Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000004362	ENSGT00390000012268 #7	ENSGT00940000166702 #8	ENSGT00940000163115 #9	ENSGT00940000162961 #11	ENSGT00960000187009 #12	ENSGT00940000162037 #13	ENSGT00940000156753.c #14	ENSGT00940000156753.d #15	ENSGT00730000111410 #16	ENSGT01010000222890 #17	ENSGT00390000018558.l #18	ENSGT00940000161212 #19	ENSGT00390000017387 #20	ENSGT00940000154347.a #21	ENSGT00940000160663 #22	ENSGT00390000005197.b #23	ENSGT00940000157086.b #24	ENSGT00730000111217 #25	ENSGT00390000002529 #26	ENSGT00730000111369 #27	ENSGT00940000160096 #28	ENSGT00940000159787 #29	ENSGT00940000161058 #30	ENSGT00940000157106 #31	ENSGT01090000260040.b.a.b #32	ENSGT00940000158934 #33	ENSGT00940000160902 #34	ENSGT00940000160207 #35	ENSGT00950000183113.a.b #36	ENSGT00390000002707 #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	WFDC13 (ENSSVLG00005001659) #7	ENSSVLG00005001641 #8	WFDC11 (ENSSVLG00005001621) #9	ENSSVLG00005001609 #10	WFDC9 (ENSSVLG00005001595) #11	ENSSVLG00005001583 #12	ENSSVLG00005001559 #13	EPPIN (ENSSVLG00005001541) #14	ENSSVLG00005001494 #15	WFDC2 (ENSSVLG00005001464) #16	ENSSVLG00005001444 #17	PIGT (ENSSVLG00005001374) #18	ENSSVLG00005001244 #19	TP53TG5 (ENSSVLG00005001221) #20	SYS1 (ENSSVLG00005001200) #21	SDC4 (ENSSVLG00005001186) #22	RBPJL (ENSSVLG00005001140) #23	MATN4 (ENSSVLG00005001050) #24	SLPI (ENSSVLG00005000965) #25	ENSSVLG00005000948 #26	WFDC5 (ENSSVLG00005000929) #27	KCNS1 (ENSSVLG00005000907) #28	STK4 (ENSSVLG00005000873) #29	TOMM34 (ENSSVLG00005000832) #30	PABPC1L (ENSSVLG00005000760) #31	YWHAB (ENSSVLG00005000717) #32	RIMS4 (ENSSVLG00005000677) #33	KCNK15 (ENSSVLG00005000558) #34	CCN5 (ENSSVLG00005000537) #35	ADA (ENSSVLG00005000518) #36	PKIG (ENSSVLG00005000482) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00730000111454	ENSGT00390000004362	ENSGT00390000012268 #7	ENSGT00940000163115 #9	ENSGT00940000162961 #11	ENSGT00960000187009 #12	ENSGT00940000162037 #13	ENSGT00940000156753.c #14	ENSGT00940000156753.d #15	ENSGT00730000111410 #16	ENSGT01010000222890 #17	ENSGT00390000018558.l #18	ENSGT00940000161212 #19	ENSGT00390000017387 #20	ENSGT00940000154347.a #21	ENSGT00940000160663 #22	ENSGT00390000005197.b #23	ENSGT00940000157086.b #24	ENSGT00730000111217 #25	ENSGT00390000002529 #26	ENSGT00730000111369 #27	ENSGT00940000160096 #28	ENSGT00940000159787 #29	ENSGT00940000161058.a.a #30	ENSGT00940000157106 #31	ENSGT01090000260040.b.a.b #32	ENSGT00940000158934 #33	ENSGT00940000160902 #34	ENSGT00940000160207 #35	ENSGT00940000157562	ENSGT00530000063859.b
Alpin marmot	MODERN SPECIES		ENSMMMG00000005350	ENSMMMG00000005342	WFDC13 (ENSMMMG00000005335) #7	WFDC11 (ENSMMMG00000005328) #9	WFDC9 (ENSMMMG00000005318) #11	ENSMMMG00000005311 #12	WFDC8 (ENSMMMG00000005282) #13	EPPIN (ENSMMMG00000005270) #14	ENSMMMG00000005251 #15	WFDC2 (ENSMMMG00000005234) #16	ENSMMMG00000005225 #17	PIGT (ENSMMMG00000005202) #18	DBNDD2 (ENSMMMG00000005187) #19	TP53TG5 (ENSMMMG00000005172) #20	ENSMMMG00000005147 #21	SDC4 (ENSMMMG00000005139) #22	RBPJL (ENSMMMG00000005104) #23	