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Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000016025.a	ENSGT00940000161055	ENSGT00940000153434.a.a	ENSGT00390000002374	ENSGT00940000157487	ENSGT00390000008742	ENSGT00940000156437	ENSGT00390000003364	ENSGT00940000158577	ENSGT00940000159488	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158006	ENSGT00950000182916.a.b.a.b	ENSGT00940000155586.B	ENSGT00530000063790.b	ENSGT00940000155804	ENSGT00940000153617.D	ENSGT00390000003343	ENSGT00940000154930	ENSGT00940000158577	ENSGT00940000159488	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182916.a.b.a.b	ENSGT00940000155586.B	ENSGT00530000063790.b	ENSGT00940000155804	ENSGT00940000153617.D	ENSGT00390000003343	ENSGT00940000154930	ENSGT00940000158577	ENSGT00520000057958	ENSGT00940000159488	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01060000248581.A.a.a.a.e.b	ENSGT01100000263561.B #15	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.e.a	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.f	ENSGT00940000162899	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.p ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.d #16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a ##16	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609.`b #37
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Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.e.b	ENSGT01060000248581.A.a.b	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.e.a	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.f	ENSGT00940000162899	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.p ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.d #16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a ##16	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b.f #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609.`b #37
Golden Hamster	MODERN SPECIES	617	Cntf (ENSMAUG00000011143) #7	Zfp91 (ENSMAUG00000011095) #8	Lpxn (ENSMAUG00000010591) #9	Or5b21 (ENSMAUG00000010581) #10	Or5b24 (ENSMAUG00000010357) #11	ENSMAUG00000010348 #12	Or5b113 (ENSMAUG00000010634) #13	ENSMAUG00000011427 #14	ENSMAUG00000010391 #15	Or9q1 (ENSMAUG00000001875) #16	Tle4 (ENSMAUG00000010722) #17	ENSMAUG00000010124 #18	ENSMAUG00000010617 #19	Cep78 (ENSMAUG00000010295) #20	Gnaq (ENSMAUG00000010263) #21	Gna14 (ENSMAUG00000010242) #22	ENSMAUG00000009666 #23	Vps13a (ENSMAUG00000011043) #24	Foxb2 (ENSMAUG00000002346) #25	ENSMAUG00000010050 #26	ENSMAUG00000011637 #27	Gcnt1 (ENSMAUG00000002095) #28	ENSMAUG00000011219 #29	Ostf1 (ENSMAUG00000011202) #30	Nmrk1 (ENSMAUG00000009949) #31	Carnmt1 (ENSMAUG00000009492) #32	D030056L22Rik (ENSMAUG00000009324) #33	Trpm6 (ENSMAUG00000011731) #34	Rorb (ENSMAUG00000010447) #35	Anxa1 (ENSMAUG00000009898) #36	Aldh1a1 (ENSMAUG00000010223) #37
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01060000248581.A.a.b	ENSGT01100000263561.B #15	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.e.a	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.f	ENSGT00940000162899	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.p ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.d #16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a ##16	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000161347	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b.f #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609.`b #37
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Mus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01060000248581.A.a.b	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.e.b	ENSGT01100000263561.B.g.a #15	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.f	ENSGT00940000162899	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.p ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.d #16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b.a ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a ##16	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609.`b #37	ENSGT00940000154609.ab ##37
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01100000263561.B.g.a #15	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.f	ENSGT00940000162899	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.p ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.d #16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b.a ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a.a.a ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a.a.b ##16	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609.`b #37	ENSGT00940000154609.ab ##37
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01100000263561.B.g.a #15	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.f	ENSGT00940000162899	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.p ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.d #16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b.a ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a.a.a ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a.a.b ##16	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609.`b #37	ENSGT00940000154609.ab ##37
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01100000263561.B.g.a #15	ENSGT01060000248581.A.a.a.a.f	ENSGT00940000162899	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.c ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.p ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.b.d #16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b.a ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a.a.a ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.b.b ##16	ENSGT01100000263494.a.b.a.a.a.a.o.a.b ##16	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609.`b #37	ENSGT00940000154609.ab ##37
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000016025.a	ENSGT00940000161055	ENSGT00940000153434.a.a	ENSGT00390000002374	ENSGT00940000157487	ENSGT00390000008742	ENSGT00940000156437	ENSGT00390000003364	ENSGT00940000158577	ENSGT00940000159488	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000161347	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37
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Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000154461.`c	ENSGT00940000154294.k.a	ENSGT00940000154294.k.b	ENSGT00940000154294.l	ENSGT01030000234669.A	ENSGT01090000260018.A.a.b	ENSGT00940000162750	ENSGT00530000063632.B	ENSGT00940000159488	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000161347	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37	ENSGT01050000244942.b.a.a
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	114											ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000161347	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00940000165714 #23	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161055	ENSGT00940000153434.a.a	ENSGT00390000002374.u	ENSGT00940000157487	ENSGT00390000008742	ENSGT00940000156437	ENSGT00390000003364	ENSGT00940000158577	ENSGT00940000159488	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000161347	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37	ENSGT01050000244942.b.a.a
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	1										ENSGT00940000159488	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000161347	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37	ENSGT01050000244942.b.a.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	88										ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.a ##17	ENSGT01030000234519.e.a.a.a.a.b #17	ENSGT00940000153241.A #19	ENSGT00390000013287 #20	ENSGT00940000162569.b #21	ENSGT00940000161347	ENSGT00940000158510 #22	ENSGT00950000183083.a.d.b #24	ENSGT00940000161970 #25	ENSGT00940000154422 #26	ENSGT00940000161348 #28	ENSGT00390000015537	ENSGT00940000155770 #29	ENSGT00920000149159 #30	ENSGT00940000159384 #31	ENSGT00390000005323 #32	ENSGT00390000001325 #33	ENSGT00940000158164 #34	ENSGT00940000157708 #35	ENSGT00940000155221 #36	ENSGT00940000154609 #37	ENSGT01050000244942.b.a.a