 PLXNB2 (ENSPMJG00000009691) #21 MAPK11 (ENSPMJG00000009658) #22 MAPK12 (ENSPMJG00000009657) #23 ENSPMJG00000009656 TUBGCP6 (ENSPMJG00000009651) #25 SELENOO (ENSPMJG00000009646) #26 TRABD (ENSPMJG00000009637) #27 ENSPMJG00000009560 PANX2 (ENSPMJG00000009559) #28 MOV10L1 (ENSPMJG00000009555) #29 MLC1 (ENSPMJG00000009553) #30 IL17REL (ENSPMJG00000009552) PIM3 (ENSPMJG00000009480) CRELD2 (ENSPMJG00000009460) ALG12 (ENSPMJG00000009459) ZBED4 (ENSPMJG00000009445) BRD1 (ENSPMJG00000009437) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Flycatcher MODERN SPECIES 10 IQUB (ENSFALG00000009903) NDUFA5 (ENSFALG00000009900) ENSFALG00000023113 LMOD2 (ENSFALG00000009898) WASL (ENSFALG00000009888) ENSFALG00000009879 SPAM1 (ENSFALG00000024464) ENSFALG00000028250 GPR37 (ENSFALG00000025236) POT1 (ENSFALG00000009838) GRM8 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#23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Medium ground finch MODERN SPECIES 27 ENSGFOG00000013259 IQUB (ENSGFOG00000013261) NDUFA5 (ENSGFOG00000013262) ENSGFOG00000013265 LMOD2 (ENSGFOG00000013267) WASL (ENSGFOG00000013269) ENSGFOG00000013273 SPAM1 (ENSGFOG00000013279) ENSGFOG00000013284 GPR37 (ENSGFOG00000013286) POT1 (ENSGFOG00000013291) ENSGFOG00000013293 GRM8 (ENSGFOG00000013295) ZNF800 (ENSGFOG00000013299) PLXNB2 (ENSGFOG00000013304) #21 MAPK11 (ENSGFOG00000013308) #22 MAPK12 (ENSGFOG00000013309) #23 ENSGFOG00000013314 HDAC10 (ENSGFOG00000013319) #24 TUBGCP6 (ENSGFOG00000013327) #25 SELENOO (ENSGFOG00000013332) #26 TRABD (ENSGFOG00000013334) #27 PANX2 (ENSGFOG00000013335) #28 MOV10L1 (ENSGFOG00000013337) #29 MLC1 (ENSGFOG00000013343) #30 PIM3 (ENSGFOG00000013349) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.a ENSGT00940000165940 ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 Zebra finch MODERN SPECIES 11 FEZF1 (ENSTGUG00000004488) CADPS2 (ENSTGUG00000004403) SLC13A1 (ENSTGUG00000004349) ENSTGUG00000004340 ENSTGUG00000004331 LMOD2 (ENSTGUG00000004327) WASL 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Laterata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 ENSGT00940000157073 ENSGT00940000156567 ENSGT00730000110895.b.a ENSGT01020000230364.a.b ENSGT01020000230364.a.a.b.b ENSGT01100000263518.B.b.b ENSGT00390000018285 ENSGT01030000234648.a.b.a.a.b ENSGT00390000008140 ENSGT01020000230394.e.a.a.a #21 ENSGT00940000160790 #22 ENSGT00940000156189 #23 ENSGT00940000164657 ENSGT00940000164395.a.b ENSGT00940000160061 #24 ENSGT00940000157810 #25 ENSGT00940000164836 ENSGT00390000005508.a #26 ENSGT00390000009067 #27 ENSGT00940000165434 ENSGT00940000153972.C #28 ENSGT00940000160150 #29 ENSGT00390000015442 #30 ENSGT00940000162265 #31 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b Common wall lizard MODERN SPECIES 1 TBC1D22A (ENSPMRG00000013181) ENSPMRG00000013215 ENSPMRG00000013218 ENSPMRG00000013220 ENSPMRG00000013232 TAFA5 (ENSPMRG00000013237) BRD1 (ENSPMRG00000013262) ZBED4 (ENSPMRG00000013267) ALG12 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cobra MODERN SPECIES 10 ENSNNAG00000006069 IQUB (ENSNNAG00000006025) NDUFA5 (ENSNNAG00000006009) ASB15 (ENSNNAG00000005917) LMOD2 (ENSNNAG00000005853) WASL (ENSNNAG00000005834) ENSNNAG00000005815 HYAL4 (ENSNNAG00000005787) GPR37 (ENSNNAG00000005729) POT1 (ENSNNAG00000005677) ENSNNAG00000005657 GRM8 (ENSNNAG00000005629) ZNF800 (ENSNNAG00000005567) ENSNNAG00000005528 #21 ENSNNAG00000005478 #21 MAPK11 (ENSNNAG00000005400) #22 MAPK12 (ENSNNAG00000005298) #23 HDAC10 (ENSNNAG00000005222) #24 TUBGCP6 (ENSNNAG00000005082) #25 SELENOO (ENSNNAG00000004830) #26 TRABD (ENSNNAG00000004805) #27 ENSNNAG00000004659 PANX2 (ENSNNAG00000004610) #28 MOV10L1 (ENSNNAG00000004541) #29 MLC1 (ENSNNAG00000004203) #30 TTLL8 (ENSNNAG00000004149) #31 PIM3 (ENSNNAG00000004133) CRELD2 (ENSNNAG00000004103) ENSNNAG00000004075 ENSNNAG00000004041 ZBED4 (ENSNNAG00000004020) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00590000083094.a.b ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a ENSGT00940000166287 ENSGT00390000014326 ENSGT00390000008099 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