ENSMMMG00000005088 #24	SLPI (ENSMMMG00000005081) #25	ENSMMMG00000005063 #26	WFDC5 (ENSMMMG00000005050) #27	STK4 (ENSMMMG00000005028) #29	ENSMMMG00000005008 #30	PABPC1L (ENSMMMG00000004982) #31	YWHAB (ENSMMMG00000004966) #32	RIMS4 (ENSMMMG00000004946) #33	KCNK15 (ENSMMMG00000004903) #34	CCN5 (ENSMMMG00000004881) #35	PHACTR3 (ENSMMMG00000004853)	ENSMMMG00000004806	PPP1R3D (ENSMMMG00000004802)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00730000111454	ENSGT00390000004362	ENSGT00390000012268 #7	ENSGT00940000163115 #9	ENSGT00940000162961 #11	ENSGT00960000187009 #12	ENSGT00940000162037 #13	ENSGT00940000156753.c #14	ENSGT00940000156753.d #15	ENSGT00730000111410 #16	ENSGT01010000222890 #17	ENSGT00390000018558.l #18	ENSGT00940000161212 #19	ENSGT00390000017387 #20	ENSGT00940000154347.a #21	ENSGT00940000160663 #22	ENSGT00390000005197.b #23	ENSGT00940000157086.b #24	ENSGT00730000111217 #25	ENSGT00390000002529 #26	ENSGT00730000111369 #27	ENSGT00940000160096 #28	ENSGT00940000159787 #29	ENSGT00940000161058.b #30	ENSGT00940000161058.a.a #30	ENSGT00940000157106 #31	ENSGT01090000260040.b.a.b #32	ENSGT00940000158934 #33	ENSGT00940000160902 #34	ENSGT00940000160207 #35	ENSGT00940000157562
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	380	ENSUPAG00010002680	ENSUPAG00010002713	ENSUPAG00010002717 #7	ENSUPAG00010002727 #9	WFDC9 (ENSUPAG00010002742) #11	ENSUPAG00010002754 #12	WFDC8 (ENSUPAG00010002767) #13	EPPIN (ENSUPAG00010002810) #14	ENSUPAG00010002820 #15	WFDC2 (ENSUPAG00010002876) #16	ENSUPAG00010002885 #17	PIGT (ENSUPAG00010002893) #18	DBNDD2 (ENSUPAG00010002913) #19	TP53TG5 (ENSUPAG00010002919) #20	ENSUPAG00010002928 #21	SDC4 (ENSUPAG00010002934) #22	RBPJL (ENSUPAG00010002946) #23	MATN4 (ENSUPAG00010002967) #24	SLPI (ENSUPAG00010003258) #25	ENSUPAG00010003262 #26	WFDC5 (ENSUPAG00010003265) #27	KCNS1 (ENSUPAG00010003273) #28	STK4 (ENSUPAG00010003279) #29	TOMM34 (ENSUPAG00010003301) #30	PABPC1L (ENSUPAG00010003318) #31	YWHAB (ENSUPAG00010003342) #32	RIMS4 (ENSUPAG00010003352) #33	KCNK15 (ENSUPAG00010003360) #34	CCN5 (ENSUPAG00010003368) #35	PHACTR3 (ENSUPAG00010003378)	SYCP2 (ENSUPAG00010003434)
Squirrel	MODERN SPECIES	114	SNX21 (ENSSTOG00000006523)	TNNC2 (ENSSTOG00000006513)	UBE2C (ENSSTOG00000006502)	DNTTIP1 (ENSSTOG00000006482)	ENSSTOG00000031894	WFDC11 (ENSSTOG00000015644) #9	WFDC9 (ENSSTOG00000010219) #11	ENSSTOG00000010208 #13	EPPIN (ENSSTOG00000015851) #14	ENSSTOG00000031891 #15	WFDC2 (ENSSTOG00000020720) #16	PIGT (ENSSTOG00000009327) #18	DBNDD2 (ENSSTOG00000022365) #19	TP53TG5 (ENSSTOG00000009319) #20	SYS1 (ENSSTOG00000009315) #21	SDC4 (ENSSTOG00000009310) #22	RBPJL (ENSSTOG00000009296) #23	MATN4 (ENSSTOG00000009281) #24	SLPI (ENSSTOG00000020296) #25	ENSSTOG00000031994	ENSSTOG00000023892 #26	WFDC5 (ENSSTOG00000030004) #27	KCNS1 (ENSSTOG00000009257) #28	STK4 (ENSSTOG00000009251) #29	ENSSTOG00000031644	TOMM34 (ENSSTOG00000019477) #30	PABPC1L (ENSSTOG00000003739) #31	YWHAB (ENSSTOG00000003733) #32	RIMS4 (ENSSTOG00000022472) #33	KCNK15 (ENSSTOG00000030351) #34	CCN5 (ENSSTOG00000025361) #35